View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8621_low_5 (Length: 490)

Name: NF8621_low_5
Description: NF8621
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8621_low_5
NF8621_low_5
[»] chr5 (22 HSPs)
chr5 (18-478)||(17266216-17266676)
chr5 (206-475)||(21870163-21870432)
chr5 (206-475)||(21874443-21874712)
chr5 (18-450)||(23077815-23078247)
chr5 (33-478)||(23563050-23563495)
chr5 (26-400)||(22505713-22506087)
chr5 (26-400)||(25851106-25851480)
chr5 (26-406)||(20345316-20345696)
chr5 (18-478)||(14883873-14884333)
chr5 (206-478)||(18782346-18782618)
chr5 (216-359)||(21883017-21883160)
chr5 (206-403)||(23461203-23461400)
chr5 (216-283)||(23526293-23526360)
chr5 (312-478)||(27521741-27521907)
chr5 (162-472)||(20803785-20804095)
chr5 (315-478)||(27682285-27682448)
chr5 (206-400)||(21410366-21410560)
chr5 (315-478)||(22329772-22329935)
chr5 (18-113)||(28892189-28892284)
chr5 (224-349)||(21332000-21332125)
chr5 (26-106)||(20824487-20824567)
chr5 (299-478)||(23537097-23537276)
[»] chr2 (23 HSPs)
chr2 (18-478)||(12577096-12577556)
chr2 (26-450)||(19716285-19716709)
chr2 (26-450)||(19720848-19721272)
chr2 (18-450)||(23097286-23097718)
chr2 (34-436)||(23274352-23274754)
chr2 (18-478)||(20848332-20848789)
chr2 (206-478)||(23116299-23116571)
chr2 (216-415)||(22742269-22742468)
chr2 (70-274)||(24704926-24705130)
chr2 (315-478)||(10871887-10872050)
chr2 (160-478)||(24656898-24657216)
chr2 (206-274)||(22462925-22462993)
chr2 (99-269)||(11351160-11351330)
chr2 (216-262)||(21320459-21320505)
chr2 (206-292)||(23205245-23205331)
chr2 (206-292)||(23676849-23676935)
chr2 (309-415)||(44382876-44382982)
chr2 (216-349)||(23028831-23028963)
chr2 (207-344)||(28350807-28350944)
chr2 (315-415)||(24265407-24265507)
chr2 (204-340)||(24817218-24817354)
chr2 (216-274)||(24678428-24678486)
chr2 (25-53)||(23105393-23105421)
[»] chr3 (43 HSPs)
chr3 (18-477)||(13944765-13945224)
chr3 (18-478)||(8744318-8744778)
chr3 (54-478)||(16384300-16384724)
chr3 (18-478)||(16831456-16831916)
chr3 (18-473)||(17189115-17189570)
chr3 (33-439)||(31941659-31942065)
chr3 (21-475)||(24190048-24190501)
chr3 (33-450)||(12357483-12357900)
chr3 (33-439)||(31692152-31692558)
chr3 (105-475)||(14290463-14290833)
chr3 (168-478)||(18131275-18131585)
chr3 (102-457)||(12857445-12857800)
chr3 (37-475)||(35982941-35983379)
chr3 (174-475)||(16825210-16825511)
chr3 (33-439)||(12181100-12181506)
chr3 (18-478)||(10408709-10409169)
chr3 (21-400)||(47126688-47127067)
chr3 (18-400)||(28757060-28757442)
chr3 (168-450)||(11958137-11958419)
chr3 (33-436)||(17494403-17494809)
chr3 (26-400)||(16326713-16327089)
chr3 (33-224)||(11949107-11949298)
chr3 (162-472)||(11861228-11861538)
chr3 (206-478)||(23414729-23415001)
chr3 (206-472)||(15065990-15066256)
chr3 (206-478)||(16695083-16695355)
chr3 (205-417)||(15230531-15230743)
chr3 (205-417)||(15236399-15236611)
chr3 (213-331)||(12843189-12843307)
chr3 (102-328)||(13317647-13317873)
chr3 (206-478)||(16803886-16804158)
chr3 (206-359)||(23079075-23079228)
chr3 (301-478)||(3688954-3689131)
chr3 (366-450)||(2245628-2245712)
chr3 (26-226)||(10417225-10417425)
chr3 (18-77)||(13317863-13317922)
chr3 (216-283)||(14873719-14873786)
chr3 (213-274)||(17497617-17497678)
chr3 (142-274)||(12501788-12501920)
chr3 (134-268)||(15008722-15008853)
chr3 (312-415)||(13255712-13255815)
chr3 (315-361)||(10008625-10008671)
chr3 (315-361)||(10909235-10909281)
[»] chr7 (32 HSPs)
chr7 (18-478)||(18050640-18051100)
chr7 (130-478)||(14144875-14145223)
chr7 (18-478)||(14283061-14283521)
chr7 (18-475)||(11385119-11385576)
chr7 (66-404)||(15099364-15099702)
chr7 (66-391)||(12712437-12712762)
chr7 (33-475)||(12798194-12798633)
chr7 (18-450)||(16947187-16947619)
chr7 (33-403)||(19150128-19150498)
chr7 (33-403)||(20749527-20749897)
chr7 (33-478)||(13676568-13677007)
chr7 (69-475)||(12459781-12460187)
chr7 (213-475)||(14260936-14261198)
chr7 (26-450)||(13024454-13024878)
chr7 (18-478)||(26115277-26115737)
chr7 (18-156)||(14140781-14140919)
chr7 (18-400)||(26091563-26091945)
chr7 (18-400)||(40924582-40924964)
chr7 (18-400)||(49155403-49155785)
chr7 (26-400)||(13965433-13965807)
chr7 (26-400)||(21755522-21755896)
chr7 (206-478)||(17703164-17703436)
chr7 (206-478)||(16726150-16726422)
chr7 (206-472)||(9591653-9591919)
chr7 (285-391)||(13004834-13004940)
chr7 (213-358)||(15145752-15145897)
chr7 (315-478)||(11233925-11234088)
chr7 (205-417)||(12203548-12203760)
chr7 (315-478)||(15157769-15157932)
chr7 (213-331)||(14042991-14043109)
chr7 (213-331)||(14353021-14353139)
chr7 (18-60)||(15343533-15343575)
[»] chr4 (26 HSPs)
chr4 (18-478)||(53750170-53750630)
chr4 (18-478)||(51603492-51603952)
chr4 (33-439)||(16150763-16151169)
chr4 (33-439)||(16154909-16155315)
chr4 (102-468)||(15073555-15073921)
chr4 (33-394)||(14993151-14993512)
chr4 (66-439)||(15266936-15267309)
chr4 (26-400)||(20893151-20893525)
chr4 (95-439)||(18259630-18259974)
chr4 (33-400)||(11204010-11204377)
chr4 (18-478)||(29450237-29450697)
chr4 (18-400)||(3261572-3261954)
chr4 (26-417)||(7357387-7357778)
chr4 (18-478)||(44658566-44659026)
chr4 (26-322)||(27903505-27903801)
chr4 (206-478)||(18604259-18604531)
chr4 (206-472)||(13513650-13513916)
chr4 (206-477)||(18223914-18224185)
chr4 (213-403)||(14697408-14697598)
chr4 (206-472)||(16248122-16248388)
chr4 (213-406)||(8343-8536)
chr4 (213-406)||(15548-15741)
chr4 (213-328)||(16219495-16219610)
chr4 (213-328)||(16222815-16222930)
chr4 (301-415)||(8389804-8389918)
chr4 (299-415)||(15144451-15144567)
[»] scaffold0765 (1 HSPs)
scaffold0765 (18-475)||(5963-6420)
[»] chr8 (22 HSPs)
chr8 (18-475)||(22054041-22054498)
chr8 (18-478)||(22027423-22027883)
chr8 (105-475)||(21928693-21929063)
chr8 (102-436)||(22374131-22374465)
chr8 (26-478)||(16268367-16268819)
chr8 (18-450)||(31413703-31414135)
chr8 (105-436)||(19985445-19985776)
chr8 (18-417)||(28984089-28984488)
chr8 (26-450)||(29300597-29301021)
chr8 (213-405)||(22523883-22524075)
chr8 (206-412)||(30310353-30310559)
chr8 (206-478)||(15536749-15537021)
chr8 (206-478)||(22043193-22043465)
chr8 (206-478)||(32603511-32603783)
chr8 (216-274)||(21163877-21163935)
chr8 (213-283)||(21391199-21391269)
chr8 (213-283)||(21780525-21780595)
chr8 (301-361)||(19481335-19481395)
chr8 (66-241)||(6606849-6607024)
chr8 (18-81)||(28989308-28989371)
chr8 (315-478)||(18860049-18860212)
chr8 (366-403)||(20391612-20391649)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (18-475)||(203522-203979)
scaffold0003 (315-478)||(424746-424909)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (18-475)||(263367-263824)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (17-478)||(9491-9951)
[»] scaffold0348 (2 HSPs)
scaffold0348 (18-478)||(17187-17647)
scaffold0348 (38-463)||(4567-4992)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (26-478)||(40207-40659)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (18-478)||(64305-64765)
scaffold0067 (18-478)||(48883-49343)
scaffold0067 (18-478)||(57917-58377)
scaffold0067 (18-439)||(29765-30186)
[»] scaffold1914 (1 HSPs)
scaffold1914 (165-475)||(936-1246)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (18-450)||(218-650)
scaffold0222 (33-394)||(20970-21331)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (18-478)||(53126-53586)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (18-478)||(22263-22723)
[»] scaffold0034 (4 HSPs)
scaffold0034 (135-478)||(11609-11952)
scaffold0034 (33-450)||(1683-2100)
scaffold0034 (26-322)||(70521-70817)
scaffold0034 (216-472)||(121885-122141)
[»] chr6 (30 HSPs)
chr6 (26-478)||(18797674-18798126)
chr6 (20-436)||(21566878-21567294)
chr6 (26-439)||(14376800-14377213)
chr6 (33-436)||(19437993-19438396)
chr6 (33-391)||(34642517-34642876)
chr6 (66-394)||(24515343-24515671)
chr6 (217-468)||(25771019-25771270)
chr6 (69-475)||(10465696-10466102)
chr6 (85-349)||(21474643-21474907)
chr6 (18-400)||(24367376-24367758)
chr6 (177-391)||(19456158-19456372)
chr6 (177-391)||(19466303-19466517)
chr6 (26-478)||(15462320-15462772)
chr6 (206-472)||(21764976-21765242)
chr6 (206-415)||(30677932-30678141)
chr6 (213-321)||(23081594-23081702)
chr6 (315-478)||(5836076-5836239)
chr6 (315-478)||(22829234-22829397)
chr6 (218-415)||(25756523-25756720)
chr6 (285-391)||(19881639-19881745)
chr6 (372-478)||(20010346-20010452)
chr6 (366-436)||(21474908-21474978)
chr6 (284-412)||(18660161-18660289)
chr6 (216-292)||(22437043-22437119)
chr6 (301-361)||(28312886-28312946)
chr6 (366-417)||(19486200-19486251)
chr6 (160-247)||(27559045-27559132)
chr6 (211-261)||(24292844-24292894)
chr6 (207-268)||(16813805-16813866)
chr6 (207-295)||(8720733-8720821)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (30-436)||(98328-98734)
scaffold0020 (102-434)||(176212-176544)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (26-439)||(8204-8617)
scaffold0235 (26-439)||(18418-18831)
[»] scaffold0664 (1 HSPs)
scaffold0664 (105-439)||(7266-7600)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (33-439)||(54203-54609)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (33-478)||(4912-5357)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (18-475)||(251-708)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (33-450)||(164132-164549)
scaffold0023 (216-283)||(30472-30539)
[»] scaffold1299 (1 HSPs)
scaffold1299 (22-394)||(1635-2007)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (84-478)||(15279-15673)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (33-478)||(39038-39481)
scaffold0010 (206-478)||(14753-15025)
[»] scaffold0053 (3 HSPs)
scaffold0053 (33-475)||(62478-62920)
scaffold0053 (26-268)||(65211-65453)
scaffold0053 (289-445)||(65058-65214)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (33-475)||(70264-70706)
[»] scaffold0523 (2 HSPs)
scaffold0523 (33-475)||(5596-6035)
scaffold0523 (160-417)||(11507-11764)
[»] chr1 (26 HSPs)
chr1 (33-475)||(21742327-21742769)
chr1 (18-450)||(24096415-24096847)
chr1 (33-394)||(20832757-20833117)
chr1 (26-400)||(21961193-21961567)
chr1 (66-475)||(21738811-21739220)
chr1 (33-439)||(22015556-22015962)
chr1 (141-478)||(19857555-19857892)
chr1 (18-400)||(38909676-38910058)
chr1 (26-400)||(20074559-20074933)
chr1 (18-400)||(48426031-48426413)
chr1 (141-400)||(20297664-20297923)
chr1 (18-400)||(31536847-31537229)
chr1 (18-400)||(37680207-37680589)
chr1 (206-478)||(21228328-21228600)
chr1 (26-400)||(52988907-52989280)
chr1 (204-415)||(16379407-16379618)
chr1 (208-478)||(17041788-17042057)
chr1 (206-460)||(24784648-24784901)
chr1 (301-478)||(16354018-16354195)
chr1 (206-417)||(21176682-21176893)
chr1 (301-361)||(41350560-41350620)
chr1 (301-415)||(16347433-16347547)
chr1 (372-478)||(20853532-20853638)
chr1 (216-331)||(20081295-20081410)
chr1 (315-361)||(51330384-51330430)
chr1 (252-328)||(21045076-21045152)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (33-445)||(619-1031)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (102-457)||(29752-30106)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (244-478)||(2198-2432)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (33-439)||(8770-9176)
[»] scaffold1530 (1 HSPs)
scaffold1530 (174-478)||(801-1105)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (85-457)||(996-1368)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (33-417)||(37095-37479)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (85-457)||(28009-28381)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (66-264)||(115751-115949)
scaffold0029 (18-267)||(93808-94057)
scaffold0029 (216-359)||(8553-8696)
[»] scaffold1433 (1 HSPs)
scaffold1433 (66-439)||(1053-1426)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (66-439)||(7933-8306)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (33-439)||(34493-34899)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (33-475)||(50261-50703)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (168-439)||(319534-319805)
scaffold0004 (33-322)||(325863-326151)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (33-450)||(5209-5626)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (33-403)||(5337-5706)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (33-475)||(43125-43567)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (102-439)||(42923-43260)
scaffold0102 (219-340)||(50186-50307)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (33-447)||(8755-9169)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (68-436)||(51842-52210)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (211-475)||(33078-33342)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (99-478)||(153714-154093)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (27-436)||(4049-4458)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (33-478)||(2787-3226)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (66-475)||(16826-17235)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (33-450)||(9505-9920)
[»] scaffold0203 (2 HSPs)
scaffold0203 (34-268)||(767-1001)
scaffold0203 (312-439)||(3793-3920)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (133-439)||(4196-4501)
[»] scaffold2062 (1 HSPs)
scaffold2062 (33-417)||(636-1025)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (206-439)||(5644-5877)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (206-475)||(115953-116222)
[»] scaffold1032 (1 HSPs)
scaffold1032 (33-439)||(557-963)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (99-440)||(5824-6165)
[»] scaffold1056 (1 HSPs)
scaffold1056 (105-475)||(1949-2317)
[»] scaffold1517 (1 HSPs)
scaffold1517 (18-439)||(1229-1650)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (227-475)||(3215-3463)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (141-417)||(6069-6344)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (168-439)||(284-555)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (18-400)||(41876-42258)
[»] scaffold1426 (1 HSPs)
scaffold1426 (26-400)||(1388-1762)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (33-394)||(71-432)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (160-400)||(514134-514374)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (26-400)||(610-984)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (70-415)||(11170-11515)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (102-472)||(36723-37093)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (219-450)||(251961-252192)
scaffold0009 (206-478)||(229555-229827)
[»] scaffold0054 (2 HSPs)
scaffold0054 (33-323)||(63377-63667)
scaffold0054 (346-436)||(63284-63374)
[»] scaffold0261 (4 HSPs)
scaffold0261 (285-435)||(12160-12310)
scaffold0261 (285-435)||(20340-20490)
scaffold0261 (175-241)||(12352-12418)
scaffold0261 (175-241)||(20532-20598)
[»] scaffold0276 (1 HSPs)
scaffold0276 (160-400)||(23704-23944)
[»] scaffold1845 (1 HSPs)
scaffold1845 (180-415)||(1070-1305)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (213-415)||(16375-16577)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (216-415)||(30092-30291)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (279-417)||(625-762)
[»] scaffold0451 (1 HSPs)
scaffold0451 (206-415)||(13798-14007)
[»] scaffold0289 (1 HSPs)
scaffold0289 (206-417)||(117-328)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (206-472)||(66817-67083)
[»] scaffold2165 (1 HSPs)
scaffold2165 (160-400)||(584-824)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (206-477)||(17489-17760)
[»] scaffold0457 (1 HSPs)
scaffold0457 (301-478)||(13757-13934)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (206-478)||(139313-139585)
[»] scaffold1220 (1 HSPs)
scaffold1220 (162-460)||(21-319)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (216-406)||(32218-32408)
scaffold0080 (206-358)||(10062-10214)
scaffold0080 (206-358)||(12717-12869)
[»] scaffold0309 (2 HSPs)
scaffold0309 (66-231)||(12916-13081)
scaffold0309 (300-415)||(19821-19936)
[»] scaffold0285 (1 HSPs)
scaffold0285 (206-478)||(5327-5599)
[»] scaffold0177 (2 HSPs)
scaffold0177 (206-405)||(14817-15016)
scaffold0177 (206-340)||(11197-11331)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (213-349)||(104562-104698)
[»] scaffold0993 (1 HSPs)
scaffold0993 (213-358)||(1318-1463)
[»] scaffold0443 (2 HSPs)
scaffold0443 (160-241)||(12080-12161)
scaffold0443 (18-81)||(11950-12013)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (216-472)||(379-635)
[»] scaffold0075 (2 HSPs)
scaffold0075 (213-406)||(48066-48259)
scaffold0075 (213-406)||(55246-55439)
[»] scaffold0679 (1 HSPs)
scaffold0679 (366-450)||(766-850)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (366-450)||(25949-26033)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (216-360)||(36641-36785)
scaffold0042 (204-328)||(26679-26803)
[»] scaffold2059 (1 HSPs)
scaffold2059 (206-349)||(601-744)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (216-359)||(453-596)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (206-349)||(208-351)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (213-328)||(7209-7324)
scaffold0270 (213-328)||(14339-14454)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (160-478)||(28631-28949)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (252-415)||(40273-40436)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (206-349)||(12956-13099)
[»] scaffold0088 (2 HSPs)
scaffold0088 (26-241)||(30083-30298)
scaffold0088 (301-400)||(30334-30433)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (217-292)||(21944-22019)
scaffold0081 (217-292)||(37368-37443)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (213-328)||(57467-57582)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (213-359)||(14420-14566)
scaffold0120 (213-274)||(11599-11660)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (213-322)||(18181-18290)
scaffold0040 (213-328)||(110760-110875)
[»] scaffold1881 (1 HSPs)
scaffold1881 (206-358)||(303-455)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (216-344)||(263-391)
[»] scaffold0447 (1 HSPs)
scaffold0447 (213-349)||(1696-1832)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (85-472)||(15288-15675)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (213-349)||(4560-4696)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (336-400)||(17698-17762)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (26-348)||(4978-5300)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (213-412)||(3661-3860)
[»] scaffold1423 (1 HSPs)
scaffold1423 (213-274)||(285-346)
[»] scaffold0611 (1 HSPs)
scaffold0611 (213-274)||(9350-9411)
[»] scaffold0609 (1 HSPs)
scaffold0609 (134-271)||(1196-1333)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (216-349)||(7489-7622)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (319-478)||(11891-12050)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (204-340)||(9192-9328)
scaffold0018 (285-346)||(23133-23194)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (300-415)||(15334-15449)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (279-354)||(12346-12421)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (33-128)||(19022-19117)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (234-472)||(66239-66477)
[»] scaffold0605 (1 HSPs)
scaffold0605 (372-445)||(1775-1848)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (299-415)||(34537-34653)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (213-349)||(9955-10091)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (206-274)||(10065-10133)
[»] scaffold0429 (1 HSPs)
scaffold0429 (284-412)||(1191-1319)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (300-340)||(24567-24607)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 421; Significance: 0; HSPs: 22)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 17266676 - 17266216
Alignment:
Q  18 tcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattac 117  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17266676 tcattagcagtctaggtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattac 17266577  T
Q  118 aattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttact 217  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17266576 aattatagcatacaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatcctcggtacaaacgttact 17266477  T
Q  218 cttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtca 317  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17266476 cttgtgacctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggcctcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtca 17266377  T
Q  318 gcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17266376 gcaggggcactatacggtttaggacgactctgatgccctttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 17266277  T
Q  418 cgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17266276 agcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 17266216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 206 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 21870432 - 21870163
Alignment:
Q  206 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 305  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || || | |||||||| ||||||||| ||| |  | |||| |||| ||||||| | | |||||    
T  21870432 acaaacattactcttgtggtctttctcaccacacttgaagcaaattatctcagtaggagcatctctcctcttaggcctcctcccatcattcaatttctgc 21870333  T
Q  306 ttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcct 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  21870332 ttacccttgtcagcaggggcactatacggcttcggacgactctgctgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttggtatcctctt 21870233  T
Q  406 cgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgat 475  Q
    | || ||||| | || ||||||||| ||||| ||  | || |||| ||| || || ||||||||||||||    
T  21870232 catatatcctgcagctacttaccaattcagaaaagttccttatcttttgatagccaatagccctcttgat 21870163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 206 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 21874712 - 21874443
Alignment:
Q  206 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 305  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || || | |||||||| ||||||||| ||| |  | |||| |||| ||||||| | | |||||    
T  21874712 acaaacattactcttgtggtctttctcaccacacttgaagcaaattatctcagtaggagcatctctcctcttaggcctcctcccatcattcaatttctgc 21874613  T
Q  306 ttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcct 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  21874612 ttacccttgtcagcaggggcactatacggcttcggacgactctgctgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttggtatcctctt 21874513  T
Q  406 cgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgat 475  Q
    | || ||||| | || ||||||||| ||||| ||  | || |||| ||| || || ||||||||||||||    
T  21874512 catatatcctgcagctacttaccaattcagaaaagttccttatcttttgatagccaatagccctcttgat 21874443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 23078247 - 23077815
Alignment:
Q  18 tcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattac 117  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||    ||| ||||||||||||| || ||||  | |||||| ||||| ||||| || |    
T  23078247 tcattagtagtctgcgtactagtcaatgcaaacactttcccaccggtcctagccttcttcggctgagtacactatgaactgatatgaccttcttcgttgc 23078148  T
Q  118 aattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttact 217  Q
    | || |||||  |||  || || ||||| || || |||||  |||| || ||||| ||||||||||| || ||| |||||||  |   |||| | || ||    
T  23078147 agttgtagcaaacaatgtctccacgcttacattcagctagggtgtgtcctttctgaccacacctgaaacatttcctctcatctctaccacaagcattgct 23078048  T
Q  218 cttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtca 317  Q
     ||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||| |  | |||| ||| |||||||| |   ||||||| || ||||||    
T  23078047 tttgtggcctttttcaccacacttgaaacatacaatctcagcaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcattcatcttctgcttccctttgtca 23077948  T
Q  318 gcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 417  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||| || | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |    
T  23077947 gcaggagcactgtaaggtttaggacgactctgctgtcccttacccctcctctcactcattaccttgtaatgagctttggtgtcttcctcatatatcctgc 23077848  T
Q  418 cgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatct 450  Q
     ||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  23077847 agctgcttaccaactcagagaaaattctaatct 23077815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 33 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 23563495 - 23563050
Alignment:
Q  33 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 132  Q
    ||||| ||||||||||| || || ||||||   ||||||||||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||| || ||||| ||  ||     
T  23563495 gtaccggtcaaagcaaacaccttaccaccagtcctaaccttcttcggctgcgtacactgcgaactaatatgaccttcctcattgcagttataacaaacat 23563396  T
Q  133 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctc 232  Q
      || || | ||| || || |||||  |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |   ||| || ||||||||||||||||| ||    
T  23563395 tgtctccacccttacagtcagctagtgtgtgtcctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctctatcacagacattactcttgtggcctttttc 23563296  T
Q  233 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatac 332  Q
     |||||||| || || || || |||| ||||||||| ||| |  | |||| |||||||| ||| |  ||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  23563295 accacacttgaagcaaacaatgtcagtaggagcatctctcctcttgggcctcctctcattatttaacctctgcttatccttttcagcaggagcactatac 23563196  T
Q  333 ggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaat 432  Q
    || || |||| | |||  |||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| | || |||||||||||    
T  23563195 ggcttcggacaactcttctgtcccttacctctacgttcactcatcatcttgtaatgagctttagtgtcctcctcataaatcctgcagctacttaccaaat 23563096  T
Q  433 cagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
     | ||||| |||||||||  || || || || || |||||||||||    
T  23563095 taaagaaatttctaatcttctgataaccaatggctctcttgatgtc 23563050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 26 - 400
Target Start/End: Original strand, 22505713 - 22506087
Alignment:
Q  26 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 125  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| || || || |||  ||||||||||||||| |  |  ||||| | |||||||||||||||| |||| || || |||    
T  22505713 agtctgcgtaccagtcaatgcaaacaccttgcccccagttctaaccttcttcggttcaggacactgtgaactgatgtgaccctctccattgcagttgtag 22505812  T
Q  126 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggc 225  Q
    ||  |||  || || ||||| || || ||||   | || ||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||   |||||| || ||||||||||    
T  22505813 cagacaatgtccccacgcttacattcagctaagctatgtcccatctgaccacacctgaagcacttcctctcgtctttaccacaaacattgctcttgtggc 22505912  T
Q  226 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggc 325  Q
    ||||||| ||||||||  |||| || ||||||| ||||||||| ||| |  | |||| ||| |||||||| |   ||||||| || ||||||||||| ||    
T  22505913 ctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagaaggagcatctctcctcttaggcctcctatcatcattcatcttctgctttcctttgtcagcaggagc 22506012  T
Q  326 actatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 400  Q
    ||| || || |||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  22506013 actgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttataatgagctttggtgtc 22506087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 26 - 400
Target Start/End: Original strand, 25851106 - 25851480
Alignment:
Q  26 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || || ||||||  |||| ||||||||||||  |  ||||| | ||| || ||||||||| |||| || || |||    
T  25851106 agtctgcgtaccagtcaaagcaaataccttcccaccagttctagccttcttcggctcaggacactgtgaactaatatgaccctctccattgcagttgtag 25851205  T
Q  126 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggc 225  Q
    ||  |||  || || |||||| | || |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||   |||||| |||||||||||||    
T  25851206 cagacaatgtctccacgcttgtattcagctagactgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctttaccacaaacattactcttgtggc 25851305  T
Q  226 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggc 325  Q
    ||||||| ||||||||  | || || |||||| || ||||||| ||| |  | |||| ||| ||||||   |   ||||||| || ||||||||||| ||    
T  25851306 ctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaagagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgtcagcaggagc 25851405  T
Q  326 actatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 400  Q
    ||| || || |||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  25851406 actgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtc 25851480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 406
Target Start/End: Original strand, 20345316 - 20345696
Alignment:
Q  26 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 125  Q
    |||||| |||||||| |||||||| || || ||||||  |||| ||||||||||||  |  ||||| | ||| || ||||| ||  |||| || || |||    
T  20345316 agtctgcgtaccagttaaagcaaataccttcccaccagttctagccttcttcggctcaggacactgtgaactaatatgaccttccccattgcagttgtag 20345415  T
Q  126 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggc 225  Q
    ||  |||  || || |||||||| ||  ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||   |||||| ||||||||||||     
T  20345416 cagacaatgtccccacgcttgcattcaactagactgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctttaccacaaacattactcttgtggg 20345515  T
Q  226 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggc 325  Q
    ||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||||||||| ||| |  | |||| ||| ||||||   |   ||||||| || ||||||||||| ||    
T  20345516 ctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagcaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgtcagcaggagc 20345615  T
Q  326 actatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctc 406  Q
    |||||| || |||||||||||||  ||||||||||| || | ||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  20345616 actataaggcttaggacgattctactgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcctc 20345696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 14884333 - 14883873
Alignment:
Q  18 tcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattac 117  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||  |||| ||||||  |  ||||| | ||| || ||||| ||  |||| |    
T  14884333 tcattaggagtctgcgtaccagtcaaagcaaacactttcccaccaattctagtcttcctcggctcaggacactgtgaactaatatgaccttccccattgc 14884234  T
Q  118 aattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttact 217  Q
    | || || ||  |||  || || |||||||| || || |   ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||  |   ||| || |||||    
T  14884233 agttgtaacagacaatgtccccacgcttgcattcagccaaactgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctctcccacagacattact 14884134  T
Q  218 cttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtca 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||| || |||||||| |||||||| ||| |  | |||| ||| ||||||   |  |||||||| || ||||||    
T  14884133 cttgtggcctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagctggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcctctgctttcctttgtca 14884034  T
Q  318 gcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 417  Q
    | ||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| | ||||||||||||||||||||| || || ||||| || |    
T  14884033 gtaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcataatcttataatgagctttggtgtcttcttcatagattctgc 14883934  T
Q  418 cgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
      | | | ||||| |||||||| | ||| ||||| || || || |||||||| ||||||||    
T  14883933 acctattaaccaactcagagaagactctgatctgctgatacccaatagcccttttgatgtc 14883873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 206 - 478
Target Start/End: Original strand, 18782346 - 18782618
Alignment:
Q  206 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 305  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||| ||||  | | || ||| |||||    | ||||||     
T  18782346 acaaacattactcttgtggcctttctcgccacagttgaaacaaacaatctccgcaggagcatccttcttcttagaccacctatcatcgaccattctctgt 18782445  T
Q  306 ttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcc 404  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||| || |||||   |||| |||||| |||  ||||| |||| ||| || || || |||    
T  18782446 ttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgttggccctt-ggtcttccgctcattcacaaccttgtaattagccttagtatcttcc 18782544  T
Q  405 tcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
    |||||||| || | || | | || |||| || ||||| ||  |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  18782545 tcgtagattctgcagctattcactaaattagggaaaactcggatctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 18782618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 359
Target Start/End: Original strand, 21883017 - 21883160
Alignment:
Q  216 ctcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| | ||||  |||| |||||||| || || ||    | |||||| || ||||| |    
T  21883017 ctcttgtggcctttctcgccacaattaaaacagacaatctcagcagaaacatctttcttcctcggccgtctatcctcgaccattctctgtttgcccttat 21883116  T
Q  316 cagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtccctta 359  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||| |||| || ||||||    
T  21883117 cagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggccctta 21883160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 403
Target Start/End: Original strand, 23461203 - 23461400
Alignment:
Q  206 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 305  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||| | || || || |||||||||||| ||||  | |||||||| |||||    | |||||      
T  23461203 acaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaatagacaatttccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctat 23461302  T
Q  306 ttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctc 403  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||| || ||||||  |||| |||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  23461303 tttcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggccctta-gtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagctttggtgtcctc 23461400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 283
Target Start/End: Original strand, 23526293 - 23526360
Alignment:
Q  216 ctcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccg 283  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  23526293 ctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaatctcagcaggagcatccttcttccttggccg 23526360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 312 - 478
Target Start/End: Original strand, 27521741 - 27521907
Alignment:
Q  312 ttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtaga 411  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  | | |||| |||  ||||| || ||||| || |||||||| || ||||    
T  27521741 ttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtgtcctcttcataga 27521840  T
Q  412 tcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
    |||| | || | | ||||||||    |||| ||| | |||||||||||| || |||||||| |||||    
T  27521841 tcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactctcaactgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 27521907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 162 - 472
Target Start/End: Original strand, 20803785 - 20804095
Alignment:
Q  162 tgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcag 261  Q
    ||||||||||  ||||||| ||| || |||||| | ||||  |  ||||| || ||||||||||||||||| ||| | || ||||| || ||||| ||||    
T  20803785 tgacccttcttgccacaccagaaacatttcttcacctcctcagggcaaacatttctcttgtggcctttctcaccataattgaaacagacaatctccgcag 20803884  T
Q  262 gagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacc 361  Q
    |||||||| ||||  | |||||||| |||||    | |||||  || ||||| ||||||||||||||||| || |||||  || | || || ||||||      
T  20803885 gagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctatttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggagactttgttggccctta-g 20803983  T
Q  362 tcttc-gctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcc 460  Q
    ||||| |||||  ||  ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| || | || | ||||||| ||||  |||| ||  |||||||||||||     
T  20803984 tcttctgctcatccacaaccttgtaatgagccttggtatcctcctcatagattctgcagctatttaccaactcaggaaaaactcggatctgttggtatct 20804083  T
Q  461 tatagccctctt 472  Q
     || ||||||||    
T  20804084 gattgccctctt 20804095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 315 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 27682448 - 27682285
Alignment:
Q  315 tcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcc 414  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| ||  ||| |||| |||  ||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  27682448 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctttctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcc 27682349  T
Q  415 taccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
    |   || | | ||||||||    |||| ||| | |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  27682348 tgtagctattaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 27682285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 400
Target Start/End: Original strand, 21410366 - 21410560
Alignment:
Q  206 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 305  Q
    |||| |||||||||| || |||||||| |||||    |||||||| |  |||| ||||| ||| ||||| || |||| ||||| |||||| |  || |||    
T  21410366 acaagcgttactcttatgacctttctctccacatcggaaacacacaacttcagtaggagtatctctctttctgggcctcctcttatcattcaccctatgc 21410465  T
Q  306 ttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 400  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || ||||||  |||| | || ||   |||||| || |||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  21410466 ttacccttatcagctggagcactgtaaggtttaccacgactttgttggtgcttacccctccgctcattcataatcttataatgagctttggtgtc 21410560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 22329935 - 22329772
Alignment:
Q  315 tcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcc 414  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| ||  | | |||| |||  ||||| || ||||| || || ||||| || |||||||    
T  22329935 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 22329836  T
Q  415 taccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
    | | || | | |||||||| |  |||| ||| | ||||||||| || || ||||||||||||||    
T  22329835 tgcagctattgaccaaatctggaaaaactctcagctgttggtacccaattgccctcttgatgtc 22329772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 28892284 - 28892189
Alignment:
Q  18 tcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttca 113  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||| ||   ||| |||||||| || || |||||||| | ||  |||||||||||||||    
T  28892284 tcattagtagtctgagtaccagtcaaagcgaatacttttcctccggttctgaccttcttaggttgagtgcactgcgcaccaatgtgaccctcttca 28892189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 21332125 - 21332000
Alignment:
Q  224 gcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggg 323  Q
    |||||||||||||||  || | ||||| |||||| || |||||||  |||| || ||||  ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||||||     
T  21332125 gcctttctcgccacaagtatagcacacaatctcaacatgagcatctttctttctaggccttctctcatcattaactctttgttttcccttatcagcagga 21332026  T
Q  324 gcactatacggtttaggacgattctg 349  Q
    ||||| || || || |||||| ||||    
T  21332025 gcactgtaaggctttggacgactctg 21332000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 106
Target Start/End: Original strand, 20824487 - 20824567
Alignment:
Q  26 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgacc 106  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||   || |||||||| || || |||||||| | ||| ||||||||    
T  20824487 agtctgcgtaccagtcaaagcaaatacttttcctccagtcctgaccttcttaggttgcgtgcactgcgaactaatgtgacc 20824567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 299 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 23537276 - 23537097
Alignment:
Q  299 tctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttc-gctcactcatcaccttataatgagctttggt 397  Q
    |||||| || ||||| |||| |||||||||||| ||  |||| ||| |||| || ||||||  ||||| ||||| |||  ||||| |||||||| |||||    
T  23537276 tctctgtttgcccttatcaggaggggcactatagggcatagggcgactctgctggcccttag-tcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggt 23537178  T
Q  398 gtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
     |||||||| || || || | || | | ||||||||||  |||| ||  |||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  23537177 atcctcctcataaattctgcagctattaaccaaatcaggaaaaactcagatctgttggtatccgatcgccctcttaatgtc 23537097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 409; Significance: 0; HSPs: 23)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 478
Target Start/End: Original strand, 12577096 - 12577556
Alignment:
Q  18 tcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattac 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12577096 tcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattac 12577195  T
Q  118 aattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttact 217  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12577196 aattatagcatacaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacatctgaaacacttcttctcatccttggtacaaacgttact 12577295  T
Q  218 cttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtca 317  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12577296 cttgtgacctttctcgccacacttaaagcacactatctcagcaggagcatccctcttactcggcctcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtca 12577395  T
Q  318 gcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 417  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12577396 gccggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcactttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 12577495  T
Q  418 cgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
     |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  12577496 agcgactcaccaaatcagaaaaaattctaatctgttggtatcctatggctctcttgatgtc 12577556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 26 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 19716709 - 19716285
Alignment:
Q  26 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 125  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||  || || |||||     
T  19716709 agtctgcgtaccagtcaatgcaaacactttcccaccggttctaaccttcttcggctgtgtgcactgcgaactgatatggccctctttgttgcagttataa 19716610  T
Q  126 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggc 225  Q
    ||  |||||||||  ||||||||||| |||||  |||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  19716609 caaacaacatcactacgcttgcaatcagctagagtgtgtcctttctgaccacacctgaaacacttcttctcatctttagtacaaacattactcttgtggc 19716510  T
Q  226 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggc 325  Q
    ||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||| ||| || | |||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| || ||||    
T  19716509 ctttctcgccacacttgtaacaaacgatctcagcaggagcatctctcctattgggcctcctctcatcattcaatctctgctttcccttgtcaacaagggc 19716410  T
Q  326 actatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgactt 425  Q
    ||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| | ||  |||    
T  19716409 actgtatggtttaggacgactctgctgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttagtgtcttcctcatatatcctgcagctgctt 19716310  T
Q  426 accaaatcagagaaaattctaatct 450  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||    
T  19716309 accaactcagagaaatttctaatct 19716285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 26 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 19721272 - 19720848
Alignment:
Q  26 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 125  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||  || || |||||     
T  19721272 agtctgcgtaccagtcaatgcaaacactttcccaccggttctaaccttcttcggctgtgtgcactgcgaactgatatggccctctttgttgcagttataa 19721173  T
Q  126 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggc 225  Q
    ||  |||||||||  ||||||||||| |||||  |||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  19721172 caaacaacatcactacgcttgcaatcagctagagtgtgtcctttctgaccacacctgaaacacttcttctcatctttagtacaaacattactcttgtggc 19721073  T
Q  226 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggc 325  Q
    ||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||| ||| || | |||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| || ||||    
T  19721072 ctttctcgccacacttgtaacaaacgatctcagcaggagcatctctcctattgggcctcctctcatcattcaatctctgctttcccttgtcaacaagggc 19720973  T
Q  326 actatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgactt 425  Q
    ||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| | ||  |||    
T  19720972 actgtatggtttaggacgactctgctgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttagtgtcttcctcatatatcctgcagctgctt 19720873  T
Q  426 accaaatcagagaaaattctaatct 450  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||    
T  19720872 accaactcagagaaatttctaatct 19720848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 23097718 - 23097286
Alignment:
Q  18 tcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattac 117  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| || || ||||||  ||||| |||||| ||||| |||||||| | ||||||||| ||||| |||| ||    
T  23097718 tcattagtagtctgcgtaccagtcaaagcaaacaccttcccaccagttctaatcttctttggctgagtgcactgtgaactgatgtggccctcctcatcac 23097619  T
Q  118 aattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttact 217  Q
    ||||||| ||  |||||||||| | |||||| |  || |   |||| || ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  23097618 aattataacaaacaacatcacccctcttgcagttagccaatgtgtgtcctttctgaccacacttgaagcacttcttctgatctttggtacaaacattact 23097519  T
Q  218 cttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtca 317  Q
     |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| ||||  ||||| |||||||||    
T  23097518 tttgtggcctttctcgccacacttaaagcaaactatctcagcaggagcatctctcctcttgggcctcctctcatcattcagtcgttgctttcccttgtca 23097419  T
Q  318 gcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 417  Q
    ||||||||||| ||||| |||||  || |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |  || ||||||||||| || |    
T  23097418 gcaggggcactgtacggcttagggagactctgatgtgctttacctctccgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgaatcttcctcgtagattctgc 23097319  T
Q  418 cgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatct 450  Q
     || |||||| || ||||| ||| |||| ||||    
T  23097318 agctacttacaaactcagaaaaagttctgatct 23097286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 34 - 436
Target Start/End: Original strand, 23274352 - 23274754
Alignment:
Q  34 taccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaac 133  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||   |||||||||||||| ||||||||||| | |||||| || ||||| ||||| || ||||||||  | |     
T  23274352 taccagtcagagcaaacactttaccaccagtcctaaccttcttcggttgtgtgcactgtgaactgatatggccctcctcattgcagttatagcaaactat 23274451  T
Q  134 atcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctcg 233  Q
     || || ||||| ||||| ||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||     
T  23274452 gtctccccgcttacaatcagctaatgtgtgtcccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatctttagtacaaacattactcttgtggcctttctca 23274551  T
Q  234 ccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacg 333  Q
    ||||||||    || || || |||| ||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  23274552 ccacacttgttgcaaacaatttcagtaggagcatctctcctcttgggcctcctctcatcatttaacctctgcttacccttgtcagcaggagcactatact 23274651  T
Q  334 gtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatc 433  Q
    | || |||||| |||| |||||||| || || || |||||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||||| ||  |||||||| ||    
T  23274652 gcttcggacgactctgttgtcccttgcccctacgttcactcatcaccttgtaatgagccttcgtatcctcttcatagatcctacagctgcttaccaactc 23274751  T
Q  434 aga 436  Q
    |||    
T  23274752 aga 23274754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 478
Target Start/End: Original strand, 20848332 - 20848789
Alignment:
Q  18 tcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattac 117  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||  |||||||||||  |  ||||| | |||||| ||||| ||  |||| |    
T  20848332 tcattaggagtctgcgtaccagtcaaagcaaacacctttccaccaattctagtcttcttcggctcaggacactgtgaactgatatgaccttccccattgc 20848431  T
Q  118 aattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttact 217  Q
    | || || ||  |||  || || |||||||| || ||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||  |   |||||| |||||    
T  20848432 agttgtaacagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctcttccacaaacattact 20848531  T
Q  218 cttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtca 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  | || || |||||| |||||||||| ||| | || ||   ||| ||||||   |   ||||||| || ||||||    
T  20848532 cttgtggcctttctcaccacacttgtagca-acaatctcaacaggagcatctctcct-cttggat-cctatcatcacccatcttctgctttcctttgtca 20848628  T
Q  318 gcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 417  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| | ||||||||||||||||||||| || || || || || |    
T  20848629 gcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcataatcttataatgagctttggtgtcttcttcataaattctgc 20848728  T
Q  418 cgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
      |   | ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  20848729 acctgttaaccaactcagaaaagattctgatctgttgatatccaatagctctcttgatgtc 20848789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 206 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 23116571 - 23116299
Alignment:
Q  206 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 305  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||| || ||||| | |||||||||| ||||  | |||||||| |||||    | |||||||    
T  23116571 acaaacattactcttgtggcctttcccgccacagttgaaacaaacaatctctgaaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgc 23116472  T
Q  306 ttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcc 404  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||| |  ||||||  |||| | |||| | |  ||||| ||||||||| |||| |||||     
T  23116471 ttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgcttgccctta-gtcttcctctcattaacaaccttgtaatgagctctggtatcctct 23116373  T
Q  405 tcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
    ||||||||||||| ||   | || ||||||| ||||| ||  |  ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  23116372 tcgtagatcctacagctgttcactaaatcagggaaaactcggagttgttggtatccgatcgccctcttgatgtc 23116299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 216 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 22742468 - 22742269
Alignment:
Q  216 ctcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgt 315  Q
    |||||||||| |||||| ||||| ||||| || || |||||| ||| | ||||| |||| |||||||| || || |||   | |||||| || ||||| |    
T  22742468 ctcttgtggcatttctcaccacaattaaagcagacaatctcaccagcaacatccttcttcctcggccgtctatcctcaaccattctctgtttgcccttat 22742369  T
Q  316 cagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcc 414  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||| |||| || ||||||  |||| |||||| |||  ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  22742368 cagcaggggcactataaggcttagggcgactctgctgaccctta-gtcttccgctcattcacgaccttgtaatgagccttggtatcctcttcgtaaatcc 22742270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 70 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 24705130 - 24704926
Alignment:
Q  70 ccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgaccctt 169  Q
    ||||||| |||||  ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||  ||||  |||  |||   ||||||||||| ||||   ||||||||||    
T  24705130 ccttcttaggctgcttgcactgagaacctatgtgaccctcttcattacaattgaagcacacaatgtcattacgcttgcaatcagctaaagtgtgaccctt 24705031  T
Q  170 ctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatcc 269  Q
    ||  ||||||  ||| || |||||  | ||||  | |||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |  |||||||||||| |||||    
T  24705030 cttgccacactggaaacatttctttacctcctcaggacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacagataatctcagcaggaacatcc 24704931  T
Q  270 ctctt 274  Q
     ||||    
T  24704930 ttctt 24704926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 315 - 478
Target Start/End: Original strand, 10871887 - 10872050
Alignment:
Q  315 tcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcc 414  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||  | | |||| |||  ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  10871887 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcttcgtagatcc 10871986  T
Q  415 taccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
    | | || | | ||||||||    |||| ||| | |||||||||||| || |||||||| |||||    
T  10871987 tgcagctattaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 10872050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 24657216 - 24656898
Alignment:
Q  160 tgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagc 259  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||| | ||||  | ||||||  ||||||||||||||||||| ||||| || |||||    ||||||||    
T  24657216 tgtgacccttcttgccacaccggaaacacttcttcacctcctcaggacaaacagtactcttgtggcctttctcaccacaattgaaacaagtaatctcagc 24657117  T
Q  260 aggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtccctta 359  Q
    |||| ||||| | ||  | ||||| ||||| ||    |  ||||| || ||||| |||| |||||||||||| || ||||| ||| |||| || ||||||    
T  24657116 aggaacatcctttttcttaggccgtctctcctcgaccatcctctgtttgcccttatcagtaggggcactatagggcttagggcgactctgctggccctta 24657017  T
Q  360 cctctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtat 458  Q
      |||| |||||| | |  ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| || | || | | | |||||| |  |||| ||  ||||||||||||    
T  24657016 -gtcttccgctcattaacaaccttgtaatgagctctggtgtcctcctcatagattctgcagctattcatcaaatctggaaaaactcggatctgttggtat 24656918  T
Q  459 cctatagccctcttgatgtc 478  Q
    || || |||||||| |||||    
T  24656917 ccgatcgccctcttaatgtc 24656898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 22462993 - 22462925
Alignment:
Q  206 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctctt 274  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||| ||||    
T  22462993 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacagttgaaacaaacaatctccgcaggagcatccttctt 22462925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 11351330 - 11351160
Alignment:
Q  99 atgtgaccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcat 198  Q
    |||||||||||||| || |||||  ||||  ||| |||||   |||||||||| ||||   | ||||||||||  ||||||| ||| || ||||   | |    
T  11351330 atgtgaccctcttccttgcaattgaagcacacaatatcactatgcttgcaatcagctaatgtatgacccttcttgccacaccagaaacatttctctacct 11351231  T
Q  199 ccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatcc 269  Q
    |||| | |||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||    
T  11351230 cctttggacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacagacaatctccgcaggagcatcc 11351160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 21320505 - 21320459
Alignment:
Q  216 ctcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcagg 262  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  21320505 ctcttgtggcctttctcgccacaattaaaacagacaatctcagcagg 21320459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 292
Target Start/End: Original strand, 23205245 - 23205331
Alignment:
Q  206 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatc 292  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| | |||||||| | ||||  | |||||||| |||||    
T  23205245 acaaacattactcttgtggcctttctcgccacagttgaaacaaacaatctccgaaggagcattcttcttcttaggccgcctatcatc 23205331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 292
Target Start/End: Original strand, 23676849 - 23676935
Alignment:
Q  206 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatc 292  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| | |||||||| | ||||  | |||||||| |||||    
T  23676849 acaaacattactcttgtggcctttctcgccacagttgaaacaaacaatctccgaaggagcattcttcttcttaggccgcctatcatc 23676935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 44382982 - 44382876
Alignment:
Q  309 cccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgt 408  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| ||  | | |||| |||  ||||| || ||||| ||||| |||||||| |    
T  44382982 cccttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcat 44382883  T
Q  409 agatcct 415  Q
    |||||||    
T  44382882 agatcct 44382876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 216 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 23028963 - 23028831
Alignment:
Q  216 ctcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgt 315  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | |||||| || |||||||||||||||||| |||| || ||||| || || ||    |  ||||| || ||||| |    
T  23028963 ctcttgtggcctttctcaccacaat-aaaacagacaatctcagcaggagcatccttcttccttggccgtctatcctcgaccatcctctgtttgcccttat 23028865  T
Q  316 cagcaggggcactatacggtttaggacgattctg 349  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||| ||||    
T  23028864 cagcaggggcactatagggcttagggcgactctg 23028831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 207 - 344
Target Start/End: Original strand, 28350807 - 28350944
Alignment:
Q  207 caaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgct 306  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  | || || |||||||||||| |||| ||| |  | || | |||||||||||| | ||| ||||    
T  28350807 caaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcagcaggaacatctctcctcttaggtctcctctcatcattcaatctttgct 28350906  T
Q  307 tacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacga 344  Q
      || |||||| |||| |||||||| || || ||||||    
T  28350907 cccctttgtcaacaggagcactatagggcttcggacga 28350944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 315 - 415
Target Start/End: Original strand, 24265407 - 24265507
Alignment:
Q  315 tcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcc 414  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| ||  ||| |||| |||  ||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  24265407 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctttctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcc 24265506  T
Q  415 t 415  Q
    |    
T  24265507 t 24265507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 24817354 - 24817218
Alignment:
Q  204 gtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctct 303  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||| |||||  || | || || ||||||| || || |||  |||| || |||| |||||||||||| | ||| |    
T  24817354 gtacaagcattactcttgtggcccttctcaccacaagtatagcaaacaatctcagtagtagtatctttctttctaggcctcctctcatcattcaatcttt 24817255  T
Q  304 gcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttagg 340  Q
    | |||||||| |||||||| |||||||| || |||||    
T  24817254 gtttacccttatcagcaggagcactataaggcttagg 24817218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Original strand, 24678428 - 24678486
Alignment:
Q  216 ctcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctctt 274  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||| ||||| ||||    
T  24678428 ctcttgtggcctttctcaccacaattaaagcagacaatctcagcaggaacatccttctt 24678486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 25 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 23105421 - 23105393
Alignment:
Q  25 cagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaact 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23105421 cagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaact 23105393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 404; Significance: 0; HSPs: 43)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 404; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 477
Target Start/End: Original strand, 13944765 - 13945224
Alignment:
Q  18 tcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattac 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13944765 tcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtggccctcttcattac 13944864  T
Q  118 aattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttact 217  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13944865 aattatagcatacaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacatctgaaacacttcttctcatccttggtacaaacgttact 13944964  T
Q  218 cttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtca 317  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13944965 cttgtgacctttctcgccacacttaaagcacactatctcagcaggagcatccctcttactcggcctcctctcatcattaagtctctgcttacccttatca 13945064  T
Q  318 gcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 417  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13945065 gtcggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 13945164  T
Q  418 cgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgt 477  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  13945165 agcgactcaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatggctctcttgatgt 13945224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 8744778 - 8744318
Alignment:
Q  18 tcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattac 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8744778 tcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggttgtgtgcactgagtactgatgtggccctcttcattac 8744679  T
Q  118 aattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttact 217  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8744678 aattatagcatacaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacatctgaaacacttcttctcatccttggtacaaacgttact 8744579  T
Q  218 cttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtca 317  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8744578 cttgtgacctttctcgccacacttaaagcacactatctcagcaggagcatccctcttactcggcctcctctcatcattaagtctctgcttacccttatca 8744479  T
Q  318 gcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 417  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8744478 gtcggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcactttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 8744379  T
Q  418 cgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  8744378 agcgactcaccaaatcagagaaaattctaatctgctggtatcctatggctctcttgatgtc 8744318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 54 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 16384724 - 16384300
Alignment:
Q  54 tttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcgg 153  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |    
T  16384724 tttccaccagttctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatatggccctcttcattacaattatagcatacaacatcaccacgcttgcaatcag 16384625  T
Q  154 ctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactat 253  Q
    | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  16384624 ccaacatgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggactttctcgccacacttaaaacaaactat 16384525  T
Q  254 ctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgt 353  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||| |||    
T  16384524 ctcagcaggagcatctctcctattcggcctcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactgtatggcttaggacgactctgttgt 16384425  T
Q  354 cccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgtt 453  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16384424 cccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttgctgtcctcctcatagatcctacagcaacttaccaaatcagagaaaattctaatctgtt 16384325  T
Q  454 ggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
    |||||||||| || |||||||||||    
T  16384324 ggtatcctatggctctcttgatgtc 16384300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 18 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 16831916 - 16831456
Alignment:
Q  18 tcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattac 117  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || |    
T  16831916 tcattagtagtctgcgtaccagtcaaagcaaacacctttccaccagttctaaccttcttcggctgtgtgcactgtgtactgatatggccctcttcgttgc 16831817  T
Q  118 aattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttact 217  Q
    | ||||| ||| |||||||||| |||||||| || |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16831816 agttataacatacaacatcaccacgcttgcagtccgctaacacgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacattact 16831717  T
Q  218 cttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtca 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16831716 cttgtggcctttctcgccacacttaaaacaaactatctcagcaggagcatctctcctattcggcctcctctcatcattaagtctctgcttacccttatca 16831617  T
Q  318 gcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 417  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  16831616 gcaggggcactatacggcttaggatgactctgctgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcatagatcctgc 16831517  T
Q  418 cgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
      |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  16831516 aacgacttaccaaatcagagaaaattcttatctgttggtaccctatggctctcttgatgtc 16831456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 473
Target Start/End: Original strand, 17189115 - 17189570
Alignment:
Q  18 tcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattac 117  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||   ||||| |||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| |||| ||    
T  17189115 tcattagtagtttgcgtaccagtcaacgcaaacactttcccaccggttctaatcttctttggctgagtacactgtgaactgatgtggccctcctcatcac 17189214  T
Q  118 aattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttact 217  Q
    ||||||| ||  |||||||||| | |||||| |  || | | |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17189215 aattataacaaacaacatcaccccacttgcagttagccaacgtgtgtcctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctttggtacaaacgttact 17189314  T
Q  218 cttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtca 317  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||| ||| |  | | || |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |    
T  17189315 tttgtggcctttctcgccacacttaaaacaaacaatatcaacaggagcatctctcctcttggacctcctctcatcattaaatctctgctttcccttgtta 17189414  T
Q  318 gcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 417  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||| |||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||    
T  17189415 gcaggagcactgtacggcttcggacgactctgctggcccttgcctctgcggtcactcatcaccttgtaatgagcttttgtgtcctcttcatagattctac 17189514  T
Q  418 cgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttg 473  Q
     || ||||||||| ||| ||||  |||| ||||  |||||||| ||||||||||||    
T  17189515 agctacttaccaactcaaagaagtttctgatcttctggtatccaatagccctcttg 17189570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 33 - 439
Target Start/End: Original strand, 31941659 - 31942065
Alignment:
Q  33 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 132  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||   ||||||||||||||||| || ||||  | |||||| || ||||| ||||| |||||||| ||  |||    
T  31941659 gtaccagtcaaagcaaacaccttaccaccagtcctaaccttcttcggctgcgtacactatgaactgatatggccctcctcattgcaattataacaaacaa 31941758  T
Q  133 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctc 232  Q
    ||||||| |||||||| || |||||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31941759 catcaccacgcttgcagtcagctagagtgtgtcccttctgaccacacctgaaacacttcttctcatctttggtacaaacattactcttgtggcctttctc 31941858  T
Q  233 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatac 332  Q
    |||||||||  |||| || ||||||||||||||||  ||| || | |||| |||||||||||| |   ||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  31941859 gccacacttgtaacaaacgatctcagcaggagcatttctcctattgggcctcctctcatcattcaacttctgcttccctttgtcagcaggagcactatac 31941958  T
Q  333 ggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaat 432  Q
    || || |||||| |||| | ||| || |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || | || ||||||||| |    
T  31941959 ggcttcggacgactctgctatcctttgctccttcgatcactcatcaccttataatgagctttcgtgtcctcctcatagattctgcagctacttaccaatt 31942058  T
Q  433 cagagaa 439  Q
    |||||||    
T  31942059 cagagaa 31942065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 21 - 475
Target Start/End: Original strand, 24190048 - 24190501
Alignment:
Q  21 ttagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaat 120  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||  |||| |||||   ||||| |||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| |||| |||||    
T  24190048 ttagtagtctgcgtaccagtcaacgcaaactctttcccaccggttctaatcttctttggctgagtacactgtgaactgatgtggccctcctcatcacaat 24190147  T
Q  121 tatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactctt 220  Q
    |||| ||  |||||||||| | |||||| |  || | | |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  24190148 tataacaaacaacatcaccccacttgcagttagccaacgtgtgtcctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctttggtacaaacgttactttt 24190247  T
Q  221 gtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagca 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||| ||| |  |   || |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  24190248 gtggcctttctcgccacacttaaaacaaacaatatcaacaggagcatctctcctcttgtacctcctctcatcattcaatctctgctttcccttgtcagca 24190347  T
Q  321 ggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgc 420  Q
    || ||||| ||||| || |||||| |||| ||  |||| ||||| || ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||| ||    
T  24190348 ggagcactgtacggcttcggacgactctgctg-gccttgcctctgcggtcagtcatcaccttgtaatgagctttcgtgtcctcttcatagattctacagc 24190446  T
Q  421 gacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgat 475  Q
     ||||||||||||||||||  |||| ||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  24190447 tacttaccaaatcagagaagtttctgatcttctggtatccaatagccctcttgat 24190501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 33 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 12357900 - 12357483
Alignment:
Q  33 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 132  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||    |||||||||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||| || ||||| || ||||||||  |||    
T  12357900 gtaccagtcagagcaaacactttaccaccggtcctaaccttcttcggttgtgtacactgcgaactgatatgaccttcctcattgcagttatagcaaacaa 12357801  T
Q  133 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctc 232  Q
    | || || ||||| ||||| ||||   |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||   ||| || ||||||||||||||||| ||    
T  12357800 cgtctccccgcttacaatcagctaatgtgtgtcctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctttatcacagacattactcttgtggcctttttc 12357701  T
Q  233 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatac 332  Q
    |||||||||  | || || ||||||||||||| ||| ||| |  | |||| |||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||| ||||||||     
T  12357700 gccacacttgtagcaaacaatctcagcaggagtatctctcctcttgggcctcctctcatcattcagcctctactttcccttgtcagcaggagcactatat 12357601  T
Q  333 ggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaat 432  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| | || ||| |||||||    
T  12357600 ggtttaggacgactctgatgtcccttacctctgcgctcactcatcaccttgtaatgagctttagtgtcttcttcatatatcctgcagctactcaccaaat 12357501  T
Q  433 cagagaaaattctaatct 450  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  12357500 cagagaaaattcttatct 12357483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 33 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 31692558 - 31692152
Alignment:
Q  33 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 132  Q
    |||||||||| |||||| || || ||||||   ||||||||||||||||| || ||||| | |||||| || ||||| ||||| || ||||| ||  |||    
T  31692558 gtaccagtcagagcaaacaccttaccaccagtcctaaccttcttcggctgcgtacactgtgaactgatatggccctcctcattgcagttataacaaacaa 31692459  T
Q  133 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctc 232  Q
    ||||||| | |||||| || |||||  |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31692458 catcaccactcttgcagtcagctagagtgtgtcccttctaaccacacctgaaacacttcttctcatctttggtacaaacattactcttgtggcctttctc 31692359  T
Q  233 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatac 332  Q
     ||||||||  |||| || |||||||||| |||||  ||| || | |||| |||||||||||| |   ||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  31692358 accacacttgtaacaaacgatctcagcagaagcatttctcctattgggcctcctctcatcattcaacttctgcttccctttgtcagcaggagcactatac 31692259  T
Q  333 ggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaat 432  Q
    || || |||||| |||| ||||| || |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || | || ||||||||| |    
T  31692258 ggcttcggacgactctgctgtcctttgctccttcgatcactcatcaccttataatgagctttcgtgtcctcctcatagattctgcagctacttaccaatt 31692159  T
Q  433 cagagaa 439  Q
    |||||||    
T  31692158 cagagaa 31692152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 105 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 14290833 - 14290463
Alignment:
Q  105 ccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttgg 204  Q
    |||||||||| ||||||||||||   |||||| || ||||| ||||| ||||   |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||         
T  14290833 ccctcttcatcacaattatagcaaataacatccccacgcttacaatcagctaaagtgtgtcctttctgtccacacctaaagcacttcttctcatctcaat 14290734  T
Q  205 tacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctg 304  Q
     ||| || |||||||||||||||||||| |||||||| || || |  ||||||| ||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| || |||||    
T  14290733 cacacacattactcttgtggcctttctcaccacacttgaagcaaataatctcagtaggagcatctctcctcttaggcctcctctcatcattcagcctctg 14290634  T
Q  305 cttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcc 404  Q
     ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  14290633 tttacctttgtcagcaggagcactatacggtttcggacgactctgctgtcccttacctctgcgctcactcatcactttataatgagctttggtatcctct 14290534  T
Q  405 tcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgat 475  Q
    || ||||| ||||  |  ||| |||| ||||| ||| |||| |||| ||| || || ||||||||||||||    
T  14290533 tcatagattctacaactgctttccaattcagaaaaatttcttatcttttgataaccaatagccctcttgat 14290463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 168 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 18131585 - 18131275
Alignment:
Q  168 ttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcat 267  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||  | |||||| |||||||||    
T  18131585 ttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctttatcacaaacattactcttgtggcctttctcgccacacttgtagcaatcaatctcaacaggagcat 18131486  T
Q  268 ccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcg 367  Q
    | ||| |  | |||| |||||||| ||| |||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||    
T  18131485 ctctcctcttgggcctcctctcattattcagtctctgttttcctttgtcagcaggagcactatatggtttaggacgactctgctgtcctttacctctccg 18131386  T
Q  368 ctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagcc 467  Q
     ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||||||| || ||| |||| ||||||||||||||| ||||  || || || || ||     
T  18131385 ttcactcatcactttgtaatgagctttagtgtcttcttcatatatcctacagctactcaccatatcagagaaaattcttatcttctgatacccaatggct 18131286  T
Q  468 ctcttgatgtc 478  Q
    |||||||||||    
T  18131285 ctcttgatgtc 18131275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 102 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 12857800 - 12857445
Alignment:
Q  102 tgaccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatcct 201  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||  ||| |||||  |||||||| || ||||  ||||| || |||| |||||| | ||| ||||||||||||||      
T  12857800 tgaccttcttcatcacaattgtagcaaacaatatcacgacgcttgcactcagctattatgtgtcctttctttccacatcggaaacacttcttctcatcac 12857701  T
Q  202 tggtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtct 301  Q
     |  ||| || |||||| ||||||| || || |||||||| ||||| || ||||||| ||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| ||||     
T  12857700 agtcacatacattactcatgtggcccttttcaccacacttgaaacagacaatctcagtaggagcatctctccttttaggcctcctctcatcattcagtcc 12857601  T
Q  302 ctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcc 401  Q
     || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  12857600 ttgtttacctttgtcagcaggagcactatacggttttggacgactctactgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttataatgagcttttgtatcc 12857501  T
Q  402 tcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggta 457  Q
    ||||| ||||| |||| || ||| ||||||||| | |||||||| |||| ||||||    
T  12857500 tcctcatagattctacagctactcaccaaatcaaaaaaaattcttatcttttggta 12857445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 37 - 475
Target Start/End: Original strand, 35982941 - 35983379
Alignment:
Q  37 cagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaacatc 136  Q
    ||||||||||||| || || |||||    ||||||||||| ||||| || || || | ||| || || || || |||||||| || |||||  ||| |||    
T  35982941 cagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacaatgcgaactaatatgtccttcctcattacagttgtagcaaacaatatc 35983040  T
Q  137 accgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggt-acaaacgttactcttgtggcctttctcgcc 235  Q
     || ||||||||||| || |   |||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||| || |||||||||||||||||||| ||    
T  35983041 cccacgcttgcaatcagccaatgtgtgtcctttctgtccacatctgaaacacttcttctcatc-tcggtcacacacattactcttgtggcctttctcacc 35983139  T
Q  236 acacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggt 335  Q
    |||||| || || |  ||| ||| ||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  35983140 acacttgaagcaaataatcacagtaggagcatctctcctcttaggcctcctctcatcattcagcctctgtttacctttgtcagcaggagcactatacggt 35983239  T
Q  336 ttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcag 435  Q
    || |||| | |||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||  |  |||||||| ||||    
T  35983240 ttcggacaactctgctgtcccttacctctgcactcactcatcactttataatgagctttggtatcctcttcatagattctacaactgcttaccaattcag 35983339  T
Q  436 agaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgat 475  Q
    | ||| |||| ||||  || || || ||||||||||||||    
T  35983340 aaaaatttcttatcttatgataaccaatagccctcttgat 35983379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 174 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 16825511 - 16825210
Alignment:
Q  174 ccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctct 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |  |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || || |||| ||||||||| |||     
T  16825511 ccacacctgaagcacttcttctcatcacggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctca 16825412  T
Q  274 tactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcact 373  Q
    |  | |||| ||||||||| || | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| || | |||||||| ||||| ||||||||    
T  16825411 tcttgggcctcctctcatctttcaatctctacttacccttgtcaggaggggcactatacggcttcggacgactcagctgtcccttgcctctgcgctcact 16825312  T
Q  374 catcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttg 473  Q
    ||||||||| ||||||||||| || || || || |||||||||| ||  |||||||| ||||| ||  |||| ||||  || || || ||||||||||||    
T  16825311 catcaccttgtaatgagctttcgtatcttcttcatagatcctacagctgcttaccaactcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttg 16825212  T
Q  474 at 475  Q
    ||    
T  16825211 at 16825210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 33 - 439
Target Start/End: Original strand, 12181100 - 12181506
Alignment:
Q  33 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 132  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||    |||||||||||||| || || ||||  | |||||| ||||| || |  || |||||||| ||  |||    
T  12181100 gtaccagtcaaagcaaacactttaccaccggtcctaaccttcttcggttgcgtacactacgaactgatatgaccttccttgttgcaattataacaaacaa 12181199  T
Q  133 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctc 232  Q
      || ||  |||| ||||| |||||  |||| || ||| | ||||| ||||||||||||||||||||  |   ||| || ||||||||||||||||| ||    
T  12181200 tgtccccaagcttacaatcagctagtgtgtgtcctttccgaccacaactgaagcacttcttctcatctctatcacagactttactcttgtggcctttttc 12181299  T
Q  233 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatac 332  Q
     |||||||| || || |  || |||| ||||||||| ||| |  | | || |||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  12181300 accacacttgaagcaaaaaatgtcagtaggagcatctctcctcttggtcctcctctcatcatttaacctctacttacccttgtcagcaggagcactatac 12181399  T
Q  333 ggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaat 432  Q
    || ||  ||||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||  |||||||| |    
T  12181400 ggcttcagacgactctgttgtcccttgcctcttcgttcactcatcaccttgtaatgagctttcgtgtcctcctcataaatcctacagccgcttaccaatt 12181499  T
Q  433 cagagaa 439  Q
    |||||||    
T  12181500 cagagaa 12181506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 478
Target Start/End: Original strand, 10408709 - 10409169
Alignment:
Q  18 tcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattac 117  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||  |||||||||||  |  ||||| | |||||| ||||| ||  |||| |    
T  10408709 tcattaggagtctgcgtaccagtcaaagcaaacacctttccaccaattctagtcttcttcggctcaggacactgtgaactgatatgaccttccccattgc 10408808  T
Q  118 aattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttact 217  Q
    | || || ||  |||  || || |||||||| || ||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||  |   |||||| |||||    
T  10408809 agttgtaacagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctcttccacaaacattact 10408908  T
Q  218 cttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtca 317  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||  |||| || |||||||| |||||||| ||| |  | |||| ||| ||||||   |   |||| ||||||||||||    
T  10408909 cttgtggcctttctcaccacatttgtaacaaacaatctcagctggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgtttacccttgtca 10409008  T
Q  318 gcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 417  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||| |||| ||||||||||| || | ||||||||| | ||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |    
T  10409009 gcaggagcactgtaaggcttaggacgactctggtgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcatagattctgc 10409108  T
Q  418 cgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
      | | | ||||| ||||| |||| ||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  10409109 acctattaaccaactcagaaaaaactctgatctgctgatatccaatagctcttttgatgtc 10409169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 400
Target Start/End: Original strand, 47126688 - 47127067
Alignment:
Q  21 ttagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaat 120  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| || || ||||||| ||||  |||||||||||  |  ||||| | |||||| ||||| ||  |||| || |    
T  47126688 ttaggagtctgcgtaccagtcaaagcaaacaccttaccaccaattctagtcttcttcggctcaggacactgtgaactgatatgaccttccccattgcagt 47126787  T
Q  121 tatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactctt 220  Q
    | || ||  |||  || || |||||||| || ||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||  |   |||||| ||||||||    
T  47126788 tgtaacagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctcttccacaaacattactctt 47126887  T
Q  221 gtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagca 320  Q
    |||||||||||| ||||||||  | || || |||||| |||||||||| ||| |  | |||| ||| ||||||   |  |||||||| || |||||||||    
T  47126888 gtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcctctgctttcctttgtcagca 47126987  T
Q  321 ggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 400  Q
    || ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  47126988 ggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcataatcttataatgagctttggtgtc 47127067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 400
Target Start/End: Original strand, 28757060 - 28757442
Alignment:
Q  18 tcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattac 117  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||  |||||||||||  |  ||||| | ||| || ||||| ||| |||| |    
T  28757060 tcattaggagtctgcgtaccagtcaaagcaaacacctttcccccaattctagtcttcttcggctcaggacactgtgaactaatatgaccttctccattgc 28757159  T
Q  118 aattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttact 217  Q
    |||| || ||  |||  || || |||||||| || ||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||  |   |||||| |||||    
T  28757160 aattgtaacagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctcttccacaaacattact 28757259  T
Q  218 cttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtca 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  | || || |||||| |||||||||| ||| |  | |||| ||| ||||||   |   ||||||| || ||||||    
T  28757260 cttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgtca 28757359  T
Q  318 gcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 400  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  28757360 gcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtc 28757442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 168 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 11958419 - 11958137
Alignment:
Q  168 ttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcat 267  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||||||  |   |||| | || || ||||||||||| || ||||||||| |||| || || |||||||||||||    
T  11958419 ttctgaccacacctgaaacacttcctctcatctctaccacaagcattgcttttgtggcctttttcaccacacttataacaaacaatttcagcaggagcat 11958320  T
Q  268 ccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcg 367  Q
    | ||| |  |  ||| ||| |||||||| | |||||| || || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |     
T  11958319 ctctcctcttaagcctcctatcatcattcattctctgtttccctttgtcagcaggagcactgtaaggtttaggacgattctgctgtcccttacctctcct 11958220  T
Q  368 ctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatct 450  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| || ||||  | ||  |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  11958219 ctcactcatcaccttgtaatgaacttttgtgtcttcctcataaatcccgcagctgcttaccaactcagagaaaactctaatct 11958137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 33 - 436
Target Start/End: Original strand, 17494403 - 17494809
Alignment:
Q  33 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 132  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||    |||||||||||||| || || ||||| | ||| || ||||| || || || || ||||||||  |||    
T  17494403 gtaccagtcagagcaaacactttaccaccggtcctaaccttcttcggttgagtacactgcgaactaatatgaccttcctcgttgcagttatagcaaacaa 17494502  T
Q  133 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctc 232  Q
      || || | ||| || || |||||  |||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||||  |   |||||| ||||||||||||||||| ||    
T  17494503 tgtctccacacttacagtcagctagtgtgtgtcctttctgaccacacctga-gcacttcttctcatctctatcacaaacattactcttgtggcctttttc 17494601  T
Q  233 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagc----aggggcact 328  Q
     ||||| || || || || ||||||| | ||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| |  |||||||||||||| |||||    ||| |||||    
T  17494602 accacatttgaagcaaacaatctcagtatgagcatctctcctcttgggcctcctctcatcatttaacctctgcttacccttctcagccagcaggagcact 17494701  T
Q  329 atacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttacc 428  Q
    ||| || || | |||| | || ||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||  ||||||    
T  17494702 atatggcttcgaacgactttgttgtcccttggctctgcgctcactcatcaccttgtaatgagctttggtatcctcctcatagattctacagctgcttacc 17494801  T
Q  429 aaatcaga 436  Q
    || |||||    
T  17494802 aactcaga 17494809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 16327089 - 16326713
Alignment:
Q  26 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 125  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||  |||||||||||||||||  || ||||| | |||||| ||||||||| |||| || || |||    
T  16327089 agtctgcgtaccagtcaatgcaaacacctttccaccagttctaaccttcttcggcttagtacactgcgaactgatatgaccctctccattgcagttgtag 16326990  T
Q  126 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggc 225  Q
    ||  |||  || || ||||| || || ||||   |||| |||||||| ||||||||||| || ||| |||||||  |   |||||| || ||||||||||    
T  16326989 cagacaatgtccccacgcttacattcagctaaattgtgtcccttctgaccacacctgaaacatttcctctcatctctaccacaaacattgctcttgtggc 16326890  T
Q  226 ctttctcgccacacttaaaacacacta-tctcagcaggagca-tccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggg 323  Q
    |||| || ||||||||| |||| || | |||||||||||||| || ||| |  | || | ||| |||||||| |   | ||||| || |||||||||||     
T  16326889 ctttttcaccacacttataacaaacaagtctcagcaggagcagtctctcctcttgggtctcctatcatcattcaccttttgctttcctttgtcagcagga 16326790  T
Q  324 gcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 400  Q
    ||||| |  || ||||||||| |||| |||||||| || || | ||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  16326789 gcactgtcaggcttaggacgactctgctgtcccttgcccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtc 16326713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 33 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 11949298 - 11949107
Alignment:
Q  33 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 132  Q
    |||||||||| |||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||| ||  || |||||   |||||||||||| || ||||| || ||||||||  |||    
T  11949298 gtaccagtcagagcaaacactttaccaccgatcctaaccttcttcgtctacgtacactgcaaactgatgtgaccttcctcattgcagttatagcaaacaa 11949199  T
Q  133 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtgg 224  Q
    |||| || ||||| ||||| ||||  ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  11949198 catctccccgcttacaatcagctaatatgtgtcctttctgaccacatctgaagcacttcttctcatctttagtacaaacattactcttgtgg 11949107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 162 - 472
Target Start/End: Original strand, 11861228 - 11861538
Alignment:
Q  162 tgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcag 261  Q
    ||||||||||  ||||||| ||| || |||||| | ||||  | |||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||| | || ||||| ||||    
T  11861228 tgacccttcttaccacaccagaaacatttcttcacctcctctggacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaatagacaatctccgcag 11861327  T
Q  262 gagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacc 361  Q
    |||||||| ||||  | |||||||| |||||    | |||||| || || || ||||||||||||||||| || |||||  || |||| || |||||| |    
T  11861328 gagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcctttatcagcaggggcactatagggcttagggtgactctggtggccctta-c 11861426  T
Q  362 tctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcc 460  Q
    |||| | |||| |||  ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||| || | | ||||| ||||  |||| ||  ||||||||||||||    
T  11861427 tcttccactcattcacaaccttgtaatgagccttggtgtcttcctcatagattctacagctattcaccaactcaggaaaaactcagatctgttggtatcc 11861526  T
Q  461 tatagccctctt 472  Q
     || ||||||||    
T  11861527 gattgccctctt 11861538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 206 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 23415001 - 23414729
Alignment:
Q  206 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 305  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||||| |||||||||||| ||||  | |||||||| |||||    | ||||||     
T  23415001 acaaacattactcttgtggcctttctcgccatagttgaaacagacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgt 23414902  T
Q  306 ttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcc 404  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||  || |||||   |||| |||||| |||  ||||| | |||||| || || ||||||    
T  23414901 ttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctattggccctt-ggtcttccgctcattcacaaccttgtcatgagccttagtatcctcc 23414803  T
Q  405 tcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
    |||||||| || | |  | | || ||||||| ||||| ||  | |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  23414802 tcgtagattctgcaggtattcactaaatcagggaaaactcggagctgttggtatccgattgccctcttgatgtc 23414729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 206 - 472
Target Start/End: Original strand, 15065990 - 15066256
Alignment:
Q  206 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 305  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| |||||||||||||| |||| || ||||| || |||||    | ||||||     
T  15065990 acaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaatcgcagcaggagcatccttcttccttggccgtctatcatcgaccattctctgt 15066089  T
Q  306 ttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcc 404  Q
    || ||||| |||||||||| |||||| || ||||| ||| |||| || ||||||  |||| |||||| ||| || ||| |||||||| ||||| || |||    
T  15066090 ttgcccttatcagcaggggaactatagggcttagggcgactctgctggccctta-gtcttccgctcattcaccatcttgtaatgagccttggtatcttcc 15066188  T
Q  405 tcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctctt 472  Q
    || || || |||| ||   | ||||| || ||||||| ||  |||| ||||||||| || ||||||||    
T  15066189 tcataaattctacagctgttcaccaactcggagaaaactcggatctattggtatccaattgccctctt 15066256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 206 - 478
Target Start/End: Original strand, 16695083 - 16695355
Alignment:
Q  206 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 305  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||    |||||||| ||||||||| ||||  | |||||||| |||||    | ||||||     
T  16695083 acaaacattactcttgcggcctttctcgccacaattgaaacaagtaatctcagctggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgt 16695182  T
Q  306 ttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcc 404  Q
    || | ||| ||||||||||||||||| || || || ||| ||||||| |||||   |||| | |||| | |  ||||| |||||||| || || ||||||    
T  16695183 ttgcacttatcagcaggggcactataaggcttcgggcgactctgatggccctt-ggtcttccactcatttacaaccttgtaatgagccttagtatcctcc 16695281  T
Q  405 tcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
    || |||||||| | || | | || ||||||| ||||| ||  |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  16695282 tcatagatcctgcagctattcactaaatcagggaaaactcggatctgttggtatccgatcgccctcttgatgtc 16695355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 205 - 417
Target Start/End: Original strand, 15230531 - 15230743
Alignment:
Q  205 tacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctg 304  Q
    ||||||| |||||||||||||| || || ||||||||  | || || |||||||||||| ||||  |  |  | |||| |||||||||||| | ||| ||    
T  15230531 tacaaacattactcttgtggcccttttcaccacacttgtagcaaacaatctcagcaggaacatcttttctcttaggcctcctctcatcatttaatctttg 15230630  T
Q  305 cttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtccctta--cctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcct 402  Q
    ||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||   || || || ||   |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  15230631 cttccctttgtcagcaggagcactatagggcttaggacgaccttgttggcctttgttcctcttc--tcactcataaccttataatgagctttggtatcct 15230728  T
Q  403 cctcgtagatcctac 417  Q
    |||| ||||| ||||    
T  15230729 cctcatagattctac 15230743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 205 - 417
Target Start/End: Original strand, 15236399 - 15236611
Alignment:
Q  205 tacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctg 304  Q
    ||||||| |||||||||||||| || || ||||||||  | || || |||||||||||| ||||  |  |  | |||| |||||||||||| | ||| ||    
T  15236399 tacaaacattactcttgtggcccttttcaccacacttgtagcaaacaatctcagcaggaacatcttttctcttaggcctcctctcatcatttaatctttg 15236498  T
Q  305 cttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtccctta--cctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcct 402  Q
    ||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||   || || || ||   |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  15236499 cttccctttgtcagcaggagcactatagggcttaggacgaccttgttggcctttgttcctcttc--tcactcataaccttataatgagctttggtatcct 15236596  T
Q  403 cctcgtagatcctac 417  Q
    |||| ||||| ||||    
T  15236597 cctcatagattctac 15236611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 213 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 12843307 - 12843189
Alignment:
Q  213 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttaccct 312  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  || | || || |||||| ||||||||||  |||| || ||||||||||||||| | | |||||| || ||||    
T  12843307 ttactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcagacaatctcaacaggagcatctttcttcctaggccgcctctcatcaatcattctctgtttgccct 12843208  T
Q  313 tgtcagcaggggcactata 331  Q
    | |||||||| ||||||||    
T  12843207 tatcagcaggagcactata 12843189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 13317873 - 13317647
Alignment:
Q  102 tgaccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatcct 201  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||  | ||||| || ||||||||||| ||||  |  ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  13317873 tgaccttcttcattacagttataacaaaccacatccccacgcttgcaatccgctaaaacatgacctttttgaccacatctgaaacacttcttctcatctt 13317774  T
Q  202 tggtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtct 301  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||  | ||||||||  |||| || |  ||| |||||||||| |||   || |||| |||||||||||| | | |    
T  13317773 tggtgcaaacattacttttgtggccttttgcaccacacttgtaacaaacaacatcaacaggagcatctctccccctaggcctcctctcatcatttaatat 13317674  T
Q  302 ctgcttacccttgtcagcaggggcact 328  Q
     || || || ||||||||||| |||||    
T  13317673 ttgttttcctttgtcagcaggagcact 13317647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 16804158 - 16803886
Alignment:
Q  206 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 305  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||| || |||||    |||||||| ||||||||| ||||  | |||||||| |||||    | ||||||     
T  16804158 acaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacaagtaatctcagctggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgt 16804059  T
Q  306 ttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcc 404  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||| || |||||   |||| |||||| |||  ||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  16804058 ttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggccctt-ggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcctcc 16803960  T
Q  405 tcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
    || || || || | || | | ||||||||||  |||| ||  |||||||||||| | || |||||||| |||||    
T  16803959 tcataaattctgcagctattaaccaaatcaggaaaaactcggatctgttggtattcgatcgccctcttaatgtc 16803886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 23079228 - 23079075
Alignment:
Q  206 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 305  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| |||||||||||||| |||| || ||||| || || ||    |  |||||     
T  23079228 acaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacaaacaatcacagcaggagcatccttcttccttggccgtctatcctcgaccatcctctgt 23079129  T
Q  306 ttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtccctta 359  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||| || ||||||    
T  23079128 tttcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgctggccctta 23079075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 301 - 478
Target Start/End: Original strand, 3688954 - 3689131
Alignment:
Q  301 tctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 400  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| ||  | | |||| |||  ||||| || ||||| || || ||    
T  3688954 tctgtttacccttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatc 3689053  T
Q  401 ctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
    ||| ||||||||||| | || | | ||||||||    |||| ||| | |||||||||||| || |||||||| |||||    
T  3689054 ctcttcgtagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 3689131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 366 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 2245712 - 2245628
Alignment:
Q  366 cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatct 450  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||  || ||| ||||| ||||| ||  |||||||||    
T  2245712 cgctcactcatcaccttataatgagctttggtatcatcctcataaatcctaaagctactcaccaactcagaaaagtttctaatct 2245628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 10417425 - 10417225
Alignment:
Q  26 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||  ||| |||||||| || || | |||||| | ||| ||||||||||| |||  ||| ||| |     
T  10417425 agtctgcgtaccagtcaaagcaaatacttttcctccagttctgaccttcttaggttgcgggcactgcgaactaatgtgaccctcatcaccacagttaaaa 10417326  T
Q  126 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggc 225  Q
    ||  ||| ||| || ||||||||||| || | ||  ||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||| |  || ||| | |||||||||||||    
T  10417325 caaacaatatctccacgcttgcaatccgccaacacatgacctttctgaccgcatctgaaacatttcttctcatcttgagtgcaagcattactcttgtggc 10417226  T
Q  226 c 226  Q
    |    
T  10417225 c 10417225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 13317922 - 13317863
Alignment:
Q  18 tcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttc 77  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||    
T  13317922 tcattagtagtctgcgtaccagtcaaagcaaacacttttccaccagttctgaccttcttc 13317863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 216 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 14873786 - 14873719
Alignment:
Q  216 ctcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccg 283  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  14873786 ctcttatggcctttctcaccacaattaaaacagacaatctcagcatgagcatccttcttcctcggccg 14873719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 213 - 274
Target Start/End: Original strand, 17497617 - 17497678
Alignment:
Q  213 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctctt 274  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||||||| || ||||| |||||||||||| ||||    
T  17497617 ttactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctgcaggagcatccttctt 17497678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 274
Target Start/End: Original strand, 12501788 - 12501920
Alignment:
Q  142 gcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacactt 241  Q
    |||||||||| ||||   ||||||||||||  ||||||| ||| || |||||  | ||||  | |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  12501788 gcttgcaatcagctaatgtgtgacccttcttgccacaccggaaacatttctttacctcctcaggacaaacattgctcttgtggcctttctcgccacaatt 12501887  T
Q  242 aaaacacactatctcagcaggagcatccctctt 274  Q
     |||||    |||||||||||| ||||| ||||    
T  12501888 gaaacaggtaatctcagcaggaacatccttctt 12501920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 15008853 - 15008722
Alignment:
Q  134 atcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctcg 233  Q
    |||||| |||||||| || |||| | | || ||||||| |||||| | ||||||||||| |||| | |||   ||||| ||||||||||||||| ||||     
T  15008853 atcaccacgcttgcattcagctatcgtatgccccttctttccacatcggaagcacttctcctcaccattg---caaacattactcttgtggcctctctca 15008757  T
Q  234 ccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatc 268  Q
    ||||||||  | || || |||||||||||| ||||    
T  15008756 ccacacttgtagcaaacaatctcagcaggaacatc 15008722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 415
Target Start/End: Original strand, 13255712 - 13255815
Alignment:
Q  312 ttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtaga 411  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| ||  | | |||| |||  ||||| || ||||| || |||||||| |||||||    
T  13255712 ttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtgtcctcttcgtaga 13255811  T
Q  412 tcct 415  Q
    ||||    
T  13255812 tcct 13255815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 315 - 361
Target Start/End: Original strand, 10008625 - 10008671
Alignment:
Q  315 tcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacc 361  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||    
T  10008625 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttacc 10008671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 315 - 361
Target Start/End: Original strand, 10909235 - 10909281
Alignment:
Q  315 tcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacc 361  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||    
T  10909235 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttacc 10909281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 397; Significance: 0; HSPs: 32)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 18051100 - 18050640
Alignment:
Q  18 tcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattac 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18051100 tcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattac 18051001  T
Q  118 aattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttact 217  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18051000 aattataacatacaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacatctgaaacacttcttctcatccttggtacaaacgttact 18050901  T
Q  218 cttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtca 317  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18050900 cttgtgacctttctcgccacacttaaagcacactatctcagcaggagcatccctcttactcggcctcctctcatcattaagtctctgcttacccttatca 18050801  T
Q  318 gcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 417  Q
    |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18050800 gtcggagcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 18050701  T
Q  418 cgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  18050700 agcgactcaccaaatcagagaaaattctaatctgctggtatcctatggctctcttgatgtc 18050640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 130 - 478
Target Start/End: Original strand, 14144875 - 14145223
Alignment:
Q  130 caacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggccttt 229  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14144875 caacatcaccacgcttgcaatcagctaacacgtgacccttttgaccacacctgaagcacttcttctcctccttggtacaaacgttactcttgtggccttt 14144974  T
Q  230 ctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcacta 329  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14144975 ctcgccatacttaaaacaaactatctcagcaggagcatctctcctatatggcctcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactg 14145074  T
Q  330 tacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttacca 429  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |  ||||| ||||    
T  14145075 tacggcttaggacgactctgctgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgccctcctcatagatcctgcaacgactcacca 14145174  T
Q  430 aatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  14145175 aatcagggaaaattctaatctgttggtatcctatggctctcttgatgtc 14145223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 18 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 14283521 - 14283061
Alignment:
Q  18 tcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattac 117  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||   |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| || |    
T  14283521 tcattagtagtctgcgtaccagtcaaagcaaacactttcccaccggttctaaccttcttcggctgtgggcactgtgtgctgatatgaccctcttcgttgc 14283422  T
Q  118 aattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttact 217  Q
    | ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14283421 agttataacatacaacatcaccacgcttgcaatcagctaatgtgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacattact 14283322  T
Q  218 cttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtca 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| || | ||||||||||||||| ||| ||   |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  14283321 cttgtggcctttctcgccacacttgtaacaaacaacctcagcaggagcatctctcctaacgggcctcctctcatcattgagtctctgcttacccttatca 14283222  T
Q  318 gcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 417  Q
    ||||||||||||||||| || || ||| |||| |||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  14283221 gcaggggcactatacggcttcgggcgactctgctgtcccttattccttctctcactcatcaccttgtaatgagctttagtgtcctcctcatagatcctgc 14283122  T
Q  418 cgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  | |||||||||||    
T  14283121 aacgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttgctaccctatgactctcttgatgtc 14283061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 11385576 - 11385119
Alignment:
Q  18 tcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattac 117  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| || || ||||||  ||||| |||||| || || |||||||| | ||||||||| ||||| |||| ||    
T  11385576 tcattagtagtctgcgtaccagtcaaagcaaacaccttcccaccagttctaatcttctttggttgagtgcactgtgaactgatgtggccctcctcatcac 11385477  T
Q  118 aattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttact 217  Q
    ||||||| ||  |||||||||| | |||||| |  || |   |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  11385476 aattataacaaacaacatcacccctcttgcagttagccaatgtgtgtcctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctttggtacaaacattact 11385377  T
Q  218 cttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtca 317  Q
     |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||| |  | ||||  ||||||||||| ||||  ||||| |||||||||    
T  11385376 tttgtggcctttctcgccacacttatagcaaactatctcagcaggagcatctctcctcttgggccttctctcatcattcagtcgttgctttcccttgtca 11385277  T
Q  318 gcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 417  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| || |||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| |  || ||||| ||||| || |    
T  11385276 gcaggggcactgtacggcttaggatgactctgttgtcccttacccctccgctcactcatcatcttgtaatgagcttttgaatcttcctcatagattctgc 11385177  T
Q  418 cgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgat 475  Q
     ||  |||||||| ||||| ||| |||| ||||  || || || || |||||||||||    
T  11385176 agctgcttaccaactcagaaaaagttctgatcttctgatagccaatggccctcttgat 11385119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 66 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 15099702 - 15099364
Alignment:
Q  66 ctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgac 165  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| | |||||| ||||| || ||||| || ||||| ||  | |  || || ||||| |||||  ||||  |||| |    
T  15099702 ctaaccttcttcggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcctcattgcagttataacaaacgatgtccccacgcttacaatcatctagagtgtgtc 15099603  T
Q  166 ccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagc 265  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||| ||||||    
T  15099602 ccttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctctatcacaaacgttactcttgtggcctttctcaccacacttgaagcaaactatgtcagtaggagc 15099503  T
Q  266 atccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt 365  Q
    ||| ||| |  | |||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||| |||| |||||||| |||||     
T  15099502 atctctcctcttgggcctcctcccatcatttaacctctgcttacccttgtcagcaggagcactatacggcgtcggacgactctgctgtcccttgcctcta 15099403  T
Q  366 cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcc 404  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  15099402 cgctcactcatcaccttgtaatgagctttcgtgtcctcc 15099364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 66 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 12712762 - 12712437
Alignment:
Q  66 ctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgac 165  Q
    |||||||||||| | || |||||||||| | |||| ||||||||  |||| || ||||||||| ||| |||||| || |||||||| |||| || |||||    
T  12712762 ctaaccttcttccgttgagtgcactgagaattgatatgaccctccccattgcagttatagcatacaatatcaccacgtttgcaatcagctaacacgtgac 12712663  T
Q  166 ccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagc 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||     
T  12712662 ccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatctttggtacaaacattacttttgtggcctttctcgccacacttaaagcaaactatctcaacaggagt 12712563  T
Q  266 atccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt 365  Q
     || ||     | || |  ||||||||||| ||||  ||||| |||||  ||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| || ||     
T  12712562 gtctcttcccttgggtcttctctcatcattcagtcgttgctttcccttaccagcaggagcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttgcccctc 12712463  T
Q  366 cgctcactcatcaccttataatgagc 391  Q
    || ||||||||||||||  |||||||    
T  12712462 cgttcactcatcaccttggaatgagc 12712437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 33 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 12798633 - 12798194
Alignment:
Q  33 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 132  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||    ||| ||||||| |||||||| ||||| | |||||| ||||| ||||||||||| || |||||  |||    
T  12798633 gtaccagtcaacgcaaaaaccttgccacctgtcctagccttcttaggctgtgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaa 12798534  T
Q  133 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggt-acaaacgttactcttgtggcctttct 231  Q
    |||| || ||||  ||||| ||||   |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||      
T  12798533 catccccacgctcacaatcagctaaagtgtgtcctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatc-tcggtcacaaacattactcttgtggcctttt- 12798436  T
Q  232 cgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactata 331  Q
      |||||||| ||||| || || |||| | ||||||| ||| |  |  ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12798435 --ccacacttgaaacaaacaatatcagtatgagcatctctcctcttgagcctcctctcatcattcaatctctgcttacccttgtcagcaggagcactata 12798338  T
Q  332 cggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaa 431  Q
    ||| || |||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||| || || ||||||| ||  ||||||||     
T  12798337 cggcttcggacgactctgctgtcccttgcctctgcgctcactcatcaccttgtaaagagctttcgtatcctcttcataaatcctacagctgcttaccaac 12798238  T
Q  432 tcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgat 475  Q
    ||||| ||  |||| ||||  || || || ||||||||||||||    
T  12798237 tcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 12798194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 16947619 - 16947187
Alignment:
Q  18 tcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattac 117  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||| ||||| ||||| |||||   |||| |||||||| ||||  | ||||| | |||||| ||||||||||| || |    
T  16947619 tcattagtagtctgcgtaccattcaatgcaaacactttcccaccggttctagccttcttcagctgaatacactgtgaactgatatgaccctcttcgttgc 16947520  T
Q  118 aattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttact 217  Q
    | || |||||  |||  || || ||||| || || |||||  |||| || ||||| |||||||| |  |||||| |||||||  |   |||| | |||||    
T  16947519 agttgtagcaaacaatgtctccacgcttacattcagctagtgtgtgtcctttctgaccacacctaacacacttcctctcatctctaccacaagcattact 16947420  T
Q  218 cttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtca 317  Q
    |||||||||||| || ||||||||  |||| || || ||| | |||||||| ||| |  | ||||  ||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  16947419 cttgtggcctttttcaccacacttgtaacaaacaatttcaactggagcatctctcctcttgggccttctctcatcattcattctctgctttcccttgtca 16947320  T
Q  318 gcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 417  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||| || |    
T  16947319 gcaggggcactgtatggtttaggacgactctgctgtcccttaccccttctctcactcatcaccttgtaatgagctttcgtatcctcttcatagattctgc 16947220  T
Q  418 cgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatct 450  Q
     || ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16947219 agctactcaccaattcagagaaaattctaatct 16947187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 33 - 403
Target Start/End: Original strand, 19150128 - 19150498
Alignment:
Q  33 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 132  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||| ||||||| || || || ||||| | ||| || || || ||||||||||| || |||||  |||    
T  19150128 gtaccagtcaacgcaaatactttaccacctatcctagccttcttaggttgcgtacactgcgaactaatatgtccttcttcattacagttgtagcaaacaa 19150227  T
Q  133 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggt-acaaacgttactcttgtggcctttct 231  Q
     ||| || ||||||||||| || |   |||| || ||||| |||||||| ||||||||||||| ||| | | | ||| || ||||| |||||||||||||    
T  19150228 tatctccacgcttgcaatcagccaatgtgtgtcctttctgaccacacctaaagcacttcttctgatc-tcgatcacacacattactgttgtggcctttct 19150326  T
Q  232 cgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactata 331  Q
    | |||||||| || || || || |||| ||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19150327 caccacacttgaagcaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttaggcctcctctcatcattcaacctctgcttacccttgtcagcaggggcactaaa 19150426  T
Q  332 cggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctc 403  Q
    ||| || |||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  19150427 cggcttcggacgactctgctgtcccttacctatgcgctcactcatcaccttgtaatgagctttggtatcctc 19150498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 33 - 403
Target Start/End: Original strand, 20749527 - 20749897
Alignment:
Q  33 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 132  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||| ||||||| || || || ||||| | ||| || || || ||||||||||| || |||||  |||    
T  20749527 gtaccagtcaacgcaaatactttaccacctatcctagccttcttaggttgcgtacactgcgaactaatatgtccttcttcattacagttgtagcaaacaa 20749626  T
Q  133 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggt-acaaacgttactcttgtggcctttct 231  Q
     ||| || ||||||||||| || |   |||| || ||||| |||||||| ||||||||||||| ||| | | | ||| || ||||| |||||||||||||    
T  20749627 tatctccacgcttgcaatcagccaatgtgtgtcctttctgaccacacctaaagcacttcttctgatc-tcgatcacacacattactgttgtggcctttct 20749725  T
Q  232 cgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactata 331  Q
    | |||||||| || || || || |||| ||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20749726 caccacacttgaagcaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttaggcctcctctcatcattcaacctctgcttacccttgtcagcaggggcactaaa 20749825  T
Q  332 cggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctc 403  Q
    ||| || |||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  20749826 cggcttcggacgactctgctgtcccttacctatgcgctcactcatcaccttgtaatgagctttggtatcctc 20749897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 33 - 478
Target Start/End: Original strand, 13676568 - 13677007
Alignment:
Q  33 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 132  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||   ||||||||||||||| ||||  ||||| | |||||| || ||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  13676568 gtaccagtcagagcaaacactttaccaccggttctaaccttcttcggttgtgcacactgtgaactgatatggccctcctcattgcagttatagcaaacta 13676667  T
Q  133 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctc 232  Q
      || || ||||| ||||| ||||   |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   |||||| |||||||||||||||||||     
T  13676668 tgtctccccgcttacaatcagctaatgtgtgtcccttctgtccacacctgaagtacttcttctcatctttatcacaaacattactcttgtggcctttctt 13676767  T
Q  233 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatac 332  Q
     ||||||||  | || || |||||| |||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| |  ||||| || || ||||||||||| |||||||||    
T  13676768 accacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctctcatcattcaacctctgttttcctttgtcagcaggagcactatac 13676867  T
Q  333 ggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaat 432  Q
    ||||||||| || |||| ||||  ||||||||      || ||||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| | || ||| |||||||    
T  13676868 ggtttaggatgactctgctgtcatttacctct------acacatcaccttgtaatgagctttagtatcttcttcatatatcctgcagctactcaccaaat 13676961  T
Q  433 cagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
    ||||||||||||| ||||  || || || || || |||||||||||    
T  13676962 cagagaaaattcttatcttctgatacccaatggctctcttgatgtc 13677007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 69 - 475
Target Start/End: Original strand, 12459781 - 12460187
Alignment:
Q  69 accttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgaccct 168  Q
    |||||||||||||| || ||||| | ||| || ||||| |||||||| || ||||||||  |||  || || ||||| || || |||||  |||| ||||    
T  12459781 accttcttcggctgagtacactgtgaactaatatgaccttcttcattgcagttatagcagacaatgtccccacgcttacattcagctagggtgtgtccct 12459880  T
Q  169 tctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatc 268  Q
    |||| |||||||| || || ||| |||||||  |   |||| | || |||||||||||||| || ||||||||  |||| || |||||||||||| ||||    
T  12459881 tctgaccacacctaaaacatttcctctcatctctaccacaagcattgctcttgtggcctttttcaccacacttgtaacagacaatctcagcaggaacatc 12459980  T
Q  269 cctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgc 368  Q
     ||| |  | |||| ||| |||||||| | | ||||||| |||||||||||| | ||| | || || ||||||||| |||| ||||||||||| || | |    
T  12459981 tctcctcttgggcctcctatcatcattcattttctgctttcccttgtcagcaagagcattgtaaggcttaggacgactctgctgtcccttacccctcctc 12460080  T
Q  369 tcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccc 468  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| | ||  || ||||| |||||||||| ||||||||  || || ||||||||||    
T  12460081 tcactcatcaccttgtaatgagcttttgtgtcttcctcatatatcctgcagctgctcaccaactcagagaaaactctaatcttctgataccctatagccc 12460180  T
Q  469 tcttgat 475  Q
    |||||||    
T  12460181 tcttgat 12460187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 213 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 14261198 - 14260936
Alignment:
Q  213 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttaccct 312  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || || |  ||||||| ||||||||  |||    | |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  14261198 ttactcttgtggcctttctcaccacacttgaagcaaataatctcagtaggagcatatctccccttaggcctcctctcatcattcagtctctacttaccct 14261099  T
Q  313 tgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagat 412  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||| |||  |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| || || ||    
T  14261098 tgtcagcaggggcactatacggcttcggacgactctactgtcccttacctttgcgctcactgatcaccttgtaatgagctttcgtatcctcttcatatat 14260999  T
Q  413 cctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgat 475  Q
    ||| | || ||| ||||| ||||||||| | || |||| ||| || || ||||||||||||||    
T  14260998 cctgcagctactcaccaactcagagaaattccttatcttttgatagccaatagccctcttgat 14260936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 26 - 450
Target Start/End: Original strand, 13024454 - 13024878
Alignment:
Q  26 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 125  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||    ||| ||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||| ||||| || || || |||    
T  13024454 agtctgcgtaccagtcaatgcaaacactttcccaccggtcctagccttcttcggctgagtacactgagaactgatatgaccttcttcgttgcagttgtag 13024553  T
Q  126 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggc 225  Q
    ||  |||  || || ||||| || || |||||  |||| || ||||  ||||||||||| || ||| ||||||   |   | || | || || |||||||    
T  13024554 cagacaatgtctccacgcttacattcagctagggtgtgtcctttctaaccacacctgaaacatttcctctcatatctaccataagcattgcttttgtggc 13024653  T
Q  226 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggc 325  Q
    |||| || ||||||||  |||| || || |||||||||||||| ||| |  | |||| ||| |||||||| |  |||||||| || ||||||||||| ||    
T  13024654 ctttttcaccacacttgtaacaaacaatttcagcaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcattcatcctctgcttccctttgtcagcaggagc 13024753  T
Q  326 actatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgactt 425  Q
    ||| || ||||||||||||||||  ||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| | ||  |||    
T  13024754 actgtaaggtttaggacgattctactgtcccttacccctcctctcactcatcaccttgtaatgagctttggtgtcttcctcatatatcctgcagctgctt 13024853  T
Q  426 accaaatcagagaaaattctaatct 450  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||    
T  13024854 accaactcagagaaaactctaatct 13024878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 26115737 - 26115277
Alignment:
Q  18 tcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattac 117  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||||||||| || |||||||||  ||||  ||||||||| |  |  ||||| ||||| || ||||| ||| |||| |    
T  26115737 tcattaggagtgtgcgtaccagtcaaagcaaacacctttccaccagttctagtcttcttcggttcaggacactgtgtactaatatgaccttctccattgc 26115638  T
Q  118 aattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttact 217  Q
    |||| || ||  |||  || || |||||||| || ||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||  |   |||||| |||||    
T  26115637 aattgtaacagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctcttccacaaacattact 26115538  T
Q  218 cttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtca 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||| || |||||||| |||||||| ||| |  | |||| ||| |||||| | |   ||||||| || ||||||    
T  26115537 cttgtggcctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagccggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcactcatcttctgctttcctttgtca 26115438  T
Q  318 gcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 417  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||||||| | ||||||||| || | ||||||||| | ||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||    
T  26115437 gcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttatcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcatagattctac 26115338  T
Q  418 cgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
      |   | ||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||| || || |||||||||||    
T  26115337 acctgttaaccaactcagagaagactctgatctgctgatatccaatggctctcttgatgtc 26115277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 156
Target Start/End: Original strand, 14140781 - 14140919
Alignment:
Q  18 tcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattac 117  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| || || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  14140781 tcattagtagtctgcgtaccagtcaaagcaaataccttcccaccagttctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtggccctcttcgttac 14140880  T
Q  118 aattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggcta 156  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14140881 aattataacatacaacatcaccacgcttgcaatcagcta 14140919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 26091945 - 26091563
Alignment:
Q  18 tcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattac 117  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||  |||||||||||  |  ||||| | |||||| ||||| ||  |||| |    
T  26091945 tcattaggagtctgcgtaccagtcaaagcaaacacctttccaccaattctagtcttcttcggctcaggacactgtgaactgatatgaccttccccattgc 26091846  T
Q  118 aattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttact 217  Q
    | || || ||  |||  || || |||||||| || ||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||  |   |||||| |||||    
T  26091845 agttgtaacagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctcttccacaaacattact 26091746  T
Q  218 cttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtca 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  | || || |||||| |||||||||| ||| |  | |||| ||| ||||||   |   ||||||| || ||||||    
T  26091745 cttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgtca 26091646  T
Q  318 gcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 400  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  26091645 gcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtc 26091563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 40924964 - 40924582
Alignment:
Q  18 tcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattac 117  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||  |||||||||||  |  ||||| | |||||| ||||| ||  |||| |    
T  40924964 tcattaggagtctgcgtaccagtcaaagcaaacacctttcccccaattctagtcttcttcggctcaggacactgtgaactgatatgaccttccccattgc 40924865  T
Q  118 aattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttact 217  Q
    | || || ||  |||  || || |||||||| || ||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||  |   |||||| |||||    
T  40924864 agttgtaacagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctcttccacaaacattact 40924765  T
Q  218 cttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtca 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  | || || |||||| |||||||||| ||| |  | |||| ||| ||||||   |   ||||||| || ||||||    
T  40924764 cttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgtca 40924665  T
Q  318 gcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 400  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  40924664 gcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcataatcttataatgagctttggtgtc 40924582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 400
Target Start/End: Original strand, 49155403 - 49155785
Alignment:
Q  18 tcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattac 117  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||  |||||||||||  |  ||||| | |||||| ||||| ||  |||| |    
T  49155403 tcattaggagtctgcgtaccagtcaaagcaaacacctttccaccaattctagtcttcttcggctcaggacactgtgaactgatatgaccttccccattgc 49155502  T
Q  118 aattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttact 217  Q
    | || || ||  |||  || || |||||||| || ||||   | ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||  |   |||||| |||||    
T  49155503 agttgtaacagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactatgacccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctcttccacaaacattact 49155602  T
Q  218 cttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtca 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  | || || |||||| |||||||||| ||| |  | |||| ||| || |||   |  |||||||| || ||||||    
T  49155603 cttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcctcacccatcctctgctttcctttgtca 49155702  T
Q  318 gcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 400  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  49155703 gcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcataatcttataatgagctttggtgtc 49155785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 13965807 - 13965433
Alignment:
Q  26 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 125  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||  |||| ||||||||||||  |  ||||| | |||||| ||||||||| |||| ||||| |||    
T  13965807 agtctgcgtaccagtcaatgcaaacaccttcccaccagttctagccttcttcggctcaggacactgtgaactgatatgaccctctccattgcaattgtag 13965708  T
Q  126 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggc 225  Q
    ||  ||| ||| || |||||||| || |||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||  | ||||| ||   |||||| ||||||||||||     
T  13965707 cagacaatatccccacgcttgcattcagctagactgtgacccttctgaccacacctgaagcattttctatcatctttaccacaaacattactcttgtggt 13965608  T
Q  226 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggc 325  Q
    ||||||| ||||||||  | ||  | ||||||||||||||||| ||| |  | |||| ||| ||||||   |   ||||||| || ||||||||||| ||    
T  13965607 ctttctcaccacacttgtagcaatcaatctcagcaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgtcagcaggagc 13965508  T
Q  326 actatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 400  Q
    ||| || || ||||||||||| || ||||||||||| || | ||||||||| | ||  |||||||||||||||||    
T  13965507 actgtaaggcttaggacgattatgttgtcccttacccctcctctcactcattatctggtaatgagctttggtgtc 13965433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 26 - 400
Target Start/End: Original strand, 21755522 - 21755896
Alignment:
Q  26 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 125  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| || || || |||  |||||||||||||||||  |  ||||| |  || || ||||||||| |||| || || |||    
T  21755522 agtctgcgtaccagtcaatgcaaacaccttgcccccagttctaaccttcttcggctcaggacactgtgagctaatatgaccctctccattgcagttgtag 21755621  T
Q  126 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggc 225  Q
    ||  ||| ||| || ||||| || || ||||   ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||   |||||| || ||||||||||    
T  21755622 cagacaatatccccacgcttacattcagctaaagtgtgacccttctgaccacacctgaaacacttcctctcatctttaccacaaacattgctcttgtggc 21755721  T
Q  226 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggc 325  Q
    |||| || ||||||||  |||| || |||||||  |||||||| ||| |  | |||| | | |||||| | |   ||||||| || ||||||||||| ||    
T  21755722 ctttttcaccacacttgtaacaaacaatctcagagggagcatctctcctcttaggcctcatgtcatcactcatattctgctttcctttgtcagcaggagc 21755821  T
Q  326 actatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 400  Q
    ||| || || ||||||||||| || ||||||||||| || | ||||||||| | ||| |||||||||||| ||||    
T  21755822 actgtaaggcttaggacgattttgttgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttgatgtc 21755896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 206 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 17703436 - 17703164
Alignment:
Q  206 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 305  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||| || || || |||||||||||| ||||  | |||||||| |||||    | ||||||     
T  17703436 acaaacattactcttgtggcctttcccgccacagttgaaacaaacaatatccgcaggagcatccttcttctttggccgcctatcatcgaccattctctgt 17703337  T
Q  306 ttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcc 404  Q
    || ||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||| |||| || |||||   |||| |||||| |||  ||||| ||||||||| |||| |||||     
T  17703336 ttgcccttatcagtaggggcactataaggtttagggcgactctgctggccctt-ggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagctctggtatcctct 17703238  T
Q  405 tcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
    || |||||||||| ||   | |||||||  | ||||| ||  |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  17703237 tcatagatcctacagctgttcaccaaataggcgaaaactcggatctgttggtatccgatcgccctcttgatgtc 17703164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 206 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 16726422 - 16726150
Alignment:
Q  206 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 305  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||| || || || |||||||||||| ||||  | |||||||| |||||    | ||||||     
T  16726422 acaaacattactcttgtggcctttcccgccacagttgaaacaaacaatatccgcaggagcatccttcttctttggccgcctatcatcgaccattctctgt 16726323  T
Q  306 ttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcct 405  Q
    || ||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||| |||| || |||||     |||||||| |||  ||||| ||||||||| |||| ||||| |    
T  16726322 ttgcccttatcagtaggggcactttaaggtttagggcgactctgctggcccttggtctttcgctcattcacaaccttgtaatgagctctggtatcctctt 16726223  T
Q  406 cgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
    | |||||||||| ||   | |||||||  | ||||| ||  |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  16726222 catagatcctacagctgttcaccaaataggcgaaaactcggatctgttggtatccgatcgccctcttgatgtc 16726150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 206 - 472
Target Start/End: Original strand, 9591653 - 9591919
Alignment:
Q  206 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 305  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||| ||||  | |||||||| ||||||   | |||||||    
T  9591653 acaaacattgctcttgtggcctttctcgccacagttgaaacagacaatctctgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcaaccattctctgc 9591752  T
Q  306 ttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcc 404  Q
    || ||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||| |||| || |||||   |||| | |||| | |  ||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  9591753 ttgcccttatcaacaggggcactataaggcttagggcgactctgctggccctt-ggtcttcctctcattaacaaccttgtaatgagctctggtatcctcc 9591851  T
Q  405 tcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctctt 472  Q
    || ||||| || | || | | ||||||||||  |||| ||  |||||||||||||| || ||||||||    
T  9591852 tcatagattctgcagctattcaccaaatcaggaaaaactcggatctgttggtatccgatcgccctctt 9591919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 285 - 391
Target Start/End: Original strand, 13004834 - 13004940
Alignment:
Q  285 ctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttat 384  Q
    ||||||||||| ||||  ||||| |||||| |||||||||| || ||||| ||||||||| |||| |||||||| || || || |||||||||||||| |    
T  13004834 ctctcatcattcagtcgttgctttcccttgccagcaggggcgctgtacggcttaggacgactctgttgtcccttgcccctccgttcactcatcaccttgt 13004933  T
Q  385 aatgagc 391  Q
    |||||||    
T  13004934 aatgagc 13004940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 213 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 15145897 - 15145752
Alignment:
Q  213 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttaccct 312  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||  ||||  | || |||||||||||||||||| ||||  | || ||||| ||||||   | |||||| || ||||    
T  15145897 ttactcctgtggcctttctcaccacaagtaaagaagacaatctcagcaggagcatccttcttcttagggcgcctatcatcaactactctctgtttgccct 15145798  T
Q  313 tgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtccctt 358  Q
    | |||||||||| |||||| || ||||||||| |||| || |||||    
T  15145797 tatcagcagggggactataaggcttaggacgactctgttgaccctt 15145752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 315 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 11234088 - 11233925
Alignment:
Q  315 tcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcc 414  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| ||  | | |||| |||  ||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  11234088 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcc 11233989  T
Q  415 taccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
    | | || | | ||||||||    |||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  11233988 tgcagctattgaccaaatcctgaaaaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 11233925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 205 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 12203760 - 12203548
Alignment:
Q  205 tacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctg 304  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  | || || ||| |||||||| |||| ||| |  | || | |||||||||||| | ||| ||    
T  12203760 tacaaacattactcttgtggcccttctcaccacacttgtagcaaacaatcacagcaggaacatctctcctcttaggtctcctctcatcattcaatctttg 12203661  T
Q  305 cttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcc-ct-tacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcct 402  Q
     || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||   || || || || | ||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  12203660 tttccctttgtcagcaggagcactgtagggcttaggacgaccttgctggcctctgttcctctt--ctcactcataaccttataatgaactttggtatcct 12203563  T
Q  403 cctcgtagatcctac 417  Q
    |||| ||||| ||||    
T  12203562 cctcatagattctac 12203548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 315 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 15157932 - 15157769
Alignment:
Q  315 tcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcc 414  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| ||  ||| |||| |||  ||||| || ||||| || || ||||| || |||||||    
T  15157932 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctttctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 15157833  T
Q  415 taccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
    | | || | | ||||||||    |||| ||| | |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  15157832 tgcagctattaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 15157769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 331
Target Start/End: Original strand, 14042991 - 14043109
Alignment:
Q  213 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttaccct 312  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  || | || || |||||| || |||||||  |||| || || ||||||||||||   | |||||| |||||||    
T  14042991 ttactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcatacaatctcaacatgagcatctttctttctagggcgcctctcatcaaccattctctgtttaccct 14043090  T
Q  313 tgtcagcaggggcactata 331  Q
    | |||||||| ||||||||    
T  14043091 tatcagcaggagcactata 14043109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 331
Target Start/End: Original strand, 14353021 - 14353139
Alignment:
Q  213 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttaccct 312  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  || | || || |||||| || |||||||  |||| || || ||||||||||||   | |||||| |||||||    
T  14353021 ttactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcatacaatctcaacatgagcatctttctttctagggcgcctctcatcaaccattctctgtttaccct 14353120  T
Q  313 tgtcagcaggggcactata 331  Q
    | |||||||| ||||||||    
T  14353121 tatcagcaggagcactata 14353139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 60
Target Start/End: Original strand, 15343533 - 15343575
Alignment:
Q  18 tcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccac 60  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15343533 tcattagtagtctgcgtaccagtcaaagcaaacacttttccac 15343575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 397; Significance: 0; HSPs: 26)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 53750630 - 53750170
Alignment:
Q  18 tcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattac 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  53750630 tcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtggccctcttcattac 53750531  T
Q  118 aattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttact 217  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53750530 aattatagcatacaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacatctgaaacacttcttctcatccttggtacaaacgttact 53750431  T
Q  218 cttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtca 317  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  53750430 cttgtgacctttctcgccacacttaaagcacactatctcagcaggagcatccctcttactcggcctcctctcatcattaagtctctgcttacccttatca 53750331  T
Q  318 gcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 417  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53750330 gtcggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcactttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 53750231  T
Q  418 cgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  53750230 agcgactcaccaaatcagagaaaattctaatctgctggtatcctatggctctcttgatgtc 53750170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 51603952 - 51603492
Alignment:
Q  18 tcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattac 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51603952 tcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtggccctcttcattac 51603853  T
Q  118 aattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttact 217  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51603852 aattatagcacacaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacatctgaaacacttcttctcatccttggtacaaacgttact 51603753  T
Q  218 cttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtca 317  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  51603752 cttgtgacctttctcgccacacttaaagcacactatctcagcaggagcatccctcttactcggcctcctctcatcattaagtctctgcttacccttatca 51603653  T
Q  318 gcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 417  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51603652 gtcggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcactttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 51603553  T
Q  418 cgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  51603552 agcgactcaccaaatcagagaaaattctaatctgctggtatcctatggctctcttgatgtc 51603492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 33 - 439
Target Start/End: Original strand, 16150763 - 16151169
Alignment:
Q  33 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 132  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||   ||||||||||||||| |   |||| || |  || || || |||||||||| ||| ||||||||  |||    
T  16150763 gtaccagtcaatgcaaacactttcccaccggttctaaccttcttcggtttcttgcattgcgagctaatatgcccctcttcatcacagttatagcaaacaa 16150862  T
Q  133 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctc 232  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||  |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16150863 catcaccacgcttgcaatcagctagtgtgtgtcctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctttagtacaaacattactcttgtggcctttctc 16150962  T
Q  233 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatac 332  Q
    |||||||||| | || || || ||| |||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| |   ||||||| || ||||||| ||| |||||||||    
T  16150963 gccacacttatagcaaacaatatcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctctcatcattcaacttctgctttcctttgtcagtaggagcactatac 16151062  T
Q  333 ggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaat 432  Q
    || || |||||| |||| ||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | || ||||||||| |    
T  16151063 ggcttcggacgactctgctgtcctttgccccttcgatcactcatcaccttgtaatgagcttttgtgtcctcctcatagattctgcagctacttaccaatt 16151162  T
Q  433 cagagaa 439  Q
    |||||||    
T  16151163 cagagaa 16151169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 33 - 439
Target Start/End: Original strand, 16154909 - 16155315
Alignment:
Q  33 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 132  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||   ||||||||||||||| |   |||| || |  || || || |||||||||| ||| ||||||||  |||    
T  16154909 gtaccagtcaatgcaaacactttcccaccggttctaaccttcttcggtttcttgcattgcgagctaatatgcccctcttcatcacagttatagcaaacaa 16155008  T
Q  133 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctc 232  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||  |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16155009 catcaccacgcttgcaatcagctagtgtgtgtcctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctttagtacaaacattactcttgtggcctttctc 16155108  T
Q  233 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatac 332  Q
    |||||||||| | || || || ||| |||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| |   ||||||| || ||||||| ||| |||||||||    
T  16155109 gccacacttatagcaaacaatatcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctctcatcattcaacttctgctttcctttgtcagtaggagcactatac 16155208  T
Q  333 ggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaat 432  Q
    || || |||||| |||| ||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | || ||||||||| |    
T  16155209 ggcttcggacgactctgctgtcctttgccccttcgatcactcatcaccttgtaatgagcttttgtgtcctcctcatagattctgcagctacttaccaatt 16155308  T
Q  433 cagagaa 439  Q
    |||||||    
T  16155309 cagagaa 16155315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 102 - 468
Target Start/End: Original strand, 15073555 - 15073921
Alignment:
Q  102 tgaccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatcct 201  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||   |||||||||| ||||   |||| || |||| ||||||||| || ||||||||||||||      
T  15073555 tgaccttcttcatcacaattatagcaaacaacatcacaaagcttgcaatcagctaatgtgtgtcctttctttccacacctaaaacacttcttctcatcac 15073654  T
Q  202 tggtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtct 301  Q
     |  ||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||| ||||||||| ||| | || |||| |||||||||||| |||||    
T  15073655 ggtcacatacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacagacaatctcagtaggagcatctctcctcctaggcctcctctcatcattcagtct 15073754  T
Q  302 ctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcc 401  Q
    ||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  15073755 ctgtttaactttgtcagcaggagcactatacggtttcggacgactcagctgtcccttacctctacgctcactcatcaccttataatgagcttttgtatcc 15073854  T
Q  402 tcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccc 468  Q
    || || |||||||||| || ||| ||||||||||| ||| | || |||| |||||| || |||||||    
T  15073855 tcttcatagatcctacagctactcaccaaatcagaaaaattccttatcttttggtagccgatagccc 15073921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 33 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 14993512 - 14993151
Alignment:
Q  33 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 132  Q
    |||||| |||||||||| || || |||||    ||||||||||| || || || ||||| | |||||| ||||| || ||||| || || |||||  |||    
T  14993512 gtaccattcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggttgcgtacactgcgaactgatatgaccttcctcattgcagttgtagcaaacaa 14993413  T
Q  133 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctc 232  Q
    |||| ||  |||||||||| ||||   |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||  ||   |  |||||| ||||||||||||||||| ||    
T  14993412 catccccatgcttgcaatcagctaaagtgtgtcctttctgaccacacctgaagcacttcttcttctcacggtcacaaacattactcttgtggcctttttc 14993313  T
Q  233 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatac 332  Q
     |||||||| ||||| || || |||| ||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14993312 accacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcctctcatcattcaatctctgcttacccttgtcagcaggggcactatac 14993213  T
Q  333 ggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagcttt 394  Q
    || ||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14993212 ggcttcagacgactctgttgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttt 14993151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 66 - 439
Target Start/End: Original strand, 15266936 - 15267309
Alignment:
Q  66 ctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgac 165  Q
    ||||||||||||||||| || ||||  | |||||| ||||| ||||| || || ||||||||  |||  || ||  |||| ||||| |||||  |||| |    
T  15266936 ctaaccttcttcggctgcgtacactacgaactgatatgaccttcttcgttgcagttatagcaaacaatgtctccatgcttacaatcagctagagtgtgtc 15267035  T
Q  166 ccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagc 265  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||| |||||||| ||||| |||||  ||||||| || || || || |  | ||||||    
T  15267036 ctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctctgtcacaaacattactcttatggcccttctcatcacacttgaagcaaacaatattcgtaggagc 15267135  T
Q  266 atccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt 365  Q
    ||| ||| |  | |||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| |||||||| |||||     
T  15267136 atctctcctcttgggcctcctctcatcatttaacctctgcttacccttgtcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgttgtcccttgcctctg 15267235  T
Q  366 cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaa 439  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| | || ||||| ||||||||||||    
T  15267236 cgttcactcatcaccttgtaatgagctttcgtgtcctcctcataaatcctgcagctacttatcaaatcagagaa 15267309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 26 - 400
Target Start/End: Original strand, 20893151 - 20893525
Alignment:
Q  26 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||  || ||||| | |||||| || ||||||||||| || || |||    
T  20893151 agtctgcgtaccagtcaaagcaaacacctttccaccagttctaaccttcttcggctcagtacactgcgaactgatatgcccctcttcattgcagttgtag 20893250  T
Q  126 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggc 225  Q
     |  ||| ||| || |||||||| || ||||   |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |   |||||| || ||||||| ||    
T  20893251 tagacaatatccccacgcttgcattcagctaaattgtgtcccttctgaccacacctgaagcacttcctctcatctctaccacaaacattgctcttgttgc 20893350  T
Q  226 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggc 325  Q
    |||| || ||||||||  |||| || ||||||| ||||||||| ||| |  | |||| ||| |||||||| |   ||||||| || ||||||||||| ||    
T  20893351 ctttttcaccacacttgtaacaaacaatctcagaaggagcatctctcctcttaggcctcctatcatcattcatcttctgctttcctttgtcagcaggagc 20893450  T
Q  326 actatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 400  Q
    ||| || || ||||||||| |||| |||||||| || || | ||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  20893451 actttaaggcttaggacgactctgctgtcccttgcccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtc 20893525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 95 - 439
Target Start/End: Original strand, 18259630 - 18259974
Alignment:
Q  95 actgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttc 194  Q
    |||||| ||||| || ||||| || ||||||||  |||  || || ||||| ||||| |||||  |||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  18259630 actgatatgaccttcctcattgcagttatagcaaacaatgtccccacgcttacaatcagctagagtgtgtcctttctgaccacacctgaagcacttcttc 18259729  T
Q  195 tcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcat 294  Q
    |||||  |   |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| || || || | || |||||||||  || |  | |||| |||||||||||    
T  18259730 tcatctctatcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttaaagcaaacaatattagtaggagcatctgtcctcttgggcctcctctcatcat 18259829  T
Q  295 taagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagcttt 394  Q
    | |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| || |||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  18259830 ttaacctctgcttacccttgtcagcaggagcactatacggcttcggatgactctgctgtcccttgcccctacgctcactcatcaccttgtaatgagattt 18259929  T
Q  395 ggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaa 439  Q
     || || || || ||||||||   || |||||| |||||||||||    
T  18259930 tgtatcttcttcatagatcctgtagctacttactaaatcagagaa 18259974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 33 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 11204377 - 11204010
Alignment:
Q  33 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 132  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||  |||| |||| |||||||  |  ||||| | |||||| ||||||||| |||| ||||| |||||  |||    
T  11204377 gtaccagtcaaagcaaacaccttcccaccagttctagcctttttcggctcaggacactgtgaactgatatgaccctctccattgcaattgtagcagacaa 11204278  T
Q  133 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctc 232  Q
     ||| || |||||||| |  |||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||  | |||||  |   |||||| || |||||||||||||||||    
T  11204277 tatccccacgcttgcattaagctagactgtgacccttctgaccacacctgaagcattttctatcatctctaccacaaacattgctcttgtggcctttctc 11204178  T
Q  233 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatac 332  Q
     ||||||||| |||| || ||||||| ||||||||| ||| |  | || | ||| |||||||| |   ||| ||| || ||||||||||| ||||||||     
T  11204177 accacacttataacaaacaatctcagaaggagcatctctcctcttgggtctcctatcatcattcatcttctactttcctttgtcagcaggagcactataa 11204078  T
Q  333 ggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 400  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  11204077 ggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtc 11204010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 29450697 - 29450237
Alignment:
Q  18 tcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattac 117  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||  |||||||||||  |  ||||| | |||||||||||| ||  |||| |    
T  29450697 tcattaggagtctgcgtaccagtcaaagcaaacacctttcccccaattctagtcttcttcggctcaggacactgtgaactgatgtgaccttccccattgc 29450598  T
Q  118 aattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttact 217  Q
    | || || ||  |||  || || |||||||| || ||||   ||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||      |||||| |||||    
T  29450597 agttgtaacagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtgacccttctgaccacacctgaaacacttcctatcatctcctccacaaacattact 29450498  T
Q  218 cttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtca 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  | || || |||||| |||||||||| ||| |  | |||| ||| ||||||   |   ||||||| || ||||||    
T  29450497 cttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttaggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgtca 29450398  T
Q  318 gcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 417  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| | ||||||||||||||||||||| || || || ||  | |    
T  29450397 gcaggagcactgtaaggtttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcataatcttataatgagctttggtgtcttcttcataaattttgc 29450298  T
Q  418 cgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
      | | | ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  29450297 acctattaaccaactcagaaaagattctgatctgttgatatccaatagcccttttgatgtc 29450237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 3261954 - 3261572
Alignment:
Q  18 tcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattac 117  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||  |||||||||||  |  ||||| | |||||| ||||| ||  |||| |    
T  3261954 tcattaggagtctgcgtaccagtcaaagcaaacacctttccaccaattctagtcttcttcggctcaggacactgtgaactgatatgaccttccccattgc 3261855  T
Q  118 aattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttact 217  Q
    | || || ||  |||  || || |||||||| || ||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||  |   |||||| |||||    
T  3261854 agttgtaacagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctcttccacaaacattact 3261755  T
Q  218 cttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtca 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  | || || |||||| |||||||||| ||| |  | |||| ||| ||||||   |   ||||||| || ||||||    
T  3261754 cttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgtca 3261655  T
Q  318 gcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 400  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  3261654 gcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtc 3261572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 417
Target Start/End: Original strand, 7357387 - 7357778
Alignment:
Q  26 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 125  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || || |||| |  |||| ||||||||||||  |  ||||| | ||| || ||||||||| |||| || || |||    
T  7357387 agtctgtgtaccagtcaatgcaaacaccttcccactagttctagccttcttcggctcaggacactgtgaactaatatgaccctctccattgcagttgtag 7357486  T
Q  126 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggc 225  Q
    ||  |||  || || |||||||| || ||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||   | |||| || ||||||||||    
T  7357487 cagacaatgtctccacgcttgcattcagctaaattgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcctctcatctttaccataaacattgctcttgtggc 7357586  T
Q  226 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggc 325  Q
    ||||||| |||| |||  |||| || ||||||||||||||||| ||| |  | |||| ||| ||||||   |   ||||||| || ||||||||||| ||    
T  7357587 ctttctcaccactcttgtaacaaacaatctcagcaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgtcagcaggagc 7357686  T
Q  326 actatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 417  Q
    | | || || |||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| | ||| |||||||| |||||||| || || || |||||||    
T  7357687 aatgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagccttggtgtcttcttcataaatcctac 7357778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 44659026 - 44658566
Alignment:
Q  18 tcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattac 117  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||||||||| || |||||||||  ||||  ||||||||| |  |  ||||| | ||| || ||||  ||| |||| |    
T  44659026 tcattaggagtctgcgtaccattcaaagcaaacacctttccaccagttctagtcttcttcggttcaggacactgtgaactaatatgacattctccattgc 44658927  T
Q  118 aattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttact 217  Q
    |||| || ||  ||| ||| || |||||||| || ||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||  |   |||||| |||||    
T  44658926 aattgtaacagacaatatccccacgcttgcattcagctaaactgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctcttccacaaacattact 44658827  T
Q  218 cttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtca 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  | || || |||||| |||||||||| ||| |  | |||| ||| |||| |   |   ||||||| || |||||     
T  44658826 cttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatgacccatcttctgctttcctttgtcc 44658727  T
Q  318 gcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 417  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| | ||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||    
T  44658726 gcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcatagattctac 44658627  T
Q  418 cgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
      |   | ||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||| || || |||||||||||    
T  44658626 acctgttaaccaactcagagaagactctgatctgctgatatccaatggctctcttgatgtc 44658566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 322
Target Start/End: Original strand, 27903505 - 27903801
Alignment:
Q  26 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |  ||| |||||||| || || |||||||| | ||| ||||  ||||| |||||||| |||||     
T  27903505 agtctgcgtaccagtcaaagcaaatacttttcctcaagttctgaccttcttaggttgcgtgcactgtgaactaatgttgccctcctcattacagttataa 27903604  T
Q  126 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggc 225  Q
    ||  ||| ||| || |||||||| || || | ||  ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  27903605 caaacaatatctccacgcttgcattcagccaacacatgacctttctgaccacatctgaaacacttcttctcatctttggtgcagacattactcttgtggc 27903704  T
Q  226 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcagg 322  Q
    ||||| | ||||||||  |||| || |  ||| |||||||||| |||   || ||||||||||||||||| | ||| || || || |||||||||||    
T  27903705 ctttcgcaccacacttgtaacaaacaacatcaacaggagcatctctccccctaggccgcctctcatcattcaatctttgttttcctttgtcagcagg 27903801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 206 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 18604531 - 18604259
Alignment:
Q  206 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 305  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| | |||||||||| ||||  | |||||||| |||||    | |||||||    
T  18604531 acaaacattactcttgtggcctttctcgccacagttaaaacaaataatctccgaaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgc 18604432  T
Q  306 ttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcc 404  Q
    || ||||| |||||||||||| |||| || ||||| ||| |||| || ||||||  |||| | |||| | |  ||||| ||||||||| |||| |||||     
T  18604431 ttgcccttatcagcaggggcattataaggcttagggcgactctgctggccctta-gtcttcctctcattaacaaccttgtaatgagctatggtatcctct 18604333  T
Q  405 tcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
    || |||||||||| ||   | |||||||||| ||||| ||  |  ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  18604332 tcatagatcctacagctgttcaccaaatcagggaaaactcggagttgttggtatccgatcgccctcttgatgtc 18604259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 206 - 472
Target Start/End: Original strand, 13513650 - 13513916
Alignment:
Q  206 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 305  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||| ||||  | |||||||| ||||||   | |||||||    
T  13513650 acaaacattgctcttgtggcctttctcgccacagttgaaacagacaatctctgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcaaccattctctgc 13513749  T
Q  306 ttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcc 404  Q
    || ||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||| |||| || |||||   |||| | |||| | |  ||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  13513750 ttgcccttatcaacaggggcactataaggcttagggcgactctgctggccctt-ggtcttcctctcattaacaaccttgtaatgagctctggtatcctcc 13513848  T
Q  405 tcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctctt 472  Q
    || ||||| || | || | | ||||||||||  |||| ||  |||||||||||||| || ||||||||    
T  13513849 tcatagattctgcagctattcaccaaatcaggaaaaactcggatctgttggtatccgatcgccctctt 13513916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 206 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 18224185 - 18223914
Alignment:
Q  206 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 305  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||| ||||  | ||||| || |||||    | ||||||     
T  18224185 acaaacattacacttgtggcctttctcgccacagttgaaacaaacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgtctatcatcgaccattctctgt 18224086  T
Q  306 ttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcc 404  Q
    || ||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||| |||| || |||||   |||| |||||| |||  ||||| |||||||| ||||| || |||    
T  18224085 ttgcccttatcaacaggggcactataaggcttagggcgactctgctggccctt-ggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcttcc 18223987  T
Q  405 tcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgt 477  Q
    |||||||| || | || | | || ||||||| ||||| |   |||||||||||||| || ||| |||| ||||    
T  18223986 tcgtagattctgcagctattcactaaatcagggaaaactgggatctgttggtatccgatcgccatcttcatgt 18223914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 213 - 403
Target Start/End: Original strand, 14697408 - 14697598
Alignment:
Q  213 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttaccct 312  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||  || | || || |||||||||| ||||||  |||| || |||| |||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  14697408 ttactcttatggcctttctcaccacaagtatagcaaacaatctcagcagtagcatctttctttctaggcctcctctcatcattcaatctttgcttaccct 14697507  T
Q  313 tgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctc 403  Q
    | |||||||| ||||| || || || |||||| | || || ||||| ||| | | |||| |||  || || |||||||||||||| |||||    
T  14697508 tatcagcaggagcactgtaaggctttggacgactttgctgacccttgcctttcctctcattcacaactttgtaatgagctttggtatcctc 14697598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 16248388 - 16248122
Alignment:
Q  206 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 305  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| | || |||||    |||||||  ||||||||| ||||  | |||||||| |||||    | ||||||     
T  16248388 acaaacattactcttgtggcctttctcaccataattgaaacatgtaatctcagttggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgt 16248289  T
Q  306 ttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttc-gctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcc 404  Q
    |  ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||| || ||||||  ||||| ||||| |||  ||||| |||||||| || || ||||||    
T  16248288 tggcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttag-tcttctgctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcctcc 16248190  T
Q  405 tcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctctt 472  Q
    |  |||||||| | || | | |||||||||| ||||| ||  |||||||||||||  || ||||||||    
T  16248189 ttatagatcctgcagctattaaccaaatcagggaaaactcggatctgttggtatctgatcgccctctt 16248122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 213 - 406
Target Start/End: Original strand, 8343 - 8536
Alignment:
Q  213 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttaccct 312  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  || | || || |||||| ||||||||||  ||||  | || ||||||||||||   | |||||| |||||||    
T  8343 ttactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcagacaatctcaacaggagcatctttctttatagggcgcctctcatcaaccattctctgtttaccct 8442  T
Q  313 tgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctc 406  Q
    | |||||||| ||||| || || ||||||||| |||| || || ||  || |||||||| |||  | ||| |||||||  ||||| ||||||||    
T  8443 tatcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgctgacctttggcttttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatcctcctc 8536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 213 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 15741 - 15548
Alignment:
Q  213 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttaccct 312  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  || | || || |||||| ||||||||||  |||| || || ||||||||||||   | |||||| |||||||    
T  15741 ttactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcagacaatctcaacaggagcatctttctttctagggcgcctctcatcaaccattctctgtttaccct 15642  T
Q  313 tgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctc 406  Q
    | |||||||| ||||| || |  ||||||||| |||| || || ||  || |||||||| |||  | ||| |||||||  ||||| ||||||||    
T  15641 tatcagcaggagcactgtaagtcttaggacgactctgctgacctttgacttttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatcctcctc 15548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 213 - 328
Target Start/End: Original strand, 16219495 - 16219610
Alignment:
Q  213 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttaccct 312  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  || | ||||  |||||| ||||||||||  |||| || |||| |||||| ||||||| ||| || || ||||    
T  16219495 ttactcttatggcctttctcgccacaagtatagcacataatctcaacaggagcatctttctttctaggcctcctctcgtcattaactctttgttttccct 16219594  T
Q  313 tgtcagcaggggcact 328  Q
    | |||||||| |||||    
T  16219595 tatcagcaggagcact 16219610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 213 - 328
Target Start/End: Original strand, 16222815 - 16222930
Alignment:
Q  213 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttaccct 312  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  || | ||||  |||||| ||||||||||  |||| || |||| |||||| ||||||| ||| || || ||||    
T  16222815 ttactcttatggcctttctcgccacaagtatagcacataatctcaacaggagcatctttctttctaggcctcctctcgtcattaactctttgttttccct 16222914  T
Q  313 tgtcagcaggggcact 328  Q
    | |||||||| |||||    
T  16222915 tatcagcaggagcact 16222930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 301 - 415
Target Start/End: Original strand, 8389804 - 8389918
Alignment:
Q  301 tctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 400  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| ||  | |  ||| |||  ||||| || ||||| ||||| ||    
T  8389804 tctgtttacccttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttggtatc 8389903  T
Q  401 ctcctcgtagatcct 415  Q
    |||||| ||||||||    
T  8389904 ctcctcatagatcct 8389918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 15144567 - 15144451
Alignment:
Q  299 tctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttc-gctcactcatcaccttataatgagctttggt 397  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||| |||| || ||||||  ||||| ||||| |||  ||||| |||||||| |||||    
T  15144567 tctctgtttgcccttatcagcaggggcgctataaggcttagggcgactctgctggcccttag-tcttccgctcattcacgaccttgtaatgagccttggt 15144469  T
Q  398 gtcctcctcgtagatcct 415  Q
     ||||||||||| |||||    
T  15144468 atcctcctcgtaaatcct 15144451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0765 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 1)
Name: scaffold0765
Description:

Target: scaffold0765; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 18 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 6420 - 5963
Alignment:
Q  18 tcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattac 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  6420 tcattagtagtctgtgtaccagtcaaagcaaatacctttccaccagttctaaccttcttctgttgtgtgcactgagtactgatgtggccctattcgttac 6321  T
Q  118 aattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttact 217  Q
    ||||||||||| ||| ||| || ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6320 aattatagcatacaatatcgccacgcttacaatcagctagcacgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttact 6221  T
Q  218 cttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtca 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||| || |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  6220 cttgtggcctttctcgccacacttaaaacaaactatctcgacaggagcatctctcctattcggcctcctctcatcattcagtctttgcttacccttgtca 6121  T
Q  318 gcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 417  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |    
T  6120 gcaggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacctcttcgttcactcatcactttataatgagctttggtgtcctcctcataaatcctgc 6021  T
Q  418 cgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgat 475  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  6020 aatgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatggctctcttgat 5963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 290; Significance: 1e-162; HSPs: 22)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 18 - 475
Target Start/End: Original strand, 22054041 - 22054498
Alignment:
Q  18 tcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattac 117  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || |    
T  22054041 tcattagtagtctgcgtaccagtcaaagcaaacacttttccaccagttctatccttcttcggctgtgtgcactgtgtactgatatggccctcttcgttgc 22054140  T
Q  118 aattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttact 217  Q
    | ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||  | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22054141 agttataacatacaacatcaccacgcttgcaatccgctaaaaggtgacccttctgaccacatctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacattact 22054240  T
Q  218 cttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtca 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22054241 cttgtggcctttctcgccacacttaaaacaaactatctcagcagaagcatctctcctattcggcctcctctcatcattaagtctctgcttacccttatca 22054340  T
Q  318 gcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 417  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  22054341 gcaggggcactgtacggcttaggacgactctgccgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcacagatcctgc 22054440  T
Q  418 cgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgat 475  Q
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  22054441 aacgactcaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatggctctcttgat 22054498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 18 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 22027883 - 22027423
Alignment:
Q  18 tcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattac 117  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||      
T  22027883 tcattagtagtctgcgtaccggtcaatgcaaacacttttccaccggttctaaccttcttcggctgtgtgcactgagaactgatatggccctcttcattgt 22027784  T
Q  118 aattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttact 217  Q
    | ||||||||  |||| || || | ||| ||||| ||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  22027783 agttatagcaaacaacgtctcccctcttacaatcagctaatgtgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctttggtacaaacattact 22027684  T
Q  218 cttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtca 317  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||| || | |||| |||||||||||| | ||| ||||| |||||||||    
T  22027683 cttgtggcctttatcgccacacttgtaacaaactatctcagcaggagcatctctcctattgggcctcctctcatcattcaatctttgctttcccttgtca 22027584  T
Q  318 gcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 417  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |    
T  22027583 gcaggggcactgtacggtttaggacgactctgctgtcccttaccacttcgctcactcatcaccttataatgatcttttgtgtcctcctcatagatcctgc 22027484  T
Q  418 cgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  22027483 aacgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttgataccctatggctctcttgatgtc 22027423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 105 - 475
Target Start/End: Original strand, 21928693 - 21929063
Alignment:
Q  105 ccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttgg 204  Q
    |||||||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||||||  | |   |||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||    
T  21928693 ccctcttcatcacaattatagcaaacgacatcaccacgcttgcaatcacccaaagtgtgtcctttctgtccacatctgaaacacttcttctcatc-tcgg 21928791  T
Q  205 t-acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctct 303  Q
    | ||  || ||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| |  ||||||| ||||||||| ||| | || |||| |||||||||||| || ||||    
T  21928792 tcacttacattactctcgtggcccttttcgccacacttgaaacaaagaatctcagtaggagcatctctcctcctaggcctcctctcatcattcagcctct 21928891  T
Q  304 gcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctc 403  Q
    | || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  21928892 gttttcctttgtcagcaggagcactatacggtttaggacgactctgttgtcccttacctctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttggtatcctc 21928991  T
Q  404 ctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgat 475  Q
     || ||||| |||| ||  |||||||| ||||| ||| |||| ||||  || || || ||||||||||||||    
T  21928992 ttcatagattctacagctgcttaccaattcagaaaaatttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 21929063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 102 - 436
Target Start/End: Original strand, 22374131 - 22374465
Alignment:
Q  102 tgaccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatcct 201  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||| ||||   |||| || |||| ||||||||| || |||||||| |||||      
T  22374131 tgaccttcttcatcacaattatagcaaacaatatcaccacgcttgcaatcagctaatgtgtgtcctttctttccacacctaaaacacttcttttcatcac 22374230  T
Q  202 tggtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtct 301  Q
     |  ||| || |||||||||||| |||| || |||||||| ||||| || ||||||| ||||| ||| ||| | || |||| |||||| |||||||||||    
T  22374231 ggtcacatacattactcttgtggtctttttcaccacacttgaaacagacaatctcagtaggagaatctctcctcctaggcctcctctcctcattaagtct 22374330  T
Q  302 ctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcc 401  Q
     || ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  22374331 ttgtttacctttgacagcaggggcactatacggtttcggacgactctactgtcccttacctctgcgctcactcatcaccttataatgagcttttgtatcc 22374430  T
Q  402 tcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcaga 436  Q
    ||||  |||||||||| || ||| |||||||||||    
T  22374431 tcctgatagatcctacagctactcaccaaatcaga 22374465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 26 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 16268819 - 16268367
Alignment:
Q  26 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||  |  ||||| | |||||| ||||||||| |||| ||||| |||    
T  16268819 agtctgcgtaccagtcaaagcaaacacttttccaccagttctagccttcttcggctcaggacactgtgaactgatatgaccctctccattgcaattgtag 16268720  T
Q  126 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggc 225  Q
    ||  ||| ||| || |||||||| || |||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||| |||||||||||||    
T  16268719 cagacaatatccccacgcttgcattcagctaggctatgacccttctgaccacacctgaagcacttcctctcatctttaccacaaacattactcttgtggc 16268620  T
Q  226 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggc 325  Q
    ||||||| ||||||||  |||| || ||||||| ||||||||| |||||  | |||| ||| |||||| | |   ||||||| || ||||||||| | ||    
T  16268619 ctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagaaggagcatctctcttcttaggcctcctgtcatcactcatcttctgctttcctttgtcagcaagagc 16268520  T
Q  326 actatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgactt 425  Q
    ||| || || |||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| |  || ||||||||||||||||| || || || || ||||  | | |     
T  16268519 actgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcattatattgtaatgagctttggtgtcttcttcataaattctacaactatta 16268420  T
Q  426 accaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
    ||||| |||||||| | ||| ||||| || || || |||||||| ||||||||    
T  16268419 accaactcagagaagactctgatctgctgatacccaatagcccttttgatgtc 16268367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 31414135 - 31413703
Alignment:
Q  18 tcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattac 117  Q
    ||||||| ||||||  |||||||||| ||||| ||||| |||||   |||| ||||||||| ||| || ||||| | |||||| ||||| ||||| || |    
T  31414135 tcattagtagtctgcataccagtcaatgcaaacactttcccaccggttctagccttcttcgactgagtacactgtgaactgatatgaccttcttcgttgc 31414036  T
Q  118 aattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttact 217  Q
    | || |||||  |||  || || ||||| || || |||||  |||| || ||||| |||||||| || |||||| |||||||  |   |||| | || ||    
T  31414035 agttgtagcaaacaatgtccccacgcttacattcagctagtgtgtgtcctttctgaccacacctaaaacacttcctctcatctctaccacaagcattgct 31413936  T
Q  218 cttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtca 317  Q
    ||| |||||||| || |||||||| ||||| || || ||| |||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  31413935 cttatggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatttcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctctcatcattcattctctgctttcccttgtca 31413836  T
Q  318 gcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 417  Q
    |||||||| || || |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |    
T  31413835 gcaggggcgctgtaaggtttaggacgactctgctgtcccttaccccttcgctcactcatcattttgtaatgagctttggtgtcttcctcatatatcctgc 31413736  T
Q  418 cgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatct 450  Q
     ||   ||||||| | |||||||||| ||||||    
T  31413735 agctgtttaccaacttagagaaaattttaatct 31413703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 105 - 436
Target Start/End: Original strand, 19985445 - 19985776
Alignment:
Q  105 ccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttgg 204  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||| || | ||||||||| ||||   |||| |  ||||||||||| |||||  |||||||||||||   |     
T  19985445 ccctcttcatcacaattatagcaaacaacatccccactcttgcaatcagctaatgtgtgtcatttctgtccacatctgaaatacttcttctcatcacggt 19985544  T
Q  205 tacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctg 304  Q
     ||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||| ||| |  | |||| |||||||||| | |  |||||    
T  19985545 cacatacattactcttgtggcttttttcgccacacttgaaacaaacaatctcagtaggagcatctctcctcttaggcctcctctcatcaatcatcctctg 19985644  T
Q  305 cttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcc 404  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||| | |||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||     
T  19985645 tttacccttgtccgcaggggcactatacggcttcggacgactctgctatcccttgccactgcgctcactcatcaccttgtaatgagctttggtatcctct 19985744  T
Q  405 tcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcaga 436  Q
    || || |||||||  |  ||||||||||||||    
T  19985745 tcatatatcctacaactgcttaccaaatcaga 19985776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 417
Target Start/End: Original strand, 28984089 - 28984488
Alignment:
Q  18 tcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattac 117  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||  |||||||||||  |  ||||| | |||||| ||||| ||  |||| |    
T  28984089 tcattaggagtctgtgtaccagtcagagcaaacacctttccaccaattctagtcttcttcggctcaggacactgtgaactgatatgaccttccccattgc 28984188  T
Q  118 aattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttact 217  Q
    | || || ||  |||  || || |||||||| || ||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||  |   |||||| |||||    
T  28984189 agttgtaacagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctcttccacaaacattact 28984288  T
Q  218 cttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtca 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||| || |||||| | |||||||| ||| |  | |||| ||| ||||||   |  |||||||| ||||||||     
T  28984289 cttgtggcctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcaactggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcctctgctttcccttgtcc 28984388  T
Q  318 gcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 417  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| | ||| ||||||||||||||||| || || || |||||||    
T  28984389 gcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcataatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcataaatcctac 28984488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 26 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 29301021 - 29300597
Alignment:
Q  26 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 125  Q
    |||||| ||||| ||||| | ||| ||||| ||||| |  ||| ||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||    
T  29301021 agtctgcgtacccgtcaatgaaaacactttcccaccgatcctagccttcttcggctgagtacactgagaactgatatgaccttcttcattgcagttatag 29300922  T
Q  126 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggc 225  Q
     |  |||  || || ||||| || || |||||  |||| ||  |||| |||||||| || |||||| | |||||  |   |||| | || ||||||||||    
T  29300921 tagacaatgtccccacgcttacattcagctagtgtgtgtcctctctgaccacacctaaaacacttcctttcatctctaccacaagcattgctcttgtggc 29300822  T
Q  226 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggc 325  Q
    || | || |||||||||||||| || || ||||| ||| |||| | | |  | |||| ||| |||||||| |   ||||||| || ||||||||||| ||    
T  29300821 ctctttcaccacacttaaaacaaacaatttcagcgggaacatctcccctcttgggcctcctatcatcattcatcttctgcttccctttgtcagcaggagc 29300722  T
Q  326 actatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgactt 425  Q
    ||| || |||||||||||| ||| |||||||||||| || | ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| | ||  |||    
T  29300721 actgtaaggtttaggacgactctaatgtcccttacccctcctctcactcattaccttgtaatgagcttttgtgtcctcctcatatatcctgcagctgctt 29300622  T
Q  426 accaaatcagagaaaattctaatct 450  Q
    || || |||||||||| ||||||||    
T  29300621 actaactcagagaaaactctaatct 29300597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 213 - 405
Target Start/End: Original strand, 22523883 - 22524075
Alignment:
Q  213 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttaccct 312  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  || | ||||| |||||| ||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||| ||| || || ||||    
T  22523883 ttactcctgtggcctttctcgccacaagtatagcacacaatctcaacaggagcatctttcttcctaggccgcctctcatcattaactctttgttttccct 22523982  T
Q  313 tgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcct 405  Q
    | |||||||||||||| || || || |||||| |||| || || || ||| |||||||| |||  | ||| |||||||| || || |||||||    
T  22523983 tatcagcaggggcactgtaaggctttggacgactctgctgacctttgccttttcgctcattcacaatcttgtaatgagccttagtatcctcct 22524075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 206 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 30310559 - 30310353
Alignment:
Q  206 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 305  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || || || |||||||||||| ||||  | |||||||| |||||    | ||||||     
T  30310559 acaaacattactcttgtggcctttctcgccacagttgaaacaaacaatatccgcaggagcatccttcttctttggccgcctatcatcgaccattctctgt 30310460  T
Q  306 ttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcc 404  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| || |||||   |||| |||||| |||  ||||| |||||||| || || ||||||    
T  30310459 ttgcccttatcagcaggggcactataaggtttagggcgactctgctgaccctt-ggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcctcc 30310361  T
Q  405 tcgtagat 412  Q
    ||||||||    
T  30310360 tcgtagat 30310353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 206 - 478
Target Start/End: Original strand, 15536749 - 15537021
Alignment:
Q  206 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 305  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |  ||||| | |||||||||| ||||  | |||||||| |||||    | |||||||    
T  15536749 acaaacattactcttgtggccttcttcgccacaattaaaacaaataatctccgaaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgc 15536848  T
Q  306 ttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcc 404  Q
    || ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||| |||| || |||||   |||| |||||| |||  ||||| |||||||| ||  | || |||    
T  15536849 ttgcccttatcggcaggggcactataaggcttagggcgactctgctggccctt-ggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttactatcttcc 15536947  T
Q  405 tcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
    ||||||||||| | || | | || ||||||| ||||| || ||  ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  15536948 tcgtagatcctgcagctattcactaaatcagggaaaactcgaagttgttggtatccgatcgccctcttgatgtc 15537021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 206 - 478
Target Start/End: Original strand, 22043193 - 22043465
Alignment:
Q  206 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 305  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||    |||||||  ||||||||| ||||  | |||||||| |||||    | ||||||     
T  22043193 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaaacaagtaatctcagttggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgt 22043292  T
Q  306 ttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcc 404  Q
    || |||||||||| |||||||||||| || |||||  || |||| || |||||   |||| |||||| |||  ||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  22043293 ttgcccttgtcagtaggggcactataaggcttagggtgactctgctggccctt-ggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcctcc 22043391  T
Q  405 tcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
    || || ||||| |  | | | |||||||||| ||||| ||  |||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  22043392 tcataaatcctgcatctattaaccaaatcagggaaaactcggatctgttggtatccgatcgccctcttaatgtc 22043465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 206 - 478
Target Start/End: Original strand, 32603511 - 32603783
Alignment:
Q  206 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 305  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||| || ||||| || || || | |||||||||| ||||  | || ||||| |||||    | |||||||    
T  32603511 acaaacattactcttgtggcctttcccaccacagttgaaacaaacaatttccgaaggagcatccttcttcttaggtcgcctatcatcgaccattctctgc 32603610  T
Q  306 ttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcc 404  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||| || ||||||  |||| | |||| | |  ||||| ||||||||| |||| |||||     
T  32603611 ttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgctggccctta-gtcttcctctcattaacaaccttgtaatgagctctggtatcctct 32603709  T
Q  405 tcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
    ||||||||||||| ||   | |||||||||| ||||| ||  |  ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  32603710 tcgtagatcctacagctgttcaccaaatcagggaaaactcggagttgttgatatccgatcgccctcttgatgtc 32603783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 21163935 - 21163877
Alignment:
Q  216 ctcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctctt 274  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  21163935 ctcttgtggtctttctcgccacaattaaaacagacaatctcagcaggagcatccttctt 21163877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 213 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 21391269 - 21391199
Alignment:
Q  213 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccg 283  Q
    |||||||||||||||||||| |||||   |||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  21391269 ttactcttgtggcctttctcaccacaagaaaaacaaacaatctcagcaggagcatccttcttcctcggccg 21391199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 213 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 21780595 - 21780525
Alignment:
Q  213 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccg 283  Q
    |||||||||||||||||||| |||||   |||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  21780595 ttactcttgtggcctttctcaccacaagaaaaacaaacaatctcagcaggagcatccttcttcctcggccg 21780525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 301 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 19481395 - 19481335
Alignment:
Q  301 tctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacc 361  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||    
T  19481395 tctgtttacccttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttacc 19481335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 66 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 6607024 - 6606849
Alignment:
Q  66 ctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgac 165  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| | |||||  || || ||||||| ||||||  ||||  ||| ||| || |||||||| || |||| | | || |    
T  6607024 ctaaccttcttaggctgtgtacactgtgaactgagatgtccttcttcatcacaattgaagcaaacaatatccccacgcttgcattcagctatcgtatgcc 6606925  T
Q  166 ccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacactt 241  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||||| ||     | ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  6606924 ccttctttccacatcggaagcacttcttctcctcaccattgcaaacattactcttgtggcccttctcaccacactt 6606849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 81
Target Start/End: Original strand, 28989308 - 28989371
Alignment:
Q  18 tcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggct 81  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||  |||||||||||    
T  28989308 tcattaggagtctgtgtaccagtcagagcaaacacctttccaccaattctagtcttcttcggct 28989371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 478
Target Start/End: Original strand, 18860049 - 18860212
Alignment:
Q  315 tcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcc 414  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| ||  | | |||| |||  ||||| || ||||| || || ||||| || |||||||    
T  18860049 tcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcc 18860148  T
Q  415 taccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
    ||| || | | |||||||| |  |||| ||| | ||||||||| || || ||||||||||||||    
T  18860149 tacagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 18860212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 366 - 403
Target Start/End: Original strand, 20391612 - 20391649
Alignment:
Q  366 cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctc 403  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  20391612 cgctcactcataaccttataatgagctttggtatcctc 20391649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 18 - 475
Target Start/End: Original strand, 203522 - 203979
Alignment:
Q  18 tcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattac 117  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||    
T  203522 tcattagtagtctgcgtaccagtcaaagcaaacacttttccactagttctaaccttcttcgactgtgtgcactgtgtactgatatggccctcttcgttac 203621  T
Q  118 aattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttact 217  Q
    | ||||| ||| ||||||||||   ||||||||| ||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  203622 agttataacatacaacatcaccatccttgcaatccgctaaaaggtgacccttctgaccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacattact 203721  T
Q  218 cttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtca 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||   |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  203722 cttgtggcctttctcgccacacttaaaacaaactatctcaccaggagcatctctcctaacgggcctcctctcatcattcagtctctgcttacccttgtca 203821  T
Q  318 gcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 417  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  203822 gcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcatagatcctgc 203921  T
Q  418 cgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgat 475  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  203922 aacgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtaccctatggctctcttgat 203979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 478
Target Start/End: Original strand, 424746 - 424909
Alignment:
Q  315 tcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcc 414  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||| | || |||||||| ||  | |||||| ||| || ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| |    
T  424746 tcagcaggggcattgtacggcttaggacgactatgctgtcccttgcccttccgctcattcaccatcttgtaatgagccttggtatcctcctcatagattc 424845  T
Q  415 taccgcgacttaccaaat-cagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
    | | || | | ||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  424846 tgcagctattaaccaaatccaga-aaaactctaatctgttgatatccaatcgccctcttaatgtc 424909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 18 - 475
Target Start/End: Original strand, 263367 - 263824
Alignment:
Q  18 tcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattac 117  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||    
T  263367 tcattagtagtctgcgtaccagtcaaagcaaacacttttccactagttctaaccttcttcgactgtgtgcactgtgtactgatatggccctcttcgttac 263466  T
Q  118 aattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttact 217  Q
    | ||||| ||| ||||||||||   ||||||||| ||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  263467 agttataacatacaacatcaccatccttgcaatccgctaaaaggtgacccttctgaccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacattact 263566  T
Q  218 cttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtca 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||   |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  263567 cttgtggcctttctcgccacacttaaaacaaactatctcagcaggagcatctctcctaacgggcctcctctcatcattcagtctctgcttacccttgtca 263666  T
Q  318 gcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 417  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |    
T  263667 gcaggggcactgtacggcttaagacgactctgctgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgaactttggtgtcctcctcatagatcctgc 263766  T
Q  418 cgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgat 475  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  263767 aacgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtaccctatggctctcttgat 263824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 17 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 9951 - 9491
Alignment:
Q  17 atcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcatta 116  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || | |||||| ||     
T  9951 atcattagtagtctgcgtaccagtcaaagcaaacacttttccaccagttctaaccttcttcggcagtgtgcactgtgtactgatatggcactcttcgttg 9852  T
Q  117 caattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttac 216  Q
    || ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||  | |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9851 cagttataacatacaacatcaccacgcttgcaatccgctaaaaggtgacccttctaaccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacattac 9752  T
Q  217 tcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtc 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||   |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  9751 tcttgtggcctttctcgccacacttaaaacaaactatctcagcaggagcatctctcctaacgggcctcctctcatcattaagtctcagcttacccttatc 9652  T
Q  317 agcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatccta 416  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  9651 agcaggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcatagatcctg 9552  T
Q  417 ccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
    |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||    
T  9551 caacgacttaccaaatc-gagaaaattctaatctgttggtacactatggctctcttgatgtc 9491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 2)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 18 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 17647 - 17187
Alignment:
Q  18 tcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattac 117  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| || |    
T  17647 tcattagtagtctgcgtaccagtcaaagcaaacattttcccaccagttctaaccttcttcggctgtgtacactgagtactgatatggccctcttcgttgc 17548  T
Q  118 aattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttact 217  Q
    |||| || ||| |||||||||| ||| || |||| ||||   |||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17547 aattgtaacatacaacatcaccacgcatgtaatccgctaatgtgtgacccttttgatcacacctaaagcacttcttctcatccttggtacaaacattact 17448  T
Q  218 cttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtca 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||| ||||| || || |||||||||    
T  17447 cttgtggcctttctcgccacacttataacaaactatctcagcaggagcatctctcctattcggcctcctctcatcattcagtctttgttttcccttgtca 17348  T
Q  318 gcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 417  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  17347 gcaggggcactgtacggtttaggacgactctgctgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagcttttgtgtcctcctcatagatcctgc 17248  T
Q  418 cgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
      ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  17247 aacgatttaccaaatcagagaagattctaatctgttgctaccctatggctctcttgatgtc 17187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 38 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 4992 - 4567
Alignment:
Q  38 agtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaacatca 137  Q
    |||||||||||| |||||||||||   |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||| || || || ||||| ||| ||||||||    
T  4992 agtcaaagcaaacacttttccaccggttctaaccttcctcggctgtgtacactgagtactgatatggccctcctcgttgcagttataacatacaacatca 4893  T
Q  138 ccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccac 237  Q
    || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  4892 ccacgcttgcaatcagctaacatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatctttggtacaaacattactcttgtggcctttctggccac 4793  T
Q  238 acttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggttt 337  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| || | |||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  4792 acttataacagactatctcagcaggagcatctctcctatttggcctcctctcatcattcagtctttgctttcccttgtcaaaaggggcactgtacggttt 4693  T
Q  338 aggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagag 437  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||     |||||||||||| ||||    
T  4692 aggacgactctgctgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgaggttttgtgtcctcctcatagattctgaaatgacttaccaaattagag 4593  T
Q  438 aaaattctaatctgttggtatcctat 463  Q
    || ||||||||||||||||| |||||    
T  4592 aagattctaatctgttggtaccctat 4567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 26 - 478
Target Start/End: Original strand, 40207 - 40659
Alignment:
Q  26 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || || |||||     
T  40207 agtctgcgtaccagtcaaagcaaacactttcccaccggttctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatatggccctcttcgttgcagttataa 40306  T
Q  126 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggc 225  Q
    ||| |||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  40307 catacaacatcacaacgcttgcaatccgctaacatgtgacccttctaaccacacctgaagcacttcttatcatctttggtacaaacattactcttgtggc 40406  T
Q  226 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggc 325  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  40407 ctttctcgccacacttataacagactatctcagcaggagcatctctcctattcggcctcctctcatcattcagtctttgctttcccttgtcagcaggggc 40506  T
Q  326 actatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgactt 425  Q
    ||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| || |  ||||||    
T  40507 actgtacggtttaggacgactctgttgtcccatacctcttcgctcactcatcaccttataatgagcttttgtgtcctctttatagattctgcaacgactt 40606  T
Q  426 accaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
    ||||||| |||||| |||||||| | |||||| ||||| || |||||||||||    
T  40607 accaaattagagaagattctaatatattggtaccctatggctctcttgatgtc 40659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 18 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 64765 - 64305
Alignment:
Q  18 tcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattac 117  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||| | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||| | ||| || || |||||||||| ||    
T  64765 tcattagtagtctgcgtaccagccaaagcaaacactttcctaccagttctaaccttcttcggttgtgtgcactgtgaactaatatggccctcttcatcac 64666  T
Q  118 aattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttact 217  Q
    ||||||||||  | |||||||| ||||||||||  |||||  |||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  64665 aattatagcaaactacatcaccacgcttgcaattagctagtgtgtgtcctttctgaccacacctgaaacatttcttctcatccttggtacaaacattact 64566  T
Q  218 cttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtca 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  64565 cttgtggcctttctcgccacacttgtaacaaactatctcagcaggagcatccctcctattcggcctcctttcatcattcagtctctgctttcccttgtca 64466  T
Q  318 gcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 417  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |    
T  64465 gccggggcactatacggtttaggacgactctgctgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagcttttgagtcctcctcatatatcctgc 64366  T
Q  418 cgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  64365 aacgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttgataccctatggctctcttgatgtc 64305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 18 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 49343 - 48883
Alignment:
Q  18 tcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattac 117  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||| | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||| | ||| || || |||||||||| ||    
T  49343 tcattagtagtctgcgtaccagccaaagcaaacactttcctaccagttctaaccttcttcggttgtgtgcactgtgaactaatatggccctcttcatcac 49244  T
Q  118 aattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttact 217  Q
    ||||||||||  | |||||||| ||||||||||  |||||  |||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  49243 aattatagcaaactacatcaccacgcttgcaattagctagtgtgtgtcctttctgaccacacctgaaacatttcttctcatccttggtacaaacattact 49144  T
Q  218 cttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtca 317  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  49143 cttgtggcccttctcgccacacttgtaacaaactatctcagcaggagcatccctcctattcggcctcctttcatcattcagtctctgctttcccttgtca 49044  T
Q  318 gcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 417  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |    
T  49043 gccggggcactatacggtttaggacgactctgctgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagcttttgagtcctcctcatatatcctgc 48944  T
Q  418 cgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||||||    
T  48943 aacgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgctgataccctatggctctcttgatgtc 48883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 18 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 58377 - 57917
Alignment:
Q  18 tcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattac 117  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||| | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||| | ||| || || |||||||||| ||    
T  58377 tcattagtagtctgcgtaccagccaaagcaaacactttcctaccagttctaaccttcttcggttgtgtgcactgtgaactaatatggccctcttcatcac 58278  T
Q  118 aattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttact 217  Q
    ||||||||||  | |||||||| ||||||||||  |||||  |||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  58277 aattatagcaaactacatcaccacgcttgcaattagctagtgtgtgtcctttctgaccacacctgaaacatttcttctcatccttggtacaaacattact 58178  T
Q  218 cttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtca 317  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  58177 cttgtggcccttctcgccacacttgtaacaaactatctcagcaggagcatccctcctattcggcctcctttcatcattcagtctctgctttcccttgtca 58078  T
Q  318 gcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 417  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |    
T  58077 gccggggcactatacggtttaggacgactctgctgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagcttttgagtcctcctcatatatcctgc 57978  T
Q  418 cgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||||||    
T  57977 aacgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgctgataccctatggctctcttgatgtc 57917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 439
Target Start/End: Original strand, 29765 - 30186
Alignment:
Q  18 tcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattac 117  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||||||||| || || |||||    |||||||||||||| || || ||||| | |||||| ||||| || ||||| |    
T  29765 tcattaactgtctgcgtaccagtcaaagcaaacaccttaccacctgtcctaaccttcttcggttgcgtacactgcgaactgatatgaccttcctcattgc 29864  T
Q  118 aattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttact 217  Q
    || |||| ||  | |  || || | ||| ||||| |||||  |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |   ||||||||||||    
T  29865 aaatataacaaacgatgtccccacacttacaatcagctagagtgtgtcccttttgaccacacctgaagcacttcttctcatctctatcacaaacgttact 29964  T
Q  218 cttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtca 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||| |||| |||| ||| |  | |||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  29965 cttgtggcctttctcaccacacttgaagcaaactatgtcagtaggaacatctctcctcttgggcctcctctcatcatttaaactctgcttacccttgtca 30064  T
Q  318 gcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 417  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  30065 gcaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttcgtgtcctcctcataaatcctac 30164  T
Q  418 cgcgacttaccaaatcagagaa 439  Q
     ||  |||||||||||||||||    
T  30165 agctgcttaccaaatcagagaa 30186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1914 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold1914
Description:

Target: scaffold1914; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 165 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 1246 - 936
Alignment:
Q  165 cccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggag 264  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||    
T  1246 cccttctgtccacatctgaaacacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtgacctttctcgccacacttaaagcatactatctcagcagaag 1147  T
Q  265 catccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctct 364  Q
    || || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1146 cacccttcttactcggcctcctctcatcattaagtctctgcttacccttatcagccggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctct 1047  T
Q  365 tcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctata 464  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||     
T  1046 tcgctcactcttcaccttataatgagctttggtgtcctcctcatagatcctgcagcgactcaccaaattagagaaaattctgatctgttggtatcctatg 947  T
Q  465 gccctcttgat 475  Q
    |||||||||||    
T  946 gccctcttgat 936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 18 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 650 - 218
Alignment:
Q  18 tcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattac 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||| |    
T  650 tcattagtagtctgtgtaccagtcaatgcaaacactttcccatcggttctaaccttcttcggctgtgtgcactgtgaactgatatggccctcttcattgc 551  T
Q  118 aattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttact 217  Q
    | ||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||  |||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  550 agttatagcaaacaacatcaccacgcttgcaatcagctaggctgtgtcctttctgaccacacctgaaacacttcttctcatccttggtacaaacatcact 451  T
Q  218 cttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtca 317  Q
    |||||||||||||  |||||| ||  |||| || ||||||||||||||||| ||| || | |||| |||||||||||| | | ||||||| |||||||||    
T  450 cttgtggcctttcctgccacatttgtaacaaacgatctcagcaggagcatctctcctattgggcctcctctcatcattcaatatctgctttcccttgtca 351  T
Q  318 gcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 417  Q
    ||||||||||| ||||| |||||  || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  350 gcaggggcactgtacggcttagggtgactctgttgtcccttacctcttcgttcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 251  T
Q  418 cgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatct 450  Q
      | ||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  250 aactactcaccaaatcagagaagattcttatct 218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 33 - 394
Target Start/End: Original strand, 20970 - 21331
Alignment:
Q  33 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 132  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||   ||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||  | ||||| ||||| || ||||||||    |    
T  20970 gtaccagtcagagcaaacactttaccaccggttctaaccttcttcggttgtgtacactgtgaactgatacggccctcctcattgcagttatagcaaatta 21069  T
Q  133 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctc 232  Q
      || || ||||| |||||  |||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21070 tgtctccccgcttacaatcaactaatgtgtgtcccttctgtccacacctgaagcacttcttctcacctttagtacaaacattactcttgtggcctttctc 21169  T
Q  233 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatac 332  Q
     ||||||||  | || || |||||||||| |||||| ||| |  | |||| |||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  21170 accacacttgtagcaaacaatctcagcagaagcatctctcctcttgggcctcctctcatcattcagcctctgttttcctttgtcagcaggggcactatac 21269  T
Q  333 ggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagcttt 394  Q
    |||||||||||| |||  |||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21270 ggtttaggacgactctactgtcccttgcctttacgctcactcatcaccttgtaatgagcttt 21331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 18 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 53586 - 53126
Alignment:
Q  18 tcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattac 117  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||| |||||| || | |||||| || |||||||||||||    
T  53586 tcattagtagtctgcgtaccagtcaatgcaaatactttcccaccggttctaaccttcttcggctatgtgcattgtgaactgatatggccctcttcattac 53487  T
Q  118 aattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttact 217  Q
    | ||||| ||| | || ||||| |||||||||||  |||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  53486 agttataacataccacgtcaccacgcttgcaatcaactaggatgtgtcctttttgaccacacctgaatcatttcttctcatccttagtacaaacattact 53387  T
Q  218 cttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtca 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| || ||| ||||| ||||||| ||| || | |||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  53386 cttgtggcctttctcgccacacttgtaacaaacgatcccagcaagagcatctctcctattgggcctcctctcatcattcaatctctgctttcccttgtca 53287  T
Q  318 gcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 417  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |    
T  53286 gcaggggcactgtatggtttaggacgaacttgatgtcccttatctcttcgctcactcatcaccttataatgagccttggtgtcttcctcatatatcctgc 53187  T
Q  418 cgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
     || ||| |||||||| ||||| |||||||||| ||| || || || || |||||||||||    
T  53186 agctactcaccaaatccgagaagattctaatcttttgatacccaatggctctcttgatgtc 53126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 18 - 478
Target Start/End: Original strand, 22263 - 22723
Alignment:
Q  18 tcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattac 117  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||| |   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |    
T  22263 tcattagtagtctgagtaccagtcaatgcaaacactataccaacggttctaaccttcttcggctgtgtgcactgagaactgatatggccctcttcattgc 22362  T
Q  118 aattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttact 217  Q
    | ||||||||  |||||||||| |||||||||||  ||||  |||| || ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||    
T  22363 agttatagcaaacaacatcaccacgcttgcaatcaactagggtgtgtcctttctgaccacacttgaagcatttcttctcatccttagtaaaaacattact 22462  T
Q  218 cttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtca 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||| |||||||||| ||| || | |||| |||||||||||| ||||| || || || |||||     
T  22463 cttgtggcctttctcgccacacttgtaacaaacgatctcaacaggagcatctctcctattgggcctcctctcatcattcagtctttgatttcctttgtcg 22562  T
Q  318 gcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 417  Q
    ||||||||||| || ||||||||| || |||  ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |    
T  22563 gcaggggcactgtatggtttaggaagactctactgtcccttaccccttcgcccactcatcaccatataatgagcttttgtgtcctcctcatagattctgc 22662  T
Q  418 cgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
     || |||||||||||||||||||||||| ||||  || || || || || |||||||||||    
T  22663 agctacttaccaaatcagagaaaattcttatcttctgatacccaatggctctcttgatgtc 22723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 4)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 135 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 11952 - 11609
Alignment:
Q  135 tcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctcgc 234  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11952 tcaccacgcttgcaatcagctagagtgtgtcctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctttagtacaaacattactcttgtggcctttctcgc 11853  T
Q  235 cacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacgg 334  Q
    |||||||  |||| || ||||||| ||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||    
T  11852 cacacttgtaacaaacgatctcagtaggagcatctctcctcttgggcctcctctcatcattaagtctctgctttcctttgtcagcaggagcactatatgg 11753  T
Q  335 tttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatca 434  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| || || ||||| | ||  ||||||||||||    
T  11752 tttaggacgactctgctgtcccttacctcttctctcactcatcaccttataatgagccttagtgtcctcttcatatatcctgcagctgcttaccaaatca 11653  T
Q  435 gagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
    ||||||||| |||||| ||| || ||||| || |||||||||||    
T  11652 gagaaaattttaatcttttgataccctatggctctcttgatgtc 11609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 33 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 2100 - 1683
Alignment:
Q  33 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 132  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||    |||||||||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||| || ||||| || ||||||||  |||    
T  2100 gtaccagtcagagcaaacactttaccaccggtcctaaccttcttcggttgtgtacactgcgaactgatatgaccttcctcattgcagttatagcaaacaa 2001  T
Q  133 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctc 232  Q
    | || || ||||| ||||| ||||   |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||   |||||| ||||||||||||||||||||    
T  2000 cgtctccccgcttacaatcagctaatgtgtgtcctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctttatcacaaacattactcttgtggcctttctc 1901  T
Q  233 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatac 332  Q
     ||||||||  | || || || ||||||||||||||  || |  | |||| |||||||||||| || ||||| || || ||||||||||| ||||||||     
T  1900 accacacttgtagcaaacaatttcagcaggagcatctatcctcttgggcctcctctcatcattcagcctctgttttcctttgtcagcaggagcactatat 1801  T
Q  333 ggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaat 432  Q
    ||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || || || || || ||| | | || ||| |||||||    
T  1800 ggtttaggatgactctgctgtcccttacctctgcgctcactcatcaccttgtaatgagctttagtatcttcttcatatatcatgctgctactcaccaaat 1701  T
Q  433 cagagaaaattctaatct 450  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  1700 cagagaaaattcttatct 1683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 26 - 322
Target Start/End: Original strand, 70521 - 70817
Alignment:
Q  26 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 125  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||  ||| |||||||| || || |||||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| |||||     
T  70521 agtctgcgtaccagtcaaaacaaatacttttcctccagttctgaccttcttaggttgcgtgcactgtgaactaatgtggccctcctcattacagttataa 70620  T
Q  126 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggc 225  Q
    ||  ||| ||| || |||||||| || || | ||  ||||| || || || || ||||| |||||||||||||| ||||| || || |||| ||||||||    
T  70621 caaacaatatctccacgcttgcattcagccaacacatgacctttatgaccgcatctgaaacacttcttctcatctttggtgcagacattacccttgtggc 70720  T
Q  226 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcagg 322  Q
    ||||| | ||||||||  |||| || |  ||| |||||||||| |||   || ||||||||||||||||| | ||| || || || |||||||||||    
T  70721 ctttcgcaccacacttgtaacaaacaacatcaacaggagcatctctccccctaggccgcctctcatcattcaatctttgttttcctttgtcagcagg 70817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 122141 - 121885
Alignment:
Q  216 ctcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgt 315  Q
    |||||||||||||| || ||||| || |||||    |||||||| ||||||||| ||||  | |||||||| |||||    | |||||| || ||||| |    
T  122141 ctcttgtggcctttttcaccacaattgaaacaagtaatctcagctggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttat 122042  T
Q  316 cagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcct 415  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||| |||  || ||||||    | |||||| | |  ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  122041 cagcaggggcactatagggcttagggcgactctattggcccttagtcgtccgctcatttacaaccttgtaatgagccttggtatcctcctcatagattct 121942  T
Q  416 accgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctctt 472  Q
     | || | | ||||| ||||  |||| ||  |||||||||||||| || ||||||||    
T  121941 gcagctattcaccaactcaggaaaaactcggatctgttggtatccgattgccctctt 121885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 30)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 26 - 478
Target Start/End: Original strand, 18797674 - 18798126
Alignment:
Q  26 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 125  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||   |||||||||||| || || |||||||| | |||||| || || || ||||| || ||||||    
T  18797674 agtctgcgtaccagtcaatgcaaacactttcccaccggttctaaccttctttggttgagtgcactgtgaactgatatggccttcatcattgcagttatag 18797773  T
Q  126 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggc 225  Q
    ||  |||| ||||| ||||||||||| |||||  |||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||| || || ||||| |||||||||||||    
T  18797774 caaacaacgtcaccacgcttgcaatcagctagagtgtgtcccttctgaccacacctgaaacatttctgctcatctttagtgcaaacattactcttgtggc 18797873  T
Q  226 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggc 325  Q
    ||||||||||||||||| |||| || || ||  |||||||||||||| |  | |||| |||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  18797874 ctttctcgccacacttataacaaacaatatccacaggagcatccctcctcttgggcctcctctcatcattcaatctttgctttcccttgtcagcaggagc 18797973  T
Q  326 actatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgactt 425  Q
    ||||||||| || |||||| |||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||  |||||||| || ||||| || | || ||||    
T  18797974 actatacggcttcggacgactctgctgtcccttgcctctgcggtcactcatcaccttgtaatgagcttctgtgtcctcttcatagattctgcagctactt 18798073  T
Q  426 accaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
    ||||| ||||||||  |||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  18798074 accaactcagagaagtttctgatcttctggtatccaatagccctcttgatgtc 18798126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 20 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 21567294 - 21566878
Alignment:
Q  20 attagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaa 119  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| |||||| ||||| |||||||| | ||||||||| ||||| | || ||||    
T  21567294 attagtagtctgcgtaccagtcaaagcaaacacttttccaccggttctaatcttctttggctgagtgcactgggaactgatgtggccctccttatcacaa 21567195  T
Q  120 ttatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactct 219  Q
    ||||| ||  |||||||||| | |||||| |  || |   |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |    
T  21567194 ttataacaaacaacatcacccctcttgcagttagccaatgtgtgtcctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctttagtacaaacattacttt 21567095  T
Q  220 tgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagc 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| |  | ||||  ||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||    
T  21567094 tgtggcctttctcgccacacttaaagcaaactatttcagcaggagcatctctcctcttgggccttctctcatcattcagtcgttgctttcccttgtcagc 21566995  T
Q  320 aggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccg 419  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||| |  || ||||| ||||| |||| |    
T  21566994 aggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttactcctccgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgaatcttcctcatagattctacag 21566895  T
Q  420 cgacttaccaaatcaga 436  Q
    |  |||||||| |||||    
T  21566894 ctgcttaccaactcaga 21566878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 14377213 - 14376800
Alignment:
Q  26 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 125  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||| || || | ||||||||| ||||||||||| || |||||     
T  14377213 agtctgcgtaccagtcaatgcaaacacttttccaccggttctaaccttcttcggctgtgtacattgcgaactgatgtggccctcttcattgcagttataa 14377114  T
Q  126 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggc 225  Q
    ||  |||||||||| ||||| ||||  ||||   |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  14377113 caaacaacatcaccacgcttacaattagctaaagtgtgtcctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctttagtacaaacattactcttgtggc 14377014  T
Q  226 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggc 325  Q
    ||||||| || |||||  | || || |  ||| |||||||||| ||| || | || | |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||    
T  14377013 ctttctcaccgcacttgtagcaaacaacatcaacaggagcatctctcctattgggtctcctctcatcattcaacctctgttttcccttgtcagcaggagc 14376914  T
Q  326 actatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgactt 425  Q
    ||||||||| || |||||| |||| |||||||| |  ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| | || |||     
T  14376913 actatacggcttcggacgactctgctgtcccttgctccttcgatcactcatcaccttgtaatgagctttcgtgtcctcctcatagatcctgcagctacta 14376814  T
Q  426 accaaatcagagaa 439  Q
    ||||| ||||||||    
T  14376813 accaattcagagaa 14376800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 33 - 436
Target Start/End: Original strand, 19437993 - 19438396
Alignment:
Q  33 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 132  Q
    |||||||||| |||||| || || |||| |   |||||||||||||||||||||||||| | |||||| || | |||||| || || ||||| ||| |||    
T  19437993 gtaccagtcagagcaaacaccttaccactagtcctaaccttcttcggctgtgtgcactgcgaactgatatggcgctcttcgttgcagttataacatacaa 19438092  T
Q  133 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctc 232  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||  |||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  19438093 catcaccacgcttgcaatcagctagagtgtgtcctttctgaccacacctgaaacacttattctcatctttagtacaaacattactcaagtggcctttctc 19438192  T
Q  233 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatac 332  Q
     ||||||||  |||  || ||||||||||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  19438193 accacacttgtaacgaacgatctcagcaggagcatctctcctcttgggcctcctctcatcatttaacctctgcttacccttgtcagcaggagcactatat 19438292  T
Q  333 ggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaat 432  Q
    || || |||||| |||| |||||||||||||| |  |||||||  ||||| |||| ||| || || ||||| || |||||||||| ||  |||||||| |    
T  19438293 ggcttcggacgactctgctgtcccttacctctcctttcactcactaccttgtaataagccttcgtatcctcttcatagatcctacagctgcttaccaact 19438392  T
Q  433 caga 436  Q
    ||||    
T  19438393 caga 19438396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 33 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 34642876 - 34642517
Alignment:
Q  33 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 132  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||| |||||    |||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||  |||| || || |||||| |||    
T  34642876 gtaccagccaaggcaaacactttcccaccggtcctaaccttcttcggttgagtgcactgagaactgatatgaccctccccattgcagttgtagcatacaa 34642777  T
Q  133 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctc 232  Q
     |||||| || || ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  34642776 tatcaccacgtttacaatcagctaacacgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatctttggtacaaacattacttttgtggcccttctc 34642677  T
Q  233 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttact--cggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactat 330  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||  || || |  ||   || | ||| |||||||| ||||  ||||| |||||  ||||||| |||||||    
T  34642676 gccacacttaaagcaaactatctccgcaggagtgtctct-tcccttggggtctcctttcatcattcagtcgttgctttcccttaccagcaggagcactat 34642578  T
Q  331 acggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagc 391  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||| || || || |||||||||||||| ||||||||    
T  34642577 acggcttaggacgactctgttgtcccttgcccctccgttcactcatcaccttgtaatgagc 34642517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 66 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 24515671 - 24515343
Alignment:
Q  66 ctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgac 165  Q
    |||||| || |||| || || ||||| | |||||||||||| || ||||| || ||||| ||  ||||||| || | ||| ||||| |||||  |||| |    
T  24515671 ctaaccgtcctcggttgcgtacactgcgaactgatgtgaccttcctcattgcagttataacaaacaacatctcccctcttccaatcagctagtgtgtgtc 24515572  T
Q  166 ccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagc 265  Q
      ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || || ||| |||||||    
T  24515571 ttttctgaccacacctgaaacacttcttctcatctttagtacaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttataacaaacaatatcaacaggagc 24515472  T
Q  266 atccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt 365  Q
    ||| ||| |  | |||| |||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||     
T  24515471 atctctcctcttgggcctcctctcatcattcagcctctgttttcccttgtcagcaggagcactatatggtttaggacgactctgttgtcccttgcctctg 24515372  T
Q  366 cgctcactcatcaccttataatgagcttt 394  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||    
T  24515371 cggtcactcatcaccttgtaatgagcttt 24515343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 217 - 468
Target Start/End: Original strand, 25771019 - 25771270
Alignment:
Q  217 tcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtc 316  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||| ||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  25771019 tcttgtggcctttttcaccacacttgaaacagacaatctcagtaggagcatctctcctcttaggcctcctctcatcattcagcctctgtttacctttgtc 25771118  T
Q  317 agcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatccta 416  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||| || || ||||||    
T  25771119 agcaggagcactatacggttacggacgactctgttgtcccttacctctgcgctcactcatcactctataatgagcttttgtatcctcttcataaatccta 25771218  T
Q  417 ccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccc 468  Q
    | ||  |||||||| ||||| ||| | || |||| |||||| || |||||||    
T  25771219 cagctgcttaccaactcagaaaaattccttatcttttggtagccaatagccc 25771270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 69 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 10466102 - 10465696
Alignment:
Q  69 accttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgaccct 168  Q
    |||||||||||||| || ||||| | ||| || ||||| |||||||| || ||||||||  |||  || || ||||| || || |||||  |||| ||||    
T  10466102 accttcttcggctgagtacactgtgaactaatatgaccttcttcattgcagttatagcagacaatgtccccacgcttacattcagctagggtgtgtccct 10466003  T
Q  169 tctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatc 268  Q
    |||| |||||||| || || ||| |||||||  |   |||| | || |||||||||||||| || ||||||||  |||| || |||||||||||| ||||    
T  10466002 tctgaccacacctaaaacatttcctctcatctctaccacaagcattgctcttgtggcctttttcaccacacttgtaacagacaatctcagcaggaacatc 10465903  T
Q  269 cctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgc 368  Q
     ||| |  | |||| ||| |||||||| | | ||||||| |||||||||||| | ||| | || || ||||||||| |||| ||||||||||| || | |    
T  10465902 tctcctcttgggcctcctatcatcattcattttctgctttcccttgtcagcaagagcattgtaaggcttaggacgactctgctgtcccttacccctcctc 10465803  T
Q  369 tcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccc 468  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| | ||  || ||||| |||||||||| ||||||||  || || ||||||||||    
T  10465802 tcactcatcaccttgtaatgagcttttgtgtcttcctcatatatcctgcagctgctcaccaactcagagaaaactctaatcttctgataccctatagccc 10465703  T
Q  469 tcttgat 475  Q
    |||||||    
T  10465702 tcttgat 10465696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 85 - 349
Target Start/End: Original strand, 21474643 - 21474907
Alignment:
Q  85 tgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaa 184  Q
    ||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||| |||||  ||| |||||| |||||||| || || |   |||| || ||||  ||||| | |||    
T  21474643 tgcactgagaactaatatgaccctcttcatcacaattgtagcacacaatatcaccacgcttgcactcagccaatgtgtgtcctttcttcccacatcggaa 21474742  T
Q  185 gcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgc 284  Q
     ||||||||||||||   |  ||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||| ||||||||| ||| | || |||| |    
T  21474743 acacttcttctcatcacggtcacatacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatctcagtaggagcatctctcctcctaggcctc 21474842  T
Q  285 ctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctg 349  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||    
T  21474843 ctctcatcattcagcatctgcttacccttgtcagcaggagcactatacggcttcggacgactctg 21474907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 400
Target Start/End: Original strand, 24367376 - 24367758
Alignment:
Q  18 tcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattac 117  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| || || ||||||  ||||   |||||||| |  | |||||| | ||| || ||||| ||| |||| |    
T  24367376 tcattaggagtctgcgtaccagtcaaagcaaacaccttcccaccagttctagttttcttcggttcagggcactgtgaactaatatgaccttctccattgc 24367475  T
Q  118 aattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttact 217  Q
    |||| || ||  |||  || || |||||||| || ||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||  |   |||||| |||||    
T  24367476 aattgtaacagacaatgtccccccgcttgcattcagctaaactgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctcttccacaaacattact 24367575  T
Q  218 cttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtca 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  | || || |||||| || ||||||| ||| |  | |||| ||| ||||||   |   ||||||| || ||||||    
T  24367576 cttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacatgagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgtca 24367675  T
Q  318 gcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 400  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  24367676 gcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtc 24367758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 177 - 391
Target Start/End: Original strand, 19456158 - 19456372
Alignment:
Q  177 cacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttac 276  Q
    |||||||||||||||||||||||  |   ||| || ||||||||||||||||| || |||||||| || || || ||||||| ||||| ||| ||| |      
T  19456158 cacctgaagcacttcttctcatctctatcacagacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaagcaaacaatctcagtaggagtatctctcctct 19456257  T
Q  277 tcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcat 376  Q
    | |||| |||||||||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||     
T  19456258 tgggcctcctctcatcattcagcctttgttttcctttgtcagcaggagcactatatggtttaggacgactctgttgtcccttacctctgcgttcactcac 19456357  T
Q  377 caccttataatgagc 391  Q
    || ||| ||||||||    
T  19456358 cagcttgtaatgagc 19456372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 177 - 391
Target Start/End: Original strand, 19466303 - 19466517
Alignment:
Q  177 cacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttac 276  Q
    |||||||||||||||||||||||  |   ||| || ||||||||||||||||| || |||||||| || || || ||||||| ||||| ||| ||| |      
T  19466303 cacctgaagcacttcttctcatctctatcacagacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaagcaaacaatctcagtaggagtatctctcctct 19466402  T
Q  277 tcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcat 376  Q
    | |||| |||||||||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||     
T  19466403 tgggcctcctctcatcattcagcctttgttttcctttgtcagcaggagcactatatggtttaggacgactctgttgtcccttacctctgcgttcactcac 19466502  T
Q  377 caccttataatgagc 391  Q
    || ||| ||||||||    
T  19466503 cagcttgtaatgagc 19466517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 26 - 478
Target Start/End: Original strand, 15462320 - 15462772
Alignment:
Q  26 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 125  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||  ||| |||||||| || || |||||||| | ||| ||||| ||||| |||  ||| |||||     
T  15462320 agtctgcgtaccagtcaaggcaaatacttttcctccagttctgaccttcttaggttgcgtgcactgcgaactaatgtggccctcctcaccacagttataa 15462419  T
Q  126 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggc 225  Q
    ||  | | ||| || |||||||| || || | ||  ||||| ||||| || || ||||| || |||||||||||  |||| || || |||||||||||||    
T  15462420 cacacgatatctccccgcttgcactcagccaacacatgacctttctgaccgcatctgaaacatttcttctcatctctggtgcagacattactcttgtggc 15462519  T
Q  226 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggc 325  Q
    ||||| | ||||||||  ||||||| |  ||| ||||||  || |||   || ||| ||||||||||||| | |||||| || || |||| |||||| ||    
T  15462520 ctttcgcaccacacttgtaacacacaacatcaacaggagtctctctccctctaggctgcctctcatcattcaatctctgtttgcctttgttagcaggagc 15462619  T
Q  326 actatacggtttaggacgattctgatgtccctta--cctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgac 423  Q
    ||| || || || || ||| |    || ||||||  |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||| || ||    
T  15462620 actgtagggcttcgggcgactactctgacccttattcctcttc--tcactcatcaccttgtaatgagctttcgtatcctcctcataaatcctacagctac 15462717  T
Q  424 ttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
    | ||||| || |||||||| || ||||  || ||||| || || |||||||||||    
T  15462718 tcaccaactccgagaaaatcctgatcttctgatatccaatggctctcttgatgtc 15462772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 206 - 472
Target Start/End: Original strand, 21764976 - 21765242
Alignment:
Q  206 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 305  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||| ||||  | |||||||| |||||    | |||||      
T  21764976 acaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacagacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctaa 21765075  T
Q  306 ttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcct 405  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||| || |||| |    | | |||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21765076 ttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggccctcagtgttccactcattcacaaccttgtaatgagctttggtgtcctcct 21765175  T
Q  406 cgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctctt 472  Q
    | |||||  ||| ||   | ||||||||||  |||| ||  |||||||||||||| || ||||||||    
T  21765176 catagattttacagctgttcaccaaatcagcaaaaactcggatctgttggtatccaattgccctctt 21765242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 206 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 30678141 - 30677932
Alignment:
Q  206 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 305  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||  | || || | ||||||||||| |||  |||| || |||| |||||||||||| |  || |||    
T  30678141 acaaacattactcttgtggctcttctcaccacacttgtagcaaacaacctcagcaggagtatctttctttctaggcctcctctcatcattcaccctttgc 30678042  T
Q  306 ttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcct 405  Q
    ||||  || |||||||| ||  | || || || ||||||||||| || | |||||| || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| || ||||    
T  30678041 ttacatttatcagcaggagcgttgtaaggctttggacgattctgctgactcttacccctccgctcactcataaccttgtaattagctttggtatcttcct 30677942  T
Q  406 cgtagatcct 415  Q
    | ||||||||    
T  30677941 catagatcct 30677932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 213 - 321
Target Start/End: Original strand, 23081594 - 23081702
Alignment:
Q  213 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttaccct 312  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  || |||| || |||||| ||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||| || |    
T  23081594 ttactcttgtggcctttctcaccacaagtataacaaacaatctcaacaggagcatctttcttcctaggccgcctctcatcattaactctttgctttcctt 23081693  T
Q  313 tgtcagcag 321  Q
    | |||||||    
T  23081694 tatcagcag 23081702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 315 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 5836239 - 5836076
Alignment:
Q  315 tcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcc 414  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||  | |||||| |||    ||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  5836239 tcagcaggggcactatacggcttaggacgactctgttgtcccttgcccttccgctcattcacagtcttgtagtgagctttggtatcctcttcgtaaatcc 5836140  T
Q  415 taccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
    | | || | | |||||||| |  |||| |||||||| |||||| || || |||||||| |||||    
T  5836139 tgcagctattaaccaaatccggaaaaactctaatctattggtacccaatcgccctcttaatgtc 5836076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 315 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 22829397 - 22829234
Alignment:
Q  315 tcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcc 414  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| ||  | | |||  |||  | |||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  22829397 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttgcccttcctctcgttcacaatcttatagtgagccttggtatcctcttcatagatcc 22829298  T
Q  415 taccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
    | | || | | |||||||| |  |||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  22829297 tgcagctattgaccaaatctggaaaaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 22829234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 218 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 25756720 - 25756523
Alignment:
Q  218 cttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtca 317  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||| ||||  | |||||||| |||||    | |||||| || ||||| |||    
T  25756720 cttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatca 25756621  T
Q  318 gcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcct 415  Q
     |  |||||||||| || ||||| ||| |||| || ||||||  |||| || ||| | | |||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  25756620 actagggcactatagggcttagggcgactctgctggccctta-gtcttccggtcattaaccaccttgtaatgagctcgggtgtcctcctcatagatcct 25756523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 391
Target Start/End: Original strand, 19881639 - 19881745
Alignment:
Q  285 ctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttat 384  Q
    ||||||||||| ||||  ||||| |||||  |||||||||| || ||||| ||||||||| | || ||| |||| || || || |||||||||||||| |    
T  19881639 ctctcatcattcagtcgttgctttcccttaccagcaggggcgctgtacggcttaggacgactttgttgttccttgcccctccgttcactcatcaccttgt 19881738  T
Q  385 aatgagc 391  Q
    |||||||    
T  19881739 aatgagc 19881745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 372 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 20010452 - 20010346
Alignment:
Q  372 ctcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctct 471  Q
    |||||||||||||||||||| || || |||||||| || || |||| || ||| ||||| || ||||||||||| ||||  || ||||| || || ||||    
T  20010452 ctcatcaccttataatgagcctttgtatcctcctcataaattctacagctactcaccaattctgagaaaattctgatcttctgatatccaatggctctct 20010353  T
Q  472 tgatgtc 478  Q
    |||||||    
T  20010352 tgatgtc 20010346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 366 - 436
Target Start/End: Original strand, 21474908 - 21474978
Alignment:
Q  366 cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcaga 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||| ||  |||||||| |||||    
T  21474908 cgctcactcatcaccttataatgagcttttgtatcctcttcataaatcctacagctgcttaccaattcaga 21474978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 284 - 412
Target Start/End: Original strand, 18660161 - 18660289
Alignment:
Q  284 cctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcacctta 383  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||| ||||| || || || |||||| | || || | ||||||| | | ||||||||   ||||     
T  18660161 cctctcatcattaaccctctgctcacccttatcagcaggagcactgtaaggctttggacgactttgctgactcttacctttcctctcactcacagccttg 18660260  T
Q  384 taatgagctttggtgtcctcctcgtagat 412  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||    
T  18660261 taatgagctttcgtatcctcctcatagat 18660289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 292
Target Start/End: Original strand, 22437043 - 22437119
Alignment:
Q  216 ctcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatc 292  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||| ||||| ||||  | |||||||| |||||    
T  22437043 ctcttgtggcctttctcaccacaattaaagcagacaatctcagcaggaacatccttcttcttaggccgcctatcatc 22437119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 301 - 361
Target Start/End: Original strand, 28312886 - 28312946
Alignment:
Q  301 tctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacc 361  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||    
T  28312886 tctgtttacctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttacc 28312946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 366 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 19486251 - 19486200
Alignment:
Q  366 cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 417  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  19486251 cgctcactcataaccttgtaatgagctttggtatcctcttcgtagattctac 19486200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 27559132 - 27559045
Alignment:
Q  160 tgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaaca 247  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||| | ||||  | ||||||  ||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  27559132 tgtgacccttcttgccacaccggaaacacttcttcacctcctcaggacaaacagtactcttgtggcctttctcaccacaattgaaaca 27559045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 211 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 24292894 - 24292844
Alignment:
Q  211 cgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcag 261  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  24292894 cgttgctcttgtggcctttctcgccacaattgaaacacacaatctctgcag 24292844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 268
Target Start/End: Original strand, 16813805 - 16813866
Alignment:
Q  207 caaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatc 268  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  | || || |||||||||||| ||||    
T  16813805 caaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcagcaggatcatc 16813866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 207 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 8720821 - 8720733
Alignment:
Q  207 caaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcatt 295  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  | || || |||||| ||||| |||| ||| |  | |||| ||||||||||||    
T  8720821 caaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcatcaggatcatctctcctcttaggcctcctctcatcatt 8720733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 155; Significance: 4e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 30 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 98734 - 98328
Alignment:
Q  30 tgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatc 129  Q
    ||||||||||||| |||||| || || ||||||   |||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| || || ||||| |||     
T  98734 tgtgtaccagtcagagcaaacaccttaccaccagtcctaaccttcttcggctgtgtgcactgcgaactgatatggccctcttcgttgcagttataacata 98635  T
Q  130 caacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggccttt 229  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||  |||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  98634 caacatcaccacgcttgcaatcagctagagtgtgtcctttctgaccacacctgaaacacttcttctcatctttagtacaaacattactcttgtggccttt 98535  T
Q  230 ctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcacta 329  Q
    ||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||| |||    | |||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  98534 ctcgccacacttgtaacaaacgatctcagcaggagcatctctccacttgggcctcctctcatcatttaacctctgcttacccttgtcagcatgagcacta 98435  T
Q  330 tacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttacca 429  Q
    || || || |||||| |||| |||||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| || | |||||||| ||  |||||||    
T  98434 tatggcttcggacgactctgttgtcccttacctctcctttcactcattaccttgtaatgagccttcgtatcctcttcattgatcctacagctgcttacca 98335  T
Q  430 aatcaga 436  Q
    | |||||    
T  98334 actcaga 98328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 102 - 434
Target Start/End: Original strand, 176212 - 176544
Alignment:
Q  102 tgaccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatcct 201  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||   |||| || |||| ||||||||| || ||||||||||||||      
T  176212 tgaccttcttcatcacaattatagcaaacaacatcaccacgcttgcaatcagctaatgtgtgtcctttctttccacacctaaaacacttcttctcatcac 176311  T
Q  202 tggtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtct 301  Q
     |  ||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||| | || |||| |||||||||||| |||||    
T  176312 ggtcacatacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacagacaatctctgtaggagcatctctcctcctaggcctcctctcatcattcagtct 176411  T
Q  302 ctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcc 401  Q
    ||| ||| | ||||  ||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  176412 ctgtttaactttgttggcaggagcactatacggtttcggacgactctgctgtcccttacctctacgctcactcatcaccttataatgagcttttgtatcc 176511  T
Q  402 tcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatca 434  Q
    || || |||||||||| || ||| |||||||||    
T  176512 tcttcatagatcctacagctactcaccaaatca 176544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 26 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 8617 - 8204
Alignment:
Q  26 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 125  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||   ||||||||||||||| ||  ||||||| | |||||| || |||| |||||| || |||||     
T  8617 agtctgcgtaccagtcaatgcaaacactttcccaccggttctaaccttcttcggttgattgcactgcgaactgatatggccctattcattgcagttataa 8518  T
Q  126 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggc 225  Q
    ||  |||| ||||| ||||||||||| |||||  |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  8517 caaacaacgtcaccacgcttgcaatcagctagagtgtgtcccttctgaccacacctgaaacacttcttctcatccttagtacaaacattactcttgtggc 8418  T
Q  226 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggc 325  Q
    | ||||||||||||||| |||| || || ||| || ||||||| ||| |  | || | |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||    
T  8417 cattctcgccacacttataacaaacaatatcaacatgagcatctctcctcttgggtctcctctcatcattcagcctctgctttcccttgtcagcaggagc 8318  T
Q  326 actatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgactt 425  Q
    ||||||||| || |||||| |||| |||||||| || || || |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||| || | || ||||    
T  8317 actatacggcttcggacgactctgttgtcccttgcccctgcggtcactcatcaccttgtaatgagctttcatgtcctcctcatagattctgcagcaactt 8218  T
Q  426 accaaatcagagaa 439  Q
    ||||| ||||||||    
T  8217 accaattcagagaa 8204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 26 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 18831 - 18418
Alignment:
Q  26 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 125  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||   ||||||||||||||| ||  ||||||| | |||||| || |||| |||||| || |||||     
T  18831 agtctgcgtaccagtcaatgcaaacactttcccaccggttctaaccttcttcggttgattgcactgcgaactgatatggccctattcattgcagttataa 18732  T
Q  126 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggc 225  Q
    ||  |||| ||||| ||||||||||| |||||  |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  18731 caaacaacgtcaccacgcttgcaatcagctagagtgtgtcccttctgaccacacctgaaacacttcttctcatccttagtacaaacattactcttgtggc 18632  T
Q  226 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggc 325  Q
    | ||||||||||||||| |||| || || ||| || ||||||| ||| |  | || | |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||    
T  18631 cattctcgccacacttataacaaacaatatcaacatgagcatctctcctcttgggtctcctctcatcattcagcctctgctttcccttgtcagcaggagc 18532  T
Q  326 actatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgactt 425  Q
    ||||||||| || |||||| |||| |||||||| || || || |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||| || | || ||||    
T  18531 actatacggcttcggacgactctgttgtcccttgcccctgcggtcactcatcaccttgtaatgagctttcatgtcctcctcatagattctgcagcaactt 18432  T
Q  426 accaaatcagagaa 439  Q
    ||||| ||||||||    
T  18431 accaattcagagaa 18418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 147; Significance: 3e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 105 - 439
Target Start/End: Original strand, 7266 - 7600
Alignment:
Q  105 ccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttgg 204  Q
    |||||||||| | | ||||| ||  |||||||||| ||||||||||| |||||  |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  7266 ccctcttcatcatagttataacaaacaacatcaccacgcttgcaatcagctagagtgtgtcctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctttag 7365  T
Q  205 tacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctg 304  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||| ||| || | |||| |||||||||||| |  |||||    
T  7366 tacaaacattactcttgtggcctttctcgccacacttgtaacaaacaatctcagcaggagcatctctcctattgggcctcctctcatcattcaacctctg 7465  T
Q  305 cttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcc 404  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||| |||| ||||| || |  ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  7466 cttacccttgtcaacaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtcctttgctccttcgatcactcatcaccttgtaatgagctttcgtgtcctcc 7565  T
Q  405 tcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaa 439  Q
    || ||||| || | || ||||||||| ||||||||    
T  7566 tcatagattctgcagctacttaccaattcagagaa 7600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 143; Significance: 6e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 33 - 439
Target Start/End: Original strand, 54203 - 54609
Alignment:
Q  33 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 132  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||     |||||||| ||||| ||||||||| | |  ||||| |||||||||||||| || ||||| ||  |||    
T  54203 gtaccagtgaaagcaaacactttaccactggtcctaacctttttcggttgtgtgcaccgtgagctgatatgaccctcttcattgcagttataacaaacaa 54302  T
Q  133 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctc 232  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  54303 catcaccacgcttgcaataagctagagtgtgtcccttctgaccacacctgaaacacttcttctcatctttagtacaaacattactcttgtggcctttctc 54402  T
Q  233 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatac 332  Q
    |||||||||  |||| || ||||||||| ||||||  |   || | |||| |||||||||||| |  |||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  54403 gccacacttgtaacaaacgatctcagcaagagcatttcatctattgggcctcctctcatcattcaacctctgcttccctttgtcagcaggagcactatac 54502  T
Q  333 ggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaat 432  Q
    || || |||||| |||||||||| || |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| || | || ||||||||| |    
T  54503 ggctttggacgactctgatgtcctttgctccttcgatcactcatcaccttataatgagctttcatgtcctcctcatagattctgcagctacttaccaatt 54602  T
Q  433 cagagaa 439  Q
    |||||||    
T  54603 cagagaa 54609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 142; Significance: 3e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 33 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 5357 - 4912
Alignment:
Q  33 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 132  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||   ||||||||||||||| | ||| ||||  | |||||| || ||||| ||||| || ||||||||  |||    
T  5357 gtaccagtcagagcaaacactttaccaccggttctaaccttcttcggttatgtacactatgaactgatatggccctcctcattgcagttatagcaaacaa 5258  T
Q  133 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctc 232  Q
    |||| |  ||||| ||||| ||||   |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||| || ||||||||||||||||| ||    
T  5257 catctctccgcttacaatcagctaaagtgtgtcccttctgaccacacctgaagcacttcttctcatccttatcacagacattactcttgtggcctttttc 5158  T
Q  233 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatac 332  Q
    |||||||||  | || || ||||||||||||||||| ||| | || |||| |||||||| ||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  5157 gccacacttgtagcaaacaatctcagcaggagcatctctcctcctaggccacctctcattattcagcctttgctttcccttgtcagcaggagcactatat 5058  T
Q  333 ggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaat 432  Q
    |||||||||||| |||  | ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||| | | || ||| ||||| |    
T  5057 ggtttaggacgactctactttcctttacctcttcgttcactcatcaccttgtaatgagctttagtgtcttcctcatatatcatgcagctactcaccaatt 4958  T
Q  433 cagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
    ||||||||||||||||||  || || || || || |||||||||||    
T  4957 cagagaaaattctaatcttctgatacccaatggctctcttgatgtc 4912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 142; Significance: 3e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 708 - 251
Alignment:
Q  18 tcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattac 117  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||   ||||| |||||| ||||| |||||||| | ||||||||| ||||| |||| ||    
T  708 tcattagtagtctgcgtaccagtcaacgcaaacactttcccaccggttctaatcttctttggctgagtgcactgtgaactgatgtggccctcctcatcac 609  T
Q  118 aattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttact 217  Q
    ||||||| ||  ||||||||   | |||||| |  || |   |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  608 aattataacaaacaacatcattcctcttgcagttagccaatgtgtgtcctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctttggtacaaacattact 509  T
Q  218 cttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtca 317  Q
     |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||| |  | || |  ||||||||||| || |  ||||| |||||||||    
T  508 tttgtggcctttctcgccacacttaaagcaaactatctcagtaggagcatctctcctcttgggtcttctctcatcattcagccgttgctttcccttgtca 409  T
Q  318 gcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 417  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |  || ||||||||||| || |    
T  408 gcagggggactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccctccgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgaatcttcctcgtagattctgc 309  T
Q  418 cgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgat 475  Q
     ||  |||||||| ||||| ||| |||| ||||  || || || || |||||||||||    
T  308 agctgcttaccaactcagaaaaagttctgatcttctgatagccaatggccctcttgat 251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 142; Significance: 3e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 33 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 164549 - 164132
Alignment:
Q  33 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 132  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||   |||||||||||||||||| ||  | || | |||||| || || |||||||| || ||||| ||  |||    
T  164549 gtaccggtcaatgcaaacactttcccaccggttctaaccttcttcggctgagtataatgcgaactgatatggccttcttcattgcagttataacaaacaa 164450  T
Q  133 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctc 232  Q
    ||| ||| |||||||||||  |||   |||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  164449 cattaccacgcttgcaatcaactaaagtgtgtcctttctgaccacacctgaaacacttcttctcatccttagaacaaacattactcttgtggcctttctc 164350  T
Q  233 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatac 332  Q
    |||||||||  |||| || |||||||||||||| || ||| || | |||| |||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||     
T  164349 gccacacttgtaacaaacgatctcagcaggagcgtctctcctattgggcctcctctcatcattcaacctctgttttcccttgtcagcaggggcactgtat 164250  T
Q  333 ggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaat 432  Q
    | |||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| || ||||| | || ||| ||||| |    
T  164249 gatttaggacgactctgctgtcctttacctcttcgttcactcatcaccttgtaatgagctttcgtgttctcctcatatatcctgcagctactcaccaact 164150  T
Q  433 cagagaaaattctaatct 450  Q
    | ||||||||||| ||||    
T  164149 cggagaaaattctgatct 164132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 30539 - 30472
Alignment:
Q  216 ctcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccg 283  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  30539 ctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaatctcagcaggagcatccttcttccttggccg 30472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1299 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold1299
Description:

Target: scaffold1299; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 22 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 2007 - 1635
Alignment:
Q  22 tagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaatt 121  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||   ||||| |||||| ||||| |||||||| | ||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  2007 tagcagtctgcgtactagtcaaagcaaacactttcccaccggttctaatcttctttggctgagtgcactgggaactgatgtggccctcctcatcacaatt 1908  T
Q  122 atagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttg 221  Q
    ||| ||  |||||||||| | |||||| |  || |   |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  1907 ataacaaacaacatcacccctcttgcagttagccaatgtgtgtcctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctttggtacaaacattacttttg 1808  T
Q  222 tggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcag 321  Q
    ||||||||||||||||||||| | || | ||| ||||||| |||||| ||| |  | ||||  ||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||    
T  1807 tggcctttctcgccacacttatagcaaattatttcagcagtagcatctctcctcttgggccttctctcatcattcagtcgttgctttcccttgtcagcag 1708  T
Q  322 gggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagcttt 394  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||| | ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1707 gggcactgtacggcttaggacgactctgttttcccttacccctccgctcactcatcaccttgtaatgagcttt 1635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 84 - 478
Target Start/End: Original strand, 15279 - 15673
Alignment:
Q  84 gtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctga 183  Q
    |||||||| | |||||| || ||||||||||| || ||||| ||  |||||||||| ||||||||||| |||||  |||| |  ||||| ||||||||||    
T  15279 gtgcactgtgaactgatatggccctcttcattgcagttataacaaacaacatcaccacgcttgcaatcagctagagtgtgtcatttctgaccacacctga 15378  T
Q  184 agcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccg 283  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || |  ||||||||||||||||| ||| || | ||||     
T  15379 agcacttcttctcgtccttagtacaaacattactcttgtggcctttctcgccacacttatagcagaaaatctcagcaggagcatctctcctattgggcct 15478  T
Q  284 cctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcacctta 383  Q
    |||||||||||| |  |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||||| || |   |||| ||||||||||||||     
T  15479 cctctcatcatttaacctctgctttcgcttgtcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgttgtcctttgctcattcgatcactcatcaccttg 15578  T
Q  384 taatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||| || | || ||||||||| ||||||||| |||| ||||  || || || || || |||||||||||    
T  15579 taatgagctttcgtttcctcctcatagattctgcagctacttaccaattcagagaaatttctgatcttctgatacccaatggctctcttgatgtc 15673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 33 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 39481 - 39038
Alignment:
Q  33 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 132  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||    |||||||||||||  ||||| ||||| | ||||||  |||| || ||||| || ||||||||  |||    
T  39481 gtaccagtcagagcaaacactttaccaccggtcctaaccttcttcgattgtgtacactgcgaactgatacgaccttcctcattgcagttatagcaaacaa 39382  T
Q  133 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctc 232  Q
    |||| || ||||| ||||  ||||   |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||   |||||| ||||||||||||||||||||    
T  39381 catctccccgcttacaattagctaatgtgtgtcctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctttatcacaaacattactcttgtggcctttctc 39282  T
Q  233 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatac 332  Q
     ||||||||  | || || ||||||||||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  39281 accacacttgtagcaaacaatctcagcaggagcatctctcctcttgggcctcctctcatcattcagcctctgctttcccttgtcagcaggagcactatat 39182  T
Q  333 ggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaat 432  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| || ||||| | || ||| ||||| |    
T  39181 ggtttaggaagactctgctgtcccttacctcttcgttcactcatcaccttgtaatgagctttagtatcttcctcatatatcctgcagctactcaccaact 39082  T
Q  433 cagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
    |  |||||||||||||||  ||||| || || || |||||||||||    
T  39081 c--agaaaattctaatcttctggtacccaatggctctcttgatgtc 39038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 206 - 478
Target Start/End: Original strand, 14753 - 15025
Alignment:
Q  206 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 305  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||| ||||  | |||||| | |||||    | ||||||     
T  14753 acaaacattactcttgtggccattctcgccacacttgaaacaaacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcatatcatcgaccattctctgt 14852  T
Q  306 ttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcc 404  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||| || |||||   |||| |||||| |||  ||||  |||||||| ||||| || |||    
T  14853 ttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgctggccctt-ggtcttccgctcattcacaacctagtaatgagccttggtatcttcc 14951  T
Q  405 tcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
    |||||||| || | || | | || |||||||  |||| ||  |||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  14952 tcgtagattctgcagctattcactaaatcaggaaaaactcggatctgttggtatccgatcgccctcttaatgtc 15025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 135; Significance: 4e-70; HSPs: 3)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 33 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 62920 - 62478
Alignment:
Q  33 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 132  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||    ||||| ||||| ||||| || ||||| | |||||| ||||| | ||||||||| || ||| |  |||    
T  62920 gtaccagtcaaagcaaacactttgccacctgtcctaactttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttattcattacagttgtagaaaacaa 62821  T
Q  133 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctc 232  Q
    |||| || ||||| ||||| ||||   ||||  | ||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |  ||| || ||||||||||||||||||||    
T  62820 catccccacgcttacaatcagctaaagtgtgtactttctgaccacacctaaagcacttcttctcatcatggtcacatacattactcttgtggcctttctc 62721  T
Q  233 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatac 332  Q
     |||||||| ||  | || || |||| ||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  62720 accacacttgaattaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttaggcctcctctcatcattcaatctctgcttacccttgtcagcaggggcactatac 62621  T
Q  333 ggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaat 432  Q
    || || |||||| |||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| | || ||||||||| |    
T  62620 ggcttcggacgactctgctgccccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttggtatcctcttcatatatcctgcagctacttaccaact 62521  T
Q  433 cagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgat 475  Q
    |||||||| | || |||| ||| || || ||||||||||||||    
T  62520 cagagaaattccttatcttttgatagccaatagccctcttgat 62478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 26 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 65453 - 65211
Alignment:
Q  26 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 125  Q
    |||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||    ||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||| || || |||| |||||||||     
T  65453 agtctgcgtaccagtcaatgcatacacttttccaccggtcctaaccttctttggctgggtgcactgtgaactgatgtggccttcctcatcacaattataa 65354  T
Q  126 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggc 225  Q
    ||  ||||||| || | ||| ||||  || | | |||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  65353 caaacaacatctcctctcttacaattagccaacgtgtgtcctttctgaccacacctgaagcactttttctcatctttggtacaaacattactcttgtggc 65254  T
Q  226 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatc 268  Q
    ||||||||||||||||  |||| || | |||||||||||||||    
T  65253 ctttctcgccacacttgtaacaaacaacctcagcaggagcatc 65211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 289 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 65214 - 65058
Alignment:
Q  289 catcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatg 388  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || ||| |||| ||||| |||   |||| ||||||||||||||| |||||    
T  65214 catcattcagtctctgcttgcccttatcagcaggggcactatatggcttcgggcgactctgttgtccattattccttctctcactcatcaccttgtaatg 65115  T
Q  389 agctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattct 445  Q
    |||||| || ||||| || || || || | || ||| ||||| ||||||||| ||||    
T  65114 agcttttgtatcctcttcataaattctgcagctactcaccaactcagagaaatttct 65058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 33 - 475
Target Start/End: Original strand, 70264 - 70706
Alignment:
Q  33 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 132  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||    ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| || || || || |||||||| || |||||  |||    
T  70264 gtaccagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactaatatgtccttcctcattacagttgtagcaaacaa 70363  T
Q  133 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggt-acaaacgttactcttgtggcctttct 231  Q
     ||| || ||||||||||| || |   |||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  70364 tatccccacgcttgcaatcagccaatgtgtgtcctttctgtccacatctgaaacacttcttctcatc-tcggtcacacacattactcttgtggcctttct 70462  T
Q  232 cgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactata 331  Q
    | ||||||||||| || |  ||||||| ||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  70463 caccacacttaaagcaaataatctcagtaggagcatctctcctcttaggcctcctctcatcattcagcctctgtttacctttgtcagcaggagcactata 70562  T
Q  332 cggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaa 431  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||  ||||||||     
T  70563 cggtttcggacgactctgttgtcccttacctctgcgctcactcatcactttataatgagctttggtatcctcttcatagattctacagctgcttaccaat 70662  T
Q  432 tcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgat 475  Q
    ||||| ||| |||| ||||  || || || ||||||||||||||    
T  70663 tcagaaaaatttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 70706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 130; Significance: 4e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 33 - 475
Target Start/End: Original strand, 5596 - 6035
Alignment:
Q  33 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 132  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||    ||||||||||| || || || ||||| | |||||| ||||| |||||||||||||| |||||  |||    
T  5596 gtaccagtcaacgcaaacactttgccacctgtcctaaccttcttaggttgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacaattgtagcaaacaa 5695  T
Q  133 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggt-acaaacgttactcttgtggcctttct 231  Q
    |||| || ||||| ||||| ||||   |||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| | | | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  5696 catccccacgcttacaatcagctaaagtgtgtcctttctgaccacacctaaagcacttcttctcatc-tcgatcacacacgttactcttgtggcctttct 5794  T
Q  232 cgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactata 331  Q
    | |||||||| || || | |||||||| ||||||||| ||| |  |  ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||   |||||    
T  5795 caccacacttgaagcaaattatctcagtaggagcatctctcctcttaagcctcctctcatcattcaatctctgcttacccttgtcagcaggg---ctata 5891  T
Q  332 cggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaa 431  Q
    ||| || |||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||| || || ||||| | || |||||||||     
T  5892 cggcttcggacgactatgttgtcccttacctctgcgctcactcatcaccttgtaataagctttcgtatcctcttcatatatcctgcagctacttaccaat 5991  T
Q  432 tcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgat 475  Q
    ||||||||| | || |||| ||| || || ||||||||||||||    
T  5992 tcagagaaattccttatcttttgatagccaatagccctcttgat 6035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 160 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 11764 - 11507
Alignment:
Q  160 tgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagc 259  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||  |   ||| || |||||||||||||||||||  ||||||||  | || || |||||| |    
T  11764 tgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctcttccacatacattactcttgtggcctttcttaccacacttgtatcatacaatctcatc 11665  T
Q  260 aggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtccctta 359  Q
     || ||||| ||| |  | |||  ||| ||||||   |   ||||||| || ||||||||| | ||| | || || |||||||||||||| |||||||||    
T  11664 tggtgcatctctcctcttgggcttcctatcatcacccatcttctgctttcctttgtcagcaagagcaatgtaaggcttaggacgattctgttgtccctta 11565  T
Q  360 cctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 417  Q
    || || | ||||||||| | ||| ||||||||||||||||| || || || |||||||    
T  11564 cccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcataaatcctac 11507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 128; Significance: 6e-66; HSPs: 26)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 33 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 21742769 - 21742327
Alignment:
Q  33 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 132  Q
    ||||||||||| ||||| || || |||||    ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| || || || || |||||||| || |||||  |||    
T  21742769 gtaccagtcaacgcaaataccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactaatatgtccttcctcattacagttgtagcaaacaa 21742670  T
Q  133 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggt-acaaacgttactcttgtggcctttct 231  Q
    |||| || ||||||||||| || |   |||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  21742669 catccccacgcttgcaatcagccaatgtgtgtcctttctgaccacacctaaagcacttcttctcatc-tcggtcacatacattactcttgtggcctttct 21742571  T
Q  232 cgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactata 331  Q
    | |||||||| || || |  ||||||| ||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  21742570 caccacacttgaagcaaataatctcagtaggagcatctctcctcttaggcctcctctcatcattcagtctctgcttacccttgtcagtaggagcactata 21742471  T
Q  332 cggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaa 431  Q
    |||||| |||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| | || ||| |||||     
T  21742470 cggtttcggacgactctactgtcccttacctctgcgctcactcatcaccttgtaatgagctttcgtatcctcttcatatatcctgcagctactcaccaac 21742371  T
Q  432 tcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgat 475  Q
    |||||||||||||| ||||  |  || || ||||||||||||||    
T  21742370 tcagagaaaattcttatcttctcataaccaatagccctcttgat 21742327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 24096847 - 24096415
Alignment:
Q  18 tcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattac 117  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||   |||| ||||||||||||| || ||||| | |||||| ||||| ||||| || |    
T  24096847 tcattagtagtctgcgtaccagtcaatgcaaacactttcccaccggttctagccttcttcggctgagtacactgtgaactgatatgaccttcttcgttgc 24096748  T
Q  118 aattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttact 217  Q
    | || |||||  |||  || || ||||| || || |||||  |||| || ||||| |||||||| || |||||| |||||||  |   |||| | |||||    
T  24096747 agttgtagcaaacaatgtccccacgcttacattcagctagtgtgtgtcctttctgaccacacctaaaacacttcctctcatctctaccacaagcattact 24096648  T
Q  218 cttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtca 317  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||| |||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| |  ||||| || || ||||||    
T  24096647 cttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctctcatcattcatcctctgttttcctttgtca 24096548  T
Q  318 gcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 417  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |    
T  24096547 gcaggagcactataaggtttaggacgactctgttgtcccttacttcttcgctcactcgtcaccttgtaatgagctttggtgtcttcctcatatatcctgc 24096448  T
Q  418 cgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatct 450  Q
     ||  || ||||| |||||||||||||||||||    
T  24096447 agctgctcaccaactcagagaaaattctaatct 24096415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 33 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 20833117 - 20832757
Alignment:
Q  33 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 132  Q
    |||||||||| |||||| ||||| | |||    ||||||||| |||| || || ||||| | |||||||||||| || ||||| || ||||| ||  |||    
T  20833117 gtaccagtcagagcaaacactttactaccggtcctaaccttcctcggttgcgtacactgcgaactgatgtgaccttcctcattgcagttataacaaacaa 20833018  T
Q  133 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctc 232  Q
    |||| || | ||||||||| |||||  |||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20833017 catctcccctcttgcaatcagctagtgtgtgtcctttctgaccacacctgaaacaattcttctcatctttagtacaaacattactcttgtggcctttctc 20832918  T
Q  233 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatac 332  Q
    |||||||||  | || || || ||| |||||||||| ||| |  | || | |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  20832917 gccacacttgtagcaaacaatatcaacaggagcatctctcctcttgggtctcctctcatcattcagcctctgctttcccttgtcagcaggagcactata- 20832819  T
Q  333 ggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagcttt 394  Q
     ||||||||||| |||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  20832818 tgtttaggacgactctgctgtcccttgcctctacggtcactcatcaccttgtaatgagcttt 20832757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 26 - 400
Target Start/End: Original strand, 21961193 - 21961567
Alignment:
Q  26 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||  | |||||| | |||||| ||||||||| |||| || || |||    
T  21961193 agtctgcgtaccagtcaaagcaaatacctttccaccagttctaaccttcttcggctcagggcactgcgaactgatatgaccctctccattgcagttgtag 21961292  T
Q  126 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggc 225  Q
    ||  ||| ||| || ||||| || || ||||   |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||| || ||||||||||    
T  21961293 cagacaatatccccacgcttacattcagctaaactgtgtcccttctgaccacacctgaagcacttcctctcatctttaccacaaacattgctcttgtggc 21961392  T
Q  226 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggc 325  Q
    |||| || ||||||||  |||| || ||||||| ||||||||| ||| |  | || | ||| |||||||| |   ||||||| || ||||||| ||| ||    
T  21961393 ctttttcaccacacttgtaacaaacaatctcagaaggagcatctctcctcttgggtctcctatcatcattcatcttctgctttcctttgtcagaaggagc 21961492  T
Q  326 actatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 400  Q
    ||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  21961493 actgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacctctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtc 21961567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 66 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 21739220 - 21738811
Alignment:
Q  66 ctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgac 165  Q
    ||||||||||| ||||  || ||||| | |||||| ||||| ||||||||| | || |||||   |||||| || ||||| |||||  |||   |||| |    
T  21739220 ctaaccttcttaggctccgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattatagttgtagcaaaaaacatccccacgcttacaatcaactaaggtgtgtc 21739121  T
Q  166 ccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggt-acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggag 264  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||||||||| | | | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || || |  ||||||| |||||    
T  21739120 ctttctgaccacacctaaagcacttcttctcatc-tcgatcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgaagcaaataatctcagtaggag 21739022  T
Q  265 catccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctct 364  Q
    || | ||| |  | |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||| || || |||||| |||| ||||||||||||||    
T  21739021 cacctctcctcttaggcctcctctcatcattcaatctctgcttacccttgtcagcatgggcgctatatggcttcggacgactctgttgtcccttacctct 21738922  T
Q  365 tcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctata 464  Q
     || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| | || ||||||||| ||||| ||| | || | || ||| || || |||    
T  21738921 gcggtcactcatcaccttgtaatgagctttcgtatcctcttcatatatcctgcagctacttaccaattcagaaaaattccttaccttttgatagccaata 21738822  T
Q  465 gccctcttgat 475  Q
    |||||||||||    
T  21738821 gccctcttgat 21738811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 33 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 22015962 - 22015556
Alignment:
Q  33 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 132  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||    ||||||||||||||||| || |||||   ||| || ||| | || || || || ||||| ||  |||    
T  22015962 gtaccagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttcggctgcgtacactgcaaactaatatgatcttcctcgttgcagttataacaaacaa 22015863  T
Q  133 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctc 232  Q
    |||| || ||||||||||| ||||   |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |   |||||| ||||| || |||||||| ||    
T  22015862 catccccacgcttgcaatcagctaaagtgtgtcctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctctatcacaaacattacttttttggcctttttc 22015763  T
Q  233 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatac 332  Q
     |||||||| || || || || |  | ||||||||| |||||  | |||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  22015762 tccacacttgaatcaaacaatatttgtaggagcatctctcttctttggcctcctctcatcatttattctcttcttacccttgtcagcaggagcactatac 22015663  T
Q  333 ggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaat 432  Q
    || || |||||| |||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  | || || |||||||||| ||  ||||||||||    
T  22015662 ggcttcggacgactctgctgtccctttcccctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttcgtaacttcttcatagatcctacagctgcttaccaaat 22015563  T
Q  433 cagagaa 439  Q
    |||||||    
T  22015562 cagagaa 22015556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 141 - 478
Target Start/End: Original strand, 19857555 - 19857892
Alignment:
Q  141 cgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacact 240  Q
    ||||| ||||| |||||  |||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||  |   ||| || ||||||||||||||||| || |||||||    
T  19857555 cgcttacaatcagctagtgtgtgtcctttctgaccacacctgaagcatttcttctcatctctatcacagacattactcttgtggcctttttcaccacact 19857654  T
Q  241 taaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttagg 340  Q
    | || || || ||||| | || |||||| ||| |  | |||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  19857655 tgaagcaaacaatctcggtagaagcatctctcctcttaggcctcctctcatcattcaacctctgcttacccttgtcagcaggagcactatatggtttagg 19857754  T
Q  341 acgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaa 440  Q
    |||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||||| ||| ||  |||||||| ||||| ||     
T  19857755 acgactctgttgtcccttacctctgcgttcactcatcaccttgtaatgagccttagtatcctcttcatagatcttacagctgcttaccaactcagaaaag 19857854  T
Q  441 attctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
     |||||||||  || || || || || |||||||||||    
T  19857855 tttctaatcttctgatagccaatggctctcttgatgtc 19857892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 38910058 - 38909676
Alignment:
Q  18 tcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattac 117  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||  |  ||||| | |||||| ||||| ||  |||| |    
T  38910058 tcattaggagtctgcgtaccagtcaaggcaaaaacctttccaccaattctagtcttcttcggctcaggacactgtgaactgatatgaccttccccattgc 38909959  T
Q  118 aattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttact 217  Q
    | || || ||  |||  || || |||||||| || ||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||  |   |||||| |||||    
T  38909958 agttgtaacagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctcttccacaaacattact 38909859  T
Q  218 cttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtca 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  | || || |||||| |||||||||| ||| |  | |||| ||| ||||||   |  |||||||| || ||||||    
T  38909858 cttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcctctgctttcctttgtca 38909759  T
Q  318 gcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 400  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| || | | ||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  38909758 gcaggagcactgtaaggtttaggacgattctgttgtcccttacccctcctcccactcattatcttgtaatgagctttggtgtc 38909676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 26 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 20074933 - 20074559
Alignment:
Q  26 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 125  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |  || || |||  |||||||||||||||||  |  ||||| | | |||| ||||||||| |||| || || |||    
T  20074933 agtctgcgtaccagtcaatgcaaacatcttgcccccagttctaaccttcttcggctcaggacactgcgaattgatatgaccctctccattgcagttgtag 20074834  T
Q  126 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggc 225  Q
    ||  ||| ||| || |||||||| || || |   ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||| || ||||||||||    
T  20074833 cagacaatatccccacgcttgcattcagccaagctgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcctctcatctttactacaaacattgctcttgtggc 20074734  T
Q  226 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggc 325  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||| |||||||  |||||||| ||| |  |  ||| ||| |||||| | |   ||||||| || ||||||||||  ||    
T  20074733 ctttctcaccacacttgtaacacacaatctcagtgggagcatctctcctcttaagcctcctgtcatcactcatcttctgctttcctttgtcagcagaagc 20074634  T
Q  326 actatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 400  Q
    ||| || || |||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  20074633 actgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtc 20074559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 400
Target Start/End: Original strand, 48426031 - 48426413
Alignment:
Q  18 tcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattac 117  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||  |||||||||||  |  ||||| | |||||| ||||| ||  |||| |    
T  48426031 tcattaggagtctgcgtaccagtcaaagcaaacacctttccaccaattctagtcttcttcggctcaggacactgtgaactgatatgaccttccccattgc 48426130  T
Q  118 aattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttact 217  Q
    | || || ||  |||  || || |||||||| || ||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||  |   |||||| |||||    
T  48426131 agttgtaacagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctcttccacaaacattact 48426230  T
Q  218 cttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtca 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  | || || |||||| |||||||||| ||| |  | |||| ||| ||||||   |   ||||||| || ||||||    
T  48426231 cttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgtca 48426330  T
Q  318 gcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 400  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  48426331 gcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtc 48426413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 141 - 400
Target Start/End: Original strand, 20297664 - 20297923
Alignment:
Q  141 cgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacact 240  Q
    |||||||| || |||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  20297664 cgcttgcattcagctaggctgtgacccttctaaccacacctgaagcacttcctctcatctttaccacaaacattactcttgtggcatttctcaccacact 20297763  T
Q  241 taaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttagg 340  Q
    |  |||| || ||||||||||||||||| ||| |  | |||| ||| ||||||   |   |||| || |||||||||| ||| ||||| || || |||||    
T  20297764 tgtaacaaacaatctcagcaggagcatctctcctcttgggcctcctgtcatcacccatcttctgttttcccttgtcagtaggagcactgtaaggcttagg 20297863  T
Q  341 acgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 400  Q
    ||||||||||||||||||||| || | ||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  20297864 acgattctgatgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtc 20297923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 31537229 - 31536847
Alignment:
Q  18 tcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattac 117  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||||| || |||||||||| ||||  |||||||||||  |  ||||| | ||| || || || ||  |||| |    
T  31537229 tcattaggagtctgcgtaccagtcagagcaaacacctttccaccaattctagtcttcttcggctcaggacactgtgaactaatatggccttccccattgc 31537130  T
Q  118 aattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttact 217  Q
    | || || ||  |||  || || |||||||| || ||||   ||||||||||||| |||||||||||||| ||  | |||||  |   |||||| || ||    
T  31537129 agttgtaacagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtgacccttctgaccacacctgaagcattttctatcatctctaccacaaacattgct 31537030  T
Q  218 cttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtca 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||| ||||||||| ||| |  | || | ||| |||||||| |  |||||||| || ||||||    
T  31537029 cttgtggcctttctcaccacacttataacaaacaatctcagaaggagcatctctcctcttgggtctcctatcatcattcatcctctgctttcctttgtca 31536930  T
Q  318 gcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 400  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  31536929 gcaggagcactataaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtc 31536847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 400
Target Start/End: Original strand, 37680207 - 37680589
Alignment:
Q  18 tcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattac 117  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| || || ||||||| ||||  |||| ||||||  |  ||||| | ||| || ||||| ||| |||| |    
T  37680207 tcattaggagtctgcgtaccagtcaaagcaaacaccttcccaccaattctagtcttcctcggctcaggacactgtgaactaatatgaccttctccattgc 37680306  T
Q  118 aattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttact 217  Q
    |||| || ||  |||  || || |||||||| || ||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||  |   |||||| |||||    
T  37680307 aattgtaacagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctcttccacaaacattact 37680406  T
Q  218 cttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtca 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  | || || |||||| |||||| ||| ||| |  | |||| ||| ||||||   |   ||||||| || ||||||    
T  37680407 cttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagtatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgtca 37680506  T
Q  318 gcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 400  Q
    | ||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  37680507 gtaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtc 37680589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 206 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 21228600 - 21228328
Alignment:
Q  206 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 305  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||| ||||  | |||||||| |||||    | ||||||     
T  21228600 acaaacattactcttgtggcctttctcgccacagttgaaacaaacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgt 21228501  T
Q  306 ttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttc-gctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcc 404  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||| || ||||||  ||||| ||||| |||  ||||| |||||||| || || ||||||    
T  21228500 ttacccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggccctta-gtcttctgctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcctcc 21228402  T
Q  405 tcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
    || |||||||| | || | | || ||||||| ||||| ||  |||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  21228401 tcatagatcctgcagctattaactaaatcagggaaaactcagatctgttggtatccgatcgccctcttaatgtc 21228328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 26 - 400
Target Start/End: Original strand, 52988907 - 52989280
Alignment:
Q  26 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 125  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| || || || |||  ||||||||||||||| |  |  || || | |||||| ||||||||| |||| || || |||    
T  52988907 agtctgcgtaccagtcaatgcaaacaccttgcccccagttctaaccttcttcggttcaggacattgtgaactgatatgaccctctccattgcagttgtag 52989006  T
Q  126 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggc 225  Q
    ||  |||  || || ||||| || || ||||   ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||   |||||| || ||||||||||    
T  52989007 cagacaatgtccccacgcttacattcagctaaattgtgacccttctgaccacacctgaaacacttcctctcatctttaccacaaacattgctcttgtggc 52989106  T
Q  226 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggc 325  Q
    |||| || ||||||||  |||| || ||||||| ||||||||| ||| |  | |||| ||| |||||||| |   ||||||| || ||||||||||| ||    
T  52989107 ctttttcaccacacttgtaacaaacaatctcagaaggagcatctctcctcttaggcctcctatcatcattcatcttctgctttcctttgtcagcaggagc 52989206  T
Q  326 actatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 400  Q
    ||| || || ||||||||||| || ||||||||||| || | ||||||||| |  || |||||||||||||||||    
T  52989207 actgtaaggcttaggacgattttgctgtcccttacccctcctctcactcatta-tttgtaatgagctttggtgtc 52989280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 204 - 415
Target Start/End: Original strand, 16379407 - 16379618
Alignment:
Q  204 gtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctct 303  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||   | | || || |||||||||  | ||||  |||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  16379407 gtacaaacattacttttgtggcctttctcaccacaagcatagcaaacaatctcagcaacaacatctttctttctcggcctcctctcatcattaactctct 16379506  T
Q  304 gcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctc 403  Q
    | || ||||| ||||||| |||||| || || ||||||||| |||| || ||||| ||| | |||||| |||  ||||| |||||||| || || |||||    
T  16379507 gtttgcccttatcagcagaggcactgtaaggcttaggacgactctgttgacccttgcctttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcctc 16379606  T
Q  404 ctcgtagatcct 415  Q
    ||| || |||||    
T  16379607 ctcataaatcct 16379618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 208 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 17042057 - 17041788
Alignment:
Q  208 aaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgctt 307  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |  ||||| | |||||||||| ||||  | |||||||| |||||    | |||||||||    
T  17042057 aaacattactcttgtggcctttcccgccacagttgaaacaaaa-atctccgaaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgctt 17041959  T
Q  308 acccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctc 406  Q
     ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||| || ||||||  |||| | |||| | |  ||||| ||||||||| |||| ||||| ||    
T  17041958 gcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgctggccctta-gtcttcctctcattaacaaccttgtaatgagctctggtatcctcttc 17041860  T
Q  407 gtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
    ||||||||||| ||   | |||||||||| ||||| ||  |  ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  17041859 gtagatcctacagctgttcaccaaatcagggaaaactcggagttgttggtatccgatcgccctcttgatgtc 17041788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 24784901 - 24784648
Alignment:
Q  206 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 305  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||| | || ||||| || ||||| |||||||||||| ||||  | |||||||| |||||    | ||||||     
T  24784901 acaaacattgctcttgtggcctttctcaccataattgaaacagacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgt 24784802  T
Q  306 ttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcc 404  Q
    || ||||| ||||||| ||||||||| || |||||  || |||| || ||||||  |||| |||||| |||  ||||| |||||||| ||| | ||||||    
T  24784801 ttgcccttatcagcagaggcactatagggcttagggagactctgttggccctta-gtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttgttatcctcc 24784703  T
Q  405 tcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcc 460  Q
    || ||||| |||| ||   | |||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||    
T  24784702 tcatagattctacagctgttcaccaaatcag-gaaaactcggatctgttggtatcc 24784648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 301 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 16354195 - 16354018
Alignment:
Q  301 tctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 400  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| ||  | | |||| |||  ||||| || ||||| || || ||    
T  16354195 tctgtttacccttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatc 16354096  T
Q  401 ctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
    ||| ||||||||||| | || | | ||||||||    |||| ||| | |||||||||||| || |||||||| |||||    
T  16354095 ctcttcgtagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 16354018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 417
Target Start/End: Original strand, 21176682 - 21176893
Alignment:
Q  206 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 305  Q
    |||||| || ||||||||| ||||||| ||||| |||| ||| || |||||  ||||||||||| ||||  | |||||||| |||||    | ||||||     
T  21176682 acaaacattgctcttgtggactttctcaccacaattaatacagacaatctccacaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgt 21176781  T
Q  306 ttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcc 404  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| |  ||||| | | |||| || ||||||  |||| |||||| |||  ||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  21176782 ttgcccttatcagcaggggcactatatgtcttagggctactctgctggccctta-gtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcctcc 21176880  T
Q  405 tcgtagatcctac 417  Q
    || ||||| ||||    
T  21176881 tcatagattctac 21176893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 301 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 41350620 - 41350560
Alignment:
Q  301 tctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacc 361  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||    
T  41350620 tctgtttacccttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttacc 41350560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 301 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 16347547 - 16347433
Alignment:
Q  301 tctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 400  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| ||  | | |||| |||  ||||| || ||||| || || ||    
T  16347547 tctgtttacccttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatc 16347448  T
Q  401 ctcctcgtagatcct 415  Q
    ||| |||||||||||    
T  16347447 ctcttcgtagatcct 16347433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 372 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 20853638 - 20853532
Alignment:
Q  372 ctcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctct 471  Q
    |||||||||||||||||||| || || |||||||| || || |||| || ||| ||||| || ||||||||||| ||||  || ||||| || || ||||    
T  20853638 ctcatcaccttataatgagcctttgtatcctcctcataaattctacagctactcaccaattctgagaaaattctgatcttctgatatccaatggctctct 20853539  T
Q  472 tgatgtc 478  Q
    |||||||    
T  20853538 tgatgtc 20853532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 20081410 - 20081295
Alignment:
Q  216 ctcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgt 315  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||| || ||||| ||||  | |||||||| |||||    | |||||| || ||||| |    
T  20081410 ctcttgtggcctttctcaccacaattaaagcagacaatctcagcatgaacatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttat 20081311  T
Q  316 cagcaggggcactata 331  Q
    |||||||||| |||||    
T  20081310 cagcaggggcgctata 20081295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 315 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 51330430 - 51330384
Alignment:
Q  315 tcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacc 361  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||    
T  51330430 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttacc 51330384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 252 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 21045152 - 21045076
Alignment:
Q  252 atctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcact 328  Q
    |||||||||| ||||||  |||| || || | |||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  21045152 atctcagcagtagcatctttctttcttggtctcctctcatcattaactctttgcttgcccttatcagcaggagcact 21045076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 125; Significance: 4e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 33 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 1031 - 619
Alignment:
Q  33 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 132  Q
    ||||| ||||||||||| || || ||||||   |||||||||||||| || || ||||| | |||||| ||||| || ||||| || |||||  |  |||    
T  1031 gtaccggtcaaagcaaacaccttaccaccagtcctaaccttcttcggttgcgtacactgcgaactgatatgaccttcctcattgcagttataataaacaa 932  T
Q  133 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctc 232  Q
      || || ||||| ||||| |||||  |||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |   |||||||||||||||||||||||| ||    
T  931 tgtccccacgcttacaatcagctagagtgtatcctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctctatcacaaacgttactcttgtggcctttttc 832  T
Q  233 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatac 332  Q
     |||||||| || || || ||||| | ||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  831 accacacttgaagcaaacaatctcggtaggagcatctctcctcttgggcctcctctcatcatttaacctcttcttacccttgtcagcaggagcattatac 732  T
Q  333 ggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaat 432  Q
    || || |||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||| | || |||||||||||    
T  731 ggcttcggacgactctgttgtcccttacctctgcgttcactcatcaccttgtaatgagctttgttgtcctcctcataaatcctgcagctacttaccaaat 632  T
Q  433 cagagaaaattct 445  Q
    |||||||| ||||    
T  631 cagagaaatttct 619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 102 - 457
Target Start/End: Original strand, 29752 - 30106
Alignment:
Q  102 tgaccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatcct 201  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||  |||||||||| |||||||| || ||||   |||| || |||   ||||||| ||| |||||||||||||| |    
T  29752 tgaccttcttcatcacaattgtagcaaacaacatcaccacgcttgcactcagctattgtgtgtcctttcgtcccacaccggaaacacttcttctcatcat 29851  T
Q  202 tggtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtct 301  Q
     | ||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| | |||||||||  ||||||||| ||| | || |||| |||||||||||| |||||    
T  29852 ggttacaaacattactcttgtggcccttttcaccacacttgaaatagactatctcaataggagcatctctcctcctaggcctcctctcatcattcagtct 29951  T
Q  302 ctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcc 401  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  29952 ctgcttacctttgtcagcaggagcactagacggtttcggacgactctgctgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttataatgagcctttgtatcc 30051  T
Q  402 tcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggta 457  Q
    || || ||||| ||||  | ||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  30052 tcttcatagattctacaactactcaccaaatcagag-aaattcttatcttttggta 30106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 123; Significance: 5e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 244 - 478
Target Start/End: Original strand, 2198 - 2432
Alignment:
Q  244 aacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacg 343  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| || || ||| |||||||||||| |  || ||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  2198 aacaaactatctcagcaggagcatctctcctattccgcctcctctcatcattcaacctttgctttcctttgtcagtaggggcactgtacggtttaggacg 2297  T
Q  344 attctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaatt 443  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |  |||||||| |||||||||||||||    
T  2298 actctgctgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagcttttgtgtcctcctcatagatcttgcaacgacttactaaatcagagaaaatt 2397  T
Q  444 ctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
    ||||||||||| || ||||| || ||||| |||||    
T  2398 ctaatctgttgataccctatggctctcttcatgtc 2432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 123; Significance: 5e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 33 - 439
Target Start/End: Original strand, 8770 - 9176
Alignment:
Q  33 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 132  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||    |||||||||||||| || |||||||| | |||||| || || ||||| || || || |||||  |||    
T  8770 gtaccagtcaatgcaaacactttcccaccggtactaaccttcttcggttgagtgcactgcgaactgatatggccttcttcgttgcagttgtagcaaacaa 8869  T
Q  133 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctc 232  Q
      ||||| ||||||||||| |||||  |||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  8870 tgtcaccacgcttgcaatcagctagagtgtgtcctttctgaccacacctgaaacacttcttctcatctttagtacaaacattactcttgtggccattctc 8969  T
Q  233 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatac 332  Q
    |||||||||| |||| || |||||| |||||||||| ||| |  | || |  ||||||||||| ||  ||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  8970 gccacacttataacaaacaatctcatcaggagcatctctcctcttgggtcttctctcatcattcagcttctgcttccctttgtcagcaggagcactatac 9069  T
Q  333 ggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaat 432  Q
    || || |||||| |||| ||||| || |  ||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||  | | || ||||||||| |    
T  9070 ggcttcggacgactctgctgtcctttgctccttcgatcactcatcacctaataatgagatttcgtgtcctcctcatagattatgcagctacttaccaatt 9169  T
Q  433 cagagaa 439  Q
    |||||||    
T  9170 cagagaa 9176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1530 (Bit Score: 121; Significance: 9e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold1530
Description:

Target: scaffold1530; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 174 - 478
Target Start/End: Original strand, 801 - 1105
Alignment:
Q  174 ccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctct 273  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||   ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||  | || || ||||||||||||||||| |||     
T  801 ccacacctgaagtacttcttctcatctttatcacagacattactcttgtggcctttctagccacacttgtagcaaacaatctcagcaggagcatctctcc 900  T
Q  274 tactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcact 373  Q
    |  | |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  901 tcttaggcctcctctcatcattcaatctctgcttacccttgtcagcaggagcactatatggtttaggacgactctgttgtcccttacctctgcgctcact 1000  T
Q  374 catcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttg 473  Q
    ||||||||| |||||||| ||  | |||||||| || || || | || ||| ||||| |||||||||||||||||||  || || || || || ||||||    
T  1001 catcaccttgtaatgagccttattatcctcctcatatattctgcagctactcaccaactcagagaaaattctaatcttctgatacccaatggctctcttg 1100  T
Q  474 atgtc 478  Q
    |||||    
T  1101 atgtc 1105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 121; Significance: 9e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 85 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 1368 - 996
Alignment:
Q  85 tgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaa 184  Q
    |||||||||  || || ||||||||||||| |||||| |||||  ||| |||||| ||||| || || || |   |||| || ||||  ||||| | |||    
T  1368 tgcactgagagctaatatgaccctcttcatcacaattgtagcacacaatatcaccacgcttacactcagccaatgtgtgtcctttcttcccacatcggaa 1269  T
Q  185 gcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgc 284  Q
     ||||||||||||||   |  ||| || |||| |||||||||||| || ||||| |||||||| || |||| || ||||||||| ||| | || |||| |    
T  1268 acacttcttctcatcacggtcacatacattacccttgtggcctttttcaccacatttaaaacagacaatcttagtaggagcatctctcctcctaggcctc 1169  T
Q  285 ctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttat 384  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1168 ctctcatcattcagtctctgcttacccttgtcaacaggagcactatacggtttcggacgactctgctgtcccttacctctgcgctcactcatcaccttat 1069  T
Q  385 aatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggta 457  Q
    |||||||||| ||||||||||| || || || | || ||| ||||||||||||||| | || |||| ||||||    
T  1068 aatgagcttttgtgtcctcctcatatattctgcagctactcaccaaatcagagaaattccttatcttttggta 996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 121; Significance: 9e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 33 - 417
Target Start/End: Original strand, 37095 - 37479
Alignment:
Q  33 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 132  Q
    ||||| ||||||| ||| || || ||||||   ||||||||||||||||| || ||||| | |||||| ||||| || ||||| || ||||||||  |||    
T  37095 gtaccggtcaaagaaaacaccttaccaccagtcctaaccttcttcggctgcgtacactgtgaactgatatgaccttcctcattgcagttatagcaaacaa 37194  T
Q  133 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctc 232  Q
     ||| || | ||| ||||| |||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||   |||||| ||||||||||||||||||||    
T  37195 tatccccacacttacaatcagctagtgtgtgtcccttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctttatcacaaacattactcttgtggcctttctc 37294  T
Q  233 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatac 332  Q
    ||||||||| || || |  || |||| |||||  || ||| |  | |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  37295 gccacacttgaagcaaaaaatatcagtaggagtgtctctcctcttgggcctcctctcatcattcaatctctgcttacccttgtcggcaagagcactatac 37394  T
Q  333 ggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 417  Q
    || || |||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || || || || ||||||||||    
T  37395 ggcttcggacgactctgctgtcccttacctctacgttcactcatcaccttgtaatgagctttcgtatcttcttcatagatcctac 37479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 121; Significance: 9e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 85 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 28381 - 28009
Alignment:
Q  85 tgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaa 184  Q
    |||||||||  || || ||||||||||||| |||||| |||||  ||| |||||| ||||| || || || |   |||| || ||||  ||||| | |||    
T  28381 tgcactgagagctaatatgaccctcttcatcacaattgtagcacacaatatcaccacgcttacactcagccaatgtgtgtcctttcttcccacatcggaa 28282  T
Q  185 gcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgc 284  Q
     ||||||||||||||   |  ||| || |||| |||||||||||| || ||||| |||||||| || |||| || ||||||||| ||| | || |||| |    
T  28281 acacttcttctcatcacggtcacatacattacccttgtggcctttttcaccacatttaaaacagacaatcttagtaggagcatctctcctcctaggcctc 28182  T
Q  285 ctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttat 384  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28181 ctctcatcattcagtctctgcttacccttgtcaacaggagcactatacggtttcggacgactctgctgtcccttacctctgcgctcactcatcaccttat 28082  T
Q  385 aatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggta 457  Q
    |||||||||| ||||||||||| || || || | || ||| ||||||||||||||| | || |||| ||||||    
T  28081 aatgagcttttgtgtcctcctcatatattctgcagctactcaccaaatcagagaaattccttatcttttggta 28009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 66 - 264
Target Start/End: Original strand, 115751 - 115949
Alignment:
Q  66 ctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgac 165  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||  |||| |||||||||||| | | |||||| ||||||||||| |||| || |||||    
T  115751 ctaaccttcttcggttgagtgcactgagaactgatatgaccctccccattgcaattatagcatactatatcaccacgcttgcaatcagctaacacgtgac 115850  T
Q  166 ccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  115851 ccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatctttggtacaaacattacttttgtggcctttctcgccacacttaaagcaaactatttcagcaggag 115949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 94057 - 93808
Alignment:
Q  18 tcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattac 117  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||   || |||||||| || || |||||||| | ||| ||||||||||| |||  ||    
T  94057 tcattagtagtctgcgtaccagtcaaagcaaatacttttcctccagtcctgaccttcttaggttgagtgcactgcgaactaatgtgaccctcatcaccac 93958  T
Q  118 aattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttact 217  Q
    | ||| | ||  ||| ||| || ||||||||||| || | ||  ||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||| |  || ||| | |||||    
T  93957 agttaaaacaaacaatatctccacgcttgcaatccgccaacacatgacctttctgaccgcatctgaaacatttcttctcatcttgagtgcaagcattact 93858  T
Q  218 cttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcat 267  Q
    ||||||||| ||| | ||||| ||  |||| || | |||| |||||||||    
T  93857 cttgtggcccttcacaccacatttgtaacaaacaacctcaacaggagcat 93808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 359
Target Start/End: Original strand, 8553 - 8696
Alignment:
Q  216 ctcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||| |||| ||| ||||  | ||||| || || ||    |  ||||| || ||||| |    
T  8553 ctcttgtggcctttctcgccacaattaaaacagataatctcagcaagagcgtccttcttctttggccgtctatcctcgaccatcctctgtttgcccttat 8652  T
Q  316 cagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtccctta 359  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||| |||| || ||||||    
T  8653 cagcaggggcactatagggcttagggcgactctgttggccctta 8696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1433 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold1433
Description:

Target: scaffold1433; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 66 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 1426 - 1053
Alignment:
Q  66 ctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgac 165  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| | |||||| ||||| || ||||| ||| | |||||  ||| ||| || ||||| || || ||||   |||| |    
T  1426 ctaaccttcttaggctgagtacactgcgaactgatatgaccttcctcattgcaagtgtagcaaacaatatccccacgcttacattcagctaaagtgtgtc 1327  T
Q  166 ccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagc 265  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |   |||| | ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| | |||||||| ||||||    
T  1326 ctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctctatcacaagcattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaattatctcagtaggagc 1227  T
Q  266 atccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt 365  Q
    ||| ||| |  | |||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || || || |||||| |||| |||||||| |||||     
T  1226 atctctcctcttgggcctcctctcatcattcagcctctgtttacccttgtcagcaggagcactgtatggcttcggacgactctgttgtcccttgcctcta 1127  T
Q  366 cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaa 439  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  1126 cgctcactcatcaccttgtaatgagctttcgtatcctcttcatagatcctacagctgcttaccaaatcagagaa 1053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 66 - 439
Target Start/End: Original strand, 7933 - 8306
Alignment:
Q  66 ctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgac 165  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| | |||||| ||||| || ||||| ||| | |||||  ||| ||| || ||||| || || ||||   |||| |    
T  7933 ctaaccttcttaggctgagtacactgcgaactgatatgaccttcctcattgcaagtgtagcaaacaatatccccacgcttacattcagctaaagtgtgtc 8032  T
Q  166 ccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagc 265  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |   |||| | ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| | |||||||| ||||||    
T  8033 ctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctctatcacaagcattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaattatctcagtaggagc 8132  T
Q  266 atccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt 365  Q
    ||| ||| |  | |||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || || || |||||| |||| |||||||| |||||     
T  8133 atctctcctcttgggcctcctctcatcattcagcctctgtttacccttgtcagcaggagcactgtatggcttcggacgactctgttgtcccttgcctcta 8232  T
Q  366 cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaa 439  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  8233 cgctcactcatcaccttgtaatgagctttcgtatcctcttcatagatcctacagctgcttaccaaatcagagaa 8306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 33 - 439
Target Start/End: Original strand, 34493 - 34899
Alignment:
Q  33 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 132  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||    ||||||||||||||||| || ||||  | ||| || ||||| || ||||| || ||||| ||  |||    
T  34493 gtaccagtcaaggcaaacacctttccacctgtcctaaccttcttcggctgcgtacactacgaactaatatgaccttcctcattgcagttataacaaacaa 34592  T
Q  133 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctc 232  Q
    | || || ||||| |||||  |||   |||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||  |   ||| || ||||||||||||||||||||    
T  34593 cgtccccacgcttacaatcaactaatgtgtgtcctttctaaccacacctgaagcacttcttctcatctctatcacagacattactcttgtggcctttctc 34692  T
Q  233 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatac 332  Q
     |||||||| ||||| || || |||| ||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| |  || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34693 accacacttgaaacaaacaatgtcagtaggagcatctctcctcttgggcctcctctcatcatttaacctttgcttacccttgtcagcaggagcactatac 34792  T
Q  333 ggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaat 432  Q
     | || |||||| |||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| | || |||||||||||    
T  34793 agcttcggacgactctgctgtcccttgcctctgcgttcactcatcaccttgtaatgagcttttgtgtcctcctcataaatcctgcagctacttaccaaat 34892  T
Q  433 cagagaa 439  Q
    |||||||    
T  34893 cagagaa 34899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 33 - 475
Target Start/End: Original strand, 50261 - 50703
Alignment:
Q  33 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 132  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||    ||||||||||| ||||| || ||||  | |||||| ||||| || ||||| || || |||||  |||    
T  50261 gtaccagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgggtacactacgaactgatatgaccttcctcattgcagttgtagcaaacaa 50360  T
Q  133 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggt-acaaacgttactcttgtggcctttct 231  Q
     ||| || ||||| ||||| ||||   |||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||| |||| |    
T  50361 tatccccacgcttacaatcagctaaggtgtgtcctttctgaccacacctgaaacacttcttctcatc-tcggtcacaaacattactcttgtggtcttttt 50459  T
Q  232 cgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactata 331  Q
    | |||||||| ||||| || || |||| ||||||||| ||| |  | |||| ||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50460 caccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcctctcatcattccatctatgcttacccttgtcagcaggggcactata 50559  T
Q  332 cggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaa 431  Q
    ||| || |||| | |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || || || || |||||||||| ||  ||||||||     
T  50560 cggcttcggaccactctgctgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttcgtatcttcttcatagatcctacagctgcttaccaac 50659  T
Q  432 tcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgat 475  Q
    ||||| ||  |||| ||||  || || || ||||||||||||||    
T  50660 tcagaaaagtttcttatcttctgataaccaatagccctcttgat 50703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 168 - 439
Target Start/End: Original strand, 319534 - 319805
Alignment:
Q  168 ttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcat 267  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||   ||| || |||||||||||||||||||||||||||||  | || || ||| ||||||||||||    
T  319534 ttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctttatcacagacattactcttgtggcctttctcgccacacttgtagcaaacaatcccagcaggagcat 319633  T
Q  268 ccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcg 367  Q
    | ||| || | |||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||||| || || |||||    
T  319634 ctctcctattgggcctcctctcatcattcagcctctgcttatccttgtcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtcctttgccccttcg 319733  T
Q  368 ctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaa 439  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || || || | || ||||||||| ||||||||    
T  319734 atcacttatcaccttgtaatgagctttcgtgtcctcctcataaattctgcagctacttaccaattcagagaa 319805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 33 - 322
Target Start/End: Original strand, 325863 - 326151
Alignment:
Q  33 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 132  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||   |||||||||||| || ||||||||||| | |||||| || ||||||||||| || ||||| ||  |||    
T  325863 gtaccagtcaaagcaaacactttaccaccggttctaaccttctttggttgtgtgcactgtgaactgatatggccctcttcattgcagttataacaaacaa 325962  T
Q  133 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctc 232  Q
    |||| || ||||| ||||  ||||   |||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||   ||| || |||||||||||| |||||||    
T  325963 catctccccgcttacaattagctaatgtgtgtcctttctgaccacacttgaagcacttcttctcatctttatcacagacattactcttgtggtctttctc 326062  T
Q  233 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcagg 322  Q
    |||||||||  | || || ||||||||||||||||| ||| || | |||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  326063 gccacacttgtagcaaacaatctcagcaggagcatctctccta-ttggcctcctctcatcattcagcctctgcttacccttgttagcagg 326151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 33 - 450
Target Start/End: Original strand, 5209 - 5626
Alignment:
Q  33 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 132  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||    |||||||||||||| || || ||||| | |||||| ||||| || ||||| || ||||| ||  |||    
T  5209 gtaccagtcagagcaaacactttaccaccggtcctaaccttcttcggttgagtacactgcgaactgatatgaccttcctcattgcagttataacaaacaa 5308  T
Q  133 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctc 232  Q
    | || || ||||| ||||  ||||   |||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||   ||| || |||||| |||||||||||||    
T  5309 cgtctccccgcttacaattagctaatgtgtgtcctttctaaccacacctgaagcacttcttctcatctttatcacagacattactcctgtggcctttctc 5408  T
Q  233 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatac 332  Q
    ||| |||||  | || || ||||||||||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| |  ||||| || ||||| |||||||| ||||||||     
T  5409 gccgcacttgtagcaaacaatctcagcaggagcatctctcctcgtgggcctcctctcatcattcaacctctgttttcccttatcagcaggagcactatat 5508  T
Q  333 ggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaat 432  Q
    |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| | || ||| ||||| |    
T  5509 ggtttaggacgactctgttgtcctttacctcttcgttcactcatcaccttgtaatgagctttagtatcttcttcatatatcctgcagctactcaccaact 5608  T
Q  433 cagagaaaattctaatct 450  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  5609 cagagaaaattcttatct 5626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 108; Significance: 5e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 33 - 403
Target Start/End: Original strand, 5337 - 5706
Alignment:
Q  33 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 132  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||    |||  |||||| ||||| || ||||| | |||||| ||||| ||||||||||| || |||||  |||    
T  5337 gtaccagtcaacgcaaaaaccttgccacctgacctagacttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaa 5436  T
Q  133 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggt-acaaacgttactcttgtggcctttct 231  Q
    |||| || ||||| ||||| ||||   |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||| |    
T  5437 catccccacgcttacaatcagctaaagtgtgtcctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatc-tcggtcacaaacattactcttgtggccttttt 5535  T
Q  232 cgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactata 331  Q
    | |||||||| ||||| || || |||| ||||||||| ||| | || |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  5536 caccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcct-cttggcctcctctcatcattcaatctctgcttacccttgtcagtaggggcactgta 5634  T
Q  332 cggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctc 403  Q
    ||| ||  || || |||| ||||||||  ||||  ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  5635 cggcttccgatgactctgctgtcccttgactctatgctcactcatcactttgtaatgagctttggtatcctc 5706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 108; Significance: 5e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 33 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 43567 - 43125
Alignment:
Q  33 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 132  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||    | ||||||||| ||||   ||||||| |  || || ||||||||||||| ||||||||||||  |||    
T  43567 gtaccagtcaaagcaaacaccttgccacctgtccgaaccttcttgggcttcttgcactgcgagctaatatgaccctcttcatcacaattatagcaaacaa 43468  T
Q  133 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggt-acaaacgttactcttgtggcctttct 231  Q
    |||| || ||||| ||||| ||||   |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | | | ||| || |||||||||||||| || |    
T  43467 catccccacgcttacaatcagctaaagtgtgtcctttctgtccacacctaaagcacttcttctcatc-tcgatcacacacattactcttgtggccctttt 43369  T
Q  232 cgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactata 331  Q
    | | |||||| ||||| || ||||||  ||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| || ||||| ||||| |||| || ||| ||||||||    
T  43368 cacgacacttgaaacagacaatctcattaggagcatctctcctcttaggcctcctctcatcattcagcctctgtttacctttgttagaaggagcactata 43269  T
Q  332 cggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaa 431  Q
    | |||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||| |  || ||||||| ||  |||||||||    
T  43268 cagttttggacgactctgttgtcccttacctctgcgctcactcatcaccttgtaatgacatttggtatcctcttaatatatcctacagctgcttaccaaa 43169  T
Q  432 tcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgat 475  Q
    || |||||| | || |||| ||| || || ||||||||||||||    
T  43168 tctgagaaattccttatcttttgataaccaatagccctcttgat 43125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 102 - 439
Target Start/End: Original strand, 42923 - 43260
Alignment:
Q  102 tgaccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatcct 201  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||  ||||||| || |||||  |||| ||||   |||| || ||||| | |||||| ||||||||||||||||| |    
T  42923 tgaccttctgcattacaattgtagcaaacaacatccccacgcttaaaatccgctaaagtgtgtcctttctgactacacctaaagcacttcttctcatc-t 43021  T
Q  202 tggt-acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtc 300  Q
     ||| |||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | |||||||| ||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| |  |    
T  43022 cggtcacaaacattactcttgtggcctttctcacaacacttgaaacaaattatctcagtaggagcatctctcctcttaggcctcctctcatcattcaacc 43121  T
Q  301 tctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 400  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||  |||||||| ||||  |||| |||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  43122 tctgtttacccttgtcagcaggggcactatacggcttcggacgactctactgtcccttgcctcggcgcttactcatcaccttgtaatgagcttttgtatc 43221  T
Q  401 ctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaa 439  Q
    ||| || |||||| ||| ||  |||||||||||||||||    
T  43222 ctcatcatagatcttacagctgcttaccaaatcagagaa 43260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 219 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 50307 - 50186
Alignment:
Q  219 ttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcag 318  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||| ||||| ||||  | |||||||| |||||    | |||||| || ||||| ||||    
T  50307 ttgtggcctttctcaccacaattaaagcagacaatctcagcaggaacatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcag 50208  T
Q  319 caggggcactatacggtttagg 340  Q
    ||||||| ||||| || |||||    
T  50207 caggggcgctataaggcttagg 50186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 33 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 9169 - 8755
Alignment:
Q  33 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 132  Q
    |||||||||| |||||| || || |||||    |||||||||||||  ||||| ||||| | | |||| ||||| || ||||| || ||||||||  |||    
T  9169 gtaccagtcagagcaaacacattaccaccggtcctaaccttcttcgtttgtgtacactgcgaattgatttgaccttcctcattgcagttatagcaaacaa 9070  T
Q  133 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctc 232  Q
    |||| || ||||| ||||  ||||   |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||| || ||||||||||||| ||||||    
T  9069 catctccccgcttacaattagctaatgtgtgtcctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatccttatcacagacattactcttgtggcttttctc 8970  T
Q  233 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatac 332  Q
     ||||||||  | || || |||| ||||| |||||| ||| |  | |||| |||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||     
T  8969 accacacttgtagcaaacaatcttagcagaagcatctctcctcttgggcctcctctcatcattcagcctctgctttcccttgtctgcaggagcactatat 8870  T
Q  333 ggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaat 432  Q
    |||||| ||| | |||| | ||| ||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| || || ||||| || ||||| | || ||| ||||| |    
T  8869 ggtttatgacaactctgctatcctttacctcttcgttcactcataaccttgtcatgagctttagtatcttcctcatatatcctgcagctactcaccaact 8770  T
Q  433 cagagaaaattctaa 447  Q
    |||||||||||||||    
T  8769 cagagaaaattctaa 8755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 68 - 436
Target Start/End: Original strand, 51842 - 52210
Alignment:
Q  68 aaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgaccc 167  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| | ||| || | ||| ||||||| ||| |||||| |  ||||||||||  |||||||||  ||||   |||| ||     
T  51842 aaccttctttggctgcgtacactgtgaactaatattaccttcttcatcacagttatagaaaacaacatcaccatgcttgcaataagctaaagtgtgtcct 51941  T
Q  168 ttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggt-acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagca 266  Q
    ||||  |||||||| ||||||||||||||||| | | | ||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |  ||||||| |||||||    
T  51942 ttcttaccacacctaaagcacttcttctcatc-tcgatcacatacattactcttgtggcctttctcaccacacttgaaacagataatctcagtaggagca 52040  T
Q  267 tccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttc 366  Q
    || ||| | || |||| |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||  |||| |||||||||||||| |    
T  52041 tctctcctcctaggcctcctctcatcattcagcctctgtttacctttgtcagcaggagcactatacagtttcggacggctctgctgtcccttacctctgc 52140  T
Q  367 gctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcaga 436  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||||| ||  |||||||| |||||    
T  52141 gctcactcatcactttataatgagcctttgtatcctcttcataaatcctacagctgcttaccaattcaga 52210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 101; Significance: 7e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 211 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 33342 - 33078
Alignment:
Q  211 cgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacc 310  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || || ||| |||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| |  ||||| || ||    
T  33342 cgttgctcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatttcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctctcatcattcatcctctgttttcc 33243  T
Q  311 cttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtag 410  Q
     ||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||     
T  33242 tttgtcagcaggagcactgtatggtttaggacgactctgctgtcccttaccccttcgctcactcatcaccttgtaatgagctttggtgtcttcctcatat 33143  T
Q  411 atcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgat 475  Q
    ||||| | ||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||| || || ||||| || |||||    
T  33142 atcctgcagctgcttaccaactcagagaaaattctaatcttttgatacccaatagctcttttgat 33078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 99 - 478
Target Start/End: Original strand, 153714 - 154093
Alignment:
Q  99 atgtgaccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcat 198  Q
    |||||||| || ||||| || ||||||||  |||  || || ||||| ||||| ||||   |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  153714 atgtgaccttcctcattgcagttatagcaaacaatgtctccacgcttacaatcagctaatgtgtgtcctttctgaccacacctgaagcacttcttctcat 153813  T
Q  199 ccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaag 298  Q
    |  |   ||| || |||||||| |||| ||| || |||||||| || || || |||||||  |||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| ||    
T  153814 ctctatcacagacattactcttatggcttttttcaccacacttgaagcaaacaatctcagtgggagcatctctcctcttgggcctcctctcatcattcag 153913  T
Q  299 tctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtg 398  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||| |||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||| ||     
T  153914 tcgctgcttacccttgtcagcaggagcactatatggcttcggacgactctgctgtcccttacctctttgttcacccatcaccttgtaatgagctttcgtc 154013  T
Q  399 tcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
    |||||||| || ||||||| ||  |||||||| ||||||||  |||||||||  || || || || || |||||||||||    
T  154014 tcctcctcataaatcctacagctgcttaccaactcagagaagtttctaatcttctgataaccaatggctctcttgatgtc 154093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 27 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 4458 - 4049
Alignment:
Q  27 gtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagc 126  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || |||||    ||||||||||| ||||| || ||||| | ||| || || || || |||||||| || ||||    
T  4458 gtctgcgtaccagtcaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactaatatgtccttcctcattacagttgtagc 4359  T
Q  127 atccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggt-acaaacgttactcttgtggc 225  Q
    |  ||| ||| || ||||||||||| || |   |||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| | | | ||| || ||||| |||| |     
T  4358 aaacaatatccccacgcttgcaatcagccaatgtgtgtcctttctgaccacacctaaagcacttcttctcatc-tcgatcacacacattacttttgtagt 4260  T
Q  226 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggc 325  Q
    ||||||| |||||||| || || |  ||||||| ||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  4259 ctttctcaccacacttgaagcaaataatctcagtaggagcatctctcctcttaggcctcctctcatcattcaacctctgtttacctttgtcagcaggagc 4160  T
Q  326 actatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgactt 425  Q
    |||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||  | ||||    
T  4159 actatacggtttcggacgactctactgtcccttacctctgcgctcactcatcactttataatgagcttttgtatcctcttcatagatcctacaactactt 4060  T
Q  426 accaaatcaga 436  Q
    ||||| |||||    
T  4059 accaattcaga 4049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 33 - 478
Target Start/End: Original strand, 2787 - 3226
Alignment:
Q  33 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 132  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||   ||||||||||||||| ||||  ||||| | |||||| || ||||| ||||| || ||||||||  | |    
T  2787 gtaccagtcagagcaaacactttaccaccggttctaaccttcttcggttgtgcacactgtgaactgatatggccctcctcattgcagttatagcaaacta 2886  T
Q  133 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctc 232  Q
      || || ||||| ||||| ||||   |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   |||||| |||||||||||||||||||     
T  2887 tgtctccccgcttacaatcagctaatgtgtgtcccttctgtccacacctgaagaacttcttctcatctttatcacaaacattactcttgtggcctttctt 2986  T
Q  233 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatac 332  Q
     ||||||||  | || || |||||| |||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| |  ||||| || || ||||||||||| |||||||||    
T  2987 accacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctctcatcattcaacctctgttttcctttgtcagcaggagcactatac 3086  T
Q  333 ggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaat 432  Q
    ||||||||| || |||| ||||  ||||||||      || ||||||||| ||||||||||| || || || || || ||||| | || ||| |||||||    
T  3087 ggtttaggatgactctgctgtcatttacctct------acacatcaccttgtaatgagctttagtatcttcttcatatatcctgcagctactcaccaaat 3180  T
Q  433 cagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
    ||||||||||||| ||||  || || || || || |||||||||||    
T  3181 cagagaaaattcttatcttctgatacccaatggctctcttgatgtc 3226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 66 - 475
Target Start/End: Original strand, 16826 - 17235
Alignment:
Q  66 ctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgac 165  Q
    ||||||||||| | ||| || ||||| | ||| || || || || |||||||| || |||||  ||| ||| || ||||||||||| || |   |||| |    
T  16826 ctaaccttcttagtctgcgtacactgcgaactaatatgtccttcctcattacagttgtagcaaacaatatccccacgcttgcaatcagccaatgtgtgtc 16925  T
Q  166 ccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggt-acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggag 264  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||||||||| | | | ||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |  ||||||| |||||    
T  16926 ctttctgaccacacctaaagcacttcttctcatc-tcgatcacacacattactcttgtggcctttctctccacacttgaaacaaataatctcagtaggag 17024  T
Q  265 catccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctct 364  Q
    |||| ||| |  | |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||| |||| |||||||| ||| |    
T  17025 catctctcctcttaggcctcctctcatcattcagtttctgcttacccttgtcggcaggagcactatacggcttcggacgactctgttgtcccttgccttt 17124  T
Q  365 tcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctata 464  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| || || || ||||  |  |||||||| ||||| ||| | || |||| ||| || || |||    
T  17125 gcgctcactcatcaccttgtaatgagctttggtattctcttcatatattctacatctgcttaccaattcagaaaaattccttatctattgatagccaata 17224  T
Q  465 gccctcttgat 475  Q
    |||||||||||    
T  17225 gccctcttgat 17235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 33 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 9920 - 9505
Alignment:
Q  33 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 132  Q
    |||||||||| |||||| || || ||||||   |||||||||||||| || || || || | ||| || || ||||| ||||| || ||||||||  |||    
T  9920 gtaccagtcagagcaaacaccttaccaccagtcctaaccttcttcggttgcgtacattgtgaacttatatggccctcctcattgcagttatagcaaacaa 9821  T
Q  133 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctc 232  Q
    |||| || ||||| |||||  ||||  |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||| || |||||||||||||| |||||    
T  9820 catctccccgcttacaatcaactagggtgtgtcctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatccttatcacagacattactcttgtggcccttctc 9721  T
Q  233 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatac 332  Q
     ||||||||  | || || || |||||||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| |  || ||||| ||||| |||||| | ||||||||     
T  9720 accacacttgtagcaaacaatatcagcaggagcatctctcctgtttggcctcctctcatcattcatcctttgctttcccttatcagcaagagcactatat 9621  T
Q  333 ggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaat 432  Q
    ||||||||| || |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| || || ||||||||  | ||||| | || ||| ||||| |    
T  9620 ggtttaggatgactctgctgtcctttacctcttcgttcactcatcaccttgtaaagagccttagtatcctcctc--atatcctgcagctactcaccaact 9523  T
Q  433 cagagaaaattctaatct 450  Q
    ||||||| ||||| ||||    
T  9522 cagagaagattcttatct 9505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 34 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 1001 - 767
Alignment:
Q  34 taccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaac 133  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||   |||||||||| |||| || || ||||| | |||||| |||||||||||||| || ||||| ||  |||     
T  1001 taccagtcaaagcaaacactttaccaccggttctaaccttcctcggttgcgtacactgtgaactgatatgaccctcttcattgcagttataacaaacaat 902  T
Q  134 atcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctcg 233  Q
    |||||| ||||||||||| |||||  |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||| |    
T  901 atcaccacgcttgcaatcagctagagtgtgtcctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctttagtacaaacattactcttatggcctttcttg 802  T
Q  234 ccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatc 268  Q
    ||||||||  |||| || |||||||||||||||||    
T  801 ccacacttgtaacaaacaatctcagcaggagcatc 767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 312 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 3920 - 3793
Alignment:
Q  312 ttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtaga 411  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||||| || |  ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  3920 ttgtcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtcctttgctccttcgatcactcatcaccttgtaatgagctttcgtgtcctcctcataga 3821  T
Q  412 tcctaccgcgacttaccaaatcagagaa 439  Q
    | || | || ||||||||| ||||||||    
T  3820 ttctgcagctacttaccaattcagagaa 3793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 133 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 4501 - 4196
Alignment:
Q  133 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctc 232  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||   |||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||  |   |||||| |||||||| |||||||||||    
T  4501 catcaccacgcttacaatcagctaatgtgtgtcctttctgaccacacctgaagcatttcttctcatctctatcacaaacattactcttttggcctttctc 4402  T
Q  233 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatac 332  Q
    ||||||||| || || || || |||| ||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||| | |||    
T  4401 gccacacttgaagcaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcctctcatcatttaaactctgcttacccttgtcagcaggagcagtgtac 4302  T
Q  333 ggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaat 432  Q
    || || |||||| |||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||| || ||||||| ||  ||||||||||    
T  4301 ggcttcggacgactctgttgtcccttgcctctacgttcactcatcaccttgtaatgag-tttcgtatcctcctcataaatcctacagctgcttaccaaat 4203  T
Q  433 cagagaa 439  Q
    |||||||    
T  4202 cagagaa 4196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2062 (Bit Score: 98; Significance: 5e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold2062
Description:

Target: scaffold2062; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 33 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 1025 - 636
Alignment:
Q  33 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactga-----tgtgaccctcttcattacaattatagca 127  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||   |||||||||||||| ||||| ||||| | |||||     ||||||| || || || || ||||||||    
T  1025 gtaccagtcaaagcaaacaccttaccaccagtcctaaccttcttcggttgtgtacactgcgaactgaactgatgtgaccttcctcgttgcagttatagca 926  T
Q  128 tccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcct 227  Q
      |||  ||||| ||||| ||||| |||||  |||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||  |   ||| || |||||||||||||||    
T  925 aacaatgtcaccacgcttacaatcagctagtgtgtgtcctttctgaccacacatgaagcacttcttctcatctctatcacagacattactcttgtggcct 826  T
Q  228 ttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcac 327  Q
    || || |||||||| || || || || ||   ||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  825 ttttcaccacacttgaagcaaacaatatccataggagcatctctcctcttgggcctcctctcatcattcagtcgctgcttacccttgtcagcaggagtac 726  T
Q  328 tatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 417  Q
    |||| || || |||||| |||| |||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| || |||||||    
T  725 tatatggcttcggacgactctgttgtcccttacctctacattcactcatcaccttgtaatgagatttcgtgtcctcctcataaatcctac 636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 98; Significance: 5e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 206 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 5877 - 5644
Alignment:
Q  206 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 305  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||  || | || || |||| ||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| |||||||||    
T  5877 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgtaataaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcctctcatcattcagtctctgc 5778  T
Q  306 ttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcct 405  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| || |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || || || |    
T  5777 ttacccttgtcagcaggagcactatacggcttcggatgactctgctgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttcgtatcttctt 5678  T
Q  406 cgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaa 439  Q
    | |||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  5677 catagatcctacagctgcttaccaaatcagagaa 5644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 98; Significance: 5e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 206 - 475
Target Start/End: Original strand, 115953 - 116222
Alignment:
Q  206 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 305  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||| | ||||| || || |||| ||||||||||||| |  | |||| |||||||||||| ||||||| |    
T  115953 acaaacattactcttgtggcctttttcaccacacatgaaacaaacaatatcagtaggagcatccctcctcttaggcctcctctcatcattcagtctcttc 116052  T
Q  306 ttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcct 405  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    || || |    
T  116053 ttacccttgtcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttcaaatcttctt 116152  T
Q  406 cgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgat 475  Q
    |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||| || |  || || || ||||||||||||||    
T  116153 cacagatcctacagctgcttaccaaatcagagaaatttcttattttctgataaccaatagccctcttgat 116222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1032 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold1032
Description:

Target: scaffold1032; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 33 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 963 - 557
Alignment:
Q  33 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 132  Q
    ||||| ||||||||||| || || ||||||   ||||||||||| ||||| || ||||| | |||||| || || || || || || ||||| ||  |||    
T  963 gtaccggtcaaagcaaacaccttaccaccagtcctaaccttctttggctgcgtacactgcgaactgatatgtccttcctcgttgcagttataacaaacaa 864  T
Q  133 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctc 232  Q
      || || ||||| ||||| |||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |   |||||| ||||||||||||||||| ||    
T  863 tgtccccacgcttacaatcagctagtgtgtgtcccttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctctatcacaaacattactcttgtggcctttttc 764  T
Q  233 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatac 332  Q
     |||||||| || ||  | || || | ||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| |  |||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  763 accacacttgaagcaatcaatgtccgtaggagcatctctcctcttgggcctcctctcatcatttaacctctgcttccccttgtcggcaggagcactatac 664  T
Q  333 ggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaat 432  Q
    || || |||||| | || |||||||| |||||  | |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  | ||||| | || |||||||||||    
T  663 ggcttcggacgactttgctgtcccttgcctctatgttcactcatcaccttgtaatgagctttggtatcttcctcagaaatcctgcagctacttaccaaat 564  T
Q  433 cagagaa 439  Q
    |||||||    
T  563 cagagaa 557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 99 - 440
Target Start/End: Original strand, 5824 - 6165
Alignment:
Q  99 atgtgaccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcat 198  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| ||  ||||||| || ||||||||||| ||||   |||| || ||||||||||| ||||| |||||||||| ||    
T  5824 atgtgtccctcttcatcacaattataacaaacaacatccccacgcttgcaatcagctaatgtgtgtcctttctgtccacatctgaaacacttcttcttat 5923  T
Q  199 ccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaag 298  Q
    |      ||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||  |||||  ||| ||||| ||| | || |||| |||||||||||| ||    
T  5924 ctcaatcacacacattactcttgtggcctttctcaccacacttgaaatagacagtctcattaggggcatctctcctcctaggcctcctctcatcattcag 6023  T
Q  299 tctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtg 398  Q
      |||| || || ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||     
T  6024 catctgttttcctttgtcagcaggagcactatacggtttcggacgactctgctgacccttacctctgcgctcactcatcactttataatgagctttcgta 6123  T
Q  399 tcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaa 440  Q
    ||||| || || || |||  ||  ||||||||||| ||||||    
T  6124 tcctcttcatatattctaaagctgcttaccaaatccgagaaa 6165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1056 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold1056
Description:

Target: scaffold1056; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 105 - 475
Target Start/End: Original strand, 1949 - 2317
Alignment:
Q  105 ccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttgg 204  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||| ||||   | || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||    
T  1949 ccctcttcatcacaattatagcatacaacatc-ccacgcttacaatcagctaaagtatgtcctttctgtccacacctaaagcacttcttctcatc-tcgg 2046  T
Q  205 t-acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctct 303  Q
    | ||| || |||||||||||||||||||| |||||||| || || |  || |||| ||||||||| | | |  | |||| |||||||||||| || ||||    
T  2047 tcacacacattactcttgtggcctttctcaccacacttgaagcaaataatttcagtaggagcatctcacctcttaggcctcctctcatcattcagcctct 2146  T
Q  304 gcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctc 403  Q
    | ||||| ||||||||||  |||||| ||||||| |||||| |||  | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  2147 gtttacctttgtcagcagaagcacta-acggtttcggacgactctactatcccttacctctgcgctcactcatcactttataatgagcttttgtatcctc 2245  T
Q  404 ctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgat 475  Q
     || ||||| |||| ||  ||||| || ||||| ||| |||| ||||  || || || ||||||| ||||||    
T  2246 ttcatagattctacagctgcttactaattcagaaaaatttcttatcttctgataaccaatagcccgcttgat 2317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1517 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold1517
Description:

Target: scaffold1517; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 1650 - 1229
Alignment:
Q  18 tcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattac 117  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||    || |||||||||||||| || ||||| | |||||| ||||| |||||||| |    
T  1650 tcattagtagtctgcgtaccagtcaatgcaaacactttccctccggtcctgaccttcttcggctgagtacactgcgaactgatatgaccttcttcattgc 1551  T
Q  118 aattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttact 217  Q
    | || |||||  |||  || || | ||| || || |||||  |||| |||||||  |||||||| || || ||| || ||||  |   |||| | || ||    
T  1550 agttgtagcaaacaatgtccccacacttacattcagctagggtgtgtcccttctaaccacacctaaaacatttcctcacatctctaccacaagcattgct 1451  T
Q  218 cttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtca 317  Q
    |||||||||||| || ||||||||  |||| || ||||||||||||||||| ||| |  | |||| ||| |||||||| | | |||| || |||||||||    
T  1450 cttgtggcctttttcaccacacttgtaacagacaatctcagcaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcattcattttctgttttcccttgtca 1351  T
Q  318 gcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 417  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  1350 gcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgctgtcccttacctctcctctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtgtcttcctcatatatcctac 1251  T
Q  418 cgcgacttaccaaatcagagaa 439  Q
     ||  |||||||| ||||||||    
T  1250 agctgcttaccaactcagagaa 1229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 227 - 475
Target Start/End: Original strand, 3215 - 3463
Alignment:
Q  227 tttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggca 326  Q
    |||||| |||||||| || || |  ||||||| ||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3215 tttctccccacacttgaagcaaataatctcagtaggagcatctctcctcttgggcctcctctcatcattcaatctctgcttacccttgtcagcaggggca 3314  T
Q  327 ctatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgactta 426  Q
    |||||||| || |||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| | |  |||||    
T  3315 ctatacggcttcggacgactctgttgtcccttgcctctgcgctcactcatcaccttataatgagctttcgtatcctcttcatatatcctgcaggtactta 3414  T
Q  427 ccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgat 475  Q
    |||| ||||| ||  | || |||| ||| || || ||||||||||||||    
T  3415 ccaattcagaaaagttccttatcttttgataaccaatagccctcttgat 3463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 141 - 417
Target Start/End: Original strand, 6069 - 6344
Alignment:
Q  141 cgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacact 240  Q
    ||||||||||| |||||  |||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |   ||| || ||||||||||||||||| || |||||||    
T  6069 cgcttgcaatcagctagtgtgtgtcctttctgaccacatctgaagcacttcttctcatctctatcacagacattactcttgtggcctttttcaccacact 6168  T
Q  241 taaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttagg 340  Q
    | || || || || |||| | ||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| |  || |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||    
T  6169 tgaagcaaacaatgtcagtaagagcatctctcctcttgggcctcctctcatcatttaacct-tgcttacccttgtcagtaggagcactatacggcttcgg 6267  T
Q  341 acgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 417  Q
    |||| |||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  6268 acgactctgctgtcccttgcctctgcgttcactcatcaccttgtaatgagctttcgtgtcctcctcataaatcctac 6344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 168 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 555 - 284
Alignment:
Q  168 ttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcat 267  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |   ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||   ||||||||    
T  555 ttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctgtatcacaaacactacttttgtggcctttctcgccacacttgaaacaaacaatatctataggagcat 456  T
Q  268 ccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcg 367  Q
    | ||| |  | ||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||| | || |||||||||||||| ||    
T  455 ctctcctcttgggccttctctcatcatttaacctctgcttacccttgtcagaaggagcactatacggcttcggacgactgtgctgtcccttacctctacg 356  T
Q  368 ctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaa 439  Q
     | |||||||||||| |||||||||||  |||||||||| || ||||| |  |  |||||||||||||||||    
T  355 tttactcatcaccttgtaatgagctttcctgtcctcctcataaatcctgcaactgcttaccaaatcagagaa 284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 400
Target Start/End: Original strand, 41876 - 42258
Alignment:
Q  18 tcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattac 117  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||  |||||||||||  |  ||||| | |||||| ||||| ||  |||| |    
T  41876 tcattaggagtctgcgtaccagtcaaagcaaacacctttcccccaattctagtcttcttcggctcaggacactgtgaactgatatgaccttccccattgc 41975  T
Q  118 aattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttact 217  Q
    | || || ||  |||  || || |||||||| || ||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||  |   |||||| |||||    
T  41976 agttgtaacagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctcttccacaaacattact 42075  T
Q  218 cttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtca 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  | || || |||||| |||||||||| ||| |  | |||| ||| ||||||   |   ||||||| || ||||||    
T  42076 cttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgtca 42175  T
Q  318 gcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 400  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  42176 gcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccctcctctcactcataatcttataatgagctttggtgtc 42258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1426 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold1426
Description:

Target: scaffold1426; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 1762 - 1388
Alignment:
Q  26 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 125  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||  ||||||||||||||| |  |  ||||| | |||||| ||||||||| |||| || || |||    
T  1762 agtctgcgtaccagtcaatgcaaacactttgcccccagttctaaccttcttcggttcgggacactgtgaactgatatgaccctctccattgcagttgtag 1663  T
Q  126 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggc 225  Q
    ||   ||  || || |||||||| || ||||   |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||   |||||| ||||||||||| |    
T  1662 cagataatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtgtcccttctgaccacacctgaagcacttcctctcatctttaccacaaacattactcttgtgtc 1563  T
Q  226 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggc 325  Q
    ||||||| ||||||||  |||| || ||||||| ||||||||| ||| |  | |||| ||| |||||| | |   ||||||| || ||||||||||| ||    
T  1562 ctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagaaggagcatctctcctcttaggcctcctatcatcactcatcttctgctttcctttgtcagcaggagc 1463  T
Q  326 actatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 400  Q
    ||| || || ||| |||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| |  || |||||||||||||||||    
T  1462 actgtaaggcttatgacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatgttgtaatgagctttggtgtc 1388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 33 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 432 - 71
Alignment:
Q  33 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 132  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||    |||||||||||||| || || || || | ||| || ||||| || ||||| || ||||| ||  |||    
T  432 gtaccagtcaaagcaaacaccttgccaccggtcctaaccttcttcggttgcgtacattgcgaactaatatgaccttcctcattgcagttataacaaacaa 333  T
Q  133 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctc 232  Q
      || || ||||| ||||| |||||  |||| |  ||||| |||||| |||||||||||||||||||  |   ||| || ||||||||||||||||||||    
T  332 tgtccccacgcttacaatcagctagtgtgtgtcttttctgaccacacatgaagcacttcttctcatctctatcacagacattactcttgtggcctttctc 233  T
Q  233 gccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatac 332  Q
    ||||||||| || || || || |||| |||||| || ||  |  | |||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||| | |||    
T  232 gccacacttgaagcaaacaatatcagtaggagcctctctgctcttgggcctcctctcatcatttaacctctgcttacccttgtcagcaggagcattttac 133  T
Q  333 ggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagcttt 394  Q
    || || |||||| |||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  132 ggcttcggacgactctgctgtcccttgcctctgcgttcactcatcaccttgtaatgagcttt 71  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 160 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 514374 - 514134
Alignment:
Q  160 tgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagc 259  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||   |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||  |||| || |||||||     
T  514374 tgtgtcccttctgaccacacctgaagcacttcctctcgtctttaccacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcaga 514275  T
Q  260 aggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtccctta 359  Q
    ||||||||| ||| |  | |||| ||| |||||||| |   ||| ||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||||    
T  514274 aggagcatctctcctcttaggcctcctatcatcattcatcttcttctttcctttgtcagcaggagcactttaaggcttaggacgattctgctgtccctta 514175  T
Q  360 cctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 400  Q
    || || | ||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  514174 cccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtc 514134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 400
Target Start/End: Original strand, 610 - 984
Alignment:
Q  26 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 125  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| || || || |||  ||||||||||||||| |  |  ||||| | ||| || ||||||||| |||| || || |||    
T  610 agtctgcgtaccagtcaatgcaaacaccttgcccccagttctaaccttcttcggttcaggacactgtgaacttatatgaccctctccattgcagttgtag 709  T
Q  126 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggc 225  Q
    ||  |||  || || ||||| || || ||||   ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||   |||||| || ||||||||||    
T  710 cagacaatgtccccacgcttacattcagctaaattgtgacccttctgaccgcacctgaagcacttcctctcatctttaccacaaacattgctcttgtggc 809  T
Q  226 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggc 325  Q
    |||| || ||||||||  |||| || ||||||| ||||||||| ||| |  | |||| ||| |||||| | |   ||| ||| || ||||||||||| ||    
T  810 ctttttcaccacacttgtaacaaacaatctcagaaggagcatctctcctcttaggcctcctatcatcaatcaacttctactttcctttgtcagcaggagc 909  T
Q  326 actatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 400  Q
    ||| || || |||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  910 actgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtc 984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 70 - 415
Target Start/End: Original strand, 11170 - 11515
Alignment:
Q  70 ccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgaccctt 169  Q
    ||||||||||||| || ||||| |  ||||| |||||||||||||| || || |||||  |||  || || ||||| || || |||||   ||| |||||    
T  11170 ccttcttcggctgagtacactgtgagctgatatgaccctcttcattgcagttgtagcagacaatgtccccacgcttacattcagctagtgcgtgtccctt 11269  T
Q  170 ctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatcc 269  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||  |   |||| | || |||||||||||||| || ||||||||  |||| || ||||||| |||||||||     
T  11270 ctgaccacacctgaagcacttcctctcatctctaccacaagcattgctcttgtggcctttttcaccacacttgtaacaaacaatctcagaaggagcatct 11369  T
Q  270 ctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgct 369  Q
    ||| |  | || | ||| |||||||| |   ||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||||||| |||| || |||||||| || | ||    
T  11370 ctcctcttaggactcctatcatcattcaaaatctgctttcctttgtcagcaggagcactataaggcttaggacgaatctgctgacccttacccctcctct 11469  T
Q  370 cactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcct 415  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  11470 cactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcctcataaatcct 11515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 102 - 472
Target Start/End: Original strand, 36723 - 37093
Alignment:
Q  102 tgaccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatcct 201  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||  ||| |||||  ||||||||||| |||| | | ||||||||||  ||||||| ||| || |||||| | ||||    
T  36723 tgaccctcttccttgcaattaaagcacacaatatcactacgcttgcaatcagctaacgtatgacccttcttgccacaccggaaacatttcttcacctcct 36822  T
Q  202 tggtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtct 301  Q
      | |||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||| ||||  | |||||||| |||||    | |||    
T  36823 ctggacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacagacgatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattct 36922  T
Q  302 ctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 400  Q
    ||| || ||||| ||||||||||||||||| || |||||  || |||| || ||||||  |||| |||||| | |  ||||| |||||||||||||||||    
T  36923 ctgtttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggagactctgctggccctta-gtcttccgctcatttacaaccttgtaatgagctttggtgtc 37021  T
Q  401 ctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctctt 472  Q
    |||||| ||||| |||| |    | ||||||||||  |||| ||  |||||||||||||| || ||||||||    
T  37022 ctcctcatagattctacagttgttcaccaaatcaggaaaaactcggatctgttggtatccaattgccctctt 37093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 219 - 450
Target Start/End: Original strand, 251961 - 252192
Alignment:
Q  219 ttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcag 318  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||| || ||||||| ||| |  | |||| ||| |||||||| |   | || || ||  || |||    
T  251961 ttgtggcctttttcaccacacttgaaacacacaatctcaacaagagcatctctcctcttgggcctcctatcatcattcatcttatgttttcctgtggcag 252060  T
Q  319 caggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctacc 418  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |     
T  252061 caggagcactgtaaggtttaggacgattatgttgtcccttacccctcctctcactcatcaccttgtaatgagctttggtgtcttcctcatatatcctgca 252160  T
Q  419 gcgacttaccaaatcagagaaaattctaatct 450  Q
    ||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  252161 gctgcttaccaattcagagaaaattctaatct 252192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 206 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 229827 - 229555
Alignment:
Q  206 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 305  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||| ||||| | |||||||| |||||    | ||||||     
T  229827 acaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacaaacaatctccgcaggagcatccttcttattaggccgcctatcatcgaccattctctgt 229728  T
Q  306 ttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcc 404  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||| ||  |||||  |||| | |||| |||  ||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  229727 ttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggtcctta-gtcttcctctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcctcc 229629  T
Q  405 tcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
    || || || || | || | | ||||||||||  |||| ||  |||||||||||||  || |||||||| |||||    
T  229628 tcataaattctgcagctattaaccaaatcaggaaaaactcggatctgttggtatctgatcgccctcttaatgtc 229555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 33 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 63667 - 63377
Alignment:
Q  33 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaa 132  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||     ||||||||||| ||||| || ||||| | |||||| ||||| || |||||| | || |||||  |||    
T  63667 gtaccagtcaaagcaaacaccttgccacttgtcctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcctcattatagttgtagcaaacaa 63568  T
Q  133 catcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggt-acaaacgttactcttgtggcctttct 231  Q
     ||| ||  |||| ||||| ||||   |||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||| |    
T  63567 tatccccatgcttacaatcagctaaagtgtgtcctttctgaccacacctgaaacacttcttctcatc-tcggtcacaaacattactcttgtggcctttat 63469  T
Q  232 cgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggg 323  Q
    | |||||||| ||||| || || |||| ||||||||| ||| |  | |||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  63468 caccacacttgaaacaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcctctcatcattcaatctttgcttacccttgtcagcaggg 63377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 346 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 63374 - 63284
Alignment:
Q  346 tctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcaga 436  Q
    |||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||||| || ||||||||| |||||    
T  63374 tctgctgtaccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttcgtatcctcttcataaatcctacagctacttaccaattcaga 63284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 4)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 285 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 12310 - 12160
Alignment:
Q  285 ctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttat 384  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||| | || | |||||| ||||| || |||||||||||||| |    
T  12310 ctctcatcattcagtctctgcttacccttgtcagcaggagcactgtacggcttcggacgactatgctatcccttgcctctacgatcactcatcaccttgt 12211  T
Q  385 aatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcag 435  Q
    ||||| |||| || |||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||    
T  12210 aatgatctttcgtatcctcctcataaatcctacagctgcttaccaaatcag 12160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 285 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 20490 - 20340
Alignment:
Q  285 ctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttat 384  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||| | || | |||||| ||||| || |||||||||||||| |    
T  20490 ctctcatcattcagtctctgcttacccttgtcagcaggagcactgtacggcttcggacgactatgctatcccttgcctctacgatcactcatcaccttgt 20391  T
Q  385 aatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcag 435  Q
    ||||| |||| || |||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||    
T  20390 aatgatctttcgtatcctcctcataaatcctacagctgcttaccaaatcag 20340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 175 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 12418 - 12352
Alignment:
Q  175 cacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacactt 241  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12418 cacacctaaagcacttcttctcatctttacgaaaaacattactcttgtggcctttctcgccacactt 12352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 175 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 20598 - 20532
Alignment:
Q  175 cacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacactt 241  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20598 cacacctaaagcacttcttctcatctttacgaaaaacattactcttgtggcctttctcgccacactt 20532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0276 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0276
Description:

Target: scaffold0276; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 160 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 23944 - 23704
Alignment:
Q  160 tgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagc 259  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||  |   ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||  | || || |||||| |    
T  23944 tgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctcttccacatacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtatcaaacaatctcaac 23845  T
Q  260 aggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtccctta 359  Q
    ||||||||| ||| |  | |||| ||| ||||||   |   ||||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||||||| |||| |||||||||    
T  23844 aggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgttgtccctta 23745  T
Q  360 cctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 400  Q
    || || | ||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  23744 cccctcctctcactcataatcttataatgagttttggtgtc 23704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1845 (Bit Score: 64; Significance: 9e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold1845
Description:

Target: scaffold1845; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 180 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 1305 - 1070
Alignment:
Q  180 ctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcg 279  Q
    |||||||||||| |||||||  |   |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||||||||| ||| |  | |    
T  1305 ctgaagcacttcctctcatctctaccacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagcaggagcatctctcctcttgg 1206  T
Q  280 gccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcac 379  Q
    | | ||| |||||||| |   ||||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||  |||||||| || || | ||||||||| |     
T  1205 gtctcctatcatcattcatcttctgctttcctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattcttctgtccctttcccctcctctcactcattat 1106  T
Q  380 cttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcct 415  Q
    ||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  1105 cttgtaatgagctttggtgtcttcttcgtaaatcct 1070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 213 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 16577 - 16375
Alignment:
Q  213 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttaccct 312  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||  | || || | ||||||||||| |||  |||| || |||| |||||||||||| |  || |||||||| |    
T  16577 ttactcttgtggcccttctcaccacacttgtagcaaacaacctcagcaggagtatctttctttctaggcctcctctcatcattcaccctttgcttacctt 16478  T
Q  313 tgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagat 412  Q
    | |||||||| |||||||| || || |||||| |||| || | |||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  16477 tatcagcaggagcactataaggctttggacgactctgctgactcttacccctccgctcactcataaccttgtaatgagctttggtatcttcctcatagat 16378  T
Q  413 cct 415  Q
    |||    
T  16377 cct 16375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 216 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 30291 - 30092
Alignment:
Q  216 ctcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgt 315  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| |||| || |||||||||||||||||  || |  | |||| ||| |||||||| |   |||| || || ||||    
T  30291 ctcttgtggcctttttcaccacacttataacaaacaatctcagcaggagcatctttcctcttgggcctcctgtcatcattcatcttctgtttccctttgt 30192  T
Q  316 cagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcct 415  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||| || | ||||||||| | ||  ||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  30191 cagcaggagcactgtaaggtttaggacgattctgttatcccttacccctcctctcactcattatctagtaatgagcttttgtgtcctcctcatatatcct 30092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 279 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 762 - 625
Alignment:
Q  279 ggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatca 378  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  762 ggcctcctctcatcattcagtctctatttacctttgtcagcaggagcactgtacggtttcggacgactctgctgtcccttacctctacactcactcatca 663  T
Q  379 ccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 417  Q
    ||||||  |||||||| || ||||| || || |||||||    
T  662 ccttat-gtgagcttttgtatcctcttcataaatcctac 625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0451 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0451
Description:

Target: scaffold0451; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 206 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 14007 - 13798
Alignment:
Q  206 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 305  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||| ||||  | |||||||| |||||    | ||||||     
T  14007 acaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgt 13908  T
Q  306 ttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcc 404  Q
    || ||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||| |||| || ||||||  |||| |||||| | |  ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  13907 ttgcccttatcatcaggggcactatagggcttagggcgactctgttggccctta-gtcttccgctcattaacaaccttgtaatgagctctggtgtcctcc 13809  T
Q  405 tcgtagatcct 415  Q
    |||||||||||    
T  13808 tcgtagatcct 13798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0289 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0289
Description:

Target: scaffold0289; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 206 - 417
Target Start/End: Original strand, 117 - 328
Alignment:
Q  206 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 305  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||| ||||  | |||||||| |||||    | ||||||     
T  117 acaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacagacaatctctgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgt 216  T
Q  306 ttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcc 404  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||  | ||||||  |||| |||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  217 tttcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgccggccctta-gtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagctttggtgtcctcc 315  T
Q  405 tcgtagatcctac 417  Q
    || ||||| ||||    
T  316 tcatagattctac 328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 206 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 67083 - 66817
Alignment:
Q  206 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 305  Q
    |||||| || |||||||||||||| || ||||||||| |||| || ||||| | ||||||||| ||| |  | || | ||| |||||||| |   ||| |    
T  67083 acaaacattgctcttgtggcctttttcaccacacttataacaaacaatctcggaaggagcatctctcctcttgggtctcctatcatcattcatcatctac 66984  T
Q  306 ttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcct 405  Q
    || || |||||| |||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||| || || | ||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  66983 tttcctttgtcaacaggagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttgcccctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcct 66884  T
Q  406 cgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctctt 472  Q
    | || ||||| | ||   |||||||||||||||| | ||| ||||| || || || ||||| |||||    
T  66883 cataaatcctgcagctgtttaccaaatcagagaacactctgatctgctgatacccaatagctctctt 66817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2165 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold2165
Description:

Target: scaffold2165; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 160 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 824 - 584
Alignment:
Q  160 tgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagc 259  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||| |||| || ||   |||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||  |||| || |||||||     
T  824 tgtgtcccttttgaccacacctgaagcacttcctctcgtctttaccacaaacattgctcttgtggcctttctcaccaaacttgtaacaaacaatctcaga 725  T
Q  260 aggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtccctta 359  Q
    ||||||||| ||| |  | |||| ||| |||||||| |   ||||||| || ||||||  ||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||||    
T  724 aggagcatctctcctcttaggcctcctatcatcattcatcttctgctttcctttgtcaataggagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtccctta 625  T
Q  360 cctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 400  Q
    || || | || |||||| | ||| |||| | ||||||||||    
T  624 cccctcctctaactcattatcttgtaataaactttggtgtc 584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 206 - 477
Target Start/End: Original strand, 17489 - 17760
Alignment:
Q  206 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 305  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||| ||||  | |||||||| |||||    | ||| ||     
T  17489 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaaacagacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctatgt 17588  T
Q  306 ttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcc 404  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||| || ||||||  |||| |||||| |||  ||| | |||||||| ||||| ||||||    
T  17589 ttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggccctta-gtcttccgctcattcacaaccgtgtaatgagccttggtatcctcc 17687  T
Q  405 tcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgt 477  Q
    || || || || | || | | ||||||||||  |||| ||  |||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  17688 tcataaattctgcagctattaaccaaatcaggaaaaactcggatctgttggtatccgattgccctcttaatgt 17760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0457 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0457
Description:

Target: scaffold0457; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 301 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 13934 - 13757
Alignment:
Q  301 tctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 400  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  13934 tctgctttcctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttttaatgagctttggtgtc 13835  T
Q  401 ctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
     || || ||||| ||||  |   | ||||| |||||||| | ||| ||||| || ||||  ||||| |||||||||||    
T  13834 ttcttcatagattctacacctgttaaccaactcagagaagactctgatctgctgatatctaatagctctcttgatgtc 13757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 206 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 139585 - 139313
Alignment:
Q  206 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 305  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || ||    |||||||| |||| |||||||||  | |||||||| |||||    | ||||||     
T  139585 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcaagtaatctcagctggagtatccctcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgt 139486  T
Q  306 ttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcc 404  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||| || |||||   |||| |||||| |||  ||||| |||||||| || || || |||    
T  139485 ttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgctggccctt-ggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagcctttgtatcttcc 139387  T
Q  405 tcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
    ||||||||||| | || | | || ||||||| ||||||||  | |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  139386 tcgtagatcctgcagctattcactaaatcagggaaaattcggagctgttgatatccgatcgccctcttgatgtc 139313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1220 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1220
Description:

Target: scaffold1220; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 162 - 460
Target Start/End: Original strand, 21 - 319
Alignment:
Q  162 tgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcag 261  Q
    ||||||||||  ||||||| ||| || |||||| | ||||| | |||||| || || |||||||||||||| |||||  | ||||| || ||||| |||     
T  21 tgacccttcttgccacaccggaaacatttcttcacctcctttggacaaacattgcttttgtggcctttctcaccacaaatgaaacagacaatctccgcaa 120  T
Q  262 gagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacc 361  Q
    |||||||| ||||  | |||||||| |||||   ||  ||||  || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||| || ||||||      
T  121 gagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgacaatactctatttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggccctta-g 219  T
Q  362 tctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcc 460  Q
    |||| |||||| |||  ||||| | ||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||   | ||||||||||  |||| ||| |||| |||||||||    
T  220 tcttccgctcattcacaaccttgtgatgagctttggtgtcttcctcataaatcctacagctgttcaccaaatcaggaaaaactctgatcttttggtatcc 319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 216 - 406
Target Start/End: Original strand, 32218 - 32408
Alignment:
Q  216 ctcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||  | |||||||| |||||    | ||| || || ||||| |    
T  32218 ctcttgtggcctttctcgccacaattaaaacagacaatctcagcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctttgtttgcccttat 32317  T
Q  316 cagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctc 406  Q
    ||||| |||| ||||| || ||||| ||| |||| || ||||||  |||| |||||| |||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  32318 cagcaagggcgctatagggcttagggcgactctgctggccctta-gtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcctcctc 32408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 206 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 10214 - 10062
Alignment:
Q  206 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 305  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| | || ||||| || || || |||||||||||| ||||  | |||||||| |||||    | |||||||    
T  10214 acaaacattactcttgtggcctttcccgccatagttgaaacaaacaatatccgcaggagcatccttcttctttggccgcctatcatcgaccattctctgc 10115  T
Q  306 ttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtccctt 358  Q
    || ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||| |||| || |||||    
T  10114 ttgcccttatcagcaagggcactataaggtttagggcgactctgctgaccctt 10062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 206 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 12869 - 12717
Alignment:
Q  206 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 305  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| | || ||||| || || || |||||||||||| ||||  | |||||||| |||||    | |||||||    
T  12869 acaaacattactcttgtggcctttcccgccatagttgaaacaaacaatatccgcaggagcatccttcttctttggccgcctatcatcgaccattctctgc 12770  T
Q  306 ttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtccctt 358  Q
    || ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||| |||| || |||||    
T  12769 ttgcccttatcagcaagggcactataaggtttagggcgactctgctgaccctt 12717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 66 - 231
Target Start/End: Original strand, 12916 - 13081
Alignment:
Q  66 ctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgac 165  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| | |||||| ||||| ||||||||||| || |||||  ||||||| || ||||| ||||| ||||   |||| |    
T  12916 ctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccccacgcttacaatcagctaaagtgtgtc 13015  T
Q  166 ccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttct 231  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||||| ||   |  ||| || |||||||||||||||||||    
T  13016 ctttctgaccacacctaaagcacttcttctcgtcacggtcacatacattactcttgtggcctttct 13081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 415
Target Start/End: Original strand, 19821 - 19936
Alignment:
Q  300 ctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgt 399  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||| || |||||| || | |||||| |||  | ||| |||||||  ||||| |    
T  19821 ctctgttttcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgctgacccttagctttccgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtat 19920  T
Q  400 cctcctcgtagatcct 415  Q
    ||||||| ||||||||    
T  19921 cctcctcatagatcct 19936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0285 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0285
Description:

Target: scaffold0285; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 206 - 478
Target Start/End: Original strand, 5327 - 5599
Alignment:
Q  206 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 305  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||| ||||  | |||||||| |||||    | ||||||     
T  5327 acaaacattactcttatggcccttctcgccacagttgaaacaaacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgt 5426  T
Q  306 ttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcc 404  Q
    || ||||| |||||| |||||||||| || ||||| ||| |||| || |||||   |||| |||||| |||  ||||| |||||||| || || |||||     
T  5427 ttgcccttatcagcaagggcactataaggcttagggcgactctgctggccctt-ggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcctca 5525  T
Q  405 tcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
    || ||||| || | || | | ||||||||||  |||| ||  |||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  5526 tcatagattctgcagctattcaccaaatcaggaaaaactcggatctgttggtatccgatcgccctcttaatgtc 5599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 206 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 15016 - 14817
Alignment:
Q  206 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 305  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| | |||||||||| ||||  | ||| |||| |||||    | ||||||     
T  15016 acaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaatctccgtaggagcatccttcttcttaggctgcctatcatcgaccattctctgt 14917  T
Q  306 ttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcc 404  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||| || ||||||  |||| |||||| |||  ||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  14916 ttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggccctta-gtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcctcc 14818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 206 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 11331 - 11197
Alignment:
Q  206 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 305  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| | |||||||||| ||||  | ||| |||| |||||    | ||||||     
T  11331 acaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaatctccgtaggagcatccttcttcttaggctgcctatcatcgaccattctctgt 11232  T
Q  306 ttacccttgtcagcaggggcactatacggtttagg 340  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  11231 ttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagg 11197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 213 - 349
Target Start/End: Original strand, 104562 - 104698
Alignment:
Q  213 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttaccct 312  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  || | || || |||||| ||||||||||  |||| || ||||||||||||||| | | |||||| || ||||    
T  104562 ttactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcaaacaatctcaacaggagcatctttctttctaggccgcctctcatcaatcattctctgttttccct 104661  T
Q  313 tgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctg 349  Q
    | |||||||| |||||||| || || |||||| ||||    
T  104662 tatcagcaggagcactataaggctttggacgactctg 104698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0993
Description:

Target: scaffold0993; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 358
Target Start/End: Original strand, 1318 - 1463
Alignment:
Q  213 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttaccct 312  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  || |||| || |||||| ||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||||   | |||||| |||||||    
T  1318 ttactcttgtggcctttctcaccacaagtataacaaacaatctcaacaggagcttccatctttctcgggcgcctatcatcaaccattctctgtttaccct 1417  T
Q  313 tgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtccctt 358  Q
    | |||||||| ||||| || || ||||| ||| |||| || |||||    
T  1418 tatcagcaggagcactgtaaggcttagggcgactctgttggccctt 1463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 241
Target Start/End: Original strand, 12080 - 12161
Alignment:
Q  160 tgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacactt 241  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||  |   |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12080 tgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctcttccacaaacattactcttgtggcctttctcaccacactt 12161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 81
Target Start/End: Original strand, 11950 - 12013
Alignment:
Q  18 tcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggct 81  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||  |||||||||||    
T  11950 tcattaggagtctgtgtaccagtcaaagcaaacacctttccaccaattctagtcttcttcggct 12013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 472
Target Start/End: Original strand, 379 - 635
Alignment:
Q  216 ctcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgt 315  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| ||||| |||| || |||||||| || ||    |  ||||| || ||||| |    
T  379 ctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacaaacaatctcagcaggaacatccttcttccttggccgcctatcttcgaccatcctctgtttgcccttat 478  T
Q  316 cagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcc 414  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| ||| |||| || ||||||  |||| ||||||  ||  ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||    
T  479 cagcaggggcgctataaggcttagggcgactctgctggccctta-gtcttccgctcatacacaaccttgtaatgagccttagtgtcctcctcataaatcc 577  T
Q  415 taccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctctt 472  Q
    | |  |  || ||||| ||||||| || || ||||| |||||| || || ||||||||    
T  578 tgcaactgctcaccaactcagagagaactcgaatcttttggtaaccaattgccctctt 635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 406
Target Start/End: Original strand, 48066 - 48259
Alignment:
Q  213 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttaccct 312  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  || | || || |||||| ||||||||||  |||| || || ||||||||||||   | |||||| |||||||    
T  48066 ttactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcagacaatctcaacaggagcatctttctttctagggcgcctctcatcaaccattctctgtttaccct 48165  T
Q  313 tgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctc 406  Q
    | |||||||| ||||| || || ||||||||| |||| || || ||  || |||||||| |||  | ||| |||||||  ||||| ||||||||    
T  48166 tatcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgctgacctttggcttttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatcctcctc 48259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 213 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 55439 - 55246
Alignment:
Q  213 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttaccct 312  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  || | || || |||||| ||||||||||  |||| || || ||||||||||||   | |||||| |||||||    
T  55439 ttactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcagacaatctcaacaggagcatctttctttctagggcgcctctcatcaaccattctctgtttaccct 55340  T
Q  313 tgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctc 406  Q
    | |||||||| ||||| || |  ||||||||| |||| || || ||  || |||||||| |||  | ||| |||||||  ||||| ||||||||    
T  55339 tatcagcaggagcactgtaagtcttaggacgactctgctgacctttgtcttttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatcctcctc 55246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0679 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0679
Description:

Target: scaffold0679; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 366 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 850 - 766
Alignment:
Q  366 cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatct 450  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||| || ||| ||||| ||||| ||  |||||||||    
T  850 cgctcactcatcaccttataatgagctttggtatcatcctcataaatcctacagctactcaccaactcagaaaagtttctaatct 766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 366 - 450
Target Start/End: Original strand, 25949 - 26033
Alignment:
Q  366 cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatct 450  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||| || ||| ||||| ||||| ||  |||||||||    
T  25949 cgctcactcatcaccttataatgagctttggtatcatcctcataaatcctacagctactcaccaactcagaaaagtttctaatct 26033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 216 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 36785 - 36641
Alignment:
Q  216 ctcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgt 315  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||| || ||||| || || ||    |  || || || ||||| |    
T  36785 ctcttatggcctttctcgccacaattaaaacagacaatctcagcaggagcatccttcttccttggccgtctatcctcgaccatcctttgtttgcccttat 36686  T
Q  316 cagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttac 360  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||| |||| || |||||||    
T  36685 cagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttac 36641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 328
Target Start/End: Original strand, 26679 - 26803
Alignment:
Q  204 gtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctct 303  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| |||||  || | || || | |||||||| || |||  |||| || |||| |||||||||||| | ||| |    
T  26679 gtacaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcaaacaacctcagcagtagtatctttctttctaggcctcctctcatcattcactcttt 26778  T
Q  304 gcttacccttgtcagcaggggcact 328  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||    
T  26779 gcttacccttaccagcaggagcact 26803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2059 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold2059
Description:

Target: scaffold2059; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 744 - 601
Alignment:
Q  206 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 305  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| ||||| || |||||    |||||||| ||||||||||||||  | |||||||| |||||    | ||||||     
T  744 acaaacattactcttgtggtctttctcaccacaattgaaacaagtaatctcagctggagcatccctcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgt 645  T
Q  306 ttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctg 349  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||    
T  644 ttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctg 601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 359
Target Start/End: Original strand, 453 - 596
Alignment:
Q  216 ctcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgt 315  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||| | ||||  | || ||||| |||||    | |||||| || ||||| |    
T  453 ctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaatctcagcaggagcattcttcttcttaggtcgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttat 552  T
Q  316 cagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtccctta 359  Q
    ||||||| |||||||| || ||||| ||| |||| || ||||||    
T  553 cagcaggagcactatagggcttagggcgactctgctggccctta 596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 349
Target Start/End: Original strand, 208 - 351
Alignment:
Q  206 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 305  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||| || || || |||||||||||| ||||  | |||  ||| |||||    | |||||||    
T  208 acaaacattactcttgtggcctttcccgccacagttgaaacaaacaatatccgcaggagcatccttcttctttggcttcctatcatcgaccattctctgc 307  T
Q  306 ttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctg 349  Q
    || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  308 ttgcccttatctgcaggggcactataaggtttagggcgactctg 351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 328
Target Start/End: Original strand, 7209 - 7324
Alignment:
Q  213 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttaccct 312  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||  || | || || |||||| ||||||||||  |||| || |||| |||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  7209 ttactcttatggcctttctcaccacaagtatagcaaacaatctcaacaggagcatctttctttctaggcctcctctcatcattcattctttgcttaccct 7308  T
Q  313 tgtcagcaggggcact 328  Q
    | |||||||| |||||    
T  7309 tatcagcaggagcact 7324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 328
Target Start/End: Original strand, 14339 - 14454
Alignment:
Q  213 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttaccct 312  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||  || | || || |||||| ||||||||||  |||| || |||| |||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  14339 ttactcttatggcctttctcaccacaagtatagcaaacaatctcaacaggagcatctttctttctaggcctcctctcatcattcattctttgcttaccct 14438  T
Q  313 tgtcagcaggggcact 328  Q
    | |||||||| |||||    
T  14439 tatcagcaggagcact 14454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 28949 - 28631
Alignment:
Q  160 tgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagc 259  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||| || |||||  | ||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||    |||| |||    
T  28949 tgtgacccttcttgccacaccggaaacatttctttacctccttaggacaaacattgctcttgtggcctttctcgccacaattgaaacaggtaatcttagc 28850  T
Q  260 aggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtccctta 359  Q
    |||| ||||| ||||  | ||||| ||||| ||    | |||||| || ||||| ||| ||||||||||||| || ||||| | |  ||| || ||||||    
T  28849 aggaacatccttcttcttaggccgtctctcctcgaccattctctgtttgcccttatcaacaggggcactatatggcttagggcaacactgctggccctta 28750  T
Q  360 cctcttc-gctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtat 458  Q
      ||||| ||||| | |  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||   | || ||||| |  |||||||  ||||||||||||    
T  28749 -gtcttctgctcattaacaaccttgtaatgagctctggtgtcctcctcgtagattctgcagctgttcactaaatctggaaaaattcggatctgttggtat 28651  T
Q  459 cctatagccctcttgatgtc 478  Q
    || || |||||||| |||||    
T  28650 ccgatcgccctcttaatgtc 28631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 40436 - 40273
Alignment:
Q  252 atctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgat 351  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||| ||||| ||||||   | |||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||| |||| |    
T  40436 atctcagcaggagcatctttctttctcgggcgcctatcatcaaccactctctgttttcccttatcagcaggggcactgtaaggcttaggacgactctgtt 40337  T
Q  352 gtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcct 415  Q
    | |||||  |  |||||||| |||  | ||| |||||||  ||||| ||||||||||| |||||    
T  40336 gacccttggcctttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatcctcctcgtaaatcct 40273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 13099 - 12956
Alignment:
Q  206 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 305  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||| || || || |||||||||||| ||||  | |||  ||| |||||    | |||||||    
T  13099 acaaacattactcttgtggcctttcccgccacagttgaaacaaacaatatccgcaggagcatccttcttctttggcttcctatcatcgaccattctctgc 13000  T
Q  306 ttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctg 349  Q
    || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  12999 ttgcccttatctgcaggggcactataaggtttagggcgactctg 12956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 241
Target Start/End: Original strand, 30083 - 30298
Alignment:
Q  26 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 125  Q
    |||||| |||||| |||| ||||| || |||||||||  |||||||||||||||||  |  ||||| | |||||| ||||||||| |||| || || ||     
T  30083 agtctgcgtaccaatcaatgcaaacacctttccaccatttctaaccttcttcggctcaggacactgcgaactgatatgaccctctccattgcagttgtaa 30182  T
Q  126 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggc 225  Q
    ||  |||  || || ||||| || || |||||  |||| |  ||||| ||||||||||| |||||| |||||||  |   ||||||||| || |||||||    
T  30183 cagacaatgtccccacgcttacattcagctaggttgtgtcttttctgaccacacctgaatcacttcctctcatctctaccacaaacgttgcttttgtggc 30282  T
Q  226 ctttctcgccacactt 241  Q
    ||||||| ||||||||    
T  30283 ctttctcaccacactt 30298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 301 - 400
Target Start/End: Original strand, 30334 - 30433
Alignment:
Q  301 tctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 400  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||||||| |||| |||||||| || || | |||||||||   ||| |||||||||||||||||    
T  30334 tctgctttcctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgctgtcccttgcccctcctctcactcattgtcttgtaatgagctttggtgtc 30433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 292
Target Start/End: Original strand, 21944 - 22019
Alignment:
Q  217 tcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatc 292  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||| || ||||| || |||||    
T  21944 tcttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaatctcagcaggagcatccttcttccttggccgtctatcatc 22019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 292
Target Start/End: Original strand, 37368 - 37443
Alignment:
Q  217 tcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatc 292  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||| || ||||| || |||||    
T  37368 tcttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaatctcagcaggagcatccttcttccttggccgtctatcatc 37443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 57582 - 57467
Alignment:
Q  213 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttaccct 312  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  || |  | || |||||| ||||||||||  |||| || |||| |||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  57582 ttactcttatggcctttctcgccacaagtatagtaaacaatctcaacaggagcatctttctttctaggcctcctctcatcattcattctttgcttaccct 57483  T
Q  313 tgtcagcaggggcact 328  Q
    | |||||||| |||||    
T  57482 tatcagcaggagcact 57467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 213 - 359
Target Start/End: Original strand, 14420 - 14566
Alignment:
Q  213 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttaccct 312  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  ||||||| || ||||| |||||||||||| ||||  | |||||||| ||||     | |||||| || ||||    
T  14420 ttactcttatggcctttctcgccacaagtaaaacagacaatctctgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcattgaccattctctgtttgccct 14519  T
Q  313 tgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtccctta 359  Q
    | ||||||| ||||||||| || ||||| ||| |||| || ||||||    
T  14520 tatcagcagaggcactataaggcttagggcgactctgttgaccctta 14566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 274
Target Start/End: Original strand, 11599 - 11660
Alignment:
Q  213 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctctt 274  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||||||| || ||||| ||| |||||||| ||||    
T  11599 ttactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctgcatgagcatccttctt 11660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 213 - 322
Target Start/End: Original strand, 18181 - 18290
Alignment:
Q  213 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttaccct 312  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||  |  | || || |||||||||| ||||||  |||| || |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  18181 ttactcttatggcctttctcaccacaagtgtagcaaacaatctcagcagtagcatctttctttcttggcctcctctcatcattaactctttgcttaccct 18280  T
Q  313 tgtcagcagg 322  Q
    | ||||||||    
T  18281 tatcagcagg 18290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 110875 - 110760
Alignment:
Q  213 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttaccct 312  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  || | || || |||||| ||||||||||  |||| || || ||||||||||||   | ||||||||| ||||    
T  110875 ttactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcagacaatctcaacaggagcatctttctttctagggcgcctctcatcaaccattctctgcttcccct 110776  T
Q  313 tgtcagcaggggcact 328  Q
    | || ||||| |||||    
T  110775 tatcggcaggagcact 110760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1881 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1881
Description:

Target: scaffold1881; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 455 - 303
Alignment:
Q  206 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgc 305  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| | |||||||||| ||||  | |||||||| |||||    | ||| ||     
T  455 acaaacattgctcttgtggcctttctcgccacaattgaaacaaacaatctccgtaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctttgt 356  T
Q  306 ttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtccctt 358  Q
    || ||||| |||||||||||| |||| || ||||| ||| |||| || |||||    
T  355 ttgcccttatcagcaggggcaatataaggcttagggcgactctgctggccctt 303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 344
Target Start/End: Original strand, 263 - 391
Alignment:
Q  216 ctcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgt 315  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||| ||||| ||||  | ||||| || || ||    | |||||| || ||||| |    
T  263 ctcttgtggcctttctcaccacaattaaagcagacaatctcagcaggaacatccttcttcttaggccgtctatcctcgaccattctctgtttgcccttat 362  T
Q  316 cagcaggggcactatacggtttaggacga 344  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  363 cagcaggggcactgtacggcttaggacga 391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 1832 - 1696
Alignment:
Q  213 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttaccct 312  Q
    |||||||| |||||||||||||||||   | | ||||| ||||||  |||||||||  |||| || |||| |||||||||||||| ||| || || ||||    
T  1832 ttactcttatggcctttctcgccacaagcatagcacacaatctcattaggagcatctttctttctaggcctcctctcatcattaactctttgttttccct 1733  T
Q  313 tgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctg 349  Q
    | |||||||| ||||| || || || |||||| ||||    
T  1732 tatcagcaggagcactgtaaggctttggacgactctg 1696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 15675 - 15288
Alignment:
Q  85 tgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaa 184  Q
    ||||||||| || ||| |||||||| ||||| |||||  ||||  |||  |||  | |||||||||| ||||   | ||||||||||  ||||||| |||    
T  15675 tgcactgagaaccgatatgaccctcatcattgcaattgaagcacacaatgtcattgtgcttgcaatcagctaatgtatgacccttcttgccacaccggaa 15576  T
Q  185 gcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgc 284  Q
     ||||||||  | ||||  | |||||  || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |  ||||| |||||||||||| ||||  | ||||||    
T  15575 acacttctttgcctcctctggacaaaaattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacagatgatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgc 15476  T
Q  285 ctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctctt-cgctcactcatcacctta 383  Q
    || |||||    | |||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | | |||| || | ||||  |||| | |||| | |  || ||     
T  15475 ctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagctggggcactatagggcttagggcaactctgctggcgctta-gtcttccactcatttacaacattg 15377  T
Q  384 taatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctctt 472  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||   | ||||||||||  |||| ||  |||||||||||||| || ||||||||    
T  15376 taatgagctttcgtgtcctcctcatagattctacagctgttcaccaaatcaggaaaaactcagatctgttggtatccaattgccctctt 15288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 4696 - 4560
Alignment:
Q  213 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttaccct 312  Q
    |||||||| |||||||||||||||||   | | ||||| ||||||  |||||||||  |||| || |||| |||||||||||||| ||| || || ||||    
T  4696 ttactcttatggcctttctcgccacaagcatagcacacaatctcattaggagcatctttctttctaggcctcctctcatcattaactctttgttttccct 4597  T
Q  313 tgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctg 349  Q
    | |||||||| ||||| || || || |||||| ||||    
T  4596 tatcagcaggagcactgtaaggctttggacgactctg 4560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 336 - 400
Target Start/End: Original strand, 17698 - 17762
Alignment:
Q  336 ttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtc 400  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| || | ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  17698 ttaggacgactctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttataatgagctttggtgtc 17762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 5300 - 4978
Alignment:
Q  26 agtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatag 125  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||    ||| ||||||||||||| || ||||  | |||||| ||||| ||||| || || || |||    
T  5300 agtctgcgtaccagtcaatgcaaacactttcccaccggtcctagccttcttcggctgagtacactatgaactgatatgaccttcttcgttgcagttgtag 5201  T
Q  126 catccaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggc 225  Q
    ||  |||  || || ||||| || || |||||  |||| || ||||| ||||||||||| || ||| ||||||   |   |||| | ||  | |||||||    
T  5200 cagacaatgtctccacgcttacattcagctagggtgtgtcctttctgaccacacctgaaacatttcctctcatttctaccacaagcattgtttttgtggc 5101  T
Q  226 ctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggc 325  Q
    |||| ||  ||| |||  |||| || || |||||||||||||| ||| |  | |||| ||| |||||||| |  |||||||| || ||||||||||| ||    
T  5100 ctttttcatcactcttttaacaaacaatttcagcaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcattcatcctctgcttccctttgtcagcaggagc 5001  T
Q  326 actatacggtttaggacgattct 348  Q
    ||| || ||||||||||||||||    
T  5000 actgtaaggtttaggacgattct 4978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 3860 - 3661
Alignment:
Q  213 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttaccct 312  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||  | || || |||||| ||| | |||| ||| |  | || | |||||||||||| | ||| || || ||||    
T  3860 ttactcttgtggcccctctcgccacacttgtagcaaacaatctcaacagaaacatctctcctcttaggtctcctctcatcattcaatctttgtttcccct 3761  T
Q  313 tgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcc-ct-tacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtag 410  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||||   || || || || | |||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  3760 tgtcagcaggagcactatagggcttaggacgaccttgctggcctctgttcctcttc--tcactcataaccttataatgtgctttggtatcctcctcatag 3663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1423 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1423
Description:

Target: scaffold1423; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 213 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 346 - 285
Alignment:
Q  213 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctctt 274  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||||||| || ||||| |||||||||||| ||||    
T  346 ttactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctgcaggagcatccttctt 285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0611 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0611
Description:

Target: scaffold0611; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 213 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 9411 - 9350
Alignment:
Q  213 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctctt 274  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||||||| || ||||| |||||||||||| ||||    
T  9411 ttactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctgcaggagcatccttctt 9350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0609 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0609
Description:

Target: scaffold0609; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 134 - 271
Target Start/End: Original strand, 1196 - 1333
Alignment:
Q  134 atcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtgacccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatccttggtacaaacgttactcttgtggcctttctcg 233  Q
    |||||| |||||||| || |||| | | || ||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||     | ||||| |||||||||||||| |||||     
T  1196 atcaccacgcttgcattcagctatcgtatgccccttctttccacatcggaagcacttcttctcctcaccattgcaaacattactcttgtggcccttctca 1295  T
Q  234 ccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccct 271  Q
    ||||||||  |||| || ||||||| |||| |||||||    
T  1296 ccacacttgtaacaaacaatctcagtaggaacatccct 1333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 216 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 7622 - 7489
Alignment:
Q  216 ctcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgt 315  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||| ||||| ||||  | |||||||| || ||    | |||||| || ||||| |    
T  7622 ctcttgtggcctttctcaccacaattaaagcagacaatctcagcaggaacatccttcttcttaggccgcctatcttcgaccattctctgtttgcccttat 7523  T
Q  316 cagcaggggcactatacggtttaggacgattctg 349  Q
    ||||||||||||| || || ||||| ||| ||||    
T  7522 cagcaggggcactgtaaggcttagggcgactctg 7489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 319 - 478
Target Start/End: Original strand, 11891 - 12050
Alignment:
Q  319 caggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcg-ctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctac 417  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| | |||||  |||  |||  | ||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| |    
T  11891 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgc-tcttcctctcgttcactatcttgtagtgagccttggtatcctcttcatagatcctgc 11989  T
Q  418 cgcgacttaccaaatcagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctcttgatgtc 478  Q
     || | | |||||||| |  |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  11990 agctattgaccaaatccggaaaaactctaatctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 12050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 9328 - 9192
Alignment:
Q  204 gtacaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctct 303  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||| |||||  || | || || ||||||| || || |||  |||| || |||| |||||||||||| | ||| |    
T  9328 gtacaagcattactcttgtggcccttctcaccacaagtatagcaaacaatctcagtagtagtatctttctttctaggcctcctctcatcattcaatcttt 9229  T
Q  304 gcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttagg 340  Q
    | |||||||| |||||||| |||||||| || |||||    
T  9228 gtttacccttatcagcaggagcactataaggcttagg 9192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 23194 - 23133
Alignment:
Q  285 ctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgatt 346  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  23194 ctctcatcattcaatctctgtttacccttatcagcaggagcactgtaaggcttaggacgatt 23133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 415
Target Start/End: Original strand, 15334 - 15449
Alignment:
Q  300 ctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgt 399  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||| || |||||| || | |||||| |||  | ||| |||||||  ||||| |    
T  15334 ctctgtttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgttgacccttagctttccgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtat 15433  T
Q  400 cctcctcgtagatcct 415  Q
    ||||||| ||||||||    
T  15434 cctcctcatagatcct 15449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 354
Target Start/End: Original strand, 12346 - 12421
Alignment:
Q  279 ggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtc 354  Q
    |||| |||||||||||| || ||||| ||| | ||||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||| ||||    
T  12346 ggcctcctctcatcattcagcctctgtttatctttgtcagcaggagcactatacgatttcggacgactctgctgtc 12421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 19117 - 19022
Alignment:
Q  33 gtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaactctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcat 128  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||    |||||||||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||| || ||||| || |||||||||    
T  19117 gtaccagtcagagcaaacactttaccaccggtcctaaccttcttcggttgtgtacactgcgaactgatatgaccttcctcattgcagttatagcat 19022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 66477 - 66239
Alignment:
Q  234 ccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacg 333  Q
    ||||| |||||||| || ||||||  |||||||||| |||| || ||||| || || |||   | |||||| || ||||| ||||||||||||||||| |    
T  66477 ccacatttaaaacagacaatctcaataggagcatccttcttccttggccgtctatcctcaaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcactatagg 66378  T
Q  334 gtttaggacgattctgatgtcccttacctctt-cgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaat 432  Q
    | ||||| ||| |||| || ||||||  |||| |||||| |||  ||||| |||||||| ||||| || ||||| || || |||| ||   | || || |    
T  66377 gcttagggcgactctgctggccctta-gtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcttcctcataaattctacagctgttcacgaact 66279  T
Q  433 cagagaaaattctaatctgttggtatcctatagccctctt 472  Q
    | ||||||| ||  |||||||||||||| || ||||||||    
T  66278 cggagaaaactcggatctgttggtatccaattgccctctt 66239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0605 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0605
Description:

Target: scaffold0605; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 372 - 445
Target Start/End: Original strand, 1775 - 1848
Alignment:
Q  372 ctcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaccgcgacttaccaaatcagagaaaattct 445  Q
    |||||||||||||||||||| || || |||||||| || || |||| || ||| ||||| || |||||||||||    
T  1775 ctcatcaccttataatgagcctttgtatcctcctcataaattctacagctactcaccaattctgagaaaattct 1848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 34653 - 34537
Alignment:
Q  299 tctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttc-gctcactcatcaccttataatgagctttggt 397  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||| |||| || ||||||  ||||| ||||| |||  ||||| |||||||| |||||    
T  34653 tctctgtttgcccttatcagcaggggcgctataaggcttagggcgactctgctggcccttag-tcttccgctcattcacgaccttgtaatgagccttggt 34555  T
Q  398 gtcctcctcgtagatcct 415  Q
     ||||||||||| |||||    
T  34554 atcctcctcgtaaatcct 34537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 213 - 349
Target Start/End: Original strand, 9955 - 10091
Alignment:
Q  213 ttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctcttactcggccgcctctcatcattaagtctctgcttaccct 312  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||  || |||| || |||||  ||||||||||  |||| || || ||||||||||||   | ||| || |||||||    
T  9955 ttactcttatggcctttctcaccacaagtacaacatacaatctcgacaggagcatctttcttcctagggcgcctctcatcaaccattctttgtttaccct 10054  T
Q  313 tgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctg 349  Q
    | | |||||| ||||| || || ||||||||| ||||    
T  10055 tattagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctg 10091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 206 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 10133 - 10065
Alignment:
Q  206 acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcaggagcatccctctt 274  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| | |||||||||| ||||    
T  10133 acaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacagacaatctccgtaggagcatccttctt 10065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0429 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0429
Description:

Target: scaffold0429; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 284 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 1319 - 1191
Alignment:
Q  284 cctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcacctta 383  Q
    |||||||||||| |  ||||||| |||||| |||||||| | ||| || || || ||||||||||| || | ||||||| | | ||||||||   ||||     
T  1319 cctctcatcattcaccctctgctcacccttatcagcaggagtactgtaaggctttggacgattctgttgactcttacctttcctctcactcacagccttg 1220  T
Q  384 taatgagctttggtgtcctcctcgtagat 412  Q
    | ||||||||| || |||||||| |||||    
T  1219 tgatgagctttcgtatcctcctcatagat 1191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 300 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 24607 - 24567
Alignment:
Q  300 ctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggtttagg 340  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  24607 ctctgtttacccttatcagcaggggcactataaggtttagg 24567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University