View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8645_2 (Length: 466)

Name: NF8645_2
Description: NF8645
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8645_2
NF8645_2
[»] scaffold0080 (6 HSPs)
scaffold0080 (26-466)||(11150-11590)
scaffold0080 (30-466)||(30837-31273)
scaffold0080 (30-466)||(36302-36739)
scaffold0080 (27-421)||(53635-54029)
scaffold0080 (252-442)||(50069-50259)
scaffold0080 (26-112)||(13805-13891)
[»] chr8 (63 HSPs)
chr8 (26-466)||(30311495-30311935)
chr8 (26-466)||(15535373-15535813)
chr8 (26-466)||(22131392-22131832)
chr8 (27-466)||(17672375-17672814)
chr8 (26-466)||(32602134-32602575)
chr8 (26-466)||(22041817-22042257)
chr8 (27-466)||(20016615-20017054)
chr8 (27-466)||(18858567-18859006)
chr8 (26-466)||(21164889-21165329)
chr8 (27-466)||(22118527-22118966)
chr8 (27-466)||(22127311-22127750)
chr8 (27-466)||(19482424-19482855)
chr8 (26-466)||(19979957-19980397)
chr8 (27-466)||(21252934-21253373)
chr8 (27-466)||(21782772-21783211)
chr8 (27-466)||(21392213-21392652)
chr8 (27-466)||(21786707-21787146)
chr8 (48-466)||(23652031-23652449)
chr8 (28-466)||(19864446-19864885)
chr8 (27-466)||(22422244-22422683)
chr8 (28-466)||(22375806-22376244)
chr8 (30-466)||(22246788-22247224)
chr8 (112-466)||(21920185-21920539)
chr8 (26-433)||(31414820-31415227)
chr8 (30-465)||(23656918-23657353)
chr8 (27-465)||(23887015-23887457)
chr8 (26-451)||(21323630-21324054)
chr8 (222-466)||(22988720-22988964)
chr8 (48-466)||(20008294-20008712)
chr8 (27-291)||(22522711-22522975)
chr8 (48-466)||(21927417-21927836)
chr8 (26-466)||(29301777-29302217)
chr8 (30-466)||(20394488-20394924)
chr8 (26-454)||(16269575-16270003)
chr8 (27-179)||(21781539-21781691)
chr8 (312-466)||(19114680-19114834)
chr8 (29-227)||(22989274-22989472)
chr8 (30-424)||(31569198-31569591)
chr8 (57-466)||(19861425-19861834)
chr8 (26-451)||(22052868-22053293)
chr8 (26-454)||(4984044-4984472)
chr8 (26-451)||(28982916-28983341)
chr8 (26-451)||(28988135-28988560)
chr8 (26-454)||(27356538-27356966)
chr8 (26-465)||(20390090-20390516)
chr8 (27-448)||(16875447-16875868)
chr8 (48-232)||(19984404-19984588)
chr8 (26-241)||(22061030-22061245)
chr8 (109-454)||(6605660-6606005)
chr8 (27-451)||(21848689-21849113)
chr8 (26-89)||(22030470-22030533)
chr8 (27-448)||(20650707-20651128)
chr8 (27-157)||(23155394-23155524)
chr8 (26-156)||(22373168-22373298)
chr8 (27-134)||(16414413-16414520)
chr8 (27-169)||(22436590-22436732)
chr8 (153-454)||(14567144-14567445)
chr8 (27-133)||(23902487-23902593)
chr8 (173-326)||(19869823-19869976)
chr8 (27-134)||(21194892-21194999)
chr8 (27-134)||(24932176-24932283)
chr8 (351-448)||(21195215-21195312)
chr8 (404-448)||(23155769-23155813)
[»] chr3 (76 HSPs)
chr3 (26-466)||(16805094-16805534)
chr3 (27-466)||(5108759-5109198)
chr3 (27-466)||(16637316-16637755)
chr3 (27-466)||(48426990-48427429)
chr3 (27-466)||(6602279-6602718)
chr3 (27-466)||(10007143-10007582)
chr3 (27-466)||(12888252-12888691)
chr3 (27-466)||(15346393-15346832)
chr3 (27-466)||(10907753-10908192)
chr3 (27-466)||(15400665-15401104)
chr3 (27-466)||(15587540-15587979)
chr3 (29-466)||(53383168-53383605)
chr3 (27-466)||(3687486-3687925)
chr3 (27-466)||(5423078-5423517)
chr3 (27-466)||(13254233-13254672)
chr3 (26-466)||(16693707-16694147)
chr3 (27-466)||(20060202-20060641)
chr3 (27-466)||(16754849-16755288)
chr3 (56-466)||(14874676-14875086)
chr3 (115-466)||(15723170-15723521)
chr3 (30-466)||(17491393-17491829)
chr3 (165-466)||(12499791-12500092)
chr3 (27-466)||(15261173-15261612)
chr3 (202-466)||(15340812-15341076)
chr3 (27-206)||(15357886-15358065)
chr3 (26-454)||(11959305-11959733)
chr3 (26-451)||(31693321-31693746)
chr3 (26-451)||(31940471-31940896)
chr3 (26-451)||(12358663-12359088)
chr3 (28-248)||(14579557-14579777)
chr3 (26-451)||(11950044-11950469)
chr3 (22-466)||(13318634-13319078)
chr3 (48-451)||(17187942-17188345)
chr3 (26-451)||(12179906-12180337)
chr3 (27-466)||(15013904-15014343)
chr3 (26-454)||(47125509-47125937)
chr3 (48-451)||(15229171-15229574)
chr3 (48-451)||(15235039-15235442)
chr3 (30-448)||(16379068-16379486)
chr3 (27-164)||(24185035-24185172)
chr3 (30-366)||(13943677-13944013)
chr3 (48-368)||(16826439-16826754)
chr3 (30-454)||(28755883-28756307)
chr3 (30-424)||(41179117-41179511)
chr3 (26-466)||(10418181-10418621)
chr3 (48-430)||(18132504-18132886)
chr3 (30-424)||(44778842-44779236)
chr3 (26-466)||(14088226-14088666)
chr3 (51-212)||(11888526-11888687)
chr3 (27-448)||(30139377-30139798)
chr3 (27-448)||(30148928-30149349)
chr3 (27-134)||(43164550-43164657)
chr3 (48-466)||(13970278-13970696)
chr3 (26-424)||(16834651-16835044)
chr3 (26-267)||(10407720-10407961)
chr3 (26-293)||(12510619-12510886)
chr3 (27-442)||(15948618-15949033)
chr3 (48-257)||(14291690-14291899)
chr3 (27-448)||(15611674-15612095)
chr3 (27-104)||(15714204-15714281)
chr3 (26-247)||(24189076-24189297)
chr3 (28-448)||(8272548-8272968)
chr3 (111-354)||(12269875-12270118)
chr3 (27-451)||(13965500-13965925)
chr3 (26-454)||(16327796-16328224)
chr3 (222-397)||(11889623-11889798)
chr3 (27-448)||(6151001-6151422)
chr3 (27-127)||(18437022-18437122)
chr3 (30-232)||(8745530-8745732)
chr3 (27-79)||(26791561-26791613)
chr3 (26-157)||(17200496-17200627)
chr3 (33-103)||(12272254-12272324)
chr3 (27-159)||(25768178-25768310)
chr3 (259-454)||(10385236-10385431)
chr3 (404-448)||(18915297-18915341)
chr3 (351-448)||(25767889-25767986)
[»] chr1 (45 HSPs)
chr1 (26-466)||(21233711-21234151)
chr1 (26-466)||(17042995-17043435)
chr1 (27-466)||(21838889-21839328)
chr1 (27-466)||(33389010-33389449)
chr1 (27-466)||(21832241-21832680)
chr1 (27-466)||(51331474-51331913)
chr1 (27-466)||(16348576-16349016)
chr1 (39-466)||(24792609-24793036)
chr1 (27-466)||(19108307-19108746)
chr1 (39-465)||(22503282-22503708)
chr1 (27-466)||(41351649-41352082)
chr1 (27-466)||(430097-430536)
chr1 (26-466)||(20140022-20140462)
chr1 (26-442)||(22360224-22360640)
chr1 (27-466)||(21750879-21751318)
chr1 (48-466)||(50618400-50618818)
chr1 (27-465)||(21862354-21862792)
chr1 (27-350)||(16378150-16378473)
chr1 (26-450)||(19661116-19661540)
chr1 (48-451)||(21743554-21743957)
chr1 (22-429)||(19856281-19856688)
chr1 (48-433)||(20833902-20834287)
chr1 (30-454)||(24097587-24098011)
chr1 (303-466)||(21026112-21026275)
chr1 (26-466)||(20854740-20855180)
chr1 (26-451)||(20938043-20938468)
chr1 (26-454)||(48424855-48425283)
chr1 (26-454)||(52987723-52988151)
chr1 (26-454)||(20296363-20296791)
chr1 (195-316)||(20944119-20944240)
chr1 (26-454)||(37679031-37679459)
chr1 (26-454)||(31537977-31538405)
chr1 (26-454)||(38910806-38911234)
chr1 (24-268)||(41310694-41310938)
chr1 (26-454)||(21952860-21953288)
chr1 (27-448)||(20829373-20829794)
chr1 (302-466)||(41308612-41308776)
chr1 (27-157)||(35930806-35930936)
chr1 (27-157)||(41215837-41215967)
chr1 (27-442)||(20927017-20927432)
chr1 (27-157)||(20527301-20527431)
chr1 (391-466)||(16378081-16378156)
chr1 (27-148)||(22133735-22133856)
chr1 (340-451)||(23196543-23196654)
chr1 (27-88)||(21200935-21200996)
[»] chr4 (44 HSPs)
chr4 (26-466)||(18225094-18225534)
chr4 (27-466)||(14301628-14302067)
chr4 (27-466)||(8051272-8051711)
chr4 (27-466)||(8388336-8388775)
chr4 (27-466)||(14682491-14682930)
chr4 (27-466)||(27713260-27713699)
chr4 (27-466)||(12478524-12478963)
chr4 (27-466)||(19776442-19776881)
chr4 (27-466)||(23957671-23958110)
chr4 (27-466)||(40474964-40475403)
chr4 (26-466)||(15145541-15145973)
chr4 (27-395)||(17092798-17093166)
chr4 (27-398)||(16234641-16235012)
chr4 (112-466)||(16353241-16353596)
chr4 (27-466)||(14849015-14849454)
chr4 (27-466)||(14696037-14696476)
chr4 (26-451)||(16149650-16150075)
chr4 (26-451)||(16153796-16154221)
chr4 (26-451)||(15357028-15357453)
chr4 (28-295)||(16218325-16218592)
chr4 (28-295)||(16221645-16221912)
chr4 (27-451)||(14161409-14161833)
chr4 (26-451)||(15001273-15001697)
chr4 (48-378)||(1647207-1647537)
chr4 (297-463)||(18613743-18613909)
chr4 (30-424)||(51604704-51605098)
chr4 (27-184)||(22631910-22632067)
chr4 (26-454)||(3262702-3263130)
chr4 (48-451)||(15072298-15072701)
chr4 (28-259)||(23443237-23443467)
chr4 (26-384)||(44659774-44660132)
chr4 (26-451)||(27902325-27902750)
chr4 (26-454)||(29451445-29451873)
chr4 (26-130)||(16251498-16251602)
chr4 (26-466)||(8707835-8708271)
chr4 (26-384)||(11205140-11205498)
chr4 (27-397)||(15257921-15258290)
chr4 (222-466)||(15323141-15323385)
chr4 (364-466)||(1640326-1640428)
chr4 (27-448)||(15291067-15291488)
chr4 (22-92)||(16353174-16353244)
chr4 (401-466)||(29037427-29037492)
chr4 (30-132)||(12340777-12340879)
chr4 (404-448)||(14999257-14999301)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (27-466)||(40108-40547)
scaffold0109 (22-466)||(14031-14476)
[»] chr5 (48 HSPs)
chr5 (27-466)||(18780970-18781409)
chr5 (27-466)||(16358358-16358797)
chr5 (27-466)||(34568350-34568789)
chr5 (27-466)||(27520262-27520701)
chr5 (27-466)||(27612210-27612649)
chr5 (27-466)||(27666581-27667020)
chr5 (27-465)||(22349776-22350214)
chr5 (27-466)||(40710636-40711075)
chr5 (30-466)||(22330981-22331417)
chr5 (27-466)||(14997830-14998269)
chr5 (27-465)||(19771817-19772255)
chr5 (27-466)||(37289587-37290026)
chr5 (27-466)||(41772698-41773137)
chr5 (27-466)||(22136524-22136963)
chr5 (27-466)||(29474164-29474603)
chr5 (27-463)||(27683491-27683927)
chr5 (50-466)||(20801253-20801669)
chr5 (27-466)||(25428289-25428728)
chr5 (27-466)||(26736818-26737257)
chr5 (27-466)||(21337385-21337824)
chr5 (30-466)||(23473083-23473519)
chr5 (27-466)||(20466190-20466629)
chr5 (26-384)||(21562115-21562472)
chr5 (48-466)||(22234032-22234450)
chr5 (26-454)||(24796487-24796915)
chr5 (26-454)||(20344132-20344560)
chr5 (26-379)||(20823378-20823731)
chr5 (26-466)||(28893032-28893472)
chr5 (26-466)||(28921858-28922298)
chr5 (26-454)||(25849925-25850353)
chr5 (30-415)||(17267428-17267813)
chr5 (26-454)||(14885081-14885509)
chr5 (26-454)||(37541471-37541899)
chr5 (26-379)||(22463876-22464229)
chr5 (26-328)||(20777889-20778191)
chr5 (26-454)||(22504529-22504957)
chr5 (27-448)||(21935279-21935700)
chr5 (27-448)||(23507540-23507961)
chr5 (27-448)||(24583066-24583487)
chr5 (163-466)||(28914640-28914943)
chr5 (163-466)||(28929908-28930211)
chr5 (48-451)||(21409008-21409408)
chr5 (168-466)||(21679010-21679308)
chr5 (341-464)||(24618700-24618823)
chr5 (341-464)||(24714931-24715054)
chr5 (341-464)||(24747959-24748082)
chr5 (48-163)||(21676946-21677061)
chr5 (404-448)||(23505100-23505144)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (26-466)||(16113-16553)
scaffold0044 (27-466)||(2375-2816)
[»] chr7 (57 HSPs)
chr7 (26-465)||(15267-15706)
chr7 (27-466)||(14956467-14956906)
chr7 (27-466)||(11551020-11551459)
chr7 (27-466)||(10872603-10873042)
chr7 (27-466)||(11235131-11235570)
chr7 (27-466)||(12689415-12689854)
chr7 (27-466)||(14334309-14334748)
chr7 (27-466)||(15158975-15159414)
chr7 (27-466)||(44789269-44789708)
chr7 (27-466)||(8709518-8709957)
chr7 (27-466)||(18179658-18180097)
chr7 (27-397)||(13688023-13688393)
chr7 (26-466)||(15146801-15147242)
chr7 (27-373)||(18588089-18588435)
chr7 (30-451)||(14041623-14042044)
chr7 (30-451)||(14351653-14352074)
chr7 (26-268)||(9590479-9590721)
chr7 (27-466)||(48813170-48813608)
chr7 (48-466)||(15626438-15626856)
chr7 (26-451)||(15100498-15100923)
chr7 (48-451)||(12204717-12205120)
chr7 (48-455)||(16948389-16948796)
chr7 (48-466)||(14262162-14262579)
chr7 (26-433)||(13675399-13675806)
chr7 (26-454)||(13966563-13966991)
chr7 (30-448)||(14139611-14140029)
chr7 (56-454)||(16070222-16070618)
chr7 (48-466)||(19149125-19149541)
chr7 (26-454)||(12458566-12458994)
chr7 (26-454)||(13023283-13023711)
chr7 (26-454)||(26092693-26093121)
chr7 (48-466)||(20748524-20748940)
chr7 (26-451)||(11386324-11386749)
chr7 (30-391)||(23503769-23504130)
chr7 (26-454)||(49154227-49154655)
chr7 (26-454)||(26116485-26116913)
chr7 (303-466)||(11770435-11770598)
chr7 (26-451)||(15342360-15342785)
chr7 (26-454)||(11301108-11301536)
chr7 (30-391)||(18051852-18052213)
chr7 (26-466)||(19614589-19615029)
chr7 (27-448)||(7825831-7826252)
chr7 (27-448)||(27105692-27106113)
chr7 (27-448)||(27172212-27172633)
chr7 (26-451)||(14284271-14284696)
chr7 (375-466)||(14213587-14213678)
chr7 (27-133)||(11770320-11770426)
chr7 (389-466)||(8200541-8200618)
chr7 (26-86)||(16727300-16727360)
chr7 (26-86)||(17704372-17704432)
chr7 (27-150)||(4442157-4442280)
chr7 (27-157)||(13379105-13379235)
chr7 (28-157)||(17925872-17926001)
chr7 (173-326)||(39210-39363)
chr7 (27-157)||(13458257-13458387)
chr7 (421-466)||(13687977-13688022)
chr7 (31-148)||(15716825-15716942)
[»] chr2 (48 HSPs)
chr2 (27-466)||(44384019-44384458)
chr2 (27-466)||(21143490-21143929)
chr2 (27-466)||(9485771-9486210)
chr2 (28-466)||(24711589-24712027)
chr2 (27-466)||(16926915-16927354)
chr2 (27-466)||(17000555-17000994)
chr2 (26-466)||(24677044-24677484)
chr2 (27-466)||(27219571-27220010)
chr2 (27-466)||(10870405-10870844)
chr2 (27-466)||(24875199-24875638)
chr2 (27-466)||(41606834-41607273)
chr2 (27-466)||(24263925-24264364)
chr2 (27-466)||(27372824-27373263)
chr2 (60-466)||(23189474-23189879)
chr2 (27-466)||(24705931-24706370)
chr2 (27-466)||(21323715-21324154)
chr2 (27-397)||(9337206-9337576)
chr2 (27-466)||(23106177-23106616)
chr2 (30-466)||(22734226-22734662)
chr2 (27-466)||(23073418-23073857)
chr2 (27-466)||(24818679-24819118)
chr2 (48-466)||(23112291-23112712)
chr2 (26-451)||(19650498-19650923)
chr2 (26-451)||(23098466-23098891)
chr2 (26-451)||(23278346-23278771)
chr2 (26-454)||(1065318-1065746)
chr2 (30-424)||(27789337-27789731)
chr2 (26-451)||(19717465-19717890)
chr2 (302-466)||(22323580-22323744)
chr2 (30-391)||(12575983-12576344)
chr2 (26-283)||(25255657-25255914)
chr2 (26-454)||(31832225-31832653)
chr2 (48-451)||(30010654-30011057)
chr2 (48-451)||(30209387-30209790)
chr2 (108-433)||(24950178-24950503)
chr2 (60-125)||(23611069-23611134)
chr2 (208-466)||(27208802-27209060)
chr2 (251-455)||(23295501-23295705)
chr2 (306-451)||(25264624-25264769)
chr2 (27-448)||(24829637-24830058)
chr2 (30-133)||(22279993-22280096)
chr2 (27-157)||(25130473-25130603)
chr2 (351-448)||(22279678-22279775)
chr2 (48-157)||(22760039-22760148)
chr2 (26-62)||(23204273-23204309)
chr2 (348-451)||(45534510-45534613)
chr2 (27-157)||(24568117-24568247)
chr2 (404-448)||(12639059-12639103)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (26-466)||(57970-58410)
scaffold0017 (24-466)||(17975-18418)
scaffold0017 (72-466)||(195444-195838)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (27-466)||(8893-9332)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (27-466)||(107723-108162)
scaffold0029 (24-466)||(114514-114956)
scaffold0029 (26-266)||(94805-95045)
[»] chr6 (62 HSPs)
chr6 (27-466)||(22828409-22828848)
chr6 (26-466)||(27563886-27564326)
chr6 (27-466)||(28261251-28261690)
chr6 (27-466)||(28284226-28284665)
chr6 (27-466)||(28340000-28340439)
chr6 (27-466)||(27189224-27189663)
chr6 (27-466)||(27259577-27260016)
chr6 (28-466)||(24293837-24294275)
chr6 (26-466)||(16925692-16926131)
chr6 (28-466)||(16961537-16961975)
chr6 (26-466)||(19866475-19866915)
chr6 (27-466)||(2872857-2873296)
chr6 (27-466)||(25114340-25114779)
chr6 (26-466)||(22435657-22436097)
chr6 (27-466)||(20633994-20634433)
chr6 (26-466)||(5837272-5837712)
chr6 (42-466)||(25763297-25763721)
chr6 (30-466)||(25607918-25608354)
chr6 (22-465)||(22760504-22760947)
chr6 (27-466)||(18405998-18406437)
chr6 (108-466)||(22444055-22444413)
chr6 (27-265)||(16573879-16574117)
chr6 (27-265)||(16621263-16621501)
chr6 (163-465)||(23080258-23080560)
chr6 (27-409)||(23085825-23086207)
chr6 (28-269)||(18183422-18183663)
chr6 (48-451)||(14377991-14378394)
chr6 (48-451)||(14379541-14379944)
chr6 (26-451)||(25769647-25770072)
chr6 (27-466)||(15461124-15461563)
chr6 (26-185)||(21755002-21755160)
chr6 (26-454)||(10466902-10467330)
chr6 (27-270)||(18963142-18963385)
chr6 (51-466)||(19881086-19881501)
chr6 (48-450)||(18796494-18796896)
chr6 (26-451)||(19454827-19455251)
chr6 (30-391)||(28280870-28281231)
chr6 (26-455)||(19436801-19437230)
chr6 (26-454)||(24366212-24366640)
chr6 (26-466)||(34643639-34644079)
chr6 (26-232)||(24516461-24516667)
chr6 (26-451)||(21473404-21473828)
chr6 (264-466)||(18196024-18196226)
chr6 (27-448)||(16380427-16380848)
chr6 (27-181)||(30679061-30679215)
chr6 (27-448)||(16648023-16648444)
chr6 (28-451)||(21568046-21568469)
chr6 (27-150)||(23998352-23998475)
chr6 (27-448)||(1646868-1647289)
chr6 (307-466)||(18965629-18965788)
chr6 (26-151)||(8761805-8761930)
chr6 (27-157)||(14130566-14130696)
chr6 (27-157)||(16100112-16100242)
chr6 (219-466)||(19487528-19487765)
chr6 (27-157)||(23025800-23025930)
chr6 (27-104)||(23080573-23080650)
chr6 (27-65)||(28311819-28311857)
chr6 (26-62)||(23496245-23496281)
chr6 (340-396)||(5295573-5295629)
chr6 (55-178)||(18450579-18450702)
chr6 (404-454)||(16234828-16234878)
chr6 (368-448)||(18578015-18578095)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (26-466)||(37731-38171)
scaffold0042 (27-465)||(22661-23099)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (27-466)||(9321-9760)
[»] scaffold0079 (4 HSPs)
scaffold0079 (26-466)||(35450-35891)
scaffold0079 (112-295)||(28225-28408)
scaffold0079 (26-451)||(2686-3111)
scaffold0079 (22-92)||(28405-28475)
[»] scaffold0008 (6 HSPs)
scaffold0008 (28-463)||(85709-86144)
scaffold0008 (27-466)||(85142-85581)
scaffold0008 (27-169)||(132401-132543)
scaffold0008 (26-157)||(26031-26162)
scaffold0008 (341-448)||(132715-132822)
scaffold0008 (306-448)||(25799-25941)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (30-466)||(10429-10865)
scaffold0028 (30-466)||(16891-17327)
scaffold0028 (31-466)||(45106-45541)
scaffold0028 (48-466)||(48447-48865)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (30-466)||(35981-36417)
scaffold0081 (30-466)||(20557-20993)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (26-466)||(54902-55342)
scaffold0031 (28-466)||(109585-110023)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (28-436)||(51258-51666)
scaffold0102 (26-451)||(41667-42091)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (27-466)||(3387-3826)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (27-451)||(151080-151504)
scaffold0023 (27-466)||(2417-2856)
scaffold0023 (111-466)||(86724-87078)
[»] scaffold0309 (2 HSPs)
scaffold0309 (27-466)||(16596-17035)
scaffold0309 (48-466)||(11748-12167)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (27-466)||(24857-25296)
[»] scaffold0647 (2 HSPs)
scaffold0647 (27-466)||(7571-8010)
scaffold0647 (27-436)||(2884-3293)
[»] scaffold0319 (1 HSPs)
scaffold0319 (28-466)||(721-1157)
[»] scaffold0312 (1 HSPs)
scaffold0312 (27-466)||(14-453)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (27-370)||(21296-21639)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (104-466)||(7969-8331)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (27-466)||(8004-8443)
scaffold0358 (27-466)||(17200-17639)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (27-466)||(6999-7438)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (27-466)||(7975-8414)
scaffold0120 (27-157)||(24440-24570)
[»] scaffold2004 (1 HSPs)
scaffold2004 (27-466)||(725-1160)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (27-465)||(691-1126)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (27-465)||(40588-41026)
scaffold0022 (27-465)||(74308-74746)
scaffold0022 (48-466)||(55710-56128)
scaffold0022 (27-448)||(8738-9159)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (27-436)||(20223-20632)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (27-466)||(8327-8765)
[»] scaffold1602 (1 HSPs)
scaffold1602 (49-466)||(1-418)
[»] scaffold1423 (1 HSPs)
scaffold1423 (27-451)||(1294-1718)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (138-466)||(23097-23425)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (28-451)||(3551-3974)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (27-466)||(24445-24884)
scaffold0011 (26-451)||(150539-150964)
scaffold0011 (404-448)||(181897-181941)
[»] scaffold0114 (3 HSPs)
scaffold0114 (27-465)||(18253-18691)
scaffold0114 (22-293)||(22002-22273)
scaffold0114 (30-170)||(39307-39447)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (27-466)||(7176-7615)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (27-466)||(17609-18042)
[»] scaffold0010 (4 HSPs)
scaffold0010 (39-466)||(3869-4296)
scaffold0010 (26-454)||(40244-40672)
scaffold0010 (30-268)||(45342-45580)
scaffold0010 (341-451)||(45626-45735)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (141-465)||(4150-4474)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (30-466)||(14394-14830)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (27-466)||(13123-13562)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (92-466)||(30900-31274)
scaffold0026 (48-466)||(50765-51183)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (79-424)||(28446-28772)
scaffold0215 (318-466)||(28774-28922)
[»] scaffold0018 (3 HSPs)
scaffold0018 (27-466)||(10653-11092)
scaffold0018 (27-466)||(24210-24649)
scaffold0018 (140-466)||(16958-17284)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (28-466)||(103188-103618)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (27-461)||(494978-495412)
scaffold0001 (48-451)||(453146-453549)
scaffold0001 (26-454)||(515264-515692)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (39-466)||(406-832)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (138-442)||(6354-6658)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (48-466)||(14423-14841)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (28-466)||(5826-6264)
scaffold0270 (28-466)||(12956-13394)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (27-466)||(16832-17270)
scaffold0040 (402-466)||(111775-111839)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (28-295)||(29828-30095)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (29-466)||(15135-15572)
[»] scaffold1985 (1 HSPs)
scaffold1985 (182-466)||(407-691)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (27-397)||(2623-2993)
[»] scaffold0074 (2 HSPs)
scaffold0074 (28-466)||(5067-5504)
scaffold0074 (56-370)||(11172-11486)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (30-466)||(217335-217771)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (27-451)||(15890-16313)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (27-248)||(15906-16128)
[»] scaffold0083 (3 HSPs)
scaffold0083 (39-466)||(8958-9385)
scaffold0083 (39-129)||(1324-1414)
scaffold0083 (39-129)||(6628-6718)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (26-451)||(24184-24609)
scaffold0104 (48-451)||(44350-44753)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (30-466)||(5804-6240)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (26-451)||(10798-11223)
[»] scaffold0149 (3 HSPs)
scaffold0149 (30-247)||(1-218)
scaffold0149 (26-451)||(5262-5686)
scaffold0149 (26-451)||(9693-10117)
[»] scaffold0298 (1 HSPs)
scaffold0298 (26-466)||(9969-10408)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (26-454)||(250587-251015)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (26-466)||(201379-201819)
scaffold0004 (56-451)||(324674-325069)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (54-433)||(2892-3271)
scaffold0034 (26-355)||(69436-69765)
[»] scaffold0993 (1 HSPs)
scaffold0993 (26-300)||(1-275)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (73-303)||(10284-10514)
scaffold0476 (66-451)||(1496-1881)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (27-449)||(28594-29016)
scaffold0067 (48-421)||(50113-50486)
scaffold0067 (48-421)||(59147-59520)
scaffold0067 (48-421)||(65535-65908)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (237-466)||(38070-38299)
scaffold0122 (27-92)||(41417-41482)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (26-451)||(2183-2608)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (26-451)||(29196-29621)
[»] scaffold0130 (3 HSPs)
scaffold0130 (267-466)||(44795-44994)
scaffold0130 (195-433)||(8888-9126)
scaffold0130 (48-181)||(4822-4955)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (266-466)||(7844-8044)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (48-451)||(19322-19725)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (26-451)||(1839-2264)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (48-455)||(4142-4552)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (27-451)||(4719-5143)
scaffold0035 (27-451)||(42019-42443)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (48-451)||(49074-49477)
[»] scaffold0560 (2 HSPs)
scaffold0560 (30-195)||(8657-8822)
scaffold0560 (189-250)||(10914-10975)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (26-451)||(33304-33730)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (28-466)||(22099-22536)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (48-466)||(49808-50226)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (26-451)||(766-1190)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (48-465)||(16068-16485)
scaffold0266 (22-448)||(7768-8194)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (26-451)||(13247-13672)
scaffold0261 (26-451)||(21426-21851)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (26-382)||(19545-19901)
scaffold0077 (306-448)||(26457-26599)
[»] scaffold1477 (1 HSPs)
scaffold1477 (26-433)||(215-621)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (48-454)||(31252-31658)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (26-466)||(25068-25508)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (26-455)||(99473-99902)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (26-433)||(37636-38043)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (48-465)||(5022-5439)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (48-465)||(28481-28898)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (26-451)||(14170-14601)
scaffold0124 (27-448)||(5718-6141)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (318-466)||(3556-3704)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (26-455)||(9027-9456)
scaffold0222 (26-268)||(1400-1642)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (26-451)||(42887-43311)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (315-466)||(1007-1158)
[»] scaffold0304 (1 HSPs)
scaffold0304 (48-451)||(1418-1821)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (26-355)||(566-895)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (54-451)||(967-1364)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (48-465)||(176277-176694)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (26-466)||(268563-269003)
scaffold0007 (27-436)||(84432-84840)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (26-455)||(612-1038)
scaffold0420 (26-226)||(7809-8007)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (26-465)||(79742-80181)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (26-414)||(21127-21515)
scaffold0058 (27-436)||(27160-27569)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (26-455)||(53011-53440)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (48-451)||(64452-64844)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (26-451)||(262194-262619)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (26-448)||(10697-11119)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (48-466)||(46967-47385)
scaffold0053 (48-451)||(55780-56183)
[»] scaffold0445 (1 HSPs)
scaffold0445 (166-466)||(1900-2200)
[»] scaffold0076 (4 HSPs)
scaffold0076 (26-466)||(31588-32028)
scaffold0076 (26-232)||(54322-54528)
scaffold0076 (27-448)||(42231-42652)
scaffold0076 (249-415)||(55034-55200)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (81-451)||(6720-7090)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (27-232)||(114950-115155)
scaffold0037 (305-466)||(115171-115332)
[»] scaffold1373 (1 HSPs)
scaffold1373 (28-454)||(747-1173)
[»] scaffold2111 (1 HSPs)
scaffold2111 (48-269)||(520-741)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (27-448)||(25367-25788)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (27-448)||(34058-34479)
[»] scaffold0162 (3 HSPs)
scaffold0162 (27-448)||(14881-15302)
scaffold0162 (30-157)||(11089-11216)
scaffold0162 (306-448)||(11365-11507)
[»] scaffold1715 (1 HSPs)
scaffold1715 (26-454)||(919-1347)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (26-451)||(9372-9793)
scaffold0235 (26-451)||(19586-20007)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (26-466)||(20804-21244)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (24-145)||(11067-11189)
[»] scaffold0348 (3 HSPs)
scaffold0348 (26-232)||(18394-18600)
scaffold0348 (72-268)||(9831-10027)
scaffold0348 (26-112)||(5760-5846)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (153-466)||(39-352)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (26-454)||(6056-6484)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (26-454)||(28900-29327)
[»] scaffold0285 (1 HSPs)
scaffold0285 (356-431)||(9215-9290)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (26-94)||(12267-12335)
[»] scaffold0302 (2 HSPs)
scaffold0302 (26-448)||(184-606)
scaffold0302 (26-448)||(7126-7548)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (48-178)||(11201-11331)
[»] scaffold1830 (1 HSPs)
scaffold1830 (243-466)||(949-1172)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (349-451)||(3896-3998)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (165-455)||(12349-12639)
[»] scaffold0876 (2 HSPs)
scaffold0876 (28-157)||(859-988)
scaffold0876 (306-424)||(1137-1255)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (195-451)||(16229-16485)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (219-451)||(44753-44985)
[»] scaffold1646 (1 HSPs)
scaffold1646 (224-466)||(1279-1521)
[»] scaffold1488 (2 HSPs)
scaffold1488 (27-157)||(715-845)
scaffold1488 (351-448)||(1038-1135)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (28-150)||(1797-1919)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (28-134)||(16345-16451)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (28-448)||(1865-2285)
scaffold0218 (27-127)||(26621-26721)
[»] scaffold0089 (2 HSPs)
scaffold0089 (192-384)||(14790-14982)
scaffold0089 (255-451)||(416-612)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (27-157)||(13537-13667)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (30-150)||(7015-7135)
[»] scaffold0467 (2 HSPs)
scaffold0467 (27-129)||(1533-1635)
scaffold0467 (306-382)||(1812-1888)
[»] scaffold0180 (3 HSPs)
scaffold0180 (276-466)||(33914-34104)
scaffold0180 (255-451)||(380-576)
scaffold0180 (255-451)||(4700-4896)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (48-157)||(89764-89873)
scaffold0021 (27-131)||(7445-7549)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (27-157)||(6917-7047)
[»] scaffold0697 (1 HSPs)
scaffold0697 (401-466)||(6939-7004)
[»] scaffold0146 (2 HSPs)
scaffold0146 (26-103)||(9865-9942)
scaffold0146 (26-103)||(17532-17609)
[»] scaffold0610 (2 HSPs)
scaffold0610 (27-94)||(4838-4905)
scaffold0610 (351-448)||(7165-7262)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (27-150)||(7152-7275)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (27-133)||(380-486)
[»] scaffold0062 (1 HSPs)
scaffold0062 (252-454)||(8920-9122)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (404-466)||(2219-2281)
[»] scaffold1208 (1 HSPs)
scaffold1208 (174-269)||(1748-1843)
[»] scaffold0827 (1 HSPs)
scaffold0827 (173-268)||(5259-5354)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (26-61)||(2838-2873)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (366-465)||(36069-36168)
[»] scaffold0462 (1 HSPs)
scaffold0462 (48-92)||(2267-2311)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (351-451)||(195210-195310)


Alignment Details
Target: scaffold0080 (Bit Score: 397; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 466
Target Start/End: Original strand, 11150 - 11590
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11150 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 11249  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11250 ttgagatcagggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 11349  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  11350 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcggttcgtggtggtgtttatcgatgatatttt 11449  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11450 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaattttatgctaaattgtctaagtgtgaa 11549  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  11550 ttctggttgaaggaagtaagttttcttggccatgttatttc 11590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 30 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 31273 - 30837
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 129  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||    
T  31273 ttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagatatgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattaatttga 31174  T
Q  130 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 229  Q
    ||| | | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  31173 gattaggttatcaccagatcaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatacaaagttatgcctttcga 31074  T
Q  230 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||    
T  31073 tgttatgaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcagttcgtggttgttttcatcgaagatattttaatt 30974  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattct 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  30973 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaggtgttaaaagaaaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttct 30874  T
Q  430 ggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||||| || || |||||||| ||| ||||||||||    
T  30873 ggttgaaagaggtcagttttcttggccatgttatttc 30837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 30 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 36739 - 36302
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||    
T  36739 ttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagatttgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattaatttga 36640  T
Q  130 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 229  Q
    ||| | | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  36639 gattaggttatcaccagatcaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatacaaagttatgcctttcga 36540  T
Q  230 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||| || || ||||||||||| |||    
T  36539 tgttatgaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatctttttgtggttgtttttattgatgatatttttatt 36440  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattct 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  36439 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaggtgttaaaagaaaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttct 36340  T
Q  430 ggttgaaggaagtaa-gttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||||| || |||| ||||| | ||| ||||||||||    
T  36339 ggttgaaagaggtaaggttttgttggccatgttatttc 36302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 27 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 54029 - 53635
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54029 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagatagatt 53930  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  53929 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttctgaacacggtatggtccctatgagtacaaagttatgccttt 53830  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||||    
T  53829 cggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcacatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgttttcaatgatgatattttg 53730  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtg 421  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  53729 atttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtg 53635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 252 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 50259 - 50069
Alignment:
Q  252 tttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaac 351  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  50259 tttatggagtacatgaatcacatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgttttcaatgatgatattttgatttactccaagtctgaagaagaac 50160  T
Q  352 atgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagt 442  Q
    ||| ||||||| ||||| | || |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  50159 atgttgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgcgaattttggttgaaagaagt 50069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 26 - 112
Target Start/End: Original strand, 13805 - 13891
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagtttt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13805 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagtttt 13891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 393; Significance: 0; HSPs: 63)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 466
Target Start/End: Original strand, 30311495 - 30311935
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30311495 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgataattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 30311594  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30311595 ttgagatcagggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 30311694  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||    
T  30311695 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgttgttgtgtttattgacgatatttt 30311794  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30311795 aatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 30311894  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  30311895 ttctggttgaaagaagtaagttttcttggccatgttatttc 30311935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 15535813 - 15535373
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15535813 tcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 15535714  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15535713 ttgagatcagggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaaaacagttatcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 15535614  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||    
T  15535613 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcacatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgacatttt 15535514  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15535513 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 15535414  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15535413 ttctggttgaaagaagtaagttttcttggccatgttatttc 15535373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 466
Target Start/End: Original strand, 22131392 - 22131832
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22131392 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 22131491  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22131492 ttgagaacagggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttaagaacgcattacggtcactatgaatataaagttatgcctt 22131591  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  22131592 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcgattctttgttgtgtttatcgatgatatttt 22131691  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22131692 gatctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 22131791  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  22131792 ttctggttgaaggaagtaagttttcttggccatgttatttc 22131832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 17672375 - 17672814
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  17672375 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 17672474  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17672475 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 17672574  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||    
T  17672575 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 17672674  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17672675 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 17672774  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  17672775 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 17672814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 32602575 - 32602134
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32602575 tcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccactaccgagaattgatgatttgatggatcagttagagggtgcaaaagttttcagcaagattgat 32602476  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32602475 ttgagatcagggtatcaccagattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 32602376  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  32602375 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcggttcgttgttgtgtttatcgatgatatttt 32602276  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32602275 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtcaaagtgtgaa 32602176  T
Q  426 ttc-tggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||| |||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  32602175 ttcttggttgaaagaagtaagtttttttggccatgttatttc 32602134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 22042257 - 22041817
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22042257 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcgaaagttttcagcaagattgat 22042158  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22042157 ttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgtgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 22042058  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  22042057 tcggtgtgaccaattcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgtgtttatcgacgatatttt 22041958  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  22041957 gatgtactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagcgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgagaa 22041858  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  22041857 ttctggttgaaagaaataagttttcttggccatgttatttc 22041817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 20016615 - 20017054
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  20016615 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 20016714  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20016715 tgaggtcaggttatcaccagattaaggtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 20016814  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||    
T  20016815 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 20016914  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20016915 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaat 20017014  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  20017015 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 20017054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 18859006 - 18858567
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  18859006 cagtggaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 18858907  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18858906 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcaggacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 18858807  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| || ||||||    
T  18858806 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgacattttg 18858707  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18858706 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 18858607  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  18858606 tctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgttatttc 18858567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 466
Target Start/End: Original strand, 21164889 - 21165329
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  21164889 tcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgcattttcagcaagattgat 21164988  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21164989 ttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgaatataaagttatgcctt 21165088  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||    
T  21165089 tcggtgttacgaatgcacctggagtgtttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcattcttggatcgattcgtggttgtttttatctatgatatttt 21165188  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||     
T  21165189 aatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttaaaagagaagaaactttatgctaaattatccaagtgtgag 21165288  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  21165289 ttctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttc 21165329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 22118527 - 22118966
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  22118527 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 22118626  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22118627 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgtagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactttgaatataaagttatgccttt 22118726  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||    
T  22118727 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 22118826  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22118827 atttactccaagactgaagaagaacgtgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 22118926  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||| ||| || || |||||||| ||| ||||||||||    
T  22118927 tctggtcgaaagaggtgagttttctaggccatgttatttc 22118966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 22127311 - 22127750
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  22127311 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 22127410  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22127411 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgtagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactttgaatataaagttatgccttt 22127510  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||    
T  22127511 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 22127610  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22127611 atttactccaagactgaagaagaacgtgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 22127710  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||| ||| || || |||||||| ||| ||||||||||    
T  22127711 tctggtcgaaagaggtgagttttctaggccatgttatttc 22127750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 19482424 - 19482855
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  19482424 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattga--------tggatcagttagtgggtgcgcgagttttcagcaagattgatt 19482515  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19482516 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaagttatgccttt 19482615  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  19482616 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggggtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcagttcgtggttgtgttcatcgacgatattttg 19482715  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19482716 atttactccaagactgaagaagaacatgcagaacatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 19482815  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||  ||||||||||    
T  19482816 tctggttgaaagaagtgagttttcttggtcatgttatttc 19482855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 26 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 19980397 - 19979957
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  19980397 tcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgat 19980298  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19980297 ttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgtagaagacaactttcagaacactgtatggtcactatgaatataaagttatgcctt 19980198  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  19980197 ttggtgttaccaatgcgcctggagtgtttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttatcgacgatatttt 19980098  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||     
T  19980097 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagaatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaattttatgctaaattatctaagtatgat 19979998  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  19979997 ttctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttc 19979957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 21253373 - 21252934
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21253373 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatcaactttcgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagatagatt 21253274  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  21253273 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgagtacaaagttatgccttt 21253174  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||| || |||||||||||||||    
T  21253173 cggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgaggttgtttttatcgatgatattttg 21253074  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||  ||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  21253073 atttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttctgcaagtattgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgagaat 21252974  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| ||  ||||||||||    
T  21252973 tctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttc 21252934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 21782772 - 21783211
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21782772 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagatagatt 21782871  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  21782872 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagagcgcggtatggtcactatgagtacaaagttatgccttt 21782971  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||| || ||||||||||| |||    
T  21782972 cggtgttacgaatgcacctggagtatttatggattacatgaatcgcatctttcatgcatttttggattggttcgtggttgtttttatcgatgatatattg 21783071  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| | || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21783072 atttactccaagtctgaagaagaacatgttgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgcgaat 21783171  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| ||  ||||||||||    
T  21783172 tctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttc 21783211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 21392213 - 21392652
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21392213 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagatagatt 21392312  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  21392313 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagagcgcggtatggtcactatgagtacaaagttatgccttt 21392412  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||| || ||||||||||| |||    
T  21392413 cggtgttacgaatgcacctggagtatttatggattacatgaatcgcatctttcatgcatttttggattggttcgtggttgtttttatcgatgatatattg 21392512  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| | || |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  21392513 atttactccaagtctgaagaagaacatgttgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcaaaattgtctaagtgcgaat 21392612  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| ||  ||||||||||    
T  21392613 tctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttc 21392652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 21786707 - 21787146
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21786707 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagatagatt 21786806  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  21786807 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagagcgcggtatggtcactatgagtacaaagttatgccttt 21786906  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||| || ||||||||||| |||    
T  21786907 cggtgttacgaatgcacctggagtatttatggattacatgaatcgcatctttcatgcatttttggattggttcgtggttgtttttatcgatgatatattg 21787006  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| | || |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  21787007 atttactccaagtctgaagaagaacatgttgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcaaaattgtctaagtgcgaat 21787106  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| ||  ||||||||||    
T  21787107 tctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttc 21787146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 48 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 23652449 - 23652031
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 147  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  23652449 aagaataggtatctacttctgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatttaagatcaggttatcaccaga 23652350  T
Q  148 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 247  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  23652349 ttaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacaggtttcagaacgcgttatggacattatgagtacaaagttatgccttttggtgttacaaatgcacctgg 23652250  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  23652249 tgtgtttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgttttcattgatgatactttgatttactccaagactgaagag 23652150  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 447  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  23652149 gaacatgctgagcatttgaagattgttttacaagtgttgaaagagaagaagctatatgctaaattgtctaagtgtgaattttggttgaaagaggtaagtt 23652050  T
Q  448 ttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||| ||| |||| |||||    
T  23652049 ttcttggccatgtcatttc 23652031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 28 - 466
Target Start/End: Original strand, 19864446 - 19864885
Alignment:
Q  28 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 127  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  19864446 agttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatttgatggatcagttagtgggtgctaaatttttcagcaagatagattt 19864545  T
Q  128 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 227  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  19864546 gagatcaggttatcaccagattaaagtaaaatatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgagtagaaagttatgcctttc 19864645  T
Q  228 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttga 327  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||| | ||||| ||||| |||||||||||||    
T  19864646 ggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatctcatctttcatgcatttttggattggttcatggttgttttcattgatgatattttga 19864745  T
Q  328 tttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattg-tcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||| ||||  | | | || ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  19864746 tttactctaagtctgaagaagaacatattgagcatttgaaactggtttttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgcgaat 19864845  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||  ||||||||||    
T  19864846 tctggttgaaagaagtgagttttcttggacatgttatttc 19864885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 22422244 - 22422683
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||| || || || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || || ||||||||||| |    
T  22422244 cagttgaataaagtgacgataaagaataggtattcacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgact 22422343  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  22422344 tgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagatagcattcagaacgcgttatggacattatgaatataaagtgatgccttt 22422443  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    |||||| || ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  22422444 cggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgtattcattgatgatattttg 22422543  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  22422544 atttactccaagtccgaagaagaacatgttgaacatttgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatcaaagtgtgaat 22422643  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    | |||||||| || || ||||| || ||| ||||||||||    
T  22422644 tatggttgaaagaggtgagtttccttggccatgttatttc 22422683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 28 - 466
Target Start/End: Original strand, 22375806 - 22376244
Alignment:
Q  28 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 127  Q
    ||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||    
T  22375806 agttgaataaagtaacgataaagaatagatatccacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtattcagcaagattgattt 22375905  T
Q  128 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 227  Q
    ||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||| |||||||||| |||||||||    
T  22375906 gagatcgggttatcaacagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacacgttatggacattattaatataaagtgatgcctttc 22376005  T
Q  228 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttga 327  Q
     |  | || |||||||| || |||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  22376006 agcattacaaatgcaccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggatcgttttgtggttgtgttcatcgacgatattttta 22376105  T
Q  328 tttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaatt 427  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||  | |||||||||||||| || | | ||||    
T  22376106 tatactccaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgctaaattgtcaaactataaatt 22376205  T
Q  428 ctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||  |  | |||||||| ||| ||||||||||    
T  22376206 ctggttgaaatagatgagttttcttggccatgttatttc 22376244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 30 - 466
Target Start/End: Original strand, 22246788 - 22247224
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 129  Q
    ||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||    
T  22246788 ttgaataaggtaacgataaagaatgggtatccacttccaagaattgatgctttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgttcagcaagattgatttga 22246887  T
Q  130 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 229  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  22246888 gatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagaccgcttttagaacaagttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcgg 22246987  T
Q  230 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    ||| || ||||| || || |||||||||||||| |||||||| || || | ||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||     
T  22246988 tgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcctgcgtttttggatcgtttcatggttgtgttcatcgacgatattttgata 22247087  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattct 429  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||  ||||||||||||  | ||||||||||| || |||||||||||||    
T  22247088 tactccaagattgaaggagaacatgttgagcatttgtagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgctaaattttcaaagtgtgaattct 22247187  T
Q  430 ggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||||| || |  |||||||  ||| ||||||||||    
T  22247188 ggttgaaagaggcgagttttcatggccatgttatttc 22247224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 112 - 466
Target Start/End: Original strand, 21920185 - 21920539
Alignment:
Q  112 tcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaata 211  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||    
T  21920185 tcagcaagatagatttgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcgttatggacattatgagta 21920284  T
Q  212 taaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttc 311  Q
    ||| || ||| | |||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||| |||||| | ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||     
T  21920285 taaggtgatgtcgttcggtgttacaaatgcacatggagtatttatggagtacatgaattgtatctttcaagcatttttggatcggttcgtggttgttttt 21920384  T
Q  312 atcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaat 411  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  21920385 attgatgatattttgatttacttcaagactgaagaagaatatgctgagcatttgaagttagttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgcgaaat 21920484  T
Q  412 tgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||  ||||||||||    
T  21920485 tgtctaagtgtgagttctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttc 21920539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 26 - 433
Target Start/End: Original strand, 31414820 - 31415227
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  31414820 tcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcagcaagattgac 31414919  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || || || |||||||| || ||||| || || |||||||    
T  31414920 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 31415019  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || |||||||| || ||||||||| |    
T  31415020 tcggtgttactaatgcgcctggggtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattct 31415119  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    |||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||  | |||||||| ||||| |||||| |     
T  31415120 gatttattctaagaccgaagaggagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttaaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcaaagtgtaag 31415219  T
Q  426 ttctggtt 433  Q
    ||||||||    
T  31415220 ttctggtt 31415227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 30 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 23657353 - 23656918
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 129  Q
    |||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23657353 ttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttcgtaggtgcaaaagttttcagcaagattgacttga 23657254  T
Q  130 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 229  Q
    | ||| | || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||| || |||||||| || |||||||||||    
T  23657253 ggtcaggttaccatcagattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcgg 23657154  T
Q  230 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||  |||  | ||||| || || ||||||||| | ||     
T  23657153 tgttactaatgcgcctggcgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttatggttgtatttattgatgatattctaata 23657054  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattct 429  Q
    || || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||  | ||||| || ||||| |||||||| || |    
T  23657053 tattctaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaagttgtcaaagtgtgagttat 23656954  T
Q  430 ggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttattt 465  Q
    |||| |  |||||||||||||| ||| || ||||||    
T  23656953 ggttaagtgaagtaagttttcttggccatattattt 23656918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 27 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 23887457 - 23887015
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   || || |||||||||||||    
T  23887457 cagttgaataaagtaacgataaagaataggtatccacttcgaagaattgatgatttgatggattagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgatt 23887358  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| |   | ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || || || || |||||||| || || || |||  ||| ||||||||    
T  23887357 tgaggttgggttatcaccagattaaagtgaaagacgaggatatgcataagacggcctttaggacacgttatggacattacgagtattcagtgatgccttt 23887258  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    |||||| || ||||| || |  |||||||||||||| |||||||  || || ||||| | ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23887257 cggtgttactaatgcgccagatgtgtttatggagtacatgaatcatatttttcatgcttatttagatcgcttcgtggttgtgttcatcgatgatattttg 23887158  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgc----tgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgt 422  Q
    || ||||| ||| || ||||||||||||     ||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||  | ||||| || ||||| ||||||    
T  23887157 atatactctaagtctaaagaagaacatgtatgttgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaggagaagaagttatatgccaagttgtcaaagtgt 23887058  T
Q  423 gaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttattt 465  Q
    ||||||| |||||| || || |||||||| ||| |||||||||    
T  23887057 gaattctagttgaatgaggtgagttttcttggccatgttattt 23887015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 451
Target Start/End: Original strand, 21323630 - 21324054
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||     
T  21323630 tcagttgaataaagttacaataaagaataggtatccacttccgaggattgacgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaagtttttagtaagattgac 21323729  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || || || ||||| || || || || || || |||||||    
T  21323730 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgagtacaatgtgatgcctt 21323829  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |   |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||| |    
T  21323830 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattcgtggttgtgtttatcgatgacattct 21323929  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    ||| || || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||| | | ||||||||| ||  | |||||||| ||||| ||||||||     
T  21323930 gatctattcaaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaaattttgaaagagaa-aagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgag 21324028  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
    |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  21324029 ttctggttaagtgaagtgagttttct 21324054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 222 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 22988964 - 22988720
Alignment:
Q  222 cctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgata 321  Q
    ||||||||||| |||||| | ||  | ||||||||||| || ||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22988964 cctttcggtgtcaccaatacgccacgtgtgtttatggaatacatgaatcacatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgtgttcatcgatgata 22988865  T
Q  322 ttttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtg 421  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  22988864 ttttgatatattccaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagctttatgctaaattgtcaaagtg 22988765  T
Q  422 tgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||| ||| ||||||||||    
T  22988764 tgaattctggttgaaagaggtgagttttcttggccatgttatttc 22988720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 48 - 466
Target Start/End: Original strand, 20008294 - 20008712
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 147  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||   || ||||| |||||||||||||| ||| | || || ||||    
T  20008294 aagaatagatatccacttccgagaattgatgatttaatggatcaattagtgggtgcacgcgtgttcagtaagattgatttgagctcaggttaccatcaga 20008393  T
Q  148 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 247  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  20008394 ttaaggtgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 20008493  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     ||||||||||||||||||||  | || |||||||| | | |||||  ||| || |||||||| |  ||||||||  | ||||| || |||| |||||||    
T  20008494 tgtgtttatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttagtgatgatatcctaatttattctaagaatgaagaa 20008593  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 447  Q
    || ||||| |||||| |||||||||| |||||| ||| |||||| |||||  | ||||| || ||||| || |||||||| ||||| |  ||||||||||    
T  20008594 gagcatgcagagcatatgaagattgtgttgcaactgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattttggttaagtgaagtaagtt 20008693  T
Q  448 ttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||| ||| || |||||||    
T  20008694 ttcttggccatattatttc 20008712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 27 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 22522975 - 22522711
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    || || |||||||||||||    
T  22522975 cagttgaacaaagtaacgataaagaacaggtatccacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgctcgtgtgtttagcaagattgatt 22522876  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||| | || ||||| |||||||| ||||||||    
T  22522875 tgagatcgggttatcaccagaataaagtgaaagatgaagatatgcagaaaacggcttttagaacacgttatcgacattatgagtataaagtgatgccttt 22522776  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttgg 291  Q
    |||||| || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  22522775 cggtgttacaaatgcgccaggagtgtttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttgg 22522711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 48 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 21927836 - 21927417
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    || ||||| || ||||||||||| ||| | || || ||||    
T  21927836 aagaataggtatccacttccgagaattgacgacttaatggatcagttagtgggtgctcgtgtgttcagtaaaattgatttgaggtcaggttaccatcaga 21927737  T
Q  148 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 247  Q
    |||| ||||| |||||  |||||||||||||  | || || || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| || ||||| |||||    
T  21927736 ttaaggtgaaggatgagcatatgcagaagacgacctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcagtgttactaatgcgcctgg 21927637  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     ||||||||||||||||||||  | || |||||||| | | |||||  ||| || |||||||| || ||||| || || ||||| || ||||||||||||    
T  21927636 tgtgtttatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagactgaagaa 21927537  T
Q  348 gaaca-tgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagt 446  Q
    || || ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||  | ||||| || ||||| || |||||||||||||| |  ||||||||     
T  21927536 gagcattgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattctggttaagtgaagtaaga 21927437  T
Q  447 tttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||| ||| || |||||||    
T  21927436 tttcttggccatattatttc 21927417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 466
Target Start/End: Original strand, 29301777 - 29302217
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||   || ||||| || |||||     
T  29301777 tcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccgcttccgaggattgatgatctgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgttcagtaaaattgac 29301876  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||  | |||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||||    
T  29301877 ttgaggtcgggttatcactagattaaggtgaaagatgagaatatgcagaagacggcattcagaacacgttatgggcattatgagtataaggtgatgcctt 29301976  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| |||||  | || || |||||||| || ||||  || || || || || || ||||| ||| |    
T  29301977 ttggtgttacaaatgcacctggggtatttatggagtacatgaacagaatttttcatgcattcttagatcagtttgttgtggtatttattgatgacattct 29302076  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    ||||||||| ||||| |||||| ||||||| || ||  |||||||||| || ||||||| |||||||| |||  | ||||| || ||||| || ||||||    
T  29302077 gatttactctaagaccgaagaataacatgcagaacacttgaagattgtgttacaagtgttgaaagagaggaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaa 29302176  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  29302177 ttctggttgagtgaagtaagttttcttggccacgttatttc 29302217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 30 - 466
Target Start/End: Original strand, 20394488 - 20394924
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 129  Q
    |||||||| || || || ||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   || || |  |||||||||||||    
T  20394488 ttgaacaaagtgacaataaagaatagggatccacttctaagaatcgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttattaagattgatttga 20394587  T
Q  130 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 229  Q
    ||||  | ||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||   | | ||||||||  |    
T  20394588 gatcgggctatcatcagattaaactgaaggatgaagatatgtagaagacggcttttaggacacgttacggacattacgaataatcaatgatgccttttag 20394687  T
Q  230 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    ||  || |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||| || |||||||||||     
T  20394688 tgctacaaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttagatcgctttgttgttgtgttcattgacgatattttgata 20394787  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattct 429  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||| ||  | ||||| || ||||| |||||||||||||    
T  20394788 tactctaagtctgaagaagaacatgccgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaaaaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgaattct 20394887  T
Q  430 ggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||  | || |||||||| ||| || |||||||    
T  20394888 ggttgaataaggtgagttttcttggccatattatttc 20394924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 26 - 454
Target Start/End: Original strand, 16269575 - 16270003
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||  |||| || |||||||||    
T  16269575 tcagttgaacaaggttacgataaagaacaggtatccgcttccgagaattgacgatttgatggatcagttggttggtgctaagatttttagtaagattgat 16269674  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  16269675 ttgaggtctagttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 16269774  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || || |  ||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||   || || || |||||||| |||||||| ||    
T  16269775 tcggtgttactaacgggcctggtgtgtttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgttcattgatgatatctt 16269874  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    |||||| ||||||| |||||| || ||||| ||||| ||||  ||||| |||||||||| ||| || ||||   | ||||| || ||||| || |||||     
T  16269875 gatttattccaagaatgaagaggagcatgcagagcacctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgcaaagttgtcaaaatgtgag 16269974  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 454  Q
    |||||||| |  ||||| || ||||||||    
T  16269975 ttctggttaagtgaagtgagctttctggg 16270003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 27 - 179
Target Start/End: Original strand, 21781539 - 21781691
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21781539 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagatagatt 21781638  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagaca 179  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21781639 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagaca 21781691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 312 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 19114834 - 19114680
Alignment:
Q  312 atcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaat 411  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  19114834 atcgacgatattttgatttactccaagaccgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaat 19114735  T
Q  412 tgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  19114734 tgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 19114680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 29 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22989472 - 22989274
Alignment:
Q  29 gttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttg 128  Q
    |||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  || || |||||||||||||||    
T  22989472 gttgaataaagtaacgataaagaataggtatccacttccaataattgatgacttgatggatcagttagtggctgcaagtgtgtttagcaagattgatttg 22989373  T
Q  129 agatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 227  Q
    |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||    
T  22989372 agatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaatacagctttcagaacgcgttatgggtattatgaatataaagtgatgcctttc 22989274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 30 - 424
Target Start/End: Original strand, 31569198 - 31569591
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 129  Q
    |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  31569198 ttgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggaccagctagtgggtgcaaaggtgttcagtaagattgacttga 31569297  T
Q  130 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 229  Q
    | ||| | || || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  31569298 ggtca-gttaccatcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcgg 31569396  T
Q  230 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    ||| || || || || || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||||  |||||| || || || || ||||||||| |||||    
T  31569397 tgttactaacgcgcccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatattctgatt 31569496  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtga 424  Q
    || || |||||||||||||| ||||| || |||||||  |||||  ||||||| | ||||||||||||  | ||||| |||||||| || |||||    
T  31569497 tattcgaagactgaagaagagcatgcagaacatctgagaattgtgctgcaagttttgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaaatgtga 31569591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 57 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 19861834 - 19861425
Alignment:
Q  57 tatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtga 156  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     || ||||   | ||| ||||||| ||| | || || |||||||| ||||    
T  19861834 tatcgacttccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtggtcgtgtgttcatgtaaattaatttgaggtcaggttaccatcagattaaggtga 19861735  T
Q  157 aagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttat 256  Q
    | |||||||||||||||||||| || || || || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||    
T  19861734 aggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattatgagtataaggtaatgcccttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttat 19861635  T
Q  257 ggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgct 356  Q
    | ||||||||||  | || |||||||| | | |||||  ||| || |||||||| || ||||||||  | ||||| || |||| |||||||||||||||     
T  19861634 gaagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcctaatttattctaagaatgaagaagaacatgca 19861535  T
Q  357 gagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcg 456  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||| | |||||  | ||||| || ||||| || |||||||| ||||| |  |||||||||||||| |||     
T  19861534 gagcatctgaagattgagttgcaagtgttgaaataaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattttggttaagtgaagtaagttttcttggcc 19861435  T
Q  457 atgttatttc 466  Q
    || |||||||    
T  19861434 atattatttc 19861425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 26 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 22053293 - 22052868
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||  ||||||  ||||||||     
T  22053293 tcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatccgcttccgagaattgatgacttgatggatcagctggttggtgcaaagattttcaataagattgac 22053194  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||  | || || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||||| || |||||  | || |||||||    
T  22053193 ttgaggtctggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgaataccaggtgatgcctt 22053094  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||| |||||   || || | ||| ||||| ||||||||  |    
T  22053093 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcctttctggataagtttgtgggtgtattcattgatgatatcct 22052994  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
     ||||| || ||||||||||| || ||||| || ||||||| |||||| ||||||||   ||||||||| ||  | |||||||| ||||  || ||||||    
T  22052993 aatttattctaagactgaagaggagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagtactgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgttgaaatgtgaa 22052894  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
    |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  22052893 ttctggttaagtgaagtgagttttct 22052868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 26 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 4984472 - 4984044
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || |||||||| | |||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  |||| || |||||||||    
T  4984472 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaagtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatttttagtaagattgat 4984373  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||  | ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  4984372 ttgaggtctggttatcatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 4984273  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || || || ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| | |||   || || || ||||||||  ||||||  ||    
T  4984272 tcggtgtaactaaagcgcctggtgtttttatggagtacatgaatcgaatcttccatgcttttctagataagtttgttgtggtgttcattaatgatacctt 4984173  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    |||||| |||||||  || ||||| ||||| ||||||||||  || || ||||||||||  || ||||||  | | |||| ||| ||||| || |||||     
T  4984172 gatttattccaagaacgaggaagagcatgcagagcatctgagaatagtattgcaagtgttaaaggagaagcgattgtatgttaagttgtcaaaatgtgag 4984073  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 454  Q
    |||||||| |  ||||| || ||||||||    
T  4984072 ttctggttaagtgaagtgagctttctggg 4984044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 26 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 28983341 - 28982916
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  ||||||| |||||||||    
T  28983341 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgccaagattttcagtaagattgat 28983242  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    |||||  |  | ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  28983241 ttgagggctggttatcatcagataaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 28983142  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||   || || || || || || ||||||||| |    
T  28983141 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgtggtggtatttattgatgatattct 28983042  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
     || || ||||||| ||| || || ||||| ||||||||||  || || |||||||||| ||| || ||||   | |||||||| || ||  | ||||||    
T  28983041 aatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaatagtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcacaatgtgaa 28982942  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
    ||||||||    ||||||||||||||    
T  28982941 ttctggttacgtgaagtaagttttct 28982916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 26 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 28988560 - 28988135
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  ||||||| |||||||||    
T  28988560 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgccaagattttcagtaagattgat 28988461  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    |||||  |  | ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  28988460 ttgagggctggttatcatcagataaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 28988361  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||   || || || || || || ||||||||| |    
T  28988360 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgtggtggtatttattgatgatattct 28988261  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
     || || ||||||| ||| || || ||||| ||||||||||  || || |||||||||| ||| || ||||   | |||||||| || ||  | ||||||    
T  28988260 aatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaatagtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcacaatgtgaa 28988161  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
    ||||||||    ||||||||||||||    
T  28988160 ttctggttacgtgaagtaagttttct 28988135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 26 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 27356966 - 27356538
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| ||  | || ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  |||| || ||||||||     
T  27356966 tcagttgaacaaagtttcgataaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatttttagtaagattgac 27356867  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||  | ||  | ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||| || ||||| || || |||||||    
T  27356866 ttgagatctggttactatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 27356767  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||| |||||   || || || ||||| || |||||||| ||    
T  27356766 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtacatgaaccgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatctt 27356667  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
     ||||| ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||| |  ||||||||||   | ||||| || ||||| || |||||     
T  27356666 aatttattccaagaatgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagttttaaaagagaagaggttgtatgcgaagttgtcgaaatgtgag 27356567  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 454  Q
    |||||||| |  ||||| || ||||||||    
T  27356566 ttctggttaagtgaagtgagctttctggg 27356538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 20390516 - 20390090
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||   || || ||||||||||||    
T  20390516 tcagttgaataaagtgacgataaataataggtatccacttccgagaattgatgattttatggatcagttagtgggttcacgtgtgtttagcaagattgat 20390417  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||  | || || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || || || || || ||||| || ||  |||||||||| ||| |||    
T  20390416 ttgaggtcgggttaccatcagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaaaacggcctttaggacacgatatggacattacaaatataaagtgatgtctt 20390317  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||  ||||             ||  |||||| | || |||||||| || |||||||| || || |||||||| || ||||| || ||    
T  20390316 tcggtgttactaatgtgcctg-------------gtgcatgaatagaattttccatgctttcttggatcggtttgtggttgtgtttattgatgacatctt 20390230  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||||||| ||| || || ||  | ||||| || ||||| || | ||||    
T  20390229 gatttattctaagactgaagaagagcatgcggagcatttaaagattgtgttgcaagtgttgaaggaaaaaaagttgtatgccaagttgtccaaatttgaa 20390130  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttattt 465  Q
    |||| ||| |  |||| ||||||||| ||| || ||||||    
T  20390129 ttctagttaagtgaagcaagttttcttggccatattattt 20390090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 448
Target Start/End: Original strand, 16875447 - 16875868
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||| | || || || ||||||||||    
T  16875447 cagttgaacaaggtgacgattaagaattggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 16875546  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  ||||||||    || || || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  16875547 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcagaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 16875646  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     || ||  | ||||| || || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || || || || |||||||| ||||||||||||    
T  16875647 tggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 16875746  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
     | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||  |  | | ||| || |||||||||||||| |    
T  16875747 gtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagt 16875846  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttt 448  Q
    | |||||||||||||| |||||    
T  16875847 tttggttgaaggaagtgagttt 16875868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 48 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 19984588 - 19984404
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 147  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||   || ||||| || ||||||||||| ||| | || || ||||    
T  19984588 aagaataggtatccacttctgaggattgatgatttaatggatcagttagtgggtgcacgtgtgttcagtaaaattgatttgaggtcaggttaccatcaga 19984489  T
Q  148 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgt 232  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||    
T  19984488 ttaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattatgaataaaaggtgatgcctttcggtgt 19984404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 26 - 241
Target Start/End: Original strand, 22061030 - 22061245
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||| || |||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||     
T  22061030 tcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttcccaggattgatgacttaatgaatcagttggtgggtgcaaaagttttcagtaagattgac 22061129  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||  || || || || || |||||||| |||||||| || || |||||||    
T  22061130 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggaaatgcagaagaaggcctttaggacacgatatggtcattatgaatacaaggtgatgcctt 22061229  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgc 241  Q
    ||||||| || |||||    
T  22061230 tcggtgttactaatgc 22061245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 109 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 6606005 - 6605660
Alignment:
Q  109 ttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatga 208  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  | ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  6606005 ttttcagtaagattgatttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacga 6605906  T
Q  209 atataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtg 308  Q
     || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||   || || || ||     
T  6605905 gtacaaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggta 6605806  T
Q  309 ttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgcta 408  Q
    || || ||||||||||| || || ||||||| ||| || || ||||| ||||||||||  ||||| ||||| |||| ||| || ||||   | |||||||    
T  6605805 tttattgatgatattttaatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaggtgttgaaggaaaagaggttgtatgcta 6605706  T
Q  409 aattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctggg 454  Q
    | || || || ||||| |||||||| |  ||||| || ||||||||    
T  6605705 agttatcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtgagctttctggg 6605660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 451
Target Start/End: Original strand, 21848689 - 21849113
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||| | || || || ||||||||||    
T  21848689 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccatttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 21848788  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||| || |   |||||||    || || || ||| ||||  | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  21848789 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcgaaagatatatccaaaactgcgttccgaacaaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 21848888  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     || ||  | ||||| || || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || || || || |||||||| ||||||||||||    
T  21848889 tggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 21848988  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
     | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||  |  | | ||| || ||||||||||| || |    
T  21848989 gtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgggagt 21849088  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
    | |||||||||||||| ||||||||    
T  21849089 tttggttgaaggaagtgagttttct 21849113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 22030533 - 22030470
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggat 89  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22030533 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggat 22030470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 448
Target Start/End: Original strand, 20650707 - 20651128
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||| | || || || ||||||||||    
T  20650707 cagttgaacaaggtgacaattaagaatcggtatccacttccgaggattgatgatttgatggatcaactagttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 20650806  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||| || |||| ||| || |  ||||||||    || ||||| ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  20650807 tgagatcaggatatcatcaaattagagtaaaggcagaagatatatccaaaacagcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 20650906  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     || ||  | ||||| || || || || || |||||||||||| | || ||  || | | | |||| || || ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  20650907 tggagtatctaatgcgccaggtgtcttcatagagtatatgaatagaatattttatccttatctggaccgttttgtagtggtgttcatagatgatattttg 20651006  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
     | || || ||  |||| || || ||||| |||||| ||| |||||| |||||||| | ||| |||||  |  | | |||||| ||||||||||||||      
T  20651007 gtgtattcgaaatctgaggaggagcatgccgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaggagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgtgaga 20651106  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttt 448  Q
    | |||||||||||||| |||||    
T  20651107 tttggttgaaggaagtgagttt 20651128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 157
Target Start/End: Original strand, 23155394 - 23155524
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| | || |||||| |||| || || ||||||||||    
T  23155394 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgcttctgaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcagaagtgtttagtaagattgatt 23155493  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaa 157  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||||||    
T  23155494 tgagatcaggatatcatcagattagagtgaa 23155524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 26 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 22373298 - 22373168
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    || |||||||| ||||||    
T  22373298 tcagttgaataaagtgacgataaagaatagatatccacttccaagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgctcgtgtgttcagcaaaattgat 22373199  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtga 156  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||    
T  22373198 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtga 22373168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 16414520 - 16414413
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||| || || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||| | || || || ||||||||||    
T  16414520 cagttgaacaaagtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 16414421  T
Q  127 tgagatca 134  Q
    ||||||||    
T  16414420 tgagatca 16414413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 22436732 - 22436590
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||| | | || |||||| | || || || ||||||||||    
T  22436732 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgcttatgaggattgatgatttgatggatcggctggttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 22436633  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatat 169  Q
    |||||||| | ||||| || |||| ||||||||  ||||||||    
T  22436632 tgagatcaggatatcatcatattagagtgaaagcggaagatat 22436590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 14567445 - 14567144
Alignment:
Q  153 gtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgt 252  Q
    ||||| ||||| ||| |||| ||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || |    
T  14567445 gtgaaggatgaggatttgcaaaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaaggcgcctggtgttt 14567346  T
Q  253 ttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaaca 352  Q
    |||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||   || || || ||||| || |||||||| || ||||| ||||||| ||| || || ||    
T  14567345 ttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatcttaatttattccaagaatgaggaggagca 14567246  T
Q  353 tgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctg 452  Q
    |||  |||| || || || || |||||||||| ||| || |||| | | ||||| || ||||| || ||||| |||||||| |  ||||| || ||||||    
T  14567245 tgcaaagcacctaaaaatagtgttgcaagtgttgaaggaaaagagattgtatgcaaagttgtcgaaatgtgagttctggttaagtgaagtgagctttctg 14567146  T
Q  453 gg 454  Q
    ||    
T  14567145 gg 14567144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 23902593 - 23902487
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || ||||||  |||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||| | || |||||  |||| ||||| ||||||||||    
T  23902593 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcagtatccgcttctgaggattgatgatttaatggatcagctggttggtgcggaagtgttcagtaagattgatt 23902494  T
Q  127 tgagatc 133  Q
    |||||||    
T  23902493 tgagatc 23902487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 19869976 - 19869823
Alignment:
Q  173 gaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgc 272  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| |||  ||| |||||||| || ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||  |     
T  19869976 gaagactgccttcagaacccgttatggtcattatgagtattcagtgatgccttttggagtgtccaacgcgccaggagtgtttatggagtatatgaacaga 19869877  T
Q  273 atcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    || |||||| | | ||| ||||  ||||| || || ||||| ||||||||||||    
T  19869876 attttccatccgtatttagatcagttcgttgtagtattcattgatgatattttg 19869823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 134
Target Start/End: Original strand, 21194892 - 21194999
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||| | || |||||| | || || || ||||||||||    
T  21194892 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgcttctgaggattgatgatttaatggatcagctggttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 21194991  T
Q  127 tgagatca 134  Q
    | ||||||    
T  21194992 tcagatca 21194999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 134
Target Start/End: Original strand, 24932176 - 24932283
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||| || || || || ||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| | || |||||| | || || || ||||||||||    
T  24932176 cagttgaacaaagtgacgattaaaaatcggtatccacttccaatgattgatgatttgatggatcagctggtcggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 24932275  T
Q  127 tgagatca 134  Q
    ||||||||    
T  24932276 tgagatca 24932283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 448
Target Start/End: Original strand, 21195215 - 21195312
Alignment:
Q  351 catgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttt 448  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||||||| | ||| |||||  |  | | |||||| ||||||||| |||| || |||||| |||||||||||||    
T  21195215 catgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtattgaaggagaaccagttatgtgctaagttgtctaagagtgagttttggttgcaggaagtaagttt 21195312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 404 - 448
Target Start/End: Original strand, 23155769 - 23155813
Alignment:
Q  404 tgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttt 448  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  23155769 tgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagttt 23155813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 389; Significance: 0; HSPs: 76)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 466
Target Start/End: Original strand, 16805094 - 16805534
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16805094 tcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 16805193  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16805194 ttgagatcagggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagcacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 16805293  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||    
T  16805294 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtacatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgacatttt 16805393  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16805394 gatttactccaagactgaaggagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 16805493  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16805494 ttctggttgaaagaagtaagttttcttggccatgttatttc 16805534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 5108759 - 5109198
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  5108759 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 5108858  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5108859 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 5108958  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  5108959 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatatcttg 5109058  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5109059 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagaaaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 5109158  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  5109159 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 5109198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 16637755 - 16637316
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16637755 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 16637656  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16637655 tgagatcaggctatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccctt 16637556  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  16637555 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgatattttg 16637456  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16637455 atctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 16637356  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  16637355 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 16637316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 48427429 - 48426990
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  48427429 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 48427330  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48427329 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 48427230  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  48427229 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgatattttg 48427130  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48427129 atctactccaagactgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 48427030  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  48427029 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 48426990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 6602718 - 6602279
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  6602718 cagttgagcaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 6602619  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6602618 tgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcaaaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaagttatgccttt 6602519  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6602518 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttg 6602419  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6602418 atttactccaagaccgaagaagaacatgctgagcatctgacgattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 6602319  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||| ||||||||||    
T  6602318 tctggttgaatgaagtgagtttccttggccatgttatttc 6602279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 10007582 - 10007143
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  10007582 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 10007483  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10007482 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 10007383  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10007382 tggagttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttg 10007283  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10007282 atttactccaagactgaagaagaacattctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 10007183  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  10007182 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 10007143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 12888691 - 12888252
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  12888691 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 12888592  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12888591 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 12888492  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12888491 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagtagtgttcatcgatgatattttg 12888392  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12888391 atttactccaagactgaagaagaacatgccgagcacctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgcaaaattgtctaagtgtgaat 12888292  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||| ||||||||||    
T  12888291 tctggttgaaagaagtgagtttacttggccatgttatttc 12888252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 15346393 - 15346832
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  15346393 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 15346492  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15346493 tgaggtcaggttatcaccagcttaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 15346592  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||    
T  15346593 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 15346692  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15346693 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 15346792  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  15346793 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 15346832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 10908192 - 10907753
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  10908192 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 10908093  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10908092 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 10907993  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10907992 tggagttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttg 10907893  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10907892 atttactccaagactgaagaagaacattttgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 10907793  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  10907792 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 10907753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 15400665 - 15401104
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  15400665 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 15400764  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15400765 tgaggtcaggttatcaccaaattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 15400864  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||    
T  15400865 tggtgttaccaatgcacttggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgatgatattttg 15400964  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  15400965 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcgagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagt 15401064  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  15401065 tctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgttatttc 15401104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 15587540 - 15587979
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  15587540 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 15587639  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15587640 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgatatggtcactatgaatataaagttatgccttt 15587739  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||    
T  15587740 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttctggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 15587839  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15587840 atctactccaagactgaagaagaacatgttgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 15587939  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  15587940 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 15587979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 29 - 466
Target Start/End: Original strand, 53383168 - 53383605
Alignment:
Q  29 gttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttg 128  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  53383168 gttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatttg 53383267  T
Q  129 agatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcg 228  Q
    |||||  | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  53383268 agatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaagttatgcctttcg 53383367  T
Q  229 gtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgat 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  53383368 gtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgat 53383467  T
Q  329 ttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattc 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53383468 ttactccaagactgaagaagaacatgcggaacatctgaagattgtcttacaggtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattc 53383567  T
Q  429 tggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||| ||||||||||    
T  53383568 tggttgaatgaagtgagtttccttggccatgttatttc 53383605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 3687925 - 3687486
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  3687925 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggagcacgagttttcagcaagattgatt 3687826  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3687825 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 3687726  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3687725 tggagttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttg 3687626  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3687625 atttactccaagactgaagaagaacatgcagagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgaat 3687526  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||  ||||||||||    
T  3687525 tctggttgaaagaagtgagttttctaggtcatgttatttc 3687486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 5423078 - 5423517
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  5423078 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 5423177  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5423178 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 5423277  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||    
T  5423278 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttatgttcatcgacgatatcttg 5423377  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5423378 atttactctaagactgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 5423477  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||| |||||| ||||| ||||| || ||| ||||||||||    
T  5423478 tcttgttgaatgaagtgagtttccttggccatgttatttc 5423517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 13254672 - 13254233
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  13254672 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcaactagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 13254573  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13254572 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 13254473  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||    
T  13254472 tggagttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 13254373  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13254372 atctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 13254273  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  13254272 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 13254233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 16694147 - 16693707
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  16694147 tcagttgaataaggtaactatcaagaatatgtatccacttccgagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcgaaagtcttcagcaagattgat 16694048  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16694047 ttgagatcaggttatcaccagattaatgtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgctatggtcactatgaatataaagttatgccat 16693948  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || || |||||    
T  16693947 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtaaatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttagtagttgtgtttatagacgaaatttt 16693848  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16693847 gatatactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgag 16693748  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  16693747 ttctggttgaaagaagtaagttttcttggtcatgttatttc 16693707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 20060202 - 20060641
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  20060202 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 20060301  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20060302 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 20060401  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||    
T  20060402 tggagttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttctggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 20060501  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20060502 atttactccaagactgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaat 20060601  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  20060602 tttggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 20060641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 16754849 - 16755288
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16754849 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 16754948  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16754949 tgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaagttatgccttt 16755048  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| || || |||||||||    
T  16755049 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttattgacgatattttg 16755148  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  16755149 atttactccaagactgaagaagaacatgcggaacatttgaagattgttttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtttgtgtgtgaat 16755248  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||| ||||||||||    
T  16755249 tctggttgaatgaagtgagtttccttggccatgttatttc 16755288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 56 - 466
Target Start/End: Original strand, 14874676 - 14875086
Alignment:
Q  56 gtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtg 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||     
T  14874676 gtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagatagatttgagatcaggttatcaccagattaaagta 14874775  T
Q  156 aaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgttta 255  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |    
T  14874776 aaagacgaagatttgcagaagacatctttcagaacgcggtatggtcactatgaatacaaagttatgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtattca 14874875  T
Q  256 tggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgc 355  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14874876 tggagtacatgaatcgcatctttcatgcctttttggatcgattcgtggttgtttttatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgc 14874975  T
Q  356 tgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  14874976 tgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttctggttgaaagaagtaagttttcttggc 14875075  T
Q  456 gatgttatttc 466  Q
      |||||||||    
T  14875076 cttgttatttc 14875086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 115 - 466
Target Start/End: Original strand, 15723170 - 15723521
Alignment:
Q  115 gcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataa 214  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15723170 gcaagattgatttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacacgttatggtcactatgaatataa 15723269  T
Q  215 agttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatc 314  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| |||    
T  15723270 agttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatc 15723369  T
Q  315 gatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgt 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15723370 gatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgt 15723469  T
Q  415 ctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  15723470 cgaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 15723521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 30 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 17491829 - 17491393
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 129  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  17491829 ttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgagaattgattatttgatggatcagttagtgggtgcaagtgttttcagcaagatagatttga 17491730  T
Q  130 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 229  Q
    ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||| |    
T  17491729 gatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaaaacagctttcagaacgcgttatggacattatgagtacaaagttatgcctttcag 17491630  T
Q  230 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    ||| || |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| |||    
T  17491629 tgttacaaatgcacctggagtatttatgaagtacatgaatcgcatctttcattcatttttggatcggttcgtggttgtttttattgatgatattttaatt 17491530  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattct 429  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17491529 tactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgtgaattct 17491430  T
Q  430 ggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||  ||||||||||    
T  17491429 ggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttc 17491393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 165 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 12500092 - 12499791
Alignment:
Q  165 gatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtata 264  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12500092 gatatgcataagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtaca 12499993  T
Q  265 tgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatct 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12499992 tgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttatcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatct 12499893  T
Q  365 gaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatt 464  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||    
T  12499892 gaagattgtcttgcaagtgttgatagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatt 12499793  T
Q  465 tc 466  Q
    ||    
T  12499792 tc 12499791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 15261612 - 15261173
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||| ||||| || || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || || |||||||||||||    
T  15261612 cagttaaacaaagtgacgataaagaatagatatccacttccgagaattgatgaattgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgatt 15261513  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||  | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  15261512 tgagatcgggttatcactagattaaactgaaagatgaagatatgcagaagatggcttttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgccttt 15261413  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    |||||| |  ||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  15261412 cggtgttagaaatgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatctttcatgcgtttttggatcgtttcgtggttgtattcatcgatgatattttg 15261313  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  15261312 atatattccaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaggagaagaagctttatgctaaattgtaaaagtgtgaat 15261213  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||| ||||||||||    
T  15261212 tctggttgaaagaggtgagttttcttggccatgttatttc 15261173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 202 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 15341076 - 15340812
Alignment:
Q  202 actatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  15341076 actatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgt 15340977  T
Q  302 agttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactt 401  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15340976 ggttgtgtttatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcgagtgttgaaagagaagaaactt 15340877  T
Q  402 tatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  15340876 tatgccaaattgtctaagtgtgagttctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgttatttc 15340812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 27 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 15358065 - 15357886
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  15358065 cagttgaacaaggttactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 15357966  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactat 206  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357965 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgatgatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactat 15357886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 454
Target Start/End: Original strand, 11959305 - 11959733
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||    
T  11959305 tcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttgatggatcagttagtgagtgcaaaggtgttcagtaagattgat 11959404  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||  | || || ||||| || || || ||||| ||||||||||||||  |||| || || || |||||||| || ||||| || || |||||||    
T  11959405 ttgaggtctggttaccatcagatgaaggtcaaggatgaggatatgcagaagacgacttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 11959504  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | || |||||||| ||| |||||  |||  |||||||||| || |||||||||||    
T  11959505 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggaatatatgaataggattttccatgcttttctggataaatttctagttgtgtttattgatgatatttt 11959604  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
     || || ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||| | |||||| ||||   | ||||| || ||||| || ||||||    
T  11959605 aatctattccaagaatgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagttttgaaagaaaagaggttgtatgcaaagttgtcaaaatgtgaa 11959704  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 454  Q
    |||||||| |  ||||| |||||||||||    
T  11959705 ttctggttaagtgaagtgagttttctggg 11959733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 451
Target Start/End: Original strand, 31693321 - 31693746
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||  |||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||     
T  31693321 tcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgagggttgacgacttgatggaccagttagtgggtgcaaaggttttcagtaagattgac 31693420  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | || || || || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| || |||||||| || || |||||||    
T  31693421 ttgaggtcaggttaccatcaaatcaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggacattatgaatacaaggtgatgcctt 31693520  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||| | | |||||  |||||| ||||| || || ||||| ||  |    
T  31693521 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaactgaattttccatgcttatctggataaattcgtggttgtatttattgatgacatact 31693620  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    |||||| |  |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||  | |||||||| ||||| || |||||     
T  31693621 gatttatttaaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagttttgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcaaaatgtgag 31693720  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||    
T  31693721 ttctggttaagtgaagtaagttttct 31693746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 31940896 - 31940471
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||     
T  31940896 tcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgacgacttgatggaccagttagtgggtgcaaaggttttcagtaagattgac 31940797  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | || || || || || ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || || || ||||  || |||||||| || || |||||||    
T  31940796 ttgaggtcaggttaccatcaaatcaaggtgaaggatgaggatatgcataagacagcctttaggacacgatatgcacattatgaatacaaggtgatgcctt 31940697  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| | | |||||  |||||| ||||| || || ||||| ||  |    
T  31940696 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataaattcgtggttgtatttattgatgacatact 31940597  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    |||||| || |||||||||||| | ||||| || |||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||  | |||||||| ||||| || |||||     
T  31940596 gatttattcaaagactgaagaatagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagttttgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcaaaatgtgag 31940497  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||    
T  31940496 ttctggttaagtgaagtaagttttct 31940471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 451
Target Start/End: Original strand, 12358663 - 12359088
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||| |||| || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||     
T  12358663 tcagttgcacaaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggttttcagtaagaatgac 12358762  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |  || || ||||| || || ||||| || || |||||||    
T  12358763 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaagacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctt 12358862  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |   |||||  ||| || ||||| || || ||||| ||| |    
T  12358863 tcggtgttactaaagcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattagtggttgtatttattgatgacattct 12358962  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||  | |||||||| ||||| ||||||||     
T  12358963 gatttattcaaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgag 12359062  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
    |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  12359063 ttctggttaagtgaagtgagttttct 12359088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 28 - 248
Target Start/End: Original strand, 14579557 - 14579777
Alignment:
Q  28 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 127  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  14579557 agttgaataaggtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgatttgatggatcaattagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgattt 14579656  T
Q  128 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 227  Q
    ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| || ||||| ||||| || ||| | |||    
T  14579657 gaggtcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaatgcggtatggacattatgagtataaggtgatgtcgttc 14579756  T
Q  228 ggtgtgaccaatgcacctgga 248  Q
    ||||| || ||||||||||||    
T  14579757 ggtgttacaaatgcacctgga 14579777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 451
Target Start/End: Original strand, 11950044 - 11950469
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||  ||||| || ||||||||     
T  11950044 tcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggattgacgacttgatggatcatttggtgggtgcaagggtttttagtaagattgac 11950143  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||| || ||||| || |  |||||||    
T  11950144 ttgaggtcaggttaccatcagatcaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggggatgcctt 11950243  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || || |||||||| |   |||||  |||||| |||||||| || ||||||||| |    
T  11950244 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtagatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattcgtggttgtgtttattgatgatattct 11950343  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||  | |||||||| ||||| ||||||||     
T  11950344 gatttattctaagactgaagaagagcatgcagaacatttgaagattgtgttgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgag 11950443  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
    |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  11950444 ttctggttaagtgaagtgagttttct 11950469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 22 - 466
Target Start/End: Original strand, 13318634 - 13319078
Alignment:
Q  22 atcatcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagat 121  Q
    ||||||||||||| || || || || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||    
T  13318634 atcatcagttgaataaagttacaataaagaacagatatccactcccgaggattgatgatttgatggatcagttggtgggtgcaaaagtttttagtaaaat 13318733  T
Q  122 tgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatg 221  Q
    ||| ||||| ||| | || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || || || |  |||||||| || ||||| || || |||    
T  13318734 tgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacaatatggtcattacgaatacaaggtgatg 13318833  T
Q  222 cctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgata 321  Q
    || |||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||| |||||  ||| || || || || || |||||||    
T  13318834 ccattcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttttctggataaatttgtggtggtatttattgatgata 13318933  T
Q  322 ttttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactt-tatgctaaattgtctaagt 420  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||| || ||||| || |||||||||||| | |||||| | | ||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  13318934 ttttaatttattccaagactaaagaggagcatgcagaacatctgaagattatgttgcaaattttgaaagag-agaaatttgtatgctaaattgtcgaagt 13319032  T
Q  421 gtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    | || |||||||| |  ||||| |||||||| ||| | ||||||||    
T  13319033 gcgagttctggttaagtgaagtgagttttctaggctacgttatttc 13319078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 48 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 17188345 - 17187942
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 147  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||| | || || ||||    
T  17188345 aagaacaggtatccacttccgaggatggatgacttgatggatcagttggtgggtgcaaaggtttttagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcaga 17188246  T
Q  148 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 247  Q
    | || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  17188245 tcaaggtgaaggatgaggatatgcagaagactgcctttaggacacgatacggtcattacgaatataaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 17188146  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     ||||| ||||||||||||||  | || || ||||| | |||||||  ||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||| || | |||||| |||    
T  17188145 tgtgttcatggagtatatgaacagaatttttcatgcctatttggataaatttgtggttgtattcattgatgacattctgatttattcaaggactgaggaa 17188046  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 447  Q
    || ||||| || |||||||| ||||| |||||||| | ||||||||| ||  | ||||| |||||||| |||||||| |||||||| |  ||||| ||||    
T  17188045 gagcatgcagaacatctgaaaattgtattgcaagtattgaaagagaaaaagttgtatgccaaattgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagtt 17187946  T
Q  448 ttct 451  Q
    ||||    
T  17187945 ttct 17187942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 12180337 - 12179906
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||   || || || ||||||||     
T  12180337 tcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcacgtgtatttagtaagattgac 12180238  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcac------tatgaatataaagtta 219  Q
    ||||| ||| | || || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||||      ||||||||||| || |    
T  12180237 ttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatatatatgaatataaggtga 12180138  T
Q  220 tgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatga 319  Q
    || |||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |   || ||  |||||| |||||||  || |||||    
T  12180137 tgtctttcggtgttactaatgcacctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctgaataaattcgtggttgtgtctattgatga 12180038  T
Q  320 tattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaag 419  Q
     ||| | ||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | | |||||| |||||  | |||||||| ||||| |||    
T  12180037 cattctaatttattataagactgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaaatattgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcgaag 12179938  T
Q  420 tgtgaattctggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
    ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  12179937 tgtgagttctggttaattgaagtgagttttct 12179906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 15013904 - 15014343
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||| ||||||||| ||||   || ||||| ||||||||||    
T  15013904 cagttgaacaaagtgacaataaagaataggtatccacttccgaggatccacgatttgatggattagttagtggatgcacgtgtgttcagtaagattgatt 15014003  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    | |||||  | |||||||| || | |||||||||||| ||||| ||||||||  | || || ||  ||||||| || || ||||||   || ||||||||    
T  15014004 taagatcgggctatcaccatatcagagtgaaagatgaggatattcagaagacgacctttaggacatgttatggacattacgaatattcggtgatgccttt 15014103  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    |||||| || || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| | |||||||||||| || |||||||| || ||||||||| |     
T  15014104 cggtgttactaacgcgcctggagtgtttatggaatatatgaatcgtatttttcatgcttatttggatcgatttgttgttgtgtttatagatgatattcta 15014203  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaag-attgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    || ||||| ||||| || || |||||||| |||||| || || ||||| |||||||||  ||| ||||||||  | ||||| || || || ||||| |||    
T  15014204 atatactctaagaccgaggaggaacatgccgagcat-tgtagaattgttttgcaagtgctgaaggagaagaagttatatgccaagttatcgaagtgcgaa 15014302  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||| || |||||||    
T  15014303 ttctggttgaacgaagtgagttttcttggccatattatttc 15014343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 26 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 47125937 - 47125509
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  |||| || |||||||||    
T  47125937 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgccaagatttttagtaagattgat 47125838  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  47125837 ttgaggtctggttatcatcagataaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 47125738  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||   || || || ||||| || ||||||||| |    
T  47125737 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattct 47125638  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
     || || ||||||| ||| || || ||||| ||||||||||  || || |||||||||| ||| || ||||   | |||||||| || || || ||||||    
T  47125637 aatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaatagtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgaa 47125538  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 454  Q
    ||||||||  | |||||||||||||||||    
T  47125537 ttctggttacatgaagtaagttttctggg 47125509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 48 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 15229574 - 15229171
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||||||| ||| | || || ||||    
T  15229574 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttaatcgatcagttagtgggtgcacgcgtgttcagcaaaattgatttgaggtcaggttaccatcaga 15229475  T
Q  148 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 247  Q
    |||| ||||| |  ||||||||| |||| || || || || || || ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| ||| |    
T  15229474 ttaaggtgaagggggaagatatgtagaaaacggcctttaggacacgatatggacattatgaatataaggtgatgcctttcggcgttactaatgcgcctag 15229375  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     ||||||||||| || |||||| | |  |||||||| | | | |||  ||| || |||||||| || |||||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  15229374 tgtgtttatggaatacatgaatagaactttccatgcttatctagataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcttaatttattctaagactgaagaa 15229275  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 447  Q
    || ||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| |||||| |||||  | ||||| |  ||||| || ||||||||| |||| |  ||||||||||    
T  15229274 gagcatgcagagcatctgaaaattatgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccatgttgtccaaatgtgaattcgggttaagtgaagtaagtt 15229175  T
Q  448 ttct 451  Q
    ||||    
T  15229174 ttct 15229171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 48 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 15235442 - 15235039
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||||||| ||| | || || ||||    
T  15235442 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttaatcgatcagttagtgggtgcacgcgtgttcagcaaaattgatttgaggtcaggttaccatcaga 15235343  T
Q  148 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 247  Q
    |||| ||||| |  ||||||||| |||| || || || || || || ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| ||| |    
T  15235342 ttaaggtgaagggggaagatatgtagaaaacggcctttaggacacgatatggacattatgaatataaggtgatgcctttcggcgttactaatgcgcctag 15235243  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     ||||||||||| || |||||| | |  |||||||| | | | |||  ||| || |||||||| || |||||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  15235242 tgtgtttatggaatacatgaatagaactttccatgcttatctagataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcttaatttattctaagactgaagaa 15235143  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 447  Q
    || ||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| |||||| |||||  | ||||| |  ||||| || ||||||||| |||| |  ||||||||||    
T  15235142 gagcatgcagagcatctgaaaattatgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccatgttgtccaaatgtgaattcgggttaagtgaagtaagtt 15235043  T
Q  448 ttct 451  Q
    ||||    
T  15235042 ttct 15235039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 30 - 448
Target Start/End: Original strand, 16379068 - 16379486
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 129  Q
    |||||||| || || || ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  16379068 ttgaacaaagttacaattaagaataggcatccacttccgaggattgatgacttgatggaccacctagtgggtgcaaaggtttttagtaagattgatttga 16379167  T
Q  130 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 229  Q
    | ||| | || || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || || || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  16379168 ggtcaggttaccatcaaattaaggtgaatgatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcgg 16379267  T
Q  230 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    ||| || || || || || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||||  |||| | || || || || ||||||||| |||||    
T  16379268 tgttactaacgcgcccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcctttctggataaattcctggtggtatttattgatgatattctgatt 16379367  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattct 429  Q
    || || |||||| ||||||| ||||| || |||||||  ||||| |||||||| | |||||| |||||  | ||||| |||||||| || ||||| || |    
T  16379368 tattctaagacttaagaagagcatgcagaacatctgagaattgtgttgcaagtattgaaagaaaagaagttgtatgccaaattgtcaaaatgtgagtttt 16379467  T
Q  430 ggttgaaggaagtaagttt 448  Q
    || | |  |||||||||||    
T  16379468 ggctaagtgaagtaagttt 16379486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 27 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 24185172 - 24185035
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  24185172 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 24185073  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaa 164  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  24185072 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaa 24185035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 30 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 13944013 - 13943677
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 129  Q
    |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  13944013 ttgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggaccagctagtgggtgcaaaggtgttcagtaagattgacttga 13943914  T
Q  130 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 229  Q
    | ||| | || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || || || || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  13943913 ggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcgg 13943814  T
Q  230 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    ||| || || || || || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||||  |||||| || || || || ||||||||| |||||    
T  13943813 tgttactaacgcgcccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatattctgatt 13943714  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctga 366  Q
    || || |||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  13943713 tattcgaagactgaagaagagcatgcagaacatctga 13943677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 48 - 368
Target Start/End: Original strand, 16826439 - 16826754
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||   || || || || ||||||||||| ||| | || || ||||    
T  16826439 aagaataggtatccacttccgaggattgacgatttaatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagtaaaattgatttgaggtcaggttaccatcaga 16826538  T
Q  148 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 247  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | || || || |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||  ||||    
T  16826539 ttaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacgacctttaggacacgttttggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgtctgg 16826638  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     |||||||||||||||||||| || || ||||||||     |||||  ||| || |||||||| || ||||| || |||||||| ||  |||||||||||    
T  16826639 tgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgc-----tggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattctgagactgaagaa 16826733  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaag 368  Q
    || ||||| ||||||||||||    
T  16826734 gagcatgcagagcatctgaag 16826754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 30 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 28756307 - 28755883
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 129  Q
    |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || || ||||  ||  |||| || |||||||||||||    
T  28756307 ttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcaattggttggtgttaagatttttagtaagattgatttga 28756208  T
Q  130 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 229  Q
    | ||  | ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  28756207 ggtctggttatcatcagataaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcgg 28756108  T
Q  230 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    ||| || ||||| || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||   || || || ||||| || |||||||| || |||    
T  28756107 tgttactaatgcgccgggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatcttaatt 28756008  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattct 429  Q
    || ||||||| ||| || || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| ||| || ||||   | |||||||| || || || ||||| ||||    
T  28756007 tattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgagttct 28755908  T
Q  430 ggttgaaggaagtaagttttctggg 454  Q
    |||| || |||||||||||||||||    
T  28755907 ggttaaatgaagtaagttttctggg 28755883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 30 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 41179511 - 41179117
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 129  Q
    |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  41179511 ttgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggaccagctagtgggtgcaaaggtgttcagtaagattgacttga 41179412  T
Q  130 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 229  Q
    | ||| | || || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || || ||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  41179411 ggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcgg 41179312  T
Q  230 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    ||| || || ||||| || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||||  |||||| || || || || ||||||||| |||||    
T  41179311 tgttactaacgcacccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatattctgatt 41179212  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtga 424  Q
    || || |||||||||||||| ||| | || |||||||  |||||  ||||||| | ||||||||||||  | ||||| |||||||| || |||||    
T  41179211 tattcgaagactgaagaagagcattcagaacatctgagaattgtgctgcaagttttgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaaatgtga 41179117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 26 - 466
Target Start/End: Original strand, 10418181 - 10418621
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||||||     
T  10418181 tcagttgaacaaagttacaataaagaatagatatccacttccgcggattgatgatttgatggaccagttggtaggtgctaaagtttttagtaagattgac 10418280  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||  | || || || ||||||||||| || ||||||||||||||||| || || || || || || ||||| || || || ||||| |||||||    
T  10418281 ttgaggtcgggttaccatcaaattaaagtgaaggacgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 10418380  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || || || || || |||||||| ||    
T  10418381 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtatttatagatgatatctt 10418480  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    ||| || || || |||||||| ||||| || || || ||||||||||| |||||| | | |||||||| |||  | ||||| ||  |||| ||||| ||     
T  10418481 gatctattcaaaaactgaagaggaacacgccgaacacctgaagattgtgttgcaaatattgaaagagaggaagttgtatgccaagctgtcgaagtgcgag 10418580  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| ||| | ||||||||    
T  10418581 ttctggttaaatgaagtgagttttctaggccacgttatttc 10418621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 48 - 430
Target Start/End: Original strand, 18132504 - 18132886
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 147  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| | || || ||||    
T  18132504 aagaacaggtatccacttccgaggattgacgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggttttcagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcaga 18132603  T
Q  148 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 247  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || || || || || || ||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  18132604 ttaaggtgaaggatgaggatatgcaaaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 18132703  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |   |||||  ||| || |||||||| || || |||||  | ||||| || |||||||||||     
T  18132704 tgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttacctggataaatttgtggttgtgtttattgacgatatcctaatttattcaaagactgaagag 18132803  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctg 430  Q
    || | | | || ||||||| |||| | |||||||||| |||||| |||||  | |||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  18132804 gagcttacggaacatctgaggattatgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcgaagtgcgagttctg 18132886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 30 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 44779236 - 44778842
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 129  Q
    |||||||| || || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  44779236 ttgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgagaattgatgacttgatggaccagctagtgggtgcaaaggtgttcagtaagattgacttga 44779137  T
Q  130 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 229  Q
    | ||| | || || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  44779136 ggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcgg 44779037  T
Q  230 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    ||| || || || || || || || ||||||| ||||||||| || || ||||| ||| |||||  |||||| || || || || ||||| ||| |||||    
T  44779036 tgttactaacgcgcccggtgtattcatggagtttatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgacattctgatt 44778937  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtga 424  Q
    || || |||||||||||||| ||||| || |||||||  ||||| |||||||| | |||||| | |||| | ||||| ||| |||| || |||||    
T  44778936 tattcgaagactgaagaagagcatgcagaacatctgagaattgtgttgcaagttttgaaagaaaggaaattgtatgccaaactgtcgaaatgtga 44778842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 26 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 14088666 - 14088226
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||| || ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||| || ||||||||  |||| || || |||||     
T  14088666 tcagttgaataaagttacgataaagaacagatatccgcttccgagaattgacgacctgatggatcagttggttggtgcaaagatttttagtaaaattgac 14088567  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | || || ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || || |||||||| || |||||||| || |||||||    
T  14088566 ttgaggtcaggttaccatcagatcaaggtgaaagatgaggacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctt 14088467  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | || || ||||| |   |||||  ||| || ||||| ||||| ||||| |||||    
T  14088466 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaacagaatttttcatgcttacctggataaatttgtggttgtattcattgatgacatttt 14088367  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    ||| || || |  ||||| ||||| ||||| || ||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||  | ||||| |||||||| ||||| ||     
T  14088366 gatctattcgagaactgaggaagagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcaaagtgcgag 14088267  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    || ||||| |  ||||| |||||||| ||| || |||||||    
T  14088266 ttttggttaagtgaagtgagttttcttggccatattatttc 14088226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 51 - 212
Target Start/End: Original strand, 11888526 - 11888687
Alignment:
Q  51 aataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagatta 150  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  11888526 aataggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgatttgagatcgggttatcaccagatta 11888625  T
Q  151 aagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatat 212  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||| || || || |||||||| || |||||||||    
T  11888626 aagtgaaagacgaggatatgcagaagacagcctttaggacacgttatggacattatgaatat 11888687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 27 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 30139798 - 30139377
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || || || ||||||||||    
T  30139798 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 30139699  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  ||||||||    || || || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  30139698 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 30139599  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     || ||  | |||||||| || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || || || || |||||||| ||||||||||||    
T  30139598 tggagtatctaatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 30139499  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
     | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||  |  | | ||| || |||||||||||||| |    
T  30139498 gtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagt 30139399  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttt 448  Q
    | |||||||||||||| |||||    
T  30139398 tttggttgaaggaagtgagttt 30139377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 27 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 30149349 - 30148928
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || || || ||||||||||    
T  30149349 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 30149250  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  ||||||||    || || || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  30149249 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 30149150  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     || ||  | |||||||| || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || || || || |||||||| ||||||||||||    
T  30149149 tggagtatctaatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 30149050  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
     | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||  |  | | ||| || |||||||||||||| |    
T  30149049 gtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagt 30148950  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttt 448  Q
    | |||||||||||||| |||||    
T  30148949 tttggttgaaggaagtgagttt 30148928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 27 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 43164657 - 43164550
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||  ||    
T  43164657 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaatatttttt 43164558  T
Q  127 tgagatca 134  Q
    ||||||||    
T  43164557 tgagatca 43164550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 48 - 466
Target Start/End: Original strand, 13970278 - 13970696
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 147  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||  ||||||||||||| || ||||| ||  |||| || || ||||| ||||||||| | || || ||||    
T  13970278 aagaacagatatccgcttccgaggattgacgacctgatggatcagttggttggtgcgaagatttttagtaaaattgacttgagatcaggttaccatcaga 13970377  T
Q  148 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 247  Q
    | || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || || |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  13970378 tcaaggtgaaagatgaggacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 13970477  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     ||||| ||||||||||||||  | || || ||||| |   |||||  ||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |  ||||| |||    
T  13970478 tgtgttcatggagtatatgaacagaatttttcatgcttacctggataaatttgtggttgtattcattgatgacattttgatctattcgagaactgaggaa 13970577  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 447  Q
    || ||||| || ||||||| | |||| |||||||| | ||||||||||||  | ||||| |||||||| ||||| || || ||||| |  ||||| ||||    
T  13970578 gagcatgcagaacatctgagggttgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcaaagtgcgagttttggttaagtgaagtgagtt 13970677  T
Q  448 ttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||| ||| || |||||||    
T  13970678 ttcttggccatattatttc 13970696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 424
Target Start/End: Original strand, 16834651 - 16835044
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||||||     ||| |||||||||||||| || ||||||||  ||||||| ||||||||     
T  16834651 tcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatccgcttccgaga-----tgacttgatggatcagttggttggtgcaaagattttcagtaagattgac 16834745  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||  | || || || ||||| ||||| |||| ||||||||||||||| || || || || ||||||||||| || | ||| || || |||||||    
T  16834746 ttgaggtctggttaccatcaaattaaggtgaaggatggagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgtatacaaggtgatgcctt 16834845  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||| |||||   || || ||||| || || ||||| ||  |    
T  16834846 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcatttctggataagtttgtggttgtatttattgatgacatcct 16834945  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtga 424  Q
     ||||| || |||||||| || || ||||| || ||||||| |||||| |||||||| | |||||| |||||  | ||||| |||||||| || |||||    
T  16834946 aatttattctaagactgacgaggagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagtattgaaagaaaagaagttgtatgccaaattgtcaaaatgtga 16835044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 26 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 10407961 - 10407720
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  ||||||| |||||||||    
T  10407961 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagattttcagtaagattgat 10407862  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  10407861 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtaatgcctt 10407762  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatga 267  Q
    || |||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||    
T  10407761 tctgtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatga 10407720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 293
Target Start/End: Original strand, 12510619 - 12510886
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||  ||||||| ||||||||     
T  12510619 tcagttgaaaaaggttacgataaagaacaggtatccgcttccgagaattgacgatttgatggatcagttggttggtgctaagattttcagtaagattgac 12510718  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||  | || ||  |||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||| | |||||||    
T  12510719 ttgaggtctggttaccattagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcatttaggacacgttatggtcattacgagtacaaaatgatgcctt 12510818  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 293  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||||||| |||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  12510819 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgtttatgaagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 12510886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 27 - 442
Target Start/End: Original strand, 15948618 - 15949033
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||| | || || || ||||||||||    
T  15948618 cagttgaacaaagtaacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 15948717  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||| | | ||||| ||||||| ||| || |  ||||||||    || || || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  15948718 tgagattaggatatcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattccgtgatgccatt 15948817  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     || ||  ||||||| || || || |||||||| ||||||||| | || || ||| | | |||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||||    
T  15948818 tggagtatccaatgcgccaggtgtctttatggaatatatgaatagaatatttcatccttatttggaccgatttgtggtggttttcatagatgatattttg 15948917  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
     | || || ||| |||| ||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||  |  | |  || || ||||||||||||||||    
T  15948918 gtgtattcgaagtctgaggaagagcatgttgagcatctgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgagccaagttgtctaagtgtgaat 15949017  T
Q  427 tctggttgaaggaagt 442  Q
    | ||||||||||||||    
T  15949018 tttggttgaaggaagt 15949033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 48 - 257
Target Start/End: Original strand, 14291690 - 14291899
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 147  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    || |||||||| ||||||||||| ||  | || || ||||    
T  14291690 aagaacaggtatccacttctgagaattgacgatttaatggatcagttagtgggtgcttgtgtgttcagcaaaattgatttgaggtcgggttaccatcaga 14291789  T
Q  148 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 247  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || |||| ||||||||||||||||||  | |||| ||||||||| || ||||| |||||    
T  14291790 ttaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttttggtcactatgaatataagatgatgcatttcggtgttactaatgcgcctgg 14291889  T
Q  248 agtgtttatg 257  Q
     |||||||||    
T  14291890 tgtgtttatg 14291899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 15612095 - 15611674
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||  | || || || ||||||||||    
T  15612095 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgctgaggtgtttagtaagattgatt 15611996  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| |||||| |  ||||||||    || || || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  15611995 tgagatcaggatatcatcagattagagtgaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 15611896  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     || ||  | |||||||| || || |||||||| ||||||||| | || || ||| | | | |||| || || || || |||||||| ||||||||||||    
T  15611895 tggagtatctaatgcaccaggtgtctttatggaatatatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 15611796  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
     | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||| ||     | | ||| || ||||||||| |||| |    
T  15611795 gtgtattcgaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtcttgcaagttttgaaagataaccggttgtgtgccaagttgtctaagcgtgagt 15611696  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttt 448  Q
    | |||||||||||||| |||||    
T  15611695 tttggttgaaggaagtgagttt 15611674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 104
Target Start/End: Original strand, 15714204 - 15714281
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgca 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15714204 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgca 15714281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 24189297 - 24189076
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||     
T  24189297 tcagttgaataaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttggtgggtgcaaaggtttttagtaagattgac 24189198  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || || ||||| || ||||||||||| ||| |||    
T  24189197 ttgaggtcaggttaccatcagatcaaggtgaaggatgaggatatgcagaagactgcctttaggacacgatacggtcattacgaatataaagtgatgtctt 24189098  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctgg 247  Q
    ||||||| || ||||| |||||    
T  24189097 tcggtgttactaatgcgcctgg 24189076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 448
Target Start/End: Original strand, 8272548 - 8272968
Alignment:
Q  28 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 127  Q
    ||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || || || |||||||||||    
T  8272548 agttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcagaggtgtttagtaagattgattt 8272647  T
Q  128 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 227  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  ||||||||    || || || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||     
T  8272648 gagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcagaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccattt 8272747  T
Q  228 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttga 327  Q
    || ||  | ||||| || || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || || || || |||||||| ||||||||||||     
T  8272748 ggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttgg 8272847  T
Q  328 tttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaatt 427  Q
    | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||  |  | |  || || |||||||||||||| ||    
T  8272848 tgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgcgccaagttgtctaagtgtgagtt 8272947  T
Q  428 ctggttgaaggaagtaagttt 448  Q
     |||||||||||||| |||||    
T  8272948 ttggttgaaggaagtgagttt 8272968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 111 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 12270118 - 12269875
Alignment:
Q  111 ttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaat 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| ||||||||||    
T  12270118 ttcagcaagattgatttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacactatgaat 12270019  T
Q  211 ataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgtt 310  Q
    |||| || |||||||||||||| || ||||  ||||  |||||||||||||||||||| || || |||||||| | | | |||  ||| || ||||||||    
T  12270018 ataaggtgatgcctttcggtgttactaatgttcctgatgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatcttgataaatttgtggttgtgtt 12269919  T
Q  311 catcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatg 354  Q
     || ||||| || |||||||| || |||| ||||||||| ||||    
T  12269918 tattgatgacatcttgatttattcaaagattgaagaagagcatg 12269875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 451
Target Start/End: Original strand, 13965500 - 13965925
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||| | || || || ||||||||||    
T  13965500 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 13965599  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
     ||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  | ||||||    || || || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  13965600 cgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcggtagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 13965699  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     || ||  ||||||| || || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || || || || |||||||| ||||||||||||    
T  13965700 tggagtatccaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 13965799  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaa-catgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
     | || || ||| |||| |||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||  | |||||||||  |  | | ||| || ||||||||||||||     
T  13965800 gtgtattcgaagtctgaggaagaagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagacttgaaagagaaccagttgtctgccaatttgtctaagtgtgag 13965899  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
    || |||||||||||||| ||||||||    
T  13965900 ttttggttgaaggaagtgagttttct 13965925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 454
Target Start/End: Original strand, 16327796 - 16328224
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||| ||||| |  || ||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  |||| || ||||||||     
T  16327796 tcagttgaataaggtcatgataaagaacaggtatccactttcgagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatttttagtaagattgac 16327895  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||  ||  | || || |||||||| |||||  |||| ||||||||||| ||  |||| || || || |||||||| || || || || || |||||||    
T  16327896 ttgatgtctggttaccatcagattaaggtgaagaatgaggatatgcagaaaacgacttttaggacacgatatggtcattacgagtacaaggtgatgcctt 16327995  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||  | ||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||| |||  ||||   || || || ||||| || |||||||||||    
T  16327996 tcggtgttactaacacgcctggtgtgtttatggagtacatgaaccgaattttccatgcctttccggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatttt 16328095  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
     || || || |||| |||||| || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||  | |||||||||||   | ||||| || ||||| || |||||     
T  16328096 aatctattctaagaatgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagatttgaaagagaagaggttgtatgcaaagttgtcaaaatgtgag 16328195  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 454  Q
    || ||||| |  ||||| |||||||||||    
T  16328196 ttatggttaagtgaagtgagttttctggg 16328224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 222 - 397
Target Start/End: Original strand, 11889623 - 11889798
Alignment:
Q  222 cctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgata 321  Q
    ||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  11889623 cctttcggtgtcactaatgcgccaggtgtgttcatggaatacatgaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgcttcgtggttgtgttcattgatgata 11889722  T
Q  322 ttttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaa 397  Q
    ||||||| ||||| |||  | | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||    
T  11889723 ttttgatatactctaagtttaaggaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaggagaagaa 11889798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 448
Target Start/End: Original strand, 6151001 - 6151422
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||| | || || || ||||||||||    
T  6151001 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcgatatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 6151100  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| |||||| |  ||||||||    || || |  ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  6151101 tgagatcaggatatcatcagattagagtgaaggcagaagatatatccaaaactgtgttccgaacgaggtatggacactatgagtattttgtgatgccatt 6151200  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     || ||  | ||||| || || || ||||||||||||||||||   || || ||| | | | | || || || || || ||||| || ||||||||||||    
T  6151201 tggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggagtatatgaataaaatatttcatccttatctagaccgttttgtggtggtgtttatagatgatattttg 6151300  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
     | || || ||  |||| || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||  |  | | |||||| ||||||||||| || |    
T  6151301 gtgtattcgaaatctgaggaggagcatgctgagcatctgacgattgtgttgcaagtgttgaaggagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgcgagt 6151400  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttt 448  Q
    | |||||||||||||| |||||    
T  6151401 tttggttgaaggaagtgagttt 6151422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 18437122 - 18437022
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||| ||||| || || || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  18437122 cagtttaacaaagtgacaataaagaatatgtatccactcccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaagtgttttcagcaagatagatt 18437023  T
Q  127 t 127  Q
    |    
T  18437022 t 18437022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 232
Target Start/End: Original strand, 8745530 - 8745732
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 129  Q
    |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  8745530 ttgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggaccagctagtgggtgcaaaggtgttcagtaagattgacttga 8745629  T
Q  130 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 229  Q
    |  || | || || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | || || || || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  8745630 ggacaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacgccctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcgg 8745729  T
Q  230 tgt 232  Q
    |||    
T  8745730 tgt 8745732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 79
Target Start/End: Original strand, 26791561 - 26791613
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatga 79  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26791561 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatga 26791613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 26 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 17200627 - 17200496
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||||||||| || || |||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||| | || || || |||||||||    
T  17200627 tcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgctcccgaggattgatgatttgatggatcaactggttggtgcagaggtgtttagtaagattgat 17200528  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaa 157  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||| ||||||    
T  17200527 ttgagatcaggatatcatcagattagagtgaa 17200496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 12272324 - 12272254
Alignment:
Q  33 aacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgc 103  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  12272324 aacaaggttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgc 12272254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 25768310 - 25768178
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||| || || || |||||| | ||||| ||||  || ||||||||||||||||||||| | || |||||| | || || || || |||||||    
T  25768310 cagttgaacaaagtgacgattaagaatcgatatccgcttctaaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcagaggtgtttagtaacattgatt 25768211  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaag 159  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||||||||    
T  25768210 tgagatcaggatatcatcagattagagtgaaag 25768178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 10385431 - 10385236
Alignment:
Q  259 agtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctga 358  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||| | |||   || || || |||||||| |||||||| |||||||| |||||||  || ||||| ||||| |     
T  10385431 agtacatgaatcgaatcttccatgcttttctagataagtttgttgtggtgttcattgatgatatcttgatttattccaagaacgaggaagagcatgcagg 10385332  T
Q  359 gcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctggg 454  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||| ||| || ||||   | |||||||| ||||| || ||||| |||||||| |  ||||| || ||||||||    
T  10385331 gcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtgagctttctggg 10385236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 18915341 - 18915297
Alignment:
Q  404 tgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttt 448  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18915341 tgctaagttgtccaagtgtgaattttggttgaaggaagtaagttt 18915297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 25767986 - 25767889
Alignment:
Q  351 catgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttt 448  Q
    |||||||||||| ||| |||| | |||||||| | ||| |||||  |  | | |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  25767986 catgctgagcatttgaggattatgttgcaagtcttgaaggagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagttt 25767889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 389; Significance: 0; HSPs: 45)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 466
Target Start/End: Original strand, 21233711 - 21234151
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21233711 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 21233810  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21233811 ttgagatcagggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 21233910  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||    
T  21233911 tcggtgtgatcaatgcacctcgagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgacatttt 21234010  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21234011 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgaacatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 21234110  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  21234111 ttctggttgaaagaagtaagttttcttggccatgttatttc 21234151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 466
Target Start/End: Original strand, 17042995 - 17043435
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17042995 tcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccactaccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 17043094  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17043095 ttgagatcagggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacatctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 17043194  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  17043195 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcggttcgttgttgtgtttatcgatgatatttt 17043294  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17043295 gatttactccaagactaaagaagaacatgctgagcatatgaagattgtcttgcaagtattgaaagagaagaaactttatgctaaattgtcaaagtgtgaa 17043394  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  17043395 ttctggttgaaagaagtaagttttcttggccatgttatttc 17043435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 21839328 - 21838889
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  21839328 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 21839229  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21839228 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 21839129  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||    
T  21839128 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgatgatattttg 21839029  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21839028 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 21838929  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  21838928 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 21838889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 33389010 - 33389449
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  33389010 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 33389109  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33389110 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 33389209  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||    
T  33389210 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 33389309  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33389310 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 33389409  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  33389410 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 33389449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 21832680 - 21832241
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  21832680 cagttgaacaaggtaactatcaagattaggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 21832581  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21832580 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcaaaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 21832481  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||    
T  21832480 cggtgtgaccaatgcacatggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 21832381  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21832380 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 21832281  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  21832280 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 21832241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 51331474 - 51331913
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  51331474 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 51331573  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51331574 tgagatcaggctatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 51331673  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||    
T  51331674 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 51331773  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  51331774 atttactccaagactgaagaagaacatgcggagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagttttatgctaaattgtctaagtgtgaat 51331873  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  51331874 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 51331913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 16348576 - 16349016
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16348576 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 16348675  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16348676 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 16348775  T
Q  227 cggt-gtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
     ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16348776 tgggagttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatatttt 16348875  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16348876 gatttactccaagactgaagaagaacatgcagagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 16348975  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||  ||||||||||    
T  16348976 ttctggttgaaagaagtgagttttctaggtcatgttatttc 16349016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 39 - 466
Target Start/End: Original strand, 24792609 - 24793036
Alignment:
Q  39 gtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggt 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||| | |    
T  24792609 gtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatttgaggtcaggtt 24792708  T
Q  139 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  24792709 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaaggtatgccttttggtgtgaccaa 24792808  T
Q  239 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaag 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  24792809 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttattgatgatattttgatttactccaag 24792908  T
Q  339 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaagg 438  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  24792909 actgaagaagaacatgttgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagaaaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttctggttgaaag 24793008  T
Q  439 aagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24793009 aagtaagttttcttggccatgttatttc 24793036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 19108746 - 19108307
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  19108746 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 19108647  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19108646 tgaggtcaggttatcaccagataaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcaccatgaatataaagttatgccttt 19108547  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19108546 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccacgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgatgatattttg 19108447  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  19108446 atttactctaagactgaaaaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttccaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagt 19108347  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  19108346 tctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgttatttc 19108307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 39 - 465
Target Start/End: Original strand, 22503282 - 22503708
Alignment:
Q  39 gtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  22503282 gtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagatagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatttgagatcaggtt 22503381  T
Q  139 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 238  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  22503382 atcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgaatataaagttatgtctttcggtgttaccaa 22503481  T
Q  239 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaag 338  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22503482 tgcacctggagtgtttatggagtaaatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcggggttgttttcatcgatgatattttgatttactccaag 22503581  T
Q  339 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaagg 438  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |    
T  22503582 actgaagaagaacatgttgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttaaaagagaagaaactttatgctaaaatatctaagtgtgagttctggttgaaag 22503681  T
Q  439 aagtaagttttctgggcgatgttattt 465  Q
    | ||||||||||| ||| |||| ||||    
T  22503682 aggtaagttttcttggccatgtcattt 22503708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 41351649 - 41352082
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaa-taggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  41351649 cagttgaacaaggtaactatcaagaaataggtatccacttccgagaaat-------tgatggatcagttagtgggtgcgcgagttttcagcaagattgat 41351741  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41351742 ttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaagttatgcctt 41351841  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  41351842 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggggtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcagttcgtggttgtgttcatcgacgatatttt 41351941  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41351942 gatttactccaagactgaagaagaacatgcagaacatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 41352041  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||  ||||||||||    
T  41352042 ttctggttgaaagaagtgagttttcttggtcatgttatttc 41352082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 430097 - 430536
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  430097 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatcaacttccaaggattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagatagatt 430196  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| || || |||||||||||    
T  430197 tgagatcaggttatcaccatattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagccttcagaacgcggtatgctcactatgagtacaaggttatgccttt 430296  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  430297 cggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgattcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgttttcattgatgatattttg 430396  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  430397 atttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattatctaagtgtgaat 430496  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| ||  ||||||||||    
T  430497 tctggttaaaagaagtgagctttcttgggcatgttatttc 430536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 26 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 20140462 - 20140022
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  20140462 tcagttgaacaaagtgacaataaagaataggtatccacttccgagaatcgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgat 20140363  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || || || ||| | |    
T  20140362 ttgagttcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggacattatgagtacaaggtaatgtcgt 20140263  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  | ||||| ||||| |||||||||||    
T  20140262 tcggtgtcacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgttttttggttgttttcattgatgatatttt 20140163  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  20140162 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgatcacttgaagattgttttgcaagtgttgaaagaaaagaagctctatgctaaattgtctaagtgtgaa 20140063  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||||  |||| || ||||| ||| ||||||||||    
T  20140062 ttctggttgaaaaaagtgagctttcttggccatgttatttc 20140022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 26 - 442
Target Start/End: Original strand, 22360224 - 22360640
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  22360224 tcagttgaacaaggtgacaataaagaatagatatccacttccgaggattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcaacaagatagat 22360323  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||    
T  22360324 ttgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggacattatgagtacaaagttatgcctt 22360423  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||| || || |||||||||||    
T  22360424 tcggtgttacaaatgcaccttgagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcattttaggatcggttcgtcgttgtttttattgatgatatttt 22360523  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||  | || ||||| |||| |||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||    
T  22360524 gatttactccaagtctgaagaagaacctgctgagcatttgaaactggttttgcaggtgttgaaagagaagatgatttatgcgaaattgtctaagtgtgaa 22360623  T
Q  426 ttctggttgaaggaagt 442  Q
    |||||||||||||||||    
T  22360624 ttctggttgaaggaagt 22360640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 21751318 - 21750879
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||| ||||    
T  21751318 cagttgaacaaagtaacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatttgatggatcagttagtaggtgcaagtgttttcaacaagatagatt 21751219  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  21751218 tgagatcgggtcatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgtagaagacaacttttaggacgcggtatggacattatgagtataaagttatgccttt 21751119  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| || ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||     
T  21751118 tggtgttactaatgctcttggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgttttcattgatgatatttta 21751019  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21751018 atttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagttggttttgcaagtgttgaaaaagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 21750919  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||||| || ||||||| |||||| ||  ||||||||||    
T  21750918 tctggttaaaagaagtaatttttcttggacatgttatttc 21750879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 48 - 466
Target Start/End: Original strand, 50618400 - 50618818
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || || | ||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  50618400 aagaataggtatccacttccgagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttaacaagattgatttgagatcgggttatcaccaga 50618499  T
Q  148 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  50618500 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaacttttagaacgcgatatggacattatgagtataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcccctgg 50618599  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  50618600 agtgtttatggagtacatgaatcacatttttcatgcattttttgatcgtttcgtggttgttttcattgatgacattttgatttactccaagactgaggaa 50618699  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 447  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || || ||||    
T  50618700 gaacatgttgagcatttgaagactgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatcaaagtgtgaattctggttgaaagaggtgagtt 50618799  T
Q  448 ttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||| ||  ||||||||||    
T  50618800 ttcttggacatgttatttc 50618818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 27 - 465
Target Start/End: Original strand, 21862354 - 21862792
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||   || |||||||||||  |||    
T  21862354 cagttgaacaaagtaacgagaaagaataggtatccacttccaagaatagatgacttgatggatcagttggtgggtgcacgtgtgttcagcaagatacatt 21862453  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  || ||||| |||||||||||||||||    
T  21862454 tgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcggtatgcacattatgagtataaagttatgccttt 21862553  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    |||||| || ||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| || || ||||| |||||     
T  21862554 cggtgttacaaatgcacctagtgtgtttatggagcacatgaatcgcatttttcatgcatttttggaccgtttcgtggttgtttttattgatgacatttta 21862653  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  21862654 atttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatttgaagatggttttgcaagtgttcaaagagaagaagctttatgctaaattatctaagtgtgaat 21862753  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttattt 465  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||  |||||||||    
T  21862754 tctggttgaaagaggtgagttttcttggacatgttattt 21862792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 27 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 16378473 - 16378150
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||| |||||||||||    
T  16378473 cagttgaataaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgcgtgttcaacaagattgatt 16378374  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  16378373 tgagatcaggttatcactagattaaagtgaaagatgaggatatgcagaagacggcttttagaacgcgttatggacattatgaatataaagtgatgccttt 16378274  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||  ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||    
T  16378273 cggtgttacaaatgcgcctggtgtgttcatggagtacatgaatcgaatttttcatgtgtttttggatcgtttcgtggttgtgtttattgatgacattttg 16378174  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaa 350  Q
    || |||| |||| | |||||||||    
T  16378173 atatacttcaagtccgaagaagaa 16378150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 26 - 450
Target Start/End: Original strand, 19661116 - 19661540
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||     
T  19661116 tcagttgaataaagttacgataaagaacaggtatccacttccgagaattgacgacttaatggatcagttagtgggtgcaaatgttttcagtaagattgac 19661215  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |  || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  19661216 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctctaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctt 19661315  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| |   | |||  |||||| |||||||| || ||||| || ||    
T  19661316 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctagataaattcgtggttgtgtttattgatgacatctt 19661415  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    |||||| || | |||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||| ||||||  ||||| |||||  | |||||||| ||||| ||||||||     
T  19661416 gatttattcaaggactgaagaagagcatgcatagcatctgaagattgtattgtaagtgttaaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgag 19661515  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttc 450  Q
    |||||||| |  ||||| |||||||    
T  19661516 ttctggttaagtgaagtgagttttc 19661540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 48 - 451
Target Start/End: Original strand, 21743554 - 21743957
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   || || || || ||||||||||| ||| | || || ||||    
T  21743554 aagaataggtatccacttccgagaattgacgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagtaaaattgatttgaggtcaggttaccatcaga 21743653  T
Q  148 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 247  Q
    |||| |||||  |||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  21743654 ttaaggtgaagaatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 21743753  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     ||||||||||||||||||||  | || |||||||| | | |||||  ||| || |||||||| || ||| | || || ||||| || ||||||||||||    
T  21743754 tgtgtttatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatcacatcttaatttattctaagactgaagaa 21743853  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 447  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||  | ||||| || ||||| || ||||| |||||||| |  |||||||||     
T  21743854 gagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgagttctggttaagtgaagtaagtc 21743953  T
Q  448 ttct 451  Q
    ||||    
T  21743954 ttct 21743957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 22 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 19856688 - 19856281
Alignment:
Q  22 atcatcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagat 121  Q
    ||||||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  19856688 atcatcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttccgagaattgacgacttaatggatcaattagtgggtgcaaaggttttcagtaagat 19856589  T
Q  122 tgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatg 221  Q
    ||| || || ||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||| ||||||||||||| || |||    
T  19856588 tgacttaaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggttactatgaatataaggtgatg 19856489  T
Q  222 cctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgata 321  Q
    ||||||| ||| ||  |||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| |   |||||  |||||| |||||||| || | ||| |    
T  19856488 cctttcgttgttactcatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctggataaattcgtggttgtgtttattggtgaca 19856389  T
Q  322 ttttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtg 421  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||  || ||||||||||| || |||||| | |  ||||| |||||  | |||||||| ||||| |||||    
T  19856388 ttttgatttattctaagactgaagaagagcatgaagaacatctgaagatagtattgcaaatattaaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcaaagtg 19856289  T
Q  422 tgaattct 429  Q
    ||| ||||    
T  19856288 tgagttct 19856281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 48 - 433
Target Start/End: Original strand, 20833902 - 20834287
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 147  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||| ||||| ||| | || || || |    
T  20833902 aagaacagatatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttggtgggtgcaaaggttttcagtatgattgacttgaggtcaggttaccatcaaa 20834001  T
Q  148 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 247  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || || || |||||||| || ||||| || || |||||||| ||||| || ||||| | |||    
T  20834002 ttaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttaggtgttactaatgcgcgtgg 20834101  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |   |||||  |||||| |||||||| || ||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  20834102 tgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattcgtggttgtgtttattgatgatattctgatttattcaaagactgaagaa 20834201  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggtt 433  Q
    |||||||| || ||| |||||||||| |||||| | | ||||||||| |   | |||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  20834202 gaacatgcagaacatttgaagattgtgttgcaaattttgaaagagaaaaggttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggtt 20834287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 30 - 454
Target Start/End: Original strand, 24097587 - 24098011
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 129  Q
    |||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||    
T  24097587 ttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgagaattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcagcaagatcgacttga 24097686  T
Q  130 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 229  Q
    | ||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||  || || ||||| || || |||||||||||    
T  24097687 ggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatgaacattacgaatacaaggtgatgcctttcgg 24097786  T
Q  230 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |  || |||||||| ||| |||||  |||||| || || || || ||||| ||| ||||     
T  24097787 tgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccaaattttccatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgacattctgatc 24097886  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattct 429  Q
    || || ||||||||||| || ||||| ||  ||||||||||||| ||| |||| | |||||| |||||  | |||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  24097887 tattctaagactgaagaggagcatgcagaaaatctgaagattgtattgtaagtcttgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcaaagtgtgagttct 24097986  T
Q  430 ggttgaaggaagtaagttttctggg 454  Q
    |||| |  ||||| |||||||||||    
T  24097987 ggttaagtgaagtgagttttctggg 24098011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 303 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 21026275 - 21026112
Alignment:
Q  303 gttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaacttt 402  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21026275 gttgttttcatcgatgatattttaatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaacttt 21026176  T
Q  403 atgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| | ||| ||||||||||    
T  21026175 atgctaaaatatctaagtgtgagttctggttgaaagaagtgagtttttttggccatgttatttc 21026112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 26 - 466
Target Start/End: Original strand, 20854740 - 20855180
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || |||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||||||     
T  20854740 tcagttgaacaaagttacaataaagaatagatatccacttccgcggattgatgacttgatggaccagttggtaggtgctaaagtttttagtaagattgac 20854839  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||  | || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  20854840 ttgaggtcgggttaccatcagattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctt 20854939  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || || || || || |||||||||||    
T  20854940 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtatttatagatgatatttt 20855039  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactt-tatgctaaattgtctaagtgtga 424  Q
    |||||| || || |||||||| || ||||| || ||  |||||||||| |||||  | | ||| ||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||    
T  20855040 gatttattctaaaactgaagaggagcatgcagaacacttgaagattgtgttgcagattttgaaggag-agaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcga 20855138  T
Q  425 attctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
     |||||||| |  ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  20855139 gttctggttaagtgaagtgagttttctaggccatgttatttc 20855180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 26 - 451
Target Start/End: Original strand, 20938043 - 20938468
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||     
T  20938043 tcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttcctaggattgacgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtttttagtaagattgac 20938142  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | || || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || || || || || |||||||| || ||||| || || |||||||    
T  20938143 ttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaaaacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 20938242  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |  ||||||  |||||| |||||||| || ||||| | | |    
T  20938243 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacttggataaattcgtggttgtgtttattgatgacagtct 20938342  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||  ||||||||||  || || || ||||| | ||||||||| ||  | |||||||| ||||| ||||||||     
T  20938343 gatttattcgaagactgaagaagagcatgtagagcatctgagaatagtattacaagtattgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgag 20938442  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||    
T  20938443 ttctggttaattgaagtaagttttct 20938468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 48425283 - 48424855
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  |||| || |||||||||    
T  48425283 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatttttagtaagattgat 48425184  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  48425183 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 48425084  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||   || || || ||||| || |||||||||||    
T  48425083 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatttt 48424984  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
     || || ||||||| ||| || || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| ||| || ||||   | |||||||| || || || |||||     
T  48424983 aatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgag 48424884  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 454  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||    
T  48424883 ttctggttaaatgaagtaagttttctggg 48424855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 52988151 - 52987723
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  |||| || |||||||||    
T  52988151 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatttttagtaagattgat 52988052  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  52988051 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 52987952  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||   || || || ||||| || |||||||||||    
T  52987951 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatttt 52987852  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
     || || ||||||| ||| || || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| ||| || ||||   | |||||||| || || || |||||     
T  52987851 aatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgag 52987752  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 454  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||    
T  52987751 ttctggttaaatgaagtaagttttctggg 52987723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 26 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 20296791 - 20296363
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||  |||| || |||||||||    
T  20296791 tcagttgaacaaggttacgataaagaacaggtatccgcttccgagaattgaggatttgatggatcagttggttggtgctaagatttttagtaagattgat 20296692  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||  | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  20296691 ttgaggtctggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 20296592  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||| |||||   || || || ||||| || |||||||| ||    
T  20296591 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtacatgaaccgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatctt 20296492  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
     ||||| || |||| |||||| || ||||| |||||||| |  ||||| |||||||||| ||| || |||| | | ||||| || ||||| || |||||     
T  20296491 aatttattctaagaatgaagaggagcatgcagagcatctaagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagagattgtatgcaaagttgtcaaaatgtgag 20296392  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 454  Q
    |||||||| |  ||||| || ||||||||    
T  20296391 ttctggttaagtgaagtgagctttctggg 20296363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 195 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 20944240 - 20944119
Alignment:
Q  195 tatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatc 294  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20944240 tatggtcattatgaataaaaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatc 20944141  T
Q  295 gattcgtagttgtgttcatcga 316  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  20944140 ggttcgtagttgtgttcatcga 20944119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 26 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 37679459 - 37679031
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || || ||||| ||  | || || |||||||||    
T  37679459 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcaattggttggtgctaagatatttagtaagattgat 37679360  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  37679359 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 37679260  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||   || || || ||||| || |||||||||||    
T  37679259 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaatcgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatttt 37679160  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
     || || ||||||| ||| ||  | ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| ||| || ||||   | |||||||| || || || ||||||    
T  37679159 aatctattccaagaatgaggagaagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgaa 37679060  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 454  Q
    ||||||||    |||||||||||| ||||    
T  37679059 ttctggttaggtgaagtaagttttttggg 37679031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 26 - 454
Target Start/End: Original strand, 31537977 - 31538405
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||  | || ||||| ||  | || || ||||| |||    
T  31537977 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacagatatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcaactggttggtgctaagatatttagtaagatagat 31538076  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  31538077 ttgaggtctggttatcatcagataaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 31538176  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||   || || || ||||| || |||||||||||    
T  31538177 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatttt 31538276  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
     || || ||||||| ||| || || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| ||| || ||||   | |||||||| || || || |||||     
T  31538277 aatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgag 31538376  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 454  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||    
T  31538377 ttctggttaaatgaagtaagttttctggg 31538405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 26 - 454
Target Start/End: Original strand, 38910806 - 38911234
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  ||||||| |||||||||    
T  38910806 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacagatatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagattttcagtaagattgat 38910905  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || || || || |||||||| || || ||||| || || |||||||    
T  38910906 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatacaaggtgatgcctt 38911005  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |  || |||||||| ||  |||||   || || || || || || |||||||||||    
T  38911006 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccaaattttccatgctttcctggataagtttgttgtggtatttattgatgatatttt 38911105  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
     || || ||||||| ||| || || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| ||| || ||||   | ||||||||  |||| || |||||     
T  38911106 aatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagctgtcgaaatgtgag 38911205  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 454  Q
    |||||||| |  ||||| || ||||||||    
T  38911206 ttctggttaagtgaagtgagctttctggg 38911234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 24 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 41310938 - 41310694
Alignment:
Q  24 catcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattg 123  Q
    ||||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||   || ||  | || | ||    
T  41310938 catcagttgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccgagaattgacgatttaatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttcgtaaaactg 41310839  T
Q  124 atttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcc 223  Q
    ||||||| ||  | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||| || ||| |    
T  41310838 atttgaggtccggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataacgtgatgtc 41310739  T
Q  224 tttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaa 268  Q
    ||||||||| || ||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  41310738 tttcggtgttactaatgcgcctagtgtgtttatggagtatatgaa 41310694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 26 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 21953288 - 21952860
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||  ||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  |||| || ||||||||     
T  21953288 tcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccgcttcctggaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatttttagtaagattgac 21953189  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||  | || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  21953188 ttgaggtcgggttaccatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 21953089  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||   || || || ||||| || |||||||| ||    
T  21953088 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgtttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatctt 21952989  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
     ||||| |||||||  ||||| || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||| | |||||| ||||   | ||||| || ||||| || |||||     
T  21952988 aatttattccaagaacgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagttttgaaagaaaagaggttgtatgcgaagttgtcaaaatgtgag 21952889  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 454  Q
    |||||||| |  ||||| || ||||||||    
T  21952888 ttctggttaagcgaagtgagctttctggg 21952860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 27 - 448
Target Start/End: Original strand, 20829373 - 20829794
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || || || ||||||||||    
T  20829373 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 20829472  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  ||||||||    || || || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  20829473 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 20829572  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     || ||  | |||||||| || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || || || || |||||||| ||||||||||||    
T  20829573 tggagtatctaatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 20829672  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
     | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||  |  | | ||| || |||||||||||||| |    
T  20829673 gtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagt 20829772  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttt 448  Q
    | |||||||||||||| |||||    
T  20829773 tttggttgaaggaagtgagttt 20829794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 302 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 41308776 - 41308612
Alignment:
Q  302 agttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactt 401  Q
    ||||||||| || ||||| || || ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||  |     
T  41308776 agttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagactgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttg 41308677  T
Q  402 tatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||| || ||||| || |||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||| || |||||||    
T  41308676 tatgccaagttgtccaaatgtgaattttggttaagtgaagtaagttttcttggccatattatttc 41308612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 157
Target Start/End: Original strand, 35930806 - 35930936
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||  | || || || ||||||||||    
T  35930806 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgctgaggtgtttagtaagattgatt 35930905  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaa 157  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||||||    
T  35930906 tgagatcaggatatcatcagattagagtgaa 35930936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 157
Target Start/End: Original strand, 41215837 - 41215967
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||  |||| || || ||||||||||    
T  41215837 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgcttccaaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcggaagtgtttagtaagattgatt 41215936  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaa 157  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||||||    
T  41215937 tgagatcaggatatcatcagattagagtgaa 41215967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 20927432 - 20927017
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||| || || || |||||| | ||||||||||  || ||||||||||||||||||||| | || |||||| | || || ||||||||||||     
T  20927432 cagttgaacaaagtgacgattaagaatcgatatccacttcaaaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcagaggtgtttagcaagattgata 20927333  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  ||||||||    || || || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  20927332 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 20927233  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     || ||  | ||||| || || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | ||||  | || || || |||||||| ||||||||||||    
T  20927232 tggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggacagttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 20927133  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
     | || || ||| |||| ||||| |||| ||||||| ||| |||||| |||||||| | ||| |||||  |  | | |||||| || ||||||||||| |    
T  20927132 gtgtattcgaagtctgaggaagagcatgatgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaggagaatcagttatgtgctaagttatctaagtgtgagt 20927033  T
Q  427 tctggttgaaggaagt 442  Q
    | ||||||||||||||    
T  20927032 tttggttgaaggaagt 20927017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 20527431 - 20527301
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||| || || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||  | | |||| || || || ||||||||||    
T  20527431 cagttgaacaaagtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagaagatacaaaggtgtttagtaagattgatt 20527332  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaa 157  Q
    |||||||| | ||||| | ||||| ||||||    
T  20527331 tgagatcaggatatcatctgattagagtgaa 20527301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 391 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 16378156 - 16378081
Alignment:
Q  391 agaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||| ||||||||||    
T  16378156 agaagaagctatatgctaaattgtcaaagtgtgaattctggttgaaagaggttagttttcttggccatgttatttc 16378081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 27 - 148
Target Start/End: Original strand, 22133735 - 22133856
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||| ||||| ||  |||||||| ||||||||||| || | ||| |  || | || || ||||||||||    
T  22133735 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgcttccaagggttgatgatctgatggatcagctatttggtactgaaatgtttagtaagattgatt 22133834  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagat 148  Q
    |||||||| | ||||| |||||    
T  22133835 tgagatcaggatatcatcagat 22133856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 340 - 451
Target Start/End: Original strand, 23196543 - 23196654
Alignment:
Q  340 ctgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaagga 439  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||   | ||||| || ||||| || || || |||||||| |  ||    
T  23196543 ctgaagaagagcatgtagagcatctgaaaattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaggttgtatgccaagttgtccaaatgcgagttctggttaagtga 23196642  T
Q  440 agtaagttttct 451  Q
    ||||||||||||    
T  23196643 agtaagttttct 23196654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 88
Target Start/End: Original strand, 21200935 - 21200996
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatgga 88  Q
    |||||||| |||||||  || |||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21200935 cagttgaataaggtaatgattaagaatcgatatccactcccgaggattgatgatttgatgga 21200996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 385; Significance: 0; HSPs: 44)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 466
Target Start/End: Original strand, 18225094 - 18225534
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18225094 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 18225193  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18225194 ttgagatcagggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 18225293  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || || |||||    
T  18225294 tcggtgtgaccaatgcacctggactgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcggttcgtagttgtgtttattgacgacatttt 18225393  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18225394 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 18225493  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||| ||| ||||||||||    
T  18225494 ttctggttgaaagaagtaccttttcttggccatgttatttc 18225534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 14301628 - 14302067
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  14301628 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 14301727  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14301728 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 14301827  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||    
T  14301828 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgatgatattttg 14301927  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14301928 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 14302027  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  14302028 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 14302067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 8051272 - 8051711
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  8051272 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 8051371  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8051372 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 8051471  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||    
T  8051472 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 8051571  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8051572 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaat 8051671  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  8051672 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 8051711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 8388775 - 8388336
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  8388775 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 8388676  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8388675 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 8388576  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  8388575 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgatatttta 8388476  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8388475 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 8388376  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| || || ||||| || ||| ||||||||||    
T  8388375 tctggttgaatgaggtgagtttccttggccatgttatttc 8388336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 14682930 - 14682491
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||     
T  14682930 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatc 14682831  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14682830 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgacgatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaggttatgccttt 14682731  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14682730 tggtgttaccaatgcacctggagagtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 14682631  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14682630 atttactccaagactgaaaaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaat 14682531  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  14682530 tctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgttatttc 14682491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 27713699 - 27713260
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  27713699 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatgggtcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 27713600  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27713599 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 27713500  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||    
T  27713499 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 27713400  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27713399 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 27713300  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  27713299 tctagttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 27713260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 12478963 - 12478524
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  12478963 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 12478864  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12478863 tgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 12478764  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12478763 tggagttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttg 12478664  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12478663 atttactccaagaccgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaat 12478564  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  12478563 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 12478524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 19776442 - 19776881
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  19776442 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 19776541  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19776542 tgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 19776641  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19776642 tggagttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttg 19776741  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19776742 atttactccaagaccgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaat 19776841  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  19776842 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 19776881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 23958110 - 23957671
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  23958110 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 23958011  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23958010 tgaggtcaggatatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 23957911  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||    
T  23957910 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 23957811  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23957810 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 23957711  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  23957710 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 23957671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 40475403 - 40474964
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  40475403 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 40475304  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40475303 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcataagacagctttcagaacccgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 40475204  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  40475203 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggtttgtggttgtgttcatcgatgatattttg 40475104  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40475103 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtcgaagtgtgaat 40475004  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  40475003 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 40474964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 26 - 466
Target Start/End: Original strand, 15145541 - 15145973
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||    
T  15145541 tcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattga--------tggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaacattgat 15145632  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||  | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15145633 ttgagatcgggttatcactagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 15145732  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  15145733 tcggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtacatgaatcgtatctttcatgcatttttggatcgattcgtggttgtctttatcgatgatatttt 15145832  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  15145833 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaacattgtcttgcaagtgttgaaagagaggaaactttatgctaaattatctaagtgtgag 15145932  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15145933 ttctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttc 15145973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 27 - 395
Target Start/End: Original strand, 17092798 - 17093166
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  17092798 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcaactagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 17092897  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17092898 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 17092997  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||    
T  17092998 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 17093097  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaag 395  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  17093098 atctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaag 17093166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 27 - 398
Target Start/End: Original strand, 16234641 - 16235012
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16234641 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 16234740  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16234741 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 16234840  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16234841 tggagttaccaatacacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttg 16234940  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaa 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  16234941 atttactccaagactgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaa 16235012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 112 - 466
Target Start/End: Original strand, 16353241 - 16353596
Alignment:
Q  112 tcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaata 211  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16353241 tcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaata 16353340  T
Q  212 taaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttc 311  Q
     |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||    
T  16353341 caaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgttctc 16353440  T
Q  312 atcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaat 411  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16353441 atcgatgatattttaatttactccaagaccgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaat 16353540  T
Q  412 tgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctg-ggcgatgttatttc 466  Q
    | ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||  ||| ||||||||||    
T  16353541 tatctaagtgtgagttctggttaaaagaggtaagttttctntggccatgttatttc 16353596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 14849015 - 14849454
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||    || || |||||| ||||||    
T  14849015 cagttgaataaagtaacgataaagaatagatatccacttccaaaaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcgcgtgtatttagcaaggttgatt 14849114  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||  | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||    
T  14849115 tgagatcgggttatcaccaaattaaagtgagagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacgcgttatggacattatgaatataaagagatgccttt 14849214  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    |||||| || ||||| || || |||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  14849215 cggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggatcgcttcgtggttgtgttcatcgacgatattttg 14849314  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    || ||||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||    
T  14849315 atatactccaagtccgaagaagaacatgttgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaggagaagaagttatatgctaaattgtcaaagtgtgaat 14849414  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||| | ||||||||    
T  14849415 tctggttgaaagaggtaagttttcttggccaagttatttc 14849454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 14696476 - 14696037
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |   || || |||||||||||||    
T  14696476 cagttgaacaaagtaacgataaagaatatgtatctacttccaagaattgatgattttatggatcagttagtgggtgtacgtgtgtttagcaagattgatt 14696377  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||  | || ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||| |||||  ||| ||||||||    
T  14696376 tgagatcgggttaacaccaaattaaagtgaaagataaggatatgcagaagacggcctttagaacgcgttatggacattattaatattcagtgatgccttt 14696277  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| || ||||| || || |||||||||||||| |||||    || || ||||| | ||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  14696276 tggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaactctatttttcatgcgtatttggattgcttcgtggttgtgttcattgatgatattttg 14696177  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    || ||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||| |    
T  14696176 atatactcgaagtccgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaatttatatgctaagttgtcaaagtgtgagt 14696077  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||| ||||||||||    
T  14696076 tctggttgaatgaggtgagttttcttggccatgttatttc 14696037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 16150075 - 16149650
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||     
T  16150075 tcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcaaaggttttcagtaagattgac 16149976  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||| || ||||| || || |||||||    
T  16149975 ttgaggtcaggttaccaccagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 16149876  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |   |||||  ||| || |||||||| || || |||||| |    
T  16149875 tcggtgttactaatgcacctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctggataaatttgtggttgtgtttattgacgatattct 16149776  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    |||||| || | |||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||| | | |||||| |||||  | |||||||| || || ||||||||     
T  16149775 gatttattcaatgactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaaatattgaaagaaaagaagttgtatgctaagttatcgaagtgtgag 16149676  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||    
T  16149675 ttctggttaagtgaagtaagttttct 16149650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 16154221 - 16153796
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||     
T  16154221 tcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcaaaggttttcagtaagattgac 16154122  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||| || ||||| || || |||||||    
T  16154121 ttgaggtcaggttaccaccagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 16154022  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |   |||||  ||| || |||||||| || || |||||| |    
T  16154021 tcggtgttactaatgcacctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctggataaatttgtggttgtgtttattgacgatattct 16153922  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    |||||| || | |||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||| | | |||||| |||||  | |||||||| || || ||||||||     
T  16153921 gatttattcaatgactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaaatattgaaagaaaagaagttgtatgctaagttatcgaagtgtgag 16153822  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||    
T  16153821 ttctggttaagtgaagtaagttttct 16153796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 451
Target Start/End: Original strand, 15357028 - 15357453
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  15357028 tcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcaaaggttttcagcaagattgac 15357127  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    || || ||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || |||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  15357128 ttaaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatacaaggtgatgcctt 15357227  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |   |||||   ||||  ||||| || || ||||| ||| |    
T  15357228 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctggataagttcgcggttgtatttattgatgacattct 15357327  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| | |||||| |||||  | ||||| || ||||| || |||||     
T  15357328 gatttattctaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattacaagtattgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcgaaatgtgag 15357427  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
    |||||||| |  ||| ||||||||||    
T  15357428 ttctggttaagtgaattaagttttct 15357453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 16218592 - 16218325
Alignment:
Q  28 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 127  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||   || || ||||||||||| ||    
T  16218592 agttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttaatggattagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgactt 16218493  T
Q  128 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 227  Q
    ||| ||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  16218492 gaggtcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaggatatgcagaagacagcttttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgcccttc 16218393  T
Q  228 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcg 295  Q
    ||||| || ||||   | || |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  16218392 ggtgttacaaatgtgtcaggtgtgtttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcg 16218325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 16221912 - 16221645
Alignment:
Q  28 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 127  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||   || || ||||||||||| ||    
T  16221912 agttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttaatggattagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgactt 16221813  T
Q  128 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 227  Q
    ||| ||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  16221812 gaggtcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaggatatgcagaagacagcttttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgcccttc 16221713  T
Q  228 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcg 295  Q
    ||||| || ||||   | || |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  16221712 ggtgttacaaatgtgtcaggtgtgtttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcg 16221645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 27 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 14161833 - 14161409
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||| |||||||||||    
T  14161833 cagttgaacaaggtaacgatacagaataggtatccacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgcgtgttcaacaagattgatt 14161734  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||  | ||||||||||||| ||| ||  |||||||||| |||||||| ||||| || || |||||  | || ||||||| |  ||| ||||||||    
T  14161733 tgagatcgggttatcaccagattagagtaaagaatgaagatatacagaagacggcttttaggacacgttacagacattatgaattttcagtgatgccttt 14161634  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||  | || || ||||| | | |||||   ||||||||||| || || ||||||||  |     
T  14161633 cggtgtttctaatgcacctggagtatttatggagtatatgaacagaatttttcatgcttatctggataagttcgtagttgtatttattgatgatatccta 14161534  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactt-tatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    ||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  | || |||| ||| || ||| || || ||||| || ||||| || ||||||    
T  14161533 atttattctgagacagaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttctacaggtgttgaagga-aagtaagttgtatgccaagttgtcgaaatgtgaa 14161435  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
    ||||||||||| || || ||||||||    
T  14161434 ttctggttgaatgaggtgagttttct 14161409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 451
Target Start/End: Original strand, 15001273 - 15001697
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||   || || || || ||||||    
T  15001273 tcagttgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccgaggattgacgatttaatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagtaaaattgat 15001372  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||  |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  15001373 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacatgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctt 15001472  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||  || ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || || |||||||| | | |||||  ||| || |||||||| || ||||| || ||    
T  15001473 tcggtgatactaatgcgcctgttgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatctt 15001572  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    |||||| || |||| ||||||||| ||||| || ||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||  | ||||| || |||| ||| |||| |    
T  15001573 gatttattctaagattgaagaagagcatgcagaacatctgaggattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtttaaatgtg-a 15001671  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
     ||||||| |  ||||||||||||||    
T  15001672 gtctggttaagtgaagtaagttttct 15001697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 48 - 378
Target Start/End: Original strand, 1647207 - 1647537
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||| ||| | || || || |    
T  1647207 aagaataggtatccacttccgaggattgatgacttgatggaccagttggtaggtgcaaaagtttttagtaaaattgacttgaggtcaggttaccatcaaa 1647306  T
Q  148 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 247  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  1647307 ttaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggactcgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 1647406  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     ||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||| |||||  |||||| || || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||     
T  1647407 tgtgtttatggagtatatgaataggattttccatgcttttctggataaattcgtggtggtattcattgatgatattttgatttattctaagactgaagag 1647506  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgc 378  Q
    || ||||| || || ||||||||||| ||||    
T  1647507 gagcatgcagaacacctgaagattgtgttgc 1647537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 297 - 463
Target Start/End: Original strand, 18613743 - 18613909
Alignment:
Q  297 ttcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaaga 396  Q
    |||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18613743 ttcgtagttgtgtttattgacgacattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaaga 18613842  T
Q  397 aactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttat 463  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||    
T  18613843 aactttatgcaaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaaaaagtaagttttctaggccatgttat 18613909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 30 - 424
Target Start/End: Original strand, 51604704 - 51605098
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 129  Q
    |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  51604704 ttgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggaccagctagtgggtgcaaaggtgttcagtaagattgacttga 51604803  T
Q  130 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 229  Q
    | ||| | || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  51604804 ggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcgg 51604903  T
Q  230 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    ||| || || || || || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||||  |||||| || || || || ||||||||| |||||    
T  51604904 tgttactaacgcgcccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatattctgatt 51605003  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtga 424  Q
    || || |||||||||||||| ||||| || |||||||  |||||  ||||||| | ||||||||||||  | ||||| |||||||| || |||||    
T  51605004 tattcgaagactgaagaagagcatgcagaacatctgagaattgtgctgcaagttttgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaaatgtga 51605098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 27 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 22632067 - 22631910
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  22632067 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaagtgttttcagcaagatagatt 22631968  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttt 184  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22631967 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagcttt 22631910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 454
Target Start/End: Original strand, 3262702 - 3263130
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  |||| || |||||||||    
T  3262702 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatttttagtaagattgat 3262801  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  3262802 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 3262901  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||   || || || ||||| || |||||||||||    
T  3262902 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatttt 3263001  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
     || || ||||||| ||| || || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| ||| || ||||   | |||||||| || || || |||||     
T  3263002 aatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgag 3263101  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 454  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||    
T  3263102 ttctggttaaatgaagtaagttttctggg 3263130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 48 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 15072701 - 15072298
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 147  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    || |||||||| ||||||||||| ||| | || || || |    
T  15072701 aagaacagatatccacttccgataattgatgatttaatggatcagttagtgggtgctcgtgtgttcagcaaaattgatttgaggtcaggttaccatcaaa 15072602  T
Q  148 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 247  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||| || || || || || || || ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  15072601 ttaaggtgaaggatgaagatacgcaaaaaacggcctttaggacacgatatggacattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 15072502  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     |||||||||||||| |||||| |  | |||||||| | | |||||  ||| || |||||||| || ||||||||  | ||||| || |||| |||| ||    
T  15072501 tgtgtttatggagtacatgaatagagttttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcctaatttattctaagaatgaataa 15072402  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 447  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||   | ||||| || ||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||    
T  15072401 gagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaggttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagtt 15072302  T
Q  448 ttct 451  Q
    ||||    
T  15072301 ttct 15072298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 23443467 - 23443237
Alignment:
Q  28 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 127  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || || | ||||||||||||    
T  23443467 agttgaacaaagtaacgataaagaatatgtatccacttccgagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcatgtgtgtttaccaagattgattt 23443368  T
Q  128 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 227  Q
    |||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||    
T  23443367 gagattgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcataagacaacttttagaacacgttatggacattatgagtataaagtgatgcctttc 23443268  T
Q  228 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatgga 259  Q
    ||| | || ||||| || || |||||||||||    
T  23443267 ggt-ttacgaatgcgccaggtgtgtttatgga 23443237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 26 - 384
Target Start/End: Original strand, 44659774 - 44660132
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || || |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  ||||||| |||||||||    
T  44659774 tcagttgaacaaggttacgatcaagaacagatatccgctccctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagattttcagtaagattgat 44659873  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  44659874 ttgaggtcaggttatcatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 44659973  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || || || ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||   || || || ||||| || || ||||||||    
T  44659974 tcggtgttactaacgcgcctggtgtatttatggagtacatgaatcgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgacgatatttt 44660073  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 384  Q
     || || ||||||| ||| || || ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  44660074 aatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtgttgcaagtgt 44660132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 26 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 27902750 - 27902325
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||  | || |||||||||||||| || || |||||     
T  27902750 tcagttgaacaaagttacaataaagaacagatatccacttccgaggattgatgacttgatggaccaaatggtaggtgcaaaagtttttagtaaaattgac 27902651  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | || || || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || || || || |||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  27902650 ttgaggtcaggttaccatcaaattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctt 27902551  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || || || ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||  |||||  |||||| || || || || ||| |||||||    
T  27902550 tcggtgttactaaagcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgctttcctggataaattcgtggtggtatttattgatcatatttt 27902451  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactt-tatgctaaattgtctaagtgtga 424  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||| || ||  |||||||||| |||||  | | ||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||    
T  27902450 gatttattctaagactgaagaggagcatgcagaacacatgaagattgtgttgcagattttgaaagag-agaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcga 27902352  T
Q  425 attctggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
     |||| ||| || ||||| ||||||||    
T  27902351 gttctagttaaatgaagtgagttttct 27902325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 26 - 454
Target Start/End: Original strand, 29451445 - 29451873
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  ||||||| |||||||||    
T  29451445 tcagttgaacaaggttacgatcaagaacagatatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagattttcagtaagattgat 29451544  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  29451545 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 29451644  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||   || || || || || || |||||||||||    
T  29451645 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtatttattgatgatatttt 29451744  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
     || || ||||||| ||| || || ||||| || |||||||  ||||| |||||||||| ||| || |||| | | ||||| || ||||| || |||||     
T  29451745 aatctattccaagaatgaggaggagcatgcagatcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagagattgtatgcaaagttgtcgaaatgtgag 29451844  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 454  Q
    |||||||| |  ||||| || ||||||||    
T  29451845 ttctggttaagtgaagtgagctttctggg 29451873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 26 - 130
Target Start/End: Original strand, 16251498 - 16251602
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16251498 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatgtatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 16251597  T
Q  126 ttgag 130  Q
    |||||    
T  16251598 ttgag 16251602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 26 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 8708271 - 8707835
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   || || || ||||||       
T  8708271 tcagttgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgcacgcgtgtttagtaagatt--- 8708175  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
     |||| ||  | || || || |||||||| ||||||||||||||| |||| || || || || || || ||||| || || ||||||  ||| |||||||    
T  8708174 -tgaggtcgggttaccatcatattaaagtaaaagatgaagatatgtagaaaacggcctttagcacacgatatggacattacgaatattcagtgatgcctt 8708076  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || || || |  || |||||||||||||| |||||| | || |||||||| | ||||||||| || || |||||||| || ||||| || ||    
T  8708075 tcggtgttactaacgcgcggggtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatttggatcggtttgtggttgtgtttattgatgacatctt 8707976  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    |||||| || ||| |||||||||| ||||| ||||||  |||  |||| |||||||||| ||| || |||||  | ||||| || ||||| || ||||||    
T  8707975 gatttattctaagtctgaagaagagcatgcagagcattagaaagttgtgttgcaagtgttgaaggaaaagaagatgtatgccaagttgtccaaatgtgaa 8707876  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    || ||||| |  |||||||||||| | ||| || |||||||    
T  8707875 ttttggttaagtgaagtaagttttattggccatattatttc 8707835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 26 - 384
Target Start/End: Original strand, 11205140 - 11205498
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || || ||||| ||  | || |||||||||||     
T  11205140 tcagttgaacaaggttacgataaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcaattggttggtgctaagatctttagcaagattgac 11205239  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  11205240 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 11205339  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||| |||||   || || || ||||| || |||||||| ||    
T  11205340 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgtttatggagtacatgaaccgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatctt 11205439  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 384  Q
     ||||| ||||||| |||||| || ||||| || || ||||  ||||| ||||||||||    
T  11205440 aatttattccaagaatgaagaggagcatgcagaacacctgagaattgtattgcaagtgt 11205498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 27 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 15258290 - 15257921
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||||||||||||||    || || ||||||||||| |    
T  15258290 cagttgaataaggttacgataaagaacaggtatccactttcgaggattgatgatta-atcgatcagttagtgggtgctcgtgtgtttagcaagattgact 15258192  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | || || ||||| || ||||| |||||  ||||||||||||| || || || || || |||||||| || |||||||| || ||||||||    
T  15258191 tgaggtcaggttaccatcagatcaaggtgaaggatgagaatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgccttt 15258092  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||||| | | || ||  ||| || |||||||| || |||||||| |||    
T  15258091 cggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggaatatatgaaccgaattttccatgcctatctgaataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcttg 15257992  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaa 397  Q
    ||||| || | ||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| | |||||| |||||    
T  15257991 atttattcaaggaccgaagaagagcatgcagagcatctaaagattgtattgcaagtatcgaaagaaaagaa 15257921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 222 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 15323385 - 15323141
Alignment:
Q  222 cctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgata 321  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||| | || |||||||| | | |||||  ||| || |||||||| || |||||||    
T  15323385 cctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggaatacatgaatagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgata 15323286  T
Q  322 ttttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtg 421  Q
    || | ||||| || |||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||  | ||||| || ||||| || ||    
T  15323285 ttgtaatttattctaagagtgaagaagagcatgcagagcatctgaaaattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatg 15323186  T
Q  422 tgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||| ||| || |||||||    
T  15323185 tgaattctggttaagtgaagtaagttttcttggccatattatttc 15323141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 364 - 466
Target Start/End: Original strand, 1640326 - 1640428
Alignment:
Q  364 tgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttat 463  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||  || |||||||    
T  1640326 tgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattttcaaagtgtgaattctggttgaaagaggtaagttttcttagccatgttat 1640425  T
Q  464 ttc 466  Q
    |||    
T  1640426 ttc 1640428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 27 - 448
Target Start/End: Original strand, 15291067 - 15291488
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||| | || || || ||||||||||    
T  15291067 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 15291166  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  ||||||||    || || || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  15291167 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcagaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 15291266  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     || ||  | ||||| || || || |||||||| || ||||||   || || ||| | | | |||| |  || || || |||||||| ||||||||||||    
T  15291267 tggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaataaaatatttcatccttatctggaccattttgtggtggtgttcatagatgatattttg 15291366  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
     | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||  |  | |  || || |||||||||||||| |    
T  15291367 gtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgcgccaagttgtctaagtgtgagt 15291466  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttt 448  Q
    | |||||||||||||| |||||    
T  15291467 tttggttgaaggaagtgagttt 15291488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 22 - 92
Target Start/End: Original strand, 16353174 - 16353244
Alignment:
Q  22 atcatcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcag 92  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16353174 atcatcagttgaataaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcag 16353244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 401 - 466
Target Start/End: Original strand, 29037427 - 29037492
Alignment:
Q  401 ttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  29037427 ttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 29037492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 132
Target Start/End: Original strand, 12340777 - 12340879
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 129  Q
    ||||||||||| || || || ||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||| |||| ||||| ||||||||||| |    
T  12340777 ttgaacaaggtgacgattaacaattggtatccgctcccgaggattgatgatttgatggatcaattggttggtgcagaagtgttcagtaagattgatttaa 12340876  T
Q  130 gat 132  Q
    |||    
T  12340877 gat 12340879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 14999301 - 14999257
Alignment:
Q  404 tgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttt 448  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  14999301 tgctaagttgtctaagtgtgaattttggttgaaggaagtgagttt 14999257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 384; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 40547 - 40108
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  40547 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaactgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 40448  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40447 tgagatcagggtatcactagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcaaaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 40348  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  40347 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgatgacattttg 40248  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40247 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 40148  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  40147 tctggttgaaagaagtaagttttcttggccatgttatttc 40108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 466
Target Start/End: Original strand, 14031 - 14476
Alignment:
Q  22 atcatcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagat 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14031 atcatcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagat 14130  T
Q  122 tgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatg 221  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14131 tgatttgagatcggggtatcactagattaaagtgaaagatgatgatatgcagaagatagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatg 14230  T
Q  222 cctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgata 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||    
T  14231 cctttcggtgtgaccaatgcacctggaatgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcggttcgtggtggtgtttatcgatgata 14330  T
Q  322 -ttttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagt 420  Q
     |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14331 ttttttatttactccatgactgaagaagaatatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattttctaagt 14430  T
Q  421 gtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  14431 gtgaattctgtttgaaggaagtaagttttcttggccatgttatttc 14476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 380; Significance: 0; HSPs: 48)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 18781409 - 18780970
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18781409 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacctccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 18781310  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18781309 tgagatcagggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 18781210  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  18781209 cggtgtgaccaacgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgacattttg 18781110  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  18781109 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttttgcgaaattgtctaagtgtgaat 18781010  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  18781009 tctgattgaaggaagtaagttttcttggccatgttatttc 18780970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 16358797 - 16358358
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16358797 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 16358698  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16358697 tgagatcaggctatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccctt 16358598  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  16358597 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgatattttg 16358498  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16358497 atctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 16358398  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  16358397 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 16358358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 34568789 - 34568350
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  34568789 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 34568690  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34568689 tgagatcaggctatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccctt 34568590  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  34568589 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgatattttg 34568490  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34568489 atctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 34568390  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  34568389 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 34568350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 27520701 - 27520262
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  27520701 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 27520602  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27520601 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 27520502  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||     
T  27520501 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatatttta 27520402  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27520401 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 27520302  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  27520301 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 27520262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 27612649 - 27612210
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  27612649 cagttgaacaaggtaactatcaaaaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggaccagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 27612550  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27612549 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 27612450  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  27612449 tggagttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgtgtttatcgacgatattttg 27612350  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27612349 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 27612250  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  27612249 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 27612210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 27666581 - 27667020
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  27666581 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccactttcgagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgagttttcagcaagatagatt 27666680  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27666681 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttttgccttt 27666780  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  27666781 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgtgttcatcgacgatatcttg 27666880  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27666881 atttactccaagactgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 27666980  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||| ||||||||||    
T  27666981 tctggttgaatgaagtgagtttccttggccatgttatttc 27667020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 22350214 - 22349776
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  22350214 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccatttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 22350115  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22350114 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 22350015  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22350014 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcacatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtattcatcgatgatattttg 22349915  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  22349914 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagt 22349815  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttattt 465  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  22349814 tctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgttattt 22349776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 40711075 - 40710636
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  40711075 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 40710976  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40710975 tgagatcaggctatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 40710876  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||    
T  40710875 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 40710776  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40710775 atctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 40710676  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| || || ||||| || ||| ||||||||||    
T  40710675 tctggttgaaagaggtgagtttccttggccatgttatttc 40710636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 466
Target Start/End: Original strand, 22330981 - 22331417
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||    
T  22330981 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatttga 22331080  T
Q  130 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 229  Q
    | ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22331081 ggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttgg 22331180  T
Q  230 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22331181 tgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttgatt 22331280  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattct 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22331281 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattct 22331380  T
Q  430 ggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  22331381 ggttgaaagaagtgagttttctaggctatgttatttc 22331417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 14997830 - 14998269
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  14997830 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 14997929  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14997930 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 14998029  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||    
T  14998030 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 14998129  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14998130 atttactccaagactgaagaggaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 14998229  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  14998230 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 14998269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 19772255 - 19771817
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  19772255 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcaactagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 19772156  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| | | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19772155 tgaggtgaggatatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 19772056  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| |||    
T  19772055 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgttcatcgacgatatcttg 19771956  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19771955 atttactccaagactgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 19771856  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttattt 465  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  19771855 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttattt 19771817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 37289587 - 37290026
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  37289587 cagttgaataaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 37289686  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37289687 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcattatgaatataaagttatgccttt 37289786  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||    
T  37289787 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 37289886  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37289887 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 37289986  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  37289987 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 37290026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 41773137 - 41772698
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  41773137 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 41773038  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41773037 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 41772938  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||    
T  41772937 tggtgttaccaatgcacctagagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatatcttg 41772838  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  41772837 atttactccaagactgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaatttttatgctaaattgtctaaatgtgaat 41772738  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  41772737 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 41772698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 22136963 - 22136524
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  22136963 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 22136864  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22136863 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcaggacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 22136764  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| || ||||||    
T  22136763 tggtgttactaatgcacctggagtgtttatggggtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgacattttg 22136664  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22136663 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttttgctaaattgtctaagtgtgaat 22136564  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  22136563 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 22136524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 29474164 - 29474603
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  29474164 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 29474263  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29474264 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatggagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 29474363  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || || |||||||| |||||||||||||||    
T  29474364 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcagtttgtggttgtgtttatcgatgatattttg 29474463  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  29474464 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgataaattatcgaagtgtgaat 29474563  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  29474564 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 29474603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 463
Target Start/End: Original strand, 27683491 - 27683927
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  27683491 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 27683590  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27683591 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 27683690  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  ||||||||    
T  27683691 tggtgttaccaatgcacctggagtgtctatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacaatattttg 27683790  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27683791 atttactccaagactgacgaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgagagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 27683890  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttat 463  Q
    ||||||| || ||||| |||||||| ||| |||||||    
T  27683891 tctggttcaaagaagtgagttttctaggccatgttat 27683927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 50 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 20801669 - 20801253
Alignment:
Q  50 gaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagatt 149  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20801669 gaataggtatcctcttccgagaattgatgatttcatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatttgagatcagggtatcaccagatt 20801570  T
Q  150 aaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggag 249  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  20801569 aaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggag 20801470  T
Q  250 tgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaaga 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20801469 tgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttttctttatcgatgatattttaatttactccaagactgaagaaga 20801370  T
Q  350 acatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtttt 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||     
T  20801369 acatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgctgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaagtttc 20801270  T
Q  450 ctgggcgatgttatttc 466  Q
    || ||| |||| |||||    
T  20801269 cttggccatgtcatttc 20801253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 25428728 - 25428289
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||     
T  25428728 cagttgaacaaggtaacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaagtgttttcagcaagatagatc 25428629  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  25428628 tgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcggtatggccactatgaatacaaagttatgccttt 25428529  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    |||||| || |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||||    
T  25428528 cggtgttacaaatgcacctggactatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggaccgattcgtggttgtttttattgatgatattttg 25428429  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  | || |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  25428428 atttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaatctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgtgaat 25428329  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||| |||||| ||||| || ||||| ||  ||||||||||    
T  25428328 tctagttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttc 25428289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 26736818 - 26737257
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||    
T  26736818 cagttgaacaaagtaacgataaagaatatgtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacatgtatttagcaagattgatt 26736917  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  26736918 tgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaacttttagaacacgttatggacaatatgaatataaagtgatgccttt 26737017  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||  || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26737018 cggtgttacaaatgcacctggtgtgtttatggagtacatgaatcaaatttttcatgcatttttagatcgtttcgtggttgtgttcatcgatgatattttg 26737117  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||  |||||| |||||  | ||||||||||| || ||||||||||    
T  26737118 atttactccaagtccgaagaagaacatgctgaacatttgaagattattttgcaagtgctgaaagataagaagttatatgctaaattatcaaagtgtgaat 26737217  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  26737218 tctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttc 26737257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 21337385 - 21337824
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||   || || |||||||||||||    
T  21337385 cagttgaccaaagtaacgataaagaataggtatccaattccaagaattgatgacttgatggatcagttattgggtgcatgtgtgtttagcaagattgatt 21337484  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||  | |||||||||||||| ||||||||    
T  21337485 tgaggtcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaatacagcttttagaacacgttatggatattatgaatataaagtgatgccttt 21337584  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    |||||| || ||||| || || ||||||||||| || |||||||| || || ||||| ||||||||| | || || ||||| |||||||| |||||||||    
T  21337585 cggtgttacgaatgcgccaggtgtgtttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcgtttttggatagcttagtggttgtattcatcgacgatattttg 21337684  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  21337685 atttactccaagtttgaagaagaacatgctgagcacttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaaactttatgctaaattatcaaagtgtgaat 21337784  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||| | ||||||||    
T  21337785 tctggttgaaagaggtgagttttctcggccacgttatttc 21337824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 30 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 23473519 - 23473083
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 129  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||    
T  23473519 ttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgatttga 23473420  T
Q  130 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 229  Q
    ||||    ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  23473419 gatcggtttatcatcaaattaaagtgaaagatgaagatatgtagaagacggcttttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcgg 23473320  T
Q  230 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    ||| || ||||| || || |||| ||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||     
T  23473319 tgttacaaatgcgccaggtgtgtctatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgatg 23473220  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattct 429  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||| | | ||  |||| |||||||||  ||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  23473219 tactcaaagtctgaagaagaacatgctgagcgtttaaaagttgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgctaaattgtcaaagtgtgagttct 23473120  T
Q  430 ggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
     |||||| || || |||||||| ||| ||||||||||    
T  23473119 agttgaatgaggtgagttttcttggccatgttatttc 23473083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 20466190 - 20466629
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||| ||  |||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   || || |||||||||||||    
T  20466190 cagttgaataaactaacaataaagaataagtatccacttccaagaattgatgatttgatggatcagttactgggtgcacgtgtgtttagcaagattgatt 20466289  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    | |||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || || || || |||||||| || || ||||||  ||| ||||||||    
T  20466290 taagatcaggttatcaccagattaaagtgaaagacgaggatatgcaaaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatattcagtgatgccttt 20466389  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| || |||||||| || ||||||||| |||| |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  20466390 tggtgttactaatgcaccgggtgtgtttatgaagtacatgaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgcttcgtggttgtgatcatcgatgatattttg 20466489  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||  | ||||| || ||||| |||||||| |    
T  20466490 atatactctaagtctgaagaagaacatgttgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaggagaagaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgagt 20466589  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||| ||||||||||    
T  20466590 tctggttgaatgaggtgagttttcttggccatgttatttc 20466629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 384
Target Start/End: Original strand, 21562115 - 21562472
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||   || |||||||||||||||    
T  21562115 tcagttgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatggtttaatggatcagttagtgg-tgcacgcgtgttcagcaagattgat 21562213  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || || || || ||||| || |||||||||||||| ||| |||    
T  21562214 ttgaggtcgggttaccaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaaaacggcctttaggacacgatatggacattatgaatataaagtgatgtctt 21562313  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || |||||  |||| |||||||||||||| |||||| | || |||||||| | ||| ||| | || ||||||||||| || ||||| ||  |    
T  21562314 tcggtgttactaatgcgtctggtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcctatttagattggtttgtagttgtgtttatagatgacatcct 21562413  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 384  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||| |||||| | || ||||| || |||||||    
T  21562414 gatttattctaagactgaagaagagcatgcagagcatttaaaaattgtgtttcaagtgt 21562472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 48 - 466
Target Start/End: Original strand, 22234032 - 22234450
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||   || || || || ||||||||||| | | | || || ||||    
T  22234032 aagaataggtatccacttccgaggattgatgatttaatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagtaaaattgatttgaggttaggttaccatcaga 22234131  T
Q  148 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 247  Q
    |||| ||||  ||||| ||||||| |||||| || || || ||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  22234132 ttaaggtgatggatgaggatatgccgaagacggcctttaggacatgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 22234231  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     |||||| |||||||||||||    || |||||||| | | |||||  ||| || |||||||| || ||||| || || ||||| || ||||||||||||    
T  22234232 tgtgtttgtggagtatatgaacaaaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagactgaagaa 22234331  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 447  Q
    || ||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||  | ||||  || || || || |||||||||||||| |  ||||||||||    
T  22234332 gagcatgcagatcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgtcaagttatcaaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagtt 22234431  T
Q  448 ttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||| ||| || |||||||    
T  22234432 ttcttggccatattatttc 22234450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 26 - 454
Target Start/End: Original strand, 24796487 - 24796915
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  ||||||| |||||||||    
T  24796487 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgccaagattttcagtaagattgat 24796586  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  24796587 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 24796686  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||   || || || ||||| || ||||||||| |    
T  24796687 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattct 24796786  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
     ||||| ||||||| ||| || || ||||| ||||||||||  || || |||||||||| ||| || ||||   | |||||||| || || || ||||||    
T  24796787 aatttattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaatagtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgaa 24796886  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 454  Q
    ||||||||  | |||||||||||||||||    
T  24796887 ttctggttacatgaagtaagttttctggg 24796915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 20344560 - 20344132
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  |||| |||||||||||     
T  20344560 tcagttgaacaaagtcacgataaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatttttagcaagattgac 20344461  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  20344460 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 20344361  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || || |  ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||| |||||   || || || ||||| || |||||||| ||    
T  20344360 tcggtgttactaacgtgcctggtgtgtttatggagtacatgaaccgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatctt 20344261  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
     ||||| ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||   | |||||||| ||||| || |||||     
T  20344260 aatttattccaagaatgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtcttgcaagttttgaaagagaagaggttgtatgctaagttgtcaaaatgtgag 20344161  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 454  Q
    |||||||| |  ||||| || ||||||||    
T  20344160 ttctggttaagtgaagtgagctttctggg 20344132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 26 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 20823731 - 20823378
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||||||     
T  20823731 tcagttgaacaaagttacaataaagaatagatatccacttccgcggattgatgatttgatggaccagttggtaggtgctaaagtttttagtaagattgac 20823632  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||  | || || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  20823631 ttgaggtcgggttaccatcaaattaaagtgaaagacgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctt 20823532  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || || ||||| || |||||||| ||    
T  20823531 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtgtttatagatgatatatt 20823432  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgca 379  Q
    ||| || || || |||||||| ||||| || || || ||||||||||| |||||    
T  20823431 gatctattcaaaaactgaagaggaacacgccgaacacctgaagattgtgttgca 20823378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 26 - 466
Target Start/End: Original strand, 28893032 - 28893472
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || |||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||     
T  28893032 tcagttgaacaaagttacaataaagaatagatatccacttccgcggattgatgacttgatggaccagttggtaggtgctaaagtttttagcaagattgac 28893131  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||  | || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  28893132 ttgaggtcgggttaccatcagattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctt 28893231  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || || || || || ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || || || || || |||||||| ||    
T  28893232 tcggtgttactaacgcgccgggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtatttatagatgatatatt 28893331  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactt-tatgctaaattgtctaagtgtga 424  Q
    ||| || || || |||||||| ||||| || || || ||||||||||| |||||  | | ||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||    
T  28893332 gatctattctaaaactgaagaggaacacgccgaacacctgaagattgtgttgcagattttgaaagag-agaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcga 28893430  T
Q  425 attctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
     |||||||| |  ||||| |||||||| ||| |||| |||||    
T  28893431 gttctggttaagtgaagtgagttttctaggccatgtcatttc 28893472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 26 - 466
Target Start/End: Original strand, 28921858 - 28922298
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || |||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||     
T  28921858 tcagttgaacaaagttacaataaagaatagatatccacttccgcggattgatgacttgatggaccagttggtaggtgctaaagtttttagcaagattgac 28921957  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||  | || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  28921958 ttgaggtcgggttaccatcagattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctt 28922057  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || || || || || ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || || || || || |||||||| ||    
T  28922058 tcggtgttactaacgcgccgggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtatttatagatgatatatt 28922157  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactt-tatgctaaattgtctaagtgtga 424  Q
    ||| || || || |||||||| ||||| || || || ||||||||||| |||||  | | ||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||    
T  28922158 gatctattctaaaactgaagaggaacacgccgaacacctgaagattgtgttgcagattttgaaagag-agaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcga 28922256  T
Q  425 attctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
     |||||||| |  ||||| |||||||| ||| |||| |||||    
T  28922257 gttctggttaagtgaagtgagttttctaggccatgtcatttc 28922298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 26 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 25850353 - 25849925
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||| |||| || |||||||||    
T  25850353 tcagttgaacaaggttacgataaagaacagatatccgcttccgagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaaaatttttagtaagattgat 25850254  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  25850253 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 25850154  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || || || ||||| || ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| ||| |||||   || || || |||||||| |||||||| ||    
T  25850153 tcggtgttactaacgcgcctggtgtatttatggagtacatgaaccaaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtagtgttcattgatgatatctt 25850054  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    |||||| || |||| |||||| || ||||| ||||||||||  || || |||||||||| ||| || ||||   | ||||| || ||||| || |||||     
T  25850053 gatttattcgaagaatgaagaggagcatgcagagcatctgagaatagtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgcaaagttgtcgaaatgtgag 25849954  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 454  Q
    |||||||| |  ||||| |||||||||||    
T  25849953 ttctggttaagtgaagtgagttttctggg 25849925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 30 - 415
Target Start/End: Original strand, 17267428 - 17267813
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 129  Q
    |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  17267428 ttgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggaccagctagtgggtgcaaaggtgttcagtaagattgacttga 17267527  T
Q  130 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 229  Q
    | ||| | || || || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || || || || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  17267528 ggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcgg 17267627  T
Q  230 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    ||| || || || || || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||||  ||| || || || || || ||||||||| |||||    
T  17267628 tgttactaacgcgcccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcctttctggataaatttgtggtggtatttattgatgatattctgatt 17267727  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtc 415  Q
    || || |||||||||||||| ||||| || || ||||  ||||| |||||||||| |||||| |||||  | ||||| ||||||||    
T  17267728 tattcaaagactgaagaagagcatgcagaacacctgagaattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaaattgtc 17267813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 26 - 454
Target Start/End: Original strand, 14885081 - 14885509
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  ||||||| |||||||||    
T  14885081 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgccaagattttcagtaagattgat 14885180  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  14885181 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtaaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 14885280  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||   || || || || || || |||||||| ||    
T  14885281 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgtggtggtatttattgatgatatctt 14885380  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
     ||||| ||||||| ||| || ||||| || ||||||||||  || || |||||||||| ||| || ||||   | |||||||| ||||| || |||||     
T  14885381 aatttattccaagaatgaggaggaacacgcagagcatctgagaatagtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttgtcaaaatgtgag 14885480  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 454  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||    
T  14885481 ttctggttaaatgaagtaagtttcctggg 14885509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 26 - 454
Target Start/End: Original strand, 37541471 - 37541899
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || || ||||| ||  |||| || |||||||||    
T  37541471 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcaattggttggtgctaagatttttagtaagattgat 37541570  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  37541571 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 37541670  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| ||| |||||   || || || || || || ||||||||| |    
T  37541671 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggaatacatgaatcgaattttccatgcctttctggataagtttgttgtggtatttattgatgatattct 37541770  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
     || || ||||||| ||| || ||||| || ||||||||||  || || |||||||||| ||| || ||||   | |||||||| || || || |||||     
T  37541771 aatctattccaagaatgaggaggaacacgcagagcatctgagaatagtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgag 37541870  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 454  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||    
T  37541871 ttctggttaaatgaagtaagttttctggg 37541899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 26 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 22464229 - 22463876
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || |||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||||||     
T  22464229 tcagttgaacaaagttacaataaagaatagatatccacttccgcggattgatgacttgatggaccagttggtaggtgctaaagtttttagtaagattgac 22464130  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
     |||| ||  | || || || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || || || || |||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  22464129 ctgaggtcgggttaccatcaaattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctt 22464030  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || || || |||||  |||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || || || || || |||||||||||    
T  22464029 tcggtgttactaacgcgcctggtatgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtatttatagatgatatttt 22463930  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgca 379  Q
    |||||| || || |||||||| || ||||| || ||  |||||||||| |||||    
T  22463929 gatttattctaaaactgaagaggagcatgcagaacacttgaagattgtgttgca 22463876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 26 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 20778191 - 20777889
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||| | ||||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||||||     
T  20778191 tcagttgaacaaggttacaataaagaataggtatccactcccgcggattgacgacttgatggaccagttggtaggtgctaaagtttttagtaagattgac 20778092  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||  | || || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| || ||||| || || ||||| ||||| |||||||    
T  20778091 ttgaggtcgggttaccatcaaattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttagaacacgatatggacattacgaatacaaagtgatgcctt 20777992  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || || || ||||| || || |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || || ||||| || |||||||||||    
T  20777991 tcggtgttactaacgcgcctggtgtattcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtgtttatagatgatatttt 20777892  T
Q  326 gat 328  Q
    |||    
T  20777891 gat 20777889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 26 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 22504957 - 22504529
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||  ||||||||||| |||||| ||||||| || ||||| |   ||||||| ||||||||     
T  22504957 tcagttgaacaaggttacgataaagaacaggtatccgcttcatagaattgatgacttgatgaatcagttggttggtgctaggattttcagtaagattgac 22504858  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||  || || || || || |||||||| || || || ||||| |||||||    
T  22504857 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagatggcctttaggacacgatatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 22504758  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || || |  ||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||   || || || ||||| || |||||||| ||    
T  22504757 tcggtgttactaacgagcctggtgtgtttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatctt 22504658  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
     ||||| || ||||  ||||| || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||| | |||||||||||   | ||||| || ||||| || |||||     
T  22504657 aatttattctaagaacgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagttttgaaagagaagaggttgtatgcaaagttgtcaaaatgtgag 22504558  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 454  Q
    |||||||| |  ||||| |||||||||||    
T  22504557 ttctggttaagtgaagtgagttttctggg 22504529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 27 - 448
Target Start/End: Original strand, 21935279 - 21935700
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || || || ||||||||||    
T  21935279 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 21935378  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  ||||||||    || || || ||| ||||  | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  21935379 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcagaagatatatccaaaactgcgttccgaacaaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 21935478  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     || ||  | |||||||| || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || || || || |||||||| ||||||||||||    
T  21935479 tggagtatctaatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 21935578  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
     | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||  |  | | ||| || |||||||||||||| |    
T  21935579 gtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagt 21935678  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttt 448  Q
    | |||||||||||||| |||||    
T  21935679 tttggttgaaggaagtgagttt 21935700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 27 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 23507961 - 23507540
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || || || ||||||||||    
T  23507961 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 23507862  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  ||||||||    || || || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  23507861 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 23507762  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     || ||  | |||||||| || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || || || || |||||||| ||||||||||||    
T  23507761 tggagtatctaatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 23507662  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
     | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||  |    | ||| || |||||||||||||| |    
T  23507661 gtgtattcgaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtattgaaagagaaccagtgatgtgcaaagttgtctaagtgtgagt 23507562  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttt 448  Q
    | |||||||||||||| |||||    
T  23507561 tttggttgaaggaagtgagttt 23507540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 24583487 - 24583066
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||| | || || || ||||||||||    
T  24583487 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 24583388  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||| || |   |||||||    || || || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  24583387 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcaaaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 24583288  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     || ||  | ||||| || || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || || || || |||||||| ||||||||||||    
T  24583287 tggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 24583188  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
     | || || |||  ||| ||||| |||||||||||| |||  ||||| |||||||| | |||||||||  |  | |  || || |||||||||||||| |    
T  24583187 gtgtattcaaagtttgaggaagagcatgctgagcatttgagaattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgcgccaagttgtctaagtgtgagt 24583088  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttt 448  Q
    | |||||||||||||| |||||    
T  24583087 tttggttgaaggaagtgagttt 24583066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 163 - 466
Target Start/End: Original strand, 28914640 - 28914943
Alignment:
Q  163 aagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagta 262  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| ||||||||    
T  28914640 aagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgccgggtgtgttcatggagta 28914739  T
Q  263 tatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcat 362  Q
    |||||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || || || || || |||||||| ||||| || || || |||||||| ||||| || || ||     
T  28914740 tatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtatttatagatgatatattgatctattctaaaactgaagaggaacacgccgaacac 28914839  T
Q  363 ctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactt-tatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgtt 461  Q
    ||||||||||| |||||  | | ||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |  ||||| |||||||| ||| ||||     
T  28914840 ctgaagattgtgttgcagattttgaaagag-agaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaagtgagttttctaggccatgtc 28914938  T
Q  462 atttc 466  Q
    |||||    
T  28914939 atttc 28914943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 163 - 466
Target Start/End: Original strand, 28929908 - 28930211
Alignment:
Q  163 aagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagta 262  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| ||||||||    
T  28929908 aagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgccgggtgtgttcatggagta 28930007  T
Q  263 tatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcat 362  Q
    |||||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || || || || || |||||||| ||||| || || || |||||||| ||||| || || ||     
T  28930008 tatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtatttatagatgatatattgatctattctaaaactgaagaggaacacgccgaacac 28930107  T
Q  363 ctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactt-tatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgtt 461  Q
    ||||||||||| |||||  | | ||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |  ||||| |||||||| ||| ||||     
T  28930108 ctgaagattgtgttgcagattttgaaagag-agaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaagtgagttttctaggccatgtc 28930206  T
Q  462 atttc 466  Q
    |||||    
T  28930207 atttc 28930211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 48 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 21409408 - 21409008
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 147  Q
    |||||||| ||||||| |||||| || || |||||||||||||||||  |||||||    || ||||| || ||||| || ||||   | |||||||| |    
T  21409408 aagaatagatatccacctccgaggatcgacgatttgatggatcagttgatgggtgcgcgtgtgttcagtaaaattgacttaagatggggctatcaccata 21409309  T
Q  148 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 247  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||||||| || || || || | ||| || ||  | ||||||   || |||||||||||||| |  ||||| || ||    
T  21409308 tcaaagtgaaagatgaggatattcagaagacggcctttaggacacattacggacataacgaatattctgtgatgcctttcggtgttattaatgcgccagg 21409209  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
    ||| |||||||| ||||||||| | || || ||| | | | | ||||| || || |||||||| || ||||||||| |||  ||||| ||| |||| ||     
T  21409208 agtatttatggaatatatgaattgtatttttcatacttatctagatcgttttgttgttgtgtttatagatgatattctgaaatactctaagtctgaggag 21409109  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 447  Q
    |||||||| |||||| |||  ||||| |||||||||  ||   |||||||  | ||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  21409108 gaacatgccgagcatttgagaattgttttgcaagtgctga---agaagaatttatatgccaagttatcgaagtgcgaattctggttgaacgaagtgagtt 21409012  T
Q  448 ttct 451  Q
    ||||    
T  21409011 ttct 21409008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 168 - 466
Target Start/End: Original strand, 21679010 - 21679308
Alignment:
Q  168 atgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatga 267  Q
    ||||||||||| || || || || || |||||||| || | |||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  21679010 atgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacggatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatga 21679109  T
Q  268 atcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaa 367  Q
    |  | || || ||||  |   | |||  ||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |  ||||| ||||| ||||| || |||| ||     
T  21679110 acagaatttttcatgtttacctagataaatttgtggttgtattcattgatgacattttgatctattcgagaactgaggaagagcatgcagaacatccgag 21679209  T
Q  368 gattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||  | ||||| |||||||| ||||| || || ||||| |  ||||| |||||||| ||| || |||||||    
T  21679210 gattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcaaagtgcgagttttggttaagtgaagtgagttttcttggccatattatttc 21679308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 341 - 464
Target Start/End: Original strand, 24618700 - 24618823
Alignment:
Q  341 tgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaa 440  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||   | ||||| || ||||| || || || |||||||| |  |||    
T  24618700 tgaagaagagcatgcagagcatctgaaaattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaggttgtatgccaagttgtccaaatgcgagttctggttaagtgaa 24618799  T
Q  441 gtaagttttctgggcgatgttatt 464  Q
    ||||||||||||||| || |||||    
T  24618800 gtaagttttctgggccatattatt 24618823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 341 - 464
Target Start/End: Original strand, 24714931 - 24715054
Alignment:
Q  341 tgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaa 440  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||   | ||||| || ||||| || || || |||||||| |  |||    
T  24714931 tgaagaagagcatgcagagcatctgaaaattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaggttgtatgccaagttgtccaaatgcgagttctggttaagtgaa 24715030  T
Q  441 gtaagttttctgggcgatgttatt 464  Q
    ||||||||||||||| || |||||    
T  24715031 gtaagttttctgggccatattatt 24715054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 341 - 464
Target Start/End: Original strand, 24747959 - 24748082
Alignment:
Q  341 tgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaa 440  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||   | ||||| || ||||| || || || |||||||| |  |||    
T  24747959 tgaagaagagcatgcagagcatctgaaaattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaggttgtatgccaagttgtccaaatgcgagttctggttaagtgaa 24748058  T
Q  441 gtaagttttctgggcgatgttatt 464  Q
    ||||||||||||||| || |||||    
T  24748059 gtaagttttctgggccatattatt 24748082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 163
Target Start/End: Original strand, 21676946 - 21677061
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 147  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||| || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| ||| | || || ||||    
T  21676946 aagaatagatatccgcttccgagaattgacgacctgatggatcagttggttggtgcaaagatttttagtaaaattgacttgaggtcaggttaccatcaga 21677045  T
Q  148 ttaaagtgaaagatga 163  Q
    | || |||||||||||    
T  21677046 tcaaggtgaaagatga 21677061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 404 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 23505144 - 23505100
Alignment:
Q  404 tgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttt 448  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  23505144 tgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagttt 23505100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 373; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 16553 - 16113
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16553 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 16454  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16453 ttgaggtcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagttttcagaacgcgttgtggtcactatgaatataaagttatgcctt 16354  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||    
T  16353 tccgtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttattgacgatatttt 16254  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  16253 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaaatttatgctaacttgtctaagtgtgaa 16154  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  16153 ttctggttgaaagaattaagttttcttggccatgttatttc 16113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 2816 - 2375
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |   ||||| |||||||||||||    
T  2816 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggattagttagtgggtgaacgtgtttttagcaagattgatt 2717  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2716 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagttttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 2617  T
Q  227 -cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  2616 ccggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgtgtttatcgacgatatttt 2517  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaatt-gtctaagtgtga 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||    
T  2516 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaataacctttatgctaacttggtctaagtgtga 2417  T
Q  425 attctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  2416 attctggttgaaagaattaagttttcttggccatgttatttc 2375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 372; Significance: 0; HSPs: 57)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 465
Target Start/End: Original strand, 15267 - 15706
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15267 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgaggatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 15366  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15367 ttgaggtcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 15466  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  15467 tcggtgtaaacaatgcgcctagagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcggttcgtagttgcgtttatcgacgatatttt 15566  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15567 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgatgattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 15666  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttattt 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  15667 ttctggttgaaggaagtaagttttcttggccatgttattt 15706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 14956906 - 14956467
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  14956906 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 14956807  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14956806 tgaggtcaggttatcaccaaattaaagtaaaagatgaaaatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 14956707  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14956706 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 14956607  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14956606 atttactccaagactgaagaagaagatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaat 14956507  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  14956506 tctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgttatttc 14956467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 11551020 - 11551459
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  11551020 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 11551119  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11551120 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 11551219  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11551220 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 11551319  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11551320 atttattccaagactgaagaagaacatgttgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaat 11551419  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  11551420 tctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgttatttc 11551459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 10873042 - 10872603
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  10873042 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 10872943  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10872942 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 10872843  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||    
T  10872842 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttctggatcggtttgtggtcgtgtttatcgacgatattttg 10872743  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10872742 atctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatcctaaattgtctaagtgtgaat 10872643  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  10872642 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 10872603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 11235131 - 11235570
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  11235131 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 11235230  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11235231 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacacgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 11235330  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||    
T  11235331 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 11235430  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11235431 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 11235530  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  11235531 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 11235570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 12689854 - 12689415
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  12689854 cagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 12689755  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12689754 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctctgagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 12689655  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12689654 tggtgttaccaatgcacctagagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtattcatcgatgatattttg 12689555  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  12689554 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagt 12689455  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  12689454 tctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgttatttc 12689415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 14334748 - 14334309
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  14334748 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 14334649  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14334648 tgaggtcaggttatcaccagattaaggtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcaaaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 14334549  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||    
T  14334548 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 14334449  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14334448 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaat 14334349  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  14334348 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 14334309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 15158975 - 15159414
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  15158975 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 15159074  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15159075 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 15159174  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||    
T  15159175 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 15159274  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15159275 atttactccaagactgacgaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 15159374  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  15159375 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 15159414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 44789269 - 44789708
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  44789269 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 44789368  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44789369 tgagatcaggttgtcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 44789468  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||| ||||| |||||||||    
T  44789469 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttatgtttatcgacgatattttg 44789568  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44789569 atctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 44789668  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| || || ||||| || ||| ||||||||||    
T  44789669 tctggttgaaagaggtgagtttccttggccatgttatttc 44789708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 8709957 - 8709518
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  8709957 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 8709858  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8709857 tgaggtcaggatatcaccagattaaggtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 8709758  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||||    
T  8709757 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttatggttgtgtttatcgacgatattttg 8709658  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8709657 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 8709558  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  8709557 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 8709518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 18180097 - 18179658
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  18180097 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttcagagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 18179998  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  18179997 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggccactacgaatataaagttatgccttt 18179898  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||  ||||||||    
T  18179897 cggtgtgaccaatgcacctagagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggattggttcgtaattgtgtttatcgaccatattttg 18179798  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaa-gaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  18179797 atttactccaagactgaagaagaacatgccgagcatctcaagattgtcttacaagtgttg-aagagaangacactttatgccaaattgtctaagtatgaa 18179699  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||| ||||||||||    
T  18179698 ttctggttgaaagaggtgagttttcttggccatgttatttc 18179658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 27 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 13688393 - 13688023
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  13688393 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 13688294  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13688293 tgaggtcaggttatcactagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtccctatgaatataaagttatgccttt 13688194  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||    
T  13688193 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 13688094  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaa 397  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  13688093 atttactccaagactgacgaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaa 13688023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 26 - 466
Target Start/End: Original strand, 15146801 - 15147242
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||    
T  15146801 tcagttgaataaagtaactatgaagaataggtatccacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagatagat 15146900  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||| || || || ||||||||||||||||    
T  15146901 ttgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttaaaacgcgatatggacattacgagtataaagttatgcctt 15147000  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgca-tttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattt 324  Q
    | ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||    
T  15147001 ttggtgttacaaatgcacctggtgtgtttatggagtacatgaatcgcattttccatgcattttttggatcggttcgtggtttttttcattgatgatattt 15147100  T
Q  325 tgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtga 424  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15147101 ttatctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgcaaaattgtctaagtgtga 15147200  T
Q  425 attctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
     ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15147201 gttctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttc 15147242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 27 - 373
Target Start/End: Original strand, 18588089 - 18588435
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  18588089 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 18588188  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18588189 tgaggtcaggatatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcactatgaaaataaagttatgccttt 18588288  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||    
T  18588289 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaattgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 18588388  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgt 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18588389 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgt 18588435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 30 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 14042044 - 14041623
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 129  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||    
T  14042044 ttgaacaaagtaacgataaagaataggtgtccacttccaagaattgagaacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgacttga 14041945  T
Q  130 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 229  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||    
T  14041944 gatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatggagaagacagcttttagaacgcgttatggacattatgagtacaaagtgatgcctttcgg 14041845  T
Q  230 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    ||| || ||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  14041844 tgttacaaatgcacctgatgtgtttatggagtacatgaatcacatttttcatgcatttttggatcgtttcgtagttattttcattgatgatattttgatt 14041745  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattct 429  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  14041744 tactccaagactgaggaagaacatgatgagcatttgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaataaactttatgctaaattatcaaagtgtgaattct 14041645  T
Q  430 ggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
     |||||| || || ||||||||    
T  14041644 agttgaaagaggtgagttttct 14041623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 30 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 14352074 - 14351653
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 129  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||    
T  14352074 ttgaacaaagtaacgataaagaataggtgtccacttccaagaattgagaacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgacttga 14351975  T
Q  130 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 229  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||    
T  14351974 gatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatggagaagacagcttttagaacgcgttatggacattatgagtacaaagtgatgcctttcgg 14351875  T
Q  230 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    ||| || ||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  14351874 tgttacaaatgcacctgatgtgtttatggagtacatgaatcacatttttcatgcatttttggatcgtttcgtagttattttcattgatgatattttgatt 14351775  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattct 429  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  14351774 tactccaagactgaggaagaacatgatgagcatttgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaataaactttatgctaaattatcaaagtgtgaattct 14351675  T
Q  430 ggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
     |||||| || || ||||||||    
T  14351674 agttgaaagaggtgagttttct 14351653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 26 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 9590721 - 9590479
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9590721 tcagttgaacaaggtaactatcaagtataggtatccacttctgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaatttttcagcaagattgat 9590622  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9590621 ttgaggtcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 9590522  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaa 268  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9590521 ttggtgtgaccaatgcacttggagtgtttatggagtatatgaa 9590479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 48813170 - 48813608
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||| || ||||| || ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||   || || |||||||||||||    
T  48813170 cagttgaataaagtaacgataaagtattggtatccacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggcgcacgtgtgtttagcaagattgatt 48813269  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| | || || || |||||||| || || ||||||  ||| ||||||||    
T  48813270 tgagatcaggttatcaccaaattaaagtgaaagacgaggatatgcagaagacaacctttaggacacgttatggacattacgaatattcagtgatgccttt 48813369  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    |||||| || ||||| ||  | |||||||||||||| |||||| | || || ||||| | ||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  48813370 cggtgttactaatgcgccaagtgtgtttatggagtacatgaattgtatttttcatgcttatttagatcgcttcgtggttgtgttcattgatgatattttg 48813469  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    || ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||  | |||||  ||||||| ||||||||||    
T  48813470 atatactctaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgtgttgcaagtgctgaaggagaagaagttatatgc-caattgtcaaagtgtgaat 48813568  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||| ||||||||||    
T  48813569 tctggttgaatgaggtgagttttcttggccatgttatttc 48813608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 48 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 15626856 - 15626438
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 147  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  15626856 aagaataggtatccacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgatttgagatcgggctatcaccaga 15626757  T
Q  148 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 247  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||| || || |||||  | || || ||||||   || ||||||||| |||| || |||||||| ||    
T  15626756 ttaaactgaaagatgaagatacgaagaagacggcttttaggacacgttacagacattacgaatattcggtgatgcctttcagtgttactaatgcaccagg 15626657  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     || ||||||||||| ||||| || || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||  ||| ||||||||    
T  15626656 tgtatttatggagtacatgaaccgtatttttcatgcttatttagatcgcttcgtggttgcgttcatcgatgatattttaatatactataagtctgaagaa 15626557  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 447  Q
    |||||||  ||| || |||||||||| |||||||||  ||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||    
T  15626556 gaacatgtcgagtatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgctaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagtt 15626457  T
Q  448 ttctgggcgatgttatttc 466  Q
    | || ||| || |||||||    
T  15626456 tccttggccatattatttc 15626438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 26 - 451
Target Start/End: Original strand, 15100498 - 15100923
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    || |||||||| ||||||    
T  15100498 tcagttgaacaaggttacgataaagaataggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgctcgtgtattcagcaaaattgat 15100597  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | || || || || |||||||| ||  ||||||| || |||||||    
T  15100598 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacgacctttaggacacgatatggtcattacaaatataaggtgatgcctt 15100697  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| |   |||||  |||||| |||||||| || ||||| || ||    
T  15100698 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattcgtggttgtgtttattgatgacatctt 15100797  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||  | ||||| || ||||| || |||||     
T  15100798 gatttattctaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagatcgtcttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgag 15100897  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||    
T  15100898 ttctggttaagtgaagtaagttttct 15100923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 48 - 451
Target Start/End: Original strand, 12204717 - 12205120
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||||||| ||| | || || ||||    
T  12204717 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgcatgcgtgttcagcaaaattgatttgaggtcaggttaccatcaga 12204816  T
Q  148 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 247  Q
    |||| |||||  |||||||||||||||| || || || || |  || ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  12204817 ttaaggtgaagtatgaagatatgcagaaaacggcctttaggatacgatatggacattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 12204916  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     |||||||||||||| |||||| | || |||||||| | | |||||  ||  || || ||||| || |||||||| || ||||| |  ||||||||||||    
T  12204917 tgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatctggataaatctgtggtcgtgtttattgatgatatcttaatttattttaagactgaagaa 12205016  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 447  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||  | ||||| || ||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||    
T  12205017 gagcatgcagagcatctgaaaattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagtt 12205116  T
Q  448 ttct 451  Q
    ||||    
T  12205117 ttct 12205120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 48 - 455
Target Start/End: Original strand, 16948389 - 16948796
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 147  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| | || || || |    
T  16948389 aagaataggtatccactcccgagaattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcagcaagattgacttgaggtcaggttaccatcaaa 16948488  T
Q  148 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 247  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  16948489 ttaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgaataaaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 16948588  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || |||||||| || ||||||||| ||||||| || || |  |||||     
T  16948589 cgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattctgatttattctaaaatcgaagag 16948688  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 447  Q
    || || || ||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||  | ||||||||  |||| |||||||| || ||||| |  ||||| ||||    
T  16948689 gagcacgcagagcatctgaagattgtgttgcaagtcttgaaagaaaagaagttgtatgctaagctgtcaaagtgtgagttttggttaagtgaagtgagtt 16948788  T
Q  448 ttctgggc 455  Q
    ||||||||    
T  16948789 ttctgggc 16948796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 48 - 466
Target Start/End: Original strand, 14262162 - 14262579
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 147  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||| ||| | || || || |    
T  14262162 aagaataggtatccacttccgaggtttgatgatttaatggatcagttagtgggtgctcgtgtgttcagcaagattgatttgaggtcaggttaccatcata 14262261  T
Q  148 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 247  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||  || || || || |  |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  14262262 ttaaggtgaaggatgaggatatgcagaagatggcctttaggacacaatatggtcattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 14262361  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     ||||||||||||||||||||| | || |||||||| | | |||||  ||| || |||||||| || ||||| || || ||||| || | ||||||||||    
T  14262362 tgtgtttatggagtatatgaatagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattcta-gactgaagaa 14262460  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 447  Q
    || ||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||  | ||||| || ||||| || |||||||| ||||| |  ||||||||||    
T  14262461 gagcatgcagagcatctgaagattatgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattttggttaagtgaagtaagtt 14262560  T
Q  448 ttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||| ||| || |||||||    
T  14262561 ttcttggccatattatttc 14262579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 13675806 - 13675399
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  13675806 tcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacataatggatcagttagtgggtgcaaaggttttcaacaagattgac 13675707  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| || || || || || ||||| || || ||||| || || |||||||    
T  13675706 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatggagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctt 13675607  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |   |||||  ||| || ||||| || || ||||| ||| |    
T  13675606 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaatttgtggttgtatttattgatgacattct 13675507  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||| ||  | |||||||| ||||| ||||||||     
T  13675506 gatttattcaaagactgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtattgaatgagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgag 13675407  T
Q  426 ttctggtt 433  Q
    ||||||||    
T  13675406 ttctggtt 13675399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 26 - 454
Target Start/End: Original strand, 13966563 - 13966991
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||| |||| || |||||||||    
T  13966563 tcagttgaacaaagtcacgataaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaaaatttttagtaagattgat 13966662  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||  | || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  13966663 ttgagatctggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacgacctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 13966762  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||| |||||   || || || ||||| || |||||||| ||    
T  13966763 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgtttatggagtacatgaaccgaatcttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatctt 13966862  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
     ||||| ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||   | |||||||| ||||| || |||||     
T  13966863 aatttattccaagaatgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtcttgcaagttttgaaagagaagaggttgtatgctaagttgtcaaaatgtgag 13966962  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 454  Q
    |||||||| |  ||||| || ||||||||    
T  13966963 ttctggttaagtgaagtgagctttctggg 13966991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 30 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 14140029 - 14139611
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 129  Q
    |||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| | ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||    
T  14140029 ttgaacaaagttacaattaagaataggtatccacttccgaggattgatgacttgatggaccagctggtgggtgcaaaggtttttagtaatattgacttga 14139930  T
Q  130 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 229  Q
    | ||| | || || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || || || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  14139929 ggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcgg 14139830  T
Q  230 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    ||| || || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||||  |||||| || || || || |||||||||||||||    
T  14139829 tgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatattttgatt 14139730  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattct 429  Q
    || || |||||||||||||| ||||| || |||||||  ||||| |||||||| | |||||| |||||  | ||||| |||||||| || ||||| || |    
T  14139729 tattctaagactgaagaagagcatgcagaacatctgagaattgtgttgcaagtattgaaagaaaagaagttgtatgccaaattgtcaaaatgtgagtttt 14139630  T
Q  430 ggttgaaggaagtaagttt 448  Q
    || | |  |||||||||||    
T  14139629 ggctaagtgaagtaagttt 14139611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 56 - 454
Target Start/End: Original strand, 16070222 - 16070618
Alignment:
Q  56 gtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtg 155  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    ||  | || || ||||||||||| ||| | || || |||||||| |||    
T  16070222 gtatccacttccgagaattgatgacttgatggaccagttagtgggtgctcgtgtgcttagtaaaattgatttgaggtcaggttaccatcagattaaggtg 16070321  T
Q  156 aaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgttta 255  Q
    || ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||  ||||||||    
T  16070322 aaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcct--agtgttta 16070419  T
Q  256 tggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgc 355  Q
    |||||||||||||  | || |||||||  | | |||||  ||| || |||||||| || ||||||||| | ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  16070420 tggagtatatgaacagaattttccatgtctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattctcatttattctaagactgaagaagagcatgc 16070519  T
Q  356 tgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctggg 454  Q
     ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||  | ||||| || ||||| || ||||| |||||||| |  |||||||||||||||||    
T  16070520 agagtatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgagttctggttaagtgaagtaagttttctggg 16070618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 48 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 19149541 - 19149125
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 147  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||    | || || || ||||||||||| ||| | || |   |||    
T  19149541 aagaataggtatccacttccaagaattgacgatttaatggatcggttagtgggtgcacgtatgtttagtaaaattgatttgaggtcaggttaccta-aga 19149443  T
Q  148 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 247  Q
    |||| ||||| ||||| ||| |||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  19149442 ttaaggtgaaggatgaggat-tgcagaagacggcctttaggacacgttacggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 19149344  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     ||||||||||||||||||||| | || |||||||| | | |||||  ||| || |||||||| || ||||| || || ||||| || |||||||| |||    
T  19149343 tgtgtttatggagtatatgaattgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagactgatgaa 19149244  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 447  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||  | | ||  || ||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||    
T  19149243 gagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtgtgtcaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagtt 19149144  T
Q  448 ttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||| ||| || |||||||    
T  19149143 ttcttggccatattatttc 19149125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 12458994 - 12458566
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||  | |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||    
T  12458994 tcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatccgcttccgaggattgatgacctaatggatcagttagtaggtgcgaaagtgttcagtaagatcgat 12458895  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||  | || || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  12458894 ttgaggtctggttaccatcagataaaggtgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttagaacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctt 12458795  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||| ||||    ||||||||||| ||| |||||   ||||| |||||||| || |||||||||||    
T  12458794 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatttgaacataatcttccatgcttttctggataatttcgttgttgtgtttattgatgatatttt 12458695  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
     || || ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||| | |||||| |||||  | ||||| || ||||| || |||||     
T  12458694 aatctattccaagaatgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagttttgaaagaaaagaagttgtatgcaaagttgtcaaaatgtgag 12458595  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 454  Q
    |||||||| |  ||||| || ||||||||    
T  12458594 ttctggttaagtgaagtgagatttctggg 12458566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 13023711 - 13023283
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || || || |||||||||||     
T  13023711 tcagttgaacaaagttacgataaagaatagatatccacttccgagaattgatgatttgatggatcaattggtgggtgcgaaggtgtttagcaagattgac 13023612  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||  | || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||| || ||||| || || |||||||    
T  13023611 ttgaggtctggttaccatcagataaaggtgaatgatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 13023512  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || |||||| | |||||||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || || ||||| || ||||||| |||    
T  13023511 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatgtattatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtgtttattgatgataattt 13023412  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||| || |||||||  ||||| |||||||| | |||||| |||||  | ||||| || ||||| || |||||     
T  13023411 gatttattctaagactgaagaggagcatgcagaacatctgagaattgtattgcaagttttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgag 13023312  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 454  Q
    || ||||| |  ||||| |||||||||||    
T  13023311 ttgtggttaagtgaagtgagttttctggg 13023283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 454
Target Start/End: Original strand, 26092693 - 26093121
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  |||| || |||||||||    
T  26092693 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatttttagtaagattgat 26092792  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  26092793 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 26092892  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||   || || || ||||| || |||||||||||    
T  26092893 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatttt 26092992  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
     || || ||||||| ||| || || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| ||| || ||||   | |||||||| || || || |||||     
T  26092993 aatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgag 26093092  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 454  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||    
T  26093093 ttctggttaaatgaagtaagttttctggg 26093121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 48 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 20748940 - 20748524
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 147  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||    | || || || ||||||||||| ||| | || |   |||    
T  20748940 aagaataggtatccacttccaagaattgacgatttaatggatcggttagtgggtgcacgtatgtttagtaaaattgatttgaggtcaggttaccta-aga 20748842  T
Q  148 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 247  Q
    |||| ||||| ||||| ||| |||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  20748841 ttaaggtgaaggatgaggat-tgcagaagacggcctttaggacacgttacggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 20748743  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     ||||||||||||||||||||  | || |||||||| | | |||||  ||| || |||||||| || ||||| || || ||||| || |||||||| |||    
T  20748742 tgtgtttatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagactgatgaa 20748643  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 447  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||  | | ||  || ||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||    
T  20748642 gagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtgtgtcaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagtt 20748543  T
Q  448 ttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||| ||| || |||||||    
T  20748542 ttcttggccatattatttc 20748524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 26 - 451
Target Start/End: Original strand, 11386324 - 11386749
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||||||  |||| || ||||||||     
T  11386324 tcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccgcttccgaggattgacgacttgatggatcagttggttggtgcaaagatttttagtaagattgac 11386423  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | || || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |  || || || |||| |||||| || ||||| || || |||||||    
T  11386424 ttgaggtcaggttaccatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggactttaggacacgttgtggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 11386523  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||| || || || ||||||||||||| |||  | || || ||||| ||| ||||| ||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  11386524 tcggtgttactaatgcgccaggtgtatttatggagtataagaacagaatttttcatgcttttctggatagattcgtggtggtgtttattgatgatatttt 11386623  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
     ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| || || ||   ||||||||| ||  | |||||||| ||||| || ||||||    
T  11386624 aatttattctaagactgaagaagagcatgccgagcatctgaggattgtattacaggttctgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaaatgtgaa 11386723  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
    |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  11386724 ttctggttaagtgaagtgagttttct 11386749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 30 - 391
Target Start/End: Original strand, 23503769 - 23504130
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 129  Q
    |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  23503769 ttgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggaccagctagtgggtgcaaaggtgttcagtaagattgacttga 23503868  T
Q  130 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 229  Q
    | ||| | || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || || || || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  23503869 ggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcgg 23503968  T
Q  230 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    ||| || || || || || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||||  |||||| || || || || ||||||||| |||||    
T  23503969 tgttactaacgcgcccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatattctgatt 23504068  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaaga 391  Q
    || || |||||||||||||| ||||| || |||||||  ||||| |||||||| | ||||||    
T  23504069 tattcgaagactgaagaagagcatgcagaacatctgagaattgtgttgcaagttttgaaaga 23504130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 26 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 49154655 - 49154227
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  | || || |||||||||    
T  49154655 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatatttagtaagattgat 49154556  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  49154555 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 49154456  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||| ||| ||||| || || |||||||| ||| |||||   || || || ||||| || |||||||||||    
T  49154455 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggggtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatttt 49154356  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
     || || ||||||| ||| || || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| ||| || ||||   | |||||||| || || || |||||     
T  49154355 aatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgag 49154256  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 454  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||    
T  49154255 ttctggttaaatgaagtaagttttctggg 49154227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 26 - 454
Target Start/End: Original strand, 26116485 - 26116913
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  ||||||| |||||||||    
T  26116485 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagattttcagtaagattgat 26116584  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || || || || | ||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  26116585 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacattatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 26116684  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || || || ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||   ||  | || ||||| || || ||||||||    
T  26116685 tcggtgttactaacgcgcctggtgtttttatggagtacatgaatcgaatcttccatgcttttctggataagtttcttgtggtgtttattgacgatatttt 26116784  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
     || || ||||||| ||| || || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| ||| || ||||   | ||||| || ||||| || |||||     
T  26116785 aatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgcaaagttgtcgaaatgtgag 26116884  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 454  Q
    |||||||| |  ||||| || ||||||||    
T  26116885 ttctggttaagtgaagtgagctttctggg 26116913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 303 - 466
Target Start/End: Original strand, 11770435 - 11770598
Alignment:
Q  303 gttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaacttt 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||  | |    
T  11770435 gttgtgttcatcgatgatattttgatatactccaagtctgagggagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagttat 11770534  T
Q  403 atgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  11770535 atgttaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttc 11770598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 26 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 15342785 - 15342360
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||| |||| ||| |||| |||||||||||||| || ||||||||  ||||||| ||||||||     
T  15342785 tcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatccgctttcgaggatttatgacttgatggatcagttggttggtgcaaagattttcagtaagattgac 15342686  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||  | || || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||| || || |||||||    
T  15342685 ttgaggtctggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 15342586  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | || |||||||  ||| |||||   || || ||||| ||||| || |||||  |    
T  15342585 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaactgaattttccatgtctttctggataagtttgtggttgtattcattgacgatatcct 15342486  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
     ||||| || |||||| |||| || ||||| || ||||||| |||||| ||||||||   ||||||||| ||  | |||||||| ||||| || ||||||    
T  15342485 aatttattctaagactaaagaggagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagtactgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaaatgtgaa 15342386  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
    |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  15342385 ttctggttaagtgaagtgagttttct 15342360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 26 - 454
Target Start/End: Original strand, 11301108 - 11301536
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  | || || |||||||||    
T  11301108 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacagatatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatatttagtaagattgat 11301207  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||  | || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  11301208 ttgaggtctggttaccatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 11301307  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||   || || || ||||| || |||||||| ||    
T  11301308 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatctt 11301407  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
     ||||| ||||||| ||| || || ||||| ||||||||||  || || |||||||||| ||| || ||||   | |||||||| ||||| || |||||     
T  11301408 aatttattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaatagtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttgtcaaaatgtgag 11301507  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 454  Q
     ||||||| || |||||||||||||||||    
T  11301508 atctggttaaatgaagtaagttttctggg 11301536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 30 - 391
Target Start/End: Original strand, 18051852 - 18052213
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 129  Q
    |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  18051852 ttgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggaccagctagtgggtgcaaaggtgttcagtaagattgacttga 18051951  T
Q  130 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 229  Q
    | ||| | || || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  18051952 ggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcgg 18052051  T
Q  230 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    ||| || || || || || || || ||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||||  |||||| || || || || ||||| ||| |||||    
T  18052052 tgttactaacgcgcccggtgtattcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgacattctgatt 18052151  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaaga 391  Q
    || || |||||||||||||| ||||| || |||||||  ||||| |||||||| | ||||||    
T  18052152 tattcgaagactgaagaagagcatgcagaacatctgagaattgtgttgcaagttttgaaaga 18052213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 26 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 19615029 - 19614589
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||| || ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||| || ||||||||  |||| || || |||||     
T  19615029 tcagttgaataaagttacgataaagaacagatatccgcttccgagaattgacgacctgatggatcagttggttggtgcaaagatttttagtaaaattgac 19614930  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | || || ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || || |||||||| || |||||||| || |||||||    
T  19614929 ttgaggtcaggttaccatcagatcaaggtgaaagatgaggacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctt 19614830  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | || || ||||| |   |||||  ||| || ||||| ||||| ||||| |||||    
T  19614829 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaacagaatttttcatgcttacctggataaatttgtggttgtattcattgatgacatttt 19614730  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    ||| || || |  ||||| ||||| ||||| || ||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||  | ||||| |||||||| ||||| ||     
T  19614729 gatctattcgagaactgaggaagagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcaaagtgcgag 19614630  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    || ||||| |  ||||| |||||||| ||| || |||||||    
T  19614629 ttttggttaagtgaagtgagttttcttggccatattatttc 19614589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 27 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 7826252 - 7825831
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || || || ||||||||||    
T  7826252 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 7826153  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  ||||||||    || || || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  7826152 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 7826053  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     || ||  | |||||||| || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || || || || |||||||| ||||||||||||    
T  7826052 tggagtatctaatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 7825953  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
     | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||  |  | | ||| || |||||||||||||| |    
T  7825952 gtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagt 7825853  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttt 448  Q
    | |||||||||||||| |||||    
T  7825852 tttggttgaaggaagtgagttt 7825831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 27 - 448
Target Start/End: Original strand, 27105692 - 27106113
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || || || ||||||||||    
T  27105692 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 27105791  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  ||||||||    || || || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  27105792 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 27105891  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     || ||  | |||||||| || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || || || || |||||||| ||||||||||||    
T  27105892 tggagtatctaatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 27105991  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
     | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||  |  | | ||| || |||||||||||||| |    
T  27105992 gtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagt 27106091  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttt 448  Q
    | |||||||||||||| |||||    
T  27106092 tttggttgaaggaagtgagttt 27106113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 27 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 27172633 - 27172212
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || || || ||||||||||    
T  27172633 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 27172534  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  ||||||||    || || || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  27172533 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 27172434  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     || ||  | |||||||| || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || || || || |||||||| ||||||||||||    
T  27172433 tggagtatctaatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 27172334  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
     | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||  |  | | ||| || |||||||||||||| |    
T  27172333 gtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagt 27172234  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttt 448  Q
    | |||||||||||||| |||||    
T  27172233 tttggttgaaggaagtgagttt 27172212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 26 - 451
Target Start/End: Original strand, 14284271 - 14284696
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| ||  | || ||||| |||||||| |||||||  ||||  || |||||||||||||| ||  |||||||  |||| || || || ||     
T  14284271 tcagttgaacaaagttgcgataaagaacaggtatccgcttccgaagattggcgacttgatggatcagttggtttgtgcaaagatttttagtaatatcgac 14284370  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| |   | || || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || || || || |||||| |||| || |||||||| || |||||||    
T  14284371 ttgaggtatggttaccatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttattgtcattacgaatataaggtgatgcctt 14284470  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||  | || || ||||| ||  |||||   || || ||||| ||||| ||||| |||||    
T  14284471 tcggtgttactaatgcgcctggcgtgttcatggagtatataaacaggatttttcatgctttcctggataagtttgtggttgtattcattgatgacatttt 14284570  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||| | || ||||||| |||| | |||||||| | |||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||     
T  14284571 gatttattctaagactgaagaggagcatacagaacatctgaggattatattgcaagtattgaaagagaagaagctgtatgctaagttgtcgaaatgtgag 14284670  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
    |||| ||| |  ||||| ||||||||    
T  14284671 ttctagttaagtgaagtgagttttct 14284696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 375 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 14213678 - 14213587
Alignment:
Q  375 ttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  14213678 ttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtcaaagtgtgaattctggttgaaagaagtaagttttcttggccatgttatttc 14213587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 133
Target Start/End: Original strand, 11770320 - 11770426
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    || || ||||||||| |||    
T  11770320 cagttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgctcgtgtgtttagcaagattaatt 11770419  T
Q  127 tgagatc 133  Q
    |||||||    
T  11770420 tgagatc 11770426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 389 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 8200618 - 8200541
Alignment:
Q  389 agagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  8200618 agagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 8200541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 26 - 86
Target Start/End: Original strand, 16727300 - 16727360
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatg 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16727300 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttctgagaattgatgatttgatg 16727360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 26 - 86
Target Start/End: Original strand, 17704372 - 17704432
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatg 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17704372 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttctgagaattgatgatttgatg 17704432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 4442280 - 4442157
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||| ||||| || || |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||  |||| || || ||||||||||    
T  4442280 cagttgaagaaggtgacgattaagaatcggtatccgcttccgaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcggaagtgtttagtaagattgatt 4442181  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagatta 150  Q
    |||||||| | ||||| |||||||    
T  4442180 tgagatcaggatatcatcagatta 4442157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 13379235 - 13379105
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||   ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||| | || || || ||||||||||    
T  13379235 cagttgaacaaggtgactattaagaatctttatcctcttccaaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 13379136  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaa 157  Q
    |||||||| | ||||| ||||| | ||||||    
T  13379135 tgagatcaggatatcatcagatcagagtgaa 13379105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 17926001 - 17925872
Alignment:
Q  28 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 127  Q
    ||||||||||||| || || ||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| | || ||||   |||| || || || ||||||||    
T  17926001 agttgaacaaggtgacgattaagaatcagtatccgcttccgaggattgatgatttgagggatcagctggttggtgtggaagtatttagtaaaattgattt 17925902  T
Q  128 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaa 157  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  17925901 gagatcaagatatcatcagattagagtgaa 17925872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 326
Target Start/End: Original strand, 39210 - 39363
Alignment:
Q  173 gaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgc 272  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| |||   || |||||||| || ||| |||| || || ||||| |||||||||||||||||  |     
T  39210 gaagactgccttcagaacccgttatggtcattatgagtattcggtgatgccttttggagtgtccaacgcgccaggagtttttatggagtatatgaacaga 39309  T
Q  273 atcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    || |||||| ||| ||| ||||  ||||| || || ||||| ||||||||||||    
T  39310 attttccatccatatttagatcagttcgttgtagtattcattgatgatattttg 39363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 13458387 - 13458257
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||| ||||||| ||| || |||||| | ||||| ||||  || ||||||||||||||||| ||  | || |||||  |||| ||||| ||||||||||    
T  13458387 cagttaaacaaggcaacgattaagaatcgatatccgcttcaaaggattgatgatttgatggaccaactggttggtgcggaagtgttcagtaagattgatt 13458288  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaa 157  Q
    | |||||| | |||||  |||||| ||||||    
T  13458287 tcagatcaggatatcattagattagagtgaa 13458257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 421 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 13688022 - 13687977
Alignment:
Q  421 gtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  13688022 gtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 13687977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 148
Target Start/End: Original strand, 15716825 - 15716942
Alignment:
Q  31 tgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgag 130  Q
    |||||||||| || || ||||||  |||| | || ||||| ||||| ||| ||||||||||||| || |||||  |||| ||||| ||||||||||| ||    
T  15716825 tgaacaaggtgacgattaagaatcagtattcgctcccgaggattgaggatatgatggatcagttggttggtgcggaagtgttcagtaagattgatttaag 15716924  T
Q  131 atcaaggtatcaccagat 148  Q
     ||| | ||||| |||||    
T  15716925 gtcacgatatcagcagat 15716942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 368; Significance: 0; HSPs: 48)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 44384019 - 44384458
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  44384019 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 44384118  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44384119 tgagattaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 44384218  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44384219 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttg 44384318  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44384319 atctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 44384418  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  44384419 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 44384458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 21143490 - 21143929
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  21143490 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatcaacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 21143589  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21143590 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatacagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 21143689  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21143690 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 21143789  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  21143790 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagt 21143889  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  21143890 tctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgttatttc 21143929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 9486210 - 9485771
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  9486210 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 9486111  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9486110 tgagatcaggctatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccctt 9486011  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  9486010 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgatattttg 9485911  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9485910 atctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 9485811  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  9485810 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 9485771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 24712027 - 24711589
Alignment:
Q  28 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  24712027 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgagttttcagcaagattgattt 24711928  T
Q  128 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 227  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24711927 gagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 24711828  T
Q  228 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttga 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||    
T  24711827 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcattttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttga 24711728  T
Q  328 tttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaatt 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24711727 tttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaatt 24711628  T
Q  428 ctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  24711627 ctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 24711589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 16927354 - 16926915
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16927354 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 16927255  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16927254 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 16927155  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  16927154 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgatattttg 16927055  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16927054 atctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 16926955  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| || || ||||| || ||| ||||||||||    
T  16926954 tctggttgaaagaggtgagtttccttggccatgttatttc 16926915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 17000994 - 17000555
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  17000994 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 17000895  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17000894 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 17000795  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  17000794 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatcgacgatattttg 17000695  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17000694 atctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 17000595  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| || || ||||| || ||| ||||||||||    
T  17000594 tctggttgaaagaggtgagtttccttggccatgttatttc 17000555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 24677484 - 24677044
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24677484 tcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagatttcagcaagattgat 24677385  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24677384 ttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagatagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaagttatgcctt 24677285  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  24677284 tcggtgttacgaatgcacctgtagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggtttttttcatcgatgatatttt 24677185  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  24677184 aatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttaaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgag 24677085  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  24677084 ttctggttgaaagaggtaagttttctgggccatgttatttc 24677044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 27220010 - 27219571
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  27220010 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 27219911  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27219910 tgagatcaggctatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgatatggtcactatgaatataaagttatgccttt 27219811  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||    
T  27219810 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 27219711  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27219710 atctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 27219611  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  27219610 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 27219571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 10870844 - 10870405
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  10870844 cagttgaacaaggtaactatcaagaacaggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggagcacgagttttcagcaagattgatt 10870745  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10870744 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 10870645  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||    
T  10870644 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 10870545  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10870544 atctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgcgaaattgtctaagtgtgaat 10870445  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  10870444 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 10870405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 24875199 - 24875638
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  24875199 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcgattagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 24875298  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24875299 tgaggtcaggttatcatcagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 24875398  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  24875399 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtattcattgatgatattttg 24875498  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  24875499 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagt 24875598  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  24875599 tctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgttatttc 24875638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 41606834 - 41607273
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  41606834 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 41606933  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41606934 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 41607033  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||    
T  41607034 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcacatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 41607133  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41607134 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 41607233  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  41607234 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 41607273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 24264364 - 24263925
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  24264364 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 24264265  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24264264 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 24264165  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||||| ||||| |||||||||    
T  24264164 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggattggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 24264065  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24264064 atttactccaagactgaagaggaacatgttgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 24263965  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  24263964 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 24263925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 27373263 - 27372824
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  27373263 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 27373164  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27373163 tgaggtcaggatatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 27373064  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||    
T  27373063 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggaatatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 27372964  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27372963 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 27372864  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  27372863 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 27372824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 60 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 23189879 - 23189474
Alignment:
Q  60 ccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaag 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | | |||||| |||||||||| ||||    
T  23189879 ccacttccgagaattgatgatttgatggatcggttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgacttgaggttaggttatcactagattaaagtaaaag 23189780  T
Q  160 atgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatgga 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23189779 atgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatgga 23189680  T
Q  260 gtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgag 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23189679 gtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgtttatagacgatattttgatttactccaagactgaggaagaacatgctgag 23189580  T
Q  360 catctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatg 459  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  23189579 catctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtg-attctggttgaagaaagtaagttttctgggccatg 23189481  T
Q  460 ttatttc 466  Q
    |||||||    
T  23189480 ttatttc 23189474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 24705931 - 24706370
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24705931 cagttgaacaaggtaactatcaaaaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggattagttagtgggtgcgaaagttttcagcaagattgatt 24706030  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24706031 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaaaaagaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 24706130  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| || |||||||||||||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||||    
T  24706131 tggtgttaccaatgtacctggagtgtttatggagtacatgaatcatatctttcacgcatttttggatcggttcgtggctgttttcattgatgatattttg 24706230  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  24706231 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaaatgtgagt 24706330  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24706331 tctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttc 24706370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 21323715 - 21324154
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  21323715 cagttaaacaaggtaactatcaagaatagatatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 21323814  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||  | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  21323815 tgagatcgggttatcaccagattaaggtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacacgttatggccactatgagtataaagttatgccttt 21323914  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  21323915 tggtgttaccaatacacctggagtatttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggattggttcgtagttgttttcatcgacgatattttg 21324014  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |    
T  21324015 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaggagaagaaactttatgctaaactatctaagtgtgagt 21324114  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||| |||| |||||    
T  21324115 tctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgtcatttc 21324154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 27 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 9337576 - 9337206
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  9337576 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgagttttcagcaagattgatt 9337477  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9337476 tgagatcaggctatcaccagattaaagtaaaagacgaagatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccctt 9337377  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||    
T  9337376 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 9337277  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaa 397  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  9337276 atctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaa 9337206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 23106177 - 23106616
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23106177 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttggtgggtgcaaaagttttcagcaagatagatt 23106276  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  23106277 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcggtatggtcactatgagtacaaagttatgccttt 23106376  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  23106377 cggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcagttcgtggttgttttcattgatgatattttg 23106476  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  23106477 atttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgcgaat 23106576  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    | ||||| || ||||| || ||||| ||  ||||||||||    
T  23106577 tatggttaaaagaagtgagctttcttggacatgttatttc 23106616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 30 - 466
Target Start/End: Original strand, 22734226 - 22734662
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 129  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||| |||||||    
T  22734226 ttgaacaaggtaacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtacaagtgttttcaacaagatagatttga 22734325  T
Q  130 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 229  Q
    ||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||    
T  22734326 gatcaggttatcaccatattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggacattatgagtacaaagttatgcctttcgg 22734425  T
Q  230 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    ||| |  |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| |||    
T  22734426 tgttataaatgcacctggagtatttatgtagtacatgaatcgcatctttcatgaatttttggatcggttcgtggttgtttttattgatgatattttaatt 22734525  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattct 429  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  22734526 tactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgtaaattct 22734625  T
Q  430 ggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||  ||||||||||    
T  22734626 ggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttc 22734662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 23073857 - 23073418
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||     
T  23073857 cagttgaacaaagtaacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaagtattttcagcaagatagatc 23073758  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  23073757 tgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgatatggccattatgaatacaaagttatgccttt 23073658  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  23073657 cggtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaaccgcatctttcatgcatttttggaatgtttcgtggttgttttcattgatgatattttg 23073558  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||   ||| ||||| | || || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23073557 atttactccaagtctgaagaagaacatactagccatttgaagttggttttccaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 23073458  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| ||  ||||||||||    
T  23073457 tctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttc 23073418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 24818679 - 24819118
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||    
T  24818679 cagttgaataaggtaacgataaagaataggtatccacttccaagaactgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtattcagcaagattgatt 24818778  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || || |||||||| || || ||||||  ||| ||||||||    
T  24818779 tgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatattcagtgatgccttt 24818878  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    |||||| || ||||| || || ||||||||||||||  ||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  24818879 cggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggagtacttgaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgcttcatggttgtgttcattgatgatattttg 24818978  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||     
T  24818979 atatactctaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaggattgtcttgcaagtgctgaaggagaagaagctttatgctaagttgtcaaagtgtgaac 24819078  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24819079 tctggttgaatgaagtaagttttcttggccatgttatttc 24819118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 48 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 23112712 - 23112291
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat---ttgagatcaaggtatcacc 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    | |||||||||||||||   ||||| ||  | || || |    
T  23112712 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgcacgcatattcagcaagattgatgatttgaggtcgggttaccatc 23112613  T
Q  145 agattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacc 244  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| || || || || ||||| ||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||| ||    
T  23112612 agattaaggtgaaagatgaagatatgtagaaaacggcctttaggacgcgatatggacattatgaatataaagtgatgtctttcggtgttactaatgcgcc 23112513  T
Q  245 tggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaa 344  Q
    | | |||||||||||||| |||||| | || |||||||| | | ||||||  || ||||||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||||    
T  23112512 tagtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatctggatcagtttgtagttgtgtttattgatgatatcttgatttattctaagactgaa 23112413  T
Q  345 gaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaa 444  Q
    ||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||||||| ||| || |||||  | ||||| || ||||| || |||||||||||||| |  |||||||    
T  23112412 gaagagcatgcagagcatttaaagattgtgttgcaagtgttgaaggaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaa 23112313  T
Q  445 gttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||||| ||| || |||||||    
T  23112312 gttttcttggccatattatttc 23112291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 451
Target Start/End: Original strand, 19650498 - 19650923
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||     
T  19650498 tcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcaaaggttttcagtaagattgac 19650597  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||  ||| | || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | || || || || |||||||| || || || || || |||||||    
T  19650598 ttgaagtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacgacctttaggacacgatatggtcattacgagtacaaggtgatgcctt 19650697  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| |  || |||||||| |||||||||  ||| || |||||||| || ||||||||| |    
T  19650698 tcggtgtcactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccaaattttccatgcttttttggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattct 19650797  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
     ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||  | |||||||| ||||| || |||||     
T  19650798 aatttattctaagaccgaagaggagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagttttgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcaaaatgtgag 19650897  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
    |||| ||| |  ||||||||||||||    
T  19650898 ttctagttaagtgaagtaagttttct 19650923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 451
Target Start/End: Original strand, 23098466 - 23098891
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||| ||| ||||| || |||||||||||||| || ||||||||  |||| || ||||||||     
T  23098466 tcagttgaacaaagtgacgataaagaacaggtatccgcttctgaggattgacgacttgatggatcagttggttggtgcaaagatttttagtaagattgac 23098565  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | || || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||| || || |||||||    
T  23098566 ttgaggtcaggataccatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgaatagaaggtgatgcctt 23098665  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||| | || || ||||| ||| ||||| ||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  23098666 tcggtgttactaatgcgcctggtgtatttatggagtatatgaataggatttttcatgcttttctggatagattcgtggtggtgtttattgatgatatttt 23098765  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
     ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| || || ||   ||||||||| |   | |||||||| ||||| || ||||||    
T  23098766 aatttattctaagactgaagaagagcatgccgagcatctgaggattgtattacaggttctgaaagagaaaatgttgtatgctaagttgtcgaaatgtgaa 23098865  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
    |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  23098866 ttctggttaagtgaagtgagttttct 23098891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 26 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 23278771 - 23278346
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||     
T  23278771 tcagttgaacaaagttacaatcaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtttttagtaagattgac 23278672  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||  ||| | || || || ||||| ||||| ||  | ||||||||||||||  | || || || || ||||| || || ||||| || || |||||||    
T  23278671 ttgaagtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggacaaggatatgcagaagacgacctttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctt 23278572  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| | | |||||   ||||| ||||| || || ||||| ||| |    
T  23278571 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataatttcgtggttgtttttattgatgacattct 23278472  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||| | | ||||||||| ||  | |||||||| ||||| ||||| ||     
T  23278471 gatttattctaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaaatattgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgcgag 23278372  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
    |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  23278371 ttctggttaagtgaagtgagttttct 23278346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 26 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 1065746 - 1065318
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  ||||||| |||||||||    
T  1065746 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagattttcagtaagattgat 1065647  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  1065646 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 1065547  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||   || || || || || || |||||||||||    
T  1065546 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaatcgaatcttccatgcttttctggataagtttgtggtggtatttattgatgatatttt 1065447  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
     || || ||||||| ||| || || ||||| ||||||||||  || || |||||||||| ||| || ||||   | |||||||| || || || |||||     
T  1065446 aatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaatagtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgag 1065347  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 454  Q
    ||||| || || |||||||||||||||||    
T  1065346 ttctgattaaatgaagtaagttttctggg 1065318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 30 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 27789731 - 27789337
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 129  Q
    |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  27789731 ttgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggaccagctagtgggtgcaaaggtgttcagtaagattgacttga 27789632  T
Q  130 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 229  Q
    | ||| | || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || || || || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  27789631 ggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcgg 27789532  T
Q  230 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    ||| || || || || || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||||  |||||| || || || || ||||||||| |||||    
T  27789531 tgttactaacgcgcccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatattctgatt 27789432  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtga 424  Q
    || || |||||||||||||| ||||| || |||||||  |||||  ||||||| | ||||||||||||  | ||||| |||||||| || |||||    
T  27789431 tattcgaagactgaagaagagcatgcagaacatctgagaattgtgctgcaagttttgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaaatgtga 27789337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 26 - 451
Target Start/End: Original strand, 19717465 - 19717890
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||| || |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||     
T  19717465 tcagttgaacaaagttacgataaagaacagatatccacttctgaggattgatgacttgatggatcagttggtgggtgcaaaggtttttaacaagattgac 19717564  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | || || ||||| ||  |||| ||||| |||||||| ||||| || || || || || |||||||| || ||||| || || |||||||    
T  19717565 ttgaggtcaggttaccatcagatcaagttgaaggatgaggatatgcacaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 19717664  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||  |||    |||||||| || ||||||||| |    
T  19717665 tcggtgttactaaagcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaattttgggttgtgtttattgatgatattct 19717764  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
     ||||| || |||||||||||  | ||||| || |||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||     
T  19717765 aatttattctaagactgaagatcagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagttttgaaagaaaagaagctgtatgctaagttgtcgaagtgtgag 19717864  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
    |||||||| |  |||||||| |||||    
T  19717865 ttctggttaagtgaagtaagatttct 19717890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 302 - 466
Target Start/End: Original strand, 22323580 - 22323744
Alignment:
Q  302 agttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactt 401  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||    
T  22323580 agttgtgtttatcgacgatatcttgatttactccaagactgaagaagaacatgccgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctt 22323679  T
Q  402 tatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| ||||    
T  22323680 tatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttgtttc 22323744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 30 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 12576344 - 12575983
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 129  Q
    |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  12576344 ttgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggaccagctagtgggtgcaaaggtgttcagtaagattgacttga 12576245  T
Q  130 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 229  Q
    | ||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || || || || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  12576244 ggtcaggttaccaccaaattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatacggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcgg 12576145  T
Q  230 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    ||| || || || || || || || ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||  |||||| || || || || ||||| ||| |||||    
T  12576144 tgttactaacgcgcccggtgtattcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttttggataaattcgtggtggtatttattgatgacattctgatt 12576045  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaaga 391  Q
    || || |||||||||||||| ||||| || |||||||  ||||| |||||||| | ||||||    
T  12576044 tattcgaagactgaagaagagcatgcagaacatctgagaattgtgttgcaagttttgaaaga 12575983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 26 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 25255914 - 25255657
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||    
T  25255914 tcagttgaacaaggttacgataaagaataggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcacgtgtgttcagcaaaattgat 25255815  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||| || |||||||| || |||||||    
T  25255814 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctt 25255715  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgc 283  Q
    ||||||| || ||||| | ||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  25255714 tcggtgttactaatgcgcttggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgc 25255657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 26 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 31832653 - 31832225
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| || || ||||| ||  |||| || |||||||||    
T  31832653 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcaattggttggtgctaagatttttagtaagattgat 31832554  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || || || |||||||    
T  31832553 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaggtgatgcctt 31832454  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||   || || || ||||| || |||||||| ||    
T  31832453 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatctt 31832354  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
     ||||| ||||||| ||| || || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| ||| || ||||   | ||||| || ||||| || |||||     
T  31832353 aatttattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgcaaagttgtcgaaatgtgag 31832254  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 454  Q
    |||||||| |  |||||||||||||||||    
T  31832253 ttctggttaagtgaagtaagttttctggg 31832225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 48 - 451
Target Start/End: Original strand, 30010654 - 30011057
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 147  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||    || ||||| || || || || |||| | | ||||||||||    
T  30010654 aagaataagtatccacttccgaggatcgacgatttgatggatccgttagtgggtgcgcgtgtgttcagtaaaatggacttaagattaggctatcaccaga 30010753  T
Q  148 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 247  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||  | || || || ||||| || || || ||||||   || ||||||||| |||| || ||||| || ||    
T  30010754 ttaaagtgaaagatgaggatattcagaagacgacctttaggacacgttacggacattacgaatattctgtgatgcctttcagtgttactaatgcgccagg 30010853  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
    |||||||||| | ||||||||||| || || ||| | | | ||||||| || || || ||||| || |||||||||||||| ||||||||| | || ||     
T  30010854 agtgtttatgaaatatatgaatcgtatttttcatacttatctggatcgttttgttgtcgtgtttatagatgatattttgatatactccaagtccgaggag 30010953  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 447  Q
    |||||||  |||||| |||  ||||| |||||||||  | ||||||||||  | ||||| || || || | ||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  30010954 gaacatgtcgagcatttgagaattgttttgcaagtgctgcaagagaagaagttatatgccaagttatcgatgtgcgaattctggttgaacgaagtgagtt 30011053  T
Q  448 ttct 451  Q
    ||||    
T  30011054 ttct 30011057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 48 - 451
Target Start/End: Original strand, 30209387 - 30209790
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 147  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||    || ||||| || ||||| || || ||| | ||||||||||    
T  30209387 aagaataagtatccacttccgaggatcgaagatttgatggatcagttagtgggtgcgcgtgtgttcagtaaaattgagttaaggtcaggctatcaccaga 30209486  T
Q  148 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 247  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||||||| || || || || |||||  | || ||  |||||   || |||||||||||||| || ||||| |  ||    
T  30209487 tcaaagtgaaagatgaggatattcagaagacggcctttaggacacgttacagacattacaaatattttgtgatgcctttcggtgttactaatgcgctggg 30209586  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
    |||||||||||| ||||||||||  || || ||| | | | ||||||| || || |||||||| || |||||||||||||| ||||||||| | || ||     
T  30209587 agtgtttatggaatatatgaatcatatttttcatacttatctggatcgttttgttgttgtgtttatagatgatattttgatatactccaagtccgaggag 30209686  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 447  Q
    |||||||  || ||| |||  ||||| || ||||||  ||||||||||||  | | ||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  30209687 gaacatgtcgaacatttgagaattgtttttcaagtgctgaaagagaagaagttatctgccaagttatcgaagtgcgaattctggttgaacgaagtgagtt 30209786  T
Q  448 ttct 451  Q
    ||||    
T  30209787 ttct 30209790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 108 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 24950503 - 24950178
Alignment:
Q  108 gttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatg 207  Q
    ||||| || |||||||| ||||| ||| | || || |||||||| || || |||||||||||||||||||| || || || || || |||||||| || |    
T  24950503 gtttttagtaagattgacttgaggtcaggttaccatcagattaaggtaaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacg 24950404  T
Q  208 aatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgt 307  Q
    |||| || || |||||||||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |   |||||  ||| |  |||||    
T  24950403 aatacaaggtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaatttgcggttgt 24950304  T
Q  308 gttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgct 407  Q
     ||  | ||||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||| | | ||||||||| ||  | ||||||    
T  24950303 atttgttgatgatattctgatttattcaaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaaatattgaaagagaaaaagttgtatgct 24950204  T
Q  408 aaattgtctaagtgtgaattctggtt 433  Q
    || ||||| |||||||| || |||||    
T  24950203 aagttgtcgaagtgtgagttatggtt 24950178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 60 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 23611134 - 23611069
Alignment:
Q  60 ccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23611134 ccacttccgagaattgatgatttgatggatcggttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 23611069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 208 - 466
Target Start/End: Original strand, 27208802 - 27209060
Alignment:
Q  208 aatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgt 307  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||| || || || ||| | ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||  |||||| || ||    
T  27208802 aatacaaagtgatgtctttcggtgttactaaagcgcctagtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaattcgtggtggt 27208901  T
Q  308 gttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactt-tatgc 406  Q
    ||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||||| |||||  | | ||||||| ||||| || |||||    
T  27208902 gtttatagatgatattttgatttattctaagactgaagaggtgcatgcagagcacctgaagattgtgttgcagattttgaaagag-agaaagttgtatgc 27209000  T
Q  407 taaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
     || ||||| ||||| || |||||||| |  ||||| |||||||| ||| | ||||||||    
T  27209001 caacttgtcgaagtgcgagttctggttaagtgaagtgagttttctaggccacgttatttc 27209060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 251 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 23295705 - 23295501
Alignment:
Q  251 gtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaa 350  Q
    ||| |||||||||||||| || || |||||||| |   |||||  ||| || |||||||| || ||||| ||  ||||||| || ||||||||||||||     
T  23295705 gttnatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcctgatttattcaaagactgaagaagag 23295606  T
Q  351 catgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttc 450  Q
    ||||| || |||||||||||||| || ||||| | ||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||| |||||||    
T  23295605 catgcagaacatctgaagattgtgttacaagttttgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaattgaagtgagttttc 23295506  T
Q  451 tgggc 455  Q
    |||||    
T  23295505 tgggc 23295501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 306 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 25264769 - 25264624
Alignment:
Q  306 gtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatg 405  Q
    ||||| || ||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  | ||||    
T  25264769 gtgtttattgatgacatcttgatttattctaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatg 25264670  T
Q  406 ctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
    | || ||||| || ||||| |||||||| |  ||||||||||||||    
T  25264669 ccaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtaagttttct 25264624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 448
Target Start/End: Original strand, 24829637 - 24830058
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||| | || || || ||||||||||    
T  24829637 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 24829736  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
     |||||||   ||||| ||||||| ||| || |  ||||||||    || || || ||  ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  24829737 agagatcagaatatcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaaccgcgtttcgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 24829836  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     || ||  | ||||| || || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || || || || |||||||| ||||||||||||    
T  24829837 tggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 24829936  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
     | || || ||| |||| ||||| ||||| |||||| ||| |||||| |||||| | | |||||||||  |  | | ||| || |||||||||||||| |    
T  24829937 gtgtattcaaagtctgaggaagagcatgcggagcatttgaggattgtgttgcaattcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagt 24830036  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttt 448  Q
    | ||||| |||||||| |||||    
T  24830037 tttggttcaaggaagtgagttt 24830058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 30 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 22280096 - 22279993
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 129  Q
    ||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||| | || || || |||||||||||||    
T  22280096 ttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgcagaggtgtttagtaagattgatttga 22279997  T
Q  130 gatc 133  Q
    ||||    
T  22279996 gatc 22279993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 25130603 - 25130473
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||| |||| || || |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||  | || |||||  |||| || || ||||||||||    
T  25130603 cagttgaactaggtgacgattaagaatcggtatccgcttccgaggattgatgattttatggatcaactggttggtgcggaagtgtttagtaagattgatt 25130504  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaa 157  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||||||    
T  25130503 tgagatcaggatatcatcagattagagtgaa 25130473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 351 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 22279775 - 22279678
Alignment:
Q  351 catgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttt 448  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||  |  | | ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  22279775 catgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtattgaaagagaaccagttatgtgcaaagttgtctaagtgtgaattttggttgaaggaagtgagttt 22279678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 48 - 157
Target Start/End: Original strand, 22760039 - 22760148
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 147  Q
    |||||| |||| || ||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||| | ||  | || |||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  22760039 aagaatcggtacccgcttccaaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcagaggtgcttagtaagattgatttgagatcaagatatcatcata 22760138  T
Q  148 ttaaagtgaa 157  Q
    ||| ||||||    
T  22760139 ttagagtgaa 22760148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 23204309 - 23204273
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatcca 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23204309 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatcca 23204273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 348 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 45534613 - 45534510
Alignment:
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 447  Q
    |||||||| |||||| |||  ||||| |||||||||  ||||||||||||  | ||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  45534613 gaacatgccgagcatttgagaattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgccaagttatcgaagtgcgaattctggttgaacgaagtgagtt 45534514  T
Q  448 ttct 451  Q
    ||||    
T  45534513 ttct 45534510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 157
Target Start/End: Original strand, 24568117 - 24568247
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||| || || || |||||| ||||||  ||||| || ||||||||||| |||||| || | || |||||| | || || || ||||||||||    
T  24568117 cagttgaacaaagtgacgattaagaatcggtatctgcttccaaggattgatgatttaatggattagctggttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 24568216  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaa 157  Q
    |||||||| | ||||| || |||| ||||||    
T  24568217 tgagatcaggatatcatcatattagagtgaa 24568247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 404 - 448
Target Start/End: Original strand, 12639059 - 12639103
Alignment:
Q  404 tgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttt 448  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  12639059 tgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagttt 12639103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 365; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 58410 - 57970
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  58410 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcaattagtgggtgcaaaagtttttagcaagattgat 58311  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  58310 ttgaggtcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgaatataaagttatgcctt 58211  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  58210 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggattatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcagttcgtagttgtgtttatcgatgacatttt 58111  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  58110 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgtgcatctgaagattgtcttccaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 58011  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  58010 ttctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttc 57970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 24 - 466
Target Start/End: Original strand, 17975 - 18418
Alignment:
Q  24 catcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattg 123  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17975 catcagttgaacaaagtaactatcaaaaataggtatccactaccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattg 18074  T
Q  124 atttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcc 223  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18075 atttgagatcatgttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagatatctttcagtacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcc 18174  T
Q  224 tttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatt 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||    
T  18175 tttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatgtagtacatgaatcgcatcttccaagcatttttggagcggttcgtggttgttttcattgatgacatt 18274  T
Q  324 ttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatct-gaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgt 422  Q
    || ||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18275 tt-atttactccaagtattaagaagaacatgctgaacatctaaaaaattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgt 18373  T
Q  423 gaattctggttgaaggaagtaa-gttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    || ||||||||||| || |||| ||||| | ||| ||||||||||    
T  18374 gagttctggttgaaagaggtaaggttttgttggccatgttatttc 18418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 72 - 466
Target Start/End: Original strand, 195444 - 195838
Alignment:
Q  72 attgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgc 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||  | || |||||||||||||    
T  195444 attgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatttgagatcgggttatcaccagattaagataaatgatgaagatatgc 195543  T
Q  172 agaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcg 271  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  195544 agaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatgcaccagaagtatttatggagtatatgaatcg 195643  T
Q  272 catcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagatt 371  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  195644 catcttccatgcatttctggatcgttttgtggttgtctttatcgatgatattttgatttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatctgaaggtt 195743  T
Q  372 gtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| |||||    
T  195744 gtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaactatctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgtcatttc 195838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 364; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 9332 - 8893
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  9332 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 9233  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9232 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 9133  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||    
T  9132 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgatgatattttg 9033  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9032 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 8933  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  8932 tctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 8893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 360; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 107723 - 108162
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  107723 cagttgaacaagataactatcaagaataggtatccacttccgagaatggatgatttgatggatcagttagtgggtgcaagagttttcagcaagattgatt 107822  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  107823 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgtagaagatagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 107922  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  107923 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgagtcgcatcttccatgcgtttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 108022  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  108023 atttactccaagattgaagaggaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaat 108122  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  108123 tctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttc 108162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 24 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 114956 - 114514
Alignment:
Q  24 catcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattg 123  Q
    ||||||||||| || || || || ||||| || ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||| || ||||||||  |||| || || ||||    
T  114956 catcagttgaataaagttacgataaagaacagatatcctcttccgagaattgacgacctgatggatcagttggttggtgcaaagatttttagtaaaattg 114857  T
Q  124 atttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcc 223  Q
    | ||| | ||| | || || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || || || || || |||||||| || |||||||| || |||||    
T  114856 acttgtggtcaggttaccatcagatcaaggtgaaagatgaagacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcc 114757  T
Q  224 tttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatt 323  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| | || || ||||| |   |||||  ||| || ||||| ||||| ||||| |||    
T  114756 tttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggaatatatgaatagaatttttcatgcttacctggataaatttgtggttgtattcattgatgacatt 114657  T
Q  324 ttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtg 423  Q
    ||||| || || |  ||||| ||||| ||||| || ||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||| |    
T  114656 ttgatctattcaagaactgaggaagagcatgcagaacatctgatgattgtattgcaagtattgaaagagaagaaattgtatgccaaattgtcgaagtgcg 114557  T
Q  424 aattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    | |||||||| || ||||| |||||||| ||| || |||||||    
T  114556 agttctggttaaatgaagtgagttttcttggccatattatttc 114514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 26 - 266
Target Start/End: Original strand, 94805 - 95045
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || |||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||     
T  94805 tcagttgaacaaagttacaataaagaatagatatccacttccgcggattgatgacttgatggaccagttggtaggtgctaaagtttttagcaagattgac 94904  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||  | || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  94905 ttgaggtcgggttaccatcagattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcactacgaatacaaagtgatgcctt 95004  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatg 266  Q
    ||||||| || || || || || ||||| ||||||||||||    
T  95005 tcggtgttactaacgcgccgggtgtgttcatggagtatatg 95045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 356; Significance: 0; HSPs: 62)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 22828409 - 22828848
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  22828409 cagttgaataaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 22828508  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22828509 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagataaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 22828608  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22828609 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgtatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgcgttcatcgatgatattttg 22828708  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  22828709 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagt 22828808  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  22828809 tctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgttatttc 22828848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 466
Target Start/End: Original strand, 27563886 - 27564326
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  27563886 tcagttgaacaaagttactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgat 27563985  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    || |||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27563986 ttaagatcaggttatcaccaaattaaagtaaaagatgaagatatgcagaaggcagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 27564085  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  27564086 tcggtgtgaccattgcacctaaagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttagatcggttcgtggttgtgttcatcgatgaaatttt 27564185  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27564186 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgaa 27564285  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  27564286 ttctggttgaaagaagtaagttttcttggccatgttatttc 27564326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 28261251 - 28261690
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28261251 cagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacaagttttcagcaagattgatt 28261350  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28261351 tgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgctatggtcactatgaatacaaagttatgccttt 28261450  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28261451 cgttgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttg 28261550  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28261551 atttactccaagactgaagaagaacatgcagagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaat 28261650  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |  ||| ||||||||||    
T  28261651 tctggttgaaagaagtgagtttccctggccatgttatttc 28261690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 28284665 - 28284226
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28284665 cagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacaagttttcagcaagattgatt 28284566  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28284565 tgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgctatggtcactatgaatacaaagttatgccttt 28284466  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28284465 cgttgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttg 28284366  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28284365 atttactccaagactgaagaagaacatgcagagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaat 28284266  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |  ||| ||||||||||    
T  28284265 tctggttgaaagaagtgagtttccctggccatgttatttc 28284226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 28340000 - 28340439
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28340000 cagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacaagttttcagcaagattgatt 28340099  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28340100 tgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgctatggtcactatgaatacaaagttatgccttt 28340199  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28340200 cgttgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgacgatattttg 28340299  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28340300 atttactccaagactgaagaagaacatgcagagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaat 28340399  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |  ||| ||||||||||    
T  28340400 tctggttgaaagaagtgagtttccctggccatgttatttc 28340439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 27189663 - 27189224
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27189663 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacaagttttcagcaagattgatt 27189564  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||  | |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27189563 tgagatcgggttatcaccagattaaggtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactacgaatacaaagttatgccttt 27189464  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||    
T  27189463 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttagatcggttcgtggttgtattcatcgacgatatcttg 27189364  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27189363 atttactccaagactgaagaagaacatgcggaacatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtccaagtgtgaat 27189264  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||| ||||||||||    
T  27189263 tctggttgaaagaagtgagtttccttggccatgttatttc 27189224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 27259577 - 27260016
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27259577 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacaagttttcagcaagattgatt 27259676  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||  | |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27259677 tgagatcgggttatcaccagattaaggtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactacgaatacaaagttatgccttt 27259776  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||    
T  27259777 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttagatcggttcgtggttgtattcatcgacgatatcttg 27259876  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27259877 atttactccaagactgaagaagaacatgcggaacatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtccaagtgtgaat 27259976  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||| ||||||||||    
T  27259977 tctggttgaaagaagtgagtttccttggccatgttatttc 27260016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 466
Target Start/End: Original strand, 24293837 - 24294275
Alignment:
Q  28 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||||||||||||||    
T  24293837 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgattt 24293936  T
Q  128 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 227  Q
    ||| ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24293937 gaggtcaggatatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgtgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttt 24294036  T
Q  228 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttga 327  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||    
T  24294037 ggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttga 24294136  T
Q  328 tttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaatt 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24294137 tttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaatt 24294236  T
Q  428 ctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  24294237 ctggttgaaagaagtgagttttctaggccatgttatttc 24294275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 466
Target Start/End: Original strand, 16925692 - 16926131
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16925692 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatctacttc-gagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagtttttagcaagattgat 16925790  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  16925791 ttgaggtaaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgtagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgaatataatgttatgccgt 16925890  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16925891 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttttggagtatatgaagcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgttttcatcgatgatatttt 16925990  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  16925991 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaagttatctaagtgtgaa 16926090  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| |||||    
T  16926091 ttctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgtcatttc 16926131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 466
Target Start/End: Original strand, 16961537 - 16961975
Alignment:
Q  28 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  16961537 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtcggtgcgaaagtttttagcaagattgattt 16961636  T
Q  128 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 227  Q
    ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  16961637 gaggtcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgaatataaagttatgtcgttc 16961736  T
Q  228 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttga 327  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  16961737 ggtgtgaccaatgcacctgaagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgttttcattgacgatattttga 16961836  T
Q  328 tttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaatt 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  16961837 tttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaagtcatctaagtgtgaatt 16961936  T
Q  428 ctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||| |||| |||||    
T  16961937 ctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgtcatttc 16961975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 19866915 - 19866475
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  19866915 tcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgat 19866816  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    || |||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19866815 ttaagatcaggttatcacgagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgaatataaagttatgcctt 19866716  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||    
T  19866715 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgctttgtggttgtttttatcgatgatatttt 19866616  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||     
T  19866615 gatttactccaagactgaaaaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaactatctaagcgtgag 19866516  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  19866515 ttctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttc 19866475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 2872857 - 2873296
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  2872857 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 2872956  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||  | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2872957 tgaggtcgggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 2873056  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||| ||||| |||||||||    
T  2873057 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttatgtttatcgacgatattttg 2873156  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2873157 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgttttgcaagtgttgaaggagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaat 2873256  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    | |||||||| ||||| ||||| || ||| ||||||||||    
T  2873257 tttggttgaaagaagtgagtttccttggccatgttatttc 2873296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 25114779 - 25114340
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  25114779 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 25114680  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    || |  || | ||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25114679 tggggccaggttatcatcagattaaagtaaaggttgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactgtgaatataaagttatgccttt 25114580  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25114579 tggtgttaccaatacacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttttgttcatcgatgatattttg 25114480  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  25114479 atctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgtcaaattatctaagtgtgaat 25114380  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||| ||||||||||    
T  25114379 tctggttgaaagaggtgagttttcttggccatgttatttc 25114340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 26 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 22436097 - 22435657
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  22436097 tcagttaaacaaagtaactatcaataataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcatgtgttttcagcaagattgat 22435998  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22435997 ttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcaaaacgtgttatggtcactatgaatacaaagttatgcctt 22435898  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  22435897 ttggtgttaccaatgcacctagagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttatcgatgatatttt 22435798  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||     
T  22435797 aatttactccaagactaaagaagaacatgttgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatcctaaattatctaagtgtgag 22435698  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  22435697 ttctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttc 22435657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 20633994 - 20634433
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20633994 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagatagatt 20634093  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  20634094 tgagatctggttatcaccagattaaagtagaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggacattatgagtacaaagttatgccttt 20634193  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||    
T  20634194 cggtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttattgatgatattttg 20634293  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  20634294 atttactccaagtctaaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgtgaat 20634393  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| ||  ||||||||||    
T  20634394 tctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttc 20634433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 26 - 466
Target Start/End: Original strand, 5837272 - 5837712
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||    
T  5837272 tcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcttttgttttcagcaagattgat 5837371  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  5837372 ttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagaccgctttcagaacgcgttatggtcactatgagtacaaagttatgcctt 5837471  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || || ||| |    
T  5837472 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgctttgtggttgtcttcattgacgacattct 5837571  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||     
T  5837572 gatttattccaagactgaggaagaacatgttgagcatctgaagactgttttgcaagtgttgaaagaaaagaagctttatgccaagttgtctaagtgtgag 5837671  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||| | ||||||||    
T  5837672 ttctggttgaaagaggtaagttttcttggccacgttatttc 5837712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 42 - 466
Target Start/End: Original strand, 25763297 - 25763721
Alignment:
Q  42 actatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatc 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  25763297 actatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatttgagatcaggttatc 25763396  T
Q  142 accagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgc 241  Q
    ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  25763397 accagaaaaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggccactatgagtataaagttatgcctttcggtgttacaaatgc 25763496  T
Q  242 acctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagact 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  | ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  25763497 acctggactgtttatggagtatatgaatcgcatcttccttgcatttttggatcgctttatggttgtctttattgatgacattttaatttactccaagact 25763596  T
Q  342 gaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaag 441  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |    
T  25763597 gaaggagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagataaaaatgtatgctaaattatctaattgtgaattctggttgaaagagg 25763696  T
Q  442 taagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||    
T  25763697 taagttttcttggccatgtcatttc 25763721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 30 - 466
Target Start/End: Original strand, 25607918 - 25608354
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 129  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||    
T  25607918 ttgaacaaggtgactataaagaataggtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcatgtgttttcagcaagatagatttga 25608017  T
Q  130 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 229  Q
    ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || || || ||||  |||||    
T  25608018 gatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagacatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggacattatgagtacaaggtaatgctgttcgg 25608117  T
Q  230 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    ||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  25608118 tgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaattgcatctttcatgcatttttggatcgattcgtagttgtttttattgatgatattttgatt 25608217  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattct 429  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25608218 tactccaagtctgaagaagaagatgctgagcatttgaagattgttttacaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtcaaagtgtgaattct 25608317  T
Q  430 ggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  25608318 ggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttc 25608354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 22 - 465
Target Start/End: Original strand, 22760504 - 22760947
Alignment:
Q  22 atcatcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagat 121  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||| ||||||||||    
T  22760504 atcaacagttgaacaatgtaacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggattagttagtgggtgcacgtgttgtcagcaagat 22760603  T
Q  122 tgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatg 221  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  22760604 tgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcacaagacagctttcagaacgcgttatggacattatgagtataaagttatg 22760703  T
Q  222 cctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgata 321  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||  ||||||    
T  22760704 cctttcggtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttattaatgata 22760803  T
Q  322 ttttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtg 421  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| | || ||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  22760804 ttttgatttactccaagtctgaagaagagcatgctgagcatttgaagctggttttgtaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtg 22760903  T
Q  422 tgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttattt 465  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||  |||||||||    
T  22760904 tgaattctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttattt 22760947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 18405998 - 18406437
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  18405998 cagttgaacaaggtaacaataaagaataggtatccacctccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaagtgttttcagcaagatagatt 18406097  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||  |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| || ||||| ||||| || ||||| ||    
T  18406098 tgagatcgggtcatcaccagattaaagtgaaagattaagatatgcagaagacagccttcagaacgtattatggacattatgagtataaggtgatgccgtt 18406197  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  18406198 cggtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgttttgtggttgttttcattgatgatattttg 18406297  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  18406298 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaaactggttttgcaagtgttgaaagagaagaaactatatgctaaattgtttaagtgtgaat 18406397  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| ||  ||||||||||    
T  18406398 tctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttc 18406437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 108 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 22444413 - 22444055
Alignment:
Q  108 gttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  22444413 gttttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcataacgtgttatggtcactatg 22444314  T
Q  208 aatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgt 307  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  22444313 aatacaaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctagagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgt 22444214  T
Q  308 gttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgct 407  Q
     || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  22444213 ttttatcgatgatattttaatttactccaagactaaagaagaacatgttgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatcct 22444114  T
Q  408 aaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  22444113 aaattatctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttc 22444055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 27 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 16574117 - 16573879
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  16574117 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 16574018  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16574017 tgaggtcaggatatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 16573918  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatat 265  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16573917 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatat 16573879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 27 - 265
Target Start/End: Original strand, 16621263 - 16621501
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  16621263 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 16621362  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16621363 tgaggtcaggatatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 16621462  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatat 265  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16621463 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatat 16621501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 163 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 23080560 - 23080258
Alignment:
Q  163 aagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagta 262  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  23080560 aagatatgcagaagacggattttagaacgcgttatggacattatgaatataaagtgatgtctttcggtgttacaaatgcacctggagtgtttatggagta 23080461  T
Q  263 tatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcat 362  Q
     ||||||||||| || ||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  23080460 catgaatcgcatttttcatgcatttctagatcgtttcgtggttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagtctgaggaagaacatgctgagcat 23080361  T
Q  363 ctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgtta 462  Q
     |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||| ||||||    
T  23080360 ttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaaactttatgctaaattatcaaagtttgaattctggttgaaagaggtgagtttccttggccatgtta 23080261  T
Q  463 ttt 465  Q
    |||    
T  23080260 ttt 23080258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 27 - 409
Target Start/End: Original strand, 23085825 - 23086207
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||| || ||||| || |||||||||||| | ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||   || || ||||||||||| |    
T  23085825 cagttgaataaagtaacgataaagaataggtattcccttccaagaattgacgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgact 23085924  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||  | || || ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| || || || || |||||||| || |||||||||  ||| ||||||||    
T  23085925 tgaggtcgggttaccatcagattaaagtaaaagatgaagatatctagaagacggcctttaggacacgttatggacattatgaatattcagtgatgccttt 23086024  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    |||||| || ||||| || || |||||||||||||| |||||||| || || ||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23086025 cggtgttacaaatgcgccgggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcgtatttggatcgcttcgtggttgtgttcatcgatgatattttg 23086124  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaa 409  Q
    || ||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  | | |||||||| |||||||||||    
T  23086125 atatactctaagtatgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctggaggagaagaagctttatgctaa 23086207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 28 - 269
Target Start/End: Original strand, 18183422 - 18183663
Alignment:
Q  28 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 127  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||   || || ||||||||||||||    
T  18183422 agttgaataaggtaacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttgatgcatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgattt 18183521  T
Q  128 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 227  Q
    ||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  18183522 gaggtccggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacgtcttttagcacgcgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttc 18183621  T
Q  228 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaat 269  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  18183622 ggtgttacaaatgcgcctggtgtgtttatggtgtacatgaat 18183663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 48 - 451
Target Start/End: Original strand, 14377991 - 14378394
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 147  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| | || || || |    
T  14377991 aagaacaggtatccacttcctaggatttatgacttgttggatcagttagtgggtgcaaaggttttcagtaagattgaattgagatcaggttaccatcaaa 14378090  T
Q  148 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 247  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  14378091 ttaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 14378190  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||| |||||  ||| || ||||| || || ||||||| | ||||||| || |||||||||||     
T  14378191 tgtgttcatggagtatatgaaccgaattttacatgcttttctggataaatttgtggttgtatttattgatgatagtctgatttattctaagactgaagag 14378290  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 447  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||  | ||||| || ||||| || ||||| || ||||| |  ||||||||||    
T  14378291 gagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtcttgaaagagaaaaagttgtatgccaagttgtcgaaatgtgagttttggttaagtgaagtaagtt 14378390  T
Q  448 ttct 451  Q
    ||||    
T  14378391 ttct 14378394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 48 - 451
Target Start/End: Original strand, 14379541 - 14379944
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 147  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| | || || || |    
T  14379541 aagaacaggtatccacttcctaggatttatgacttgttggatcagttagtgggtgcaaaggttttcagtaagattgaattgagatcaggttaccatcaaa 14379640  T
Q  148 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 247  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  14379641 ttaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 14379740  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||| |||||  ||| || ||||| || || ||||||| | ||||||| || |||||||||||     
T  14379741 tgtgttcatggagtatatgaaccgaattttacatgcttttctggataaatttgtggttgtatttattgatgatagtctgatttattctaagactgaagag 14379840  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 447  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||  | ||||| || ||||| || ||||| || ||||| |  ||||||||||    
T  14379841 gagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtcttgaaagagaaaaagttgtatgccaagttgtcgaaatgtgagttttggttaagtgaagtaagtt 14379940  T
Q  448 ttct 451  Q
    ||||    
T  14379941 ttct 14379944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 26 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 25770072 - 25769647
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    || |||||||| ||||||    
T  25770072 tcagttgaataaagtgacgataaagaacaggtatccacttccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgctcgtgtattcagcaaaattgat 25769973  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  || || || || || ||||| || ||||| ||||| || ||| |||    
T  25769972 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaatgatgaggatatgcagaaaatggcctttaggacacgatatggacattatgagtataaggtgatgtctt 25769873  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||| | |  ||||  ||| || |||||||| || ||||||||  |    
T  25769872 tcggtgttactaatgcgcctggtgtatttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatccggataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcct 25769773  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
     ||||| || |||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| | | |||  | |||||||| ||||| || ||||||    
T  25769772 aatttattctaagtatgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaataaatgaagttgtatgctaagttgtccaaatgtgaa 25769673  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||    
T  25769672 ttctggttaagtgaagtaagttttct 25769647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 15461563 - 15461124
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  15461563 cagttgaacaaagttacaatcaagaatagatatccacttccgcggattgatgatttgatggaccagttggtaggtgctaaagtttttagcaagattgact 15461464  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||  | || || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||    
T  15461463 tgaggtcgggttaccatcaaattaaagtgaaagacgaagatatgcaaaagacggcctttagaacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgccttt 15461364  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    |||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| | |||  ||| || || ||||| || ||||||||| ||    
T  15461363 cggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctttctagataaatttgtggtggtgtttatagatgatattctg 15461264  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactt-tatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    ||||| || || |||||||| ||||| || || ||  |||||||||| |||||  | | ||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||     
T  15461263 atttattctaaaactgaagaggaacacgccgaacacttgaagattgtgttgcagattttgaaagag-agaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcgat 15461165  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||| |  ||||| |||||||| ||| | ||||||||    
T  15461164 ttctggttaagtgaagtgagttttctaggccacgttatttc 15461124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 21755160 - 21755002
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||    
T  21755160 tcagttgaacaag-taactatcaagaataggtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcatttgttttcagcaagatagat 21755062  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttc 185  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21755061 ttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttc 21755002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 26 - 454
Target Start/End: Original strand, 10466902 - 10467330
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || ||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||     
T  10466902 tcagttgaacaaagttacagtaaagaacaggtatccacttccgagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcagtaagattgac 10467001  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||  | || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||  |||| || ||||| ||||| |||||||    
T  10467002 ttgaggtctggttaccatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgataaagtcattacgaatacaaagtgatgcctt 10467101  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||   || || || ||||| || ||||||||| |    
T  10467102 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttatggataagtttgttgtggtgtttattgatgatattct 10467201  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
     || || ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||| | |||||| ||||   | ||||| || ||||| || |||||     
T  10467202 aatctattccaagaatgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagttttgaaagaaaagaggttgtatgcaaagttgtcaaaatgtgag 10467301  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 454  Q
    |||||||| |  ||||| |||||||||||    
T  10467302 ttctggttaagcgaagtgagttttctggg 10467330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 27 - 270
Target Start/End: Original strand, 18963142 - 18963385
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||| || || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||   || || |||||||||||||    
T  18963142 cagttgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgatttgatgtatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgatt 18963241  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| || || |||||||| || || ||||||  ||| ||||||||    
T  18963242 tgagatcgggctatcaccagattaaagtgaaagatgacgatatgcagaagacgacttttaggacacgttatggacattacgaatattcagtgatgccttt 18963341  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatc 270  Q
    |||||| || |||||||| || || ||||||||||| |||||||    
T  18963342 cggtgttactaatgcaccaggtgtatttatggagtacatgaatc 18963385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 51 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 19881501 - 19881086
Alignment:
Q  51 aataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagatta 150  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| ||| | || || ||||| |    
T  19881501 aatagatatccgcttccgaggattgacgacttgatggatcagttggttggtgcaaagatttttagtaaaattgacttgaggtcaggttaccatcagatca 19881402  T
Q  151 aagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagt 250  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| || || || || || |||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  19881401 aggtgaaagatgaagacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacaaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgt 19881302  T
Q  251 gtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaa 350  Q
    ||| ||||||||||||||| | || || ||||| |   |||||  ||| || ||||||||||| ||||| |||||||| || || |  ||||| |||||     
T  19881301 gttcatggagtatatgaataggatttttcatgcttacctggataaatttgtggttgtgttcattgatgacattttgatctattcgagaactgaggaagag 19881202  T
Q  351 catgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttc 450  Q
    ||||| || ||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| |  ||||| |||||||    
T  19881201 catgcagaacatctgaggattgtattgcaagtattgaaagagaagaaactgtatgccaaattgtcaaagtgcgagttctggttaagtgaagtgagttttc 19881102  T
Q  451 tgggcgatgttatttc 466  Q
    | ||| || |||||||    
T  19881101 ttggccatattatttc 19881086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 48 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 18796896 - 18796494
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 147  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| ||| | || || ||||    
T  18796896 aagaacaggtatccgcttccgaggattgacgacttgatggatcagttggttggtgcaaagatttttagtaaaattgacttgaggtcaggctaccatcaga 18796797  T
Q  148 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 247  Q
    | || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||| || |||||||| || ||||||||| |||| || ||||  |||||    
T  18796796 tcaaggtgaaggatgaggatatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcagtgttactaatgtgcctgg 18796697  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| | | |||||  ||| || ||||| ||||| ||| | |||||||| || || |  |||||||||    
T  18796696 tgtgttcatggagtatatgaacagaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtattcattgataacattttgatctattctagaactgaagaa 18796597  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 447  Q
    || ||||| || |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||  | ||||| |||||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||    
T  18796596 gagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaagtgtgagttctggttaaatgaagtgagtt 18796497  T
Q  448 ttc 450  Q
    |||    
T  18796496 ttc 18796494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 26 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 19455251 - 19454827
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || | ||| ||| ||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||   || || || |||||| |     
T  19455251 tcagttgaacaaagttacgataacgaacaggaatccact-ccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcacgtgtatttagtaagatttac 19455153  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| || || || || || |||||||| || ||||| || || ||| |||    
T  19455152 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaagatatgtagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgtctt 19455053  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |  ||||||  ||| || ||||| || || ||||| || ||    
T  19455052 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacttggataaatttgtggttgtatttattgatgacatctt 19454953  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    |||||| || |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| | |||||| |||||  | |||||||| ||||| ||||||||     
T  19454952 gatttattcaaagactaaagaagagcatgcagagcatctgaagatagtattgcaagttttgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcaaagtgtgag 19454853  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
    |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  19454852 ttctggttaagtgaagtgagttttct 19454827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 30 - 391
Target Start/End: Original strand, 28280870 - 28281231
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 129  Q
    |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| | || |||||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  28280870 ttgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggaccagctggtaggtgcaaaggtgttcagtaagattgacttga 28280969  T
Q  130 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 229  Q
    | ||| | || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || || || || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  28280970 ggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcgg 28281069  T
Q  230 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    ||| || || || || || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||||  |||||| || || || || ||||| ||| |||||    
T  28281070 tgttactaacgcgccgggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgacattctgatt 28281169  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaaga 391  Q
    || || |||||||||| ||| ||||| || |||||||  ||||| |||||||| | ||||||    
T  28281170 tattcgaagactgaaggagagcatgcagaacatctgagaattgtgttgcaagttttgaaaga 28281231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 26 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 19437230 - 19436801
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||| || ||||||||     
T  19437230 tcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggatttatgacttgatggatcagttggtgggtgcagaggtttttagtaagattgac 19437131  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||||| || || ||||| || || |||||||    
T  19437130 ttgaggtcaggttaccatcagatcaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacagcctttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctt 19437031  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||| ||| | ||||| |||||||||||||| |  || |||||||| | | |||||  ||| || |||||||| || ||||| ||| |    
T  19437030 tcggtgttactaatgcgcctagtgtgttcatggagtatatgaaccaaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacattct 19436931  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    ||| || || |  ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||| |    ||||||||  |  | |||||||| ||||| ||||||||     
T  19436930 gatctattctagaactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaaattctaaaagagaaagagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgag 19436831  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggc 455  Q
    ||||| || |  ||||| ||||||||||||    
T  19436830 ttctgcttaagtgaagtgagttttctgggc 19436801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 26 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 24366640 - 24366212
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  ||||||| |||||||||    
T  24366640 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagattttcagtaagattgat 24366541  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  24366540 ttgaggtctggttatcatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcaaaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 24366441  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||  || || || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||   || || || ||||| || |||||||||||    
T  24366440 tcggtgttactaatgtgccaggtgtatttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatttt 24366341  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
     || || ||||||| ||| || || ||||| ||||| ||||  ||||| |||||||||| ||| || ||||   | ||||| || ||||| ||||||||     
T  24366340 aatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcacctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgcaaagttgtcgaagtgtgag 24366241  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 454  Q
    |||||||| |  ||||| || ||||||||    
T  24366240 ttctggttaagtgaagtgagctttctggg 24366212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 26 - 466
Target Start/End: Original strand, 34643639 - 34644079
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  |||| || || |||||     
T  34643639 tcagttgaataaagttacgataaagaacagatatcctcttccgagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgccaagatttttagtaaaattgac 34643738  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | || || || || || |||||||||||||| ||||||||||| || || || || || |||||||| || |||||||| || |||||||    
T  34643739 ttgaggtcaggttaccatcaaatcaaggtgaaagatgaagacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctt 34643838  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||||||| | || || ||||| | | |||||  ||| || ||||||| ||| ||||| |||||    
T  34643839 tcggtgttactaacgcgcctggggtgttcatggagtatatgaatagaatttttcatgcttatctggataaatttgtggttgtgtacattgatgacatttt 34643938  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    ||| || || |  || || ||||| ||||| || ||||| |  ||||| |||||||| | ||||||||||||  | ||||| |||||||| ||||||||     
T  34643939 gatctattcgacaacggaggaagagcatgcagaacatctaagaattgtgttgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaagtgtgag 34644038  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||| |  ||||||||||| || ||| || |||||||    
T  34644039 ttctggttaagtgaagtaagtttccttggccatattatttc 34644079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 26 - 232
Target Start/End: Original strand, 24516461 - 24516667
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||     
T  24516461 tcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtttttagtaagattgac 24516560  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | || || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  24516561 ttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctt 24516660  T
Q  226 tcggtgt 232  Q
    |||||||    
T  24516661 tcggtgt 24516667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 26 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 21473828 - 21473404
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||| | ||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    || |||| ||| ||||||    
T  21473828 tcagttgaataaagtgacgataaagaacatgtatcgacttcctagaattgatgatttaatgaatcagttagtgggtgctcgtgtgttcaacaaaattgat 21473729  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || || || || || ||||| || ||||| ||||| || ||| |||    
T  21473728 ttgaggtcaggttaccatcagattaaagtgaaggatgaggatatgcagaaaacggcctttaggacacgatatggacattatgagtataaggtgatgtctt 21473629  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||| ||| || ||||| | ||| |||||||||||||||||||| || || || ||||| | | |||||  ||| || |||||||| ||  |||||||  |    
T  21473628 tcgatgttactaatgcgc-tggtgtgtttatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttatttatgatatcct 21473530  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
     ||||| || |||| |||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||  | ||||  || ||||| || ||||||    
T  21473529 aatttattctaagaatgaagaggagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagaaaggaagttgtatgtcaagttgtccaaatgtgaa 21473430  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||    
T  21473429 ttctggttaagtgaagtaagttttct 21473404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 264 - 466
Target Start/End: Original strand, 18196024 - 18196226
Alignment:
Q  264 atgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatc 363  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| || || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||| |||||     
T  18196024 atgaatcgtatttttcatgcgtttttggatcgttttgtggttgtgttcatttatgatattttgatatactccaagtccgaagaagagcatgctaagcatt 18196123  T
Q  364 tgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttat 463  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||| |||||||| || || | |||||| ||| |||||||    
T  18196124 tgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagctatatgctaaattgtcaaagtatgaattttggttgaaagatgtgaattttcttggccatgttat 18196223  T
Q  464 ttc 466  Q
    |||    
T  18196224 ttc 18196226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 27 - 448
Target Start/End: Original strand, 16380427 - 16380848
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || || || ||||||||||    
T  16380427 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 16380526  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  ||||||||    || || || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  16380527 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 16380626  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     || ||  | |||||||| || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || || || || |||||||| ||||||||||||    
T  16380627 tggagtatctaatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 16380726  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
     | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||  |  | | ||| || |||||||||||||| |    
T  16380727 gtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagt 16380826  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttt 448  Q
    | |||||||||||||| |||||    
T  16380827 tttggttgaaggaagtgagttt 16380848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 27 - 181
Target Start/End: Original strand, 30679061 - 30679215
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   || || |||||||||||||    
T  30679061 cagttgaacaaagtgacaataaagaataggtatctacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtacacgtgtgtttagcaagattgatt 30679160  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagc 181  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  30679161 tgagatcaggctatcatcagattaaagtgacggatgaggatatgcagaagacagc 30679215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 27 - 448
Target Start/End: Original strand, 16648023 - 16648444
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || || ||||||||||    
T  16648023 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcaaaggtgtttagtaagattgatt 16648122  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  ||||||||    || || || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  16648123 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcagaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 16648222  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     || ||  | ||||| || || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || || || || |||||||| ||||||||||||    
T  16648223 tggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 16648322  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
     | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||  |  | |  || || |||||||||||||| |    
T  16648323 gtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgcgccaagttgtctaagtgtgagt 16648422  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttt 448  Q
    | |||||||||||||| |||||    
T  16648423 tttggttgaaggaagtgagttt 16648444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 451
Target Start/End: Original strand, 21568046 - 21568469
Alignment:
Q  28 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 127  Q
    |||||||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||  | ||||||||  |||| || |||||||| ||    
T  21568046 agttgaacaaagtgacgataaagaacaggtatccgctgccgaggattgacgacttgatggatcaattgtttggtgcaaagatttttagtaagattgactt 21568145  T
Q  128 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 227  Q
    ||| ||| | || || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || || || || | ||||||||| || ||||| ||||| ||| |||||    
T  21568146 gaggtcaggttaccatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacactttatggtcattacgaatacaaagtgatgtctttc 21568245  T
Q  228 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttga 327  Q
    ||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||| |||||  |||  | ||||| || || ||||||||| |||    
T  21568246 ggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttttctggataaatttatggttgtatttattgatgatattctga 21568345  T
Q  328 tttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaatt 427  Q
    |||| || ||||| ||||| || ||||  || ||||||| |||||  ||  | || | |||||| |||||  | |||||||| ||||| || ||||||||    
T  21568346 tttattctaagaccgaagaggagcatgtagaacatctgaggattgaattataggttttgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcgaaatgtgaatt 21568445  T
Q  428 ctggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
    |||| | |  ||||||||||||||    
T  21568446 ctggctaattgaagtaagttttct 21568469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 23998475 - 23998352
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || || |||||||||||||    
T  23998475 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcagaggtgtttagcaagattgatt 23998376  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagatta 150  Q
    |||||||| | ||||| |||||||    
T  23998375 tgagatcaggatatcatcagatta 23998352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 27 - 448
Target Start/End: Original strand, 1646868 - 1647289
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||  | || || || ||||||||||    
T  1646868 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgctgaggtgtttagtaagattgatt 1646967  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| |||||| |  ||||||||    || || || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  1646968 tgagatcaggatatcatcagattagagtgaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 1647067  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     || ||  | ||||| || || || |||||||| ||||||||| | || || ||| | | | |||| || || || || |||||||| ||||| ||||||    
T  1647068 tggagtatctaatgcgccaggtgtctttatggaatatatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgacattttg 1647167  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
     | || || |||  ||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| | |||||| ||     | | ||| || |||||||||||||| |    
T  1647168 gtgtattcgaagtttgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagataaccggttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagt 1647267  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttt 448  Q
    | |||||||||||||| |||||    
T  1647268 tttggttgaaggaagtgagttt 1647289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 307 - 466
Target Start/End: Original strand, 18965629 - 18965788
Alignment:
Q  307 tgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgc 406  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  | ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| || ||||||  ||||||||||||  | |||||    
T  18965629 tgttcattgatgatattttgatatatgctaagtctgaagaagaacattctgagcatttgaagattgtttttcaagtgatgaaagagaagaagttatatgc 18965728  T
Q  407 taaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| || ||| || |||||||    
T  18965729 taagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagtttccttggccatattatttc 18965788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 151
Target Start/End: Original strand, 8761805 - 8761930
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| |  || || ||||| | ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  8761805 tcagttgaacaaaggtacaataaagaacaagtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcgaaagttttcagcaagattgac 8761904  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaa 151  Q
    ||||| ||| | || || ||||||||    
T  8761905 ttgaggtcaggttaccatcagattaa 8761930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 14130696 - 14130566
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||| || || || || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||  |||| || |||||||||||||    
T  14130696 cagttgaacaaagtgacgattaaaaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcggaagtgtttagcaagattgatt 14130597  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaa 157  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  14130596 tgaggtcaagatatcatcagattagagtgaa 14130566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 16100242 - 16100112
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| |||||| | || || || ||||||||||    
T  16100242 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccactaccaaggattgatgatttgatggatcaactagttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 16100143  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaa 157  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||||||    
T  16100142 tgagatcaggatatcatcagattatagtgaa 16100112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 219 - 466
Target Start/End: Original strand, 19487528 - 19487765
Alignment:
Q  219 atgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatg 318  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||          |||| | ||||||||| || || ||||| || || ||||    
T  19487528 atgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtacatgaat----------atgcttatttggatcggtttgtggttgtttttattgatg 19487617  T
Q  319 atattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaa 418  Q
    | || |||||||| || ||| |||||||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||||||| ||| |  |||||  | ||||| || ||||| ||    
T  19487618 acatcttgatttattctaagtctgaagaagagcatgcagagcatttaaagattgtgttgcaagtgttgaaggtaaagaagttgtatgccaagttgtccaa 19487717  T
Q  419 gtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
     |||||||||||||| |  |||||||||||||| ||| || |||||||    
T  19487718 atgtgaattctggttaagtgaagtaagttttcttggccatattatttc 19487765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 157
Target Start/End: Original strand, 23025800 - 23025930
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||   | || || || ||||||||||    
T  23025800 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgcttccgaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgtggaggtgtttagtaagattgatt 23025899  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaa 157  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  23025900 tgaggtcaagatatcatcagattagagtgaa 23025930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 23080650 - 23080573
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgca 104  Q
    |||||||| || ||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23080650 cagttgaataaagtaacgataaagaatagatattcacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgca 23080573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 27 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 28311857 - 28311819
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccactt 65  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28311857 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccactt 28311819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 62
Target Start/End: Original strand, 23496245 - 23496281
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatcca 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23496245 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatcca 23496281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 396
Target Start/End: Original strand, 5295573 - 5295629
Alignment:
Q  340 ctgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaaga 396  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  5295573 ctgaagaagagcatgcagagcatctgaaaattgtgttgcaagtgttgaaagaaaaga 5295629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 18450702 - 18450579
Alignment:
Q  55 ggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagt 154  Q
    |||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||||||    || ||||| || ||||| || || ||  | |||||| |||| |||||    
T  18450702 ggtatccacttccgaggatcaacgatttgatggatcaattagtgggtgcgcttgtgttcagtaaaattgacttaagctcgggctatcactagatcaaagt 18450603  T
Q  155 gaaagatgaagatatgcagaagac 178  Q
    |||||| || ||||| ||||||||    
T  18450602 gaaagaagaggatattcagaagac 18450579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 404 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 16234878 - 16234828
Alignment:
Q  404 tgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctggg 454  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||    
T  16234878 tgctaagttgtctaagtgtgaattttggttgaaggaagggagtttcctggg 16234828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 368 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 18578095 - 18578015
Alignment:
Q  368 gattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttt 448  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||  || | | |||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||    
T  18578095 gattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccaattatgtgctaagttgtctaagtatgagttttggttgaaggaagtgagttt 18578015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 353; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 466
Target Start/End: Original strand, 37731 - 38171
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  37731 tcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggattagttagtgggtgcacatgttttcagcaagattgat 37830  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37831 ttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgaatataaagttatgcctt 37930  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  37931 tcggtgttacgaatgcacctggagtgtttatggagtatataaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgcggttgttttcatcgatgatatttt 38030  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  38031 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgag 38130  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  38131 ttctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttc 38171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 27 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 23099 - 22661
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    | || |||||||||||||    
T  23099 cagttgaataaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaatagatgatttgatggatcagttagtgggtgaatgtctgtttagcaagattgatt 23000  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||  | || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || || || |||||||| || || ||||||   || ||||||||    
T  22999 tgagatcgggctaccaccagattaaagtgaaagacgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatattcggtgatgccttt 22900  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    || ||| || | ||| || || |||||||||||||| |||||||| || || ||||| | ||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  22899 cgttgttacaactgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcgtatttggatcacttcgtggttgtgttcatcaatgatattttg 22800  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    || ||||| ||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||||  ||| || |||||  | ||||| || ||||| |||||||| |    
T  22799 atatactctaagtctgaagaagaacacactgagcatttgaagattgttttgcaagtgccgaaggaaaagaagttatatgccaagttgtcaaagtgtgagt 22700  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttattt 465  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||    
T  22699 tctggttgaatgaggtaagttttcttggccatgttattt 22661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 352; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 9760 - 9321
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||    
T  9760 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatctgatggatcagttagtgggtacacgtgttttcagcaagattgatt 9661  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9660 tgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 9561  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  9560 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtattcatcgatgatattttt 9461  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  9460 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagt 9361  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  9360 tctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgttatttc 9321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 338; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 35891 - 35450
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  35891 tcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgat 35792  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35791 ttgaggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 35692  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  35691 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtggttgttctcatcgatgatatttt 35592  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  35591 aatttactccaagaccgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgag 35492  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaa-gttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||||||||| || |||| ||||| | ||| ||||||||||    
T  35491 ttctggttgaaagaggtaaggttttgttggccatgttatttc 35450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 112 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 28408 - 28225
Alignment:
Q  112 tcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaata 211  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28408 tcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaata 28309  T
Q  212 taaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcg 295  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28308 caaagttatgccttttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcg 28225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 3111 - 2686
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||   || || || || ||||||    
T  3111 tcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgacgattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagtaaaattgat 3012  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | || || ||||||||   ||| ||||| ||||||||||||||  | || || ||  | ||||| || || ||||||||||| |||||||    
T  3011 ttgaggtcaggttaccatcagattaagtcgaaggatgaggatatgcagaagacgacctttaggacatgatatggacattacgaatataaagtgatgcctt 2912  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| |   |||||  |||||| |||||||| || ||||| || ||    
T  2911 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattcgtggttgtgtttattgatgacatctt 2812  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  | ||||| || |||||||| |||||     
T  2811 gatttattcaaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagagaagaagttgtatgccaagttgtctaaatgtgag 2712  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||    
T  2711 ttctggttaagtgaagtaagttttct 2686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #4
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 22 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 28475 - 28405
Alignment:
Q  22 atcatcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcag 92  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28475 atcatcagttgaataaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcag 28405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 332; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 463
Target Start/End: Original strand, 85709 - 86144
Alignment:
Q  28 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||    
T  85709 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttacgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagtaagattgattt 85808  T
Q  128 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 227  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  85809 gagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttt 85908  T
Q  228 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttga 327  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  85909 ggtgttaccaatgcacctggagtgtttatagagtaaatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgttttcatcgatgacattttga 86008  T
Q  328 tttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaatt 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  86009 tttactccaagactgaagaagaacatattgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaggagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgaatt 86108  T
Q  428 ctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttat 463  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||    
T  86109 ctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttat 86144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 85142 - 85581
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  85142 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttacgaggattgatgatttgatggatcagttagtgggtacaaaagttttcagcaagatagatt 85241  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  85242 tgagataaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacacggtatggtcactatgagtacaaagttatgccttt 85341  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||     
T  85342 cggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttagatcggttcgtggttgtttttattgatgatatttta 85441  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  85442 atttcctccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagcttgttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgcgaat 85541  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| ||  ||||||||||    
T  85542 tctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttc 85581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 169
Target Start/End: Original strand, 132401 - 132543
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||| ||  | || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||| | || || || ||||||||||    
T  132401 cagttgaacaaagtggcgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 132500  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatat 169  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||| || | |||||||||    
T  132501 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggctgaagatat 132543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 26162 - 26031
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||  || || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||  | || |||||| | || || || |||||||||    
T  26162 tcagttgaacattgtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatgtatcatcttgttggtgcagaggtgtttagtaagattgat 26063  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaa 157  Q
    ||||||||| | ||||| | ||||| ||||||    
T  26062 ttgagatcaggatatcatccgattagagtgaa 26031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #5
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 341 - 448
Target Start/End: Original strand, 132715 - 132822
Alignment:
Q  341 tgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaa 440  Q
    ||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||  |  | | |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  132715 tgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagttttgaaagagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaa 132814  T
Q  441 gtaagttt 448  Q
    || |||||    
T  132815 gtgagttt 132822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #6
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 306 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 25941 - 25799
Alignment:
Q  306 gtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatg 405  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||  |||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||  | ||| |||||  | || | ||    
T  25941 gtgttcatagatgatattttggtatattcgaaatctgaggaagaacatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagatttgaaggagaaccagctatgtg 25842  T
Q  406 ctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttt 448  Q
    |||| ||  |||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  25841 ctaagtttcctaagtgtgagttttggttgcaggaagtaagttt 25799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 329; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 10865 - 10429
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  10865 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatcgacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatttga 10766  T
Q  130 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 229  Q
    | ||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10765 ggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacgactttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttgg 10666  T
Q  230 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10665 tgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtattcatcgatgatattttgatt 10566  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattct 429  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  10565 tactccaagactgaaaaagaacatgctgagcatctaaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagttct 10466  T
Q  430 ggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||||  ||||| ||||| || ||| ||||||||||    
T  10465 ggttgagagaagtgagtttccttggccatgttatttc 10429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 17327 - 16891
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  17327 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatcgacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatttga 17228  T
Q  130 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 229  Q
    | ||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17227 ggtcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaggatatgcagaagacggctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttgg 17128  T
Q  230 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17127 tgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcacatcttccatgcatttttggattggttcgtagttgtattcatcgatgatattttgatt 17028  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattct 429  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  17027 tactccaagactgaaaaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgagttct 16928  T
Q  430 ggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||||  ||||| ||||| || ||| ||||||||||    
T  16927 ggttgagagaagtgagtttccttggccatgttatttc 16891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 45541 - 45106
Alignment:
Q  31 tgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgag 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  45541 tgaacaaggtaactatcaagaataggtatccgcttccaagaattgacgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatttgag 45442  T
Q  131 atcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggt 230  Q
     ||| | |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  45441 gtcaggttatcaccagattaaggtaaaggatgaggatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggt 45342  T
Q  231 gtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgattt 330  Q
    || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45341 gttaccaatgcacctagagtatttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgtgttcatcgatgatattttgattt 45242  T
Q  331 actccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctg 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45241 actccaagactgaagaagaacatgctgatcatctgaagattgtcttgcaagtattgaaagagaaaaaactttatgccaaattgtctaagtgtgaattctg 45142  T
Q  431 gttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||| || || |||||||| ||| ||||||||||    
T  45141 gttgaaagaggtgagttttcttggccatgttatttc 45106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 48 - 466
Target Start/End: Original strand, 48447 - 48865
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 147  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||| || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| ||| | || || ||||    
T  48447 aagaatagatatccgcttccgagaattgacgacctgatggatcagttggttggtgcaaagatttttagtaaaattgacttgaggtcaggttaccatcaga 48546  T
Q  148 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 247  Q
    | || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || || |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  48547 tcaaggtgaaagatgaggacatgcagaagactgcctttagcacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 48646  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     ||||| ||||||||||||||  | || || ||||| |   |||||  ||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |  ||||| |||    
T  48647 tgtgttcatggagtatatgaacagaatttttcatgcttacctggataaatttgtggttgtattcattgatgacattttgatctattcgagaactgaggaa 48746  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 447  Q
    || ||||| || ||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||  | ||||| |||||||| ||||| || || ||||| |  ||||| ||||    
T  48747 gagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcaaagtgcgagttttggttaagtgaagtgagtt 48846  T
Q  448 ttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||| ||| || |||||||    
T  48847 ttcttggccatattatttc 48865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 30 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 36417 - 35981
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 129  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  36417 ttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgagaattaatgatttgatggatcagttagtgggttgaaaagttttcagcaagatagatttga 36318  T
Q  130 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 229  Q
    ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36317 gatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgagtataaagttatgcctttcgg 36218  T
Q  230 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    ||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  36217 tgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcacatctttcatgcatttttggatcgatttgtggttgttttcattgatgatattttaatt 36118  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattct 429  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  36117 tactctaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttaatagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttct 36018  T
Q  430 ggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    || |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  36017 ggatgaaagaagtaagttttcttggccatgttatttc 35981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 30 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 20993 - 20557
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 129  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  20993 ttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgagaattaatgatttgatggatcagttagtgggttgaaaagttttcagcaagatagatttga 20894  T
Q  130 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 229  Q
    ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  20893 gatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcactatgagtacaaagatatgcctttcgg 20794  T
Q  230 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    ||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  20793 tgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcacatctttcatgcatttttggatcgatttgtggttgttttcattgatgatattttaatt 20694  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattct 429  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  20693 tactctaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttaagagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttct 20594  T
Q  430 ggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    || |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  20593 ggatgaaagaagtaagttttcttggccatgttatttc 20557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 26 - 466
Target Start/End: Original strand, 54902 - 55342
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  54902 tcagttgaacaaagtaactatcaagaatagatatccacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgat 55001  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55002 ttgagatcaggttataaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacacgatatggtcactatgaatataaagttatgcctt 55101  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||| ||  | |||||||||||    
T  55102 ttggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtaattgaatcgcatcttccatgcatttttggatccctttgtggttgtttttctggatgatatttt 55201  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  55202 tatttactccaatactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtttaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgag 55301  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||||  | ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  55302 ttctggttgaaaaaggtaagttttcttggccatgttatttc 55342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 28 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 110023 - 109585
Alignment:
Q  28 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 127  Q
    ||||||||| ||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||   || || || || ||||||||    
T  110023 agttgaacatggttacgataaagaacaggtatccgcttccgagaattgacgatttaatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagtaaaattgattt 109924  T
Q  128 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 227  Q
    ||| ||  | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || |||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  109923 gaggtctggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattatgaatataaggtgatgcctttc 109824  T
Q  228 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttga 327  Q
    ||||| || ||||  ||| | ||||||||||||| |||||| || || |||||||| | | | |||  ||| || |||||||| || ||||| ||  |||    
T  109823 ggtgttactaatgtgcctagtgtgtttatggagtctatgaaccgaattttccatgcctatctagataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcgtga 109724  T
Q  328 tttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaatt 427  Q
    |||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||  | ||||| |||||||| || || || ||    
T  109723 tttattctaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcaaaatgcgagtt 109624  T
Q  428 ctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||| |  |||||||||||||| ||| || |||||||    
T  109623 ctggttaagtgaagtaagttttcttggccatattatttc 109585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 28 - 436
Target Start/End: Original strand, 51258 - 51666
Alignment:
Q  28 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 127  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  51258 agttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgattt 51357  T
Q  128 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 227  Q
    ||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  51358 gagatcgggttatcaccagattaaggtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaagtcatgcctttt 51457  T
Q  228 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttga 327  Q
    ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  || || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  51458 ggtgttaccaatgcacctcgagtatttatggagtatatgaatcgcatctttcatgcacttttggatcactttgtggttgttttcatcgatgacattttga 51557  T
Q  328 tttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaatt 427  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||    
T  51558 tttactccaagactgaagaagaagatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaactatctaagtgtgagtt 51657  T
Q  428 ctggttgaa 436  Q
    || ||||||    
T  51658 ctagttgaa 51666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 42091 - 41667
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    || || || || ||||||    
T  42091 tcagttgaataaagtgacgattaagaacaggtatccacttccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgctcgtgtgtttagtaaaattgat 41992  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || || || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  41991 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaatacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctt 41892  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    |||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | || || ||||| | | |||||  ||| || |||||||| || ||||| || ||    
T  41891 tcggagttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaacagaattttgcatgcttatatggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatctt 41792  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
     ||||| || |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||  | ||||  ||  |||| |||||||||    
T  41791 aatttattctaagaatgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaagtgttg-aagaaaagaagttgtatgacaagctgtccaagtgtgaa 41693  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
    ||||||||    ||||||||||||||    
T  41692 ttctggttacgcgaagtaagttttct 41667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 280; Significance: 1e-156; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 3826 - 3387
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||     
T  3826 cagttgaacaaagtaacaataaagaataggtatccactttcgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaagtgttttcagcaagatagatc 3727  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  3726 tgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcagtatggacattatgagtataaagttatgccttt 3627  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    |||||| || ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  3626 cggtgttactaattcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgttttgtggttgttttcattgatgatattttg 3527  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3526 atttactccaactctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaattgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgaat 3427  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  3426 tctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgttatttc 3387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 27 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 151504 - 151080
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  151504 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagatagatt 151405  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  151404 tgagatctggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgagtacaaagttatgccttt 151305  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    |||||| |  ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||| |||||||     
T  151304 cggtgttatgaatgcacttggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttatcgataatatttta 151205  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  151204 atttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggtgttgcaagtgttgaaagagaataagctttatgcgaaattgtctaagtgcgaat 151105  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
    |||||||||| ||||| || |||||    
T  151104 tctggttgaaagaagtgagctttct 151080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 2417 - 2856
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||   || || |||||||||||||    
T  2417 cagttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttgatggatgaattagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgatt 2516  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||     
T  2517 tgagatccggttatcaccatattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacgcgttatggacattatgagtataaagtgatgccttc 2616  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| || || || | ||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  2617 tggtgttacaaacgcgcttggtgtgtttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgtattcattgatgatattttg 2716  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  2717 atttactccaagtctgaggaagaacatgctgagcatttgaagactagtttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatcaaagtgtgaat 2816  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||  | |||||||| ||| ||||||||||    
T  2817 tctggttgaaagagatgagttttcttggccatgttatttc 2856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 111 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 87078 - 86724
Alignment:
Q  111 ttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaat 210  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  | ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || || || || ||||| || || ||  |||    
T  87078 ttcagtaagattgatttaagatcgggctatcaccagatcaaagtgaaagatgaggatattcagaagacggcctttaggacacgttacggacattacaaat 86979  T
Q  211 ataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgtt 310  Q
    ||    | |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||||||||  || || ||||| | |||| ||||||| || ||| ||||    
T  86978 attcgatgatgcctttcggtgttactaacgcccctggagtgtttatggaatatatgaatcatatttttcatgcttatttgaatcgatttgttgttatgtt 86879  T
Q  311 catcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaa 410  Q
     || ||||| ||| | || ||||| ||||| || || |||||||| |||||| | |||| ||| |||||||||  ||| ||||| ||  | |||||  |     
T  86878 tatagatgagattctaatatactctaagaccgaggaggaacatgccgagcat-ttaagaatgttttgcaagtgctgaaggagaataagttatatgcctag 86780  T
Q  411 ttgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||    
T  86779 ttatcgaagtgcgaattctggttgaacgaagtaagttttcttggccatattatttc 86724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 2)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 17035 - 16596
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17035 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagatagatt 16936  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  16935 tgagatcaggttatcaccagattaaagtgaaaggtgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggtcattatgagtacaaagttatgccttt 16836  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||    
T  16835 cggtgttacaaatgcaccaggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcacttttggatcggttcgtggtggtttttatcgatgatattttg 16736  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||    
T  16735 atttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgtaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaattgcgaat 16636  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| ||  ||||||||||    
T  16635 tctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttc 16596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 48 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 12167 - 11748
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattga-tttgagatcaaggtatcaccag 146  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||   || || || || ||||| |||||| ||| | || || |||    
T  12167 aagaacaggtatccacttccgagaattgacgatttaatggatcaattagtgggtgcacgtgtgtttagtaaaattgaatttgaggtcaggttaccatcag 12068  T
Q  147 attaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctg 246  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||    
T  12067 attaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctg 11968  T
Q  247 gagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaaga 346  Q
    | ||||||||||||||||||||  | || || ||||| | | |||||  ||| || |||||||| || ||||||||  | ||||| || |||| ||||||    
T  11967 gtgtgtttatggagtatatgaacagaatttttcatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcctaatttattctaagaatgaaga 11868  T
Q  347 agaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagt 446  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||  | ||||| || ||||| || ||||||||||||||||  ||| |||||    
T  11867 agagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttgagtgaattaagt 11768  T
Q  447 tttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||| ||| || |||||||    
T  11767 tttcttggccatattatttc 11748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 24857 - 25296
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |    
T  24857 cagttgaacaaaataacgataaagaataggtatccacttccgataattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaagtgttttcagcaagattgact 24956  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  24957 tgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgatgatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggacaatatgaatataaagtgatgccttt 25056  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| | || || || |||||||||    
T  25057 cggtgttacaaatgcacctgaagtgtttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgtttcgtggttctttttattgacgatattttg 25156  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25157 atttactccaagattgaggaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagataagaaactttatgctaaattatctaagtgtgaat 25256  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||| | |||||||| ||  ||||||||||    
T  25257 tctggttgaaagaattgagttttcttggatatgttatttc 25296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 2)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 7571 - 8010
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  7571 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccactttcaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaatgttttcagcaagatagatt 7670  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  7671 tgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagactgctttcagaacgggttatggacattatgagtacaaagttatgccttt 7770  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| || || ||||||||||||    
T  7771 cggtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcatagttgtttttattgatgatattttg 7870  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| | || |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  7871 atttactccaagtctgaagaagaacatgttgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtatgaat 7970  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| | ||| || ||||| ||  ||||||||||    
T  7971 tctggttgaaaggagtgagctttcttggacatgttatttc 8010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 27 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 3293 - 2884
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   || || |||||||||||||    
T  3293 cagttgaataaagtgacgataaagaataggtacccacttccaagaattgatgatttgatggatcaattagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgatt 3194  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || || || || ||||| || || ||  |||||  ||| ||||||||    
T  3193 tgagatcgggctatcaccagattaaagtgaaagatgaggatatgcagaagatggcctttaggacacgttacggacattacaaatattcagtgatgccttt 3094  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    |||||| || |||||||| || || |||||||| || |||||||| || || ||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3093 cggtgttactaatgcaccgggtgtatttatggaatacatgaatcgtatttttcatgcttatttggatcgtttcgtggttgtgttcatcgatgatattttg 2994  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    || || || ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||  ||||||||||||  | |||||| ||||||| ||||||||||    
T  2993 atataatctaagtctgaagaagaacatgctgaacatttgaagattattttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgctcaattgtcaaagtgtgaat 2894  T
Q  427 tctggttgaa 436  Q
    ||||||||||    
T  2893 tctggttgaa 2884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 1)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 28 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 1157 - 721
Alignment:
Q  28 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 127  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1157 agttgaacaaggtgacaatcaagaataggtatccacttccgagtattgatgatttgatggatcagttggtgggtgcaaaagttttcagcaagatagattt 1058  T
Q  128 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 227  Q
    ||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| |||    
T  1057 gagatc--gttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcggtatggccattatgagtataaggtgatgccgttc 960  T
Q  228 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttga 327  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  959 ggtgttacaaatgcgcctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttatcgatgatattttga 860  T
Q  328 tttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaatt 427  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  859 tttacttcaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaacctttatgcgaaattgtctaagggtgaatt 760  T
Q  428 ctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||  ||||||||||    
T  759 ctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttc 721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0312 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 1)
Name: scaffold0312
Description:

Target: scaffold0312; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 453 - 14
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  453 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatcaacttccaaggattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagatagatt 354  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| || || |||||||||||    
T  353 tgagatcaggttatcaccatattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagccttcagaacgcggtatgctcactatgagtacaaggttatgccttt 254  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  253 cggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgattcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgttttcattgatgatattttg 154  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  153 atttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattatctaagtgtgaat 54  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| ||  ||||||||||    
T  53 tctggttaaaagaagtgagctttcttgggcatgttatttc 14  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 27 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 21639 - 21296
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||| |||||||||||||    
T  21639 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcacgtgtttttagcaagattgatt 21540  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21539 tgaggtcaggatatcaccagattaaagtaaaggatggagagatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggttactatgaatataaagttatgccttt 21440  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||    
T  21439 tggtgttaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcggtttgtggttgtgtttatcgacgatattttg 21340  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagat 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21339 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagat 21296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 104 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 8331 - 7969
Alignment:
Q  104 aaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcac 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  8331 aaaagttttcagcaagattgatttgagatcagggtatcaccatattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaatgctttatggtcac 8232  T
Q  204 tatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtag 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| | |    
T  8231 tatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcacatcttccatgcctttttggatcggttcattg 8132  T
Q  304 ttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaacttta 403  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8131 ttgtgtttatcgacgatattttgatttacttcaaaactgaggaggaacatgctgaacatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaacttta 8032  T
Q  404 tgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  8031 tgctaaattatctaaatgtgagttctggttgaaagaggtaagttttatgggccatgttatttc 7969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 8443 - 8004
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||||||  | || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8443 cagttgaacaaggtgtcaataaagaataggtatccactttcgaggattgatgatttgatggatcaattagtgggtgcaaaagttttcagcaagatagatt 8344  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  8343 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcagtatggtcactatgagtacaaagttatgccttt 8244  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||||    
T  8243 cggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtatatgaatcacatctttcatgcatttttggatcggttcgtgcttgttttcattgatgatattttg 8144  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    ||||||||||||  ||| |||||| ||| ||||||| ||||| | || |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  8143 atttactccaagtttgaggaagaatatgttgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgcgaat 8044  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| ||  ||||||||||    
T  8043 tctggttgaaagaagtgagctttcttggatatgttatttc 8004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 17639 - 17200
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||||||  | || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17639 cagttgaacaaggtgtcaataaagaataggtatccactttcgaggattgatgatttgatggatcaattagtgggtgcaaaagttttcagcaagatagatt 17540  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  17539 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaggatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcagtatggtcactatgagtacaaagttatgccttt 17440  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |  |||| ||||| ||||||||||||    
T  17439 cggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtatatgaatcacatctttcatgcatttttggatcggttcttgcttgttttcattgatgatattttg 17340  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    ||||||||||||  ||| |||||| ||  ||||||| ||||| | || |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  17339 atttactccaagtttgatgaagaatattttgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgcgaat 17240  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| ||  ||||||||||    
T  17239 tctggttgaaagaagtgagctttcttggatatgttatttc 17200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 6999 - 7438
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||   || || |||||||||||||    
T  6999 cagttaaacaaagtgacgataaagaataggtatccacttccaagaattgacgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgatt 7098  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||| | ||    
T  7099 tgagatcaggttatcaccagattaaagtgaaagatggagatatgcagaagacaacttttagaacgcgttatggacattatgagtataaagtgatgtcgtt 7198  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||||    
T  7199 cggtgttacaaatgcacctggtgtgtttatggagtacatgaatcgaatctttcatgcatttttggatcgtttcatggttgtattcatcgatgacattttg 7298  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7299 gtttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaagactgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtcaaagtgtgaat 7398  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||| ||||||||||    
T  7399 tctggttgaatgaggtgagttttcttggccatgttatttc 7438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 8414 - 7975
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  8414 cagttgaataaagtgacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaagtgttttcagcaagatagatt 8315  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||| ||||| || ||||| ||    
T  8314 tgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagttttcagaacgcgttatggagattatgagtataaggtgatgccgtt 8215  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  8214 cggtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgttttgtggttgttttcattgatgatattttg 8115  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||| | || |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  8114 atttactccatgtctgaagaagaacatgctaagcatttgaagctagttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgtgaat 8015  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| ||  ||||||||||    
T  8014 tctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttc 7975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 24570 - 24440
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  | || |||||| | || || || ||||||||||    
T  24570 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgcttccaaggattgatgatttgatggatcaactggttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 24471  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaa 157  Q
    | |||||| | ||||| ||||||| ||||||    
T  24470 taagatcaggatatcatcagattagagtgaa 24440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2004 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold2004
Description:

Target: scaffold2004; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 725 - 1160
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  725 cagttgaaaaaagtaacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggattagttagtgggtgcaagtgttttcagcaagatagatt 824  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||   | ||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  825 tgaga---aagtg-cagaagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcggtatggtcactatgaatataaagtgatgccttt 920  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  || || ||||| ||||| |||| |||||||    
T  921 cggtgttacaaatgcacctggagtgtttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcagtttgtggttgttttcatagatggtattttg 1020  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  1021 atttactccaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattatctaagtgtgaat 1120  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||  ||||||||||    
T  1121 tctggttgaaagaggtgagttttcttggacatgttatttc 1160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 27 - 465
Target Start/End: Original strand, 691 - 1126
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||    
T  691 cagttgaataaggtaacaataaagaataggtatccacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgaacgtgttttcagcaagattgatt 790  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||    
T  791 tgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggacattatgagtataaggtgatgccgtt 890  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    |||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  891 cggtgttacaaatgcacctagagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgttttcattgatgatattttg 990  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    |||||||||||| ||   |||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  991 atttactccaagtct---gaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgtgaat 1087  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttattt 465  Q
    |||||||||  ||||| || ||||| ||  |||||||||    
T  1088 tctggttgagagaagtgagctttcttggacatgttattt 1126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 27 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 41026 - 40588
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  41026 cagttgaacaaagtaacaataaagaataggtatccacttccaagaactgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 40927  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||    
T  40926 tgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagataaagatatgcagaagacagcttttagaatgcgatatggacattatgagtataaagtgatgccttt 40827  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||||| |||||     
T  40826 cggtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggtttttttcattgatgacatttta 40727  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40726 atttactccaagaccgaggaagatcatgctgagcatttgaagactgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgaat 40627  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttattt 465  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||| |||||||||    
T  40626 tctggttgaaagaggtgagttttcttggccatgttattt 40588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 27 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 74746 - 74308
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  74746 cagttgaacaaagtaacaataaagaataggtatccacttccaagaactgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 74647  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||    
T  74646 tgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagataaagatatgcagaagacagcttttagaatgcgatatggacattatgagtataaagtgatgccttt 74547  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||||| |||||     
T  74546 cggtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggtttttttcattgatgacatttta 74447  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  74446 atttactccaagaccgaggaagatcatgctgagcatttgaagactgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgaat 74347  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttattt 465  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||| |||||||||    
T  74346 tctggttgaaagaggtgagttttcttggccatgttattt 74308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 48 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 56128 - 55710
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || || | ||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  56128 aagaataggtatccacttccgagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttaacaagattgatttgagatcgggttatcaccaga 56029  T
Q  148 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  56028 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaacttttagaacgcgatatggacattatgagtataaagtgatgcctttcggtgttacaaatgcccctgg 55929  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  55928 agtgtttatggagtacatgaatcacatttttcatgcattttttgatcgtttcgtggttgttttcattgatgacattttgatttactccaagactgaggaa 55829  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 447  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || || ||||    
T  55828 gaacatgttgagcatttgaagactgttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatcaaagtgtgaattctggttgaaagaggtgagtt 55729  T
Q  448 ttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||| ||  ||||||||||    
T  55728 ttcttggacatgttatttc 55710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 448
Target Start/End: Original strand, 8738 - 9159
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||  | ||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||  | || || || ||||||||||    
T  8738 cagttgaacaatttgactattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgctgaggtgtttagtaagattgatt 8837  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||| ||||| |  || || |  ||||||||    || || || ||  ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  8838 tgagatcaggatatcatcagataagggtaaaggcggaagatatatccaaaaccgcgtttcgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 8937  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     || ||  | |||||||| || || |||||||  || |||||| | || || ||| | | | ||||||| || ||  | |||||||| ||||||||||||    
T  8938 tggagtatctaatgcaccaggtgtctttatgggatacatgaatagaatatttcatccttatctggatcgttttgtgatggtgttcatagatgatattttg 9037  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
     | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||  |  | | || ||| || ||||||||||| |    
T  9038 gtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtattgaaagagaactagttatgtgttaagttatctaagtgtgagt 9137  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttt 448  Q
    | |||||||||||||| |||||    
T  9138 tttggttgaaggaagtgagttt 9159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 27 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 20632 - 20223
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  20632 cagttgaacaaagtgacaataaagaataggtatccacttccaagaattgatgacttaatggatcagttagtgggtgctagtgttttcagcaagattgact 20533  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||    
T  20532 tgagatcaggttatcaacagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcggtatggacattatgagtataaggtgatgccgtt 20433  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    |||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||    
T  20432 cggtgttacaaatgcacctagagtgtttatggagtacatgaatcatatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttattgatgatattttg 20333  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20332 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaagttggttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 20233  T
Q  427 tctggttgaa 436  Q
    ||||||||||    
T  20232 tctggttgaa 20223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 8765 - 8327
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||| ||||| || || |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  8765 cagttgaaaaaggtgacaataaagaataggtattcacttccgaggattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttt-cagcaagatagatt 8667  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  8666 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacatctttcataacgcgttatggtcactatgagtacaaagttatgccttt 8567  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    |||||| || |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  8566 cggtgttacgaatgcacctgtagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgtttttatcgatgatattttg 8467  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    |||||||||||| || | ||||||||| |||||||| ||||| | || |||||||||| |||||| ||||| | |||||| |||||||||||||| ||||    
T  8466 atttactccaagtctaaggaagaacattctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagaaaagaagcattatgcgaaattgtctaagtgcgaat 8367  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| ||  ||||||||||    
T  8366 tctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttc 8327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1602 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold1602
Description:

Target: scaffold1602; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 49 - 466
Target Start/End: Original strand, 1 - 418
Alignment:
Q  49 agaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagat 148  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||    
T  1 agaataggtatccacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgcgtgttcagcaagattgacttgagatcgggttatcaccagat 100  T
Q  149 taaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgga 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||||||||||     
T  101 taaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgtgttatggacattatgagtataacgtgatgccgttcggtgttacaaatgcacctggt 200  T
Q  249 gtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaag 348  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  201 gtgttgatggagtacatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgttttcattgatgacattttgatttactccaagactgaggaag 300  T
Q  349 aacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttt 448  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||    
T  301 aacatgctgagcatttgaagactgtgttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttt 400  T
Q  449 tctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||| ||| ||||||||||    
T  401 tcttggccatgttatttc 418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1423 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 1)
Name: scaffold1423
Description:

Target: scaffold1423; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 27 - 451
Target Start/End: Original strand, 1294 - 1718
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  1294 cagttaaacaaggtgacaataaagaaaaggtatccacttccgaggattgatgattttatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagatagctt 1393  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||  | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  1394 tgagatcgggttatcaccatattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcagtatggccattatgagtacaaagttatgccttt 1493  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||| | ||||| ||||| ||||||||||||    
T  1494 cggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcacatctttcatgcatttttggattggttcatggttgttttcattgatgatattttg 1593  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| | || |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  1594 atttactccaagtctgaagaagaacatgttgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgtgaat 1693  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
    |||||||||| ||||| || |||||    
T  1694 tctggttgaaagaagtgagctttct 1718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 138 - 466
Target Start/End: Original strand, 23097 - 23425
Alignment:
Q  138 tatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgacca 237  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  23097 tatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagcgttcagaacgcgttatggtcactatgagtacaaagttatgcctttcggtgttacca 23196  T
Q  238 atgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaa 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  23197 atgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcacatcttccatgcatttttggatcggttagtagttgtgtttatcgacgacattttgatttactccaa 23296  T
Q  338 gactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaag 437  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||     
T  23297 aactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttacaagtgttgaaagagaagaaactttatgccaaactgtctaagtgtgaattctggttgaaa 23396  T
Q  438 gaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  23397 gaagtgagttttcttggccatgttatttc 23425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 28 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 3974 - 3551
Alignment:
Q  28 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 127  Q
    |||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  3974 agttgaacaaagtaacgataaaaaataggtatccacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagatagattt 3875  T
Q  128 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 227  Q
    ||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  3874 gagatcgggttatcaccatattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagcttttagaacgcgttatggacactatgaatataaagtgatgcctttc 3775  T
Q  228 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttga 327  Q
    ||||| || ||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  3774 ggtgttacaaatgcacctgctgtgtttatggagtacgtgaatcgcatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgttttcattgatgacattttga 3675  T
Q  328 tttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaatt 427  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  3674 tttactccaagactgaggaagaacatgctgagcatttgaagactgttttggaagtgttgaaagagaaaaagttttatgctaaattgtcaaagtgtgaatt 3575  T
Q  428 ctggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
     |||||||| || || ||||||||    
T  3574 atggttgaaagaggtgagttttct 3551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 24445 - 24884
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||||   || || |||||||||||||    
T  24445 cagttgaataaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgacgacttaatggatcaattagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgatt 24544  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  24545 tgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacgcgttatggacattatgaatataaagtgatgccttt 24644  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    |||||| || ||||| || || |||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24645 cggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggaacgtttcgtggttgtgttcatcgatgatattttg 24744  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||| || ||||||||||    
T  24745 atatactcgaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagttatatgctaaattatcaaagtgtgaat 24844  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24845 tctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttc 24884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 150964 - 150539
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||   || || || ||||||||     
T  150964 tcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcacgtgtatttagtaagattgac 150865  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||  | ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  150864 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacatgatatggacactatgaatataaagtgatgcctt 150765  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||| ||| | ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |   |||||  |||| | ||||  || || ||||| |||||    
T  150764 tcggtgttactaatgcgcctagtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaattcatggttgaatttattgatgacatttt 150665  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||  | ||||| || ||||| |||||||||    
T  150664 gatttattctaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaagtgtgaa 150565  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
    |||||||| |  || |||||||||||    
T  150564 ttctggttaagtgaggtaagttttct 150539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 181941 - 181897
Alignment:
Q  404 tgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttt 448  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  181941 tgctaagttgtctaagtgtgaattttggttgaaggaagtgagttt 181897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 3)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 27 - 465
Target Start/End: Original strand, 18253 - 18691
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18253 cagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttctgaggattgatgatttgatggatcagttagtgagtgcaaaagttttcagcaagatagatt 18352  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  18353 tgagatcaggttatcactagattatagtaaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcggtatgatcactatgagtacaaagttatgccttt 18452  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    |||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  18453 cggtgttacgaatgcacctagagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcagttcgtggttgtttttatcgatgatattttg 18552  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||| ||||||| ||||| | || ||||||||||  ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  18553 atttaccccaagtttgaagaagaacatgatgagcatttgaagctggttttgcaagtgttaaaagagatgaagctttatgcgaaattgtctaagtgcgaat 18652  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttattt 465  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| ||  |||||||||    
T  18653 tctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttattt 18691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 22 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 22273 - 22002
Alignment:
Q  22 atcatcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagat 121  Q
    |||||||||||||||| || || || ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| || |||||    
T  22273 atcatcagttgaacaaagttacgataaagaacagatatccacttccgaggattgatgacttgatggaccagttggtgggtgaaaaagtttttagtaagat 22174  T
Q  122 tgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatg 221  Q
     || ||||| ||| | || || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||| ||||| || || || |||    
T  22173 cgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattatgagtacaaggtgatg 22074  T
Q  222 cctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggat 293  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  22073 cctttcggtgttactaacgcacctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggat 22002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 39447 - 39307
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 129  Q
    |||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||||    
T  39447 ttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttcatggaccagttggtgggtgcaaaagtttttagtaagatcgacttga 39348  T
Q  130 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatg 170  Q
    | ||| | || || || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  39347 ggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatg 39307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 7615 - 7176
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |    
T  7615 cagttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttagtgggtgctaatgttttcagcaagattgact 7516  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| || ||||| ||||| || ||| | ||    
T  7515 tgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagcgttcagaacgtggtatggacattatgagtataaggtgatgtcgtt 7416  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    |||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||    
T  7415 cggtgttacaaatgcacctagagtgtttatggagtacatgaatcgtatctttcatgcatttttagatcggttcgtggttgtttttattgatgatattttg 7316  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7315 atttactccaagaccgaggaagaacatgttgagcatttgaagttggttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgcgaaattgtctaagtgtgaat 7216  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||||| || ||||| |||||||| ||  ||||||||||    
T  7215 tctggttaaaagaagtgagttttcttggacatgttatttc 7176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 18042 - 17609
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |   |||||||||||||| ||||    
T  18042 cagttgaacaaagtaacaataaagaataggtatccacttccaataattgatgacttgatggatcagttggtgggtg-acgtgttttcagcaagatagatt 17944  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||    
T  17943 tgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaacttttagaacgcggtatggacattatgagtataaggtgatgccttt 17844  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||     ||    
T  17843 cggtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgttttcaatgatga-----tg 17749  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  17748 atttacttcaatactgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaatctttatgctaaattatctaagtgtgaat 17649  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  17648 tctggttgaaagaagtgagttttcttggccatgttatttc 17609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 4)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 39 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 4296 - 3869
Alignment:
Q  39 gtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggt 138  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||   || || |||||||||||||| |||||  | |    
T  4296 gtaacgataaagaataggtatccgcttccaagaattgatgatttgatggatcattttgtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgatttaagatcgggtt 4197  T
Q  139 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| | || |||||||||||||| ||| |||||||||| || ||    
T  4196 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacacgttatagacattatgaatataaagtgatgtctttcggtgttacaaa 4097  T
Q  239 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaag 338  Q
    | | || || |||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  4096 tacgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgatatactccaag 3997  T
Q  339 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaagg 438  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  3996 actgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgtattgcaagtgctgaaagagaagaagctatatgctaaattgtcaaagtgtgaattctggttgaaag 3897  T
Q  439 aagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    | || |||||||| ||| ||||||||||    
T  3896 aggtgagttttcttggcaatgttatttc 3869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 454
Target Start/End: Original strand, 40244 - 40672
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  | || || |||||||||    
T  40244 tcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatatttagtaagattgat 40343  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||  | ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||    
T  40344 ttgaggtctggttatcatcagataaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 40443  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||   || || || ||||| || |||||||||||    
T  40444 tcggtgttactaatgcgcctggtgtttttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatttt 40543  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
     || || ||||||| ||| || || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| ||| || ||||   | |||||||| || || || |||||     
T  40544 aatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgag 40643  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 454  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||    
T  40644 ttctggttaaatgaagtaagttttctggg 40672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 30 - 268
Target Start/End: Original strand, 45342 - 45580
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 129  Q
    |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  45342 ttgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtttttagtaagattgacttga 45441  T
Q  130 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 229  Q
    | ||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||  || || || || || |||||||| || ||||| || || |||||||||||    
T  45442 ggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagatggcctttaggacacgatatggtcattaagaataaaaggtgatgcctttcgg 45541  T
Q  230 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaa 268  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  45542 tgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaa 45580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 341 - 451
Target Start/End: Original strand, 45626 - 45735
Alignment:
Q  341 tgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaa 440  Q
    ||||||||| |||||  | |||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||  | |||||| ||||||| |||||||| |||||||| |  |||    
T  45626 tgaagaagagcatgcaaaacatctgaagattgtgttacaagttttgaaagagaagaagttgtatgct-aattgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaa 45724  T
Q  441 gtaagttttct 451  Q
    |||||||||||    
T  45725 gtaagttttct 45735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 141 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 4474 - 4150
Alignment:
Q  141 caccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatg 240  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  4474 caccagattaaggtaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcaaaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttttggtgttaccaatg 4375  T
Q  241 cacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagac 340  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || || ||||| || || ||||||||| ||||||||| |||||     
T  4374 cacttggagtgtttatggagtatatgaatcgtatcttccatgcatttttggatggctttgtggttgtttttattgatgatattctgatttacttcaagaa 4275  T
Q  341 tgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaa 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||     
T  4274 tgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtgagttctggttgaaagag 4175  T
Q  441 gtaagttttctgggcgatgttattt 465  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||    
T  4174 gtaagttttcttggccatgttattt 4150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 30 - 466
Target Start/End: Original strand, 14394 - 14830
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 129  Q
    ||||| || ||||| || |||||||  ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||    
T  14394 ttgaataaagtaacgataaagaataaatatccacttccaagaattaatgattttatggatcagttagtgggtgcacgtgtgttcagcaagattgatttga 14493  T
Q  130 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 229  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  14494 gatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagactgcttttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcgg 14593  T
Q  230 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    ||| || ||||| || || |||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||     
T  14594 tgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggatagtttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgata 14693  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattct 429  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  14694 tactccaagattgaagaagaacatgttgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgctaaattgtcaaagtgtgaattct 14793  T
Q  430 ggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
     |||||| || || |||||||| ||| ||||||||||    
T  14794 agttgaaagaggtgagttttcttggccatgttatttc 14830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 13123 - 13562
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||| |  || ||||    
T  13123 cagttgaacaaagtaacgataaagaataagtatccacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagaagaatagatt 13222  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  13223 tgagatcgggttatctccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacacggtatggtcactatgagtacaaagttatgccttt 13322  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| || ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  || |  ||||||||||||    
T  13323 tggtgttacgaatgcacgtggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgatttaaaagatgatattttg 13422  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| | || |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  13423 atttactccaagtctgaagaagaacatgatgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgcgaat 13522  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| ||  ||||||||||    
T  13523 tctggttaaaagaagtgagctttcttggacatgttatttc 13562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 92 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 31274 - 30900
Alignment:
Q  92 gttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacg 191  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31274 gttagtgggtgcaagtgttttcagcaagatagatctgagatcgagttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacg 31175  T
Q  192 cgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttgg 291  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  31174 cggtatggccactatgaatataaagttatgcctttcggtgttacaaatgcacctagagtatttatggagtgcatgaatcgcatctttcatgcatttttgg 31075  T
Q  292 atcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaaga 391  Q
    |||| ||| | ||||| || || |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||| ||||||    
T  31074 atcggttcatggttgtttttattgatgatattttgatttactccaagtcttaataagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaaga 30975  T
Q  392 gaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||  ||||||||||    
T  30974 gaagaagctttatgttaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaagtgagctttcttggacatgttatttc 30900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 48 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 51183 - 50765
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 147  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    || || || || ||||||||||| ||| | || || ||||    
T  51183 aagaataggtatccactttcgagaattgaagatttaatggatcagttagtgggtgctcttgtatttagtaaaattgatttgaggtcaggttaccatcaga 51084  T
Q  148 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 247  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||| |||||| || || || || || |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  51083 ttaaggtgaaggatgaggatatgccgaagacggcctttaggacacgatatggtcattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 50984  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     ||||||||||||||||||||| | || || ||||| | | |||||  |||  | |||||||| || ||||| || || ||||| || | ||||||||||    
T  50983 tgtgtttatggagtatatgaatagaatttttcatgcctatctggataaatttttggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctatgactgaagaa 50884  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 447  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||  | ||||| || ||||| || |||||||||| ||| |  ||||||||||    
T  50883 gagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagataagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattcttgttaagtgaagtaagtt 50784  T
Q  448 ttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||| ||| || |||||||    
T  50783 ttcttggccatattatttc 50765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 79 - 424
Target Start/End: Original strand, 28446 - 28772
Alignment:
Q  79 atttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagac 178  Q
    |||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28446 atttaatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatttgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagac 28545  T
Q  179 agctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttc 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28546 agctttcagaacgcgttatggtcactatgaatacaaagttatgc-------------------acctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttc 28626  T
Q  279 catgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgc 378  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28627 catgcatttttggatcgtttcgtggttgtttttatcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgc 28726  T
Q  379 aagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtga 424  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28727 aagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatctaagtgtga 28772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 318 - 466
Target Start/End: Original strand, 28774 - 28922
Alignment:
Q  318 gatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtcta 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28774 gatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatcta 28873  T
Q  418 agtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||| | || |||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  28874 agtgtaagttatggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttc 28922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 3)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 10653 - 11092
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||    
T  10653 cagttgaataaggtaacgataaagaataggtatccacttccaagaactgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtattcagcaagattgatt 10752  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || || |||||||| || || ||||||  ||| ||||||||    
T  10753 tgagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatattcagtgatgccttt 10852  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    |||||| || ||||| || || ||||||||||||||  ||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  10853 cggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggagtacttgaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgcttcatggttgtgttcattgatgatattttg 10952  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||     
T  10953 atatactctaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaggattgtcttgcaagtgctgaaggagaagaagctttatgctaagttgtcaaagtgtgaac 11052  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  11053 tctggttgaatgaagtaagttttcttggccatgttatttc 11092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Original strand, 24210 - 24649
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || || ||||||||||| |    
T  24210 cagttgaataaggtaacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgact 24309  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    ||||||   | |||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||| |||||  ||| ||||||||    
T  24310 tgagattgggttatcactagattaaagtaaaagacgaggatatgcagaagacaacttttagaacacgttattgacactataaatattcagtgatgccttt 24409  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    |||||| || || || ||  | |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| | | | ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  24410 cggtgttacaaacgcgccaagtgtgtttatggagtacatgaatcgcatttttcatgcgtatctagatcgtttcgtggttgtgttcatcgacgacattttg 24509  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    || ||||| |||||||||||||||| || || |||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||  | |||||||| ||||| || |||||||    
T  24510 atatactctaagactgaagaagaacttgttgcgcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgctaagttgtcaaaatgtgaat 24609  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||| ||||||||||    
T  24610 tctggttgaatgaggtgagttttctaggccatgttatttc 24649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 140 - 466
Target Start/End: Original strand, 16958 - 17284
Alignment:
Q  140 tcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaat 239  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || || |||||||| || || ||||||  ||| |||||||||||||| || |||    
T  16958 tcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatattcagtgatgcctttcggtgttacaaat 17057  T
Q  240 gcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaaga 339  Q
    || || || ||||||||||||||  ||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  17058 gcgccaggtgtgtttatggagtacttgaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgcttcatggttgtgttcattgatgatattttgatatactctaaga 17157  T
Q  340 ctgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaagga 439  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||    
T  17158 ctgaagaagaacatgctgagcatttgaggattgtcttgcaagtgctgaaggagaagaagctttatgctaagttgtcaaagtgtgaactctggttgaatga 17257  T
Q  440 agtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  17258 agtaagttttcttggccatgttatttc 17284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 218; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 28 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 103618 - 103188
Alignment:
Q  28 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 127  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  103618 agttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatg--------gatcaattagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgattt 103527  T
Q  128 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 227  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  103526 gagatcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagatggattttagaacgcgttatggacactatgagtataaagtgatgcctttc 103427  T
Q  228 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttga 327  Q
    |||||  | ||||| || || |||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||    
T  103426 ggtgttgcaaatgcgccaggtgtgtttatggagtgcatgaatcgcatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggtagtattcatcgatgatattttga 103327  T
Q  328 tttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaatt 427  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| || ||| |||||| ||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  103326 tttactccaagtctgaggaagaacatgccgaacatttgaagactgttttgcaagtgctgaaagagaagaagctttatgctaaattatcaaagtgtgaatt 103227  T
Q  428 ctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||| ||||| || || |||||||| ||| ||||||||||    
T  103226 ctgattgaaagaggtgagttttcttggccatgttatttc 103188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 27 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 495412 - 494978
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||   || || ||||| ||| |||    
T  495412 cagttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggttcacgtgtgtttagcaatatttatt 495313  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  495312 tgagatctggttatcacctgattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgccttt 495213  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    |||||| || ||||| || || |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||    
T  495212 cggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttattgagtacatgaatcgtatttttcatgcgtttttggatcgttttgtggttgtgttcatcgacgatattttg 495113  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    || ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||| |    
T  495112 atatactcgaagtctgaagaagaacatgctgagtatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagctatatgctaaattgtcaaagtctgagt 495013  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgtt 461  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||| |||||    
T  495012 tctggttgaatgaggtgagttttcttggccatgtt 494978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 48 - 451
Target Start/End: Original strand, 453146 - 453549
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |  || |||||||| ||||||||||| ||  | || || ||||    
T  453146 aagaataggtatccacttccgaggatcgatgatttaatggatcagttagtgggtgctagtgtattcagcaaaattgatttgaggtcgggttaccatcaga 453245  T
Q  148 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 247  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |  || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  453246 ttaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaagacacgatatggacactatgaatataaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 453345  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     ||||||||||| |||||||| || || |||||||| | | |||||  ||| || |||||||| || ||||| || |||||||| |  ||||||||||||    
T  453346 tgtgtttatggaatatatgaaccgaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttatttgaagactgaagaa 453445  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 447  Q
    || ||||| || |||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||  | ||||  || ||||| || ||||| |||||||| |  |||||||| |    
T  453446 gagcatgcagaacatctgaagattgtattacaagtattgaaagagaagaagttgtatgtcaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtaagat 453545  T
Q  448 ttct 451  Q
    ||||    
T  453546 ttct 453549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 26 - 454
Target Start/End: Original strand, 515264 - 515692
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||  |||| || ||||||||     
T  515264 tcagttgaacaaggttacgataaagaataggtatccgcttcctagaattgatgacttgatggatcagttggttggtgctaagatttttagtaagattgac 515363  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||  | || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||| || || || ||||| |||||||    
T  515364 ttgaggtctggttaccatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgattacaaagtgatgcctt 515463  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || || || ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||| |||||   || || |||||||| || |||||||| ||    
T  515464 tcggtgttactaacgcgcctggtgtatttatggagtacatgaaccgaattttccatgcttttctggataagtttgtcgttgtgtttattgatgatatctt 515563  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
     ||||| ||||||| |||||| ||||| || ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||   | ||||| || ||||| || |||||     
T  515564 aatttattccaagaatgaagaggaacacgcagagcatctgagaattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaggttgtatgcaaagttgtcaaaatgtgag 515663  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 454  Q
    |||||||| |  ||||| |||||||||||    
T  515664 ttctggttaagtgaagtgagttttctggg 515692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 208; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 39 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 832 - 406
Alignment:
Q  39 gtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggt 138  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||   |||||| ||||||| |||||||||||  | |    
T  832 gtaacaataaagaataggtatccacttccgagaattgataacttgatggatcagttagtgagtgcacgtgttttccgcaagatagatttgagatcgggtt 733  T
Q  139 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||  ||||| || ||||| ||||| || ||||||||| || | || ||    
T  732 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatgtccagaagacagcttttagaatgcagtatggacattatgagtataaggtaatgcctttcagttttactaa 633  T
Q  239 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaag 338  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||| |||    
T  632 tgcacctggagtatttatggagtatatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcagttcgtagttgtttttatttatgatattttgatttactctaag 533  T
Q  339 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaagg 438  Q
     ||||||||||||||  ||||||| ||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| |    
T  532 tctgaagaagaacat-atgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgcgaagttatctaactgtgaattttggttgaaag 434  T
Q  439 aagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    | ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  433 aggtaagttttcttggccatgttatttc 406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 138 - 442
Target Start/End: Original strand, 6354 - 6658
Alignment:
Q  138 tatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgacca 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| || |    
T  6354 tatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacaactttcagaacgcggtatggtcactatgagtacaaagttttgcctttcggtgttacga 6453  T
Q  238 atgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaa 337  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  6454 atgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcgtttttggatcggttcgtggttgtttttatcgatgatattttgatttactccaa 6553  T
Q  338 gactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaag 437  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||     
T  6554 gtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgcgaaattgtctaagtgcgaattctggttgaaa 6653  T
Q  438 gaagt 442  Q
    |||||    
T  6654 gaagt 6658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 48 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 14841 - 14423
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 147  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||   || || ||||| ||  ||||||||||| | ||||||| ||    
T  14841 aagaataggtatccacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtacacgtgtgtttagcaacatcaatttgagatcaggttatcacccga 14742  T
Q  148 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||| || || ||||||||    
T  14741 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacgacttttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcgatgttacaaaggcacctgg 14642  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     ||||||||||| || |||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  14641 tgtgtttatggaatacatgaatcgaatttttcatgcgtttttggatcgtttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgatatactcgaagtccgaagaa 14542  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 447  Q
    || |||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||    
T  14541 gagcatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagctatattctaaattgtcaaagtgtgagttctggttgaatgaggttagtt 14442  T
Q  448 ttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||| ||| ||||||||||    
T  14441 ttcttggccatgttatttc 14423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 28 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 6264 - 5826
Alignment:
Q  28 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 127  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||   || || ||||||||||||||    
T  6264 agttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgacttgttggatcagttagtgagtgcacgtgtgtttagcaagattgattt 6165  T
Q  128 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 227  Q
    ||||||  | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||    
T  6164 gagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatcaggatatgcagaagacgacttttagaatgcgttatggacattatgaatataaagtgatgtctttc 6065  T
Q  228 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttga 327  Q
    ||||| || ||||| || || ||||||||||| || |||||||| ||  | || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6064 ggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggaatacatgaatcgtattattcaagcattttttgatcgcttcgtggttgtgttcatcgatgatattttga 5965  T
Q  328 tttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaatt 427  Q
    | ||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||  |||||| ||||    
T  5964 tatactcgaagtccgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttacaagtgttgaaagagaagaagctatatgctaaactgttaaagtgtaaatt 5865  T
Q  428 ctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||| | ||||||||    
T  5864 ctggttgaaagaggtaagttttcttggccacgttatttc 5826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 28 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 13394 - 12956
Alignment:
Q  28 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 127  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||   || || ||||||||||||||    
T  13394 agttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgacttgttggatcagttagtgagtgcacgtgtgtttagcaagattgattt 13295  T
Q  128 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 227  Q
    ||||||  | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||    
T  13294 gagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatcaggatatgcagaagacgacttttagaatgcgttatggacattatgaatataaagtgatgtctttc 13195  T
Q  228 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttga 327  Q
    ||||| || ||||| || || ||||||||||| || |||||||| ||  | || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13194 ggtgttacaaatgcgccaggtgtgtttatggaatacatgaatcgtattattcaagcattttttgatcgcttcgtggttgtgttcatcgatgatattttga 13095  T
Q  328 tttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaatt 427  Q
    | ||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||  |||||| ||||    
T  13094 tatactcgaagtccgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttacaagtgttgaaagagaagaagctatatgctaaactgttaaagtgtaaatt 12995  T
Q  428 ctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||| | ||||||||    
T  12994 ctggttgaaagaggtaagttttcttggccacgttatttc 12956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 27 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 17270 - 16832
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   || || || |||||| |||    
T  17270 cagttgaataaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgatttgatggatcaattagtgggtgcacgtgtgtttagtaagattaatt 17171  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| || |||||||||  ||| || |||||    
T  17170 tgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagacgaggatatgcagaagacaacttttagaacacgttatggacattatgaatattcagtgat-ccttt 17072  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    |||||| |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  17071 cggtgttaccaatgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgcttcgtggttgtgttcatcgacgatattttg 16972  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||  | ||||| |||||||| |||||| |||    
T  16971 atatactccaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgttgaaagagaagaagttatatgccaaattgtcaaagtgtcaat 16872  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||| ||||| || || ||| || | ||| ||||||||||    
T  16871 tctgattgaaagaggtgagtgtttttggcaatgttatttc 16832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 402 - 466
Target Start/End: Original strand, 111775 - 111839
Alignment:
Q  402 tatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||| || |||||||    
T  111775 tatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaagaggtgagttttcttggccatattatttc 111839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 28 - 295
Target Start/End: Original strand, 29828 - 30095
Alignment:
Q  28 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 127  Q
    |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29828 agttgaacaaagttagtatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagatagtgggtgcacaagttttcagcaagattgattt 29927  T
Q  128 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 227  Q
    ||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29928 gagatcgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagacatgtagaagacagctttcaaaacccgatatggtcactatgaatataaagttatgcctttt 30027  T
Q  228 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcg 295  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30028 ggtgttaccaatgcacctggagtaattatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcg 30095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 29 - 466
Target Start/End: Original strand, 15135 - 15572
Alignment:
Q  29 gttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttg 128  Q
    |||||| || ||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || || |||||||||| ||||    
T  15135 gttgaagaaagtaacaataaagaataggtatacacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgctttg 15234  T
Q  129 agatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcg 228  Q
    |||||  | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||| | || |||||||||||||| || |||||||    
T  15235 agatcgggttatcatcggattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcttttagaacttgttatagacattatgaatataaagtgattcctttcg 15334  T
Q  229 gtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgat 328  Q
    |||| || ||||| || ||  | ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  15335 gtgttacaaatgcgccaggtatctttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggatcgtttcgtgattgtgttcatcgacgatattttgat 15434  T
Q  329 ttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattc 428  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||   |||||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  15435 atactccaagactgaagaagaacaagctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctaaaagagaaaaagttatatgctaaattgtcaaagtgtgaattc 15534  T
Q  429 tggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    | |||||| || || |||||||| ||| |||| |||||    
T  15535 tagttgaaagaggtgagttttcttggccatgtaatttc 15572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1985 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold1985
Description:

Target: scaffold1985; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 182 - 466
Target Start/End: Original strand, 407 - 691
Alignment:
Q  182 tttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccat 281  Q
    ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  407 tttcagaacacggtatggtcactattaatataaagttatgcctttcggtgttacgaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatcttccat 506  T
Q  282 gcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaag 381  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  507 gcatttttggatcggttcttagttgtgttcatcgatgataatttgattgactccaagactaaagaagaacatgctgagcatttgaagattgtcctgcaag 606  T
Q  382 tgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  607 tgttaaaagagaagaaactttatgctaaattatcaaagtgtgagttctggctgaaagaagtaagttttcttggccatgttatttc 691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 27 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 2993 - 2623
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||   ||||||| |||||| ||||    
T  2993 cagttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccatgaattgatgacttgatggatcagttagtggatgcacgtgttttcatcaagatagatt 2894  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  2893 tgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatccagaagacaccttttagaacgcgatatggacactatgaataaaaagtgatgccgtt 2794  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    | |||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| ||||| || || ||||||||||||    
T  2793 cagtgttacaaatgcacctcgagtgtttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttgaatcatttcgtggttgtttttattgatgatattttg 2694  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaa 397  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||  || ||||||||    
T  2693 atttactgcaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttaaaggagaagaa 2623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 28 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 5504 - 5067
Alignment:
Q  28 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 127  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||   || || ||||||||||||||    
T  5504 agttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttcctataattgatgatttgttggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgattt 5405  T
Q  128 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 227  Q
    |||||   | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |  |||||||||  ||| |||||||||    
T  5404 gagattgggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacggcctttagaacacgttatgggctttatgaatattcagtgatgcctttc 5305  T
Q  228 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttga 327  Q
    ||||| || ||||| || || ||||| || ||||| |||||||| || || ||||| | ||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||    
T  5304 ggtgttacgaatgcgccaggtgtgttcat-gagtacatgaatcgtatttttcatgcgtatttggatcgctttgtggttgtgttcattgacgatattttga 5206  T
Q  328 tttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaatt 427  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||  | ||||| || ||||| |||||||| ||    
T  5205 tatactccaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgcaaagttgtcaaagtgtgagtt 5106  T
Q  428 ctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||| ||||||||||    
T  5105 ctggttgaatgaggtgagttttcttggccatgttatttc 5067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 56 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 11486 - 11172
Alignment:
Q  56 gtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtg 155  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||| | || || | |||||| |||    
T  11486 gtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttggtgggtgcaaaggtttttagtaagattgacttgaggtcaggttaccatctgattaaggtg 11387  T
Q  156 aaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgttta 255  Q
    || ||| | |||||||||||||| || || || || || ||||| || || ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |    
T  11386 aaggattaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcacctggtgtgttca 11287  T
Q  256 tggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgc 355  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| | |||||||  ||| || |||||||| || ||||||||| | ||||| || ||||||||||| || |||||    
T  11286 tggagtatatgaaccgaattttccatgcttctttggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattctaatttattctaagactgaagaggagcatgc 11187  T
Q  356 tgagcatctgaagat 370  Q
     || |||||||||||    
T  11186 agaacatctgaagat 11172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 30 - 466
Target Start/End: Original strand, 217335 - 217771
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 129  Q
    |||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||  |||||||||||||||    
T  217335 ttgaacaaagtgacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgttttgcaagattgatttga 217434  T
Q  130 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 229  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  | || ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  217435 gatcgggttatcaccagattaaagtgaaagacgaggatatgcagaagacgtcctttagaacacgttatggacattatgaatataaagtgatgcctttcgg 217534  T
Q  230 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    ||| || ||||| || || |||||||||||||| |||||||  || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||     
T  217535 tgttacaaatgccccaggtgtgtttatggagtacatgaatcatatttttcatgcgttttttgatcgtttcgtggttgtgatcattgatgatattttgata 217634  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattct 429  Q
    ||||| |||   ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  217635 tactcgaagttcgaagaagaacatgttgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagctatatgttaaattgtcaaagtgtgagttct 217734  T
Q  430 ggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
     |||||| || || |||||||| ||| | ||||||||    
T  217735 agttgaatgaggtgagttttcttggccacgttatttc 217771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 177; Significance: 3e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 27 - 451
Target Start/End: Original strand, 15890 - 16313
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||| || || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  15890 cagttgaataaagtgacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggattagttagtgggtgcacatgtgttcagcaagattgatt 15989  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||  ||||| ||||  |||||||| || ||||| |||  ||| ||||||||    
T  15990 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaagacgaggatatgcagaagatggcttttagaaaacgttatggacattatgagtattcagtgatgccttt 16089  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     ||||| || || || || || ||||||||| |||| ||||||||||| || ||||| | | | ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  16090 gggtgttacaaacgcgccaggtgtgtttatgtagtacatgaatcgcatttttcatgcgtatctagatcgtttcgtggttatattcatcgatgatattttg 16189  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    || ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||  || ||||||||  | |||||||| ||||| ||||||||||    
T  16190 atatactctaagactgaagaggaatatgctgagcatttgaagatt-ttttgcaagtgttcaaggagaagaagttatatgctaagttgtcaaagtgtgaat 16288  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
    |||||||||| || |||||||||||    
T  16289 tctggttgaatgaggtaagttttct 16313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 27 - 248
Target Start/End: Original strand, 15906 - 16128
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  15906 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatt 16005  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagt-gaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  16006 tgagatcaggttatcaccagattaaagtaaaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcattatgaatataaggttatgcgtt 16105  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctgga 248  Q
    | ||||| |||||||||||||||    
T  16106 ttggtgttaccaatgcacctgga 16128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 168; Significance: 7e-90; HSPs: 3)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 39 - 466
Target Start/End: Original strand, 8958 - 9385
Alignment:
Q  39 gtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggt 138  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||  | |    
T  8958 gtaacgataaagaataggtatccacttccaaggatagatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgcgtgtttagcaagattgatttgagatcgggtt 9057  T
Q  139 atcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaa 238  Q
    ||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||||| ||||| || || |||||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||| || ||    
T  9058 atcaccagattaaggtgaaagacggggatatggagaagacggcttttaggacacgttatggacattatgaatattcagtgatgcctttcggtgttacaaa 9157  T
Q  239 tgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaag 338  Q
    ||| || || |||||||||||||| |||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  9158 tgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgtttcgtggttgtgttcatggatgatattttgatatactctaag 9257  T
Q  339 actgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaagg 438  Q
     ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||  ||| ||||||||  | ||||| ||  |||| |||||||||||||||||| | |    
T  9258 tctgaagaagaacatgttgagcatttgaggattgttttgcaagtgctgaaggagaagaagttatatgccaagctgtcaaagtgtgaattctggttggatg 9357  T
Q  439 aagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    | || |||||||| ||| ||||||||||    
T  9358 aggtgagttttcttggccatgttatttc 9385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 39 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 1414 - 1324
Alignment:
Q  39 gtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 129  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||    
T  1414 gtaacgataaagaataggtatccacttccaaggatagatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgcgtgtttagcaagattgatttga 1324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 39 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 6718 - 6628
Alignment:
Q  39 gtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 129  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||    
T  6718 gtaacgataaagaataggtatccacttccaaggatagatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgcgtgtttagcaagattgatttga 6628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 26 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 24609 - 24184
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||     
T  24609 tcagttaaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcaagggtgttcagtaagattgac 24510  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||||| || || ||||| || || |||||||    
T  24509 ttgaggtcaagttaccaccagattaaggtgaaggatgacgatatgcagaagacagcctttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctt 24410  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| | | |||||  ||| || |||||||| || ||||||||| |    
T  24409 tcggtgttactaatgcgcctggggtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttctctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattct 24310  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| |  ||||| |||||  | |||||||| ||||| ||||||||     
T  24309 gatttattctaagactgaagaggagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaagtattaaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgag 24210  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||    
T  24209 ttctggttaagtgaagtaagttttct 24184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 48 - 451
Target Start/End: Original strand, 44350 - 44753
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 147  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    || ||||| || ||||||||||| ||  | || || ||||    
T  44350 aagaacaggtatccacttccgagaattgacgatttgatggatcagttagtgggtgctcgtgtgttcagtaaaattgatttgaggtcgggttaccatcaga 44449  T
Q  148 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 247  Q
    |||| ||||| ||||| |||||| ||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  44450 ttaaggtgaaggatgaggatatggagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 44549  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     ||||||||||||||||||||    || |||||||||| | |||||  ||| || |||||||| || ||||| || || ||||| || |||||| |||||    
T  44550 tgtgtttatggagtatatgaaaaaaattttccatgcatatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagactaaagaa 44649  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 447  Q
    || ||| |  | |||||||||||||| |||||||| | |||||| || ||  | ||||| || ||||| || |||||||| ||||| |  ||||||||||    
T  44650 gagcatacaaaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagaaaataagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattttggttaagtgaagtaagtt 44749  T
Q  448 ttct 451  Q
    ||||    
T  44750 ttct 44753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 30 - 466
Target Start/End: Original strand, 5804 - 6240
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 129  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||   || || ||||||||||| ||||    
T  5804 ttgaataaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgacgacttgatggaccagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgacttga 5903  T
Q  130 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 229  Q
    ||||  | |||||||||||||||||||| || ||  ||||||| ||||| ||||| ||||| ||  |||| || || ||||||   || |||||||||||    
T  5904 gatcgggttatcaccagattaaagtgaaggacgacaatatgcaaaagacggcttttagaacacgacatggacattaggaatattcggtgatgcctttcgg 6003  T
Q  230 tgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatt 329  Q
    ||| || || || || || |||||||||||||| |||||||| || |||||||||| | | ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||     
T  6004 tgttacaaacgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtattttccatgcatatctagatcgtttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgata 6103  T
Q  330 tactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattct 429  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||  ||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  6104 tactctaaggctgaagaagaacatgctgagcaattgaagattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgctaagttgtcaaagtgtgaattct 6203  T
Q  430 ggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||||| || || | |||||| ||  ||||||||||    
T  6204 ggttgaatgaggtcatttttcttggtcatgttatttc 6240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 158; Significance: 7e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 26 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 11223 - 10798
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   || |||| |||||||||     
T  11223 tcagttgaataaagtgacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgcacgcgtgttcaacaagattgac 11124  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||  | || || |||||||||||||||||  ||||||||||||| || || || |  || || || || || |||||||||||||| |||||||    
T  11123 ttgaggtcgggttaccatcagattaaagtgaaagaaaaagatatgcagaaaacggcctttaagacacgatacgggcattatgaatataaagtgatgcctt 11024  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| | || |||||||| | |||||||| ||| ||||||||||| || ||||| || ||    
T  11023 tcggtgttaccaatgcgcctggtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatttggatcaatttgtagttgtgtttattgatgacatctt 10924  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||| | |||||| | |||||||| |||||||||| |||||| |||||  | ||||| || ||||| || ||||||    
T  10923 gatttattctaagactgaagaagagcatacagagcatttaaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaa 10824  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||    
T  10823 ttctggttaagtgaagtaagttttct 10798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 158; Significance: 7e-84; HSPs: 3)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 30 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 218 - 1
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 129  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  218 ttgaacaatgtgactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagtttgtgggtgcacgcgttttcagcaagattgatttga 119  T
Q  130 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcgg 229  Q
    ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  118 gatcaggttatcaccagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaagacagatttcagaacacggtatggtcactatgtatataaagttatgccttttgg 19  T
Q  230 tgtgaccaatgcacctgg 247  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  18 tgttaccaatgcacctgg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 26 - 451
Target Start/End: Original strand, 5262 - 5686
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||    || |||||||||||||||    
T  5262 tcagttgaacaaggttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcaattagtgggtgctcgtgtattcagcaagattgat 5361  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||||||||||||||| || |||| ||    
T  5362 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcactatgaatataaggtgatgcatt 5461  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || |||||  |||  |||||||||||||||||||| || || |||||||| | | |||||  ||| || |||||||| || ||||| || ||    
T  5462 tcggtgttactaatgcgactgc-gtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatctt 5560  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  | ||||| || ||||| || |||||     
T  5561 gatttattcaaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagagaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgag 5660  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||    
T  5661 ttctggttaagtgaagtaagttttct 5686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 26 - 451
Target Start/End: Original strand, 9693 - 10117
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||    || |||||||||||||||    
T  9693 tcagttgaacaaggttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcaattagtgggtgctcgtgtattcagcaagattgat 9792  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||||||||||||||| || |||| ||    
T  9793 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcactatgaatataaggtgatgcatt 9892  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || |||||  |||  |||||||||||||||||||| || || |||||||| | | |||||  ||| || |||||||| || ||||| || ||    
T  9893 tcggtgttactaatgcgactgc-gtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatctt 9991  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  | ||||| || ||||| || |||||     
T  9992 gatttattcaaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagagaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgag 10091  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||    
T  10092 ttctggttaagtgaagtaagttttct 10117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 466
Target Start/End: Original strand, 9969 - 10408
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  9969 tcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgacgacttaatggatcagttagtgggtgcaaaggttttcagcaagattgac 10068  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    || || || ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||  | || || |||||||| || |||||||| || |||||||    
T  10069 ttaaggtc-aggtaccatcagattaaggtgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttgggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctt 10167  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||| ||| | |||||||||||||||||||| || || |||||||| |   | |||  |||||| |||||||| || ||||| || ||    
T  10168 tcggtgttactaatgcgcctagtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctagataaattcgtggttgtgtttattgatgacatctt 10267  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||  | ||||  || ||||| ||||||||     
T  10268 gatttattcaaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagaaaagaagttgtatgtcaagttgtcaaagtgtgag 10367  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||| |  |||||||||||||| ||| || |||||||    
T  10368 ttctggttaagtgaagtaagttttcttggccatattatttc 10408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 251015 - 250587
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||     
T  251015 tcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttaatggatcaattggtgggtgcaaaggtgttcagcaagattgac 250916  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||  | || || |||||||| ||||| |||||  ||||||||||||| || || || || || |||||||| || ||||| || || |||||||    
T  250915 ttgaggtctggttaccatcagattaaggtgaaggatgagaatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 250816  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || |||||||| || ||||| || ||    
T  250815 tcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgttgttgtgtttattgatgacatctt 250716  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||   | |||||||| ||||| || |||||     
T  250715 gatttattctaagactgaagaggagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttgtcgaaatgtgag 250616  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 454  Q
    |||||||| |  ||||| |||||||||||    
T  250615 ttctggttaagtgaagtgagttttctggg 250587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 466
Target Start/End: Original strand, 201379 - 201819
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||| || ||||||||||||    
T  201379 tcagttgaataaagtgacgataaaaaataggtatccacttccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtacacgagtgtttagcaagattgat 201478  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||  | || || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || || || || || ||||| || || ||||||  ||| |||||||    
T  201479 ttgaggtcgggttaccatcagattaaagtaaaagatgaagatatgcagaaaacggcctttaggacacgatatggacattacgaatattcagtgatgcctt 201578  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||  | || || |||||||||||||| |||||| | || |||||||| | ||||||||| || || |||||||| || |||||||||||    
T  201579 tcggtgttactaacacgccgggtgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatttggatcggtttgtggttgtgtttattgatgatatttt 201678  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||| |||| |||||||||| ||| || ||||| || ||||| |||| ||| || ||||||    
T  201679 gatatactctaagactgaagaagaacatgcagaacatttgaaggttgtgttgcaagtgttgaaggaaaagaagctgtatgccaaatggtccaaatgtgaa 201778  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||| |  ||||||| |||||| ||| || |||||||    
T  201779 ttctggttaagtgaagtaaattttcttggccatattatttc 201819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 56 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 325069 - 324674
Alignment:
Q  56 gtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtg 155  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| || || ||| | || || |||||||| |||    
T  325069 gtatccacttccgaggattgacgacttgatggatcagttagtgggtgcgaaggtttttagtaagattgacttaaggtcaggttaccatcagattaaggtg 324970  T
Q  156 aaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgttta 255  Q
    || |||||||||||||||||||| || || || || || |||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |    
T  324969 aaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttca 324870  T
Q  256 tggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgc 355  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| | | |||||  |||||| ||||| || || ||||| ||| |||| || || | |||||||||||| ||||     
T  324869 tggagtatatgaaccgaattttccatgcctatctggataaattcgtggttgtatttattgatgacattctgatctattcaaggactgaagaagagcatgt 324770  T
Q  356 tgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
     || |||||||||||||| |||||| | | ||||||||| ||  | |||||||| | ||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  324769 agaacatctgaagattgtattgcaaattttgaaagagaaaaagttgtatgctaagtcgtcgaagtgtgaattctggttaagtgaagtaagttttct 324674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 148; Significance: 6e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 54 - 433
Target Start/End: Original strand, 2892 - 3271
Alignment:
Q  54 aggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaag 153  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| | || || |||||||| |    
T  2892 aggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcaaaggttttcagcaagattgacttgaggtcaggttaccatcagattaagg 2991  T
Q  154 tgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtt 253  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| || || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  2992 tgaaggatgaggatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtt 3091  T
Q  254 tatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacat 353  Q
     |||||||||||||| || || |||||||| | | |||||  |||||| |||||||| || ||||| ||  | ||||| || |||||||||||||| |||    
T  3092 catggagtatatgaaccgaattttccatgcctatctggataaattcgtggttgtgtttattgatgacatcctaatttattcaaagactgaagaagagcat 3191  T
Q  354 gctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggtt 433  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  3192 gcagagcatctgaagattgtattgcaagtattgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggtt 3271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 26 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 69765 - 69436
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||| || || |||||     
T  69765 tcagttgaacaaagttacaataaagaacagatatccacttccgaggattgatgacttgatggaccaattggtaggtgcaaaagtttttagtaaaattgac 69666  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | || || || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||| || ||||| || || |||||||    
T  69665 ttgaggtcaggttaccatcaaattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 69566  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||  |||||| || || || || |||||||||||    
T  69565 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatatttt 69466  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgc 355  Q
    |||||| || ||||||||||| || |||||    
T  69465 gatttattctaagactgaagaggagcatgc 69436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0993
Description:

Target: scaffold0993; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 26 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 275 - 1
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    ||||||| |||||| |||    
T  275 tcagttgaaaaaagtaactataaagaataggtatccacttccaagaattgatgacttgatggatccgttagtgggtgcgcgtgttttcaacaagatagat 176  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||  | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||| |||||     
T  175 ttgagatcgggttatcactagattaaagtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttagaacgcggtatggacattatgagtataaagttttgcctc 76  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcg 300  Q
    || |||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  75 tcagtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgtttcg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 73 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 10514 - 10284
Alignment:
Q  73 ttgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgca 172  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10514 ttgatgacttgatggatcagttagtgggtgcatgtgttttcagcaagatagatttgagatcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgca 10415  T
Q  173 gaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgc 272  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  10414 gaagacagcttttagaacgcgggatggtcattatgagtataaggtgatgcctttcggtgttacaaatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgc 10315  T
Q  273 atcttccatgcatttttggatcgattcgtag 303  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  10314 atctttcaagcatttttggatcggttcgtag 10284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 66 - 451
Target Start/End: Original strand, 1496 - 1881
Alignment:
Q  66 ccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaag 165  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| |  |||||||| |||||||| ||||| ||| | || || ||||| || ||||| ||| | |    
T  1496 ccgaggattgatgacttgatggatcagctagtgggtgcgagggttttcagtaagattgacttgaggtcaggctaccatcagatcaaggtgaaggataagg 1595  T
Q  166 atatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatat 265  Q
    ||||||||||||| || || || || || |||||||| || |||||||| || ||| |||||| ||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  1596 atatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgtctttcgttgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatat 1695  T
Q  266 gaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctg 365  Q
    |||  | || || ||||| |   |||||  ||| || ||| | ||||| ||||| ||| ||||| | || | ||| |||||||| ||||| || ||||||    
T  1696 gaacagaatttttcatgcctacctggataaatttgtggttctattcattgatgacattctgattaattcaaggacagaagaagagcatgcagaacatctg 1795  T
Q  366 aagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||||||||  | ||||| |||||||| |||||||| |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  1796 aagattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttttct 1881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 27 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 29016 - 28594
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    || |||| ||| |||||||    
T  29016 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgctcgtgtattcaacaaaattgatt 28917  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||| || |||||||| || ||||||||    
T  28916 tgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgccttt 28817  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||| |||||||||||||||| || || |||||||| |   |||||  ||| || |||||||| || ||||| || |||    
T  28816 cggtgttactaatgcgcctggtgtgcttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttg 28717  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||  | | ||| || ||||| || ||||| |    
T  28716 atttattctaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagatcgtcttgaaagtgttgaaagaaaagaagttgtctgcgaagttgtcaaaatgtgagt 28617  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagtttt 449  Q
    |||||||  | ||||||||||||    
T  28616 tctggttagatgaagtaagtttt 28594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 48 - 421
Target Start/End: Original strand, 50113 - 50486
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 147  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||| || ||||| || ||||| ||| | || || || |    
T  50113 aagaacaggtatccactaccgaggattgatgacttgatggaccagttggtgagtgcaaaagtttttagtaagatcgacttgaggtcaggttaccatcaaa 50212  T
Q  148 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 247  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || || || ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| || ||  | || ||    
T  50213 ttaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcatttaggacacgatatggacattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacacgcccgg 50312  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||||  |||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||    
T  50313 tgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttttttggataaattcgtggttgtattcattgatgatattttaatttattctaagacggaagaa 50412  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtg 421  Q
    || ||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||    
T  50413 gagcatgcggaacatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtg 50486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 48 - 421
Target Start/End: Original strand, 59147 - 59520
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 147  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||| || ||||| || ||||| ||| | || || || |    
T  59147 aagaacaggtatccactaccgaggattgatgacttgatggaccagttggtgagtgcaaaagtttttagtaagatcgacttgaggtcaggttaccatcaaa 59246  T
Q  148 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 247  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || || || ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| || ||  | || ||    
T  59247 ttaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacacgcccgg 59346  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||||  |||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||    
T  59347 tgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttttttggataaattcgtggttgtattcattgatgatattttaatttattctaagacggaagaa 59446  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtg 421  Q
    || ||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||    
T  59447 gagcatgcggaacatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtg 59520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 48 - 421
Target Start/End: Original strand, 65535 - 65908
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 147  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||| || ||||| || ||||| ||| | || || || |    
T  65535 aagaacaggtatccactaccgaggattgatgacttgatggaccagttggtgagtgcaaaagtttttagtaagatcgacttgaggtcaggttaccatcaaa 65634  T
Q  148 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 247  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || || || ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| || ||  | || ||    
T  65635 ttaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcatttaggacacgatatggacattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaacacgcccgg 65734  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     ||||| |||||||||||||| || || || ||||| |||||||||  |||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||    
T  65735 tgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttttttggataaattcgtggttgtattcattgatgatattttaatttattctaagacggaagaa 65834  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtg 421  Q
    || ||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||    
T  65835 gagcatgcggaacatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtg 65908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 237 - 466
Target Start/End: Original strand, 38070 - 38299
Alignment:
Q  237 aatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactcca 336  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  38070 aatgcacctggagtatttatggagtacatgaatcgcatctttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgttttcattgatgatattttgatttactaca 38169  T
Q  337 agactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaa 436  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38170 agtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagctggttttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaa 38269  T
Q  437 ggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
     ||||| || ||||| ||  ||||||||||    
T  38270 agaagtgagctttcttggacatgttatttc 38299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 92
Target Start/End: Original strand, 41417 - 41482
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcag 92  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41417 cagttgaacaaggtgaccataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcag 41482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 451
Target Start/End: Original strand, 2183 - 2608
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    || |||| ||| ||||||    
T  2183 tcagttgaataaagttacgataaagaacaggtatccacttccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgcttgtgtattcaacaaaattgat 2282  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||  | || || || || ||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  2283 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaaaacgacctttaggacacgatatggacattatgaatataaagtaatgcctt 2382  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| | |||||||  ||| || |||||||| || ||||||||| |    
T  2383 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatttggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattct 2482  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
     ||||| || |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||  ||||| | |||  | ||||| || |||||||| ||||||    
T  2483 aatttattctaagaatgaagaagagcatgcagagcatctgaagattttgttgcaagtgtttaaagaaaggaagttgtatgccaagttgtctaaatgtgaa 2582  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||    
T  2583 ttctggttaagtgaagtaagttttct 2608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 451
Target Start/End: Original strand, 29196 - 29621
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    || |||| ||| ||||||    
T  29196 tcagttgaataaagttacgataaagaacaggtatccacttccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgcttgtgtattcaacaaaattgat 29295  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||  | || || || || ||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  29296 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaaaacgacctttaggacacgatatggacattatgaatataaagtaatgcctt 29395  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| | |||||||  ||| || |||||||| || ||||||||| |    
T  29396 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatttggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattct 29495  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
     ||||| || |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||  ||||| | |||  | ||||| || |||||||| ||||||    
T  29496 aatttattctaagaatgaagaagagcatgcagagcatctgaagattttgttgcaagtgtttaaagaaaggaagttgtatgccaagttgtctaaatgtgaa 29595  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||    
T  29596 ttctggttaagtgaagtaagttttct 29621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 140; Significance: 4e-73; HSPs: 3)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 267 - 466
Target Start/End: Original strand, 44795 - 44994
Alignment:
Q  267 aatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctga 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44795 aatcgcatcttccatgcatttttggatcggttcgtagttgaattaatcgaagatattttgatatactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctga 44894  T
Q  367 agattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||| ||||||||||    
T  44895 agattgtcttgcaaatgttgaaagagaagaaactttatgccaaattgtctaagtgtgacttctggttgaaagaggtgagttttcttggccatgttatttc 44994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 195 - 433
Target Start/End: Original strand, 8888 - 9126
Alignment:
Q  195 tatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatc 294  Q
    ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||    || |||||||| | | |||||     
T  8888 tatggacattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatgaagtacatgaacttaattttccatgcttatctggata 8987  T
Q  295 gattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaa 394  Q
     ||| || || ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| |||||| ||    
T  8988 aatttgtggtcgtgtttattgatgatatctttatttattctaagactgaagaagagcatgcagagcatctgaaaattatgttgcaagtgttgaaagaaaa 9087  T
Q  395 gaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggtt 433  Q
    |||  | ||||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  9088 gaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggtt 9126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 48 - 181
Target Start/End: Original strand, 4822 - 4955
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 147  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||| ||||||| | | | || || | ||    
T  4822 aagaatagatatccacttctgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaaaatttatttgaggttaggttaccatctga 4921  T
Q  148 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagc 181  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  4922 ttaaggtgaaggatgaagatatgcagaaaacagc 4955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 266 - 466
Target Start/End: Original strand, 7844 - 8044
Alignment:
Q  266 gaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctg 365  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7844 gaatcgcatctttcatgcatttttggatcggttcgtggttgtttttgtcgacgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctg 7943  T
Q  366 aagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttattt 465  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| | | |||||||||    
T  7944 aagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaactatctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaagttttcttgcccatgttattt 8043  T
Q  466 c 466  Q
    |    
T  8044 c 8044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 136; Significance: 9e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 48 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 19725 - 19322
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||    || |||||||||||||||||||| ||| | || || ||||    
T  19725 aagaataggtatccacttccgaggattgatgatctaatggatcaattagtgggtgctcgtgtgttcagcaagattgatttgaggtcaggttaccatcaga 19626  T
Q  148 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 247  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  19625 ttaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 19526  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     ||||||||||||||||| ||    || |||||||| | | | |||  ||| || ||| |||| || ||||| || || ||||| || ||||| |||||     
T  19525 tgtgtttatggagtatataaacaaaattttccatgcttatctagataaatttgtggttatgtttattgatgacatcttaatttattctaagaccgaagag 19426  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 447  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||  | ||||| || ||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||    
T  19425 gagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagataagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagtt 19326  T
Q  448 ttct 451  Q
    ||||    
T  19325 ttct 19322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 2264 - 1839
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||   || || || || ||||||    
T  2264 tcagttgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccgagaattgacgatttaatggatcaattagtgggtgcacgtgtgtttagtaaaattgat 2165  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||  | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  2164 ttgaggtctggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctt 2065  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||  || ||||| ||| | ||||||||||||||||||||  | || |||||||| | | |||||  | | || |||||||| || ||||| || ||    
T  2064 tcggtgctactaatgcgcctagtgtgtttatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaaattgtggttgtgtttattgatgacatctt 1965  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
     ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||  | ||||| || ||||| || ||||||    
T  1964 aatttattctaagactgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaataagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaa 1865  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
    || ||||| |  ||||||||||||||    
T  1864 ttttggttaagtgaagtaagttttct 1839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 133; Significance: 6e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 48 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 4552 - 4142
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 147  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||   || || || || ||||||||||| ||  | || || ||||    
T  4552 aagaacaggtatccacttccgagaattgacgatttaatggatcagtttgtgggtgcacctgtgtttagtaaaattgatttgaggtccggttaccatcaga 4453  T
Q  148 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaa---gttatgcctttcggtgtgaccaatgcacc 244  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| |||||||||||    || |||||||||||||| || ||||| ||    
T  4452 ttaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattatgaatataataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcc 4353  T
Q  245 tggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaa 344  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| | | |||||  ||| || |||||||| || ||| | || |||||||| |  |||||||||    
T  4352 tggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatcacatcttgatttattataagactgaa 4253  T
Q  345 gaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaa 444  Q
    ||||| |||||  | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  | ||||| || ||||| || |||||||| ||||| |  |||||||    
T  4252 gaagagcatgcataacatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagagaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattttggttaagtgaagtaa 4153  T
Q  445 gttttctgggc 455  Q
    |||||||||||    
T  4152 gttttctgggc 4142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 133; Significance: 6e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 27 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 5143 - 4719
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||   || || || || ||||| |    
T  5143 cagttgaataaggttacgataaagaacaggtatccacttccgagaattgacgatttaatggatcaattagtgggtgcacgtgtgtttagtaaaattgact 5044  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||| || || ||  | ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  5043 tgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgccgaagacggcctttaggtcacgttatggttactatgaatataaggtgatgccttt 4944  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |   |||||  ||||||||||||||| || ||||| ||| ||    
T  4943 cggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctggataaattcgtagttgtgtttattgatgacattctg 4844  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| | |||||| |||||  | |||||||| ||||| || ||||| |    
T  4843 atttattctaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattacaagtattgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcgaattgtgagt 4744  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
    ||||||| |  ||||| ||||||||    
T  4743 tctggttaagtgaagtcagttttct 4719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 27 - 451
Target Start/End: Original strand, 42019 - 42443
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||||   || |||   |||||||| |    
T  42019 cagttgaacaaagtgacaataaagaataggtatccacttctgaggatcgacgatttgatggatcagttagtgggtgcatttgtgttctttaagattgact 42118  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    | |||||| | ||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||| || || || || | ||| |  || || ||||||   || ||||||||    
T  42119 taagatcaggctatcaccagatcaaagtgaaagatggggatattcagaagacggcctttaggacacattacgaacattacgaatattcggtgatgccttt 42218  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    |||||| || || || |  |||||||||||||| ||||||||||  || || ||||| | |||||||||||| ||  ||||||| || ||||||||| ||    
T  42219 cggtgttactaacgcgcaaggagtgtttatggaatatatgaatcatatttttcatgcttatttggatcgatttgtttttgtgtttatagatgatattctg 42318  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    || ||||||||||| || || |||||||| |||||| |||   |||| |||||||||  ||| ||||||||  | ||||| |  || || ||||| ||||    
T  42319 atatactccaagaccgaggaggaacatgccgagcatttgagatttgttttgcaagtgctgaaggagaagaagttatatgccagtttatcgaagtgcgaat 42418  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||    
T  42419 tctggttgaacgaagtgagttttct 42443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 48 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 49477 - 49074
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 147  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||    || |||||||| ||||||||||| ||| | || || ||||    
T  49477 aagattaggtatccacttctgaggatcgatggtttaatggatcagttagtgggtgctcgtgtattcagcaaaattgatttgaggtcaggttaccatcaga 49378  T
Q  148 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 247  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| |||||    
T  49377 ttaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggcgttactaatgcgcctgg 49278  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     ||||||||||||||||||||    || |||||||| | | |||||  ||| || |||||||| || ||||| || |||||||| || ||||||||||||    
T  49277 tgtgtttatggagtatatgaacaaaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattctaagactgaagaa 49178  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 447  Q
    || ||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||  | ||||| || ||||| || ||||| |||||||| |   |||||||||    
T  49177 gagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtcaagtaagtt 49078  T
Q  448 ttct 451  Q
    ||||    
T  49077 ttct 49074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0560
Description:

Target: scaffold0560; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 30 - 195
Target Start/End: Original strand, 8657 - 8822
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 129  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  8657 ttgaagaaggtaactatcaagaataggaatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgttttcagcaagattgatttga 8756  T
Q  130 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgtt 195  Q
    | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8757 ggtcaggttatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacatctttcagaacgcgtt 8822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 189 - 250
Target Start/End: Original strand, 10914 - 10975
Alignment:
Q  189 acgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagt 250  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10914 acgcgttatggtcactatgagtataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagt 10975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 33730 - 33304
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaa-gaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattga 124  Q
    ||||||||||||||| || || || ||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||   || || | |||||||||    
T  33730 tcagttgaacaaggttaccattaaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcaattagtgggtgcacgtgtgtttaacaagattga 33631  T
Q  125 tttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcct 224  Q
     ||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || || |||||||| || ||||||    
T  33630 cttgaggtcaggttaccatcagattaatgtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgaatataaggtgatgcct 33531  T
Q  225 ttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattt 324  Q
    |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |  || |||||||| | |||||||  |||||| ||||||||||| ||||| || |    
T  33530 ttcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccaaattttccatgcctatttggataaattcgtggttgtgttcattgatgacatct 33431  T
Q  325 tgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtga 424  Q
    ||||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || || |||| ||||||||||||  | ||||| || ||||  || |||||    
T  33430 tgatttattctaagactgaagaagagcatgcagaacatctaaagattgtattacaggtgttgaaagagaagaagttgtatgccaagttgttaaaatgtga 33331  T
Q  425 attctggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
     |||| ||| |  ||||||||||||||    
T  33330 gttctagttaagtgaagtaagttttct 33304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 28 - 466
Target Start/End: Original strand, 22099 - 22536
Alignment:
Q  28 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 127  Q
    |||||||||| || || || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   || || ||||||||||||||    
T  22099 agttgaacaaagtgacaataaagaatagttatccacttccaagaatcgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgattt 22198  T
Q  128 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 227  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||| || || ||  |||||  ||| |||||||||    
T  22199 gagatcgagctatcatcagattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttacggacattacaaatattcagtgatgcctttc 22298  T
Q  228 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttga 327  Q
     |||| || |||||||| || || |||| ||| || |||||| |||| |  ||||| | ||| |||||  | || ||||||||||| |||||||||||||    
T  22299 -gtgttactaatgcaccgggtgtatttacggaatacatgaattgcatttctcatgcttatttagatcgcattgttgttgtgttcattgatgatattttga 22397  T
Q  328 tttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaatt 427  Q
    | ||||| ||| ||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||||  | ||||||| |   | ||||| || ||||| |||||||||||    
T  22398 tatactctaagtctgaagaagaacacgccaagcatttgaagattgttttgcaagtgctgcaagagaaaacgttatatgccaagttgtcaaagtgtgaatt 22497  T
Q  428 ctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||||||| || || |||||| | ||| || |||||||    
T  22498 ctggttgaatgaggtgagtttttttggccatattatttc 22536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 48 - 466
Target Start/End: Original strand, 49808 - 50226
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 147  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    || ||| |||||||||||||||| ||| | || ||  |||    
T  49808 aagaacaggtatctactttcgagaattgacgatttcatggatcagttagtgggtgctcgtgtgttctgcaagattgatttgaggtcaggttaccattaga 49907  T
Q  148 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 247  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||  | || || || || |||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  49908 ttaaggtgaatgatgaggatatgcagaatacgccctttaggacacgatatggtcattatgaatataaggtgatgcctttcgatgttactaatgcgcctgg 50007  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     |||||||||||||||||||| || || |||||||| | | |||||  ||| || |||||||| || ||||| || || ||||| || ||||||||||||    
T  50008 tgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctaagactgaagaa 50107  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 447  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||  | ||||| || ||||| || |||||||||| ||| |  ||||||||||    
T  50108 gagcatgcagagcatctgaagattgtgtttcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattcttgttaagtgaagtaagtt 50207  T
Q  448 ttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||| ||| || |||||||    
T  50208 ttcttggccatattatttc 50226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 126; Significance: 8e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 451
Target Start/End: Original strand, 766 - 1190
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||     
T  766 tcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgacgacttaatggatcagttagtgggtgc-aaaggtttcagcaagattgac 864  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | || || || || ||||| || || |||||||| || |||||||    
T  865 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacgacctttaggacacgatatggacattacgaatataaggtgatgcctt 964  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| |   |||||  |||||| |||| ||| || ||||| || ||    
T  965 tcggtgttactaatgcgcctggcgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctggataaattcgtggttgagtttattgatgacatctt 1064  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    |||||| || |||| |||||||||  |||| || |||||||||||||| |||||||| |  || ||||||||  | ||||| || ||||| |||||||||    
T  1065 gatttattctaagaatgaagaagagaatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtattaaaggagaagaagttgtatgccaagttgtcgaagtgtgaa 1164  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
    || ||||| |  ||||| ||||||||    
T  1165 ttttggttaagtgaagtgagttttct 1190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 126; Significance: 8e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 48 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 16485 - 16068
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 147  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    || || || || ||| ||||||| ||| | || || ||||    
T  16485 aagaacaggtatccagttccgagaattgacgatttaatggatcagttagtgggtgcttgtgtgtttagtaaaatttatttgaggtcaggttaccatcaga 16386  T
Q  148 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 247  Q
    |||| ||||| ||||| ||| |||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  16385 ttaaggtgaaggatgaggatttgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 16286  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     ||||||||||||||||||||  | || |||||||| | | |||||  ||| || |||||||| || ||||| || || ||||| || | ||||||||||    
T  16285 tgtgtttatggagtatatgaacggaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattctacgactgaagaa 16186  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 447  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||   | ||||| || ||||| || |||||||| ||||| |  ||||||||||    
T  16185 gagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattttggttaagtgaagtaagtt 16086  T
Q  448 ttctgggcgatgttattt 465  Q
    |||| ||| || ||||||    
T  16085 ttcttggccatattattt 16068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 448
Target Start/End: Original strand, 7768 - 8194
Alignment:
Q  22 atcatcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagat 121  Q
    |||| |||||||||||||| || || |||||| | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||  | || |||||| | || || || |||||    
T  7768 atcaacagttgaacaaggtgacgattaagaatcgatatccacttccacggattgatgatttgatggatcaactggttggtgcagaggtgtttagtaagat 7867  T
Q  122 tgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatg 221  Q
    ||||||||| ||| | ||||| ||||||| ||| || |   |||||||    || || || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || |||    
T  7868 tgatttgaggtcaggatatcatcagattagagtaaaggcgaaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatg 7967  T
Q  222 cctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgata 321  Q
    || || || ||  | |||||||| || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || ||  | || ||||| || |||||||    
T  7968 ccatttggagtatctaatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttttggtggtgtttatagatgata 8067  T
Q  322 ttttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtg 421  Q
    ||||  | || || ||| | || ||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||  |  | | |||||| |||||||||||    
T  8068 ttttagtgtattcgaagtcggaggaagagcatgttgagcatctgaggattgtgttgcaagttttgaaagagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtg 8167  T
Q  422 tgaattctggttgaaggaagtaagttt 448  Q
    ||  || |||||||||||||| |||||    
T  8168 tgtgttttggttgaaggaagtgagttt 8194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 126; Significance: 8e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 451
Target Start/End: Original strand, 13247 - 13672
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||||| | || |||||||| |||||||||||    || || ||||||||||||    
T  13247 tcagttgaataaggttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgataacttcatggatcatttagtgggtgctcgtgtgtttagcaagattgat 13346  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||  | ||||| || || |||||||| || |||||||    
T  13347 ttgaggtcaggttaccatcagattaatgtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacatgatatggacattacgaatataaggtgatgcctt 13446  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| || | | |||||  ||| || |||||||| || ||||| || ||    
T  13447 tcggtcttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccacgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatctt 13546  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||  | ||||| |||||||| || |||||     
T  13547 gatttattcgaagacagaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgcaaaattgtcaaaatgtgag 13646  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||    
T  13647 ttctggttaagtgaagtaagttttct 13672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 26 - 451
Target Start/End: Original strand, 21426 - 21851
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||||| | || |||||||| |||||||||||    || || ||||||||||||    
T  21426 tcagttgaataaggttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgataacttcatggatcatttagtgggtgctcgtgtgtttagcaagattgat 21525  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||  | ||||| || || |||||||| || |||||||    
T  21526 ttgaggtcaggttaccatcagattaatgtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacatgatatggacattacgaatataaggtgatgcctt 21625  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| || | | |||||  ||| || |||||||| || ||||| || ||    
T  21626 tcggtcttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccacgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatctt 21725  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||  | ||||| || ||||| || |||||     
T  21726 gatttattcgaagacagaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgcgaagttgtcaaaatgtgag 21825  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||    
T  21826 ttctggttaagtgaagtaagttttct 21851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 26 - 382
Target Start/End: Original strand, 19545 - 19901
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||| ||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19545 tcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttctgaggattgacgacttaatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 19644  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||  | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || || |||||||| || |||||||    
T  19645 ttgaggtcgggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgaatataaggtgatgcctt 19744  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    || |||| || |||||  |||  |||||||||||||||||||| || || |||||||| |  ||||||  |||||| |||||||| || ||||| || ||    
T  19745 tcagtgttactaatgcgtctgacgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacttggataaattcgtggttgtgtttattgatgacatctt 19844  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 382  Q
    |||||| || |||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  19845 gatttattctaagaatgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagt 19901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 306 - 448
Target Start/End: Original strand, 26457 - 26599
Alignment:
Q  306 gtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatg 405  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||| ||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||  |  | | ||    
T  26457 gtgttcatagatgatattttggtgtattcgaagtctgaggaagagcatgctgaacatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttatgtg 26556  T
Q  406 ctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttt 448  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  26557 ctaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagttt 26599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1477 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold1477
Description:

Target: scaffold1477; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 26 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 621 - 215
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || |||||  |||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  621 tcagttgaacaaagttacaataaagaacgggtatccacttccgaggattgacgacttaatggatcagttagtgggtgcaaaggttttcagcaagattgac 522  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| |||   || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || || ||||| ||||| |||||||    
T  521 ttgaggtcagcttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattaagaatacaaagtgatgcctt 422  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||||||||| || || |||||||| | | |||||  |||| | ||||| || || ||||| |||||    
T  421 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatgaagtatatgaaccgaattttccatgcctatctggataaattcatggttgtatttattgatgacatttt 322  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    |||| | |  | |||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||  | ||||| || ||||| ||||||||     
T  321 gatt-attttaggactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtattgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaagtgtgat 223  T
Q  426 ttctggtt 433  Q
    ||||||||    
T  222 ttctggtt 215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 123; Significance: 5e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 48 - 454
Target Start/End: Original strand, 31252 - 31658
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||  | || || ||||    
T  31252 aagaataggtatccacttccgagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggtgttcagtaagattgacttgaggtctggttaccatcaga 31351  T
Q  148 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 247  Q
    | || ||||||||||| |||||||||||||| || || || |  || ||||| || || ||||| ||  | ||||||||| |||| || ||||| |||||    
T  31352 taaaggtgaaagatgaggatatgcagaagacggcctttaggagacgatatggacattacgaatacaagttgatgcctttcagtgttactaatgcgcctgg 31451  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     || |||||||| |||||||| || || |||||||| ||| ||| |  ||| || || ||||| || ||||||||| ||||||| || |||||||||||     
T  31452 ggtatttatggaatatatgaaccgaattttccatgcttttctggttaaatttgtggtggtgtttattgatgatattctgatttattctaagactgaagag 31551  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 447  Q
    || ||||| ||||||||||||||| | |||||||| | |||||| |||||  | ||||| ||  |||| |||||||| |||||||| |  ||||| ||||    
T  31552 gagcatgcagagcatctgaagattatattgcaagtcttgaaagaaaagaagttgtatgcaaagctgtcaaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagtt 31651  T
Q  448 ttctggg 454  Q
    |||||||    
T  31652 ttctggg 31658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 26 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 25508 - 25068
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||     
T  25508 tcagttgaacaaagttacaataaagaacagatatccacttccgagatttgatgacttgatggaccagttggtgggtgcaaaagtttttagtaaaattgac 25409  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||  | || || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || || || || |  |||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  25408 ttgaggtctggttaccatcaaattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacaatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctt 25309  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| |  || || ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||  |||||| || || || || |||||||||||    
T  25308 tcggtgttattaacgcgcctggcgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctttctggataaattcgtggtggtatttatagatgatatttt 25209  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactt-tatgctaaattgtctaagtgtga 424  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||| |||||  |||||||||| |||||  | | ||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||    
T  25208 gatttattctaagactgaagaggagcatgcagagcacttgaagattgtgttgcagattttgaaagag-agaaagttgtatgccaagttgtcgaagtggga 25110  T
Q  425 attctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
     |||||||| |  ||||| |||||||| ||| | ||||||||    
T  25109 gttctggttaactgaagtgagttttctaggccacgttatttc 25068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 26 - 455
Target Start/End: Original strand, 99473 - 99902
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||     
T  99473 tcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttggtgggtgcaaaggtttttagtaagattgaa 99572  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || ||||| || || ||||| || || |||||||    
T  99573 ttgaggtcaggttaccatcagatcaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacagcctttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctt 99672  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||| | | |||||  ||| || |||||||| || ||||| ||| |    
T  99673 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaatcgaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacattct 99772  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    ||| || || |  ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||| |    |||||||| ||  | |||||||| ||||| ||||||||     
T  99773 gatctattctagaactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaaattctaaaagagaaaaagttatatgctaagttgtcgaagtgtgag 99872  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggc 455  Q
    |||||||| |  ||||| ||||||||||||    
T  99873 ttctggttaagtgaagtgagttttctgggc 99902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 26 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 38043 - 37636
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||||||| |||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||     
T  38043 tcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatccactttcgaggattgatgacttaatggatcaattagtgggtgcaaaggttttcagtaagattgac 37944  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | || || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||| || || |||||||    
T  37943 ttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttagaacacgttatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 37844  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
     |||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |   |||||  ||| || ||||  || || ||||| ||| |    
T  37843 acggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggataaatttgtggttgaatttattgatgacattct 37744  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||  |||| | |||||| |||||  | |||||||| ||||| ||||||||     
T  37743 gatttattcaaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtattagaagtattgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcaaagtgtgag 37644  T
Q  426 ttctggtt 433  Q
    || |||||    
T  37643 ttttggtt 37636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 48 - 465
Target Start/End: Original strand, 5022 - 5439
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 147  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    || |||||  | ||||||||||| ||| | || || || |    
T  5022 aagaatagatatccacttccgagaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgctcgtgtgttcagacaaattgatttgaggtcaggttaccatcaaa 5121  T
Q  148 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 247  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || || || ||||| || ||||| |||||  | ||| |||||||||| || ||||| |||||    
T  5122 ttaaggtgaaggatgaagatatgcagaaaacggcctttaggacacgatatggacattatgagtataagatgatgtctttcggtgttactaatgcgcctgg 5221  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     |||||||||||||| |||||| | || |||||||| | | |||||  ||| || |||||||| || ||||||||  | ||||| || |||| |||||||    
T  5222 tgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcctaatttattctaagaatgaagaa 5321  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 447  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||  | ||||| || ||||| || |||||||| ||||| |  | ||||||||    
T  5322 gagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattttggttaagtggagtaagtt 5421  T
Q  448 ttctgggcgatgttattt 465  Q
    |||| ||| || ||||||    
T  5422 ttcttggccatattattt 5439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 48 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 28898 - 28481
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 147  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||   || ||||| || ||||| ||||| ||| | || || ||||    
T  28898 aagaatagatatccacttccgagaattgatgatttaatagatcagttagtgggtgcacgcgtgttcagtaaaattgacttgaggtcaggttaccatcaga 28799  T
Q  148 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 247  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||  | || || || || ||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  28798 ttaaggtgaaggatgaggatatgcagaaaacgacctttaggacacgatatggacattatgagtataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 28699  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     || |||||||||||||||||  | || |||||||| | | |||||  ||| || |||||||| || ||||||||  | ||||| || | || |||||||    
T  28698 tgtatttatggagtatatgaacagaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcctaatttattctaggaatgaagaa 28599  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 447  Q
     | ||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||| | ||||| || ||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||    
T  28598 aagcatgcagagcatctgatgattgtgttgcaagtgttgaaagaaaagaaattgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagtt 28499  T
Q  448 ttctgggcgatgttattt 465  Q
    |||| ||| || ||||||    
T  28498 ttcttggccatattattt 28481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 14601 - 14170
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||   || || || ||||||||     
T  14601 tcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagtaagattgac 14502  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcac------tatgaatataaagtta 219  Q
    ||||| ||| | || || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||||      ||||||||||| || |    
T  14501 ttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcactatatatatgaatataaggtga 14402  T
Q  220 tgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatga 319  Q
    || |||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |   || ||  |||||| |||||||  || |||||    
T  14401 tgtctttcggtgttactaatgcacctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcctacctgaataaattcgtggttgtgtctattgatga 14302  T
Q  320 tattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaag 419  Q
     ||| | ||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | | |||||| |||||  | |||||||| ||||| |||    
T  14301 cattctaatttattataagactgaagaagagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaaatattgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcgaag 14202  T
Q  420 tgtgaattctggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
    ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  14201 tgtgagttctggttaattgaagtgagttttct 14170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 448
Target Start/End: Original strand, 5718 - 6141
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || || || ||||||||||    
T  5718 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 5817  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  ||||||||    || || || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  5818 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcagaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 5917  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggag-tatatgaatc-gcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattt 324  Q
     || ||  | ||||| || || || ||||| ||  || ||||||  | || || ||| | | | |||| || || || || |||||||| ||||||||||    
T  5918 tggagtatctaatgcgccaggtgtctttattgaaatacatgaataagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattt 6017  T
Q  325 tgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtga 424  Q
    || | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||  |  | | ||| || ||||||||||||||    
T  6018 tggtgtattcgaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtga 6117  T
Q  425 attctggttgaaggaagtaagttt 448  Q
     || |||||||||||||| |||||    
T  6118 gttttggttgaaggaagtgagttt 6141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 318 - 466
Target Start/End: Original strand, 3556 - 3704
Alignment:
Q  318 gatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtcta 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3556 gatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattatcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattatcta 3655  T
Q  418 agtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  3656 agtgtgagttctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttc 3704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 26 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 9456 - 9027
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||     
T  9456 tcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttagtggatgcaaaggtttttagtaagattgac 9357  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| | || || || ||||| ||||| || || |||||||||||||| || || || || || |||||||| || ||||| || || ||| |||    
T  9356 ttgagatcaggttaccatcaaattaaggtgaaggacgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgtctt 9257  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| |  || |||||||| | | |||||  ||| || ||||| || || ||||| || ||    
T  9256 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccaaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtatttattgatgacatctt 9157  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
     ||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| | ||||||||| ||  | | |||||| ||||| ||||||||     
T  9156 aatttattcaaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttacaagttttgaaagagaaaaagttgtgtgctaagttgtcgaagtgtgag 9057  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggc 455  Q
    |||| ||| |  ||||| ||||||||||||    
T  9056 ttctagttaagtgaagtgagttttctgggc 9027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 26 - 268
Target Start/End: Original strand, 1400 - 1642
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||     
T  1400 tcagttgaacaaagttacgataaagaacagatatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttggtgggtgcaaaagtttttagtaagattgac 1499  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| || || ||||| |||||| ||||||| || || || || || |||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  1500 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtaaaggatgaggatatgaagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctt 1599  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaa 268  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||| |||||||    
T  1600 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggaggatatgaa 1642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 26 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 43311 - 42887
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||| |||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||     
T  43311 tcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccactttcgaggattgacgacttgatggatcagttagtgggtgcaaaggttttcagtaagattgac 43212  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | || || || ||||| ||||| ||||| | |||||||||||  || || || || || |||||||| || ||||| || || |||||||    
T  43211 ttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgagggtatgcagaagagggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 43112  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||| |||| |   |||||  ||| || |||||||| || ||||||||| |    
T  43111 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatcgagtatatgaaccgaat-ttctatgcttacctggataaatttgtggttgtgtttattgatgatattct 43013  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    ||| || || |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||| | | ||||||||||||  | |||||||| ||||| ||||||||     
T  43012 gatctattcaaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaaaattgtgttgcaaatattgaaagagaagaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgag 42913  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
    |||||||| |  |||||||| |||||    
T  42912 ttctggttaagtgaagtaagctttct 42887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 315 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 1158 - 1007
Alignment:
Q  315 gatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgt 414  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |    
T  1158 gatgatattctgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagaaaagaaactttatgctaaactat 1059  T
Q  415 ctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  1058 ctaagtgtgagttctggttgaaagaggtaagttttcttggccatgttatttc 1007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0304 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0304
Description:

Target: scaffold0304; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 48 - 451
Target Start/End: Original strand, 1418 - 1821
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 147  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||    || |  || || ||||||||||| ||| | || || ||||    
T  1418 aagaacaggtatccatttccgaggattgatgatttaatggatcagtcagtgggtgctcgtgtgtatagtaaaattgatttgaggtcaggttaccatcaga 1517  T
Q  148 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 247  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||| |  || || || || ||||  |||||||||||||| || ||  |||||||||| || ||||| |||||    
T  1518 ttaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggtctttaggacacgatatgaacactatgaatataaggtgatatctttcggtgttactaatgcgcctgg 1617  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     ||||||||||||||||| || || || |||||||| | | |||||  ||| || |||||||| || ||||| || |||||||| || ||||||||||||    
T  1618 tgtgtttatggagtatataaaccgaattttccatgcctatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattctaagactgaagaa 1717  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 447  Q
    || ||||| ||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  | ||||| || ||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||    
T  1718 gagcatgcagaagatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagagaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgagttctggttaaatgaagttagtt 1817  T
Q  448 ttct 451  Q
    ||||    
T  1818 ttct 1821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 26 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 895 - 566
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    || || ||||| |||| |    
T  895 tcagttgaataaagtgacgataaagaataggtatcaacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgctcgtgtgtttagcaaaattggt 796  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || || |||||||| ||||||||||| || ||||| |    
T  795 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacagcctttaggacacgatatggtcattatgaatataaggtgatgccat 696  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||| | | | |||  ||| || |||||||| || ||||| || ||    
T  695 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctagataaatttgtggttgtgtttattgatgacatctt 596  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgc 355  Q
     ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  595 aatttattctaagactgaagaagagcatgc 566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 54 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 1364 - 967
Alignment:
Q  54 aggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaag 153  Q
    ||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||| |||||  |  |||||||||| ||||    
T  1364 aggtatccacttccgaggatcgacaatttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgttcagtaagattgatttaagatcgggccatcaccagatcaaag 1265  T
Q  154 tgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtt 253  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| || || || |||||  | || ||  |||||   || |||||||||||||| || || || || ||||||||    
T  1264 tgaaagatgaggatattcataagacagcctttaggacacgttacagacattacaaatattcggtgatgcctttcggtgttactaacgcgccgggagtgtt 1165  T
Q  254 tatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacat 353  Q
    |||||| ||||||||||| || || ||||| | ||||||||  || || |||||||| || ||||||||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  1164 tatggaatatatgaatcgtatttttcatgcttatttggatcagtttgttgttgtgtttatagatgatattatgatatactctaagaccgaagaggaacat 1065  T
Q  354 gctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
    || |||||| |||  ||||| ||||||||   ||| ||||||||  | ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  1064 gcggagcatttgagaattgttttgcaagtactgaaggagaagaagttatatgccaaattatcgaagtgtgaattctggttgaacgaagtgacttttct 967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 48 - 465
Target Start/End: Original strand, 176277 - 176694
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||   || || |||| |||||||||||| ||  | || ||  |||    
T  176277 aagaataggtatccacttccgcgaattgatgatttaatggatcagttagtgggtgcacgcgtgtttagcatgattgatttgaggtcgggttaccattaga 176376  T
Q  148 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 247  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || ||  | || || || || ||||| || || ||||||  ||| ||  |||||||||| || ||||| |||||    
T  176377 ttaaagtaaaagatgaagatatgcataaaacgacctttaggacacgatatggacattacgaatattcagtgatatctttcggtgttactaatgcgcctgg 176476  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     |||||||||||||| |||||| | || |||||||| | ||||||||| || || ||||| || || ||||| || |||||||| || ||| ||||||||    
T  176477 tgtgtttatggagtacatgaatagaattttccatgcttatttggatcggtttgttgttgtatttattgatgacatcttgatttattctaagtctgaagaa 176576  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 447  Q
    || ||||| |||||| | |||||||| ||| |||||| ||| || |||||  | ||||| || ||||| || |||||||||||||| |  ||||||| ||    
T  176577 gagcatgcagagcatttaaagattgtgttgtaagtgttgaatgaaaagaagttgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaaatt 176676  T
Q  448 ttctgggcgatgttattt 465  Q
    |||| ||| || ||||||    
T  176677 ttcttggccatattattt 176694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 26 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 269003 - 268563
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||||||     
T  269003 tcagttgaacaaagttacaataaagaataggtatccactcccgcggattgatgacttgatggaccagttggtaggtgctaaagtttttagtaagattgac 268904  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||  | || || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || | |||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  268903 ttgaggtcgggttaccatcaaattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatgtggtcattacgaatacaaagtgatgcctt 268804  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| |  || |||||||| ||| |||||  |||||| || ||||| || |||||||||||    
T  268803 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccagattttccatgcttttctggataaattcgtggtggtgtttatagatgatatttt 268704  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactt-tatgctaaattgtctaagtgtga 424  Q
    |||||| || || |||||||| ||||| || || || ||||||||||| |||||  | | ||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||    
T  268703 gatttattctaaaactgaagaggaacacgccgaacacctgaagattgtgttgcagattttgaaagag-agaaagttgtatgccaagttgtcgaagtgcga 268605  T
Q  425 attctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
     |||||||| |  ||||| ||||| || ||| ||||||||||    
T  268604 gttctggttaagtgaagtgagtttcctaggccatgttatttc 268563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 436
Target Start/End: Original strand, 84432 - 84840
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||    || ||||  || ||||| |    
T  84432 cagttgaataaagtgacaataaagaataggtatcgacttccgaggattaacgatttgatggat-agttagtgggtgcgcgtgtgttcaataaaattgact 84530  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||  | ||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  | || || || ||||| || || || ||||||   || ||||||||    
T  84531 tgagatcgggctatcaccggatcaaagtgaaagatgaggatattcagaagacgacctttaggacacgttacggacattacgaatattttgtgatgccttt 84630  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    |||||| || ||||| |   |||| |||||||| ||||||||||| || || ||| | | | | ||||| || || |||||||| || ||||||||| ||    
T  84631 cggtgttactaatgcgctgagagtatttatggaatatatgaatcgtatttttcatacttatctagatcgttttgttgttgtgtttatagatgatattatg 84730  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    || ||||| |||||  | || || ||||| |||||| |||  ||||| |||||||||  ||||||||||||  | ||||| || || || ||||| ||||    
T  84731 atatactctaagaccaaggaggagcatgccgagcatttgagaattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgccaagttatcaaagtgcgaat 84830  T
Q  427 tctggttgaa 436  Q
    ||||||||||    
T  84831 tctggttgaa 84840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 26 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 1038 - 612
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |  ||||  |||| || || |||||     
T  1038 tcagttgaataaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttggtgag--caaagttttttagtaatattgac 941  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | || || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || || || |||||||| || ||||| || || |||||||    
T  940 ttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 841  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||| || || ||||| ||| |||||||||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || || ||||| || ||||| ||| |    
T  840 tcggtgttactaatgcgccgggtgtgttcatgtagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggtggtgtttattgatgacattct 741  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
     ||||| || ||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||  | |||||||||||||| || |||||     
T  740 aatttattctaagactgaagaggagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgctaaattgtcgaaatgtgag 641  T
Q  426 ttctggttgaag-gaagtaagttttctgggc 455  Q
    || ||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  640 ttttggt--aagtgaagtaagttttctgggc 612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 8007 - 7809
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||  | |||||  |||| || || |||||     
T  8007 tcagttgaataaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttgatggatcagttggt--gagcaaagttttttagtaatattgac 7910  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | || || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || || || |||||||| || ||||| || || |||||||    
T  7909 ttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 7810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 108; Significance: 5e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 26 - 465
Target Start/End: Original strand, 79742 - 80181
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||  ||||||| ||||||||     
T  79742 tcagttgaacaaagttaccataaagaacaggtatccactttcgaggattgatgacttgatggatcagttggttggtgcaaagattttcagtaagattgac 79841  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | || || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || || || |||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  79842 ttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctt 79941  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||| | ||| ||||| ||||||||||||||  | || || ||||| ||  |||||   || || || || ||||| |||||||||||    
T  79942 tcggtgttactaatgcgcttggtgtgttcatggagtatatgaacaggatttttcatgctttcctggataagtttgtggtagtattcattgatgatatttt 80041  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
     ||||| || ||||||||||| || |||||  ||||||||| |||||| || || || | |||||| |||||  | |||||||||||||| || || ||     
T  80042 aatttattctaagactgaagaggagcatgcaaagcatctgaggattgtattacaggttttgaaagaaaagaagttgtatgctaaattgtcaaaatgcgag 80141  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttattt 465  Q
    || ||||| |  ||||||||||| || ||| || ||||||    
T  80142 ttttggttaagtgaagtaagtttccttggccatattattt 80181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 26 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 21515 - 21127
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||  | ||||||||||||||||| || ||||||||     
T  21515 tcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgacgacttggtggatcaagtggtgggtgcaaaagtttttagtaagattgac 21416  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | || || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||  | ||||| |||||||| || || || ||||    
T  21415 ttgaggtcaggttaccatcaaattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgacacggtcattatgaatagaaggtgatacctt 21316  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || || |||||||||||||| || || || ||||| ||| |||||  ||| |||||||| ||  | ||||||||| |    
T  21315 tcggtgttactaatgcgcctggtgtattcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttttctggataaatttgtagttgtatttcttgatgatattct 21216  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgt 414  Q
     ||||| || ||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| | |||||| || ||  | |||||||||||||    
T  21215 aatttattctaagactgaagaggagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagttttgaaagaaaataagttgtatgctaaattgt 21127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 436
Target Start/End: Original strand, 27160 - 27569
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||   || ||||| || ||||| |    
T  27160 cagttgaataaagtgacaataaagaataggtatccacttccgaggatcaatgatttgatgtatcagttagtgggtgcacgtgtgttcagtaaaattgact 27259  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    | |||||  | ||||||| ||| ||| |||||||||| || || |||||||  |  || || |  ||||| ||  | |||||||||   || ||||||||    
T  27260 taagatcgggctatcaccggatcaaactgaaagatgaggacattcagaagatggactttaggatacgttacggaaattatgaatattctgtgatgccttt 27359  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||| |||| ||||||||||| || || ||| | | | | ||||| || || |||||||| || ||||||||  ||    
T  27360 cggtgttactaatgcgccgggagtatttgtggaatatatgaatcgtatttttcatacttatctagatcgttttgttgttgtgtttatagatgatatcctg 27459  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
    || ||||| ||| |||| || |||||||| |||||| |||  ||||| |||||||||  ||||||||||||  | ||||| || || || ||||| ||||    
T  27460 atatactctaagtctgaggaggaacatgccgagcatttgagaattgttttgcaagtgctgaaagagaagaagttatatgccaagttatcaaagtgagaat 27559  T
Q  427 tctggttgaa 436  Q
    ||||||||||    
T  27560 tctggttgaa 27569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 26 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 53440 - 53011
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||| || ||||||||| | || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||     
T  53440 tcagttgaataaagttacaataaagaacagatatccactttctaggattgatgacttgatggatcaattagtgggtgcaaaggtttttagtaagattgac 53341  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | || || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || || || ||||| || || || || || || || ||||    
T  53340 ttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgagtacaaggtgatacctt 53241  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||| ||| || ||||  |||||  |||| |||||||||||||| || || |||||||| |   |||||  ||| || ||||| || || ||||||||| |    
T  53240 tcgatgttactaatgtgcctggtttgttcatggagtatatgaaccggattttccatgcttacctggataaatttgtggttgtatttattgatgatattct 53141  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||| | | ||||||||| ||  | |||| ||| ||||| ||||||||     
T  53140 gatttattctaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaaatattgaaagagaaaaagttgtatgttaagttgtcgaagtgtgag 53041  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggc 455  Q
    |||||||| |  ||||| ||||||||||||    
T  53040 ttctggttaagtgaagtgagttttctgggc 53011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 48 - 451
Target Start/End: Original strand, 64452 - 64844
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 147  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| || ||||||||||||| |||    || |||||||||||||||||||| ||  | || || ||||    
T  64452 aagaataggtatccacttacgaggattgatggtttaattgatcagttagtggatgctcgtgtgttcagcaagattgatttgaggtccggttaccatcaga 64551  T
Q  148 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 247  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | || || || || |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |           |||||    
T  64552 ttaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacgtcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgccgttcggcg-----------cctgg 64640  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     |||||||||||||||||||| || || |||||||| | | |||||  ||| || |||||||| || ||||| || || ||||| || ||||||||||||    
T  64641 tgtgtttatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttaatttattcaaagactgaagaa 64740  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 447  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||  | ||||| || ||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||    
T  64741 gagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaaaagaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagtt 64840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 26 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 262619 - 262194
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||| ||| |||| ||| |||| |||||||||||||| || ||||||||  ||||||| ||||||||     
T  262619 tcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatccgctttcgaggatttatgacttgatggatcagttggttggtgcaaagattttcagtaagattgac 262520  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||  | || || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||||| || || |||||||    
T  262519 ttgaggtctggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgttatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 262420  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | || |||||||  ||| |||||   || || ||||| ||||| || |||||  |    
T  262419 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaactgaattttccatgtctttctggataagtttgtggttgtattcattgacgatatcct 262320  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
     ||||| || |||||| |||| || ||||| || ||||||| |||||| ||||||||   ||||||||| ||  | |||||||| ||||| || ||||||    
T  262319 aatttattctaagactaaagaggagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagtactgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaaatgtgaa 262220  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
    |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  262219 ttctggttaagtgaagtgagttttct 262194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 26 - 448
Target Start/End: Original strand, 10697 - 11119
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||  |||| ||  |||||||| |||||||||||||| || ||||||||  |||| || ||||| ||     
T  10697 tcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatctgcttctgaagattgatgacttgatggatcagttggttggtgcaaatatttttagtaagatcgac 10796  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||  | || || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || || || || || |||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  10797 ttgaggtctggttaccatcagataaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctt 10896  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||  |||||  ||||||||| || || || |||||||||||    
T  10897 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgctttcctggataaattcgtagtggtatttattgatgatatttt 10996  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
     ||||| || ||||||||||| || ||||| || ||||||| |||||| |||||||| |  |||||||||||  | ||||| |||||||| || |||||     
T  10997 aatttattctaagactgaagaggagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagtatttaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcaaaatgtgag 11096  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttt 448  Q
    || ||| | |  |||||||||||    
T  11097 ttttggctaagtgaagtaagttt 11119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 48 - 466
Target Start/End: Original strand, 46967 - 47385
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||   || || || || ||||||| ||| ||  | || || ||||    
T  46967 aagaataggtatccacttccgagaattaacgatttaatggatcagctagtgggtgcacgtgtgtttagtaaaattgattggaggtccggttaccatcaga 47066  T
Q  148 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 247  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||  || || || || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  47067 ttaaggtgaaggatgaggatatgcagaagatggcctttaggacacgttatggtcattatgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 47166  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     ||||||||| |||||||||| |  || |||||||| | | | |||  ||| || |||||||| || ||||||||  | ||||| |  |||| ||||||     
T  47167 tgtgtttatgaagtatatgaaccaaattttccatgcctatctagataaatttgtggttgtgtttattgatgatatcctaatttattttaagaatgaagat 47266  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 447  Q
    || ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| || ||  | ||||| |  ||||| || |||||||| ||||| |  |||||| |||    
T  47267 gagcatgcagagcatctgcagattgtattgcaagtgttgaaagaaaaaaagttgtatgcgacgttgtcaaaatgtgaattttggttaagtgaagtaggtt 47366  T
Q  448 ttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||| ||| || |||||||    
T  47367 ttcttggccatattatttc 47385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 48 - 451
Target Start/End: Original strand, 55780 - 56183
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 147  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||||||||  ||||||  |||||||| ||||| ||| | || || || |    
T  55780 aagaacagatatccgcttccgaggattgacgacttgatggaccagttggtcggtgcaaagattttcaataagattgacttgaggtcaggttaccatcaaa 55879  T
Q  148 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 247  Q
    || | ||||| ||||||||||||||||||||  | || || || ||||||||||| || ||||| ||| | |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  55880 ttcaggtgaaggatgaagatatgcagaagacgacctttaggacacgttatggtcattacgaatacaaattgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgg 55979  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaa 347  Q
     || || |||||||||||||| || || || ||||| ||| |||||   ||  | ||||| ||||| ||||| ||  | ||||| ||||||||||||||     
T  55980 tgtattcatggagtatatgaaccgtatttttcatgcttttctggataagtttatggttgtattcattgatgacatcctaatttattccaagactgaagag 56079  T
Q  348 gaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagtt 447  Q
    || ||||| || ||||||| |||||| ||||||||   ||||||||| ||  | |||||||| ||||| || |||||||||||||| |  ||||| ||||    
T  56080 gagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagtactgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaaatgtgaattctggttaagtgaagtgagtt 56179  T
Q  448 ttct 451  Q
    ||||    
T  56180 ttct 56183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0445 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0445
Description:

Target: scaffold0445; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 166 - 466
Target Start/End: Original strand, 1900 - 2200
Alignment:
Q  166 atatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatat 265  Q
    ||||||||||||| || || || || |||||||| || || ||||||  ||| ||| |||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| ||    
T  1900 atatgcagaagacggcctttaggacacgttatggacattacgaatatgcagtgatggctttcggtgttactaatgcgccgggtgtgtttatggagtacat 1999  T
Q  266 gaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctg 365  Q
    |||||| || || ||||| | ||| ||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| ||||||| ||    
T  2000 gaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgcttcatggttgtgttcattgatgatattttgatatactctaagtctcaagaagaacatgttgagcatttg 2099  T
Q  366 aagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttattt 465  Q
    |||||||| |||||||||  ||| ||||||||  |  |||| || ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||  |||||||||    
T  2100 aagattgttttgcaagtgctgaaggagaagaagttaaatgccaagttgtcaaagtgtgaattctggttgaatgaggtgagttttcttggtcatgttattt 2199  T
Q  466 c 466  Q
    |    
T  2200 c 2200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 4)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 26 - 466
Target Start/End: Original strand, 31588 - 32028
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||| || |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| || ||||||||  |||| || || |||||     
T  31588 tcagttgaataaagttacaataaagaaaagatatccacttccgagaattgacgacatgatggatcagttggttggtgcaaagatttttagtaaaattgac 31687  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | || || ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || || |||||||| || |||||||| || |||||||    
T  31688 ttgaggtcaggttaccatcagatcaaggtgaaagatgaggacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctt 31787  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | || || ||||| |   |||||  ||| || ||||| ||||| ||||| |||||    
T  31788 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaacagaatttttcatgcttacctggataaatttgtggttgtattcattgatgacatttt 31887  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    ||| || || |  ||||| ||||| ||||| || ||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||  | ||||| |||||||| ||||| ||     
T  31888 gatctattcgagaactgaggaagagcatgcagaacatctgaggattgtattgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcaaagtgcgag 31987  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    || ||||| |  ||||| |||||||| ||| || |||||||    
T  31988 ttttggttaagtgaagtgagttttcttggccatattatttc 32028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 26 - 232
Target Start/End: Original strand, 54322 - 54528
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||     
T  54322 tcagttgaacaaagttacgataaagaatagatatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagatagtgggtgcaaaggtgttcagtaagattgac 54421  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || ||||| || || ||||| || || |||||||    
T  54422 ttgaggtcaggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggacattacgaatacaaggtgatgcctt 54521  T
Q  226 tcggtgt 232  Q
    |||||||    
T  54522 tcggtgt 54528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 42652 - 42231
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||| | || || || ||||||||||    
T  42652 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgcataggtgtttagtaagattgatt 42553  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  ||||||||    || || || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  42552 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattttgtgatgccatt 42453  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     || ||  | ||||| |  || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || || || || |||||||| ||||||||||||    
T  42452 tggagtatctaatgcgctaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 42353  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
     | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||  |  | | ||| || |||||||||||||| |    
T  42352 gtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagt 42253  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttt 448  Q
    | |||||||||||||| |||||    
T  42252 tttggttgaaggaagtgagttt 42231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 249 - 415
Target Start/End: Original strand, 55034 - 55200
Alignment:
Q  249 gtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaag 348  Q
    ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| | | |  |||||| || || || || ||||||||| | || || || ||||||||||| |    
T  55034 gtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctagttaaattcgtggtggtatttattgatgatattctaatctattctaagactgaagagg 55133  T
Q  349 aacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtc 415  Q
    | ||||| || |||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||  | |||||||| |||||    
T  55134 agcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagttttgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtc 55200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 81 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 7090 - 6720
Alignment:
Q  81 ttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacag 180  Q
    |||||||||| ||||||||||||    || ||| | |||||||||||||| ||| | || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  7090 ttgatggatcggttagtgggtgctcgtgtattccgtaagattgatttgaggtcaggttaccatcagattaaagtgaaggatgaggatatgcagaagacgg 6991  T
Q  181 ctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttcca 280  Q
    | || || || || |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||||||| || || || ||    
T  6990 cctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctgatgtgtttatagagtatatgaaccgaatttttca 6891  T
Q  281 tgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaa 380  Q
    ||| ||| ||  |  ||| || |||||||| || ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  6890 tgcttttctgattaaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattctaagactgaggaagagcatgtagaacatctgaagattgtattgcaa 6791  T
Q  381 gtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
    || | ||||||||||||  | ||||| || ||||| || ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  6790 gtattgaaagagaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgagttctggttaagtgaagtgagttttct 6720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 27 - 232
Target Start/End: Original strand, 114950 - 115155
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || || |||||||||||||    
T  114950 cagttgaataaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgacttgatggatcagttagtgggtgcacgtgtgtttagcaagattgatt 115049  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||  || || || || |||||||| || || ||||||  ||| ||||||||    
T  115050 tgagatcgggttatcaccagattaaagtgaaagacgaggatatccagaagatggcctttaggacacgttatggacattacgaatattgagtgatgccttt 115149  T
Q  227 cggtgt 232  Q
    ||||||    
T  115150 cggtgt 115155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 305 - 466
Target Start/End: Original strand, 115171 - 115332
Alignment:
Q  305 tgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttat 404  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||| |||||| |  | |||    
T  115171 tgtgttcatcgatgatattttgatatactctaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgctgaaggagaagtagttatat 115270  T
Q  405 gctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    || || ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||| ||||||||||    
T  115271 gccaagttgtcaaagtgtgaattttggttgaaagaggtgagttttcttggccatgttatttc 115332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold1373
Description:

Target: scaffold1373; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 454
Target Start/End: Original strand, 747 - 1173
Alignment:
Q  28 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 127  Q
    |||||||||| || || || |||||  ||||||  |||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  |||| || |||||||| ||    
T  747 agttgaacaaagttacgataaagaaccggtatctgcttccgaggattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatttttagtaagattgactt 846  T
Q  128 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 227  Q
    ||| ||  | || || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||| || || || ||||| |||||||||    
T  847 gaggtctggttaccatcagataaaggtgaaggatgaggatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttc 946  T
Q  228 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttga 327  Q
    ||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||| |  || |||||||  ||| |||||  ||| || ||||| ||||| || |||||||| |    
T  947 ggtgttactaacgcgcctggtgtgtttatggagtatatgaaccaaattttccatgattttctggataaatttgttgttgtattcattgacgatattttaa 1046  T
Q  328 tttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaatt 427  Q
    | || ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||| | |||||| ||||   | ||||| || ||||| || ||||| ||    
T  1047 tctattccaagaatgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtgttgcaagttttgaaagaaaagaggttgtatgcaaagttgtcaaaatgtgagtt 1146  T
Q  428 ctggttgaaggaagtaagttttctggg 454  Q
    |||||| |  ||||| |||||||||||    
T  1147 ctggttaagtgaagtgagttttctggg 1173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2111 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold2111
Description:

Target: scaffold2111; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 48 - 269
Target Start/End: Original strand, 520 - 741
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 147  Q
    ||||| || ||||| |||||||||| ||| ||  ||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||  | || ||  | |    
T  520 aagaacagatatccgcttccgagaactgacgacctgatggatcagttggttggtgcaaaagtttttagtaagattgacttgaggtcgggttaccatgaaa 619  T
Q  148 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctgg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || || || || || |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||    
T  620 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcacctgg 719  T
Q  248 agtgtttatggagtatatgaat 269  Q
     ||||| |||||||||||||||    
T  720 tgtgttcatggagtatatgaat 741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 27 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 25788 - 25367
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || || || ||||||||||    
T  25788 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 25689  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  ||||||||    || || || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  25688 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 25589  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     || ||  | |||||||| || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || || || || |||||||| ||||||||||||    
T  25588 tggagtatctaatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 25489  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
     | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||  |  | | ||| || |||||||||||||| |    
T  25488 gtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagt 25389  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttt 448  Q
    | |||||||||||||| |||||    
T  25388 tttggttgaaggaagtgagttt 25367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 27 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 34479 - 34058
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||| | || || || ||||||||||    
T  34479 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatgcacttccgaggattgatgatttgatggatcagctggtcggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 34380  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  |||||||| |  || || || ||  ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  34379 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcggaagatatacccaaaaccgcgtttcgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 34280  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     || ||  ||||||| || || || || ||||||||||||||| | || || ||| | | | |||| || || || || |||||||| ||||||||||||    
T  34279 tggagtatccaatgcgccaggtgtcttcatggagtatatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 34180  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
     | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||  |  | | ||| || ||||||||||||||||    
T  34179 gtgtattcgaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttatgtgcaaagttgtctaagtgtgaat 34080  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttt 448  Q
    | |||||| |||||||||||||    
T  34079 tttggttggaggaagtaagttt 34058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 3)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 27 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 15302 - 14881
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || || || ||||||||||    
T  15302 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagtgggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 15203  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgccttt 226  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  ||||||||    || || || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||||| ||    
T  15202 tgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatt 15103  T
Q  227 cggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttg 326  Q
     || ||  | |||||||| || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || || || || |||||||| ||||||||||||    
T  15102 tggagtatctaatgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttg 15003  T
Q  327 atttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaat 426  Q
     | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||  |  | | ||| || |||||||||||||| |    
T  15002 gtgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagt 14903  T
Q  427 tctggttgaaggaagtaagttt 448  Q
    | |||||||||||||| |||||    
T  14902 tttggttgaaggaagtgagttt 14881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 157
Target Start/End: Original strand, 11089 - 11216
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 129  Q
    |||||||| || || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  | || ||| || | || ||||| |||||||||||||    
T  11089 ttgaacaaagtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcaactggttggttcagaggtgttcagtaagattgatttga 11188  T
Q  130 gatcaaggtatcaccagattaaagtgaa 157  Q
    ||||| | ||||| ||||||| ||||||    
T  11189 gatcaggatatcatcagattagagtgaa 11216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 306 - 448
Target Start/End: Original strand, 11365 - 11507
Alignment:
Q  306 gtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatg 405  Q
    |||||||| |||||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||  ||||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||  |  | | ||    
T  11365 gtgttcatagatgatattttggtgtattcgaagtctgaggaagagcataatgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttatgtg 11464  T
Q  406 ctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttt 448  Q
    | || || | ||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  11465 caaagttatataagtgtgagttttggttgaaggaagtgagttt 11507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1715 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold1715
Description:

Target: scaffold1715; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 1347 - 919
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| |  ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  |||| || ||||| ||     
T  1347 tcagttgaacaaggttacgataaagaacatatatccgcttccgaggattgacgacttgatggatcagttggttggtgctaagatttttagtaagatcgac 1248  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||  | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || || || || || |||||||| || || || ||||| |||||||    
T  1247 ttgaggtctggttaccatcagattaaggtgaaggatgaggatattcagaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgagtacaaagtaatgcctt 1148  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| ||||   ||| || ||||| || || |||||||||||    
T  1147 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggacaaatttgttgttgtatttattgatgatatttt 1048  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
     ||||| || |||| |||||| || ||||| ||||||||||  ||||| |||||||| | |||||| |||| | | ||||| ||  |||| || |||||     
T  1047 aatttattctaagaatgaagaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagttttgaaagaaaagagattgtatgcaaagctgtcaaaatgtgag 948  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 454  Q
    |||| ||| |  ||||| |||||||||||    
T  947 ttctagttaagtgaagtgagttttctggg 919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 451
Target Start/End: Original strand, 9372 - 9793
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||  |  | |||||     
T  9372 tcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttctgaggattgatgacttgacggatcagctagtgggtgcaaaggttttttgttaaattgac 9471  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | || || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||| || ||||| || || |||||||    
T  9472 ttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 9571  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||||||     |   |  ||| || |||||||| || ||||||||| |    
T  9572 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgc----ctacctaaatttgtggttgtgtttattgatgatattct 9667  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    ||||||  | | ||||||||| || ||| | || ||| |||||||||| |||||| | | ||||||||| ||  | |||||||| ||||| ||||||||     
T  9668 gatttaagctaggactgaagaggagcatacagaacatttgaagattgtgttgcaaattttgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgag 9767  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
    |||||||| |  |||||||| |||||    
T  9768 ttctggttaagtgaagtaagatttct 9793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 451
Target Start/End: Original strand, 19586 - 20007
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||  |  | |||||     
T  19586 tcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttctgaggattgatgacttgacggatcagctagtgggtgcaaaggttttttgttaaattgac 19685  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | || || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||| || ||||| || || |||||||    
T  19686 ttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcttttaggacacgatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctt 19785  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||||||     |   |  ||| || |||||||| || ||||||||| |    
T  19786 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgc----ctacctaaatttgtggttgtgtttattgatgatattct 19881  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    ||||||  | | ||||||||| || ||| | || ||| |||||||||| |||||| | | ||||||||| ||  | |||||||| ||||| ||||||||     
T  19882 gatttaagctaggactgaagaggagcatacagaacatttgaagattgtgttgcaaattttgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgag 19981  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
    |||||||| |  |||||||| |||||    
T  19982 ttctggttaagtgaagtaagctttct 20007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 21244 - 20804
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||| || || || || ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||  |||| || || |||||     
T  21244 tcagttgaataaagttacgataaagaacagatatccgcttccgagaattgatgacttgatggaccagttggttggtgcaaagatttttagtaaaattgac 21145  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | || ||  ||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || || || || ||||||||||| |||||||| || |||| ||    
T  21144 ttgaggtcaggttaccattagattaaggtgaaagatgaggacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcactacgaatataaggtgatgcttt 21045  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | || || ||||| |   |||||  ||| || || || ||||| ||||| |||||    
T  21044 tcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaacagaatttttcatgcctacctggataaatttgtggtggtattcattgatgacatttt 20945  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    ||| || || |  | ||| ||||| ||||| || ||||||| || ||| |||||||| |  | |||||||||  | ||||| |||||||| ||||||||     
T  20944 gatctattctagaaatgaggaagagcatgcagaacatctgaggactgtattgcaagtattcatagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaagtgtgag 20845  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||| |  ||||| |||||||| ||| || |||||||    
T  20844 ttctggttaagtgaagtgagttttcttggccatattatttc 20804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 24 - 145
Target Start/End: Original strand, 11067 - 11189
Alignment:
Q  24 catcagttgaacaag-gtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagatt 122  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||     
T  11067 catcagttgaacaaaagtaactattaagaacaggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcacatgttttcagcaagata 11166  T
Q  123 gatttgagatcaaggtatcacca 145  Q
    |||||||||||| | ||||||||    
T  11167 gatttgagatcaggttatcacca 11189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 79; Significance: 9e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 232
Target Start/End: Original strand, 18394 - 18600
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||     
T  18394 tcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacatccgaggattgatgacttgatggaccaattggtgggtgcaaaagtttttagtaagatcgac 18493  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||| | || || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  18494 ttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgcagaagacggcctttagaacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctt 18593  T
Q  226 tcggtgt 232  Q
    |||||||    
T  18594 tcggtgt 18600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 268
Target Start/End: Original strand, 9831 - 10027
Alignment:
Q  72 attgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgc 171  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||| | || || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  9831 attgatgacttgatggaccagttggtgggtgcaaaagtttttagtaagatcgacttgaggtcaggttaccatcaaattaaggtgaaggatgaagatatgc 9930  T
Q  172 agaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaa 268  Q
    ||||||| || || || || || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||||||    
T  9931 agaagacggcctttaggacacgatatggtcattacgaatacaaagtgatgcctttcggtgttactaatgcgccaggtgtgttcatggagtatatgaa 10027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 26 - 112
Target Start/End: Original strand, 5760 - 5846
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagtttt 112  Q
    |||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  5760 tcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttgatggaccagttggtgggtgcaaaagtttt 5846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 153 - 466
Target Start/End: Original strand, 39 - 352
Alignment:
Q  153 gtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgt 252  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || || || || || |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  39 gtgaaagatgaagacatgcagaagactgcctttaggacacgatatggtcattacgaatataaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgt 138  T
Q  253 ttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaaca 352  Q
    | ||||||||||||||| | || || ||||| | | |||||  ||| || || |||| ||| ||||| |||||||| || || |  || || ||||| ||    
T  139 tcatggagtatatgaatagaatttttcatgcttatctggataaatttgtggtagtgtacattgatgacattttgatctattcgacaacggaggaagagca 238  T
Q  353 tgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctg 452  Q
    ||| || |||||||  ||||| |||||||| | ||||||||||||  | ||||| |||||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||||| ||     
T  239 tgcagaacatctgagaattgtgttgcaagtattgaaagagaagaagttgtatgccaaattgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtaagtttcctt 338  T
Q  453 ggcgatgttatttc 466  Q
    ||| || |||||||    
T  339 ggccatattatttc 352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 26 - 454
Target Start/End: Original strand, 6056 - 6484
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||| ||| ||||| || |||||||||||||| || ||||||||  |||| || ||||| ||     
T  6056 tcagttgaacaaggttacgataaagaacaggtatccgcttctgaggattgacgacttgatggatcagttggttggtgcaaagatttttagtaagatcgac 6155  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| ||  | || || ||||| || | ||| |||||||| ||||||||||| || || || || ||  ||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  6156 ttgaggtctggttaccatcagataaaggggaaggatgaagacatgcagaagacggcctttaggacacgaaatggtcattacgaatacaaagtgatgcctt 6255  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || || || | ||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||  |||||  |||| | || || || || |||||||||||    
T  6256 tcggtgttactaacgcgcatggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgctttcctggataaattcatggtggtatttattgatgatatttt 6355  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
     || || ||||||| |||||| || ||||| || |||||||  ||||| ||||| || | |||||| |||||  | ||||| || ||||  || |||||     
T  6356 aatctattccaagaatgaagaggagcatgcagaacatctgagaattgtattgcacgttttgaaagaaaagaagttgtatgcaaagttgttaaaatgtgag 6455  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 454  Q
    || ||||| |  ||||| |||||||||||    
T  6456 ttatggttaagtgaagtgagttttctggg 6484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 26 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 29327 - 28900
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| |   ||||||| ||||||||     
T  29327 tcagttgaataaggttacgataaagaacaggtatccgcttccgagaattgacgatttgatggatcaattggttggtgctaggattttcagtaagattgac 29228  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||| |   | || || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||  || || || || || |||||||| || || || ||||| |||||||    
T  29227 ttgaggtttggttaccatcagataaaagtgaaggatgaggatatgcagaagatggcctttaggacacgatatggtcattacgagtacaaagtgatgcctt 29128  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||||||| |||||||||| |  || |||||||| ||| |||||   || || || ||||| || |||||||| ||    
T  29127 tcggtgttactaacgcgcctggtgtgtttatgtagtatatgaacctaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatctt 29028  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
     || || || |||| ||||| ||| ||||| ||||| ||||  ||||| |||||||| | |||||| ||||   | ||||| || ||||| || |||||     
T  29027 aatctattctaagaatgaag-agagcatgcagagcacctgagaattgtgttgcaagttttgaaagaaaagaggttgtatgcgaagttgtcaaaatgtgag 28929  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttttctggg 454  Q
    |||||||| |  ||||| || ||||||||    
T  28928 ttctggttaagtgaagtgagctttctggg 28900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0285 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0285
Description:

Target: scaffold0285; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 356 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 9290 - 9215
Alignment:
Q  356 tgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctgg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9290 tgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctgg 9215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 69; Significance: 9e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 94
Target Start/End: Original strand, 12267 - 12335
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagtt 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12267 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagtt 12335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 26 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 606 - 184
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | | || |||||| | || || || |||||||||    
T  606 tcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatctgctggttggtgcagaggtgtttagtaagattgat 507  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  ||||||||    || || || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||| | |    
T  506 ttgagatcaggatatcaccagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgtcat 407  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | || ||  | ||||| || || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || || || || ||||| || |||||||||||    
T  406 ttggagtatctaatgcgccaggtgtttttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgtttatagatgatatttt 307  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    | | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||  |  | | |||||| || |||||||||||     
T  306 ggtgtattcgaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagttttgaaagagaaccagttatgtgctaagttttctaagtgtgag 207  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttt 448  Q
    || |||||||||||||| |||||    
T  206 ttttggttgaaggaagtgagttt 184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 26 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 7548 - 7126
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgat 125  Q
    ||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| | || |||||| | || || || |||||||||    
T  7548 tcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatatgatggatcagctggttggtgcataggtgtttagtaagattgat 7449  T
Q  126 ttgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctt 225  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  ||||||||    || || || ||| ||||| | ||||| |||||||| |||   || ||| | |    
T  7448 ttgagatcaggatatcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgtcat 7349  T
Q  226 tcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatttt 325  Q
    | || ||  | ||||| || || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| || || || || ||||| || |||||||||||    
T  7348 ttggagtatctaatgcgccaggtgtttttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgtttatagatgatatttt 7249  T
Q  326 gatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaa 425  Q
    | | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||  |  | | |||||| ||||||||||||||     
T  7248 ggtgtattcgaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgtgag 7149  T
Q  426 ttctggttgaaggaagtaagttt 448  Q
    || |||||||||||||| |||||    
T  7148 ttttggttgaaggaagtgagttt 7126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 48 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 11331 - 11201
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    || |||||||| ||||||||||| ||| | || || ||||    
T  11331 aagaataggtatccacttccgagaattgacgatttaatggatcagttagtgggtgctcgtgtgttcagcaaaattgatttgaggtcaggttaccatcaga 11232  T
Q  148 ttaaagtgaaagatgaagatatgcagaagac 178  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11231 ttaaggtgaaggatgaggatatgcagaagac 11201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1830 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold1830
Description:

Target: scaffold1830; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 243 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 1172 - 949
Alignment:
Q  243 cctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactg 342  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||| | | |||||  ||| || |||||||| || ||||| || |||||||| || |||||||    
T  1172 cctggtgtgtttatggagtatatgaacagaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattcaaagactg 1073  T
Q  343 aagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagt 442  Q
    ||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| | |||||| |||||  | ||||| || ||||| || ||||| |||| ||| || |||||    
T  1072 aagaagagcatgcagaacatctgaatattgtattgcaagtattgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaaatgtgagttctagttaaatgaagt 973  T
Q  443 aagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||||||| ||| || |||||||    
T  972 aagttttcttggccatattatttc 949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 349 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 3998 - 3896
Alignment:
Q  349 aacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttt 448  Q
    |||||||||||||| ||||| |  | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  3998 aacatgctgagcatttgaaggtgattttgcaagtgttgaaagagaagaagctttatgctaaattgtctatgtgtgaattctggttaaaagaagtaagttt 3899  T
Q  449 tct 451  Q
    |||    
T  3898 tct 3896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 165 - 455
Target Start/End: Original strand, 12349 - 12639
Alignment:
Q  165 gatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtata 264  Q
    |||||||||||||| || || || || |  |||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  12349 gatatgcagaagacggcctttaggacacaatatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaatgcgcctggtgtgttcatggagtata 12448  T
Q  265 tgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatct 364  Q
     ||| || || |||||||| |  |||||   ||| || ||||| || || ||| ||||| |||| || || |||||||||||||| ||||| || |||||    
T  12449 cgaaccgaattttccatgcttacttggaaaaatttgtggttgtatttattgataatattctgatctattcaaagactgaagaagagcatgcagaacatct 12548  T
Q  365 gaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggc 455  Q
    ||||||||| |||||| | | ||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||| | |||||||  |  ||||| ||||||||||||    
T  12549 gaagattgtgttgcaattattgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcaaagtgtaagttctggtaaagtgaagtgagttttctgggc 12639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 157
Target Start/End: Original strand, 859 - 988
Alignment:
Q  28 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 127  Q
    ||||||||||||| || || |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||| |||| || || |||||||||||    
T  859 agttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgcttccgaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcagaagtgtttagtaagattgattt 958  T
Q  128 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaa 157  Q
    ||||||  | ||||| ||||||| ||||||    
T  959 gagatcgggatatcatcagattagagtgaa 988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 306 - 424
Target Start/End: Original strand, 1137 - 1255
Alignment:
Q  306 gtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatg 405  Q
    ||||| || |||||||||||| | || || ||| |||| || || |||||||||||| ||| |||||| |||||||| | ||| |||||  || | | ||    
T  1137 gtgtttatagatgatattttggtgtattcgaagtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaggagaaccaattatgtg 1236  T
Q  406 ctaaattgtctaagtgtga 424  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  1237 ctaaattgtcgaagtgtga 1255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 195 - 451
Target Start/End: Original strand, 16229 - 16485
Alignment:
Q  195 tatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatc 294  Q
    |||||||| || ||||| || || |||||||||||||| || || || ||||| |||||  | ||||||||||| || || |||||||| |   |||||     
T  16229 tatggtcattacgaatacaaggtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcctagagtatatgaaccgaattttccatgcttacctggata 16328  T
Q  295 gattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaa 394  Q
     |||||| |||||||| || ||||||||| ||||||| || ||||||||| |||  ||||  || ||||||||||| || |||||| | | ||| || ||    
T  16329 aattcgtggttgtgtttattgatgatattctgatttattcaaagactgaaaaagtgcatgtagaacatctgaagatagtattgcaaatattgaaggaaaa 16428  T
Q  395 gaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
    |||  | |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||||||||    
T  16429 gaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtaagttttct 16485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 44985 - 44753
Alignment:
Q  219 atgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatg 318  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||||  ||| || |||||||| || ||||    
T  44985 atgcctttcggtgttactaatgcgcctggagtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttttctggataaatttgtggttgtgtttattgatg 44886  T
Q  319 atattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaa 418  Q
    | || |||||||| ||||||| |||||| || |||||  | |||||||  ||| | |||||||||| ||| || ||||   | ||||||||  |||| ||    
T  44885 acatcttgatttattccaagaatgaagaggagcatgcaaaacatctgagaattatattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagctgtcaaa 44786  T
Q  419 gtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
     ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  44785 atgtgagttctggttaagtgaagtgagttttct 44753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1646 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1646
Description:

Target: scaffold1646; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 224 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 1521 - 1279
Alignment:
Q  224 tttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatatt 323  Q
    ||||||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||| |||||  |||||| || || ||||| |||||||||    
T  1521 tttcggtgttactaacgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtagtattcattgatgatatt 1422  T
Q  324 ttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtg 423  Q
    || ||||| || ||||||||||| || ||||| || ||||||| |||||| || || || | |||||| |||||  | |||||||||||||| || || |    
T  1421 ttaatttattctaagactgaagaggagcatgcagaacatctgaggattgtattacaggttttgaaagaaaagaagttgtatgctaaattgtcaaaatgcg 1322  T
Q  424 aattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    | || ||||| |  ||||||||||| || ||| || |||||||    
T  1321 agttttggttaagtgaagtaagtttccttggccatattatttc 1279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1488 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold1488
Description:

Target: scaffold1488; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 157
Target Start/End: Original strand, 715 - 845
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||  || | || || ||||||||||    
T  715 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgattccgaggattgatgatttgatggatcagttggttggtgcggaaatgtttagtaagattgatt 814  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaa 157  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||||||    
T  815 tgagatcaggatatcatcagattagagtgaa 845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1488; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 351 - 448
Target Start/End: Original strand, 1038 - 1135
Alignment:
Q  351 catgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttt 448  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||  |  | | |||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  1038 catgctgagcatttgaggattgtgttgcaagttttgaaagagaaccagttatgtgctaagttgtcgaagtgtgaattttggttgcaggaagtgagttt 1135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 150
Target Start/End: Original strand, 1797 - 1919
Alignment:
Q  28 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 127  Q
    |||||||||| || || || | |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||| | || || ||||||||||||||    
T  1797 agttgaacaaagtgacgattatgaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagttggttggtgcagaggtgtttagcaagattgattt 1896  T
Q  128 gagatcaaggtatcaccagatta 150  Q
    ||||||| | ||||| |||||||    
T  1897 gagatcaggatatcatcagatta 1919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 16451 - 16345
Alignment:
Q  28 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 127  Q
    ||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||  |||| || || |||||||||||    
T  16451 agttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccgaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcggaagtgtttagtaagattgattt 16352  T
Q  128 gagatca 134  Q
    |||||||    
T  16351 gagatca 16345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 448
Target Start/End: Original strand, 1865 - 2285
Alignment:
Q  28 agttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgattt 127  Q
    |||||||||| || || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||| |||| || || |||||||||||    
T  1865 agttgaacaaagtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcagaagtgtttagtaagattgattt 1964  T
Q  128 gagatcaaggtatcaccagattaaagtgaaagatgaagatatgcagaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttc 227  Q
    ||||||  | ||||| || |||| |||||| |  ||||||||    || || || ||| ||||| | ||| | |||||||| |||   || ||||| ||     
T  1965 gagatcgggatatcatcaaattagagtgaaggcggaagatatatccaaaaccgcattccgaacgaggtatagacactatgagtattctgtgatgccattt 2064  T
Q  228 ggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttga 327  Q
    || ||  | |||||||| || || |||||||| || |||||| | || || ||| | | | |||| |  || || || ||||| || ||||||||||||     
T  2065 ggagtatctaatgcaccaggtgtctttatggaataaatgaatagaatatttcatccttatctggaccattttgtggtggtgttaatagatgatattttgg 2164  T
Q  328 tttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaatt 427  Q
    | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||| | ||||| || | |||||||||  |  | | |||||| |||||||||||||| ||    
T  2165 tgtattcaaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattatgttgcaggtcttgaaagagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgtgagtt 2264  T
Q  428 ctggttgaaggaagtaagttt 448  Q
     |||||| ||||||| |||||    
T  2265 ttggttggaggaagtgagttt 2285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 26721 - 26621
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||  |  | ||||||||||||||||    
T  26721 cagttgaacatggtgactataaagaattggtatccgcttccgaggattgattatttgatggatcagttagttagtgcggagatattcagcaagattgatt 26622  T
Q  127 t 127  Q
    |    
T  26621 t 26621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 192 - 384
Target Start/End: Original strand, 14790 - 14982
Alignment:
Q  192 cgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttgg 291  Q
    ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||| || || || ||||| || ||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||| |||    
T  14790 cgttatggtcattacgagtacaaagtgatgcctttcggtgttactaacgcgcctggtgtttttatggagtacatgaatctaatcttccatgcttttctgg 14889  T
Q  292 atcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgt 384  Q
    ||   || || || ||||| || ||||||||||| || || ||||||| ||| || || ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  14890 ataagtttgttgtggtgtttattgatgatattttaatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgt 14982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 255 - 451
Target Start/End: Original strand, 416 - 612
Alignment:
Q  255 atggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatg 354  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| | | |||||  ||| || |||||||| || ||||| ||| |||| || || | |||||||||| | |||     
T  416 atggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacattctgatctattcaaggactgaagaatagcatt 515  T
Q  355 ctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
    | || |||||||||||||| |||||  | | ||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  516 cagaacatctgaagattgtgttgcagattttgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttttct 612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 157
Target Start/End: Original strand, 13537 - 13667
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||| || || || ||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||| | || || || |||||||| |    
T  13537 cagttgaacaaagtgacgattaagaatgagtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagctagttggtgcagaggtgtttagtaagattgaat 13636  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaa 157  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| ||||||    
T  13637 tgagatcaggatatcatcagattacagtgaa 13667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 7135 - 7015
Alignment:
Q  30 ttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttga 129  Q
    ||||||||||| || || || ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | || |||||| | || || || |||||||||||||    
T  7135 ttgaacaaggtgacgattaaaaatcggtatccacttcagaggattgatgatttgatggatcagctggttggtgcagaggtgtttagtaagattgatttga 7036  T
Q  130 gatcaaggtatcaccagatta 150  Q
    ||||| | ||||| |||||||    
T  7035 gatcaggatatcatcagatta 7015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 129
Target Start/End: Original strand, 1533 - 1635
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||| || || || |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||| | || || || ||||||||||    
T  1533 cagttgaacaaagtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttgatggatcagttggttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 1632  T
Q  127 tga 129  Q
    |||    
T  1633 tga 1635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 306 - 382
Target Start/End: Original strand, 1812 - 1888
Alignment:
Q  306 gtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtcttgcaagt 382  Q
    ||||| || |||||||||||| | || || ||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  1812 gtgtttatagatgatattttggtgtattcgaagtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagt 1888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 276 - 466
Target Start/End: Original strand, 33914 - 34104
Alignment:
Q  276 ttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatgctgagcatctgaagattgtct 375  Q
    |||||||| | ||||||| | ||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || | | |||||||||| ||||| |||||| | |||||| | |    
T  33914 ttccatgcttatttggattggttcgtggttgtatttattgatgacattttgatttattctaggtctgaagaagagcatgcagagcatttaaagattatgt 34013  T
Q  376 tgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||||||  || || |||||  | ||||| || ||||| || |||||||||||||| |  |||||||||||||| ||| || |||||||    
T  34014 tgcaagtgttaaaggaaaagaagatgtatgccaagttgtccaaatgtgaattctggttaagtgaagtaagttttcttggccatattatttc 34104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 255 - 451
Target Start/End: Original strand, 380 - 576
Alignment:
Q  255 atggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatg 354  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| | | |||||  ||| || |||||||| || ||||| ||| |||| || || | |||||||||| | |||     
T  380 atggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacattctgatctattcaaggactgaagaatagcatt 479  T
Q  355 ctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
    | || |||||||||||||| |||||  | | ||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  480 cagaacatctgaagattgtgttgcagattttgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttttct 576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 255 - 451
Target Start/End: Original strand, 4700 - 4896
Alignment:
Q  255 atggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatg 354  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| | | |||||  ||| || |||||||| || ||||| ||| |||| || || | |||||||||| | |||     
T  4700 atggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataaatttgtggttgtgtttattgatgacattctgatctattcaaggactgaagaatagcatt 4799  T
Q  355 ctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
    | || |||||||||||||| |||||  | | ||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  4800 cagaacatctgaagattgtgttgcagattttgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagttctggttaagtgaagtgagttttct 4896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 48 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 89873 - 89764
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatttgagatcaaggtatcaccaga 147  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| | || |||||  |||| || || |||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  89873 aagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttcatggatcagctggttggtgcggaagtgtttagtaagattgatttgagatcaggatatcatcaga 89774  T
Q  148 ttaaagtgaa 157  Q
    ||| ||||||    
T  89773 ttagagtgaa 89764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 7549 - 7445
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||||||||||||| || || |||||| | ||||| ||||| || | ||||||||||||||||||| | || ||| || | || || ||||| |||||||    
T  7549 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcgatatccgcttccaaggactgatgatttgatggatcagctggttggtacagaggtgtttagcaaaattgatt 7450  T
Q  127 tgaga 131  Q
    |||||    
T  7449 tgaga 7445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 157
Target Start/End: Original strand, 6917 - 7047
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    |||| ||||||||| || || |||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| || | || |||||  |||| || || ||||||||||    
T  6917 cagtcgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgcttccgaggattgatggtttgatggattagctggttggtgcggaagtgtttagtaagattgatt 7016  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagattaaagtgaa 157  Q
    |||||||| | ||||| || |||| ||||||    
T  7017 tgagatcaggatatcatcatattagagtgaa 7047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0697 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0697
Description:

Target: scaffold0697; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 401 - 466
Target Start/End: Original strand, 6939 - 7004
Alignment:
Q  401 ttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||  ||||||||||    
T  6939 ttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttaaaagaagtaatttttcttggacatgttatttc 7004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 103
Target Start/End: Original strand, 9865 - 9942
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgc 103  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  9865 tcagttgaataaggttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcacttagtgggtgc 9942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 103
Target Start/End: Original strand, 17532 - 17609
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgc 103  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  17532 tcagttgaataaggttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttaatggatcacttagtgggtgc 17609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 94
Target Start/End: Original strand, 4838 - 4905
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagtt 94  Q
    |||||||||||||| || || |||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4838 cagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatctgcttccgaggattgatgatttgatggatcagtt 4905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 448
Target Start/End: Original strand, 7165 - 7262
Alignment:
Q  351 catgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttt 448  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||||||| | ||| |||||  |  | | |||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||    
T  7165 catgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaggagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgcaggaagtgagttt 7262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 150
Target Start/End: Original strand, 7152 - 7275
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||| || || || |||||| ||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||| | || |||||| | || || || ||||||||||    
T  7152 cagttgaacaaagtgacaattaagaatcggtatccgcttccaaggatttatgatttgatggatcagctggttggtgcagaggtgtttagtaagattgatt 7251  T
Q  127 tgagatcaaggtatcaccagatta 150  Q
    | |||||| | ||||| |||||||    
T  7252 taagatcaggatatcatcagatta 7275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 27 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 486 - 380
Alignment:
Q  27 cagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcagttagtgggtgcaaaagttttcagcaagattgatt 126  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||  | || |||||| | || || || ||||| ||||    
T  486 cagttgaacaaagtaacgattaagaatcggaatccacttccgaagattgatgatttgatggatcaactggttggtgcagaggtgtttagtaagatagatt 387  T
Q  127 tgagatc 133  Q
    |||||||    
T  386 tgagatc 380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0062 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0062
Description:

Target: scaffold0062; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 252 - 454
Target Start/End: Original strand, 8920 - 9122
Alignment:
Q  252 tttatggagtatatgaatcgcatcttccatgcatttttggatcgattcgtagttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaac 351  Q
    ||||||||||| ||||| |  || |||||||| ||| |||||   || || || ||||| || |||||||| || || || ||||||| ||| || || |    
T  8920 tttatggagtacatgaaccaaattttccatgcttttctggataagtttgttgtggtgtttattgatgatatattaatatattccaagaatgaggaggagc 9019  T
Q  352 atgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttct 451  Q
    |||| ||||||||||  ||||| |||||||||| ||| || ||||   | |||||||| || || || ||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  9020 atgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttatcaaaatgtgagttctggttaaatgaagtaagttttct 9119  T
Q  452 ggg 454  Q
    |||    
T  9120 ggg 9122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 2281 - 2219
Alignment:
Q  404 tgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttatttc 466  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||    
T  2281 tgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagttttcttggtcatgttatttc 2219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1208 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1208
Description:

Target: scaffold1208; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 269
Target Start/End: Original strand, 1748 - 1843
Alignment:
Q  174 aagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaat 269  Q
    ||||| ||||| || || || ||||||||||| ||||||   ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||||    
T  1748 aagactgcttttaggacccgatatggtcactacgaatatttggttatgccttttggggtgactaatgcaccaggagtgttcatggagcacatgaat 1843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0827 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0827
Description:

Target: scaffold0827; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 5354 - 5259
Alignment:
Q  173 gaagacagctttcagaacgcgttatggtcactatgaatataaagttatgcctttcggtgtgaccaatgcacctggagtgtttatggagtatatgaa 268  Q
    |||||| || |||||||  ||||||||||| ||||| |||   || |||||||| || ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  5354 gaagactgccttcagaagccgttatggtcattatgagtattcggtgatgccttttggagtgtccaacgcgccaggagtgtttatggagtatatgaa 5259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 61
Target Start/End: Original strand, 2838 - 2873
Alignment:
Q  26 tcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatcc 61  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2838 tcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatcc 2873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 366 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 36168 - 36069
Alignment:
Q  366 aagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttctgggcgatgttattt 465  Q
    |||||||| |||||||| | |||||| |||||  | ||||| || ||||| |||||||| |||||||| |  |||||||||||||| ||| || ||||||    
T  36168 aagattgtattgcaagtattgaaagaaaagaagttgtatgccaagttgtcaaagtgtgagttctggttaagtgaagtaagttttcttggccatattattt 36069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 48 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 2311 - 2267
Alignment:
Q  48 aagaataggtatccacttccgagaattgatgatttgatggatcag 92  Q
    |||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  2311 aagaatcggtatccactcccaaggattgatgatttgatggatcag 2267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 351 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 195310 - 195210
Alignment:
Q  351 catgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgtggaaagagaagaaactttatgctaaattgtctaagtgtgaattctggttgaaggaagtaagttttc 450  Q
    ||||| || ||||||| |||||| ||||||||   ||||||||| ||  | |||||||| ||||| || |||||||||||||| |  ||||| |||||||    
T  195310 catgcagaacatctgaggattgtattgcaagtactgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaaatgtgaattctggttaagtgaagtgagttttc 195211  T
Q  451 t 451  Q
    |    
T  195210 t 195210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University