View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8649_high_2 (Length: 286)

Name: NF8649_high_2
Description: NF8649
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8649_high_2
NF8649_high_2
[»] chr3 (148 HSPs)
chr3 (4-267)||(14641968-14642231)
chr3 (1-267)||(3394417-3394683)
chr3 (4-265)||(12275922-12276183)
chr3 (1-263)||(6158772-6159034)
chr3 (1-267)||(13522825-13523092)
chr3 (1-265)||(179122-179386)
chr3 (1-245)||(2248385-2248630)
chr3 (5-261)||(37038195-37038452)
chr3 (1-267)||(6819480-6819746)
chr3 (1-223)||(10833754-10833976)
chr3 (5-267)||(18367177-18367439)
chr3 (1-241)||(8928080-8928321)
chr3 (1-241)||(1988647-1988887)
chr3 (1-225)||(24152859-24153083)
chr3 (1-265)||(42324636-42324900)
chr3 (1-218)||(11192501-11192717)
chr3 (4-267)||(10563081-10563343)
chr3 (10-240)||(50243130-50243361)
chr3 (1-225)||(43550092-43550316)
chr3 (3-222)||(16979326-16979545)
chr3 (19-222)||(13029709-13029912)
chr3 (1-216)||(50351415-50351630)
chr3 (1-245)||(10989219-10989463)
chr3 (19-222)||(13026117-13026320)
chr3 (4-218)||(40807416-40807630)
chr3 (4-218)||(14441588-14441802)
chr3 (4-225)||(16643418-16643639)
chr3 (5-225)||(14966415-14966635)
chr3 (3-222)||(6805378-6805597)
chr3 (4-218)||(5206072-5206286)
chr3 (4-218)||(40812253-40812467)
chr3 (4-218)||(54875901-54876115)
chr3 (1-214)||(11913145-11913358)
chr3 (4-218)||(14508268-14508481)
chr3 (4-218)||(17693488-17693702)
chr3 (3-212)||(33564555-33564764)
chr3 (1-208)||(17513010-17513217)
chr3 (1-220)||(55292056-55292275)
chr3 (4-218)||(17538527-17538740)
chr3 (1-219)||(18889783-18890001)
chr3 (1-214)||(43928775-43928988)
chr3 (26-218)||(44273894-44274086)
chr3 (1-220)||(10554685-10554904)
chr3 (3-222)||(35961304-35961523)
chr3 (1-212)||(53646475-53646686)
chr3 (4-218)||(2841881-2842094)
chr3 (4-218)||(17685261-17685475)
chr3 (4-218)||(35064999-35065212)
chr3 (1-222)||(41943-42164)
chr3 (5-218)||(17519292-17519505)
chr3 (5-218)||(17534154-17534367)
chr3 (4-211)||(17670127-17670334)
chr3 (1-195)||(18893067-18893261)
chr3 (3-220)||(31224370-31224588)
chr3 (1-210)||(38311418-38311628)
chr3 (4-214)||(50348444-50348654)
chr3 (1-210)||(20248399-20248608)
chr3 (3-218)||(13519702-13519918)
chr3 (4-212)||(17044392-17044600)
chr3 (4-216)||(43889217-43889429)
chr3 (4-218)||(35354019-35354236)
chr3 (4-218)||(15931925-15932139)
chr3 (1-208)||(19443941-19444148)
chr3 (1-215)||(3803258-3803472)
chr3 (1-223)||(9533544-9533766)
chr3 (4-218)||(12511268-12511482)
chr3 (1-223)||(14763376-14763598)
chr3 (3-218)||(10541875-10542090)
chr3 (4-218)||(22307001-22307215)
chr3 (1-223)||(23371122-23371344)
chr3 (17-218)||(12470222-12470423)
chr3 (3-218)||(14519683-14519897)
chr3 (3-218)||(14152816-14153031)
chr3 (4-218)||(41172788-41173003)
chr3 (4-218)||(18699891-18700105)
chr3 (1-222)||(16324956-16325177)
chr3 (4-218)||(49900148-49900370)
chr3 (3-218)||(6156126-6156340)
chr3 (3-218)||(50755799-50756013)
chr3 (1-223)||(51300810-51301032)
chr3 (3-218)||(9511583-9511797)
chr3 (3-218)||(9519558-9519772)
chr3 (3-218)||(14671244-14671459)
chr3 (3-218)||(54330723-54330937)
chr3 (3-202)||(26055045-26055244)
chr3 (3-218)||(24546257-24546475)
chr3 (25-174)||(14567651-14567800)
chr3 (3-202)||(5223566-5223765)
chr3 (3-202)||(15465337-15465536)
chr3 (3-217)||(15565935-15566148)
chr3 (1-217)||(17937949-17938163)
chr3 (3-210)||(18739325-18739530)
chr3 (3-217)||(25104620-25104832)
chr3 (4-129)||(5215156-5215281)
chr3 (4-133)||(17046631-17046760)
chr3 (10-218)||(12952462-12952669)
chr3 (1-113)||(51603015-51603127)
chr3 (3-214)||(17207766-17207975)
chr3 (1-116)||(19568826-19568941)
chr3 (60-222)||(22652248-22652409)
chr3 (120-246)||(52989492-52989618)
chr3 (1-109)||(46723041-46723149)
chr3 (119-218)||(11258887-11258986)
chr3 (1-92)||(14647518-14647609)
chr3 (3-123)||(8631257-8631377)
chr3 (3-101)||(15465631-15465729)
chr3 (1-101)||(12305599-12305699)
chr3 (3-101)||(5223860-5223958)
chr3 (120-218)||(14682743-14682841)
chr3 (3-142)||(8023718-8023857)
chr3 (1-91)||(54521309-54521399)
chr3 (5-101)||(29544431-29544527)
chr3 (17-92)||(11986837-11986912)
chr3 (2-77)||(13436799-13436874)
chr3 (159-218)||(19568941-19569000)
chr3 (3-101)||(26054852-26054950)
chr3 (4-101)||(22764048-22764145)
chr3 (4-84)||(11258984-11259064)
chr3 (1-101)||(28848207-28848307)
chr3 (3-142)||(6002443-6002582)
chr3 (1-101)||(15978009-15978109)
chr3 (1-93)||(36528062-36528154)
chr3 (165-219)||(18893009-18893063)
chr3 (1-142)||(40039759-40039900)
chr3 (1-101)||(7780932-7781032)
chr3 (5-91)||(16453869-16453955)
chr3 (170-218)||(17046582-17046630)
chr3 (210-267)||(11886294-11886352)
chr3 (4-101)||(10247312-10247409)
chr3 (1-93)||(3264725-3264817)
chr3 (131-218)||(42353218-42353306)
chr3 (176-218)||(14568649-14568691)
chr3 (3-61)||(34159842-34159900)
chr3 (1-63)||(54039165-54039227)
chr3 (3-107)||(4656182-4656286)
chr3 (4-72)||(30152450-30152518)
chr3 (5-72)||(8276516-8276583)
chr3 (11-142)||(14284519-14284650)
chr3 (1-48)||(17956867-17956914)
chr3 (210-267)||(12512441-12512499)
chr3 (3-61)||(17463694-17463752)
chr3 (3-45)||(55477023-55477065)
chr3 (3-48)||(14528665-14528710)
chr3 (3-48)||(17393245-17393290)
chr3 (148-213)||(37917146-37917211)
chr3 (3-48)||(51158684-51158729)
chr3 (1-77)||(17759073-17759149)
chr3 (1-77)||(19060393-19060469)
[»] chr4 (98 HSPs)
chr4 (1-267)||(9638378-9638644)
chr4 (3-267)||(10704869-10705133)
chr4 (3-267)||(10918639-10918903)
chr4 (1-218)||(3337519-3337736)
chr4 (1-239)||(630318-630557)
chr4 (4-267)||(15447834-15448092)
chr4 (4-222)||(15990455-15990673)
chr4 (3-222)||(10694664-10694883)
chr4 (3-222)||(10908430-10908649)
chr4 (1-247)||(56115251-56115498)
chr4 (4-225)||(12611264-12611485)
chr4 (3-222)||(15008382-15008601)
chr4 (4-225)||(23802882-23803103)
chr4 (6-222)||(40619946-40620162)
chr4 (1-218)||(35660266-35660483)
chr4 (1-247)||(33849132-33849379)
chr4 (4-225)||(51463485-51463706)
chr4 (1-225)||(10056885-10057109)
chr4 (4-218)||(19609744-19609958)
chr4 (1-223)||(24046949-24047171)
chr4 (4-218)||(25091073-25091287)
chr4 (4-218)||(53630891-53631105)
chr4 (1-241)||(33186298-33186538)
chr4 (1-223)||(18212981-18213203)
chr4 (4-218)||(10356854-10357068)
chr4 (4-218)||(37019089-37019303)
chr4 (1-218)||(33243711-33243928)
chr4 (1-220)||(16277742-16277961)
chr4 (1-220)||(53387352-53387571)
chr4 (4-218)||(42875219-42875433)
chr4 (3-218)||(16997950-16998160)
chr4 (4-218)||(14549046-14549260)
chr4 (1-218)||(19435112-19435330)
chr4 (3-212)||(9923622-9923831)
chr4 (3-212)||(11479028-11479237)
chr4 (4-213)||(15114648-15114856)
chr4 (1-222)||(28385659-28385880)
chr4 (4-170)||(15011931-15012097)
chr4 (4-218)||(11425375-11425579)
chr4 (3-218)||(19566336-19566550)
chr4 (3-218)||(14630246-14630461)
chr4 (3-217)||(10237915-10238128)
chr4 (3-214)||(15344301-15344510)
chr4 (1-213)||(15214460-15214672)
chr4 (3-218)||(25513163-25513377)
chr4 (146-267)||(9871126-9871247)
chr4 (3-214)||(40229727-40229938)
chr4 (88-222)||(15883917-15884051)
chr4 (4-218)||(26445305-26445518)
chr4 (3-214)||(44024021-44024231)
chr4 (4-218)||(2425039-2425252)
chr4 (25-218)||(3485331-3485521)
chr4 (1-214)||(46740623-46740835)
chr4 (6-218)||(16026349-16026559)
chr4 (5-212)||(20595850-20596056)
chr4 (3-214)||(45314754-45314964)
chr4 (3-126)||(55582703-55582826)
chr4 (1-109)||(22725500-22725608)
chr4 (1-142)||(13046060-13046201)
chr4 (1-101)||(15534658-15534758)
chr4 (77-218)||(14508182-14508322)
chr4 (1-101)||(14049054-14049154)
chr4 (140-247)||(43251116-43251225)
chr4 (1-101)||(30147392-30147492)
chr4 (3-125)||(18108295-18108417)
chr4 (137-218)||(13036328-13036409)
chr4 (1-101)||(12033359-12033459)
chr4 (1-101)||(36038347-36038447)
chr4 (1-101)||(44615765-44615865)
chr4 (1-101)||(49547359-49547459)
chr4 (77-211)||(12622799-12622932)
chr4 (3-93)||(14185427-14185517)
chr4 (4-137)||(19081759-19081892)
chr4 (1-101)||(50221925-50222025)
chr4 (169-218)||(26922254-26922303)
chr4 (1-101)||(19243177-19243277)
chr4 (1-142)||(17376081-17376222)
chr4 (1-139)||(54364105-54364243)
chr4 (169-218)||(55582624-55582673)
chr4 (1-101)||(29267830-29267930)
chr4 (210-267)||(51992894-51992952)
chr4 (1-72)||(17146318-17146389)
chr4 (1-72)||(18247739-18247810)
chr4 (1-72)||(22355098-22355169)
chr4 (3-61)||(15117940-15117998)
chr4 (148-213)||(12134421-12134486)
chr4 (3-48)||(14951294-14951339)
chr4 (210-267)||(32466931-32466988)
chr4 (3-48)||(55377226-55377271)
chr4 (1-48)||(5683394-5683441)
chr4 (1-72)||(19020009-19020080)
chr4 (1-72)||(47357183-47357254)
chr4 (3-45)||(7640774-7640816)
chr4 (1-39)||(9871090-9871128)
chr4 (5-63)||(15287901-15287959)
chr4 (5-63)||(15295011-15295069)
chr4 (3-72)||(10643746-10643815)
chr4 (4-48)||(25120076-25120120)
[»] chr7 (137 HSPs)
chr7 (1-267)||(58833-59099)
chr7 (1-265)||(17070708-17070972)
chr7 (4-267)||(47094451-47094714)
chr7 (1-267)||(8756811-8757077)
chr7 (1-265)||(12755121-12755385)
chr7 (4-267)||(4325427-4325690)
chr7 (1-267)||(832438-832704)
chr7 (1-267)||(1197618-1197884)
chr7 (1-225)||(18456063-18456287)
chr7 (1-267)||(13408143-13408409)
chr7 (1-267)||(40555158-40555424)
chr7 (5-222)||(32160621-32160838)
chr7 (3-267)||(13699306-13699569)
chr7 (3-222)||(708972-709191)
chr7 (3-222)||(16550421-16550640)
chr7 (3-222)||(16615022-16615241)
chr7 (1-215)||(14415899-14416113)
chr7 (4-225)||(13647655-13647876)
chr7 (1-214)||(48743727-48743940)
chr7 (1-222)||(48812254-48812475)
chr7 (1-220)||(15213917-15214136)
chr7 (1-222)||(14191503-14191722)
chr7 (1-225)||(29004235-29004459)
chr7 (1-241)||(37727342-37727582)
chr7 (3-222)||(16462452-16462671)
chr7 (1-222)||(14188709-14188928)
chr7 (1-218)||(33001334-33001551)
chr7 (1-225)||(34957584-34957808)
chr7 (1-223)||(11661520-11661742)
chr7 (3-221)||(47975328-47975546)
chr7 (1-206)||(32771760-32771965)
chr7 (4-220)||(36685667-36685884)
chr7 (3-218)||(13745193-13745408)
chr7 (4-218)||(12465678-12465892)
chr7 (4-218)||(46386505-46386719)
chr7 (1-210)||(15167403-15167612)
chr7 (3-220)||(30820673-30820890)
chr7 (1-225)||(38828474-38828698)
chr7 (1-220)||(17505419-17505638)
chr7 (1-220)||(17547576-17547795)
chr7 (4-218)||(12371695-12371909)
chr7 (4-218)||(44374366-44374580)
chr7 (4-218)||(44383231-44383445)
chr7 (4-218)||(11066888-11067102)
chr7 (4-218)||(13147890-13148104)
chr7 (1-223)||(18607702-18607924)
chr7 (1-210)||(10896409-10896618)
chr7 (4-225)||(16998839-16999066)
chr7 (4-218)||(8851577-8851791)
chr7 (1-219)||(14422204-14422422)
chr7 (1-262)||(13864810-13865062)
chr7 (3-216)||(19282514-19282727)
chr7 (11-214)||(32434014-32434217)
chr7 (1-223)||(18872575-18872797)
chr7 (3-163)||(29052572-29052732)
chr7 (25-218)||(12127602-12127796)
chr7 (1-223)||(16008793-16009015)
chr7 (4-218)||(14258772-14258986)
chr7 (1-214)||(14153387-14153599)
chr7 (4-218)||(20585776-20585986)
chr7 (3-223)||(147833-148053)
chr7 (3-223)||(14566417-14566637)
chr7 (4-183)||(12323348-12323527)
chr7 (4-218)||(32301602-32301816)
chr7 (58-218)||(13745672-13745832)
chr7 (3-218)||(14928749-14928964)
chr7 (3-218)||(15352215-15352430)
chr7 (81-218)||(13894515-13894652)
chr7 (3-218)||(43277160-43277376)
chr7 (1-218)||(21538604-21538820)
chr7 (1-218)||(39292152-39292368)
chr7 (52-212)||(15119761-15119921)
chr7 (3-218)||(16580080-16580295)
chr7 (94-246)||(14273739-14273892)
chr7 (3-218)||(48213362-48213576)
chr7 (4-218)||(18875264-18875478)
chr7 (4-210)||(20619714-20619920)
chr7 (25-218)||(16585390-16585583)
chr7 (1-137)||(15720250-15720386)
chr7 (3-218)||(24270399-24270613)
chr7 (3-218)||(25941858-25942072)
chr7 (61-218)||(16460407-16460564)
chr7 (3-202)||(13918184-13918383)
chr7 (3-213)||(3192710-3192920)
chr7 (1-225)||(46580339-46580549)
chr7 (86-202)||(25926993-25927109)
chr7 (3-214)||(14161272-14161482)
chr7 (5-218)||(20252761-20252973)
chr7 (3-218)||(4691313-4691527)
chr7 (5-212)||(9743500-9743706)
chr7 (3-213)||(15978473-15978682)
chr7 (3-217)||(18080135-18080348)
chr7 (3-218)||(3287417-3287625)
chr7 (2-218)||(15576247-15576462)
chr7 (19-214)||(8514179-8514373)
chr7 (3-216)||(8564008-8564220)
chr7 (3-101)||(1856817-1856915)
chr7 (1-79)||(13897805-13897883)
chr7 (1-101)||(23664538-23664638)
chr7 (3-101)||(13917990-13918088)
chr7 (95-213)||(28719885-28720003)
chr7 (1-101)||(11303724-11303824)
chr7 (1-101)||(29800906-29801006)
chr7 (86-148)||(1857092-1857154)
chr7 (3-101)||(25926717-25926815)
chr7 (117-218)||(20487863-20487964)
chr7 (1-101)||(16108274-16108374)
chr7 (1-101)||(29797087-29797187)
chr7 (3-134)||(46473562-46473693)
chr7 (5-212)||(3136721-3136924)
chr7 (3-71)||(11309876-11309944)
chr7 (2-212)||(16065874-16066083)
chr7 (4-66)||(44190667-44190729)
chr7 (1-101)||(24702705-24702805)
chr7 (1-101)||(24705152-24705252)
chr7 (1-101)||(32125967-32126067)
chr7 (1-101)||(41523394-41523494)
chr7 (1-101)||(41525856-41525956)
chr7 (169-218)||(21675491-21675540)
chr7 (159-218)||(15720196-15720255)
chr7 (1-101)||(14948708-14948808)
chr7 (1-141)||(37538905-37539045)
chr7 (3-85)||(21660570-21660652)
chr7 (1-46)||(14105882-14105927)
chr7 (3-101)||(18431188-18431286)
chr7 (11-125)||(44305758-44305872)
chr7 (3-128)||(12191835-12191960)
chr7 (159-202)||(1858646-1858689)
chr7 (1-72)||(15760777-15760848)
chr7 (3-61)||(15376301-15376359)
chr7 (3-61)||(20384711-20384769)
chr7 (3-61)||(27217377-27217435)
chr7 (5-47)||(28720040-28720082)
chr7 (3-48)||(125989-126034)
chr7 (3-56)||(456843-456896)
chr7 (3-48)||(11287000-11287045)
chr7 (3-56)||(16233042-16233095)
[»] scaffold0328 (1 HSPs)
scaffold0328 (1-267)||(19059-19325)
[»] chr6 (104 HSPs)
chr6 (1-267)||(611111-611377)
chr6 (1-265)||(18658579-18658843)
chr6 (1-239)||(19825904-19826142)
chr6 (1-267)||(29847918-29848186)
chr6 (1-225)||(19443695-19443919)
chr6 (1-218)||(28947764-28947981)
chr6 (1-220)||(27851421-27851640)
chr6 (3-222)||(15173872-15174091)
chr6 (4-225)||(20556511-20556732)
chr6 (1-249)||(20733862-20734110)
chr6 (1-239)||(15817173-15817411)
chr6 (4-225)||(25619375-25619596)
chr6 (1-225)||(16133085-16133309)
chr6 (1-208)||(8767678-8767885)
chr6 (4-218)||(17318540-17318754)
chr6 (4-218)||(19655647-19655861)
chr6 (4-218)||(18702984-18703198)
chr6 (4-218)||(18708919-18709133)
chr6 (4-225)||(14979040-14979261)
chr6 (1-208)||(25347556-25347763)
chr6 (4-218)||(7827392-7827606)
chr6 (4-201)||(15891129-15891326)
chr6 (1-208)||(8759932-8760138)
chr6 (1-222)||(13764769-13764983)
chr6 (5-220)||(34296688-34296903)
chr6 (4-218)||(23150685-23150898)
chr6 (3-214)||(20182988-20183198)
chr6 (3-214)||(22152793-22153003)
chr6 (3-218)||(25601694-25601909)
chr6 (3-212)||(18928149-18928358)
chr6 (1-180)||(1254215-1254394)
chr6 (1-214)||(5834150-5834362)
chr6 (1-214)||(20177170-20177382)
chr6 (1-222)||(23956278-23956499)
chr6 (4-218)||(27125894-27126109)
chr6 (4-218)||(15705029-15705243)
chr6 (1-214)||(22158609-22158821)
chr6 (1-218)||(23491586-23491803)
chr6 (1-218)||(23497184-23497401)
chr6 (4-218)||(31734128-31734340)
chr6 (4-218)||(19773127-19773341)
chr6 (4-223)||(4477073-4477292)
chr6 (3-218)||(18455489-18455703)
chr6 (12-218)||(27317981-27318187)
chr6 (3-218)||(25921150-25921364)
chr6 (1-171)||(755-925)
chr6 (3-173)||(23655804-23655974)
chr6 (1-194)||(23838443-23838636)
chr6 (3-218)||(18398339-18398553)
chr6 (1-168)||(25807602-25807769)
chr6 (3-218)||(18585040-18585253)
chr6 (3-218)||(32259268-32259481)
chr6 (3-213)||(17857109-17857319)
chr6 (21-218)||(22556669-22556866)
chr6 (3-218)||(13285129-13285343)
chr6 (3-214)||(20411089-20411299)
chr6 (79-202)||(27556905-27557028)
chr6 (3-142)||(29044806-29044945)
chr6 (87-198)||(23415151-23415262)
chr6 (1-156)||(31022112-31022267)
chr6 (2-141)||(34141041-34141180)
chr6 (2-141)||(34153657-34153796)
chr6 (10-212)||(15938650-15938851)
chr6 (1-92)||(7430069-7430160)
chr6 (4-111)||(22806276-22806383)
chr6 (4-102)||(27330390-27330488)
chr6 (4-102)||(27391130-27391228)
chr6 (1-101)||(12942666-12942766)
chr6 (1-101)||(28288922-28289022)
chr6 (1-92)||(14594040-14594131)
chr6 (5-212)||(22523388-22523594)
chr6 (3-101)||(23415441-23415539)
chr6 (3-210)||(23221294-23221500)
chr6 (5-213)||(31161878-31162085)
chr6 (3-101)||(27557199-27557297)
chr6 (1-142)||(35057000-35057141)
chr6 (1-101)||(15891994-15892094)
chr6 (1-101)||(33862270-33862370)
chr6 (162-225)||(25752963-25753026)
chr6 (162-225)||(25755133-25755196)
chr6 (1-101)||(1540497-1540597)
chr6 (5-101)||(17883087-17883183)
chr6 (3-65)||(19234658-19234720)
chr6 (1-101)||(12742794-12742894)
chr6 (1-69)||(16135613-16135680)
chr6 (10-142)||(31163462-31163594)
chr6 (138-213)||(16135519-16135594)
chr6 (4-142)||(3007530-3007668)
chr6 (3-101)||(19858510-19858608)
chr6 (169-218)||(29044682-29044731)
chr6 (174-218)||(19234617-19234661)
chr6 (1-72)||(1555527-1555598)
chr6 (1-72)||(16826406-16826477)
chr6 (1-72)||(21776134-21776205)
chr6 (1-72)||(25175112-25175183)
chr6 (3-61)||(18334180-18334238)
chr6 (3-61)||(24423063-24423121)
chr6 (1-72)||(27654635-27654706)
chr6 (11-82)||(32277427-32277498)
chr6 (3-61)||(26924035-26924093)
chr6 (3-61)||(33864794-33864852)
chr6 (3-56)||(8055551-8055604)
chr6 (3-48)||(16240320-16240365)
chr6 (235-267)||(19829601-19829633)
[»] chr1 (66 HSPs)
chr1 (1-267)||(44822537-44822802)
chr1 (1-265)||(8276407-8276671)
chr1 (1-267)||(24815267-24815533)
chr1 (1-265)||(21180740-21181004)
chr1 (1-267)||(38057066-38057332)
chr1 (4-267)||(22349959-22350222)
chr1 (1-267)||(7792267-7792533)
chr1 (3-267)||(16401039-16401303)
chr1 (1-225)||(20031305-20031529)
chr1 (3-227)||(50000884-50001109)
chr1 (1-225)||(2332625-2332849)
chr1 (3-222)||(46198142-46198361)
chr1 (4-218)||(21239713-21239927)
chr1 (1-246)||(22130480-22130726)
chr1 (1-223)||(28312763-28312985)
chr1 (3-222)||(29764051-29764274)
chr1 (3-218)||(51323695-51323910)
chr1 (4-218)||(41227122-41227336)
chr1 (4-218)||(41225869-41226083)
chr1 (4-218)||(42912470-42912684)
chr1 (1-247)||(296745-296992)
chr1 (4-225)||(13881034-13881255)
chr1 (1-218)||(7052470-7052688)
chr1 (4-218)||(20588099-20588313)
chr1 (4-218)||(20592637-20592851)
chr1 (3-218)||(12710308-12710523)
chr1 (1-208)||(23194966-23195173)
chr1 (4-218)||(4596263-4596477)
chr1 (4-218)||(16058732-16058946)
chr1 (4-218)||(19676131-19676345)
chr1 (1-219)||(20437642-20437860)
chr1 (4-218)||(21046467-21046681)
chr1 (3-218)||(14238029-14238244)
chr1 (1-225)||(45574467-45574680)
chr1 (9-218)||(51082636-51082845)
chr1 (4-218)||(20634052-20634267)
chr1 (1-210)||(16372178-16372388)
chr1 (1-218)||(38887502-38887720)
chr1 (3-218)||(45496365-45496581)
chr1 (3-218)||(22823824-22824038)
chr1 (3-218)||(50544272-50544486)
chr1 (4-215)||(24720112-24720322)
chr1 (3-214)||(1643020-1643228)
chr1 (3-218)||(39060516-39060731)
chr1 (3-214)||(14792979-14793189)
chr1 (59-247)||(294426-294624)
chr1 (3-218)||(17902179-17902393)
chr1 (1-214)||(44891873-44892084)
chr1 (4-218)||(18121025-18121238)
chr1 (1-141)||(9784758-9784898)
chr1 (1-97)||(21659685-21659781)
chr1 (21-218)||(6833635-6833831)
chr1 (1-213)||(16655793-16656004)
chr1 (1-101)||(29535528-29535628)
chr1 (1-101)||(13227340-13227440)
chr1 (4-101)||(16362395-16362492)
chr1 (1-101)||(21841243-21841343)
chr1 (1-101)||(21922877-21922977)
chr1 (3-93)||(10812786-10812876)
chr1 (1-101)||(41372948-41373048)
chr1 (4-91)||(23593322-23593409)
chr1 (210-267)||(45754830-45754888)
chr1 (3-61)||(13989382-13989440)
chr1 (9-142)||(20708746-20708879)
chr1 (1-72)||(22366527-22366598)
chr1 (182-218)||(48301352-48301388)
[»] scaffold0220 (4 HSPs)
scaffold0220 (1-267)||(16135-16401)
scaffold0220 (1-265)||(13319-13583)
scaffold0220 (1-188)||(8686-8873)
scaffold0220 (210-267)||(17783-17841)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (1-267)||(159365-159631)
[»] chr8 (109 HSPs)
chr8 (1-265)||(39694943-39695207)
chr8 (1-267)||(15635595-15635861)
chr8 (4-267)||(20454610-20454873)
chr8 (4-267)||(20455367-20455630)
chr8 (4-267)||(20460345-20460608)
chr8 (1-247)||(364178-364425)
chr8 (3-220)||(41680551-41680768)
chr8 (1-225)||(17460702-17460926)
chr8 (1-247)||(44522841-44523088)
chr8 (1-225)||(25483889-25484113)
chr8 (1-216)||(38185501-38185716)
chr8 (1-222)||(19882384-19882605)
chr8 (3-222)||(23478496-23478715)
chr8 (3-222)||(26454127-26454346)
chr8 (1-215)||(18024110-18024324)
chr8 (4-267)||(42266013-42266273)
chr8 (1-247)||(44432251-44432499)
chr8 (1-222)||(19880244-19880465)
chr8 (1-225)||(22237669-22237893)
chr8 (1-247)||(17795622-17795869)
chr8 (1-220)||(42559943-42560161)
chr8 (1-207)||(39363955-39364161)
chr8 (1-241)||(21579622-21579862)
chr8 (4-216)||(21861038-21861250)
chr8 (4-218)||(5760953-5761167)
chr8 (4-217)||(21326356-21326569)
chr8 (1-225)||(19808012-19808236)
chr8 (4-218)||(6102171-6102385)
chr8 (4-218)||(20178939-20179153)
chr8 (4-217)||(21321758-21321971)
chr8 (4-218)||(19140185-19140399)
chr8 (1-223)||(27941304-27941526)
chr8 (49-218)||(361675-361844)
chr8 (3-211)||(18833898-18834106)
chr8 (4-218)||(39936429-39936642)
chr8 (4-218)||(42818325-42818539)
chr8 (52-217)||(32950022-32950187)
chr8 (1-210)||(8728352-8728561)
chr8 (3-212)||(6573474-6573682)
chr8 (3-212)||(22207693-22207902)
chr8 (1-210)||(44476851-44477061)
chr8 (1-210)||(44480113-44480323)
chr8 (1-222)||(11775138-11775359)
chr8 (1-233)||(29763284-29763516)
chr8 (7-218)||(22483167-22483377)
chr8 (4-218)||(17437736-17437950)
chr8 (4-212)||(5082630-5082838)
chr8 (3-218)||(20084055-20084270)
chr8 (12-218)||(18816886-18817093)
chr8 (4-165)||(23660688-23660849)
chr8 (3-218)||(4381210-4381424)
chr8 (3-214)||(22258721-22258931)
chr8 (3-215)||(20517535-20517746)
chr8 (3-202)||(14397521-14397720)
chr8 (3-218)||(22344462-22344676)
chr8 (3-218)||(22356122-22356336)
chr8 (5-213)||(17501350-17501558)
chr8 (3-207)||(23914355-23914558)
chr8 (3-214)||(23670073-23670283)
chr8 (3-214)||(38988890-38989100)
chr8 (3-214)||(39019987-39020197)
chr8 (11-218)||(17978842-17979048)
chr8 (3-218)||(36305079-36305293)
chr8 (42-218)||(18815279-18815454)
chr8 (3-218)||(22474172-22474386)
chr8 (4-142)||(36732942-36733080)
chr8 (3-210)||(36405477-36405683)
chr8 (3-216)||(24907198-24907409)
chr8 (3-218)||(21513741-21513954)
chr8 (4-142)||(21399206-21399344)
chr8 (4-142)||(21793699-21793837)
chr8 (117-222)||(8414241-8414346)
chr8 (3-101)||(16198371-16198469)
chr8 (25-218)||(18118603-18118796)
chr8 (14-216)||(25757575-25757776)
chr8 (10-212)||(24624095-24624296)
chr8 (14-216)||(25295555-25295756)
chr8 (3-212)||(18827650-18827858)
chr8 (3-216)||(19331994-19332204)
chr8 (192-267)||(23409978-23410053)
chr8 (1-101)||(14397326-14397426)
chr8 (1-101)||(18677650-18677750)
chr8 (1-101)||(4541959-4542059)
chr8 (1-101)||(24485629-24485729)
chr8 (1-211)||(24238843-24239052)
chr8 (4-91)||(22002239-22002326)
chr8 (3-216)||(45559593-45559798)
chr8 (132-218)||(21345945-21346031)
chr8 (5-64)||(4233215-4233274)
chr8 (169-218)||(5080429-5080478)
chr8 (1-218)||(22313251-22313468)
chr8 (11-142)||(21495115-21495246)
chr8 (11-125)||(20176519-20176633)
chr8 (11-125)||(20221246-20221360)
chr8 (1-77)||(8414164-8414240)
chr8 (3-61)||(1484918-1484976)
chr8 (176-210)||(18122329-18122363)
chr8 (210-267)||(19699438-19699496)
chr8 (3-61)||(20045783-20045841)
chr8 (1-35)||(32950188-32950222)
chr8 (3-48)||(29759453-29759498)
chr8 (3-72)||(45290135-45290204)
chr8 (1-72)||(18618830-18618901)
chr8 (3-61)||(5852880-5852938)
chr8 (3-61)||(14409032-14409090)
chr8 (3-48)||(15320029-15320074)
chr8 (3-48)||(15500398-15500443)
chr8 (3-48)||(17150656-17150701)
chr8 (4-120)||(19866406-19866522)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (1-267)||(6170-6436)
[»] chr2 (94 HSPs)
chr2 (4-267)||(24883757-24884020)
chr2 (3-267)||(10039551-10039815)
chr2 (3-267)||(31520488-31520752)
chr2 (1-218)||(24273674-24273891)
chr2 (1-222)||(26903574-26903795)
chr2 (3-222)||(25183603-25183822)
chr2 (3-225)||(18358386-18358608)
chr2 (3-222)||(21081388-21081607)
chr2 (1-241)||(41301388-41301629)
chr2 (1-225)||(22173443-22173667)
chr2 (1-225)||(27472666-27472890)
chr2 (1-218)||(43707700-43707916)
chr2 (4-267)||(18388715-18388978)
chr2 (1-212)||(20915531-20915742)
chr2 (1-239)||(34858800-34859039)
chr2 (1-239)||(34873862-34874101)
chr2 (6-247)||(23338820-23339062)
chr2 (4-218)||(9975349-9975563)
chr2 (3-218)||(23969040-23969255)
chr2 (1-223)||(21073142-21073364)
chr2 (1-222)||(21915038-21915259)
chr2 (4-218)||(5031548-5031762)
chr2 (4-218)||(24781258-24781472)
chr2 (4-218)||(36839591-36839805)
chr2 (1-247)||(28349298-28349554)
chr2 (1-220)||(20590737-20590956)
chr2 (4-214)||(27484888-27485098)
chr2 (4-218)||(17306907-17307121)
chr2 (1-223)||(9242175-9242397)
chr2 (4-218)||(24515606-24515820)
chr2 (17-218)||(23068881-23069082)
chr2 (1-210)||(6482946-6483156)
chr2 (1-210)||(6486413-6486623)
chr2 (1-223)||(19662070-19662292)
chr2 (3-213)||(21368532-21368742)
chr2 (4-218)||(19201618-19201833)
chr2 (4-218)||(28652920-28653134)
chr2 (1-223)||(6260793-6261015)
chr2 (3-218)||(9785002-9785217)
chr2 (3-218)||(21316079-21316293)
chr2 (3-214)||(22690105-22690315)
chr2 (3-214)||(22694701-22694911)
chr2 (3-218)||(25587104-25587318)
chr2 (20-218)||(29113782-29113979)
chr2 (5-218)||(22686260-22686472)
chr2 (3-215)||(21335870-21336081)
chr2 (4-223)||(2524165-2524366)
chr2 (3-218)||(22332138-22332351)
chr2 (132-267)||(22501239-22501374)
chr2 (132-267)||(22509173-22509308)
chr2 (86-202)||(31345379-31345495)
chr2 (5-218)||(1384105-1384317)
chr2 (3-218)||(28345493-28345707)
chr2 (6-217)||(23609898-23610108)
chr2 (3-142)||(23778712-23778852)
chr2 (1-101)||(20261696-20261796)
chr2 (117-223)||(30643812-30643918)
chr2 (1-101)||(10684348-10684448)
chr2 (3-82)||(22255768-22255847)
chr2 (3-101)||(31345656-31345754)
chr2 (3-101)||(38967956-38968054)
chr2 (5-213)||(22786717-22786924)
chr2 (1-101)||(24897781-24897881)
chr2 (1-101)||(24900264-24900364)
chr2 (1-101)||(24902741-24902841)
chr2 (1-101)||(24905218-24905318)
chr2 (1-101)||(24907693-24907793)
chr2 (4-139)||(20272855-20272990)
chr2 (4-62)||(7186942-7187000)
chr2 (4-98)||(40911863-40911957)
chr2 (1-101)||(23136056-23136156)
chr2 (4-63)||(22501375-22501434)
chr2 (4-63)||(22509309-22509368)
chr2 (2-142)||(36734901-36735041)
chr2 (109-216)||(24841375-24841481)
chr2 (3-138)||(24302220-24302353)
chr2 (183-222)||(34492089-34492128)
chr2 (3-86)||(15632770-15632853)
chr2 (1-72)||(19887313-19887384)
chr2 (3-61)||(18809459-18809517)
chr2 (210-267)||(25045376-25045434)
chr2 (3-61)||(28577615-28577673)
chr2 (3-61)||(23711601-23711659)
chr2 (3-61)||(26505895-26505953)
chr2 (3-61)||(26508373-26508431)
chr2 (3-61)||(27920352-27920410)
chr2 (3-61)||(32039086-32039144)
chr2 (3-48)||(67363-67408)
chr2 (3-56)||(571919-571972)
chr2 (3-56)||(39682835-39682888)
chr2 (1-37)||(24383112-24383148)
chr2 (4-48)||(24686639-24686683)
chr2 (3-47)||(27261357-27261401)
chr2 (4-72)||(34135089-34135157)
[»] chr5 (78 HSPs)
chr5 (5-267)||(17812767-17813029)
chr5 (1-264)||(24277021-24277284)
chr5 (1-264)||(24384929-24385192)
chr5 (4-267)||(17875370-17875633)
chr5 (1-225)||(18418825-18419049)
chr5 (3-222)||(263273-263492)
chr5 (1-239)||(22412405-22412643)
chr5 (3-222)||(17011142-17011361)
chr5 (1-220)||(36460388-36460607)
chr5 (3-225)||(29448251-29448473)
chr5 (1-218)||(32607740-32607957)
chr5 (1-225)||(30138579-30138802)
chr5 (3-217)||(27868992-27869206)
chr5 (1-225)||(6766074-6766298)
chr5 (1-218)||(21399419-21399635)
chr5 (3-220)||(21557461-21557679)
chr5 (17-218)||(20565974-20566175)
chr5 (4-220)||(31456216-31456432)
chr5 (3-212)||(26761827-26762036)
chr5 (1-247)||(22758305-22758553)
chr5 (4-218)||(19921054-19921267)
chr5 (3-220)||(21554796-21555013)
chr5 (1-222)||(33472979-33473200)
chr5 (1-214)||(20198001-20198216)
chr5 (4-212)||(33895300-33895508)
chr5 (1-215)||(41876008-41876222)
chr5 (1-210)||(22336748-22336957)
chr5 (3-212)||(8833624-8833824)
chr5 (1-223)||(38145153-38145375)
chr5 (1-210)||(22340286-22340495)
chr5 (27-210)||(22750372-22750555)
chr5 (1-210)||(19511614-19511824)
chr5 (1-225)||(42960790-42961014)
chr5 (1-223)||(28370671-28370893)
chr5 (1-223)||(37598532-37598754)
chr5 (3-218)||(16062906-16063120)
chr5 (3-218)||(36509201-36509409)
chr5 (1-137)||(40917388-40917524)
chr5 (4-218)||(18744070-18744283)
chr5 (3-214)||(8504286-8504496)
chr5 (3-218)||(16605021-16605235)
chr5 (3-218)||(1627798-1628012)
chr5 (10-216)||(14026232-14026437)
chr5 (3-214)||(23199809-23200017)
chr5 (1-109)||(24617338-24617446)
chr5 (1-109)||(24713569-24713677)
chr5 (1-109)||(24746597-24746705)
chr5 (52-218)||(22111020-22111185)
chr5 (144-241)||(12122080-12122177)
chr5 (1-213)||(28901346-28901557)
chr5 (1-213)||(28937741-28937952)
chr5 (1-109)||(24668612-24668720)
chr5 (1-109)||(24738381-24738489)
chr5 (1-109)||(24751150-24751258)
chr5 (2-101)||(37804489-37804588)
chr5 (1-92)||(43243073-43243164)
chr5 (3-82)||(17909023-17909102)
chr5 (3-209)||(31478801-31479005)
chr5 (1-101)||(10732526-10732626)
chr5 (72-214)||(26749538-26749679)
chr5 (82-218)||(30611973-30612108)
chr5 (82-218)||(30613933-30614068)
chr5 (5-101)||(42244955-42245051)
chr5 (3-101)||(29351402-29351500)
chr5 (4-101)||(29346456-29346553)
chr5 (4-101)||(29348929-29349026)
chr5 (11-72)||(7528428-7528489)
chr5 (3-48)||(27183209-27183254)
chr5 (4-72)||(11342190-11342258)
chr5 (1-72)||(11903-11974)
chr5 (1-72)||(21074247-21074318)
chr5 (1-72)||(22367133-22367204)
chr5 (1-72)||(25426177-25426248)
chr5 (1-48)||(43444047-43444094)
chr5 (5-63)||(7424886-7424944)
chr5 (3-61)||(20909528-20909586)
chr5 (3-45)||(23065046-23065088)
chr5 (3-48)||(22883944-22883989)
[»] scaffold0635 (1 HSPs)
scaffold0635 (3-267)||(7255-7519)
[»] scaffold0607 (1 HSPs)
scaffold0607 (1-267)||(3077-3343)
[»] scaffold0630 (1 HSPs)
scaffold0630 (3-267)||(8435-8699)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (4-267)||(8428-8691)
[»] scaffold0001 (5 HSPs)
scaffold0001 (4-267)||(77058-77321)
scaffold0001 (1-225)||(152625-152849)
scaffold0001 (1-222)||(176208-176429)
scaffold0001 (1-222)||(168855-169076)
scaffold0001 (4-72)||(139619-139687)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (1-267)||(51329-51595)
scaffold0042 (1-115)||(67191-67305)
[»] scaffold0180 (2 HSPs)
scaffold0180 (1-218)||(28783-29000)
scaffold0180 (1-77)||(9996-10072)
[»] scaffold0108 (2 HSPs)
scaffold0108 (3-267)||(5788-6052)
scaffold0108 (3-218)||(7200-7413)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (4-267)||(35989-36252)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (1-221)||(15990-16210)
[»] scaffold0338 (3 HSPs)
scaffold0338 (3-222)||(3359-3578)
scaffold0338 (1-56)||(1-56)
scaffold0338 (3-48)||(8590-8635)
[»] scaffold0515 (1 HSPs)
scaffold0515 (3-222)||(4446-4669)
[»] scaffold0306 (1 HSPs)
scaffold0306 (3-222)||(4446-4669)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (1-239)||(105311-105549)
scaffold0023 (1-247)||(162674-162921)
scaffold0023 (3-61)||(94927-94985)
[»] scaffold0334 (2 HSPs)
scaffold0334 (1-218)||(1505-1722)
scaffold0334 (1-153)||(1-153)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (1-218)||(21153-21370)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (1-216)||(21677-21892)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (3-222)||(5874-6093)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (4-225)||(12382-12603)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (1-225)||(406-630)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (4-227)||(428-650)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (3-222)||(22186-22405)
[»] scaffold0026 (4 HSPs)
scaffold0026 (3-222)||(21497-21716)
scaffold0026 (1-208)||(123975-124182)
scaffold0026 (1-223)||(110902-111124)
scaffold0026 (8-218)||(146152-146362)
[»] scaffold0308 (1 HSPs)
scaffold0308 (17-267)||(12705-12955)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (1-218)||(9475-9692)
[»] scaffold0109 (3 HSPs)
scaffold0109 (1-245)||(2731-2975)
scaffold0109 (3-218)||(394-609)
scaffold0109 (3-218)||(5697-5912)
[»] scaffold0672 (1 HSPs)
scaffold0672 (1-216)||(7971-8186)
[»] scaffold0057 (2 HSPs)
scaffold0057 (3-222)||(70245-70464)
scaffold0057 (4-115)||(71934-72045)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (1-223)||(9371-9593)
[»] scaffold0061 (2 HSPs)
scaffold0061 (4-218)||(15004-15218)
scaffold0061 (4-218)||(24062-24276)
[»] scaffold0364 (1 HSPs)
scaffold0364 (1-218)||(7553-7770)
[»] scaffold0104 (4 HSPs)
scaffold0104 (1-206)||(26358-26563)
scaffold0104 (1-206)||(27740-27945)
scaffold0104 (3-218)||(7639-7854)
scaffold0104 (3-218)||(14270-14485)
[»] scaffold1783 (1 HSPs)
scaffold1783 (1-229)||(658-886)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (3-222)||(11113-11332)
[»] scaffold0077 (6 HSPs)
scaffold0077 (1-247)||(22959-23206)
scaffold0077 (1-208)||(17672-17879)
scaffold0077 (1-171)||(22594-22765)
scaffold0077 (4-183)||(33794-33973)
scaffold0077 (77-208)||(23381-23512)
scaffold0077 (210-268)||(3085-3143)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (4-218)||(78484-78698)
[»] scaffold1283 (1 HSPs)
scaffold1283 (4-218)||(885-1099)
[»] scaffold0737 (2 HSPs)
scaffold0737 (4-218)||(5131-5345)
scaffold0737 (1-220)||(6092-6312)
[»] scaffold0083 (4 HSPs)
scaffold0083 (1-218)||(397-614)
scaffold0083 (1-218)||(5701-5918)
scaffold0083 (6-93)||(1480-1567)
scaffold0083 (1-30)||(11420-11449)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (4-225)||(82400-82620)
[»] scaffold0462 (3 HSPs)
scaffold0462 (3-222)||(10636-10856)
scaffold0462 (3-214)||(744-953)
scaffold0462 (3-214)||(6250-6459)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (1-225)||(6438-6662)
scaffold0123 (51-218)||(16358-16524)
[»] scaffold0032 (3 HSPs)
scaffold0032 (1-225)||(67507-67731)
scaffold0032 (21-218)||(62405-62602)
scaffold0032 (3-213)||(116822-117032)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (4-247)||(138165-138409)
[»] scaffold0384 (1 HSPs)
scaffold0384 (4-218)||(7803-8017)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (3-221)||(11924-12142)
[»] scaffold0599 (1 HSPs)
scaffold0599 (1-214)||(421-634)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (5-218)||(39519-39732)
[»] scaffold0125 (2 HSPs)
scaffold0125 (3-218)||(27720-27935)
scaffold0125 (4-225)||(1527-1748)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (4-218)||(22209-22423)
scaffold0080 (1-241)||(29128-29369)
scaffold0080 (1-241)||(34593-34834)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (4-218)||(58168-58382)
scaffold0064 (1-101)||(68438-68538)
[»] scaffold0802 (1 HSPs)
scaffold0802 (3-212)||(5084-5293)
[»] scaffold0371 (2 HSPs)
scaffold0371 (3-212)||(10864-11073)
scaffold0371 (79-174)||(17223-17318)
[»] scaffold0051 (3 HSPs)
scaffold0051 (3-211)||(64486-64694)
scaffold0051 (3-202)||(31386-31585)
scaffold0051 (3-101)||(31680-31778)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (4-218)||(120330-120544)
scaffold0034 (3-175)||(29614-29786)
[»] scaffold1539 (1 HSPs)
scaffold1539 (4-218)||(1327-1541)
[»] scaffold0452 (2 HSPs)
scaffold0452 (4-218)||(13083-13297)
scaffold0452 (1-213)||(8065-8277)
[»] scaffold0439 (2 HSPs)
scaffold0439 (4-218)||(11579-11793)
scaffold0439 (3-218)||(3839-4055)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (4-218)||(143033-143247)
scaffold0020 (4-180)||(169415-169591)
[»] scaffold0019 (4 HSPs)
scaffold0019 (1-223)||(133579-133801)
scaffold0019 (1-223)||(133165-133387)
scaffold0019 (35-218)||(29578-29761)
scaffold0019 (1-72)||(33804-33875)
[»] scaffold0039 (2 HSPs)
scaffold0039 (3-218)||(10346-10562)
scaffold0039 (3-48)||(19940-19985)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (4-210)||(7006-7213)
[»] scaffold0632 (1 HSPs)
scaffold0632 (3-218)||(585-800)
[»] scaffold0335 (2 HSPs)
scaffold0335 (10-212)||(1130-1332)
scaffold0335 (3-48)||(6236-6281)
[»] scaffold0111 (2 HSPs)
scaffold0111 (4-218)||(12954-13168)
scaffold0111 (151-218)||(19368-19435)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (4-218)||(21072-21286)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (4-218)||(126168-126382)
scaffold0011 (21-214)||(32878-33070)
[»] scaffold0292 (1 HSPs)
scaffold0292 (4-218)||(6933-7147)
[»] scaffold0241 (3 HSPs)
scaffold0241 (4-218)||(1984-2198)
scaffold0241 (4-134)||(5413-5543)
scaffold0241 (126-218)||(5137-5229)
[»] scaffold0153 (2 HSPs)
scaffold0153 (1-167)||(4568-4734)
scaffold0153 (1-72)||(11683-11754)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (3-181)||(23621-23799)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (3-218)||(5743-5958)
[»] scaffold0546 (3 HSPs)
scaffold0546 (3-218)||(7395-7610)
scaffold0546 (1-92)||(10332-10423)
scaffold0546 (166-218)||(11215-11267)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (4-183)||(106621-106800)
[»] scaffold0544 (1 HSPs)
scaffold0544 (1-223)||(2142-2364)
[»] scaffold0529 (2 HSPs)
scaffold0529 (32-218)||(7937-8123)
scaffold0529 (74-186)||(8154-8266)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (79-257)||(21022-21200)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (26-182)||(11101-11257)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (35-211)||(8752-8928)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (4-216)||(21490-21702)
[»] scaffold1633 (1 HSPs)
scaffold1633 (4-218)||(625-839)
[»] scaffold1766 (1 HSPs)
scaffold1766 (4-180)||(1112-1288)
[»] scaffold1186 (1 HSPs)
scaffold1186 (3-218)||(1131-1346)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (87-222)||(33334-33469)
scaffold0138 (3-101)||(33648-33746)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (3-218)||(186922-187137)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (3-214)||(66449-66660)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (3-218)||(168857-169073)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (3-218)||(25936-26150)
[»] scaffold0232 (1 HSPs)
scaffold0232 (3-218)||(3690-3905)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (3-218)||(30032-30247)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (63-218)||(22478-22633)
[»] scaffold1204 (1 HSPs)
scaffold1204 (1-213)||(765-977)
[»] scaffold0134 (2 HSPs)
scaffold0134 (74-218)||(9715-9858)
scaffold0134 (3-61)||(38338-38396)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (3-214)||(65398-65608)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (3-218)||(18585-18799)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (3-218)||(34685-34895)
[»] scaffold0825 (2 HSPs)
scaffold0825 (9-125)||(1057-1173)
scaffold0825 (143-267)||(1372-1496)
[»] scaffold0521 (1 HSPs)
scaffold0521 (1-213)||(7931-8143)
[»] scaffold0401 (1 HSPs)
scaffold0401 (3-214)||(8244-8455)
[»] scaffold1160 (1 HSPs)
scaffold1160 (3-214)||(110-320)
[»] scaffold0684 (1 HSPs)
scaffold0684 (4-139)||(1-136)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (3-217)||(10132-10335)
[»] scaffold0293 (2 HSPs)
scaffold0293 (79-202)||(19945-20068)
scaffold0293 (3-101)||(19676-19774)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (3-214)||(18071-18281)
[»] scaffold0063 (2 HSPs)
scaffold0063 (3-214)||(62143-62353)
scaffold0063 (3-46)||(39326-39369)
[»] scaffold0048 (1 HSPs)
scaffold0048 (3-214)||(56401-56611)
[»] scaffold0230 (2 HSPs)
scaffold0230 (3-218)||(7272-7485)
scaffold0230 (1-101)||(14424-14524)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (3-213)||(11635-11844)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (4-213)||(11625-11833)
[»] scaffold0117 (4 HSPs)
scaffold0117 (1-114)||(21285-21398)
scaffold0117 (86-202)||(39515-39631)
scaffold0117 (55-101)||(39809-39855)
scaffold0117 (3-60)||(42271-42328)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (3-218)||(18543-18758)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (4-213)||(2198-2406)
scaffold0409 (4-213)||(10453-10661)
[»] scaffold0200 (2 HSPs)
scaffold0200 (86-202)||(17836-17952)
scaffold0200 (3-101)||(18130-18228)
[»] scaffold0686 (1 HSPs)
scaffold0686 (1-107)||(767-873)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (3-142)||(8037-8176)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (1-123)||(2403-2524)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (1-211)||(32671-32880)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (1-218)||(35932-36148)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (3-212)||(13189-13402)
[»] scaffold0414 (1 HSPs)
scaffold0414 (3-214)||(11764-11974)
[»] scaffold0256 (2 HSPs)
scaffold0256 (3-126)||(2470-2593)
scaffold0256 (124-218)||(3059-3153)
[»] scaffold2015 (1 HSPs)
scaffold2015 (1-80)||(98-177)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (3-102)||(24480-24579)
scaffold0162 (169-214)||(24586-24631)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (1-101)||(3500-3600)
[»] scaffold1278 (1 HSPs)
scaffold1278 (25-212)||(880-1066)
[»] scaffold0436 (1 HSPs)
scaffold0436 (3-101)||(8495-8593)
[»] scaffold0369 (2 HSPs)
scaffold0369 (1-91)||(16403-16493)
scaffold0369 (144-218)||(16528-16602)
[»] scaffold0013 (2 HSPs)
scaffold0013 (3-120)||(7794-7911)
scaffold0013 (169-217)||(7929-7977)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (129-210)||(2377-2458)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (1-101)||(21225-21325)
[»] scaffold0174 (1 HSPs)
scaffold0174 (11-218)||(20499-20706)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (1-101)||(53-154)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (1-77)||(9601-9677)
[»] scaffold0956 (1 HSPs)
scaffold0956 (4-66)||(2341-2403)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (159-216)||(2362-2419)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (1-101)||(9718-9818)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (1-101)||(11766-11866)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (4-66)||(174566-174628)
[»] scaffold0695 (1 HSPs)
scaffold0695 (3-101)||(6423-6521)
[»] scaffold1662 (1 HSPs)
scaffold1662 (166-218)||(1-53)
[»] scaffold0321 (1 HSPs)
scaffold0321 (212-267)||(627-683)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (11-142)||(17160-17291)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (75-142)||(40902-40969)
scaffold0139 (3-45)||(40847-40889)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (210-267)||(53258-53316)
[»] scaffold1753 (1 HSPs)
scaffold1753 (3-48)||(892-937)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (11-72)||(35055-35116)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (3-47)||(935-979)
[»] scaffold0892 (1 HSPs)
scaffold0892 (17-72)||(2946-3001)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (183-218)||(7104-7139)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (3-61)||(13909-13967)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (3-45)||(37886-37928)
scaffold0044 (3-61)||(40916-40974)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (210-267)||(3641-3701)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (3-48)||(12521-12566)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (3-72)||(8123-8192)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (3-48)||(30494-30539)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (3-48)||(53970-54015)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (4-48)||(15802-15846)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (22-82)||(4741-4801)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 148)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 4 - 267
Target Start/End: Original strand, 14641968 - 14642231
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14641968 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 14642067  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14642068 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 14642167  T
Q  204 taacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagacttaca 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14642168 taacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagacttaca 14642231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Original strand, 3394417 - 3394683
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3394417 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttaaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatga 3394516  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3394517 aaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaagctcaaaactagaagtactatgaattcaattaaggtgtttaagagt 3394616  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagacttaca 267  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  3394617 atttaacccatgttgtgagttgatcttgggataggaatggaagttgttaataagttatagacttaca 3394683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 4 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 12276183 - 12275922
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12276183 gttagctttccaatgactttggtttgacttaaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 12276084  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12276083 ttcagcataaccatttctaagttaagccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtgtt 12275984  T
Q  204 taacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagactta 265  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  12275983 taacccatgttgtgagttgatcttgggataggaatggaagttgttaataagttatagactta 12275922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 6159034 - 6158772
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  6159034 tttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatgtttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatga 6158935  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6158934 aaattcaacataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 6158835  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagact 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6158834 atttaacctatgttgtgagttgatcttgggataggaatggaagttgttattaagttatagact 6158772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Original strand, 13522825 - 13523092
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  13522825 tttgttagctttccaatggctttggtttaacttgaaaataatttttagtttttgagatatgatgagaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatga 13522924  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatcc-aaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagag 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13522925 aaattcagcataatcatttctaagttaatccaaaaacttatgcgataattccaaggctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagag 13523024  T
Q  200 tatttaacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagacttaca 267  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  13523025 tatttaacccatgttgtgagttgatcttgggataggaatggaagttgttaataagttatagacttaca 13523092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 179122 - 179386
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  179122 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaataccccaagtaggtcttagtgaaatcttatga 179221  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  179222 aaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttgaattaaggtgtttaacagt 179321  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagactta 265  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||  ||||||||||||||    
T  179322 atttaatccatgttgtgagttgatcttgggataggaatggaggttgttaagaagttatagactta 179386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 2248385 - 2248630
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  2248385 tttgttagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatga 2248484  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2248485 aaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaacccttaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 2248584  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgat-cttgggatatgaatgaaagtt 245  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  2248585 atttaacccatgttgtgagttgatccttgggttaggaatgaaagtt 2248630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 5 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 37038452 - 37038195
Alignment:
Q  5 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaa-tacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  37038452 ttagcttttcaatggctttggtttgatttgaaaatgatttttggtttttgagatatgataaaaaatactccagagaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 37038353  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37038352 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattcaaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaagatgtttaagagtatt 37038253  T
Q  204 taacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttataga 261  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  37038252 taacctatgttttgagttgatctttggataagaatggaagttgttattaagttataga 37038195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 6819746 - 6819480
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6819746 tttgttagctttccaatgactttggtttgacatgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatga 6819647  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6819646 aaattaaggataaccgtttctaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaagctcaaaactataagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 6819547  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagacttaca 267  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||| ||  ||||||||| |||||||    
T  6819546 atttaatctatgttgtgggttgatcttgggataggaatgggagttcttcataagttatatacttaca 6819480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 10833754 - 10833976
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10833754 tttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgaattttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatga 10833853  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10833854 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagt 10833953  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttga 223  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  10833954 atttaacccatgttgtgagttga 10833976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 5 - 267
Target Start/End: Original strand, 18367177 - 18367439
Alignment:
Q  5 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18367177 ttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatatttcaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaat 18367276  T
Q  105 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 204  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18367277 tcagtataacccgttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaagctagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 18367376  T
Q  205 aacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagacttaca 267  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||| ||| |||||||||||||    
T  18367377 aacccatgttgtgagttgatcttgggatagcaatgggagttgttaataaattatagacttaca 18367439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 8928080 - 8928321
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8928080 tttgttagatttccaatggctttggtttgacctgaaaatgatttttggtttttgagatataatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatga 8928179  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8928180 aaattcagcataaccatttctaagataatccaaaacttatgggataattccaaggctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 8928279  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgat-cttgggatatgaatgaa 241  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  8928280 atttaacccatgttgtgagttgatccttgggttaggaatgaa 8928321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 1988647 - 1988887
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  1988647 tttgttagctttccaatggctttagtttgacttgaaaatgatatttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgcaattttatga 1988746  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1988747 aaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactataactactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 1988846  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaa 241  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1988847 gtttaaccaatgttgtgagttgatcttgggataggaatgaa 1988887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 24152859 - 24153083
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  24152859 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatga 24152958  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24152959 aaattcagcataaccgtttctaaattaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtctaagagt 24153058  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatc 225  Q
    | |||||| ||||||||||||||||    
T  24153059 acttaacccatgttgtgagttgatc 24153083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 42324636 - 42324900
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |    
T  42324636 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatataatcaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttagaa 42324735  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||  | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42324736 aaattcagtataaccatttctaagttagtcaaaaacttagagaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 42324835  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagactta 265  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  42324836 atttaacccatgttgtgagttgatcttgggatataaatggaagttgttaataaggtatagactta 42324900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 11192717 - 11192501
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  11192717 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttt-tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggccttagtgaaatcttatga 11192619  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11192618 aaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 11192519  T
Q  201 atttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||||    
T  11192518 atttaacctatgttgtga 11192501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 10563343 - 10563081
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10563343 gttagctttccagtggctttggtttgatgtgaaaatgatttttggtgcttgagatatgatgaacatactcaaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 10563244  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10563243 ttcagtataatcatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 10563144  T
Q  204 taacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagacttaca 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  10563143 taacctatgttgtgagttgatcttgggata-ggatggaagttattattaatttatagacttaca 10563081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 50243361 - 50243130
Alignment:
Q  10 tttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagc 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50243361 tttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagc 50243262  T
Q  110 ataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacct 209  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  50243261 ataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgagataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaaccc 50243162  T
Q  210 atgttgtgagttgat-cttgggatatgaatga 240  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  50243161 atgttgtgagttgatccttggggtatgaatga 50243130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 43550092 - 43550316
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  43550092 tttgttaattttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgataaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatga 43550191  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43550192 aaattcagcataaccgtttctaaattaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 43550291  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatc 225  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    
T  43550292 atttaacccatgttgtgagttgatc 43550316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16979545 - 16979326
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  16979545 tgttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgattttttgtgtttgagatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttataaaa 16979446  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16979445 attcagcatgaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 16979346  T
Q  203 ttaacctatgttgtgagttg 222  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16979345 ttaacctatgttgtgagttg 16979326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 19 - 222
Target Start/End: Original strand, 13029709 - 13029912
Alignment:
Q  19 gctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13029709 gctttggtttgacttgaaaatgatttttagttttttaaatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatt 13029808  T
Q  119 tctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13029809 tctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 13029908  T
Q  219 gttg 222  Q
    ||||    
T  13029909 gttg 13029912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 50351415 - 50351630
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  50351415 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatga 50351514  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50351515 aaattcagcataaccatttctaagtcgatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaacttgaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagagt 50351614  T
Q  201 atttaacctatgttgt 216  Q
    ||||||| ||||||||    
T  50351615 atttaacatatgttgt 50351630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 10989219 - 10989463
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  10989219 tttgttagctttccaatggctttggtctgacatgaaaataattttg-gtttttaagatatgatgaaaatgctccaaggaggtcttagtgaaatcttatga 10989317  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10989318 aaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 10989417  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatc-ttgggatatgaatgaaagtt 245  Q
    |||||| | |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  10989418 atttaatccatgttgtgagttgaactttgggatatcaatgaaagtt 10989463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 222
Target Start/End: Original strand, 13026117 - 13026320
Alignment:
Q  19 gctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13026117 gctttggtttgacttgaaaatgatttttagttttttaaatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatt 13026216  T
Q  119 tctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13026217 tctaagttaatccaaaaattatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 13026316  T
Q  219 gttg 222  Q
    ||||    
T  13026317 gttg 13026320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 40807630 - 40807416
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40807630 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 40807531  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  40807530 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatt 40807431  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||    
T  40807430 taacctatgttgtga 40807416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 14441802 - 14441588
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14441802 gttagttttccagtgactttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 14441703  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14441702 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatt 14441603  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||    
T  14441602 taacctatgttgtga 14441588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16643639 - 16643418
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16643639 gttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgatttatagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaa 16643540  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16643539 ttcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaacactcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 16643440  T
Q  204 taacctatgttgtgagttgatc 225  Q
    ||| | ||||||||||||||||    
T  16643439 taatccatgttgtgagttgatc 16643418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 5 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14966635 - 14966415
Alignment:
Q  5 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 104  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  14966635 ttagcttttcaatgacattggtttgacttgaaaataatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaattttatgaaaat 14966536  T
Q  105 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 204  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14966535 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattctaaacctaaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtattt 14966436  T
Q  205 aacctatgttgtgagttgatc 225  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  14966435 aacctatgttatgagttgatc 14966415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 6805378 - 6805597
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6805378 tgttagctttccagtggctttggtgtgacttgaaaatgatttctggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcctagtgaaatcttatgaaa 6805477  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6805478 attcagcataactgtttctaagttaatctaaaacttatggaataattccaaacctcaaaattagaagtactatgagttcaattaagttgtttaagagtat 6805577  T
Q  203 ttaacctatgttgtgagttg 222  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6805578 ttaacctatgttgtgagttg 6805597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 5206072 - 5206286
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5206072 gttagatttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatatttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 5206171  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  5206172 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattatggtgtttaagattatt 5206271  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||    
T  5206272 taacctatgttgtga 5206286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 40812467 - 40812253
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40812467 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtgcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 40812368  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  40812367 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatt 40812268  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||| ||||    
T  40812267 taacctatgtggtga 40812253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 54875901 - 54876115
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54875901 gttagctttccagtggagttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttgtgaaaa 54876000  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54876001 ttcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatt 54876100  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||    
T  54876101 taacctatgttgtga 54876115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 11913358 - 11913145
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  11913358 tttgttagctttccaatgactttggtttcacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatga 11913259  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11913258 aaattcagtataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagt 11913159  T
Q  201 atttaacctatgtt 214  Q
    || |||| ||||||    
T  11913158 atgtaacttatgtt 11913145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 14508481 - 14508268
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14508481 gttagctttcctatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 14508382  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  14508381 ttcagcataaccgttt-taagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatt 14508283  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||    
T  14508282 taacctatgttgtga 14508268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 17693702 - 17693488
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  ||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17693702 gttagttttccaatggctttggtttgatgtgaaagttatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 17693603  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  17693602 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaaatagggtgtttaagagtatt 17693503  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||    
T  17693502 taacctatgttgtga 17693488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 33564764 - 33564555
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33564764 tgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 33564665  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  33564664 attcagcctaacagtttctatgttaatccaaaacttatggaataattccaatcctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtat 33564565  T
Q  203 ttaacctatg 212  Q
    ||||||||||    
T  33564564 ttaacctatg 33564555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 17513217 - 17513010
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||    
T  17513217 tttgttagctttctaattgagttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcgtagga 17513118  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17513117 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttattgaataattccaaacctccaaactagaagtgctatgagttcaattaaggtgtttgagagt 17513018  T
Q  201 atttaacc 208  Q
    ||||||||    
T  17513017 atttaacc 17513010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 55292056 - 55292275
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  55292056 tttgttagctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatcatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatga 55292155  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  55292156 aaattcagcataaccctttttaagttaacccaaaacttatgggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaaaagt 55292255  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagt 220  Q
    |||||||| ||||| |||||    
T  55292256 atttaacccatgttatgagt 55292275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 17538740 - 17538527
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17538740 gttagctttccaatt-ctttggtttgacgtgcaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 17538642  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  17538641 ttcagcataaccttttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcgaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatt 17538542  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||    
T  17538541 taacctatgttgtga 17538527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18890001 - 18889783
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  18890001 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttaatgtttgagttatgatggaaatactccaggtaggtcttagtgaaatcttatga 18889902  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18889901 aaattccgcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggatagttccaaggctcaaatctagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagt 18889802  T
Q  201 atttaacctatgttgtgag 219  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  18889801 atttaacccatgttgtgag 18889783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 43928988 - 43928775
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43928988 tttgttagctttccaatggctttgatttgatctgaaaataatttttaatttttgagatataatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatga 43928889  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43928888 aaattcagcataatcatttctaagttgatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaattagaagtactatgagttcaattaaggtgcttaagagt 43928789  T
Q  201 atttaacctatgtt 214  Q
    ||||||| ||||||    
T  43928788 atttaacatatgtt 43928775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 26 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 44274086 - 44273894
Alignment:
Q  26 tttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagt 125  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44274086 tttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagt 44273987  T
Q  126 taatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44273986 taatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtttttaagagtatttaacctatgttgtga 44273894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 10554904 - 10554685
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10554904 tttgttagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatga 10554805  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  10554804 aaattcagcataaccctttttaagttaatccaaaacttatgggataattcaaaggctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtctaagagt 10554705  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagt 220  Q
    |||||||| ||||| |||||    
T  10554704 atttaacccatgttatgagt 10554685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 35961304 - 35961523
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  35961304 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaa 35961403  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35961404 aattagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaaatagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 35961503  T
Q  203 ttaacctatgttgtgagttg 222  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  35961504 ttaacctatgttgtgagttg 35961523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 53646475 - 53646686
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  53646475 tttgttagatttccaatgattttggtttgacttgaaaatgatttttgttttttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaattttatga 53646574  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  53646575 aaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagt 53646674  T
Q  201 atttaacctatg 212  Q
    ||||||| ||||    
T  53646675 atttaacatatg 53646686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 2841881 - 2842094
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2841881 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgataaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 2841980  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  2841981 ttcagcataacc-gttccaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatt 2842079  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||    
T  2842080 taacctatgttgtga 2842094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 17685261 - 17685475
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17685261 gttagctttccagtggcgttggtttgacgtgaaaatgaattttggtacttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 17685360  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  17685361 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaaatactatgaattcaattagggtgtttaagagtatt 17685460  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    ||| |||| ||||||    
T  17685461 taatctatcttgtga 17685475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 35064999 - 35065212
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  35064999 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaattatttttggttcttgagatatgatgaaaatactcccatgaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 35065098  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  35065099 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatt-caaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatt 35065197  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||    
T  35065198 taacctatgttgtga 35065212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 42164 - 41943
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  42164 tttgttagctttccaatgactctggtttggcatgaaaataatttttagtttaagagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatga 42065  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  42064 aaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagt 41965  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttg 222  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  41964 atttaacctaagttgtgagttg 41943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 218
Target Start/End: Original strand, 17519292 - 17519505
Alignment:
Q  5 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 104  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17519292 ttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggatcttgagatgtgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 17519391  T
Q  105 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 204  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17519392 tcagcataaccgttactaagataatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactaaggtgtttaagagtattt 17519491  T
Q  205 aacctatgttgtga 218  Q
    ||| ||||||||||    
T  17519492 aacatatgttgtga 17519505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 218
Target Start/End: Original strand, 17534154 - 17534367
Alignment:
Q  5 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 104  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17534154 ttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggatcttgagatgtgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 17534253  T
Q  105 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 204  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17534254 tcagcataaccgttactaagataatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactaaggtgtttaagagtattt 17534353  T
Q  205 aacctatgttgtga 218  Q
    ||| ||||||||||    
T  17534354 aacatatgttgtga 17534367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 4 - 211
Target Start/End: Original strand, 17670127 - 17670334
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    ||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17670127 gttagcttttcagtggcgttggtttgacgtgaaaatgaattttggtacttgagatatgatgaaaatactacaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 17670226  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17670227 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaaatactatgagttcaattagggtgtttaagagtatt 17670326  T
Q  204 taacctat 211  Q
    ||| ||||    
T  17670327 taatctat 17670334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 18893261 - 18893067
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  18893261 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgacttttagtttttgagttatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatga 18893162  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgttta 195  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  18893161 aaattcagcagaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactacaagtaatatgagtttaattaaggtgttta 18893067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 220
Target Start/End: Original strand, 31224370 - 31224588
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||| | |||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31224370 tgttagctttctagtggtattggtttcacttgaaaatgatttttggtttttaagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaa 31224469  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtg-tttaagagta 201  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  31224470 tttcagtataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgttttaagagta 31224569  T
Q  202 tttaacctatgttgtgagt 220  Q
    ||||||| ||| |||||||    
T  31224570 tttaacccatgctgtgagt 31224588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 38311418 - 38311628
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  38311418 tttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatga 38311517  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattcc-aaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagag 199  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38311518 aaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttagggaataattccaaaacctcgaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagag 38311617  T
Q  200 tatttaaccta 210  Q
    |||||||||||    
T  38311618 tatttaaccta 38311628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 214
Target Start/End: Original strand, 50348444 - 50348654
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  50348444 gttagctttccagtggctttagtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttggtgaaatcttatgaaaa 50348543  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||    
T  50348544 ttcagtataaccatttctaagttaatccaaaactcatgggataattccaaacctcaaaactataagtactaggggtttaattaaggggtttaagagtatt 50348643  T
Q  204 taacctatgtt 214  Q
    |||||||||||    
T  50348644 taacctatgtt 50348654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 20248399 - 20248608
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  20248399 tttgttagttttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatga 20248498  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  20248499 aaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaatatttccaaacctcgaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaaaagt 20248598  T
Q  201 atttaaccta 210  Q
    ||||||||||    
T  20248599 atttaaccta 20248608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 13519918 - 13519702
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||| | || |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13519918 tgttagctttctattgactttcgtttgacttgaaattgatttttggtttttgagatataatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 13519819  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaa-ggtgtttaagagta 201  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||| || |||||||||||    
T  13519818 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttgattaagggggtttaagagta 13519719  T
Q  202 tttaacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||||    
T  13519718 tttaacctatgttgtga 13519702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 17044600 - 17044392
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17044600 gttagatttccagtggctttagtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaa 17044501  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  17044500 ttcaacataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaattagaaatactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatt 17044401  T
Q  204 taacctatg 212  Q
    |||||||||    
T  17044400 taacctatg 17044392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Original strand, 43889217 - 43889429
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  43889217 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaa 43889316  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  43889317 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaatttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaagggttttaagagtatt 43889416  T
Q  204 taacctatgttgt 216  Q
    |||| | ||||||    
T  43889417 taacatgtgttgt 43889429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 35354236 - 35354019
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgat---ttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||   |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  35354236 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaacgagatcttagtgaaatcttatga 35354137  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||    
T  35354136 aaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactgggagtttaattaaggggtttaagagt 35354037  T
Q  201 atttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||||    
T  35354036 atttaacctatgttgtga 35354019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 15931925 - 15932139
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||  || ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15931925 gttagctttccagtggccttggtttgatgtgcaaatgattttgggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 15932024  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  15932025 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaagaaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatt 15932124  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    | | |||||||||||    
T  15932125 tcatctatgttgtga 15932139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 19444148 - 19443941
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||    
T  19444148 tttgttagcttcccaatggctttggtttgacatgaaagtgatttttggtttttgagatattatgaaaatactccaaggaggtcttattaaaattttatga 19444049  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  19444048 aaattcagcataaccatttctaagtgaatccaaaacttatgggataattccaaagctccaaactagaagtgccatgagttcaattaaggtgtttgagaat 19443949  T
Q  201 atttaacc 208  Q
    ||||||||    
T  19443948 atttaacc 19443941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 3803472 - 3803258
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||| || | ||||| | |||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  3803472 tttgttagctttccaatgactctagtttggcgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatga 3803373  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3803372 aaattcagcaaaaccgtttctaagttaatcaaaatcttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttaaattaaggtgtttaagagt 3803273  T
Q  201 atttaacctatgttg 215  Q
    |||||||||||||||    
T  3803272 atttaacctatgttg 3803258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9533766 - 9533544
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  9533766 tttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatga 9533667  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9533666 aaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagt 9533567  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttga 223  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  9533566 atttaacccatgttgtgagttga 9533544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 12511482 - 12511268
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  12511482 gttagatttccagtggctttggtttgatgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaa 12511383  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  12511382 ttcagcataactgtttcttagttaatccaaaacttatggaataattccaaaccttaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatt 12511283  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||| | ||||||||    
T  12511282 taacatgtgttgtga 12511268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 14763376 - 14763598
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  14763376 tttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatga 14763475  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14763476 aaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagt 14763575  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttga 223  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  14763576 atttaacccatgttgtgagttga 14763598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Original strand, 10541875 - 10542090
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10541875 tgttatctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatcatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 10541974  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||    
T  10541975 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaacagtat 10542074  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||| | ||||||||    
T  10542075 ttaacatgtgttgtga 10542090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 22307001 - 22307215
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  22307001 gttatctttccagtgactttggtttgacgtgaaaatgatttttgattattgagatatgatgaaaatactcgaaggaggtcttactgaaatcctatgaaaa 22307100  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  22307101 ttcagcataaccgtttctaagttaatcccaaacttaaggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatt 22307200  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||| ||||||||||    
T  22307201 taacttatgttgtga 22307215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 23371122 - 23371344
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  23371122 tttgttagctttccaatggctttggtttgactataaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatga 23371221  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23371222 aaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaactggtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagt 23371321  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttga 223  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  23371322 atttaacccatgttgtgagttga 23371344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 12470423 - 12470222
Alignment:
Q  17 tggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataacca 116  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  12470423 tggctttgatttgacgtgaaaattatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccg 12470324  T
Q  117 tttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 216  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  12470323 tttctaatttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaggggtttaagagtatttaacatgtgttgt 12470224  T
Q  217 ga 218  Q
    ||    
T  12470223 ga 12470222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 14519897 - 14519683
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14519897 tgttagctttccagtggcattggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 14519798  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |   ||||||| | ||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14519797 attctgcataactatttctaagtcaatccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 14519699  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||    
T  14519698 ttaacctatgttgtga 14519683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Original strand, 14152816 - 14153031
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  14152816 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaaagaattttggtttttgagttatgatgaaaatacttcaagaaggtcttagtgaacttttatgaaa 14152915  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||| ||||||| ||||||| || || |||||||||||||  |   ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  14152916 attccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtat 14153015  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||    
T  14153016 ttaacctatgttgtga 14153031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 41172788 - 41173003
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41172788 gttagctttccagcggctttcgtttgacgtgaaaacaattttttgttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaa 41172887  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaa-ggtgtttaagagtat 202  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  | |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||    
T  41172888 ttcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagagaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaagggggtttaagagtat 41172987  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||    
T  41172988 ttaacctatgttgtga 41173003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 18699891 - 18700105
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    ||||| |||||| |||||||  |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  18699891 gttagatttccagtggctttaatttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaa 18699990  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| | ||||||  ||||||||||||    
T  18699991 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttttggaataattccaaacctcaaaactagaagtgctaggagtttagttaagggatttaagagtatt 18700090  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||| | ||||||||    
T  18700091 taacatgtgttgtga 18700105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 16324956 - 16325177
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| | ||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  16324956 tttgttatctttccaatggatttggtttggcgtgaaaatgatttatggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatga 16325055  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |    
T  16325056 aaatttagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttatcggataatttcaaggctaaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttatgaat 16325155  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttg 222  Q
    ||||| |||| |||||||||||    
T  16325156 atttatcctaagttgtgagttg 16325177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 49900370 - 49900148
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    ||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49900370 gttagcttttcagtggatttggtttgacgtgaaaatggtttttggttattgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 49900271  T
Q  104 ttcagcataacc--------atttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgttta 195  Q
    ||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||  ||||    
T  49900270 ttcagcataaccgtttctaagtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactagaagtttaattaaggatttta 49900171  T
Q  196 agagtatttaacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||||| ||||    
T  49900170 agagtatttaacctatgtggtga 49900148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 6156340 - 6156126
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6156340 tgttagctttccagtggcgttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 6156241  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||  ||||||| |||||||||| || |||||||||||||  |   ||||||| | ||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6156240 atttcgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 6156142  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||    
T  6156141 ttaacctatgttgtga 6156126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Original strand, 50755799 - 50756013
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  50755799 tgttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggtggtcttagtgaaattttatgaaa 50755898  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || |||||| ||||||  |   ||||||| | ||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50755899 attccgcataactatttctaagtcaacccaaaatttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 50755997  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||    
T  50755998 ttaacctatgttgtga 50756013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 51301032 - 51300810
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||  ||  ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  51301032 tttgttagctttccaatggatttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggatttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatga 51300933  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  51300932 aaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaactggtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgtaattaaggtgtttaagagt 51300833  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttga 223  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  51300832 atttaacccatgttgtgagttga 51300810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Original strand, 9511583 - 9511797
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9511583 tgttagctttccagtggctttggtttgacttcaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 9511682  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat-tccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagta 201  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||  | ||||||| | |||||| |  |||||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  9511683 attccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttat-ggatcgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagattaattaaggtgcttaagagta 9511780  T
Q  202 tttaacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||||    
T  9511781 tttaacctatgttgtga 9511797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Original strand, 9519558 - 9519772
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9519558 tgttagctttccagtggctttggtttgacttcaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 9519657  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat-tccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagta 201  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||  | ||||||| | |||||| |  |||||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  9519658 attccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttat-ggatcgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagattaattaaggtgcttaagagta 9519755  T
Q  202 tttaacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||||    
T  9519756 tttaacctatgttgtga 9519772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 14671459 - 14671244
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| |||  | | |||||||| |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  14671459 tgttagctttccagtggtgtcgatttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaa 14671360  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||    
T  14671359 attcagcataactgtttgtaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaacagtat 14671260  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||| | ||||||||    
T  14671259 ttaacatgtgttgtga 14671244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Original strand, 54330723 - 54330937
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54330723 tgttagctttccagtggctttggtttgatttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 54330822  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||| ||||||| |||| || || || |||||||||||||  |   ||||||| | ||| || |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54330823 attccgcataactatttttaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 54330921  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||    
T  54330922 ttaacctatgttgtga 54330937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 202
Target Start/End: Original strand, 26055045 - 26055244
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||   ||||| |||| | ||| |||| || | |||||  |||||||||||||||||    
T  26055045 tgttagctttctaatgcctttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtaaaattactgcacgtaggtcacagtgaaatcttatgaaa 26055144  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26055145 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 26055244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 24546475 - 24546257
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga-- 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||      
T  24546475 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaattttatgaaa 24546376  T
Q  101 --aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaaga 198  Q
      |||||| ||||||| |||||||||| || |||||||| ||||  |   ||||||| | ||| |  |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24546375 ttaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaactcatggattgtctccaaacttcaaagcctg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaaga 24546277  T
Q  199 gtatttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  24546276 gtatttaacctatgttgtga 24546257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 25 - 174
Target Start/End: Original strand, 14567651 - 14567800
Alignment:
Q  25 gtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaag 124  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14567651 gtttgaattgaaaatgacatttagtttttgatttatgatcaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaag 14567750  T
Q  125 ttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtacta 174  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14567751 ttaatccaaaacttatgaaataattccaaacctcaaaactagaagtacta 14567800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 5223765 - 5223566
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||| |||| | ||||| |||| | |||| ||||| |||   ||||| |||||| ||| |||| || | |||||  |||||||||||||||||    
T  5223765 tgttagctttctaatgccattggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgatcaaattactccacgtaggtcacagtgaaatcttatgaaa 5223666  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5223665 attcagcataaccatttctaagttaatcaaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 5223566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 15465536 - 15465337
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||| |||| | ||||| |||| | |||| ||||| |||   ||||| |||| | ||| |||| || | |||||  |||||||||||||||||    
T  15465536 tgttagctttctaatgccattggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaaatcttatgaaa 15465437  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15465436 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 15465337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 15566148 - 15565935
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  15566148 tgttagctttccagtggcatcagtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcatagtgaaattttatgaaa 15566049  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||  ||||||| |||||||||| || |||||||||||||  |   ||||||| | ||| |   |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15566048 atttcgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagc-ctatttactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 15565950  T
Q  203 ttaacctatgttgtg 217  Q
    |||||||||||||||    
T  15565949 ttaacctatgttgtg 15565935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 17938163 - 17937949
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||    
T  17938163 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgatttatgatgaaaatactctaaggaggtcttagtgaaattttacga 17938064  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| || ||||| |||||||  |  |||||||| | |||  | |   || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17938063 aaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaccttatggattgtttccaaactttaaagtttg-tttattatgagttcaattaagg-gtttaagagt 17937966  T
Q  201 atttaacctatgttgtg 217  Q
    |||||||||| ||||||    
T  17937965 atttaacctaggttgtg 17937949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18739530 - 18739325
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  18739530 tgttagctttccaatggctttggtttcactttaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttacgaaa 18739431  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || ||||| |||||||  |  |||||||| | |||  | |   || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18739430 attccgcataactatttctaagtcaacccaaaccttatggattgtttccaaactttaaagtttg-tttattatgagttcaattaagg-gtttaagagtat 18739333  T
Q  203 ttaaccta 210  Q
    ||||||||    
T  18739332 ttaaccta 18739325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 217
Target Start/End: Original strand, 25104620 - 25104832
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  25104620 tgttagctttccagtggctttgatttgacttgaaa-tgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaaattttacgaaa 25104718  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||| ||||||| ||||| |||| || |||||||||||||  |  |||||||| | |||| | |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25104719 attccgcataactatttccaagtcaacccaaaacttatggattgtttccaaacttcaaaatttg-tgtactatcagttcaattaaggtgtttaagagtat 25104817  T
Q  203 ttaacctatgttgtg 217  Q
    ||||| |||||||||    
T  25104818 ttaacttatgttgtg 25104832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 5215281 - 5215156
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5215281 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactacaaggaggtcttagtgaaatcttgtgaaaa 5215182  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaat 129  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  5215181 ttcagcataaccgtttctaagttaat 5215156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 17046760 - 17046631
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17046760 gttagatttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaa 17046661  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaa 133  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17046660 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaa 17046631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 12952669 - 12952462
Alignment:
Q  10 tttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagc 109  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||    
T  12952669 tttccattggctttggtttgacttgaaactgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttacgaaaatcccgc 12952570  T
Q  110 ataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacct 209  Q
    ||||| ||||| |||| || ||||||||||| |  |   ||||||| | ||| || |  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12952569 ataactatttcaaagtcaacccaaaacttatagattgtgtccaaacttcaaatcttg-tgttctatgagctcaattaaggtgtttaagagtatttaacct 12952471  T
Q  210 atgttgtga 218  Q
    |||||||||    
T  12952470 atgttgtga 12952462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 51603015 - 51603127
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51603015 tttgttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatga 51603114  T
Q  101 aaattcagcataa 113  Q
    |||||||| ||||    
T  51603115 aaattcagtataa 51603127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 17207975 - 17207766
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  17207975 tgttagctttccagtggctttggttttaattgcaaatgaattttggtttt-gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatgttatgaaa 17207877  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||| |  |   ||||||| | ||| || |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17207876 attccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttattgattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaaataaggtgtttaagagtat 17207778  T
Q  203 ttaacctatgtt 214  Q
    ||||||||||||    
T  17207777 ttaacctatgtt 17207766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 19568826 - 19568941
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |    
T  19568826 tttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaagcaggtcttagtgaaatcttagca 19568925  T
Q  101 aaattcagcataacca 116  Q
    |||||||| |||||||    
T  19568926 aaattcagtataacca 19568941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 60 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 22652409 - 22652248
Alignment:
Q  60 tgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaa 159  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| || || |||||||||||||  |   ||||||| | |    
T  22652409 tgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtatccaaacttca 22652310  T
Q  160 aaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttg 222  Q
    || || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22652309 aagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttg 22652248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 120 - 246
Target Start/End: Original strand, 52989492 - 52989618
Alignment:
Q  120 ctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgag 219  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  52989492 ctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgag 52989591  T
Q  220 ttgatcttgggatatgaatgaaagttg 246  Q
    |||||| | || || ||||||| ||||    
T  52989592 ttgatccttgggtaggaatgaaggttg 52989618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 46723041 - 46723149
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  46723041 tttgttagctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttactaaaatcttatga 46723140  T
Q  101 aaattcagc 109  Q
    |||||||||    
T  46723141 aaattcagc 46723149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 119 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 11258986 - 11258887
Alignment:
Q  119 tctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11258986 tctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 11258887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 14647518 - 14647609
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaa 92  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  14647518 tttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttaatgaaa 14647609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 8631377 - 8631257
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||| ||||| |||||| ||| ||||    
T  8631377 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgttgaaaacactccaaggagatcttattgaaattttacgaaa 8631278  T
Q  103 attcagcataaccatttctaa 123  Q
    |||| | ||||| | ||||||    
T  8631277 attccgtataactaattctaa 8631257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 15465729 - 15465631
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 101  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  15465729 tgttagctttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 15465631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 12305699 - 12305599
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  12305699 tttgttagctttccaatgactttagtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatga 12305600  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  12305599 a 12305599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 5223958 - 5223860
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 101  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  5223958 tgttagctttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgcgatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 5223860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 120 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 14682841 - 14682743
Alignment:
Q  120 ctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||    
T  14682841 ctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaacagtatttaacatgtgttgtga 14682743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 8023857 - 8023718
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||| |||| || ||| ||| | | ||||    
T  8023857 tgttagctttctaatggcttgggtttgacttaaaaatgatttctagattttgagttatgatgaaaatactacaagtaggttttggtgcaatttaacgaaa 8023758  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 142  Q
    ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||||    
T  8023757 atttagcataactatttttaagtcaacccaaaacttatgg 8023718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 54521399 - 54521309
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaa 91  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54521399 tttgttagctttccaatggctttaattttactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaa 54521309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 101
Target Start/End: Original strand, 29544431 - 29544527
Alignment:
Q  5 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 101  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||    
T  29544431 ttagctttccaatggctttaatttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtgaatttttatgaa 29544527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 92
Target Start/End: Original strand, 11986837 - 11986912
Alignment:
Q  17 tggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaa 92  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  11986837 tggctttggtttgacttgaaaatgatctttagtttttgagttatgatgaaaatactacaagggggtcttagtgaaa 11986912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 13436874 - 13436799
Alignment:
Q  2 ttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaag 77  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13436874 ttgttagctttccaatggatttggtttggcttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaag 13436799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 159 - 218
Target Start/End: Original strand, 19568941 - 19569000
Alignment:
Q  159 aaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19568941 aaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 19569000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 101
Target Start/End: Original strand, 26054852 - 26054950
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 101  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  26054852 tgttagctttccagtggcttcggttttacatgaaaatgatttttggtgtttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 26054950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 101
Target Start/End: Original strand, 22764048 - 22764145
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 101  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| | |||||||    
T  22764048 gttagcttttcagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtagatcttagtgaatttttatgaa 22764145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 11259064 - 11258984
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtct 84  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11259064 gttagctttccagtggctttggtttgatgtgaaaatgatttttggctcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtct 11258984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Original strand, 28848207 - 28848307
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  28848207 tttgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatga 28848306  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  28848307 a 28848307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 6002582 - 6002443
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||| | | ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||| |||   ||    
T  6002582 tgttatctttccaatggcgttagtttgacttgaaaatgttttgtggattttgagttatgatgaaaacacttcaagtaggtcttggggaaattttaaagaa 6002483  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 142  Q
    ||| |||||||| ||||| |||| | ||||| ||||||||    
T  6002482 atttagcataactatttccaagtcattccaatacttatgg 6002443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 15978109 - 15978009
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | | | ||||||| |||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  15978109 tttgttagctttccaatggctttggtggggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatga 15978010  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  15978009 a 15978009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 36528154 - 36528062
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaat 93  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||  ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  36528154 tttgtcagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgattcttggtgtttgatttatgatgaaaataccccaaggaggtcttagcgaaat 36528062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18893063 - 18893009
Alignment:
Q  165 agaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgag 219  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18893063 agaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgag 18893009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 40039759 - 40039900
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||  ||| | | ||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||   ||||| ||| |     
T  40039759 tttgttatcttttcaatggatttggtttgacttgaaaatattttatggattttgagttatgatgaaaacacttcaagagggtcttgaagaaattttaagg 40039858  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 142  Q
    ||| | |||||||| ||||| |||| || |||||||||||||    
T  40039859 aaacttagcataactatttccaagtcaacccaaaacttatgg 40039900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Original strand, 7780932 - 7781032
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||| || | ||||  | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  7780932 tttgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttctggtttaggcgttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatga 7781031  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  7781032 a 7781032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 91
Target Start/End: Original strand, 16453869 - 16453955
Alignment:
Q  5 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaa 91  Q
    |||||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  16453869 ttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaa 16453955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 17046630 - 17046582
Alignment:
Q  170 tactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 218  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17046630 tactattagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 17046582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 210 - 267
Target Start/End: Original strand, 11886294 - 11886352
Alignment:
Q  210 atgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttg-ttattaagttatagacttaca 267  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  11886294 atgttgtgagttgatcttgggataggaatggaagttgtttattaagttatagatttaca 11886352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 101
Target Start/End: Original strand, 10247312 - 10247409
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 101  Q
    ||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||| |||| || | |||| | ||| |||| || ||||||||||||||| | |||||||    
T  10247312 gttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgtgttatggtcaaattactgcacggaggtcttagtgaatttttatgaa 10247409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 3264725 - 3264817
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaat 93  Q
    ||||||||||| ||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||  | |||||  | ||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  3264725 tttgttagcttcccagtggccatggtttgacgtgaaaatgatttttgatgtttgatttgtgatgaaaataccccaaggaggtcttagcgaaat 3264817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 131 - 218
Target Start/End: Original strand, 42353218 - 42353306
Alignment:
Q  131 caaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggt-gtttaagagtatttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||| ||||| | ||||| || ||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42353218 caaaacttagggaataattctaaacctcaaaacaaaaagtattaggagtttaattaagggagtttaagagtatttaacgtatgttgtga 42353306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 218
Target Start/End: Original strand, 14568649 - 14568691
Alignment:
Q  176 gagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14568649 gagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacctatgttgtga 14568691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 34159900 - 34159842
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatg 61  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  34159900 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 34159842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 54039165 - 54039227
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgat 63  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||   ||||||||||||    
T  54039165 tttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgat 54039227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 4656286 - 4656182
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| | ||  ||||| | |||||||| |||||| |||| | |||||  | |||| ||| ||||    
T  4656286 tgttagctttcccatgactttggtttggcttgaaaatgatgtctatattttgggttatgatgacaatactccaagtatgtcttgataaaattttacgaaa 4656187  T
Q  103 attca 107  Q
    |||||    
T  4656186 attca 4656182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 30152518 - 30152450
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatact 72  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||  |||||| |||||| ||| ||||    
T  30152518 gttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaatttgagttatgatcaaattact 30152450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 5 - 72
Target Start/End: Original strand, 8276516 - 8276583
Alignment:
Q  5 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatact 72  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||   |||||||||||| ||| ||||    
T  8276516 ttagctttctaatggctttggtttgacgtcgaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 8276583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 14284650 - 14284519
Alignment:
Q  11 ttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagca 110  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||||  ||||||||  | |||||| ||| | |||  ||| |||||||| |||    
T  14284650 ttccattggccttggtttgacttgaaaataatgttttgtttttgagttatgaataaaatactctacggaggttttaataaaactttacgaaaattccgca 14284551  T
Q  111 taaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 142  Q
     ||   ||||||||| || ||||| |||||||    
T  14284550 caattgtttctaagtcaacccaaaccttatgg 14284519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 17956867 - 17956914
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttag 48  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||    
T  17956867 tttgttagctttccaatggctttggtttgacatctaaatgatatttag 17956914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 267
Target Start/End: Original strand, 12512441 - 12512499
Alignment:
Q  210 atgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagtt-gttattaagttatagacttaca 267  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  12512441 atgttgagagttgatcttggggtagaaatgaaagttagttattaagttacagacttaca 12512499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 17463752 - 17463694
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatg 61  Q
    |||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  17463752 tgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 17463694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 55477065 - 55477023
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttt 45  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  55477065 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttt 55477023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 48
Target Start/End: Original strand, 14528665 - 14528710
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttag 48  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  14528665 tgttagctttctaatggatttggtttgacttccaaatgatttttag 14528710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 17393290 - 17393245
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttag 48  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  17393290 tgttacctttccaatggcgttggtttgactccaaaatgatttttag 17393245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 213
Target Start/End: Original strand, 37917146 - 37917211
Alignment:
Q  148 ttccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgt 213  Q
    |||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  37917146 ttccaaacttcaaaactataagtattaggagtttaattaagaggtttaagagcatttaacctatgt 37917211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 48
Target Start/End: Original strand, 51158684 - 51158729
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttag 48  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  51158684 tgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttag 51158729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 17759073 - 17759149
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaag 77  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||  ||| | | ||||||| |||||| |||| ||| ||||    
T  17759073 tttgttagcttttcaatggatttggtttgacttaaaaattgtttgtggattttgagttatgataaaaacactccaag 17759149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 19060393 - 19060469
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaag 77  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||  ||| | | ||||||| |||||| |||| ||| ||||    
T  19060393 tttgttagcttttcaatggatttggtttgacttaaaaattgtttgtggattttgagttatgataaaaacactccaag 19060469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 243; Significance: 1e-135; HSPs: 98)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 9638644 - 9638378
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9638644 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatga 9638545  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9638544 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaatctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 9638445  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagacttaca 267  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9638444 atttaatctatgttgtgagttgatcttgggataggaatggaagttgttattaagttatagacttaca 9638378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 3 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 10705133 - 10704869
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10705133 tgttagctttccaatggctctggcttgacttgaaaataattttttgtttttgagatatgatgaaaatattgcaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaa 10705034  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10705033 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 10704934  T
Q  203 ttaacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagacttaca 267  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  10704933 ttaacccatgttgtgagttgatcttgggataggaatggaagttgttaataagttatagacttaca 10704869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 3 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 10918903 - 10918639
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10918903 tgttagctttccaatggctctggcttgacttgaaaataattttttgtttttgagatatgatgaaaatattgcaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaa 10918804  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10918803 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 10918704  T
Q  203 ttaacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagacttaca 267  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  10918703 ttaacccatgttgtgagttgatcttgggataggaatggaagttgttaataagttatagacttaca 10918639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 3337736 - 3337519
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3337736 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagttttcaatatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatga 3337637  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3337636 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 3337537  T
Q  201 atttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||||    
T  3337536 atttaacctatgttgtga 3337519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 630318 - 630557
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  630318 tttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatga 630417  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  630418 aaattcagcataaccgtttctaatttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 630517  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgat-cttgggatatgaatg 239  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  630518 atttaacccatgttgtgagttgatccttggggtatgaatg 630557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 4 - 267
Target Start/End: Original strand, 15447834 - 15448092
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15447834 gttagctttctattggctttggtctgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 15447933  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15447934 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactggaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 15448033  T
Q  204 taacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagacttaca 267  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||     ||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  15448034 taacccatgttctgagttgatcttgg-----gaatggaagttgtaaataagttatagacttaca 15448092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 4 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 15990673 - 15990455
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15990673 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 15990574  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15990573 ttcagcacaaccatttctaagttaatctaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagattatt 15990474  T
Q  204 taacctatgttgtgagttg 222  Q
    |||||||||||||||||||    
T  15990473 taacctatgttgtgagttg 15990455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 10694664 - 10694883
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10694664 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaataatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactctaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 10694763  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10694764 attcagcataaccatttctaagttattccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagattat 10694863  T
Q  203 ttaacctatgttgtgagttg 222  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  10694864 ttaacctatgttgtgagttg 10694883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 10908430 - 10908649
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10908430 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaataatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactctaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 10908529  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10908530 attcagcataaccatttctaagttattccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagattat 10908629  T
Q  203 ttaacctatgttgtgagttg 222  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  10908630 ttaacctatgttgtgagttg 10908649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 56115251 - 56115498
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  56115251 tttgttagctttccaatggctttgatttgacttgaaaatgatttttagtttttaagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatga 56115350  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  56115351 aaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaagcagaagtactatgagttctattaaggtgtttaagagt 56115450  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttg-atcttgggatatgaatgaaagttgt 247  Q
    |||||| | ||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||    
T  56115451 atttaatccatgttgtgagttgaaccttgggatagcaatgaaagttgt 56115498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12611485 - 12611264
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  12611485 gttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaacgaggtcttagtgaaaccttatgaaaa 12611386  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12611385 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 12611286  T
Q  204 taacctatgttgtgagttgatc 225  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  12611285 taacccatgttgtgagttgatc 12611264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 15008601 - 15008382
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15008601 tgttagctttccagtggctttggttttacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 15008502  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15008501 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatggcataattcgaaacctcaaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 15008402  T
Q  203 ttaacctatgttgtgagttg 222  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  15008401 ttaacctatgttgtaagttg 15008382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 225
Target Start/End: Original strand, 23802882 - 23803103
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23802882 gttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatgtgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaa 23802981  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23802982 tttagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 23803081  T
Q  204 taacctatgttgtgagttgatc 225  Q
    ||||| ||||| ||||||||||    
T  23803082 taacccatgttatgagttgatc 23803103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 6 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 40620162 - 40619946
Alignment:
Q  6 tagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaatt 105  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40620162 tagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaatgaggtcttagtgaaatcttatgaaaatt 40620063  T
Q  106 cagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattta 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  40620062 cagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaatctcaaaactagaagtactatgagttaaattaaggtgtttaagagtattat 40619963  T
Q  206 acctatgttgtgagttg 222  Q
    |||||||||||||||||    
T  40619962 acctatgttgtgagttg 40619946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 35660483 - 35660266
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  35660483 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatga 35660384  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  35660383 aaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttatggaataatctcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaagtgtttaagagt 35660284  T
Q  201 atttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||||    
T  35660283 atttaacctatgttgtga 35660266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 33849379 - 33849132
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33849379 tttgttagctttccaatggctttggtttgaatcgaaaatgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatga 33849280  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33849279 aaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttacgagt 33849180  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatc-ttgggatatgaatgaaagttgt 247  Q
    |||||| | |||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||    
T  33849179 atttaatccatgttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttgt 33849132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 225
Target Start/End: Original strand, 51463485 - 51463706
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51463485 gttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtctaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaa 51463584  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  51463585 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaatttatgcgataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaggcgtttaagagtatt 51463684  T
Q  204 taacctatgttgtgagttgatc 225  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  51463685 taacccatgttgtgagttgatc 51463706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 10057109 - 10056885
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  10057109 tttgttagctttccaatggcattggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactctaaggaggtcttagtgaaattttatga 10057010  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  10057009 aaattcagcataacagtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaatctagaagtaccaggagttcaattaaggtgtttaagagt 10056910  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatc 225  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||    
T  10056909 atttaacatatgttatgagttgatc 10056885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 19609958 - 19609744
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19609958 gttacctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 19609859  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  19609858 ttcagcataaccgtttctaaattaatccaaaacttaaggtataattccaaacctcaaaactagaagtactatcagttcaactagggtgtttaagagtatt 19609759  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||    
T  19609758 taacctatgttgtga 19609744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 24046949 - 24047171
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||  | | |||||||||||||| |||||||    
T  24046949 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgattcttggtttttgagttatgatggaaatactctaggtaggtcttagtgaaaccttatga 24047048  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24047049 aaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagt 24047148  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttga 223  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  24047149 atttaacccatgttgtgagttga 24047171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 25091287 - 25091073
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25091287 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 25091188  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  25091187 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcgaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatt 25091088  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    ||||| |||||||||    
T  25091087 taaccaatgttgtga 25091073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 53630891 - 53631105
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  53630891 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaatgaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 53630990  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  53630991 ttcggcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcaaaacctcaaaactagaagtattatgagttcaattagggtgtttaagagtatt 53631090  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||    
T  53631091 taacctatgttgtga 53631105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 33186538 - 33186298
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  33186538 tttgttagctttccagtggctttggtttgactcgaaaataatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttagga 33186439  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||| || |||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33186438 aaatttagtataacattttctaagttagtccaaaacttatggaataactccaaccctcaaaattagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 33186339  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaa 241  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  33186338 gtttaacctatgttgtgagttgatcttggtataggaatgaa 33186298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18213203 - 18212981
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  18213203 tttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatga 18213104  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18213103 aaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagt 18213004  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttga 223  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  18213003 atttaacccatgttgtgagttga 18212981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 10356854 - 10357068
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10356854 gttagctttccagtggctttggtgtgacatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatacaccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 10356953  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  10356954 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtattatgagttcaactagggtgtttaagagtatt 10357053  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||    
T  10357054 taacctatgttgtga 10357068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 37019303 - 37019089
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37019303 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 37019204  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  37019203 ttcagcataatcgtttataagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgggttcaactaaggtgtttaagagtatt 37019104  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||| |||||    
T  37019103 taacctatgctgtga 37019089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 33243711 - 33243928
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  33243711 tttgttagctttccaatgattttgatttgacttgaaaataatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaaggggtcttagtgaaatcttatga 33243810  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  33243811 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggatgattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattgaggtgtttaagagt 33243910  T
Q  201 atttaacctatgttgtga 218  Q
    |  |||||||||||||||    
T  33243911 agctaacctatgttgtga 33243928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 16277742 - 16277961
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  16277742 tttgttagctttccaacggctttggtttgactcgaaaatgatttttggtttttgagttatcatgaaaatactccaaggaggttttactgaaatcttatga 16277841  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  16277842 aaattcagcataaccctttttaagttaatccaaaacttatgggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtctaagagt 16277941  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagt 220  Q
    |||||||| ||||| |||||    
T  16277942 atttaacccatgttatgagt 16277961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 53387352 - 53387571
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  53387352 tttgttagctttccaatggatttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatcatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatga 53387451  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  53387452 aaattcagcataaccctttttaagttaatccaaaacttatgggataattccaagactcaaaattagaagtaatatgagttcaattaaggtgtctaagagt 53387551  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagt 220  Q
    |||||||| ||||| |||||    
T  53387552 atttaacccatgttatgagt 53387571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 42875433 - 42875219
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42875433 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaataatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 42875334  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  42875333 ttcagcgtaactgtttctaagttaatccaaaacttaatgaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaggagtatt 42875234  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||    
T  42875233 taacctatgttgtga 42875219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16998160 - 16997950
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16998160 tgttagctttccagtggctttggtttgacttaaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 16998061  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||     |||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  16998060 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaa-----aagtactatgagttgaactagggtgtttaagagtat 16997966  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||    
T  16997965 ttaacctatgttgtga 16997950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 14549260 - 14549046
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  14549260 gttagctttccagtggctttggtttgatgtgaaaatgagttttggttcttgagatatgatgaaagtactccatggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 14549161  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  14549160 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaagactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatt 14549061  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    || ||||||||||||    
T  14549060 tagcctatgttgtga 14549046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 19435112 - 19435330
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||    
T  19435112 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattatatga 19435211  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaa-ggtgtttaagag 199  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | || |||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||    
T  19435212 aaattcagcataaccgtttctaagtcagtctaaaatttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaagggggtttaagag 19435311  T
Q  200 tatttaacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19435312 tatttaacctatgttgtga 19435330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9923831 - 9923622
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9923831 tgttagctttccggtggctttagtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 9923732  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |    
T  9923731 attcagcctaacagtttctaagttaatccaaaacttatggaatgattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaatagtgt 9923632  T
Q  203 ttaacctatg 212  Q
    ||||||||||    
T  9923631 ttaacctatg 9923622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 11479028 - 11479237
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  11479028 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaggtcttagtgaaattttatgaaa 11479127  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||    
T  11479128 attcagcctaacagtttccaagttaatccaaaacttatggaatgattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagattat 11479227  T
Q  203 ttaacctatg 212  Q
    ||||||||||    
T  11479228 ttaacctatg 11479237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 15114856 - 15114648
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  15114856 gttagatttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactcaaagtaggtcttagtgaaat-ttatgaaaa 15114758  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  15114757 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaaccttaaaactagaagtactaggagtttaattaaggagtttaagagtatt 15114658  T
Q  204 taacctatgt 213  Q
    ||||||||||    
T  15114657 taacctatgt 15114648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 28385880 - 28385659
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  28385880 tttgttagctttccaatgactctggtttggcgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatga 28385781  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  28385780 aaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagt 28385681  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttg 222  Q
    |||||||| | |||||||||||    
T  28385680 atttaacccaagttgtgagttg 28385659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 170
Target Start/End: Original strand, 15011931 - 15012097
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  15011931 gttagctttcccgtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttagttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaa 15012030  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagt 170  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  15012031 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagt 15012097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 11425579 - 11425375
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| | |||||||||| || || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||          |    
T  11425579 gttagctttccagtagctttggttttacgtgcaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatattccaaggaggtcttagtgaaa----------a 11425490  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  11425489 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactattagttcaattagggtgtttaagagtatt 11425390  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||    
T  11425389 taacctatgttgtga 11425375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Original strand, 19566336 - 19566550
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||    
T  19566336 tgttagctttccagtggctttggtttgaattgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaattttgtgaaa 19566435  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||  |   ||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19566436 attctgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 19566534  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||    
T  19566535 ttaacctatgttgtga 19566550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 14630461 - 14630246
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||  ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14630461 tgttagttttccagtggctttggtttgacttaaaaattattttcggttcttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 14630362  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    | || ||||||| ||||||| || || |||||||||||||  |   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  14630361 aatccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagtgtat 14630262  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||    
T  14630261 ttaacctatgttgtga 14630246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 217
Target Start/End: Original strand, 10237915 - 10238128
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10237915 tgttagctttccagtggcgttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 10238014  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||  |  |||||||| | |||||| |  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  10238015 attccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtttccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttaaattaatgtgtttaagagtat 10238113  T
Q  203 ttaacctatgttgtg 217  Q
    |||| ||| ||||||    
T  10238114 ttaagctacgttgtg 10238128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15344510 - 15344301
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15344510 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 15344411  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || || ||||||||||  |   ||||||  | ||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15344410 attccgcataactatttctaagtcaaccccaaacttatggattgtctccaaa-ttcaaagct-tatgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 15344313  T
Q  203 ttaacctatgtt 214  Q
    ||||||||||||    
T  15344312 ttaacctatgtt 15344301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 15214460 - 15214672
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| || |||  |||| | ||||| || || | ||||||    
T  15214460 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttaaaaatgatttttggattttgagatatgatggaattaccccaagcaagtcttggtaaatttttatga 15214559  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||  ||||| ||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||    
T  15214560 aaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttattgaatatttccaaacctcgaaactggaagtactaggagtttaattaagaggtttaagagt 15214659  T
Q  201 atttaacctatgt 213  Q
    |||||||||||||    
T  15214660 atttaacctatgt 15214672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 25513377 - 25513163
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25513377 tgttagctttccattgactttggttcgacttgaaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 25513278  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
     ||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |   | ||||||| ||| || |  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  25513277 gttccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgggttgtcttcaaacctcaaagcttg-tgtactacgagttcaattacggtgtttaagaatat 25513179  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||    
T  25513178 ttaacctatgttgtga 25513163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 146 - 267
Target Start/End: Original strand, 9871126 - 9871247
Alignment:
Q  146 aattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagtt 245  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  9871126 aattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtttatcttgggataggaatggaagtt 9871225  T
Q  246 gttattaagttatagacttaca 267  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  9871226 gttattaagttatagacttaca 9871247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 40229938 - 40229727
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtctt-agtgaaatcttatgaa 101  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  40229938 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttataatgaaaatactccaaggaggtcttaagtgaaattttatgaa 40229839  T
Q  102 aattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagta 201  Q
    ||||| ||||||  ||||||| || || |||||||||||||  |   ||||||| | ||| || |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40229838 aattctgcataattatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtatttaagagta 40229740  T
Q  202 tttaacctatgtt 214  Q
    |||||||||||||    
T  40229739 tttaacctatgtt 40229727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 88 - 222
Target Start/End: Original strand, 15883917 - 15884051
Alignment:
Q  88 tgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaa 187  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15883917 tgaaattttatgaaaatttagcataaccgtttctaagttgatccaaaacttagggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaa 15884016  T
Q  188 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttg 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15884017 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttg 15884051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 26445518 - 26445305
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  26445518 gttagctttccagtagctttggtttgaattgaaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaa 26445419  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    ||  | ||||| |||||||||| || |||||||||||||  |   ||||||| | ||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26445418 tttcggataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgatttcaattaaggtgtttaagagtatt 26445320  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||    
T  26445319 taacctatgttgtga 26445305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Original strand, 44024021 - 44024231
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44024021 tgttagatttcccgtggctttggtttgacttgaaaataatttttggtttctgagttattatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 44024120  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||| |||||||  |||||| || || |||||||||||||  |   ||||||| | ||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44024121 attccgcataactgtttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 44024219  T
Q  203 ttaacctatgtt 214  Q
    ||||||||||||    
T  44024220 ttaacctatgtt 44024231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 2425039 - 2425252
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||     
T  2425039 gttagctttccagtggctttagtttgacttgaaaatgatttttgctttttgagttatgatgaaactactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaat 2425138  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    ||| ||||||| ||||||| || || |||||||||||||  |   ||||||  | |||  | |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2425139 ttccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaaattcaaaggttg-tgcactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 2425237  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||    
T  2425238 taacctatgttgtga 2425252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 3485521 - 3485331
Alignment:
Q  25 gtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaag 124  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  3485521 gtttgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaattgtta--aaaattcagcataaccgtttctaag 3485424  T
Q  125 ttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||  || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  3485423 ttaatccaaaacttagggaataattcc-aaccccaagactagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatctagcatatgttgtga 3485331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 46740835 - 46740623
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||| ||| || ||||||||||||| || |||    
T  46740835 tttgttagctttccagtgactttggtttgacttgaaaatgatgtttggtttttgagttatgataaaaatactccaaagacgtcttagtgaaattttgtga 46740736  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||| ||||||| ||||||| || || |||||||||||||  |   ||||||| | ||| || |  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  46740735 aaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaagatgtttaagagt 46740637  T
Q  201 atttaacctatgtt 214  Q
    ||||||||||||||    
T  46740636 atttaacctatgtt 46740623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 6 - 218
Target Start/End: Original strand, 16026349 - 16026559
Alignment:
Q  6 tagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaatt 105  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16026349 tagctttccagtggcttcagtttgacttgaaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaatt 16026448  T
Q  106 cagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattta 205  Q
    | ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||  |   | ||||| | |||  | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16026449 ccgcataagtatttctaagttaacccaaaacttatggattgtctacaaacttcaaagtttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagta-tta 16026546  T
Q  206 acctatgttgtga 218  Q
    ||| |||||||||    
T  16026547 acccatgttgtga 16026559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Original strand, 20595850 - 20596056
Alignment:
Q  5 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 104  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  20595850 ttagctttctaatggctttggtttgacatgaaaataatttttagattttgagttatgatgaaaatacttcaagtaggtcttggtgaaattttacgaaaat 20595949  T
Q  105 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 204  Q
    |||||||||  |||| ||||| || || ||||||||||  | || |||||||| |||||| | |||  || ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  20595950 tcagcataattatttgtaagtcaaccccaaacttatggtttgatgccaaacctcaaaacttg-agttataggagttcaattatgatgtttaagagtattt 20596048  T
Q  205 aacctatg 212  Q
    ||||||||    
T  20596049 aacctatg 20596056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Original strand, 45314754 - 45314964
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||   || ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45314754 tgttagatttccagtggctttggtttgacttgagtctggtttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 45314853  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || ||||||||| |||  |   ||||||| | ||| || |  | | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45314854 attccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttgtggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgcattatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 45314952  T
Q  203 ttaacctatgtt 214  Q
    ||||||||||||    
T  45314953 ttaacctatgtt 45314964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 55582826 - 55582703
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  55582826 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatgtttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaattttatgaaa 55582727  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagtt 126  Q
    |||| ||||||| |||||||||||    
T  55582726 attccgcataactatttctaagtt 55582703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 22725500 - 22725608
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  22725500 tttgttagctttccaaaggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaagtcttactgaaatcttatga 22725599  T
Q  101 aaattcagc 109  Q
    |||||||||    
T  22725600 aaattcagc 22725608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 13046060 - 13046201
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |  ||||||||||||||| |||| ||||||| || |||| ||| ||    
T  13046060 tttgttagctttccaatgcctttggtttgacttgaaaatgatttttatatttttatttatgatgaaaatactccaagtaggtcttggtaaaattttacga 13046159  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 142  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | || |||||| ||||||    
T  13046160 aaattcaacataaccatttctaaatcaacccaaaagttatgg 13046201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 15534758 - 15534658
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  15534758 tttgttagctttccaatggctttagtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatga 15534659  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  15534658 a 15534658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 77 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 14508322 - 14508182
Alignment:
Q  77 ggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatg 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| || || |||||||||||||  |   ||||||| | ||| || |  ||||||||    
T  14508322 ggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaactttaaagcttgt-gtactatg 14508224  T
Q  177 agttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14508223 agttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 14508182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 14049154 - 14049054
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  14049154 tttgttagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatatttggtttttgagatatcataaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatga 14049055  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  14049054 a 14049054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 140 - 247
Target Start/End: Original strand, 43251116 - 43251225
Alignment:
Q  140 tgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtg-tttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatc-ttgggatatgaa 237  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||  ||    
T  43251116 tgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgttttaagagtatttaatccatgttgtgagttgaactttgggataacaa 43251215  T
Q  238 tgaaagttgt 247  Q
    ||||||||||    
T  43251216 tgaaagttgt 43251225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 30147492 - 30147392
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||    
T  30147492 tttgttagctttccaatggctttggttttacttaaaaatgatttttaacttttgagatatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaatttttatga 30147393  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  30147392 a 30147392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 125
Target Start/End: Original strand, 18108295 - 18108417
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    |||||| |||||| |||  | |||||||||| |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  18108295 tgttagatttccagtggtgtcggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaa 18108394  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagt 125  Q
    ||||||||||||  |||||||||    
T  18108395 attcagcataactgtttctaagt 18108417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 137 - 218
Target Start/End: Original strand, 13036328 - 13036409
Alignment:
Q  137 ttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 218  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13036328 ttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatattgtga 13036409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Original strand, 12033359 - 12033459
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  12033359 tttgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatga 12033458  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  12033459 a 12033459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 36038447 - 36038347
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||    
T  36038447 tttgttagctttccaatggctttaatttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgataaaaatactcaaaggaggtcttagtgaatttttatga 36038348  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  36038347 a 36038347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 44615865 - 44615765
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  44615865 tttgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatga 44615766  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  44615765 a 44615765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Original strand, 49547359 - 49547459
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||    
T  49547359 tttgttagctttccaatgactctggtttggcgtgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttaatgaatttttatga 49547458  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  49547459 a 49547459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 77 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 12622932 - 12622799
Alignment:
Q  77 ggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatg 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| || || || |||||||||||||  |   ||||||| | ||| || |  ||||||||    
T  12622932 ggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttttaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttgt-gtactatg 12622834  T
Q  177 agttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctat 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12622833 agttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctat 12622799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 14185517 - 14185427
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaat 93  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  14185517 tgttagctttccagtggctttggtgtgacttgaaaatgattcttggtttttgagttatgatgaaaatacgccaaggaggtcttagcgaaat 14185427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 137
Target Start/End: Original strand, 19081759 - 19081892
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||| ||||||| ||| ||| ||||||| | |||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| || |||| ||| |||||    
T  19081759 gttatctttccactggattttgtttgacatcaaaatgatttttaaattttgagttatgatgaaaacacttcaaggagatcttggtaaaattttacgaaaa 19081858  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaact 137  Q
    |||||||||||| |||| |||| || ||||||||    
T  19081859 ttcagcataaccgtttccaagtcaacccaaaact 19081892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Original strand, 50221925 - 50222025
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  50221925 tttgttggctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatga 50222024  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  50222025 a 50222025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 169 - 218
Target Start/End: Original strand, 26922254 - 26922303
Alignment:
Q  169 gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26922254 gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 26922303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 19243277 - 19243177
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   | || ||||||||| ||||  | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  19243277 tttgttagctttccaatggctttggtttggagtaaatatgatttttggtttaggtgttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatga 19243178  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  19243177 a 19243177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 17376081 - 17376222
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||| ||| | | ||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||   ||||| ||| |     
T  17376081 tttgttagctttccaatggatttaggtttacttgaaaatgttttgtggattttgagttatgatgaaaacacttcaagtgggtcttgaagaaattttaagg 17376180  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 142  Q
    ||| | |||||||| ||||| |||| || |||||||||||||    
T  17376181 aaacttagcataactatttccaagtcaacccaaaacttatgg 17376222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 54364105 - 54364243
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||| ||| | | ||||||| ||||||||||| ||| ||||  |||||| | ||||| ||| |     
T  54364105 tttgttagatttccaatgaatttagtttgacttgaaaatgttttgtggattttgagttatgatgaaaacactccaagtgggtcttggagaaattttaagt 54364204  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaactta 139  Q
    ||| | |||||||| ||||| |||| || ||||||||||    
T  54364205 aaacttagcataactatttccaagtcaacccaaaactta 54364243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 169 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 55582673 - 55582624
Alignment:
Q  169 gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  55582673 gtactatgagttcaattaaagtgtttaagagtatttaatctatgttgtga 55582624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 29267930 - 29267830
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| || ||   | |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||    
T  29267930 tttgttagctttccaatgactttagtgtggagtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtctcagtgaatttttatga 29267831  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  29267830 a 29267830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 210 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 51992952 - 51992894
Alignment:
Q  210 atgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttg-ttattaagttatagacttaca 267  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  51992952 atgttgtgagttgatcttgggttaggaatggaagttgtttattaagttatagacttaca 51992894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 17146318 - 17146389
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatact 72  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||   |||||||||||| ||| ||||    
T  17146318 tttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 17146389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 18247810 - 18247739
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatact 72  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||   |||||||||||| ||| ||||    
T  18247810 tttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 18247739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 22355098 - 22355169
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatact 72  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||   |||||||||||| ||| ||||    
T  22355098 tttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 22355169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 61
Target Start/End: Original strand, 15117940 - 15117998
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatg 61  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  15117940 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 15117998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 213
Target Start/End: Original strand, 12134421 - 12134486
Alignment:
Q  148 ttccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgt 213  Q
    |||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  12134421 ttccaaacttcaaaactaaaagtattaggagtttaattaagaggtttaagagtatttaacctatgt 12134486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 14951339 - 14951294
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttag 48  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  14951339 tgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttag 14951294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 210 - 267
Target Start/End: Original strand, 32466931 - 32466988
Alignment:
Q  210 atgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagacttaca 267  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||    
T  32466931 atgttgagagttgatcctgggataggagtggaggttgttattaagttatagacttaca 32466988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 48
Target Start/End: Original strand, 55377226 - 55377271
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttag 48  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  55377226 tgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttag 55377271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 5683394 - 5683441
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttag 48  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||    
T  5683394 tttgttagctttccaatggttttggtttgacgtccaaatgatttttag 5683441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 19020080 - 19020009
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatact 72  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||||||||   |||||||||||| ||| ||||    
T  19020080 tttgttagctttctaatggttttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 19020009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 47357254 - 47357183
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatact 72  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||| |  |||||||||||||   |||||||||||| ||| ||||    
T  47357254 tttgttagctttctaatggccttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 47357183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 45
Target Start/End: Original strand, 7640774 - 7640816
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttt 45  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  7640774 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttt 7640816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 9871090 - 9871128
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaat 39  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  9871090 tttgttagcttttcaatgactttggtttgacttgaaaat 9871128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 63
Target Start/End: Original strand, 15287901 - 15287959
Alignment:
Q  5 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgat 63  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||   ||||||||||||    
T  15287901 ttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgat 15287959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 63
Target Start/End: Original strand, 15295011 - 15295069
Alignment:
Q  5 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgat 63  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||   ||||||||||||    
T  15295011 ttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgat 15295069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 10643815 - 10643746
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatact 72  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||||||||   |||||||||||| ||| ||||    
T  10643815 tgttagctttctaatggttttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 10643746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 48
Target Start/End: Original strand, 25120076 - 25120120
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttag 48  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  25120076 gttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttag 25120120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 137)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Original strand, 58833 - 59099
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  58833 tttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgaattttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatga 58932  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  58933 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagagt 59032  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagacttaca 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  59033 atttaacctatgttgtgagttgatcttgggataggaatgaaagttgttattaagttatagacttaca 59099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 17070708 - 17070972
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  17070708 tttgttagctttccaatgactttgttttgacttgaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttattgaaatcttatga 17070807  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17070808 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaattctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 17070907  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagactta 265  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17070908 atttaacctatgttgtaagttgatcttgggatatgaatggaagttgttattaagttatagactta 17070972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 4 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 47094714 - 47094451
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47094714 gttagctttccagtggctttgatttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 47094615  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47094614 ttcagcataaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagtagtactatgatttcaattaaggtgtttaagagtatt 47094515  T
Q  204 taacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagacttaca 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47094514 taacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttaataagttatagacttaca 47094451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Original strand, 8756811 - 8757077
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  8756811 tttgttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgataaaaatactccgaggaggtcttagtgaaatcttatga 8756910  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8756911 aaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttttgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 8757010  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagacttaca 267  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  8757011 atttaacccatgttgtgagttgatcttgggataggaatggaagttgttaataagttatagacttaca 8757077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 12755121 - 12755385
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  12755121 tttgttagatttccaatggctttggtttgactagaaaatgagttttagattttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtgaaatcttatga 12755220  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12755221 aaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaacccttaaaactagaggtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 12755320  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagactta 265  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12755321 atttgacccatgttgtgagttgatcttgggataggaatgaaagttgttaataagttatagactta 12755385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 4 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 4325690 - 4325427
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  4325690 gttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaataatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaagaaggtcttaatgaaatcttatgaaaa 4325591  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4325590 ttcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgcgataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 4325491  T
Q  204 taacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagacttaca 267  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  4325490 taatccatgttgtgagttgatcttgggataggaatggaagttgttaataagttatagacttaca 4325427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Original strand, 832438 - 832704
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  832438 tttgttagctttccaatggctttggtttgactcaaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatga 832537  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  832538 aaattcagcaaaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttcaattaagatgtttaagagt 832637  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagacttaca 267  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  832638 atttaacccatgttgtgagttgatcttgggataggaatgaaagttgttaataagttatagacttaca 832704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Original strand, 1197618 - 1197884
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  1197618 tttgttagctttccaatggctttggtttgactcaaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatga 1197717  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  1197718 aaattcagcaaaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttcaattaagatgtttaagagt 1197817  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagacttaca 267  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1197818 atttaacccatgttgtgagttgatcttgggataggaatgaaagttgttaataagttatagacttaca 1197884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 18456063 - 18456287
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  18456063 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatga 18456162  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456163 aaattcagcataaccatttctaaattaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 18456262  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatc 225  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    
T  18456263 atttaacccatgttgtgagttgatc 18456287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 13408409 - 13408143
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  13408409 tttgttagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaattctccaagtaggtcttagtgaaatcttatga 13408310  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  13408309 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaggctcaaaactagaagtactatgagttcaattaagttttttaagagt 13408210  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagacttaca 267  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||| |||||||||||| ||||    
T  13408209 atttaacccatgttgtgagttgattttgggataggaatgggagttgttaataagttatagacgtaca 13408143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Original strand, 40555158 - 40555424
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  40555158 tttgttaactttccaatggctttggtttgacttcaaaatgatttttgatttttgagatatgatgtaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatga 40555257  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40555258 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagtgt 40555357  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagacttaca 267  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  40555358 atttaacccatattgtgagttgatcttgggataggaatagaagttgttaataagttataaacttaca 40555424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 5 - 222
Target Start/End: Original strand, 32160621 - 32160838
Alignment:
Q  5 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 104  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32160621 ttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 32160720  T
Q  105 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32160721 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 32160820  T
Q  205 aacctatgttgtgagttg 222  Q
    ||||||||||||||||||    
T  32160821 aacctatgttgtgagttg 32160838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 3 - 267
Target Start/End: Original strand, 13699306 - 13699569
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  13699306 tgttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggccttagtgaaatcttaggaaa 13699405  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13699406 attcagtataaccatttctaagttaatctgaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagagtat 13699505  T
Q  203 ttaacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagacttaca 267  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  13699506 ttaacccatgttgtgagttgatctttggataggaatggaagttg-taataagttatagacttaca 13699569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 708972 - 709191
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  708972 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 709071  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  709072 attcagcttaactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactattagttcaattaaggtgtttaagagtat 709171  T
Q  203 ttaacctatgttgtgagttg 222  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  709172 ttaacctatgttgtgagttg 709191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 16550421 - 16550640
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16550421 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgattttttgtatttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 16550520  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  16550521 attgagaataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaagtgtttaagagtat 16550620  T
Q  203 ttaacctatgttgtgagttg 222  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16550621 ttaacctatgttgtgagttg 16550640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16615241 - 16615022
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16615241 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgattttttgtatttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 16615142  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  16615141 attgagaataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaagtgtttaagagtat 16615042  T
Q  203 ttaacctatgttgtgagttg 222  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16615041 ttaacctatgttgtgagttg 16615022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 14415899 - 14416113
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14415899 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgacttttagtgtttgatttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatga 14415998  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14415999 aaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 14416098  T
Q  201 atttaacctatgttg 215  Q
    |||||||||||||||    
T  14416099 atttaacctatgttg 14416113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13647876 - 13647655
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13647876 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaa 13647777  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13647776 ttcagcataaccgtttctaaattaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagattatt 13647677  T
Q  204 taacctatgttgtgagttgatc 225  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  13647676 taacccatgttgtgagttgatc 13647655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 48743940 - 48743727
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |    
T  48743940 tttgttagcttttcaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggagaacttagtgaaatcttataa 48743841  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48743840 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagatgtactatgagttcaattaaggtgtttaggagt 48743741  T
Q  201 atttaacctatgtt 214  Q
    ||||||| ||||||    
T  48743740 atttaacatatgtt 48743727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 48812475 - 48812254
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  48812475 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactgcaaggaggtcttagtgaaattttatga 48812376  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  48812375 aaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagagaataattccaaacctcaaaactagaagtattaggagtttaattaaggtgtttaagagt 48812276  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttg 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  48812275 atttaacctatgttgtgagttg 48812254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 15214136 - 15213917
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15214136 tttgttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatga 15214037  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15214036 aaattcagtataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagt 15213937  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagt 220  Q
    || |||  ||||||||||||    
T  15213936 atgtaatttatgttgtgagt 15213917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 14191503 - 14191722
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  14191503 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgactt--agtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatattatga 14191600  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14191601 aaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactataagtactataagttcaattaaggtgtttaagagt 14191700  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttg 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  14191701 atttaacctatgttgtgagttg 14191722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 29004459 - 29004235
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||    
T  29004459 tttgttagctttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactcaagggaggtcctagtgaaatcttatga 29004360  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29004359 aaatttagcataaccgtttccaagttaatcgaaaacttatgggataattccaggactaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 29004260  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatc 225  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    
T  29004259 atttaacccatgttgtgagttgatc 29004235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 37727342 - 37727582
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||    
T  37727342 tttgttagctttccagtggctttggtttgactcaaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatgctccaaggaggtcttagtgaaatcttagga 37727441  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37727442 aaatttagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccatcaaaactagaagtactatgagttcaatcaaggtgtttaagagt 37727541  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaa 241  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37727542 ttttaacctatgttgtgagttgatcttgggataggaatgaa 37727582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16462671 - 16462452
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16462671 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 16462572  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  16462571 attcagcatagctgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttaaattaaggtgattaacagtat 16462472  T
Q  203 ttaacctatgttgtgagttg 222  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16462471 ttaacctatgttgtgagttg 16462452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 14188709 - 14188928
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  14188709 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgactt--agtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtctttgtgaaatattatga 14188806  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14188807 aaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactataagtactattagttcaattaaggtgtttaagagt 14188906  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttg 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  14188907 atttaacctatgttgtgagttg 14188928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 33001551 - 33001334
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  33001551 tttgttagctttccaatggctttggtttaacttgaaaatgatttttgatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttagga 33001452  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33001451 aaattcagtatatccatttcttagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaaatactatgagttcaattaaggtgtttaagaga 33001352  T
Q  201 atttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||||    
T  33001351 atttaacctatgttgtga 33001334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 34957808 - 34957584
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  34957808 tttgttagctttcaaatggctttggtttgactcaaaaatgatttttagtttttgagatatgattaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatga 34957709  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34957708 aaattcagcataaccatttctaaggtaatccaaaacttatgggataattccaaggatcaaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagt 34957609  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatc 225  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||    
T  34957608 atttaacccatgttatgagttgatc 34957584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11661742 - 11661520
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  11661742 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgacttttattttttgagttatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatga 11661643  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11661642 aaattcaacacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaatgtgtttaagagt 11661543  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttga 223  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  11661542 atttaacccatgttgtgagttga 11661520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 221
Target Start/End: Original strand, 47975328 - 47975546
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47975328 tgttagcttttcagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttgatgtttgagatatgatgaaaatgctccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 47975427  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47975428 attcagcataacagtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacatcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 47975527  T
Q  203 ttaacctatgttgtgagtt 221  Q
    |||||||||||||||||||    
T  47975528 ttaacctatgttgtgagtt 47975546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 32771965 - 32771760
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || | ||||||||||||||||||||||    
T  32771965 tttgttagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatttttagtttttgagatgtgatgaaaataatccaggtaggtcttagtgaaatcttatga 32771866  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32771865 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagt 32771766  T
Q  201 atttaa 206  Q
    ||||||    
T  32771765 atttaa 32771760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 220
Target Start/End: Original strand, 36685667 - 36685884
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36685667 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 36685766  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtg-tttaagagtat 202  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  36685767 ttcagcgtaaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaagatgttttaagagtat 36685866  T
Q  203 ttaacctatgttgtgagt 220  Q
    |||||| |||||||||||    
T  36685867 ttaacccatgttgtgagt 36685884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Original strand, 13745193 - 13745408
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13745193 tgttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 13745292  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13745293 attcagcataaccgtttctaagtcgatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttcagagtat 13745392  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||    
T  13745393 ttaacctatgttgtga 13745408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 12465678 - 12465892
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12465678 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 12465777  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  12465778 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgacttcaattaggatgtttaagagtatt 12465877  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||| ||||||||||    
T  12465878 taacttatgttgtga 12465892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 46386505 - 46386719
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46386505 gttagctttccagtggctttggtttgaagtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatattccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 46386604  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  46386605 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactatggtgtttaagagtatt 46386704  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||    
T  46386705 taacctatgttgtga 46386719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15167612 - 15167403
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  15167612 tttgttagctttctaatggctttggtttgacttgaaaatgacttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatga 15167513  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15167512 aaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcgaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagt 15167413  T
Q  201 atttaaccta 210  Q
    ||||||||||    
T  15167412 atttaaccta 15167403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 220
Target Start/End: Original strand, 30820673 - 30820890
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||| | |||  |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30820673 tgttagctttctagtggtattggtttgacttgaaaataatttttggtttttaagatatgataaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttatgaaa 30820772  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30820773 attcagcataaccgtttctaagataatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 30820872  T
Q  203 ttaacctatgttgtgagt 220  Q
    |||||| |||||||||||    
T  30820873 ttaacccatgttgtgagt 30820890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 38828698 - 38828474
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||  | |||||||||||||||| |||||||    
T  38828698 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatggaaatactctagggaggtcttagtgaaaccttatga 38828599  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38828598 aaattcagcacaactatttctaagttaatccaaaacttatgagacaattccaaggctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 38828499  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatc 225  Q
    |||||||| | ||||||||||||||    
T  38828498 atttaacccacgttgtgagttgatc 38828474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 17505419 - 17505638
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  17505419 tttgttagctttccaatgactttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatcatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatga 17505518  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  17505519 aaattcagcataaccctttttaagttaatccaaaacttatgggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtctaagagt 17505618  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagt 220  Q
    |||||||| ||||| |||||    
T  17505619 atttaacccatgttatgagt 17505638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 17547795 - 17547576
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  17547795 tttgttagctttccaatgactttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatcatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatga 17547696  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  17547695 aaattcagcataaccctttttaagttaatccaaaacttatgggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtctaagagt 17547596  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagt 220  Q
    |||||||| ||||| |||||    
T  17547595 atttaacccatgttatgagt 17547576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 12371909 - 12371695
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12371909 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgcgatatggtaaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 12371810  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  12371809 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactaggatgtttaagagtatt 12371710  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||    
T  12371709 taacctatgttgtga 12371695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 44374580 - 44374366
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44374580 gttagctttccagtgactttggtttgacatgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 44374481  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  44374480 ttcaacataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccagacctcaaaactagaagtactatgagttcaaatagggtgtttaagagtatt 44374381  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||    
T  44374380 taacctatgttgtga 44374366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 44383445 - 44383231
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44383445 gttagctttccagtgactttggtttgacatgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 44383346  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  44383345 ttcaacataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccagacctcaaaactagaagtactatgagttcaaatagggtgtttaagagtatt 44383246  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||    
T  44383245 taacctatgttgtga 44383231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 11067102 - 11066888
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  11067102 gttagctttccagtggctttgatttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccatggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 11067003  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  11067002 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattgcaaacctcaaaactagaagtactatgatttcaactagggtgtttaagagtatt 11066903  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||| ||||||||||    
T  11066902 taacttatgttgtga 11066888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 13147890 - 13148104
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13147890 gttagctttccattggatttggtttgacgtgaaaatcattttttgttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 13147989  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  13147990 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactacaagtattatgagatcaactagggtgtttaagagtatt 13148089  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||    
T  13148090 taacctatgttgtga 13148104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18607924 - 18607702
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||    
T  18607924 tttgtcagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttaaggaaatcttatga 18607825  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18607824 aaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagt 18607725  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttga 223  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  18607724 atttaacccatgttgtgagttga 18607702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 10896409 - 10896618
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  10896409 tttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttagtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatga 10896508  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  10896509 aaattcagcacaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcgaaactagaagtattatgagttcaattaagctgtttaagagt 10896608  T
Q  201 atttaaccta 210  Q
    ||||||||||    
T  10896609 atttaaccta 10896618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16999066 - 16998839
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  16999066 gttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagagatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttaggaaaa 16998967  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagt------actatgagttcaattaaggtgtttaag 197  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||      || ||||||||||||||||||||||||    
T  16998966 ttcagtataaccttttctatgttaatccaaaacttatagaataattccaaccctcaaaactagaagtaccatcaccatgagttcaattaaggtgtttaag 16998867  T
Q  198 agtatttaacctatgttgtgagttgatc 225  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16998866 agtatttaacccatgttgtgagttgatc 16998839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 8851577 - 8851791
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8851577 gttaggtttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgagttttggttctggagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 8851676  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  8851677 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagattatt 8851776  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||| ||||    
T  8851777 taacctatgtggtga 8851791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 14422422 - 14422204
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  14422422 tttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatga 14422323  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||     
T  14422322 aaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagc 14422223  T
Q  201 atttaacctatgttgtgag 219  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  14422222 atttaacccatgttgtgag 14422204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 13864810 - 13865062
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |    
T  13864810 tttgttagctttccaatggatttgggttgacttaaaaatgatttttagtttttgagatatgaggaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttagaa 13864909  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||         ||||||||    
T  13864910 aaattcagtacaaccttttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaagtagaagtactatgagttcaa---------ttaagagt 13865000  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagac 262  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||    
T  13865001 atttaatccatgttatgagttgatcttgggataggaatgggagttgttaataagttatagac 13865062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19282727 - 19282514
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||  | ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19282727 tgttagctttttagtggctttgagttgacttgaaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 19282628  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19282627 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaaatagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtat 19282528  T
Q  203 ttaacctatgttgt 216  Q
    ||||||||||||||    
T  19282527 ttaacctatgttgt 19282514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 214
Target Start/End: Original strand, 32434014 - 32434217
Alignment:
Q  11 ttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagca 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32434014 ttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagca 32434113  T
Q  111 taaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaaccta 210  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||  | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||    
T  32434114 taaccgtttctaaattaatccaaaacttaatgaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaatcta 32434213  T
Q  211 tgtt 214  Q
    ||||    
T  32434214 tgtt 32434217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18872797 - 18872575
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  18872797 tttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatga 18872698  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18872697 aaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagt 18872598  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttga 223  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  18872597 atttaacccatgttgtgagttga 18872575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 163
Target Start/End: Original strand, 29052572 - 29052732
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29052572 tgttagctttccagtggttttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 29052671  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaac 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29052672 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaac 29052732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 218
Target Start/End: Original strand, 12127602 - 12127796
Alignment:
Q  25 gtttgacttgaaaatgatttttagttt-ttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaa 123  Q
    ||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12127602 gtttgacgtgaaaatgattttttggttcttgagatatgatgaaaatacttcagggaggtattagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaa 12127701  T
Q  124 gttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12127702 gttaatccaaaagttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaaatagggtgtttaagagtatttaacgtatgttgtga 12127796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16009015 - 16008793
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  16009015 tttgctagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatga 16008916  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16008915 aaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagt 16008816  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttga 223  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  16008815 atttaacccatgttgtgagttga 16008793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 14258986 - 14258772
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  14258986 gttagctttccagtggctttgctttgacatgaaaatgaactttggttcttgagatatgatgaaaggactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaa 14258887  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  14258886 ttcagcataaccgtttcaaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatt 14258787  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||| | ||||||||    
T  14258786 taacatttgttgtga 14258772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 14153387 - 14153599
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  14153387 tttgttagctttacaatggctttggtttgacttgaaaataatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatga 14153486  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |   ||||||| | ||| |  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14153487 aaattcagcataaccgtttctaatttaatccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcctg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 14153585  T
Q  201 atttaacctatgtt 214  Q
    ||||||||||||||    
T  14153586 atttaacctatgtt 14153599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20585986 - 20585776
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||    |||||||||||||||||    
T  20585986 gttagctttcccgtggctttggtttgacgtgaaaatgagttttggttcttgaggtatgatgaaaatactccaaggaggt----gtgaaatcttatgaaaa 20585891  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  20585890 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaattagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatt 20585791  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||| ||||||||||    
T  20585790 taacttatgttgtga 20585776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 148053 - 147833
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  148053 tgttagctttacaatggctttggtttgactctaaaatgaattttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaa 147954  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  147953 attcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtat 147854  T
Q  203 ttaacctatgttgtgagttga 223  Q
    |||||| ||||||||| ||||    
T  147853 ttaacccatgttgtgaattga 147833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14566637 - 14566417
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  14566637 tgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaa 14566538  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||||||| |||  |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  14566537 attcagcaaaacattttccaagttaatccaaaactggtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgtaattaaggtgtttaagagtat 14566438  T
Q  203 ttaacctatgttgtgagttga 223  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  14566437 ttaacccatgttgtgagttga 14566417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 183
Target Start/End: Original strand, 12323348 - 12323527
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||   |||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12323348 gttagctttccgggggctttggtttgacgtgaaaatgatatttggttcttgagatatgatgaaaatacttgaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 12323447  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaa 183  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  12323448 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactaaaagtactatgagttcaa 12323527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 32301816 - 32301602
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  32301816 gttagttttccagtgactttggtttgacatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttaatgaaattttatgaaaa 32301717  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  32301716 tacagcataaccgtttataagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactataagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatt 32301617  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||| | ||||||||    
T  32301616 taacatgtgttgtga 32301602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 58 - 218
Target Start/End: Original strand, 13745672 - 13745832
Alignment:
Q  58 tatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacct 157  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  13745672 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatagccgtttctaagtcaatccaaaacttattgaataattccaaacct 13745771  T
Q  158 aaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 218  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13745772 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 13745832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Original strand, 14928749 - 14928964
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  14928749 tgttagctttccaatggcgtcagtttgactagaaaatgatttttggtttacgagttatgatgaaaataatacaaggagtacttagtgaaattttatgaaa 14928848  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||    
T  14928849 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaagactagaagtactaggagtttaattaaagtgtttaaaagtat 14928948  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
     |||||||||||||||    
T  14928949 ctaacctatgttgtga 14928964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Original strand, 15352215 - 15352430
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  15352215 tgttagctttccaatggcgtcagtttgactagaaaatgatttttggtttacgagttatgatgaaaataatacaaggagtacttagtgaaattttatgaaa 15352314  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||    
T  15352315 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaagactagaagtactaggagtttaattaatgtgtttaaaagtat 15352414  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
     |||||||||||||||    
T  15352415 ctaacctatgttgtga 15352430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 81 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 13894652 - 13894515
Alignment:
Q  81 gtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagtt 180  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  13894652 gtcttagtgaaatcttattaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggatgattccaaagctcaaaactagaagtactatgagtt 13894553  T
Q  181 caattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13894552 caattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 13894515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Original strand, 43277160 - 43277376
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttat-gaa 101  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||    
T  43277160 tgttagctttcaagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatacttcaagaaggtcttagtgaaattttatcaaa 43277259  T
Q  102 aattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagta 201  Q
    ||||| ||||||| ||||||| || ||  ||||||||||||  |   ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  43277260 aattccgcataactatttctaggtcaactcaaaacttatggattgtctccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagta 43277359  T
Q  202 tttaacctatgttgtga 218  Q
    |||||| ||||||||||    
T  43277360 tttaacatatgttgtga 43277376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 21538604 - 21538820
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  21538604 tttgttagttttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttaaattttgagttatgatgaaaacactccaaggaggtcttggtgaaattttatga 21538703  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||| |  |  |||||||| | |||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21538704 aaattccgcataatcatttctaagtcaacccaaaacttatagattgtttccaaacttcaaaacttg-tgtactattagttcaattaaggtgtttaagagt 21538802  T
Q  201 atttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||||    
T  21538803 atttaacctatgttgtga 21538820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 39292152 - 39292368
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  39292152 tttgttagctttccattgactttggtttgaattgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtgaaattttatga 39292251  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||| ||||||| |||| ||| | ||  ||||||||||||  |  |||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39292252 aaattccgcataactatttttaaatcaactcaaaacttatggattgtttccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 39292350  T
Q  201 atttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||||    
T  39292351 atttaacctatgttgtga 39292368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 52 - 212
Target Start/End: Original strand, 15119761 - 15119921
Alignment:
Q  52 ttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattcc 151  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15119761 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttataaatattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcc 15119860  T
Q  152 aaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatg 212  Q
    ||| || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15119861 aaaactcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatg 15119921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16580295 - 16580080
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    |||||||||| || |||| || ||||||| |||||||| ||||| ||||  ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  16580295 tgttagcttttcagtggcgttagtttgacatgaaaatggtttttggtttaggagttgtgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaaa 16580196  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||    
T  16580195 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaacagtat 16580096  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||| | ||||||||    
T  16580095 ttaacatgtgttgtga 16580080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 94 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 14273892 - 14273739
Alignment:
Q  94 cttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtt 193  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14273892 cttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaacccttaaaactagaagtactatgagttcaattaagatgtt 14273793  T
Q  194 taagagtatttaacctatgttgtgagttgat-cttgggatatgaatgaaagttg 246  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||    
T  14273792 taagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgaaggttg 14273739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Original strand, 48213362 - 48213576
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48213362 tgttagatttccattcgctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 48213461  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||| ||||||| |||| ||||| || | |||||||||||  |   ||||||| | ||| | |   |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  48213462 attccgcataactatttttaagtcaacctaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagc-atgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagaatat 48213560  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||    
T  48213561 ttaacctatgttgtga 48213576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 18875264 - 18875478
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18875264 gttagctttccagtggatttggtttgacgtgaaaataatttttggttcttgagatatgataaaaatactccaaggatgtcttagtgaaattttatgaaaa 18875363  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    ||| ||||||| ||||||| || |||||||||||| |||  |   ||||||||| |||||||||||||  | ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  18875364 ttccgcataactatttctaggtcaatccaaaacttgtggattgtctccaaacctcaaaactagaagtaacaggagtttaattaaggggtttaagagtatt 18875463  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||    
T  18875464 taacctatgttgtga 18875478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 20619920 - 20619714
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| | |||| ||| |||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||| |||||||||    
T  20619920 gttagctttccagtagcttcggtgtgacgtgaaaaagatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttaataaaattttatgaaaa 20619821  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||| || || || |||||||| |||||||||||||    
T  20619820 ttcagcataaccgtttctaagttaatccataacttatggaataattccaaaactcaaaattagaagtattaggattttaattaaggggtttaagagtatt 20619721  T
Q  204 taaccta 210  Q
    |||||||    
T  20619720 taaccta 20619714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 25 - 218
Target Start/End: Original strand, 16585390 - 16585583
Alignment:
Q  25 gtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaag 124  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||  ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16585390 gtttgacatgaaaatggtttttggtttaggagttgtgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaaaattcagcataaccgtttctaag 16585489  T
Q  125 ttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||    
T  16585490 ttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaacagtatttaacatgtgttgtga 16585583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 15720386 - 15720250
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  15720386 tttgttagctttccaatggttttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgaggtatgataaaaatactccaaggaggtcttagcgaaatcttatga 15720287  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaact 137  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15720286 aaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaact 15720250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Original strand, 24270399 - 24270613
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  24270399 tgttagctttcaaatggaattggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaatgaggtcttagtgaaattttatgaaa 24270498  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||| ||||||| |||| ||||| || | |||||||||||  |   ||||||| | ||| || |  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24270499 attccgcataactatttttaagtcaaccgaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtattgtgagttcaattaaggtgtttaagagtat 24270597  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||    
T  24270598 ttaacctatgttgtga 24270613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 25942072 - 25941858
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25942072 tgttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatgctccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 25941973  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||| |||| |  ||||||| || || ||||| |||||||  |   ||||||| | ||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25941972 attctgcatgataatttctaggtcaacccaaatcttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 25941874  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||    
T  25941873 ttaacctatgttgtga 25941858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 61 - 218
Target Start/End: Original strand, 16460407 - 16460564
Alignment:
Q  61 gatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaa 160  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  16460407 gatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaa 16460506  T
Q  161 aactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| | |||||||| | ||||||||    
T  16460507 aactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaatattatttaacatgtgttgtga 16460564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 202
Target Start/End: Original strand, 13918184 - 13918383
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||| |||  | ||||| |||| | |||| ||||| |||   ||||| |||| | ||| |||| || | ||||| ||||||||||||||||||    
T  13918184 tgttagctttctaattccattggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaaatcttatgaaa 13918283  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13918284 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 13918383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Original strand, 3192710 - 3192920
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    |||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  3192710 tgttagttttgcagtgtctttggtttgacttgaaaatgatttttagattttgagttatgatgaaaacactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaa 3192809  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||  ||||||| |||||||||| || ||||||||||||   |  ||| |||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  3192810 attgtgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgatttgtttctaaacttcaaaactagaagtattatgagtttaattaagaggtttaagagtat 3192909  T
Q  203 ttaacctatgt 213  Q
    |||||||||||    
T  3192910 ttaacctatgt 3192920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 46580339 - 46580549
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  46580339 tttgttagttttccaatgactttagtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagttcttactgaaattttatga 46580438  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatggg-ataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagag 199  Q
    ||||||||||||             ||||  |  ||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46580439 aaattcagcata-------------taat--attactgatgggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagag 46580523  T
Q  200 tatttaacctatgttgtgagttgatc 225  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  46580524 tatttaacctatgttatgagttgatc 46580549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 86 - 202
Target Start/End: Original strand, 25926993 - 25927109
Alignment:
Q  86 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaatt 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  25926993 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaatt 25927092  T
Q  186 aaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||||||||||||||||    
T  25927093 aaggtgtttaagagtat 25927109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Original strand, 14161272 - 14161482
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  14161272 tgttagatttccattggctttggtttgacttgaaaatcatttttggtttttgaggtttgataaaaatactccaagaaggtcttagtgaaattttatgaaa 14161371  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||| ||||||| ||||||| || || |||||||||||||  |   ||||||| | ||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14161372 attctgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagattat 14161470  T
Q  203 ttaacctatgtt 214  Q
    ||||||||||||    
T  14161471 ttaacctatgtt 14161482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 218
Target Start/End: Original strand, 20252761 - 20252973
Alignment:
Q  5 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 104  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  20252761 ttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaatgaggtcttagtaaaattttacgaaaat 20252860  T
Q  105 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 204  Q
    || ||||||| |||||||||| || |||||| ||||||  |   ||||||| | ||| ||    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20252861 tccgcataactatttctaagtcaacccaaaatttatggattgtctccaaacttcaaagct-tttgtactatgagttcaattaagatgtttaagagtattt 20252959  T
Q  205 aacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||    
T  20252960 aacctatgttgtga 20252973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Original strand, 4691313 - 4691527
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    |||||| |||||| |||  | |||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4691313 tgttagatttccagtggagtcggtttgacttgaaaataatttttggtttttgatttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 4691412  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||  |   ||||||| | |||  | |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4691413 attccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagtttg-tgtactatgagttaaattaaggtgtttaagagtat 4691511  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
    |||||| |||||||||    
T  4691512 ttaaccaatgttgtga 4691527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Original strand, 9743500 - 9743706
Alignment:
Q  5 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 104  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||   ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9743500 ttagcttttcagtggctttggtttgacttgaaaatgattttgtctttttaagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 9743599  T
Q  105 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 204  Q
    || ||||||| ||||||| || || |||||||||||||  |   ||||||| | ||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  9743600 tcggcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaactttaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggcgtttaagcgtattt 9743698  T
Q  205 aacctatg 212  Q
    ||||||||    
T  9743699 aacctatg 9743706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Original strand, 15978473 - 15978682
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||  || |||  ||||||||    
T  15978473 tgttagctttccactgactttggcttgacttgaaaatgatttttagattttgagttatgatgaaaacactccaaggaggtctcggtaaaactttatgaaa 15978572  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||  ||||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||  ||||||||| |     
T  15978573 atttcgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggaatgtttccaaacctcaaaactagaagtactaggggtt-aattaagaggtttaagagcac 15978671  T
Q  203 ttaacctatgt 213  Q
    |||||||||||    
T  15978672 ttaacctatgt 15978682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 217
Target Start/End: Original strand, 18080135 - 18080348
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  18080135 tgttagctttacagtggctttgatttgacttgaaaatgatttttggtttttgacttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatttaatgaaa 18080234  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||| ||||||| ||||||| || || |||||||||||||  |  |||||||| || ||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||| || ||||    
T  18080235 attccgcataactatttctatgtcaacccaaaacttatggattgtttccaaacttagaaacttg-tgtactatgaattcgattaaggtgtttcagggtat 18080333  T
Q  203 ttaacctatgttgtg 217  Q
    ||||  |||||||||    
T  18080334 ttaagttatgttgtg 18080348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 3287625 - 3287417
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  3287625 tgttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaagaaggtcttagtgaaattttatgaaa 3287526  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||| ||||||| ||||||| || || |||||||||||||  |   |||||||       ||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||    
T  3287525 attccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaac-------ctagaagtattaggagtttaattaaggggtttaagaatat 3287433  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||| ||||||||||    
T  3287432 ttaacgtatgttgtga 3287417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 218
Target Start/End: Original strand, 15576247 - 15576462
Alignment:
Q  2 ttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 101  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||| || ||||| || |||| |||| |||||||||| |||||||    
T  15576247 ttgttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaataatttttggtttttgagttatcataaaaatgctccaagaaggttttagtgaaattttatgaa 15576346  T
Q  102 aattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagta 201  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||  |   ||||||| | ||| || |   |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15576347 aattctgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tctactatgagttcaattaaggtgtttaagggta 15576445  T
Q  202 tttaacctatgttgtga 218  Q
    |||||| ||||||||||    
T  15576446 tttaacttatgttgtga 15576462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 214
Target Start/End: Original strand, 8514179 - 8514373
Alignment:
Q  19 gctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatt 118  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| | ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||    
T  8514179 gctttggtttgacttgaaaaagaattttgggttttgaattatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttgtgaaaattccgcataactatt 8514278  T
Q  119 tctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 214  Q
    |||| || || |||||||||||||  |   |  |||| | ||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8514279 tctaggtcaacccaaaacttatggattgtcttaaaacttcaaatcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacatatgtt 8514373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Original strand, 8564008 - 8564220
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    |||||||||| |||||| ||| || |||  |||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||  |||||| || |||  ||||||||    
T  8564008 tgttagcttttcaatggttttcgtgtgatgtgaagatgatttttagattttaagttatgatgaaaatactccaagtgggtcttggtaaaactttatgaaa 8564107  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || ||||| || ||||  |  ||||||||   |||| | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8564108 attcagcataaccgtttctaagtcaacccaaagctaatggtttgtttccaaactccaaaaattg-tgtactatgatttcaattaaggtgtttaagagtat 8564206  T
Q  203 ttaacctatgttgt 216  Q
    ||||||||||||||    
T  8564207 ttaacctatgttgt 8564220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 101
Target Start/End: Original strand, 1856817 - 1856915
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 101  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  1856817 tgttagctttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 1856915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 13897883 - 13897805
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaagga 79  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13897883 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgattattagtttttgagatatgatgaaaatactccaagga 13897805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Original strand, 23664538 - 23664638
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  23664538 tttgttagctttctaatggctttagtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatga 23664637  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  23664638 a 23664638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 101
Target Start/End: Original strand, 13917990 - 13918088
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 101  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  13917990 tgttagctttccagtggctttggtttgacatgaaaatgattattggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 13918088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 95 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 28720003 - 28719885
Alignment:
Q  95 ttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgttt 194  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||  ||||||| ||||| |||||||  ||||    
T  28720003 ttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagggaatatttccaaacctcaaaactatgagtactaggagtttaattaagaggttt 28719904  T
Q  195 aagagtatttaacctatgt 213  Q
    || ||||||||||||||||    
T  28719903 aaaagtatttaacctatgt 28719885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 11303824 - 11303724
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  11303824 tttgttagctttccaatggctttaatttgactcgaaattgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatga 11303725  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  11303724 a 11303724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 29801006 - 29800906
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||    
T  29801006 tttgttagctttccaatggctttaatttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccacggaggtcttagtgaatttttatga 29800907  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  29800906 a 29800906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 86 - 148
Target Start/End: Original strand, 1857092 - 1857154
Alignment:
Q  86 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1857092 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat 1857154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 101
Target Start/End: Original strand, 25926717 - 25926815
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 101  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  25926717 tgttagctttctagtggctttagtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 25926815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 117 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20487964 - 20487863
Alignment:
Q  117 tttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||| |||||||| |||||| |||||||||| | ||||||    
T  20487964 tttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactaggagtactaggtgtttaattaaggggtttaacagtatttaacatgtgttgt 20487865  T
Q  217 ga 218  Q
    ||    
T  20487864 ga 20487863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Original strand, 16108274 - 16108374
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||| ||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  16108274 tttgttacctttttaatggatttggtttggcttgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatga 16108373  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  16108374 a 16108374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 29797187 - 29797087
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||    
T  29797187 tttgttagctttccaatggctctaatttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccacggaggtcttagtgaatttttatga 29797088  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  29797087 a 29797087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 46473693 - 46473562
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||  ||||||||    
T  46473693 tgttagctttccaatagttttggtttgactagaaaatgaattttacatttggaggtatgatgaaaatactccaagcgggtcttagtaaaactttatgaaa 46473594  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaa 134  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||| |||||    
T  46473593 attcagcataattattcctaagttaaaccaaa 46473562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 3136924 - 3136721
Alignment:
Q  5 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||   ||||||| |||||  ||||||| || | |||||||||| |||| ||||||| || |||| ||| ||||||    
T  3136924 ttagctttccaatggctttgctttgacc--aaaatgagttttatattttgagttagg-tgaaaatactccaagtaggtcttggtaaaattttaagaaaat 3136828  T
Q  105 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 204  Q
    | ||||||||  |||| |||| || |||||||||||||  |  |||||||| | |||||| | ||||||| ||||| ||||| | ||||||||||| |||    
T  3136827 taagcataactgtttccaagtcaacccaaaacttatggtttgtttccaaacatcaaaacttg-agtactaagagtttaattaggatgtttaagagtgttt 3136729  T
Q  205 aacctatg 212  Q
    ||||||||    
T  3136728 aacctatg 3136721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 11309944 - 11309876
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatac 71  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  11309944 tgttagctttccattggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatac 11309876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16066083 - 16065874
Alignment:
Q  2 ttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 101  Q
    ||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| | ||||||||||| ||| |||| ||||||| ||| ||| |||  ||    
T  16066083 ttgttagatttctaacggctttggtttgactttaaaataatttttagattttgtgttatgatgaaaacactccaagtaggtcttggtgcaattttacaaa 16065984  T
Q  102 aattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagta 201  Q
    ||||||||||||| ||||  |||| ||  |||||  ||||   |  |||||||||| |||| | | ||||||| ||||| ||| | |||||||||||||     
T  16065983 aattcagcataactattttcaagtgaacacaaaagctatgatttggttccaaacctcaaaatttg-agtactaggagtttaatcatggtgtttaagagtg 16065885  T
Q  202 tttaacctatg 212  Q
    |||||||||||    
T  16065884 tttaacctatg 16065874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 66
Target Start/End: Original strand, 44190667 - 44190729
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaa 66  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44190667 gttagcttttcaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaa 44190729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 24702805 - 24702705
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  24702805 tttgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatga 24702706  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  24702705 a 24702705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 24705252 - 24705152
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  24705252 tttgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatga 24705153  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  24705152 a 24705152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 32126067 - 32125967
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  32126067 tttgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatga 32125968  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  32125967 a 32125967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 41523494 - 41523394
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  41523494 tttgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatga 41523395  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  41523394 a 41523394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 41525956 - 41525856
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  41525956 tttgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatga 41525857  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  41525856 a 41525856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 169 - 218
Target Start/End: Original strand, 21675491 - 21675540
Alignment:
Q  169 gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21675491 gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 21675540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 159 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 15720255 - 15720196
Alignment:
Q  159 aaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15720255 aaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacttatgttgtga 15720196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Original strand, 14948708 - 14948808
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || || | | ||||||| |||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  14948708 tttgttagccttccaatggctttagtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatga 14948807  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  14948808 a 14948808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 37539045 - 37538905
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| | | ||||||| ||| ||||||| ||| |||| ||||||| | ||||| ||| |     
T  37539045 tttgttagctttccaatgtctttggtttgacttaaaaatgttttgtggattttgagttattatgaaaacactccaagtaggtcttggagaaattttaagg 37538946  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatg 141  Q
    ||| |  ||||||| ||||| |||| ||  |||||||||||    
T  37538945 aaacttggcataactatttccaagtcaacacaaaacttatg 37538905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 21660652 - 21660570
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtctt 85  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| | | ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  21660652 tgttatctttccaatggcgttggtttgacatgaaaatgttttgtggattttgagttatgatgaaaacacttcaagtaggtctt 21660570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 14105882 - 14105927
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgattttt 46  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14105882 tttgttagctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgattttt 14105927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 18431286 - 18431188
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 101  Q
    ||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||  ||||  | | |||||||||||||||  ||| ||||||||||||| | |||||||    
T  18431286 tgttatctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttcggtttaggtgttatgatgaaaatactcaaagtaggtcttagtgaatttttatgaa 18431188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 125
Target Start/End: Original strand, 44305758 - 44305872
Alignment:
Q  11 ttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagca 110  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | | ||||||  ||||||||||| ||||||||  ||||||   ||||| ||| | ||||| ||||    
T  44305758 ttccaatggatttggtttgacttgaaaatgttttgtggattttgatttatgatgaaaacacttcaagtgggtcttgaagaaattttaaggaaatttagca 44305857  T
Q  111 taaccatttctaagt 125  Q
    |||| ||||| ||||    
T  44305858 taactatttccaagt 44305872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 12191960 - 12191835
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| | | ||||||| ||| ||  ||| ||| |||| ||||||| |   ||| ||| ||||    
T  12191960 tgttaactttccattggctttggtttgacttgaaaatattttgtggattttgagttatcatataaacactccaagtaggtcttggaagaattttacgaaa 12191861  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaa 128  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||    
T  12191860 attcagcataaccacttctaaattaa 12191835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 202
Target Start/End: Original strand, 1858646 - 1858689
Alignment:
Q  159 aaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1858646 aaaactagaagttctacgagttcaattaaggtgtttaagagtat 1858689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 15760777 - 15760848
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatact 72  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||   |||||||||||| ||| ||||    
T  15760777 tttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 15760848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 61
Target Start/End: Original strand, 15376301 - 15376359
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatg 61  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  15376301 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 15376359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 61
Target Start/End: Original strand, 20384711 - 20384769
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatg 61  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  20384711 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 20384769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 27217435 - 27217377
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatg 61  Q
    |||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  27217435 tgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 27217377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 28720082 - 28720040
Alignment:
Q  5 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgattttta 47  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  28720082 ttagctttccaattggtttggtttgacttaaaaatgattttta 28720040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 126034 - 125989
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttag 48  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  126034 tgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgagttttag 125989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 456896 - 456843
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgag 56  Q
    |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  456896 tgttagctttccaatggcgtcggttggacttgaaaatgaattttggtttatgag 456843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 11287045 - 11287000
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttag 48  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  11287045 tgttagctttctaatggctttggtttgtcttccaaatgatttttag 11287000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 16233095 - 16233042
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgag 56  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  16233095 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgaattttggtttatgag 16233042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Original strand, 19059 - 19325
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  19059 tttgttagctttacaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactacaaggagatcttagtgaaatcttatga 19158  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19159 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 19258  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagacttaca 267  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  19259 atttaacccatgttgtgagttgatcttgggataggaatggaagttgttaataagttatagacttaca 19325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 104)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 611377 - 611111
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  611377 tttgttagctttccaatggctttgatttgacttgaaaataatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatga 611278  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  611277 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactaaaattactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 611178  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagacttaca 267  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  611177 atttaacccatgttgtgagttgatcttgggataggaatgaaagttgttaataagttatagacttaca 611111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 18658843 - 18658579
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  18658843 tttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgaaatatgataaaaatactccgaggaggtcttagtgaaatcttatga 18658744  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18658743 aaattcagcataaccatttctaagttaatctaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 18658644  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagactta 265  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  18658643 atttaacccatgttgtgagttgatcttgggataggaatggaagttgttaataagttatagactta 18658579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 19825904 - 19826142
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  19825904 tttgttagctttccaatgaatttgttttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaaatcttatga 19826003  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19826004 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatcggataattccaaaccttaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 19826103  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatg 239  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19826104 atttaaattatgttgtgagttgatcttgggataggaatg 19826142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Original strand, 29847918 - 29848186
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||    
T  29847918 tttgttagctttccaatgaatttggtttgacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttaatgaaatcttatga 29848017  T
Q  101 aaa--ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaaga 198  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29848018 aaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaaga 29848117  T
Q  199 gtatttaacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagacttaca 267  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  29848118 gtatttaatccatgttgtgagttgatcttgggataggaatagaagttgttaataagttatagacttaca 29848186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 19443695 - 19443919
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  19443695 tttgttagctttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgaagaaaatactccacgtaggtcttagtgaaatcttatga 19443794  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19443795 aaattcagcataaccatttccaagttaatcgaaaacttatgggataattccagaactaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 19443894  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatc 225  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    
T  19443895 atttaacccatgttgtgagttgatc 19443919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 28947981 - 28947764
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28947981 tttgttagctttccaatgactttgctttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatga 28947882  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28947881 aaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagagt 28947782  T
Q  201 atttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||||    
T  28947781 atttaacctatgttgtga 28947764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 27851640 - 27851421
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27851640 tttgttagctttccaatggatttggtttcacttgaaaatgatttttgatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatga 27851541  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27851540 aaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagt 27851441  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagt 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  27851440 atttaacctatgttgtgagt 27851421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 15173872 - 15174091
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15173872 tgttagctttccagtggatttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaatgaggtcttagtgaaatcttatgaaa 15173971  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  15173972 attcaacataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaattgtttaagggtat 15174071  T
Q  203 ttaacctatgttgtgagttg 222  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15174072 ttaacctatgttgtgagttg 15174091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 225
Target Start/End: Original strand, 20556511 - 20556732
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20556511 gttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaa 20556610  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  20556611 ttcagcataaccgtttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaaatactatgagttaaattaaggtgttaaagagtatt 20556710  T
Q  204 taacctatgttgtgagttgatc 225  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  20556711 taacccatgttgtgagttgatc 20556732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 20733862 - 20734110
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  20733862 tttgttagctttccaatggctttagtttcacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatct-atga 20733960  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20733961 aaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagt 20734060  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttga-tcttgggatatgaatgaaagttgtta 249  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||| || ||||||| |||||||    
T  20734061 atttaacctatgttgtgagtcgacccttggggtaggaatgaaggttgtta 20734110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 15817173 - 15817411
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  15817173 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgataatactccaagaaggtcttagtgaaattttatga 15817272  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  15817273 aaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaagggataattccaaccctcaaaactagaagtattatgaggtcaattaagttgtttaagatt 15817372  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatg 239  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  15817373 atttaacccatgttgtgagttgatcttggggtaggaatg 15817411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 4 - 225
Target Start/End: Original strand, 25619375 - 25619596
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25619375 gttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttattttttgagatatgatggaaatagtccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaa 25619474  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25619475 ttcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaagtaccatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 25619574  T
Q  204 taacctatgttgtgagttgatc 225  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  25619575 taacccatgttgtgagttgatc 25619596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 16133085 - 16133309
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||    
T  16133085 tttgttagctttccaatgtcgttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaattcatagga 16133184  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16133185 aaattcagcataaccatttccaagttaatcggaaacttatgggataattccaggactaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 16133284  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatc 225  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    
T  16133285 atttaacccatgttgtgagttgatc 16133309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 8767678 - 8767885
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8767678 tttgttagctttccaatggctttggtttgacatgaaaataatttttggtttttgagatattatgaaagtactccaaggaggtcttagtgaaatcttatga 8767777  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8767778 aaattcagcataaccatttctaagtgaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagaat 8767877  T
Q  201 atttaacc 208  Q
    ||||||||    
T  8767878 atttaacc 8767885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 17318540 - 17318754
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17318540 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgagttttggttcttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 17318639  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17318640 ttcagcataaccgtttctaaggtaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatt 17318739  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||    
T  17318740 taacctatgttgtga 17318754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 19655647 - 19655861
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19655647 gttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 19655746  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19655747 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatt 19655846  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||    
T  19655847 taacctatgttgtga 19655861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18703198 - 18702984
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  18703198 gttagctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagcaggtcatagtgaaatctaatgaaaa 18703099  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  18703098 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtttttaagagtatt 18702999  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||    
T  18702998 taacctatgttgtga 18702984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18709133 - 18708919
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  18709133 gttagctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagcaggtcatagtgaaatctaatgaaaa 18709034  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  18709033 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatt 18708934  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||    
T  18708933 taacctatgttgtga 18708919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 225
Target Start/End: Original strand, 14979040 - 14979261
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  14979040 gttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatgtttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggaggtcttggtgaaatcttaggaaaa 14979139  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14979140 ttcagtataaccttttctaatttaatccaaaacttatagaataatttcaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 14979239  T
Q  204 taacctatgttgtgagttgatc 225  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  14979240 taacccatgttgtgagttgatc 14979261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 25347763 - 25347556
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||    
T  25347763 tttgttagctttccaatggcgttggtttaacttgaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcgtagga 25347664  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  25347663 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctccaaactagaagtgccatgagttcaattaaggtgtttgagagt 25347564  T
Q  201 atttaacc 208  Q
    ||||||||    
T  25347563 atttaacc 25347556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 7827606 - 7827392
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7827606 gttagctttctagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagaaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 7827507  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  7827506 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaattagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatt 7827407  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||    
T  7827406 taacctatgttgtga 7827392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 15891129 - 15891326
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15891129 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 15891228  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagta 201  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  15891229 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctaaaaactagaagtactatgatttcaattagggtgtttaagagta 15891326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 8759932 - 8760138
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8759932 tttgttagctttccaatggctgtggattgacatgaaaataattttg-gtttttgagatattatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatga 8760030  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8760031 aaattcagcataaccatttctaagtgaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagaat 8760130  T
Q  201 atttaacc 208  Q
    ||||||||    
T  8760131 atttaacc 8760138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 13764983 - 13764769
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  13764983 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgactttt-------gagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttaatgaaatattatga 13764891  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  13764890 aaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttaaattaaggtgttttagagt 13764791  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttg 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  13764790 atttaacctatgttgtgagttg 13764769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Original strand, 34296688 - 34296903
Alignment:
Q  5 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 104  Q
    ||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34296688 ttagcttcccaaaggctttggcttcacttgaaaatgatttttggtttttgggatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 34296787  T
Q  105 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 204  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |    
T  34296788 tcagtataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaaggactatgagtttaattagggtgtttaagagtatgt 34296887  T
Q  205 aacctatgttgtgagt 220  Q
    ||| ||||||||||||    
T  34296888 aacttatgttgtgagt 34296903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 23150685 - 23150898
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23150685 gttagcttttcaatggctttggtttgacgtgaaaataatttttggttcttgagatatgatgaaaatattccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 23150784  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  23150785 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaattagaagtactatgagttcaact-aggtgtttaagagtatt 23150883  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||    
T  23150884 taacctatgttgtga 23150898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20183198 - 20182988
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20183198 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttaaaaatgatttttcgtttttgagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaa 20183099  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20183098 atttagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggatgattccaaacct-caagctagaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagagtat 20183000  T
Q  203 ttaacctatgtt 214  Q
    ||||||| ||||    
T  20182999 ttaacctttgtt 20182988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Original strand, 22152793 - 22153003
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22152793 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttaaaaatgatttttcgtttttgagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaa 22152892  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22152893 atttagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggatgattccaaacct-caagctagaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagagtat 22152991  T
Q  203 ttaacctatgtt 214  Q
    ||||||| ||||    
T  22152992 ttaacctttgtt 22153003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Original strand, 25601694 - 25601909
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  25601694 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgagttttggtttttgcgttatgatgaaaatactccaaggaggttttagtgaaattttatgaaa 25601793  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  25601794 attcagcacaaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtaataagagtttaattaaggggtttaagagtat 25601893  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||| ||||    
T  25601894 ttaacctatgtggtga 25601909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18928358 - 18928149
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18928358 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaattatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 18928259  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  18928258 attcagcctaacagtttctaagttaatccaaaacttatggaatgattcaaaaactcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtat 18928159  T
Q  203 ttaacctatg 212  Q
    || |||||||    
T  18928158 tttacctatg 18928149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 1254394 - 1254215
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  1254394 tttgttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactctaaggaggtcttagtgaaatcttatga 1254295  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagtt 180  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  1254294 aaattcagtataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagtt 1254215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 5834150 - 5834362
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  5834150 tttgttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatattatga 5834249  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  5834250 aaattcagcataaccgtttctaag-taatccaaaacatagggaataattctaaatctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgactaagagt 5834348  T
Q  201 atttaacctatgtt 214  Q
    ||||||||||||||    
T  5834349 atttaacctatgtt 5834362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20177382 - 20177170
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  20177382 tttgttagctttccaatggctttagtttcacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatattatga 20177283  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  20177282 aaattcagcataaccgtttctaag-caatccaaaacatagggaataattctaaacctcaaaactataagtactaggagttcaattaaggtgtctaagagt 20177184  T
Q  201 atttaacctatgtt 214  Q
    ||||||||||||||    
T  20177183 atttaacctatgtt 20177170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 23956499 - 23956278
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||| || | ||||| | |||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  23956499 tttgttagctttccaatgactctagtttggcgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatga 23956400  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  23956399 aaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggtttaattaaggtgtttaagagt 23956300  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttg 222  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  23956299 atttaacctaagttgtgagttg 23956278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 27125894 - 27126109
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagttt-ttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  27125894 gttagctttccagtggcttttgtttgaggtgaaaatgattttttggttcttgagatacgatgaaaatactttaaaaaggtcttagtgaaatcttatgaaa 27125993  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  27125994 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaagaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtat 27126093  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||    
T  27126094 ttaacctatgttgtga 27126109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 15705029 - 15705243
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  15705029 gttagctttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatacctcaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaa 15705128  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  15705129 ttcagcataactgtttcttagttaatccaaaatttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatt 15705228  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||| | ||||||||    
T  15705229 taacatgtgttgtga 15705243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 22158609 - 22158821
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  22158609 tttgttagctttccaatggctttagtttcacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatattatga 22158708  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  22158709 aaattcagcataaccgtttctaag-aaatccaaaacatagggaataattctaaacctcaaaactaaaagtactaggagttcaattaaggtgactaagagt 22158807  T
Q  201 atttaacctatgtt 214  Q
    ||||||||||||||    
T  22158808 atttaacctatgtt 22158821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 23491586 - 23491803
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  23491586 tttgttagctttccaatggctttggtttggattgaaaataatttttggtttttgagatatgatgacaatattccaaggaggtcttagtgaaattttatga 23491685  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  23491686 aaattcagcataactgttactaagttaatccaaaacttaggtaataattccaaacctcaaaaatagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagt 23491785  T
Q  201 atttaacctatgttgtga 218  Q
    || |||| ||||||||||    
T  23491786 atctaacatatgttgtga 23491803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 23497184 - 23497401
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  23497184 tttgttagctttccaatggctttggtttggattgaaaataatttttggtttttgagatatgatgacaatattccaaggaggtcttagtgaaattttatga 23497283  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  23497284 aaattcagcataactgttactaagttaatccaaaacttaggtaataattccaaacctcaaaaatagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagt 23497383  T
Q  201 atttaacctatgttgtga 218  Q
    || |||| ||||||||||    
T  23497384 atctaacatatgttgtga 23497401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 31734340 - 31734128
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31734340 gttagttttccagtggctttggtttgacgtgaaaataatattagattcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 31734241  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  31734240 ttcagcataatcgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtac--tgagttcaactagggtgtttaagagtatt 31734143  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||    
T  31734142 taacctatgttgtga 31734128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 19773127 - 19773341
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    ||||| |||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  19773127 gttagttttccagtggtttttgtttgacatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaa 19773226  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    || ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  19773227 tttagcataactgtttttaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatt 19773326  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||| | ||||||||    
T  19773327 taacatgtgttgtga 19773341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 4477292 - 4477073
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  4477292 gttagctttccaatggatttggtttgactctaaaatgatttttggtttatgagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaa 4477193  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    ||||||| |||  |||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4477192 ttcagcaaaacattttccaagttaatcaaaaactggtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatt 4477093  T
Q  204 taacctatgttgtgagttga 223  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  4477092 taacccatgttgtgagttga 4477073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Original strand, 18455489 - 18455703
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  18455489 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatacttcaaggaggttttagtgaaattttatgaaa 18455588  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||  |   ||||||| | ||| || | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18455589 attccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttgta-tactatgagttcaattaaggtctttaagagtat 18455687  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||    
T  18455688 ttaacctatgttgtga 18455703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Original strand, 27317981 - 27318187
Alignment:
Q  12 tccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcat 111  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27317981 tccagtggctttgatttgacgtgaaaaggatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaagaggttttagtgaaatcttatgaaaattcagcat 27318080  T
Q  112 aaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctat 211  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||   || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  27318081 aaccgtttctaagttaattcaaaactagaggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaaatatggtgtttaagagtatttaacctac 27318180  T
Q  212 gttgtga 218  Q
    |||||||    
T  27318181 gttgtga 27318187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 25921364 - 25921150
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25921364 tgttatctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 25921265  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||   |   ||||||| | |||  | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25921264 attccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgaattgtctccaaacttcaaagtttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 25921166  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||    
T  25921165 ttaacctatgttgtga 25921150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 925 - 755
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  925 tttgttagctttccaatggctttggttttacttgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatga 826  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagta 171  Q
    |||||||| ||||   |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  825 aaattcagtataattgtttctaagttaatctaaaatttatggaataattccaaagctcaaaactagaagta 755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 23655974 - 23655804
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  23655974 tgttagctttccagtggctttggtttgccttgaaaataatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaaattttatgaaa 23655875  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtact 173  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23655874 attcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagagaataattccaaacctcaaaactagaagtact 23655804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 23838636 - 23838443
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||| ||    
T  23838636 tttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtatgtcttagggaaatcttaaga 23838537  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgttt 194  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  23838536 aaattcagcacaaccattaccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtaatatgagtgcaattaaggtgttt 23838443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18398553 - 18398339
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  18398553 tgttagctttctattggatttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccagggaggtcttagtgaaattttacgaaa 18398454  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||| |  |   ||||||| | |||||| |  || ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18398453 attccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatagattgtgtccaaacttcaaaacttg-tgttctatgagctcaattaaggtgtttaagagtat 18398355  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||| ||||||||||    
T  18398354 ttaacttatgttgtga 18398339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 25807769 - 25807602
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||| |||||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  25807769 tttgttagctttccaatgactctggtttgtcgtgaaaattatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatga 25807670  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaa 168  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  25807669 aaattcagcaaaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaa 25807602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18585253 - 18585040
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18585253 tgttagctttccagtggatttggtttgacttgaaaattatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 18585154  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || || |||||||| ||||  |  ||||| | ||| || |  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  18585153 attccgcataactatttctaagtcaaccccaaacttat-ggattgtctcaaacttcaaagcttg-tgtactgtgagttcaattaaggtgtttaaaagtat 18585056  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
    |||||||| |||||||    
T  18585055 ttaacctaagttgtga 18585040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 32259481 - 32259268
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32259481 tgttagttttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttgctttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 32259382  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||| ||||||| ||||||| || || |||||||||||||  |   |||||| ||  || || |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32259381 attccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaa-cttcaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgcttaagagtat 32259284  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||    
T  32259283 ttaacctatgttgtga 32259268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Original strand, 17857109 - 17857319
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  17857109 tgttagatttccaatggctttggtatgacttgaaaatgatttttagattttgggttatgatgaaaacactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaa 17857208  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||| | ||||| |||||||||| || |||||||||||||  |  |||||||| | ||||| ||||||| || || || |||||||  ||||||||||||    
T  17857209 attccggataactatttctaagtcaacccaaaacttatggtttgtttccaaacttcaaaacgagaagtattaggaatttaattaagaggtttaagagtat 17857308  T
Q  203 ttaacctatgt 213  Q
    |||||||||||    
T  17857309 ttaacctatgt 17857319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22556866 - 22556669
Alignment:
Q  21 tttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  22556866 tttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagttatgatgaacatactccaagaaggtcttagtgaaattttatgaaaattttgcataaccatttc 22556767  T
Q  121 taagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 218  Q
    || || || |||||||||||||  |   ||||||| | |||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22556766 taggtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacatcaaaactagaagtactaggagtttcattaaggggtttaagagtatttaacctattttgtga 22556669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 13285343 - 13285129
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  13285343 tgttagctttctagtggctttagttttacttgaaaatgatttttggtttttgatttatgatgaaaacactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaa 13285244  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||| ||||||| |||||||||  || |||||||||||||  |   ||||||| | |||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13285243 attccgcataactatttctaagccaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttcatttaaggtgtttaagagtat 13285145  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||| ||||||    
T  13285144 ttaacctatattgtga 13285129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Original strand, 20411089 - 20411299
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  20411089 tgttagcattccagtggctttggtttgacttgaaaataagttttggtttttgaggtatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaattttatgaaa 20411188  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||| ||||||| ||||||| || || |||||||||||||  |   ||||||| | ||| || |  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20411189 attccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtatccaaacttcaaagcttg-tgtaatatgagttcaattaagttgtttaagagtat 20411287  T
Q  203 ttaacctatgtt 214  Q
    ||||||||||||    
T  20411288 ttaacctatgtt 20411299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 79 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 27557028 - 27556905
Alignment:
Q  79 aggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgag 178  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||| |||||||    
T  27557028 aggtcatagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaattagaagttctatgag 27556929  T
Q  179 ttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  27556928 ttcaattaaggtgtttaagagtat 27556905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 29044945 - 29044806
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  29044945 tgttagctttccagtggctttggttttacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatacttcaaggagatcttagtgaaatgttatgaaa 29044846  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 142  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  29044845 attccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 29044806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 87 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 23415262 - 23415151
Alignment:
Q  87 gtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaatta 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  23415262 gtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaatta 23415163  T
Q  187 aggtgtttaaga 198  Q
    ||||||||||||    
T  23415162 aggtgtttaaga 23415151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 31022112 - 31022267
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  31022112 tttgttagctttccaatgactctggtttggcgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatacttcaaggagatcttagtgaaattttatga 31022211  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacc 156  Q
    |||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  31022212 aaattcactaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacc 31022267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 141
Target Start/End: Original strand, 34141041 - 34141180
Alignment:
Q  2 ttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 101  Q
    |||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||| |||||||    
T  34141041 ttgttagctttctagtggcgttggtatgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgataaaaatactccaagaagatcttagtgaaattttatgaa 34141140  T
Q  102 aattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatg 141  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  34141141 aattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatg 34141180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 141
Target Start/End: Original strand, 34153657 - 34153796
Alignment:
Q  2 ttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 101  Q
    |||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||| |||||||    
T  34153657 ttgttagctttctagtggcgttggtatgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgataaaaatactccaagaagatcttagtgaaattttatgaa 34153756  T
Q  102 aattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatg 141  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  34153757 aattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatg 34153796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 212
Target Start/End: Original strand, 15938650 - 15938851
Alignment:
Q  10 tttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| ||| ||||||| |||    
T  15938650 tttccaatggctttggtttgacttgaaaattatttttatcttttgagttatgatgaaaatactctaagtaggtcttggtgaaattttacgaaaatttagc 15938749  T
Q  110 ataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacct 209  Q
    ||||| |||| ||||| || |||||||||||||  |  |||||||  | |||| | | |||  || |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15938750 ataactatttttaagtcaacccaaaacttatggtttgtttccaaaattcaaaaattg-agtgttaggagttcaattaaggtgtttaagggtatttaacct 15938848  T
Q  210 atg 212  Q
    |||    
T  15938849 atg 15938851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 7430160 - 7430069
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaa 92  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  7430160 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttaatgaaa 7430069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 22806383 - 22806276
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  22806383 gttagctttccagtggctttggtttgacctgaaaatgatttttggttcgtgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaa 22806284  T
Q  104 ttcagcat 111  Q
    ||||||||    
T  22806283 ttcagcat 22806276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 102
Target Start/End: Original strand, 27330390 - 27330488
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27330390 gttagttttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 27330488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 102
Target Start/End: Original strand, 27391130 - 27391228
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27391130 gttagttttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 27391228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 12942766 - 12942666
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  12942766 tttgttagctttccaatggctttagtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatga 12942667  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  12942666 a 12942666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Original strand, 28288922 - 28289022
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  28288922 tttgttagctttccaatggctttggttggactcgaaaatgagttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatga 28289021  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  28289022 a 28289022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 14594040 - 14594131
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaa 92  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  14594040 tttgttagctttccgatggctttggtttgatttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttaatgaaa 14594131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Original strand, 22523388 - 22523594
Alignment:
Q  5 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 104  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||| || ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||  ||| ||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  22523388 ttagctttctaatggctttgttttggcttaaagatgatttttaggttttgagttatggtgaaaatactaaaagtaggtcttggtgaaattttacgaaaat 22523487  T
Q  105 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 204  Q
    |||||||||| |||| ||||| || ||| || ||||||  |  |  ||||||| |||||| | ||||||| ||||| ||| | | |||||||||||||||    
T  22523488 tcagcataactatttttaagtgaacccataagttatggtttggtcgcaaacctcaaaacttg-agtactaggagtttaataaggatgtttaagagtattt 22523586  T
Q  205 aacctatg 212  Q
    ||||||||    
T  22523587 aacctatg 22523594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 23415539 - 23415441
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 101  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  23415539 tgttagctttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttgttgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 23415441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23221500 - 23221294
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||| || |  ||||||||| |||  ||||||||    
T  23221500 tgttagctttccaatttttttggtttgacttgaaaatgatatttagatttggagttatgatgaaaatactccatgtgggtcttagtaaaactttatgaaa 23221401  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||||||||||   || |||||||||  |||| |||||||  |  |||||||| | |||| | | |||| || ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  23221400 attcagcataatttttcctaagttaaatcaaaccttatggtttgtttccaaacttcaaaatttg-agtattaggagtttaattaagatgtttaagagtat 23221302  T
Q  203 ttaaccta 210  Q
    | ||||||    
T  23221301 taaaccta 23221294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 213
Target Start/End: Original strand, 31161878 - 31162085
Alignment:
Q  5 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 104  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||| |||| ||||||| | ||||| ||| | ||||    
T  31161878 ttagcattccaatgactttgatttgacatcaaaatgatttttagattttgagttatgttgaaaacactccaagtaggtcttggagaaattttaagtaaat 31161977  T
Q  105 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 204  Q
    | ||||| || ||||| |||| || |||||||||||||  |  |||||||  | |||||| | |||| || ||||| ||||| | ||||||| |||||||    
T  31161978 ttagcatgactatttccaagtcaacccaaaacttatggtttgtttccaaatttcaaaacttg-agtattaagagtttaattatgatgtttaaaagtattt 31162076  T
Q  205 aacctatgt 213  Q
    |||||||||    
T  31162077 aacctatgt 31162085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 27557297 - 27557199
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 101  Q
    ||||||||||||  ||| ||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||    
T  27557297 tgttagctttccggtggatttagtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggatgtcttagtgaatttttatgaa 27557199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 35057141 - 35057000
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | | ||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||| | ||||| ||| |     
T  35057141 tttgttagctttccaatggctttagtttgacttgaaaatgttttatggattttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttggagaaattttaagg 35057042  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 142  Q
    ||| |  ||||||| ||||| |||| || | |||||||||||    
T  35057041 aaacttggcataactatttccaagtcaaccaaaaacttatgg 35057000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Original strand, 15891994 - 15892094
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||    | |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  15891994 tttgttagctttccaatggcttttgttttgtgttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatga 15892093  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  15892094 a 15892094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 33862370 - 33862270
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  33862370 tttgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatga 33862271  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  33862270 a 33862270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 162 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25753026 - 25752963
Alignment:
Q  162 actagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatc 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  25753026 actagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttagaccatgttgtgagttgatc 25752963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 162 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25755196 - 25755133
Alignment:
Q  162 actagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatc 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  25755196 actagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttagaccatgttgtgagttgatc 25755133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Original strand, 1540497 - 1540597
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||| ||||  | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  1540497 tttgttagctttccaatggctttggtgtggcataaaaatgagttttggtttaggcgttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatga 1540596  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  1540597 a 1540597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 101
Target Start/End: Original strand, 17883087 - 17883183
Alignment:
Q  5 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | ||  |||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  17883087 ttagctttccaatggctttggtttggcgttaatttgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 17883183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 19234720 - 19234658
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatga 65  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19234720 tgttagattttcattggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatga 19234658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 12742894 - 12742794
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||   | ||| |||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  12742894 tttgttagctttccaatggctttagtgtggagtaaaattgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatga 12742795  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  12742794 a 12742794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 16135680 - 16135613
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaat 69  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  16135680 tttgttagctttccaatggctttggtttaactt-aaaatgatttttatattttgagatatgatgtaaat 16135613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 31163594 - 31163462
Alignment:
Q  10 tttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagc 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | | ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||   ||||| |||   ||| | |||    
T  31163594 tttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgttttgtggattttgagttatgatgaaaacacttcaagtaggtcttgaggaaattttaaagaaacttagc 31163495  T
Q  110 ataaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 142  Q
    ||||| ||||| |||| | ||||| ||||||||    
T  31163494 ataactatttccaagtcattccaatacttatgg 31163462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 138 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16135594 - 16135519
Alignment:
Q  138 tatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgt 213  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16135594 tatggaatatttccaaacctcaaaactataagtactaggagtttaattaagaggtttaagagtatttaacctatgt 16135519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 142
Target Start/End: Original strand, 3007530 - 3007668
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| | | ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |  |||| |||   |||    
T  3007530 gttatcttttcaatggcgttggtttgacttgaaaatgttttgtggattttgagttatgatgaaaacacttcaagtaggtcttgggaaaattttaaagaaa 3007629  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 142  Q
     | |||||||| ||||| |||| | ||||| ||||||||    
T  3007630 cttagcataactatttccaagtcattccaatacttatgg 3007668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 101
Target Start/End: Original strand, 19858510 - 19858608
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 101  Q
    ||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||| |||| ||||  ||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||| | |||||||    
T  19858510 tgttagctttctagtggcgtcggtttgacttgaaaatgaattttggtttaggagttatgatgaaaatactcaaaggagatcttagtgaatttttatgaa 19858608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 169 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 29044731 - 29044682
Alignment:
Q  169 gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29044731 gtactgtgagttcaattaaggtgtttaagagtatataacctatgttgtga 29044682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 19234661 - 19234617
Alignment:
Q  174 atgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19234661 atgagttcaattaaggtgtttaaaagtatttaacctatgttgtga 19234617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 1555598 - 1555527
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatact 72  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||   |||||||||||| ||| ||||    
T  1555598 tttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 1555527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 16826406 - 16826477
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatact 72  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||   |||||||||||| ||| ||||    
T  16826406 tttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 16826477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 21776134 - 21776205
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatact 72  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||   |||||||||||| ||| ||||    
T  21776134 tttgttagctttctaatggctttggtttgacgccaaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 21776205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 25175183 - 25175112
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatact 72  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||| |  ||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||    
T  25175183 tttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagatattgagatatgattaaattact 25175112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 61
Target Start/End: Original strand, 18334180 - 18334238
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatg 61  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  18334180 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 18334238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 24423121 - 24423063
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatg 61  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  24423121 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 24423063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 27654635 - 27654706
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatact 72  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||| |  |||||||||||||   |||||||||||| ||| ||||    
T  27654635 tttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 27654706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Original strand, 32277427 - 32277498
Alignment:
Q  11 ttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggt 82  Q
    ||||| |||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||    
T  32277427 ttccattggccttagtttgacttgaaaataatgttttgtttttgagttatgaagaaaatactctaaggaggt 32277498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 61
Target Start/End: Original strand, 26924035 - 26924093
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatg 61  Q
    |||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  26924035 tgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 26924093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 33864852 - 33864794
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatg 61  Q
    |||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  33864852 tgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 33864794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 8055604 - 8055551
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgag 56  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  8055604 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgaattttggtttatgag 8055551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 16240365 - 16240320
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttag 48  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  16240365 tgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttag 16240320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 235 - 267
Target Start/End: Original strand, 19829601 - 19829633
Alignment:
Q  235 gaatgaaagttgttattaagttatagacttaca 267  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19829601 gaatggaagttgttattaagttatagacttaca 19829633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 66)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Original strand, 44822537 - 44822802
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44822537 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatga 44822636  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44822637 aaattcagcataaccgtttccaagttaatccaaaacttacgggataattccaaacctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggggtttaagagt 44822736  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagacttaca 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  44822737 atttaacctatgttgtgagttgatcttgggata-gaatggaagttgttattaggttatagacttaca 44822802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 8276407 - 8276671
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  8276407 tttgttagctttccaatggctttggtttggcttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaaatcttatga 8276506  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  8276507 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgagataattccaaacctcaaaactagaagtactataggttcaattaaggcgtttaagagt 8276606  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagactta 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8276607 atttaacctatgttgtgagttgatcttgggataggaatggaagttgttattaagttatagactta 8276671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Original strand, 24815267 - 24815533
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  24815267 tttgttagctttccaatgtctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatga 24815366  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24815367 aaattcagcaaaaccgtttccaagttaatccaaaacttatgggataattctaaggctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagt 24815466  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagacttaca 267  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  24815467 atttaacccatgttgtgagttgatcttgggataggaatggaagttgttaataagttatagacttaca 24815533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 21180740 - 21181004
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  21180740 tttgttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgaattttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatga 21180839  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21180840 aatttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaattcttaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 21180939  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagactta 265  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  21180940 atttaacccatgttgtgagttgattttgggataggaatggaagttgttaataagttatagactta 21181004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Original strand, 38057066 - 38057332
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  38057066 tttgttagctttctagtggctttcgtttaacttgcaaattatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaagggggtattagtgaaatcttatga 38057165  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38057166 aaattcagtataaccatttctaagttaatacaaaacttatgggattattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtacaattaaggtgtttaagagt 38057265  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagacttaca 267  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38057266 atttaacctatgttgtgagttaatcttgggataggaatgaaagttgttattaagttatagacttaca 38057332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 4 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22350222 - 22349959
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22350222 gttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatcatttctagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaa 22350123  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22350122 ttcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaagtactacgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 22350023  T
Q  204 taacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagacttaca 267  Q
     |||  |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  22350022 caactcatgttgagagttgatcttgggataggaatggaagttgttaataagttatagacttaca 22349959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Original strand, 7792267 - 7792533
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  7792267 tttgttagatttccaatggctttggtttgaattgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatga 7792366  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||     
T  7792367 aaattcagcaaaaccgtttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatgtgagttcaattaaggtgtttaagagc 7792466  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagacttaca 267  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  7792467 atttaacccatgttgtgatttgatcttgggataggaatggaagttgttaataagttatagacataca 7792533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 3 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 16401303 - 16401039
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16401303 tgttagctttccaatggctttggtttgactcaaaaatgacttttagtgtttgagatatgatcaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 16401204  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16401203 attcagcaaaatcgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatagtat 16401104  T
Q  203 ttaacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagacttaca 267  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||| | ||||||| |||||||||||||||||    
T  16401103 ttaacccatgttttgagttgatcttgggacaggaatggaggttgttaataagttatagacttaca 16401039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 20031305 - 20031529
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  20031305 tttgttagctttccaatgtttttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactcaatggaggtcttagtgaaatcttatga 20031404  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20031405 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaacccttaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaggagt 20031504  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatc 225  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    
T  20031505 atttaacccatgttgtgagttgatc 20031529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 3 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 50001109 - 50000884
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50001109 tgttagctttccaatggctttagtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 50001010  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatcc-aaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagta 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50001009 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaaacttatgagataattcaaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagta 50000910  T
Q  202 tttaacctatgttgtgagttgatctt 227  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  50000909 tttaacctatgttgtgagttggtctt 50000884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 2332625 - 2332849
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  | |||||||||||||||| |||||||    
T  2332625 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatggaaatactctagggaggtcttagtgaaaccttatga 2332724  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2332725 aaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 2332824  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatc 225  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    
T  2332825 atttaacccatgttgtgagttgatc 2332849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 46198142 - 46198361
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46198142 tgttagctttccggtgactttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttaatgaaatcttatgaaa 46198241  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46198242 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 46198341  T
Q  203 ttaacctatgttgtgagttg 222  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  46198342 ttaacctatattgtgagttg 46198361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 21239713 - 21239927
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21239713 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 21239812  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  21239813 ttcagcataatcgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagaatttt 21239912  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||    
T  21239913 taacctatgttgtga 21239927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Original strand, 22130480 - 22130726
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  22130480 tttgttagctttccaatggaattggtttgatttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatga 22130579  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22130580 aaattcagcataatcttttctaatttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 22130679  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgat-cttgggatatgaatgaaagttg 246  Q
    |||||||| |||||||||||| || |||||| || ||||| ||||||    
T  22130680 atttaacccatgttgtgagtttatccttggggtaggaatggaagttg 22130726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 28312985 - 28312763
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  28312985 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgacttttagtttttgagttatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatga 28312886  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28312885 aaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaggctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagt 28312786  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttga 223  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  28312785 atttaacccatgttgtgagttga 28312763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 29764051 - 29764274
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29764051 tgttagctttccagtggatttggtttaacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 29764150  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattcca----aacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaaga 198  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29764151 attcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaattaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaaga 29764250  T
Q  199 gtatttaacctatgttgtgagttg 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  29764251 gtatttaacctatgttgtgagttg 29764274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 51323910 - 51323695
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51323910 tgttagatttccagtggctttggtttgacttgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 51323811  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51323810 attccgcataactatttctaagtcaattcaaaacttatggaataactccaaaccttaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 51323711  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||| ||||||||||    
T  51323710 ttaacatatgttgtga 51323695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 41227122 - 41227336
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41227122 gttagctttccagtggctttggtttgacgcgaaaatgattttttgttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 41227221  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  41227222 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactaggatgtttaagagtatt 41227321  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||    
T  41227322 taacctatgttgtga 41227336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 41225869 - 41226083
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41225869 gttagctttccagtggctttggattgacgagaaaatgatttttagttcttgagatatgataaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 41225968  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  41225969 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactaggatgtttaagagtatt 41226068  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||    
T  41226069 taacctatgttgtga 41226083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 42912684 - 42912470
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42912684 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 42912585  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  42912584 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactataagttcaattagggtgtttaagagtatt 42912485  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||  ||||||||||    
T  42912484 taatatatgttgtga 42912470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 296992 - 296745
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  296992 tttgttagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatatttgatttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagcgaaatcttatga 296893  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  296892 aaattcagcacaaccatttctaaattaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaccatgagttcaattaaggtgtttacgagt 296793  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatc-ttgggatatgaatgaaagttgt 247  Q
    |||||| | |||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||    
T  296792 atttaatccatgttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttgt 296745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 225
Target Start/End: Original strand, 13881034 - 13881255
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    ||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13881034 gttagctttacagtggttttggtttgacttggaaatgatttttagtttttgtgatatgatgaaattagtccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaa 13881133  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13881134 ttcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaaactaaaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 13881233  T
Q  204 taacctatgttgtgagttgatc 225  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  13881234 taacccatgttgtgagttgatc 13881255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 7052470 - 7052688
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  7052470 tttgttaactttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtattagtgaaattttatga 7052569  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaa-ggtgtttaagag 199  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||    
T  7052570 aaattctgcataaccgtttctaagtcagtccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaagggggtttaagag 7052669  T
Q  200 tatttaacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  7052670 tatttaacctatgttgtga 7052688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20588313 - 20588099
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| |||||||||||||   ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  20588313 gttagctttccagtggctttggtttggtgtgaaaatcatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaagagatcttagtgaaattttatgaaaa 20588214  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20588213 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatt 20588114  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||    
T  20588113 taacctatgttgtga 20588099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20592851 - 20592637
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| |||||||||||||   ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  20592851 gttagctttccagtggctttggtttggtgtgaaaatcatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaagagatcttagtgaaattttatgaaaa 20592752  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20592751 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatt 20592652  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||    
T  20592651 taacctatgttgtga 20592637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 12710523 - 12710308
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  12710523 tgttagctttccagtggcgttggtttgacttacaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaatttatgaaa 12710424  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12710423 attcagcataaccgtttctaagtcaatccgaaacttatggaataactccaaacctcaaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 12710324  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||    
T  12710323 ttaacctatgttgtga 12710308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 23194966 - 23195173
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  23194966 tttgttagctttccaatgactttggtttaacttgaaaatgacttttagtgtttgagttatgataaaaatactcctaagaggtcttagtgaaatcttatga 23195065  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  23195066 aaattcagcataaccctttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctccaaactagaagtaccatgagttcaattaaggtgtttgagagt 23195165  T
Q  201 atttaacc 208  Q
    ||||||||    
T  23195166 atttaacc 23195173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 4596263 - 4596477
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4596263 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 4596362  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||| |||  |||||| || |||| |||||||||||    
T  4596363 ttcaacataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtaatataggttcaactagggtgcttaagagtatt 4596462  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||    
T  4596463 taacctatgttgtga 4596477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 16058732 - 16058946
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16058732 gttagctttccagtggctttgatttgacgagaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggttttagtgaaatcttatgaaaa 16058831  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  16058832 ttcagcataaccgtttctaatttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagattatt 16058931  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    ||| |||||||||||    
T  16058932 taagctatgttgtga 16058946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 19676345 - 19676131
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19676345 gttagctttccagtggttttagttggacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 19676246  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  19676245 ttcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatt 19676146  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||  ||||||||||    
T  19676145 taatatatgttgtga 19676131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 20437642 - 20437860
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  20437642 tttgttagctttccaatggatttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatga 20437741  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20437742 aaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggcttaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagt 20437841  T
Q  201 atttaacctatgttgtgag 219  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  20437842 atttaacccatgttgtgag 20437860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 21046467 - 21046681
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  21046467 gttaggtttccagtggctttggtttgatgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaataatccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaa 21046566  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  21046567 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgggttcaattagggtgtttaagtgtatt 21046666  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||    
T  21046667 taacctatgttgtga 21046681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Original strand, 14238029 - 14238244
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    |||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14238029 tgttagcttttcagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttagtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 14238128  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  14238129 attcagcataactgtttctgagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaagactagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtat 14238228  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
     |||||||||||||||    
T  14238229 ctaacctatgttgtga 14238244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 45574467 - 45574680
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||           
T  45574467 tttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtgaaat------- 45574559  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
        ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45574560 ----tcagcataaccgtttctaaattaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtgctatgagttcaattaaggtgtttaagcgt 45574655  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatc 225  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    
T  45574656 atttaacccatgttgtgagttgatc 45574680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 9 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 51082845 - 51082636
Alignment:
Q  9 ctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 108  Q
    ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  51082845 ctttccagtggcgtaggtttgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttaagaaaattcag 51082746  T
Q  109 cataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  51082745 cataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaagactagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacc 51082646  T
Q  209 tatgttgtga 218  Q
    ||||||||||    
T  51082645 tatgttgtga 51082636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 20634052 - 20634267
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20634052 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaa 20634151  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaag-gtgtttaagagtat 202  Q
    |||||||||||| |||||| || ||||||||||||   | |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  20634152 ttcagcataaccgtttctatgtcaatccaaaacttggagaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaagagggtttaagagtat 20634251  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||    
T  20634252 ttaacctatgttgtga 20634267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16372388 - 16372178
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  16372388 tttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatga 16372289  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaaccta-aaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagag 199  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| || ||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  16372288 aaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctacaaaaataaaagtaatatgagtgaaattaaggtgtttaagag 16372189  T
Q  200 tatttaaccta 210  Q
    |||||||||||    
T  16372188 tatttaaccta 16372178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 38887502 - 38887720
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  38887502 tttgttagctttcgaatggctttggtttgatttgaaaatgatttttgatttttgaggtatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatga 38887601  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaa-ggtgtttaagag 199  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  | |||||| |||| || |||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||    
T  38887602 aaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagagaataattacaaaactcaaaactagaagtactaggagtttaattaagggggtttaagag 38887701  T
Q  200 tatttaacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  38887702 tatttaacctatgttgtga 38887720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 45496581 - 45496365
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  45496581 tgttagctttctaatgactttagttttacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaa 45496482  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtg-tttaagagta 201  Q
    | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||    
T  45496481 actcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagggaataatttcaaacctccaaactagaagtactctgagtttaattaaggggatttaagagta 45496382  T
Q  202 tttaacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||||    
T  45496381 tttaacctatgttgtga 45496365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Original strand, 22823824 - 22824038
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  22823824 tgttagctttccagtggctttggtttgacttcaaaataatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaa 22823923  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||  |   ||||||| | |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22823924 attccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagattat 22824022  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||    
T  22824023 ttaacctatgttgtga 22824038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 50544486 - 50544272
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  50544486 tgttagctttcgggtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggttttagtgaaattttatgaaa 50544387  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||  |   ||||||  | ||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50544386 attcggcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaatttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 50544288  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||    
T  50544287 ttaacctatgttgtga 50544272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 215
Target Start/End: Original strand, 24720112 - 24720322
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  24720112 gttagccttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggttttttagttatgatgaaaatacttcatggaggtcttagtgaaattttatgaaaa 24720211  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    ||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||  |   ||||||| | ||| || |  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24720212 ttccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgcactatgagttcagttaaggtgtttaagagtatt 24720310  T
Q  204 taacctatgttg 215  Q
    ||||||||||||    
T  24720311 taacctatgttg 24720322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 1643228 - 1643020
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1643228 tgttaactttccaatggctttagtttgacttgaa--tgatttttggtttttgagttatgatgaaaatacgccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 1643131  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||| ||||||| ||||||| || || |||||||||||||  |   ||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1643130 attccgcataactatttctatgtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 1643032  T
Q  203 ttaacctatgtt 214  Q
    ||||||||||||    
T  1643031 ttaacctatgtt 1643020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 39060731 - 39060516
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaa-tggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  39060731 tgttagctttccaagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaa 39060632  T
Q  102 aattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagta 201  Q
    ||||  | ||||| |||||||||| || |||||||||||||  |   || ||||   ||| || |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39060631 aatttcgtataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctctaaactccaaagcttg-tgtactatgagttcaattaagatgtttaagagta 39060533  T
Q  202 tttaacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||||    
T  39060532 tttaacctatgttgtga 39060516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Original strand, 14792979 - 14793189
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14792979 tgttagctttccagtgactttggttggacttgaaaatgatttttggttttagagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 14793078  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||  ||||||| ||||||| || || |||||||||||||  |   ||||||| | ||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14793079 atttcgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 14793177  T
Q  203 ttaacctatgtt 214  Q
    ||||||||||||    
T  14793178 ttaacctatgtt 14793189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 59 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 294624 - 294426
Alignment:
Q  59 atgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatt--------- 149  Q
    |||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  294624 atgatggaaatactccaagtatgtcttagtgaaatcttatgaaaatttagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattgggataatt 294525  T
Q  150 ccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttg-atcttgggatatgaatgaaagttgt 247  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||    
T  294524 ccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgaaccttgggatagcaatgaaagttgt 294426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Original strand, 17902179 - 17902393
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||| ||||||||    
T  17902179 tgttagctttccagtggctttggcttgacttgaaaatgatttttggttttcaagttatgatgaaaatactccaaggtggtcttgatgaaattttatgaaa 17902278  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||  |   ||||||  | ||| | |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17902279 attctgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaaattcaaagc-atgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 17902377  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||    
T  17902378 ttaacctatgttgtga 17902393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 44892084 - 44891873
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  44892084 tttgttagatttcccgtggctttggtttgccttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactctaaggagatcttagtgaaattttatga 44891985  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||| ||||||| ||||||| || || |||||| ||||||  |   ||||||| | ||| || | | |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44891984 aaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaatttatggattgtctccaaacttcaaatcttgta-tactatgagtacaattaaggtgtttaagagt 44891886  T
Q  201 atttaacctatgtt 214  Q
    | ||||||||||||    
T  44891885 a-ttaacctatgtt 44891873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18121238 - 18121025
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18121238 gttagctttctagtggatttggttggacttgaaaatgatttttggttcttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaa 18121139  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    ||  ||||||  ||||||| || || |||||||||||||  |   ||||||| | ||| |  |  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18121138 tttcgcataattatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcctg-tgcactatgaattcaattaaggtgtttaagagtatt 18121040  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||    
T  18121039 taacctatgttgtga 18121025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 9784758 - 9784898
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |    
T  9784758 tttgttagctttccaatggttttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatacttcaaggagatcttggtgaaattttataa 9784857  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatg 141  Q
    ||||||  |||||| || || |||| || ||||||||||||    
T  9784858 aaattccacataactatctccaagtcaacccaaaacttatg 9784898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 21659781 - 21659685
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatctta 97  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21659781 tttgttagctttccaatggcttcggtttggcatgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatctta 21659685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 6833831 - 6833635
Alignment:
Q  21 tttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttc 120  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||| |||||    
T  6833831 tttggttttaattgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaatttcgaataactatttc 6833732  T
Q  121 taagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||| || |||||||||||||  |   ||||||  | ||| || |   |||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||    
T  6833731 taagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaatttcaaagcttg-tttactgtgagttcaattaaggagcttaagagtatataacctatgttgtga 6833635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16656004 - 16655793
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| || || |||  |||| | ||||| || || | ||||||    
T  16656004 tttgttaggtttctaatgactttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggtggaattaccccaagcaagtcttggtaaatttttatga 16655905  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||  |||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||   |||  |||||    
T  16655904 aaatt-agcataaccatttataagtaaatccaaaacttgtggaatgtttccaaacctcaaaattagaagtactaggagtttaattaaaaggttggagagt 16655806  T
Q  201 atttaacctatgt 213  Q
    |||||||||||||    
T  16655805 atttaacctatgt 16655793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 29535628 - 29535528
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||    
T  29535628 tttgttagctttccaatggctttggttttacttgaaaatgatttttagcttttgagatatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaatttttatga 29535529  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  29535528 a 29535528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 13227440 - 13227340
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||    
T  13227440 tttgttagctttccaatgactttggttttacttgaaaatgatttttagcttttgagatatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaatttttatga 13227341  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  13227340 a 13227340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 16362492 - 16362395
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  16362492 gttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 16362395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 21841343 - 21841243
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  21841343 tttgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgaattttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatga 21841244  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  21841243 a 21841243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Original strand, 21922877 - 21922977
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  21922877 tttgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatga 21922976  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  21922977 a 21922977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 93
Target Start/End: Original strand, 10812786 - 10812876
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaat 93  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  10812786 tgttagctttccagtgcctttggtttgacttagaaatgatttttggtctttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagcgaaat 10812876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 41373048 - 41372948
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||| |||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  41373048 tttgttagatttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatga 41372949  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  41372948 a 41372948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 91
Target Start/End: Original strand, 23593322 - 23593409
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaa 91  Q
    |||| |||||||||||||||||||||   | |||||||||||| ||||  ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  23593322 gttatctttccaatggctttggtttggagtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaattactccaaggaggtcttagtgaa 23593409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 210 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 45754888 - 45754830
Alignment:
Q  210 atgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttg-ttattaagttatagacttaca 267  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  45754888 atgttgtgagttgatcttgggataggaatggaagttgtttattaagttatagatttaca 45754830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 13989440 - 13989382
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatg 61  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  13989440 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 13989382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 142
Target Start/End: Original strand, 20708746 - 20708879
Alignment:
Q  9 ctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 108  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| | | ||||||| ||||||||||| |||| ||| || |||| | ||||| |||   ||| | ||    
T  20708746 ctttccaatggcgttggtttgacttaaaaatgttttgtggattttgagttatgatgaaaacactttaagtagatcttggggaaattttaaagaaacttag 20708845  T
Q  109 cataaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 142  Q
    |||||  ||||| |||| | ||||| ||||||||    
T  20708846 cataattatttccaagtcattccaatacttatgg 20708879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 22366598 - 22366527
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatact 72  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||| |  |||||||||||||   |||||||||||| ||| ||||    
T  22366598 tttgttagctttctaatgactttggtttgacatcgaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 22366527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 182 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 48301388 - 48301352
Alignment:
Q  182 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 218  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48301388 aattaaggggtttaagagtatttaacctatgtggtga 48301352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 4)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 16401 - 16135
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16401 tttgctagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgcgatatgatgaaaatactttaaggaggtcttagtgaaatcttatga 16302  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16301 atattcagcataatcatttctaagttaatccaaaacttatgggataattctcaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatgaaggtgtttaagagt 16202  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagacttaca 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16201 atttaacctatgttgtgagttgatcttgagataggaatgaaagttgttattaagttatagacttaca 16135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 13583 - 13319
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13583 tttgttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgattttaaatttttgaaatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatga 13484  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13483 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacatatgagataattcccaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaagttgtttaagagt 13384  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagactta 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  13383 atttaacctatgttgtgagttgatcttgggatatgattggaagttgttattaagttatagactta 13319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 8873 - 8686
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  8873 tttgttagctttccaatggttttggtttgacttgaaaatgattttaaatttttgaaatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttgtga 8774  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaag 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8773 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacatatgagataattcccaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaag 8686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 17841 - 17783
Alignment:
Q  210 atgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttg-ttattaagttatagacttaca 267  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||| |||||||||| |||||    
T  17841 atgttgtgagttgatcttggcataggaatggaagttgtttataaagttatagatttaca 17783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Original strand, 159365 - 159631
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  159365 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaataatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 159464  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  159465 aaattcagcataaccatttctaaattaatccaaaacttatgggataattcaaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgattaagagt 159564  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagacttaca 267  Q
    ||| |||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  159565 attcaactcatgttgagagttgatcttgggataggaatgaaagttgttaataagttatagacttaca 159631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 109)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 39694943 - 39695207
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  39694943 tttgttagctttccaatggctttggtttgacctgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttagga 39695042  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39695043 aaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 39695142  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagactta 265  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39695143 gtttaacctatgttgtgagttgatcttgggataggaatggaagttgttattaagttatagactta 39695207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Original strand, 15635595 - 15635861
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  15635595 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggcttttgagatataatgaagatactccaaggaggtcttagtgaaattttatga 15635694  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15635695 aaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaatcctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 15635794  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagacttaca 267  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  15635795 atttaacccatgttgtgagttgatcttgggataggaatggaagttgttaataagttataggcttaca 15635861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 4 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 20454873 - 20454610
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  20454873 gttagctttccattggctttcatttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactcgaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaa 20454774  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20454773 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattcaaacccacaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 20454674  T
Q  204 taacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagacttaca 267  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  20454673 taacccatgttgtgagttgatcttgggataggaatgtaatttgttaataagttatagacttaca 20454610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 4 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 20455630 - 20455367
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  20455630 gttagctttctagtggctttcgtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaataccccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaa 20455531  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20455530 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgagataattccatccctcaaaactagaagtactatgaggtcaattaaggtgtttaagagtatt 20455431  T
Q  204 taacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagacttaca 267  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  20455430 taacccatgttgtgagttgatcttgggataggaatgtaagttgttaataagttatagacttaca 20455367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 4 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 20460608 - 20460345
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  20460608 gttagctttctagtggctttcgtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaataccccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaa 20460509  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20460508 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgagataattccatccctcaaaactagaagtactatgaggtcaattaaggtgtttaagagtatt 20460409  T
Q  204 taacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagacttaca 267  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  20460408 taacccatgttgtgagttgatcttgggataggaatgtaagttgttaataagttatagacttaca 20460345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 364425 - 364178
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  364425 tttgttagctttccaatggctttagtttgacttgaaaatgatttttagtttttaagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatga 364326  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  364325 aaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagatt 364226  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttg-atcttgggatatgaatgaaagttgt 247  Q
    |||||| | ||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||    
T  364225 atttaatccatgttgtgagttgaaccttgggatagcaatgaaagttgt 364178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 3 - 220
Target Start/End: Original strand, 41680551 - 41680768
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41680551 tgttagctttccaatggctttggattgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 41680650  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41680651 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtat 41680750  T
Q  203 ttaacctatgttgtgagt 220  Q
    ||||||||||||||||||    
T  41680751 ttaacctatgttgtgagt 41680768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 17460702 - 17460926
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  17460702 tttgttagtttttcaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatga 17460801  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17460802 aaattcaacataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 17460901  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  17460902 atttaacctatgttgtgagttgatc 17460926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 44522841 - 44523088
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  44522841 tttgttagctttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatctcatga 44522940  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44522941 aaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttacgagt 44523040  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatc-ttgggatatgaatgaaagttgt 247  Q
    |||||| | |||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||    
T  44523041 atttaatccatgttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttgt 44523088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 25483889 - 25484113
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  25483889 tttgttagctttccaatgcctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatga 25483988  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25483989 aaattcagcataaacgtttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaattagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 25484088  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatc 225  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    
T  25484089 atttaacccatgttgtgagttgatc 25484113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 38185501 - 38185716
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  38185501 tttgttagctttccaatgactttggtttgactcgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatga 38185600  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38185601 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagt 38185700  T
Q  201 atttaacctatgttgt 216  Q
    |||||| | |||||||    
T  38185701 atttaatccatgttgt 38185716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 19882605 - 19882384
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  19882605 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgaattttagtttttgagttataatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatga 19882506  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  19882505 aaattcagcataactgtttctaagttaatcccaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttaaattaaggtgtttaagggt 19882406  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttg 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  19882405 atttaacctatgttgtgagttg 19882384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 23478715 - 23478496
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23478715 tgttacctttccagtggcttgggtttgacttgaaaatgatttttagtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 23478616  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||    
T  23478615 atgcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactaaggtgtttcatagtat 23478516  T
Q  203 ttaacctatgttgtgagttg 222  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  23478515 ttaacatatgttgtgagttg 23478496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 26454346 - 26454127
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26454346 tgttagctttccagtggcattggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatataatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 26454247  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26454246 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacatcaaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 26454147  T
Q  203 ttaacctatgttgtgagttg 222  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  26454146 ttaacctatgttgtaagttg 26454127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 18024110 - 18024324
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18024110 tttgttagctttccaatagctttgatttgactcgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatga 18024209  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18024210 aaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggcatagttccaaggctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 18024309  T
Q  201 atttaacctatgttg 215  Q
    |||||||||||||||    
T  18024310 atttaacctatgttg 18024324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 4 - 267
Target Start/End: Original strand, 42266013 - 42266273
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||    
T  42266013 gttagctttccagtggctttagtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatctta---aaa 42266109  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42266110 ttcagtataaccttttctaagttaatccaaagcttatggaataattccaaccctccaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 42266209  T
Q  204 taacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagacttaca 267  Q
     |||  |||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  42266210 caactcatgttgagagttaatcttgggataggaatggaagttgttaataagttataaacttaca 42266273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 44432499 - 44432251
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttag-tttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatg 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||  | |||||||||||||||| ||||||    
T  44432499 tttgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgattttttggtttttgagttatgatggaaatactctagggaggtcttagtgaaaccttatg 44432400  T
Q  100 aaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagag 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44432399 aaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagag 44432300  T
Q  200 tatttaacctatgttgtgagttgatc-ttgggatatgaatgaaagttgt 247  Q
    ||||||| | |||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||    
T  44432299 tatttaatccatgttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttgt 44432251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 19880465 - 19880244
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19880465 tttgttagcttttcaatggctttggtttggtgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactacaaggaggtcttagtgaaatcttatga 19880366  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19880365 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttattggataattccaaatctcgaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 19880266  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttg 222  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  19880265 atttaacctatgttgtaagttg 19880244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 22237669 - 22237893
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||    
T  22237669 tttgttagctttccaatggcattggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgttgaaaatactccaaggaggtcttagagaaatcttagga 22237768  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||    
T  22237769 aaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattatgttgtttaagagt 22237868  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatc 225  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  22237869 atttaacctatgttatgagttgatc 22237893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 17795869 - 17795622
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17795869 tttgttagctttccaatggcttgggtttgactcgaaaatgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatga 17795770  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  17795769 aaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttacaagt 17795670  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatc-ttgggatatgaatgaaagttgt 247  Q
    |||||| | |||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||    
T  17795669 atttaatccatgttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttgt 17795622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 42559943 - 42560161
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42559943 tttgttagcttttcaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatga 42560042  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42560043 aaattcagtataaccgtttctaagttaatccaaaacttatagaataattccaaagct-caaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagt 42560141  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagt 220  Q
    || |||| ||||||||||||    
T  42560142 atgtaacttatgttgtgagt 42560161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 39364161 - 39363955
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||    
T  39364161 tttgttagctttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgataaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcgtagga 39364062  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39364061 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctccaaactagaagtgctatgagttcaattaaggtgtttgagagt 39363962  T
Q  201 atttaac 207  Q
    |||||||    
T  39363961 atttaac 39363955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 21579622 - 21579862
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||| |||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  21579622 tttgttagatttctagtggctttggtttgactcgaatatgatttttagtttttgatttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttagga 21579721  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21579722 aaatttagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaaattagaaatactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 21579821  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaa 241  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  21579822 gtttaacctatgttgtgagttgatcttggtataggaatgaa 21579862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Original strand, 21861038 - 21861250
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21861038 gttagctttctaaaggcttttgtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgctgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaa 21861137  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21861138 ttcagcataaccgtttctaagtttatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 21861237  T
Q  204 taacctatgttgt 216  Q
    ||||| |||||||    
T  21861238 taacccatgttgt 21861250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 5761167 - 5760953
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5761167 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaattatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 5761068  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5761067 ttcagcataactgtttctaggttaatcaaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtaccatgagttcaattagggtgtttaagagtatt 5760968  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||    
T  5760967 taacctatgttgtga 5760953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Original strand, 21326356 - 21326569
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21326356 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgacttttagtttttgagttatgatcaaaatactccaagatggtcttagtgaaatcttatgaaaa 21326455  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  21326456 ttcagcataaccagttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctaaaaattaaaagtacaatgagttcaattaaagagtttaagagtatt 21326555  T
Q  204 taacctatgttgtg 217  Q
    ||||||||||||||    
T  21326556 taacctatgttgtg 21326569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 19808012 - 19808236
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  19808012 tttgtaagctttccaatgatattggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatcctctaaggaggtcttagtgaaattttatga 19808111  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  19808112 aaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagt 19808211  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatc 225  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  19808212 atttaacctatgttatgagttgatc 19808236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 6102171 - 6102385
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6102171 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgcaaatggtttttggttcttgagatatgataaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 6102270  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  6102271 ttcagcataacagtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatatttaagagtatt 6102370  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||    
T  6102371 taacctatgttgtga 6102385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 20178939 - 20179153
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20178939 gttagctttccagtgactttggtttgacatgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 20179038  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  20179039 ttcaacataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccagacctcaaaactagaagtactatgagttcaaatagggtgtttaagagtatt 20179138  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||    
T  20179139 taacctatgttgtga 20179153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Original strand, 21321758 - 21321971
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  21321758 gttagctttccaatggcttagatttgacttgaaaatgacttttagtttttgagttatgatcaaaatactccaagatggtcttagtaaaatcttatgaaaa 21321857  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21321858 ttcagcataaccagttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctaaaaattataagtactatgagttcaattaaagtgtttaagagtatt 21321957  T
Q  204 taacctatgttgtg 217  Q
    ||||||||||||||    
T  21321958 taacctatgttgtg 21321971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 19140399 - 19140185
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19140399 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgacaatgatttttggttcttgtgatatgatgcaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 19140300  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  19140299 ttcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaacagtatt 19140200  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||    
T  19140199 taacctatgttgtga 19140185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 27941304 - 27941526
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  27941304 tttgttagctttccaatggcttcggtgtgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatacttcaagtaggtcttagggaaatcttatga 27941403  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||    
T  27941404 aaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaatgctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaatagt 27941503  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttga 223  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  27941504 atttaacccatgttgtgagttga 27941526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 49 - 218
Target Start/End: Original strand, 361675 - 361844
Alignment:
Q  49 tttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat 148  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  361675 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat 361774  T
Q  149 tccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 218  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  361775 tccaaagctcaaaactaggagtactatgagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 361844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 3 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 18834106 - 18833898
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18834106 tgttagcttttcagtggctttggttttacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 18834007  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  18834006 attcagcataatcgtttctaagttaatcaaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtat 18833907  T
Q  203 ttaacctat 211  Q
    |||||||||    
T  18833906 ttaacctat 18833898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 39936429 - 39936642
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39936429 gttagctttccggtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggctcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 39936528  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  39936529 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaagaaataattccaaatctcgaaactagaagtactatgagttcaact-aggtgtttaagagtatt 39936627  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||    
T  39936628 taacctatgttgtga 39936642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 42818325 - 42818539
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42818325 gttagatttccagtggctttagtttgacgtgaaaatgatttttggttcttaagatatgatgaaaatactccaaggaggttttagtgaaatcttatgaaaa 42818424  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  42818425 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatt 42818524  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    ||| ||||| |||||    
T  42818525 taatctatggtgtga 42818539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 52 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 32950187 - 32950022
Alignment:
Q  52 ttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattcc 151  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32950187 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattcc 32950088  T
Q  152 aaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtg 217  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32950087 aaagctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagattatttaacctatgttgtg 32950022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 8728352 - 8728561
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  8728352 tttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgaattttagtttaggagttatgatgaaaatactacaagtaggtcttagtgaaatcttatga 8728451  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattcc-aaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagag 199  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8728452 aaattcagcataaccgtttctaagttaatcc-aaacttagggaataattccaaaacctcgaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagag 8728550  T
Q  200 tatttaaccta 210  Q
    |||||||||||    
T  8728551 tatttaaccta 8728561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 6573474 - 6573682
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6573474 tgttagctttccggtggctttggtttgacttgaaaatgattttt-gattttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 6573572  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  6573573 attcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaggtactaggggttcaattaagttgtttaagagtat 6573672  T
Q  203 ttaacctatg 212  Q
     |||| ||||    
T  6573673 ctaacatatg 6573682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22207902 - 22207693
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  22207902 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaataagttttgggttttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaattttatgaaa 22207803  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||    
T  22207802 attcagcataactgtttctaaattaatccaaaacttatggaataattccaaacctgaaaactagaagtatcaggggttcaattaaggtgtttaagagtat 22207703  T
Q  203 ttaacctatg 212  Q
    ||||||||||    
T  22207702 ttaacctatg 22207693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 44477061 - 44476851
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||   || ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  44477061 tttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttagaagttatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatga 44476962  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacct-aaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagag 199  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  44476961 aaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcgaaaactagaagtattatgaattcaattaaggtgtttaagag 44476862  T
Q  200 tatttaaccta 210  Q
    |||||||||||    
T  44476861 tatttaaccta 44476851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 44480323 - 44480113
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||   || ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  44480323 tttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttagaagttatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatga 44480224  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacct-aaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagag 199  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  44480223 aaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcgaaaactagaagtattatgaattcaattaaggtgtttaagag 44480124  T
Q  200 tatttaaccta 210  Q
    |||||||||||    
T  44480123 tatttaaccta 44480113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 11775359 - 11775138
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||| ||||||||| || | ||||| | |||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  11775359 tttgttagatttccaatgactctagtttggcgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatga 11775260  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  11775259 aaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggtttaattaaggtgtttaagagt 11775160  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttg 222  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  11775159 atttaacctaagttgtgagttg 11775138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 29763284 - 29763516
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  29763284 tttgttagctttctagtgtctttggtttgactcgaaaatgaattttagtttttgagttataatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttagga 29763383  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||   ||||||    
T  29763384 aaatttagaataatcatttctaagttaatccgaaacttatagaataattccaaccctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaagatgggaaagagt 29763483  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatcttgggata 233  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29763484 gtttaacctatgttgtgaattgatcttgggata 29763516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22483377 - 22483167
Alignment:
Q  7 agctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22483377 agctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattc 22483278  T
Q  107 agcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 206  Q
     ||||||| |||||||||| || |||||||||||||  |   ||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22483277 cgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 22483179  T
Q  207 cctatgttgtga 218  Q
    | ||||||||||    
T  22483178 cttatgttgtga 22483167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 17437736 - 17437950
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  17437736 gttagctttccagtggctttggtttgacgtaaaaatgattttttgttcttgagatatgatgaaaatactccaatgaggtcttagtgaaattttatgaaaa 17437835  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| || || || || |||||||| |||||||||||||    
T  17437836 ttcagcacaaccgtttctaatttaatccaaaacttatggaataattccaaatctcaaaactagaaataataggattttaattaaggagtttaagagtatt 17437935  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||| ||||    
T  17437936 taacctatgtggtga 17437950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 212
Target Start/End: Original strand, 5082630 - 5082838
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| || ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  5082630 gttagctttccagtggttttggtttaacatgaaaataatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtctgagtgaaattttatgaaaa 5082729  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  5082730 ttcagcataatcgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatt 5082829  T
Q  204 taacctatg 212  Q
    |||| ||||    
T  5082830 taacttatg 5082838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Original strand, 20084055 - 20084270
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  20084055 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttataatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaa 20084154  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaa-ggtgtttaagagta 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||  | ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| || | |||||| ||    
T  20084155 attcagcataaccgtttctaagtcagtccaaaacttagagaataattccaaacct-caaactagaagtactaggagtttaattaagggggcttaagatta 20084253  T
Q  202 tttaacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||||    
T  20084254 tttaacctatgttgtga 20084270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Original strand, 18816886 - 18817093
Alignment:
Q  12 tccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttt--tagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagc 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  18816886 tccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgc 18816985  T
Q  110 ataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacct 209  Q
    ||||  |||||||||| || |||||||||||||  |   ||||||| | ||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18816986 ataattatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacatcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacct 18817084  T
Q  210 atgttgtga 218  Q
    |||||||||    
T  18817085 atgttgtga 18817093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 23660849 - 23660688
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23660849 gttagctttacagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaattagtccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaa 23660750  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaacta 165  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  23660749 ttcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaaacta 23660688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Original strand, 4381210 - 4381424
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4381210 tgttagctttctagtggctttagtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttacgataaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 4381309  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||   |   ||||||| | ||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4381310 attctgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgaattttctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 4381408  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||    
T  4381409 ttaacctatgttgtga 4381424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Original strand, 22258721 - 22258931
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22258721 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggttttttagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 22258820  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||| ||||||| ||||||| || || |||||||||||||  |   ||||||| | ||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22258821 attccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtatccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 22258919  T
Q  203 ttaacctatgtt 214  Q
    |||| |||||||    
T  22258920 ttaaactatgtt 22258931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 215
Target Start/End: Original strand, 20517535 - 20517746
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  20517535 tgttagttttccagtggctttggcttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaa 20517634  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat-tccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagta 201  Q
    |||| |||||||  ||||||||| || ||||||||||| ||||  | ||||||| | |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20517635 attccgcataactgtttctaagtcaacccaaaacttat-ggatcgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagta 20517732  T
Q  202 tttaacctatgttg 215  Q
    ||||||||||||||    
T  20517733 tttaacctatgttg 20517746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 202
Target Start/End: Original strand, 14397521 - 14397720
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||| |||   ||||| |||| | ||| |||| || | |||||  |||||||||||||||||    
T  14397521 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttgtagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaaatcttatgaaa 14397620  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14397621 attcagcataatcatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 14397720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22344676 - 22344462
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22344676 tgttagctttctagtggctttggttttacttgaaaatgatttttggattttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 22344577  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||  |   || |||| | ||| || |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22344576 attccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctctaaacttcaaagcttg-tgtactgtgagttcaattaaggtgtttaagagtat 22344478  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||    
T  22344477 ttaacctatgttgtga 22344462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22356336 - 22356122
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22356336 tgttagctttctagtggctttggttttacttgaaaatgatttttggattttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 22356237  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||  |   || |||| | ||| || |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22356236 attccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctctaaacttcaaagcttg-tgtactgtgagttcaattaaggtgtttaagagtat 22356138  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||    
T  22356137 ttaacctatgttgtga 22356122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 17501558 - 17501350
Alignment:
Q  5 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 104  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||  |||| | ||||| || || | |||||||||     
T  17501558 ttagctttccaatggcttgggtttaacttaaaaatgatttttagattttgagatatgatggaattaccccaagcaagtcttggtaaatttttatgaaaaa 17501459  T
Q  105 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 204  Q
    | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  17501458 ttagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttatggaatatttccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaagaggtttaagagtattt 17501359  T
Q  205 aacctatgt 213  Q
    |||||||||    
T  17501358 aacctatgt 17501350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 23914558 - 23914355
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||| ||||   || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||    
T  23914558 tgttagctttccagtggcgtcggtttgactttaaaatgatttttggtttagaagttatgatgaaaatacttcaagtaggtcctattgaaattttatgaaa 23914459  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||  ||||||| |||||| |||||    
T  23914458 attcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaagtagaagtactaggagtt-tattaaggggtttaacagtat 23914360  T
Q  203 ttaac 207  Q
    |||||    
T  23914359 ttaac 23914355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23670283 - 23670073
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||    
T  23670283 tgttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactctaaggaggtcttagtgaaattttattaaa 23670184  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||| ||||||| ||||||| || || ||||||||||||   |   ||||||| | |||  | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23670183 attccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatgaattgtatccaaacttcaaagattg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 23670085  T
Q  203 ttaacctatgtt 214  Q
    ||||||||||||    
T  23670084 ttaacctatgtt 23670073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 38989100 - 38988890
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38989100 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttaggttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 38989001  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||| ||||||| |||||||  | || ||| |||||||||  |   ||||||| | ||| || |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38989000 attccgcataactatttctagttcaacccagaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactataagttcaattaaggtgtttaagagtat 38988902  T
Q  203 ttaacctatgtt 214  Q
    ||||||||||||    
T  38988901 ttaacctatgtt 38988890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 39020197 - 39019987
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39020197 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttaggttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 39020098  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||| ||||||| |||||||  | || ||| |||||||||  |   ||||||| | ||| || |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39020097 attccgcataactatttctagttcaacccagaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactataagttcaattaaggtgtttaagagtat 39019999  T
Q  203 ttaacctatgtt 214  Q
    ||||||||||||    
T  39019998 ttaacctatgtt 39019987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 218
Target Start/End: Original strand, 17978842 - 17979048
Alignment:
Q  11 ttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagca 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |    
T  17978842 ttccagtggctttggtttgacttgaaaataagttttggtttttgagttatgatgaaaatatttcaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgga 17978941  T
Q  111 taaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaaccta 210  Q
    |||| |||||||||| || |||||||||||||  |   ||||||| | |||  | |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17978942 taactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagtttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaatagtatttaaccta 17979040  T
Q  211 tgttgtga 218  Q
    ||||||||    
T  17979041 tgttgtga 17979048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 36305293 - 36305079
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  36305293 tgttagctttccagtggctttagtttgacttgaaaatggtttttgctttttgagttatgataaaaatactccaatgaggtcttagtgaaattttatgaaa 36305194  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||  ||||||| |||||||||| || |||||||| ||||  |   ||||||| | |||||| |  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  36305193 atttcgcataactatttctaagtaaacccaaaactcatggattgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagtccaattaagatgtttaagagtat 36305095  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||    
T  36305094 ttaacctatgttgtga 36305079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 42 - 218
Target Start/End: Original strand, 18815279 - 18815454
Alignment:
Q  42 tttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatg 141  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  18815279 tttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatg 18815378  T
Q  142 ggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 218  Q
    |  |   ||||||| | |||  | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18815379 gattgtctccaaacttcaaagtttg-tgtactatgagttcaattaaagtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 18815454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22474386 - 22474172
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22474386 tgttagctttcccatggctttagtttgacttgaaaacgatttttggtttttgaattatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 22474287  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    | ||  |||||  ||||||| || || |||||| ||||||  |   ||||||| | ||| || |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22474286 actccacataattatttctaggtcaacccaaaatttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgcttaagagtat 22474188  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||    
T  22474187 ttaacctatgttgtga 22474172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 142
Target Start/End: Original strand, 36732942 - 36733080
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  36732942 gttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagttatgatgaaaatactccaatgaggtcttggtgaaattttatgaaaa 36733041  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 142  Q
    ||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  36733042 ttccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 36733080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 210
Target Start/End: Original strand, 36405477 - 36405683
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||  ||||||||  |||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36405477 tgttagctttcccgtggctttgaattgatttgaaaatgatttttgttttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 36405576  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||| ||||||| ||||||| || || ||||||||||||   |   ||||||| | ||| || |  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  36405577 attccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatgaattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaatgtgtttaatagtat 36405675  T
Q  203 ttaaccta 210  Q
    ||||||||    
T  36405676 ttaaccta 36405683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 24907409 - 24907198
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||  |||||||| | |||||||| ||||||||    
T  24907409 tgttagctttctagtggctttggtttgactttaaaatgatttttgatttttgagttatgacgaaaatactctaaggaggtttgagtgaaattttatgaaa 24907310  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||| ||||||| | |||||||| || ||||||||||| ||||  || | ||| | |||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  24907309 attccgcataactaattctaagtcaacccaaaacttat-ggattgtttccaacttcaaaacttg-tgtactatgagttcaattaagttgtttaagaatat 24907212  T
Q  203 ttaacctatgttgt 216  Q
    ||||||||| ||||    
T  24907211 ttaacctatattgt 24907198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 21513954 - 21513741
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  21513954 tgttagcattctagtggctttggtttggcttgaaaatgatttttgggttttgagatatgatcaaaatactccaa-gaggtcttagtgaaattttatgaaa 21513856  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||| ||||||| ||||||| || || |||||| ||||||  |   ||||||| | ||| ||    | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21513855 attctgcataactatttctaggtcaacccaaaatttatggattgtctccaaacttcaaagct-tttgcactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 21513757  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||| ||| ||||||    
T  21513756 ttaacatattttgtga 21513741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 21399344 - 21399206
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    ||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  21399344 gttagttttccaatggattcggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaaattttatgaaaa 21399245  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 142  Q
    ||| ||||||| ||||||| || || |||||||||||||    
T  21399244 ttctgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatgg 21399206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 21793837 - 21793699
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    ||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  21793837 gttagttttccaatggattcggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaaattttatgaaaa 21793738  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 142  Q
    ||| ||||||| ||||||| || || |||||||||||||    
T  21793737 ttctgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatgg 21793699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 117 - 222
Target Start/End: Original strand, 8414241 - 8414346
Alignment:
Q  117 tttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8414241 tttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctaagttgt 8414340  T
Q  217 gagttg 222  Q
    ||||||    
T  8414341 gagttg 8414346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 16198469 - 16198371
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 101  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  16198469 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgattaaaatactccacggaggtcttagtgaaattttatgaa 16198371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 218
Target Start/End: Original strand, 18118603 - 18118796
Alignment:
Q  25 gtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaag 124  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| || |||  |||| ||||||| || || | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  18118603 gtttgacttaaaaatgatttttagattttgagataagatggaattacaccaagtaggtcttggtaaatttttacgaaaattcagcctaaccgtttctaag 18118702  T
Q  125 ttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtacta-tgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 218  Q
    | ||||||||||||||||  |  | |||||| | |||||| | |||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18118703 tcaatccaaaacttatggtttgttcccaaacttcaaaacttg-agtattagggagttcaattaaggtgttttagagtatttaacctatgttgtga 18118796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 25757776 - 25757575
Alignment:
Q  14 caatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataa 113  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||  |||  |||||||||||||||||||    
T  25757776 caatggttttggtttgacttgaaaataatttttagatttggagttatgatgaaaatactccaagtgggtcttagcaaaactttatgaaaattcagcataa 25757677  T
Q  114 ccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgt 213  Q
      ||| ||||||||| |||||  ||||||  |  |||||||| | |||| | | |||| || ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  25757676 ttattcctaagttaaaccaaactttatggtttgtttccaaacttcaaaatttg-agtattaggagtttaattaagaggtttaagagtatttaacctatgt 25757578  T
Q  214 tgt 216  Q
    |||    
T  25757577 tgt 25757575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 24624296 - 24624095
Alignment:
Q  10 tttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagc 109  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||| ||| ||||||||| |    
T  24624296 tttctaatggatttggtttgacttaaaaattatttttagattttgagttatgatgaaaatactccaagtaggtctttgtgcaattttacgaaaattcaac 24624197  T
Q  110 ataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacct 209  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||  |||||  |  | |||||||  |||||| | | || || ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  24624196 ataactatttctaagtgaacccaaaagctatggtttggtcccaaaccctaaaacttg-attaataggagtttaattaggatgtttaagagtatttaacct 24624098  T
Q  210 atg 212  Q
    |||    
T  24624097 atg 24624095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 25295756 - 25295555
Alignment:
Q  14 caatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataa 113  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||  |||  | |||||||||||||||||    
T  25295756 caatggttttggtttgacttgaaaataatttttagatttggagttatgatgaaaatactccaagtgggtcttagcaaaacttcatgaaaattcagcataa 25295657  T
Q  114 ccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgt 213  Q
      ||| ||||||||| |||||  ||||||  |  |||||||| | |||| | | |||| || ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  25295656 ttattcctaagttaaaccaaactttatggtttgtttccaaacttcaaaatttg-agtattaggagtttaattaagaggtttaagagtatttaacctatgt 25295558  T
Q  214 tgt 216  Q
    |||    
T  25295557 tgt 25295555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18827858 - 18827650
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||| || ||||  |||||| ||| ||||    
T  18827858 tgttagatttccaatggatttggtttggcttaaaaatgattgttagtttttgagttatggtgaaaatactacaagtagatcttgctgaaattttacgaaa 18827759  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||| |||||  |||| | ||  |||||||||  |||||  | |||||||| || |||||| | ||||||| ||||  ||||| | |||||||||||||    
T  18827758 attcaacataattatttttgagcgaatccaaaagatatggtttgattccaaaactcaaaacttg-agtactaggagtctaattaggatgtttaagagtat 18827660  T
Q  203 ttaacctatg 212  Q
    |||| |||||    
T  18827659 ttaaactatg 18827650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Original strand, 19331994 - 19332204
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    |||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||| ||| |||||    
T  19331994 tgttagctttgcaatagtttttgtttgacttgaaaatgatttttagatttggagttatgatgaaaatactccaagtgggtcttagt-aaaactt-tgaaa 19332091  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||| |||||||  ||| ||||||||| ||||| |||||||  |  |||||||| | |||| |  ||||| |  || || |||||||  ||||||||||||    
T  19332092 atttagcataaatattcctaagttaaaccaaatcttatggtttgtttccaaacttcaaaa-tttaagtattcggattttaattaagaggtttaagagtat 19332190  T
Q  203 ttaacctatgttgt 216  Q
    ||||||||||||||    
T  19332191 ttaacctatgttgt 19332204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 192 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 23410053 - 23409978
Alignment:
Q  192 tttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagacttaca 267  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23410053 tttaagagtatttaacatatgttgtgagttgatcttgggatagaaatgaaagttgttattaagttatagatttaca 23409978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Original strand, 14397326 - 14397426
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||    
T  14397326 tttgttagctttccaatggctttggtatggtgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaatttatga 14397425  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  14397426 a 14397426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Original strand, 18677650 - 18677750
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  18677650 tttgttacctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatga 18677749  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  18677750 a 18677750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Original strand, 4541959 - 4542059
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  4541959 tttgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatga 4542058  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  4542059 a 4542059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Original strand, 24485629 - 24485729
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||| ||||  ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  24485629 tttgttagctttccaatggctttggcttggcgtgaaaatgacttttggtttaggagttatgattaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatga 24485728  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  24485729 a 24485729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 24239052 - 24238843
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||| | | ||||||| ||| ||||||| ||| ||||  ||||||   ||||| ||| |     
T  24239052 tttgttagctttccaatggatttagtttgacttaaaaatgttttgtggattttgagttataatgaaaacactccaagagggtcttgaagaaattttaagg 24238953  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||| | |||||||  ||||| |||| || ||||||||||| |  |  |||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  24238952 aaacttagcataattatttccaagtcaacccaaaacttatcgtttgtttccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttcaattaatgtgtttaagatt 24238854  T
Q  201 atttaacctat 211  Q
    | |||||||||    
T  24238853 aattaacctat 24238843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 22002326 - 22002239
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaa 91  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||  ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  22002326 gttagctttccaatggctttggtttgacgtaaaaataagttttggtttaggagttatgatgaaaataccccaaggaggtcttagtgaa 22002239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 216
Target Start/End: Original strand, 45559593 - 45559798
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| |||        |||||||||||| |||    |||||||| |||  ||||||||    
T  45559593 tgttagctttccaattgttttggtttgacttgaaaataatttttagattt-------ggatgaaaatactccaaatgagtcttagtaaaactttatgaaa 45559685  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||| |||||  ||| ||||||||| ||||| |||||||  |  |||||||| | |||| | | |||| || || || |||||||  ||||||||||||    
T  45559686 attcaacataattattcctaagttaaaccaaaccttatggtttgtttccaaacttcaaaatttg-agtattaggattttaattaagaggtttaagagtat 45559784  T
Q  203 ttaacctatgttgt 216  Q
    ||||||||||||||    
T  45559785 ttaacctatgttgt 45559798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 218
Target Start/End: Original strand, 21345945 - 21346031
Alignment:
Q  132 aaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 218  Q
    |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||    
T  21345945 aaaacttagggaataattccaaatctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaacagtatttaacatgtgttgtga 21346031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 4233274 - 4233215
Alignment:
Q  5 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatg 64  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  4233274 ttagctttccaatggctttcgtttgacttaaaaataatttttagattttgagatatgatg 4233215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 169 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 5080478 - 5080429
Alignment:
Q  169 gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5080478 gtactgtgagttcaattaaggtgtttaaaagtatttaacctatgttgtga 5080429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22313468 - 22313251
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||| |   ||||||| ||||||||||| ||| ||||  |||||| | ||||| ||| |     
T  22313468 tttgttagctttccaatggttccggtttgacttgaaaatgttttgtgaattttgagttatgatgaaaacactgcaagtgggtcttggagaaattttaagg 22313369  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||| | |||||||| ||||  |||| || ||||||| |||||  |  |||||||| | ||||     |||| || || || |||||||||||||||  ||    
T  22313368 aaacttagcataactattttcaagtcaacccaaaacctatggtttgtttccaaacatcaaaatctttagtattaggatttaaattaaggtgtttaatggt 22313269  T
Q  201 atttaacctatgttgtga 218  Q
    |||| |||||||||||||    
T  22313268 atttgacctatgttgtga 22313251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 142
Target Start/End: Original strand, 21495115 - 21495246
Alignment:
Q  11 ttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagca 110  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||| |||||||||  |||||||| ||| | |||  ||| |||||||| |||    
T  21495115 ttccattggccttggtttgacttgaaaataatgttttgtttttgagttatgaagaaaatactctaaggaggttttaataaaactttacgaaaattccgca 21495214  T
Q  111 taaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 142  Q
     ||   ||||||||| || ||||| |||||||    
T  21495215 caattgtttctaagtcaacccaaaccttatgg 21495246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 125
Target Start/End: Original strand, 20176519 - 20176633
Alignment:
Q  11 ttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagca 110  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | | ||||||  ||||||||||| ||||||||  ||||||   ||||| ||| | ||||| ||||    
T  20176519 ttccaatggatttggtttgacttgaaaatgttttgtggattttgatttatgatgaaaacacttcaagtgggtcttgaagaaattttaaggaaatttagca 20176618  T
Q  111 taaccatttctaagt 125  Q
    |||| ||||| ||||    
T  20176619 taactatttccaagt 20176633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 125
Target Start/End: Original strand, 20221246 - 20221360
Alignment:
Q  11 ttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagca 110  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | | ||||||  ||||||||||| ||||||||  ||||||   ||||| ||| | ||||| ||||    
T  20221246 ttccaatggatttggtttgacttgaaaatgttttgtggattttgatttatgatgaaaacacttcaagtgggtcttgaagaaattttaaggaaatttagca 20221345  T
Q  111 taaccatttctaagt 125  Q
    |||| ||||| ||||    
T  20221346 taactatttccaagt 20221360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 8414164 - 8414240
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaag 77  Q
    |||||||||||||||||| || | ||||| | |||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| ||||    
T  8414164 tttgttagctttccaatgactctagtttggcgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaag 8414240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 1484976 - 1484918
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatg 61  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  1484976 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 1484918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 210
Target Start/End: Original strand, 18122329 - 18122363
Alignment:
Q  176 gagttcaattaaggtgtttaagagtatttaaccta 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18122329 gagttcaattaaggtgtttaagagtatttaaccta 18122363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 19699496 - 19699438
Alignment:
Q  210 atgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttg-ttattaagttatagacttaca 267  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  19699496 atgttgtgagttgatcttaggataggaatggaagttgtttattaagttatagatttaca 19699438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 61
Target Start/End: Original strand, 20045783 - 20045841
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatg 61  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  20045783 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 20045841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 32950222 - 32950188
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttga 35  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32950222 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttga 32950188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 29759498 - 29759453
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttag 48  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  29759498 tgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttag 29759453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 72
Target Start/End: Original strand, 45290135 - 45290204
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatact 72  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||  |||  ||| |||||||||||||||    
T  45290135 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgaattttgttttaggagttatgatgaaaatact 45290204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 18618901 - 18618830
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatact 72  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| | |  |||||||||||||   |||||||||||| ||| ||||    
T  18618901 tttgttagctttctaatggctttggtttgccgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 18618830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 61
Target Start/End: Original strand, 5852880 - 5852938
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatg 61  Q
    |||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  5852880 tgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 5852938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 61
Target Start/End: Original strand, 14409032 - 14409090
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatg 61  Q
    |||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  14409032 tgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 14409090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 48
Target Start/End: Original strand, 15320029 - 15320074
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttag 48  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  15320029 tgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttag 15320074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 48
Target Start/End: Original strand, 15500398 - 15500443
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttag 48  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  15500398 tgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttag 15500443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 48
Target Start/End: Original strand, 17150656 - 17150701
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttag 48  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  17150656 tgttagctttctaatggctttggttggacttccaaatgatttttag 17150701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 19866522 - 19866406
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||  |  | ||||||||||| |||| || |||| |||||||||| || | |||| ||   | ||| |||||||||    
T  19866522 gttagatttctaatggctttggtttgagctccatatgatttttagatttttagttatggtgaaaatactacaggtaggtattgaagcaattttatgaaaa 19866423  T
Q  104 ttcagcataaccatttc 120  Q
    |||||||| ||| ||||    
T  19866422 ttcagcatgaccctttc 19866406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 6436 - 6170
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  6436 tttgttagctttgcaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaaaactccaagtaggtcttagtgaaatcttatga 6337  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6336 aaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttttgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 6237  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagacttaca 267  Q
     ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6236 ttttaatccatgttgtgagttgatcttgggataggaatggaagttgttattaagttatagacttaca 6170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 94)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 4 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 24884020 - 24883757
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24884020 gttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 24883921  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24883920 ttcagtataaccctttctaagttaatctaaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaattactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 24883821  T
Q  204 taacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagacttaca 267  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24883820 taacccatgtagtgagttgatcttgggataggaatgaaagttgttaataagttatagacttaca 24883757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 3 - 267
Target Start/End: Original strand, 10039551 - 10039815
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  10039551 tgttagctttctagtggtattggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccagggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 10039650  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10039651 attcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 10039750  T
Q  203 ttaacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagacttaca 267  Q
    |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  10039751 ttaatccatgatgtgagttgatcttgggatatgaatggaagttgttaataagttatagacttaca 10039815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 3 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 31520752 - 31520488
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31520752 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcatagtgaaatcttatgaaa 31520653  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31520652 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatagaataattccaaccctcaaaactgaaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 31520553  T
Q  203 ttaacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagacttaca 267  Q
    |||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  31520552 ttaactcatgttgtgagtttatcttgggataggaatggaagttgttaataagttatagacttaca 31520488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 24273674 - 24273891
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24273674 tttgttagctttccaatgactttggtttgacctgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatga 24273773  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24273774 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagtgt 24273873  T
Q  201 atttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||||    
T  24273874 atttaacctatgttgtga 24273891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 26903795 - 26903574
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26903795 tttgttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatga 26903696  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26903695 aaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagt 26903596  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttg 222  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  26903595 atttaacctatattgtgagttg 26903574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 25183822 - 25183603
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25183822 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 25183723  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25183722 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactataagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 25183623  T
Q  203 ttaacctatgttgtgagttg 222  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  25183622 ttaacctatgttgtgagttg 25183603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 3 - 225
Target Start/End: Original strand, 18358386 - 18358608
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18358386 tgttagcttttcagtggctttggtttgacttgaaaatgttttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 18358485  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18358486 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 18358585  T
Q  203 ttaacctatgttgtgagttgatc 225  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  18358586 ttaacctatgttatgagttgatc 18358608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 21081388 - 21081607
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21081388 tgttagctttctagtggctttggtttgacttaaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 21081487  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21081488 atttagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaagttgtttaagagtat 21081587  T
Q  203 ttaacctatgttgtgagttg 222  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  21081588 ttaacctatgttgtgagttg 21081607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 41301388 - 41301629
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  41301388 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaagtgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatga 41301487  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41301488 aaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttatgagataattccaacccttaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 41301587  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgat-cttgggatatgaatgaa 241  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  41301588 atttaacccatgttgtgagttgatccttgggttaggaatgaa 41301629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 22173443 - 22173667
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  22173443 tttgttagctttccaatgggtttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatga 22173542  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22173543 aaatttagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcaaaccctcaaaactcaaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 22173642  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatc 225  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    
T  22173643 atttaacccatgttgtgagttgatc 22173667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 27472890 - 27472666
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  27472890 tttgttagctttccagtgaaattggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatga 27472791  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27472790 aaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 27472691  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatc 225  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||    
T  27472690 atttaacttatgttatgagttgatc 27472666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 43707700 - 43707916
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43707700 tttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatga 43707799  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  43707800 aaattcagcataacc-gttctaagttaatctaaaacttatggaataattcgaaacctcaaaactagaagtaccatgagttcaattaaggtgtttaagatt 43707898  T
Q  201 atttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||||    
T  43707899 atttaacctatgttgtga 43707916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 267
Target Start/End: Original strand, 18388715 - 18388978
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||    
T  18388715 gttagctttccagtgactttggtttgacttaaaaatgatttatggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatctttggaaaa 18388814  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18388815 ttcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 18388914  T
Q  204 taacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagacttaca 267  Q
    | ||  |||||| |||||||| || | ||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  18388915 ttactcatgttgagagttgatttttgtataggaatgtaatttgttaataagttatagacttaca 18388978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 20915742 - 20915531
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||    
T  20915742 tttgttagttttccaattgctttggtttgacttgaaaatgattcttattttttgagatatgatgaaaatactccaatgatatcttagtgaaatcttatga 20915643  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20915642 aaattcagcataaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaagctgtttaagagt 20915543  T
Q  201 atttaacctatg 212  Q
    ||||||||||||    
T  20915542 atttaacctatg 20915531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 34858800 - 34859039
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||| ||    
T  34858800 tttgttagctttccaatggcattggttttacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaaaaggtcttagagaaatcttagga 34858899  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34858900 aaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagt 34858999  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgat-cttgggatatgaatg 239  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  34859000 atttaacctatgttatgagttgatccttgggataggaatg 34859039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 34873862 - 34874101
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||| ||    
T  34873862 tttgttagctttccaatggcattggttttacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaaaaggtcttagagaaatcttagga 34873961  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34873962 aaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagt 34874061  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgat-cttgggatatgaatg 239  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  34874062 atttaacctatgttatgagttgatccttgggataggaatg 34874101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 6 - 247
Target Start/End: Original strand, 23338820 - 23339062
Alignment:
Q  6 tagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaatt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23338820 tagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaatt 23338919  T
Q  106 cagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattta 205  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23338920 cagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttacgagtattta 23339019  T
Q  206 acctatgttgtgagttgatc-ttgggatatgaatgaaagttgt 247  Q
    | | |||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||    
T  23339020 atccatgttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttgt 23339062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 9975563 - 9975349
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9975563 gttagttttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 9975464  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  9975463 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatt 9975364  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||    
T  9975363 taacctatgttgtga 9975349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Original strand, 23969040 - 23969255
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  23969040 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatacgatgaaaataattaatggaggtcttagtgaaattttatgaaa 23969139  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23969140 attcagcataacagtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtat 23969239  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||    
T  23969240 ttaacctatgttgtga 23969255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 21073142 - 21073364
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  21073142 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgacttttagtttttgagttatgatggaaatactccaagtaagtcttagtgaaatcttatga 21073241  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  21073242 aaattcagcacaaccatttctaagttaattcaaaacttatgggataattccaatactcaaaactagaagcaatatgagttcaattaaggtatttcagagt 21073341  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttga 223  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  21073342 atttaacccatgttgtgagttga 21073364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 21915259 - 21915038
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| | |||| ||||  ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  21915259 tttgttagatttccaatggctttggtttggcgtgaaaataagttttggtttaggagttatgatgaaaataccccaaggaggtcttagtgaaattttatga 21915160  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21915159 aaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 21915060  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttg 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  21915059 atttaacctatgttgtgagttg 21915038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 5031548 - 5031762
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5031548 gttagctttccagtggatttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 5031647  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  5031648 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactataagtactatgagttcaactaggctgtttaagagtatt 5031747  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||| ||||||||||    
T  5031748 taacatatgttgtga 5031762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 24781258 - 24781472
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24781258 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttatgaaaa 24781357  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  24781358 ttcagcataaccgtttctaatttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagaatatt 24781457  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||    
T  24781458 taacctatgttgtga 24781472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 36839805 - 36839591
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36839805 gttagttttccagtggatttggttttacatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 36839706  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  36839705 ttcagcataatcgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatt 36839606  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||    
T  36839605 taacctatgttgtga 36839591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 28349554 - 28349298
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  28349554 tttgttagctttgcaatggctttggtttgacttaaaaatgatttttagtttttgagatatgatggaaatactccaagtaggtcttcgtgaaatcttatga 28349455  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggat---------aattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtg 191  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28349454 aaattcagctcaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtg 28349355  T
Q  192 tttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatc-ttgggatatgaatgaaagttgt 247  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| |||| | ||||||||  ||||||||||||    
T  28349354 tttaagagtatttaatccatgttgtgatttgaactttgggatagcaatgaaagttgt 28349298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 20590737 - 20590956
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  20590737 tttgttatctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatcatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatga 20590836  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  20590837 aaattcagcataaccctttttaagttaatccaaaacttaagggataattccaagactcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtctaagagt 20590936  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagt 220  Q
    |||||||| ||||| |||||    
T  20590937 atttaacccatgttatgagt 20590956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 214
Target Start/End: Original strand, 27484888 - 27485098
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  27484888 gttagctttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggttcttgagatataatgaaaatactccaagtaggtcttagtggaattttatgaaaa 27484987  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27484988 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatt 27485087  T
Q  204 taacctatgtt 214  Q
    |||| ||||||    
T  27485088 taacatatgtt 27485098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 17307121 - 17306907
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17307121 gttagctttctagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcctgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 17307022  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||    
T  17307021 ttcagcataaccgtttcttagttaatccaaaacttaaggaataattccaaaactcaaaactagaagtactatgagttcaactaaggtgtttaagatcatt 17306922  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||| ||||||||||    
T  17306921 taacatatgttgtga 17306907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9242397 - 9242175
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||    
T  9242397 tttgttagcttcccaatggctttggtttgactttaaagtgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtagatcttagggaaatcttatga 9242298  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  9242297 aaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaactaaggtgtttaagagt 9242198  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttga 223  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  9242197 atttaacccatgttgtgagttga 9242175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 24515820 - 24515606
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24515820 gttagctttccagtgtctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttctttagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 24515721  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    ||||| |||| | |||||| |||||||||||||||| || |||| | |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24515720 ttcagtataatcgtttctacgttaatccaaaacttaaggaataaattcaaatctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 24515621  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    ||| |||||||||||    
T  24515620 taatctatgttgtga 24515606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 218
Target Start/End: Original strand, 23068881 - 23069082
Alignment:
Q  17 tggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataacca 116  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  23068881 tggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttattgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccg 23068980  T
Q  117 tttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  23068981 tttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactataagtactaagagtttaattaaggggtttaagagtatttaacatgtgttgt 23069080  T
Q  217 ga 218  Q
    ||    
T  23069081 ga 23069082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 6483156 - 6482946
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||   || ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  6483156 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttcaaaatgatttttggtttagaagttatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatga 6483057  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacct-aaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagag 199  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  6483056 aaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcgaaaactagaagtattatgaattcaattaaggtgtttaagag 6482957  T
Q  200 tatttaaccta 210  Q
    |||||||||||    
T  6482956 tatttaaccta 6482946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 6486623 - 6486413
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||   || ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  6486623 tttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttagaagttatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatga 6486524  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacct-aaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagag 199  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  6486523 aaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcgaaaactagaagtattatgaattcaattaaggtgtttaagag 6486424  T
Q  200 tatttaaccta 210  Q
    |||||||||||    
T  6486423 tatttaaccta 6486413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 19662070 - 19662292
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  19662070 tttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatga 19662169  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19662170 aaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagt 19662269  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttga 223  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  19662270 atttaacccatgttgtgagttga 19662292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 21368742 - 21368532
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21368742 tgttagctttccggtggatttggtttggcttgaaaatgagttttggtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 21368643  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||||    
T  21368642 attcaacataaccgtttctaagttaatccaaaaattatggaataattctaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaaataagaggtttaagagtat 21368543  T
Q  203 ttaacctatgt 213  Q
    |||||||||||    
T  21368542 ttaacctatgt 21368532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 19201618 - 19201833
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaa-tacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | | ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19201618 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatatgtggttcttgagatatgatgaaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 19201717  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  19201718 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatttaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtat 19201817  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||| ||||    
T  19201818 ttaacctatgtggtga 19201833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 28652920 - 28653134
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    ||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28652920 gttagattttcagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgataaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatggaaa 28653019  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| ||| || |||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  28653020 ttcagcataaccgtttttaggttaatccgaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatt 28653119  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||| ||| ||||||    
T  28653120 taacatatcttgtga 28653134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 6260793 - 6261015
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  6260793 tttgttaactttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatga 6260892  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||| || || ||||  |||||||||||||||||||    
T  6260893 aaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactagaaatattacgagtgaaattaaggtgtttaagagt 6260992  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttga 223  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  6260993 atttaacccatgttgtgagttga 6261015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 9785217 - 9785002
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  9785217 tgttagctttcaagtggcgttggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaa 9785118  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||| |||||    
T  9785117 attcagcataattgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagaactaggagtttaattaaggggtttaacagtat 9785018  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||| | ||||||||    
T  9785017 ttaacatgtgttgtga 9785002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Original strand, 21316079 - 21316293
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| || | || ||||||| ||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21316079 tgttagctttccagtgtccttcgtttgacgtgaaaataatatttggtttttgagttatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 21316178  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||| || |||| |||||||||| || |||||||||||||  |   ||||||| | ||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21316179 attccgcttaactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 21316277  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||    
T  21316278 ttaacctatgttgtga 21316293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22690315 - 22690105
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22690315 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 22690216  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||  |||||| |||||||||| || |||||||||||||  |   ||||||| | |||   ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22690215 attccacataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagtcag-tgtactatgagttcaattaagatgtttaagagtat 22690117  T
Q  203 ttaacctatgtt 214  Q
    ||||||||||||    
T  22690116 ttaacctatgtt 22690105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22694911 - 22694701
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22694911 tgttagctttccagtggcgttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 22694812  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||  |||||| ||||||| || || |||||||||||||  |   ||||||| | |||   ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22694811 attccacataactatttctatgtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagtcag-tgtactatgagttcaattaagatgtttaagagtat 22694713  T
Q  203 ttaacctatgtt 214  Q
    ||||||||||||    
T  22694712 ttaacctatgtt 22694701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Original strand, 25587104 - 25587318
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25587104 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 25587203  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||  |||||| ||||||| || || |||||||||||||  |   ||||||| | ||| || |  ||||| |||||||||||||| |||||||||  ||    
T  25587204 attccacataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactgtgagttcaattaagatgtttaagaaaat 25587302  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||    
T  25587303 ttaacctatgttgtga 25587318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 20 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 29113979 - 29113782
Alignment:
Q  20 ctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccattt 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||     
T  29113979 ctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaattccacataactattc 29113880  T
Q  120 ctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 218  Q
    |||||| || |||||||||||||  |  |||||||| | |||| | |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29113879 ctaagtcaacccaaaacttatggattgtttccaaacttcaaaatttg-tgtactattagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 29113782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22686472 - 22686260
Alignment:
Q  5 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  22686472 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaatatgatttttggtttttgaggtatgatgaaaacactctaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaat 22686373  T
Q  105 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 204  Q
    || ||| ||| |||||||| | || |||||||||||||  |   || |||| | ||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22686372 tccgcacaactatttctaattcaacccaaaacttatggattgtctcgaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 22686274  T
Q  205 aacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||    
T  22686273 aacctatgttgtga 22686260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 215
Target Start/End: Original strand, 21335870 - 21336081
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  21335870 tgttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggattttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaagttttatgaaa 21335969  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || ||||||  |||||  |   ||||||| | ||| || |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21335970 attccgcataactatttctaagtcaacccaaaagctatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaagatgtttaagagtat 21336068  T
Q  203 ttaacctatgttg 215  Q
    |||||||||||||    
T  21336069 ttaacctatgttg 21336081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Original strand, 2524165 - 2524366
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||                |||||||||    
T  2524165 gttagatttccagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagg----------------ttatgaaaa 2524248  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaa-gttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||||||||||   ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  2524249 ttcagcataacc---tctaaagttaatctaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactataagtactatgagttcaatcaaggtatttaagagtat 2524345  T
Q  203 ttaacctatgttgtgagttga 223  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  2524346 ttaacctatgttgtgagttga 2524366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22332351 - 22332138
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| ||| ||| |||||||| ||| ||| ||||||||    
T  22332351 tgttagctttccagtggctttgatttgacttgaaaatgatttttagattttgagttatggcgaaaacactccaatgaggtcttggtg-aattttatgaaa 22332253  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||  |  |||||||| | |||| | |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22332252 attccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtttccaaacttcaaaaattg-tgtactatgagttcaattaaggtgttcaagagtat 22332154  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||    
T  22332153 ttaacctatgttgtga 22332138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 132 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22501374 - 22501239
Alignment:
Q  132 aaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatcttggga 231  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  22501374 aaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaggtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtcgtgagttgatcttggga 22501275  T
Q  232 tatgaatgaaagttgttattaagttatagacttaca 267  Q
    || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  22501274 taggaatggaagttgttaataagttatagacttaca 22501239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 132 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22509308 - 22509173
Alignment:
Q  132 aaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatcttggga 231  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  22509308 aaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaggtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtcgtgagttgatcttggga 22509209  T
Q  232 tatgaatgaaagttgttattaagttatagacttaca 267  Q
    || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  22509208 taggaatggaagttgttaataagttatagacttaca 22509173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 86 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 31345495 - 31345379
Alignment:
Q  86 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaatt 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  31345495 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttataggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaatt 31345396  T
Q  186 aaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||||||||||||||||    
T  31345395 aaggtgtttaagagtat 31345379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 218
Target Start/End: Original strand, 1384105 - 1384317
Alignment:
Q  5 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 104  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  1384105 ttagctttccagtggctttggattgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaat 1384204  T
Q  105 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 204  Q
    ||  |||||| |||||||||| ||  |||||||||||   |   ||||||| | ||| || |  |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  1384205 tccacataactatttctaagtcaactcaaaacttatgaattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtaccatgagttctattaaggtgtttacgagtattt 1384303  T
Q  205 aacctatgttgtga 218  Q
    |||||||| |||||    
T  1384304 aacctatgctgtga 1384317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Original strand, 28345493 - 28345707
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  28345493 tgttagctttccagtggctttgattttacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaacactccaaggaggtcttggtgaaattttacgaaa 28345592  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat-tccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagta 201  Q
    |||| ||||||| |||||||||  || | ||||||||| ||||  | ||||||| | |||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  28345593 attccgcataactatttctaagccaaccaaaaacttat-ggatcgtctccaaacttcaaaacttg-tgtactatgagttcatttaaggtgtttaatagta 28345690  T
Q  202 tttaacctatgttgtga 218  Q
     |||| |||||||||||    
T  28345691 cttaatctatgttgtga 28345707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 6 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 23610108 - 23609898
Alignment:
Q  6 tagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaatt 105  Q
    |||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  23610108 tagctttccagtgtatttagtttgacttgaaaatgatttacgatttttgagttatgatgaaaatactcgaaggaggtcttagtgaaattttatgcaaatt 23610009  T
Q  106 cagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattta 205  Q
    | ||||||| |||||||||| || ||||||| |||||  |   ||||||| | ||| || |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23610008 ctgcataactatttctaagtcaacccaaaacctatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactgtgagttcaattaaggtgtttaagagtattta 23609910  T
Q  206 acctatgttgtg 217  Q
    ||||||||||||    
T  23609909 acctatgttgtg 23609898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 142
Target Start/End: Original strand, 23778712 - 23778852
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatg-aa 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||| | ||    
T  23778712 tgttagctttccaatggctttgatttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactctaaggaggttttagtgaaattttacgaaa 23778811  T
Q  102 aattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 142  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| || ||||| |||||||    
T  23778812 aattccgcataactatttctaagtcaacccaaaccttatgg 23778852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 20261796 - 20261696
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  20261796 tttgttagctttccaatggctttagtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatga 20261697  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  20261696 a 20261696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 117 - 223
Target Start/End: Original strand, 30643812 - 30643918
Alignment:
Q  117 tttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 216  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30643812 tttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactaaaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgt 30643911  T
Q  217 gagttga 223  Q
    |||||||    
T  30643912 gagttga 30643918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Original strand, 10684348 - 10684448
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  10684348 tttgttagctttccaatggctttagttttactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatga 10684447  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  10684448 a 10684448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 22255847 - 22255768
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggt 82  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  22255847 tgttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactctaaggaggt 22255768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 31345754 - 31345656
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 101  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||    
T  31345754 tgttagcttttcagtggctttggtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaatttttatgaa 31345656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 38968054 - 38967956
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 101  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  38968054 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttttgtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 38967956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 213
Target Start/End: Original strand, 22786717 - 22786924
Alignment:
Q  5 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| | || |||  |||| | ||||| || || | || |||||||    
T  22786717 ttagctttccaatggctttagtttgacttaaaaatgttttttagattttgagatatgagggaattaccccaagcaagtcttggtaaatttttgtgaaaat 22786816  T
Q  105 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 204  Q
    |  |||||||| ||||||| | |||||||||| ||||| |   |||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||  ||   ||  |||||||||    
T  22786817 t-tgcataaccgtttctaactcaatccaaaacctatggaacgtttccaaacctcaaaactagaagtattaggagtttaatcgagagattggagagtattt 22786915  T
Q  205 aacctatgt 213  Q
    |||||||||    
T  22786916 aacctatgt 22786924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Original strand, 24897781 - 24897881
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||  ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  24897781 tttgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttttgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatga 24897880  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  24897881 a 24897881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Original strand, 24900264 - 24900364
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||  ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  24900264 tttgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttttgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatga 24900363  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  24900364 a 24900364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Original strand, 24902741 - 24902841
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||  ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  24902741 tttgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttttgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatga 24902840  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  24902841 a 24902841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Original strand, 24905218 - 24905318
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||  ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  24905218 tttgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttttgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatga 24905317  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  24905318 a 24905318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Original strand, 24907693 - 24907793
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||  ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  24907693 tttgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttttgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatga 24907792  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  24907793 a 24907793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 20272990 - 20272855
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||||||  ||| | |||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||| || || | |||  ||||    
T  20272990 gttagctttccaatgaatttagattgatttaaaaatgatttttagattttgagttatgatggaaatactccaagtaggtcttggtaaatttttaccaaaa 20272891  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaactta 139  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  20272890 ttcagcataaccgtttctatgtcaatccaaaactta 20272855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 7187000 - 7186942
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatga 62  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7187000 gttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatga 7186942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 40911957 - 40911863
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttat 98  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  40911957 gttagctttccagtagctttgatttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatataatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaatcttat 40911863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 23136156 - 23136056
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  23136156 tttgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatga 23136057  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  23136056 a 23136056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 22501434 - 22501375
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgat 63  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22501434 gttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttgtagtttttgagatatgat 22501375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 22509368 - 22509309
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgat 63  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22509368 gttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttgtagtttttgagatatgat 22509309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 142
Target Start/End: Original strand, 36734901 - 36735041
Alignment:
Q  2 ttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||| | ||||| ||| | |    
T  36734901 ttgttagatttccaatggctttggtttgacttgaaaatgttttgtgggttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttggagaaattttaagga 36735000  T
Q  102 aattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 142  Q
    || |   |||||| ||||| |||| || | |||||||||||    
T  36735001 aacttgacataactatttccaagtcaacctaaaacttatgg 36735041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 109 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 24841481 - 24841375
Alignment:
Q  109 cataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 208  Q
    |||||| ||||| |||| || |||||||||||||| |  ||||||||   |||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24841481 cataactatttccaagtcaacccaaaacttatgggttgtttccaaactccaaaacttgt-gtactatgagttcaattaaggtatttaagagtatttaacc 24841383  T
Q  209 tatgttgt 216  Q
    ||||||||    
T  24841382 tatgttgt 24841375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 24302353 - 24302220
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||| |||| |||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||  || |||  || ||||    
T  24302353 tgttagctttctaatggcttcgatttaactt-aaaatg-tttttaggttttgtgctatgatgaaaatactacaagtaggtcttgatgcaattgtacgaaa 24302256  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaactt 138  Q
    |||||||||||| |||| ||||| || |||||||||    
T  24302255 attcagcataactatttttaagtgaacccaaaactt 24302220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 222
Target Start/End: Original strand, 34492089 - 34492128
Alignment:
Q  183 attaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttg 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34492089 attaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttg 34492128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 15632853 - 15632770
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtctta 86  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||| |||| |  ||| ||| |||||||||||||    
T  15632853 tgttggctttctaatggctttggtttgacttggaaataagttttaatttttgagttatgttacaaaaactccaaggaggtctta 15632770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 19887313 - 19887384
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatact 72  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||   |||||||||||| ||| ||||    
T  19887313 tttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 19887384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 18809517 - 18809459
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatg 61  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  18809517 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 18809459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 25045434 - 25045376
Alignment:
Q  210 atgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttg-ttattaagttatagacttaca 267  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  25045434 atgttgtgagttgatcttgggttaggaatgtaagttgtttattaagttatagacgtaca 25045376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 28577673 - 28577615
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatg 61  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  28577673 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 28577615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 61
Target Start/End: Original strand, 23711601 - 23711659
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatg 61  Q
    |||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  23711601 tgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 23711659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 26505953 - 26505895
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatg 61  Q
    |||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  26505953 tgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 26505895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 26508431 - 26508373
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatg 61  Q
    |||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  26508431 tgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 26508373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 61
Target Start/End: Original strand, 27920352 - 27920410
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatg 61  Q
    |||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  27920352 tgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 27920410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 61
Target Start/End: Original strand, 32039086 - 32039144
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatg 61  Q
    |||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  32039086 tgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 32039144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 67408 - 67363
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttag 48  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  67408 tgttagatttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttag 67363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 571972 - 571919
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgag 56  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  571972 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgaattttggtttatgag 571919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 39682888 - 39682835
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgag 56  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  39682888 tgttagctttccagtggcatcggtttgacttgaaaatgaattttggtttatgag 39682835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 24383148 - 24383112
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaa 37  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  24383148 tttgttagctttccaatggatttggtttgatttgaaa 24383112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 48
Target Start/End: Original strand, 24686639 - 24686683
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttag 48  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  24686639 gttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttag 24686683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 27261401 - 27261357
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgattttta 47  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  27261401 tgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaataattttta 27261357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Original strand, 34135089 - 34135157
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatact 72  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||  | ||||||||| | |||| |  |||||||||||||||    
T  34135089 gttagctttctaattgctttggtttgacttccatatgattttttgatttttatttatgatgaaaatact 34135157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 78)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 5 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 17813029 - 17812767
Alignment:
Q  5 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17813029 ttagctttccaatggctttgatttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaat 17812930  T
Q  105 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 204  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17812929 tcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaagggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgaattcaattaaggtgtttaagagtattt 17812830  T
Q  205 aacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagacttaca 267  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17812829 aacccatgttgtgagttgatcttgggataggaatgaaagttgttaataagttatagacttaca 17812767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Original strand, 24277021 - 24277284
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  24277021 tttgttagctttccaatggatttggttttacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatga 24277120  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24277121 aaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactataagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 24277220  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagactt 264  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  24277221 atttaacccatgttgtgagttgatcttgggataggaatggaagttgttaataagttatagactt 24277284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 24385192 - 24384929
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  24385192 tttgttagctttccaatggatttggttttacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatga 24385093  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24385092 aaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactataagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 24384993  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagactt 264  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  24384992 atttaacccatgttgtgagttgatcttgggataggaatggaagttgttaataagttatagactt 24384929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 4 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 17875633 - 17875370
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17875633 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgataaaaatactccgaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 17875534  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17875533 ttcagcataaccgtttccaagttaatccaaaacttatagaataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 17875434  T
Q  204 taacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagacttaca 267  Q
    |||||  | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  17875433 taacccctattgtgagttgatcttgggatatgaatggtagttgttaataagttatagacttaca 17875370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18419049 - 18418825
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  18419049 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatga 18418950  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18418949 aaattcagcataatcgtttctaaattaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaagtgtttaagagt 18418850  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatc 225  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    
T  18418849 atttaacccatgttgtgagttgatc 18418825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 263492 - 263273
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  263492 tgttagctttccgatgactttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatacgccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 263393  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  263392 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattgcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 263293  T
Q  203 ttaacctatgttgtgagttg 222  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  263292 ttaacctatgttgtgagttg 263273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22412643 - 22412405
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  22412643 tttgttagctttccaatgactttattttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatga 22412544  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22412543 aagttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 22412444  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatg 239  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  22412443 gtttaacctatgttgtgagttgatcttggggtaggaatg 22412405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 17011361 - 17011142
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17011361 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttcagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 17011262  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17011261 atttagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacttcaaaactaaaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 17011162  T
Q  203 ttaacctatgttgtgagttg 222  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  17011161 ttaacctatgttgtgagttg 17011142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 36460607 - 36460388
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36460607 tttgttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatga 36460508  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36460507 aaattcagtataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagt 36460408  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagt 220  Q
    || |||| ||||||||||||    
T  36460407 atgtaacttatgttgtgagt 36460388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 29448473 - 29448251
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29448473 tgttagctttccggtggctttagtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatattatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 29448374  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29448373 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaactagaagtagtatgagttcaattaagatgtttaagagtat 29448274  T
Q  203 ttaacctatgttgtgagttgatc 225  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  29448273 ttaacctatgttatgagttgatc 29448251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 32607740 - 32607957
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  32607740 tttgttagctttccaatgtctttggtttgacttgaaaataatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatga 32607839  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  32607840 aaattcagcataaccgtttctaagctaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactataagttcaattagggtgtttaagagt 32607939  T
Q  201 atttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||||    
T  32607940 atttaacctatgttgtga 32607957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 30138579 - 30138802
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||    
T  30138579 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggttttagtgaac-cttatga 30138677  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30138678 aaattcagcataaccgtttctaagttaacccaaaatttatgggataatttcaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 30138777  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatc 225  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    
T  30138778 atttaacccatgttgtgagttgatc 30138802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 217
Target Start/End: Original strand, 27868992 - 27869206
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27868992 tgttagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 27869091  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27869092 attcagcacaaacatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaccatgagttcaattaaggtgtttgagagtat 27869191  T
Q  203 ttaacctatgttgtg 217  Q
    |||||||||||||||    
T  27869192 ttaacctatgttgtg 27869206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 6766298 - 6766074
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||| ||||||    
T  6766298 tttgttagctttccaatgacttttgtttgacttaaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttggtaaaattttatga 6766199  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6766198 aaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaaatagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 6766099  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatc 225  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  6766098 atttaacctatgttatgagttgatc 6766074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 21399419 - 21399635
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  21399419 tttgttagctttccaatgactttggtttgactt-aaaatgattttcagtttttgagatatgataaaaatactccaaggaggttttagtgaaattttatga 21399517  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21399518 aaatttagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 21399617  T
Q  201 atttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  21399618 atttaacctattttgtga 21399635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 220
Target Start/End: Original strand, 21557461 - 21557679
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  21557461 tgttagctttctagtggtattggtttgacttgaaaatgatttttggcttttaagatatgatgaaaatactccaaggatgtcttagtgaaatcttacgaaa 21557560  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgttt-aagagta 201  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  21557561 attcagtataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactataagttcaattaaggtgtttaaagagta 21557660  T
Q  202 tttaacctatgttgtgagt 220  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  21557661 tttaaactatgttgtgagt 21557679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20566175 - 20565974
Alignment:
Q  17 tggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataacca 116  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  20566175 tggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccg 20566076  T
Q  117 tttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20566075 tttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaattactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 20565976  T
Q  217 ga 218  Q
    ||    
T  20565975 ga 20565974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 31456432 - 31456216
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||    
T  31456432 gttaactttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttgggaaaa 31456333  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    || || |||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31456332 ttaagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaaaaattccaaccctcaaaactagaaatactatgagtttaattaaggtgtttaagagtatt 31456233  T
Q  204 taacctatgttgtgagt 220  Q
    ||||| || ||||||||    
T  31456232 taacccatattgtgagt 31456216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 26762036 - 26761827
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  26762036 tgttagctttccagtggctttggttttacttgaaactgatttttgatttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaac 26761937  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  26761936 attcaacataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataactccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtat 26761837  T
Q  203 ttaacctatg 212  Q
    ||||||||||    
T  26761836 ttaacctatg 26761827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 22758305 - 22758553
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttg-agatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||| |||||||  | |||||||||||||||| ||||||    
T  22758305 tttgttagctttccaatggctttagcttgacttgaaaatgatttttggtttttttagttatgatggaaatactctagggaggtcttagtgaaaccttatg 22758404  T
Q  100 aaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagag 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22758405 aaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagcactatgagttcaattaaggtgtttacgag 22758504  T
Q  200 tatttaacctatgttgtgagttgatc-ttgggatatgaatgaaagttgt 247  Q
    ||||||| | |||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||    
T  22758505 tatttaatccatgttgtgagttgaactttgggataacaatgaaagttgt 22758553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 19921267 - 19921054
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19921267 gttagctttccagtgg-tttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaaatcttagtgaaatcttatgaaaa 19921169  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  19921168 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaaccttaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatt 19921069  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||| ||||||||||    
T  19921068 taacatatgttgtga 19921054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 3 - 220
Target Start/End: Original strand, 21554796 - 21555013
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  21554796 tgttagctttctagtggtattggtttgacttgaaaatgattttg-gtttttaagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttaggaaa 21554894  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgttt-aagagta 201  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  21554895 attcagtctaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaactagaagtactacgagttcaattaaggtgtttaaagagta 21554994  T
Q  202 tttaacctatgttgtgagt 220  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  21554995 tttaacccatgttgtgagt 21555013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 33472979 - 33473200
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||| || | ||||| | |||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  33472979 tttgttagctttccaatgactctagtttggcgtgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatga 33473078  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  33473079 aaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggtttaattaaggtgtttaagagt 33473178  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttg 222  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  33473179 atttaacctaagttgtgagttg 33473200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 20198001 - 20198216
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttg--agatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttat 98  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||    
T  20198001 tttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttttttttttttagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgacattttat 20198100  T
Q  99 gaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaaga 198  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  20198101 gaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaacttgaagtactaggagtttaattaaggggtataaga 20198200  T
Q  199 gtatttaacctatgtt 214  Q
    ||||||||||||||||    
T  20198201 gtatttaacctatgtt 20198216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 212
Target Start/End: Original strand, 33895300 - 33895508
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  33895300 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatattgtgaaaa 33895399  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  33895400 ttcagcataatcgtttctaagttaatccaaaacttatagaataaatccaaacctcaaaactataagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatt 33895499  T
Q  204 taacctatg 212  Q
    |||||||||    
T  33895500 taacctatg 33895508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 41876008 - 41876222
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||| | |||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  41876008 tttgttagatttccaatgactctggtttggcatgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatga 41876107  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41876108 aaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaatcttagggaataattccaaacctcaaaactaaaagtactatgagttaaattaaggtgtttaagagt 41876207  T
Q  201 atttaacctatgttg 215  Q
    |||||||||||||||    
T  41876208 atttaacctatgttg 41876222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22336957 - 22336748
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  22336957 tttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatga 22336858  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  22336857 aaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactaaaagtaatatgagtgaaattaaggtgtttaagagt 22336758  T
Q  201 atttaaccta 210  Q
    ||||||||||    
T  22336757 atttaaccta 22336748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 8833624 - 8833824
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8833624 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttt--------gagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 8833715  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||    
T  8833716 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttc-attaagttgtttaagagtat 8833814  T
Q  203 ttaacctatg 212  Q
    ||||||||||    
T  8833815 ttaacctatg 8833824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 38145153 - 38145375
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  38145153 tttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatga 38145252  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  38145253 aaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatacgagtgcaattaaggtgtttaagagt 38145352  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttga 223  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  38145353 atttaacccatgttgtgagttga 38145375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22340495 - 22340286
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  22340495 tttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaagagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatga 22340396  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  22340395 aaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttataggataattccaaggctcaaaactaaaagtaatatgagtgaaattaaggtgtttaagagt 22340296  T
Q  201 atttaaccta 210  Q
    ||||||||||    
T  22340295 atttaaccta 22340286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 27 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22750555 - 22750372
Alignment:
Q  27 ttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagtt 126  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22750555 ttgacttgaaaataacttttagtttttgagttatgatggaaatactccaagtaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtt 22750456  T
Q  127 aatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaaccta 210  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22750455 aatccaaaacttagggaataattccaaacctcgaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaaccta 22750372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 19511824 - 19511614
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||   || ||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  19511824 tttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttagaagttatgatggaaatactccaagtaggtcttagtggaatcttatga 19511725  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacct-aaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagag 199  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||  ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  19511724 aaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcgaaaactagaagcattatgaattcaattaaggtgtttaagag 19511625  T
Q  200 tatttaaccta 210  Q
    |||||||||||    
T  19511624 tatttaaccta 19511614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 42961014 - 42960790
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||| ||||||    
T  42961014 tttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatggtttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttcgggaaattttatga 42960915  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  42960914 aaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgcttaagagt 42960815  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatc 225  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    
T  42960814 atttaacccatgttgtgagttgatc 42960790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 28370671 - 28370893
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  28370671 tttgttagctttccagtggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatga 28370770  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  28370771 aaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaactggtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgtaattaaggtgtttaagagt 28370870  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttga 223  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  28370871 atttaacccatgttgtgagttga 28370893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 37598532 - 37598754
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  37598532 tttgttagatttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatga 37598631  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  || |||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  37598632 aaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggacaattccaaggctcaaaactagaattaatatgagtgcaattaaggtttttaagagt 37598731  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttga 223  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  37598732 atttaacccatgttgtgagttga 37598754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16063120 - 16062906
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16063120 tgttagctttacagtggatttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 16063021  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||| |  |   || |||| | ||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16063020 attctgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatagattgtctctaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 16062922  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||    
T  16062921 ttaacctatgttgtga 16062906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Original strand, 36509201 - 36509409
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |        ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36509201 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaagg--------tttttgagatatgatgaaaatgctccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 36509292  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaa-ggtgtttaagagta 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  | |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||    
T  36509293 attcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagagaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaagggggtttaagagta 36509392  T
Q  202 tttaacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||||    
T  36509393 tttaacctatgttgtga 36509409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 40917388 - 40917524
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  40917388 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactcaaaggaggtcttagtgaaattttatga 40917487  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaact 137  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40917488 aaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaact 40917524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18744283 - 18744070
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  18744283 gttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatatttggttcttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttataaaaa 18744184  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    ||| ||||||| ||||||| || || |||||||||||||  |   ||||||| | ||| || |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18744183 ttccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgcactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 18744085  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||    
T  18744084 taacctatgttgtga 18744070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Original strand, 8504286 - 8504496
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8504286 tgttagctttcctgtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 8504385  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||| ||||||| ||||||| || || |||||||||||||  |   | ||||| | ||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  8504386 attccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtcttcaaacttcaaagcttg-tgtactatgaattcaattaaggtgtttaagattat 8504484  T
Q  203 ttaacctatgtt 214  Q
    ||||||||||||    
T  8504485 ttaacctatgtt 8504496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Original strand, 16605021 - 16605235
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  16605021 tgttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatggtttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaagtttatgaaa 16605120  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||| ||||||| |||| ||||| || |||||||||||||  |   ||||||| | ||| || |  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16605121 attccgcataactatttataagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactgtgagttcaattaaagtgtttaagagtat 16605219  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||    
T  16605220 ttaacctatgttgtga 16605235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Original strand, 1627798 - 1628012
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  1627798 tgttatctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttaacttttgagttatgatgaaaatactcgaaggaggtcttaatgaaattttatgaaa 1627897  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||| ||||||| ||||||| || || |||||||||||||  |   ||||||| | ||| || |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1627898 attccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattttctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaacgtgtttaagagtat 1627996  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||    
T  1627997 ttaacctatgttgtga 1628012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 216
Target Start/End: Original strand, 14026232 - 14026437
Alignment:
Q  10 tttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagc 109  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||    
T  14026232 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggttcttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaatcccgc 14026331  T
Q  110 ataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacct 209  Q
     |||| |||||||||| || ||||||| |||||  |   ||||||| | ||| || |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14026332 ctaactatttctaagtcaacccaaaacatatggattgtctccaaacttcaaatcttg-tgtactatgagttgaattaaggtgtttaagagtatttaacct 14026430  T
Q  210 atgttgt 216  Q
    |||||||    
T  14026431 atgttgt 14026437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Original strand, 23199809 - 23200017
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23199809 tgttagctttcccatggctttggtttgacttgaaaat---ttttggtttctgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 23199905  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgttt-aagagta 201  Q
    |||| ||||||| ||||||| || || |||||||||||||  |   ||||||  | ||| || |  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  23199906 attccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaaattcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaagtgtttgaagagta 23200004  T
Q  202 tttaacctatgtt 214  Q
    |||||||||||||    
T  23200005 tttaacctatgtt 23200017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 24617338 - 24617446
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  24617338 tttgttagctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatga 24617437  T
Q  101 aaattcagc 109  Q
    |||||||||    
T  24617438 aaattcagc 24617446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 24713569 - 24713677
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  24713569 tttgttagctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatga 24713668  T
Q  101 aaattcagc 109  Q
    |||||||||    
T  24713669 aaattcagc 24713677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 24746597 - 24746705
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  24746597 tttgttagctttccaatggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatga 24746696  T
Q  101 aaattcagc 109  Q
    |||||||||    
T  24746697 aaattcagc 24746705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 52 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22111185 - 22111020
Alignment:
Q  52 ttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattcc 151  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||  |   |||    
T  22111185 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctcc 22111086  T
Q  152 aaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 218  Q
    |||| | ||| || |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22111085 aaacttcaaagcttg-tgtactgtgagttctattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 22111020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 144 - 241
Target Start/End: Original strand, 12122080 - 12122177
Alignment:
Q  144 ataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaa 241  Q
    ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12122080 ataattctaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtgtttaacctatgttgtgagttgatcttgggataggaatgaa 12122177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 28901557 - 28901346
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| || || |||  |||| | ||||| || || | ||||||    
T  28901557 tttgttaggtttctaatgactttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggtggaattaccccaagcaagtcttggtaaatttttatga 28901458  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||  |||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||   |||  |||||    
T  28901457 aaatt-agcataaccatttataagtaaatccaaaacttgtggaatgtttccaaacctcaaaattagaagtactaggagtttaattaaaaggttggagagt 28901359  T
Q  201 atttaacctatgt 213  Q
    |||||||||||||    
T  28901358 atttaacctatgt 28901346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 28937952 - 28937741
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| || || |||  |||| | ||||| || || | ||||||    
T  28937952 tttgttaggtttctaatgactttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggtggaattaccccaagcaagtcttggtaaatttttatga 28937853  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||  |||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||   |||  |||||    
T  28937852 aaatt-agcataaccatttataagtaaatccaaaacttgtggaatgtttccaaacctcaaaattagaagtactaggagtttaattaaaaggttggagagt 28937754  T
Q  201 atttaacctatgt 213  Q
    |||||||||||||    
T  28937753 atttaacctatgt 28937741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 24668612 - 24668720
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  24668612 tttgttagctttccaatggcttttgattgacgtgaaaatgatttttggtttttgggttatgatgaaattactccaaggaggtcttactgaaatcttatga 24668711  T
Q  101 aaattcagc 109  Q
    |||||||||    
T  24668712 aaattcagc 24668720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 24738381 - 24738489
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  24738381 tttgttagctttccaatggcttttgattgacgtgaaaatgatttttggtttttgggttatgatgaaattactccaaggaggtcttactgaaatcttatga 24738480  T
Q  101 aaattcagc 109  Q
    |||||||||    
T  24738481 aaattcagc 24738489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 24751150 - 24751258
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  24751150 tttgttagctttccaatggcttttgattgacgtgaaaatgatttttggtttttgggttatgatgaaattactccaaggaggtcttactgaaatcttatga 24751249  T
Q  101 aaattcagc 109  Q
    |||||||||    
T  24751250 aaattcagc 24751258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 101
Target Start/End: Original strand, 37804489 - 37804588
Alignment:
Q  2 ttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  37804489 ttgttagctttccaatggctttagtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 37804588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 43243073 - 43243164
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaa 92  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  43243073 tttgttagctttccaatgattttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttaatgaaa 43243164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 17909102 - 17909023
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggt 82  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  17909102 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactctaaggaggt 17909023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 31479005 - 31478801
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||  ||||||||||||||| | || ||||||| ||||||| ||| ||||    
T  31479005 tgttagctttataatgactttggtttgacttaaaaagaatttttagattttgatttatgatgaaaatactac-agtaggtcttggtgaaattttacgaaa 31478907  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||  |||||  |||||  |  ||||||| || |||||| | ||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||    
T  31478906 attcagcataaccatttttaagtgaactcaaaagctatggtttggttccaaaactcaaaacttg-agtactaggagtttaattatgatgtttaagagtat 31478808  T
Q  203 ttaacct 209  Q
    |||||||    
T  31478807 ttaacct 31478801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Original strand, 10732526 - 10732626
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  10732526 tttgttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaatttttatga 10732625  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  10732626 a 10732626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 72 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 26749679 - 26749538
Alignment:
Q  72 ttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagta 171  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||| || || || |||||| ||||||  |   ||||||| | ||| ||    |||    
T  26749679 ttcaaggaggtcttagcgaaattttatgaaaattccgcataactatttataggtcaacccaaaatttatggattgtctccaaacttcaaagctttt-gta 26749581  T
Q  172 ctatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26749580 ctatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 26749538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 82 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 30612108 - 30611973
Alignment:
Q  82 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttc 181  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||| ||||| || |||||| ||||||  |   ||||||  | |||||| |  ||||||||||||     
T  30612108 tcttagtgaaattttataaaaattccgcataactatttgtaagtcaacccaaaatttatggattgtctccaaaattcaaaacttgt-gtactatgagttg 30612010  T
Q  182 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30612009 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 30611973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 82 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 30614068 - 30613933
Alignment:
Q  82 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttc 181  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||  |   |  |||  | ||| || |  ||||||||||||     
T  30614068 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctttaaaattcaaagcttgt-gtactatgagttg 30613970  T
Q  182 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30613969 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 30613933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 101
Target Start/End: Original strand, 42244955 - 42245051
Alignment:
Q  5 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||| || | | ||||||| |||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||    
T  42244955 ttagctttccaatggctttggtgtggcgtaaaaatgagttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaatttttatgaa 42245051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 29351500 - 29351402
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 101  Q
    |||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| | ||| |||| || ||||||||||||||| | |||||||    
T  29351500 tgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacggaggtcttagtgaatttttatgaa 29351402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 4 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 29346553 - 29346456
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 101  Q
    ||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| | ||| |||| || ||||||||||||||| | |||||||    
T  29346553 gttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacggaggtcttagtgaatttttatgaa 29346456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 4 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 29349026 - 29348929
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 101  Q
    ||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| | ||| |||| || ||||||||||||||| | |||||||    
T  29349026 gttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacggaggtcttagtgaatttttatgaa 29348929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 7528489 - 7528428
Alignment:
Q  11 ttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatact 72  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  7528489 ttccattggccttggtttgacttgaaaataatgttttgtttttgagttatgaagaaaatact 7528428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 48
Target Start/End: Original strand, 27183209 - 27183254
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttag 48  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  27183209 tgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttag 27183254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 11342258 - 11342190
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatact 72  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||   |||||||||||| ||| ||||    
T  11342258 gttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 11342190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 11974 - 11903
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatact 72  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||| |  |||||||||||||   |||||||||||| ||| ||||    
T  11974 tttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 11903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 21074247 - 21074318
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatact 72  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||| |  |||||||||||||   |||||||||||| ||| ||||    
T  21074247 tttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 21074318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 22367133 - 22367204
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatact 72  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||    |||||||||||| ||| ||||    
T  22367133 tttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttaaaacttgagatatgattaaattact 22367204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 25426248 - 25426177
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatact 72  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||| |  |||||||||||||   |||||||||||| ||| ||||    
T  25426248 tttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 25426177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 43444047 - 43444094
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttag 48  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  43444047 tttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttag 43444094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 7424944 - 7424886
Alignment:
Q  5 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgat 63  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||   ||||||||||||    
T  7424944 ttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgat 7424886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 20909586 - 20909528
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatg 61  Q
    |||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  20909586 tgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 20909528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 23065088 - 23065046
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttt 45  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  23065088 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttt 23065046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 48
Target Start/End: Original strand, 22883944 - 22883989
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttag 48  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  22883944 tgttagctttctaatggctttggtttgacgttcaaatgatttttag 22883989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0635 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0635
Description:

Target: scaffold0635; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 3 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 7519 - 7255
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  7519 tgttagctttctagtggtattggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccagggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 7420  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7419 attcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 7320  T
Q  203 ttaacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagacttaca 267  Q
    |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  7319 ttaatccatgatgtgagttgatcttgggatatgaatggaagttgttaataagttatagacttaca 7255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0607
Description:

Target: scaffold0607; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 3343 - 3077
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  3343 tttgttagctttccaatgacttttgtttgacttgaaaatgatattttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatga 3244  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3243 aaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgagataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaagatgtttaagagt 3144  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagacttaca 267  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  3143 atttaacccatgttgcgagttgatcttgggatatgaatggaagttgttaataagttatagacttaca 3077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0630 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0630
Description:

Target: scaffold0630; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 3 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 8699 - 8435
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  8699 tgttagctttccagtggctttggtttcacttgaaaatgatttttggtgtttgatatatgatgaaaatactccaaggaagtcttggtgaaatcttatgaaa 8600  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8599 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactacaagtactatgagttcaattaagatgtttaagagtat 8500  T
Q  203 ttaacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagacttaca 267  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8499 ttaacctatgttgtgagttgatattgggataggaatgaaagttgttattaagttatagacttaca 8435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 4 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 8691 - 8428
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  8691 gttagctttccagtgtctttggtttgacttgaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactctaaggaggtgttagtgaaattttatgaaaa 8592  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8591 ttcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaaaagtatt 8492  T
Q  204 taacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagacttaca 267  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||    
T  8491 taatccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatggacgttgttaataagttatagacttaca 8428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 5)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 4 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 77321 - 77058
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  77321 gttagctttccagtggctttgatttgacgtggaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 77222  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  77221 ttcagcataagcgtttctaagttaattcaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtacaatgagttcaattaaggtgtttaagattatt 77122  T
Q  204 taacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagacttaca 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  77121 taacctatgttgtgagttgatcttgggataggaatagaagttgttattaagttatagacttaca 77058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 152625 - 152849
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  152625 tttgttagctttccaatggttttggtttgacttgaaaatgatatttattttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatga 152724  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  152725 aaattcagcaaaactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaacccttaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 152824  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatc 225  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||    
T  152825 atttaatccatgttgtaagttgatc 152849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 176429 - 176208
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| || ||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  176429 tttgttagctttccaatgactctggtttgacgtgaaaataatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatga 176330  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  176329 aaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagt 176230  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttg 222  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  176229 atttaacctaagttgtgagttg 176208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 169076 - 168855
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| || ||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  169076 tttgttagctttccaatgactctggtttgacgtgaaaataatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatga 168977  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  168976 aaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggagtttaagagt 168877  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttg 222  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  168876 atttaacctaagttgtgagttg 168855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Original strand, 139619 - 139687
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatact 72  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  |  | ||||||||||| |||| || |||| ||||||||||    
T  139619 gttagctttctaatggctttggtttgagctccatatgatttttagatttttagttatggtgaaaatact 139687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 51595 - 51329
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  51595 tttgttagctttccagtggatttggtctgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatcaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatga 51496  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  51495 aaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgagataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttaaaataaggtgtttaagagt 51396  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagacttaca 267  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  51395 atttaatcaatgttgtgagttgatcttgggataggaatggaagatgttaataagttatagacttaca 51329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 67305 - 67191
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  67305 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatga 67206  T
Q  101 aaattcagcataacc 115  Q
    |||||||||||||||    
T  67205 aaattcagcataacc 67191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 28783 - 29000
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28783 tttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatga 28882  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28883 aaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaaaagt 28982  T
Q  201 atttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||||    
T  28983 atttaacctatgttgtga 29000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 10072 - 9996
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaag 77  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10072 tttgttagctttccaatgattttggtttgactcgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaag 9996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 6052 - 5788
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  6052 tgttagctttccattggatttggtttgacttgaaaatgatttttgatttttgagttatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaa 5953  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5952 attcagcataaccgtttcaaagtcagtccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatagtat 5853  T
Q  203 ttaacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagacttaca 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  5852 ttaacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatataagttgttattaagttatagacttaca 5788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Original strand, 7200 - 7413
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  || |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7200 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaataattttttgtttta-agttatgataaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 7298  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || |||||| ||||||  |   ||||||  | |||  | |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7299 attctgcataactatttctaagtcaacccaaaatttatggattgtctccaaaattcaaagtttg-tgtactatgagttaaattaaggtgtttaagagtat 7397  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||    
T  7398 ttaacctatgttgtga 7413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 4 - 267
Target Start/End: Original strand, 35989 - 36252
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  35989 gttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttctggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggttttagtgaaatcttaggaaaa 36088  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36089 ttcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 36188  T
Q  204 taacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagacttaca 267  Q
      ||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36189 cgactcatgttgagagttgatcttgggataggaatgaaagttgttaataagttatagacttaca 36252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16210 - 15990
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  16210 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatga 16111  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  16110 aaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaaatactataagttcaattaaggtgtttaatagt 16011  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagtt 221  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16010 atttaacctatgttgtgagtt 15990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 3)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 3359 - 3578
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3359 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgattttttctgtttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttatgaaa 3458  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3459 attcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatagtat 3558  T
Q  203 ttaacctatgttgtgagttg 222  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  3559 ttaacctatgttgtgagttg 3578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 56 - 1
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgag 56  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  56 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttaatttttgag 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 8635 - 8590
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttag 48  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  8635 tgttagctttctaatggctttggtttgacttctagatgatttttag 8590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0515 (Bit Score: 183; Significance: 5e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0515
Description:

Target: scaffold0515; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 4669 - 4446
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4669 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 4570  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattcca----aacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaaga 198  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4569 attcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaattaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaaga 4470  T
Q  199 gtatttaacctatgttgtgagttg 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  4469 gtatttaacctatgttgtgagttg 4446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 183; Significance: 5e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 4669 - 4446
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4669 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 4570  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattcca----aacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaaga 198  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4569 attcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaattaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaaga 4470  T
Q  199 gtatttaacctatgttgtgagttg 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  4469 gtatttaacctatgttgtgagttg 4446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 183; Significance: 5e-99; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 105549 - 105311
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  105549 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatatttagtttttgagatatgatgaaaatacaccaaggaggtctaagtgaaattttatga 105450  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  105449 aaattcagcataacagtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaaactcaaaactagaagtactatgagttcaattaaagtgtttaagagt 105350  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatg 239  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  105349 atttaacccatgttgtgagttgatcttggggtaggaatg 105311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 162921 - 162674
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  162921 tttgttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttaagatatgatgaaaatactccaagaaggtcttagtgaaatcttatga 162822  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  162821 aaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacatatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 162722  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatc-ttgggatatgaatgaaagttgt 247  Q
    ||||||   |||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||    
T  162721 atttaattcatgttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttgt 162674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 94985 - 94927
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatg 61  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  94985 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 94927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 2)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 1722 - 1505
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1722 tttgttagctttacaatggctttggtttaacttgaaaatgatttttagtttttgagatgtgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatga 1623  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1622 aaattcggcataaccaattctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaacaagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 1523  T
Q  201 atttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||||    
T  1522 atttaacctatgttgtga 1505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 153 - 1
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  153 tttgttatctttccaatggctttggtttaactggaaaatgatttttagtttttgagatgtgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatga 54  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaa 153  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53 aaattcggcataaccaattctatgttaatccaaaacttatgggataattccaa 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 21370 - 21153
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  21370 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttggaaatgatttctagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaaga 21271  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21270 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattttaattctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 21171  T
Q  201 atttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||||    
T  21170 atttaacctatgttgtga 21153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 21892 - 21677
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21892 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatga 21793  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21792 aaattcagcacaaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtttttaagagt 21693  T
Q  201 atttaacctatgttgt 216  Q
    |||||||| |||||||    
T  21692 atttaacccatgttgt 21677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 6093 - 5874
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6093 tgttagatttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactctaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 5994  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  5993 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtat 5894  T
Q  203 ttaacctatgttgtgagttg 222  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  5893 ttaacatatgttgtgagttg 5874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 178; Significance: 5e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12603 - 12382
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12603 gttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgaagaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaa 12504  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12503 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagagtatt 12404  T
Q  204 taacctatgttgtgagttgatc 225  Q
    ||||| || |||||||||||||    
T  12403 taacccattttgtgagttgatc 12382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 630 - 406
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||    
T  630 tttgttagctttctaatggttttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaaaaggtcttagtgaaatcttgtga 531  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  530 aaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagc 431  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatc 225  Q
    ||||||||  |||||||||||||||    
T  430 atttaacccgtgttgtgagttgatc 406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 176; Significance: 7e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 650 - 428
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  650 gttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgatttttagttttttagatatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaa 551  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  550 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtg-ttaagagtatt 452  T
Q  204 taacctatgttgtgagttgatctt 227  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  451 taacccatgttgtgagttgatctt 428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 176; Significance: 7e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 22186 - 22405
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  22186 tgttaactttccagtggattttgtttgacttgaaaatgatttttggtgtttgacatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaag 22285  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22286 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctaaaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 22385  T
Q  203 ttaacctatgttgtgagttg 222  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  22386 ttaacctatgttgtgagttg 22405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 176; Significance: 7e-95; HSPs: 4)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 21716 - 21497
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21716 tgttagctttccagtggctttggtttaacttgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 21617  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    || |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21616 atccagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 21517  T
Q  203 ttaacctatgttgtgagttg 222  Q
    || |||||||||||||||||    
T  21516 ttcacctatgttgtgagttg 21497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 123975 - 124182
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  123975 tttgttagcattccaatggctttgaattgacatgaaaataatttttggtttttgagatattatgaaaatactccaatgaggtgttagtgaaatcttatga 124074  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  124075 aaattcagcataaccatttctaagtgaatccaaaacttatgggataatttcaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagaat 124174  T
Q  201 atttaacc 208  Q
    ||||||||    
T  124175 atttaacc 124182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 111124 - 110902
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  111124 tttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatga 111025  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  111024 aaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagt 110925  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttga 223  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  110924 atttaacccatgttgtgagttga 110902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 8 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 146362 - 146152
Alignment:
Q  8 gctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattca 107  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  146362 gctttccagtggctttggtttgacgtgaaaaggatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttatgaaaattca 146263  T
Q  108 gcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaac 207  Q
    | |||||  |||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||     
T  146262 gaataacagtttctaagttaatccaaaacatatgtaataattcaaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaat 146163  T
Q  208 ctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||    
T  146162 ctatgttgtga 146152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0308 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0308
Description:

Target: scaffold0308; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 17 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 12955 - 12705
Alignment:
Q  17 tggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataacca 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||     
T  12955 tggctttggttttacttgaaaatgatttctagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataacct 12856  T
Q  117 tttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||     
T  12855 tttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaatccataaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattcaactcatgttga 12756  T
Q  217 gagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagacttaca 267  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  12755 gagttgatattggaataggaatgaaaattgttaataagttatagacttaca 12705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 9692 - 9475
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9692 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgaattttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatga 9593  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  9592 aaattaagcataactatttctaagttaatccaaaacttatgagacaattccaaggctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagatt 9493  T
Q  201 atttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9492 atttaacctatgttgtga 9475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 3)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 2975 - 2731
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2975 tttgttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttaagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatga 2876  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2875 aaattcagcataaccgtttctaagttaatcc-aagcttatgggataattccaaagctcaaaactagaaatactacgagttcaattaaggtgtttaagagt 2777  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatc-ttgggatatgaatgaaagtt 245  Q
    |||||| | |||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||    
T  2776 atttaatccatgttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagtt 2731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Original strand, 394 - 609
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |  |||| ||||  ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  394 tgttagctttccagtggcatcggtttgacttgaaaaagtattttggtttaggagttatgttgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 493  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  494 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactcgaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtat 593  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
     |||||||||||||||    
T  594 ctaacctatgttgtga 609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Original strand, 5697 - 5912
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    |||||| ||| || |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  5697 tgttagattttcagtggcatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatgttgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaa 5796  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  5797 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtat 5896  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
      |||||||| |||||    
T  5897 caaacctatgctgtga 5912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0672 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0672
Description:

Target: scaffold0672; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 7971 - 8186
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  7971 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatga 8070  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  8071 aaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttatgatt 8170  T
Q  201 atttaacctatgttgt 216  Q
    |||||||| |||||||    
T  8171 atttaacccatgttgt 8186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Original strand, 70245 - 70464
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  70245 tgttagctttccagtggctttagtttgactcgaaaatgatttttggtttatgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 70344  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  70345 attcagcataaccatttctaagttaatcaaaaacttatgagataattccaaaactcaaaactagaagtactataagttcaattaaggtgtttaagagtat 70444  T
Q  203 ttaacctatgttgtgagttg 222  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  70445 ttaacctatgttatgagttg 70464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 72045 - 71934
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  72045 gttagctttccaattgctttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaa 71946  T
Q  104 ttcagcataacc 115  Q
    ||||| ||||||    
T  71945 ttcaggataacc 71934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 171; Significance: 7e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 9371 - 9593
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  9371 tttgttagctttccaatggctttggtttgactggaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatga 9470  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
     ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9471 taattcagcacaaccgtttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtacaattaaggtgtttaagagt 9570  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttga 223  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  9571 atttaacccatgttgtgagttga 9593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 171; Significance: 7e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 15004 - 15218
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15004 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgacaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 15103  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15104 ttcagcataaccgtttctaagttaatctaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatt 15203  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||    
T  15204 taacctatgttgtga 15218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 24062 - 24276
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24062 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgacaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 24161  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24162 ttcagcataaccgtttctaagttaatctaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatt 24261  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||    
T  24262 taacctatgttgtga 24276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 7770 - 7553
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  7770 tttgttagctttccaatggttttgatttgacttgaaaattatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtcaaatcttatga 7671  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  7670 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattcaaaagctcaaaattagaagtactatgagttcaattaaggtgtttattagt 7571  T
Q  201 atttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||||    
T  7570 atttaacctatgttgtga 7553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 4)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 26563 - 26358
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  26563 tttgttagctttccaatggctttggtttgactagaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaggtaggtcttagtgaaatcttatga 26464  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26463 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaagctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagt 26364  T
Q  201 atttaa 206  Q
    ||||||    
T  26363 atttaa 26358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 27945 - 27740
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  27945 tttgttagctttccaatggctttggtttgactagaaaatgatttttaatttttgagatatgatgaaaatactccaggtaggtcttagtgaaatcttatga 27846  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27845 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaagctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagt 27746  T
Q  201 atttaa 206  Q
    ||||||    
T  27745 atttaa 27740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 7854 - 7639
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||| ||||||||    
T  7854 tgttagctttccagtggctttggtttgatgtgaaaaagatatttggtttttgagttatgatgaaaatactccaagaaggtctttgtgtaattttatgaaa 7755  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||    
T  7754 attcagcataattgtttgtaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttagttaaggggtttaagagtat 7655  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||    
T  7654 ttaacctatgttgtga 7639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 14485 - 14270
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||| ||||||||    
T  14485 tgttagctttccagtggctttggtttgatgtgaaaaagatatttggtttttgagttatgatgaaaatactccaagaaggtctttgtgtaattttatgaaa 14386  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||    
T  14385 attcagcataattgtttgtaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttagttaaggggtttaagagtat 14286  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||    
T  14285 ttaacctatgttgtga 14270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1783 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold1783
Description:

Target: scaffold1783; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 886 - 658
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  886 tttgttagcttacgaatgactttggtttgacttgaaactgatatttcgtttttgagatatgatgaaaatactacaaggaggtcttagtgaaattttatga 787  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  786 aaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctccaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagatt 687  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatcttgg 229  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  686 atttaacccatgttatgagttgatcttgg 658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 11332 - 11113
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11332 tgttatctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgacttttggtttttgagatatgatgaaaatacgccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 11233  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11232 attcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 11133  T
Q  203 ttaacctatgttgtgagttg 222  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  11132 ttaacctatgttgtgagttg 11113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 6)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 23206 - 22959
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||  | |||||||||||||||| |||||||    
T  23206 tttgttagctttccaatggctttggtttgaattgaaaatgatttttggtttttgagttatgatggaaatactctagggaggtcttagtgaaaccttatga 23107  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23106 aaattcagcacatccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaatgctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 23007  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatc-ttgggatatgaatgaaagttgt 247  Q
    |||||| | |||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||    
T  23006 atttaatccatgttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttgt 22959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 17672 - 17879
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||  | ||| |||||||||||| |||||||    
T  17672 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgattttttgtttttgagttatgatggaaatactctagggatgtcttagtgaaaccttatga 17771  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  17772 aaattcagcacagccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagaat 17871  T
Q  201 atttaacc 208  Q
    ||||||||    
T  17872 atttaacc 17879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 22594 - 22765
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaagg-aggtcttagtgaaatcttatg 99  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||  | || |||||||||||||| ||||||    
T  22594 tttgttagcattccaatgactttggtttgacttgaaaatgattttttgtttttgagttatgatggaaatactctaggggaggtcttagtgaaaccttatg 22693  T
Q  100 aaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagta 171  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  22694 aaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagta 22765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 33973 - 33794
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||| ||||| | |||| |||||||| ||||||| | |||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33973 gttagcattccagtagcttcggtttgacgtgaaaataaattttggttctcgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaaatcttatgaaaa 33874  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaa 183  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  33873 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactataagtactatgagttcaa 33794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 77 - 208
Target Start/End: Original strand, 23381 - 23512
Alignment:
Q  77 ggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatg 176  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||    
T  23381 ggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatg 23480  T
Q  177 agttcaattaaggtgtttaagagtatttaacc 208  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23481 agttcaattaaggtgtttaagaatatttaacc 23512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 3143 - 3085
Alignment:
Q  210 atgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagttatagacttacat 268  Q
    |||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  3143 atgttgtgagttgaccttgggatagaaatggaagttgttactgagttatagatttacat 3085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 78698 - 78484
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  78698 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttatgaaaa 78599  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  78598 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactaaggtgttaaagagtatt 78499  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||    
T  78498 taacctatgttgtga 78484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1283 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold1283
Description:

Target: scaffold1283; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 885 - 1099
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  885 gttagatttccagtggctttggattgacgtgaaaatgatttttagttcttgagatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 984  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  985 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcaaaacctcaaaactagaagtattatgagttcaattagggtgtttaagagtatt 1084  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||    
T  1085 taacctatgttgtga 1099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 5131 - 5345
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5131 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttgtttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 5230  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  5231 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatt 5330  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    ||| |||||||||||    
T  5331 taaactatgttgtga 5345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 6092 - 6312
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  6092 tttgttagctttccaatggctttggtttcacttgaaaatgaaatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttataa 6191  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaagg-tgtttaagag 199  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  6192 aaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaagatcaaaactagaagtactatgagttcaattagggttttttaagag 6291  T
Q  200 tatttaacctatgttgtgagt 220  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  6292 tatttaacttatgttgtgagt 6312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 4)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 397 - 614
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  397 tttgatagctttccaatggttttgctttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactacaaggaggtcttagtgaaatcttagga 496  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  497 aaattcagtatatccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaaatactatgagttaaattaaggtgtttaagaga 596  T
Q  201 atttaacctatgttgtga 218  Q
    |||||| |||||||||||    
T  597 atttaatctatgttgtga 614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 5701 - 5918
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  5701 tttgatagctttccaatggttttgctttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactacaaggaggtcttagtgaaatcttagga 5800  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  5801 aaattcagtatatccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaaatactatgagttaaattaaggtgtttaagaga 5900  T
Q  201 atttaacctatgttgtga 218  Q
    |||||| |||||||||||    
T  5901 atttaatctatgttgtga 5918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 6 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 1567 - 1480
Alignment:
Q  6 tagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaat 93  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1567 tagctttccagtggttttggtttgacttgaaaatgatattttgtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaat 1480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 30
Target Start/End: Original strand, 11420 - 11449
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttga 30  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11420 tttgttagctttccaatggctttggtttga 11449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 82620 - 82400
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  82620 gttagctttccaattgttttggtttcacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaa 82521  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  82520 ttcagcataaccgtttctaagttaattcaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtattatgagttcaattaaggtg-ttaagagtatt 82422  T
Q  204 taacctatgttgtgagttgatc 225  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  82421 taacccatgttgtgagttgatc 82400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 161; Significance: 7e-86; HSPs: 3)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 10856 - 10636
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    |||||||||| || | |||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  10856 tgttagcttttcagtagctttggtttcacttgaaaattatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaagaggacttagtgaaatcttatgaaa 10757  T
Q  103 attcagcataaccattt-ctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagta 201  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10756 attcagcataaccattttctaagttaatccaaaacttaagggataattccaaaactcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagta 10657  T
Q  202 tttaacctatgttgtgagttg 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  10656 tttaacctatgttgtgagttg 10636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 953 - 744
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  953 tgttagctttctagtgggtttggtttgacttgaaaatgatttttggtttctgagttatgatgaaaatac-tcaatgaggtcttagtgaaattttatgaaa 855  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||| ||| ||| ||||||| || || |||||||||||||  |   ||||||| | ||| ||    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  854 attccgcagaactatttctatgtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagct-tttgtactataaattcaattaaggtgtttaagagtat 756  T
Q  203 ttaacctatgtt 214  Q
    ||||||||||||    
T  755 ttaacctatgtt 744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 6459 - 6250
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  6459 tgttagctttctagtgggtttggtttgacttgaaaatgatttttggtttctgagttatgatgaaaatac-tcaatgaggtcttagtgaaattttatgaaa 6361  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||| ||| ||| ||||||| || || |||||||||||||  |   ||||||| | ||| ||    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  6360 attccgcagaactatttctatgtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagct-tttgtactataaattcaattaaggtgtttaagagtat 6262  T
Q  203 ttaacctatgtt 214  Q
    ||||||||||||    
T  6261 ttaacctatgtt 6250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 161; Significance: 7e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 6662 - 6438
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  6662 tttgttagctttccaatgacttcggtttgaattgaaaattagttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttagga 6563  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6562 aaattcagtataatcatttataagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagt 6463  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatc 225  Q
     ||||||||||||| ||||| ||||    
T  6462 gtttaacctatgttatgagtagatc 6438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 51 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16524 - 16358
Alignment:
Q  51 tttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattc 150  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||  |   ||    
T  16524 tttgagttatgatgaaaatactccaaggatgtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattttctc 16425  T
Q  151 caaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||| | |||  |  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16424 caaacttcaaagat-catgtactatgagttcaattaaggggtttaagagtatttaacctatgttgtga 16358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 161; Significance: 7e-86; HSPs: 3)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 67731 - 67507
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  67731 tttgttagctttcctatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatga 67632  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  67631 aaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagagaataattccaaatctgaaaactagaagtactaggatttcaattaaggtgtttaagaat 67532  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgatc 225  Q
    ||||||||||||||  |||||||||    
T  67531 atttaacctatgttaagagttgatc 67507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 218
Target Start/End: Original strand, 62405 - 62602
Alignment:
Q  21 tttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttc 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  62405 tttgttttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttc 62504  T
Q  121 taagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgttta-agagtatttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||| || ||||||||| |||  |   ||||||| |  || |  |  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  62505 taagtcaaaccaaaacttgtggattgtctccaaacttctaagcctg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttagggagtatttaacctatgttgtga 62602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Original strand, 116822 - 117032
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||  | | |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  116822 tgttagctttgcagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttagattttgagttatgaggaaaccattccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaa 116921  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||   ||||| |||||||||| || |||||||||||||  |  |||||||| | ||||| ||||||| || ||||| || ||||  ||||||||||||    
T  116922 attctatataactatttctaagtcaacccaaaacttatggtttgtttccaaacttcaaaaccagaagtattaggagtttaagtaagaggtttaagagtat 117021  T
Q  203 ttaacctatgt 213  Q
    | |||||||||    
T  117022 taaacctatgt 117032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 161; Significance: 7e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 138409 - 138165
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||  | ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  138409 gttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatggaaatactctagggaggtcttcgtgaaaccttatgaaaa 138310  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  138309 ttcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgtgataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttacgagtatt 138210  T
Q  204 taacctatgttgtgagttgatc-ttgggatatgaatgaaagttgt 247  Q
    ||| | |||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||    
T  138209 taatccatgttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttgt 138165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 7803 - 8017
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7803 gttagctttctagtggctttggttttacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 7902  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  7903 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacttcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatt 8002  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||    
T  8003 taacctatgttgtga 8017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 221
Target Start/End: Original strand, 11924 - 12142
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11924 tgttagctttccagtggctttggttttacttgaaaatgatttttggtgtttgaattattatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 12023  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12024 atttagcataactgtttcaaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtaa 12123  T
Q  203 ttaacctatgttgtgagtt 221  Q
    |||||||||||||||||||    
T  12124 ttaacctatgttgtgagtt 12142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 634 - 421
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  634 tttgttagctttccaatgactttggtttcacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatga 535  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  534 aaattcagtataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaactagaagtactttgagttcaattagggtgtttaagagt 435  T
Q  201 atttaacctatgtt 214  Q
    || |||| ||||||    
T  434 atgtaacttatgtt 421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 5 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 39732 - 39519
Alignment:
Q  5 ttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaat 104  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39732 ttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagggcttagtgaaatcttatgaaaat 39633  T
Q  105 tcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattt 204  Q
    |||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  39632 tcaggataatcgtttctatgttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgatttcaattaggatgtttaagagtattt 39533  T
Q  205 aacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||    
T  39532 aacctatgttgtga 39519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 156; Significance: 6e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 27935 - 27720
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  27935 tgttagctttccagtggctttagtttgaattgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaaaataattccaggaggtcttactgaaattttatgaaa 27836  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27835 attcagcaaaaccgtttctaagtcaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtacaattaaggtgtttaagagtat 27736  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
    |||| |||||||||||    
T  27735 ttaatctatgttgtga 27720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 225
Target Start/End: Original strand, 1527 - 1748
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaa-tgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  1527 gttatctttccagtggctttggtttgacttgaaaaatgatttttattttttgagatatgatgaaaatactccatggaggtcttagtgaaatcttaggaaa 1626  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  1627 attcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaacccccaaaactagaagtactatgagttcaattaaggt-tttaagattat 1725  T
Q  203 ttaacctatgttgtgagttgatc 225  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  1726 ttaacccatgttgtgagttgatc 1748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 22209 - 22423
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22209 gttagctttccagtggctttggtttcacgtgaaaattatttttggttattgagatatgatgaaaatgctccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 22308  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  22309 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaacttgaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatt 22408  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||    
T  22409 taacctatgttgtga 22423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 29369 - 29128
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  29369 tttgtaagctttcgaatggctttagtttgacttaaaaatgatttttagtttttaaaatatgatgaaaatactccacggaggtcttagtgaaatcttatga 29270  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29269 aaattcagcataaccgtttccatgttaatcaaaaacttatgggataattccaggactaaaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagt 29170  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgat-cttgggatatgaatgaa 241  Q
    |||||| | ||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  29169 atttaagccatgttgtgagttgatccttgggttaggaatgaa 29128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 34834 - 34593
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  34834 tttgtaagctttcgaatggctttagtttgacttaaaaatgatttttagtttttaaaatatgatgaaaatactccacggaggtcttagtgaaatcttatga 34735  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34734 aaattcagcataaccgtttccatgttaatcaaaaacttatgggataattccaggactaaaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagt 34635  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttgat-cttgggatatgaatgaa 241  Q
    |||||| | ||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  34634 atttaagccatgttgtgagttgatccttgggttaggaatgaa 34593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 151; Significance: 6e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 58382 - 58168
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  58382 gttagctttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatctgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttatgaaaa 58283  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  58282 ttcagcataagcgtttctaagttaatccaaaacataaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatt 58183  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||||| ||||||||    
T  58182 taacctgtgttgtga 58168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 68538 - 68438
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  68538 tttgttagctttccaatggatttggttttacttgaaaatgatttttatcttttgagatatgatggaaatactccaagttggtcttagtgaatttttatga 68439  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  68438 a 68438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0802 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0802
Description:

Target: scaffold0802; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 5084 - 5293
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  5084 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaataatttttgatttttgagatatgatgaaaatacttcaagaaggtcttagtgaaattttatgaaa 5183  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  5184 attcagcctaacagtttctaagttaatccaaaacttatggaatgattccaaacctcaaaactagaagttctaggggttcaattaaggtgtttaagagtat 5283  T
Q  203 ttaacctatg 212  Q
    ||||||||||    
T  5284 ttaacctatg 5293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 10864 - 11073
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  10864 tgttaactttccagtggctttggtttgacttgaaaatgaattttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaattttatgaaa 10963  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  10964 attcagaataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcgaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtat 11063  T
Q  203 ttaacctatg 212  Q
    ||||||||||    
T  11064 ttaacctatg 11073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 79 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 17318 - 17223
Alignment:
Q  79 aggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtacta 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  17318 aggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattttaaatctcaaaactagaagtacta 17223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 149; Significance: 9e-79; HSPs: 3)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 3 - 211
Target Start/End: Original strand, 64486 - 64694
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  64486 tgttagatttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaagaaggtcttagtgaaattttatgaaa 64585  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||     
T  64586 attcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttgtggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtag 64685  T
Q  203 ttaacctat 211  Q
    |||||||||    
T  64686 ttaacctat 64694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 31585 - 31386
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||| |||| | ||||| |||| | |||| ||||| |||   ||||| |||| | ||| |||| || | |||||  |||||||||||||||||    
T  31585 tgttagctttctaatgccattggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggttaaattactgcacgtaggtcacagtgaaatcttatgaaa 31486  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31485 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaatccttaaaactagaagttctatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 31386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 31778 - 31680
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 101  Q
    |||||| |||||  ||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  31778 tgttagatttccggtggctttgggtttacatgaaaatgattttttgtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 31680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 120544 - 120330
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  120544 gttagctttccagtggctttagtttgacgcgaaaatgatttttttttcttgagatatgatgaaaatacttcaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaa 120445  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  120444 ttcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaggggtttaagagtatt 120345  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||| | ||||||||    
T  120344 taacatgtgttgtga 120330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Original strand, 29614 - 29786
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29614 tgttagatttccagtggctttgatttgacttgaaaatcatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 29713  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactat 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29714 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactagaagtactat 29786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1539 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold1539
Description:

Target: scaffold1539; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 1541 - 1327
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  1541 gttagctttccagtgactttggtttgatgtgaaaatgatttttggttcttgggatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaa 1442  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  1441 tttagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatt 1342  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||| ||||    
T  1341 taacctatgtggtga 1327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0452
Description:

Target: scaffold0452; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 13083 - 13297
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  13083 gttagctttccagtggctttggtgtgacgtgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaa 13182  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  13183 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaaatagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatt 13282  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||| | ||||||||    
T  13283 taacatgtgttgtga 13297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 8065 - 8277
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||| || |||  |||| | ||||| || || | ||||||    
T  8065 tttgttagccttcctatggatttggtttgacttaaaaatgatgtttagatttagagatatgatggaattaccccaagcaagtcttggtaaatttttatga 8164  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||| ||||| ||||| |||||||  ||||||||||    
T  8165 aaattcagcataaccgtttctaactcaatccaaaacttatggaatatttccaaaactcaaaactagaaatactaggagtttaattaagaggtttaagagt 8264  T
Q  201 atttaacctatgt 213  Q
    ||||||| |||||    
T  8265 atttaacgtatgt 8277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 11793 - 11579
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11793 gttagctttccattggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttattatcaaaatactccaaggaggtcttagcgaaatcttatgaaaa 11694  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    ||||||| | || |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  11693 ttcagcacagccgtttctaagttaatccaaaacctagggaataattccaaacctcaaaactagaagtattaggagtttaattacggtgtttaagagtatt 11594  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    | |||||||||||||    
T  11593 tgacctatgttgtga 11579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 4055 - 3839
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  4055 tgttagctttccagtggctctggtttgacttgaaaatgacttttggtatttgagatatgatgaaaatactccatggagatcttagtgaaattttatgaaa 3956  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaa-ggtgtttaagagta 201  Q
    ||| ||  ||||  ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||| || |||| ||||||    
T  3955 atttagtttaacagtttctaagtcaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactggaagtactaggagtttaattaagggggttttagagta 3856  T
Q  202 tttaacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||||    
T  3855 tttaacctatgttgtga 3839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 143247 - 143033
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  143247 gttagctttccagtggttttagtttgacatgaaaagaatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaa 143148  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  143147 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatt 143048  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||| ||||    
T  143047 taacctatgtggtga 143033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 180
Target Start/End: Original strand, 169415 - 169591
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  169415 gttagctttccagtggctttagtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactctaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaa 169514  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagtt 180  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  169515 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 169591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 4)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 133579 - 133801
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||  ||| |||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  133579 tttgttagctttccaatggctttagtttgactttaaaatgattttttgtttaggagttatgttgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatga 133678  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  133679 aatttcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaattagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagt 133778  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttga 223  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  133779 atttaacccatgttgtgagttga 133801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 133387 - 133165
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  133387 tttgttagcttttcaatggctttggtttgacttttaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactcaaagtaggtcttagggaaatcttatga 133288  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||    
T  133287 aaattcagcacaaccattttcaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaagaggtttaagtgt 133188  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttga 223  Q
    |||||||  ||||||||||||||    
T  133187 atttaactcatgttgtgagttga 133165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 35 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 29761 - 29578
Alignment:
Q  35 aaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaa 134  Q
    |||||||||||| ||||   || ||||||||||||||| ||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29761 aaaatgatttttggtttagtagttatgatgaaaatactacaaggaatacttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaa 29662  T
Q  135 acttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29661 acttagggaataattccaaacctcaagactagaagtactaagagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacctatgttgtga 29578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 33875 - 33804
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatact 72  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||    
T  33875 tttgttagatttccaatggctttggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatact 33804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 141; Significance: 6e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Original strand, 10346 - 10562
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10346 tgttagctttccagtagctttggtttaacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaa 10445  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaa-ggtgtttaagagta 201  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||| |||||    
T  10446 attcagcataaacgtttctaagttaatccaaaacttatagaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaagggggtttatgagta 10545  T
Q  202 tttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||| |||||||    
T  10546 tttaacctacgttgtga 10562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 48
Target Start/End: Original strand, 19940 - 19985
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttag 48  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||    
T  19940 tgttagctttccaatggctttggtttgaagtccaaatgatttttag 19985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 210
Target Start/End: Original strand, 7006 - 7213
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggcttt-ggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||    
T  7006 gttagctttccagtggcttttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatattatgaaaatactccaagtagatcttagtgaaattttatgaaa 7105  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  7106 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtat 7205  T
Q  203 ttaaccta 210  Q
    ||||||||    
T  7206 ttaaccta 7213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0632 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0632
Description:

Target: scaffold0632; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 800 - 585
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    |||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  800 tgttagcttttccgtggcttttgtttgacttgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 701  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||||||||||  |||||||| || ||||| | ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  700 attcagcataactgtttctaaggtagtccaatatttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtccaactagggtgtttaagagtat 601  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||    
T  600 ttaacctatgttgtga 585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 139; Significance: 9e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 1332 - 1130
Alignment:
Q  10 tttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagc 109  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  1332 tttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttgatttttgagatatgatgaaaatactccaaggatatcttagtgaaattttatgaaaattcagc 1233  T
Q  110 ataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacct 209  Q
     ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  1232 ctaacagtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaagatggttaagagtatttaacct 1133  T
Q  210 atg 212  Q
    |||    
T  1132 atg 1130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 48
Target Start/End: Original strand, 6236 - 6281
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttag 48  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  6236 tgttagctttctaatggctttggtttgacttctaaatgatttttag 6281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 139; Significance: 9e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 12954 - 13168
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12954 gttagatttccagtggttttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcctgagatatgttgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaa 13053  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  13054 ttcagcacaaccatttttaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactaaaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatt 13153  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||    
T  13154 taacctatgttgtga 13168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 151 - 218
Target Start/End: Original strand, 19368 - 19435
Alignment:
Q  151 caaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19368 caaacctcaaaactaaaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 19435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 139; Significance: 9e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 21286 - 21072
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||    
T  21286 gttagatttccagtggctttggtttgacgtgaaaatgatttttggttcgtgagatatgatgaaaatactccaagtagatcttagtgaaattttatgaaaa 21187  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  21186 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaatagtatt 21087  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||| | ||||||||    
T  21086 taacatgtgttgtga 21072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 139; Significance: 9e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 126382 - 126168
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  126382 gttagctttccagttgctttggtttaacgtgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaa 126283  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  126282 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattctaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatt 126183  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||| | ||||||||    
T  126182 taacatgtgttgtga 126168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 33070 - 32878
Alignment:
Q  21 tttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttc 120  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||     
T  33070 tttggtttgacttgaaaatgaattttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactttttt 32971  T
Q  121 taagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 214  Q
    || || || |||||||||||||  |   ||||||| | ||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32970 taggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 32878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 7147 - 6933
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  7147 gttagctctccagtggctttggtttgacgtaaaaatgatttttggttcttgatatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaa 7048  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  7047 ttcagcataactgtttcttagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaagagtttaattaaggggtttaagagtatt 6948  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||| | ||||||||    
T  6947 taacatgtgttgtga 6933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 3)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 2198 - 1984
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||| ||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2198 gttagctttccagtgactttagtttgacgtgaaaataatttttgattcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 2099  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||| |||||    
T  2098 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcatacctcaaaactagaagtattatgagttctattagggtatttaagggtatt 1999  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||    
T  1998 taacctatgttgtga 1984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 5543 - 5413
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5543 gttagctttccactgactttggtttgacatgaaaatgatttttgattcttgagatatgatgaaaatactctaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 5444  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaa 134  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5443 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaa 5413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 126 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 5229 - 5137
Alignment:
Q  126 taatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5229 taatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 5137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0153 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0153
Description:

Target: scaffold0153; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 4734 - 4568
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  4734 tttgttagctttccaatggcattggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatga 4635  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactaga 167  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  4634 aaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactaga 4568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0153; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 11754 - 11683
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatact 72  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11754 tttgttagctttccaatggcattggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatact 11683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 181
Target Start/End: Original strand, 23621 - 23799
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23621 tgttagctttccagtggctttggtttgacttaaaaatgattttttgtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaa 23720  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttc 181  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  23721 attcagcataagcgtttctaaattaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaactagaagtactatgagttc 23799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Original strand, 5743 - 5958
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  5743 tgttagctttccagtggcgtcggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaa 5842  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||    
T  5843 attcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaacagtat 5942  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||| | ||||||||    
T  5943 ttaacatgtgttgtga 5958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 3)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 7610 - 7395
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    |||||| ||| || |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  7610 tgttagattttcagtggcatcggtttgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatgttgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaa 7511  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  7510 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtat 7411  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
      |||||||| |||||    
T  7410 caaacctatgctgtga 7395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 10332 - 10423
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaa 92  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10332 tttgttagctttccaatggatttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttaagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaa 10423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 11267 - 11215
Alignment:
Q  166 gaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11267 gaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacctatgttgtga 11215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 183
Target Start/End: Original strand, 106621 - 106800
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  106621 gttagctttccagtgaaattggtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 106720  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaa 183  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  106721 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaa 106800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 2142 - 2364
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  2142 tttgttagctttccaatggctttggtttgactataaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatga 2241  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||||||| |||  |||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2242 aaattcagcaaaacattttccaagttaatcaaaaactggtgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagt 2341  T
Q  201 atttaacctatgttgtgagttga 223  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  2342 atttaacccatgttgtgagttga 2364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 32 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 8123 - 7937
Alignment:
Q  32 ttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatcc 131  Q
    |||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  8123 ttgaaaatgatttttgactcttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataattgtttctaagttaatcc 8024  T
Q  132 aaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 218  Q
    |||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8023 aaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagtttaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 7937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 74 - 186
Target Start/End: Original strand, 8154 - 8266
Alignment:
Q  74 caaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtact 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||| ||    
T  8154 caaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataattgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagttct 8253  T
Q  174 atgagttcaatta 186  Q
    |||||||||||||    
T  8254 atgagttcaatta 8266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 79 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 21200 - 21022
Alignment:
Q  79 aggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgag 178  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21200 aggtctcagtgaaattttatgaaaattcagcacaaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgag 21101  T
Q  179 ttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttattaagtta 257  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21100 ttcaattaagggttttaagagcatttaacctatgttgtgagtttatcttgggataggaatgtaagttgttattaagtta 21022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 129; Significance: 8e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 11257 - 11101
Alignment:
Q  26 tttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagt 125  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11257 tttgacttgaaaatgatttttggtttttgatatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagt 11158  T
Q  126 taatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttca 182  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  11157 taatctaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttca 11101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 129; Significance: 8e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 35 - 211
Target Start/End: Original strand, 8752 - 8928
Alignment:
Q  35 aaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaa 134  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8752 aaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaa 8851  T
Q  135 acttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctat 211  Q
    ||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  8852 acttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaaactat 8928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 129; Significance: 8e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 21702 - 21490
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  21702 gttagatttccagtggatttggtttgacgtgaaaatgatttttggttattgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttggtgaaattttatgaaaa 21603  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  21602 ttcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaaactcaaaactagaagtattaggagtttaattaaggggtttaagagtatt 21503  T
Q  204 taacctatgttgt 216  Q
    |||| | ||||||    
T  21502 taacatgtgttgt 21490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1633 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold1633
Description:

Target: scaffold1633; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 839 - 625
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    ||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||| |||| ||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  839 gttagcttttcagttgctttggtttgacgtgaaaatgaattttggttctcgagatatgataaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaa 740  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  739 ttcaacataaccgtttctaagttaattcaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactataagtactatgagttcaactagggggtttaagagtatt 640  T
Q  204 taacctatgttgtga 218  Q
    |||||||| ||||||    
T  639 taacctattttgtga 625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1766 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold1766
Description:

Target: scaffold1766; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 180
Target Start/End: Original strand, 1112 - 1288
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1112 gttagctttccagtggctttagtttgacgtgaaaatgatttttggttcttgagatatgatgaaaatactctaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaa 1211  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagtt 180  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  1212 ttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 1288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1186 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold1186
Description:

Target: scaffold1186; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 1346 - 1131
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||  ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1346 tgttagttttccagtggctttggtttgacttaaaaattattttcggttcttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 1247  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    | || ||||||| ||||||| || || |||||||||||||  |   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  1246 aatccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagtgtat 1147  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||    
T  1146 ttaacctatgttgtga 1131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 87 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 33469 - 33334
Alignment:
Q  87 gtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaatta 186  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33469 gtgaaatcttatgaaaattcagaataaccatttctaagttaatccaaaacttatgagataattccaaacctcaaaactagaagcactatgagttcaatta 33370  T
Q  187 aggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttg 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33369 aggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttg 33334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 33746 - 33648
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 101  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||    
T  33746 tgttagctttccagtgactttggtttgacttgaaaatgagttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccgaggaggtcttagtgaatttttatgaa 33648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Original strand, 186922 - 187137
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||  ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  186922 tgttagttttccagtggctttggtttgacttaaaaattattttcggttcttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 187021  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    | || ||||||| ||||||| || || |||||||||||||  |   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  187022 aatccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagtgtat 187121  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||    
T  187122 ttaacctatgttgtga 187137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Original strand, 66449 - 66660
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  66449 tgttagctttccagtggctttgatttgacttgaaaatgattttttgtttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaa 66548  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||| || |||| |||||||||| || |||||||||||||  |   ||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  66549 attccgcctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaagcttcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgcttaagagtat 66648  T
Q  203 ttaacctatgtt 214  Q
    ||||||||||||    
T  66649 ttaacctatgtt 66660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 169073 - 168857
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  169073 tgttagctttccagtggctttggtttgacctgaaaatgacttttggtttttgagatatgatgaaaatactctaaggagatcttagtgaaattttatgaaa 168974  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaa-ggtgtttaagagta 201  Q
    ||| || |||||  ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||| |||||| || |||| ||||||    
T  168973 atttagtataacagtttctaagtcaatccaaaacttagggaataattccaaacctctaaactggaagtactaggagtttaattaagggggttttagagta 168874  T
Q  202 tttaacctatgttgtga 218  Q
    |||||| ||||||||||    
T  168873 tttaacttatgttgtga 168857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 26150 - 25936
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26150 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaattatttttagtttttgagctatgatgaaaataccccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 26051  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat-tccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagta 201  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || |||||||| || ||||  | | ||| | | |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26050 attccgcataactatttctaagtcaacccaaaactgat-ggatcgtcttcaatcttcaaaacttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagta 25953  T
Q  202 tttaacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||||    
T  25952 tttaacctatgttgtga 25936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 3905 - 3690
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| | |  | |||||||||| |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  3905 tgttagctttccattagagtcggtttgactttaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaa 3806  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||| | |||    
T  3805 attcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaaggactaggagtttaattaaggggtttaacaatat 3706  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||| | ||||||||    
T  3705 ttaacatgtgttgtga 3690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 30247 - 30032
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| || | | ||||||||| |||||||||||||  |||  ||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  30247 tgttagctttccagtgtcgtaggtttgactagaaaatgatttttgatttaggagttatgatgaaaatactacaaggagtacttagtgaaattttatgaaa 30148  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| || |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  30147 attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaggaaataattccaaacctcaagactagaagtaataggagtttaattaaggtgtttaagagtat 30048  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
     |||| ||||||||||    
T  30047 ctaacttatgttgtga 30032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 63 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22633 - 22478
Alignment:
Q  63 tgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaa 162  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  22633 tgaaaatactccaaggaggtcgtagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaa 22534  T
Q  163 ctagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22533 ctagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacctatgttgtga 22478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1204 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold1204
Description:

Target: scaffold1204; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 765 - 977
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| || |||  |||| | ||||| || || | ||||||    
T  765 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttaaaaatgatttttggattttgagatatgatggaattaccccaagcaagtcttggtaaatttttatga 864  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||    
T  865 aaattcagcataaccgtttctaagtcaatacaaaacttatagaatatttccaaacctcgaaactagaagtactaggagtttaattaagaggtttaagagt 964  T
Q  201 atttaacctatgt 213  Q
    |||||||||||||    
T  965 atttaacctatgt 977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 74 - 218
Target Start/End: Original strand, 9715 - 9858
Alignment:
Q  74 caaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtact 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9715 caaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtact 9814  T
Q  174 atgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9815 atgagttcaact-aggtgtttaagagtatttaacctatattgtga 9858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 38396 - 38338
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatg 61  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  38396 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatg 38338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Original strand, 65398 - 65608
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  65398 tgttagatttccagtggctttggtttgacttgaaaaggagttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 65497  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||| ||||||| ||||||| || || ||||||||||||   |   ||||||| | ||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  65498 attccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatgaattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 65596  T
Q  203 ttaacctatgtt 214  Q
    ||||||||||||    
T  65597 ttaacctatgtt 65608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18799 - 18585
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||  |||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  18799 tgttagctttccagtgactttggtttgacttgataatggtttttgtttttcgagttatgatgaaaatactccaaggaagtcttagagaaatcttatgaaa 18700  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |   ||||||| | ||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18699 attctgcataactatttctaagtcaatccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 18601  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||| ||||||||||    
T  18600 ttaacatatgttgtga 18585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 34895 - 34685
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34895 tgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttttttttttagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 34796  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    || | ||||||| |||||||    || |||||||||||||  |   ||||||| | ||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34795 ataccgcataactatttcta----aacccaaaacttatggattttctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 34701  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||    
T  34700 ttaacctatgttgtga 34685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0825
Description:

Target: scaffold0825; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 9 - 125
Target Start/End: Original strand, 1057 - 1173
Alignment:
Q  9 ctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1057 ctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcag 1156  T
Q  109 cataaccatttctaagt 125  Q
    || ||||||||||||||    
T  1157 cacaaccatttctaagt 1173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 143 - 267
Target Start/End: Original strand, 1372 - 1496
Alignment:
Q  143 gataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaa 242  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1372 gataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgatcttgggataggaatgaaa 1471  T
Q  243 gttgttattaagttatagacttaca 267  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||    
T  1472 gttgttaataagttttagacttaca 1496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 8143 - 7931
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||  |||| | ||||| || || | ||||||    
T  8143 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttaaaaatgatttgtagattttgagatatgatggaattaccccaagaaagtcttggtaaatttttatga 8044  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||  ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| ||| |    
T  8043 aaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacatatgaaatgtttccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaagaggtttgagaat 7944  T
Q  201 atttaacctatgt 213  Q
    |||||||||||||    
T  7943 atttaacctatgt 7931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0401 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0401
Description:

Target: scaffold0401; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 8455 - 8244
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagttttt-gagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 101  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  8455 tgttagctttccagtggctttgaattgacttgaaaatgatttttggttttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaa 8356  T
Q  102 aattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagta 201  Q
    ||||| ||||||| ||||||| || || |||||||||||||  |   ||||||| | ||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8355 aattctgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgaattcaattaaggtgtttaagagta 8257  T
Q  202 tttaacctatgtt 214  Q
    |||||||||||||    
T  8256 tttaacctatgtt 8244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1160 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold1160
Description:

Target: scaffold1160; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 320 - 110
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  320 tgttagctttccagtggttttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactgtaaggagatcttagtgaaattttatgaaa 221  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||  ||||||| ||||||| || || | |||||||||||  |   ||||||| | ||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  220 atttcgcataactatttctaggtcaacctaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 122  T
Q  203 ttaacctatgtt 214  Q
    ||||||||||||    
T  121 ttaacctatgtt 110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0684 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0684
Description:

Target: scaffold0684; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 136 - 1
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  136 gttagctttccagtggctttagtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatggaaatagtccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaa 37  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaactta 139  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36 ttcagtataaccttttctaagttaatccaaaactta 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 10335 - 10132
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    |||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  10335 tgttagatttcaagtggttttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaatt-ttatgaaa 10237  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    | || ||          |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||    
T  10236 agtccgc----------ctaagtcaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttgagagtat 10147  T
Q  203 ttaacctatgttgtg 217  Q
    |||||||||||||||    
T  10146 ttaacctatgttgtg 10132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 79 - 202
Target Start/End: Original strand, 19945 - 20068
Alignment:
Q  79 aggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgag 178  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  19945 aggtcatagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgag 20044  T
Q  179 ttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  20045 ttcaattaaggtgtttaagagtat 20068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 101
Target Start/End: Original strand, 19676 - 19774
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 101  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  19676 tgttagctttccattggctttagtttgacatgaaaatgatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 19774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Original strand, 18071 - 18281
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  18071 tgttagctttccagtggatttggtttgacttgaaaatcatgttttgtttttgagttatgatgaaaatactccaagcaggtcttagtgaaattttatgaaa 18170  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||| ||||||| ||||||| || || |||||||||||||  |   ||||||| | ||| || |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18171 attccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 18269  T
Q  203 ttaacctatgtt 214  Q
    ||||||||||||    
T  18270 ttaacctatgtt 18281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 62353 - 62143
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  62353 tgttagatttcccgtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 62254  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||| ||||||| | ||||| || || |||||||||||||  |   ||||||| | ||| || |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  62253 attccgcataactacttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgaattcaattaaggtgtttaagagtat 62155  T
Q  203 ttaacctatgtt 214  Q
    ||||||||||||    
T  62154 ttaacctatgtt 62143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 46
Target Start/End: Original strand, 39326 - 39369
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgattttt 46  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  39326 tgttagctttccaatggcgtcggtttgacttgaaaatgattttt 39369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 56611 - 56401
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  56611 tgttagctttccattggttttggtttaacttgcaaatgatttttggttttggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaaattttatgaaa 56512  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||| ||||||| ||||||| || || |||||||||||||  |   ||||||| | ||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56511 attccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 56413  T
Q  203 ttaacctatgtt 214  Q
    ||||||||||||    
T  56412 ttaacctatgtt 56401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Original strand, 7272 - 7485
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  7272 tgttagctttccagtggatttggtttgacttgaaaattatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaagtttatgaaa 7371  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || || |||||||| ||||  |  ||||| | ||| || |  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  7372 attccgcataactatttctaagtcaaccccaaacttat-ggattgtctcaaacttcaaagcttg-tgtactgtgagttcaattaaggtgtttaaaagtat 7469  T
Q  203 ttaacctatgttgtga 218  Q
    |||||||| |||||||    
T  7470 ttaacctaagttgtga 7485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 14524 - 14424
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||   | |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  14524 tttgttagctttccaatggctttagtgtggagtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatga 14425  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  14424 a 14424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 213
Target Start/End: Original strand, 11635 - 11844
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||| || |||| ||||||||    
T  11635 tgttagctttccagtggatttggtttaatttgaaaatgatttttagattttgagttatgatggaaatactccaaggcggtcttggtaaaattttatgaaa 11734  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||  ||||||| |||||||||| || |||||||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| | | ||||||||||    
T  11735 atttcgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtttccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaa-gaggttaagagtat 11833  T
Q  203 ttaacctatgt 213  Q
    |||||||||||    
T  11834 ttaacctatgt 11844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 213
Target Start/End: Original strand, 11625 - 11833
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| || || ||   |||| ||||||| || || | ||||| |||    
T  11625 gttagctttccaatgggtttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggtggaattaacccaagcaggtcttggtaaatttttatggaaa 11724  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||| ||    
T  11725 ttcagcataaccgtttctaaatcaatccaaaacttatggaatatttccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaagaggtttaagagt-tt 11823  T
Q  204 taacctatgt 213  Q
    ||||||||||    
T  11824 taacctatgt 11833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 4)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 21398 - 21285
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  21398 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatga 21299  T
Q  101 aaattcagcataac 114  Q
    ||||||||||||||    
T  21298 aaattcagcataac 21285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 86 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 39631 - 39515
Alignment:
Q  86 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaatt 185  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  39631 agtgaaatcttaagaaaattcaggataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaatttctatgagttcaatt 39532  T
Q  186 aaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||||||||||||||||    
T  39531 aaggtgtttaagagtat 39515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 39855 - 39809
Alignment:
Q  55 agatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  39855 agatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaacttttatgaa 39809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 42328 - 42271
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatat 60  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||    
T  42328 tgttatctatccagtggctttggtttgacatgaaaataatttttggtgtttgagatat 42271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Original strand, 18543 - 18758
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    |||||||||| || |||| | ||||||||| ||| || |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18543 tgttagctttacagtggcgtcggtttgactcgaatataatttttggtttttgatttatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 18642  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgttt-aagagta 201  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||  |   |||||| ||  ||| |    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18643 attcggcataactatttctaagtcaaaccaaaacttatggattgtctccaaa-cttcaaagtctgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaaagagta 18741  T
Q  202 tttaacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||||||||||    
T  18742 tttaacctatgttgtga 18758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 213
Target Start/End: Original strand, 2198 - 2406
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||| || || |||  |||| ||||||| || || | ||||| |||    
T  2198 gttagatttccaatggttttggtttgccttaaaaatgatttatagattttgagatatggtggaattaccccaagtaggtcttggtaaatttttatggaaa 2297  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||  |||||||||| ||    
T  2298 ttcagcataaccgtttctaaatcaatccaaaacttatggaatatttccaaacctcaaaactagaagaactaggagtttaattaagaggtttaagagt-tt 2396  T
Q  204 taacctatgt 213  Q
    ||||||||||    
T  2397 taacctatgt 2406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 213
Target Start/End: Original strand, 10453 - 10661
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaa 103  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||| || || |||  |||| ||||||| || || | ||||| |||    
T  10453 gttagatttccaatggttttggtttgccttaaaaatgatttatagattttgagatatggtggaattaccccaagtaggtcttggtaaatttttatggaaa 10552  T
Q  104 ttcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 203  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||  |||| ||||| ||    
T  10553 ttcagcataaccgtttctaaatcaatccaaaacttatggaatatttccaaacctcaaaactagaagaactaggagtttaattaagaggtttgagagt-tt 10651  T
Q  204 taacctatgt 213  Q
    ||||||||||    
T  10652 taacctatgt 10661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 86 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 17952 - 17836
Alignment:
Q  86 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaatt 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  17952 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagtttatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactataagttctatgagttcaatt 17853  T
Q  186 aaggtgtttaagagtat 202  Q
    ||| |||||||||||||    
T  17852 aagatgtttaagagtat 17836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 18228 - 18130
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 101  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  18228 tgttagctttccagtggcttttgtttgacatgaaaataatttttggtgtttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 18130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 87; Significance: 9e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 873 - 767
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  873 tttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgacattttatga 774  T
Q  101 aaattca 107  Q
    |||||||    
T  773 aaattca 767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 142
Target Start/End: Original strand, 8037 - 8176
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8037 tgttagatttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatatttggtttttgagttatgaagaaaataccacaaggaggtcttagtgaaattttatgaaa 8136  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 142  Q
    |||| ||||||| |||||| ||| || |||||||||||||    
T  8137 attccgcataactatttcttagtcaacccaaaacttatgg 8176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 2524 - 2403
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||    
T  2524 tttgttag-tttccaatggctttggttagacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactacaaagaggtcttagtgaagttttatga 2426  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaa 123  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  2425 aaattcagcataaccgtttctaa 2403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 32880 - 32671
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||| || |||  |||| | |||||  | || | ||||||    
T  32880 tttgttatctttccaatggctttggtttgacttaaaaatgatttctagatttttagatatgatggaattaccccaagcaagtcttgataaatttttatga 32781  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    ||||| ||||||| | ||||||| | |||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||  |||  |||||    
T  32780 aaatt-agcataatcgtttctaaatcaatccaaaacttatggaatgtttccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaagaagttggagagt 32682  T
Q  201 atttaacctat 211  Q
    |||||||||||    
T  32681 atttaacctat 32671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 82; Significance: 9e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 35932 - 36148
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||| |    
T  35932 tttgctagctttccaatgacttcagttttacttgaaaatgattttttgctttttagttatgatgaaaatactcaaaggatgtcttagtgaaattttataa 36031  T
Q  101 aaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagt 200  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||  |||||||||||   |   ||||||| | ||| || |  |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  36032 aaattccgcataactatttctaagtcaactcaaaacttatgtattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtactaggagtttaattaaggtgtttaagagt 36130  T
Q  201 atttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||||    
T  36131 atttaacctatgttgtga 36148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 13189 - 13402
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgaga----tatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttat 98  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||     ||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||| ||||    
T  13189 tgttagctttccagtggttttggtttgacttgaaaatgatatttaggttgtgagtgagttatgatgaaaacactcgaaggaggtcttggtgaaattttat 13288  T
Q  99 gaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaaga 198  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||  |  | |||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||||||  ||||||||    
T  13289 gaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgttcccaaacttcaaaactataagtattacgagtttaattaagaggtttaaga 13388  T
Q  199 gtatttaacctatg 212  Q
    ||||||||| ||||    
T  13389 gtatttaacatatg 13402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0414
Description:

Target: scaffold0414; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Original strand, 11764 - 11974
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  11764 tgttagatttccagtggctttggttttggttgaaaatgatttttggtttttgagttataatgaaaatactccaagggggtcttagtgaaattttatgaaa 11863  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 202  Q
    |||   |||||| ||||||| || || | |||||||||||  |   ||||||| | ||| || |  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11864 atttcacataactatttctaggtcaaccgaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tgtattatgagttcaattaaggtgcttaagagtat 11962  T
Q  203 ttaacctatgtt 214  Q
    ||||||||||||    
T  11963 ttaacctatgtt 11974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 126
Target Start/End: Original strand, 2470 - 2593
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2470 tgttagctttccagttgctttgatttgacttgaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtaaaatcttatgaaa 2569  T
Q  103 attcagcataaccatttctaagtt 126  Q
    |||||||||||   ||||||||||    
T  2570 attcagcataattgtttctaagtt 2593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 124 - 218
Target Start/End: Original strand, 3059 - 3153
Alignment:
Q  124 gttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3059 gttaatccaaaacttatggaataattccaaaactcaaaactagaagtattatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 3153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2015 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold2015
Description:

Target: scaffold2015; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 98 - 177
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggag 80  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  98 tttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatactccaaggag 177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 102
Target Start/End: Original strand, 24480 - 24579
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||    
T  24480 tgttagctttccagtggctttggttttacttgaaaatgatttttagtttttgagttatgatgaaaatactccaaagagatcttagtgaaattttatgaaa 24579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 169 - 214
Target Start/End: Original strand, 24586 - 24631
Alignment:
Q  169 gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586 gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 24631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 3600 - 3500
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||    
T  3600 tttgttagctttccaatggctttggtttgactcgaaaatgatatttggtttttgagatatgacgaaaataatccaaggaggtcttagtgaatttttatga 3501  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  3500 a 3500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1278 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold1278
Description:

Target: scaffold1278; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 1066 - 880
Alignment:
Q  25 gtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaag 124  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||| ||||  ||||||||  |||  |||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  1066 gtttgacttgaaaatgatttttatattttaagttatgatgaaaatactccaagtgggtcttaggaaaactttacaaaaattcagcataaccatttcttag 967  T
Q  125 ttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatg 212  Q
    | || ||||| |||||||  |  ||||||||   ||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  966 tcaacccaaagcttatggtttgtttccaaactccaaaact-tatgtactttgagttcaattaaggtgtttaagggtatttaacctatg 880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0436 (Bit Score: 67; Significance: 8e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0436
Description:

Target: scaffold0436; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 8593 - 8495
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 101  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||    
T  8593 tgttagctttccagtggctttggtttgaattgaaaatgatattttgtttttgagatatgatgaaaataatccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 8495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 67; Significance: 8e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 16403 - 16493
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaa 91  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  16403 tttgttagatttccaatggctttggtttgacttcaaaatgatttttggtttttgagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaa 16493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 218
Target Start/End: Original strand, 16528 - 16602
Alignment:
Q  144 ataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||||| || || ||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||    
T  16528 ataattcaaaacctcaaaactataagtactaggaatttaattaagggttttaaaaatatttaacctatgttgtga 16602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 120
Target Start/End: Original strand, 7794 - 7911
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 102  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||  ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  7794 tgttagctttccagtggctttggtttgaattaaaaatgatttttggtttgagagttttgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttacgaaa 7893  T
Q  103 attcagcataaccatttc 120  Q
    |||| ||||||| |||||    
T  7894 attccgcataactatttc 7911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 169 - 217
Target Start/End: Original strand, 7929 - 7977
Alignment:
Q  169 gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtg 217  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  7929 gtactatgagtttaattaaggtgcttaagagtatttaacctctgttgtg 7977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 129 - 210
Target Start/End: Original strand, 2377 - 2458
Alignment:
Q  129 tccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaaccta 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2377 tccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaaccta 2458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 21325 - 21225
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  21325 tttgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatga 21226  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  21225 a 21225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 218
Target Start/End: Original strand, 20499 - 20706
Alignment:
Q  11 ttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagca 110  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||| |||| ||||||| | ||||| ||| | ||| | ||||    
T  20499 ttccaatggttttggtttgacttgaaaatgatttttagattttgagttatgacggaaatactccaagtaggtcttggagaaattttaaggaaacttagca 20598  T
Q  111 taaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaactagaagtacta-tgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacct 209  Q
    |||| ||||| |||| || || ||||||||||  |  |||||||| | ||||||   |||| ||  | ||| ||||||||| || ||||||||||||||     
T  20599 taactatttccaagtcaacccgaaacttatggtttgtttccaaacttcaaaact-ttagtattacggggttaaattaaggttttaaagagtatttaacca 20697  T
Q  210 atgttgtga 218  Q
    |||||||||    
T  20698 atgttgtga 20706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 154 - 53
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaa-tgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  154 tttgttagctttccaatggctttggtttggcgtaaaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatg 55  T
Q  100 aa 101  Q
    ||    
T  54 aa 53  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 9677 - 9601
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaag 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  9677 tttgttagctttccaatggctttggtttgactctaaaatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatacttcaag 9601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0956 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0956
Description:

Target: scaffold0956; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 66
Target Start/End: Original strand, 2341 - 2403
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaa 66  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2341 gttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgattttttgtttttgagatatgatgaa 2403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 159 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 2419 - 2362
Alignment:
Q  159 aaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  2419 aaaactagaagtactatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacccatgttgt 2362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 9818 - 9718
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| || ||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  9818 tttgttagctttccaatggctttggtttggagtaaaaattatatttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatga 9719  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  9718 a 9718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 11866 - 11766
Alignment:
Q  1 tttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    | || ||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  11866 tttgttagctttccaatggctttggtttagagtaaacatgatttttggtttaggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatga 11767  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  11766 a 11766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 66
Target Start/End: Original strand, 174566 - 174628
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaa 66  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  174566 gttagccttccagtggctttggtttgacttgaaaatgatttttggtttttgatatatgatgaa 174628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0695 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0695
Description:

Target: scaffold0695; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 6521 - 6423
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaa 101  Q
    ||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||| | |||||||    
T  6521 tgttagctttccagtggcgtcggtgtgacttgaaaatgatttttggtttaggagttatgatgcaaatactcaaaggaggtcttaatgaatttttatgaa 6423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1662 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1662
Description:

Target: scaffold1662; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 218
Target Start/End: Original strand, 1 - 53
Alignment:
Q  166 gaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 218  Q
    ||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1 gaagtgctatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 53  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0321 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0321
Description:

Target: scaffold0321; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 267
Target Start/End: Original strand, 627 - 683
Alignment:
Q  212 gttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagtt-gttattaagttatagacttaca 267  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  627 gttgtgagttgatcttgggataggaatgaaagttatttattaagttatagatttaca 683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 17291 - 17160
Alignment:
Q  11 ttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagca 110  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||| |||||||||  ||| |||| ||| | |||  ||| |||||||| |||    
T  17291 ttccattggccttggtttgacttgaaaataatgttttgtttttgagttatgaagaaaatactctaagaaggttttaataaaactttacgaaaattccgca 17192  T
Q  111 taaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 142  Q
     ||   ||||||||| || ||||| |||||||    
T  17191 caattgtttctaagtcaacccaaaccttatgg 17160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 75 - 142
Target Start/End: Original strand, 40902 - 40969
Alignment:
Q  75 aaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgg 142  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||  | || |||||||||||||    
T  40902 aaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctatatcaaaccaaaacttatgg 40969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 45
Target Start/End: Original strand, 40847 - 40889
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttt 45  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  40847 tgttagctttccactagctttggtttgaattgaaaatgatttt 40889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 267
Target Start/End: Original strand, 53258 - 53316
Alignment:
Q  210 atgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttg-ttattaagttatagacttaca 267  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||    
T  53258 atgttgtgagttgatcctgggataggaatgaaagttgtttatcaagttataaacttaca 53316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1753 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1753
Description:

Target: scaffold1753; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 937 - 892
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttag 48  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  937 tgttagctttctaatggctttggtttgacgtgcaaatgatttttag 892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 72
Target Start/End: Original strand, 35055 - 35116
Alignment:
Q  11 ttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatact 72  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  35055 ttccattggccttggtttgacttgaaaataatattttgtttttgagttatgaagaaaatact 35116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 979 - 935
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgattttta 47  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  979 tgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgattttta 935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0892 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0892
Description:

Target: scaffold0892; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 3001 - 2946
Alignment:
Q  17 tggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatact 72  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  3001 tggctttggtttgacttgaaaatactattttgtttttgagttatgaagaaaatact 2946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 183 - 218
Target Start/End: Original strand, 7104 - 7139
Alignment:
Q  183 attaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7104 attaaggtgtctaagagtatttaacctatgttgtga 7139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 13967 - 13909
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatg 61  Q
    ||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  13967 tgttagctttccagtggaatcggtttgacttgaaaatgagttttggtttttgagttatg 13909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 37928 - 37886
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttt 45  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  37928 tgttagctttcaaatggctttggtttgacttccaaatgatttt 37886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 40974 - 40916
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatg 61  Q
    |||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  40974 tgttagctttacagtggcatcggtttgacttgaaaatgattttcggtttttgagttatg 40916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 3701 - 3641
Alignment:
Q  210 atgttgtgagttgatctt--gggatatgaatgaaagttg-ttattaagttatagacttaca 267  Q
    ||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  3701 atgttgtgagttgatcttgcgcgataggaatgaaagttgtttattaagttatagatttaca 3641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 48
Target Start/End: Original strand, 12521 - 12566
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttag 48  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  12521 tgttagctttctaatggctttgggttgacttccaaatgatttttag 12566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 72
Target Start/End: Original strand, 8123 - 8192
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatact 72  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||||||   |||||||||||| ||| ||||    
T  8123 tgttagctatctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 8192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 30539 - 30494
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttag 48  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  30539 tgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttag 30494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 54015 - 53970
Alignment:
Q  3 tgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttag 48  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  54015 tgttaactttctaatggctttggtttgactttcaaatgatttttag 53970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 15846 - 15802
Alignment:
Q  4 gttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgatttttag 48  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15846 gttagatttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttag 15802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 4801 - 4741
Alignment:
Q  22 ttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggt 82  Q
    |||||||||||||||||| || | | ||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||    
T  4801 ttggtttgacttgaaaataatgtgttgtttttgagttatgaagaaaatactctaaggaggt 4741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University