View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8649_low_2 (Length: 421)

Name: NF8649_low_2
Description: NF8649
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8649_low_2
NF8649_low_2
[»] chr6 (43 HSPs)
chr6 (88-403)||(27622913-27623228)
chr6 (94-403)||(27283574-27283883)
chr6 (88-393)||(13517401-13517713)
chr6 (94-400)||(30551193-30551506)
chr6 (155-388)||(33369703-33369944)
chr6 (155-388)||(29556241-29556482)
chr6 (155-400)||(27200870-27201123)
chr6 (155-400)||(27248110-27248363)
chr6 (155-371)||(4539032-4539256)
chr6 (155-403)||(28214138-28214394)
chr6 (157-393)||(34457761-34458005)
chr6 (155-390)||(29579717-29579960)
chr6 (155-373)||(26792516-26792742)
chr6 (170-400)||(27064174-27064412)
chr6 (155-371)||(26109674-26109899)
chr6 (155-388)||(27014409-27014650)
chr6 (155-388)||(29508106-29508347)
chr6 (94-400)||(27491811-27492125)
chr6 (170-388)||(14138689-14138915)
chr6 (94-388)||(27209584-27209886)
chr6 (94-388)||(27239342-27239644)
chr6 (155-421)||(27355356-27355630)
chr6 (170-373)||(4764462-4764673)
chr6 (155-388)||(26927437-26927679)
chr6 (155-400)||(26665910-26666163)
chr6 (155-400)||(26771881-26772134)
chr6 (155-379)||(28167188-28167420)
chr6 (94-373)||(4531994-4532280)
chr6 (155-388)||(16756506-16756748)
chr6 (155-400)||(4779584-4779837)
chr6 (155-400)||(16937279-16937532)
chr6 (155-394)||(8898950-8899197)
chr6 (155-400)||(16680832-16681085)
chr6 (88-388)||(24298967-24299275)
chr6 (155-371)||(15405803-15406028)
chr6 (155-371)||(15417590-15417815)
chr6 (155-379)||(24870402-24870635)
chr6 (94-388)||(27031706-27032008)
chr6 (94-379)||(22928067-22928360)
chr6 (94-388)||(13292157-13292460)
chr6 (94-388)||(27025827-27026129)
chr6 (94-340)||(20131253-20131500)
chr6 (94-340)||(22201370-22201617)
[»] chr7 (34 HSPs)
chr7 (88-388)||(3451936-3452244)
chr7 (89-400)||(26268209-26268527)
chr7 (94-393)||(26678233-26678539)
chr7 (105-403)||(26508848-26509154)
chr7 (94-393)||(26663041-26663347)
chr7 (157-393)||(16744711-16744955)
chr7 (155-400)||(31083812-31084066)
chr7 (94-388)||(2779929-2780230)
chr7 (88-373)||(31130616-31130909)
chr7 (155-400)||(26441938-26442191)
chr7 (155-393)||(26596356-26596603)
chr7 (94-400)||(31557533-31557847)
chr7 (155-400)||(26313052-26313306)
chr7 (155-400)||(4206069-4206322)
chr7 (155-400)||(45393913-45394166)
chr7 (157-400)||(4138436-4138687)
chr7 (155-400)||(11447582-11447835)
chr7 (155-388)||(22148573-22148814)
chr7 (95-379)||(16443134-16443426)
chr7 (155-400)||(26519501-26519754)
chr7 (99-379)||(16048027-16048315)
chr7 (155-379)||(39206353-39206585)
chr7 (155-379)||(45737995-45738227)
chr7 (157-400)||(24585726-24585978)
chr7 (94-388)||(11417931-11418233)
chr7 (155-388)||(5154768-5155010)
chr7 (155-365)||(5140526-5140744)
chr7 (94-379)||(10848299-10848592)
chr7 (207-388)||(22152800-22152989)
chr7 (207-388)||(22208715-22208904)
chr7 (88-379)||(5165078-5165377)
chr7 (94-388)||(2161257-2161558)
chr7 (155-388)||(16511637-16511879)
chr7 (88-388)||(10910072-10910380)
[»] chr8 (25 HSPs)
chr8 (88-274)||(15775288-15775474)
chr8 (155-400)||(29836023-29836276)
chr8 (157-393)||(28355223-28355467)
chr8 (150-400)||(33265420-33265678)
chr8 (155-379)||(18716177-18716409)
chr8 (94-403)||(12085937-12086253)
chr8 (157-400)||(31483142-31483393)
chr8 (94-362)||(31361267-31361542)
chr8 (93-379)||(22074135-22074429)
chr8 (155-400)||(44567680-44567934)
chr8 (157-400)||(19201654-19201906)
chr8 (155-400)||(19681156-19681409)
chr8 (94-379)||(18797404-18797697)
chr8 (94-388)||(21341394-21341697)
chr8 (94-388)||(14569841-14570143)
chr8 (94-388)||(15774260-15774562)
chr8 (155-388)||(2130552-2130794)
chr8 (155-400)||(9361304-9361556)
chr8 (88-388)||(19694802-19695110)
chr8 (155-390)||(22139598-22139842)
chr8 (94-388)||(33249049-33249351)
chr8 (94-377)||(16260635-16260926)
chr8 (155-377)||(19654610-19654841)
chr8 (94-388)||(27602137-27602439)
chr8 (155-371)||(19910451-19910676)
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (88-274)||(13178638-13178824)
chr5 (94-400)||(15752004-15752317)
chr5 (94-400)||(30036128-30036441)
chr5 (94-400)||(33523086-33523399)
chr5 (88-393)||(33881815-33882127)
chr5 (155-400)||(31819627-31819880)
chr5 (157-393)||(40466757-40467001)
chr5 (155-388)||(6881007-6881248)
chr5 (155-388)||(9543934-9544175)
chr5 (94-400)||(18493914-18494227)
chr5 (94-371)||(37351810-37352094)
chr5 (155-400)||(37745555-37745808)
chr5 (95-390)||(22895119-22895422)
chr5 (155-400)||(28953001-28953254)
chr5 (94-400)||(43084956-43085262)
chr5 (155-400)||(9324165-9324419)
chr5 (155-400)||(26487075-26487329)
chr5 (155-379)||(2517768-2518000)
chr5 (153-400)||(12138864-12139119)
chr5 (94-393)||(30158729-30159035)
chr5 (155-388)||(18121639-18121881)
chr5 (155-400)||(3796235-3796488)
chr5 (155-388)||(15651967-15652208)
chr5 (155-400)||(32589481-32589734)
chr5 (155-400)||(37761676-37761929)
chr5 (157-393)||(11330343-11330587)
chr5 (155-373)||(31438166-31438392)
chr5 (94-379)||(8658639-8658931)
chr5 (88-373)||(24730678-24730970)
chr5 (95-379)||(25207012-25207304)
chr5 (95-379)||(25271168-25271460)
chr5 (155-400)||(34623201-34623454)
chr5 (155-400)||(5644502-5644755)
chr5 (88-400)||(13317966-13318285)
chr5 (155-400)||(28655947-28656200)
chr5 (88-400)||(30175170-30175489)
chr5 (155-394)||(37664710-37664957)
chr5 (155-400)||(13435875-13436128)
chr5 (155-400)||(18368736-18368989)
chr5 (94-388)||(23726931-23727233)
chr5 (94-390)||(23898587-23898892)
chr5 (155-379)||(41681408-41681638)
chr5 (94-388)||(11556048-11556350)
chr5 (155-388)||(23632664-23632906)
chr5 (94-388)||(22992286-22992588)
chr5 (94-365)||(13179962-13180241)
chr5 (155-369)||(33299249-33299472)
chr5 (94-388)||(33784176-33784478)
chr5 (94-388)||(24976538-24976840)
chr5 (155-388)||(24608939-24609181)
chr5 (155-388)||(30941324-30941566)
[»] chr2 (41 HSPs)
chr2 (88-274)||(3790473-3790659)
chr2 (94-400)||(19409718-19410031)
chr2 (94-400)||(13929845-13930158)
chr2 (94-400)||(37932072-37932385)
chr2 (155-400)||(3789138-3789391)
chr2 (94-400)||(16822572-16822885)
chr2 (94-400)||(16898595-16898908)
chr2 (94-393)||(37679132-37679438)
chr2 (94-393)||(37694397-37694703)
chr2 (94-400)||(32056447-32056760)
chr2 (157-393)||(253948-254192)
chr2 (157-400)||(21670469-21670720)
chr2 (159-393)||(34297851-34298093)
chr2 (157-393)||(9343283-9343527)
chr2 (157-393)||(16168180-16168424)
chr2 (88-379)||(27397051-27397350)
chr2 (157-393)||(27810405-27810649)
chr2 (157-393)||(39045178-39045423)
chr2 (95-390)||(21696423-21696726)
chr2 (94-400)||(39896764-39897077)
chr2 (88-400)||(22921372-22921691)
chr2 (157-393)||(37945161-37945405)
chr2 (88-379)||(31882987-31883285)
chr2 (155-393)||(12593516-12593762)
chr2 (155-400)||(34161536-34161789)
chr2 (155-379)||(37384371-37384603)
chr2 (155-400)||(11628479-11628732)
chr2 (88-373)||(12709852-12710144)
chr2 (155-400)||(34868329-34868582)
chr2 (155-390)||(34268216-34268460)
chr2 (155-379)||(27123216-27123448)
chr2 (157-400)||(27782918-27783169)
chr2 (88-379)||(19449639-19449939)
chr2 (155-373)||(40240245-40240471)
chr2 (155-388)||(23117481-23117723)
chr2 (150-379)||(27427761-27428000)
chr2 (99-388)||(28888939-28889236)
chr2 (155-388)||(31868102-31868344)
chr2 (282-388)||(20844600-20844706)
chr2 (155-388)||(12662175-12662418)
chr2 (88-195)||(20844802-20844908)
[»] chr4 (29 HSPs)
chr4 (88-274)||(24813636-24813822)
chr4 (94-400)||(54840097-54840410)
chr4 (94-400)||(31119756-31120069)
chr4 (94-400)||(21976410-21976723)
chr4 (157-393)||(20331743-20331987)
chr4 (155-393)||(27156632-27156878)
chr4 (94-388)||(14752762-14753063)
chr4 (94-400)||(40098879-40099192)
chr4 (155-390)||(6576552-6576796)
chr4 (94-379)||(5701256-5701548)
chr4 (93-379)||(15379482-15379776)
chr4 (155-373)||(18793949-18794175)
chr4 (155-388)||(36323643-36323884)
chr4 (155-388)||(36337852-36338093)
chr4 (155-379)||(39857342-39857574)
chr4 (155-390)||(5012597-5012841)
chr4 (88-379)||(15275865-15276164)
chr4 (95-379)||(15234546-15234838)
chr4 (155-400)||(33667107-33667360)
chr4 (156-390)||(1906984-1907227)
chr4 (155-388)||(24119359-24119601)
chr4 (94-388)||(24585616-24585918)
chr4 (155-400)||(14105250-14105503)
chr4 (155-400)||(30760470-30760723)
chr4 (155-388)||(34182263-34182504)
chr4 (94-274)||(24814547-24814726)
chr4 (155-388)||(17019747-17019989)
chr4 (233-379)||(14671717-14671871)
chr4 (155-195)||(14671910-14671950)
[»] chr3 (60 HSPs)
chr3 (94-400)||(24334835-24335148)
chr3 (88-400)||(18231851-18232170)
chr3 (94-400)||(28109250-28109564)
chr3 (94-400)||(10649730-10650042)
chr3 (94-400)||(17978238-17978551)
chr3 (94-400)||(5020370-5020683)
chr3 (155-400)||(6536090-6536343)
chr3 (155-388)||(11103731-11103972)
chr3 (157-393)||(5589705-5589949)
chr3 (157-393)||(5717721-5717965)
chr3 (157-393)||(5728631-5728875)
chr3 (157-393)||(5763493-5763737)
chr3 (88-400)||(28345830-28346149)
chr3 (157-393)||(29658316-29658560)
chr3 (155-388)||(31029613-31029854)
chr3 (155-388)||(32445801-32446042)
chr3 (94-379)||(16617776-16618070)
chr3 (94-379)||(22041087-22041381)
chr3 (94-393)||(32297297-32297603)
chr3 (156-390)||(4340047-4340289)
chr3 (94-388)||(18285666-18285967)
chr3 (94-388)||(18300967-18301268)
chr3 (155-400)||(22864211-22864464)
chr3 (155-400)||(22879270-22879523)
chr3 (155-388)||(4630430-4630671)
chr3 (88-400)||(31957737-31958056)
chr3 (157-400)||(47030114-47030366)
chr3 (155-373)||(4423582-4423808)
chr3 (155-400)||(17970227-17970481)
chr3 (94-400)||(18249377-18249690)
chr3 (155-400)||(5602660-5602913)
chr3 (155-400)||(20570203-20570456)
chr3 (170-388)||(5473638-5473864)
chr3 (155-421)||(16404139-16404413)
chr3 (155-379)||(48472590-48472822)
chr3 (155-373)||(21681406-21681632)
chr3 (155-400)||(10402811-10403064)
chr3 (155-400)||(51788681-51788934)
chr3 (155-379)||(20072693-20072925)
chr3 (94-379)||(15367923-15368217)
chr3 (94-390)||(19701064-19701368)
chr3 (155-400)||(28027930-28028183)
chr3 (94-388)||(29142063-29142365)
chr3 (94-388)||(35887409-35887711)
chr3 (155-400)||(8218284-8218537)
chr3 (94-388)||(4728275-4728577)
chr3 (94-388)||(5658783-5659085)
chr3 (94-388)||(6208544-6208846)
chr3 (94-388)||(18057917-18058219)
chr3 (94-388)||(4789940-4790242)
chr3 (94-388)||(8282769-8283071)
chr3 (94-390)||(16422854-16423158)
chr3 (155-274)||(16599406-16599525)
chr3 (94-388)||(15886026-15886328)
chr3 (94-388)||(18337273-18337575)
chr3 (155-388)||(22380949-22381191)
chr3 (94-274)||(7080022-7080201)
chr3 (94-388)||(4690324-4690626)
chr3 (94-371)||(15734425-15734710)
chr3 (284-388)||(7079877-7079981)
[»] chr1 (16 HSPs)
chr1 (99-400)||(51644921-51645229)
chr1 (155-400)||(10951791-10952044)
chr1 (157-373)||(10969369-10969593)
chr1 (155-400)||(3647846-3648099)
chr1 (155-400)||(28591780-28592033)
chr1 (94-390)||(16201276-16201580)
chr1 (155-379)||(28156425-28156657)
chr1 (155-379)||(41786640-41786872)
chr1 (99-371)||(20333667-20333947)
chr1 (94-388)||(14692162-14692464)
chr1 (94-388)||(14694844-14695146)
chr1 (94-388)||(14697528-14697830)
chr1 (94-388)||(14700209-14700511)
chr1 (99-379)||(20467504-20467792)
chr1 (235-388)||(21891136-21891297)
chr1 (190-263)||(13769558-13769631)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (155-403)||(14636-14892)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (155-393)||(2361-2607)
scaffold0322 (94-379)||(12769-13062)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (94-379)||(8187-8479)
[»] scaffold0143 (2 HSPs)
scaffold0143 (155-400)||(10615-10869)
scaffold0143 (94-388)||(33981-34283)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (104-379)||(28012-28293)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (94-388)||(12725-13026)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (155-400)||(2483-2736)
scaffold0159 (323-400)||(18505-18582)
[»] scaffold0241 (1 HSPs)
scaffold0241 (88-379)||(25809-26108)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (155-400)||(16273-16526)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (95-379)||(490-782)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (88-388)||(24213-24521)
[»] scaffold0792 (1 HSPs)
scaffold0792 (155-388)||(3921-4163)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (155-388)||(8966-9209)
[»] scaffold0099 (2 HSPs)
scaffold0099 (283-388)||(40064-40171)
scaffold0099 (155-198)||(39922-39965)
[»] scaffold0685 (1 HSPs)
scaffold0685 (94-198)||(1309-1412)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (332-388)||(6751-6807)
[»] scaffold0477 (1 HSPs)
scaffold0477 (155-198)||(13281-13324)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 292; Significance: 1e-164; HSPs: 43)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 88 - 403
Target Start/End: Original strand, 27622913 - 27623228
Alignment:
Q  88 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 187  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27622913 ctgacattgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 27623012  T
Q  188 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcatagaaatc 287  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623013 gaaatgcatgatggttgacagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcatagaaatc 27623112  T
Q  288 ctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgg 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623113 ctctttggagataacgccgttgggagacgtaccagaaccatggctgagggtagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgg 27623212  T
Q  388 ggaaaaccccgttatg 403  Q
    ||| ||| ||||||||    
T  27623213 ggataacgccgttatg 27623228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 94 - 403
Target Start/End: Original strand, 27283574 - 27283883
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  27283574 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 27283672  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacac-gacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcatagaaatcctctt 292  Q
    |||||  ||||  ||||||||||||| |  || | | |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27283673 catgactgttggcagtttgtagacacagttttgaagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcatagaaatcctctt 27283772  T
Q  293 tggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaa 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |    
T  27283773 tggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggtagatagctaatcaacttactggggatagaattctggaagacccgactggggata 27283872  T
Q  393 accccgttatg 403  Q
    || ||||||||    
T  27283873 acgccgttatg 27283883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 88 - 393
Target Start/End: Original strand, 13517401 - 13517713
Alignment:
Q  88 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 187  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  13517401 ctgatattgatattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 13517499  T
Q  188 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tca 279  Q
    | |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |        ||     
T  13517500 gtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacgttagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattct 13517599  T
Q  280 tagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 379  Q
    | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13517600 tggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagac 13517699  T
Q  380 ccgactggggaaaa 393  Q
    | ||||||||||||    
T  13517700 ctgactggggaaaa 13517713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 94 - 400
Target Start/End: Original strand, 30551193 - 30551506
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  30551193 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 30551291  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 285  Q
    |||||  ||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  30551292 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagatatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 30551391  T
Q  286 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 385  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30551392 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgacc 30551491  T
Q  386 ggggaaaaccccgtt 400  Q
    ||||||||| |||||    
T  30551492 ggggaaaacgccgtt 30551506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 155 - 388
Target Start/End: Original strand, 33369703 - 33369944
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33369703 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 33369802  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  33369803 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggt 33369902  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggg 388  Q
    |  |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  33369903 atgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactggg 33369944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 155 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 29556482 - 29556241
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29556482 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 29556383  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||      
T  29556382 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctttttgaagatgacgccgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcagataggc 29556283  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggg 388  Q
    |  |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  29556282 atgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactggg 29556241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 155 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 27201123 - 27200870
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27201123 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 27201024  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgcta--------catcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    ||||||||||||||| ||||        | || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  27201023 gcacgtagtggctcgagctatattacaccttcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagct 27200924  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||  ||||   |||||||||||| |||||    
T  27200923 atgcaacttgctggggatagaatcttgagagactttactggggaaaacaccgtt 27200870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 155 - 400
Target Start/End: Original strand, 27248110 - 27248363
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27248110 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 27248209  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgcta--------catcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    ||||||||||||||| ||||        | || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  27248210 gcacgtagtggctcgagctatattacaccttcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagct 27248309  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||  ||||   |||||||||||| |||||    
T  27248310 atgcaacttgctggggatagaatcttgagagactttactggggaaaacaccgtt 27248363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 155 - 371
Target Start/End: Original strand, 4539032 - 4539256
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4539032 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 4539131  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  4539132 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagct 4539231  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatct 371  Q
    |  ||||||||||||||||||||||    
T  4539232 atgcaacttgctggggatagaatct 4539256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 155 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 28214394 - 28214138
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28214394 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 28214295  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  28214294 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagct 28214195  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgttatg 403  Q
    |  |||||||||||  || |||||| ||||| |   |||||||||||| ||||||||    
T  28214194 atacaacttgctggaaattgaatctcggaaggctttactggggaaaacgccgttatg 28214138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 157 - 393
Target Start/End: Original strand, 34457761 - 34458005
Alignment:
Q  157 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 256  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34457761 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaacgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 34457860  T
Q  257 acgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaa 348  Q
    || ||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||     
T  34457861 acatagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatat 34457960  T
Q  349 tcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaa 393  Q
     ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  34457961 gcaacttgctggagatagagtcttggaagacctgactggggaaaa 34458005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 155 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 29579960 - 29579717
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29579960 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 29579861  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||| ||||||| |        || | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| |    
T  29579860 gcacgtagtggcccgtgctatattacacattcttggaaatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggt 29579761  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgggga 390  Q
       ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29579760 gtgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgactgggga 29579717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 155 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 26792742 - 26792516
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26792742 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 26792643  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |    
T  26792642 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagacgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggt 26792543  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttg 373  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||    
T  26792542 atgcaacttgctggggatagaatcttg 26792516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 170 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 27064412 - 27064174
Alignment:
Q  170 atgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcg 269  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27064412 atgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcg 27064313  T
Q  270 tgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggg 361  Q
    ||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |  ||  | |||||||||     
T  27064312 tgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcagaaccatggctgagggcaggcaagtatgcgacttgctgga 27064213  T
Q  362 gatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27064212 gatagaatcttggaagacccgactggggaaaacgccgtt 27064174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 155 - 371
Target Start/End: Original strand, 26109674 - 26109899
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  26109674 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacgagacatcagagtattgg 26109773  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgcta--------catcatagaaatcctctttggagataacgccg-ttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc 345  Q
    ||||||||||||||||||||        | || | |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  26109774 gcacgtagtggctcgtgctatgttacaccttcttggaaatcctctttggagatgacgtcgtttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagc 26109873  T
Q  346 taatcaacttgctggggatagaatct 371  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||    
T  26109874 tatgcaacttgctggggatagaatct 26109899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 155 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 27014650 - 27014409
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27014650 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 27014551  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |    
T  27014550 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggt 27014451  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggg 388  Q
    |  | ||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  27014450 atgcgactcgctggggatagaatctcggaagactctactggg 27014409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 155 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 29508347 - 29508106
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  29508347 gtaatatgcataattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggagaagacaagacatcagagtattgg 29508248  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  29508247 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggt 29508148  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggg 388  Q
    |   ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  29508147 atgtaacttgctggggatagaatctcggaagactctactggg 29508106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 94 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 27492125 - 27491811
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  27492125 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 27492027  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta--------catcatagaaa 285  Q
    |||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||        | || | ||||    
T  27492026 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtagctcgtgctatattacaccttcttggaaa 27491927  T
Q  286 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgac 384  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||  ||    
T  27491926 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggaccatggctgagggcaggtaggtaaacaacttgcttggggatagaatcttgagagacctcac 27491827  T
Q  385 tggggaaaaccccgtt 400  Q
     ||||||||| |||||    
T  27491826 cggggaaaacgccgtt 27491811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 170 - 388
Target Start/End: Original strand, 14138689 - 14138915
Alignment:
Q  170 atgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcg 269  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14138689 atgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcg 14138788  T
Q  270 tgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggg 361  Q
    ||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| ||||||    
T  14138789 tgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaactcgctggg 14138888  T
Q  362 gatagaatcttggaagacccgactggg 388  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||    
T  14138889 gatagaatctcggaagactctactggg 14138915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 94 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 27209886 - 27209584
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || ||| |||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||    
T  27209886 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtagtatgcatggttatgcatgtatgaatgcttgtaatg 27209788  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacat--catag------aa 284  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||       ||    
T  27209787 catgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagatagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctagattacatattccagtaa 27209688  T
Q  285 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 384  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||    
T  27209687 atcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctac 27209588  T
Q  385 tggg 388  Q
    ||||    
T  27209587 tggg 27209584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 94 - 388
Target Start/End: Original strand, 27239342 - 27239644
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || ||| |||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||    
T  27239342 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtagtatgcatggttatgcatgtatgaatgcttgtaatg 27239440  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacat--catag------aa 284  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||       ||    
T  27239441 catgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagatagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctagattacatattccagtaa 27239540  T
Q  285 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 384  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||    
T  27239541 atcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctac 27239640  T
Q  385 tggg 388  Q
    ||||    
T  27239641 tggg 27239644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 155 - 421
Target Start/End: Original strand, 27355356 - 27355630
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27355356 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 27355455  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | |||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||| ||| |    
T  27355456 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctatggagatgacgtcgttgggggacgtatcggagccaaggctgagggcaggtaggt 27355555  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgttatgatgtccatctcattgctg 421  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||  |||||  || ||||||||| ||||| || ||  ||||||| |||||    
T  27355556 atgcaacttgctggggatagaatcttgagagacctcaccggggaaaacgccgttgtgctgggcatctcagtgctg 27355630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 170 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 4764673 - 4764462
Alignment:
Q  170 atgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcg 269  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4764673 atgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcg 4764574  T
Q  270 tgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggg 361  Q
    ||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||    
T  4764573 tgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggg 4764474  T
Q  362 gatagaatcttg 373  Q
    ||||||||||||    
T  4764473 gatagaatcttg 4764462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 155 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 26927679 - 26927437
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 253  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||    
T  26927679 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattg 26927580  T
Q  254 ggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc 345  Q
    ||||||||||||||||||||| || | |        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||    
T  26927579 ggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtatcggaaccaaggctgaggatagatagc 26927480  T
Q  346 taatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggg 388  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||| | ||||||    
T  26927479 taatcaactcgctggggatagaatctcgggagactctactggg 26927437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 155 - 400
Target Start/End: Original strand, 26665910 - 26666163
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26665910 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgtatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 26666009  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||  |  || |    
T  26666010 gcacgtagtggctcgtgctatatgacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggtgggcaggt 26666109  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||    
T  26666110 atgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 26666163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 155 - 400
Target Start/End: Original strand, 26771881 - 26772134
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26771881 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgtatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 26771980  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||  |  || |    
T  26771981 gcacgtagtggctcgtgctatatgacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggtgggcaggt 26772080  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||    
T  26772081 atgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 26772134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 155 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 28167420 - 28167188
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28167420 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 28167321  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | |||||    
T  28167320 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagct 28167221  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 379  Q
    |  |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  28167220 atgcaacttgctggggatagagtcttgggagac 28167188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 94 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 4532280 - 4531994
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || |  | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  4532280 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 4532182  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 285  Q
    |||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |        || | ||||    
T  4532181 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgagctatattacacattcttggaaa 4532082  T
Q  286 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttg 373  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  4532081 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggctggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttg 4531994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 155 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 16756748 - 16756506
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 253  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||    
T  16756748 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattg 16756649  T
Q  254 ggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc 345  Q
    ||||||||||||||||||||| || | |        |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  16756648 ggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagc 16756549  T
Q  346 taatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggg 388  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  16756548 tatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactggg 16756506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 155 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 4779837 - 4779584
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||    
T  4779837 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagaattttgg 4779738  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||  || |    
T  4779737 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggcaggcaggt 4779638  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||    
T  4779637 atgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 4779584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 155 - 400
Target Start/End: Original strand, 16937279 - 16937532
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16937279 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 16937378  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| || | |        || || |||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| |    
T  16937379 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggagattctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggt 16937478  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
    |    |||||||||||||||| |||||  |||| | |||||||||||| |||||    
T  16937479 atgtgacttgctggggatagagtcttgagagactccactggggaaaacgccgtt 16937532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 155 - 394
Target Start/End: Original strand, 8898950 - 8899197
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8898950 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 8899049  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    ||||||||||||||||||||  | | |        || ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| |    
T  8899050 gcacgtagtggctcgtgctatgttacacattctcggagatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggt 8899149  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaac 394  Q
    |   ||||||||||||||||| |||||  |||| | || |||||||||    
T  8899150 atgtaacttgctggggatagagtcttgagagactccaccggggaaaac 8899197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 155 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 16681085 - 16680832
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16681085 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 16680986  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||| |||||||||||||||  | | |        || ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| |    
T  16680985 gcacatagtggctcgtgctatgttacacattctcggagatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggt 16680886  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
    |   ||||||||||||||||| |||||  |||| | || ||||||||| |||||    
T  16680885 atgtaacttgctggggatagagtcttgagagactccaccggggaaaacgccgtt 16680832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 88 - 388
Target Start/End: Original strand, 24298967 - 24299275
Alignment:
Q  88 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 187  Q
    |||| ||||| |||| |||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||| || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  24298967 ctgatattgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 24299065  T
Q  188 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata----- 281  Q
    | |||||||||  ||||    |||||||||||   | ||| | || |||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| || | |         
T  24299066 gtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagttccacagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctcgtgctatattacacattc 24299165  T
Q  282 ---gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaaga 378  Q
       |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24299166 ttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaaga 24299265  T
Q  379 cccgactggg 388  Q
    | | ||||||    
T  24299266 ctctactggg 24299275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 155 - 371
Target Start/End: Original strand, 15405803 - 15406028
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 253  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||    |||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||    
T  15405803 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattg 15405902  T
Q  254 ggcacgtagtggctcgtgctacatcataga--------aatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc 345  Q
    ||||||||||||||||||||| || | | |        |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  15405903 ggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctgaaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagc 15406002  T
Q  346 taatcaacttgctggggatagaatct 371  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||    
T  15406003 tatgcaacttgctggggatagaatct 15406028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 155 - 371
Target Start/End: Original strand, 15417590 - 15417815
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 253  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||    |||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||    
T  15417590 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattg 15417689  T
Q  254 ggcacgtagtggctcgtgctacatcataga--------aatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc 345  Q
    ||||||||||||||||||||| || | | |        |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  15417690 ggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctgaaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagc 15417789  T
Q  346 taatcaacttgctggggatagaatct 371  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||    
T  15417790 tatgcaacttgctggggatagaatct 15417815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 155 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 24870635 - 24870402
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 253  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  | ||    ||||||||||| | | | | | || |||||||||| | ||||||||    
T  24870635 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgctggcgatttgtagacacaattccgcagagacagacaagacactggagtattg 24870536  T
Q  254 ggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc 345  Q
    |||||||| |||||||||||| || | |        |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  24870535 ggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagc 24870436  T
Q  346 taatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 379  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24870435 tatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 24870402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 94 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 27032008 - 27031706
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  27032008 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgtttgtaatg 27031910  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 284  Q
    |||||  ||||    ||||||||||| | | | | | || |||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||| || | |        |||    
T  27031909 catgactgttggcgatttgtagacacaattccgcagagacagacaagacactggagcattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcttggaa 27031810  T
Q  285 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||    
T  27031809 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagttatgcaacttgctggggataggatctcggaagactctac 27031710  T
Q  385 tggg 388  Q
    ||||    
T  27031709 tggg 27031706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 94 - 379
Target Start/End: Original strand, 22928067 - 22928360
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||    
T  22928067 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtgatg 22928165  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 284  Q
    |||||  ||||    ||||||||||| | | | | | || |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| || | |        |||    
T  22928166 catgactgttggcgatttgtagacacaattccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaa 22928265  T
Q  285 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 379  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22928266 atcctctttggagataacatcgttgggagatgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 22928360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 94 - 388
Target Start/End: Original strand, 13292157 - 13292460
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||    
T  13292157 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatg 13292255  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 284  Q
    |||||  ||||    ||||||||||| | ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||    
T  13292256 catgactgttggcgatttgtagacacaatttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaa 13292355  T
Q  285 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatag-ctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccga 383  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||| |||| |||||||||| | ||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | |    
T  13292356 atcctctttggagatgacgtcgttgggggacgtatcgggaccaaggctgagggccggtagtctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactcta 13292455  T
Q  384 ctggg 388  Q
    |||||    
T  13292456 ctggg 13292460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 94 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 27026129 - 27025827
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||    
T  27026129 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatg 27026031  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcataga--------a 284  Q
    |||||  ||||    ||||||||||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | | |        |    
T  27026030 catgactgttggcgatttgtagacaaagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctgaaa 27025931  T
Q  285 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||| | ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||    
T  27025930 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccaaggctgagggccggtagttatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctac 27025831  T
Q  385 tggg 388  Q
    ||||    
T  27025830 tggg 27025827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 94 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 20131500 - 20131253
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || ||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  20131500 ttgacattggaaatgcaacatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatggatgcttgaaatg 20131402  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 285  Q
    |||||||||||  | |||||| | ||   ||| |     |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |        ||||    
T  20131401 catgatggttggcaatttgta-agacagtttctc-----agacaagacatcggagtgttgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcctggaaa 20131308  T
Q  286 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcag 340  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  20131307 tcctctttggagatatcgtcgttgggagacgtatcgaaaccatggctgagggcag 20131253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 94 - 340
Target Start/End: Original strand, 22201370 - 22201617
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || ||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  22201370 ttgacattggaaatgcaacatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatggatgcttgaaatg 22201468  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 285  Q
    |||||||||||  | |||||| | ||   ||| |     |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |        ||||    
T  22201469 catgatggttggcaatttgta-agacagtttctc-----agacaagacatcggagtgttgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcctggaaa 22201562  T
Q  286 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcag 340  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  22201563 tcctctttggagatatcgtcgttgggagacgtatcgaaaccatggctgagggcag 22201617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 34)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 88 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 3452244 - 3451936
Alignment:
Q  88 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 187  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3452244 ctgacattgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcatgaatgatt 3452145  T
Q  188 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tca 279  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |        ||     
T  3452144 gaaatgcatgatggttgacagtttgtagacacgacttcacggggaagccaagacatcagatcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattct 3452045  T
Q  280 tagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 379  Q
    | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3452044 tggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtaccggagccaaggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 3451945  T
Q  380 ccgactggg 388  Q
     | ||||||    
T  3451944 tctactggg 3451936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 89 - 400
Target Start/End: Original strand, 26268209 - 26268527
Alignment:
Q  89 tgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattg 188  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26268209 tgacatttgtattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcatgaatgattg 26268308  T
Q  189 aaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcat 280  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |        || |    
T  26268309 aaatgcatgatggttgacagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctt 26268408  T
Q  281 agaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacc 380  Q
     |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  26268409 ggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgg-acctaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagact 26268507  T
Q  381 cgactggggaaaaccccgtt 400  Q
      |||||||||||| |||||    
T  26268508 ttactggggaaaacgccgtt 26268527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 94 - 393
Target Start/End: Original strand, 26678233 - 26678539
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || || ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  26678233 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtgatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 26678331  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 285  Q
    |||||  ||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  26678332 catgactgttggcagtttgtaggcatgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 26678431  T
Q  286 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 385  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  26678432 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 26678531  T
Q  386 ggggaaaa 393  Q
    ||||||||    
T  26678532 ggggaaaa 26678539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 105 - 403
Target Start/End: Original strand, 26508848 - 26509154
Alignment:
Q  105 aatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttg 204  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||    
T  26508848 aatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatggttgtaatgcatgactgttg 26508946  T
Q  205 atagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttgg 295  Q
      |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |        ||||||||||||||    
T  26508947 gcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacattacacattcctggaaatcctctttgg 26509046  T
Q  296 agataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaacc 395  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  26509047 agataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatcaacttgctgggggtagaatcttggaagacccgactggggataacg 26509146  T
Q  396 ccgttatg 403  Q
    ||||||||    
T  26509147 ccgttatg 26509154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 94 - 393
Target Start/End: Original strand, 26663041 - 26663347
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || || ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  26663041 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtgatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 26663139  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 285  Q
    |||||  ||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  26663140 catgactgttggcagtttgtaggcatgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 26663239  T
Q  286 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 385  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  26663240 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 26663339  T
Q  386 ggggaaaa 393  Q
    ||||||||    
T  26663340 ggggaaaa 26663347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 157 - 393
Target Start/End: Original strand, 16744711 - 16744955
Alignment:
Q  157 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 256  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16744711 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 16744810  T
Q  257 acgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaa 348  Q
    |||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||     
T  16744811 acgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgacggaaccatagctgagggcaggtagatat 16744910  T
Q  349 tcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaa 393  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16744911 gcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaa 16744955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 155 - 400
Target Start/End: Original strand, 31083812 - 31084066
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||   |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31083812 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 31083911  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  31083912 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagct 31084011  T
Q  347 aatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||  |||| | || ||||||||| |||||    
T  31084012 aaacaacttgcttggggatagaatcttgagagactccaccggggaaaacgccgtt 31084066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 94 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 2780230 - 2779929
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  2780230 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 2780132  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 285  Q
    |||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  2780131 catgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 2780032  T
Q  286 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 385  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  2780031 tcctctttgaagatgacgccgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggcatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 2779932  T
Q  386 ggg 388  Q
    |||    
T  2779931 ggg 2779929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 88 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 31130909 - 31130616
Alignment:
Q  88 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 187  Q
    |||| |||| ||||| |||||| | ||| ||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  31130909 ctgatattgttattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 31130811  T
Q  188 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tca 279  Q
    | |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |        ||     
T  31130810 gtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattct 31130711  T
Q  280 tagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaacc-atggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttg 373  Q
    | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  31130710 tggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtattggaaccaatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttg 31130616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 155 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 26442191 - 26441938
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26442191 gtaatacgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 26442092  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| |    
T  26442091 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggt 26441992  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||| |||||    
T  26441991 atgcaacttgctggggatagaatcttgagagaccccaccggggaaaacgccgtt 26441938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 155 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 26596603 - 26596356
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26596603 gtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 26596504  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaacc-atggctgagggcagatagc 345  Q
    |||||||||||||| ||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||| || ||||||||||| |||     
T  26596503 gcacgtagtggctcatgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccaatagctgagggcaggtaga 26596404  T
Q  346 taatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaa 393  Q
    ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26596403 tatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaa 26596356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 94 - 400
Target Start/End: Original strand, 31557533 - 31557847
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||    
T  31557533 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattacgcatgtatgaatgcttgtaatg 31557631  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta--------catcatagaaa 285  Q
    |||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||        | || | ||||    
T  31557632 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtagctcgtgctatattacaccttcttggaaa 31557731  T
Q  286 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgac 384  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||   ||    
T  31557732 tcctctttggagatggcgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtaaacaacttgcttggggatagaatcttggaagactttac 31557831  T
Q  385 tggggaaaaccccgtt 400  Q
    |||||||||| |||||    
T  31557832 tggggaaaacgccgtt 31557847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 155 - 400
Target Start/End: Original strand, 26313052 - 26313306
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||   |||  | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26313052 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcattttgtaggcaagacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 26313151  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||    
T  26313152 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaact 26313251  T
Q  347 aatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||  |||| | || ||||||||| |||||    
T  26313252 aaacaacttgcttggggatagaatcttgagagactccaccggggaaaacgccgtt 26313306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 155 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 4206322 - 4206069
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||   |||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4206322 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtgttgg 4206223  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  4206222 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgccggaaccatggccgagggcaggtaggt 4206123  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||  |||| | || ||||||||| |||||    
T  4206122 atgcaacttgctggggatagaatcttgagagactccaccggggaaaacgccgtt 4206069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 155 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 45394166 - 45393913
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  45394166 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagaatattgg 45394067  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||| ||||| |        || | | |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  45394066 gcacgtagtggctcatgctatattacacattcttgggaatcctctttggagatgacgtcgttgagagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagct 45393967  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||    
T  45393966 atgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 45393913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 157 - 400
Target Start/End: Original strand, 4138436 - 4138687
Alignment:
Q  157 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 256  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4138436 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 4138535  T
Q  257 acgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaa 348  Q
    |||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||  || ||     
T  4138536 acgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggcaggtat 4138635  T
Q  349 tcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
     ||||||||||| ||||||||||||  || | | |||||||||||| |||||    
T  4138636 gcaacttgctggagatagaatcttgagaggctccactggggaaaacgccgtt 4138687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 155 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 11447835 - 11447582
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  11447835 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgtttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagatcattgg 11447736  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  || |    
T  11447735 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggt 11447636  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||    
T  11447635 atgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 11447582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 155 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 22148814 - 22148573
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22148814 gtaatgtgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 22148715  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||      
T  22148714 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccctggctgagggcaggtaggc 22148615  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggg 388  Q
    |  ||||| ||||||||||| |||| ||||||| | ||||||    
T  22148614 atgcaactggctggggataggatctcggaagactctactggg 22148573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 95 - 379
Target Start/End: Original strand, 16443134 - 16443426
Alignment:
Q  95 tgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgc 194  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||| | |||||| | || ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  16443134 tgatattggaaatgcaatatgtatggatgatataa-aagttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 16443232  T
Q  195 atgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 285  Q
    ||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| || | |        ||||    
T  16443233 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattgaagtattgggcatgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 16443332  T
Q  286 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 379  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16443333 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggagccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 16443426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 155 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 26519754 - 26519501
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  26519754 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagatcattgg 26519655  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  || |    
T  26519654 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggt 26519555  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||    
T  26519554 atgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 26519501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 99 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 16048315 - 16048027
Alignment:
Q  99 attgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatga 198  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| |||| |||||| | || ||| |||||||||| || |||||||||||| | | |||||||||    
T  16048315 attggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttt-atcaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatacatgtatgaatgctcgtaatgcatga 16048217  T
Q  199 tggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcct 289  Q
      ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||||||    
T  16048216 ctgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcct 16048117  T
Q  290 ctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 379  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16048116 ctttggagataaagtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 16048027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 155 - 379
Target Start/End: Original strand, 39206353 - 39206585
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39206353 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 39206452  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | |||||    
T  39206453 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagct 39206552  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 379  Q
    |  |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  39206553 atgcaacttgctgaggatagaatcttgggagac 39206585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 155 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 45738227 - 45737995
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45738227 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 45738128  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | |||||    
T  45738127 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagct 45738028  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 379  Q
    |  ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  45738027 atgcaatttgctggggatagaatcttgggagac 45737995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 157 - 400
Target Start/End: Original strand, 24585726 - 24585978
Alignment:
Q  157 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagaca-ttagagtattggg 255  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||  ||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24585726 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaacgcatgactgttggcagtttgtaggcacgactttacggggaagacaagacatttagagtattggg 24585825  T
Q  256 cacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagcta 347  Q
    ||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||| ||| ||    
T  24585826 cacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgaaggcaggtagata 24585925  T
Q  348 atcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
      ||||||||||| ||||||||||||  || | | |||||||||||| |||||    
T  24585926 tgcaacttgctggagatagaatcttgagaggctccactggggaaaacgccgtt 24585978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 94 - 388
Target Start/End: Original strand, 11417931 - 11418233
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  11417931 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 11418029  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaa 284  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |        | |||    
T  11418030 catgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacgcattcctggaa 11418129  T
Q  285 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||    
T  11418130 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctac 11418229  T
Q  385 tggg 388  Q
    ||||    
T  11418230 tggg 11418233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 155 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 5155010 - 5154768
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 253  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||    
T  5155010 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattg 5154911  T
Q  254 ggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc 345  Q
    ||||||||||||||||||||| || | |        |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  5154910 ggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagc 5154811  T
Q  346 taatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggg 388  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||    
T  5154810 tatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctactggg 5154768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 155 - 365
Target Start/End: Original strand, 5140526 - 5140744
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5140526 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 5140625  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    ||||||||||||||||||||  | | |        || ||||||| ||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| |    
T  5140626 gcacgtagtggctcgtgctatgttacacattctcggagatcctctatggagatgacgtcattgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggt 5140725  T
Q  347 aatcaacttgctggggata 365  Q
    |   |||||||||||||||    
T  5140726 atgtaacttgctggggata 5140744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 94 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 10848592 - 10848299
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||| | || ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| || |    
T  10848592 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttt-atcagatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaacg 10848494  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 284  Q
    |||||  ||||  ||||||||||||    ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| |        |||    
T  10848493 catgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgcgctatatcacacattcttggaa 10848394  T
Q  285 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 379  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||  | |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  10848393 atcctctttggagataacgtcattgggagacgtatcggaaccatggctgagggcgggttgctacgcgacttgctggggacagaatctcggaagac 10848299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 207 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 22152989 - 22152800
Alignment:
Q  207 agtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggaga 298  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||    
T  22152989 agtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggaga 22152890  T
Q  299 taacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggg 388  Q
    | ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||  |  ||||| ||||||||||| |||| ||||||| | ||||||    
T  22152889 tgacgtcgttgggagacgtatcggaaccctggctgagggcaggtaggcatgcaactggctggggataggatctcggaagactctactggg 22152800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 207 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 22208904 - 22208715
Alignment:
Q  207 agtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggaga 298  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||    
T  22208904 agtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggaga 22208805  T
Q  299 taacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggg 388  Q
    | ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||  |  ||||| ||||||||||| |||| ||||||| | ||||||    
T  22208804 tgacgtcgttgggagacgtatcggaaccctggctgagggcaggtaggcatgcaactggctggggataggatctcggaagactctactggg 22208715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 88 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 5165377 - 5165078
Alignment:
Q  88 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 187  Q
    |||| ||||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  5165377 ctgatattgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 5165279  T
Q  188 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata----- 281  Q
    | |||||||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |         
T  5165278 gtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattc 5165179  T
Q  282 ---gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaaga 378  Q
       |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||    
T  5165178 ctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagagtcttgggaga 5165079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 94 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 2161558 - 2161257
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  2161558 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 2161460  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 284  Q
    |||||| ||||  || | ||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||    
T  2161459 catgattgttggcagctggtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 2161360  T
Q  285 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 384  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | ||    
T  2161359 atcctctttggagacgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcag-tagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctac 2161261  T
Q  385 tggg 388  Q
    ||||    
T  2161260 tggg 2161257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 155 - 388
Target Start/End: Original strand, 16511637 - 16511879
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 253  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||    |||||||||||   | | | | || |||||||||| | ||||||||    
T  16511637 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattg 16511736  T
Q  254 ggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc 345  Q
    |||||||| || ||||||||| || | |        |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||     
T  16511737 ggcacgtaatgactcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagt 16511836  T
Q  346 taatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggg 388  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  16511837 tatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactggg 16511879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 88 - 388
Target Start/End: Original strand, 10910072 - 10910380
Alignment:
Q  88 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 187  Q
    |||| ||||| |||| |||||||| ||||||| ||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  10910072 ctgatattgacattggaaatgcaatatgtatgaatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 10910170  T
Q  188 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttca-cgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata---- 281  Q
    | |||||| ||  ||||    ||||||||||| | |||| | | || |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| || | |        
T  10910171 gtaatgcacgactgttggcgatttgtagacac-agttcagcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacatt 10910269  T
Q  282 ----gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaag 377  Q
        |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||| || ||    
T  10910270 cctggaaatcctctttggagatgacgttgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgaggatagaatctcgggag 10910369  T
Q  378 acccgactggg 388  Q
    || | ||||||    
T  10910370 actctactggg 10910380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 25)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 88 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 15775474 - 15775288
Alignment:
Q  88 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 187  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15775474 ctgacattgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcatgaatgatt 15775375  T
Q  188 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 274  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15775374 gaaatgcatgatggttgacagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtggtggctcgtgcta 15775288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 155 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 29836276 - 29836023
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29836276 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 29836177  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| || | |        |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  29836176 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggt 29836077  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29836076 atgcaacttgctggagatagaatcttggaagacccgactggggaaaacgccgtt 29836023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 157 - 393
Target Start/End: Original strand, 28355223 - 28355467
Alignment:
Q  157 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 256  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28355223 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 28355322  T
Q  257 acgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaa 348  Q
    |||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||     
T  28355323 acgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatat 28355422  T
Q  349 tcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaa 393  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28355423 gcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaa 28355467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 150 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 33265678 - 33265420
Alignment:
Q  150 gacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagt 249  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33265678 gacacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagt 33265579  T
Q  250 attgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcaga 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||     
T  33265578 attgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggaaatgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcagg 33265479  T
Q  342 tagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
    ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||   |||||||||||| |||||    
T  33265478 taggtatgcaacttgctggggatagaatcttgagagactttactggggaaaacgccgtt 33265420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 155 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 18716409 - 18716177
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18716409 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 18716310  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  18716309 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagct 18716210  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 379  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18716209 atgcaacttgctggggatagaatcttgggagac 18716177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 94 - 403
Target Start/End: Original strand, 12085937 - 12086253
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    ||||| ||| |||||| | ||| ||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  12085937 ttgatgttggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 12086035  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 285  Q
    |||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  12086036 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 12086135  T
Q  286 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 385  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  || |||||| ||||| |   |||    
T  12086136 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatacaacttgctggaaattgaatctcggaaggctttact 12086235  T
Q  386 ggggaaaaccccgttatg 403  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  12086236 ggggaaaacgccgttatg 12086253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 157 - 400
Target Start/End: Original strand, 31483142 - 31483393
Alignment:
Q  157 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 256  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  || |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31483142 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtcggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 31483241  T
Q  257 acgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaa 348  Q
    |||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||     
T  31483242 acgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatat 31483341  T
Q  349 tcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
     ||| ||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||    
T  31483342 gcaatttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 31483393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 94 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 31361542 - 31361267
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  31361542 ttgatattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 31361444  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 285  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  31361443 catgactgttggcagtttgtagacacagtttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggaaa 31361344  T
Q  286 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggg 362  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||    
T  31361343 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctgggg 31361267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 93 - 379
Target Start/End: Original strand, 22074135 - 22074429
Alignment:
Q  93 attgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaat 192  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||| || | |||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||    
T  22074135 attgacattggaaatgcaacatgtatgggtggtataatagtttt-attaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaat 22074233  T
Q  193 gcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------ga 283  Q
    ||||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| |        ||    
T  22074234 gcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggaatattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttgga 22074333  T
Q  284 aatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 379  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22074334 aatcctctttggatataacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 22074429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 155 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 44567934 - 44567680
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44567934 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagaatattgg 44567835  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca---------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc 345  Q
    |||||||| |||||| |||| |         || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  44567834 gcacgtagcggctcgcgctatattacacatttcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaaccatggctgaggacaggtagc 44567735  T
Q  346 taatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
    ||  |||||||||||  |||||||||||||||||   |||||||||||| |||||    
T  44567734 tatgcaacttgctggaaatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 44567680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 157 - 400
Target Start/End: Original strand, 19201654 - 19201906
Alignment:
Q  157 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 256  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19201654 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaagcacaacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 19201753  T
Q  257 acgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaa 348  Q
    |||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||  ||||||||||| || ||||    
T  19201754 acgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccacagctgagggcaggtaactaa 19201853  T
Q  349 tcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
     |||||||| ||||||||||||||||  |||| | || ||||||||| |||||    
T  19201854 acaacttgcttggggatagaatcttgagagactccaccggggaaaacgccgtt 19201906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 155 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 19681409 - 19681156
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  19681409 gtaatatgcatgattatacatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagatcattgg 19681310  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  || |    
T  19681309 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggt 19681210  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||    
T  19681209 atgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 19681156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 94 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 18797697 - 18797404
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||| | ||| ||||||||||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  18797697 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatggtataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 18797599  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 284  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||    
T  18797598 catgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaa 18797499  T
Q  285 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 379  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  18797498 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctaaggatagaatcttgggagac 18797404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 94 - 388
Target Start/End: Original strand, 21341394 - 21341697
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  21341394 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 21341492  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 284  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||    
T  21341493 catgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaa 21341592  T
Q  285 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccga 383  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| || ||||||||||| ||||||| | |    
T  21341593 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgcttgaggatagaatctcggaagactcta 21341692  T
Q  384 ctggg 388  Q
    |||||    
T  21341693 ctggg 21341697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 94 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 14570143 - 14569841
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  14570143 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 14570045  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 284  Q
    |||||| ||||    |||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| |        || | |||    
T  14570044 catgattgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacacagtggctcgtgctatactacacattcttggaa 14569945  T
Q  285 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  14569944 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaactcgctggggatagaatctcggaagactctac 14569845  T
Q  385 tggg 388  Q
    ||||    
T  14569844 tggg 14569841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 94 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 15774562 - 15774260
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||| ||||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  15774562 ttgacattggaaatgcgacatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 15774464  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 284  Q
    |||||  ||||  || | ||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |        |||    
T  15774463 catgactgttggcagctggtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacattacacattcctggaa 15774364  T
Q  285 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  15774363 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctac 15774264  T
Q  385 tggg 388  Q
    ||||    
T  15774263 tggg 15774260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 155 - 388
Target Start/End: Original strand, 2130552 - 2130794
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 253  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  | ||    ||||||||||| | | | | | || |||||||||| | ||||||||    
T  2130552 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgctggcgatttgtagacacaattccgcagagacagacaagacactggagtattg 2130651  T
Q  254 ggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc 345  Q
    ||||||||||||||||||||| || | |        |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  2130652 ggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcagatagc 2130751  T
Q  346 taatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggg 388  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  2130752 tatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactggg 2130794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 155 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 9361556 - 9361304
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9361556 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 9361457  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || |  ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||| | ||| |    
T  9361456 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgaaaatcctctttggagatgacgtcgttgggggacgtatcgg-accatagctgagggccggtaggt 9361358  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
    |   |||| |||||||||||| |||||  |||| | || ||||||||| |||||    
T  9361357 atgtaactggctggggatagagtcttgagagactccaccggggaaaacgccgtt 9361304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 88 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 19695110 - 19694802
Alignment:
Q  88 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 187  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||  || | ||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  19695110 ctgatattgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttc-attaaatgcatggacacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 19695012  T
Q  188 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata----- 281  Q
    | |||||||||  ||||    |||||||||||   | | | | || |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| || || | |         
T  19695011 gtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgttatattacacattc 19694912  T
Q  282 ---gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaaga 378  Q
       |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19694911 ctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgagagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaaga 19694812  T
Q  379 cccgactggg 388  Q
    | | ||||||    
T  19694811 ctctactggg 19694802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 155 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 22139842 - 22139598
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 253  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||  ||||  |||||||||||||   | | | | || |||||||||| | ||||||||    
T  22139842 gtaatatgcatgattatgcgtgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattg 22139743  T
Q  254 ggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc 345  Q
    ||||||||||||||||||||| || | |        |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||    
T  22139742 ggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacttatcggaaccatgactgagggcaggtagc 22139643  T
Q  346 taatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgggga 390  Q
    ||  |||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||    
T  22139642 tatacaacttgctggggacagaatctcggaagactctactgggga 22139598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 94 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 33249351 - 33249049
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  33249351 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 33249253  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 284  Q
    |||||  ||||    |||||||||||   ||| | | || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||    
T  33249252 catgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacaaacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaa 33249153  T
Q  285 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  33249152 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccaaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttggaagactctac 33249053  T
Q  385 tggg 388  Q
    ||||    
T  33249052 tggg 33249049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 94 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 16260926 - 16260635
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||  |||  |||| ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||    
T  16260926 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacggtttc-atcaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgttatg 16260828  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 284  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||   | | | | || |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| || | |        |||    
T  16260827 catgactgttggcagtttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaa 16260728  T
Q  285 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaag 377  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  16260727 atcctctttggagataacgtcgttgggagacttatcggaaccatgactgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaag 16260635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 155 - 377
Target Start/End: Original strand, 19654610 - 19654841
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 253  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||| |||| ||||||||   | | | | || |||||||||| | ||||||||    
T  19654610 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgtatgactgttgacagttggtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattg 19654709  T
Q  254 ggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc 345  Q
    |||||||| |||||||||||| || | |        |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||    
T  19654710 ggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacttatcggaaccatgactgagggcaggtagc 19654809  T
Q  346 taatcaacttgctggggatagaatcttggaag 377  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  19654810 tatgcaacttgctggggatagaatctcggaag 19654841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 94 - 388
Target Start/End: Original strand, 27602137 - 27602439
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  27602137 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 27602235  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 284  Q
    |||||  ||||    ||||||||| |   ||| | | || |||||||||| | |||| |||||||||  ||||||||||||| || | |        |||    
T  27602236 catgactgttggcgatttgtagacgcagtttcgcagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcggtggctcgtgctatattacacattcttggaa 27602335  T
Q  285 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 384  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||  |||||||||||||| |||| | ||    
T  27602336 atcctctttggagctgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctaaggatagaatcttgggagactctac 27602435  T
Q  385 tggg 388  Q
    ||||    
T  27602436 tggg 27602439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 155 - 371
Target Start/End: Original strand, 19910451 - 19910676
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 253  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||    |||||||||||   | | | | || |||||||||| | ||||||||    
T  19910451 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattg 19910550  T
Q  254 ggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc 345  Q
    |||||  |||||||||||||| || | |        |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  19910551 ggcacacagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagc 19910650  T
Q  346 taatcaacttgctggggatagaatct 371  Q
    ||  |||||||||| |||||||||||    
T  19910651 tatgcaacttgctgaggatagaatct 19910676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 88 - 274
Target Start/End: Original strand, 13178638 - 13178824
Alignment:
Q  88 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 187  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13178638 ctgacattgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcatgaatgatt 13178737  T
Q  188 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 274  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13178738 gaaatgcatgatggttgacagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtggtggctcgtgcta 13178824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 94 - 400
Target Start/End: Original strand, 15752004 - 15752317
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  15752004 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 15752102  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 285  Q
    |||||  ||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  15752103 catgaccgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 15752202  T
Q  286 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 385  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15752203 tcctctttggggatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgact 15752302  T
Q  386 ggggaaaaccccgtt 400  Q
    ||||||||| |||||    
T  15752303 ggggaaaacgccgtt 15752317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 94 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 30036441 - 30036128
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || |  | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  30036441 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 30036343  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 285  Q
    |||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  30036342 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 30036243  T
Q  286 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 385  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30036242 tcctctttggggatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgact 30036143  T
Q  386 ggggaaaaccccgtt 400  Q
    ||||||||| |||||    
T  30036142 ggggaaaacgccgtt 30036128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 94 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 33523399 - 33523086
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  33523399 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 33523301  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 285  Q
    |||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  33523300 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 33523201  T
Q  286 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 385  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33523200 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgacc 33523101  T
Q  386 ggggaaaaccccgtt 400  Q
    ||||||||| |||||    
T  33523100 ggggaaaacgccgtt 33523086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 88 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 33882127 - 33881815
Alignment:
Q  88 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 187  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  33882127 ctgatattgatattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 33882029  T
Q  188 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tca 279  Q
    | |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |        ||     
T  33882028 gtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacgttagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattct 33881929  T
Q  280 tagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 379  Q
    | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33881928 tggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagac 33881829  T
Q  380 ccgactggggaaaa 393  Q
    | ||||||||||||    
T  33881828 ctgactggggaaaa 33881815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 155 - 400
Target Start/End: Original strand, 31819627 - 31819880
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31819627 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 31819726  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||| ||||||||| ||||| || | |        |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  31819727 gcacatagtggctcatgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggt 31819826  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31819827 atgcaacttgctggagatagaatcttggaagacccgactggggaaaacgccgtt 31819880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 157 - 393
Target Start/End: Original strand, 40466757 - 40467001
Alignment:
Q  157 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 256  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40466757 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 40466856  T
Q  257 acgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaa 348  Q
    |||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||     
T  40466857 acgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatat 40466956  T
Q  349 tcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaa 393  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40466957 gcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaa 40467001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 155 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 6881248 - 6881007
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6881248 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 6881149  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  6881148 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggt 6881049  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggg 388  Q
    |  |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  6881048 atgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactggg 6881007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 155 - 388
Target Start/End: Original strand, 9543934 - 9544175
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9543934 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 9544033  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  9544034 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggt 9544133  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggg 388  Q
    |  ||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  9544134 atgcaactcgctggggatagaatctcggaagactctactggg 9544175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 94 - 400
Target Start/End: Original strand, 18493914 - 18494227
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||| ||| | ||||| ||||||| |||| || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  18493914 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 18494012  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgc-----taca---tcatagaaa 285  Q
    |||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||     ||||   || | ||||    
T  18494013 catgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacatagtggctcgtgctatgttacacattcttggaaa 18494112  T
Q  286 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 385  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||     
T  18494113 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggccagtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctacc 18494212  T
Q  386 ggggaaaaccccgtt 400  Q
    ||||||||| |||||    
T  18494213 ggggaaaacgccgtt 18494227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 94 - 371
Target Start/End: Original strand, 37351810 - 37352094
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| ||   || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  37351810 ttgatattggaaatgcaatatgcatggatgttataacagttcc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 37351908  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 285  Q
    |||||  ||||  | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  37351909 catgactgttggcatttggtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 37352008  T
Q  286 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatct 371  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  37352009 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 37352094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 155 - 400
Target Start/End: Original strand, 37745555 - 37745808
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  37745555 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaaaacaagacatcagagtattgg 37745654  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgcta--------catcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    ||||||||||||||||||||        | || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  37745655 gcacgtagtggctcgtgctatattacaccttcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagct 37745754  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
    |  ||||| ||||||||||||||||||  ||||   |||||||||||| |||||    
T  37745755 atgcaactcgctggggatagaatcttgagagactttactggggaaaacaccgtt 37745808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 95 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 22895422 - 22895119
Alignment:
Q  95 tgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgc 194  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | |||||| | || ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  22895422 tgatattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgcaatgc 22895324  T
Q  195 atgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 285  Q
    ||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  22895323 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagtcattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 22895224  T
Q  286 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 385  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  22895223 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcagatagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 22895124  T
Q  386 gggga 390  Q
    |||||    
T  22895123 gggga 22895119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 155 - 400
Target Start/End: Original strand, 28953001 - 28953254
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28953001 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattggagtattgg 28953100  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctacat--cata------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||       ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  28953101 gcacgtagtggctcgtgctatattacatattcttgaaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagct 28953200  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
    |  || ||||||||||| ||||||| |||||||   |||||||||||| |||||    
T  28953201 atgcatcttgctggggacagaatctcggaagactttactggggaaaacgccgtt 28953254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 94 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 43085262 - 43084956
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  43085262 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 43085164  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca-tcatagaaatcctctt 292  Q
    |||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || | ||||||||||     
T  43085163 catgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattcttggaaatcctctc 43085064  T
Q  293 tggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaa 392  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   ||||||||||||||||| |||||  |||| | || |||||||    
T  43085063 tggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggatagagtcttgagagactccaccggggaaa 43084964  T
Q  393 accccgtt 400  Q
    || |||||    
T  43084963 acgccgtt 43084956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 155 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 9324419 - 9324165
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||   |||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9324419 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 9324320  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||    
T  9324319 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaact 9324220  T
Q  347 aatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||  |||| | || ||||||||| |||||    
T  9324219 aaacaacttgcttggggatagaatcttgagagactccaccggggaaaacgccgtt 9324165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 155 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 26487329 - 26487075
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||   |||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26487329 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 26487230  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||    
T  26487229 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaact 26487130  T
Q  347 aatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||  |||| | || ||||||||| |||||    
T  26487129 aaacaacttgcttggggatagaatcttgagagactccaccggggaaaacgccgtt 26487075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 155 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 2518000 - 2517768
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2518000 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 2517901  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  || |    
T  2517900 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtaccggagccacggctgagggcaggcaggt 2517801  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 379  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  2517800 atgcaacttgctggagatagaatcttgaaagac 2517768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 153 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 12139119 - 12138864
Alignment:
Q  153 atgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtatt 252  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||   |||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12139119 atgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtatt 12139020  T
Q  253 gggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatag 344  Q
    |||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  ||    
T  12139019 gggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcag 12138920  T
Q  345 ctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
     ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||    
T  12138919 gtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 12138864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 94 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 30159035 - 30158729
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  30159035 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 30158937  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 285  Q
    |||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  30158936 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggagaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 30158837  T
Q  286 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 385  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||  || ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||    
T  30158836 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcagaaccaaggctgaggataggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacttgact 30158737  T
Q  386 ggggaaaa 393  Q
    ||||||||    
T  30158736 ggggaaaa 30158729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 155 - 388
Target Start/End: Original strand, 18121639 - 18121881
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagaca-ttagagtattg 253  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  18121639 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcaccgggaagacaagacatttagagtattg 18121738  T
Q  254 ggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc 345  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||        | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||    
T  18121739 ggcacgtagtggctcgtgctatatcacgcattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccaaggctgagggcaggtagc 18121838  T
Q  346 taatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggg 388  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||    
T  18121839 tatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctactggg 18121881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 155 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 3796488 - 3796235
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3796488 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagcattgg 3796389  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  || |    
T  3796388 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggt 3796289  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||    
T  3796288 atgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 3796235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 155 - 388
Target Start/End: Original strand, 15651967 - 15652208
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15651967 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 15652066  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| | | |||||||||||||  || ||||| |||||||||||| |||||    
T  15652067 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgatgtcgttgggagacgtgtcgaaaccaaggctgagggcaggtagct 15652166  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggg 388  Q
    |  |||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||    
T  15652167 atgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctactggg 15652208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 155 - 400
Target Start/End: Original strand, 32589481 - 32589734
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  32589481 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgatcgttggcagtttgtaggcacgacttcgcgggaaagacaagacattggagtattgg 32589580  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  32589581 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggggatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagat 32589680  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||    
T  32589681 atacaacttgctggagatagaatcttgggagacctgactggggagaacgccgtt 32589734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 155 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 37761929 - 37761676
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  37761929 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagatatcagaatattgg 37761830  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  37761829 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttgaagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagct 37761730  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
       ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||    
T  37761729 gtgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 37761676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 157 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 11330587 - 11330343
Alignment:
Q  157 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 256  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11330587 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 11330488  T
Q  257 acgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaa 348  Q
    |||||| ||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||     
T  11330487 acgtagcggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtat 11330388  T
Q  349 tcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaa 393  Q
      ||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||    
T  11330387 gtaacttgctggggatagagtcttgagagacctgactggggaaaa 11330343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 155 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 31438392 - 31438166
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31438392 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 31438293  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||  |    
T  31438292 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaagt 31438193  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttg 373  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||    
T  31438192 atgcaacttgctggggatagaatcttg 31438166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 94 - 379
Target Start/End: Original strand, 8658639 - 8658931
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || |  | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  8658639 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 8658737  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 285  Q
    |||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  8658738 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtgttgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 8658837  T
Q  286 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 379  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  8658838 tcctctttggagatgacgtcgctgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggaaatagaatctcggaagac 8658931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 88 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 24730970 - 24730678
Alignment:
Q  88 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 187  Q
    |||| |||| ||||| |||||| | ||| ||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  24730970 ctgatattgttattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 24730872  T
Q  188 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tca 279  Q
    | |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |        ||     
T  24730871 gtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggcccgtgctatattacacattct 24730772  T
Q  280 tagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttg 373  Q
    | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  24730771 tggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgccacttgctggggatagaatcttg 24730678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 95 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 25207304 - 25207012
Alignment:
Q  95 tgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgc 194  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| |||| |||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  25207304 tgatattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttt-atcaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 25207206  T
Q  195 atgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 285  Q
    ||||  ||||  |||||||||||||   ||||| | || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||        || | | ||    
T  25207205 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcacagagatagtcaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacattacacattcctgggaa 25207106  T
Q  286 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 379  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25207105 tcctctttggagataacgtcgtcgggagacgtatcagaaccagggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 25207012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 95 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 25271460 - 25271168
Alignment:
Q  95 tgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgc 194  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| |||| |||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  25271460 tgatattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttt-atcaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 25271362  T
Q  195 atgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 285  Q
    ||||  ||||  |||||||||||||   ||||| | || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||        || | | ||    
T  25271361 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcacagagatagtcaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacattacacattcctgggaa 25271262  T
Q  286 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 379  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25271261 tcctctttggagataacgtcgtcgggagacgtatcagaaccagggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 25271168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 155 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 34623454 - 34623201
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34623454 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 34623355  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||| ||| |    
T  34623354 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgggggcaggtaggt 34623255  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||  |||| | || ||||||||| |||||    
T  34623254 atgcaacttgctggggatagaatcttgagagactccaccggggaaaacgccgtt 34623201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 155 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 5644755 - 5644502
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5644755 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 5644656  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  5644655 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagat 5644556  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
    |  ||||||||||  || |||||||||  || | | |||||||||||| |||||    
T  5644555 atgcaacttgctgtagacagaatcttgagaggctccactggggaaaacgccgtt 5644502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 88 - 400
Target Start/End: Original strand, 13317966 - 13318285
Alignment:
Q  88 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 187  Q
    |||| |||| ||||| |||||| | ||| ||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  13317966 ctgatattgttattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 13318064  T
Q  188 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tca 279  Q
    | |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |        ||     
T  13318065 gtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagaatattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattct 13318164  T
Q  280 tagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 379  Q
    | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13318165 tggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagac 13318264  T
Q  380 ccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
       |||||||||||| |||||    
T  13318265 tttactggggaaaacgccgtt 13318285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 155 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 28656200 - 28655947
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28656200 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 28656101  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgc-----taca---tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    ||||||||||||||||||     ||||   || | |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||  || |||||||||||| ||| |    
T  28656100 gcacgtagtggctcgtgctatgttacacattcttggaaatcttctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagtcaaggctgagggcaggtaggt 28656001  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
    |  || |||||||||||||||||||||  |||| | || ||||||||| |||||    
T  28656000 atgcaccttgctggggatagaatcttgagagactccaccggggaaaacgccgtt 28655947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 88 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 30175489 - 30175170
Alignment:
Q  88 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 187  Q
    |||| |||||||||| |||||| | ||| ||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || ||| || |||||||  |||||||||||||| ||    
T  30175489 ctgatattgatattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtattacgcatgattgtgcatgtatgaatgctt 30175391  T
Q  188 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tca 279  Q
    | |||||||||  ||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        ||     
T  30175390 gtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgactttacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattct 30175291  T
Q  280 tagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 379  Q
    | |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||  || |    
T  30175290 tggaaatcttctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttgagaggc 30175191  T
Q  380 ccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
     | |||||||||||| |||||    
T  30175190 tccactggggaaaacgccgtt 30175170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 155 - 394
Target Start/End: Original strand, 37664710 - 37664957
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37664710 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacgttagagtattgg 37664809  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||  |  || |    
T  37664810 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaaccaaggctgagggtgggcaggt 37664909  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaac 394  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||| |||||   ||||||||||||    
T  37664910 atgcaacttgctggagatagaatcttgaaagactttactggggaaaac 37664957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 155 - 400
Target Start/End: Original strand, 13435875 - 13436128
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13435875 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 13435974  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| | || ||| |||||||||| | ||| |    
T  13435975 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcattgggagacgtatcagagccaaggctgagggctggtaggt 13436074  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||  |||| | || ||||||||| |||||    
T  13436075 atgcaacttgctggggatagaatcttgagagactccaccggggaaaacgccgtt 13436128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 155 - 400
Target Start/End: Original strand, 18368736 - 18368989
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18368736 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 18368835  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| || | |        || || |||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| |    
T  18368836 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggagattctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggt 18368935  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
    |   |||||||||||||||||  ||||  |||| | |||||||||||| |||||    
T  18368936 atgtaacttgctggggatagagccttgagagactccactggggaaaacgccgtt 18368989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 94 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 23727233 - 23726931
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  23727233 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 23727135  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 284  Q
    |||||  || |  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||    
T  23727134 catgactgtcggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 23727035  T
Q  285 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | ||    
T  23727034 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctac 23726935  T
Q  385 tggg 388  Q
    ||||    
T  23726934 tggg 23726931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 94 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 23898892 - 23898587
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  |||| ||| || | || |||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||| ||||    
T  23898892 ttgacattgaaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-atcaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtacgaatgcttgtaatg 23898794  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 284  Q
     ||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || | |        |||    
T  23898793 tatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaa 23898694  T
Q  285 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccga 383  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||| | |    
T  23898693 atcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgcttggggatagaatctcggaagactcta 23898594  T
Q  384 ctgggga 390  Q
    |||||||    
T  23898593 ctgggga 23898587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 155 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 41681638 - 41681408
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||     || ||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41681638 gtaatatgcgtgattatgcatgtatgaatgt----aacgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagtcattagagtattgg 41681543  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctacat----cat------agaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatag 344  Q
    |||||||||||||||||||| ||    |||      | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||     
T  41681542 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatgactgagggcaggtaa 41681443  T
Q  345 ctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 379  Q
    |||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41681442 ctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 41681408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 94 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 11556350 - 11556048
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  11556350 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 11556252  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaa 284  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |        | |||    
T  11556251 catgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacgcattcctggaa 11556152  T
Q  285 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||| | ||    
T  11556151 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagagtcttgggagactctac 11556052  T
Q  385 tggg 388  Q
    ||||    
T  11556051 tggg 11556048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 155 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 23632906 - 23632664
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 253  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  |||||||||||||   | ||| | || |||||||||| | |||| |||    
T  23632906 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagttccacagagacagacaagacactggagtgttg 23632807  T
Q  254 ggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc 345  Q
    ||||||  ||||||||||||| || | |        |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  23632806 ggcacgcggtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcagatagc 23632707  T
Q  346 taatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggg 388  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  23632706 tatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactggg 23632664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 94 - 388
Target Start/End: Original strand, 22992286 - 22992588
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||    
T  22992286 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatg 22992384  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 284  Q
    |||||  ||||    |||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||    
T  22992385 catgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 22992484  T
Q  285 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | ||    
T  22992485 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctac 22992584  T
Q  385 tggg 388  Q
    ||||    
T  22992585 tggg 22992588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 94 - 365
Target Start/End: Original strand, 13179962 - 13180241
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  13179962 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 13180060  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 284  Q
    |||||  ||||  | |||||||||||   ||| | | || |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||    
T  13180061 catgactgttggcattttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaa 13180160  T
Q  285 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggata 365  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||  ||||| ||||||||||    
T  13180161 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtaggtatgcaactcgctggggata 13180241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 155 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 33299472 - 33299249
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 253  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||    
T  33299472 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattg 33299373  T
Q  254 ggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc 345  Q
    ||||||||||||||||||||| || | |        |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||  ||| |||||| | ||||    
T  33299372 ggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggcggagggccggtagc 33299273  T
Q  346 taatcaacttgctggggatagaat 369  Q
    ||  ||||||||||||||||||||    
T  33299272 tatgcaacttgctggggatagaat 33299249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 94 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 33784478 - 33784176
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  33784478 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 33784380  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaa 284  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |        | |||    
T  33784379 catgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacgcattcctggaa 33784280  T
Q  285 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||   | ||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | ||    
T  33784279 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaagttgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctac 33784180  T
Q  385 tggg 388  Q
    ||||    
T  33784179 tggg 33784176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 94 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 24976840 - 24976538
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  24976840 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 24976742  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttca-cgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------ga 283  Q
    |||||  ||||    ||||||||||| | |||  | | || |||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| || | |        ||    
T  24976741 catgactgttggcgatttgtagacac-agttctgcagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctcgtgctatattacacattcctgga 24976643  T
Q  284 aatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccga 383  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |    
T  24976642 aatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagttatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactcta 24976543  T
Q  384 ctggg 388  Q
    |||||    
T  24976542 ctggg 24976538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 155 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 24609181 - 24608939
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 253  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||    |||||||||||   | | | | || |||||||||| | ||||||||    
T  24609181 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcacgactgttggcgatttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattg 24609082  T
Q  254 ggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc 345  Q
    |||||||| |||||||||||| || | |        |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||     
T  24609081 ggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgagagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagt 24608982  T
Q  346 taatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggg 388  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  24608981 tatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactggg 24608939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 155 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 30941566 - 30941324
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 253  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||    |||||||||||   | | ||| || |||||||||| | ||||||||    
T  30941566 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagttccgcggagacagacaagacactggagtattg 30941467  T
Q  254 ggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc 345  Q
    |||||  |||||||||||||| || | |        |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  30941466 ggcacacagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagc 30941367  T
Q  346 taatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggg 388  Q
    ||  |||||||||| ||||||||||| || |||| | ||||||    
T  30941366 tatgcaacttgctgaggatagaatctcgggagactctactggg 30941324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 41)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 88 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 3790659 - 3790473
Alignment:
Q  88 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 187  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3790659 ctgacattgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcatgaatgatt 3790560  T
Q  188 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 274  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3790559 gaaatgcatgatggttgacagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtggtggctcgtgcta 3790473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 94 - 400
Target Start/End: Original strand, 19409718 - 19410031
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  19409718 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 19409816  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 285  Q
    |||||  ||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  19409817 catgaccgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 19409916  T
Q  286 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 385  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19409917 tcctctttggggatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagaccccact 19410016  T
Q  386 ggggaaaaccccgtt 400  Q
    ||||||||| |||||    
T  19410017 ggggaaaacgccgtt 19410031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 94 - 400
Target Start/End: Original strand, 13929845 - 13930158
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  13929845 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 13929943  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 285  Q
    |||||  ||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  13929944 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 13930043  T
Q  286 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 385  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  13930044 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaaacaacttgctggagatagaatcttgggagacctgact 13930143  T
Q  386 ggggaaaaccccgtt 400  Q
    ||||| ||| |||||    
T  13930144 ggggagaacgccgtt 13930158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 94 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 37932385 - 37932072
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| ||   || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  37932385 ttgatattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgagcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 37932287  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 285  Q
    |||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  37932286 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 37932187  T
Q  286 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 385  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37932186 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgact 37932087  T
Q  386 ggggaaaaccccgtt 400  Q
    ||||||||| |||||    
T  37932086 ggggaaaacgccgtt 37932072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 155 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 3789391 - 3789138
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3789391 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 3789292  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| || | |        |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  3789291 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaaccatggctgagggcaggtagct 3789192  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
    |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3789191 atgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaacgccgtt 3789138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 94 - 400
Target Start/End: Original strand, 16822572 - 16822885
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  16822572 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 16822670  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 285  Q
    |||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  16822671 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 16822770  T
Q  286 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 385  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16822771 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgacc 16822870  T
Q  386 ggggaaaaccccgtt 400  Q
    ||||||||| |||||    
T  16822871 ggggaaaacgccgtt 16822885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 94 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 16898908 - 16898595
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  16898908 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 16898810  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 285  Q
    |||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  16898809 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 16898710  T
Q  286 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 385  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16898709 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgacc 16898610  T
Q  386 ggggaaaaccccgtt 400  Q
    ||||||||| |||||    
T  16898609 ggggaaaacgccgtt 16898595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 94 - 393
Target Start/End: Original strand, 37679132 - 37679438
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  37679132 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 37679230  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 285  Q
    |||||  ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |        || |    
T  37679231 catgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggaga 37679330  T
Q  286 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 385  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  37679331 tcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 37679430  T
Q  386 ggggaaaa 393  Q
    ||||||||    
T  37679431 ggggaaaa 37679438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 94 - 393
Target Start/End: Original strand, 37694397 - 37694703
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  37694397 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 37694495  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 285  Q
    |||||  ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |        || |    
T  37694496 catgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggaga 37694595  T
Q  286 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 385  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  37694596 tcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 37694695  T
Q  386 ggggaaaa 393  Q
    ||||||||    
T  37694696 ggggaaaa 37694703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 94 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 32056760 - 32056447
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  32056760 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 32056662  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 285  Q
    |||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  32056661 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 32056562  T
Q  286 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 385  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32056561 tcctctttggagatgacgtcgttgggagatgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgacc 32056462  T
Q  386 ggggaaaaccccgtt 400  Q
    ||||||||| |||||    
T  32056461 ggggaaaacgccgtt 32056447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 157 - 393
Target Start/End: Original strand, 253948 - 254192
Alignment:
Q  157 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 256  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  253948 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 254047  T
Q  257 acgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaa 348  Q
    |||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||     
T  254048 acgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatat 254147  T
Q  349 tcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaa 393  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  254148 acaacttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaa 254192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 157 - 400
Target Start/End: Original strand, 21670469 - 21670720
Alignment:
Q  157 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 256  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21670469 aatatgcatgcttatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 21670568  T
Q  257 acgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaa 348  Q
    |||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||     
T  21670569 acgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatat 21670668  T
Q  349 tcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  21670669 gcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaacgccgtt 21670720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 159 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 34298093 - 34297851
Alignment:
Q  159 tatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcac 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34298093 tatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcac 34297994  T
Q  259 gtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatc 350  Q
    |||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |    
T  34297993 gtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgc 34297894  T
Q  351 aacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaa 393  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||    
T  34297893 aacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaaaaa 34297851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 157 - 393
Target Start/End: Original strand, 9343283 - 9343527
Alignment:
Q  157 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 256  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9343283 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 9343382  T
Q  257 acgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaa 348  Q
    |||||||| ||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||     
T  9343383 acgtagtgactcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatat 9343482  T
Q  349 tcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaa 393  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9343483 gcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaa 9343527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 157 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 16168424 - 16168180
Alignment:
Q  157 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 256  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16168424 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacggcttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 16168325  T
Q  257 acgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaa 348  Q
    |||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||     
T  16168324 acgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatat 16168225  T
Q  349 tcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaa 393  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16168224 gcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaa 16168180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 88 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 27397350 - 27397051
Alignment:
Q  88 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 187  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||| | || ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  27397350 ctgaaattgacattggaaatgcaacatgtatggatggtataacagtttt-attaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 27397252  T
Q  188 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata----- 281  Q
    | |||||||||  ||||  |||||||||||||   |||   | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |         
T  27397251 gtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgtagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattc 27397152  T
Q  282 ---gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaaga 378  Q
       |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27397151 ttggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaaga 27397052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 157 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 27810649 - 27810405
Alignment:
Q  157 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 256  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27810649 aataggcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacggcttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 27810550  T
Q  257 acgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaa 348  Q
    |||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||     
T  27810549 acgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatat 27810450  T
Q  349 tcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaa 393  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27810449 gcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaa 27810405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 157 - 393
Target Start/End: Original strand, 39045178 - 39045423
Alignment:
Q  157 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 256  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39045178 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 39045277  T
Q  257 acgtagtggctcgtgc-----taca---tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaa 348  Q
    ||||||||||||||||     ||||   || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||     
T  39045278 acgtagtggctcgtgctatgttacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatat 39045377  T
Q  349 tcaac-ttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaa 393  Q
     |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39045378 gcaactttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaa 39045423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 95 - 390
Target Start/End: Original strand, 21696423 - 21696726
Alignment:
Q  95 tgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgc 194  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||  || | |||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  21696423 tgatattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttc-attaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 21696521  T
Q  195 atgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgc-----taca---tcatagaaa 285  Q
    ||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     ||||   || | ||||    
T  21696522 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcaatattacacattcctggaaa 21696621  T
Q  286 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| | | |||    
T  21696622 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaaggctctact 21696721  T
Q  386 gggga 390  Q
    |||||    
T  21696722 gggga 21696726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 94 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 39897077 - 39896764
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || |  | |||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||    
T  39897077 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctcgtaatg 39896979  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 285  Q
    |||||  ||||  | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  39896978 catgactgttggcattttgtaggcgcgacttcacggggaagacaagacatcagaatattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 39896879  T
Q  286 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 385  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  39896878 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttggaagactttact 39896779  T
Q  386 ggggaaaaccccgtt 400  Q
    ||||||||| |||||    
T  39896778 ggggaaaacgccgtt 39896764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 88 - 400
Target Start/End: Original strand, 22921372 - 22921691
Alignment:
Q  88 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 187  Q
    |||| ||||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||| || | ||| || |  | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  22921372 ctgatattgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttt-attaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 22921470  T
Q  188 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tca 279  Q
    | |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |        ||     
T  22921471 gtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattct 22921570  T
Q  280 tagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 379  Q
    | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||  || |    
T  22921571 tggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttgagaggc 22921670  T
Q  380 ccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
     | |||||||||||| |||||    
T  22921671 tccactggggaaaacgccgtt 22921691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 157 - 393
Target Start/End: Original strand, 37945161 - 37945405
Alignment:
Q  157 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 256  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||||||   |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37945161 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgctggtaatgcatgactattggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 37945260  T
Q  257 acgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaa 348  Q
    |||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||     
T  37945261 acgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagatgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatat 37945360  T
Q  349 tcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaa 393  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37945361 gcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaa 37945405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 88 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 31883285 - 31882987
Alignment:
Q  88 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 187  Q
    |||| ||||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || |  | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  31883285 ctgatattgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 31883187  T
Q  188 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tca 279  Q
    | |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |        ||     
T  31883186 gtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattct 31883087  T
Q  280 tagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 379  Q
    | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31883086 tggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcagaaccaaggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagac 31882987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 155 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 12593762 - 12593516
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||  || |||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12593762 gtaatacgcatgattatgcatgtatgaatgcctgtaatgcatgactgttgacagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 12593663  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    ||||||||||||||||||||  | | |        || ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| |    
T  12593662 gcacgtagtggctcgtgctatgttacacattctcggagatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggt 12593563  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaa 393  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12593562 atgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaa 12593516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 155 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 34161789 - 34161536
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34161789 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgtttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 34161690  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgc-----taca---tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    ||||||||||||||||||     ||||   || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | || ||| |||||||||| | ||| |    
T  34161689 gcacgtagtggctcgtgctatgttacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcagagccaaggctgagggctggtaggt 34161590  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||  |||| | || ||||||||| |||||    
T  34161589 atgcaacttgctggggatagaatcttgagagactccaccggggaaaacgccgtt 34161536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 155 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 37384603 - 37384371
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37384603 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 37384504  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| || ||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  37384503 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaattcttctgtggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggt 37384404  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 379  Q
    |  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37384403 atgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 37384371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 155 - 400
Target Start/End: Original strand, 11628479 - 11628732
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||   |||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11628479 gtaatatgtatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattggagtattgg 11628578  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  11628579 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtaggt 11628678  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||  |||| | || ||||||||| |||||    
T  11628679 atgcaacttgctggggatagaatcttgagagactccaccggggaaaacgccgtt 11628732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 88 - 373
Target Start/End: Original strand, 12709852 - 12710144
Alignment:
Q  88 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 187  Q
    |||| |||| ||||| |||||| | ||| ||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  12709852 ctgatattgttattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 12709950  T
Q  188 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tca 279  Q
    | |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |        ||     
T  12709951 gtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggcccgtgctatattacacattct 12710050  T
Q  280 tagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttg 373  Q
    | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  12710051 tggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgccacttgctggggatagaatcttg 12710144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 155 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 34868582 - 34868329
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  34868582 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtagacacgacttcacggggaagacaagacatcagatcattgg 34868483  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  || |    
T  34868482 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggt 34868383  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||    
T  34868382 atgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 34868329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 155 - 390
Target Start/End: Original strand, 34268216 - 34268460
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 253  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||    
T  34268216 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattg 34268315  T
Q  254 ggcacgtagtggctcgtgcta-------cat-catagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc 345  Q
    |||||||||||||||||||||       ||| | | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  34268316 ggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattcctggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagc 34268415  T
Q  346 taatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgggga 390  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  34268416 tatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggga 34268460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 155 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 27123448 - 27123216
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27123448 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 27123349  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | |||||    
T  27123348 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagct 27123249  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 379  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27123248 atgcaacttgctggggatagaatcttgggagac 27123216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 157 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 27783169 - 27782918
Alignment:
Q  157 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 256  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27783169 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 27783070  T
Q  257 acgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaa 348  Q
    |||||||||||||||||| |        || | |||||||||| ||||||| | | |||||| ||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||     
T  27783069 acgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctatggagatgatgtcgttggtagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtat 27782970  T
Q  349 tcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
      |||||||||||||||||||||||  |||| | |||||| ||||| |||||    
T  27782969 gtaacttgctggggatagaatcttgagagactccactgggaaaaacgccgtt 27782918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 88 - 379
Target Start/End: Original strand, 19449639 - 19449939
Alignment:
Q  88 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 187  Q
    |||| ||||| |||| |||||||| ||  ||||||| ||||||| |||| |||| |||||| | || ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  19449639 ctgaaattgacattgaaaatgcaatatacatggatgatataacagtttt-atcaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 19449737  T
Q  188 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca------- 279  Q
    | || ||||||  ||||  ||||||||||||    ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||           
T  19449738 gtaacgcatgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgcgctatatcacacattc 19449837  T
Q  280 -tagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc-taatcaacttgctggggatagaatcttggaag 377  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  19449838 ttagaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcgggtagcatatgcaacttgctggggatagaatctcggaag 19449937  T
Q  378 ac 379  Q
    ||    
T  19449938 ac 19449939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 155 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 40240471 - 40240245
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40240471 gtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacgttagagtattgg 40240372  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    ||||||||||||||||||||  | | |        || ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| |    
T  40240371 gcacgtagtggctcgtgctatgttacacattctcggagatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggt 40240272  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttg 373  Q
    |   ||||||||||||||||| |||||    
T  40240271 atgtaacttgctggggatagagtcttg 40240245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 155 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 23117723 - 23117481
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatga-tggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||  | |||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||    
T  23117723 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgtttgtaatgcatgactgtttgcga-tttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtatt 23117625  T
Q  253 gggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatag 344  Q
    |||||||||||||||||||||| || | |        |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  23117624 gggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggaggcgtatcggaaccatggctgagggcaggtag 23117525  T
Q  345 ctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggg 388  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  23117524 ctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctactggg 23117481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 150 - 379
Target Start/End: Original strand, 27427761 - 27428000
Alignment:
Q  150 gacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagag 248  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  |||||||||||||   | | | | || |||||||||| | |||    
T  27427761 gacacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggag 27427860  T
Q  249 tattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcag 340  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || | |        ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27427861 tattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctccttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcag 27427960  T
Q  341 atagctaat-caacttgctggggatagaatcttggaagac 379  Q
     ||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  27427961 gtagcttatgcaacttgctggggacagaatctcggaagac 27428000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 99 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 28889236 - 28888939
Alignment:
Q  99 attgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatga 198  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | ||| || |   ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  28889236 attggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggtgtgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgttatgcatga 28889138  T
Q  199 tggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcct 289  Q
      ||||    |||||||||||   ||| | | || ||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||| || | |        ||||||||    
T  28889137 ctgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagatgttggagtattgggcatgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcct 28889038  T
Q  290 ctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggg 388  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||    
T  28889037 ctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctactggg 28888939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 155 - 388
Target Start/End: Original strand, 31868102 - 31868344
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 253  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | |||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||    
T  31868102 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattg 31868201  T
Q  254 ggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc 345  Q
    ||||||||||||||||||||| || | |        |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| | |||     
T  31868202 ggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggctgagggccggtagg 31868301  T
Q  346 taatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggg 388  Q
    ||   |||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  31868302 tatgaaacttgatggggatagaatctcggaagactctactggg 31868344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 282 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 20844706 - 20844600
Alignment:
Q  282 gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagaccc 381  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  20844706 gaaatcatctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactc 20844607  T
Q  382 gactggg 388  Q
     ||||||    
T  20844606 tactggg 20844600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 155 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 12662418 - 12662175
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 253  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||    |||||| ||||   | ||| | || |||||||||| | |||| |||    
T  12662418 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtaaacacagttccacagagacagacaagacactggagtgttg 12662319  T
Q  254 ggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc 345  Q
    |||||| |||||||||||||| || | |        |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||     
T  12662318 ggcacgcagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagg 12662219  T
Q  346 taatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgactggg 388  Q
    ||  |||||||| || ||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  12662218 tatgcaacttgcttgaggatagaatctcggaagactctactggg 12662175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 88 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 20844908 - 20844802
Alignment:
Q  88 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 187  Q
    |||| ||||| |||| |||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||  || | ||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  20844908 ctgatattgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttc-attaaatgcataggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 20844810  T
Q  188 gaaatgca 195  Q
    | ||||||    
T  20844809 gtaatgca 20844802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 29)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 88 - 274
Target Start/End: Original strand, 24813636 - 24813822
Alignment:
Q  88 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 187  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24813636 ctgacattgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcatgaatgatt 24813735  T
Q  188 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 274  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24813736 gaaatgcatgatggttgacagtttgtagacacgacttcatggggaagacaagacattagagtattgggcacgtggtggctcgtgcta 24813822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 94 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 54840410 - 54840097
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | |||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  54840410 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 54840312  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 285  Q
    |||||  ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  54840311 catgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattggattattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 54840212  T
Q  286 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 385  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54840211 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacccgact 54840112  T
Q  386 ggggaaaaccccgtt 400  Q
    ||||||||| |||||    
T  54840111 ggggaaaacgccgtt 54840097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 94 - 400
Target Start/End: Original strand, 31119756 - 31120069
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  31119756 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 31119854  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 285  Q
    |||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  31119855 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 31119954  T
Q  286 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 385  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31119955 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgacc 31120054  T
Q  386 ggggaaaaccccgtt 400  Q
    ||||||||| |||||    
T  31120055 ggggaaaacgccgtt 31120069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 94 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 21976723 - 21976410
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  21976723 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 21976625  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 285  Q
    |||||  ||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  21976624 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagatatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 21976525  T
Q  286 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 385  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21976524 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgacc 21976425  T
Q  386 ggggaaaaccccgtt 400  Q
    ||||||||| |||||    
T  21976424 ggggaaaacgccgtt 21976410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 157 - 393
Target Start/End: Original strand, 20331743 - 20331987
Alignment:
Q  157 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 256  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20331743 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 20331842  T
Q  257 acgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaa 348  Q
    |||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||     
T  20331843 acgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatat 20331942  T
Q  349 tcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaa 393  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20331943 gcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaa 20331987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 155 - 393
Target Start/End: Original strand, 27156632 - 27156878
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27156632 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggagaagacaagacattagagtattgg 27156731  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  27156732 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagat 27156831  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaa 393  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27156832 atgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaa 27156878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 94 - 388
Target Start/End: Original strand, 14752762 - 14753063
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    ||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  14752762 ttgatattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 14752860  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 285  Q
    |||||  ||||  | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  14752861 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacgagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 14752960  T
Q  286 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 385  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  14752961 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 14753060  T
Q  386 ggg 388  Q
    |||    
T  14753061 ggg 14753063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 94 - 400
Target Start/End: Original strand, 40098879 - 40099192
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    ||||||||| |||||| | ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  40098879 ttgatattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 40098977  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 285  Q
    |||||  |||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  40098978 catgactgttggtattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 40099077  T
Q  286 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 385  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||  || | | |||    
T  40099078 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttgagaggctccact 40099177  T
Q  386 ggggaaaaccccgtt 400  Q
    ||||||||| |||||    
T  40099178 ggggaaaacgccgtt 40099192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 155 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 6576796 - 6576552
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6576796 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcatggggaagacaagacattagagtattgg 6576697  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctc-tttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc 345  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||      
T  6576696 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctcttttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaag 6576597  T
Q  346 taatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgggga 390  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  6576596 tatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactccactgggga 6576552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 94 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 5701548 - 5701256
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  5701548 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 5701450  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 285  Q
    |||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  5701449 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 5701350  T
Q  286 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 379  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5701349 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcagaaccaaggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagac 5701256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 93 - 379
Target Start/End: Original strand, 15379482 - 15379776
Alignment:
Q  93 attgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaat 192  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||| || | |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||    
T  15379482 attgacattggaaatgcaacatgtatgggtggtataatagtttt-attaaatgtatggacacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaacgcttgtaat 15379580  T
Q  193 gcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------ga 283  Q
    ||||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| |        ||    
T  15379581 gcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggaatattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttgga 15379680  T
Q  284 aatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 379  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15379681 aatcctctttggatataacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 15379776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 155 - 373
Target Start/End: Original strand, 18793949 - 18794175
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18793949 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 18794048  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| |    
T  18794049 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggt 18794148  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttg 373  Q
    |   ||||||||||||||||| |||||    
T  18794149 atgtaacttgctggggatagagtcttg 18794175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 155 - 388
Target Start/End: Original strand, 36323643 - 36323884
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36323643 gtaatgtgcatgattatgcatgcatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagaatattgg 36323742  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||      
T  36323743 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctccttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggc 36323842  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggg 388  Q
    |  |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  36323843 atgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactggg 36323884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 155 - 388
Target Start/End: Original strand, 36337852 - 36338093
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36337852 gtaatgtgcatgattatgcatgcatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagaatattgg 36337951  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||      
T  36337952 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctccttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggc 36338051  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggg 388  Q
    |  |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  36338052 atgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactggg 36338093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 155 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 39857574 - 39857342
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||   |||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39857574 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 39857475  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||| || ||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  39857474 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaattcttctgtggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggt 39857375  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 379  Q
    |  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39857374 atgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 39857342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 155 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 5012841 - 5012597
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||   |||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5012841 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcgtgactattggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtgttgg 5012742  T
Q  255 g-cacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc 345  Q
    | ||||||||||||||||||| || | |        |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||     
T  5012741 ggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccacggctgagggcaggtagg 5012642  T
Q  346 taatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgggga 390  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  5012641 tatgcaacttgctggggatagaatcttgagagacccgactgggga 5012597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 88 - 379
Target Start/End: Original strand, 15275865 - 15276164
Alignment:
Q  88 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 187  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||| | |||| || | |||||| | || ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  15275865 ctgaaattgacattggaaatgcaacatgtataggtggtataatagtttt-attaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 15275963  T
Q  188 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata----- 281  Q
    | |||||||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |         
T  15275964 gtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattc 15276063  T
Q  282 ---gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaaga 378  Q
       ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15276064 ttggaaatcctctttggagataacgttgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgacttgctggggacagaatctcggaaga 15276163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 95 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 15234838 - 15234546
Alignment:
Q  95 tgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgc 194  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | |||||| | ||  |  |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  15234838 tgatattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgtatgggcacatggtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 15234740  T
Q  195 atgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 285  Q
    ||||| || |  || ||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  15234739 atgattgtgggcagcttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 15234640  T
Q  286 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 379  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15234639 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatgactgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 15234546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 155 - 400
Target Start/End: Original strand, 33667107 - 33667360
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  33667107 gtaatatgcatgattatacatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagatcattgg 33667206  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  || |    
T  33667207 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggt 33667306  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||    
T  33667307 atgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 33667360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 156 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 1907227 - 1906984
Alignment:
Q  156 taatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgg 254  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||    
T  1907227 taatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggtagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgg 1907128  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| || | |        |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  1907127 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagataacgtcattgggagacgtatcggaaccatgactgagggcaggtagct 1907028  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgggga 390  Q
    |  |||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||    
T  1907027 atgcaacttgctggggatagaatctcggaaggctctactgggga 1906984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 155 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 24119601 - 24119359
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24119601 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 24119502  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctacatcata---------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc 345  Q
    |||||||||||||||||||| || | |          ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||   |||     
T  24119501 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggaaaatcctctttggagatgacatcgttgggagacgtatcgggaccaaggctgagggccagtaga 24119402  T
Q  346 taatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggg 388  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  24119401 tatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactggg 24119359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 94 - 388
Target Start/End: Original strand, 24585616 - 24585918
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  24585616 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 24585714  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 284  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||    
T  24585715 catgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 24585814  T
Q  285 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | ||    
T  24585815 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcagatagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctac 24585914  T
Q  385 tggg 388  Q
    ||||    
T  24585915 tggg 24585918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 155 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 14105503 - 14105250
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  || |  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14105503 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtgggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 14105404  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| || | |        || ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||  | ||| |    
T  14105403 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggagatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggtcggtaggt 14105304  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
    |   ||||||||||||||||| |||||  |||| | |||||||||||| |||||    
T  14105303 atgtaacttgctggggatagagtcttgagagactccactggggaaaacgccgtt 14105250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 155 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 30760723 - 30760470
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  30760723 gtaatatgcatgattatacatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagatcattgg 30760624  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  || |    
T  30760623 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctttttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggt 30760524  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||    
T  30760523 atgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 30760470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 155 - 388
Target Start/End: Original strand, 34182263 - 34182504
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34182263 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcaattcgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 34182362  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||| ||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | |||||    
T  34182363 gcacatagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcgggacctaggctgagggccggtagct 34182462  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggg 388  Q
    |  |||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||    
T  34182463 atgcaacttgctggggatagagtcttgggagactctactggg 34182504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 94 - 274
Target Start/End: Original strand, 24814547 - 24814726
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  24814547 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 24814645  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 274  Q
    |||||  ||||  | ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24814646 catgactgttggcattttgtaggcacgactttacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 24814726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 155 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 17019989 - 17019747
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 253  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||    |||||||||||   | ||| | || |||||||||| | |||| |||    
T  17019989 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagttccacagagacagacaagacactggagtgttg 17019890  T
Q  254 ggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc 345  Q
    |||||| |||||||||||||| || | |        |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||     
T  17019889 ggcacgcagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagt 17019790  T
Q  346 taatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggg 388  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  17019789 tatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactggg 17019747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 233 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 14671871 - 14671717
Alignment:
Q  233 agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaa 324  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| || | |        |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  14671871 agacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaa 14671772  T
Q  325 ccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 379  Q
    |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14671771 ccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 14671717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 155 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 14671950 - 14671910
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgca 195  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  14671950 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgca 14671910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 60)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 94 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 24335148 - 24334835
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  24335148 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 24335050  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 285  Q
    |||||  ||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  24335049 catgaccgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 24334950  T
Q  286 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 385  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24334949 tcctctttggggatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagaccccact 24334850  T
Q  386 ggggaaaaccccgtt 400  Q
    ||||||||| |||||    
T  24334849 ggggaaaacgccgtt 24334835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 88 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 18232170 - 18231851
Alignment:
Q  88 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 187  Q
    ||||| |||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || |  | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  18232170 ctgacgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 18232072  T
Q  188 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tca 279  Q
    | |||||||||   |||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |        ||     
T  18232071 gtaatgcatgactattggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattct 18231972  T
Q  280 tagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 379  Q
    | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  18231971 tggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagac 18231872  T
Q  380 ccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
    ||||| ||||||||| |||||    
T  18231871 ccgaccggggaaaacgccgtt 18231851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 94 - 400
Target Start/End: Original strand, 28109250 - 28109564
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||| | ||||||||||||||| |||  |||    
T  28109250 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatggttatgcatgtatgaatgcttgtgatg 28109348  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 285  Q
    |||||  |||   ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  28109349 catgactgttagcagtttgtaggcacgacttcaccgggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 28109448  T
Q  286 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagaccc-gac 384  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||    
T  28109449 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaaacaacttgctggagatagaatcttggaaaaccctgac 28109548  T
Q  385 tggggaaaaccccgtt 400  Q
    |||||||||| |||||    
T  28109549 tggggaaaacgccgtt 28109564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 94 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 10650042 - 10649730
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  10650042 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 10649944  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 285  Q
    |||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  10649943 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 10649844  T
Q  286 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 385  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  10649843 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttggaaga-cttact 10649745  T
Q  386 ggggaaaaccccgtt 400  Q
    ||||||||| |||||    
T  10649744 ggggaaaacgccgtt 10649730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 94 - 400
Target Start/End: Original strand, 17978238 - 17978551
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| || ||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  17978238 ttgacattggaactgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 17978336  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 285  Q
    |||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  17978337 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaaaacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 17978436  T
Q  286 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 385  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17978437 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgacc 17978536  T
Q  386 ggggaaaaccccgtt 400  Q
    ||||||||| |||||    
T  17978537 ggggaaaacgccgtt 17978551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 94 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 5020683 - 5020370
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  5020683 ttgatattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 5020585  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 285  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  5020584 catgactgttggcagtttgtagacacagtttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggaaa 5020485  T
Q  286 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 385  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||   |||    
T  5020484 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggggatagaatcttgagagactttact 5020385  T
Q  386 ggggaaaaccccgtt 400  Q
    ||||||||| |||||    
T  5020384 ggggaaaacgccgtt 5020370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 155 - 400
Target Start/End: Original strand, 6536090 - 6536343
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  6536090 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagaatattgg 6536189  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  6536190 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttgaagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagct 6536289  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||    
T  6536290 atgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 6536343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 155 - 388
Target Start/End: Original strand, 11103731 - 11103972
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11103731 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcacggggaagacaagacattagagtattgg 11103830  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  11103831 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggt 11103930  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggg 388  Q
    |  |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  11103931 atgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactggg 11103972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 157 - 393
Target Start/End: Original strand, 5589705 - 5589949
Alignment:
Q  157 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 256  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5589705 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 5589804  T
Q  257 acgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaa 348  Q
    |||||||| ||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||     
T  5589805 acgtagtgactcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtaggtat 5589904  T
Q  349 tcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaa 393  Q
     ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5589905 gcaacttgctagagatagaatcttggaagacctgactggggaaaa 5589949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 157 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 5717965 - 5717721
Alignment:
Q  157 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 256  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5717965 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacggcttcacggggaaggcaagacattagagtattgggc 5717866  T
Q  257 acgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaa 348  Q
    |||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||     
T  5717865 acgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatat 5717766  T
Q  349 tcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaa 393  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5717765 gcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaa 5717721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 157 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 5728875 - 5728631
Alignment:
Q  157 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 256  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5728875 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacggcttcacggggaaggcaagacattagagtattgggc 5728776  T
Q  257 acgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaa 348  Q
    |||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||     
T  5728775 acgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatat 5728676  T
Q  349 tcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaa 393  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5728675 gcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaa 5728631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 157 - 393
Target Start/End: Original strand, 5763493 - 5763737
Alignment:
Q  157 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 256  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5763493 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacggcttcacggggaaggcaagacattagagtattgggc 5763592  T
Q  257 acgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaa 348  Q
    |||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||     
T  5763593 acgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatat 5763692  T
Q  349 tcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaa 393  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5763693 gcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaa 5763737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 88 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 28346149 - 28345830
Alignment:
Q  88 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 187  Q
    |||| ||||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||| || | ||| || |  | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  28346149 ctgatattgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttt-attaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 28346051  T
Q  188 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta--------catca 279  Q
    | |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | ||     
T  28346050 gtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacaccttct 28345951  T
Q  280 tagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 379  Q
    | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||  || |    
T  28345950 tggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttgagaggc 28345851  T
Q  380 ccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
     | |||||||||||| |||||    
T  28345850 tccactggggaaaacgccgtt 28345830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 157 - 393
Target Start/End: Original strand, 29658316 - 29658560
Alignment:
Q  157 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 256  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29658316 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcgcgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 29658415  T
Q  257 acgtagtggctcgtgc-----taca---tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaa 348  Q
    ||||||||||||||||     ||||   || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||| ||| ||     
T  29658416 acgtagtggctcgtgctatgttacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgttggaaccatagctgagggcaggtagatat 29658515  T
Q  349 tcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaa 393  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29658516 gcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaa 29658560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 155 - 388
Target Start/End: Original strand, 31029613 - 31029854
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31029613 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggtacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 31029712  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||    
T  31029713 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccacggctgagggcaggtagct 31029812  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggg 388  Q
    |  |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  31029813 atgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactggg 31029854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 155 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 32446042 - 32445801
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32446042 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 32445943  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgc-----taca---tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    ||||||||||||||||||     ||||   || | |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  32445942 gcacgtagtggctcgtgctatgttacacattcttggaaatcctctttggtgatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagct 32445843  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggg 388  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  32445842 atgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctactggg 32445801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 94 - 379
Target Start/End: Original strand, 16617776 - 16618070
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  16617776 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatggtataacagtttt-atcaaatgtatggacacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgaaatg 16617874  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaa 284  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||        | |||    
T  16617875 catgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtagctcgtgctatatcacacattcttggaa 16617974  T
Q  285 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc-taatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 379  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16617975 atcctctttggagatatcgtcgttgggagacgcatcggaaccatggctgagggcgggtagcatatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 16618070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 94 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 22041381 - 22041087
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  22041381 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatggtataacagtttt-atcaaatgtatggacacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgaaatg 22041283  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaa 284  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||        | |||    
T  22041282 catgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtagctcgtgctatatcacacattcttggaa 22041183  T
Q  285 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc-taatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 379  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22041182 atcctctttggagatatcgtcgttgggagacgcatcggaaccatggctgagggcgggtagcatatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 22041087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 94 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 32297603 - 32297297
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  32297603 ttgatattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 32297505  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 285  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |        || |    
T  32297504 catgactgttggcagtttgtagacacagtttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggaga 32297405  T
Q  286 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 385  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  32297404 tcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgcaactcgctggagatagaatcttggaagacctgact 32297305  T
Q  386 ggggaaaa 393  Q
    ||||||||    
T  32297304 ggggaaaa 32297297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 156 - 390
Target Start/End: Original strand, 4340047 - 4340289
Alignment:
Q  156 taatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattggg 255  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4340047 taatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattggg 4340146  T
Q  256 cacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagcta 347  Q
    ||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||| ||    
T  4340147 cacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggtaggta 4340246  T
Q  348 atcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgggga 390  Q
      ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  4340247 tgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctactgggga 4340289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 94 - 388
Target Start/End: Original strand, 18285666 - 18285967
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    ||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||    
T  18285666 ttgatattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattacgcatgtatgaatgcttgtaatg 18285764  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 285  Q
    |||||  ||||  | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  18285765 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacgagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 18285864  T
Q  286 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 385  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  18285865 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 18285964  T
Q  386 ggg 388  Q
    |||    
T  18285965 ggg 18285967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 94 - 388
Target Start/End: Original strand, 18300967 - 18301268
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    ||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||    
T  18300967 ttgatattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattacgcatgtatgaatgcttgtaatg 18301065  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 285  Q
    |||||  ||||  | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  18301066 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacgagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 18301165  T
Q  286 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 385  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  18301166 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 18301265  T
Q  386 ggg 388  Q
    |||    
T  18301266 ggg 18301268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 155 - 400
Target Start/End: Original strand, 22864211 - 22864464
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  22864211 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcatggggaagacaagacgtcagagtattgg 22864310  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  22864311 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttgaagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggt 22864410  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||| |||||    
T  22864411 atgcaacttgctggggatagaatcttgggagactttactggggaaaacgccgtt 22864464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 155 - 400
Target Start/End: Original strand, 22879270 - 22879523
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  22879270 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcatggggaagacaagacgtcagagtattgg 22879369  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  22879370 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttgaagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggt 22879469  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||| |||||    
T  22879470 atgcaacttgctggggatagaatcttgggagactttactggggaaaacgccgtt 22879523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 155 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 4630671 - 4630430
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4630671 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 4630572  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgc-----taca---tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    ||||||||||||||||||     ||||   || | |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||    
T  4630571 gcacgtagtggctcgtgctatgttacacattcttggaaatcctctttggtgatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcatgtagct 4630472  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggg 388  Q
    |  |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  4630471 atgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactggg 4630430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 88 - 400
Target Start/End: Original strand, 31957737 - 31958056
Alignment:
Q  88 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 187  Q
    |||| ||||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||| || | ||| || |  | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  31957737 ctgatattgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttt-attaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 31957835  T
Q  188 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tca 279  Q
    | |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |        ||     
T  31957836 gtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattct 31957935  T
Q  280 tagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 379  Q
    | |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||  || |    
T  31957936 tggaaatcctctttggagatgacgttgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttgagaggc 31958035  T
Q  380 ccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
     | |||||||||||| |||||    
T  31958036 tccactggggaaaacaccgtt 31958056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 157 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 47030366 - 47030114
Alignment:
Q  157 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 256  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  47030366 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagaatattgggc 47030267  T
Q  257 acgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaa 348  Q
    |||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  47030266 acgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttgaagatgacgtcgttgggagacgcatcggaaccatggctgagggcaggtagctat 47030167  T
Q  349 tcaac-ttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
     |||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  47030166 gcaactttgctggagatagaatcttggaagactccactggggaaaacgccgtt 47030114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 155 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 4423808 - 4423582
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4423808 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttataggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 4423709  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |    
T  4423708 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggt 4423609  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttg 373  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||    
T  4423608 atgcaacttgctggggatagaatcttg 4423582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 155 - 400
Target Start/End: Original strand, 17970227 - 17970481
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||   |||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17970227 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcactttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 17970326  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| || ||    
T  17970327 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacatattggaaccatggctgagggcaggtaact 17970426  T
Q  347 aatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||  |||| | || ||||||||| |||||    
T  17970427 aaacaacttgcttggggatagaatcttgagagactccaccggggaaaacgccgtt 17970481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 94 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 18249690 - 18249377
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  18249690 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 18249592  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 285  Q
    |||||  ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  18249591 catgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 18249492  T
Q  286 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 385  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   ||||||||||||||||| |||||  |||| | ||     
T  18249491 tcctctatggagatgacgtcgttgggggacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggatagagtcttgagagactccacc 18249392  T
Q  386 ggggaaaaccccgtt 400  Q
    ||||||||| |||||    
T  18249391 ggggaaaacgccgtt 18249377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 155 - 400
Target Start/End: Original strand, 5602660 - 5602913
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5602660 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 5602759  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  5602760 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagat 5602859  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||  || | | |||||||||||| |||||    
T  5602860 atgcaacttgctggagatagaatcttgagaggctccactggggaaaacgccgtt 5602913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 155 - 400
Target Start/End: Original strand, 20570203 - 20570456
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20570203 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggggagacaagacattagagtattgg 20570302  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| | | ||| |    
T  20570303 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgaggaccggtaggt 20570402  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
    |   |||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||| |||||    
T  20570403 atgtaacttgctggggatagaatcttgagagactccactggggaaaacgccgtt 20570456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 170 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 5473864 - 5473638
Alignment:
Q  170 atgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcg 269  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5473864 atgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcg 5473765  T
Q  270 tgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggg 361  Q
    ||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| ||||||    
T  5473764 tgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaactcgctggg 5473665  T
Q  362 gatagaatcttggaagacccgactggg 388  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||    
T  5473664 gatagaatctcggaagactctactggg 5473638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 155 - 421
Target Start/End: Original strand, 16404139 - 16404413
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16404139 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 16404238  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | |||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||| ||| |    
T  16404239 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctatggagatgacgtcgttgggggacgtatcggagccaaggctgagggcaggtaggt 16404338  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgttatgatgtccatctcattgctg 421  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||  |||||  || ||||||||| ||||| || ||  ||||||| |||||    
T  16404339 atgcaacttgctggggatagaatcttgagagacctcaccggggaaaacgccgttgtgctgggcatctcagtgctg 16404413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 155 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 48472822 - 48472590
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48472822 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 48472723  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | |||||    
T  48472722 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagct 48472623  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 379  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48472622 atgcaacttgctggggatagaatcttgggagac 48472590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 155 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 21681632 - 21681406
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21681632 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 21681533  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| || | |        || ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| |    
T  21681532 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggagatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggt 21681433  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttg 373  Q
    |   ||||||||||||||||| |||||    
T  21681432 atgtaacttgctggggatagagtcttg 21681406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 155 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 10403064 - 10402811
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10403064 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 10402965  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    ||||||||||||||||||||  | | |        || ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||| | ||| |    
T  10402964 gcacgtagtggctcgtgctatgttacacattctcggagatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgggggccggtaggt 10402865  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
    |   ||||||||||||||||| |||||  |||||| || ||||||||| |||||    
T  10402864 atgtaacttgctggggatagagtcttgagagaccccaccggggaaaacgccgtt 10402811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 155 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 51788934 - 51788681
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  51788934 gtaatatgcatgattatacatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagatcattgg 51788835  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  || |    
T  51788834 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggt 51788735  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||    
T  51788734 atgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 51788681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 155 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 20072925 - 20072693
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20072925 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacatcacggggaagacaagacatcagagtattgg 20072826  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | |||||    
T  20072825 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagct 20072726  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 379  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20072725 atgcaacttgctggggatagaatcttgggagac 20072693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 94 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 15368217 - 15367923
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||| | || ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  15368217 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttt-atcagatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 15368119  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 284  Q
    |||||  ||||  ||||||||||||    ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |        |||    
T  15368118 catgactgttggcagtttgtagacatagtttcccagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgcgctacatcacacattcttggaa 15368019  T
Q  285 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc-taatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 379  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15368018 atcctctttggagataacgtcattgggagacgtatcggaaccatggttgagggcgggtagcatatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 15367923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 94 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 19701368 - 19701064
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  |||| ||| || | | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  19701368 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-atcaaatgcatgggcttgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 19701270  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 284  Q
     ||||  ||||  |||||||||||||   ||| |   || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||    
T  19701269 tatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcatagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaa 19701170  T
Q  285 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 384  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  19701169 atcttctttggagataacgccattgggagacgtatcggaaccatgactgagggcaggtagctatacaacttgctggggatagaatctcggaagactctac 19701070  T
Q  385 tgggga 390  Q
    ||||||    
T  19701069 tgggga 19701064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 155 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 28028183 - 28027930
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28028183 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcatgacttcacggggaagacaagacattagagtaatgg 28028084  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    ||| ||||||||||||||||||        || | ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||| |    
T  28028083 gcaagtagtggctcgtgctacattacacattcttggaaatcctcttcggagatgacgtcgttgggagacgtgtcgggacctaggctgagggccggtaggt 28027984  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||  ||||   |||||||||||| |||||    
T  28027983 atgcaacttgctggggatagaatcttgagagactttactggggaaaacgccgtt 28027930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 94 - 388
Target Start/End: Original strand, 29142063 - 29142365
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| ||| |||||||| ||| ||| ||||||| |||  || | |||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  29142063 ttgacattggaaacgcaacatgcatgaatgatataacagtttc-attaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 29142161  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 284  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||    
T  29142162 catgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaa 29142261  T
Q  285 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 384  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | ||    
T  29142262 atcctcttcggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctac 29142361  T
Q  385 tggg 388  Q
    ||||    
T  29142362 tggg 29142365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 94 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 35887711 - 35887409
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  35887711 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 35887613  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcataga--------a 284  Q
    |||||  ||||| |||||||||||||   ||| | | || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || | | |        |    
T  35887612 catgactgttgacagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattgaagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctgaaa 35887513  T
Q  285 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||| | ||    
T  35887512 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagagtcttgggagactctac 35887413  T
Q  385 tggg 388  Q
    ||||    
T  35887412 tggg 35887409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 155 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 8218537 - 8218284
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  8218537 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaacgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaaggcgttagagtattgg 8218438  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||| ||||||||||||| |        || | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| |    
T  8218437 gcacgtggtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggt 8218338  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
    |   |||||||||| |||||| |||||  |||| | |||||||||||| |||||    
T  8218337 atgtaacttgctggagatagagtcttgagagactccactggggaaaacgccgtt 8218284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 94 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 4728577 - 4728275
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||    
T  4728577 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatg 4728479  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 284  Q
    |||||  ||||    |||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||    
T  4728478 catgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 4728379  T
Q  285 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||    
T  4728378 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctac 4728279  T
Q  385 tggg 388  Q
    ||||    
T  4728278 tggg 4728275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 94 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 5659085 - 5658783
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  5659085 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 5658987  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 284  Q
    |||||  ||||  || | ||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||    
T  5658986 catgactgttggcagctggtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacaccttcctggaa 5658887  T
Q  285 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | ||    
T  5658886 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctac 5658787  T
Q  385 tggg 388  Q
    ||||    
T  5658786 tggg 5658783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 94 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 6208846 - 6208544
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||    
T  6208846 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatg 6208748  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 284  Q
    |||||  ||||    |||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||    
T  6208747 catgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 6208648  T
Q  285 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||    
T  6208647 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctac 6208548  T
Q  385 tggg 388  Q
    ||||    
T  6208547 tggg 6208544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 94 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 18058219 - 18057917
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  18058219 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 18058121  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 284  Q
    |||||  ||||    |||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||    
T  18058120 catgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 18058021  T
Q  285 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | ||    
T  18058020 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctac 18057921  T
Q  385 tggg 388  Q
    ||||    
T  18057920 tggg 18057917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 94 - 388
Target Start/End: Original strand, 4789940 - 4790242
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||| | ||| ||||||||||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  4789940 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatggtataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 4790038  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 284  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || | |        |||    
T  4790039 catgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaa 4790138  T
Q  285 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 384  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||  |||||||||||||| |||| | ||    
T  4790139 atcctcttcggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctaaggatagaatcttgggagactctac 4790238  T
Q  385 tggg 388  Q
    ||||    
T  4790239 tggg 4790242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 94 - 388
Target Start/End: Original strand, 8282769 - 8283071
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  8282769 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 8282867  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 284  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||   | | | | || |||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| || | |        |||    
T  8282868 catgactgttggcagtttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctcgtgctatattacacattcctggaa 8282967  T
Q  285 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  8282968 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctac 8283067  T
Q  385 tggg 388  Q
    ||||    
T  8283068 tggg 8283071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 94 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 16423158 - 16422854
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    ||||||| | |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  16423158 ttgatatcggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attatatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 16423060  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 284  Q
    |||||  ||||   ||||||||||||   | | | | || ||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||||| || | |        |||    
T  16423059 catgactgttggcggtttgtagacacagttccgcagagacagacaaggcactggagtattgggtacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaa 16422960  T
Q  285 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 384  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||    
T  16422959 atcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagttatgcaacttgcaggggatagaatctcggaagactctac 16422860  T
Q  385 tgggga 390  Q
    ||||||    
T  16422859 tgggga 16422854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 155 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 16599525 - 16599406
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||   |||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16599525 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 16599426  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgcta 274  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16599425 gcacgtagtggctcgtgcta 16599406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 94 - 388
Target Start/End: Original strand, 15886026 - 15886328
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  15886026 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 15886124  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 284  Q
    |||||  ||||    ||||||||||    | | | | || |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| || | |        |||    
T  15886125 catgactgttggcgatttgtagacatagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaa 15886224  T
Q  285 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 384  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  15886225 atcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatctcggaagactctac 15886324  T
Q  385 tggg 388  Q
    ||||    
T  15886325 tggg 15886328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 94 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 18337575 - 18337273
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| || ||||||||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||    
T  18337575 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatacaacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctcgtaatg 18337477  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 284  Q
    |||||  ||||    ||||||||||    ||| | | || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||        |||    
T  18337476 catgactgttggcgatttgtagacatagtttcgcagagacagacaggacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattatactttcctggaa 18337377  T
Q  285 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||    
T  18337376 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccctggctgagggcaggtagctacgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctac 18337277  T
Q  385 tggg 388  Q
    ||||    
T  18337276 tggg 18337273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 155 - 388
Target Start/End: Original strand, 22380949 - 22381191
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 253  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||||||  ||||    ||||||||||    ||| | | || ||||| |||||| ||||||||    
T  22380949 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctcgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacatagtttcgcagagacagacaggacattggagtattg 22381048  T
Q  254 ggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc 345  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||        |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22381049 ggcacgtagtggctcgtgctatattatactttcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagc 22381148  T
Q  346 taatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggg 388  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||    
T  22381149 tatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctactggg 22381191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 94 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 7080201 - 7080022
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||  || | ||| || | || |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  7080201 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggcacgtaataggcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 7080103  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 274  Q
    |||||  ||||  | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7080102 catgaccgttggcaattcgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 7080022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 94 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 4690626 - 4690324
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  4690626 ttgatattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 4690528  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 284  Q
    |||||  ||||    |||||||||||   | | | | || |||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| || | |        |||    
T  4690527 catgactgttggcgatttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 4690428  T
Q  285 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | ||    
T  4690427 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctac 4690328  T
Q  385 tggg 388  Q
    ||||    
T  4690327 tggg 4690324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 94 - 371
Target Start/End: Original strand, 15734425 - 15734710
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||  || | ||| |||| ||  ||||||||||||  ||||||||||||||  ||| ||||    
T  15734425 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttc-attaaatgcataggcacataatatgcatgactatgcatgtatgaattcttgtaatg 15734523  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 284  Q
    |||||  ||||    |||||||||||   |||   | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||    
T  15734524 catgactgttggcgatttgtagacacagtttcgtagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 15734623  T
Q  285 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatct 371  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15734624 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggttgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 15734710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 284 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 7079981 - 7079877
Alignment:
Q  284 aatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccga 383  Q
    |||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |    
T  7079981 aatcttctctggggataacgtcgttgggagacgtgtcggaaccaaggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactcta 7079882  T
Q  384 ctggg 388  Q
    |||||    
T  7079881 ctggg 7079877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 16)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 99 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 51645229 - 51644921
Alignment:
Q  99 attgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatga 198  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  51645229 attggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 51645131  T
Q  199 tggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctc 290  Q
      ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||    
T  51645130 ctgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctc 51645031  T
Q  291 tttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgggga 390  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||    
T  51645030 tttgaagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactgggga 51644931  T
Q  391 aaaccccgtt 400  Q
    |||| |||||    
T  51644930 aaacgccgtt 51644921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 155 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 10952044 - 10951791
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10952044 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgactttacggggaagacaagacattagagtattgg 10951945  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||    
T  10951944 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccacggctgagggcaggtagct 10951845  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||  || | | |||||||||||| |||||    
T  10951844 aaacaacttgctggagatagaatcttgagaggctccactggggaaaacgccgtt 10951791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 157 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 10969593 - 10969369
Alignment:
Q  157 aatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 256  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10969593 aatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggc 10969494  T
Q  257 acgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaa 348  Q
    |||||||| ||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||     
T  10969493 acgtagtgactcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtat 10969394  T
Q  349 tcaacttgctggggatagaatcttg 373  Q
     | ||||||||||||||||||||||    
T  10969393 gccacttgctggggatagaatcttg 10969369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 155 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 3648099 - 3647846
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3648099 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 3648000  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    ||||||||||||||||||||  | | |        || ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  3647999 gcacgtagtggctcgtgctatgttacacattctcggagatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggt 3647900  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
    |   ||||||||||||||||| |||||  |||| | || ||||||||| |||||    
T  3647899 atgtaacttgctggggatagagtcttgagagactccaccggggaaaacgccgtt 3647846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 155 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 28592033 - 28591780
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28592033 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagaatattgg 28591934  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| |    
T  28591933 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggctggtaggt 28591834  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
    |   |||||||| |||||||| |||||  |||| | |||||||||||| |||||    
T  28591833 atgtaacttgctagggatagagtcttgagagactccactggggaaaacgccgtt 28591780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 94 - 390
Target Start/End: Original strand, 16201276 - 16201580
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| |||| |||||| |  | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  16201276 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttt-atcaaatgtatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 16201374  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 284  Q
    |||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || | |        |||    
T  16201375 catgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcatgctatattacacattcctggaa 16201474  T
Q  285 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 384  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||    
T  16201475 atcctctttggagataacaccgttgggagacgtatcggaaccatgactgagggcaggtagctatgcaacttgctgggggtagaatctcggaagactctac 16201574  T
Q  385 tgggga 390  Q
    ||||||    
T  16201575 tgggga 16201580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 155 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 28156657 - 28156425
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28156657 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 28156558  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | |||||    
T  28156557 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagct 28156458  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 379  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28156457 atgcaacttgctggggatagaatcttgggagac 28156425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 155 - 379
Target Start/End: Original strand, 41786640 - 41786872
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  41786640 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacgtcagagtattgg 41786739  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  || |    
T  41786740 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccacggctgagggcaggcaggt 41786839  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 379  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  41786840 atgcaacttgctggagatagaatcttgaaagac 41786872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 99 - 371
Target Start/End: Original strand, 20333667 - 20333947
Alignment:
Q  99 attgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatga 198  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | ||| || | || ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  20333667 attggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 20333765  T
Q  199 tggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcct 289  Q
      ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||||||    
T  20333766 ctgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcct 20333865  T
Q  290 ctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatct 371  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20333866 ctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 20333947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 94 - 388
Target Start/End: Original strand, 14692162 - 14692464
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  14692162 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 14692260  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 284  Q
    ||||   ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||    
T  14692261 catggctgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 14692360  T
Q  285 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | ||    
T  14692361 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagagcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctac 14692460  T
Q  385 tggg 388  Q
    ||||    
T  14692461 tggg 14692464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 94 - 388
Target Start/End: Original strand, 14694844 - 14695146
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  14694844 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 14694942  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 284  Q
    ||||   ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||    
T  14694943 catggctgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 14695042  T
Q  285 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | ||    
T  14695043 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagagcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctac 14695142  T
Q  385 tggg 388  Q
    ||||    
T  14695143 tggg 14695146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 94 - 388
Target Start/End: Original strand, 14697528 - 14697830
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  14697528 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 14697626  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 284  Q
    ||||   ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||    
T  14697627 catggctgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 14697726  T
Q  285 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | ||    
T  14697727 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagagcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctac 14697826  T
Q  385 tggg 388  Q
    ||||    
T  14697827 tggg 14697830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 94 - 388
Target Start/End: Original strand, 14700209 - 14700511
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  14700209 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 14700307  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 284  Q
    ||||   ||||  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||    
T  14700308 catggctgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 14700407  T
Q  285 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | ||    
T  14700408 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagagcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctac 14700507  T
Q  385 tggg 388  Q
    ||||    
T  14700508 tggg 14700511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 99 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 20467792 - 20467504
Alignment:
Q  99 attgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatga 198  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| || | |||||| | || ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  20467792 attggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttt-attaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 20467694  T
Q  199 tggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcct 289  Q
      ||||  || ||||||||||   |||   | || ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || | |        ||||||||    
T  20467693 ctgttggcagcttgtagacaccgtttcgtagagacagacaaggcattggagtattggccacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcct 20467594  T
Q  290 ctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 379  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20467593 ctttggagataacgtcgttgggagacatatcggaaccatggctgagggtaggtagctatgtaacttgctggggatagaatctcggaagac 20467504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 235 - 388
Target Start/End: Original strand, 21891136 - 21891297
Alignment:
Q  235 acaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaacc 326  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| || | |        |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  21891136 acaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaacc 21891235  T
Q  327 atggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggg 388  Q
    |||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  21891236 atggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatctcggaagactctactggg 21891297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 190 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 13769631 - 13769558
Alignment:
Q  190 aatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagt 263  Q
    |||||||||  ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13769631 aatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaatacattagagtattgggcacgtagt 13769558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 116; Significance: 7e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 155 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 14892 - 14636
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14892 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 14793  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  14792 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagct 14693  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgttatg 403  Q
    |  |||||||||||  || |||||| ||||| |   |||||||||||| ||||||||    
T  14692 atacaacttgctggaaattgaatctcggaaggctttactggggaaaacgccgttatg 14636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 155 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 2607 - 2361
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2607 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagcattgg 2508  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||  ||||||||  ||||||||||| ||| |    
T  2507 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgttgttgggagacgtgtcggaaccaaagctgagggcaggtagat 2408  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaa 393  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2407 atacaacttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaa 2361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 94 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 13062 - 12769
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||| ||| |||| || ||||||| |||| |||| |||||| | || ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  13062 ttgacattggaaatgcaatatgcatgggtgatataacagtttt-atcaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 12964  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 284  Q
     ||||  ||||  |||| ||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |        |||    
T  12963 tatgactgttggcagttagtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacattacacatccctggaa 12864  T
Q  285 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 379  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||   |||||| || ||||||||||| |||||||    
T  12863 atcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccacggccgagggcaggtagctatgaaacttgttgcggatagaatctcggaagac 12769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 94 - 379
Target Start/End: Original strand, 8187 - 8479
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  || | ||| || |  | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  8187 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttc-attaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 8285  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 285  Q
    |||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  8286 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 8385  T
Q  286 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 379  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8386 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcagaaccaaggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagac 8479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 111; Significance: 7e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 155 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 10869 - 10615
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  10869 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaagcacgacttcacagggaagacaagacattagaatattgg 10770  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca---------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc 345  Q
    |||||||||||||||||||| |         || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  10769 gcacgtagtggctcgtgctatattacacatttcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaaccatggctgaggacaggtagc 10670  T
Q  346 taatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
    ||  |||||||||||  |||||||||||||||||   |||||||||||| |||||    
T  10669 tatgcaacttgctggaaatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 10615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 94 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 34283 - 33981
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  34283 ttgatattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 34185  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 284  Q
    |||||  ||||    |||||||||||   | ||| | || |||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| || | |        |||    
T  34184 catgactgttggcgatttgtagacacagttccacagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctcgtgctatattacacattcctggaa 34085  T
Q  285 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 384  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||| || |||| | ||    
T  34084 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgaggatagaatctcgggagactctac 33985  T
Q  385 tggg 388  Q
    ||||    
T  33984 tggg 33981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 111; Significance: 7e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 104 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 28293 - 28012
Alignment:
Q  104 aaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggtt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||| | || ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  |||    
T  28293 aaatgcaacatgtatggatggtataacagtttt-attaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtt 28195  T
Q  204 gatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta-----cat-catagaaatcctctttgga 296  Q
    |  |||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||     ||| | | |||||||||||||||    
T  28194 ggcagtttgtagacacagtttcgctgagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgttatatcacacattcttggaaatcctctttgga 28095  T
Q  297 gataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 379  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28094 gataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatataacttgctggggatagaatctcggaagac 28012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 94 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 13026 - 12725
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  13026 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 12928  T
Q  194 catgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 285  Q
    |||||  ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  12927 catgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 12828  T
Q  286 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 385  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||| | |||    
T  12827 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagagtcttgggagactctact 12728  T
Q  386 ggg 388  Q
    |||    
T  12727 ggg 12725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 155 - 400
Target Start/End: Original strand, 2483 - 2736
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2483 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaagacatcagagtattgg 2582  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    |||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  2583 gcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagat 2682  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
    |  ||||||||||| ||||||||||||  || | | |||||||||||| |||||    
T  2683 atgcaacttgctggagatagaatcttgagaggctccactggggaaaacgccgtt 2736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 18582 - 18505
Alignment:
Q  323 aaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||  || | | |||||||||||| |||||    
T  18582 aaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttgagaggctccactggggaaaacgccgtt 18505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 88 - 379
Target Start/End: Original strand, 25809 - 26108
Alignment:
Q  88 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 187  Q
    |||| ||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||| | |||| |||| |||||| | ||  || |||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  25809 ctgaaattgacattggaaatgaaagatgtatgggtggtataatagtttt-atcaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 25907  T
Q  188 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata----- 281  Q
    | |||||||||  ||||  |||||||||||||   ||| | | || | |||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||| |         
T  25908 gtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacacacaaaacattggactattgggcacgtagtggctcatgctatatcacacattc 26007  T
Q  282 ---gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaaga 378  Q
       |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  26008 ttggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaagcaacttgctggggaaagaatctcggaaga 26107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 89; Significance: 9e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 155 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 16526 - 16273
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacggggaagacaagacattagagtattgg 254  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  16526 gtaatatgcatgattgtgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaagacaaaacatcagagtattgg 16427  T
Q  255 gcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagct 346  Q
    ||||||||||||||||| || |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| |    
T  16426 gcacgtagtggctcgtgttatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggt 16327  T
Q  347 aatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaaccccgtt 400  Q
    |   |||| |||||||||||| |||||  |||| | || ||||||||| |||||    
T  16326 atgtaactggctggggatagagtcttgagagactccaccggggaaaacgccgtt 16273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 89; Significance: 9e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 95 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 782 - 490
Alignment:
Q  95 tgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgc 194  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | |||||| | ||  |  |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  782 tgatattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgtatgggcactttgtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 684  T
Q  195 atgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 285  Q
    ||||| || |  || ||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || | |        ||||    
T  683 atgattgtgggcagcttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtgtctcgtgctatattacacattcccggaaa 584  T
Q  286 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 379  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  583 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcagaaccatggttgagggcaggtagctatgcaacctgctggggatagaatctcggaagac 490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 88 - 388
Target Start/End: Original strand, 24213 - 24521
Alignment:
Q  88 ctgacattgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgatt 187  Q
    |||| ||||| |||| |||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||| || | ||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  24213 ctgatattgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttt-attaaatgcatgggcatgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 24311  T
Q  188 gaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata----- 281  Q
    | |||||| ||  | ||    ||||||||| |   | | ||| || |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| || | |         
T  24312 gtaatgcacgactgctggcgatttgtagacgcagttccgcggagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattc 24411  T
Q  282 ---gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaaga 378  Q
       ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24412 ctggaaattctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaaga 24511  T
Q  379 cccgactggg 388  Q
    | | ||||||    
T  24512 ctctactggg 24521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0792 (Bit Score: 74; Significance: 8e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0792
Description:

Target: scaffold0792; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 155 - 388
Target Start/End: Original strand, 3921 - 4163
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 253  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||    |||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||    
T  3921 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattg 4020  T
Q  254 ggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc 345  Q
    |||||| |||||||||||||| || | |        || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  4021 ggcacgcagtggctcgtgctatattacacattcttggacatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctaagggcaggtagc 4120  T
Q  346 taatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggg 388  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||    
T  4121 tatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctactggg 4163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 155 - 388
Target Start/End: Original strand, 8966 - 9209
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatgatggttgatagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattg 253  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||    |||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||    
T  8966 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattg 9065  T
Q  254 ggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc 345  Q
    ||||||||||||||||||||| || | |        || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  9066 ggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggacatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagc 9165  T
Q  346 taatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgactggg 388  Q
     |  |||||||| || ||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  9166 catgcaacttgcttgaggatagaatctcggaagactctactggg 9209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 283 - 388
Target Start/End: Original strand, 40064 - 40171
Alignment:
Q  283 aaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctga-gggcagatagctaat-caacttgctggggatagaatcttggaagacc 380  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||     
T  40064 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgaggggcaggtagttaatgcaacttgctggggatagaatctcggaagact 40163  T
Q  381 cgactggg 388  Q
    | ||||||    
T  40164 ctactggg 40171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 155 - 198
Target Start/End: Original strand, 39922 - 39965
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatga 198  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  39922 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 39965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0685 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0685
Description:

Target: scaffold0685; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 198
Target Start/End: Original strand, 1309 - 1412
Alignment:
Q  94 ttgatattgcaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatg 193  Q
    |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||  || | ||| || | || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  1309 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 1407  T
Q  194 catga 198  Q
    |||||    
T  1408 catga 1412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 332 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 6807 - 6751
Alignment:
Q  332 tgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggg 388  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  6807 tgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactggg 6751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0477 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0477
Description:

Target: scaffold0477; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 155 - 198
Target Start/End: Original strand, 13281 - 13324
Alignment:
Q  155 gtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattgaaatgcatga 198  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  13281 gtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 13324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University