View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8650_low_21 (Length: 277)

Name: NF8650_low_21
Description: NF8650
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8650_low_21
NF8650_low_21
[»] chr6 (48 HSPs)
chr6 (2-277)||(27272634-27272912)
chr6 (2-277)||(22934934-22935206)
chr6 (2-277)||(23857379-23857651)
chr6 (110-277)||(24863692-24863859)
chr6 (110-277)||(26918355-26918522)
chr6 (110-277)||(27000048-27000215)
chr6 (108-277)||(13299005-13299174)
chr6 (108-277)||(15424371-15424540)
chr6 (108-277)||(24304672-24304841)
chr6 (108-277)||(26988974-26989143)
chr6 (110-277)||(16749829-16749996)
chr6 (2-127)||(27629913-27630038)
chr6 (110-277)||(29572988-29573155)
chr6 (113-277)||(4757742-4757906)
chr6 (110-277)||(30558070-30558237)
chr6 (1-273)||(20160570-20160839)
chr6 (1-273)||(22171992-22172261)
chr6 (2-277)||(4525156-4525428)
chr6 (140-276)||(3696086-3696222)
chr6 (110-277)||(16944081-16944248)
chr6 (1-277)||(29549344-29549617)
chr6 (146-277)||(4545829-4545960)
chr6 (138-277)||(27044390-27044529)
chr6 (113-277)||(27360046-27360210)
chr6 (113-277)||(27450389-27450553)
chr6 (113-277)||(27485107-27485271)
chr6 (146-277)||(4724188-4724319)
chr6 (138-277)||(4773009-4773148)
chr6 (138-277)||(26116464-26116603)
chr6 (146-277)||(28207465-28207596)
chr6 (113-277)||(26777669-26777836)
chr6 (113-277)||(34463400-34463567)
chr6 (113-277)||(29501393-29501557)
chr6 (1-259)||(22477345-22477603)
chr6 (140-277)||(16674144-16674281)
chr6 (113-277)||(27007705-27007869)
chr6 (110-277)||(14143339-14143506)
chr6 (110-277)||(26787919-26788086)
chr6 (110-277)||(27196292-27196459)
chr6 (110-277)||(27252781-27252948)
chr6 (135-273)||(27290428-27290566)
chr6 (1-273)||(28162526-28162795)
chr6 (110-259)||(22457006-22457155)
chr6 (1-273)||(13522131-13522400)
chr6 (1-273)||(33374314-33374583)
chr6 (1-273)||(8892368-8892637)
chr6 (1-273)||(8903603-8903872)
chr6 (137-213)||(27629818-27629894)
[»] chr7 (33 HSPs)
chr7 (1-277)||(16503377-16503653)
chr7 (1-277)||(16518413-16518689)
chr7 (116-277)||(10916865-10917026)
chr7 (110-277)||(2154552-2154719)
chr7 (2-277)||(11424773-11425048)
chr7 (2-277)||(5127863-5128138)
chr7 (110-277)||(4145120-4145287)
chr7 (110-277)||(9618630-9618797)
chr7 (110-277)||(16736457-16736624)
chr7 (110-277)||(16751511-16751678)
chr7 (110-277)||(17523511-17523678)
chr7 (110-277)||(17529537-17529704)
chr7 (110-277)||(26275091-26275258)
chr7 (110-277)||(26319866-26320033)
chr7 (110-276)||(45387322-45387488)
chr7 (111-277)||(5147337-5147503)
chr7 (110-276)||(26669912-26670078)
chr7 (1-277)||(26435127-26435403)
chr7 (1-259)||(16041196-16041451)
chr7 (110-277)||(24592538-24592705)
chr7 (138-277)||(31564387-31564526)
chr7 (110-276)||(26537868-26538037)
chr7 (113-277)||(31124902-31125066)
chr7 (140-277)||(3445315-3445452)
chr7 (1-258)||(16450014-16450268)
chr7 (192-277)||(11441633-11441718)
chr7 (110-277)||(2109002-2109169)
chr7 (110-277)||(26484673-26484840)
chr7 (110-277)||(2775338-2775505)
chr7 (134-277)||(39211020-39211163)
chr7 (1-273)||(31088465-31088734)
chr7 (1-273)||(45733333-45733602)
chr7 (110-237)||(18540778-18540905)
[»] chr4 (23 HSPs)
chr4 (2-277)||(17013885-17014160)
chr4 (108-277)||(14665009-14665178)
chr4 (116-277)||(24592425-24592586)
chr4 (1-277)||(14763415-14763691)
chr4 (110-276)||(27163429-27163595)
chr4 (113-277)||(5005869-5006033)
chr4 (2-277)||(6569738-6570013)
chr4 (110-277)||(40105749-40105916)
chr4 (110-277)||(14098534-14098701)
chr4 (110-277)||(31126629-31126796)
chr4 (1-273)||(15227757-15228026)
chr4 (138-276)||(18800725-18800863)
chr4 (1-258)||(1900144-1900398)
chr4 (138-277)||(54833408-54833547)
chr4 (1-273)||(15285043-15285312)
chr4 (140-277)||(30753777-30753914)
chr4 (138-277)||(36344626-36344765)
chr4 (113-277)||(33673909-33674076)
chr4 (110-173)||(21969694-21969757)
chr4 (116-277)||(14235636-14235797)
chr4 (1-273)||(24460720-24460989)
chr4 (140-237)||(39850661-39850758)
chr4 (2-83)||(5005755-5005836)
[»] chr8 (22 HSPs)
chr8 (108-277)||(2137329-2137498)
chr8 (108-277)||(27608975-27609144)
chr8 (110-277)||(19688076-19688243)
chr8 (108-277)||(16277530-16277699)
chr8 (1-277)||(16283318-16283594)
chr8 (110-277)||(19208430-19208597)
chr8 (2-276)||(31489821-31490095)
chr8 (116-277)||(14557608-14557769)
chr8 (110-277)||(28362025-28362192)
chr8 (113-277)||(19674422-19674586)
chr8 (110-277)||(31354502-31354669)
chr8 (110-277)||(33258701-33258868)
chr8 (137-273)||(18710591-18710727)
chr8 (113-277)||(3329577-3329741)
chr8 (138-277)||(19286468-19286607)
chr8 (138-277)||(12092794-12092933)
chr8 (113-259)||(29829303-29829449)
chr8 (1-273)||(44562973-44563242)
chr8 (1-273)||(9354494-9354763)
chr8 (1-273)||(19659113-19659382)
chr8 (113-204)||(19518280-19518374)
chr8 (1-78)||(18710455-18710532)
[»] chr5 (49 HSPs)
chr5 (108-277)||(23752458-23752627)
chr5 (108-277)||(24688165-24688334)
chr5 (110-277)||(33777474-33777641)
chr5 (108-277)||(11549339-11549508)
chr5 (108-277)||(23717996-23718165)
chr5 (108-273)||(22999126-22999291)
chr5 (116-277)||(30934626-30934787)
chr5 (2-277)||(24969903-24970172)
chr5 (110-277)||(15658768-15658935)
chr5 (110-277)||(26480379-26480546)
chr5 (3-277)||(41674589-41674863)
chr5 (110-277)||(2511038-2511205)
chr5 (110-277)||(5637897-5638064)
chr5 (110-277)||(8665483-8665650)
chr5 (110-277)||(9317438-9317605)
chr5 (110-277)||(12132142-12132309)
chr5 (110-277)||(15758865-15759032)
chr5 (110-276)||(30152005-30152171)
chr5 (2-273)||(9548555-9548826)
chr5 (110-276)||(30168456-30168622)
chr5 (113-277)||(6874295-6874459)
chr5 (1-277)||(23892084-23892360)
chr5 (110-277)||(18375420-18375587)
chr5 (1-273)||(22888351-22888620)
chr5 (138-277)||(18500738-18500877)
chr5 (138-277)||(28649250-28649389)
chr5 (110-277)||(33516343-33516510)
chr5 (137-277)||(34616532-34616672)
chr5 (113-277)||(37770995-37771159)
chr5 (110-277)||(29967074-29967241)
chr5 (110-277)||(30029402-30029569)
chr5 (113-277)||(31431430-31431594)
chr5 (113-277)||(37754970-37755134)
chr5 (1-259)||(25198910-25199165)
chr5 (113-277)||(37671491-37671655)
chr5 (113-277)||(37358651-37358815)
chr5 (113-277)||(28959794-28959961)
chr5 (113-277)||(31826415-31826582)
chr5 (110-277)||(43078236-43078406)
chr5 (116-277)||(29889090-29889251)
chr5 (2-277)||(32599480-32599752)
chr5 (113-277)||(3789531-3789695)
chr5 (1-277)||(11325675-11325948)
chr5 (1-273)||(13184660-13184929)
chr5 (1-273)||(33877128-33877397)
chr5 (110-237)||(40473597-40473727)
chr5 (1-273)||(13440506-13440775)
chr5 (140-237)||(24681457-24681554)
chr5 (140-237)||(24723984-24724081)
[»] chr2 (44 HSPs)
chr2 (108-277)||(23128666-23128835)
chr2 (110-277)||(27434544-27434711)
chr2 (108-277)||(28882186-28882355)
chr2 (108-277)||(12655514-12655683)
chr2 (108-277)||(20837890-20838059)
chr2 (110-277)||(34286328-34286495)
chr2 (110-277)||(34291388-34291555)
chr2 (113-277)||(11635286-11635450)
chr2 (110-277)||(34279423-34279590)
chr2 (113-277)||(11641475-11641639)
chr2 (110-277)||(21677282-21677449)
chr2 (110-277)||(22926128-22926295)
chr2 (110-276)||(34861654-34861820)
chr2 (110-276)||(37686010-37686176)
chr2 (110-276)||(37701275-37701441)
chr2 (110-276)||(32049772-32049938)
chr2 (110-276)||(37925467-37925633)
chr2 (1-273)||(21703268-21703537)
chr2 (110-277)||(31876255-31876422)
chr2 (110-276)||(19416600-19416766)
chr2 (110-277)||(16829438-16829605)
chr2 (110-277)||(16891876-16892043)
chr2 (1-277)||(31891428-31891701)
chr2 (1-273)||(27118556-27118825)
chr2 (2-237)||(13936684-13936919)
chr2 (113-277)||(39890048-39890215)
chr2 (140-277)||(40233515-40233652)
chr2 (8-273)||(19456525-19456787)
chr2 (138-277)||(37375163-37375302)
chr2 (1-273)||(34303407-34303676)
chr2 (146-277)||(260853-260984)
chr2 (1-273)||(34156879-34157148)
chr2 (1-273)||(3784522-3784791)
chr2 (1-273)||(16163467-16163736)
chr2 (140-237)||(12716742-12716839)
chr2 (140-237)||(27777226-27777323)
chr2 (140-237)||(27803711-27803808)
chr2 (140-237)||(27816984-27817081)
chr2 (140-237)||(39051962-39052059)
chr2 (113-204)||(9350155-9350249)
chr2 (2-83)||(11635483-11635564)
chr2 (2-83)||(11641672-11641753)
chr2 (140-237)||(12586814-12586911)
chr2 (1-66)||(37375026-37375091)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (110-277)||(40180-40347)
scaffold0089 (108-277)||(47096-47265)
scaffold0089 (110-277)||(29741-29908)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (108-277)||(27268-27437)
[»] chr3 (59 HSPs)
chr3 (108-277)||(18051199-18051368)
chr3 (110-277)||(4796805-4796972)
chr3 (108-277)||(4721568-4721737)
chr3 (116-277)||(8301419-8301580)
chr3 (108-277)||(18330606-18330775)
chr3 (108-277)||(6192253-6192422)
chr3 (108-277)||(15741246-15741415)
chr3 (110-277)||(15892858-15893025)
chr3 (110-277)||(29148907-29149074)
chr3 (116-277)||(8295917-8296078)
chr3 (108-277)||(35880703-35880872)
chr3 (1-277)||(18277204-18277480)
chr3 (1-277)||(18292505-18292781)
chr3 (1-277)||(18307806-18308082)
chr3 (110-277)||(5609474-5609641)
chr3 (110-277)||(5713166-5713333)
chr3 (110-277)||(5724076-5724243)
chr3 (110-277)||(5757234-5757401)
chr3 (110-277)||(5768125-5768292)
chr3 (110-277)||(28339241-28339408)
chr3 (110-277)||(31964625-31964792)
chr3 (110-277)||(50134223-50134390)
chr3 (110-276)||(7996501-7996667)
chr3 (110-276)||(10643009-10643175)
chr3 (110-276)||(47023392-47023558)
chr3 (113-277)||(4416861-4417025)
chr3 (113-277)||(28116106-28116270)
chr3 (110-277)||(7073151-7073318)
chr3 (108-277)||(10396070-10396239)
chr3 (137-277)||(22387730-22387870)
chr3 (110-277)||(17985108-17985275)
chr3 (108-277)||(21674630-21674799)
chr3 (110-277)||(18225130-18225297)
chr3 (110-276)||(24328098-24328264)
chr3 (110-276)||(5013651-5013817)
chr3 (113-277)||(6542614-6542778)
chr3 (113-277)||(18242681-18242845)
chr3 (134-273)||(18530351-18530490)
chr3 (1-273)||(16626662-16626931)
chr3 (113-277)||(36997229-36997396)
chr3 (113-277)||(5596509-5596673)
chr3 (2-277)||(5466816-5467091)
chr3 (182-277)||(51782034-51782129)
chr3 (137-277)||(22871008-22871148)
chr3 (137-277)||(22886067-22886207)
chr3 (137-277)||(28021241-28021381)
chr3 (137-277)||(4346839-4346979)
chr3 (182-277)||(51797123-51797219)
chr3 (146-277)||(8211713-8211844)
chr3 (110-277)||(32292691-32292858)
chr3 (140-277)||(48465896-48466033)
chr3 (110-277)||(31034269-31034436)
chr3 (1-277)||(17993936-17994209)
chr3 (140-277)||(11110501-11110638)
chr3 (1-273)||(4625777-4626046)
chr3 (140-237)||(20577039-20577136)
chr3 (113-237)||(29665162-29665289)
chr3 (1-273)||(5652220-5652489)
chr3 (2-83)||(28116303-28116384)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (110-277)||(240-408)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (110-277)||(7350-7517)
[»] chr1 (9 HSPs)
chr1 (2-277)||(41793419-41793694)
chr1 (110-276)||(28584958-28585124)
chr1 (110-277)||(10962647-10962814)
chr1 (110-277)||(51638195-51638362)
chr1 (59-273)||(16208146-16208354)
chr1 (1-273)||(20340450-20340719)
chr1 (134-273)||(20461082-20461221)
chr1 (110-277)||(28151839-28152006)
chr1 (1-78)||(20460976-20461053)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (110-276)||(9178-9344)
scaffold0159 (110-276)||(19993-20159)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (110-277)||(15041-15208)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (110-277)||(26312-26480)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (108-277)||(30429-30597)
scaffold0124 (119-273)||(20375-20529)
scaffold0124 (1-78)||(20281-20358)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (146-277)||(7963-8094)
[»] scaffold2173 (2 HSPs)
scaffold2173 (53-127)||(1-75)
scaffold2173 (137-213)||(94-170)
[»] scaffold0415 (2 HSPs)
scaffold0415 (138-277)||(6015-6157)
scaffold0415 (202-273)||(2032-2103)
[»] scaffold0336 (2 HSPs)
scaffold0336 (137-277)||(9571-9711)
scaffold0336 (2-66)||(8102-8166)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (134-277)||(46919-47072)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (1-273)||(2773-3042)
[»] scaffold0558 (1 HSPs)
scaffold0558 (116-273)||(143-300)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 181; Significance: 7e-98; HSPs: 48)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 27272912 - 27272634
Alignment:
Q  2 tctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacagc 101  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27272912 tctcaacatccattctacccgccattttactattagtatcctttgccatcaggaccacctcaagtacctgtgaatgctattgtgcagcagaagccacaac 27272813  T
Q  102 aaccatcagttca---acaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactcca 198  Q
    ||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  27272812 aaccaccagttcagcaacaacaacaacagaatcagcaagtcagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactctactcca 27272713  T
Q  199 tagagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
     ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27272712 gagagggcattgtacaaccagacagggtaagcccccacctgatccgtcgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 27272634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 22935206 - 22934934
Alignment:
Q  2 tctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacagc 101  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||| | || | ||||||||||||||| ||||| ||||  || |||| |  ||| |    
T  22935206 tctcaacatcccttctttccgccattctatcatcagtatcccttgccaccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaac 22935107  T
Q  102 aaccatcagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatag 201  Q
    |     | |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  22935106 agttgccggttcaacaacaacaa---aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatag 22935010  T
Q  202 agggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22935009 aggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 22934934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 23857651 - 23857379
Alignment:
Q  2 tctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacagc 101  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||| | || | ||||||||||||||| ||||| ||||  || |||| |  ||| |    
T  23857651 tctcaacatcccttctttccgccattctatcatcagtatcccttgccaccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaac 23857552  T
Q  102 aaccatcagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatag 201  Q
    |     | |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  23857551 agttgccggttcaacaacaacaa---aatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatag 23857455  T
Q  202 agggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23857454 aggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 23857379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Original strand, 24863692 - 24863859
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  24863692 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcatt 24863791  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  24863792 gtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgt 24863859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Original strand, 26918355 - 26918522
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26918355 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcatt 26918454  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  26918455 gtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 26918522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Original strand, 27000048 - 27000215
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  27000048 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcatt 27000147  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  27000148 gtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgt 27000215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 108 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 13299174 - 13299005
Alignment:
Q  108 cagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggca 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  13299174 cagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggca 13299075  T
Q  208 ttgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  13299074 ttgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgt 13299005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 108 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 15424540 - 15424371
Alignment:
Q  108 cagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggca 207  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15424540 cagttgaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggca 15424441  T
Q  208 ttgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  15424440 ttgtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgt 15424371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 108 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 24304841 - 24304672
Alignment:
Q  108 cagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggca 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  24304841 cagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggca 24304742  T
Q  208 ttgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  24304741 ttgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgt 24304672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 108 - 277
Target Start/End: Original strand, 26988974 - 26989143
Alignment:
Q  108 cagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggca 207  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  26988974 cagttcaacaacatcaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggaca 26989073  T
Q  208 ttgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  26989074 ttgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgt 26989143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Original strand, 16749829 - 16749996
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16749829 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcatt 16749928  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  16749929 gtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 16749996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 27630038 - 27629913
Alignment:
Q  2 tctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacagc 101  Q
    ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  27630038 tctcagcatccattcttcccaccgttttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcaacagaagccacaac 27629939  T
Q  102 aaccatcagttcaacaacaacaacag 127  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  27629938 aaccaccagttcagcaacaacaacag 27629913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Original strand, 29572988 - 29573155
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||| || |    
T  29572988 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacact 29573087  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    | || || ||  |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  29573088 gcacgactaggcagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 29573155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 113 - 277
Target Start/End: Original strand, 4757742 - 4757906
Alignment:
Q  113 caacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgta 212  Q
    ||||||||||| ||| | ||| |  ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||    
T  4757742 caacaacaacagcagcagcagtatactagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacattgta 4757841  T
Q  213 caaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  4757842 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 4757906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 30558237 - 30558070
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||  | ||||  || |||||||| ||||| ||||    
T  30558237 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcatt 30558138  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || || ||||||    
T  30558137 gtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgt 30558070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 20160570 - 20160839
Alignment:
Q  1 ctctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacag 100  Q
    |||||||||||| ||||  || |||||||||||||| |||||| | ||| | || | ||||||||||||||| ||||| ||||  ||||| || |  ||     
T  20160570 ctctcaacatcctttctatccaccattttaccatcagtatcctctaccaccgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaaaacagcaa 20160669  T
Q  101 caaccatcagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccata 200  Q
    || ||| ||| ||||||||||||||||   || ||| |||||||||| || ||||| ||||||||||| |||| |||||| || |  |||||||| || |    
T  20160670 cagccaccagctcaacaacaacaacag---caacaaactagacctacctttcctccgataccgatgttatatgctgagttactcccaactttacttcaca 20160766  T
Q  201 gagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaa 273  Q
    |||||||||| ||||||||  | |||||||| |||||||||||||| | |||||||||| | ||||| |||||    
T  20160767 gagggcattgcacaaccaggcaaggcaagcctccacctgatccgttacctcccaggttctgttccgatctcaa 20160839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 22172261 - 22171992
Alignment:
Q  1 ctctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacag 100  Q
    |||||||||||| ||||  || |||||||||||||| |||||| | ||| | || | ||||||||||||||| ||||| ||||  ||||| || |  ||     
T  22172261 ctctcaacatcctttctatccaccattttaccatcagtatcctctaccaccgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaaaacagcaa 22172162  T
Q  101 caaccatcagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccata 200  Q
    || ||| ||| ||||||||||||||||   || ||| |||||||||| || ||||| ||||||||||| |||| |||||| || |  |||||||| || |    
T  22172161 cagccaccagctcaacaacaacaacag---caacaaactagacctacctttcctccgataccgatgttatatgctgagttactcccaactttacttcaca 22172065  T
Q  201 gagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaa 273  Q
    |||||||||| ||||||||  | |||||||| |||||||||||||| | |||||||||| | ||||| |||||    
T  22172064 gagggcattgcacaaccaggcaaggcaagcctccacctgatccgttacctcccaggttctgttccgatctcaa 22171992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 277
Target Start/End: Original strand, 4525156 - 4525428
Alignment:
Q  2 tctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacagc 101  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||| |||| | ||||||||| || || ||||| || |  || |||   | ||| |    
T  4525156 tctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtatcctttgccaccaggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtacaacatc 4525255  T
Q  102 aaccatcagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatag 201  Q
    ||||  |||||||||| || || |||   ||| |  ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||    
T  4525256 aaccgccagttcaacagcagcagcag---cagtatactagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagag 4525352  T
Q  202 agggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||| ||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || | |||||||    
T  4525353 aggacattgcacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcccaaatgt 4525428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 140 - 276
Target Start/End: Original strand, 3696086 - 3696222
Alignment:
Q  140 agacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctg 239  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||    
T  3696086 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctg 3696185  T
Q  240 atccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatg 276  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||    
T  3696186 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatg 3696222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 16944248 - 16944081
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| || || || |||||||| ||||||||||||||||  ||  | ||||  ||| ||||||| ||||| ||||    
T  16944248 gttcaacagcaacaacaaaatcagcaagccaggccaaccttccctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcatt 16944149  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  16944148 gtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 16944081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 29549344 - 29549617
Alignment:
Q  1 ctctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacag 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||| | || | ||||||||| || || ||||| || |  || |||  || |||     
T  29549344 ctctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaacat 29549443  T
Q  101 caaccatcagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccata 200  Q
    |||||  ||||||||||||| || |||   ||  | |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||| | ||||  ||| ||||||| |    
T  29549444 caaccgccagttcaacaacagcagcag---caatacgctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccaga 29549540  T
Q  201 gagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  29549541 gagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 29549617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 146 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 4545960 - 4545829
Alignment:
Q  146 actttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgt 245  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  4545960 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 4545861  T
Q  246 tgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  4545860 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 4545829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 138 - 277
Target Start/End: Original strand, 27044390 - 27044529
Alignment:
Q  138 ctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacc 237  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||| | ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  27044390 ctagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacc 27044489  T
Q  238 tgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||| ||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  27044490 tgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 27044529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 113 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 27360210 - 27360046
Alignment:
Q  113 caacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgta 212  Q
    ||||||||||||||| | ||| |  ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||  ||  | ||||  ||| ||||||| ||||| |||||||    
T  27360210 caacaacaacaacagcagcagtatactagaccaacttttcctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggacattgta 27360111  T
Q  213 caaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  27360110 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 27360046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 113 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 27450553 - 27450389
Alignment:
Q  113 caacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgta 212  Q
    ||||||||||||||| | ||| |  ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||  ||  | ||||  ||| ||||||| ||||| |||||||    
T  27450553 caacaacaacaacagcagcagtatactagaccaacttttcctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggacattgta 27450454  T
Q  213 caaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  27450453 caactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 27450389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 113 - 277
Target Start/End: Original strand, 27485107 - 27485271
Alignment:
Q  113 caacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgta 212  Q
    ||||||||||||||| | ||| |  ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||  | ||||  ||||||||||| ||||| |||||||    
T  27485107 caacaacaacaacagcagcagtatactagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacattgta 27485206  T
Q  213 caaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  27485207 caactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 27485271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 146 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 4724319 - 4724188
Alignment:
Q  146 actttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgt 245  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||    
T  4724319 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacaaggcaagccaccacctgatccgt 4724220  T
Q  246 tgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  4724219 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 4724188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 138 - 277
Target Start/End: Original strand, 4773009 - 4773148
Alignment:
Q  138 ctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacc 237  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||| || || || || ||| |||| |||||||||||    
T  4773009 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacc 4773108  T
Q  238 tgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  4773109 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 4773148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 138 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 26116603 - 26116464
Alignment:
Q  138 ctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacc 237  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||  ||  | |||| |||||||||||| ||||| |||||||| || ||| |||||||||| |||||    
T  26116603 ctagaccaacttttcctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccgactttactccagagaggtcattgtacgactagacagggcaagccaccacc 26116504  T
Q  238 tgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  26116503 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 26116464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 146 - 277
Target Start/End: Original strand, 28207465 - 28207596
Alignment:
Q  146 actttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgt 245  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||    
T  28207465 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacaaggcaagccaccacctgatccgt 28207564  T
Q  246 tgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  28207565 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 28207596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 113 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 26777836 - 26777669
Alignment:
Q  113 caacaacaacaacagaatcagcaa---gctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||   |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||  ||  | ||||  ||| ||||||| ||||| ||||    
T  26777836 caacaacaacagcagcagcagcaatatgctagaccaaccttccctcctataccgatgttgtatgccgaacttcttccaactctactccagagaggtcatt 26777737  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  26777736 gtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 26777669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 113 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 34463567 - 34463400
Alignment:
Q  113 caacaacaacaacagaatcagcaa---gctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||| | ||||||    | ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||| || |    
T  34463567 caacaacaacaacagcagcagcaatataccagaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacact 34463468  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    | || || ||| | || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  34463467 gcacgactagacaaggaaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 34463400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 113 - 277
Target Start/End: Original strand, 29501393 - 29501557
Alignment:
Q  113 caacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgta 212  Q
    ||||||||||| ||| | ||| |  ||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||  ||  | ||||  ||| ||||||| ||||| |||||||    
T  29501393 caacaacaacagcagcagcagtatactagaccaaccttccctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgta 29501492  T
Q  213 caaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  29501493 caactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 29501557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 22477603 - 22477345
Alignment:
Q  1 ctctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacag 100  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||| || ||| | |||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||| ||||  || || | || |||     
T  22477603 ctctcagcatcccttctttccaccattctatcattagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgcaattgctcaacaaatgcaacaa 22477504  T
Q  101 caaccatcagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccata 200  Q
    ||  || | ||||||||||||| |||  | || |||||||||||||| || ||||  ||||| ||| ||||||  ||||| || | |||| |||| |  |    
T  22477503 cagtcaccggttcaacaacaacgacaacagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgatgtatgccgagttactcccgactctacttctca 22477404  T
Q  201 gagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttc 259  Q
     | |||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22477403 tatggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttc 22477345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 140 - 277
Target Start/End: Original strand, 16674144 - 16674281
Alignment:
Q  140 agacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctg 239  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||| | ||||  ||||||||||| ||||| || || || || ||| |||| |||||||||||||    
T  16674144 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctg 16674243  T
Q  240 atccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  16674244 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 16674281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 113 - 277
Target Start/End: Original strand, 27007705 - 27007869
Alignment:
Q  113 caacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgta 212  Q
    ||||||||||| ||| | ||| |  ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||  | ||||  ||||||||||| ||||| || || |    
T  27007705 caacaacaacagcagcagcagtatactagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgca 27007804  T
Q  213 caaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    | || ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  27007805 cgactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 27007869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 14143506 - 14143339
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||| ||||||| |||| | || |||||||||||||| || ||||  ||||| ||| | |||| ||||||||| | |||| |||| |  |||||||| |    
T  14143506 gttcaccaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcact 14143407  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    |  ||| |||| |||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  14143406 gcgcaatcagacaggggaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgt 14143339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Original strand, 26787919 - 26788086
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||| ||||||| |||| | || |||||||||||||| || ||||  ||||| ||| | |||| ||||||||| | |||| |||| |  |||||||| |    
T  26787919 gttcaccaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcact 26788018  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    |  ||| |||| |||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  26788019 gcgcaatcagacaggggaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgt 26788086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Original strand, 27196292 - 27196459
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||| ||||||| |||| | || |||||||||||||| || ||||  ||||| ||| | |||| ||||||||| | |||| |||| |  |||||||| |    
T  27196292 gttcaccaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcact 27196391  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    |  ||| |||| |||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  27196392 gcgcaatcagacaggggaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgt 27196459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 27252948 - 27252781
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||| ||||||| |||| | || |||||||||||||| || ||||  ||||| ||| | |||| ||||||||| | |||| |||| |  |||||||| |    
T  27252948 gttcaccaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcact 27252849  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    |  ||| |||| |||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  27252848 gcgcaatcagacaggggaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgt 27252781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 27290566 - 27290428
Alignment:
Q  135 aagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgtacaaccagatagggcaagccccc 234  Q
    ||||||||||||| || ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| | |||| |||| |  |||||||| |  ||||||||| |||||||||| ||    
T  27290566 aagctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactacacaaccagacagggcaagcctcc 27290467  T
Q  235 acctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaa 273  Q
    |||||||||||| | ||||| |||| | || ||||||||    
T  27290466 acctgatccgttacctcccaagttccgttctgacctcaa 27290428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 28162526 - 28162795
Alignment:
Q  1 ctctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacag 100  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||  | || ||||  | || |||     
T  28162526 ctctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggacaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaa 28162625  T
Q  101 caaccatcagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccata 200  Q
    || ||  ||| |||||||| ||| |||   || |||||||||||||| || ||||  ||||| ||||| |||| ||| || || | |||| |||| |  |    
T  28162626 cagcctccagctcaacaacgacagcag---caacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctca 28162722  T
Q  201 gagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaa 273  Q
     |||||| || ||||||||| |||||||||| |||| |||||| | || ||||| |||| | || ||||||||    
T  28162723 aagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacttgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaa 28162795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 110 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 22457155 - 22457006
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||| |||  | || |||||||||||||| || ||||  ||||| ||| ||||||  ||||| || | |||| |||| |  | | |||| |    
T  22457155 gttcaacaacaacgacaacagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgatgtatgccgagttactcccgactctacttctcataaggcact 22457056  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttc 259  Q
    | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22457055 gcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttc 22457006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 13522400 - 13522131
Alignment:
Q  1 ctctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacag 100  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||  | || ||||  | || |||     
T  13522400 ctctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaa 13522301  T
Q  101 caaccatcagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccata 200  Q
    || ||  ||| |||||||| ||| |||   || || ||||||||||| || ||||  ||||| ||||| |||| ||| || || | |||| |||| |  |    
T  13522300 cagcctccagctcaacaacgacagcag---caacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctca 13522204  T
Q  201 gagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaa 273  Q
     |||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||| | || ||||| |||| | || ||||||||    
T  13522203 aagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaa 13522131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 33374583 - 33374314
Alignment:
Q  1 ctctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacag 100  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||  | || ||||  | || |||     
T  33374583 ctctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaa 33374484  T
Q  101 caaccatcagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccata 200  Q
    || ||  ||| |||||||| ||| |||   || || ||||||||||| || ||||  ||||| ||||| |||| ||| || || | |||| |||| |  |    
T  33374483 cagcctccagctcaacaacgacagcag---caacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctca 33374387  T
Q  201 gagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaa 273  Q
     |||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||| | || ||||| |||| | || ||||||||    
T  33374386 aagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaa 33374314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 8892637 - 8892368
Alignment:
Q  1 ctctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacag 100  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||| |||||||||| || | ||||||||||||||| |||||  | || ||||  | || |||     
T  8892637 ctctcagcatcccttctttccaccattatatcatcagtattctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaa 8892538  T
Q  101 caaccatcagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccata 200  Q
    || ||  ||| |||||||| ||| ||| | |||   ||||||||||| || ||||  ||||| ||||| |||| ||| || || | |||| |||| |  |    
T  8892537 cagcctccagctcaacaacgacagcagcaacag---gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctca 8892441  T
Q  201 gagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaa 273  Q
     |||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||| | || ||||| |||| | || ||||||||    
T  8892440 aagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaa 8892368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 8903872 - 8903603
Alignment:
Q  1 ctctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacag 100  Q
    |||||| ||||  ||||| || ||||| || ||||| ||| |||||||||| || | ||||||||||||||| |||||  | || ||||  | || |||     
T  8903872 ctctcagcatctcttctttccaccattctatcatcagtattctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaa 8903773  T
Q  101 caaccatcagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccata 200  Q
    || ||  ||| |||||||| ||| ||| | |||   ||||||||||| || ||||  ||||| ||||| |||| ||| || || | |||| |||| |  |    
T  8903772 cagcctccagctcaacaacgacagcagcaacag---gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctca 8903676  T
Q  201 gagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaa 273  Q
     |||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||| | || ||||| |||| | || ||||||||    
T  8903675 aagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaa 8903603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 27629894 - 27629818
Alignment:
Q  137 gctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgtac 213  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| || ||||  || ||||| || ||||| ||||||||    
T  27629894 gctaggcctacttttcctccaatcccgatgttgtatgctgatttacttccaacattacttcagagaggtcattgtac 27629818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 33)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 16503653 - 16503377
Alignment:
Q  1 ctctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacag 100  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||| | || | ||||||||||||||| ||||| ||||  || |||| |  |||     
T  16503653 ctctcagcatcctttctttccgccattctatcatcagtatcccttgccaccgggtcaacctcaggtacccgttaatgcaattgctcaacagatgaaacaa 16503554  T
Q  101 caaccatcagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccata 200  Q
    || |   | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16503553 cagctgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccata 16503454  T
Q  201 gagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  16503453 gagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgt 16503377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 16518689 - 16518413
Alignment:
Q  1 ctctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacag 100  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||| | || | ||||||||||||||| ||||| ||||  || |||| |  |||     
T  16518689 ctctcagcatcctttctttccgccattctatcatcagtatcccttgccaccgggtcaacctcaggtacccgttaatgcaattgctcaacagatgaaacaa 16518590  T
Q  101 caaccatcagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccata 200  Q
    || |   | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16518589 cagctgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccata 16518490  T
Q  201 gagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  16518489 gagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgt 16518413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 116 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 10917026 - 10916865
Alignment:
Q  116 caacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgtacaa 215  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10917026 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaa 10916927  T
Q  216 ccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  10916926 ccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgt 10916865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Original strand, 2154552 - 2154719
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  2154552 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacatactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcatt 2154651  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  2154652 gtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgt 2154719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 2 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 11425048 - 11424773
Alignment:
Q  2 tctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacagc 101  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||| | || | |||||| |||||||| ||||| || |  || |||| |  ||| |    
T  11425048 tctcagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaac 11424949  T
Q  102 aaccatcagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatag 201  Q
    |     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  11424948 agttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatag 11424849  T
Q  202 agggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  11424848 agggcattgcacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgt 11424773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 277
Target Start/End: Original strand, 5127863 - 5128138
Alignment:
Q  2 tctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacagc 101  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||| | || | |||||| |||||||| ||||| ||||  || |||| |  ||| |    
T  5127863 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtatcctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattgctcaacagatgaaacaac 5127962  T
Q  102 aaccatcagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatag 201  Q
    |     | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  5127963 agttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctacttttcctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatag 5128062  T
Q  202 agggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  5128063 agggcattgtacaaccagacagggtaagcccccacctaatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 5128138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 4145287 - 4145120
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  4145287 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcatt 4145188  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  4145187 gtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 4145120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Original strand, 9618630 - 9618797
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  9618630 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcatt 9618729  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  9618730 gtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 9618797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 16736624 - 16736457
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  16736624 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcatt 16736525  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  16736524 gtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 16736457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 16751678 - 16751511
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  16751678 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcatt 16751579  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  16751578 gtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 16751511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Original strand, 17523511 - 17523678
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  17523511 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcatt 17523610  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  17523611 gtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 17523678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 17529704 - 17529537
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  17529704 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcatt 17529605  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  17529604 gtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 17529537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 26275258 - 26275091
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  26275258 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcatt 26275159  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  26275158 gtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 26275091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 26320033 - 26319866
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  26320033 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcatt 26319934  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  26319933 gtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 26319866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 110 - 276
Target Start/End: Original strand, 45387322 - 45387488
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  45387322 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcatt 45387421  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatg 276  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||    
T  45387422 gtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatg 45387488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 111 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 5147503 - 5147337
Alignment:
Q  111 ttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattg 210  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  5147503 ttcaacaacaacaacaaaatcaacaagctagacctacttttcctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattg 5147404  T
Q  211 tacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  5147403 tacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 5147337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 110 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 26670078 - 26669912
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  26670078 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcatt 26669979  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatg 276  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| || ||||||||    
T  26669978 gtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcccccaaggttcaggtctgatctcaaatg 26669912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 26435127 - 26435403
Alignment:
Q  1 ctctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacag 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||| ||||| | || | |||||| |||||||| ||||| ||||  || |||| |  |||     
T  26435127 ctctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaa 26435226  T
Q  101 caaccatcagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccata 200  Q
    ||     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||  | ||||  ||| ||||||| |    
T  26435227 cagatgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccaga 26435326  T
Q  201 gagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  26435327 gagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 26435403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Original strand, 16041196 - 16041451
Alignment:
Q  1 ctctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacag 100  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||||||| |||| || | ||||||||||||||| ||| |  | || ||||| | || |||     
T  16041196 ctctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgtcatcgggtcaacctcaggtacccgttaattccgtcgttcagcaaatgcaacaa 16041295  T
Q  101 caaccatcagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccata 200  Q
    || ||| |||||   |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || | |||| |||| |  |    
T  16041296 cagccaccagtt---caacaacaacagcatcaacaagctagacctaccttccctccgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctca 16041392  T
Q  201 gagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttc 259  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16041393 gagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttc 16041451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 24592705 - 24592538
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || || || |||||||| ||||||||||||||||  ||  | ||||  ||| ||||||| ||||| ||||    
T  24592705 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagccaggccaaccttccctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcatt 24592606  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  24592605 gtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 24592538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 138 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 31564526 - 31564387
Alignment:
Q  138 ctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacc 237  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  31564526 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacc 31564427  T
Q  238 tgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  31564426 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 31564387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 110 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 26538037 - 26537868
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaa---gctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggc 206  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||    | ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  26538037 gttcaacaacaacaacagcagcagcaatataccagaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggc 26537938  T
Q  207 attgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatg 276  Q
    ||||| | || ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||    
T  26537937 attgtgcgactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatg 26537868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 113 - 277
Target Start/End: Original strand, 31124902 - 31125066
Alignment:
Q  113 caacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgta 212  Q
    ||||||||||||||| | ||| |  ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||  | ||||  ||||||||||| ||||| |||||||    
T  31124902 caacaacaacaacagcagcagtatactagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacattgta 31125001  T
Q  213 caaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  31125002 caactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 31125066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 140 - 277
Target Start/End: Original strand, 3445315 - 3445452
Alignment:
Q  140 agacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctg 239  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||  | ||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  3445315 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctg 3445414  T
Q  240 atccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  3445415 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 3445452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16450268 - 16450014
Alignment:
Q  1 ctctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacag 100  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||| | |||||  | || |||||   || |||     
T  16450268 ctctcagcatcccttctttccaccattttatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccattaatgccgtcgttcagcaagtgcaacaa 16450169  T
Q  101 caaccatcagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccata 200  Q
    || ||| ||| |||||| ||||| |||   || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||| | ||||  ||||| || | |||| |||| |  |    
T  16450168 cagccaccagctcaacagcaacagcag---caacaagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctca 16450072  T
Q  201 gagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggtt 258  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  16450071 gagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatcctttgcctcccaggtt 16450014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 192 - 277
Target Start/End: Original strand, 11441633 - 11441718
Alignment:
Q  192 tactccatagagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  11441633 tactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 11441718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 2109169 - 2109002
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||| ||||||| |||| | || |||||||||||||| || ||||  ||||| ||| | |||| ||||||||| | |||| |||| |  |||||||| |    
T  2109169 gttcaccaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgatatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcact 2109070  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    | |||| |||| |||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  2109069 gcacaatcagacaggggaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgt 2109002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Original strand, 26484673 - 26484840
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||| ||||||| |||| | || |||||||||||||| || ||||  ||||| ||| | |||| ||||||||| | |||| |||| |  |||||||| |    
T  26484673 gttcaccaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcact 26484772  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    | |||| |||| |||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  26484773 gcacaatcagacaggggaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgt 26484840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Original strand, 2775338 - 2775505
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||| ||||||| |||| | || || ||||||||||| || ||||  ||||| ||| | |||| ||||| ||| | |||| |||| |  |||||||| |    
T  2775338 gttcaccaacaacgacagtagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagtagctcccgactctacttctcagagggcact 2775437  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    | |||| |||| |||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  2775438 gcacaatcagacaggggaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgt 2775505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 134 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 39211163 - 39211020
Alignment:
Q  134 caagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgtacaaccagatagggcaagcccc 233  Q
    |||||||||||||| || ||||  ||||| ||| | |||| ||||||||| | |||| |||| |  |||||||| || |||| |||| |||| ||||  |    
T  39211163 caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcttc 39211064  T
Q  234 cacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  39211063 cacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgt 39211020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 31088734 - 31088465
Alignment:
Q  1 ctctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacag 100  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||  | || ||||  | || |||     
T  31088734 ctctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaa 31088635  T
Q  101 caaccatcagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccata 200  Q
    || ||  ||| |||||||| ||| |||   || || ||||||||||| || ||||  ||||| ||||| |||| ||| || || | |||| |||| |  |    
T  31088634 cagcctccagctcaacaacgacagcag---caacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctca 31088538  T
Q  201 gagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaa 273  Q
     |||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||| | || ||||| |||| | || ||||||||    
T  31088537 aagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaa 31088465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 45733333 - 45733602
Alignment:
Q  1 ctctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacag 100  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||  | || ||||  | || |||     
T  45733333 ctctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaa 45733432  T
Q  101 caaccatcagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccata 200  Q
    || ||  ||| |||||||| ||| |||   || || ||||||||||| || ||||  ||||| ||||| |||| ||| || ||  | ||| |||| |  |    
T  45733433 cagcctccagctcaacaacgacagcag---caacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcttaactctacttctca 45733529  T
Q  201 gagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaa 273  Q
     |||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||| | || ||||| |||| | || ||||||||    
T  45733530 aagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaa 45733602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 110 - 237
Target Start/End: Original strand, 18540778 - 18540905
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||| ||||||| |||| | || ||||||||||||||||| ||||  ||||| ||| | |||| ||||||||| | |||| |||| |  |||||||| |    
T  18540778 gttcaccaacaacgacagcagcaacaagctagacctacttttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcact 18540877  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacc 237  Q
    | |||| |||| |||| ||||| |||||    
T  18540878 gcacaatcagacaggggaagcctccacc 18540905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 144; Significance: 9e-76; HSPs: 23)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 277
Target Start/End: Original strand, 17013885 - 17014160
Alignment:
Q  2 tctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacagc 101  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||| ||||| | || | |||||| |||||||| ||||| ||||  || |||| |  ||| |    
T  17013885 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattgctcaacagatgaaacaac 17013984  T
Q  102 aaccatcagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatag 201  Q
    |     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||    
T  17013985 agttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccaaag 17014084  T
Q  202 agggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17014085 agggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 17014160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 108 - 277
Target Start/End: Original strand, 14665009 - 14665178
Alignment:
Q  108 cagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggca 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  14665009 cagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagaggaca 14665108  T
Q  208 ttgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  14665109 ttgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgt 14665178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 116 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 24592586 - 24592425
Alignment:
Q  116 caacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgtacaa 215  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24592586 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaa 24592487  T
Q  216 ccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  24592486 ccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgt 24592425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 14763691 - 14763415
Alignment:
Q  1 ctctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacag 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||| | || | ||||||||| || || ||||| || |  || |||  || |||     
T  14763691 ctctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaacat 14763592  T
Q  101 caaccatcagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccata 200  Q
    ||||   | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| |    
T  14763591 caactgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaa 14763492  T
Q  201 gagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  14763491 gagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 14763415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 110 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 27163595 - 27163429
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  27163595 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcatt 27163496  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatg 276  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||    
T  27163495 gtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatg 27163429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 113 - 277
Target Start/End: Original strand, 5005869 - 5006033
Alignment:
Q  113 caacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgta 212  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  5005869 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 5005968  T
Q  213 caaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  5005969 caactagacaaggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 5006033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 277
Target Start/End: Original strand, 6569738 - 6570013
Alignment:
Q  2 tctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacagc 101  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||| | || | |||||| |||||||| ||||| ||||  || |||| |  ||| |    
T  6569738 tctcagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 6569837  T
Q  102 aaccatcagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatag 201  Q
    |     |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||  | ||||  ||| ||||||| ||    
T  6569838 agatgccagttcaacagcaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagag 6569937  T
Q  202 agggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  6569938 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 6570013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 40105916 - 40105749
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||  | ||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  40105916 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgaacttcttccaactttactccagagagggcatt 40105817  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    |||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  40105816 gtacgactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 40105749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Original strand, 14098534 - 14098701
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||  | ||||  ||| ||||||| ||||||||||    
T  14098534 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcatt 14098633  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| | || |||||||||    
T  14098634 gtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggactgatctcaaatgt 14098701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 31126796 - 31126629
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||| | ||||  ||| ||||||| ||||||||||    
T  31126796 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcatt 31126697  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  31126696 gtacaactagacagggtaagcccccacctgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 31126629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 15227757 - 15228026
Alignment:
Q  1 ctctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacag 100  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||| | || ||||| | || |||     
T  15227757 ctctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgctgtcgttcagcaaatgcaacaa 15227856  T
Q  101 caaccatcagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccata 200  Q
    || ||| ||| |||||||||||| |||   || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||| | ||||  ||||| || | |||| |||| |  |    
T  15227857 cagccaccagctcaacaacaacagcag---caacaagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctca 15227953  T
Q  201 gagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaa 273  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||| | || ||||||||    
T  15227954 gagggcactgtacaaccagacagggtaagcctccacctgatccattgcctcccaggttccgttctgacctcaa 15228026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 138 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 18800863 - 18800725
Alignment:
Q  138 ctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacc 237  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||    
T  18800863 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacc 18800764  T
Q  238 tgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatg 276  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||    
T  18800763 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatg 18800725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Original strand, 1900144 - 1900398
Alignment:
Q  1 ctctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacag 100  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||  | || ||||| | || |||     
T  1900144 ctctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaa 1900243  T
Q  101 caaccatcagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccata 200  Q
    || ||| |||||||||| ||||||||   ||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||| ||||||  ||||| || | |||| |||| |  |    
T  1900244 cagccaccagttcaacagcaacaaca---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgctgtatgccgagttactcccgactctacttctca 1900340  T
Q  201 gagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggtt 258  Q
    ||||||| || ||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  1900341 gagggcactgcacaaccagacatggtaagcctccacctgatccgttgcttctcaggtt 1900398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 138 - 277
Target Start/End: Original strand, 54833408 - 54833547
Alignment:
Q  138 ctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacc 237  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||| | ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  54833408 ctagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactaggcagggcaagcccccacc 54833507  T
Q  238 tgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||| ||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  54833508 tgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 54833547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 15285312 - 15285043
Alignment:
Q  1 ctctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacag 100  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||| | ||||| || | ||||||||| ||||| ||||| || || ||||| | || |||     
T  15285312 ctctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtcaacctcaggtgcccgttaatgccatcgttcagcaaatgcaacaa 15285213  T
Q  101 caaccatcagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccata 200  Q
    || ||| ||  |||||||||||| |||   || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||| | ||| | ||||| || | |||| |||| |  |    
T  15285212 cagccaccaactcaacaacaacagcag---caacaagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatttcgagttactcccgactctacttctca 15285116  T
Q  201 gagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaa 273  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  15285115 gagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccggtctgacctcaa 15285043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 140 - 277
Target Start/End: Original strand, 30753777 - 30753914
Alignment:
Q  140 agacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctg 239  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||  | ||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  30753777 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctg 30753876  T
Q  240 atccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  30753877 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 30753914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 138 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 36344765 - 36344626
Alignment:
Q  138 ctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacc 237  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||| | ||||  ||||||||||| ||||| || || || || ||| |||| |||||||||||    
T  36344765 ctagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacc 36344666  T
Q  238 tgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  36344665 tgatccgttgcctccgaggttcaggtctgatctcaaatgt 36344626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 113 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 33674076 - 33673909
Alignment:
Q  113 caacaacaacaacagaatcagcaa---gctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||| | ||||||    | ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||| || |    
T  33674076 caacaacaacaacagcagcagcaatataccagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacact 33673977  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    | || || ||  |||||||||| ||||| || ||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  33673976 gcacgactaggcagggcaagcctccaccggacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 33673909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 173
Target Start/End: Original strand, 21969694 - 21969757
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatg 173  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  21969694 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatg 21969757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 116 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 14235797 - 14235636
Alignment:
Q  116 caacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgtacaa 215  Q
    |||||||| ||| | || |||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||||  ||| |||| | |||| | || | || |||||| |||||||    
T  14235797 caacaacagcagcaacaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagctgctcccgactctgcttcttaaagggcactgtacaa 14235698  T
Q  216 ccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||| |||||||||| |||||| | || |||| ||||||||||   | |||||||||||||    
T  14235697 ccagacagggcaagcctccacctaaccctttgcctcccaggttccatttcgacctcaaatgt 14235636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 24460989 - 24460720
Alignment:
Q  1 ctctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacag 100  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||| |||||||||| || | ||||||||||||||| |||||  | || ||||  | || |||     
T  24460989 ctctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtattctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaa 24460890  T
Q  101 caaccatcagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccata 200  Q
    || ||  ||| |||||||| ||| ||| | |||   ||||||||||| || ||||  ||||| ||||| |||| ||| || || | |||| |||| |  |    
T  24460889 cagcctccagctcaacaacgacagcagcaacag---gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctca 24460793  T
Q  201 gagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaa 273  Q
     |||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||| | || ||||| |||| | || ||||||||    
T  24460792 aagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaa 24460720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 237
Target Start/End: Original strand, 39850661 - 39850758
Alignment:
Q  140 agacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacc 237  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||| || || || || ||  |||||||||| |||||    
T  39850661 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccacc 39850758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 2 - 83
Target Start/End: Original strand, 5005755 - 5005836
Alignment:
Q  2 tctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattg 83  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||| | || | |||||| |||||||| ||||| ||||    
T  5005755 tctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattg 5005836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 22)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 108 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 2137498 - 2137329
Alignment:
Q  108 cagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggca 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2137498 cagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggca 2137399  T
Q  208 ttgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  2137398 ttgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgt 2137329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 108 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 27609144 - 27608975
Alignment:
Q  108 cagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggca 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27609144 cagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggca 27609045  T
Q  208 ttgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  27609044 ttgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgt 27608975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Original strand, 19688076 - 19688243
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19688076 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcatt 19688175  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  19688176 gtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgt 19688243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 108 - 277
Target Start/End: Original strand, 16277530 - 16277699
Alignment:
Q  108 cagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggca 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16277530 cagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggca 16277629  T
Q  208 ttgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  16277630 ttgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgt 16277699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 16283318 - 16283594
Alignment:
Q  1 ctctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacag 100  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| || ||| | |||||||||||| |||| | ||||||||||||| | ||||| ||||  || |||| |  |||     
T  16283318 ctctcagcatcctttctttccgccattctatcattagtatcctttgccaccaggtcaacctcaggtacccattaatgcaattgctcaacagatgaaacaa 16283417  T
Q  101 caaccatcagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccata 200  Q
    ||     | |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  16283418 cagttgccggttcaacaacaacaacaacatcaacaagctagacctaccttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactcctta 16283517  T
Q  201 gagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16283518 gagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 16283594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 19208597 - 19208430
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  19208597 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcatt 19208498  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  19208497 gtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 19208430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 31490095 - 31489821
Alignment:
Q  2 tctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacagc 101  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||| | || | |||||| || ||||| ||||| ||||  || |||| |  |||||    
T  31490095 tctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcgattgcccaacagatgaaacagc 31489996  T
Q  102 aaccatcagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatag 201  Q
    |     | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||    
T  31489995 agatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagag 31489896  T
Q  202 agggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatg 276  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||    
T  31489895 agggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatg 31489821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 116 - 277
Target Start/End: Original strand, 14557608 - 14557769
Alignment:
Q  116 caacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgtacaa 215  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14557608 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccaatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaa 14557707  T
Q  216 ccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  14557708 ccagacagggcaagccctcgcctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgt 14557769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 28362192 - 28362025
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  28362192 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcatt 28362093  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  28362092 gtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 28362025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 113 - 277
Target Start/End: Original strand, 19674422 - 19674586
Alignment:
Q  113 caacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgta 212  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  19674422 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 19674521  T
Q  213 caaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  19674522 caactagacagggcaaacccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 19674586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Original strand, 31354502 - 31354669
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  31354502 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgccgagttgcttccaactttactccagagagggcatt 31354601  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  31354602 gtacaactagacagggcaagcctccacctgatcctttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 31354669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Original strand, 33258701 - 33258868
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || || || |||||||| ||||||||||||||||  ||  | ||||  ||| ||||||| ||||| ||||    
T  33258701 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagccaggccaaccttccctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcatt 33258800  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  33258801 gtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 33258868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 137 - 273
Target Start/End: Original strand, 18710591 - 18710727
Alignment:
Q  137 gctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccac 236  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||    
T  18710591 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagccctcac 18710690  T
Q  237 ctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaa 273  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||||| || |||||    
T  18710691 ctgatccgctgcctccaaggttcaggtctgatctcaa 18710727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 113 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 3329741 - 3329577
Alignment:
Q  113 caacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgta 212  Q
    ||||||||||| ||| | ||| |  ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||| || || |    
T  3329741 caacaacaacagcagcagcagtatactagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgca 3329642  T
Q  213 caaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    | || ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  3329641 cgactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 3329577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 138 - 277
Target Start/End: Original strand, 19286468 - 19286607
Alignment:
Q  138 ctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacc 237  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||| | ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  19286468 ctagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactaggcagggcaagcccccacc 19286567  T
Q  238 tgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||| ||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  19286568 tgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 19286607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 138 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 12092933 - 12092794
Alignment:
Q  138 ctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacc 237  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||  | ||||  ||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  12092933 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcggaacttcttccaactctactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacc 12092834  T
Q  238 tgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  12092833 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 12092794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 113 - 259
Target Start/End: Original strand, 29829303 - 29829449
Alignment:
Q  113 caacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgta 212  Q
    ||||||||||| ||| | ||| |  ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |  ||  | ||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  29829303 caacaacaacagcagcagcagtatactagaccaacttttcctcctataccaatgttgtacgcagaacttcttccaactttactccagagagggcattgta 29829402  T
Q  213 caaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttc 259  Q
    | |||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  29829403 ccaccagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 29829449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 44562973 - 44563242
Alignment:
Q  1 ctctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacag 100  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    || ||||  | || |||     
T  44562973 ctctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggacaacctcaggtacccgttaatgccgccgttcagcgaatgcaacaa 44563072  T
Q  101 caaccatcagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccata 200  Q
    || ||  ||| |||||||| ||| |||   || |||||||||||||| || ||||  ||||| ||| | |||| ||||||||| | |||| |||| |  |    
T  44563073 cagcctccagctcaacaacgacagcag---caacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctca 44563169  T
Q  201 gagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaa 273  Q
     |||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||| | || ||||| |||| | || ||||||||    
T  44563170 aagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaa 44563242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 9354494 - 9354763
Alignment:
Q  1 ctctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacag 100  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||  | || ||||  | || |||     
T  9354494 ctctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaa 9354593  T
Q  101 caaccatcagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccata 200  Q
    || ||  ||| |||||||| ||| |||   || || ||||||||||| || ||||  ||||| ||||| |||| ||| || || | |||| ||||||  |    
T  9354594 cagcctccagctcaacaacgacagcag---caacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctactcctca 9354690  T
Q  201 gagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaa 273  Q
     |||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||| | || ||||| |||| | || ||||||||    
T  9354691 aagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaa 9354763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 19659382 - 19659113
Alignment:
Q  1 ctctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacag 100  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||  | || ||||  | || |||     
T  19659382 ctctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaa 19659283  T
Q  101 caaccatcagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccata 200  Q
    |||||  ||| |||||||| ||| |||   || || ||||||||||| || ||||  ||||| ||||| |||| ||| || || | |||| |||| |  |    
T  19659282 caacctccagctcaacaacgacagcag---caacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctca 19659186  T
Q  201 gagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaa 273  Q
     |||||  || ||||||||| |||||||||| |||||||| |||| || ||||| |||| | || ||||||||    
T  19659185 aagggcgctgcacaaccagacagggcaagcctccacctgacccgtcgcctcccaagttccgttcggacctcaa 19659113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 19518374 - 19518280
Alignment:
Q  113 caacaacaacaacagaatcagcaa---gctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagg 204  Q
    ||||||||||||||| | ||||||    | ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  19518374 caacaacaacaacagcagcagcaatataccagaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagg 19518280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 18710455 - 18710532
Alignment:
Q  1 ctctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgc 78  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||| | || | ||||||||| ||||| |||||    
T  18710455 ctctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcccgtcaatgc 18710532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 49)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 108 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 23752627 - 23752458
Alignment:
Q  108 cagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggca 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23752627 cagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagagggca 23752528  T
Q  208 ttgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23752527 ttgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgt 23752458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 108 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 24688334 - 24688165
Alignment:
Q  108 cagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggca 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24688334 cagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatattgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggca 24688235  T
Q  208 ttgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  24688234 ttgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgt 24688165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Original strand, 33777474 - 33777641
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  33777474 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcatt 33777573  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33777574 gtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgt 33777641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 108 - 277
Target Start/End: Original strand, 11549339 - 11549508
Alignment:
Q  108 cagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggca 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11549339 cagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagagggca 11549438  T
Q  208 ttgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  11549439 ttgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgt 11549508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 108 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 23718165 - 23717996
Alignment:
Q  108 cagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggca 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23718165 cagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagagggca 23718066  T
Q  208 ttgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  23718065 ttgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgt 23717996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 108 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 22999291 - 22999126
Alignment:
Q  108 cagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggca 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  22999291 cagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagaggaca 22999192  T
Q  208 ttgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaa 273  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  22999191 ttgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaa 22999126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 116 - 277
Target Start/End: Original strand, 30934626 - 30934787
Alignment:
Q  116 caacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgtacaa 215  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30934626 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaa 30934725  T
Q  216 ccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  30934726 ccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgt 30934787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 277
Target Start/End: Original strand, 24969903 - 24970172
Alignment:
Q  2 tctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacagc 101  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||| | || | ||||||||||||||| ||||| ||||  || |||| |  ||| |    
T  24969903 tctcagcatcctttctttccgccattctatcatcagtatcccttgccaccgggtcaacctcaggtacccgttaatgcaattgctcaacagatgaaacaac 24970002  T
Q  102 aaccatcagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatag 201  Q
    | |   | ||||||||||||||      ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  24970003 agctgccggttcaacaacaaca------tcaacaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatag 24970096  T
Q  202 agggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  24970097 agggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgt 24970172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 15658935 - 15658768
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  15658935 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcatt 15658836  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  15658835 gtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 15658768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Original strand, 26480379 - 26480546
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  26480379 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcatt 26480478  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  26480479 gtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 26480546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 277
Target Start/End: Original strand, 41674589 - 41674863
Alignment:
Q  3 ctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacagca 102  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||| | || |||||||| |||||||| ||||| ||||  || |||| |  ||| ||    
T  41674589 ctcagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtccacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaaca 41674688  T
Q  103 accatcagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccataga 202  Q
         | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||  ||||||||||| |||    
T  41674689 gttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaaga 41674788  T
Q  203 gggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || || |||||||||    
T  41674789 gggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcagatctgatctcaaatgt 41674863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Original strand, 2511038 - 2511205
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  2511038 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcatt 2511137  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  2511138 gtacaactagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 2511205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Original strand, 5637897 - 5638064
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  5637897 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcatt 5637996  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  5637997 gtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 5638064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 8665650 - 8665483
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  8665650 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcatt 8665551  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  8665550 gtacaactagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 8665483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Original strand, 9317438 - 9317605
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  9317438 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcatt 9317537  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  9317538 gtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 9317605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Original strand, 12132142 - 12132309
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  12132142 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcatt 12132241  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  12132242 gtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 12132309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 15759032 - 15758865
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  15759032 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcatt 15758933  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  15758932 gtacaactagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 15758865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 110 - 276
Target Start/End: Original strand, 30152005 - 30152171
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  30152005 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcatt 30152104  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatg 276  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||    
T  30152105 gtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatg 30152171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 9548826 - 9548555
Alignment:
Q  2 tctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacagc 101  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||| | || | |||||| |||||||| ||||| ||||  || |||| |  ||| |    
T  9548826 tctcagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaac 9548727  T
Q  102 aaccatcagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatag 201  Q
    |     |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||  ||||||||||| ||    
T  9548726 agatgccgattcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaag 9548627  T
Q  202 agggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaa 273  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||    
T  9548626 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaa 9548555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 110 - 276
Target Start/End: Original strand, 30168456 - 30168622
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  30168456 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcatt 30168555  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatg 276  Q
    |||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||    
T  30168556 gtacgactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatg 30168622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 113 - 277
Target Start/End: Original strand, 6874295 - 6874459
Alignment:
Q  113 caacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgta 212  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  6874295 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagctgcttccaactttactccagagagggcattgta 6874394  T
Q  213 caaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  6874395 caactagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 6874459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 23892084 - 23892360
Alignment:
Q  1 ctctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacag 100  Q
    |||||| ||||| ||||| ||  |||| || ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||| || || ||||| | || |||     
T  23892084 ctctcagcatcctttctttccaacattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccatcgttcagcaaatgcaacaa 23892183  T
Q  101 caaccatcagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccata 200  Q
    || ||| | |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||  ||||||  |||||||||| |||| |||| |  |    
T  23892184 cagccaccggttcaacaacaacaacaacatcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatcatgtatgccgagttgcttccgactctacttctca 23892283  T
Q  201 gagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  23892284 gagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccggtccgacctcaaatgt 23892360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 18375587 - 18375420
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||  | ||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  18375587 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagatcttcttccaactttactccagagagggcatt 18375488  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  18375487 gtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 18375420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 22888351 - 22888620
Alignment:
Q  1 ctctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacag 100  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || | |||||||||| |||| |||||  | || ||||| | || |||     
T  22888351 ctctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtaaccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaa 22888450  T
Q  101 caaccatcagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccata 200  Q
    || ||| |||||   |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||| || | |||| || | |  |    
T  22888451 cagccaccagtt---caacaacaacagcatcaacaagctagacctaccttccctccgataccaatgttgtatgctgagttactcccgactctatttctca 22888547  T
Q  201 gagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaa 273  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||    
T  22888548 gagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaa 22888620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 138 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 18500877 - 18500738
Alignment:
Q  138 ctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacc 237  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||    
T  18500877 ctagaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacc 18500778  T
Q  238 tgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  18500777 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 18500738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 138 - 277
Target Start/End: Original strand, 28649250 - 28649389
Alignment:
Q  138 ctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacc 237  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||    
T  28649250 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacc 28649349  T
Q  238 tgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  28649350 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 28649389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Original strand, 33516343 - 33516510
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||  | ||||  || |||||||| ||||| ||||    
T  33516343 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcatt 33516442  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || || ||||||    
T  33516443 gtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgt 33516510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 137 - 277
Target Start/End: Original strand, 34616532 - 34616672
Alignment:
Q  137 gctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccac 236  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  34616532 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccac 34616631  T
Q  237 ctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  34616632 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 34616672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 113 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 37771159 - 37770995
Alignment:
Q  113 caacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgta 212  Q
    ||||||||||| ||| | ||| |  ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||    
T  37771159 caacaacaacagcagcagcagtatactagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggtcattgta 37771060  T
Q  213 caaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    | || ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  37771059 cgactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 37770995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 29967241 - 29967074
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || || || |||||||| ||||| ||||||||||  ||  | ||||  ||| ||||||| ||||| ||||    
T  29967241 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagccaggccaaccttccctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcatt 29967142  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  29967141 gtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 29967074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Original strand, 30029402 - 30029569
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || || || |||||||| ||||| ||||||||||  ||  | ||||  ||| ||||||| ||||| ||||    
T  30029402 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagccaggccaaccttccctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcatt 30029501  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  30029502 gtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 30029569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 113 - 277
Target Start/End: Original strand, 31431430 - 31431594
Alignment:
Q  113 caacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgta 212  Q
    ||||||||||| ||| | ||| |  |||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||    
T  31431430 caacaacaacagcagcagcagtatactaggccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagagggcattgta 31431529  T
Q  213 caaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    | || ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  31431530 cgactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 31431594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 113 - 277
Target Start/End: Original strand, 37754970 - 37755134
Alignment:
Q  113 caacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgta 212  Q
    ||||||||||| ||| | ||| |  ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||    
T  37754970 caacaacaacagcagcagcagtatactagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggtcattgta 37755069  T
Q  213 caaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    | || ||| | |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  37755070 cgactagacaaggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 37755134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Original strand, 25198910 - 25199165
Alignment:
Q  1 ctctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacag 100  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||| ||| || ||  | || ||||| | || |||     
T  25198910 ctctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtactcgttaacgccgtcgttcagcaaatgcaacaa 25199009  T
Q  101 caaccatcagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccata 200  Q
    || ||| |||||   |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||  ||||| || | |||| |||| |  |    
T  25199010 cagccaccagtt---caacaacaacagcatcaacaagctagacctaccttttctccgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctca 25199106  T
Q  201 gagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttc 259  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  25199107 gagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttacctcccaggttc 25199165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 113 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 37671655 - 37671491
Alignment:
Q  113 caacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgta 212  Q
    ||||||||||| ||| | ||| |  ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||| || || |    
T  37671655 caacaacaacagcagcagcagtatactagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgca 37671556  T
Q  213 caaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    | || ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  37671555 cgactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 37671491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 113 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 37358815 - 37358651
Alignment:
Q  113 caacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgta 212  Q
    ||||||||||||||| | ||| |  ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||  | ||||  ||| ||||||| ||||| |||||||    
T  37358815 caacaacaacaacagcagcagtatactagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcggaacttcttccaactctactccagagaggtcattgta 37358716  T
Q  213 caaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  37358715 caactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 37358651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 113 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 28959961 - 28959794
Alignment:
Q  113 caacaacaacaacagaatcagcaa---gctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||   |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||  | ||||  ||| ||||||| ||||| ||||    
T  28959961 caacaacaacagcagcagcagcaatatgctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcatt 28959862  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  28959861 gtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 28959794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 113 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 31826582 - 31826415
Alignment:
Q  113 caacaacaacaacagaatcagcaa---gctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||| | ||||||    | ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||  | ||||  ||| ||||||| ||||||||||    
T  31826582 caacaacaacaacagcagcagcaatataccagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcatt 31826483  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  31826482 gtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 31826415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Original strand, 43078236 - 43078406
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaa---gctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggc 206  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||    | ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||  | ||||  ||| ||||||| |||||||    
T  43078236 gttcaacaacaacaacagcagcagcaatataccagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggc 43078335  T
Q  207 attgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  43078336 attgtacgactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 43078406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 29889251 - 29889090
Alignment:
Q  116 caacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgtacaa 215  Q
    ||||||| |||| | || |||||||||||||| || ||||  ||||| |||||||||| |||| | || |  ||| |||| |  |||||||| || || |    
T  29889251 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgctgagctactcccaactctacttctcagagggcactgcacca 29889152  T
Q  216 ccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  29889151 ccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccggtctgacctcatatgt 29889090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 32599752 - 32599480
Alignment:
Q  2 tctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacagc 101  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||| | || | ||||||||| || || ||||| || |  ||||||   | ||| |    
T  32599752 tctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccacccggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcagcaggtacaacatc 32599653  T
Q  102 aaccatcagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatag 201  Q
    ||||  |||||||||| || || |||   ||  | |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||  | ||||  ||||||||||| ||    
T  32599652 aaccgccagttcaacagcagcagcag---caatatgctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagag 32599556  T
Q  202 agggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||| || || || || ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  32599555 aggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 32599480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 113 - 277
Target Start/End: Original strand, 3789531 - 3789695
Alignment:
Q  113 caacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgta 212  Q
    ||||||||||| ||| | ||| |  ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||  | ||||  ||||||||||| ||||| || || |    
T  3789531 caacaacaacagcagcagcagtatactagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgca 3789630  T
Q  213 caaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    | || ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  3789631 cgactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 3789695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 11325675 - 11325948
Alignment:
Q  1 ctctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacag 100  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||  | || ||||  | || |||     
T  11325675 ctctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccattgggacaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaa 11325774  T
Q  101 caaccatcagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccata 200  Q
    || ||  ||| |||||||| ||| |||   || || ||||||||||| || ||||  ||||| ||||| |||| ||| || || | |||| |||| |  |    
T  11325775 cagcctccagctcaacaacgacagcag---caacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctca 11325871  T
Q  201 gagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
     |||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||| | || ||||| |||| | || ||||||||||||    
T  11325872 aagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaaatgt 11325948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 13184929 - 13184660
Alignment:
Q  1 ctctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacag 100  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||  | || ||||  | || |||     
T  13184929 ctctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaa 13184830  T
Q  101 caaccatcagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccata 200  Q
    || ||  ||| |||||||| ||| |||   || || ||||||||||| || ||||  ||||| ||||| |||| ||| || || | |||| |||| |  |    
T  13184829 cagcctccagctcaacaacgacagcag---caacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctca 13184733  T
Q  201 gagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaa 273  Q
     |||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||| | || ||||| |||| | || ||||||||    
T  13184732 aagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaa 13184660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 33877128 - 33877397
Alignment:
Q  1 ctctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacag 100  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||  | || ||||  | || |||     
T  33877128 ctctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaa 33877227  T
Q  101 caaccatcagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccata 200  Q
    || ||  ||| |||||||| ||| |||   || || ||||||||||| || ||||  ||||| ||||| |||| ||| || || | |||| |||| |  |    
T  33877228 cagcctccagctcaacaacgacagcag---caacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctca 33877324  T
Q  201 gagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaa 273  Q
     |||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||| | || ||||| |||| | || ||||||||    
T  33877325 aagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaa 33877397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 110 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 40473727 - 40473597
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaa---gctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggc 206  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||    | ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||| |    
T  40473727 gttcaacaacaacaacagcagcagcaatataccagaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggac 40473628  T
Q  207 attgtacaaccagatagggcaagcccccacc 237  Q
    | || || || ||  |||||||||| |||||    
T  40473627 actgcacgactaggcagggcaagcctccacc 40473597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 13440775 - 13440506
Alignment:
Q  1 ctctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacag 100  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||  | || ||||  | || |||     
T  13440775 ctctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaa 13440676  T
Q  101 caaccatcagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccata 200  Q
    || ||  ||| |||||||| ||| |||   || || ||||||||||| || ||||  ||||| ||||| |||| | | || || | |||| |||| |  |    
T  13440675 cagcctccagctcaacaacgacagcag---caacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctaaattactcccgactctacttctca 13440579  T
Q  201 gagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaa 273  Q
     |||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||| | || ||||| |||| | || ||||||||    
T  13440578 aagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaa 13440506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 237
Target Start/End: Original strand, 24681457 - 24681554
Alignment:
Q  140 agacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacc 237  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||| || || || || ||  |||||||||| |||||    
T  24681457 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccacc 24681554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 237
Target Start/End: Original strand, 24723984 - 24724081
Alignment:
Q  140 agacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacc 237  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||| || || || || ||  |||||||||| |||||    
T  24723984 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccacc 24724081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 44)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 108 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 23128835 - 23128666
Alignment:
Q  108 cagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggca 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23128835 cagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggca 23128736  T
Q  208 ttgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  23128735 ttgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgt 23128666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 27434711 - 27434544
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  27434711 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccggctttactccatagagggcatt 27434612  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27434611 gtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaagttcaggtccgacctcaaatgt 27434544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 108 - 277
Target Start/End: Original strand, 28882186 - 28882355
Alignment:
Q  108 cagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggca 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  28882186 cagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggca 28882285  T
Q  208 ttgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  28882286 ttgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgt 28882355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 108 - 277
Target Start/End: Original strand, 12655514 - 12655683
Alignment:
Q  108 cagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggca 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  12655514 cagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggca 12655613  T
Q  208 ttgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  12655614 ttgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgt 12655683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 108 - 277
Target Start/End: Original strand, 20837890 - 20838059
Alignment:
Q  108 cagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggca 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  20837890 cagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggca 20837989  T
Q  208 ttgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20837990 ttgtacaactagacagggcaagcccccacctgatctgttgcctcccaggttcaggtccgaccttaaatgt 20838059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Original strand, 34286328 - 34286495
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  34286328 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcatt 34286427  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  34286428 gtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 34286495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Original strand, 34291388 - 34291555
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  34291388 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcatt 34291487  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  34291488 gtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 34291555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 113 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 11635450 - 11635286
Alignment:
Q  113 caacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgta 212  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  11635450 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 11635351  T
Q  213 caaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  11635350 caactagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 11635286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Original strand, 34279423 - 34279590
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  34279423 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcatt 34279522  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  34279523 gtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 34279590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 113 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 11641639 - 11641475
Alignment:
Q  113 caacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgta 212  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  11641639 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgatacagatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 11641540  T
Q  213 caaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  11641539 caactagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 11641475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 21677449 - 21677282
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  21677449 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcatt 21677350  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  21677349 gtacaactagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 21677282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 22926295 - 22926128
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  22926295 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcatt 22926196  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  22926195 gtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 22926128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 110 - 276
Target Start/End: Original strand, 34861654 - 34861820
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  34861654 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcatt 34861753  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatg 276  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||    
T  34861754 gtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatg 34861820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 110 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 37686176 - 37686010
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  37686176 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcatt 37686077  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatg 276  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||    
T  37686076 gtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatg 37686010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 110 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 37701441 - 37701275
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  37701441 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcatt 37701342  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatg 276  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||    
T  37701341 gtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatg 37701275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 110 - 276
Target Start/End: Original strand, 32049772 - 32049938
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  32049772 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcatt 32049871  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatg 276  Q
    ||||||| ||| |||| || |||||||| || ||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||    
T  32049872 gtacaactagacagggtaaacccccaccggacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatg 32049938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 110 - 276
Target Start/End: Original strand, 37925467 - 37925633
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  37925467 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccaatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcatt 37925566  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatg 276  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||    
T  37925567 gtacaactagacagggtaagcccccacccgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatg 37925633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 21703537 - 21703268
Alignment:
Q  1 ctctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacag 100  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||  | || || || | || |||     
T  21703537 ctctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcaacaaatgcaacaa 21703438  T
Q  101 caaccatcagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccata 200  Q
    || ||| |||||   |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||| || | |||| |||| |  |    
T  21703437 cagccaccagtt---caacaacaacagcatcaacaagctagacctaccttccctccgataccaatgttgtatgctgagttactcccgactctacttctca 21703341  T
Q  201 gagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaa 273  Q
    ||||||| || ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||    
T  21703340 gagggcactgcacaaccagacaggacaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaa 21703268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Original strand, 31876255 - 31876422
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |  ||  | ||||  ||| ||||||| ||||||||||    
T  31876255 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtacgcggaacttcttccaactctactccagagagggcatt 31876354  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  31876355 gtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 31876422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 110 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 19416766 - 19416600
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||  ||  | ||||  ||| ||||||| ||||| ||||    
T  19416766 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagccaggccaactttccctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcatt 19416667  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatg 276  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||    
T  19416666 gtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatg 19416600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 16829605 - 16829438
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||  | ||||  || |||||||| ||||| ||||    
T  16829605 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcatt 16829506  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || || ||||||    
T  16829505 gtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgt 16829438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Original strand, 16891876 - 16892043
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||  | ||||  || |||||||| ||||| ||||    
T  16891876 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcatt 16891975  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || || ||||||    
T  16891976 gtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgt 16892043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 31891701 - 31891428
Alignment:
Q  1 ctctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacag 100  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||  | || ||||  | || |||     
T  31891701 ctctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggacaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaa 31891602  T
Q  101 caaccatcagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccata 200  Q
    || ||  ||| |||||||| ||| |||   || |||||||||||||| || ||||  ||||| ||||| |||| ||| || || | |||| |||| |  |    
T  31891601 cagcctccagctcaacaacgacagcag---caacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctca 31891505  T
Q  201 gagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
     |||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  31891504 aagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgt 31891428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 27118556 - 27118825
Alignment:
Q  1 ctctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacag 100  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||  | || ||||  | || |||     
T  27118556 ctctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaa 27118655  T
Q  101 caaccatcagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccata 200  Q
    || ||  ||| |||||||| ||| |||   || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| || || | |||| |||| |  |    
T  27118656 cagcctccagctcaacaacgacagcag---caacaagctagacctaccttccctccgataccgatgttgtatgctgaattactcccgactctacttctca 27118752  T
Q  201 gagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaa 273  Q
     |||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||| | || ||||||||    
T  27118753 aagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgtcgcctcccaagttccgttcggacctcaa 27118825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13936919 - 13936684
Alignment:
Q  2 tctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacagc 101  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||| | || | |||||| || ||||| ||||| ||||  || |||| |  ||| |    
T  13936919 tctcagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaac 13936820  T
Q  102 aaccatcagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatag 201  Q
    | |   | |||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||    
T  13936819 agctgccggttcaacaacaacagcaaagtcagcaagccagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagag 13936720  T
Q  202 agggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacc 237  Q
    ||| || || || || ||  |||||||||| |||||    
T  13936719 aggacactgcacgactaggcagggcaagcctccacc 13936684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 113 - 277
Target Start/End: Original strand, 39890048 - 39890215
Alignment:
Q  113 caacaacaacaacagaatcagcaa---gctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||   |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||  | ||||  || |||||||| ||||| ||||    
T  39890048 caacaacaacagcagcagcagcaatatgctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcatt 39890147  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| | || |||||||||    
T  39890148 gtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcagggctgatctcaaatgt 39890215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 140 - 277
Target Start/End: Original strand, 40233515 - 40233652
Alignment:
Q  140 agacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctg 239  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| | ||||  ||||||||||| ||||| || || || || ||| |||| |||||||||||||    
T  40233515 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctg 40233614  T
Q  240 atccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  40233615 atccgttgcctccaaggttccggtctgacctcaaatgt 40233652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 19456787 - 19456525
Alignment:
Q  8 catccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacagcaaccat 107  Q
    ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||| | ||||| || | ||||||||| ||||| ||||| || ||  |||| | || ||| || |||     
T  19456787 catcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtcaacctcaggtgcccgttaatgccatcgtttagcaaatgcaacaacagccac 19456688  T
Q  108 cagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggca 207  Q
    ||| |||||||||||| |||   || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||| | ||||  ||||| || | |||| |||| |  | ||||||    
T  19456687 cagctcaacaacaacagcag---caacaagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcatagggca 19456591  T
Q  208 ttgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaa 273  Q
     || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||    
T  19456590 ctgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaa 19456525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 138 - 277
Target Start/End: Original strand, 37375163 - 37375302
Alignment:
Q  138 ctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacc 237  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||| | ||||  ||||||||||| ||||| || || || || ||| |||| |||||||||||    
T  37375163 ctagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacc 37375262  T
Q  238 tgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  37375263 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 37375302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 34303676 - 34303407
Alignment:
Q  1 ctctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacag 100  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||   | || ||||  | || |||     
T  34303676 ctctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgtcgtcgtccagcgaatgcaacaa 34303577  T
Q  101 caaccatcagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccata 200  Q
    || ||  ||| |||||||| ||| |||   || |||||||||||||| || ||||  ||||| ||||| |||| ||| || || | |||| |||| |  |    
T  34303576 cagcctccagctcaacaacgacagcag---caacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctca 34303480  T
Q  201 gagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaa 273  Q
     |||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||| | || ||||||||    
T  34303479 aagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgtcgcctcccaagttccgttcggacctcaa 34303407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 260984 - 260853
Alignment:
Q  146 actttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgt 245  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||  | ||||  ||||||||||| ||||| || || || || ||| |||| |||||||||||||||| ||    
T  260984 acttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatctgt 260885  T
Q  246 tgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  260884 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 260853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 34156879 - 34157148
Alignment:
Q  1 ctctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacag 100  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||  | || ||||  | || |||     
T  34156879 ctctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaa 34156978  T
Q  101 caaccatcagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccata 200  Q
    || ||  ||| |||||||| ||| |||   || || ||||||||||| || ||||  ||||| ||||| |||| ||| || || | |||| |||| |  |    
T  34156979 cagcctccagctcaacaacgacagcag---caacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctca 34157075  T
Q  201 gagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaa 273  Q
     |||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||| | || ||||| |||| | || ||||||||    
T  34157076 aagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaa 34157148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 3784522 - 3784791
Alignment:
Q  1 ctctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacag 100  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||  | || ||||  | || |||     
T  3784522 ctctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaa 3784621  T
Q  101 caaccatcagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccata 200  Q
    || ||  ||| |   ||||||| |||| | || || ||||||||||| || ||||  ||||| ||||| |||| ||| || || | |||| |||| |  |    
T  3784622 cagcctccagct---caacaacgacagtagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctca 3784718  T
Q  201 gagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaa 273  Q
     |||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||| | || ||||| |||| | || ||||||||    
T  3784719 aagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaa 3784791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 16163467 - 16163736
Alignment:
Q  1 ctctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacag 100  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||| |||||||||| || | ||||||||||||||| |||||  | || ||||  | || |||     
T  16163467 ctctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtattctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaa 16163566  T
Q  101 caaccatcagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccata 200  Q
    || ||  ||| |||||||| ||| |||   || || ||||||||||| || ||||  ||||| ||||| |||| ||| || || | |||| |||| |  |    
T  16163567 cagcctccagctcaacaacgacagcag---caacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctca 16163663  T
Q  201 gagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaa 273  Q
     |||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||| | || ||||| |||| | || ||||||||    
T  16163664 aagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaa 16163736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 12716839 - 12716742
Alignment:
Q  140 agacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacc 237  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||| || || || || ||  |||||||||| |||||    
T  12716839 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccacc 12716742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 237
Target Start/End: Original strand, 27777226 - 27777323
Alignment:
Q  140 agacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacc 237  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||| || || || || ||  |||||||||| |||||    
T  27777226 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccacc 27777323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 237
Target Start/End: Original strand, 27803711 - 27803808
Alignment:
Q  140 agacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacc 237  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||| || || || || ||  |||||||||| |||||    
T  27803711 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccacc 27803808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 237
Target Start/End: Original strand, 27816984 - 27817081
Alignment:
Q  140 agacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacc 237  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||| || || || || ||  |||||||||| |||||    
T  27816984 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccacc 27817081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 39052059 - 39051962
Alignment:
Q  140 agacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacc 237  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||| || || || || ||  |||||||||| |||||    
T  39052059 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccacc 39051962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 9350249 - 9350155
Alignment:
Q  113 caacaacaacaacagaatcagcaa---gctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagg 204  Q
    ||||||||||||||| | ||||||    | ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  9350249 caacaacaacaacagcagcagcaatataccagaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagg 9350155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 2 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 11635564 - 11635483
Alignment:
Q  2 tctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattg 83  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||| | || | |||||| |||||||| ||||| ||||    
T  11635564 tctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattg 11635483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 2 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 11641753 - 11641672
Alignment:
Q  2 tctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattg 83  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||| | || | |||||| |||||||| ||||| ||||    
T  11641753 tctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattg 11641672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 140 - 237
Target Start/End: Original strand, 12586814 - 12586911
Alignment:
Q  140 agacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacc 237  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||  ||||||||||| ||||| || || || || ||  |||||||||| |||||    
T  12586814 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagtcgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccacc 12586911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Original strand, 37375026 - 37375091
Alignment:
Q  1 ctctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggt 66  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||| | || | |||||||||    
T  37375026 ctctcagcatccgttcttcccgccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggt 37375091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 40347 - 40180
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40347 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcatt 40248  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  40247 gtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgccccccaggttcaggtccgatctcaaatgt 40180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 108 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 47265 - 47096
Alignment:
Q  108 cagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggca 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  47265 cagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagaggaca 47166  T
Q  208 ttgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  47165 ttgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgt 47096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Original strand, 29741 - 29908
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29741 gttcaacaacaacaacaacatcaacaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcatt 29840  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  29841 gtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgt 29908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 134; Significance: 8e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 108 - 277
Target Start/End: Original strand, 27268 - 27437
Alignment:
Q  108 cagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggca 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27268 cagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagagggca 27367  T
Q  208 ttgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  27368 ttgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgt 27437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 134; Significance: 8e-70; HSPs: 59)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 108 - 277
Target Start/End: Original strand, 18051199 - 18051368
Alignment:
Q  108 cagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggca 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  18051199 cagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagaggaca 18051298  T
Q  208 ttgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  18051299 ttgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgctgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgt 18051368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 4796972 - 4796805
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  4796972 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcatt 4796873  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  4796872 gtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgt 4796805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 108 - 277
Target Start/End: Original strand, 4721568 - 4721737
Alignment:
Q  108 cagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggca 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  4721568 cagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggca 4721667  T
Q  208 ttgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4721668 ttgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgctgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgt 4721737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 116 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 8301580 - 8301419
Alignment:
Q  116 caacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgtacaa 215  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8301580 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaa 8301481  T
Q  216 ccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  8301480 ccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgt 8301419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 108 - 277
Target Start/End: Original strand, 18330606 - 18330775
Alignment:
Q  108 cagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggca 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  18330606 cagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgaccttactccatagagggca 18330705  T
Q  208 ttgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  18330706 ttgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgt 18330775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 108 - 277
Target Start/End: Original strand, 6192253 - 6192422
Alignment:
Q  108 cagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggca 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  6192253 cagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggca 6192352  T
Q  208 ttgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6192353 ttgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatctgctgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgt 6192422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 108 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 15741415 - 15741246
Alignment:
Q  108 cagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggca 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  15741415 cagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggca 15741316  T
Q  208 ttgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  15741315 ttgtacaaccagacagggcaagcccccacctgattcgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgt 15741246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 15893025 - 15892858
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15893025 gttcaacaacaacaacaacatcaacaagctagacctactttccctccgataccaatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcatt 15892926  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  15892925 gtacaaccagacagggcaagcccccacctgatcctttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgt 15892858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 29149074 - 29148907
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  29149074 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcatt 29148975  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  29148974 gtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 29148907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 116 - 277
Target Start/End: Original strand, 8295917 - 8296078
Alignment:
Q  116 caacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgtacaa 215  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8295917 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccacagagggcattgtacaa 8296016  T
Q  216 ccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  8296017 ccagacagggcaagcccctacctgatctgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgt 8296078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 108 - 277
Target Start/End: Original strand, 35880703 - 35880872
Alignment:
Q  108 cagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggca 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  35880703 cagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggca 35880802  T
Q  208 ttgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  35880803 ttgtacaaccaaacagggcaagcccccacctgatccgctgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgt 35880872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 18277480 - 18277204
Alignment:
Q  1 ctctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacag 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||| | || | ||||||||| || || ||||| || |  || |||  || |||     
T  18277480 ctctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaacat 18277381  T
Q  101 caaccatcagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccata 200  Q
    ||||   | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| |    
T  18277380 caactgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaa 18277281  T
Q  201 gagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  18277280 gagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatcagttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 18277204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 18292781 - 18292505
Alignment:
Q  1 ctctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacag 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||| | || | ||||||||| || || ||||| || |  || |||  || |||     
T  18292781 ctctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaacat 18292682  T
Q  101 caaccatcagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccata 200  Q
    ||||   | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| |    
T  18292681 caactgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaa 18292582  T
Q  201 gagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  18292581 gagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatcagttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 18292505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 18308082 - 18307806
Alignment:
Q  1 ctctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacag 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||| | || | ||||||||| || || ||||| || |  || |||  || |||     
T  18308082 ctctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaacat 18307983  T
Q  101 caaccatcagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccata 200  Q
    ||||   | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| |    
T  18307982 caactgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaa 18307883  T
Q  201 gagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  18307882 gagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatcagttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 18307806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 5609641 - 5609474
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  5609641 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcatt 5609542  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  5609541 gtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 5609474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Original strand, 5713166 - 5713333
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  5713166 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagccagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcatt 5713265  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  5713266 gtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 5713333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Original strand, 5724076 - 5724243
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  5724076 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagccagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcatt 5724175  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  5724176 gtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 5724243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 5757401 - 5757234
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  5757401 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagccagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcatt 5757302  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  5757301 gtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 5757234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 5768292 - 5768125
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  5768292 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagccagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcatt 5768193  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  5768192 gtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 5768125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Original strand, 28339241 - 28339408
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  28339241 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcatt 28339340  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  28339341 gtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 28339408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 31964792 - 31964625
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  31964792 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcatt 31964693  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  31964692 gtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 31964625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 50134390 - 50134223
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  50134390 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcatt 50134291  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  50134290 gtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 50134223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 110 - 276
Target Start/End: Original strand, 7996501 - 7996667
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  7996501 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcatt 7996600  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatg 276  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||    
T  7996601 gtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatg 7996667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 110 - 276
Target Start/End: Original strand, 10643009 - 10643175
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  10643009 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcatt 10643108  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatg 276  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||    
T  10643109 gtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatg 10643175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 110 - 276
Target Start/End: Original strand, 47023392 - 47023558
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  47023392 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcatt 47023491  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatg 276  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||    
T  47023492 gtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatg 47023558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 113 - 277
Target Start/End: Original strand, 4416861 - 4417025
Alignment:
Q  113 caacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgta 212  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  4416861 caacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgta 4416960  T
Q  213 caaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  4416961 caactagacagggcaaacccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 4417025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 113 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 28116270 - 28116106
Alignment:
Q  113 caacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgta 212  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  28116270 caacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccagagagggcattgta 28116171  T
Q  213 caaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  28116170 caactagacagggcaagcccccacttgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 28116106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Original strand, 7073151 - 7073318
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  7073151 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctacttttcctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcatt 7073250  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    |||| || ||| | || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  7073251 gtacgactagacaaggtaagcccccgcctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 7073318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 108 - 277
Target Start/End: Original strand, 10396070 - 10396239
Alignment:
Q  108 cagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggca 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||| | ||||  ||||||||||| ||||| ||    
T  10396070 cagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggaca 10396169  T
Q  208 ttgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
     || ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  10396170 ctgcacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 10396239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 137 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 22387870 - 22387730
Alignment:
Q  137 gctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccac 236  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22387870 gctagaccgacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 22387771  T
Q  237 ctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  22387770 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 22387730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 17985275 - 17985108
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||| | ||||  ||| ||||||| ||||||||||    
T  17985275 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcatt 17985176  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || || ||||||    
T  17985175 gtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgt 17985108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 108 - 277
Target Start/End: Original strand, 21674630 - 21674799
Alignment:
Q  108 cagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggca 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||  | ||||  ||| ||||||| ||||||||    
T  21674630 cagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccaaagagggca 21674729  T
Q  208 ttgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    |||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  21674730 ttgtacgactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 21674799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Original strand, 18225130 - 18225297
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||  ||  | ||||  ||| ||||||| ||||| ||||    
T  18225130 gttcaacaacaacaacaaaatcaacaagctaggcctaccttccctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcatt 18225229  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  18225230 gtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 18225297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 110 - 276
Target Start/End: Original strand, 24328098 - 24328264
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || || || |||||||| ||||||||||||||||  ||  | ||||  ||| ||||||| ||||| ||||    
T  24328098 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagccaggccaaccttccctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcatt 24328197  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatg 276  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||    
T  24328198 gtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatg 24328264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 110 - 276
Target Start/End: Original strand, 5013651 - 5013817
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||| |  ||  | ||||  ||| ||||||| ||||||||||    
T  5013651 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagccaggccaacttttcctcctataccaatgttgtacgcggaacttcttccaactctactccagagagggcatt 5013750  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatg 276  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||    
T  5013751 gtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatg 5013817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 113 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 6542778 - 6542614
Alignment:
Q  113 caacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgta 212  Q
    ||||||||||| ||| | ||| |  ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||| || || |    
T  6542778 caacaacaacagcagcagcagtatactagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgca 6542679  T
Q  213 caaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  6542678 caactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 6542614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 113 - 277
Target Start/End: Original strand, 18242681 - 18242845
Alignment:
Q  113 caacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgta 212  Q
    ||||||||||||||| | ||| |  ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||  | ||||  ||||||||||| ||||| |||||||    
T  18242681 caacaacaacaacagcagcagtatactagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacattgta 18242780  T
Q  213 caaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  18242781 caactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 18242845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 134 - 273
Target Start/End: Original strand, 18530351 - 18530490
Alignment:
Q  134 caagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgtacaaccagatagggcaagcccc 233  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| |||||| || |||||| |||| |  |||||||| || ||||||||| |||||||||| |    
T  18530351 caagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgctgagttactcctgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 18530450  T
Q  234 cacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaa 273  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||    
T  18530451 cacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaa 18530490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 16626931 - 16626662
Alignment:
Q  1 ctctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacag 100  Q
    |||||| ||||| ||||| || || || || ||||| |||||| | ||||| || | ||||| ||||||||| ||||| || || ||||| | || |||     
T  16626931 ctctcagcatcccttctttccaccgttctatcatcagtatcctctaccatcgggtcaacctccggtacccgttaatgccatcgttcagcaaatgcaacaa 16626832  T
Q  101 caaccatcagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccata 200  Q
    || ||| ||| |||||||||||| |||   || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||| | ||||| ||||| || |  ||| |||| | ||    
T  16626831 cagccaccagctcaacaacaacagcag---caacaagctagacctacctttcctccgataccaatgatatatgtcgagttactccctactctacttctta 16626735  T
Q  201 gagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaa 273  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||    
T  16626734 gagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaa 16626662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 113 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 36997396 - 36997229
Alignment:
Q  113 caacaacaacaacagaatcagcaa---gctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||| | ||||||    | ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||| | ||||  ||| ||||||| ||||||||||    
T  36997396 caacaacaacaacagcagcagcaatataccagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcatt 36997297  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  36997296 gtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 36997229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 113 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 5596673 - 5596509
Alignment:
Q  113 caacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgta 212  Q
    ||||||||||| ||| | ||| |  ||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||  ||  | ||||  ||| ||||||| ||||| |||||||    
T  5596673 caacaacaacagcagcagcagtatactagaccaaccttccctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgta 5596574  T
Q  213 caaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  5596573 caactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 5596509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 277
Target Start/End: Original strand, 5466816 - 5467091
Alignment:
Q  2 tctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacagc 101  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | || | ||||||||| || || ||||| || |  || |||   | ||  |    
T  5466816 tctcagcatccgttcttcccaccattttatcatcagtaccctttgccacccggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtacaacgtc 5466915  T
Q  102 aaccatcagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatag 201  Q
    ||||  |||||||||| || || ||| | ||  | | |||||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||  ||  | ||||  ||| ||||||| ||    
T  5466916 aaccgccagttcaacagcagcagcagcagcaatatgatagaccaacttttcctcttatacctatgttgtatgcagaactccttccaactctactccagag 5467015  T
Q  202 agggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  5467016 agggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 5467091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 182 - 277
Target Start/End: Original strand, 51782034 - 51782129
Alignment:
Q  182 cttctgactttactccatagagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  51782034 cttctaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 51782129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 137 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 22871148 - 22871008
Alignment:
Q  137 gctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccac 236  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||  | ||||  ||| ||||||| |||||||||||||| || ||  |||| ||||||||||    
T  22871148 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactaggcagggtaagcccccac 22871049  T
Q  237 ctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  22871048 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 22871008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 137 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 22886207 - 22886067
Alignment:
Q  137 gctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccac 236  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||  | ||||  ||| ||||||| |||||||||||||| || ||  |||| ||||||||||    
T  22886207 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactaggcagggtaagcccccac 22886108  T
Q  237 ctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  22886107 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 22886067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 137 - 277
Target Start/End: Original strand, 28021241 - 28021381
Alignment:
Q  137 gctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccac 236  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||  | ||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  28021241 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactatactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccac 28021340  T
Q  237 ctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||| || | ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  28021341 ctgatccattacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 28021381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 137 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 4346979 - 4346839
Alignment:
Q  137 gctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccac 236  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||  | ||||  ||||||||||| ||||| || || || || ||| |||| ||||||||||    
T  4346979 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccac 4346880  T
Q  237 ctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  4346879 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 4346839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 182 - 277
Target Start/End: Original strand, 51797123 - 51797219
Alignment:
Q  182 cttctgactttactccatagagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttc-ccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||| || |||||||||    
T  51797123 cttctaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctcacaaggttcaggtctgatctcaaatgt 51797219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 146 - 277
Target Start/End: Original strand, 8211713 - 8211844
Alignment:
Q  146 actttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgt 245  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||  | ||||  ||| ||||||| |||||||||||||| || ||  |||| |||||||||||||||||||    
T  8211713 acttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactaggcagggtaagcccccacctgatccgt 8211812  T
Q  246 tgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  8211813 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 8211844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Original strand, 32292691 - 32292858
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||| ||||||| |||| | || |||||||||||||| || ||||  ||||| ||| | |||| ||||||||| | |||| |||| |  |||||||| |    
T  32292691 gttcaccaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcact 32292790  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    | |||| |||| |||| ||| | |||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  32292791 gcacaatcagacaggggaagtctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgt 32292858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 140 - 277
Target Start/End: Original strand, 48465896 - 48466033
Alignment:
Q  140 agacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctg 239  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||  | ||||  ||||||||||| ||||| || || || || ||| |||| |||||||||||||    
T  48465896 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccaaagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctg 48465995  T
Q  240 atccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  48465996 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 48466033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 31034436 - 31034269
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||| ||||||| |||| | || || ||||||||||| || ||||  ||||| ||| | |||| ||||||||| | |||| |||| |  |||||||| |    
T  31034436 gttcaccaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcact 31034337  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    | |||| |||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  31034336 gcacaatcagacaggggaagcctccacctgatccgttacctcctaggttccggtctgacctcaaatgt 31034269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 17994209 - 17993936
Alignment:
Q  1 ctctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacag 100  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||  | || ||||  | || |||     
T  17994209 ctctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaa 17994110  T
Q  101 caaccatcagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccata 200  Q
    || ||  ||| |||||||| ||| ||| | |||   ||||||||||| || ||||  ||||| ||||| |||| ||| || || | |||| |||| |  |    
T  17994109 cagcctccagctcaacaacgacagcagcaacag---gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctca 17994013  T
Q  201 gagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
     |||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||| | || ||||| |||| | || ||||||||||||    
T  17994012 aagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaaatgt 17993936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 11110638 - 11110501
Alignment:
Q  140 agacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctg 239  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||  | ||||  ||||||||||| ||||| || || || || ||| |||| ||||| |||||||    
T  11110638 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcctccacctg 11110539  T
Q  240 atccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  11110538 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 11110501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 4625777 - 4626046
Alignment:
Q  1 ctctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacag 100  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||   | || ||||  | || |||     
T  4625777 ctctcagcatcccttctttccaccattatatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgtcgtcgtccagcgaatgcaacaa 4625876  T
Q  101 caaccatcagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccata 200  Q
    || ||  ||| |||||||| ||| |||   || || ||||||||||| || ||||  ||||| ||||| |||| ||| || || | |||| |||| |  |    
T  4625877 cagcctccagctcaacaacgacagcag---caacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctca 4625973  T
Q  201 gagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaa 273  Q
     |||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||| | || ||||| |||| | || ||||||||    
T  4625974 aagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaa 4626046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 20577136 - 20577039
Alignment:
Q  140 agacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacc 237  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||| || || || || ||  |||||||||| |||||    
T  20577136 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccacc 20577039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 113 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 29665289 - 29665162
Alignment:
Q  113 caacaacaacaacagaatcagcaa---gctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||| | ||||||    | ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||| || |    
T  29665289 caacaacaacaacagcagcagcaatataccagaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacact 29665190  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacc 237  Q
    | || || ||  |||||||||| |||||    
T  29665189 gcacgactaggcagggcaagcctccacc 29665162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 5652220 - 5652489
Alignment:
Q  1 ctctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacag 100  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||| ||||| ||| || | ||||||||||||||| |||||  | || ||||  | || |||     
T  5652220 ctctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcgtttgcaatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaa 5652319  T
Q  101 caaccatcagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccata 200  Q
    || ||  ||| |||||||| ||| ||| | |||   ||||||||||| || ||||  ||||| ||||| |||| ||| || || | |||| ||||||  |    
T  5652320 cagcctccagctcaacaacgacagcagcaacag---gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctactcctca 5652416  T
Q  201 gagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaa 273  Q
     |||||| || ||||||||| ||||||||||  ||||||| |||| || ||||| |||| | || ||||||||    
T  5652417 aagggcactgcacaaccagacagggcaagccttcacctgacccgtcgcctcccaagttccgttcggacctcaa 5652489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 2 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 28116384 - 28116303
Alignment:
Q  2 tctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattg 83  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||| | || | |||||| |||||||| ||||| ||||    
T  28116384 tctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattg 28116303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 408 - 240
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatg-ttgagttgcttctgactttactccatagagggcat 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  408 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctttagttgcttccgactttactccatagagggcat 309  T
Q  209 tgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  308 tgtacaaccagacagggcaagcccccaccggatccgttgcctcccaagttcaggtccgatctcaaatgt 240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 7517 - 7350
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  7517 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcatt 7418  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  7417 gtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 7350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 9)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 41793694 - 41793419
Alignment:
Q  2 tctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacagc 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||| | || | |||||| || ||||| ||||| ||||  |  |||| |  ||| |    
T  41793694 tctcaacatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctccacagatgaaacaac 41793595  T
Q  102 aaccatcagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatag 201  Q
    |     | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||    
T  41793594 agatgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagag 41793495  T
Q  202 agggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  41793494 agggcattgtacaactagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 41793419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 110 - 276
Target Start/End: Original strand, 28584958 - 28585124
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  28584958 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcatt 28585057  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatg 276  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||    
T  28585058 gtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatg 28585124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Original strand, 10962647 - 10962814
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||    
T  10962647 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttgctccagagagggcatt 10962746  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  10962747 gtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 10962814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Original strand, 51638195 - 51638362
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||  ||  | ||||  ||| ||||||| ||||||||||    
T  51638195 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttcccttcgataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcatt 51638294  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    |||| || ||  |||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  51638295 gtacgactaggcagggtaagcccccacctgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 51638362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 59 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 16208354 - 16208146
Alignment:
Q  59 cctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacagcaaccatcagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaa 158  Q
    |||||||||||| | ||||| || || ||||| | || ||| || ||| ||||||||||||||||      ||| |||||||||||||| || ||||| |    
T  16208354 cctcaggtacccattaatgccatcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaaca------tcaacaagctagacctacctttcctccga 16208261  T
Q  159 taccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggtt 258  Q
    |||| |||||||||   ||||| || | |||| |||| |  |||||||| || ||||||||| |||| || || |||||||||||||||| |||||||||    
T  16208260 taccaatgttgtataccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggaaaacctccacctgatccgttgcctcccaggtt 16208161  T
Q  259 caggtccgacctcaa 273  Q
    | | || ||||||||    
T  16208160 ccgttctgacctcaa 16208146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 20340719 - 20340450
Alignment:
Q  1 ctctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacag 100  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||  | || || || | || |||     
T  20340719 ctctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccgtcgttcaacaaatgcaacaa 20340620  T
Q  101 caaccatcagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccata 200  Q
    || ||  ||| |   |||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||| | ||||  ||| | || |  ||| |||| |  |    
T  20340619 cagcctccagct---caacaacaacagcatcagcaagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagctactcccaactctacttctca 20340523  T
Q  201 gagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaa 273  Q
    ||||||| |  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||| | || ||||||||    
T  20340522 gagggcactacacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttacctcctaggttccgttctgacctcaa 20340450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 134 - 273
Target Start/End: Original strand, 20461082 - 20461221
Alignment:
Q  134 caagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgtacaaccagatagggcaagcccc 233  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||  ||| | ||||  ||||| || | |||| |||| |  |||||||| || ||||||||| |||||||||| |    
T  20461082 caagctagacctacctttcctccgatactaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctc 20461181  T
Q  234 cacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaa 273  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||    
T  20461182 cacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaa 20461221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Original strand, 28151839 - 28152006
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||| ||||||| |||| | || |||||||||||||| || ||||  ||||| ||| | |||| ||||||||| | |||| |||| |  |||||||| |    
T  28151839 gttcaccaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcact 28151938  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    | |||| |||| |||| ||||| |||||||||| ||| | ||||||| || |||| ||||||||||||    
T  28151939 gcacaatcagacaggggaagcctccacctgatctgttacctcccaggctccggtctgacctcaaatgt 28152006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 20460976 - 20461053
Alignment:
Q  1 ctctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgc 78  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||| || |||||||||||| | ||||| || | ||||||||||||||| |||||    
T  20460976 ctctcagcatcctttctttccaccattctatcatcaatatcctctaccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 20461053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 110 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 9344 - 9178
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  9344 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcatt 9245  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatg 276  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||    
T  9244 gtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatg 9178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 110 - 276
Target Start/End: Original strand, 19993 - 20159
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  19993 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcatt 20092  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatg 276  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||    
T  20093 gtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatg 20159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 92; Significance: 9e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 15208 - 15041
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||  | ||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  15208 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagatcttcttccaactttactccagagagggcatt 15109  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  15108 gtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 15041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 110 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 26480 - 26312
Alignment:
Q  110 gttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcatt 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||| | ||||  ||| ||||||| ||||||||||    
T  26480 gttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcatt 26381  T
Q  210 gtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcc-caggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| || |||||||||    
T  26380 gtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaaggttcaggtctgatctcaaatgt 26312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 108 - 277
Target Start/End: Original strand, 30429 - 30597
Alignment:
Q  108 cagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggca 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||  ||  | ||||  || |||||||| ||||| ||    
T  30429 cagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttcc-tcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtca 30527  T
Q  208 ttgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || || ||||||    
T  30528 ttgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgt 30597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 119 - 273
Target Start/End: Original strand, 20375 - 20529
Alignment:
Q  119 caacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgtacaacca 218  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||| || || || ||||| |||||||||| |||||| || | |||| |||| |  |||||||| || |||||||    
T  20375 caacaacagcagcaacaagctagacctacctttcccccgataccaatgttgtatgctgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaacca 20474  T
Q  219 gatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaa 273  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||    
T  20475 gacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaa 20529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 20281 - 20358
Alignment:
Q  1 ctctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgc 78  Q
    |||||| ||||| ||||| ||  |||| || ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||    
T  20281 ctctcagcatcccttctttccatcattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 20358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 146 - 277
Target Start/End: Original strand, 7963 - 8094
Alignment:
Q  146 actttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgt 245  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||    
T  7963 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacaaggcaagccaccacctgatccgt 8062  T
Q  246 tgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  8063 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 8094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2173 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold2173
Description:

Target: scaffold2173; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 53 - 127
Target Start/End: Original strand, 1 - 75
Alignment:
Q  53 ggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacagcaaccatcagttcaacaacaacaacag 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  1 ggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcaacagaagccacaacaaccaccagttcagcaacaacaacag 75  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2173; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 213
Target Start/End: Original strand, 94 - 170
Alignment:
Q  137 gctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgtac 213  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| || ||||  || ||||| || ||||| ||||||||    
T  94 gctaggcctacttttcctccaatcccgatgttgtatgctgatttacttccaacattacttcagagaggtcattgtac 170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 138 - 277
Target Start/End: Original strand, 6015 - 6157
Alignment:
Q  138 ctagaccta-ctttccctccaataccgatgttg-tatgttgagttgcttctgacttt-actccatagagggcattgtacaaccagatagggcaagccccc 234  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||||||||||  |||| |||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||| ||    
T  6015 ctagacctaacttttcctcctataccgatgtttatatgctgagttgcttccaacttttactccaaagagggcattgtacgactagacagggcaagccacc 6114  T
Q  235 acctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  6115 acctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgt 6157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 2103 - 2032
Alignment:
Q  202 agggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaa 273  Q
    |||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||    
T  2103 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaa 2032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 137 - 277
Target Start/End: Original strand, 9571 - 9711
Alignment:
Q  137 gctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccac 236  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||  | ||||  ||| ||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  9571 gctagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagcccccac 9670  T
Q  237 ctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaaatgt 277  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| || || |||||||||    
T  9671 ctgatccgttgcctccaaggttcagatctgatctcaaatgt 9711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Original strand, 8102 - 8166
Alignment:
Q  2 tctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggt 66  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||| |||| | |||||||||    
T  8102 tctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtatcctttgccaccaggccaacctcaggt 8166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 134 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 47072 - 46919
Alignment:
Q  134 caagctagacctacttt-ccctccaatacc-gatgttgtatgttgagttgcttctgac---tttactccatagaggg-cattgtacaacc-agatagggc 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||   |   |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  47072 caagctagacctacttttccctccgatacccgatgttgtatgctgagttgcttccccccgatttactccatagagggacattgtacaacctagacagggc 46973  T
Q  227 aa--gcccccacctgatccgttgcttcccaggttc-aggtccgacctcaaatgt 277  Q
    ||  |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  46972 aaacgcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaaggtccgatctcaaatgt 46919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 3042 - 2773
Alignment:
Q  1 ctctcaacatccgttcttcccgccattttaccatcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcagcagaagccacag 100  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||  | || || || | || |||     
T  3042 ctctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccgtcgttcaacaaatgcaacaa 2943  T
Q  101 caaccatcagttcaacaacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccata 200  Q
    || ||  ||| |   |||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||| | ||||  ||| | || |  ||| |||| |  |    
T  2942 cagcctccagct---caacaacaacagcatcagcaagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagctactcccaactctacttctca 2846  T
Q  201 gagggcattgtacaaccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaa 273  Q
    ||||||| |  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||| | || ||||||||    
T  2845 gagggcactacacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttacctcctaggttccgttctgacctcaa 2773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0558 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0558
Description:

Target: scaffold0558; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 300 - 143
Alignment:
Q  116 caacaacaacagaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttgtatgttgagttgcttctgactttactccatagagggcattgtacaa 215  Q
    ||||| |||||| | || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||| | ||||  ||||| || | |||| |||| |  |||||||| ||  |||    
T  300 caacagcaacagcagcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgctcaa 201  T
Q  216 ccagatagggcaagcccccacctgatccgttgcttcccaggttcaggtccgacctcaa 273  Q
    ||||| | |||||||| |||||||||||||||| | |||||||| | || ||||||||    
T  200 ccagacatggcaagcctccacctgatccgttgccttccaggttccgttctgacctcaa 143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University