View Alignment
This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF8680_1 (Length: 789)
Name: NF8680_1
Description: NF8680
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF8680_1 |
 | |
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| [»] chr6 (1 HSPs) |
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| [»] chr2 (4 HSPs) |
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| [»] chr8 (1 HSPs) |
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| [»] chr4 (2 HSPs) |
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Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 710; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 710; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 34681831 - 34681045
Alignment:
| Q |
1 |
ctagtcaacataaagatgacaaagattgatatcgcataaatgaaaaaagctttaatcactcttgattcaagcaacatggcattttgcaaagcaaatattt |
100 |
Q |
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| T |
34681831 |
ctagtcaacataaagatgacaaagattgatatcgcataaatgaagaaagctttaatcactcttgattcgagcaacatggcattttgcaaagcaaatattt |
34681732 |
T |
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| Q |
101 |
tatccaaagcaacaaacatggtagcctgttttgcttcaaaagtttcctataaaatataagtagagataaagtataagtagatgttattaatcaaagaaat |
200 |
Q |
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| T |
34681731 |
tatccaaagcaacaaacatcgtagcctgttttgcttcaaaagtttcctataaaatataagtagagataaagtataagtagatgttcttaatcaaagaaat |
34681632 |
T |
|
| Q |
201 |
tattaacgatgcatatgtatttggattcaacactatagttgcaaacctgagcagataatattgtttttgaattttccattaaccgatcgtgaagaccttg |
300 |
Q |
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| T |
34681631 |
tattaaggatgcatgtgtataaggattcaacactatagttgcaaacctgagcagataatactgtttttgaattttccattaaccgatcgtgaagaccttg |
34681532 |
T |
|
| Q |
301 |
catctgctcttgacgttgtaaaagctcttcttgttgcttatgtccatattcagaaaaatattgtaggcttttcctacatttcaccaattatgaggttagc |
400 |
Q |
| |
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|
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| T |
34681531 |
catctgctcttgacgttgtaaaagctcttcttgttgcttatgtccatattcagaaaaatattgtacgcttttcctacatttcaccaattatgaggttagc |
34681432 |
T |
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| Q |
401 |
actttgcataatatgatttatgaatatattacaaatttataacatttaaccgatcttacctgctttcctctagtgctttgaattgaacctcgttcaatga |
500 |
Q |
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| T |
34681431 |
actttgcataatatgatttatgaatatatgacaaatttataacatttaaccgatcttacctgctttcctctagtgctttgaattgaacctcgttcaatga |
34681332 |
T |
|
| Q |
501 |
atttagtcccttgagtgccgtggattgtccgtctaaaagttcttgttgtttttctaaggaaacccctgccatatttccaatatcttccgccttagtttgt |
600 |
Q |
| |
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|
| T |
34681331 |
atttagtcccttgagtgccgtggattgtccgtctaaaagttcttgttgtttttctaaggaaacccctgccatatttccaatatcttccgccttagtttgt |
34681232 |
T |
|
| Q |
601 |
agagtgttcatctttgatgacatagtatctccaactttgataacttcattctcaatctgaatggcttcatctcactcgacttttctatttcttttcccaa |
700 |
Q |
| |
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| T |
34681231 |
agagtgttcatctttgatgacatagtatttccaactttgataacttcattctcaatctcaatggcttcatct--cttaacttttctatttcttttcccaa |
34681134 |
T |
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| Q |
701 |
ataactataagattctttgagcaatgtgacaccatcctctaacttcctcttcatgtcctcttgaccttcttctaattgcgattgtgatg |
789 |
Q |
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|
|
| T |
34681133 |
ataactataagattctttgagcaatgctacaccatcctctaacttcctcttcatgtcctcttgaccttcttctaattgcgattgtgatg |
34681045 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 698; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 698; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 26979436 - 26978650
Alignment:
| Q |
1 |
ctagtcaacataaagatgacaaagattgatatcgcataaatgaaaaaagctttaatcactcttgattcaagcaacatggcattttgcaaagcaaatattt |
100 |
Q |
| |
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|
|
| T |
26979436 |
ctagtcaacataaagatgacaaagattgatatcgcataaatgaagaaagctttaatcactcttgattcgagcaacatggcattttgcaaagcaaatattt |
26979337 |
T |
|
| Q |
101 |
tatccaaagcaacaaacatggtagcctgttttgcttcaaaagtttcctataaaatataagtagagataaagtataagtagatgttattaatcaaagaaat |
200 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
26979336 |
tatccaaagcaacaaacatggtagcctgttttgcttcgaaagtttcctataaaatataagtagagataaagtataagtagatgttcttaatcaaagaaat |
26979237 |
T |
|
| Q |
201 |
tattaacgatgcatatgtatttggattcaacactatagttgcaaacctgagcagataatattgtttttgaattttccattaaccgatcgtgaagaccttg |
300 |
Q |
| |
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|||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
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|
| T |
26979236 |
tattaaggatgcatgtgtataaggattcaacactatagttgcaaacctgagcagataatattgtttttgaattttccattagccgatcgtgaagaccttg |
26979137 |
T |
|
| Q |
301 |
catctgctcttgacgttgtaaaagctcttcttgttgcttatgtccatattcagaaaaatattgtaggcttttcctacatttcaccaattatgaggttagc |
400 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
26979136 |
catctgctcttgacgttgtaaaagctcttcttgttgcttatgtccatattcagaaaaatattgtaggcttttcctacatttcaccaattatgaggttaac |
26979037 |
T |
|
| Q |
401 |
actttgcataatatgatttatgaatatattacaaatttataacatttaaccgatcttacctgctttcctctagtgctttgaattgaacctcgttcaatga |
500 |
Q |
| |
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|
|
| T |
26979036 |
actttgcataatatgatttatgaatatattacaaatttataacatttaaccgatcctacctgctttcctccagtgctttgaattgaacctcgttcaatga |
26978937 |
T |
|
| Q |
501 |
atttagtcccttgagtgccgtggattgtccgtctaaaagttcttgttgtttttctaaggaaacccctgccatatttccaatatcttccgccttagtttgt |
600 |
Q |
| |
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|
| T |
26978936 |
atttagtcccttgagcgcggtggattgtccgtctaaaagttcttgttgtttttctaaggaaacccctgccatatttccaatatcttccgccttagtttgt |
26978837 |
T |
|
| Q |
601 |
agagtgttcatctttgatgacatagtatctccaactttgataacttcattctcaatctgaatggcttcatctcactcgacttttctatttcttttcccaa |
700 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26978836 |
agagtgttcatctttgatgacatagtatttccaactttgataacttcattctcaatctcaatggcttcatct--cttaacttttctatttcttttcccaa |
26978739 |
T |
|
| Q |
701 |
ataactataagattctttgagcaatgtgacaccatcctctaacttcctcttcatgtcctcttgaccttcttctaattgcgattgtgatg |
789 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26978738 |
ataactataagattctttgagcaatgctacaccatcctctaacttcctcttcatgtcctcttgaccttcttctaattgcgattgtgatg |
26978650 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 573; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 789
Target Start/End: Original strand, 27087244 - 27088033
Alignment:
| Q |
1 |
ctagtcaacataaagatgacaaagattgatatcgcataaatgaaaaaagctttaatcactcttgattcaagcaacatggcattttgcaaagcaaatattt |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
27087244 |
ctagtcaacataaagacgacaaagattgatatcacataaatgaagaaagctttaatcattcttgattcaagcaacatggcattttgcaaagcaaagattt |
27087343 |
T |
|
| Q |
101 |
tatccaaagcaacaaacatggtagcctgttttgcttcaaaagtttcctataaaatataagtagagataaagtataagtagatgttattaatcaaagaaat |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
27087344 |
tatccaaagcaacaaacatggtagcctgttttgcctcaaaagtttcctataaaatataagtagaggtaaagtataagtagatgttcttaatcaaaaaaat |
27087443 |
T |
|
| Q |
201 |
tattaacgatgcatatgtatttggattcaaca--------ctatagttgcaaacctgagcagataatattgtttttgaattttccattaaccgatcgtga |
292 |
Q |
| |
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|||||| ||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
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|
| T |
27087444 |
tattaaggatgcatgtgtataaggatctaacagccagaaactatagttgcaaacctgagcagataatattgtttttgaattttccattaaccgatcatga |
27087543 |
T |
|
| Q |
293 |
agaccttgcatctgctcttgacgttgtaaaagctcttcttgttgcttatgtccatattcagaaaaatattgtaggcttttcctacatttcaccaattatg |
392 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
27087544 |
agtccttgcatctgttcttgacgtcgtaaaagctcttcttgttgcttatgtccatattcagaaaaatattgtaggcttttcctacatttcaccaataatg |
27087643 |
T |
|
| Q |
393 |
aggttagcactttgcataatatgatttatgaatatattacaaatttataacatttaaccgatcttacctgctttcctctagtgctttgaattgaacctcg |
492 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |
|
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| T |
27087644 |
aggttagcactttgcatagtatgatttatgaata-----caaatttataacatttaaccaatcttacctgctttcctctaatgctttgagttgaacctcg |
27087738 |
T |
|
| Q |
493 |
ttcaatgaatttagtcccttgagtgccgtggattgtccgtctaaaagttcttgttgtttttctaaggaaacccctgccatatttccaatatcttccgcct |
592 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
27087739 |
ttcaatgaatttagtcccttgagtgccgtggattgtccgtctaaaagttcttgttgtttttctaaggaaacccctgccatatttccaatatcttccgctt |
27087838 |
T |
|
| Q |
593 |
tagtttgtagagtgttcatctttgatgacatagtatctccaactttgataacttcattctcaatctgaatggcttcatctcactcgacttttctatttct |
692 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
27087839 |
tggtttgtagagtgttcatctttgatgacatagcatctccaactttgatcacttcattttcaatctcaatggtttcatct--cttaacttttctatttct |
27087936 |
T |
|
| Q |
693 |
tttcccaaataactataagattctttgagcaatgtgacaccatcctctaacttcctcttcatgtcctcttgaccttcttctaattgcgattgtgatg |
789 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |
|
|
| T |
27087937 |
tttcccaaataactataagattctttgagcaatgcaaccccatcctctaattttctcttcatgtcctcttgaccttcttctagttgtgactgtgatg |
27088033 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 523; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 27021136 - 27020360
Alignment:
| Q |
1 |
ctagtcaacataaagatgacaaagattgatatcgcataaatgaaaaaagctttaatcactcttgattcaagcaacatggcattttgcaaagcaaatattt |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |
|
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| T |
27021136 |
ctagtcaacatgaagatgacaaagattgatatcgcataaatgaagaaagctttaatcactcttgattcaatcaacatggcattttgcaaagcaaagattt |
27021037 |
T |
|
| Q |
101 |
tatccaaagcaacaaacatggtagcctgttttgcttcaaaagtttcctataaaatataagtagagataaagtataagtagatgttattaatcaaag---- |
196 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||| || | ||||||| |
|
|
| T |
27021036 |
tatccaaagcaacaaacatggtagcctgttttgcctcaaaagtttcctataaagtataggtagagataaactattagtagatcttctgaatcaaaagaaa |
27020937 |
T |
|
| Q |
197 |
aaattattaacgatgcatatgtatttggattcaacact--------atagttgcaaacctgagcagataatattgtttttgaattttccattaaccgatc |
288 |
Q |
| |
|
||| |||||| ||||||| | ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27020936 |
aaaatattaaggatgcatgtttataaggatttaacactcggaaactatagttgcaaacctgagcagataatattgtttttgaattttccattaaccgatc |
27020837 |
T |
|
| Q |
289 |
gtgaagaccttgcatctgctcttgacgttgtaaaagctcttcttgttgcttatgtccatattcagaaaaatattgtaggcttttcctacatttcaccaat |
388 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
27020836 |
gtgaagtccttgcatctgctcttgacgtcttaaaagctcttcttgttgcttatgtccatattcagaaaaatattgtaggcttttcctacatctcaccaat |
27020737 |
T |
|
| Q |
389 |
tatgaggttagcactttgcataatatgatttatgaatatattacaaatttataacatttaaccgatcttacctgctttcctctagtgctttgaattgaac |
488 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
27020736 |
tatgaggttagcactttgcataatatgatttatgaata-----caaatttataaaatttgataaatcttacctgctttcctctaatgctttgaattgaac |
27020642 |
T |
|
| Q |
489 |
ctcgttcaatgaatttagtcccttgagtgccgtggattgtccgtctaaaagttcttgttgtttttctaaggaaacccctgccatatttccaatatcttcc |
588 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27020641 |
ctcgttcaatgaatttagtcccttgagtgctgtggattgcccatctaaaagttcatgttgtttttctaaggaaacccttgcaatatttccaatatcttcc |
27020542 |
T |
|
| Q |
589 |
gccttagtttgtagagtgttcatctttgatgacatagtatctccaactttgataacttcattctcaatctgaatggcttcatctcactcgacttttctat |
688 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||| |
|
|
| T |
27020541 |
gctttggtttgtagagtgttcatctttgatgacatagtatctccaactttgataacttcattctcaatctcaatggcttc--ctctcttaacttttctat |
27020444 |
T |
|
| Q |
689 |
ttcttttcccaaataactataagattctttgagcaatgtgacaccatcctctaacttcctcttcatgtcctcttgaccttcttc |
772 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
27020443 |
ttcttttcccaaataactataagattctttgagcaatgctacaccatcctctaacttcatcttcatgtcttcttgaccttcttc |
27020360 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 237 - 771
Target Start/End: Original strand, 39748288 - 39748815
Alignment:
| Q |
237 |
agttgcaaacctgagcagataatattgtttttgaattttccattaaccgatcgtgaagaccttgcatctgctcttgacgttgtaaaagctcttcttgttg |
336 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||| |||| |||| ||||||| || || || || ||| ||||||||| || || |
|
|
| T |
39748288 |
agttgcaaacctgagctgataatatttttttcgagctttccattaattgatcatgaacttcttgcatttgttcctgtcgccgtagaagctcttcatgctg |
39748387 |
T |
|
| Q |
337 |
cttatgtccatattcagaaaaatattgtaggcttttcctacatttcaccaattatgaggttagcactttgcataatatgatttatgaatatattacaaat |
436 |
Q |
| |
|
||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| | | ||||||| | ||||| |
|
|
| T |
39748388 |
cttttgcccatattcagcaaaatattgtagatttttcctacatttcacaaattatgaggttaacattttgccaagttaaatttatgcctt-----caaat |
39748482 |
T |
|
| Q |
437 |
ttataacatttaaccgatcttacctgctttcctctagtgctttgaattgaacctcgttcaatgaatttagtcccttgagtgccgtggattgtccgtctaa |
536 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
39748483 |
ttatggcatttaatcaactttacctgctttcctctagtgctttgaattgaacctcattcaatgaatttaggaacttgagtgccgtggattgtccttctac |
39748582 |
T |
|
| Q |
537 |
aagttcttgttgtttttctaaggaaacccctgccatatttccaatatcttccgccttagtttgtagagtgttcatctttgatgacatagtatctccaact |
636 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| ||||| || | |||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
39748583 |
aagttgatgttgtttatctaaagagatccctgccacattttcaatatcttcagccttgctttgtagaatgttcatctttgatgacatagcatctccaact |
39748682 |
T |
|
| Q |
637 |
ttgataacttcattctcaatctgaatggcttcatctcactcgacttttctatttcttttcccaaataactataagattctttgagcaatgtgacaccatc |
736 |
Q |
| |
|
||||| || | ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
39748683 |
ttgattaccttattctcaatctcaatggcttcatct--cttaacttttctatttctttgcccaaataattataagactccttgagcaatgctaccccatc |
39748780 |
T |
|
| Q |
737 |
ctctaacttcctcttcatgtcctcttgaccttctt |
771 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
39748781 |
ctctaaattccttttcatgttctcttggccttctt |
39748815 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 357; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 11632963 - 11632198
Alignment:
| Q |
4 |
gtcaacataaagatgacaaagattgatatcgcataaatgaaaaaagctttaatcactcttgattcaagcaacatggcattttgcaaagcaaatattttat |
103 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
11632963 |
gtcaacataaaaatgacaaagattgatatggcatacatgaagaaagctttaatcaatcttgattcaagcaacatggcattttgcaaagcaaagattttat |
11632864 |
T |
|
| Q |
104 |
ccaaagcaacaaacatggtagcctgttttgcttcaaaagtttcctataaaatataagtagagataaagtataagtagatgttattaatcaaagaaattat |
203 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||| || ||||||||| |||| | |
|
|
| T |
11632863 |
ccaaagcaacaaacatggtagcttgttttgcctcaaaagtttcctgtaa-----------------agtataaatagatattcttaatcaaaataattgt |
11632781 |
T |
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| Q |
204 |
taacgatgcatatgtatttggattcaacac--------tatagttgcaaacctgagcagataatattgtttttgaattttccattaaccgatcgtgaaga |
295 |
Q |
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| T |
11632780 |
-aaggatgcatgtgtataaggatttaacacccagaaactatagtttcaaacctgagtagacaatattgtttttaaattttccattaaacgatcatgaatt |
11632682 |
T |
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| Q |
296 |
ccttgcatctgctcttgacgttgtaaaagctcttcttgttgcttatgtccatattcagaaaaatattgtaggcttttcctacatttcaccaattatgagg |
395 |
Q |
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| T |
11632681 |
ccttgcatctgttcttgacgtcgtaagagttcttcttgttgcttatgtccatattcagcaaaatattgtaggcttttcctacatttcaccaattatgagg |
11632582 |
T |
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| Q |
396 |
ttagcactttgcata------atatgatttatgaatatattacaaatttataacatttaaccgatcttacctgctttcctctagtgctttgaattgaacc |
489 |
Q |
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| T |
11632581 |
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11632496 |
T |
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| Q |
490 |
tcgttcaatgaatttagtcccttgagtgccgtggattgtccgtctaaaagttcttgttgtttttctaaggaaacccctgccatatttccaatatcttccg |
589 |
Q |
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| T |
11632495 |
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11632396 |
T |
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| Q |
590 |
ccttagtttgtagagtgttcatctttgatgacatagtatctccaactttgataacttcattctcaatctgaatggcttcatctcactcgacttttctatt |
689 |
Q |
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| T |
11632395 |
ctttgctttgtagcgtgttcatctttgatgacatagcatctccaactttgatcacttcattttcaatctcaatggcttcatct--cttaacttttctatt |
11632298 |
T |
|
| Q |
690 |
tcttttcccaaataactataagattctttgagcaatgtgacaccatcctctaacttcctcttcatgtcctcttgaccttcttctaattgcgattgtgatg |
789 |
Q |
| |
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| T |
11632297 |
tctttgcccaaataactataagattcctttagcaatgctacaccatcctctaatttcctcttcatgtcctcttgaccttcttctagttgtgattgcgatg |
11632198 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000005; HSPs: 2)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 732 - 789
Target Start/End: Original strand, 1959845 - 1959902
Alignment:
| Q |
732 |
ccatcctctaacttcctcttcatgtcctcttgaccttcttctaattgcgattgtgatg |
789 |
Q |
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| T |
1959845 |
ccatcctctaaattcctcttcatgtcctcttggccttcttttagttgtgattgtgatg |
1959902 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 613 - 673
Target Start/End: Original strand, 1959758 - 1959818
Alignment:
| Q |
613 |
tttgatgacatagtatctccaactttgataacttcattctcaatctgaatggcttcatctc |
673 |
Q |
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| T |
1959758 |
tttgatgacatagcatctccaactttgattaccttattctcaatttcaatggcttcatctc |
1959818 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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