View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8733_low_3 (Length: 202)

Name: NF8733_low_3
Description: NF8733
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8733_low_3
NF8733_low_3
[»] chr7 (95 HSPs)
chr7 (1-178)||(33423276-33423453)
chr7 (1-179)||(47740331-47740509)
chr7 (1-179)||(25893917-25894095)
chr7 (1-179)||(33839715-33839893)
chr7 (1-180)||(45690096-45690275)
chr7 (1-179)||(17855433-17855611)
chr7 (1-179)||(22979647-22979825)
chr7 (1-179)||(23393051-23393229)
chr7 (1-179)||(33695821-33695999)
chr7 (1-179)||(35355893-35356071)
chr7 (1-179)||(47066977-47067155)
chr7 (1-179)||(49171362-49171540)
chr7 (1-179)||(46913114-46913294)
chr7 (1-179)||(20165814-20165992)
chr7 (1-179)||(27018121-27018299)
chr7 (1-179)||(35328069-35328247)
chr7 (1-179)||(45482663-45482841)
chr7 (5-179)||(2341661-2341836)
chr7 (1-179)||(33411265-33411443)
chr7 (17-179)||(36389377-36389539)
chr7 (1-179)||(40670568-40670746)
chr7 (1-179)||(26579717-26579895)
chr7 (1-179)||(31586853-31587031)
chr7 (1-179)||(37846016-37846194)
chr7 (1-179)||(48609677-48609855)
chr7 (1-179)||(10028493-10028673)
chr7 (1-170)||(15877555-15877724)
chr7 (1-184)||(19563452-19563635)
chr7 (13-179)||(5183825-5183991)
chr7 (1-179)||(5712173-5712351)
chr7 (1-179)||(33332794-33332971)
chr7 (1-179)||(35757020-35757198)
chr7 (1-179)||(35767486-35767657)
chr7 (1-179)||(31625709-31625886)
chr7 (1-179)||(45063357-45063533)
chr7 (1-179)||(31429475-31429653)
chr7 (5-167)||(41990870-41991032)
chr7 (5-179)||(43499494-43499668)
chr7 (1-178)||(33870250-33870424)
chr7 (21-179)||(29446863-29447020)
chr7 (48-179)||(30076527-30076658)
chr7 (1-186)||(10618303-10618481)
chr7 (47-179)||(28233936-28234068)
chr7 (1-145)||(33720070-33720214)
chr7 (1-179)||(35752034-35752201)
chr7 (1-179)||(43489223-43489390)
chr7 (1-185)||(46817415-46817588)
chr7 (8-179)||(37127949-37128109)
chr7 (1-179)||(24923024-24923191)
chr7 (1-179)||(36816845-36817012)
chr7 (1-179)||(7876328-7876495)
chr7 (1-179)||(48085863-48086030)
chr7 (60-179)||(44405412-44405531)
chr7 (14-155)||(44564356-44564497)
chr7 (1-179)||(21718122-21718288)
chr7 (1-179)||(24228546-24228713)
chr7 (8-170)||(26941541-26941692)
chr7 (1-179)||(29610640-29610807)
chr7 (63-179)||(41904272-41904388)
chr7 (1-179)||(46898016-46898183)
chr7 (8-179)||(26371061-26371221)
chr7 (1-171)||(25037516-25037675)
chr7 (1-178)||(45502817-45502983)
chr7 (1-179)||(45237533-45237700)
chr7 (1-178)||(33393333-33393499)
chr7 (8-179)||(498188-498348)
chr7 (1-179)||(2332024-2332191)
chr7 (1-179)||(7257386-7257553)
chr7 (1-179)||(44003370-44003537)
chr7 (1-177)||(39453484-39453642)
chr7 (1-179)||(47906758-47906926)
chr7 (1-175)||(29098756-29098915)
chr7 (1-104)||(16482847-16482950)
chr7 (1-177)||(35484641-35484807)
chr7 (1-145)||(32556640-32556773)
chr7 (2-178)||(46103127-46103291)
chr7 (1-94)||(39866670-39866763)
chr7 (1-175)||(41855064-41855228)
chr7 (1-179)||(44659849-44660015)
chr7 (1-179)||(39323621-39323779)
chr7 (1-177)||(15643948-15644113)
chr7 (8-108)||(38448508-38448608)
chr7 (5-179)||(47460772-47460935)
chr7 (1-94)||(33455101-33455194)
chr7 (5-93)||(29863024-29863112)
chr7 (36-179)||(37443602-37443734)
chr7 (114-179)||(42272180-42272244)
chr7 (1-93)||(7720578-7720670)
chr7 (1-61)||(30077043-30077103)
chr7 (5-64)||(35557739-35557798)
chr7 (5-104)||(21649442-21649542)
chr7 (121-179)||(33455201-33455259)
chr7 (1-59)||(35823295-35823353)
chr7 (121-165)||(39866762-39866806)
chr7 (46-89)||(26456159-26456202)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (1-179)||(39556-39734)
[»] chr8 (66 HSPs)
chr8 (1-179)||(32984077-32984255)
chr8 (1-181)||(41862224-41862404)
chr8 (5-179)||(9303574-9303748)
chr8 (5-179)||(24079901-24080075)
chr8 (1-179)||(37956425-37956603)
chr8 (1-179)||(10646127-10646305)
chr8 (1-179)||(40435153-40435331)
chr8 (1-179)||(43328711-43328889)
chr8 (1-179)||(5946051-5946229)
chr8 (1-179)||(9734259-9734435)
chr8 (1-175)||(31830959-31831133)
chr8 (1-179)||(33730641-33730819)
chr8 (2-177)||(32114254-32114429)
chr8 (1-179)||(2714553-2714730)
chr8 (1-179)||(6365990-6366168)
chr8 (5-179)||(13356120-13356294)
chr8 (1-179)||(17718722-17718900)
chr8 (5-179)||(33981663-33981837)
chr8 (1-179)||(41653899-41654077)
chr8 (1-178)||(37301326-37301503)
chr8 (1-179)||(2275917-2276094)
chr8 (1-179)||(25185903-25186081)
chr8 (1-179)||(37419944-37420122)
chr8 (1-179)||(45236565-45236743)
chr8 (1-179)||(9013688-9013865)
chr8 (1-179)||(41231950-41232128)
chr8 (5-181)||(35628785-35628961)
chr8 (5-179)||(45066592-45066766)
chr8 (1-179)||(13760646-13760826)
chr8 (1-176)||(44088446-44088621)
chr8 (1-178)||(22878395-22878572)
chr8 (1-180)||(25248043-25248216)
chr8 (1-156)||(29048426-29048581)
chr8 (53-179)||(12032986-12033112)
chr8 (5-178)||(41639922-41640095)
chr8 (5-179)||(45258518-45258691)
chr8 (46-179)||(3904126-3904258)
chr8 (63-179)||(41981534-41981650)
chr8 (1-179)||(4447295-4447462)
chr8 (1-167)||(42701301-42701468)
chr8 (1-179)||(117329-117496)
chr8 (1-179)||(31940319-31940485)
chr8 (1-182)||(10378313-10378483)
chr8 (66-179)||(31336163-31336276)
chr8 (1-179)||(41843257-41843424)
chr8 (1-179)||(9713693-9713857)
chr8 (1-179)||(3211210-3211376)
chr8 (9-173)||(40649837-40649990)
chr8 (8-179)||(40458772-40458932)
chr8 (1-179)||(2379144-2379311)
chr8 (8-174)||(4975412-4975567)
chr8 (1-104)||(39915887-39915990)
chr8 (2-173)||(32373733-32373892)
chr8 (1-179)||(9509400-9509567)
chr8 (1-179)||(33896843-33897009)
chr8 (1-94)||(27243213-27243306)
chr8 (1-94)||(27254788-27254881)
chr8 (8-179)||(33622467-33622625)
chr8 (18-99)||(41981454-41981535)
chr8 (1-179)||(3490399-3490566)
chr8 (1-162)||(38631656-38631806)
chr8 (5-179)||(26196317-26196479)
chr8 (1-106)||(31148953-31149057)
chr8 (104-179)||(41425429-41425503)
chr8 (3-66)||(164728-164791)
chr8 (114-179)||(39901674-39901739)
[»] chr6 (45 HSPs)
chr6 (1-179)||(5882510-5882688)
chr6 (1-184)||(8615244-8615427)
chr6 (1-179)||(18101495-18101673)
chr6 (1-175)||(14891383-14891557)
chr6 (1-179)||(22551061-22551239)
chr6 (1-179)||(24168095-24168273)
chr6 (1-179)||(26377204-26377382)
chr6 (1-177)||(2892192-2892368)
chr6 (1-179)||(19415533-19415711)
chr6 (5-179)||(34527862-34528036)
chr6 (10-179)||(11988974-11989143)
chr6 (1-179)||(959904-960082)
chr6 (1-179)||(1970715-1970893)
chr6 (1-179)||(7393586-7393764)
chr6 (1-179)||(28947091-28947269)
chr6 (1-170)||(16703370-16703539)
chr6 (1-177)||(7345114-7345290)
chr6 (10-179)||(22341788-22341959)
chr6 (1-179)||(2593852-2594030)
chr6 (1-178)||(19281056-19281233)
chr6 (1-179)||(599896-600074)
chr6 (1-179)||(10507908-10508086)
chr6 (1-179)||(33452572-33452750)
chr6 (1-179)||(24224070-24224249)
chr6 (1-179)||(5294801-5294979)
chr6 (1-179)||(5299353-5299531)
chr6 (1-179)||(30743448-30743626)
chr6 (1-126)||(30467656-30467781)
chr6 (29-179)||(23261929-23262079)
chr6 (1-179)||(28948845-28949012)
chr6 (1-172)||(13329385-13329545)
chr6 (1-179)||(15965437-15965604)
chr6 (1-180)||(7167586-7167754)
chr6 (16-179)||(4487546-4487698)
chr6 (1-179)||(3291012-3291179)
chr6 (1-179)||(3786753-3786920)
chr6 (1-180)||(1398557-1398725)
chr6 (104-179)||(18661830-18661905)
chr6 (1-79)||(929663-929741)
chr6 (104-179)||(24913096-24913171)
chr6 (3-94)||(1939578-1939669)
chr6 (1-53)||(11743070-11743122)
chr6 (120-179)||(34262342-34262401)
chr6 (120-177)||(375729-375786)
chr6 (5-85)||(375807-375887)
[»] chr5 (75 HSPs)
chr5 (1-179)||(24253386-24253564)
chr5 (1-179)||(43262183-43262361)
chr5 (1-180)||(43326378-43326557)
chr5 (5-179)||(27501055-27501229)
chr5 (1-178)||(15398483-15398660)
chr5 (1-184)||(739699-739882)
chr5 (1-179)||(35626042-35626220)
chr5 (1-182)||(6901803-6901984)
chr5 (1-180)||(5184976-5185155)
chr5 (1-184)||(12648801-12648984)
chr5 (1-179)||(3466681-3466859)
chr5 (1-179)||(7722053-7722231)
chr5 (1-179)||(15683795-15683973)
chr5 (1-179)||(18479668-18479846)
chr5 (5-179)||(39932587-39932761)
chr5 (1-179)||(40886028-40886205)
chr5 (1-180)||(27938901-27939081)
chr5 (1-179)||(2484292-2484470)
chr5 (8-179)||(31938908-31939079)
chr5 (1-179)||(25831525-25831702)
chr5 (1-178)||(27278474-27278655)
chr5 (1-179)||(28424795-28424971)
chr5 (8-179)||(40278858-40279029)
chr5 (1-179)||(5137719-5137897)
chr5 (34-179)||(29789295-29789440)
chr5 (5-179)||(38756487-38756662)
chr5 (1-179)||(13504742-13504920)
chr5 (1-179)||(890910-891087)
chr5 (1-179)||(763727-763905)
chr5 (46-179)||(34451299-34451432)
chr5 (1-177)||(40110238-40110413)
chr5 (1-179)||(19295734-19295901)
chr5 (1-179)||(27503383-27503550)
chr5 (1-179)||(33617589-33617756)
chr5 (1-179)||(38015514-38015681)
chr5 (1-179)||(23195248-23195415)
chr5 (1-178)||(9424593-9424759)
chr5 (1-160)||(4149698-4149847)
chr5 (1-179)||(5497277-5497444)
chr5 (1-179)||(6973067-6973234)
chr5 (1-179)||(13957674-13957841)
chr5 (8-170)||(42658671-42658822)
chr5 (1-179)||(31293989-31294167)
chr5 (1-179)||(9374502-9374669)
chr5 (1-179)||(36365445-36365612)
chr5 (1-141)||(40632503-40632634)
chr5 (8-179)||(14971989-14972149)
chr5 (26-179)||(3656568-3656710)
chr5 (31-179)||(38492647-38492783)
chr5 (1-180)||(2585466-2585634)
chr5 (1-179)||(24167784-24167951)
chr5 (1-108)||(12558090-12558196)
chr5 (8-156)||(6206895-6207032)
chr5 (5-179)||(27390605-27390768)
chr5 (1-179)||(38637910-38638077)
chr5 (8-105)||(5120036-5120132)
chr5 (30-177)||(36948492-36948626)
chr5 (1-94)||(42247856-42247949)
chr5 (1-179)||(1402505-1402672)
chr5 (1-179)||(18327173-18327340)
chr5 (1-104)||(36472348-36472451)
chr5 (2-178)||(33623940-33624105)
chr5 (107-179)||(612757-612830)
chr5 (1-179)||(40686903-40687069)
chr5 (1-82)||(9171111-9171192)
chr5 (8-64)||(15300977-15301033)
chr5 (5-64)||(9527124-9527183)
chr5 (121-184)||(42247786-42247849)
chr5 (116-184)||(3940331-3940399)
chr5 (21-88)||(3940411-3940478)
chr5 (105-179)||(9171035-9171108)
chr5 (142-179)||(21785995-21786032)
chr5 (1-67)||(33316320-33316386)
chr5 (26-94)||(612830-612897)
chr5 (1-57)||(28756082-28756138)
[»] chr4 (123 HSPs)
chr4 (1-179)||(31532135-31532313)
chr4 (1-179)||(21366609-21366787)
chr4 (1-179)||(34276551-34276729)
chr4 (1-179)||(237481-237659)
chr4 (5-179)||(9798473-9798647)
chr4 (1-179)||(18462013-18462191)
chr4 (1-179)||(23437596-23437774)
chr4 (1-178)||(6019932-6020109)
chr4 (1-186)||(42085211-42085396)
chr4 (1-179)||(39077549-39077727)
chr4 (1-179)||(44984765-44984943)
chr4 (1-179)||(53854430-53854607)
chr4 (1-178)||(32366661-32366838)
chr4 (1-179)||(2826682-2826859)
chr4 (1-179)||(19387688-19387866)
chr4 (1-179)||(31972336-31972514)
chr4 (1-179)||(41632007-41632184)
chr4 (1-179)||(51363011-51363188)
chr4 (1-179)||(53461816-53461994)
chr4 (1-179)||(54574940-54575118)
chr4 (1-177)||(41702461-41702637)
chr4 (1-179)||(146429-146607)
chr4 (1-179)||(3170630-3170808)
chr4 (1-179)||(22618514-22618690)
chr4 (1-179)||(26091258-26091436)
chr4 (1-179)||(29478364-29478542)
chr4 (5-179)||(31914206-31914379)
chr4 (1-179)||(42765842-42766019)
chr4 (1-179)||(43471695-43471873)
chr4 (5-179)||(45797487-45797661)
chr4 (1-179)||(47344660-47344838)
chr4 (1-179)||(54607966-54608144)
chr4 (1-179)||(55056259-55056437)
chr4 (1-179)||(41949386-41949566)
chr4 (5-177)||(397410-397582)
chr4 (1-177)||(50457812-50457988)
chr4 (1-176)||(6285311-6285486)
chr4 (1-179)||(407758-407934)
chr4 (1-179)||(23609091-23609269)
chr4 (1-179)||(27373080-27373257)
chr4 (5-175)||(50534639-50534809)
chr4 (5-179)||(55776053-55776226)
chr4 (5-179)||(55840231-55840404)
chr4 (1-179)||(56022998-56023176)
chr4 (8-179)||(41560339-41560510)
chr4 (1-179)||(2243462-2243640)
chr4 (1-179)||(29777257-29777435)
chr4 (1-175)||(35446510-35446683)
chr4 (1-179)||(42222295-42222473)
chr4 (1-179)||(49881059-49881241)
chr4 (1-178)||(53834055-53834232)
chr4 (1-179)||(3692210-3692388)
chr4 (1-179)||(31070074-31070251)
chr4 (1-179)||(50234004-50234182)
chr4 (1-179)||(54086414-54086590)
chr4 (1-179)||(55519831-55520009)
chr4 (1-179)||(38591672-38591846)
chr4 (1-185)||(54805608-54805796)
chr4 (5-179)||(42033183-42033357)
chr4 (1-179)||(47662102-47662280)
chr4 (1-179)||(48313561-48313737)
chr4 (1-179)||(14017376-14017552)
chr4 (5-179)||(48657832-48658000)
chr4 (1-179)||(1932767-1932945)
chr4 (1-162)||(39587796-39587957)
chr4 (3-179)||(54424988-54425163)
chr4 (5-180)||(50536623-50536798)
chr4 (1-161)||(22468788-22468948)
chr4 (1-177)||(51951686-51951861)
chr4 (5-170)||(33897504-33897669)
chr4 (1-179)||(36532830-36532998)
chr4 (37-180)||(52728306-52728448)
chr4 (1-179)||(48259512-48259688)
chr4 (8-179)||(45633779-45633939)
chr4 (5-179)||(48654822-48655002)
chr4 (1-179)||(15060289-15060456)
chr4 (1-179)||(9997931-9998098)
chr4 (1-179)||(5117438-5117605)
chr4 (1-179)||(22620597-22620764)
chr4 (1-179)||(37239090-37239257)
chr4 (1-179)||(46708741-46708908)
chr4 (1-179)||(47811910-47812077)
chr4 (1-184)||(34552323-34552495)
chr4 (82-179)||(35595772-35595869)
chr4 (1-179)||(20351842-20352009)
chr4 (1-179)||(43890932-43891099)
chr4 (1-179)||(52688353-52688520)
chr4 (1-179)||(54715039-54715206)
chr4 (1-179)||(27873550-27873715)
chr4 (1-179)||(31881314-31881481)
chr4 (1-177)||(54216317-54216482)
chr4 (1-179)||(4486581-4486748)
chr4 (52-184)||(42509351-42509483)
chr4 (11-179)||(49014112-49014269)
chr4 (1-179)||(33289707-33289873)
chr4 (1-179)||(34835181-34835348)
chr4 (5-179)||(38547601-38547764)
chr4 (1-179)||(54216736-54216903)
chr4 (1-179)||(52461370-52461534)
chr4 (106-178)||(33048990-33049062)
chr4 (46-135)||(52396775-52396865)
chr4 (77-178)||(35344868-35344968)
chr4 (1-179)||(14335101-14335268)
chr4 (1-175)||(27398607-27398770)
chr4 (1-179)||(27580123-27580290)
chr4 (1-175)||(46720029-46720195)
chr4 (1-179)||(1662261-1662426)
chr4 (1-94)||(3293097-3293190)
chr4 (1-161)||(33557960-33558109)
chr4 (102-179)||(48259704-48259780)
chr4 (1-179)||(573807-573974)
chr4 (1-179)||(6371249-6371416)
chr4 (1-81)||(42557586-42557666)
chr4 (1-93)||(43231507-43231598)
chr4 (1-94)||(11972203-11972296)
chr4 (104-179)||(51981479-51981554)
chr4 (111-179)||(3291805-3291873)
chr4 (30-179)||(27872612-27872750)
chr4 (8-179)||(18206512-18206682)
chr4 (74-179)||(42558270-42558367)
chr4 (1-103)||(49057933-49058035)
chr4 (1-40)||(17555625-17555664)
chr4 (1-85)||(43478064-43478147)
[»] chr2 (81 HSPs)
chr2 (1-179)||(17600839-17601017)
chr2 (1-179)||(746469-746647)
chr2 (1-179)||(23901782-23901960)
chr2 (1-180)||(38997104-38997283)
chr2 (1-179)||(4034595-4034773)
chr2 (1-179)||(6594458-6594636)
chr2 (1-179)||(45370993-45371171)
chr2 (1-180)||(11184975-11185154)
chr2 (1-179)||(2324889-2325067)
chr2 (1-179)||(13815218-13815396)
chr2 (1-179)||(14660449-14660627)
chr2 (1-179)||(26710348-26710526)
chr2 (1-179)||(27651034-27651212)
chr2 (5-179)||(34518374-34518548)
chr2 (1-179)||(40635221-40635399)
chr2 (1-173)||(6430476-6430648)
chr2 (1-176)||(10424598-10424773)
chr2 (5-179)||(10244582-10244756)
chr2 (1-179)||(27400406-27400584)
chr2 (1-179)||(32327364-32327542)
chr2 (1-179)||(27024418-27024596)
chr2 (1-179)||(33427647-33427825)
chr2 (1-179)||(40735467-40735645)
chr2 (5-179)||(1091951-1092125)
chr2 (5-179)||(4609633-4609807)
chr2 (1-179)||(5726132-5726310)
chr2 (1-179)||(32948449-32948626)
chr2 (1-179)||(7892688-7892866)
chr2 (1-179)||(40037146-40037323)
chr2 (5-179)||(2914138-2914312)
chr2 (5-179)||(14697537-14697711)
chr2 (1-179)||(37255337-37255510)
chr2 (5-179)||(37620867-37621044)
chr2 (1-173)||(15925083-15925255)
chr2 (1-180)||(11159625-11159803)
chr2 (12-179)||(32856436-32856603)
chr2 (1-179)||(9444686-9444874)
chr2 (1-145)||(32608383-32608527)
chr2 (49-176)||(25294886-25295013)
chr2 (1-153)||(8432942-8433094)
chr2 (1-145)||(12842106-12842250)
chr2 (1-179)||(35158050-35158217)
chr2 (8-145)||(41172468-41172605)
chr2 (1-184)||(28641287-28641459)
chr2 (1-178)||(39103050-39103216)
chr2 (1-184)||(29687044-29687216)
chr2 (1-122)||(42899918-42900039)
chr2 (1-179)||(12730064-12730231)
chr2 (1-179)||(27331301-27331472)
chr2 (72-179)||(447633-447740)
chr2 (45-179)||(1229674-1229809)
chr2 (1-177)||(145285-145450)
chr2 (1-179)||(4258493-4258659)
chr2 (1-179)||(21734900-21735067)
chr2 (12-184)||(19428421-19428582)
chr2 (8-179)||(13543624-13543784)
chr2 (1-180)||(39301196-39301364)
chr2 (1-179)||(2688729-2688896)
chr2 (1-179)||(12333497-12333662)
chr2 (1-180)||(27764862-27765029)
chr2 (1-179)||(43898971-43899137)
chr2 (29-179)||(3711664-3711803)
chr2 (1-179)||(44481831-44481998)
chr2 (71-180)||(12827136-12827244)
chr2 (8-179)||(34249275-34249435)
chr2 (1-174)||(28566703-28566865)
chr2 (1-179)||(43356102-43356266)
chr2 (72-141)||(28014856-28014925)
chr2 (1-77)||(12814617-12814693)
chr2 (1-174)||(35126783-35126945)
chr2 (1-180)||(2000338-2000504)
chr2 (1-177)||(3266299-3266455)
chr2 (1-94)||(40544150-40544243)
chr2 (1-162)||(8056629-8056779)
chr2 (5-179)||(30545828-30545991)
chr2 (121-179)||(40544085-40544143)
chr2 (1-64)||(10176562-10176625)
chr2 (1-40)||(28019960-28019999)
chr2 (102-179)||(10176637-10176714)
chr2 (29-104)||(38985342-38985416)
chr2 (124-179)||(42900781-42900835)
[»] chr1 (108 HSPs)
chr1 (1-179)||(31308005-31308183)
chr1 (1-179)||(45538157-45538335)
chr1 (1-179)||(3611140-3611318)
chr1 (1-179)||(44661974-44662152)
chr1 (1-179)||(17994951-17995129)
chr1 (1-179)||(21139412-21139590)
chr1 (1-179)||(23984759-23984937)
chr1 (1-173)||(4068689-4068861)
chr1 (1-177)||(43251715-43251891)
chr1 (1-179)||(5981174-5981352)
chr1 (1-179)||(25058692-25058870)
chr1 (5-179)||(25678259-25678433)
chr1 (1-179)||(46967041-46967219)
chr1 (1-179)||(47671590-47671768)
chr1 (1-179)||(6327548-6327725)
chr1 (1-179)||(24245025-24245203)
chr1 (1-179)||(26277181-26277359)
chr1 (1-179)||(31040713-31040891)
chr1 (1-179)||(35273600-35273778)
chr1 (1-179)||(36566334-36566512)
chr1 (1-179)||(38790197-38790375)
chr1 (1-179)||(41999819-41999997)
chr1 (1-179)||(46616553-46616731)
chr1 (5-182)||(37620189-37620366)
chr1 (4-179)||(26085398-26085572)
chr1 (1-180)||(33112817-33112995)
chr1 (1-179)||(23932509-23932687)
chr1 (1-179)||(38331859-38332037)
chr1 (1-179)||(39646572-39646750)
chr1 (1-179)||(49253975-49254153)
chr1 (8-179)||(47317326-47317497)
chr1 (1-179)||(33884092-33884270)
chr1 (1-179)||(33959982-33960160)
chr1 (1-182)||(5980072-5980253)
chr1 (8-175)||(26794315-26794482)
chr1 (1-184)||(50774221-50774404)
chr1 (1-179)||(24885505-24885683)
chr1 (1-179)||(26524889-26525067)
chr1 (1-179)||(46784427-46784605)
chr1 (1-179)||(47383732-47383910)
chr1 (1-179)||(51057075-51057253)
chr1 (1-175)||(23220939-23221107)
chr1 (1-179)||(35692663-35692842)
chr1 (1-179)||(47187109-47187287)
chr1 (1-179)||(49398988-49399166)
chr1 (1-178)||(3285406-3285582)
chr1 (1-179)||(36003134-36003315)
chr1 (1-166)||(42863869-42864034)
chr1 (1-176)||(28888585-28888760)
chr1 (1-148)||(31844380-31844527)
chr1 (1-135)||(25518818-25518952)
chr1 (1-179)||(48373508-48373677)
chr1 (1-179)||(42313361-42313543)
chr1 (32-179)||(2450529-2450676)
chr1 (1-179)||(41467632-41467799)
chr1 (8-179)||(2657314-2657474)
chr1 (1-179)||(27983603-27983765)
chr1 (51-179)||(4808699-4808827)
chr1 (1-179)||(33073215-33073382)
chr1 (1-178)||(6626025-6626191)
chr1 (46-179)||(51045596-51045729)
chr1 (1-179)||(10928071-10928238)
chr1 (34-176)||(45475848-45475987)
chr1 (3-179)||(4953058-4953223)
chr1 (1-173)||(26472185-26472346)
chr1 (1-162)||(51403034-51403185)
chr1 (1-179)||(29770674-29770841)
chr1 (1-116)||(31979998-31980113)
chr1 (1-179)||(2954859-2955026)
chr1 (48-179)||(4156438-4156576)
chr1 (1-179)||(42234844-42235010)
chr1 (1-180)||(4243489-4243657)
chr1 (1-179)||(26685860-26686027)
chr1 (1-173)||(34752320-34752481)
chr1 (86-179)||(13312531-13312624)
chr1 (1-179)||(30289910-30290077)
chr1 (1-179)||(41895164-41895331)
chr1 (1-184)||(39475778-39475949)
chr1 (1-179)||(1388477-1388644)
chr1 (47-179)||(47772172-47772304)
chr1 (1-116)||(2556909-2557024)
chr1 (1-179)||(33187344-33187505)
chr1 (1-181)||(38716245-38716414)
chr1 (1-173)||(44544052-44544213)
chr1 (1-176)||(32448652-32448807)
chr1 (1-179)||(5961267-5961434)
chr1 (1-179)||(51155590-51155756)
chr1 (1-153)||(13281588-13281729)
chr1 (8-179)||(44293455-44293615)
chr1 (1-179)||(7561528-7561709)
chr1 (1-179)||(10920204-10920371)
chr1 (10-94)||(13313248-13313332)
chr1 (1-94)||(46428327-46428420)
chr1 (9-180)||(48683329-48683489)
chr1 (8-162)||(35991616-35991759)
chr1 (1-179)||(52367887-52368054)
chr1 (1-88)||(24649802-24649889)
chr1 (1-104)||(27924722-27924825)
chr1 (5-179)||(52323946-52324110)
chr1 (1-87)||(39637904-39637986)
chr1 (104-179)||(38718167-38718242)
chr1 (1-56)||(4156188-4156243)
chr1 (46-156)||(24215812-24215911)
chr1 (120-179)||(31286504-31286563)
chr1 (142-179)||(31844818-31844855)
chr1 (118-148)||(39359502-39359532)
chr1 (1-49)||(10919313-10919361)
chr1 (120-184)||(24649727-24649791)
[»] chr3 (112 HSPs)
chr3 (1-179)||(40419839-40420017)
chr3 (1-179)||(47257797-47257975)
chr3 (1-179)||(49330041-49330219)
chr3 (1-179)||(27066978-27067156)
chr3 (1-179)||(37313403-37313581)
chr3 (1-179)||(38416724-38416902)
chr3 (1-179)||(40130959-40131137)
chr3 (1-179)||(41464356-41464534)
chr3 (1-179)||(43612047-43612225)
chr3 (1-179)||(47809596-47809775)
chr3 (1-179)||(7855114-7855292)
chr3 (1-179)||(22399101-22399278)
chr3 (1-179)||(24100287-24100464)
chr3 (1-179)||(28048392-28048570)
chr3 (1-179)||(40643804-40643982)
chr3 (1-179)||(40804510-40804688)
chr3 (1-179)||(48739233-48739411)
chr3 (5-178)||(51170034-51170207)
chr3 (1-178)||(55453245-55453422)
chr3 (1-179)||(29625827-29626005)
chr3 (1-179)||(32234398-32234575)
chr3 (1-179)||(42291846-42292024)
chr3 (1-179)||(51102378-51102556)
chr3 (2-184)||(52628959-52629140)
chr3 (1-179)||(2666004-2666182)
chr3 (1-179)||(7755307-7755484)
chr3 (1-179)||(20754393-20754571)
chr3 (5-175)||(35594129-35594299)
chr3 (5-179)||(35748311-35748485)
chr3 (1-179)||(39634572-39634749)
chr3 (1-179)||(41732532-41732710)
chr3 (1-179)||(44222833-44223011)
chr3 (1-179)||(51452751-51452928)
chr3 (6-177)||(48609732-48609903)
chr3 (1-179)||(39053398-39053576)
chr3 (1-179)||(43125835-43126012)
chr3 (1-164)||(52215080-52215243)
chr3 (1-179)||(37324545-37324723)
chr3 (1-179)||(44806688-44806866)
chr3 (1-179)||(46134360-46134538)
chr3 (1-179)||(51146215-51146393)
chr3 (2-177)||(43183917-43184092)
chr3 (1-179)||(41293319-41293496)
chr3 (5-178)||(43021722-43021896)
chr3 (1-179)||(53943588-53943765)
chr3 (1-154)||(24376577-24376730)
chr3 (20-179)||(46126010-46126168)
chr3 (1-179)||(52638846-52639024)
chr3 (1-177)||(53832486-53832662)
chr3 (1-179)||(18946907-18947085)
chr3 (1-179)||(36368943-36369120)
chr3 (1-179)||(41216459-41216637)
chr3 (1-181)||(5560023-5560210)
chr3 (5-177)||(47894822-47894994)
chr3 (1-146)||(53637845-53637990)
chr3 (1-179)||(25641650-25641817)
chr3 (1-179)||(42589834-42590001)
chr3 (1-177)||(48546842-48547007)
chr3 (1-179)||(34279721-34279888)
chr3 (1-179)||(38156632-38156799)
chr3 (1-179)||(51415973-51416140)
chr3 (1-177)||(54159000-54159166)
chr3 (1-179)||(54707220-54707387)
chr3 (1-179)||(55000178-55000345)
chr3 (1-162)||(46949379-46949538)
chr3 (8-179)||(54401198-54401358)
chr3 (1-143)||(37758933-37759075)
chr3 (1-179)||(39141125-39141293)
chr3 (1-176)||(49130582-49130746)
chr3 (1-179)||(31286793-31286960)
chr3 (1-179)||(41635800-41635967)
chr3 (1-179)||(47510940-47511107)
chr3 (64-179)||(33550467-33550582)
chr3 (57-179)||(52864550-52864671)
chr3 (1-179)||(55379989-55380156)
chr3 (1-174)||(40022078-40022240)
chr3 (8-184)||(37028734-37028899)
chr3 (1-179)||(25353558-25353725)
chr3 (1-179)||(53115451-53115618)
chr3 (8-177)||(45058894-45059052)
chr3 (1-181)||(24688118-24688287)
chr3 (1-181)||(51224036-51224204)
chr3 (1-154)||(17665549-17665691)
chr3 (43-128)||(47182046-47182131)
chr3 (1-93)||(28576187-28576279)
chr3 (1-179)||(30251501-30251668)
chr3 (1-108)||(2227995-2228102)
chr3 (5-178)||(51143825-51143987)
chr3 (6-108)||(47402810-47402911)
chr3 (1-183)||(43176734-43176905)
chr3 (104-179)||(48534007-48534082)
chr3 (1-93)||(41882066-41882158)
chr3 (1-93)||(48726073-48726165)
chr3 (1-178)||(42998790-42998955)
chr3 (8-179)||(44945935-44946089)
chr3 (26-179)||(52756067-52756213)
chr3 (5-179)||(50731914-50732077)
chr3 (5-179)||(50780779-50780942)
chr3 (1-93)||(21597223-21597315)
chr3 (1-179)||(40165656-40165822)
chr3 (95-179)||(30429227-30429311)
chr3 (127-179)||(40688431-40688483)
chr3 (1-70)||(52434143-52434213)
chr3 (28-179)||(41609098-41609238)
chr3 (5-70)||(48752093-48752158)
chr3 (1-40)||(51942544-51942583)
chr3 (137-179)||(41882011-41882053)
chr3 (120-173)||(52434291-52434344)
chr3 (5-93)||(177169-177257)
chr3 (8-108)||(8847718-8847818)
chr3 (5-49)||(37741443-37741487)
chr3 (138-178)||(37760346-37760386)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (1-179)||(13762-13940)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (1-184)||(2427-2610)
[»] scaffold0949 (1 HSPs)
scaffold0949 (1-179)||(1873-2051)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (1-179)||(11133-11310)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (1-179)||(75244-75422)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (1-179)||(18854-19032)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (9-179)||(176666-176836)
scaffold0007 (5-179)||(278014-278190)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (1-148)||(32565-32712)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (1-179)||(3092-3261)
[»] scaffold0429 (1 HSPs)
scaffold0429 (51-186)||(4589-4724)
[»] scaffold0721 (1 HSPs)
scaffold0721 (1-179)||(7094-7262)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (1-180)||(20476-20644)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (3-179)||(14750-14915)
[»] scaffold2003 (1 HSPs)
scaffold2003 (1-179)||(106-272)
[»] scaffold0684 (1 HSPs)
scaffold0684 (1-179)||(4554-4722)
[»] scaffold0163 (1 HSPs)
scaffold0163 (1-179)||(3396-3564)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (8-103)||(19228-19327)
[»] scaffold0271 (1 HSPs)
scaffold0271 (1-145)||(17910-18043)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 95)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 33423453 - 33423276
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33423453 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 33423354  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcac 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33423353 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 33423276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 47740509 - 47740331
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47740509 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcactta 47740410  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47740409 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 47740331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 25894095 - 25893917
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25894095 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 25893996  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25893995 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 25893917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 33839893 - 33839715
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33839893 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 33839794  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33839793 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccttagttgtcacc 33839715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 45690275 - 45690096
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45690275 tttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 45690176  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcaccc 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45690175 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccc 45690096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 17855433 - 17855611
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||    
T  17855433 tttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatactactta 17855532  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17855533 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 17855611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 22979825 - 22979647
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22979825 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 22979726  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22979725 aaaatatgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 22979647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 23393229 - 23393051
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23393229 tttctagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 23393130  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23393129 aaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 23393051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 33695999 - 33695821
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33695999 tttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 33695900  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33695899 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 33695821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 35355893 - 35356071
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  35355893 tttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccactta 35355992  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35355993 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 35356071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 47067155 - 47066977
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47067155 tttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 47067056  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47067055 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 47066977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 49171540 - 49171362
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  49171540 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 49171441  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  49171440 aaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 49171362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 46913114 - 46913294
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46913114 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 46913213  T
Q  101 aaaa--tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46913214 aaaatgtgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 46913294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 20165992 - 20165814
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20165992 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 20165893  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20165892 aaaatgtacttatgtggctaatgtgtataggttgaggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 20165814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 27018121 - 27018299
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27018121 tttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgtggtcaagatagttcatggataccactta 27018220  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27018221 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 27018299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 35328247 - 35328069
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35328247 tttctaaattacctatgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 35328148  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35328147 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 35328069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 45482663 - 45482841
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45482663 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcactta 45482762  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45482763 aaaatatgcttatgtgactgatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 45482841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 2341836 - 2341661
Alignment:
Q  5 tagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaa 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  2341836 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacaacttaaaaa 2341737  T
Q  105 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccat-gggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2341736 tgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggggtaccctagttgtcacc 2341661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 33411265 - 33411443
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33411265 tttcttgattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 33411364  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  33411365 aaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccataagtaccctagttgtcacc 33411443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Original strand, 36389377 - 36389539
Alignment:
Q  17 gaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtg 116  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  36389377 gaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtg 36389476  T
Q  117 gctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36389477 gctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 36389539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 40670568 - 40670746
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40670568 tttctagattacctttgaagaatggtggataatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccactta 40670667  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40670668 aaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccttagttgtcacc 40670746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 26579895 - 26579717
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  26579895 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccacaaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatgtataccactta 26579796  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26579795 aaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 26579717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 31586853 - 31587031
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31586853 tttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccactta 31586952  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  31586953 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataagtaccctagttctcacc 31587031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 37846194 - 37846016
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| || |||||||| || ||||||| ||||||    
T  37846194 tttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtgggatcaagataatttatggataccactta 37846095  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37846094 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 37846016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 48609855 - 48609677
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  48609855 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagataattcatgtataccactta 48609756  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48609755 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatacaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 48609677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 10028493 - 10028673
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  10028493 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccactta 10028592  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatggg--taccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  10028593 aaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccactattcttccatgggtataccctagttgtcacc 10028673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 15877555 - 15877724
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15877555 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaacaaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 15877654  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtacccta 170  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15877655 aaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 15877724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 19563452 - 19563635
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19563452 tttctagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcactta 19563551  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacccaaaa 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  19563552 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttaaggtaaattacccaccattcttccatgggtactctaattgtcaccaaaaa 19563635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 5183991 - 5183825
Alignment:
Q  13 ctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgctta 112  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5183991 ctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataacacttaaaaatgtgctta 5183892  T
Q  113 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  5183891 tgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttatcacc 5183825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 5712173 - 5712351
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| || || |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  5712173 tttctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttattagtggggtcaagatagtttatggataccactta 5712272  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  5712273 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattttttcatgggtaccctagttgtcacc 5712351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 33332794 - 33332971
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  33332794 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat-gataccactta 33332892  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33332893 aaaatatgcttatgcggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 33332971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 35757198 - 35757020
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  35757198 tttctagattaactttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat-gataccactta 35757100  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-ggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35757099 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 35757020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 35767486 - 35767657
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||     |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35767486 tttctagattacctttgaagaatggtgggta-----ccc--caatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 35767578  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35767579 aaaatgtgtttatatggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 35767657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 31625709 - 31625886
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  31625709 tttctagattaccttcgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactta 31625808  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31625809 aaaatgtgcttatgtgactaatgtatattggttggagtaaatta-ccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 31625886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 45063533 - 45063357
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  45063533 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggagtcaagatagttcatggataccactta 45063434  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  45063433 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtat--gttgaggtaaattatccaccattctttcattggtactctagttgtcacc 45063357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 31429653 - 31429475
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||    
T  31429653 tttctagattatctttgaagaatggtgggtgatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagtacatggataccactta 31429554  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31429553 aaaatgtgtttatgtgactaatgtgtattggttgaagtaaattactcatcattctttcatgggtaccctagttgtcacc 31429475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 41991032 - 41990870
Alignment:
Q  5 tagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaa 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  41991032 tagattacctttgaagaatggtggataatttacacaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaa 41990933  T
Q  105 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtacc 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  41990932 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggtttggataaattactcaccattcttccatgggtacc 41990870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Original strand, 43499494 - 43499668
Alignment:
Q  5 tagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaa 104  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43499494 tagattacctttaaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 43499593  T
Q  105 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    | | |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  43499594 tatacttatgtggccaatgtatattagttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttctcacc 43499668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 33870250 - 33870424
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||    
T  33870250 tttctagatcacctttaaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgtaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccattta 33870349  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcac 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||||    
T  33870350 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattct---atgggtactctagttgtcac 33870424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Original strand, 29446863 - 29447020
Alignment:
Q  21 aatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggcta 120  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  29446863 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtgacta 29446962  T
Q  121 atgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29446963 atgtgtattggttggagt-aattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 29447020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 48 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 30076658 - 30076527
Alignment:
Q  48 atgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccc 147  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  30076658 atgaaaatgatcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattagttggcgtaaattaccc 30076559  T
Q  148 atcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30076558 atcattcttccatggataccctagttgtcacc 30076527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 10618303 - 10618481
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |       |||||||||| ||| ||||||    
T  10618303 tttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgg-------atagttcatgaataccactta 10618395  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacccaaaact 186  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  10618396 aaaatatgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttatcacctaaaact 10618481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 47 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 28234068 - 28233936
Alignment:
Q  47 aatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacc 146  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28234068 aatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaactacc 28233969  T
Q  147 catcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    || | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28233968 cacctttctttcatgggtaccctagttgtcacc 28233936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 33720214 - 33720070
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  33720214 tttctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttgatggagtcaagatagttcatggataccactta 33720115  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 145  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33720114 aaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattac 33720070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 35752201 - 35752034
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||          
T  35752201 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatat------ 35752108  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  35752107 -----gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 35752034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 43489223 - 43489390
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||          
T  43489223 tttctaaattacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatat------ 43489316  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  43489317 -----gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagtctagttgtcacc 43489390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 46817588 - 46817415
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||| ||||          
T  46817588 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatat------ 46817495  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacccaaaac 185  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||    
T  46817494 -----gtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacctaaaac 46817415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 179
Target Start/End: Original strand, 37127949 - 37128109
Alignment:
Q  8 attacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgt 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||           ||| ||||    
T  37127949 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcat-----------aaatatgt 37128037  T
Q  108 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  37128038 gcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 37128109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 24923191 - 24923024
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| ||||          
T  24923191 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatgaatat------ 24923098  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  24923097 -----gtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccatccttctttcatgggtagcctagttgtcacc 24923024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 36817012 - 36816845
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||               
T  36817012 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg----------- 36816924  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  36816923 aatatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 36816845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 7876495 - 7876328
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||| ||||          
T  7876495 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatat------ 7876402  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
         || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  7876401 -----gtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcattggtagcctagttgtcacc 7876328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 48085863 - 48086030
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||               
T  48085863 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg----------- 48085951  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| || |||||    
T  48085952 aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctaattatcacc 48086030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 60 - 179
Target Start/End: Original strand, 44405412 - 44405531
Alignment:
Q  60 aatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttcca 159  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  44405412 aatttattggtagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacctaccattcttcca 44405511  T
Q  160 tgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||  ||||||||||||    
T  44405512 tgggtattctagttgtcacc 44405531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Original strand, 44564356 - 44564497
Alignment:
Q  14 tttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttat 113  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || || | ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  44564356 tttgaagaatggtggataatttacccaccaatcaataaaaataagcaatttattagtggtgtcaagatagttcatagataccacttaaaaatatgcttat 44564455  T
Q  114 gtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattct 155  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  44564456 gtgactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattct 44564497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 81; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 21718122 - 21718288
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||               
T  21718122 tttctaaattacctttgaataacggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg----------- 21718210  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||    
T  21718211 aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccattatt-tttcatgggtagcctagttgtcacc 21718288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 81; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 24228546 - 24228713
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||               
T  24228546 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg----------- 24228634  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  24228635 aatatatgcttatgtggctaatgtgtattggtttgggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctaattgtcacc 24228713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 81; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 26941692 - 26941541
Alignment:
Q  8 attacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgt 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||           || ||||    
T  26941692 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 26941604  T
Q  108 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtacccta 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  26941603 gcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattactcatcattctttcatgggtagccta 26941541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 81; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 29610640 - 29610807
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||||||               
T  29610640 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatagttcatg----------- 29610728  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||| ||||    
T  29610729 aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggagtaaattactcatcattctttcatgggtagcatagttgccacc 29610807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 81; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 63 - 179
Target Start/End: Original strand, 41904272 - 41904388
Alignment:
Q  63 ttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgg 162  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||      
T  41904272 ttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccataa 41904371  T
Q  163 gtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||| |||||||||||||    
T  41904372 gtatcctagttgtcacc 41904388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 81; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 46898183 - 46898016
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||| |||| || ||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||| ||||          
T  46898183 tttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaataaatatgagcaatttattgatggggtcaaaatagttcatgaatat------ 46898090  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46898089 -----gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 46898016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 179
Target Start/End: Original strand, 26371061 - 26371221
Alignment:
Q  8 attacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgt 107  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||| ||||           ||    
T  26371061 attatctttgaagaatggtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaaaatagttcatgaatat-----------gt 26371149  T
Q  108 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  26371150 gcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 26371221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 25037675 - 25037516
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||               
T  25037675 tttctaaattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaatcaattaaaatgatcaatttattggtggggtcaagatagttcatg----------- 25037587  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctag 171  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  25037586 aatatgtgcttatgtggctgatgtgtattgattggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctag 25037516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 45502983 - 45502817
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||           |||| || |||    
T  45502983 tttctagattaactttgaagaatggtgagtaatttacctaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttagttgggtcaa-----------gataccattta 45502895  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcac 178  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  45502894 aaaatatgcttatgtagctaatgtatattggttgaggtaaattacccaccgttcttccatggataccttagttgtcac 45502817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 45237700 - 45237533
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| || ||  |||||||||| |||||| ||||          
T  45237700 tttctaaattacctttgaagaatgataggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgaggtcaagataattcatgaatat------ 45237607  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
         |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| | |||||||||||    
T  45237606 -----gtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttttatgggtagcttagttgtcacc 45237533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 33393333 - 33393499
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  33393333 tttctagattacctttaaaaaatagtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccaccta 33393432  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcac 178  Q
    ||||           || ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33393433 aaaa-----------ggttaatgttcattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 33393499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 498348 - 498188
Alignment:
Q  8 attacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgt 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||           || ||||    
T  498348 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 498260  T
Q  108 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  498259 gcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattatccatcattctttcatggctagcctagttgccacc 498188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 2332024 - 2332191
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| |||| ||||||| |||| || |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||          
T  2332024 tttctaaattatctttgaaaaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtgggatcaagatagttcatgaatat------ 2332117  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
         |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  2332118 -----gtgcttatgtggttactgtgtattggttggggtaaattatccaccatttttccatgggtacccaagttgtcacc 2332191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 7257386 - 7257553
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||| ||| ||    
T  7257386 tttctagattaccttcgaaaaatgatgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaataccaccta 7257485  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||| |||           ||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  7257486 aaaaggtg-----------aatgattattggttggggtaaattacccaccatttttctatgggtaccctagttgtcacc 7257553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 44003537 - 44003370
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||  ||| | |||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  44003537 tttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaactaatcataatgagcaatttattggtggagtcaagatagtttatggataccaccta 44003438  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||| |||           ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44003437 aaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 44003370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 39453642 - 39453484
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||                   
T  39453642 tttctaaattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtt--------------- 39453558  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtca 177  Q
       ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  39453557 ---atgtgtttatgtgactaatgtgtaatggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 39453484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 47906926 - 47906758
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||               
T  47906926 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg----------- 47906838  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggt-aaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||    
T  47906837 aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattagggtaaaattacccatcattttttcatggatagcctagttgccacc 47906758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Original strand, 29098756 - 29098915
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||                
T  29098756 tttctaaattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcat------------ 29098843  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgt 175  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||| || |||||||||    
T  29098844 ---atatgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattactcatcattttttcatggatagcctagttgt 29098915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 64; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 16482950 - 16482847
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||| ||| ||    
T  16482950 tttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgataatgagcaatttattggtggggtcaagatggtttatggataccaccta 16482851  T
Q  101 aaaa 104  Q
    ||||    
T  16482850 aaaa 16482847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 64; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 35484641 - 35484807
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaa-tttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactt 99  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||              
T  35484641 tttctaaattatctttgaagaatggtgggtaaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg---------- 35484730  T
Q  100 aaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtca 177  Q
     || ||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  35484731 -aatatgtgcttatgtgactaatgtgtattatttgaggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctaattgtca 35484807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 32556773 - 32556640
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| || || ||| ||||||||||||||               
T  32556773 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggacaagatagttcatg----------- 32556685  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 145  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32556684 aatatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattac 32556640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 178
Target Start/End: Original strand, 46103127 - 46103291
Alignment:
Q  2 ttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaa 101  Q
    ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||| || || ||||||| |||||||||| ||||           
T  46103127 ttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacc-accaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaaaatagttcatgaatat------- 46103218  T
Q  102 aaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcac 178  Q
        |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  46103219 ----gtgcttatgtggctaatgtgtattagttggagtaaattactcatcattctttcatgggtagtctagttgtcac 46103291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 62; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 39866670 - 39866763
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatat 94  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||    
T  39866670 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatat 39866763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 62; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Original strand, 41855064 - 41855228
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||| |||||||  |||||||||| ||||| | |||||||||||||||           |    
T  41855064 tttctaaattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaatgtgagcaatttattggtggagtcaagatagttcat-----------a 41855152  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtac-cctagttgt 175  Q
    || || ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  41855153 aatatatgcttatgtggctaatgtgtattagtttggataaattacccatcattcttccatggatactcctagttgt 41855228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 44659849 - 44660015
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||               
T  44659849 tttctaaattacctttgaagaatggtgg-taatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg----------- 44659936  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    || || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||| ||||    
T  44659937 aatatatgcttatgtggctaatgtgtatcggttggagtaaattatccatcattcttttatgggtagcctagttgccacc 44660015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 39323621 - 39323779
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||| || || |||||||||||||||||| |             
T  39323621 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaa--------- 39323711  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
              ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  39323712 ----------tatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccatcattctttcatgagtagcctagttgtcacc 39323779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 15644113 - 15643948
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||| ||| ||    
T  15644113 tttctagattatctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaaaatagtttatggataccaccta 15644014  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtca 177  Q
    |||| |||           ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||    
T  15644013 aaaaggtg-----------aatgtttattgattggggtaaattacccaccattttttcatgggtacactagttgtca 15643948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 38448608 - 38448508
Alignment:
Q  8 attacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgt 107  Q
    |||||||||||| |||  ||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  38448608 attacctttgaaaaattgtggataatttacccaccaatcaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaatatcacctaaaaatgt 38448509  T
Q  108 g 108  Q
    |    
T  38448508 g 38448508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 47460935 - 47460772
Alignment:
Q  5 tagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaa 104  Q
    |||||||| ||| || |||| ||| ||||||||||| ||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  47460935 tagattacttttaaaaaatggtggataatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaa 47460836  T
Q  105 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
      ||           ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  47460835 gatg-----------aatgtttattggttgaggtaaattacccaccattttttcatgggtaccctagttgtcacc 47460772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 33455101 - 33455194
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatat 94  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||| || || |||||||||||||||||| ||||    
T  33455101 tttctaaattacctatgaagaatggtggataatttacccaccaaccaataaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatat 33455194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 93
Target Start/End: Original strand, 29863024 - 29863112
Alignment:
Q  5 tagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggata 93  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||    
T  29863024 tagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaataatttattggtggaatcaaaatagttcatggata 29863112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 36 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 37443734 - 37443602
Alignment:
Q  36 acccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 135  Q
    ||||| ||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||| ||| |||||| |||           ||||| ||||||||||    
T  37443734 acccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatagataccacctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttgg 37443646  T
Q  136 ggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  37443645 ggtaaattacccaccatttttttatgggtaccctagttgtcacc 37443602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 179
Target Start/End: Original strand, 42272180 - 42272244
Alignment:
Q  114 gtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  42272180 gtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccataattcttccat-gataccctagttgtcacc 42272244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 7720670 - 7720578
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggata 93  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||  || |||| ||||| |||||||| | | |||||| |||||||||||||||||    
T  7720670 tttcttgattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccactaaccaataaaaataagcaatttatagattgggttaagatagttcatggata 7720578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 30077103 - 30077043
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaa 61  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  30077103 tttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgggcaa 30077043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 64
Target Start/End: Original strand, 35557739 - 35557798
Alignment:
Q  5 tagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaattt 64  Q
    |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  35557739 tagaatacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 35557798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 21649542 - 21649442
Alignment:
Q  5 tagattacctttgaagaa-tgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaa 103  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||  || || ||||||||||||||||||| || || |  | ||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  21649542 tagattacctttgaaaaaatgatgggtaatttacttattaaccaatgaaaatgagcaatttattagtagatttaagatagtttatggataccacctaaaa 21649443  T
Q  104 a 104  Q
    |    
T  21649442 a 21649442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 121 - 179
Target Start/End: Original strand, 33455201 - 33455259
Alignment:
Q  121 atgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  33455201 atgtgtattggtttgggtaaattgtccatcattctttcataggtagcctagttgtcacc 33455259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Original strand, 35823295 - 35823353
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagc 59  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  35823295 tttctaaattaccttagaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagc 35823353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 165
Target Start/End: Original strand, 39866762 - 39866806
Alignment:
Q  121 atgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggta 165  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  39866762 atgtgtattggttggggtaaattatccaccattctttcatgggta 39866806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 46 - 89
Target Start/End: Original strand, 26456159 - 26456202
Alignment:
Q  46 caatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatg 89  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  26456159 caatgaaaatgagcaatttattggtgggatcaagatagttcatg 26456202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 39734 - 39556
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39734 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 39635  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39634 aaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 39556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 66)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 32984255 - 32984077
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32984255 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 32984156  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32984155 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 32984077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 41862224 - 41862404
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41862224 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcactta 41862323  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcaccca 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  41862324 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtatcctaattgtcaccca 41862404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 9303748 - 9303574
Alignment:
Q  5 tagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaa 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9303748 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 9303649  T
Q  105 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9303648 tgtgtttatgtggctaatgtgtattggtcggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 9303574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 24080075 - 24079901
Alignment:
Q  5 tagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaa 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24080075 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 24079976  T
Q  105 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24079975 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 24079901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 37956425 - 37956603
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37956425 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 37956524  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  37956525 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattatttcatggataccctagttgtcacc 37956603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 10646127 - 10646305
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10646127 tttctagattacctttgaaaaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 10646226  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10646227 aaaatgttcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 10646305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 40435331 - 40435153
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40435331 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaacttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccactta 40435232  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40435231 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 40435153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 43328711 - 43328889
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43328711 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 43328810  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43328811 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 43328889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 5946051 - 5946229
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5946051 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccactta 5946150  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  5946151 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattctttcataggtaccctagttgtcacc 5946229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 9734259 - 9734435
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9734259 tttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-cactta 9734357  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9734358 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggt-aattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 9734435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 31831133 - 31830959
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31831133 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 31831034  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgt 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  31831033 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgatttgggtaaattacctaccattcttccatgggtaccctagttgt 31830959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 33730819 - 33730641
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33730819 tttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaatatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 33730720  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33730719 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 33730641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 177
Target Start/End: Original strand, 32114254 - 32114429
Alignment:
Q  2 ttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  32114254 ttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaaaatagttcatggataccacttaa 32114353  T
Q  102 aaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtca 177  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  32114354 aaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 32114429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 2714553 - 2714730
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2714553 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggataccactta 2714652  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  2714653 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccat-ggtactttagttgtcacc 2714730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 6365990 - 6366168
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  6365990 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaatatagttcatggataccactta 6366089  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  6366090 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattctttcatggataccctagttgtcacc 6366168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 13356294 - 13356120
Alignment:
Q  5 tagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaa 104  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13356294 tagattacatttgaagaaaggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 13356195  T
Q  105 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13356194 tgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattcttccatgggtactctagttgtcacc 13356120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 17718900 - 17718722
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17718900 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattgatggggtcaagatagttcatggataccactta 17718801  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17718800 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagctgtcacc 17718722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 33981837 - 33981663
Alignment:
Q  5 tagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaa 104  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33981837 tagattatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 33981738  T
Q  105 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33981737 tgtgcttatgcggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 33981663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 41653899 - 41654077
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  41653899 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggggtcaaaataattcatggataccactta 41653998  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41653999 aaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 41654077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 37301503 - 37301326
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  37301503 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggccaaaatagttcatggataccactta 37301404  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcac 178  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37301403 aaaatgtgtttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcac 37301326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 2275917 - 2276094
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||     
T  2275917 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt- 2276015  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  2276016 aaaatatgcttatgtggctaatgtgtattgattagggtaaattacccatcattcttccatgggtagactagttgtcacc 2276094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 25185903 - 25186081
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  25185903 tttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggataccactta 25186002  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  25186003 aaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctaatcgtcacc 25186081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 37419944 - 37420122
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||    
T  37419944 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatactactta 37420043  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37420044 aaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattgattaaggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 37420122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 45236743 - 45236565
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45236743 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccactta 45236644  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  45236643 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttttatgggtatcctagttgtcacc 45236565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 9013688 - 9013865
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  9013688 tttctagattacctttgaagaatggtaggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccactta 9013787  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9013788 aaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggtt-aggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 9013865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 41231950 - 41232128
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41231950 tttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 41232049  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  41232050 aaaatgtgcttatgtgaccaatgtgtattggttggggtaaattacccactattcctccatggataccctagttgtcacc 41232128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 181
Target Start/End: Original strand, 35628785 - 35628961
Alignment:
Q  5 tagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaa 104  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  35628785 tagattaactttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcaagaataccacttaaaaa 35628884  T
Q  105 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcaccca 181  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  35628885 tgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttctatgagtaccctagttgtcaccca 35628961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 45066766 - 45066592
Alignment:
Q  5 tagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaa 104  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45066766 tagattacctttgaagaataatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 45066667  T
Q  105 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  45066666 tgtgcttatgtggctaatgtgtattgattataataaattacccatcattcttccatgggtaccctaattctcacc 45066592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 122; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 13760826 - 13760646
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||    
T  13760826 tttcaagattacctttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccattta 13760727  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgg--gtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  13760726 aaaatgtgcttctgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtgtaccctagttgtcacc 13760646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 44088621 - 44088446
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  44088621 tttctagattacctttgaagaatgatgaataatttactcaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactta 44088522  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtc 176  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  44088521 aaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggatactctaattgtc 44088446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 22878395 - 22878572
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |   |||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22878395 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccttccaatgaaaatgatcaattttttgttggggtcaagatagttcatggataccactta 22878494  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcac 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22878495 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccacaattcttctatgggtaccctagttgtcac 22878572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 117; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 25248043 - 25248216
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||     
T  25248043 tttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaa------aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttt 25248136  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcaccc 180  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  25248137 aaaatgtgcttatgttgctaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattcttccatggataccctaattgtcaccc 25248216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 29048581 - 29048426
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29048581 tttctagattatctttgaagaatggtggataatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttagtggggtcaagatagttcatggataccactta 29048482  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29048481 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctt 29048426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 53 - 179
Target Start/End: Original strand, 12032986 - 12033112
Alignment:
Q  53 aatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcat 152  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12032986 aatgagcaatttgttggtgcggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccat 12033085  T
Q  153 tcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  12033086 tcttccatgggtaccctagttgtcacc 12033112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 178
Target Start/End: Original strand, 41639922 - 41640095
Alignment:
Q  5 tagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaa 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  41639922 tagattacctttgaagaatgatgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatagataccgcttaaaaa 41640021  T
Q  105 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcac 178  Q
    | || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  41640022 tatgtttatgtggctaatgtgtattagttgggataaattacccaccattcttccatagataccctagttgtcac 41640095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Original strand, 45258518 - 45258691
Alignment:
Q  5 tagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaa 104  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  45258518 tagattacttttgaagaatggtcggtaatttacccaccaaccaatgtaaatgagcaatttgttggaggggtcaagatagttcatggataccatttaaaaa 45258617  T
Q  105 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  45258618 tgtgtttatgtaactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat-ggtactctagttatcacc 45258691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 102; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 46 - 179
Target Start/End: Original strand, 3904126 - 3904258
Alignment:
Q  46 caatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  3904126 caatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg-ataccacttaaaaatgtgcttatgtggctattgtgtattggttagggtaaattac 3904224  T
Q  146 ccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3904225 ccaccattcttccatgggtaccctagttatcacc 3904258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 63 - 179
Target Start/End: Original strand, 41981534 - 41981650
Alignment:
Q  63 ttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgg 162  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41981534 ttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 41981633  T
Q  163 gtaccctagttgtcacc 179  Q
     ||||||||||||||||    
T  41981634 ataccctagttgtcacc 41981650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 4447462 - 4447295
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||          
T  4447462 tttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttataggtggggtcaagatagttcatgaatat------ 4447369  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
         ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4447368 -----gtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 4447295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 42701468 - 42701301
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactt- 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||     
T  42701468 tttctagattacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttagtggggtcaagatagttcatgaataccactta 42701369  T
Q  100 --aaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtacc 167  Q
      |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  42701368 aaaaaaatgtgct--tgtgactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccatccttccatgggtacc 42701301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 117496 - 117329
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||               
T  117496 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg----------- 117408  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  117407 aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttcgggtaaattattcatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 117329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 31940319 - 31940485
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||               
T  31940319 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg----------- 31940407  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  31940408 aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 31940485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 10378313 - 10378483
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||          
T  10378313 tttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttataggtggggtcaagatagttcatgaatat------ 10378406  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacccaa 182  Q
         ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10378407 -----gtgcttatgtggctaatatgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacccaa 10378483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 66 - 179
Target Start/End: Original strand, 31336163 - 31336276
Alignment:
Q  66 ttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggta 165  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  31336163 ttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgtttatatggctaatgtgtattggttggggcaaattacccaccattcttccatgggta 31336262  T
Q  166 ccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||    
T  31336263 ccctagttgtcacc 31336276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 41843257 - 41843424
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||| ||||          
T  41843257 tttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtccagatagttcatgaatat------ 41843350  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||    
T  41843351 -----gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcttagttatcacc 41843424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 9713693 - 9713857
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||| ||||          
T  9713693 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaac---caatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatat------ 9713783  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  9713784 -----gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 9713857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 81; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 3211210 - 3211376
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||          
T  3211210 tttctaaattacctttgaa-aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatgaatat------ 3211302  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
         |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3211303 -----gtgcttatgtggctaatgtgtattcgttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccatagttgtcacc 3211376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 40649990 - 40649837
Alignment:
Q  9 ttacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtg 108  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || |||| ||| |||||| ||||           |||    
T  40649990 ttacctttaaagaatgatgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaataattcatgaatat-----------gtg 40649902  T
Q  109 cttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagtt 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  40649901 cttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaactacccatcattctttcatgggtagcctagtt 40649837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 40458932 - 40458772
Alignment:
Q  8 attacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgt 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||           || ||||    
T  40458932 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 40458844  T
Q  108 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    | || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  40458843 gtttttgtggctaatatgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 40458772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 2379144 - 2379311
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||| || || || |||| |||||||||| ||||          
T  2379144 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgaacaatttatttgtgggatcaaaatagttcatgaatat------ 2379237  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
         ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  2379238 -----gtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatggatagcctagttgtcacc 2379311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 4975567 - 4975412
Alignment:
Q  8 attacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgt 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||           || ||||    
T  4975567 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 4975479  T
Q  108 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttg 174  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  4975478 gcttatatggctaatgtgtattggtttgggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttg 4975412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 39915990 - 39915887
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39915990 tttctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccactta 39915891  T
Q  101 aaaa 104  Q
    ||||    
T  39915890 aaaa 39915887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 32373892 - 32373733
Alignment:
Q  2 ttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaa 101  Q
    ||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||           |    
T  32373892 ttctaaattacctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatg-----------a 32373804  T
Q  102 aaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagtt 173  Q
    | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||    
T  32373803 atatgtgcttatgtgattaatgtgtattggttggggtaaatta-ccaccattcttccatggataacctagtt 32373733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 9509567 - 9509400
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| || || |||| ||||||||||||| ||||          
T  9509567 tttctaaattacctttaaagaatggtgtgtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatagttcatgaatat------ 9509474  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
         ||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  9509473 -----gtgtttatgtggcaaatttttattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttttcacc 9509400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 33897009 - 33896843
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||| ||| ||    
T  33897009 tttctagattacctttgaa-aatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatagataccaccta 33896911  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||  ||           ||||| |||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  33896910 aaaagatg-----------aatgtttattggttggagtaaattacccaccattttttcatgggtaccctagttgtcacc 33896843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 27243306 - 27243213
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatat 94  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||| ||||    
T  27243306 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggccaagatagttcatgaatat 27243213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 27254881 - 27254788
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatat 94  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||| ||||    
T  27254881 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggccaagatagttcatgaatat 27254788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 33622625 - 33622467
Alignment:
Q  8 attacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgt 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||  | ||||||| |||||||||| ||||           ||    
T  33622625 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatatatttat-gggtcaaaatagttcatgaatat-----------gt 33622538  T
Q  108 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||    
T  33622537 ggttatgtgactaatgtgtattggttgggataaattacccatcattttttcat-ggtagcctagttgtcacc 33622467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 99
Target Start/End: Original strand, 41981454 - 41981535
Alignment:
Q  18 aagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactt 99  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  41981454 aagaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt 41981535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 3490566 - 3490399
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||| || ||| ||    
T  3490566 tttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttatggttaccaccta 3490467  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||| |||           ||||| |||||||||||||||| |||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  3490466 aaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaactacccaccattttttcataggtaccctagttgtcacc 3490399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 38631656 - 38631806
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||               
T  38631656 tttctaaattacctttgaaaaatggtggataatttacccatcaaccaatgaatatgagcaatttattggtgtggtcaagatagttcatg----------- 38631744  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgg 162  Q
    || || ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||    
T  38631745 aatatatgcttatgtggttaatatgtattggttgggataaattatccaccattcttcaatgg 38631806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 26196479 - 26196317
Alignment:
Q  5 tagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaa 104  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||| | ||| | |||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||    
T  26196479 tagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataat-aacaatttattggtggggtcaaaatagtttatggataccacctaaaaa 26196381  T
Q  105 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
     |||           ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  || |||||||||||||    
T  26196380 ggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgaatatcctagttgtcacc 26196317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 31149057 - 31148953
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||  || |||||||||||||| |||| ||| | |||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  31149057 tttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttattcactaaccaatgaaaatgagctatttattgatggggttaagatagttcat-gataccactta 31148959  T
Q  101 aaaatg 106  Q
    ||||||    
T  31148958 aaaatg 31148953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 104 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 41425503 - 41425429
Alignment:
Q  104 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||  ||||||| |||||||| ||||    
T  41425503 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattatccataattcttttatgggtagcctagttgccacc 41425429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 3 - 66
Target Start/End: Original strand, 164728 - 164791
Alignment:
Q  3 tctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgt 66  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  164728 tctagattacctttaaggaatgatgggtaatttatccaccaaccaataaaaatgagcaatttgt 164791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 179
Target Start/End: Original strand, 39901674 - 39901739
Alignment:
Q  114 gtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  39901674 gtggctaatgtttattggttgaggtaaattatccaccattcttcaatggataccttagttgtcacc 39901739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 45)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 5882510 - 5882688
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5882510 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 5882609  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5882610 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 5882688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 8615244 - 8615427
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8615244 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 8615343  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacccaaaa 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8615344 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccactattcttccatgggtaccctagttgtcaccaaaaa 8615427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 18101673 - 18101495
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18101673 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccactta 18101574  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18101573 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtatcctagttgtcacc 18101495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 14891557 - 14891383
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14891557 tttctagattgcctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 14891458  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgt 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14891457 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgt 14891383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 22551239 - 22551061
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||    
T  22551239 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccaccta 22551140  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22551139 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 22551061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 24168095 - 24168273
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24168095 tttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 24168194  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24168195 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 24168273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 26377382 - 26377204
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26377382 tttctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 26377283  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26377282 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 26377204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 2892192 - 2892368
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2892192 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 2892291  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtca 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  2892292 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttctatgggtaccctagttgtca 2892368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 19415711 - 19415533
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  19415711 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgaccaatttgttggtggggtcaagatagctcatggataccactta 19415612  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19415611 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 19415533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 34528036 - 34527862
Alignment:
Q  5 tagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaa 104  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  34528036 tagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggataccacttaaaaa 34527937  T
Q  105 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34527936 tgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 34527862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 11989143 - 11988974
Alignment:
Q  10 tacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgc 109  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  11989143 tacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgc 11989044  T
Q  110 ttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11989043 ttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 11988974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 960082 - 959904
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  960082 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatggaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatagataccactta 959983  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  959982 aaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 959904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 1970715 - 1970893
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1970715 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaataaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcactta 1970814  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  1970815 aaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtactttagttgtcacc 1970893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 7393764 - 7393586
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7393764 tttctagattacctttaaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 7393665  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  7393664 aaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccataattgtcacc 7393586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 28947091 - 28947269
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  28947091 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagataattcatgtataccactta 28947190  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28947191 aaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 28947269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 16703370 - 16703539
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  16703370 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccactta 16703469  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtacccta 170  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  16703470 aaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacgcatcattcttccatgggtatccta 16703539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 7345290 - 7345114
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  7345290 tttctagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccactta 7345191  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtca 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||    
T  7345190 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgtctaccttagttgtca 7345114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 22341959 - 22341788
Alignment:
Q  10 tacctttgaagaatgatgggtaatttacccatca--atcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgt 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22341959 tacctttgaagaatggtgggtaatttacccaacacaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 22341860  T
Q  108 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22341859 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccttagttgtcacc 22341788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 2594030 - 2593852
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2594030 tttctagattatctttgaagaattgtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 2593931  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2593930 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattatccaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 2593852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 19281233 - 19281056
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19281233 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttgcccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcactta 19281134  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcac 178  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  19281133 aaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataggtagcctagttgtcac 19281056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 599896 - 600074
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  599896 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 599995  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  599996 aaaatgtgtttatgtgactaatttgtattggttgggataaattatccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 600074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 10508086 - 10507908
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10508086 tttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgataatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 10507987  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  10507986 aaaatgtgcttacgtggctaatgtgtattggttggggtaaactacccaccattcttcgatggctaccctagttgtcacc 10507908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 33452750 - 33452572
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33452750 tttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgaataatttgttgttggggtcaagatagttcatggataccactta 33452651  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33452650 aaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 33452572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 24224249 - 24224070
Alignment:
Q  1 tttctagatt-acctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  24224249 tttctagatttacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggataccactt 24224150  T
Q  100 aaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  24224149 aaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacctactattctttcatgagtatcctagttgtcacc 24224070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 5294979 - 5294801
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  5294979 tttctagattacttttgaagaatagtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactta 5294880  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5294879 aaaatgtgcttatgtgactaatgtatattgattgaggtaaattactcaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 5294801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 5299531 - 5299353
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  5299531 tttctagattacttttgaagaatagtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactta 5299432  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5299431 aaaatgtgcttatgtgactaatgtatattgattgaggtaaattactcaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 5299353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 30743626 - 30743448
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  30743626 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgagatcaagatagtttatggataccactta 30743527  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||| ||||||| || |||||    
T  30743526 aaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattacctaccattctttcatggataccctaattatcacc 30743448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 30467781 - 30467656
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30467781 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaacaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 30467682  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgt 126  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  30467681 aacatgtgcttatgtggctaatgtgt 30467656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 99; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 29 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 23262079 - 23261929
Alignment:
Q  29 gtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtat 128  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  23262079 gtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggggttaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgaggttaatatgtat 23261980  T
Q  129 tggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  23261979 tggttggggtaaattatccaccgttctttcataggtaccctagttgtcacc 23261929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 28949012 - 28948845
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| ||||          
T  28949012 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatgaatata----- 28948918  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  28948917 ------tgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 28948845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 13329385 - 13329545
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| || || |||| ||||||||||||           |    
T  13329385 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggttaagatagttcat-----------a 13329473  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagt 172  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  13329474 aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagt 13329545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 15965437 - 15965604
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || |||| |||||| |||||| ||||          
T  15965437 tttctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatacttcatgaatat------ 15965530  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
         ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  15965531 -----gtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 15965604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 7167586 - 7167754
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  7167586 tttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattagtggggtcaagatagtttatggataccaccta 7167685  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcaccc 180  Q
    |||| |||           ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7167686 aaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcaccc 7167754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 179
Target Start/End: Original strand, 4487546 - 4487698
Alignment:
Q  16 tgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgt 115  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||           || || ||||    
T  4487546 tgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatat-----------gtactcatgt 4487634  T
Q  116 ggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  4487635 ggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 4487698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 3291012 - 3291179
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||| || || |||| ||||||||||||           |    
T  3291012 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgaacaatttatttgtggggttaagatagttcat-----------a 3291100  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||    
T  3291101 aatatgtgcttatgtggctaatatgtattgattgaggtaaattacccatcattctttcatggatagcctaattgtcacc 3291179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 3786753 - 3786920
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||  ||||| || || ||||||| |||||||||| ||||          
T  3786753 tttctaaattacttttgaagaatggtggataatttacctaccaatcaatgaaaatgaagaatttatttgtggggtcaatatagttcatgaatat------ 3786846  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
         |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  3786847 -----gtgcttatgtggctaatgtgtattagttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 3786920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 1398557 - 1398725
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| |||| ||||||| |||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||| ||||          
T  1398557 tttctaaattatctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgaggtcaagatagttgatgaatat------ 1398650  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcaccc 180  Q
         ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  1398651 -----gtgcttatgtggctaatatgtattggttggagtaaattacccgtcattctttcataggtagcctagttgtcaccc 1398725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 104 - 179
Target Start/End: Original strand, 18661830 - 18661905
Alignment:
Q  104 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  18661830 atgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 18661905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Original strand, 929663 - 929741
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaag 79  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  929663 tttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaag 929741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 104 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 24913171 - 24913096
Alignment:
Q  104 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| | |||||||||||    
T  24913171 atgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgagtagcttagttgtcacc 24913096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 1939669 - 1939578
Alignment:
Q  3 tctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatat 94  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||    
T  1939669 tctaaattatctttgaagaatggtggataatttacctataaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatggatat 1939578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 11743122 - 11743070
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaa 53  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11743122 tttctagattacccttgaagaatggtgggtaatttatccatcaatcaatgaaa 11743070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 120 - 179
Target Start/End: Original strand, 34262342 - 34262401
Alignment:
Q  120 aatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34262342 aatgtttattggttgtgataaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 34262401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 375786 - 375729
Alignment:
Q  120 aatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtca 177  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| || ||||||    
T  375786 aatgtttattggttggggtaaattatccaccatttttccatgggtaccttaattgtca 375729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 375887 - 375807
Alignment:
Q  5 tagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagtt 85  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||||||||||| | |||  ||| | |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  375887 tagattacttttgaaaaatggtgggtaatttacctaccaactaatcataatgcgcaatttattggtggggtcaagatagtt 375807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 75)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 24253386 - 24253564
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24253386 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 24253485  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24253486 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 24253564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 43262361 - 43262183
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43262361 tttctatattacctttgaagaatggtgggtaattaacctaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 43262262  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43262261 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 43262183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 43326557 - 43326378
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43326557 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 43326458  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcaccc 180  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43326457 aaaatgtgcctatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttggcaccc 43326378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 27501229 - 27501055
Alignment:
Q  5 tagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaa 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27501229 tagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 27501130  T
Q  105 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27501129 tgtgcttatgtggctaatgtgtattgtttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 27501055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 15398660 - 15398483
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15398660 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 15398561  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcac 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  15398560 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtactctagttgtcac 15398483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 739882 - 739699
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  739882 tttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 739783  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacccaaaa 184  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  739782 aaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacctaaaa 739699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 35626042 - 35626220
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  35626042 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactta 35626141  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35626142 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtactctagttgtcacc 35626220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 6901803 - 6901984
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  6901803 tttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccactta 6901902  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacccaa 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6901903 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcatccaa 6901984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 5184976 - 5185155
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  5184976 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccactta 5185075  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcaccc 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5185076 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattactcaccattcttccatgggtatcctagttgtcaccc 5185155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 12648801 - 12648984
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  12648801 tttctagattatctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccactta 12648900  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacccaaaa 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12648901 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacccaaaa 12648984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 3466859 - 3466681
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3466859 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 3466760  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  3466759 aaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttttatgggtaccctagttgtcacc 3466681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 7722053 - 7722231
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7722053 tttctagattgcctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 7722152  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7722153 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtttgggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 7722231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 15683795 - 15683973
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15683795 tttctagattacctttgaagaatgatgtgtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 15683894  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15683895 aaaatgtgcttatatggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccataagtaccctagttgtcacc 15683973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 18479846 - 18479668
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18479846 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccactta 18479747  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  18479746 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatggataccctagtagtcacc 18479668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Original strand, 39932587 - 39932761
Alignment:
Q  5 tagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaa 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39932587 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 39932686  T
Q  105 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39932687 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattaccaaccattcttccatgggtactctagttgtcacc 39932761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 40886205 - 40886028
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||     
T  40886205 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt- 40886107  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40886106 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttttcacc 40886028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 137; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 27938901 - 27939081
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27938901 tttctagattatttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 27939000  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatggg-taccctagttgtcaccc 180  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27939001 aaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggttaccctagttgtcaccc 27939081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 2484470 - 2484292
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||    
T  2484470 tttctagattatctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggatactactta 2484371  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2484370 aaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 2484292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 8 - 179
Target Start/End: Original strand, 31938908 - 31939079
Alignment:
Q  8 attacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgt 107  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31938908 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 31939007  T
Q  108 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31939008 gtttatatgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 31939079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 25831525 - 25831702
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||    
T  25831525 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaataagcaatttgttggtggggtcaa-atagttcatggataccaatta 25831623  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||    
T  25831624 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccttatttgtcacc 25831702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 27278655 - 27278474
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatag----ttcatggatatca 96  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    |||||||||| ||    
T  27278655 tttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagataattcatggatacca 27278556  T
Q  97 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcac 178  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27278555 cttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcac 27278474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 124; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 28424971 - 28424795
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  28424971 tttctagattacctttgaaggatagtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaatg--caatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccactta 28424874  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  28424873 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggatactctagttgtcacc 28424795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 124; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 8 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 40279029 - 40278858
Alignment:
Q  8 attacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgt 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  40279029 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaacataattcatggataccacttaaaaatgt 40278930  T
Q  108 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  40278929 gcttatgtggctaatgtgtattgattgagataaattacccatcattcttccatgaataccctagttgtcacc 40278858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 5137719 - 5137897
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5137719 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 5137818  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||| || | |||||||| ||| |||||||||||   ||||||||||||||||    
T  5137819 aaaatgtgtttatgtggctaatatgtattgatttgagtaaattatccaccattcttccattaataccctagttgtcacc 5137897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 122; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 34 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 29789440 - 29789295
Alignment:
Q  34 ttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt 133  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29789440 ttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggtt 29789341  T
Q  134 ggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29789340 gggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 29789295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 38756662 - 38756487
Alignment:
Q  5 tagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaa 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38756662 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaataaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaa 38756563  T
Q  105 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt-ccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  38756562 tgtgtttatgtggctaatgtgtattagttgagataaattacccacaattcttcccataggtaccctagttgtcacc 38756487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 13504920 - 13504742
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13504920 tttctagattaccatcgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccactta 13504821  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13504820 aaaatgtgcttatgtgactaatatgtattagttgggataaattatccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 13504742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 890910 - 891087
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||     
T  890910 tttctagattacttttgaagaatggtggataatttatccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtcgagtcaagatagttcatggataccactt- 891008  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  891009 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacctaccattcttccatgggtatcctaattgtcacc 891087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 763727 - 763905
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| || ||| |||| |||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  763727 tttctagattatttttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaataaaaatgagtaatttgttggtggagttaagatagttcatggatatcactta 763826  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||    
T  763827 aaaatgtacttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccatcattctttgatggatactctagttgtcacc 763905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 46 - 179
Target Start/End: Original strand, 34451299 - 34451432
Alignment:
Q  46 caatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 145  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34451299 caatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaatatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattac 34451398  T
Q  146 ccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34451399 ccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 34451432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 40110238 - 40110413
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  40110238 tttctatattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggt-gggtcaagatagttcatagataccactta 40110336  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtca 177  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||| | | |||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  40110337 aaaatgtgcttatgtggttaatgtatattagttagggtaaattatctaccattcttccatgagtatcctaattgtca 40110413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 19295734 - 19295901
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||| ||||          
T  19295734 tttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatagttcatgtatat------ 19295827  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  19295828 -----gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 19295901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 27503383 - 27503550
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||          
T  27503383 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatat------ 27503476  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  27503477 -----gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 27503550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 33617589 - 33617756
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||          
T  33617589 tttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatgaatat------ 33617682  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33617683 -----gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 33617756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 38015681 - 38015514
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||          
T  38015681 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatat------ 38015588  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  38015587 -----gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 38015514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 23195415 - 23195248
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||          
T  23195415 tttctaaattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatat------ 23195322  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  23195321 -----gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccgtcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 23195248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 9424759 - 9424593
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||| ||||          
T  9424759 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatata----- 9424665  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcac 178  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  9424664 ------tgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcac 9424593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 4149698 - 4149847
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||| |          |||||| ||||||    
T  4149698 tttctatattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtta----------tggataccactta 4149787  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccat 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  4149788 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccat 4149847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 5497277 - 5497444
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| || || ||||||| |||||||||| ||||          
T  5497277 tttctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaaaatagttcatgaatat------ 5497370  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  5497371 -----gtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 5497444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 6973067 - 6973234
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||               
T  6973067 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg----------- 6973155  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  6973156 aatatgtgcttatgtgactaatatgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgacacc 6973234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 13957674 - 13957841
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||               
T  13957674 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg----------- 13957762  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    || ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  13957763 aatatgcgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 13957841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 42658822 - 42658671
Alignment:
Q  8 attacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgt 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||           || || |    
T  42658822 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatat 42658734  T
Q  108 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtacccta 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  42658733 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagccta 42658671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 31294167 - 31293989
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||| |||||  | |||| |||| ||| ||||||    
T  31294167 tttctagattacctttaaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaaattattggtagggtccgggtagtccatgaataccactta 31294068  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||| |||||| |||  | |||  |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31294067 aaaatatgcttacgtgattgatggttattggttggagtaaattacccaccattcttacatgggtaccctagttgtcacc 31293989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 81; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 9374669 - 9374502
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||| ||||          
T  9374669 tttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatgaatat------ 9374576  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
         ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  9374575 -----gtgtttaggtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 9374502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 36365612 - 36365445
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||               
T  36365612 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg----------- 36365524  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||  ||||||| ||||    
T  36365523 aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattagccatcattctttcatggatagtctagttgccacc 36365445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 40632503 - 40632634
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |         
T  40632503 tttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacc----- 40632597  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaa 141  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40632598 ----ggtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaa 40632634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 179
Target Start/End: Original strand, 14971989 - 14972149
Alignment:
Q  8 attacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgt 107  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||| ||||           ||    
T  14971989 attaactttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtttatgaatat-----------gt 14972077  T
Q  108 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  14972078 gcttatgtgactaatgtgtattgattaggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 14972149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 26 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 3656710 - 3656568
Alignment:
Q  26 tgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtg 125  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||| ||||           ||||||||||||||||||||    
T  3656710 tgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttttggggtcaagatagttcatgaatat-----------gtgcttatgtggctaatgtg 3656622  T
Q  126 tattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  3656621 tattggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 3656568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 31 - 179
Target Start/End: Original strand, 38492647 - 38492783
Alignment:
Q  31 aatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattg 130  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||           ||||||||||| |||||||||||||    
T  38492647 aatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatat-----------gtgcttatgtgactaatgtgtattg 38492735  T
Q  131 gttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||    
T  38492736 gttggggtaaattacccatcattctttcat-ggtagcctagttgccacc 38492783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 2585466 - 2585634
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||  ||    
T  2585466 tttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccatcta 2585565  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcaccc 180  Q
    ||||  ||           ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  2585566 aaaagttg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatggataccctaattgtcaccc 2585634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 24167951 - 24167784
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||| |||| | ||| | |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  24167951 tttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataataaacaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccaccta 24167852  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||| |||           ||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24167851 aaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattactcaacatttttccatgggtaccctagttgtcacc 24167784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 12558196 - 12558090
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  12558196 tttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattgatgtggtcaagatagttcat-gataccactta 12558098  T
Q  101 aaaatgtg 108  Q
    ||||||||    
T  12558097 aaaatgtg 12558090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 156
Target Start/End: Original strand, 6206895 - 6207032
Alignment:
Q  8 attacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgt 107  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| || |  ||||||| |||||||||| ||||           ||    
T  6206895 attacttttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgagcaatttatttggggggtcaaaatagttcatgaatat-----------gt 6206983  T
Q  108 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6206984 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 6207032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Original strand, 27390605 - 27390768
Alignment:
Q  5 tagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaa 104  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| || |||||||| ||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  27390605 tagattacctttgaaaaatggtggatagtttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaa 27390704  T
Q  105 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
     |||           |||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27390705 ggtg-----------aatgttcattggttggggtaaattatccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 27390768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 38638077 - 38637910
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||| |||| | |||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||  ||    
T  38638077 tttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagtaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccaacta 38637978  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||| |||           ||||| |||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38637977 aaaaggtg-----------aatgtttattagttggggtaaattacccacaatttttccatgggtaccctagttgtcacc 38637910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 105
Target Start/End: Original strand, 5120036 - 5120132
Alignment:
Q  8 attacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaat 105  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  5120036 attacctttgatgaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttattggtagggtcaagatagttcat-gataccacttaaaaat 5120132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 36948626 - 36948492
Alignment:
Q  30 taatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtatt 129  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||    
T  36948626 taatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtagggt-aagatagttcatggatat-----------gtgcttatgtggctaatgtgtatt 36948539  T
Q  130 ggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtca 177  Q
    || | |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  36948538 gg-tagggtaaattacccaccattcttgcatgagtaccctagctgtca 36948492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 42247949 - 42247856
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatat 94  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||| ||||    
T  42247949 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtttatgaatat 42247856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 1402672 - 1402505
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||| |||| | |||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||| |||  |    
T  1402672 tttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagtaatttattggtgggatcaagatagtttatggataccaccca 1402573  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||| |||           ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  1402572 aaaaggtg-----------aatgtttattagttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttatcacc 1402505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 18327340 - 18327173
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||| ||| |||| | |||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  18327340 tttctagattatctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaattataatgcgcaatttattggtggagtcaagatagtttatggataccaccta 18327241  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||| |||           ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  18327240 aaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccttagttatcacc 18327173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 36472451 - 36472348
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||     
T  36472451 tttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacttt 36472352  T
Q  101 aaaa 104  Q
    ||||    
T  36472351 aaaa 36472348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 33624105 - 33623940
Alignment:
Q  2 ttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaa 101  Q
    ||||| |||||||||||| |||| | | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||| ||| ||||||| |||           
T  33624105 ttctaaattacctttgaataatggtagataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaataattcatgggtat------- 33624013  T
Q  102 aaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcac 178  Q
        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||| |||| ||||||| |||||||    
T  33624012 ----gtgcttatgtggctaatgtgtatcggttggggtaaattatccaccatttttcaatggataccctaattgtcac 33623940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 107 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 612830 - 612757
Alignment:
Q  107 tgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-gtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  612830 tgcttatgtggctaatgtgtattggttgggagtaaattactcagtattcttccatgggtatcctagttgtcacc 612757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 40686903 - 40687069
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||| ||| |||| | |||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||| ||  ||    
T  40686903 tttctagattacctttgagaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagtaatttattggtggggtcaagatagtttatgaataccatcta 40687002  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||| |||           ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  40687003 aaaa-gtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccataggtaccctaattgtcacc 40687069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 9171192 - 9171111
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagata 82  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  9171192 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaacaaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagata 9171111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 15301033 - 15300977
Alignment:
Q  8 attacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaattt 64  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  15301033 attacctttgaagaatgattggtaatttacacatcaaccaatgaaaatgagcaattt 15300977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 9527183 - 9527124
Alignment:
Q  5 tagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaattt 64  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  9527183 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaattt 9527124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 121 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 42247849 - 42247786
Alignment:
Q  121 atgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacccaaaa 184  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||| ||||    
T  42247849 atgtgtattgattggggtaaattacccatcattctttcatggatagcctagttgacacctaaaa 42247786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 3940399 - 3940331
Alignment:
Q  116 ggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacccaaaa 184  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||    
T  3940399 ggctaatgtgtattggttcgaataaattactcatcattcttccatagataccttagttgtcaccgaaaa 3940331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 3940478 - 3940411
Alignment:
Q  21 aatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcat 88  Q
    |||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||    
T  3940478 aatggtgggtaatttacccaccaacaaatgaaaatgagcaatttattggtgcggtcaagataattcat 3940411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 105 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 9171108 - 9171035
Alignment:
Q  105 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||   |||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  9171108 tgtgcttatgtggttaatgtgtattgatt-gggtaaattacttgtcattctttcataggtagcctagttgtcacc 9171035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 179
Target Start/End: Original strand, 21785995 - 21786032
Alignment:
Q  142 ttacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21785995 ttacctatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 21786032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 33316386 - 33316320
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgtt 67  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||   |||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  33316386 tttctagattacttttaaagaatgacaagtaatttacttatcaaccaatgaaaataagcaatttgtt 33316320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 612897 - 612830
Alignment:
Q  26 tgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatat 94  Q
    ||||||||||| ||| ||| || ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  612897 tgggtaatttaaccaccaacca-tgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagtttattgatat 612830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 28756082 - 28756138
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatga 57  Q
    ||||||||| |||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  28756082 tttctagatcacctttaaagaaaggtggataatttacccaccaagcaatgaaaatga 28756138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 123)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 31532313 - 31532135
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31532313 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 31532214  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31532213 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 31532135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 21366787 - 21366609
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21366787 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 21366688  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21366687 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 21366609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 34276551 - 34276729
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34276551 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 34276650  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34276651 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 34276729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 237481 - 237659
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  237481 tttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataacactta 237580  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  237581 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttatcacc 237659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Original strand, 9798473 - 9798647
Alignment:
Q  5 tagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaa 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9798473 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 9798572  T
Q  105 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9798573 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 9798647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 18462191 - 18462013
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18462191 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcactta 18462092  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18462091 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaatcacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacc 18462013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 23437596 - 23437774
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23437596 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 23437695  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23437696 aaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 23437774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 6019932 - 6020109
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  6019932 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccactta 6020031  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcac 178  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6020032 aaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 6020109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 42085211 - 42085396
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42085211 tttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 42085310  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacccaaaact 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  42085311 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccatagttgtcacctaaaact 42085396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 39077549 - 39077727
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  39077549 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccactta 39077648  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39077649 aaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaacattcttccatgggtaccctagttgtcacc 39077727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 44984765 - 44984943
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44984765 tttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 44984864  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44984865 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 44984943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 53854607 - 53854430
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  53854607 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 53854508  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53854507 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcacc 53854430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 32366838 - 32366661
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32366838 tttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 32366739  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcac 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32366738 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgtggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 32366661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 2826859 - 2826682
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2826859 tttctagattccctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 2826760  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2826759 aaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcacc 2826682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 19387866 - 19387688
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  19387866 tttctagattacgtttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatggataccactta 19387767  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19387766 aaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 19387688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 31972514 - 31972336
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  31972514 tttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccactta 31972415  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  31972414 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctaattgtcacc 31972336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 41632184 - 41632007
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41632184 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggt-gggtcaagatagttcatggatatcgctta 41632086  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  41632085 aaaatgtacttatatggctaatatgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtatcctagttgtcacc 41632007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 51363011 - 51363188
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  51363011 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccactta 51363110  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51363111 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcacc 51363188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 53461994 - 53461816
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  53461994 tttctaaattacctatgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 53461895  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  53461894 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 53461816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 54575118 - 54574940
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54575118 tttctagattatcttagaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttggtggtggggtcaagatagttcatggataccactta 54575019  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54575018 aaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 54574940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 41702637 - 41702461
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  41702637 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaacttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccactta 41702538  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtca 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41702537 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtca 41702461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 146607 - 146429
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  146607 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 146508  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  146507 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgtggtaaattacccaccattcttctatgcgtactctagttgtcacc 146429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 3170630 - 3170808
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3170630 tttctagattacctttgaagaatggtgtgtaatttacccaccaaccaataaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcactta 3170729  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  3170730 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggatactctagttgtcacc 3170808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 22618690 - 22618514
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22618690 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttgg-tgggtcaagatagttcatggataccactta 22618592  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22618591 aaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggtt-aggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 22618514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 26091436 - 26091258
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26091436 tttctaaattatcttggaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 26091337  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26091336 aaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 26091258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 29478364 - 29478542
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29478364 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 29478463  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29478464 aaaatgtgcttatatggctaatgtgtattagttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 29478542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Original strand, 31914206 - 31914379
Alignment:
Q  5 tagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaa 104  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31914206 tagattacctttgaagaattgtggataatttacccaccaaccaatgaaactgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 31914305  T
Q  105 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31914306 tgtgcttatg-ggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 31914379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 42766019 - 42765842
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  42766019 tttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg-ataccactta 42765921  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42765920 aaaatgtgctaatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccttagttgtcacc 42765842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 43471873 - 43471695
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43471873 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattggtgtggtcaagatagttcatggataccactta 43471774  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43471773 aaaatgtgattatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 43471695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Original strand, 45797487 - 45797661
Alignment:
Q  5 tagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaa 104  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45797487 tagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 45797586  T
Q  105 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45797587 tgtacttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacctaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 45797661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 47344660 - 47344838
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47344660 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 47344759  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47344760 aaaatatgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattattcaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 47344838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 54607966 - 54608144
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  54607966 tttctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgtataccactta 54608065  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  54608066 aaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattcttccatggataccctagtagtcacc 54608144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 55056437 - 55056259
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||    
T  55056437 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacaactta 55056338  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  55056337 aaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtacccttgttgtcacc 55056259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 41949386 - 41949566
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41949386 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 41949485  T
Q  101 aaaatgtgct--tatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  41949486 aaaatgtgcttatatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataggtaccctagttgtcacc 41949566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 177
Target Start/End: Original strand, 397410 - 397582
Alignment:
Q  5 tagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaa 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  397410 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 397509  T
Q  105 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtca 177  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  397510 tgtgtttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtca 397582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 50457988 - 50457812
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  50457988 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactta 50457889  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtca 177  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50457888 aaaatgtgcttatgttgctaatgtgtattggttgaggtaaattatacaccattcttccatgggtaccctagttgtca 50457812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 132; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 6285311 - 6285486
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  6285311 tttctatattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaaaatagttcatggataccactta 6285410  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtc 176  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6285411 aaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 6285486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 407758 - 407934
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  407758 tttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-cactta 407856  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  407857 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggt-aattatccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 407934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 23609091 - 23609269
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  23609091 tttctagattatctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaatcaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcacggataccactta 23609190  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23609191 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctatttgtcacc 23609269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 27373080 - 27373257
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  27373080 tttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccactta 27373179  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  27373180 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat-ggtactctaattgtcacc 27373257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 175
Target Start/End: Original strand, 50534639 - 50534809
Alignment:
Q  5 tagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaa 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50534639 tagattacctttgaagaatggtgggtaacttacccaccaatcaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 50534738  T
Q  105 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgt 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  50534739 tgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccttagttgt 50534809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Original strand, 55776053 - 55776226
Alignment:
Q  5 tagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaa 104  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  55776053 tagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggt-gggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 55776151  T
Q  105 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  55776152 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataagtaccctagttgtcacc 55776226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Original strand, 55840231 - 55840404
Alignment:
Q  5 tagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaa 104  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  55840231 tagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggt-gggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 55840329  T
Q  105 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  55840330 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataagtaccctagttgtcacc 55840404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 56023176 - 56022998
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  56023176 tttctagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttgttagtggggtcaagatagttcatggataccactta 56023077  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  56023076 aaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattttttcatgggtaccctagttgtcacc 56022998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 8 - 179
Target Start/End: Original strand, 41560339 - 41560510
Alignment:
Q  8 attacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgt 107  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41560339 attacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt 41560438  T
Q  108 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41560439 gcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagctgtcacc 41560510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 2243462 - 2243640
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2243462 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtcgggtcaagatagttcatggataccactta 2243561  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2243562 aaaatgtatttatgtggcttatgtgtattagttggagtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacc 2243640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 29777435 - 29777257
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| | ||||| ||||||    
T  29777435 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcgagatagtttacggataccactta 29777336  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  29777335 aaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacc 29777257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Original strand, 35446510 - 35446683
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35446510 tttctagattaccttttaagaatggtgggtaatttacc-accgaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggggtcaagatagttcatggatatcactta 35446608  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgt 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35446609 aaaatgtgcttatttggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgt 35446683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 42222295 - 42222473
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  42222295 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcattgataccactta 42222394  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  42222395 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacacaccattcttttatgggtaccctagttgtcacc 42222473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 126; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 49881241 - 49881059
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  49881241 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccactta 49881142  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggg----taaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  49881141 aaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgggcgggataaattacccaccattcttccatgggtactctagttgtcacc 49881059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 126; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 53834232 - 53834055
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  53834232 tttctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaacaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgcggtcaagatagttcatggataccactta 53834133  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcac 178  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  53834132 aaaatgtgcttatgtgactaatgtatattgattgaagtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcac 53834055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 3692388 - 3692210
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| || |||| ||||||    
T  3692388 tttctagattacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtgggattaagatagtttattgataccactta 3692289  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3692288 aaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 3692210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 31070251 - 31070074
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  31070251 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgctggtggagtcaagatagttcatg-ataccactta 31070153  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31070152 aaaatgtgctcatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 31070074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 50234004 - 50234182
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  50234004 tttctagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtgggatcaagatagttaatggataccactta 50234103  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  50234104 aaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatggataccctagttgtcacc 50234182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 54086414 - 54086590
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||    
T  54086414 tttctagattac-tttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggt-gggtcaagatagttcatggataccgctta 54086511  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54086512 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgcattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 54086590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 55519831 - 55520009
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||| |||  |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  55519831 tttctagattacttttgaagaatggtggataatttatccaccaactaatgaaaatgagcaattttttggtgggatcaagatagttcatggataccactta 55519930  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  55519931 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgtggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 55520009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 122; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 38591672 - 38591846
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |      
T  38591672 tttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccatt-- 38591769  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38591770 --aatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 38591846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 54805796 - 54805608
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||||| |||| ||||||    
T  54805796 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttggtgggattaagatagttcatagataccactta 54805697  T
Q  101 aaaatgtg----cttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacccaaaac 185  Q
    ||||||||     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  54805696 aaaatgtgtttatttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattactcatcattgttccatgggtaccctagatgtcacccaaaac 54805608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Original strand, 42033183 - 42033357
Alignment:
Q  5 tagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaa 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42033183 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaattaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 42033282  T
Q  105 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42033283 tgtgtttatgtagctaatgtatattggttgagataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 42033357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 47662280 - 47662102
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| || | ||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  47662280 tttctagattacctttgaataatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttagtggtgtcaatatagttaatggataccactta 47662181  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47662180 aaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacc 47662102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 48313561 - 48313737
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  48313561 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttgg-tgggtcaagatagttcatggataccactt- 48313658  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||| ||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48313659 aaaatatgcttatgtagctaatatatattggttagggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 48313737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 14017552 - 14017376
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||     
T  14017552 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt- 14017454  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
     || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14017453 -aagtgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacctgccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 14017376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Original strand, 48657832 - 48658000
Alignment:
Q  5 tagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaa 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||      |||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48657832 tagattacctttgaagaatggtgggt------cccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 48657925  T
Q  105 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48657926 tgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 48658000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 1932767 - 1932945
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  1932767 tttctagattacctttgaagaatagtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttgttagtggggtcaagatagttcatagataccactta 1932866  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||    
T  1932867 aaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattatccatcattttttcatgggtaccctagttatcacc 1932945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 39587957 - 39587796
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39587957 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacctaccaaccaatgaatatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 39587858  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgg 162  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  39587857 aaaatgtgcttatataactaatgtatattggttagggtaaattacccaccattcttccatgg 39587796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 179
Target Start/End: Original strand, 54424988 - 54425163
Alignment:
Q  3 tctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaa 102  Q
    |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  54424988 tctagattccctatgaagaatggtgggtaatttacccaccgaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaa 54425087  T
Q  103 aatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  54425088 aatgtgcttatgtgactaatgtctattggttggggtaaattacccacgattcttccat-ggtacactagttgtcacc 54425163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 5 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 50536798 - 50536623
Alignment:
Q  5 tagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaa 104  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  50536798 tagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccgatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagatagttaatggataccacttaaaaa 50536699  T
Q  105 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcaccc 180  Q
    | || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  50536698 tatgtttatgtgactaatgtgtattagttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgttaccc 50536623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 22468948 - 22468788
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||    
T  22468948 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatagataccactta 22468849  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatg 161  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||    
T  22468848 aaaatatgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccatttttccatg 22468788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 51951686 - 51951861
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||  | | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  51951686 tttctagattacttttgaagaatgatgagtaatttatccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttaatggagtcaagatagttcatggatatcagtta 51951785  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtca 177  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  51951786 aaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggtt-gtgtaaattacccaccattcttccatggataccctaattgtca 51951861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 33897669 - 33897504
Alignment:
Q  5 tagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaa 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33897669 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 33897570  T
Q  105 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtacccta 170  Q
    | || |||| |||||||||||||||  ||||  ||||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  33897569 tatgattatatggctaatgtgtattaattggaataaattacccaccattcttctataggtacccta 33897504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 36532998 - 36532830
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||          ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36532998 tttctaaattacctttgaagaatgatgggtaatttacaccacaat----------gagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 36532909  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36532908 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 36532830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 37 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 52728448 - 52728306
Alignment:
Q  37 cccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg 136  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |    
T  52728448 cccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgcgtattggttgag 52728349  T
Q  137 gtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcaccc 180  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52728348 gtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcaccc 52728306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 99; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 48259688 - 48259512
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||| |||||     
T  48259688 tttctagattacccttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaattagttggtggagtcaagatagttcatgaataccactt- 48259590  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||    
T  48259589 aaaatgtgcttatgtggctaatatgtattgattagggtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctacttatcacc 48259512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 45633939 - 45633779
Alignment:
Q  8 attacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgt 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||           ||    
T  45633939 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatat-----------gt 45633851  T
Q  108 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  45633850 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 45633779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Original strand, 48654822 - 48655002
Alignment:
Q  5 tagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaa 104  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  48654822 tagattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttgatagataccacttaaaaa 48654921  T
Q  105 tgtgcttatgtggcta------atgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||| ||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  48654922 tgtacttatgtggctaatgtgtatgtgtattggttggggtaaattacctaccattcttccatggctaccctaattgtcacc 48655002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 15060456 - 15060289
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||               
T  15060456 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg----------- 15060368  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  15060367 aatatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 15060289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 9998098 - 9997931
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||          
T  9998098 tttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagtaatttattggtgggatcaagatagttcatgaatat------ 9998005  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9998004 -----gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 9997931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 5117605 - 5117438
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||               
T  5117605 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg----------- 5117517  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||  ||||||||||||    
T  5117516 aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttaatggatagtctagttgtcacc 5117438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 22620597 - 22620764
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||               
T  22620597 tttctaaattatctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg----------- 22620685  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||    
T  22620686 aatatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccatcattcttttatgggtagcctagttgccacc 22620764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 37239257 - 37239090
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||          
T  37239257 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatat------ 37239164  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  37239163 -----gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 37239090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 46708908 - 46708741
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||               
T  46708908 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg----------- 46708820  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | || |||||||||||||    
T  46708819 aatatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaatcacccatcattctttcattgatagcctagttgtcacc 46708741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 47811910 - 47812077
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||          
T  47811910 tttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaatatgagcaatttattgattgagtcaagatagttcatgaatat------ 47812003  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  47812004 -----gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatggataccctaattgtcacc 47812077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 34552323 - 34552495
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||||||| ||||          
T  34552323 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggtgtcaagatagttcatgaatat------ 34552416  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacccaaaa 184  Q
         ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  34552417 -----gtgcttatgcggctaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccaaaaa 34552495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 82 - 179
Target Start/End: Original strand, 35595772 - 35595869
Alignment:
Q  82 agttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35595772 agttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 35595869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 20352009 - 20351842
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| || || || ||||||||||||||| ||||          
T  20352009 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaatat------ 20351916  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  20351915 -----gtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagtctagttgtcacc 20351842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 43890932 - 43891099
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||| ||||          
T  43890932 tttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggagtcaatatagttcatgaatat------ 43891025  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  43891026 -----gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccatagttgtcacc 43891099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 52688353 - 52688520
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || |||| |||||||||| ||||          
T  52688353 tttctaaattaccttagaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaatagttcatgaatata----- 52688447  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  52688448 ------tgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 52688520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 54715039 - 54715206
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||          
T  54715039 tttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaacatagttcatgaatat------ 54715132  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
         |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  54715133 -----gtgcttatgtggctaatgtgtattagttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttatcacc 54715206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 27873715 - 27873550
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||| ||||||||||||| ||||          
T  27873715 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaatcaatgaaaatgagtaatttatttgtggggttaagatagttcatgaatat------ 27873622  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||    
T  27873621 -----gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt--ttgggtagcctagttgtcacc 27873550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 81; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 31881481 - 31881314
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||               
T  31881481 tttctaaattacctatgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg----------- 31881393  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  31881392 aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattattcatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 31881314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 54216317 - 54216482
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||               
T  54216317 tttctaaattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg----------- 54216405  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtca 177  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  54216406 aatatgtgcttatgttgctaatgtgtattggttggggtaaattatcgatcattctttcatgggtaacctagttgtca 54216482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 4486748 - 4486581
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| ||||          
T  4486748 tttctaaattatctttgaagaacggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatgaatat------ 4486655  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||  ||||||||||||    
T  4486654 -----gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatagatagtctagttgtcacc 4486581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 52 - 184
Target Start/End: Original strand, 42509351 - 42509483
Alignment:
Q  52 aaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatca 151  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||    
T  42509351 aaatgaccaatttattggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtgactaatgtgtattggttaggataaattatccacca 42509450  T
Q  152 ttcttccatgggtaccctagttgtcacccaaaa 184  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  42509451 ttcttccatgagtaccctagttatcaccaaaaa 42509483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 75; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 179
Target Start/End: Original strand, 49014112 - 49014269
Alignment:
Q  11 acctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgct 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||           || |||| ||    
T  49014112 acctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtact 49014200  T
Q  111 tatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  49014201 tatgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 49014269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 33289707 - 33289873
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||  |||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||| |||           
T  33289707 tttctaaattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtaggatcaagatagttcatgaatac------ 33289800  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  33289801 -----gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagccta-ttgtcacc 33289873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 34835181 - 34835348
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||| ||  ||    
T  34835181 tttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaataccatcta 34835280  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||| |||           ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34835281 aaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 34835348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 38547764 - 38547601
Alignment:
Q  5 tagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaa 104  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  38547764 tagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaa 38547665  T
Q  105 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
     |||           ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  38547664 ggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttctatgggtaccctagttgtcacc 38547601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 54216903 - 54216736
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||               
T  54216903 tttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatg----------- 54216815  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    || |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  54216814 aatatgtgcttatgtgattaatgtgtattggttgggataaattaccctccattcttccatggataccctagttatcacc 54216736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 52461370 - 52461534
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||   || || |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||          
T  52461370 tttctaaattacctttgaa---tggtgtgtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatat------ 52461460  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  52461461 -----gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatggatagcctagttgccacc 52461534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 178
Target Start/End: Original strand, 33048990 - 33049062
Alignment:
Q  106 gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcac 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33048990 gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 33049062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 46 - 135
Target Start/End: Original strand, 52396775 - 52396865
Alignment:
Q  46 caatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaa-gatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52396775 caatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 52396865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 77 - 178
Target Start/End: Original strand, 35344868 - 35344968
Alignment:
Q  77 aagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtc 176  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  35344868 aagatagttcatggataccacttgaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-tggtaaattatccaccattcttccataggtatcctagttgtc 35344966  T
Q  177 ac 178  Q
    ||    
T  35344967 ac 35344968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 14335268 - 14335101
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  14335268 tttctagattacctttgaaaaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtagggtcaagatagttcatagataccaccta 14335169  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||| |||           ||||   |||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  14335168 aaaaggtg-----------aatgctcattgtttgaggtaaattacccaccattctttcatgggtactctagttgtcacc 14335101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 27398770 - 27398607
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||| | |||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  27398770 tttctagattacttttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgcgcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccactta 27398671  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgt 175  Q
    |||||||            ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||    
T  27398670 aaaatgt-----------aaatgtttattggttggggtaaattacccaccattttttcattggtaccctagttgt 27398607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 27580123 - 27580290
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  27580123 tttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccaccta 27580222  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||  ||           ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | || ||||||||    
T  27580223 aaaagatg-----------aatgtttattggttggggtaaattatccatcatttttccatgggtatcttatttgtcacc 27580290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Original strand, 46720029 - 46720195
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  46720029 tttctagattaactttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattgatggggtcaagatagtttatggataccaccta 46720128  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgt 175  Q
    |||| |||  |||       |||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  46720129 aaaaggtg-atat-------atgtttattggttgaggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgt 46720195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 1662426 - 1662261
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  1662426 tttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacctaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccaccta 1662327  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||  |             ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1662326 aaaagat-------------atgttcattggttggggtaaattactcatcattcttccataggtaccctagttgtcacc 1662261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 62; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 3293190 - 3293097
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatat 94  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||    
T  3293190 tttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatat 3293097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 33558109 - 33557960
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||               
T  33558109 tttctaaattatctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgaggaatttatttgtagggtcaagatagttcatg----------- 33558021  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatg 161  Q
    || ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33558020 aatatgtatttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatg 33557960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 102 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 48259780 - 48259704
Alignment:
Q  102 aaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48259780 aaatgtgcttatgtggctaatatgtattgattggggtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcacc 48259704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 573807 - 573974
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| | ||| |||| | ||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  573807 tttctagattacctttaaaaaatggtgggtaatttacctaccaaccaatcataatgaacaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccaccta 573906  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||| |||           ||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  573907 aaaaagtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccactatttttccatgagtacactagttgtcacc 573974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 6371416 - 6371249
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||| || | || || ||| ||    
T  6371416 tttctagattacctttgaaaaatagtgggtaatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttagggttaccaccta 6371317  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||| |||           ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  6371316 aaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccattttttcataggtaccctagttgtcacc 6371249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Original strand, 42557586 - 42557666
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagat 81  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  42557586 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagat 42557666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 43231507 - 43231598
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggata 93  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  43231507 tttctagattac-tttgaagaatggtgggtaatttatccatcaaccaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggata 43231598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 11972296 - 11972203
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatat 94  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||| ||||    
T  11972296 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatat 11972203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 104 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 51981554 - 51981479
Alignment:
Q  104 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||  |||||| |||||    
T  51981554 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcattggtagactagttatcacc 51981479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 3291873 - 3291805
Alignment:
Q  111 tatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||| ||||||||    
T  3291873 tatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatggatagcctaattgtcacc 3291805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 179
Target Start/End: Original strand, 27872612 - 27872750
Alignment:
Q  30 taatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtatt 129  Q
    ||||||||||| ||| |||| | |||||||||||| || || || ||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||           ||||| ||||    
T  27872612 taatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattagtgggatcaagatagtttatggataccacctaaaaaggtg-----------aatgtttatt 27872700  T
Q  130 ggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  27872701 ggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccgtagttgtcacc 27872750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 18206682 - 18206512
Alignment:
Q  8 attacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaag----atagttcatggatatcacttaaaa 103  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||    |||||||||||||| ||| |||||    
T  18206682 attacttttgaagaacggtgggtaatttacctctcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatatatagttcatggataccacctaaaa 18206583  T
Q  104 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
       |    |||||   |||||  ||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  18206582 --ttaaaaatgtg---aatgttcattggttgaaataaattacccatcatttttccatgggtaccttagttgtcacc 18206512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 74 - 179
Target Start/End: Original strand, 42558270 - 42558367
Alignment:
Q  74 gtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagtt 173  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||        ||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||    
T  42558270 gtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgt--------ggctaatgtgtattgattagggtaaattatccaccattcttccatgggtatcttagtt 42558361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 49058035 - 49057933
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||| ||| |  ||| || ||||||||| |||| || |||    
T  49058035 tttctagattacctttaaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaataatttattgatgaggttaaaatagttcatagataccattta 49057936  T
Q  101 aaa 103  Q
    |||    
T  49057935 aaa 49057933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 17555664 - 17555625
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttaccca 40  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17555664 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttaccca 17555625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Original strand, 43478064 - 43478147
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagtt 85  Q
    |||||||||||| ||  |||||  |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||| || ||  |||||||||||||    
T  43478064 tttctagattactttcaaagaaccatgggtaatttatcgatcaaccaatg-aaatgagcaatttattagtgtggtcaagatagtt 43478147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 81)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 17600839 - 17601017
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17600839 tttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 17600938  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17600939 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 17601017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 746469 - 746647
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  746469 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccactta 746568  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  746569 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 746647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 23901782 - 23901960
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23901782 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 23901881  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23901882 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 23901960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 38997104 - 38997283
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38997104 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 38997203  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcaccc 180  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38997204 aaaatgtgcttatgtggctaatgtctattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcaccc 38997283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 4034595 - 4034773
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  4034595 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccactta 4034694  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4034695 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 4034773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 6594636 - 6594458
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6594636 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 6594537  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6594536 aaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 6594458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 45370993 - 45371171
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45370993 tttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggcggggtcaagatagttcatggataccactta 45371092  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45371093 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 45371171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 11184975 - 11185154
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11184975 tttctagattacctttgaagaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 11185074  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcaccc 180  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11185075 aaaatgtgcttatatgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccc 11185154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 2325067 - 2324889
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2325067 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 2324968  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  2324967 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgaataccctagttgtcacc 2324889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 13815396 - 13815218
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13815396 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 13815297  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13815296 aaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccacctttctttcatgggtaccctagttgtcacc 13815218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 14660449 - 14660627
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14660449 tttctagattgcctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 14660548  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14660549 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggtgtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 14660627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 26710348 - 26710526
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26710348 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcattttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 26710447  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26710448 aaaatgtgcttatgtggctgatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 26710526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 27651212 - 27651034
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27651212 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccgcccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 27651113  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27651112 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 27651034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Original strand, 34518374 - 34518548
Alignment:
Q  5 tagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaa 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34518374 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaa 34518473  T
Q  105 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34518474 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccactattcttccatgggtaccctagttgtcacc 34518548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 40635221 - 40635399
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40635221 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 40635320  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40635321 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 40635399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 6430476 - 6430648
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6430476 tttctagattaccttcgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 6430575  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagtt 173  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6430576 aaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagtt 6430648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 10424598 - 10424773
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10424598 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 10424697  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtc 176  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10424698 aaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 10424773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 10244756 - 10244582
Alignment:
Q  5 tagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaa 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10244756 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 10244657  T
Q  105 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10244656 tgtgcttatgtagctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 10244582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 27400406 - 27400584
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27400406 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 27400505  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27400506 aaaatgtacttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 27400584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 32327364 - 32327542
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  32327364 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccagccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccactta 32327463  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32327464 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattatccatcattcttccataggtaccctagttgtcacc 32327542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 27024418 - 27024596
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27024418 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccacaaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccactta 27024517  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27024518 aaaatatgattatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccattattcttccatgggtaccctagttgtcacc 27024596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 33427825 - 33427647
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  33427825 tttctagattacctttgaataatggtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccactta 33427726  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  33427725 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacacaccattctttcatgggtaccctagttatcacc 33427647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 40735467 - 40735645
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  40735467 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccactta 40735566  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  40735567 aaaatgtacttatgcggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccatcattcttccatgagtaccctaattgtcacc 40735645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 1092125 - 1091951
Alignment:
Q  5 tagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaa 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1092125 tagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 1092026  T
Q  105 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1092025 tgtgtttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 1091951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Original strand, 4609633 - 4609807
Alignment:
Q  5 tagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaa 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4609633 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaataagtaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 4609732  T
Q  105 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4609733 tgtgcttatgtgcctaatgtgtattggttggggtaaattatccaacattcttccatgggtaccctagttgtcacc 4609807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 5726132 - 5726310
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  5726132 tttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggttaccactta 5726231  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5726232 aaaatgtgtttatatggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 5726310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 32948449 - 32948626
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  32948449 tttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaga-agttcatggataccactta 32948547  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  32948548 aaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacccatcattcttctatgggtactctagttgtcacc 32948626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 7892866 - 7892688
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  7892866 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggcggggtcaatatagttcatggataccactta 7892767  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  7892766 aaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggtttgggtaaattacccaccattcttccatagataccctagttgtcacc 7892688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 40037146 - 40037323
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  40037146 tttctagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccactta 40037245  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  40037246 aaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgaggtaaattacccatcatt-tttcatgggtaccctagttgtcacc 40037323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 2914312 - 2914138
Alignment:
Q  5 tagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaa 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2914312 tagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 2914213  T
Q  105 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  2914212 tgtgcttatgtggctgatgtgtatcggttgaggtaaattacccaccattcttccatggatatcctagttgtcacc 2914138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 14697711 - 14697537
Alignment:
Q  5 tagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaa 104  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14697711 tagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtgtgatcaagatagttcatggataccacttaaaaa 14697612  T
Q  105 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14697611 tgtgcttatgtagctaatgtgtattggtcggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacc 14697537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 37255510 - 37255337
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||      |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  37255510 tttctagattacctttgaagaatgg-----aatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactta 37255416  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37255415 aaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacc 37255337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 37621044 - 37620867
Alignment:
Q  5 tagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggt---caagatagttcatggatatcacttaa 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| |||||||    
T  37621044 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtactcaagatagttcatggataccacttaa 37620945  T
Q  102 aaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37620944 aaatgtgcttatgtggcttatgtgtattggtttggataaattatccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 37620867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 117; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 15925083 - 15925255
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15925083 tttctagattacctttcaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagtaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccactta 15925182  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagtt 173  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  15925183 aaaatatgcttatgtagctaatgtgtattggttgaggtaaattatccatcattctttcatagataccctagtt 15925255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 11159625 - 11159803
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||    
T  11159625 tttcttgattacctttgaaaaatggtgg-taatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatgccactta 11159723  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcaccc 180  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11159724 aaaatgtgtttatgtggctattgtgtattggatggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcaccc 11159803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 32856603 - 32856436
Alignment:
Q  12 cctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgctt 111  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  32856603 cctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttagtgggatcaagatagttcatggataccacttacaaatgtgctt 32856504  T
Q  112 atgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32856503 atgtggctaatgtatattggttgaggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 32856436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 9444686 - 9444874
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccat-------caatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggata 93  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||       ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  9444686 tttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttaccaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgctggtggggtcaagatagttcatggata 9444785  T
Q  94 tcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac---ccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9444786 ccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattattcttccatggataccctagttgtcacc 9444874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 32608383 - 32608527
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  32608383 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggtgtcaagatagttcatgtataccactta 32608482  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32608483 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 32608527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 49 - 176
Target Start/End: Original strand, 25294886 - 25295013
Alignment:
Q  49 tgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 148  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25294886 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 25294985  T
Q  149 tcattcttccatgggtaccctagttgtc 176  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25294986 tcattcttccatgagtaccctagttgtc 25295013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 8433094 - 8432942
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||     
T  8433094 tttctagattatctttgaagaatggtggataatttacctgccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgtggtcaagatagttcatggataccacttt 8432995  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcatt 153  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8432994 aaaatatacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatt 8432942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 12842106 - 12842250
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||| || |||    
T  12842106 tttcttgattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggagtcaagatagttcttggataccaatta 12842205  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 145  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12842206 aaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 12842250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 35158217 - 35158050
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||          
T  35158217 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatat------ 35158124  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
         ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  35158123 -----gtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 35158050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 94; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 145
Target Start/End: Original strand, 41172468 - 41172605
Alignment:
Q  8 attacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgt 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||  | || |||||||||||||    
T  41172468 attacatttgaagaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttattggtgaggtcaagatagttcaaaggtaccacttaaaaatgt 41172567  T
Q  108 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41172568 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 41172605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 28641459 - 28641287
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||          
T  28641459 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatat------ 28641366  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacccaaaa 184  Q
       ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  28641365 ---atgt--ttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccattattctttcatgggtagcctagttgtcaccaaaaa 28641287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 39103050 - 39103216
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||| ||||          
T  39103050 tttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattgatggggtcaaaatagttcatgaatat------ 39103143  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcac 178  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39103144 -----gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 39103216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 29687044 - 29687216
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||          
T  29687044 tttctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatat------ 29687137  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacccaaaa 184  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  29687138 -----gtgcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccaaaaa 29687216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 42899918 - 42900039
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42899918 tttctagattaccttcgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 42900017  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaat 122  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  42900018 aaaatgcgcttatgtggctaat 42900039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 12730064 - 12730231
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||           ||    
T  12730064 tttctaaattacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca-----------ta 12730152  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  12730153 aatatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttatggtaaattacccatcattctttcatggatagcctagttgccacc 12730231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 27331301 - 27331472
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||          
T  27331301 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtagggtcaagatagttcatgaatat------ 27331394  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
     | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  27331395 -atatgtgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctaattgtcacc 27331472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 72 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 447740 - 447633
Alignment:
Q  72 gggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctag 171  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  447740 gggtcaagatagttcatgtataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcatccatgggtaccctag 447641  T
Q  172 ttgtcacc 179  Q
    ||||||||    
T  447640 ttgtcacc 447633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 45 - 179
Target Start/End: Original strand, 1229674 - 1229809
Alignment:
Q  45 tcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatta 144  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  1229674 tcaatgaaaatgaacaatttgttgatggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatctggctaatatatattggttgggataaatta 1229773  T
Q  145 cccatcattcttccatggg-taccctagttgtcacc 179  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  1229774 cccaccattcttccatgggttacccaagttgtcacc 1229809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 145285 - 145450
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||           
T  145285 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatac------ 145378  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtca 177  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  145379 -----gtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 145450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 4258493 - 4258659
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||          
T  4258493 tttctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgt-gggtcaagatagttcatgaatat------ 4258585  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  4258586 -----gtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattcgttcatgggtagcctagttgtcacc 4258659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 21735067 - 21734900
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||          
T  21735067 tttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattgggggggtcaagatagttcatgaatat------ 21734974  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
         ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21734973 -----gtgcttatgtggctaatgtatattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 21734900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 19428582 - 19428421
Alignment:
Q  12 cctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgctt 111  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||| ||||           ||||||    
T  19428582 cctttgaagaatggtgggtaatttacccaccgaccaatgaaaatgagcaatttacttgtggggtcaagatagttcatgaatat-----------gtgctt 19428494  T
Q  112 atgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacccaaaa 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||    
T  19428493 atgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccaccaaaaa 19428421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 13543784 - 13543624
Alignment:
Q  8 attacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgt 107  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||| ||||           ||    
T  13543784 attacttttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatat-----------gt 13543696  T
Q  108 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  13543695 gcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 13543624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 39301364 - 39301196
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||               
T  39301364 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg----------- 39301276  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcaccc 180  Q
    || |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  39301275 aatatgtgcttatatgactaatgtgtattggttagggtaaattatccatcattctttcatggatagcctagttgtcaccc 39301196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 81; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 2688896 - 2688729
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | || ||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||| ||||          
T  2688896 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccgattaatgaaaattagcaatttatttgtagggtcaagatagttcatgaatat------ 2688803  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  2688802 -----gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatggatagcctagttgtcacc 2688729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 81; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 12333662 - 12333497
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||| ||            
T  12333662 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgtat-------- 12333571  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  12333570 ---atgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccatcattctttcat-ggtagcctagttgtcacc 12333497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 27765029 - 27764862
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||||||               
T  27765029 tttctaaattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg----------- 27764941  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcaccc 180  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||| |||||    
T  27764940 aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaaccatca-tctttcatgggtagcctagttgccaccc 27764862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 43899137 - 43898971
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||| ||||          
T  43899137 tttctaaattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatgaatat------ 43899044  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  43899043 -----gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 43898971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 179
Target Start/End: Original strand, 3711664 - 3711803
Alignment:
Q  29 gtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtat 128  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||           ||||||||| |||||||||||||    
T  3711664 gtaatttacctaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatat-----------gtgcttatgcggctaatgtgtat 3711752  T
Q  129 tggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  3711753 tggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 3711803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 44481831 - 44481998
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  44481831 tttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccaccta 44481930  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||| |||           || || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  44481931 aaaaggtg-----------aaagtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctggttgtcacc 44481998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 71 - 180
Target Start/End: Original strand, 12827136 - 12827244
Alignment:
Q  71 tgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtacccta 170  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||| | |||    
T  12827136 tgggttaagatagttcatg-ataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatttttccacaggtgctcta 12827234  T
Q  171 gttgtcaccc 180  Q
    ||||||||||    
T  12827235 gttgtcaccc 12827244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 179
Target Start/End: Original strand, 34249275 - 34249435
Alignment:
Q  8 attacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgt 107  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||| ||||           ||    
T  34249275 attatctttgaagaatggtgagtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtttatgaatat-----------gt 34249363  T
Q  108 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  34249364 gcttatgtgactaatgtgtattgattgaggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 34249435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 28566865 - 28566703
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||| ||||          
T  28566865 tttctaaattacttttgaagaatggtggataatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttctggggtcaagatagttcatgaatat------ 28566772  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttg 174  Q
         ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  28566771 -----gtgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttg 28566703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 43356102 - 43356266
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||               
T  43356102 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaa---acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg----------- 43356187  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||    
T  43356188 aatatgtgcttatgtggctaatttgtattggtttgagtaaattacccatgattctttcatggttagcctagttgtcacc 43356266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 72 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 28014925 - 28014856
Alignment:
Q  72 gggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaa 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28014925 gggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaa 28014856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 12814617 - 12814693
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtca 77  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12814617 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtca 12814693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 60; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 35126783 - 35126945
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  35126783 tttctagattacctttgaaaaacggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccaccta 35126882  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttg 174  Q
    |||| |||           ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||    
T  35126883 aaaaggtg-----------aatgtttattggttgggataaattacccaccatttttccatagataccctagttg 35126945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 2000504 - 2000338
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||| ||||||||           ||    
T  2000504 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaatagttca-----------ta 2000416  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcaccc 180  Q
    || ||||||||| |||||| || |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  2000415 aatatgtgcttacgtggctcatatgtatt-gttggggtaaattactcatcattctttcat-ggtagcctagttgtcaccc 2000338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 3266299 - 3266455
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||               
T  3266299 tttctaaattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg----------- 3266387  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtca 177  Q
    || ||||||||         |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  3266388 aatatgtgctt---------atgtgtattggttgaggtaaattacccatcattctttcatgggtaacctagttgtca 3266455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 40544243 - 40544150
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatat 94  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||    
T  40544243 tttctaaattacctttgaagaatggtggatagtttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatat 40544150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 8056629 - 8056779
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||||| | |||| || || | || |||||||||||||               
T  8056629 tttctaaattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaactatttatttgtggagtgaagatagttcatg----------- 8056717  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgg 162  Q
    || ||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  8056718 aatatgcgcttatgtagctaatgtgtattggttggagtaaattactcatcattctttcatgg 8056779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Original strand, 30545828 - 30545991
Alignment:
Q  5 tagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaa 104  Q
    |||||||  ||||||||||| ||| ||||||||| | ||| |||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||  |  ||||||    
T  30545828 tagattatttttgaagaatggtggataatttacctaccaaacaataaaaatgagcaacttattggtggggtcaagatagttcgtggatacaatctaaaaa 30545927  T
Q  105 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    | ||           |||||  |||||||  ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  30545928 tatg-----------aatgttcattggttcaggtaaattacccatcattcctccatagataccctagttgtcacc 30545991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 40544143 - 40544085
Alignment:
Q  121 atgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  40544143 atgtgtattggttgaggtaaattacacatcattctttcatgggtagtctagttgtcacc 40544085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Original strand, 10176562 - 10176625
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaattt 64  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||  || |||| ||||||||||||||||||    
T  10176562 tttctagattacctttaaagaatggtgggtaacttattcaccaattaatgaaaatgagcaattt 10176625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 28019999 - 28019960
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttaccca 40  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28019999 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttaccca 28019960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 179
Target Start/End: Original strand, 10176637 - 10176714
Alignment:
Q  102 aaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||| ||||||  ||||||| |||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  10176637 aaatgtgtttatgtaactaatgtttattggttgaagtaaattaaccattattcttccatggacaccctagttatcacc 10176714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 38985416 - 38985342
Alignment:
Q  29 gtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaa 104  Q
    ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| || | |  |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  38985416 gtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttatt-gatatgtcaagatagttcatggataccacctaaaaa 38985342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 179
Target Start/End: Original strand, 42900781 - 42900835
Alignment:
Q  124 tgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  42900781 tgtattggttgagataaattacccaccattcttccatgtgta-cctagttgtcacc 42900835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 108)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 31308005 - 31308183
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31308005 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 31308104  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31308105 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 31308183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 45538157 - 45538335
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45538157 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 45538256  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45538257 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 45538335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 3611140 - 3611318
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3611140 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 3611239  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3611240 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 3611318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 44661974 - 44662152
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  44661974 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccactta 44662073  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44662074 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 44662152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 17995129 - 17994951
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  17995129 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggataccactta 17995030  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17995029 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttggcacc 17994951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 21139590 - 21139412
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21139590 tttctagattacctttgaagtatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 21139491  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21139490 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 21139412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 23984759 - 23984937
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23984759 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 23984858  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23984859 aaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 23984937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 4068861 - 4068689
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4068861 tttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 4068762  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagtt 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4068761 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagtt 4068689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 43251715 - 43251891
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43251715 tttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccactta 43251814  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtca 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43251815 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 43251891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 5981174 - 5981352
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5981174 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 5981273  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5981274 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 5981352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 25058692 - 25058870
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||    
T  25058692 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaatagttcatggataccactta 25058791  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25058792 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 25058870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 25678433 - 25678259
Alignment:
Q  5 tagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaa 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25678433 tagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 25678334  T
Q  105 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25678333 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccatagttgtcacc 25678259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 46967219 - 46967041
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46967219 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 46967120  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46967119 aaaatgtgcttatgtggctaatatgtatttgttaggataaattacccatcattctttcatgggtaccctagttgtcacc 46967041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 47671590 - 47671768
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47671590 tttctagattacctttgaagaatggtggataatttaccgaccaaccaatgaaaatgagctatttgttggaggggtcaagatagttcatggataccactta 47671689  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47671690 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 47671768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 6327725 - 6327548
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6327725 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 6327626  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6327625 aaaatgtgcttat-tgactaatgtgtattggttggggtaaattacccactattcttccatgggtaccctagttgtcacc 6327548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 24245203 - 24245025
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24245203 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 24245104  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24245103 aaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattagttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttatcacc 24245025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 26277181 - 26277359
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26277181 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 26277280  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26277281 aaaatttgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 26277359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 31040713 - 31040891
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31040713 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 31040812  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31040813 aaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattattccatgggtaccctagttgtcacc 31040891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 35273600 - 35273778
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35273600 tttctaaattatctttgaagaatggtggataatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 35273699  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35273700 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacacaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 35273778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 36566334 - 36566512
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36566334 tttctagattacctttgaagaatagtgggtaatatattcaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 36566433  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36566434 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttcgggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 36566512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 38790375 - 38790197
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  38790375 tttctagattacctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccactta 38790276  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38790275 aaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 38790197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 41999819 - 41999997
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  41999819 tttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatggataccactta 41999918  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41999919 aaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttatcacc 41999997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 46616553 - 46616731
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  46616553 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcactta 46616652  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  46616653 aaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtactctaggtgtcacc 46616731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 5 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 37620366 - 37620189
Alignment:
Q  5 tagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaa 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37620366 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 37620267  T
Q  105 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacccaa 182  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37620266 tgtccttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgtgtaccctagttgtcacccaa 37620189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 26085572 - 26085398
Alignment:
Q  4 ctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaa 103  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  26085572 ctagattacctt-gaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaa 26085474  T
Q  104 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26085473 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 26085398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 33112995 - 33112817
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33112995 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 33112896  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcaccc 180  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  33112895 aaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcat-ggtaccctagttgtcaccc 33112817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 23932687 - 23932509
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  23932687 tttcttgattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggacaccactta 23932588  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23932587 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgatcagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 23932509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 38332037 - 38331859
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38332037 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcactta 38331938  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38331937 aaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtactctagttgtcacc 38331859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 39646572 - 39646750
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  39646572 tttctagattgcctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataggtcatggataccactta 39646671  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39646672 aaaatgtgcttatgtaactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 39646750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 49254153 - 49253975
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  49254153 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccactta 49254054  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  49254053 aaaatgtgcttatatggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctaattatcacc 49253975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 132; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 8 - 179
Target Start/End: Original strand, 47317326 - 47317497
Alignment:
Q  8 attacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgt 107  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  47317326 attacctttgaagaatggtgggtaatttattcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgtataccacttaaaaatgt 47317425  T
Q  108 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47317426 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttctatgggtaccctagttgtcacc 47317497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 33884092 - 33884270
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||    
T  33884092 tttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccattta 33884191  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  33884192 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctaattgtcacc 33884270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 33960160 - 33959982
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||    
T  33960160 tttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccattta 33960061  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  33960060 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctaattgtcacc 33959982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 5980072 - 5980253
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  5980072 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttaatggataccactta 5980171  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacccaa 182  Q
    |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  5980172 aaaattagcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccatttttccataggtaccctagctgtcacccaa 5980253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 8 - 175
Target Start/End: Original strand, 26794315 - 26794482
Alignment:
Q  8 attacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgt 107  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  26794315 attacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgt 26794414  T
Q  108 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgt 175  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  26794415 gtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctagttgt 26794482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 50774221 - 50774404
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  50774221 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaattaacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 50774320  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacccaaaa 184  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50774321 aaaatatgcttatgtgaccaatgtgtattggttgggataaattacccacctttcttccatgggtaccctagttgtcacctaaaa 50774404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 24885505 - 24885683
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24885505 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgatcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 24885604  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  24885605 aaaatatgtttatgtggataatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgaataccctagttgtcacc 24885683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 26525067 - 26524889
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||    
T  26525067 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagtttatagataccactta 26524968  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26524967 aaaatatgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccactattcttccatggataccctagttgtcacc 26524889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 46784427 - 46784605
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    || ||||||||||||||||| ||||||    
T  46784427 tttctagattacctttgaggaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggagaagtaaagatagttcatggataccactta 46784526  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46784527 aaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattcttccatgggtaccctaattgtcacc 46784605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 47383910 - 47383732
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47383910 tttctatattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 47383811  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  47383810 aaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattgattgggataaattacccaccattctttcattggtaccctagttgtcacc 47383732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 51057075 - 51057253
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  51057075 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagatcatggataccactta 51057174  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51057175 aaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattagttgaggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 51057253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 124; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 23221107 - 23220939
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23221107 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 23221008  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgt 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23221007 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg------tatccaccattcttccatgggtaccctagttgt 23220939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 124; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 35692842 - 35692663
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaattta-cccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||    
T  35692842 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatcccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccgctt 35692743  T
Q  100 aaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  35692742 aaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccgttcttccatggatactctagttgtcacc 35692663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 47187109 - 47187287
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  47187109 tttctagattacctttgaagattgatgagtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccactta 47187208  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  47187209 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattatccaccattctttcatgggtaccgtagttgtcacc 47187287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 49399166 - 49398988
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||| ||||||    
T  49399166 tttctagattacctttgaagaatggtaggtaatttatccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggagttaagatagtttatggataccactta 49399067  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49399066 aaaatgtgtttatgtggctaatgtctattggttggggtaaattacccactattcttccatgggtatcctagttgtcacc 49398988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 122; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 3285406 - 3285582
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||     
T  3285406 tttctagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt- 3285504  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcac 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3285505 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcac 3285582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 36003134 - 36003315
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36003134 tttctaaattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttactggtggggtcaagatagttcatggataccactta 36003233  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttc---catgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||   ||| ||||||||||||||||||    
T  36003234 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttcggataaattacccaccattcttctttcataggtaccctagttgtcacc 36003315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 42863869 - 42864034
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||    
T  42863869 tttctagactacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagctatttgttggtggggtcaagatagttcatggatactactta 42863968  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtac 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  42863969 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgagtac 42864034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 28888585 - 28888760
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  28888585 tttctagattaactttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgatcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactta 28888684  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtc 176  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  28888685 aaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattgattgagataaattatccaccattcttccatgagtaccctagttgtc 28888760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 31844380 - 31844527
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31844380 tttctagattacctttgaggaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccactta 31844479  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31844480 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 31844527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 25518818 - 25518952
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25518818 tttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 25518917  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 135  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25518918 aaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 25518952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 48373508 - 48373677
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48373508 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcagtttattggtggggtcaagatagttcatggataccactta 48373607  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  48373608 aaaatgtgctt---------atgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccttagttgtcacc 48373677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 42313543 - 42313361
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgg----gtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatca 96  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||     ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||  ||| ||    
T  42313543 tttctagattatctttgaagaatggtggatatataatttacccaccaaccaatgaaaatgagaaatttattggtggagtcaagatagttcattaatacca 42313444  T
Q  97 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42313443 cttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 42313361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 32 - 179
Target Start/End: Original strand, 2450529 - 2450676
Alignment:
Q  32 atttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgg 131  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| || |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2450529 atttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttagtggaatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattgg 2450628  T
Q  132 ttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2450629 ttggggtaaattacctatcattcttccatgggtatcctagttgtcacc 2450676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 41467799 - 41467632
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||          
T  41467799 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatat------ 41467706  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  41467705 -----gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 41467632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 179
Target Start/End: Original strand, 2657314 - 2657474
Alignment:
Q  8 attacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgt 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||           ||    
T  2657314 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatat-----------gt 2657402  T
Q  108 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  2657403 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 2657474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 27983765 - 27983603
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||                ||| || |||    
T  27983765 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggg----------------ataccattta 27983682  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27983681 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 27983603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 51 - 179
Target Start/End: Original strand, 4808699 - 4808827
Alignment:
Q  51 aaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatc 150  Q
    ||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4808699 aaaatgaacaatttattgatagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccacc 4808798  T
Q  151 attcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4808799 attcttccatggataccctagttgtcacc 4808827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 33073215 - 33073382
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||          
T  33073215 tttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttataggtggggtcaagatagttcatgaatat------ 33073308  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
         ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33073309 -----gtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 33073382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 6626191 - 6626025
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||          
T  6626191 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatat------ 6626098  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcac 178  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  6626097 -----gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgtcac 6626025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 46 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 51045729 - 51045596
Alignment:
Q  46 caatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 145  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  51045729 caatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagatagtttatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattagggtaaattac 51045630  T
Q  146 ccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||| |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  51045629 ccaccattcttctacgggtatcctagttgtcacc 51045596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 10928071 - 10928238
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||          
T  10928071 tttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatgaatat------ 10928164  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  10928165 -----gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgaataccctagttgtcacc 10928238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 34 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 45475987 - 45475848
Alignment:
Q  34 ttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt 133  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45475987 ttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttgatggataccacttacaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt 45475888  T
Q  134 ggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtc 176  Q
     |||||||||||||| ||||||| |   |||||||||||||||    
T  45475887 -gggtaaattacccaccattctttc--tggtaccctagttgtc 45475848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 179
Target Start/End: Original strand, 4953058 - 4953223
Alignment:
Q  3 tctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaa 102  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||           ||    
T  4953058 tctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-----------aa 4953146  T
Q  103 aatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||    
T  4953147 tatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatggatagcctaattgtcacc 4953223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 26472346 - 26472185
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||               
T  26472346 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg----------- 26472258  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagtt 173  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||    
T  26472257 aatatgtgcttatgtggctaatgtgtcttggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagtt 26472185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 51403185 - 51403034
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||     
T  51403185 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt- 51403087  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgg 162  Q
    |||||||||||         || ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  51403086 aaaatgtgctt---------atatgtattggttgggataaattactcaccattcttccatgg 51403034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 29770674 - 29770841
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||          
T  29770674 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatat------ 29770767  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||    
T  29770768 -----gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattttttcatgggtagcctagttgccacc 29770841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 31980113 - 31979998
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31980113 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattgttagggtcaagatagttcatggataccactta 31980014  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtg 116  Q
    ||||||| ||||||||    
T  31980013 aaaatgtccttatgtg 31979998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 81; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 2954859 - 2955026
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  2954859 tttctagattacctttgacaaatggtgggtaatttacccaccaatcaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagttaatggataccactta 2954958  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||| |||           | ||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2954959 aaaaggtg-----------attgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 2955026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 81; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 48 - 179
Target Start/End: Original strand, 4156438 - 4156576
Alignment:
Q  48 atgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaaga-------tagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaa 140  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||       ||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4156438 atgaaaatgaccaatttgttggtggggtcaagactcaatatagtttatggataccacttaaaaatgtatttatgtggctaatgtgtattggttggggtaa 4156537  T
Q  141 attacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  4156538 attacccatcatttttccatgggtactctagttgtcacc 4156576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 81; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 42234844 - 42235010
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||               
T  42234844 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg----------- 42234932  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  42234933 aatatgtgcttatgtggttaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 42235010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 4243657 - 4243489
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||| ||||          
T  4243657 tttctaaattacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagtttatgaatat------ 4243564  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcaccc 180  Q
         |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  4243563 -----gtgcttatgtggctaatgtgtattggatggggtaaattacccataattctttcatgggtagtctagttgtcaccc 4243489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 26685860 - 26686027
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  26685860 tttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtagggtcaagatagtttatggataccaccta 26685959  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||| |||           ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26685960 aaaaagtg-----------aatgtttattggttgaggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 26686027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 75; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 34752481 - 34752320
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||| || || || | ||||||||||||| ||||          
T  34752481 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaaataaaatgagcaatttatttgtgggcttaagatagttcatgaatat------ 34752388  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagtt 173  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  34752387 -----gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattctttcatgggtaacctagtt 34752320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 86 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 13312624 - 13312531
Alignment:
Q  86 catggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13312624 catggataccacttaaatatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacc 13312531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 30290077 - 30289910
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||          
T  30290077 tttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccagtgaatatgagcaatttattggtggagtcaagatagttcatgaatat------ 30289984  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
         |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  30289983 -----gtgcttatgtggttaatgtgtattggttgaggtaaattatccaccattcttccatgagtaccttagttgtcacc 30289910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 41895331 - 41895164
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| |||| | ||| |||||||| || ||  ||||||||||||||||| ||||          
T  41895331 tttctaaattacctttaaagaattgtgggtaatttacccaccaaccaataacaattagcaatttatttgtgaggtcaagatagttcatgaatat------ 41895238  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  41895237 -----gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggtgtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 41895164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 39475949 - 39475778
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  39475949 tttctagagtacctttgaaaaatgatgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattgg-tgggtcaagatagtttatggataccaccta 39475851  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacccaaaa 184  Q
    ||||||||           || || ||||||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  39475850 aaaatgtg-----------aacgtttattggttgggataaataacccatcattttttcatgggtaccctagttgtcaccaaaaa 39475778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 1388477 - 1388644
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  1388477 tttctagattacatttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcatgatgagcaatttattggtagggtcaagatagtttatggataccaccta 1388576  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||| |||           ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1388577 aaaaggtg-----------aatgtttattggttgaggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 1388644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 47772304 - 47772172
Alignment:
Q  47 aatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacc 146  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||  ||| || ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||     
T  47772304 aatgaaaataagcaatttgttggtagggtcaaaatagtttatatataccatttaaaaatgtgtttatgtgactaatgtatattggttggagtaaattaca 47772205  T
Q  147 catcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    || |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  47772204 caccattcttccatgggtaccttaattgtcacc 47772172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 2557024 - 2556909
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||  ||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  2557024 tttctagattacctttgaagaatggtggataatttatccactaactaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaagatagttcatgaataccactta 2556925  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtg 116  Q
    |||||||| |||||||    
T  2556924 aaaatgtgtttatgtg 2556909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 33187344 - 33187505
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| ||||||    
T  33187344 tttctagattatctttaaagaatggtggataatttacacaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggttggatcaagatagtttatagataccactta 33187443  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||                 ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33187444 aa-----------------aatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 33187505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 38716414 - 38716245
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||| ||| ||    
T  38716414 tttctagattatctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttatggataccaccta 38716315  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcaccca 181  Q
    |||| |||           ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  38716314 aaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtacccttgttgtcaccca 38716245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 44544213 - 44544052
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||               
T  44544213 tttctaaattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg----------- 44544125  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagtt 173  Q
    || |||| |||||||  ||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  44544124 aatatgtacttatgtaactaatgtatattagttagggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagtt 44544052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 32448652 - 32448807
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||          
T  32448652 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatat------ 32448745  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtc 176  Q
         ||||||| |||         ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  32448746 -----gtgcttaagtg---------tattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtc 32448807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 5961434 - 5961267
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||| |||  ||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  5961434 tttctagattacttttgaaaaatggtggataatttacccaccaacaaatcataatgagcaatttattggtgggatcaagatagtttatggataccaccta 5961335  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||| |||           ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5961334 aaaaggtg-----------aatgtttattggttgaggtaaattacccatcatttttccatgggtaccctagttgtcacc 5961267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 51155756 - 51155590
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||               
T  51155756 tttctaaattacctttgaaaaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgaacaatttattggtggagtcaagatagttcatg----------- 51155668  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    || ||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  51155667 aatatgtgtttatgtgactaatgtgtattgattagggtaaattacccaccattcttccat-ggtaccttagctgtcacc 51155590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 13281729 - 13281588
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||| || || ||||||| ||||||||||               
T  13281729 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgacaatgaacaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg----------- 13281641  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcatt 153  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  13281640 aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattatccatcatt 13281588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 62; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 44293615 - 44293455
Alignment:
Q  8 attacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgt 107  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||           || ||||    
T  44293615 attacctttgaagaatagtaggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 44293527  T
Q  108 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
     |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  44293526 acttatgtggctaatatatattagttggggtaaattactcatcattctttcatggatagcctagttgccacc 44293455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 7561709 - 7561528
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaag-atagttcatggatatcactt 99  Q
    |||||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  |    | ||  |||   | |    
T  7561709 tttctaaattacctttgaaaaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaattacccataatttatagttcat 7561610  T
Q  100 aaaaatgtgcttatgtgg--ctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
     || ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7561609 gaatatgtgcttacgtggggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattcttccatggataccctagttgtcacc 7561528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 10920204 - 10920371
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||| | ||||  |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  10920204 tttctagattatctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgcacaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccaccta 10920303  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||| |||           ||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  10920304 aaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattaccgaccatttttccatggataccttagttgtcacc 10920371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 13313332 - 13313248
Alignment:
Q  10 tacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatat 94  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  13313332 tacctttgaagaattgtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggttaagatagttcatggatat 13313248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 46428420 - 46428327
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatat 94  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  46428420 tttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccagcaaccaatgaatatgagcaatttattgatggggtcaagatagttcatgaatat 46428327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 48683489 - 48683329
Alignment:
Q  9 ttacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtg 108  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||||||| ||| |||| | ||||| |||||| ||||| | |||||||||||| ||||||| ||| ||||||  ||    
T  48683489 ttacctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgaacaatttattggtggagtcaagatagtttatggataccacctaaaaagatg 48683390  T
Q  109 cttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcaccc 180  Q
               ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48683389 -----------aatgtttattggttgggataaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcaccc 48683329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 35991759 - 35991616
Alignment:
Q  8 attacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgt 107  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||  | |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||           || || |    
T  35991759 attacctttgaagaattgtgggtaatttatccaccaacaattgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatat 35991671  T
Q  108 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgg 162  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  35991670 gcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattagctatcattctttcatgg 35991616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 52367887 - 52368054
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||| |||||||||| || |||  ||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  52367887 tttctggattacctttaaaaaattgtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtagggtcaagatagtttatggataccaccta 52367986  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||| |||           ||||| ||||| ||  | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  52367987 aaaaggtg-----------aatgtttattgatttagataaattacccatcatttttccataggtaccctagttgtcacc 52368054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 24649889 - 24649802
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcat 88  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  24649889 tttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagttatttattggtggggtcaagatagttcat 24649802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 27924825 - 27924722
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  27924825 tttctagattacttttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtgggatcaagatagtttatggataccaccta 27924726  T
Q  101 aaaa 104  Q
    ||||    
T  27924725 aaaa 27924722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Original strand, 52323946 - 52324110
Alignment:
Q  5 tagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaa 104  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||| | ||||| |||||| ||||| ||||||||||| || ||| ||| ||| ||||||    
T  52323946 tagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgaacaatttattggtggggtcaagataatttatgaataccacctaaaaa 52324045  T
Q  105 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
     |||           |||||  |||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  52324046 ggtg----------aaatgttcattgattggagtaaattacccaccaatcttccatgggtaccctagttgtcacc 52324110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Original strand, 39637904 - 39637986
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttca 87  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39637904 tttctagattacctatgaagaatggtgggtaatttacccaccaataaa----aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttca 39637986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 104 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 38718242 - 38718167
Alignment:
Q  104 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg-gtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  38718242 atgtgcttatgtggctaatgtatatcggttgggagtaaattacccatcattctttcat-ggtagcctagttgtcacc 38718167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 4156243 - 4156188
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatg 56  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  4156243 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatg 4156188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 156
Target Start/End: Original strand, 24215812 - 24215911
Alignment:
Q  46 caatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 145  Q
    ||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||| ||||         ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24215812 caatgaaaatgagcaatttatttgtaggatcaagatagttcatgaatat---------atgt--ttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattac 24215900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 120 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 31286563 - 31286504
Alignment:
Q  120 aatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  31286563 aatgtttattggttggggtaaattatccaccatttttctatgggtaccctagttgtcacc 31286504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 179
Target Start/End: Original strand, 31844818 - 31844855
Alignment:
Q  142 ttacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31844818 ttacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 31844855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 148
Target Start/End: Original strand, 39359502 - 39359532
Alignment:
Q  118 ctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39359502 ctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 39359532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 10919361 - 10919313
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaat 49  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  10919361 tttctagattatctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaat 10919313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 24649791 - 24649727
Alignment:
Q  120 aatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacccaaaa 184  Q
    ||||| |||| ||||  |||||||| ||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  24649791 aatgtttattagttgatgtaaattatccaccattctttcaaggataccctagttgtcacccaaaa 24649727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 151; Significance: 4e-80; HSPs: 112)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 40419839 - 40420017
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40419839 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 40419938  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40419939 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattactcaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 40420017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 47257797 - 47257975
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  47257797 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccactta 47257896  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47257897 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 47257975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 49330041 - 49330219
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  49330041 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 49330140  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49330141 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 49330219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 27067156 - 27066978
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27067156 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcactta 27067057  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27067056 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattcttccatggataccctagttgtcacc 27066978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 37313403 - 37313581
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37313403 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcactta 37313502  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  37313503 aaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtactctaggtgtcacc 37313581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 38416902 - 38416724
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38416902 tttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 38416803  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38416802 aaaatgtgcttacgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 38416724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 40131137 - 40130959
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40131137 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgtctgtggggtcaagatagttcatggataccactta 40131038  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40131037 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 40130959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 41464356 - 41464534
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  41464356 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccactta 41464455  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41464456 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccagcattcttccatgggtactctagttgtcacc 41464534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 43612225 - 43612047
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43612225 tttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggcgtggtcaagatagttcatggataccactta 43612126  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43612125 aaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 43612047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 47809775 - 47809596
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47809775 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 47809676  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-ggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47809675 aaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 47809596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 7855292 - 7855114
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  7855292 tttctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcaaggataccactta 7855193  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7855192 aaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 7855114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 22399101 - 22399278
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||     
T  22399101 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggaaaccactt- 22399199  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22399200 aaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 22399278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 24100287 - 24100464
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  24100287 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg-ataccactta 24100385  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24100386 aaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 24100464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 28048570 - 28048392
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28048570 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 28048471  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28048470 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattaatttgggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 28048392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 40643804 - 40643982
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  40643804 tttctaaattatctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggatatcattta 40643903  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40643904 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 40643982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 40804688 - 40804510
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  40804688 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtaggatcaagatagttcatggataccactta 40804589  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40804588 aaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattagttagggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 40804510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 48739411 - 48739233
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  48739411 tttctagattacttttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatggataccactta 48739312  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48739311 aaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 48739233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 5 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 51170207 - 51170034
Alignment:
Q  5 tagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaa 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51170207 tagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 51170108  T
Q  105 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcac 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51170107 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccatagttgtcac 51170034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 138; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 55453422 - 55453245
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  55453422 tttctaggttacctttgaagaatggtgggtaatttactcatcaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccactta 55453323  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcac 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  55453322 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcac 55453245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 29626005 - 29625827
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29626005 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 29625906  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||    
T  29625905 aaaatatgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctaattatcacc 29625827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 32234575 - 32234398
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||     
T  32234575 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt- 32234477  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32234476 aaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccactattcttccatgggtaccctagttgtcacc 32234398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 42291846 - 42292024
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||     
T  42291846 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttg 42291945  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42291946 aaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 42292024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 51102556 - 51102378
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51102556 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcactta 51102457  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  51102456 aaaatgtatttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccgttggtaccctagttgtcacc 51102378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 135; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 184
Target Start/End: Original strand, 52628959 - 52629140
Alignment:
Q  2 ttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52628959 ttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaa 52629058  T
Q  102 aaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacccaaaa 184  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  52629059 aaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcaccaaaaa 52629140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 2666004 - 2666182
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2666004 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 2666103  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  2666104 aaactgtgcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattacccactattctttcatgggtactctagttgtcacc 2666182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 7755484 - 7755307
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||||     
T  7755484 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagattatggataccactt- 7755386  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7755385 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgcttggggtaaataacccatcattcttccatgggtaccctacttgtcacc 7755307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 20754571 - 20754393
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  20754571 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagagtcaagatagttcatggatatcactta 20754472  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  20754471 aaaatatgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattattccatgagtaccctagttgtcacc 20754393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 175
Target Start/End: Original strand, 35594129 - 35594299
Alignment:
Q  5 tagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaa 104  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35594129 tagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaataaaaatgagcaatttgttgatggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaa 35594228  T
Q  105 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgt 175  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35594229 tatgcttatgtggctaatgtgtattagttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgt 35594299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 35748485 - 35748311
Alignment:
Q  5 tagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaa 104  Q
    ||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35748485 tagattagctttgaagaatagtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 35748386  T
Q  105 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35748385 tatgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattcttccatggataccctagttgtcacc 35748311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 39634749 - 39634572
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  39634749 tttctagattacttttgaagaatggtgggtattttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaa-atagttcatggataccactta 39634651  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39634650 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccacaattcttccatgggtaccctagttgtcacc 39634572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 41732532 - 41732710
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41732532 tttctagattacctttgaaaaatggtggataatttatccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttagtggggtcaagatagttcatggataccactta 41732631  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  41732632 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccatccttccatggataccccagttgtcacc 41732710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 44222833 - 44223011
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  44222833 tttctaaattacctttgaaaaatagtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatgaataccactta 44222932  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44222933 aaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 44223011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 51452928 - 51452751
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  51452928 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccactta 51452829  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  51452828 aaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttagggtaaattacccatcattcttccat-ggtaccctaattgtcacc 51452751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 6 - 177
Target Start/End: Original strand, 48609732 - 48609903
Alignment:
Q  6 agattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaat 105  Q
    |||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48609732 agattaccttcgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaat 48609831  T
Q  106 gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtca 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48609832 gtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 48609903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 39053398 - 39053576
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39053398 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgatcaatttgttgatggggtcaagatagttcatggataccactta 39053497  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||| ||||||||||||    
T  39053498 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattcgttggggtaaattacccatcatttttttatggatactctagttgtcacc 39053576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 43125835 - 43126012
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43125835 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaatcaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccactta 43125934  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||| |||||||||||||    
T  43125935 aaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttttataggta-cctagttgtcacc 43126012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 124; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 52215080 - 52215243
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  52215080 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaactaatgaacatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccactta 52215179  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggt 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  52215180 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttctatgggt 52215243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 37324545 - 37324723
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  37324545 tttctaaattacctttgaagaatggtaggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgtataccactta 37324644  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37324645 aaaatatatttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 37324723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 44806688 - 44806866
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  44806688 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggaatcaagatagttcatggataccactta 44806787  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44806788 aaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgaagtaaattatccacaattctttcatgggtaccctagttgtcacc 44806866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 46134360 - 46134538
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46134360 tttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 46134459  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  46134460 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattattcaccattctttcatggataccctaattgtcacc 46134538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 51146393 - 51146215
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51146393 tttctagattatctttgaagaatggtaggtaatttacacatcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccactta 51146294  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  51146293 aaaatttgcttatgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgccacc 51146215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 177
Target Start/End: Original strand, 43183917 - 43184092
Alignment:
Q  2 ttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  43183917 ttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgagatcaagatagttcatggataccacttaa 43184016  T
Q  102 aaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtca 177  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43184017 aaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttgaggtaaattactcaccattcttccataggtaccctagttgtca 43184092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 41293496 - 41293319
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||| ||| |||||     
T  41293496 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtgggatcaagataattcatgaataccactt- 41293398  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  41293397 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctaattgtcacc 41293319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 178
Target Start/End: Original strand, 43021722 - 43021896
Alignment:
Q  5 tagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttggg-tcaagatagttcatggatatcacttaaaa 103  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  43021722 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtgggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaa 43021821  T
Q  104 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcac 178  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  43021822 atgtgcttatgtagctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataggtaccctagttgtcac 43021896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 53943765 - 53943588
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  53943765 tttctagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactta 53943666  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  53943665 aaaatatacttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat-ggtactctagttgtcacc 53943588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 24376577 - 24376730
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  24376577 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacgcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccactta 24376676  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattc 154  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  24376677 aaaatgtgcttatgtggcttatgtgtatttgttggggtaaattacccaccattc 24376730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 179
Target Start/End: Original strand, 46126010 - 46126168
Alignment:
Q  20 gaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggct 119  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  46126010 gaatggtggataatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtggct 46126109  T
Q  120 aatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46126110 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcacc 46126168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 52638846 - 52639024
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||    
T  52638846 tttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttaccaacgaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagataattcatggataccactta 52638945  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  52638946 aaaatgtgcttctgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccaccattattctatgggtaccctagttgtcacc 52639024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 53832662 - 53832486
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| || |||    
T  53832662 tttctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggtgtcaagatagtttatggataccaatta 53832563  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtca 177  Q
    |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||    
T  53832562 aaaaggggcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgtgttccctagttgtca 53832486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 18946907 - 18947085
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| || |||    
T  18946907 tttctagattatctttgaagaatggtgcgtaatttacctaccaaccaatgaaaatgaacaatttgtttgtggggtcaagatagttcatggataccagtta 18947006  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18947007 aaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgagacaaattacccaccattcttccatgggtaccctacttgtcacc 18947085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 36368943 - 36369120
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36368943 tttctagattacctttgaagaatggtcgataatttacccaccaactaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 36369042  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| | |||||| |||||    
T  36369043 aaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttagggtaaattacccacca-tcttccatgggtgctctagttatcacc 36369120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 41216459 - 41216637
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||    
T  41216459 tttctagattacctttaaaggatggtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaataagcaatttgttggtggggttaatatagttcatggataccactta 41216558  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  41216559 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattaattgggataaattacccactattcttccataggtactctagttgtcacc 41216637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 5560210 - 5560023
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaat-----gagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatc 95  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||     |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |    
T  5560210 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaattaaatgagcaatttgtttgtggggtcaagatagttcatggatacc 5560111  T
Q  96 acttaaaaatgtgcttatgtggc--taatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcaccca 181  Q
    |||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5560110 acttaaaaatatgcttatgtgactataatgtctattggttggggtaaattatccaccattcttccatgagtaccctagttgtcaccca 5560023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 47894994 - 47894822
Alignment:
Q  5 tagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaa 104  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| | |||  ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47894994 tagattacctttaaagaatggtggataatttacctaccaactaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 47894895  T
Q  105 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtca 177  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47894894 tgtgcttatgtgactaatgtatattagttgaggtaaatcatccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 47894822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 102; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 53637845 - 53637990
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  53637845 tttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttagtggggtcaggataattcatggataccactta 53637944  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacc 146  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  53637945 aaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgaggtaaattacc 53637990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 25641650 - 25641817
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||           |    
T  25641650 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcat-----------a 25641738  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  25641739 aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 25641817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 42589834 - 42590001
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||          
T  42589834 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatat------ 42589927  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  42589928 -----gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 42590001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 48547007 - 48546842
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  48547007 tttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttgg-tgggtcaa-atagttcatggataccactta 48546910  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtca 177  Q
    |||||||||||         |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48546909 aaaatgtgctt---------atgtgtattgattggggtaaattatccaccattcttccatggataccctagttgtca 48546842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 34279888 - 34279721
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||               
T  34279888 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg----------- 34279800  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  34279799 aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatggatagcctagttgccacc 34279721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 38156799 - 38156632
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||| || || |||||||||||||||||| ||||          
T  38156799 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatat------ 38156706  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  38156705 -----gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 38156632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 51415973 - 51416140
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||          
T  51415973 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgtatat------ 51416066  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  51416067 -----gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 51416140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 54159166 - 54159000
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  54159166 tttctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggagtcaagatagttcatagataccactta 54159067  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtca 177  Q
    ||||||||||||         ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  54159066 aaaatgtgctta---------tgtgtattggttggggt-aattactcaccattcttccatgggtaccctagttgtca 54159000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 54707387 - 54707220
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||| ||||          
T  54707387 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatat------ 54707294  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  54707293 -----gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 54707220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 55000345 - 55000178
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||          
T  55000345 tttctaaattaccttagaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtagggtcaagatagttcatgaatat------ 55000252  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  55000251 -----gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 55000178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 46949379 - 46949538
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  46949379 tttctagattatctttgaaga-tggtgtgtaatttacccaccgaccaatgaaaatgaacaatttgttggcgggatcaagatagttcatggataccactta 46949477  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgg 162  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  46949478 aaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggtt-ggataaattacccaccattcttccatgg 46949538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 179
Target Start/End: Original strand, 54401198 - 54401358
Alignment:
Q  8 attacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgt 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||           ||    
T  54401198 attacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatat-----------gt 54401286  T
Q  108 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||    
T  54401287 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctaattgccacc 54401358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 37758933 - 37759075
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||| | ||||||||||| ||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  37758933 tttctagattgcttttgaagaatggtgaataatttatccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatgaagtcaagatagttcatagataccactta 37759032  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 143  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37759033 aaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 37759075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 39141293 - 39141125
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||          
T  39141293 tttctaaattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatat------ 39141200  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
       ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||    
T  39141199 ---atgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccatcattctttcat-ggtaacctagttatcacc 39141125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 49130582 - 49130746
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||| ||||          
T  49130582 tttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattgatgaggtcaagatagttcatgaatat------ 49130675  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtc 176  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  49130676 -----gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtc 49130746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 31286960 - 31286793
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||               
T  31286960 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg----------- 31286872  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  31286871 aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattactcatcattctttcatgagtagcctagttgtcacc 31286793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 41635967 - 41635800
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||               
T  41635967 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg----------- 41635879  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  41635878 aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccatcattctttcatgggtaatctagttgtcacc 41635800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 47511107 - 47510940
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||               
T  47511107 tttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg----------- 47511019  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  47511018 aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggagtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 47510940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 64 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 33550582 - 33550467
Alignment:
Q  64 tgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatggg 163  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||      
T  33550582 tgttggtggggttaagataattcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgaa 33550483  T
Q  164 taccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||||    
T  33550482 taccctagttgtcacc 33550467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 57 - 179
Target Start/End: Original strand, 52864550 - 52864671
Alignment:
Q  57 agcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 156  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  52864550 agcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccatttaaaaatgtgtttatgtagctaatgtatattggtt-gagtaaattacccaccattctt 52864648  T
Q  157 ccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  52864649 ccatgggtaccctagttgtcacc 52864671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 81; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 55379989 - 55380156
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  55379989 tttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccaccta 55380088  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||| |||           ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  55380089 aaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 55380156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 40022078 - 40022240
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||               
T  40022078 tttctaaattacctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg----------- 40022166  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttg 174  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||    
T  40022167 aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattactcatcattctttcatgggtagcgtagttg 40022240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 184
Target Start/End: Original strand, 37028734 - 37028899
Alignment:
Q  8 attacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgt 107  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||| ||||           ||    
T  37028734 attacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggagtcaagatagttcatgaatat-----------gt 37028822  T
Q  108 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacccaaaa 184  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||    
T  37028823 gtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccaccaaaaa 37028899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 25353558 - 25353725
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||| | ||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  25353558 tttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataataagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccaccta 25353657  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||| |||           |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25353658 aaaaggtg-----------aatgttcattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 25353725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 53115451 - 53115618
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  53115451 tttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccactta 53115550  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||| |||           ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  53115551 aaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattatccaccatttttccataggtaccctagttgtcacc 53115618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 177
Target Start/End: Original strand, 45058894 - 45059052
Alignment:
Q  8 attacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgt 107  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||           || ||||    
T  45058894 attacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgt 45058982  T
Q  108 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtca 177  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  45058983 gcttatgttgctaatgtatattgattggggtaaattacccatcattctttcatgggcagcctagttgtca 45059052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 75; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 24688118 - 24688287
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||| ||||          
T  24688118 tttctaaattacctttgaaaaattgtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaaaatagttcatgaatat------ 24688211  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcaccca 181  Q
         ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  24688212 -----gtgtttatgtggctaatgtctactggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtaacctagttgtcaccca 24688287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 75; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 51224204 - 51224036
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||               
T  51224204 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaa-caataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg----------- 51224117  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcaccca 181  Q
    || ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||    
T  51224116 aatatgtgcttatgtgactaatatatattggttggggtaaattacccatcattcttttatgggtagcctagttgccaccca 51224036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 17665691 - 17665549
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||               
T  17665691 tttctaaattacctatgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg----------- 17665603  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattc 154  Q
    || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17665602 aatatatgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattc 17665549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 43 - 128
Target Start/End: Original strand, 47182046 - 47182131
Alignment:
Q  43 aatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtat 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47182046 aatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtat 47182131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 28576279 - 28576187
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggata 93  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  28576279 tttctagattacctttgaagtatgatgggtaatttacccatcaaccgatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagtttatggata 28576187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 30251668 - 30251501
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| || ||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  30251668 tttctagactacctttgaaaaatggtgggtaatttactcaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccaccta 30251569  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||| |||           |||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30251568 aaaaggtg-----------aatgttcattggttgggctaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 30251501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 64; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 2228102 - 2227995
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||     
T  2228102 tttctagattacctttgaaaaatggtgggaaatttaccgatcaaccaatgaaaataagcaatttattggtgaggtcaagatagttcatagatatcacttc 2228003  T
Q  101 aaaatgtg 108  Q
    ||||||||    
T  2228002 aaaatgtg 2227995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 64; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 178
Target Start/End: Original strand, 51143825 - 51143987
Alignment:
Q  5 tagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaa 104  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||    
T  51143825 tagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaatatagtttatggataccacctaaaaa 51143924  T
Q  105 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcac 178  Q
     |||           ||||| |||||||||| |||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||    
T  51143925 ggtg-----------aatgtttattggttggagtaaattacccaccattttttcatgggtaccctagttgtcac 51143987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 47402911 - 47402810
Alignment:
Q  6 agattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaat 105  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  47402911 agattacctttaaagaatggtgggtaatttatccatcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtagggtcaagatagttcat-gataccatttaaaaat 47402813  T
Q  106 gtg 108  Q
    |||    
T  47402812 gtg 47402810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 43176905 - 43176734
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||| ||| |||| | ||||| |||||| |||||   |||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  43176905 tttctagattacctttgaaaaatggtggataatttatccaccaaccaatcataatgaacaatttattggtgatgtcaagatagtttatggataccaccta 43176806  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacccaaa 183  Q
    |||| |||            |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43176805 aaaaggtgg-----------atgtttattggttgggataaattacccatcatttttccatgggtaccctagttgtcacccaaa 43176734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 60; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 104 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 48534082 - 48534007
Alignment:
Q  104 atgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  48534082 atgtgcttatgtggctaatgtgtatcggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 48534007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 41882158 - 41882066
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggata 93  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  41882158 tttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggata 41882066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 48726165 - 48726073
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggata 93  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  48726165 tttctaaattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaataagcaatttattggtagagtcaagacagttcatggata 48726073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 42998955 - 42998790
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||| | ||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  42998955 tttctagattacctttgaa-aatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgatcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccaccta 42998857  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcac 178  Q
    |||| |||           ||||  ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  42998856 aaaaggtg-----------aatgcttattggttgggataaattacccaccatttttccatgagtaccttagttgtcac 42998790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 44946089 - 44945935
Alignment:
Q  8 attacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgt 107  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||                 || ||||    
T  44946089 attatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatag-----------------aatatgt 44946007  T
Q  108 gcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  44946006 gcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattattcatcattctttcatgcgtagcctagttgtcacc 44945935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 26 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 52756213 - 52756067
Alignment:
Q  26 tgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaat--- 122  Q
    ||||| |||||||||  || |||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||| ||||           |||||||||||||||||       
T  52756213 tgggttatttacccactaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatat-----------gtgcttatgtggctaattaa 52756125  T
Q  123 -gtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  52756124 tgtgtattggtttgggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 52756067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 50732077 - 50731914
Alignment:
Q  5 tagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaa 104  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||   |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||  |||||     
T  50732077 tagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcttaatgagcaatttgttggtggggtcaaggtagtttatggataccatctaaaac 50731978  T
Q  105 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
     |||           |||||   |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50731977 ggtg-----------aatgttcgttggttggagtaaatttcccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 50731914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Original strand, 50780779 - 50780942
Alignment:
Q  5 tagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaa 104  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||   |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||  |||||     
T  50780779 tagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcttaatgagcaatttgttggtggggtcaaggtagtttatggataccatctaaaac 50780878  T
Q  105 tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
     |||           |||||   |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50780879 ggtg-----------aatgttcgttggttggagtaaatttcccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 50780942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 21597315 - 21597223
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggata 93  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||| |||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||    
T  21597315 tttctagattacctttgaaaaatggtgagtaatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtgggatcaagatagtttatggata 21597223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 40165656 - 40165822
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| |||| ||||||||||| ||| |||| | |||||| ||||| ||||| | |||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  40165656 tttctaaattatctttgaaaaataatgg-taatttacccaccaagcaatcataatgagtaatttattggtggagtcaagatagtttatggataccaccta 40165754  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||| |||           ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  40165755 aaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattatccaccatttttccatgggtaccctggttgtcacc 40165822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 95 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 30429311 - 30429227
Alignment:
Q  95 cacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||| ||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  30429311 cacttaaaaatgtgtttatgtgactaatatgtattaattgggataaattatccaccattcttccgtaggtaccctagttgtcacc 30429227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 127 - 179
Target Start/End: Original strand, 40688431 - 40688483
Alignment:
Q  127 attggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  40688431 attggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctaattgtcacc 40688483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 52434143 - 52434213
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaa-tttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggt 70  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||| |||| | |||||||||||| |||||    
T  52434143 tttctagattacctttgaaaaatggtgggtaattttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggt 52434213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 179
Target Start/End: Original strand, 41609098 - 41609238
Alignment:
Q  28 ggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgta 127  Q
    ||||||||||| | |||  |||||||||||||||||| || || | || || ||||||||||||||  || ||||||||||           |||||  |    
T  41609098 ggtaatttacctaccaactaatgaaaatgagcaatttattagtggagttaaaatagttcatggatactacctaaaaatgtg-----------aatgttca 41609186  T
Q  128 ttggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  41609187 ttggttgaggtaaattatccgtcattcttccatgggtacattagttgtcacc 41609238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 70
Target Start/End: Original strand, 48752093 - 48752158
Alignment:
Q  5 tagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggt 70  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||| | |||| ||||||| |||||    
T  48752093 tagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgtgcaatttattggt 48752158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 51942583 - 51942544
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttaccca 40  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  51942583 tttctagattacctttgaagaatggtaggtaatttaccca 51942544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 41882053 - 41882011
Alignment:
Q  137 gtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41882053 gtaaattatccaccattcttccacgggtaccctagttgtcacc 41882011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 120 - 173
Target Start/End: Original strand, 52434291 - 52434344
Alignment:
Q  120 aatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagtt 173  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||    
T  52434291 aatgtttattggttggagtaaattacccaccatttttctataggtaccctagtt 52434344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 93
Target Start/End: Original strand, 177169 - 177257
Alignment:
Q  5 tagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggata 93  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||  || ||| |||| | || ||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||    
T  177169 tagattacctttgaaaaatggtgggtaatttagtcaccaaccaatcataacgagtaatttattggtgggatcaagatactttatggata 177257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 8847818 - 8847718
Alignment:
Q  8 attacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgt 107  Q
    ||||||||||||||||  ||  ||||||||  | |||  ||| ||||||| |||||| ||||| || |||| |||||||| | ||| |||||||||||||    
T  8847818 attacctttgaagaatagtgtataatttacataccaactaataaaaatgaacaatttattggtgggatcaaaatagttcacgaataccacttaaaaatgt 8847719  T
Q  108 g 108  Q
    |    
T  8847718 g 8847718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 49
Target Start/End: Original strand, 37741443 - 37741487
Alignment:
Q  5 tagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaat 49  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  37741443 tagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaat 37741487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 178
Target Start/End: Original strand, 37760346 - 37760386
Alignment:
Q  138 taaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcac 178  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  37760346 taaattacccaccattcttccataggtaccctagttatcac 37760386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 13940 - 13762
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13940 tttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 13841  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13840 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 13762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 144; Significance: 6e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 2610 - 2427
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2610 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaaattatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggataccactta 2511  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacccaaaa 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  2510 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttccatgggtaccctagttatcaccaaaaa 2427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0949 (Bit Score: 143; Significance: 2e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0949
Description:

Target: scaffold0949; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 1873 - 2051
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1873 tttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 1972  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1973 aaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 2051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 143; Significance: 2e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 11310 - 11133
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11310 tttctagattaccttt-aagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactta 11212  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11211 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 11133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 75422 - 75244
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  75422 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgcataccactta 75323  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  75322 aaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattattcaccattcttccattggtaacctagttgtcacc 75244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 127; Significance: 9e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 19032 - 18854
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  19032 tttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggataccactta 18933  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18932 aaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattagttggaataaattatccacaattcttccatgggtaccctagttgtcacc 18854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 127; Significance: 9e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 9 - 179
Target Start/End: Original strand, 176666 - 176836
Alignment:
Q  9 ttacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtg 108  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||     
T  176666 ttacctttgaagaatggtgggtaatttaccgaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttgaaaatgta 176765  T
Q  109 cttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  176766 cttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtatcctagttgtcacc 176836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Original strand, 278014 - 278190
Alignment:
Q  5 tagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatc--acttaaa 102  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||    
T  278014 tagattacctttgaagaatggtgggtaaattactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccccacttaaa 278113  T
Q  103 aatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  278114 aatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 278190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 32565 - 32712
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || |||    
T  32565 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaattaacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccattta 32664  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 148  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32665 aaaatgtgtttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattaccca 32712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 3092 - 3261
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||          |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  3092 tttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttattcac---------aaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatatcactta 3182  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  3183 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttctatggataccttagttgtcacc 3261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0429 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0429
Description:

Target: scaffold0429; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 51 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 4724 - 4589
Alignment:
Q  51 aaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatc 150  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  4724 aaaatgaacaatttgttggtggggtaaagatagtttatggataccacttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttgggataaattacccacc 4625  T
Q  151 attcttccatgggtaccctagttgtcacccaaaact 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4624 attcttccatgggtaccctagttgtcaccaaaaact 4589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0721 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0721
Description:

Target: scaffold0721; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 7094 - 7262
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaa-tgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactt 99  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||         
T  7094 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatat----- 7188  T
Q  100 aaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
          ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  7189 ------gtgcttatgtggccaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 7262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 82; Significance: 6e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 20644 - 20476
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||| ||| ||    
T  20644 tttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttatggataccaccta 20545  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcaccc 180  Q
    |||| |||           ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20544 aaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcaccc 20476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 71; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 179
Target Start/End: Original strand, 14750 - 14915
Alignment:
Q  3 tctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcacttaaa 102  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||| ||| ||||    
T  14750 tctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaataccacctaaa 14849  T
Q  103 aatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    || |||           ||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14850 aaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacctaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 14915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2003 (Bit Score: 57; Significance: 5e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold2003
Description:

Target: scaffold2003; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 106 - 272
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||| ||| ||| ||    
T  106 tttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggagtcaagatagtttatgaataccaccta 205  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    |||| |||           |||||  |||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  206 aaaaggtg-----------aatgttaattggttgaggtaaatt-cccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0684 (Bit Score: 54; Significance: 3e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0684
Description:

Target: scaffold0684; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 4722 - 4554
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaa-tgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactt 99  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||| || ||    
T  4722 tttctagattacctttcaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaaatgagtaatttattggtgaggtcaagatagttcatggataccattt 4623  T
Q  100 aaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||| |||           |||||  ||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4622 aaaaaggtg-----------aatgttcattggttgaagtaaattatccaccattcttccatgggtactctagttgtcacc 4554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 54; Significance: 3e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 3396 - 3564
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatg-aaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactt 99  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||| || ||    
T  3396 tttctagattacctttcaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaaatgagtaatttattggtgaggtcaagatagttcatggataccattt 3495  T
Q  100 aaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 179  Q
    ||||| |||           |||||  ||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3496 aaaaaggtg-----------aatgttcattggttgaagtaaattatccaccattcttccatgggtactctagttgtcacc 3564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 103
Target Start/End: Original strand, 19228 - 19327
Alignment:
Q  8 attacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagata----gttcatggatatcacttaaaa 103  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    ||||||||||| ||| |||||    
T  19228 attacttttgaagaacggtgggtaatttacctctcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatatatagttcatggataccacctaaaa 19327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0271 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0271
Description:

Target: scaffold0271; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 17910 - 18043
Alignment:
Q  1 tttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggttgggtcaagatagttcatggatatcactta 100  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||| ||| | | ||||| ||| || ||| |||           
T  17910 tttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgatcaatttattgatggagtcaaaatattttatgaatac------ 18003  T
Q  101 aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 145  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18004 -----gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 18043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University