View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8751_high_5 (Length: 350)

Name: NF8751_high_5
Description: NF8751
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8751_high_5
NF8751_high_5
[»] chr8 (34 HSPs)
chr8 (48-230)||(10284549-10284731)
chr8 (48-226)||(12831047-12831225)
chr8 (48-226)||(504043-504221)
chr8 (43-226)||(34012218-34012401)
chr8 (48-226)||(23122519-23122697)
chr8 (48-208)||(44507027-44507187)
chr8 (55-226)||(14547929-14548100)
chr8 (48-227)||(40423864-40424043)
chr8 (48-226)||(15197333-15197511)
chr8 (48-230)||(37038479-37038661)
chr8 (53-229)||(5957835-5958011)
chr8 (67-235)||(8841345-8841513)
chr8 (48-231)||(15048098-15048281)
chr8 (48-231)||(43414498-43414681)
chr8 (47-193)||(1179895-1180041)
chr8 (48-230)||(4854781-4854963)
chr8 (48-226)||(30479396-30479574)
chr8 (43-232)||(15258845-15259034)
chr8 (48-227)||(16056322-16056501)
chr8 (50-188)||(10621047-10621185)
chr8 (92-208)||(9122229-9122345)
chr8 (38-226)||(24307715-24307903)
chr8 (48-226)||(34307216-34307394)
chr8 (48-192)||(16383377-16383521)
chr8 (100-233)||(42354503-42354636)
chr8 (47-217)||(14055523-14055693)
chr8 (48-199)||(42221515-42221666)
chr8 (41-231)||(20074869-20075041)
chr8 (48-228)||(17443825-17444005)
chr8 (48-230)||(32032725-32032906)
chr8 (120-230)||(40467772-40467882)
chr8 (144-230)||(32707921-32708007)
chr8 (144-208)||(42710234-42710298)
chr8 (48-107)||(24307629-24307688)
[»] chr2 (38 HSPs)
chr2 (48-217)||(33436031-33436200)
chr2 (48-226)||(10249304-10249482)
chr2 (48-226)||(13438343-13438521)
chr2 (48-226)||(32505570-32505748)
chr2 (48-199)||(30915463-30915614)
chr2 (48-230)||(20700815-20700997)
chr2 (53-226)||(28863460-28863633)
chr2 (48-208)||(9058480-9058640)
chr2 (48-226)||(17473020-17473198)
chr2 (48-226)||(40701478-40701656)
chr2 (53-226)||(19930742-19930915)
chr2 (48-226)||(7465657-7465835)
chr2 (48-199)||(4060685-4060836)
chr2 (48-231)||(40613819-40614002)
chr2 (48-230)||(36168836-36169018)
chr2 (43-226)||(28381577-28381760)
chr2 (48-231)||(42257193-42257376)
chr2 (48-233)||(38732354-38732539)
chr2 (48-208)||(38882751-38882913)
chr2 (48-176)||(26891476-26891604)
chr2 (48-231)||(2533124-2533306)
chr2 (48-230)||(43490121-43490303)
chr2 (48-157)||(5574479-5574588)
chr2 (48-230)||(38273061-38273242)
chr2 (48-208)||(27864704-27864851)
chr2 (48-191)||(17819961-17820104)
chr2 (65-233)||(2997402-2997570)
chr2 (79-233)||(41758616-41758772)
chr2 (54-232)||(3439985-3440163)
chr2 (48-233)||(33436211-33436386)
chr2 (133-229)||(44152012-44152108)
chr2 (48-199)||(45097684-45097835)
chr2 (48-231)||(13365351-13365536)
chr2 (53-188)||(41575142-41575278)
chr2 (91-230)||(3737986-3738125)
chr2 (134-231)||(17823874-17823971)
chr2 (102-230)||(3034901-3035029)
chr2 (142-217)||(2329352-2329431)
[»] chr1 (34 HSPs)
chr1 (48-226)||(9474798-9474976)
chr1 (48-230)||(32813247-32813429)
chr1 (48-208)||(2581915-2582075)
chr1 (48-226)||(27564657-27564835)
chr1 (48-226)||(41758805-41758983)
chr1 (48-230)||(51898601-51898783)
chr1 (48-217)||(50630458-50630627)
chr1 (47-199)||(3000318-3000470)
chr1 (48-226)||(48716204-48716382)
chr1 (48-208)||(38632261-38632421)
chr1 (48-199)||(38595154-38595305)
chr1 (43-233)||(45044475-45044665)
chr1 (48-226)||(47452242-47452420)
chr1 (48-208)||(43132-43292)
chr1 (48-232)||(5958916-5959100)
chr1 (74-197)||(13414787-13414910)
chr1 (48-228)||(49811447-49811627)
chr1 (48-226)||(37649198-37649376)
chr1 (48-208)||(8346327-8346488)
chr1 (49-230)||(44453980-44454165)
chr1 (53-181)||(44548343-44548471)
chr1 (48-230)||(50590918-50591100)
chr1 (68-233)||(11152293-11152458)
chr1 (48-232)||(47748443-47748626)
chr1 (48-208)||(7740733-7740893)
chr1 (53-226)||(26274437-26274607)
chr1 (48-230)||(37926356-37926538)
chr1 (48-228)||(23597011-23597191)
chr1 (48-230)||(6260870-6261052)
chr1 (48-230)||(41608411-41608593)
chr1 (42-199)||(3302482-3302639)
chr1 (48-232)||(26440734-26440908)
chr1 (89-230)||(44332289-44332430)
chr1 (120-228)||(34339968-34340075)
[»] scaffold0110 (1 HSPs)
scaffold0110 (48-232)||(8779-8963)
[»] chr3 (43 HSPs)
chr3 (53-233)||(30801648-30801828)
chr3 (52-199)||(52629304-52629451)
chr3 (48-226)||(53982011-53982189)
chr3 (47-231)||(8076392-8076576)
chr3 (48-231)||(33118767-33118951)
chr3 (48-226)||(33644200-33644378)
chr3 (48-226)||(54868817-54868995)
chr3 (48-226)||(17470405-17470583)
chr3 (48-233)||(20764830-20765015)
chr3 (48-233)||(35536626-35536811)
chr3 (48-226)||(49607414-49607592)
chr3 (53-196)||(31456694-31456837)
chr3 (46-232)||(51419276-51419462)
chr3 (43-233)||(26141445-26141637)
chr3 (48-233)||(41189679-41189864)
chr3 (48-230)||(11347840-11348022)
chr3 (48-230)||(14623757-14623939)
chr3 (51-233)||(26754698-26754880)
chr3 (48-226)||(36707350-36707524)
chr3 (48-232)||(45058469-45058652)
chr3 (48-230)||(8956762-8956944)
chr3 (53-226)||(48587023-48587186)
chr3 (231-302)||(29555212-29555283)
chr3 (48-230)||(35965700-35965874)
chr3 (51-232)||(42823114-42823295)
chr3 (48-208)||(9562999-9563159)
chr3 (47-233)||(47531864-47532050)
chr3 (68-233)||(13897970-13898135)
chr3 (48-233)||(24699870-24700054)
chr3 (48-151)||(27714888-27714991)
chr3 (38-124)||(11095377-11095463)
chr3 (48-174)||(48375680-48375806)
chr3 (48-164)||(11907371-11907487)
chr3 (56-198)||(39670019-39670161)
chr3 (89-233)||(1758374-1758515)
chr3 (78-199)||(36331278-36331399)
chr3 (48-230)||(35093585-35093767)
chr3 (46-174)||(41080707-41080833)
chr3 (68-127)||(43745766-43745825)
chr3 (166-226)||(11095289-11095349)
chr3 (134-199)||(21746137-21746202)
chr3 (144-233)||(43746435-43746524)
chr3 (68-164)||(45320390-45320486)
[»] chr4 (37 HSPs)
chr4 (48-226)||(6034044-6034222)
chr4 (48-226)||(48182971-48183149)
chr4 (48-232)||(31910192-31910376)
chr4 (48-199)||(480396-480547)
chr4 (47-226)||(41236346-41236525)
chr4 (48-231)||(50052345-50052528)
chr4 (48-226)||(24995029-24995207)
chr4 (48-233)||(29239886-29240071)
chr4 (48-199)||(11511411-11511562)
chr4 (48-199)||(42044316-42044467)
chr4 (48-208)||(54473473-54473633)
chr4 (48-231)||(50526088-50526271)
chr4 (86-230)||(41823920-41824064)
chr4 (48-188)||(29234205-29234345)
chr4 (48-228)||(40574779-40574959)
chr4 (48-233)||(19670631-19670816)
chr4 (48-229)||(48647645-48647826)
chr4 (48-232)||(3481654-3481828)
chr4 (48-208)||(23608235-23608395)
chr4 (48-230)||(50813810-50813992)
chr4 (48-230)||(55475191-55475373)
chr4 (48-233)||(47986208-47986392)
chr4 (65-233)||(17983658-17983826)
chr4 (41-231)||(29547876-29548066)
chr4 (52-174)||(53352540-53352661)
chr4 (48-232)||(28480184-28480368)
chr4 (48-232)||(28481059-28481243)
chr4 (48-232)||(28481934-28482118)
chr4 (48-228)||(29977885-29978065)
chr4 (75-227)||(47104571-47104723)
chr4 (47-182)||(8343129-8343264)
chr4 (48-231)||(32766958-32767141)
chr4 (48-236)||(18924407-18924595)
chr4 (78-233)||(29589655-29589810)
chr4 (48-231)||(44536663-44536845)
chr4 (144-227)||(56300086-56300169)
chr4 (48-182)||(55079679-55079814)
[»] chr7 (40 HSPs)
chr7 (48-231)||(21234401-21234584)
chr7 (48-199)||(38267040-38267191)
chr7 (48-226)||(8080305-8080483)
chr7 (48-230)||(46033719-46033901)
chr7 (48-204)||(35137533-35137689)
chr7 (48-199)||(38837217-38837368)
chr7 (48-226)||(4999436-4999614)
chr7 (48-226)||(19329842-19330020)
chr7 (48-217)||(19436118-19436287)
chr7 (48-199)||(40957707-40957858)
chr7 (34-208)||(7389375-7389548)
chr7 (49-233)||(35522877-35523061)
chr7 (53-192)||(3784000-3784139)
chr7 (53-207)||(32951434-32951588)
chr7 (48-233)||(8238212-8238398)
chr7 (53-199)||(3694372-3694518)
chr7 (48-230)||(26296644-26296826)
chr7 (48-230)||(38044197-38044379)
chr7 (48-226)||(11044188-11044356)
chr7 (48-230)||(22343361-22343543)
chr7 (48-230)||(41423682-41423864)
chr7 (48-181)||(36208173-36208306)
chr7 (48-157)||(36361904-36362013)
chr7 (48-226)||(36362026-36362192)
chr7 (77-229)||(16374743-16374895)
chr7 (48-228)||(41915741-41915921)
chr7 (48-226)||(3434562-3434730)
chr7 (48-231)||(31735884-31736060)
chr7 (82-232)||(27744225-27744375)
chr7 (48-230)||(35468773-35468955)
chr7 (48-233)||(32564341-32564526)
chr7 (48-233)||(40846028-40846213)
chr7 (48-228)||(7727906-7728086)
chr7 (48-208)||(18207180-18207339)
chr7 (48-228)||(39255844-39256023)
chr7 (89-229)||(2318160-2318302)
chr7 (46-140)||(46374810-46374904)
chr7 (166-231)||(46374741-46374806)
chr7 (91-229)||(32045880-32046018)
chr7 (166-226)||(36361847-36361907)
[»] chr5 (29 HSPs)
chr5 (43-226)||(33149560-33149743)
chr5 (48-226)||(2740274-2740452)
chr5 (53-226)||(18520806-18520979)
chr5 (48-228)||(35943812-35943992)
chr5 (48-226)||(35785199-35785377)
chr5 (48-217)||(36732873-36733042)
chr5 (55-217)||(13811659-13811821)
chr5 (48-226)||(14831814-14831992)
chr5 (48-230)||(15409528-15409710)
chr5 (48-226)||(40145407-40145585)
chr5 (48-231)||(31008988-31009171)
chr5 (48-229)||(6679698-6679879)
chr5 (48-183)||(28177775-28177910)
chr5 (48-232)||(26720516-26720700)
chr5 (48-232)||(26990265-26990449)
chr5 (120-232)||(2177436-2177548)
chr5 (48-232)||(3921181-3921365)
chr5 (48-231)||(2252085-2252268)
chr5 (48-233)||(6259916-6260101)
chr5 (75-231)||(20073433-20073589)
chr5 (48-175)||(42414275-42414402)
chr5 (43-231)||(39688814-39689002)
chr5 (53-196)||(36875564-36875698)
chr5 (48-229)||(33825243-33825424)
chr5 (92-230)||(21370048-21370186)
chr5 (48-228)||(9603813-9603993)
chr5 (56-139)||(41470425-41470508)
chr5 (96-158)||(31132392-31132454)
chr5 (68-153)||(16327921-16328006)
[»] chr6 (22 HSPs)
chr6 (55-226)||(32869685-32869856)
chr6 (53-208)||(22880598-22880753)
chr6 (48-226)||(17598554-17598732)
chr6 (48-230)||(31976248-31976430)
chr6 (48-226)||(11427616-11427796)
chr6 (48-226)||(15832577-15832755)
chr6 (53-199)||(23128076-23128222)
chr6 (48-191)||(6209422-6209565)
chr6 (48-233)||(31952945-31953130)
chr6 (48-226)||(29857827-29858005)
chr6 (48-231)||(30341277-30341460)
chr6 (48-230)||(15989960-15990142)
chr6 (48-233)||(15507939-15508124)
chr6 (60-197)||(31109351-31109488)
chr6 (48-230)||(31110679-31110859)
chr6 (48-230)||(4231548-4231730)
chr6 (55-215)||(946383-946543)
chr6 (53-208)||(28536428-28536581)
chr6 (52-180)||(9379680-9379808)
chr6 (92-217)||(30870058-30870183)
chr6 (48-170)||(12732482-12732604)
chr6 (185-230)||(22421997-22422042)
[»] scaffold0321 (1 HSPs)
scaffold0321 (48-199)||(10058-10209)
[»] scaffold1268 (1 HSPs)
scaffold1268 (48-229)||(848-1029)
[»] scaffold1267 (1 HSPs)
scaffold1267 (48-229)||(848-1029)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (48-226)||(4029-4207)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (78-229)||(152528-152679)
[»] scaffold0316 (1 HSPs)
scaffold0316 (78-157)||(17084-17163)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 131; Significance: 6e-68; HSPs: 34)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 48 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 10284731 - 10284549
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||    
T  10284731 gagttatgatacatagacacccttaagtgacaatacactctttgacacccacacaaaaatttgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 10284632  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 230  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  10284631 tctttcctttcatcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaaggttgtataagaataaaaggtgtctatgtaacattttcc 10284549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 48 - 226
Target Start/End: Original strand, 12831047 - 12831225
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||    
T  12831047 gagtaatgatacatagacacccttaggtgacaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 12831146  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 226  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||| ||||    
T  12831147 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaatggtgtctatgtatcatt 12831225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 48 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 504221 - 504043
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||    
T  504221 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacacattc 504122  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 226  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||| ||||    
T  504121 tcttttctctcatcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtatcatt 504043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 43 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 34012401 - 34012218
Alignment:
Q  43 tttacgagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcata 142  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |    
T  34012401 tttatgagtaatgatacatagacacccttaggtggtaatacaccctttgacacccacacaaaaatttgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcaca 34012302  T
Q  143 ttttctctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 226  Q
     ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||  ||||||| ||| ||||    
T  34012301 ctttctcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtacgagaataaagggtgtctatgtatcatt 34012218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 48 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23122697 - 23122519
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||    
T  23122697 gagtaatgatacatagacacccttaagtggcaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcataagcacactttc 23122598  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 226  Q
    ||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||| ||||    
T  23122597 tcttttctctcctgttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtatcatt 23122519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 48 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 44507187 - 44507027
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| |||  ||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  44507187 gagtaatgatacatagacacccttaggtggtaatacactctttaacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgtacaagcatactttc 44507088  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaa 208  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  44507087 tcttttctctcatcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaa 44507027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 55 - 226
Target Start/End: Original strand, 14547929 - 14548100
Alignment:
Q  55 gatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcc 154  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |    
T  14547929 gatacatagacacccttaggtggcaatacaccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttttc 14548028  T
Q  155 tctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 226  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||  ||||||| ||| ||||    
T  14548029 tctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaaggatgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 14548100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 48 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 40424043 - 40423864
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||    
T  40424043 gagtaatgatacatagatacccttaggtggcaatacaccctttgacatccacacaaaaatctgacacgtagtcatgtggaccccgcacaagcacactttc 40423944  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattt 227  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| |||||    
T  40423943 tcttttctctcctcttctctcttcctaatacatgaggtgtacaagggtgtatgggaataaaaggtgtctatgtatcattt 40423864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 48 - 226
Target Start/End: Original strand, 15197333 - 15197511
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||    
T  15197333 gagtaatgatacatagacactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 15197432  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 226  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||||| |||||||| | |||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||    
T  15197433 tcttttctctcctcttttctcttccaaatgcatgaggtgtacaagggtgtatgggaataaaaagtgtctatgtatcatt 15197511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 48 - 230
Target Start/End: Original strand, 37038479 - 37038661
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| | | ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||    
T  37038479 gagtaatgatacatagacatctttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttc 37038578  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 230  Q
    | ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||  |||| || ||||||||||||    
T  37038579 tatttcctctcctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaagggtgtatagaaataaagggtgtttatgtaacattttcc 37038661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 53 - 229
Target Start/End: Original strand, 5957835 - 5958011
Alignment:
Q  53 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 152  Q
    |||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| || | |||||||||    
T  5957835 atgatacatagacattcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaatcacactttctcttt 5957934  T
Q  153 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttc 229  Q
    |||||| ||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||  |||| || |||||||||||    
T  5957935 cctctcctcttctctcttcctagtgcatgaggtgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtttatgtaacattttc 5958011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 67 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8841513 - 8841345
Alignment:
Q  67 cccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctctcatcttccc 166  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |    
T  8841513 cccttaggtggcagtacaccctttgacacccacacaaaaatctaacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctctttcctctcctcttctc 8841414  T
Q  167 tcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcctttga 235  Q
    | |||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||    
T  8841413 ttttcctagtgcatggggtgtacaagagtgtatgagaataaatggtgtctatgtaacattttccattga 8841345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15048281 - 15048098
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||| | ||||    
T  15048281 gagttatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttgacacc-acacaaaaatctgacacgtagccacatggaccccgcacaagcacactttc 15048183  T
Q  148 tctttcc-tctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcct 231  Q
    |||||   |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||  ||||||||||||    
T  15048182 tctttttatctcctcttctctcttcctaatgtatgggatgtacaagggtgtatcggaataaagggtgtctatataacattttcct 15048098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 43414681 - 43414498
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||||| | |||||  || ||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||| |||| | |||||||||| | ||||    
T  43414681 gagttatgatacatagacatccttagatggcaacacaccctttgacacccacacaaaaatctaacacgtggtcacatggatcccgcacaagcacactttc 43414582  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcct 231  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||   ||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  43414581 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatggcaataaagggtgtctatgtaacattttcct 43414498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 47 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 1180041 - 1179895
Alignment:
Q  47 cgagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatatttt 146  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||   |||||||||| | |||    
T  1180041 cgagtaatgatacatagacacccttaggtggtaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcatgtggattccgcacaagcacacttt 1179942  T
Q  147 ctctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagg 193  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  1179941 ctcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagg 1179895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 48 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 4854963 - 4854781
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| | || | ||| ||||||  ||||||||| | ||||    
T  4854963 gagtaatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttaacacctacataaaaatctgatatgtggccacatggaccctgcacaagcacactttc 4854864  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 230  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  4854863 tcttttctctcctcttctctcttactaatgtatgggatgtacaagggtatatgagaataaagagtgtctatgtaacattttcc 4854781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 48 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 30479574 - 30479396
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |  |  ||||||||||||||| | | ||||    
T  30479574 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccctttgacatccacataaaaatctgacatgtggctatatggacctcgcacaagtacactttc 30479475  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 226  Q
    |||||| |||  ||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||||||||    
T  30479474 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatgaggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacatt 30479396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 43 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15259034 - 15258845
Alignment:
Q  43 tttacgagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcata 142  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||  || ||||||| || | |||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||  ||||||||| |    
T  15259034 tttaagagttatgatacatagatactcttagatggcaatacatccctggacatccacataaaaatctgacatgtggtcacgtggaccctgcacaagcaca 15258935  T
Q  143 ttttctctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcctt 232  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||    || ||||||||||  ||||||   ||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  15258934 ttttctctttcctctcctcttctctcttcctagaatataggatgtacaaaagtgtatggaaataaagggtgtctatgtaacattttcctt 15258845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 48 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16056501 - 16056322
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||| || | ||  |||||| |||||||| | | ||||    
T  16056501 gagttatgatacataaacatccttatgtgacaatacatcccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttc 16056402  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattt 227  Q
    |||||| |||  ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |||||||||    
T  16056401 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattt 16056322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 50 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 10621185 - 10621047
Alignment:
Q  50 gttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctc 149  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| | || | |||||||||| | ||||||    
T  10621185 gttatgatacatagacatccttaggtggtaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagccacatcgatcccgcacaagcacactttctc 10621086  T
Q  150 tttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgta 188  Q
    ||| ||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  10621085 ttttctctcctcttctctcttcctaatatatgggatgta 10621047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 92 - 208
Target Start/End: Original strand, 9122229 - 9122345
Alignment:
Q  92 acacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaa 191  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  9122229 acacccacacaaaaatctgacatgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttctcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaa 9122328  T
Q  192 gggtgtataagaataaa 208  Q
    | ||||||  |||||||    
T  9122329 gagtgtatgggaataaa 9122345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 38 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24307903 - 24307715
Alignment:
Q  38 attaatttacgagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaa 137  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||| || |||||||||||| |||||| ||| | || | ||  |||||| |||||||    
T  24307903 attattttaagagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacatcccttgacacccacacaaaaatctgatatgtggccatatggaccccgcacaa 24307804  T
Q  138 gcatattttctctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 226  Q
    | | | |||||||||| |||  ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||||||||    
T  24307803 gtacactttctctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacatt 24307715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 48 - 226
Target Start/End: Original strand, 34307216 - 34307394
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| || | ||  || ||| |||||||| | | ||||    
T  34307216 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggacatatgaaccccgcacaagtacactttc 34307315  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 226  Q
    |||||| |||  ||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||||||||    
T  34307316 tctttcttcttctcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacatt 34307394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 48 - 192
Target Start/End: Original strand, 16383377 - 16383521
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| || | ||  |||||| |||||||| | | ||||    
T  16383377 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttc 16383476  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaag 192  Q
    |||||| |||  ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  16383477 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaag 16383521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 100 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 42354636 - 42354503
Alignment:
Q  100 ataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtat 199  Q
    |||||||| ||||||||  ||| ||||| ||| || ||||| | |||||||||| |||  ||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  42354636 ataaaaatctgacacgtgttcatgtggatctcacataagcacactttctctttcatcttctcttctctcttcctagtgcatggggtgtagaagggtgtat 42354537  T
Q  200 aagaataaaatgtgtctacgtaacattttccttt 233  Q
     ||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  42354536 gagaataaatggtgtctatgtaacattttccttt 42354503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 14055693 - 14055523
Alignment:
Q  47 cgagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctc-gcacaagcatattt 145  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| | |||||| ||||| |||||| | ||| ||||||||||||||| |  |||||||  | ||    
T  14055693 cgagttatgatacattgacacccttaggtgacaatacactccttgacatccacacaaaaatcttacatgtagtcacgtggacccctacacaagc-cactt 14055595  T
Q  146 tctctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtcta 217  Q
    | |||||||||| |||||| |||||| ||||| ||| | | ||||| ||||||| ||||||||  |||||||    
T  14055594 tttctttcctctgatcttctctcttcttaatgaatgaggtatacaaaggtgtatgagaataaatagtgtcta 14055523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 48 - 199
Target Start/End: Original strand, 42221515 - 42221666
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||| | | ||||| |||||||||||  | | |||||||||| |||||| ||||||||| |||  |||||| |  ||||||| | ||||    
T  42221515 gagtaatgatacatatacatccttaggtgacaatacattcctggacacccacacaaaaatctgacacgtaatcatatggaccccatacaagcacactttc 42221614  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtat 199  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| |||  || || |||||||||||||||    
T  42221615 tctttcatctcatcttctctcttccaaatatatagggtgtacaagggtgtat 42221666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 41 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20075041 - 20074869
Alignment:
Q  41 aatttacgagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagca 140  Q
    |||||| |||| |||||||||||| | ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||        ||||||||||  |||||||||    
T  20075041 aatttatgagtaatgatacatagacatccttaggtggcaatacactctttgacacccacataaaaatgtga--------cacgtggaccctgcacaagca 20074950  T
Q  141 tattttctctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcct 231  Q
     | ||||||||||||||  ||||| ||||||||| | ||||           ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20074949 cactttctctttcctcttctcttctctcttcctagttcatg----------aggtgtatgagaataaaatgtgtctatgtaacattttcct 20074869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 48 - 228
Target Start/End: Original strand, 17443825 - 17444005
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||   || |||| |||| |||||| ||||| ||||||| ||||||| | |||||  | | ||||    
T  17443825 gagttatgatacatagacaaccttaggtgacaatacacttcttaacactcacacaaaaatctgacatgtagtcatgtggaccccacacaaagacactttc 17443924  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatttt 228  Q
    |||||| |||  ||||| ||||||| | |||||| | ||||||||| |||||    |||||  ||||||| ||||||||||    
T  17443925 tctttcatcttctcttctctcttcccagtgcatgagttgtacaaggatgtattcttataaagggtgtctatgtaacatttt 17444005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 230
Target Start/End: Original strand, 32032725 - 32032906
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||| |||| |||| ||||| |||||| ||||| || | ||  |||| |  ||||||| | | ||||    
T  32032725 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacatcctt-gacatccacacaaaaatctgacatgtggccatatggatcctgcacaagtacactttc 32032823  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 230  Q
    ||||||  ||  ||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  32032824 tctttctccttctcttctctcttcctaatacatgaggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 32032906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Original strand, 40467772 - 40467882
Alignment:
Q  120 cacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacg 219  Q
    ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||| |||||||   | |||  | |||||| ||||||| |    
T  40467772 cacgtggacttcgcacaagcacactttctctttcctctcatcttctctcttcctagtctatggggtgtacaaaaatttatggggataaaaggtgtctatg 40467871  T
Q  220 taacattttcc 230  Q
    |||||||||||    
T  40467872 taacattttcc 40467882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 32708007 - 32707921
Alignment:
Q  144 tttctctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 230  Q
    |||||||||| |||  ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  32708007 tttctctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 32707921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 42710298 - 42710234
Alignment:
Q  144 tttctctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaa 208  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  42710298 tttctcttttctctcctcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaa 42710234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 48 - 107
Target Start/End: Original strand, 24307629 - 24307688
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaat 107  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  24307629 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacatccattgacacccacacaaaaat 24307688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 38)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 48 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 33436200 - 33436031
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||    
T  33436200 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctaacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 33436101  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtcta 217  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  33436100 tctttcctctcatcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaagggtgtatgagaataaaaggtgtcta 33436031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 48 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 10249482 - 10249304
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||    
T  10249482 gagtaatgatacatagacacccttaggtgacaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 10249383  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 226  Q
    ||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||| ||||    
T  10249382 tcttttctctcctcttttctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtatcatt 10249304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 48 - 226
Target Start/End: Original strand, 13438343 - 13438521
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||    
T  13438343 gagtaatgatacatagacacccttaggtgacaatacatcctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 13438442  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 226  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||  ||||||| ||| ||||    
T  13438443 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaaggatgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 13438521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 48 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 32505748 - 32505570
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||    
T  32505748 gagtaatgatacatagacacccttaggtgacaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 32505649  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 226  Q
    | ||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||| ||||    
T  32505648 tattttctctcctcttctctcttcttaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaagagtgtctatgtatcatt 32505570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 48 - 199
Target Start/End: Original strand, 30915463 - 30915614
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||    
T  30915463 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacccccacataaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgtacaagcacactttc 30915562  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtat 199  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  30915563 tcttttctctcatcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtat 30915614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 48 - 230
Target Start/End: Original strand, 20700815 - 20700997
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||    
T  20700815 gagtaatgatacatagacatccttatgtggcaatacaccctttgactcctacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcataagcacactttc 20700914  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 230  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  20700915 tctttcctctcctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtaacattttcc 20700997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 53 - 226
Target Start/End: Original strand, 28863460 - 28863633
Alignment:
Q  53 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 152  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  28863460 atgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 28863559  T
Q  153 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 226  Q
      |||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||  ||||||| ||| ||||    
T  28863560 tatctcctcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 28863633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 48 - 208
Target Start/End: Original strand, 9058480 - 9058640
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||    
T  9058480 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcatgtggaccccgcacaagcacactttc 9058579  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaa 208  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||    
T  9058580 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagagtgtatgggaataaa 9058640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 48 - 226
Target Start/End: Original strand, 17473020 - 17473198
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||    
T  17473020 gagtaatgatacatagacacccttagatggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttc 17473119  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 226  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||  ||||||| ||| ||||    
T  17473120 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 17473198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 48 - 226
Target Start/End: Original strand, 40701478 - 40701656
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || | ||||    
T  40701478 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtagttacgtggaccccgcacaatcacactttc 40701577  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 226  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||| ||||||| ||| ||||    
T  40701578 tcttttctctcatcttctctcttcctaatgcatcgggtgtacaagggtgtatggaaataaaaggtgtctatgtatcatt 40701656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 53 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19930915 - 19930742
Alignment:
Q  53 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 152  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || | |||||||||    
T  19930915 atgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacatccacacaaaaatctgacacgtagtcatgtggaccccgcacaaacacactttctcttt 19930816  T
Q  153 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 226  Q
     ||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||    
T  19930815 tctctcctcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaagggtgtatgggaataaaaggtgtctatgtatcatt 19930742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 48 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 7465835 - 7465657
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||    
T  7465835 gagtaatgatacatagacacccttagatggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccacacaagcacactttc 7465736  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 226  Q
    |||||  |||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||  ||||||| ||| ||||    
T  7465735 tcttttatctcttcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 7465657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 48 - 199
Target Start/End: Original strand, 4060685 - 4060836
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||| | |||| ||||| | ||||    
T  4060685 gagtaatgatacatagacacccttaggtgacaatacaccttttgacatccacacaaaaatctgacacgtagttacgtggatcccgcataagcacactttc 4060784  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtat 199  Q
    | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4060785 ttttttctctcatcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtat 4060836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 40614002 - 40613819
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| |||||| |||||||||| | ||||    
T  40614002 gagttatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtggccacatggaccccgcacaagcacactttc 40613903  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcct 231  Q
    ||||| ||||| | |||  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  40613902 tcttttctctcctattctttcttcataatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtaacattttcct 40613819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 48 - 230
Target Start/End: Original strand, 36168836 - 36169018
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||||| | |||||  |||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  36168836 gagttatgatacatagacatccttagatgacaatacatcctttaactcccacacaaaaatttgacacgtggccacatggaccccgcacaagcatactttc 36168935  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 230  Q
    ||||| ||||| | ||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||  |||| || ||||||||||||    
T  36168936 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagagtgtatgagaataaagggtgtttatgtaacattttcc 36169018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 43 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 28381760 - 28381577
Alignment:
Q  43 tttacgagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcata 142  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||| |    
T  28381760 tttatgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacacctttcgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacatggactccgcacaagcaca 28381661  T
Q  143 ttttctctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 226  Q
     ||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||| |||||  |||||||  ||||||| ||| ||||    
T  28381660 ctttctcttttctctcatcttctctcttcctaatatatggggtgtacaaggatgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 28381577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 42257193 - 42257376
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||||| | | ||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||| |||||||||| | ||||    
T  42257193 gagttatgatacatagacatctttaggtggcaatacatcatttgacacccacataaaaatctgacacgtggccacatggaccccgcacaagcacactttc 42257292  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcct 231  Q
    ||||| ||||| |||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||  ||||||| |||| ||||||||    
T  42257293 tcttttctctcctcttctttcttcctaatgtatggggtgtacaagagtgtatagaaataaagggtgtctatgtaatattttcct 42257376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 48 - 233
Target Start/End: Original strand, 38732354 - 38732539
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||| || ||||  |||||| |||||||| | | ||||    
T  38732354 gagttatgatacataaacacccttatgtgacaatacatcccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggtcatatggaccccgcacaagtacactttc 38732453  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttccttt 233  Q
    |||||| |||  ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||   | ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  38732454 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatgagatgtacaaggatgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttccttt 38732539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 48 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 38882913 - 38882751
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctc---gcacaagcatatt 144  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |   ||||||||  | |    
T  38882913 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaata-accctttgacatccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggacccccccgcacaagcgcact 38882815  T
Q  145 ttctctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaa 208  Q
    |||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  38882814 ttctcttttctcttatcttatctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaa 38882751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 48 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 26891604 - 26891476
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||| | |||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  26891604 gagttatgatacatagccacccttaggtggcaatacacccctagacacccacacaaaaatctgacatgtggtcacgtggacctcgaacaagcacattttc 26891505  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaat 176  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  26891504 tctttcctcttctcttctctcttcctaat 26891476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 2533124 - 2533306
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||| | |||| |||||||||| | |||     
T  2533124 gagttatgatacatagacatccttaagtggcaatacatcctttgacacc-acacaaaaatctgacacgtagccacatagaccccgcacaagcacactttt 2533222  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcct 231  Q
    |||||  |||| ||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||  |||||||  |||| ||  ||||||||||||    
T  2533223 tcttttatctcctcttctctcttcccaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtatatataacattttcct 2533306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 48 - 230
Target Start/End: Original strand, 43490121 - 43490303
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| || | ||  |||||| |||||||| | | |||     
T  43490121 gagttatgatacataaacacccttaggtgacaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacacttta 43490220  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 230  Q
    |||||| |||  ||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  43490221 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatagggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 43490303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 48 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 5574588 - 5574479
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||    
T  5574588 gagtaatgatacatagacactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacataaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttc 5574489  T
Q  148 tctttcctct 157  Q
    ||||| ||||    
T  5574488 tcttttctct 5574479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 48 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 38273242 - 38273061
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||  || ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||| ||||| |||| | ||||    
T  38273242 gagttatgatacatagacattcttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatctgacacgtagccacatggaccccgcactagcacactttc 38273143  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 230  Q
    ||||| ||||| | ||| |||||||||||| ||||| ||||||| | ||||| ||||||||  |||| || |||| |||||||    
T  38273142 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaa-gatgtatgagaataaatggtgtttatgtaatattttcc 38273061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 48 - 208
Target Start/End: Original strand, 27864704 - 27864851
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||| | ||||    
T  27864704 gagtaatgatacatagacacccttatgtggcaatacaccctttgacatccacacaaaaatctgacacgtaatcacgtggaccccgcaaaagcacactttc 27864803  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaa 208  Q
    |||||             ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27864804 tcttt-------------ctcttcctaatacatgggatgtacaagggtgtatgagaataaa 27864851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 48 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 17820104 - 17819961
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||||| | |  || ||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| || || ||||||||| | ||||| || ||||||    
T  17820104 gagttatgatacatagacaactataggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggttacgtggaccccacacaaacacattttc 17820005  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaa 191  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  17820004 tctttcatctcctcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaa 17819961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 65 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 2997570 - 2997402
Alignment:
Q  65 aacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctctcatcttc 164  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| || | ||  |||||| |||||||| | | |||||||||| |||  |||||    
T  2997570 aacccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttctctttcttcttctcttc 2997471  T
Q  165 cctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttccttt 233  Q
     ||||||||||| |||| | |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  2997470 tctcttcctaatacatgaggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaagtgtctatgtaacatttcccttt 2997402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 79 - 233
Target Start/End: Original strand, 41758616 - 41758772
Alignment:
Q  79 aatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaa--gcatattttctctttcctctcatcttccctcttcctaat 176  Q
    |||| ||| ||||||||| | |||||||| |||||||||| ||| |  | |||||| ||  ||| |||||||||||  |||| ||||| |||||||||||    
T  41758616 aatataccttttgacacctatataaaaatctgacacgtagccacataaatctcgcataaacgcacattttctcttttatctcctcttctctcttcctaat 41758715  T
Q  177 gcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttccttt 233  Q
      ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  41758716 atatggggtgtacaaggatgtatgagaataaaatgtgtctatgtaacatttttcttt 41758772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 54 - 232
Target Start/End: Original strand, 3439985 - 3440163
Alignment:
Q  54 tgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttc 153  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| |||||||| | | |||||||||| |||||| | ||| ||  | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  3439985 tgatacgtagacacccttaggtggcaatacactcctggacacccacacaaaaatctaacatgtgattacgtggaccccgcacaagcacattttctctttc 3440084  T
Q  154 ctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcctt 232  Q
    ||||| ||||| ||||| |||    || || ||||||| |||||||   ||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  3440085 ctctcctcttctctctttctagaatatagggtgtacaaaggtgtatggaaataaagggtgtctatgtaacattttcctt 3440163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 48 - 233
Target Start/End: Original strand, 33436211 - 33436386
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| | |||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||   || |||||| | ||||||||| | ||||    
T  33436211 gagtaatgatacatagacatccttagatggcaatacaccttttgacacccacataaaaatctgacacgtgaccatgtggactttgcacaagcacactttc 33436310  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttccttt 233  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||| | |||| |          |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  33436311 tctttcctatcctcttctctcttcctagttcatgag----------gtgtatgagaataaaaggtgtctatgtaacattttccttt 33436386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 133 - 229
Target Start/End: Original strand, 44152012 - 44152108
Alignment:
Q  133 cacaagcatattttctctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttc 229  Q
    |||||||| | |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||| |||| || |||||||||||    
T  44152012 cacaagcacactttctctttcatctcctcttctctcttcctaatgcatgagatatacaagggtgtatgcgaataaaaggtgtttatgtaacattttc 44152108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 48 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 45097835 - 45097684
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||| | | ||||| ||| ||||||| || |||||||||| | |||||| ||||| || | ||  |||||| |||||||| | | ||||    
T  45097835 gagttatgatacataaacatccttaggtggcaatacatcccttgacacccatacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttc 45097736  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtat 199  Q
    |||||| |||  ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  45097735 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatcggatgtacaagagtgtat 45097684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 13365351 - 13365536
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaac--ccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattt 145  Q
    ||||||||||||||| | ||  |||||  || ||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||| ||   ||  |||||| |||||||| | | ||    
T  13365351 gagttatgatacataaacacacccttagatggcaatataccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtgaccatatggaccccgcacaagtacactt 13365450  T
Q  146 tctctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcct 231  Q
    |||||||| |||  ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||   | ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  13365451 tctctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgaatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcct 13365536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 53 - 188
Target Start/End: Original strand, 41575142 - 41575278
Alignment:
Q  53 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctc-gcacaagcatattttctctt 151  Q
    |||||||||||| | |||||  ||  ||||||||||||||||  |||| |||||||||||| || |||| ||||||| |  |||||||| | ||||||||    
T  41575142 atgatacatagacatccttagatggtaatacaccctttgacattcacacaaaaatttgacatgtggtcatgtggacccctacacaagcacactttctctt 41575241  T
Q  152 tcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgta 188  Q
    || |||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  41575242 tcatctcctcttctctcgtcctaatgcatgagatgta 41575278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 91 - 230
Target Start/End: Original strand, 3737986 - 3738125
Alignment:
Q  91 gacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtaca 190  Q
    |||||||||| |||||| ||||| || |||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  ||||||||    || || ||||||    
T  3737986 gacacccacacaaaaatctgacatgtggtcatgtggaccccgcacaagcacattttctttttcctctcctcttctttcttcctagaatatagggtgtaca 3738085  T
Q  191 agggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 230  Q
    | ||||||| | |||| |  ||||||| ||||||||||||    
T  3738086 aaggtgtatgaaaatatagggtgtctatgtaacattttcc 3738125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 231
Target Start/End: Original strand, 17823874 - 17823971
Alignment:
Q  134 acaagcatattttctctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcct 231  Q
    ||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||| |||  ||||| |||||||||||||||   ||||||   |||||| |||||||||||||    
T  17823874 acaagcacactttctctttcatctcatcttctctcttccaaatatatggggtgtacaagggtgtatgtaaataaaggatgtctatgtaacattttcct 17823971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 102 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 3035029 - 3034901
Alignment:
Q  102 aaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataa 201  Q
    |||||| ||||| || ||||  |||||| |||||||| ||| |||||||||| |||  ||||| ||||||||||| |||| | ||||| | |||||||      
T  3035029 aaaaatctgacatgtggtcatatggaccccgcacaagtatactttctctttcttcttctcttctctcttcctaatacatgaggtgtaccaaggtgtatgc 3034930  T
Q  202 gaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 230  Q
     | ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  3034929 aattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 3034901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 217
Target Start/End: Original strand, 2329352 - 2329431
Alignment:
Q  142 attttctctttcctctcatcttccctcttcc---ta-atgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtcta 217  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||   || ||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  2329352 attttctctttcctctcctcttctctcttcccgatagatatatgggatgtacaagggtgaataagaataaaaagtgtcta 2329431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 34)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 48 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 9474976 - 9474798
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||    
T  9474976 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacactttc 9474877  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 226  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||| ||||    
T  9474876 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtatgagaataaagagtgtctatgtatcatt 9474798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 48 - 230
Target Start/End: Original strand, 32813247 - 32813429
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||| | ||||    
T  32813247 gagttatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatctgacacgtggtcacatggaccccgcacaagcacactttc 32813346  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 230  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  32813347 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtaacattttcc 32813429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 48 - 208
Target Start/End: Original strand, 2581915 - 2582075
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||    
T  2581915 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 2582014  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaa 208  Q
    | ||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  2582015 ttttttctctcctcttctctcttcctaatacatgaggtgtacaagggtgtattagaataaa 2582075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 48 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 27564835 - 27564657
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| | ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||    
T  27564835 gagtaatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtaatcacgtggaccccgcacaagcacactttc 27564736  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 226  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||  ||||||| ||| ||||    
T  27564735 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 27564657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 48 - 226
Target Start/End: Original strand, 41758805 - 41758983
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| || | ||||    
T  41758805 gagtaatgatacatagacaccattaaatggcaatacaccctttgacaaccacacaaaaatctgacacgtagtcacatggaccccgcacaaacacactttc 41758904  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 226  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||| ||||    
T  41758905 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtatcatt 41758983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 48 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 51898783 - 51898601
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| | | ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||    
T  51898783 gagtaatgatacatagacatctttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttc 51898684  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 230  Q
    | ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||  |||| || ||||||||||||    
T  51898683 tatttcctctcctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaagggtgtatagaaataaagggtgtttatgtaacattttcc 51898601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 48 - 217
Target Start/End: Original strand, 50630458 - 50630627
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||    
T  50630458 gagtaatgatacatagatacccttaggtggcaatacatcctttgttacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 50630557  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtcta 217  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  50630558 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatagggtgtacaagggtgtatgagaataaatggtgtcta 50630627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 47 - 199
Target Start/End: Original strand, 3000318 - 3000470
Alignment:
Q  47 cgagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatatttt 146  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| | |||    
T  3000318 cgagtaatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgtacaagcacacttt 3000417  T
Q  147 ctctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtat 199  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  3000418 ctcttttctctcatcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtat 3000470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 48 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 48716382 - 48716204
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||     
T  48716382 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccatttgacatccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacacttta 48716283  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 226  Q
    ||||| || || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||  ||||||| ||| ||||    
T  48716282 tcttttctttcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 48716204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 48 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 38632421 - 38632261
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||     
T  38632421 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccttttaacatccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttt 38632322  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaa 208  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  38632321 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaa 38632261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 48 - 199
Target Start/End: Original strand, 38595154 - 38595305
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||| | ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||    
T  38595154 gagtaatgatacataaacacctttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgtacaagcacactttc 38595253  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtat 199  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  38595254 tcttttctctcatcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtat 38595305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 43 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 45044665 - 45044475
Alignment:
Q  43 tttacgagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcata 142  Q
    |||| ||||||||||||||| |   ||||| ||| ||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||| |||||| ||||||| || |    
T  45044665 tttaagagttatgatacatacatttccttaggtggcaatacaccatttgacacccatacaaaaatctgacatgtagccacatggaccccgcacaaacaca 45044566  T
Q  143 ttttctctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttccttt 233  Q
    |||||||||| ||||  ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  45044565 ttttctcttttctcttctcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgagaataaatgatgtctacgtaacattttccttt 45044475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 48 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 47452420 - 47452242
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||    
T  47452420 gagtaatgatacatagacacccttaggtggtaatacaccctttgacacccacacaaaaatctaacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttc 47452321  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 226  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||  |||||||  ||||||| ||| ||||    
T  47452320 tcttttctctcctcttctctcttcctattgcatggggtgtacaaggatgtatgggaataaagagtgtctatgtatcatt 47452242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 48 - 208
Target Start/End: Original strand, 43132 - 43292
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| |  |||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||    
T  43132 gagtaatgatacatagacagtcttaggagacaatacatcctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggactccgcacaagcacactttc 43231  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaa 208  Q
    ||||| ||||| || || ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  43232 tcttttctctcctcctctctctttctaatgcatggggtgtacaagagtgtataagaataaa 43292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 48 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 5959100 - 5958916
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||| ||||| || ||||  |||||| |||||||| | | ||||    
T  5959100 gagttatgatacataaacacccttaagtggcaatacacctcttgacacccacacaaaaatctgacatgtggtcatatggaccccgcacaagtacactttc 5959001  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcctt 232  Q
    |||||| |||  ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||   | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5959000 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaatgtgtctatgtaacattttcctt 5958916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 74 - 197
Target Start/End: Original strand, 13414787 - 13414910
Alignment:
Q  74 gtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctctcatcttccctcttcct 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  13414787 gtgacaatacaccctttgacacccacacaaaaatctaacacgtagtcacgtggaccccacacaagcacattttctcttttctatcatcttctctcttcct 13414886  T
Q  174 aatgcatgggatgtacaagggtgt 197  Q
    |||||||||  ||||| |||||||    
T  13414887 aatgcatggagtgtactagggtgt 13414910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 48 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 49811627 - 49811447
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||  | |||  |||||||||| | ||||    
T  49811627 gagttatgatagatagacatccttaggtgacaatacaccatttgacatccacacaaaaatctgacacgtagccatatagactccgcacaagcacactttc 49811528  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatttt 228  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||| | || |||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  49811527 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgtatgtggtgcacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatttt 49811447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 48 - 226
Target Start/End: Original strand, 37649198 - 37649376
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| | | ||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |   |||||||||| | ||||    
T  37649198 gagtaatgatacatagacatctttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacgtggtcacgtgaattccgcacaagcacactttc 37649297  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 226  Q
     |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||  ||||||| ||| ||||    
T  37649298 ccttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 37649376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 48 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 8346488 - 8346327
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||  ||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||    
T  8346488 gagtaatgatacatagtcacctttaggtggcaatacaccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccctgcacaagcacactttc 8346389  T
Q  148 tctttcctctcatc-ttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaa 208  Q
    ||||| ||||| || ||  |||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||    
T  8346388 tcttttctctcctctttttctcttcctaatgcatggagtgtacaaaggtgtatgagaataaa 8346327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 49 - 230
Target Start/End: Original strand, 44453980 - 44454165
Alignment:
Q  49 agttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttct 148  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |  |||| ||||||| |||||| ||||| || || ||||||| | | |||||||| | ||| |    
T  44453980 agttatgatacatagacacctttaagtggcaatacatctcttgatacccacacaaaaatctgacatgtggttacgtggatcccacacaagcacacttttt 44454079  T
Q  149 ctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggat----gtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 230  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    ||| |||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||    
T  44454080 ctttcctctcatcttctctcttcctaatgcatggggtcagagtataagggtgtataagaataaatggtgtttatgtaacattttcc 44454165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 53 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 44548471 - 44548343
Alignment:
Q  53 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 152  Q
    |||||||||||| | | ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  44548471 atgatacatagacatctttaggtggcaatacaccatttgatacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 44548372  T
Q  153 cctctcatcttccctcttcctaatgcatg 181  Q
     ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  44548371 tctctcttcttctctcttcctaatgcatg 44548343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 48 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 50591100 - 50590918
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| || | ||  |||||| |||||||| | | ||||    
T  50591100 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttc 50591001  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 230  Q
    |||||| |||  ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||   | ||||| || |||| ||||||||||||    
T  50591000 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtatctatgtaacattttcc 50590918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 68 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 11152458 - 11152293
Alignment:
Q  68 ccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctctcatcttccct 167  Q
    ||||| ||| |||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||   ||||| ||||||||| ||||| ||    
T  11152458 ccttaggtggcaatacacccttcgacatccacacaaaaatctgacacgtagtcatgtagaccccgcacaagcacgctttctttttcctctcctcttctct 11152359  T
Q  168 cttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttccttt 233  Q
    ||||| | |||||||| |||| |||| ||||| ||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  11152358 cttcccagtgcatggggtgtagaaggatgtatgagaataaatggtgtctatataacattttccttt 11152293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 48 - 232
Target Start/End: Original strand, 47748443 - 47748626
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || | ||  |||| | |||||||| ||| ||||    
T  47748443 gagttatgatacataaatacccttaggtggcaatacaccctt-gacacccatataaaaatctgacatgtggccatatggatcccgcacaagtatactttc 47748541  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcctt 232  Q
    |||||| |||  ||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||   | ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  47748542 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagagtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcctt 47748626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 48 - 208
Target Start/End: Original strand, 7740733 - 7740893
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||||||||||||| || | ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||| |  | ||||||| | |||||  ||||||||    
T  7740733 gagttatgatacattgacaaccttatgtgacaatacatccattgacacctacataaaaatatgacacgtggctatgtggaccccacacaaatatattttc 7740832  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaa 208  Q
    | |||| |||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||| | ||||  ||||||||    
T  7740833 tttttcatctcctcttctctcttcctgttgcatgggatgtacaaagatgtacgagaataaa 7740893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 53 - 226
Target Start/End: Original strand, 26274437 - 26274607
Alignment:
Q  53 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 152  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||| | ||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||| |  ||||||| | | ||| |||||    
T  26274437 atgatacatagacacccttatgtggcaatacatcatttgacatccacagaaaaatctgacacatagtcacgtggatcctgcacaagtacactttttcttt 26274536  T
Q  153 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 226  Q
     |||   ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||  ||||||| ||| ||||    
T  26274537 tctc---tcttctctcttcctaatgcatgagatgcacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 26274607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 48 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 37926538 - 37926356
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||||| | | ||| ||| ||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||| | ||| |||| | || ||||| | | ||||    
T  37926538 gagttatgatacatagatatctttaggtggcaatacatcttttaacacccacataaaaatctgacacgtggccacatggatcccgtacaagtacactttc 37926439  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 230  Q
    ||||| ||||  ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||  |||||||  |||||||  ||| |||||||    
T  37926438 tcttttctcttctcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaaggatgtatgtgaataaatggtgtctatataatattttcc 37926356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 48 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23597191 - 23597011
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| | | ||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||| |||||| || | |||     
T  23597191 gagtaatgatacatagacatcattaggtggcaatacactctttgatacccacataaaaatctgacacgtggccacgttgaccttgcacaaacacacttta 23597092  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatttt 228  Q
    ||||| ||||| | ||| || |||||| | |||| | ||| ||||| ||||| |||||||||  |||||| ||||||||||    
T  23597091 tcttttctctcctattctctattcctagttcatgaggtgtccaaggatgtatgagaataaaaaatgtctatgtaacatttt 23597011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 48 - 230
Target Start/End: Original strand, 6260870 - 6261052
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||| |||  ||||||||| |  |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  6260870 gagttatgatagatagatatccttaggtggtaatacacccctgaacacccacataaaaatctaacatgtggtcacgtggaccccgcataagcacattttc 6260969  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 230  Q
    | |||| |||| ||||| ||||| ||| |  || || ||||||| ||||||| | ||||||  |||| || ||||||||||||    
T  6260970 tatttcttctcctcttctctctttctagtatatagggtgtacaaaggtgtatgaaaataaatggtgtgtatgtaacattttcc 6261052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 48 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 41608593 - 41608411
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||| | | ||||| ||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||| || | ||  |||||| || ||||| | | ||||    
T  41608593 gagttatgatacataaacatccttaggtggcaatacaccccttgacactcacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgtacaagtacactttc 41608494  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 230  Q
    |||||| |||  ||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||   | ||||| |||| || ||||||||||||    
T  41608493 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatagggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtttatgtaacattttcc 41608411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 42 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 3302639 - 3302482
Alignment:
Q  42 atttacgagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcat 141  Q
    ||||| |||| |||||||||| | | ||||| ||||||||| |  | | |||||||||| |||||| ||||||||| |||  |||||| |  |||||||     
T  3302639 atttatgagtaatgatacatatacatccttaggtgacaatatattcctggacacccacacaaaaatctgacacgtaatcatatggaccccatacaagcac 3302540  T
Q  142 attttctctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtat 199  Q
    | ||||| |||| |||||||||| ||||||| |||  || || |||||||||||||||    
T  3302539 actttctttttcatctcatcttctctcttccaaatatatagggtgtacaagggtgtat 3302482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 48 - 232
Target Start/End: Original strand, 26440734 - 26440908
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||||| |||| ||||| | |||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| | ||| |||| | |||| ||||| | ||||    
T  26440734 gagttaggatagatagacatccttagatgacaatacaccctttaacacccacacaaaaatctgacacgtggccacatggatcccgcataagcacactttc 26440833  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcctt 232  Q
    ||||          ||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||   ||| || ||||||||||||||    
T  26440834 tctt----------ttctctcttcgtaatgtatggaatgtacaagggtgtataggaataaaggatgtttatgtaacattttcctt 26440908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 89 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 44332430 - 44332289
Alignment:
Q  89 ttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgta 188  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || | |   |||||| |||||||| ||| |||||||||| |||  ||||| ||||||||||| ||| |  ||||    
T  44332430 ttgacacccacataaaaatctgacatgtggccctatggaccccgcacaagtatactttctctttcttcttctcttctctcttcctaatacatagagtgta 44332331  T
Q  189 caagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 230  Q
    |||||||||||   | ||||| || |||| ||||||||||||    
T  44332330 caagggtgtatgcaattaaaaggtatctatgtaacattttcc 44332289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 120 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 34340075 - 34339968
Alignment:
Q  120 cacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacg 219  Q
    ||||||||||||| | ||||| | ||||| ||| ||||  ||||| ||||||| | ||||| || |||||||| |||| | | ||||||| ||||||| |    
T  34340075 cacgtggacctcgtataagcacagtttcttttttctcttctcttctctcttccaagtgcatagggtgtacaagagtgt-tgaaaataaaaggtgtctatg 34339977  T
Q  220 taacatttt 228  Q
    |||||||||    
T  34339976 taacatttt 34339968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0110 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0110
Description:

Target: scaffold0110; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 48 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8963 - 8779
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||  ||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| | ||||||    
T  8963 gagttatgatatatagacatccttaagtgacaatacactatttgacatctacacaaaaatttgacacatagtcacgtggaccccacacaagtacattttc 8864  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcctt 232  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  8863 tctttcctcccatcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtataagaataaaaggtgtctatgtaacattttcctt 8779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 43)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 53 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 30801828 - 30801648
Alignment:
Q  53 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 152  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||  |||||| | |||||||| |||||||||||    
T  30801828 atgatacatagacacccttaggtgataatacaccctttgatacccacacaaaaatatgacatgtagtcatatggaccccacacaagcacattttctcttt 30801729  T
Q  153 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttccttt 233  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  30801728 cctctcatcttctctcttcctagtacatggggtgtacaagggtgtatgagaataaaaggtgtctatgtaacattttccttt 30801648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 52 - 199
Target Start/End: Original strand, 52629304 - 52629451
Alignment:
Q  52 tatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctt 151  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||    
T  52629304 tatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgtacaagcacactttctctt 52629403  T
Q  152 tcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtat 199  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52629404 ttctctcatcttctctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtat 52629451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 48 - 226
Target Start/End: Original strand, 53982011 - 53982189
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||    
T  53982011 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 53982110  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 226  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||  ||||||| ||| ||||    
T  53982111 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaaggttgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 53982189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 231
Target Start/End: Original strand, 8076392 - 8076576
Alignment:
Q  47 cgagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatatttt 146  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  8076392 cgagtaatgatacataaacacccttaggtggcagtacaccctttgacacccacacaaaaatctaacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacacttt 8076491  T
Q  147 ctctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcct 231  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||  |||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  8076492 ctctttcctctcctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaaaagtgtatgagaataaatggtgtctatgtaacattttcct 8076576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 33118951 - 33118767
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | || || || | ||||    
T  33118951 gagttatgatacatagacacccttaggtgacaatacaccctttgacacccacacaaaaatttgacacgtagtcacgtggatccctcagaaacacactttc 33118852  T
Q  148 tctttcctctcat-cttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcct 231  Q
    ||||||||||| | |||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||||   ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  33118851 tctttcctctcctccttctctctccctagtgcatggggtgtacaagggtgtatggaaataaagggtgtctacgtaacattttcct 33118767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 48 - 226
Target Start/End: Original strand, 33644200 - 33644378
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||    
T  33644200 gagtaatgatacatagacacccttgggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 33644299  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 226  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||  ||||||| ||| ||||    
T  33644300 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtataagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 33644378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 48 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 54868995 - 54868817
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || | ||||    
T  54868995 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtagttacgtggaccccgcacaatcacactttc 54868896  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 226  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||| ||||||| ||| ||||    
T  54868895 tcttttctctcatcttctctcttcctaatgcatagggtgtacaagggtgtatggaaataaaaggtgtctatgtatcatt 54868817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 48 - 226
Target Start/End: Original strand, 17470405 - 17470583
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||    
T  17470405 gagtaatgatacatagacacctttaggtggcaatacaccttttaacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccacacaagcacactttc 17470504  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 226  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||  ||||||| ||| ||||    
T  17470505 tcttttctctcatcttctctcttcctaatgcatgggatgtacaaatatgtatgagaataaatggtgtctatgtatcatt 17470583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 48 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20765015 - 20764830
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||| |||  ||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||| | ||| |||||| || ||||||| | ||||    
T  20765015 gagttatgagacatagacatccttaggtggtaatacactctttaacacccacacaaaaatctgacacgtggccacatggaccccgtacaagcacactttc 20764916  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttccttt 233  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  20764915 tcttttctctcatcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgagaataaatggtgtctatgtaacattttccttt 20764830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 48 - 233
Target Start/End: Original strand, 35536626 - 35536811
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| | ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||  |||||||| | || |    
T  35536626 gagtaatgatacatagacatccttatgtggcaatacaccatttgacacccacataaaaatgtgacacgtggtcatgtggaccttacacaagcacacttcc 35536725  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttccttt 233  Q
    |||||| |||  ||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  35536726 tctttcatcttctcttctctcttcctagtgcatggggtgtagaagggtgtatgagaataaatggtgtctatgtaacattttccttt 35536811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 48 - 226
Target Start/End: Original strand, 49607414 - 49607592
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||| | ||||    
T  49607414 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccacacaagcacactttc 49607513  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 226  Q
    ||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||   |||||||||||||||  |||||||  ||||||| ||| ||||    
T  49607514 tcttttctctcctcttttctcttcctaatgcatgacgtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 49607592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 53 - 196
Target Start/End: Original strand, 31456694 - 31456837
Alignment:
Q  53 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 152  Q
    |||||||||||| |||| || | | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  31456694 atgatacatagacacccataggcggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcatgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 31456793  T
Q  153 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtg 196  Q
     ||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31456794 tctctcctcttttctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtg 31456837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 46 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 51419462 - 51419276
Alignment:
Q  46 acgagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattt 145  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||| | ||| | |||| |||||||||| | ||    
T  51419462 acgagttatgatacatagacatccttagatgacaatacatcctttaacacccacacaaaaatctgacacgtggccacatagaccccgcacaagcacactt 51419363  T
Q  146 tctctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcctt 232  Q
    ||||||| ||||| | ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||   ||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  51419362 tctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatggaaataaaaggtgtttatgtaacattttcctt 51419276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 43 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26141637 - 26141445
Alignment:
Q  43 tttacgagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcata 142  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||| | |||||||| |    
T  26141637 tttatgagttatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatctgacacgtggtcacatggaccccacacaagcaca 26141538  T
Q  143 ttttctctttcctctcatcttc--cctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttccttt 233  Q
     ||||||||| ||||| |||||   |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||   ||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  26141537 ctttctcttttctctcctcttctttctcttcctaatgtatggggtgtacaagagtgtatggaaataaagggtgtctatgtaacattttccttt 26141445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 48 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 41189864 - 41189679
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||| | | ||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||| | ||||    
T  41189864 gagttatgatacatatacatccttaggtggcaatacatcatttgacacccacataaaaatttgacacgtggccacatggaccccgcacaagcacactttc 41189765  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttccttt 233  Q
    ||||| ||||| |||||  ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||   ||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  41189764 tcttttctctcctcttctttcttcctaatgtatggagtgtacaagagtgtatggaaataaagggtgtctatgtaacattttccttt 41189679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 48 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 11348022 - 11347840
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| ||||||  ||| ||||| | ||||    
T  11348022 gagttatgatacatagacatccttaggtgacaatacatcctttgacatccacacaaaaatctgacacgtggccacatggaccctgcataagcacactttc 11347923  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 230  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||  |||||||  ||||||| ||| ||||||||    
T  11347922 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgtatggggtgtataagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtaccattttcc 11347840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 48 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 14623939 - 14623757
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||| |||||||| | ||||    
T  14623939 gagtaatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccccttgacacccacataaaaatctgacatgtgttcatgtggacctcacacaagcacactttc 14623840  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 230  Q
    |||||| |||  ||||| ||||| ||| |||||| | |||| |||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  14623839 tctttcatcttctcttctctctttctagtgcatgaggtgtagaaggatgtatgagaataaatggtgtctatgtaacattttcc 14623757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 51 - 233
Target Start/End: Original strand, 26754698 - 26754880
Alignment:
Q  51 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 150  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  26754698 ttatgattcatagacacccttaggtggcaatacacccttggacatccacacaaaaatctgacatgtggtcacatggaccccgcacaagcacattttctct 26754797  T
Q  151 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttccttt 233  Q
    |||||||| ||||| |||||||||    || || ||||||| |||||||   ||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  26754798 ttcctctcctcttctctcttcctagaatatagggtgtacaaaggtgtatggaaataaagagtgtctatgtaacattttccttt 26754880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 48 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 36707524 - 36707350
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||| | |||    ||| | ||||    
T  36707524 gagtaatgatacatagatacccttaggtgacaatacaccctttgacatccacacaaaaatctgacacgtagttacgtggatcccgc----gcacactttc 36707429  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 226  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||  |||||  |||||||| ||||||| ||| ||||    
T  36707428 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaagaatgtatgggaataaaaggtgtctatgtatcatt 36707350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 48 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 45058652 - 45058469
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||   ||  |||||| |||||||| ||| ||||    
T  45058652 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccctt-gacacccacataaaaatctgacatgtgaccatatggaccccgcacaagtatactttc 45058554  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcctt 232  Q
    |||||| |||  ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||   | ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  45058553 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaatggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcctt 45058469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 48 - 230
Target Start/End: Original strand, 8956762 - 8956944
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| | ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||  |||||||| | || |    
T  8956762 gagtaatgatacatagacatccttatgtggcaatacatcctttgacacccacataaaaatgtgacacgtgttcatgtggaccttacacaagcacacttcc 8956861  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 230  Q
    |||||| |||  ||||| ||||||||| ||||  || |||| |||||||||| ||||||||   |||||| ||||||||||||    
T  8956862 tctttcatcttctcttctctcttcctagtgcacagggtgtagaagggtgtatgagaataaatgctgtctatgtaacattttcc 8956944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 53 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 48587186 - 48587023
Alignment:
Q  53 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 152  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| | | ||||||||     
T  48587186 atgatacatagatacccttaggtggcaatacaccctttgacacctacataaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagtacactttctctt- 48587088  T
Q  153 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 226  Q
             ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||| ||| ||||    
T  48587087 ---------ttctctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtatatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 48587023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 231 - 302
Target Start/End: Original strand, 29555212 - 29555283
Alignment:
Q  231 tttgatggatagtctcatttattgggtttgttctcttggtatttggacaacacgatactgttctattgtatt 302  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29555212 tttgatggatagtttcatttattgggtttgttctcttggtatttggacaacacgatacggttctattgtatt 29555283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 48 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 35965874 - 35965700
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||| | | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||        ||| |  ||||||||| | ||||    
T  35965874 gagtaatgatacatatacatccttaagtgataatacatcctttgacacccacataaaaatctgacacgt--------ggatcctgcacaagcacactttc 35965783  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 230  Q
    ||||||||||| ||||  || ||| |||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  35965782 tctttcctctcctcttttcttttcttaattcatgaggtgtacaagggtgtatgagaataaaaggtgtctatgtaacattttcc 35965700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 51 - 232
Target Start/End: Original strand, 42823114 - 42823295
Alignment:
Q  51 ttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctct 150  Q
    |||||||||||| | ||| ||| |||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||  |||||| |||| ||| ||| |||||||    
T  42823114 ttatgatacataaacaccattatgtggtaatacaccccttgacacccacaaaaaaatttgacatgtggtcatatggaccccgcataagtatactttctct 42823213  T
Q  151 ttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcctt 232  Q
    ||| | |  ||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  42823214 ttcttattctcttctctcttcctaatacatgaggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcctt 42823295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 48 - 208
Target Start/End: Original strand, 9562999 - 9563159
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||| | ||| |||  |||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||| || | ||||    
T  9562999 gagtaatgatacataaacaccattagatgacaatacaacctttgacatccatataaaaatctgacacgtagtcacgtggatcctgcacaaacacactttc 9563098  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaa 208  Q
    ||| | ||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||  |||||||    
T  9563099 tctcttctctcctcttctctcttcctaatgcatgagttgtacaaaggtgtatgggaataaa 9563159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 47 - 233
Target Start/End: Original strand, 47531864 - 47532050
Alignment:
Q  47 cgagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatatttt 146  Q
    |||||||||||||||||| | |||||  || ||||||||| ||| ||| ||||| || ||| |||||||| | ||  || ||| |||||||||| | |||    
T  47531864 cgagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccttttaacatccacacaagaatctgacacgtggccatatgaaccccgcacaagcacacttt 47531963  T
Q  147 ctctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttccttt 233  Q
    |||||| ||||| | ||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||  |||| || |||||||||||||||    
T  47531964 ctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggaatgtacaagtgtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttccttt 47532050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 68 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13898135 - 13897970
Alignment:
Q  68 ccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctctcatcttccct 167  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||| |||||||| | |||||||||| |||  ||||| ||    
T  13898135 ccttaggtggcaatacaccccttgacacccacataaaaatctgacacgtgttcatgtggacctcacacaagcacactttctctttcatcttctcttctct 13898036  T
Q  168 cttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttccttt 233  Q
    || |||| || ||||| |||| ||  |||||| ||||||||  |||||||  ||||||||| ||||    
T  13898035 ctccctagtgtatggggtgtagaaaagtgtatgagaataaatggtgtctatctaacatttttcttt 13897970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 48 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24700054 - 24699870
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| | |||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||  | |||| || | ||||    
T  24700054 gagtaatgatacatagacatccttagttggcaatacaccttttgacacccacataaaaatctggcacgtggccacgtggaccctgtacaaacacactttc 24699955  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttccttt 233  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| |  ||| | |||| || | ||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  24699954 tctttcctctcctcttctctcttcctagtttatgaggtgtataa-gatgtatgagaataaaagatgtctatgtaacattttccttt 24699870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 48 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 27714991 - 27714888
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||    
T  27714991 gagtaatgatacatagacacctttaggtggtaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcatgtggaccccgcacaagcacactttc 27714892  T
Q  148 tctt 151  Q
    ||||    
T  27714891 tctt 27714888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 11095463 - 11095377
Alignment:
Q  38 attaatttacgagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgt 124  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  11095463 attaaattaagagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgt 11095377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 48 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 48375806 - 48375680
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |  | | ||| | |||||| ||||  || ||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  48375806 gagttatgattcatagacacccttaggtgacaatacacccctgaaaatccatacaaaaatctgacgtgtggtcacatggaccccgcacaagcacattttc 48375707  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttccta 174  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  48375706 tctttcctctcctcttctctcttccta 48375680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 48 - 164
Target Start/End: Original strand, 11907371 - 11907487
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |  |||| |||| |||||| ||||| || ||||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  11907371 gagttatgatacatagacacccttaggtgacaatacacacctgaacactcacacaaaaatctgacatgtggtcatatggaccccgcacaagcacattttc 11907470  T
Q  148 tctttcctctcatcttc 164  Q
    ||||| ||||| |||||    
T  11907471 tcttttctctcctcttc 11907487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 56 - 198
Target Start/End: Original strand, 39670019 - 39670161
Alignment:
Q  56 atacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcct 155  Q
    ||||||||| | ||||| ||| ||||| | || |||||| | | |||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||| ||| | || |||||| ||    
T  39670019 atacatagacatccttatgtggcaatatatcccttgacatctatataaaaatttgacacgtgatcatgtggacctcgtacacgcacacttcctcttttct 39670118  T
Q  156 ctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgta 198  Q
    ||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  39670119 ctcctcttctctcttcttaatgtatgagatgtacaagggtgta 39670161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 89 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1758515 - 1758374
Alignment:
Q  89 ttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgta 188  Q
    |||||||||||| |||||| |||||  | || ||||||||  | ||||| || |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  1758515 ttgacacccacacaaaaatctgacatatggttacgtggactccacacaaacacattttctctttcatctcctcttctctcttcctaatgcatggg-tgta 1758417  T
Q  189 caagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttccttt 233  Q
    ||| |||||||  |||||||  |||| || |||||||||| ||||    
T  1758416 caaaggtgtat--gaataaacagtgtttatgtaacatttttcttt 1758374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 78 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 36331399 - 36331278
Alignment:
Q  78 caatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctctcatcttccctcttcctaatg 177  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||| || | ||  |||||| |||||||| | | |||||||||| |||  ||||| |||||||||||     
T  36331399 caatgcaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttctctttcttcttctcttctctcttcctaata 36331300  T
Q  178 catgggatgtacaagggtgtat 199  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  36331299 catggggtgtacaagggtgtat 36331278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 230
Target Start/End: Original strand, 35093585 - 35093767
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||||| |||||||||| | | ||| ||||||||||| | ||||||| ||||  |||||| ||||| || |||| ||| ||  |  ||||||| | ||||    
T  35093585 gagttacgatacatagacaactttaggtgacaatacaacatttgacatccacgcaaaaatctgacatgtggtcatgtgaactccatacaagcacactttc 35093684  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 230  Q
    |||| | |||  | ||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||   |||||| ||||||||||||    
T  35093685 tcttgcatctttttttctctcttcctagtgcatgagatgtacaaaggtgtatgagaataaatgatgtctaggtaacattttcc 35093767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 174
Target Start/End: Original strand, 41080707 - 41080833
Alignment:
Q  46 acgagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattt 145  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||  |||||| ||| | || |||| ||||||| | |||||||| ||||    
T  41080707 acgagtaatgatacatagacatcctta-gtagcaaaacaccctttgacacccacgcaaaaatctgatatgtggtcatgtggacc-cacacaagcacattt 41080804  T
Q  146 tctctttcctctcatcttccctcttccta 174  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  41080805 tctctttcatctcctcttctctcttccta 41080833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 127
Target Start/End: Original strand, 43745766 - 43745825
Alignment:
Q  68 ccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtgga 127  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  43745766 ccttaagtggcaatacactctttgacatccacgtaaaaatttgacacgtcatcacgtgga 43745825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 11095349 - 11095289
Alignment:
Q  166 ctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 226  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||| ||||    
T  11095349 ctcttcctaatgcatcgggtgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtatcatt 11095289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 21746202 - 21746137
Alignment:
Q  134 acaagcatattttctctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtat 199  Q
    ||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||| |||  ||| | |||||||||||||||    
T  21746202 acaagcacactttctctttcatctcatcttctctcttccaaatatatgaggtgtacaagggtgtat 21746137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 233
Target Start/End: Original strand, 43746435 - 43746524
Alignment:
Q  144 tttctctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttccttt 233  Q
    |||||||||| |||| |||||  |||||||| |||||| | ||||||||||||||| | || |||  |||| || |||||||||| ||||    
T  43746435 tttctctttcatctcctcttctttcttcctagtgcatgaggtgtacaagggtgtatgacaacaaagggtgtttatgtaacatttttcttt 43746524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 164
Target Start/End: Original strand, 45320390 - 45320486
Alignment:
Q  68 ccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctctcatcttc 164  Q
    |||||||||||||||||| | || |||| |||| |||||| ||| ||||||| | |||||| || |||||  | ||||||| |||| |||| |||||    
T  45320390 ccttaagtgacaatacactcattaacactcacacaaaaatctgatacgtagttatgtggacttcacacaaatacattttctttttcatctcctcttc 45320486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 37)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 48 - 226
Target Start/End: Original strand, 6034044 - 6034222
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||| | ||||    
T  6034044 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacatgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttc 6034143  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 226  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  6034144 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaaaggtgtctatgtatcatt 6034222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 48 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 48183149 - 48182971
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||    
T  48183149 gagtaatgatacatagacacccttacgtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 48183050  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 226  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||| ||||    
T  48183049 tcttttctctcctcttctctcttcttaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtatcatt 48182971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 48 - 232
Target Start/End: Original strand, 31910192 - 31910376
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||| |||||| |||||||||| | ||||    
T  31910192 gagttatgatacatagacatccttaggtgacaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagccacatggaccccgcacaagcacactttc 31910291  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcctt 232  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  31910292 tcttttctctcatcttctctcttcctaatgtatgggatgtacaagagtgtatgggaataaatggtgtctatgtaacattttcctt 31910376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 48 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 480547 - 480396
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||    
T  480547 gagtaatgatacatagacacccttaggtgacaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgtacaagcacactttc 480448  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtat 199  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  480447 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaaaggtgtat 480396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 226
Target Start/End: Original strand, 41236346 - 41236525
Alignment:
Q  47 cgagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatatttt 146  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  41236346 cgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccttttgacatccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacacttt 41236445  T
Q  147 ctctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 226  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||  ||||||| ||| ||||    
T  41236446 ctcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 41236525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 50052528 - 50052345
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||    
T  50052528 gagtaatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 50052429  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcct 231  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||  | ||||||| |||||||  |||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  50052428 tctttcctctcctcttctctcttcctagtgcataaggtgtacaaaggtgtatgggaataaagggtgtctatgtaacattttcct 50052345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 48 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24995207 - 24995029
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||| || || |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  24995207 gagtaatgatatatggacacccttagatggcaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacattttc 24995108  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 226  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||  ||||||| ||| ||||    
T  24995107 tcttttctctcctcttctctcttcttaatgcatggggtgtacaatggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 24995029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 48 - 233
Target Start/End: Original strand, 29239886 - 29240071
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||    
T  29239886 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccatttgacatccacacaaaaatctaacacgtagtcacgtggaccccacacaagcacactttc 29239985  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttccttt 233  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||  |||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  29239986 tctttcctctcctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaagagtgtatgggaataaagggtgtctatgtaacattttccttt 29240071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 48 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 11511562 - 11511411
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||    
T  11511562 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacataaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 11511463  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtat 199  Q
    ||||| ||||  ||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  11511462 tcttttctcttctcttctctcttcttaatgcatgaggtgtacaagggtgtat 11511411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 48 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 42044467 - 42044316
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||    
T  42044467 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacatccttgtacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 42044368  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtat 199  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42044367 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtat 42044316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 48 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 54473633 - 54473473
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||     
T  54473633 gagtaatgatacatagacacccttaggtgacaatacaccatttgacacccacacaaaaatctaacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacacttta 54473534  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaa 208  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||  |||||||    
T  54473533 tcttttctctcctcttctctcttcctaatacatggagtgtacaagggtgtatgggaataaa 54473473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 50526271 - 50526088
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| | | ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||   ||||||||||   ||||    
T  50526271 gagtaatgatacatagacatctttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtggtcacgtggattccgcacaagcacgctttc 50526172  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcct 231  Q
    | ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||  |||| || |||||||||||||    
T  50526171 tatttcctctcctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaagggtgtatagaaataaagggtgtttatgtaacattttcct 50526088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 86 - 230
Target Start/End: Original strand, 41823920 - 41824064
Alignment:
Q  86 cctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggat 185  Q
    ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| | |    
T  41823920 cctttaacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacatggaccccgcacaagcacactttctcttttctctcttcttctctcttcctaatgcatgaggt 41824019  T
Q  186 gtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 230  Q
    |||||| ||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  41824020 gtacaaaggtgtatgagaataaatggtgtctatgtaacattttcc 41824064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 48 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 29234345 - 29234205
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||| |||  || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||    
T  29234345 gagtaatgatacatagacacccttagatggcaatacaccctttgataccttcacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 29234246  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgta 188  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  29234245 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgta 29234205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 48 - 228
Target Start/End: Original strand, 40574779 - 40574959
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |  || |||| | || ||||||| | ||||    
T  40574779 gagttatgatacatagacatccttaggtggtaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgctgctacatggatcccgaacaagcacactttc 40574878  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatttt 228  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||    
T  40574879 tcttttctctcctcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtatgagaataaaaggtgtctatctaacatttt 40574959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 48 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19670816 - 19670631
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||| || | ||  |||||| |||||||| | | ||||    
T  19670816 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacactcacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttc 19670717  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttccttt 233  Q
    |||||| |||  ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  19670716 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttccttt 19670631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 48 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 48647826 - 48647645
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||| ||||| | | ||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||  |||||||||| | ||||    
T  48647826 gagttatgacacataaacatccttaggtaacaatacacctcttaacacccacataaaaatctaacacgtggtcacgtggactccgcacaagcacaatttc 48647727  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttc 229  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||| | ||||||| ||||||   |||||| |||||||||||    
T  48647726 tctttcctctcctcttctctcttcctagtgcatagaatgtacaaagatgtataaaaataaatgatgtctatgtaacattttc 48647645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 48 - 232
Target Start/End: Original strand, 3481654 - 3481828
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||| | ||||    
T  3481654 gagtaatgatacatagacacctttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccacacaagcacactttc 3481753  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcctt 232  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||          ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  3481754 tctttcctcccatcttctctctttctagtgcat----------agggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcctt 3481828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 48 - 208
Target Start/End: Original strand, 23608235 - 23608395
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||  | |||||||| | ||||    
T  23608235 gagtaatgatatatagacacccttagatgacaatacaccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtgaactccacacaagcacactttc 23608334  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaa 208  Q
    |||||  |||| ||||| |||||||||||||||| | |||||| || |||||  |||||||    
T  23608335 tcttttatctcctcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacagggatgtatgggaataaa 23608395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 48 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 50813992 - 50813810
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||| | || |||| |||  ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| || ||||  || ||| |||||||| | | ||||    
T  50813992 gagttatgatacataaacactcttaggtggtaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggtcatatgaaccccgcacaagtacactttc 50813893  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 230  Q
    |||||| |||  ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  50813892 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatgagatgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 50813810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 48 - 230
Target Start/End: Original strand, 55475191 - 55475373
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||| | | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || | ||  ||||||  ||| ||| | | ||||    
T  55475191 gagttatgatacataaacatccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccctgcataagtacactttc 55475290  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 230  Q
    |||||| |||  ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  55475291 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 55475373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 48 - 233
Target Start/End: Original strand, 47986208 - 47986392
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||| || |||||| ||||| |||||| ||||| || | ||  |||||| |||||||| | | ||||    
T  47986208 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacatcccttgacatccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttc 47986307  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttccttt 233  Q
    |||||| | |  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  47986308 tctttcttattctcttctctcttcctaatacatgggatgtacaagggtgtat-gcaattaaaggtgtctatgtaacattttccttt 47986392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 65 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17983826 - 17983658
Alignment:
Q  65 aacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctctcatcttc 164  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| || | ||  |||||| |||||||| | | |||||||||| |||  |||||    
T  17983826 aacccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttctctttcttcttctcttc 17983727  T
Q  165 cctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttccttt 233  Q
     ||||||||||| |||| | |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  17983726 tctcttcctaatacatgaggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaagtgtctatgtaacatttcccttt 17983658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 41 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 29548066 - 29547876
Alignment:
Q  41 aatttacgagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagca 140  Q
    |||||| ||||||||||||||| | | ||||| ||| ||||||| || |||||||||||| |||||| ||||| || | ||  |||| | |||| ||| |    
T  29548066 aatttaagagttatgatacataaacatccttaggtggcaatacatcccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggatcccgcataagta 29547967  T
Q  141 tattttctctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcct 231  Q
     | ||| |||||| |||  ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  29547966 cactttttctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcct 29547876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 52 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 53352661 - 53352540
Alignment:
Q  52 tatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctt 151  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||  |||| ||||| ||| |||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  53352661 tatgatacatagacacccttaggtg-caatacattctttaacacctacacaaaaatctgacacgtagttaagtggaccccgcacaagcatactttctctt 53352563  T
Q  152 tcctctcatcttccctcttccta 174  Q
    | ||||| ||||| |||||||||    
T  53352562 ttctctcctcttctctcttccta 53352540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 48 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 28480368 - 28480184
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||   || |||| |||| |||||| ||||| ||||||| ||||||| | ||||| || | ||||    
T  28480368 gagttataatacatagacaaccttaggtgacaatacacttcttaacactcacacaaaaatctgacatgtagtcatgtggaccccacacaaacacactttc 28480269  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcctt 232  Q
    || ||| |||| ||||| ||||||||| |||||| | ||||||||| |||||    |||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  28480268 tccttcatctcctcttctctcttcctagtgcatgagttgtacaaggatgtattcttataaagggtgtctatgtaacattttcctt 28480184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 48 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 28481243 - 28481059
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||   || |||| |||| |||||| ||||| ||||||| ||||||| | ||||| || | ||||    
T  28481243 gagttataatacatagacaaccttaggtgacaatacacttcttaacactcacacaaaaatctgacatgtagtcatgtggaccccacacaaacacactttc 28481144  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcctt 232  Q
    || ||| |||| ||||| ||||||||| |||||| | ||||||||| |||||    |||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  28481143 tccttcatctcctcttctctcttcctagtgcatgagttgtacaaggatgtattcttataaagggtgtctatgtaacattttcctt 28481059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 48 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 28482118 - 28481934
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||   || |||| |||| |||||| ||||| ||||||| ||||||| | ||||| || | ||||    
T  28482118 gagttataatacatagacaaccttaggtgacaatacacttcttaacactcacacaaaaatctgacatgtagtcatgtggaccccacacaaacacactttc 28482019  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcctt 232  Q
    || ||| |||| ||||| ||||||||| |||||| | ||||||||| |||||    |||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  28482018 tccttcatctcctcttctctcttcctagtgcatgagttgtacaaggatgtattcttataaagggtgtctatgtaacattttcctt 28481934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 48 - 228
Target Start/End: Original strand, 29977885 - 29978065
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||| | | || || ||| |||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||| | |||||||| | ||||    
T  29977885 gagtaatgatacatacagaaccataggtggcaatacaccccttaacacccacacaaaaatctgacacgtagtcatatggaccccacacaagcacactttc 29977984  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatttt 228  Q
    |||||| |||  ||||  ||||  |||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||  | |||| ||||||||||    
T  29977985 tctttcatcttctcttttctctcactaatgtatggggtgtacaagtgtgtataggaataaaagatatctatgtaacatttt 29978065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 75 - 227
Target Start/End: Original strand, 47104571 - 47104723
Alignment:
Q  75 tgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctctcatcttccctcttccta 174  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||    | |||| | ||||| || | |||||||||| |||| ||||| |||||| ||    
T  47104571 tgacaatacactctctgacacccacacaaaaatttgacacgtggttttattgaccccacacaaacacactttctctttcatctcctcttctctcttctta 47104670  T
Q  175 atgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattt 227  Q
    ||||||| | ||||| ||  ||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  47104671 atgcatgaggtgtactagaatgtacgagaataaaaagtgtctacgtaacattt 47104723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 47 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 8343264 - 8343129
Alignment:
Q  47 cgagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatatttt 146  Q
    |||||||||||||||| | | ||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| || | ||  |||||| |||| ||| ||| |||    
T  8343264 cgagttatgatacataaacatccttaggtggcaatacatcctttgacacctacataaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcataagtatacttt 8343165  T
Q  147 ctctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgg 182  Q
    ||||||| |||  ||||| ||||||||||| |||||    
T  8343164 ctctttcttcttctcttctctcttcctaatacatgg 8343129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 32766958 - 32767141
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||| | || |||| ||| |||||||||| |||||||||| | |||||| ||||| || | ||  ||||||  ||||||| | | ||||    
T  32766958 gagttatgatacataaacactcttaggtggcaatacaccccttgacacccatacaaaaatctgacatgtggccatatggaccctgcacaagtacactttc 32767057  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcct 231  Q
    |||||| |||  || || ||||| ||||| ||| |  |||||||||||||||   | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  32767058 tctttcttcttctcctctctctttctaatacatagagtgtacaagggtgtatgcaattaaaatgtgtctatgtaacattttcct 32767141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 48 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 18924595 - 18924407
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||||||||| |||| | ||||||| ||| |||||||||| |||| | ||||| |||||| ||||| || |  |  || ||  |||||||| | | ||||    
T  18924595 gagttatgatccataaatacccttaggtggcaatacaccccttgatatccacacaaaaatctgacatgtggcaatatgaactccgcacaagtacactttc 18924496  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcctttgat 236  Q
    |||||| |||  ||||| ||||||||||| |||| | |||| ||||||||||   | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  18924495 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatgaggtgtaaaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcctttgat 18924407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 29589810 - 29589655
Alignment:
Q  78 caatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctctcatcttccctcttcctaatg 177  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| ||| | || | ||  |||||| | |||||| | | |||||||||| |||  ||||| |||||||||||     
T  29589810 caatacaccccttgacacccacacaaaaatctgatatgtggccatatggaccccacacaagtacactttctctttcttcttctcttctctcttcctaata 29589711  T
Q  178 catgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttccttt 233  Q
    |||| | |||||||| ||||||   | ||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  29589710 catgaggtgtacaagagtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaatattttccttt 29589655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 44536845 - 44536663
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||| ||| |||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||| || ||||  | |||| | || ||| | | ||||    
T  44536845 gagttatgatacataaacacttttaggtggcaatacaccctt-gacatccacacaaaaatctgacatgtggtcatatagaccccacataagtacactttc 44536747  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcct 231  Q
    |||||| |||  ||||| ||||||||||| ||| || ||||||||  |||||   | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  44536746 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatagggtgtacaagaatgtatgcaattaaaatgtgtctatgtaacattttcct 44536663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 56300169 - 56300086
Alignment:
Q  144 tttctctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattt 227  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||  ||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  56300169 tttctctttcctctcctcttctctctttctaatgtatgagatgtacaagattgtatgagaataaagaatgtctacgtaacattt 56300086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 48 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 55079814 - 55079679
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtgga-cctcgcacaagcatatttt 146  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||  |||||||||| | |||||| ||||| || | ||  |||| || | |||||| | | |||    
T  55079814 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacacctcttgacacccatacaaaaatctgacatgtggccatatggacccccacacaagtacacttt 55079715  T
Q  147 ctctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgg 182  Q
    ||||||| |||  ||||| ||||||||||| |||||    
T  55079714 ctctttcttcttctcttctctcttcctaatacatgg 55079679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 40)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 21234401 - 21234584
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||| ||||||    
T  21234401 gagttatgatacatagacatccttaggtgacaatacaccctttgacactcacacaaaaatttgacacgtagccacatgtaccccgcacaagcacattttc 21234500  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcct 231  Q
    |||| |||||| | | | |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  21234501 tcttacctctcctttcctctcttcctaatgtatggggtgtacaatggtgtatgagaataaaaggtgtctatgtaacattttcct 21234584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 48 - 199
Target Start/End: Original strand, 38267040 - 38267191
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||    
T  38267040 gagtaatgatacatagacacccttatgtgacaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 38267139  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtat 199  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  38267140 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatgggatgtacgaaggtgtat 38267191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 48 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 8080483 - 8080305
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||    
T  8080483 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacctacataaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 8080384  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 226  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||  ||||||| ||| ||||    
T  8080383 tcttttctctcctcttctctcttcctattgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 8080305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 48 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 46033901 - 46033719
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||  |||||||||||||||||    
T  46033901 gagttatgatacatagatattcttaggtggcaatacaccctttaacacccacataaaaatctgacacgtggtcacatgaactccgcacaagcatattttc 46033802  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 230  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  46033801 tcttttctctcctcttctctattcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgagaataaatggtgtctatgtaacattttcc 46033719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 48 - 204
Target Start/End: Original strand, 35137533 - 35137689
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||    
T  35137533 gagtaatgataaatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctaacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacactttc 35137632  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaa 204  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35137633 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtatgagaa 35137689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 48 - 199
Target Start/End: Original strand, 38837217 - 38837368
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||  ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||    
T  38837217 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacacccttgtacacctacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 38837316  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtat 199  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38837317 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtat 38837368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 48 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 4999614 - 4999436
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  || ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| || | ||||    
T  4999614 gagtaatgatacatagacacccttagatggcaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgatacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacactttc 4999515  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 226  Q
    |||||  |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  4999514 tcttttatctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaaaggtgtctatgtatcatt 4999436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 48 - 226
Target Start/End: Original strand, 19329842 - 19330020
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| | ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||    
T  19329842 gagtaatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtaatcacgtggaccccgcacaagcacactttc 19329941  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 226  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||  ||||||| ||| ||||    
T  19329942 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 19330020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 48 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 19436287 - 19436118
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||| | ||||    
T  19436287 gagtaatgatacatagacatccttaggtgacaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcataagcacactttc 19436188  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtcta 217  Q
    ||||| ||||  ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  19436187 tcttttctcttctcttttctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaatggtgtcta 19436118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 48 - 199
Target Start/End: Original strand, 40957707 - 40957858
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||| | ||||    
T  40957707 gagtaatgatacatagacactcttaggtggcaatacactctttgatacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgtacaagcacactttc 40957806  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtat 199  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40957807 tcttttctctcatcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtat 40957858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 34 - 208
Target Start/End: Original strand, 7389375 - 7389548
Alignment:
Q  34 tgttattaatttacgagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgc 133  Q
    |||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  7389375 tgttattattttaagagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgc 7389474  T
Q  134 acaagcatattttctctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaa 208  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||| |  || ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||  |||||||    
T  7389475 acaagcacactttctcttttctctcctactctctcttcctaatacatggggtgtac-agggtgtatgggaataaa 7389548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Original strand, 35522877 - 35523061
Alignment:
Q  49 agttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttct 148  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||| | ||  |||| | |||||||||| | |||||    
T  35522877 agttatgatacatagacatccttaagtggcaatacaccatttaacacccacacaaaaatctgacacgtggccatatggatcccgcacaagcacactttct 35522976  T
Q  149 ctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttccttt 233  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||  |||| || |||||||||||||||    
T  35522977 cttttctctcttcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtttatgtaacattttccttt 35523061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 53 - 192
Target Start/End: Original strand, 3784000 - 3784139
Alignment:
Q  53 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 152  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||    
T  3784000 atgatacatagacacccttaggtggcaatacatcttttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttctcttt 3784099  T
Q  153 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaag 192  Q
     ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  3784100 tctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaag 3784139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 53 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 32951588 - 32951434
Alignment:
Q  53 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 152  Q
    |||||||||||| || ||||  |||||||||| ||||| ||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  32951588 atgatacatagacactcttagatgacaatacatcctttaacatccacacaaaaatctaacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 32951489  T
Q  153 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataa 207  Q
     ||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  32951488 tctctcctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgagaataa 32951434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 48 - 233
Target Start/End: Original strand, 8238212 - 8238398
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaaccct-taagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatatttt 146  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||  |||||| |||||||| | | |||    
T  8238212 gagttatgatacataaacaccctgtaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacatgtagtcatatggaccccgcacaagtacacttt 8238311  T
Q  147 ctctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttccttt 233  Q
    ||||||| |||  ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||   | ||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  8238312 ctctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggcgtctatgtaacattttccttt 8238398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 53 - 199
Target Start/End: Original strand, 3694372 - 3694518
Alignment:
Q  53 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 152  Q
    |||||| ||| | ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||| | |||||||||    
T  3694372 atgatatatacacacccttaggtgacaatacaccttttaacacccacacaaaaatctgacacgtagtcatgtggatcccgcacaagcacactttctcttt 3694471  T
Q  153 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtat 199  Q
     ||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  3694472 tctctcctcttctctcttcccaatgcatggggtgtacaagagtgtat 3694518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 48 - 230
Target Start/End: Original strand, 26296644 - 26296826
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||| |||| | ||  |||||| |||||||||  ||||||    
T  26296644 gagttatgatacatagacatccttaggtgacaatataccctttaacatccacataaaaatctgatacgtggccatatggaccccgcacaagcgcattttc 26296743  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 230  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| ||||| ||| | |||||||||||||||   |||| |  ||||||||||||||||||||    
T  26296744 tcttttctctcctcttctctcttcttaatgtatgaggtgtacaagggtgtatggaaatatatggtgtctacgtaacattttcc 26296826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 48 - 230
Target Start/End: Original strand, 38044197 - 38044379
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||| |||| ||  |||||| |||||||| | | ||||    
T  38044197 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacatccacacaaaaatctgacatgtagccatatggaccccgcacaagtacactttc 38044296  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 230  Q
    |||||| |||  ||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  38044297 tctttcttcttctcttttctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 38044379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 48 - 226
Target Start/End: Original strand, 11044188 - 11044356
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||           ||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||    
T  11044188 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacatcctttgacacccc----------tgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagtacactttc 11044277  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||| | ||||||  ||||||| ||| ||||    
T  11044278 tctttcctctcatcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaaaggtgtatgaaaataaagagtgtctatgtatcatt 11044356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 48 - 230
Target Start/End: Original strand, 22343361 - 22343543
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||   ||  |||||| |||||||| | | ||||    
T  22343361 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtgaccatatggaccccgcacaagtacactttc 22343460  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 230  Q
    |||||| |||  ||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  22343461 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatgaggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 22343543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 48 - 230
Target Start/End: Original strand, 41423682 - 41423864
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||||| | | |||  ||  ||||||||  |||||||  ||| |||||| ||||| || ||||||| || | || ||||||||||||||    
T  41423682 gagttatgatacatagacatcattagatggtaatacacctcttgacacttacacaaaaatctgacatgtggtcacgtagatcccgtacaagcatattttc 41423781  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 230  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||||    
T  41423782 tctttcatctcctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtttatgtaacattttcc 41423864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 48 - 181
Target Start/End: Original strand, 36208173 - 36208306
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||  | |||||||||||| |||||  ||||| || ||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  36208173 gagttatgatacatagacacccttaggtggtaatacattcattgacacccacacaaaaagctgacatgtggtcacgtggaccctgcacaagcacattttc 36208272  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatg 181  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  36208273 tctttcctctcctcttctctcttcctagtgcatg 36208306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 48 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 36362013 - 36361904
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||    
T  36362013 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacatcctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccacacaagcacactttc 36361914  T
Q  148 tctttcctct 157  Q
    ||||| ||||    
T  36361913 tcttttctct 36361904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 48 - 226
Target Start/End: Original strand, 36362026 - 36362192
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| |||  |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||    
T  36362026 gagtaatgatacatagacacccttaggtggtaatacatcctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccacacaagcacactttc 36362125  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 226  Q
    |||||             ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||| ||||    
T  36362126 tcttt------------tctcttcctaatacatgggatgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtatcatt 36362192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 77 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16374895 - 16374743
Alignment:
Q  77 acaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctctcatcttccctcttcctaat 176  Q
    |||||||| || |||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||| |  ||||||||| |||| | ||| |||||||||||    
T  16374895 acaatacatcccttgacatccacacaaaaatctgacacgtggtcacgtggatctcacacaagcacacattctctttcatctctttttctctcttcctaat 16374796  T
Q  177 gcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttc 229  Q
    | ||||  ||||||| ||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  16374795 gtatggagtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttc 16374743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 48 - 228
Target Start/End: Original strand, 41915741 - 41915921
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||| || | ||  |||||| |||||||| | | ||||    
T  41915741 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacacctacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttc 41915840  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatttt 228  Q
    |||||| |||  ||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||||||||||    
T  41915841 tctttcttcttctcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacatttt 41915921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 48 - 226
Target Start/End: Original strand, 3434562 - 3434730
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||    
T  3434562 gagtaatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaaactgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttc 3434661  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 226  Q
    ||||          ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||  ||||||| ||| ||||    
T  3434662 tctt----------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaaggctgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 3434730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 31735884 - 31736060
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||| |||| ||||||||| |||       ||||| | ||| |||| | |||||||||| | ||||    
T  31735884 gagttatgatacatagacatccttaggtggcaatacactctttaacacccacacaaa-------cacgtggccacatggatcccgcacaagcacactttc 31735976  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcct 231  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||| || ||||  ||||||||||||    
T  31735977 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaaaggtatctatctaacattttcct 31736060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 82 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 27744375 - 27744225
Alignment:
Q  82 acaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatg 181  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| ||||| || | |||||||| | | || ||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  27744375 acaccctttgatacccacacaaaaatctgacatgtggccacgtggatccctcataagcacattttctctatcctctcctcttctctcttcctagtgcatg 27744276  T
Q  182 ggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcctt 232  Q
    |||||||||||| | |||  |||||||  |||| ||  |||||||||||||    
T  27744275 ggatgtacaaggatatatgggaataaatggtgtttatataacattttcctt 27744225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 48 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 35468955 - 35468773
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| | |||||  || ||||||| | |||||||||||||||||||| | | | ||   || |||||||  |||||| || | ||||    
T  35468955 gagtaatgatacatagacatccttagatggcaatacatcatttgacacccacataaaaatctaatatgtgaccatgtggaccctgcacaaacacactttc 35468856  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 230  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||| | |||| |||||| |||| ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  35468855 tctttcctatcctcttctctcttcctagttcatgagatgtataaggatgtatgagaataaaaggtgtatatgtaacattttcc 35468773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 48 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 32564526 - 32564341
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||| | |  |||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| || |  |  |||||| |||||||  | | ||||    
T  32564526 gagttatgatacataaacattcttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggctatatggaccccgcacaaatacactttc 32564427  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttccttt 233  Q
    |||||| |||  ||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||   | |||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  32564426 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatgaggtgtacaagggtgtatgcaattaaaatatgtctatgtaacatcttccttt 32564341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 48 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 40846213 - 40846028
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||| | | ||||| ||| |||||||||| |||||| ||||| |||||| | ||| ||||| |  |||||| |||||||  | | ||||    
T  40846213 gagttatgatacataaacatccttaggtggcaatacaccccttgacatccacacaaaaatctaacatgtagttatatggaccccgcacaaatacactttc 40846114  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttccttt 233  Q
    |||||| |||  ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||||   | ||||| || |||| |||||||||||||||    
T  40846113 tctttcttcttctcttctctcttcctaaaagatgagatgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtatctatgtaacattttccttt 40846028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 48 - 228
Target Start/End: Original strand, 7727906 - 7728086
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||  ||||||||  ||||||  ||||||||||| ||||| || ||||  |||||| |||||||| | | ||||    
T  7727906 gagttatgatacataaacacccttaggtggtaatacacctcttgacattcacataaaaatctgacatgtggtcatatggaccccgcacaagtacactttc 7728005  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatttt 228  Q
    | |||| |||  ||||| |||||||||||  ||||| ||||||||| |||||   | ||||| ||||||| ||||||||||    
T  7728006 tgtttcttcttctcttctctcttcctaatatatggggtgtacaaggatgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacatttt 7728086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 48 - 208
Target Start/End: Original strand, 18207180 - 18207339
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||  |||||||||| | |||||| | |||||| | |||||| ||| | |||||||| | ||||    
T  18207180 gagttatgatacatagacaaccttaggtggcaatacacctcttgacacccatacaaaaatctaacacgt-ggcacgtgaaccccacacaagcacactttc 18207278  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaa 208  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||||| || || |  ||||||||||||||| | ||||||    
T  18207279 tctttcatctcctcttctctcttcctagtggatagagtgtacaagggtgtatgataataaa 18207339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 48 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 39256023 - 39255844
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||  |||| ||||| | |||||| |||||||| | |||||||||  | |||||| | | ||||    
T  39256023 gagttatgatacatagacaaccttaggtggcaatacaccacttgatacccatacaaaaatctgacacgt-ggcacgtggactccacacaagaacactttc 39255925  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatttt 228  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||   || || | |||||||||||||||| | ||||||  ||||||| ||||||||||    
T  39255924 tctttcatctcctcttctctcttcccggtggatagaatgtacaagggtgtatgataataaagggtgtctatgtaacatttt 39255844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 89 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 2318302 - 2318160
Alignment:
Q  89 ttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctctcatcttccctct-tc-ctaatgcatgggatg 186  Q
    |||||||||||| |||||| ||||  || ||||||||||||   || ||||||| |||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||  ||    
T  2318302 ttgacacccacacaaaaatctgacgtgtggtcacgtggacccgacataagcatactttctctttcatctcatcttctctctctctctaatgcatggagtg 2318203  T
Q  187 tacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttc 229  Q
    ||||| |||||||   |||||| |||||||| |||||||||||    
T  2318202 tacaaaggtgtatggaaataaagtgtgtctatgtaacattttc 2318160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 46 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 46374904 - 46374810
Alignment:
Q  46 acgagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagca 140  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| | ||| |||||| ||||||||||    
T  46374904 acgagttatgatacatagacatccttaggtggcaacacaccctttaacacccacacaaaaatctgacacgtggccacatggaccccgcacaagca 46374810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 46374806 - 46374741
Alignment:
Q  166 ctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcct 231  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  46374806 ctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtaacattttcct 46374741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 229
Target Start/End: Original strand, 32045880 - 32046018
Alignment:
Q  91 gacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtaca 190  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  ||  | |||| |  || |||||| ||||| |||| |||||||||| ||||| | |||  ||| ||||||||    
T  32045880 gacacccacataaaaatctgacacgtaaccatatagaccccatactagcatactttctttttcatctcatcttctctctttcaaatatatgagatgtaca 32045979  T
Q  191 agggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttc 229  Q
    |||||||||   ||||||   |||||| |||||||||||    
T  32045980 agggtgtatgtaaataaagaatgtctatgtaacattttc 32046018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 36361907 - 36361847
Alignment:
Q  166 ctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 226  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||| ||||    
T  36361907 ctcttcctaatacatggaatgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtatcatt 36361847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 29)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 43 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 33149743 - 33149560
Alignment:
Q  43 tttacgagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcata 142  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |    
T  33149743 tttatgagtaatgatacatagacacccttaggtggtaatacaccctttgacacccacacaaaaatttgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcaca 33149644  T
Q  143 ttttctctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 226  Q
     ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||  ||||||| ||| ||||    
T  33149643 ctttctcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtacgagaataaagggtgtctatgtatcatt 33149560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 48 - 226
Target Start/End: Original strand, 2740274 - 2740452
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||    
T  2740274 gagtaatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttc 2740373  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 226  Q
    ||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||| ||| ||||    
T  2740374 tcttttctctccccttctctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 2740452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 53 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18520979 - 18520806
Alignment:
Q  53 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 152  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  18520979 atgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 18520880  T
Q  153 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 226  Q
      |||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||  ||||||| ||| ||||    
T  18520879 tatctcctcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaagggtgtatgaaaataaagggtgtctatgtatcatt 18520806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 48 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 35943992 - 35943812
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| | | |||||||| | ||||    
T  35943992 gagttatgatacatagacacccttaggtggcaatacatcatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagttacgtggatcccacacaagcacactttc 35943893  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatttt 228  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||    
T  35943892 tctttcctctcctcttttctcttcctagtgcatggggtgtacaagggtgtatggaaataaaatgtgtctatgtaacatttt 35943812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 48 - 226
Target Start/End: Original strand, 35785199 - 35785377
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| || | ||||    
T  35785199 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtagttacgtggatcccgcacaatcacactttc 35785298  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 226  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||| ||||||| ||| ||||    
T  35785299 tcttttctctcatcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatggaaataaaaggtgtctatgtatcatt 35785377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 48 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 36733042 - 36732873
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||    
T  36733042 gagtaatgatacatagacacccttaggtagcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 36732943  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtcta 217  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||  |||||||    
T  36732942 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtcta 36732873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 55 - 217
Target Start/End: Original strand, 13811659 - 13811821
Alignment:
Q  55 gatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcc 154  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||  |    
T  13811659 gatacatagacacccttaggtggcaatacatcatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttctc 13811758  T
Q  155 tctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtcta 217  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||  |||||||    
T  13811759 tctcctcttctctcttcctaatgcatgggatgtacaaggatgtatgggaataaatggtgtcta 13811821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 48 - 226
Target Start/End: Original strand, 14831814 - 14831992
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||    
T  14831814 gagtaatgatacatagacactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacataaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttc 14831913  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 226  Q
    | |||  |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||  ||||||| ||| ||||    
T  14831914 ttttttttctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaaggatgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 14831992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 48 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15409710 - 15409528
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||| | | ||    
T  15409710 gagttatgatacatagacatccttaggtgacaatacattctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagccacatggaccccgcacaagcacactctc 15409611  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 230  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||  |||| || ||||||||||||    
T  15409610 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgcgaataaagggtgtttatgtaacattttcc 15409528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 48 - 226
Target Start/End: Original strand, 40145407 - 40145585
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||    
T  40145407 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttaacatccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 40145506  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 226  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| | | ||||||||||| ||| ||||||||  ||||||| ||| ||||    
T  40145507 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcacgaggtgtacaagggtatatgagaataaagggtgtctatgtatcatt 40145585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Original strand, 31008988 - 31009171
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||  |||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||    
T  31008988 gagttatgatacataaacatccttaggtgacaatacattcttccacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttc 31009087  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcct 231  Q
    | ||||||||  ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  31009088 tatttcctcttctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcct 31009171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 48 - 229
Target Start/End: Original strand, 6679698 - 6679879
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||||| | | ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||| || ||||||    
T  6679698 gagttatgatacatagacatctttaggtggcaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtggtcacatggaccccgcacaaacacattttc 6679797  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttc 229  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||   |||||| |||||||||||    
T  6679798 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgtatagggtgtacaagggtgtatgacaataaatgatgtctatgtaacattttc 6679879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 48 - 183
Target Start/End: Original strand, 28177775 - 28177910
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||| || | ||||    
T  28177775 gagttatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtggtcacatggaccccgcacaaacacactttc 28177874  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatggg 183  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  28177875 tcttttctctcctcttccctcttcctaatgtatggg 28177910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 48 - 232
Target Start/End: Original strand, 26720516 - 26720700
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||| | ||| |||| | |||||||||| | ||||    
T  26720516 gagttatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttaacacctacaaaaaaatctgacacgtggccacatggatcccgcacaagcacactttc 26720615  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcctt 232  Q
    ||||| ||||  ||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||   ||||||  |||||||||||||    
T  26720616 tcttttctcttctcttctctcttcctaatgtatggggtgtactagggtgtatgagaataaatgatgtctatataacattttcctt 26720700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 48 - 232
Target Start/End: Original strand, 26990265 - 26990449
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||| | ||| |||| | |||||||||| | ||||    
T  26990265 gagttatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttaacacctacaaaaaaatctgacacgtggccacatggatcccgcacaagcacactttc 26990364  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcctt 232  Q
    ||||| ||||  ||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||   ||||||  |||||||||||||    
T  26990365 tcttttctcttctcttctctcttcctaatgtatggggtgtactagggtgtatgagaataaatgatgtctatataacattttcctt 26990449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 120 - 232
Target Start/End: Original strand, 2177436 - 2177548
Alignment:
Q  120 cacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacg 219  Q
    |||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |    
T  2177436 cacgtggatcccacacaagcacattttctctttcctctcctcttctctcttcctagtgcattggatgtacaagggtgtatgagaataaaatgtgtctctg 2177535  T
Q  220 taacattttcctt 232  Q
    |||||||||||||    
T  2177536 taacattttcctt 2177548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 48 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 3921365 - 3921181
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| || | ||  |||||| |||||||| | | ||||    
T  3921365 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttc 3921266  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcctt 232  Q
    |||||| |||  ||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  3921265 tctttcttcttctcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcctt 3921181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2252268 - 2252085
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||| | | ||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| || | ||  |||||| |||||||| | | ||||    
T  2252268 gagttatgatacataaacatccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttc 2252169  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcct 231  Q
    |||||| |||  ||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  2252168 tctttcttcttctcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcct 2252085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 48 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 6260101 - 6259916
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||| | | || || ||||||||||||||||| ||||||||  |||||| | |||| | ||||| |||||||| || ||||| | ||||    
T  6260101 gagtaatgatacatacacaaccataggtgacaatacaccctttaacacccacgcaaaaatctaacacatggtcacatggacctcacagaagcacactttc 6260002  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttccttt 233  Q
    |||||| |||| ||||| ||||  |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||   | |||| |||||||||||||||    
T  6260001 tctttcatctcctcttctctctcactaatgtatgggatgtacaagtgtgtataggaataaaggatatctatgtaacattttccttt 6259916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 75 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20073589 - 20073433
Alignment:
Q  75 tgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctctcatcttccctcttccta 174  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||   ||||||||||  ||||||||| | ||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  20073589 tgacaatacaccctttgacactcacataaaaatcttgcacgtgaccacgtggaccctgcacaagcacactttctatttcctctcctcttctctcttccta 20073490  T
Q  175 atgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcct 231  Q
     | |||| ||| ||||| ||||||| |||||||||  ||||||  ||||||||||||    
T  20073489 gttcatgagatttacaaaggtgtatgagaataaaaaatgtctatctaacattttcct 20073433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 48 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 42414402 - 42414275
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| |||  || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||     
T  42414402 gagtaatgatacatagacaccagtaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcatgtggaccccgcacaagcacacttta 42414303  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaa 175  Q
    ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  42414302 tcttttctttcctcttctctcttcctaa 42414275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 43 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 39689002 - 39688814
Alignment:
Q  43 tttacgagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcata 142  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||| ||| | || ||||  || ||| |||| ||| | |    
T  39689002 tttaagagttatgatacataaacacccttaagtggcaatacatcccttgacacccacacaaaaatctgatatgtggtcatatgaaccccgcataagtaca 39688903  T
Q  143 ttttctctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcct 231  Q
     |||||||||| |||  ||||| ||||||||||| ||| || ||||||| |||||||   | ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  39688902 ctttctctttcttcttttcttctctcttcctaatacatagggtgtacaaaggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcct 39688814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 53 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 36875698 - 36875564
Alignment:
Q  53 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 152  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||         ||||||||||| | |||||||||| | |||||||||    
T  36875698 atgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaat---------agtcacgtggatcccgcacaagcacactttctcttt 36875608  T
Q  153 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtg 196  Q
      |||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  36875607 tttctcctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtg 36875564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 48 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 33825424 - 33825243
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| ||||| |||||| |  |||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||| ||||  |||||||| | ||||    
T  33825424 gagtaatgatgcatagacattcttaggtggcaatacactccttgacacccacataaaaatctgacacgtgttcatgtgaaccttacacaagcacactttc 33825325  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttc 229  Q
    |||||  |||  ||||| ||||||||| |||||||| |||| |||| ||||| ||||||||  ||||| | |||||||||||    
T  33825324 tcttttatcttctcttctctcttcctagtgcatggggtgtagaaggctgtatgagaataaatggtgtcaatgtaacattttc 33825243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 92 - 230
Target Start/End: Original strand, 21370048 - 21370186
Alignment:
Q  92 acacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaa 191  Q
    ||||||||  |||||| ||||| || |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||| |  ||  |||||||||    
T  21370048 acacccactcaaaaatctgacatgtggtcacgtggaccccgcacaaacacattttctctttcctctcatcttctttcttcctagtatataagatgtacaa 21370147  T
Q  192 gggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 230  Q
     ||||||| | ||||||  |||| || ||||||||||||    
T  21370148 aggtgtatgaaaataaagggtgtttatgtaacattttcc 21370186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 48 - 228
Target Start/End: Original strand, 9603813 - 9603993
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||| | | ||||| |||| ||||||| | || ||||| ||| |||||| |||||| | ||||  |||||| |  |||| || | ||||    
T  9603813 gagtaatgatacatatacatccttaggtgataatacactcattcacacctacacaaaaatctgacacatggtcatatggaccccatacaatcacactttc 9603912  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatttt 228  Q
    |||||| | || ||||| |||||| || ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  9603913 tctttcatttcgtcttctctcttcttagtgcttgggatgtacaaaggtgtatgagaataaatggtgtctacgtaacatttt 9603993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 41470508 - 41470425
Alignment:
Q  56 atacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagc 139  Q
    ||||||||| ||| ||| ||| ||||||| ||||| | |  || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41470508 atacatagacacctttaggtggcaatacatcctttaaaattcatataaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagc 41470425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 158
Target Start/End: Original strand, 31132392 - 31132454
Alignment:
Q  96 ccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctctc 158  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  31132392 ccacacaaaaatctgacaagtagtcacgtggaccccgcacaagcatactttttcttttctctc 31132454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 153
Target Start/End: Original strand, 16327921 - 16328006
Alignment:
Q  68 ccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttc 153  Q
    ||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||| ||||| |||||||| | ||| ||||||    
T  16327921 ccttaggtggcaatacatccattgacacccacataaaaatctgacacgtgttcatgtgcacctcacacaagcacactttttctttc 16328006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 22)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 55 - 226
Target Start/End: Original strand, 32869685 - 32869856
Alignment:
Q  55 gatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcc 154  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |    
T  32869685 gatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttttc 32869784  T
Q  155 tctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 226  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||  ||||||| ||| ||||    
T  32869785 tctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaaggatgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 32869856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 53 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 22880753 - 22880598
Alignment:
Q  53 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 152  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  22880753 atgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaattctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 22880654  T
Q  153 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaa 208  Q
     ||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  22880653 tctctcctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgggaataaa 22880598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 48 - 226
Target Start/End: Original strand, 17598554 - 17598732
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||    
T  17598554 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacatcttttgacacccacacaaaaatctgacacgttgtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 17598653  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 226  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||| ||||||| ||| ||||    
T  17598654 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatggaaataaaaggtgtctatgtatcatt 17598732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 48 - 230
Target Start/End: Original strand, 31976248 - 31976430
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||| || ||| |||||||||| | ||||    
T  31976248 gagttatgatacatagacatccttaggtggcaatataccctttaacacccacacaaaaatctgacacgtggtcacatgaaccccgcacaagcacactttc 31976347  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 230  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  31976348 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgagaataaatggtgtctatgtaacattttcc 31976430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 48 - 226
Target Start/End: Original strand, 11427616 - 11427796
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaaccct--taagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattt 145  Q
    |||| |||||||||||| |||||  || ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||    
T  11427616 gagtaatgatacatagacaccctcttaggtggcaatacatcctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactt 11427715  T
Q  146 tctctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 226  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||| ||||    
T  11427716 tctcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtatcatt 11427796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 48 - 226
Target Start/End: Original strand, 15832577 - 15832755
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||  | ||||||    
T  15832577 gagtaatgatacatagacacctttaggtgacaataaatcatttgacacccacacaaaaatttgacacgtagtcacgtggatcctgcacaaatacattttc 15832676  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 226  Q
    |||||  |||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||  ||||||||||| ||||    
T  15832677 tcttttttctcctcttctatcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtattggaataaagggtgtctacgtatcatt 15832755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 53 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 23128222 - 23128076
Alignment:
Q  53 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 152  Q
    |||||| ||||| ||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||| | |||||||||    
T  23128222 atgatatatagacacctttatgtgataatacatcctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccacacaagcacactttctcttt 23128123  T
Q  153 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtat 199  Q
     ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23128122 tctctcctcttttctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtat 23128076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 48 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 6209565 - 6209422
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||  |||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||    
T  6209565 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacactatttgacactcacacaaaaatctgtcacgtagtcacgtggaccccgcactagcacactttc 6209466  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaa 191  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6209465 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatgggatgtacaa 6209422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 48 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 31953130 - 31952945
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||| ||||| | ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||| ||||| || | ||||    
T  31953130 gagtaatgatagatagacatccttaggtggcaatacaccccttgacacccacataaaaatctgacatgtgttcatgtggacctcacacaaacacactttc 31953031  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttccttt 233  Q
    |||||| |||  ||||| ||||||||| |||||||| |||| |||| ||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  31953030 tctttcatcttctcttctctcttcctagtgcatggggtgtagaaggatgtatgagaataaatggtgtctatgtaacattttccttt 31952945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 48 - 226
Target Start/End: Original strand, 29857827 - 29858005
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||  || ||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| | |||| ||||| | ||||    
T  29857827 gagtaatgatacatagacacctttagatggcaatacaccttttaacacccacacaaaaatctgacacgtagttacgtggatcccgcataagcacactttc 29857926  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 226  Q
    ||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||  ||||||| ||| ||||    
T  29857927 tcttttctcttctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 29858005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 48 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 30341460 - 30341277
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| || | ||  |||||| |||||||| | | ||||    
T  30341460 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttc 30341361  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcct 231  Q
    |||||| |||  ||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  30341360 tctttcttcttctcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcct 30341277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 48 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15990142 - 15989960
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| || | ||  |||||| |||||||| | | ||||    
T  15990142 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttc 15990043  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 230  Q
    |||||| |||  ||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  15990042 tctttcttcttctcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 15989960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 48 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15508124 - 15507939
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| || | ||  |||||| |||||||| | | ||||    
T  15508124 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttc 15508025  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttccttt 233  Q
    |||||| |||  ||||| |||||||||||  ||||| ||||||||| |||||   | ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  15508024 tctttcttcttctcttctctcttcctaatatatggggtgtacaaggatgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttccttt 15507939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 60 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 31109488 - 31109351
Alignment:
Q  60 atagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctctca 159  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||| | | ||||||||| |||||     
T  31109488 atagacacccttaggtggcaatacaccctttgacatccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtagaccccgcaaaagtacactttctcttttctctcc 31109389  T
Q  160 tcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgt 197  Q
    ||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  31109388 tcttttctcttcctaatgcatggggtatacaagggtgt 31109351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 48 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 31110859 - 31110679
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||  ||| ||||||  ||||||||| | ||||    
T  31110859 gagttatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttgacactcaca--aaaatctgacacgtaaccacatggaccctgcacaagcacactttc 31110762  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 230  Q
    ||||| ||||  ||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||   ||||||   |||||| ||||||||||||    
T  31110761 tcttttctctactcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaaaggtgtatggaaataaaggatgtctatgtaacattttcc 31110679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 48 - 230
Target Start/End: Original strand, 4231548 - 4231730
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||||||||| |||| | | | ||| ||| |||||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||| | ||  |||||| |||||||| | | ||||    
T  4231548 gagttatgattcataaacatcattaggtggcaatacaccccttgccacccacacaaaaatctgacacgtggccatatggaccccgcacaagtacactttc 4231647  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 230  Q
    |||||| |||  ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  4231648 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 4231730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 55 - 215
Target Start/End: Original strand, 946383 - 946543
Alignment:
Q  55 gatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcc 154  Q
    |||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||| ||  |||||| |||||| |||||||||  | | ||| | |||| | ||||||||| |    
T  946383 gatacatagacatccttaggtgataatacaccctttgacacctacccaaaaatctgacacctagtcacgtaaatcccgctctagcacactttctcttttc 946482  T
Q  155 tctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtc 215  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||| | ||||||| |||||    
T  946483 tctcctcttctctcttcctaatgcatgagatgtacaagaatgtatgacaataaaaagtgtc 946543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 53 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 28536581 - 28536428
Alignment:
Q  53 atgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctcttt 152  Q
    |||||||||| | | ||||| ||| ||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||  |||| ||||||| | |||||||| | |||||||||    
T  28536581 atgatacataaacatccttaggtggcaatacaacccttgacacccacacaaaaatctgacacg--gtcatgtggaccccacacaagcacactttctcttt 28536484  T
Q  153 cctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaa 208  Q
      |||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  28536483 tatcttctcttccctcttcctactgcatggggtgtacaagggtgtatgaaaataaa 28536428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 52 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 9379808 - 9379680
Alignment:
Q  52 tatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctt 151  Q
    ||||||||||||| | |||||  |||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||| | || ||||| ||| ||||| || ||||||||||    
T  9379808 tatgatacatagacatccttagatgacaatacatcccttgacacccatacaaaaatttgacacgtggccatgtggatctcacacaaacacattttctctt 9379709  T
Q  152 tcctctcatcttccctcttcctaatgcat 180  Q
    || |||  ||||  |||||||||||||||    
T  9379708 tcatcttctcttttctcttcctaatgcat 9379680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 92 - 217
Target Start/End: Original strand, 30870058 - 30870183
Alignment:
Q  92 acacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaa 191  Q
    ||||||| |||||||| | ||| || ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |  || || |||||||    
T  30870058 acacccatataaaaatctaacatgtggtcacatggaccccgcacaagcacattttctctttcctctcctcttctctctttctagtatatagggtgtacaa 30870157  T
Q  192 gggtgtataagaataaaatgtgtcta 217  Q
     ||||||| | ||||||  |||||||    
T  30870158 aggtgtatgaaaataaagggtgtcta 30870183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 48 - 170
Target Start/End: Original strand, 12732482 - 12732604
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| |  |||||||| ||||| |  | |||||||||||| |||||| |||||||| |  | ||||| | | || ||||| ||||||    
T  12732482 gagtaatgatacatagacattcttaagtggcaatataatcattgacacccacacaaaaatctgacacgtggctatgtggatcccacataagcacattttc 12732581  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctctt 170  Q
    |||||| |||| ||||| |||||    
T  12732582 tctttcatctcctcttctctctt 12732604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22422042 - 22421997
Alignment:
Q  185 tgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttcc 230  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  22422042 tgtacaagggtgtatgagaataaatggtgtctatgtaacattttcc 22421997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0321 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0321
Description:

Target: scaffold0321; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 48 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 10209 - 10058
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||    
T  10209 gagttatgatacatagacacctttaggtggcaatacatcctttgacatccacataaaaatctgacacgtagtcacgtggaccgcgtacaagcacactttc 10110  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtat 199  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  10109 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatagggtgtacaagggtgtat 10058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1268 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold1268
Description:

Target: scaffold1268; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 48 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 1029 - 848
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| | | ||| ||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||||||||||| | | |||||||||| | ||||    
T  1029 gagtaatgatacatagacatctttaggtggcaatacaccctttaacatccacacaaaaaactgacacgtagtcacgtgaatcccgcacaagcacactttc 930  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttc 229  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||  |||||||  |||| || |||||||||||    
T  929 tctttcctctcctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaagagtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttc 848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1267 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold1267
Description:

Target: scaffold1267; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 48 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 1029 - 848
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| | | ||| ||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||  ||||||||||||||||| | | |||||||||| | ||||    
T  1029 gagtaatgatacatagacatctttaggtggcaatacaccctttaacatccacacaaaaaactgacacgtagtcacgtgaatcccgcacaagcacactttc 930  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttc 229  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||  |||||||  |||| || |||||||||||    
T  929 tctttcctctcctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaagagtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttc 848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 48 - 226
Target Start/End: Original strand, 4029 - 4207
Alignment:
Q  48 gagttatgatacatagaaacccttaagtgacaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttc 147  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||  || ||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| | |||| ||||| | ||||    
T  4029 gagtaatgatacatagacacctttagatggcaatacaccttttaacacccacacaaaaatctgacacgtagttacgtggatcccgcataagcacactttc 4128  T
Q  148 tctttcctctcatcttccctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacatt 226  Q
    ||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||  ||||||| ||| ||||    
T  4129 tcttttctcttctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 4207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 78 - 229
Target Start/End: Original strand, 152528 - 152679
Alignment:
Q  78 caatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctctcatcttccctcttcctaatg 177  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| || ||||  |||| | |||||||  | | |||||||||| |||  ||||| ||||| |||||     
T  152528 caatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggtcatatggatcccgcacaaatacactttctctttcttcttctcttctctctttctaata 152627  T
Q  178 catgggatgtacaagggtgtataagaataaaatgtgtctacgtaacattttc 229  Q
    ||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||| |||||||||||    
T  152628 catgggatgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttc 152679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0316 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0316
Description:

Target: scaffold0316; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 157
Target Start/End: Original strand, 17084 - 17163
Alignment:
Q  78 caatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggacctcgcacaagcatattttctctttcctct 157  Q
    ||||||| || | |||| ||||| |||||| ||||| || ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  17084 caatacatccctcgacatccacacaaaaatctgacatgtggtcacatggaccccgcacaagcacattttctctttcctct 17163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University