View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8760_high_6 (Length: 391)

Name: NF8760_high_6
Description: NF8760
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8760_high_6
NF8760_high_6
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (18-386)||(33965-34333)
[»] chr8 (19 HSPs)
chr8 (18-386)||(32377445-32377813)
chr8 (18-386)||(32431402-32431770)
chr8 (18-386)||(7341235-7341603)
chr8 (18-386)||(8422393-8422761)
chr8 (18-378)||(30304147-30304507)
chr8 (18-378)||(35965282-35965642)
chr8 (18-378)||(43370931-43371291)
chr8 (18-374)||(2145536-2145897)
chr8 (41-378)||(43688731-43689068)
chr8 (20-378)||(7169064-7169413)
chr8 (35-376)||(45455542-45455883)
chr8 (18-309)||(22581061-22581352)
chr8 (206-378)||(1115936-1116108)
chr8 (225-378)||(39751772-39751925)
chr8 (47-207)||(45116582-45116742)
chr8 (46-207)||(44321173-44321334)
chr8 (67-241)||(14401359-14401532)
chr8 (96-212)||(17316787-17316903)
chr8 (103-186)||(13781580-13781663)
[»] chr7 (22 HSPs)
chr7 (18-386)||(43622672-43623040)
chr7 (18-386)||(30787695-30788063)
chr7 (18-386)||(45764535-45764903)
chr7 (18-386)||(617286-617654)
chr7 (18-378)||(18106552-18106912)
chr7 (18-378)||(42500571-42500931)
chr7 (18-378)||(47062047-47062407)
chr7 (18-269)||(15067162-15067413)
chr7 (18-378)||(43827143-43827503)
chr7 (122-378)||(8400750-8401006)
chr7 (265-378)||(15060777-15060890)
chr7 (20-150)||(12116908-12117038)
chr7 (47-207)||(1297321-1297481)
chr7 (48-232)||(16795663-16795847)
chr7 (46-207)||(40445130-40445291)
chr7 (47-207)||(47867065-47867225)
chr7 (47-207)||(16794179-16794339)
chr7 (47-207)||(43378874-43379034)
chr7 (47-207)||(40794258-40794418)
chr7 (47-207)||(45172475-45172635)
chr7 (63-207)||(46791660-46791804)
chr7 (47-220)||(8193845-8194019)
[»] chr2 (27 HSPs)
chr2 (18-386)||(211978-212346)
chr2 (18-386)||(5348323-5348691)
chr2 (18-386)||(41561168-41561536)
chr2 (18-386)||(10622991-10623359)
chr2 (18-378)||(27274897-27275257)
chr2 (18-380)||(38946925-38947287)
chr2 (18-378)||(39795134-39795494)
chr2 (18-378)||(3802103-3802463)
chr2 (18-378)||(24750822-24751183)
chr2 (20-378)||(24604628-24604986)
chr2 (18-378)||(1098363-1098723)
chr2 (18-376)||(45476524-45476881)
chr2 (18-378)||(12907029-12907389)
chr2 (18-378)||(43948819-43949179)
chr2 (20-378)||(34920321-34920679)
chr2 (18-378)||(436475-436836)
chr2 (21-378)||(41007520-41007877)
chr2 (18-378)||(9655320-9655679)
chr2 (18-293)||(7264229-7264504)
chr2 (18-378)||(11692367-11692712)
chr2 (23-378)||(17996714-17997069)
chr2 (128-378)||(28354549-28354799)
chr2 (20-185)||(24941189-24941354)
chr2 (68-232)||(28423061-28423225)
chr2 (47-224)||(21535507-21535678)
chr2 (94-185)||(3353894-3353985)
chr2 (340-378)||(7264196-7264234)
[»] chr1 (31 HSPs)
chr1 (18-386)||(3946998-3947366)
chr1 (18-386)||(3984269-3984637)
chr1 (18-386)||(44466738-44467106)
chr1 (18-386)||(20350612-20350980)
chr1 (18-386)||(38774652-38775020)
chr1 (18-378)||(29355225-29355585)
chr1 (18-378)||(5079099-5079459)
chr1 (18-378)||(13630580-13630940)
chr1 (18-378)||(41455001-41455361)
chr1 (18-378)||(12649116-12649476)
chr1 (18-378)||(37016078-37016438)
chr1 (18-378)||(50116300-50116660)
chr1 (18-378)||(38691476-38691836)
chr1 (18-378)||(46974328-46974688)
chr1 (20-378)||(13174945-13175303)
chr1 (18-378)||(51663422-51663782)
chr1 (94-378)||(21942977-21943261)
chr1 (18-295)||(19498001-19498277)
chr1 (18-371)||(32106191-32106533)
chr1 (283-378)||(44619905-44620000)
chr1 (217-371)||(26466006-26466160)
chr1 (47-207)||(36360086-36360246)
chr1 (47-207)||(45472687-45472847)
chr1 (47-207)||(7403953-7404115)
chr1 (51-207)||(28863225-28863381)
chr1 (47-180)||(27283402-27283535)
chr1 (47-207)||(18887360-18887520)
chr1 (337-378)||(7980068-7980109)
chr1 (47-180)||(20240037-20240170)
chr1 (189-286)||(25231558-25231655)
chr1 (92-205)||(31445866-31445979)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (18-378)||(2045-2405)
[»] chr6 (10 HSPs)
chr6 (18-386)||(1611288-1611656)
chr6 (18-378)||(31147486-31147846)
chr6 (18-303)||(28357557-28357842)
chr6 (18-378)||(29287490-29287845)
chr6 (18-378)||(18607160-18607520)
chr6 (18-378)||(21357887-21358244)
chr6 (18-378)||(23961869-23962226)
chr6 (304-378)||(28251060-28251134)
chr6 (47-207)||(9095463-9095623)
chr6 (302-378)||(24220332-24220408)
[»] chr4 (22 HSPs)
chr4 (18-378)||(19072194-19072554)
chr4 (30-386)||(49565013-49565369)
chr4 (18-378)||(9891186-9891546)
chr4 (18-378)||(3404954-3405314)
chr4 (18-378)||(41024363-41024723)
chr4 (18-378)||(4769298-4769658)
chr4 (18-378)||(38463374-38463734)
chr4 (19-378)||(4976919-4977278)
chr4 (18-378)||(44049774-44050134)
chr4 (18-378)||(11502670-11503030)
chr4 (18-378)||(4978495-4978851)
chr4 (20-378)||(21471958-21472316)
chr4 (194-378)||(51643211-51643395)
chr4 (18-345)||(6182875-6183202)
chr4 (267-378)||(18580117-18580225)
chr4 (48-207)||(32716628-32716787)
chr4 (47-180)||(4617919-4618052)
chr4 (47-207)||(1591168-1591328)
chr4 (47-207)||(17916521-17916681)
chr4 (46-172)||(17496893-17497019)
chr4 (47-207)||(46517000-46517160)
chr4 (47-224)||(13897349-13897526)
[»] chr3 (29 HSPs)
chr3 (18-386)||(3949899-3950267)
chr3 (18-378)||(6742051-6742411)
chr3 (19-386)||(8159521-8159888)
chr3 (18-386)||(30946179-30946547)
chr3 (18-378)||(13746258-13746618)
chr3 (18-378)||(16445784-16446144)
chr3 (18-378)||(36816053-36816413)
chr3 (35-378)||(14399719-14400063)
chr3 (18-376)||(46991783-46992141)
chr3 (18-378)||(48249403-48249764)
chr3 (18-378)||(7841553-7841912)
chr3 (18-376)||(77557-77915)
chr3 (18-378)||(6504492-6504852)
chr3 (18-378)||(21954776-21955135)
chr3 (18-378)||(7838760-7839120)
chr3 (158-378)||(9428510-9428730)
chr3 (18-334)||(29949193-29949508)
chr3 (18-334)||(29998347-29998662)
chr3 (87-334)||(29908027-29908273)
chr3 (17-183)||(28610455-28610621)
chr3 (48-200)||(9556331-9556483)
chr3 (46-207)||(51548098-51548259)
chr3 (47-207)||(2284623-2284783)
chr3 (47-207)||(4120360-4120520)
chr3 (47-207)||(33940190-33940350)
chr3 (47-207)||(40467774-40467934)
chr3 (47-207)||(12491422-12491582)
chr3 (330-378)||(29930532-29930580)
chr3 (330-378)||(29979686-29979734)
[»] chr5 (21 HSPs)
chr5 (18-378)||(37819414-37819774)
chr5 (18-378)||(11031989-11032349)
chr5 (18-378)||(38858727-38859087)
chr5 (19-378)||(28884946-28885305)
chr5 (20-378)||(7020419-7020777)
chr5 (18-378)||(34078944-34079304)
chr5 (18-378)||(27866382-27866742)
chr5 (18-378)||(1036515-1036875)
chr5 (18-378)||(7799543-7799903)
chr5 (18-378)||(18536873-18537233)
chr5 (18-378)||(4202476-4202836)
chr5 (18-378)||(13566644-13566988)
chr5 (18-378)||(25895634-25895998)
chr5 (18-371)||(20287439-20287793)
chr5 (140-371)||(20286180-20286410)
chr5 (47-207)||(11819551-11819711)
chr5 (47-207)||(27013235-27013395)
chr5 (47-207)||(42343826-42343985)
chr5 (47-207)||(6553124-6553284)
chr5 (47-207)||(43295549-43295709)
chr5 (127-232)||(25053043-25053148)
[»] scaffold0341 (1 HSPs)
scaffold0341 (18-378)||(15894-16254)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (18-378)||(17233-17593)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (225-378)||(12426-12580)
[»] scaffold0201 (1 HSPs)
scaffold0201 (21-138)||(25486-25603)
[»] scaffold0340 (1 HSPs)
scaffold0340 (35-131)||(4-100)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (47-207)||(28452-28612)
[»] scaffold0325 (1 HSPs)
scaffold0325 (63-180)||(4198-4315)


Alignment Details
Target: scaffold0101 (Bit Score: 361; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 34333 - 33965
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34333 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 34234  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34233 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 34134  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34133 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 34034  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctgcttct 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34033 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 33965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 361; Significance: 0; HSPs: 19)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 386
Target Start/End: Original strand, 32377445 - 32377813
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32377445 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 32377544  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32377545 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 32377644  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32377645 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 32377744  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctgcttct 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32377745 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 32377813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 386
Target Start/End: Original strand, 32431402 - 32431770
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32431402 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 32431501  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32431502 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 32431601  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32431602 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 32431701  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctgcttct 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32431702 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 32431770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 7341603 - 7341235
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7341603 cccaagcaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 7341504  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7341503 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 7341404  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7341403 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 7341304  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctgcttct 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7341303 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 7341235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 386
Target Start/End: Original strand, 8422393 - 8422761
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8422393 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 8422492  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8422493 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatataatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 8422592  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8422593 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 8422692  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctgcttct 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8422693 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 8422761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Original strand, 30304147 - 30304507
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30304147 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 30304246  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30304247 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 30304346  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30304347 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 30304446  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30304447 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 30304507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Original strand, 35965282 - 35965642
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  35965282 cccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaatcgaatatgtcaaatcggtcgaagggaccccaactacctcaaatattggcat 35965381  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35965382 cctgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttca 35965481  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    |  ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35965482 actgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttg 35965581  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35965582 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 35965642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 43371291 - 43370931
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||    
T  43371291 cccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacgttgacat 43371192  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  43371191 cctgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcg 43371092  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  43371091 attgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagctgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgtcagctctatttg 43370992  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43370991 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 43370931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 18 - 374
Target Start/End: Original strand, 2145536 - 2145897
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2145536 cccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcat 2145635  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||     
T  2145636 cctgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacgaatgttggatgagcccaaaagatatcttcg 2145735  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccc-----t 312  Q
    || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |     |    
T  2145736 attgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacaacttcttgtcacctctattat 2145835  T
Q  313 atttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 374  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2145836 atttgccttccatatttgttgatgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 2145897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 41 - 378
Target Start/End: Original strand, 43688731 - 43689068
Alignment:
Q  41 tcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacg 140  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |    
T  43688731 tcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcttgtacatgttggttttgtagg 43688830  T
Q  141 tggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgt 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||||| ||  || ||||||||  ||||||    
T  43688831 tggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggattttggatgagcccaaaagatatcttcgattatagtactttcactttgtgt 43688930  T
Q  241 tcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttca 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43688931 tcttgagtaataagtatagttgtgctcccccaacttcgaaattagaaattgcaacggcttcttatcacctctatttgccttccatatttgttgacgttca 43689030  T
Q  341 ttgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43689031 ttgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 43689068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 20 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 7169413 - 7169064
Alignment:
Q  20 caaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcc 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||     
T  7169413 caaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcaaagtgaccctaactacctcaaacattggcatct 7169314  T
Q  120 tatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaat 219  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  7169313 tgtacatgttggttttgtaggtggagttcataaccaaaatcgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgat 7169214  T
Q  220 agtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgcc 319  Q
     ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||         |||| |||||||||    
T  7169213 tgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcatccaactttgagattatatattgcaacg---------cacctctatttgcc 7169123  T
Q  320 ttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7169122 ttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatggaatgtggtct 7169064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 35 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 45455883 - 45455542
Alignment:
Q  35 tctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtct 134  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  45455883 tctttctcatgtgtcacaaattcaaacccaaccaaatatgtcaaatcgatcgaagtgatcccaactacctcaaacattggcatcctgtacatgttggttt 45455784  T
Q  135 tgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaag 234  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||  || ||  ||||||||      
T  45455783 tgttggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaaattttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaaaatatatttgattgtggtactttcact 45455684  T
Q  235 ttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttga 334  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  45455683 ttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggctttttgtcacctctatttgcctttcatatttgttga 45455584  T
Q  335 cgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggt 376  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45455583 cgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatatggt 45455542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 22581352 - 22581061
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  22581352 cccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcgcaaatccaaacccaaccaaatatgtcaaatcggtcaaagtgaccccaactacctcaaacattgacat 22581253  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    | | ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||| |||     
T  22581252 cttgtacatgttggttttgcaggtggagtccataaccaaaaccgttagaaaattgttaaacaacttaacagatgttggatgagcccaaaagatattttcg 22581153  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacc 309  Q
    || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  22581152 attgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggattcttgtcacc 22581061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 206 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 1116108 - 1115936
Alignment:
Q  206 aaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgt 305  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1116108 aaaacatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgt 1116009  T
Q  306 cacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1116008 cacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacatttgtttcacatttgtcatgcaatgtggtct 1115936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 225 - 378
Target Start/End: Original strand, 39751772 - 39751925
Alignment:
Q  225 tactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttcca 324  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  39751772 tactttcactttgtgttcttgagtaataagtgaagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaatggtttcttgtcacctctatttgccttcca 39751871  T
Q  325 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39751872 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 39751925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 45116742 - 45116582
Alignment:
Q  47 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 146  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||| || || |||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  45116742 gtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtaactccaactatttcaaacaatggcattctatacaagttggttttgtacgtggaat 45116643  T
Q  147 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 207  Q
    |||| | |||||| || ||||||||||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  45116642 ccattatcaaaacagtcggaaaattgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 45116582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 46 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 44321334 - 44321173
Alignment:
Q  46 tgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggag 145  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||| || || |||||||  ||||||| |  ||| ||||||| |||||| |||||||||||     
T  44321334 tgtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtaactccaactatttcaaacaataacattctatacaagttggttttgtacgtggaa 44321235  T
Q  146 tccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 207  Q
    ||||| | |||||| || | |||| |||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  44321234 tccattatcaaaacagtcgaaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 44321173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 67 - 241
Target Start/End: Original strand, 14401359 - 14401532
Alignment:
Q  67 cgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttgga 166  Q
    ||||||||||  ||| ||||| || |||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||| || || ||| |||| || | ||||||  | | |    
T  14401359 cgaatatgtcatatcagttgaggtgaccccaactatctcaaacaatgacatcctatacgtgttggttttataggtgaagtcgatgaacaaaactatcgaa 14401458  T
Q  167 aaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgtt 241  Q
    ||||| |||||||| ||||  |||   |||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||  |||||||    
T  14401459 aaattattaaacaacttaacagattcaggatgagcccaaaatatatcatgaatagta-tactttcacattgtgtt 14401532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 17316903 - 17316787
Alignment:
Q  96 caactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttgg 195  Q
    |||||| |||||||| ||||||| | |||| |||||| ||||| ||| | | ||| | |||||| || ||||||||||||||||| ||||  |||  |||    
T  17316903 caactatctcaaacaatggcatcatgtacaagttggttttgtatgtgaaattcatgatcaaaacagtcggaaaattgttaaacaacttaaatgattgtgg 17316804  T
Q  196 atgagcccaaaaaatat 212  Q
     ||||| ||||||||||    
T  17316803 gtgagctcaaaaaatat 17316787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 103 - 186
Target Start/End: Original strand, 13781580 - 13781663
Alignment:
Q  103 ctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaat 186  Q
    ||||||||  ||||| | ||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||| |||| | |||||||||    
T  13781580 ctcaaacaacggcattcgatagatgttggttttgtaagtggagtccatgaccaaaacggtcggaaaagtgttgagcaatttaat 13781663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 361; Significance: 0; HSPs: 22)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 386
Target Start/End: Original strand, 43622672 - 43623040
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43622672 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 43622771  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43622772 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 43622871  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43622872 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 43622971  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctgcttct 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43622972 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 43623040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 30788063 - 30787695
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30788063 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 30787964  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30787963 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 30787864  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30787863 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 30787764  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctgcttct 386  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  30787763 ctttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtatctggttct 30787695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 45764903 - 45764535
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45764903 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 45764804  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45764803 cctatacatgctggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 45764704  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45764703 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 45764604  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctgcttct 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45764603 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcgcatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 45764535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 386
Target Start/End: Original strand, 617286 - 617654
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  617286 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 617385  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  617386 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaatcgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 617485  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  617486 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggtttcttgtcacccctatttg 617585  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctgcttct 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  617586 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 617654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 18106912 - 18106552
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18106912 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattagcat 18106813  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18106812 cctatacatgttggttttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 18106713  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18106712 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 18106613  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18106612 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 18106552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 42500931 - 42500571
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42500931 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 42500832  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42500831 cctatacatgttggttttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 42500732  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42500731 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 42500632  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42500631 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 42500571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 47062407 - 47062047
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  47062407 cccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcat 47062308  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    | | ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  47062307 cttgtacattttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaattttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccgaaagatatcttca 47062208  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtc-acccctattt 316  Q
    || ||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  47062207 attgtagtactttcactttgtgtt-ttgagtaataagtatagttgtgctcttccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcaacctctattt 47062109  T
Q  317 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47062108 gccttccatatttgttgacgttcatcgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 47062047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 18 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 15067413 - 15067162
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15067413 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccaaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 15067314  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15067313 cctatacatgttggttttgtatgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 15067214  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcct 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15067213 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcct 15067162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Original strand, 43827143 - 43827503
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaa-gtcaccccaactacctcaaacattggca 116  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  43827143 cccaaacaaagtttttatctttctcatatgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaaagtgacccaaactacctcaaacattggca 43827242  T
Q  117 tcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttc 216  Q
    || | |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  43827243 tcttgtacacgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccattggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatattttc 43827342  T
Q  217 aatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctattt 316  Q
    ||| ||| ||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43827343 aattgtagtactttcactttgtgttcttgtgaaataagtatagttgtgctcattcaacttcgaga-tagatattgcaacggcttcttgtcacctctattt 43827441  T
Q  317 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  43827442 gccttccatatttgctgacgttcattgtacacttgcttgatatttgtcatgcaatgtggtct 43827503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 122 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 8401006 - 8400750
Alignment:
Q  122 tacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatag 221  Q
    ||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  8401006 tacatgttggttttgtaggtgaaatccataaccaaaaccgttagaaaattgttaaacaacttaacagatgttggatgagcccaaaaaatatctttaattg 8400907  T
Q  222 tattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgcctt 321  Q
    || ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  8400906 tagtactttcactttgtgttcttgagaaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgccgtcttgtcacctctatttgcctt 8400807  T
Q  322 ccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  8400806 ccatatttgttgacgttcaatgtacacttgcttgatatttgtcatccaatgtggtct 8400750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 265 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 15060890 - 15060777
Alignment:
Q  265 ctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtc 364  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15060890 ctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtc 15060791  T
Q  365 atgcaatgtggtct 378  Q
    ||||||||||||||    
T  15060790 atgcaatgtggtct 15060777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 150
Target Start/End: Original strand, 12116908 - 12117038
Alignment:
Q  20 caaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcc 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  12116908 caaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggccgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatct 12117007  T
Q  120 tatacatgttggtcttgtacgtggagtccat 150  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  12117008 tgtacatgttggttttgtaggtggagtccat 12117038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 1297481 - 1297321
Alignment:
Q  47 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 146  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||  | |||||||  ||||| | |||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  1297481 gtcataaatgaaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtggctccaactatttcaaaaaatggcattctatacaagttggttttgtacgtggaat 1297382  T
Q  147 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 207  Q
    |||| | |||||| ||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||| ||||||    
T  1297381 ccattatcaaaacagttggaaaaatgttaaacaactttatcgatgttggatgagtccaaaa 1297321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 48 - 232
Target Start/End: Original strand, 16795663 - 16795847
Alignment:
Q  48 tcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtc 147  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| |   ||||||  ||||||| ||||||| | |||| ||| || |||||| |||| ||    
T  16795663 tcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaagtgagttcaactatttcaaacaatggcatcatgtacaagtttgttttgtacatggaatc 16795762  T
Q  148 cataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttca 232  Q
    ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||| |  |||| || ||| |||||||||    
T  16795763 cattatcaaaacagttggaaaattgttaaacaattttaccgatgttggatgagtccaaaataagtcttgaacagttttactttca 16795847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 46 - 207
Target Start/End: Original strand, 40445130 - 40445291
Alignment:
Q  46 tgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggag 145  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||| || || |||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||| ||||     
T  40445130 tgtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatggcattctatacaagttggttttgtacatggaa 40445229  T
Q  146 tccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 207  Q
    ||||| | |||||| ||  ||||| |||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  40445230 tccattatcaaaacagtcagaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 40445291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 47 - 207
Target Start/End: Original strand, 47867065 - 47867225
Alignment:
Q  47 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 146  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||| || || |||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||| | |||||||||||||    
T  47867065 gtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatggcattctatacaagttgattttgtacgtggagt 47867164  T
Q  147 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 207  Q
    |||| | |||| | ||  ||||| |||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  47867165 ccattatcaaagcagtcagaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 47867225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 207
Target Start/End: Original strand, 16794179 - 16794339
Alignment:
Q  47 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 146  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||| |||||| || || |||||||  ||||||| ||||||| | |||| ||| || ||||||||||| |    
T  16794179 gtcataaatgaaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatggcatcatgtacaagtttgttttgtacgtggaat 16794278  T
Q  147 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 207  Q
    |||| | |||||| || ||||||||||||||||| || |  |||||| |||||| ||||||    
T  16794279 ccattatcaaaacagtcggaaaattgttaaacaactttactgatgtttgatgagtccaaaa 16794339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 207
Target Start/End: Original strand, 43378874 - 43379034
Alignment:
Q  47 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 146  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||| ||| ||| || || || |||||||  ||||||| | | |||||||||| |||||| ||||| ||||| |    
T  43378874 gtcataaatgcaaaatcaaccgaatatgtcaaataggtcgaggtgactccaactatttcaaacaatagaatcctatacaagttggttttgtatgtggaat 43378973  T
Q  147 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 207  Q
    |||| | |||||| || ||||||||||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  43378974 ccattatcaaaacagtcggaaaattgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 43379034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 40794418 - 40794258
Alignment:
Q  47 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 146  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||| || || |||||||  | ||||| |||||| ||||||| |||| | ||||||||||| |    
T  40794418 gtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttaaaacaatggcattctatacaagttgattttgtacgtggaat 40794319  T
Q  147 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 207  Q
    ||||   |||||  || |||||| |||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  40794318 ccattctcaaaatagtcggaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 40794258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 47 - 207
Target Start/End: Original strand, 45172475 - 45172635
Alignment:
Q  47 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 146  Q
    ||||||||| ||||  |||| ||||||||| ||| ||| ||||| || | |||||  ||||| | |||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  45172475 gtcataaatgcaaaatcaactgaatatgtcaaataggtcgaagtgactcaaactatttcaaataatggcattctatacaagttggttttgtacgtggaat 45172574  T
Q  147 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 207  Q
    | || | |||||| || |||||| |||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  45172575 caattatcaaaacagtcggaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 45172635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 63 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 46791804 - 46791660
Alignment:
Q  63 caaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgt 162  Q
    |||||||||||||| ||| ||| || || || |||||||  ||||||| |||||| ||||||| ||| || ||||||||||| ||||| | |||||| ||    
T  46791804 caaccgaatatgtcaaataggtcgaggtgactccaactatttcaaacaatggcattctatacaagttagttttgtacgtggaatccattatcaaaacagt 46791705  T
Q  163 tggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 207  Q
     |||||| ||||||| || || |  ||||||||||||| ||||||    
T  46791704 cggaaaagtgttaaataactttactgatgttggatgagtccaaaa 46791660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 220
Target Start/End: Original strand, 8193845 - 8194019
Alignment:
Q  47 gtcataaat-ccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggag 145  Q
    ||||||||| || |||| |||||||||||||  ||  ||||| || || | |||||  ||||||| ||||||| | |||| |||||| |||||||||||     
T  8193845 gtcataaatgcctaaccaaaccgaatatgtcatattagttgaggtgactctaactatttcaaacaatggcatcatgtacaagttggttttgtacgtggaa 8193944  T
Q  146 tccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaata 220  Q
    | ||| | |||||| || |||||||| |||||||| || |   |||||||||||| |||||| || |||| ||||    
T  8193945 tgcattatcaaaacagtcggaaaattattaaacaactttaccaatgttggatgagtccaaaatatgtcttgaata 8194019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 361; Significance: 0; HSPs: 27)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 386
Target Start/End: Original strand, 211978 - 212346
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  211978 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 212077  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  212078 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 212177  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  212178 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 212277  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctgcttct 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  212278 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 212346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 5348691 - 5348323
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5348691 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 5348592  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5348591 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 5348492  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5348491 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 5348392  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctgcttct 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5348391 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 5348323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 41561536 - 41561168
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41561536 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 41561437  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41561436 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 41561337  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41561336 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 41561237  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctgcttct 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41561236 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 41561168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 386
Target Start/End: Original strand, 10622991 - 10623359
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10622991 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 10623090  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10623091 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttagatgagcccaaaaaatatcttca 10623190  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10623191 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 10623290  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctgcttct 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10623291 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 10623359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Original strand, 27274897 - 27275257
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27274897 cccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 27274996  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27274997 cctatacatgttggttttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 27275096  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27275097 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 27275196  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27275197 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 27275257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 38947287 - 38946925
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38947287 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 38947188  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38947187 cttatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 38947088  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38947087 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggtttcttgtcacccctatttg 38946988  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctct 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38946987 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgaaatgtggtctct 38946925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 39795494 - 39795134
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39795494 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 39795395  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39795394 cctatacatgttggttttgtacgtcgagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 39795295  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39795294 atagtattactatcaagttgtgttcttgagtaataagtatacttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 39795195  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39795194 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 39795134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Original strand, 3802103 - 3802463
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaa-cattggca 116  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  3802103 cccaaacaaaattttcctctttctcatgtgtcataaatccaaacccaactgaatatgtcaagtcggttgaagtcaccc-aactacctcaaaacattggca 3802201  T
Q  117 tcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttc 216  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3802202 tcctatacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggaagttggatgagcccaaaaaatatcttc 3802301  T
Q  217 aatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctattt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3802302 aatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctccttcaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctattt 3802401  T
Q  317 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3802402 gccttccatatttgttgaagttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 3802463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 24751183 - 24750822
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24751183 cccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcat 24751084  T
Q  118 cctata-catgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttc 216  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  24751083 cctataacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaagatatcttt 24750984  T
Q  217 aatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctattt 316  Q
     || ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24750983 gatcgtattactttcactttgtattcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctattt 24750884  T
Q  317 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24750883 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 24750822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 20 - 378
Target Start/End: Original strand, 24604628 - 24604986
Alignment:
Q  20 caaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcc 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24604628 caaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcgatcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcc 24604727  T
Q  120 tatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaat 219  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||  ||    
T  24604728 tgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacagatgttggatgagcccaaaagatatctttgat 24604827  T
Q  220 agtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgcc 319  Q
     ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  24604828 tgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttgtc 24604927  T
Q  320 ttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24604928 ttccctatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 24604986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Original strand, 1098363 - 1098723
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  1098363 cccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatctaaacccaaccgattatgtcaaatcggtcgatgtgaccccaactacctcaaacattggcat 1098462  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    | | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  1098463 catgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcg 1098562  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
     | ||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1098563 gttgtagtactttcactttgtgttcttgaataataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttg 1098662  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1098663 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 1098723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 18 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 45476881 - 45476524
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45476881 cccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaaccaaaccgaatatgtcagatcgtttgaagtgaccccaactacctcaaacattggcat 45476782  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    | | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||     
T  45476781 cttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacagatgttggatgagcccaaaagatatcttcg 45476682  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45476681 attgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttg 45476582  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggt 376  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45476581 ccttccata-ttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggt 45476524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Original strand, 12907029 - 12907389
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12907029 cccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaaccaaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcat 12907128  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    | | ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||| |||     
T  12907129 cttgtacatgttggttttgtaggtgaagtccataaccaaatccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagtccaaaagatattttcg 12907228  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12907229 attgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgaaatttgaaattgcaacggcttcttgtcacctctatttg 12907328  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12907329 ccttccatatttgttgactttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 12907389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Original strand, 43948819 - 43949179
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43948819 cccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaattcaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtagaagtgaccccaactacctcaaacattggcat 43948918  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    | | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  43948919 cttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcg 43949018  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  ||||||    
T  43949019 attgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctctaacttcgagattagataacgcaacggcttcttgtcacctatatttg 43949118  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43949119 tcttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 43949179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 20 - 378
Target Start/End: Original strand, 34920321 - 34920679
Alignment:
Q  20 caaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcc 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  34920321 caaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatatcaaatcggtcaaagtgaccccaactacctcaaacattggcatct 34920420  T
Q  120 tatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaat 219  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  34920421 tgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaatattgttaaacaacttaacagatgttggatgagcccaaaagatatcttcgat 34920520  T
Q  220 agtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgcc 319  Q
     ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34920521 tgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtataagtgtgctcctccaacttcgaaattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttgcc 34920620  T
Q  320 ttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34920621 ttccatatttgttgaatttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 34920679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 436836 - 436475
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaac-attggca 116  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  436836 cccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaacggaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaaccattggca 436737  T
Q  117 tcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttc 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||| |||||||     
T  436736 tcctgtacatgttggttttgtaggtggagtccataatcaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaaaagatgttagatgagcccaaaagatatctta 436637  T
Q  217 aatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctattt 316  Q
     || ||| ||||||||   ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  436636 gattgtagtactttcactatgtgttcttgaataataagtatagatgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctattt 436537  T
Q  317 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  436536 gccttccatatttgttgacgttcattgtacaattgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 436475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 21 - 378
Target Start/End: Original strand, 41007520 - 41007877
Alignment:
Q  21 aaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcct 120  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41007520 aaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatcgaaacccaaccgaatatatcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcct 41007619  T
Q  121 atacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaata 220  Q
     |||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||     
T  41007620 gtacatgttagttttgtaggtggagtccataatcaaaaccgttgagaaattgttaaacaacttaacagatgttggatgagcccaaaagatatcttcgatt 41007719  T
Q  221 gtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgcct 320  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41007720 gtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttgcct 41007819  T
Q  321 tccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41007820 tacatatttgttgacgttcattttagacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 41007877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 9655679 - 9655320
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  9655679 cccaaacaaagttttcct-tttctcatgtgttacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaaatgaccccaactacctcaaacattggcat 9655581  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    | | ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  9655580 catgtacatgttggttttgtaggtggagtccataatcaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcg 9655481  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  9655480 attgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataaatatagttgtgctccttcaacttcgacattagatattgcaacgacttcttgtcacctctatttg 9655381  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  9655380 ccttccatatttgttgatgttcattgtacacttacttcacatttttcatgcaatgtggtct 9655320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 18 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 7264504 - 7264229
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7264504 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacatcaaacattggcat 7264405  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7264404 cctatacatgttaattttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtttaactacttaatggatgttggatgagcctaaaaaatatcttca 7264305  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgca 293  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7264304 atggtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgca 7264229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Original strand, 11692367 - 11692712
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  11692367 cccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaactgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattggcat 11692466  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    |               ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||     
T  11692467 c---------------ttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattcttaaacaacttaacggatgttggatgggcccaaaatatatcttct 11692551  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    || ||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  11692552 attgtagtaatttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaatttcgagattaaatattgcaacggcttcttgtcaactctatttg 11692651  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11692652 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 11692712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 23 - 378
Target Start/End: Original strand, 17996714 - 17997069
Alignment:
Q  23 acaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctat 122  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||| | |    
T  17996714 acaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaagccaaccaaatatgtcaaatcggtcgaggtgaccccaactatctcaaacattggcatcttgt 17996813  T
Q  123 acatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagt 222  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  17996814 acatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccattggaatattgttaaacaacgtaacggatgttggatgagcctaaaagatatcttcaatagt 17996913  T
Q  223 attactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttc 322  Q
    | ||||||||  ||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||  | |||||||||| ||||||| ||||    
T  17996914 agtactttcactttgtgttcttgagaaataaacacagttgtgctcctccaactttgagattagaaactacaacatcgtcttgtcacctctatttgacttc 17997013  T
Q  323 catatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||| ||||    
T  17997014 catatttgttgacgttcattgtatacttgcttgatatttggcatgcaatgttgtct 17997069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 128 - 378
Target Start/End: Original strand, 28354549 - 28354799
Alignment:
Q  128 ttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattac 227  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||    
T  28354549 ttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtac 28354648  T
Q  228 tttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatat 327  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  28354649 tttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgtcacctatatttgacttccatat 28354748  T
Q  328 ttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28354749 ttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgaaatgtggtct 28354799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 185
Target Start/End: Original strand, 24941189 - 24941354
Alignment:
Q  20 caaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcc 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24941189 caaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcgatcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcc 24941288  T
Q  120 tatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaa 185  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24941289 tgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaa 24941354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 68 - 232
Target Start/End: Original strand, 28423061 - 28423225
Alignment:
Q  68 gaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaa 167  Q
    |||||||||  ||||||||| || || |||||||  ||||||| ||||||| | |||| |||||| |||||||||||  |||| | |||||| || || |    
T  28423061 gaatatgtcacatcggttgaggtgactccaactatttcaaacaatggcatcatgtacaagttggttttgtacgtggaacccattatcaaaacagtcggga 28423160  T
Q  168 aattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttca 232  Q
    ||||||||||||| || |  ||||||||||||| |||||| || |||| |||||| | |||||||    
T  28423161 aattgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaatatgtcttgaatagtttgactttca 28423225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 47 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21535678 - 21535507
Alignment:
Q  47 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 146  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||||  ||| ||||| || |||||||||| |||||| | ||||||| | ||||||||||| || |      |||    
T  21535678 gtcatatatgcaaaaccaaccgaatatgtcatatcagttgaggtgaccccaactatctcaaatagtggcatcatgtacatgttggttttat------agt 21535585  T
Q  147 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtat 224  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||  |||   |||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  21535584 ccataaccaaaactgttggaaaattgttaaccaacctaactgattgaggatgagcccaaaatatgtcttgaatagtat 21535507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 185
Target Start/End: Original strand, 3353894 - 3353985
Alignment:
Q  94 cccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaa 185  Q
    |||||||| |||||||| |  |||||| ||||||||||| || || ||||||||||| | |||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  3353894 cccaactatctcaaacaataacatcctgtacatgttggttttataggtggagtccatgatcaaaacagtcgaaaaattgttaaacaatttaa 3353985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 7264234 - 7264196
Alignment:
Q  340 attgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7264234 attgcacacttgcttcacaattgtcatgcaatgtggtct 7264196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 361; Significance: 0; HSPs: 31)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 386
Target Start/End: Original strand, 3946998 - 3947366
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3946998 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 3947097  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3947098 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 3947197  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3947198 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 3947297  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctgcttct 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3947298 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 3947366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 3984637 - 3984269
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3984637 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 3984538  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3984537 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 3984438  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3984437 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 3984338  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctgcttct 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3984337 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 3984269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 44467106 - 44466738
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44467106 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 44467007  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44467006 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 44466907  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44466906 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 44466807  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctgcttct 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44466806 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 44466738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 20350980 - 20350612
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20350980 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccaaactacctcaaacattggcat 20350881  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20350880 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 20350781  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20350780 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 20350681  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctgcttct 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20350680 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 20350612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 386
Target Start/End: Original strand, 38774652 - 38775020
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38774652 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaattcaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 38774751  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38774752 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 38774851  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38774852 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccatatttg 38774951  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctgcttct 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38774952 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 38775020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Original strand, 29355225 - 29355585
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29355225 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 29355324  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29355325 cctatacatgttggttttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 29355424  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29355425 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 29355524  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29355525 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 29355585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 5079459 - 5079099
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5079459 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 5079360  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5079359 cctatacatgttggttttgtacgtggagtccgtaaccaaaaccgtttgaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 5079260  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5079259 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatctg 5079160  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5079159 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 5079099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 13630940 - 13630580
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13630940 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 13630841  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13630840 cctatacatgttggttttgtacgtcgagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaatatatcttca 13630741  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13630740 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatacttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 13630641  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13630640 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 13630580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 41455361 - 41455001
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41455361 cccaaacaaaattttcctctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtgaccccaactacctcaaacattggcat 41455262  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41455261 cctttacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaatatatcttca 41455162  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41455161 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 41455062  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41455061 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 41455001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Original strand, 12649116 - 12649476
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12649116 cccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcataaattcaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcat 12649215  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  12649216 cctatacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaagatatcttcg 12649315  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  12649316 attgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacatagatattagatattgcaacgacttcttgtcacctctatttg 12649415  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12649416 tcttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 12649476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 37016438 - 37016078
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  37016438 cccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccaaatatgtcaaatcggtcgaaatgaccccaactacctcaaacattggcat 37016339  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    | | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  37016338 cttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcg 37016239  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37016238 attgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttg 37016139  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37016138 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 37016078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Original strand, 50116300 - 50116660
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  50116300 cccaaacaaagtttttctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcat 50116399  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||     
T  50116400 cctgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttagatgagcccaaaagatatcttcg 50116499  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50116500 attgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgacattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttg 50116599  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50116600 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 50116660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Original strand, 38691476 - 38691836
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38691476 cccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcat 38691575  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    | | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||     
T  38691576 cttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttgaaaaattgttaaacaacttaacagatgttggatgagcccaaaagatatcttcg 38691675  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  38691676 attgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacatcgagattagatattgcaacggcttcttgtcatctctatttg 38691775  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38691776 ccttccatatttgttgatgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 38691836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 46974688 - 46974328
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  46974688 cccaaacaaagtttttctctttctcatgtgtcacaaatctaaacccaaccgaatatgtcaaatcgattgaagtgaccccaactacctcaaacattggcat 46974589  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    | | ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  46974588 cttgtacctgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaagattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcg 46974489  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||    
T  46974488 attgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaactttgagattagatattgcaacgacttcttgtcacctttatttg 46974389  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  46974388 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgtttcacatttgtcatgcaatgtggtct 46974328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 20 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 13175303 - 13174945
Alignment:
Q  20 caaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcc 119  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  13175303 caaacaaatttttcctctttctcatgggtcacaaatccacacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatct 13175204  T
Q  120 tatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaat 219  Q
    | |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  13175203 tgtacatgatggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgctggaaatttgttaaacaacttagcggatgttggatgagcacaaaagatatcttcgat 13175104  T
Q  220 agtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgcc 319  Q
     ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13175103 tgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaactttgaaattagaaattgcaacggcttcttgtcacctctatttgcc 13175004  T
Q  320 ttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13175003 ttccatatttgttgattttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 13174945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 51663782 - 51663422
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  51663782 cccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacatattcaaactcaaccaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacactggcat 51663683  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
      ||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  51663682 tttatacatgttggttttgtaggtagagtccataatcaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaaaggatgttggatgagcccaaaagatatcttcg 51663583  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    || ||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  51663582 attgtagtactttcactttgtgttcttgactaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttattgtcacctctatttg 51663483  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51663482 ccttccatttttgttgacgttcaatgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 51663422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 94 - 378
Target Start/End: Original strand, 21942977 - 21943261
Alignment:
Q  94 cccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgtt 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| | ||| |    
T  21942977 cccaactacctcaaacattggcatcttgtacatgttggttttgtaggtggaatccataaccaaaaccgttgaaaatttgttaaacaacttaacgaatgat 21943076  T
Q  194 ggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgca 293  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21943077 ggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgtttttgagaaataagcatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgca 21943176  T
Q  294 acggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    || | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  21943177 acagtttcttgtcgcctctatttgccttccatatttgttgacgtttattgtacacttgtttgacatttgtcatgcaatgtggtct 21943261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 295
Target Start/End: Original strand, 19498001 - 19498277
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19498001 cccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaagcctaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcat 19498100  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    | | |||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||      
T  19498101 cttgtacatgtttgttttgtgggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagccc-aaaagtatctttg 19498199  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaac 295  Q
    || ||| ||||||||  ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19498200 attgtagtactttcactttgtgttttttagaaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaac 19498277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 371
Target Start/End: Original strand, 32106191 - 32106533
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||| |||| ||  | || |||||||||| |||||||||||||||    
T  32106191 cccaaacaaagttgtcatctttctcatgtgtcaaaaatccaaaatcaactgaatatgtcaaatcagtcaaggtgaccccaactatctcaaacattggcat 32106290  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    | | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||           ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||    
T  32106291 catgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaa-----------ttgttaaacaacttaatggatgttggatgagcttaaaatatgtcttca 32106379  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||| | | |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||| |  | |||||||||| || || |    
T  32106380 atagtagtactttcactttgtgttctggtgaaataaacatagttgtgctcctccaactttgagattatataatgcatcatcgtcttgtcacctctgttcg 32106479  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaat 371  Q
     |||||||||||||||| ||| |||| | |||||||| | ||||||| ||||||    
T  32106480 acttccatatttgttgatgttaattgcatacttgcttgatatttgtcttgcaat 32106533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 283 - 378
Target Start/End: Original strand, 44619905 - 44620000
Alignment:
Q  283 tagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44619905 tagatattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgcacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 44620000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 217 - 371
Target Start/End: Original strand, 26466006 - 26466160
Alignment:
Q  217 aatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctattt 316  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||  | | || | ||| || | |    
T  26466006 aatagtagtactttcattttgtgttcttgagaaataaacatagttgtgctccttcaactttgagattagaaactgcaacaccgttttttaacctctgtat 26466105  T
Q  317 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaat 371  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  26466106 gacttccatatttattgacgttcattgtatacttgcttgatatttgtcatgcaat 26466160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 207
Target Start/End: Original strand, 36360086 - 36360246
Alignment:
Q  47 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 146  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| || ||| |||||| || || | |||||  ||||||| || ||| ||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  36360086 gtcataaatgcaaaaccaaccgaatatatcaaataggttgaggtgactcaaactatttcaaacagtgacattctatacaagttggttttgtacgtggaat 36360185  T
Q  147 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 207  Q
    |||| | |||||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  36360186 ccattatcaaaacagttggaaaattgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 36360246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 47 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 45472847 - 45472687
Alignment:
Q  47 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 146  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||| || || |||||||  ||||||| || ||| ||||||| |||||| ||||||||||  |    
T  45472847 gtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatgacattctatacaagttggttttgtacgtgggat 45472748  T
Q  147 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 207  Q
    |||| | |||||| || |||||| |||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  45472747 ccattatcaaaacagtcggaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 45472687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 47 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 7404115 - 7403953
Alignment:
Q  47 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacatt--ggcatcctatacatgttggtcttgtacgtgga 144  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||| ||| |||||| || || |||||||  ||||||| |  ||||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  7404115 gtcataaatgcaaaactaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatatggcattctatacaagttggttttgtacgtgga 7404016  T
Q  145 gtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 207  Q
     ||||| | |||||| || |||||| |||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  7404015 atccattatcaaaacagtcggaaaagtgttaaacaactttactgatgttggatgagtccaaaa 7403953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 51 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 28863381 - 28863225
Alignment:
Q  51 taaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccat 150  Q
    ||||| |||| |||| | |||||||| ||| |||||| || || |||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||| || |||||    
T  28863381 taaatgcaaaaccaatcaaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatggcattctatacaagttggttttgtacgtagaatccat 28863282  T
Q  151 aaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 207  Q
     | |||||| || | |||| ||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||    
T  28863281 tatcaaaacagtcgaaaaagtgttaaacaattttacgaatgttggatgagtccaaaa 28863225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 47 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 27283535 - 27283402
Alignment:
Q  47 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 146  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||| || || |||||||  | ||| | |||||||||||||| |||||| |||| |||||| |    
T  27283535 gtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactattttaaataatggcatcctatacaagttggttttgtgcgtggaat 27283436  T
Q  147 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaa 180  Q
    |||  |  ||||| || |||||||||||||||||    
T  27283435 ccaatattaaaacagtcggaaaattgttaaacaa 27283402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 47 - 207
Target Start/End: Original strand, 18887360 - 18887520
Alignment:
Q  47 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 146  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||| |||||| || || |||||||  ||||||| || |||| |||||| ||| ||  |||||||||| |    
T  18887360 gtcataaatgcaaaaccaacagaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatgacatcttatacaagttagttctgtacgtggaat 18887459  T
Q  147 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 207  Q
    |||| | |||||   | ||||||||||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  18887460 ccattatcaaaaaaatcggaaaattgttaaacaactttaccgatgttggatgagaccaaaa 18887520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 337 - 378
Target Start/End: Original strand, 7980068 - 7980109
Alignment:
Q  337 ttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7980068 ttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 7980109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 20240170 - 20240037
Alignment:
Q  47 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 146  Q
    ||||||||| ||||  ||| ||||||| || ||| |||| | || || |||||||  ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  20240170 gtcataaatgcaaaatcaatcgaatatttcgaataggttaaggtgactccaactatttcaaacaatgacatcctatacaagttggttttgtacgtggaat 20240071  T
Q  147 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaa 180  Q
    |||| | |||| | ||  ||||||||||||||||    
T  20240070 ccattatcaaagcagtcagaaaattgttaaacaa 20240037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 25231655 - 25231558
Alignment:
Q  189 atgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattaga 286  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||| ||| ||| ||||||||  || |||| | | | |||||  |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  25231655 atgttggatgaacccaaaatatgtctttaattgtagtactttcactttttgttatggtgaaataaacatagttgtgctcctccaattttgagattaga 25231558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 31445979 - 31445866
Alignment:
Q  92 accccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatg 191  Q
    |||| |||||||| ||||| || ||| | |||||  ||||| || | ||||||||| || | |||||| |||| |||| |||||||||| || || |||     
T  31445979 accctaactaccttaaacaatgacattcaatacacattggttttatgcgtggagtctatgatcaaaactgttgaaaaagtgttaaacaactttatagatt 31445880  T
Q  192 ttggatgagcccaa 205  Q
    ||||||||||||||    
T  31445879 ttggatgagcccaa 31445866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 357; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 2405 - 2045
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2405 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 2306  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2305 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 2206  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2205 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 2106  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2105 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 2045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 357; Significance: 0; HSPs: 10)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 386
Target Start/End: Original strand, 1611288 - 1611656
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1611288 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 1611387  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1611388 cctataaatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 1611487  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1611488 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 1611587  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctgcttct 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1611588 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 1611656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 31147846 - 31147486
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  31147846 cccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaacacaactacctcaaacattggcat 31147747  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    | | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||     
T  31147746 catgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttgtatgagcccaaaagatatcttcg 31147647  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31147646 attgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttg 31147547  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  31147546 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcaaatttatcatgcaatgtggtct 31147486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 18 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 28357842 - 28357557
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  28357842 cccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtgaccccaactacctcaaacatttgcat 28357743  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28357742 cctatacatgttggtcttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaagatatcttca 28357643  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttctt 303  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28357642 attgtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttctt 28357557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Original strand, 29287490 - 29287845
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29287490 cccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaatccaaccgaatatgtcaaatcgatcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcat 29287589  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  29287590 cctatacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaatt-ttaaacaaattaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcg 29287688  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||||| |||||||||||| |||||||    
T  29287689 attgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgatattaga----gcaacgacttcttgtcacctctatttg 29287784  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29287785 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttttcatgcaatgtggtct 29287845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 18607520 - 18607160
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  18607520 cccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatctaaacccaatcgaatatgtcaaatctgtcgaagtgaccccaactacttcaaatattggcat 18607421  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||     
T  18607420 cctgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacgaatgttggatgagcccaaaagatatcttcg 18607321  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  18607320 attgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtattgttgtgctcctccaacttaaaaattagatattgcaacggcttcttatcacctctatttg 18607221  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18607220 ccttccatatttgttgatgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 18607160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Original strand, 21357887 - 21358244
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  21357887 cccaaacaaagttttcctctttctcatttgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgacccgaactacctcaaacattggcat 21357986  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    | | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  21357987 cttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaatatatcttcg 21358086  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    || ||| ||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21358087 attgtagtactttcactttgtgttcttgacaaataagtatagttgtgctcctcgaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttg 21358186  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    ||||||||||||||   |  ||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  21358187 ccttccatatttgt---ctatcattttacgcttgcttgacctttgtcatgcaatgtggtct 21358244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Original strand, 23961869 - 23962226
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  23961869 cccaaacaaagttttcctctttctcatttgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgacccgaactacctcaaacattggcat 23961968  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    | | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  23961969 cttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaatatatcttcg 23962068  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    || ||| ||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23962069 attgtagtactttcactttgtgttcttgacaaataagtatagttgtgctcctcgaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttg 23962168  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    ||||||||||||||   |  ||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  23962169 ccttccatatttgt---ctatcattttacgcttgcttgacctttgtcatgcaatgtggtct 23962226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 304 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 28251134 - 28251060
Alignment:
Q  304 gtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28251134 gtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 28251060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 47 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 9095623 - 9095463
Alignment:
Q  47 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 146  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||| || || |||||||  ||||||| || ||| ||||||| |||||  ||||||||||| |    
T  9095623 gtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatgacattctatacaagttggctttgtacgtggaat 9095524  T
Q  147 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 207  Q
    |||| | |||||| || |||||| |||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  9095523 ccatgatcaaaacagtcggaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 9095463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 302 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 24220408 - 24220332
Alignment:
Q  302 ttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  24220408 ttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgtttattttacacttacttgatatttgtcatgcaatgtggtct 24220332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 357; Significance: 0; HSPs: 22)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Original strand, 19072194 - 19072554
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19072194 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 19072293  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19072294 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 19072393  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19072394 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 19072493  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19072494 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 19072554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 386
Target Start/End: Original strand, 49565013 - 49565369
Alignment:
Q  30 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49565013 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 49565112  T
Q  130 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49565113 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 49565212  T
Q  230 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49565213 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 49565312  T
Q  330 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctgcttct 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49565313 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 49565369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 9891546 - 9891186
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9891546 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 9891447  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9891446 cctatacatgttggttttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagtccaaaaaatatcttca 9891347  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9891346 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 9891247  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9891246 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 9891186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 3405314 - 3404954
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3405314 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgccataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 3405215  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3405214 cctatacatgttggttttgtacgtggagtccataaccaaaaccgtttgaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 3405115  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3405114 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 3405015  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3405014 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttatcatgcaatgtggtct 3404954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 41024723 - 41024363
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |    
T  41024723 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtgaccccaaccacctcaaacattggcct 41024624  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41024623 cctatacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 41024524  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  41024523 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacgactttttgtcacccctatttg 41024424  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41024423 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 41024363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 4769658 - 4769298
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  4769658 cccaaacaaagtttttctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattgacat 4769559  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    | | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  4769558 cttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcg 4769459  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4769458 attgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgaaatcagaaattgcaacggcttcttgtcacctctatttg 4769359  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4769358 ccttccatatttgtagacattcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 4769298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Original strand, 38463374 - 38463734
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  38463374 cccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgactccaactacctcaaacattagcat 38463473  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    | | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||     
T  38463474 cttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacgaatgttggatgagcccaaaagatatcttcg 38463573  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  38463574 attgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgtcacctctatttg 38463673  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38463674 ccttccgtatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcagtgtggtct 38463734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 19 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 4977278 - 4976919
Alignment:
Q  19 ccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatc 118  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4977278 ccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatc 4977179  T
Q  119 ctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaa 218  Q
     | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  4977178 atgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacagatgttggatgagcccaaaagatatcttcga 4977079  T
Q  219 tagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgc 318  Q
    | ||| ||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  4977078 ttgtagtactttcactttgtgctctttagtaataagtatagttgtgctcctccaactttgagattagatattgcaacgacttcttgtcacctctatttgc 4976979  T
Q  319 cttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4976978 attccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 4976919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 44050134 - 44049774
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44050134 cccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatttaaacccaaccgaatatgtcaaatcgatcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcat 44050035  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  44050034 cctgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcg 44049935  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    || ||| || |||||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  44049934 attgtagtagtttcactttgtgttattgagtaataagtatagctgcgctcctccaacttcgagattagatattgcaacagcttcttgtcacctctatttg 44049835  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44049834 ccttccatatttgttgacgttcgttgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 44049774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 11503030 - 11502670
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11503030 cccaaacaaagtattcctctttctcatgtgtcacaaattcaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcat 11502931  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    | | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||     
T  11502930 cttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgtttgatgagcccaaaagatatcttcg 11502831  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    || ||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11502830 attgtagtactttctctttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcttccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttg 11502731  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
     ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11502730 tcttccatatttgttgacgttcattgtttacttgcttcacatttatcatgcaatgtggtct 11502670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Original strand, 4978495 - 4978851
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||| |||    
T  4978495 cccaaacaaagttttcctctttctcatgtatcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcgatcgaagtgaccctaactacctcaaacattgacat 4978594  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    | | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  || |||||| |||||||||| ||||||||     
T  4978595 catgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttcgaaaattgttaaacaacttaacagacgttggaagagcccaaaagatatcttcg 4978694  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||    
T  4978695 attgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaactttgagattagatattgcaacggcttcttgtcacc----tttg 4978790  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4978791 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 4978851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 20 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 21472316 - 21471958
Alignment:
Q  20 caaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcc 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  21472316 caaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcgatcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatct 21472217  T
Q  120 tatacatgttggtctt-gtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaa 218  Q
    | ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |    
T  21472216 tgtacatgttggtgtttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatctttga 21472117  T
Q  219 tagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgc 318  Q
    |  || ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  21472116 ttttagtactttcactttgtgttcttaagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattaaatattgcaacgacttcttgtcacctctatttgc 21472017  T
Q  319 cttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  21472016 cttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacattt-ttatccaatgtggtct 21471958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 194 - 378
Target Start/End: Original strand, 51643211 - 51643395
Alignment:
Q  194 ggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgca 293  Q
    |||||||||||||| |||||||  || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51643211 ggatgagcccaaaagatatctttgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgca 51643310  T
Q  294 acggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51643311 acggcgtcttgtcaactctatttgccttccatatttgttgacgttcatcgtacacttgctttacatttgtcatgcaatgtggtct 51643395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 6183202 - 6182875
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    |||||||||| || || |||||| ||  ||||| ||||||||| |||||  ||| |||| ||||||| ||  | |||||||||| |||||||||||||||    
T  6183202 cccaaacaaaattatcctctttcccagctgtcaaaaatccaaaaccaactaaatttgtcaaatcggtcgagatgaccccaactatctcaaacattggcat 6183103  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    | | ||||||||||| |||||  |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||| |    
T  6183102 catgtacatgttggttttgtagatggagttcataatcaaaactgttggaaaattgttaaacaacttaacagatgttggatgagcccaaaatatgtcttga 6183003  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| | | | |||||  ||||||||| |||||||| || ||||||||| |||||| |  | |||||||||| || ||||    
T  6183002 atagtagtactttcaatttgtgttatggtgaaataaacatagttgtgttcctccaattttgagattagatattgcatcaccgtcttgtcacctctgtttg 6182903  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgta 345  Q
     |||  |||||| |||| ||||||||||    
T  6182902 acttgaatattttttgatgttcattgta 6182875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 267 - 378
Target Start/End: Original strand, 18580117 - 18580225
Alignment:
Q  267 cctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcat 366  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18580117 cctcaaacttcgagattaaatattgcaacggcttcttgtcacctctatttg---tccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcat 18580213  T
Q  367 gcaatgtggtct 378  Q
    |||||| |||||    
T  18580214 gcaatgaggtct 18580225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 48 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 32716787 - 32716628
Alignment:
Q  48 tcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtc 147  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||| || || |||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  32716787 tcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatggcattctatacaagttggttttgtacgtggaatc 32716688  T
Q  148 cataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 207  Q
    ||| | |||||| || |||||| |||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  32716687 cattatcaaaacagtcggaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 32716628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 4618052 - 4617919
Alignment:
Q  47 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 146  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||  ||||| || || |||||||  ||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  4618052 gtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataagttgaggtgactccaactatttcaaacaatggcgtcctatacaagttggttttgtacgtggaat 4617953  T
Q  147 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaa 180  Q
    |||| | |||||| || |||||||||||||||||    
T  4617952 ccattatcaaaacagtcggaaaattgttaaacaa 4617919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 47 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 1591328 - 1591168
Alignment:
Q  47 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 146  Q
    |||| |||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||| || || |||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||| || |||||||| |    
T  1591328 gtcacaaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatggcattctatacaagttggttttctacgtggaat 1591229  T
Q  147 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 207  Q
    |||| | |||||| || | ||||||||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  1591228 ccattatcaaaacagtcgaaaaattgttaaacaactttactgatgttggatgagtccaaaa 1591168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 17916681 - 17916521
Alignment:
Q  47 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 146  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||| | || || |||||||  ||||||| |||||| |||||||   |||| ||||||||| | |    
T  17916681 gtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaatgggttaaggtgactccaactatttcaaacaatggcattctatacaaaatggttttgtacgtgaaat 17916582  T
Q  147 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 207  Q
    |||| | |||||| || |||||| |||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  17916581 ccattatcaaaacagtcggaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 17916521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 17497019 - 17496893
Alignment:
Q  46 tgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggag 145  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||| || || |||||||  ||||||| || |||| ||||||  ||||| |||||||||||     
T  17497019 tgtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtctaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatgacatcttatacaaattggttttgtacgtggaa 17496920  T
Q  146 tccataaccaaaaccgttggaaaattg 172  Q
    ||||| | |||||  || |||||||||    
T  17496919 tccattatcaaaatagtcggaaaattg 17496893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 207
Target Start/End: Original strand, 46517000 - 46517160
Alignment:
Q  47 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 146  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||  | |||||||  ||||||| || ||| ||||||| |||| | |||| |||||| |    
T  46517000 gtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgtctccaactatttcaaacaatgacattctatacaagttgattttgttcgtggaat 46517099  T
Q  147 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 207  Q
     ||| | |||||| || ||||||  ||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  46517100 tcattatcaaaacagtcggaaaaacgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 46517160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 224
Target Start/End: Original strand, 13897349 - 13897526
Alignment:
Q  47 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 146  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||||||  ||||| ||| || || ||||||| |||||||| || |||| | |||| |||||| || |||| ||| |    
T  13897349 gtcataaattcaaaacccaccgaatatgtcatatcgggtgaggtgactccaactatctcaaacaatgacatcatgtacaagttggttttctacgaggaat 13897448  T
Q  147 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtat 224  Q
    |||| | |||||| || |  |||||||||||||| ||||  |||  ||||||| ||||||| || | || ||||||||    
T  13897449 ccatgatcaaaacagtcgagaaattgttaaacaacttaaccgattctggatgaccccaaaatatgtattgaatagtat 13897526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 357; Significance: 0; HSPs: 29)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 3950267 - 3949899
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3950267 cccaagcaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 3950168  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3950167 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 3950068  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3950067 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 3949968  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctgcttct 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3949967 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 3949899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 6742411 - 6742051
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6742411 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 6742312  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6742311 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 6742212  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6742211 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 6742112  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6742111 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 6742051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 386
Target Start/End: Original strand, 8159521 - 8159888
Alignment:
Q  19 ccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8159521 ccaaacaaagttttcttctttctcgtgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatc 8159620  T
Q  119 ctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaa 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8159621 ctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaa 8159720  T
Q  219 tagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgc 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8159721 tagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgc 8159820  T
Q  319 cttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctgcttct 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8159821 cttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 8159888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 386
Target Start/End: Original strand, 30946179 - 30946547
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30946179 cccaaacaaagttttcttctttcgcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 30946278  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30946279 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 30946378  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30946379 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 30946478  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctgcttct 386  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30946479 ccttccatatttgttgactttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 30946547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Original strand, 13746258 - 13746618
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13746258 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 13746357  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13746358 cctatacatgttggttttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 13746457  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13746458 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 13746557  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13746558 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 13746618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 16446144 - 16445784
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16446144 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 16446045  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16446044 cctatacatgttggttttgtacgtcgagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaatatatcttca 16445945  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16445944 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatacttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 16445845  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16445844 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 16445784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Original strand, 36816053 - 36816413
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36816053 cccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcat 36816152  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  36816153 cctatacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaagatatcttcg 36816252  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36816253 attgtattactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacctctatttg 36816352  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36816353 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 36816413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 35 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 14400063 - 14399719
Alignment:
Q  35 tctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcacccc-aactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtc 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14400063 tctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgacccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtt 14399964  T
Q  134 ttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaa 233  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||     
T  14399963 ttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcac 14399864  T
Q  234 gttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttg 333  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14399863 tttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaaattcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttg 14399764  T
Q  334 acgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14399763 acgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 14399719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 18 - 376
Target Start/End: Original strand, 46991783 - 46992141
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  46991783 cccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcat 46991882  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  46991883 cctatacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcg 46991982  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46991983 attgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacataaagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttg 46992082  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggt 376  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  46992083 tcttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcatatttgtcatgcaatgtggt 46992141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Original strand, 48249403 - 48249764
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcacccc-aactacctcaaacattggca 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  48249403 cccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcataaatccaaactcaaccgaatatgtcaaattggtcaaagtgacccccaactacctcaaacattggca 48249502  T
Q  117 tcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttc 216  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48249503 tcctatacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttc 48249602  T
Q  217 aatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctattt 316  Q
     || ||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48249603 gattgtagtactttcactttgtgttcttgagtgataagtatagttgtgctcatccaacatagagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctattt 48249702  T
Q  317 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48249703 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 48249764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Original strand, 7841553 - 7841912
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7841553 cccaaacaaagttttcctcgttctcatgtgtcacaaatccaaatccaaccgaatatgtcaaatcggtctaagtgaccccaactacctcaaacattggcat 7841652  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  7841653 cctctacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgaacccaaaagatatcttcg 7841752  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7841753 attgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagt-tagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttg 7841851  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7841852 ccttccatatttgttgatgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 7841912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 18 - 376
Target Start/End: Original strand, 77557 - 77915
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  77557 cccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcaaaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattgacat 77656  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    | | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||| ||||||||     
T  77657 cttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttgaaaaattgttaaacaacttaacaaatgttggatgagcccaaaagatatcttcg 77756  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  77757 atggtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgtcacctctatttg 77856  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggt 376  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  77857 cctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggt 77915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Original strand, 6504492 - 6504852
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  6504492 cccaaacaaagttttcctcttcctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgacctcaactacctcaaacattggcat 6504591  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    ||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  6504592 cctgtacatgttggttatgtaggtggagtccataaccaaaacggttggaaaattgttaaaaaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcg 6504691  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  6504692 attgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcgaggttagatattgcaacggcttcttgtcacctctatgtg 6504791  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6504792 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 6504852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Original strand, 21954776 - 21955135
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  21954776 cccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaatcgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaatattggcat 21954875  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    ||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||     
T  21954876 cctgtacatgttcgttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaggtatcttcg 21954975  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    || ||  ||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21954976 attgtggtactttcactttgttttcttgagaaataagtatagttgtggtcctccaacttcgagatta-atattgcaacggcttcttgtcacctctatttg 21955074  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21955075 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 21955135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 7839120 - 7838760
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7839120 cccaaacaaagttttccactttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcgatcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcat 7839021  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    | | ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  7839020 cttgtacatgttggttttgtaggtggagtccatgaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacagatgtcggatgagcccaaaagatatcttcg 7838921  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    || ||| ||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  7838920 attgtagtactttcactttatgttcttaagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttcttgccacctctatttg 7838821  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7838820 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 7838760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 158 - 378
Target Start/End: Original strand, 9428510 - 9428730
Alignment:
Q  158 accgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtat 257  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9428510 accgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtat 9428609  T
Q  258 agttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcac 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9428610 agttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcac 9428709  T
Q  358 atttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  9428710 atttgtcatgcaatgtggtct 9428730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 18 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 29949508 - 29949193
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29949508 cccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtctcaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcaaagtgaccccaactacctcaaacattggcat 29949409  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    | | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  29949408 cttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcg 29949309  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||    
T  29949308 attgtactactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgct-ctctaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgtcacctttatttg 29949210  T
Q  318 ccttccatatttgttga 334  Q
    |||||||||||||||||    
T  29949209 ccttccatatttgttga 29949193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 18 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 29998662 - 29998347
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29998662 cccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtctcaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcaaagtgaccccaactacctcaaacattggcat 29998563  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    | | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  29998562 cttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcg 29998463  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||    
T  29998462 attgtactactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgct-ctctaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgtcacctttatttg 29998364  T
Q  318 ccttccatatttgttga 334  Q
    |||||||||||||||||    
T  29998363 ccttccatatttgttga 29998347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 87 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 29908273 - 29908027
Alignment:
Q  87 aagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaat 186  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  29908273 aagtgaccccaactacctcaaacattggcatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaac 29908174  T
Q  187 ggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattaga 286  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  29908173 ggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtactactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgct-ctctaacttcgagattaga 29908075  T
Q  287 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttga 334  Q
     ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  29908074 tattgcaacgacttcttgtcacctttatttgccttccatatttgttga 29908027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 183
Target Start/End: Original strand, 28610455 - 28610621
Alignment:
Q  17 ccccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggca 116  Q
    |||| ||||||| |||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  ||||| |  ||||||||||||||||||| ||    
T  28610455 ccccgaacaaagattttctctttctcatatgtcacaaatccaaatccaaccgaatatgtcaaattggccgaagtgattccaactacctcaaacattgaca 28610554  T
Q  117 tcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaattt 183  Q
    || | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28610555 tcttctacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaaccattt 28610621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 48 - 200
Target Start/End: Original strand, 9556331 - 9556483
Alignment:
Q  48 tcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtc 147  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||| || || |||||||  ||||||| || |||||| |||| |||||| ||||||||| | ||    
T  9556331 tcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatgacatcctgtacaagttggttttgtacgtgaaatc 9556430  T
Q  148 cataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 200  Q
    ||| | |||||| || ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  9556431 cattatcaaaacagtcggaaaattgttaaacaactttacggatgttggatgag 9556483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 46 - 207
Target Start/End: Original strand, 51548098 - 51548259
Alignment:
Q  46 tgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggag 145  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||| || || || |||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||     
T  51548098 tgtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggtcgaggtgactccaactatttcaaacaatggcattctatacaagttggttttgtacgtggaa 51548197  T
Q  146 tccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 207  Q
    ||||| | |||||| || | |||| |||||||||| || |  |||||||||| || ||||||    
T  51548198 tccattatcaaaacagtcgaaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggataagtccaaaa 51548259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 207
Target Start/End: Original strand, 2284623 - 2284783
Alignment:
Q  47 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 146  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||| ||| ||| || || || |||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  2284623 gtcataaatgcaaaatcaaccgaatatgtcaaataggtcgaggtgactccaactatttcaaacaatggcattctatacaagttggttttgtacgtggaat 2284722  T
Q  147 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 207  Q
    |||| | |||||  || |||||| |||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  2284723 ccattatcaaaatagtcggaaaagtgttaaacaactttactgatgttggatgagtccaaaa 2284783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 207
Target Start/End: Original strand, 4120360 - 4120520
Alignment:
Q  47 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 146  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||| | || || |||||||  ||||| | || ||| ||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  4120360 gtcataaatacaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttaatgtgactccaactatttcaaagaatgtcattctatacaagttggttttgtacgtggaat 4120459  T
Q  147 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 207  Q
    |||| | |||||| || |||||| |||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  4120460 ccattatcaaaacggtcggaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 4120520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 33940350 - 33940190
Alignment:
Q  47 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 146  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||| || || |||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  33940350 gtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatggcattctatacaagttggttttgtacgtggaat 33940251  T
Q  147 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 207  Q
    |||| | |||||| || |  ||| |||||||| | || |  ||||||||||||| ||||||    
T  33940250 ccattatcaaaacagtcgagaaagtgttaaacgactttaccgatgttggatgagtccaaaa 33940190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 207
Target Start/End: Original strand, 40467774 - 40467934
Alignment:
Q  47 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 146  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| || ||| |||||| || || |||||||  ||||||| || |||  |||||| |||||| ||||||||||| |    
T  40467774 gtcataaatgcaaaaccaaccgaatatttcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatgacattttatacaagttggttttgtacgtggaat 40467873  T
Q  147 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 207  Q
    |||| | |||||| || |||||| |||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  40467874 ccattatcaaaacagtcggaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 40467934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 12491582 - 12491422
Alignment:
Q  47 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 146  Q
    ||||||||| |||| |||||| |||||||| ||| ||| || || || |||||||  ||||||| || ||| ||||||| |||| | ||||||| ||| |    
T  12491582 gtcataaatgcaaaaccaaccaaatatgtcaaataggtcgaggtgactccaactatttcaaacaatgacattctatacaagttgattttgtacgcggaat 12491483  T
Q  147 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 207  Q
    |||| | |||||| ||||||||| |||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  12491482 ccattatcaaaacagttggaaaagtgttaaacaactttactgatgttggatgagtccaaaa 12491422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 330 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 29930580 - 29930532
Alignment:
Q  330 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29930580 gttgacgttcattgtacatttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 29930532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 330 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 29979734 - 29979686
Alignment:
Q  330 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29979734 gttgacgttcattgtacatttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 29979686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 345; Significance: 0; HSPs: 21)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Original strand, 37819414 - 37819774
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37819414 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacctaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 37819513  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37819514 cctatacatgttggttttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 37819613  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37819614 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 37819713  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37819714 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 37819774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Original strand, 11031989 - 11032349
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11031989 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 11032088  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11032089 cctatacatgttggttttgtacgtcgagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 11032188  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11032189 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatacttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggtttcttgtcacccctatttg 11032288  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11032289 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 11032349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Original strand, 38858727 - 38859087
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38858727 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 38858826  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38858827 cctatatatgttggttttgtacgtcgagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 38858926  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38858927 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatacttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 38859026  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38859027 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 38859087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 378
Target Start/End: Original strand, 28884946 - 28885305
Alignment:
Q  19 ccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28884946 ccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaacggattatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatc 28885045  T
Q  119 ctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaa 218  Q
    | |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28885046 caatacatgttggtttcgtacgtggaatccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaa 28885145  T
Q  219 tagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgc 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28885146 tagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgc 28885245  T
Q  319 cttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28885246 cttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 28885305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 378
Target Start/End: Original strand, 7020419 - 7020777
Alignment:
Q  20 caaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcc 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7020419 caaacaaagttttcctctttctcatgtgtcataaatctaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcc 7020518  T
Q  120 tatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaat 219  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7020519 tatacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaagatatcttcaat 7020618  T
Q  220 agtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgcc 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7020619 agtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagatgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgcc 7020718  T
Q  320 ttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7020719 ttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 7020777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 34079304 - 34078944
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34079304 cccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtgaccccaactacctcaaacattggcat 34079205  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34079204 cctatacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaagatatcttca 34079105  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34079104 attgtattactttcacgttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacctctatttg 34079005  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34079004 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 34078944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Original strand, 27866382 - 27866742
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |    
T  27866382 cccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtgaccccaaccacctcaaacattggcct 27866481  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27866482 cctatacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaagatatcttca 27866581  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||     
T  27866582 attgtattactttcacgttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaaaggtttcttgtcacctctatttt 27866681  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27866682 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 27866742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 1036875 - 1036515
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1036875 cccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcat 1036776  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    ||||||||||||| | ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||     
T  1036775 cctatacatgttgattttgtaggttgagtccgtaaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttagatgagcccaaaagatatcttcg 1036676  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||     
T  1036675 attgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttt 1036576  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  1036575 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgtgtcacatttgtcatgcaatgtggtct 1036515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Original strand, 7799543 - 7799903
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7799543 cccaaacaaagttttcctctttctcatgtctcacaaatccaaacccaaccgaatatgttaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcat 7799642  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  7799643 cctgtacatgttggttttgtaggtggagtccttaaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcg 7799742  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||     
T  7799743 attgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttt 7799842  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7799843 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 7799903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Original strand, 18536873 - 18537233
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  18536873 cccaaacaaagttttcctctttctcatgcgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtgaccccaactacctcaaacattagcat 18536972  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    | | |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  18536973 cttgtacatgttagttttgtaggtggagtccataaccaaaaccattggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcg 18537072  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18537073 attgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttg 18537172  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18537173 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 18537233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Original strand, 4202476 - 4202836
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  4202476 cccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaacagaatatgtcaaatcggtcgaagtgacctcaactacctcaaacattggcat 4202575  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    | | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  4202576 catgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaactgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcg 4202675  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4202676 attgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttg 4202775  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4202776 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttatcatgcaatgtggtct 4202836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Original strand, 13566644 - 13566988
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13566644 cccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtgaccccaactacctcaaacattggcat 13566743  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||                |||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  13566744 cctagacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaacc----------------acaacttaatggatgttgaatgatcccaaaagatatcttca 13566827  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13566828 attgtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacctctatttg 13566927  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13566928 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 13566988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Original strand, 25895634 - 25895998
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  25895634 cccaaaaaaagttttcctctttctcatgtgtcataaatccaaactcacccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaagcattggcat 25895733  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  25895734 cctatacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaagatatcttcg 25895833  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac----ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcaccccta 313  Q
    || ||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     | || |||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  25895834 attgtagtactctcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacatatatagatattagatattgcaacggcttcttgtcacctcta 25895933  T
Q  314 tttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25895934 tttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 25895998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 20287793 - 20287439
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||| ||||||||| |||||    
T  20287793 cccaaacaaagttttcctctttctcatgcgtcacaaattcaaagccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaggtgaccccaactatctcaaacataggcat 20287694  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt-aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttc 216  Q
    | | ||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  20287693 cttgtacatgttggtttggtaggtggagtccataaccagaaccgttggaaaattgttaaaaaaacttaacggatgttggatgagcgcaaaatatgtcttc 20287594  T
Q  217 aatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctattt 316  Q
    ||||||| |||||| |   | |||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||  | |||||||||| || |||    
T  20287593 aatagtagtactttgaccatttgttcttgagaaataaacataattgtgctcctccaactttgagattagaaactggaaccccgtcttgtcacctctgttt 20287494  T
Q  317 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaat 371  Q
    | ||| ||||||| |||||||||||| || |||||||| | ||||||||| ||||    
T  20287493 gactttcatatttattgacgttcattatatacttgcttgatatttgtcatacaat 20287439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 140 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 20286410 - 20286180
Alignment:
Q  140 gtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtg 239  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||| | |  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||  |||||    
T  20286410 gtggagtccataaccaaaactgttggaaaattcataa-caactaagcggatgttggatgagcccaaaatatgtcttcaatagtagtactttcattttgtg 20286312  T
Q  240 ttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttc 339  Q
    || ||||| |||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |    |||||||||| || |||| |||||||||||||||| ||||    
T  20286311 ttattgagaaataaagataattgtgctcctccaactttgagattagaaactgcaccacagtcttgtcacctctgtttgacttccatatttgttgatgttc 20286212  T
Q  340 attgtacacttgcttcacatttgtcatgcaat 371  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  20286211 attgtatacttgcttgatatttgtcatgcaat 20286180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 47 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 11819711 - 11819551
Alignment:
Q  47 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 146  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||  ||| | || || |||||||  ||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  11819711 gtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataagttaaggtgactccaactatttcaaacaatagcatcctatacaagttggttttgtacgtggaat 11819612  T
Q  147 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 207  Q
    |||| | |||||| || ||||||||||||||||| || |  ||| ||||||||| ||||||    
T  11819611 ccattatcaaaacagtcggaaaattgttaaacaactttaccgattttggatgagtccaaaa 11819551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 47 - 207
Target Start/End: Original strand, 27013235 - 27013395
Alignment:
Q  47 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 146  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||| |||||| || || |||||||  ||||||| || ||| ||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  27013235 gtcataaatgcaaaaccaacagaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatgacattctatacaagttggttttgtacgtggaat 27013334  T
Q  147 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 207  Q
    | || | |||||| || ||||||||||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  27013335 ctattatcaaaacagtcggaaaattgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 27013395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 47 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 42343985 - 42343826
Alignment:
Q  47 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 146  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||| ||| |||||| || || |||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |    
T  42343985 gtcataaatgcaaaactaaccgaatatgtcaaataggttgaggttactccaactatttcaaacaatggcattctatacaagttggttttgtatgtggaat 42343886  T
Q  147 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 207  Q
    |||| | |||||| || |||||| ||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||    
T  42343885 ccattatcaaaacagtcggaaaagtgttaaacaatatact-gatgttggatgagtccaaaa 42343826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 6553284 - 6553124
Alignment:
Q  47 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 146  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||| || || || ||||  ||||||| |||||| |||||||  ||||| ||||||||||| |    
T  6553284 gtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgactcccactatttcaaacaatggcattctatacaaattggttttgtacgtggaat 6553185  T
Q  147 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 207  Q
    |||| | |||||| || | |||| |||||||||| || |  || |||||||||| ||||||    
T  6553184 ccattatcaaaacagtcgaaaaagtgttaaacaactttaccgaagttggatgagtccaaaa 6553124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 47 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 43295709 - 43295549
Alignment:
Q  47 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 146  Q
    ||||||||| || | | ||||||||||||| ||| |||||| || || |||||||  ||||| | || ||| ||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  43295709 gtcataaatgcagaacaaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaataatgacattctatacaagttggttttgtacgtggaat 43295610  T
Q  147 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 207  Q
    |||| | |||||| || | |||| |||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  43295609 ccattatcaaaacagtcgaaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 43295549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 127 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 25053148 - 25053043
Alignment:
Q  127 gttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtatta 226  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| | |||||| |  ||||||||||||||||  || || ||| ||||||||| |||||| || |||| |||||| | |    
T  25053148 gttggttttgtacgtggaatccattatcaaaacagccggaaaattgttaaacagctttatcgatattggatgagtccaaaatatgtcttgaatagtttga 25053049  T
Q  227 ctttca 232  Q
    ||||||    
T  25053048 ctttca 25053043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0341 (Bit Score: 329; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0341
Description:

Target: scaffold0341; HSP #1
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Original strand, 15894 - 16254
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15894 cccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcataaattcaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 15993  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15994 cctatacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggaagttggatgagcccaaaaaatatcttca 16093  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16094 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 16193  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16194 cgttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 16254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 18 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 17593 - 17233
Alignment:
Q  18 cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcat 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17593 cccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcaaagtgaccccaactacctcaaacattggcat 17494  T
Q  118 cctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttca 217  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||     
T  17493 cctgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacagatgttggatgagcctaaaagatatcttcg 17394  T
Q  218 atagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttg 317  Q
    || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  17393 attgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatatttcaacggcttcttgtcacctctatttg 17294  T
Q  318 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17293 ccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttttcatgcaatgtggtct 17233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 225 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 12580 - 12426
Alignment:
Q  225 tactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgcc-ttcc 323  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||     
T  12580 tactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacagcttcttgtcacctctatttgcctttcg 12481  T
Q  324 atatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12480 atatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 12426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 138
Target Start/End: Original strand, 25486 - 25603
Alignment:
Q  21 aaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcct 120  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25486 aaacaaagttttcctctttctcatatgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaattggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcct 25585  T
Q  121 atacatgttggtcttgta 138  Q
    |||||||||||| |||||    
T  25586 atacatgttggttttgta 25603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0340 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0340
Description:

Target: scaffold0340; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 35 - 131
Target Start/End: Original strand, 4 - 100
Alignment:
Q  35 tctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttgg 131  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  4 tctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctgtacatcttgg 100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 207
Target Start/End: Original strand, 28452 - 28612
Alignment:
Q  47 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 146  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||| || || |||||||  ||||||| || ||| ||||||| |||||| || || || || |    
T  28452 gtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatgacattctatacaagttggttttttatgtagaat 28551  T
Q  147 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 207  Q
    |||| | |||||| || |||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||    
T  28552 ccattatcaaaacagtcggaaaagtgttaaacaattttaccgatgttggatgagtccaaaa 28612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0325 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0325
Description:

Target: scaffold0325; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 4315 - 4198
Alignment:
Q  63 caaccgaatatgtccaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgt 162  Q
    |||||||||||||| |||  ||||| || || |||||||  ||||||| ||||||  | |||| |||||| || || ||||| ||||| | |||||| ||    
T  4315 caaccgaatatgtcaaatatgttgaggtgactccaactatttcaaacaatggcattttctacaagttggttttatatgtggaatccattatcaaaacagt 4216  T
Q  163 tggaaaattgttaaacaa 180  Q
      ||||||||||||||||    
T  4215 cagaaaattgttaaacaa 4198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University