View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8771_low_5 (Length: 390)

Name: NF8771_low_5
Description: NF8771
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8771_low_5
NF8771_low_5
[»] chr4 (6 HSPs)
chr4 (15-379)||(16624971-16625335)
chr4 (15-363)||(9225398-9225746)
chr4 (15-357)||(5146649-5146988)
chr4 (296-363)||(18241734-18241801)
chr4 (47-230)||(21549803-21549984)
chr4 (41-222)||(16633669-16633850)
[»] chr8 (12 HSPs)
chr8 (15-386)||(18856246-18856617)
chr8 (15-386)||(26300095-26300466)
chr8 (15-386)||(18866641-18867012)
chr8 (15-363)||(10685258-10685606)
chr8 (15-363)||(35744134-35744483)
chr8 (47-363)||(23800511-23800828)
chr8 (39-222)||(16756079-16756262)
chr8 (39-222)||(28329087-28329270)
chr8 (113-222)||(21038609-21038718)
chr8 (107-190)||(26269193-26269276)
chr8 (41-168)||(33033874-33034001)
chr8 (55-190)||(15945873-15946009)
[»] chr7 (17 HSPs)
chr7 (15-386)||(21644782-21645153)
chr7 (15-386)||(9186116-9186487)
chr7 (15-363)||(21987665-21988013)
chr7 (15-386)||(49090433-49090805)
chr7 (15-363)||(16883672-16884020)
chr7 (15-363)||(18412403-18412751)
chr7 (15-363)||(24262317-24262665)
chr7 (84-363)||(12405151-12405430)
chr7 (15-355)||(5818188-5818527)
chr7 (113-222)||(25352531-25352640)
chr7 (113-222)||(25406593-25406702)
chr7 (59-222)||(7070974-7071137)
chr7 (113-222)||(3323680-3323789)
chr7 (105-190)||(3786969-3787054)
chr7 (349-386)||(18412749-18412786)
chr7 (349-386)||(21988011-21988048)
chr7 (41-190)||(44015486-44015635)
[»] scaffold0197 (1 HSPs)
scaffold0197 (15-363)||(15303-15651)
[»] chr3 (17 HSPs)
chr3 (15-386)||(3324507-3324878)
chr3 (15-363)||(32479085-32479433)
chr3 (15-363)||(8515839-8516187)
chr3 (15-363)||(16263107-16263456)
chr3 (15-362)||(9602842-9603189)
chr3 (15-363)||(28490168-28490515)
chr3 (15-252)||(2673325-2673562)
chr3 (15-59)||(1309616-1309660)
chr3 (113-222)||(10898184-10898293)
chr3 (113-222)||(6304490-6304599)
chr3 (113-222)||(10097699-10097808)
chr3 (113-222)||(10204584-10204693)
chr3 (113-222)||(22624872-22624981)
chr3 (113-222)||(29912848-29912957)
chr3 (39-170)||(47881707-47881838)
chr3 (113-190)||(10611670-10611747)
chr3 (349-386)||(16263454-16263491)
[»] chr6 (9 HSPs)
chr6 (15-363)||(14738566-14738914)
chr6 (15-363)||(24432315-24432663)
chr6 (15-363)||(29485332-29485667)
chr6 (15-307)||(33332126-33332418)
chr6 (10-352)||(24077670-24078012)
chr6 (311-363)||(33331440-33331492)
chr6 (113-222)||(13879918-13880027)
chr6 (113-222)||(22349864-22349973)
chr6 (113-222)||(25942848-25942957)
[»] chr5 (16 HSPs)
chr5 (15-363)||(33790060-33790408)
chr5 (15-363)||(27448567-27448915)
chr5 (15-363)||(31397986-31398334)
chr5 (15-363)||(43595866-43596214)
chr5 (15-363)||(43628660-43629008)
chr5 (15-363)||(37557618-37557966)
chr5 (16-363)||(24556579-24556925)
chr5 (16-363)||(24597611-24597957)
chr5 (15-123)||(28837037-28837145)
chr5 (56-273)||(34841402-34841619)
chr5 (59-190)||(31781298-31781429)
chr5 (113-190)||(25446698-25446775)
chr5 (349-386)||(27448913-27448950)
chr5 (349-386)||(43596212-43596249)
chr5 (349-386)||(43629006-43629043)
chr5 (82-170)||(10628590-10628678)
[»] chr1 (7 HSPs)
chr1 (15-363)||(41396984-41397332)
chr1 (15-363)||(47099812-47100160)
chr1 (49-363)||(19359832-19360146)
chr1 (16-279)||(9024878-9025139)
chr1 (117-321)||(17346550-17346753)
chr1 (113-222)||(9522907-9523016)
chr1 (125-220)||(2400129-2400224)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (15-363)||(1252-1600)
scaffold0006 (349-386)||(1598-1635)
[»] chr2 (9 HSPs)
chr2 (15-363)||(19348023-19348370)
chr2 (67-381)||(10446401-10446715)
chr2 (105-363)||(25402485-25402743)
chr2 (113-222)||(2737384-2737493)
chr2 (113-222)||(39681225-39681334)
chr2 (113-190)||(17933332-17933409)
chr2 (113-190)||(20053653-20053730)
chr2 (349-386)||(25402741-25402778)
chr2 (41-162)||(28456323-28456444)
[»] scaffold0842 (1 HSPs)
scaffold0842 (34-363)||(4188-4521)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (65-363)||(149949-150247)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (105-363)||(18933-19191)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (15-249)||(35755-35989)
[»] scaffold0355 (1 HSPs)
scaffold0355 (268-363)||(871-966)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (113-190)||(17536-17613)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 6)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 15 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 16625335 - 16624971
Alignment:
Q  15 catcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  16625335 catcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcacgctttgttatttccgattcgaacaactcctccttcttttagagccaaagtctc 16625236  T
Q  115 aaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcactc 214  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  16625235 aaaatattccttcctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaactcttctccggttcccaacttgtaaccactagtgcacccgcactc 16625136  T
Q  215 tcataaccatcttcataggacgcctccgcaacttgaacggaatgactactattgccccctttatccgagcaatccttcttgaagtgaccttgcatatgac 314  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  16625135 tcagaaccatcttcattggacgcctccgcaacttgaacggaaggactacgattgccccctttatccgggcaatccttcttgaaatgaccttgcttatgac 16625036  T
Q  315 aaagaaatcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctcgacttccccttgcattttcct 379  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16625035 aaagaaagcatttatactttgatttttcaaagcccttggacctcgacttccccttgccttttcct 16624971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 9225746 - 9225398
Alignment:
Q  15 catcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9225746 catcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcaaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctc 9225647  T
Q  115 aaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcactc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  9225646 aaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccagctcttctccggttcccaacttgttaccactagtgcaccctcactc 9225547  T
Q  215 tcataaccatcttcataggacgcctccgcaacttgaacggaatgactactattgccccctttatccgagcaatccttcttgaagtgaccttgcatatgac 314  Q
    |||||||| |||||||  || | ||||| ||||||||| ||  |||||| || |||||| |||||||  ||||| |||||||| ||||||||| | ||||    
T  9225546 tcataaccttcttcatttgaagtctccgtaacttgaaccgagggactaccatcgccccccttatccggacaatctttcttgaaatgaccttgcttgtgac 9225447  T
Q  315 aaagaaatcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctcgactt 363  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9225446 aaagaaagcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctagactt 9225398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 15 - 357
Target Start/End: Original strand, 5146649 - 5146988
Alignment:
Q  15 catcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctc 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||   ||    
T  5146649 catcaaacatctttatacgaacgttgctcgtgccttggactttgcacactttgttatttccgagtcgaacaactcctccttaatttagagccaaa---tc 5146745  T
Q  115 aaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcactc 214  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5146746 aaaatattccttcctaggacacatgcgataagagcatcctgagtccaaaaaccgactcttctccagttcccaacttgtgaccactagtgcacccgcactc 5146845  T
Q  215 tcataaccatcttcataggacgcctccgcaacttgaacggaatgactactattgccccctttatccgagcaatccttcttgaagtgaccttgcatatgac 314  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||  |||||| ||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5146846 tcataaccatcttcatttgatgcctccgcaacttgaacggacggactaccatcaccccctttatccggacaatccttcttgaagtgaccttgcttatgac 5146945  T
Q  315 aaagaaatcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacct 357  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  5146946 aaagaaaacacttatacttttatttgtcaaagcctttggacct 5146988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 296 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 18241801 - 18241734
Alignment:
Q  296 aagtgaccttgcatatgacaaagaaatcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctcgactt 363  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18241801 aagtgacattgcttatgacaaagaaagcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctagactt 18241734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21549984 - 21549803
Alignment:
Q  47 ccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctcaaaatattcctttctaggacacatgtgataag 146  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| | | |||||||    |||||||||||||| |||||| | || ||||  |||||||    
T  21549984 ccttgaacttttcaagccttgttgtttccaagccgaacgactccgcatacttttagctctaaagtctcaaaatactcctttttcgggcacacatgataag 21549885  T
Q  147 agcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcactctcataaccatcttcat 230  Q
    |||| |  || ||||| || |||||||| || |||| ||||||| |||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21549884 agcagcttga-tccaagacgcaacttttttc-ggtttccaacttgtgagtgctagtgcacccccactctcataaccatcttcat 21549803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16633850 - 16633669
Alignment:
Q  41 cccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctcaaaatattcctttctaggacacatgt 140  Q
    ||||| ||||| | |||| |||| || ||||| || || |||| ||||||  ||||||| || |  ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  16633850 cccataccttgaattttgaaagccttattattaccaaggcgaataactccagcttctttcagcaataaagtttcaaagtactcctttctcggacaaatgt 16633751  T
Q  141 gataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcactctcataacc 222  Q
    || ||||||| |  |||||||| |||||||  || || |||||| ||||| | ||   |||||| || ||||||||||||||    
T  16633750 gaaaagagcacctagagtccaagacccaacccttttcaggttccaaacttgtcacagttagtgctcctgcactctcataacc 16633669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 280; Significance: 1e-157; HSPs: 12)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 15 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 18856617 - 18856246
Alignment:
Q  15 catcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18856617 catcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctc 18856518  T
Q  115 aaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcactc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  18856517 aaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccagctcttctccggttcccaacttgtaaccactagtgcacccgcactc 18856418  T
Q  215 tcataaccatcttcataggacgcctccgcaacttgaacggaatgactactattgccccctttatccgagcaatccttcttgaagtgaccttgcatatgac 314  Q
    |||||||| |||||||  || |||||||||||||| || ||| |||||| || |||||| |||||||  ||||| |||||||| ||||||||| | ||||    
T  18856417 tcataaccttcttcatttgaagcctccgcaacttggaccgaaggactaccatcgccccccttatccggacaatctttcttgaaatgaccttgcttgtgac 18856318  T
Q  315 aaagaaatcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctcgacttccccttgcattttcctctctgct 386  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18856317 aaagaaagcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctcgacttccccttgccttttcctctatgct 18856246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 15 - 386
Target Start/End: Original strand, 26300095 - 26300466
Alignment:
Q  15 catcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctc 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26300095 catcaaacatctttacacgaacgttgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagagtcaaagtctc 26300194  T
Q  115 aaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcactc 214  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  26300195 aaaatattcctttctatgacacatgtgataagagcatcccaagtccaaaacccaactcttctccggttcccaacttgtaaccactagtgcacccgcactc 26300294  T
Q  215 tcataaccatcttcataggacgcctccgcaacttgaacggaatgactactattgccccctttatccgagcaatccttcttgaagtgaccttgcatatgac 314  Q
    |||||||| ||||||   || |||||||||||||| || ||| |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||    
T  26300295 tcataaccttcttcacttgaagcctccgcaacttggaccgaaggactaccatcgccccctttatccgaacaatccttcttgaaatgaccttgcttgtgac 26300394  T
Q  315 aaagaaatcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctcgacttccccttgcattttcctctctgct 386  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  26300395 aaagaaagcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctcgacttccccttgccttttcctctatgct 26300466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 15 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 18867012 - 18866641
Alignment:
Q  15 catcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18867012 catcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctc 18866913  T
Q  115 aaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcactc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  18866912 aaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccagctcttctccggttcccaacttgtaaccactagtgcacctgcactc 18866813  T
Q  215 tcataaccatcttcataggacgcctccgcaacttgaacggaatgactactattgccccctttatccgagcaatccttcttgaagtgaccttgcatatgac 314  Q
    |||||||| |||||||  || |||||||||||||| || ||| |||||| || |||||| ||||| |  ||||| |||||||| ||||||||| | ||||    
T  18866812 tcataaccttcttcatttgaagcctccgcaacttggaccgaaggactaccatcgccccccttatctggacaatctttcttgaaatgaccttgcttgtgac 18866713  T
Q  315 aaagaaatcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctcgacttccccttgcattttcctctctgct 386  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18866712 aaagaaagcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctcgacttccccttgccttttcctctatgct 18866641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 10685606 - 10685258
Alignment:
Q  15 catcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10685606 catcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctc 10685507  T
Q  115 aaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcactc 214  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  10685506 aaaatattcctttctagggctcatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaactcttctccggttcccaacttgttaccactagcgcacccgcactc 10685407  T
Q  215 tcataaccatcttcataggacgcctccgcaacttgaacggaatgactactattgccccctttatccgagcaatccttcttgaagtgaccttgcatatgac 314  Q
    |||||||| |||||||  || ||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||| |||||||  ||||| |||||||| ||||||||| | ||||    
T  10685406 tcataaccttcttcattcgaagcctccgcaacttgaaccgaaggactaccatcgccccccttatccggacaatctttcttgaaatgaccttgcttgtgac 10685307  T
Q  315 aaagaaatcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctcgactt 363  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10685306 aaagaaagcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctagactt 10685258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Original strand, 35744134 - 35744483
Alignment:
Q  15 catcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcct-ccttcttttagaatcaaagtct 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35744134 catcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactccttccttcttttagaatcaaagtct 35744233  T
Q  114 caaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcact 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  35744234 caaaatattcctttctaggacacatgtgatatgagcatcccgagtccaaaacccaactcttctccggttcccaacttgttaccactagcgcacccgcact 35744333  T
Q  214 ctcataaccatcttcataggacgcctccgcaacttgaacggaatgactactattgccccctttatccgagcaatccttcttgaagtgaccttgcatatga 313  Q
    ||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||| |||||||  ||||| |||||||| ||||||||| | |||    
T  35744334 ctcataaccttcttcatttgaagcctccgcaacttgaaccgaaggactaccatcgccccccttatccggacaatctttcttgaaatgaccttgcttgtga 35744433  T
Q  314 caaagaaatcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctcgactt 363  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35744434 caaagaaagcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctagactt 35744483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 47 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 23800828 - 23800511
Alignment:
Q  47 ccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctcaaaatattcctttctaggacacatgtgataag 146  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  23800828 ccttggactttgcacgctttgttatttccgagtcgaacaactcttccttcttttagaaccaaagtctcaaaatattccttcctaagacacatgtgataag 23800729  T
Q  147 agcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcactctcataaccatcttcataggacgcctccgcaac 246  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| || | |||||    
T  23800728 agcatcccgagttcaaaacccaactcttctccggttcccaacttgtgaccactagtgcacccgcactctcataaccatgttaatcggacaccactgcaac 23800629  T
Q  247 ttgaacggaatgactactattgccc-cctttatccgagcaatccttcttgaagtgaccttgcatatgacaaagaaatcatttatactttgatttgtcaaa 345  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  23800628 ttgaacggaaggactaccattgccctcctttatccaggcaatccttcttgaagtggccttgcttatgacaaagaaagcatttatactttgatttgtaaaa 23800529  T
Q  346 gcccttggacctcgactt 363  Q
    |||||||||||| |||||    
T  23800528 gcccttggacctagactt 23800511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 222
Target Start/End: Original strand, 16756079 - 16756262
Alignment:
Q  39 tgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctcaaaatattcctttctaggacacat 138  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||||| || ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||    || || ||||| || |||||||| ||||| ||    
T  16756079 tgcccataccttgaattttacaagccttattattaccaaggcgaactactccaccttctttcagctctaacgtttcaaagtactcctttcttggacaaat 16756178  T
Q  139 gtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcactctcataacc 222  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||| || || || |||||||||||| | ||   |||||| || ||||||||||||||    
T  16756179 gtgataagagcacccagagtccaagacccagctcttttcaggttcccaacttgtcacagttagtgctccagcactctcataacc 16756262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 28329270 - 28329087
Alignment:
Q  39 tgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctcaaaatattcctttctaggacacat 138  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||||| || ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||    || || ||||| || |||||||| ||||| ||    
T  28329270 tgcccataccttgaattttacaagccttattattaccaaggcgaactactccaccttctttcagctctaacgtttcaaagtactcctttcttggacaaat 28329171  T
Q  139 gtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcactctcataacc 222  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||| || || || |||||||||||| | ||   |||||| || ||||||||||||||    
T  28329170 gtgataagagcacccagagtccaagacccagctcttttcaggttcccaacttgtcacagttagtgctccagcactctcataacc 28329087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 21038718 - 21038609
Alignment:
Q  113 tcaaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcac 212  Q
    ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||  || || |||||||||||| | ||   |||||| || ||||    
T  21038718 tcaaagtaatcctttctcggacagatgtgataagagcacccagagtccaagacccaacccttttcaggttcccaacttgtcacagttagtgctccagcac 21038619  T
Q  213 tctcataacc 222  Q
    ||||||||||    
T  21038618 tctcataacc 21038609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 107 - 190
Target Start/End: Original strand, 26269193 - 26269276
Alignment:
Q  107 aaagtctcaaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaactt 190  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||| |  || || ||||||||||||    
T  26269193 aaagtttcaaagtagtcctttctcggacagatgtgataagagcatctagagtccaagacccagcccttttcaggttcccaactt 26269276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 41 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 33034001 - 33033874
Alignment:
Q  41 cccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctcaaaatattcctttctaggacacatgt 140  Q
    ||||| ||||| | ||||||||| || ||||| || || ||||||||||  |||||||| ||    ||||| ||||| || |||||||| | ||| ||||    
T  33034001 cccataccttgaattttgcaagccttattattaccaaggcgaacaactcaaccttctttcagctctaaagtttcaaagtactcctttctcgaacatatgt 33033902  T
Q  141 gataagagcatcccgagtccaaaaccca 168  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||    
T  33033901 gataagagcacccagagtccaagaccca 33033874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 15946009 - 15945873
Alignment:
Q  55 tttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctcaaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatccc 154  Q
    |||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||| ||    ||||| | ||| || |||||||  ||| | |||||||||||||| ||     
T  15946009 tttgcaagctttattattaccaaggcgaacaactccaccttctttcagctctaaagtttgaaagtactcctttcccggaaagatgtgataagagcaccca 15945910  T
Q  155 gagtccaaaaccca-acttttctccggttcccaactt 190  Q
    |||||||  |||||  ||||| || ||||||||||||    
T  15945909 gagtccacgacccagccttttttcaggttcccaactt 15945873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 17)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 15 - 386
Target Start/End: Original strand, 21644782 - 21645153
Alignment:
Q  15 catcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21644782 catcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagagtcaaagtctc 21644881  T
Q  115 aaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcactc 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  21644882 aaaatattcctttctaggacacatgtggtaagagcatcccgagtccaaaacccaactcttctccagttcccaacttgtaaccactagtgcacccgcactc 21644981  T
Q  215 tcataaccatcttcataggacgcctccgcaacttgaacggaatgactactattgccccctttatccgagcaatccttcttgaagtgaccttgcatatgac 314  Q
    |||||||| |||||||  || |||||||||||||| || ||| |||||| || ||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||| | ||||    
T  21644982 tcataaccttcttcatttgaagcctccgcaacttggaccgaaggactaccatcgccgcccttatccggacaatccttcttgaaatgaccttgcttgtgac 21645081  T
Q  315 aaagaaatcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctcgacttccccttgcattttcctctctgct 386  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  21645082 aaagaaagcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctcgacttccccttgccttttcctctatgct 21645153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 15 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 9186487 - 9186116
Alignment:
Q  15 catcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  9186487 catcaaacatctttagacgaacgatgcccatgccttggactttgcacgctttgttatttccgagtcaaacaactcctccttcttttagagccaaagtctc 9186388  T
Q  115 aaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcactc 214  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  9186387 aaaatatttctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaactcttctccggttcccaacttgtaaccactagtgcacccgtactc 9186288  T
Q  215 tcataaccatcttcataggacgcctccgcaacttgaacggaatgactactattgccccctttatccgagcaatccttcttgaagtgaccttgcatatgac 314  Q
    |||||||| |||||||  || |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  9186287 tcataaccttcttcatttgaagcctccacaacttgaacggaaggactaccattgccccctttgtccgggcaatccttcttgaaatgaccttgcttatgac 9186188  T
Q  315 aaagaaatcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctcgacttccccttgcattttcctctctgct 386  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  9186187 aaagaaagcatttatactttgatttgtcaaagcccttggatctcgactgccccttgccttttcctctatgct 9186116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Original strand, 21987665 - 21988013
Alignment:
Q  15 catcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  21987665 catcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcacgctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagagccaaagtctc 21987764  T
Q  115 aaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcactc 214  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21987765 aaaatattccttcctaggacacatgtgataagagcatcctgagtccaaaacctaactcttctctggttcccaacttgtgaccactagtgcacccgcactc 21987864  T
Q  215 tcataaccatcttcataggacgcctccgcaacttgaacggaatgactactattgccccctttatccgagcaatccttcttgaagtgaccttgcatatgac 314  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  21987865 tcataaccatcttcatttgacgcctccgcaacttgaacggacggactaccatcgccccctttatccgagcaatccttcttgaaatgaccttgcttatgac 21987964  T
Q  315 aaagaaatcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctcgactt 363  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21987965 aaagaaaatacttatactttgatttgtcaaagcccttggacctagactt 21988013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 15 - 386
Target Start/End: Original strand, 49090433 - 49090805
Alignment:
Q  15 catcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcaagctttgtt-atttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtct 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  49090433 catcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcacgctttttttatttccgagtcgagcaactcctccttcttttagagccaaagtct 49090532  T
Q  114 caaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcact 213  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49090533 caaaatattccttcctaagacacatgtgatcagagcatcccgagtccaaaactcaactcttctccggttcccaacttgtgaccactagtgcacccgcact 49090632  T
Q  214 ctcataaccatcttcataggacgcctccgcaacttgaacggaatgactactattgccccctttatccgagcaatccttcttgaagtgaccttgcatatga 313  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| | ||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  49090633 ctcataaccatcttcattggacgcctccgcaacttgaacggaaggactaccatttccccctttgtccgggaaatccttattgaaatgaccttgcttatga 49090732  T
Q  314 caaagaaatcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctcgacttccccttgcattttcctctctgct 386  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  49090733 caaagaaagcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctcgacttcccattgccttttcctctatgct 49090805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Original strand, 16883672 - 16884020
Alignment:
Q  15 catcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16883672 catcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctc 16883771  T
Q  115 aaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcactc 214  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  16883772 aaaatattcctttctagggctcatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaactcttctccggttcccaacttgttaccactagcgcacccgcactc 16883871  T
Q  215 tcataaccatcttcataggacgcctccgcaacttgaacggaatgactactattgccccctttatccgagcaatccttcttgaagtgaccttgcatatgac 314  Q
    |||||||| |||||||  || ||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||| |||||||  ||||| |||||||| ||||||||| | ||||    
T  16883872 tcataaccttcttcattcgaagcctccgcaacttgaaccgaaggactaccatcgccccccttatccggacaatctttcttgaaatgaccttgcttgtgac 16883971  T
Q  315 aaagaaatcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctcgactt 363  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16883972 aaagaaagcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctagactt 16884020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Original strand, 18412403 - 18412751
Alignment:
Q  15 catcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18412403 catcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagagtcaaagtctc 18412502  T
Q  115 aaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcactc 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  18412503 aaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaactcttctccgatttccaacttgtaaccactagtgcacccgtactc 18412602  T
Q  215 tcataaccatcttcataggacgcctccgcaacttgaacggaatgactactattgccccctttatccgagcaatccttcttgaagtgaccttgcatatgac 314  Q
    |||||||| |||||||  || |||||||||||||| || ||| |||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| | ||||    
T  18412603 tcataaccttcttcatttgaagcctccgcaacttggaccgaaggactaccatcgccccctttatccggacaatccttcttgaaatgaccttgcttgtgac 18412702  T
Q  315 aaagaaatcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctcgactt 363  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18412703 aaagaaagcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctagactt 18412751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 24262665 - 24262317
Alignment:
Q  15 catcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24262665 catcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctc 24262566  T
Q  115 aaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcactc 214  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  24262565 aaaatattcctttctagggctcatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaactcttctccggttcccaacttgttaccactagcgcacccgcactc 24262466  T
Q  215 tcataaccatcttcataggacgcctccgcaacttgaacggaatgactactattgccccctttatccgagcaatccttcttgaagtgaccttgcatatgac 314  Q
    |||||||| |||||||  || ||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||| |||||||  ||||| |||||||| ||||||||| | ||||    
T  24262465 tcataaccttcttcattcgaagcctccgcaacttgaaccgaaggactaccatcgccccccttatccggacaatctttcttgaaatgaccttgcttgtgac 24262366  T
Q  315 aaagaaatcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctcgactt 363  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24262365 aaagaaagcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctagactt 24262317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 84 - 363
Target Start/End: Original strand, 12405151 - 12405430
Alignment:
Q  84 caactcctccttcttttagaatcaaagtctcaaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttc 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  12405151 caactcctccttcttttagaatcaaagtctcaaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaactcaactcttctccggttc 12405250  T
Q  184 ccaacttatgaccactagtgcacccgcactctcataaccatcttcataggacgcctccgcaacttgaacggaatgactactattgccccctttatccgag 283  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||| |||||||      
T  12405251 ccaacttgttaccactagtgcacccacactctcataaccttcttcatttgaagcctccgcaacttgaaccgaaggactaccatcgccccccttatccgga 12405350  T
Q  284 caatccttcttgaagtgaccttgcatatgacaaagaaatcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctcgactt 363  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12405351 caatctttcttgaaatgaccttgcttgtgacaaagaaagcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctagactt 12405430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 15 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 5818527 - 5818188
Alignment:
Q  15 catcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  5818527 catcaaacatctttagacgaacgtttcccatgccttggactttgcaagttttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagagccaaagtctc 5818428  T
Q  115 aaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcactc 214  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  5818427 aaaatatttcttcctaggacacatgtga-aaaaacaccccgagtccaaaacccacctcttctccggttcccaacttgtgaccactaatgcacccgcactc 5818329  T
Q  215 tcataaccatcttcataggacgcctccgcaacttgaacggaatgactactattgccccctttatccgagcaatccttcttgaagtgaccttgcatatgac 314  Q
    ||||||||||||||||  |||| | || ||  ||||||||||  || || | |||||||||| |||   |||||||| ||||||| |||  || ||||||    
T  5818328 tcataaccatcttcattagacgtcaccacagtttgaacggaagaaccaccactgccccctttgtccagacaatccttgttgaagtcaccgggcttatgac 5818229  T
Q  315 aaagaaatcatttatactttgatttgtcaaagcccttggac 355  Q
    ||||||| ||||   ||  |||||||||||  |||||||||    
T  5818228 aaagaaagcattgtaacaatgatttgtcaagccccttggac 5818188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 25352640 - 25352531
Alignment:
Q  113 tcaaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcac 212  Q
    ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || || || |||||||||||| | ||   |||||| || ||||    
T  25352640 tcaaagtactcctttcttggacaaatgtgataagagcacccagagtccaagacccagctcttttcaggttcccaacttgtcacagttagtgctccagcac 25352541  T
Q  213 tctcataacc 222  Q
    ||||||||||    
T  25352540 tctcataacc 25352531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 25406702 - 25406593
Alignment:
Q  113 tcaaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcac 212  Q
    ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || || || |||||||||||| | ||   |||||| || ||||    
T  25406702 tcaaagtactcctttcttggacaaatgtgataagagcacccagagtccaagacccagctcttttcaggttcccaacttgtcacagttagtgctccagcac 25406603  T
Q  213 tctcataacc 222  Q
    ||||||||||    
T  25406602 tctcataacc 25406593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 7071137 - 7070974
Alignment:
Q  59 caagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctcaaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagt 158  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||| |||||||| ||    || || ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||    
T  7071137 caagctttattgttgccaaggcgaacaactccaccttctttcagctctaacgtttcaaagtactcctttctcggacagatgtgataagagcacccagagt 7071038  T
Q  159 ccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcactctcataacc 222  Q
    |||| |||||  | || || |||||||||||| | ||   |||||| || ||||||||||||||    
T  7071037 ccaagacccagatcttttcaggttcccaacttgtcacagttagtgctccagcactctcataacc 7070974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 113 - 222
Target Start/End: Original strand, 3323680 - 3323789
Alignment:
Q  113 tcaaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcac 212  Q
    ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||  | |||||||||||| | ||   |||||| || ||||    
T  3323680 tcaaagtactcctttcttggacaaatgtgataagagcacccggagtccaagacccagctctttccaggttcccaacttgtcacagttagtgctccagcac 3323779  T
Q  213 tctcataacc 222  Q
    ||||||||||    
T  3323780 tctcataacc 3323789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 3787054 - 3786969
Alignment:
Q  105 tcaaagtctcaaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaactt 190  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| ||| || ||||||||||| |||  | |||||  |||||||| ||||| |||||| |||||    
T  3787054 tcaaagtctcaaattatttctttcttggatacttgtgataagagaatcaagggtccattacccaactcttctctggttcctaactt 3786969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 349 - 386
Target Start/End: Original strand, 18412749 - 18412786
Alignment:
Q  349 cttggacctcgacttccccttgcattttcctctctgct 386  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18412749 cttggacctcgacttccccttgccttttcctctatgct 18412786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 349 - 386
Target Start/End: Original strand, 21988011 - 21988048
Alignment:
Q  349 cttggacctcgacttccccttgcattttcctctctgct 386  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  21988011 cttggacctcgacttccccttgccttttcctctatgct 21988048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 190
Target Start/End: Original strand, 44015486 - 44015635
Alignment:
Q  41 cccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctcaaaatattcctttctaggacacatgt 140  Q
    ||||| ||||| | ||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||    || || ||||| || ||||||||  |||| ||||    
T  44015486 cccataccttgaattttacaagccttattattaccgaggcgaacaactccaccttctttcagctctaatgtttcaaagtactcctttctcagacatatgt 44015585  T
Q  141 gataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaactt 190  Q
    |||||||||| ||  ||||||| ||||| |  || || ||||||||||||    
T  44015586 gataagagcacccatagtccaagacccagcccttttcaggttcccaactt 44015635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 1)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 15651 - 15303
Alignment:
Q  15 catcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15651 catcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctc 15552  T
Q  115 aaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcactc 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  15551 aaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaactcttctccggttcccaacttgttaccactagtgcacccgcactc 15452  T
Q  215 tcataaccatcttcataggacgcctccgcaacttgaacggaatgactactattgccccctttatccgagcaatccttcttgaagtgaccttgcatatgac 314  Q
    |||||||| |||||||  || ||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||| |||||||  ||||| |||||||| ||||||||| | ||||    
T  15451 tcataaccttcttcatttgaagcctccgcaacttgaaccgaaggactaccatcgccccccttatccggacaatctttcttgaaatgaccttgcttgtgac 15352  T
Q  315 aaagaaatcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctcgactt 363  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15351 aaagaaagcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctagactt 15303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 17)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 15 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 3324878 - 3324507
Alignment:
Q  15 catcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||    
T  3324878 catcaaacatctttagacgaacggtgcccatgccttgggctttgcatgcttttttatttccgagtcaaacaactcctccttcttttagagccaaagtatc 3324779  T
Q  115 aaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcactc 214  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  3324778 aaaatattccttcctaggacacatgtaataagagcatcccgagtccaacacccaactcttctccggttcccaacttgtgaccactagtgcacccgccctc 3324679  T
Q  215 tcataaccatcttcataggacgcctccgcaacttgaacggaatgactactattgccccctttatccgagcaatccttcttgaagtgaccttgcatatgac 314  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3324678 tcataaccatcttcattggacgccttcgcaacttgcacggaaggattaccattgccccctttattcgggcaatccttcttgaagtgaccttgcttatgac 3324579  T
Q  315 aaagaaatcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctcgacttccccttgcattttcctctctgct 386  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  3324578 aaagaaagcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctcgacttccccttgccttttcctctatgct 3324507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Original strand, 32479085 - 32479433
Alignment:
Q  15 catcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32479085 catcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctc 32479184  T
Q  115 aaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcactc 214  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  32479185 aaaatattcctttctagggctcatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaactcttctccggttcccaacttgttaccactagcgcacccgcactc 32479284  T
Q  215 tcataaccatcttcataggacgcctccgcaacttgaacggaatgactactattgccccctttatccgagcaatccttcttgaagtgaccttgcatatgac 314  Q
    |||||||| |||||||  || ||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||| |||||||  ||||| |||||||| ||||||||| | ||||    
T  32479285 tcataaccttcttcattcgaagcctccgcaacttgaaccgaaggactaccatcgccccccttatccggacaatctttcttgaaatgaccttgcttgtgac 32479384  T
Q  315 aaagaaatcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctcgactt 363  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32479385 aaagaaagcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctagactt 32479433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Original strand, 8515839 - 8516187
Alignment:
Q  15 catcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8515839 catcaaacatctttagacgaacgtttcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctc 8515938  T
Q  115 aaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcactc 214  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  8515939 aaaatattcctttctagggctcatgtgataagagcatcccgagtccaaaacctaactcttctccggttcccaacttgttaccactagtgcacccgcactc 8516038  T
Q  215 tcataaccatcttcataggacgcctccgcaacttgaacggaatgactactattgccccctttatccgagcaatccttcttgaagtgaccttgcatatgac 314  Q
    |||||||| |||||||  || ||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||| |||||||  ||||| |||||||| ||||||||| | ||||    
T  8516039 tcataaccttcttcattcgaagcctccgcaacttgaaccgaaggactaccatcgccccccttatccggacaatctttcttgaaatgaccttgcttgtgac 8516138  T
Q  315 aaagaaatcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctcgactt 363  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8516139 aaagaaagcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctagactt 8516187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Original strand, 16263107 - 16263456
Alignment:
Q  15 catcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  16263107 catcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcacgctttgttatttctgagtcgaacaactcctccttattttagagccaaagtctc 16263206  T
Q  115 aaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcactc 214  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  16263207 aaaatatttcttcctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaactcttctccgattcccaacttgtaaccactagtgcacccgcactc 16263306  T
Q  215 tcataaccatcttcataggacgcctccgcaacttgaacggaatgactactattgccccctttatccgagcaatccttcttg-aagtgaccttgcatatga 313  Q
    ||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  16263307 tcaaaaccatcttcatttgaagcctccgcaacttgaacggaaggactaccattgccccctttatcctggcaatccttcttgaaaatgaccttgcttatga 16263406  T
Q  314 caaagaaatcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctcgactt 363  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  16263407 caaagaaagcatttatactttgatttgtcaaagccctgggacctagactt 16263456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 15 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 9603189 - 9602842
Alignment:
Q  15 catcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctc 114  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||    
T  9603189 catcaaacatctatagacgaatattgtccatgctttggactttgcacgctttgttatttctgagtcgaacaacttctccttctcttagagccaaagtctc 9603090  T
Q  115 aaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcactc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9603089 aaaatattcctttctaggacacatatgataagagcatcccgagtccaaaacccaactcttctccggttcccaacttgtgaccactagtgcacccgcactc 9602990  T
Q  215 tcataaccatcttcataggacgcctccgcaacttgaacggaatgactactattgccccctttatccgagcaatccttcttgaagtgaccttgcatatgac 314  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| || ||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9602989 tcataaccatcttcatttgacgcctccgcaacttgaacggaaggacaaccattgccctctctatccggaaaatccttcttgaagtgaccttgcttatgac 9602890  T
Q  315 aaagaaatcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctcgact 362  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9602889 aaagaaagcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctagact 9602842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 28490515 - 28490168
Alignment:
Q  15 catcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28490515 catcaaacatctttagacgaacgttgcccataccttggactttgcaagctttgttatttccaagtcgaacaactcctccttctttaagaatcaaagtctc 28490416  T
Q  115 aaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcactc 214  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  28490415 aaaatattcatttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaactcagctcttctccggttcccaacttgttaccactagtgcacccgcactc 28490316  T
Q  215 tcataaccatcttcataggacgcctccgcaacttgaacggaatgactactattgccccctttatccgagcaatccttcttgaagtgaccttgcatatgac 314  Q
    |||||||| |||||||  || ||||||| ||||||||| ||| |||||| || |||||| |||||||   |||| |||||||| ||||||||| | ||||    
T  28490315 tcataaccctcttcatttgaagcctccgtaacttgaaccgaaggactaccatcgccccc-ttatccggaaaatctttcttgaaatgaccttgcttgtgac 28490217  T
Q  315 aaagaaatcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctcgactt 363  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  28490216 aaagaaagcatttatactttgatttgtcaaagcccttggatctagactt 28490168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 15 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 2673562 - 2673325
Alignment:
Q  15 catcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2673562 catcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctc 2673463  T
Q  115 aaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcactc 214  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  2673462 aaaatattcctttctagggctcatgtgataagagcatcccgagtccaaaacctaactcttctccggttcccaacttgttaccactagcgcacccgcactc 2673363  T
Q  215 tcataaccatcttcataggacgcctccgcaacttgaac 252  Q
    |||||||| |||||||  || |||||||||||||||||    
T  2673362 tcataaccttcttcattcgaagcctccgcaacttgaac 2673325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 59
Target Start/End: Original strand, 1309616 - 1309660
Alignment:
Q  15 catcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgc 59  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1309616 catcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggacgttgc 1309660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 10898293 - 10898184
Alignment:
Q  113 tcaaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcac 212  Q
    ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |  || || |||||||||||| | ||   |||||| || ||||    
T  10898293 tcaaagtactcctttcttggacaaatgtgataagagcatccagagtccaagacccagcccttttcaggttcccaacttgtcacagttagtgctccagcac 10898194  T
Q  213 tctcataacc 222  Q
    ||||||||||    
T  10898193 tctcataacc 10898184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 113 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 6304599 - 6304490
Alignment:
Q  113 tcaaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcac 212  Q
    ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| || || || |||||||||||| | ||   |||||| || ||||    
T  6304599 tcaaagtactcctttcttggacaaatgtgataagagcacccagagtcaaagacccagctcttttcaggttcccaacttgtcacagttagtgctccagcac 6304500  T
Q  213 tctcataacc 222  Q
    ||||||||||    
T  6304499 tctcataacc 6304490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 113 - 222
Target Start/End: Original strand, 10097699 - 10097808
Alignment:
Q  113 tcaaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcac 212  Q
    ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || || || |||| ||||||| | ||   |||||| || ||||    
T  10097699 tcaaagtactcctttcttggacaaatgtgataagagcacccagagtccaagacccagctcttttcaggttaccaacttgtcacagttagtgctccagcac 10097798  T
Q  213 tctcataacc 222  Q
    ||||||||||    
T  10097799 tctcataacc 10097808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 113 - 222
Target Start/End: Original strand, 10204584 - 10204693
Alignment:
Q  113 tcaaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcac 212  Q
    ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || || || |||| ||||||| | ||   |||||| || ||||    
T  10204584 tcaaagtactcctttcttggacaaatgtgataagagcacccagagtccaagacccagctcttttcaggttaccaacttgtcacagttagtgctccagcac 10204683  T
Q  213 tctcataacc 222  Q
    ||||||||||    
T  10204684 tctcataacc 10204693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 113 - 222
Target Start/End: Original strand, 22624872 - 22624981
Alignment:
Q  113 tcaaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcac 212  Q
    ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |  || || |||||||||||| | ||   |||||| || ||||    
T  22624872 tcaaagtactcctttctcggacagatgtgataagagcacccagagtccaagacccagcccttttcaggttcccaacttgtcacagttagtgctccagcac 22624971  T
Q  213 tctcataacc 222  Q
    ||||||||||    
T  22624972 tctcataacc 22624981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 113 - 222
Target Start/End: Original strand, 29912848 - 29912957
Alignment:
Q  113 tcaaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcac 212  Q
    ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |  || || |||||||||||| | ||   |||||| || ||||    
T  29912848 tcaaagtactcctttctcggacagatgtgataagagcacccagagtccaagacccagcccttttcaggttcccaacttgtcacagttagtgctccagcac 29912947  T
Q  213 tctcataacc 222  Q
    ||||||||||    
T  29912948 tctcataacc 29912957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 39 - 170
Target Start/End: Original strand, 47881707 - 47881838
Alignment:
Q  39 tgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctcaaaatattcctttctaggacacat 138  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||||  || ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||    || || ||||| || |||||||| ||||| ||    
T  47881707 tgcccataccttgaattttacaagtcttattattgccaaggcgaactactccaccttcttttagctctaatgtttcaaagtactcctttctcggacagat 47881806  T
Q  139 gtgataagagcatcccgagtccaaaacccaac 170  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  47881807 gtgataagagcacccagagtccaagacccaac 47881838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 190
Target Start/End: Original strand, 10611670 - 10611747
Alignment:
Q  113 tcaaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaactt 190  Q
    ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |  || || ||||||||||||    
T  10611670 tcaaagtactcctttctcggacagatgtgataagagcacccagagtccaagacccagcccttttcaggttcccaactt 10611747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 349 - 386
Target Start/End: Original strand, 16263454 - 16263491
Alignment:
Q  349 cttggacctcgacttccccttgcattttcctctctgct 386  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16263454 cttggacctcgacttccccttgccttttcctctatgct 16263491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 9)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 14738914 - 14738566
Alignment:
Q  15 catcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14738914 catcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctc 14738815  T
Q  115 aaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcactc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  14738814 aaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccagctcttctccggttcccaacttgttaccactagtgcacccgcactc 14738715  T
Q  215 tcataaccatcttcataggacgcctccgcaacttgaacggaatgactactattgccccctttatccgagcaatccttcttgaagtgaccttgcatatgac 314  Q
    |||||||| |||||||  || ||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||| |||||||  ||||| |||||||| ||||||||| | ||||    
T  14738714 tcataaccttcttcatttgaagcctccgcaacttgaaccgaaggactaccatcgccccccttatccggacaatctttcttgaaatgaccttgcttgtgac 14738615  T
Q  315 aaagaaatcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctcgactt 363  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14738614 aaagaaagcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctagactt 14738566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 24432663 - 24432315
Alignment:
Q  15 catcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  24432663 catcaaacatctttagacgaacggtgcccacgccttggactgtgcacgctttgttatttccgagtcgaacaactcctcattcttttagagccaaagtctc 24432564  T
Q  115 aaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcactc 214  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  24432563 aaaatattcctttctatgacatacgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaactcttctctggttcccaacttatgaccgctagtgcacccacactc 24432464  T
Q  215 tcataaccatcttcataggacgcctccgcaacttgaacggaatgactactattgccccctttatccgagcaatccttcttgaagtgaccttgcatatgac 314  Q
    |||||| |||||||||  || ||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||  | ||||    
T  24432463 tcataaacatcttcatcagatgccaccgcaacttgaacggaaggactagcattgccccctctatccgggtaatccttcttgaagtgacattgtttgtgac 24432364  T
Q  315 aaagaaatcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctcgactt 363  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  24432363 aaagaaagcatttatactttgatttgtcaaaacccttggacctagactt 24432315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Original strand, 29485332 - 29485667
Alignment:
Q  15 catcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctc 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||             |||||||||||||||| ||||||| |    
T  29485332 catcaaacatctttagacgaatgttgcccatgccttggactttgcacgctttattatttcc-------------cctccttcttttagaaccaaagtccc 29485418  T
Q  115 aaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcactc 214  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  29485419 aaaatattccttcctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaactcttctccggttcccaacttgtaaccactagtgcacccgcactc 29485518  T
Q  215 tcataaccatcttcataggacgcctccgcaacttgaacggaatgactactattgccccctttatccgagcaatccttcttgaagtgaccttgcatatgac 314  Q
    ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  29485519 tcataacaatcttcattggacacctccgcaacttgaacggatggactaccattgccccctttagccgggcaatccttcttgaaatgaccttgcttatgac 29485618  T
Q  315 aaagaaatcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctcgactt 363  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29485619 aaagaaagcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctagactt 29485667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 15 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 33332418 - 33332126
Alignment:
Q  15 catcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33332418 catcaaacatctttagacgaacgttgcccgtgccttggactttgcaagctttgttatttctgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctc 33332319  T
Q  115 aaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcactc 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  33332318 aaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaactcttctccggttcccaacttgttaccactagcgcacccgcactc 33332219  T
Q  215 tcataaccatcttcataggacgcctccgcaacttgaacggaatgactactattgccccctttatccgagcaatccttcttgaagtgaccttgc 307  Q
    |||||||| |||||||  || ||||||||||||||||| ||  ||| ||| | |||||| |||||||  ||||| |||||||| |||||||||    
T  33332218 tcataaccttcttcatttgaagcctccgcaacttgaaccgagggaccactttcgccccccttatccggacaatctttcttgaaatgaccttgc 33332126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 352
Target Start/End: Original strand, 24077670 - 24078012
Alignment:
Q  10 atggacatcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaa 109  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||| |   ||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||    
T  24077670 atggatatcaaacatatttaaacgaacggtagacatgcgttggactttgcaagccttgttatttttgagtcgaacaactccaccttcttttagatccaaa 24077769  T
Q  110 gtctcaaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccg 209  Q
    |||||||||||||||||||    | |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| | |||||||||| ||| | ||| ||||||||    
T  24077770 gtctcaaaatattcctttcccaaaaacatgtgataagagcaccctgagtccaagacccaactcttctctgattcccaacttgtgatcgctaatgcacccg 24077869  T
Q  210 cactctcataaccatcttcataggacgcctccgcaacttgaacggaatgactactattgccccctttatccgagcaatccttcttgaagtgaccttgcat 309  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||| ||| |||  ||||| ||| || || || || |  |||||||||||||||||||| ||  |    
T  24077870 cactctcataaccatcttcatcggacgccattgcaacttaaacagaagaactaccatttcctcccttgtcaggacaatccttcttgaagtgaccatgttt 24077969  T
Q  310 atgacaaa-gaaatcatttatactttgatttgtcaaagcccttg 352  Q
    |||||||| ||||| ||  |||||||||||| ||||| ||||||    
T  24077970 atgacaaatgaaat-atcgatactttgatttatcaaaccccttg 24078012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 33331492 - 33331440
Alignment:
Q  311 tgacaaagaaatcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctcgactt 363  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33331492 tgacaaagaaagcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctagactt 33331440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 13880027 - 13879918
Alignment:
Q  113 tcaaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcac 212  Q
    ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || || || |||||||||||| | ||   |||||| || ||||    
T  13880027 tcaaagtactcctttcttggacaaatgtgataagagcacccagagtccaagacccagctcttttcaggttcccaacttgtcacagttagtgctccagcac 13879928  T
Q  213 tctcataacc 222  Q
    ||||||||||    
T  13879927 tctcataacc 13879918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 113 - 222
Target Start/End: Original strand, 22349864 - 22349973
Alignment:
Q  113 tcaaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcac 212  Q
    ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||| |||||||  || || |||||||||||| | ||   |||||| || ||||    
T  22349864 tcaaagtactcctttctcggacatatgtgataagagcacctagagtccaagacccaacccttttcaggttcccaacttgtcacagttagtgctccagcac 22349963  T
Q  213 tctcataacc 222  Q
    ||||||||||    
T  22349964 tctcataacc 22349973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 113 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 25942957 - 25942848
Alignment:
Q  113 tcaaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcac 212  Q
    ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |  || || |||||||||||| | ||   |||||| || ||||    
T  25942957 tcaaagtactcctttctcggacagatgtgataagagcacccagagtccaagacccagcccttttcaggttcccaacttgtcacagttagtgctccagcac 25942858  T
Q  213 tctcataacc 222  Q
    ||||||||||    
T  25942857 tctcataacc 25942848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 16)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Original strand, 33790060 - 33790408
Alignment:
Q  15 catcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctc 114  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33790060 catcaaacatctttagatgaacgttgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctc 33790159  T
Q  115 aaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcactc 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  33790160 aaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaactcttctccggttcccaacttgttaccactagcgcacccgcactc 33790259  T
Q  215 tcataaccatcttcataggacgcctccgcaacttgaacggaatgactactattgccccctttatccgagcaatccttcttgaagtgaccttgcatatgac 314  Q
    |||||||| |||||||  || ||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||| |||||||  ||||| |||||||| ||||||||| | ||||    
T  33790260 tcataaccttcttcatttgaagcctccgcaacttgaaccgaaggactaccatcgccccccttatccggacaatctttcttgaaatgaccttgcttgtgac 33790359  T
Q  315 aaagaaatcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctcgactt 363  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33790360 aaagaaagcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctagactt 33790408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Original strand, 27448567 - 27448915
Alignment:
Q  15 catcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27448567 catcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctc 27448666  T
Q  115 aaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcactc 214  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  27448667 aaaatattcatttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccagctcttctccggttcccaacttgttaccactagtgcacccgcactc 27448766  T
Q  215 tcataaccatcttcataggacgcctccgcaacttgaacggaatgactactattgccccctttatccgagcaatccttcttgaagtgaccttgcatatgac 314  Q
    |||||||| |||||||  || |||||| |||||||||| ||| |||||| || |||||| |||||||  ||||| |||||||| ||||||||| | ||||    
T  27448767 tcataaccttcttcatttgaagcctccacaacttgaaccgaaggactaccatcgccccccttatccggacaatctttcttgaaatgaccttgcttgtgac 27448866  T
Q  315 aaagaaatcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctcgactt 363  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27448867 aaagaaagcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctagactt 27448915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 31398334 - 31397986
Alignment:
Q  15 catcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31398334 catcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctc 31398235  T
Q  115 aaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcactc 214  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  31398234 aaaatgttcctttctagggctcatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaactcttctccggttcccaacttgttaccactagcgcacccgcactc 31398135  T
Q  215 tcataaccatcttcataggacgcctccgcaacttgaacggaatgactactattgccccctttatccgagcaatccttcttgaagtgaccttgcatatgac 314  Q
    |||||||| |||||||  || ||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||| |||||||  ||||| |||||||| ||||||||| | ||||    
T  31398134 tcataaccttcttcattcgaagcctccgcaacttgaactgaaggactaccatcgccccccttatccggacaatctttcttgaaatgaccttgcttgtgac 31398035  T
Q  315 aaagaaatcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctcgactt 363  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31398034 aaagaaagcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctagactt 31397986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Original strand, 43595866 - 43596214
Alignment:
Q  15 catcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctc 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43595866 catcaaacatatttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctc 43595965  T
Q  115 aaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcactc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  43595966 aaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccagctcttctccggttcccaacttgttaccactagtgcacccgcactc 43596065  T
Q  215 tcataaccatcttcataggacgcctccgcaacttgaacggaatgactactattgccccctttatccgagcaatccttcttgaagtgaccttgcatatgac 314  Q
    |||||||| |||||||  || |||||| |||||||||| ||| |||||| || |||||  |||||||  ||||| |||||||| ||||||||| | ||||    
T  43596066 tcataaccttcttcatttgaagcctccacaacttgaaccgaaggactaccatcgcccctcttatccggacaatctttcttgaaatgaccttgcttgtgac 43596165  T
Q  315 aaagaaatcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctcgactt 363  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43596166 aaagaaagcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctagactt 43596214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Original strand, 43628660 - 43629008
Alignment:
Q  15 catcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctc 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43628660 catcaaacatatttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctc 43628759  T
Q  115 aaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcactc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  43628760 aaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccagctcttctccggttcccaacttgttaccactagtgcacccgcactc 43628859  T
Q  215 tcataaccatcttcataggacgcctccgcaacttgaacggaatgactactattgccccctttatccgagcaatccttcttgaagtgaccttgcatatgac 314  Q
    |||||||| |||||||  || |||||| |||||||||| ||| |||||| || |||||  |||||||  ||||| |||||||| ||||||||| | ||||    
T  43628860 tcataaccttcttcatttgaagcctccacaacttgaaccgaaggactaccatcgcccctcttatccggacaatctttcttgaaatgaccttgcttgtgac 43628959  T
Q  315 aaagaaatcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctcgactt 363  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43628960 aaagaaagcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctagactt 43629008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 37557966 - 37557618
Alignment:
Q  15 catcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37557966 catcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaattcctccttcttttagaatcaaagtctc 37557867  T
Q  115 aaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcactc 214  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  37557866 aaaatattccattctaggaatcatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaactcttctctggttcccaacttgttaccactagtgcacccgcactc 37557767  T
Q  215 tcataaccatcttcataggacgcctccgcaacttgaacggaatgactactattgccccctttatccgagcaatccttcttgaagtgaccttgcatatgac 314  Q
    |||||||| |||||||  || ||||||||||||||||| ||  ||| ||  | |||||| |||||||  ||||| |||||||| ||||||||| | ||||    
T  37557766 tcataaccttcttcatttgaagcctccgcaacttgaaccgagggaccaccttcgccccccttatccggacaatctttcttgaaatgaccttgcttgtgac 37557667  T
Q  315 aaagaaatcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctcgactt 363  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37557666 aaagaaagcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctagactt 37557618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 16 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 24556925 - 24556579
Alignment:
Q  16 atcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctca 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24556925 atcaaacatctttagacgaacggtgcccatgccttggactttgcacgctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagagccaaagtctca 24556826  T
Q  116 aaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcactct 215  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||    
T  24556825 aaatattcctttgtaggatacatgtgataagatcatcccaagtccaaaacccaactcttctctggttcccaacttgtgaccactagtgcacccaca-tct 24556727  T
Q  216 cataaccatcttcataggacgcctccgcaacttgaacggaatgactactattgccccctttatccgagcaatccttcttgaagtgaccttgcatatgaca 315  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||  |  ||||    
T  24556726 cataaccatcttcatcggacgccaccgcaacttgaacggaaggactaccattgccccatttatccaggcaatccttcttgaagtgaccttgtttgagaca 24556627  T
Q  316 aagaaatcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctcgactt 363  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  24556626 aagaaagcatttatactttgatttgtcaaaactcttggacctagactt 24556579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 16 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 24597957 - 24597611
Alignment:
Q  16 atcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctca 115  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24597957 atcaaacatctttagacgaacggtgcccatgccttggactttgcacgctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagagccaaagtctca 24597858  T
Q  116 aaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcactct 215  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||    
T  24597857 aaatattcctttgtaggatacatgtgataagatcatcccaagtccaaaacccaactcttctctggttcccaacttgtgaccactagtgcacccaca-tct 24597759  T
Q  216 cataaccatcttcataggacgcctccgcaacttgaacggaatgactactattgccccctttatccgagcaatccttcttgaagtgaccttgcatatgaca 315  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||  |  ||||    
T  24597758 cataaccatcttcatcggacgccaccgcaacttgaacggaaggactaccattgccccatttatccaggcaatccttcttgaagtgaccttgtttgagaca 24597659  T
Q  316 aagaaatcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctcgactt 363  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  24597658 aagaaagcatttatactttgatttgtcaaaactcttggacctagactt 24597611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Original strand, 28837037 - 28837145
Alignment:
Q  15 catcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctc 114  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  28837037 catcaaacatctttagacaaacggtgcccatgccttggactttgcatgctttgttatttccaagtcgaacaactcctccttcttttaaagccaaagtctc 28837136  T
Q  115 aaaatattc 123  Q
    |||||||||    
T  28837137 aaaatattc 28837145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 56 - 273
Target Start/End: Original strand, 34841402 - 34841619
Alignment:
Q  56 ttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctcaaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccg 155  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||    ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||| |||     
T  34841402 ttgcaagctttgttgttttcgagtcgaacaactccgtcttcttttaactccaaagtctcaaaatacttctttctagaacacatgtgatcagagcaaccca 34841501  T
Q  156 agtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcactctcataaccatcttcataggacgcctccgcaacttgaacgga 255  Q
    ||||||| ||| |||| || |  |||| |||| || ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| | | | ||||||||||| ||    
T  34841502 agtccaagacctaactattttttggtttccaatttgtgaccgctagtgcacctgcactctcctaaccatcttcatcggaagtcactgcaacttgaaccga 34841601  T
Q  256 atgactactattgccccc 273  Q
    |  ||||| |||||||||    
T  34841602 agaactaccattgccccc 34841619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 190
Target Start/End: Original strand, 31781298 - 31781429
Alignment:
Q  59 caagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctcaaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagt 158  Q
    ||||| |||||||| || || |||||||||||  ||||||| ||   ||| || ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  31781298 caagccttgttattaccaaggcgaacaactccatcttctttcagctccaatgtttcaaagtactcctttctcagacagatgtgataagagcatccagagt 31781397  T
Q  159 ccaaaacccaacttttctccggttcccaactt 190  Q
    |||| |||||||  || || ||||||||||||    
T  31781398 ccaagacccaacccttttcaggttcccaactt 31781429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 113 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 25446775 - 25446698
Alignment:
Q  113 tcaaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaactt 190  Q
    ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||  || || ||||||||||||    
T  25446775 tcaaagtactcctttctcggacagatgtgataagagcacccagagtccaagacccaacccttttcaggttcccaactt 25446698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 349 - 386
Target Start/End: Original strand, 27448913 - 27448950
Alignment:
Q  349 cttggacctcgacttccccttgcattttcctctctgct 386  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  27448913 cttggacctcgacttccccttgccttttcctctatgct 27448950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 349 - 386
Target Start/End: Original strand, 43596212 - 43596249
Alignment:
Q  349 cttggacctcgacttccccttgcattttcctctctgct 386  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  43596212 cttggacctcgacttccccttgccttttcctctatgct 43596249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 349 - 386
Target Start/End: Original strand, 43629006 - 43629043
Alignment:
Q  349 cttggacctcgacttccccttgcattttcctctctgct 386  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  43629006 cttggacctcgacttccccttgccttttcctctatgct 43629043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 10628678 - 10628590
Alignment:
Q  82 aacaactcctccttcttttagaatcaaagtctcaaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaac 170  Q
    ||||||||| |||||||| ||    ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||| |||||||    
T  10628678 aacaactccaccttctttcagctctaaagtttcaaagtactcctttctcggacaaatgtgataagaacacccagagtccaagacccaac 10628590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 7)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Original strand, 41396984 - 41397332
Alignment:
Q  15 catcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctc 114  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41396984 catcaaacatctttagacaaacgttgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctc 41397083  T
Q  115 aaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcactc 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  41397084 aaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaactcttctccggttcccaacttgttaccactagtgcacccgcactc 41397183  T
Q  215 tcataaccatcttcataggacgcctccgcaacttgaacggaatgactactattgccccctttatccgagcaatccttcttgaagtgaccttgcatatgac 314  Q
    |||||||| |||| ||  || ||||||||||||||||| ||| ||||||  | |||||| |||||||  ||||| |||||||| ||||||||| | ||||    
T  41397184 tcataaccttctttatttgaagcctccgcaacttgaaccgaaggactaccgtcgccccccttatccggacaatctttcttgaaatgaccttgcttgtgac 41397283  T
Q  315 aaagaaatcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctcgactt 363  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41397284 aaagaaagcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctagactt 41397332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 47100160 - 47099812
Alignment:
Q  15 catcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  47100160 catcaaacatctttagacgaacagtgcccatgccttggactttgcacgctttgttattttcgagtcaaacaactcctccttcttttagagccaaagtctc 47100061  T
Q  115 aaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcactc 214  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  47100060 aaaatatttcttcctatgacacatgtgataagagcatccaaggtccaaaactcaactcttctccggttcccaacttgtaaccactagtgcacccgcactc 47099961  T
Q  215 tcataaccatcttcataggacgcctccgcaacttgaacggaatgactactattgccccctttatccgagcaatccttcttgaagtgaccttgcatatgac 314  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47099960 tcataaccatcttcattggaagcctccacaacttgaacggaaggactaccattgccccctttatccgggtaatccttcttgaagtgaccttgcttatgac 47099861  T
Q  315 aaagaaatcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctcgactt 363  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  47099860 aaagaaagcatttatactttgatttgtcaaaccccttggacctagactt 47099812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 49 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 19360146 - 19359832
Alignment:
Q  49 ttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctcaaaatattcctttctaggacacatgtgataagag 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19360146 ttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagagtcaaagcctcaaaatattcctttctaggacacatgtgataagag 19360047  T
Q  149 catcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcactctcataaccatcttcataggacgcctccgcaactt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||    
T  19360046 catcccgagtccaaaacccaactcttctccggttcccaacttgtaaccactagtgcacccgcactctcataaccttcttcatttgaagcctccgcaactt 19359947  T
Q  249 gaacggaatgactactattgccccctttatccgagcaatccttcttgaagtgaccttgcatatgacaaagaaatcatttatactttgatttgtcaaagcc 348  Q
    | |||||| |||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19359946 ggacggaaggactaccatcgccccctttatccgggaaatccttcttgaaatgaccttgctaatgacaaagaaagcatttatactttgatttgtcaaagcc 19359847  T
Q  349 cttggacctcgactt 363  Q
    ||||||||| |||||    
T  19359846 cttggaccttgactt 19359832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 16 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 9025139 - 9024878
Alignment:
Q  16 atcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaa-gtctc 114  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||     
T  9025139 atcaaacatctttagacgaacggtgcccatgccttggactttgcaagctttgttatt-ccgagtcgaacaactccttcttcttttagagccaaaagtctt 9025041  T
Q  115 aaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcactc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||  ||||||||||||||| |||||||  | | ||||| ||||||||||||||||||||       
T  9025040 aaaatattcctttctaggacacatgtgataagaaaaccccaggtccaaaacccaactcttctccgacttcgaacttgtgaccactagtgcacccgca--g 9024943  T
Q  215 tcataaccatcttcataggacgcctccgcaacttgaacggaatgactactattgccccctttatc 279  Q
     |||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||||  || || |||||||||||||||    
T  9024942 acatatccatcttcatcggactccaccgcaacttgaacggaagaaccaccattgccccctttatc 9024878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 117 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 17346753 - 17346550
Alignment:
Q  117 aatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcactctc 216  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||     
T  17346753 aatattcattcctaggacacatgtgataagagcaccccgactccaaaacctaactcttctctggttcccaacttgtgaccactaatgcacccacactcta 17346654  T
Q  217 ataaccatcttcataggacgcctccgcaacttgaacggaatgactactattgccccctttatccgagcaatccttcttgaagtgaccttgcatatgacaa 316  Q
    ||||||||||||||   ||||| || ||||||||| ||||  || || |||||||||||  |  || |||||||||||||||||| |  || | ||||||    
T  17346653 ataaccatcttcatcaaacgccaccacaacttgaatggaagaaccaccattgcccccttgttt-gaacaatccttcttgaagtgatcgggcttttgacaa 17346555  T
Q  317 agaaa 321  Q
    |||||    
T  17346554 agaaa 17346550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 113 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 9523016 - 9522907
Alignment:
Q  113 tcaaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcac 212  Q
    ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |  || || |||||||||||| | ||   |||||| || ||||    
T  9523016 tcaaagtactcctttcttggacagatgtgataagagcacccagagtccaagacccatcccttttcaggttcccaacttgtcacagttagtgctccagcac 9522917  T
Q  213 tctcataacc 222  Q
    ||||||||||    
T  9522916 tctcataacc 9522907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 125 - 220
Target Start/End: Original strand, 2400129 - 2400224
Alignment:
Q  125 tttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcactctcataa 220  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |  || || |||||||||||| | ||   |||||| || ||||||||||||    
T  2400129 tttctcggacagatgtgataagagcatccagagtccaagacccagcccttttcaggttcccaacttgtcacagttagtgctccagcactctcataa 2400224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Original strand, 1252 - 1600
Alignment:
Q  15 catcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  1252 catcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcacgccttgttatttccgagtcgagctactcctccttcttttagagccaaagtctc 1351  T
Q  115 aaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcactc 214  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1352 aaaatattcatttctaagacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaactcttctccggttcccaacttgtgaccactagtgcacccgcactc 1451  T
Q  215 tcataaccatcttcataggacgcctccgcaacttgaacggaatgactactattgccccctttatccgagcaatccttcttgaagtgaccttgcatatgac 314  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  1452 tcataaccatcttcatcggacgccacaacaacttgaacggaaggactaccattgccccctttattcgggaaatccttctttaagtgaccttgcttatgac 1551  T
Q  315 aaagaaatcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctcgactt 363  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  1552 aaagaaagcatttatactttgatttgtcaaagccctgggacctagactt 1600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 349 - 386
Target Start/End: Original strand, 1598 - 1635
Alignment:
Q  349 cttggacctcgacttccccttgcattttcctctctgct 386  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  1598 cttggacctcgacttccccttgccttttcctctatgct 1635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 9)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Original strand, 19348023 - 19348370
Alignment:
Q  15 catcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19348023 catcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttctgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctc 19348122  T
Q  115 aaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcactc 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||    
T  19348123 aaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaactcttctccggttcccaacttgttaccactagcgcacctgcactc 19348222  T
Q  215 tcataaccatcttcataggacgcctccgcaacttgaacggaatgactactattgccccctttatccgagcaatccttcttgaagtgaccttgcatatgac 314  Q
    |||||||| |||||||  || ||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||| |||||||  ||||| |||||||| ||||||||| | ||||    
T  19348223 tcataaccttcttcatttgaagcctccgcaacttgaaccgaaggactaccatcgccccc-ttatccggacaatctttcttgaaatgaccttgcttgtgac 19348321  T
Q  315 aaagaaatcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctcgactt 363  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19348322 aaagaaagcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctagactt 19348370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 67 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 10446715 - 10446401
Alignment:
Q  67 gttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctcaaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacc 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10446715 gttatttccgagtcgaacaactcctctttcttttagagccaaagtatcaaaatattccttcctgggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacc 10446616  T
Q  167 caacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcactctcataaccatcttcataggacgcctccgcaacttgaacggaatgactactat 266  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10446615 caactcttctccggttcccaacttgtgaccactagtgcacccgcactctcataaccatcgtcattggttgcctccgcaacttgaacggaatgactaccat 10446516  T
Q  267 tgccccctttatccgagcaatccttcttgaagtgaccttgcatatgacaaagaaatcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctcgacttccc 366  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10446515 tgccccctttatccaggcaatccttcttgaagtgaccttgcttatgacaaagaaagcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctcgacttccc 10446416  T
Q  367 cttgcattttcctct 381  Q
    ||||| |||||||||    
T  10446415 cttgccttttcctct 10446401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 105 - 363
Target Start/End: Original strand, 25402485 - 25402743
Alignment:
Q  105 tcaaagtctcaaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  25402485 tcaaagtctcaaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaactcttctctggttcccaacttgtaaccactagtgc 25402584  T
Q  205 acccgcactctcataaccatcttcataggacgcctccgcaacttgaacggaatgactactattgccccctttatccgagcaatccttcttgaagtgacct 304  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||| || ||| |||||| || |||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  25402585 acccgcactctcataaccttcttcatttgatgcctccgcaacttggaccgaaggactaccatcgccccccttatccggacaatccttcttgaaatgacct 25402684  T
Q  305 tgcatatgacaaagaaatcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctcgactt 363  Q
    ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25402685 tgcttgtgacaaagaaagcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctagactt 25402743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 2737493 - 2737384
Alignment:
Q  113 tcaaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcac 212  Q
    ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || || || |||||||||||| | ||   |||||| || ||||    
T  2737493 tcaaagtactcctttcttggacaaatgtgataagagcacccagagtccaagacccagctcttttcaggttcccaacttgtcacagttagtgctccagcac 2737394  T
Q  213 tctcataacc 222  Q
    ||||||||||    
T  2737393 tctcataacc 2737384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 39681334 - 39681225
Alignment:
Q  113 tcaaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcac 212  Q
    ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || || || |||||||||||| | ||   |||||| || ||||    
T  39681334 tcaaagtactcctttcttggacaaatgtgataagagcacccagagtccaagacccagctcttttcaggttcccaacttgtcacagttagtgctccagcac 39681235  T
Q  213 tctcataacc 222  Q
    ||||||||||    
T  39681234 tctcataacc 39681225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 113 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 17933409 - 17933332
Alignment:
Q  113 tcaaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaactt 190  Q
    ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||  || || ||||||||||||    
T  17933409 tcaaagtactcctttctcggacagatgtgataagagcacccagagtccaagacccaacccttttcaggttcccaactt 17933332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 190
Target Start/End: Original strand, 20053653 - 20053730
Alignment:
Q  113 tcaaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaactt 190  Q
    ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |  || || ||||||||||||    
T  20053653 tcaaagtactcctttctcggacagatgtgataagagcacccagagtccaagacccagcccttttcaggttcccaactt 20053730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 349 - 386
Target Start/End: Original strand, 25402741 - 25402778
Alignment:
Q  349 cttggacctcgacttccccttgcattttcctctctgct 386  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  25402741 cttggacctcgacttccccttgccttttcctctatgct 25402778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 162
Target Start/End: Original strand, 28456323 - 28456444
Alignment:
Q  41 cccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctcaaaatattcctttctaggacacatgt 140  Q
    ||||| ||||| | ||||||||| || ||||| || || ||||||||||| |||||||| ||    || || ||||| || || ||||| ||||| ||||    
T  28456323 cccataccttgaattttgcaagccttattattaccaaggcgaacaactccaccttctttcagctgtaatgtttcaaagtactcatttctcggacagatgt 28456422  T
Q  141 gataagagcatcccgagtccaa 162  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  28456423 gataagagcaaccagagtccaa 28456444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0842 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0842
Description:

Target: scaffold0842; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 34 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 4521 - 4188
Alignment:
Q  34 aacgttgcccatgccttggactttgca----agctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctcaaaatattcctttct 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||| ||    
T  4521 aacgttgcccatgccttggactttgcacgctagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttaaagccaaagtctcaaaatatttcttcct 4422  T
Q  130 aggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcactctcataaccatcttca 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4421 aggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaactcttctccgatttccaacttgtaaccactagtgcacccgcactctcataaccatcttca 4322  T
Q  230 taggacgcctccgcaacttgaacggaatgactactattgccccctttatccgagcaatccttcttgaagtgaccttgcatatgacaaagaaatcatttat 329  Q
    |  |||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  4321 tttgacgcctctgcaaattgaacggaaggactaccattgccccctttatccgggcaatccttcttgaaatgaccttgcttatgacaaagaaagcatttat 4222  T
Q  330 actttgatttgtcaaagcccttggacctcgactt 363  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  4221 actttgatttgtcaaagctcttggacctagactt 4188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 65 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 150247 - 149949
Alignment:
Q  65 ttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctcaaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaa 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  150247 ttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctcaaaatattcctttctagggctcatgtgataagagcatcccgagtccaaaa 150148  T
Q  165 cccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcactctcataaccatcttcataggacgcctccgcaacttgaacggaatgactact 264  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||| ||| ||||||     
T  150147 cccaactcttctccggttcccaacttgttaccactagcgcacccgcactctcataaccttcttcattcgaagcctccgcaacttgaaccgaaggactacc 150048  T
Q  265 attgccccctttatccgagcaatccttcttgaagtgaccttgcatatgacaaagaaatcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctcgactt 363  Q
    || |||||| |||||||  ||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  150047 atcgccccccttatccggacaatctttcttgaaatgaccttgcttgtgacaaagaaagcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctagactt 149949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 105 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 19191 - 18933
Alignment:
Q  105 tcaaagtctcaaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  19191 tcaaagtctcaaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacctatctcttctccggttcccaacttgtaaccactagtgc 19092  T
Q  205 acccgcactctcataaccatcttcataggacgcctccgcaacttgaacggaatgactactattgccccctttatccgagcaatccttcttgaagtgacct 304  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  || |||| ||||||||| || ||| |||||| || |||||| |||||||  ||||||||||| || | ||||    
T  19091 acccgcactctcataaccttcttcatttgaagccttcgcaacttggaccgaaggactaccatcgccccccttatccggacaatccttcttaaaataacct 18992  T
Q  305 tgcatatgacaaagaaatcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctcgactt 363  Q
    ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  18991 tgcttgtgacaaagaaagcatttatactttgatttgtcaaatcccttggacctagactt 18933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 15 - 249
Target Start/End: Original strand, 35755 - 35989
Alignment:
Q  15 catcaaacatctttagacgaacgttgcccatgccttggactttgcaagctttgttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagaatcaaagtctc 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||    
T  35755 catcaaagatctttagacgaacggtgcccatgacttggattttgcaagcttttttatttccgagtcgaacaactcctccttcttttagagccaaattctc 35854  T
Q  115 aaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaacttatgaccactagtgcacccgcactc 214  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||| | ||||||||||||||  ||||     
T  35855 aaaatattccttcataagacacatgtgataagagcaccccgagtccaaaacccaactcttctctagttctcaacttgtaaccactagtgcaccgacactt 35954  T
Q  215 tcataaccatcttcataggacgcctccgcaacttg 249  Q
    |||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||    
T  35955 tcataaccatcttcaccggaggccaccgcaacttg 35989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 268 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 966 - 871
Alignment:
Q  268 gccccctttatccgagcaatccttcttgaagtgaccttgcatatgacaaagaaatcatttatactttgatttgtcaaagcccttggacctcgactt 363  Q
    |||||| |||||||  ||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||    
T  966 gccccccttatccggacaatctttcttgaaatgaccttgcttgtgacaaagaaagcatttatactttgatttgttaaatcccttggatctagactt 871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 113 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 17613 - 17536
Alignment:
Q  113 tcaaaatattcctttctaggacacatgtgataagagcatcccgagtccaaaacccaacttttctccggttcccaactt 190  Q
    ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |  || || ||||||||||||    
T  17613 tcaaagtactcctttctcggacagatgtgataagagcatccagagtccaagacccagcccttttcaggttcccaactt 17536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University