View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8775_low_1 (Length: 388)

Name: NF8775_low_1
Description: NF8775
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8775_low_1
NF8775_low_1
[»] chr3 (35 HSPs)
chr3 (14-371)||(12248329-12248685)
chr3 (14-316)||(23758314-23758616)
chr3 (14-269)||(13382153-13382409)
chr3 (14-269)||(13392747-13393003)
chr3 (14-343)||(38195778-38196107)
chr3 (14-269)||(4744819-4745074)
chr3 (14-269)||(5511775-5512030)
chr3 (14-269)||(5546505-5546760)
chr3 (14-269)||(5875146-5875401)
chr3 (14-343)||(39373107-39373437)
chr3 (14-343)||(28323701-28324031)
chr3 (14-269)||(16477358-16477615)
chr3 (14-269)||(24660997-24661251)
chr3 (14-269)||(5626861-5627115)
chr3 (14-269)||(12295704-12295958)
chr3 (14-269)||(41684756-41685010)
chr3 (14-322)||(6499864-6500180)
chr3 (16-323)||(16390427-16390744)
chr3 (14-188)||(37867664-37867838)
chr3 (14-188)||(37876182-37876356)
chr3 (14-322)||(9992794-9993112)
chr3 (14-269)||(24392956-24393211)
chr3 (14-187)||(19779600-19779773)
chr3 (14-186)||(6219538-6219710)
chr3 (14-261)||(8775794-8776040)
chr3 (14-259)||(18485129-18485373)
chr3 (104-321)||(10654248-10654462)
chr3 (14-184)||(20682617-20682787)
chr3 (14-184)||(14466815-14466985)
chr3 (14-184)||(13122889-13123059)
chr3 (21-189)||(29470675-29470843)
chr3 (14-108)||(10635920-10636014)
chr3 (328-371)||(8775686-8775729)
chr3 (328-371)||(18485055-18485098)
chr3 (290-343)||(8775729-8775782)
[»] chr2 (18 HSPs)
chr2 (14-352)||(9907060-9907398)
chr2 (14-269)||(40223396-40223651)
chr2 (14-343)||(27222409-27222738)
chr2 (14-269)||(43346462-43346717)
chr2 (14-343)||(35254021-35254351)
chr2 (14-343)||(35264630-35264960)
chr2 (14-269)||(11404345-11404604)
chr2 (14-269)||(9772231-9772489)
chr2 (44-269)||(34803301-34803526)
chr2 (14-269)||(10268046-10268300)
chr2 (14-269)||(10278623-10278877)
chr2 (14-188)||(29245393-29245567)
chr2 (14-188)||(43083835-43084009)
chr2 (14-186)||(24337264-24337436)
chr2 (14-183)||(4211085-4211254)
chr2 (14-184)||(22959203-22959373)
chr2 (14-48)||(34799692-34799726)
chr2 (14-47)||(35759242-35759275)
[»] chr7 (26 HSPs)
chr7 (14-352)||(466541-466878)
chr7 (14-269)||(2715185-2715440)
chr7 (14-269)||(9086337-9086592)
chr7 (14-269)||(26399644-26399899)
chr7 (14-269)||(8011635-8011892)
chr7 (14-343)||(11006221-11006552)
chr7 (14-269)||(26698677-26698932)
chr7 (14-189)||(21001956-21002131)
chr7 (14-188)||(5686723-5686897)
chr7 (14-188)||(9434427-9434601)
chr7 (14-269)||(24735834-24736088)
chr7 (14-269)||(11097117-11097376)
chr7 (14-269)||(40051652-40051906)
chr7 (14-261)||(1988657-1988903)
chr7 (14-188)||(6876791-6876965)
chr7 (16-193)||(19992966-19993143)
chr7 (14-261)||(42866947-42867193)
chr7 (14-186)||(22090372-22090544)
chr7 (14-184)||(4213219-4213389)
chr7 (14-184)||(17959623-17959793)
chr7 (14-182)||(8618587-8618755)
chr7 (14-184)||(168090-168260)
chr7 (23-185)||(15887203-15887365)
chr7 (328-371)||(42866840-42866883)
chr7 (301-343)||(1988593-1988635)
chr7 (301-343)||(42866883-42866925)
[»] scaffold0906 (1 HSPs)
scaffold0906 (14-371)||(3424-3788)
[»] chr6 (27 HSPs)
chr6 (14-269)||(12856018-12856273)
chr6 (14-269)||(26865861-26866116)
chr6 (14-269)||(3662413-3662668)
chr6 (14-269)||(25788797-25789052)
chr6 (14-189)||(9122013-9122188)
chr6 (14-269)||(17983618-17983877)
chr6 (14-269)||(26026489-26026743)
chr6 (14-269)||(27342797-27343051)
chr6 (14-269)||(27403537-27403791)
chr6 (16-188)||(25590360-25590532)
chr6 (14-269)||(12726317-12726576)
chr6 (14-269)||(16931463-16931718)
chr6 (14-193)||(27373928-27374107)
chr6 (14-193)||(27464281-27464460)
chr6 (98-343)||(4631883-4632129)
chr6 (98-343)||(27385409-27385655)
chr6 (98-343)||(27475822-27476068)
chr6 (98-343)||(32310648-32310894)
chr6 (14-184)||(34816655-34816825)
chr6 (14-182)||(32971358-32971526)
chr6 (100-188)||(7669378-7669466)
chr6 (14-130)||(27385644-27385760)
chr6 (14-130)||(27476057-27476173)
chr6 (14-130)||(4632118-4632234)
chr6 (14-130)||(32310543-32310659)
chr6 (23-185)||(12359298-12359460)
chr6 (328-371)||(32310894-32310937)
[»] chr4 (17 HSPs)
chr4 (14-343)||(18761969-18762297)
chr4 (14-269)||(451673-451928)
chr4 (14-343)||(24641337-24641667)
chr4 (14-269)||(30935979-30936234)
chr4 (14-269)||(21997513-21997768)
chr4 (14-343)||(27657670-27658000)
chr4 (14-250)||(55754716-55754952)
chr4 (14-269)||(10750056-10750310)
chr4 (14-269)||(10963825-10964079)
chr4 (14-269)||(36019433-36019687)
chr4 (14-188)||(24026926-24027100)
chr4 (14-186)||(17919294-17919466)
chr4 (14-188)||(19953843-19954017)
chr4 (16-188)||(40469482-40469654)
chr4 (14-184)||(16257112-16257282)
chr4 (328-371)||(18762297-18762340)
chr4 (216-283)||(40469690-40469757)
[»] scaffold0105 (1 HSPs)
scaffold0105 (14-343)||(46482-46811)
[»] chr8 (21 HSPs)
chr8 (14-269)||(209087-209342)
chr8 (14-269)||(722710-722965)
chr8 (14-269)||(29077811-29078066)
chr8 (14-269)||(32087203-32087458)
chr8 (14-269)||(15766081-15766339)
chr8 (14-269)||(15790218-15790476)
chr8 (14-343)||(13687498-13687828)
chr8 (14-269)||(36294030-36294285)
chr8 (14-269)||(242914-243168)
chr8 (14-269)||(796284-796538)
chr8 (14-269)||(3358139-3358393)
chr8 (14-269)||(9342236-9342490)
chr8 (14-188)||(19129938-19130112)
chr8 (14-188)||(26112468-26112642)
chr8 (14-261)||(36079044-36079290)
chr8 (98-343)||(44482152-44482398)
chr8 (14-184)||(6152292-6152462)
chr8 (23-185)||(19226134-19226296)
chr8 (14-130)||(44482387-44482503)
chr8 (23-185)||(30324171-30324333)
chr8 (301-343)||(36078980-36079022)
[»] chr5 (37 HSPs)
chr5 (14-269)||(9345562-9345817)
chr5 (14-269)||(23371531-23371786)
chr5 (14-269)||(23706378-23706633)
chr5 (14-269)||(36583526-36583781)
chr5 (14-269)||(42052390-42052645)
chr5 (14-269)||(14559085-14559340)
chr5 (14-269)||(24589081-24589336)
chr5 (14-269)||(30228473-30228728)
chr5 (14-269)||(15768362-15768619)
chr5 (14-269)||(15994310-15994565)
chr5 (14-269)||(31842987-31843242)
chr5 (14-269)||(37730975-37731234)
chr5 (14-269)||(6985320-6985574)
chr5 (14-269)||(14039619-14039873)
chr5 (14-269)||(22685025-22685279)
chr5 (14-269)||(23305868-23306122)
chr5 (14-269)||(27469583-27469837)
chr5 (14-269)||(17728498-17728757)
chr5 (14-269)||(27043234-27043491)
chr5 (14-269)||(31358115-31358374)
chr5 (14-250)||(17616641-17616877)
chr5 (14-269)||(39491915-39492169)
chr5 (14-269)||(14448055-14448308)
chr5 (14-269)||(24817869-24818123)
chr5 (14-188)||(5291675-5291849)
chr5 (14-188)||(27604554-27604728)
chr5 (18-323)||(31447510-31447825)
chr5 (14-186)||(40399989-40400161)
chr5 (14-261)||(35225084-35225330)
chr5 (14-187)||(39361270-39361443)
chr5 (98-343)||(36697301-36697547)
chr5 (14-184)||(22156074-22156244)
chr5 (43-189)||(1110295-1110441)
chr5 (21-189)||(20796650-20796818)
chr5 (14-130)||(36697196-36697312)
chr5 (328-371)||(36697547-36697590)
chr5 (290-343)||(35225339-35225392)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (14-269)||(32234-32489)
[»] chr1 (20 HSPs)
chr1 (14-269)||(12731552-12731807)
chr1 (14-269)||(12742145-12742400)
chr1 (14-343)||(35400043-35400373)
chr1 (14-343)||(35647568-35647898)
chr1 (14-269)||(38096126-38096383)
chr1 (14-343)||(3172589-3172920)
chr1 (14-269)||(51655375-51655629)
chr1 (14-269)||(7508343-7508597)
chr1 (14-269)||(36245931-36246185)
chr1 (14-188)||(4168401-4168575)
chr1 (14-188)||(19180085-19180259)
chr1 (14-261)||(47617437-47617682)
chr1 (14-261)||(5834278-5834524)
chr1 (14-186)||(5649257-5649429)
chr1 (14-186)||(21864824-21864996)
chr1 (14-184)||(12622677-12622847)
chr1 (21-189)||(153158-153326)
chr1 (290-343)||(5834216-5834269)
chr1 (297-343)||(47617700-47617746)
chr1 (328-368)||(47617746-47617786)
[»] scaffold1216 (1 HSPs)
scaffold1216 (16-188)||(267-439)
[»] scaffold0199 (2 HSPs)
scaffold0199 (98-352)||(23632-23894)
scaffold0199 (14-130)||(23883-23999)
[»] scaffold0454 (2 HSPs)
scaffold0454 (98-343)||(2291-2537)
scaffold0454 (14-130)||(2526-2642)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (21-189)||(52481-52649)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (16-93)||(3552-3629)
[»] scaffold0398 (2 HSPs)
scaffold0398 (23-189)||(3250-3416)
scaffold0398 (111-189)||(11593-11671)
[»] scaffold1002 (1 HSPs)
scaffold1002 (98-189)||(2861-2952)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (118-185)||(23758-23825)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 35)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 14 - 371
Target Start/End: Original strand, 12248329 - 12248685
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||| |   | || || ||||||||||||||    
T  12248329 tggacatcactccttactatccagaagaagaatacatcacaagggctgctagaattcatgctgggcataaaaggaaattaagggaaaaggatgagctact 12248428  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12248429 tcagaagaaggatgatcagatcaagcatctcttagaacagttgtttaagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 12248528  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgtttttaaatcatatgttctatacttttaattctgatgatatttattg 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12248529 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgtttttaaatcatatgttctatacttttaattctgatgatatttattg 12248628  T
Q  314 tttttaatgtcttatgctctgatacttcttatgtttttatatggttatatgctctgct 371  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  12248629 tttttaatgtcttatgctctaatacttcttatgttttta-aggtttatatgctctgct 12248685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 23758616 - 23758314
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |   | || || ||||||||||||||    
T  23758616 tggacatcactccttactatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaattaagggaaaaggatgagctact 23758517  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23758516 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactaacttgttttttacttttgt 23758417  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgtttttaaatcatatgttctatacttttaattctgatgatatttattg 313  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23758416 tcttagtagctttgtctttgtatcttaacctttatttataaatattatcattgtttataaatcatatgttctatacttttaattctgataatatttattg 23758317  T
Q  314 ttt 316  Q
    |||    
T  23758316 ttt 23758314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 13382153 - 13382409
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  13382153 tggacatcactcctttctatccagaggaagagtacatcacaagggctgctagaattcaggctgggtataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 13382252  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttg-ttttttacttttg 212  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13382253 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgtttttttacttttg 13382352  T
Q  213 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  13382353 ttcttagtagctttgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 13382409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 13392747 - 13393003
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  13392747 tggacatcactcctttctatccagaggaagagtacatcacaagggctgctagaattcaggctgggtataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 13392846  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttg-ttttttacttttg 212  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13392847 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgtttttttacttttg 13392946  T
Q  213 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  13392947 ttcttagtagctttgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 13393003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 38196107 - 38195778
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  |  |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  38196107 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 38196008  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  38196007 taagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttgt 38195909  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt-ttaaatcatatgttctatacttttaattctgatgatatttatt 312  Q
    |||  ||||  ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||    
T  38195908 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctatttttttaactctaatgatatttatt 38195809  T
Q  313 gtttttaatgtcttatgctctgatacttctt 343  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38195808 gattttaatgtcatatgctctgatacttctt 38195778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 4745074 - 4744819
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  4745074 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 4744975  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4744974 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 4744875  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  4744874 tcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 4744819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 5512030 - 5511775
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  5512030 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 5511931  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5511930 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 5511831  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  5511830 tcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 5511775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 5546505 - 5546760
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  5546505 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 5546604  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5546605 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 5546704  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  5546705 tcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 5546760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 5875146 - 5875401
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||  ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  5875146 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacaaagaatgagggaaaaggatgagctact 5875245  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5875246 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 5875345  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  5875346 tcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 5875401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 39373437 - 39373107
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  |  |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  39373437 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 39373338  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  39373337 taagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttgt 39373239  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt-ttaaatcatatgttcta-tacttttaattctgatgatatttat 311  Q
    |||  ||||  ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||| |  |||||| ||| |||||||||||    
T  39373238 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctattttttttaactctaatgatatttat 39373139  T
Q  312 tgtttttaatgtcttatgctctgatacttctt 343  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39373138 tgattttaatgtcatatgctctgatacttctt 39373107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 343
Target Start/End: Original strand, 28323701 - 28324031
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||  |  |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  28323701 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatctcaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 28323800  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  28323801 taagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-tttttacttttgt 28323899  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt-ttaaatcatatgttcta-tacttttaattctgatgatatttat 311  Q
    |||  ||||  ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||| |  |||||| ||| |||||||||||    
T  28323900 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctattttttttaactctaatgatatttat 28323999  T
Q  312 tgtttttaatgtcttatgctctgatacttctt 343  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28324000 tgattttaatgtcatatgctctgatacttctt 28324031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 16477615 - 16477358
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | |||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  16477615 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 16477516  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16477515 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 16477416  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctt--tataaatattatcattgttt 269  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||    
T  16477415 tcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatatattatcattgttt 16477358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 24661251 - 24660997
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  24661251 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 24661152  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24661151 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 24661052  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    |||| |||||| | || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  24661051 tcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatc-ttctttatatatattatcattgttt 24660997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 5626861 - 5627115
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | |||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  5626861 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 5626960  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5626961 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 5627060  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    |||| |||||| | || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  5627061 tcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatc-ttctttatatatattatcattgttt 5627115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 12295704 - 12295958
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | |||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  12295704 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 12295803  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12295804 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 12295903  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    |||| |||||| | || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  12295904 tcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatc-ttctttatatatattatcattgttt 12295958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 41685010 - 41684756
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | |||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  41685010 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 41684911  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41684910 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 41684811  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    |||| |||||| | || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  41684810 tcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatc-ttctttatatatattatcattgttt 41684756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 322
Target Start/End: Original strand, 6499864 - 6500180
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  6499864 tggacatcactcctttctatcaagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 6499963  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacac---tagcttgttttttacttt 210  Q
    | ||||||||||||| || || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||     
T  6499964 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatcttttggaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacacttttagcttg-tttttacttg 6500062  T
Q  211 tgttc-------ttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgtttttaaatcatatgttctatacttttaattctgatg 303  Q
    |||||       | |||||||||  |||||||||||||| | ||  ||| |||||||||||||||| | ||  |||||||||| | |||||| |||||||    
T  6500063 tgttctaaattatcagtagcttttcctttgtatcttaacttgtcaatat-aatattatcattgtttctgaaaaatatgttctacagttttaactctgatg 6500161  T
Q  304 atatttattgtttttaatg 322  Q
    || ||||||||||||||||    
T  6500162 atgtttattgtttttaatg 6500180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 16 - 323
Target Start/End: Original strand, 16390427 - 16390744
Alignment:
Q  16 gacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctactta 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||     
T  16390427 gacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggcagccagaattcatgctgggtttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctacttc 16390526  T
Q  116 agaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaaca---ctagcttgt-----tttttac 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    | ||||||     ||||| |    
T  16390527 agaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccgacattctttgcttgttttaatttttgc 16390626  T
Q  208 t-tttgttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgtttttaaatcatatgttcta-tacttttaattctgatgat 305  Q
    | |  ||| |||||||||||  |||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||  |  ||||| |||||| ||    
T  16390627 tctaagttgttagtagctttgcctttgtatcttaacttatctatataaatgttatcattgtttctaaatcttatgttttacaagctttaactctgataat 16390726  T
Q  306 atttattgtttttaatgt 323  Q
    ||||  ||||||||||||    
T  16390727 atttgctgtttttaatgt 16390744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 37867838 - 37867664
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  37867838 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 37867739  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37867738 taagaagaaggatgagcaaattaagtatcttttggaatagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacaccca 37867664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 37876356 - 37876182
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  37876356 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 37876257  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37876256 taagaagaaggatgagcaaattaagtatcttttggaatagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacaccca 37876182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 322
Target Start/End: Original strand, 9992794 - 9993112
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  9992794 tggacatcactcctttctatcccgaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 9992893  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacac---tagcttgttttttacttt 210  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||    
T  9992894 taagaagaaggatgatcatatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactcttagcttg-tttttacttt 9992992  T
Q  211 tgttc--------ttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgtttttaaatcatatgttctatacttttaattctgat 302  Q
     ||||        | |||||||||  || ||||||||||  | ||  |||||||||||||||| ||| | ||  |||||||||| | |||||| ||| ||    
T  9992993 ggttctaaatttatcagtagctttgcctctgtatcttaatttgtcaatataaatattatcattatttctgaaaaatatgttctacagttttaactctaat 9993092  T
Q  303 gatatttattgtttttaatg 322  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  9993093 gatatttattgtttttaatg 9993112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 24392956 - 24393211
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  24392956 tggacatcactcctttctattcagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 24393055  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttg-ttttttacttttg 212  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  24393056 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttttttacttttg 24393155  T
Q  213 ttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    ||||| |||||| | || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  24393156 ttcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatc-ttctttatatatattatcattgttt 24393211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 19779773 - 19779600
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  19779773 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcataagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 19779674  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccc 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19779673 taagaagaaggatgagcaaattaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacaccc 19779600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 186
Target Start/End: Original strand, 6219538 - 6219710
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  6219538 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 6219637  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacc 186  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6219638 taagcagaaggatgaacaaattaagtatctcttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacacc 6219710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 8776040 - 8775794
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  |  |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  8776040 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 8775941  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  8775940 taagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttgt 8775842  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattat 261  Q
    |||  ||||  ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  8775841 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattat 8775794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 18485373 - 18485129
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  |  |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  18485373 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 18485274  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  18485273 taagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttgt 18485175  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatatt 259  Q
    |||  ||||  ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  18485174 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatatt 18485129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 104 - 321
Target Start/End: Original strand, 10654248 - 10654462
Alignment:
Q  104 atgagctacttaagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgtttt 203  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  10654248 atgagctacttcagaagaaagatgatcaaatcaagtatctcttagaatagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-ttt 10654346  T
Q  204 ttacttttgttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgtttttaaatcatatgttctatacttttaattctgatg 303  Q
    |||||||||||||  ||||||||  |||||||  |||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10654347 ttacttttgttctctgtagctttgcctttgta--ttatactttctttataaatatcatcattgtttataaatcatatgttctatacttttaattctgata 10654444  T
Q  304 atatttattgtttttaat 321  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  10654445 atatttactgtttttaat 10654462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 184
Target Start/End: Original strand, 20682617 - 20682787
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  20682617 tggacatcactcctttctatacagaagaagagtacatcacaagggcatcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 20682716  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcaca 184  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  20682717 caagaagaaggatgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcaca 20682787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 14466985 - 14466815
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  14466985 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatctcaagggcaacaagaattcatgctgggtacaaaagaagattgagggaaaaggatgagctact 14466886  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcaca 184  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  14466885 caaaaagaaggatgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcaca 14466815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 13123059 - 13122889
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||| ||||||  ||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  13123059 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatctcaagggcaacaagaattcattctgggtacaaaagaagattgagggaaaaggatgagctact 13122960  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcaca 184  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  13122959 caaaaagaaggatgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcaca 13122889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 189
Target Start/End: Original strand, 29470675 - 29470843
Alignment:
Q  21 cactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaag 120  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||  ||||||  |||||||| | |||| |||||    
T  29470675 cactcctttctatccagaagatgaggacatttcaaggactgctagaattcatgctgggttgaaaagtagactgagagcaaaggatgaacaacttcagaag 29470774  T
Q  121 aaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 189  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29470775 aaggatgagcaaattaagtatctattggaacagttgtataagcaagccaaaccttagttgcacacccaa 29470843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 108
Target Start/End: Original strand, 10635920 - 10636014
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgag 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |  |||||||| |||||||||    
T  10635920 tggacatcactccttactatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaaatgagagaaaaggatgag 10636014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 328 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 8775729 - 8775686
Alignment:
Q  328 tgctctgatacttcttatgtttttatatggttatatgctctgct 371  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8775729 tgctctgatacttattatgtttttatttggttatatgctctgct 8775686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 328 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 18485098 - 18485055
Alignment:
Q  328 tgctctgatacttcttatgtttttatatggttatatgctctgct 371  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18485098 tgctctgatacttattatgtttttatttggttatatgctctgct 18485055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 8775782 - 8775729
Alignment:
Q  290 ttttaattctgatgatatttattgtttttaatgtcttatgctctgatacttctt 343  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  8775782 ttttaactctaatgatatttattgattttaatgtcacatgctctgatacttctt 8775729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 18)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 14 - 352
Target Start/End: Original strand, 9907060 - 9907398
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |   | || || ||||||||||||||    
T  9907060 tggacatcactccttactatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaattaagggaaaaggatgagctact 9907159  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9907160 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagtaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 9907259  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgtttttaaatcatatgttctatacttttaattctgatgatatttattg 313  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9907260 tcttagtagctttgtctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgtttataaatcatatgttctatacttttaattctgataatatttattg 9907359  T
Q  314 tttttaatgtcttatgctctgatacttcttatgttttta 352  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  9907360 tttttaatgtcttatgctctcatatttcttatgttttta 9907398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 40223651 - 40223396
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  40223651 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgctagaattcaggctgggtataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 40223552  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40223551 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 40223452  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  40223451 tcttagtagctttgtctttgtatcttaatccttctttatatatattatcattgttt 40223396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 27222738 - 27222409
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  |  |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  27222738 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 27222639  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  27222638 taagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttgt 27222540  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt-ttaaatcatatgttctatacttttaattctgatgatatttatt 312  Q
    |||  ||||  ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||    
T  27222539 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctatttttttaactctaatgatatttatt 27222440  T
Q  313 gtttttaatgtcttatgctctgatacttctt 343  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27222439 gattttaatgtcatatgctctgatacttctt 27222409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 43346717 - 43346462
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  43346717 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 43346618  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43346617 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 43346518  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  43346517 tcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 43346462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 35254351 - 35254021
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  |  |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  35254351 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 35254252  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  35254251 taagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttgt 35254153  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt-ttaaatcatatgttcta-tacttttaattctgatgatatttat 311  Q
    |||  ||||  ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||| |  |||||| ||| |||||||||||    
T  35254152 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctattttttttaactctaatgatatttat 35254053  T
Q  312 tgtttttaatgtcttatgctctgatacttctt 343  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35254052 tgattttaatgtcatatgctctgatacttctt 35254021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 35264960 - 35264630
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  |  |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  35264960 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 35264861  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  35264860 taagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttgt 35264762  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt-ttaaatcatatgttcta-tacttttaattctgatgatatttat 311  Q
    |||  ||||  ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||| |  |||||| ||| |||||||||||    
T  35264761 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctattttttttaactctaatgatatttat 35264662  T
Q  312 tgtttttaatgtcttatgctctgatacttctt 343  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35264661 tgattttaatgtcatatgctctgatacttctt 35264630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 11404345 - 11404604
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  11404345 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 11404444  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttg----ttttttactt 209  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    ||||||||||    
T  11404445 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttttttactt 11404544  T
Q  210 ttgttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  11404545 ttgttcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 11404604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 9772231 - 9772489
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||| |   | || || ||||||||||||||    
T  9772231 tggacatcactccttactatccagaagaagagtacatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaattaagggaaaaggatgagctact 9772330  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttg---ttttttacttt 210  Q
    | ||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  9772331 tcagaagaaagatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgtttttttttacttt 9772430  T
Q  211 tgttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9772431 tgttcttcgtagctttgtctttgtatcttaacctttctttatatatattatcattgttt 9772489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 44 - 269
Target Start/End: Original strand, 34803301 - 34803526
Alignment:
Q  44 agtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaaggatgagcaaattaagtatct 143  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||| ||||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||| || || ||||||||    
T  34803301 agtacatcacaagggttgctagaattcaggctgggtataaaagaagaatgagggaaaaggatgaactacttcagaagaaggatgatcagatcaagtatct 34803400  T
Q  144 cttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgttcttagtagctttatctttgtatcttaacc 243  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  34803401 cttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgttcttagtagctttgtctttgtatcttaatc 34803500  T
Q  244 tttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||||    
T  34803501 tttctttatatatattatcattgttt 34803526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 10268300 - 10268046
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | |||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  10268300 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 10268201  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | |||| |||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10268200 tcagaaaaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 10268101  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    |||| |||||| | || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  10268100 tcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatc-ttctttatatatattatcattgttt 10268046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 10278877 - 10278623
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | |||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  10278877 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 10278778  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | |||| |||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10278777 tcagaaaaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 10278678  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    |||| |||||| | || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  10278677 tcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatc-ttctttatatatattatcattgttt 10278623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 29245567 - 29245393
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  29245567 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacattacaagggctgcaagaattcatgctgggtttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 29245468  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29245467 taagaagaaggatgagcaaattaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacaccca 29245393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 43084009 - 43083835
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  43084009 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgttgggtttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 43083910  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43083909 taagaagaaggatgagcaaattaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacaccca 43083835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 186
Target Start/End: Original strand, 24337264 - 24337436
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  24337264 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 24337363  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacc 186  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24337364 caagaagaaggatgagcaaattaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacacc 24337436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 4211254 - 4211085
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||| |  |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  4211254 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatctcaagggcaacaagaattcatgctggatacaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 4211155  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcac 183  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  4211154 caaaaagaaggatgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcac 4211085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 184
Target Start/End: Original strand, 22959203 - 22959373
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||||  |||| || || |||||||||||    
T  22959203 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatctcaagggcaacaagaattcatgctgggtacaaaagaagattgagggaaaaagatgagctact 22959302  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcaca 184  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  22959303 caaaaagaaggatgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcaca 22959373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 48
Target Start/End: Original strand, 34799692 - 34799726
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtac 48  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34799692 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtac 34799726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 47
Target Start/End: Original strand, 35759242 - 35759275
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagta 47  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35759242 tggacatcactcctttctatccagaagaagagta 35759275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 26)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 14 - 352
Target Start/End: Original strand, 466541 - 466878
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |   | || || ||||||||||||||    
T  466541 tggacatctctccttactatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaattaagggaaaaggatgagctact 466640  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  466641 tcagaagaaagatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttt-tacttttgt 466739  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgtttttaaatcatatgttctatacttttaattctgatgatatttattg 313  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  466740 tcttagtagctttctctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgtttataactcatatgttctatacttttaattctgataatatttattg 466839  T
Q  314 tttttaatgtcttatgctctgatacttcttatgttttta 352  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  466840 tttttaatgtcttatgctctcatatttcttatgttttta 466878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 2715185 - 2715440
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  2715185 tggacatcactccttactatccagaagaagagtacatcacaagggctgctagaattcaggctgggtataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 2715284  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | | ||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2715285 tcaaaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 2715384  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  2715385 tcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 2715440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 9086592 - 9086337
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | |||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  9086592 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 9086493  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9086492 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 9086393  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  9086392 tcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 9086337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 26399644 - 26399899
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  26399644 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 26399743  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26399744 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaactgttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 26399843  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  26399844 tcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 26399899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 8011635 - 8011892
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  8011635 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 8011734  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8011735 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 8011834  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctt--tataaatattatcattgttt 269  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||    
T  8011835 tcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttctatatatattatcattgttt 8011892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 11006552 - 11006221
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  |  |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  11006552 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 11006453  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  11006452 taagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttgt 11006354  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt-ttaaatcatatgttcta--tacttttaattctgatgatattta 310  Q
    |||  ||||  ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||  |  |||||| ||| ||||||||||    
T  11006353 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctatttttttttaactctaatgatattta 11006254  T
Q  311 ttgtttttaatgtcttatgctctgatacttctt 343  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11006253 ttgattttaatgtcatatgctctgatacttctt 11006221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 26698677 - 26698932
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  26698677 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 26698776  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26698777 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaatagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacatccaactctagcttgttttttacttttgt 26698876  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  26698877 tcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 26698932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 189
Target Start/End: Original strand, 21001956 - 21002131
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  21001956 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 21002055  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21002056 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 21002131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 5686897 - 5686723
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5686897 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 5686798  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5686797 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 5686723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 9434601 - 9434427
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  9434601 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 9434502  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9434501 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 9434427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 24736088 - 24735834
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  24736088 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 24735989  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24735988 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 24735889  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    |||| |||||| | || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  24735888 tcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatc-ttctttatatatattatcattgttt 24735834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 11097376 - 11097117
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaag-ggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctac 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  11097376 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagtggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctac 11097277  T
Q  113 ttaagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgtt---ttttactt 209  Q
    || ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||    
T  11097276 ttcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttttttttactt 11097177  T
Q  210 ttgttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  11097176 ttgttcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 11097117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 40051652 - 40051906
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||  ||||| || ||||||||||||||    
T  40051652 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaataatgagggaaaaggatgagctact 40051751  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40051752 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 40051851  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    |||| |||||| | || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  40051852 tcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatc-ttctttatatatattatcattgttt 40051906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 1988903 - 1988657
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  1988903 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 1988804  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  1988803 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttgt 1988705  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattat 261  Q
    |||  ||||  ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  1988704 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattat 1988657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 188
Target Start/End: Original strand, 6876791 - 6876965
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  6876791 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 6876890  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6876891 taagaagaaggatgagcaaattaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacaccca 6876965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Original strand, 19992966 - 19993143
Alignment:
Q  16 gacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctactta 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  19992966 gacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgctagaattcatgctggattcaaaagaagaatgagagaaaaggatgagttactta 19993065  T
Q  116 agaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacact 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19993066 agaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacact 19993143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 42867193 - 42866947
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  |  |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  42867193 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 42867094  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  42867093 taagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttgt 42866995  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattat 261  Q
    |||  ||||  ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  42866994 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattat 42866947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 22090544 - 22090372
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  22090544 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggcaaccagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 22090445  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacc 186  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  22090444 caaaaagaaggatgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcacacc 22090372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 4213389 - 4213219
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  4213389 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacattacaagggcatcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagggaaaatgatgagctact 4213290  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcaca 184  Q
     ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  4213289 caagaagaaggatgagaaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcaca 4213219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 184
Target Start/End: Original strand, 17959623 - 17959793
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  17959623 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatctcaagggcaacaagaattcatgctgggtacaaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 17959722  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcaca 184  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  17959723 caaaaagaaggatgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcaca 17959793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 8618755 - 8618587
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||  |||| ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  8618755 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatctcaagggcaacaagaattcatgctgggtacaaaataagaatgagggaaaaggatgagctact 8618656  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgca 182  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  8618655 caaaaagaaggatgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgca 8618587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 168260 - 168090
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||||  |||| || || |||||||||||    
T  168260 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatctcaagggcaacaagaattcatgctgggtacaaaagaagattgagggaaaaagatgagctact 168161  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcaca 184  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  168160 caaaaagaaggatgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcaca 168090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 185
Target Start/End: Original strand, 15887203 - 15887365
Alignment:
Q  23 ctcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaa 122  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||   |||||||||  ||||| || |||||| | ||||||||  ||||||   || | || | |||| |||||||    
T  15887203 ctcctttttatccagaagatgattacacttcaagggctgatagaattcaagctgggctgaaaagaagactgagagcacagaaagaacaacttcagaagaa 15887302  T
Q  123 ggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacac 185  Q
     ||||||||  |||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  15887303 tgatgagcaggttaaatatctattggaacagatgtctaagctagccaaaccttagttgcacac 15887365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 328 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 42866883 - 42866840
Alignment:
Q  328 tgctctgatacttcttatgtttttatatggttatatgctctgct 371  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42866883 tgctctgatacttattatgtttttatttggttatatgctctgct 42866840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 301 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 1988635 - 1988593
Alignment:
Q  301 atgatatttattgtttttaatgtcttatgctctgatacttctt 343  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1988635 atgatatttattgattttaatgtcatatgctctgatacttctt 1988593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 301 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 42866925 - 42866883
Alignment:
Q  301 atgatatttattgtttttaatgtcttatgctctgatacttctt 343  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42866925 atgatatttattgattttaatgtcatatgctctgatacttctt 42866883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0906 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0906
Description:

Target: scaffold0906; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 14 - 371
Target Start/End: Original strand, 3424 - 3788
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| ||||   | || || ||||||||||||||    
T  3424 tggatatcactcccttctacccagaggaagaatacatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcataagagaaaattaagggaaaaggatgagctact 3523  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgtttttt------ac 207  Q
    | ||||||||||||| || || |  |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||      ||    
T  3524 tcagaagaaggatgatcagatcagatatctcttagagcagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaattctagctttttttttttttttac 3623  T
Q  208 ttttgttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt-ttaaatcatatgttctatacttttaattctgatgata 306  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3624 ttttgttcttagtagctttatccttgtatcttaactcttctttataaatattatcattgtttattaaatcatatgttctatacttttaattctgatgata 3723  T
Q  307 tttattgtttttaatgtcttatgctctgatacttcttatgtttttatatggttatatgctctgct 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3724 tttattgtttttaatgtcttatgctttgatacatcttatgtttttatatggttatatgctctgct 3788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 27)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 12856273 - 12856018
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  12856273 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgctagaattcaggctgggtataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 12856174  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12856173 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 12856074  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  12856073 tcttagtagctttgtctttgtatcttaatccttctttatatatattatcattgttt 12856018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 26866116 - 26865861
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  26866116 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 26866017  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26866016 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 26865917  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  26865916 tcttagtagctatgtccttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 26865861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 3662668 - 3662413
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  3662668 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 3662569  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3662568 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 3662469  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  3662468 tcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 3662413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 25789052 - 25788797
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  25789052 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 25788953  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25788952 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 25788853  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  25788852 tcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 25788797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 189
Target Start/End: Original strand, 9122013 - 9122188
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  9122013 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 9122112  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9122113 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 9122188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 17983618 - 17983877
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  17983618 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 17983717  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttg----ttttttactt 209  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    ||||||||||    
T  17983718 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttttttactt 17983817  T
Q  210 ttgttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  17983818 ttgttcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 17983877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 26026743 - 26026489
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  26026743 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 26026644  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26026643 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 26026544  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    |||| |||||| | || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  26026543 tcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatc-ttctttatatatattatcattgttt 26026489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 27343051 - 27342797
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  27343051 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 27342952  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27342951 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 27342852  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    |||| |||||| | || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  27342851 tcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatc-ttctttatatatattatcattgttt 27342797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 27403791 - 27403537
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  27403791 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 27403692  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27403691 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 27403592  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    |||| |||||| | || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  27403591 tcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatc-ttctttatatatattatcattgttt 27403537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 25590532 - 25590360
Alignment:
Q  16 gacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctactta 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  25590532 gacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgaacttctta 25590433  T
Q  116 agaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25590432 agaagaaggatgagcaaattaagtacctcttagaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 25590360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 12726317 - 12726576
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  12726317 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 12726416  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12726417 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 12726516  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaa----cctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    ||||||||||| | || |||||||||||     |||||| |||| |||||||||||||||    
T  12726517 tcttagtagctgtgtccttgtatcttaatccttctttctatatatatattatcattgttt 12726576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 16931718 - 16931463
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | |||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  16931718 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 16931619  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16931618 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagtngtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 16931519  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatat-tatcattgttt 269  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||    
T  16931518 tcttagtagctgtgtccttgtatcttaatc-ttctttatatatatatatcattgttt 16931463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 27374107 - 27373928
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  27374107 tggacatcactcctttctatctagaagaagagtatatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 27374008  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacact 193  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27374007 tcagaagaaggatgatcaaattaagtaccttttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacact 27373928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 27464460 - 27464281
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  27464460 tggacatcactcctttctatctagaagaagagtatatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 27464361  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacact 193  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27464360 tcagaagaaggatgatcaaattaagtaccttttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacact 27464281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 98 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 4632129 - 4631883
Alignment:
Q  98 agaaggatgagctacttaagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagct 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||    |||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4632129 agaaggatgagctacttcagaagaaggatgaacagattagacttctcttagaacagttgaagaagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagct 4632030  T
Q  198 tgttttttacttttgttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt-ttaaatcatatgttctatactttt-aa 295  Q
    |||| || |||||||||||  |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||| ||| | ||||| ||    
T  4632029 tgttctt-acttttgttctgtgtagttttatccttgtaccttaacctttctttataaatattatcattgtttctgaaatattatgctcttttcttttaaa 4631931  T
Q  296 ttctgatgatatttattgtttttaatgtcttatgctctgatacttctt 343  Q
     ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4631930 ctctaatgatatttattgattttaatgtcatatgctctgatacttctt 4631883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 98 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 27385655 - 27385409
Alignment:
Q  98 agaaggatgagctacttaagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagct 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||    |||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27385655 agaaggatgagctacttcagaagaaggatgaacagattagacttctcttagaacagttgaagaagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagct 27385556  T
Q  198 tgttttttacttttgttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt-ttaaatcatatgttctatactttt-aa 295  Q
    ||||||| |||||||||||  |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||  |||| ||| | ||||| ||    
T  27385555 tgttttt-acttttgttctgtgtagttttatccttgtaccttaacctttctttataaatattatcaatgtttctgaaatattatgctcttttcttttaaa 27385457  T
Q  296 ttctgatgatatttattgtttttaatgtcttatgctctgatacttctt 343  Q
     ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27385456 ctctaatgatatttattgattttaatgtcatatgctctgatacttctt 27385409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 98 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 27476068 - 27475822
Alignment:
Q  98 agaaggatgagctacttaagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagct 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||    |||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27476068 agaaggatgagctacttcagaagaaggatgaacagattagacttctcttagaacagttgaagaagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagct 27475969  T
Q  198 tgttttttacttttgttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt-ttaaatcatatgttctatactttt-aa 295  Q
    ||||||| |||||||||||  |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||  |||| ||| | ||||| ||    
T  27475968 tgttttt-acttttgttctgtgtagttttatccttgtaccttaacctttctttataaatattatcaatgtttctgaaatattatgctcttttcttttaaa 27475870  T
Q  296 ttctgatgatatttattgtttttaatgtcttatgctctgatacttctt 343  Q
     ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27475869 ctctaatgatatttattgattttaatgtcatatgctctgatacttctt 27475822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 98 - 343
Target Start/End: Original strand, 32310648 - 32310894
Alignment:
Q  98 agaaggatgagctacttaagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagct 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||    |||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32310648 agaaggatgagctacttcagaagaaggatgaacagattagacttctcttagaacagttgaagaagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagct 32310747  T
Q  198 tgttttttacttttgttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt-ttaaatcatatgttctatactttt-aa 295  Q
    |||| || |||||||||||  |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||| ||| | ||||| ||    
T  32310748 tgttctt-acttttgttctgtgtagttttatccttgtaccttaacctttctttataaatattatcattgtttctgaaatattatgctcttttcttttaaa 32310846  T
Q  296 ttctgatgatatttattgtttttaatgtcttatgctctgatacttctt 343  Q
     ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32310847 ctctaatgatatttattgattttaatgtcatatgctctgatacttctt 32310894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 184
Target Start/End: Original strand, 34816655 - 34816825
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||||  |||| || || |||||||||||    
T  34816655 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatctcaagggcaacaagaattcatgctgggtacaaaagaagattgagggaaaaagatgagctact 34816754  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcaca 184  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  34816755 caaaaagaaggatgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcaca 34816825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 182
Target Start/End: Original strand, 32971358 - 32971526
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||||  |||| || || |||||||||||    
T  32971358 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatctcaagggcaacaagaattcatgctgggtacaaaagaagattgagggaaaatgatgagctact 32971457  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgca 182  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  32971458 caaaaagaaggatgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgca 32971526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 100 - 188
Target Start/End: Original strand, 7669378 - 7669466
Alignment:
Q  100 aaggatgagctacttaagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 188  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7669378 aaggatgagctactcaagaagaaggatgagcaaatcaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacaccca 7669466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 27385760 - 27385644
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| || | | | ||||||||||| || |||||    
T  27385760 tggacatcactcctttctatccagaggcagaatacatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcataagaggaagttaagagagaaggaagaactact 27385661  T
Q  114 taagaagaaggatgagc 130  Q
    | |||||||||||||||    
T  27385660 tcagaagaaggatgagc 27385644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 27476173 - 27476057
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| || | | | ||||||||||| || |||||    
T  27476173 tggacatcactcctttctatccagaggcagaatacatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcataagaggaagttaagagagaaggaagaactact 27476074  T
Q  114 taagaagaaggatgagc 130  Q
    | |||||||||||||||    
T  27476073 tcagaagaaggatgagc 27476057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 4632234 - 4632118
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||  ||| || | | | ||||||||||| || |||||    
T  4632234 tggacatcactcctttctatccagaggcagaatacatcacaagagctgcaagaatttatgctgggcataagaggaagttaagagagaaggaagaactact 4632135  T
Q  114 taagaagaaggatgagc 130  Q
    | |||||||||||||||    
T  4632134 tcagaagaaggatgagc 4632118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 130
Target Start/End: Original strand, 32310543 - 32310659
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||  ||| || | | | ||||||||||| || |||||    
T  32310543 tggacatcactcctttctatccagaggcagaatacatcacaagagctgcaagaatttatgctgggcataagaggaagttaagagagaaggaagaactact 32310642  T
Q  114 taagaagaaggatgagc 130  Q
    | |||||||||||||||    
T  32310643 tcagaagaaggatgagc 32310659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 23 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 12359460 - 12359298
Alignment:
Q  23 ctcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaa 122  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||   |||||||||  ||||| || || ||| | ||||| ||  ||||||  ||| ||||   |||| |||||||    
T  12359460 ctcctttctatccagaagatgattacacttcaagggctgatagaattcaagcagggctgaaaagcagattgagagcaaagaatgaagaacttcagaagaa 12359361  T
Q  123 ggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacac 185  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  12359360 ggatgatcagattaaatatctattggaacagatgtctaagctagccaaaccttagttgcacac 12359298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 328 - 371
Target Start/End: Original strand, 32310894 - 32310937
Alignment:
Q  328 tgctctgatacttcttatgtttttatatggttatatgctctgct 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32310894 tgctctgatacttcttatgtttttatttggttatatgctctgct 32310937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 183; Significance: 7e-99; HSPs: 17)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 343
Target Start/End: Original strand, 18761969 - 18762297
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |  |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  18761969 tggacatcactcctttctatccagaagaggaatacatcacatgggctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 18762068  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  18762069 taagaagaaagatgaacaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-tttttactcttgt 18762167  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt-ttaaatcatatgttctatacttttaattctgatgatatttatt 312  Q
    |||  |||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||  |||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  18762168 tctgtgtagttttatctttgtaccttaacc-ttccttataaatattatcattgtttctgaaatattatgctctattcttttaactctaatgatatttatt 18762266  T
Q  313 gtttttaatgtcttatgctctgatacttctt 343  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18762267 gtttttaatgtcctatgctctgatacttctt 18762297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 451928 - 451673
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |   | || || ||||||||||||||    
T  451928 tggacatctctccttactatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaattaagggaaaaggatgagctact 451829  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  451828 tcagaagaaagatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 451729  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  451728 tcttagtagctttgtctttgtatcttaacctttctttatatatattatcattgttt 451673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 24641667 - 24641337
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  |  |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  24641667 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 24641568  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  24641567 taagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttgt 24641469  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt-ttaaatcatatgttcta-tacttttaattctgatgatatttat 311  Q
    |||  ||||  ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||| |  |||||| ||| |||||||||||    
T  24641468 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctattttttttaactctaatgatatttat 24641369  T
Q  312 tgtttttaatgtcttatgctctgatacttctt 343  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24641368 tgattttaatgtcatatgctctgatacttctt 24641337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 30935979 - 30936234
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |   | || || ||||||||||||||    
T  30935979 tggacatctctccttactatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaattaagggaaaaggatgagctact 30936078  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30936079 tcagaagaaagatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 30936178  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30936179 tcttagtagctttgtctttgtatcttaacctttctttatatatattatcattgttt 30936234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 21997768 - 21997513
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||| |   | || || ||||||||||||||    
T  21997768 tggacatctctccttactatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgttgggcataaaaggaaattaagggaaaaggatgagctact 21997669  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21997668 tcagaagaaagatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 21997569  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21997568 tcttagtagctttgtctttgtatcttaacctttctttatatatattatcattgttt 21997513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 27658000 - 27657670
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||  |  |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  27658000 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaaggattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 27657901  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    ||| ||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  27657900 taaaaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttgt 27657802  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt-ttaaatcatatgttcta-tacttttaattctgatgatatttat 311  Q
    |||  ||||  ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||| |  |||||| ||| |||||||||||    
T  27657801 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctattttttttaactctaatgatatttat 27657702  T
Q  312 tgtttttaatgtcttatgctctgatacttctt 343  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27657701 tgtttttaatgtcatatgctctgatacttctt 27657670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Original strand, 55754716 - 55754952
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  55754716 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 55754815  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  55754816 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 55754915  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttcttt 250  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||    
T  55754916 tcttagtagctgtgtctttgtatcttaatccttcttt 55754952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 10750056 - 10750310
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  10750056 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 10750155  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10750156 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtctaagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 10750255  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    |||| |||||| | || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  10750256 tcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatc-ttctttatatatattatcattgttt 10750310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 10963825 - 10964079
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  10963825 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 10963924  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10963925 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtctaagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 10964024  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    |||| |||||| | || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  10964025 tcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatc-ttctttatatatattatcattgttt 10964079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 36019687 - 36019433
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | |||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  36019687 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 36019588  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36019587 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacaattgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 36019488  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    |||| |||||| | || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  36019487 tcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatc-ttctttatatatattatcattgttt 36019433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 188
Target Start/End: Original strand, 24026926 - 24027100
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  24026926 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 24027025  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 188  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24027026 caagaagaaggatgagcaaatcaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacaccca 24027100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 17919466 - 17919294
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  17919466 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 17919367  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacc 186  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  17919366 caagaagaaggatgagcaaatcaagtatcttttggaacagatgtacaagaaagcccaaccttagttgcacacc 17919294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 188
Target Start/End: Original strand, 19953843 - 19954017
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || || || ||||||||||||||    
T  19953843 tggacatcactcctttctacccagaagaatagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaataagggaaaaggatgagctact 19953942  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 188  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19953943 caagaagaaggatgagcaaattaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagtccaaccttagttgcacaccca 19954017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 188
Target Start/End: Original strand, 40469482 - 40469654
Alignment:
Q  16 gacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctactta 115  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||     
T  40469482 gacaacactcccttctatctagaagaagagtacattacaagggctgctagaattcatgctggatttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctacttc 40469581  T
Q  116 agaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40469582 agaagaaggatgagcaaattaagtaccttttggaacaaatgtataagcaagccaaaccttagttgcacaccca 40469654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 16257282 - 16257112
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||||  |||| || || |||||||||||    
T  16257282 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatctcaagggcaacaagaattcatgctgggtacaaaagaagattgagggaaaaagatgagctact 16257183  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcaca 184  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  16257182 caaaaagaaggatgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcaca 16257112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 328 - 371
Target Start/End: Original strand, 18762297 - 18762340
Alignment:
Q  328 tgctctgatacttcttatgtttttatatggttatatgctctgct 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18762297 tgctctgatacttcttatgtttttatttggttatatgctctgct 18762340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 216 - 283
Target Start/End: Original strand, 40469690 - 40469757
Alignment:
Q  216 ttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgtttttaaatcatatgtt 283  Q
    |||||||||||  ||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||    
T  40469690 ttagtagctttgcctttgtatcttgacttgtctttataaatgttatcattgcttctgaatcatatgtt 40469757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0105
Description:

Target: scaffold0105; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 343
Target Start/End: Original strand, 46482 - 46811
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  |  |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  46482 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 46581  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  46582 taagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-tttttacttttgt 46680  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt-ttaaatcatatgttctatacttttaattctgatgatatttatt 312  Q
    |||  ||||  ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||    
T  46681 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctatttttttaactctaatgatatttatt 46780  T
Q  313 gtttttaatgtcttatgctctgatacttctt 343  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46781 gattttaatgtcatatgctctgatacttctt 46811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 21)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 209087 - 209342
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  209087 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 209186  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  209187 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 209286  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  209287 tcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 209342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 722710 - 722965
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  722710 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 722809  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  722810 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 722909  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  722910 tcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 722965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 29078066 - 29077811
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  29078066 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 29077967  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29077966 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 29077867  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  29077866 tcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 29077811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 32087203 - 32087458
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  32087203 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 32087302  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32087303 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 32087402  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  32087403 tcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 32087458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 15766081 - 15766339
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||| ||||| || ||| ||||||||||    
T  15766081 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgctagaattcaggctgggtataaaagaagaatgagggaaaagaatgagctact 15766180  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttg---ttttttacttt 210  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||    
T  15766181 ttagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttttttttacttt 15766280  T
Q  211 tgttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  15766281 tgttcttagtagctttgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 15766339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 15790218 - 15790476
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  15790218 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgctagaattcaggctgggtataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 15790317  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttg---ttttttacttt 210  Q
    | ||||||||||||| |  || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||    
T  15790318 ttagaagaaggatgatcggatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttttttttacttt 15790417  T
Q  211 tgttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  15790418 tgttcttagtagctttgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 15790476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 343
Target Start/End: Original strand, 13687498 - 13687828
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  |  |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  13687498 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 13687597  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  13687598 taagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-tttttacttttgt 13687696  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt-ttaaatcatatgttcta-tacttttaattctgatgatatttat 311  Q
    |||  ||||  ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||| |  |||||| ||| |||||||||||    
T  13687697 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctattttttttaactctaatgatatttat 13687796  T
Q  312 tgtttttaatgtcttatgctctgatacttctt 343  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13687797 tgattttaatgtcatatgctctgatacttctt 13687828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 36294285 - 36294030
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  36294285 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagagaaaaggatgagctact 36294186  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36294185 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 36294086  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    ||| ||||||| | |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  36294085 tctcagtagctgtgtctttgtatcttaatccttctttatatatattatcattgttt 36294030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 243168 - 242914
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  243168 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 243069  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  243068 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttac-tttgt 242970  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  242969 tcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 242914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 796538 - 796284
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  796538 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 796439  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  796438 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttac-tttgt 796340  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  796339 tcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 796284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 3358139 - 3358393
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  3358139 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 3358238  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3358239 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 3358338  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    |||| ||| || | || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  3358339 tcttcgtatctgtgtccttgtatcttaatc-ttctttatatatattatcattgttt 3358393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 9342490 - 9342236
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  9342490 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 9342391  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  9342390 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcatattttttacttttgt 9342291  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    |||| |||||| | || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  9342290 tcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatc-ttctttatatatattatcattgttt 9342236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 19130112 - 19129938
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  19130112 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacattacaagggctgcaagaattcatgttgggtttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 19130013  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 188  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19130012 taagaagaaggatcagcaaattaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacaccca 19129938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 26112642 - 26112468
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  26112642 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 26112543  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 188  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26112542 taagcagaaggatgaacaaattaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacaccca 26112468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 36079290 - 36079044
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  |  |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  36079290 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 36079191  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  36079190 taagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttgt 36079092  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattat 261  Q
    |||  ||||  ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  36079091 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattat 36079044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 98 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 44482398 - 44482152
Alignment:
Q  98 agaaggatgagctacttaagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagct 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||    |||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44482398 agaaggatgagctacttcagaagaaggatgaacagattagacttctcttagaacagctgaagaagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagct 44482299  T
Q  198 tgttttttacttttgttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt-ttaaatcatatgttctatactttt-aa 295  Q
    |||| || |||||||||||  |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||| ||| | ||||| ||    
T  44482298 tgttctt-acttttgttctgtgtagttttatccttgtaccttaacctttctttataaatattatcattgtttctgaaatattatgctcttttcttttaaa 44482200  T
Q  296 ttctgatgatatttattgtttttaatgtcttatgctctgatacttctt 343  Q
     ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44482199 ctctaatgatatttattgattttaatgtcatatgctctgatacttctt 44482152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 6152462 - 6152292
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  6152462 tggacatcactcctttctatcgagaagaagagtacatctcaagggcaacaagaattcatgctgggtacaaaagaagattgagggaaaaggatgagctact 6152363  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcaca 184  Q
     || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  6152362 caaaaagaagaatgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcaca 6152292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 19226296 - 19226134
Alignment:
Q  23 ctcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaa 122  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||   |||||||||  ||||| || |||||| | ||||||||  ||||||   || | || | |||| |||||||    
T  19226296 ctcctttctatccagaagatgattacacttcaagggctgatagaattcaagctgggctgaaaagaagactgagagcacagaaagaacaacttcagaagaa 19226197  T
Q  123 ggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacac 185  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  19226196 ggatgagcagattaaatatctattggaacagatgtctaagctagccaaaccttagttgcacac 19226134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 44482503 - 44482387
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||  ||| || | | | ||||||||||| || |||||    
T  44482503 tggacatcactcctttctatccagaggcagaatacatcacaagagctgcaagaatttatgctgggcataagaggaagttaagagagaaggaagaactact 44482404  T
Q  114 taagaagaaggatgagc 130  Q
    | |||||||||||||||    
T  44482403 tcagaagaaggatgagc 44482387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 185
Target Start/End: Original strand, 30324171 - 30324333
Alignment:
Q  23 ctcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaa 122  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||   |||||||||  ||||| || |||||| | ||||||||  ||||||   ||  ||| | |||| |||||||    
T  30324171 ctcctttttatccagaagatgattacacttcaagggctgatagaattcaagctgggctgaaaagaagagtgagagcacagactgaacaacttcagaagaa 30324270  T
Q  123 ggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacac 185  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  30324271 ggatgagcagattaaatatcttttggaacagatgtctaagctagccaaaccttagttgcacac 30324333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 301 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 36079022 - 36078980
Alignment:
Q  301 atgatatttattgtttttaatgtcttatgctctgatacttctt 343  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36079022 atgatatttattgattttaatgtcatatgctctgatacttctt 36078980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 37)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 9345562 - 9345817
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  9345562 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 9345661  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9345662 ttagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 9345761  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  9345762 tcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 9345817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 23371531 - 23371786
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  23371531 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 23371630  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23371631 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 23371730  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  23371731 tcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 23371786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 23706378 - 23706633
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  23706378 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 23706477  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23706478 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 23706577  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  23706578 tcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 23706633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 36583781 - 36583526
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  36583781 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 36583682  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36583681 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 36583582  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  36583581 tcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 36583526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 42052390 - 42052645
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  42052390 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 42052489  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42052490 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 42052589  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  42052590 tcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 42052645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 14559340 - 14559085
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  14559340 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 14559241  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14559240 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 14559141  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    ||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  14559140 tctcagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 14559085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 24589336 - 24589081
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| |||||  | ||||||||||||||    
T  24589336 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgaggtaaaaggatgagctact 24589237  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24589236 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 24589137  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  24589136 tcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 24589081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 30228728 - 30228473
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  30228728 tggacattactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 30228629  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30228628 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 30228529  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  30228528 tcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 30228473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 15768362 - 15768619
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  15768362 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 15768461  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15768462 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 15768561  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctt--tataaatattatcattgttt 269  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||    
T  15768562 tcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttctatatatattatcattgttt 15768619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 15994565 - 15994310
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |   | || || || |||||||||||    
T  15994565 tggacatctctccttactatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaattaagggaaaatgatgagctact 15994466  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15994465 tcagaagaaagatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 15994366  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15994365 tcttagtagctttgtctttgtatcttaacctttctttatatatattatcattgttt 15994310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 31842987 - 31843242
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||| |   | || || ||||||||||||||    
T  31842987 tggacatcactccttactatccagaagaagagtacatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaattaagggaaaaggatgagctact 31843086  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||| ||||| || || |||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31843087 tcagaagaaagatgatcagatcaagtatttcttagaatagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 31843186  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31843187 tcttagtagctttgtctttgtatcttaacctttctttatatatattatcattgttt 31843242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 37731234 - 37730975
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  37731234 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 37731135  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37731134 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 37731035  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaa----cctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||     |||||| |||| |||||||||||||||    
T  37731034 tcttagtagctgtgtctttgtatcttaatccttctttctatatatatattatcattgttt 37730975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 6985320 - 6985574
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  6985320 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 6985419  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6985420 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 6985519  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    |||| |||||| | || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  6985520 tcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatc-ttctttatatatattatcattgttt 6985574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 14039619 - 14039873
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  14039619 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 14039718  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14039719 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 14039818  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    |||| |||||| | || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  14039819 tcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatc-ttctttatatatattatcattgttt 14039873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 22685025 - 22685279
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  22685025 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 22685124  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22685125 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 22685224  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    |||| |||||| | || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  22685225 tcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatc-ttctttatatatattatcattgttt 22685279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 23305868 - 23306122
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  23305868 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 23305967  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23305968 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 23306067  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    |||| |||||| | || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  23306068 tcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatc-ttctttatatatattatcattgttt 23306122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 27469583 - 27469837
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  27469583 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 27469682  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27469683 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 27469782  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    |||| |||||| | || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  27469783 tcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatc-ttctttatatatattatcattgttt 27469837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 17728498 - 17728757
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |  |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  17728498 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatacaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 17728597  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17728598 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 17728697  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaa----cctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||     |||||| |||| |||||||||||||||    
T  17728698 tcttagtagctgtgtctttgtatcttaatccttctttctatatatatattatcattgttt 17728757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 27043491 - 27043234
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  27043491 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 27043392  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  27043391 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactccaacttgttttttacttttgt 27043292  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctt--tataaatattatcattgttt 269  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||    
T  27043291 tcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttctatatatattatcattgttt 27043234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 31358115 - 31358374
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |  |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  31358115 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatacaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 31358214  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31358215 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 31358314  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaa----cctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||     |||||| |||| |||||||||||||||    
T  31358315 tcttagtagctgtgtctttgtatcttaatccttctttctatatatatattatcattgttt 31358374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Original strand, 17616641 - 17616877
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |  |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  17616641 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatacaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 17616740  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17616741 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 17616840  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttcttt 250  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||    
T  17616841 tcttagtagctgtgtctttgtatcttaatccttcttt 17616877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 39492169 - 39491915
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| |||||  | ||||||||||||||    
T  39492169 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgaggaaaaaggatgagctact 39492070  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39492069 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 39491970  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    |||| |||||| | || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  39491969 tcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatc-ttctttatatatattatcattgttt 39491915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 14448308 - 14448055
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  14448308 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 14448209  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14448208 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 14448109  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    ||| ||||||| | |||||||||| |   |||||| |||| |||||||||||||||    
T  14448108 tctcagtagctgtgtctttgtatcct--tctttctatatatatattatcattgttt 14448055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 24818123 - 24817869
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | |||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  24818123 tggacatcaatcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 24818024  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24818023 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 24817924  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    |||| |||||| | || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  24817923 tcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatc-ttctttatatatattatcattgttt 24817869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 5291849 - 5291675
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5291849 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacattataagggctgcaagaattcatgctgggtttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 5291750  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5291749 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaatagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 5291675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 27604728 - 27604554
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  27604728 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaaggactgcaagaattcatgctgggtttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 27604629  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27604628 taagaagaaggatgagcaaattaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacaccca 27604554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 323
Target Start/End: Original strand, 31447510 - 31447825
Alignment:
Q  18 catcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaag 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  31447510 catcactcctttctatccagaagaagagtacattacaagggctgctagaattcatgctgggtttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctacttcag 31447609  T
Q  118 aagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaaca---ctagcttgttttttacttttgtt 214  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    | ||||| |||| | |||||||    
T  31447610 aagaaggatgagcaaattaagtatattttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacattctttgcttg-ttttaatttttgtt 31447708  T
Q  215 c-------ttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgtttttaaatcatatgttcta-tacttttaattctgatgata 306  Q
    |       |||||||||||  |||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||| | | |||| |||||| ||  |  ||||| |||||| |||    
T  31447709 ctaagttgttagtagctttgcctttgtatcttaacttatctatataaatgttatcattgtctctgaatcttatgttttacaagctttaactctgataata 31447808  T
Q  307 tttattgtttttaatgt 323  Q
    ||| |||||||||||||    
T  31447809 tttgttgtttttaatgt 31447825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 186
Target Start/End: Original strand, 40399989 - 40400161
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  40399989 tggacatcactcctttctatccagaagaagaatacattacaagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 40400088  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacc 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  40400089 taagaagaaggatgagcaaattaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccctagttgcacacc 40400161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Original strand, 35225084 - 35225330
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||  |  |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  35225084 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaaggattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 35225183  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  35225184 taagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-tttttacttttgt 35225282  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattat 261  Q
    |||  ||||  ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  35225283 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattat 35225330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 187
Target Start/End: Original strand, 39361270 - 39361443
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  39361270 tggacatcactcctttctacccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 39361369  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccc 187  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39361370 caagaagaatgatgagcaaattaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacaccc 39361443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 98 - 343
Target Start/End: Original strand, 36697301 - 36697547
Alignment:
Q  98 agaaggatgagctacttaagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagct 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||    |||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36697301 agaaggatgagctacttcagaagaaggatgaacagattagacttctcttagaacagttgaagaagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagct 36697400  T
Q  198 tgttttttacttttgttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt-ttaaatcatatgttctatactttt-aa 295  Q
    |||| || |||||||||||  |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||| ||| | ||||| ||    
T  36697401 tgttctt-acttttgttctgtgtagttttatccttgtaccttaacctttctttataaatattatcattgtttctgaaatattatgctcttttcttttaaa 36697499  T
Q  296 ttctgatgatatttattgtttttaatgtcttatgctctgatacttctt 343  Q
     ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36697500 ctctaatgatatttattgattttaatgtcatatgctctgatacttctt 36697547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 184
Target Start/End: Original strand, 22156074 - 22156244
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||||  |||| || || |||||||||||    
T  22156074 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatctcaagggcaacaagaattcatgctgggtacaaaagaagattgagggaaaaagatgagctact 22156173  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcaca 184  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  22156174 caaaaagaaggatgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcaca 22156244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 43 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 1110441 - 1110295
Alignment:
Q  43 gagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaaggatgagcaaattaagtatc 142  Q
    ||||||||  ||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||  ||||||  |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1110441 gagtacatttcaaggactgctagaattcatgctgggttgaaaagtagactgagagcaaaggatgaacaacttcagaagaaggatgagcaaattaagtatc 1110342  T
Q  143 tcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 189  Q
    | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1110341 tattggaacagttgtataagcaagccaaaccttagttgcacacccaa 1110295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 189
Target Start/End: Original strand, 20796650 - 20796818
Alignment:
Q  21 cactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaag 120  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||  |||  ||||| || || ||||| ||||||||  ||||||  |||||||| | |||| |||||    
T  20796650 cactcctttctatccagaagatgagtacatttcaagaactgttagaattcaagccgggttgaaaagaagactgagagcaaaggatgaacaacttcagaag 20796749  T
Q  121 aaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 189  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  20796750 aaggatgagcagattaaatatcttttggaacagatgtataagctagccaaaccttagttgcacacccaa 20796818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 130
Target Start/End: Original strand, 36697196 - 36697312
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||  ||| || | | | ||||||||||| || |||||    
T  36697196 tggacatcactcctttctatccagaggcagaatacatcacaagagctgcaagaatttatgctgggcataagaggaagttaagagagaaggaagaactact 36697295  T
Q  114 taagaagaaggatgagc 130  Q
    | |||||||||||||||    
T  36697296 tcagaagaaggatgagc 36697312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 328 - 371
Target Start/End: Original strand, 36697547 - 36697590
Alignment:
Q  328 tgctctgatacttcttatgtttttatatggttatatgctctgct 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36697547 tgctctgatacttcttatgtttttatttggttatatgctctgct 36697590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Original strand, 35225339 - 35225392
Alignment:
Q  290 ttttaattctgatgatatttattgtttttaatgtcttatgctctgatacttctt 343  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35225339 ttttaactctaatgatatttattgattttaatgtcatatgctctgatacttctt 35225392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 32489 - 32234
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  32489 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 32390  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | | ||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32389 tcaaaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 32290  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  32289 tcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 32234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 20)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 12731807 - 12731552
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |   | || || ||||||||||||||    
T  12731807 tggacatctctccttactatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaattaagggaaaaggatgagctact 12731708  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12731707 tcagaagaaagatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 12731608  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12731607 tcttagtagctttgtctttgtatcttaacctttctttatatatattatcattgttt 12731552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 12742400 - 12742145
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |   | || || ||||||||||||||    
T  12742400 tggacatctctccttactatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaattaagggaaaaggatgagctact 12742301  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742300 tcagaagaaagatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 12742201  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12742200 tcttagtagctttgtctttgtatcttaacctttctttatatatattatcattgttt 12742145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 343
Target Start/End: Original strand, 35400043 - 35400373
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  |  |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  35400043 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 35400142  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  35400143 taagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-tttttacttttgt 35400241  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt-ttaaatcatatgttcta-tacttttaattctgatgatatttat 311  Q
    |||  ||||  ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||| |  |||||| ||| |||||||||||    
T  35400242 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctattttttttaactctaatgatatttat 35400341  T
Q  312 tgtttttaatgtcttatgctctgatacttctt 343  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35400342 tgattttaatgtcatatgctctgatacttctt 35400373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 343
Target Start/End: Original strand, 35647568 - 35647898
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  |  |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  35647568 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 35647667  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  35647668 taagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-tttttacttttgt 35647766  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt-ttaaatcatatgttcta-tacttttaattctgatgatatttat 311  Q
    |||  ||||  ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||| |  |||||| ||| |||||||||||    
T  35647767 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctattttttttaactctaatgatatttat 35647866  T
Q  312 tgtttttaatgtcttatgctctgatacttctt 343  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35647867 tgattttaatgtcatatgctctgatacttctt 35647898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 38096383 - 38096126
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  38096383 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 38096284  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | | ||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38096283 tcaaaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 38096184  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctt--tataaatattatcattgttt 269  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||    
T  38096183 tcttagtagctgtgtctttgtatcttaatctttctttctatatatattatcattgttt 38096126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 3172920 - 3172589
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||  |  |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  3172920 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaaggattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 3172821  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    ||| ||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  3172820 taaaaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttgt 3172722  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt-ttaaatcatatgttcta--tacttttaattctgatgatattta 310  Q
    |||  ||||  ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||  |  |||||| ||| ||||||||||    
T  3172721 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctatttttttttaactctaatgatattta 3172622  T
Q  311 ttgtttttaatgtcttatgctctgatacttctt 343  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3172621 ttgtttttaatgtcatatgctctgatacttctt 3172589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 51655375 - 51655629
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  51655375 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 51655474  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51655475 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 51655574  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    |||| |||||| | || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  51655575 tcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatc-ttctttatatatattatcattgttt 51655629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 7508597 - 7508343
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | |||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  7508597 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaacgaagaatgagggaaaaggatgagctact 7508498  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7508497 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 7508398  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    |||| |||||| | || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  7508397 tcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatc-ttctttatatatattatcattgttt 7508343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 36245931 - 36246185
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  36245931 tggacatcactcctttctatccataagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 36246030  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36246031 tcagaagaaggatgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttacttttgt 36246130  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt 269  Q
    |||| |||||| | || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  36246131 tcttcgtagctgtgtccttgtatcttaatc-ttctttatatatattatcattgttt 36246185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 4168575 - 4168401
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  4168575 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 4168476  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4168475 taagaagaaggatgagcaaattaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacaccca 4168401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 19180259 - 19180085
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  19180259 tggacatcactcctttctatctagaagaagagtatattacaagggctgcaagaattcatgctgggtttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 19180160  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19180159 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 19180085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Original strand, 47617437 - 47617682
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  |  |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  47617437 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 47617536  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  47617537 taagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg--ttttacttttgt 47617634  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattat 261  Q
    |||  ||||  ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  47617635 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattat 47617682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 5834524 - 5834278
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||  |  |||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  5834524 tggacatcactcctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaaggattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 5834425  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttttttacttttgt 213  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  5834424 taagaagaaagatgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt-ttttacttttgt 5834326  T
Q  214 tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattat 261  Q
    |||  ||||  ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  5834325 tctgtgtagtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattat 5834278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 186
Target Start/End: Original strand, 5649257 - 5649429
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5649257 tggacatcactcctttctacccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctact 5649356  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacc 186  Q
     || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5649357 caataagaaggatgagcagattaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacacc 5649429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 21864996 - 21864824
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  21864996 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggcaacaagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 21864897  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacc 186  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  21864896 caaaaagaaggatgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcacacc 21864824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 184
Target Start/End: Original strand, 12622677 - 12622847
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||| |  |||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  12622677 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatctcaagggcaacaagaattcatgctggatacaaaagaagaatgagggaaaaggatgagctact 12622776  T
Q  114 taagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcaca 184  Q
     || |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  12622777 caaaaagaaggacgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcaca 12622847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 189
Target Start/End: Original strand, 153158 - 153326
Alignment:
Q  21 cactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaag 120  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||  ||||||  ||| |||| | |||| |||||    
T  153158 cactcctttctatccagaagatgagtacatttcaaggactgctagaattcatgctgggttgaaaagtagactgagagcaaagaatgaacaacttcagaag 153257  T
Q  121 aaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 189  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  153258 aaggatgagcaaattaagtatctattggaacagttgtataagcaagccaaaccttagttgcacacccaa 153326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 5834269 - 5834216
Alignment:
Q  290 ttttaattctgatgatatttattgtttttaatgtcttatgctctgatacttctt 343  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5834269 ttttaactctaatgatatttattgattttaatgtcatatgctctgatacttctt 5834216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 343
Target Start/End: Original strand, 47617700 - 47617746
Alignment:
Q  297 tctgatgatatttattgtttttaatgtcttatgctctgatacttctt 343  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47617700 tctaatgatatttattgattttaatgtcatatgctctgatacttctt 47617746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 328 - 368
Target Start/End: Original strand, 47617746 - 47617786
Alignment:
Q  328 tgctctgatacttcttatgtttttatatggttatatgctct 368  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  47617746 tgctctgatacttattatgtttttatttggttatatgctct 47617786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1216 (Bit Score: 121; Significance: 7e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold1216
Description:

Target: scaffold1216; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 439 - 267
Alignment:
Q  16 gacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctactta 115  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||     
T  439 gacaacactcctttctatccataagaagagtacattacaagggctgctagaattcatgctggatttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctacttc 340  T
Q  116 agaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  339 agaagaaggatgagcaaattaagtaccttttggaacaaatgtataagcaagccaaaccttagttgcacaccca 267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 98 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 23894 - 23632
Alignment:
Q  98 agaaggatgagctacttaagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagct 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||   ||||||| || ||| |  | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23894 agaaggatgagctacttcagaagaaggatgaacagattagacatctcttagagcagttaaagaaacaagcccaaccttagttgcacacccaatactagct 23795  T
Q  198 tgttttttacttttgt--------tcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt-ttaaatcatatgttctata 288  Q
    ||||||||  |||| |        | |||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23794 tgttttttttttttttaactttgcttttagtagctttatccttgtaacttaactcttctttataaatattatcattgtttgttaaatcatatgttctata 23695  T
Q  289 cttttaattctgatgatatttattgtttttaatgtcttatgctctgatacttcttatgttttta 352  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23694 cttttacttctgataatatttattg-ttttaatatcttatgctctgatatttcttatgttttta 23632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 23999 - 23883
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||  |||| ||||| |  ||||||  ||| || | | | ||||||||||| || |||||    
T  23999 tggatatcactcctttctatccagaggcagattacatcacaagatctgctagaattcgagctgggcataataggaagctaagagagaaggaagaactact 23900  T
Q  114 taagaagaaggatgagc 130  Q
    | |  ||||||||||||    
T  23899 tcatcagaaggatgagc 23883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 104; Significance: 9e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 98 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 2537 - 2291
Alignment:
Q  98 agaaggatgagctacttaagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagct 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||    |||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2537 agaaggatgagctacttcagaagaaggatgaacagattagacttctcttagaacagttgaagaagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagct 2438  T
Q  198 tgttttttacttttgttcttagtagctttatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgttt-ttaaatcatatgttctatactttt-aa 295  Q
    || || |||||||||||||  ||   |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||| ||| | ||||| ||    
T  2437 tg-ttcttacttttgttctgtgttagtttatccttgtaccttaacctttctttataaatattatcattgtttctgaaatattatgctcttttcttttaaa 2339  T
Q  296 ttctgatgatatttattgtttttaatgtcttatgctctgatacttctt 343  Q
     ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2338 ctctaatgatatttattgattttaatgtcatatgctctgatacttctt 2291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 2642 - 2526
Alignment:
Q  14 tggacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctact 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||  ||| || | | | ||||||||||| || |||||    
T  2642 tggacatcactcctttctatccagaggcagaatacatcacaagagctgcaagaatttatgctgggcataagaggaagttaagagagaaggaagaactact 2543  T
Q  114 taagaagaaggatgagc 130  Q
    | |||||||||||||||    
T  2542 tcagaagaaggatgagc 2526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 189
Target Start/End: Original strand, 52481 - 52649
Alignment:
Q  21 cactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaag 120  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||  ||||||  |||||||| | |||| |||||    
T  52481 cactcctttctatccagaagatgagtacatttcaaggactgctagaattcatgctgggttgaaaagtagactgagagcaaaggatgaacaacttcagaag 52580  T
Q  121 aaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 189  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  52581 aaggatgagcaaattaagtatctattggaacagatgtataagcaagtcaaaccttagttgcacacccaa 52649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 3629 - 3552
Alignment:
Q  16 gacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatg 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3629 gacatcactcctttctatccagaagaagagtacatcacaagagctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatg 3552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0398 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0398
Description:

Target: scaffold0398; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 189
Target Start/End: Original strand, 3250 - 3416
Alignment:
Q  23 ctcctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaa 122  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||  |||| ||||  ||||| || |||||| | ||||||||  | ||||   || |||| | |||| |||||||    
T  3250 ctcctttttatccagaagatgattacatttcaagagctgatagaattcaagctgggctgaaaagaagactaagagcacagaatgaacaacttcagaagaa 3349  T
Q  123 ggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 189  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  3350 ggatgagcagattaaatatctattggaacagatgtataagctagccaaaccttagttgcacacccaa 3416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0398; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 111 - 189
Target Start/End: Original strand, 11593 - 11671
Alignment:
Q  111 acttaagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 189  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  11593 acttcagaagaaggatgagcagattaaatatctattggaacagatgtataagctagccaaaccttagttgcacacccaa 11671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1002 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1002
Description:

Target: scaffold1002; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 98 - 189
Target Start/End: Original strand, 2861 - 2952
Alignment:
Q  98 agaaggatgagctacttaagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 189  Q
    |||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  2861 agaaggatgaacaacttcagaagaaggatgagcagattaaatatctactggaacagatgtctaagctagccaaaccttagttgcacacccaa 2952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 118 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 23825 - 23758
Alignment:
Q  118 aagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacac 185  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  23825 aagaaggatgagcagattaaatatcttttggaacagatgtctaagctagccaaaccttagttgcacac 23758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University