View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8781_high_43 (Length: 220)

Name: NF8781_high_43
Description: NF8781
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8781_high_43
NF8781_high_43
[»] chr7 (42 HSPs)
chr7 (1-217)||(8710409-8710626)
chr7 (1-218)||(18587420-18587638)
chr7 (1-217)||(11234462-11234679)
chr7 (1-217)||(13688845-13689062)
chr7 (1-217)||(15158306-15158523)
chr7 (1-217)||(14335200-14335417)
chr7 (1-217)||(8200852-8201069)
chr7 (1-217)||(44788600-44788817)
chr7 (1-217)||(17703704-17703921)
chr7 (1-217)||(18180547-18180764)
chr7 (1-217)||(11550351-11550568)
chr7 (1-217)||(14957358-14957575)
chr7 (1-217)||(12690306-12690523)
chr7 (1-217)||(9591172-9591385)
chr7 (50-217)||(10873494-10873662)
chr7 (1-217)||(15146172-15146389)
chr7 (28-187)||(14042529-14042689)
chr7 (28-187)||(14352559-14352719)
chr7 (41-214)||(18051220-18051394)
chr7 (43-214)||(13024153-13024325)
chr7 (43-214)||(16947741-16947913)
chr7 (1-55)||(16726690-16726744)
chr7 (43-214)||(19149819-19149991)
chr7 (43-214)||(20749218-20749390)
chr7 (28-214)||(15627331-15627518)
chr7 (43-214)||(12459436-12459608)
chr7 (43-214)||(14261515-14261686)
chr7 (43-214)||(21755220-21755392)
chr7 (43-214)||(26092067-26092239)
chr7 (43-213)||(26115859-26116030)
chr7 (45-214)||(11385700-11385870)
chr7 (43-214)||(13676259-13676431)
chr7 (43-214)||(15099872-15100044)
chr7 (171-217)||(14149856-14149902)
chr7 (43-104)||(14140598-14140659)
chr7 (43-214)||(14283643-14283815)
chr7 (43-214)||(49155109-49155281)
chr7 (43-211)||(40925086-40925255)
chr7 (43-104)||(12798770-12798831)
chr7 (43-104)||(15343350-15343411)
chr7 (48-137)||(12204074-12204164)
chr7 (43-89)||(13965937-13965983)
[»] chr6 (40 HSPs)
chr6 (1-217)||(2872187-2872404)
chr6 (1-217)||(16574569-16574786)
chr6 (1-217)||(16620594-16620811)
chr6 (1-217)||(24293167-24293384)
chr6 (1-217)||(27559354-27559571)
chr6 (1-217)||(29589824-29590041)
chr6 (1-218)||(28260582-28260800)
chr6 (1-218)||(28285116-28285334)
chr6 (1-218)||(28312308-28312526)
chr6 (1-218)||(28339331-28339549)
chr6 (1-217)||(25115231-25115448)
chr6 (1-218)||(27190114-27190332)
chr6 (1-218)||(27258908-27259126)
chr6 (1-217)||(19867366-19867583)
chr6 (1-217)||(16925025-16925242)
chr6 (1-218)||(5836613-5836831)
chr6 (1-217)||(22436548-22436765)
chr6 (1-217)||(18405329-18405546)
chr6 (111-217)||(22827851-22827957)
chr6 (1-218)||(23081101-23081319)
chr6 (2-217)||(18182753-18182969)
chr6 (48-198)||(23085257-23085408)
chr6 (48-214)||(30678456-30678623)
chr6 (41-214)||(34643011-34643185)
chr6 (43-214)||(18797372-18797544)
chr6 (43-214)||(19455705-19455877)
chr6 (44-214)||(21567419-21567590)
chr6 (43-104)||(19437795-19437856)
chr6 (43-214)||(10466275-10466447)
chr6 (28-103)||(21474394-21474469)
chr6 (123-217)||(20135653-20135747)
chr6 (123-217)||(22197122-22197216)
chr6 (28-137)||(25770603-25770713)
chr6 (43-104)||(15462129-15462190)
chr6 (43-213)||(24367083-24367254)
chr6 (43-89)||(19465976-19466022)
chr6 (43-88)||(14377343-14377388)
chr6 (47-104)||(20010885-20010942)
chr6 (56-104)||(19486734-19486782)
chr6 (2-30)||(22829772-22829800)
[»] chr5 (42 HSPs)
chr5 (1-217)||(22330309-22330526)
chr5 (1-217)||(29473495-29473712)
chr5 (1-217)||(14997161-14997378)
chr5 (1-217)||(19772707-19772924)
chr5 (1-217)||(37288918-37289135)
chr5 (1-217)||(22137415-22137632)
chr5 (1-217)||(27682822-27683039)
chr5 (1-217)||(16359249-16359466)
chr5 (1-217)||(22350666-22350883)
chr5 (1-217)||(27521153-27521370)
chr5 (1-217)||(34569241-34569458)
chr5 (1-217)||(40711527-40711744)
chr5 (1-217)||(18781861-18782078)
chr5 (1-217)||(27613103-27613320)
chr5 (1-217)||(27665912-27666129)
chr5 (1-217)||(41773589-41773806)
chr5 (1-217)||(21342836-21343053)
chr5 (1-217)||(20803344-20803561)
chr5 (1-217)||(21882521-21882738)
chr5 (28-217)||(25429168-25429358)
chr5 (28-217)||(26736176-26736366)
chr5 (1-109)||(23460827-23460935)
chr5 (47-217)||(23473942-23474113)
chr5 (28-217)||(21336743-21336933)
chr5 (111-184)||(23525867-23525940)
chr5 (61-213)||(20311601-20311754)
chr5 (43-214)||(20824185-20824357)
chr5 (1-104)||(21631821-21631924)
chr5 (43-214)||(20778645-20778817)
chr5 (43-214)||(23078369-23078541)
chr5 (49-214)||(17266804-17266970)
chr5 (28-211)||(14884440-14884624)
chr5 (43-214)||(23563632-23563804)
chr5 (43-217)||(22464679-22464854)
chr5 (1-64)||(23525952-23526015)
chr5 (43-214)||(28892406-28892578)
chr5 (48-137)||(21561494-21561584)
chr5 (52-208)||(21409890-21410047)
chr5 (48-187)||(21983646-21983786)
chr5 (47-214)||(22505411-22505579)
chr5 (43-211)||(25850807-25850976)
chr5 (43-89)||(20345140-20345186)
[»] chr4 (36 HSPs)
chr4 (1-217)||(23958562-23958779)
chr4 (1-217)||(8050603-8050820)
chr4 (1-217)||(14300959-14301176)
chr4 (1-217)||(19634951-19635168)
chr4 (1-217)||(27714151-27714368)
chr4 (1-217)||(40475855-40476072)
chr4 (1-217)||(12479415-12479632)
chr4 (1-217)||(16233972-16234189)
chr4 (1-217)||(16250830-16251047)
chr4 (1-217)||(18224426-18224643)
chr4 (1-217)||(19775773-19775990)
chr4 (1-217)||(8389227-8389444)
chr4 (1-217)||(17092129-17092346)
chr4 (1-217)||(14683382-14683599)
chr4 (1-191)||(16350534-16350725)
chr4 (1-217)||(15144872-15145088)
chr4 (28-217)||(14188321-14188511)
chr4 (1-217)||(14162285-14162502)
chr4 (1-217)||(14696916-14697133)
chr4 (28-217)||(16042-16232)
chr4 (1-98)||(13513285-13513382)
chr4 (79-217)||(16219045-16219184)
chr4 (79-217)||(16222365-16222504)
chr4 (43-214)||(29450819-29450991)
chr4 (41-214)||(51604072-51604246)
chr4 (43-214)||(15073177-15073349)
chr4 (43-214)||(3262076-3262248)
chr4 (43-213)||(44659148-44659319)
chr4 (41-104)||(53750750-53750813)
chr4 (43-214)||(27903203-27903375)
chr4 (43-104)||(20892960-20893021)
chr4 (41-104)||(16154711-16154774)
chr4 (43-104)||(14993649-14993710)
chr4 (43-104)||(16150565-16150626)
chr4 (43-214)||(15354322-15354494)
chr4 (43-214)||(11204514-11204686)
[»] chr3 (59 HSPs)
chr3 (1-217)||(15713535-15713752)
chr3 (1-217)||(10008034-10008251)
chr3 (1-217)||(10908644-10908861)
chr3 (1-217)||(15345724-15345941)
chr3 (1-217)||(12889143-12889360)
chr3 (1-217)||(13255124-13255341)
chr3 (1-217)||(26790892-26791109)
chr3 (1-218)||(15586871-15587089)
chr3 (1-218)||(16754180-16754398)
chr3 (1-217)||(15399996-15400213)
chr3 (1-217)||(43165109-43165326)
chr3 (1-217)||(48427881-48428098)
chr3 (1-213)||(15358521-15358734)
chr3 (1-217)||(16638207-16638424)
chr3 (1-217)||(16804426-16804643)
chr3 (1-217)||(20059533-20059750)
chr3 (1-218)||(6603169-6603386)
chr3 (1-218)||(53382497-53382715)
chr3 (1-217)||(3688377-3688594)
chr3 (1-217)||(5422409-5422626)
chr3 (1-217)||(15065505-15065722)
chr3 (1-217)||(24185624-24185841)
chr3 (1-217)||(16694598-16694815)
chr3 (1-214)||(14874047-14874261)
chr3 (28-217)||(17492285-17492475)
chr3 (47-217)||(14578933-14579104)
chr3 (1-217)||(15262064-15262281)
chr3 (1-217)||(12843582-12843799)
chr3 (41-214)||(13944471-13944645)
chr3 (43-214)||(47126391-47126563)
chr3 (142-217)||(26190937-26191012)
chr3 (48-137)||(15013284-15013374)
chr3 (43-214)||(10408415-10408587)
chr3 (41-214)||(8744898-8745072)
chr3 (43-214)||(10417555-10417727)
chr3 (43-214)||(12272785-12272957)
chr3 (43-164)||(17188871-17188993)
chr3 (43-211)||(14575436-14575605)
chr3 (43-211)||(24189754-24189923)
chr3 (43-211)||(28756769-28756938)
chr3 (43-214)||(11958691-11958863)
chr3 (43-142)||(12858005-12858105)
chr3 (43-214)||(14291042-14291214)
chr3 (43-214)||(16378444-16378616)
chr3 (43-214)||(17494093-17494266)
chr3 (43-214)||(12358037-12358209)
chr3 (43-214)||(16825791-16825963)
chr3 (43-214)||(16832038-16832210)
chr3 (43-104)||(16327219-16327280)
chr3 (43-104)||(31692695-31692756)
chr3 (47-214)||(12180791-12180959)
chr3 (43-100)||(11949435-11949492)
chr3 (153-214)||(12510104-12510165)
chr3 (43-104)||(18131856-18131917)
chr3 (43-104)||(31941461-31941522)
chr3 (48-104)||(15230161-15230217)
chr3 (48-104)||(15236029-15236085)
chr3 (43-85)||(13318044-13318086)
chr3 (117-214)||(13318087-13318184)
[»] chr2 (36 HSPs)
chr2 (1-217)||(27373715-27373932)
chr2 (1-217)||(10871296-10871513)
chr2 (1-217)||(24712480-24712697)
chr2 (1-217)||(24874530-24874747)
chr2 (1-217)||(27220462-27220679)
chr2 (1-217)||(9338028-9338245)
chr2 (1-217)||(9486662-9486879)
chr2 (1-217)||(16983686-16983903)
chr2 (1-217)||(17001446-17001663)
chr2 (1-217)||(21142821-21143038)
chr2 (1-217)||(22323122-22323339)
chr2 (1-217)||(24264816-24265033)
chr2 (1-217)||(44383350-44383567)
chr2 (1-217)||(11351491-11351708)
chr2 (1-217)||(45673792-45674009)
chr2 (1-217)||(24657438-24657655)
chr2 (1-217)||(23029241-23029458)
chr2 (1-217)||(24677933-24678150)
chr2 (1-208)||(21323046-21323254)
chr2 (5-217)||(23204760-23204973)
chr2 (1-217)||(24705262-24705479)
chr2 (6-217)||(41606175-41606382)
chr2 (28-217)||(23074309-23074499)
chr2 (28-217)||(23105535-23105725)
chr2 (1-217)||(22733554-22733771)
chr2 (1-109)||(22742746-22742854)
chr2 (47-213)||(24817666-24817833)
chr2 (28-104)||(23064973-23065049)
chr2 (43-214)||(19716839-19717011)
chr2 (41-214)||(12576802-12576976)
chr2 (61-208)||(19817302-19817450)
chr2 (44-214)||(23097841-23098012)
chr2 (48-214)||(23113172-23113339)
chr2 (43-214)||(23274042-23274214)
chr2 (43-185)||(20848067-20848210)
chr2 (48-202)||(30208747-30208902)
[»] chr1 (34 HSPs)
chr1 (1-217)||(33388341-33388558)
chr1 (1-217)||(17042327-17042544)
chr1 (1-217)||(16347907-16348124)
chr1 (1-217)||(21833132-21833349)
chr1 (1-217)||(51330804-51331021)
chr1 (13-218)||(19109197-19109403)
chr1 (1-218)||(41350980-41351198)
chr1 (1-208)||(20081688-20081896)
chr1 (1-217)||(24785169-24785386)
chr1 (1-193)||(21842066-21842259)
chr1 (1-217)||(16378924-16379141)
chr1 (1-137)||(22496568-22496705)
chr1 (1-80)||(21228868-21228947)
chr1 (138-217)||(21233181-21233260)
chr1 (28-104)||(21751991-21752067)
chr1 (116-217)||(429585-429686)
chr1 (28-211)||(31537336-31537520)
chr1 (43-214)||(38910180-38910352)
chr1 (28-214)||(21739375-21739562)
chr1 (150-217)||(22502751-22502818)
chr1 (43-214)||(12200382-12200554)
chr1 (43-214)||(22016099-22016271)
chr1 (47-214)||(24096973-24097141)
chr1 (43-214)||(48425737-48425909)
chr1 (43-214)||(52988605-52988777)
chr1 (43-213)||(37679914-37680085)
chr1 (43-104)||(21742906-21742967)
chr1 (116-217)||(21751767-21751868)
chr1 (43-186)||(19857166-19857310)
chr1 (43-214)||(20297245-20297417)
chr1 (43-214)||(20854114-20854286)
chr1 (43-104)||(20075063-20075124)
chr1 (43-214)||(20833254-20833426)
chr1 (43-104)||(18710360-18710421)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (1-217)||(10212-10429)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (1-217)||(3268-3485)
scaffold0044 (1-217)||(17004-17221)
[»] chr8 (37 HSPs)
chr8 (1-217)||(18859458-18859675)
chr8 (1-217)||(22117858-22118075)
chr8 (1-217)||(22126642-22126859)
chr8 (1-217)||(22129300-22129517)
chr8 (1-217)||(30310827-30311044)
chr8 (1-217)||(32603026-32603243)
chr8 (1-217)||(17671705-17671922)
chr8 (1-217)||(20015946-20016163)
chr8 (1-217)||(19115281-19115498)
chr8 (1-217)||(22030984-22031201)
chr8 (1-218)||(19481755-19481973)
chr8 (1-217)||(15536264-15536481)
chr8 (1-217)||(19980848-19981065)
chr8 (1-217)||(22042708-22042925)
chr8 (1-217)||(21164221-21164438)
chr8 (28-217)||(21391571-21391761)
chr8 (28-217)||(21780897-21781087)
chr8 (28-217)||(21786065-21786255)
chr8 (28-201)||(21253842-21254016)
chr8 (28-217)||(22989926-22990116)
chr8 (1-217)||(22523427-22523644)
chr8 (1-217)||(22246116-22246333)
chr8 (1-217)||(22421575-22421792)
chr8 (28-217)||(22375164-22375353)
chr8 (1-170)||(22245698-22245868)
chr8 (43-137)||(31414257-31414352)
chr8 (43-214)||(22053747-22053919)
chr8 (43-137)||(19985141-19985236)
chr8 (43-104)||(22373864-22373925)
chr8 (43-214)||(16268949-16269121)
chr8 (43-214)||(28983795-28983967)
chr8 (43-137)||(29301151-29301246)
chr8 (43-104)||(21928423-21928484)
chr8 (47-214)||(22028009-22028177)
chr8 (43-214)||(28989014-28989186)
chr8 (54-107)||(20391078-20391131)
chr8 (43-211)||(27357423-27357592)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (1-217)||(40999-41216)
scaffold0109 (1-217)||(13367-13584)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (1-217)||(22091-22308)
[»] scaffold0010 (4 HSPs)
scaffold0010 (1-217)||(14268-14485)
scaffold0010 (47-217)||(4759-4930)
scaffold0010 (43-214)||(39618-39790)
scaffold0010 (43-214)||(44712-44884)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (4-217)||(36342-36556)
[»] scaffold0080 (5 HSPs)
scaffold0080 (1-217)||(10481-10698)
scaffold0080 (1-217)||(31727-31944)
scaffold0080 (11-217)||(13146-13353)
scaffold0080 (1-217)||(37193-37410)
scaffold0080 (41-217)||(54481-54658)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (1-217)||(17309-17526)
scaffold0017 (1-202)||(195081-195283)
scaffold0017 (47-213)||(24154-24321)
[»] scaffold1881 (1 HSPs)
scaffold1881 (1-213)||(723-936)
[»] scaffold1459 (1 HSPs)
scaffold1459 (1-217)||(1275-1492)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (1-217)||(29171-29388)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (1-217)||(8102-8319)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (1-217)||(37063-37280)
scaffold0042 (47-214)||(26199-26367)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (13-217)||(11313-11518)
scaffold0028 (13-217)||(17781-17986)
scaffold0028 (66-217)||(53571-53723)
scaffold0028 (13-70)||(54996-55053)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (1-218)||(10401-10619)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (5-201)||(1-198)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (1-217)||(11599-11816)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (1-217)||(21448-21665)
scaffold0081 (1-217)||(36872-37089)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (1-209)||(50588-50797)
scaffold0102 (43-214)||(42545-42717)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (1-217)||(34958-35174)
scaffold0022 (47-217)||(41476-41647)
scaffold0022 (47-217)||(75196-75367)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (1-217)||(18494-18711)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (1-193)||(8022-8217)
scaffold0130 (48-137)||(4179-4269)
[»] scaffold0993 (2 HSPs)
scaffold0993 (1-217)||(826-1043)
scaffold0993 (165-217)||(726-778)
[»] scaffold0052 (1 HSPs)
scaffold0052 (1-156)||(7141-7297)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (28-217)||(10630-10820)
scaffold0476 (43-214)||(830-1002)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (1-217)||(13928-14145)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (41-217)||(24995-25172)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (28-217)||(11150-11340)
[»] scaffold0423 (1 HSPs)
scaffold0423 (28-217)||(2533-2723)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (1-217)||(8067-8284)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (47-217)||(12507-12678)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (41-217)||(3445-3622)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (1-217)||(23776-23993)
scaffold0011 (47-214)||(151414-151582)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (28-217)||(4278-4468)
scaffold0621 (28-78)||(1-51)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (28-217)||(8794-8984)
scaffold0358 (150-217)||(17990-18057)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (28-217)||(55740-55930)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (28-217)||(151925-152115)
scaffold0023 (1-121)||(30817-30938)
scaffold0023 (28-174)||(47253-47399)
scaffold0023 (159-217)||(1907-1965)
[»] scaffold2059 (1 HSPs)
scaffold2059 (1-109)||(1012-1120)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (28-217)||(14536-14726)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (28-217)||(495864-496054)
scaffold0001 (1-207)||(441507-441714)
scaffold0001 (43-212)||(514638-514808)
[»] scaffold1423 (1 HSPs)
scaffold1423 (28-216)||(648-837)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (1-217)||(6717-6934)
scaffold0270 (1-217)||(13847-14064)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (1-217)||(104071-104288)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (47-202)||(57903-58059)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (3-217)||(13724-13939)
[»] scaffold0243 (2 HSPs)
scaffold0243 (47-217)||(24234-24405)
scaffold0243 (43-214)||(10057-10229)
[»] scaffold0324 (2 HSPs)
scaffold0324 (1-185)||(1865-2050)
scaffold0324 (116-217)||(12573-12674)
[»] scaffold0074 (2 HSPs)
scaffold0074 (47-213)||(5961-6128)
scaffold0074 (45-214)||(14970-15140)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (1-104)||(424266-424369)
scaffold0003 (43-104)||(203339-203400)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (28-217)||(4427-4617)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (1-217)||(40750-40965)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (28-217)||(111177-111367)
scaffold0040 (47-218)||(17721-17893)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (47-217)||(15266-15437)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (47-217)||(216709-216880)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (44-208)||(17635-17799)
scaffold0114 (43-214)||(39905-40077)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (1-101)||(1-101)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (28-214)||(23568-23755)
scaffold0018 (47-213)||(9640-9807)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (142-217)||(15379-15454)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (1-214)||(15222-15436)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (47-214)||(4935-5103)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (28-142)||(8329-8444)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (4-73)||(15825-15894)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (5-65)||(2861-2921)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (43-214)||(53708-53880)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (43-214)||(1168-1340)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (29-135)||(8010-8117)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (13-76)||(48651-48714)
scaffold0007 (61-137)||(83824-83901)
[»] scaffold0312 (1 HSPs)
scaffold0312 (116-217)||(864-965)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (43-214)||(11656-11828)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (28-100)||(14873-14945)
[»] scaffold0348 (2 HSPs)
scaffold0348 (43-214)||(5134-5306)
scaffold0348 (43-104)||(17769-17830)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (43-214)||(251469-251641)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (47-137)||(1923-2014)
[»] scaffold0278 (2 HSPs)
scaffold0278 (88-217)||(1296-1426)
scaffold0278 (28-92)||(3521-3585)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (48-185)||(21475-21613)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (43-211)||(94179-94348)
scaffold0029 (43-214)||(115409-115581)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (43-210)||(140-308)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (43-214)||(772-944)
scaffold0222 (43-214)||(20661-20833)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (43-214)||(25959-26131)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (43-214)||(3455-3627)
[»] scaffold0046 (2 HSPs)
scaffold0046 (43-214)||(60586-60758)
scaffold0046 (43-89)||(70081-70127)
[»] scaffold0560 (1 HSPs)
scaffold0560 (162-217)||(8146-8201)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (28-137)||(11884-11994)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (43-214)||(49465-49637)
scaffold0067 (43-214)||(58499-58671)
scaffold0067 (43-214)||(64887-65059)
scaffold0067 (43-214)||(29471-29643)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (43-214)||(63804-63976)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (43-214)||(65583-65755)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (43-109)||(4589-4655)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (28-137)||(29451-29561)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (41-137)||(1555-1652)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (41-137)||(28568-28665)
[»] scaffold1530 (1 HSPs)
scaffold1530 (43-214)||(430-602)
[»] scaffold1433 (1 HSPs)
scaffold1433 (43-214)||(1596-1768)
[»] scaffold1032 (1 HSPs)
scaffold1032 (43-174)||(1100-1232)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (43-214)||(5430-5602)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (43-214)||(2718-2890)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (28-104)||(5560-5636)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (43-214)||(7591-7763)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (43-214)||(308-480)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (43-214)||(263073-263245)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (43-137)||(12651-12746)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (28-214)||(110457-110644)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (43-137)||(175912-176007)
scaffold0020 (47-214)||(98872-99040)
[»] scaffold1056 (1 HSPs)
scaffold1056 (28-102)||(1681-1755)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (28-137)||(43689-43799)
scaffold0104 (62-102)||(25176-25216)
[»] scaffold0765 (1 HSPs)
scaffold0765 (43-104)||(6542-6603)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (43-104)||(8747-8808)
scaffold0235 (43-104)||(18961-19022)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (164-217)||(673-726)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (43-104)||(21809-21870)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (43-214)||(8461-8633)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (43-186)||(36814-36958)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (43-214)||(49952-50124)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (43-214)||(21969-22141)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (43-214)||(70219-70391)
scaffold0034 (43-104)||(2237-2298)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (48-187)||(200758-200898)
scaffold0004 (43-214)||(325554-325726)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (45-104)||(1141-1200)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (48-137)||(4379-4469)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (48-137)||(11754-11844)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (46-104)||(67396-67454)
[»] scaffold0035 (3 HSPs)
scaffold0035 (48-102)||(41398-41452)
scaffold0035 (43-174)||(5692-5824)
scaffold0035 (125-214)||(5598-5687)
[»] scaffold0664 (1 HSPs)
scaffold0664 (43-104)||(6996-7057)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (43-104)||(20813-20874)
scaffold0261 (47-104)||(12637-12694)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (43-104)||(10071-10132)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (43-104)||(54005-54066)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (43-211)||(41585-41754)
[»] scaffold1373 (1 HSPs)
scaffold1373 (43-214)||(119-291)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (43-214)||(967-1139)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (28-214)||(5028-5215)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (43-137)||(30611-30706)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (47-104)||(5498-5555)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (43-104)||(49162-49223)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (43-214)||(29781-29953)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (159-217)||(6489-6547)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (43-104)||(10935-10996)
[»] scaffold0298 (1 HSPs)
scaffold0298 (43-104)||(9512-9573)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 42)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 8710626 - 8710409
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8710626 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 8710527  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8710526 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 8710427  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  8710426 gaactggttagagtacaa 8710409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 18587420 - 18587638
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18587420 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 18587519  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18587520 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtat 18587619  T
Q  200 gaattggttagagtacaat 218  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  18587620 gaactggttagagtacaat 18587638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 11234462 - 11234679
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11234462 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttttctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 11234561  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11234562 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 11234661  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  11234662 gaactggttagagtacaa 11234679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 13689062 - 13688845
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13689062 tttattgctttcgattgtgtgtctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 13688963  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13688962 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 13688863  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  13688862 gaactggttagagtacaa 13688845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 15158306 - 15158523
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15158306 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactactt 15158405  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15158406 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcaaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 15158505  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  15158506 gaactggttagagtacaa 15158523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 14335417 - 14335200
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14335417 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 14335318  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  14335317 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtat 14335218  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  14335217 gaactggttagagtacaa 14335200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 8201069 - 8200852
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8201069 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 8200970  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  8200969 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtat 8200870  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  8200869 gaactggttagagtacaa 8200852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 44788600 - 44788817
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44788600 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttatctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 44788699  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  44788700 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtat 44788799  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  44788800 gaactggttagagtacaa 44788817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 17703704 - 17703921
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17703704 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagttaagggttcggtgactactt 17703803  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17703804 ctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtat 17703903  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    |||||||||||| |||||    
T  17703904 gaattggttagaatacaa 17703921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 18180764 - 18180547
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18180764 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttatctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 18180665  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18180664 ctcttgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtat 18180565  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  18180564 gaactggttagagtacaa 18180547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 11550351 - 11550568
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11550351 tttattgcttttgattgtgtatctgccttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 11550450  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  |||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11550451 ctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 11550550  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  11550551 gaattggttggagtacaa 11550568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 14957575 - 14957358
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14957575 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactactt 14957476  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  |||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14957475 ctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattttgggtat 14957376  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  14957375 gaattggttggagtacaa 14957358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 12690523 - 12690306
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12690523 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgagttgagagatggtcgttgaaactccagctaagggttcggtgactactt 12690424  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  |||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12690423 ctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtat 12690324  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  12690323 gaattggttggagtacaa 12690306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 9591385 - 9591172
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9591385 tttattgctttcaattgtgtttctgcttcgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 9591286  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9591285 ctctcgtatgtttgagatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtt----tacctttgagcggtatggatgtgattctaggtat 9591190  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9591189 gaattggttagagtacaa 9591172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 50 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 10873662 - 10873494
Alignment:
Q  50 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatctt-gaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcga 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10873662 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 10873563  T
Q  149 aatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  10873562 aatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaa 10873494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 15146172 - 15146389
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||   |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15146172 tttattgctcttgattgtgcttctaagttgggtcttgctttgtcggatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 15146271  T
Q  101 ctctcgtatctt-gaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    ||||||||| || |||||||||||| |||||||||| || |||||| || || ||| | |||||| |||||||||| ||||||||||| ||  | |||||    
T  15146272 ctctcgtatgttcgaaatgtcctttatctatgtttgatcttgattttgagattgatatggtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatagttggtat 15146371  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  15146372 gaactggttagagtacaa 15146389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 14042689 - 14042529
Alignment:
Q  28 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgt 126  Q
    |||||||||| | ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| || | || || |||||||||||    
T  14042689 ttgggtcttgctatgtcaaatataaatggagagatggttgtcgaaactcaagctaagggttttgtgactacttctcttgtgtgttcaagatgtcctttgt 14042590  T
Q  127 ctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 187  Q
    ||||||||| || |||||| ||||| || || |||||| ||||||| || |||||||||||    
T  14042589 ctatgtttgatcatgattttgaaattgacttggtttgtttaccttttagtggtatggatgt 14042529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 14352719 - 14352559
Alignment:
Q  28 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgt 126  Q
    |||||||||| | ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| || | || || |||||||||||    
T  14352719 ttgggtcttgctatgtcaaatataaatggagagatggttgtcgaaactcaagctaagggttttgtgactacttctcttgtgtgttcaagatgtcctttgt 14352620  T
Q  127 ctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 187  Q
    ||||||||| || |||||| ||||| || || |||||| ||||||| || |||||||||||    
T  14352619 ctatgtttgatcatgattttgaaattgacttggtttgtttaccttttagtggtatggatgt 14352559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 41 - 214
Target Start/End: Original strand, 18051220 - 18051394
Alignment:
Q  41 tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcg 139  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||  |||||  | |||||||||||| |    
T  18051220 tgtctgatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctggtttgcttgaggtgtccaatttctatgtttggtag 18051319  T
Q  140 tgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
     ||||| ||| | |||||||| ||| |||| ||||  || |||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  18051320 agattttgaagtagatttagtgtgtttaccgttgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagta 18051394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13024325 - 13024153
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  13024325 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgaggtgtccgttgtctatgtttggtaggg 13024226  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    ||||     | || ||||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  13024225 attttttggtcgacttagtgtgtctaccgttgacgggtatggatgttatttttggtatgaattggttagagta 13024153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Original strand, 16947741 - 16947913
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | ||||| |||||| ||||||||||||||| | |    
T  16947741 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagag 16947840  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    | || | | | || ||||||||  | || ||||  ||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  16947841 actttgtagtcgacttagtttgcttgccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagta 16947913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 16726690 - 16726744
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatg 55  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16726690 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatg 16726744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 19149991 - 19149819
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |  ||||  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  19149991 tctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagag 19149892  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    | || ||| |  || |||| ||| | |||||||  ||||||||||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  19149891 actttgaagtcaatctagtatgtttgcctttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagta 19149819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20749390 - 20749218
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |  ||||  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  20749390 tctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagag 20749291  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    | || ||| |  || |||| ||| | |||||||  ||||||||||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  20749290 actttgaagtcaatctagtatgtttgcctttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagta 20749218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15627518 - 15627331
Alignment:
Q  28 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgt 126  Q
    |||||||||||| ||||   ||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | | | |  ||| |||||     
T  15627518 ttgggtcttgatatgtcgagtatgaatgaggaaatggttttcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctttagtgtgtctaaggtgttctttgc 15627419  T
Q  127 ctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    | ||||||||||| || || ||||| |||||||||||| | | |||||| || |||||||| || || |||||||| ||||| |||||    
T  15627418 cgatgtttggtcgagactttgaaattgatttagtttgtttgcatttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttggagta 15627331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 12459608 - 12459436
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | || ||  ||||| || |||||||||||| | |    
T  12459608 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtctgtttaaggtgtccgttatctatgtttggtagag 12459509  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    | || |   | |||||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  12459508 actttgtggttgatttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagta 12459436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Original strand, 14261515 - 14261686
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||| || |  ||||  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  14261515 tctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagag 14261614  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    | || ||| | ||| |||| ||||| || |||   ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||    
T  14261615 aatt-gaagtcgatctagtatgtctgccgttgtcgggtatggatgtgatttttgggatgaactggttagagta 14261686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21755392 - 21755220
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||| | || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || | | |||  |||||| | |||||||||||| | |    
T  21755392 tctgatatggaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgaggtgtcctatatctatgtttggtagag 21755293  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    ||||||   | |||||||||||||| || |||   ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  21755292 atttcgtggttgatttagtttgtctgccgttgtcgggtatggatgtgatttttgggatgaattggttagagta 21755220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Original strand, 26092067 - 26092239
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || | | ||   |||||| | |||||||||||| | |    
T  26092067 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagag 26092166  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    |||| |  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||    
T  26092167 attttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagta 26092239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 43 - 213
Target Start/End: Original strand, 26115859 - 26116030
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || | | ||   |||||| | |||||||||||| | |    
T  26115859 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagag 26115958  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagt 213  Q
    |||| |  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  26115959 attttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagt 26116030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 45 - 214
Target Start/End: Original strand, 11385700 - 11385870
Alignment:
Q  45 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 143  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||| || |  ||||  |||||| | |||||||||||| | |||    
T  11385700 tgatatgaaaggagagatggttgttgaaactccagctaagggttcaggaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagat 11385799  T
Q  144 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    || ||  | || ||||||||| | || ||||  || |||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  11385800 tttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaattggttagagta 11385870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13676431 - 13676259
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | | | |  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  13676431 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 13676332  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    | || ||| | || ||||| ||| |||| ||||  || |||||||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  13676331 actttgaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaactggttagagta 13676259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Original strand, 15099872 - 15100044
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | | | |  ||||  ||||||||||||||| | |    
T  15099872 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtctgttgtctatgtttggtagag 15099971  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    | || ||| | ||  |||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| | || ||||| | |||||||||    
T  15099972 actttgaagtcgacctagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttgggatgaactagttagagta 15100044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 217
Target Start/End: Original strand, 14149856 - 14149902
Alignment:
Q  171 ttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 217  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14149856 ttgaacggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 14149902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 43 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 14140659 - 14140598
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 104  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  14140659 tctgatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 14140598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Original strand, 14283643 - 14283815
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||| || ||||||||||| || |  ||||  |||||| | |||||||||||| | |    
T  14283643 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactctagccaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagag 14283742  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    |||| ||  | || ||||||||| | || ||||  || |||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  14283743 attttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaattggttagagta 14283815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 49155281 - 49155109
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || | | ||   |||||  | |||||||||||| | |    
T  49155281 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcccatatctatgtttggtagag 49155182  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    |||| |  || ||||| ||||| || || ||||  ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  49155181 attttgtgattgatttggtttgcctgccgttgacgggtatggatgttatttttggtatgaattggttagagta 49155109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 211
Target Start/End: Original strand, 40925086 - 40925255
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || | | ||   |||||  | || ||||||||| | |    
T  40925086 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcccatatccatgtttggtaggg 40925185  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttaga 211  Q
    |||| |  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||    
T  40925186 attttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttaga 40925255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 104
Target Start/End: Original strand, 12798770 - 12798831
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 104  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  12798770 tctgatatgaaaggaaaaatggttgttgaaactcaagctaagggttcagtaactacttctct 12798831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 15343411 - 15343350
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 104  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||   || |||||||||||    
T  15343411 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtaaagtaactacttctct 15343350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 137
Target Start/End: Original strand, 12204074 - 12204164
Alignment:
Q  48 tatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 137  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||  | ||||||||||| || |  ||||  ||||| |||||||||||||||    
T  12204074 tatgagtggagaaatggttgttgaaactctagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggt 12204164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 89
Target Start/End: Original strand, 13965937 - 13965983
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 89  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13965937 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 13965983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 40)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 2872187 - 2872404
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2872187 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 2872286  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2872287 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 2872386  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  2872387 gaactggttagagtacaa 2872404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16574786 - 16574569
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16574786 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 16574687  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16574686 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgcctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 16574587  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  16574586 gaactggttagagtacaa 16574569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 16620594 - 16620811
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16620594 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 16620693  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16620694 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgcctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 16620793  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  16620794 gaactggttagagtacaa 16620811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 24293167 - 24293384
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24293167 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 24293266  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24293267 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcaaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 24293366  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  24293367 gaactggttagagtacaa 24293384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 27559354 - 27559571
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27559354 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 27559453  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27559454 ctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacttttgagcggtatggatgtgattctgggtat 27559553  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27559554 gaattggttagagtacaa 27559571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 29589824 - 29590041
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29589824 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 29589923  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  29589924 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtat 29590023  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  29590024 gaactggttagagtacaa 29590041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 28260582 - 28260800
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28260582 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 28260681  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  28260682 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtat 28260781  T
Q  200 gaattggttagagtacaat 218  Q
    ||| |||||| ||||||||    
T  28260782 gaactggttaaagtacaat 28260800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 28285334 - 28285116
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28285334 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 28285235  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  28285234 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtat 28285135  T
Q  200 gaattggttagagtacaat 218  Q
    ||| |||||| ||||||||    
T  28285134 gaactggttaaagtacaat 28285116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 28312526 - 28312308
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28312526 tttattgctttcaattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 28312427  T
Q  101 ctctcgta-tcttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  28312426 ctctcgtatttttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtat 28312327  T
Q  200 gaattggttagagtacaat 218  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  28312326 gaactggttagagtacaat 28312308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 28339331 - 28339549
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28339331 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 28339430  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  28339431 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtat 28339530  T
Q  200 gaattggttagagtacaat 218  Q
    ||| |||||| ||||||||    
T  28339531 gaactggttaaagtacaat 28339549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 25115448 - 25115231
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25115448 tttattgctttcgattgtgtttctgcttcgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatgattgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 25115349  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25115348 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtat 25115249  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  25115248 gaactggttagagtacaa 25115231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 27190332 - 27190114
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27190332 tttattgctttcgattgtgtttctggtttgggtcttgagttgtcagatatgaatggggagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 27190233  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27190232 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatatttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtat 27190133  T
Q  200 gaattggttagagtacaat 218  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  27190132 gaactggttagagtacaat 27190114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 27258908 - 27259126
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27258908 tttattgctttcgattgtgtttctggtttgggtcttgagttgtcagatatgaatggggagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 27259007  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27259008 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatatttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtat 27259107  T
Q  200 gaattggttagagtacaat 218  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  27259108 gaactggttagagtacaat 27259126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 19867583 - 19867366
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19867583 tttattgctttcgattgtgcttctaccttgggccttgttatgtcttatatgaatgaagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 19867484  T
Q  101 ctctcgtatctt-gaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19867483 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 19867384  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||| || |||||    
T  19867383 gaactggttggaatacaa 19867366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 16925025 - 16925242
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16925025 tttattgctttcgattgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggtcgtcgaaactccagctaagggatcggtgactactt 16925124  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| || || || |||||    
T  16925125 ctctcgtatgtttgagatgtcctttttctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtttgcctttgagtggtatggacgtcatccttggtat 16925224  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16925225 gaattggttagagtacaa 16925242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 5836613 - 5836831
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  5836613 tttattgcttttgattgtgcttatactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtaactacca 5836712  T
Q  101 ctctcgtatctt-gaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||     
T  5836713 ctctagtatgtttgaaatgtcctttttctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctccctttgagcggtatggatgttattcttggtag 5836812  T
Q  200 gaattggttagagtacaat 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  5836813 gaattggttagagtacaat 5836831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22436765 - 22436548
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22436765 tttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 22436666  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||| | |||||  | |||||||| |||||||  || ||||| |||||    
T  22436665 ctctcgtatgtttgaaatgttctttgtctatgtttggtcgtgattttgagattgatatggtttgcttgcctttgagtggtatgggcgtcattcttggtat 22436566  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22436565 gaattggttagagtacaa 22436548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 18405329 - 18405546
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||   |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18405329 tttattgcttttgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 18405428  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||| || |  |||| |||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||  |||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  18405429 ctcttgtgtgtttgagatgtcccttgtctatgtttgattgtgattttgaaattaatttggtttgtctgcctttgagtggtatggatgtaattcttggtat 18405528  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  18405529 gaactggttagagtacaa 18405546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 111 - 217
Target Start/End: Original strand, 22827851 - 22827957
Alignment:
Q  111 ttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22827851 ttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattgcttag 22827950  T
Q  211 agtacaa 217  Q
    |||||||    
T  22827951 agtacaa 22827957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23081319 - 23081101
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||   |||||| ||| | ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23081319 tttattgctattgattgtgcttctaagttgggttttgctatgtcaaatattaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactactt 23081220  T
Q  101 ctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||| || | || || |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| || || |||||| |||||||||  ||||||||||| || || |||||    
T  23081219 ctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattatgaaattgacttggtttgtttacctttgattggtatggatgtaatccttggtat 23081120  T
Q  200 gaattggttagagtacaat 218  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  23081119 gaactggttagagtacaat 23081101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 217
Target Start/End: Original strand, 18182753 - 18182969
Alignment:
Q  2 ttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttc 101  Q
    |||||||| | ||||||| ||||   |||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18182753 ttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggtagtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttc 18182852  T
Q  102 tctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatg 200  Q
    ||| || | || || ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||    ||||| |||||||| | || |||||||| || || ||||||    
T  18182853 tcttgtttgtttaagatgtcatttgtctatgcttggtcgagattttgaaattgatacgttttgtttacctttgtgtggaatggatgtaatccttggtatg 18182952  T
Q  201 aattggttagagtacaa 217  Q
    |||||||||||||||||    
T  18182953 aattggttagagtacaa 18182969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 48 - 198
Target Start/End: Original strand, 23085257 - 23085408
Alignment:
Q  48 tatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttc 146  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || || ||||||||| |||||||||||| | |||||     
T  23085257 tatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtttaagatgtcctttatctatgtttggtagagatttt 23085356  T
Q  147 gaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggta 198  Q
    ||||| ||||| |||||| | |||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  23085357 gaaattgatttggtttgtttgcctttgagtggaatggatgtaattcttggta 23085408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 48 - 214
Target Start/End: Original strand, 30678456 - 30678623
Alignment:
Q  48 tatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttc 146  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || | | |||| ||| | ||||| ||||||||||| || ||     
T  30678456 tatggatggggaaatggttgtcgaaactccagctaagggtttggttactacttctctagtgtgtctgaagtgttcgttgtcgatgtttggtcgagacttt 30678555  T
Q  147 gaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    ||| | |||||||| ||| | |||||||| || |||||||| || || |||||||||||||| |||||    
T  30678556 gaagttgatttagtctgttttcctttgagtggaatggatgtaatacttggtatgaattggttggagta 30678623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 41 - 214
Target Start/End: Original strand, 34643011 - 34643185
Alignment:
Q  41 tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcg 139  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |  |||| ||||||| | |||||||||||| |    
T  34643011 tgtctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccggctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgagatgtcctatatctatgtttggtag 34643110  T
Q  140 tgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
     ||||| ||| | ||  |||||||  |||||||||  || |||||||| ||  | || |||||||||||||||||    
T  34643111 ggattttgaagtagacctagtttgcttacctttgacggggatggatgttatatttgggatgaattggttagagta 34643185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18797544 - 18797372
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |  ||||  | |||| | |||||||||||| | |    
T  18797544 tctgacatgaaaggagagatggttgttgaaactctagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtttcctatatctatgtttggtaggg 18797445  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    |||| ||  | || ||||| ||| ||||  |||  ||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  18797444 attttgaggtagacttagtgtgtttaccgctgacgggtatggatgttatttttgggatgaattggttagagta 18797372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 19455877 - 19455705
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | | | |  ||| | ||||||||||||||| | |    
T  19455877 tctgatatgaaaggtgaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgttcgttgtctatgtttggtagag 19455778  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    | || ||| | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  19455777 actttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagta 19455705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 214
Target Start/End: Original strand, 21567419 - 21567590
Alignment:
Q  44 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 142  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |  ||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  21567419 ctgacatgaaaggagagatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagaga 21567518  T
Q  143 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    ||| |   | || ||||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| | |||||||||    
T  21567519 ttttgtggtcgacttagtgtgtctaccgttgacgggtatggatgtcatttttggaatgaactagttagagta 21567590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 43 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 19437856 - 19437795
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 104  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  19437856 tctgatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 19437795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Original strand, 10466275 - 10466447
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | || ||  ||||  || |||||||||||| | |    
T  10466275 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtctgtttaaggtgtctgttatctatgtttggtaggg 10466374  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    | || |   | |||||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || || ||||||||||||||    
T  10466375 actttgtggttgatttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggataaattggttagagta 10466447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 21474469 - 21474394
Alignment:
Q  28 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctc 103  Q
    |||||||| | | |||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  21474469 ttgggtctggttatgtctgatatgaatagaaaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctc 21474394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 20135747 - 20135653
Alignment:
Q  123 ttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 217  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||| || |||||||| || || |||||| | | ||||||||||||    
T  20135747 ttgtctatgtttggccgagattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatggactagttagagtacaa 20135653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 217
Target Start/End: Original strand, 22197122 - 22197216
Alignment:
Q  123 ttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 217  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||| || |||||||| || || |||||| | | ||||||||||||    
T  22197122 ttgtctatgtttggccgagattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatggactagttagagtacaa 22197216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 25770713 - 25770603
Alignment:
Q  28 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgt 126  Q
    |||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||  | ||||||||||| || |  ||||  ||||| ||||    
T  25770713 ttgggtctggttatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaatctccagcaaagggttcaatcactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgt 25770614  T
Q  127 ctatgtttggt 137  Q
    |||||||||||    
T  25770613 ctatgtttggt 25770603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 15462190 - 15462129
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 104  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  15462190 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctct 15462129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 24367254 - 24367083
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||| ||| || || |||||||| || | | ||   |||||| | ||||| |||||| | |    
T  24367254 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaggattcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatctttggtagag 24367155  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagt 213  Q
    |||| |  || |||||||||||||| || || |  ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  24367154 attttgtgattgatttagtttgtctgccgttcacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagt 24367083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 43 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 19466022 - 19465976
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 89  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19466022 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 19465976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 43 - 88
Target Start/End: Original strand, 14377343 - 14377388
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggtt 88  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  14377343 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagcaaagggtt 14377388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 104
Target Start/End: Original strand, 20010885 - 20010942
Alignment:
Q  47 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 104  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  20010885 atatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctct 20010942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 104
Target Start/End: Original strand, 19486734 - 19486782
Alignment:
Q  56 gagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 104  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  19486734 gagaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctct 19486782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 30
Target Start/End: Original strand, 22829772 - 22829800
Alignment:
Q  2 ttattgctttcgattgtgtttctgctttg 30  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22829772 ttattgctttcgattgtgtttctgctttg 22829800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 42)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 22330309 - 22330526
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22330309 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 22330408  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22330409 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 22330508  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  22330509 gaactggttagagtacaa 22330526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 29473495 - 29473712
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29473495 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 29473594  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29473595 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 29473694  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  29473695 gaactggttagagtacaa 29473712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 14997161 - 14997378
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14997161 tttattgcttttgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactactt 14997260  T
Q  101 ctctcgtatctt-gaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14997261 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 14997360  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  14997361 gaactggttagagtacaa 14997378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 19772924 - 19772707
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19772924 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactactt 19772825  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19772824 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgatcctgggtat 19772725  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  19772724 gaactggttagagtacaa 19772707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 37288918 - 37289135
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37288918 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttttctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 37289017  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37289018 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctttgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 37289117  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  37289118 gaactggttagagtacaa 37289135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22137632 - 22137415
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22137632 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 22137533  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22137532 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtttatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattttgggtat 22137433  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  22137432 gaactggttagagtacaa 22137415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 27682822 - 27683039
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27682822 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtttgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 27682921  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27682922 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtgtgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 27683021  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| || |||||||||||    
T  27683022 gaactgtttagagtacaa 27683039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16359466 - 16359249
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16359466 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 16359367  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  16359366 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtat 16359267  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  16359266 gaactggttagagtacaa 16359249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22350883 - 22350666
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22350883 tttattgctttcgattgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 22350784  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
     ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22350783 atctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgcgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 22350684  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  22350683 gaactggttagagtacaa 22350666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 27521370 - 27521153
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27521370 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttggtttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 27521271  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  27521270 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtat 27521171  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  27521170 gaactggttagagtacaa 27521153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 34569458 - 34569241
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34569458 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 34569359  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  34569358 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtat 34569259  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  34569258 gaactggttagagtacaa 34569241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 40711744 - 40711527
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40711744 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 40711645  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  40711644 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtat 40711545  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  40711544 gaactggttagagtacaa 40711527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 18782078 - 18781861
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18782078 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgttgaaactccagctaagggttccgtgactactt 18781979  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18781978 ctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggattaagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 18781879  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18781878 gaattggttagagtacaa 18781861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 27613320 - 27613103
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27613320 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactactt 27613221  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  27613220 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattttgggtat 27613121  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  27613120 gaactggttagagtacaa 27613103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 27665912 - 27666129
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  27665912 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccgactaagggttcggtgactactt 27666011  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  27666012 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtat 27666111  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  27666112 gaactggttagagtacaa 27666129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 41773806 - 41773589
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41773806 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 41773707  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  41773706 ctctcgtatgtttgaaatgtactttgtctatgtttggtcgcgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtat 41773607  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  41773606 gaactggttagagtacaa 41773589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 21342836 - 21343053
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21342836 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 21342935  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  |||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21342936 ctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgaaatggatttagtttgtataccattgaacggtatggatgtgattctgggtat 21343035  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||||||||||||||||||    
T  21343036 gaattggttagagtacaa 21343053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 20803561 - 20803344
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20803561 tttattgctttcgattgtgtttctactttgggtctcgctttgtctgatatgaatggaaagatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactactt 20803462  T
Q  101 ctctcgtatctt-gaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20803461 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattcttggtat 20803362  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  20803361 gaagtggttagagtacaa 20803344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 21882738 - 21882521
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21882738 tttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgctatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 21882639  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  21882638 ctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagtttgtctacctttaagcggtatggatgtgattcttggtat 21882539  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||||||||||||||||||    
T  21882538 gaattggttagagtacaa 21882521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 28 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 25429358 - 25429168
Alignment:
Q  28 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgt 126  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || || |||||| ||||    
T  25429358 ttgggtcttgttatgtttgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcccttgt 25429259  T
Q  127 ctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 217  Q
    ||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  25429258 ctatgtttgatcgtgattttgagattgatttggtttgtctacctttgagtggtatggatgtaattcttggtatgaactggttagagtacaa 25429168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 217
Target Start/End: Original strand, 26736176 - 26736366
Alignment:
Q  28 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgt 126  Q
    |||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| || || |||||||||||    
T  26736176 ttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccaactaagggtttggtgactacttctcttgtatgtttaagatgtcctttgt 26736275  T
Q  127 ctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 217  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||    
T  26736276 ctatgtttgatcgtgattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtgatccttggaatgaactggttagagtacaa 26736366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 23460935 - 23460827
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23460935 tttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatgaagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 23460836  T
Q  101 ctctcgtat 109  Q
    |||||||||    
T  23460835 ctctcgtat 23460827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 23474113 - 23473942
Alignment:
Q  47 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || || |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23474113 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtattaaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattt 23474014  T
Q  146 cgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 217  Q
     ||||| || || |||||| |||||||||| || ||||| || || || |||||||| ||||||||||||||    
T  23474013 tgaaattgacttggtttgtttacctttgagtggaatggacgtaatccttggtatgaactggttagagtacaa 23473942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 217
Target Start/End: Original strand, 21336743 - 21336933
Alignment:
Q  28 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgt 126  Q
    |||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  || | || || ||||| |||||    
T  21336743 ttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagttaagggtttggtgactacttctcgtgtgtgtttaagatgtcttttgt 21336842  T
Q  127 ctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 217  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| || || | |||| |||||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||    
T  21336843 ctatgtttggtcgcgattttgaaattgacttggattgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaa 21336933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 111 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 23525940 - 23525867
Alignment:
Q  111 ttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatgga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23525940 ttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatgga 23525867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 61 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 20311754 - 20311601
Alignment:
Q  61 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttag 159  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| | | |||| ||||    
T  20311754 atggttgtcgaaaccccaactaagggttcggtgactacttctctagtatgcttgaagtgtcctttgtcgatgtttggtagagattttgcagtggacttag 20311655  T
Q  160 tttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagt 213  Q
    | ||| |  | ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  20311654 tctgtttgtcgttgagtggtatggatgtgatactaggtatgaactggttggagt 20311601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20824357 - 20824185
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || | || ||  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  20824357 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctggtgtgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 20824258  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    |||||||  | |||||||| |||||||| |||   || |||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  20824257 atttcgaggtcgatttagtgtgtctaccgttgttggggatggatgttattttcgggatgaattggttagagta 20824185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Original strand, 21631821 - 21631924
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||   |||||||||| | ||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21631821 tttattgctgttgattgtgcttctaagttgggtcttgttatgtcgaatatgaatggggaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 21631920  T
Q  101 ctct 104  Q
    ||||    
T  21631921 ctct 21631924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20778817 - 20778645
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || | || ||  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  20778817 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtgactacttctcttgtgtgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 20778718  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    |||| ||  | || ||||| |||||||| |||   || |||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  20778717 attttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgttggggatggatgttattttcgggatgaattggttagagta 20778645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Original strand, 23078369 - 23078541
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | ||||| |||||| ||||||||||||||| | |    
T  23078369 tctgatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagag 23078468  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    | || | | | ||| || ||||| | || |||   ||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  23078469 actttgtagttgatctaatttgtttgccgttgtcgggtatggatgttatttttgggatgaattggttagagta 23078541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 49 - 214
Target Start/End: Original strand, 17266804 - 17266970
Alignment:
Q  49 atgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcg 147  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||  |||||  | |||||||||||| | ||||| |    
T  17266804 atgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaggtgtccaatttctatgtttggtagagattttg 17266903  T
Q  148 aaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    || | || ||||||||| | || ||||  || |||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  17266904 aagtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaattggttagagta 17266970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 211
Target Start/End: Original strand, 14884440 - 14884624
Alignment:
Q  28 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgt 126  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || | | ||   |||||| | |    
T  14884440 ttgggtttagatgtgtctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatat 14884539  T
Q  127 ctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttaga 211  Q
    ||||||||||| | ||||| |  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||    
T  14884540 ctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtcttccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttaga 14884624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Original strand, 23563632 - 23563804
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | | | |  ||| | ||||||||||||||| | |    
T  23563632 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtacgttgtctatgtttggtagag 23563731  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    | || ||| | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  23563732 actttgaagtcgacttagtttgtttaccattgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagta 23563804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22464854 - 22464679
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || | || ||  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  22464854 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 22464755  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 217  Q
    |||| ||  | || ||||| |||||||| |||   || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||    
T  22464754 attttgaggtcgacttagtatgtctaccgttgttgggaatggatgttattttcgggatgaattggttagagtacaa 22464679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 23526015 - 23525952
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatgg 64  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23526015 tttattgctttcgattgtgcttctacgttgggtcttgatatgtctgatatgaatggagagatgg 23525952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Original strand, 28892406 - 28892578
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || | | | |  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  28892406 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctggtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 28892505  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    |||| ||| | || ||||| |||||||| |||   || |||||||| ||  | || |||||||||||||||||    
T  28892506 attttgaagtcgacttagtgtgtctaccgttgttggggatggatgtcatcttcgggatgaattggttagagta 28892578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 137
Target Start/End: Original strand, 21561494 - 21561584
Alignment:
Q  48 tatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 137  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||  ||||| |||||||||||||||    
T  21561494 tatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggt 21561584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 52 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 21410047 - 21409890
Alignment:
Q  52 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaa 150  Q
    ||||| || |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||  ||||||||| | ||||| | |     
T  21410047 aatggggaaatggttgtcgaaaccccggctaaggcttcggtgactagttctctagtatgcttgaagtgtcctttgttgatgtttggtagagattttgcag 21409948  T
Q  151 tggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggtt 208  Q
    |||| ||||| ||| | || ||||  || |||||||| || || |||||||| |||||    
T  21409947 tggacttagtctgtttgccgttgactgggatggatgtaatactaggtatgaactggtt 21409890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 187
Target Start/End: Original strand, 21983646 - 21983786
Alignment:
Q  48 tatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttc 146  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||  ||||| |||| |||||||||| | |||||     
T  21983646 tatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgagttgtccattgtttatgtttggtagagatttt 21983745  T
Q  147 gaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 187  Q
    ||| | ||| |||| ||| | || ||||  |||||||||||    
T  21983746 gaagttgatctagtatgtttgccgttgacgggtatggatgt 21983786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22505579 - 22505411
Alignment:
Q  47 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 145  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || | | ||   |||||| | |||||||||  | | |||||    
T  22505579 atatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctatgtttcatagagattt 22505480  T
Q  146 cgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
     |   |||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  22505479 tgtggtggatttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttggaatgaattggttagagta 22505411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 25850976 - 25850807
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||| || | | ||   |||||| | |||||||||||| | |    
T  25850976 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaaggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagag 25850877  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttaga 211  Q
    |||| |  || |||||||||||||| || ||||  |||||| |||| ||| | || ||||||||||||||    
T  25850876 attttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatgaatgttatttttggaatgaattggttaga 25850807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 20345186 - 20345140
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 89  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20345186 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 20345140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 36)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 23958779 - 23958562
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23958779 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 23958680  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23958679 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 23958580  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  23958579 gaactggttagagtacaa 23958562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 8050603 - 8050820
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8050603 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 8050702  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8050703 ctctcgtatgtttgaaatttcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 8050802  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  8050803 gaactggttagagtacaa 8050820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 14300959 - 14301176
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14300959 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 14301058  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14301059 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatatttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 14301158  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  14301159 gaactggttagagtacaa 14301176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 19635168 - 19634951
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19635168 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 19635069  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19635068 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgttcggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 19634969  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  19634968 gaactggttagagtacaa 19634951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 27714368 - 27714151
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27714368 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactactt 27714269  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27714268 ctctcgtatgtttgaaatgtcttttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 27714169  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  27714168 gaactggttagagtacaa 27714151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 40476072 - 40475855
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40476072 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggtggtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 40475973  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40475972 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 40475873  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  40475872 gaactggttagagtacaa 40475855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 12479632 - 12479415
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12479632 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 12479533  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  12479532 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtat 12479433  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  12479432 gaactggttagagtacaa 12479415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 16233972 - 16234189
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16233972 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 16234071  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  16234072 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtat 16234171  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  16234172 gaactggttagagtacaa 16234189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 16250830 - 16251047
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16250830 tttattgctttcgattgtgtttctgccttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 16250929  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16250930 ctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 16251029  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
     |||||||||||||||||    
T  16251030 aaattggttagagtacaa 16251047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 18224426 - 18224643
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18224426 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 18224525  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  18224526 ctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgttattttgggtat 18224625  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18224626 gaattggttagagtacaa 18224643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 19775773 - 19775990
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19775773 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactactt 19775872  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  19775873 ctctcatatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtat 19775972  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  19775973 gaactggttagagtacaa 19775990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 8389444 - 8389227
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8389444 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 8389345  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||    
T  8389344 cactcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggaat 8389245  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  8389244 gaactggttagagtacaa 8389227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 17092129 - 17092346
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17092129 tttattgctttcgattgtgtttctgccttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 17092228  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  17092229 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtat 17092328  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  17092329 gaactggttagagtacaa 17092346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 14683599 - 14683382
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14683599 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggtcgttgaaactccagctaagggttcggtgactactt 14683500  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  |||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  14683499 ctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcagtatggatgtgattctgggaat 14683400  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  14683399 gaattggttggagtacaa 14683382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 16350534 - 16350725
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16350534 tttattgctttcgattgtgtttctactttgggtcttgatttgtcggatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 16350633  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgatt 191  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16350634 ctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtctggtcgtgatttcgaaatggatctagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgatt 16350725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 15144872 - 15145088
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15144872 tttattgttttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacgt 15144971  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  15144972 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttaagcggtatggatgtga-tctgggtat 15145070  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
     || ||||| || |||||    
T  15145071 aaactggttggaatacaa 15145088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 28 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 14188511 - 14188321
Alignment:
Q  28 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatctt-gaaatgtcctttgt 126  Q
    |||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  14188511 ttgggtcttgctatgtctaatattaatggagagatggttgtcgaaactccagctaaaggttcggttactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgt 14188412  T
Q  127 ctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 217  Q
    || |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  14188411 ctttgtttgatcgtgattttgaaatggatttagtttgtttacctttgagtggaatgaatgtgattcttggtatgaactggttagagtacaa 14188321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 14162502 - 14162285
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||   |||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14162502 tttattgctcttgattgtgcttctaagttggatcttgctatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtaactactt 14162403  T
Q  101 ctctcgtatcttgaaa-tgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||| || | || ||  |||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| || ||    
T  14162402 ctcttgtgtgtttaaggtgtcctttgtctatgtatgatcgtgattttgaaatggatttagtttgtttacctttgagtggaatggatgtgattcttggcat 14162303  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  14162302 gaactggttagagtacaa 14162285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 14697133 - 14696916
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||   |||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14697133 tttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 14697034  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||| || | ||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||| || || |||||    
T  14697033 ctcttgtgtgcttaagatgtcccttgtctatgtttggtcgagattttgaaattgatttagtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtat 14696934  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  14696933 gaactggttagagtacaa 14696916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 217
Target Start/End: Original strand, 16042 - 16232
Alignment:
Q  28 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgt 126  Q
    |||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || || |||||||||||    
T  16042 ttgggtcttactatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgt 16141  T
Q  127 ctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 217  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||| |||||| |||||||    
T  16142 ctatgtttgatcgtgatttctaaattgatttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatccttggtatgaactggttaaagtacaa 16232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 13513382 - 13513285
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactac 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13513382 tttattgctttcaattgtgtttctgcttcgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactac 13513285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 79 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16219184 - 16219045
Alignment:
Q  79 gctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcg 177  Q
    |||||||||||  | ||||||||||| || | || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||| |    
T  16219184 gctaagggttcaataactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtg 16219085  T
Q  178 gtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 217  Q
    | |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||    
T  16219084 gaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaa 16219045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 79 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16222504 - 16222365
Alignment:
Q  79 gctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcg 177  Q
    |||||||||||  | ||||||||||| || | || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||| |    
T  16222504 gctaagggttcaataactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtg 16222405  T
Q  178 gtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 217  Q
    | |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||    
T  16222404 gaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaa 16222365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Original strand, 29450819 - 29450991
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || | | ||   |||||| | |||||||||||| | |    
T  29450819 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagag 29450918  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    |||| |  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  29450919 attttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagta 29450991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 41 - 214
Target Start/End: Original strand, 51604072 - 51604246
Alignment:
Q  41 tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcg 139  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||  |||||  | |||||||||||| |    
T  51604072 tgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaggtgtccaatttctatgtttggtag 51604171  T
Q  140 tgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
     ||||| ||| | || ||||||||| | ||  |||  || |||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  51604172 agattttgaagtagacttagtttgtttgccgctgacgggaatggatgttatttttgggatgaattggttagagta 51604246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15073349 - 15073177
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgt-atcttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |  ||||  ||||||||||||||||||||| | |    
T  15073349 tctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtcagtttgagttgtcctttgtctatgtttggtagag 15073250  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    | || ||| | ||| | || ||||| || ||||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  15073249 actttgaagttgatcttgtatgtctgccgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagta 15073177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Original strand, 3262076 - 3262248
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || | | ||   |||||| | |||||||||||| | |    
T  3262076 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagag 3262175  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    |||| |  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||    
T  3262176 attttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagta 3262248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 43 - 213
Target Start/End: Original strand, 44659148 - 44659319
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || | | ||   |||||| | |||||||||||| | |    
T  44659148 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagag 44659247  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagt 213  Q
    |||| |  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  44659248 attttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagt 44659319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 41 - 104
Target Start/End: Original strand, 53750750 - 53750813
Alignment:
Q  41 tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 104  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53750750 tgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 53750813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 27903375 - 27903203
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || | || ||  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  27903375 tctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 27903276  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    |||| ||  | || ||||| |||||||| ||||  || ||| |||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  27903275 attttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgatgggaatgaatgttattttagggatgaattggttagagta 27903203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 43 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 20893021 - 20892960
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 104  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  20893021 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 20892960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 41 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 16154774 - 16154711
Alignment:
Q  41 tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 104  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16154774 tgtctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 16154711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 104
Target Start/End: Original strand, 14993649 - 14993710
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 104  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  14993649 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcactaactacttctct 14993710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 16150626 - 16150565
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 104  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16150626 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 16150565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Original strand, 15354322 - 15354494
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| || | | | | |||||  ||||||||||||||| | |    
T  15354322 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctacgggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtctgttgtctatgtttggtagag 15354421  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    | ||  || | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| || ||||||||    
T  15354422 actttaaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactgattagagta 15354494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Original strand, 11204514 - 11204686
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    |||| |||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || | | ||   ||||||   |||||||||||| | |    
T  11204514 tctggtatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctggggtgtcctaaatctatgtttggtagag 11204613  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    |||| |   | |||||||||||||| || |||   ||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  11204614 attttgtggttgatttagtttgtctgccgttgtcgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagta 11204686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 59)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 15713535 - 15713752
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15713535 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 15713634  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15713635 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 15713734  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  15713735 gaactggttagagtacaa 15713752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 10008251 - 10008034
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10008251 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 10008152  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10008151 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgcgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattttgggtat 10008052  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  10008051 gaactggttagagtacaa 10008034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 10908861 - 10908644
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10908861 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 10908762  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10908761 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtcatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattttgggtat 10908662  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  10908661 gaactggttagagtacaa 10908644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 15345724 - 15345941
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15345724 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 15345823  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15345824 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtaaggatgtgattctgggtat 15345923  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  15345924 gaactggttagagtacaa 15345941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 12889360 - 12889143
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12889360 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 12889261  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  12889260 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtat 12889161  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  12889160 gaactggttagagtacaa 12889143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 13255341 - 13255124
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13255341 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 13255242  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  13255241 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtat 13255142  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  13255141 gaactggttagagtacaa 13255124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 26790892 - 26791109
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26790892 tttattgttttcgattgtgtttccgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactactt 26790991  T
Q  101 ctctcgtatctt-gaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26790992 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 26791091  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  26791092 gaactggttagagtacaa 26791109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 15586871 - 15587089
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15586871 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactactt 15586970  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  15586971 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgaatggtatggatgtgattctgggtat 15587070  T
Q  200 gaattggttagagtacaat 218  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  15587071 gaactggttagagtacaat 15587089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 16754180 - 16754398
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16754180 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 16754279  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16754280 ctctcgtatgtttgaaatgtcctctgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtat 16754379  T
Q  200 gaattggttagagtacaat 218  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  16754380 gaactggttagagtacaat 16754398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 15399996 - 15400213
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15399996 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagcttagggttcggtgactactt 15400095  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15400096 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctgcctttgagcggtatggatgtaattctgggtat 15400195  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  15400196 gaactggttagagtacaa 15400213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 43165326 - 43165109
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43165326 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 43165227  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  43165226 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtat 43165127  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  43165126 gaactggttagagtacaa 43165109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 48428098 - 48427881
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48428098 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 48427999  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  48427998 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtat 48427899  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  48427898 gaactggttagagtacaa 48427881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 15358734 - 15358521
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15358734 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 15358635  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15358634 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctgcctttgagcggtatggatgtaattctgggtat 15358535  T
Q  200 gaattggttagagt 213  Q
    ||| | ||||||||    
T  15358534 gaactagttagagt 15358521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16638424 - 16638207
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16638424 tttattgcttttgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 16638325  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  16638324 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtat 16638225  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  16638224 gaactggttagagtacaa 16638207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 16804426 - 16804643
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16804426 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtttgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactactt 16804525  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    ||||||||| ||||  ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16804526 ctctcgtatgcttgcgatgtcttctgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 16804625  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16804626 gaattggttagagtacaa 16804643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 20059533 - 20059750
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20059533 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 20059632  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  20059633 ctctagtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtat 20059732  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  20059733 gaactggttagagtacaa 20059750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 6603386 - 6603169
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6603386 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcaaaactccagctaagggttcggtgactactt 6603287  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6603286 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtat 6603187  T
Q  200 gaattggttagagtacaat 218  Q
    ||| ||||| |||||||||    
T  6603186 gaactggtt-gagtacaat 6603169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 53382497 - 53382715
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53382497 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatgaatggagagatgattgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 53382596  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  53382597 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtat 53382696  T
Q  200 gaattggttagagtacaat 218  Q
    ||| ||||| |||||||||    
T  53382697 gaactggttggagtacaat 53382715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 3688594 - 3688377
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3688594 tttattgcttccgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactactt 3688495  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  3688494 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtat 3688395  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| |||||| |||||||    
T  3688394 gaactggttacagtacaa 3688377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 5422409 - 5422626
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  5422409 tttattgctttcgattgcgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccgactaagggttcggtgactactt 5422508  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  5422509 ctctcgtatgtttgaaatgtcttttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtat 5422608  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  5422609 gaactggttagagtacaa 5422626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 15065722 - 15065505
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15065722 tttattgctttcgattgtgcttcttctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaatctccagctaagggttcggtgactactt 15065623  T
Q  101 ctctcgtatctt-gaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15065622 ctctcgtttgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattcttggtat 15065523  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15065522 gaattggttagagtacaa 15065505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 24185841 - 24185624
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24185841 tttattgctttcgattgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggtcgttgaaactccagctaagggtttggtgactactt 24185742  T
Q  101 ctctcgtatctt-gaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    ||||||||| || |   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24185741 ctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 24185642  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  24185641 gaattggttggagtacaa 24185624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16694815 - 16694598
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16694815 tttattgctttcgattgtgtttctgcgttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgagactccagctaagggttctgtgactactt 16694716  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||    
T  16694715 ctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtttggatttaattatgggtat 16694616  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16694615 gaattggttagagtacaa 16694598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 14874047 - 14874261
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14874047 tttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgatatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 14874146  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14874147 ctctcgtatgtttgaaaagttctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatgtatgtgattctgggtat 14874246  T
Q  200 gaattggttagagta 214  Q
    ||| ||||| |||||    
T  14874247 gaactggttcgagta 14874261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 17492475 - 17492285
Alignment:
Q  28 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgt 126  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || | || || |||||| ||||    
T  17492475 ttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagcgaagagttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcccttgt 17492376  T
Q  127 ctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 217  Q
     |||||||| ||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  17492375 ttatgtttgatcgtgattttgagattgatttggtttgtctacctttgagtggtatggatgtaattcttggtatgaactggttagagtacaa 17492285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 47 - 217
Target Start/End: Original strand, 14578933 - 14579104
Alignment:
Q  47 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14578933 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtaactacttctatagtatgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattt 14579032  T
Q  146 cgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 217  Q
     ||||| ||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  14579033 tgaaattgatttggtttgtttgcctttgagtggtatggatgtgattctaggtatgaactggttagagtacaa 14579104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 15262281 - 15262064
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||   |||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15262281 tttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaatggttcggtgactactt 15262182  T
Q  101 ctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||| || | || || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||| || |||||||| || || ||| |    
T  15262181 ctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtgt 15262082  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  15262081 gaactggttagagtacaa 15262064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 12843582 - 12843799
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||   |||| ||||| | ||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  12843582 tttattgctattgattgtgcttctaagttggatcttgctatgtcaaatatgaatggagagatgattgttgaaactccagctaatggttcagtgactactt 12843681  T
Q  101 ctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||| || | || || ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| || || |||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  12843682 ctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtttatgtttgatcgtgattttgaaattgacttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatcctgggtat 12843781  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  12843782 gaactggttagagtacaa 12843799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 41 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13944645 - 13944471
Alignment:
Q  41 tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcg 139  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||  |||||  | |||||||||||| |    
T  13944645 tgtctgatatggaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctagtttgcttgaggtgtccaatttctatgtttggtag 13944546  T
Q  140 tgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
     ||||| ||| | || |||||||||||||| ||||  || |||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  13944545 agattttgaagtagacttagtttgtctaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaattggttagagta 13944471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 47126563 - 47126391
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || | | ||   |||||| | |||||||||||| | |    
T  47126563 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagag 47126464  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    |||| | ||| |||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  47126463 attttgtaattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagta 47126391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 142 - 217
Target Start/End: Original strand, 26190937 - 26191012
Alignment:
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 217  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  26190937 attttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctaggtatgaactggttagagtacaa 26191012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 48 - 137
Target Start/End: Original strand, 15013284 - 15013374
Alignment:
Q  48 tatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 137  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  15013284 tatgaatggggaaatggttgtcgaaaccccagctaagggttcggtgactacttctctagtatgcttgaagtgtcctttgtcgatgtttggt 15013374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 10408587 - 10408415
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || | | ||   |||||| | |||||||||||| | |    
T  10408587 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtgtgcggtgtcctatatctatgtttggtagag 10408488  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    |||| |  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  10408487 attttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagta 10408415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 41 - 214
Target Start/End: Original strand, 8744898 - 8745072
Alignment:
Q  41 tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcg 139  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||  |||||  | |||||||||||| |    
T  8744898 tgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaggtgtccaatttctatgtttggtag 8744997  T
Q  140 tgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
     ||||| ||| | || ||||||||| | ||  |||  || |||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  8744998 agattttgaagtagacttagtttgtttgccgctgacgggaatggatgttatttttgggatgaattggttagagta 8745072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Original strand, 10417555 - 10417727
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || | | | |  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  10417555 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtgactacttctctggtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 10417654  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    |||||||  | || ||||| |||||||| |||   || |||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  10417655 atttcgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgttggggatggatgttattttcgggatgaattggttagagta 10417727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 12272957 - 12272785
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | | | |  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  12272957 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccattgtctatgtttggtagag 12272858  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    | || ||| | ||| |||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  12272857 actttgaagtcgatctagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagta 12272785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 43 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 17188993 - 17188871
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||  |||||| | |||||||||||| | |    
T  17188993 tctgatatggagggagagatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagag 17188894  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgt 164  Q
    |||| ||| | || |||||||||    
T  17188893 attttgaagtagacttagtttgt 17188871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 14575605 - 14575436
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | | | |  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  14575605 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 14575506  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttaga 211  Q
    | || ||| | ||  |||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||    
T  14575505 actttgaagtcgacctagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatttttggaatgaactggttaga 14575436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 24189923 - 24189754
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |  ||||  |||||| | |||||||||||| | |    
T  24189923 tctgatatgaagggagagatggttgttgagactccagctaagggttcagtgactacttttctcgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagag 24189824  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttaga 211  Q
    |||| ||  | || ||||||| | ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||||||||||||    
T  24189823 attttgaggtagacttagtttttttaccgctgacgggaatggatgttatttttggaatgaattggttaga 24189754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 28756938 - 28756769
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaaa-tgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || | |  |   |||||| | |||||||||||| | |    
T  28756938 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctacggtgtcctatatctatgtttggtagag 28756839  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttaga 211  Q
    |||| |  || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||    
T  28756838 attttgtgattgatttagtttgtctaccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttaga 28756769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Original strand, 11958691 - 11958863
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |  ||||  |||||| | |||||||||||| | |    
T  11958691 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagag 11958790  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    | || |   | |||||||||||| |  | |||   ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  11958791 actttgtggttgatttagtttgtttgtcgttgtcgggtatggatgttattttcggtatgaattggttagagta 11958863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 142
Target Start/End: Original strand, 12858005 - 12858105
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |  ||||  ||||| ||||||||||||||| |||    
T  12858005 tctgatatgaatggagaaacggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagtg 12858104  T
Q  142 a 142  Q
    |    
T  12858105 a 12858105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Original strand, 14291042 - 14291214
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |  ||||  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  14291042 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctatgtttggtagag 14291141  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    | || ||| | ||| | || ||| | || |||   ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||    
T  14291142 actttgaagtcgatcttgtatgtttgccgttgtcgggtatggatgtgatttttgggatgaactggttagagta 14291214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Original strand, 16378444 - 16378616
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | |||||  |||||  | |||||||||||| | |    
T  16378444 tctgatattaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgcttgaggtgtccaatatctatgtttggtagag 16378543  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    |||| ||  | || ||||||||| | || ||||  || |||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  16378544 attttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaattggttagagta 16378616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 17494266 - 17494093
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaa-ctccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgt 140  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| || |||| |||||| || | | | | |||||| ||||||||||||||| |     
T  17494266 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaaactccagctaagggttcagtaactaattctcttgtttgtctaagatgtccgttgtctatgtttggtaga 17494167  T
Q  141 gatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    || || ||| | || ||||||||| |||| ||||  |||||| |||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  17494166 gactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatgtatgttatttttgggatgaactggttagagta 17494093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Original strand, 12358037 - 12358209
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | | | |  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  12358037 tctgatatgaaaggaaaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 12358136  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    | || ||| | || ||||||||| || | ||||  ||||||||||| ||| | |  ||||| |||||||||||    
T  12358137 actttgaagtcgacttagtttgtttagcgttgacgggtatggatgttatttttgcgatgaactggttagagta 12358209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Original strand, 16825791 - 16825963
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | | | |  ||||| ||||||||  ||||| | |    
T  16825791 tctgatatgaaaggataaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtctataattggtagag 16825890  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    | || ||| | ||| | |||||| |||| ||||  ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||    
T  16825891 actttgaagtcgatcttgtttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttgggatgaactggttagagta 16825963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Original strand, 16832038 - 16832210
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |  ||||  |||||| | |||||||||||| | |    
T  16832038 tctgatatgaaagaagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagag 16832137  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    |||| ||  | || ||||||||| | || ||||  || ||||| || ||| | || |||||||||||||||||    
T  16832138 attttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggacgttatttttggaatgaattggttagagta 16832210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 104
Target Start/End: Original strand, 16327219 - 16327280
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 104  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  16327219 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctct 16327280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 104
Target Start/End: Original strand, 31692695 - 31692756
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 104  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||    
T  31692695 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaacttcagctaagggttcagtaactacttctct 31692756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 12180959 - 12180791
Alignment:
Q  47 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 145  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| || | |  || |||||| ||||||||||||||| | || ||    
T  12180959 atatgaaaggagaaatggttgttgacactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtccaagatgtccgttgtctatgtttggtagagactt 12180860  T
Q  146 cgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
     ||| | || ||||||| | |||| ||||  ||||||| ||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  12180859 tgaagtcgacttagtttctttaccgttgacgggtatggttgttatctttgggatgaactggttagagta 12180791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 100
Target Start/End: Original strand, 11949435 - 11949492
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  11949435 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactactt 11949492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 214
Target Start/End: Original strand, 12510104 - 12510165
Alignment:
Q  153 gatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    |||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  12510104 gatttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttggaatgaattggttagagta 12510165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 104
Target Start/End: Original strand, 18131856 - 18131917
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 104  Q
    ||||||||||| || || | |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  18131856 tctgatatgaaaggggaaacggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 18131917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 31941522 - 31941461
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 104  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||   || |||||||||||    
T  31941522 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtctagtaactacttctct 31941461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 15230217 - 15230161
Alignment:
Q  48 tatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 104  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  15230217 tatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcattaactacttctct 15230161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 15236085 - 15236029
Alignment:
Q  48 tatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 104  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  15236085 tatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcattaactacttctct 15236029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 85
Target Start/End: Original strand, 13318044 - 13318086
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagg 85  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  13318044 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagg 13318086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 117 - 214
Target Start/End: Original strand, 13318087 - 13318184
Alignment:
Q  117 tgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||  | ||| | || |||||||| ||||  ||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  13318087 tgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaggttgatcttgtatgtctaccgttgatgggtatggatgttatttttgggatgaattggttagagta 13318184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 36)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 27373932 - 27373715
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27373932 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 27373833  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27373832 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgcctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 27373733  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  27373732 gaactggttagagtacaa 27373715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 10871513 - 10871296
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10871513 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactactt 10871414  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10871413 ctctcgtatgtttgaaatgtcgtttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 10871314  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  10871313 gaactggttagagtacaa 10871296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 24712697 - 24712480
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24712697 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 24712598  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24712597 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtat 24712498  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  24712497 gaactggttagagtacaa 24712480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 24874530 - 24874747
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24874530 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaaggtttcggtgactactt 24874629  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24874630 ctctcgtatgtttcaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 24874729  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  24874730 gaactggttagagtacaa 24874747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 27220679 - 27220462
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27220679 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 27220580  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  27220579 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtat 27220480  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  27220479 gaactggttagagtacaa 27220462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 9338245 - 9338028
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9338245 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 9338146  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  9338145 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtat 9338046  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  9338045 gaactggttagagtacaa 9338028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 9486879 - 9486662
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9486879 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 9486780  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  9486779 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtat 9486680  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  9486679 gaactggttagagtacaa 9486662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16983903 - 16983686
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16983903 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 16983804  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  16983803 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtat 16983704  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  16983703 gaactggttagagtacaa 16983686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 17001663 - 17001446
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17001663 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttatctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 17001564  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  17001563 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtat 17001464  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  17001463 gaactggttagagtacaa 17001446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 21142821 - 21143038
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21142821 tttattgctttcgattgtgtttctgttttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcgatgactactt 21142920  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21142921 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctaggtat 21143020  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  21143021 gaactggttagagtacaa 21143038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 22323122 - 22323339
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22323122 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 22323221  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  22323222 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttaggtat 22323321  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  22323322 gaactggttagagtacaa 22323339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 24265033 - 24264816
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24265033 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgagtggatagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactactt 24264934  T
Q  101 ctctcgtatctt-gaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24264933 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtttatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 24264834  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  24264833 gaactggttagagtacaa 24264816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 44383350 - 44383567
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44383350 tttattgctttcgattgtgtttctgttttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 44383449  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  44383450 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtat 44383549  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  44383550 gaactggttagagtacaa 44383567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 11351491 - 11351708
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11351491 tttattgctttcgattgtgcttctactttgggtctagatatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 11351590  T
Q  101 ctctcgtatctt-gaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11351591 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcgatatggatgtgattctgggtat 11351690  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||||||||||||||||||    
T  11351691 gaattggttagagtacaa 11351708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 45673792 - 45674009
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45673792 tttattgctttcgattgtgattctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 45673891  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45673892 ctctcgtatgtttgagatgtcttttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgaatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 45673991  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||||||||||||||||||    
T  45673992 gaattggttagagtacaa 45674009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 24657438 - 24657655
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24657438 tttattgctttcgattgtgtttctactttggatcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 24657537  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  24657538 ctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattcttgatat 24657637  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  24657638 gaattgggtagagtacaa 24657655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 23029241 - 23029458
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23029241 tttattgctttcgattgtgcttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagtgatggttgtcgaaaatccagctaagggttcggtgactactt 23029340  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23029341 ctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 23029440  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||| || |||||    
T  23029441 gaactggttggaatacaa 23029458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 24678150 - 24677933
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24678150 tttattgctttcgattgtgcttctactttgggtctagatatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaacttcagctaagggttcggtgactactt 24678051  T
Q  101 ctctcgtatctt-gaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24678050 ctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 24677951  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  24677950 gaactggttagagtacaa 24677933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 21323046 - 21323254
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21323046 tttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgattggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 21323145  T
Q  101 ctctcgtatctt-gaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21323146 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtgtggatgtgattctgggtat 21323245  T
Q  200 gaattggtt 208  Q
    |||||||||    
T  21323246 gaattggtt 21323254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 23204973 - 23204760
Alignment:
Q  5 ttgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23204973 ttgctttccattgtgtttctgctttgggtcttgatgtgtctgatatgaatggagagatggttgtcgatactccagctaagggttcggtgactacttctct 23204874  T
Q  105 cgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaat 203  Q
    ||||| || |  ||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23204873 cgtatgctcgcgatgtcctttgtctatggatggtcgtgattttgtaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaat 23204774  T
Q  204 tggttagagtacaa 217  Q
    ||||||||||||||    
T  23204773 tggttagagtacaa 23204760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 24705262 - 24705479
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  24705262 tttattgctttcgattgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatgcagagatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtaactactt 24705361  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||| |||||    
T  24705362 ctctcgtatgtttgagatgccctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtattaatatgattcttggtat 24705461  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||||||||||||||||||    
T  24705462 gaattggttagagtacaa 24705479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 6 - 217
Target Start/End: Original strand, 41606175 - 41606382
Alignment:
Q  6 tgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctc 105  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41606175 tgctttcgat-gtgtttctgctttgtgtct-gagt-gtctgatatgaatggagagatggt-gtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctc 41606270  T
Q  106 gtatctt-gaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaatt 204  Q
    |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41606271 gtatgtttgaaatgtcctt-gtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctatctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaact 41606369  T
Q  205 ggttagagtacaa 217  Q
    |||||||||||||    
T  41606370 ggttagagtacaa 41606382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 23074499 - 23074309
Alignment:
Q  28 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgt 126  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || || |||||||||||    
T  23074499 ttgggtcttgctatgtctgatatgaatggagagatggttatcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgt 23074400  T
Q  127 ctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 217  Q
    ||||||||| || |||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23074399 ctatgtttgatcttgattttgagattgatttggtttgtctacctttgagtggtatggatgtaattcttggtatgaattggttagagtacaa 23074309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 217
Target Start/End: Original strand, 23105535 - 23105725
Alignment:
Q  28 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgt 126  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || || |||||||||||    
T  23105535 ttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgt 23105634  T
Q  127 ctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 217  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||    
T  23105635 ctatgtttgatcgtgattttgagatggatttagtttgtctacctttgatcggtatggatgtgtttctgggtatgaactggttggaatacaa 23105725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 22733554 - 22733771
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||   ||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22733554 tttattgcttttgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactactt 22733653  T
Q  101 ctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||| || | | | | |||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  22733654 ctcttgtgtgtataagatgtcccttgtctatgtttgatcgtgattttcagattgatttggtttgtctagctttgagtggtatggatgtaattcttggtat 22733753  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||  ||||||||||||||    
T  22733754 gacctggttagagtacaa 22733771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 22742746 - 22742854
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22742746 tttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 22742845  T
Q  101 ctctcgtat 109  Q
    |||||||||    
T  22742846 ctctcgtat 22742854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 213
Target Start/End: Original strand, 24817666 - 24817833
Alignment:
Q  47 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 145  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | | | ||||||||| |||||||||||| | |||||    
T  24817666 atatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtctaagatgtcctttatctatgtttggtagagattt 24817765  T
Q  146 cgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagt 213  Q
     || || ||||| |||||| | ||||||||  | |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  24817766 tgagattgatttggtttgtttgcctttgagtagaatggatgtaattcttggtatgaactggttggagt 24817833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 23065049 - 23064973
Alignment:
Q  28 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 104  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23065049 ttgggtcttgctatgtctgatatgaatggagagatggttatcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 23064973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Original strand, 19716839 - 19717011
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | ||||| |||||| ||||||||||||||| | |    
T  19716839 tctgatttgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagag 19716938  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    | || ||| | || ||||||||| | || ||||  ||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  19716939 actttgaagtcgacttagtttgtttgccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagta 19717011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 41 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 12576976 - 12576802
Alignment:
Q  41 tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcg 139  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || | |||||  |||||  | |||||||||||| |    
T  12576976 tgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaatgactacttctctggtttgcttgaggtgtccaatttctatgtttggtag 12576877  T
Q  140 tgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
     ||||| ||| | || ||||| ||| |||| ||||  || |||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  12576876 agattttgaagtagacttagtgtgtttaccgttgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagta 12576802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 61 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 19817450 - 19817302
Alignment:
Q  61 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttag 159  Q
    ||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||| || |||||| | ||||| | | |||| ||||    
T  19817450 atggttgtcaaaaacccggctaagggttcggtgactacttctctagtatgcttgaagtttcctttgtcgatatttggtagagattttgcagtggacttag 19817351  T
Q  160 tttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggtt 208  Q
    | ||| | || ||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||    
T  19817350 tctgtttgccgttgagtgggatggatgtgatactaggtatgaactggtt 19817302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 214
Target Start/End: Original strand, 23097841 - 23098012
Alignment:
Q  44 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 142  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |  ||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  23097841 ctgacatgaaaggagagatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagaga 23097940  T
Q  143 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    ||| |   | || ||||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| ||| |||||||    
T  23097941 ttttgtggtcgacttagtgtgtctaccgttgatgggtatggatgtcatttttggaatgaactgggtagagta 23098012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 48 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23113339 - 23113172
Alignment:
Q  48 tatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttc 146  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |  ||||  ||||| ||||||||||||||| | |||||     
T  23113339 tatgagtggagaaatggttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagatttt 23113240  T
Q  147 gaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    ||| | ||| |||| ||| | || ||||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  23113239 gaagttgatctagtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagta 23113172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23274214 - 23274042
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | | | |  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  23274214 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 23274115  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    | || ||| | || ||||||||| |||| ||||  || |||||||| ||| | || ||| | |||||||||||    
T  23274114 actttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatggactggttagagta 23274042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 20848210 - 20848067
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || | | ||   |||||| | |||||||||||| | |    
T  20848210 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagag 20848111  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggat 185  Q
    |||| |  || |||||||||||||| || ||||  |||||||||    
T  20848110 attttgtgattgatttagtttgtctgccgttgatgggtatggat 20848067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 202
Target Start/End: Original strand, 30208747 - 30208902
Alignment:
Q  48 tatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttc 146  Q
    |||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||||| || ||| || | ||| || ||||||||||| ||||||| | | |||||     
T  30208747 tatgaaaggggaaatggttgtcgaaaccccggcaaagggttcggtgactaattttctagtgtgcttaaagtgtcctttgtcgatgtttgatagagatttt 30208846  T
Q  147 gaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaa 202  Q
    | | |||| ||||| ||| | || ||||| || ||||||||||| || ||||||||    
T  30208847 gcagtggacttagtctgtttgccattgagtgggatggatgtgatactaggtatgaa 30208902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 34)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 33388341 - 33388558
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33388341 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 33388440  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33388441 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 33388540  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  33388541 gaactggttagagtacaa 33388558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 17042327 - 17042544
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17042327 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggccttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 17042426  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17042427 ctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 17042526  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||||||||||||||||||    
T  17042527 gaattggttagagtacaa 17042544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 16347907 - 16348124
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16347907 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 16348006  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  16348007 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtat 16348106  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  16348107 gaactggttagagtacaa 16348124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 21833349 - 21833132
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21833349 tttatggctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 21833250  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    ||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21833249 ctctcgtctgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgatttcaaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 21833150  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  21833149 gaactggttagagtacaa 21833132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 51330804 - 51331021
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51330804 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 51330903  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  51330904 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtat 51331003  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  51331004 gaactggttagagtacaa 51331021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 19109403 - 19109197
Alignment:
Q  13 gattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatctt 112  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  19109403 gattgtgcttctgctttgagtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtatgtt 19109304  T
Q  113 -gaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttaga 211  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19109303 tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcatgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttaga 19109204  T
Q  212 gtacaat 218  Q
    |||||||    
T  19109203 gtacaat 19109197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 41350980 - 41351198
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  41350980 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgcttactt 41351079  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41351080 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttagtcgtgattttgaaatggatttagtttgcctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtat 41351179  T
Q  200 gaattggttagagtacaat 218  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  41351180 gaactggttagagtacaat 41351198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 20081688 - 20081896
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20081688 tttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 20081787  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20081788 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtat 20081887  T
Q  200 gaattggtt 208  Q
    ||| |||||    
T  20081888 gaactggtt 20081896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 24785169 - 24785386
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24785169 tttattgctttcgattgtgcttctgctttgggtcttgttttatctgatatgaatggagagatggtcgttgaaattccagctaagggttcggtgactactt 24785268  T
Q  101 ctctcgtatctt-gaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  24785269 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatctggtttgtctacctttgagcggtatggatgtaattatgggtat 24785368  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||||||||||||||||||    
T  24785369 gaattggttagagtacaa 24785386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 21842259 - 21842066
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21842259 tttattgcttttgattgtgtttctgctttaggtcttgatttgtctgatatgaatggagagattgttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 21842160  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 193  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21842159 ctctcgtatgtttgaaatgtcatttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctgcctttgagcggtatggatgtgattct 21842066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16379141 - 16378924
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||   ||||||| || | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16379141 tttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcatgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 16379042  T
Q  101 ctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||| || | || || |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  16379041 ctcttgtttgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagattgatttggtttgtttacctttgagcggaatggatgtaatcctgggtat 16378942  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16378941 gaattggttagagtacaa 16378924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 22496568 - 22496705
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22496568 tttattgctttcgattgtgcttctacattgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 22496667  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 137  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  22496668 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 22496705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 21228868 - 21228947
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 80  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21228868 tttattgctttcgattgtgtttctggtttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 21228947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 138 - 217
Target Start/End: Original strand, 21233181 - 21233260
Alignment:
Q  138 cgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21233181 cgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 21233260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 21752067 - 21751991
Alignment:
Q  28 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 104  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21752067 ttgggtcttgctatgtctaatatgaatgaagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 21751991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 116 - 217
Target Start/End: Original strand, 429585 - 429686
Alignment:
Q  116 atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtac 215  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||||| || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  429585 atgtcatttgtctatgtttgatagtgattttgagatggatttggtttgtctacatttgagtggtatggatgtgattcttggtatgaattggttggaatac 429684  T
Q  216 aa 217  Q
    ||    
T  429685 aa 429686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 211
Target Start/End: Original strand, 31537336 - 31537520
Alignment:
Q  28 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgt 126  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || | | ||   |||||| | |    
T  31537336 ttgggtttggatgtgtctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatat 31537435  T
Q  127 ctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttaga 211  Q
    ||||||||||| | ||||| |  || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||    
T  31537436 ctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctaccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttaga 31537520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Original strand, 38910180 - 38910352
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| ||  | |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || | | ||   |||||| | |||||||||||| | |    
T  38910180 tctgatatgaaagggaaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagag 38910279  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    |||| |  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  38910280 attttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagta 38910352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Original strand, 21739375 - 21739562
Alignment:
Q  28 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgt 126  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || |  ||||  ||||| ||||    
T  21739375 ttgggtcttgttttatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttttcttgtttgtttgagttgtccattgt 21739474  T
Q  127 ctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    ||||||||||| | || || ||| | ||| |||| ||| | || ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  21739475 ctatgtttggtagagactttgaagtcgatctagtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagta 21739562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 150 - 217
Target Start/End: Original strand, 22502751 - 22502818
Alignment:
Q  150 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  22502751 atggatttagtttgtctacctttgagcggaatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaa 22502818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 12200554 - 12200382
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || | | ||   |||||  | |||||||||||| | |    
T  12200554 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcccatatctatgtttggtagag 12200455  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    |||| |  || |||||||| ||||| || ||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  12200454 attttgtgattgatttagtgtgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagta 12200382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Original strand, 22016099 - 22016271
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | | | |  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  22016099 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 22016198  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    | || ||| | ||  |||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  22016199 actttgaagtcgacctagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagta 22016271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 214
Target Start/End: Original strand, 24096973 - 24097141
Alignment:
Q  47 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 145  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||| || | ||||| |||||| ||||||||||||||| | || ||    
T  24096973 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaattacttctcttgtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagagactt 24097072  T
Q  146 cgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
     | | | || ||||||||| | || ||||  ||||||||||| ||| |  | |||||||||||||||||    
T  24097073 tgtagtcgacttagtttgtttgccgttgacgggtatggatgttatttttagaatgaattggttagagta 24097141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 48425909 - 48425737
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || | | ||   |||||| | |||||||||||| | |    
T  48425909 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagag 48425810  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    |||| |  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||    
T  48425809 attttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagta 48425737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 52988777 - 52988605
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || | | ||   |||||| | |||||||||||| | |    
T  52988777 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagag 52988678  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    |||| |  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||    
T  52988677 attttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagta 52988605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 43 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 37680085 - 37679914
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || | | ||   |||||| | |||||||||||| | |    
T  37680085 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagag 37679986  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagt 213  Q
    |||| |  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  37679985 attttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagt 37679914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 104
Target Start/End: Original strand, 21742906 - 21742967
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 104  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  21742906 tctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtaactacgtctct 21742967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 116 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 21751868 - 21751767
Alignment:
Q  116 atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtac 215  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| || || ||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || || || | ||||||||||    
T  21751868 atgtcctttgtctatgtttgatcgtaattttgagattgatatggtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattcttggcatcaactcgttagagtac 21751769  T
Q  216 aa 217  Q
    ||    
T  21751768 aa 21751767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 19857310 - 19857166
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | | | |  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  19857310 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgcctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 19857211  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatg 186  Q
    | || ||| | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||    
T  19857210 actttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgactggtatggatg 19857166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20297417 - 20297245
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | | ||   |||||| | | |||||||||| | |    
T  20297417 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatttatgtttggtagag 20297318  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    |||| |   | |||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  20297317 attttgtggttgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatctttggaatgaattggttagagta 20297245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Original strand, 20854114 - 20854286
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || | || ||  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  20854114 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 20854213  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    |||| ||  | || ||||| |||||||| |||   || |||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  20854214 attttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgttgggaatggatgttattttcgggatgaattggttagagta 20854286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 104
Target Start/End: Original strand, 20075063 - 20075124
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 104  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  20075063 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 20075124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Original strand, 20833254 - 20833426
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||||||  | ||||||||||| || | | | |  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  20833254 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagataagggttcattaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 20833353  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    | || ||| | || ||||||||| |||| ||||  || |||||||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  20833354 actttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaactggttagagta 20833426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 18710421 - 18710360
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 104  Q
    ||||||||||  || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  18710421 tctgatatgagaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 18710360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 10429 - 10212
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10429 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 10330  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10329 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtat 10230  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  10229 gaactggttagagtacaa 10212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 3485 - 3268
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3485 tttattgctttcgattgtgtttctgccttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcgatgactactt 3386  T
Q  101 ctctcgtatctt-gaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3385 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 3286  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  3285 gaactggttagagtacaa 3268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 17221 - 17004
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17221 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcgatgactactt 17122  T
Q  101 ctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    ||||||||| || || ||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17121 ctctcgtatgtttaagatgccctttatctatgtttagtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 17022  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||||||||||||||||||    
T  17021 gaattggttagagtacaa 17004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 37)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 18859675 - 18859458
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18859675 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 18859576  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18859575 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggaagtgattctgggtat 18859476  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  18859475 gaactggttagagtacaa 18859458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 22117858 - 22118075
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22117858 tttattgctttcgatcgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 22117957  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22117958 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctctgagcggtatggatgtgattctgggtat 22118057  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  22118058 gaactggttagagtacaa 22118075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 22126642 - 22126859
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22126642 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgattactt 22126741  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  22126742 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctctgagcggtatggatgtgattttgggtat 22126841  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  22126842 gaactggttagagtacaa 22126859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 22129300 - 22129517
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22129300 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggacagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 22129399  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22129400 ctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 22129499  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22129500 gaattggttagagtacaa 22129517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 30310827 - 30311044
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30310827 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgagactccagctaagggttcggtgactactt 30310926  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30310927 ctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 30311026  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||||||||||||||||||    
T  30311027 gaattggttagagtacaa 30311044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 32603243 - 32603026
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32603243 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 32603144  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  |||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32603143 ctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggttgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 32603044  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||||||||||||||||||    
T  32603043 gaattggttagagtacaa 32603026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 17671705 - 17671922
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17671705 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 17671804  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  17671805 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtat 17671904  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  17671905 gaactggttagagtacaa 17671922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 20015946 - 20016163
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20015946 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 20016045  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  20016046 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgggtttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtat 20016145  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  20016146 gaactggttagagtacaa 20016163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 19115498 - 19115281
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19115498 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcaaaactccagctaagggttcagtgactactt 19115399  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  19115398 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtat 19115299  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  19115298 gaactggttagagtacaa 19115281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22031201 - 22030984
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22031201 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactactt 22031102  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  22031101 ctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcatgatttcgaaatggatttagtttgtctacatttaagcggtatggatgtaattctgggtat 22031002  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22031001 gaattggttagagtacaa 22030984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 19481755 - 19481973
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  19481755 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgcttactt 19481854  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19481855 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttagtcgtgattttgaaatggatttagtttgcctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtat 19481954  T
Q  200 gaattggttagagtacaat 218  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  19481955 gaactggttagagtacaat 19481973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 15536481 - 15536264
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15536481 tttattgctttcgattatgtttctgccttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 15536382  T
Q  101 ctctcgtatcttga-aatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    ||||||||| || |   |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||     
T  15536381 ctctcgtatgtttacgttgtcctttgtctatatttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatgaatgtgattttgggtac 15536282  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15536281 gaattggttagagtacaa 15536264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 19981065 - 19980848
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19981065 tttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 19980966  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19980965 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagtttgtctacccttgagcggtatggatgtgattctgggtat 19980866  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||| || |||||    
T  19980865 gaactggttggaatacaa 19980848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22042925 - 22042708
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22042925 tttatttcttttgattgtgtttctgctttgggtcttgatttttctgatatgattggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 22042826  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  22042825 ctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgaacggtatggatgtgattctaggtat 22042726  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    |||||||||||| |||||    
T  22042725 gaattggttagaatacaa 22042708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 21164221 - 21164438
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21164221 tttattgctttcaattgtgcttcttctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactactt 21164320  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21164321 ctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgagatggacttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtat 21164420  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||| || |||||    
T  21164421 gaactggttggaatacaa 21164438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 217
Target Start/End: Original strand, 21391571 - 21391761
Alignment:
Q  28 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgt 126  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | || || |||||||||||    
T  21391571 ttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtgaccacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgt 21391670  T
Q  127 ctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 217  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  21391671 ctatgtttgatcgtgattttgagatggatttagtttttctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaa 21391761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 217
Target Start/End: Original strand, 21780897 - 21781087
Alignment:
Q  28 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgt 126  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | || || |||||||||||    
T  21780897 ttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtgaccacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgt 21780996  T
Q  127 ctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 217  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  21780997 ctatgtttgatcgtgattttgagatggatttagtttttctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaa 21781087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 217
Target Start/End: Original strand, 21786065 - 21786255
Alignment:
Q  28 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgt 126  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | || || |||||||||||    
T  21786065 ttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtgaccacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgt 21786164  T
Q  127 ctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 217  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  21786165 ctatgtttgatcgtgattttgagatggatttagtttttctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaa 21786255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 21254016 - 21253842
Alignment:
Q  28 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgt 126  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || || |||||||||||    
T  21254016 ttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgt 21253917  T
Q  127 ctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatga 201  Q
    ||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  21253916 ctatgtttgatcgtgattttgagatggatttggtttgtctacctttgagtggtatgcatgtgattcttggtatga 21253842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22990116 - 22989926
Alignment:
Q  28 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgt 126  Q
    |||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || || |||||| ||||    
T  22990116 ttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagcgaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttaagatgtcccttgt 22990017  T
Q  127 ctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 217  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || || |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||    
T  22990016 ctatgtttggtcgtgattttgaaattgacttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaa 22989926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22523644 - 22523427
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||   |||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22523644 tttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 22523545  T
Q  101 ctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||| || | || || |||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||    
T  22523544 ctcttgtgtgtttaagatgttctttttctatgtttggtcttgattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatccttggtat 22523445  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  22523444 gaactggttagagtacaa 22523427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 22246116 - 22246333
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||   |||||||||| | ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22246116 tttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggatagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 22246215  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||| || | ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||| |||||| |||||||||| |  |||||||| || || |||||    
T  22246216 ctcttgtgtgcttaatatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttgaaattaatttggtttgtttacctttgagtgaaatggatgtaatccttggtat 22246315  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22246316 gaattggttagagtacaa 22246333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 22421575 - 22421792
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||   |||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22421575 tttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 22421674  T
Q  101 ctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||| || | || || ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| || || |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| || ||    
T  22421675 ctcttgtgtgtttaagatgtcctttatctatgtttgatcgtgattttgaaattgacttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtaattcttggcat 22421774  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| | ||||| ||||||    
T  22421775 gaactagttagtgtacaa 22421792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 217
Target Start/End: Original strand, 22375164 - 22375353
Alignment:
Q  28 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgt 126  Q
    |||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | || || |||||||||||    
T  22375164 ttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggagagatggtcgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctc-cgtgtgtttaagatgtcctttgt 22375262  T
Q  127 ctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 217  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||    
T  22375263 ctatgtttggtagagattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaa 22375353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 22245698 - 22245868
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||   |||||||||| | ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22245698 tttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggatagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 22245797  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacct 170  Q
    |||| || | ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||| |||||| |||||    
T  22245798 ctcttgtgtgcttaatatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttgaaattaatttggtttgtttacct 22245868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 137
Target Start/End: Original strand, 31414257 - 31414352
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 137  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  31414257 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggt 31414352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22053919 - 22053747
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | | |||  ||||||   |||||||||||| | |    
T  22053919 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctgaggtgtcctacatctatgtttggtagag 22053820  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    | || |   | |||||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  22053819 actttgtggttgatttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagta 22053747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 43 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 19985236 - 19985141
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 137  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |  ||||  ||||| |||||||||||||||    
T  19985236 tctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggt 19985141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 22373925 - 22373864
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 104  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22373925 tctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 22373864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Original strand, 16268949 - 16269121
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |  | | ||   |||||| | |||||||||||| | |    
T  16268949 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgcttgtctggggtgtcctatatctatgtttggtagag 16269048  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    ||||||   | |||||||||||||| || |||   ||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  16269049 atttcgtggttgatttagtttgtctgccgttgtcgggtatggatgttattttcgggatgaattggttagagta 16269121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 28983967 - 28983795
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || | | ||   |||||| | |||||||||||| | |    
T  28983967 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagag 28983868  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    |||| |  || || || |||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||    
T  28983867 attttgtgattgacttggtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagta 28983795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 43 - 137
Target Start/End: Original strand, 29301151 - 29301246
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggt 137  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | | |||  ||||| |||||||||||||||    
T  29301151 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctgagttgtccgttgtctatgtttggt 29301246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 43 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 21928484 - 21928423
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 104  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  21928484 tctgatatgaatggcgaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 21928423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 214
Target Start/End: Original strand, 22028009 - 22028177
Alignment:
Q  47 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 145  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||| || | || ||  ||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  22028009 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtccattgtctatgtttggtagagattt 22028108  T
Q  146 cgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
     ||  | || ||||| ||| | || ||||  |||||| |||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  22028109 tgaggtcgacttagtatgtttgccgttgacgggtatgaatgttatttttgggatgaattggttagagta 22028177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 28989186 - 28989014
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||| || | | ||   |||||| | |||||||||||| | |    
T  28989186 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgatactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagag 28989087  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    |||| |  || || || |||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||    
T  28989086 attttgtgattgacttggtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagta 28989014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 20391131 - 20391078
Alignment:
Q  54 tggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgt 107  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  20391131 tggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctcgt 20391078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 27357592 - 27357423
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || | | ||   |||||| | |||||||||||| | |    
T  27357592 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctatgtttggtagag 27357493  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttaga 211  Q
    |||| |   | |||||||||||||| || |||   ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||    
T  27357492 attttgtggttgatttagtttgtctgccgttgtcgggtatggatgttatttttggaatgaattggttaga 27357423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 41216 - 40999
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41216 tttattgctttggattatgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 41117  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41116 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattttgggtat 41017  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  41016 gaactggttagagtacaa 40999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 13367 - 13584
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13367 tttattgctttcgattgtgtttctggtttgggtcttgatttgtctgatatgaatgaagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 13466  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  |||  ||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  13467 ctctcgtatgtttgcgatgtcctttatcaatggttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcgttatggatgtgattttgggtat 13566  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||||||||||||||||||    
T  13567 gaattggttagagtacaa 13584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22308 - 22091
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22308 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 22209  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  22208 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtat 22109  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  22108 gaactggttagagtacaa 22091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 4)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 14485 - 14268
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14485 tttattgctttcgattgcgtttctgctttgggtcttgatttgtctggtatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 14386  T
Q  101 ctctcgta-tcttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14385 ctctcgtatttttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 14286  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||||||||||||||||||    
T  14285 gaattggttagagtacaa 14268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 47 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 4930 - 4759
Alignment:
Q  47 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| || | || || ||||||||||||| |||||||||  || ||    
T  4930 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtgtgtttaacatgtcctttgtctttgtttggtcaagagtt 4831  T
Q  146 cgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 217  Q
     ||||| || ||||||||| |||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  4830 tgaaattgacttagtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatcctgggtatgaactggttagagtacaa 4759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Original strand, 39618 - 39790
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || | | ||   |||||| | |||||||||||| | |    
T  39618 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagag 39717  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    |||| |  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||    
T  39718 attttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagta 39790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Original strand, 44712 - 44884
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||| || | | | |  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  44712 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 44811  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    | || ||| | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| | |||||||||    
T  44812 actttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacaggtatggatgttatttttgggatgaactagttagagta 44884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 183; Significance: 4e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 36556 - 36342
Alignment:
Q  4 attgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctc 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36556 attgctttcgattgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctc 36457  T
Q  104 tcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaa 202  Q
    ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36456 tcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatctagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattcttggtatgaa 36357  T
Q  203 ttggttagagtacaa 217  Q
    |||||||||||||||    
T  36356 ttggttagagtacaa 36342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 182; Significance: 1e-98; HSPs: 5)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 10481 - 10698
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10481 tttattactttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 10580  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10581 ctctcgtatgtttgagatgtcctttaactatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattatgggtat 10680  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||||||||||||||||||    
T  10681 gaattggttagagtacaa 10698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 31944 - 31727
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31944 tttattgctttcgattgtgcttctgctttgggtcttgttttgtttgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtaactactt 31845  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  31844 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgatatggatttagtttgtctacctttgagcggtttggatgtgattctaggtat 31745  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||||||||||||||||||    
T  31744 gaattggttagagtacaa 31727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 13146 - 13353
Alignment:
Q  11 tcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat- 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13146 tcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatg 13245  T
Q  110 cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggtta 209  Q
     |||  |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13246 tttgcgatgtcctttaactatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattatgggtatgaattggtta 13345  T
Q  210 gagtacaa 217  Q
    ||||||||    
T  13346 gagtacaa 13353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 37410 - 37193
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  37410 tttattgctttcgattgtgcttctgctttgggtcttgttttgtttgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttctgttactactt 37311  T
Q  101 ctctcgtatctt-gaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  37310 ctctcttatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgatatggatttagtttgtctacctttgagcggtttggatgtgattctaggtat 37211  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||||||||||||||||||    
T  37210 gaattggttagagtacaa 37193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 41 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 54658 - 54481
Alignment:
Q  41 tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcg 139  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || || ||||||||| |||||||||| |||    
T  54658 tgtctaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttttctatgtttgatcg 54559  T
Q  140 tgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 217  Q
    |||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  54558 tgattttgagatggatttagtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattcttggcatgaactggttagagtacaa 54481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 182; Significance: 1e-98; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 17309 - 17526
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17309 tttattgctttcgattgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 17408  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  17409 ctctcgtatgtttgagatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcgatatggatgtgattcttggtat 17508  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||||||||||||||||||    
T  17509 gaattggttagagtacaa 17526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 195081 - 195283
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  195081 tttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgattggagagatagttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 195180  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  195181 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggacgtgatttcgagatggatttagtttctctacctttgagcggtgtggatgtgattctgggtat 195280  T
Q  200 gaa 202  Q
    |||    
T  195281 gaa 195283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 47 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 24321 - 24154
Alignment:
Q  47 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 145  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||| ||||||||| | |||||    
T  24321 atatgaatggagaaatggttgtcgaaaccccggctaagggttcagtgactacttctctagtatgcctgaagtgtcctttgtcgatgtttggtagagattt 24222  T
Q  146 cgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagt 213  Q
     | | ||||  |||| ||| |  | ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  24221 tgtagtggacctagtctgtttgtcgttgagtgggatggatgtgatactaggtatgaactggttggagt 24154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1881 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold1881
Description:

Target: scaffold1881; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 723 - 936
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  723 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttaggtaactactt 822  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  | |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  823 ctctcgtatgatagaaatgtcctttatatatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 922  T
Q  200 gaattggttagagt 213  Q
    ||||||||||||||    
T  923 gaattggttagagt 936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1459 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold1459
Description:

Target: scaffold1459; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 1275 - 1492
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1275 tttattgctttcgactttgtttctactttgggtcttgatttttctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 1374  T
Q  101 ctctcgtatctt-gaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1375 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 1474  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    |||||||||| |||||||    
T  1475 gaattggttacagtacaa 1492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 29171 - 29388
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29171 tttattgctttcgattgtgtttctactttgggtcttgatttatctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 29270  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29271 ctctcgtatgtttgagatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacatttgagcggtatggatgtgattctggatat 29370  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||||||||||||||||||    
T  29371 gaattggttagagtacaa 29388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 174; Significance: 9e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 8319 - 8102
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8319 tttattgctttcgattgtgtatctgctttaggtcttgaattgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 8220  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8219 ctctcgtatgtttgcattgtccgttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 8120  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  8119 gaattggttggagtacaa 8102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 174; Significance: 9e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 37063 - 37280
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37063 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttatctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 37162  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37163 ctctcgtatgtttgatatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcaagatggacttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 37262  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||| || |||||    
T  37263 gaactggttggaatacaa 37280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 47 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 26367 - 26199
Alignment:
Q  47 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 145  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | | | ||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  26367 atatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtctaagatgtcctttatctatgtttggtcgagactt 26268  T
Q  146 cgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
     ||||| ||||| |||||| | |||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||| |||||    
T  26267 tgaaattgatttggtttgtttgcctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttggagta 26199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 174; Significance: 9e-94; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 11518 - 11313
Alignment:
Q  13 gattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatctt 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  11518 gattgtgtttctgctttgagtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtt 11419  T
Q  113 -gaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttaga 211  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11418 tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttggtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttaga 11319  T
Q  212 gtacaa 217  Q
    ||||||    
T  11318 gtacaa 11313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 17986 - 17781
Alignment:
Q  13 gattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatctt 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  17986 gattgtgtttctgctttgagtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtt 17887  T
Q  113 -gaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttaga 211  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17886 tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttggtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttaga 17787  T
Q  212 gtacaa 217  Q
    ||||||    
T  17786 gtacaa 17781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 66 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 53723 - 53571
Alignment:
Q  66 tgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatctt-gaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgt 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  53723 tgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttggtttgt 53624  T
Q  165 ctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  53623 ctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaa 53571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 55053 - 54996
Alignment:
Q  13 gattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcg 70  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55053 gattgtgtttctgctttgagtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcg 54996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 10401 - 10619
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10401 tttattgctttcgattgtgcttctactttgggtctacatatgtctggtatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtaactactt 10500  T
Q  101 ctctcgtatctt-gaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10501 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtaattctgggtat 10600  T
Q  200 gaattggttagagtacaat 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  10601 gaattggttagagtacaat 10619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 198 - 1
Alignment:
Q  5 ttgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  198 ttgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggtcgtcgaaacttcagctaagggtttggtgactacttctct 99  T
Q  105 cgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatga 201  Q
    |||||  |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  98 cgtatgtttgagatgtcctttatctatgtttggtcatgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatga 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 11599 - 11816
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11599 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagatatggttttttaaactccagctaagggttcggtgactactt 11698  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
     ||||||||  |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11699 gtctcgtatgtttgagatgtcctttatctatgtttagtcgtgattttgaaatgaatttagtttgtctacccttgagcggtatggatgtgattatgggtat 11798  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||||||||||||||||||    
T  11799 gaattggttagagtacaa 11816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 21665 - 21448
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21665 tttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatttgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 21566  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
     ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21565 atctcgtatgtttgaaatttcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgcgtat 21466  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||| || |||||    
T  21465 gaactggttggaatacaa 21448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 37089 - 36872
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37089 tttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatttgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 36990  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
     ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36989 atctcgtatgtttgaaatttcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgcgtat 36890  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||| || |||||    
T  36889 gaactggttggaatacaa 36872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 154; Significance: 7e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 50588 - 50797
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50588 tttattgctttcgattgtgcttctaccttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactactt 50687  T
Q  101 ctctcgtatctt-gaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50688 ctctcatatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattatgggtat 50787  T
Q  200 gaattggtta 209  Q
    ||| ||||||    
T  50788 gaactggtta 50797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 42717 - 42545
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || | | | |  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  42717 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 42618  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    | || ||| | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  42617 actttgaagtcgacttagtttgtttaccattgacaggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagta 42545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 34958 - 35174
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34958 tttattgttttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacgt 35057  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  35058 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttaagcggtatggatgtga-tctgggtat 35156  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
     || ||||| || |||||    
T  35157 aaactggttggaatacaa 35174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 41647 - 41476
Alignment:
Q  47 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 145  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41647 atatgaatagagagatggttgtcaaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattt 41548  T
Q  146 cgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 217  Q
     ||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || | |||||||| ||||||||||||    
T  41547 tgaaattgacttagtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatccttgatatgaatttgttagagtacaa 41476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 75367 - 75196
Alignment:
Q  47 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 145  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  75367 atatgaatagagagatggttgtcaaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattt 75268  T
Q  146 cgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 217  Q
     ||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || | |||||||| ||||||||||||    
T  75267 tgaaattgacttagtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatccttgatatgaatttgttagagtacaa 75196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 146; Significance: 4e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 18711 - 18494
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18711 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 18612  T
Q  101 ctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    ||||||| | || || |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||    
T  18611 ctctcgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgattgtgattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatccttggtat 18512  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  18511 gaactggttagagtacaa 18494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 141; Significance: 4e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 8022 - 8217
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  8022 tttattgcttttgattgggtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaaacgttcggtgactactt 8121  T
Q  101 ctctc--gtatctt-gaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 193  Q
    |||||  |||| || |  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8122 ctctctcgtatgtttgcgatgttctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 8217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 48 - 137
Target Start/End: Original strand, 4179 - 4269
Alignment:
Q  48 tatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggt 137  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || | || || |||||  |||||||||||||||    
T  4179 tatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttatcttgtttgtttaagatgtcaattgtctatgtttggt 4269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0993
Description:

Target: scaffold0993; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 1043 - 826
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1043 tttattgcttttgattgtgtttcttttttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 944  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    || |||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| || || || || |||||| ||| |||||| ||||||||||| || || |||||    
T  943 ctgtcgtatgcttaaagtgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagattgaattggtttgtttacgtttgagtggtatggatgtaatccttggtat 844  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  843 gaactggttagagtacaa 826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 778 - 726
Alignment:
Q  165 ctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 217  Q
    |||| |||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||    
T  778 ctacgtttgagtggtatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaa 726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0052
Description:

Target: scaffold0052; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 7297 - 7141
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7297 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 7198  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatt 156  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||    
T  7197 ctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctgagattggtcgtgattttgaaatggatt 7141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 123; Significance: 2e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 28 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 10820 - 10630
Alignment:
Q  28 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgt 126  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||    
T  10820 ttgggtcttgctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtccattgt 10721  T
Q  127 ctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 217  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||    
T  10720 ctatgtttggtcgtgattttgaaattgatttagtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaa 10630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Original strand, 830 - 1002
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| || || |  ||||  |||||| | |||||||||||| | |    
T  830 tctgatatgaaaggagagatggttgttgaaacttcagctaagggttcagtgactacttcccttgtttgtttgaggtgtcctctatctatgtttggtaggg 929  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    |||| ||  | || |||||||||||||| ||||  || |||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  930 attttgaggtagacttagtttgtctaccgttgacgggaatggatgtcatttttgggatgaattggttagagta 1002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 118; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 14145 - 13928
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||   |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14145 tttattgcttttgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 14046  T
Q  101 ctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||| |||| || || |||| |||||||||| |||| |||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  14045 ctcttgtatgtttaagatgttctttgtctatttttgatcgtgactttgagattgatttggtttgtctacctttgagtggtatggatgtaattcttggtat 13946  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  13945 gaactggttagagtacaa 13928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 41 - 217
Target Start/End: Original strand, 24995 - 25172
Alignment:
Q  41 tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcg 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | || || ||||||||| |||||||||| |||    
T  24995 tgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacatctcttgtgtgtttaagatgtcctttatctatgtttgatcg 25094  T
Q  140 tgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 217  Q
    |||||| || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  25095 tgattttgagatggatttagtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactagttagagtacaa 25172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 111; Significance: 3e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 217
Target Start/End: Original strand, 11150 - 11340
Alignment:
Q  28 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgt 126  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || || |||||||||||    
T  11150 ttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgt 11249  T
Q  127 ctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 217  Q
    ||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  11250 ctatgtttgatcgtgattttgagatggatttggtttgtctacctttcagtggtatggatgtgattcttggtatgaactggttggaatacaa 11340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0423 (Bit Score: 111; Significance: 3e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0423
Description:

Target: scaffold0423; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 217
Target Start/End: Original strand, 2533 - 2723
Alignment:
Q  28 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgt 126  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || || |||||||||||    
T  2533 ttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagacatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgt 2632  T
Q  127 ctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 217  Q
    ||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  2633 ctatgtttgatcgtgattttgagatagatttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattcttggtatgaactggttggaatacaa 2723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 110; Significance: 1e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 8284 - 8067
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||   | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8284 tttattgcttttgattgtgctacttagtcgggacttgatatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 8185  T
Q  101 ctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||| || | || || |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||  |||| ||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||| |||||    
T  8184 ctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagattcatttggtttgtctaccgttgagtgctatggatgtaattcttggtat 8085  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  8084 gaactggttagagtacaa 8067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 47 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 12678 - 12507
Alignment:
Q  47 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12678 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 12579  T
Q  146 cgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 217  Q
     || || ||| | |||||  | |||||||| |||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  12578 tgagattgatatggtttgcttgcctttgagtggtatggacgtcattcttggtctgaattggttagagtacaa 12507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 106; Significance: 3e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 41 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 3622 - 3445
Alignment:
Q  41 tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||| || | || || |||||||||||||||||||| |||    
T  3622 tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactgcagctaaggtttcggtaactatttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcg 3523  T
Q  140 tgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 217  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  3522 tgattttgaaattgatttggtttgtctacctttgagtggtatggatgtaattcttggtatgaactggttagagtacaa 3445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 106; Significance: 3e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 23776 - 23993
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||   |||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23776 tttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 23875  T
Q  101 ctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||| || | || || |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||| || |||||||| || || |||||    
T  23876 ctcttgtgtgtttaagatgttctttgtctatgtttggtcgagattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtat 23975  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  23976 gaactggttagagtacaa 23993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 47 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 151582 - 151414
Alignment:
Q  47 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 145  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | | | | |||||| ||||||||||||||| | ||  |    
T  151582 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtccgttgtctatgtttggtagagacat 151483  T
Q  146 cgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
     ||| | || ||||||||| |||  ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  151482 tgaagtcgacttagtttgtttacagttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagta 151414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 4468 - 4278
Alignment:
Q  28 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgt 126  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | || || |||||||||||    
T  4468 ttgggtcttgctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccatctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgt 4369  T
Q  127 ctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 217  Q
    ||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||| || |  |||||||||||||||||    
T  4368 ctatgtttgatcgtgattttgagatcgatttggtttgtttacctttgagtggtatgaatgtgattcttggcaaaaattggttagagtacaa 4278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 51 - 1
Alignment:
Q  28 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactcca 78  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51 ttgggtcttgctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactcca 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 8984 - 8794
Alignment:
Q  28 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgt 126  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || | || || |||||||||||    
T  8984 ttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagccaagggttcagtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgt 8885  T
Q  127 ctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 217  Q
    ||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  8884 ctatgtttgattgtgattttgagatggatttagtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattcttggtatgaactggttggaatacaa 8794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 150 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 18057 - 17990
Alignment:
Q  150 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  18057 atggatttagtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattcttggtatgaactggttggaatacaa 17990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 217
Target Start/End: Original strand, 55740 - 55930
Alignment:
Q  28 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgt 126  Q
    |||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  || | |||||||||||    
T  55740 ttgggtcttactatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgattaagatgtcctttgt 55839  T
Q  127 ctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 217  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||| |||||| |||||||    
T  55840 ctatgtttgatcgtgatttctaaattgatttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatccttggtatgaactggttaaagtacaa 55930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 152115 - 151925
Alignment:
Q  28 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgt 126  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || || |||||||||||    
T  152115 ttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgt 152016  T
Q  127 ctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 217  Q
    ||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  152015 ctatgtttgatcgtgattttgagattgatttggtttgtttaccttttagtggtatggatgtgattcttggtatgaactggttggaatacaa 151925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 30817 - 30938
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30817 tttattgcttttgattgtgcttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 30916  T
Q  101 ctctcgtat-cttgaaatgtcc 121  Q
    |||||||||  |||||||||||    
T  30917 ctctcgtatgtttgaaatgtcc 30938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 174
Target Start/End: Original strand, 47253 - 47399
Alignment:
Q  28 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgt 126  Q
    |||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || | || ||  |||| |||||    
T  47253 ttgggtctttctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccatctaa-ggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaaggtgtcttttgt 47351  T
Q  127 ctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttga 174  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  47352 ctatgtttgatcgtgattttgaaattgatttggtttgtctacctttga 47399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 159 - 217
Target Start/End: Original strand, 1907 - 1965
Alignment:
Q  159 gtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 217  Q
    |||||| | |||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  1907 gtttgtttccctttgagtggtatggatgtaatccagggtatgaattggttagagtacaa 1965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2059 (Bit Score: 101; Significance: 3e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold2059
Description:

Target: scaffold2059; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 1012 - 1120
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1012 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgacatgaatggagagatggttgtcgaaactctagctaagggttcggtgactactt 1111  T
Q  101 ctctcgtat 109  Q
    |||||||||    
T  1112 ctctcgtat 1120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 217
Target Start/End: Original strand, 14536 - 14726
Alignment:
Q  28 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgt 126  Q
    |||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || || |||||||||||    
T  14536 ttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtatttaagatgtcctttgt 14635  T
Q  127 ctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 217  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||| || ||||| || || || || ||||| ||||||||||||||    
T  14636 ctatgtttggtcgagattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggaagtaatccttggaatgaactggttagagtacaa 14726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 496054 - 495864
Alignment:
Q  28 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgt 126  Q
    |||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || || |||| ||||||    
T  496054 ttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtttttaagatgttctttgt 495955  T
Q  127 ctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 217  Q
    ||||||||||||| |||||  |||| ||||| |||||| |||||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||    
T  495954 ctatgtttggtcgagatttttaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaa 495864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 441714 - 441507
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||   |||||||||  | ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  441714 tttattgctcttgattgtgcttctaaattgggtcttactatgtcaaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 441615  T
Q  101 ctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||| || | | | | ||||||||| |||||||||||| | |||||  | || ||||| |||||| | |||| ||| || |||||||| ||||| |||||    
T  441614 ctctagtgtgtctaagatgtcctttatctatgtttggtagagatttttagattgatttggtttgtttgccttagagtggaatggatgtaattcttggtat 441515  T
Q  200 gaattggt 207  Q
    ||||||||    
T  441514 gaattggt 441507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 43 - 212
Target Start/End: Original strand, 514638 - 514808
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | | ||   |||||| | |||||||||||| | |    
T  514638 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctatgtttggtagag 514737  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagag 212  Q
    |||| |   | |||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  514738 attttgtggttgatttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttggaatgaattggttagag 514808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1423 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold1423
Description:

Target: scaffold1423; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 216
Target Start/End: Original strand, 648 - 837
Alignment:
Q  28 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgt 126  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || | || || |||||||||||    
T  648 ttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttctgtgactacttcacttgtgtgtttaagatgtcctttgt 747  T
Q  127 ctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtaca 216  Q
    ||||||||| ||||||||| || || ||| | |||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  748 ctatgtttgatcgtgattttgagattgatatggtttgtttacctttgggtggtatggatgtgattatgggtatgaactggttagagtaca 837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 6934 - 6717
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||   |||||||||| | ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6934 tttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactactt 6835  T
Q  101 ctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||| || | || || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||| |||||||||| || |||||||| || || |||||    
T  6834 ctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttgaaattgacttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtat 6735  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  6734 gaactggttagagtacaa 6717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 14064 - 13847
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||   |||||||||| | ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14064 tttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactactt 13965  T
Q  101 ctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||| || | || || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||| |||||||||| || |||||||| || || |||||    
T  13964 ctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttgaaattgacttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtat 13865  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  13864 gaactggttagagtacaa 13847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 104288 - 104071
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||  |||||||| || | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  104288 tttattgctattgattgtgcttctaatttgggtcctgttatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttaggtaactactt 104189  T
Q  101 ctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||| || | || || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || || |||||| |||||||||| || |||||||| ||  |||||||    
T  104188 ctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgaaattgacttggtttgtttacctttgagtggcatggatgtaatcatgggtat 104089  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  104088 gaactggttagagtacaa 104071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 97; Significance: 8e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 47 - 202
Target Start/End: Original strand, 57903 - 58059
Alignment:
Q  47 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || || |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  57903 atatgaatggaaagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattt 58002  T
Q  146 cgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaa 202  Q
     ||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  58003 tgaaattgatttggtttgtttacctttgagcggaatggatgtgatccttggtatgaa 58059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 217
Target Start/End: Original strand, 13724 - 13939
Alignment:
Q  3 tattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttct 102  Q
    ||||||| | ||||||| ||||   |||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13724 tattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagagttcggtgactacttct 13823  T
Q  103 ctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatga 201  Q
    || || |  || | |||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||| || || |||||||    
T  13824 cttgtgtgattaagatgtccattgtctatgtttggtcgagattttaaaattgatttagtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatga 13923  T
Q  202 attggttagagtacaa 217  Q
    | ||||||||||||||    
T  13924 actggttagagtacaa 13939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 217
Target Start/End: Original strand, 24234 - 24405
Alignment:
Q  47 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgt-atcttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24234 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgcgtttgagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattt 24333  T
Q  146 cgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 217  Q
        || ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  24334 taggattgatttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattcttggcatgaactggttagagtacaa 24405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Original strand, 10057 - 10229
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | | | | |||||| |||||||||||| || | |    
T  10057 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgtctaagatgtccgttgtctatgtttagtagag 10156  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    | || ||| | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  10157 actttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagta 10229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 2050 - 1865
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||   |||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2050 tttattgcttttgattgtgctactaagttgggtctttctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 1951  T
Q  101 ctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggat 185  Q
    |||| || | || || |||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  1950 ctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagattgatatggtttgtttacctttgagcggtatggat 1865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 116 - 217
Target Start/End: Original strand, 12573 - 12674
Alignment:
Q  116 atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtac 215  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||| |||||  |||||||||| ||||||||| | ||||| || ||| | ||||||||||||    
T  12573 atgtcctttgtctatgtttgatcgtaattttgaaattgatttggtttgcttacctttgagtggtatggatataattcttggcatgcactggttagagtac 12672  T
Q  216 aa 217  Q
    ||    
T  12673 aa 12674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 92; Significance: 7e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 6128 - 5961
Alignment:
Q  47 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 145  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  6128 atatgaaaggagagatgattgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtgtgtttaagatgtcctttgtcaatgtttggtcgagatgt 6029  T
Q  146 cgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagt 213  Q
     ||||| ||||| |||||| |||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  6028 tgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatcctgggtatgaactggttagagt 5961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 45 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15140 - 14970
Alignment:
Q  45 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 143  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||| || | | | |  ||||| |||||||||||| || | |||    
T  15140 tgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagcaactacttctctagtttgtctaaggtgtccattgtctatgtttcgtagagat 15041  T
Q  144 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    || ||| | || ||||||||| | || ||||  ||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  15040 tttgaagtcgacttagtttgtttgccgttgatgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagta 14970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 92; Significance: 7e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 424369 - 424266
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  424369 tttattgcctacgattgtgtttctgctttgagtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 424270  T
Q  101 ctct 104  Q
    ||||    
T  424269 ctct 424266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 43 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 203400 - 203339
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 104  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  203400 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 203339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 4617 - 4427
Alignment:
Q  28 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgt 126  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || | || || | |||||||||    
T  4617 ttgggtcttgctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctgagggttcggtgactacttcccttgtgtgtttaagaagtcctttgt 4518  T
Q  127 ctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 217  Q
    ||||||||| || |||||| ||||| ||||| |||||| |||||||| | ||||||||||| ||||| |  ||||| ||||||||||||||    
T  4517 ctatgtttgatcatgattttgaaattgatttggtttgtttacctttgtgtggtatggatgtaattcttgtcatgaactggttagagtacaa 4427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 40750 - 40965
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||   |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40750 tttattgcttttgattgtgctactaagttgggtcttgttatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactactt 40849  T
Q  101 ctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    |||| || | || || ||||||||  |||||||||| || |||||| || || ||| | |||||| |||||||||| ||||||||| | ||||| |||||    
T  40850 ctcttgtgtgtttaatatgtcctt--tctatgtttgatcctgattttgagattgatatggtttgtttacctttgagtggtatggatttaattcttggtat 40947  T
Q  200 gaattggttagagtacaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  40948 gaactggttagagtacaa 40965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 217
Target Start/End: Original strand, 111177 - 111367
Alignment:
Q  28 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgt 126  Q
    |||||||||| | ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || | || || ||| |||||||    
T  111177 ttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagtgatggttgtcgaaactccagctaagggtttgttgactacttctcttgtgtgtttaagatgccctttgt 111276  T
Q  127 ctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 217  Q
     |||||||| ||||||||| ||||| || || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  111277 ttatgtttgatcgtgattttgaaattgacttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattcttggcatgaactggttagagtacaa 111367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 47 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 17893 - 17721
Alignment:
Q  47 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 145  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | || || |||||||||||||||||||||||| || ||    
T  17893 atatgaatggggaaatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagactt 17794  T
Q  146 cgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaat 218  Q
     ||||| ||||| |||||| |||||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||    
T  17793 tgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaat 17721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 47 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 15437 - 15266
Alignment:
Q  47 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 145  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | || || |||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  15437 atatgaaaggagagatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctacgattggtcgagattt 15338  T
Q  146 cgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 217  Q
     ||||| ||||| |||||| |||||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||    
T  15337 tgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaa 15266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 47 - 217
Target Start/End: Original strand, 216709 - 216880
Alignment:
Q  47 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 145  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  || | |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  216709 atatgaatggagagatggttgtagaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttcagatgtcctttgtctatgattggtcgagattt 216808  T
Q  146 cgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 217  Q
      |||| ||||| |||||| |||||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||    
T  216809 taaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaa 216880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 44 - 208
Target Start/End: Original strand, 17635 - 17799
Alignment:
Q  44 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtga 142  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || | || || |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  17635 ctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggctcgctgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctt-gtctatgtttgatcgtga 17733  T
Q  143 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggtt 208  Q
    ||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||    
T  17734 ttttgagatggatttagtttgcttacctttgagtggtatggatgtgattattggtatgaactggtt 17799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 40077 - 39905
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||  || ||||||||||| || | || ||  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  40077 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggtttagtaactacttctcttgtctgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 39978  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    |||| |   | || ||||| |||||||| ||||  ||||||||||| | | | || |||||||||||||||||    
T  39977 attttgtggtcgacttagtgtgtctaccgttgacaggtatggatgttagttttggaatgaattggttagagta 39905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 101 - 1
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  101 tttattgctttcgattatgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 2  T
Q  101 c 101  Q
    |    
T  1 c 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Original strand, 23568 - 23755
Alignment:
Q  28 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgt 126  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | || || ||||| ||| |    
T  23568 ttgggtcttgctatgtctaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggcgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcatttat 23667  T
Q  127 ctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    ||||||||||| | ||||| || || ||||| |||||| | |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  23668 ctatgtttggtagagattttgagattgatttggtttgtttgcctttgagtggaatggatgtaattcttggtatgaactggttggagta 23755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 213
Target Start/End: Original strand, 9640 - 9807
Alignment:
Q  47 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 145  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | | | ||||||||| |||||||||||| | |||||    
T  9640 atatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtctaagatgtcctttatctatgtttggtagagattt 9739  T
Q  146 cgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagt 213  Q
     || || ||||| |||||| | ||||||||  | |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  9740 tgagattgatttggtttgtttgcctttgagtagaatggatgtaattcttggtatgaactggttggagt 9807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 72; Significance: 6e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 142 - 217
Target Start/End: Original strand, 15379 - 15454
Alignment:
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15379 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctaggtatgaattggttagagtacaa 15454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 15222 - 15436
Alignment:
Q  1 tttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||   |||||||||  | ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15222 tttattgctcttgattgtgcttctaagttgggtcttactatgtcaaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 15321  T
Q  101 ctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtat 199  Q
    || | || | || || || |||||| |||||||||||| |  |||| || || ||||| |||||| | |||||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  15322 ctttagtgtgtttaagatatcctttatctatgtttggtagatattttgagattgatttggtttgtttgcctttgagtggaatggatgtaattcttggtat 15421  T
Q  200 gaattggttagagta 214  Q
    ||| ||||| |||||    
T  15422 gaactggttggagta 15436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 5103 - 4935
Alignment:
Q  47 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 145  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | | |  ||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  5103 atatgaatggagatatggtcgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtctaaggtgtcctttgtcgatgtttggtcgagactt 5004  T
Q  146 cgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
     ||||| |||||||||||| |  ||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||| |||||    
T  5003 tgaaattgatttagtttgtttgtctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttggagta 4935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 8444 - 8329
Alignment:
Q  28 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgt 126  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |  |||| |||||||||||    
T  8444 ttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagttaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttgagatgtcctttgt 8345  T
Q  127 ctatgtttggtcgtga 142  Q
    ||||||||| ||||||    
T  8344 ctatgtttgatcgtga 8329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 66; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 73
Target Start/End: Original strand, 15825 - 15894
Alignment:
Q  4 attgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaa 73  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15825 attgctttcgattgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaa 15894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 2921 - 2861
Alignment:
Q  5 ttgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggt 65  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2921 ttgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggt 2861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Original strand, 53708 - 53880
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||| |||||| ||||||||||||||| | |    
T  53708 tctgaaatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagag 53807  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    | || ||| | || ||||||||| | || ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||| |||||||||    
T  53808 actttgaagtcgacttagtttgtttgccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattagttagagta 53880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Original strand, 1168 - 1340
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | | | | |||||| ||||||||||||||| | |    
T  1168 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtccgttgtctatgtttggtagag 1267  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    | || ||| |||| ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  1268 actttgaagtggacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagta 1340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 60; Significance: 9e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 29 - 135
Target Start/End: Original strand, 8010 - 8117
Alignment:
Q  29 tgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtc 127  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || | || || ||||||||||||    
T  8010 tgggtcttgctatgtctaatattaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgaaaacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtc 8109  T
Q  128 tatgtttg 135  Q
    ||||||||    
T  8110 tatgtttg 8117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 60; Significance: 9e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 48714 - 48651
Alignment:
Q  13 gattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactc 76  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48714 gattgtgtttctgctttgagtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactc 48651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 61 - 137
Target Start/End: Original strand, 83824 - 83901
Alignment:
Q  61 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 137  Q
    |||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  83824 atggttatcgaaaccccggctaaggattcggtgactacttctctagtatgcttgaagtgtcctttgtcgatgtttggt 83901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0312 (Bit Score: 58; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0312
Description:

Target: scaffold0312; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 116 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 965 - 864
Alignment:
Q  116 atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtac 215  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||||| || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  965 atgtcatttgtctatgtttgatagtgattttgagatggatttggtttgtctacatttgagtggtatggatgtgattcttggtatgaattggttggaatac 866  T
Q  216 aa 217  Q
    ||    
T  865 aa 864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 11828 - 11656
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || | | ||   |||||| | |||||||||||| | |    
T  11828 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagag 11729  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    |||| |  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  11728 attttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagta 11656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 14945 - 14873
Alignment:
Q  28 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 100  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14945 ttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 14873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Original strand, 5134 - 5306
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||| ||  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  5134 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtctctttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 5233  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    |||| |   | || ||||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  5234 attttgtggtcgacttagtgtgtctaccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagta 5306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 104
Target Start/End: Original strand, 17769 - 17830
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 104  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  17769 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctct 17830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 251641 - 251469
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | ||||| |||||| ||||||||||||||| | |    
T  251641 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagag 251542  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    | || | | | ||| |||||||| | || |||   ||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  251541 actttgtagtcgatctagtttgtttgccgttgtcgggtatggatgttatttttgggatgaattggttagagta 251469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 47 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 2014 - 1923
Alignment:
Q  47 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 137  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  2014 atatgaatggggaaatggttgtcgaaaccccagctaagggttcggtgactacttctttagtatgcttgaagtgtcctttgtcgatgtttggt 1923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 88 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 1426 - 1296
Alignment:
Q  88 tcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatg 186  Q
    ||||||||||||||||| |  | || || |||||||||||||||| ||| ||||||||| || || ||||| |||||| |||||||||| |||| |||||    
T  1426 tcggtgactacttctcttgcgtgtttaagatgtcctttgtctatgcttgatcgtgattttgagattgatttggtttgtttacctttgagtggtacggatg 1327  T
Q  187 tgattctgggtatgaattggttagagtacaa 217  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  1326 tgattcttggcatgaactggttagagtacaa 1296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 3585 - 3521
Alignment:
Q  28 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 92  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3585 ttgggtcttgctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactctagctaagggttcggt 3521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 48 - 185
Target Start/End: Original strand, 21475 - 21613
Alignment:
Q  48 tatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttc 146  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||| ||||| || || ||||||||||| || ||     
T  21475 tatggatggggaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtctgaagtgtccgttctcgatgtttggtcgagacttt 21574  T
Q  147 gaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggat 185  Q
    ||| | |||||||||||| | |||||||| || ||||||    
T  21575 gaagttgatttagtttgtttgcctttgagtggaatggat 21613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 43 - 211
Target Start/End: Original strand, 94179 - 94348
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | | | |  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  94179 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctggtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 94278  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttaga 211  Q
    |||| ||| | |||||||| |||||||| |||   || |||||||| ||| | || ||||||||||||||    
T  94279 attttgaagtcgatttagtgtgtctaccgttgttggggatggatgttattttcgggatgaattggttaga 94348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 115581 - 115409
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |  |||| ||||||| | |||||||||||| | |    
T  115581 tctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgatatgtcctatatctatgtttggtaggg 115482  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    |||| ||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||  | || |||||||||||||||||    
T  115481 attttgaagtagatttagtttgcttaccactgacggggatggatgttatatttgggatgaattggttagagta 115409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 210
Target Start/End: Original strand, 140 - 308
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | | | | |||| | ||||||||||||||| | |    
T  140 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtataagatgtacgttgtctatgtttggtagag 239  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttag 210  Q
    | || ||| | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| | || ||||| |||||||    
T  240 actttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttgggatgaactggttag 308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Original strand, 772 - 944
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |  || |||||||| |||||||||||| || | |    
T  772 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtttaaaatgtccgttgtctatgtttagtagag 871  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    | || ||| | || |||||| || | || ||||  ||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  872 actttgaagtcgacttagttggttttccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagta 944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20833 - 20661
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | | | |  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  20833 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtctatgtttggtagag 20734  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    | || ||| | || ||||||||| |||| ||||  || |||||||| ||| | || ||||| | |||||||||    
T  20733 actttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaactagttagagta 20661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 26131 - 25959
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || | || ||  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  26131 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 26032  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    |||| ||  | || ||||| |||||||| ||||  || |||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  26031 attttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgatgggaatggatgttattttcgggatgaattggttagagta 25959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Original strand, 3455 - 3627
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |  |||| ||||||| | |||||||||||| | |    
T  3455 tctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgagatgtcctatatctatgtttggtaggg 3554  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    |||| ||| | || ||||||||  ||||  |||  || |||||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  3555 attttgaagtagacttagtttgcttaccactgacagggatggatgtgatatttgggatgaattggttagagta 3627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 60758 - 60586
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |  ||||  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  60758 tctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctatgtttggtagag 60659  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    | || ||| | ||| |||| ||| | || |||   ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||    
T  60658 actttgaagtcgatctagtatgtttgccgttgtcgggtatggatgtgatttttgggatgaactggttagagta 60586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 70127 - 70081
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 89  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  70127 tctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 70081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0560
Description:

Target: scaffold0560; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 162 - 217
Target Start/End: Original strand, 8146 - 8201
Alignment:
Q  162 tgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 217  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8146 tgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 8201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 11994 - 11884
Alignment:
Q  28 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgt 126  Q
    |||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |  ||||  ||||| ||||    
T  11994 ttgggtctggttatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgt 11895  T
Q  127 ctatgtttggt 137  Q
    |||||||||||    
T  11894 ctatgtttggt 11884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 49; Significance: 3e-19; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Original strand, 49465 - 49637
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || | || ||  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  49465 tctgatatgaaaggagaaatggctgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 49564  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    |||| ||  | || ||||| |||||||| ||||  ||||||||||  ||| | || |||||||||||||||||    
T  49565 attttgaggtcgacttagtgtgtctaccattgacgggtatggatgctatttttggaatgaattggttagagta 49637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Original strand, 58499 - 58671
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || | || ||  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  58499 tctgatatgaaaggagaaatggctgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 58598  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    |||| ||  | || ||||| |||||||| ||||  ||||||||||  ||| | || |||||||||||||||||    
T  58599 attttgaggtcgacttagtgtgtctaccattgacgggtatggatgctatttttggaatgaattggttagagta 58671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Original strand, 64887 - 65059
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || | || ||  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  64887 tctgatatgaaaggagaaatggctgttgaaactccagcaaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 64986  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    |||| ||  | || ||||| |||||||| ||||  ||||||||||  ||| | || |||||||||||||||||    
T  64987 attttgaggtcgacttagtgtgtctaccattgacgggtatggatgctatttttggaatgaattggttagagta 65059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 29643 - 29471
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | | | |  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  29643 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccattgtctatgtttggtagag 29544  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    | || ||| | ||  ||| |||| |||| ||||  |||||||| |||||| | || ||||| |||||||||||    
T  29543 actttgaagtcgacctagcttgtttaccgttgacgggtatggaggtgatttttgggatgaactggttagagta 29471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 49; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Original strand, 63804 - 63976
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |  ||||  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  63804 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctatgtttggtagag 63903  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    | || ||| | ||| |||| ||| | || |||   ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||    
T  63904 actttgaagtcgatctagtatgtttgccgttgttgggtatggatgtgatttttgggatgaactggttagagta 63976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 49; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Original strand, 65583 - 65755
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | || ||  |||||| | || ||||||||| | |    
T  65583 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtcctatatccatgtttggtagag 65682  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    |||| ||| | || ||||| ||| | || ||||  ||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  65683 attttgaagttgacttagtatgtttgccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagta 65755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 47; Significance: 5e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 43 - 109
Target Start/End: Original strand, 4589 - 4655
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat 109  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  4589 tctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtat 4655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 47; Significance: 5e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 29561 - 29451
Alignment:
Q  28 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgt 126  Q
    |||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || || |  ||||  ||||| ||||    
T  29561 ttgggtctggttatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttcacttgtttgtttgagttgtccattgt 29462  T
Q  127 ctatgtttggt 137  Q
    |||||||||||    
T  29461 ctatgtttggt 29451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 41 - 137
Target Start/End: Original strand, 1555 - 1652
Alignment:
Q  41 tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 137  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||| || |  ||||  ||||| |||||||||||||||    
T  1555 tgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaattacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggt 1652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 41 - 137
Target Start/End: Original strand, 28568 - 28665
Alignment:
Q  41 tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 137  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||| || |  ||||  ||||| |||||||||||||||    
T  28568 tgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaattacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggt 28665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1530 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1530
Description:

Target: scaffold1530; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 602 - 430
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||| || | | | |  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  602 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccatctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 503  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    | || ||| | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  502 actttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacaggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagta 430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1433 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1433
Description:

Target: scaffold1433; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Original strand, 1596 - 1768
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || | | | |  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  1596 tctgatacgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtaattacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 1695  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    | || ||| | ||| | |||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  1696 actttgaagtcgatcttgtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagta 1768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1032 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1032
Description:

Target: scaffold1032; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 174
Target Start/End: Original strand, 1100 - 1232
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | | | | |||||| ||||||||||||||| | |    
T  1100 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttttctaagatgtccgttgtctatgtttggtagag 1199  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttga 174  Q
    | || ||| | || ||||||||| |||| ||||    
T  1200 actttgaagtcgacttagtttgtttaccgttga 1232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Original strand, 5430 - 5602
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    |||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | |||||  ||||| |||| |||||||||| | |    
T  5430 tctgatatgaaaagagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgaggtgtccattgtttatgtttggtagag 5529  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    |||| |   | |||||||||||| | || |||    |||||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  5530 attttgtggttgatttagtttgtttgccgttgtcgcgtatggatgttatttttgggatgaattggttagagta 5602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 2890 - 2718
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |  ||||  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  2890 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagag 2791  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    | || ||| | ||| |||| ||| | || ||||  ||||| ||||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  2790 actttgaagtcgatctagtatgtttgccgttgacgggtatagatgtaatttttgggatgaactggttagagta 2718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 5636 - 5560
Alignment:
Q  28 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 104  Q
    |||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  5636 ttgggtctggttatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctct 5560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 7763 - 7591
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || | | | |  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  7763 tctgatacgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtaattacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 7664  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    | || ||| | ||| | |||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  7663 actttgaagtcgatcttgtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagta 7591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 480 - 308
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| || || ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | | ||   |||||| | |||||||||||| | |    
T  480 tctgatatgaaaggggaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctatgtttggtagag 381  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    |||| |   | |||||||||||| |||| ||||  |||||||| |||||| | || |||||||||||||||||    
T  380 attttgtggttgatttagtttgtttaccgttgacgggtatggaggtgatttttggaatgaattggttagagta 308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 263245 - 263073
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |  ||||  |||||| | |||||||||||| | |    
T  263245 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagag 263146  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    |||| ||  | || ||||||||| | || ||||  || ||||| || ||| | || |||||||||||||||||    
T  263145 attttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggacgttatttttggaatgaattggttagagta 263073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 43 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 12746 - 12651
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggt 137  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | || ||  ||||| |||||||||||||||    
T  12746 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaagttgtccattgtctatgtttggt 12651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 110644 - 110457
Alignment:
Q  28 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgt 126  Q
    |||||||| | | ||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || | | | |  ||||| ||||    
T  110644 ttgggtctggttgtgtctgatatgaaaggagaaatggttgttaaaactccggctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgt 110545  T
Q  127 ctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    ||||||||||| | || || ||| |  |  |||||||| |||||||||  ||||||||||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  110544 ctatgtttggtagagactttgaagtcaacctagtttgtttacctttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagta 110457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 43 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 176007 - 175912
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 137  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || |  ||||  ||||| |||||||||||||||    
T  176007 tctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcactaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggt 175912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 214
Target Start/End: Original strand, 98872 - 99040
Alignment:
Q  47 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 145  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | | | |  ||| | ||||||||||||||| | || ||    
T  98872 atatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgttcgttgtctatgtttggtagagactt 98971  T
Q  146 cgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
     ||| | || ||||||||| | || ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  98972 tgaagtcgacttagtttgtttgccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagta 99040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1056 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1056
Description:

Target: scaffold1056; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 1755 - 1681
Alignment:
Q  28 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttct 102  Q
    |||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  1755 ttgggtctggttatgtctgatatgaatggagaaatggttcttgaaactccagctaagggttcagtaactacttct 1681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 137
Target Start/End: Original strand, 43689 - 43799
Alignment:
Q  28 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgt 126  Q
    |||||||| | | ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||| || |  ||||  ||||| ||||    
T  43689 ttgggtctggttatgtctgatatgaatggaaaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgt 43788  T
Q  127 ctatgtttggt 137  Q
    |||||||||||    
T  43789 ctatgtttggt 43799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 25216 - 25176
Alignment:
Q  62 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttct 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  25216 tggttgtcgaaactcgagctaagggttcgataactacttct 25176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0765 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0765
Description:

Target: scaffold0765; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 43 - 104
Target Start/End: Original strand, 6542 - 6603
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 104  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  6542 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccggctaagggttcagtgactacttctct 6603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 43 - 104
Target Start/End: Original strand, 8747 - 8808
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 104  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  8747 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 8808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 43 - 104
Target Start/End: Original strand, 18961 - 19022
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 104  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  18961 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 19022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 164 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 726 - 673
Alignment:
Q  164 tctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  726 tctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaa 673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 43 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 21870 - 21809
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 104  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21870 tctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 21809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 8633 - 8461
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | | | |  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  8633 tctgatataaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccattgtctatgtttggtagag 8534  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    |||| ||  | || ||||| ||| | || ||||   |||||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  8533 attttgaggtcgacttagtatgtttgccgttgacgtgtatggatgttatttttgggatgaattggttagagta 8461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 36958 - 36814
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || | | | |  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  36958 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 36859  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatg 186  Q
    | || ||| | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||    
T  36858 actttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatg 36814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 50124 - 49952
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | | | |  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  50124 tctgatatgaaaggagaaattgttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtctatgtttggtagag 50025  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    | || ||| | ||| | |||||  |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  50024 actttgaagtcgatcttgtttgcttaccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaaatggttagagta 49952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22141 - 21969
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaaa-tgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| |||| || ||||||||||| || | |  ||  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  22141 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactttagctaagtgttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccattgtctatgtttggtagag 22042  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    |||| ||  | |||||||||||| | ||  |||  ||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  22041 attttgaggtcgatttagtttgtttgccgctgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagta 21969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 70391 - 70219
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| |||||||| || ||||||||||| || | || ||  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  70391 tctgatatgaaaggagaaattgttgttgaaactctagccaagggttcagtaactacttctctagtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 70292  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    |||| ||  | || ||||| |||||||| ||||  || ||| |||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  70291 attttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgatgggaatgtatgttatttttgggatgaattggttagagta 70219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 104
Target Start/End: Original strand, 2237 - 2298
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 104  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  2237 tctgatatgaaaggggatatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 2298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 187
Target Start/End: Original strand, 200758 - 200898
Alignment:
Q  48 tatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttc 146  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||  ||||  ||||||||||||||| | |||||     
T  200758 tatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgatttgtctgttgtctatgtttggtagagatttt 200857  T
Q  147 gaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 187  Q
    ||| | ||| |||| ||| | || ||||  |||||||||||    
T  200858 gaagttgatctagtatgtttgccgttgacgggtatggatgt 200898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 325726 - 325554
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | | | | |||||  ||||||||||||||| | |    
T  325726 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtctgttgtctatgtttggtagag 325627  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    | || ||| | || ||||| ||| |||| ||||  || |||||||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  325626 actttgaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaactggttagagta 325554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 45 - 104
Target Start/End: Original strand, 1141 - 1200
Alignment:
Q  45 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 104  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  1141 tgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 1200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 48 - 137
Target Start/End: Original strand, 4379 - 4469
Alignment:
Q  48 tatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 137  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| | || |  ||||  |||||||||||||||||||||    
T  4379 tatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttcttttgtttgtttgagttgtcctttgtctatgtttggt 4469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 48 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 11844 - 11754
Alignment:
Q  48 tatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 137  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || |  ||||  |||||||||||||||||||||    
T  11844 tatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtttgagttgtcctttgtctatgtttggt 11754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 104
Target Start/End: Original strand, 67396 - 67454
Alignment:
Q  46 gatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 104  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  67396 gatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 67454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 48 - 102
Target Start/End: Original strand, 41398 - 41452
Alignment:
Q  48 tatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttct 102  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  41398 tatgaatggggaaatggttgtcgaaacttcggctaagggttcggtgactacttct 41452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 43 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 5824 - 5692
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| || | | | | |||||| ||||||||||||||| | |    
T  5824 tctgatatgaaagaagaaatggttgttgaaactccagctatgggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtccgttgtctatgtttggtagag 5725  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttga 174  Q
    | || ||| | || ||||||||| |||| ||||    
T  5724 actttgaagtcgacttagtttgtttaccgttga 5692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 125 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 5687 - 5598
Alignment:
Q  125 gtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    ||||||||||||| | || || ||| | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  5687 gtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaattggttagagta 5598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 7057 - 6996
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 104  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  7057 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 6996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 104
Target Start/End: Original strand, 20813 - 20874
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 104  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  20813 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 20874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 104
Target Start/End: Original strand, 12637 - 12694
Alignment:
Q  47 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 104  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  12637 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctct 12694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 104
Target Start/End: Original strand, 10071 - 10132
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 104  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  10071 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtacagtaactacttctct 10132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 54066 - 54005
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 104  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  54066 tctgatatgaatgtagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcattaactacttctct 54005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 41754 - 41585
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || | | ||   |||||  | || ||||||||| | |    
T  41754 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcccatatccatgtttggtaggg 41655  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttaga 211  Q
    |||| |  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||    
T  41654 attttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttaga 41585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1373
Description:

Target: scaffold1373; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Original strand, 119 - 291
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||  || ||||||||||| || |  |||   |||||| | |||||||||| | | |    
T  119 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccaactaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttggggtgtcctatatctatgtttgttaggg 218  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    | || |   |||||||||||||| | || |||   |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  219 actttgtggtggatttagtttgtttgccgttgtcgggtatgaatgtgatttttggtatgaattggttagagta 291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 1139 - 967
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| || || || ||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||| || | | | |  ||||  ||||||||||||||| | |    
T  1139 tctgatatgaaaggggaaattgttgttgaaactccagttaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtctgttgtctatgtttggtagag 1040  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    | || ||| | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  1039 actttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagta 967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 5215 - 5028
Alignment:
Q  28 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgt 126  Q
    |||||||| | | ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||| || |||| |||||| || | | | |  ||||| ||||    
T  5215 ttgggtctggttatgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctgaggtttcagtaactatttctcttgtttgtctaagttgtccgttgt 5116  T
Q  127 ctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    | ||||||||| | || || ||| | ||| | |||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  5115 caatgtttggtagagactttgaagtcgatcttgtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagta 5028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 137
Target Start/End: Original strand, 30611 - 30706
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 137  Q
    ||||||||||| || |  |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |  ||||  ||||| |||||||||||||||    
T  30611 tctgatatgaaaggggtaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctatgtttggt 30706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 104
Target Start/End: Original strand, 5498 - 5555
Alignment:
Q  47 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 104  Q
    ||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  5498 atatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 5555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 104
Target Start/End: Original strand, 49162 - 49223
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 104  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||| || |||||||||||| || |||||||||||    
T  49162 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaaatcaagctaagggttcagtaactacttctct 49223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 29953 - 29781
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 141  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    || |||||||| || | | ||   |||||| | |||||||||||| | |    
T  29953 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaagaaccacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctatgtttggtagag 29854  T
Q  142 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 214  Q
    |||| |   | |||||||||||||| || |||   ||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||    
T  29853 attttgtggttgatttagtttgtctgccgttgttgggtatggatgtgatttttggaatgaattggtcagagta 29781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 217
Target Start/End: Original strand, 6489 - 6547
Alignment:
Q  159 gtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 217  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||| |||||| |||||||    
T  6489 gtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatccttggtatgaactggttatagtacaa 6547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 43 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 10996 - 10935
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 104  Q
    ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  10996 tctgatatgaaaggagaaatacttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctct 10935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 43 - 104
Target Start/End: Original strand, 9512 - 9573
Alignment:
Q  43 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 104  Q
    |||||||||||  | || || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  9512 tctgatatgaaacgggaaatagttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 9573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University