View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8781_high_9 (Length: 455)

Name: NF8781_high_9
Description: NF8781
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8781_high_9
NF8781_high_9
[»] chr5 (92 HSPs)
chr5 (17-434)||(24529023-24529442)
chr5 (17-434)||(9077757-9078174)
chr5 (14-434)||(25421330-25421754)
chr5 (17-433)||(24493371-24493789)
chr5 (17-434)||(25431197-25431616)
chr5 (17-428)||(1096271-1096683)
chr5 (17-428)||(23390401-23390814)
chr5 (17-321)||(21997548-21997852)
chr5 (17-434)||(13095297-13095716)
chr5 (17-428)||(8286747-8287163)
chr5 (17-434)||(13025113-13025532)
chr5 (17-340)||(21808384-21808708)
chr5 (113-427)||(22412083-22412388)
chr5 (17-340)||(21729059-21729384)
chr5 (17-428)||(22074822-22075235)
chr5 (113-374)||(29329831-29330090)
chr5 (110-374)||(10732946-10733208)
chr5 (113-374)||(42245371-42245630)
chr5 (120-336)||(11581243-11581458)
chr5 (113-336)||(2154658-2154879)
chr5 (113-374)||(264774-265033)
chr5 (17-290)||(19660879-19661154)
chr5 (113-374)||(20908909-20909168)
chr5 (113-374)||(29345877-29346136)
chr5 (113-374)||(32027290-32027549)
chr5 (17-433)||(21292870-21293289)
chr5 (113-321)||(39245033-39245239)
chr5 (113-374)||(29348350-29348609)
chr5 (113-321)||(10775735-10775942)
chr5 (120-374)||(29350830-29351082)
chr5 (142-374)||(39363310-39363540)
chr5 (17-362)||(37723704-37724049)
chr5 (113-311)||(20918017-20918212)
chr5 (120-374)||(36154789-36155039)
chr5 (141-336)||(20902053-20902248)
chr5 (121-321)||(23064415-23064614)
chr5 (121-321)||(31060974-31061171)
chr5 (123-321)||(38619337-38619537)
chr5 (120-321)||(18319093-18319290)
chr5 (120-321)||(24067013-24067210)
chr5 (121-276)||(20806845-20806998)
chr5 (142-312)||(36314504-36314675)
chr5 (22-239)||(22107709-22107926)
chr5 (113-340)||(21565445-21565668)
chr5 (22-272)||(26703882-26704129)
chr5 (22-272)||(26973615-26973862)
chr5 (109-290)||(21329541-21329719)
chr5 (144-427)||(40725782-40726069)
chr5 (113-337)||(26012033-26012255)
chr5 (142-362)||(17517174-17517400)
chr5 (113-416)||(22143951-22144254)
chr5 (120-267)||(19668805-19668951)
chr5 (280-427)||(20766035-20766174)
chr5 (120-290)||(22959576-22959741)
chr5 (113-332)||(20026942-20027158)
chr5 (184-285)||(21502205-21502308)
chr5 (22-171)||(23201164-23201312)
chr5 (37-171)||(21873073-21873206)
chr5 (68-288)||(23501402-23501622)
chr5 (34-171)||(23571893-23572029)
chr5 (37-179)||(14078969-14079111)
chr5 (372-428)||(22107278-22107334)
chr5 (318-434)||(21986046-21986164)
chr5 (228-427)||(18418594-18418793)
chr5 (17-84)||(23064330-23064396)
chr5 (17-84)||(36314353-36314420)
chr5 (120-178)||(14047988-14048046)
chr5 (187-275)||(26740705-26740789)
chr5 (34-160)||(18770179-18770304)
chr5 (17-84)||(40725673-40725740)
chr5 (17-84)||(41095852-41095918)
chr5 (17-84)||(41095895-41095961)
chr5 (198-260)||(27989004-27989061)
chr5 (17-83)||(40725717-40725783)
chr5 (142-179)||(18418528-18418565)
chr5 (230-275)||(26732892-26732937)
chr5 (17-82)||(31060889-31060953)
chr5 (34-275)||(22032139-22032380)
chr5 (37-124)||(23511919-23512006)
chr5 (121-177)||(41095692-41095747)
chr5 (17-84)||(18418421-18418488)
chr5 (17-84)||(31060846-31060912)
chr5 (68-151)||(33895953-33896035)
chr5 (17-84)||(40725630-40725696)
chr5 (17-84)||(41095809-41095875)
chr5 (17-78)||(18418465-18418526)
chr5 (17-82)||(20807019-20807083)
chr5 (91-160)||(21366839-21366907)
chr5 (241-314)||(21873277-21873350)
chr5 (17-78)||(23064373-23064433)
chr5 (17-78)||(39363247-39363308)
chr5 (17-53)||(38619293-38619329)
[»] chr1 (86 HSPs)
chr1 (17-434)||(34509583-34510002)
chr1 (17-434)||(50210112-50210536)
chr1 (17-434)||(22532072-22532491)
chr1 (17-428)||(27250634-27251048)
chr1 (17-428)||(20134984-20135403)
chr1 (113-335)||(31612209-31612430)
chr1 (113-374)||(13988763-13989022)
chr1 (113-374)||(21923297-21923556)
chr1 (113-374)||(23593741-23594000)
chr1 (113-374)||(21475093-21475352)
chr1 (31-316)||(20847173-20847459)
chr1 (113-374)||(29298034-29298292)
chr1 (121-374)||(29776592-29776844)
chr1 (113-328)||(22123119-22123333)
chr1 (17-427)||(38801297-38801707)
chr1 (115-336)||(45574886-45575108)
chr1 (22-426)||(22468604-22469014)
chr1 (157-427)||(432952-433222)
chr1 (141-321)||(21346885-21347064)
chr1 (120-336)||(21711612-21711827)
chr1 (121-336)||(21707071-21707285)
chr1 (141-321)||(21342021-21342199)
chr1 (142-321)||(13212921-13213099)
chr1 (142-336)||(21840686-21840885)
chr1 (141-374)||(16361835-16362073)
chr1 (17-228)||(21477445-21477656)
chr1 (125-321)||(16275423-16275616)
chr1 (200-428)||(21026666-21026896)
chr1 (120-321)||(40389060-40389257)
chr1 (22-272)||(21714352-21714600)
chr1 (192-321)||(15860068-15860195)
chr1 (120-236)||(27161605-27161721)
chr1 (142-317)||(14295569-14295745)
chr1 (113-340)||(33680910-33681133)
chr1 (37-239)||(22131180-22131380)
chr1 (142-275)||(20454613-20454752)
chr1 (37-239)||(48603088-48603288)
chr1 (113-340)||(22237530-22237753)
chr1 (22-275)||(42865273-42865526)
chr1 (58-173)||(20916070-20916185)
chr1 (113-421)||(35260992-35261295)
chr1 (120-336)||(21753957-21754166)
chr1 (200-340)||(22921864-22922001)
chr1 (291-428)||(22354477-22354616)
chr1 (113-395)||(21896194-21896473)
chr1 (198-427)||(16758638-16758866)
chr1 (120-267)||(52928038-52928181)
chr1 (372-431)||(48603674-48603733)
chr1 (80-275)||(21161588-21161778)
chr1 (198-393)||(21861510-21861702)
chr1 (113-329)||(20248184-20248394)
chr1 (17-84)||(13213139-13213206)
chr1 (17-84)||(16361729-16361796)
chr1 (80-175)||(20091636-20091730)
chr1 (22-171)||(21788208-21788356)
chr1 (372-434)||(22356073-22356136)
chr1 (372-434)||(22357759-22357822)
chr1 (17-84)||(29776461-29776528)
chr1 (198-336)||(41050033-41050168)
chr1 (17-83)||(21840449-21840514)
chr1 (113-336)||(16368284-16368502)
chr1 (230-317)||(20918620-20918707)
chr1 (198-337)||(50614113-50614249)
chr1 (198-337)||(50621941-50622077)
chr1 (34-179)||(6151665-6151810)
chr1 (17-84)||(14295829-14295896)
chr1 (35-160)||(22831560-22831684)
chr1 (17-84)||(21840579-21840646)
chr1 (17-84)||(45575122-45575189)
chr1 (113-155)||(431655-431697)
chr1 (35-179)||(18182275-18182418)
chr1 (17-82)||(20454837-20454901)
chr1 (17-73)||(45575089-45575145)
chr1 (17-84)||(14295785-14295852)
chr1 (352-427)||(21477654-21477732)
chr1 (17-84)||(29776505-29776572)
chr1 (263-333)||(33797570-33797638)
chr1 (30-84)||(45575166-45575220)
chr1 (54-84)||(50210513-50210543)
chr1 (17-78)||(13213101-13213162)
chr1 (17-78)||(14295747-14295808)
chr1 (17-78)||(20454754-20454815)
chr1 (17-78)||(21840623-21840684)
chr1 (17-84)||(21341915-21341982)
chr1 (17-84)||(21346779-21346846)
chr1 (199-272)||(24783155-24783230)
[»] chr6 (88 HSPs)
chr6 (17-427)||(29060343-29060755)
chr6 (17-428)||(25629260-25629671)
chr6 (40-434)||(18409726-18410126)
chr6 (54-434)||(19303440-19303821)
chr6 (55-426)||(20593615-20593987)
chr6 (17-434)||(20638182-20638603)
chr6 (17-434)||(22780126-22780545)
chr6 (17-428)||(17287701-17288114)
chr6 (59-434)||(20360859-20361238)
chr6 (113-374)||(2291186-2291445)
chr6 (113-374)||(18334598-18334857)
chr6 (113-374)||(19004943-19005202)
chr6 (113-374)||(24422444-24422703)
chr6 (113-374)||(33861691-33861950)
chr6 (17-320)||(20076506-20076805)
chr6 (113-374)||(19858925-19859184)
chr6 (113-374)||(33864175-33864434)
chr6 (17-317)||(28496489-28496790)
chr6 (17-317)||(29808900-29809201)
chr6 (129-374)||(22782139-22782383)
chr6 (113-336)||(1595446-1595667)
chr6 (113-374)||(8054926-8055185)
chr6 (113-374)||(26924646-26924905)
chr6 (113-373)||(1540918-1541176)
chr6 (113-374)||(12742214-12742473)
chr6 (113-336)||(20556936-20557158)
chr6 (121-374)||(25754715-25754965)
chr6 (17-314)||(35245386-35245684)
chr6 (114-374)||(3852023-3852280)
chr6 (120-336)||(25688405-25688620)
chr6 (17-267)||(1561104-1561356)
chr6 (56-239)||(19773818-19774003)
chr6 (120-321)||(16448586-16448783)
chr6 (35-433)||(22831322-22831723)
chr6 (17-316)||(16920651-16920950)
chr6 (25-215)||(22805559-22805749)
chr6 (142-374)||(34963292-34963529)
chr6 (143-374)||(30676716-30676952)
chr6 (17-313)||(25611744-25612047)
chr6 (120-275)||(25714323-25714478)
chr6 (175-340)||(16496204-16496370)
chr6 (21-316)||(11185318-11185605)
chr6 (17-313)||(25603406-25603709)
chr6 (207-321)||(25656619-25656732)
chr6 (198-427)||(18456705-18456930)
chr6 (185-427)||(25644295-25644537)
chr6 (144-427)||(8227416-8227703)
chr6 (198-336)||(18461865-18461997)
chr6 (113-361)||(20109039-20109285)
chr6 (184-337)||(23019377-23019529)
chr6 (22-272)||(25642250-25642499)
chr6 (142-340)||(19847990-19848194)
chr6 (22-272)||(19862783-19863032)
chr6 (113-337)||(19652098-19652317)
chr6 (22-272)||(19872925-19873174)
chr6 (198-384)||(18821795-18821976)
chr6 (22-303)||(22432054-22432334)
chr6 (22-303)||(22438604-22438884)
chr6 (34-179)||(22335053-22335197)
chr6 (80-285)||(4185870-4186069)
chr6 (80-266)||(4186240-4186419)
chr6 (113-261)||(22080799-22080945)
chr6 (80-266)||(4738626-4738805)
chr6 (22-179)||(15894593-15894749)
chr6 (113-332)||(19668275-19668491)
chr6 (142-320)||(23992349-23992533)
chr6 (81-267)||(31155465-31155644)
chr6 (68-171)||(31165006-31165107)
chr6 (217-290)||(27333262-27333336)
chr6 (217-290)||(27394002-27394076)
chr6 (198-319)||(9098528-9098646)
chr6 (86-333)||(15041552-15041799)
chr6 (198-255)||(19008787-19008843)
chr6 (235-291)||(33443068-33443124)
chr6 (17-83)||(8227702-8227768)
chr6 (80-176)||(16965471-16965566)
chr6 (91-160)||(18692086-18692154)
chr6 (17-84)||(19848234-19848301)
chr6 (17-84)||(19848278-19848345)
chr6 (372-419)||(25603299-25603346)
chr6 (17-84)||(34963185-34963252)
chr6 (114-160)||(13019394-13019439)
chr6 (35-160)||(18906928-18907052)
chr6 (17-82)||(3852338-3852402)
chr6 (17-82)||(4642934-4642998)
chr6 (91-160)||(16523558-16523626)
chr6 (17-78)||(23992286-23992347)
chr6 (17-78)||(34963229-34963290)
[»] chr4 (87 HSPs)
chr4 (17-434)||(16377422-16377839)
chr4 (14-434)||(44052628-44053051)
chr4 (17-434)||(7893505-7893922)
chr4 (17-428)||(22636238-22636650)
chr4 (17-394)||(7798577-7798956)
chr4 (25-428)||(12902567-12902973)
chr4 (17-434)||(16239869-16240288)
chr4 (54-427)||(14038498-14038863)
chr4 (56-424)||(16270145-16270515)
chr4 (120-427)||(54798669-54798969)
chr4 (120-427)||(14280219-14280518)
chr4 (113-374)||(18215280-18215540)
chr4 (113-427)||(44928829-44929146)
chr4 (17-428)||(23374264-23374672)
chr4 (120-374)||(12313-12565)
chr4 (113-374)||(15118358-15118617)
chr4 (113-374)||(44773093-44773352)
chr4 (113-374)||(50222345-50222604)
chr4 (113-374)||(52312407-52312666)
chr4 (113-374)||(44615185-44615444)
chr4 (113-373)||(18239426-18239684)
chr4 (120-339)||(52873363-52873582)
chr4 (113-336)||(1837553-1837774)
chr4 (113-427)||(8574784-8575088)
chr4 (113-321)||(15355384-15355591)
chr4 (17-428)||(17046288-17046700)
chr4 (17-433)||(14053202-14053621)
chr4 (113-336)||(7641236-7641447)
chr4 (121-336)||(51463912-51464124)
chr4 (56-300)||(3096134-3096379)
chr4 (121-374)||(23803271-23803521)
chr4 (121-374)||(12610856-12611099)
chr4 (143-427)||(44102140-44102425)
chr4 (170-428)||(7088832-7089093)
chr4 (61-285)||(15551663-15551889)
chr4 (132-340)||(6899808-6900016)
chr4 (121-321)||(15369925-15370124)
chr4 (121-321)||(15371109-15371308)
chr4 (121-321)||(15367597-15367796)
chr4 (121-321)||(15373390-15373589)
chr4 (121-321)||(15402610-15402809)
chr4 (142-374)||(19618178-19618415)
chr4 (121-321)||(16223439-16223638)
chr4 (192-374)||(19242675-19242855)
chr4 (192-374)||(3514982-3515163)
chr4 (142-336)||(14970751-14970950)
chr4 (120-321)||(20149735-20149932)
chr4 (113-321)||(39706302-39706511)
chr4 (198-374)||(21815591-21815761)
chr4 (184-427)||(52243099-52243343)
chr4 (120-395)||(13789-14061)
chr4 (37-239)||(17048409-17048609)
chr4 (22-282)||(12569820-12570078)
chr4 (121-374)||(22353740-22353993)
chr4 (22-179)||(44675436-44675593)
chr4 (22-171)||(13569306-13569454)
chr4 (113-394)||(43198492-43198769)
chr4 (110-336)||(12773910-12774128)
chr4 (22-179)||(15125197-15125354)
chr4 (22-179)||(23843282-23843439)
chr4 (198-332)||(12288211-12288342)
chr4 (142-290)||(8846287-8846433)
chr4 (37-179)||(15093594-15093736)
chr4 (113-166)||(29267517-29267570)
chr4 (34-179)||(15121956-15122101)
chr4 (372-434)||(3096803-3096865)
chr4 (233-314)||(6190481-6190563)
chr4 (372-426)||(17047979-17048033)
chr4 (32-84)||(19618499-19618551)
chr4 (110-336)||(46640453-46640675)
chr4 (17-84)||(19242536-19242603)
chr4 (17-84)||(22353609-22353676)
chr4 (113-226)||(14927843-14927955)
chr4 (198-284)||(53082202-53082284)
chr4 (17-82)||(15705192-15705256)
chr4 (17-84)||(14971078-14971145)
chr4 (17-84)||(19242493-19242559)
chr4 (17-84)||(22353653-22353720)
chr4 (17-82)||(12610728-12610792)
chr4 (17-82)||(12610771-12610835)
chr4 (17-82)||(15367512-15367576)
chr4 (17-78)||(19242580-19242641)
chr4 (17-82)||(23803542-23803606)
chr4 (17-82)||(23803585-23803649)
chr4 (17-82)||(51464145-51464209)
chr4 (235-275)||(17333298-17333338)
chr4 (40-96)||(39706543-39706598)
[»] chr3 (130 HSPs)
chr3 (17-434)||(40213620-40214038)
chr3 (40-434)||(14972682-14973076)
chr3 (17-428)||(25476290-25476701)
chr3 (17-434)||(17487659-17488078)
chr3 (17-434)||(23083260-23083679)
chr3 (17-428)||(43840735-43841148)
chr3 (17-434)||(18438337-18438756)
chr3 (17-434)||(17499141-17499560)
chr3 (56-434)||(13442115-13442496)
chr3 (54-428)||(11424668-11425040)
chr3 (17-434)||(20698335-20698755)
chr3 (56-428)||(26686729-26687103)
chr3 (17-428)||(12399011-12399425)
chr3 (113-427)||(24153115-24153430)
chr3 (113-427)||(21618345-21618650)
chr3 (40-434)||(14576732-14577124)
chr3 (113-427)||(36166494-36166799)
chr3 (113-374)||(29172589-29172849)
chr3 (113-374)||(17463075-17463334)
chr3 (113-374)||(34159223-34159482)
chr3 (113-374)||(16454287-16454546)
chr3 (113-373)||(28848618-28848876)
chr3 (120-374)||(8898998-8899250)
chr3 (113-374)||(13151796-13152056)
chr3 (113-374)||(13154261-13154521)
chr3 (113-374)||(38961897-38962157)
chr3 (113-374)||(45606913-45607172)
chr3 (113-331)||(55500839-55501055)
chr3 (113-374)||(17446661-17446919)
chr3 (113-374)||(9707613-9707872)
chr3 (113-374)||(16282817-16283076)
chr3 (113-336)||(6469178-6469395)
chr3 (120-374)||(7781353-7781605)
chr3 (113-374)||(10247729-10247988)
chr3 (40-434)||(14572417-14572810)
chr3 (113-336)||(15977409-15977633)
chr3 (17-329)||(13210333-13210647)
chr3 (60-427)||(24340628-24340999)
chr3 (142-374)||(55476417-55476647)
chr3 (121-321)||(8499422-8499621)
chr3 (113-374)||(41123787-41124043)
chr3 (114-337)||(10556882-10557105)
chr3 (121-321)||(15412333-15412532)
chr3 (115-336)||(43550522-43550744)
chr3 (121-374)||(50242728-50242978)
chr3 (121-321)||(12119784-12119983)
chr3 (17-422)||(30029637-30030049)
chr3 (17-427)||(23274489-23274903)
chr3 (232-433)||(42386428-42386632)
chr3 (114-270)||(45577947-45578102)
chr3 (121-374)||(27165154-27165407)
chr3 (121-317)||(44494715-44494908)
chr3 (142-374)||(12567479-12567716)
chr3 (142-374)||(13543944-13544181)
chr3 (103-362)||(12510939-12511205)
chr3 (139-374)||(53301511-53301747)
chr3 (121-316)||(17737142-17737337)
chr3 (17-157)||(10542619-10542759)
chr3 (121-275)||(28194599-28194752)
chr3 (22-303)||(15878083-15878363)
chr3 (17-134)||(10542852-10542969)
chr3 (217-336)||(17672626-17672744)
chr3 (142-362)||(46822187-46822413)
chr3 (22-275)||(23408234-23408485)
chr3 (143-427)||(37642170-37642458)
chr3 (17-133)||(14682183-14682300)
chr3 (233-374)||(53070659-53070799)
chr3 (17-134)||(10542747-10542864)
chr3 (113-337)||(15470827-15471047)
chr3 (17-133)||(14670661-14670778)
chr3 (113-332)||(14234382-14234605)
chr3 (113-329)||(12174265-12174467)
chr3 (113-320)||(9512825-9513026)
chr3 (113-320)||(9520800-9521001)
chr3 (113-340)||(16103685-16103905)
chr3 (113-320)||(49668091-49668292)
chr3 (144-427)||(22147431-22147717)
chr3 (120-340)||(16097238-16097454)
chr3 (113-427)||(52523633-52523946)
chr3 (200-336)||(32307666-32307798)
chr3 (372-431)||(14179592-14179651)
chr3 (113-336)||(22110349-22110569)
chr3 (36-171)||(23077642-23077776)
chr3 (17-84)||(27165069-27165135)
chr3 (198-336)||(37251165-37251300)
chr3 (120-290)||(1644718-1644882)
chr3 (37-112)||(16796117-16796192)
chr3 (198-337)||(43925947-43926083)
chr3 (17-84)||(8499337-8499403)
chr3 (34-179)||(15067499-15067644)
chr3 (17-84)||(15412248-15412314)
chr3 (34-179)||(16369216-16369361)
chr3 (93-239)||(16796195-16796339)
chr3 (17-84)||(53301784-53301850)
chr3 (17-83)||(22147716-22147782)
chr3 (36-179)||(23053244-23053387)
chr3 (37-179)||(14878672-14878814)
chr3 (25-84)||(12120045-12120103)
chr3 (17-84)||(22147759-22147826)
chr3 (17-60)||(26683157-26683200)
chr3 (17-84)||(46822080-46822147)
chr3 (372-426)||(16796707-16796761)
chr3 (296-394)||(2051138-2051238)
chr3 (17-78)||(46822124-46822185)
chr3 (235-275)||(13919350-13919390)
chr3 (17-73)||(28194557-28194612)
chr3 (17-84)||(10556804-10556870)
chr3 (199-275)||(14665380-14665458)
chr3 (17-84)||(15076200-15076267)
chr3 (17-84)||(15076244-15076311)
chr3 (17-84)||(22147803-22147869)
chr3 (17-84)||(28194514-28194580)
chr3 (17-84)||(43550758-43550825)
chr3 (17-83)||(12120003-12120068)
chr3 (34-84)||(43550802-43550852)
chr3 (30-84)||(46822049-46822103)
chr3 (218-275)||(856140-856197)
chr3 (17-78)||(10556847-10556907)
chr3 (17-78)||(15412291-15412351)
chr3 (17-82)||(17737057-17737121)
chr3 (91-160)||(18384090-18384158)
chr3 (218-275)||(23077537-23077594)
chr3 (17-78)||(27165112-27165172)
chr3 (17-82)||(50242643-50242707)
chr3 (17-78)||(55476354-55476415)
chr3 (80-179)||(12172658-12172757)
chr3 (199-272)||(14668536-14668611)
chr3 (80-179)||(15051371-15051470)
chr3 (17-73)||(43550725-43550781)
chr3 (56-84)||(43840730-43840758)
[»] chr2 (76 HSPs)
chr2 (17-434)||(23060315-23060734)
chr2 (17-434)||(22336928-22337337)
chr2 (18-428)||(22731139-22731551)
chr2 (56-434)||(23076288-23076664)
chr2 (17-428)||(23654291-23654706)
chr2 (17-428)||(22738085-22738497)
chr2 (131-434)||(23659940-23660244)
chr2 (21-291)||(8946463-8946734)
chr2 (113-374)||(18808840-18809099)
chr2 (113-374)||(23712019-23712278)
chr2 (113-374)||(39682210-39682469)
chr2 (113-373)||(23135487-23135745)
chr2 (113-374)||(24367670-24367930)
chr2 (113-374)||(26505276-26505535)
chr2 (113-374)||(26507754-26508013)
chr2 (17-275)||(23040249-23040509)
chr2 (113-336)||(45029898-45030119)
chr2 (120-374)||(21155066-21155318)
chr2 (113-374)||(24905638-24905898)
chr2 (113-374)||(24908113-24908373)
chr2 (113-374)||(23709538-23709797)
chr2 (17-433)||(38016-38435)
chr2 (113-336)||(571294-571515)
chr2 (113-374)||(24898201-24898461)
chr2 (113-374)||(24900684-24900944)
chr2 (113-374)||(24903161-24903421)
chr2 (113-374)||(6725892-6726151)
chr2 (113-336)||(24529573-24529795)
chr2 (113-374)||(28576996-28577255)
chr2 (113-374)||(32039504-32039763)
chr2 (142-374)||(23130788-23131018)
chr2 (142-374)||(23133255-23133485)
chr2 (142-374)||(34402528-34402758)
chr2 (17-312)||(23071972-23072269)
chr2 (121-336)||(43137204-43137417)
chr2 (17-362)||(23103370-23103714)
chr2 (53-433)||(20308945-20309326)
chr2 (122-374)||(22105319-22105569)
chr2 (120-294)||(24643036-24643209)
chr2 (17-228)||(21900560-21900773)
chr2 (121-336)||(38967279-38967493)
chr2 (121-428)||(298719-299027)
chr2 (168-428)||(23285818-23286077)
chr2 (60-336)||(19671675-19671952)
chr2 (142-374)||(32214927-32215164)
chr2 (22-272)||(22741027-22741276)
chr2 (184-427)||(23708524-23708769)
chr2 (142-362)||(25616107-25616333)
chr2 (113-340)||(28405881-28406103)
chr2 (113-340)||(25175754-25175976)
chr2 (22-179)||(22758875-22759031)
chr2 (113-374)||(7694-7950)
chr2 (54-135)||(23657632-23657713)
chr2 (120-267)||(18786971-18787113)
chr2 (113-290)||(7679480-7679662)
chr2 (113-290)||(22134251-22134428)
chr2 (37-179)||(22799282-22799424)
chr2 (372-434)||(27753735-27753797)
chr2 (37-314)||(23019727-23020004)
chr2 (198-336)||(23207266-23207401)
chr2 (233-384)||(32451878-32452031)
chr2 (198-427)||(20520098-20520325)
chr2 (34-179)||(24673383-24673529)
chr2 (113-336)||(22413133-22413354)
chr2 (17-84)||(32215204-32215271)
chr2 (235-284)||(23287384-23287433)
chr2 (34-179)||(24680000-24680146)
chr2 (235-275)||(26392403-26392443)
chr2 (113-160)||(23713058-23713104)
chr2 (34-160)||(45678304-45678429)
chr2 (30-84)||(32215248-32215302)
chr2 (17-78)||(23130725-23130786)
chr2 (17-78)||(23133192-23133253)
chr2 (17-78)||(34402760-34402821)
chr2 (17-82)||(38967194-38967258)
chr2 (17-82)||(43137075-43137139)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (44-434)||(3050-3441)
[»] scaffold0056 (3 HSPs)
scaffold0056 (17-433)||(17115-17539)
scaffold0056 (233-336)||(79328-79430)
scaffold0056 (22-282)||(14139-14399)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (17-434)||(339849-340263)
scaffold0003 (113-374)||(158456-158716)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (54-434)||(4350-4729)
scaffold0228 (54-434)||(11932-12311)
scaffold0228 (54-434)||(21884-22263)
[»] chr8 (86 HSPs)
chr8 (17-428)||(18818314-18818727)
chr8 (54-434)||(16092240-16092621)
chr8 (17-428)||(22874872-22875281)
chr8 (61-434)||(28648943-28649322)
chr8 (41-434)||(6759088-6759478)
chr8 (17-428)||(7372581-7372986)
chr8 (20-428)||(23406185-23406597)
chr8 (17-428)||(22626540-22626951)
chr8 (17-434)||(18879136-18879547)
chr8 (17-428)||(20536011-20536424)
chr8 (40-434)||(21923827-21924222)
chr8 (56-434)||(21918899-21919279)
chr8 (17-434)||(23648350-23648775)
chr8 (17-433)||(45130898-45131316)
chr8 (113-427)||(26219613-26219918)
chr8 (113-374)||(5853298-5853557)
chr8 (113-336)||(20046239-20046460)
chr8 (113-360)||(26225268-26225513)
chr8 (113-374)||(1484299-1484558)
chr8 (113-374)||(20403124-20403383)
chr8 (113-336)||(4542417-4542638)
chr8 (113-374)||(22001651-22001909)
chr8 (56-433)||(31971097-31971476)
chr8 (114-427)||(41598086-41598399)
chr8 (113-317)||(45290758-45290961)
chr8 (120-374)||(15203237-15203489)
chr8 (113-374)||(19896162-19896424)
chr8 (17-317)||(5866292-5866594)
chr8 (17-433)||(21389353-21389770)
chr8 (121-374)||(14409450-14409702)
chr8 (17-264)||(21255024-21255272)
chr8 (113-374)||(14823671-14823929)
chr8 (17-264)||(21249186-21249434)
chr8 (17-317)||(17140715-17141019)
chr8 (17-400)||(13597550-13597937)
chr8 (17-400)||(13508018-13508403)
chr8 (17-415)||(21778697-21779096)
chr8 (142-374)||(4483207-4483436)
chr8 (21-431)||(21395885-21396296)
chr8 (21-431)||(21790378-21790789)
chr8 (17-311)||(21490796-21491092)
chr8 (68-433)||(16199546-16199913)
chr8 (121-374)||(25484281-25484524)
chr8 (142-374)||(16413322-16413547)
chr8 (142-336)||(26223841-26224037)
chr8 (114-427)||(17612018-17612332)
chr8 (192-321)||(19937065-19937192)
chr8 (110-340)||(38855246-38855474)
chr8 (113-332)||(6520267-6520486)
chr8 (142-362)||(32121654-32121880)
chr8 (230-321)||(15070571-15070661)
chr8 (113-340)||(23760839-23761062)
chr8 (184-337)||(21285569-21285720)
chr8 (110-335)||(26355699-26355919)
chr8 (233-427)||(19801333-19801527)
chr8 (121-221)||(22965608-22965707)
chr8 (114-332)||(983407-983622)
chr8 (113-340)||(21673608-21673830)
chr8 (34-179)||(16184537-16184682)
chr8 (22-239)||(44384944-44385160)
chr8 (22-272)||(17354006-17354255)
chr8 (23-179)||(19898900-19899056)
chr8 (113-395)||(20498466-20498745)
chr8 (187-362)||(18678075-18678256)
chr8 (37-179)||(21168887-21169031)
chr8 (37-171)||(23777000-23777133)
chr8 (351-426)||(25363047-25363124)
chr8 (68-179)||(24755565-24755676)
chr8 (22-179)||(19982897-19983054)
chr8 (41-179)||(20466197-20466335)
chr8 (17-84)||(14409721-14409787)
chr8 (17-83)||(18678273-18678339)
chr8 (233-337)||(37116366-37116472)
chr8 (113-337)||(17266990-17267211)
chr8 (17-84)||(22965521-22965588)
chr8 (17-82)||(26223692-26223756)
chr8 (198-337)||(24353009-24353144)
chr8 (376-427)||(26222987-26223039)
chr8 (17-84)||(17612344-17612410)
chr8 (33-84)||(18678316-18678367)
chr8 (80-138)||(377132-377189)
chr8 (17-78)||(4483144-4483205)
chr8 (17-78)||(14409684-14409744)
chr8 (17-78)||(17612307-17612367)
chr8 (17-82)||(25484588-25484652)
chr8 (17-78)||(26223778-26223839)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (17-434)||(51716-52135)
scaffold0011 (17-428)||(167884-168297)
[»] chr7 (104 HSPs)
chr7 (17-428)||(9508991-9509405)
chr7 (115-434)||(3564263-3564584)
chr7 (17-428)||(12698634-12699048)
chr7 (17-434)||(10588838-10589260)
chr7 (113-427)||(48273288-48273594)
chr7 (113-427)||(18456319-18456634)
chr7 (25-428)||(26211804-26212212)
chr7 (78-434)||(38227344-38227702)
chr7 (113-336)||(44116405-44116627)
chr7 (113-374)||(11972393-11972652)
chr7 (113-374)||(14949128-14949387)
chr7 (113-374)||(32125388-32125647)
chr7 (113-374)||(41522814-41523073)
chr7 (113-374)||(41525276-41525535)
chr7 (17-422)||(15143948-15144350)
chr7 (113-374)||(15376719-15376978)
chr7 (113-374)||(21189601-21189860)
chr7 (113-374)||(24702135-24702394)
chr7 (113-336)||(16409956-16410177)
chr7 (113-374)||(456218-456477)
chr7 (113-374)||(16232417-16232676)
chr7 (113-374)||(20385129-20385388)
chr7 (113-374)||(11393293-11393552)
chr7 (113-374)||(27216757-27217016)
chr7 (113-374)||(24704585-24704841)
chr7 (120-374)||(18640176-18640428)
chr7 (56-428)||(16386152-16386529)
chr7 (17-239)||(14258062-14258286)
chr7 (121-336)||(3386239-3386451)
chr7 (113-374)||(20110452-20110702)
chr7 (17-317)||(34200585-34200889)
chr7 (17-311)||(11996051-11996347)
chr7 (115-374)||(13647225-13647485)
chr7 (121-321)||(13869250-13869449)
chr7 (121-336)||(38898420-38898635)
chr7 (17-340)||(10063813-10064136)
chr7 (17-200)||(13032560-13032744)
chr7 (121-336)||(13831279-13831491)
chr7 (17-312)||(28505321-28505604)
chr7 (115-433)||(40443292-40443610)
chr7 (120-427)||(17061866-17062173)
chr7 (58-427)||(27847739-27848109)
chr7 (192-374)||(18430687-18430868)
chr7 (192-374)||(16213659-16213840)
chr7 (141-336)||(24275089-24275289)
chr7 (120-374)||(26355989-26356255)
chr7 (120-374)||(26358441-26358707)
chr7 (17-155)||(16579377-16579515)
chr7 (17-155)||(16586148-16586286)
chr7 (22-275)||(18154901-18155152)
chr7 (113-418)||(2280033-2280339)
chr7 (103-267)||(15754955-15755120)
chr7 (113-246)||(15082017-15082147)
chr7 (142-317)||(16495329-16495505)
chr7 (120-336)||(67651-67867)
chr7 (17-134)||(16461233-16461350)
chr7 (113-340)||(18005550-18005772)
chr7 (143-427)||(19486649-19486937)
chr7 (22-272)||(19649552-19649801)
chr7 (184-337)||(22072882-22073037)
chr7 (198-336)||(12756715-12756847)
chr7 (22-175)||(24054270-24054421)
chr7 (120-321)||(811145-811343)
chr7 (120-267)||(47831712-47831860)
chr7 (120-333)||(16219719-16219928)
chr7 (17-134)||(16461338-16461455)
chr7 (113-340)||(44014082-44014301)
chr7 (17-134)||(15755152-15755271)
chr7 (120-337)||(16056239-16056450)
chr7 (22-171)||(9703067-9703215)
chr7 (17-96)||(16461166-16461245)
chr7 (120-195)||(18427436-18427510)
chr7 (142-224)||(16213550-16213632)
chr7 (34-313)||(15211271-15211557)
chr7 (17-73)||(3564565-3564621)
chr7 (22-179)||(32216704-32216861)
chr7 (17-73)||(40443255-40443311)
chr7 (229-427)||(1867901-1868101)
chr7 (198-427)||(15008404-15008631)
chr7 (34-275)||(17138120-17138361)
chr7 (17-84)||(13869165-13869231)
chr7 (17-84)||(16213443-16213510)
chr7 (17-84)||(38898654-38898720)
chr7 (218-320)||(14932749-14932851)
chr7 (218-320)||(15356184-15356286)
chr7 (218-320)||(15360298-15360400)
chr7 (229-332)||(12901338-12901443)
chr7 (110-155)||(16461129-16461174)
chr7 (34-275)||(12186835-12187076)
chr7 (17-84)||(13647144-13647211)
chr7 (17-84)||(16495178-16495245)
chr7 (198-260)||(14044735-14044792)
chr7 (198-260)||(14354765-14354822)
chr7 (91-160)||(14429758-14429825)
chr7 (17-84)||(13647100-13647167)
chr7 (17-60)||(16402712-16402755)
chr7 (17-84)||(16495222-16495289)
chr7 (198-272)||(2832504-2832580)
chr7 (17-82)||(3386154-3386218)
chr7 (17-82)||(13831194-13831258)
chr7 (17-78)||(13869208-13869268)
chr7 (17-78)||(16213487-16213548)
chr7 (17-78)||(16495266-16495327)
chr7 (198-275)||(18203801-18203873)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (40-434)||(16499-16893)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (17-434)||(13015-13433)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (17-434)||(39716-40134)
scaffold0080 (198-335)||(19883-20017)
scaffold0080 (34-179)||(18870-19015)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (17-428)||(1654-2067)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (50-416)||(3103-3475)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (17-428)||(8438-8847)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (56-423)||(15955-16323)
scaffold0120 (40-428)||(32864-33250)
scaffold0120 (40-428)||(45755-46141)
scaffold0120 (40-276)||(17388-17623)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (17-428)||(3273-3686)
scaffold0292 (17-428)||(147-558)
[»] scaffold0145 (4 HSPs)
scaffold0145 (56-424)||(32783-33153)
scaffold0145 (56-434)||(38602-38982)
scaffold0145 (113-336)||(9645-9867)
scaffold0145 (56-204)||(32317-32465)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (17-422)||(4652-5059)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (68-433)||(39331-39697)
scaffold0141 (17-71)||(37151-37204)
[»] scaffold0049 (2 HSPs)
scaffold0049 (68-433)||(75115-75481)
scaffold0049 (17-71)||(77608-77661)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (57-428)||(25738-26111)
scaffold0026 (93-428)||(39736-40073)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (17-340)||(128554-128876)
scaffold0031 (198-428)||(20330-20554)
scaffold0031 (22-175)||(65958-66109)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (17-434)||(8282-8697)
[»] scaffold0088 (2 HSPs)
scaffold0088 (17-428)||(20711-21127)
scaffold0088 (17-66)||(10118-10167)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (17-433)||(31869-32285)
scaffold0113 (56-84)||(31864-31892)
[»] scaffold0122 (3 HSPs)
scaffold0122 (113-360)||(44682-44929)
scaffold0122 (221-434)||(25964-26179)
scaffold0122 (339-434)||(33394-33491)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (56-434)||(6020-6404)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (17-275)||(4893-5150)
scaffold0395 (291-415)||(881-1006)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (17-333)||(28215-28533)
scaffold0046 (17-267)||(4353-4605)
scaffold0046 (17-267)||(1798-2050)
scaffold0046 (175-317)||(11252-11395)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (17-433)||(4514-4932)
scaffold0358 (372-433)||(95-156)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (17-433)||(13297-13716)
[»] scaffold0175 (4 HSPs)
scaffold0175 (17-270)||(76-329)
scaffold0175 (17-289)||(33924-34199)
scaffold0175 (266-428)||(13144-13308)
scaffold0175 (56-84)||(33919-33947)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (17-421)||(1751-2161)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (79-428)||(954-1304)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (113-374)||(20644-20903)
[»] scaffold0023 (13 HSPs)
scaffold0023 (113-374)||(94308-94567)
scaffold0023 (113-374)||(44351-44611)
scaffold0023 (17-285)||(119677-119947)
scaffold0023 (221-374)||(17446-17598)
scaffold0023 (113-340)||(100278-100500)
scaffold0023 (113-340)||(40169-40391)
scaffold0023 (113-267)||(101404-101552)
scaffold0023 (37-272)||(38542-38777)
scaffold0023 (17-84)||(17886-17953)
scaffold0023 (17-84)||(17842-17909)
scaffold0023 (30-84)||(17930-17984)
scaffold0023 (142-179)||(17765-17802)
scaffold0023 (17-78)||(17804-17865)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (17-314)||(11464-11763)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (17-428)||(15370-15784)
scaffold0114 (34-275)||(7112-7352)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (120-360)||(116332-116571)
scaffold0022 (198-337)||(128967-129102)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (17-428)||(10331-10744)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (113-374)||(37718-37977)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (113-374)||(136577-136836)
scaffold0028 (113-374)||(139046-139305)
scaffold0028 (113-374)||(143984-144243)
scaffold0028 (113-374)||(134108-134367)
scaffold0028 (113-374)||(141515-141774)
scaffold0028 (113-317)||(132563-132762)
scaffold0028 (217-340)||(62201-62321)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (113-373)||(13289-13547)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (113-336)||(40297-40518)
[»] scaffold0021 (5 HSPs)
scaffold0021 (56-275)||(121607-121827)
scaffold0021 (17-362)||(174567-174912)
scaffold0021 (352-428)||(124723-124801)
scaffold0021 (233-332)||(136370-136471)
scaffold0021 (233-332)||(145078-145179)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (113-374)||(13844-14103)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (113-321)||(4110-4317)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (113-374)||(11960-12214)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (192-434)||(22861-23104)
[»] scaffold0247 (3 HSPs)
scaffold0247 (17-427)||(17932-18345)
scaffold0247 (114-321)||(2188-2394)
scaffold0247 (33-84)||(2406-2456)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (17-433)||(1090-1507)
scaffold0106 (113-275)||(15298-15460)
scaffold0106 (142-433)||(7193-7484)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (143-336)||(16710-16902)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (17-333)||(5132-5448)
[»] scaffold0001 (6 HSPs)
scaffold0001 (114-321)||(85639-85845)
scaffold0001 (142-374)||(501003-501240)
scaffold0001 (120-340)||(160594-160809)
scaffold0001 (25-84)||(85857-85915)
scaffold0001 (33-84)||(500912-500963)
scaffold0001 (17-78)||(85820-85880)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (17-422)||(46796-47202)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (17-241)||(31961-32188)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (17-433)||(16082-16500)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (121-374)||(12-262)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (17-250)||(27681-27913)
scaffold0130 (296-434)||(27912-28052)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (122-374)||(81978-82228)
scaffold0037 (120-340)||(22665-22880)
[»] scaffold0007 (3 HSPs)
scaffold0007 (114-336)||(161133-161355)
scaffold0007 (17-84)||(161367-161433)
scaffold0007 (297-418)||(164550-164674)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (53-433)||(952-1333)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (15-241)||(2494-2722)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (32-333)||(51397-51699)
[»] scaffold0074 (2 HSPs)
scaffold0074 (121-374)||(38663-38916)
scaffold0074 (17-84)||(38936-39002)
[»] scaffold0454 (4 HSPs)
scaffold0454 (142-336)||(10692-10891)
scaffold0454 (17-83)||(10455-10520)
scaffold0454 (17-84)||(10585-10652)
scaffold0454 (17-78)||(10629-10690)
[»] scaffold0149 (5 HSPs)
scaffold0149 (142-336)||(29856-30050)
scaffold0149 (22-179)||(3546-3703)
scaffold0149 (22-179)||(7977-8134)
scaffold0149 (17-84)||(29749-29816)
scaffold0149 (17-78)||(29793-29854)
[»] scaffold0101 (2 HSPs)
scaffold0101 (120-321)||(1340-1537)
scaffold0101 (22-175)||(9123-9275)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (192-374)||(4669-4850)
[»] scaffold0363 (3 HSPs)
scaffold0363 (142-336)||(9161-9360)
scaffold0363 (17-83)||(8924-8989)
scaffold0363 (17-84)||(9054-9121)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (40-428)||(4343-4739)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (142-374)||(11207-11444)
scaffold0029 (34-179)||(12578-12723)
scaffold0029 (17-78)||(11144-11205)
[»] scaffold0494 (2 HSPs)
scaffold0494 (142-336)||(12293-12492)
scaffold0494 (17-84)||(12532-12599)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (121-317)||(15570-15764)
scaffold0261 (22-171)||(1144-1292)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (274-434)||(3428-3591)
[»] scaffold0042 (3 HSPs)
scaffold0042 (232-428)||(24206-24406)
scaffold0042 (34-179)||(35074-35218)
scaffold0042 (17-54)||(24403-24440)
[»] scaffold0461 (2 HSPs)
scaffold0461 (121-400)||(11370-11652)
scaffold0461 (17-84)||(11240-11307)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (121-400)||(38189-38471)
scaffold0124 (17-84)||(38534-38601)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (22-267)||(36260-36503)
[»] scaffold0165 (5 HSPs)
scaffold0165 (37-239)||(3337-3539)
scaffold0165 (37-239)||(7401-7603)
scaffold0165 (110-418)||(27663-27969)
scaffold0165 (372-426)||(3641-3695)
scaffold0165 (372-426)||(7705-7759)
[»] scaffold0184 (4 HSPs)
scaffold0184 (142-317)||(1087-1263)
scaffold0184 (17-84)||(1347-1414)
scaffold0184 (17-84)||(1303-1370)
scaffold0184 (17-78)||(1265-1326)
[»] scaffold0034 (6 HSPs)
scaffold0034 (17-134)||(116718-116835)
scaffold0034 (113-337)||(32437-32658)
scaffold0034 (17-132)||(116823-116938)
scaffold0034 (25-134)||(116935-117044)
scaffold0034 (54-137)||(117025-117108)
scaffold0034 (233-384)||(51833-51985)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (220-336)||(4300-4415)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (113-340)||(19166-19390)
scaffold0102 (34-119)||(48661-48746)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (22-272)||(69599-69848)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (110-340)||(10536-10762)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (110-418)||(16014-16320)
scaffold0357 (233-418)||(13147-13336)
scaffold0357 (198-260)||(2650-2707)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (113-340)||(6436-6661)
scaffold0621 (113-361)||(8370-8613)
[»] scaffold0084 (2 HSPs)
scaffold0084 (17-165)||(10101-10247)
scaffold0084 (372-433)||(10323-10384)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (22-267)||(19786-20029)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (113-340)||(14692-14916)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (30-272)||(23658-23897)
[»] scaffold0628 (2 HSPs)
scaffold0628 (113-340)||(2801-3022)
scaffold0628 (113-155)||(3283-3324)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (113-267)||(1102-1256)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (113-267)||(6510-6664)
scaffold0333 (113-267)||(13890-14044)
[»] scaffold0278 (3 HSPs)
scaffold0278 (40-136)||(7386-7482)
scaffold0278 (113-340)||(5547-5769)
scaffold0278 (37-137)||(7486-7585)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (113-336)||(45791-46010)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (113-320)||(23898-24101)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (113-340)||(2640-2861)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (113-340)||(31-255)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (22-272)||(7880-8129)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (113-267)||(15845-15999)
scaffold0020 (22-272)||(178705-178952)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (199-321)||(6137-6259)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (110-337)||(10426-10650)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (113-340)||(129808-130031)
scaffold0010 (198-427)||(60620-60848)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (34-313)||(192997-193277)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (121-340)||(945-1158)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (113-317)||(32003-32202)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (113-332)||(12665-12884)
[»] scaffold0671 (1 HSPs)
scaffold0671 (21-179)||(5898-6056)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (113-339)||(12472-12693)
[»] scaffold0096 (2 HSPs)
scaffold0096 (87-163)||(20881-20957)
scaffold0096 (22-171)||(16513-16661)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (198-395)||(53487-53681)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (113-290)||(6721-6889)
scaffold0556 (289-337)||(8090-8138)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (113-332)||(12842-13057)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (37-175)||(18056-18193)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (113-290)||(28813-28986)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (198-296)||(11952-12044)
[»] scaffold0297 (2 HSPs)
scaffold0297 (37-272)||(15742-15976)
scaffold0297 (22-175)||(10681-10830)
[»] scaffold0174 (1 HSPs)
scaffold0174 (22-179)||(18610-18767)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (109-267)||(984-1135)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (279-428)||(6675-6826)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (22-179)||(10299-10456)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (172-290)||(8118-8233)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (113-332)||(103632-103848)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (113-395)||(7997-8277)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (37-264)||(4875-5104)
[»] scaffold0634 (1 HSPs)
scaffold0634 (40-98)||(4894-4952)
[»] scaffold0484 (3 HSPs)
scaffold0484 (37-118)||(466-547)
scaffold0484 (372-426)||(1074-1128)
scaffold0484 (88-239)||(539-688)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (17-75)||(20471-20529)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (37-179)||(14482-14624)
scaffold0081 (37-179)||(38922-39064)
scaffold0081 (37-179)||(23498-23640)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (113-275)||(30235-30392)
[»] scaffold0423 (1 HSPs)
scaffold0423 (25-79)||(18-72)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (34-272)||(21866-22105)
scaffold0210 (34-272)||(29758-29997)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (34-179)||(1696-1842)
[»] scaffold0697 (1 HSPs)
scaffold0697 (120-160)||(6506-6546)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (22-105)||(32251-32334)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (229-291)||(25121-25184)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (289-416)||(225482-225611)
scaffold0012 (113-215)||(225353-225455)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (34-160)||(281071-281196)
scaffold0005 (198-336)||(267649-267784)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (218-320)||(29558-29660)
[»] scaffold1655 (1 HSPs)
scaffold1655 (17-66)||(1193-1242)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (391-428)||(17892-17929)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (198-259)||(1874-1930)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (80-138)||(6361-6418)
scaffold0158 (34-138)||(2649-2752)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (235-284)||(206575-206624)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (296-340)||(2213-2257)
[»] scaffold0780 (1 HSPs)
scaffold0780 (34-70)||(4870-4906)
[»] scaffold0447 (1 HSPs)
scaffold0447 (34-66)||(14401-14433)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (34-66)||(12396-12428)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 92)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 17 - 434
Target Start/End: Original strand, 24529023 - 24529442
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24529023 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcataaagcccccatcgctatttgagctaaagctccatcgtattaagtacaaagctc 24529122  T
Q  117 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 216  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  24529123 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcaacctcttaaacatcttaaatcgacaaactcttatataatccaataatttggaact 24529222  T
Q  217 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24529223 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataatgatatcaaat 24529322  T
Q  317 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 414  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||| ||||| ||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24529323 gcaagtcaacaacatcttaattatacattcatatctcaagtaatgcttataacattatatcacatcatattcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 24529422  T
Q  415 agattataattaacttcatc 434  Q
    |||||||| ||||| |||||    
T  24529423 agattatagttaacatcatc 24529442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 17 - 434
Target Start/End: Original strand, 9077757 - 9078174
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    |||||||||||| |||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  9077757 catcaagcccccatcgctata--agtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaggctc 9077854  T
Q  117 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 216  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  9077855 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttagaacaacaacctcttatataatccaataatttggaaca 9077954  T
Q  217 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  9077955 tcatcatcttcatcaacttagactgacccatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaagt 9078054  T
Q  317 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 414  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9078055 gcaagtcaacaacatctcaattatacattcataactcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 9078154  T
Q  415 agattataattaacttcatc 434  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  9078155 agattataattaacatcatc 9078174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 14 - 434
Target Start/End: Original strand, 25421330 - 25421754
Alignment:
Q  14 ggacatcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccc-catcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaa 112  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  25421330 ggacatcaaacccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccccccatcgctaattgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaa 25421429  T
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  25421430 gctccagggcataaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcataattcgacaacctcttatataatccaataaattgg 25421529  T
Q  213 -aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 311  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421530 aaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 25421629  T
Q  312 caaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagc 409  Q
    ||| |||||| ||||| ||||| |||||| || | ||   |||||||||||  |||| ||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  25421630 caattgcaagtcaacagcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagc 25421729  T
Q  410 ttcacagattataattaacttcatc 434  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  25421730 ttcacagattataattaacatcatc 25421754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 17 - 433
Target Start/End: Original strand, 24493371 - 24493789
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24493371 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctc 24493470  T
Q  117 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg-aac 215  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  24493471 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttatttcgacaacctcttatataatccaataatttggaaac 24493570  T
Q  216 ttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 315  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  24493571 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaagtaacaatagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaa 24493669  T
Q  316 tgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttca 413  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| || | ||   |||||| ||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  24493670 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtgatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacatatcttaaatagcttca 24493769  T
Q  414 cagattataattaacttcat 433  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  24493770 cagattataattaacatcat 24493789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 17 - 434
Target Start/End: Original strand, 25431197 - 25431616
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25431197 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttctagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctc 25431296  T
Q  117 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg-aac 215  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||    
T  25431297 caggccatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataaattggaaac 25431396  T
Q  216 ttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 315  Q
     ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25431397 atcatcatcttcat-aaattagaccgactcatgcatcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaat 25431495  T
Q  316 tgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttca 413  Q
    |||||| ||||||||||| |||| | || | ||   |||||||||||  |||| ||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  25431496 tgcaagtcaacaacatcttaaatgttcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttca 25431595  T
Q  414 cagattataattaacttcatc 434  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  25431596 cagattataattaacatcatc 25431616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 428
Target Start/End: Original strand, 1096271 - 1096683
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||| ||||    
T  1096271 catcaagcccccatcgctatta-agtattaatatactttcagggcatcaagcccc-atcgctatttgagctaaagctccatcatgttgagcacaaggctc 1096368  T
Q  117 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg-aac 215  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  1096369 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaac 1096468  T
Q  216 ttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 315  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1096469 atcaacatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggtagtatgcaaaaacaacataacataataatatcaaa 1096568  T
Q  316 tgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttca 413  Q
    |||||  ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  1096569 tgcaaatcaacaacatctcacatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttca 1096668  T
Q  414 cagattataattaac 428  Q
     || |||||||||||    
T  1096669 taggttataattaac 1096683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 17 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 23390814 - 23390401
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||   ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  23390814 catcaagcccccatcactatttgagtattaatatacttccagggtatcaagcccccatcactgaatgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctc 23390715  T
Q  117 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 216  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  23390714 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaca 23390615  T
Q  217 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23390614 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 23390515  T
Q  317 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 414  Q
    ||||  || |||||||| |||||| ||   ||   |||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  23390514 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaatagcttcac 23390415  T
Q  415 agattataattaac 428  Q
    ||||||||||||||    
T  23390414 agattataattaac 23390401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 17 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 21997852 - 21997548
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||    
T  21997852 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcataaagcccccatcgctatttgagctcaagctccatcatgttgagtacaaagctc 21997753  T
Q  117 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 216  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  21997752 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaaca 21997653  T
Q  217 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21997652 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 21997553  T
Q  317 gcaag 321  Q
    |||||    
T  21997552 gcaag 21997548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 17 - 434
Target Start/End: Original strand, 13095297 - 13095716
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  13095297 catcaagccctcatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctatttgagctaaagctccatcctgttgagtacaaagctc 13095396  T
Q  117 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg-aac 215  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  13095397 cagggcatcaagcccccaacagtgaaatgctaatgcatggacttgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaac 13095496  T
Q  216 ttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 315  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||    
T  13095497 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataacaatagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacatattgatatcaaa 13095595  T
Q  316 tgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttca 413  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| || | ||   |||| |||||   |||| ||  ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  13095596 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaaataatgtacataacattatatcacatcgtaatcaacatcaacatatcttaaacaacttca 13095695  T
Q  414 cagattataattaacttcatc 434  Q
    || |||||||||||| |||||    
T  13095696 catattataattaacatcatc 13095716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 17 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 8287163 - 8286747
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 115  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||| |||  || ||||||||||    
T  8287163 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcctccatcgctaatttgagctaaagctccaacgtggtgggtacaaagct 8287064  T
Q  116 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaa 214  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||| | |||| ||||||||||    
T  8287063 ccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcataattcgacaaccacttatattagtccagtaatttggaa 8286964  T
Q  215 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtataca-aaaacaacatgacataataatatca 313  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  8286963 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaaacagcatgacataataatatca 8286864  T
Q  314 aatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagctt 411  Q
    | |||||  || |||||||| |||||  ||  |||   |||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8286863 attgcaattcatcaacatcttaaataatcaaacattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 8286764  T
Q  412 cacagattataattaac 428  Q
    |||| | ||||||||||    
T  8286763 cacataatataattaac 8286747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 17 - 434
Target Start/End: Original strand, 13025113 - 13025532
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    |||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  13025113 catcaagctctcatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcactatttgagctaaagctccatcctgttgagtacaaagctc 13025212  T
Q  117 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg-aac 215  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  13025213 cagggcatcaagcccccaacagtgaaatgctaatgcatggacttgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaac 13025312  T
Q  216 ttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 315  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||    
T  13025313 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataacaatagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacatattgatatcaaa 13025411  T
Q  316 tgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttca 413  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| || | ||   |||| |||||   |||| ||  ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  13025412 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaaataatgtacataacattatatcacatcgtaatcaacatcaacatatcttaaacaacttca 13025511  T
Q  414 cagattataattaacttcatc 434  Q
    || |||||||||||| |||||    
T  13025512 catattataattaacatcatc 13025532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 21808708 - 21808384
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 115  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||    
T  21808708 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaaacccccatcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagct 21808609  T
Q  116 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaa 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  21808608 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaag-gctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaa 21808510  T
Q  215 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 314  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  21808509 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaa 21808410  T
Q  315 atgcaagacaacaacatctcaaatat 340  Q
     |||||  ||||||||||| ||||||    
T  21808409 ttgcaattcaacaacatcttaaatat 21808384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 113 - 427
Target Start/End: Original strand, 22412083 - 22412388
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22412083 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 22412182  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  22412183 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacgataacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatc 22412281  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttc 412  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||        || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22412282 aaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat--------aagtatgacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 22412373  T
Q  413 acagattataattaa 427  Q
    |||||||||||||||    
T  22412374 acagattataattaa 22412388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 17 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 21729384 - 21729059
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 115  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||    
T  21729384 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaaacccccatcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagct 21729285  T
Q  116 ccaaggcatcaagccccc-aacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttgga 213  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  21729284 ccaaggcatcaagccccccaacaatgacg-gctaatgcatgaactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttgga 21729186  T
Q  214 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 313  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  21729185 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatca 21729086  T
Q  314 aatgcaagacaacaacatctcaaatat 340  Q
    | |||||  ||||||||||| ||||||    
T  21729085 attgcaattcaacaacatcttaaatat 21729059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 17 - 428
Target Start/End: Original strand, 22074822 - 22075235
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 115  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||  ||| | |||  |||||||||||||    
T  22074822 catcaagcccccatcactatctgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaatactcaaacgtggtgagtacaaagct 22074921  T
Q  116 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaa 214  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||  | |||||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  22074922 ccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaagcatct--attcgacaacctcttatattagtccaataatttggaa 22075018  T
Q  215 cttcatcat-cttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 313  Q
    | ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22075019 catcatcattcttcaacaacttagaccgactcattcagcttagttaaataacaacagcaacataggaagtatacaaaatcaacatgacataataatatca 22075118  T
Q  314 aatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagctt 411  Q
    | |||||  ||||||||||| |||||| ||   |   |||||||||||| || || ||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  22075119 attgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagctt 22075218  T
Q  412 cacagattataattaac 428  Q
    |||| ||||||||||||    
T  22075219 cacatattataattaac 22075235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Original strand, 29329831 - 29330090
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  29329831 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttcg 29329929  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29329930 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 29330028  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  29330029 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 29330090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 110 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 10733208 - 10732946
Alignment:
Q  110 aaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatt 209  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10733208 aaagctcaagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatt 10733110  T
Q  210 tggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataat 309  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10733109 tggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataat 10733011  T
Q  310 atcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  10733010 atcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 10732946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 42245630 - 42245371
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42245630 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 42245532  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42245531 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 42245433  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  42245432 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 42245371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 120 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 11581458 - 11581243
Alignment:
Q  120 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11581458 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaagtcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgaaaacctcttatataatccaataatttggaacttca 11581359  T
Q  220 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 319  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11581358 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 11581260  T
Q  320 agacaacaacatctcaa 336  Q
    || ||| ||| ||||||    
T  11581259 agtcaataacgtctcaa 11581243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 113 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 2154879 - 2154658
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2154879 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 2154781  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2154780 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 2154682  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaa 336  Q
    || |||||| ||||||| ||||||    
T  2154681 aactgcaagtcaacaacgtctcaa 2154658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 265033 - 264774
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  265033 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcaacaacctcttatataatccaataatttgg 264935  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  264934 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 264836  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  264835 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 264774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 17 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 19661154 - 19660879
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 115  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||    
T  19661154 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagct 19661055  T
Q  116 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttggaa 214  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  19661054 ccatggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcaacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaa 19660956  T
Q  215 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaa 290  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||    
T  19660955 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 19660879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Original strand, 20908909 - 20909168
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20908909 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcaacaacctcttatataatccaataatttgg 20909007  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20909008 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaaagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 20909106  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  20909107 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 20909168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Original strand, 29345877 - 29346136
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29345877 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 29345975  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29345976 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaacagcatcacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 29346074  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  29346075 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 29346136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Original strand, 32027290 - 32027549
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32027290 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 32027388  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32027389 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaacaacaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 32027487  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    |||| |||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  32027488 aaatccaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 32027549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 21293289 - 21292870
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 114  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||    
T  21293289 catcaagtccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagc 21293190  T
Q  115 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttgga 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| || | ||||||||||||||    
T  21293189 tccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaattcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttaaattagtccaataatttgga 21293091  T
Q  214 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 313  Q
    || |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||  |||||  |||||||||||||||||    
T  21293090 acatcatcatcttcaacatcttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaac--aaacagtatgacataataatatca 21292993  T
Q  314 a-atgc-aagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat-tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagct 410  Q
    | || | ||  || |||||||| |  |||||| | ||   ||||||||||| || | | | |||||||||||||||| || ||| | |||||| ||| ||    
T  21292992 atattcaaattcatcaacatcttaggtatacaattattcttcaagtaatgcataaacattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacaact 21292893  T
Q  411 tcacagattataattaacttcat 433  Q
    |||||||||||||||||| ||||    
T  21292892 tcacagattataattaacctcat 21292870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 113 - 321
Target Start/End: Original strand, 39245033 - 39245239
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39245033 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttagt-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 39245131  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39245132 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 39245230  T
Q  313 aaatgcaag 321  Q
    |||||||||    
T  39245231 aaatgcaag 39245239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Original strand, 29348350 - 29348609
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29348350 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 29348448  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29348449 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataagaacagcatcacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 29348547  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  29348548 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 29348609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 113 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 10775942 - 10775735
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10775942 gctccagggcatcaagcccccaacaatgtaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 10775843  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  10775842 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgacagcgacac-agcagtatataaaaccagcatgacataataatatc 10775744  T
Q  313 aaatgcaag 321  Q
    |||||||||    
T  10775743 aaatgcaag 10775735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 120 - 374
Target Start/End: Original strand, 29350830 - 29351082
Alignment:
Q  120 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29350830 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttca 29350928  T
Q  220 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 319  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29350929 tcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataagaacagcatcacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 29351027  T
Q  320 agacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    || ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  29351028 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 29351082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 142 - 374
Target Start/End: Original strand, 39363310 - 39363540
Alignment:
Q  142 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccg 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39363310 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaa-tcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccg 39363408  T
Q  242 actcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatata 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||     
T  39363409 actcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 39363507  T
Q  342 cattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  39363508 cacatataattcaagtaatgcatatacaattat 39363540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 362
Target Start/End: Original strand, 37723704 - 37724049
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 114  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| | || |||||| |||  ||||||||||||    
T  37723704 catcaagcccccatcgctattcgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattttgagcaaatgctccaacgtggtgagtacaaagc 37723803  T
Q  115 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctatta-tataatccaataatttgga 213  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| | || ||||||||||||||    
T  37723804 tccagggcatcaagcccccaactatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttaatttagtccaataatttgga 37723902  T
Q  214 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||   |||| |||||||| || |||||    
T  37723903 acttcaacatcttcaacatcttagactgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatac---aacagcatgacatgattatatc 37723999  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgc 362  Q
    ||||  ||  || |||||||||||  || ||||||| | |||||||||||    
T  37724000 aaattaaattcatcaacatctcaatcattcattcataattcaagtaatgc 37724049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 113 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 20918212 - 20918017
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  20918212 gctccagggcatcaagcccccaacactgaaatgctaatgcatga-ctcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaatagtttgg 20918115  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 311  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  20918114 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacaaaataatat 20918017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 120 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 36155039 - 36154789
Alignment:
Q  120 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 219  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  36155039 ggcatcaagccctcaactttaaaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaaactcttgtataatccaataatttggaacttca 36154940  T
Q  220 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 319  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36154939 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa---caacac-agcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 36154844  T
Q  320 agacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    || ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  36154843 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 36154789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 141 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 20902248 - 20902053
Alignment:
Q  141 aaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttca-tcaacttagac 239  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  20902248 aaatgctaatgtatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacaacctcttaaatagtccaataatttggaacttcatcatcttaattcaacttagac 20902149  T
Q  240 cgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaa 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  20902148 cgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaagtgcaagtcaacaacgtctcaa 20902053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 121 - 321
Target Start/End: Original strand, 23064415 - 23064614
Alignment:
Q  121 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 220  Q
    |||||||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||    
T  23064415 gcatcaagcccctatcgctgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaaccccat 23064514  T
Q  221 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 320  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  23064515 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacgacac-agtagtatacaaaaacagcatgacctaataatatcaaatgcaa 23064613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 121 - 321
Target Start/End: Original strand, 31060974 - 31061171
Alignment:
Q  121 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 220  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  31060974 gcatcaagctcccaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaac-tcttgtataatccaataatttggaacttcat 31061071  T
Q  221 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 320  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31061072 catcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaaaac-agtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 31061170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 123 - 321
Target Start/End: Original strand, 38619337 - 38619537
Alignment:
Q  123 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacc---tcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 219  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||    
T  38619337 atcaagcccctatcactgaaatgctaatgcatggactcgactaattcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatcaaataatttggaacctca 38619436  T
Q  220 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 319  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38619437 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacgacac-agtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 38619535  T
Q  320 ag 321  Q
    ||    
T  38619536 ag 38619537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 120 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 18319290 - 18319093
Alignment:
Q  120 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 219  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||      
T  18319290 ggcatcaagccctcaactttaaaatgataatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaattgacaaactcttgtataatccaataatttggaactt-- 18319193  T
Q  220 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 319  Q
     |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18319192 -catcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacac-agcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 18319095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 120 - 321
Target Start/End: Original strand, 24067013 - 24067210
Alignment:
Q  120 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 219  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||       
T  24067013 ggcatcaagccctcaactttaaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaattgacaaactcttgtataatccaataatttggaact--- 24067109  T
Q  220 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 319  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24067110 tcatcttaatcaacttagaccgaccaatgcagcttggttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 24067208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 121 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 20806998 - 20806845
Alignment:
Q  121 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 220  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||    
T  20806998 gcatcaagcccccaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgaattcttaaacatcttaaatcgacaac-tcttgtataatccaataatttggaaattcat 20806901  T
Q  221 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac 276  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  20806900 catcttaatcaacatagaccgactcatgcagcttaattaaataacaacagcgacac 20806845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 142 - 312
Target Start/End: Original strand, 36314504 - 36314675
Alignment:
Q  142 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagacc 240  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  36314504 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttatattaatccaataatttggaacatcatcatcttcaacatcttagacc 36314603  T
Q  241 gactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  36314604 gactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 36314675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 22 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22107926 - 22107709
Alignment:
Q  22 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 120  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||| |    
T  22107926 agcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagg 22107828  T
Q  121 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaacttca 219  Q
    ||||  ||||||||||||    ||| ||||||||  ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||    
T  22107827 gcat-gagcccccaacaaatgtatgttaatgcatagactcgacttcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatca 22107729  T
Q  220 tcatcttcatcaacttagac 239  Q
    | |||||||  |||||||||    
T  22107728 ttatcttcaaaaacttagac 22107709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 113 - 340
Target Start/End: Original strand, 21565445 - 21565668
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttg 211  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  | | || |||||| || |||| | ||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  21565445 gctccagggcgtcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggtcacaacatcttaa-caacttagaacgacaacctcttaaataagtccaataatttg 21565542  T
Q  212 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataata 310  Q
    |||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||||    
T  21565543 gaacatcatcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtat-ccaaatcatcatgatataacaata 21565638  T
Q  311 tcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 340  Q
    || |||||||| || |||||| ||||||||    
T  21565639 tcgaatgcaagtcatcaacatttcaaatat 21565668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 22 - 272
Target Start/End: Original strand, 26703882 - 26704129
Alignment:
Q  22 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaagg 121  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  26703882 agcccccatcgctatttgagtattaatatacctccagggcat-aagcccccatcgctatt-gagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccaggg 26703979  T
Q  122 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt---c 218  Q
    |||  ||||||||||||    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||   |||| |  | || |||| | |||||||||||| ||  ||   |    
T  26703980 cat-gagcccccaacaaatctatgctaatgcatggactcaatctcttaaacatc-acaatc-atcatctcttat-ttatccaataatttagaggttcaac 26704075  T
Q  219 atcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 272  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  26704076 atcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagca 26704129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 22 - 272
Target Start/End: Original strand, 26973615 - 26973862
Alignment:
Q  22 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaagg 121  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  26973615 agcccccatcgctatttgagtattaatatacctccagggcat-aagcccccatcgctatt-gagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccaggg 26973712  T
Q  122 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt---c 218  Q
    |||  ||||||||||||    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||   |||| |  | || |||| | |||||||||||| ||  ||   |    
T  26973713 cat-gagcccccaacaaatctatgctaatgcatggactcaatctcttaaacatc-acaatc-atcatctcttat-ttatccaataatttagaggttcaac 26973808  T
Q  219 atcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 272  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  26973809 atcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagca 26973862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 109 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 21329719 - 21329541
Alignment:
Q  109 caaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataa 207  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||  || || | ||||| |   ||||||| |||||||| | ||||||    
T  21329719 caaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaactcaacc-tcttaga---acaacctcttatataaattcaataa 21329625  T
Q  208 tttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaa 290  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||    
T  21329624 tttggaacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 21329541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 144 - 427
Target Start/End: Original strand, 40725782 - 40726069
Alignment:
Q  144 tgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccga 242  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||| | |||| ||||||    
T  40725782 tgctaatgcatggactcgacttcttaaacgtcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacatcaacatcttcaacgacttggaccga 40725881  T
Q  243 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatata 341  Q
    |||||||||||||||||  |||  | |||||||  | ||||||| | ||| || ||||| |||||||||||  | | |||  ||||||||||||||||      
T  40725882 ctcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgc-aaagcatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataat 40725980  T
Q  342 cattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 427  Q
    ||   || | ||||||||||| |||| |||  |||||||| |||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||| || |||||    
T  40725981 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagcttcacagatcatcattaa 40726069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 113 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 26012255 - 26012033
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatata-atccaataattt 210  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || | ||  ||||| | ||||| || | ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  26012255 gctccagggcatcaaacccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacc-tcttataaacaacaacctcttatatatatccaataattt 26012158  T
Q  211 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataat 309  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | ||||||| | ||| |||||||| |||| |||    
T  26012157 ggaacatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaagcaacatgatataacaat 26012061  T
Q  310 atcaaatgcaagacaacaacatctcaaa 337  Q
    ||||||||  |  |||||||||||||||    
T  26012060 atcaaatgtgaatcaacaacatctcaaa 26012033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 142 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 17517400 - 17517174
Alignment:
Q  142 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat------catcttcatcaactt 235  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||| ||||      |||||| ||||||||    
T  17517400 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacgacctcttaaatagtccaataatttgaaacatcattatcaacatcttaatcaactt 17517301  T
Q  236 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctca 335  Q
    |||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| || | ||||  ||||  |||| || ||||||| ||||||||  ||||  ||||||||||| |    
T  17517300 agactgactcatgcaacttagtttaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaatcgcaattcaacaacatctta 17517201  T
Q  336 aatatacattcatgactcaagtaatgc 362  Q
    ||||| || | ||  ||||||||||||    
T  17517200 aatattcaataatatctcaagtaatgc 17517174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 113 - 416
Target Start/End: Original strand, 22143951 - 22144254
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatata---atccaataatt 209  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| | |   | |||| |||| | | ||||||| |||||||   |||||||||||    
T  22143951 gctccagggcatcaagccctcaacaatgaa-tgctaatgcatggactcaaacaactcaacaacttagaacaacaacctcttatatatatatccaataatt 22144049  T
Q  210 tggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataa 308  Q
    ||||||   ||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | | ||||| | |||||||||||| |||| ||    
T  22144050 tggaac---atcttctt--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacatcaacataggtagtatgc-aaaacaacatgatataacaa 22144143  T
Q  309 tatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatctta-aa 405  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||| || |||  || | ||||||||||| |||| |||  ||||||||  ||| |||||||||  ||||||| ||    
T  22144144 tatcaattgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattgtaaacaacatcaattcatcttataa 22144243  T
Q  406 cagcttcacag 416  Q
    || ||||||||    
T  22144244 caacttcacag 22144254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 120 - 267
Target Start/End: Original strand, 19668805 - 19668951
Alignment:
Q  120 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttc 218  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || | || |||||| || |||| | | ||||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||    
T  19668805 ggcatcaagcccccaagaatgaa-tgctaatgcatggacacaacatcttaa-caacttagaacaacaacctcttaaataagtccaataatttggaacatc 19668902  T
Q  219 atcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 267  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  19668903 atcatcatcatcaacttagaccgactcttgcagctcagttaaataacaa 19668951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 280 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 20766174 - 20766035
Alignment:
Q  280 cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattatcacat 379  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||        || ||  ||||    
T  20766174 cagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat--------aagtacgacat 20766084  T
Q  380 cataatcaacatcaaaacat-cttaaacagcttcacagattataattaa 427  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  20766083 cataatcaacatcaacacatcctaaaacagcttcacagattatcattaa 20766035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 120 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 22959741 - 22959576
Alignment:
Q  120 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | || |||||| || |||| | | ||| | | ||||| | |||||||||||||||| |||    
T  22959741 ggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacatcttaa-caacttagaacaacatcatcttata-agtccaataatttggaacatca 22959645  T
Q  220 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaa 290  Q
    |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||    
T  22959644 tcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 22959576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 113 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 20027158 - 20026942
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataa-tccaataattt 210  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||  || || | ||||| || | || |||| |||||||| |||||||||||    
T  20027158 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcaacaactcaacc-tcttataaacaacgacctcttatataaatccaataattt 20027061  T
Q  211 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaa-acaacatgacataataa 308  Q
    | |||   ||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |   ||||| |||||||    
T  20027060 gaaac---atcttctt--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatccaaaacagttcatgatataataa 20026966  T
Q  309 tatcaaatgcaagacaacaacatc 332  Q
    ||||||||||||  ||||||||||    
T  20026965 tatcaaatgcaattcaacaacatc 20026942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 184 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 21502308 - 21502205
Alignment:
Q  184 acaacctattatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagca 281  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | |||    
T  21502308 acaacctcttatataaattcaataatttggaacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggca 21502209  T
Q  282 gtat 285  Q
    ||||    
T  21502208 gtat 21502205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 171
Target Start/End: Original strand, 23201164 - 23201312
Alignment:
Q  22 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 120  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  23201164 agcccccatcgttatttaagtattaatatacttccagtgcat-aagcccccatcgctaatttgagctaatgctccatcgtgttgagtacaaagctccagg 23201262  T
Q  121 gcatcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa 171  Q
    ||||  ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  23201263 gcat-gagcccccaacatatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaa 23201312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 171
Target Start/End: Original strand, 21873073 - 21873206
Alignment:
Q  37 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaa 135  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||| |||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||  |||||||||    
T  21873073 ttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccattgctaatttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggcat-gagcccccaa 21873170  T
Q  136 ca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa 171  Q
    || |||  ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  21873171 catatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaa 21873206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 23501622 - 23501402
Alignment:
Q  68 cccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctc 166  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||    ||||||||||||| |||||| |||    
T  23501622 cccccatcgctattttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggcatga-gcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatctc 23501524  T
Q  167 ttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt---catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaata 263  Q
    ||||||||| ||||   |  | ||  ||| | |||||||| ||||||| ||   ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||| ||||||||    
T  23501523 ttaaacatcataaa--catcatctcgtat-ttatccaatattttggaagttcaacatcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaata 23501427  T
Q  264 acaacagcaacacaagcagtataca 288  Q
    |||| |||| |||| |||| |||||    
T  23501426 acaatagcagcacaggcagaataca 23501402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 171
Target Start/End: Original strand, 23571893 - 23572029
Alignment:
Q  34 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccc 132  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||| | |||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  23571893 tatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaatttaagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccc 23571990  T
Q  133 caacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa 171  Q
     |||||    ||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  23571991 aaacaaatgtatgctaatgcatggactcaatctcttaaa 23572029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 37 - 179
Target Start/End: Original strand, 14078969 - 14079111
Alignment:
Q  37 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaa 135  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||| | |||||  |||||||||    
T  14078969 ttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgttaatttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctctagggcat-gagcccccaa 14079066  T
Q  136 ca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 179  Q
    || |||  ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  14079067 cacatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatcttaa 14079111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 372 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 22107334 - 22107278
Alignment:
Q  372 tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaac 428  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22107334 tatcacatcataatcaacaacaacacaccttaaacagcttcacagattataattaac 22107278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 318 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 21986164 - 21986046
Alignment:
Q  318 caagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaatt--atcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcaca 415  Q
    |||| |||||||||||  | |||| ||||||  |||||||||||| ||||| |||  ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  21986164 caagtcaacaacatcttcattataaattcatatctcaagtaatgcatataacattttatcacctcatattcaacatcaacacatcttaaacaacttcaca 21986065  T
Q  416 gattataattaacttcatc 434  Q
     |||||| ||||| |||||    
T  21986064 aattatagttaacatcatc 21986046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 427
Target Start/End: Original strand, 18418594 - 18418793
Alignment:
Q  228 atcaacttagaccgactcatgcagcttagtt-aaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaac 326  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||  |||||  | ||    
T  18418594 atcaacttagactgactcgtgcaacttagttaaaataacaacatcaacataggcagtatac--aaacagcatgacataataatatcatttgcaattc-ac 18418690  T
Q  327 aacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatctt-aaacagcttcacagattataa 423  Q
    |||||||  ||||| || | |    ||||||||||   | || ||  |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18418691 aacatct-taatattcaataaaacttcaagtaatgtacacaacattatatcacatcataatcaatgtcaaaacatcttaaaacagcttcacaggttataa 18418789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Original strand, 23064330 - 23064396
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  23064330 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctatttga 23064396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Original strand, 36314353 - 36314420
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  36314353 catcaagcccctatcgctatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaatcgctatttga 36314420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 120 - 178
Target Start/End: Original strand, 14047988 - 14048046
Alignment:
Q  120 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta 178  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14047988 ggcatcaagccctcaactttaaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta 14048046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 26740789 - 26740705
Alignment:
Q  187 acctattatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 275  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||   | ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  26740789 acctcttatataactccaataatttggaac---aacatctt--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaaca 26740705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 18770304 - 18770179
Alignment:
Q  34 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccc 132  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||| ||||| || |||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  18770304 tattttagtattaatatactttcagggcatgag-cccccatcgttattttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccc 18770207  T
Q  133 caacaatgaaatgctaatgcatgaactc 160  Q
    ||||||    ||||||||||||| ||||    
T  18770206 caacaaatgtatgctaatgcatggactc 18770179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Original strand, 40725673 - 40725740
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||    
T  40725673 catcaagcccctatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgctatttga 40725740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 41095918 - 41095852
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  41095918 catcaagcccctatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctatttga 41095852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 41095961 - 41095895
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  41095961 catcaagcccctatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctatttga 41095895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 27989061 - 27989004
Alignment:
Q  198 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaa 260  Q
    |||||||||||||||||| |||||||     ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27989061 aatccaataatttggaacatcatcat-----tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaa 27989004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 83
Target Start/End: Original strand, 40725717 - 40725783
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttg 83  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| |||||||||||    
T  40725717 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgctatttg 40725783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 142 - 179
Target Start/End: Original strand, 18418528 - 18418565
Alignment:
Q  142 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaa 179  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18418528 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaa 18418565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 230 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 26732937 - 26732892
Alignment:
Q  230 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 275  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  26732937 caacatagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaaca 26732892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 82
Target Start/End: Original strand, 31060889 - 31060953
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt 82  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  31060889 catcaagcccctatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctattt 31060953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 275
Target Start/End: Original strand, 22032139 - 22032380
Alignment:
Q  34 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccc 132  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||| ||||| || |||| |||||||| |  |||||||||||||||| |||||  |||||     
T  22032139 tattttagtattaatatactttcagggcatgag-cccccatcgttattttgagctaatgctccatcatggtgagtacaaagctccagggcat-gagccct 22032236  T
Q  133 caacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt---catcatcttca 228  Q
    ||||||    ||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||| |||| |  | ||  ||||| |||||||||||||||  ||   ||||||||| |    
T  22032237 caacaaatgtatgctaatgcatggactcaatctcttaaaacatctt-aatc-atcatctcatatat-atccaataatttggaggttcaacatcatcttaa 22032333  T
Q  229 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 275  Q
    ||| |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||    
T  22032334 tcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcaaca 22032380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 124
Target Start/End: Original strand, 23511919 - 23512006
Alignment:
Q  37 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcat 124  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||  || ||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||    
T  23511919 ttgaatattaatatacttccagggcat-aagcccccatctttaatttgagctaaagctccatcgtggtgagtactaagctccagggcat 23512006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 41095747 - 41095692
Alignment:
Q  121 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctt 177  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  41095747 gcatcaagcctccaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaaacatctt 41095692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Original strand, 18418421 - 18418488
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||    
T  18418421 catcaagctccaatcgctatttgagtattattatacttccatagcatcaagccccaatcgctatttga 18418488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Original strand, 31060846 - 31060912
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  31060846 catcaaacccctatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctatttga 31060912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 33896035 - 33895953
Alignment:
Q  68 cccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatg 151  Q
    |||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||   |||  ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  33896035 cccccatcactatt-gagctaaagcttcatcgtgttgagtacaaagctccggagcagtaagcccccaactatgaaatgcaaatg 33895953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Original strand, 40725630 - 40725696
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  40725630 catcaagccccaatcgctatttaagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctatttga 40725696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 41095875 - 41095809
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| | | |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  41095875 catcaagcccctatcgctatttgagtatcattatact-ccagagcatcaaacccctatcgctatttga 41095809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 18418465 - 18418526
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 78  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  18418465 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgct 18418526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 20807083 - 20807019
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt 82  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| || | ||||||||||    
T  20807083 catcaagcccctatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagccactatcgctattt 20807019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 21366907 - 21366839
Alignment:
Q  91 gctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactc 160  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    ||||||||||||| ||||    
T  21366907 gctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-aagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactc 21366839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 241 - 314
Target Start/End: Original strand, 21873277 - 21873350
Alignment:
Q  241 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 314  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| || | |||| |||||| | || |||||| | ||||||||||    
T  21873277 gactcatgcaacttagttaaataacaaaagcagcataggcaggatacaacatcagcatgacttcataatatcaa 21873350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 23064373 - 23064433
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 78  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||    
T  23064373 catcaagcccctatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgct 23064433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 39363247 - 39363308
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 78  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  39363247 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgct 39363308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 53
Target Start/End: Original strand, 38619293 - 38619329
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttact 53  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  38619293 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatact 38619329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 86)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 17 - 434
Target Start/End: Original strand, 34509583 - 34510002
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  34509583 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaaggacccatcgctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaatgctc 34509682  T
Q  117 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 216  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34509683 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaact 34509782  T
Q  217 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  34509783 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataatgatatcaaat 34509882  T
Q  317 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 414  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||| ||||| ||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||     
T  34509883 gcaagtcaacaacatcttaattatacattcatatctcaagtaatgcttataacattatatcacatcatattcaacatcaacacatcttaaacagcttcaa 34509982  T
Q  415 agattataattaacttcatc 434  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  34509983 agattataattaacatcatc 34510002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 17 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 50210536 - 50210112
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttcc-agggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 115  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  50210536 catcaaacccccatcgctatttgagtattaatatactttcgagggcatcaaacccccatcgctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaatgct 50210437  T
Q  116 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaa- 214  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  50210436 ccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaa 50210337  T
Q  215 ---cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 311  Q
       | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50210336 catcatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 50210237  T
Q  312 caaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagc 409  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50210236 caaatgcaagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagc 50210137  T
Q  410 ttcacagattataattaacttcatc 434  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  50210136 ttcacagattataattaacatcatc 50210112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 17 - 434
Target Start/End: Original strand, 22532072 - 22532491
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    ||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  22532072 catcaagtccccatcggtatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcggtaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctc 22532171  T
Q  117 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 216  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  22532172 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaca 22532271  T
Q  217 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 316  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |    
T  22532272 tcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaatttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatccatt 22532371  T
Q  317 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 414  Q
    ||||  ||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22532372 gcaattcaacaacatcttaaatattcattcataattcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 22532471  T
Q  415 agattataattaacttcatc 434  Q
    || | |||| |||| |||||    
T  22532472 agttcataaataacatcatc 22532491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 17 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 27251048 - 27250634
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 115  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||  ||  |||||||||||||    
T  27251048 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttctaggacatcaagcccccatcgctaatttgagctaaagctccaatgtggtgagtacaaagct 27250949  T
Q  116 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaa 214  Q
    ||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | |||||||||||||||    
T  27250948 ccagggcatcaagcccctatcaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaatctcttatattagtccaataatttggaa 27250850  T
Q  215 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 314  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27250849 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 27250750  T
Q  315 atgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttc 412  Q
     |||||  || |||||||| |||||| ||   || | ||||||||||| || || ||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  27250749 ttgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttc 27250650  T
Q  413 acagattataattaac 428  Q
    ||||||||||||||||    
T  27250649 acagattataattaac 27250634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 17 - 428
Target Start/End: Original strand, 20134984 - 20135403
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  20134984 catcaagtccccatcgctatttgagtattaatatacttacagggcatcaagcccccatcgctaaatgatctaaagctccaacgtgttgagtataaagctc 20135083  T
Q  117 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 216  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||     
T  20135084 cagggcatcaagcccccaactatgaaatgctgatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatatagtccaataatttggaaca 20135183  T
Q  217 tcat------catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataata 310  Q
    ||||      |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||| || | ||||  ||||| |||| |||||||||||||||    
T  20135184 tcatcatcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaacaacaatagcagcataggcagattacaacaacatcatgacataataata 20135283  T
Q  311 tcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacag 408  Q
    |||  |||||  ||||||||||| || ||| || | |    ||||||||||| || || ||  ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  20135284 tcatgtgcaattcaacaacatcttaagtattcaataaaacttcaagtaatgcatacaacattatatcatatcataatgaacatcaacacatcttaaacag 20135383  T
Q  409 cttcacagattataattaac 428  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  20135384 cttcacagattataattaac 20135403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 113 - 335
Target Start/End: Original strand, 31612209 - 31612430
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  31612209 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaaactcttatataatccaataatttgg 31612308  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31612309 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-tagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 31612407  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctca 335  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  31612408 aaatgcaagtcaacaacatctca 31612430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Original strand, 13988763 - 13989022
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13988763 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 13988861  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13988862 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 13988960  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  13988961 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 13989022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 21923556 - 21923297
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21923556 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 21923458  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21923457 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 21923359  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  21923358 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 21923297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 23594000 - 23593741
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23594000 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 23593902  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23593901 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 23593803  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  23593802 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattat 23593741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 21475352 - 21475093
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21475352 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 21475254  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21475253 aacttcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 21475155  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  21475154 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 21475093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 31 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 20847459 - 20847173
Alignment:
Q  31 cgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagc 129  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  20847459 cgctatttaagtattaatatacttccagggcatcaagccccaatcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagc 20847360  T
Q  130 ccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttca 228  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20847359 ccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttca 20847261  T
Q  229 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 316  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||    
T  20847260 acaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtacacaaaatcagcatgacataaatatatcaaat 20847173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Original strand, 29298034 - 29298292
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  29298034 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttga 29298132  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  29298133 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatga-ataataatatc 29298230  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  29298231 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 29298292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 121 - 374
Target Start/End: Original strand, 29776592 - 29776844
Alignment:
Q  121 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 220  Q
    |||||||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29776592 gcatcaagccccaatcgctgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcat 29776691  T
Q  221 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 320  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29776692 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaataacatgacataataatatcaaatgcaa 29776790  T
Q  321 gacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    | ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  29776791 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 29776844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 113 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 22123333 - 22123119
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22123333 gctccagggcatcaagcccccaacaacgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 22123235  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 311  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  22123234 aacttcatcatcttaatctacttagaccgactcatgcagcttagttaaatagcaaacagcaacacaa-cagtatacaaaaatagcatgacataataatat 22123136  T
Q  312 caaatgcaagacaacaa 328  Q
    |||||||||| ||||||    
T  22123135 caaatgcaagtcaacaa 22123119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 38801707 - 38801297
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||  ||| |||||| |||  ||||||||||||    
T  38801707 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattttgagttaatgctccaacgtggtgagtacaaagc 38801608  T
Q  115 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttgga 213  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  38801607 tccagggcatcaagcccccaactatg-aatgcttatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttgga 38801509  T
Q  214 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    || |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| | |   |||| || |||||||| |||||    
T  38801508 acatcatcatcttcaacatcttaga-cgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtgtgc---aacagcaagacataattatatc 38801413  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat--cacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagct 410  Q
    |||| |||  || |||||| | | ||||||| | ||   ||||||||||| || || |||||  |||||| ||||||||| ||| | ||||||  |||||    
T  38801412 aaattcaattcatcaacatattatatatacaattattcttcaagtaatgcata-aacattataacacatcgtaatcaacaacaacatatcttattcagct 38801314  T
Q  411 tcacagattataattaa 427  Q
    ||||| |||||| ||||    
T  38801313 tcacaaattatagttaa 38801297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 115 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 45575108 - 45574886
Alignment:
Q  115 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa-catcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttgg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  45575108 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaaacatcttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttgg 45575010  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    ||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |    
T  45575009 aacatcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatacc 45574910  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaa 336  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||    
T  45574909 aaatgcaagtcaacaacgtctcaa 45574886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 22 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 22469014 - 22468604
Alignment:
Q  22 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 120  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |    
T  22469014 agcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtgttgggtactaagctccagg 22468916  T
Q  121 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaac---tt 217  Q
    |||| | |||||||||||  | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    |||||||  |||||| ||||| ||||||||||   ||    
T  22468915 gcatga-gcccccaacaaatatatgctaatgcatggactcgatctcttaaacatcttaatcaaacaacctcgtatatagtccaaaaatttggaacatctt 22468817  T
Q  218 catca---tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 314  Q
    |||||   |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||  ||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  22468816 catcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcaacataggcagattacaacaacagcatgacatcataatatcaa 22468717  T
Q  315 atgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttc 412  Q
     |||||  ||||||||||| || ||| || | ||  ||||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||    
T  22468716 ttgcaattcaacaacatcttaattattcaataatatctcaagtaatgcacataacattatatcacatcataat-tacatcagcacatcttaaacagcttc 22468618  T
Q  413 acagattataatta 426  Q
    ||||||||||||||    
T  22468617 acagattataatta 22468604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 157 - 427
Target Start/End: Original strand, 432952 - 433222
Alignment:
Q  157 actcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttag 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  432952 actcgacctcttaaacatcttaaattgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttag 433051  T
Q  257 ttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaag 356  Q
    ||||||   ||| |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||   || | |||||    
T  433052 ttaaat---aacggcaacacaggcagtatacaaaaacatcaagacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatataattcaag 433148  T
Q  357 taatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 427  Q
    |||||| |||| |||  |||||||  |||| |||||||||| |||| |||| |||||| |||||| || |||||    
T  433149 taatgcatatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatcatcataaatcagctttacagatcatcattaa 433222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 141 - 321
Target Start/End: Original strand, 21346885 - 21347064
Alignment:
Q  141 aaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagacc 240  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21346885 aaatgctaatgcatggactcgaattcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagacc 21346984  T
Q  241 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaag 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21346985 gactcatgcagcttagttaaataacaacaaagacac-agcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaag 21347064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 120 - 336
Target Start/End: Original strand, 21711612 - 21711827
Alignment:
Q  120 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 219  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  21711612 ggcatcaagccctcaactttaaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacattctaaatcgacaaactcttgtataatccaataatttggaacttca 21711711  T
Q  220 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 319  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  21711712 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacaa-tagtatacaaaaaaagcatgacagaataatatcaaatgca 21711810  T
Q  320 agacaacaacatctcaa 336  Q
    || ||||||| ||||||    
T  21711811 agtcaacaacgtctcaa 21711827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 121 - 336
Target Start/End: Original strand, 21707071 - 21707285
Alignment:
Q  121 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 220  Q
    ||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  21707071 gcatcaagccctcaactttaaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacattctaaatcgacaaactcttgtataatccaataatttggaacttcat 21707170  T
Q  221 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 320  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||    
T  21707171 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacaa-tagtatacaaaaaaagcatgacagaataatatcaaatgcaa 21707269  T
Q  321 gacaacaacatctcaa 336  Q
    | ||||||| ||||||    
T  21707270 gtcaacaacgtctcaa 21707285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 141 - 321
Target Start/End: Original strand, 21342021 - 21342199
Alignment:
Q  141 aaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagacc 240  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  21342021 aaatgctaatgcatggactcgaattcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg-acttcatcatcttaatcaacttagacc 21342119  T
Q  241 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaag 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21342120 gactcatgcagcttagttaaataacaacaaagacac-agcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaag 21342199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 142 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 13213099 - 13212921
Alignment:
Q  142 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccg 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  13213099 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacatcatcatcttaatcaacttagaccg 13213000  T
Q  242 actcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaag 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13212999 actcatgcagcttagttaaataacaacagcgacgcaa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaag 13212921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 142 - 336
Target Start/End: Original strand, 21840686 - 21840885
Alignment:
Q  142 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt------catcatcttcatcaactt 235  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |      || |||||| ||||||||    
T  21840686 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacaaccttttaaatagtccaataatttggaacattgttatcaacatcttaatcaactt 21840785  T
Q  236 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  21840786 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agcagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctca 21840884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 141 - 374
Target Start/End: Original strand, 16361835 - 16362073
Alignment:
Q  141 aaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatc------ttcatcaact 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||      || |||||||    
T  16361835 aaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacatcatcatcaacatcttaatcaact 16361934  T
Q  235 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctc 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  16361935 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacgacagcaacacaa-cagtatataaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctc 16362033  T
Q  335 aaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    || ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  16362034 aattattcacaaataattcaagtaatgcatatataattat 16362073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Original strand, 21477445 - 21477656
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  21477445 catcaagcccctatcgctatttgagtattattatact-ccagggcatcaagcccctatcgctaattgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagctc 21477543  T
Q  117 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattat-ataatccaataatttggaac 215  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  21477544 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaac 21477643  T
Q  216 ttcatcatcttca 228  Q
     ||| ||| ||||    
T  21477644 atcaacattttca 21477656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 125 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 16275616 - 16275423
Alignment:
Q  125 caagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatc 224  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16275616 caagcccccaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacagc-tcttgtataatccaataatttagaacttcatcatc 16275519  T
Q  225 ttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaag 321  Q
    || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  16275518 ttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaacaacgaca-tagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaag 16275423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 200 - 428
Target Start/End: Original strand, 21026666 - 21026896
Alignment:
Q  200 tccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatg 299  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| || ||||    
T  21026666 tccaataatttggaacatcatcatcgtcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaatataggcagtatacaaaatcagcatg 21026765  T
Q  300 acataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaac 397  Q
    || |||  ||||||| |||||  ||||||||||| |||||| ||   |   |||||||||||| || || ||  ||||||||||||||||||| ||| ||    
T  21026766 acgtaaatatatcaattgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacagcaacac 21026865  T
Q  398 atcttaaacagcttcacagattataattaac 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21026866 atcttaaacagcttcacagattataattaac 21026896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 120 - 321
Target Start/End: Original strand, 40389060 - 40389257
Alignment:
Q  120 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 219  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||       
T  40389060 ggcatcaagccctcaactttaaaatgctaatgcatggactcgacctctttaacatcttaaattgacaaactcttgtataatccaataatttggaact--- 40389156  T
Q  220 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 319  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40389157 tcatcttaatcaacctagactgactcatgcaacttggttaaataacaacagcgacac-atcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 40389255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 272
Target Start/End: Original strand, 21714352 - 21714600
Alignment:
Q  22 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaagg 121  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  21714352 agcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccaggg 21714450  T
Q  122 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt---c 218  Q
    |||  ||||||||||||    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||   |||| |  | || |||| | |||||||||||||||  ||   |    
T  21714451 cat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatctcttaaacatc-acaatc-atcatctcttat-ttatccaataatttggaggttcaac 21714546  T
Q  219 atcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 272  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  21714547 atcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagca 21714600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 192 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 15860195 - 15860068
Alignment:
Q  192 ttatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaa 291  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  15860195 ttatataatccaataatttgga-cttcatcatcttaatcaacttggaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacac-agcagtatacaaaa 15860098  T
Q  292 acaacatgacataataatatcaaatgcaag 321  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15860097 acaacatgacataataatattaaatgcaag 15860068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 120 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 27161721 - 27161605
Alignment:
Q  120 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27161721 ggcatccagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactagacctcttaaacatcttaaatcgacaaactcttatataatccaataatttggaacttca 27161622  T
Q  220 tcatcttcatcaactta 236  Q
    |||||  ||||||||||    
T  27161621 tcatcaacatcaactta 27161605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 142 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 14295745 - 14295569
Alignment:
Q  142 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagacc 240  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||    
T  14295745 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttatattaatccaataatttggaacatcatcatcttcaacattttagacc 14295646  T
Q  241 gactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| | ||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  14295645 gactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcgaatg 14295569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 113 - 340
Target Start/End: Original strand, 33680910 - 33681133
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttg 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | || |||||| || |||| | | || |||| |||||||| ||||||||||||    
T  33680910 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacatcttaacca-cttagaacaaccacctcttatataagtccaataatttg 33681007  T
Q  212 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataata 310  Q
    |||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||||    
T  33681008 gaacatcatcatcttca---acttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaata 33681103  T
Q  311 tcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 340  Q
    || |||||||| |  |||||||||||||||    
T  33681104 tcgaatgcaagtcgtcaacatctcaaatat 33681133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 37 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22131380 - 22131180
Alignment:
Q  37 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaa 135  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  22131380 ttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaa 22131283  T
Q  136 caatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaact 234  Q
    |||    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||| |  | || ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  22131282 caaatgtatgctaatgcatggactcgatctcttaaacatcat-aatc-atcatctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacaact 22131185  T
Q  235 tagac 239  Q
    |||||    
T  22131184 tagac 22131180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 142 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 20454752 - 20454613
Alignment:
Q  142 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatc------ttcatcaactt 235  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || |||| ||| ||| |||||||||||||||| | ||||||      || ||||||||    
T  20454752 aatgttaatgcatggactcgacatcttaaacatcttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacattatcatcaacatcttaatcaactt 20454653  T
Q  236 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20454652 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 20454613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 37 - 239
Target Start/End: Original strand, 48603088 - 48603288
Alignment:
Q  37 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaa 135  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  48603088 ttgagtattaatatacttccagggcat-aagcctccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaa 48603185  T
Q  136 caatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaact 234  Q
    |||    ||||||||||||| |||| | |||||||||||| | |||| |  | || ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  48603186 caaatgtatgctaatgcatggactcaatctcttaaacatcat-aatc-atcatctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacaact 48603283  T
Q  235 tagac 239  Q
    |||||    
T  48603284 tagac 48603288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 113 - 340
Target Start/End: Original strand, 22237530 - 22237753
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttg 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || | ||  ||||| || |||| | | ||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  22237530 gctccagggcatcaagcccccaacgatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-caacttagaacaacaacctcttatacaagtccaataatttg 22237627  T
Q  212 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataata 310  Q
     ||| ||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| | ||| ||| | ||| || ||||| |||| ||||    
T  22237628 aaacatcatcatcttca---acttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaaacagcgacataggcattatgc-aaatcatcatgatataacaata 22237723  T
Q  311 tcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 340  Q
    || |||||||| || |||||||||||||||    
T  22237724 tcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 22237753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 42865526 - 42865273
Alignment:
Q  22 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 120  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  42865526 agcccccatcactatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcctccatcgctagtttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagg 42865428  T
Q  121 gcatcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt- 217  Q
    ||||  ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| |  | || |||| | |||||||||||||||  ||     
T  42865427 gcat-gagcccccaacatatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatctt-aatc-atcatctcttatgt-atccaataatttggaggttc 42865333  T
Q  218 --catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 275  Q
      ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  42865332 aacatcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacatagttaaataacaatagcaaca 42865273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 58 - 173
Target Start/End: Original strand, 20916070 - 20916185
Alignment:
Q  58 gggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatga 156  Q
    ||||||||| |||| ||||||| ||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  20916070 gggcatcaagccccaatcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatgg 20916168  T
Q  157 actcgacctcttaaaca 173  Q
    |||| ||||||||||||    
T  20916169 actcaacctcttaaaca 20916185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 113 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 35261295 - 35260992
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataa-tccaataattt 210  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||   ||||||| |||| ||  ||||| ||||||| || | || |||| |||||||| |||||||||||    
T  35261295 gctccagggcatcaagcctccaacaatgaa-tgagtatgcatggactcaacaacttaa-catcttagaaacaacgacctcttatataaatccaataattt 35261198  T
Q  211 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataat 309  Q
    ||||| | ||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | ||||||| | |||||| ||||| |||| |||    
T  35261197 ggaacataat--tcttcat---cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaacagcatgatataacaat 35261104  T
Q  310 atcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaatt--atcacatcataatcaacatcaaaacatctta-aac 406  Q
    |||||||||||   | |||||||||||| || ||| ||| | ||||||||||| |||| ||||  ||||||| || | |||||||||| ||||||| |||    
T  35261103 atcaaatgcaa---atcaacatctcaaacattcatacataattcaagtaatgcatatacaattacatcacattattaacaacatcaaatcatcttataac 35261007  T
Q  407 agcttcacagattat 421  Q
    | ||||||| |||||    
T  35261006 aacttcacatattat 35260992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 120 - 336
Target Start/End: Original strand, 21753957 - 21754166
Alignment:
Q  120 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 219  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || | || |||||| || |||| | | ||| | | ||||| | ||||||||||||||||  ||    
T  21753957 ggcatcaagcccccaacaatgga-tgctaatgcatggacacaacatcttaa-caacttagaacaacatcatcttata-agtccaataatttggaacaaca 21754053  T
Q  220 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgc 318  Q
    |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||||||||    
T  21754054 tcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaaatgc 21754149  T
Q  319 aagacaacaacatctcaa 336  Q
    ||  ||||||||||||||    
T  21754150 aa-tcaacaacatctcaa 21754166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 200 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 22922001 - 22921864
Alignment:
Q  200 tccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacat 298  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || |||    
T  22922001 tccaataatttggaacatcatcatcatcatc---ttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcat 22921906  T
Q  299 gacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 340  Q
    || |||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  22921905 gatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 22921864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 291 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 22354616 - 22354477
Alignment:
Q  291 aacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat--cacatcataatcaa 388  Q
    |||| |||||||||| |||||||| |||||  || |||||||| |||||| ||   ||   ||||||||||  ||||| |||||  ||||||||||||||    
T  22354616 aacagcatgacataaaaatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaa 22354517  T
Q  389 catcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaac 428  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22354516 catcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaac 22354477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 113 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 21896473 - 21896194
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataa-tccaataattt 210  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||  || || ||||||| || | |   ||| |||||||| |||||||||||    
T  21896473 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgcgaatgcatggactcaacaactcaa-catcttagaaacaatggcctcttatataaatccaataattt 21896376  T
Q  211 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataat 309  Q
    ||||| || ||  ||||||   |||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||| | ||||||||| |||||| ||||| |||| |||    
T  21896375 ggaacatcttc--cttcat---cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgatataacaat 21896282  T
Q  310 atcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaa 395  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| || |||  || | ||| ||||||  |||| |||  |||||||| |||| ||||||||||    
T  21896281 atcaaatgcaagtcatcaacatctcaaacattcatatataattcatgtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaa 21896194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 198 - 427
Target Start/End: Original strand, 16758638 - 16758866
Alignment:
Q  198 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaa-aacaa 295  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||  |       
T  16758638 aatccaataatttggaac---atcatctt--tcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccagtt 16758732  T
Q  296 catgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatca 393  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||| | || || |||  || | ||||||||||| |||| |||  |||||||| |||| ||||| ||    
T  16758733 catgatataacaatatcaaatacaatacaacaacatcac-aacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacaaca 16758831  T
Q  394 aaacatctta-aacagcttcacagattataattaa 427  Q
    || ||| ||| ||||||||||||||| || |||||    
T  16758832 aatcatattataacagcttcacagatcatcattaa 16758866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 120 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 52928181 - 52928038
Alignment:
Q  120 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttc 218  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||| || | ||  ||||| || |||| | | ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||    
T  52928181 ggcaccaagcccccaacaatgaa-tgttaatgcatggacacaacaacttaa-caacttagaacaacaacctcttatataagtccaataatttggaacatc 52928084  T
Q  219 atcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 267  Q
    | ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52928083 accatcttca---acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 52928038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 372 - 431
Target Start/End: Original strand, 48603674 - 48603733
Alignment:
Q  372 tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttc 431  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48603674 tatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacttc 48603733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 80 - 275
Target Start/End: Original strand, 21161588 - 21161778
Alignment:
Q  80 tttgacctaaagctcca-tcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta 178  Q
    ||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||   |||  |||||||||||||    ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  21161588 tttgagctaaagctccaatcgtggtgagtacaaagctccggagcagtaagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggacttgacatcttaaacatctta 21161687  T
Q  179 aatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 275  Q
    ||    |||| |  || ||| |||||||||||||||| ||||||||   |||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  21161688 aa----caacttcgtaaatagtccaataatttggaacatcatcatc---atcaacttggatcgactcatgcaacttagttaaacaacaaacagcaaca 21161778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 198 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 21861702 - 21861510
Alignment:
Q  198 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaac 296  Q
    ||||||||||||||||||   ||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |    
T  21861702 aatccaataatttggaac---atcttctt--tcatcttagaccgactcatgcagcttagctaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-cagc 21861609  T
Q  297 atgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatca 393  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||| || |||  || | ||||||||||  |||| |||  |||||||| |||| ||||||||    
T  21861608 atgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatca 21861510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 329
Target Start/End: Original strand, 20248184 - 20248394
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || | || |||||| || |||| | |  || | | ||||| | |||||||||||||    
T  20248184 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgttaatgcatggacacaacatcttaa-caacttagaacatcatcatcttata-agtccaataatttgg 20248280  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 311  Q
    ||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||    
T  20248281 aacatcatcatc---atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaaaaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatat 20248376  T
Q  312 caaatgcaagacaacaac 329  Q
    | |||||||  |||||||    
T  20248377 cgaatgcaaatcaacaac 20248394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 13213206 - 13213139
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  13213206 catcaagcccccatcgctatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaatcgctatttga 13213139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Original strand, 16361729 - 16361796
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  16361729 catcaagcccccatcgctatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaatcgctatttga 16361796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 80 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 20091730 - 20091636
Alignment:
Q  80 tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatc 175  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  20091730 tttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatc 20091636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 21788356 - 21788208
Alignment:
Q  22 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 120  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| || ||||| |||| ||||||||||  ||||||| |||||||| |    
T  21788356 agcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgttattttgagctaatgctccatcgtggtgagtactaagctccagg 21788258  T
Q  121 gcatcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa 171  Q
    | ||  ||||||||||| |||  ||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  21788257 gtat-gagcccccaacatatg-tatgctaatgcatagactcgatctcttaaa 21788208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 372 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 22356136 - 22356073
Alignment:
Q  372 tatcacatcataatcaa-catcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcatc 434  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  22356136 tatcacatcataatcaatcatcaacacatcttaaatagcttcacagattataattaacatcatc 22356073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 372 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 22357822 - 22357759
Alignment:
Q  372 tatcacatcataatcaa-catcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcatc 434  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  22357822 tatcacatcataatcaatcatcaacacatcttaaatagcttcacagattataattaacatcatc 22357759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Original strand, 29776461 - 29776528
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  29776461 catcaagcccccatcgctatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaatcgctatttga 29776528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 198 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 41050168 - 41050033
Alignment:
Q  198 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaa-acaa 295  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||| | |||||||| |||| |       
T  41050168 aatccaataatttggaacatcatc--cttcatc---ttagaccgactcatgcagcttagttactaaacgaacagcaacataggcagtatataaaatagtt 41050074  T
Q  296 catgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaa 336  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  41050073 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaa 41050033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 83
Target Start/End: Original strand, 21840449 - 21840514
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttg 83  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  21840449 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaaacccctatcgctatttg 21840514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 113 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 16368502 - 16368284
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttg 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||   ||||||| |||| ||  ||||  ||||||| | |  | |||| |||||||| ||||||||||||    
T  16368502 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgagtatgcatggactcaacaacttag-catcttagaacatcgacctcttatataaatccaataatttg 16368405  T
Q  212 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaa--catgacataataa 308  Q
    |||| |||||||     ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | |||| |||  |||||||  ||||| |||| ||    
T  16368404 gaacatcatcat-----tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcata-taaaacaattcatgatataacaa 16368311  T
Q  309 tatcaaatgcaagacaacaacatctcaa 336  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||||    
T  16368310 tatc-aatgcaaatcaacaacatctcaa 16368284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 230 - 317
Target Start/End: Original strand, 20918620 - 20918707
Alignment:
Q  230 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatg 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||| | ||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  20918620 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaactgcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcgaatg 20918707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 198 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 50614249 - 50614113
Alignment:
Q  198 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaa-acaa 295  Q
    ||||||||||||||||||  ||||  ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | |||||| | |||| |       
T  50614249 aatccaataatttggaacaacatc--cttcat---cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagtt 50614155  T
Q  296 catgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaa 337  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  50614154 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaa 50614113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 198 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 50622077 - 50621941
Alignment:
Q  198 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaa-acaa 295  Q
    ||||||||||||||||||  ||||  ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | |||||| | |||| |       
T  50622077 aatccaataatttggaacaacatc--cttcat---cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagtt 50621983  T
Q  296 catgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaa 337  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  50621982 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaa 50621941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 179
Target Start/End: Original strand, 6151665 - 6151810
Alignment:
Q  34 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccc 132  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||| ||||| || |||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  6151665 tattttagtattaatatactttcagggcatgag-cccccatcgttattttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccc 6151762  T
Q  133 caacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 179  Q
    ||||||    ||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||    
T  6151763 caacaaatgtatgctaatgcatggactcaatctcttaaaacatcttaa 6151810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 14295896 - 14295829
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  14295896 catcaagcccctatcgctatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaatcgctatttga 14295829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 22831684 - 22831560
Alignment:
Q  35 atttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagccccc 133  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||| ||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  22831684 attttagtattaatatactttcagggcatgag-cccccatcgttattttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagccccc 22831587  T
Q  134 aacaatgaaatgctaatgcatgaactc 160  Q
    |||||    ||||||||||||| ||||    
T  22831586 aacaaatgtatgctaatgcatggactc 22831560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Original strand, 21840579 - 21840646
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||    
T  21840579 catcaagcccctatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgctatttga 21840646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 45575189 - 45575122
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  45575189 catcaagctccaatcgctatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaatcgctatttga 45575122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 155
Target Start/End: Original strand, 431655 - 431697
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 155  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  431655 gctccagggcatcaagcctccaacaatgaaatgctaatgcatg 431697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 18182418 - 18182275
Alignment:
Q  35 atttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagccccc 133  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||| || |||||| |  ||||| || | || ||||| ||||  |||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  18182418 attttagtattaatatactttcagggcat-aagcccccaacattattttgagcaaatgctccttcgtggtgagtacaaagctccagggcatga-gccccc 18182321  T
Q  134 aacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaa 179  Q
    |||||    ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  18182320 aacaaatgtatgctaatgcatggacttgatctcttaaacatcttaa 18182275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 20454901 - 20454837
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt 82  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  20454901 catcaagcccctatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctattt 20454837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 45575145 - 45575089
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaaccccca 73  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||    
T  45575145 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccaaggcatcaagccccca 45575089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 14295852 - 14295785
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | |||| || | ||||||| |||| ||||||||||||    
T  14295852 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatactcccggagcatcaagccccaatcgctatttga 14295785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 427
Target Start/End: Original strand, 21477654 - 21477732
Alignment:
Q  352 tcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 427  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||| |||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||| || |||||    
T  21477654 tcaagtaatgcgtatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagcttcacagatcatcattaa 21477732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Original strand, 29776505 - 29776572
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| || |||||||||    
T  29776505 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaattgctatttga 29776572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 263 - 333
Target Start/End: Original strand, 33797570 - 33797638
Alignment:
Q  263 aacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatct 333  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||  |||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||    
T  33797570 aacaacagcaacatatgcagcatacaaa--caacatgacataataatatcaatttcaattcaacaacatct 33797638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 45575220 - 45575166
Alignment:
Q  30 tcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| | || ||||||||||||    
T  45575220 tcgctatttgagtattattatacttccagagcatcaagctccaatcgctatttga 45575166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 54 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 50210543 - 50210513
Alignment:
Q  54 tccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50210543 tccagggcatcaaacccccatcgctatttga 50210513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 13213162 - 13213101
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 78  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  13213162 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgct 13213101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 14295808 - 14295747
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 78  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  14295808 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgct 14295747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 20454815 - 20454754
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 78  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  20454815 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgct 20454754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 21840623 - 21840684
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 78  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  21840623 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgct 21840684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Original strand, 21341915 - 21341982
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgag-tattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  21341915 catcaagcccccaacgctatttgagatattaatatact-ccagagcatcaagcccctatcgctatttga 21341982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Original strand, 21346779 - 21346846
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgag-tattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  21346779 catcaagcccccaacgctatttgagatattaatatact-ccagagcatcaagcccctatcgctatttga 21346846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 199 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 24783230 - 24783155
Alignment:
Q  199 atccaataatttggaact--tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 272  Q
    |||||||||||||||  |  |||||||||| |||| ||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  24783230 atccaataatttggatttcatcatcatcttaatcatcttattcagactcatgcaacttagttaaataacaatagca 24783155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 88)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 17 - 427
Target Start/End: Original strand, 29060343 - 29060755
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29060343 catcaagcccccatcgctatt-gagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctc 29060441  T
Q  117 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg-aac 215  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  29060442 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaac 29060541  T
Q  216 ttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 315  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29060542 atcatcatcttcatcagcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 29060641  T
Q  316 tgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttca 413  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||  |||| ||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29060642 tgcaagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcacataacattatatctcatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttca 29060741  T
Q  414 cagattataattaa 427  Q
    ||||||||||||||    
T  29060742 cagattataattaa 29060755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 17 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 25629671 - 25629260
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    |||||||||||| |||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  25629671 catcaagcccccatcgctata--agtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaggctc 25629574  T
Q  117 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 216  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||     
T  25629573 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgaaaacttcttatataatccaataatttggaaca 25629474  T
Q  217 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  25629473 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaattacaacaggaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataacaatatcaaat 25629374  T
Q  317 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 414  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25629373 gcaagtcaacaacatctcaattatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 25629274  T
Q  415 agattataattaac 428  Q
    ||||||||||||||    
T  25629273 agattataattaac 25629260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 40 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 18410126 - 18409726
Alignment:
Q  40 agtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaat 139  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  18410126 agtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctatttgagctaaagctccattgtgtggagtacaaggctccagggcatcaagcccccaacaat 18410027  T
Q  140 gaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaa----cttcatcatcttcatcaactt 235  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    | |||||||||||||||||||    
T  18410026 gaaatgataatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaacatcatcatcatcttcatcaactt 18409927  T
Q  236 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctca 335  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18409926 agaccgactcatgcagctcagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacgaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctca 18409827  T
Q  336 aatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcat 433  Q
    |  || ||||||| | |||| |||| | ||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  18409826 atcatccattcataattcaaataatacatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacatattataattaacatcat 18409727  T
Q  434 c 434  Q
    |    
T  18409726 c 18409726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 54 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 19303821 - 19303440
Alignment:
Q  54 tccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgca 153  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19303821 tccaaggcatcaagcccccatcgctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatactaatgca 19303722  T
Q  154 tgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagct 253  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19303721 tggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatcatcttcatcatcttagaccgactcatgcagct 19303622  T
Q  254 tagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactc 353  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||   ||    
T  19303621 tagttaaataacaacaacaacacaggaagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacattcatatttc 19303523  T
Q  354 aagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcatc 434  Q
    ||||||||   |||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19303522 aagtaatgtacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttcaacagcttcacagattataattaacatcatc 19303440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 55 - 426
Target Start/End: Original strand, 20593615 - 20593987
Alignment:
Q  55 ccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcat 154  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20593615 ccagggcatcaagcccccatcgctatt-gagctaaagctccatcgtgttgagcacaaggctccagggcatcaagcccccagcaatgaaatgctaatgcat 20593713  T
Q  155 gaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctt 254  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  20593714 ggactcaacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgaatcatgcagctc 20593813  T
Q  255 agttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactca 354  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| | |||    
T  20593814 agttaaataaaaacagcaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataaatca 20593913  T
Q  355 agtaatgcgtataa-aat-tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataatta 426  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20593914 agtaatgcgtataacaatatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataatta 20593987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 17 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 20638603 - 20638182
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 115  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  20638603 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagct 20638504  T
Q  116 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttggaa 214  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  20638503 ccagggcgtcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacaacctcttatattaatccaataatttggaa 20638404  T
Q  215 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 314  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20638403 catcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 20638304  T
Q  315 atgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttc 412  Q
     |||||   | ||||||||  ||||| ||  |||   ||||||||||| || ||  |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20638303 ttgcaatttatcaacatctttaatattcaaacattcttcaagtaatgcataaaacgttatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 20638204  T
Q  413 acagattataattaacttcatc 434  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  20638203 acagattataattaacatcatc 20638182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 17 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 22780545 - 22780126
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  22780545 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccaaggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctc 22780446  T
Q  117 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 216  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||     
T  22780445 caaggtatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgactacctcttatataatccaataatttggaaca 22780346  T
Q  217 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  22780345 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacaaaaacataggcaatatacaaaaacagcttgacataataatatcaatt 22780246  T
Q  317 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 414  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| || | ||   |||||||||||    || ||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22780245 gcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacgcaacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 22780146  T
Q  415 agattataattaacttcatc 434  Q
    ||||||| |||||| |||||    
T  22780145 agattatgattaacatcatc 22780126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 17 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 17288114 - 17287701
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||     
T  17288114 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaaactccaacgtgttgagtacaaagctt 17288015  T
Q  117 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 216  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  17288014 cagggcatcaagcccacaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaagcatcttaattcggcaacctcttatataatccaataatttggaaca 17287915  T
Q  217 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 316  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |    
T  17287914 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggtagtatacaaacacagcatgacataataatatcaatt 17287815  T
Q  317 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaatta--tcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 414  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| || | ||   |||||||||||  |||| ||||  ||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  17287814 gcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatgtcataacataatcaacctcaacacatcttaaacagcttcac 17287715  T
Q  415 agattataattaac 428  Q
    || |||||||||||    
T  17287714 aggttataattaac 17287701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 59 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 20361238 - 20360859
Alignment:
Q  59 ggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaa 157  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20361238 ggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaaaactccaacgtgttgagtataaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgga 20361139  T
Q  158 ctcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttag 256  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20361138 ctcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcatcattttcatcaacttagatcgactcatgcagcttag 20361039  T
Q  257 ttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaag 356  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  || |||||||| |||||| ||   ||   |||||    
T  20361038 ttaaataacaacagcaacataggcagcatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaag 20360939  T
Q  357 taatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcatc 434  Q
    |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  20360938 taatgcatataacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacatattataattaacctcatc 20360859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 2291445 - 2291186
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2291445 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 2291347  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2291346 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 2291248  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  2291247 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 2291186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 18334857 - 18334598
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18334857 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 18334759  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18334758 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 18334660  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  18334659 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 18334598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Original strand, 19004943 - 19005202
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19004943 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 19005041  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19005042 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 19005140  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  19005141 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 19005202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Original strand, 24422444 - 24422703
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24422444 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 24422542  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24422543 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 24422641  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  24422642 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 24422703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Original strand, 33861691 - 33861950
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33861691 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 33861789  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33861790 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 33861888  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  33861889 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 33861950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 320
Target Start/End: Original strand, 20076506 - 20076805
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| || | ||||||||||||| ||||| | || ||||    
T  20076506 catcaagcccccatcgctatt--agtattaatatacttccagggcatcaagccctcatcgctatt-gagcgaaagctccatcgtgttgagcataaggctc 20076602  T
Q  117 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 216  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  20076603 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcaaaatcttaaacatcttagaacaacaacctcttatataatccaataatttggaaca 20076702  T
Q  217 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  20076703 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 20076801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 19859184 - 19858925
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  19859184 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatatagtccaataatttgg 19859086  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19859085 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 19858987  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  19858986 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 19858925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Original strand, 33864175 - 33864434
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33864175 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 33864273  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33864274 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 33864372  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  33864373 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 33864434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 17 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 28496790 - 28496489
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | | |||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  28496790 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccaaggcatcaagctcacatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctc 28496691  T
Q  117 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg-aac 215  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  28496690 cagggcatcaagcctccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaac 28496591  T
Q  216 ttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 314  Q
     ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||| | ||| || ||||| ||||||||||| |    
T  28496590 atcatcatcttcaaaaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcga 28496492  T
Q  315 atg 317  Q
    |||    
T  28496491 atg 28496489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 17 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 29809201 - 29808900
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | | |||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  29809201 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccaaggcatcaagctcacatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctc 29809102  T
Q  117 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg-aac 215  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  29809101 cagggcatcaagcctccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaac 29809002  T
Q  216 ttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 314  Q
     ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||| | ||| || ||||| ||||||||||| |    
T  29809001 atcatcatcttcaaaaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcga 29808903  T
Q  315 atg 317  Q
    |||    
T  29808902 atg 29808900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 129 - 374
Target Start/End: Original strand, 22782139 - 22782383
Alignment:
Q  129 cccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttca 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  22782139 cccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctctcatataatccaataatttggaaattcatcatcttaa 22782238  T
Q  229 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaa 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22782239 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 22782337  T
Q  329 catctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    | |||||| ||| ||  ||| | ||||||||||| |||| ||||||    
T  22782338 cgtctcaattattcacacataattcaagtaatgcatatacaattat 22782383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 113 - 336
Target Start/End: Original strand, 1595446 - 1595667
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1595446 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 1595544  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1595545 aacttcatcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 1595643  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaa 336  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||    
T  1595644 aaatgcaattcaacaacgtctcaa 1595667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Original strand, 8054926 - 8055185
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8054926 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 8055024  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8055025 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-aagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 8055123  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  8055124 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 8055185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 26924905 - 26924646
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26924905 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 26924807  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26924806 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-tagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 26924708  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  26924707 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 26924646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 113 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 1541176 - 1540918
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1541176 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 1541078  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  1541077 aacttcatcatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagtatgacataataatatc 1540979  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaatta 373  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| |||||    
T  1540978 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaatta 1540918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Original strand, 12742214 - 12742473
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12742214 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgaccttgtaat-atcttaaatcaacaacctcttatataatccaataatttgg 12742312  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12742313 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 12742411  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  12742412 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 12742473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 113 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 20557158 - 20556936
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  20557158 gctccacgacatcaagcccacaacaatgaaatgttaatgcatggactcgaccacttaaacatcttaaattgaaaacctcttatataatccaataatttgg 20557059  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  20557058 aacttcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatggcataataatatc 20556960  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaa 336  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||    
T  20556959 aaatgcaagtcaacaacgtctcaa 20556936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 121 - 374
Target Start/End: Original strand, 25754715 - 25754965
Alignment:
Q  121 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 220  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  25754715 gcatcaagcccccaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaac-tcttgtataatccaataatttggaacttcat 25754812  T
Q  221 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 320  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25754813 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 25754911  T
Q  321 gacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
      ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  25754912 atcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattat 25754965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 314
Target Start/End: Original strand, 35245386 - 35245684
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||    
T  35245386 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatactttcagggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagc 35245485  T
Q  115 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa-catcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttgg 212  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| || ||| | || ||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  35245486 tccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagactcgacctcttaaaacaacttgattcaacaacctcttatattagtccaataatttgg 35245584  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 311  Q
    ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| | |||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  35245585 aacatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaaacaccaacataggcagtatac---aacaacatgacataataatat 35245681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 114 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 3852280 - 3852023
Alignment:
Q  114 ctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgga 213  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  3852280 ctccaaagcatcaagcccccaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaac-tcttgtataatccaataatttgga 3852183  T
Q  214 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 313  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  3852182 acttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtttaataacaacagcaacacaa-tagtatacaaaaacagcatgacatgataatataa 3852084  T
Q  314 aatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  3852083 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 3852023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 120 - 336
Target Start/End: Original strand, 25688405 - 25688620
Alignment:
Q  120 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 219  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  25688405 ggcatcaagccctcaactttgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcgtaaatcgataacctcttatataatccaataatttggaacctca 25688504  T
Q  220 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 319  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  25688505 ttatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaactgca 25688603  T
Q  320 agacaacaacatctcaa 336  Q
    || ||||||| ||||||    
T  25688604 agtcaacaacgtctcaa 25688620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 267
Target Start/End: Original strand, 1561104 - 1561356
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 115  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||    
T  1561104 catcaagcccttctcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagct 1561203  T
Q  116 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa-catcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttgga 213  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| || ||||| ||||||| ||  ||||| |||||||| |||||||    
T  1561204 ccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggattcgacctcttaaaacaacttaattcgacaatctcgtatattaatccaattatttgga 1561302  T
Q  214 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 267  Q
    || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1561303 acatcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa 1561356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 56 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 19774003 - 19773818
Alignment:
Q  56 cagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcat 154  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19774003 cagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcat 19773904  T
Q  155 gaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagac 239  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19773903 ggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagac 19773818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 120 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 16448783 - 16448586
Alignment:
Q  120 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 219  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||      
T  16448783 ggcatcaagccctcaactttaaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaattgacaaactcttgtataatccaataatttggaactt-- 16448686  T
Q  220 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 319  Q
     |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16448685 -catcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacac-agcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 16448588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 35 - 433
Target Start/End: Original strand, 22831322 - 22831723
Alignment:
Q  35 atttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccc 132  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| | |||| |||||| |||  |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  22831322 atttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatttttagctaatgctccaacgtcgtgagtacaaagctccagggaatcaagcccc 22831421  T
Q  133 caacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttcatca 231  Q
    |||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  22831422 caactatgaa-tgctaatgtatggactcgacctcttaaacaacttaattcaacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaaca 22831520  T
Q  232 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaaca 330  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| | | |   ||| |||||||||||| ||||||||| |||  || |||||    
T  22831521 tagtagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcactgttc---aacgacatgacataatcatatcaaattcaattcatcaaca 22831617  T
Q  331 tctcaaa--tatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat--cacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataatta 426  Q
    ||| | |  ||||||  |||   ||||||||||| || || |||||  |||||||||||||||| ||| | ||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  22831618 tcttagatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacatcataatcaacaacaacatatcttattcagcttcacagattatagtta 22831716  T
Q  427 acttcat 433  Q
    || ||||    
T  22831717 acctcat 22831723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 16920950 - 16920651
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt--gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 114  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||  || |||| |||||| |||  ||||||||||||    
T  16920950 catcaagaccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccattgctatttttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagc 16920851  T
Q  115 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttgga 213  Q
    |||| ||  |||||||||| || ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | ||||| ||||||||    
T  16920850 tccagggtgtcaagccccctactatgaa-tgctaatgcatggacttgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaacaatttgga 16920752  T
Q  214 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    || |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||   |||| ||||||||||  |||||    
T  16920751 acatcatcatcttcaacatctttgaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcagcataggcagtatac---aacatcatgacataagtatatc 16920655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 25 - 215
Target Start/End: Original strand, 22805559 - 22805749
Alignment:
Q  25 ccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcat 124  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  22805559 ccccatcgctatttaagtattaatatacttccaaggcatcaagcccccatcgctaaatgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctccagggcat 22805658  T
Q  125 caagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaac 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  22805659 caagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacaacttcttatataatccaataatttggaac 22805749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 142 - 374
Target Start/End: Original strand, 34963292 - 34963529
Alignment:
Q  142 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatc------ttcatcaactt 235  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||      || ||||||||    
T  34963292 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacatcatcatcaacatcttaatcaactt 34963391  T
Q  236 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctca 335  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  34963392 agaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctca 34963490  T
Q  336 aatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    | ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  34963491 attattcacatataattcaagtaatgcatatataattat 34963529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 143 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 30676952 - 30676716
Alignment:
Q  143 atgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatc------ttcatcaactta 236  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||      || |||||||||    
T  30676952 atgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacatcatcatcaacatcttaatcaactta 30676853  T
Q  237 gaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaa 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  30676852 gaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agcagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 30676754  T
Q  337 atatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
     ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  30676753 ttattcacatataattcaagtaatgcatatataattat 30676716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 25612047 - 25611744
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctat-ttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 115  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||| |||||| | |  |||||||||||||    
T  25612047 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaaattgagctaatgctccaacatggtgagtacaaagct 25611948  T
Q  116 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaac 215  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| | || || |||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  25611947 ccagggcatcaagcccccaacaatgaaatcctaatgcatggacacgacctcttaaacatctt-attcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaac 25611849  T
Q  216 ttcatcatcttca-------tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataa 308  Q
     ||| ||||  ||       ||||| | ||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||| || | ||||  ||||| |||| |||||||||| ||    
T  25611848 atcaacatcaacatcttaattcaacatggactgactcatgcgacttagttaattaacaacagcagcataggcagattacaacaacatcatgacataacaa 25611749  T
Q  309 tatca 313  Q
    |||||    
T  25611748 tatca 25611744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 120 - 275
Target Start/End: Original strand, 25714323 - 25714478
Alignment:
Q  120 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 219  Q
    |||||||||||| ||||  ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  25714323 ggcatcaagccctcaactttgaaaagttaatgcatggactcgacctcttaaacatattaaaccggcaacctcttatataatccaataatttggaacatca 25714422  T
Q  220 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 275  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25714423 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 25714478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 175 - 340
Target Start/End: Original strand, 16496204 - 16496370
Alignment:
Q  175 cttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaa 273  Q
    ||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16496204 cttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaa 16496303  T
Q  274 cacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 340  Q
    || | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||    
T  16496304 cataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatcttaaatat 16496370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 316
Target Start/End: Original strand, 11185318 - 11185605
Alignment:
Q  21 aagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctcca 118  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||   ||||||||||  ||||    
T  11185318 aagcccccatcgttatttgagtattaatatacttctagggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaatgctccaacgcggtgagtacaaaaatcca 11185417  T
Q  119 aggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaact 216  Q
     ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||     
T  11185418 gggcatcaagcccccaactatg-aatgctaatgcatggactcgacctcttaaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaaca 11185516  T
Q  217 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 315  Q
    ||| |||         ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||   ||||| |||   |||||||||||||||| ||||||||    
T  11185517 tcaacat---------cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatgtgcagtgtac---aacaacatgacataattatatcaaa 11185604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 25603709 - 25603406
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctat-ttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 115  Q
    |||||||||||| |  |||||||| ||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||  |||| |||| |||||| | |  |||||||||||||    
T  25603709 catcaagcccccatttctatttgaatattaatatactaccagagcatcaagcccccatcgctaaattgagctaatgctccaacatggtgagtacaaagct 25603610  T
Q  116 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaac 215  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | || || |||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  25603609 ccagggcatcaagccctcaacaatgaaatgctaatgcatggacacgacctcttaaacatctt-attcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaac 25603511  T
Q  216 ttcatcatcttca-------tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataa 308  Q
     ||| ||||  ||       ||||| | ||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||| || | ||||  ||||| |||| |||||||||| ||    
T  25603510 atcaacatcaacatcttaattcaacatggactgactcatgcgacttagttaattaacaacagcagcataggcagattacaacaacatcatgacataacaa 25603411  T
Q  309 tatca 313  Q
    |||||    
T  25603410 tatca 25603406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 207 - 321
Target Start/End: Original strand, 25656619 - 25656732
Alignment:
Q  207 atttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataat 306  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25656619 atttggaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca-tagcagtatacaaaaacagcatgacataat 25656717  T
Q  307 aatatcaaatgcaag 321  Q
    |||||||||||||||    
T  25656718 aatatcaaatgcaag 25656732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 198 - 427
Target Start/End: Original strand, 18456705 - 18456930
Alignment:
Q  198 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaaca 297  Q
    |||||||||| ||||||| |||||  |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||    
T  18456705 aatccaataaattggaacatcatc--cttcatc---ttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-tagtatacaaaaacagca 18456798  T
Q  298 tgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaa 395  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| |||  |||||||  |||| ||||||||||    
T  18456799 tgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaa 18456897  T
Q  396 acatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 427  Q
     |||| |||| ||||||||||||| || |||||    
T  18456898 tcatcataaatcagcttcacagatcatcattaa 18456930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 185 - 427
Target Start/End: Original strand, 25644295 - 25644537
Alignment:
Q  185 caacctattatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacacaagcag 282  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||   ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||    
T  25644295 caacctcttatataaatccaataatttggaac---atcttctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcag 25644389  T
Q  283 tatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatc 380  Q
    ||| |||||||| | ||| |||| ||||||||||| ||| || |||||||||||| || |||  || | |||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  25644390 tatgcaaaaacagcgtgatataacaatatcaaatgtaagtcatcaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcgtatacaattatatcacatc 25644489  T
Q  381 ataatcaacatcaaaacatctta-aacagcttcacagattataattaa 427  Q
    | || |||||||||| |||| || | ||||||||||||| || |||||    
T  25644490 aaaaacaacatcaaatcatcatatatcagcttcacagatcatcattaa 25644537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 144 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 8227703 - 8227416
Alignment:
Q  144 tgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccga 242  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||    
T  8227703 tgctaatgcatggactcgacttcttaaacgtcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacatcaacatcttcaacaacttggaccga 8227604  T
Q  243 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatata 341  Q
    |||||||||||||||||  |||  | |||||||  | ||||||| | |||||| ||||| |||||||||||  | | |||  ||||||||||||||||      
T  8227603 ctcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgc-aaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataat 8227505  T
Q  342 cattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 427  Q
    ||   || | ||||||||||| |||| |||  |||||||| |||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||| || |||||    
T  8227504 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagcttcacagatcatcattaa 8227416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 198 - 336
Target Start/End: Original strand, 18461865 - 18461997
Alignment:
Q  198 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaaca 297  Q
    |||||||||| ||||||| |||||  |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||    
T  18461865 aatccaataaattggaacatcatc--cttcatc---ttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-tagtatacaaaaacagca 18461958  T
Q  298 tgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaa 336  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  18461959 tgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 18461997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 113 - 361
Target Start/End: Original strand, 20109039 - 20109285
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataa-tccaataattt 210  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||  || || | ||||| || | || |||| |||||||| | |||||||||    
T  20109039 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcaacaactcaacc-tcttagaaacaacgacctcttatataaattcaataattt 20109136  T
Q  211 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataat 309  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| | ||||||| ||||| |||||| | |||| |||    
T  20109137 ggaacatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacataatataacaat 20109233  T
Q  310 atcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatg 361  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||| |||  || | ||||||||||    
T  20109234 atcaaatgcaagtcatcaacatctcaaatattcatatataattcaagtaatg 20109285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 184 - 337
Target Start/End: Original strand, 23019377 - 23019529
Alignment:
Q  184 acaacctattatata-atccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagca 281  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||    
T  23019377 acaacctcttatatatatccaataatttggaacatcatcatctt--tcatcttagaccgacttatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagca 23019474  T
Q  282 gtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaa 337  Q
    |||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23019475 gtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaa 23019529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 22 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 25642499 - 25642250
Alignment:
Q  22 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 120  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  25642499 agcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagg 25642401  T
Q  121 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt--- 217  Q
    ||||  ||||||||||||    ||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||| |  | || |||| | |||||||||||||||| ||       
T  25642400 gcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggacttgatctcttaaacatctt-aatc-atcatctcttat-ttatccaataatttggaagttcaa 25642305  T
Q  218 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 272  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||  |||||||||||| ||||    
T  25642304 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaactaggttaaataacaatagca 25642250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 142 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 19848194 - 19847990
Alignment:
Q  142 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat------catcttcatcaactt 235  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||      |||||| ||||||||    
T  19848194 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacgacctcttaaatagtccaataatttggaacatcattatcaacatcttaatcaactt 19848095  T
Q  236 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctca 335  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| || | ||||  ||||  |||| ||  |||||| |||||||| |||||  |||||| |||| |    
T  19848094 agactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaacacataaaaatatcaattgcaattcaacaatatctta 19847995  T
Q  336 aatat 340  Q
    |||||    
T  19847994 aatat 19847990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 272
Target Start/End: Original strand, 19862783 - 19863032
Alignment:
Q  22 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 120  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  19862783 agcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagg 19862881  T
Q  121 gcatcaagcccccaac-aatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt-- 217  Q
    ||||  ||||||||||  |||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||| |  | || |||| | |||||||||||||||  ||      
T  19862882 gcat-gagcccccaacttatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaacatcat-aatc-atcatctcttat-ttatccaataatttggaggttca 19862976  T
Q  218 -catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 272  Q
     ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  19862977 acatcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagca 19863032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 113 - 337
Target Start/End: Original strand, 19652098 - 19652317
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttg 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | || |||||| || |||| | | ||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  19652098 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacatcttaa-caacttagaacaacaacctcttaaataactccaataatttg 19652195  T
Q  212 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataata 310  Q
    |||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||||    
T  19652196 gaacatcatcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaata 19652291  T
Q  311 tcaaatgcaagacaacaacatctcaaa 337  Q
    || |||||||  |||||||||||||||    
T  19652292 tcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 19652317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 272
Target Start/End: Original strand, 19872925 - 19873174
Alignment:
Q  22 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 120  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  19872925 agcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagg 19873023  T
Q  121 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt--- 217  Q
    |||| |  |||| ||  |||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||| |  | || |||| | ||||||||||||| |  ||       
T  19873024 gcatgagcccccaaattatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaacatcat-aatc-atcatctcttat-ttatccaataatttgaaggtttaa 19873119  T
Q  218 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 272  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  19873120 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagca 19873174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 198 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 18821976 - 18821795
Alignment:
Q  198 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaaca 297  Q
    |||||||||| ||||||| |||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  18821976 aatccaataaattggaacatcatc--cttcatc---ttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagca 18821883  T
Q  298 tgacataataatatcaaatgcaagacaacaa-catctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat-tatcacatcataa 384  Q
    || ||||| |||||| || ||||| |||||| |||||||| ||| |||| |    |||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  18821882 tgccataacaatatc-aacgcaagccaacaatcatctcaattattcatttaaacttcaagtaatgcgtatacattatatcacatcataa 18821795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 22 - 303
Target Start/End: Original strand, 22432054 - 22432334
Alignment:
Q  22 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||      
T  22432054 agcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctattttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagttccaga 22432152  T
Q  121 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt--- 217  Q
    ||||  ||||||||||||    |||| |||||||| |||||| |||||||||||| | |||| |  | || |||| | || ||||||||||||  ||       
T  22432153 gcat-gagcccccaacaaatgtatgcaaatgcatggactcgatctcttaaacatcat-aatc-atcatctcttat-ttatacaataatttggaggttcaa 22432248  T
Q  218 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacat 303  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||| || | ||||| ||||| ||||  |||||||    
T  22432249 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaattaacaatagcagcataggcagtttacaacaacagtatgacat 22432334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 22 - 303
Target Start/End: Original strand, 22438604 - 22438884
Alignment:
Q  22 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||      
T  22438604 agcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctattttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagttccaga 22438702  T
Q  121 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt--- 217  Q
    ||||  ||||||||||||    |||| |||||||| |||||| |||||||||||| | |||| |  | || |||| | || ||||||||||||  ||       
T  22438703 gcat-gagcccccaacaaatgtatgcaaatgcatggactcgatctcttaaacatcat-aatc-atcatctcttat-ttatacaataatttggaggttcaa 22438798  T
Q  218 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacat 303  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||| || | ||||| ||||| ||||  |||||||    
T  22438799 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaattaacaatagcagcataggcagtttacaacaacagtatgacat 22438884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 34 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 22335197 - 22335053
Alignment:
Q  34 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccc 132  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||  ||||||    
T  22335197 tatttgagtattaatatacttccagggcaa-aagcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtgttgcgtacaaagctccagggcat-gagcccc 22335100  T
Q  133 caacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaa 179  Q
    ||||||    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  22335099 caacaaatgtatgctaatgcatggactcgatctcttaaacatcttaa 22335053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 80 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 4186069 - 4185870
Alignment:
Q  80 tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaa 179  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||   |||  |||||||||||||    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4186069 tttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagccccggagcagtaagcccccaacaaatgtatgataatgcatggactcgacctcttaaacatcttaa 4185970  T
Q  180 atcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacacaa 278  Q
        ||||| | ||| ||| |||||||||||||||   |||| || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |     
T  4185969 ----acaacttcttaaatagtccaataatttggaa---catcgtcatcatcaacttggaccgactcatgcagcatagttaaacaacagacagcaacatag 4185877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 80 - 266
Target Start/End: Original strand, 4186240 - 4186419
Alignment:
Q  80 tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaa 179  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||   |||  |||||||||||||    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4186240 tttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccggagcagtaagcccccaacaaatgtatgctaatgcatgacctcgacctcttaaacatcttaa 4186339  T
Q  180 atcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca 266  Q
        ||||| | ||| ||| |||||||||||||||    ||| || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  4186340 ----acaacttcttaaatagtccaataatttggaa---tatcgtcatcatcaacttggaccgactcatgcagcatagttaaacaaca 4186419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 113 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 22080945 - 22080799
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttg 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || |  |  ||||| || |||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  22080945 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgtatggacacatcaacttaa-ca-cttaaaacaacaacctcttatataagtccaataatttg 22080849  T
Q  212 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaa 261  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22080848 gaacatcatcatcttaatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaa 22080799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 80 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 4738805 - 4738626
Alignment:
Q  80 tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaa 179  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||   |||  |||||||||||||    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  4738805 tttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccggagcagtaagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgacctcttagacatcttaa 4738706  T
Q  180 atcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca 266  Q
        ||||  | ||| ||| |||||||||||||||   |||| || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  4738705 ----acaatttcttaaatagtccaataatttggaa---catcgtcatcatcaacttggaccgactcatgcagcatagttaaacaaca 4738626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 15894749 - 15894593
Alignment:
Q  22 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaagg 121  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||| |||| |||||| | ||    
T  15894749 agcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgttatttgagctaatgctccatcgtgttgtgtactaagctctaggg 15894651  T
Q  122 catcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 179  Q
    ||| |||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  15894650 cat-aagcccccaacatatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatcttaa 15894593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 113 - 332
Target Start/End: Original strand, 19668275 - 19668491
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataa-tccaataattt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||| || |||| |||||||| |||||||||||    
T  19668275 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaa-tgagtatgcatggactcaacaacttaa-catcttagaatcaacgacctcttatataaatccaataattt 19668372  T
Q  211 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaa-acaacatgacataataa 308  Q
    |||||   ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |   ||||| ||||| |   ||||| |||| ||    
T  19668373 ggaac---atcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaaacagcaacatagatagtatgcaaaacagttcatgatataacaa 19668467  T
Q  309 tatcaaatgcaagacaacaacatc 332  Q
    ||||||||||||  ||||||||||    
T  19668468 tatcaaatgcaaatcaacaacatc 19668491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 142 - 320
Target Start/End: Original strand, 23992349 - 23992533
Alignment:
Q  142 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat------catcttcatcaactt 235  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | || |||  ||| ||| |||||||||||||||| ||||      |||||| ||||||||    
T  23992349 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaatacaacgaccgcttaaatagtccaataatttggaacatcattatcaacatcttaatcaactt 23992448  T
Q  236 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 320  Q
    |||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||| || | ||||  ||||  |||| || ||||||| |||||||| |||||    
T  23992449 agactgactcatgcaacttagctaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaattgcaa 23992533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 81 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 31155644 - 31155465
Alignment:
Q  81 ttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaa 179  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||   |||  |||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  31155644 ttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccggagcagtaagcccccaacatatgta-tgctaatgcatggactcgacatcttaaacatcttaa 31155546  T
Q  180 atcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 267  Q
        ||||| |  || ||| |||||||||||||||   ||||||| |||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  31155545 ----acaacttcgtaaatagtccaataatttggaa---catcatcatcatcaacttggattgactcatgcaacttagttaaataacaa 31155465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 68 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 31165107 - 31165006
Alignment:
Q  68 cccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctct 167  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||    
T  31165107 cccccatcgctattcgagctaaagctccatcgtgttgagtactaagctccagggcat-gagcccccaacaatg-tatgctaatgcatggactcgatctct 31165010  T
Q  168 taaa 171  Q
    ||||    
T  31165009 taaa 31165006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 217 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 27333336 - 27333262
Alignment:
Q  217 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaa 290  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||    
T  27333336 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 27333262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 217 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 27394076 - 27394002
Alignment:
Q  217 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaa 290  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||    
T  27394076 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 27394002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 198 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 9098646 - 9098528
Alignment:
Q  198 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaa- 295  Q
    ||||||||||||||||||   ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | |||||||     
T  9098646 aatccaataatttggaac---atcttctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacaaaggcagtatgc-aaaacaat 9098553  T
Q  296 -catgacataataatatcaaatgca 319  Q
     ||||| |||| |||||||||||||    
T  9098552 tcatgatataacaatatcaaatgca 9098528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 15041799 - 15041552
Alignment:
Q  86 ctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgac 185  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| | |||||||||||    ||||||||||||| |||||  |||||||| |||| || ||  |    
T  15041799 ctaaagctccatcgtgttgagtactaagctctagggcatga-gcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgttctcttaaaaatctcaa-tcatc 15041702  T
Q  186 aac-ctattatataatccaataatttggaacttca---tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagca 281  Q
    ||| || |||||||  |||||||||||||  ||||   |||||||  ||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||| || | || | |||    
T  15041701 aactcttttatata--ccaataatttggaggttcaacatcatcttgttcatcttataaagactcatgcaacttagttaaataacaatagtagcataggca 15041604  T
Q  282 gtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatct 333  Q
    |   |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  15041603 gatcacaacaacagcatgacattataatatcaaatgcaattcaataacatct 15041552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 198 - 255
Target Start/End: Original strand, 19008787 - 19008843
Alignment:
Q  198 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctta 255  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  19008787 aatccaataatttgga-cttcatcatcttaatcaacttggaccaactcatgcagctta 19008843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 291
Target Start/End: Original strand, 33443068 - 33443124
Alignment:
Q  235 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaa 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  33443068 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacataggcagtatataaaa 33443124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 8227768 - 8227702
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttg 83  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| |||||||||||    
T  8227768 catcaagcccctatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgctatttg 8227702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 80 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 16965566 - 16965471
Alignment:
Q  80 tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatct 176  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||| ||||||||| || ||||| | |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  16965566 tttgagctaaagctccatcgtggtgagtactaagctccagagcat-aagcccccatcatatgaa-tactaatgcatggactcgatctcttaaacatct 16965471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 91 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 18692154 - 18692086
Alignment:
Q  91 gctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactc 160  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||||    
T  18692154 gctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-aagcccccaacaaatgtatgctaatgcatgaactc 18692086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 19848301 - 19848234
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| || | ||||||||||||    
T  19848301 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccacaatcgctatttga 19848234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 19848345 - 19848278
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||    
T  19848345 catcaagtcccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgctatttga 19848278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 372 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 25603346 - 25603299
Alignment:
Q  372 tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagatt 419  Q
    |||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||    
T  25603346 tatcacatcataatcaatgactaaacatcttaaacagcttcacagatt 25603299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Original strand, 34963185 - 34963252
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||    
T  34963185 catcaagtcccaatcgctatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaatcactatttga 34963252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 160
Target Start/End: Original strand, 13019394 - 13019439
Alignment:
Q  114 ctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactc 160  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  13019394 ctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatggactc 13019439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 160
Target Start/End: Original strand, 18906928 - 18907052
Alignment:
Q  35 atttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagccccc 133  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||| || |||||| |  ||||| || |||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  18906928 attttagtattaatatactttcagggcat-aagcccccaacattattttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagccccc 18907025  T
Q  134 aacaatgaaatgctaatgcatgaactc 160  Q
    |||||    ||||||||||||| ||||    
T  18907026 aacaaatgtatgctaatgcatggactc 18907052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 3852402 - 3852338
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt 82  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  3852402 catcaagcccctatcgctatttaagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctattt 3852338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 4642998 - 4642934
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt 82  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| || || ||||||| |||| ||||||||||    
T  4642998 catcaagcccctatcgctatttgagtattaatatac-tctagagcatcaagcccctatcgctattt 4642934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 16523626 - 16523558
Alignment:
Q  91 gctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactc 160  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    ||||||||||||| ||||    
T  16523626 gctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-aagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactc 16523558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 23992286 - 23992347
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 78  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  23992286 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgct 23992347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 34963229 - 34963290
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 78  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  34963229 catcaagccccaatcactatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaatcgct 34963290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 87)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 17 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 16377839 - 16377422
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||     
T  16377839 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctt 16377740  T
Q  117 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 216  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  16377739 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttacataatccaataatttggaact 16377640  T
Q  217 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 316  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  16377639 tcattatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac--aaacagcatgacataataatatcaaat 16377542  T
Q  317 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 414  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||    
T  16377541 gcaagtcaacaacatctcaattatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctccac 16377442  T
Q  415 agattataattaacttcatc 434  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  16377441 agattataattaacatcatc 16377422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 14 - 434
Target Start/End: Original strand, 44052628 - 44053051
Alignment:
Q  14 ggacatcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaa 112  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  44052628 ggacatcaagcccccatcgatatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctattttgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaa 44052727  T
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44052728 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcgtagattcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttgg 44052827  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44052828 aacatcatcatcttcatcaacttaggccgactcatgcagctcagttaaataacaacatcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 44052927  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagct 410  Q
    || |||||  || |||||||| |||||| ||   ||   |||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  44052928 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgctcataacattatatcacatcataatcaacatcagcacatcttaaacagct 44053027  T
Q  411 tcacagattataattaacttcatc 434  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  44053028 tcacagattataattaacatcatc 44053051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 17 - 434
Target Start/End: Original strand, 7893505 - 7893922
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  7893505 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagcttcaacgtgttgagtacaaagctc 7893604  T
Q  117 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg-aac 215  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  7893605 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaac 7893704  T
Q  216 ttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 315  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  7893705 atcatcatcttcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 7893804  T
Q  316 tgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaatta--tcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttca 413  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||| || | ||   |||||||||||  |||  ||||  ||||||||||||   || ||| ||||||||||||||||||    
T  7893805 tgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataccattatttcacatcataat---cagcaacacatcttaaacagcttca 7893901  T
Q  414 cagattataattaacttcatc 434  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  7893902 cagattataattaacatcatc 7893922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 17 - 428
Target Start/End: Original strand, 22636238 - 22636650
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  22636238 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagcacaaagctc 22636337  T
Q  117 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 216  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  22636338 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttagacatcttaattcaacaacctcttatataatccaataatttggaaaa 22636437  T
Q  217 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  22636438 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacatagacagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 22636537  T
Q  317 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 414  Q
    ||||  || |||||||| |||||| ||   ||   ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  22636538 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcgacatcaacacatctt-aacagcttcac 22636636  T
Q  415 agattataattaac 428  Q
    ||||||||||||||    
T  22636637 agattataattaac 22636650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 17 - 394
Target Start/End: Original strand, 7798577 - 7798956
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  7798577 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgcttattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctc 7798676  T
Q  117 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 216  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  7798677 cagagcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttagaaca 7798776  T
Q  217 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  7798777 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 7798876  T
Q  317 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaa 394  Q
    ||||| || |||||||| |||||| || | ||   |||||||||||  |||| ||  ||||||| |||||||||||||||    
T  7798877 gcaagtcatcaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattgtatcacaacataatcaacatcaa 7798956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 25 - 428
Target Start/End: Original strand, 12902567 - 12902973
Alignment:
Q  25 ccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggca 123  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||    
T  12902567 ccccttcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagctccagggca 12902666  T
Q  124 tcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttcatca 222  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  12902667 tcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatca 12902765  T
Q  223 tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaaga 322  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||      
T  12902766 tcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaatt 12902865  T
Q  323 caacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagatta 420  Q
    || |||||||| |||||| ||   || | ||||||||||| || || ||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12902866 catcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagatta 12902965  T
Q  421 taattaac 428  Q
    ||||||||    
T  12902966 taattaac 12902973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 17 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 16240288 - 16239869
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  16240288 catcaagctcccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctatctgagctaaagctccatcatgttgagtacaaagctc 16240189  T
Q  117 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg-aac 215  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||    
T  16240188 cagggcatcaagcccccatcaatgaaatgctaatgcatggactcgacctgttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatctaataatttggaaac 16240089  T
Q  216 ttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 315  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||| | | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  16240088 atcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaacttaattaaataacaatagcaaaataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaa 16239990  T
Q  316 tgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttca 413  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| || | ||   | |||||||||  |||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  16239989 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatactttaagtaatgcaaataacattatatcatatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcg 16239890  T
Q  414 cagattataattaacttcatc 434  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  16239889 cagattataattaacatcatc 16239869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 54 - 427
Target Start/End: Original strand, 14038498 - 14038863
Alignment:
Q  54 tccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgca 153  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14038498 tccagggcatcaagcccccatcgctatt-gagctaaagctccatcatgttgagca-aaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgca 14038595  T
Q  154 tgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagct 253  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14038596 tggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataattt--------atcatcttcatcaacttagactgactcatgcagct 14038687  T
Q  254 tagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactc 353  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||   ||    
T  14038688 tagttaaataacaacagcaacacatgcagtatacaaaaacaacatggcataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacattcatatttc 14038787  T
Q  354 aagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaa 427  Q
    |||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14038788 aagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatgttaaacagcttcacagattataattaa 14038863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 56 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 16270515 - 16270145
Alignment:
Q  56 cagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 155  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16270515 cagggcatcaagcccccatctctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtccaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 16270416  T
Q  156 aactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg-aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctt 254  Q
     |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16270415 gactcgatctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaacatcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagctt 16270316  T
Q  255 agttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactca 354  Q
    | ||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| || | ||   |||    
T  16270315 aattaaataacaatagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagttaacaacatcttaaatattcaattatacttca 16270217  T
Q  355 agtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataat 424  Q
    ||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16270216 agtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataat 16270145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 120 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 54798969 - 54798669
Alignment:
Q  120 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  54798969 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaaaatcttaaatcgacaacctcttatataatccaatactttggaacttca 54798870  T
Q  220 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 319  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54798869 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttgaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 54798770  T
Q  320 agacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattatcacatcataatcaacatcaaaacatctt-aaacagcttcacagat 418  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||        || ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  54798769 agtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat--------aagtatgacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagcttcacagat 54798678  T
Q  419 tataattaa 427  Q
    ||| |||||    
T  54798677 tatcattaa 54798669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 120 - 427
Target Start/End: Original strand, 14280219 - 14280518
Alignment:
Q  120 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 219  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  14280219 ggcatcaagccctcaactttaaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaattgacaaactcttgtataatccaataatttggaacttca 14280318  T
Q  220 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 319  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14280319 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-ggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 14280417  T
Q  320 agacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattatcacatcataatcaacatcaaaacatctt-aaacagcttcacagat 418  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||        || ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  14280418 agtcaacaacatctcaaatatagattcataattcaagtaat--------aagtatgacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagcttcacagat 14280509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 18215540 - 18215280
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||     
T  18215540 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctctcatataatccaataatttga 18215441  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18215440 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 18215342  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  18215341 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 18215280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 113 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 44929146 - 44928829
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44929146 gctccagggcatcaagccaccaacaatgaaatgctaatccatggattcgacctcttaaacatctttaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 44929047  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  44929046 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatgtc 44928947  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaa-cagc 409  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| |||  |||||||  |||| |||||| ||| |||| |||| ||||    
T  44928946 aaatgcaagtcaataacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataaacaacataaaatcatcataaatcagc 44928847  T
Q  410 ttcacagattataattaa 427  Q
    ||||||||| || |||||    
T  44928846 ttcacagatcatcattaa 44928829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 17 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 23374672 - 23374264
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 115  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||    
T  23374672 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccagggcatcaagccccaatcgctattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagct 23374573  T
Q  116 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaa 214  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  23374572 ccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaactcgacaacctcttatattaatccaataatttggaa 23374474  T
Q  215 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 314  Q
          |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||  |||||||    
T  23374473 ------catcttcaacaacttagaacgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaa 23374380  T
Q  315 atgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttc 412  Q
     |||||  ||||||||||| |||||| ||   |   |||||||||||| || || ||  ||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||    
T  23374379 ttgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacagatcttaaaaagcttc 23374280  T
Q  413 acagattataattaac 428  Q
    | |||||||| |||||    
T  23374279 agagattatagttaac 23374264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 120 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 12565 - 12313
Alignment:
Q  120 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12565 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttca 12467  T
Q  220 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 319  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12466 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 12368  T
Q  320 agacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    || ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  12367 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 12313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 15118617 - 15118358
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15118617 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 15118519  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15118518 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 15118420  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  15118419 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 15118358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 44773352 - 44773093
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44773352 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 44773254  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44773253 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 44773155  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  44773154 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacaaataattcaagtaatgcatatacaattat 44773093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 50222604 - 50222345
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50222604 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 50222506  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50222505 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cattatacaaaaacagcatgacataataatatc 50222407  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  50222406 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 50222345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Original strand, 52312407 - 52312666
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  52312407 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 52312505  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52312506 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 52312604  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  52312605 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 52312666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Original strand, 44615185 - 44615444
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44615185 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcaacaacctcttatataatccaataatttgg 44615283  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  44615284 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaatacagcatgacataataatatc 44615382  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  44615383 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 44615444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 113 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 18239684 - 18239426
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18239684 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 18239586  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18239585 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcagcacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 18239487  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaatta 373  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| |||||    
T  18239486 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaatta 18239426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 120 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 52873582 - 52873363
Alignment:
Q  120 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  52873582 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaacatca 52873483  T
Q  220 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  52873482 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 52873383  T
Q  320 agacaacaacatctcaaata 339  Q
    || ||||| ||||| |||||    
T  52873382 agtcaacatcatcttaaata 52873363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 113 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 1837774 - 1837553
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1837774 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 1837676  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  1837675 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatacc 1837577  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaa 336  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||    
T  1837576 aaatgcaagtcaacaacgtctcaa 1837553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 113 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 8575088 - 8574784
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||    
T  8575088 gctccagggcatcaagcccc-aacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatccacaacctcttatataatccaatgctttgg 8574990  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8574989 aacctcatcatcttaattaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatac-aaaacaacatgacataataatatc 8574892  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattatcacatcataatcaacatcaaaacat-cttaaacagctt 411  Q
    ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||        || ||  ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  8574891 aaatgtaattcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat--------aagtacgacatcataatcaacatcaacacatcctaaaacagctt 8574800  T
Q  412 cacagattataattaa 427  Q
    || ||||||| |||||    
T  8574799 catagattatcattaa 8574784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 113 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 15355591 - 15355384
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  15355591 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacttcttaaatcgactacctcttatataatccaataatttgg 15355492  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15355491 aacttcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacac-agcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 15355393  T
Q  313 aaatgcaag 321  Q
    |||||||||    
T  15355392 aaatgcaag 15355384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 428
Target Start/End: Original strand, 17046288 - 17046700
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||  ||||| ||||||    
T  17046288 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatactttcagggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtgcaaagc 17046387  T
Q  115 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttgga 213  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  17046388 tccagggcatcaagccctcaactatgaa-tgttaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttgga 17046486  T
Q  214 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | |||||   | |||||||||||||||| |||||    
T  17046487 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtat---agaacaacatgacataattatatc 17046583  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaa-attat--cacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagc 409  Q
    |||| |||  || |||||||| |  ||||||  |||   |||||||||  ||||||| |||||  |||||| ||||||||| ||| | ||||||  ||||    
T  17046584 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaat--gtataaacattataacacatcttaatcaacaacaacatatcttattcagc 17046681  T
Q  410 ttcacagattataattaac 428  Q
    |||||||||||||||||||    
T  17046682 ttcacagattataattaac 17046700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 14053621 - 14053202
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 114  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||    
T  14053621 catcaagcccccatcgctattttagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagc 14053522  T
Q  115 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttgga 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| || | ||||||||||||||    
T  14053521 tccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttacattagtccaataatttgga 14053423  T
Q  214 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    || |||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| || || |  ||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  14053422 acatcatcatcttcaacatcttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaaacaacagcatagacagtatac--aaacagcatgacataataatatc 14053325  T
Q  313 aaatgcaagacaacaaca-tctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat-tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagct 410  Q
    || | |||  || ||||| ||| |   |||||   ||   ||||||||||| || | | | ||||||||||||||||||| ||| | |||||| || |||    
T  14053324 aatttcaattcatcaacattcttatgcatacaaatattcttcaagtaatgcataaacattatatcacatcataatcaacaacaacatatcttatacggct 14053225  T
Q  411 tcacagattataattaacttcat 433  Q
    |||||||||||||||||| ||||    
T  14053224 tcacagattataattaacctcat 14053202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 113 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 7641447 - 7641236
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7641447 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 7641349  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||    
T  7641348 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaac-----------acaaaaacaacatgacataataatatc 7641260  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaa 336  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||    
T  7641259 aaatgcaagtcaacaacgtctcaa 7641236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 121 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 51464124 - 51463912
Alignment:
Q  121 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 220  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  51464124 gcatcaagcccccaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaac-tcttgtataatccaataatttggaacttcat 51464027  T
Q  221 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 320  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51464026 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 51463928  T
Q  321 gacaacaacatctcaa 336  Q
      ||||||| ||||||    
T  51463927 atcaacaacgtctcaa 51463912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 56 - 300
Target Start/End: Original strand, 3096134 - 3096379
Alignment:
Q  56 cagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcat 154  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||| |||| ||| || |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3096134 cagggcgtcaagcccccatcgctaatttgagctaatgcttcaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcat 3096232  T
Q  155 gaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatcc-aataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagct 253  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3096233 ggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattattctaataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagct 3096332  T
Q  254 tagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatga 300  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  3096333 tagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatga 3096379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 121 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 23803521 - 23803271
Alignment:
Q  121 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 220  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||    
T  23803521 gcatcaagcccacaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaac-tcttgtataattcaataatttggaacttcat 23803424  T
Q  221 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 320  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23803423 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 23803325  T
Q  321 gacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
      ||||||| ||| || ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  23803324 atcaacaacgtctaaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattat 23803271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 121 - 374
Target Start/End: Original strand, 12610856 - 12611099
Alignment:
Q  121 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 220  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12610856 gcatcaagcccccaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaac-tattgtataatccaataatttggaacttcat 12610953  T
Q  221 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 320  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12610954 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca--------acaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 12611045  T
Q  321 gacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
      ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  12611046 atcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattat 12611099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 143 - 427
Target Start/End: Original strand, 44102140 - 44102425
Alignment:
Q  143 atgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccga 242  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44102140 atgctaatgcatggactcgacctcttagacatcttaaatcgacaaactcttgtataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccga 44102239  T
Q  243 ctcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatac 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||| |    
T  44102240 ctcatgcagcttagttaaataacaacaataacac-agtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtaaacaacgtctcaattattc 44102338  T
Q  343 attcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 427  Q
    |   || | ||||||||||| |||| |||  |||||||  |||| || ||||||| |||| |||| ||||||||||||| || |||||    
T  44102339 acatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-catcatcaaatcatcataaatcagcttcacagatcatcattaa 44102425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 170 - 428
Target Start/End: Original strand, 7088832 - 7089093
Alignment:
Q  170 aacatcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaac 268  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7088832 aacatcttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttagaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaac 7088931  T
Q  269 agcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataa 368  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  || |||||||| | |||| ||   || | ||||||||||| || ||    
T  7088932 agcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttacatattcaaatattattcaagtaatgcataaaa 7089031  T
Q  369 aat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaac 428  Q
     ||  |||||||||||||| | || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7089032 cattatatcacatcataattagcaacaacacatcttaaacaacttcacagattataattaac 7089093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 61 - 285
Target Start/End: Original strand, 15551663 - 15551889
Alignment:
Q  61 catcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaact 159  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  15551663 catcaagcccccatcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggact 15551761  T
Q  160 cgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagtt 258  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15551762 cgacctattaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagtt 15551861  T
Q  259 aaataac-aacagcaacacaagcagtat 285  Q
    ||||||| |||||||||| | |||||||    
T  15551862 aaataacaaacagcaacataggcagtat 15551889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 132 - 340
Target Start/End: Original strand, 6899808 - 6900016
Alignment:
Q  132 ccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaa-cttcatcatcttcatc 230  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  6899808 ccaataatgaaatgctaatgcatggattcgacctcttaaacattttaattcgaaaacctcttatataattcaataatttggaaacatcatcatcttcatc 6899907  T
Q  231 aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaaca 330  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6899908 aacttagaccgactcatgcatcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatac-aaaacaacatagcataataatatcaaatgcaagtcaacaaca 6900006  T
Q  331 tctcaaatat 340  Q
    ||| ||||||    
T  6900007 tcttaaatat 6900016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 121 - 321
Target Start/End: Original strand, 15369925 - 15370124
Alignment:
Q  121 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaacttca 219  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||    
T  15369925 gcatcaagcccccaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacatca 15370023  T
Q  220 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 319  Q
     |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15370024 acatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 15370122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 121 - 321
Target Start/End: Original strand, 15371109 - 15371308
Alignment:
Q  121 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaacttca 219  Q
    |||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||    
T  15371109 gcatcaagcccccaacaaagaa-tggtaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacatca 15371207  T
Q  220 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 319  Q
     |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15371208 acatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 15371306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 121 - 321
Target Start/End: Original strand, 15367597 - 15367796
Alignment:
Q  121 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttca 219  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||    
T  15367597 gcattaagcccccaacaaagaa-tgctaatgaatggactcgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatca 15367695  T
Q  220 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 319  Q
     |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15367696 acatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 15367794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 121 - 321
Target Start/End: Original strand, 15373390 - 15373589
Alignment:
Q  121 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaacttca 219  Q
    |||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||| ||| |||    
T  15373390 gcatcaagcccccaacaaagaa-tggtaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttgaaacatca 15373488  T
Q  220 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 319  Q
     |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15373489 acatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 15373587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 121 - 321
Target Start/End: Original strand, 15402610 - 15402809
Alignment:
Q  121 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaacttca 219  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||    
T  15402610 gcatcaagcccccaacaaagaa-tgcaaatgcatggactcgacttcttaaccatcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacatca 15402708  T
Q  220 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 319  Q
     |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15402709 acatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 15402807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 142 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 19618415 - 19618178
Alignment:
Q  142 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatc------ttcatcaactt 235  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||| ||||||| |||||||| | ||||||      || ||||||||    
T  19618415 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttaaatagtccaatagtttggaacattatcatcaacatcttaatcaactt 19618316  T
Q  236 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  19618315 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agcagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctca 19618217  T
Q  336 aatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    | ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  19618216 attattcacctataattcaagtaatgcatatataattat 19618178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 121 - 321
Target Start/End: Original strand, 16223439 - 16223638
Alignment:
Q  121 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttca 219  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||    
T  16223439 gcattaagcccccaacaaagaa-tgctaatgaatggactcgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatca 16223537  T
Q  220 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 319  Q
     |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  16223538 acatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatctaatgca 16223636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 192 - 374
Target Start/End: Original strand, 19242675 - 19242855
Alignment:
Q  192 ttatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaa 291  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  19242675 ttatataatccaataatttgga-cttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaa 19242772  T
Q  292 acaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  19242773 acagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattat 19242855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 192 - 374
Target Start/End: Original strand, 3514982 - 3515163
Alignment:
Q  192 ttatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaa 291  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3514982 ttatataatccaataatttagaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaaaaacaacagcaacac-agcagtatacaaaa 3515080  T
Q  292 acaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  3515081 acagcaagacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattat 3515163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 142 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 14970950 - 14970751
Alignment:
Q  142 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatc------ttcatcaactt 235  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||      || ||||||||    
T  14970950 aatgctaatgcatcgactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacatcatcatcaacattttaatcaactt 14970851  T
Q  236 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctca 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  14970850 agaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaaaca-gcaatatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctca 14970752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 120 - 321
Target Start/End: Original strand, 20149735 - 20149932
Alignment:
Q  120 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 219  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||       
T  20149735 ggcatcaagccctcaactttaaaatgctaatgcatggactcgacctctttaacatcttaaattgataaactcttgtataatccaataatttggaact--- 20149831  T
Q  220 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 319  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||  | ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20149832 tcatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttgataaaataacaacagcgacac-atcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 20149930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 113 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 39706511 - 39706302
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctatta-tata-atccaataatt 209  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||  ||||| | ||||| || | ||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  39706511 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaatatatatccaataatt 39706414  T
Q  210 tggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataa 308  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||    
T  39706413 tggaacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaa 39706315  T
Q  309 tatcaaatgcaag 321  Q
    |||| ||||||||    
T  39706314 tatcgaatgcaag 39706302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 198 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 21815761 - 21815591
Alignment:
Q  198 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaaca 297  Q
    |||||||||| ||||||| |||||  |||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||    
T  21815761 aatccaataaattggaacatcatc--cttcatc---ttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacgacagcaacacaa-ctgtatacaaaaacagca 21815668  T
Q  298 tgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  21815667 tgacataataatataaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 21815591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 184 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 52243343 - 52243099
Alignment:
Q  184 acaacctattatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagca 281  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||   ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  52243343 acaacctcttatataaatccaataatttggaac---atcttctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggca 52243249  T
Q  282 gtatacaaa-aacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcaca 378  Q
    |||| ||||  |   ||||| |||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||| || |||  || |  |||||||||| |||| |||  |||||||    
T  52243248 gtatgcaaatcagttcatgatataacaatatcaaatgaaattcaacaacatctcaaacattcatatataatccaagtaatgcatatacaattatatcaca 52243149  T
Q  379 tcataatcaacatcaaaacatctta-aacagcttcacagattataattaa 427  Q
    | |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  52243148 ttataaacaacatcaaatcatcttataacagcttcacagatcatcattaa 52243099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 120 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 14061 - 13789
Alignment:
Q  120 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaat-cgacaacctattatataa-tccaataatttggaactt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||| ||  || || |||||||||  | || |||| |||||||| ||||||||||||||||      
T  14061 ggcatcaagcccccaacaatgaa-tgtgaatgcatggactcaacaactcaa-catcttaaaaacaacgacctcttatataaatccaataatttggaac-- 13966  T
Q  218 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 316  Q
     ||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  13965 -atcttctt--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaat 13870  T
Q  317 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaa 395  Q
    ||||| || ||||||||||||||| |||  || | ||||||||||  |||| |||  |||||||| |||| ||||||||||    
T  13869 gcaagtcatcaacatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaa 13789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 37 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 17048609 - 17048409
Alignment:
Q  37 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaa 135  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  17048609 ttgagtattaatatacttccagggcat-atgcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaa 17048512  T
Q  136 caatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaact 234  Q
    |||    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||| |  | || ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  17048511 caaatgtatgctaatgcatggactcgatctcttaaacatcat-aatc-atcatctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacaact 17048414  T
Q  235 tagac 239  Q
    |||||    
T  17048413 tagac 17048409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 22 - 282
Target Start/End: Original strand, 12569820 - 12570078
Alignment:
Q  22 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaagg 121  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  12569820 agcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgttatttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccaggg 12569918  T
Q  122 catcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgga--actt 217  Q
     || |||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| |  | || |||||| |||||||||||||||   |      
T  12569919 tat-aagcccccaacatatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatctt-aatc-atcatctcttatat-atccaataatttggagttcaa 12570013  T
Q  218 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcag 282  Q
    ||||||||| |||| |||| |  |||||||||| | |||||||||||||| |||| || ||||||    
T  12570014 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcatcatagttaaataacaatagcagcataagcag 12570078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 121 - 374
Target Start/End: Original strand, 22353740 - 22353993
Alignment:
Q  121 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa-catcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttggaact-t 217  Q
    |||||||||||| | || |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||  ||| |||||| |||| |||||||||| | | |    
T  22353740 gcatcaagccccaatcactgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaaacatcttaatttgac--cctcttatattaatcgaataatttgggaatat 22353836  T
Q  218 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatg 317  Q
    |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||  |  |  ||||||||||||||| |||||||| |     
T  22353837 catcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttaggtaaataacaacagcagcataggcagattgtagcaacaacatgacataacaatatcaatta 22353936  T
Q  318 caagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    |||  ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  22353937 caattcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 22353993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 179
Target Start/End: Original strand, 44675436 - 44675593
Alignment:
Q  22 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  44675436 agcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgttaatttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagg 44675534  T
Q  121 gcatcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 179  Q
    ||||  ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  44675535 gcat-gagcccccaacatatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatcttaa 44675593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 171
Target Start/End: Original strand, 13569306 - 13569454
Alignment:
Q  22 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||| | |||| |||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  13569306 agcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaatttcagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagg 13569404  T
Q  121 gcatcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa 171  Q
    ||||  ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  13569405 gcat-gagcccccaacatatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaa 13569454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 113 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 43198769 - 43198492
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttg 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||  || || | ||||| |   ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  43198769 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaactcaacc-tcttagaa--acaacctcttatataaatccaataatttg 43198674  T
Q  212 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaa--catgacataataa 308  Q
    ||||   ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  || ||| | |||||||  ||||| ||||  |    
T  43198673 gaac---atcttctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacaatatgc-aaaacaattcatgatataacca 43198580  T
Q  309 tatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaa 394  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||  || | ||||||||||  |||| |||  |||||||| |||| |||||||||    
T  43198579 tatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 43198492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 110 - 336
Target Start/End: Original strand, 12773910 - 12774128
Alignment:
Q  110 aaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatt 209  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||  || |  | |||||| || |||||| | ||| | | ||||| | ||||||||||    
T  12773910 aaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgttaatgcatcgacacatcatcttaa-caacttaaaacaacatcatcttata-agtccaataatt 12774006  T
Q  210 tggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataa 308  Q
    || |    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||    
T  12774007 tgaa----catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaa 12774101  T
Q  309 tatcaaatgcaagacaacaacatctcaa 336  Q
    |||| ||| |||  ||||||||||||||    
T  12774102 tatcgaatacaa-tcaacaacatctcaa 12774128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 22 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 15125354 - 15125197
Alignment:
Q  22 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 120  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  15125354 agcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgttaatttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagg 15125256  T
Q  121 gcatcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 179  Q
    | ||  ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  15125255 gaat-gagcccccaacatatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatcttaa 15125197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 22 - 179
Target Start/End: Original strand, 23843282 - 23843439
Alignment:
Q  22 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 120  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||| | || |||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  23843282 agcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgttaatttgagccaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagg 23843380  T
Q  121 gcatcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 179  Q
    ||||  ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  23843381 gcat-gagcccccaacatatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatcttaa 23843439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 198 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 12288342 - 12288211
Alignment:
Q  198 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaa-aacaa 295  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||  |       
T  12288342 aatccaataatttggaac---atcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccagtt 12288248  T
Q  296 catgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatc 332  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  12288247 catgatataacaatatcaaatgcaattcaacaacatc 12288211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 290
Target Start/End: Original strand, 8846287 - 8846433
Alignment:
Q  142 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagacc 240  Q
    |||||||||||||| || | || |||||| || |||| | | ||||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||    
T  8846287 aatgctaatgcatggacacaacatcttaa-caacttagaacaacaacctcttaaataagtccaataatttggaacatcatcatc---atcaacttagacc 8846382  T
Q  241 gactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaa 290  Q
    |||| || ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||    
T  8846383 gacttattcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 8846433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 37 - 179
Target Start/End: Original strand, 15093594 - 15093736
Alignment:
Q  37 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaa 135  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||  |||||||||    
T  15093594 ttgagtattaatatacttccagggcat-aagccaccatcgctaatttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggcat-gagcccccaa 15093691  T
Q  136 ca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctct-taaacatcttaa 179  Q
    || |||  ||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||    
T  15093692 catatg-tatgctaatgcatggactcgatctctaaaaacatcttaa 15093736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 166
Target Start/End: Original strand, 29267517 - 29267570
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctc 166  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  29267517 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctc 29267570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 15122101 - 15121956
Alignment:
Q  34 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccc 132  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||| | ||||| || |||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  15122101 tattttagtattaatatactttcagggcatgag-cccccattgttattttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccc 15122004  T
Q  133 caacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 179  Q
    ||||||    ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  15122003 caacaaatgtatgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatcttaa 15121956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 372 - 434
Target Start/End: Original strand, 3096803 - 3096865
Alignment:
Q  372 tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcatc 434  Q
    |||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  3096803 tatctcatcataatcagcaacaacacatcttaaacagcttcacatattataattaacctcatc 3096865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 233 - 314
Target Start/End: Original strand, 6190481 - 6190563
Alignment:
Q  233 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| | |||| || |||||| | |||||||||| ||||||||    
T  6190481 cttagaccgactcatgcagcttagttaaacatcaaacagcaacataggcagcattcaaaaatagcatgacataacaatatcaa 6190563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 372 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 17048033 - 17047979
Alignment:
Q  372 tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataatta 426  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  17048033 tatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacaggttgtaatta 17047979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 19618551 - 19618499
Alignment:
Q  32 gctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  19618551 gctatttgagtattattatacttccagagcatcaaaccccaatcgctatttga 19618499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 46640675 - 46640453
Alignment:
Q  110 aaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataat 208  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||   ||||||| |||| || |||||| ||||||| | |  | |||| |||||||| |||||||||    
T  46640675 aaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgagtatgcatggactcaacatcttaa-catcttagaccatcgacctcttatataaatccaataat 46640578  T
Q  209 ttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaa-acaacatgacataat 306  Q
    ||| |||  |||  | ||||||   |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |  ||||||| |||| |   ||||| ||||     
T  46640577 ttgaaacaacat--ttttcatc---ttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatagacagtatataaaacagttcatgatataac 46640483  T
Q  307 aatatcaaatgcaagacaacaacatctcaa 336  Q
    ||||||||||| ||  ||| ||||||||||    
T  46640482 aatatcaaatgaaaatcaataacatctcaa 46640453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Original strand, 19242536 - 19242603
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||    
T  19242536 catcaagcccctatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgctatttga 19242603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Original strand, 22353609 - 22353676
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||    
T  22353609 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaatcactatttga 22353676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 14927955 - 14927843
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatata-atccaataatttg 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||  ||| ||| | ||| | | ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  14927955 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatggacacaacaactt-aactttttataacaacaacctcttatatatatctaataatttg 14927858  T
Q  212 gaacttcatcatctt 226  Q
    |||| ||||||||||    
T  14927857 gaacatcatcatctt 14927843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 53082284 - 53082202
Alignment:
Q  198 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagta 284  Q
    ||||||||||||||||||   | ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||    
T  53082284 aatccaataatttggaac---aacatctt--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagta 53082202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 82
Target Start/End: Original strand, 15705192 - 15705256
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt 82  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  15705192 catcaagcccctatcgctatttgagtattaatatactt-cagagcatcaagcccctatcgctattt 15705256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 14971145 - 14971078
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||  |||| ||||||||||||    
T  14971145 catcaagcccctatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaggccccaatcgctatttga 14971078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Original strand, 19242493 - 19242559
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  19242493 catcaagcccctatcgctatttaagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctatttga 19242559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Original strand, 22353653 - 22353720
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||    
T  22353653 catcaagccccaatcactatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgctatttga 22353720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 82
Target Start/End: Original strand, 12610728 - 12610792
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt 82  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  12610728 catcaagcccttatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctattt 12610792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 82
Target Start/End: Original strand, 12610771 - 12610835
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt 82  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  12610771 catcaagcccctatcgctatttaagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctattt 12610835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 82
Target Start/End: Original strand, 15367512 - 15367576
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt 82  Q
    ||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  15367512 catcaagcccctgtcactatttaagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctattt 15367576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 19242580 - 19242641
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 78  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  19242580 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagcccctatcgct 19242641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 23803606 - 23803542
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt 82  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  23803606 catcaagccccaatcgctatttaagtattaatatac-tccaaggcatcaagccccaatcgctattt 23803542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 23803649 - 23803585
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt 82  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  23803649 catcaagcccctatcgctatttaagtattaatatac-tccaaggcatcaagccccaatcgctattt 23803585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 51464209 - 51464145
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt 82  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  51464209 catcaagcccctatcgctatttaagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctattt 51464145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 235 - 275
Target Start/End: Original strand, 17333298 - 17333338
Alignment:
Q  235 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 275  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  17333298 tagactgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaaca 17333338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 40 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 39706598 - 39706543
Alignment:
Q  40 agtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctcca 96  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || || |||| |||||||||||    
T  39706598 agtattaatatacttccagggcatcaagcccccaacg-taattgagctaaagctcca 39706543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 130)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 17 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 40214038 - 40213620
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40214038 catcaagcccacatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctc 40213939  T
Q  117 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 216  Q
    || | |||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40213938 caggacatcaagccatccacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaact 40213839  T
Q  217 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 316  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  40213838 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacatcaacac-agcagtatacataaacatcatgacataataatatcaaat 40213740  T
Q  317 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 414  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  40213739 gcaagtcaacaacatctcaattatacattcataatccaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctttac 40213640  T
Q  415 agattataattaacttcatc 434  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  40213639 agattataattaacatcatc 40213620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 40 - 434
Target Start/End: Original strand, 14972682 - 14973076
Alignment:
Q  40 agtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaat 139  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| | || |||||| | |||||| |||||||||||    
T  14972682 agtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctatt-gagctaaagctccatcgtgttgagca-aaggctccaggacatcaatcccccaacaat 14972779  T
Q  140 gaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagac 239  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14972780 gaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagac 14972879  T
Q  240 cgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaata 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  14972880 cgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaatcaacaacatctcatata 14972979  T
Q  340 tacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcatc 434  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  14972980 tacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcatagattataattaacatcatc 14973076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 17 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 25476701 - 25476290
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    |||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  25476701 catcaagccctcatcgctatt-gagtattaatatacttacagggcatcaa-cccccatcactatttgagctaaagctccatcttgttgagtacaaagctc 25476604  T
Q  117 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 216  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  25476603 cagggcatcaaacccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaca 25476504  T
Q  217 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25476503 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaaaaacaacagcaacacaggtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 25476404  T
Q  317 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 414  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||| ||  ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  25476403 gcaagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgcataacattatatcacatcattatcatcatcaacacatcttaaacagcttcac 25476304  T
Q  415 agattataattaac 428  Q
    ||||| ||||||||    
T  25476303 agattgtaattaac 25476290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 17 - 434
Target Start/End: Original strand, 17487659 - 17488078
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  17487659 catcaagcccccatcactatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctc 17487758  T
Q  117 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 216  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  17487759 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaca 17487858  T
Q  217 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  17487859 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 17487958  T
Q  317 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 414  Q
    ||||  || |||||||| |||||| ||   ||   ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  17487959 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagattcac 17488058  T
Q  415 agattataattaacttcatc 434  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  17488059 agattataattaacatcatc 17488078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 17 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 23083679 - 23083260
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||    
T  23083679 catcaagcccccatcactatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaaactc 23083580  T
Q  117 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 216  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  23083579 caaggcatcaaacccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaaca 23083480  T
Q  217 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |    
T  23083479 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaatt 23083380  T
Q  317 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 414  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| || |  |   || ||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  23083379 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattttacttctagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaatatcaacacatcttaaacagcttcac 23083280  T
Q  415 agattataattaacttcatc 434  Q
    ||||| |||||||| |||||    
T  23083279 agattgtaattaacatcatc 23083260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 17 - 428
Target Start/End: Original strand, 43840735 - 43841148
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  43840735 catcaaacccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctatttgagctaaagctctttcgtgttgagtacaaagctc 43840834  T
Q  117 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 216  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  43840835 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaca 43840934  T
Q  217 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 316  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  43840935 tcattatcttcatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 43841034  T
Q  317 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 414  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| || | ||   |||||||||||  |||| ||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43841035 gcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 43841134  T
Q  415 agattataattaac 428  Q
    ||||||||||||||    
T  43841135 agattataattaac 43841148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 17 - 434
Target Start/End: Original strand, 18438337 - 18438756
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  18438337 catcaagcccccatcgctatt-gagtattaatatacttccagggcatcaagcccccttcactatttgagctaaaactccatcgtgttgagtacaaagctc 18438435  T
Q  117 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttg-gaac 215  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||    
T  18438436 cagggcatcaagcctccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttgaaaac 18438535  T
Q  216 ttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 315  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18438536 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaa 18438635  T
Q  316 tgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttca 413  Q
    |||||| |||||||||||    |||||||||||  |||||||||||| ||||| ||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18438636 tgcaagtcaacaacatcttttttatacattcatatctcaagtaatgcatataacattatatcacatcatattcaacatcaacacatcttaaacagcttca 18438735  T
Q  414 cagattataattaacttcatc 434  Q
    ||||||||| ||||| |||||    
T  18438736 cagattatagttaacatcatc 18438756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 17 - 434
Target Start/End: Original strand, 17499141 - 17499560
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  17499141 catcaagcccccatcactatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctc 17499240  T
Q  117 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 216  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  17499241 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaca 17499340  T
Q  217 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  17499341 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 17499440  T
Q  317 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 414  Q
    ||||  || |||||||| |||||| ||   ||   ||||||||||| ||||| ||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  17499441 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaacacatcttaaacagattcac 17499540  T
Q  415 agattataattaacttcatc 434  Q
    | |||||||||||| |||||    
T  17499541 aaattataattaacatcatc 17499560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 56 - 434
Target Start/End: Original strand, 13442115 - 13442496
Alignment:
Q  56 cagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcat 154  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  13442115 cagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatattaatgcat 13442214  T
Q  155 gaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctt 254  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13442215 ggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctt 13442314  T
Q  255 agttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactca 354  Q
    |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||| |||||| ||   ||   |||    
T  13442315 agttaaataacaacggcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttca 13442414  T
Q  355 agtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcatc 434  Q
    ||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13442415 agtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatc 13442496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 54 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 11425040 - 11424668
Alignment:
Q  54 tccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgca 153  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11425040 tccagagcatcaagcccccatcactatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgca 11424941  T
Q  154 tgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagct 253  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11424940 tggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagct 11424841  T
Q  254 tagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactc 353  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||  ||||   | ||||||||||| ||| ||||||| | ||    
T  11424840 tagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataacaatatcaatagcaa---atcaacatctcaattatgcattcataattc 11424745  T
Q  354 aagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaac 428  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11424744 aagtaatgcgtataacattatatcacatcataaacaacttcaacacatcttaaacagcttcacagattaaaattaac 11424668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 17 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 20698755 - 20698335
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 115  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||| |||  |||||||||||||    
T  20698755 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttgcatagcatcaagcccccatcgctaatttgagttaaagctccaacgtggtgagtacaaagct 20698656  T
Q  116 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttggaa 214  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  20698655 ccagggaatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaa 20698556  T
Q  215 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 314  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  20698555 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacgtaataatatcaa 20698456  T
Q  315 atgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat-tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttca 413  Q
     |||||  || |||||||| | |||| ||   ||   ||||||||||| || | | | |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  20698455 ttgcaattcatcaacatcttatatattcaaatattcttcaagtaatgcataaacattatatcacatcataatcaacttcaacacatcttgaacagcttca 20698356  T
Q  414 cagattataattaacttcatc 434  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  20698355 cagattataattaacatcatc 20698335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 56 - 428
Target Start/End: Original strand, 26686729 - 26687103
Alignment:
Q  56 cagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 155  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||| | | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26686729 cagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaaactccaacatgttgagtacaaagctctagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 26686828  T
Q  156 aactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctta 255  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26686829 gactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatatagtccaataatttggaacatcatcatcttcttcaacttagaccgactcatgcagctta 26686928  T
Q  256 gttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaa 355  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||| |  | ||   ||||    
T  26686929 gttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatcttaaatattccattatacttcaa 26687028  T
Q  356 gtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaac 428  Q
    |||||||  |||| ||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26687029 gtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaac 26687103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 17 - 428
Target Start/End: Original strand, 12399011 - 12399425
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 115  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| |||  ||||||||  |||    
T  12399011 catcaagcccccattgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacagtgct 12399110  T
Q  116 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaa 214  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  12399111 ccagggcatcaagccaccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaatttgacaacctcttatattagtccaataatttggaa 12399209  T
Q  215 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 314  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  12399210 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaa 12399309  T
Q  315 atgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttc 412  Q
    ||||||  ||||||||||| |||||| ||   |   |||||||||||| ||  | ||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  12399310 atgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataagacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaatagcttc 12399409  T
Q  413 acagattataattaac 428  Q
    |||||||||| |||||    
T  12399410 acagattatagttaac 12399425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 113 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 24153430 - 24153115
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24153430 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 24153331  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | | ||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  24153330 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgatagcaacataggtagtatac-aaaacagcatgacataataatatc 24153232  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagct 410  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| || | ||   |||| ||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24153231 aaatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaaataatgcacataacataatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 24153132  T
Q  411 tcacagattataattaa 427  Q
    |||||||||||||||||    
T  24153131 tcacagattataattaa 24153115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 113 - 427
Target Start/End: Original strand, 21618345 - 21618650
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  21618345 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacttcttaaatcgacaacctcttatataatccaatactttgg 21618444  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  21618445 aacttcatcttctcaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatac-aaaacagcatgacataataatatc 21618542  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattatcacatcataatcaacatcaaaacat-cttaaacagctt 411  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||        || ||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  21618543 aaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat--------aagtatgacatcataatcaacatcaacacatcctaaaacagctt 21618634  T
Q  412 cacagattataattaa 427  Q
    || ||||||| |||||    
T  21618635 catagattatcattaa 21618650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 40 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 14577124 - 14576732
Alignment:
Q  40 agtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaat 139  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  14577124 agtattaatatacgtccagggcatcaagccctcatcgctatt-gagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaaaaat 14577026  T
Q  140 gaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttaga 238  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||  ||| |||||||||||||||   |||||||  ||||||||||||    
T  14577025 gaaatgcaaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaaataacaacctcttaagtaagtccaataatttggaa---catcatcaacatcaacttaga 14576929  T
Q  239 ccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaat 338  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |  ||||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  14576928 ccgactcattcaacttagttaaataacaacagcaacatagacagtata-aacaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaat 14576830  T
Q  339 atacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcatc 434  Q
    || || | ||   ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  14576829 attcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacaacttcacagattataattaacatcatc 14576732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 113 - 427
Target Start/End: Original strand, 36166494 - 36166799
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  36166494 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcggcctctttaacttcttaaatcgacaacctcttatataatccaatactttgg 36166593  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  36166594 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacac-agcagtatac-aaaacagcatgacataataatatc 36166691  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattatcacatcataatcaacatcaaaacat-cttaaacagctt 411  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||        || ||  ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  36166692 aaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat--------aagtacgacatcataatcaacatcaacacatcctaaaacagctt 36166783  T
Q  412 cacagattataattaa 427  Q
    || ||||||| |||||    
T  36166784 catagattatcattaa 36166799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 29172849 - 29172589
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  29172849 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttga 29172750  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29172749 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 29172651  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  29172650 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 29172589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Original strand, 17463075 - 17463334
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17463075 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 17463173  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17463174 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 17463272  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  17463273 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 17463334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Original strand, 34159223 - 34159482
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34159223 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 34159321  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34159322 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 34159420  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  34159421 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 34159482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 16454546 - 16454287
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16454546 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 16454448  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16454447 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 16454349  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  16454348 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 16454287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 113 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 28848876 - 28848618
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28848876 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcaacaacctcttatataatccaataatttgg 28848778  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28848777 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 28848679  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaatta 373  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| |||||    
T  28848678 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaatta 28848618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 120 - 374
Target Start/End: Original strand, 8898998 - 8899250
Alignment:
Q  120 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8898998 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttca 8899096  T
Q  220 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 319  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8899097 tcatcttaatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 8899195  T
Q  320 agacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    || ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  8899196 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 8899250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 13152056 - 13151796
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13152056 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 13151958  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 311  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13151957 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatat 13151859  T
Q  312 caaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  13151858 caaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 13151796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 13154521 - 13154261
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13154521 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 13154423  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 311  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13154422 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatat 13154324  T
Q  312 caaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  13154323 caaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 13154261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 38962157 - 38961897
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38962157 gctccagggcatcaagcccccaacaatgtaatgctaatgcatagactcgatctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 38962058  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38962057 aacttcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 38961959  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  38961958 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 38961897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 45607172 - 45606913
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45607172 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 45607074  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45607073 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 45606975  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  45606974 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 45606913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 113 - 331
Target Start/End: Original strand, 55500839 - 55501055
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  55500839 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 55500937  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  55500938 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 55501036  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacat 331  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  55501037 aaatgcaagtcaacaacat 55501055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 17446919 - 17446661
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17446919 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgggctcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 17446821  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17446820 aacttcatcatcttaatcaacttaga-cgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 17446723  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  17446722 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatatcattcaagtaatgcatatacaattat 17446661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 9707872 - 9707613
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  9707872 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaaactcttgtataatccaataatttgg 9707774  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9707773 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 9707675  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    |||| |||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  9707674 aaatacaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 9707613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 16283076 - 16282817
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16283076 gctccagggcatcaagcccccaacaataaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 16282978  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  16282977 aactttatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatt 16282879  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
     |||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  16282878 gaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 16282817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 113 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 6469395 - 6469178
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6469395 gctccagggcatcaagcccccaacaatgacatgctaatgcatggactcgacctctta-----cttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 6469301  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6469300 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 6469202  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaa 336  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||    
T  6469201 aaatgcaagtcaacaacgtctcaa 6469178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 120 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 7781605 - 7781353
Alignment:
Q  120 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 219  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781605 ggcatcaagccctcaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttca 7781507  T
Q  220 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 319  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7781506 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 7781408  T
Q  320 agacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    |  ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  7781407 aatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 7781353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 10247988 - 10247729
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  10247988 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttgtataatccaataatttgg 10247890  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10247889 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaacagcagcacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 10247791  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  10247790 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 10247729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 40 - 434
Target Start/End: Original strand, 14572417 - 14572810
Alignment:
Q  40 agtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaat 139  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14572417 agtattaatatacttccagagcatcaagccctcatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaat 14572516  T
Q  140 gaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttaga 238  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||  ||| |||||||||||||||   || ||||  ||||||||||||    
T  14572517 gaaatgcaaatgcatagactcgacctcttaaacatcttaaaacaacatcctcttaagtaagtccaataatttggaa---caacatcaacatcaacttaga 14572613  T
Q  239 ccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||| ||||    
T  14572614 ccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagacagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaattgagagtcaacaacatcttaaat 14572712  T
Q  339 atacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcatc 434  Q
    || || | ||   |||| |||||   | || ||  ||||||||||||| |||||| || | |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  14572713 attcaattatacttcaaataatgaaaaaaacattatatcacatcataaacaacataaacaaatcttaaacaacttcacaaattataattaacatcatc 14572810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 113 - 336
Target Start/End: Original strand, 15977409 - 15977633
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaa---tcgacaacctattatataatccaataatt 209  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||   |||||||||| || |||||||||||||||    
T  15977409 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaat-atcttaaaaaatcgacaacctcttgtataatccaataatt 15977507  T
Q  210 tggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataat 309  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15977508 tggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-tagtatacaaaaacaacatgacataataat 15977606  T
Q  310 atcaaatgcaagacaacaacatctcaa 336  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15977607 atcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 15977633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 13210647 - 13210333
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 115  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||    
T  13210647 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatactttcagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagct 13210548  T
Q  116 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa-catcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttgga 213  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  13210547 ccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaaacgacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttgaa 13210449  T
Q  214 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  13210448 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 13210350  T
Q  313 aaatgcaagacaacaac 329  Q
     |||||||  |||||||    
T  13210349 gaatgcaaatcaacaac 13210333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 60 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 24340999 - 24340628
Alignment:
Q  60 gcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaact 159  Q
    ||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  24340999 gcatcaagcctctatcgctatttgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacactgaaatgctaatgcatggact 24340900  T
Q  160 cgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattat-ataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagtt 258  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  24340899 cgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagtt 24340800  T
Q  259 aaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagt 357  Q
    || |||||| |||||||| | ||||||| | | |||| ||||| ||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||| ||   || | ||||||    
T  24340799 aattaacaatcagcaacatatgcagtatgc-acaacatcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacatctcaaatattcacatataattcaagt 24340701  T
Q  358 aatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 427  Q
    ||||| |||| |||  |||||||| |||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||| || |||||    
T  24340700 aatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagcttcacagatcatcattaa 24340628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 142 - 374
Target Start/End: Original strand, 55476417 - 55476647
Alignment:
Q  142 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccg 241  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  55476417 aatgctaatgcatagactcgacctcttaaacatcttaa-tcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccg 55476515  T
Q  242 actcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatata 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||     
T  55476516 actcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 55476614  T
Q  342 cattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  55476615 cacatataattcaagtaatgcatatacaattat 55476647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 121 - 321
Target Start/End: Original strand, 8499422 - 8499621
Alignment:
Q  121 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 220  Q
    |||||||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8499422 gcatcaagcccctatcgctgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacctcat 8499521  T
Q  221 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 320  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8499522 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacac-agtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 8499620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Original strand, 41123787 - 41124043
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41123787 gctccagggcattaaggccccatcaatgaaatgctaatgcatggattcgacctcttaa-catcttaaatcgacaaccttttatataatccaataatttgg 41123885  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41123886 aactttatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa---caacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 41123981  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  41123982 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 41124043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 114 - 337
Target Start/End: Original strand, 10556882 - 10557105
Alignment:
Q  114 ctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgga 213  Q
    ||||| ||||||||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  10556882 ctccagggcatcaagcccctatcgctgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataattcaataatttgga 10556981  T
Q  214 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 313  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  10556982 acttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacac-atcagcatacaaaaacggcatgacataataatatca 10557080  T
Q  314 aatgcaagacaa-caacatctcaaa 337  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||    
T  10557081 aatgcaagccaatcaacatctcaaa 10557105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 121 - 321
Target Start/End: Original strand, 15412333 - 15412532
Alignment:
Q  121 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 220  Q
    |||||||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15412333 gcatcaagcccctatcgctgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacctcat 15412432  T
Q  221 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 320  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15412433 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacac-agtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 15412531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 115 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 43550744 - 43550522
Alignment:
Q  115 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa-catcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttgg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  43550744 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaaacatcttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttgg 43550646  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    ||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43550645 aacatcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataatgacagcaacatatgcagtatgcaaaaacaacatgacataataatatc 43550546  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaa 336  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||    
T  43550545 aaatgcaagtcaacaacgtctcaa 43550522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 121 - 374
Target Start/End: Original strand, 50242728 - 50242978
Alignment:
Q  121 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 220  Q
    |||||||||||||||||| |||  | | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  50242728 gcatcaagcccccaacaaagaac-gttgatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaac-tcttgtataatccaataatttggaacttcat 50242825  T
Q  221 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 320  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50242826 cattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 50242924  T
Q  321 gacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
      ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  50242925 atcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattat 50242978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 121 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 12119983 - 12119784
Alignment:
Q  121 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 220  Q
    |||||||||||| | |  |||||||||||||||||  ||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12119983 gcatcaagcccctatcgctgaaatgctaatgcatggcctttacttcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcat 12119884  T
Q  221 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 320  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12119883 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttgttaaataacaacagcgacac-agcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 12119785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 422
Target Start/End: Original strand, 30029637 - 30030049
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||| |||| ||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  30029637 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagg-cat-aagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacatgttgagtacaaagctc 30029734  T
Q  117 caaggcatcaagcccccaaca--atgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaa 214  Q
    || ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||| || |||| |||||||||||||||    
T  30029735 cagggcatcaagcccccatcactatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttgtatagtccaataatttggaa 30029834  T
Q  215 cttcatcatcttca------tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataa 308  Q
    | ||||||||  ||      ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| || |  |||  ||||| |||| |||||||||| ||    
T  30029835 catcatcatcaacatctcattcaacttagactgactcatgcaacttagtttaataacaatagcagcatagacagattacaacaacagcatgacataagaa 30029934  T
Q  309 tatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaac 406  Q
    |||||  |||||  | ||||| ||| |||||| || | |    ||||||||||   | || ||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  30029935 tatcatttgcaattc-acaacgtcttaaatattcaataaaacttcaagtaatgtacacaacattatatcacatcataatcaatgtcaaaacatcttaaac 30030033  T
Q  407 agcttcacagattata 422  Q
    ||||||||| ||||||    
T  30030034 agcttcacatattata 30030049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 427
Target Start/End: Original strand, 23274489 - 23274903
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 115  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||| |||||||||| || |||| |||||| |||  |||||||||||||    
T  23274489 catcaaacccctatcgctatttgagtattattatact-ccagggcatcaagcccctatcgctattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagct 23274587  T
Q  116 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattat-ataatccaataatttggaa 214  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||| ||| ||||||| |||| ||    
T  23274588 ccagggcatcaagcccccaacactgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaatttgacaaccttttataatagtccaatactttgaaa 23274687  T
Q  215 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 313  Q
    | ||| |||||||    |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| | ||||||| | |||||| ||||| |||||||||||     
T  23274688 catcaacatcttcgatgacttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgc-aaaacatcatgatataataatatcg 23274786  T
Q  314 aatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaatt--atcacatcataatcaacatcaaaacatcttaa-acagct 410  Q
    || |||||  ||||||||||||||||| ||   || | |||||||| |  |||| ||||  ||||||| |||| |||||||||| |||| |||  |||||    
T  23274787 aacgcaagtaaacaacatctcaaatattcacatataattcaagtaaagaatatacaattacatcacattataaacaacatcaaatcatcataattcagct 23274886  T
Q  411 tcacagattataattaa 427  Q
    |||||||| || |||||    
T  23274887 tcacagatcatcattaa 23274903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 232 - 433
Target Start/End: Original strand, 42386428 - 42386632
Alignment:
Q  232 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacat 331  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  42386428 acttagaccgactcatgcagtttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataacaatatcaaatgcaagtcaacaacat 42386527  T
Q  332 ctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatctt-aaacagcttcacagattataattaac 428  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||| ||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  42386528 ctcaaatattcattcataattcaagcaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaaacagcttcacagattatcattaac 42386627  T
Q  429 ttcat 433  Q
     ||||    
T  42386628 atcat 42386632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 114 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 45578102 - 45577947
Alignment:
Q  114 ctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgga 213  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45578102 ctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgga 45578004  T
Q  214 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacag 270  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45578003 acttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacag 45577947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 121 - 374
Target Start/End: Original strand, 27165154 - 27165407
Alignment:
Q  121 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 220  Q
    |||||||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27165154 gcatcaagcccctatcgctgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacctcat 27165253  T
Q  221 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 319  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |  |||||| | |||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  27165254 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaatatagacagtatgc-aaaacaacatgatataccaatatcaaatgca 27165352  T
Q  320 agacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    || || ||| ||||||||||| |||  || | | ||||| |||||||| ||||||    
T  27165353 agtcatcaatatctcaaatattcatatataatttaagtattgcgtatacaattat 27165407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 121 - 317
Target Start/End: Original strand, 44494715 - 44494908
Alignment:
Q  121 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 220  Q
    |||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||| |||||||||    
T  44494715 gcatcaagcccccaacaaagaa-tgttaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaac-tcttgtataattcaataatttagaacttcat 44494812  T
Q  221 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatg 317  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  44494813 catcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacac-agcagtatacaaaaacagcataacataataatatcaaatg 44494908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 142 - 374
Target Start/End: Original strand, 12567479 - 12567716
Alignment:
Q  142 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat------catcttcatcaactt 235  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||      |||||| ||||||||    
T  12567479 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacatcataaacaacatcttaatcaactt 12567578  T
Q  236 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  12567579 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agcaatatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctca 12567677  T
Q  336 aatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    | ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  12567678 attattcacatataattcaagtaatgcatatataattat 12567716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 142 - 374
Target Start/End: Original strand, 13543944 - 13544181
Alignment:
Q  142 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat------catcttcatcaactt 235  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||      |||||| ||||||||    
T  13543944 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacatcattatcaacatcttaatcaactt 13544043  T
Q  236 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  13544044 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agcaatatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctca 13544142  T
Q  336 aatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    | ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  13544143 attattcacatataattcaagtaatgcatatataattat 13544181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 103 - 362
Target Start/End: Original strand, 12510939 - 12511205
Alignment:
Q  103 tgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatc 201  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||    
T  12510939 tgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaatttgacaacctcttatattaatc 12511038  T
Q  202 caataatttggaacttcat------catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaa 295  Q
    |||||||||||||| ||||      |||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||| || | ||||  ||||  |||||    
T  12511039 caataatttggaacatcattatcaacatcttaatcaacttagaatgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacaa 12511138  T
Q  296 catgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgc 362  Q
    || ||||||| |||||||| |||||  |||||||||||  ||||| || | ||  ||||||||||||    
T  12511139 caagacataaaaatatcaattgcaattcaacaacatcttcaatattcaataatatctcaagtaatgc 12511205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 139 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 53301747 - 53301511
Alignment:
Q  139 tgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttaga 238  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  53301747 tgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcaacaacctcttatataatccaataatttggaacctcatcatcttaatcaacttaga 53301648  T
Q  239 ccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagaca-acaacatctcaa 336  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||  ||| |||||||    
T  53301647 ccgactcatacaacttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcattcaatatctcaa 53301549  T
Q  337 atatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    |||| |||  || | ||||||| | |||||| ||||||    
T  53301548 atattcatatataattcaagtattacgtatacaattat 53301511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 121 - 316
Target Start/End: Original strand, 17737142 - 17737337
Alignment:
Q  121 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 220  Q
    |||||||||||||||||| ||| || ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  17737142 gcatcaagcccccaacaaagaa-tgataatgcatagactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaac-tattgtatgatccaataacttggaacttcat 17737239  T
Q  221 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagta---tacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 316  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||   ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  17737240 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agcaatatactacaacaacagcatgacataataatatcaaat 17737337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 10542759 - 10542619
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  10542759 catcaagcccccatcgctatttgaatattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctc 10542660  T
Q  117 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaa 157  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10542659 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgataatgcatgaa 10542619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 121 - 275
Target Start/End: Original strand, 28194599 - 28194752
Alignment:
Q  121 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 220  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  28194599 gcatcaaacccccaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaac-tcttgtataatccaataatttggaacctcat 28194696  T
Q  221 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 275  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28194697 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 28194752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 15878363 - 15878083
Alignment:
Q  22 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 120  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  15878363 agcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagg 15878265  T
Q  121 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt--- 217  Q
    ||||  ||||||||||||    |||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |  | || |||| | |||||||||||||||  ||       
T  15878264 gcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatgaactcgatctcttaaacatcat-aatc-atcatctcttat-ttatccaataatttggaggttcaa 15878169  T
Q  218 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacat 303  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| || | ||||  ||||| ||||| |||||||    
T  15878168 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacaatatgacat 15878083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 10542969 - 10542852
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  10542969 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctc 10542870  T
Q  117 caaggcatcaagccccca 134  Q
    || |||||||||||||||    
T  10542869 cagggcatcaagccccca 10542852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 217 - 336
Target Start/End: Original strand, 17672626 - 17672744
Alignment:
Q  217 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 316  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17672626 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaaca-tagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 17672724  T
Q  317 gcaagacaacaacatctcaa 336  Q
    ||||  ||||||| ||||||    
T  17672725 gcaaatcaacaacgtctcaa 17672744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 142 - 362
Target Start/End: Original strand, 46822187 - 46822413
Alignment:
Q  142 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat------catcttcatcaactt 235  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||      |||||| ||||||||    
T  46822187 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacatcattatcaacatcttaatcaactt 46822286  T
Q  236 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctca 335  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| || | ||||  ||||  ||||||| ||||||| |||||||| |||||  ||||||||||| |    
T  46822287 agactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacaacaagacataaaaatatcaattgcaattcaacaacatctta 46822386  T
Q  336 aatatacattcatgactcaagtaatgc 362  Q
    ||||| || | ||  ||||||||||||    
T  46822387 aatattcaataatatctcaagtaatgc 46822413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 22 - 275
Target Start/End: Original strand, 23408234 - 23408485
Alignment:
Q  22 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaagg 121  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||    
T  23408234 agcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatgag-cccccatcgctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctctaggg 23408332  T
Q  122 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt---c 218  Q
    |||  ||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |  | || |||| | |||||||||||||||  ||   |    
T  23408333 cat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatgaactcgatctcttaaacatc-aaaatc-atcatctcttat-ttatccaataatttggaggttcaac 23408428  T
Q  219 atcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 275  Q
    |||||||| |||| |||| || |||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||    
T  23408429 atcatcttgatcatcttatactgactcatgcaacttggttaattaacaatagcaaca 23408485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 143 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 37642458 - 37642170
Alignment:
Q  143 atgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccg 241  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||| | |||| |||||    
T  37642458 atgctaatgcatggactcgacttcttaaacgtcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacatcaacatcttcaacgacttggaccg 37642359  T
Q  242 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 340  Q
    ||||||||||||||||||  |||  | |||||||| | ||||||| | |||||| ||||| |||||||||||  | | |||  ||||||||||||||||     
T  37642358 actcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgc-aaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataa 37642260  T
Q  341 acattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 427  Q
     ||   || | ||||||||||| |||| |||  |||||||| |||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||| || |||||    
T  37642259 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagcttcacagatcatcattaa 37642170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 133
Target Start/End: Original strand, 14682183 - 14682300
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 115  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  14682183 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagct 14682282  T
Q  116 ccaaggcatcaagccccc 133  Q
    ||||||||||||||||||    
T  14682283 ccaaggcatcaagccccc 14682300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 233 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 53070799 - 53070659
Alignment:
Q  233 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatc 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  53070799 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataa-cagtatacaaaaacaacaagacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 53070701  T
Q  333 tcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    |||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  53070700 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 53070659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 10542864 - 10542747
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  10542864 catcaagcccccattgctatttgagtactaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctc 10542765  T
Q  117 caaggcatcaagccccca 134  Q
    || |||||||||||||||    
T  10542764 cagggcatcaagccccca 10542747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 113 - 337
Target Start/End: Original strand, 15470827 - 15471047
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttg 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || | ||  ||||| || |||| | | ||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  15470827 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcattgacacaacaacttaa-caacttagaacaacaacctcttaaataagtccaataatttg 15470924  T
Q  212 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataata 310  Q
    |||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||||    
T  15470925 gaacatcatcatcttca---acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaata 15471020  T
Q  311 tcaaatgcaagacaacaacatctcaaa 337  Q
    || |||||||| || ||||||||||||    
T  15471021 tcgaatgcaagtcatcaacatctcaaa 15471047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 133
Target Start/End: Original strand, 14670661 - 14670778
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 115  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||  ||| |||||||||    
T  14670661 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatgcttccagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaaagctccaacgtggtgactacaaagct 14670760  T
Q  116 ccaaggcatcaagccccc 133  Q
    ||||||||||||||||||    
T  14670761 ccaaggcatcaagccccc 14670778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 113 - 332
Target Start/End: Original strand, 14234382 - 14234605
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatata-----atccaata 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | |   ||||| | ||||| || | ||||||| |||||||     ||||||||    
T  14234382 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaataacttaa-cttcttataaacaacaaccttttatatatatatatccaata 14234479  T
Q  207 atttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataa 305  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| | ||| || ||||| ||||    
T  14234480 atttggaacatcatcatcttaatcaacttagactgattcatgcagcttagttaaataacaagcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataa 14234578  T
Q  306 taatatcaaatgcaagacaacaacatc 332  Q
     |||||| |||||||| || |||||||    
T  14234579 caatatcgaatgcaagtcatcaacatc 14234605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 113 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 12174467 - 12174265
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |         ||||||||| | | ||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  12174467 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgttaatgcatggacac---------aacatcttagaacaacaacctcttata-agtccaataatttgg 12174379  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 311  Q
    ||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||    
T  12174378 aacatcatcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatat 12174283  T
Q  312 caaatgcaagacaacaac 329  Q
    | ||||||| ||||||||    
T  12174282 cgaatgcaaaacaacaac 12174265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 113 - 320
Target Start/End: Original strand, 9512825 - 9513026
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | || |||||| || |||||| | ||| | | ||||| | |||||||||||||    
T  9512825 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacatcttaa-caacttaaaacaacatcatcttata-agtccaataatttgg 9512921  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 311  Q
    ||| |||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||    
T  9512922 aacatcatcatcatcatc---ttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatat 9513017  T
Q  312 caaatgcaa 320  Q
    | |||||||    
T  9513018 cgaatgcaa 9513026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 113 - 320
Target Start/End: Original strand, 9520800 - 9521001
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | || |||||| ||||||| | | ||| | | ||||| | |||||||||||||    
T  9520800 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacatcttaa-catcttagaacaacatcatcttata-agtccaataatttgg 9520896  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 311  Q
    ||| |||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||    
T  9520897 aacatcatcatcatcatc---ttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatat 9520992  T
Q  312 caaatgcaa 320  Q
    | |||||||    
T  9520993 cgaatgcaa 9521001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 113 - 340
Target Start/End: Original strand, 16103685 - 16103905
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |  | |||||  || |||||| | ||| | | ||||| | |||||||||||||    
T  16103685 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgttaatgcatggacacatcatcttag-caacttaaaacaacatcatcttata-agtccaataatttgg 16103781  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 311  Q
    ||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||    
T  16103782 aacatcatcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacgaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatat 16103877  T
Q  312 caaatgcaagacaacaacatctcaaatat 340  Q
    | |||||||  ||||||||||||||||||    
T  16103878 cgaatgcaa-tcaacaacatctcaaatat 16103905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 113 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 49668292 - 49668091
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | || |||||| || |||| | | ||| | | ||||| | |||||||||||||    
T  49668292 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacatcttaa-caacttagaacaacatcatcttata-agtccaataatttgg 49668196  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 311  Q
    ||| |||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||    
T  49668195 aacatcatcatcatcatc---ttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatat 49668100  T
Q  312 caaatgcaa 320  Q
    | |||||||    
T  49668099 cgaatgcaa 49668091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 144 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 22147717 - 22147431
Alignment:
Q  144 tgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccga 242  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||| | |||| ||||||    
T  22147717 tgctaatgcatggactcgacttcttaaacgtcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacatcaacatcttcaacgacttggaccga 22147618  T
Q  243 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatata 341  Q
     ||||||||||||||||  |||  | |||||||  | || |||| | |||||| ||||| |||||||||||  | | |||  ||||||||||||||||      
T  22147617 gtcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcggtatgc-aaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataat 22147519  T
Q  342 cattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 427  Q
    ||   || | ||||||||||| |||| |||  |||||||| |||| |||||| ||| |||| |||| ||||||||||||| || |||||    
T  22147518 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat-aaatcatcataaatcagcttcacagatcatcattaa 22147431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 120 - 340
Target Start/End: Original strand, 16097238 - 16097454
Alignment:
Q  120 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| |||| || | || |||||| || |||| | | |||| || ||| |||| |||||||||||||||| ||    
T  16097238 ggcatcaagcccccaacaatgaa-tgttaattcatggacacaacatcttaa-caacttagaacaacaatctcttaaataagtccaataatttggaacatc 16097335  T
Q  219 atcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatg 317  Q
    ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| ||| ||||  || ||| | |||| |||||| ||||    
T  16097336 atcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcaatatgcaaat-catcatcatataacaatatcgaatg 16097431  T
Q  318 caagacaacaacatctcaaatat 340  Q
    |||| || |||||||||||||||    
T  16097432 caagtcatcaacatctcaaatat 16097454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 113 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 52523946 - 52523633
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataa-tccaataattt 210  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||  || || ||||||| ||   |||| || |||||||| |||||||||||    
T  52523946 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgttaatgcatggactcaacaactcaa-catcttagaaataacaaactcttatataaatccaataattt 52523849  T
Q  211 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaa-acaacatgacataataa 308  Q
    |||||   ||| |||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| ||||| |   ||||| |||| ||    
T  52523848 ggaac---atcttctg--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacagttcatgatataacaa 52523754  T
Q  309 tatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatctta-aa 405  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||||| || |||  || | ||||||||||| |||| |||  |||||||| |||| ||||||| || ||||||| ||    
T  52523753 tatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatc-aatcatcttataa 52523655  T
Q  406 cagcttcacagattataattaa 427  Q
    ||||||| ||||| || |||||    
T  52523654 cagcttctcagatcatcattaa 52523633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 200 - 336
Target Start/End: Original strand, 32307666 - 32307798
Alignment:
Q  200 tccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacat 298  Q
    ||||||||||||||||  |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || |||    
T  32307666 tccaataatttggaacaacatcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcat 32307761  T
Q  299 gacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaa 336  Q
    || |||| |||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  32307762 gatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 32307798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 372 - 431
Target Start/End: Original strand, 14179592 - 14179651
Alignment:
Q  372 tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttc 431  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14179592 tatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacttc 14179651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 113 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 22110569 - 22110349
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataa-tccaataattt 210  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||   ||||||| |||| ||  ||||| ||||||| || | || |||| |||||||| |||||||||||    
T  22110569 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgagtatgcatggactcaacaacttaa-catcttagaaacaacgacctcttatataaatccaataattt 22110472  T
Q  211 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaa-acaacatgacataataa 308  Q
    ||||| |||||  |||||||   |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | |||||| | |||| |   ||||| |||| ||    
T  22110471 ggaacatcatc--cttcatc---ttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaa 22110377  T
Q  309 tatcaaatgcaagacaacaacatctcaa 336  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  22110376 tatcaaatgcaaatcaacagcatctcaa 22110349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 23077776 - 23077642
Alignment:
Q  36 tttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagccccca 134  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| |||||  ||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||||||||    
T  23077776 tttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctagtttgagataatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggcat-gagccccca 23077679  T
Q  135 aca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa 171  Q
    ||| |||  ||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  23077678 acatatg-tatgctaatgaatggactcgatctcttaaa 23077642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Original strand, 27165069 - 27165135
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  27165069 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctatttga 27165135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 198 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 37251300 - 37251165
Alignment:
Q  198 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaa-acaa 295  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||| | |||||||| |||| |       
T  37251300 aatccaataatttggaac---atcatcttc--catcttagaccgagtcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagtt 37251206  T
Q  296 catgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaa 336  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  37251205 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaa 37251165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 1644882 - 1644718
Alignment:
Q  120 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || | || |||||| || |||| | | ||| | | ||||| | ||||||||||||||||   |    
T  1644882 ggcatcaagcccctaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacatcttaa-caacttagaacaacatcatcttata-agtccaataatttggaac---a 1644789  T
Q  220 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaa 290  Q
     |||| ||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||    
T  1644788 acatcgtcatcaacttagaccaacttatgttgcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatgcaaa 1644718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 112
Target Start/End: Original strand, 16796117 - 16796192
Alignment:
Q  37 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaa 112  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||    
T  16796117 ttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaa 16796192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 198 - 337
Target Start/End: Original strand, 43925947 - 43926083
Alignment:
Q  198 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaa-acaa 295  Q
    ||||||||||||||||||   | ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | |||||| | |||| |       
T  43925947 aatccaataatttggaac---aacatctt--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagct 43926041  T
Q  296 catgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaa 337  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  43926042 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaa 43926083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Original strand, 8499337 - 8499403
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  8499337 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctatttga 8499403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 179
Target Start/End: Original strand, 15067499 - 15067644
Alignment:
Q  34 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccc 132  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||| ||||| || |||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  15067499 tattttagtattaatatactttcagggcatgag-cccccatcgttattttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccc 15067596  T
Q  133 caacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 179  Q
    ||||||    ||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||    
T  15067597 caacaaatgtatgctaatgcatggactcaatctcttaaaacatcttaa 15067644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Original strand, 15412248 - 15412314
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  15412248 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctatttga 15412314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 179
Target Start/End: Original strand, 16369216 - 16369361
Alignment:
Q  34 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccc 132  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||| ||||| || |||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||| ||    
T  16369216 tattttagtattaatatactttcagggcatgag-cccccatcgttattttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-aagctcc 16369313  T
Q  133 caacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 179  Q
    ||||||    ||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||    
T  16369314 caacaaatgtatgctaatgcatggactcaatctcttaaaacatcttaa 16369361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 239
Target Start/End: Original strand, 16796195 - 16796339
Alignment:
Q  93 tccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctat 192  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||| |  | || |    
T  16796195 tccatcgtggtgagtacaaagctccagggcatga-gcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatctcttaaacatcat-aatc-atcatctct 16796291  T
Q  193 tata-taatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagac 239  Q
    |||| || | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  16796292 tatattagtgcaataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagac 16796339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 53301850 - 53301784
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  53301850 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatactt-cagagcatcaagcccctatcgctatttga 53301784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 22147782 - 22147716
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttg 83  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  22147782 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaatcgctatttg 22147716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 36 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 23053387 - 23053244
Alignment:
Q  36 tttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagccccca 134  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  ||| ||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||  | ||||||    
T  23053387 tttgagtattaatatatttccagggcat-aagcccccatttctagtttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccaaggcat-gatccccca 23053290  T
Q  135 aca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 179  Q
    ||| |||  ||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||    
T  23053289 acatatg-tatgctaatgcatggactcaatctcttaaaacatcttaa 23053244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 14878814 - 14878672
Alignment:
Q  37 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaa 135  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||  | |||||| |||||||||||||||  ||||||| || ||||| |||||  ||||||| |    
T  14878814 ttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatctttaatttgagctaaagctccatcgtggtgagtactaatctccagggcat-gagcccccta 14878717  T
Q  136 ca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 179  Q
    || |||  ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  14878716 catatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatcttaa 14878672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 12120103 - 12120045
Alignment:
Q  25 ccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  12120103 ccccgtcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctatttga 12120045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 22147826 - 22147759
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||    
T  22147826 catcaagcccctatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgctatttga 22147759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Original strand, 26683157 - 26683200
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccaggg 60  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26683157 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccaggg 26683200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Original strand, 46822080 - 46822147
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||    
T  46822080 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgctatttga 46822147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 372 - 426
Target Start/End: Original strand, 16796707 - 16796761
Alignment:
Q  372 tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataatta 426  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  16796707 tatcacatcataatcaaaaacaacacatcttaaacaacttcacatattataatta 16796761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 296 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 2051238 - 2051138
Alignment:
Q  296 catgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatca 393  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||  || | ||||||||||| |||| |||  |||||||| |||| ||||||||    
T  2051238 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatca 2051139  T
Q  394 a 394  Q
    |    
T  2051138 a 2051138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 46822124 - 46822185
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 78  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  46822124 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaatcgct 46822185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 275
Target Start/End: Original strand, 13919350 - 13919390
Alignment:
Q  235 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  13919350 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaaca 13919390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 73
Target Start/End: Original strand, 28194557 - 28194612
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaaccccca 73  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  28194557 catcaagcccctatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaaaccccca 28194612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Original strand, 10556804 - 10556870
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||   ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  10556804 catcaagcccccatcgctatttgagtattaccatac-tccagagcatcaagcccctatcgctatttga 10556870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 275
Target Start/End: Original strand, 14665380 - 14665458
Alignment:
Q  199 atccaataatttggaact--tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 275  Q
    |||||||||||||||  |  |||||||||| |||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  14665380 atccaataatttggagttcatcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcaaca 14665458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 15076267 - 15076200
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||    
T  15076267 catcaagccccaatctctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgctatttga 15076200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 15076311 - 15076244
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||| ||||||||    
T  15076311 catcaagcccctatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatctctatttga 15076244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 22147869 - 22147803
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  22147869 catcaagcccctatcgctatttaagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctatttga 22147803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Original strand, 28194514 - 28194580
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  28194514 catcaagcctcaatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctatttga 28194580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 43550825 - 43550758
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||| |||  ||||||||||||    
T  43550825 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccaaagcatcaagccctaatcgctatttga 43550758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 12120068 - 12120003
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttg 83  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||| |||| |||||||||||    
T  12120068 catcaagcccctatcgctatttgagtattaatatac-tccaaagcatcaagcccctatcgctatttg 12120003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 43550852 - 43550802
Alignment:
Q  34 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  43550852 tatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaatcgctatttga 43550802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 84
Target Start/End: Original strand, 46822049 - 46822103
Alignment:
Q  30 tcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||    
T  46822049 tcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgctatttga 46822103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 218 - 275
Target Start/End: Original strand, 856140 - 856197
Alignment:
Q  218 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 275  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  856140 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttagttgaataacaatagcaaca 856197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 10556847 - 10556907
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 78  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||| ||||||    
T  10556847 catcaagcccctatcgctatttgagtattactatac-tccagggcatcaagcccctatcgct 10556907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 15412291 - 15412351
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 78  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||    
T  15412291 catcaagcccctatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgct 15412351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 82
Target Start/End: Original strand, 17737057 - 17737121
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt 82  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  17737057 catcaagcccctatcgctatttaagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctattt 17737121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 18384158 - 18384090
Alignment:
Q  91 gctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactc 160  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    ||||||||||||| ||||    
T  18384158 gctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-aagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactc 18384090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 218 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 23077594 - 23077537
Alignment:
Q  218 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 275  Q
    ||||||||| |||| |||| |  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  23077594 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttggttaaataacaacagcaaca 23077537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 27165112 - 27165172
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 78  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||    
T  27165112 catcaagcccctatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgct 27165172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 82
Target Start/End: Original strand, 50242643 - 50242707
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt 82  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  50242643 catcaagcccctatcgttatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctattt 50242707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 55476354 - 55476415
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 78  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  55476354 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgct 55476415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 179
Target Start/End: Original strand, 12172658 - 12172757
Alignment:
Q  80 tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatctta 178  Q
    ||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||| || |||||  ||||||||||||    ||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||    
T  12172658 tttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctacagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcaatctcttaaaacatctta 12172756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 199 - 272
Target Start/End: Original strand, 14668536 - 14668611
Alignment:
Q  199 atccaataatttggaact--tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 272  Q
    |||||||||||||||  |  |||||||||| |||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  14668536 atccaataatttggagttcatcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaatagca 14668611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 179
Target Start/End: Original strand, 15051371 - 15051470
Alignment:
Q  80 tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatctta 178  Q
    ||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||  || |||||||||    ||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||    
T  15051371 tttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gaggccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcaatctcttaaaacatctta 15051469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 43550781 - 43550725
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaaccccca 73  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||    
T  43550781 catcaagccctaatcgctatttgagtattattatacttccaaggcatcaagccccca 43550725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 56 - 84
Target Start/End: Original strand, 43840730 - 43840758
Alignment:
Q  56 cagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43840730 cagggcatcaaacccccatcgctatttga 43840758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 76)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 17 - 434
Target Start/End: Original strand, 23060315 - 23060734
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23060315 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctc 23060414  T
Q  117 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg-aac 215  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  23060415 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaac 23060514  T
Q  216 ttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 315  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23060515 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaat 23060614  T
Q  316 tgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttca 413  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||  | | ||   |||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23060615 tgcaagtcaacaacatcttaaatattaaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttca 23060714  T
Q  414 cagattataattaacttcatc 434  Q
    || |||||||||||| |||||    
T  23060715 ca-attataattaacatcatc 23060734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 17 - 434
Target Start/End: Original strand, 22336928 - 22337337
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  22336928 catcaagcccccatcgctatt-gagtattaatatacttccagggcatcaagcccc-atcgcaatttgagctaaagctccattgtgttgagtacaaagctc 22337025  T
Q  117 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 216  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||        ||||||||     
T  22337026 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacttcttaattcgacaacctcttatataa--------tttggaaca 22337117  T
Q  217 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22337118 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggctgtatataaaaacagcatgacataataatatcaaat 22337217  T
Q  317 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  22337218 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacatatcttaaacaacttcac 22337317  T
Q  415 agattataattaacttcatc 434  Q
    | |||||||||||| |||||    
T  22337318 aaattataattaacatcatc 22337337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 18 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 22731551 - 22731139
Alignment:
Q  18 atcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctcc 117  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  22731551 atcaagcccccatcgttatttgagtattaatatacttcaagggcaccaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctcc 22731452  T
Q  118 aaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt 217  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  22731451 agggaatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctgttagacatctttattcaacaacctcttatataatccaataatttggaacat 22731352  T
Q  218 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatg 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  22731351 catcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 22731252  T
Q  318 caagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcaca 415  Q
    |||  || |||||| | |||||| ||   ||   |||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22731251 caattcatcaacatattaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcaca 22731152  T
Q  416 gattataattaac 428  Q
    |||||||||||||    
T  22731151 gattataattaac 22731139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 56 - 434
Target Start/End: Original strand, 23076288 - 23076664
Alignment:
Q  56 cagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 155  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||     |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076288 cagggcatcaagcccccatcgctatttgagctaaagctccatcgt-----gtacaaaggttcagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 23076382  T
Q  156 aactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaa-cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctt 254  Q
     ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23076383 gactcggcctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaacatcatcatcttcatccacttagaccgactcatgcagctt 23076482  T
Q  255 agttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactca 354  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||| || | ||   |||    
T  23076483 agttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaatatcttaaatattcaattatacttca 23076582  T
Q  355 agtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcatc 434  Q
    ||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23076583 agtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacagcttaaacagcttcacagattataattaacatcatc 23076664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 17 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 23654706 - 23654291
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 115  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  23654706 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagct 23654607  T
Q  116 ccaaggcatcaagccccc-aacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttgga 213  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  23654606 ccagggcatcaagccccccaacaatgaa-tgctagtgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttgga 23654508  T
Q  214 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 313  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  23654507 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacagcataggcagcatacaaatacatcatgacataataatatca 23654408  T
Q  314 aatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagctt 411  Q
    | |||||  || |||||||| |||||| ||   || ||||||||||||| || || ||  |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  23654407 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaagtattactcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataattaacaacaacacatcttaaacagctt 23654308  T
Q  412 cacagattataattaac 428  Q
    |||||||||||||||||    
T  23654307 cacagattataattaac 23654291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 17 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 22738497 - 22738085
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  |||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  22738497 catcaagcccccatcgctaattgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcactaattgagttaaagctccaacgtgttgagtacagagctc 22738398  T
Q  117 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 216  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  22738397 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggatccgaccttttagacatcttaattcaacaacctcttatataatccaataatttggaaca 22738298  T
Q  217 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 316  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  22738297 tcatcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacattaa-ataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 22738199  T
Q  317 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 414  Q
    ||||  || |||||||| |||||| ||   ||   |||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22738198 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 22738099  T
Q  415 agattataattaac 428  Q
    ||||||||||||||    
T  22738098 agattataattaac 22738085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 131 - 434
Target Start/End: Original strand, 23659940 - 23660244
Alignment:
Q  131 cccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23659940 cccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatcatcttcatc 23660039  T
Q  231 aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaaca 330  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  23660040 aacttagaccgactcatgtatcttagttaaacaacaacagcaacataggcagtatac-gaaacaggatgacataataatatcaaatgcaaatcaacaaca 23660138  T
Q  331 tctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaac 428  Q
    ||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  23660139 tcttaaatattcaatcataactcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctttacaaattataattaac 23660238  T
Q  429 ttcatc 434  Q
     |||||    
T  23660239 atcatc 23660244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 21 - 291
Target Start/End: Original strand, 8946463 - 8946734
Alignment:
Q  21 aagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 120  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  8946463 aagcccccattgctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagcccccatcgctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagg 8946562  T
Q  121 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg-aacttca 219  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  8946563 gcatcaagtccctaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaacatca 8946662  T
Q  220 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaa 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  8946663 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttagataacaatagcaacataggcagtatacaaaa 8946734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Original strand, 18808840 - 18809099
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18808840 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 18808938  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18808939 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 18809037  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  18809038 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 18809099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 23712278 - 23712019
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23712278 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 23712180  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23712179 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 23712081  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  23712080 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 23712019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Original strand, 39682210 - 39682469
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39682210 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 39682308  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39682309 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 39682407  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  39682408 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 39682469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 113 - 373
Target Start/End: Original strand, 23135487 - 23135745
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23135487 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 23135585  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23135586 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 23135684  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaatta 373  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| |||||    
T  23135685 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaatta 23135745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Original strand, 24367670 - 24367930
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24367670 gctccagggcatcaagcccccaacaatgtaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 24367769  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24367770 aacttcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 24367868  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  24367869 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 24367930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Original strand, 26505276 - 26505535
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26505276 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 26505374  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  26505375 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agcagtatacaaaaatagcatgacataataatatc 26505473  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  26505474 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 26505535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Original strand, 26507754 - 26508013
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26507754 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 26507852  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  26507853 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agcagtatacaaaaatagcatgacataataatatc 26507951  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  26507952 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 26508013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 17 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 23040509 - 23040249
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 115  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||  ||||||||||  |    
T  23040509 catcaagctcccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaaatt 23040410  T
Q  116 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaa 214  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  23040409 tcaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgcactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaa 23040310  T
Q  215 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 275  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23040309 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 23040249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 113 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 45030119 - 45029898
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45030119 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 45030021  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45030020 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacaa-caatatacaaaaacaacatgacataataatatc 45029922  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaa 336  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||    
T  45029921 aaatgcaagtcaacaacgtctcaa 45029898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 120 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 21155318 - 21155066
Alignment:
Q  120 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  21155318 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttct 21155220  T
Q  220 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 319  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  21155219 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 21155121  T
Q  320 agacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    || ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  21155120 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 21155066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 24905898 - 24905638
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24905898 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 24905800  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 311  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24905799 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatat 24905701  T
Q  312 caaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  24905700 caaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 24905638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 24908373 - 24908113
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24908373 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 24908275  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 311  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24908274 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatat 24908176  T
Q  312 caaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  24908175 caaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 24908113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 23709797 - 23709538
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23709797 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 23709699  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23709698 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 23709600  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  23709599 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 23709538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 38435 - 38016
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||    
T  38435 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagc 38336  T
Q  115 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa-catcttaaat-cgacaacctattatataa-tccaataatttg 211  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| || | ||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  38335 tccagggcatcaagcccc-aacaatgaa-tgctaatgcatggactccacctcttaaaacaacataaattcgacaacctcttatattagtccaataatttg 38238  T
Q  212 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 311  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  38237 gaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatat 38139  T
Q  312 caaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat-tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagct 410  Q
    ||| | | |  || || ||||| |  ||||||  |||   ||||||||||| || | | | ||||||||||||||||||| ||| |  ||||| ||||||    
T  38138 caatttcgattcatcatcatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcataaacattatatcacatcataatcaacaacaacatgtcttatacagct 38039  T
Q  411 tcacagattataattaacttcat 433  Q
    ||| |||||||||||||| ||||    
T  38038 tcagagattataattaacctcat 38016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 113 - 336
Target Start/End: Original strand, 571294 - 571515
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  571294 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 571392  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  571393 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 571491  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaa 336  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||    
T  571492 aaatgcaagtcaacaacgtctcaa 571515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 24898461 - 24898201
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24898461 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcaacaacctcttatataatccaataatttgg 24898363  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 311  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24898362 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatat 24898264  T
Q  312 caaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  24898263 caaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 24898201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 24900944 - 24900684
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24900944 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcaacaacctcttatataatccaataatttgg 24900846  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 311  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24900845 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatat 24900747  T
Q  312 caaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  24900746 caaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 24900684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 24903421 - 24903161
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24903421 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcaacaacctcttatataatccaataatttgg 24903323  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 311  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24903322 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatat 24903224  T
Q  312 caaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  24903223 caaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 24903161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Original strand, 6725892 - 6726151
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  6725892 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttacatcgacaacctcttatataattcaataatttgg 6725990  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6725991 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 6726089  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  6726090 aaatgtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 6726151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 113 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 24529795 - 24529573
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24529795 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 24529696  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24529695 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataacaacaacaacac-atcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 24529597  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaa 336  Q
    || ||||||  |||||| ||||||    
T  24529596 aagtgcaagttaacaacgtctcaa 24529573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Original strand, 28576996 - 28577255
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  28576996 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcaacaacttcttatataatccaataatttgg 28577094  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  28577095 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacgcaa-cagtatacaaaaacagcatgatataataatatc 28577193  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  28577194 aaatgcaagccaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 28577255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 32039763 - 32039504
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32039763 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 32039665  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32039664 aacttcatcatcttaatcaacttagaccggctcatgcagcttagttaaataacaacagtaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 32039566  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  32039565 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 32039504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 142 - 374
Target Start/End: Original strand, 23130788 - 23131018
Alignment:
Q  142 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccg 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23130788 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaa-tcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccg 23130886  T
Q  242 actcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatata 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||     
T  23130887 actcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 23130985  T
Q  342 cattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  23130986 cacatataattcaagtaatgcatatacaattat 23131018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 142 - 374
Target Start/End: Original strand, 23133255 - 23133485
Alignment:
Q  142 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccg 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23133255 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaa-tcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccg 23133353  T
Q  242 actcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatata 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||     
T  23133354 actcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 23133452  T
Q  342 cattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  23133453 cacatataattcaagtaatgcatatacaattat 23133485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 142 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 34402758 - 34402528
Alignment:
Q  142 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccg 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34402758 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaa-tcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccg 34402660  T
Q  242 actcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatata 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||     
T  34402659 actcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 34402561  T
Q  342 cattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  34402560 cacatataattcaagtaatgcatatacaattat 34402528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 23072269 - 23071972
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||    
T  23072269 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagc 23072170  T
Q  115 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttgga 213  Q
    || |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  23072169 tctagagcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgaaaacctcttatattaatccaataatttgga 23072071  T
Q  214 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  23072070 acatcatcatcttcaacaacttagtccgactcatgcagcttagttaaataacgaacaacaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 23071972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 121 - 336
Target Start/End: Original strand, 43137204 - 43137417
Alignment:
Q  121 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 220  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  43137204 gcatcaagcccccaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaatactttggaacttaat 43137302  T
Q  221 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 320  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43137303 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agtaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 43137401  T
Q  321 gacaacaacatctcaa 336  Q
    | ||||||| ||||||    
T  43137402 gtcaacaacgtctcaa 43137417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 23103714 - 23103370
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 114  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||    
T  23103714 catcaagcccccatcgctatttgagtagtaatatactttcagggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagc 23103615  T
Q  115 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttgga 213  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| || | ||||||| ||||||    
T  23103614 tccagggcatcaagcccc-aacaatgag-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttaaattagtccaatattttgga 23103517  T
Q  214 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 313  Q
    || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||  ||||| |||||||| || ||||||    
T  23103516 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataaaaacagcaacataggcagtatac--aaacagcatgacatgattatatca 23103419  T
Q  314 aatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgc 362  Q
    ||| |||  || |||||||||||  || ||||||| | |||||| ||||    
T  23103418 aattcaattcatcaacatctcaatcattcattcataattcaagtcatgc 23103370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 53 - 433
Target Start/End: Original strand, 20308945 - 20309326
Alignment:
Q  53 ttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaat 150  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  20308945 ttccagggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaactatgaa-tgctaat 20309043  T
Q  151 gcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgc 249  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  20309044 gcatggactcgacatcttaaacaacttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgc 20309143  T
Q  250 agcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcat 348  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||   |||| ||||||||||| ||||||||| |||  || |||||||| |  ||||||   ||    
T  20309144 agcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatac---aacagcatgacataattatatcaaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaatat 20309240  T
Q  349 gactcaagtaatgcgtataaaattat--cacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcat 433  Q
       ||||||||||| || || |||||  |||||||||||||||| ||| | ||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20309241 tcttcaagtaatgcata-aacattataacacatcataatcaacaacaacatatcttattcagcttcacagattatagttaacctcat 20309326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 122 - 374
Target Start/End: Original strand, 22105319 - 22105569
Alignment:
Q  122 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatc 221  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  22105319 catcaagtccccaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaac-tcttgtataatccaataatttgaaacttcatc 22105416  T
Q  222 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaag 321  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22105417 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 22105516  T
Q  322 acaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
     ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  22105517 tcaacaacttctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 22105569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 120 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 24643209 - 24643036
Alignment:
Q  120 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 219  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  24643209 ggcatcaagcctccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaatcatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcg 24643110  T
Q  220 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaaca 294  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  24643109 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-atcagtatacaaaaaca 24643036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21900773 - 21900560
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctat-ttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 115  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  21900773 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatactttcagggcatcaagcccccatcgctaaattgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagct 21900674  T
Q  116 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaa 214  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  21900673 ccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggacttgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaa 21900574  T
Q  215 cttcatcatcttca 228  Q
    | ||||||||||||    
T  21900573 catcatcatcttca 21900560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 121 - 336
Target Start/End: Original strand, 38967279 - 38967493
Alignment:
Q  121 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 220  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  38967279 gcatcaagcccccaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaaactcctatataatccaatattttggaacttcat 38967377  T
Q  221 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 320  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  38967378 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacatcgacacaa-caatatacaaaaatagcatgaaataataatatcaaatgcaa 38967476  T
Q  321 gacaa-caacatctcaa 336  Q
    | ||| |||||||||||    
T  38967477 gtcaatcaacatctcaa 38967493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 121 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 299027 - 298719
Alignment:
Q  121 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 220  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||| |||||| ||||||||    
T  299027 gcatcaagcccccaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaaacatgttaaatcgacaac-tcttgtataatccaaaaatttgaaacttcat 298930  T
Q  221 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 319  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||  ||||||| ||||    
T  298929 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgca 298830  T
Q  320 agacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacaga 417  Q
    |  ||||||||||| |||||| ||   |   |||||||||||| || || ||  |||||||||||||| || | ||| |||||||| ||||||||||| |    
T  298829 attcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataattaataacaacacatcttatacagcttcacata 298730  T
Q  418 ttataattaac 428  Q
    ||||| |||||    
T  298729 ttatagttaac 298719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 168 - 428
Target Start/End: Original strand, 23285818 - 23286077
Alignment:
Q  168 taaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca 266  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23285818 taaacatcttaattcaacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca 23285917  T
Q  267 acagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtat 366  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||    |||||||||||||||| |||||  || |||||||| |||||| ||    |   ||||||||||| ||     
T  23285918 acagcaacataggcagtatacaaaaaca----gacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatgttcttcaagtaatgcataa 23286013  T
Q  367 aaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaac 428  Q
    || ||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23286014 aacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattataattaac 23286077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 60 - 336
Target Start/End: Original strand, 19671675 - 19671952
Alignment:
Q  60 gcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaact 159  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||| || ||||| || |||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||    
T  19671675 gcatcaagcccctatcgctaattgagcttaagcttcaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagctcccaaccatgaaatgctaatgcatagact 19671774  T
Q  160 cgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattat-ataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagtt 258  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  19671775 cgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagtt 19671874  T
Q  259 aaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaa 336  Q
    || |||||| |||||||| | ||||||| | |||||| ||||| ||||||||||| || |||||  |||||||||||||    
T  19671875 aattaacaatcagcaacataggcagtatgc-aaaacatcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacatctcaa 19671952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 142 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 32215164 - 32214927
Alignment:
Q  142 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatc------ttcatcaactt 235  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||      || ||||||||    
T  32215164 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacatcatcatcaacatcttaatcaactt 32215065  T
Q  236 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctca 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  32215064 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacac-agcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctca 32214966  T
Q  336 aatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    | ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  32214965 attattcacatataattcaagtaatgcatatataattat 32214927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 22741276 - 22741027
Alignment:
Q  22 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 120  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  22741276 agcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagg 22741178  T
Q  121 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt--- 217  Q
    ||||  ||||||||||||    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |  | || |||| | |||||||||||||||| ||       
T  22741177 gcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatctcttaaacatctt-aatc-atcatctcttat-ttatccaataatttggaagttcaa 22741082  T
Q  218 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 272  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||  |||||||||||| ||||    
T  22741081 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaactaggttaaataacaatagca 22741027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 184 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 23708769 - 23708524
Alignment:
Q  184 acaacctattatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacacaagca 281  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| | |||    
T  23708769 acaacctcttatataaatccaataatttggaacatcatcatctt--tcaacttagaccgactcaagcagcttagttaaataacagatagcaacataggca 23708672  T
Q  282 gtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacat 379  Q
    |||| | |||||||||||| |||| |||||||| |||||  || | |||||||||| || ||   || | ||||||||||| |||| |||  ||||||||    
T  23708671 gtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaattgcaaatcatcgacatctcaaacattcaaatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacat 23708573  T
Q  380 cataatcaacatcaaaacatctta-aacagcttcacagattataattaa 427  Q
     |||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  23708572 tataaacaacatcaattcatcttataacagcttcacagatcatcattaa 23708524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 142 - 362
Target Start/End: Original strand, 25616107 - 25616333
Alignment:
Q  142 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat------catcttcatcaactt 235  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||      |||||| ||||||||    
T  25616107 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacatcattattaacatcttaatcaactt 25616206  T
Q  236 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctca 335  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||| || | ||||  ||||  |||| || ||||||| |||||||| |||||  ||||||||||| |    
T  25616207 agactgactcatgcaacttagttaaattacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaattgcaattcaacaacatctta 25616306  T
Q  336 aatatacattcatgactcaagtaatgc 362  Q
    ||||| || | ||  ||||||||||||    
T  25616307 aatattcaataatatctcaagtaatgc 25616333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 113 - 340
Target Start/End: Original strand, 28405881 - 28406103
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |  | |||||| || |||| | | ||| | | ||||| | |||||||||||||    
T  28405881 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacatcatcttaa-caacttagaacaacatcatcttata-agtccaataatttgg 28405977  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 311  Q
    ||  ||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||    
T  28405978 aaaatcatcatc---atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaatcatcatgatataacaatat 28406074  T
Q  312 caaatgcaagacaacaacatctcaaatat 340  Q
    | |||||||  ||||||||||||||||||    
T  28406075 cgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 28406103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 113 - 340
Target Start/End: Original strand, 25175754 - 25175976
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataatccaataatttg 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||  ||||| | ||||| || | ||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  25175754 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttata-agtccaataatttg 25175850  T
Q  212 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataata 310  Q
    |||| ||||||||   |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||||    
T  25175851 gaacatcatcatc---atcaacttagacagattcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaata 25175946  T
Q  311 tcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 340  Q
    || |||||||  ||||||||||||||||||    
T  25175947 tcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 25175976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 22 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 22759031 - 22758875
Alignment:
Q  22 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 120  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||| |  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |    
T  22759031 agcccccatcgttatttgagtatttatatacttccagggcat-aggcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctctagg 22758933  T
Q  121 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaa 179  Q
    ||||  ||||||||||||    ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  22758932 gcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatctcttatacatcttaa 22758875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 7950 - 7694
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataa-tccaataattt 210  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||  || || | ||||| || | || |||| |||||||| |||||||||||    
T  7950 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcaacaactcaacc-tcttagaaacaacgacctcttatataaatccaataattt 7853  T
Q  211 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataat 309  Q
    |||||   ||| ||||  ||| ||||||| || |||||||||||||||||  ||||| |||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||    
T  7852 ggaac---atcttctt--tcatcttagactgaatcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacatgatataacaat 7759  T
Q  310 atcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| || |||  || | ||||||||||  |||| ||||||    
T  7758 atcaaatgcaagtcatcaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattat 7694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 54 - 135
Target Start/End: Original strand, 23657632 - 23657713
Alignment:
Q  54 tccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaa 135  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  23657632 tccagggtatcaagcccccatcgctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaggctccagggcatcaagcccccaa 23657713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 120 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 18787113 - 18786971
Alignment:
Q  120 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaactt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||  ||||| ||||||| || | || |||| |||||||| ||||||||||||||||      
T  18787113 ggcatcaagcccccaacaatgaa-tgcgaatgcatggactcaacaacttaa-catcttagaaacaacgacctcttatataaatccaataatttggaac-- 18787018  T
Q  218 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 267  Q
     ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18787017 -atcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 18786971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 113 - 290
Target Start/End: Original strand, 7679480 - 7679662
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatata-atccaataattt 210  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || | ||  ||||| | ||||| || |  |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  7679480 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgttaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacttcaacctcttatatatatccaataattt 7679577  T
Q  211 ggaacttcatc----atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaa 290  Q
    ||||| |||||    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||    
T  7679578 ggaacatcatccatcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 7679662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 113 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 22134428 - 22134251
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | || |||||| || |||| | | ||  | | ||||| | |||||||||||||    
T  22134428 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacatcttaa-caacttagaacaacttcatcttata-agtccaataatttgg 22134332  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaactt---agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaa 290  Q
    ||| |||||||| |||||| | |   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||    
T  22134331 aacatcatcatcatcatcatcatcatagaccgactcatgcagcttagttaaatatcaacagcaacataggcagtatgcaaa 22134251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 37 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 22799424 - 22799282
Alignment:
Q  37 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaa 135  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||  |||||||||    
T  22799424 ttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtgttgagtactaagctccagggcat-gagcccccaa 22799327  T
Q  136 ca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 179  Q
    || |||  ||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||    
T  22799326 catatg-tatgctaatgcatggactcggtctcttaaaacatcttaa 22799282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 372 - 434
Target Start/End: Original strand, 27753735 - 27753797
Alignment:
Q  372 tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcatc 434  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||    
T  27753735 tatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagtttcacatattataattaacatcatc 27753797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 37 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 23020004 - 23019727
Alignment:
Q  37 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaa 135  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||  | ||||||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||    
T  23020004 ttgagtattaatatacatccagggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaattcaccatcgtgttgagtactaagctccagggcatga-gcccccaa 23019907  T
Q  136 ca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt---catcatcttcatc 230  Q
    || ||| | |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| |  | || |||||| |||||||||||||||  ||   ||||||||| |||    
T  23019906 catatgta-tgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatctt-aatc-atcatctcttatat-atccaataatttggaggttcgacatcatcttaatc 23019811  T
Q  231 aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 314  Q
    | |||| |  |||||||  | |||||||||||||||| |||| || | ||||   |||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  23019810 atcttatattgactcataaaacttagttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacaacatgacttcataatatcaa 23019727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 198 - 336
Target Start/End: Original strand, 23207266 - 23207401
Alignment:
Q  198 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaa-acaa 295  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | |||||||| |||| |       
T  23207266 aatccaataatttggaac---atcatctt--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagtt 23207360  T
Q  296 catgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaa 336  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  23207361 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacgacatctcaa 23207401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 233 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 32452031 - 32451878
Alignment:
Q  233 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaa-ca 330  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||| | |||| || |||||| | |||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||    
T  32452031 cttagaccgactcatgcagcttggttaaacatcaaacagcaacataggcagcattcaaaaatagcatgacataacaatatc-aatgcaagccaacaatca 32451933  T
Q  331 tctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtata-aaattatcacatcataa 384  Q
    |||||| ||| |||| |    |||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  32451932 tctcaattattcatttaaacttcaagtaatgcgtatacataatatcacatcataa 32451878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 198 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 20520325 - 20520098
Alignment:
Q  198 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaa-acaa 295  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | |||||| | |||| |       
T  20520325 aatccaataatttggaac---attatctt--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatatgcagtacataaaacagtt 20520231  T
Q  296 catgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtata-aaat-tatcacatcataatcaacatca 393  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||  ||||||||||||||| || |||  || | ||||||||||| |||| |||| |||||||| || | | ||||||    
T  20520230 catgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaacatctcaaacat-catatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacgacatca 20520133  T
Q  394 aaacatctta-aacagcttcacagattataattaa 427  Q
    || ||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  20520132 aatcatcttataacaacttcacagattatcattaa 20520098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 179
Target Start/End: Original strand, 24673383 - 24673529
Alignment:
Q  34 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt--gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagccc 131  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |  | ||||||| |||||  || |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||  |||||    
T  24673383 tattttagtattaatatactttcagggcatgag-ctcccatcgttatttttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagccc 24673480  T
Q  132 ccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 179  Q
    |||||||    ||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||    
T  24673481 ccaacaaatgtatgctaatgcatggactcaatctcttaaaacatcttaa 24673529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 22413354 - 22413133
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttg 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||   ||||||| |||| ||  ||||| ||||||||| |    |||| |||||||| ||||||||||||    
T  22413354 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgagtatgcatggactcaacaacttaa-catcttaaaacattgacctcttatataaatccaataatttg 22413257  T
Q  212 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaa-acaacatgacataata-- 307  Q
    ||||   ||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||| ||||| | |||||||| |||| |   ||||| |||| |      
T  22413256 gaac---atcatctt--tcatcttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaat 22413162  T
Q  308 atatcaaatgcaagacaacaacatctcaa 336  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  22413161 atatcaaatgcaaatcaacaacatctcaa 22413133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 32215271 - 32215204
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||    
T  32215271 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgctatttga 32215204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 235 - 284
Target Start/End: Original strand, 23287384 - 23287433
Alignment:
Q  235 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagta 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||    
T  23287384 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacataggcagta 23287433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 179
Target Start/End: Original strand, 24680000 - 24680146
Alignment:
Q  34 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt--gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagccc 131  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||| |||||  || |||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||  |||||    
T  24680000 tattttagtattaatatactttcagggcatgag-cccccatcgttatttttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagccc 24680097  T
Q  132 ccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 179  Q
    |||||||    ||||||||||||  |||| | ||||| |||||||||||    
T  24680098 ccaacaaatgtatgctaatgcattgactcaatctcttaaaacatcttaa 24680146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 275
Target Start/End: Original strand, 26392403 - 26392443
Alignment:
Q  235 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  26392403 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaaca 26392443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 23713104 - 23713058
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactc 160  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  23713104 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatggactc 23713058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 45678429 - 45678304
Alignment:
Q  34 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccc 132  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||| |||| |  ||||||||| ||||| || |||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  45678429 tattttagtattaatatactttcagtgcattag-cccccatcgttattttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccc 45678332  T
Q  133 caacaatgaaatgctaatgcatgaactc 160  Q
    ||||||    ||||||||||||| ||||    
T  45678331 caacaaatgtatgctaatgcatggactc 45678304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 32215302 - 32215248
Alignment:
Q  30 tcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  32215302 tcgctatttgagtattattatacttacagagcatcaagccccaatcgctatttga 32215248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 23130725 - 23130786
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 78  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  23130725 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgct 23130786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 23133192 - 23133253
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 78  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  23133192 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgct 23133253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 34402821 - 34402760
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 78  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  34402821 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgct 34402760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 82
Target Start/End: Original strand, 38967194 - 38967258
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt 82  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  38967194 catcaagcccctatcactatttgagtattattatact-ccagagcatcaaacccctatcgctattt 38967258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 82
Target Start/End: Original strand, 43137075 - 43137139
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt 82  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  43137075 catcaagcccctatcgctatttaagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctattt 43137139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 44 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 3441 - 3050
Alignment:
Q  44 ttaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaa 143  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3441 ttaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaaa 3342  T
Q  144 tgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgac 243  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3341 tgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttagaacaacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgac 3242  T
Q  244 tcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatataca 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3241 tcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatataca 3143  T
Q  344 ttcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcatc 434  Q
    ||||| | ||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  3142 ttcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttcacaggttataattaacatcatc 3050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 3)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 17 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 17539 - 17115
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  17539 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaacctc 17440  T
Q  117 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaa-- 214  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||      
T  17439 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcaacctcgtaaacatcttaattcgacaacctctcatataatccaataatttggaaac 17340  T
Q  215 --cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatac--aaaaacaacatgacataataata 310  Q
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  17339 atcatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaaaacagcatgacataataata 17240  T
Q  311 tcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacag 408  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  17239 tcaaatgcaagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaacacgtcttaaacag 17140  T
Q  409 cttcacagattataattaacttcat 433  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||    
T  17139 ctttacagattataattaacatcat 17115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 233 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 79430 - 79328
Alignment:
Q  233 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatc 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  79430 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacga-cagtatataaaaacagcatgacataataatttcaaatgcaagtcaacaacgtc 79332  T
Q  333 tcaa 336  Q
    ||||    
T  79331 tcaa 79328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 14399 - 14139
Alignment:
Q  22 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaagg 121  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  14399 agcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgttatttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccaggg 14301  T
Q  122 catcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaaatcgacaacctattatata-atccaataatttgga--act 216  Q
    ||| |||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| |  | || ||||||| |||||||||||||||   |     
T  14300 cat-aagcccccaacatatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatctt-aatc-atcatctcttatatatatccaataatttggagttca 14205  T
Q  217 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcag 282  Q
     ||||||||| |||| |||| |  |||||||||| | |||||||||||||| |||| || ||||||    
T  14204 acatcatcttaatcatcttatatagactcatgcatcatagttaaataacaatagcagcataagcag 14139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 17 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 340263 - 339849
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  340263 catcaagcccccatcgctatt--agtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgcaattttagctaaagctccatcgtgttgagtacaaggctc 340166  T
Q  117 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 216  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  340165 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataattttgaact 340066  T
Q  217 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 316  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  340065 tcatcatcttcgtcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-acaacaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaaat 339968  T
Q  317 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 414  Q
     |||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  339967 -caagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgtgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 339869  T
Q  415 agattataattaacttcatc 434  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  339868 agattataattaacgtcatc 339849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 158716 - 158456
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  158716 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcaacaacctcttatataatccaataatttgg 158617  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  158616 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 158518  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  158517 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 158456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 54 - 434
Target Start/End: Original strand, 4350 - 4729
Alignment:
Q  54 tccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgca 153  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4350 tccagggcatcaagcccccatcgctatt-gagctaaagctccatcgtgttgagta-aaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgca 4447  T
Q  154 tgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagct 253  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4448 tggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttgtataatccaataatttggaacataatcattttcatcaacttagaccgactcatgc-gct 4546  T
Q  254 tagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactc 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  4547 tagttaaataacaacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattc 4646  T
Q  354 aagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcatc 434  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4647 aagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatc 4729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 54 - 434
Target Start/End: Original strand, 11932 - 12311
Alignment:
Q  54 tccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgca 153  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11932 tccagggcatcaagcccccatcgctatt-gagctaaagctccatcgtgttgagta-aaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgca 12029  T
Q  154 tgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagct 253  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12030 tggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttgtataatccaataatttggaacataatcattttcatcaacttagaccgactcatgc-gct 12128  T
Q  254 tagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactc 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  12129 tagttaaataacaacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattc 12228  T
Q  354 aagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcatc 434  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12229 aagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatc 12311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 54 - 434
Target Start/End: Original strand, 21884 - 22263
Alignment:
Q  54 tccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgca 153  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21884 tccagggcatcaagcccccatcgctatt-gagctaaagctccatcgtgttgagta-aaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgca 21981  T
Q  154 tgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagct 253  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21982 tggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttgtataatccaataatttggaacataatcattttcatcaacttagaccgactcatgc-gct 22080  T
Q  254 tagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactc 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  22081 tagttaaataacaacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattc 22180  T
Q  354 aagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcatc 434  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22181 aagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatc 22263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 86)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 17 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 18818727 - 18818314
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  18818727 catcaagcccccatcactatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctc 18818628  T
Q  117 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 216  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  18818627 cagggcatcaatcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaca 18818528  T
Q  217 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  18818527 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 18818428  T
Q  317 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 414  Q
    | ||| ||||| ||||| |||||| || | ||   |||||||||||  |||| ||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18818427 gtaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 18818328  T
Q  415 agattataattaac 428  Q
    ||||||||||||||    
T  18818327 agattataattaac 18818314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 54 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 16092621 - 16092240
Alignment:
Q  54 tccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgca 153  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16092621 tccagggcatcaagcccccatcgctatt-gagctaaagctccatcgtattgagca-aaggctccagggcatcaagcctccaacaatgaaatgctaatgca 16092524  T
Q  154 tgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagct 253  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092523 tggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaatagtttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagct 16092424  T
Q  254 tagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactc 353  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |     
T  16092423 tagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattt 16092324  T
Q  354 aagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatctt-aaacagcttcacagattataattaacttcatc 434  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| || |||||||||||| |||||    
T  16092323 aagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacaacttcgcatattataattaacatcatc 16092240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 17 - 428
Target Start/End: Original strand, 22874872 - 22875281
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||| | || ||||    
T  22874872 catcaagcccccgtcgctata--agtattaatatacttccagggcatcaagccctcatcgctatt-gagctaaagctccatcgtgttgagca-aaggctc 22874967  T
Q  117 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 216  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||     
T  22874968 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgataatgcatggactcgacctcttaaatatcttaaatcaacaacctcttatatagtccaataatttggaaca 22875067  T
Q  217 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 316  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22875068 tcatcatcttcatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaatagcagcagcaacacaggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaaat 22875166  T
Q  317 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatctt-aaacagcttca 413  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  22875167 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagcttca 22875266  T
Q  414 cagattataattaac 428  Q
    |||||||||||||||    
T  22875267 cagattataattaac 22875281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 61 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 28649322 - 28648943
Alignment:
Q  61 catcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactc 160  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28649322 catcaagcccccatcgctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaggctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactc 28649223  T
Q  161 gacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaa----cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttag 256  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28649222 gacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaacatcatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttag 28649123  T
Q  257 ttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaag 356  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| | |||||    
T  28649122 ttaaataacaaaagcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatcttaattatacattcataattcaag 28649023  T
Q  357 taatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcatc 434  Q
    ||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  28649022 taatgtgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacatattataattaacatcatc 28648943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 41 - 434
Target Start/End: Original strand, 6759088 - 6759478
Alignment:
Q  41 gtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatg 140  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  6759088 gtattaatatacttccagggcatcaagccctcatcgctatt-gagctaaagctccatcgtattgagca-aaggctccagggcatcaagcccccaacaatg 6759185  T
Q  141 aaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagacc 240  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  6759186 aaatgctaatgcatggactcaacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgga-catcatcatcttcatcaacttagacc 6759284  T
Q  241 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| |||    
T  6759285 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaag---tcaacatctcaattat 6759381  T
Q  341 acattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatctt-aaacagcttcacagattataattaacttcatc 434  Q
    ||| |||| | |||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6759382 acactcataattcaattaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagcttcacagattataattaacatcatc 6759478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 17 - 428
Target Start/End: Original strand, 7372581 - 7372986
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7372581 catcaatcccccatcgctgtttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcaatatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctc 7372680  T
Q  117 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 216  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  7372681 cagtgcatcaagcccccaacaatgaaatgttgatgcatggactcaacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaca 7372780  T
Q  217 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  7372781 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 7372880  T
Q  317 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacag 416  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| || | ||   ||||||||||| ||      ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7372881 gcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgctta------tatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacag 7372974  T
Q  417 attataattaac 428  Q
    ||||||||||||    
T  7372975 attataattaac 7372986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 20 - 428
Target Start/End: Original strand, 23406185 - 23406597
Alignment:
Q  20 caagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaa 119  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||||     
T  23406185 caagcacccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccaccatcgctaattgagctaaggctccaacgtgttgagtacaaagctccag 23406284  T
Q  120 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  23406285 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaacatca 23406384  T
Q  220 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23406385 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgca 23406484  T
Q  320 agacaac--aacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcaca 415  Q
    || ||||  | ||||| |||||| || | ||   |||||||||||  |||| ||  ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  23406485 agtcaacatatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacatagtcaacatcaacacatcttaaacaacttcaca 23406584  T
Q  416 gattataattaac 428  Q
     ||||||||||||    
T  23406585 tattataattaac 23406597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 17 - 428
Target Start/End: Original strand, 22626540 - 22626951
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    |||||||||||| |||||||   ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  22626540 catcaagcccccatcgctata--agtattattatacttccagggcatcaagcccccatcgctatttgagctaaagctcaatcgtgttgagtacaaggctc 22626637  T
Q  117 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttg-gaac 215  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||    
T  22626638 cagggcatcaagcctccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttgaaaac 22626737  T
Q  216 ttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 315  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22626738 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaaa 22626836  T
Q  316 tgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttca 413  Q
    | |||  ||||||||||| |||||| || | ||   |||||||||| |||||| ||  ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  22626837 tacaaatcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgtgtataacattatatcacatcattatcatcatcaacacatcttaaacagcttca 22626936  T
Q  414 cagattataattaac 428  Q
    |||||||||||||||    
T  22626937 cagattataattaac 22626951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 17 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 18879547 - 18879136
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  18879547 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccaccatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctc 18879448  T
Q  117 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 216  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  18879447 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaa--tgacaacctcttatataatccaataatttggaaca 18879350  T
Q  217 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||     ||||||||||||||| |    
T  18879349 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaaca-----acataataatatcaatt 18879255  T
Q  317 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 414  Q
    ||||  || |||||||| |||||| ||   ||   |||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||    
T  18879254 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgctcataacattatatcacatcataatcaacatcagcacatctt-atcagcttcac 18879156  T
Q  415 agattataattaacttcatc 434  Q
    |||||||| ||||| |||||    
T  18879155 agattatagttaacatcatc 18879136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 17 - 428
Target Start/End: Original strand, 20536011 - 20536424
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  20536011 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattaagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagctc 20536110  T
Q  117 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 216  Q
     | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| || |||| || ||||||||| ||||||||||||||     
T  20536111 tagggcatcaaacccccaacaatgaaatgctaatgcatggactagacctcttagacatcttaattcaacaatctcttatataattcaataatttggaaca 20536210  T
Q  217 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  20536211 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagaaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 20536310  T
Q  317 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 414  Q
    ||||  || |||||||| |||||| ||   ||   |||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  20536311 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcgacatcaacacatcttaaacaacttcac 20536410  T
Q  415 agattataattaac 428  Q
    ||||||||||||||    
T  20536411 agattataattaac 20536424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 40 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 21924222 - 21923827
Alignment:
Q  40 agtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaat 139  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| | | ||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  21924222 agtattaatatactttcagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacttgttgcgtacaaagctccagggcattaagcccc-aacaat 21924124  T
Q  140 gaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagac 239  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21924123 gaaatgctaatgcatggacttgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttacataatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagac 21924024  T
Q  240 cgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaata 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  21924023 cgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtctacaaaaacaacatgacatgataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaata 21923924  T
Q  340 tacattcatgactcaagtaatgcgtataaaatta--tcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcatc 434  Q
    | || | ||   |||||||||||  ||||  |||  |  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21923923 ttcaattatacttcaagtaatgcacataaccttattttgcatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatc 21923827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 56 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 21919279 - 21918899
Alignment:
Q  56 cagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  21919279 cagggcatcaaacccccatcgctatttgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccgcaacaatgaa-tgctaatgcatg 21919181  T
Q  156 aactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctt 254  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21919180 gactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagctt 21919081  T
Q  255 agttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatac-attcatgactc 353  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||| | | | ||   ||    
T  21919080 agttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattcttc 21918981  T
Q  354 aagtaatgcgtataaaat-tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcatc 434  Q
    ||||||||| || | | | |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  21918980 aagtaatgcataaacattatatcacatcataatcagcagcaacacatcttaaacagcttcacagatcgtaattaacctcatc 21918899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 434
Target Start/End: Original strand, 23648350 - 23648775
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||  || |||||||||||||||    
T  23648350 catcaagcccccatcgctaattgagtattaatagacttccagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaatgtgttgagtacaaagctc 23648449  T
Q  117 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 216  Q
    || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||     
T  23648450 cagggcatcaagcccccaactgtgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatatagtccaataatttggaaca 23648549  T
Q  217 tcat------catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataata 310  Q
    ||||      |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| | ||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  23648550 tcatcatcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatagcaacataggcagattacaacaacaacatgacataataata 23648649  T
Q  311 tcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacag 408  Q
    |||  ||||| |||||||||||| |||||| || | |    |||||||||||  | || ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23648650 tcatttgcaatacaacaacatcttaaatattcaataaaacttcaagtaatgcacacaacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacag 23648749  T
Q  409 cttcacagattataattaacttcatc 434  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||    
T  23648750 cttaacagattataattaacatcatc 23648775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 17 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 45131316 - 45130898
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||    
T  45131316 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagc 45131217  T
Q  115 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttgga 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| || | ||||||||||||||    
T  45131216 tccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttaaattagtccaataatttgga 45131118  T
Q  214 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 313  Q
    || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  45131117 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaac--aaacagcatgacataataatatca 45131020  T
Q  314 aatgc-aagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat-tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagctt 411  Q
    | | | ||  || |||||||| |  |||||| | ||   ||||||||||| || | | | |||||||||||||||| || ||| | |||||| |||||||    
T  45131019 atttcaaattcatcaacatcttaggtatacaattattcttcaagtaatgcataaacattatatcacatcataatcatcaacaacaaatcttatacagctt 45130920  T
Q  412 cacagattataattaacttcat 433  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  45130919 cacagattataattaacctcat 45130898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 113 - 427
Target Start/End: Original strand, 26219613 - 26219918
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  26219613 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaatactttgg 26219712  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  26219713 aacttcatcatcataatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacac-agcagtatac-aaaatagtatgacataataatatc 26219810  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattatcacatcataatcaacatcaaaacat-cttaaacagctt 411  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||        || ||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  26219811 aaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat--------aagtatgacatcataatcaacatcaacacatcctaaaacagctt 26219902  T
Q  412 cacagattataattaa 427  Q
    || ||||||| |||||    
T  26219903 catagattatcattaa 26219918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 5853557 - 5853298
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5853557 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 5853459  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5853458 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 5853360  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  5853359 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 5853298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 113 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 20046460 - 20046239
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20046460 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 20046362  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20046361 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 20046263  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaa 336  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||    
T  20046262 aaatgcaagtcaacaacgtctcaa 20046239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 113 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 26225513 - 26225268
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  26225513 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaatactttgg 26225414  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  26225413 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-caatatac-aaaacagtatgacataataatatc 26225316  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaat 360  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  26225315 aaatacaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 26225268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Original strand, 1484299 - 1484558
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1484299 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 1484397  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1484398 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 1484496  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  1484497 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 1484558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Original strand, 20403124 - 20403383
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20403124 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 20403222  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20403223 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 20403321  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  20403322 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 20403383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 113 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 4542638 - 4542417
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4542638 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 4542540  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4542539 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-caagatacaaaaacagcatgacataataatatc 4542441  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaa 336  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||    
T  4542440 aaatgcaagtcaacaacgtctcaa 4542417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Original strand, 22001651 - 22001909
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22001651 gctccagggcatcaagcccc-aacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catgttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 22001748  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22001749 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 22001847  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  22001848 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 22001909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 56 - 433
Target Start/End: Original strand, 31971097 - 31971476
Alignment:
Q  56 cagggcatcaaacccccatcgctat-ttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcat 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31971097 cagggcatcaaacccccatcgctaaattgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcat 31971195  T
Q  155 gaactcgacctcttaaa-catcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagc 252  Q
    | |||||| |||||||| || ||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31971196 ggactcgatctcttaaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagc 31971295  T
Q  253 ttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgact 352  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||  || |||||||| |  ||||||   ||   |    
T  31971296 ttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaattccaattcatcaacatcttatgtatacaaatattctt 31971394  T
Q  353 caagtaatgcgtataaaat-tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcat 433  Q
    |||||||||| || | | | ||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  31971395 caagtaatgcataaacattatatcacatcataatcaacaacaacatatcttatacatcttcacagattataattaacctcat 31971476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 114 - 427
Target Start/End: Original strand, 41598086 - 41598399
Alignment:
Q  114 ctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgga 213  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41598086 ctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaattgacaacctcttatataatccaataatttgga 41598184  T
Q  214 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 313  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41598185 acttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttgaataacaacagcaacac-agtagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 41598283  T
Q  314 aatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaa-cagct 410  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| |||  |||||||  |||| |||||||||| |||| |||| ||| |    
T  41598284 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagtt 41598382  T
Q  411 tcacagattataattaa 427  Q
    |||||||| || |||||    
T  41598383 tcacagatcatcattaa 41598399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 113 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 45290961 - 45290758
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45290961 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 45290862  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45290861 aacttcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 45290763  T
Q  313 aaatg 317  Q
    |||||    
T  45290762 aaatg 45290758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 120 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 15203489 - 15203237
Alignment:
Q  120 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15203489 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttca 15203391  T
Q  220 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 319  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  15203390 tcatcttaatcaacttagagcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgta 15203292  T
Q  320 agacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    || ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  15203291 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 15203237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Original strand, 19896162 - 19896424
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19896162 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 19896260  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgac---ataataat 309  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  19896261 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cggtatacaaaaacagcatgacataataataat 19896359  T
Q  310 atcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  19896360 atcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 19896424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 5866594 - 5866292
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||    
T  5866594 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagc 5866495  T
Q  115 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttgga 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  5866494 tccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttgga 5866396  T
Q  214 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  5866395 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 5866297  T
Q  313 aaatg 317  Q
     ||||    
T  5866296 gaatg 5866292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 17 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 21389770 - 21389353
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||  ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||    
T  21389770 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttctagggcatcaagccgccatcgctaaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagc 21389671  T
Q  115 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctatta-tataatccaataatttgga 213  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  21389670 tccagggcatcaagcccccaactatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttaatatagtccaataatttgga 21389572  T
Q  214 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | | |||||||   |||| ||||||||||| |||||    
T  21389571 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatac---aacagcatgacataattatatc 21389475  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat--cacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagct 410  Q
    |||| |||  || |||||||| |  ||||||  |||   ||||||||||| || || |||||  ||| |||||||||||| ||| | ||||||  |||||    
T  21389474 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaacaacaacatatcttattcagct 21389376  T
Q  411 tcacagattataattaacttcat 433  Q
    ||||| |||| ||||||||||||    
T  21389375 tcacatattacaattaacttcat 21389353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 121 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 14409702 - 14409450
Alignment:
Q  121 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 220  Q
    |||||||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14409702 gcatcaagcccctatcgctgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacctcat 14409603  T
Q  221 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 320  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14409602 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 14409504  T
Q  321 gacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    | ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  14409503 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 14409450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 264
Target Start/End: Original strand, 21255024 - 21255272
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 115  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||    
T  21255024 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttctagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagct 21255123  T
Q  116 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttggaa 214  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  21255124 ccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaa 21255222  T
Q  215 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa 264  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21255223 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa 21255272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Original strand, 14823671 - 14823929
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14823671 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 14823769  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14823770 aacttcatcatcttaatcaatttagacc-actcatgcagcaaagttaaataacaacaacaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 14823867  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  14823868 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 14823929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 17 - 264
Target Start/End: Original strand, 21249186 - 21249434
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 115  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||    
T  21249186 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttctagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagct 21249285  T
Q  116 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttggaa 214  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  21249286 ccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcggcctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaa 21249384  T
Q  215 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa 264  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21249385 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa 21249434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 317
Target Start/End: Original strand, 17140715 - 17141019
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctattt-gagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta---tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaa 112  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||    
T  17140715 catcaagcccccatcgctattttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatttttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaa 17140814  T
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttg 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  17140815 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tactaatgtatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttg 17140913  T
Q  212 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataata 310  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||  || |||||||||||||||    
T  17140914 gaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aatccatcatgacataataata 17141012  T
Q  311 tcaaatg 317  Q
    || ||||    
T  17141013 tcgaatg 17141019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 13597937 - 13597550
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 115  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| |||| |||||| | |  |||||||||||||    
T  13597937 catcaagccccaatcactatttgagtattattatacttccagggcatcaagccccagtcgctaatttgagctaatgctccaacatggtgagtacaaagct 13597838  T
Q  116 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattat-ataatccaataatttggaa 214  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  13597837 ccagggcatcaagcccccaacactgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaa 13597738  T
Q  215 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 313  Q
    | ||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| || | |||||| ||||| |||||||||||     
T  13597737 cgtcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataagcagaatgc-aaaacatcatgatataataatatcg 13597639  T
Q  314 aatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatc 400  Q
    || |||||  ||||||||| ||||||| ||   || | ||||||||||| |||| |||  |||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  13597638 aacgcaagtaaacaacatcccaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatc 13597550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 13508403 - 13508018
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  13508403 catcaagcctctatcgttatttgagtattactatact-ccagggcatcaagcccctatcgctaattgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagctc 13508305  T
Q  117 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattat-ataatccaataatttggaac 215  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  13508304 cagggcatcaagcccccaacactgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaac 13508205  T
Q  216 ttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 314  Q
     ||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| ||| | | |||| ||||| ||||||||||| |    
T  13508204 gtcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgc-acaacatcatgatataataatatcga 13508106  T
Q  315 atgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatc 400  Q
    | |||||  ||||||||||||||||| ||   || | ||||||||||| |||| |||  |||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  13508105 acgcaagtaaacaacatctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatc 13508018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 21779096 - 21778697
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||  ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||    
T  21779096 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttctagggcatcaagccgccatcgctaaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagc 21778997  T
Q  115 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctatta-tataatccaataatttgga 213  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  21778996 tccagggcatcaagcccccaactatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttaatatagtccaataatttgga 21778898  T
Q  214 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | | |||||||   |||| ||||||||||| |||||    
T  21778897 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatac---aacagcatgacataattatatc 21778801  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat--cacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagct 410  Q
    |||| |||  || |||||||| |  ||||||  |||   ||||||||||| || || |||||  ||| |||||||||||| ||| | ||||||  |||||    
T  21778800 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaacaacaacatatcttattcagct 21778702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 142 - 374
Target Start/End: Original strand, 4483207 - 4483436
Alignment:
Q  142 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccg 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4483207 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaa-tcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccg 4483305  T
Q  242 actcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatata 341  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||     
T  4483306 actcatgcagcttagtt-aataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 4483403  T
Q  342 cattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  4483404 cacatataattcaagtaatgcatatacaattat 4483436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 21 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 21396296 - 21395885
Alignment:
Q  21 aagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctcca 118  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||  ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||||||    
T  21396296 aagcccccatcgctatttgagtattaatatacttctagggcatcaagccgccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctcca 21396197  T
Q  119 aggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctatta-tataatccaataatttggaactt 217  Q
     ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||| |    
T  21396196 gggcataaagcccccaactatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttaatatagtccaataatgtggaacat 21396098  T
Q  218 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 316  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||   |||| ||||| ||||| |||||||||    
T  21396097 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatac---aacagcatgagataattatatcaaat 21396001  T
Q  317 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat--cacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 414  Q
     |||  || |||||||| |  ||||||  |||   ||||||||||| || || |||||  ||| |||||||||| | ||| | ||||||  |||||||||    
T  21396000 tcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaataacaacatatcttattcagcttcac 21395902  T
Q  415 agattataattaacttc 431  Q
    |||||| ||||||||||    
T  21395901 agattacaattaacttc 21395885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 21 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 21790789 - 21790378
Alignment:
Q  21 aagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctcca 118  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||  ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||||||    
T  21790789 aagcccccatcgctatttgagtattaatatacttctagggcatcaagccgccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctcca 21790690  T
Q  119 aggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctatta-tataatccaataatttggaactt 217  Q
     ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||| |    
T  21790689 gggcataaagcccccaactatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttaatatagtccaataatgtggaacat 21790591  T
Q  218 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 316  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||   |||| ||||| ||||| |||||||||    
T  21790590 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatac---aacagcatgagataattatatcaaat 21790494  T
Q  317 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat--cacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 414  Q
     |||  || |||||||| |  ||||||  |||   ||||||||||| || || |||||  ||| |||||||||| | ||| | ||||||  |||||||||    
T  21790493 tcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaataacaacatatcttattcagcttcac 21790395  T
Q  415 agattataattaacttc 431  Q
    |||||| ||||||||||    
T  21790394 agattacaattaacttc 21790378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Original strand, 21490796 - 21491092
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 115  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || | ||||||| ||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||    
T  21490796 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccagggcatcaagccacaatcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagct 21490895  T
Q  116 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa-catcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttgga 213  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  21490896 ccagggcatcaagcccccaacaacgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaaacatcttaattcgacaacctcttatattaattcaataatttgga 21490994  T
Q  214 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 311  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| ||||||||||    
T  21490995 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatat 21491092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 68 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 16199913 - 16199546
Alignment:
Q  68 cccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacct 165  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  16199913 cccccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacct 16199815  T
Q  166 cttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa 264  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16199814 cttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataa 16199715  T
Q  265 c-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcg 363  Q
    | |||||||||| |  |||||| |  ||||||||||||||||||||||||| | |||  || | |||||| |  ||||||   ||   |||||||||||     
T  16199714 caaacagcaacatagacagtattc--aaacaacatgacataataatatcaatttcaattcatctacatcttaggtatacaaatattcttcaagtaatgca 16199617  T
Q  364 tataaaat-tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcat 433  Q
    || | | | ||| ||||||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16199616 taaacattatattacatcataatcaacaacaacatatcttatacagcttcacagattataattaacctcat 16199546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 121 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 25484524 - 25484281
Alignment:
Q  121 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 220  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||||    
T  25484524 gcatcaagcccacaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaac-tcttgtataatccaataatttagaacttcat 25484427  T
Q  221 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 320  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25484426 catcttaatcaacttagaccaactcgtgcagcttagttaaataacaacagc--------tagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 25484335  T
Q  321 gacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
      ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  25484334 atcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 25484281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 142 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 16413547 - 16413322
Alignment:
Q  142 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccg 241  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |  |  |||| ||| ||| ||||||||||||||||      ||||| ||||||||||||||    
T  16413547 aatgctaatgcatggactcgaccacttaaacatcttaattaaatgacctcttaaatagtccaataatttggaac------atcttaatcaacttagaccg 16413454  T
Q  242 actcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatata 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||     
T  16413453 actcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 16413355  T
Q  342 cattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  16413354 cacatataattcaagtaatgcatatataattat 16413322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 142 - 336
Target Start/End: Original strand, 26223841 - 26224037
Alignment:
Q  142 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatca---tcttcatcaacttaga 238  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||   |||| |||||||||||    
T  26223841 aatgttaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacatcatcaacatcttaatcaacttaga 26223940  T
Q  239 ccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaa 336  Q
     |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26223941 tcgacccatgcagcttaattaaataacaacagcaata-aagcaatatacaaaaatagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 26224037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 114 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 17612332 - 17612018
Alignment:
Q  114 ctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattat-ataatccaataatttgg 212  Q
    ||||| ||||||||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  17612332 ctccagggcatcaagcccctatcgctgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcaacaacctcttataatagtccaataatttgg 17612233  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 311  Q
    ||| ||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| | ||||||| | |||||| ||||| ||||||||||    
T  17612232 aacatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcaacaacataggcagtatgc-aaaacatcatgatataataatat 17612134  T
Q  312 caaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaa-cagct 410  Q
    |  | | |||  ||||||||||||||||  ||   || | ||||||||||| |||| ||||||  || ||| || ||||||||| |||| |||| |||||    
T  17612133 cgcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatca-cattataaacatcaaatcatcataaatcagct 17612035  T
Q  411 tcacagattataattaa 427  Q
    |||||||| || |||||    
T  17612034 tcacagatcatcattaa 17612018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 192 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 19937192 - 19937065
Alignment:
Q  192 ttatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaa 291  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  19937192 ttatataatccaataatttgga-cttcatcatcttaatcaacttggaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaa 19937095  T
Q  292 acaacatgacataataatatcaaatgcaag 321  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  19937094 acagcatgacataataagatcaaatgcaag 19937065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 110 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 38855474 - 38855246
Alignment:
Q  110 aaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataatccaataat 208  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||   ||  ||||| | ||||| || | ||||||| ||||||| |||||||||    
T  38855474 aaagctccagtgcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacataacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttatata-tccaataat 38855378  T
Q  209 ttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataata 307  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |    
T  38855377 ttggaacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataaca 38855279  T
Q  308 atatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 340  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  38855278 atatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 38855246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 113 - 332
Target Start/End: Original strand, 6520267 - 6520486
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatata-atccaataattt 210  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || | ||  ||||| | ||||| || | ||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  6520267 gctccagggcatcaagcccccgacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataattt 6520364  T
Q  211 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataat 309  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||    
T  6520365 ggaacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaat 6520463  T
Q  310 atcaaatgcaagacaacaacatc 332  Q
    ||| |||||||| || |||||||    
T  6520464 atcgaatgcaagtcatcaacatc 6520486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 142 - 362
Target Start/End: Original strand, 32121654 - 32121880
Alignment:
Q  142 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat------catcttcatcaactt 235  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||      |||||| ||||||||    
T  32121654 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaactcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacatcattatcaacatcttaatcaactt 32121753  T
Q  236 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctca 335  Q
    |||  |||||||||| |||||||||||||||| |||| || | ||||  ||||  |||| || ||||||| |||||||| |||||  ||||||||||| |    
T  32121754 agaatgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaattgcaattcaacaacatctta 32121853  T
Q  336 aatatacattcatgactcaagtaatgc 362  Q
    ||||| || | ||  ||||||||||||    
T  32121854 aatattcaataatatctcaagtaatgc 32121880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 230 - 321
Target Start/End: Original strand, 15070571 - 15070661
Alignment:
Q  230 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaag 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15070571 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacac-agtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 15070661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 113 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 23761062 - 23760839
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttg 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||   || |||||| || |||| | | | ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  23761062 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacaaaacatcttaa-caacttagaacaataacctcttatataagtccaataatttg 23760965  T
Q  212 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataata 310  Q
    |||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||   ||| || ||||| |||| ||||    
T  23760964 gaacatcatcatcttca---acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat-gtaaatcatcatgatataacaata 23760869  T
Q  311 tcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 340  Q
    |  ||| |||  ||||||||||||||||||    
T  23760868 ttgaattcaaatcaacaacatctcaaatat 23760839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 184 - 337
Target Start/End: Original strand, 21285569 - 21285720
Alignment:
Q  184 acaacctattatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagca 281  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| | |||    
T  21285569 acaacctcttatataaatccaataatttggaac---atcttcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttgttaaataacaaacaacaacataggca 21285665  T
Q  282 gtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaa 337  Q
    |||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  21285666 gtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaa 21285720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 110 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 26355919 - 26355699
Alignment:
Q  110 aaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataat 208  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | || |||||| ||| ||| | | ||||||| ||| |||| |||||||||    
T  26355919 aaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacatcttaaccat-ttagaacaacaacctcttaaataagtccaataat 26355822  T
Q  209 ttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataata 307  Q
    ||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || || || |||| |    
T  26355821 ttggaacatcatcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcacgatataaca 26355726  T
Q  308 atatcaaatgcaagacaacaacatctca 335  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||    
T  26355725 atatcgaatgcaa-tcaacaacatctca 26355699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 233 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 19801527 - 19801333
Alignment:
Q  233 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatc 332  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||    
T  19801527 cttagaccggctcatgcagcttagttaaataacaatagcaacacaa-cagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaacgcaagtcaacaacgtc 19801430  T
Q  333 tcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattatcacatcata-atcaacatcaaaacatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 427  Q
    |||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| |||||| |||  ||| | |||||||||  |||| |||| ||||||||||||| || |||||    
T  19801429 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattataacacaatataacaacatcaagtcatcgtaaatcagcttcacagatcatcattaa 19801333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 121 - 221
Target Start/End: Original strand, 22965608 - 22965707
Alignment:
Q  121 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 220  Q
    |||||||||||| | || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22965608 gcatcaagccccaatcactgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcggcaacctcttatataatccaataatttggaacttcat 22965706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 114 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 983622 - 983407
Alignment:
Q  114 ctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattat-ataatccaataatttg 211  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||  ||| ||||||||| || | || |||| |||| | ||||||||||||||    
T  983622 ctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgcgaatgcatggactcaacaactt-aacatcttagaaacaacgacctcttataaaaatccaataatttg 983525  T
Q  212 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaa-aacaacatgacataataat 309  Q
    |||   |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||| ||   ||||| |||| |||    
T  983524 gaa---catcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaacaagttcatgatataacaat 983430  T
Q  310 atcaaatgcaagacaacaacatc 332  Q
     ||||||||||  ||||||||||    
T  983429 ctcaaatgcaattcaacaacatc 983407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 113 - 340
Target Start/End: Original strand, 21673608 - 21673830
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataatccaataatttg 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||  ||||| | ||||| || | ||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  21673608 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttata-agtccaataatttg 21673704  T
Q  212 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataata 310  Q
    |||| | ||||||   ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||| | ||| ||| | ||| || ||||| |||| ||||    
T  21673705 gaacatgatcatc---atcaacttagaccgactcatgcatcatagttaaataacaaacaacaacataggcattatgc-aaatcatcatgatataacaata 21673800  T
Q  311 tcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 340  Q
    || |||||||  ||||||||||||||||||    
T  21673801 tcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 21673830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 34 - 179
Target Start/End: Original strand, 16184537 - 16184682
Alignment:
Q  34 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccc 132  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  16184537 tatttgagtattaatattcttccagggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggcat-aagcccc 16184634  T
Q  133 caaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 179  Q
    ||||| |||  ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  16184635 caacatatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatcttaa 16184682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 44385160 - 44384944
Alignment:
Q  22 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 120  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || || | |||| | |||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||| |    
T  44385160 agcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcctcaatcgttaatttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagg 44385062  T
Q  121 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcg-acctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaacttc 218  Q
    ||||  ||||||||||||   |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||   |||| |  | || ||||| || |||||||||||||||| ||    
T  44385061 gcat-gagcccccaacaaatgaatgctaatgcatggactcgaatctcttaaacatc-acaatc-atcatctcttatattagtccaataatttggaacatc 44384965  T
Q  219 atcatcttcatcaacttagac 239  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  44384964 atcatcttcaacaacttagac 44384944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 22 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 17354255 - 17354006
Alignment:
Q  22 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 120  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| | |    
T  17354255 agcccccatcgttaattgagtattaatatacttccaaggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaatgctccatcgtgttgagtacaaagctctagg 17354157  T
Q  121 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt--- 217  Q
    ||||  |||||| |||||    ||||||||||||| ||||||  ||||||||||| | |||| |  | || |||| | |||||||||||||||  ||       
T  17354156 gcat-gagcccctaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatttcttaaacatcat-aatc-atcatctcttat-ttatccaataatttggaggttcaa 17354061  T
Q  218 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 272  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  17354060 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagca 17354006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 179
Target Start/End: Original strand, 19898900 - 19899056
Alignment:
Q  23 gcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaagg 121  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||| | || |||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  19898900 gcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgttaatttgagcgaatgctccatcgtgttgagtactaagctccaggg 19898998  T
Q  122 catcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 179  Q
    |||  ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  19898999 cat-gagcccccaacatatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatcttaa 19899056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 113 - 395
Target Start/End: Original strand, 20498466 - 20498745
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataa-tccaataattt 210  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||  || |  ||||||| || | || |||| |||||||| |||||||||||    
T  20498466 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgcgaatgcatggactcaacaactcag-catcttagaaacaacgacctcttatataaatccaataattt 20498563  T
Q  211 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataat 309  Q
    |||||   ||| ||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||| | |||||||  ||||  | ||||| |||| |||    
T  20498564 ggaac---atcttctt--tcatcttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgtaaaat-agcatgatataacaat 20498657  T
Q  310 atcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaa 395  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| || |||  || | ||||||||||  |||| |||  |||||||| |||| ||||||||||    
T  20498658 atcaaatgcaagtcatcaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaa 20498745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 187 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 18678256 - 18678075
Alignment:
Q  187 acctattatataatccaataatttggaacttcat------catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagc 280  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||      |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| || | ||    
T  18678256 acctcttaaatagtccaataatttggaacatcattatcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggc 18678157  T
Q  281 agtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgc 362  Q
    ||  ||||  |||| || ||||||| |||||||| |||||  ||||||||||| |||||| || | ||  ||||||||||||    
T  18678156 agattacatcaacagcaagacataaaaatatcaattgcaattcaacaacatcttaaatattcaataatatctcaagtaatgc 18678075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 21169031 - 21168887
Alignment:
Q  37 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaa 135  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||  |||||||||    
T  21169031 ttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggcat-gagcccccaa 21168934  T
Q  136 ca-atgaaatgctaatgcatg--aactcgacctctt-aaacatcttaa 179  Q
    || |||  |||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||    
T  21168933 catatg-tatgctaatgcatggaaactcgatctcttaaaacatcttaa 21168887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 23777133 - 23777000
Alignment:
Q  37 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaa 135  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||    
T  23777133 ttgagtattaatatacttccaaggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggcatga-gcccccaa 23777036  T
Q  136 ca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa 171  Q
    || ||| | |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  23777035 catatgta-tgctaatgcatggactcgatctcttaaa 23777000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 351 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 25363124 - 25363047
Alignment:
Q  351 ctcaagtaatgcgtataaaattat--cacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataatta 426  Q
    |||||||||||| || || |||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25363124 ctcaagtaatgcataaaacattataccacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattataatta 25363047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 68 - 179
Target Start/End: Original strand, 24755565 - 24755676
Alignment:
Q  68 cccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctc 166  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||| |||    
T  24755565 cccccatcgttatttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggcat-aagcccccaacatatgta-tgctaatgcatggactcgatctc 24755662  T
Q  167 tt-aaacatcttaa 179  Q
    || |||||||||||    
T  24755663 ttaaaacatcttaa 24755676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 179
Target Start/End: Original strand, 19982897 - 19983054
Alignment:
Q  22 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 120  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||| |||  |||||||||| |||| ||| |||||||| |    
T  19982897 agcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgttaatttgagctagtgctccatcgtgttgactactaagctccagg 19982995  T
Q  121 gcatcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 179  Q
    ||||  ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||    
T  19982996 gcat-gagcccccaacatatg-tatgctaatgcatggactcaatctcttaaaacatcttaa 19983054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 41 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 20466335 - 20466197
Alignment:
Q  41 gtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaat 139  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||     
T  20466335 gtattaatatactttcagggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaaa 20466238  T
Q  140 gaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 179  Q
       ||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||    
T  20466237 tgtatgctaatgcatggactcaatctcttaaaacatcttaa 20466197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 14409787 - 14409721
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  14409787 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctatttga 14409721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 18678339 - 18678273
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttg 83  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  18678339 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaatcgctatttg 18678273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 233 - 337
Target Start/End: Original strand, 37116366 - 37116472
Alignment:
Q  233 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaa-acaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaaca 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | |||||| | |||| |   ||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  37116366 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 37116465  T
Q  331 tctcaaa 337  Q
    |||||||    
T  37116466 tctcaaa 37116472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 113 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 17267211 - 17266990
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataa-tccaataattt 210  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||   ||||||| |||| ||  ||||| ||||||| ||   || |||| |||||||| |||||||||||    
T  17267211 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgagtatgcatggactcaacaacttaa-catcttagaaaaaacgacctcttatataaatccaataattt 17267114  T
Q  211 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaa-acaacatgacataataa 308  Q
    |||||   | ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||| | |||||| | ||||     ||||| |||| ||    
T  17267113 ggaac---aacatctt--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacggttcatgatataacaa 17267019  T
Q  309 tatcaaatgcaagacaacaacatctcaaa 337  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  17267018 tatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaa 17266990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Original strand, 22965521 - 22965588
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  22965521 catcaaggccctatcgctatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaatcgctatttga 22965588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 82
Target Start/End: Original strand, 26223692 - 26223756
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt 82  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  26223692 catcaagcccctatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctattt 26223756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 198 - 337
Target Start/End: Original strand, 24353009 - 24353144
Alignment:
Q  198 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaa-acaa 295  Q
    ||||||||||||||||||   | ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | |||||| | |||| |       
T  24353009 aatccaataatttggaac---aacatctt--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagtt 24353103  T
Q  296 catgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaa 337  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  24353104 catgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaacatctcaaa 24353144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 376 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 26223039 - 26222987
Alignment:
Q  376 acatcataatcaacatcaaaacat-cttaaacagcttcacagattataattaa 427  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  26223039 acatcataatcaacatcaacacatcctaaaacagcttcacagattatcattaa 26222987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 17612410 - 17612344
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| | ||||||| |||| ||||||||||||    
T  17612410 catcaagcccccatcgctatttgagtatcaatatac-tccggagcatcaagcccctatcgctatttga 17612344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 18678367 - 18678316
Alignment:
Q  33 ctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  18678367 ctatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaatcgctatttga 18678316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 138
Target Start/End: Original strand, 377132 - 377189
Alignment:
Q  80 tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaa 138  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  377132 tttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaa 377189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 4483144 - 4483205
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 78  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  4483144 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgct 4483205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 14409744 - 14409684
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 78  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||    
T  14409744 catcaagcccctatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgct 14409684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 17612367 - 17612307
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 78  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||    
T  17612367 catcaagcccctatcgctatttgagtatcaatatac-tccagggcatcaagcccctatcgct 17612307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 25484652 - 25484588
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt 82  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  25484652 catcaagcccttatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctattt 25484588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 26223778 - 26223839
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 78  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  26223778 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgct 26223839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 17 - 434
Target Start/End: Original strand, 51716 - 52135
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  51716 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccaaggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctc 51815  T
Q  117 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 216  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  51816 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaaacaaaaacctcttatataatccaataatttggaaca 51915  T
Q  217 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  51916 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcaatatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 52015  T
Q  317 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 414  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| || | ||   |||||||||||  |||| ||  ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  52016 gcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatctacatcaacacatcttaaacagcttcac 52115  T
Q  415 agattataattaacttcatc 434  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  52116 agattataattaacatcatc 52135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 17 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 168297 - 167884
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 115  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  168297 catcaagcccccatcgctatttgagtattaaaatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagct 168198  T
Q  116 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaa 214  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  168197 ccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaa 168099  T
Q  215 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 314  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  168098 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaa 167999  T
Q  315 atgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat-tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttca 413  Q
     |||||  || |||||||| |||||| ||   || | ||||||||||| || | | | ||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||    
T  167998 ttgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcataaacattatatcacatcataatcaaccaaaacacatcttaaacagcttca 167899  T
Q  414 cagattataattaac 428  Q
     ||||||||||||||    
T  167898 aagattataattaac 167884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 104)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 17 - 428
Target Start/End: Original strand, 9508991 - 9509405
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 115  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  9508991 catcatgcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaaacccccatcgctattttgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagct 9509090  T
Q  116 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaac 215  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9509091 ccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaac 9509190  T
Q  216 ttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 315  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||     
T  9509191 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagtaacataggcagtatacaataacagcatgacataataatatcaat 9509290  T
Q  316 tgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaa--ttatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttca 413  Q
    |||||  || |||||||| |||||| ||   ||   |||||||||||  |||| |   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9509291 tgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttca 9509390  T
Q  414 cagattataattaac 428  Q
    |||||||||||||||    
T  9509391 cagattataattaac 9509405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 115 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 3564584 - 3564263
Alignment:
Q  115 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaa 214  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  3564584 tccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttagaa 3564485  T
Q  215 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3564484 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 3564385  T
Q  315 atgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaatt--atcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttc 412  Q
    ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  3564384 atgtaagtcaacaacatctcaattatacattcataattcaagtaatgcgtataacattagatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacaacttc 3564285  T
Q  413 acagattataattaacttcatc 434  Q
    | || ||||||||||| |||||    
T  3564284 ataggttataattaacatcatc 3564263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 17 - 428
Target Start/End: Original strand, 12698634 - 12699048
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  12698634 catcaagccgccatcactatttgagtattaatatacttccaaggaatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctc 12698733  T
Q  117 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 216  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  12698734 caggacatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcaacctcttagacatcttaattcaacaaccttttatataatccaataatttggaaca 12698833  T
Q  217 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaa-acaacatgacataataatatcaaa 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||     
T  12698834 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataataatatcaat 12698933  T
Q  316 tgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttca 413  Q
    |||||  || |||||||| |||||| ||   ||   |||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12698934 tgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttca 12699033  T
Q  414 cagattataattaac 428  Q
    |||||||||||||||    
T  12699034 cagattataattaac 12699048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 17 - 434
Target Start/End: Original strand, 10588838 - 10589260
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 115  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||    
T  10588838 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagct 10588937  T
Q  116 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaa--tgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttgg 212  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  10588938 ccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttgg 10589037  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    ||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10589038 aacatcatcatcttcgacaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatatgcagtatacaaaaacaacatgacataatcatatc 10589137  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat-tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagctt 411  Q
    || |||||  |||||||||||  ||| | ||   ||   ||||| ||||| || | | | |||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||    
T  10589138 aattgcaattcaacaacatcttcaatgttcaaatattcttcaagcaatgcataaacattatatcacatcataatcagcaacaacacatcttaaatagctt 10589237  T
Q  412 cacagattataattaacttcatc 434  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  10589238 cacagattataattaacctcatc 10589260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 113 - 427
Target Start/End: Original strand, 48273288 - 48273594
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  48273288 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaatactttgg 48273387  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48273388 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 48273487  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattatcacatcataatcaacatcaaaacatctt-aaacagctt 411  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||        || ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  48273488 aaatgcaagtcaacaacatctc-aatatacattcataattcaagtaat--------aagtatgacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagctt 48273578  T
Q  412 cacagattataattaa 427  Q
    |||||||||| |||||    
T  48273579 cacagattatcattaa 48273594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 113 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 18456634 - 18456319
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18456634 gctccagggcatcaagcccctaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 18456535  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18456534 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgatagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatc 18456436  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagct 410  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| || | ||   |||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18456435 aaatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 18456336  T
Q  411 tcacagattataattaa 427  Q
    |||||||||||||||||    
T  18456335 tcacagattataattaa 18456319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 25 - 428
Target Start/End: Original strand, 26211804 - 26212212
Alignment:
Q  25 ccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaa-cccccatcgctatt-tgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggc 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| | ||| |||| |||||| |||  |||||||||||||||| |||    
T  26211804 ccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaaggcccccatcgctaatctgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggc 26211903  T
Q  123 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttcatc 221  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  26211904 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaagcaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatc 26212002  T
Q  222 at-cttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 320  Q
    || ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  26212003 attcttcaacaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaattgcaa 26212102  T
Q  321 gacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagat 418  Q
      ||||||||||| |||||| ||   |   |||||||||||| || || ||  |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  26212103 ttcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacattataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagat 26212202  T
Q  419 tataattaac 428  Q
    ||||||||||    
T  26212203 tataattaac 26212212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 78 - 434
Target Start/End: Original strand, 38227344 - 38227702
Alignment:
Q  78 tatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctt 177  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38227344 tatttgagctatagctccatcgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaattctaatgcatggactcgacctcttaaacatctt 38227443  T
Q  178 aaatcgacaacctattatataatccaataatttgg-aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac 276  Q
    || | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  38227444 aatttgacaacctcttatataatccaataatttggaaacatcatcatcttcatctacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacat 38227543  T
Q  277 aagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatg--cgtataaaattat 374  Q
    | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || | ||   |||| |||||  | ||| |   |||    
T  38227544 aggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaattaatgtacatatcattatat 38227642  T
Q  375 cacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcatc 434  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||    
T  38227643 cacatcttaatcaacatcaacatatcttaaatatcttcacatattataattaacatcatc 38227702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 113 - 336
Target Start/End: Original strand, 44116405 - 44116627
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44116405 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttgg 44116504  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44116505 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaacagcaacac-agcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 44116603  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaa 336  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||    
T  44116604 aaatgcaagtcaacaacgtctcaa 44116627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Original strand, 11972393 - 11972652
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11972393 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 11972491  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11972492 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 11972590  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  11972591 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 11972652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 14949387 - 14949128
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14949387 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 14949289  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14949288 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 14949190  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  14949189 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 14949128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Original strand, 32125388 - 32125647
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32125388 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 32125486  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32125487 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 32125585  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  32125586 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 32125647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Original strand, 41522814 - 41523073
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41522814 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 41522912  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41522913 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 41523011  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  41523012 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 41523073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Original strand, 41525276 - 41525535
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41525276 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 41525374  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41525375 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 41525473  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  41525474 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 41525535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 15144350 - 15143948
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| || ||||||||||||||| ||||| | || ||||    
T  15144350 catcaagcccccatcgctatt-gagtattaatatacttccagggcatcaaatcctcatcgctatt-gagctaaagctccatcgtgttgagca-aaggctc 15144254  T
Q  117 caaggcatcaagcccccaaca--atgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaa 214  Q
    || |||||| |||||||| |   ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| || | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15144253 cagggcatctagcccccatcgctatgaaatactaatgcatgaactcgacatcttaaacctctttaaacaacaacctcttatataatccaataatttggaa 15144154  T
Q  215 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 314  Q
    | ||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| ||| |||| || || || ||||||||||    
T  15144153 catcatcatc----tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca-tctcagtatgcaataacagcaagatatcataatatcaa 15144059  T
Q  315 atgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatctt-aaacagctt 411  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  15144058 atgcaagccaacaacatctcaagtatacattcataatttaagtaatgcgtataacatcatatcacatcataatcaatgtcaaaacatcttaaaacagctt 15143959  T
Q  412 cacagattata 422  Q
     ||||||||||    
T  15143958 gacagattata 15143948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 15376978 - 15376719
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15376978 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 15376880  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15376879 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 15376781  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  15376780 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 15376719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 21189860 - 21189601
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21189860 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 21189762  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21189761 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 21189663  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  21189662 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 21189601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Original strand, 24702135 - 24702394
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24702135 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 24702233  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702234 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 24702332  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  24702333 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 24702394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 113 - 336
Target Start/End: Original strand, 16409956 - 16410177
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16409956 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacgtcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 16410054  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16410055 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 16410153  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaa 336  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||    
T  16410154 aaatgcaagtcaacaacgtctcaa 16410177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Original strand, 456218 - 456477
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  456218 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 456316  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  456317 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 456415  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  456416 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 456477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Original strand, 16232417 - 16232676
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16232417 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 16232515  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16232516 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 16232614  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  16232615 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 16232676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 20385388 - 20385129
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20385388 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 20385290  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20385289 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 20385191  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  20385190 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 20385129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 11393552 - 11393293
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11393552 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 11393454  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11393453 aactccatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 11393355  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  11393354 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 11393293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Original strand, 27216757 - 27217016
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27216757 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 27216855  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27216856 aacttcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 27216954  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  27216955 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 27217016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Original strand, 24704585 - 24704841
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24704585 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 24704683  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  24704684 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacaa---gacataataatatc 24704779  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  24704780 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 24704841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 120 - 374
Target Start/End: Original strand, 18640176 - 18640428
Alignment:
Q  120 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  18640176 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgaactcttaat-atcttaaatcgacaacctcttatatagtccaataatttggaccttca 18640274  T
Q  220 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 319  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18640275 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 18640373  T
Q  320 agacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    || ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  18640374 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 18640428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 56 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 16386529 - 16386152
Alignment:
Q  56 cagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgca 153  Q
    ||||||||||| |||||||| |||  ||||| |||| |||||| |||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16386529 cagggcatcaagcccccatcactaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtaaaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgca 16386431  T
Q  154 tgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagc 252  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16386430 tggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagc 16386331  T
Q  253 ttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgac 351  Q
    ||||||||||||| |||| | ||| | ||||||||||||| || ||||||||||  ||||||| || |   || |||||||| |||||| ||  ||   |    
T  16386330 ttagttaaataacaaacaacgacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgtatttcatcaacatcttaaatattcaaacaattc 16386231  T
Q  352 tcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaac 428  Q
    ||||||||||| || || ||  ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16386230 tcaagtaatgcataaaacattatattacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattatagttaac 16386152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 239
Target Start/End: Original strand, 14258062 - 14258286
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    |||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14258062 catcaagcccccatcgataattgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgcaatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctc 14258161  T
Q  117 caaggcatcaagccccc-aacaa-tgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaa 214  Q
    || ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14258162 cagggcatcatgccccccaacaaatgaaatgctaatgtatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaa 14258261  T
Q  215 cttcatcatcttcatcaacttagac 239  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  14258262 catcatcatcttcatcaacttagac 14258286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 121 - 336
Target Start/End: Original strand, 3386239 - 3386451
Alignment:
Q  121 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 220  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  3386239 gcatcaagcccccaacaaagaa-tgctaatgcatgaactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaac-tcttgtataatccaataatttggaacttcat 3386336  T
Q  221 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 320  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  3386337 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-tagtatacaaaaacagcatgacatgataatatcaaatgcaa 3386435  T
Q  321 gacaacaacatctcaa 336  Q
    | ||||||| ||||||    
T  3386436 gtcaacaacgtctcaa 3386451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Original strand, 20110452 - 20110702
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20110452 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgataatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 20110551  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20110552 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagc-----------tatacaaaaacagcatgacataataatatc 20110640  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  20110641 aaatgcaagtcaataacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 20110702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 17 - 317
Target Start/End: Original strand, 34200585 - 34200889
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctattt-gagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaag 113  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||  ||||| |||| |||||| |||  |||||||||||    
T  34200585 catcaagcccccatcgctattttgagtattaatatacttccaaggcatcaaaccctcatcactaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaag 34200684  T
Q  114 ctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa-catcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttg 211  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  34200685 ctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttg 34200783  T
Q  212 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataata 310  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||||||||    
T  34200784 gaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataata 34200882  T
Q  311 tcaaatg 317  Q
    || ||||    
T  34200883 tcgaatg 34200889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 11996347 - 11996051
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 115  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  11996347 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagct 11996248  T
Q  116 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa-catcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttgga 213  Q
    |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  11996247 ccagagcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcaacctcttaaaacatcttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttgga 11996149  T
Q  214 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 311  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| ||||||||||    
T  11996148 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcatcttagttaattaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatat 11996051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 115 - 374
Target Start/End: Original strand, 13647225 - 13647485
Alignment:
Q  115 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa-catcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttgg 212  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  13647225 tccaaggcattaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaaacatcttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttgg 13647323  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    ||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  13647324 aacatcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatc 13647423  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  13647424 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 13647485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 121 - 321
Target Start/End: Original strand, 13869250 - 13869449
Alignment:
Q  121 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 220  Q
    |||||||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13869250 gcatcaagcccctatcgctgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacctcat 13869349  T
Q  221 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 320  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13869350 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacac-agtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 13869448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 121 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 38898635 - 38898420
Alignment:
Q  121 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 220  Q
    |||||||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  38898635 gcatcaagcccctatcgctgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcac 38898536  T
Q  221 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 320  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38898535 catcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacgacac-agcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 38898437  T
Q  321 gacaa-caacatctcaa 336  Q
    | ||| |||||||||||    
T  38898436 gtcaatcaacatctcaa 38898420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 17 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 10064136 - 10063813
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  10064136 catcaagcccctatcgctatttgagtattattatacttc-agggcatcaagcccctatcgctaattgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagctc 10064038  T
Q  117 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattat-ataatccaataatttggaac 215  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  10064037 cagggcatcaagcccccaacactgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttcattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaac 10063938  T
Q  216 ttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 314  Q
     ||| || ||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| | || |||| | | |||| ||||| ||||||||||| |    
T  10063937 atcaacaccttcaacgacttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcggtatgc-acaacatcatgatataataatatcga 10063839  T
Q  315 atgcaagacaacaacatctcaaatat 340  Q
    |  ||||  |||||||||||||||||    
T  10063838 acacaagtaaacaacatctcaaatat 10063813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 200
Target Start/End: Original strand, 13032560 - 13032744
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 115  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  13032560 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccattgctattttgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagct 13032659  T
Q  116 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataat 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  13032660 ccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataat 13032744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 121 - 336
Target Start/End: Original strand, 13831279 - 13831491
Alignment:
Q  121 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 220  Q
    |||||||||| ||||| | ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  13831279 gcatcaagcctccaaccaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaac-tcttgtataatccaataatttggaacttcat 13831376  T
Q  221 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 320  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13831377 catcttaatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacac-ggtagtatacaaaaacaacatgacataataatataaaatgcaa 13831475  T
Q  321 gacaacaacatctcaa 336  Q
    | ||||||| ||||||    
T  13831476 gtcaacaacgtctcaa 13831491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 28505604 - 28505321
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||    
T  28505604 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagc 28505505  T
Q  115 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttgga 213  Q
    |||| ||||              ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  28505504 tccagggca--------------atgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttgga 28505420  T
Q  214 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  28505419 acatcatcatcttcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 28505321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 115 - 433
Target Start/End: Original strand, 40443292 - 40443610
Alignment:
Q  115 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttgga 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  40443292 tccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaaccttttatattagtccaataatttgga 40443390  T
Q  214 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |  |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| ||  ||||| |||||||||||||||||    
T  40443391 atatcatcatcttcaacatcttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacatacgcagtaaac--aaacagcatgacataataatatc 40443488  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat-tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagctt 411  Q
    || | |||  || |||||||| |  ||||||   ||   ||||||||||| || | | | ||||||||||||||||||| | | | |||||| |||||||    
T  40443489 aatttcaattcatcaacatcttaggtatacaaatattcttcaagtaatgcataaacattatatcacatcataatcaacaacgacatatcttatacagctt 40443588  T
Q  412 cacagattataattaacttcat 433  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  40443589 cacagattataattaacctcat 40443610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 120 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 17062173 - 17061866
Alignment:
Q  120 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 219  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||    
T  17062173 ggcatcaagccctcaactttaaaatgctaatgcatggatt-gacctcttaaacatcttaaatcgacaaactcttgtataatccaataatttgaaacttca 17062075  T
Q  220 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgc 318  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  17062074 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaactc-agcagtatac-aaaatagcatgacataataatatcaaatgc 17061977  T
Q  319 aagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaa-cagcttcaca 415  Q
    ||| || |||| |||||| |||  |   || | ||||||||||| |||| |||  |||||||  |||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  17061976 aagtcagcaacgtctcaattattaacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttcaca 17061878  T
Q  416 gattataattaa 427  Q
    ||| || |||||    
T  17061877 gatcattattaa 17061866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 58 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 27848109 - 27847739
Alignment:
Q  58 gggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 155  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||| | |  ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  27848109 gggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaatgctccaacatggtgagtacaaagcttcagggcatcaagcccccaactatgaa-tgctaatgcatg 27848011  T
Q  156 aactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctt 254  Q
     ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||    
T  27848010 gactcgacctcttaaacaacttaattcggcaacctcttatactagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacatcttagaccgattcatgcagctt 27847911  T
Q  255 agttaaataa-caacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactc 353  Q
    ||||||||||  |||||||||| | ||||| |||   ||||  |||||||||| ||||||||| |||  || |||||||| |  ||||||  |||   ||    
T  27847910 agttaaataataaacagcaacataggcagtgtac---aacagtatgacataattatatcaaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttc 27847814  T
Q  354 aagtaatgcgtataaaattat--cacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaa 427  Q
    ||||||||| || || |||||  |||||||||||||||| ||| | ||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  27847813 aagtaatgcata-aacattatcacacatcataatcaacaacaacatatcttattcagcttcacagattatagttaa 27847739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 192 - 374
Target Start/End: Original strand, 18430687 - 18430868
Alignment:
Q  192 ttatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaa 291  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  18430687 ttatataatccaataatttggaacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatataaaa 18430785  T
Q  292 acaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  18430786 acatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 18430868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 192 - 374
Target Start/End: Original strand, 16213659 - 16213840
Alignment:
Q  192 ttatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaa 291  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16213659 ttatataatccaataatttggaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agcagtatacaaaa 16213757  T
Q  292 acaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| || ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  16213758 acaacatgacataataatatcaaatccaagtcaacaacgtcttaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattat 16213840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 141 - 336
Target Start/End: Original strand, 24275089 - 24275289
Alignment:
Q  141 aaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatca------tcttcatcaact 234  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| || || |||| ||| ||| |||||||||||||||| | ||||      |||| |||||||    
T  24275089 aaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacgtcttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacataatcaacaacatcttaatcaact 24275188  T
Q  235 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctc 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  24275189 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctc 24275287  T
Q  335 aa 336  Q
    ||    
T  24275288 aa 24275289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 120 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 26356255 - 26355989
Alignment:
Q  120 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaa---tcgacaacctattatataatccaataatttggaact 216  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26356255 ggcatcaagccctcaactatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaat-atcttaaaaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaact 26356157  T
Q  217 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca----------agcagtatacaaaaacaacatgacataat 306  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||          | ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  26356156 tcatcatcttaatcaatttagactgactcatgcagcaaagttaaataacaacaacaacacaacataaacacaacagtatacaaaaacagcataacataat 26356057  T
Q  307 aatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  26356056 aatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 26355989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 120 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 26358707 - 26358441
Alignment:
Q  120 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaa---tcgacaacctattatataatccaataatttggaact 216  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26358707 ggcatcaagccctcaactatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaat-atcttaaaaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaact 26358609  T
Q  217 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca----------agcagtatacaaaaacaacatgacataat 306  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||          | ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  26358608 tcatcatcttaatcaatttagactgactcatgcagcaaagttaaataacaacaacaacacaacataaacacaacagtatacaaaaacagcataacataat 26358509  T
Q  307 aatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  26358508 aatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 26358441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 155
Target Start/End: Original strand, 16579377 - 16579515
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16579377 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctc 16579476  T
Q  117 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 155  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16579477 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 16579515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 16586286 - 16586148
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16586286 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctc 16586187  T
Q  117 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 155  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16586186 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 16586148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 18155152 - 18154901
Alignment:
Q  22 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaagg 121  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  18155152 agcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccaggg 18155054  T
Q  122 catcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca- 219  Q
    |||  ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||| |  | || |||| | |||||||||||||||  ||||     
T  18155053 cat-gagcccccaacatatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaacatc-tcaatc-atcatctcttat-ttatccaataatttggaggttcaa 18154959  T
Q  220 --tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 275  Q
      ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  18154958 cttcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcaaca 18154901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 113 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 2280339 - 2280033
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataa-tccaataattt 210  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||  || || | ||||| || | || |||| |||||||| | |||||||||    
T  2280339 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcaacaactcaacc-tcttagaaacaacgacctcttatataaattcaataattt 2280242  T
Q  211 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataat 309  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| | ||||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  2280241 ggaacatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataataat 2280145  T
Q  310 atcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatctta-aac 406  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| |||  || | |||| |||| | ||||||||  |||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||    
T  2280144 atcaaatgcaaatcaacaacatctcaaatattcatatataattcaaataatacatataaaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcttataac 2280045  T
Q  407 agcttcacagat 418  Q
    ||||||||||||    
T  2280044 agcttcacagat 2280033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 103 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 15755120 - 15754955
Alignment:
Q  103 tgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa-catcttaaatcgacaacctattatat-aat 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| || ||||| ||||||| ||  ||||| |||    
T  15755120 tgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggattcgacctcttaaaacaacttaattcgacaatctcgtatattaat 15755022  T
Q  201 ccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 267  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15755021 ccaattatttggaacatcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa 15754955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 113 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 15082147 - 15082017
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||    
T  15082147 gctccagggcatcaagccccaaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaattgacaaactcttgtataatccaataatttgg 15082048  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactca 246  Q
    |||||   |||||| |||||||||||||||||||    
T  15082047 aactt---catcttaatcaacttagaccgactca 15082017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 142 - 317
Target Start/End: Original strand, 16495329 - 16495505
Alignment:
Q  142 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagacc 240  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  16495329 aatgctaatgcatggacttgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttatattaatccaataatttggaacatcatcatcttcaacatcttagacc 16495428  T
Q  241 gactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  16495429 gactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcgaatg 16495505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 120 - 336
Target Start/End: Original strand, 67651 - 67867
Alignment:
Q  120 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatata-atccaataatttggaactt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||  ||||| | ||||| || | ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  67651 ggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataagcaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacat 67748  T
Q  218 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 316  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  67749 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 67847  T
Q  317 gcaagacaacaacatctcaa 336  Q
    ||||  ||||||||||||||    
T  67848 gcaaatcaacaacatctcaa 67867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 16461350 - 16461233
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16461350 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatactttcagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacgttttgagtacaaagctc 16461251  T
Q  117 caaggcatcaagccccca 134  Q
    || |||||||||||||||    
T  16461250 cagggcatcaagccccca 16461233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 113 - 340
Target Start/End: Original strand, 18005550 - 18005772
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataatccaataatttg 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| || | ||||||| ||||| | |||||||||| |    
T  18005550 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatgaacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttata-agtccaataattcg 18005646  T
Q  212 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataata 310  Q
    |||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||   ||| || ||||| |||| ||||    
T  18005647 gaacatcatcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataagcagtat-ggaaatcatcatgatataacaata 18005742  T
Q  311 tcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 340  Q
    || |||||||  ||||||||||||||||||    
T  18005743 tcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 18005772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 143 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 19486937 - 19486649
Alignment:
Q  143 atgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccg 241  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||| | |||| |||||    
T  19486937 atgctaatgcatggactcgacttcttaaacgtcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacatcaacatcttcaacgacttggaccg 19486838  T
Q  242 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 340  Q
    ||||||||||||||||||  |||  | |||||||| | ||||||| | |||||| ||||| |||||||||||  | | |||  ||||||||||||||||     
T  19486837 actcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgc-aaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataa 19486739  T
Q  341 acattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 427  Q
     ||   || | |||||| |||| |||| |||  |||||||| |||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||| || |||||    
T  19486738 tcacatataattcaagttatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagcttcacagatcatcattaa 19486649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 22 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 19649801 - 19649552
Alignment:
Q  22 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 120  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  19649801 agcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagg 19649703  T
Q  121 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt--- 217  Q
    ||||  ||||||||||||    ||||||||||||| |||||| |||||||| ||| | |||| |  | || |||| | |||||||||||||||  ||       
T  19649702 gcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatctcttaaatatcat-aatc-atcatctcttat-ttatccaataatttggaggttcaa 19649607  T
Q  218 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 272  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  19649606 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagca 19649552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 184 - 337
Target Start/End: Original strand, 22072882 - 22073037
Alignment:
Q  184 acaacctattatata-atccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagca 281  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||    
T  22072882 acaacctcttatatatatccaatagtttggaacatcatcatcttaatcaacttagactgacccatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggca 22072981  T
Q  282 gtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaa 337  Q
     ||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  22072982 ctatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaa 22073037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 198 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 12756847 - 12756715
Alignment:
Q  198 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaaca 297  Q
    |||||||||| ||||||| |||||  |||||||   ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  12756847 aatccaataaattggaacatcatc--cttcatc---ttagaccgactcgagcagtttagttaaataacaacagcaacacaa-caatatacaaaaacaaca 12756754  T
Q  298 tgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaa 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  12756753 tgacataataatatcaaatgcaagtaaacaacgtctcaa 12756715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 175
Target Start/End: Original strand, 24054270 - 24054421
Alignment:
Q  22 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaagg 121  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  24054270 agcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatgag-cccccatctctatttgagctaaagctccatcgcgttgagtacaaagctccaggg 24054368  T
Q  122 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatc 175  Q
    |||  ||||||||||||    ||||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  24054369 cat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatcacttaaacatc 24054421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 120 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 811343 - 811145
Alignment:
Q  120 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaactt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||  ||||| | ||||| || | ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |    
T  811343 ggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttatataagtccaataatttggaacat 811246  T
Q  218 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 316  Q
    |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  811245 catcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 811150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 120 - 267
Target Start/End: Original strand, 47831712 - 47831860
Alignment:
Q  120 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctatta-tata-atccaataatttggaact 216  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||  ||||| | ||||| || | ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||     
T  47831712 ggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaatatatatccaataatttggaaca 47831809  T
Q  217 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 267  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47831810 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 47831860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 120 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 16219928 - 16219719
Alignment:
Q  120 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||  ||||| || |||| | | ||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||    
T  16219928 ggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-caacttagaacaacaacctcttatataagtcgaataatttggaacatc 16219831  T
Q  219 atcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatg 317  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  16219830 atcatcttca---acttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatg 16219735  T
Q  318 caagacaacaacatct 333  Q
    |||| || ||||||||    
T  16219734 caagtcatcaacatct 16219719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 16461455 - 16461338
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  16461455 catcaagcccccaacgctatttgagtactaatatactttcagggcatcaagccctcatcgctaattgagctaaagcttcaacgtgttgagtacaaagctc 16461356  T
Q  117 caaggcatcaagccccca 134  Q
    || |||||||||||||||    
T  16461355 cagggcatcaagccccca 16461338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 340
Target Start/End: Original strand, 44014082 - 44014301
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataatccaataatttg 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||  ||||| | ||||| || | ||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  44014082 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttata-agtccaataatttg 44014178  T
Q  212 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataata 310  Q
    |||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||||    
T  44014179 gaacatcatcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaata 44014274  T
Q  311 tcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 340  Q
    || |||||||   | |||||||||||||||    
T  44014275 tcgaatgcaa---atcaacatctcaaatat 44014301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 15755271 - 15755152
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 114  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||   ||||||||| |    
T  15755271 catcaagcccttctcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggcgagtacaaacc 15755172  T
Q  115 tccaaggcatcaagccccca 134  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15755171 tccaaggcatcaagccccca 15755152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 120 - 337
Target Start/End: Original strand, 16056239 - 16056450
Alignment:
Q  120 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaactt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||  || || | ||||| || | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||      
T  16056239 ggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcaacaactcaacc-tcttagaaacaacaacctcttatataaatccaataatttggaac-- 16056334  T
Q  218 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 316  Q
     ||| ||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |  || ||| |  ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  16056335 -atcttctt--tcaacttagaccgactgatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacattatgc--aaacaacatgatataacaatatcaaat 16056429  T
Q  317 gcaagacaacaacatctcaaa 337  Q
    ||||  |||||||||||||||    
T  16056430 gcaaatcaacaacatctcaaa 16056450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 171
Target Start/End: Original strand, 9703067 - 9703215
Alignment:
Q  22 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||| | |||| |||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  9703067 agcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaatttcagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagg 9703165  T
Q  121 gcatcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa 171  Q
    ||||  ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  9703166 gcat-gagcccccaacatatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaa 9703215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 16461245 - 16461166
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctcca 96  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  16461245 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctcca 16461166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 120 - 195
Target Start/End: Original strand, 18427436 - 18427510
Alignment:
Q  120 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattat 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  18427436 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttat 18427510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 142 - 224
Target Start/End: Original strand, 16213550 - 16213632
Alignment:
Q  142 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatc 224  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |  |||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  16213550 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaatgacctcttaaatagtccaataatttggaacatcatcatc 16213632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 313
Target Start/End: Original strand, 15211271 - 15211557
Alignment:
Q  34 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccc 132  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||| || ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  15211271 tatttgaatattaatatacttccagggcatgag-cccccatcgttaatttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-aagcccc 15211368  T
Q  133 caac-aatgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaacttcatcatcttca- 228  Q
    ||||  |||  ||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||| |||| |  | || ||||| || |||||||||||||||| ||| ||||  ||     
T  15211369 caacttatg-tatgctaatgcatggactctaactcttaaaacatctt-aatc-atcatctcttatattagtccaataatttggaacatcaacatcaacat 15211465  T
Q  229 ------tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtat-acaaaaacaacatgacataataatatca 313  Q
          ||||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| || | |||| || |||| |||| |||||||||| |||||||    
T  15211466 cttaattcaacatggactgactcatgcaacttagttaattaacaacagcagcataggcagaatcacaacaacatcatgacataacaatatca 15211557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 3564621 - 3564565
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaaccccca 73  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  3564621 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccccca 3564565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 32216861 - 32216704
Alignment:
Q  22 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  || || || ||||| || ||||||||||| |||||| |||| |||||||||| || ||||| |||||||| |    
T  32216861 agcccccatcgctatttgagtattaaaatattttcaaggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaatgctccatcgtgttaagtactaagctccagg 32216763  T
Q  121 gcatcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 179  Q
    ||||  ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  32216762 gcat-gagcccccaacatatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatcttaa 32216704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 73
Target Start/End: Original strand, 40443255 - 40443311
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaaccccca 73  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  40443255 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccccca 40443311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 1868101 - 1867901
Alignment:
Q  229 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaa-acaacatgacataataatatcaaatgcaagacaac 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||| | |||||||| |||| |   ||||| |||| |||||| |||||||   |||    
T  1868101 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaactaacaacaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatatc-aatgcaaatgaac 1868003  T
Q  327 aacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtata-aaat-tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataat 424  Q
    ||||||||||| || |||  || | ||| ||||||| |||| |||| |||||||| || | |||||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||    
T  1868002 aacatctcaaacat-catatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatcttaaaaagcttcacagatcatcat 1867904  T
Q  425 taa 427  Q
    |||    
T  1867903 taa 1867901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 198 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 15008631 - 15008404
Alignment:
Q  198 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaa-acaa 295  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||   || ||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| | | |||||| |||| |       
T  15008631 aatccaataatttggaacatcat--tcttcatc---ttggaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatataaaacagtt 15008537  T
Q  296 catgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtata-aaat-tatcacatcataatcaacatca 393  Q
    ||||| |||| |||||||| |||||  |||||||| |||||| || |||  || | ||||||||||| |||| |||| |||||||| || | ||||||||    
T  15008536 catgatataacaatatcaa-tgcaaatcaacaacacctcaaacat-catatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatca 15008439  T
Q  394 aaacatctta-aacagcttcacagattataattaa 427  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  15008438 aatcatcttataacagcttcacagattatcattaa 15008404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 17138361 - 17138120
Alignment:
Q  34 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccc 132  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||| ||||| || |||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  17138361 tattttagtattaatatactttcagggcatgag-cccccatcgttattttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccc 17138264  T
Q  133 caacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt---catcatcttca 228  Q
    ||||||    ||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||| |||| |  | ||  ||||| |||||||||||||||  ||   ||||||||| |    
T  17138263 caacaaatgtatgctaatgcatggactcaatctcttaaaacatctt-aatc-atcatctcatatat-atccaataatttggaggttcaacatcatcttaa 17138167  T
Q  229 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 275  Q
    ||| |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||    
T  17138166 tcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcaaca 17138120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Original strand, 13869165 - 13869231
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  13869165 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctatttga 13869231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Original strand, 16213443 - 16213510
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  16213443 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaatcgctatttga 16213510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 38898720 - 38898654
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  38898720 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctatttga 38898654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 218 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 14932851 - 14932749
Alignment:
Q  218 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatg 317  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| || | || | | ||  ||||| || | ||||||||||||||||||| ||    
T  14932851 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaacaatagcatgacataataatatcaattg 14932752  T
Q  318 caa 320  Q
    |||    
T  14932751 caa 14932749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 218 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 15356286 - 15356184
Alignment:
Q  218 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatg 317  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| || | || | | ||  ||||| || | ||||||||||||||||||| ||    
T  15356286 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaacaatagcatgacataataatatcaattg 15356187  T
Q  318 caa 320  Q
    |||    
T  15356186 caa 15356184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 218 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 15360400 - 15360298
Alignment:
Q  218 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatg 317  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| || | || | | ||  ||||| || | ||||||||||||||||||| ||    
T  15360400 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaacaatagcatgacataataatatcaattg 15360301  T
Q  318 caa 320  Q
    |||    
T  15360300 caa 15360298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 332
Target Start/End: Original strand, 12901338 - 12901443
Alignment:
Q  229 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaa-acaacatgacataataatatcaaatgcaagacaac 326  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||| | ||||||||||||| |   ||||| |||| |||||||||||||| ||| |    
T  12901338 tcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatacaaaataattcatgatataacaatatcaaatgcaaaacagc 12901437  T
Q  327 aacatc 332  Q
    ||||||    
T  12901438 aacatc 12901443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 16461174 - 16461129
Alignment:
Q  110 aaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 155  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16461174 aaagctccagggcatcaatcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 16461129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 275
Target Start/End: Original strand, 12186835 - 12187076
Alignment:
Q  34 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccc 132  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||| ||||| || |||| ||||||||||  |||||||||||||| | |||||  ||||||    
T  12186835 tattttagtattaatatactttcagggcatgag-cccccatcgttattttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctctagggcat-gagcccc 12186932  T
Q  133 caacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt---catcatcttca 228  Q
    ||||||    ||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||| |||| |  | ||  ||||| |||||||||||||||  ||   ||||||||| |    
T  12186933 caacaaatgtatgctaatgcatggactcaatctcttaaaacatctt-aatc-atcatctcatatat-atccaataatttggaggttcaacatcatcttaa 12187029  T
Q  229 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 275  Q
    ||| |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||    
T  12187030 tcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcaaca 12187076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Original strand, 13647144 - 13647211
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| || |||||||||    
T  13647144 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaattgctatttga 13647211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Original strand, 16495178 - 16495245
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  16495178 catcaaacccctatcgctatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaatcgctatttga 16495245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 198 - 260
Target Start/End: Original strand, 14044735 - 14044792
Alignment:
Q  198 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaa 260  Q
    ||||||||||||||||||   | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14044735 aatccaataatttggaac---aacatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaa 14044792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 198 - 260
Target Start/End: Original strand, 14354765 - 14354822
Alignment:
Q  198 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaa 260  Q
    ||||||||||||||||||   | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14354765 aatccaataatttggaac---aacatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaa 14354822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 91 - 160
Target Start/End: Original strand, 14429758 - 14429825
Alignment:
Q  91 gctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactc 160  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  14429758 gctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-aagcccccaacaatg-tatgctaatgcatggactc 14429825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Original strand, 13647100 - 13647167
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||    
T  13647100 catcaagtcccaatcgctatttgagtattattatacttccaaagcatcaagccccaatcgctatttga 13647167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 16402755 - 16402712
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccaggg 60  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  16402755 catcaagcccccatcgttatttgagtattaatatacttccaggg 16402712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Original strand, 16495222 - 16495289
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | |||| || | ||||||| |||| ||||||||||||    
T  16495222 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatactcccggagcatcaagccccaatcgctatttga 16495289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 2832580 - 2832504
Alignment:
Q  198 aatccaataatttggaact--tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 272  Q
    ||||||||||||||||  |  |||||||||| |||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  2832580 aatccaataatttggagttcatcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaatagca 2832504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 82
Target Start/End: Original strand, 3386154 - 3386218
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt 82  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  3386154 catcaagcccctatcgctatttaagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctattt 3386218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 82
Target Start/End: Original strand, 13831194 - 13831258
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt 82  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  13831194 catcaagcccctatcgctatttgaatattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctattt 13831258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 13869208 - 13869268
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 78  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||    
T  13869208 catcaagcccctatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgct 13869268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 16213487 - 16213548
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 78  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  16213487 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgct 16213548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 16495266 - 16495327
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 78  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  16495266 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgct 16495327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 198 - 275
Target Start/End: Original strand, 18203801 - 18203873
Alignment:
Q  198 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 275  Q
    ||||||||||||||||||   | ||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  18203801 aatccaataatttggaac---aacatctt--tcatcttagatcgactcatgcagcttagttaataaacaacaacaaca 18203873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 40 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 16893 - 16499
Alignment:
Q  40 agtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaat 139  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| | || ||| || ||||||||||| ||||||||    
T  16893 agtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctatt-gagctaaagctccatcgtgttgagca-aaggcttcagggcatcaagcctccaacaat 16796  T
Q  140 gaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagac 239  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  16795 gaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgaaacatcatcatcttcatcaatttagac 16696  T
Q  240 cgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaata 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||    
T  16695 cgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaaatggaagtcaacagcatctcaagta 16596  T
Q  340 tacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcatc 434  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  16595 tacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcaaaatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagactataattaacatcatc 16499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 17 - 434
Target Start/End: Original strand, 13015 - 13433
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  13015 catcaagtccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagctc 13114  T
Q  117 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 216  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  13115 cagggcatcaagcccc-aacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaca 13213  T
Q  217 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  13214 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 13313  T
Q  317 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 414  Q
    ||||  || |||||||| |||||| ||   ||   ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13314 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 13413  T
Q  415 agattataattaacttcatc 434  Q
    | |||||||||||| |||||    
T  13414 aaattataattaacatcatc 13433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 17 - 434
Target Start/End: Original strand, 39716 - 40134
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39716 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagctcccatcgctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctc 39815  T
Q  117 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 216  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  39816 cagggcatcaagtccccaacaatgaaatgctaatgcatggacccgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaca 39915  T
Q  217 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 316  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39916 tcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcagcttaattaaataacaatagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaaat 40014  T
Q  317 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 414  Q
    ||| | ||| ||||||| ||||||    | ||   |||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  40015 gcatgtcaataacatcttaaatatttgattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcataaagagcttcac 40114  T
Q  415 agattataattaacttcatc 434  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  40115 agattataattaacatcatc 40134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 198 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 20017 - 19883
Alignment:
Q  198 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaa-acaa 295  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| | |||||||| |||| |       
T  20017 aatccaataatttggaac---atcatctt--tcatcttagaccgactcatgcagcttaattaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagtt 19923  T
Q  296 catgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctca 335  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  19922 catgatataacaatatcaaatgcaattcaacaacatctca 19883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 19015 - 18870
Alignment:
Q  34 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccc 132  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||| | ||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  19015 tattttagtattaatatactttcagggcataagacccc-atcgttattttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccc 18918  T
Q  133 caacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 179  Q
    ||||||    ||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||    
T  18917 caacaaatgtatgctaatgcatggactcaatctcttaaaacatcttaa 18870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 17 - 428
Target Start/End: Original strand, 1654 - 2067
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||   ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  1654 catcaagcccccatcactatttgagtattaatatacttccagggtatcaagcccccatcactgaatgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctc 1753  T
Q  117 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 216  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  1754 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaca 1853  T
Q  217 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1854 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 1953  T
Q  317 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 414  Q
    ||||  || |||||||| |||||| ||   ||   |||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  1954 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaatagcttcac 2053  T
Q  415 agattataattaac 428  Q
    ||||||||||||||    
T  2054 agattataattaac 2067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 50 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 3475 - 3103
Alignment:
Q  50 tacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaa 149  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3475 tacttctagggcatcaagcccccatcgctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctctagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaa 3376  T
Q  150 tgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaa----cttcatcatcttcatcaacttagaccgactc 245  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3375 tgcatggactcgacctcttaaatatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaacatcatcatcatcttcatcaacttagaccgactc 3276  T
Q  246 atgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacatt 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  3275 atgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaatgtaattcaacaacatctcaagtatacatt 3176  T
Q  346 catgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacag 416  Q
    ||| | ||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3175 cataattcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacag 3103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 17 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 8847 - 8438
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  8847 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttctagggcatcaagcccccatcactaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctc 8748  T
Q  117 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 216  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  8747 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacaacctcttatataatccaataatttggaaca 8648  T
Q  217 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  8647 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaat---aacagcaacataggcagtat-caaaaacagcatgacataataatatcaatt 8552  T
Q  317 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 414  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| || | ||   |||||||||||  |||| ||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8551 gcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 8452  T
Q  415 agattataattaac 428  Q
    ||||||||||||||    
T  8451 agattataattaac 8438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 56 - 423
Target Start/End: Original strand, 15955 - 16323
Alignment:
Q  56 cagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 155  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15955 cagggcatcaagcccccatcgctatttgaactaaagctccatcgttttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 16054  T
Q  156 aactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctta 255  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16055 gactcgacctcttaaacatcttaattcgaaaacctcttatataatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctta 16154  T
Q  256 gttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaa 355  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  16155 gttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacagcaagatatcataatatcaaatgcaagccaacatcatctcaagtatacattcataactcaa 16254  T
Q  356 gtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatctt-aaacagcttcacagattataa 423  Q
    ||||||| ||||| ||  |||||| |||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16255 gtaatgcatataacattatatcacgtcatgatcaacatc--aacatcttaaaacagcttcacagattataa 16323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 40 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 33250 - 32864
Alignment:
Q  40 agtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaat 139  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | |  ||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  33250 agtattaatatacttccagggcatcaagctcttatcgctatt-gagctaaagctccatcgtgttgagcacaaggctccagggcatcaagcccccaacaat 33152  T
Q  140 gaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagac 239  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33151 gaaatgctaatgcatggactcaacctcttaaacatcttagaacaacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagac 33052  T
Q  240 cgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaata 339  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||    
T  33051 cgactcatgcagcttagttaattaacaacagcaacacaggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatcttaaata 32953  T
Q  340 tacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat--cacatcataatcaacatcaaaacatc-ttaaacagcttcacagattataattaac 428  Q
    | |||| ||   || |||||||| ||||| |||||  |||||||| |||||||||  | |||| | ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  32952 ttcatt-atacttcgagtaatgcatataacattataacacatcatgatcaacatc--agcatcataaaatagcttcacagattataactaac 32864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 40 - 428
Target Start/End: Original strand, 45755 - 46141
Alignment:
Q  40 agtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaat 139  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | |  ||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  45755 agtattaatatacttccagggcatcaagctcttatcgctatt-gagctaaagctccatcgtgttgagcacaaggctccagggcatcaagcccccaacaat 45853  T
Q  140 gaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagac 239  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45854 gaaatgctaatgcatggactcaacctcttaaacatcttagaacaacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagac 45953  T
Q  240 cgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaata 339  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||    
T  45954 cgactcatgcagcttagttaattaacaacagcaacacaggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatcttaaata 46052  T
Q  340 tacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat--cacatcataatcaacatcaaaacatc-ttaaacagcttcacagattataattaac 428  Q
    | |||| ||   || |||||||| ||||| |||||  |||||||| |||||||||  | |||| | ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  46053 ttcatt-atacttcgagtaatgcatataacattataacacatcatgatcaacatc--agcatcataaaatagcttcacagattataactaac 46141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 40 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 17623 - 17388
Alignment:
Q  40 agtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaat 139  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||| || ||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||| ||||||||||||||    
T  17623 agtattaatatacttccagggcatcaagcccgtatcgctatt-gagctatagctccatcgtgttgagcacaaggctctagggcattaagcccccaacaat 17525  T
Q  140 gaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagac 239  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17524 gaaatgttaatgcatggactcaacctcttaaacattttagaacgacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagac 17425  T
Q  240 cgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac 276  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17424 cgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacac 17388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 428
Target Start/End: Original strand, 3273 - 3686
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||    
T  3273 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacgtccagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaatctc 3372  T
Q  117 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 216  Q
     | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  3373 tagggcatctagcccccaaaaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttagacatcttaattcaacaacctcttatataatccaataatttggaaca 3472  T
Q  217 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  3473 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataactaaagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 3572  T
Q  317 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 414  Q
    ||||  || |||||||| |||||| ||   ||   |||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  3573 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcaaataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcat 3672  T
Q  415 agattataattaac 428  Q
    ||||||||||||||    
T  3673 agattataattaac 3686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 17 - 428
Target Start/End: Original strand, 147 - 558
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  147 catcaagcccccatcactatttgagtattaatataattccagcgcatcaagcccccatcgctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtgcaaagctc 246  T
Q  117 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 216  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| || |||||||||||||     
T  247 cagggcatcaagcccccaacaaagaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgac-acctcttatatagtctaataatttggaaca 345  T
Q  217 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 316  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||| |||| | |||||| |||||||||||| |    
T  346 tcatcatctttatcgacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaataacataggcagtatac-aaaatagcatgacgtaataatatcaatt 444  T
Q  317 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 414  Q
    | ||| ||||||||||| |||||| |  | ||   |||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  445 ggaagtcaacaacatcttaaatattcgattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcat 544  T
Q  415 agattataattaac 428  Q
    | ||||||||||||    
T  545 atattataattaac 558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 4)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 56 - 424
Target Start/End: Original strand, 32783 - 33153
Alignment:
Q  56 cagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 155  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32783 cagggcatcaagcccccatctctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtccaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 32882  T
Q  156 aactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg-aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctt 254  Q
     |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32883 gactcgatctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaacatcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagctt 32982  T
Q  255 agttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactca 354  Q
    | ||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| || | ||   |||    
T  32983 aattaaataacaatagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagttaacaacatcttaaatattcaattatacttca 33081  T
Q  355 agtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataat 424  Q
    ||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33082 agtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataat 33153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 56 - 434
Target Start/End: Original strand, 38602 - 38982
Alignment:
Q  56 cagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 155  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38602 cagggcatcaagcccccatcgatatttgcgctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 38701  T
Q  156 aactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg-aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctt 254  Q
     ||| || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38702 gactagaactcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaacatcatcatcttcatcaacttagaccgagtcatgcagctt 38801  T
Q  255 agttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactca 354  Q
    | ||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||| || | ||   |||    
T  38802 aattaaataacaatagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaataaacaacatcttaaatattcaattatacttca 38900  T
Q  355 agtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcatc 434  Q
    ||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38901 agtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatc 38982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 113 - 336
Target Start/End: Original strand, 9645 - 9867
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  9645 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaaaaataatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcctatataatccaataatttgg 9744  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  9745 gacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatc 9843  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaa 336  Q
    || |||||| ||||||| ||||||    
T  9844 aagtgcaagtcaacaacgtctcaa 9867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 56 - 204
Target Start/End: Original strand, 32317 - 32465
Alignment:
Q  56 cagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 155  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32317 cagggcatcaagcccccatctctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtccaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 32416  T
Q  156 aactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaa 204  Q
     |||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  32417 gactcgatctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaa 32465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 17 - 422
Target Start/End: Original strand, 4652 - 5059
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||| |||    
T  4652 catcaagcccccatcactatttgagtattaatatacttccaaggcatcaagcccccatcgctaattgacctaaagctccaacgtggtgagtacaaaactc 4751  T
Q  117 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaac 215  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  4752 cagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaaattaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaac 4850  T
Q  216 ttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 315  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  4851 atcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagattagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaaa 4950  T
Q  316 tgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttca 413  Q
    |||||  ||||||||||| || ||| ||   |   |||||||||||| || || ||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  4951 tgcaattcaacaacatcttaagtattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttca 5050  T
Q  414 cagattata 422  Q
    |||||||||    
T  5051 cagattata 5059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 68 - 433
Target Start/End: Original strand, 39331 - 39697
Alignment:
Q  68 cccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctct 167  Q
    |||||||||||||||   | ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  39331 cccccatcgctatttaggccaaagctcaatcgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccc-aacaattaaatgctaatgcatggactcgacctct 39429  T
Q  168 taaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg-aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca 266  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39430 taaacatcttaattggacaacctcttatataatccaataatttggaaagatcatcgtcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca 39529  T
Q  267 acagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtat 366  Q
    ||| ||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||    
T  39530 acaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacat 39628  T
Q  367 aaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcat 433  Q
    || ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  39629 aacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcatagattataattaacatcat 39697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 71
Target Start/End: Original strand, 37151 - 37204
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccc 71  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  37151 catcaagcccccatcgctatt-gagtattaatatacttccagggcatcaagcccc 37204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 2)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 68 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 75481 - 75115
Alignment:
Q  68 cccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctct 167  Q
    |||||||||||||||   | ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  75481 cccccatcgctatttaggccaaagctcaatcgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccc-aacaattaaatgctaatgcatggactcgacctct 75383  T
Q  168 taaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg-aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca 266  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  75382 taaacatcttaattggacaacctcttatataatccaataatttggaaagatcatcgtcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca 75283  T
Q  267 acagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtat 366  Q
    ||| ||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||    
T  75282 acaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacat 75184  T
Q  367 aaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcat 433  Q
    || ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  75183 aacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcatagattataattaacatcat 75115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 77661 - 77608
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccc 71  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  77661 catcaagcccccatcgctatt-gagtattaatatacttccagggcatcaagcccc 77608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 57 - 428
Target Start/End: Original strand, 25738 - 26111
Alignment:
Q  57 agggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatga 156  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  25738 agggcatcaagcccccatcgttatttgagctaaagctccatcgtgtttagtacaaagctccagggcatcaagcctccaacaatgaaatgctaatgcatgg 25837  T
Q  157 actcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg-aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctta 255  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25838 actcgacctcttatacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaacatcattatcttcatcaacttagaccgactcatgaagctta 25937  T
Q  256 gttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaa 355  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || | ||   ||||    
T  25938 gttaaataacaatagcaacataggcagtatac-aaaatatcatgacataataatatcaaatgcaagtaaacaacatctcaaatattcaattatacttcaa 26036  T
Q  356 gtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaac 428  Q
    ||||||| | ||| ||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26037 gtaatgcatttaacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttcacagattataattaac 26111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 93 - 428
Target Start/End: Original strand, 39736 - 40073
Alignment:
Q  93 tccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctat 192  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||| |    
T  39736 tccatcgtgttgagtacaaagctccagggtatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaaaaacttaattcgacaacctct 39835  T
Q  193 tatataatccaataatttgg-aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaa 291  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||    
T  39836 tatataatccaataatttggaaacatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgaagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatac-aaa 39934  T
Q  292 acaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaac 389  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || | ||   ||||||||||| | ||| ||  ||||||||||||||||||    
T  39935 atatcatgacataataatatcaaatgcaagtaaacaacatctcaaatattcaattatacttcaagtaatgcatttaacattatatcacatcataatcaac 40034  T
Q  390 atcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaac 428  Q
    |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40035 atcaacgcatcttaaacagcttcacaaattataattaac 40073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 17 - 340
Target Start/End: Original strand, 128554 - 128876
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  128554 catcaagcccccattgctatttgagtattaatatacttcaagggcatcaagcccccatcgctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctc 128653  T
Q  117 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 216  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  128654 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaaca 128753  T
Q  217 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 316  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||  |  | | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  128754 tcatcatcttaatcaaattagaccaactcatgcaacttagttaaataacaaaagcaaca-aaaaaaaaaaaaaaaacagcatgacataataatatcaaat 128852  T
Q  317 gcaagacaacaacatctcaaatat 340  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||    
T  128853 gcaagtcaacaacatcttaaatat 128876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 198 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 20554 - 20330
Alignment:
Q  198 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaaca 297  Q
    |||||||||| ||||||| |||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  20554 aatccaataagttggaacatcatc--cttcatc---ttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-atcagtatac-aaaacaaca 20462  T
Q  298 tgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattatcacatcataatcaacatcaaaac 397  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||  ||  |||   ||||||||| |    
T  20461 tgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataaaacatcaaatc 20362  T
Q  398 atcttaaa-cagcttcacagattataattaac 428  Q
    ||| |||| ||||||||||||| || ||||||    
T  20361 atcataaatcagcttcacagatcatcattaac 20330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 66109 - 65958
Alignment:
Q  22 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaagg 121  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||    
T  66109 agcccccatcactatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctatttgagctaaagctccatcgtgttgagttcaaagctccaggg 66011  T
Q  122 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatc 175  Q
    |||  ||||||||||||    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  66010 cat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatctcttaaacatc 65958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 434
Target Start/End: Original strand, 8282 - 8697
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatt--tgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 114  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |  ||| |||| ||||||  ||  |||||||||||     
T  8282 catcaagcccccatcgctattttagtattaatatacttccagggcatcaagtccccatcgctaatgttgagctaatgctccaatgtggtgagtacaaaga 8381  T
Q  115 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaa 214  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8382 tccagggcatcaagcccccaactatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaaaatcttaa-tcgacaacctcttatataatccaataatttggaa 8479  T
Q  215 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 314  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  8480 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcaacataggtagtatacaaaaacagtatgacataataatatcaa 8579  T
Q  315 atgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 414  Q
     |||||| ||||||||||| ||| || ||    |   |||||||||||  |||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  8580 ttgcaagtcaacaacatcttaaacattcaagtgtacttcaagtaatgcacataacatta--acatcataatcaacatcaacacatcctaaacagcttcac 8677  T
Q  415 agattataattaacttcatc 434  Q
    ||||| |||||||| |||||    
T  8678 agattgtaattaacatcatc 8697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 2)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 428
Target Start/End: Original strand, 20711 - 21127
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 115  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  20711 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagct 20810  T
Q  116 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaa 214  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  20811 ccaaggcatcaatcccccaacaatgaaatcctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaa 20910  T
Q  215 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 313  Q
    | ||| |||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20911 catcaacatcttcaacgacttagaccgactcataaagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcaaaaacaacatgacataataatatca 21010  T
Q  314 aatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagctt 411  Q
    | |||||  ||||||||||| | |||| ||    |    |||||||||| || || ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  21011 attgcaattcaacaacatcttatatattcaaatgttctacaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcagcatcaacacatcttaaacagctt 21110  T
Q  412 cacagattataattaac 428  Q
    ||||| |||||||||||    
T  21111 cacaggttataattaac 21127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 66
Target Start/End: Original strand, 10118 - 10167
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaa 66  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10118 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaa 10167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 17 - 433
Target Start/End: Original strand, 31869 - 32285
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 115  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||    
T  31869 catcaaacccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagct 31968  T
Q  116 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaa 214  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  31969 ccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaa 32067  T
Q  215 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 314  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  32068 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaac--aaacaacatgacataataatatcaa 32165  T
Q  315 atgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat-tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttca 413  Q
     | |||  || |||||||| |  ||||||   ||   ||||||||||| || | | | ||||||||||||||||||| | | | |||||| |||||||||    
T  32166 tttcaattcatcaacatcttaggtatacaaatattcttcaagtaatgcataaacattatatcacatcataatcaacaacgacatatcttatacagcttca 32265  T
Q  414 cagattataattaacttcat 433  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  32266 cagattataattaacctcat 32285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 56 - 84
Target Start/End: Original strand, 31864 - 31892
Alignment:
Q  56 cagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31864 cagggcatcaaacccccatcgctatttga 31892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 3)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 113 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 44929 - 44682
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  44929 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatattaaatcgacaacctcttatataatccaatactttgg 44830  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44829 aacttcatcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 44730  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaat 360  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  44729 aaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 44682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 221 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 26179 - 25964
Alignment:
Q  221 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  26179 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgtaa 26080  T
Q  321 gacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagat 418  Q
      ||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  26079 ttcaacaacgtctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcatagat 25980  T
Q  419 tataattaacttcatc 434  Q
    |||||||||| |||||    
T  25979 tataattaacatcatc 25964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 339 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 33491 - 33394
Alignment:
Q  339 atacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat--cacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcatc 434  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  33491 atacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttcataggttataattaacatcatc 33394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 56 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 6404 - 6020
Alignment:
Q  56 cagggcatcaaacccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcat 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6404 cagggcatcaagcccccatcgctattttgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagcttcagggcatcaagcctccaacaatgaaatgctaatgcat 6305  T
Q  155 gaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctt 254  Q
      ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6304 agactcgacctcttaaacatcttaatttgacaacctcttatataatccaaaaatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctt 6205  T
Q  255 agttaaataacaacagcaacacaa---gcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgac 351  Q
    ||||||||||||||| |||||  |   | |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||  || |||||||| |||||| ||   ||       
T  6204 agttaaataacaacaacaacaacataggtagtatacaaaaacagcatgacatgataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattct 6105  T
Q  352 tcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcatc 434  Q
    |||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  6104 tcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacattttataattaacatcatc 6020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 17 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 5150 - 4893
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5150 catcaagcccccatcgctatt-gagcattaatatacttccagggcatcaaacccccatcgctagttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctc 5052  T
Q  117 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 216  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  5051 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaca 4952  T
Q  217 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 275  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4951 tcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaacttagttaaataacaacagcaaca 4893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 291 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 1006 - 881
Alignment:
Q  291 aacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat--cacatcataatcaa 388  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| || |||| | |||||||||||  |||| |||||  |||||| ||||| |    
T  1006 aacagcatggcataataatatcaa-tgcaagtcaacaaaatctcaaatattcaatcataattcaagtaatgcacataacattatatcacatcgtaatcga 908  T
Q  389 catcaaaacatcttaaacagcttcaca 415  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  907 catcaacacatcttaaacagcttcaca 881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 17 - 333
Target Start/End: Original strand, 28215 - 28533
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 115  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| | || ||||||| | || ||||| ||||| ||||| | |  |||||||||||||    
T  28215 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatactttcagggctttaagcccccattgttaatttgagctaaacctccaacatggtgagtacaaagct 28314  T
Q  116 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaa 214  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||| |||||||    
T  28315 ccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattagtccaatagtttggaa 28414  T
Q  215 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 314  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28415 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 28514  T
Q  315 atgcaagacaacaacatct 333  Q
     |||||  |||||||||||    
T  28515 ttgcaattcaacaacatct 28533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 267
Target Start/End: Original strand, 4353 - 4605
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 115  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| | |||||| | |||||||| |||| ||||||| ||||| |||| |||||| ||   |||||||||||||    
T  4353 catcaagccccaatcgatatttgagtattattatacttcaaaggcatcaagccccaatcgctaatttgagctaatgctccaacgaggtgagtacaaagct 4452  T
Q  116 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa-catcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttgga 213  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  4453 ccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctctaaaaacatcttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttgga 4551  T
Q  214 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 267  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4552 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 4605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 267
Target Start/End: Original strand, 1798 - 2050
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 115  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||    
T  1798 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttctagggcatcaagccccaatcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagct 1897  T
Q  116 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa-catcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttgga 213  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| || ||| | || ||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  1898 ccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagactcgacctcttaaaacaacttgattcaacaacctcttatattagtccaataatttgga 1996  T
Q  214 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 267  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1997 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 2050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 175 - 317
Target Start/End: Original strand, 11252 - 11395
Alignment:
Q  175 cttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagca 272  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11252 cttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagca 11351  T
Q  273 acacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatg 317  Q
    ||| | ||||||| | ||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  11352 acataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcgaatg 11395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 17 - 433
Target Start/End: Original strand, 4514 - 4932
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 115  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||    
T  4514 catcaagcccccatcggtatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagct 4613  T
Q  116 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaa- 214  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  4614 ccagggcatcaagcccctaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaa 4712  T
Q  215 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 314  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||  | |||||    
T  4713 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataaatacatcaa 4812  T
Q  315 atgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat-tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttca 413  Q
     |||||  || ||| |||| |  ||||||   ||   |||||||| || || | | | ||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||| |||||    
T  4813 ttgcaattcatcaaaatcttatgtatacaaatattcttcaagtaaggcataaacattatatcacatcataatcaacaacaacatatcttatacaacttca 4912  T
Q  414 cagattataattaacttcat 433  Q
    ||||||||| ||||| ||||    
T  4913 cagattatacttaacctcat 4932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 372 - 433
Target Start/End: Original strand, 95 - 156
Alignment:
Q  372 tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcat 433  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  95 tatcacatcataatcaacaacaacatatcttatacaacttcacagattatacttaacctcat 156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 17 - 433
Target Start/End: Original strand, 13297 - 13716
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||    
T  13297 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagc 13396  T
Q  115 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa-catcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttgg 212  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  13397 tccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaaacgacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttgg 13495  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  13496 aacatcatcaacttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacatgataatatc 13594  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat-tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagctt 411  Q
    || | | |  || |||||||| |  ||||||  |||   ||||||||||| || | | | ||||||||||||||||||| | | | |||||| |||||||    
T  13595 aatttcgattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcataaacattatatcacatcataatcaacaacgacatatcttatacagctt 13694  T
Q  412 cacagattataattaacttcat 433  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  13695 cacagattataattaacctcat 13716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 4)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 17 - 270
Target Start/End: Original strand, 76 - 329
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  76 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatctctaattgagctaaagctccaacgcattaagtacaaagctc 175  T
Q  117 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 216  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  176 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaca 275  T
Q  217 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacag 270  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  276 tcattatcttcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaacag 329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 289
Target Start/End: Original strand, 33924 - 34199
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 114  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||  |||||||||||     
T  33924 catcaaacccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagt 34023  T
Q  115 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttgga 213  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  34024 tgcagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagactcgacctcttaagcaacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttgga 34122  T
Q  214 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaa 289  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||    
T  34123 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaa 34199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 266 - 428
Target Start/End: Original strand, 13144 - 13308
Alignment:
Q  266 aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgta 365  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||| || | ||   |||||||||||  |    
T  13144 aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcaca 13243  T
Q  366 taaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaac 428  Q
    ||| ||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13244 taacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagtttcacagattataattaac 13308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 56 - 84
Target Start/End: Original strand, 33919 - 33947
Alignment:
Q  56 cagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33919 cagggcatcaaacccccatcgctatttga 33947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 17 - 421
Target Start/End: Original strand, 1751 - 2161
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta----tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaa 112  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||    ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||    
T  1751 catcaagcccccatcgttatttgagtattaatatacttctagggcatcaagcccccatcgctaattttttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaa 1850  T
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttg 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  1851 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttg 1949  T
Q  212 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 311  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  1950 gaacatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaacagcgacataggcagtatacaaaatcaacatgacataatgatat 2049  T
Q  312 caaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagc 409  Q
    ||| |||||  ||||||||||| |||||| ||  ||| | ||||||||||| || || ||  |||| |||||||||||||| ||| | ||| || |||||    
T  2050 caattgcaattcaacaacatcttaaatattcaaacattattcaagtaatgcataaaacattatatctcatcataatcaacaacaacatatcatatacagc 2149  T
Q  410 ttcacagattat 421  Q
    || ||| |||||    
T  2150 tttacatattat 2161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 79 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 1304 - 954
Alignment:
Q  79 atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta 178  Q
    |||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1304 atttgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta 1206  T
Q  179 aatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca 277  Q
    | |||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  1205 attcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacata 1106  T
Q  278 agcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat-tatca 376  Q
     |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  || |||||||| |||||| ||   || | ||||||||||| || | | | |||||    
T  1105 ggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcataaacattatatca 1006  T
Q  377 catcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaac 428  Q
    |||||||||||||   || |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1005 catcataatcaaccaaaacacatcttaaacagcttcaaagattataattaac 954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 182; Significance: 3e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Original strand, 20644 - 20903
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20644 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 20742  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20743 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 20841  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  20842 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 20903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 182; Significance: 3e-98; HSPs: 13)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Original strand, 94308 - 94567
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  94308 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 94406  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  94407 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 94505  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  94506 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 94567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Original strand, 44351 - 44611
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  44351 gctccagggcatcaagtccccaacaattaaaagctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataattttg 44449  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatac-aaaaacaacatgacataataatat 311  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  44450 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaaacagcatgacataataatat 44548  T
Q  312 caaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  44549 caaatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatagaattat 44611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 285
Target Start/End: Original strand, 119677 - 119947
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 115  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| |||  |||||||| ||||    
T  119677 catcaagcccccattgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacagagct 119776  T
Q  116 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttggaa 214  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  119777 ccagggcatcaagccctcaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaa 119875  T
Q  215 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtat 285  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  119876 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 119947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 221 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 17598 - 17446
Alignment:
Q  221 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 320  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17598 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacac-agcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 17500  T
Q  321 gacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    | ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  17499 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattat 17446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 113 - 340
Target Start/End: Original strand, 100278 - 100500
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataatccaataatttg 211  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || | ||  ||||| | ||||| ||   ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  100278 gctccagggcatcaagctcccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaaaaacaacctcttatata-tccaataatttg 100374  T
Q  212 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataata 310  Q
    |||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||||||||    
T  100375 gaacatcatcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataataata 100470  T
Q  311 tcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 340  Q
    || |||||||  ||||||||||||||||||    
T  100471 tcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 100500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 113 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 40391 - 40169
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataatccaataatttg 211  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || | ||  ||||| | ||||| || | ||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  40391 gctccacggcatcaagtccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaccaacaacctcttata-agtccaataatttg 40295  T
Q  212 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataata 310  Q
    |||| ||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||  | ||| || ||||| |||| ||||    
T  40294 gaacatcatcatc---atcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagtaggc-aaatcatcatgatataacaata 40199  T
Q  311 tcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 340  Q
    || |||||||  ||||||||||||||||||    
T  40198 tcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 40169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 113 - 267
Target Start/End: Original strand, 101404 - 101552
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | || |||||| || |||||| | ||| | | ||||| | ||||||||||| |    
T  101404 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacatcttaa-caacttaaaacaacatcatcttata-agtccaataatttag 101500  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 267  Q
    ||| ||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  101501 aacatcatcatc---atcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaacaacaa 101552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 37 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 38777 - 38542
Alignment:
Q  37 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaa 135  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||| |||| ||||| |||| |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||    
T  38777 ttgagtattaatatacttctagggcat-aagcccccattgctaatttgagctaatgctcaatcgtgttgagtactaagctccagggcatga-gcccccaa 38680  T
Q  136 ca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt---catcatcttcatc 230  Q
    || ||| | |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| |  | || ||||| ||||||||||||||||  ||   ||||||||| |||    
T  38679 catatgta-tgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatctt-aatc-atcatctcttata-aatccaataatttggaggttcaacatcatcttaatc 38584  T
Q  231 aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 272  Q
    | |||| |  |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  38583 atcttatattgactcatgcaacttagttaaataacaatagca 38542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #9
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 17953 - 17886
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  17953 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaatcgctatttga 17886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #10
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 17909 - 17842
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||    
T  17909 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgctatttga 17842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #11
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 17984 - 17930
Alignment:
Q  30 tcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| || ||||||| |||| ||||||||||||    
T  17984 tcgctatttgagtattattatacttctagagcatcaagccccaatcgctatttga 17930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 17802 - 17765
Alignment:
Q  142 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaa 179  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  17802 aatgctaatgcacggactcgacctcttaaacatcttaa 17765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 17865 - 17804
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 78  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| |||| || |||| ||||||    
T  17865 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccagagcattaagccccaatcgct 17804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 11763 - 11464
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 115  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||    
T  11763 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagct 11664  T
Q  116 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa-catcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttgga 213  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  11663 ccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaaacgacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttgga 11565  T
Q  214 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 313  Q
    || || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11564 acatcttcatcttcaacaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggtagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 11465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 178; Significance: 8e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 17 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 15784 - 15370
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||    
T  15784 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagc 15685  T
Q  115 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa-catcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttgg 212  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||| || ||| | |||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  15684 tccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgttaatgcatggactagacctcttaaaacaacttgattcgacaacctcttatattagtccaataatttgg 15586  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15585 aacatcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaagagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatc 15487  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat-tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagctt 411  Q
    || | |||  || |||||||| |  |||| |   ||   ||||||||||| || | | | |||||||||||||||| || ||| | |||||| |||||||    
T  15486 aatttcaattcatcaacatcttatgtataaaaatattcttcaagtaatgcataaatattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagctt 15387  T
Q  412 cacagattataattaac 428  Q
    |||||||||||||||||    
T  15386 cacagattataattaac 15370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 275
Target Start/End: Original strand, 7112 - 7352
Alignment:
Q  34 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagccccc 133  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| || |||      
T  7112 tattttagtattaatatactttcagggcatgag-cccccatcgttatttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcatgaa-cccaa 7209  T
Q  134 aacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt---catcatcttcat 229  Q
    |||||    ||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||| |||| |  | ||  ||||| |||||||||||||||  ||   ||||||||| ||    
T  7210 aacaaatgtatgctaatgcatggactcaatctcttaaaacatctt-aatc-atcatctcatatat-atccaataatttggaggttcaacatcatcttaat 7306  T
Q  230 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 275  Q
    || |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||    
T  7307 catcttaaatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcaaca 7352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 178; Significance: 8e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 120 - 360
Target Start/End: Original strand, 116332 - 116571
Alignment:
Q  120 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatcc-aataatttggaacttc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  116332 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaaatactttggaacttc 116431  T
Q  219 atcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgc 318  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  116432 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatac-aaaacagcatgacataatcatatcaaatgc 116529  T
Q  319 aagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaat 360  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  116530 aagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 116571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 198 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 129102 - 128967
Alignment:
Q  198 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaa- 295  Q
    ||||||||||||||||||   | ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | |||||| |  |||||||     
T  129102 aatccaataatttggaac---aacatctt--tcatcttagaccgactcatgcagcttagtt-aataacaaacagcaacataggcagtaca-taaaacaat 129010  T
Q  296 -catgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaa 337  Q
     ||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  129009 tcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaa 128967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 177; Significance: 3e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 17 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 10744 - 10331
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||    
T  10744 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagc 10645  T
Q  115 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa-catcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttgg 212  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  10644 tccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaaacgacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttgg 10546  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 311  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| | |||||||||   |||| ||||||||||||||||    
T  10545 aacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcatagttaattaacaaacagcaacataggcagtatac---aacagcatgacataataatat 10449  T
Q  312 caaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgt-ataaaattatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagct 410  Q
    ||| | |||  ||||||||||| || ||||||   ||   ||||||||||| | || |   |||||||||||||||| || | | | |||||| ||||||    
T  10448 caatttcaattcaacaacatcttaagtatacaaatattcttcaagtaatgcataatcattatatcacatcataatcatcaacgacatatcttatacagct 10349  T
Q  411 tcacagattataattaac 428  Q
    ||||||||||||||||||    
T  10348 tcacagattataattaac 10331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Original strand, 37718 - 37977
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37718 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 37816  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37817 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 37915  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  37916 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 37977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Original strand, 136577 - 136836
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  136577 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcaacaacctcttatataatccaataatttgg 136675  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  136676 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaatacagcatgacataataatatc 136774  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  136775 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 136836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Original strand, 139046 - 139305
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  139046 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcaacaacctcttatataatccaataatttgg 139144  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  139145 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaatacagcatgacataataatatc 139243  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  139244 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 139305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Original strand, 143984 - 144243
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  143984 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcaacaacctcttatataatccaataatttgg 144082  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  144083 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaatacagcatgacataataatatc 144181  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  144182 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 144243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Original strand, 134108 - 134367
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  134108 gctccacggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcaacaacctcttatataatccaataatttgg 134206  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  134207 aacttcatcatcttaatcaacatagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaatacagcatgacataataatatc 134305  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  134306 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 134367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Original strand, 141515 - 141774
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  141515 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcaacaacctcttatataatccaataatttgg 141613  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  141614 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaatacagcatgacataataatatc 141712  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  141713 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 141774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 113 - 317
Target Start/End: Original strand, 132563 - 132762
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |  | |||||| || |||||| | ||| | | ||||| | |||||||||||||    
T  132563 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacatcatcttaa-caacttaaaacaacatcatcttata-agtccaataatttgg 132659  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 311  Q
    ||| |||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||| | || |||||    
T  132660 aacatcatcatcatcatc---ttagaccgactcatgcagcttagataaataacaaacagcaacataagtagtatgcaaaatcatcatgatacaacaatat 132756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 217 - 340
Target Start/End: Original strand, 62201 - 62321
Alignment:
Q  217 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 315  Q
    |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||  ||||||| ||||  ||||||||||| ||    
T  62201 tcatcatcatcttcgacttaaaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtat-gaaaaacatcatggtataataatatcgaa 62299  T
Q  316 tgcaagacaacaacatctcaaatat 340  Q
    |||   |||||||||||||||||||    
T  62300 tgc---acaacaacatctcaaatat 62321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 173; Significance: 7e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 113 - 373
Target Start/End: Original strand, 13289 - 13547
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13289 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 13387  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13388 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 13486  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaatta 373  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| |||||    
T  13487 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaatta 13547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 113 - 336
Target Start/End: Original strand, 40297 - 40518
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40297 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 40395  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  40396 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacaggatgacataataatatc 40494  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaa 336  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||    
T  40495 aaatgcaagtcaacaacgtctcaa 40518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 56 - 275
Target Start/End: Original strand, 121607 - 121827
Alignment:
Q  56 cagggcatcaaacccccatcgctat-ttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcat 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  121607 cagggcatcaaacccccatcgctaaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcat 121706  T
Q  155 gaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctt 254  Q
    | |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  121707 ggactcgacctcttaaacatattaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctt 121806  T
Q  255 agttaaataacaacagcaaca 275  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  121807 agttaaataacaacaacaaca 121827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 362
Target Start/End: Original strand, 174567 - 174912
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 114  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| | ||  |||||  ||  ||||||||||||    
T  174567 catcaagccaccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattttgagcaaattctccaatgtggtgagtacaaagc 174666  T
Q  115 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctatta-tataatccaataatttgga 213  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||| | || ||||||||||||||    
T  174667 tccagggcatcaagcccccaactatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgataacctcttaatttagtccaataatttgga 174765  T
Q  214 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
     | |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||   |||| |||||||| || |||||    
T  174766 gcatcatcaacttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatac---aacagcatgacatgattatatc 174862  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgc 362  Q
    |||| |||  ||||||||||||||  || ||||||| | |||||||||||    
T  174863 aaattcaattcaacaacatctcaatcattcattcataattcaagtaatgc 174912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 352 - 428
Target Start/End: Original strand, 124723 - 124801
Alignment:
Q  352 tcaagtaatgcgtataaaattat--cacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaac 428  Q
    ||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  124723 tcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaac 124801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 136471 - 136370
Alignment:
Q  233 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaa-acaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaaca 330  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||| ||| | |||||| |||||| |   ||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  136471 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcgacataggcagtacacaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 136372  T
Q  331 tc 332  Q
    ||    
T  136371 tc 136370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 145179 - 145078
Alignment:
Q  233 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaa-acaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaaca 330  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||| ||| | |||||| |||||| |   ||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  145179 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcgacataggcagtacacaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 145080  T
Q  331 tc 332  Q
    ||    
T  145079 tc 145078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Original strand, 13844 - 14103
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13844 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgatctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 13942  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13943 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagataaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 14041  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  14042 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 14103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 113 - 321
Target Start/End: Original strand, 4110 - 4317
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4110 gctccagggcatcaagcccccaacaatgtaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 4209  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  4210 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacgacagcgacac-agcagtatacaaaaccagcatgacataataatatc 4308  T
Q  313 aaatgcaag 321  Q
    |||||||||    
T  4309 aaatgcaag 4317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 155; Significance: 4e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 113 - 374
Target Start/End: Original strand, 11960 - 12214
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11960 gctccagggcatcaagccaccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 12059  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  12060 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtta------aacagcaacac-agcagtatactaaaacagcatgacataataatatc 12152  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  12153 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 12214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 192 - 434
Target Start/End: Original strand, 22861 - 23104
Alignment:
Q  192 ttatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaa 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  22861 ttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-accagtatacaaaa 22959  T
Q  292 acaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaac 389  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || | ||   |||||||||||  |||| ||  ||||||||| ||||||||    
T  22960 acagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcgtaatcaac 23059  T
Q  390 atcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcatc 434  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  23060 atcaacacatcttaaacagcttcacagattataaataacatcatc 23104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 153; Significance: 6e-81; HSPs: 3)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 18345 - 17932
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||| |||| || |||| ||||| ||||| |||  ||||||||||||||    
T  18345 catcaagcccctatcgctatttgagtattattatact-ccagggcatcaagcccctatcgttaattgagctaaacctccaacgtggtgagtacaaagctc 18247  T
Q  117 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattat-ataatccaataatttggaac 215  Q
    || |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  18246 cagggcatcaaccccccaacactgaaatgataatgcatggactcgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaac 18147  T
Q  216 ttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 314  Q
     ||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| ||| | | |||| ||||| ||||||||||| |    
T  18146 atcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcattatgc-acaacatcatgatataataatatcga 18048  T
Q  315 atgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaa-cagctt 411  Q
    | |||||  ||||||||||||||||| ||   || | ||||||||||| |||| |||  |||||||| |||| |||||||||| |||| |||| ||||||    
T  18047 acgcaagtaaacaacatctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagctt 17948  T
Q  412 cacagattataattaa 427  Q
    ||||||| || |||||    
T  17947 cacagatcatcattaa 17932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 114 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 2394 - 2188
Alignment:
Q  114 ctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgga 213  Q
    ||||| ||||| ||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  2394 ctccagggcataaagcccctatcgctgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacattttaaaccgacaacctcttatataatccaataatttaga 2295  T
Q  214 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 313  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2294 acttcatcattttaatcaacttagaccgactcttgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 2196  T
Q  314 aatgcaag 321  Q
    ||||||||    
T  2195 aatgcaag 2188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 2456 - 2406
Alignment:
Q  33 ctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  2456 ctatttgagtattaatatact-ccagggcatcaagcccctatcgctatttga 2406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 433
Target Start/End: Original strand, 1090 - 1507
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 114  Q
    |||||||||||   |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||    
T  1090 catcaagccccgaccgctatttgagttttaatatacttccaggacatcaagcccccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagc 1189  T
Q  115 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttgga 213  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  1190 tccagggcatgaagcccccaactatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttgga 1288  T
Q  214 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||   |||| ||||||||||| |||||    
T  1289 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtgtac---aacatcatgacataattatatc 1385  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat--cacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagct 410  Q
    |||| |||  || |||||||| |  ||||||  |||   ||||||||||| || || |||||  ||| |||||||||||| ||| | ||||||  |||||    
T  1386 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaacaacaacatatcttattcagct 1484  T
Q  411 tcacagattataattaacttcat 433  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||    
T  1485 tcatagattatagttaacctcat 1507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 113 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 15460 - 15298
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  15460 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaaactcttatataatccaataatttgg 15361  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 275  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15360 aacttcatcatcttaatcaacgtagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaaca 15298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 142 - 433
Target Start/End: Original strand, 7193 - 7484
Alignment:
Q  142 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagacc 240  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  7193 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacatcttagacc 7292  T
Q  241 gactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaata 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||   |||||||||| ||||| ||||||||| |||  || |||||||| |  ||    
T  7293 gactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatac---aacaacatgaaataattatatcaaattcaattcatcaacatcttatgta 7389  T
Q  340 tacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat--cacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcat 433  Q
    ||||  |||   ||||||||||| || || |||||  ||| |||||||||||| ||| | ||||||  |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  7390 tacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaacaacaacatatcttattcagcttcatagattatagttaacctcat 7484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 143 - 336
Target Start/End: Original strand, 16710 - 16902
Alignment:
Q  143 atgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccga 242  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16710 atgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgaccaactcttgtataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccga 16809  T
Q  243 ctcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaa 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  16810 ctcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 16902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 148; Significance: 6e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 5448 - 5132
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||    
T  5448 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggtatcaagcccccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagc 5349  T
Q  115 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttgga 213  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  5348 tccagggcatcaagcccccaactatgaa-tgttaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttgga 5250  T
Q  214 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | | | |||||   |||| ||||||||||| |||||    
T  5249 acgtcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacatcaacataggtattatac---aacatcatgacataattatatc 5153  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatct 333  Q
    |||| |||  || ||||||||    
T  5152 aaattcaattcatcaacatct 5132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 148; Significance: 6e-78; HSPs: 6)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 114 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 85845 - 85639
Alignment:
Q  114 ctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgga 213  Q
    ||||| ||||||||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  85845 ctccagggcatcaagcccctatcgctgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcaacaacctcttatataatccaataatttgga 85746  T
Q  214 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 313  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  85745 acttcatcatcttaatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 85647  T
Q  314 aatgcaag 321  Q
    ||||||||    
T  85646 aatgcaag 85639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 142 - 374
Target Start/End: Original strand, 501003 - 501240
Alignment:
Q  142 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatca------tcttcatcaactt 235  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||| |||||||||||||||| | ||||      |||| ||||||||    
T  501003 aatgctaatgcatagactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacataatcaacaacatcttaatcaactt 501102  T
Q  236 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  501103 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agcaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctca 501201  T
Q  336 aatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    | ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  501202 attattcacatataattcaagtaatgcatatataattat 501240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 120 - 340
Target Start/End: Original strand, 160594 - 160809
Alignment:
Q  120 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataat-ccaataatttggaacttc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||| || |||||| | ||||||| ||| ||||| |||||||||||| || ||    
T  160594 ggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacgcaacctcttaa-caacttaaagcaacaacctcttaaataattccaataatttgggacatc 160691  T
Q  219 atcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatg 317  Q
    ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||||||||    
T  160692 atcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaaatg 160787  T
Q  318 caagacaacaacatctcaaatat 340  Q
    |||  ||||||||| ||||||||    
T  160788 caa-tcaacaacatgtcaaatat 160809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 85915 - 85857
Alignment:
Q  25 ccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  85915 ccccatcgctatttgagtattaatatact-ccagggcatcaagcccctatcgctatttga 85857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 84
Target Start/End: Original strand, 500912 - 500963
Alignment:
Q  33 ctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  500912 ctatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaatcgctatttga 500963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 85880 - 85820
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 78  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||    
T  85880 catcaagcccctatcgctatttgagcattaatatac-tccagggcatcaagcccctatcgct 85820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 422
Target Start/End: Original strand, 46796 - 47202
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||   |||||||||||    
T  46796 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttctagggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggggagtacaaagc 46895  T
Q  115 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttgga 213  Q
    || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  46896 tctagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttgaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttgga 46994  T
Q  214 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 312  Q
    || |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| | ||||| ||||    || |||||||||||||||||    
T  46995 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtttacag---cagcatgacataataatatc 47091  T
Q  313 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat-tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagctt 411  Q
    || | |||  || |||||||| |  ||||||   ||    |||||||||| || | | | ||||||||||||| || || ||| | |||||| |||||||    
T  47092 aatttcaattcatcaacatcttatgtatacaaatattctccaagtaatgcataaacattatatcacatcataaacatcaacaacatatcttatacagctt 47191  T
Q  412 cacagattata 422  Q
    |||||||||||    
T  47192 cacagattata 47202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 241
Target Start/End: Original strand, 31961 - 32188
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| || |||  ||  ||||||||||||    
T  31961 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaatgccccaatgtggtgagtacaaagc 32060  T
Q  115 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaa 214  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32061 tccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggacttgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaa 32160  T
Q  215 c-ttcatcatcttcatcaacttagaccg 241  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||    
T  32161 caatcatcatcttcatcaacttagaccg 32188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 141; Significance: 9e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 433
Target Start/End: Original strand, 16082 - 16500
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta---tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaag 113  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||| | || |||||| |||  |||||||||||    
T  16082 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatttttgagcaaatgctccaacgtggtgagtacaaag 16181  T
Q  114 ctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttgg 212  Q
    ||||| || ||||||| |||||| ||| ||||||| |||||| |||||| |||||| ||| ||||| |||||||||| ||| | || || ||||||||||    
T  16182 ctccagggtatcaagcgcccaactatg-aatgctattgcatggactcgatctcttagacaacttaattcgacaacctcttacattagtctaataatttgg 16280  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 311  Q
    ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||   |||| ||||||||||| ||||    
T  16281 aacatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataagaaacagcaacataggcagtatac---aacagcatgacataattatat 16377  T
Q  312 caaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat--cacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagc 409  Q
    ||||| |||  || |||||| | |  ||||||  |||   ||||||||||| || || |||||  |||||||||||||||| ||| | ||||||  ||||    
T  16378 caaattcaattcatcaacatattatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacatcataatcaacaacaacatatcttattcagc 16476  T
Q  410 ttcacagattataattaacttcat 433  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||    
T  16477 ttcacagattatagttaacctcat 16500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 138; Significance: 6e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 121 - 374
Target Start/End: Original strand, 12 - 262
Alignment:
Q  121 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 220  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  12 gcatcaagcccccaacaaagaa-tgccaatacatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaac-tcttgtataatccaataattgggaacttcat 109  T
Q  221 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 320  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  110 catcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-tagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 208  T
Q  321 gacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
      ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  209 atcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattat 262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 138; Significance: 6e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Original strand, 27681 - 27913
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    |||||||||||| |||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  27681 catcaagcccccatcgctata--agtattaatatacttccagggcatcaagcccc-atcgctatttgagctaaagctccatcgtgtttagtacaaggctc 27777  T
Q  117 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaa-- 214  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  27778 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttagaacaacaacctcttatataatccaataatttggaaac 27877  T
Q  215 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgca 250  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27878 catcatcatcttcataaacttagaccgactcatgca 27913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 296 - 434
Target Start/End: Original strand, 27912 - 28052
Alignment:
Q  296 catgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatca 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  27912 catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatca 28011  T
Q  394 aaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcatc 434  Q
    | | |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  28012 acaaatcttaaacaacttcacaggttataattaacatcatc 28052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 138; Significance: 6e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 122 - 374
Target Start/End: Original strand, 81978 - 82228
Alignment:
Q  122 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaac-ttcat 220  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  81978 catcaagcccccaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaac-tcttgtataatccaataatttggaaccttcat 82075  T
Q  221 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 320  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  82076 catcttaatcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaacagcaacac-agtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 82174  T
Q  321 gacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
      ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  82175 atcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattat 82228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 120 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 22880 - 22665
Alignment:
Q  120 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttc 218  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || | || |||||| || |||| | | ||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||    
T  22880 ggcatcaagcccccaa-aatgaa-tgctaatgcatggacacaacatcttaa-caacttagaacaacaacctcttatacaagtccaataatttggaacatc 22784  T
Q  219 atcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatg 317  Q
    |||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  22783 atcaccttca---acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcgacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatg 22688  T
Q  318 caagacaacaacatctcaaatat 340  Q
    |||| || |||||||||||||||    
T  22687 caagtcatcaacatctcaaatat 22665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 136; Significance: 9e-71; HSPs: 3)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 114 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 161355 - 161133
Alignment:
Q  114 ctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgga 213  Q
    ||||| ||||||||||||| | |  ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  161355 ctccagggcatcaagcccctatcgctgaaatgttaatgcatggactcgacttcttaaacattttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgaa 161256  T
Q  214 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 313  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  161255 acttcatcatcttaaccaacttagaccgactcatgcagcttagttaaatatcaacagcgacac-agcagtatacaaaaacataatgacataataatatca 161157  T
Q  314 aatgcaagacaa-caacatctcaa 336  Q
    |||||||| ||| |||||||||||    
T  161156 aatgcaagtcaatcaacatctcaa 161133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 161433 - 161367
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||| || | ||||||||||||    
T  161433 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatactt-taggccatcaagcctctatcgctatttga 161367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 297 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 164674 - 164550
Alignment:
Q  297 atgacataataatatcaaatgcaagacaa-caacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatca 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||   || | |||| |||||| |||| |||  |||||||  |||| ||||||||    
T  164674 atgacataataatatcaaatgcaagtcaatcaacatctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatca 164576  T
Q  394 aaacatcttaaa-cagcttcacagat 418  Q
    || |||| |||| |||||||||||||    
T  164575 aatcatcataaatcagcttcacagat 164550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 135; Significance: 4e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 53 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 1333 - 952
Alignment:
Q  53 ttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaat 150  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1333 ttccagggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaat 1235  T
Q  151 gcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgc 249  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| | || |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  1234 gcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttaaaatagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgc 1135  T
Q  250 agcttagttaaataa-caacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcat 348  Q
    ||||||||||| |||  |||| ||||| | |||||||||   |||| ||||||||||| ||||||| | |||  || |||||||| |  ||||||   ||    
T  1134 agcttagttaattaataaacatcaacataggcagtatac---aacatcatgacataattatatcaatttcaattcatcaacatcttatgtatacaaatat 1038  T
Q  349 gactcaagtaatgcgtataaaattat--cacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcat 433  Q
       ||||||||||| || || |||||  |||||||||||||||| ||| | || ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  1037 tcttcaagtaatgcata-aacattataacacatcataatcaacaacaacatattttatacagcttcacagattatagttaacctcat 952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 131; Significance: 9e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 15 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 2722 - 2494
Alignment:
Q  15 gacatcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaa 112  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||    
T  2722 gacatcaagcccccatcactatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgttaattttgagctaatgctccaacgttgtgagtacaaa 2623  T
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttg 211  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  2622 gctctagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttg 2524  T
Q  212 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccg 241  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  2523 gaacatcatcatcttcaacaacttagaccg 2494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 131; Significance: 9e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 32 - 333
Target Start/End: Original strand, 51397 - 51699
Alignment:
Q  32 gctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta---tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaag 128  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||| | || |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| |||    
T  51397 gctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatttttgagcaaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcattaag 51496  T
Q  129 cccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttc 227  Q
    |||||||| | ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||    
T  51497 cccccaactaagaa-tgctcatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcattttc 51595  T
Q  228 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaac 326  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||   |||| ||||||||||| ||| ||||| |||  || |    
T  51596 aacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatac---aacatcatgacataattataacaaattcaattcatc 51692  T
Q  327 aacatct 333  Q
    |||||||    
T  51693 aacatct 51699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 123; Significance: 5e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 121 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 38916 - 38663
Alignment:
Q  121 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 220  Q
    |||||||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38916 gcatcaagcccctatcgctgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgaaaacctcttatataatccaataatttggaacctcat 38817  T
Q  221 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 319  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  38816 catcttaatcaacttagacctactcatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaaatgca 38718  T
Q  320 agacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    || || ||| |||||||||||  ||  || | ||||||| |||||||| ||||||    
T  38717 agtcatcaatatctcaaatatttatatataattcaagtattgcgtatacaattat 38663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 39002 - 38936
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||  ||||||||||||    
T  39002 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccgtatcgctatttga 38936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 4)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 142 - 336
Target Start/End: Original strand, 10692 - 10891
Alignment:
Q  142 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt------catcatcttcatcaactt 235  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |      || |||||| ||||||||    
T  10692 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacaaccttttaaatagtccaataatttggaacattgttatcaacatcttaatcaactt 10791  T
Q  236 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  10792 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agcagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctca 10890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 83
Target Start/End: Original strand, 10455 - 10520
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttg 83  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  10455 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaaacccctatcgctatttg 10520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Original strand, 10585 - 10652
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||    
T  10585 catcaagcccctatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgctatttga 10652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 10629 - 10690
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 78  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  10629 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgct 10690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 5)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 142 - 336
Target Start/End: Original strand, 29856 - 30050
Alignment:
Q  142 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttca-tcaacttagacc 240  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  29856 aatgctaatgcatggaatcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacttcatcatcttaattgaacttagacc 29955  T
Q  241 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaa 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||    
T  29956 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaagtgtaagtcaacaacgtctcaa 30050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 179
Target Start/End: Original strand, 3546 - 3703
Alignment:
Q  22 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 120  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| || ||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  3546 agcccccatcgttatttgagtataaatatacttccagggcat-aagcccccatcgttattttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagg 3644  T
Q  121 gcatcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 179  Q
    ||||  |||||| |||| |||  || |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  3645 gcat-gagcccctaacatatg-tatactaatgcatggactcgatctcttaaaacatcttaa 3703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 179
Target Start/End: Original strand, 7977 - 8134
Alignment:
Q  22 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 120  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| || ||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  7977 agcccccatcgttatttgagtataaatatacttccagggcat-aagcccccatcgttattttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagg 8075  T
Q  121 gcatcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 179  Q
    ||||  |||||| |||| |||  || |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  8076 gcat-gagcccctaacatatg-tatactaatgcatggactcgatctcttaaaacatcttaa 8134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Original strand, 29749 - 29816
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| |  |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  29749 catcaagcccctatcggtatttgagtattattacacttccagagcatcaagccccaatcgctatttga 29816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 29793 - 29854
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 78  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  29793 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgct 29854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 120 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 1537 - 1340
Alignment:
Q  120 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 219  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||      
T  1537 ggcatcaagccctcaactttaaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaattgacaaactcttgtataatccaataatttggaactt-- 1440  T
Q  220 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 319  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1439 -catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaacaataacacatg-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 1342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 22 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 9275 - 9123
Alignment:
Q  22 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 120  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  9275 agcccccatcgttaattgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaatgctccatcgtgttgagtacaaagctccagg 9177  T
Q  121 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatc 175  Q
    ||||  ||||||||||||    ||||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  9176 gcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatttcttaaacatc 9123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 192 - 374
Target Start/End: Original strand, 4669 - 4850
Alignment:
Q  192 ttatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaa 291  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4669 ttatataatccaataatttggaacctcatcatcctaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agcagtatacaaaa 4767  T
Q  292 acaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  4768 acaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattat 4850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 3)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 142 - 336
Target Start/End: Original strand, 9161 - 9360
Alignment:
Q  142 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat------catcttcatcaactt 235  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||||||| || |      |||||| ||||||||    
T  9161 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacaaccttttaaatagtccaataatttggaacatcgttatcaacatcttaatcaactt 9260  T
Q  236 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  9261 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatataaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctca 9359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 83
Target Start/End: Original strand, 8924 - 8989
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttg 83  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  8924 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaaacccctatcgctatttg 8989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Original strand, 9054 - 9121
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | |||| || |||| ||||||||||||    
T  9054 catcaagcccctatcgctatttgagtattattatacttccggagcattaagccccaatcgctatttga 9121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 40 - 428
Target Start/End: Original strand, 4343 - 4739
Alignment:
Q  40 agtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagta--caaag-ctccaaggcatcaagcccccaac 136  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||| ||| || ||||||||||||||| ||||| |  ||||| ||||  |||||||| ||||||||    
T  4343 agtattaatatacttccagggcat-aagccctcatcgcaatt-gagctaaagctccatcgtgttgagcaaacaaaggctccggggcatcaatcccccaac 4440  T
Q  137 aatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaac--- 233  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||       
T  4441 aatgaaatgctaatgcatggactcaacctcttaaacatcttaaa-caacaacctcgtatataatccaataatttggaacatcatcatcttaatcaacctc 4539  T
Q  234 ----ttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaac 329  Q
         |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || | ||||||| ||| | || || || || ||||||||||||  ||  |||||||    
T  4540 ttatatagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacagcataggcagtatgcaacagcagcaagatatcataatatcaaatataattcaacaac 4639  T
Q  330 atctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatctt-aaacagcttcacagattataatta 426  Q
    |||| |||||| |||| ||   ||||||||||| ||  | ||  ||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  4640 atcttaaatattcatttatacttcaagtaatgcataatacattatatcacatcatgatcaacatc--aacatcttaaaacagcctcacaaattataatta 4737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 142 - 374
Target Start/End: Original strand, 11207 - 11444
Alignment:
Q  142 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatc------ttcatcaactt 235  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||| |||||||||||||||| | ||||||      || ||||| ||    
T  11207 aatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacattatcatcaacatcttaatcaaatt 11306  T
Q  236 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctca 335  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  11307 agaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctca 11405  T
Q  336 aatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaattat 374  Q
    | ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  11406 attattcacatatgattcaagtaatgcatatataattat 11444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 179
Target Start/End: Original strand, 12578 - 12723
Alignment:
Q  34 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccc 132  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| || | || |||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  12578 tatttgagtattagtatacttccagagcgt-aagcccccatcactaatttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccc 12675  T
Q  133 caacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 179  Q
    ||||||    ||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||    
T  12676 caacaaatgtatgctaatgcatggactcaatctcttaaaacatcttaa 12723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 11144 - 11205
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 78  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  11144 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgct 11205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 106; Significance: 7e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 142 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 12492 - 12293
Alignment:
Q  142 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatc------ttcatcaactt 235  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||| ||||||||||||| || ||||||||      || ||||||||    
T  12492 aatgctaatgcatgtactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggtacatcatcatcaacatcttaatcaactt 12393  T
Q  236 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctca 335  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  12392 agaccgacttatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agcagaatacaaaaacagcatgacaaaataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctca 12294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 12599 - 12532
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| || | ||||||||||||    
T  12599 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagcctcaatcgctatttga 12532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 106; Significance: 7e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 121 - 317
Target Start/End: Original strand, 15570 - 15764
Alignment:
Q  121 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 220  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  15570 gcatcaagcccccaacaaagaa-tgctaatccatggactcgaattcttaaacatcttaaatcgacaac-tcttgtataatccaataatttggaacttcat 15667  T
Q  221 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatg 317  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  15668 catcttaatcaacttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatac-aaaccatcatgatataataatatcgaatg 15764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 171
Target Start/End: Original strand, 1144 - 1292
Alignment:
Q  22 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 120  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| |  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||      
T  1144 agcccccatcgttatttgagtattaatatacttctagggcat-atgcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccaga 1242  T
Q  121 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa 171  Q
     |||  ||||||||||||    ||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  1243 acat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatatcttaaa 1292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 101; Significance: 7e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 274 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 3591 - 3428
Alignment:
Q  274 cacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat-- 371  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||| ||      
T  3591 cacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacactcataattcaagtaatgcgtataacatta 3492  T
Q  372 tatcacatcataatcaacatcaaaacatctt-aaacagcttcacagattataattaacttcatc 434  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  3491 tatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagcttcatagattataattaacatcatc 3428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 232 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 24406 - 24206
Alignment:
Q  232 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaa-acaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaaca 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||  || |||||    
T  24406 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataaaaatatcaattgcaattcatcaaca 24307  T
Q  331 tctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataa-tcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaa 427  Q
    ||| |||||| ||   ||   |||||||||||  |||| ||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24306 tcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataattcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaa 24207  T
Q  428 c 428  Q
    |    
T  24206 c 24206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 34 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 35218 - 35074
Alignment:
Q  34 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagccccc 133  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  35218 tatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgttatttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggcat-aagccccc 35121  T
Q  134 aaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 179  Q
    |||| |||  ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  35120 aacatatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatcttaa 35074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 24440 - 24403
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttactt 54  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  24440 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatactt 24403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 121 - 400
Target Start/End: Original strand, 11370 - 11652
Alignment:
Q  121 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattat-ataatccaataatttggaacttca 219  Q
    |||||||||||| | |  ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  11370 gcatcaagcccctatcgctgaaatgataatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacatca 11469  T
Q  220 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgc 318  Q
     |||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||| | |||||| ||||| |||||||||||  | |     
T  11470 acatcttcaacgacttagattgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgc-aaaacatcatgatataataatatcgcacgt 11568  T
Q  319 aagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatc 400  Q
    |||  ||||||||||||||||  ||   || | ||||||||||| |||| |||  |||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  11569 aagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatc 11652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Original strand, 11240 - 11307
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| | || ||||||||||||    
T  11240 catcaagcccccatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagctccaatcgctatttga 11307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 121 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 38471 - 38189
Alignment:
Q  121 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattat-ataatccaataatttggaacttca 219  Q
    |||||||||||| | |  ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  38471 gcatcaagcccctatcgctgaaatgataatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacatca 38372  T
Q  220 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgc 318  Q
     |||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||| | |||||| ||||| |||||||||||  | |     
T  38371 acatcttcaacgacttagattgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgc-aaaacatcatgatataataatatcgcacgt 38273  T
Q  319 aagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatc 400  Q
    |||  ||||||||||||||||  ||   || | ||||||||||| |||| |||  |||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  38272 aagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatc 38189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 38601 - 38534
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| | || ||||||||||||    
T  38601 catcaagcccccatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagctccaatcgctatttga 38534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 91; Significance: 6e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 22 - 267
Target Start/End: Original strand, 36260 - 36503
Alignment:
Q  22 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaagg 121  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||    
T  36260 agcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatgag-cccccatcgctatttgagctaaagctccatcatgttgagtacaaagctccaggg 36358  T
Q  122 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt---c 218  Q
    |||  ||||||||||||    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||   |||| |  | || |||| | |||||||||||||||  ||   |    
T  36359 cat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcaacctcttaaacatc-acaatc-atcatctcttat-ttatccaataatttggaggttcaac 36454  T
Q  219 atcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 267  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36455 atcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 36503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 5)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 37 - 239
Target Start/End: Original strand, 3337 - 3539
Alignment:
Q  37 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaa 135  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||| | ||||||||    
T  3337 ttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagcttcagggcatga-gcccccaa 3434  T
Q  136 caatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttcatcaact 234  Q
    |||    ||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  3435 caaatgtatgctaatgcatggacttgacttcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacaact 3534  T
Q  235 tagac 239  Q
    |||||    
T  3535 tagac 3539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 37 - 239
Target Start/End: Original strand, 7401 - 7603
Alignment:
Q  37 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaa 135  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||| | ||||||||    
T  7401 ttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagcttcagggcatga-gcccccaa 7498  T
Q  136 caatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttcatcaact 234  Q
    |||    ||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  7499 caaatgtatgctaatgcatggactagacttcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacaact 7598  T
Q  235 tagac 239  Q
    |||||    
T  7599 tagac 7603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 110 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 27969 - 27663
Alignment:
Q  110 aaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataa-tccaataa 207  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||  ||||| ||||||| || | || |||| |||||||| ||||||||    
T  27969 aaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgcgaatgcatggactcaacaacttaa-catcttagaaacaacgacctcttatataaatccaataa 27872  T
Q  208 tttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataat 306  Q
    ||||||||   ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||| | | ||||| | |||||| ||||| ||||     
T  27871 tttggaac---atcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgc-aaaacagcatgatataac 27778  T
Q  307 aatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatctta- 403  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||| || ||   || | || |||||||| |||| |||  |||||||| |||| |||||||||| |||||||     
T  27777 aatatcaaatgtaaatcaacaacatctcaaacattcacatataattctagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaatcatcttat 27678  T
Q  404 aacagcttcacagat 418  Q
    |||||||||||||||    
T  27677 aacagcttcacagat 27663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 372 - 426
Target Start/End: Original strand, 3641 - 3695
Alignment:
Q  372 tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataatta 426  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3641 tatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattataatta 3695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #5
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 372 - 426
Target Start/End: Original strand, 7705 - 7759
Alignment:
Q  372 tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataatta 426  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7705 tatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattataatta 7759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 4)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 142 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 1263 - 1087
Alignment:
Q  142 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagacc 240  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  1263 aatgctaatgcatggacttgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttatattaatccaataatttggaacatcatcatcttcaacatcttagacc 1164  T
Q  241 gactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  1163 gactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcgaatg 1087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 1414 - 1347
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  1414 catcaaacccctatcgctatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaatcgctatttga 1347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 1370 - 1303
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 84  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | |||| || | ||||||| |||| ||||||||||||    
T  1370 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatactcccggagcatcaagccccaatcgctatttga 1303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 1326 - 1265
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 78  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  1326 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgct 1265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 6)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 134
Target Start/End: Original strand, 116718 - 116835
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  116718 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctc 116817  T
Q  117 caaggcatcaagccccca 134  Q
    || |||||||||||||||    
T  116818 cagggcatcaagccccca 116835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 113 - 337
Target Start/End: Original strand, 32437 - 32658
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataa-tccaataattt 210  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||  || || | ||||| || | || |||| |||||||| | |||||||||    
T  32437 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcaacaactcaacc-tcttagaaacaacgacctcttatataaattcaataattt 32534  T
Q  211 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataat 309  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | ||||||| | |||||||||||| |||| |||    
T  32535 ggaacatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaacaacatgatataacaat 32631  T
Q  310 atcaaatgcaagacaacaacatctcaaa 337  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||    
T  32632 atcaaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 32658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 132
Target Start/End: Original strand, 116823 - 116938
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||     
T  116823 catcaagcccccattgctatttgagtactaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctt 116922  T
Q  117 caaggcatcaagcccc 132  Q
    || |||||||||||||    
T  116923 cagggcatcaagcccc 116938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 134
Target Start/End: Original strand, 116935 - 117044
Alignment:
Q  25 ccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcat 124  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  116935 ccccatcgctatttaagtattaatatacttccagggcaacaagcccctatcgctaattgagctaaaactccaacgtgttgagtacaaagctccagggcat 117034  T
Q  125 caagccccca 134  Q
    ||||||||||    
T  117035 caagccccca 117044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #5
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 54 - 137
Target Start/End: Original strand, 117025 - 117108
Alignment:
Q  54 tccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaaca 137  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  117025 tccagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctctagggcatcaagcccccaaca 117108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #6
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 233 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 51985 - 51833
Alignment:
Q  233 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaa-ca 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| ||| | |||| || |||||| | || |||||||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  51985 cttagaccgactcatgcagcttagttaaacatcaaacagc-acataggcagcattcaaaaatagcaagacataataatatc-aatgcaagccaacaatca 51888  T
Q  331 tctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat-tatcacatcataa 384  Q
    |||||| ||| |||| |    |||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  51887 tctcaattattcatttaaacttcaagtaatgcgtatacattatatcacatcataa 51833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 220 - 336
Target Start/End: Original strand, 4300 - 4415
Alignment:
Q  220 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 319  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4300 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgca 4398  T
Q  320 agacaacaacatctcaa 336  Q
    |  ||||||| ||||||    
T  4399 aatcaacaacgtctcaa 4415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 113 - 340
Target Start/End: Original strand, 19166 - 19390
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataa-tccaataattt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||   ||  ||||| | ||||| || | ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  19166 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacataacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttatataagtccaataattt 19263  T
Q  211 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataat 309  Q
    ||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||    
T  19264 ggaacatcatcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaat 19359  T
Q  310 atcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 340  Q
    ||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  19360 atcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 19390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 48746 - 48661
Alignment:
Q  34 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaa 119  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||  || ||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  48746 tatttgagtattaatatacttccagggcat-gagcccccatctttattttgagctaaagctccattgtggtgagtacaaagctccaa 48661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 22 - 272
Target Start/End: Original strand, 69599 - 69848
Alignment:
Q  22 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  69599 agcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagg 69697  T
Q  121 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt--- 217  Q
    ||||  ||||||||||||    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||| |  | || |||| | |||||||||||||||  ||       
T  69698 gcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatctcttaaacatcat-aatc-atcatctcttat-ttatccaataatttggaggttcaa 69793  T
Q  218 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 272  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  69794 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagca 69848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 110 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 10762 - 10536
Alignment:
Q  110 aaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| || | || |||||| || |||| | | ||||||| |||||||| |||||||||    
T  10762 aaagctccaaggcatcaagcccccaacgatgaa-tgcaaatgcatggacacaacatcttaa-caacttagaacaacaacctcttatataagtccaataat 10665  T
Q  209 ttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataata 307  Q
    ||||||| ||| ||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |    
T  10664 ttggaacatcaccatcttca---acttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataaca 10569  T
Q  308 atatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 340  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  10568 atatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 10536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 110 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 16320 - 16014
Alignment:
Q  110 aaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataa-tccaataa 207  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||  || || ||||||| || | || |||| |||||||| ||||||||    
T  16320 aaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgcgaatgcatggactcaacaactcaa-catcttagaaacaacgacctcttatataaatccaataa 16223  T
Q  208 tttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataat 306  Q
    ||||||||   ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||| | | ||||| | |||||||||||| ||||     
T  16222 tttggaac---atcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgc-aaaacaacatgatataac 16129  T
Q  307 aatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatctta- 403  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||| || | |  || | ||||||||||| |||| |||  |||||||| |||| |||||||||| |||||||     
T  16128 aatatcaaatgtaaatcaacaacatctcaaacattcttatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaatcatcttat 16029  T
Q  404 aacagcttcacagat 418  Q
    |||||||||||||||    
T  16028 aacagcttcacagat 16014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 233 - 418
Target Start/End: Original strand, 13147 - 13336
Alignment:
Q  233 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacat 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||| | ||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  13147 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacat 13245  T
Q  332 ctcaaa-tatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatctta-aacagcttcacagat 418  Q
    || |||  || |||  || | ||||||||||| |||| |||  |||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  13246 ctgaaaccattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaatcatcttataacagcttcacagat 13336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 260
Target Start/End: Original strand, 2650 - 2707
Alignment:
Q  198 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaa 260  Q
    ||||||||||||||||||   | ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2650 aatccaataatttggaac---aacatctt--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaa 2707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 113 - 340
Target Start/End: Original strand, 6436 - 6661
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataatccaataatttg 211  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || | ||  ||||| | ||||| ||   ||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  6436 gctccagggcatcaagcccgcaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaaaaacaacctcttata-agtccaataatttg 6532  T
Q  212 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataata 310  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||||    
T  6533 gaacatcatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaata 6631  T
Q  311 tcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 340  Q
    || |||||||  ||||||||||||||||||    
T  6632 tcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 6661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 361
Target Start/End: Original strand, 8370 - 8613
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataat-ccaataattt 210  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||  || || | ||||| || | ||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  8370 gctccagggcatcaagccaccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcaactactcaacc-tcttagaaacaacaacctcttatataaaaccaataattt 8467  T
Q  211 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataat 309  Q
    ||||    ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | |||||| ||||| |||| |||    
T  8468 ggaat---atcttctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaacagcatgatataacaat 8561  T
Q  310 atcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatg 361  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||| |||  || | ||||||||||    
T  8562 atcaaatgcaagtcatcaacatctcaaatattcatatataattcaagtaatg 8613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 165
Target Start/End: Original strand, 10101 - 10247
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||  ||||||||||||||| ||||| | || ||||    
T  10101 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcacta-ttgtgctaaagctccatcgtgttgagca-aaggctc 10198  T
Q  117 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacct 165  Q
    || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10199 cagggcatcaaggcccaaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacct 10247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 372 - 433
Target Start/End: Original strand, 10323 - 10384
Alignment:
Q  372 tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcat 433  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  10323 tatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattattattaacatcat 10384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 79; Significance: 9e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 22 - 267
Target Start/End: Original strand, 19786 - 20029
Alignment:
Q  22 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaagg 121  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  19786 agcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatgag-cccccatcgctaattgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaaactccaggg 19884  T
Q  122 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt---c 218  Q
    |||  ||||||||||||    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||| |  | || |||| | |||||||||||||||  ||   |    
T  19885 cat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatctcttaaacatcat-aatc-attatctcttat-ttatccaataatttggaggttcaac 19980  T
Q  219 atcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 267  Q
    |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  19981 atcatcttgatcatcttataccgactcatgcagcttgattaaataacaa 20029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 113 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 14916 - 14692
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaat-cgacaacctattatata-atccaataattt 210  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||  ||||| | ||||| || | ||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  14916 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttatattcaacaacctcttaaatatatccaataattt 14819  T
Q  211 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataat 309  Q
    ||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||| | |||| || ||||| ||| ||||    
T  14818 ggaacatcatcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaactaacaaacagcaacataggcagta-agaaaatcatcatgatatagtaat 14723  T
Q  310 atcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 340  Q
    ||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  14722 atcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 14692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 30 - 272
Target Start/End: Original strand, 23658 - 23897
Alignment:
Q  30 tcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagc 129  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  |||    
T  23658 tcgctatttgagtattaatatacctccagggcat-aagcccccatcactatt-gagctaaagctctatcgtgttgagtacaaagctccatggcat-gagc 23754  T
Q  130 ccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt---catcatctt 226  Q
    |||||||||    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||   |||| |  | || |||| | |||||||||||||||  ||   |||||||||    
T  23755 ccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatctcttaaacatc-acaatc-atcatctcttat-ttatccaataatttggaggttcaacatcatctt 23851  T
Q  227 catcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 272  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  23852 gatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagca 23897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 113 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 3022 - 2801
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |  | |||||| || |||||| | ||| | | ||||| | |||||||||||||    
T  3022 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacatcatcttaa-caacttaaaacaacatcatcttata-agtccaataatttgg 2926  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 311  Q
    ||| |||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||    
T  2925 aacatcatcatcatcatc---ttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagctacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatat 2830  T
Q  312 caaatgcaagacaacaacatctcaaatat 340  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  2829 caaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 2801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 113 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 3324 - 3283
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 155  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3324 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatg 3283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 113 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 1256 - 1102
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatata-atccaataattt 210  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||  ||||| | ||||| || | ||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  1256 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataattt 1159  T
Q  211 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 267  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1158 ggaacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 1102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 113 - 267
Target Start/End: Original strand, 6510 - 6664
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatata-atccaataattt 210  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||  ||||| | ||||| || | ||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  6510 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataagcaacaacctcttaaatatatccaataattt 6607  T
Q  211 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 267  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6608 ggaacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 6664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 113 - 267
Target Start/End: Original strand, 13890 - 14044
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatata-atccaataattt 210  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||  ||||| | ||||| || | ||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  13890 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataagcaacaacctcttaaatatatccaataattt 13987  T
Q  211 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 267  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13988 ggaacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 14044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 40 - 136
Target Start/End: Original strand, 7386 - 7482
Alignment:
Q  40 agtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaac 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7386 agtattaatttacttccagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaac 7482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 113 - 340
Target Start/End: Original strand, 5547 - 5769
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataatccaataatttg 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || | ||  ||||| | || || || | ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5547 gctccagggcatcaagcccccaacaatgga-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcatataaacaacaacctcttata-aatccaataatttg 5643  T
Q  212 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataata 310  Q
    |||| | || |||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||  |||| || ||||| |||| ||||    
T  5644 gaacatgattatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagtaaaataacaaacagcaacataggcagtat-gaaaatcatcatgatataacaata 5739  T
Q  311 tcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 340  Q
    || |||||||  ||||||||||||||||||    
T  5740 tcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 5769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 37 - 137
Target Start/End: Original strand, 7486 - 7585
Alignment:
Q  37 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaac 136  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| || |||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7486 ttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccc-atcgataattgagctaaaactccaacgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaac 7584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 113 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 46010 - 45791
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttg 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | || |||||| || |||| | | ||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  46010 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacatcttaa-caacttagaacaacaacctcttaaataagtccaataatttg 45913  T
Q  212 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataata 310  Q
    |||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||||    
T  45912 gaacatcatcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagaaaaataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaata 45817  T
Q  311 tcaaatgcaagacaacaacatctcaa 336  Q
    || |||| ||| || |||||||||||    
T  45816 tcgaatgtaagtcatcaacatctcaa 45791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 113 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 24101 - 23898
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttg 211  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || | || |||||| || |||| | | ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  24101 gctccagggcatcaatcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacatcttaa-caacttagaacaacaacctcttatataagtccaataatttg 24004  T
Q  212 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataata 310  Q
    |||| ||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||||    
T  24003 gaacatcatcatcttca---acttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaata 23908  T
Q  311 tcaaatgcaa 320  Q
    || |||||||    
T  23907 tcgaatgcaa 23898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 113 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 2861 - 2640
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||  ||||| | ||||||| | ||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  2861 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttaaaacaacaacctcttata-agtccaataatttgg 2765  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 311  Q
    ||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||   ||| || ||||  |||| |||||    
T  2764 aacatcatcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacatcaacataggcagtat-gtaaatcatcatgttataacaatat 2669  T
Q  312 caaatgcaagacaacaacatctcaaatat 340  Q
      |||||||  ||||||||||||||||||    
T  2668 tgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 2640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 69; Significance: 9e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 113 - 340
Target Start/End: Original strand, 31 - 255
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatata-atccaataattt 210  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||  ||||| | ||||| |||| ||||||| |||  || ||||||||||||    
T  31 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataatcaacaacctcttaagtatatccaataattt 128  T
Q  211 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataat 309  Q
    ||||| ||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||    
T  129 ggaacatcatcatc---atcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaat 224  T
Q  310 atcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 340  Q
    ||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  225 atcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 69; Significance: 9e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 8129 - 7880
Alignment:
Q  22 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 120  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| || |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  8129 agcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcactaatttgagctaatgctccatcgtgttgagtacaaagctccagg 8031  T
Q  121 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt--- 217  Q
    ||||  ||||||||||||    ||| ||||||||| |||||| |||||||||||| | |||| |  | || |||| | |||||||||||||||| ||       
T  8030 gcat-gagcccccaacaaatgtatgttaatgcatggactcgatctcttaaacatcat-aatc-atcatctcttat-ttatccaataatttggaagttcaa 7935  T
Q  218 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 272  Q
    ||||||||| |||| || | | ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  7934 catcatcttgatcatctcatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagca 7880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 113 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 15999 - 15845
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatata-atccaataattt 210  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||  || | ||  ||||| | ||||| || | ||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  15999 gctccagggcatcaaacccccaacaatgaa-tgctaatgcatagacacaacaacttaa-cttcttataagcaacaacctcttaaatatatccaataattt 15902  T
Q  211 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 267  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15901 ggaacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 15845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 272
Target Start/End: Original strand, 178705 - 178952
Alignment:
Q  22 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaagg 121  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||||| |||  ||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||    
T  178705 agcccccatcgctaattgagtgttaatataccgccagggcat-aagcccccatcgctatt-gagctaaagctccatcatgttaagtacaaagctccaggg 178802  T
Q  122 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt---c 218  Q
     || | |||||||||||    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||   |||| |  | || |||| | |||||||||||||||  ||   |    
T  178803 tatga-gcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatctcttaaacatc-acaatc-atcatctcttat-ttatccaataatttggaggttcaac 178898  T
Q  219 atcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 272  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  178899 atcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagca 178952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 199 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 6259 - 6137
Alignment:
Q  199 atccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaaca 297  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||| | ||| || ||    
T  6259 atccaataatttggaacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagtaacataggcagtatgc-aaatcatca 6161  T
Q  298 tgacataataatatcaaatgcaag 321  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||    
T  6160 tgatataacaatatcgaatgcaag 6137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 110 - 337
Target Start/End: Original strand, 10426 - 10650
Alignment:
Q  110 aaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatata-atccaataa 207  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || | ||  ||||| | ||||| || | ||||||| ||||||| |||||||||    
T  10426 aaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatccatggacacaacaacttaacc-tcttataaacaacaacctcttatatatatccaataa 10523  T
Q  208 tttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataat 306  Q
    |||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| ||||     
T  10524 tttggaacat-atcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttttttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataac 10619  T
Q  307 aatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaa 337  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  10620 aatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaa 10650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 113 - 340
Target Start/End: Original strand, 129808 - 130031
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttg 211  Q
    |||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||| || | || |||||| || |||  | | ||||||| ||| |||| |||| |||||||    
T  129808 gctccagggcatcaagcctgcaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacatcttaa-caacttggaacaacaacctcttaaataagtccattaatttg 129905  T
Q  212 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataata 310  Q
    |||| || |||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||||    
T  129906 gaacatcttcatc---atcaacttagaccgactcatgcatcttagttaaataacacacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaata 130001  T
Q  311 tcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 340  Q
    || |||||||| || |||||||||||||||    
T  130002 tcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 130031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 198 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 60848 - 60620
Alignment:
Q  198 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaa-acaa 295  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| | ||||||||||||| |       
T  60848 aatccaataatttggaac---atcatctt--tcatcttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatacaaaacagct 60754  T
Q  296 catgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtata-aaat-tatcacatcataatcaacatca 393  Q
    ||||| |||  |||||||| |||||  ||||||||||||||| || |||  || | ||||||||||| |||| |||| |||||||| || | ||||||||    
T  60753 catgatataccaatatcaa-tgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacataattaacaacatca 60655  T
Q  394 aaacatctta-aacagcttcacagattataattaa 427  Q
    || ||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  60654 aatcattttataacagcttcacagattatcattaa 60620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 34 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 193277 - 192997
Alignment:
Q  34 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccc 132  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||| || ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  193277 tatttgagtattaatatacttccagggcatgag-cccccatcgttaatttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccc 193180  T
Q  133 caaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa-catcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaacttcatcatcttca- 228  Q
    ||||| |||  ||||||||||||| |||| | || ||||| |||||| |||| |  | || ||||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |     
T  193179 caacatatg-tatgctaatgcatggactctaactgttaaagcatctt-aatc-atcatctcttatattagtccaataatttggaacatcaacatcttaat 193083  T
Q  229 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtat-acaaaaacaacatgacataataatatca 313  Q
    ||||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| || | |||| || |||| |||| |||||||||| |||||||    
T  193082 tcaacatggactgactcatgcaacttagttaattaacaacagcagcataggcagaatcacaacaacatcatgacataacaatatca 192997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 121 - 340
Target Start/End: Original strand, 945 - 1158
Alignment:
Q  121 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttca 219  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||  || || || | || ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||   |    
T  945 gcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaactcaa-caacatagatcaacaacctcttatataagtccaataatttggaac---a 1039  T
Q  220 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgc 318  Q
    || ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | |||||| ||||| |||| |||||||||| |    
T  1040 tcttctt--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaacagcatgatataacaatatcaaatac 1136  T
Q  319 aagacaacaacatctcaaatat 340  Q
     |  || |||||||||||||||    
T  1137 gaatcatcaacatctcaaatat 1158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 113 - 317
Target Start/End: Original strand, 32003 - 32202
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |  | |||||| || |||||| | ||| | | ||||| | |||||||||||||    
T  32003 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacatcatcttaa-caacttaaaacaacatcatcttata-agtccaataatttgg 32099  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 311  Q
    ||| |||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||| ||||| ||||| || ||||| |||| |||||    
T  32100 aacatcatcatcatcatc---ttagaccgactcatgcagcttagataaataacaaacaacaacataagtagtatgcaaaatcatcatgatataacaatat 32196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 113 - 332
Target Start/End: Original strand, 12665 - 12884
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaa-atcgacaacctattatataa-tccaataattt 210  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || | ||  ||||| | |||||  | | ||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  12665 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgataatgcatggacacaacaacttaa-cttcttattaacaacaacctcttatataagtccaatcattt 12762  T
Q  211 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataat 309  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| | ||| ||| | ||| || ||||| |||| |||    
T  12763 ggaacatcatcataatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagctaaataacaaacaacaacataggcaatatgc-aaatcatcatgatataacaat 12861  T
Q  310 atcaaatgcaagacaacaacatc 332  Q
    ||| |||||||| || |||||||    
T  12862 atcgaatgcaagtcatcaacatc 12884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0671 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0671
Description:

Target: scaffold0671; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Original strand, 5898 - 6056
Alignment:
Q  21 aagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaa 119  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||     
T  5898 aagcccccaacgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagctcccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtgttgagtactaagctccag 5996  T
Q  120 ggcatcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 179  Q
    |||||  ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  5997 ggcat-gagcccccaacatatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatcttaa 6056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 113 - 339
Target Start/End: Original strand, 12472 - 12693
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataa-tccaataattt 210  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||| ||  ||||| ||||||| ||   || |||| |||||||| |||||||||||    
T  12472 gctccagggcatcaagcccccaacgat-aaatgcgaatgcatggactcaacaacttaa-catcttagaaaaaacgacctcttatataaatccaataattt 12569  T
Q  211 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataat 309  Q
    |||||   ||| ||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||    
T  12570 ggaac---atcttctt--tcatcttagaccgactcatgtagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaat 12663  T
Q  310 atcaaatgcaagacaacaacatctcaaata 339  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  12664 atcaaatgcaagtcatcaacatctcaaata 12693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 87 - 163
Target Start/End: Original strand, 20881 - 20957
Alignment:
Q  87 taaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgac 163  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20881 taaagctccaacgtgttgagtacaaagctccagggcatcaaggccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgac 20957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 16661 - 16513
Alignment:
Q  22 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 120  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| || ||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  16661 agcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgttattttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagg 16563  T
Q  121 gcatcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa 171  Q
    ||||  | ||||||||| |||  ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  16562 gcat-gatcccccaacatatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaa 16513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 198 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 53681 - 53487
Alignment:
Q  198 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaac 296  Q
    ||||||||||||||||||   ||| ||||  ||| ||||||| || |||||||||||||||||  ||||| |||||||| | ||||||| ||||| ||||    
T  53681 aatccaataatttggaac---atcttctt--tcatcttagactgattcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caac 53588  T
Q  297 atgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaa 394  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||  || | ||||||||||  |||| |||  |||||||| |||| |||||||||    
T  53587 atgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 53488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 113 - 290
Target Start/End: Original strand, 6721 - 6889
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttg 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||| |||| |||| | | ||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  6721 gctccatggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatggacacaacctctt-aacaacttagaacaacaacctcttaaataagtccaataatttg 6818  T
Q  212 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaa 290  Q
    |||| |||||||         ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||    
T  6819 gaacatcatcat---------cttagaccgactcatgcagctcagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 6889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 289 - 337
Target Start/End: Original strand, 8090 - 8138
Alignment:
Q  289 aaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaa 337  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8090 aaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaa 8138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 113 - 332
Target Start/End: Original strand, 12842 - 13057
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttg 211  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |  | ||  ||||| || |||| | | ||||||| |||||||| |||||||||||     
T  12842 gctccagggcatgaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggaaacaacaacttaa-caacttagaacaacaacctcttatataagtccaataatttt 12939  T
Q  212 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataata 310  Q
    |||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||||    
T  12940 gaacatcatcatcttca---acttagaccgactcatgctgctcagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcagcatgatataacaata 13035  T
Q  311 tcaaatgcaagacaacaacatc 332  Q
    || |||||||| || |||||||    
T  13036 tcgaatgcaagtcatcaacatc 13057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 37 - 175
Target Start/End: Original strand, 18056 - 18193
Alignment:
Q  37 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaa 135  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || | ||||||||    
T  18056 ttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtgttcagtactaagctccagggtatga-gcccccaa 18153  T
Q  136 caatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatc 175  Q
    |||    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  18154 caaatgtatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatc 18193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 113 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 28986 - 28813
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | || |||||| || |||| | | ||| | | || || | |||||||||||||    
T  28986 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacatcttaa-caacttagaacaacatcatctttta-agtccaataatttgg 28890  T
Q  213 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca--acagcaacacaagcagtatacaaa 290  Q
    ||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| | ||||||| ||||    
T  28889 aacatcatcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacattacagcaacataggcagtatgcaaa 28813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 198 - 296
Target Start/End: Original strand, 11952 - 12044
Alignment:
Q  198 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaac 296  Q
    |||||||||| ||||||| |||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  11952 aatccaataaattggaacatcatc--cttcatc---ttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtataccaaaacaac 12044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 37 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 15976 - 15742
Alignment:
Q  37 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaa 135  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| |||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||| |||    
T  15976 ttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaatttgagttaatgctccatcgtgttgagtacaaagctccagggcat-gagcccgcaa 15879  T
Q  136 caatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt---catcatcttcatcaa 232  Q
    |||    ||||||||||||| ||| || |||||||||||| | |||| |  | || |||| | |||||||||||||||  ||   ||||||||| ||||     
T  15878 caaatgtatgctaatgcatggacttgatctcttaaacatcat-aatc-atcatctcttat-ttatccaataatttggaggttcaacatcatcttgatcat 15782  T
Q  233 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 272  Q
    |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  15781 cttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagca 15742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 10830 - 10681
Alignment:
Q  22 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaagg 121  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||    |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||    
T  10830 agcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatta--atttgagctaatgctccatcgtgttgagtacaaagctctaggg 10734  T
Q  122 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatc 175  Q
    |||  ||||||||||||    || |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  10733 cat-gagcccccaacaaatgtatcctaatgcatggactcgatctcttaaacatc 10681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 22 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 18767 - 18610
Alignment:
Q  22 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 120  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||| | |    
T  18767 agcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgttaatttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctctagg 18669  T
Q  121 gcatcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 179  Q
    ||||  ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  18668 gcat-gagcccccaacatatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatcttaa 18610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 109 - 267
Target Start/End: Original strand, 984 - 1135
Alignment:
Q  109 caaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataa 207  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || | ||  || || | ||||| |   |||| || |||||||| ||||||||    
T  984 caaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaattcatggacacaacaactcaacc-tcttaga---acaatctcttatataaatccaataa 1078  T
Q  208 tttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 267  Q
    ||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1079 tttggaac---atcttcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 1135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 279 - 428
Target Start/End: Original strand, 6675 - 6826
Alignment:
Q  279 gcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatca 376  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||  ||||||||||| |||||| ||  ||| | ||||||||||| || ||  |  |||||    
T  6675 gcagtatacaaaatcaacatgacataatgatatcaatagcaattcaacaacatcttaaatattcaaacattattcaagtaatgcataaaacgttatatca 6774  T
Q  377 catcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaac 428  Q
    |||||||||||||| ||| | ||| || ||||||| ||||||||||| ||||    
T  6775 catcataatcaacaacaacatatcatatacagctttacagattataaataac 6826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 22 - 179
Target Start/End: Original strand, 10299 - 10456
Alignment:
Q  22 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 120  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||| | |    
T  10299 agcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgttaatttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctcaagg 10397  T
Q  121 gcatcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 179  Q
    ||||  ||| ||||||| |||  ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  10398 gcat-gagcacccaacatatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatcttaa 10456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 172 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 8233 - 8118
Alignment:
Q  172 catcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aaca 269  Q
    |||||||||||  |||||| ||| |||| ||||||||||||||||   ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  8233 catcttaaatcatcaacctcttaaataaatccaataatttggaac---atcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaacaaacaaaca 8139  T
Q  270 gcaacacaagcagtatacaaa 290  Q
    |||||| | ||||||||||||    
T  8138 gcaacataggcagtatacaaa 8118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 103848 - 103632
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaa-atcgacaacctattatataa-tccaataattt 210  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||   ||||||| |||| ||  ||||| |||||||  | | || |||| |||||||| |||||||||||    
T  103848 gctccatggcatcaagcccccaacaatgaa-tgagtatgcatggactcaacaacttaa-catcttagcaacaacgacctcttatataaatccaataattt 103751  T
Q  211 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaa-ataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaa--catgacataata 307  Q
    |||||   ||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |  |||||||||| | | |||||| ||||||||  ||||| |||| |    
T  103750 ggaac---atcctctt--tcaacttagaccgactaatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggtagtata-aaaaacaattcatgatataaca 103657  T
Q  308 atatcaaatgcaagacaacaacatc 332  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  103656 atatcaaatgcaaaacaacaacatc 103632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 8277 - 7997
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttg 211  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || | ||   | || || |||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  8277 gctccagggcatcaatcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaagtcaa-caacttagatcaacaacctcttatataaatccaataatttg 8180  T
Q  212 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaac-agcaacacaagcagtatacaaaa-acaacatgacataataat 309  Q
    |||| || || |  ||||||   ||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||| || | ||||||| ||||  |   ||||| ||||||||    
T  8179 gaacatcttctt--tcatca---tagaccgacgcatgcagcttaattaaataacaaatagcagcataggcagtatgcaaatcagctcatgatataataat 8085  T
Q  310 atcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaa 395  Q
    |||||||| ||  ||||||||||| ||| || |||  || | ||||||||||  ||||||||  |||||||| |||| ||||||||||    
T  8084 atcaaatgaaattcaacaacatcttaaacattcatatataattcaagtaatgtatataaaattatatcacattataaacaacatcaaa 7997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 5104 - 4875
Alignment:
Q  37 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaa 135  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||| |||||||| | |||||||| |||||  | ||||| ||||||||||    
T  5104 ttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaatgctccatcatgttgagtactaagctttagggcat-aagcccccaa 5007  T
Q  136 caatgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaaatcgacaacctattatata-atccaataatttggaactt---catcatcttcatc 230  Q
    ||     |||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| |  | || ||||||| |||||||||||||||  ||   ||||||||| |||    
T  5006 catatctatgctattgcatggactcgatctcttaaaacatctt-aatc-atcatctcttatatatatccaataatttggaggttcaacatcatcttaatc 4909  T
Q  231 aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa 264  Q
    | |||| |  |||||||||| |||||||||||||    
T  4908 atcttatattgactcatgcaacttagttaaataa 4875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0634 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0634
Description:

Target: scaffold0634; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 4952 - 4894
Alignment:
Q  40 agtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatc 98  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4952 agtattaatatacttccaggccatcaagcccccatcgctatttgagctaaagctccatc 4894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 118
Target Start/End: Original strand, 466 - 547
Alignment:
Q  37 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctcca 118  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  466 ttgagtattaatatacttccagggcat-aagcctccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctcca 547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 372 - 426
Target Start/End: Original strand, 1074 - 1128
Alignment:
Q  372 tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataatta 426  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1074 tatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacatcttcacagattataatta 1128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 239
Target Start/End: Original strand, 539 - 688
Alignment:
Q  88 aaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaa 187  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||| ||| | | |||||||||||    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||| |  |    
T  539 aaagctccattgtggtgagtacaaagctccagggcctga-gcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatctcttaaacatcat-aatc-atca 635  T
Q  188 cctattata-taatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagac 239  Q
     || ||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||    
T  636 tctcttatattagtccaataatttggaacatcattatcttcaacaactaagac 688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 75
Target Start/End: Original strand, 20471 - 20529
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatc 75  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  20471 catcaagcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatc 20529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 179
Target Start/End: Original strand, 14482 - 14624
Alignment:
Q  37 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaa 135  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||| ||||| |||| ||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||    
T  14482 ttgagtattaatatacttccagggaat-aagcccccttcgctaatttgagctaatgctacatcgtgttgagtactaagctccagggcatga-gcccccaa 14579  T
Q  136 ca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 179  Q
    || ||| | |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  14580 catatgta-tgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatcttaa 14624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 179
Target Start/End: Original strand, 38922 - 39064
Alignment:
Q  37 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaa 135  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||| ||||| |||| ||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||    
T  38922 ttgagtattaatatacttccagggtat-aagcccccttcgctaatttgagctaatgctgcatcgtgttgagtactaagctccagggcatga-gcccccaa 39019  T
Q  136 ca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 179  Q
    || ||| | |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  39020 catatgta-tgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatcttaa 39064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 179
Target Start/End: Original strand, 23498 - 23640
Alignment:
Q  37 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaa 135  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||| || |||||   |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||    
T  23498 ttgagtattaatatacttccagggaat-aagcccccatcgataatttgagaaaaagctacatcgtgttgagtactaagctccagggcatga-gcccccaa 23595  T
Q  136 ca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 179  Q
    || ||| | |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  23596 catatgta-tgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatcttaa 23640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 113 - 275
Target Start/End: Original strand, 30235 - 30392
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatat-aatccaataattt 210  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||  ||| |||| || |  | |||| |||||| |||||||||||||    
T  30235 gctccagggcatcaagcccccaacaatgtaatgctaatgcatggacttgacgtctt--acaacttagaaacatcgacctcttatataaatccaataattt 30332  T
Q  211 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 275  Q
    ||||   || ||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||   ||||||||||||    
T  30333 ggaa---caacatctt--tcatcttagaccgactcatgcagtttaattaatatacaacagcaaca 30392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0423 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0423
Description:

Target: scaffold0423; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 25 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 72 - 18
Alignment:
Q  25 ccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta 79  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  72 ccccatcgctatttgagttttaatatacttccagggcatcaagcccccatcgcta 18  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 22105 - 21866
Alignment:
Q  34 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccc 132  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  22105 tattttagtattaatatactttcagggcatgag-cccccatcgttattttgagttaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccc 22008  T
Q  133 caac-aatgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt---catcatcttc 227  Q
    |||| |||| ||||||||||||||  ||| | ||||| ||||||||| |||| |  | ||  ||||| |||||||||||||||  ||   |||||||||     
T  22007 caacaaatgtaatgctaatgcatgggctcaatctcttaaaacatctt-aatc-atcatctcatatat-atccaataatttggaggttcaacatcatctta 21911  T
Q  228 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 272  Q
    |||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  21910 atcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagca 21866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 29997 - 29758
Alignment:
Q  34 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccc 132  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  29997 tattttagtattaatatactttcagggcatgag-cccccatcgttattttgagttaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccc 29900  T
Q  133 caac-aatgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt---catcatcttc 227  Q
    |||| |||| ||||||||||||||  ||| | ||||| ||||||||| |||| |  | ||  ||||| |||||||||||||||  ||   |||||||||     
T  29899 caacaaatgtaatgctaatgcatgggctcaatctcttaaaacatctt-aatc-atcatctcatatat-atccaataatttggaggttcaacatcatctta 29803  T
Q  228 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 272  Q
    |||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  29802 atcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagca 29758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 179
Target Start/End: Original strand, 1696 - 1842
Alignment:
Q  34 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt--gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagccc 131  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |  | ||||||| |||||  || |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||  |||||    
T  1696 tattttagtattaatatactttcagggcatgag-ctcccatcgttatttttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagccc 1793  T
Q  132 ccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 179  Q
    |||||||    ||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||    
T  1794 ccaacaaatgtatgctaatgcatggactcaatctcttaaaacatcttaa 1842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0697 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0697
Description:

Target: scaffold0697; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 160
Target Start/End: Original strand, 6506 - 6546
Alignment:
Q  120 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactc 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6506 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactc 6546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 105
Target Start/End: Original strand, 32251 - 32334
Alignment:
Q  22 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattga 105  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||| |||| |||||||||| ||||    
T  32251 agcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgttaatttgagctaatgctccatcgtgttga 32334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 291
Target Start/End: Original strand, 25121 - 25184
Alignment:
Q  229 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaa 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | |||||||| ||||    
T  25121 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaa 25184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 289 - 416
Target Start/End: Original strand, 225482 - 225611
Alignment:
Q  289 aaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcatgactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatc 386  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||  || | ||||||||||| |||| |||  |||||||| |||| |    
T  225482 aaaacagcgtgatataataatatcaaatgcaa-tcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaac 225580  T
Q  387 aacatcaaaacatctta-aacagcttcacag 416  Q
    ||||||||| |||| || | |||||||||||    
T  225581 aacatcaaatcatcatatatcagcttcacag 225611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 215
Target Start/End: Original strand, 225353 - 225455
Alignment:
Q  113 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatat-aatccaataattt 210  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||  | | ||| ||||| || | ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  225353 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatggactcaacaac-tcaacctcttagaaacaacaacctcttatataaatccaataattt 225450  T
Q  211 ggaac 215  Q
    |||||    
T  225451 ggaac 225455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 281196 - 281071
Alignment:
Q  34 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccc 132  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||| ||||| || |||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  281196 tattttagtattaatatactttcagggcatgag-cccccatcgttattttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccc 281099  T
Q  133 caacaatgaaatgctaatgcatgaactc 160  Q
    ||||||    ||||||||||||| ||||    
T  281098 caacaaatgtatgctaatgcatggactc 281071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 198 - 336
Target Start/End: Original strand, 267649 - 267784
Alignment:
Q  198 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaa-acaa 295  Q
    |||| |||||||||||||   ||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||| ||||| | |||||||| |||| |       
T  267649 aatcaaataatttggaac---atcatctt--tcatcttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacatcaacatatgcagtatataaaacagtt 267743  T
Q  296 catgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaa 336  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  267744 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaatatctcaa 267784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 218 - 320
Target Start/End: Original strand, 29558 - 29660
Alignment:
Q  218 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatg 317  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||| || | || | | ||  ||||| || | ||||||||||||||||||| ||    
T  29558 catcatcttaatcaacttagactgactcatgtgacttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaataatagcatgacataataatatcaattg 29657  T
Q  318 caa 320  Q
    |||    
T  29658 caa 29660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1655 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1655
Description:

Target: scaffold1655; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 66
Target Start/End: Original strand, 1193 - 1242
Alignment:
Q  17 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaa 66  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  1193 catcaaacccccatcgctatttgagtattaatatacttccaaggcatcaa 1242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 391 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 17929 - 17892
Alignment:
Q  391 tcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaac 428  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17929 tcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaac 17892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 198 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 1930 - 1874
Alignment:
Q  198 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagtta 259  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  1930 aatccaataatttggaacatcatc--cttcatc---ttagaccgactcatgcagcttagtta 1874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 138
Target Start/End: Original strand, 6361 - 6418
Alignment:
Q  80 tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaa 138  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  6361 tttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaa 6418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 138
Target Start/End: Original strand, 2649 - 2752
Alignment:
Q  34 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccc 132  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||  ||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||  ||||||    
T  2649 tattttagtattaatatactttcagggcatgag-cccccatcattattttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctcaagggcat-gagcccc 2746  T
Q  133 caacaa 138  Q
    ||||||    
T  2747 caacaa 2752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 206624 - 206575
Alignment:
Q  235 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagta 284  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||    
T  206624 tagatcgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacataggcagta 206575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 296 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 2257 - 2213
Alignment:
Q  296 catgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 340  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  2257 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 2213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0780 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0780
Description:

Target: scaffold0780; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 34 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 4906 - 4870
Alignment:
Q  34 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaaccc 70  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  4906 tatttgagcattaatatacttccagggcatcaaaccc 4870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 34 - 66
Target Start/End: Original strand, 14401 - 14433
Alignment:
Q  34 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaa 66  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14401 tatttgagtattaatatacttccagggcatcaa 14433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 34 - 66
Target Start/End: Original strand, 12396 - 12428
Alignment:
Q  34 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaa 66  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12396 tatttgagtattaatatacttccagggcatcaa 12428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University