View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8810A_high_11 (Length: 442)

Name: NF8810A_high_11
Description: NF8810A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8810A_high_11
NF8810A_high_11
[»] chr5 (92 HSPs)
chr5 (20-437)||(24529023-24529442)
chr5 (20-437)||(9077757-9078174)
chr5 (17-437)||(25421330-25421754)
chr5 (20-436)||(24493371-24493789)
chr5 (20-437)||(25431197-25431616)
chr5 (20-431)||(1096271-1096683)
chr5 (20-431)||(23390401-23390814)
chr5 (20-324)||(21997548-21997852)
chr5 (20-437)||(13095297-13095716)
chr5 (20-437)||(13025113-13025532)
chr5 (20-431)||(8286747-8287163)
chr5 (116-430)||(22412083-22412388)
chr5 (20-343)||(21808384-21808708)
chr5 (20-343)||(21729059-21729384)
chr5 (20-431)||(22074822-22075235)
chr5 (116-377)||(29329831-29330090)
chr5 (113-377)||(10732946-10733208)
chr5 (116-377)||(42245371-42245630)
chr5 (123-377)||(11581205-11581458)
chr5 (116-377)||(264774-265033)
chr5 (116-339)||(2154658-2154879)
chr5 (116-377)||(20908909-20909168)
chr5 (116-377)||(29345877-29346136)
chr5 (116-377)||(32027290-32027549)
chr5 (20-293)||(19660879-19661154)
chr5 (116-376)||(39245033-39245291)
chr5 (116-377)||(29348350-29348609)
chr5 (20-436)||(21292870-21293289)
chr5 (116-377)||(10775681-10775942)
chr5 (123-377)||(29350830-29351082)
chr5 (145-377)||(39363310-39363540)
chr5 (20-365)||(37723704-37724049)
chr5 (123-377)||(36154789-36155039)
chr5 (116-314)||(20918017-20918212)
chr5 (144-339)||(20902053-20902248)
chr5 (124-324)||(23064415-23064614)
chr5 (124-324)||(31060974-31061171)
chr5 (126-324)||(38619337-38619537)
chr5 (123-377)||(18319039-18319290)
chr5 (123-324)||(24067013-24067210)
chr5 (124-279)||(20806845-20806998)
chr5 (145-315)||(36314504-36314675)
chr5 (25-242)||(22107709-22107926)
chr5 (147-430)||(40725782-40726069)
chr5 (145-365)||(17517174-17517400)
chr5 (116-343)||(21565445-21565668)
chr5 (25-275)||(26703882-26704129)
chr5 (25-275)||(26973615-26973862)
chr5 (112-293)||(21329541-21329719)
chr5 (116-419)||(22143951-22144254)
chr5 (116-340)||(26012033-26012255)
chr5 (283-430)||(20766035-20766174)
chr5 (123-270)||(19668805-19668951)
chr5 (123-293)||(22959576-22959741)
chr5 (116-335)||(20026942-20027158)
chr5 (187-288)||(21502205-21502308)
chr5 (25-174)||(23201164-23201312)
chr5 (40-174)||(21873073-21873206)
chr5 (321-437)||(21986046-21986164)
chr5 (71-291)||(23501402-23501622)
chr5 (37-174)||(23571893-23572029)
chr5 (40-182)||(14078969-14079111)
chr5 (231-430)||(18418594-18418793)
chr5 (375-431)||(22107278-22107334)
chr5 (20-87)||(23064330-23064396)
chr5 (20-87)||(36314353-36314420)
chr5 (123-181)||(14047988-14048046)
chr5 (190-278)||(26740705-26740789)
chr5 (37-163)||(18770179-18770304)
chr5 (20-87)||(40725673-40725740)
chr5 (20-87)||(41095852-41095918)
chr5 (20-87)||(41095895-41095961)
chr5 (201-263)||(27989004-27989061)
chr5 (20-86)||(40725717-40725783)
chr5 (145-182)||(18418528-18418565)
chr5 (233-278)||(26732892-26732937)
chr5 (20-85)||(31060889-31060953)
chr5 (37-278)||(22032139-22032380)
chr5 (40-127)||(23511919-23512006)
chr5 (124-180)||(41095692-41095747)
chr5 (20-87)||(18418421-18418488)
chr5 (20-87)||(31060846-31060912)
chr5 (71-154)||(33895953-33896035)
chr5 (20-87)||(40725630-40725696)
chr5 (20-87)||(41095809-41095875)
chr5 (20-81)||(18418465-18418526)
chr5 (20-85)||(20807019-20807083)
chr5 (94-163)||(21366839-21366907)
chr5 (244-317)||(21873277-21873350)
chr5 (20-81)||(23064373-23064433)
chr5 (20-81)||(39363247-39363308)
chr5 (20-56)||(38619293-38619329)
[»] chr1 (86 HSPs)
chr1 (20-437)||(34509583-34510002)
chr1 (20-437)||(50210112-50210536)
chr1 (20-437)||(22532072-22532491)
chr1 (20-431)||(27250634-27251048)
chr1 (20-431)||(20134984-20135403)
chr1 (116-377)||(31612209-31612469)
chr1 (116-377)||(13988763-13989022)
chr1 (116-377)||(21923297-21923556)
chr1 (116-377)||(23593741-23594000)
chr1 (116-377)||(21475093-21475352)
chr1 (116-377)||(29298034-29298292)
chr1 (124-377)||(29776592-29776844)
chr1 (34-319)||(20847173-20847459)
chr1 (116-377)||(22123073-22123333)
chr1 (25-429)||(22468604-22469014)
chr1 (118-377)||(45574848-45575108)
chr1 (160-430)||(432952-433222)
chr1 (20-430)||(38801297-38801707)
chr1 (144-418)||(21346885-21347161)
chr1 (123-377)||(21711612-21711865)
chr1 (124-377)||(21707071-21707323)
chr1 (144-418)||(21342021-21342296)
chr1 (145-377)||(13212867-13213099)
chr1 (144-377)||(16361835-16362073)
chr1 (145-377)||(21840686-21840923)
chr1 (20-231)||(21477445-21477656)
chr1 (128-324)||(16275423-16275616)
chr1 (203-431)||(21026666-21026896)
chr1 (123-324)||(40389060-40389257)
chr1 (25-275)||(21714352-21714600)
chr1 (195-324)||(15860068-15860195)
chr1 (123-239)||(27161605-27161721)
chr1 (145-320)||(14295569-14295745)
chr1 (116-343)||(33680910-33681133)
chr1 (40-242)||(22131180-22131380)
chr1 (145-278)||(20454613-20454752)
chr1 (116-424)||(35260992-35261295)
chr1 (40-242)||(48603088-48603288)
chr1 (116-343)||(22237530-22237753)
chr1 (25-278)||(42865273-42865526)
chr1 (61-176)||(20916070-20916185)
chr1 (123-339)||(21753957-21754166)
chr1 (116-398)||(21896194-21896473)
chr1 (203-343)||(22921864-22922001)
chr1 (201-430)||(16758638-16758866)
chr1 (294-431)||(22354477-22354616)
chr1 (201-396)||(21861510-21861702)
chr1 (123-270)||(52928038-52928181)
chr1 (375-434)||(48603674-48603733)
chr1 (83-278)||(21161588-21161778)
chr1 (116-332)||(20248184-20248394)
chr1 (20-87)||(13213139-13213206)
chr1 (20-87)||(16361729-16361796)
chr1 (83-178)||(20091636-20091730)
chr1 (25-174)||(21788208-21788356)
chr1 (375-437)||(22356073-22356136)
chr1 (375-437)||(22357759-22357822)
chr1 (20-87)||(29776461-29776528)
chr1 (201-339)||(41050033-41050168)
chr1 (20-86)||(21840449-21840514)
chr1 (116-339)||(16368284-16368502)
chr1 (233-320)||(20918620-20918707)
chr1 (201-340)||(50614113-50614249)
chr1 (201-340)||(50621941-50622077)
chr1 (37-182)||(6151665-6151810)
chr1 (20-87)||(14295829-14295896)
chr1 (38-163)||(22831560-22831684)
chr1 (20-87)||(21840579-21840646)
chr1 (20-87)||(45575122-45575189)
chr1 (116-158)||(431655-431697)
chr1 (38-182)||(18182275-18182418)
chr1 (20-85)||(20454837-20454901)
chr1 (20-76)||(45575089-45575145)
chr1 (20-87)||(14295785-14295852)
chr1 (355-430)||(21477654-21477732)
chr1 (20-87)||(29776505-29776572)
chr1 (266-336)||(33797570-33797638)
chr1 (33-87)||(45575166-45575220)
chr1 (57-87)||(50210513-50210543)
chr1 (20-81)||(13213101-13213162)
chr1 (20-81)||(14295747-14295808)
chr1 (20-81)||(20454754-20454815)
chr1 (20-81)||(21840623-21840684)
chr1 (20-87)||(21341915-21341982)
chr1 (20-87)||(21346779-21346846)
chr1 (202-275)||(24783155-24783230)
[»] chr6 (87 HSPs)
chr6 (20-430)||(29060343-29060755)
chr6 (20-431)||(25629260-25629671)
chr6 (43-437)||(18409726-18410126)
chr6 (57-437)||(19303440-19303821)
chr6 (58-429)||(20593615-20593987)
chr6 (20-437)||(22780126-22780545)
chr6 (20-437)||(20638182-20638603)
chr6 (20-431)||(17287701-17288114)
chr6 (62-437)||(20360859-20361238)
chr6 (116-377)||(2291186-2291445)
chr6 (116-377)||(18334598-18334857)
chr6 (116-377)||(19004943-19005202)
chr6 (116-377)||(24422444-24422703)
chr6 (116-377)||(33861691-33861950)
chr6 (20-377)||(20076506-20076856)
chr6 (116-377)||(19858925-19859184)
chr6 (116-377)||(33864175-33864434)
chr6 (132-377)||(22782139-22782383)
chr6 (20-320)||(28496489-28496790)
chr6 (20-320)||(29808900-29809201)
chr6 (116-377)||(1595446-1595705)
chr6 (116-377)||(8054926-8055185)
chr6 (116-377)||(26924646-26924905)
chr6 (116-376)||(1540918-1541176)
chr6 (116-377)||(12742214-12742473)
chr6 (116-377)||(20556900-20557158)
chr6 (124-377)||(25754715-25754965)
chr6 (117-377)||(3852023-3852280)
chr6 (20-317)||(35245386-35245684)
chr6 (123-339)||(25688405-25688620)
chr6 (20-270)||(1561104-1561356)
chr6 (123-377)||(16448532-16448783)
chr6 (59-242)||(19773818-19774003)
chr6 (38-436)||(22831322-22831723)
chr6 (20-319)||(16920651-16920950)
chr6 (28-218)||(22805559-22805749)
chr6 (145-377)||(34963292-34963529)
chr6 (146-377)||(30676716-30676952)
chr6 (20-316)||(25611744-25612047)
chr6 (123-278)||(25714323-25714478)
chr6 (178-343)||(16496204-16496370)
chr6 (24-319)||(11185318-11185605)
chr6 (201-430)||(18456705-18456930)
chr6 (20-422)||(25603299-25603709)
chr6 (210-324)||(25656619-25656732)
chr6 (188-430)||(25644295-25644537)
chr6 (147-430)||(8227416-8227703)
chr6 (201-370)||(18461865-18462028)
chr6 (116-364)||(20109039-20109285)
chr6 (187-340)||(23019377-23019529)
chr6 (25-275)||(25642250-25642499)
chr6 (145-343)||(19847990-19848194)
chr6 (25-275)||(19862783-19863032)
chr6 (116-340)||(19652098-19652317)
chr6 (201-387)||(18821795-18821976)
chr6 (25-275)||(19872925-19873174)
chr6 (25-306)||(22432054-22432334)
chr6 (25-306)||(22438604-22438884)
chr6 (37-182)||(22335053-22335197)
chr6 (83-288)||(4185870-4186069)
chr6 (83-269)||(4186240-4186419)
chr6 (116-264)||(22080799-22080945)
chr6 (83-269)||(4738626-4738805)
chr6 (25-182)||(15894593-15894749)
chr6 (116-335)||(19668275-19668491)
chr6 (145-323)||(23992349-23992533)
chr6 (84-270)||(31155465-31155644)
chr6 (71-174)||(31165006-31165107)
chr6 (220-293)||(27333262-27333336)
chr6 (220-293)||(27394002-27394076)
chr6 (201-322)||(9098528-9098646)
chr6 (89-422)||(15041465-15041799)
chr6 (201-258)||(19008787-19008843)
chr6 (238-294)||(33443068-33443124)
chr6 (20-86)||(8227702-8227768)
chr6 (83-179)||(16965471-16965566)
chr6 (94-163)||(18692086-18692154)
chr6 (20-87)||(19848234-19848301)
chr6 (20-87)||(19848278-19848345)
chr6 (20-87)||(34963185-34963252)
chr6 (117-163)||(13019394-13019439)
chr6 (38-163)||(18906928-18907052)
chr6 (20-85)||(3852338-3852402)
chr6 (20-85)||(4642934-4642998)
chr6 (94-163)||(16523558-16523626)
chr6 (20-81)||(23992286-23992347)
chr6 (20-81)||(34963229-34963290)
[»] chr4 (88 HSPs)
chr4 (20-437)||(16377422-16377839)
chr4 (20-437)||(7893505-7893922)
chr4 (17-437)||(44052628-44053051)
chr4 (20-397)||(7798577-7798956)
chr4 (20-431)||(22636238-22636650)
chr4 (20-437)||(16239869-16240288)
chr4 (28-431)||(12902567-12902973)
chr4 (57-430)||(14038498-14038863)
chr4 (59-427)||(16270145-16270515)
chr4 (123-430)||(54798669-54798969)
chr4 (123-430)||(14280219-14280518)
chr4 (116-377)||(18215280-18215540)
chr4 (116-430)||(44928829-44929146)
chr4 (123-377)||(12313-12565)
chr4 (116-377)||(15118358-15118617)
chr4 (20-431)||(23374264-23374672)
chr4 (116-377)||(44773093-44773352)
chr4 (116-377)||(50222345-50222604)
chr4 (116-377)||(52312407-52312666)
chr4 (116-377)||(44615185-44615444)
chr4 (116-376)||(18239426-18239684)
chr4 (123-342)||(52873363-52873582)
chr4 (116-370)||(1837522-1837774)
chr4 (116-430)||(8574784-8575088)
chr4 (116-377)||(15355330-15355591)
chr4 (20-431)||(17046288-17046700)
chr4 (20-436)||(14053202-14053621)
chr4 (116-377)||(7641198-7641447)
chr4 (124-377)||(51463874-51464124)
chr4 (59-303)||(3096134-3096379)
chr4 (124-377)||(23803271-23803521)
chr4 (124-377)||(12610856-12611099)
chr4 (146-430)||(44102140-44102425)
chr4 (173-431)||(7088832-7089093)
chr4 (64-288)||(15551663-15551889)
chr4 (135-364)||(6899808-6900037)
chr4 (124-324)||(15369925-15370124)
chr4 (124-324)||(15371109-15371308)
chr4 (124-430)||(15367597-15367905)
chr4 (124-430)||(15402610-15402918)
chr4 (145-377)||(19618178-19618415)
chr4 (124-324)||(15373390-15373589)
chr4 (195-377)||(19242675-19242855)
chr4 (124-324)||(16223439-16223638)
chr4 (195-377)||(3514982-3515163)
chr4 (145-377)||(14970713-14970950)
chr4 (123-324)||(20149735-20149932)
chr4 (201-377)||(21815591-21815761)
chr4 (187-430)||(52243099-52243343)
chr4 (123-398)||(13789-14061)
chr4 (116-324)||(39706302-39706511)
chr4 (40-242)||(17048409-17048609)
chr4 (25-285)||(12569820-12570078)
chr4 (124-377)||(22353740-22353993)
chr4 (116-397)||(43198492-43198769)
chr4 (25-182)||(44675436-44675593)
chr4 (25-174)||(13569306-13569454)
chr4 (113-339)||(12773910-12774128)
chr4 (25-182)||(15125197-15125354)
chr4 (25-182)||(23843282-23843439)
chr4 (201-335)||(12288211-12288342)
chr4 (145-293)||(8846287-8846433)
chr4 (40-182)||(15093594-15093736)
chr4 (116-169)||(29267517-29267570)
chr4 (236-370)||(6190481-6190616)
chr4 (37-182)||(15121956-15122101)
chr4 (375-437)||(3096803-3096865)
chr4 (375-429)||(17047979-17048033)
chr4 (35-87)||(19618499-19618551)
chr4 (113-339)||(46640453-46640675)
chr4 (20-87)||(19242536-19242603)
chr4 (20-87)||(22353609-22353676)
chr4 (116-229)||(14927843-14927955)
chr4 (201-287)||(53082202-53082284)
chr4 (20-85)||(15705192-15705256)
chr4 (20-87)||(14971078-14971145)
chr4 (20-87)||(19242493-19242559)
chr4 (20-87)||(22353653-22353720)
chr4 (299-377)||(15464892-15464970)
chr4 (20-85)||(12610728-12610792)
chr4 (20-85)||(12610771-12610835)
chr4 (20-85)||(15367512-15367576)
chr4 (20-81)||(19242580-19242641)
chr4 (20-85)||(23803542-23803606)
chr4 (20-85)||(23803585-23803649)
chr4 (20-85)||(51464145-51464209)
chr4 (238-278)||(17333298-17333338)
chr4 (43-99)||(39706543-39706598)
[»] chr3 (130 HSPs)
chr3 (20-437)||(40213620-40214038)
chr3 (43-437)||(14972682-14973076)
chr3 (20-431)||(25476290-25476701)
chr3 (20-437)||(23083260-23083679)
chr3 (20-437)||(17487659-17488078)
chr3 (20-431)||(43840735-43841148)
chr3 (20-437)||(18438337-18438756)
chr3 (20-437)||(17499141-17499560)
chr3 (57-431)||(11424668-11425040)
chr3 (59-437)||(13442115-13442496)
chr3 (59-431)||(26686729-26687103)
chr3 (20-437)||(20698335-20698755)
chr3 (20-431)||(12399011-12399425)
chr3 (116-430)||(24153115-24153430)
chr3 (116-430)||(21618345-21618650)
chr3 (43-437)||(14576732-14577124)
chr3 (116-430)||(36166494-36166799)
chr3 (116-377)||(29172589-29172849)
chr3 (116-377)||(17463075-17463334)
chr3 (116-377)||(34159223-34159482)
chr3 (116-377)||(16454287-16454546)
chr3 (116-376)||(28848618-28848876)
chr3 (123-377)||(8898998-8899250)
chr3 (116-377)||(13151796-13152056)
chr3 (116-377)||(13154261-13154521)
chr3 (116-377)||(38961897-38962157)
chr3 (116-377)||(45606913-45607172)
chr3 (116-334)||(55500839-55501055)
chr3 (116-377)||(9707613-9707872)
chr3 (116-377)||(16282817-16283076)
chr3 (116-377)||(17446661-17446919)
chr3 (123-377)||(7781353-7781605)
chr3 (116-377)||(10247729-10247988)
chr3 (43-437)||(14572417-14572810)
chr3 (116-339)||(6469178-6469395)
chr3 (116-339)||(15977409-15977633)
chr3 (63-430)||(24340628-24340999)
chr3 (20-332)||(13210333-13210647)
chr3 (145-377)||(55476417-55476647)
chr3 (116-377)||(41123787-41124043)
chr3 (124-324)||(8499422-8499621)
chr3 (118-377)||(43550484-43550744)
chr3 (117-340)||(10556882-10557105)
chr3 (124-324)||(15412333-15412532)
chr3 (124-377)||(50242728-50242978)
chr3 (124-324)||(12119784-12119983)
chr3 (20-425)||(30029637-30030049)
chr3 (20-430)||(23274489-23274903)
chr3 (235-436)||(42386428-42386632)
chr3 (124-377)||(27165154-27165407)
chr3 (117-273)||(45577947-45578102)
chr3 (145-377)||(12567479-12567716)
chr3 (145-377)||(13543944-13544181)
chr3 (124-320)||(44494715-44494908)
chr3 (106-365)||(12510939-12511205)
chr3 (142-377)||(53301511-53301747)
chr3 (124-319)||(17737142-17737337)
chr3 (20-160)||(10542619-10542759)
chr3 (124-278)||(28194599-28194752)
chr3 (25-306)||(15878083-15878363)
chr3 (145-365)||(46822187-46822413)
chr3 (146-430)||(37642170-37642458)
chr3 (20-137)||(10542852-10542969)
chr3 (220-377)||(17672626-17672782)
chr3 (236-377)||(53070659-53070799)
chr3 (25-278)||(23408234-23408485)
chr3 (20-136)||(14682183-14682300)
chr3 (20-137)||(10542747-10542864)
chr3 (116-340)||(15470827-15471047)
chr3 (20-136)||(14670661-14670778)
chr3 (116-335)||(14234382-14234605)
chr3 (147-430)||(22147431-22147717)
chr3 (116-332)||(12174265-12174467)
chr3 (116-323)||(9512825-9513026)
chr3 (116-323)||(9520800-9521001)
chr3 (116-343)||(16103685-16103905)
chr3 (116-323)||(49668091-49668292)
chr3 (116-430)||(52523633-52523946)
chr3 (123-343)||(16097238-16097454)
chr3 (203-339)||(32307666-32307798)
chr3 (375-434)||(14179592-14179651)
chr3 (116-339)||(22110349-22110569)
chr3 (39-174)||(23077642-23077776)
chr3 (20-87)||(27165069-27165135)
chr3 (201-339)||(37251165-37251300)
chr3 (123-293)||(1644718-1644882)
chr3 (40-115)||(16796117-16796192)
chr3 (201-340)||(43925947-43926083)
chr3 (20-87)||(8499337-8499403)
chr3 (37-182)||(15067499-15067644)
chr3 (20-87)||(15412248-15412314)
chr3 (37-182)||(16369216-16369361)
chr3 (96-242)||(16796195-16796339)
chr3 (20-87)||(53301784-53301850)
chr3 (20-86)||(22147716-22147782)
chr3 (39-182)||(23053244-23053387)
chr3 (299-397)||(2051138-2051238)
chr3 (40-182)||(14878672-14878814)
chr3 (28-87)||(12120045-12120103)
chr3 (20-87)||(22147759-22147826)
chr3 (20-63)||(26683157-26683200)
chr3 (20-87)||(46822080-46822147)
chr3 (375-429)||(16796707-16796761)
chr3 (20-81)||(46822124-46822185)
chr3 (238-278)||(13919350-13919390)
chr3 (20-76)||(28194557-28194612)
chr3 (20-87)||(10556804-10556870)
chr3 (202-278)||(14665380-14665458)
chr3 (20-87)||(15076200-15076267)
chr3 (20-87)||(15076244-15076311)
chr3 (20-87)||(22147803-22147869)
chr3 (20-87)||(28194514-28194580)
chr3 (20-87)||(43550758-43550825)
chr3 (20-86)||(12120003-12120068)
chr3 (37-87)||(43550802-43550852)
chr3 (33-87)||(46822049-46822103)
chr3 (221-278)||(856140-856197)
chr3 (20-81)||(10556847-10556907)
chr3 (20-81)||(15412291-15412351)
chr3 (20-85)||(17737057-17737121)
chr3 (94-163)||(18384090-18384158)
chr3 (221-278)||(23077537-23077594)
chr3 (20-81)||(27165112-27165172)
chr3 (20-85)||(50242643-50242707)
chr3 (20-81)||(55476354-55476415)
chr3 (83-182)||(12172658-12172757)
chr3 (202-275)||(14668536-14668611)
chr3 (83-182)||(15051371-15051470)
chr3 (20-76)||(43550725-43550781)
chr3 (59-87)||(43840730-43840758)
[»] chr2 (77 HSPs)
chr2 (20-437)||(23060315-23060734)
chr2 (20-437)||(22336928-22337337)
chr2 (21-431)||(22731139-22731551)
chr2 (59-437)||(23076288-23076664)
chr2 (20-431)||(23654291-23654706)
chr2 (20-431)||(22738085-22738497)
chr2 (134-437)||(23659940-23660244)
chr2 (24-294)||(8946463-8946734)
chr2 (116-377)||(18808840-18809099)
chr2 (116-377)||(23712019-23712278)
chr2 (116-377)||(39682210-39682469)
chr2 (116-376)||(23135487-23135745)
chr2 (116-377)||(24367670-24367930)
chr2 (116-377)||(26505276-26505535)
chr2 (116-377)||(26507754-26508013)
chr2 (123-377)||(21155066-21155318)
chr2 (116-377)||(24905638-24905898)
chr2 (116-377)||(24908113-24908373)
chr2 (116-370)||(45029867-45030119)
chr2 (116-377)||(23709538-23709797)
chr2 (20-278)||(23040249-23040509)
chr2 (116-377)||(24898201-24898461)
chr2 (116-377)||(24900684-24900944)
chr2 (116-377)||(24903161-24903421)
chr2 (116-377)||(571294-571553)
chr2 (116-377)||(6725892-6726151)
chr2 (20-436)||(38016-38435)
chr2 (116-377)||(28576996-28577255)
chr2 (116-377)||(32039504-32039763)
chr2 (116-339)||(24529573-24529795)
chr2 (145-377)||(23130788-23131018)
chr2 (145-377)||(23133255-23133485)
chr2 (145-377)||(34402528-34402758)
chr2 (20-365)||(23103370-23103714)
chr2 (124-377)||(43137204-43137455)
chr2 (20-315)||(23071972-23072269)
chr2 (125-377)||(22105319-22105569)
chr2 (56-436)||(20308945-20309326)
chr2 (123-297)||(24643036-24643209)
chr2 (124-377)||(38967279-38967531)
chr2 (20-231)||(21900560-21900773)
chr2 (124-431)||(298719-299027)
chr2 (171-431)||(23285818-23286077)
chr2 (63-430)||(19671675-19672043)
chr2 (145-377)||(32214927-32215164)
chr2 (187-430)||(23708524-23708769)
chr2 (25-275)||(22741027-22741276)
chr2 (145-365)||(25616107-25616333)
chr2 (116-343)||(28405881-28406103)
chr2 (116-343)||(25175754-25175976)
chr2 (116-377)||(7694-7950)
chr2 (25-182)||(22758875-22759031)
chr2 (57-138)||(23657632-23657713)
chr2 (123-270)||(18786971-18787113)
chr2 (116-293)||(7679480-7679662)
chr2 (116-293)||(22134251-22134428)
chr2 (40-182)||(22799282-22799424)
chr2 (375-437)||(27753735-27753797)
chr2 (236-387)||(32451878-32452031)
chr2 (201-430)||(20520098-20520325)
chr2 (40-317)||(23019727-23020004)
chr2 (201-339)||(23207266-23207401)
chr2 (116-423)||(22413048-22413354)
chr2 (37-182)||(24673383-24673529)
chr2 (20-87)||(32215204-32215271)
chr2 (238-287)||(23287384-23287433)
chr2 (37-182)||(24680000-24680146)
chr2 (238-278)||(26392403-26392443)
chr2 (116-163)||(23713058-23713104)
chr2 (306-377)||(24642862-24642933)
chr2 (37-163)||(45678304-45678429)
chr2 (33-87)||(32215248-32215302)
chr2 (20-81)||(23130725-23130786)
chr2 (20-81)||(23133192-23133253)
chr2 (20-81)||(34402760-34402821)
chr2 (20-85)||(38967194-38967258)
chr2 (20-85)||(43137075-43137139)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (47-437)||(3050-3441)
[»] scaffold0056 (3 HSPs)
scaffold0056 (20-436)||(17115-17539)
scaffold0056 (236-370)||(79297-79430)
scaffold0056 (25-285)||(14139-14399)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (20-437)||(339849-340263)
scaffold0003 (116-377)||(158456-158716)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (57-437)||(4350-4729)
scaffold0228 (57-437)||(11932-12311)
scaffold0228 (57-437)||(21884-22263)
[»] chr8 (87 HSPs)
chr8 (20-431)||(18818314-18818727)
chr8 (57-437)||(16092240-16092621)
chr8 (20-431)||(22874872-22875281)
chr8 (64-437)||(28648943-28649322)
chr8 (44-437)||(6759088-6759478)
chr8 (20-431)||(7372581-7372986)
chr8 (23-431)||(23406185-23406597)
chr8 (20-431)||(22626540-22626951)
chr8 (20-437)||(18879136-18879547)
chr8 (20-431)||(20536011-20536424)
chr8 (43-437)||(21923827-21924222)
chr8 (59-437)||(21918899-21919279)
chr8 (20-437)||(23648350-23648775)
chr8 (116-430)||(26219613-26219918)
chr8 (20-436)||(45130898-45131316)
chr8 (116-377)||(5853298-5853557)
chr8 (116-363)||(26225268-26225513)
chr8 (116-377)||(1484299-1484558)
chr8 (116-377)||(20046201-20046460)
chr8 (116-377)||(20403124-20403383)
chr8 (116-377)||(4542379-4542638)
chr8 (116-377)||(22001651-22001909)
chr8 (117-430)||(41598086-41598399)
chr8 (123-377)||(15203237-15203489)
chr8 (116-377)||(19896162-19896424)
chr8 (59-436)||(31971097-31971476)
chr8 (116-320)||(45290758-45290961)
chr8 (20-320)||(5866292-5866594)
chr8 (124-377)||(14409450-14409702)
chr8 (20-436)||(21389353-21389770)
chr8 (116-377)||(14823671-14823929)
chr8 (20-267)||(21255024-21255272)
chr8 (20-403)||(13597550-13597937)
chr8 (20-267)||(21249186-21249434)
chr8 (20-403)||(13508018-13508403)
chr8 (20-320)||(17140715-17141019)
chr8 (145-377)||(4483207-4483436)
chr8 (20-418)||(21778697-21779096)
chr8 (24-434)||(21395885-21396296)
chr8 (24-434)||(21790378-21790789)
chr8 (20-314)||(21490796-21491092)
chr8 (71-436)||(16199546-16199913)
chr8 (124-377)||(25484281-25484524)
chr8 (145-377)||(16413322-16413547)
chr8 (117-430)||(17612018-17612332)
chr8 (145-339)||(26223841-26224037)
chr8 (195-324)||(19937065-19937192)
chr8 (113-343)||(38855246-38855474)
chr8 (145-365)||(32121654-32121880)
chr8 (116-335)||(6520267-6520486)
chr8 (236-430)||(19801333-19801527)
chr8 (233-324)||(15070571-15070661)
chr8 (116-343)||(23760839-23761062)
chr8 (187-340)||(21285569-21285720)
chr8 (113-338)||(26355699-26355919)
chr8 (124-224)||(22965608-22965707)
chr8 (117-335)||(983407-983622)
chr8 (116-343)||(21673608-21673830)
chr8 (37-182)||(16184537-16184682)
chr8 (25-242)||(44384944-44385160)
chr8 (116-398)||(20498466-20498745)
chr8 (25-364)||(17353912-17354255)
chr8 (190-365)||(18678075-18678256)
chr8 (26-182)||(19898900-19899056)
chr8 (40-182)||(21168887-21169031)
chr8 (40-174)||(23777000-23777133)
chr8 (354-429)||(25363047-25363124)
chr8 (71-182)||(24755565-24755676)
chr8 (25-182)||(19982897-19983054)
chr8 (44-182)||(20466197-20466335)
chr8 (236-404)||(37116366-37116537)
chr8 (20-87)||(14409721-14409787)
chr8 (20-86)||(18678273-18678339)
chr8 (116-340)||(17266990-17267211)
chr8 (236-418)||(17439423-17439609)
chr8 (20-87)||(22965521-22965588)
chr8 (20-85)||(26223692-26223756)
chr8 (201-340)||(24353009-24353144)
chr8 (379-430)||(26222987-26223039)
chr8 (20-87)||(17612344-17612410)
chr8 (36-87)||(18678316-18678367)
chr8 (83-141)||(377132-377189)
chr8 (20-81)||(4483144-4483205)
chr8 (20-81)||(14409684-14409744)
chr8 (20-81)||(17612307-17612367)
chr8 (20-85)||(25484588-25484652)
chr8 (20-81)||(26223778-26223839)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (20-437)||(51716-52135)
scaffold0011 (20-431)||(167884-168297)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (43-437)||(16499-16893)
[»] chr7 (104 HSPs)
chr7 (20-431)||(9508991-9509405)
chr7 (118-437)||(3564263-3564584)
chr7 (20-431)||(12698634-12699048)
chr7 (116-430)||(48273288-48273594)
chr7 (116-430)||(18456319-18456634)
chr7 (20-437)||(10588838-10589260)
chr7 (28-431)||(26211804-26212212)
chr7 (81-437)||(38227344-38227702)
chr7 (116-377)||(11972393-11972652)
chr7 (116-377)||(14949128-14949387)
chr7 (116-377)||(32125388-32125647)
chr7 (116-377)||(41522814-41523073)
chr7 (116-377)||(41525276-41525535)
chr7 (116-377)||(44116405-44116665)
chr7 (20-425)||(15143948-15144350)
chr7 (116-377)||(15376719-15376978)
chr7 (116-377)||(21189601-21189860)
chr7 (116-377)||(24702135-24702394)
chr7 (116-377)||(456218-456477)
chr7 (116-377)||(16232417-16232676)
chr7 (116-377)||(16409956-16410215)
chr7 (116-377)||(20385129-20385388)
chr7 (116-377)||(11393293-11393552)
chr7 (116-377)||(27216757-27217016)
chr7 (116-377)||(24704585-24704841)
chr7 (123-377)||(18640176-18640428)
chr7 (59-431)||(16386152-16386529)
chr7 (116-377)||(20110452-20110702)
chr7 (124-377)||(3386239-3386489)
chr7 (20-242)||(14258062-14258286)
chr7 (20-320)||(34200585-34200889)
chr7 (20-314)||(11996051-11996347)
chr7 (118-377)||(13647225-13647485)
chr7 (124-324)||(13869250-13869449)
chr7 (124-377)||(38898382-38898635)
chr7 (20-343)||(10063813-10064136)
chr7 (20-203)||(13032560-13032744)
chr7 (124-339)||(13831279-13831491)
chr7 (20-315)||(28505321-28505604)
chr7 (123-430)||(17061866-17062173)
chr7 (195-377)||(18430687-18430868)
chr7 (118-436)||(40443292-40443610)
chr7 (61-430)||(27847739-27848109)
chr7 (195-377)||(16213659-16213840)
chr7 (123-377)||(26355989-26356255)
chr7 (123-377)||(26358441-26358707)
chr7 (144-370)||(24275089-24275320)
chr7 (20-158)||(16579377-16579515)
chr7 (20-158)||(16586148-16586286)
chr7 (116-421)||(2280033-2280339)
chr7 (25-365)||(18154810-18155152)
chr7 (106-270)||(15754955-15755120)
chr7 (116-249)||(15082017-15082147)
chr7 (145-320)||(16495329-16495505)
chr7 (123-339)||(67651-67867)
chr7 (146-430)||(19486649-19486937)
chr7 (20-137)||(16461233-16461350)
chr7 (116-343)||(18005550-18005772)
chr7 (25-365)||(19649458-19649801)
chr7 (201-430)||(12756622-12756847)
chr7 (187-340)||(22072882-22073037)
chr7 (25-178)||(24054270-24054421)
chr7 (123-324)||(811145-811343)
chr7 (123-270)||(47831712-47831860)
chr7 (123-336)||(16219719-16219928)
chr7 (20-137)||(16461338-16461455)
chr7 (116-343)||(44014082-44014301)
chr7 (20-137)||(15755152-15755271)
chr7 (123-340)||(16056239-16056450)
chr7 (25-174)||(9703067-9703215)
chr7 (20-99)||(16461166-16461245)
chr7 (123-198)||(18427436-18427510)
chr7 (232-430)||(1867901-1868101)
chr7 (145-227)||(16213550-16213632)
chr7 (201-430)||(15008404-15008631)
chr7 (37-316)||(15211271-15211557)
chr7 (20-76)||(3564565-3564621)
chr7 (25-182)||(32216704-32216861)
chr7 (20-76)||(40443255-40443311)
chr7 (37-278)||(17138120-17138361)
chr7 (20-87)||(13869165-13869231)
chr7 (20-87)||(16213443-16213510)
chr7 (20-87)||(38898654-38898720)
chr7 (221-323)||(14932749-14932851)
chr7 (221-323)||(15356184-15356286)
chr7 (221-323)||(15360298-15360400)
chr7 (232-335)||(12901338-12901443)
chr7 (113-158)||(16461129-16461174)
chr7 (37-278)||(12186835-12187076)
chr7 (20-87)||(13647144-13647211)
chr7 (20-87)||(16495178-16495245)
chr7 (201-263)||(14044735-14044792)
chr7 (201-263)||(14354765-14354822)
chr7 (94-163)||(14429758-14429825)
chr7 (20-87)||(13647100-13647167)
chr7 (20-63)||(16402712-16402755)
chr7 (20-87)||(16495222-16495289)
chr7 (201-275)||(2832504-2832580)
chr7 (20-85)||(3386154-3386218)
chr7 (20-85)||(13831194-13831258)
chr7 (20-81)||(13869208-13869268)
chr7 (20-81)||(16213487-16213548)
chr7 (20-81)||(16495266-16495327)
chr7 (201-278)||(18203801-18203873)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (20-437)||(13015-13433)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (20-437)||(39716-40134)
scaffold0080 (201-338)||(19883-20017)
scaffold0080 (37-182)||(18870-19015)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (53-419)||(3103-3475)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (20-431)||(8438-8847)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (20-431)||(1654-2067)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (59-426)||(15955-16323)
scaffold0120 (43-431)||(32864-33250)
scaffold0120 (43-431)||(45755-46141)
scaffold0120 (43-279)||(17388-17623)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (20-431)||(3273-3686)
scaffold0292 (20-431)||(147-558)
[»] scaffold0145 (4 HSPs)
scaffold0145 (59-427)||(32783-33153)
scaffold0145 (59-437)||(38602-38982)
scaffold0145 (116-339)||(9645-9867)
scaffold0145 (59-207)||(32317-32465)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (71-436)||(39331-39697)
scaffold0141 (20-74)||(37151-37204)
[»] scaffold0049 (2 HSPs)
scaffold0049 (71-436)||(75115-75481)
scaffold0049 (20-74)||(77608-77661)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (60-431)||(25738-26111)
scaffold0026 (96-431)||(39736-40073)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (20-425)||(4652-5059)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (20-364)||(128554-128897)
scaffold0031 (201-431)||(20330-20554)
scaffold0031 (25-178)||(65958-66109)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (20-437)||(8282-8697)
[»] scaffold0122 (3 HSPs)
scaffold0122 (116-363)||(44682-44929)
scaffold0122 (224-437)||(25964-26179)
scaffold0122 (342-437)||(33394-33491)
[»] scaffold0088 (2 HSPs)
scaffold0088 (20-431)||(20711-21127)
scaffold0088 (20-69)||(10118-10167)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (20-436)||(31869-32285)
scaffold0113 (59-87)||(31864-31892)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (59-437)||(6020-6404)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (20-278)||(4893-5150)
scaffold0395 (294-418)||(881-1006)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (20-336)||(28215-28533)
scaffold0046 (20-270)||(4353-4605)
scaffold0046 (20-270)||(1798-2050)
scaffold0046 (178-320)||(11252-11395)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (20-436)||(4514-4932)
scaffold0358 (375-436)||(95-156)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (20-436)||(13297-13716)
[»] scaffold0175 (4 HSPs)
scaffold0175 (20-273)||(76-329)
scaffold0175 (20-292)||(33924-34199)
scaffold0175 (269-431)||(13144-13308)
scaffold0175 (59-87)||(33919-33947)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (20-424)||(1751-2161)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (116-377)||(20644-20903)
[»] scaffold0023 (13 HSPs)
scaffold0023 (116-377)||(94308-94567)
scaffold0023 (116-377)||(44351-44611)
scaffold0023 (20-288)||(119677-119947)
scaffold0023 (224-377)||(17446-17598)
scaffold0023 (116-343)||(100278-100500)
scaffold0023 (116-343)||(40169-40391)
scaffold0023 (116-270)||(101404-101552)
scaffold0023 (40-275)||(38542-38777)
scaffold0023 (20-87)||(17886-17953)
scaffold0023 (20-87)||(17842-17909)
scaffold0023 (33-87)||(17930-17984)
scaffold0023 (145-182)||(17765-17802)
scaffold0023 (20-81)||(17804-17865)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (82-431)||(954-1304)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (123-363)||(116332-116571)
scaffold0022 (201-340)||(128967-129102)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (20-317)||(11464-11763)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (116-377)||(37718-37977)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (20-431)||(15370-15784)
scaffold0114 (37-278)||(7112-7352)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (116-377)||(136577-136836)
scaffold0028 (116-377)||(139046-139305)
scaffold0028 (116-377)||(143984-144243)
scaffold0028 (116-377)||(134108-134367)
scaffold0028 (116-377)||(141515-141774)
scaffold0028 (116-320)||(132563-132762)
scaffold0028 (220-343)||(62201-62321)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (20-431)||(10331-10744)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (116-376)||(13289-13547)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (116-377)||(40297-40556)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (116-377)||(13844-14103)
[»] scaffold0021 (5 HSPs)
scaffold0021 (59-278)||(121607-121827)
scaffold0021 (20-365)||(174567-174912)
scaffold0021 (355-431)||(124723-124801)
scaffold0021 (236-335)||(136370-136471)
scaffold0021 (236-335)||(145078-145179)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (116-377)||(4110-4371)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (116-377)||(11960-12214)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (195-437)||(22861-23104)
[»] scaffold0247 (3 HSPs)
scaffold0247 (20-430)||(17932-18345)
scaffold0247 (117-421)||(2088-2394)
scaffold0247 (36-87)||(2406-2456)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (146-430)||(16710-16995)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (20-436)||(1090-1507)
scaffold0106 (116-278)||(15298-15460)
scaffold0106 (145-436)||(7193-7484)
[»] scaffold0001 (6 HSPs)
scaffold0001 (117-421)||(85539-85845)
scaffold0001 (145-377)||(501003-501240)
scaffold0001 (123-343)||(160594-160809)
scaffold0001 (28-87)||(85857-85915)
scaffold0001 (36-87)||(500912-500963)
scaffold0001 (20-81)||(85820-85880)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (20-336)||(5132-5448)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (20-425)||(46796-47202)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (20-244)||(31961-32188)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (124-377)||(12-262)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (125-377)||(81978-82228)
scaffold0037 (123-343)||(22665-22880)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (20-436)||(16082-16500)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (20-253)||(27681-27913)
scaffold0130 (299-437)||(27912-28052)
[»] scaffold0007 (3 HSPs)
scaffold0007 (117-377)||(161095-161355)
scaffold0007 (300-421)||(164550-164674)
scaffold0007 (20-87)||(161367-161433)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (56-436)||(952-1333)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (18-244)||(2494-2722)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (35-336)||(51397-51699)
[»] scaffold0074 (2 HSPs)
scaffold0074 (124-377)||(38663-38916)
scaffold0074 (20-87)||(38936-39002)
[»] scaffold0454 (4 HSPs)
scaffold0454 (145-377)||(10692-10929)
scaffold0454 (20-86)||(10455-10520)
scaffold0454 (20-87)||(10585-10652)
scaffold0454 (20-81)||(10629-10690)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (195-377)||(4669-4850)
[»] scaffold0363 (3 HSPs)
scaffold0363 (145-377)||(9161-9398)
scaffold0363 (20-86)||(8924-8989)
scaffold0363 (20-87)||(9054-9121)
[»] scaffold0149 (5 HSPs)
scaffold0149 (145-339)||(29856-30050)
scaffold0149 (25-182)||(3546-3703)
scaffold0149 (25-182)||(7977-8134)
scaffold0149 (20-87)||(29749-29816)
scaffold0149 (20-81)||(29793-29854)
[»] scaffold0101 (2 HSPs)
scaffold0101 (123-324)||(1340-1537)
scaffold0101 (25-178)||(9123-9275)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (43-431)||(4343-4739)
[»] scaffold0494 (2 HSPs)
scaffold0494 (145-377)||(12255-12492)
scaffold0494 (20-87)||(12532-12599)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (145-377)||(11207-11444)
scaffold0029 (37-182)||(12578-12723)
scaffold0029 (20-81)||(11144-11205)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (124-320)||(15570-15764)
scaffold0261 (25-174)||(1144-1292)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (277-437)||(3428-3591)
[»] scaffold0461 (2 HSPs)
scaffold0461 (124-403)||(11370-11652)
scaffold0461 (20-87)||(11240-11307)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (124-403)||(38189-38471)
scaffold0124 (20-87)||(38534-38601)
[»] scaffold0042 (3 HSPs)
scaffold0042 (235-431)||(24206-24406)
scaffold0042 (37-182)||(35074-35218)
scaffold0042 (20-57)||(24403-24440)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (25-270)||(36260-36503)
[»] scaffold0165 (5 HSPs)
scaffold0165 (40-242)||(3337-3539)
scaffold0165 (40-242)||(7401-7603)
scaffold0165 (113-421)||(27663-27969)
scaffold0165 (375-429)||(3641-3695)
scaffold0165 (375-429)||(7705-7759)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (223-377)||(4300-4453)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (113-421)||(16014-16320)
scaffold0357 (236-421)||(13147-13336)
scaffold0357 (201-263)||(2650-2707)
[»] scaffold0184 (4 HSPs)
scaffold0184 (145-320)||(1087-1263)
scaffold0184 (20-87)||(1347-1414)
scaffold0184 (20-87)||(1303-1370)
scaffold0184 (20-81)||(1265-1326)
[»] scaffold0034 (6 HSPs)
scaffold0034 (20-137)||(116718-116835)
scaffold0034 (116-340)||(32437-32658)
scaffold0034 (20-135)||(116823-116938)
scaffold0034 (28-137)||(116935-117044)
scaffold0034 (57-140)||(117025-117108)
scaffold0034 (236-387)||(51833-51985)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (116-343)||(19166-19390)
scaffold0102 (37-122)||(48661-48746)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (25-275)||(69599-69848)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (113-343)||(10536-10762)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (116-343)||(6436-6661)
scaffold0621 (116-364)||(8370-8613)
[»] scaffold0084 (2 HSPs)
scaffold0084 (20-168)||(10101-10247)
scaffold0084 (375-436)||(10323-10384)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (25-270)||(19786-20029)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (116-343)||(14692-14916)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (33-275)||(23658-23897)
[»] scaffold0628 (2 HSPs)
scaffold0628 (116-343)||(2801-3022)
scaffold0628 (116-158)||(3283-3324)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (116-270)||(1102-1256)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (116-270)||(6510-6664)
scaffold0333 (116-270)||(13890-14044)
[»] scaffold0278 (3 HSPs)
scaffold0278 (43-139)||(7386-7482)
scaffold0278 (116-343)||(5547-5769)
scaffold0278 (40-140)||(7486-7585)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (116-339)||(45791-46010)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (116-323)||(23898-24101)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (116-343)||(2640-2861)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (116-343)||(31-255)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (25-275)||(7880-8129)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (116-270)||(15845-15999)
scaffold0020 (25-275)||(178705-178952)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (202-324)||(6137-6259)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (113-340)||(10426-10650)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (116-343)||(129808-130031)
scaffold0010 (201-430)||(60620-60848)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (37-316)||(192997-193277)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (124-343)||(945-1158)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (201-398)||(53487-53681)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (116-320)||(32003-32202)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (116-335)||(12665-12884)
[»] scaffold0671 (1 HSPs)
scaffold0671 (24-182)||(5898-6056)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (116-342)||(12472-12693)
[»] scaffold0096 (2 HSPs)
scaffold0096 (90-166)||(20881-20957)
scaffold0096 (25-174)||(16513-16661)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (116-293)||(6721-6889)
scaffold0556 (292-340)||(8090-8138)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (116-335)||(12842-13057)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (40-178)||(18056-18193)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (116-293)||(28813-28986)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (201-299)||(11952-12044)
[»] scaffold0297 (2 HSPs)
scaffold0297 (40-275)||(15742-15976)
scaffold0297 (25-178)||(10681-10830)
[»] scaffold0174 (1 HSPs)
scaffold0174 (25-182)||(18610-18767)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (112-270)||(984-1135)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (282-431)||(6675-6826)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (25-182)||(10299-10456)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (116-398)||(7997-8277)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (175-293)||(8118-8233)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (116-335)||(103632-103848)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (40-267)||(4875-5104)
[»] scaffold0634 (1 HSPs)
scaffold0634 (43-101)||(4894-4952)
[»] scaffold0484 (3 HSPs)
scaffold0484 (40-121)||(466-547)
scaffold0484 (375-429)||(1074-1128)
scaffold0484 (91-242)||(539-688)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (20-78)||(20471-20529)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (40-182)||(14482-14624)
scaffold0081 (40-182)||(38922-39064)
scaffold0081 (40-182)||(23498-23640)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (116-278)||(30235-30392)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (292-419)||(225482-225611)
scaffold0012 (116-218)||(225353-225455)
[»] scaffold0423 (1 HSPs)
scaffold0423 (28-82)||(18-72)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (37-275)||(21866-22105)
scaffold0210 (37-275)||(29758-29997)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (37-182)||(1696-1842)
[»] scaffold0697 (1 HSPs)
scaffold0697 (123-163)||(6506-6546)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (25-108)||(32251-32334)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (232-294)||(25121-25184)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (37-163)||(281071-281196)
scaffold0005 (201-339)||(267649-267784)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (221-323)||(29558-29660)
[»] scaffold1655 (1 HSPs)
scaffold1655 (20-69)||(1193-1242)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (394-431)||(17892-17929)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (201-262)||(1874-1930)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (83-141)||(6361-6418)
scaffold0158 (37-141)||(2649-2752)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (238-287)||(206575-206624)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (299-343)||(2213-2257)
[»] scaffold0780 (1 HSPs)
scaffold0780 (37-73)||(4870-4906)
[»] scaffold0447 (1 HSPs)
scaffold0447 (37-69)||(14401-14433)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (37-69)||(12396-12428)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (305-377)||(13092-13164)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 92)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 20 - 437
Target Start/End: Original strand, 24529023 - 24529442
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24529023 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcataaagcccccatcgctatttgagctaaagctccatcgtattaagtacaaagctc 24529122  T
Q  120 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 219  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  24529123 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcaacctcttaaacatcttaaatcgacaaactcttatataatccaataatttggaact 24529222  T
Q  220 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24529223 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataatgatatcaaat 24529322  T
Q  320 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 417  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24529323 gcaagtcaacaacatcttaattatacattcatatctcaagtaatgcttataacattatatcacatcatattcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 24529422  T
Q  418 agattataattaacttcatc 437  Q
    |||||||| ||||| |||||    
T  24529423 agattatagttaacatcatc 24529442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 20 - 437
Target Start/End: Original strand, 9077757 - 9078174
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    |||||||||||| |||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  9077757 catcaagcccccatcgctata--agtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaggctc 9077854  T
Q  120 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 219  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  9077855 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttagaacaacaacctcttatataatccaataatttggaaca 9077954  T
Q  220 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 319  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  9077955 tcatcatcttcatcaacttagactgacccatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaagt 9078054  T
Q  320 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 417  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9078055 gcaagtcaacaacatctcaattatacattcataactcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 9078154  T
Q  418 agattataattaacttcatc 437  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  9078155 agattataattaacatcatc 9078174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 17 - 437
Target Start/End: Original strand, 25421330 - 25421754
Alignment:
Q  17 ggacatcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccc-catcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaa 115  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  25421330 ggacatcaaacccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccccccatcgctaattgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaa 25421429  T
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  25421430 gctccagggcataaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcataattcgacaacctcttatataatccaataaattgg 25421529  T
Q  216 -aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 314  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421530 aaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 25421629  T
Q  315 caaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagc 412  Q
    ||| |||||| ||||| ||||| |||||| || | |||  |||||||||||  |||| ||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  25421630 caattgcaagtcaacagcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagc 25421729  T
Q  413 ttcacagattataattaacttcatc 437  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  25421730 ttcacagattataattaacatcatc 25421754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 20 - 436
Target Start/End: Original strand, 24493371 - 24493789
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24493371 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctc 24493470  T
Q  120 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg-aac 218  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  24493471 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttatttcgacaacctcttatataatccaataatttggaaac 24493570  T
Q  219 ttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 318  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  24493571 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaagtaacaatagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaa 24493669  T
Q  319 tgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttca 416  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| || | |||  |||||| ||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  24493670 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtgatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacatatcttaaatagcttca 24493769  T
Q  417 cagattataattaacttcat 436  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  24493770 cagattataattaacatcat 24493789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 20 - 437
Target Start/End: Original strand, 25431197 - 25431616
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25431197 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttctagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctc 25431296  T
Q  120 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg-aac 218  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||    
T  25431297 caggccatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataaattggaaac 25431396  T
Q  219 ttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 318  Q
     ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25431397 atcatcatcttcat-aaattagaccgactcatgcatcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaat 25431495  T
Q  319 tgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttca 416  Q
    |||||| ||||||||||| |||| | || | |||  |||||||||||  |||| ||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  25431496 tgcaagtcaacaacatcttaaatgttcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttca 25431595  T
Q  417 cagattataattaacttcatc 437  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  25431596 cagattataattaacatcatc 25431616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 20 - 431
Target Start/End: Original strand, 1096271 - 1096683
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||| ||||    
T  1096271 catcaagcccccatcgctatta-agtattaatatactttcagggcatcaagcccc-atcgctatttgagctaaagctccatcatgttgagcacaaggctc 1096368  T
Q  120 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaa-c 218  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  1096369 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaac 1096468  T
Q  219 ttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 318  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1096469 atcaacatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggtagtatgcaaaaacaacataacataataatatcaaa 1096568  T
Q  319 tgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttca 416  Q
    |||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  1096569 tgcaaatcaacaacatctcacatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttca 1096668  T
Q  417 cagattataattaac 431  Q
     || |||||||||||    
T  1096669 taggttataattaac 1096683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 20 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 23390814 - 23390401
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||   ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  23390814 catcaagcccccatcactatttgagtattaatatacttccagggtatcaagcccccatcactgaatgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctc 23390715  T
Q  120 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 219  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  23390714 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaca 23390615  T
Q  220 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23390614 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 23390515  T
Q  320 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 417  Q
    ||||  || |||||||| |||||| ||   ||   |||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  23390514 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaatagcttcac 23390415  T
Q  418 agattataattaac 431  Q
    ||||||||||||||    
T  23390414 agattataattaac 23390401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 21997852 - 21997548
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||    
T  21997852 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcataaagcccccatcgctatttgagctcaagctccatcatgttgagtacaaagctc 21997753  T
Q  120 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 219  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  21997752 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaaca 21997653  T
Q  220 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21997652 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 21997553  T
Q  320 gcaag 324  Q
    |||||    
T  21997552 gcaag 21997548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 20 - 437
Target Start/End: Original strand, 13095297 - 13095716
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  13095297 catcaagccctcatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctatttgagctaaagctccatcctgttgagtacaaagctc 13095396  T
Q  120 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg-aac 218  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  13095397 cagggcatcaagcccccaacagtgaaatgctaatgcatggacttgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaac 13095496  T
Q  219 ttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 318  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||    
T  13095497 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataacaatagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacatattgatatcaaa 13095595  T
Q  319 tgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttca 416  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| || | |||  |||| |||||   |||| ||  ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  13095596 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaaataatgtacataacattatatcacatcgtaatcaacatcaacatatcttaaacaacttca 13095695  T
Q  417 cagattataattaacttcatc 437  Q
    || |||||||||||| |||||    
T  13095696 catattataattaacatcatc 13095716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 20 - 437
Target Start/End: Original strand, 13025113 - 13025532
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    |||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  13025113 catcaagctctcatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcactatttgagctaaagctccatcctgttgagtacaaagctc 13025212  T
Q  120 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg-aac 218  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  13025213 cagggcatcaagcccccaacagtgaaatgctaatgcatggacttgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaac 13025312  T
Q  219 ttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 318  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||    
T  13025313 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataacaatagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacatattgatatcaaa 13025411  T
Q  319 tgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttca 416  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| || | |||  |||| |||||   |||| ||  ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  13025412 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaaataatgtacataacattatatcacatcgtaatcaacatcaacatatcttaaacaacttca 13025511  T
Q  417 cagattataattaacttcatc 437  Q
    || |||||||||||| |||||    
T  13025512 catattataattaacatcatc 13025532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 20 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 8287163 - 8286747
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||| |||  || ||||||||||    
T  8287163 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcctccatcgctaatttgagctaaagctccaacgtggtgggtacaaagct 8287064  T
Q  119 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaa 217  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||| | |||| ||||||||||    
T  8287063 ccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcataattcgacaaccacttatattagtccagtaatttggaa 8286964  T
Q  218 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtataca-aaaacaacatgacataataatatca 316  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  8286963 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaaacagcatgacataataatatca 8286864  T
Q  317 aatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagctt 414  Q
    | |||||  || |||||||| |||||  ||  |||   |||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8286863 attgcaattcatcaacatcttaaataatcaaacattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 8286764  T
Q  415 cacagattataattaac 431  Q
    |||| | ||||||||||    
T  8286763 cacataatataattaac 8286747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 116 - 430
Target Start/End: Original strand, 22412083 - 22412388
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22412083 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 22412182  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  22412183 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacgataacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatc 22412281  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttc 415  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22412282 aaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat--------aagtatgacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 22412373  T
Q  416 acagattataattaa 430  Q
    |||||||||||||||    
T  22412374 acagattataattaa 22412388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 20 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 21808708 - 21808384
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||    
T  21808708 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaaacccccatcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagct 21808609  T
Q  119 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  21808608 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaag-gctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaa 21808510  T
Q  218 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 317  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  21808509 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaa 21808410  T
Q  318 atgcaagacaacaacatctcaaatat 343  Q
     |||||  ||||||||||| ||||||    
T  21808409 ttgcaattcaacaacatcttaaatat 21808384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 20 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 21729384 - 21729059
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||    
T  21729384 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaaacccccatcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagct 21729285  T
Q  119 ccaaggcatcaagccccc-aacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttgga 216  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  21729284 ccaaggcatcaagccccccaacaatgacg-gctaatgcatgaactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttgga 21729186  T
Q  217 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 316  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  21729185 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatca 21729086  T
Q  317 aatgcaagacaacaacatctcaaatat 343  Q
    | |||||  ||||||||||| ||||||    
T  21729085 attgcaattcaacaacatcttaaatat 21729059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 20 - 431
Target Start/End: Original strand, 22074822 - 22075235
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 118  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||  ||| | |||  |||||||||||||    
T  22074822 catcaagcccccatcactatctgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaatactcaaacgtggtgagtacaaagct 22074921  T
Q  119 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||  | |||||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  22074922 ccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaagcatct--attcgacaacctcttatattagtccaataatttggaa 22075018  T
Q  218 cttcatcat-cttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 316  Q
    | ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22075019 catcatcattcttcaacaacttagaccgactcattcagcttagttaaataacaacagcaacataggaagtatacaaaatcaacatgacataataatatca 22075118  T
Q  317 aatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagctt 414  Q
    | |||||  ||||||||||| |||||| ||   |   |||||||||||| || || ||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  22075119 attgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagctt 22075218  T
Q  415 cacagattataattaac 431  Q
    |||| ||||||||||||    
T  22075219 cacatattataattaac 22075235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Original strand, 29329831 - 29330090
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  29329831 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttcg 29329929  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29329930 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 29330028  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  29330029 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 29330090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 113 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 10733208 - 10732946
Alignment:
Q  113 aaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatt 212  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10733208 aaagctcaagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatt 10733110  T
Q  213 tggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataat 312  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10733109 tggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataat 10733011  T
Q  313 atcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  10733010 atcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 10732946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 42245630 - 42245371
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42245630 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 42245532  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42245531 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 42245433  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  42245432 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 42245371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 123 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 11581458 - 11581205
Alignment:
Q  123 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11581458 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaagtcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgaaaacctcttatataatccaataatttggaacttca 11581359  T
Q  223 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 322  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11581358 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 11581260  T
Q  323 agacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    || ||| ||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||  |||| ||||||    
T  11581259 agtcaataacgtctcaattattcacgtataattcaagtaatgtatatacaattat 11581205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 265033 - 264774
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  265033 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcaacaacctcttatataatccaataatttgg 264935  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  264934 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 264836  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  264835 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 264774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 116 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 2154879 - 2154658
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2154879 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 2154781  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2154780 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 2154682  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaa 339  Q
    || |||||| ||||||| ||||||    
T  2154681 aactgcaagtcaacaacgtctcaa 2154658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Original strand, 20908909 - 20909168
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20908909 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcaacaacctcttatataatccaataatttgg 20909007  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20909008 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaaagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 20909106  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  20909107 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 20909168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Original strand, 29345877 - 29346136
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29345877 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 29345975  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29345976 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaacagcatcacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 29346074  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  29346075 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 29346136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Original strand, 32027290 - 32027549
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32027290 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 32027388  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32027389 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaacaacaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 32027487  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    |||| |||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  32027488 aaatccaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 32027549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 20 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 19661154 - 19660879
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||    
T  19661154 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagct 19661055  T
Q  119 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttggaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  19661054 ccatggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcaacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaa 19660956  T
Q  218 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaa 293  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||    
T  19660955 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 19660879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 116 - 376
Target Start/End: Original strand, 39245033 - 39245291
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39245033 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttagt-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 39245131  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39245132 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 39245230  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaatta 376  Q
    ||||||||| ||| ||| || ||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| |||||    
T  39245231 aaatgcaagtcaataacgtcccaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaatta 39245291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Original strand, 29348350 - 29348609
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29348350 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 29348448  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29348449 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataagaacagcatcacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 29348547  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  29348548 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 29348609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 20 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 21293289 - 21292870
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 117  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||    
T  21293289 catcaagtccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagc 21293190  T
Q  118 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttgga 216  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| || | ||||||||||||||    
T  21293189 tccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaattcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttaaattagtccaataatttgga 21293091  T
Q  217 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 316  Q
    || |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||  |||||  |||||||||||||||||    
T  21293090 acatcatcatcttcaacatcttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaac--aaacagtatgacataataatatca 21292993  T
Q  317 a-atgc-aagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat-tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagct 413  Q
    | || | ||  || |||||||| |  |||||| | ||   ||||||||||| || | | | |||||||||||||||| || ||| | |||||| ||| ||    
T  21292992 atattcaaattcatcaacatcttaggtatacaattattcttcaagtaatgcataaacattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacaact 21292893  T
Q  414 tcacagattataattaacttcat 436  Q
    |||||||||||||||||| ||||    
T  21292892 tcacagattataattaacctcat 21292870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 10775942 - 10775681
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10775942 gctccagggcatcaagcccccaacaatgtaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 10775843  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  10775842 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgacagcgacac-agcagtatataaaaccagcatgacataataatatc 10775744  T
Q  316 aaatgcaagacaa-caacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||| ||| ||   |||| |||| |||||| |||| ||||||    
T  10775743 aaatgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattat 10775681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 123 - 377
Target Start/End: Original strand, 29350830 - 29351082
Alignment:
Q  123 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29350830 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttca 29350928  T
Q  223 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 322  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29350929 tcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataagaacagcatcacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 29351027  T
Q  323 agacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    || ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  29351028 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 29351082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 145 - 377
Target Start/End: Original strand, 39363310 - 39363540
Alignment:
Q  145 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccg 244  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39363310 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaa-tcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccg 39363408  T
Q  245 actcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatata 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||     
T  39363409 actcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 39363507  T
Q  345 cattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  39363508 cacatataattcaagtaatgcatatacaattat 39363540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 365
Target Start/End: Original strand, 37723704 - 37724049
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 117  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| | || |||||| |||  ||||||||||||    
T  37723704 catcaagcccccatcgctattcgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattttgagcaaatgctccaacgtggtgagtacaaagc 37723803  T
Q  118 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctatta-tataatccaataatttgga 216  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| | || ||||||||||||||    
T  37723804 tccagggcatcaagcccccaactatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttaatttagtccaataatttgga 37723902  T
Q  217 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||   |||| |||||||| || |||||    
T  37723903 acttcaacatcttcaacatcttagactgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatac---aacagcatgacatgattatatc 37723999  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgc 365  Q
    ||||  ||  || |||||||||||  || ||||||||| |||||||||||    
T  37724000 aaattaaattcatcaacatctcaatcattcattcataattcaagtaatgc 37724049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 123 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 36155039 - 36154789
Alignment:
Q  123 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 222  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  36155039 ggcatcaagccctcaactttaaaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaaactcttgtataatccaataatttggaacttca 36154940  T
Q  223 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 322  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36154939 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa---caacac-agcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 36154844  T
Q  323 agacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    || ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  36154843 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 36154789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 116 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 20918212 - 20918017
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  20918212 gctccagggcatcaagcccccaacactgaaatgctaatgcatga-ctcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaatagtttgg 20918115  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  20918114 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacaaaataatat 20918017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 144 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 20902248 - 20902053
Alignment:
Q  144 aaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttca-tcaacttagac 242  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  20902248 aaatgctaatgtatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacaacctcttaaatagtccaataatttggaacttcatcatcttaattcaacttagac 20902149  T
Q  243 cgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaa 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  20902148 cgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaagtgcaagtcaacaacgtctcaa 20902053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 124 - 324
Target Start/End: Original strand, 23064415 - 23064614
Alignment:
Q  124 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 223  Q
    |||||||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||    
T  23064415 gcatcaagcccctatcgctgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaaccccat 23064514  T
Q  224 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 323  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  23064515 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacgacac-agtagtatacaaaaacagcatgacctaataatatcaaatgcaa 23064613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 124 - 324
Target Start/End: Original strand, 31060974 - 31061171
Alignment:
Q  124 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 223  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  31060974 gcatcaagctcccaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaac-tcttgtataatccaataatttggaacttcat 31061071  T
Q  224 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 323  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31061072 catcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaaaac-agtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 31061170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 126 - 324
Target Start/End: Original strand, 38619337 - 38619537
Alignment:
Q  126 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacc---tcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 222  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||    
T  38619337 atcaagcccctatcactgaaatgctaatgcatggactcgactaattcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatcaaataatttggaacctca 38619436  T
Q  223 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 322  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38619437 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacgacac-agtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 38619535  T
Q  323 ag 324  Q
    ||    
T  38619536 ag 38619537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 123 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 18319290 - 18319039
Alignment:
Q  123 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 222  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||      
T  18319290 ggcatcaagccctcaactttaaaatgataatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaattgacaaactcttgtataatccaataatttggaactt-- 18319193  T
Q  223 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 322  Q
     |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18319192 -catcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacac-agcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 18319095  T
Q  323 agacaa-caacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    || ||| |||| |||||| ||| ||   |||| |||| |||||| |||| ||||||    
T  18319094 agtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattat 18319039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 123 - 324
Target Start/End: Original strand, 24067013 - 24067210
Alignment:
Q  123 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 222  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||       
T  24067013 ggcatcaagccctcaactttaaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaattgacaaactcttgtataatccaataatttggaact--- 24067109  T
Q  223 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 322  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24067110 tcatcttaatcaacttagaccgaccaatgcagcttggttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 24067208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 124 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 20806998 - 20806845
Alignment:
Q  124 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 223  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||    
T  20806998 gcatcaagcccccaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgaattcttaaacatcttaaatcgacaac-tcttgtataatccaataatttggaaattcat 20806901  T
Q  224 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac 279  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  20806900 catcttaatcaacatagaccgactcatgcagcttaattaaataacaacagcgacac 20806845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 145 - 315
Target Start/End: Original strand, 36314504 - 36314675
Alignment:
Q  145 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagacc 243  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  36314504 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttatattaatccaataatttggaacatcatcatcttcaacatcttagacc 36314603  T
Q  244 gactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  36314604 gactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 36314675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 25 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 22107926 - 22107709
Alignment:
Q  25 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 123  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||| |    
T  22107926 agcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagg 22107828  T
Q  124 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaacttca 222  Q
    ||||  ||||||||||||    ||| ||||||||  ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||    
T  22107827 gcat-gagcccccaacaaatgtatgttaatgcatagactcgacttcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatca 22107729  T
Q  223 tcatcttcatcaacttagac 242  Q
    | |||||||  |||||||||    
T  22107728 ttatcttcaaaaacttagac 22107709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 147 - 430
Target Start/End: Original strand, 40725782 - 40726069
Alignment:
Q  147 tgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccga 245  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||| | |||| ||||||    
T  40725782 tgctaatgcatggactcgacttcttaaacgtcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacatcaacatcttcaacgacttggaccga 40725881  T
Q  246 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatata 344  Q
    |||||||||||||||||  |||  | |||||||  | ||||||| | ||| || ||||| |||||||||||  | | |||  ||||||||||||||||      
T  40725882 ctcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgc-aaagcatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataat 40725980  T
Q  345 cattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 430  Q
    ||   |||| ||||||||||| |||| |||  |||||||| |||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||| || |||||    
T  40725981 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagcttcacagatcatcattaa 40726069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 145 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 17517400 - 17517174
Alignment:
Q  145 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat------catcttcatcaactt 238  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||| ||||      |||||| ||||||||    
T  17517400 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacgacctcttaaatagtccaataatttgaaacatcattatcaacatcttaatcaactt 17517301  T
Q  239 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctca 338  Q
    |||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| || | ||||  ||||  |||| || ||||||| ||||||||  ||||  ||||||||||| |    
T  17517300 agactgactcatgcaacttagtttaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaatcgcaattcaacaacatctta 17517201  T
Q  339 aatatacattcataactcaagtaatgc 365  Q
    ||||| || | ||| ||||||||||||    
T  17517200 aatattcaataatatctcaagtaatgc 17517174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 116 - 343
Target Start/End: Original strand, 21565445 - 21565668
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttg 214  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  | | || |||||| || |||| | ||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  21565445 gctccagggcgtcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggtcacaacatcttaa-caacttagaacgacaacctcttaaataagtccaataatttg 21565542  T
Q  215 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataata 313  Q
    |||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||||    
T  21565543 gaacatcatcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtat-ccaaatcatcatgatataacaata 21565638  T
Q  314 tcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 343  Q
    || |||||||| || |||||| ||||||||    
T  21565639 tcgaatgcaagtcatcaacatttcaaatat 21565668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 25 - 275
Target Start/End: Original strand, 26703882 - 26704129
Alignment:
Q  25 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaagg 124  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  26703882 agcccccatcgctatttgagtattaatatacctccagggcat-aagcccccatcgctatt-gagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccaggg 26703979  T
Q  125 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt---c 221  Q
    |||  ||||||||||||    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||   |||| |  | || |||| | |||||||||||| ||  ||   |    
T  26703980 cat-gagcccccaacaaatctatgctaatgcatggactcaatctcttaaacatc-acaatc-atcatctcttat-ttatccaataatttagaggttcaac 26704075  T
Q  222 atcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 275  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  26704076 atcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagca 26704129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 25 - 275
Target Start/End: Original strand, 26973615 - 26973862
Alignment:
Q  25 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaagg 124  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  26973615 agcccccatcgctatttgagtattaatatacctccagggcat-aagcccccatcgctatt-gagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccaggg 26973712  T
Q  125 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt---c 221  Q
    |||  ||||||||||||    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||   |||| |  | || |||| | |||||||||||| ||  ||   |    
T  26973713 cat-gagcccccaacaaatctatgctaatgcatggactcaatctcttaaacatc-acaatc-atcatctcttat-ttatccaataatttagaggttcaac 26973808  T
Q  222 atcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 275  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  26973809 atcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagca 26973862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 112 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 21329719 - 21329541
Alignment:
Q  112 caaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataa 210  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||  || || | ||||| |   ||||||| |||||||| | ||||||    
T  21329719 caaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaactcaacc-tcttaga---acaacctcttatataaattcaataa 21329625  T
Q  211 tttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaa 293  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||    
T  21329624 tttggaacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 21329541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 116 - 419
Target Start/End: Original strand, 22143951 - 22144254
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatata---atccaataatt 212  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| | |   | |||| |||| | | ||||||| |||||||   |||||||||||    
T  22143951 gctccagggcatcaagccctcaacaatgaa-tgctaatgcatggactcaaacaactcaacaacttagaacaacaacctcttatatatatatccaataatt 22144049  T
Q  213 tggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataa 311  Q
    ||||||   ||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | | ||||| ||||| |||||||| |||| ||    
T  22144050 tggaac---atcttctt--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacatcaacataggtagtatgcaaaa-caacatgatataacaa 22144143  T
Q  312 tatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatctta-aa 408  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||| || |||  |||| ||||||||||| |||| |||  ||||||||  ||| |||||||||  ||||||| ||    
T  22144144 tatcaattgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattgtaaacaacatcaattcatcttataa 22144243  T
Q  409 cagcttcacag 419  Q
    || ||||||||    
T  22144244 caacttcacag 22144254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 116 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 26012255 - 26012033
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatata-atccaataattt 213  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || | ||  ||||| | ||||| || | ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  26012255 gctccagggcatcaaacccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaacc-tcttataaacaacaacctcttatatatatccaataattt 26012158  T
Q  214 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataat 312  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | ||||||| | ||| |||||||| |||| |||    
T  26012157 ggaacatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaagcaacatgatataacaat 26012061  T
Q  313 atcaaatgcaagacaacaacatctcaaa 340  Q
    ||||||||  |  |||||||||||||||    
T  26012060 atcaaatgtgaatcaacaacatctcaaa 26012033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 283 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 20766174 - 20766035
Alignment:
Q  283 cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattatcacat 382  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        || ||  ||||    
T  20766174 cagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat--------aagtacgacat 20766084  T
Q  383 cataatcaacatcaaaacat-cttaaacagcttcacagattataattaa 430  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  20766083 cataatcaacatcaacacatcctaaaacagcttcacagattatcattaa 20766035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 123 - 270
Target Start/End: Original strand, 19668805 - 19668951
Alignment:
Q  123 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttc 221  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || | || |||||| || |||| | | ||||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||    
T  19668805 ggcatcaagcccccaagaatgaa-tgctaatgcatggacacaacatcttaa-caacttagaacaacaacctcttaaataagtccaataatttggaacatc 19668902  T
Q  222 atcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 270  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  19668903 atcatcatcatcaacttagaccgactcttgcagctcagttaaataacaa 19668951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 123 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 22959741 - 22959576
Alignment:
Q  123 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | || |||||| || |||| | | ||| | | ||||| | |||||||||||||||| |||    
T  22959741 ggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacatcttaa-caacttagaacaacatcatcttata-agtccaataatttggaacatca 22959645  T
Q  223 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaa 293  Q
    |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||    
T  22959644 tcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 22959576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 116 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 20027158 - 20026942
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataa-tccaataattt 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||  || || | ||||| || | || |||| |||||||| |||||||||||    
T  20027158 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcaacaactcaacc-tcttataaacaacgacctcttatataaatccaataattt 20027061  T
Q  214 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaa-acaacatgacataataa 311  Q
    | |||   ||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |   ||||| |||||||    
T  20027060 gaaac---atcttctt--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatccaaaacagttcatgatataataa 20026966  T
Q  312 tatcaaatgcaagacaacaacatc 335  Q
    ||||||||||||  ||||||||||    
T  20026965 tatcaaatgcaattcaacaacatc 20026942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 187 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 21502308 - 21502205
Alignment:
Q  187 acaacctattatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagca 284  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | |||    
T  21502308 acaacctcttatataaattcaataatttggaacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggca 21502209  T
Q  285 gtat 288  Q
    ||||    
T  21502208 gtat 21502205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 174
Target Start/End: Original strand, 23201164 - 23201312
Alignment:
Q  25 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 123  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  23201164 agcccccatcgttatttaagtattaatatacttccagtgcat-aagcccccatcgctaatttgagctaatgctccatcgtgttgagtacaaagctccagg 23201262  T
Q  124 gcatcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa 174  Q
    ||||  ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  23201263 gcat-gagcccccaacatatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaa 23201312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 40 - 174
Target Start/End: Original strand, 21873073 - 21873206
Alignment:
Q  40 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaa 138  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||| |||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||  |||||||||    
T  21873073 ttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccattgctaatttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggcat-gagcccccaa 21873170  T
Q  139 ca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa 174  Q
    || |||  ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  21873171 catatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaa 21873206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 321 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 21986164 - 21986046
Alignment:
Q  321 caagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaatt--atcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcaca 418  Q
    |||| |||||||||||  | |||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||  ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  21986164 caagtcaacaacatcttcattataaattcatatctcaagtaatgcatataacattttatcacctcatattcaacatcaacacatcttaaacaacttcaca 21986065  T
Q  419 gattataattaacttcatc 437  Q
     |||||| ||||| |||||    
T  21986064 aattatagttaacatcatc 21986046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 71 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 23501622 - 23501402
Alignment:
Q  71 cccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctc 169  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||    ||||||||||||| |||||| |||    
T  23501622 cccccatcgctattttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggcatga-gcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatctc 23501524  T
Q  170 ttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt---catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaata 266  Q
    ||||||||| ||||   |  | ||  ||| | |||||||| ||||||| ||   ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||| ||||||||    
T  23501523 ttaaacatcataaa--catcatctcgtat-ttatccaatattttggaagttcaacatcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaata 23501427  T
Q  267 acaacagcaacacaagcagtataca 291  Q
    |||| |||| |||| |||| |||||    
T  23501426 acaatagcagcacaggcagaataca 23501402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 37 - 174
Target Start/End: Original strand, 23571893 - 23572029
Alignment:
Q  37 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccc 135  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||| | |||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  23571893 tatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaatttaagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccc 23571990  T
Q  136 caacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa 174  Q
     |||||    ||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  23571991 aaacaaatgtatgctaatgcatggactcaatctcttaaa 23572029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 40 - 182
Target Start/End: Original strand, 14078969 - 14079111
Alignment:
Q  40 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaa 138  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||| | |||||  |||||||||    
T  14078969 ttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgttaatttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctctagggcat-gagcccccaa 14079066  T
Q  139 ca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 182  Q
    || |||  ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  14079067 cacatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatcttaa 14079111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 231 - 430
Target Start/End: Original strand, 18418594 - 18418793
Alignment:
Q  231 atcaacttagaccgactcatgcagcttagtt-aaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaac 329  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||  |||||  | ||    
T  18418594 atcaacttagactgactcgtgcaacttagttaaaataacaacatcaacataggcagtatac--aaacagcatgacataataatatcatttgcaattc-ac 18418690  T
Q  330 aacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatctt-aaacagcttcacagattataa 426  Q
    |||||||  ||||| || | | |  ||||||||||   | || ||  |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18418691 aacatct-taatattcaataaaacttcaagtaatgtacacaacattatatcacatcataatcaatgtcaaaacatcttaaaacagcttcacaggttataa 18418789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 375 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 22107334 - 22107278
Alignment:
Q  375 tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaac 431  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22107334 tatcacatcataatcaacaacaacacaccttaaacagcttcacagattataattaac 22107278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Original strand, 23064330 - 23064396
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  23064330 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctatttga 23064396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Original strand, 36314353 - 36314420
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  36314353 catcaagcccctatcgctatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaatcgctatttga 36314420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 123 - 181
Target Start/End: Original strand, 14047988 - 14048046
Alignment:
Q  123 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta 181  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14047988 ggcatcaagccctcaactttaaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta 14048046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 26740789 - 26740705
Alignment:
Q  190 acctattatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 278  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||   | ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  26740789 acctcttatataactccaataatttggaac---aacatctt--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaaca 26740705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 18770304 - 18770179
Alignment:
Q  37 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccc 135  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||| ||||| || |||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  18770304 tattttagtattaatatactttcagggcatgag-cccccatcgttattttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccc 18770207  T
Q  136 caacaatgaaatgctaatgcatgaactc 163  Q
    ||||||    ||||||||||||| ||||    
T  18770206 caacaaatgtatgctaatgcatggactc 18770179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Original strand, 40725673 - 40725740
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||    
T  40725673 catcaagcccctatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgctatttga 40725740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 41095918 - 41095852
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  41095918 catcaagcccctatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctatttga 41095852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 41095961 - 41095895
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  41095961 catcaagcccctatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctatttga 41095895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 27989061 - 27989004
Alignment:
Q  201 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaa 263  Q
    |||||||||||||||||| |||||||     ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27989061 aatccaataatttggaacatcatcat-----tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaa 27989004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 86
Target Start/End: Original strand, 40725717 - 40725783
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttg 86  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| |||||||||||    
T  40725717 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgctatttg 40725783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 145 - 182
Target Start/End: Original strand, 18418528 - 18418565
Alignment:
Q  145 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaa 182  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18418528 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaa 18418565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 233 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 26732937 - 26732892
Alignment:
Q  233 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 278  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  26732937 caacatagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaaca 26732892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 85
Target Start/End: Original strand, 31060889 - 31060953
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt 85  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  31060889 catcaagcccctatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctattt 31060953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 278
Target Start/End: Original strand, 22032139 - 22032380
Alignment:
Q  37 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccc 135  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||| ||||| || |||| |||||||| |  |||||||||||||||| |||||  |||||     
T  22032139 tattttagtattaatatactttcagggcatgag-cccccatcgttattttgagctaatgctccatcatggtgagtacaaagctccagggcat-gagccct 22032236  T
Q  136 caacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt---catcatcttca 231  Q
    ||||||    ||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||| |||| |  | ||  ||||| |||||||||||||||  ||   ||||||||| |    
T  22032237 caacaaatgtatgctaatgcatggactcaatctcttaaaacatctt-aatc-atcatctcatatat-atccaataatttggaggttcaacatcatcttaa 22032333  T
Q  232 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 278  Q
    ||| |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||    
T  22032334 tcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcaaca 22032380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 127
Target Start/End: Original strand, 23511919 - 23512006
Alignment:
Q  40 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcat 127  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||  || ||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||    
T  23511919 ttgaatattaatatacttccagggcat-aagcccccatctttaatttgagctaaagctccatcgtggtgagtactaagctccagggcat 23512006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 41095747 - 41095692
Alignment:
Q  124 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctt 180  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  41095747 gcatcaagcctccaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaaacatctt 41095692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Original strand, 18418421 - 18418488
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||    
T  18418421 catcaagctccaatcgctatttgagtattattatacttccatagcatcaagccccaatcgctatttga 18418488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Original strand, 31060846 - 31060912
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  31060846 catcaaacccctatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctatttga 31060912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 33896035 - 33895953
Alignment:
Q  71 cccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatg 154  Q
    |||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||   |||  ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  33896035 cccccatcactatt-gagctaaagcttcatcgtgttgagtacaaagctccggagcagtaagcccccaactatgaaatgcaaatg 33895953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Original strand, 40725630 - 40725696
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  40725630 catcaagccccaatcgctatttaagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctatttga 40725696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 41095875 - 41095809
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| | | |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  41095875 catcaagcccctatcgctatttgagtatcattatact-ccagagcatcaaacccctatcgctatttga 41095809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 81
Target Start/End: Original strand, 18418465 - 18418526
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 81  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  18418465 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgct 18418526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 20807083 - 20807019
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt 85  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| || | ||||||||||    
T  20807083 catcaagcccctatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagccactatcgctattt 20807019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 21366907 - 21366839
Alignment:
Q  94 gctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactc 163  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    ||||||||||||| ||||    
T  21366907 gctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-aagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactc 21366839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 317
Target Start/End: Original strand, 21873277 - 21873350
Alignment:
Q  244 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 317  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| || | |||| |||||| | || |||||| | ||||||||||    
T  21873277 gactcatgcaacttagttaaataacaaaagcagcataggcaggatacaacatcagcatgacttcataatatcaa 21873350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 81
Target Start/End: Original strand, 23064373 - 23064433
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 81  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||    
T  23064373 catcaagcccctatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgct 23064433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 81
Target Start/End: Original strand, 39363247 - 39363308
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 81  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  39363247 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgct 39363308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 56
Target Start/End: Original strand, 38619293 - 38619329
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttact 56  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  38619293 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatact 38619329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 86)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 20 - 437
Target Start/End: Original strand, 34509583 - 34510002
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  34509583 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaaggacccatcgctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaatgctc 34509682  T
Q  120 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 219  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34509683 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaact 34509782  T
Q  220 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  34509783 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataatgatatcaaat 34509882  T
Q  320 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 417  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||     
T  34509883 gcaagtcaacaacatcttaattatacattcatatctcaagtaatgcttataacattatatcacatcatattcaacatcaacacatcttaaacagcttcaa 34509982  T
Q  418 agattataattaacttcatc 437  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  34509983 agattataattaacatcatc 34510002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 20 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 50210536 - 50210112
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttcc-agggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 118  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  50210536 catcaaacccccatcgctatttgagtattaatatactttcgagggcatcaaacccccatcgctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaatgct 50210437  T
Q  119 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaa- 217  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  50210436 ccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaa 50210337  T
Q  218 ---cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 314  Q
       | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50210336 catcatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 50210237  T
Q  315 caaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagc 412  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50210236 caaatgcaagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagc 50210137  T
Q  413 ttcacagattataattaacttcatc 437  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  50210136 ttcacagattataattaacatcatc 50210112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 20 - 437
Target Start/End: Original strand, 22532072 - 22532491
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    ||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  22532072 catcaagtccccatcggtatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcggtaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctc 22532171  T
Q  120 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 219  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  22532172 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaca 22532271  T
Q  220 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 319  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |    
T  22532272 tcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaatttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatccatt 22532371  T
Q  320 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 417  Q
    ||||  ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22532372 gcaattcaacaacatcttaaatattcattcataattcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 22532471  T
Q  418 agattataattaacttcatc 437  Q
    || | |||| |||| |||||    
T  22532472 agttcataaataacatcatc 22532491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 20 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 27251048 - 27250634
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||  ||  |||||||||||||    
T  27251048 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttctaggacatcaagcccccatcgctaatttgagctaaagctccaatgtggtgagtacaaagct 27250949  T
Q  119 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaa 217  Q
    ||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| | |||||||||||||||    
T  27250948 ccagggcatcaagcccctatcaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaatctcttatattagtccaataatttggaa 27250850  T
Q  218 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 317  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27250849 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 27250750  T
Q  318 atgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttc 415  Q
     |||||  || |||||||| |||||| ||   || | ||||||||||| || || ||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  27250749 ttgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttc 27250650  T
Q  416 acagattataattaac 431  Q
    ||||||||||||||||    
T  27250649 acagattataattaac 27250634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 20 - 431
Target Start/End: Original strand, 20134984 - 20135403
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  20134984 catcaagtccccatcgctatttgagtattaatatacttacagggcatcaagcccccatcgctaaatgatctaaagctccaacgtgttgagtataaagctc 20135083  T
Q  120 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 219  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||     
T  20135084 cagggcatcaagcccccaactatgaaatgctgatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatatagtccaataatttggaaca 20135183  T
Q  220 tcat------catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataata 313  Q
    ||||      |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||| || | ||||  ||||| |||| |||||||||||||||    
T  20135184 tcatcatcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaacaacaatagcagcataggcagattacaacaacatcatgacataataata 20135283  T
Q  314 tcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacag 411  Q
    |||  |||||  ||||||||||| || ||| || | | |  ||||||||||| || || ||  ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  20135284 tcatgtgcaattcaacaacatcttaagtattcaataaaacttcaagtaatgcatacaacattatatcatatcataatgaacatcaacacatcttaaacag 20135383  T
Q  412 cttcacagattataattaac 431  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  20135384 cttcacagattataattaac 20135403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Original strand, 31612209 - 31612469
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  31612209 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaaactcttatataatccaataatttgg 31612308  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31612309 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-tagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 31612407  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  31612408 aaatgcaagtcaacaacatctcagttattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 31612469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Original strand, 13988763 - 13989022
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13988763 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 13988861  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13988862 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 13988960  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  13988961 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 13989022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 21923556 - 21923297
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21923556 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 21923458  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21923457 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 21923359  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  21923358 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 21923297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 23594000 - 23593741
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23594000 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 23593902  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23593901 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 23593803  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  23593802 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattat 23593741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 21475352 - 21475093
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21475352 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 21475254  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21475253 aacttcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 21475155  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  21475154 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 21475093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Original strand, 29298034 - 29298292
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  29298034 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttga 29298132  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  29298133 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatga-ataataatatc 29298230  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  29298231 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 29298292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 124 - 377
Target Start/End: Original strand, 29776592 - 29776844
Alignment:
Q  124 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 223  Q
    |||||||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29776592 gcatcaagccccaatcgctgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcat 29776691  T
Q  224 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 323  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29776692 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaataacatgacataataatatcaaatgcaa 29776790  T
Q  324 gacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    | ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  29776791 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 29776844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 34 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 20847459 - 20847173
Alignment:
Q  34 cgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagc 132  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  20847459 cgctatttaagtattaatatacttccagggcatcaagccccaatcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagc 20847360  T
Q  133 ccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttca 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20847359 ccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttca 20847261  T
Q  232 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 319  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||    
T  20847260 acaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtacacaaaatcagcatgacataaatatatcaaat 20847173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 22123333 - 22123073
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22123333 gctccagggcatcaagcccccaacaacgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 22123235  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 314  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  22123234 aacttcatcatcttaatctacttagaccgactcatgcagcttagttaaatagcaaacagcaacacaa-cagtatacaaaaatagcatgacataataatat 22123136  T
Q  315 caaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    |||||||||| ||||||  |||||| ||| ||    ||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  22123135 caaatgcaagtcaacaatgtctcaattattcacatttaattcaagtaatgcatatacaattat 22123073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 25 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 22469014 - 22468604
Alignment:
Q  25 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 123  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |    
T  22469014 agcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtgttgggtactaagctccagg 22468916  T
Q  124 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaac---tt 220  Q
    |||| | |||||||||||  | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    |||||||  |||||| ||||| ||||||||||   ||    
T  22468915 gcatga-gcccccaacaaatatatgctaatgcatggactcgatctcttaaacatcttaatcaaacaacctcgtatatagtccaaaaatttggaacatctt 22468817  T
Q  221 catca---tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 317  Q
    |||||   |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||  ||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  22468816 catcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcaacataggcagattacaacaacagcatgacatcataatatcaa 22468717  T
Q  318 atgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttc 415  Q
     |||||  ||||||||||| || ||| || | ||| ||||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||    
T  22468716 ttgcaattcaacaacatcttaattattcaataatatctcaagtaatgcacataacattatatcacatcataat-tacatcagcacatcttaaacagcttc 22468618  T
Q  416 acagattataatta 429  Q
    ||||||||||||||    
T  22468617 acagattataatta 22468604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 118 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 45575108 - 45574848
Alignment:
Q  118 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa-catcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttgg 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  45575108 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaaacatcttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttgg 45575010  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    ||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |    
T  45575009 aacatcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatacc 45574910  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| |||  |   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  45574909 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattaacatataattcaagtaatgcatatacaattat 45574848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 160 - 430
Target Start/End: Original strand, 432952 - 433222
Alignment:
Q  160 actcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttag 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  432952 actcgacctcttaaacatcttaaattgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttag 433051  T
Q  260 ttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaag 359  Q
    ||||||   ||| |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||   |||| |||||    
T  433052 ttaaat---aacggcaacacaggcagtatacaaaaacatcaagacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatataattcaag 433148  T
Q  360 taatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 430  Q
    |||||| |||| |||  |||||||  |||| |||||||||| |||| |||| |||||| |||||| || |||||    
T  433149 taatgcatatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatcatcataaatcagctttacagatcatcattaa 433222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 38801707 - 38801297
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||  ||| |||||| |||  ||||||||||||    
T  38801707 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattttgagttaatgctccaacgtggtgagtacaaagc 38801608  T
Q  118 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttgga 216  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  38801607 tccagggcatcaagcccccaactatg-aatgcttatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttgga 38801509  T
Q  217 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    || |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| | |   |||| || |||||||| |||||    
T  38801508 acatcatcatcttcaacatcttaga-cgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtgtgc---aacagcaagacataattatatc 38801413  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat--cacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagct 413  Q
    |||| |||  || |||||| | | ||||||| | ||   ||||||||||| || || |||||  |||||| ||||||||| ||| | ||||||  |||||    
T  38801412 aaattcaattcatcaacatattatatatacaattattcttcaagtaatgcata-aacattataacacatcgtaatcaacaacaacatatcttattcagct 38801314  T
Q  414 tcacagattataattaa 430  Q
    ||||| |||||| ||||    
T  38801313 tcacaaattatagttaa 38801297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 144 - 418
Target Start/End: Original strand, 21346885 - 21347161
Alignment:
Q  144 aaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagacc 243  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21346885 aaatgctaatgcatggactcgaattcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagacc 21346984  T
Q  244 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaa-caacatctcaaata 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||    
T  21346985 gactcatgcagcttagttaaataacaacaaagacac-agcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaatcaacgtctcaatta 21347083  T
Q  343 tacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaa-cagcttcaca 418  Q
    | ||   |||| |||| |||||| |||| |||  |||||||  |||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  21347084 ttcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttcaca 21347161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 123 - 377
Target Start/End: Original strand, 21711612 - 21711865
Alignment:
Q  123 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 222  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  21711612 ggcatcaagccctcaactttaaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacattctaaatcgacaaactcttgtataatccaataatttggaacttca 21711711  T
Q  223 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 322  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  21711712 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacaa-tagtatacaaaaaaagcatgacagaataatatcaaatgca 21711810  T
Q  323 agacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    || ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||| ||||||| |||| ||||||    
T  21711811 agtcaacaacgtctcaattattcacatataaatcatgtaatgcctatacaattat 21711865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 124 - 377
Target Start/End: Original strand, 21707071 - 21707323
Alignment:
Q  124 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 223  Q
    ||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  21707071 gcatcaagccctcaactttaaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacattctaaatcgacaaactcttgtataatccaataatttggaacttcat 21707170  T
Q  224 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 323  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||    
T  21707171 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacaa-tagtatacaaaaaaagcatgacagaataatatcaaatgcaa 21707269  T
Q  324 gacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    | ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||| ||||||| |||| ||||||    
T  21707270 gtcaacaacgtctcaattattcacatataaatcatgtaatgcctatacaattat 21707323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 144 - 418
Target Start/End: Original strand, 21342021 - 21342296
Alignment:
Q  144 aaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagacc 243  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  21342021 aaatgctaatgcatggactcgaattcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg-acttcatcatcttaatcaacttagacc 21342119  T
Q  244 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaa-caacatctcaaata 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||    
T  21342120 gactcatgcagcttagttaaataacaacaaagacac-agcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaatcaacgtctcaatta 21342218  T
Q  343 tacattcataactcaagtaatgcgtataaaatt--atcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaa-cagcttcaca 418  Q
    | ||   |||| |||| |||||| |||| ||||  ||||||  |||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  21342219 ttcacaaataattcaattaatgcatatacaattacatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttcaca 21342296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 145 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 13213099 - 13212867
Alignment:
Q  145 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccg 244  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  13213099 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacatcatcatcttaatcaacttagaccg 13213000  T
Q  245 actcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaa-caacatctcaaatat 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||    
T  13212999 actcatgcagcttagttaaataacaacagcgacgcaa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaatcaacgtctcaattat 13212901  T
Q  344 acattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
     ||   |||| |||| |||||| |||| ||||||    
T  13212900 tcacaaataattcaattaatgcatatacaattat 13212867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 144 - 377
Target Start/End: Original strand, 16361835 - 16362073
Alignment:
Q  144 aaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatc------ttcatcaact 237  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||      || |||||||    
T  16361835 aaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacatcatcatcaacatcttaatcaact 16361934  T
Q  238 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctc 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  16361935 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacgacagcaacacaa-cagtatataaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctc 16362033  T
Q  338 aaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    || ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  16362034 aattattcacaaataattcaagtaatgcatatataattat 16362073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 145 - 377
Target Start/End: Original strand, 21840686 - 21840923
Alignment:
Q  145 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt------catcatcttcatcaactt 238  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |      || |||||| ||||||||    
T  21840686 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacaaccttttaaatagtccaataatttggaacattgttatcaacatcttaatcaactt 21840785  T
Q  239 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctca 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  21840786 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agcagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctca 21840884  T
Q  339 aatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    | ||| ||   |||| | ||||||||| |||| ||||||    
T  21840885 attattcacatataatttaagtaatgcatatataattat 21840923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 231
Target Start/End: Original strand, 21477445 - 21477656
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  21477445 catcaagcccctatcgctatttgagtattattatact-ccagggcatcaagcccctatcgctaattgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagctc 21477543  T
Q  120 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattat-ataatccaataatttggaac 218  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  21477544 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaac 21477643  T
Q  219 ttcatcatcttca 231  Q
     ||| ||| ||||    
T  21477644 atcaacattttca 21477656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 128 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 16275616 - 16275423
Alignment:
Q  128 caagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatc 227  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16275616 caagcccccaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacagc-tcttgtataatccaataatttagaacttcatcatc 16275519  T
Q  228 ttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaag 324  Q
    || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  16275518 ttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaacaacgaca-tagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaag 16275423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 203 - 431
Target Start/End: Original strand, 21026666 - 21026896
Alignment:
Q  203 tccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatg 302  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| || ||||    
T  21026666 tccaataatttggaacatcatcatcgtcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaatataggcagtatacaaaatcagcatg 21026765  T
Q  303 acataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaac 400  Q
    || |||  ||||||| |||||  ||||||||||| |||||| ||   |   |||||||||||| || || ||  ||||||||||||||||||| ||| ||    
T  21026766 acgtaaatatatcaattgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacagcaacac 21026865  T
Q  401 atcttaaacagcttcacagattataattaac 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21026866 atcttaaacagcttcacagattataattaac 21026896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 123 - 324
Target Start/End: Original strand, 40389060 - 40389257
Alignment:
Q  123 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 222  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||       
T  40389060 ggcatcaagccctcaactttaaaatgctaatgcatggactcgacctctttaacatcttaaattgacaaactcttgtataatccaataatttggaact--- 40389156  T
Q  223 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 322  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40389157 tcatcttaatcaacctagactgactcatgcaacttggttaaataacaacagcgacac-atcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 40389255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 275
Target Start/End: Original strand, 21714352 - 21714600
Alignment:
Q  25 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaagg 124  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  21714352 agcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccaggg 21714450  T
Q  125 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt---c 221  Q
    |||  ||||||||||||    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||   |||| |  | || |||| | |||||||||||||||  ||   |    
T  21714451 cat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatctcttaaacatc-acaatc-atcatctcttat-ttatccaataatttggaggttcaac 21714546  T
Q  222 atcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 275  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  21714547 atcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagca 21714600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 195 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 15860195 - 15860068
Alignment:
Q  195 ttatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaa 294  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  15860195 ttatataatccaataatttgga-cttcatcatcttaatcaacttggaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacac-agcagtatacaaaa 15860098  T
Q  295 acaacatgacataataatatcaaatgcaag 324  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15860097 acaacatgacataataatattaaatgcaag 15860068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 123 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 27161721 - 27161605
Alignment:
Q  123 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 222  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27161721 ggcatccagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactagacctcttaaacatcttaaatcgacaaactcttatataatccaataatttggaacttca 27161622  T
Q  223 tcatcttcatcaactta 239  Q
    |||||  ||||||||||    
T  27161621 tcatcaacatcaactta 27161605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 145 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 14295745 - 14295569
Alignment:
Q  145 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagacc 243  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||    
T  14295745 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttatattaatccaataatttggaacatcatcatcttcaacattttagacc 14295646  T
Q  244 gactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| | ||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  14295645 gactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcgaatg 14295569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 116 - 343
Target Start/End: Original strand, 33680910 - 33681133
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttg 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | || |||||| || |||| | | || |||| |||||||| ||||||||||||    
T  33680910 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacatcttaacca-cttagaacaaccacctcttatataagtccaataatttg 33681007  T
Q  215 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataata 313  Q
    |||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||||    
T  33681008 gaacatcatcatcttca---acttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaata 33681103  T
Q  314 tcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 343  Q
    || |||||||| |  |||||||||||||||    
T  33681104 tcgaatgcaagtcgtcaacatctcaaatat 33681133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 40 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 22131380 - 22131180
Alignment:
Q  40 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaa 138  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  22131380 ttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaa 22131283  T
Q  139 caatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaact 237  Q
    |||    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||| |  | || ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  22131282 caaatgtatgctaatgcatggactcgatctcttaaacatcat-aatc-atcatctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacaact 22131185  T
Q  238 tagac 242  Q
    |||||    
T  22131184 tagac 22131180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 145 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 20454752 - 20454613
Alignment:
Q  145 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatc------ttcatcaactt 238  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || |||| ||| ||| |||||||||||||||| | ||||||      || ||||||||    
T  20454752 aatgttaatgcatggactcgacatcttaaacatcttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacattatcatcaacatcttaatcaactt 20454653  T
Q  239 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20454652 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 20454613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 116 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 35261295 - 35260992
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataa-tccaataattt 213  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||   ||||||| |||| ||  ||||| ||||||| || | || |||| |||||||| |||||||||||    
T  35261295 gctccagggcatcaagcctccaacaatgaa-tgagtatgcatggactcaacaacttaa-catcttagaaacaacgacctcttatataaatccaataattt 35261198  T
Q  214 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataat 312  Q
    ||||| | ||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | ||||||| | |||||| ||||| |||| |||    
T  35261197 ggaacataat--tcttcat---cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaacagcatgatataacaat 35261104  T
Q  313 atcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaatt--atcacatcataatcaacatcaaaacatctta-aac 409  Q
    |||||||||||   | |||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| |||| ||||  ||||||| || | |||||||||| ||||||| |||    
T  35261103 atcaaatgcaa---atcaacatctcaaacattcatacataattcaagtaatgcatatacaattacatcacattattaacaacatcaaatcatcttataac 35261007  T
Q  410 agcttcacagattat 424  Q
    | ||||||| |||||    
T  35261006 aacttcacatattat 35260992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 40 - 242
Target Start/End: Original strand, 48603088 - 48603288
Alignment:
Q  40 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaa 138  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  48603088 ttgagtattaatatacttccagggcat-aagcctccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaa 48603185  T
Q  139 caatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaact 237  Q
    |||    ||||||||||||| |||| | |||||||||||| | |||| |  | || ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  48603186 caaatgtatgctaatgcatggactcaatctcttaaacatcat-aatc-atcatctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacaact 48603283  T
Q  238 tagac 242  Q
    |||||    
T  48603284 tagac 48603288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 116 - 343
Target Start/End: Original strand, 22237530 - 22237753
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttg 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || | ||  ||||| || |||| | | ||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  22237530 gctccagggcatcaagcccccaacgatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-caacttagaacaacaacctcttatacaagtccaataatttg 22237627  T
Q  215 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataata 313  Q
     ||| ||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| | ||| ||| | ||| || ||||| |||| ||||    
T  22237628 aaacatcatcatcttca---acttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaaacagcgacataggcattatgc-aaatcatcatgatataacaata 22237723  T
Q  314 tcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 343  Q
    || |||||||| || |||||||||||||||    
T  22237724 tcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 22237753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 42865526 - 42865273
Alignment:
Q  25 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 123  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  42865526 agcccccatcactatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcctccatcgctagtttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagg 42865428  T
Q  124 gcatcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt- 220  Q
    ||||  ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| |  | || |||| | |||||||||||||||  ||     
T  42865427 gcat-gagcccccaacatatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatctt-aatc-atcatctcttatgt-atccaataatttggaggttc 42865333  T
Q  221 --catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 278  Q
      ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  42865332 aacatcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacatagttaaataacaatagcaaca 42865273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 61 - 176
Target Start/End: Original strand, 20916070 - 20916185
Alignment:
Q  61 gggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatga 159  Q
    ||||||||| |||| ||||||| ||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  20916070 gggcatcaagccccaatcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatgg 20916168  T
Q  160 actcgacctcttaaaca 176  Q
    |||| ||||||||||||    
T  20916169 actcaacctcttaaaca 20916185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 123 - 339
Target Start/End: Original strand, 21753957 - 21754166
Alignment:
Q  123 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 222  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || | || |||||| || |||| | | ||| | | ||||| | ||||||||||||||||  ||    
T  21753957 ggcatcaagcccccaacaatgga-tgctaatgcatggacacaacatcttaa-caacttagaacaacatcatcttata-agtccaataatttggaacaaca 21754053  T
Q  223 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgc 321  Q
    |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||||||||    
T  21754054 tcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaaatgc 21754149  T
Q  322 aagacaacaacatctcaa 339  Q
    ||  ||||||||||||||    
T  21754150 aa-tcaacaacatctcaa 21754166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 116 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 21896473 - 21896194
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataa-tccaataattt 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||  || || ||||||| || | |   ||| |||||||| |||||||||||    
T  21896473 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgcgaatgcatggactcaacaactcaa-catcttagaaacaatggcctcttatataaatccaataattt 21896376  T
Q  214 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataat 312  Q
    ||||| || ||  ||||||   |||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||| | ||||||||| |||||| ||||| |||| |||    
T  21896375 ggaacatcttc--cttcat---cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgatataacaat 21896282  T
Q  313 atcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaa 398  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| || |||  |||| ||| ||||||  |||| |||  |||||||| |||| ||||||||||    
T  21896281 atcaaatgcaagtcatcaacatctcaaacattcatatataattcatgtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaa 21896194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 203 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 22922001 - 22921864
Alignment:
Q  203 tccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacat 301  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || |||    
T  22922001 tccaataatttggaacatcatcatcatcatc---ttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcat 22921906  T
Q  302 gacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 343  Q
    || |||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  22921905 gatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 22921864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 201 - 430
Target Start/End: Original strand, 16758638 - 16758866
Alignment:
Q  201 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaa-aacaa 298  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||  |       
T  16758638 aatccaataatttggaac---atcatctt--tcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccagtt 16758732  T
Q  299 catgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatca 396  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||| | || || |||  |||| ||||||||||| |||| |||  |||||||| |||| ||||| ||    
T  16758733 catgatataacaatatcaaatacaatacaacaacatcac-aacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacaaca 16758831  T
Q  397 aaacatctta-aacagcttcacagattataattaa 430  Q
    || ||| ||| ||||||||||||||| || |||||    
T  16758832 aatcatattataacagcttcacagatcatcattaa 16758866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 294 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 22354616 - 22354477
Alignment:
Q  294 aacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat--cacatcataatcaa 391  Q
    |||| |||||||||| |||||||| |||||  || |||||||| |||||| ||   ||   ||||||||||  ||||| |||||  ||||||||||||||    
T  22354616 aacagcatgacataaaaatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaa 22354517  T
Q  392 catcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaac 431  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22354516 catcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaac 22354477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 201 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 21861702 - 21861510
Alignment:
Q  201 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaac 299  Q
    ||||||||||||||||||   ||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||| | ||||||| ||||| || |    
T  21861702 aatccaataatttggaac---atcttctt--tcatcttagaccgactcatgcagcttagctaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-cagc 21861609  T
Q  300 atgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatca 396  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||| || |||  |||| ||||||||||  |||| |||  |||||||| |||| ||||||||    
T  21861608 atgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatca 21861510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 123 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 52928181 - 52928038
Alignment:
Q  123 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttc 221  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||| || | ||  ||||| || |||| | | ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||    
T  52928181 ggcaccaagcccccaacaatgaa-tgttaatgcatggacacaacaacttaa-caacttagaacaacaacctcttatataagtccaataatttggaacatc 52928084  T
Q  222 atcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 270  Q
    | ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52928083 accatcttca---acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 52928038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 375 - 434
Target Start/End: Original strand, 48603674 - 48603733
Alignment:
Q  375 tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttc 434  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48603674 tatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacttc 48603733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 83 - 278
Target Start/End: Original strand, 21161588 - 21161778
Alignment:
Q  83 tttgacctaaagctcca-tcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta 181  Q
    ||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||   |||  |||||||||||||    ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  21161588 tttgagctaaagctccaatcgtggtgagtacaaagctccggagcagtaagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggacttgacatcttaaacatctta 21161687  T
Q  182 aatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 278  Q
    ||    |||| |  || ||| |||||||||||||||| ||||||||   |||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  21161688 aa----caacttcgtaaatagtccaataatttggaacatcatcatc---atcaacttggatcgactcatgcaacttagttaaacaacaaacagcaaca 21161778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 116 - 332
Target Start/End: Original strand, 20248184 - 20248394
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || | || |||||| || |||| | |  || | | ||||| | |||||||||||||    
T  20248184 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgttaatgcatggacacaacatcttaa-caacttagaacatcatcatcttata-agtccaataatttgg 20248280  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 314  Q
    ||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||    
T  20248281 aacatcatcatc---atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaaaaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatat 20248376  T
Q  315 caaatgcaagacaacaac 332  Q
    | |||||||  |||||||    
T  20248377 cgaatgcaaatcaacaac 20248394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 13213206 - 13213139
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  13213206 catcaagcccccatcgctatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaatcgctatttga 13213139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Original strand, 16361729 - 16361796
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  16361729 catcaagcccccatcgctatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaatcgctatttga 16361796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 83 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 20091730 - 20091636
Alignment:
Q  83 tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatc 178  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  20091730 tttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatc 20091636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 21788356 - 21788208
Alignment:
Q  25 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 123  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| || ||||| |||| ||||||||||  ||||||| |||||||| |    
T  21788356 agcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgttattttgagctaatgctccatcgtggtgagtactaagctccagg 21788258  T
Q  124 gcatcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa 174  Q
    | ||  ||||||||||| |||  ||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  21788257 gtat-gagcccccaacatatg-tatgctaatgcatagactcgatctcttaaa 21788208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 375 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 22356136 - 22356073
Alignment:
Q  375 tatcacatcataatcaa-catcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcatc 437  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  22356136 tatcacatcataatcaatcatcaacacatcttaaatagcttcacagattataattaacatcatc 22356073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 375 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 22357822 - 22357759
Alignment:
Q  375 tatcacatcataatcaa-catcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcatc 437  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  22357822 tatcacatcataatcaatcatcaacacatcttaaatagcttcacagattataattaacatcatc 22357759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Original strand, 29776461 - 29776528
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  29776461 catcaagcccccatcgctatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaatcgctatttga 29776528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 201 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 41050168 - 41050033
Alignment:
Q  201 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaa-acaa 298  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||| | |||||||| |||| |       
T  41050168 aatccaataatttggaacatcatc--cttcatc---ttagaccgactcatgcagcttagttactaaacgaacagcaacataggcagtatataaaatagtt 41050074  T
Q  299 catgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaa 339  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  41050073 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaa 41050033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 86
Target Start/End: Original strand, 21840449 - 21840514
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttg 86  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  21840449 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaaacccctatcgctatttg 21840514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 16368502 - 16368284
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttg 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||   ||||||| |||| ||  ||||  ||||||| | |  | |||| |||||||| ||||||||||||    
T  16368502 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgagtatgcatggactcaacaacttag-catcttagaacatcgacctcttatataaatccaataatttg 16368405  T
Q  215 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaa--catgacataataa 311  Q
    |||| |||||||     ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | |||| |||  |||||||  ||||| |||| ||    
T  16368404 gaacatcatcat-----tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcata-taaaacaattcatgatataacaa 16368311  T
Q  312 tatcaaatgcaagacaacaacatctcaa 339  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||||    
T  16368310 tatc-aatgcaaatcaacaacatctcaa 16368284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 233 - 320
Target Start/End: Original strand, 20918620 - 20918707
Alignment:
Q  233 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatg 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||| | ||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  20918620 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaactgcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcgaatg 20918707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 50614249 - 50614113
Alignment:
Q  201 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaa-acaa 298  Q
    ||||||||||||||||||  ||||  ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | |||||| | |||| |       
T  50614249 aatccaataatttggaacaacatc--cttcat---cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagtt 50614155  T
Q  299 catgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaa 340  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  50614154 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaa 50614113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 50622077 - 50621941
Alignment:
Q  201 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaa-acaa 298  Q
    ||||||||||||||||||  ||||  ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | |||||| | |||| |       
T  50622077 aatccaataatttggaacaacatc--cttcat---cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagtt 50621983  T
Q  299 catgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaa 340  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  50621982 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaa 50621941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 182
Target Start/End: Original strand, 6151665 - 6151810
Alignment:
Q  37 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccc 135  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||| ||||| || |||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  6151665 tattttagtattaatatactttcagggcatgag-cccccatcgttattttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccc 6151762  T
Q  136 caacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 182  Q
    ||||||    ||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||    
T  6151763 caacaaatgtatgctaatgcatggactcaatctcttaaaacatcttaa 6151810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 14295896 - 14295829
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  14295896 catcaagcccctatcgctatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaatcgctatttga 14295829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 22831684 - 22831560
Alignment:
Q  38 atttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagccccc 136  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||| ||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  22831684 attttagtattaatatactttcagggcatgag-cccccatcgttattttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagccccc 22831587  T
Q  137 aacaatgaaatgctaatgcatgaactc 163  Q
    |||||    ||||||||||||| ||||    
T  22831586 aacaaatgtatgctaatgcatggactc 22831560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Original strand, 21840579 - 21840646
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||    
T  21840579 catcaagcccctatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgctatttga 21840646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 45575189 - 45575122
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  45575189 catcaagctccaatcgctatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaatcgctatttga 45575122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 158
Target Start/End: Original strand, 431655 - 431697
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 158  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  431655 gctccagggcatcaagcctccaacaatgaaatgctaatgcatg 431697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 18182418 - 18182275
Alignment:
Q  38 atttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagccccc 136  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||| || |||||| |  ||||| || | || ||||| ||||  |||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  18182418 attttagtattaatatactttcagggcat-aagcccccaacattattttgagcaaatgctccttcgtggtgagtacaaagctccagggcatga-gccccc 18182321  T
Q  137 aacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaa 182  Q
    |||||    ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  18182320 aacaaatgtatgctaatgcatggacttgatctcttaaacatcttaa 18182275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 20454901 - 20454837
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt 85  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  20454901 catcaagcccctatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctattt 20454837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 45575145 - 45575089
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaaccccca 76  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||    
T  45575145 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccaaggcatcaagccccca 45575089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 14295852 - 14295785
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | |||| || | ||||||| |||| ||||||||||||    
T  14295852 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatactcccggagcatcaagccccaatcgctatttga 14295785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 430
Target Start/End: Original strand, 21477654 - 21477732
Alignment:
Q  355 tcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 430  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||| |||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||| || |||||    
T  21477654 tcaagtaatgcgtatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagcttcacagatcatcattaa 21477732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Original strand, 29776505 - 29776572
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| || |||||||||    
T  29776505 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaattgctatttga 29776572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 336
Target Start/End: Original strand, 33797570 - 33797638
Alignment:
Q  266 aacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatct 336  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||  |||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||    
T  33797570 aacaacagcaacatatgcagcatacaaa--caacatgacataataatatcaatttcaattcaacaacatct 33797638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 45575220 - 45575166
Alignment:
Q  33 tcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| | || ||||||||||||    
T  45575220 tcgctatttgagtattattatacttccagagcatcaagctccaatcgctatttga 45575166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 57 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 50210543 - 50210513
Alignment:
Q  57 tccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50210543 tccagggcatcaaacccccatcgctatttga 50210513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 13213162 - 13213101
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 81  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  13213162 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgct 13213101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 14295808 - 14295747
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 81  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  14295808 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgct 14295747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 20454815 - 20454754
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 81  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  20454815 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgct 20454754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 81
Target Start/End: Original strand, 21840623 - 21840684
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 81  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  21840623 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgct 21840684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Original strand, 21341915 - 21341982
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgag-tattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  21341915 catcaagcccccaacgctatttgagatattaatatact-ccagagcatcaagcccctatcgctatttga 21341982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Original strand, 21346779 - 21346846
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgag-tattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  21346779 catcaagcccccaacgctatttgagatattaatatact-ccagagcatcaagcccctatcgctatttga 21346846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 202 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 24783230 - 24783155
Alignment:
Q  202 atccaataatttggaact--tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 275  Q
    |||||||||||||||  |  |||||||||| |||| ||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  24783230 atccaataatttggatttcatcatcatcttaatcatcttattcagactcatgcaacttagttaaataacaatagca 24783155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 87)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 20 - 430
Target Start/End: Original strand, 29060343 - 29060755
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29060343 catcaagcccccatcgctatt-gagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctc 29060441  T
Q  120 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg-aac 218  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  29060442 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaac 29060541  T
Q  219 ttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 318  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29060542 atcatcatcttcatcagcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 29060641  T
Q  319 tgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttca 416  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||| ||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29060642 tgcaagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcacataacattatatctcatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttca 29060741  T
Q  417 cagattataattaa 430  Q
    ||||||||||||||    
T  29060742 cagattataattaa 29060755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 20 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 25629671 - 25629260
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    |||||||||||| |||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  25629671 catcaagcccccatcgctata--agtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaggctc 25629574  T
Q  120 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 219  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||     
T  25629573 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgaaaacttcttatataatccaataatttggaaca 25629474  T
Q  220 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  25629473 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaattacaacaggaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataacaatatcaaat 25629374  T
Q  320 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 417  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25629373 gcaagtcaacaacatctcaattatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 25629274  T
Q  418 agattataattaac 431  Q
    ||||||||||||||    
T  25629273 agattataattaac 25629260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 43 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 18410126 - 18409726
Alignment:
Q  43 agtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaat 142  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  18410126 agtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctatttgagctaaagctccattgtgtggagtacaaggctccagggcatcaagcccccaacaat 18410027  T
Q  143 gaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaa----cttcatcatcttcatcaactt 238  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    | |||||||||||||||||||    
T  18410026 gaaatgataatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaacatcatcatcatcttcatcaactt 18409927  T
Q  239 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctca 338  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18409926 agaccgactcatgcagctcagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacgaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctca 18409827  T
Q  339 aatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcat 436  Q
    |  || ||||||||| |||| |||| | ||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  18409826 atcatccattcataattcaaataatacatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacatattataattaacatcat 18409727  T
Q  437 c 437  Q
    |    
T  18409726 c 18409726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 57 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 19303821 - 19303440
Alignment:
Q  57 tccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgca 156  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19303821 tccaaggcatcaagcccccatcgctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatactaatgca 19303722  T
Q  157 tgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagct 256  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19303721 tggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatcatcttcatcatcttagaccgactcatgcagct 19303622  T
Q  257 tagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactc 356  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  19303621 tagttaaataacaacaacaacacaggaagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacattcatatttc 19303523  T
Q  357 aagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcatc 437  Q
    ||||||||   |||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19303522 aagtaatgtacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttcaacagcttcacagattataattaacatcatc 19303440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 58 - 429
Target Start/End: Original strand, 20593615 - 20593987
Alignment:
Q  58 ccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcat 157  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20593615 ccagggcatcaagcccccatcgctatt-gagctaaagctccatcgtgttgagcacaaggctccagggcatcaagcccccagcaatgaaatgctaatgcat 20593713  T
Q  158 gaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctt 257  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  20593714 ggactcaacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgaatcatgcagctc 20593813  T
Q  258 agttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactca 357  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||    
T  20593814 agttaaataaaaacagcaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataaatca 20593913  T
Q  358 agtaatgcgtataa-aat-tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataatta 429  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20593914 agtaatgcgtataacaatatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataatta 20593987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 20 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 22780545 - 22780126
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  22780545 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccaaggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctc 22780446  T
Q  120 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 219  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||     
T  22780445 caaggtatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgactacctcttatataatccaataatttggaaca 22780346  T
Q  220 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 319  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  22780345 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacaaaaacataggcaatatacaaaaacagcttgacataataatatcaatt 22780246  T
Q  320 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 417  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| || | |||  |||||||||||    || ||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22780245 gcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacgcaacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 22780146  T
Q  418 agattataattaacttcatc 437  Q
    ||||||| |||||| |||||    
T  22780145 agattatgattaacatcatc 22780126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 20 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 20638603 - 20638182
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  20638603 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagct 20638504  T
Q  119 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttggaa 217  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  20638503 ccagggcgtcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacaacctcttatattaatccaataatttggaa 20638404  T
Q  218 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 317  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20638403 catcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 20638304  T
Q  318 atgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttc 415  Q
     |||||   | ||||||||  ||||| ||  |||   ||||||||||| || ||  |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20638303 ttgcaatttatcaacatctttaatattcaaacattcttcaagtaatgcataaaacgttatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 20638204  T
Q  416 acagattataattaacttcatc 437  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  20638203 acagattataattaacatcatc 20638182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 20 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 17288114 - 17287701
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||     
T  17288114 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaaactccaacgtgttgagtacaaagctt 17288015  T
Q  120 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 219  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  17288014 cagggcatcaagcccacaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaagcatcttaattcggcaacctcttatataatccaataatttggaaca 17287915  T
Q  220 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 319  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |    
T  17287914 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggtagtatacaaacacagcatgacataataatatcaatt 17287815  T
Q  320 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaatta--tcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 417  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| || | |||  |||||||||||  |||| ||||  ||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  17287814 gcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatgtcataacataatcaacctcaacacatcttaaacagcttcac 17287715  T
Q  418 agattataattaac 431  Q
    || |||||||||||    
T  17287714 aggttataattaac 17287701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 62 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 20361238 - 20360859
Alignment:
Q  62 ggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaa 160  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20361238 ggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaaaactccaacgtgttgagtataaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgga 20361139  T
Q  161 ctcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttag 259  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20361138 ctcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcatcattttcatcaacttagatcgactcatgcagcttag 20361039  T
Q  260 ttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaag 359  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  || |||||||| |||||| ||   ||   |||||    
T  20361038 ttaaataacaacagcaacataggcagcatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaag 20360939  T
Q  360 taatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcatc 437  Q
    |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  20360938 taatgcatataacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacatattataattaacctcatc 20360859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 2291445 - 2291186
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2291445 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 2291347  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2291346 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 2291248  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  2291247 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 2291186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 18334857 - 18334598
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18334857 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 18334759  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18334758 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 18334660  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  18334659 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 18334598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Original strand, 19004943 - 19005202
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19004943 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 19005041  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19005042 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 19005140  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  19005141 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 19005202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Original strand, 24422444 - 24422703
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24422444 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 24422542  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24422543 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 24422641  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  24422642 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 24422703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Original strand, 33861691 - 33861950
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33861691 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 33861789  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33861790 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 33861888  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  33861889 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 33861950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 20 - 377
Target Start/End: Original strand, 20076506 - 20076856
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| || | ||||||||||||| ||||| | || ||||    
T  20076506 catcaagcccccatcgctatt--agtattaatatacttccagggcatcaagccctcatcgctatt-gagcgaaagctccatcgtgttgagcataaggctc 20076602  T
Q  120 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 219  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  20076603 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcaaaatcttaaacatcttagaacaacaacctcttatataatccaataatttggaaca 20076702  T
Q  220 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  20076703 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 20076801  T
Q  320 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||   | |||||||| ||| || || | |||  ||||||||||||||||| |||||    
T  20076802 gcaa---atcaacatcttaaaaattcaattatacttcaagtaatgcgtataacattat 20076856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 19859184 - 19858925
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  19859184 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatatagtccaataatttgg 19859086  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19859085 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 19858987  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  19858986 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 19858925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Original strand, 33864175 - 33864434
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33864175 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 33864273  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33864274 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 33864372  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  33864373 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 33864434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 132 - 377
Target Start/End: Original strand, 22782139 - 22782383
Alignment:
Q  132 cccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttca 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  22782139 cccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctctcatataatccaataatttggaaattcatcatcttaa 22782238  T
Q  232 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaa 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22782239 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 22782337  T
Q  332 catctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    | |||||| ||| ||  ||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  22782338 cgtctcaattattcacacataattcaagtaatgcatatacaattat 22782383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 20 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 28496790 - 28496489
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | | |||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  28496790 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccaaggcatcaagctcacatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctc 28496691  T
Q  120 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg-aac 218  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  28496690 cagggcatcaagcctccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaac 28496591  T
Q  219 ttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 317  Q
     ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||| | ||| || ||||| ||||||||||| |    
T  28496590 atcatcatcttcaaaaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcga 28496492  T
Q  318 atg 320  Q
    |||    
T  28496491 atg 28496489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 20 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 29809201 - 29808900
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | | |||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  29809201 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccaaggcatcaagctcacatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctc 29809102  T
Q  120 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg-aac 218  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  29809101 cagggcatcaagcctccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaac 29809002  T
Q  219 ttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 317  Q
     ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||| | ||| || ||||| ||||||||||| |    
T  29809001 atcatcatcttcaaaaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcga 29808903  T
Q  318 atg 320  Q
    |||    
T  29808902 atg 29808900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Original strand, 1595446 - 1595705
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1595446 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 1595544  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1595545 aacttcatcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 1595643  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||  ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||  |||| ||||||    
T  1595644 aaatgcaattcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatggatatacaattat 1595705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Original strand, 8054926 - 8055185
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8054926 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 8055024  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8055025 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-aagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 8055123  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  8055124 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 8055185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 26924905 - 26924646
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26924905 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 26924807  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26924806 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-tagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 26924708  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  26924707 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 26924646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 116 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 1541176 - 1540918
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1541176 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 1541078  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  1541077 aacttcatcatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagtatgacataataatatc 1540979  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaatta 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| |||||    
T  1540978 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaatta 1540918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Original strand, 12742214 - 12742473
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12742214 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgaccttgtaat-atcttaaatcaacaacctcttatataatccaataatttgg 12742312  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12742313 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 12742411  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  12742412 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 12742473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 20557158 - 20556900
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  20557158 gctccacgacatcaagcccacaacaatgaaatgttaatgcatggactcgaccacttaaacatcttaaattgaaaacctcttatataatccaataatttgg 20557059  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  20557058 aacttcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatggcataataatatc 20556960  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| |  ||||  |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  20556959 aaatgcaagtcaacaacgtctcaatttcacat--ataattcaagtaatgcatatacaattat 20556900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 124 - 377
Target Start/End: Original strand, 25754715 - 25754965
Alignment:
Q  124 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 223  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  25754715 gcatcaagcccccaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaac-tcttgtataatccaataatttggaacttcat 25754812  T
Q  224 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 323  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25754813 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 25754911  T
Q  324 gacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
      ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  25754912 atcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattat 25754965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 117 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 3852280 - 3852023
Alignment:
Q  117 ctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgga 216  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  3852280 ctccaaagcatcaagcccccaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaac-tcttgtataatccaataatttgga 3852183  T
Q  217 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 316  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  3852182 acttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtttaataacaacagcaacacaa-tagtatacaaaaacagcatgacatgataatataa 3852084  T
Q  317 aatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  3852083 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 3852023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 20 - 317
Target Start/End: Original strand, 35245386 - 35245684
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||    
T  35245386 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatactttcagggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagc 35245485  T
Q  118 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa-catcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttgg 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| || ||| | || ||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  35245486 tccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagactcgacctcttaaaacaacttgattcaacaacctcttatattagtccaataatttgg 35245584  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 314  Q
    ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| | |||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  35245585 aacatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaaacaccaacataggcagtatac---aacaacatgacataataatat 35245681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 123 - 339
Target Start/End: Original strand, 25688405 - 25688620
Alignment:
Q  123 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 222  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  25688405 ggcatcaagccctcaactttgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcgtaaatcgataacctcttatataatccaataatttggaacctca 25688504  T
Q  223 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 322  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  25688505 ttatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaactgca 25688603  T
Q  323 agacaacaacatctcaa 339  Q
    || ||||||| ||||||    
T  25688604 agtcaacaacgtctcaa 25688620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 20 - 270
Target Start/End: Original strand, 1561104 - 1561356
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 118  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||    
T  1561104 catcaagcccttctcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagct 1561203  T
Q  119 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa-catcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttgga 216  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| || ||||| ||||||| ||  ||||| |||||||| |||||||    
T  1561204 ccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggattcgacctcttaaaacaacttaattcgacaatctcgtatattaatccaattatttgga 1561302  T
Q  217 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 270  Q
    || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1561303 acatcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa 1561356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 123 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 16448783 - 16448532
Alignment:
Q  123 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 222  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||      
T  16448783 ggcatcaagccctcaactttaaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaattgacaaactcttgtataatccaataatttggaactt-- 16448686  T
Q  223 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 322  Q
     |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16448685 -catcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacac-agcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 16448588  T
Q  323 agacaa-caacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    || ||| |||| |||||| ||| ||   |||| |||| |||||| |||| ||||||    
T  16448587 agtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattat 16448532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 59 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 19774003 - 19773818
Alignment:
Q  59 cagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcat 157  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19774003 cagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcat 19773904  T
Q  158 gaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagac 242  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19773903 ggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagac 19773818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 38 - 436
Target Start/End: Original strand, 22831322 - 22831723
Alignment:
Q  38 atttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccc 135  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| | |||| |||||| |||  |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  22831322 atttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatttttagctaatgctccaacgtcgtgagtacaaagctccagggaatcaagcccc 22831421  T
Q  136 caacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttcatca 234  Q
    |||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  22831422 caactatgaa-tgctaatgtatggactcgacctcttaaacaacttaattcaacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaaca 22831520  T
Q  235 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaaca 333  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| | | |   ||| |||||||||||| ||||||||| |||  || |||||    
T  22831521 tagtagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcactgttc---aacgacatgacataatcatatcaaattcaattcatcaaca 22831617  T
Q  334 tctcaaa--tatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat--cacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataatta 429  Q
    ||| | |  ||||||  |||   ||||||||||| || || |||||  |||||||||||||||| ||| | ||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  22831618 tcttagatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacatcataatcaacaacaacatatcttattcagcttcacagattatagtta 22831716  T
Q  430 acttcat 436  Q
    || ||||    
T  22831717 acctcat 22831723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 16920950 - 16920651
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt--gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 117  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||  || |||| |||||| |||  ||||||||||||    
T  16920950 catcaagaccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccattgctatttttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagc 16920851  T
Q  118 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttgga 216  Q
    |||| ||  |||||||||| || ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | ||||| ||||||||    
T  16920850 tccagggtgtcaagccccctactatgaa-tgctaatgcatggacttgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaacaatttgga 16920752  T
Q  217 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    || |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||   |||| ||||||||||  |||||    
T  16920751 acatcatcatcttcaacatctttgaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcagcataggcagtatac---aacatcatgacataagtatatc 16920655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 28 - 218
Target Start/End: Original strand, 22805559 - 22805749
Alignment:
Q  28 ccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcat 127  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  22805559 ccccatcgctatttaagtattaatatacttccaaggcatcaagcccccatcgctaaatgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctccagggcat 22805658  T
Q  128 caagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaac 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  22805659 caagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacaacttcttatataatccaataatttggaac 22805749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 145 - 377
Target Start/End: Original strand, 34963292 - 34963529
Alignment:
Q  145 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatc------ttcatcaactt 238  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||      || ||||||||    
T  34963292 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacatcatcatcaacatcttaatcaactt 34963391  T
Q  239 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctca 338  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  34963392 agaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctca 34963490  T
Q  339 aatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    | ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  34963491 attattcacatataattcaagtaatgcatatataattat 34963529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 146 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 30676952 - 30676716
Alignment:
Q  146 atgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatc------ttcatcaactta 239  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||      || |||||||||    
T  30676952 atgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacatcatcatcaacatcttaatcaactta 30676853  T
Q  240 gaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaa 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  30676852 gaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agcagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 30676754  T
Q  340 atatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
     ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  30676753 ttattcacatataattcaagtaatgcatatataattat 30676716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 20 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 25612047 - 25611744
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctat-ttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||| |||||| | |  |||||||||||||    
T  25612047 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaaattgagctaatgctccaacatggtgagtacaaagct 25611948  T
Q  119 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaac 218  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| | || || |||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  25611947 ccagggcatcaagcccccaacaatgaaatcctaatgcatggacacgacctcttaaacatctt-attcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaac 25611849  T
Q  219 ttcatcatcttca-------tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataa 311  Q
     ||| ||||  ||       ||||| | ||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||| || | ||||  ||||| |||| |||||||||| ||    
T  25611848 atcaacatcaacatcttaattcaacatggactgactcatgcgacttagttaattaacaacagcagcataggcagattacaacaacatcatgacataacaa 25611749  T
Q  312 tatca 316  Q
    |||||    
T  25611748 tatca 25611744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 123 - 278
Target Start/End: Original strand, 25714323 - 25714478
Alignment:
Q  123 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 222  Q
    |||||||||||| ||||  ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  25714323 ggcatcaagccctcaactttgaaaagttaatgcatggactcgacctcttaaacatattaaaccggcaacctcttatataatccaataatttggaacatca 25714422  T
Q  223 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 278  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25714423 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 25714478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 178 - 343
Target Start/End: Original strand, 16496204 - 16496370
Alignment:
Q  178 cttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaa 276  Q
    ||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16496204 cttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaa 16496303  T
Q  277 cacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 343  Q
    || | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||    
T  16496304 cataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatcttaaatat 16496370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 24 - 319
Target Start/End: Original strand, 11185318 - 11185605
Alignment:
Q  24 aagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctcca 121  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||   ||||||||||  ||||    
T  11185318 aagcccccatcgttatttgagtattaatatacttctagggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaatgctccaacgcggtgagtacaaaaatcca 11185417  T
Q  122 aggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaact 219  Q
     ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||     
T  11185418 gggcatcaagcccccaactatg-aatgctaatgcatggactcgacctcttaaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaaca 11185516  T
Q  220 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 318  Q
    ||| |||         ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||   ||||| |||   |||||||||||||||| ||||||||    
T  11185517 tcaacat---------cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatgtgcagtgtac---aacaacatgacataattatatcaaa 11185604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 201 - 430
Target Start/End: Original strand, 18456705 - 18456930
Alignment:
Q  201 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaaca 300  Q
    |||||||||| ||||||| |||||  |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||    
T  18456705 aatccaataaattggaacatcatc--cttcatc---ttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaat-agtatacaaaaacagca 18456798  T
Q  301 tgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaa 398  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| |||  |||||||  |||| ||||||||||    
T  18456799 tgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaa 18456897  T
Q  399 acatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 430  Q
     |||| |||| ||||||||||||| || |||||    
T  18456898 tcatcataaatcagcttcacagatcatcattaa 18456930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 25603709 - 25603299
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctat-ttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 118  Q
    |||||||||||| |  |||||||| ||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||  |||| |||| |||||| | |  |||||||||||||    
T  25603709 catcaagcccccatttctatttgaatattaatatactaccagagcatcaagcccccatcgctaaattgagctaatgctccaacatggtgagtacaaagct 25603610  T
Q  119 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaac 218  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | || || |||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  25603609 ccagggcatcaagccctcaacaatgaaatgctaatgcatggacacgacctcttaaacatctt-attcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaac 25603511  T
Q  219 ttcatcatcttca-------tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataa 311  Q
     ||| ||||  ||       ||||| | ||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||| || | ||||  ||||| |||| |||||||||| ||    
T  25603510 atcaacatcaacatcttaattcaacatggactgactcatgcgacttagttaattaacaacagcagcataggcagattacaacaacatcatgacataacaa 25603411  T
Q  312 tatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaac 409  Q
    |||||  |  ||  | || ||||||||| ||| || | | |  ||||||||||  || || ||  |||||||||||||||||   | |||||||||||||    
T  25603410 tatcatttataattc-actacatctcaattattcaataaaacttcaagtaatgtatacaacatcatatcacatcataatcaatgactaaacatcttaaac 25603312  T
Q  410 agcttcacagatt 422  Q
    |||||||||||||    
T  25603311 agcttcacagatt 25603299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 210 - 324
Target Start/End: Original strand, 25656619 - 25656732
Alignment:
Q  210 atttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataat 309  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25656619 atttggaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca-tagcagtatacaaaaacagcatgacataat 25656717  T
Q  310 aatatcaaatgcaag 324  Q
    |||||||||||||||    
T  25656718 aatatcaaatgcaag 25656732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 188 - 430
Target Start/End: Original strand, 25644295 - 25644537
Alignment:
Q  188 caacctattatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacacaagcag 285  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||   ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||    
T  25644295 caacctcttatataaatccaataatttggaac---atcttctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcag 25644389  T
Q  286 tatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatc 383  Q
    ||| |||||||| | ||| |||| ||||||||||| ||| || |||||||||||| || |||  |||| |||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  25644390 tatgcaaaaacagcgtgatataacaatatcaaatgtaagtcatcaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcgtatacaattatatcacatc 25644489  T
Q  384 ataatcaacatcaaaacatctta-aacagcttcacagattataattaa 430  Q
    | || |||||||||| |||| || | ||||||||||||| || |||||    
T  25644490 aaaaacaacatcaaatcatcatatatcagcttcacagatcatcattaa 25644537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 147 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 8227703 - 8227416
Alignment:
Q  147 tgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccga 245  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||    
T  8227703 tgctaatgcatggactcgacttcttaaacgtcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacatcaacatcttcaacaacttggaccga 8227604  T
Q  246 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatata 344  Q
    |||||||||||||||||  |||  | |||||||  | ||||||| | |||||| ||||| |||||||||||  | | |||  ||||||||||||||||      
T  8227603 ctcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgc-aaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataat 8227505  T
Q  345 cattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 430  Q
    ||   |||| ||||||||||| |||| |||  |||||||| |||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||| || |||||    
T  8227504 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagcttcacagatcatcattaa 8227416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 201 - 370
Target Start/End: Original strand, 18461865 - 18462028
Alignment:
Q  201 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaaca 300  Q
    |||||||||| ||||||| |||||  |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||    
T  18461865 aatccaataaattggaacatcatc--cttcatc---ttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaat-agtatacaaaaacagca 18461958  T
Q  301 tgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtata 370  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| ||||    
T  18461959 tgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatata 18462028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 116 - 364
Target Start/End: Original strand, 20109039 - 20109285
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataa-tccaataattt 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||  || || | ||||| || | || |||| |||||||| | |||||||||    
T  20109039 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcaacaactcaacc-tcttagaaacaacgacctcttatataaattcaataattt 20109136  T
Q  214 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataat 312  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| | ||||||| ||||| |||||| | |||| |||    
T  20109137 ggaacatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacataatataacaat 20109233  T
Q  313 atcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatg 364  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||    
T  20109234 atcaaatgcaagtcatcaacatctcaaatattcatatataattcaagtaatg 20109285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 187 - 340
Target Start/End: Original strand, 23019377 - 23019529
Alignment:
Q  187 acaacctattatata-atccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagca 284  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||    
T  23019377 acaacctcttatatatatccaataatttggaacatcatcatctt--tcatcttagaccgacttatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagca 23019474  T
Q  285 gtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaa 340  Q
    |||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23019475 gtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaa 23019529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 25 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 25642499 - 25642250
Alignment:
Q  25 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 123  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  25642499 agcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagg 25642401  T
Q  124 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt--- 220  Q
    ||||  ||||||||||||    ||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||| |  | || |||| | |||||||||||||||| ||       
T  25642400 gcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggacttgatctcttaaacatctt-aatc-atcatctcttat-ttatccaataatttggaagttcaa 25642305  T
Q  221 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 275  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||  |||||||||||| ||||    
T  25642304 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaactaggttaaataacaatagca 25642250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 145 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 19848194 - 19847990
Alignment:
Q  145 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat------catcttcatcaactt 238  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||      |||||| ||||||||    
T  19848194 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacgacctcttaaatagtccaataatttggaacatcattatcaacatcttaatcaactt 19848095  T
Q  239 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctca 338  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| || | ||||  ||||  |||| ||  |||||| |||||||| |||||  |||||| |||| |    
T  19848094 agactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaacacataaaaatatcaattgcaattcaacaatatctta 19847995  T
Q  339 aatat 343  Q
    |||||    
T  19847994 aatat 19847990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 275
Target Start/End: Original strand, 19862783 - 19863032
Alignment:
Q  25 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 123  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  19862783 agcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagg 19862881  T
Q  124 gcatcaagcccccaac-aatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt-- 220  Q
    ||||  ||||||||||  |||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||| |  | || |||| | |||||||||||||||  ||      
T  19862882 gcat-gagcccccaacttatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaacatcat-aatc-atcatctcttat-ttatccaataatttggaggttca 19862976  T
Q  221 -catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 275  Q
     ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  19862977 acatcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagca 19863032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 116 - 340
Target Start/End: Original strand, 19652098 - 19652317
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttg 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | || |||||| || |||| | | ||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  19652098 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacatcttaa-caacttagaacaacaacctcttaaataactccaataatttg 19652195  T
Q  215 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataata 313  Q
    |||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||||    
T  19652196 gaacatcatcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaata 19652291  T
Q  314 tcaaatgcaagacaacaacatctcaaa 340  Q
    || |||||||  |||||||||||||||    
T  19652292 tcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 19652317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 201 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 18821976 - 18821795
Alignment:
Q  201 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaaca 300  Q
    |||||||||| ||||||| |||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  18821976 aatccaataaattggaacatcatc--cttcatc---ttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagca 18821883  T
Q  301 tgacataataatatcaaatgcaagacaacaa-catctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat-tatcacatcataa 387  Q
    || ||||| |||||| || ||||| |||||| |||||||| ||| |||| | |  |||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  18821882 tgccataacaatatc-aacgcaagccaacaatcatctcaattattcatttaaacttcaagtaatgcgtatacattatatcacatcataa 18821795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 275
Target Start/End: Original strand, 19872925 - 19873174
Alignment:
Q  25 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 123  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  19872925 agcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagg 19873023  T
Q  124 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt--- 220  Q
    |||| |  |||| ||  |||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||| |  | || |||| | ||||||||||||| |  ||       
T  19873024 gcatgagcccccaaattatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaacatcat-aatc-atcatctcttat-ttatccaataatttgaaggtttaa 19873119  T
Q  221 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 275  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  19873120 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagca 19873174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 306
Target Start/End: Original strand, 22432054 - 22432334
Alignment:
Q  25 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||      
T  22432054 agcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctattttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagttccaga 22432152  T
Q  124 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt--- 220  Q
    ||||  ||||||||||||    |||| |||||||| |||||| |||||||||||| | |||| |  | || |||| | || ||||||||||||  ||       
T  22432153 gcat-gagcccccaacaaatgtatgcaaatgcatggactcgatctcttaaacatcat-aatc-atcatctcttat-ttatacaataatttggaggttcaa 22432248  T
Q  221 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacat 306  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||| || | ||||| ||||| ||||  |||||||    
T  22432249 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaattaacaatagcagcataggcagtttacaacaacagtatgacat 22432334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 306
Target Start/End: Original strand, 22438604 - 22438884
Alignment:
Q  25 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||      
T  22438604 agcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctattttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagttccaga 22438702  T
Q  124 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt--- 220  Q
    ||||  ||||||||||||    |||| |||||||| |||||| |||||||||||| | |||| |  | || |||| | || ||||||||||||  ||       
T  22438703 gcat-gagcccccaacaaatgtatgcaaatgcatggactcgatctcttaaacatcat-aatc-atcatctcttat-ttatacaataatttggaggttcaa 22438798  T
Q  221 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacat 306  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||| || | ||||| ||||| ||||  |||||||    
T  22438799 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaattaacaatagcagcataggcagtttacaacaacagtatgacat 22438884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 37 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 22335197 - 22335053
Alignment:
Q  37 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccc 135  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||  ||||||    
T  22335197 tatttgagtattaatatacttccagggcaa-aagcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtgttgcgtacaaagctccagggcat-gagcccc 22335100  T
Q  136 caacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaa 182  Q
    ||||||    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  22335099 caacaaatgtatgctaatgcatggactcgatctcttaaacatcttaa 22335053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 83 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 4186069 - 4185870
Alignment:
Q  83 tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaa 182  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||   |||  |||||||||||||    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4186069 tttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagccccggagcagtaagcccccaacaaatgtatgataatgcatggactcgacctcttaaacatcttaa 4185970  T
Q  183 atcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacacaa 281  Q
        ||||| | ||| ||| |||||||||||||||   |||| || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |     
T  4185969 ----acaacttcttaaatagtccaataatttggaa---catcgtcatcatcaacttggaccgactcatgcagcatagttaaacaacagacagcaacatag 4185877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 83 - 269
Target Start/End: Original strand, 4186240 - 4186419
Alignment:
Q  83 tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaa 182  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||   |||  |||||||||||||    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4186240 tttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccggagcagtaagcccccaacaaatgtatgctaatgcatgacctcgacctcttaaacatcttaa 4186339  T
Q  183 atcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca 269  Q
        ||||| | ||| ||| |||||||||||||||    ||| || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  4186340 ----acaacttcttaaatagtccaataatttggaa---tatcgtcatcatcaacttggaccgactcatgcagcatagttaaacaaca 4186419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 116 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 22080945 - 22080799
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttg 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || |  |  ||||| || |||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  22080945 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgtatggacacatcaacttaa-ca-cttaaaacaacaacctcttatataagtccaataatttg 22080849  T
Q  215 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaa 264  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22080848 gaacatcatcatcttaatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaa 22080799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 83 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 4738805 - 4738626
Alignment:
Q  83 tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaa 182  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||   |||  |||||||||||||    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  4738805 tttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccggagcagtaagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgacctcttagacatcttaa 4738706  T
Q  183 atcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca 269  Q
        ||||  | ||| ||| |||||||||||||||   |||| || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  4738705 ----acaatttcttaaatagtccaataatttggaa---catcgtcatcatcaacttggaccgactcatgcagcatagttaaacaaca 4738626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 15894749 - 15894593
Alignment:
Q  25 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaagg 124  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||| |||| |||||| | ||    
T  15894749 agcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgttatttgagctaatgctccatcgtgttgtgtactaagctctaggg 15894651  T
Q  125 catcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 182  Q
    ||| |||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  15894650 cat-aagcccccaacatatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatcttaa 15894593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 116 - 335
Target Start/End: Original strand, 19668275 - 19668491
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataa-tccaataattt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||| |||| ||  ||||| ||||||| |||| || |||| |||||||| |||||||||||    
T  19668275 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaa-tgagtatgcatggactcaacaacttaa-catcttagaatcaacgacctcttatataaatccaataattt 19668372  T
Q  214 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaa-acaacatgacataataa 311  Q
    |||||   ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |   ||||| ||||| |   ||||| |||| ||    
T  19668373 ggaac---atcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaaacagcaacatagatagtatgcaaaacagttcatgatataacaa 19668467  T
Q  312 tatcaaatgcaagacaacaacatc 335  Q
    ||||||||||||  ||||||||||    
T  19668468 tatcaaatgcaaatcaacaacatc 19668491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 145 - 323
Target Start/End: Original strand, 23992349 - 23992533
Alignment:
Q  145 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat------catcttcatcaactt 238  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | || |||  ||| ||| |||||||||||||||| ||||      |||||| ||||||||    
T  23992349 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaatacaacgaccgcttaaatagtccaataatttggaacatcattatcaacatcttaatcaactt 23992448  T
Q  239 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 323  Q
    |||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||| || | ||||  ||||  |||| || ||||||| |||||||| |||||    
T  23992449 agactgactcatgcaacttagctaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaattgcaa 23992533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 84 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 31155644 - 31155465
Alignment:
Q  84 ttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaa 182  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||   |||  |||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  31155644 ttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccggagcagtaagcccccaacatatgta-tgctaatgcatggactcgacatcttaaacatcttaa 31155546  T
Q  183 atcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 270  Q
        ||||| |  || ||| |||||||||||||||   ||||||| |||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  31155545 ----acaacttcgtaaatagtccaataatttggaa---catcatcatcatcaacttggattgactcatgcaacttagttaaataacaa 31155465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 71 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 31165107 - 31165006
Alignment:
Q  71 cccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctct 170  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||    
T  31165107 cccccatcgctattcgagctaaagctccatcgtgttgagtactaagctccagggcat-gagcccccaacaatg-tatgctaatgcatggactcgatctct 31165010  T
Q  171 taaa 174  Q
    ||||    
T  31165009 taaa 31165006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 220 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 27333336 - 27333262
Alignment:
Q  220 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaa 293  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||    
T  27333336 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 27333262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 220 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 27394076 - 27394002
Alignment:
Q  220 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaa 293  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||    
T  27394076 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 27394002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 201 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 9098646 - 9098528
Alignment:
Q  201 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaa- 298  Q
    ||||||||||||||||||   ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | |||||||     
T  9098646 aatccaataatttggaac---atcttctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacaaaggcagtatgc-aaaacaat 9098553  T
Q  299 -catgacataataatatcaaatgca 322  Q
     ||||| |||| |||||||||||||    
T  9098552 tcatgatataacaatatcaaatgca 9098528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 89 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 15041799 - 15041465
Alignment:
Q  89 ctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgac 188  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| | |||||||||||    ||||||||||||| |||||  |||||||| |||| || ||  |    
T  15041799 ctaaagctccatcgtgttgagtactaagctctagggcatga-gcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgttctcttaaaaatctcaa-tcatc 15041702  T
Q  189 aac-ctattatataatccaataatttggaacttca---tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagca 284  Q
    ||| || |||||||  |||||||||||||  ||||   |||||||  ||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||| || | || | |||    
T  15041701 aactcttttatata--ccaataatttggaggttcaacatcatcttgttcatcttataaagactcatgcaacttagttaaataacaatagtagcataggca 15041604  T
Q  285 gtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat-tatcacatc 383  Q
    |   |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||| || ||| || | | | ||||||||||||  ||| | |  | || |||    
T  15041603 gatcacaacaacagcatgacattataatatcaaatgcaattcaataacatcttaagtattcaataaaatctcaagtaatgcacatacattaaaccaaatc 15041504  T
Q  384 ataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagatt 422  Q
     |||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  15041503 ttaattatcatcaacacatcttaaacagctttacagatt 15041465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 201 - 258
Target Start/End: Original strand, 19008787 - 19008843
Alignment:
Q  201 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctta 258  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  19008787 aatccaataatttgga-cttcatcatcttaatcaacttggaccaactcatgcagctta 19008843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 294
Target Start/End: Original strand, 33443068 - 33443124
Alignment:
Q  238 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaa 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  33443068 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacataggcagtatataaaa 33443124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 8227768 - 8227702
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttg 86  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| |||||||||||    
T  8227768 catcaagcccctatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgctatttg 8227702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 83 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 16965566 - 16965471
Alignment:
Q  83 tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatct 179  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||| ||||||||| || ||||| | |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  16965566 tttgagctaaagctccatcgtggtgagtactaagctccagagcat-aagcccccatcatatgaa-tactaatgcatggactcgatctcttaaacatct 16965471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 18692154 - 18692086
Alignment:
Q  94 gctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactc 163  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||||    
T  18692154 gctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-aagcccccaacaaatgtatgctaatgcatgaactc 18692086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 19848301 - 19848234
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| || | ||||||||||||    
T  19848301 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccacaatcgctatttga 19848234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 19848345 - 19848278
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||    
T  19848345 catcaagtcccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgctatttga 19848278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Original strand, 34963185 - 34963252
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||    
T  34963185 catcaagtcccaatcgctatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaatcactatttga 34963252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 117 - 163
Target Start/End: Original strand, 13019394 - 13019439
Alignment:
Q  117 ctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactc 163  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  13019394 ctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatggactc 13019439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 163
Target Start/End: Original strand, 18906928 - 18907052
Alignment:
Q  38 atttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagccccc 136  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||| || |||||| |  ||||| || |||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  18906928 attttagtattaatatactttcagggcat-aagcccccaacattattttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagccccc 18907025  T
Q  137 aacaatgaaatgctaatgcatgaactc 163  Q
    |||||    ||||||||||||| ||||    
T  18907026 aacaaatgtatgctaatgcatggactc 18907052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 3852402 - 3852338
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt 85  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  3852402 catcaagcccctatcgctatttaagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctattt 3852338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 4642998 - 4642934
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt 85  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| || || ||||||| |||| ||||||||||    
T  4642998 catcaagcccctatcgctatttgagtattaatatac-tctagagcatcaagcccctatcgctattt 4642934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 16523626 - 16523558
Alignment:
Q  94 gctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactc 163  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    ||||||||||||| ||||    
T  16523626 gctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-aagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactc 16523558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 81
Target Start/End: Original strand, 23992286 - 23992347
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 81  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  23992286 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgct 23992347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 81
Target Start/End: Original strand, 34963229 - 34963290
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 81  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  34963229 catcaagccccaatcactatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaatcgct 34963290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 88)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 20 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 16377839 - 16377422
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||     
T  16377839 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctt 16377740  T
Q  120 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 219  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  16377739 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttacataatccaataatttggaact 16377640  T
Q  220 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 319  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  16377639 tcattatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac--aaacagcatgacataataatatcaaat 16377542  T
Q  320 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 417  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||    
T  16377541 gcaagtcaacaacatctcaattatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctccac 16377442  T
Q  418 agattataattaacttcatc 437  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  16377441 agattataattaacatcatc 16377422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 20 - 437
Target Start/End: Original strand, 7893505 - 7893922
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  7893505 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagcttcaacgtgttgagtacaaagctc 7893604  T
Q  120 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg-aac 218  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  7893605 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaac 7893704  T
Q  219 ttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 318  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  7893705 atcatcatcttcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 7893804  T
Q  319 tgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaatta--tcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttca 416  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||| || | |||  |||||||||||  |||  ||||  ||||||||||||   || ||| ||||||||||||||||||    
T  7893805 tgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataccattatttcacatcataat---cagcaacacatcttaaacagcttca 7893901  T
Q  417 cagattataattaacttcatc 437  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  7893902 cagattataattaacatcatc 7893922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 17 - 437
Target Start/End: Original strand, 44052628 - 44053051
Alignment:
Q  17 ggacatcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaa 115  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  44052628 ggacatcaagcccccatcgatatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctattttgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaa 44052727  T
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44052728 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcgtagattcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttgg 44052827  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44052828 aacatcatcatcttcatcaacttaggccgactcatgcagctcagttaaataacaacatcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 44052927  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagct 413  Q
    || |||||  || |||||||| |||||| ||   ||   |||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  44052928 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgctcataacattatatcacatcataatcaacatcagcacatcttaaacagct 44053027  T
Q  414 tcacagattataattaacttcatc 437  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  44053028 tcacagattataattaacatcatc 44053051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 20 - 397
Target Start/End: Original strand, 7798577 - 7798956
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  7798577 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgcttattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctc 7798676  T
Q  120 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 219  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  7798677 cagagcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttagaaca 7798776  T
Q  220 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  7798777 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 7798876  T
Q  320 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaa 397  Q
    ||||| || |||||||| |||||| || | |||  |||||||||||  |||| ||  ||||||| |||||||||||||||    
T  7798877 gcaagtcatcaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattgtatcacaacataatcaacatcaa 7798956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 20 - 431
Target Start/End: Original strand, 22636238 - 22636650
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  22636238 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagcacaaagctc 22636337  T
Q  120 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 219  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  22636338 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttagacatcttaattcaacaacctcttatataatccaataatttggaaaa 22636437  T
Q  220 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  22636438 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacatagacagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 22636537  T
Q  320 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 417  Q
    ||||  || |||||||| |||||| ||   ||   ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  22636538 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcgacatcaacacatctt-aacagcttcac 22636636  T
Q  418 agattataattaac 431  Q
    ||||||||||||||    
T  22636637 agattataattaac 22636650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 20 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 16240288 - 16239869
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  16240288 catcaagctcccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctatctgagctaaagctccatcatgttgagtacaaagctc 16240189  T
Q  120 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg-aac 218  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||    
T  16240188 cagggcatcaagcccccatcaatgaaatgctaatgcatggactcgacctgttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatctaataatttggaaac 16240089  T
Q  219 ttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 318  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||| | | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  16240088 atcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaacttaattaaataacaatagcaaaataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaa 16239990  T
Q  319 tgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttca 416  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| || | |||  | |||||||||  |||| ||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  16239989 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatactttaagtaatgcaaataacattatatcatatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcg 16239890  T
Q  417 cagattataattaacttcatc 437  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  16239889 cagattataattaacatcatc 16239869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 28 - 431
Target Start/End: Original strand, 12902567 - 12902973
Alignment:
Q  28 ccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggca 126  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||    
T  12902567 ccccttcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagctccagggca 12902666  T
Q  127 tcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttcatca 225  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  12902667 tcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatca 12902765  T
Q  226 tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaaga 325  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||      
T  12902766 tcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaatt 12902865  T
Q  326 caacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagatta 423  Q
    || |||||||| |||||| ||   || | ||||||||||| || || ||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12902866 catcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagatta 12902965  T
Q  424 taattaac 431  Q
    ||||||||    
T  12902966 taattaac 12902973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 57 - 430
Target Start/End: Original strand, 14038498 - 14038863
Alignment:
Q  57 tccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgca 156  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14038498 tccagggcatcaagcccccatcgctatt-gagctaaagctccatcatgttgagca-aaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgca 14038595  T
Q  157 tgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagct 256  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14038596 tggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataattt--------atcatcttcatcaacttagactgactcatgcagct 14038687  T
Q  257 tagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactc 356  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  14038688 tagttaaataacaacagcaacacatgcagtatacaaaaacaacatggcataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacattcatatttc 14038787  T
Q  357 aagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaa 430  Q
    |||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14038788 aagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatgttaaacagcttcacagattataattaa 14038863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 59 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 16270515 - 16270145
Alignment:
Q  59 cagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 158  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16270515 cagggcatcaagcccccatctctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtccaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 16270416  T
Q  159 aactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg-aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctt 257  Q
     |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16270415 gactcgatctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaacatcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagctt 16270316  T
Q  258 agttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactca 357  Q
    | ||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| || | |||  |||    
T  16270315 aattaaataacaatagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagttaacaacatcttaaatattcaattatacttca 16270217  T
Q  358 agtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataat 427  Q
    ||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16270216 agtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataat 16270145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 123 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 54798969 - 54798669
Alignment:
Q  123 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  54798969 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaaaatcttaaatcgacaacctcttatataatccaatactttggaacttca 54798870  T
Q  223 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 322  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54798869 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttgaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 54798770  T
Q  323 agacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattatcacatcataatcaacatcaaaacatctt-aaacagcttcacagat 421  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        || ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  54798769 agtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat--------aagtatgacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagcttcacagat 54798678  T
Q  422 tataattaa 430  Q
    ||| |||||    
T  54798677 tatcattaa 54798669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 123 - 430
Target Start/End: Original strand, 14280219 - 14280518
Alignment:
Q  123 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 222  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  14280219 ggcatcaagccctcaactttaaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaattgacaaactcttgtataatccaataatttggaacttca 14280318  T
Q  223 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 322  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14280319 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-ggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 14280417  T
Q  323 agacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattatcacatcataatcaacatcaaaacatctt-aaacagcttcacagat 421  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||        || ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  14280418 agtcaacaacatctcaaatatagattcataattcaagtaat--------aagtatgacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagcttcacagat 14280509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 18215540 - 18215280
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||     
T  18215540 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctctcatataatccaataatttga 18215441  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18215440 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 18215342  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  18215341 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 18215280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 116 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 44929146 - 44928829
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44929146 gctccagggcatcaagccaccaacaatgaaatgctaatccatggattcgacctcttaaacatctttaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 44929047  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  44929046 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatgtc 44928947  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaa-cagc 412  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| |||  |||||||  |||| |||||| ||| |||| |||| ||||    
T  44928946 aaatgcaagtcaataacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataaacaacataaaatcatcataaatcagc 44928847  T
Q  413 ttcacagattataattaa 430  Q
    ||||||||| || |||||    
T  44928846 ttcacagatcatcattaa 44928829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 123 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 12565 - 12313
Alignment:
Q  123 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12565 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttca 12467  T
Q  223 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 322  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12466 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 12368  T
Q  323 agacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    || ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  12367 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 12313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 15118617 - 15118358
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15118617 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 15118519  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15118518 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 15118420  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  15118419 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 15118358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 23374672 - 23374264
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 118  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||    
T  23374672 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccagggcatcaagccccaatcgctattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagct 23374573  T
Q  119 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  23374572 ccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaactcgacaacctcttatattaatccaataatttggaa 23374474  T
Q  218 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 317  Q
          |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||  |||||||    
T  23374473 ------catcttcaacaacttagaacgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaa 23374380  T
Q  318 atgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttc 415  Q
     |||||  ||||||||||| |||||| ||   |   |||||||||||| || || ||  ||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||    
T  23374379 ttgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacagatcttaaaaagcttc 23374280  T
Q  416 acagattataattaac 431  Q
    | |||||||| |||||    
T  23374279 agagattatagttaac 23374264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 44773352 - 44773093
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44773352 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 44773254  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44773253 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 44773155  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  44773154 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacaaataattcaagtaatgcatatacaattat 44773093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 50222604 - 50222345
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50222604 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 50222506  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50222505 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cattatacaaaaacagcatgacataataatatc 50222407  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  50222406 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 50222345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Original strand, 52312407 - 52312666
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  52312407 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 52312505  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52312506 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 52312604  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  52312605 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 52312666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Original strand, 44615185 - 44615444
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44615185 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcaacaacctcttatataatccaataatttgg 44615283  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  44615284 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaatacagcatgacataataatatc 44615382  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  44615383 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 44615444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 116 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 18239684 - 18239426
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18239684 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 18239586  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18239585 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcagcacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 18239487  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaatta 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| |||||    
T  18239486 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaatta 18239426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 123 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 52873582 - 52873363
Alignment:
Q  123 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  52873582 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaacatca 52873483  T
Q  223 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  52873482 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 52873383  T
Q  323 agacaacaacatctcaaata 342  Q
    || ||||| ||||| |||||    
T  52873382 agtcaacatcatcttaaata 52873363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 116 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 1837774 - 1837522
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1837774 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 1837676  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  1837675 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatacc 1837577  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtata 370  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| ||||    
T  1837576 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatata 1837522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 116 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 8575088 - 8574784
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||    
T  8575088 gctccagggcatcaagcccc-aacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatccacaacctcttatataatccaatgctttgg 8574990  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8574989 aacctcatcatcttaattaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatac-aaaacaacatgacataataatatc 8574892  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattatcacatcataatcaacatcaaaacat-cttaaacagctt 414  Q
    ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        || ||  ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  8574891 aaatgtaattcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat--------aagtacgacatcataatcaacatcaacacatcctaaaacagctt 8574800  T
Q  415 cacagattataattaa 430  Q
    || ||||||| |||||    
T  8574799 catagattatcattaa 8574784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 15355591 - 15355330
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  15355591 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacttcttaaatcgactacctcttatataatccaataatttgg 15355492  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15355491 aacttcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacac-agcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 15355393  T
Q  316 aaatgcaagacaa-caacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||| ||| ||   |||| |||| |||||| |||| ||||||    
T  15355392 aaatgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattat 15355330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 20 - 431
Target Start/End: Original strand, 17046288 - 17046700
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||  ||||| ||||||    
T  17046288 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatactttcagggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtgcaaagc 17046387  T
Q  118 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttgga 216  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  17046388 tccagggcatcaagccctcaactatgaa-tgttaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttgga 17046486  T
Q  217 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | |||||   | |||||||||||||||| |||||    
T  17046487 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtat---agaacaacatgacataattatatc 17046583  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaa-attat--cacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagc 412  Q
    |||| |||  || |||||||| |  ||||||  |||   |||||||||  ||||||| |||||  |||||| ||||||||| ||| | ||||||  ||||    
T  17046584 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaat--gtataaacattataacacatcttaatcaacaacaacatatcttattcagc 17046681  T
Q  413 ttcacagattataattaac 431  Q
    |||||||||||||||||||    
T  17046682 ttcacagattataattaac 17046700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 20 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 14053621 - 14053202
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||    
T  14053621 catcaagcccccatcgctattttagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagc 14053522  T
Q  118 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttgga 216  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| || | ||||||||||||||    
T  14053521 tccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttacattagtccaataatttgga 14053423  T
Q  217 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    || |||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| || || |  ||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  14053422 acatcatcatcttcaacatcttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaaacaacagcatagacagtatac--aaacagcatgacataataatatc 14053325  T
Q  316 aaatgcaagacaacaaca-tctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat-tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagct 413  Q
    || | |||  || ||||| ||| |   |||||   ||   ||||||||||| || | | | ||||||||||||||||||| ||| | |||||| || |||    
T  14053324 aatttcaattcatcaacattcttatgcatacaaatattcttcaagtaatgcataaacattatatcacatcataatcaacaacaacatatcttatacggct 14053225  T
Q  414 tcacagattataattaacttcat 436  Q
    |||||||||||||||||| ||||    
T  14053224 tcacagattataattaacctcat 14053202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 7641447 - 7641198
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7641447 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 7641349  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||    
T  7641348 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaac-----------acaaaaacaacatgacataataatatc 7641260  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| |||  |   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  7641259 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattatttacatataattcaagtaatgcatatacaattat 7641198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 124 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 51464124 - 51463874
Alignment:
Q  124 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 223  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  51464124 gcatcaagcccccaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaac-tcttgtataatccaataatttggaacttcat 51464027  T
Q  224 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 323  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51464026 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 51463928  T
Q  324 gacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
      ||||||| |||||| ||| ||   |||| |||| |||||| |||| ||||||    
T  51463927 atcaacaacgtctcaattattcacatataattcaaataatgcatatataattat 51463874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 59 - 303
Target Start/End: Original strand, 3096134 - 3096379
Alignment:
Q  59 cagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcat 157  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||| |||| ||| || |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3096134 cagggcgtcaagcccccatcgctaatttgagctaatgcttcaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcat 3096232  T
Q  158 gaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatcc-aataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagct 256  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3096233 ggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattattctaataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagct 3096332  T
Q  257 tagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatga 303  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  3096333 tagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatga 3096379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 124 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 23803521 - 23803271
Alignment:
Q  124 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 223  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||    
T  23803521 gcatcaagcccacaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaac-tcttgtataattcaataatttggaacttcat 23803424  T
Q  224 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 323  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23803423 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 23803325  T
Q  324 gacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
      ||||||| ||| || ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  23803324 atcaacaacgtctaaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattat 23803271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 124 - 377
Target Start/End: Original strand, 12610856 - 12611099
Alignment:
Q  124 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 223  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12610856 gcatcaagcccccaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaac-tattgtataatccaataatttggaacttcat 12610953  T
Q  224 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 323  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12610954 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca--------acaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 12611045  T
Q  324 gacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
      ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  12611046 atcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattat 12611099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 146 - 430
Target Start/End: Original strand, 44102140 - 44102425
Alignment:
Q  146 atgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccga 245  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44102140 atgctaatgcatggactcgacctcttagacatcttaaatcgacaaactcttgtataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccga 44102239  T
Q  246 ctcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatac 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||| |    
T  44102240 ctcatgcagcttagttaaataacaacaataacac-agtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtaaacaacgtctcaattattc 44102338  T
Q  346 attcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 430  Q
    |   |||| ||||||||||| |||| |||  |||||||  |||| || ||||||| |||| |||| ||||||||||||| || |||||    
T  44102339 acatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-catcatcaaatcatcataaatcagcttcacagatcatcattaa 44102425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 173 - 431
Target Start/End: Original strand, 7088832 - 7089093
Alignment:
Q  173 aacatcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaac 271  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7088832 aacatcttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttagaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaac 7088931  T
Q  272 agcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataa 371  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  || |||||||| | |||| ||   || | ||||||||||| || ||    
T  7088932 agcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttacatattcaaatattattcaagtaatgcataaaa 7089031  T
Q  372 aat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaac 431  Q
     ||  |||||||||||||| | || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7089032 cattatatcacatcataattagcaacaacacatcttaaacaacttcacagattataattaac 7089093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 64 - 288
Target Start/End: Original strand, 15551663 - 15551889
Alignment:
Q  64 catcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaact 162  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  15551663 catcaagcccccatcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggact 15551761  T
Q  163 cgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagtt 261  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15551762 cgacctattaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagtt 15551861  T
Q  262 aaataac-aacagcaacacaagcagtat 288  Q
    ||||||| |||||||||| | |||||||    
T  15551862 aaataacaaacagcaacataggcagtat 15551889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 135 - 364
Target Start/End: Original strand, 6899808 - 6900037
Alignment:
Q  135 ccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaa-cttcatcatcttcatc 233  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  6899808 ccaataatgaaatgctaatgcatggattcgacctcttaaacattttaattcgaaaacctcttatataattcaataatttggaaacatcatcatcttcatc 6899907  T
Q  234 aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaaca 333  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6899908 aacttagaccgactcatgcatcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatac-aaaacaacatagcataataatatcaaatgcaagtcaacaaca 6900006  T
Q  334 tctcaaatatacattcataactcaagtaatg 364  Q
    ||| |||||| || | |||  ||||||||||    
T  6900007 tcttaaatattcaattatacttcaagtaatg 6900037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 124 - 324
Target Start/End: Original strand, 15369925 - 15370124
Alignment:
Q  124 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaacttca 222  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||    
T  15369925 gcatcaagcccccaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacatca 15370023  T
Q  223 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 322  Q
     |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15370024 acatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 15370122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 124 - 324
Target Start/End: Original strand, 15371109 - 15371308
Alignment:
Q  124 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaacttca 222  Q
    |||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||    
T  15371109 gcatcaagcccccaacaaagaa-tggtaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacatca 15371207  T
Q  223 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 322  Q
     |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15371208 acatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 15371306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 124 - 430
Target Start/End: Original strand, 15367597 - 15367905
Alignment:
Q  124 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttca 222  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||    
T  15367597 gcattaagcccccaacaaagaa-tgctaatgaatggactcgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatca 15367695  T
Q  223 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 322  Q
     |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15367696 acatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 15367794  T
Q  323 agacaa-caacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaa-cagcttcaca 418  Q
    || ||| |||| |||||| ||| ||   |||| |||| ||| || |||| |||  |||||||  |||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  15367795 agtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttcaca 15367893  T
Q  419 gattataattaa 430  Q
    ||| || |||||    
T  15367894 gatcatcattaa 15367905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 124 - 430
Target Start/End: Original strand, 15402610 - 15402918
Alignment:
Q  124 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaacttca 222  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||    
T  15402610 gcatcaagcccccaacaaagaa-tgcaaatgcatggactcgacttcttaaccatcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacatca 15402708  T
Q  223 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 322  Q
     |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15402709 acatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 15402807  T
Q  323 agacaa-caacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaa-cagcttcaca 418  Q
    || ||| |||| |||||| ||| ||   |||| |||| ||| || |||| |||  |||||||  |||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  15402808 agtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttcaca 15402906  T
Q  419 gattataattaa 430  Q
    ||| || |||||    
T  15402907 gatcatcattaa 15402918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 145 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 19618415 - 19618178
Alignment:
Q  145 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatc------ttcatcaactt 238  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||| ||||||| |||||||| | ||||||      || ||||||||    
T  19618415 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttaaatagtccaatagtttggaacattatcatcaacatcttaatcaactt 19618316  T
Q  239 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctca 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  19618315 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctca 19618217  T
Q  339 aatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    | ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  19618216 attattcacctataattcaagtaatgcatatataattat 19618178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 124 - 324
Target Start/End: Original strand, 15373390 - 15373589
Alignment:
Q  124 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaacttca 222  Q
    |||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||| ||| |||    
T  15373390 gcatcaagcccccaacaaagaa-tggtaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttgaaacatca 15373488  T
Q  223 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 322  Q
     |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15373489 acatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 15373587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 195 - 377
Target Start/End: Original strand, 19242675 - 19242855
Alignment:
Q  195 ttatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaa 294  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  19242675 ttatataatccaataatttgga-cttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaa 19242772  T
Q  295 acaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  19242773 acagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattat 19242855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 124 - 324
Target Start/End: Original strand, 16223439 - 16223638
Alignment:
Q  124 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttca 222  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||    
T  16223439 gcattaagcccccaacaaagaa-tgctaatgaatggactcgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatca 16223537  T
Q  223 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 322  Q
     |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  16223538 acatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatctaatgca 16223636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 195 - 377
Target Start/End: Original strand, 3514982 - 3515163
Alignment:
Q  195 ttatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaa 294  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3514982 ttatataatccaataatttagaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaaaaacaacagcaacac-agcagtatacaaaa 3515080  T
Q  295 acaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  3515081 acagcaagacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattat 3515163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 145 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 14970950 - 14970713
Alignment:
Q  145 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatc------ttcatcaactt 238  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||      || ||||||||    
T  14970950 aatgctaatgcatcgactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacatcatcatcaacattttaatcaactt 14970851  T
Q  239 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctca 338  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  14970850 agaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaaaca-gcaatatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctca 14970752  T
Q  339 aatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    | ||| ||   |||| ||||||||| | |||| ||||||    
T  14970751 attattcacatataattcaagtaatacatatataattat 14970713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 123 - 324
Target Start/End: Original strand, 20149735 - 20149932
Alignment:
Q  123 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 222  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || || || || ||||||||||||||||||||||       
T  20149735 ggcatcaagccctcaactttaaaatgctaatgcatggactcgacctctttaacatcttaaattgataaactcttgtataatccaataatttggaact--- 20149831  T
Q  223 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 322  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||  | ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20149832 tcatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttgataaaataacaacagcgacac-atcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 20149930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 201 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 21815761 - 21815591
Alignment:
Q  201 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaaca 300  Q
    |||||||||| ||||||| |||||  |||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||    
T  21815761 aatccaataaattggaacatcatc--cttcatc---ttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacgacagcaacacaa-ctgtatacaaaaacagca 21815668  T
Q  301 tgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  21815667 tgacataataatataaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 21815591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 187 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 52243343 - 52243099
Alignment:
Q  187 acaacctattatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagca 284  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||   ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  52243343 acaacctcttatataaatccaataatttggaac---atcttctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggca 52243249  T
Q  285 gtatacaaa-aacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcaca 381  Q
    |||| ||||  |   ||||| |||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||| || |||  ||||  |||||||||| |||| |||  |||||||    
T  52243248 gtatgcaaatcagttcatgatataacaatatcaaatgaaattcaacaacatctcaaacattcatatataatccaagtaatgcatatacaattatatcaca 52243149  T
Q  382 tcataatcaacatcaaaacatctta-aacagcttcacagattataattaa 430  Q
    | |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  52243148 ttataaacaacatcaaatcatcttataacagcttcacagatcatcattaa 52243099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 123 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 14061 - 13789
Alignment:
Q  123 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaat-cgacaacctattatataa-tccaataatttggaactt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||| ||  || || |||||||||  | || |||| |||||||| ||||||||||||||||      
T  14061 ggcatcaagcccccaacaatgaa-tgtgaatgcatggactcaacaactcaa-catcttaaaaacaacgacctcttatataaatccaataatttggaac-- 13966  T
Q  221 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 319  Q
     ||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  13965 -atcttctt--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaat 13870  T
Q  320 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaa 398  Q
    ||||| || ||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||  |||| |||  |||||||| |||| ||||||||||    
T  13869 gcaagtcatcaacatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaa 13789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 116 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 39706511 - 39706302
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctatta-tata-atccaataatt 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||  ||||| | ||||| || | ||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  39706511 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaatatatatccaataatt 39706414  T
Q  213 tggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataa 311  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||    
T  39706413 tggaacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaa 39706315  T
Q  312 tatcaaatgcaag 324  Q
    |||| ||||||||    
T  39706314 tatcgaatgcaag 39706302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 40 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 17048609 - 17048409
Alignment:
Q  40 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaa 138  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  17048609 ttgagtattaatatacttccagggcat-atgcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaa 17048512  T
Q  139 caatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaact 237  Q
    |||    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||| |  | || ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  17048511 caaatgtatgctaatgcatggactcgatctcttaaacatcat-aatc-atcatctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacaact 17048414  T
Q  238 tagac 242  Q
    |||||    
T  17048413 tagac 17048409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 285
Target Start/End: Original strand, 12569820 - 12570078
Alignment:
Q  25 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaagg 124  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  12569820 agcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgttatttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccaggg 12569918  T
Q  125 catcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgga--actt 220  Q
     || |||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| |  | || |||||| |||||||||||||||   |      
T  12569919 tat-aagcccccaacatatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatctt-aatc-atcatctcttatat-atccaataatttggagttcaa 12570013  T
Q  221 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcag 285  Q
    ||||||||| |||| |||| |  |||||||||| | |||||||||||||| |||| || ||||||    
T  12570014 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcatcatagttaaataacaatagcagcataagcag 12570078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 124 - 377
Target Start/End: Original strand, 22353740 - 22353993
Alignment:
Q  124 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa-catcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttggaact-t 220  Q
    |||||||||||| | || |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||  ||| |||||| |||| |||||||||| | | |    
T  22353740 gcatcaagccccaatcactgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaaacatcttaatttgac--cctcttatattaatcgaataatttgggaatat 22353836  T
Q  221 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatg 320  Q
    |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||  |  |  ||||||||||||||| |||||||| |     
T  22353837 catcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttaggtaaataacaacagcagcataggcagattgtagcaacaacatgacataacaatatcaatta 22353936  T
Q  321 caagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    |||  ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  22353937 caattcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 22353993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 116 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 43198769 - 43198492
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttg 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||  || || | ||||| |   ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  43198769 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaactcaacc-tcttagaa--acaacctcttatataaatccaataatttg 43198674  T
Q  215 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaa--catgacataataa 311  Q
    ||||   ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  || ||| | |||||||  ||||| ||||  |    
T  43198673 gaac---atcttctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacaatatgc-aaaacaattcatgatataacca 43198580  T
Q  312 tatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaa 397  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||  |||| ||||||||||  |||| |||  |||||||| |||| |||||||||    
T  43198579 tatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 43198492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 182
Target Start/End: Original strand, 44675436 - 44675593
Alignment:
Q  25 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  44675436 agcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgttaatttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagg 44675534  T
Q  124 gcatcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 182  Q
    ||||  ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  44675535 gcat-gagcccccaacatatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatcttaa 44675593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 174
Target Start/End: Original strand, 13569306 - 13569454
Alignment:
Q  25 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||| | |||| |||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  13569306 agcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaatttcagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagg 13569404  T
Q  124 gcatcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa 174  Q
    ||||  ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  13569405 gcat-gagcccccaacatatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaa 13569454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 113 - 339
Target Start/End: Original strand, 12773910 - 12774128
Alignment:
Q  113 aaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatt 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||  || |  | |||||| || |||||| | ||| | | ||||| | ||||||||||    
T  12773910 aaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgttaatgcatcgacacatcatcttaa-caacttaaaacaacatcatcttata-agtccaataatt 12774006  T
Q  213 tggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataa 311  Q
    || |    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||    
T  12774007 tgaa----catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaa 12774101  T
Q  312 tatcaaatgcaagacaacaacatctcaa 339  Q
    |||| ||| |||  ||||||||||||||    
T  12774102 tatcgaatacaa-tcaacaacatctcaa 12774128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 15125354 - 15125197
Alignment:
Q  25 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 123  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  15125354 agcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgttaatttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagg 15125256  T
Q  124 gcatcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 182  Q
    | ||  ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  15125255 gaat-gagcccccaacatatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatcttaa 15125197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 182
Target Start/End: Original strand, 23843282 - 23843439
Alignment:
Q  25 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 123  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||| | || |||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  23843282 agcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgttaatttgagccaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagg 23843380  T
Q  124 gcatcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 182  Q
    ||||  ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  23843381 gcat-gagcccccaacatatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatcttaa 23843439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 201 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 12288342 - 12288211
Alignment:
Q  201 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaa-aacaa 298  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||  |       
T  12288342 aatccaataatttggaac---atcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccagtt 12288248  T
Q  299 catgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatc 335  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  12288247 catgatataacaatatcaaatgcaattcaacaacatc 12288211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 145 - 293
Target Start/End: Original strand, 8846287 - 8846433
Alignment:
Q  145 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagacc 243  Q
    |||||||||||||| || | || |||||| || |||| | | ||||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||    
T  8846287 aatgctaatgcatggacacaacatcttaa-caacttagaacaacaacctcttaaataagtccaataatttggaacatcatcatc---atcaacttagacc 8846382  T
Q  244 gactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaa 293  Q
    |||| || ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||    
T  8846383 gacttattcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 8846433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 40 - 182
Target Start/End: Original strand, 15093594 - 15093736
Alignment:
Q  40 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaa 138  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||  |||||||||    
T  15093594 ttgagtattaatatacttccagggcat-aagccaccatcgctaatttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggcat-gagcccccaa 15093691  T
Q  139 ca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctct-taaacatcttaa 182  Q
    || |||  ||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||    
T  15093692 catatg-tatgctaatgcatggactcgatctctaaaaacatcttaa 15093736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 169
Target Start/End: Original strand, 29267517 - 29267570
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctc 169  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  29267517 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctc 29267570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 236 - 370
Target Start/End: Original strand, 6190481 - 6190616
Alignment:
Q  236 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaa-ca 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| | |||| || |||||| | |||||||||| |||||| |||| |||  ||||| ||    
T  6190481 cttagaccgactcatgcagcttagttaaacatcaaacagcaacataggcagcattcaaaaatagcatgacataacaatatc-aatgtaagcgaacaatca 6190579  T
Q  334 tctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtata 370  Q
    |||||| ||| |||| | |  ||||||||||||||||    
T  6190580 tctcaattattcatttaaacttcaagtaatgcgtata 6190616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 15122101 - 15121956
Alignment:
Q  37 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccc 135  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||| | ||||| || |||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  15122101 tattttagtattaatatactttcagggcatgag-cccccattgttattttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccc 15122004  T
Q  136 caacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 182  Q
    ||||||    ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  15122003 caacaaatgtatgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatcttaa 15121956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 375 - 437
Target Start/End: Original strand, 3096803 - 3096865
Alignment:
Q  375 tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcatc 437  Q
    |||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  3096803 tatctcatcataatcagcaacaacacatcttaaacagcttcacatattataattaacctcatc 3096865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 375 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 17048033 - 17047979
Alignment:
Q  375 tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataatta 429  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  17048033 tatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacaggttgtaatta 17047979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 19618551 - 19618499
Alignment:
Q  35 gctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  19618551 gctatttgagtattattatacttccagagcatcaaaccccaatcgctatttga 19618499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 46640675 - 46640453
Alignment:
Q  113 aaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataat 211  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||   ||||||| |||| || |||||| ||||||| | |  | |||| |||||||| |||||||||    
T  46640675 aaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgagtatgcatggactcaacatcttaa-catcttagaccatcgacctcttatataaatccaataat 46640578  T
Q  212 ttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaa-acaacatgacataat 309  Q
    ||| |||  |||  | ||||||   |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |  ||||||| |||| |   ||||| ||||     
T  46640577 ttgaaacaacat--ttttcatc---ttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatagacagtatataaaacagttcatgatataac 46640483  T
Q  310 aatatcaaatgcaagacaacaacatctcaa 339  Q
    ||||||||||| ||  ||| ||||||||||    
T  46640482 aatatcaaatgaaaatcaataacatctcaa 46640453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Original strand, 19242536 - 19242603
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||    
T  19242536 catcaagcccctatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgctatttga 19242603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Original strand, 22353609 - 22353676
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||    
T  22353609 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaatcactatttga 22353676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14927955 - 14927843
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatata-atccaataatttg 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||  ||| ||| | ||| | | ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  14927955 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatggacacaacaactt-aactttttataacaacaacctcttatatatatctaataatttg 14927858  T
Q  215 gaacttcatcatctt 229  Q
    |||| ||||||||||    
T  14927857 gaacatcatcatctt 14927843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 53082284 - 53082202
Alignment:
Q  201 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagta 287  Q
    ||||||||||||||||||   | ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||    
T  53082284 aatccaataatttggaac---aacatctt--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagta 53082202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 85
Target Start/End: Original strand, 15705192 - 15705256
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt 85  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  15705192 catcaagcccctatcgctatttgagtattaatatactt-cagagcatcaagcccctatcgctattt 15705256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 14971145 - 14971078
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||  |||| ||||||||||||    
T  14971145 catcaagcccctatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaggccccaatcgctatttga 14971078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Original strand, 19242493 - 19242559
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  19242493 catcaagcccctatcgctatttaagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctatttga 19242559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Original strand, 22353653 - 22353720
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||    
T  22353653 catcaagccccaatcactatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgctatttga 22353720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 299 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 15464970 - 15464892
Alignment:
Q  299 catgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||  |||| ||||||| ||| |||| ||||||    
T  15464970 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtattgcatatacaattat 15464892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 85
Target Start/End: Original strand, 12610728 - 12610792
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt 85  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  12610728 catcaagcccttatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctattt 12610792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 85
Target Start/End: Original strand, 12610771 - 12610835
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt 85  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  12610771 catcaagcccctatcgctatttaagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctattt 12610835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 85
Target Start/End: Original strand, 15367512 - 15367576
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt 85  Q
    ||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  15367512 catcaagcccctgtcactatttaagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctattt 15367576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 81
Target Start/End: Original strand, 19242580 - 19242641
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 81  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  19242580 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagcccctatcgct 19242641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 23803606 - 23803542
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt 85  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  23803606 catcaagccccaatcgctatttaagtattaatatac-tccaaggcatcaagccccaatcgctattt 23803542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 23803649 - 23803585
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt 85  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  23803649 catcaagcccctatcgctatttaagtattaatatac-tccaaggcatcaagccccaatcgctattt 23803585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 51464209 - 51464145
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt 85  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  51464209 catcaagcccctatcgctatttaagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctattt 51464145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 238 - 278
Target Start/End: Original strand, 17333298 - 17333338
Alignment:
Q  238 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 278  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  17333298 tagactgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaaca 17333338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 43 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 39706598 - 39706543
Alignment:
Q  43 agtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctcca 99  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || || |||| |||||||||||    
T  39706598 agtattaatatacttccagggcatcaagcccccaacg-taattgagctaaagctcca 39706543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 297; Significance: 1e-167; HSPs: 130)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 20 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 40214038 - 40213620
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40214038 catcaagcccacatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctc 40213939  T
Q  120 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 219  Q
    || | |||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40213938 caggacatcaagccatccacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaact 40213839  T
Q  220 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 319  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  40213838 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacatcaacac-agcagtatacataaacatcatgacataataatatcaaat 40213740  T
Q  320 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 417  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  40213739 gcaagtcaacaacatctcaattatacattcataatccaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctttac 40213640  T
Q  418 agattataattaacttcatc 437  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  40213639 agattataattaacatcatc 40213620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 43 - 437
Target Start/End: Original strand, 14972682 - 14973076
Alignment:
Q  43 agtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaat 142  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| | || |||||| | |||||| |||||||||||    
T  14972682 agtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctatt-gagctaaagctccatcgtgttgagca-aaggctccaggacatcaatcccccaacaat 14972779  T
Q  143 gaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagac 242  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14972780 gaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagac 14972879  T
Q  243 cgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaata 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  14972880 cgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaatcaacaacatctcatata 14972979  T
Q  343 tacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcatc 437  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  14972980 tacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcatagattataattaacatcatc 14973076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 20 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 25476701 - 25476290
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    |||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  25476701 catcaagccctcatcgctatt-gagtattaatatacttacagggcatcaa-cccccatcactatttgagctaaagctccatcttgttgagtacaaagctc 25476604  T
Q  120 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 219  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  25476603 cagggcatcaaacccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaca 25476504  T
Q  220 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25476503 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaaaaacaacagcaacacaggtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 25476404  T
Q  320 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 417  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||  ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  25476403 gcaagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgcataacattatatcacatcattatcatcatcaacacatcttaaacagcttcac 25476304  T
Q  418 agattataattaac 431  Q
    ||||| ||||||||    
T  25476303 agattgtaattaac 25476290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 20 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 23083679 - 23083260
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||    
T  23083679 catcaagcccccatcactatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaaactc 23083580  T
Q  120 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 219  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  23083579 caaggcatcaaacccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaaca 23083480  T
Q  220 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |    
T  23083479 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaatt 23083380  T
Q  320 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 417  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| || |  ||  || ||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  23083379 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattttacttctagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaatatcaacacatcttaaacagcttcac 23083280  T
Q  418 agattataattaacttcatc 437  Q
    ||||| |||||||| |||||    
T  23083279 agattgtaattaacatcatc 23083260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 20 - 437
Target Start/End: Original strand, 17487659 - 17488078
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  17487659 catcaagcccccatcactatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctc 17487758  T
Q  120 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 219  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  17487759 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaca 17487858  T
Q  220 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  17487859 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 17487958  T
Q  320 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 417  Q
    ||||  || |||||||| |||||| ||   ||   ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  17487959 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagattcac 17488058  T
Q  418 agattataattaacttcatc 437  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  17488059 agattataattaacatcatc 17488078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 20 - 431
Target Start/End: Original strand, 43840735 - 43841148
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  43840735 catcaaacccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctatttgagctaaagctctttcgtgttgagtacaaagctc 43840834  T
Q  120 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 219  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  43840835 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaca 43840934  T
Q  220 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 319  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  43840935 tcattatcttcatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 43841034  T
Q  320 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 417  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| || | |||  |||||||||||  |||| ||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43841035 gcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 43841134  T
Q  418 agattataattaac 431  Q
    ||||||||||||||    
T  43841135 agattataattaac 43841148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 20 - 437
Target Start/End: Original strand, 18438337 - 18438756
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  18438337 catcaagcccccatcgctatt-gagtattaatatacttccagggcatcaagcccccttcactatttgagctaaaactccatcgtgttgagtacaaagctc 18438435  T
Q  120 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttg-gaac 218  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||    
T  18438436 cagggcatcaagcctccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttgaaaac 18438535  T
Q  219 ttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 318  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18438536 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaa 18438635  T
Q  319 tgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttca 416  Q
    |||||| |||||||||||    |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18438636 tgcaagtcaacaacatcttttttatacattcatatctcaagtaatgcatataacattatatcacatcatattcaacatcaacacatcttaaacagcttca 18438735  T
Q  417 cagattataattaacttcatc 437  Q
    ||||||||| ||||| |||||    
T  18438736 cagattatagttaacatcatc 18438756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 20 - 437
Target Start/End: Original strand, 17499141 - 17499560
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  17499141 catcaagcccccatcactatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctc 17499240  T
Q  120 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 219  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  17499241 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaca 17499340  T
Q  220 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  17499341 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 17499440  T
Q  320 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 417  Q
    ||||  || |||||||| |||||| ||   ||   ||||||||||| ||||| ||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  17499441 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaacacatcttaaacagattcac 17499540  T
Q  418 agattataattaacttcatc 437  Q
    | |||||||||||| |||||    
T  17499541 aaattataattaacatcatc 17499560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 57 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 11425040 - 11424668
Alignment:
Q  57 tccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgca 156  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11425040 tccagagcatcaagcccccatcactatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgca 11424941  T
Q  157 tgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagct 256  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11424940 tggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagct 11424841  T
Q  257 tagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactc 356  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||  ||||   | ||||||||||| ||| ||||||||| ||    
T  11424840 tagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataacaatatcaatagcaa---atcaacatctcaattatgcattcataattc 11424745  T
Q  357 aagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaac 431  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11424744 aagtaatgcgtataacattatatcacatcataaacaacttcaacacatcttaaacagcttcacagattaaaattaac 11424668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 59 - 437
Target Start/End: Original strand, 13442115 - 13442496
Alignment:
Q  59 cagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcat 157  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  13442115 cagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatattaatgcat 13442214  T
Q  158 gaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctt 257  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13442215 ggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctt 13442314  T
Q  258 agttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactca 357  Q
    |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||| |||||| ||   ||   |||    
T  13442315 agttaaataacaacggcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttca 13442414  T
Q  358 agtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcatc 437  Q
    ||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13442415 agtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatc 13442496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 59 - 431
Target Start/End: Original strand, 26686729 - 26687103
Alignment:
Q  59 cagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 158  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||| | | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26686729 cagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaaactccaacatgttgagtacaaagctctagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 26686828  T
Q  159 aactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctta 258  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26686829 gactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatatagtccaataatttggaacatcatcatcttcttcaacttagaccgactcatgcagctta 26686928  T
Q  259 gttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaa 358  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||| |  | |||  ||||    
T  26686929 gttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatcttaaatattccattatacttcaa 26687028  T
Q  359 gtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaac 431  Q
    |||||||  |||| ||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26687029 gtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaac 26687103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 20 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 20698755 - 20698335
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||| |||  |||||||||||||    
T  20698755 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttgcatagcatcaagcccccatcgctaatttgagttaaagctccaacgtggtgagtacaaagct 20698656  T
Q  119 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttggaa 217  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  20698655 ccagggaatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaa 20698556  T
Q  218 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 317  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  20698555 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacgtaataatatcaa 20698456  T
Q  318 atgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat-tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttca 416  Q
     |||||  || |||||||| | |||| ||   ||   ||||||||||| || | | | |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  20698455 ttgcaattcatcaacatcttatatattcaaatattcttcaagtaatgcataaacattatatcacatcataatcaacttcaacacatcttgaacagcttca 20698356  T
Q  417 cagattataattaacttcatc 437  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  20698355 cagattataattaacatcatc 20698335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 20 - 431
Target Start/End: Original strand, 12399011 - 12399425
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 118  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| |||  ||||||||  |||    
T  12399011 catcaagcccccattgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacagtgct 12399110  T
Q  119 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaa 217  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  12399111 ccagggcatcaagccaccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaatttgacaacctcttatattagtccaataatttggaa 12399209  T
Q  218 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 317  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  12399210 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaa 12399309  T
Q  318 atgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttc 415  Q
    ||||||  ||||||||||| |||||| ||   |   |||||||||||| ||  | ||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  12399310 atgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataagacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaatagcttc 12399409  T
Q  416 acagattataattaac 431  Q
    |||||||||| |||||    
T  12399410 acagattatagttaac 12399425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 116 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 24153430 - 24153115
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24153430 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 24153331  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | | ||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  24153330 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgatagcaacataggtagtatac-aaaacagcatgacataataatatc 24153232  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagct 413  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| || | |||  |||| ||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24153231 aaatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaaataatgcacataacataatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 24153132  T
Q  414 tcacagattataattaa 430  Q
    |||||||||||||||||    
T  24153131 tcacagattataattaa 24153115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 116 - 430
Target Start/End: Original strand, 21618345 - 21618650
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  21618345 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacttcttaaatcgacaacctcttatataatccaatactttgg 21618444  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  21618445 aacttcatcttctcaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatac-aaaacagcatgacataataatatc 21618542  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattatcacatcataatcaacatcaaaacat-cttaaacagctt 414  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        || ||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  21618543 aaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat--------aagtatgacatcataatcaacatcaacacatcctaaaacagctt 21618634  T
Q  415 cacagattataattaa 430  Q
    || ||||||| |||||    
T  21618635 catagattatcattaa 21618650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 43 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 14577124 - 14576732
Alignment:
Q  43 agtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaat 142  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  14577124 agtattaatatacgtccagggcatcaagccctcatcgctatt-gagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaaaaat 14577026  T
Q  143 gaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttaga 241  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||  ||| |||||||||||||||   |||||||  ||||||||||||    
T  14577025 gaaatgcaaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaaataacaacctcttaagtaagtccaataatttggaa---catcatcaacatcaacttaga 14576929  T
Q  242 ccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaat 341  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |  ||||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  14576928 ccgactcattcaacttagttaaataacaacagcaacatagacagtata-aacaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaat 14576830  T
Q  342 atacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcatc 437  Q
    || || | |||  ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  14576829 attcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacaacttcacagattataattaacatcatc 14576732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 116 - 430
Target Start/End: Original strand, 36166494 - 36166799
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  36166494 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcggcctctttaacttcttaaatcgacaacctcttatataatccaatactttgg 36166593  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  36166594 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacac-agcagtatac-aaaacagcatgacataataatatc 36166691  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattatcacatcataatcaacatcaaaacat-cttaaacagctt 414  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        || ||  ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  36166692 aaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat--------aagtacgacatcataatcaacatcaacacatcctaaaacagctt 36166783  T
Q  415 cacagattataattaa 430  Q
    || ||||||| |||||    
T  36166784 catagattatcattaa 36166799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 29172849 - 29172589
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  29172849 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttga 29172750  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29172749 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 29172651  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  29172650 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 29172589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Original strand, 17463075 - 17463334
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17463075 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 17463173  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17463174 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 17463272  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  17463273 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 17463334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Original strand, 34159223 - 34159482
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34159223 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 34159321  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34159322 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 34159420  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  34159421 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 34159482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 16454546 - 16454287
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16454546 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 16454448  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16454447 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 16454349  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  16454348 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 16454287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 116 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 28848876 - 28848618
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28848876 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcaacaacctcttatataatccaataatttgg 28848778  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28848777 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 28848679  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaatta 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| |||||    
T  28848678 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaatta 28848618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 123 - 377
Target Start/End: Original strand, 8898998 - 8899250
Alignment:
Q  123 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8898998 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttca 8899096  T
Q  223 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 322  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8899097 tcatcttaatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 8899195  T
Q  323 agacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    || ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  8899196 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 8899250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 13152056 - 13151796
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13152056 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 13151958  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13151957 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatat 13151859  T
Q  315 caaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  13151858 caaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 13151796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 13154521 - 13154261
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13154521 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 13154423  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13154422 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatat 13154324  T
Q  315 caaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  13154323 caaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 13154261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 38962157 - 38961897
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38962157 gctccagggcatcaagcccccaacaatgtaatgctaatgcatagactcgatctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 38962058  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38962057 aacttcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 38961959  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  38961958 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 38961897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 45607172 - 45606913
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45607172 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 45607074  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45607073 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 45606975  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  45606974 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 45606913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 116 - 334
Target Start/End: Original strand, 55500839 - 55501055
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  55500839 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 55500937  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  55500938 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 55501036  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacat 334  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  55501037 aaatgcaagtcaacaacat 55501055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 9707872 - 9707613
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  9707872 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaaactcttgtataatccaataatttgg 9707774  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9707773 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 9707675  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    |||| |||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  9707674 aaatacaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 9707613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 16283076 - 16282817
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16283076 gctccagggcatcaagcccccaacaataaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 16282978  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  16282977 aactttatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatt 16282879  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
     |||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  16282878 gaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 16282817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 17446919 - 17446661
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17446919 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgggctcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 17446821  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17446820 aacttcatcatcttaatcaacttaga-cgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 17446723  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  17446722 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatatcattcaagtaatgcatatacaattat 17446661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 123 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 7781605 - 7781353
Alignment:
Q  123 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 222  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781605 ggcatcaagccctcaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttca 7781507  T
Q  223 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 322  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7781506 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 7781408  T
Q  323 agacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    |  ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  7781407 aatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 7781353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 10247988 - 10247729
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  10247988 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttgtataatccaataatttgg 10247890  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10247889 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaacagcagcacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 10247791  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  10247790 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 10247729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 43 - 437
Target Start/End: Original strand, 14572417 - 14572810
Alignment:
Q  43 agtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaat 142  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14572417 agtattaatatacttccagagcatcaagccctcatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaat 14572516  T
Q  143 gaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttaga 241  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||  ||| |||||||||||||||   || ||||  ||||||||||||    
T  14572517 gaaatgcaaatgcatagactcgacctcttaaacatcttaaaacaacatcctcttaagtaagtccaataatttggaa---caacatcaacatcaacttaga 14572613  T
Q  242 ccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaat 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||| ||||    
T  14572614 ccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagacagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaattgagagtcaacaacatcttaaat 14572712  T
Q  342 atacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcatc 437  Q
    || || | |||  |||| |||||   | || ||  ||||||||||||| |||||| || | |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  14572713 attcaattatacttcaaataatgaaaaaaacattatatcacatcataaacaacataaacaaatcttaaacaacttcacaaattataattaacatcatc 14572810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 116 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 6469395 - 6469178
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6469395 gctccagggcatcaagcccccaacaatgacatgctaatgcatggactcgacctctta-----cttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 6469301  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6469300 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 6469202  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaa 339  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||    
T  6469201 aaatgcaagtcaacaacgtctcaa 6469178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 116 - 339
Target Start/End: Original strand, 15977409 - 15977633
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaa---tcgacaacctattatataatccaataatt 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||   |||||||||| || |||||||||||||||    
T  15977409 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaat-atcttaaaaaatcgacaacctcttgtataatccaataatt 15977507  T
Q  213 tggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataat 312  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15977508 tggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-tagtatacaaaaacaacatgacataataat 15977606  T
Q  313 atcaaatgcaagacaacaacatctcaa 339  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15977607 atcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 15977633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 63 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 24340999 - 24340628
Alignment:
Q  63 gcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaact 162  Q
    ||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  24340999 gcatcaagcctctatcgctatttgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacactgaaatgctaatgcatggact 24340900  T
Q  163 cgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattat-ataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagtt 261  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  24340899 cgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagtt 24340800  T
Q  262 aaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagt 360  Q
    || |||||| |||||||| | ||||||| | | |||| ||||| ||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||| ||   |||| ||||||    
T  24340799 aattaacaatcagcaacatatgcagtatgc-acaacatcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacatctcaaatattcacatataattcaagt 24340701  T
Q  361 aatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 430  Q
    ||||| |||| |||  |||||||| |||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||| || |||||    
T  24340700 aatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagcttcacagatcatcattaa 24340628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 13210647 - 13210333
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||    
T  13210647 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatactttcagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagct 13210548  T
Q  119 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa-catcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttgga 216  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  13210547 ccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaaacgacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttgaa 13210449  T
Q  217 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  13210448 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 13210350  T
Q  316 aaatgcaagacaacaac 332  Q
     |||||||  |||||||    
T  13210349 gaatgcaaatcaacaac 13210333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 145 - 377
Target Start/End: Original strand, 55476417 - 55476647
Alignment:
Q  145 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccg 244  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  55476417 aatgctaatgcatagactcgacctcttaaacatcttaa-tcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccg 55476515  T
Q  245 actcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatata 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||     
T  55476516 actcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 55476614  T
Q  345 cattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  55476615 cacatataattcaagtaatgcatatacaattat 55476647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Original strand, 41123787 - 41124043
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41123787 gctccagggcattaaggccccatcaatgaaatgctaatgcatggattcgacctcttaa-catcttaaatcgacaaccttttatataatccaataatttgg 41123885  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41123886 aactttatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa---caacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 41123981  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  41123982 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 41124043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 124 - 324
Target Start/End: Original strand, 8499422 - 8499621
Alignment:
Q  124 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 223  Q
    |||||||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8499422 gcatcaagcccctatcgctgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacctcat 8499521  T
Q  224 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 323  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8499522 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacac-agtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 8499620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 118 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 43550744 - 43550484
Alignment:
Q  118 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa-catcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttgg 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  43550744 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaaacatcttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttgg 43550646  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    ||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43550645 aacatcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataatgacagcaacatatgcagtatgcaaaaacaacatgacataataatatc 43550546  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||  |||| ||||||    
T  43550545 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgtatatacaattat 43550484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 117 - 340
Target Start/End: Original strand, 10556882 - 10557105
Alignment:
Q  117 ctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgga 216  Q
    ||||| ||||||||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  10556882 ctccagggcatcaagcccctatcgctgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataattcaataatttgga 10556981  T
Q  217 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  10556982 acttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacac-atcagcatacaaaaacggcatgacataataatatca 10557080  T
Q  317 aatgcaagacaa-caacatctcaaa 340  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||    
T  10557081 aatgcaagccaatcaacatctcaaa 10557105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 124 - 324
Target Start/End: Original strand, 15412333 - 15412532
Alignment:
Q  124 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 223  Q
    |||||||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15412333 gcatcaagcccctatcgctgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacctcat 15412432  T
Q  224 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 323  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15412433 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacac-agtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 15412531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 124 - 377
Target Start/End: Original strand, 50242728 - 50242978
Alignment:
Q  124 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 223  Q
    |||||||||||||||||| |||  | | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  50242728 gcatcaagcccccaacaaagaac-gttgatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaac-tcttgtataatccaataatttggaacttcat 50242825  T
Q  224 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 323  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50242826 cattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 50242924  T
Q  324 gacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
      ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  50242925 atcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattat 50242978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 124 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 12119983 - 12119784
Alignment:
Q  124 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 223  Q
    |||||||||||| | |  |||||||||||||||||  ||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12119983 gcatcaagcccctatcgctgaaatgctaatgcatggcctttacttcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcat 12119884  T
Q  224 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 323  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12119883 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttgttaaataacaacagcgacac-agcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 12119785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 20 - 425
Target Start/End: Original strand, 30029637 - 30030049
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||| |||| ||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  30029637 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagg-cat-aagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacatgttgagtacaaagctc 30029734  T
Q  120 caaggcatcaagcccccaaca--atgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaa 217  Q
    || ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||| || |||| |||||||||||||||    
T  30029735 cagggcatcaagcccccatcactatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttgtatagtccaataatttggaa 30029834  T
Q  218 cttcatcatcttca------tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataa 311  Q
    | ||||||||  ||      ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| || |  |||  ||||| |||| |||||||||| ||    
T  30029835 catcatcatcaacatctcattcaacttagactgactcatgcaacttagtttaataacaatagcagcatagacagattacaacaacagcatgacataagaa 30029934  T
Q  312 tatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaac 409  Q
    |||||  |||||  | ||||| ||| |||||| || | | |  ||||||||||   | || ||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  30029935 tatcatttgcaattc-acaacgtcttaaatattcaataaaacttcaagtaatgtacacaacattatatcacatcataatcaatgtcaaaacatcttaaac 30030033  T
Q  410 agcttcacagattata 425  Q
    ||||||||| ||||||    
T  30030034 agcttcacatattata 30030049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 20 - 430
Target Start/End: Original strand, 23274489 - 23274903
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 118  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||| |||||||||| || |||| |||||| |||  |||||||||||||    
T  23274489 catcaaacccctatcgctatttgagtattattatact-ccagggcatcaagcccctatcgctattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagct 23274587  T
Q  119 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattat-ataatccaataatttggaa 217  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||| ||| ||||||| |||| ||    
T  23274588 ccagggcatcaagcccccaacactgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaatttgacaaccttttataatagtccaatactttgaaa 23274687  T
Q  218 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 316  Q
    | ||| |||||||    |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| | ||||||| | |||||| ||||| |||||||||||     
T  23274688 catcaacatcttcgatgacttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgc-aaaacatcatgatataataatatcg 23274786  T
Q  317 aatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaatt--atcacatcataatcaacatcaaaacatcttaa-acagct 413  Q
    || |||||  ||||||||||||||||| ||   |||| |||||||| |  |||| ||||  ||||||| |||| |||||||||| |||| |||  |||||    
T  23274787 aacgcaagtaaacaacatctcaaatattcacatataattcaagtaaagaatatacaattacatcacattataaacaacatcaaatcatcataattcagct 23274886  T
Q  414 tcacagattataattaa 430  Q
    |||||||| || |||||    
T  23274887 tcacagatcatcattaa 23274903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 235 - 436
Target Start/End: Original strand, 42386428 - 42386632
Alignment:
Q  235 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacat 334  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  42386428 acttagaccgactcatgcagtttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataacaatatcaaatgcaagtcaacaacat 42386527  T
Q  335 ctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatctt-aaacagcttcacagattataattaac 431  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  42386528 ctcaaatattcattcataattcaagcaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaaacagcttcacagattatcattaac 42386627  T
Q  432 ttcat 436  Q
     ||||    
T  42386628 atcat 42386632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 124 - 377
Target Start/End: Original strand, 27165154 - 27165407
Alignment:
Q  124 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 223  Q
    |||||||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27165154 gcatcaagcccctatcgctgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacctcat 27165253  T
Q  224 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 322  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |  |||||| | |||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  27165254 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaatatagacagtatgc-aaaacaacatgatataccaatatcaaatgca 27165352  T
Q  323 agacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    || || ||| ||||||||||| |||  |||| | ||||| |||||||| ||||||    
T  27165353 agtcatcaatatctcaaatattcatatataatttaagtattgcgtatacaattat 27165407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 117 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 45578102 - 45577947
Alignment:
Q  117 ctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgga 216  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45578102 ctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgga 45578004  T
Q  217 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacag 273  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45578003 acttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacag 45577947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 145 - 377
Target Start/End: Original strand, 12567479 - 12567716
Alignment:
Q  145 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat------catcttcatcaactt 238  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||      |||||| ||||||||    
T  12567479 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacatcataaacaacatcttaatcaactt 12567578  T
Q  239 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctca 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  12567579 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agcaatatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctca 12567677  T
Q  339 aatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    | ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  12567678 attattcacatataattcaagtaatgcatatataattat 12567716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 145 - 377
Target Start/End: Original strand, 13543944 - 13544181
Alignment:
Q  145 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat------catcttcatcaactt 238  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||      |||||| ||||||||    
T  13543944 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacatcattatcaacatcttaatcaactt 13544043  T
Q  239 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctca 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  13544044 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agcaatatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctca 13544142  T
Q  339 aatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    | ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  13544143 attattcacatataattcaagtaatgcatatataattat 13544181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 124 - 320
Target Start/End: Original strand, 44494715 - 44494908
Alignment:
Q  124 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 223  Q
    |||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||| |||||||||    
T  44494715 gcatcaagcccccaacaaagaa-tgttaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaac-tcttgtataattcaataatttagaacttcat 44494812  T
Q  224 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatg 320  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  44494813 catcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacac-agcagtatacaaaaacagcataacataataatatcaaatg 44494908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 106 - 365
Target Start/End: Original strand, 12510939 - 12511205
Alignment:
Q  106 tgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatc 204  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||    
T  12510939 tgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaatttgacaacctcttatattaatc 12511038  T
Q  205 caataatttggaacttcat------catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaa 298  Q
    |||||||||||||| ||||      |||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||| || | ||||  ||||  |||||    
T  12511039 caataatttggaacatcattatcaacatcttaatcaacttagaatgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacaa 12511138  T
Q  299 catgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgc 365  Q
    || ||||||| |||||||| |||||  |||||||||||  ||||| || | ||| ||||||||||||    
T  12511139 caagacataaaaatatcaattgcaattcaacaacatcttcaatattcaataatatctcaagtaatgc 12511205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 142 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 53301747 - 53301511
Alignment:
Q  142 tgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttaga 241  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  53301747 tgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcaacaacctcttatataatccaataatttggaacctcatcatcttaatcaacttaga 53301648  T
Q  242 ccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagaca-acaacatctcaa 339  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||  ||| |||||||    
T  53301647 ccgactcatacaacttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaagtcattcaatatctcaa 53301549  T
Q  340 atatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    |||| |||  |||| ||||||| | |||||| ||||||    
T  53301548 atattcatatataattcaagtattacgtatacaattat 53301511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 124 - 319
Target Start/End: Original strand, 17737142 - 17737337
Alignment:
Q  124 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 223  Q
    |||||||||||||||||| ||| || ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  17737142 gcatcaagcccccaacaaagaa-tgataatgcatagactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaac-tattgtatgatccaataacttggaacttcat 17737239  T
Q  224 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagta---tacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 319  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||   ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  17737240 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agcaatatactacaacaacagcatgacataataatatcaaat 17737337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 20 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 10542759 - 10542619
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  10542759 catcaagcccccatcgctatttgaatattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctc 10542660  T
Q  120 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaa 160  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10542659 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgataatgcatgaa 10542619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 124 - 278
Target Start/End: Original strand, 28194599 - 28194752
Alignment:
Q  124 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 223  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  28194599 gcatcaaacccccaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaac-tcttgtataatccaataatttggaacctcat 28194696  T
Q  224 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 278  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28194697 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 28194752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 15878363 - 15878083
Alignment:
Q  25 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 123  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  15878363 agcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagg 15878265  T
Q  124 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt--- 220  Q
    ||||  ||||||||||||    |||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |  | || |||| | |||||||||||||||  ||       
T  15878264 gcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatgaactcgatctcttaaacatcat-aatc-atcatctcttat-ttatccaataatttggaggttcaa 15878169  T
Q  221 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacat 306  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| || | ||||  ||||| ||||| |||||||    
T  15878168 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacaatatgacat 15878083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 145 - 365
Target Start/End: Original strand, 46822187 - 46822413
Alignment:
Q  145 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat------catcttcatcaactt 238  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||      |||||| ||||||||    
T  46822187 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacatcattatcaacatcttaatcaactt 46822286  T
Q  239 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctca 338  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| || | ||||  ||||  ||||||| ||||||| |||||||| |||||  ||||||||||| |    
T  46822287 agactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacaacaagacataaaaatatcaattgcaattcaacaacatctta 46822386  T
Q  339 aatatacattcataactcaagtaatgc 365  Q
    ||||| || | ||| ||||||||||||    
T  46822387 aatattcaataatatctcaagtaatgc 46822413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 146 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 37642458 - 37642170
Alignment:
Q  146 atgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccg 244  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||| | |||| |||||    
T  37642458 atgctaatgcatggactcgacttcttaaacgtcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacatcaacatcttcaacgacttggaccg 37642359  T
Q  245 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 343  Q
    ||||||||||||||||||  |||  | |||||||| | ||||||| | |||||| ||||| |||||||||||  | | |||  ||||||||||||||||     
T  37642358 actcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgc-aaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataa 37642260  T
Q  344 acattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 430  Q
     ||   |||| ||||||||||| |||| |||  |||||||| |||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||| || |||||    
T  37642259 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagcttcacagatcatcattaa 37642170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 10542969 - 10542852
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  10542969 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctc 10542870  T
Q  120 caaggcatcaagccccca 137  Q
    || |||||||||||||||    
T  10542869 cagggcatcaagccccca 10542852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 220 - 377
Target Start/End: Original strand, 17672626 - 17672782
Alignment:
Q  220 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 319  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17672626 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaaca-tagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 17672724  T
Q  320 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||  ||||||| |||||| ||| ||   |||| |||| |||||| |||| ||||||    
T  17672725 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaaataatgcatatataattat 17672782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 236 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 53070799 - 53070659
Alignment:
Q  236 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  53070799 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataa-cagtatacaaaaacaacaagacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 53070701  T
Q  336 tcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    |||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  53070700 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 53070659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 278
Target Start/End: Original strand, 23408234 - 23408485
Alignment:
Q  25 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaagg 124  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||    
T  23408234 agcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatgag-cccccatcgctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctctaggg 23408332  T
Q  125 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt---c 221  Q
    |||  ||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |  | || |||| | |||||||||||||||  ||   |    
T  23408333 cat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatgaactcgatctcttaaacatc-aaaatc-atcatctcttat-ttatccaataatttggaggttcaac 23408428  T
Q  222 atcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 278  Q
    |||||||| |||| |||| || |||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||    
T  23408429 atcatcttgatcatcttatactgactcatgcaacttggttaattaacaatagcaaca 23408485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 20 - 136
Target Start/End: Original strand, 14682183 - 14682300
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  14682183 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagct 14682282  T
Q  119 ccaaggcatcaagccccc 136  Q
    ||||||||||||||||||    
T  14682283 ccaaggcatcaagccccc 14682300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 10542864 - 10542747
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  10542864 catcaagcccccattgctatttgagtactaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctc 10542765  T
Q  120 caaggcatcaagccccca 137  Q
    || |||||||||||||||    
T  10542764 cagggcatcaagccccca 10542747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 116 - 340
Target Start/End: Original strand, 15470827 - 15471047
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttg 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || | ||  ||||| || |||| | | ||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  15470827 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcattgacacaacaacttaa-caacttagaacaacaacctcttaaataagtccaataatttg 15470924  T
Q  215 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataata 313  Q
    |||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||||    
T  15470925 gaacatcatcatcttca---acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaata 15471020  T
Q  314 tcaaatgcaagacaacaacatctcaaa 340  Q
    || |||||||| || ||||||||||||    
T  15471021 tcgaatgcaagtcatcaacatctcaaa 15471047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 136
Target Start/End: Original strand, 14670661 - 14670778
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||  ||| |||||||||    
T  14670661 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatgcttccagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaaagctccaacgtggtgactacaaagct 14670760  T
Q  119 ccaaggcatcaagccccc 136  Q
    ||||||||||||||||||    
T  14670761 ccaaggcatcaagccccc 14670778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 116 - 335
Target Start/End: Original strand, 14234382 - 14234605
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatata-----atccaata 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | |   ||||| | ||||| || | ||||||| |||||||     ||||||||    
T  14234382 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaataacttaa-cttcttataaacaacaaccttttatatatatatatccaata 14234479  T
Q  210 atttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataa 308  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| | ||| || ||||| ||||    
T  14234480 atttggaacatcatcatcttaatcaacttagactgattcatgcagcttagttaaataacaagcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataa 14234578  T
Q  309 taatatcaaatgcaagacaacaacatc 335  Q
     |||||| |||||||| || |||||||    
T  14234579 caatatcgaatgcaagtcatcaacatc 14234605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 147 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 22147717 - 22147431
Alignment:
Q  147 tgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccga 245  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||| | |||| ||||||    
T  22147717 tgctaatgcatggactcgacttcttaaacgtcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacatcaacatcttcaacgacttggaccga 22147618  T
Q  246 ctcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatata 344  Q
     ||||||||||||||||  |||  | |||||||  | || |||| | |||||| ||||| |||||||||||  | | |||  ||||||||||||||||      
T  22147617 gtcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcggtatgc-aaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataat 22147519  T
Q  345 cattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 430  Q
    ||   |||| ||||||||||| |||| |||  |||||||| |||| |||||| ||| |||| |||| ||||||||||||| || |||||    
T  22147518 cacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat-aaatcatcataaatcagcttcacagatcatcattaa 22147431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 116 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 12174467 - 12174265
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |         ||||||||| | | ||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  12174467 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgttaatgcatggacac---------aacatcttagaacaacaacctcttata-agtccaataatttgg 12174379  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 314  Q
    ||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||    
T  12174378 aacatcatcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatat 12174283  T
Q  315 caaatgcaagacaacaac 332  Q
    | ||||||| ||||||||    
T  12174282 cgaatgcaaaacaacaac 12174265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 116 - 323
Target Start/End: Original strand, 9512825 - 9513026
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | || |||||| || |||||| | ||| | | ||||| | |||||||||||||    
T  9512825 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacatcttaa-caacttaaaacaacatcatcttata-agtccaataatttgg 9512921  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 314  Q
    ||| |||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||    
T  9512922 aacatcatcatcatcatc---ttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatat 9513017  T
Q  315 caaatgcaa 323  Q
    | |||||||    
T  9513018 cgaatgcaa 9513026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 116 - 323
Target Start/End: Original strand, 9520800 - 9521001
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | || |||||| ||||||| | | ||| | | ||||| | |||||||||||||    
T  9520800 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacatcttaa-catcttagaacaacatcatcttata-agtccaataatttgg 9520896  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 314  Q
    ||| |||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||    
T  9520897 aacatcatcatcatcatc---ttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatat 9520992  T
Q  315 caaatgcaa 323  Q
    | |||||||    
T  9520993 cgaatgcaa 9521001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 116 - 343
Target Start/End: Original strand, 16103685 - 16103905
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |  | |||||  || |||||| | ||| | | ||||| | |||||||||||||    
T  16103685 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgttaatgcatggacacatcatcttag-caacttaaaacaacatcatcttata-agtccaataatttgg 16103781  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 314  Q
    ||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||    
T  16103782 aacatcatcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacgaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatat 16103877  T
Q  315 caaatgcaagacaacaacatctcaaatat 343  Q
    | |||||||  ||||||||||||||||||    
T  16103878 cgaatgcaa-tcaacaacatctcaaatat 16103905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 116 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 49668292 - 49668091
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | || |||||| || |||| | | ||| | | ||||| | |||||||||||||    
T  49668292 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacatcttaa-caacttagaacaacatcatcttata-agtccaataatttgg 49668196  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 314  Q
    ||| |||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||    
T  49668195 aacatcatcatcatcatc---ttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatat 49668100  T
Q  315 caaatgcaa 323  Q
    | |||||||    
T  49668099 cgaatgcaa 49668091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 116 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 52523946 - 52523633
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataa-tccaataattt 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||  || || ||||||| ||   |||| || |||||||| |||||||||||    
T  52523946 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgttaatgcatggactcaacaactcaa-catcttagaaataacaaactcttatataaatccaataattt 52523849  T
Q  214 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaa-acaacatgacataataa 311  Q
    |||||   ||| |||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| ||||| |   ||||| |||| ||    
T  52523848 ggaac---atcttctg--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacagttcatgatataacaa 52523754  T
Q  312 tatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatctta-aa 408  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||||| || |||  |||| ||||||||||| |||| |||  |||||||| |||| ||||||| || ||||||| ||    
T  52523753 tatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatc-aatcatcttataa 52523655  T
Q  409 cagcttcacagattataattaa 430  Q
    ||||||| ||||| || |||||    
T  52523654 cagcttctcagatcatcattaa 52523633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 123 - 343
Target Start/End: Original strand, 16097238 - 16097454
Alignment:
Q  123 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttc 221  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| |||| || | || |||||| || |||| | | |||| || ||| |||| |||||||||||||||| ||    
T  16097238 ggcatcaagcccccaacaatgaa-tgttaattcatggacacaacatcttaa-caacttagaacaacaatctcttaaataagtccaataatttggaacatc 16097335  T
Q  222 atcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatg 320  Q
    ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| ||| ||||  || ||| | |||| |||||| ||||    
T  16097336 atcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcaatatgcaaat-catcatcatataacaatatcgaatg 16097431  T
Q  321 caagacaacaacatctcaaatat 343  Q
    |||| || |||||||||||||||    
T  16097432 caagtcatcaacatctcaaatat 16097454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 203 - 339
Target Start/End: Original strand, 32307666 - 32307798
Alignment:
Q  203 tccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacat 301  Q
    ||||||||||||||||  |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || |||    
T  32307666 tccaataatttggaacaacatcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcat 32307761  T
Q  302 gacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaa 339  Q
    || |||| |||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  32307762 gatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaa 32307798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 375 - 434
Target Start/End: Original strand, 14179592 - 14179651
Alignment:
Q  375 tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttc 434  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14179592 tatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacttc 14179651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 116 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 22110569 - 22110349
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataa-tccaataattt 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||   ||||||| |||| ||  ||||| ||||||| || | || |||| |||||||| |||||||||||    
T  22110569 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgagtatgcatggactcaacaacttaa-catcttagaaacaacgacctcttatataaatccaataattt 22110472  T
Q  214 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaa-acaacatgacataataa 311  Q
    ||||| |||||  |||||||   |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | |||||| | |||| |   ||||| |||| ||    
T  22110471 ggaacatcatc--cttcatc---ttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaa 22110377  T
Q  312 tatcaaatgcaagacaacaacatctcaa 339  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  22110376 tatcaaatgcaaatcaacagcatctcaa 22110349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 39 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 23077776 - 23077642
Alignment:
Q  39 tttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagccccca 137  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| |||||  ||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||||||||    
T  23077776 tttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctagtttgagataatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggcat-gagccccca 23077679  T
Q  138 aca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa 174  Q
    ||| |||  ||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  23077678 acatatg-tatgctaatgaatggactcgatctcttaaa 23077642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Original strand, 27165069 - 27165135
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  27165069 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctatttga 27165135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 201 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 37251300 - 37251165
Alignment:
Q  201 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaa-acaa 298  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||| | |||||||| |||| |       
T  37251300 aatccaataatttggaac---atcatcttc--catcttagaccgagtcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagtt 37251206  T
Q  299 catgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaa 339  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  37251205 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaa 37251165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 1644882 - 1644718
Alignment:
Q  123 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 222  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || | || |||||| || |||| | | ||| | | ||||| | ||||||||||||||||   |    
T  1644882 ggcatcaagcccctaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacatcttaa-caacttagaacaacatcatcttata-agtccaataatttggaac---a 1644789  T
Q  223 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaa 293  Q
     |||| ||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||    
T  1644788 acatcgtcatcaacttagaccaacttatgttgcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatgcaaa 1644718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 40 - 115
Target Start/End: Original strand, 16796117 - 16796192
Alignment:
Q  40 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaa 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||    
T  16796117 ttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaa 16796192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 340
Target Start/End: Original strand, 43925947 - 43926083
Alignment:
Q  201 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaa-acaa 298  Q
    ||||||||||||||||||   | ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | |||||| | |||| |       
T  43925947 aatccaataatttggaac---aacatctt--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagct 43926041  T
Q  299 catgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaa 340  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  43926042 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaa 43926083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Original strand, 8499337 - 8499403
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  8499337 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctatttga 8499403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 182
Target Start/End: Original strand, 15067499 - 15067644
Alignment:
Q  37 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccc 135  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||| ||||| || |||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  15067499 tattttagtattaatatactttcagggcatgag-cccccatcgttattttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccc 15067596  T
Q  136 caacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 182  Q
    ||||||    ||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||    
T  15067597 caacaaatgtatgctaatgcatggactcaatctcttaaaacatcttaa 15067644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Original strand, 15412248 - 15412314
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  15412248 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctatttga 15412314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 182
Target Start/End: Original strand, 16369216 - 16369361
Alignment:
Q  37 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccc 135  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||| ||||| || |||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||| ||    
T  16369216 tattttagtattaatatactttcagggcatgag-cccccatcgttattttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-aagctcc 16369313  T
Q  136 caacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 182  Q
    ||||||    ||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||    
T  16369314 caacaaatgtatgctaatgcatggactcaatctcttaaaacatcttaa 16369361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 242
Target Start/End: Original strand, 16796195 - 16796339
Alignment:
Q  96 tccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctat 195  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||| |  | || |    
T  16796195 tccatcgtggtgagtacaaagctccagggcatga-gcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatctcttaaacatcat-aatc-atcatctct 16796291  T
Q  196 tata-taatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagac 242  Q
    |||| || | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  16796292 tatattagtgcaataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagac 16796339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 53301850 - 53301784
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  53301850 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatactt-cagagcatcaagcccctatcgctatttga 53301784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 20 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 22147782 - 22147716
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttg 86  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  22147782 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaatcgctatttg 22147716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 39 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 23053387 - 23053244
Alignment:
Q  39 tttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagccccca 137  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||  ||| ||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||  | ||||||    
T  23053387 tttgagtattaatatatttccagggcat-aagcccccatttctagtttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccaaggcat-gatccccca 23053290  T
Q  138 aca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 182  Q
    ||| |||  ||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||    
T  23053289 acatatg-tatgctaatgcatggactcaatctcttaaaacatcttaa 23053244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 299 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 2051238 - 2051138
Alignment:
Q  299 catgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatca 396  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||  |||| ||||||||||| |||| |||  |||||||| |||| ||||||||    
T  2051238 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatca 2051139  T
Q  397 a 397  Q
    |    
T  2051138 a 2051138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 14878814 - 14878672
Alignment:
Q  40 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaa 138  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||  | |||||| |||||||||||||||  ||||||| || ||||| |||||  ||||||| |    
T  14878814 ttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatctttaatttgagctaaagctccatcgtggtgagtactaatctccagggcat-gagcccccta 14878717  T
Q  139 ca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 182  Q
    || |||  ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  14878716 catatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatcttaa 14878672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 12120103 - 12120045
Alignment:
Q  28 ccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  12120103 ccccgtcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctatttga 12120045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 22147826 - 22147759
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||    
T  22147826 catcaagcccctatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgctatttga 22147759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 63
Target Start/End: Original strand, 26683157 - 26683200
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccaggg 63  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26683157 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccaggg 26683200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Original strand, 46822080 - 46822147
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||    
T  46822080 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgctatttga 46822147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 375 - 429
Target Start/End: Original strand, 16796707 - 16796761
Alignment:
Q  375 tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataatta 429  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  16796707 tatcacatcataatcaaaaacaacacatcttaaacaacttcacatattataatta 16796761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 81
Target Start/End: Original strand, 46822124 - 46822185
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 81  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  46822124 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaatcgct 46822185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 278
Target Start/End: Original strand, 13919350 - 13919390
Alignment:
Q  238 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  13919350 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaaca 13919390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 76
Target Start/End: Original strand, 28194557 - 28194612
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaaccccca 76  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  28194557 catcaagcccctatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaaaccccca 28194612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Original strand, 10556804 - 10556870
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||   ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  10556804 catcaagcccccatcgctatttgagtattaccatac-tccagagcatcaagcccctatcgctatttga 10556870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 278
Target Start/End: Original strand, 14665380 - 14665458
Alignment:
Q  202 atccaataatttggaact--tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 278  Q
    |||||||||||||||  |  |||||||||| |||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  14665380 atccaataatttggagttcatcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcaaca 14665458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 15076267 - 15076200
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||    
T  15076267 catcaagccccaatctctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgctatttga 15076200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 15076311 - 15076244
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||| ||||||||    
T  15076311 catcaagcccctatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatctctatttga 15076244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 22147869 - 22147803
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  22147869 catcaagcccctatcgctatttaagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctatttga 22147803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Original strand, 28194514 - 28194580
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  28194514 catcaagcctcaatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctatttga 28194580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 43550825 - 43550758
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||| |||  ||||||||||||    
T  43550825 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccaaagcatcaagccctaatcgctatttga 43550758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 12120068 - 12120003
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttg 86  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||| |||| |||||||||||    
T  12120068 catcaagcccctatcgctatttgagtattaatatac-tccaaagcatcaagcccctatcgctatttg 12120003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 43550852 - 43550802
Alignment:
Q  37 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  43550852 tatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaatcgctatttga 43550802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 87
Target Start/End: Original strand, 46822049 - 46822103
Alignment:
Q  33 tcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||    
T  46822049 tcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgctatttga 46822103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 278
Target Start/End: Original strand, 856140 - 856197
Alignment:
Q  221 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 278  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  856140 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttagttgaataacaatagcaaca 856197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 81
Target Start/End: Original strand, 10556847 - 10556907
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 81  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||| ||||||    
T  10556847 catcaagcccctatcgctatttgagtattactatac-tccagggcatcaagcccctatcgct 10556907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 81
Target Start/End: Original strand, 15412291 - 15412351
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 81  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||    
T  15412291 catcaagcccctatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgct 15412351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 85
Target Start/End: Original strand, 17737057 - 17737121
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt 85  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  17737057 catcaagcccctatcgctatttaagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctattt 17737121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 18384158 - 18384090
Alignment:
Q  94 gctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactc 163  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    ||||||||||||| ||||    
T  18384158 gctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-aagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactc 18384090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 23077594 - 23077537
Alignment:
Q  221 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 278  Q
    ||||||||| |||| |||| |  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  23077594 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttggttaaataacaacagcaaca 23077537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 81
Target Start/End: Original strand, 27165112 - 27165172
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 81  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||    
T  27165112 catcaagcccctatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgct 27165172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 85
Target Start/End: Original strand, 50242643 - 50242707
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt 85  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  50242643 catcaagcccctatcgttatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctattt 50242707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 81
Target Start/End: Original strand, 55476354 - 55476415
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 81  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  55476354 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgct 55476415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 83 - 182
Target Start/End: Original strand, 12172658 - 12172757
Alignment:
Q  83 tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatctta 181  Q
    ||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||| || |||||  ||||||||||||    ||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||    
T  12172658 tttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctacagggcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcaatctcttaaaacatctta 12172756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 202 - 275
Target Start/End: Original strand, 14668536 - 14668611
Alignment:
Q  202 atccaataatttggaact--tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 275  Q
    |||||||||||||||  |  |||||||||| |||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  14668536 atccaataatttggagttcatcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaatagca 14668611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 83 - 182
Target Start/End: Original strand, 15051371 - 15051470
Alignment:
Q  83 tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatctta 181  Q
    ||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||  || |||||||||    ||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||    
T  15051371 tttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gaggccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcaatctcttaaaacatctta 15051469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 43550781 - 43550725
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaaccccca 76  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||    
T  43550781 catcaagccctaatcgctatttgagtattattatacttccaaggcatcaagccccca 43550725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 59 - 87
Target Start/End: Original strand, 43840730 - 43840758
Alignment:
Q  59 cagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43840730 cagggcatcaaacccccatcgctatttga 43840758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 290; Significance: 1e-162; HSPs: 77)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 20 - 437
Target Start/End: Original strand, 23060315 - 23060734
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23060315 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctc 23060414  T
Q  120 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg-aac 218  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  23060415 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaac 23060514  T
Q  219 ttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 318  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23060515 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaat 23060614  T
Q  319 tgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttca 416  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||  | | |||  |||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23060615 tgcaagtcaacaacatcttaaatattaaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttca 23060714  T
Q  417 cagattataattaacttcatc 437  Q
    || |||||||||||| |||||    
T  23060715 ca-attataattaacatcatc 23060734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 20 - 437
Target Start/End: Original strand, 22336928 - 22337337
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  22336928 catcaagcccccatcgctatt-gagtattaatatacttccagggcatcaagcccc-atcgcaatttgagctaaagctccattgtgttgagtacaaagctc 22337025  T
Q  120 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 219  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||        ||||||||     
T  22337026 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacttcttaattcgacaacctcttatataa--------tttggaaca 22337117  T
Q  220 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22337118 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggctgtatataaaaacagcatgacataataatatcaaat 22337217  T
Q  320 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  22337218 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacatatcttaaacaacttcac 22337317  T
Q  418 agattataattaacttcatc 437  Q
    | |||||||||||| |||||    
T  22337318 aaattataattaacatcatc 22337337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 21 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 22731551 - 22731139
Alignment:
Q  21 atcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctcc 120  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  22731551 atcaagcccccatcgttatttgagtattaatatacttcaagggcaccaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctcc 22731452  T
Q  121 aaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt 220  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  22731451 agggaatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctgttagacatctttattcaacaacctcttatataatccaataatttggaacat 22731352  T
Q  221 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatg 320  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  22731351 catcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 22731252  T
Q  321 caagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcaca 418  Q
    |||  || |||||| | |||||| ||   ||   |||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22731251 caattcatcaacatattaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcaca 22731152  T
Q  419 gattataattaac 431  Q
    |||||||||||||    
T  22731151 gattataattaac 22731139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 59 - 437
Target Start/End: Original strand, 23076288 - 23076664
Alignment:
Q  59 cagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 158  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||     |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076288 cagggcatcaagcccccatcgctatttgagctaaagctccatcgt-----gtacaaaggttcagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 23076382  T
Q  159 aactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaa-cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctt 257  Q
     ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23076383 gactcggcctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaacatcatcatcttcatccacttagaccgactcatgcagctt 23076482  T
Q  258 agttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactca 357  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||| || | |||  |||    
T  23076483 agttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaatatcttaaatattcaattatacttca 23076582  T
Q  358 agtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcatc 437  Q
    ||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23076583 agtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacagcttaaacagcttcacagattataattaacatcatc 23076664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 20 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 23654706 - 23654291
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  23654706 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagct 23654607  T
Q  119 ccaaggcatcaagccccc-aacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttgga 216  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  23654606 ccagggcatcaagccccccaacaatgaa-tgctagtgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttgga 23654508  T
Q  217 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 316  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  23654507 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacagcataggcagcatacaaatacatcatgacataataatatca 23654408  T
Q  317 aatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagctt 414  Q
    | |||||  || |||||||| |||||| ||   || ||||||||||||| || || ||  |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  23654407 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaagtattactcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataattaacaacaacacatcttaaacagctt 23654308  T
Q  415 cacagattataattaac 431  Q
    |||||||||||||||||    
T  23654307 cacagattataattaac 23654291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 20 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 22738497 - 22738085
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  |||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  22738497 catcaagcccccatcgctaattgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcactaattgagttaaagctccaacgtgttgagtacagagctc 22738398  T
Q  120 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 219  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  22738397 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggatccgaccttttagacatcttaattcaacaacctcttatataatccaataatttggaaca 22738298  T
Q  220 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 319  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  22738297 tcatcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacattaa-ataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 22738199  T
Q  320 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 417  Q
    ||||  || |||||||| |||||| ||   ||   |||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22738198 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 22738099  T
Q  418 agattataattaac 431  Q
    ||||||||||||||    
T  22738098 agattataattaac 22738085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 134 - 437
Target Start/End: Original strand, 23659940 - 23660244
Alignment:
Q  134 cccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatc 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23659940 cccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatcatcttcatc 23660039  T
Q  234 aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaaca 333  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  23660040 aacttagaccgactcatgtatcttagttaaacaacaacagcaacataggcagtatac-gaaacaggatgacataataatatcaaatgcaaatcaacaaca 23660138  T
Q  334 tctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaac 431  Q
    ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  23660139 tcttaaatattcaatcataactcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctttacaaattataattaac 23660238  T
Q  432 ttcatc 437  Q
     |||||    
T  23660239 atcatc 23660244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 24 - 294
Target Start/End: Original strand, 8946463 - 8946734
Alignment:
Q  24 aagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 123  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  8946463 aagcccccattgctatttgagtattaatatacttccaggacatcaagcccccatcgctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagg 8946562  T
Q  124 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg-aacttca 222  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  8946563 gcatcaagtccctaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaacatca 8946662  T
Q  223 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaa 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  8946663 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttagataacaatagcaacataggcagtatacaaaa 8946734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Original strand, 18808840 - 18809099
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18808840 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 18808938  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18808939 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 18809037  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  18809038 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 18809099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 23712278 - 23712019
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23712278 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 23712180  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23712179 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 23712081  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  23712080 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 23712019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Original strand, 39682210 - 39682469
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39682210 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 39682308  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39682309 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 39682407  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  39682408 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 39682469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 116 - 376
Target Start/End: Original strand, 23135487 - 23135745
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23135487 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 23135585  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23135586 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 23135684  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaatta 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| |||||    
T  23135685 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaatta 23135745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Original strand, 24367670 - 24367930
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24367670 gctccagggcatcaagcccccaacaatgtaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 24367769  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24367770 aacttcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 24367868  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  24367869 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 24367930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Original strand, 26505276 - 26505535
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26505276 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 26505374  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  26505375 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agcagtatacaaaaatagcatgacataataatatc 26505473  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  26505474 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 26505535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Original strand, 26507754 - 26508013
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26507754 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 26507852  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  26507853 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agcagtatacaaaaatagcatgacataataatatc 26507951  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  26507952 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 26508013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 123 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 21155318 - 21155066
Alignment:
Q  123 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  21155318 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttct 21155220  T
Q  223 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 322  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  21155219 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 21155121  T
Q  323 agacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    || ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  21155120 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 21155066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 24905898 - 24905638
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24905898 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 24905800  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24905799 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatat 24905701  T
Q  315 caaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  24905700 caaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 24905638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 24908373 - 24908113
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24908373 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 24908275  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24908274 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatat 24908176  T
Q  315 caaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  24908175 caaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 24908113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 116 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 45030119 - 45029867
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45030119 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 45030021  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45030020 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacaa-caatatacaaaaacaacatgacataataatatc 45029922  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtata 370  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| ||||    
T  45029921 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatata 45029867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 23709797 - 23709538
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23709797 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 23709699  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23709698 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 23709600  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  23709599 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 23709538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 20 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 23040509 - 23040249
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 118  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||  ||||||||||  |    
T  23040509 catcaagctcccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaaatt 23040410  T
Q  119 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaa 217  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  23040409 tcaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgcactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaa 23040310  T
Q  218 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 278  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23040309 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 23040249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 24898461 - 24898201
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24898461 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcaacaacctcttatataatccaataatttgg 24898363  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24898362 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatat 24898264  T
Q  315 caaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  24898263 caaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 24898201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 24900944 - 24900684
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24900944 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcaacaacctcttatataatccaataatttgg 24900846  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24900845 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatat 24900747  T
Q  315 caaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  24900746 caaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 24900684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 24903421 - 24903161
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24903421 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcaacaacctcttatataatccaataatttgg 24903323  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagc-ttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24903322 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatat 24903224  T
Q  315 caaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  24903223 caaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 24903161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Original strand, 571294 - 571553
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  571294 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 571392  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  571393 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 571491  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| | | ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  571492 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattgttcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 571553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Original strand, 6725892 - 6726151
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  6725892 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttacatcgacaacctcttatataattcaataatttgg 6725990  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6725991 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 6726089  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  6726090 aaatgtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 6726151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 20 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 38435 - 38016
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||    
T  38435 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagc 38336  T
Q  118 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa-catcttaaat-cgacaacctattatataa-tccaataatttg 214  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| || | ||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  38335 tccagggcatcaagcccc-aacaatgaa-tgctaatgcatggactccacctcttaaaacaacataaattcgacaacctcttatattagtccaataatttg 38238  T
Q  215 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 314  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  38237 gaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatat 38139  T
Q  315 caaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat-tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagct 413  Q
    ||| | | |  || || ||||| |  ||||||  |||   ||||||||||| || | | | ||||||||||||||||||| ||| |  ||||| ||||||    
T  38138 caatttcgattcatcatcatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcataaacattatatcacatcataatcaacaacaacatgtcttatacagct 38039  T
Q  414 tcacagattataattaacttcat 436  Q
    ||| |||||||||||||| ||||    
T  38038 tcagagattataattaacctcat 38016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Original strand, 28576996 - 28577255
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  28576996 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcaacaacttcttatataatccaataatttgg 28577094  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  28577095 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacgcaa-cagtatacaaaaacagcatgatataataatatc 28577193  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  28577194 aaatgcaagccaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 28577255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 32039763 - 32039504
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32039763 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 32039665  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32039664 aacttcatcatcttaatcaacttagaccggctcatgcagcttagttaaataacaacagtaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 32039566  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  32039565 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 32039504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 116 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 24529795 - 24529573
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24529795 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 24529696  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24529695 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataacaacaacaacac-atcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 24529597  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaa 339  Q
    || ||||||  |||||| ||||||    
T  24529596 aagtgcaagttaacaacgtctcaa 24529573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 145 - 377
Target Start/End: Original strand, 23130788 - 23131018
Alignment:
Q  145 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccg 244  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23130788 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaa-tcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccg 23130886  T
Q  245 actcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatata 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||     
T  23130887 actcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 23130985  T
Q  345 cattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  23130986 cacatataattcaagtaatgcatatacaattat 23131018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 145 - 377
Target Start/End: Original strand, 23133255 - 23133485
Alignment:
Q  145 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccg 244  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23133255 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaa-tcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccg 23133353  T
Q  245 actcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatata 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||     
T  23133354 actcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 23133452  T
Q  345 cattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  23133453 cacatataattcaagtaatgcatatacaattat 23133485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 145 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 34402758 - 34402528
Alignment:
Q  145 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccg 244  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34402758 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaa-tcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccg 34402660  T
Q  245 actcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatata 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||     
T  34402659 actcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 34402561  T
Q  345 cattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  34402560 cacatataattcaagtaatgcatatacaattat 34402528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 20 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 23103714 - 23103370
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 117  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||    
T  23103714 catcaagcccccatcgctatttgagtagtaatatactttcagggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagc 23103615  T
Q  118 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttgga 216  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| || | ||||||| ||||||    
T  23103614 tccagggcatcaagcccc-aacaatgag-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttaaattagtccaatattttgga 23103517  T
Q  217 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 316  Q
    || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||  ||||| |||||||| || ||||||    
T  23103516 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataaaaacagcaacataggcagtatac--aaacagcatgacatgattatatca 23103419  T
Q  317 aatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgc 365  Q
    ||| |||  || |||||||||||  || ||||||||| |||||| ||||    
T  23103418 aattcaattcatcaacatctcaatcattcattcataattcaagtcatgc 23103370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 124 - 377
Target Start/End: Original strand, 43137204 - 43137455
Alignment:
Q  124 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 223  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  43137204 gcatcaagcccccaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaatactttggaacttaat 43137302  T
Q  224 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 323  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43137303 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agtaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 43137401  T
Q  324 gacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    | ||||||| |||||| | | ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  43137402 gtcaacaacgtctcaattgttcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 43137455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 20 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 23072269 - 23071972
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||    
T  23072269 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagc 23072170  T
Q  118 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttgga 216  Q
    || |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  23072169 tctagagcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgaaaacctcttatattaatccaataatttgga 23072071  T
Q  217 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  23072070 acatcatcatcttcaacaacttagtccgactcatgcagcttagttaaataacgaacaacaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 23071972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 125 - 377
Target Start/End: Original strand, 22105319 - 22105569
Alignment:
Q  125 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatc 224  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  22105319 catcaagtccccaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaac-tcttgtataatccaataatttgaaacttcatc 22105416  T
Q  225 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaag 324  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22105417 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 22105516  T
Q  325 acaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
     ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  22105517 tcaacaacttctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 22105569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 56 - 436
Target Start/End: Original strand, 20308945 - 20309326
Alignment:
Q  56 ttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaat 153  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  20308945 ttccagggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaactatgaa-tgctaat 20309043  T
Q  154 gcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgc 252  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  20309044 gcatggactcgacatcttaaacaacttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgc 20309143  T
Q  253 agcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcat 351  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||   |||| ||||||||||| ||||||||| |||  || |||||||| |  ||||||   ||    
T  20309144 agcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatac---aacagcatgacataattatatcaaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaatat 20309240  T
Q  352 aactcaagtaatgcgtataaaattat--cacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcat 436  Q
       ||||||||||| || || |||||  |||||||||||||||| ||| | ||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20309241 tcttcaagtaatgcata-aacattataacacatcataatcaacaacaacatatcttattcagcttcacagattatagttaacctcat 20309326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 123 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 24643209 - 24643036
Alignment:
Q  123 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 222  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  24643209 ggcatcaagcctccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaatcatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcg 24643110  T
Q  223 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaaca 297  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  24643109 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-atcagtatacaaaaaca 24643036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 124 - 377
Target Start/End: Original strand, 38967279 - 38967531
Alignment:
Q  124 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 223  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  38967279 gcatcaagcccccaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaaactcctatataatccaatattttggaacttcat 38967377  T
Q  224 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 323  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  38967378 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacatcgacacaa-caatatacaaaaatagcatgaaataataatatcaaatgcaa 38967476  T
Q  324 gacaa-caacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    | ||| ||||||||||| ||| ||   |||| |||| |||||| |||| ||||||    
T  38967477 gtcaatcaacatctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattat 38967531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 20 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21900773 - 21900560
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctat-ttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  21900773 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatactttcagggcatcaagcccccatcgctaaattgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagct 21900674  T
Q  119 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaa 217  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  21900673 ccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggacttgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaa 21900574  T
Q  218 cttcatcatcttca 231  Q
    | ||||||||||||    
T  21900573 catcatcatcttca 21900560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 124 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 299027 - 298719
Alignment:
Q  124 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 223  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||| |||||| ||||||||    
T  299027 gcatcaagcccccaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaaacatgttaaatcgacaac-tcttgtataatccaaaaatttgaaacttcat 298930  T
Q  224 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 322  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||  ||||||| ||||    
T  298929 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgca 298830  T
Q  323 agacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacaga 420  Q
    |  ||||||||||| |||||| ||   |   |||||||||||| || || ||  |||||||||||||| || | ||| |||||||| ||||||||||| |    
T  298829 attcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataattaataacaacacatcttatacagcttcacata 298730  T
Q  421 ttataattaac 431  Q
    ||||| |||||    
T  298729 ttatagttaac 298719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 171 - 431
Target Start/End: Original strand, 23285818 - 23286077
Alignment:
Q  171 taaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca 269  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23285818 taaacatcttaattcaacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca 23285917  T
Q  270 acagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtat 369  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||    |||||||||||||||| |||||  || |||||||| |||||| ||    |   ||||||||||| ||     
T  23285918 acagcaacataggcagtatacaaaaaca----gacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatgttcttcaagtaatgcataa 23286013  T
Q  370 aaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaac 431  Q
    || ||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23286014 aacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattataattaac 23286077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 63 - 430
Target Start/End: Original strand, 19671675 - 19672043
Alignment:
Q  63 gcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaact 162  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||| || ||||| || |||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||    
T  19671675 gcatcaagcccctatcgctaattgagcttaagcttcaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagctcccaaccatgaaatgctaatgcatagact 19671774  T
Q  163 cgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagtt 261  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  19671775 cgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagtt 19671874  T
Q  262 aaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagt 360  Q
    || |||||| |||||||| | ||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || |||||  ||||||||||||| ||| ||   |||| ||||||    
T  19671875 aattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacatctcaa-tattcacatataattcaagt 19671972  T
Q  361 aatgcgtataaaattat--cacatcataatcaacatcaaaacatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 430  Q
    ||||| |||| ||||||  ||||| |||| |||||||||  |||| || | |||||||||||||||| |||||    
T  19671973 aatgcatatacaattatatcacattataa-caacatcaat-catcatagatcagcttcacagattatcattaa 19672043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 145 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 32215164 - 32214927
Alignment:
Q  145 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatc------ttcatcaactt 238  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||      || ||||||||    
T  32215164 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacatcatcatcaacatcttaatcaactt 32215065  T
Q  239 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctca 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  32215064 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctca 32214966  T
Q  339 aatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    | ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  32214965 attattcacatataattcaagtaatgcatatataattat 32214927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 187 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 23708769 - 23708524
Alignment:
Q  187 acaacctattatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacacaagca 284  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| | |||    
T  23708769 acaacctcttatataaatccaataatttggaacatcatcatctt--tcaacttagaccgactcaagcagcttagttaaataacagatagcaacataggca 23708672  T
Q  285 gtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacat 382  Q
    |||| | |||||||||||| |||| |||||||| |||||  || | |||||||||| || ||   |||| ||||||||||| |||| |||  ||||||||    
T  23708671 gtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaattgcaaatcatcgacatctcaaacattcaaatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacat 23708573  T
Q  383 cataatcaacatcaaaacatctta-aacagcttcacagattataattaa 430  Q
     |||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  23708572 tataaacaacatcaattcatcttataacagcttcacagatcatcattaa 23708524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 25 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 22741276 - 22741027
Alignment:
Q  25 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 123  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  22741276 agcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagg 22741178  T
Q  124 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt--- 220  Q
    ||||  ||||||||||||    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |  | || |||| | |||||||||||||||| ||       
T  22741177 gcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatctcttaaacatctt-aatc-atcatctcttat-ttatccaataatttggaagttcaa 22741082  T
Q  221 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 275  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||  |||||||||||| ||||    
T  22741081 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaactaggttaaataacaatagca 22741027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 145 - 365
Target Start/End: Original strand, 25616107 - 25616333
Alignment:
Q  145 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat------catcttcatcaactt 238  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||      |||||| ||||||||    
T  25616107 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacatcattattaacatcttaatcaactt 25616206  T
Q  239 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctca 338  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||| || | ||||  ||||  |||| || ||||||| |||||||| |||||  ||||||||||| |    
T  25616207 agactgactcatgcaacttagttaaattacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaattgcaattcaacaacatctta 25616306  T
Q  339 aatatacattcataactcaagtaatgc 365  Q
    ||||| || | ||| ||||||||||||    
T  25616307 aatattcaataatatctcaagtaatgc 25616333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 116 - 343
Target Start/End: Original strand, 28405881 - 28406103
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |  | |||||| || |||| | | ||| | | ||||| | |||||||||||||    
T  28405881 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacatcatcttaa-caacttagaacaacatcatcttata-agtccaataatttgg 28405977  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 314  Q
    ||  ||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||    
T  28405978 aaaatcatcatc---atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaatcatcatgatataacaatat 28406074  T
Q  315 caaatgcaagacaacaacatctcaaatat 343  Q
    | |||||||  ||||||||||||||||||    
T  28406075 cgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 28406103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 116 - 343
Target Start/End: Original strand, 25175754 - 25175976
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataatccaataatttg 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||  ||||| | ||||| || | ||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  25175754 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttata-agtccaataatttg 25175850  T
Q  215 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataata 313  Q
    |||| ||||||||   |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||||    
T  25175851 gaacatcatcatc---atcaacttagacagattcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaata 25175946  T
Q  314 tcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 343  Q
    || |||||||  ||||||||||||||||||    
T  25175947 tcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 25175976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 7950 - 7694
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataa-tccaataattt 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||  || || | ||||| || | || |||| |||||||| |||||||||||    
T  7950 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcaacaactcaacc-tcttagaaacaacgacctcttatataaatccaataattt 7853  T
Q  214 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataat 312  Q
    |||||   ||| ||||  ||| ||||||| || |||||||||||||||||  ||||| |||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| |||    
T  7852 ggaac---atcttctt--tcatcttagactgaatcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacatgatataacaat 7759  T
Q  313 atcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| || |||  |||| ||||||||||  |||| ||||||    
T  7758 atcaaatgcaagtcatcaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattat 7694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 22759031 - 22758875
Alignment:
Q  25 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 123  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||| |  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |    
T  22759031 agcccccatcgttatttgagtatttatatacttccagggcat-aggcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctctagg 22758933  T
Q  124 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaa 182  Q
    ||||  ||||||||||||    ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  22758932 gcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatctcttatacatcttaa 22758875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 57 - 138
Target Start/End: Original strand, 23657632 - 23657713
Alignment:
Q  57 tccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaa 138  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  23657632 tccagggtatcaagcccccatcgctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaggctccagggcatcaagcccccaa 23657713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 123 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 18787113 - 18786971
Alignment:
Q  123 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaactt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||  ||||| ||||||| || | || |||| |||||||| ||||||||||||||||      
T  18787113 ggcatcaagcccccaacaatgaa-tgcgaatgcatggactcaacaacttaa-catcttagaaacaacgacctcttatataaatccaataatttggaac-- 18787018  T
Q  221 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 270  Q
     ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18787017 -atcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 18786971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 116 - 293
Target Start/End: Original strand, 7679480 - 7679662
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatata-atccaataattt 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || | ||  ||||| | ||||| || |  |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  7679480 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgttaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacttcaacctcttatatatatccaataattt 7679577  T
Q  214 ggaacttcatc----atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaa 293  Q
    ||||| |||||    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||    
T  7679578 ggaacatcatccatcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 7679662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 116 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 22134428 - 22134251
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | || |||||| || |||| | | ||  | | ||||| | |||||||||||||    
T  22134428 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacatcttaa-caacttagaacaacttcatcttata-agtccaataatttgg 22134332  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaactt---agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaa 293  Q
    ||| |||||||| |||||| | |   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||    
T  22134331 aacatcatcatcatcatcatcatcatagaccgactcatgcagcttagttaaatatcaacagcaacataggcagtatgcaaa 22134251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 40 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 22799424 - 22799282
Alignment:
Q  40 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaa 138  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||  |||||||||    
T  22799424 ttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtgttgagtactaagctccagggcat-gagcccccaa 22799327  T
Q  139 ca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 182  Q
    || |||  ||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||    
T  22799326 catatg-tatgctaatgcatggactcggtctcttaaaacatcttaa 22799282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 375 - 437
Target Start/End: Original strand, 27753735 - 27753797
Alignment:
Q  375 tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcatc 437  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||    
T  27753735 tatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagtttcacatattataattaacatcatc 27753797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 236 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 32452031 - 32451878
Alignment:
Q  236 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaa-ca 333  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||| | |||| || |||||| | |||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||    
T  32452031 cttagaccgactcatgcagcttggttaaacatcaaacagcaacataggcagcattcaaaaatagcatgacataacaatatc-aatgcaagccaacaatca 32451933  T
Q  334 tctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtata-aaattatcacatcataa 387  Q
    |||||| ||| |||| | |  |||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  32451932 tctcaattattcatttaaacttcaagtaatgcgtatacataatatcacatcataa 32451878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 201 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 20520325 - 20520098
Alignment:
Q  201 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaa-acaa 298  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| | |||||| | |||| |       
T  20520325 aatccaataatttggaac---attatctt--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatatgcagtacataaaacagtt 20520231  T
Q  299 catgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtata-aaat-tatcacatcataatcaacatca 396  Q
    ||||| |||| |||||||| |||||  ||||||||||||||| || |||  |||| ||||||||||| |||| |||| |||||||| || | | ||||||    
T  20520230 catgatataacaatatcaa-tgcaaatcaacaacatctcaaacat-catatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacgacatca 20520133  T
Q  397 aaacatctta-aacagcttcacagattataattaa 430  Q
    || ||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  20520132 aatcatcttataacaacttcacagattatcattaa 20520098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 40 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 23020004 - 23019727
Alignment:
Q  40 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaa 138  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||  | ||||||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||    
T  23020004 ttgagtattaatatacatccagggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaattcaccatcgtgttgagtactaagctccagggcatga-gcccccaa 23019907  T
Q  139 ca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt---catcatcttcatc 233  Q
    || ||| | |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| |  | || |||||| |||||||||||||||  ||   ||||||||| |||    
T  23019906 catatgta-tgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatctt-aatc-atcatctcttatat-atccaataatttggaggttcgacatcatcttaatc 23019811  T
Q  234 aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 317  Q
    | |||| |  |||||||  | |||||||||||||||| |||| || | ||||   |||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  23019810 atcttatattgactcataaaacttagttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacaacatgacttcataatatcaa 23019727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 201 - 339
Target Start/End: Original strand, 23207266 - 23207401
Alignment:
Q  201 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaa-acaa 298  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | |||||||| |||| |       
T  23207266 aatccaataatttggaac---atcatctt--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagtt 23207360  T
Q  299 catgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaa 339  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  23207361 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacgacatctcaa 23207401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 22413354 - 22413048
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttg 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||   ||||||| |||| ||  ||||| ||||||||| |    |||| |||||||| ||||||||||||    
T  22413354 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgagtatgcatggactcaacaacttaa-catcttaaaacattgacctcttatataaatccaataatttg 22413257  T
Q  215 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaa-acaacatgacataata-- 310  Q
    ||||   ||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||| ||||| | |||||||| |||| |   ||||| |||| |      
T  22413256 gaac---atcatctt--tcatcttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaat 22413162  T
Q  311 atatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatctta-a 407  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| || || |||  |||| ||| ||||||| |||| | |  |||||||| || | |||||||||| ||||||| |    
T  22413161 atatcaaatgcaaatcaacaacatctc-aacat-cataaataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatcttata 22413064  T
Q  408 acagcttcacagatta 423  Q
    ||||||||||||||||    
T  22413063 acagcttcacagatta 22413048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 182
Target Start/End: Original strand, 24673383 - 24673529
Alignment:
Q  37 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt--gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagccc 134  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |  | ||||||| |||||  || |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||  |||||    
T  24673383 tattttagtattaatatactttcagggcatgag-ctcccatcgttatttttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagccc 24673480  T
Q  135 ccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 182  Q
    |||||||    ||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||    
T  24673481 ccaacaaatgtatgctaatgcatggactcaatctcttaaaacatcttaa 24673529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 32215271 - 32215204
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||    
T  32215271 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgctatttga 32215204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 238 - 287
Target Start/End: Original strand, 23287384 - 23287433
Alignment:
Q  238 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagta 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||    
T  23287384 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacataggcagta 23287433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 182
Target Start/End: Original strand, 24680000 - 24680146
Alignment:
Q  37 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt--gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagccc 134  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||| |||||  || |||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||  |||||    
T  24680000 tattttagtattaatatactttcagggcatgag-cccccatcgttatttttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagccc 24680097  T
Q  135 ccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 182  Q
    |||||||    ||||||||||||  |||| | ||||| |||||||||||    
T  24680098 ccaacaaatgtatgctaatgcattgactcaatctcttaaaacatcttaa 24680146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 278
Target Start/End: Original strand, 26392403 - 26392443
Alignment:
Q  238 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  26392403 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaaca 26392443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 23713104 - 23713058
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactc 163  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  23713104 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatggactc 23713058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 24642933 - 24642862
Alignment:
Q  306 taataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  24642933 taataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 24642862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 45678429 - 45678304
Alignment:
Q  37 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccc 135  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||| |||| |  ||||||||| ||||| || |||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  45678429 tattttagtattaatatactttcagtgcattag-cccccatcgttattttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccc 45678332  T
Q  136 caacaatgaaatgctaatgcatgaactc 163  Q
    ||||||    ||||||||||||| ||||    
T  45678331 caacaaatgtatgctaatgcatggactc 45678304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 32215302 - 32215248
Alignment:
Q  33 tcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  32215302 tcgctatttgagtattattatacttacagagcatcaagccccaatcgctatttga 32215248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 81
Target Start/End: Original strand, 23130725 - 23130786
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 81  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  23130725 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgct 23130786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 81
Target Start/End: Original strand, 23133192 - 23133253
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 81  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  23133192 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgct 23133253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 34402821 - 34402760
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 81  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  34402821 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgct 34402760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 85
Target Start/End: Original strand, 38967194 - 38967258
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt 85  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  38967194 catcaagcccctatcactatttgagtattattatact-ccagagcatcaaacccctatcgctattt 38967258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 85
Target Start/End: Original strand, 43137075 - 43137139
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt 85  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  43137075 catcaagcccctatcgctatttaagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctattt 43137139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 47 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 3441 - 3050
Alignment:
Q  47 ttaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaa 146  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3441 ttaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaaa 3342  T
Q  147 tgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgac 246  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3341 tgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttagaacaacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgac 3242  T
Q  247 tcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatataca 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3241 tcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatataca 3143  T
Q  347 ttcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcatc 437  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  3142 ttcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttcacaggttataattaacatcatc 3050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 3)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 20 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 17539 - 17115
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  17539 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaacctc 17440  T
Q  120 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaa-- 217  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||      
T  17439 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcaacctcgtaaacatcttaattcgacaacctctcatataatccaataatttggaaac 17340  T
Q  218 --cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatac--aaaaacaacatgacataataata 313  Q
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  17339 atcatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaaaacagcatgacataataata 17240  T
Q  314 tcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacag 411  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  17239 tcaaatgcaagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaacacgtcttaaacag 17140  T
Q  412 cttcacagattataattaacttcat 436  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||    
T  17139 ctttacagattataattaacatcat 17115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 236 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 79430 - 79297
Alignment:
Q  236 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatc 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  79430 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacga-cagtatataaaaacagcatgacataataatttcaaatgcaagtcaacaacgtc 79332  T
Q  336 tcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtata 370  Q
    |||| ||| ||   |||| ||||||||||| ||||    
T  79331 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatata 79297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 14399 - 14139
Alignment:
Q  25 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaagg 124  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  14399 agcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgttatttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccaggg 14301  T
Q  125 catcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaaatcgacaacctattatata-atccaataatttgga--act 219  Q
    ||| |||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| |  | || ||||||| |||||||||||||||   |     
T  14300 cat-aagcccccaacatatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatctt-aatc-atcatctcttatatatatccaataatttggagttca 14205  T
Q  220 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcag 285  Q
     ||||||||| |||| |||| |  |||||||||| | |||||||||||||| |||| || ||||||    
T  14204 acatcatcttaatcatcttatatagactcatgcatcatagttaaataacaatagcagcataagcag 14139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 20 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 340263 - 339849
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  340263 catcaagcccccatcgctatt--agtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgcaattttagctaaagctccatcgtgttgagtacaaggctc 340166  T
Q  120 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 219  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  340165 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataattttgaact 340066  T
Q  220 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 319  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  340065 tcatcatcttcgtcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-acaacaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaaat 339968  T
Q  320 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 417  Q
     |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  339967 -caagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgtgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 339869  T
Q  418 agattataattaacttcatc 437  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  339868 agattataattaacgtcatc 339849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 158716 - 158456
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  158716 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcaacaacctcttatataatccaataatttgg 158617  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  158616 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 158518  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  158517 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 158456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 57 - 437
Target Start/End: Original strand, 4350 - 4729
Alignment:
Q  57 tccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgca 156  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4350 tccagggcatcaagcccccatcgctatt-gagctaaagctccatcgtgttgagta-aaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgca 4447  T
Q  157 tgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagct 256  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4448 tggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttgtataatccaataatttggaacataatcattttcatcaacttagaccgactcatgc-gct 4546  T
Q  257 tagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactc 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4547 tagttaaataacaacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattc 4646  T
Q  357 aagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcatc 437  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4647 aagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatc 4729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 57 - 437
Target Start/End: Original strand, 11932 - 12311
Alignment:
Q  57 tccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgca 156  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11932 tccagggcatcaagcccccatcgctatt-gagctaaagctccatcgtgttgagta-aaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgca 12029  T
Q  157 tgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagct 256  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12030 tggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttgtataatccaataatttggaacataatcattttcatcaacttagaccgactcatgc-gct 12128  T
Q  257 tagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactc 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12129 tagttaaataacaacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattc 12228  T
Q  357 aagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcatc 437  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12229 aagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatc 12311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 57 - 437
Target Start/End: Original strand, 21884 - 22263
Alignment:
Q  57 tccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgca 156  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21884 tccagggcatcaagcccccatcgctatt-gagctaaagctccatcgtgttgagta-aaggctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgca 21981  T
Q  157 tgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagct 256  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21982 tggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttgtataatccaataatttggaacataatcattttcatcaacttagaccgactcatgc-gct 22080  T
Q  257 tagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactc 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22081 tagttaaataacaacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattc 22180  T
Q  357 aagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcatc 437  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22181 aagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatc 22263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 275; Significance: 1e-153; HSPs: 87)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 20 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 18818727 - 18818314
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  18818727 catcaagcccccatcactatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctc 18818628  T
Q  120 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 219  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  18818627 cagggcatcaatcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaca 18818528  T
Q  220 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  18818527 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 18818428  T
Q  320 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 417  Q
    | ||| ||||| ||||| |||||| || | |||  |||||||||||  |||| ||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18818427 gtaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 18818328  T
Q  418 agattataattaac 431  Q
    ||||||||||||||    
T  18818327 agattataattaac 18818314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 57 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 16092621 - 16092240
Alignment:
Q  57 tccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgca 156  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16092621 tccagggcatcaagcccccatcgctatt-gagctaaagctccatcgtattgagca-aaggctccagggcatcaagcctccaacaatgaaatgctaatgca 16092524  T
Q  157 tgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagct 256  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092523 tggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaatagtttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagct 16092424  T
Q  257 tagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactc 356  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |     
T  16092423 tagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattt 16092324  T
Q  357 aagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatctt-aaacagcttcacagattataattaacttcatc 437  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| || |||||||||||| |||||    
T  16092323 aagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacaacttcgcatattataattaacatcatc 16092240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 20 - 431
Target Start/End: Original strand, 22874872 - 22875281
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||| | || ||||    
T  22874872 catcaagcccccgtcgctata--agtattaatatacttccagggcatcaagccctcatcgctatt-gagctaaagctccatcgtgttgagca-aaggctc 22874967  T
Q  120 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 219  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||     
T  22874968 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgataatgcatggactcgacctcttaaatatcttaaatcaacaacctcttatatagtccaataatttggaaca 22875067  T
Q  220 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 319  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22875068 tcatcatcttcatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaatagcagcagcaacacaggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaaat 22875166  T
Q  320 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatctt-aaacagcttca 416  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  22875167 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagcttca 22875266  T
Q  417 cagattataattaac 431  Q
    |||||||||||||||    
T  22875267 cagattataattaac 22875281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 64 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 28649322 - 28648943
Alignment:
Q  64 catcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactc 163  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28649322 catcaagcccccatcgctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaggctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactc 28649223  T
Q  164 gacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaa----cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttag 259  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28649222 gacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaacatcatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttag 28649123  T
Q  260 ttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaag 359  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  28649122 ttaaataacaaaagcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatcttaattatacattcataattcaag 28649023  T
Q  360 taatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcatc 437  Q
    ||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  28649022 taatgtgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacatattataattaacatcatc 28648943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 44 - 437
Target Start/End: Original strand, 6759088 - 6759478
Alignment:
Q  44 gtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatg 143  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  6759088 gtattaatatacttccagggcatcaagccctcatcgctatt-gagctaaagctccatcgtattgagca-aaggctccagggcatcaagcccccaacaatg 6759185  T
Q  144 aaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagacc 243  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  6759186 aaatgctaatgcatggactcaacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgga-catcatcatcttcatcaacttagacc 6759284  T
Q  244 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| |||    
T  6759285 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaag---tcaacatctcaattat 6759381  T
Q  344 acattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatctt-aaacagcttcacagattataattaacttcatc 437  Q
    ||| |||||| |||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6759382 acactcataattcaattaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagcttcacagattataattaacatcatc 6759478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 20 - 431
Target Start/End: Original strand, 7372581 - 7372986
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7372581 catcaatcccccatcgctgtttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcaatatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctc 7372680  T
Q  120 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 219  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  7372681 cagtgcatcaagcccccaacaatgaaatgttgatgcatggactcaacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaca 7372780  T
Q  220 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  7372781 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 7372880  T
Q  320 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacag 419  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| || | |||  ||||||||||| ||      ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7372881 gcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgctta------tatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacag 7372974  T
Q  420 attataattaac 431  Q
    ||||||||||||    
T  7372975 attataattaac 7372986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 23 - 431
Target Start/End: Original strand, 23406185 - 23406597
Alignment:
Q  23 caagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaa 122  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||||     
T  23406185 caagcacccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccaccatcgctaattgagctaaggctccaacgtgttgagtacaaagctccag 23406284  T
Q  123 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  23406285 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaacatca 23406384  T
Q  223 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23406385 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgca 23406484  T
Q  323 agacaac--aacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcaca 418  Q
    || ||||  | ||||| |||||| || | |||  |||||||||||  |||| ||  ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  23406485 agtcaacatatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacatagtcaacatcaacacatcttaaacaacttcaca 23406584  T
Q  419 gattataattaac 431  Q
     ||||||||||||    
T  23406585 tattataattaac 23406597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 20 - 431
Target Start/End: Original strand, 22626540 - 22626951
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    |||||||||||| |||||||   ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  22626540 catcaagcccccatcgctata--agtattattatacttccagggcatcaagcccccatcgctatttgagctaaagctcaatcgtgttgagtacaaggctc 22626637  T
Q  120 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttg-gaac 218  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||    
T  22626638 cagggcatcaagcctccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttgaaaac 22626737  T
Q  219 ttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 318  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22626738 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaaa 22626836  T
Q  319 tgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttca 416  Q
    | |||  ||||||||||| |||||| || | |||  |||||||||| |||||| ||  ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  22626837 tacaaatcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgtgtataacattatatcacatcattatcatcatcaacacatcttaaacagcttca 22626936  T
Q  417 cagattataattaac 431  Q
    |||||||||||||||    
T  22626937 cagattataattaac 22626951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 20 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 18879547 - 18879136
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  18879547 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccaccatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctc 18879448  T
Q  120 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 219  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  18879447 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaa--tgacaacctcttatataatccaataatttggaaca 18879350  T
Q  220 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||     ||||||||||||||| |    
T  18879349 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaaca-----acataataatatcaatt 18879255  T
Q  320 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 417  Q
    ||||  || |||||||| |||||| ||   ||   |||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||    
T  18879254 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgctcataacattatatcacatcataatcaacatcagcacatctt-atcagcttcac 18879156  T
Q  418 agattataattaacttcatc 437  Q
    |||||||| ||||| |||||    
T  18879155 agattatagttaacatcatc 18879136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 20 - 431
Target Start/End: Original strand, 20536011 - 20536424
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  20536011 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattaagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagctc 20536110  T
Q  120 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 219  Q
     | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| || |||| || ||||||||| ||||||||||||||     
T  20536111 tagggcatcaaacccccaacaatgaaatgctaatgcatggactagacctcttagacatcttaattcaacaatctcttatataattcaataatttggaaca 20536210  T
Q  220 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  20536211 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagaaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 20536310  T
Q  320 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 417  Q
    ||||  || |||||||| |||||| ||   ||   |||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  20536311 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcgacatcaacacatcttaaacaacttcac 20536410  T
Q  418 agattataattaac 431  Q
    ||||||||||||||    
T  20536411 agattataattaac 20536424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 43 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 21924222 - 21923827
Alignment:
Q  43 agtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaat 142  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| | | ||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  21924222 agtattaatatactttcagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacttgttgcgtacaaagctccagggcattaagcccc-aacaat 21924124  T
Q  143 gaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagac 242  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21924123 gaaatgctaatgcatggacttgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttacataatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagac 21924024  T
Q  243 cgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaata 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  21924023 cgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtctacaaaaacaacatgacatgataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaata 21923924  T
Q  343 tacattcataactcaagtaatgcgtataaaatta--tcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcatc 437  Q
    | || | |||  |||||||||||  ||||  |||  |  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21923923 ttcaattatacttcaagtaatgcacataaccttattttgcatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatc 21923827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 59 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 21919279 - 21918899
Alignment:
Q  59 cagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  21919279 cagggcatcaaacccccatcgctatttgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccgcaacaatgaa-tgctaatgcatg 21919181  T
Q  159 aactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctt 257  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21919180 gactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagctt 21919081  T
Q  258 agttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatac-attcataactc 356  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||| | | | ||   ||    
T  21919080 agttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattcttc 21918981  T
Q  357 aagtaatgcgtataaaat-tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcatc 437  Q
    ||||||||| || | | | |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  21918980 aagtaatgcataaacattatatcacatcataatcagcagcaacacatcttaaacagcttcacagatcgtaattaacctcatc 21918899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 20 - 437
Target Start/End: Original strand, 23648350 - 23648775
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||  || |||||||||||||||    
T  23648350 catcaagcccccatcgctaattgagtattaatagacttccagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaatgtgttgagtacaaagctc 23648449  T
Q  120 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 219  Q
    || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||     
T  23648450 cagggcatcaagcccccaactgtgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatatagtccaataatttggaaca 23648549  T
Q  220 tcat------catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataata 313  Q
    ||||      |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| | ||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  23648550 tcatcatcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatagcaacataggcagattacaacaacaacatgacataataata 23648649  T
Q  314 tcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacag 411  Q
    |||  ||||| |||||||||||| |||||| || | | |  |||||||||||  | || ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23648650 tcatttgcaatacaacaacatcttaaatattcaataaaacttcaagtaatgcacacaacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacag 23648749  T
Q  412 cttcacagattataattaacttcatc 437  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||    
T  23648750 cttaacagattataattaacatcatc 23648775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 116 - 430
Target Start/End: Original strand, 26219613 - 26219918
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  26219613 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaatactttgg 26219712  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  26219713 aacttcatcatcataatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacac-agcagtatac-aaaatagtatgacataataatatc 26219810  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattatcacatcataatcaacatcaaaacat-cttaaacagctt 414  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        || ||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  26219811 aaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat--------aagtatgacatcataatcaacatcaacacatcctaaaacagctt 26219902  T
Q  415 cacagattataattaa 430  Q
    || ||||||| |||||    
T  26219903 catagattatcattaa 26219918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 20 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 45131316 - 45130898
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||    
T  45131316 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagc 45131217  T
Q  118 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttgga 216  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| || | ||||||||||||||    
T  45131216 tccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttaaattagtccaataatttgga 45131118  T
Q  217 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 316  Q
    || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  45131117 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaac--aaacagcatgacataataatatca 45131020  T
Q  317 aatgc-aagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat-tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagctt 414  Q
    | | | ||  || |||||||| |  |||||| | ||   ||||||||||| || | | | |||||||||||||||| || ||| | |||||| |||||||    
T  45131019 atttcaaattcatcaacatcttaggtatacaattattcttcaagtaatgcataaacattatatcacatcataatcatcaacaacaaatcttatacagctt 45130920  T
Q  415 cacagattataattaacttcat 436  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  45130919 cacagattataattaacctcat 45130898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 5853557 - 5853298
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5853557 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 5853459  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5853458 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 5853360  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  5853359 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 5853298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 116 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 26225513 - 26225268
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  26225513 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaatactttgg 26225414  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  26225413 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-caatatac-aaaacagtatgacataataatatc 26225316  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaat 363  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26225315 aaatacaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 26225268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Original strand, 1484299 - 1484558
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1484299 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 1484397  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1484398 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 1484496  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  1484497 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 1484558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 20046460 - 20046201
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20046460 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 20046362  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20046361 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 20046263  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| |||  |   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  20046262 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattatttacatataattcaagtaatgcatatacaattat 20046201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Original strand, 20403124 - 20403383
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20403124 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 20403222  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20403223 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 20403321  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  20403322 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 20403383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 4542638 - 4542379
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4542638 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 4542540  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4542539 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-caagatacaaaaacagcatgacataataatatc 4542441  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||  ||||||||||| |||| ||||||    
T  4542440 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatatagttcaagtaatgcatatacaattat 4542379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Original strand, 22001651 - 22001909
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22001651 gctccagggcatcaagcccc-aacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catgttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 22001748  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22001749 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 22001847  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  22001848 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 22001909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 117 - 430
Target Start/End: Original strand, 41598086 - 41598399
Alignment:
Q  117 ctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgga 216  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41598086 ctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaattgacaacctcttatataatccaataatttgga 41598184  T
Q  217 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 316  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41598185 acttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttgaataacaacagcaacac-agtagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 41598283  T
Q  317 aatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaa-cagct 413  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| |||  |||||||  |||| |||||||||| |||| |||| ||| |    
T  41598284 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagtt 41598382  T
Q  414 tcacagattataattaa 430  Q
    |||||||| || |||||    
T  41598383 tcacagatcatcattaa 41598399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 123 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 15203489 - 15203237
Alignment:
Q  123 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15203489 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttca 15203391  T
Q  223 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 322  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  15203390 tcatcttaatcaacttagagcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgta 15203292  T
Q  323 agacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    || ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  15203291 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 15203237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Original strand, 19896162 - 19896424
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19896162 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 19896260  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgac---ataataat 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  19896261 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cggtatacaaaaacagcatgacataataataat 19896359  T
Q  313 atcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  19896360 atcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 19896424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 59 - 436
Target Start/End: Original strand, 31971097 - 31971476
Alignment:
Q  59 cagggcatcaaacccccatcgctat-ttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcat 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31971097 cagggcatcaaacccccatcgctaaattgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcat 31971195  T
Q  158 gaactcgacctcttaaa-catcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagc 255  Q
    | |||||| |||||||| || ||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31971196 ggactcgatctcttaaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagc 31971295  T
Q  256 ttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataact 355  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||  || |||||||| |  ||||||   ||   |    
T  31971296 ttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaattccaattcatcaacatcttatgtatacaaatattctt 31971394  T
Q  356 caagtaatgcgtataaaat-tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcat 436  Q
    |||||||||| || | | | ||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  31971395 caagtaatgcataaacattatatcacatcataatcaacaacaacatatcttatacatcttcacagattataattaacctcat 31971476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 116 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 45290961 - 45290758
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45290961 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 45290862  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45290861 aacttcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 45290763  T
Q  316 aaatg 320  Q
    |||||    
T  45290762 aaatg 45290758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 20 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 5866594 - 5866292
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||    
T  5866594 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagc 5866495  T
Q  118 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttgga 216  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  5866494 tccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttgga 5866396  T
Q  217 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  5866395 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 5866297  T
Q  316 aaatg 320  Q
     ||||    
T  5866296 gaatg 5866292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 124 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 14409702 - 14409450
Alignment:
Q  124 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 223  Q
    |||||||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14409702 gcatcaagcccctatcgctgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacctcat 14409603  T
Q  224 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 323  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14409602 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 14409504  T
Q  324 gacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    | ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  14409503 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 14409450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 20 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 21389770 - 21389353
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||  ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||    
T  21389770 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttctagggcatcaagccgccatcgctaaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagc 21389671  T
Q  118 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctatta-tataatccaataatttgga 216  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  21389670 tccagggcatcaagcccccaactatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttaatatagtccaataatttgga 21389572  T
Q  217 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | | |||||||   |||| ||||||||||| |||||    
T  21389571 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatac---aacagcatgacataattatatc 21389475  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat--cacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagct 413  Q
    |||| |||  || |||||||| |  ||||||  |||   ||||||||||| || || |||||  ||| |||||||||||| ||| | ||||||  |||||    
T  21389474 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaacaacaacatatcttattcagct 21389376  T
Q  414 tcacagattataattaacttcat 436  Q
    ||||| |||| ||||||||||||    
T  21389375 tcacatattacaattaacttcat 21389353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Original strand, 14823671 - 14823929
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14823671 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 14823769  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14823770 aacttcatcatcttaatcaatttagacc-actcatgcagcaaagttaaataacaacaacaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 14823867  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  14823868 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 14823929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 20 - 267
Target Start/End: Original strand, 21255024 - 21255272
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||    
T  21255024 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttctagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagct 21255123  T
Q  119 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttggaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  21255124 ccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaa 21255222  T
Q  218 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa 267  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21255223 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa 21255272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 20 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 13597937 - 13597550
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 118  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| |||| |||||| | |  |||||||||||||    
T  13597937 catcaagccccaatcactatttgagtattattatacttccagggcatcaagccccagtcgctaatttgagctaatgctccaacatggtgagtacaaagct 13597838  T
Q  119 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattat-ataatccaataatttggaa 217  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  13597837 ccagggcatcaagcccccaacactgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaa 13597738  T
Q  218 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 316  Q
    | ||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| || | |||||| ||||| |||||||||||     
T  13597737 cgtcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataagcagaatgc-aaaacatcatgatataataatatcg 13597639  T
Q  317 aatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatc 403  Q
    || |||||  ||||||||| ||||||| ||   |||| ||||||||||| |||| |||  |||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  13597638 aacgcaagtaaacaacatcccaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatc 13597550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 20 - 267
Target Start/End: Original strand, 21249186 - 21249434
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||    
T  21249186 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttctagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagct 21249285  T
Q  119 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttggaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  21249286 ccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcggcctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaa 21249384  T
Q  218 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa 267  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21249385 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa 21249434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 13508403 - 13508018
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    ||||||||| |  ||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  13508403 catcaagcctctatcgttatttgagtattactatact-ccagggcatcaagcccctatcgctaattgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagctc 13508305  T
Q  120 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattat-ataatccaataatttggaac 218  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  13508304 cagggcatcaagcccccaacactgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaac 13508205  T
Q  219 ttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 317  Q
     ||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| ||| | | |||| ||||| ||||||||||| |    
T  13508204 gtcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgc-acaacatcatgatataataatatcga 13508106  T
Q  318 atgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatc 403  Q
    | |||||  ||||||||||||||||| ||   |||| ||||||||||| |||| |||  |||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  13508105 acgcaagtaaacaacatctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatc 13508018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 320
Target Start/End: Original strand, 17140715 - 17141019
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctattt-gagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta---tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaa 115  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||    
T  17140715 catcaagcccccatcgctattttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatttttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaa 17140814  T
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttg 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  17140815 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tactaatgtatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttg 17140913  T
Q  215 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataata 313  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||  || |||||||||||||||    
T  17140914 gaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aatccatcatgacataataata 17141012  T
Q  314 tcaaatg 320  Q
    || ||||    
T  17141013 tcgaatg 17141019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 145 - 377
Target Start/End: Original strand, 4483207 - 4483436
Alignment:
Q  145 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccg 244  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4483207 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaa-tcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccg 4483305  T
Q  245 actcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatata 344  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||     
T  4483306 actcatgcagcttagtt-aataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 4483403  T
Q  345 cattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  4483404 cacatataattcaagtaatgcatatacaattat 4483436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 20 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 21779096 - 21778697
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||  ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||    
T  21779096 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttctagggcatcaagccgccatcgctaaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagc 21778997  T
Q  118 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctatta-tataatccaataatttgga 216  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  21778996 tccagggcatcaagcccccaactatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttaatatagtccaataatttgga 21778898  T
Q  217 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | | |||||||   |||| ||||||||||| |||||    
T  21778897 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatac---aacagcatgacataattatatc 21778801  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat--cacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagct 413  Q
    |||| |||  || |||||||| |  ||||||  |||   ||||||||||| || || |||||  ||| |||||||||||| ||| | ||||||  |||||    
T  21778800 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaacaacaacatatcttattcagct 21778702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 21396296 - 21395885
Alignment:
Q  24 aagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctcca 121  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||  ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||||||    
T  21396296 aagcccccatcgctatttgagtattaatatacttctagggcatcaagccgccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctcca 21396197  T
Q  122 aggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctatta-tataatccaataatttggaactt 220  Q
     ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||| |    
T  21396196 gggcataaagcccccaactatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttaatatagtccaataatgtggaacat 21396098  T
Q  221 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 319  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||   |||| ||||| ||||| |||||||||    
T  21396097 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatac---aacagcatgagataattatatcaaat 21396001  T
Q  320 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat--cacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 417  Q
     |||  || |||||||| |  ||||||  |||   ||||||||||| || || |||||  ||| |||||||||| | ||| | ||||||  |||||||||    
T  21396000 tcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaataacaacatatcttattcagcttcac 21395902  T
Q  418 agattataattaacttc 434  Q
    |||||| ||||||||||    
T  21395901 agattacaattaacttc 21395885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 24 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 21790789 - 21790378
Alignment:
Q  24 aagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctcca 121  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||  ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||||||    
T  21790789 aagcccccatcgctatttgagtattaatatacttctagggcatcaagccgccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctcca 21790690  T
Q  122 aggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctatta-tataatccaataatttggaactt 220  Q
     ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||| |    
T  21790689 gggcataaagcccccaactatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttaatatagtccaataatgtggaacat 21790591  T
Q  221 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 319  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||   |||| ||||| ||||| |||||||||    
T  21790590 catcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatac---aacagcatgagataattatatcaaat 21790494  T
Q  320 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat--cacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 417  Q
     |||  || |||||||| |  ||||||  |||   ||||||||||| || || |||||  ||| |||||||||| | ||| | ||||||  |||||||||    
T  21790493 tcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaataacaacatatcttattcagcttcac 21790395  T
Q  418 agattataattaacttc 434  Q
    |||||| ||||||||||    
T  21790394 agattacaattaacttc 21790378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 20 - 314
Target Start/End: Original strand, 21490796 - 21491092
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 118  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || | ||||||| ||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||    
T  21490796 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccagggcatcaagccacaatcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagct 21490895  T
Q  119 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa-catcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttgga 216  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  21490896 ccagggcatcaagcccccaacaacgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaaacatcttaattcgacaacctcttatattaattcaataatttgga 21490994  T
Q  217 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 314  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| ||||||||||    
T  21490995 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatat 21491092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 71 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 16199913 - 16199546
Alignment:
Q  71 cccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacct 168  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  16199913 cccccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacct 16199815  T
Q  169 cttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa 267  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16199814 cttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataa 16199715  T
Q  268 c-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcg 366  Q
    | |||||||||| |  |||||| |  ||||||||||||||||||||||||| | |||  || | |||||| |  ||||||   ||   |||||||||||     
T  16199714 caaacagcaacatagacagtattc--aaacaacatgacataataatatcaatttcaattcatctacatcttaggtatacaaatattcttcaagtaatgca 16199617  T
Q  367 tataaaat-tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcat 436  Q
    || | | | ||| ||||||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16199616 taaacattatattacatcataatcaacaacaacatatcttatacagcttcacagattataattaacctcat 16199546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 124 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 25484524 - 25484281
Alignment:
Q  124 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 223  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||||    
T  25484524 gcatcaagcccacaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaac-tcttgtataatccaataatttagaacttcat 25484427  T
Q  224 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 323  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25484426 catcttaatcaacttagaccaactcgtgcagcttagttaaataacaacagc--------tagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 25484335  T
Q  324 gacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
      ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  25484334 atcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 25484281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 145 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 16413547 - 16413322
Alignment:
Q  145 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccg 244  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |  |  |||| ||| ||| ||||||||||||||||      ||||| ||||||||||||||    
T  16413547 aatgctaatgcatggactcgaccacttaaacatcttaattaaatgacctcttaaatagtccaataatttggaac------atcttaatcaacttagaccg 16413454  T
Q  245 actcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatata 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||     
T  16413453 actcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt 16413355  T
Q  345 cattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  16413354 cacatataattcaagtaatgcatatataattat 16413322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 117 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 17612332 - 17612018
Alignment:
Q  117 ctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattat-ataatccaataatttgg 215  Q
    ||||| ||||||||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  17612332 ctccagggcatcaagcccctatcgctgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcaacaacctcttataatagtccaataatttgg 17612233  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 314  Q
    ||| ||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| | ||||||| | |||||| ||||| ||||||||||    
T  17612232 aacatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcaacaacataggcagtatgc-aaaacatcatgatataataatat 17612134  T
Q  315 caaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaa-cagct 413  Q
    |  | | |||  ||||||||||||||||  ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||  || ||| || ||||||||| |||| |||| |||||    
T  17612133 cgcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatca-cattataaacatcaaatcatcataaatcagct 17612035  T
Q  414 tcacagattataattaa 430  Q
    |||||||| || |||||    
T  17612034 tcacagatcatcattaa 17612018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 145 - 339
Target Start/End: Original strand, 26223841 - 26224037
Alignment:
Q  145 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatca---tcttcatcaacttaga 241  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||   |||| |||||||||||    
T  26223841 aatgttaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacatcatcaacatcttaatcaacttaga 26223940  T
Q  242 ccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaa 339  Q
     |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26223941 tcgacccatgcagcttaattaaataacaacagcaata-aagcaatatacaaaaatagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 26224037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 195 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 19937192 - 19937065
Alignment:
Q  195 ttatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaa 294  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  19937192 ttatataatccaataatttgga-cttcatcatcttaatcaacttggaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaa 19937095  T
Q  295 acaacatgacataataatatcaaatgcaag 324  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  19937094 acagcatgacataataagatcaaatgcaag 19937065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 113 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 38855474 - 38855246
Alignment:
Q  113 aaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataatccaataat 211  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||   ||  ||||| | ||||| || | ||||||| ||||||| |||||||||    
T  38855474 aaagctccagtgcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacataacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttatata-tccaataat 38855378  T
Q  212 ttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataata 310  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |    
T  38855377 ttggaacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataaca 38855279  T
Q  311 atatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 343  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  38855278 atatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 38855246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 145 - 365
Target Start/End: Original strand, 32121654 - 32121880
Alignment:
Q  145 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat------catcttcatcaactt 238  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||      |||||| ||||||||    
T  32121654 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaactcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacatcattatcaacatcttaatcaactt 32121753  T
Q  239 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctca 338  Q
    |||  |||||||||| |||||||||||||||| |||| || | ||||  ||||  |||| || ||||||| |||||||| |||||  ||||||||||| |    
T  32121754 agaatgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaattgcaattcaacaacatctta 32121853  T
Q  339 aatatacattcataactcaagtaatgc 365  Q
    ||||| || | ||| ||||||||||||    
T  32121854 aatattcaataatatctcaagtaatgc 32121880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 116 - 335
Target Start/End: Original strand, 6520267 - 6520486
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatata-atccaataattt 213  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || | ||  ||||| | ||||| || | ||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  6520267 gctccagggcatcaagcccccgacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataattt 6520364  T
Q  214 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataat 312  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||    
T  6520365 ggaacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaat 6520463  T
Q  313 atcaaatgcaagacaacaacatc 335  Q
    ||| |||||||| || |||||||    
T  6520464 atcgaatgcaagtcatcaacatc 6520486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 236 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 19801527 - 19801333
Alignment:
Q  236 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatc 335  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||    
T  19801527 cttagaccggctcatgcagcttagttaaataacaatagcaacacaa-cagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaacgcaagtcaacaacgtc 19801430  T
Q  336 tcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattatcacatcata-atcaacatcaaaacatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 430  Q
    |||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| |||||| |||  ||| | |||||||||  |||| |||| ||||||||||||| || |||||    
T  19801429 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattataacacaatataacaacatcaagtcatcgtaaatcagcttcacagatcatcattaa 19801333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 233 - 324
Target Start/End: Original strand, 15070571 - 15070661
Alignment:
Q  233 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaag 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15070571 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacac-agtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 15070661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 116 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 23761062 - 23760839
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttg 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||   || |||||| || |||| | | | ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  23761062 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacaaaacatcttaa-caacttagaacaataacctcttatataagtccaataatttg 23760965  T
Q  215 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataata 313  Q
    |||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||   ||| || ||||| |||| ||||    
T  23760964 gaacatcatcatcttca---acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat-gtaaatcatcatgatataacaata 23760869  T
Q  314 tcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 343  Q
    |  ||| |||  ||||||||||||||||||    
T  23760868 ttgaattcaaatcaacaacatctcaaatat 23760839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 187 - 340
Target Start/End: Original strand, 21285569 - 21285720
Alignment:
Q  187 acaacctattatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagca 284  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| | |||    
T  21285569 acaacctcttatataaatccaataatttggaac---atcttcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttgttaaataacaaacaacaacataggca 21285665  T
Q  285 gtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaa 340  Q
    |||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  21285666 gtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaa 21285720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 113 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 26355919 - 26355699
Alignment:
Q  113 aaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataat 211  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | || |||||| ||| ||| | | ||||||| ||| |||| |||||||||    
T  26355919 aaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacatcttaaccat-ttagaacaacaacctcttaaataagtccaataat 26355822  T
Q  212 ttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataata 310  Q
    ||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || || || |||| |    
T  26355821 ttggaacatcatcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcacgatataaca 26355726  T
Q  311 atatcaaatgcaagacaacaacatctca 338  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||    
T  26355725 atatcgaatgcaa-tcaacaacatctca 26355699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 124 - 224
Target Start/End: Original strand, 22965608 - 22965707
Alignment:
Q  124 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 223  Q
    |||||||||||| | || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22965608 gcatcaagccccaatcactgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcggcaacctcttatataatccaataatttggaacttcat 22965706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 117 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 983622 - 983407
Alignment:
Q  117 ctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattat-ataatccaataatttg 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||  ||| ||||||||| || | || |||| |||| | ||||||||||||||    
T  983622 ctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgcgaatgcatggactcaacaactt-aacatcttagaaacaacgacctcttataaaaatccaataatttg 983525  T
Q  215 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaa-aacaacatgacataataat 312  Q
    |||   |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||| ||   ||||| |||| |||    
T  983524 gaa---catcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaacaagttcatgatataacaat 983430  T
Q  313 atcaaatgcaagacaacaacatc 335  Q
     ||||||||||  ||||||||||    
T  983429 ctcaaatgcaattcaacaacatc 983407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 116 - 343
Target Start/End: Original strand, 21673608 - 21673830
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataatccaataatttg 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||  ||||| | ||||| || | ||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  21673608 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttata-agtccaataatttg 21673704  T
Q  215 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataata 313  Q
    |||| | ||||||   ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||| | ||| ||| | ||| || ||||| |||| ||||    
T  21673705 gaacatgatcatc---atcaacttagaccgactcatgcatcatagttaaataacaaacaacaacataggcattatgc-aaatcatcatgatataacaata 21673800  T
Q  314 tcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 343  Q
    || |||||||  ||||||||||||||||||    
T  21673801 tcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 21673830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 37 - 182
Target Start/End: Original strand, 16184537 - 16184682
Alignment:
Q  37 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccc 135  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  16184537 tatttgagtattaatattcttccagggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggcat-aagcccc 16184634  T
Q  136 caaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 182  Q
    ||||| |||  ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  16184635 caacatatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatcttaa 16184682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 44385160 - 44384944
Alignment:
Q  25 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 123  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || || | |||| | |||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||| |    
T  44385160 agcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcctcaatcgttaatttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagg 44385062  T
Q  124 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcg-acctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaacttc 221  Q
    ||||  ||||||||||||   |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||   |||| |  | || ||||| || |||||||||||||||| ||    
T  44385061 gcat-gagcccccaacaaatgaatgctaatgcatggactcgaatctcttaaacatc-acaatc-atcatctcttatattagtccaataatttggaacatc 44384965  T
Q  222 atcatcttcatcaacttagac 242  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  44384964 atcatcttcaacaacttagac 44384944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 116 - 398
Target Start/End: Original strand, 20498466 - 20498745
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataa-tccaataattt 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||  || |  ||||||| || | || |||| |||||||| |||||||||||    
T  20498466 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgcgaatgcatggactcaacaactcag-catcttagaaacaacgacctcttatataaatccaataattt 20498563  T
Q  214 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataat 312  Q
    |||||   ||| ||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||| | |||||||  ||||  | ||||| |||| |||    
T  20498564 ggaac---atcttctt--tcatcttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgtaaaat-agcatgatataacaat 20498657  T
Q  313 atcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaa 398  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| || |||  |||| ||||||||||  |||| |||  |||||||| |||| ||||||||||    
T  20498658 atcaaatgcaagtcatcaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaa 20498745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 17354255 - 17353912
Alignment:
Q  25 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 123  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| | |    
T  17354255 agcccccatcgttaattgagtattaatatacttccaaggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaatgctccatcgtgttgagtacaaagctctagg 17354157  T
Q  124 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt--- 220  Q
    ||||  |||||| |||||    ||||||||||||| ||||||  ||||||||||| | |||| |  | || |||| | |||||||||||||||  ||       
T  17354156 gcat-gagcccctaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatttcttaaacatcat-aatc-atcatctcttat-ttatccaataatttggaggttcaa 17354061  T
Q  221 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataata-----atatc 315  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||| |||| || | ||||  ||||| ||||  ||||||| |||     |||||    
T  17354060 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacattatgacatcatataacgatatc 17353961  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatg 364  Q
    |||| ||||  | || ||||||||  || ||||||||| ||||||||||    
T  17353960 aaatacaagcaagcatcatctcaatcattcattcataattcaagtaatg 17353912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 190 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 18678256 - 18678075
Alignment:
Q  190 acctattatataatccaataatttggaacttcat------catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagc 283  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||      |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| || | ||    
T  18678256 acctcttaaatagtccaataatttggaacatcattatcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggc 18678157  T
Q  284 agtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgc 365  Q
    ||  ||||  |||| || ||||||| |||||||| |||||  ||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||||    
T  18678156 agattacatcaacagcaagacataaaaatatcaattgcaattcaacaacatcttaaatattcaataatatctcaagtaatgc 18678075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 26 - 182
Target Start/End: Original strand, 19898900 - 19899056
Alignment:
Q  26 gcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaagg 124  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||| | || |||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  19898900 gcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgttaatttgagcgaatgctccatcgtgttgagtactaagctccaggg 19898998  T
Q  125 catcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 182  Q
    |||  ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  19898999 cat-gagcccccaacatatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatcttaa 19899056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 40 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 21169031 - 21168887
Alignment:
Q  40 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaa 138  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||  |||||||||    
T  21169031 ttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggcat-gagcccccaa 21168934  T
Q  139 ca-atgaaatgctaatgcatg--aactcgacctctt-aaacatcttaa 182  Q
    || |||  |||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||    
T  21168933 catatg-tatgctaatgcatggaaactcgatctcttaaaacatcttaa 21168887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 40 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 23777133 - 23777000
Alignment:
Q  40 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaa 138  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||    
T  23777133 ttgagtattaatatacttccaaggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggcatga-gcccccaa 23777036  T
Q  139 ca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa 174  Q
    || ||| | |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  23777035 catatgta-tgctaatgcatggactcgatctcttaaa 23777000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 354 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 25363124 - 25363047
Alignment:
Q  354 ctcaagtaatgcgtataaaattat--cacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataatta 429  Q
    |||||||||||| || || |||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25363124 ctcaagtaatgcataaaacattataccacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattataatta 25363047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 71 - 182
Target Start/End: Original strand, 24755565 - 24755676
Alignment:
Q  71 cccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctc 169  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||| |||    
T  24755565 cccccatcgttatttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggcat-aagcccccaacatatgta-tgctaatgcatggactcgatctc 24755662  T
Q  170 tt-aaacatcttaa 182  Q
    || |||||||||||    
T  24755663 ttaaaacatcttaa 24755676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 182
Target Start/End: Original strand, 19982897 - 19983054
Alignment:
Q  25 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 123  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||| |||  |||||||||| |||| ||| |||||||| |    
T  19982897 agcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgttaatttgagctagtgctccatcgtgttgactactaagctccagg 19982995  T
Q  124 gcatcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 182  Q
    ||||  ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||    
T  19982996 gcat-gagcccccaacatatg-tatgctaatgcatggactcaatctcttaaaacatcttaa 19983054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 20466335 - 20466197
Alignment:
Q  44 gtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaat 142  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||     
T  20466335 gtattaatatactttcagggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaaa 20466238  T
Q  143 gaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 182  Q
       ||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||    
T  20466237 tgtatgctaatgcatggactcaatctcttaaaacatcttaa 20466197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 236 - 404
Target Start/End: Original strand, 37116366 - 37116537
Alignment:
Q  236 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaa-acaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaaca 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | |||||| | |||| |   ||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  37116366 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 37116465  T
Q  334 tctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtata-aaat-tatcacatcataatcaacatcaaaacatct 404  Q
    ||||||| || |||  |||| ||| ||||||| |||| |||| |||||||| || | |||||||||| |||||    
T  37116466 tctcaaacat-catatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatct 37116537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 14409787 - 14409721
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  14409787 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctatttga 14409721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 20 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 18678339 - 18678273
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttg 86  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  18678339 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaatcgctatttg 18678273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 17267211 - 17266990
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataa-tccaataattt 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||   ||||||| |||| ||  ||||| ||||||| ||   || |||| |||||||| |||||||||||    
T  17267211 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgagtatgcatggactcaacaacttaa-catcttagaaaaaacgacctcttatataaatccaataattt 17267114  T
Q  214 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaa-acaacatgacataataa 311  Q
    |||||   | ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||| | |||||| | ||||     ||||| |||| ||    
T  17267113 ggaac---aacatctt--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacggttcatgatataacaa 17267019  T
Q  312 tatcaaatgcaagacaacaacatctcaaa 340  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  17267018 tatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaa 17266990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 236 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 17439609 - 17439423
Alignment:
Q  236 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaa-acaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaaca 333  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| | |||||| | |||| |   ||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  17439609 cttagtccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 17439510  T
Q  334 tctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtata-aaat-tatcacatcataatcaacatcaaaacatctta-aacagcttcaca 418  Q
    ||||||| || |||  |||| ||| ||||||| |||| |||| |||||||| || |||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||    
T  17439509 tctcaaacat-catatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattatcaacattaaatcatattataacagcttcaca 17439423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Original strand, 22965521 - 22965588
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  22965521 catcaaggccctatcgctatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaatcgctatttga 22965588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 85
Target Start/End: Original strand, 26223692 - 26223756
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt 85  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  26223692 catcaagcccctatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctattt 26223756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 201 - 340
Target Start/End: Original strand, 24353009 - 24353144
Alignment:
Q  201 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaa-acaa 298  Q
    ||||||||||||||||||   | ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | |||||| | |||| |       
T  24353009 aatccaataatttggaac---aacatctt--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagtt 24353103  T
Q  299 catgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaa 340  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  24353104 catgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaacatctcaaa 24353144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 379 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 26223039 - 26222987
Alignment:
Q  379 acatcataatcaacatcaaaacat-cttaaacagcttcacagattataattaa 430  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  26223039 acatcataatcaacatcaacacatcctaaaacagcttcacagattatcattaa 26222987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 17612410 - 17612344
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| | ||||||| |||| ||||||||||||    
T  17612410 catcaagcccccatcgctatttgagtatcaatatac-tccggagcatcaagcccctatcgctatttga 17612344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 18678367 - 18678316
Alignment:
Q  36 ctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  18678367 ctatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaatcgctatttga 18678316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 141
Target Start/End: Original strand, 377132 - 377189
Alignment:
Q  83 tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaa 141  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  377132 tttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaa 377189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 81
Target Start/End: Original strand, 4483144 - 4483205
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 81  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  4483144 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgct 4483205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 14409744 - 14409684
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 81  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||    
T  14409744 catcaagcccctatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgct 14409684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 17612367 - 17612307
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 81  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||    
T  17612367 catcaagcccctatcgctatttgagtatcaatatac-tccagggcatcaagcccctatcgct 17612307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 25484652 - 25484588
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt 85  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  25484652 catcaagcccttatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctattt 25484588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 81
Target Start/End: Original strand, 26223778 - 26223839
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 81  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  26223778 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgct 26223839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 20 - 437
Target Start/End: Original strand, 51716 - 52135
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  51716 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccaaggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctc 51815  T
Q  120 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 219  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  51816 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaaacaaaaacctcttatataatccaataatttggaaca 51915  T
Q  220 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  51916 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcaatatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 52015  T
Q  320 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 417  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| || | |||  |||||||||||  |||| ||  ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  52016 gcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatctacatcaacacatcttaaacagcttcac 52115  T
Q  418 agattataattaacttcatc 437  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  52116 agattataattaacatcatc 52135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 20 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 168297 - 167884
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  168297 catcaagcccccatcgctatttgagtattaaaatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagct 168198  T
Q  119 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  168197 ccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaa 168099  T
Q  218 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 317  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  168098 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaa 167999  T
Q  318 atgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat-tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttca 416  Q
     |||||  || |||||||| |||||| ||   || | ||||||||||| || | | | ||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||    
T  167998 ttgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcataaacattatatcacatcataatcaaccaaaacacatcttaaacagcttca 167899  T
Q  417 cagattataattaac 431  Q
     ||||||||||||||    
T  167898 aagattataattaac 167884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 43 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 16893 - 16499
Alignment:
Q  43 agtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaat 142  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| | || ||| || ||||||||||| ||||||||    
T  16893 agtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctatt-gagctaaagctccatcgtgttgagca-aaggcttcagggcatcaagcctccaacaat 16796  T
Q  143 gaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagac 242  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  16795 gaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgaaacatcatcatcttcatcaatttagac 16696  T
Q  243 cgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaata 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||    
T  16695 cgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaaatggaagtcaacagcatctcaagta 16596  T
Q  343 tacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcatc 437  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  16595 tacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcaaaatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagactataattaacatcatc 16499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 104)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 20 - 431
Target Start/End: Original strand, 9508991 - 9509405
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 118  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  9508991 catcatgcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaaacccccatcgctattttgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagct 9509090  T
Q  119 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaac 218  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9509091 ccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaac 9509190  T
Q  219 ttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 318  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||     
T  9509191 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagtaacataggcagtatacaataacagcatgacataataatatcaat 9509290  T
Q  319 tgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaa--ttatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttca 416  Q
    |||||  || |||||||| |||||| ||   ||   |||||||||||  |||| |   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9509291 tgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttca 9509390  T
Q  417 cagattataattaac 431  Q
    |||||||||||||||    
T  9509391 cagattataattaac 9509405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 118 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 3564584 - 3564263
Alignment:
Q  118 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaa 217  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  3564584 tccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttagaa 3564485  T
Q  218 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3564484 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 3564385  T
Q  318 atgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaatt--atcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttc 415  Q
    ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  3564384 atgtaagtcaacaacatctcaattatacattcataattcaagtaatgcgtataacattagatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacaacttc 3564285  T
Q  416 acagattataattaacttcatc 437  Q
    | || ||||||||||| |||||    
T  3564284 ataggttataattaacatcatc 3564263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 20 - 431
Target Start/End: Original strand, 12698634 - 12699048
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  12698634 catcaagccgccatcactatttgagtattaatatacttccaaggaatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctc 12698733  T
Q  120 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 219  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  12698734 caggacatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcaacctcttagacatcttaattcaacaaccttttatataatccaataatttggaaca 12698833  T
Q  220 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaa-acaacatgacataataatatcaaa 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||     
T  12698834 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataataatatcaat 12698933  T
Q  319 tgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttca 416  Q
    |||||  || |||||||| |||||| ||   ||   |||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12698934 tgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttca 12699033  T
Q  417 cagattataattaac 431  Q
    |||||||||||||||    
T  12699034 cagattataattaac 12699048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 116 - 430
Target Start/End: Original strand, 48273288 - 48273594
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  48273288 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaatactttgg 48273387  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48273388 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 48273487  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattatcacatcataatcaacatcaaaacatctt-aaacagctt 414  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||        || ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  48273488 aaatgcaagtcaacaacatctc-aatatacattcataattcaagtaat--------aagtatgacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagctt 48273578  T
Q  415 cacagattataattaa 430  Q
    |||||||||| |||||    
T  48273579 cacagattatcattaa 48273594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 116 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 18456634 - 18456319
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18456634 gctccagggcatcaagcccctaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 18456535  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18456534 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgatagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatc 18456436  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagct 413  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| || | |||  |||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18456435 aaatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 18456336  T
Q  414 tcacagattataattaa 430  Q
    |||||||||||||||||    
T  18456335 tcacagattataattaa 18456319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 20 - 437
Target Start/End: Original strand, 10588838 - 10589260
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||    
T  10588838 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagct 10588937  T
Q  119 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaa--tgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttgg 215  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  10588938 ccagggcatcaagcccccaacaatgaatgctgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttgg 10589037  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    ||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10589038 aacatcatcatcttcgacaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatatgcagtatacaaaaacaacatgacataatcatatc 10589137  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat-tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagctt 414  Q
    || |||||  |||||||||||  ||| | ||   ||   ||||| ||||| || | | | |||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||    
T  10589138 aattgcaattcaacaacatcttcaatgttcaaatattcttcaagcaatgcataaacattatatcacatcataatcagcaacaacacatcttaaatagctt 10589237  T
Q  415 cacagattataattaacttcatc 437  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  10589238 cacagattataattaacctcatc 10589260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 28 - 431
Target Start/End: Original strand, 26211804 - 26212212
Alignment:
Q  28 ccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaa-cccccatcgctatt-tgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggc 125  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| | ||| |||| |||||| |||  |||||||||||||||| |||    
T  26211804 ccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaaggcccccatcgctaatctgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggc 26211903  T
Q  126 atcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttcatc 224  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  26211904 atcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaagcaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatc 26212002  T
Q  225 at-cttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 323  Q
    || ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  26212003 attcttcaacaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaattgcaa 26212102  T
Q  324 gacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagat 421  Q
      ||||||||||| |||||| ||   |   |||||||||||| || || ||  |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  26212103 ttcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacattataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagat 26212202  T
Q  422 tataattaac 431  Q
    ||||||||||    
T  26212203 tataattaac 26212212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 81 - 437
Target Start/End: Original strand, 38227344 - 38227702
Alignment:
Q  81 tatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctt 180  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38227344 tatttgagctatagctccatcgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaattctaatgcatggactcgacctcttaaacatctt 38227443  T
Q  181 aaatcgacaacctattatataatccaataatttgg-aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac 279  Q
    || | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  38227444 aatttgacaacctcttatataatccaataatttggaaacatcatcatcttcatctacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacat 38227543  T
Q  280 aagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatg--cgtataaaattat 377  Q
    | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || | |||  |||| |||||  | ||| |   |||    
T  38227544 aggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaattaatgtacatatcattatat 38227642  T
Q  378 cacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcatc 437  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||    
T  38227643 cacatcttaatcaacatcaacatatcttaaatatcttcacatattataattaacatcatc 38227702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Original strand, 11972393 - 11972652
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11972393 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 11972491  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11972492 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 11972590  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  11972591 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 11972652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 14949387 - 14949128
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14949387 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 14949289  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14949288 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 14949190  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  14949189 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 14949128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Original strand, 32125388 - 32125647
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32125388 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 32125486  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32125487 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 32125585  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  32125586 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 32125647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Original strand, 41522814 - 41523073
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41522814 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 41522912  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41522913 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 41523011  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  41523012 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 41523073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Original strand, 41525276 - 41525535
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41525276 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 41525374  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41525375 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 41525473  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  41525474 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 41525535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Original strand, 44116405 - 44116665
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44116405 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttgg 44116504  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44116505 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaacagcaacac-agcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 44116603  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||| ||||| |||| ||||||    
T  44116604 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagcaatgcatatacaattat 44116665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 20 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 15144350 - 15143948
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| || ||||||||||||||| ||||| | || ||||    
T  15144350 catcaagcccccatcgctatt-gagtattaatatacttccagggcatcaaatcctcatcgctatt-gagctaaagctccatcgtgttgagca-aaggctc 15144254  T
Q  120 caaggcatcaagcccccaaca--atgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaa 217  Q
    || |||||| |||||||| |   ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| || | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15144253 cagggcatctagcccccatcgctatgaaatactaatgcatgaactcgacatcttaaacctctttaaacaacaacctcttatataatccaataatttggaa 15144154  T
Q  218 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 317  Q
    | ||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| ||| |||| || || || ||||||||||    
T  15144153 catcatcatc----tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca-tctcagtatgcaataacagcaagatatcataatatcaa 15144059  T
Q  318 atgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatctt-aaacagctt 414  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  15144058 atgcaagccaacaacatctcaagtatacattcataatttaagtaatgcgtataacatcatatcacatcataatcaatgtcaaaacatcttaaaacagctt 15143959  T
Q  415 cacagattata 425  Q
     ||||||||||    
T  15143958 gacagattata 15143948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 15376978 - 15376719
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15376978 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 15376880  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15376879 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 15376781  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  15376780 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 15376719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 21189860 - 21189601
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21189860 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 21189762  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21189761 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 21189663  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  21189662 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 21189601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Original strand, 24702135 - 24702394
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24702135 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 24702233  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702234 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 24702332  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  24702333 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 24702394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Original strand, 456218 - 456477
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  456218 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 456316  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  456317 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 456415  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  456416 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 456477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Original strand, 16232417 - 16232676
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16232417 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 16232515  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16232516 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 16232614  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  16232615 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 16232676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Original strand, 16409956 - 16410215
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16409956 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacgtcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 16410054  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16410055 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 16410153  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||| | |||| ||||||    
T  16410154 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatacatatacaattat 16410215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 20385388 - 20385129
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20385388 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 20385290  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20385289 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 20385191  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  20385190 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 20385129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 11393552 - 11393293
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11393552 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 11393454  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11393453 aactccatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 11393355  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  11393354 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 11393293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Original strand, 27216757 - 27217016
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27216757 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 27216855  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27216856 aacttcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 27216954  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  27216955 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 27217016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Original strand, 24704585 - 24704841
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24704585 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 24704683  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  24704684 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacaa---gacataataatatc 24704779  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  24704780 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 24704841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 123 - 377
Target Start/End: Original strand, 18640176 - 18640428
Alignment:
Q  123 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  18640176 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgaactcttaat-atcttaaatcgacaacctcttatatagtccaataatttggaccttca 18640274  T
Q  223 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 322  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18640275 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 18640373  T
Q  323 agacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    || ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  18640374 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 18640428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 59 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 16386529 - 16386152
Alignment:
Q  59 cagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgca 156  Q
    ||||||||||| |||||||| |||  ||||| |||| |||||| |||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16386529 cagggcatcaagcccccatcactaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtaaaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgca 16386431  T
Q  157 tgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagc 255  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16386430 tggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagc 16386331  T
Q  256 ttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataac 354  Q
    ||||||||||||| |||| | ||| | ||||||||||||| || ||||||||||  ||||||| || |   || |||||||| |||||| ||  ||   |    
T  16386330 ttagttaaataacaaacaacgacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgtatttcatcaacatcttaaatattcaaacaattc 16386231  T
Q  355 tcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaac 431  Q
    ||||||||||| || || ||  ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16386230 tcaagtaatgcataaaacattatattacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattatagttaac 16386152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Original strand, 20110452 - 20110702
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20110452 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgataatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 20110551  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20110552 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagc-----------tatacaaaaacagcatgacataataatatc 20110640  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  20110641 aaatgcaagtcaataacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 20110702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 124 - 377
Target Start/End: Original strand, 3386239 - 3386489
Alignment:
Q  124 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 223  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  3386239 gcatcaagcccccaacaaagaa-tgctaatgcatgaactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaac-tcttgtataatccaataatttggaacttcat 3386336  T
Q  224 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 323  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  3386337 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-tagtatacaaaaacagcatgacatgataatatcaaatgcaa 3386435  T
Q  324 gacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    | ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||| | |||| ||||||    
T  3386436 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatacatatacaattat 3386489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 20 - 242
Target Start/End: Original strand, 14258062 - 14258286
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    |||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14258062 catcaagcccccatcgataattgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgcaatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctc 14258161  T
Q  120 caaggcatcaagccccc-aacaa-tgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaa 217  Q
    || ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14258162 cagggcatcatgccccccaacaaatgaaatgctaatgtatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaa 14258261  T
Q  218 cttcatcatcttcatcaacttagac 242  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  14258262 catcatcatcttcatcaacttagac 14258286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 20 - 320
Target Start/End: Original strand, 34200585 - 34200889
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctattt-gagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaag 116  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||  ||||| |||| |||||| |||  |||||||||||    
T  34200585 catcaagcccccatcgctattttgagtattaatatacttccaaggcatcaaaccctcatcactaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaag 34200684  T
Q  117 ctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa-catcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttg 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  34200685 ctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttg 34200783  T
Q  215 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataata 313  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||||||||    
T  34200784 gaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataata 34200882  T
Q  314 tcaaatg 320  Q
    || ||||    
T  34200883 tcgaatg 34200889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 11996347 - 11996051
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  11996347 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagct 11996248  T
Q  119 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa-catcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttgga 216  Q
    |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  11996247 ccagagcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcaacctcttaaaacatcttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttgga 11996149  T
Q  217 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 314  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| ||||||||||    
T  11996148 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcatcttagttaattaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatat 11996051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 118 - 377
Target Start/End: Original strand, 13647225 - 13647485
Alignment:
Q  118 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa-catcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttgg 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  13647225 tccaaggcattaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaaacatcttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttgg 13647323  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    ||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  13647324 aacatcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatc 13647423  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  13647424 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 13647485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 124 - 324
Target Start/End: Original strand, 13869250 - 13869449
Alignment:
Q  124 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 223  Q
    |||||||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13869250 gcatcaagcccctatcgctgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacctcat 13869349  T
Q  224 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 323  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13869350 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacac-agtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 13869448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 124 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 38898635 - 38898382
Alignment:
Q  124 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 223  Q
    |||||||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  38898635 gcatcaagcccctatcgctgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaacttcac 38898536  T
Q  224 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 323  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38898535 catcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacgacac-agcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 38898437  T
Q  324 gacaa-caacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    | ||| ||||||||||| ||| ||   |||| |||| |||||| |||| ||||||    
T  38898436 gtcaatcaacatctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattat 38898382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 20 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 10064136 - 10063813
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  10064136 catcaagcccctatcgctatttgagtattattatacttc-agggcatcaagcccctatcgctaattgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagctc 10064038  T
Q  120 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattat-ataatccaataatttggaac 218  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  10064037 cagggcatcaagcccccaacactgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttcattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaac 10063938  T
Q  219 ttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 317  Q
     ||| || ||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| | || |||| | | |||| ||||| ||||||||||| |    
T  10063937 atcaacaccttcaacgacttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcggtatgc-acaacatcatgatataataatatcga 10063839  T
Q  318 atgcaagacaacaacatctcaaatat 343  Q
    |  ||||  |||||||||||||||||    
T  10063838 acacaagtaaacaacatctcaaatat 10063813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 20 - 203
Target Start/End: Original strand, 13032560 - 13032744
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  13032560 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccattgctattttgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagct 13032659  T
Q  119 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataat 203  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  13032660 ccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataat 13032744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 124 - 339
Target Start/End: Original strand, 13831279 - 13831491
Alignment:
Q  124 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 223  Q
    |||||||||| ||||| | ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  13831279 gcatcaagcctccaaccaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaac-tcttgtataatccaataatttggaacttcat 13831376  T
Q  224 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 323  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13831377 catcttaatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacac-ggtagtatacaaaaacaacatgacataataatataaaatgcaa 13831475  T
Q  324 gacaacaacatctcaa 339  Q
    | ||||||| ||||||    
T  13831476 gtcaacaacgtctcaa 13831491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 28505604 - 28505321
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||    
T  28505604 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagc 28505505  T
Q  118 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttgga 216  Q
    |||| ||||              ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  28505504 tccagggca--------------atgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttgga 28505420  T
Q  217 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  28505419 acatcatcatcttcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 28505321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 123 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 17062173 - 17061866
Alignment:
Q  123 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 222  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||    
T  17062173 ggcatcaagccctcaactttaaaatgctaatgcatggatt-gacctcttaaacatcttaaatcgacaaactcttgtataatccaataatttgaaacttca 17062075  T
Q  223 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgc 321  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  17062074 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaactc-agcagtatac-aaaatagcatgacataataatatcaaatgc 17061977  T
Q  322 aagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaa-cagcttcaca 418  Q
    ||| || |||| |||||| |||  |   |||| ||||||||||| |||| |||  |||||||  |||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  17061976 aagtcagcaacgtctcaattattaacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttcaca 17061878  T
Q  419 gattataattaa 430  Q
    ||| || |||||    
T  17061877 gatcattattaa 17061866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 195 - 377
Target Start/End: Original strand, 18430687 - 18430868
Alignment:
Q  195 ttatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaa 294  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  18430687 ttatataatccaataatttggaacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatataaaa 18430785  T
Q  295 acaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  18430786 acatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 18430868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 118 - 436
Target Start/End: Original strand, 40443292 - 40443610
Alignment:
Q  118 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttgga 216  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  40443292 tccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaaccttttatattagtccaataatttgga 40443390  T
Q  217 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |  |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| ||  ||||| |||||||||||||||||    
T  40443391 atatcatcatcttcaacatcttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacatacgcagtaaac--aaacagcatgacataataatatc 40443488  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat-tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagctt 414  Q
    || | |||  || |||||||| |  ||||||   ||   ||||||||||| || | | | ||||||||||||||||||| | | | |||||| |||||||    
T  40443489 aatttcaattcatcaacatcttaggtatacaaatattcttcaagtaatgcataaacattatatcacatcataatcaacaacgacatatcttatacagctt 40443588  T
Q  415 cacagattataattaacttcat 436  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  40443589 cacagattataattaacctcat 40443610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 61 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 27848109 - 27847739
Alignment:
Q  61 gggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 158  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||| | |  ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  27848109 gggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaatgctccaacatggtgagtacaaagcttcagggcatcaagcccccaactatgaa-tgctaatgcatg 27848011  T
Q  159 aactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctt 257  Q
     ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||    
T  27848010 gactcgacctcttaaacaacttaattcggcaacctcttatactagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacatcttagaccgattcatgcagctt 27847911  T
Q  258 agttaaataa-caacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactc 356  Q
    ||||||||||  |||||||||| | ||||| |||   ||||  |||||||||| ||||||||| |||  || |||||||| |  ||||||  |||   ||    
T  27847910 agttaaataataaacagcaacataggcagtgtac---aacagtatgacataattatatcaaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttc 27847814  T
Q  357 aagtaatgcgtataaaattat--cacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaa 430  Q
    ||||||||| || || |||||  |||||||||||||||| ||| | ||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  27847813 aagtaatgcata-aacattatcacacatcataatcaacaacaacatatcttattcagcttcacagattatagttaa 27847739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 195 - 377
Target Start/End: Original strand, 16213659 - 16213840
Alignment:
Q  195 ttatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaa 294  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16213659 ttatataatccaataatttggaacctcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agcagtatacaaaa 16213757  T
Q  295 acaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| || ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  16213758 acaacatgacataataatatcaaatccaagtcaacaacgtcttaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattat 16213840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 123 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 26356255 - 26355989
Alignment:
Q  123 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaa---tcgacaacctattatataatccaataatttggaact 219  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26356255 ggcatcaagccctcaactatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaat-atcttaaaaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaact 26356157  T
Q  220 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca----------agcagtatacaaaaacaacatgacataat 309  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||          | ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  26356156 tcatcatcttaatcaatttagactgactcatgcagcaaagttaaataacaacaacaacacaacataaacacaacagtatacaaaaacagcataacataat 26356057  T
Q  310 aatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  26356056 aatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 26355989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 123 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 26358707 - 26358441
Alignment:
Q  123 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaa---tcgacaacctattatataatccaataatttggaact 219  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26358707 ggcatcaagccctcaactatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaat-atcttaaaaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaact 26358609  T
Q  220 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca----------agcagtatacaaaaacaacatgacataat 309  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||          | ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  26358608 tcatcatcttaatcaatttagactgactcatgcagcaaagttaaataacaacaacaacacaacataaacacaacagtatacaaaaacagcataacataat 26358509  T
Q  310 aatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  26358508 aatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 26358441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 144 - 370
Target Start/End: Original strand, 24275089 - 24275320
Alignment:
Q  144 aaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatca------tcttcatcaact 237  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| || || |||| ||| ||| |||||||||||||||| | ||||      |||| |||||||    
T  24275089 aaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacgtcttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacataatcaacaacatcttaatcaact 24275188  T
Q  238 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctc 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  24275189 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctc 24275287  T
Q  338 aaatatacattcataactcaagtaatgcgtata 370  Q
    || ||| ||   |||| ||||||||||| ||||    
T  24275288 aattattcacatataattcaagtaatgcatata 24275320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 20 - 158
Target Start/End: Original strand, 16579377 - 16579515
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16579377 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctc 16579476  T
Q  120 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 158  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16579477 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 16579515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 20 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 16586286 - 16586148
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16586286 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctc 16586187  T
Q  120 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 158  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16586186 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 16586148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 116 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 2280339 - 2280033
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataa-tccaataattt 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||  || || | ||||| || | || |||| |||||||| | |||||||||    
T  2280339 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcaacaactcaacc-tcttagaaacaacgacctcttatataaattcaataattt 2280242  T
Q  214 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataat 312  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| | ||||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  2280241 ggaacatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataataat 2280145  T
Q  313 atcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatctta-aac 409  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| |||  |||| |||| |||| | ||||||||  |||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||    
T  2280144 atcaaatgcaaatcaacaacatctcaaatattcatatataattcaaataatacatataaaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcttataac 2280045  T
Q  410 agcttcacagat 421  Q
    ||||||||||||    
T  2280044 agcttcacagat 2280033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 25 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 18155152 - 18154810
Alignment:
Q  25 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaagg 124  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  18155152 agcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccaggg 18155054  T
Q  125 catcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca- 222  Q
    |||  ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||| |  | || |||| | |||||||||||||||  ||||     
T  18155053 cat-gagcccccaacatatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaacatc-tcaatc-atcatctcttat-ttatccaataatttggaggttcaa 18154959  T
Q  223 --tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaaca-----acatgacataataatatc 315  Q
      ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||  ||||| ||||     |||| ||||||  |||||    
T  18154958 cttcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcaacataggcagattacaacaacagtatgacatcacataacgatatc 18154859  T
Q  316 aaatgcaagacaa-caacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgc 365  Q
    ||||  || |||| |||||||||||  || ||||||||| |||||||||||    
T  18154858 aaat--aaaacaagcaacatctcaatcattcattcataattcaagtaatgc 18154810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 106 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 15755120 - 15754955
Alignment:
Q  106 tgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa-catcttaaatcgacaacctattatat-aat 203  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| || ||||| ||||||| ||  ||||| |||    
T  15755120 tgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggattcgacctcttaaaacaacttaattcgacaatctcgtatattaat 15755022  T
Q  204 ccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 270  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15755021 ccaattatttggaacatcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa 15754955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 116 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 15082147 - 15082017
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||    
T  15082147 gctccagggcatcaagccccaaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaattgacaaactcttgtataatccaataatttgg 15082048  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactca 249  Q
    |||||   |||||| |||||||||||||||||||    
T  15082047 aactt---catcttaatcaacttagaccgactca 15082017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 145 - 320
Target Start/End: Original strand, 16495329 - 16495505
Alignment:
Q  145 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagacc 243  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  16495329 aatgctaatgcatggacttgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttatattaatccaataatttggaacatcatcatcttcaacatcttagacc 16495428  T
Q  244 gactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  16495429 gactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcgaatg 16495505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 123 - 339
Target Start/End: Original strand, 67651 - 67867
Alignment:
Q  123 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatata-atccaataatttggaactt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||  ||||| | ||||| || | ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  67651 ggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataagcaacaacctcttaaatatatccaataatttggaacat 67748  T
Q  221 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 319  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  67749 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 67847  T
Q  320 gcaagacaacaacatctcaa 339  Q
    ||||  ||||||||||||||    
T  67848 gcaaatcaacaacatctcaa 67867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 146 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 19486937 - 19486649
Alignment:
Q  146 atgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccg 244  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||| | |||| |||||    
T  19486937 atgctaatgcatggactcgacttcttaaacgtcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacatcaacatcttcaacgacttggaccg 19486838  T
Q  245 actcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 343  Q
    ||||||||||||||||||  |||  | |||||||| | ||||||| | |||||| ||||| |||||||||||  | | |||  ||||||||||||||||     
T  19486837 actcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgc-aaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataa 19486739  T
Q  344 acattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 430  Q
     ||   |||| |||||| |||| |||| |||  |||||||| |||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||| || |||||    
T  19486738 tcacatataattcaagttatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagcttcacagatcatcattaa 19486649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 20 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 16461350 - 16461233
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16461350 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatactttcagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacgttttgagtacaaagctc 16461251  T
Q  120 caaggcatcaagccccca 137  Q
    || |||||||||||||||    
T  16461250 cagggcatcaagccccca 16461233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 116 - 343
Target Start/End: Original strand, 18005550 - 18005772
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataatccaataatttg 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| | ||||| || | ||||||| ||||| | |||||||||| |    
T  18005550 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatgaacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttata-agtccaataattcg 18005646  T
Q  215 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataata 313  Q
    |||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||   ||| || ||||| |||| ||||    
T  18005647 gaacatcatcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataagcagtat-ggaaatcatcatgatataacaata 18005742  T
Q  314 tcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 343  Q
    || |||||||  ||||||||||||||||||    
T  18005743 tcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 18005772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 19649801 - 19649458
Alignment:
Q  25 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 123  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  19649801 agcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagg 19649703  T
Q  124 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt--- 220  Q
    ||||  ||||||||||||    ||||||||||||| |||||| |||||||| ||| | |||| |  | || |||| | |||||||||||||||  ||       
T  19649702 gcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatctcttaaatatcat-aatc-atcatctcttat-ttatccaataatttggaggttcaa 19649607  T
Q  221 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaaca-----acatgacataataatatc 315  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| || |  |||  ||||| ||||     |||| |||||| ||||||    
T  19649606 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcatagacagattacaacaacaatatgacatcacataacaatatc 19649507  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgc 365  Q
    ||||  || ||| |||||||||||  || ||||||||| |||||||||||    
T  19649506 aaat-aaaaacagcaacatctcaatcattcattcataattcaagtaatgc 19649458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 201 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 12756847 - 12756622
Alignment:
Q  201 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaaca 300  Q
    |||||||||| ||||||| |||||  |||||||   ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  12756847 aatccaataaattggaacatcatc--cttcatc---ttagaccgactcgagcagtttagttaaataacaacagcaacacaa-caatatacaaaaacaaca 12756754  T
Q  301 tgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaa 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||| ||   | || ||||||||||| |||| |||  |||||||  |||| ||||||||||    
T  12756753 tgacataataatatcaaatgcaagtaaacaacgtctcaattattcacataaaattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaa 12756655  T
Q  399 acatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 430  Q
     |||| |||| |||| |||||||| || |||||    
T  12756654 tcatcataaatcagcatcacagatcatcattaa 12756622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 187 - 340
Target Start/End: Original strand, 22072882 - 22073037
Alignment:
Q  187 acaacctattatata-atccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagca 284  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||    
T  22072882 acaacctcttatatatatccaatagtttggaacatcatcatcttaatcaacttagactgacccatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggca 22072981  T
Q  285 gtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaa 340  Q
     ||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  22072982 ctatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaa 22073037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 178
Target Start/End: Original strand, 24054270 - 24054421
Alignment:
Q  25 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaagg 124  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  24054270 agcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatgag-cccccatctctatttgagctaaagctccatcgcgttgagtacaaagctccaggg 24054368  T
Q  125 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatc 178  Q
    |||  ||||||||||||    ||||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  24054369 cat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatcacttaaacatc 24054421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 123 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 811343 - 811145
Alignment:
Q  123 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaactt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||  ||||| | ||||| || | ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |    
T  811343 ggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttatataagtccaataatttggaacat 811246  T
Q  221 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 319  Q
    |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  811245 catcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 811150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 123 - 270
Target Start/End: Original strand, 47831712 - 47831860
Alignment:
Q  123 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctatta-tata-atccaataatttggaact 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||  ||||| | ||||| || | ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||     
T  47831712 ggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaatatatatccaataatttggaaca 47831809  T
Q  220 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 270  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47831810 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 47831860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 123 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 16219928 - 16219719
Alignment:
Q  123 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttc 221  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||  ||||| || |||| | | ||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||    
T  16219928 ggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-caacttagaacaacaacctcttatataagtcgaataatttggaacatc 16219831  T
Q  222 atcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatg 320  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  16219830 atcatcttca---acttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatg 16219735  T
Q  321 caagacaacaacatct 336  Q
    |||| || ||||||||    
T  16219734 caagtcatcaacatct 16219719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 16461455 - 16461338
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  16461455 catcaagcccccaacgctatttgagtactaatatactttcagggcatcaagccctcatcgctaattgagctaaagcttcaacgtgttgagtacaaagctc 16461356  T
Q  120 caaggcatcaagccccca 137  Q
    || |||||||||||||||    
T  16461355 cagggcatcaagccccca 16461338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 116 - 343
Target Start/End: Original strand, 44014082 - 44014301
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataatccaataatttg 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||  ||||| | ||||| || | ||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  44014082 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttata-agtccaataatttg 44014178  T
Q  215 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataata 313  Q
    |||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||||    
T  44014179 gaacatcatcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaata 44014274  T
Q  314 tcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 343  Q
    || |||||||   | |||||||||||||||    
T  44014275 tcgaatgcaa---atcaacatctcaaatat 44014301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 15755271 - 15755152
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 117  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||   ||||||||| |    
T  15755271 catcaagcccttctcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggcgagtacaaacc 15755172  T
Q  118 tccaaggcatcaagccccca 137  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15755171 tccaaggcatcaagccccca 15755152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 123 - 340
Target Start/End: Original strand, 16056239 - 16056450
Alignment:
Q  123 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaactt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||  || || | ||||| || | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||      
T  16056239 ggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcaacaactcaacc-tcttagaaacaacaacctcttatataaatccaataatttggaac-- 16056334  T
Q  221 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 319  Q
     ||| ||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |  || ||| |  ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  16056335 -atcttctt--tcaacttagaccgactgatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacattatgc--aaacaacatgatataacaatatcaaat 16056429  T
Q  320 gcaagacaacaacatctcaaa 340  Q
    ||||  |||||||||||||||    
T  16056430 gcaaatcaacaacatctcaaa 16056450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 174
Target Start/End: Original strand, 9703067 - 9703215
Alignment:
Q  25 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||| | |||| |||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  9703067 agcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaatttcagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagg 9703165  T
Q  124 gcatcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa 174  Q
    ||||  ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  9703166 gcat-gagcccccaacatatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaa 9703215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 16461245 - 16461166
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctcca 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  16461245 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctcca 16461166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 123 - 198
Target Start/End: Original strand, 18427436 - 18427510
Alignment:
Q  123 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattat 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  18427436 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctctt-aacatcttaaatcgacaacctcttat 18427510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 232 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 1868101 - 1867901
Alignment:
Q  232 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaa-acaacatgacataataatatcaaatgcaagacaac 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||| | |||||||| |||| |   ||||| |||| |||||| |||||||   |||    
T  1868101 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaactaacaacaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatatc-aatgcaaatgaac 1868003  T
Q  330 aacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtata-aaat-tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataat 427  Q
    ||||||||||| || |||  |||| ||| ||||||| |||| |||| |||||||| || | |||||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||    
T  1868002 aacatctcaaacat-catatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatcttaaaaagcttcacagatcatcat 1867904  T
Q  428 taa 430  Q
    |||    
T  1867903 taa 1867901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 145 - 227
Target Start/End: Original strand, 16213550 - 16213632
Alignment:
Q  145 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatc 227  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |  |||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  16213550 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaatgacctcttaaatagtccaataatttggaacatcatcatc 16213632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 201 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 15008631 - 15008404
Alignment:
Q  201 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaa-acaa 298  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||   || ||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| | | |||||| |||| |       
T  15008631 aatccaataatttggaacatcat--tcttcatc---ttggaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatataaaacagtt 15008537  T
Q  299 catgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtata-aaat-tatcacatcataatcaacatca 396  Q
    ||||| |||| |||||||| |||||  |||||||| |||||| || |||  |||| ||||||||||| |||| |||| |||||||| || | ||||||||    
T  15008536 catgatataacaatatcaa-tgcaaatcaacaacacctcaaacat-catatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatca 15008439  T
Q  397 aaacatctta-aacagcttcacagattataattaa 430  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  15008438 aatcatcttataacagcttcacagattatcattaa 15008404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 37 - 316
Target Start/End: Original strand, 15211271 - 15211557
Alignment:
Q  37 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccc 135  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||| || ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  15211271 tatttgaatattaatatacttccagggcatgag-cccccatcgttaatttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-aagcccc 15211368  T
Q  136 caac-aatgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaacttcatcatcttca- 231  Q
    ||||  |||  ||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||| |||| |  | || ||||| || |||||||||||||||| ||| ||||  ||     
T  15211369 caacttatg-tatgctaatgcatggactctaactcttaaaacatctt-aatc-atcatctcttatattagtccaataatttggaacatcaacatcaacat 15211465  T
Q  232 ------tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtat-acaaaaacaacatgacataataatatca 316  Q
          ||||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| || | |||| || |||| |||| |||||||||| |||||||    
T  15211466 cttaattcaacatggactgactcatgcaacttagttaattaacaacagcagcataggcagaatcacaacaacatcatgacataacaatatca 15211557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 3564621 - 3564565
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaaccccca 76  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  3564621 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccccca 3564565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 32216861 - 32216704
Alignment:
Q  25 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  || || || ||||| || ||||||||||| |||||| |||| |||||||||| || ||||| |||||||| |    
T  32216861 agcccccatcgctatttgagtattaaaatattttcaaggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaatgctccatcgtgttaagtactaagctccagg 32216763  T
Q  124 gcatcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 182  Q
    ||||  ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  32216762 gcat-gagcccccaacatatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatcttaa 32216704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 76
Target Start/End: Original strand, 40443255 - 40443311
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaaccccca 76  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  40443255 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagccccca 40443311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 17138361 - 17138120
Alignment:
Q  37 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccc 135  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||| ||||| || |||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  17138361 tattttagtattaatatactttcagggcatgag-cccccatcgttattttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccc 17138264  T
Q  136 caacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt---catcatcttca 231  Q
    ||||||    ||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||| |||| |  | ||  ||||| |||||||||||||||  ||   ||||||||| |    
T  17138263 caacaaatgtatgctaatgcatggactcaatctcttaaaacatctt-aatc-atcatctcatatat-atccaataatttggaggttcaacatcatcttaa 17138167  T
Q  232 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 278  Q
    ||| |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||    
T  17138166 tcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcaaca 17138120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Original strand, 13869165 - 13869231
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  13869165 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctatttga 13869231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Original strand, 16213443 - 16213510
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  16213443 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaatcgctatttga 16213510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 38898720 - 38898654
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  38898720 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctatttga 38898654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 221 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 14932851 - 14932749
Alignment:
Q  221 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatg 320  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| || | || | | ||  ||||| || | ||||||||||||||||||| ||    
T  14932851 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaacaatagcatgacataataatatcaattg 14932752  T
Q  321 caa 323  Q
    |||    
T  14932751 caa 14932749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 221 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 15356286 - 15356184
Alignment:
Q  221 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatg 320  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| || | || | | ||  ||||| || | ||||||||||||||||||| ||    
T  15356286 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaacaatagcatgacataataatatcaattg 15356187  T
Q  321 caa 323  Q
    |||    
T  15356186 caa 15356184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 221 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 15360400 - 15360298
Alignment:
Q  221 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatg 320  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| || | || | | ||  ||||| || | ||||||||||||||||||| ||    
T  15360400 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaacaatagcatgacataataatatcaattg 15360301  T
Q  321 caa 323  Q
    |||    
T  15360300 caa 15360298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 335
Target Start/End: Original strand, 12901338 - 12901443
Alignment:
Q  232 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaa-acaacatgacataataatatcaaatgcaagacaac 329  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||| | ||||||||||||| |   ||||| |||| |||||||||||||| ||| |    
T  12901338 tcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatacaaaataattcatgatataacaatatcaaatgcaaaacagc 12901437  T
Q  330 aacatc 335  Q
    ||||||    
T  12901438 aacatc 12901443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 16461174 - 16461129
Alignment:
Q  113 aaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 158  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16461174 aaagctccagggcatcaatcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 16461129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 278
Target Start/End: Original strand, 12186835 - 12187076
Alignment:
Q  37 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccc 135  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||| ||||| || |||| ||||||||||  |||||||||||||| | |||||  ||||||    
T  12186835 tattttagtattaatatactttcagggcatgag-cccccatcgttattttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctctagggcat-gagcccc 12186932  T
Q  136 caacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt---catcatcttca 231  Q
    ||||||    ||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||| |||| |  | ||  ||||| |||||||||||||||  ||   ||||||||| |    
T  12186933 caacaaatgtatgctaatgcatggactcaatctcttaaaacatctt-aatc-atcatctcatatat-atccaataatttggaggttcaacatcatcttaa 12187029  T
Q  232 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 278  Q
    ||| |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||    
T  12187030 tcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcaaca 12187076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Original strand, 13647144 - 13647211
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| || |||||||||    
T  13647144 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaattgctatttga 13647211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Original strand, 16495178 - 16495245
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  16495178 catcaaacccctatcgctatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaatcgctatttga 16495245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 201 - 263
Target Start/End: Original strand, 14044735 - 14044792
Alignment:
Q  201 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaa 263  Q
    ||||||||||||||||||   | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14044735 aatccaataatttggaac---aacatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaa 14044792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 201 - 263
Target Start/End: Original strand, 14354765 - 14354822
Alignment:
Q  201 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaa 263  Q
    ||||||||||||||||||   | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14354765 aatccaataatttggaac---aacatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaa 14354822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 163
Target Start/End: Original strand, 14429758 - 14429825
Alignment:
Q  94 gctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactc 163  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  14429758 gctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-aagcccccaacaatg-tatgctaatgcatggactc 14429825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Original strand, 13647100 - 13647167
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||    
T  13647100 catcaagtcccaatcgctatttgagtattattatacttccaaagcatcaagccccaatcgctatttga 13647167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 16402755 - 16402712
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccaggg 63  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  16402755 catcaagcccccatcgttatttgagtattaatatacttccaggg 16402712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Original strand, 16495222 - 16495289
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | |||| || | ||||||| |||| ||||||||||||    
T  16495222 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatactcccggagcatcaagccccaatcgctatttga 16495289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 2832580 - 2832504
Alignment:
Q  201 aatccaataatttggaact--tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 275  Q
    ||||||||||||||||  |  |||||||||| |||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  2832580 aatccaataatttggagttcatcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaatagca 2832504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 85
Target Start/End: Original strand, 3386154 - 3386218
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt 85  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  3386154 catcaagcccctatcgctatttaagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctattt 3386218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 85
Target Start/End: Original strand, 13831194 - 13831258
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt 85  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  13831194 catcaagcccctatcgctatttgaatattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgctattt 13831258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 81
Target Start/End: Original strand, 13869208 - 13869268
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 81  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| ||||||    
T  13869208 catcaagcccctatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccctatcgct 13869268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 81
Target Start/End: Original strand, 16213487 - 16213548
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 81  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  16213487 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgct 16213548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 81
Target Start/End: Original strand, 16495266 - 16495327
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 81  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  16495266 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgct 16495327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 201 - 278
Target Start/End: Original strand, 18203801 - 18203873
Alignment:
Q  201 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 278  Q
    ||||||||||||||||||   | ||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  18203801 aatccaataatttggaac---aacatctt--tcatcttagatcgactcatgcagcttagttaataaacaacaacaaca 18203873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 20 - 437
Target Start/End: Original strand, 13015 - 13433
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  13015 catcaagtccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagctc 13114  T
Q  120 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 219  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  13115 cagggcatcaagcccc-aacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaca 13213  T
Q  220 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 319  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  13214 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 13313  T
Q  320 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 417  Q
    ||||  || |||||||| |||||| ||   ||   ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13314 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 13413  T
Q  418 agattataattaacttcatc 437  Q
    | |||||||||||| |||||    
T  13414 aaattataattaacatcatc 13433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 20 - 437
Target Start/End: Original strand, 39716 - 40134
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39716 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagctcccatcgctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctc 39815  T
Q  120 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 219  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  39816 cagggcatcaagtccccaacaatgaaatgctaatgcatggacccgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaca 39915  T
Q  220 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 319  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39916 tcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcagcttaattaaataacaatagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaaat 40014  T
Q  320 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 417  Q
    ||| | ||| ||||||| ||||||    | |||  |||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  40015 gcatgtcaataacatcttaaatatttgattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcataaagagcttcac 40114  T
Q  418 agattataattaacttcatc 437  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  40115 agattataattaacatcatc 40134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 201 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 20017 - 19883
Alignment:
Q  201 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaa-acaa 298  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| | |||||||| |||| |       
T  20017 aatccaataatttggaac---atcatctt--tcatcttagaccgactcatgcagcttaattaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagtt 19923  T
Q  299 catgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctca 338  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  19922 catgatataacaatatcaaatgcaattcaacaacatctca 19883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 19015 - 18870
Alignment:
Q  37 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccc 135  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||| | ||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  19015 tattttagtattaatatactttcagggcataagacccc-atcgttattttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccc 18918  T
Q  136 caacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 182  Q
    ||||||    ||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||    
T  18917 caacaaatgtatgctaatgcatggactcaatctcttaaaacatcttaa 18870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 53 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 3475 - 3103
Alignment:
Q  53 tacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaa 152  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3475 tacttctagggcatcaagcccccatcgctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctctagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaa 3376  T
Q  153 tgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaa----cttcatcatcttcatcaacttagaccgactc 248  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3375 tgcatggactcgacctcttaaatatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaacatcatcatcatcttcatcaacttagaccgactc 3276  T
Q  249 atgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacatt 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  3275 atgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaatgtaattcaacaacatctcaagtatacatt 3176  T
Q  349 cataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacag 419  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3175 cataattcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacag 3103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 20 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 8847 - 8438
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  8847 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttctagggcatcaagcccccatcactaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctc 8748  T
Q  120 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 219  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  8747 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacaacctcttatataatccaataatttggaaca 8648  T
Q  220 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  8647 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaat---aacagcaacataggcagtat-caaaaacagcatgacataataatatcaatt 8552  T
Q  320 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 417  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| || | |||  |||||||||||  |||| ||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8551 gcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 8452  T
Q  418 agattataattaac 431  Q
    ||||||||||||||    
T  8451 agattataattaac 8438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 20 - 431
Target Start/End: Original strand, 1654 - 2067
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||   ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  1654 catcaagcccccatcactatttgagtattaatatacttccagggtatcaagcccccatcactgaatgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctc 1753  T
Q  120 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 219  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  1754 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaca 1853  T
Q  220 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1854 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 1953  T
Q  320 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 417  Q
    ||||  || |||||||| |||||| ||   ||   |||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  1954 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaatagcttcac 2053  T
Q  418 agattataattaac 431  Q
    ||||||||||||||    
T  2054 agattataattaac 2067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 59 - 426
Target Start/End: Original strand, 15955 - 16323
Alignment:
Q  59 cagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 158  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15955 cagggcatcaagcccccatcgctatttgaactaaagctccatcgttttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 16054  T
Q  159 aactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctta 258  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16055 gactcgacctcttaaacatcttaattcgaaaacctcttatataatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctta 16154  T
Q  259 gttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaa 358  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  16155 gttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacagcaagatatcataatatcaaatgcaagccaacatcatctcaagtatacattcataactcaa 16254  T
Q  359 gtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatctt-aaacagcttcacagattataa 426  Q
    ||||||| ||||| ||  |||||| |||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16255 gtaatgcatataacattatatcacgtcatgatcaacatc--aacatcttaaaacagcttcacagattataa 16323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 43 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 33250 - 32864
Alignment:
Q  43 agtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaat 142  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | |  ||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  33250 agtattaatatacttccagggcatcaagctcttatcgctatt-gagctaaagctccatcgtgttgagcacaaggctccagggcatcaagcccccaacaat 33152  T
Q  143 gaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagac 242  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33151 gaaatgctaatgcatggactcaacctcttaaacatcttagaacaacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagac 33052  T
Q  243 cgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaata 342  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||    
T  33051 cgactcatgcagcttagttaattaacaacagcaacacaggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatcttaaata 32953  T
Q  343 tacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat--cacatcataatcaacatcaaaacatc-ttaaacagcttcacagattataattaac 431  Q
    | |||| |||  || |||||||| ||||| |||||  |||||||| |||||||||  | |||| | ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  32952 ttcatt-atacttcgagtaatgcatataacattataacacatcatgatcaacatc--agcatcataaaatagcttcacagattataactaac 32864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 43 - 431
Target Start/End: Original strand, 45755 - 46141
Alignment:
Q  43 agtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaat 142  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | |  ||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  45755 agtattaatatacttccagggcatcaagctcttatcgctatt-gagctaaagctccatcgtgttgagcacaaggctccagggcatcaagcccccaacaat 45853  T
Q  143 gaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagac 242  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45854 gaaatgctaatgcatggactcaacctcttaaacatcttagaacaacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagac 45953  T
Q  243 cgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaata 342  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||    
T  45954 cgactcatgcagcttagttaattaacaacagcaacacaggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatcttaaata 46052  T
Q  343 tacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat--cacatcataatcaacatcaaaacatc-ttaaacagcttcacagattataattaac 431  Q
    | |||| |||  || |||||||| ||||| |||||  |||||||| |||||||||  | |||| | ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  46053 ttcatt-atacttcgagtaatgcatataacattataacacatcatgatcaacatc--agcatcataaaatagcttcacagattataactaac 46141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 43 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 17623 - 17388
Alignment:
Q  43 agtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaat 142  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||| || ||| ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||| ||||||||||||||    
T  17623 agtattaatatacttccagggcatcaagcccgtatcgctatt-gagctatagctccatcgtgttgagcacaaggctctagggcattaagcccccaacaat 17525  T
Q  143 gaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagac 242  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17524 gaaatgttaatgcatggactcaacctcttaaacattttagaacgacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagac 17425  T
Q  243 cgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac 279  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17424 cgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacac 17388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 20 - 431
Target Start/End: Original strand, 3273 - 3686
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||    
T  3273 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacgtccagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaatctc 3372  T
Q  120 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 219  Q
     | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  3373 tagggcatctagcccccaaaaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttagacatcttaattcaacaacctcttatataatccaataatttggaaca 3472  T
Q  220 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  3473 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataactaaagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 3572  T
Q  320 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 417  Q
    ||||  || |||||||| |||||| ||   ||   |||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  3573 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcaaataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcat 3672  T
Q  418 agattataattaac 431  Q
    ||||||||||||||    
T  3673 agattataattaac 3686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 20 - 431
Target Start/End: Original strand, 147 - 558
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  147 catcaagcccccatcactatttgagtattaatataattccagcgcatcaagcccccatcgctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtgcaaagctc 246  T
Q  120 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 219  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| || |||||||||||||     
T  247 cagggcatcaagcccccaacaaagaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgac-acctcttatatagtctaataatttggaaca 345  T
Q  220 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 319  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||| |||| | |||||| |||||||||||| |    
T  346 tcatcatctttatcgacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaataacataggcagtatac-aaaatagcatgacgtaataatatcaatt 444  T
Q  320 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 417  Q
    | ||| ||||||||||| |||||| |  | |||  |||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  445 ggaagtcaacaacatcttaaatattcgattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcat 544  T
Q  418 agattataattaac 431  Q
    | ||||||||||||    
T  545 atattataattaac 558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 4)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 59 - 427
Target Start/End: Original strand, 32783 - 33153
Alignment:
Q  59 cagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 158  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32783 cagggcatcaagcccccatctctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtccaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 32882  T
Q  159 aactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg-aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctt 257  Q
     |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32883 gactcgatctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaacatcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagctt 32982  T
Q  258 agttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactca 357  Q
    | ||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| || | |||  |||    
T  32983 aattaaataacaatagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagttaacaacatcttaaatattcaattatacttca 33081  T
Q  358 agtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataat 427  Q
    ||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33082 agtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataat 33153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 59 - 437
Target Start/End: Original strand, 38602 - 38982
Alignment:
Q  59 cagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 158  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38602 cagggcatcaagcccccatcgatatttgcgctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 38701  T
Q  159 aactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg-aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctt 257  Q
     ||| || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38702 gactagaactcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaacatcatcatcttcatcaacttagaccgagtcatgcagctt 38801  T
Q  258 agttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactca 357  Q
    | ||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||| || | |||  |||    
T  38802 aattaaataacaatagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaataaacaacatcttaaatattcaattatacttca 38900  T
Q  358 agtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcatc 437  Q
    ||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38901 agtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatc 38982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 116 - 339
Target Start/End: Original strand, 9645 - 9867
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  9645 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaaaaataatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcctatataatccaataatttgg 9744  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  9745 gacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatc 9843  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaa 339  Q
    || |||||| ||||||| ||||||    
T  9844 aagtgcaagtcaacaacgtctcaa 9867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 59 - 207
Target Start/End: Original strand, 32317 - 32465
Alignment:
Q  59 cagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 158  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32317 cagggcatcaagcccccatctctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtccaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 32416  T
Q  159 aactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaa 207  Q
     |||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  32417 gactcgatctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaa 32465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 71 - 436
Target Start/End: Original strand, 39331 - 39697
Alignment:
Q  71 cccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctct 170  Q
    |||||||||||||||   | ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  39331 cccccatcgctatttaggccaaagctcaatcgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccc-aacaattaaatgctaatgcatggactcgacctct 39429  T
Q  171 taaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg-aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca 269  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39430 taaacatcttaattggacaacctcttatataatccaataatttggaaagatcatcgtcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca 39529  T
Q  270 acagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtat 369  Q
    ||| ||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||    
T  39530 acaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacat 39628  T
Q  370 aaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcat 436  Q
    || ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  39629 aacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcatagattataattaacatcat 39697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 74
Target Start/End: Original strand, 37151 - 37204
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccc 74  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  37151 catcaagcccccatcgctatt-gagtattaatatacttccagggcatcaagcccc 37204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 2)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 71 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 75481 - 75115
Alignment:
Q  71 cccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctct 170  Q
    |||||||||||||||   | ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  75481 cccccatcgctatttaggccaaagctcaatcgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccc-aacaattaaatgctaatgcatggactcgacctct 75383  T
Q  171 taaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg-aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca 269  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  75382 taaacatcttaattggacaacctcttatataatccaataatttggaaagatcatcgtcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca 75283  T
Q  270 acagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtat 369  Q
    ||| ||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||    
T  75282 acaacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacat 75184  T
Q  370 aaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcat 436  Q
    || ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  75183 aacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcatagattataattaacatcat 75115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 77661 - 77608
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccc 74  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  77661 catcaagcccccatcgctatt-gagtattaatatacttccagggcatcaagcccc 77608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 60 - 431
Target Start/End: Original strand, 25738 - 26111
Alignment:
Q  60 agggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatga 159  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  25738 agggcatcaagcccccatcgttatttgagctaaagctccatcgtgtttagtacaaagctccagggcatcaagcctccaacaatgaaatgctaatgcatgg 25837  T
Q  160 actcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg-aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctta 258  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25838 actcgacctcttatacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaacatcattatcttcatcaacttagaccgactcatgaagctta 25937  T
Q  259 gttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaa 358  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || | |||  ||||    
T  25938 gttaaataacaatagcaacataggcagtatac-aaaatatcatgacataataatatcaaatgcaagtaaacaacatctcaaatattcaattatacttcaa 26036  T
Q  359 gtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaac 431  Q
    ||||||| | ||| ||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26037 gtaatgcatttaacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttcacagattataattaac 26111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 96 - 431
Target Start/End: Original strand, 39736 - 40073
Alignment:
Q  96 tccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctat 195  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||| |    
T  39736 tccatcgtgttgagtacaaagctccagggtatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaaaaacttaattcgacaacctct 39835  T
Q  196 tatataatccaataatttgg-aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaa 294  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||    
T  39836 tatataatccaataatttggaaacatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgaagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatac-aaa 39934  T
Q  295 acaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaac 392  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || | |||  ||||||||||| | ||| ||  ||||||||||||||||||    
T  39935 atatcatgacataataatatcaaatgcaagtaaacaacatctcaaatattcaattatacttcaagtaatgcatttaacattatatcacatcataatcaac 40034  T
Q  393 atcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaac 431  Q
    |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40035 atcaacgcatcttaaacagcttcacaaattataattaac 40073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 20 - 425
Target Start/End: Original strand, 4652 - 5059
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||| |||    
T  4652 catcaagcccccatcactatttgagtattaatatacttccaaggcatcaagcccccatcgctaattgacctaaagctccaacgtggtgagtacaaaactc 4751  T
Q  120 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaac 218  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  4752 cagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaaattaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaac 4850  T
Q  219 ttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 318  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  4851 atcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagattagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaaa 4950  T
Q  319 tgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttca 416  Q
    |||||  ||||||||||| || ||| ||   |   |||||||||||| || || ||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  4951 tgcaattcaacaacatcttaagtattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttca 5050  T
Q  417 cagattata 425  Q
    |||||||||    
T  5051 cagattata 5059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 20 - 364
Target Start/End: Original strand, 128554 - 128897
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  128554 catcaagcccccattgctatttgagtattaatatacttcaagggcatcaagcccccatcgctatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctc 128653  T
Q  120 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 219  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  128654 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttggaaca 128753  T
Q  220 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 319  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||  |  | | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  128754 tcatcatcttaatcaaattagaccaactcatgcaacttagttaaataacaaaagcaaca-aaaaaaaaaaaaaaaacagcatgacataataatatcaaat 128852  T
Q  320 gcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatg 364  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| || | |||  ||||||||||    
T  128853 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatg 128897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 201 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 20554 - 20330
Alignment:
Q  201 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaaca 300  Q
    |||||||||| ||||||| |||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  20554 aatccaataagttggaacatcatc--cttcatc---ttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacat-cagtatacaaaa-caaca 20462  T
Q  301 tgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattatcacatcataatcaacatcaaaac 400  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||  ||  |||   ||||||||| |    
T  20461 tgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataaaacatcaaatc 20362  T
Q  401 atcttaaa-cagcttcacagattataattaac 431  Q
    ||| |||| ||||||||||||| || ||||||    
T  20361 atcataaatcagcttcacagatcatcattaac 20330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 66109 - 65958
Alignment:
Q  25 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaagg 124  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||    
T  66109 agcccccatcactatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctatttgagctaaagctccatcgtgttgagttcaaagctccaggg 66011  T
Q  125 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatc 178  Q
    |||  ||||||||||||    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  66010 cat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatctcttaaacatc 65958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 20 - 437
Target Start/End: Original strand, 8282 - 8697
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatt--tgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |  ||| |||| ||||||  ||  |||||||||||     
T  8282 catcaagcccccatcgctattttagtattaatatacttccagggcatcaagtccccatcgctaatgttgagctaatgctccaatgtggtgagtacaaaga 8381  T
Q  118 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaa 217  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8382 tccagggcatcaagcccccaactatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaaaatcttaa-tcgacaacctcttatataatccaataatttggaa 8479  T
Q  218 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 317  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  8480 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcaacataggtagtatacaaaaacagtatgacataataatatcaa 8579  T
Q  318 atgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcac 417  Q
     |||||| ||||||||||| ||| || ||    ||  |||||||||||  |||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  8580 ttgcaagtcaacaacatcttaaacattcaagtgtacttcaagtaatgcacataacatta--acatcataatcaacatcaacacatcctaaacagcttcac 8677  T
Q  418 agattataattaacttcatc 437  Q
    ||||| |||||||| |||||    
T  8678 agattgtaattaacatcatc 8697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 3)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 116 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 44929 - 44682
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  44929 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatattaaatcgacaacctcttatataatccaatactttgg 44830  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44829 aacttcatcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 44730  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaat 363  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44729 aaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 44682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 224 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 26179 - 25964
Alignment:
Q  224 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  26179 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgtaa 26080  T
Q  324 gacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagat 421  Q
      ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  26079 ttcaacaacgtctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcatagat 25980  T
Q  422 tataattaacttcatc 437  Q
    |||||||||| |||||    
T  25979 tataattaacatcatc 25964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 342 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 33491 - 33394
Alignment:
Q  342 atacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat--cacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcatc 437  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  33491 atacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttcataggttataattaacatcatc 33394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 2)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 20 - 431
Target Start/End: Original strand, 20711 - 21127
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  20711 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagct 20810  T
Q  119 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaa 217  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  20811 ccaaggcatcaatcccccaacaatgaaatcctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaa 20910  T
Q  218 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 316  Q
    | ||| |||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20911 catcaacatcttcaacgacttagaccgactcataaagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcaaaaacaacatgacataataatatca 21010  T
Q  317 aatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagctt 414  Q
    | |||||  ||||||||||| | |||| ||    |    |||||||||| || || ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  21011 attgcaattcaacaacatcttatatattcaaatgttctacaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcagcatcaacacatcttaaacagctt 21110  T
Q  415 cacagattataattaac 431  Q
    ||||| |||||||||||    
T  21111 cacaggttataattaac 21127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 69
Target Start/End: Original strand, 10118 - 10167
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaa 69  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10118 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaa 10167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 20 - 436
Target Start/End: Original strand, 31869 - 32285
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 118  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||    
T  31869 catcaaacccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagct 31968  T
Q  119 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaa 217  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  31969 ccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaa 32067  T
Q  218 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 317  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  32068 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaac--aaacaacatgacataataatatcaa 32165  T
Q  318 atgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat-tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttca 416  Q
     | |||  || |||||||| |  ||||||   ||   ||||||||||| || | | | ||||||||||||||||||| | | | |||||| |||||||||    
T  32166 tttcaattcatcaacatcttaggtatacaaatattcttcaagtaatgcataaacattatatcacatcataatcaacaacgacatatcttatacagcttca 32265  T
Q  417 cagattataattaacttcat 436  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  32266 cagattataattaacctcat 32285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 59 - 87
Target Start/End: Original strand, 31864 - 31892
Alignment:
Q  59 cagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31864 cagggcatcaaacccccatcgctatttga 31892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 59 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 6404 - 6020
Alignment:
Q  59 cagggcatcaaacccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcat 157  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6404 cagggcatcaagcccccatcgctattttgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagcttcagggcatcaagcctccaacaatgaaatgctaatgcat 6305  T
Q  158 gaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctt 257  Q
      ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6304 agactcgacctcttaaacatcttaatttgacaacctcttatataatccaaaaatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctt 6205  T
Q  258 agttaaataacaacagcaacacaa---gcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataac 354  Q
    ||||||||||||||| |||||  |   | |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||  || |||||||| |||||| ||   ||       
T  6204 agttaaataacaacaacaacaacataggtagtatacaaaaacagcatgacatgataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattct 6105  T
Q  355 tcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcatc 437  Q
    |||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  6104 tcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacattttataattaacatcatc 6020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 20 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 5150 - 4893
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5150 catcaagcccccatcgctatt-gagcattaatatacttccagggcatcaaacccccatcgctagttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctc 5052  T
Q  120 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 219  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  5051 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaca 4952  T
Q  220 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 278  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4951 tcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaacttagttaaataacaacagcaaca 4893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 294 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 1006 - 881
Alignment:
Q  294 aacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat--cacatcataatcaa 391  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||  |||| |||||  |||||| ||||| |    
T  1006 aacagcatggcataataatatcaa-tgcaagtcaacaaaatctcaaatattcaatcataattcaagtaatgcacataacattatatcacatcgtaatcga 908  T
Q  392 catcaaaacatcttaaacagcttcaca 418  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  907 catcaacacatcttaaacagcttcaca 881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 20 - 336
Target Start/End: Original strand, 28215 - 28533
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| | || ||||||| | || ||||| ||||| ||||| | |  |||||||||||||    
T  28215 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatactttcagggctttaagcccccattgttaatttgagctaaacctccaacatggtgagtacaaagct 28314  T
Q  119 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaa 217  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||| |||||||    
T  28315 ccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatattagtccaatagtttggaa 28414  T
Q  218 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 317  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28415 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 28514  T
Q  318 atgcaagacaacaacatct 336  Q
     |||||  |||||||||||    
T  28515 ttgcaattcaacaacatct 28533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 20 - 270
Target Start/End: Original strand, 4353 - 4605
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 118  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| | |||||| | |||||||| |||| ||||||| ||||| |||| |||||| ||   |||||||||||||    
T  4353 catcaagccccaatcgatatttgagtattattatacttcaaaggcatcaagccccaatcgctaatttgagctaatgctccaacgaggtgagtacaaagct 4452  T
Q  119 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa-catcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttgga 216  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  4453 ccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctctaaaaacatcttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttgga 4551  T
Q  217 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 270  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4552 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 4605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 270
Target Start/End: Original strand, 1798 - 2050
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 118  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||    
T  1798 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttctagggcatcaagccccaatcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagct 1897  T
Q  119 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa-catcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttgga 216  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| || ||| | || ||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  1898 ccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagactcgacctcttaaaacaacttgattcaacaacctcttatattagtccaataatttgga 1996  T
Q  217 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 270  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1997 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 2050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 178 - 320
Target Start/End: Original strand, 11252 - 11395
Alignment:
Q  178 cttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagca 275  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11252 cttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagca 11351  T
Q  276 acacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatg 320  Q
    ||| | ||||||| | ||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  11352 acataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcgaatg 11395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 20 - 436
Target Start/End: Original strand, 4514 - 4932
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 118  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||    
T  4514 catcaagcccccatcggtatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagct 4613  T
Q  119 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaa- 217  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  4614 ccagggcatcaagcccctaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaa 4712  T
Q  218 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 317  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||  | |||||    
T  4713 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataaatacatcaa 4812  T
Q  318 atgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat-tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttca 416  Q
     |||||  || ||| |||| |  ||||||   ||   |||||||| || || | | | ||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||| |||||    
T  4813 ttgcaattcatcaaaatcttatgtatacaaatattcttcaagtaaggcataaacattatatcacatcataatcaacaacaacatatcttatacaacttca 4912  T
Q  417 cagattataattaacttcat 436  Q
    ||||||||| ||||| ||||    
T  4913 cagattatacttaacctcat 4932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 375 - 436
Target Start/End: Original strand, 95 - 156
Alignment:
Q  375 tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcat 436  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  95 tatcacatcataatcaacaacaacatatcttatacaacttcacagattatacttaacctcat 156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 20 - 436
Target Start/End: Original strand, 13297 - 13716
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||    
T  13297 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagc 13396  T
Q  118 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa-catcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttgg 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  13397 tccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaaacgacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttgg 13495  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  13496 aacatcatcaacttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacatgataatatc 13594  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat-tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagctt 414  Q
    || | | |  || |||||||| |  ||||||  |||   ||||||||||| || | | | ||||||||||||||||||| | | | |||||| |||||||    
T  13595 aatttcgattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcataaacattatatcacatcataatcaacaacgacatatcttatacagctt 13694  T
Q  415 cacagattataattaacttcat 436  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  13695 cacagattataattaacctcat 13716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 4)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 20 - 273
Target Start/End: Original strand, 76 - 329
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  76 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatctctaattgagctaaagctccaacgcattaagtacaaagctc 175  T
Q  120 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaact 219  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  176 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaaca 275  T
Q  220 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacag 273  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  276 tcattatcttcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaacag 329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 292
Target Start/End: Original strand, 33924 - 34199
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 117  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||  |||||||||||     
T  33924 catcaaacccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagt 34023  T
Q  118 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttgga 216  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  34024 tgcagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatagactcgacctcttaagcaacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttgga 34122  T
Q  217 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaa 292  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||    
T  34123 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaa 34199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 269 - 431
Target Start/End: Original strand, 13144 - 13308
Alignment:
Q  269 aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgta 368  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||| || | |||  |||||||||||  |    
T  13144 aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcaca 13243  T
Q  369 taaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaac 431  Q
    ||| ||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13244 taacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagtttcacagattataattaac 13308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 59 - 87
Target Start/End: Original strand, 33919 - 33947
Alignment:
Q  59 cagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33919 cagggcatcaaacccccatcgctatttga 33947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 20 - 424
Target Start/End: Original strand, 1751 - 2161
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta----tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaa 115  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||    ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||    
T  1751 catcaagcccccatcgttatttgagtattaatatacttctagggcatcaagcccccatcgctaattttttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaa 1850  T
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttg 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  1851 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttg 1949  T
Q  215 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 314  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  1950 gaacatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaacagcgacataggcagtatacaaaatcaacatgacataatgatat 2049  T
Q  315 caaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagc 412  Q
    ||| |||||  ||||||||||| |||||| ||  ||| | ||||||||||| || || ||  |||| |||||||||||||| ||| | ||| || |||||    
T  2050 caattgcaattcaacaacatcttaaatattcaaacattattcaagtaatgcataaaacattatatctcatcataatcaacaacaacatatcatatacagc 2149  T
Q  413 ttcacagattat 424  Q
    || ||| |||||    
T  2150 tttacatattat 2161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Original strand, 20644 - 20903
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20644 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 20742  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20743 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 20841  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  20842 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 20903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 13)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Original strand, 94308 - 94567
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  94308 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 94406  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  94407 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 94505  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  94506 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 94567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Original strand, 44351 - 44611
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  44351 gctccagggcatcaagtccccaacaattaaaagctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataattttg 44449  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatac-aaaaacaacatgacataataatat 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  44450 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaaacagcatgacataataatat 44548  T
Q  315 caaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  44549 caaatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatagaattat 44611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 20 - 288
Target Start/End: Original strand, 119677 - 119947
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 118  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| |||  |||||||| ||||    
T  119677 catcaagcccccattgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacagagct 119776  T
Q  119 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttggaa 217  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  119777 ccagggcatcaagccctcaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttggaa 119875  T
Q  218 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtat 288  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  119876 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 119947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 224 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 17598 - 17446
Alignment:
Q  224 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 323  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17598 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 17500  T
Q  324 gacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    | ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  17499 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattat 17446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 116 - 343
Target Start/End: Original strand, 100278 - 100500
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataatccaataatttg 214  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || | ||  ||||| | ||||| ||   ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  100278 gctccagggcatcaagctcccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaaaaacaacctcttatata-tccaataatttg 100374  T
Q  215 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataata 313  Q
    |||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||||||||    
T  100375 gaacatcatcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataataata 100470  T
Q  314 tcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 343  Q
    || |||||||  ||||||||||||||||||    
T  100471 tcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 100500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 116 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 40391 - 40169
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataatccaataatttg 214  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || | ||  ||||| | ||||| || | ||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  40391 gctccacggcatcaagtccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaccaacaacctcttata-agtccaataatttg 40295  T
Q  215 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataata 313  Q
    |||| ||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||  | ||| || ||||| |||| ||||    
T  40294 gaacatcatcatc---atcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagtaggc-aaatcatcatgatataacaata 40199  T
Q  314 tcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 343  Q
    || |||||||  ||||||||||||||||||    
T  40198 tcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 40169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 116 - 270
Target Start/End: Original strand, 101404 - 101552
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | || |||||| || |||||| | ||| | | ||||| | ||||||||||| |    
T  101404 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacatcttaa-caacttaaaacaacatcatcttata-agtccaataatttag 101500  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 270  Q
    ||| ||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  101501 aacatcatcatc---atcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaacaacaa 101552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 40 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 38777 - 38542
Alignment:
Q  40 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaa 138  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||| |||| ||||| |||| |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||    
T  38777 ttgagtattaatatacttctagggcat-aagcccccattgctaatttgagctaatgctcaatcgtgttgagtactaagctccagggcatga-gcccccaa 38680  T
Q  139 ca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt---catcatcttcatc 233  Q
    || ||| | |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| |  | || ||||| ||||||||||||||||  ||   ||||||||| |||    
T  38679 catatgta-tgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatctt-aatc-atcatctcttata-aatccaataatttggaggttcaacatcatcttaatc 38584  T
Q  234 aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 275  Q
    | |||| |  |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  38583 atcttatattgactcatgcaacttagttaaataacaatagca 38542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #9
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 17953 - 17886
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  17953 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaatcgctatttga 17886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #10
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 17909 - 17842
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||    
T  17909 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgctatttga 17842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #11
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 17984 - 17930
Alignment:
Q  33 tcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| || ||||||| |||| ||||||||||||    
T  17984 tcgctatttgagtattattatacttctagagcatcaagccccaatcgctatttga 17930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 17802 - 17765
Alignment:
Q  145 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaa 182  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  17802 aatgctaatgcacggactcgacctcttaaacatcttaa 17765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 17865 - 17804
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 81  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| |||| || |||| ||||||    
T  17865 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccagagcattaagccccaatcgct 17804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 82 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 1304 - 954
Alignment:
Q  82 atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta 181  Q
    |||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1304 atttgagctaaagctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacatctta 1206  T
Q  182 aatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca 280  Q
    | |||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  1205 attcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacata 1106  T
Q  281 agcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat-tatca 379  Q
     |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  || |||||||| |||||| ||   || | ||||||||||| || | | | |||||    
T  1105 ggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcataaacattatatca 1006  T
Q  380 catcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaac 431  Q
    |||||||||||||   || |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1005 catcataatcaaccaaaacacatcttaaacagcttcaaagattataattaac 954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 182; Significance: 3e-98; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 123 - 363
Target Start/End: Original strand, 116332 - 116571
Alignment:
Q  123 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatcc-aataatttggaacttc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  116332 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaaatactttggaacttc 116431  T
Q  222 atcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgc 321  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  116432 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatac-aaaacagcatgacataatcatatcaaatgc 116529  T
Q  322 aagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaat 363  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  116530 aagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 116571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 201 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 129102 - 128967
Alignment:
Q  201 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaa- 298  Q
    ||||||||||||||||||   | ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | |||||| |  |||||||     
T  129102 aatccaataatttggaac---aacatctt--tcatcttagaccgactcatgcagcttagtt-aataacaaacagcaacataggcagtaca-taaaacaat 129010  T
Q  299 -catgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaa 340  Q
     ||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  129009 tcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaa 128967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 20 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 11763 - 11464
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagct 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||    
T  11763 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagct 11664  T
Q  119 ccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa-catcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttgga 216  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  11663 ccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaaacgacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttgga 11565  T
Q  217 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 316  Q
    || || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11564 acatcttcatcttcaacaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggtagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 11465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 178; Significance: 7e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Original strand, 37718 - 37977
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37718 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 37816  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37817 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 37915  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  37916 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 37977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 178; Significance: 7e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 20 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 15784 - 15370
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||    
T  15784 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagc 15685  T
Q  118 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa-catcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttgg 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||| || ||| | |||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  15684 tccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgttaatgcatggactagacctcttaaaacaacttgattcgacaacctcttatattagtccaataatttgg 15586  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15585 aacatcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaagagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatc 15487  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat-tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagctt 414  Q
    || | |||  || |||||||| |  |||| |   ||   ||||||||||| || | | | |||||||||||||||| || ||| | |||||| |||||||    
T  15486 aatttcaattcatcaacatcttatgtataaaaatattcttcaagtaatgcataaatattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagctt 15387  T
Q  415 cacagattataattaac 431  Q
    |||||||||||||||||    
T  15386 cacagattataattaac 15370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 278
Target Start/End: Original strand, 7112 - 7352
Alignment:
Q  37 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagccccc 136  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| || |||      
T  7112 tattttagtattaatatactttcagggcatgag-cccccatcgttatttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcatgaa-cccaa 7209  T
Q  137 aacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt---catcatcttcat 232  Q
    |||||    ||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||| |||| |  | ||  ||||| |||||||||||||||  ||   ||||||||| ||    
T  7210 aacaaatgtatgctaatgcatggactcaatctcttaaaacatctt-aatc-atcatctcatatat-atccaataatttggaggttcaacatcatcttaat 7306  T
Q  233 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 278  Q
    || |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||    
T  7307 catcttaaatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcaaca 7352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 178; Significance: 7e-96; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Original strand, 136577 - 136836
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  136577 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcaacaacctcttatataatccaataatttgg 136675  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  136676 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaatacagcatgacataataatatc 136774  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  136775 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 136836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Original strand, 139046 - 139305
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  139046 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcaacaacctcttatataatccaataatttgg 139144  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  139145 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaatacagcatgacataataatatc 139243  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  139244 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 139305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Original strand, 143984 - 144243
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  143984 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcaacaacctcttatataatccaataatttgg 144082  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  144083 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaatacagcatgacataataatatc 144181  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  144182 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 144243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Original strand, 134108 - 134367
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  134108 gctccacggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcaacaacctcttatataatccaataatttgg 134206  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  134207 aacttcatcatcttaatcaacatagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaatacagcatgacataataatatc 134305  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  134306 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 134367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Original strand, 141515 - 141774
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  141515 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcaacaacctcttatataatccaataatttgg 141613  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  141614 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaatacagcatgacataataatatc 141712  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  141713 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 141774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 116 - 320
Target Start/End: Original strand, 132563 - 132762
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |  | |||||| || |||||| | ||| | | ||||| | |||||||||||||    
T  132563 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacatcatcttaa-caacttaaaacaacatcatcttata-agtccaataatttgg 132659  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 314  Q
    ||| |||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||| | || |||||    
T  132660 aacatcatcatcatcatc---ttagaccgactcatgcagcttagataaataacaaacagcaacataagtagtatgcaaaatcatcatgatacaacaatat 132756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 220 - 343
Target Start/End: Original strand, 62201 - 62321
Alignment:
Q  220 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 318  Q
    |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||  ||||||| ||||  ||||||||||| ||    
T  62201 tcatcatcatcttcgacttaaaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtat-gaaaaacatcatggtataataatatcgaa 62299  T
Q  319 tgcaagacaacaacatctcaaatat 343  Q
    |||   |||||||||||||||||||    
T  62300 tgc---acaacaacatctcaaatat 62321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 177; Significance: 3e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 20 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 10744 - 10331
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||    
T  10744 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagc 10645  T
Q  118 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa-catcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttgg 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  10644 tccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaaacgacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttgg 10546  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 314  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| | |||||||||   |||| ||||||||||||||||    
T  10545 aacatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcatagttaattaacaaacagcaacataggcagtatac---aacagcatgacataataatat 10449  T
Q  315 caaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgt-ataaaattatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagct 413  Q
    ||| | |||  ||||||||||| || ||||||   ||   ||||||||||| | || |   |||||||||||||||| || | | | |||||| ||||||    
T  10448 caatttcaattcaacaacatcttaagtatacaaatattcttcaagtaatgcataatcattatatcacatcataatcatcaacgacatatcttatacagct 10349  T
Q  414 tcacagattataattaac 431  Q
    ||||||||||||||||||    
T  10348 tcacagattataattaac 10331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 177; Significance: 3e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 116 - 376
Target Start/End: Original strand, 13289 - 13547
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13289 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 13387  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13388 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 13486  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaatta 376  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| |||||    
T  13487 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaatta 13547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Original strand, 40297 - 40556
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40297 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaa-catcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 40395  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  40396 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacaggatgacataataatatc 40494  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   | || ||||||||||| |||| ||||||    
T  40495 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacataaaattcaagtaatgcatatacaattat 40556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Original strand, 13844 - 14103
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13844 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgatctcgtaat-atcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 13942  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13943 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagataaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 14041  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  14042 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 14103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 59 - 278
Target Start/End: Original strand, 121607 - 121827
Alignment:
Q  59 cagggcatcaaacccccatcgctat-ttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcat 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  121607 cagggcatcaaacccccatcgctaaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcat 121706  T
Q  158 gaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctt 257  Q
    | |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  121707 ggactcgacctcttaaacatattaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctt 121806  T
Q  258 agttaaataacaacagcaaca 278  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  121807 agttaaataacaacaacaaca 121827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 365
Target Start/End: Original strand, 174567 - 174912
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 117  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| | ||  |||||  ||  ||||||||||||    
T  174567 catcaagccaccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattttgagcaaattctccaatgtggtgagtacaaagc 174666  T
Q  118 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctatta-tataatccaataatttgga 216  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||| | || ||||||||||||||    
T  174667 tccagggcatcaagcccccaactatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgataacctcttaatttagtccaataatttgga 174765  T
Q  217 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
     | |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||   |||| |||||||| || |||||    
T  174766 gcatcatcaacttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatac---aacagcatgacatgattatatc 174862  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgc 365  Q
    |||| |||  ||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||    
T  174863 aaattcaattcaacaacatctcaatcattcattcataattcaagtaatgc 174912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 355 - 431
Target Start/End: Original strand, 124723 - 124801
Alignment:
Q  355 tcaagtaatgcgtataaaattat--cacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaac 431  Q
    ||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  124723 tcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaac 124801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 136471 - 136370
Alignment:
Q  236 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaa-acaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaaca 333  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||| ||| | |||||| |||||| |   ||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  136471 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcgacataggcagtacacaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 136372  T
Q  334 tc 335  Q
    ||    
T  136371 tc 136370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 145179 - 145078
Alignment:
Q  236 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaa-acaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaaca 333  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||| ||| | |||||| |||||| |   ||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  145179 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcgacataggcagtacacaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 145080  T
Q  334 tc 335  Q
    ||    
T  145079 tc 145078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 163; Significance: 7e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Original strand, 4110 - 4371
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4110 gctccagggcatcaagcccccaacaatgtaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 4209  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  4210 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacgacagcgacac-agcagtatacaaaaccagcatgacataataatatc 4308  T
Q  316 aaatgcaagacaa-caacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||| ||| ||   |||| |||| |||||| |||| ||||||    
T  4309 aaatgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattat 4371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 116 - 377
Target Start/End: Original strand, 11960 - 12214
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11960 gctccagggcatcaagccaccaacaatgaaatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgg 12059  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  12060 aacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtta------aacagcaacac-agcagtatactaaaacagcatgacataataatatc 12152  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  12153 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattat 12214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 158; Significance: 6e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 195 - 437
Target Start/End: Original strand, 22861 - 23104
Alignment:
Q  195 ttatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaa 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  22861 ttatataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-accagtatacaaaa 22959  T
Q  295 acaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaac 392  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || | |||  |||||||||||  |||| ||  ||||||||| ||||||||    
T  22960 acagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcgtaatcaac 23059  T
Q  393 atcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcatc 437  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  23060 atcaacacatcttaaacagcttcacagattataaataacatcatc 23104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 157; Significance: 3e-83; HSPs: 3)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 18345 - 17932
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||| |||| || |||| ||||| ||||| |||  ||||||||||||||    
T  18345 catcaagcccctatcgctatttgagtattattatact-ccagggcatcaagcccctatcgttaattgagctaaacctccaacgtggtgagtacaaagctc 18247  T
Q  120 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattat-ataatccaataatttggaac 218  Q
    || |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  18246 cagggcatcaaccccccaacactgaaatgataatgcatggactcgacttcttaaacatcttaattcgacaacctcttataatagtccaataatttggaac 18147  T
Q  219 ttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 317  Q
     ||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| ||| | | |||| ||||| ||||||||||| |    
T  18146 atcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcattatgc-acaacatcatgatataataatatcga 18048  T
Q  318 atgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaa-cagctt 414  Q
    | |||||  ||||||||||||||||| ||   |||| ||||||||||| |||| |||  |||||||| |||| |||||||||| |||| |||| ||||||    
T  18047 acgcaagtaaacaacatctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagctt 17948  T
Q  415 cacagattataattaa 430  Q
    ||||||| || |||||    
T  17947 cacagatcatcattaa 17932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 117 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 2394 - 2088
Alignment:
Q  117 ctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgga 216  Q
    ||||| ||||| ||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  2394 ctccagggcataaagcccctatcgctgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacattttaaaccgacaacctcttatataatccaataatttaga 2295  T
Q  217 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 316  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2294 acttcatcattttaatcaacttagaccgactcttgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 2196  T
Q  317 aatgcaagacaa-caacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaa-cagc 412  Q
    |||||||| |||  ||| |||||| ||| ||   |||| |||| |||||| |||| |||  |||||||  |||| |||||||||| |||| |||| ||||    
T  2195 aatgcaagtcaattaacgtctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagc 2097  T
Q  413 ttcacagat 421  Q
    |||||||||    
T  2096 ttcacagat 2088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 2456 - 2406
Alignment:
Q  36 ctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  2456 ctatttgagtattaatatact-ccagggcatcaagcccctatcgctatttga 2406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 153; Significance: 6e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 146 - 430
Target Start/End: Original strand, 16710 - 16995
Alignment:
Q  146 atgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccga 245  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16710 atgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgaccaactcttgtataatccaataatttggaacttcatcatcttaatcaacttagaccga 16809  T
Q  246 ctcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatac 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||      
T  16810 ctcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattt 16908  T
Q  346 attcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 430  Q
    |   |||| ||||||||||| |||| |||  |||||||  |||| || ||||||| |||| |||| ||||||||||||| || |||||    
T  16909 acatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-catcatcaaatcatcataaatcagcttcacagatcatcattaa 16995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 436
Target Start/End: Original strand, 1090 - 1507
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 117  Q
    |||||||||||   |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||    
T  1090 catcaagccccgaccgctatttgagttttaatatacttccaggacatcaagcccccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagc 1189  T
Q  118 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttgga 216  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  1190 tccagggcatgaagcccccaactatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttgga 1288  T
Q  217 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||   |||| ||||||||||| |||||    
T  1289 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtgtac---aacatcatgacataattatatc 1385  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat--cacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagct 413  Q
    |||| |||  || |||||||| |  ||||||  |||   ||||||||||| || || |||||  ||| |||||||||||| ||| | ||||||  |||||    
T  1386 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaacaacaacatatcttattcagct 1484  T
Q  414 tcacagattataattaacttcat 436  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||    
T  1485 tcatagattatagttaacctcat 1507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 116 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 15460 - 15298
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  15460 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaaactcttatataatccaataatttgg 15361  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 278  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15360 aacttcatcatcttaatcaacgtagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaaca 15298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 145 - 436
Target Start/End: Original strand, 7193 - 7484
Alignment:
Q  145 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagacc 243  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  7193 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacatcttagacc 7292  T
Q  244 gactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaata 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||   |||||||||| ||||| ||||||||| |||  || |||||||| |  ||    
T  7293 gactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatac---aacaacatgaaataattatatcaaattcaattcatcaacatcttatgta 7389  T
Q  343 tacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat--cacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcat 436  Q
    ||||  |||   ||||||||||| || || |||||  ||| |||||||||||| ||| | ||||||  |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  7390 tacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaacaacaacatatcttattcagcttcatagattatagttaacctcat 7484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 6)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 117 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 85845 - 85539
Alignment:
Q  117 ctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgga 216  Q
    ||||| ||||||||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  85845 ctccagggcatcaagcccctatcgctgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcaacaacctcttatataatccaataatttgga 85746  T
Q  217 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 316  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  85745 acttcatcatcttaatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 85647  T
Q  317 aatgcaagacaa-caacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaa-cagc 412  Q
    |||||||| ||| |||| ||| || ||| ||   |||| |||| |||||| |||| |||  |||||||  |||| |||||||||| |||| |||| ||||    
T  85646 aatgcaagtcaatcaacgtctgaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagc 85548  T
Q  413 ttcacagat 421  Q
    |||||||||    
T  85547 ttcacagat 85539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 145 - 377
Target Start/End: Original strand, 501003 - 501240
Alignment:
Q  145 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatca------tcttcatcaactt 238  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||| |||||||||||||||| | ||||      |||| ||||||||    
T  501003 aatgctaatgcatagactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacataatcaacaacatcttaatcaactt 501102  T
Q  239 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctca 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  501103 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agcaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctca 501201  T
Q  339 aatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    | ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  501202 attattcacatataattcaagtaatgcatatataattat 501240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 123 - 343
Target Start/End: Original strand, 160594 - 160809
Alignment:
Q  123 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataat-ccaataatttggaacttc 221  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||| || |||||| | ||||||| ||| ||||| |||||||||||| || ||    
T  160594 ggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacgcaacctcttaa-caacttaaagcaacaacctcttaaataattccaataatttgggacatc 160691  T
Q  222 atcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatg 320  Q
    ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||||||||    
T  160692 atcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaaatg 160787  T
Q  321 caagacaacaacatctcaaatat 343  Q
    |||  ||||||||| ||||||||    
T  160788 caa-tcaacaacatgtcaaatat 160809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 85915 - 85857
Alignment:
Q  28 ccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  85915 ccccatcgctatttgagtattaatatact-ccagggcatcaagcccctatcgctatttga 85857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 87
Target Start/End: Original strand, 500912 - 500963
Alignment:
Q  36 ctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  500912 ctatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaatcgctatttga 500963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 85880 - 85820
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 81  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||    
T  85880 catcaagcccctatcgctatttgagcattaatatac-tccagggcatcaagcccctatcgct 85820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 148; Significance: 6e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 5448 - 5132
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||    
T  5448 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggtatcaagcccccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagc 5349  T
Q  118 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttgga 216  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  5348 tccagggcatcaagcccccaactatgaa-tgttaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttgga 5250  T
Q  217 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | | | |||||   |||| ||||||||||| |||||    
T  5249 acgtcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacatcaacataggtattatac---aacatcatgacataattatatc 5153  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatct 336  Q
    |||| |||  || ||||||||    
T  5152 aaattcaattcatcaacatct 5132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 146; Significance: 9e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 20 - 425
Target Start/End: Original strand, 46796 - 47202
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||   |||||||||||    
T  46796 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttctagggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggggagtacaaagc 46895  T
Q  118 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttgga 216  Q
    || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  46896 tctagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcgacctcttgaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttgga 46994  T
Q  217 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 315  Q
    || |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| | ||||| ||||    || |||||||||||||||||    
T  46995 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtttacag---cagcatgacataataatatc 47091  T
Q  316 aaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat-tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagctt 414  Q
    || | |||  || |||||||| |  ||||||   ||    |||||||||| || | | | ||||||||||||| || || ||| | |||||| |||||||    
T  47092 aatttcaattcatcaacatcttatgtatacaaatattctccaagtaatgcataaacattatatcacatcataaacatcaacaacatatcttatacagctt 47191  T
Q  415 cacagattata 425  Q
    |||||||||||    
T  47192 cacagattata 47202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 244
Target Start/End: Original strand, 31961 - 32188
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| || |||  ||  ||||||||||||    
T  31961 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaatgccccaatgtggtgagtacaaagc 32060  T
Q  118 tccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaa 217  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32061 tccagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggacttgacctcttaaacatcttaattcgacaacctcttatataatccaataatttggaa 32160  T
Q  218 c-ttcatcatcttcatcaacttagaccg 244  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||    
T  32161 caatcatcatcttcatcaacttagaccg 32188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 124 - 377
Target Start/End: Original strand, 12 - 262
Alignment:
Q  124 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 223  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  12 gcatcaagcccccaacaaagaa-tgccaatacatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaac-tcttgtataatccaataattgggaacttcat 109  T
Q  224 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 323  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  110 catcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-tagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 208  T
Q  324 gacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
      ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  209 atcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattat 262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 125 - 377
Target Start/End: Original strand, 81978 - 82228
Alignment:
Q  125 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaac-ttcat 223  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  81978 catcaagcccccaacaaagaa-tgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaac-tcttgtataatccaataatttggaaccttcat 82075  T
Q  224 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 323  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  82076 catcttaatcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaacagcaacac-agtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 82174  T
Q  324 gacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
      ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  82175 atcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattat 82228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 123 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 22880 - 22665
Alignment:
Q  123 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttc 221  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || | || |||||| || |||| | | ||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||    
T  22880 ggcatcaagcccccaa-aatgaa-tgctaatgcatggacacaacatcttaa-caacttagaacaacaacctcttatacaagtccaataatttggaacatc 22784  T
Q  222 atcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatg 320  Q
    |||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||    
T  22783 atcaccttca---acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcgacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatg 22688  T
Q  321 caagacaacaacatctcaaatat 343  Q
    |||| || |||||||||||||||    
T  22687 caagtcatcaacatctcaaatat 22665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 141; Significance: 9e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 20 - 436
Target Start/End: Original strand, 16082 - 16500
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta---tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaag 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||| | || |||||| |||  |||||||||||    
T  16082 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatttttgagcaaatgctccaacgtggtgagtacaaag 16181  T
Q  117 ctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttgg 215  Q
    ||||| || ||||||| |||||| ||| ||||||| |||||| |||||| |||||| ||| ||||| |||||||||| ||| | || || ||||||||||    
T  16182 ctccagggtatcaagcgcccaactatg-aatgctattgcatggactcgatctcttagacaacttaattcgacaacctcttacattagtctaataatttgg 16280  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 314  Q
    ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||   |||| ||||||||||| ||||    
T  16281 aacatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataagaaacagcaacataggcagtatac---aacagcatgacataattatat 16377  T
Q  315 caaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat--cacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagc 412  Q
    ||||| |||  || |||||| | |  ||||||  |||   ||||||||||| || || |||||  |||||||||||||||| ||| | ||||||  ||||    
T  16378 caaattcaattcatcaacatattatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacatcataatcaacaacaacatatcttattcagc 16476  T
Q  413 ttcacagattataattaacttcat 436  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||    
T  16477 ttcacagattatagttaacctcat 16500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 138; Significance: 6e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 20 - 253
Target Start/End: Original strand, 27681 - 27913
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    |||||||||||| |||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  27681 catcaagcccccatcgctata--agtattaatatacttccagggcatcaagcccc-atcgctatttgagctaaagctccatcgtgtttagtacaaggctc 27777  T
Q  120 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaa-- 217  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  27778 cagggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttagaacaacaacctcttatataatccaataatttggaaac 27877  T
Q  218 cttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgca 253  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27878 catcatcatcttcataaacttagaccgactcatgca 27913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 299 - 437
Target Start/End: Original strand, 27912 - 28052
Alignment:
Q  299 catgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatca 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  27912 catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatca 28011  T
Q  397 aaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcatc 437  Q
    | | |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  28012 acaaatcttaaacaacttcacaggttataattaacatcatc 28052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 138; Significance: 6e-72; HSPs: 3)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 117 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 161355 - 161095
Alignment:
Q  117 ctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgga 216  Q
    ||||| ||||||||||||| | |  ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  161355 ctccagggcatcaagcccctatcgctgaaatgttaatgcatggactcgacttcttaaacattttaaatcgacaacctcttatataatccaataatttgaa 161256  T
Q  217 acttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 316  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  161255 acttcatcatcttaaccaacttagaccgactcatgcagcttagttaaatatcaacagcgacac-agcagtatacaaaaacataatgacataataatatca 161157  T
Q  317 aatgcaagacaa-caacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||| ||   |||| |||| |||||| |||| ||||||    
T  161156 aatgcaagtcaatcaacatctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattat 161095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 164674 - 164550
Alignment:
Q  300 atgacataataatatcaaatgcaagacaa-caacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatca 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||   |||| |||| |||||| |||| |||  |||||||  |||| ||||||||    
T  164674 atgacataataatatcaaatgcaagtcaatcaacatctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatca 164576  T
Q  397 aaacatcttaaa-cagcttcacagat 421  Q
    || |||| |||| |||||||||||||    
T  164575 aatcatcataaatcagcttcacagat 164550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 161433 - 161367
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||| || | ||||||||||||    
T  161433 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatactt-taggccatcaagcctctatcgctatttga 161367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 56 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 1333 - 952
Alignment:
Q  56 ttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaat 153  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1333 ttccagggcatcaagcccccatcgctaattttgagctaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaat 1235  T
Q  154 gcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgc 252  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| | || |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  1234 gcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttaaaatagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgc 1135  T
Q  253 agcttagttaaataa-caacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcat 351  Q
    ||||||||||| |||  |||| ||||| | |||||||||   |||| ||||||||||| ||||||| | |||  || |||||||| |  ||||||   ||    
T  1134 agcttagttaattaataaacatcaacataggcagtatac---aacatcatgacataattatatcaatttcaattcatcaacatcttatgtatacaaatat 1038  T
Q  352 aactcaagtaatgcgtataaaattat--cacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcat 436  Q
       ||||||||||| || || |||||  |||||||||||||||| ||| | || ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  1037 tcttcaagtaatgcata-aacattataacacatcataatcaacaacaacatattttatacagcttcacagattatagttaacctcat 952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 131; Significance: 8e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 2722 - 2494
Alignment:
Q  18 gacatcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta--tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaa 115  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||    
T  2722 gacatcaagcccccatcactatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgttaattttgagctaatgctccaacgttgtgagtacaaa 2623  T
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttg 214  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  2622 gctctagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattaatccaataatttg 2524  T
Q  215 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccg 244  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  2523 gaacatcatcatcttcaacaacttagaccg 2494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 131; Significance: 8e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 35 - 336
Target Start/End: Original strand, 51397 - 51699
Alignment:
Q  35 gctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta---tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaag 131  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||| | || |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| |||    
T  51397 gctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaatttttgagcaaatgctccaacgtggtgagtacaaagctccagggcattaag 51496  T
Q  132 cccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttc 230  Q
    |||||||| | ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||    
T  51497 cccccaactaagaa-tgctcatgcatggactcgacctcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcattttc 51595  T
Q  231 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaac 329  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||   |||| ||||||||||| ||| ||||| |||  || |    
T  51596 aacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatac---aacatcatgacataattataacaaattcaattcatc 51692  T
Q  330 aacatct 336  Q
    |||||||    
T  51693 aacatct 51699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 124 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 38916 - 38663
Alignment:
Q  124 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 223  Q
    |||||||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38916 gcatcaagcccctatcgctgaaatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgaaaacctcttatataatccaataatttggaacctcat 38817  T
Q  224 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 322  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |  |||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  38816 catcttaatcaacttagacctactcatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaaatgca 38718  T
Q  323 agacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    || || ||| |||||||||||  ||  |||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  38717 agtcatcaatatctcaaatatttatatataattcaagtattgcgtatacaattat 38663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 39002 - 38936
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||  ||||||||||||    
T  39002 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaagcccgtatcgctatttga 38936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 4)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 145 - 377
Target Start/End: Original strand, 10692 - 10929
Alignment:
Q  145 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt------catcatcttcatcaactt 238  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |      || |||||| ||||||||    
T  10692 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacaaccttttaaatagtccaataatttggaacattgttatcaacatcttaatcaactt 10791  T
Q  239 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctca 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  10792 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agcagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctca 10890  T
Q  339 aatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    | ||| ||   |||| | ||||||||| |||| ||||||    
T  10891 attattcacatataatttaagtaatgcatatataattat 10929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 86
Target Start/End: Original strand, 10455 - 10520
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttg 86  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  10455 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaaacccctatcgctatttg 10520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Original strand, 10585 - 10652
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||    
T  10585 catcaagcccctatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgctatttga 10652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 81
Target Start/End: Original strand, 10629 - 10690
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 81  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  10629 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgct 10690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 123; Significance: 5e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 195 - 377
Target Start/End: Original strand, 4669 - 4850
Alignment:
Q  195 ttatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaa 294  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4669 ttatataatccaataatttggaacctcatcatcctaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agcagtatacaaaa 4767  T
Q  295 acaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  4768 acaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattat 4850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 3)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 145 - 377
Target Start/End: Original strand, 9161 - 9398
Alignment:
Q  145 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat------catcttcatcaactt 238  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||||||| || |      |||||| ||||||||    
T  9161 aatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacaaccttttaaatagtccaataatttggaacatcgttatcaacatcttaatcaactt 9260  T
Q  239 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctca 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  9261 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatataaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctca 9359  T
Q  339 aatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    | ||| ||   |||| | ||||||||| |||| ||||||    
T  9360 attattcacatataatttaagtaatgcatatataattat 9398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 86
Target Start/End: Original strand, 8924 - 8989
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttg 86  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  8924 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatac-tccagagcatcaaacccctatcgctatttg 8989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Original strand, 9054 - 9121
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | |||| || |||| ||||||||||||    
T  9054 catcaagcccctatcgctatttgagtattattatacttccggagcattaagccccaatcgctatttga 9121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 5)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 145 - 339
Target Start/End: Original strand, 29856 - 30050
Alignment:
Q  145 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttca-tcaacttagacc 243  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  29856 aatgctaatgcatggaatcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacttcatcatcttaattgaacttagacc 29955  T
Q  244 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaa 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||    
T  29956 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaagtgtaagtcaacaacgtctcaa 30050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 182
Target Start/End: Original strand, 3546 - 3703
Alignment:
Q  25 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 123  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| || ||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  3546 agcccccatcgttatttgagtataaatatacttccagggcat-aagcccccatcgttattttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagg 3644  T
Q  124 gcatcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 182  Q
    ||||  |||||| |||| |||  || |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  3645 gcat-gagcccctaacatatg-tatactaatgcatggactcgatctcttaaaacatcttaa 3703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 182
Target Start/End: Original strand, 7977 - 8134
Alignment:
Q  25 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 123  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| || ||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  7977 agcccccatcgttatttgagtataaatatacttccagggcat-aagcccccatcgttattttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagg 8075  T
Q  124 gcatcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 182  Q
    ||||  |||||| |||| |||  || |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  8076 gcat-gagcccctaacatatg-tatactaatgcatggactcgatctcttaaaacatcttaa 8134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Original strand, 29749 - 29816
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| |  |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  29749 catcaagcccctatcggtatttgagtattattacacttccagagcatcaagccccaatcgctatttga 29816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 81
Target Start/End: Original strand, 29793 - 29854
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 81  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  29793 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgct 29854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 123 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 1537 - 1340
Alignment:
Q  123 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttca 222  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||      
T  1537 ggcatcaagccctcaactttaaaatgctaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaaattgacaaactcttgtataatccaataatttggaactt-- 1440  T
Q  223 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 322  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1439 -catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaacaataacacatg-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 1342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 9275 - 9123
Alignment:
Q  25 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 123  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  9275 agcccccatcgttaattgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaatgctccatcgtgttgagtacaaagctccagg 9177  T
Q  124 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatc 178  Q
    ||||  ||||||||||||    ||||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  9176 gcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatttcttaaacatc 9123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 43 - 431
Target Start/End: Original strand, 4343 - 4739
Alignment:
Q  43 agtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagta--caaag-ctccaaggcatcaagcccccaac 139  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||| ||| || ||||||||||||||| ||||| |  ||||| ||||  |||||||| ||||||||    
T  4343 agtattaatatacttccagggcat-aagccctcatcgcaatt-gagctaaagctccatcgtgttgagcaaacaaaggctccggggcatcaatcccccaac 4440  T
Q  140 aatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaac--- 236  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||       
T  4441 aatgaaatgctaatgcatggactcaacctcttaaacatcttaaa-caacaacctcgtatataatccaataatttggaacatcatcatcttaatcaacctc 4539  T
Q  237 ----ttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaac 332  Q
         |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || | ||||||| ||| | || || || || ||||||||||||  ||  |||||||    
T  4540 ttatatagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacagcataggcagtatgcaacagcagcaagatatcataatatcaaatataattcaacaac 4639  T
Q  333 atctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatctt-aaacagcttcacagattataatta 429  Q
    |||| |||||| |||| |||  ||||||||||| ||  | ||  ||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  4640 atcttaaatattcatttatacttcaagtaatgcataatacattatatcacatcatgatcaacatc--aacatcttaaaacagcctcacaaattataatta 4737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 145 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 12492 - 12255
Alignment:
Q  145 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatc------ttcatcaactt 238  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||| ||||||||||||| || ||||||||      || ||||||||    
T  12492 aatgctaatgcatgtactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggtacatcatcatcaacatcttaatcaactt 12393  T
Q  239 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctca 338  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  12392 agaccgacttatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agcagaatacaaaaacagcatgacaaaataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctca 12294  T
Q  339 aatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    | ||| ||    ||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  12293 attattcacatttaattcaagtaatgcatatataattat 12255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 12599 - 12532
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| || | ||||||||||||    
T  12599 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagcctcaatcgctatttga 12532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 145 - 377
Target Start/End: Original strand, 11207 - 11444
Alignment:
Q  145 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcatcatc------ttcatcaactt 238  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||| |||||||||||||||| | ||||||      || ||||| ||    
T  11207 aatgttaatgcatggactcgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttaaatagtccaataatttggaacattatcatcaacatcttaatcaaatt 11306  T
Q  239 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctca 338  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  11307 agaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctca 11405  T
Q  339 aatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    | ||| ||   || | ||||||||||| |||| ||||||    
T  11406 attattcacatatgattcaagtaatgcatatataattat 11444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 182
Target Start/End: Original strand, 12578 - 12723
Alignment:
Q  37 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccc 135  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| || | || |||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  12578 tatttgagtattagtatacttccagagcgt-aagcccccatcactaatttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccc 12675  T
Q  136 caacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 182  Q
    ||||||    ||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||    
T  12676 caacaaatgtatgctaatgcatggactcaatctcttaaaacatcttaa 12723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 81
Target Start/End: Original strand, 11144 - 11205
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 81  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  11144 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgct 11205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 106; Significance: 7e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 124 - 320
Target Start/End: Original strand, 15570 - 15764
Alignment:
Q  124 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaacttcat 223  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  15570 gcatcaagcccccaacaaagaa-tgctaatccatggactcgaattcttaaacatcttaaatcgacaac-tcttgtataatccaataatttggaacttcat 15667  T
Q  224 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatg 320  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  15668 catcttaatcaacttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatac-aaaccatcatgatataataatatcgaatg 15764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 174
Target Start/End: Original strand, 1144 - 1292
Alignment:
Q  25 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 123  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| |  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||      
T  1144 agcccccatcgttatttgagtattaatatacttctagggcat-atgcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccaga 1242  T
Q  124 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa 174  Q
     |||  ||||||||||||    ||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  1243 acat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatatcttaaa 1292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 277 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 3591 - 3428
Alignment:
Q  277 cacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat-- 374  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||      
T  3591 cacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacactcataattcaagtaatgcgtataacatta 3492  T
Q  375 tatcacatcataatcaacatcaaaacatctt-aaacagcttcacagattataattaacttcatc 437  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  3491 tatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagcttcatagattataattaacatcatc 3428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 124 - 403
Target Start/End: Original strand, 11370 - 11652
Alignment:
Q  124 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattat-ataatccaataatttggaacttca 222  Q
    |||||||||||| | |  ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  11370 gcatcaagcccctatcgctgaaatgataatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacatca 11469  T
Q  223 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgc 321  Q
     |||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||| | |||||| ||||| |||||||||||  | |     
T  11470 acatcttcaacgacttagattgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgc-aaaacatcatgatataataatatcgcacgt 11568  T
Q  322 aagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatc 403  Q
    |||  ||||||||||||||||  ||   |||| ||||||||||| |||| |||  |||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  11569 aagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatc 11652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Original strand, 11240 - 11307
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| | || ||||||||||||    
T  11240 catcaagcccccatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagctccaatcgctatttga 11307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 124 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 38471 - 38189
Alignment:
Q  124 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattat-ataatccaataatttggaacttca 222  Q
    |||||||||||| | |  ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  38471 gcatcaagcccctatcgctgaaatgataatgcatggactcgacttcttaaacatcttaaatcgacaacctcttataatagtccaataatttggaacatca 38372  T
Q  223 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgc 321  Q
     |||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||| | |||||| ||||| |||||||||||  | |     
T  38371 acatcttcaacgacttagattgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgc-aaaacatcatgatataataatatcgcacgt 38273  T
Q  322 aagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatc 403  Q
    |||  ||||||||||||||||  ||   |||| ||||||||||| |||| |||  |||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  38272 aagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatc 38189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 38601 - 38534
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| | || ||||||||||||    
T  38601 catcaagcccccatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagctccaatcgctatttga 38534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 235 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 24406 - 24206
Alignment:
Q  235 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaa-acaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaaca 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||  || |||||    
T  24406 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataaaaatatcaattgcaattcatcaaca 24307  T
Q  334 tctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataa-tcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaa 430  Q
    ||| |||||| ||   ||   |||||||||||  |||| ||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24306 tcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataattcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaa 24207  T
Q  431 c 431  Q
    |    
T  24206 c 24206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 37 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 35218 - 35074
Alignment:
Q  37 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagccccc 136  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  35218 tatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgttatttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagggcat-aagccccc 35121  T
Q  137 aaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 182  Q
    |||| |||  ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  35120 aacatatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatcttaa 35074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 24440 - 24403
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttactt 57  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  24440 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatactt 24403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 91; Significance: 6e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 25 - 270
Target Start/End: Original strand, 36260 - 36503
Alignment:
Q  25 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaagg 124  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||    
T  36260 agcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatgag-cccccatcgctatttgagctaaagctccatcatgttgagtacaaagctccaggg 36358  T
Q  125 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt---c 221  Q
    |||  ||||||||||||    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||   |||| |  | || |||| | |||||||||||||||  ||   |    
T  36359 cat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcaacctcttaaacatc-acaatc-atcatctcttat-ttatccaataatttggaggttcaac 36454  T
Q  222 atcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 270  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36455 atcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 36503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 5)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 40 - 242
Target Start/End: Original strand, 3337 - 3539
Alignment:
Q  40 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaa 138  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||| | ||||||||    
T  3337 ttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagcttcagggcatga-gcccccaa 3434  T
Q  139 caatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttcatcaact 237  Q
    |||    ||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  3435 caaatgtatgctaatgcatggacttgacttcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacaact 3534  T
Q  238 tagac 242  Q
    |||||    
T  3535 tagac 3539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 40 - 242
Target Start/End: Original strand, 7401 - 7603
Alignment:
Q  40 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaa 138  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||| | ||||||||    
T  7401 ttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagcttcagggcatga-gcccccaa 7498  T
Q  139 caatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttcatcaact 237  Q
    |||    ||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  7499 caaatgtatgctaatgcatggactagacttcttaaacaacttaattcgacaacctcttatattagtccaataatttggaacatcatcatcttcaacaact 7598  T
Q  238 tagac 242  Q
    |||||    
T  7599 tagac 7603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 113 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 27969 - 27663
Alignment:
Q  113 aaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataa-tccaataa 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||  ||||| ||||||| || | || |||| |||||||| ||||||||    
T  27969 aaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgcgaatgcatggactcaacaacttaa-catcttagaaacaacgacctcttatataaatccaataa 27872  T
Q  211 tttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataat 309  Q
    ||||||||   ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||| | | ||||| | |||||| ||||| ||||     
T  27871 tttggaac---atcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgc-aaaacagcatgatataac 27778  T
Q  310 aatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatctta- 406  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||| || ||   |||| || |||||||| |||| |||  |||||||| |||| |||||||||| |||||||     
T  27777 aatatcaaatgtaaatcaacaacatctcaaacattcacatataattctagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaatcatcttat 27678  T
Q  407 aacagcttcacagat 421  Q
    |||||||||||||||    
T  27677 aacagcttcacagat 27663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 375 - 429
Target Start/End: Original strand, 3641 - 3695
Alignment:
Q  375 tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataatta 429  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3641 tatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattataatta 3695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #5
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 375 - 429
Target Start/End: Original strand, 7705 - 7759
Alignment:
Q  375 tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataatta 429  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7705 tatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattataatta 7759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 223 - 377
Target Start/End: Original strand, 4300 - 4453
Alignment:
Q  223 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 322  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4300 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-agtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgca 4398  T
Q  323 agacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    |  ||||||| |||||| ||  ||   |||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  4399 aatcaacaacgtctcaattaatcacatataattcaagtaatgcatatataattat 4453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 113 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 16320 - 16014
Alignment:
Q  113 aaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataa-tccaataa 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||  || || ||||||| || | || |||| |||||||| ||||||||    
T  16320 aaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgcgaatgcatggactcaacaactcaa-catcttagaaacaacgacctcttatataaatccaataa 16223  T
Q  211 tttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataat 309  Q
    ||||||||   ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| | | ||||| ||||| |||||||| ||||     
T  16222 tttggaac---atcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgcaaaa-caacatgatataac 16129  T
Q  310 aatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatctta- 406  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||| || | |  |||| ||||||||||| |||| |||  |||||||| |||| |||||||||| |||||||     
T  16128 aatatcaaatgtaaatcaacaacatctcaaacattcttatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaatcatcttat 16029  T
Q  407 aacagcttcacagat 421  Q
    |||||||||||||||    
T  16028 aacagcttcacagat 16014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 236 - 421
Target Start/End: Original strand, 13147 - 13336
Alignment:
Q  236 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacat 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||| | ||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  13147 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacat 13245  T
Q  335 ctcaaa-tatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaaacatctta-aacagcttcacagat 421  Q
    || |||  || |||  |||| ||||||||||| |||| |||  |||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  13246 ctgaaaccattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaatcatcttataacagcttcacagat 13336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 263
Target Start/End: Original strand, 2650 - 2707
Alignment:
Q  201 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaa 263  Q
    ||||||||||||||||||   | ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2650 aatccaataatttggaac---aacatctt--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaa 2707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 4)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 145 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 1263 - 1087
Alignment:
Q  145 aatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatat-aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagacc 243  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  1263 aatgctaatgcatggacttgacctcttaaacatcttaattcaacgacctcttatattaatccaataatttggaacatcatcatcttcaacatcttagacc 1164  T
Q  244 gactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  1163 gactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcgaatg 1087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 1414 - 1347
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  1414 catcaaacccctatcgctatttgagtattattatacttccagagcatcaagccccaatcgctatttga 1347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 1370 - 1303
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttga 87  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | |||| || | ||||||| |||| ||||||||||||    
T  1370 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatactcccggagcatcaagccccaatcgctatttga 1303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 1326 - 1265
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct 81  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  1326 catcaagccccaatcgctatttgagtattattatacttccggagcatcaagccccaatcgct 1265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 6)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 137
Target Start/End: Original strand, 116718 - 116835
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  116718 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctc 116817  T
Q  120 caaggcatcaagccccca 137  Q
    || |||||||||||||||    
T  116818 cagggcatcaagccccca 116835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 116 - 340
Target Start/End: Original strand, 32437 - 32658
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataa-tccaataattt 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||  || || | ||||| || | || |||| |||||||| | |||||||||    
T  32437 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcaacaactcaacc-tcttagaaacaacgacctcttatataaattcaataattt 32534  T
Q  214 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataat 312  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | ||||||| | |||||||||||| |||| |||    
T  32535 ggaacatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaacaacatgatataacaat 32631  T
Q  313 atcaaatgcaagacaacaacatctcaaa 340  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||    
T  32632 atcaaatgcaa-tcaacaacatctcaaa 32658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 135
Target Start/End: Original strand, 116823 - 116938
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||     
T  116823 catcaagcccccattgctatttgagtactaatatacttccagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctt 116922  T
Q  120 caaggcatcaagcccc 135  Q
    || |||||||||||||    
T  116923 cagggcatcaagcccc 116938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 137
Target Start/End: Original strand, 116935 - 117044
Alignment:
Q  28 ccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcat 127  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  116935 ccccatcgctatttaagtattaatatacttccagggcaacaagcccctatcgctaattgagctaaaactccaacgtgttgagtacaaagctccagggcat 117034  T
Q  128 caagccccca 137  Q
    ||||||||||    
T  117035 caagccccca 117044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #5
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 57 - 140
Target Start/End: Original strand, 117025 - 117108
Alignment:
Q  57 tccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaaca 140  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  117025 tccagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctctagggcatcaagcccccaaca 117108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #6
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 51985 - 51833
Alignment:
Q  236 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaa-ca 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| ||| | |||| || |||||| | || |||||||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  51985 cttagaccgactcatgcagcttagttaaacatcaaacagc-acataggcagcattcaaaaatagcaagacataataatatc-aatgcaagccaacaatca 51888  T
Q  334 tctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat-tatcacatcataa 387  Q
    |||||| ||| |||| | |  |||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  51887 tctcaattattcatttaaacttcaagtaatgcgtatacattatatcacatcataa 51833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 116 - 343
Target Start/End: Original strand, 19166 - 19390
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataa-tccaataattt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||   ||  ||||| | ||||| || | ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  19166 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacataacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttatataagtccaataattt 19263  T
Q  214 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataat 312  Q
    ||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||    
T  19264 ggaacatcatcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaat 19359  T
Q  313 atcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 343  Q
    ||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  19360 atcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 19390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 48746 - 48661
Alignment:
Q  37 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaa 122  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||  || ||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  48746 tatttgagtattaatatacttccagggcat-gagcccccatctttattttgagctaaagctccattgtggtgagtacaaagctccaa 48661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 25 - 275
Target Start/End: Original strand, 69599 - 69848
Alignment:
Q  25 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  69599 agcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaagctccagg 69697  T
Q  124 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt--- 220  Q
    ||||  ||||||||||||    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||| |  | || |||| | |||||||||||||||  ||       
T  69698 gcat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatctcttaaacatcat-aatc-atcatctcttat-ttatccaataatttggaggttcaa 69793  T
Q  221 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 275  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  69794 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagca 69848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 113 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 10762 - 10536
Alignment:
Q  113 aaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataat 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| || | || |||||| || |||| | | ||||||| |||||||| |||||||||    
T  10762 aaagctccaaggcatcaagcccccaacgatgaa-tgcaaatgcatggacacaacatcttaa-caacttagaacaacaacctcttatataagtccaataat 10665  T
Q  212 ttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataata 310  Q
    ||||||| ||| ||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |    
T  10664 ttggaacatcaccatcttca---acttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataaca 10569  T
Q  311 atatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 343  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  10568 atatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 10536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 116 - 343
Target Start/End: Original strand, 6436 - 6661
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataatccaataatttg 214  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || | ||  ||||| | ||||| ||   ||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  6436 gctccagggcatcaagcccgcaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaaaaacaacctcttata-agtccaataatttg 6532  T
Q  215 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataata 313  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||||    
T  6533 gaacatcatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaata 6631  T
Q  314 tcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 343  Q
    || |||||||  ||||||||||||||||||    
T  6632 tcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 6661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 116 - 364
Target Start/End: Original strand, 8370 - 8613
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataat-ccaataattt 213  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||  || || | ||||| || | ||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  8370 gctccagggcatcaagccaccaacaatgaa-tgctaatgcatggactcaactactcaacc-tcttagaaacaacaacctcttatataaaaccaataattt 8467  T
Q  214 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataat 312  Q
    ||||    ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | |||||| ||||| |||| |||    
T  8468 ggaat---atcttctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaacagcatgatataacaat 8561  T
Q  313 atcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatg 364  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||    
T  8562 atcaaatgcaagtcatcaacatctcaaatattcatatataattcaagtaatg 8613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 20 - 168
Target Start/End: Original strand, 10101 - 10247
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctc 119  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||  ||||||||||||||| ||||| | || ||||    
T  10101 catcaagcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatcacta-ttgtgctaaagctccatcgtgttgagca-aaggctc 10198  T
Q  120 caaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacct 168  Q
    || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10199 cagggcatcaaggcccaaacaatgaaatgctaatgcatggactcgacct 10247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 375 - 436
Target Start/End: Original strand, 10323 - 10384
Alignment:
Q  375 tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaacttcat 436  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  10323 tatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattattattaacatcat 10384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 79; Significance: 9e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 270
Target Start/End: Original strand, 19786 - 20029
Alignment:
Q  25 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaagg 124  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  19786 agcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcatgag-cccccatcgctaattgagctaaagctccatcgtgttgagtacaaaactccaggg 19884  T
Q  125 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt---c 221  Q
    |||  ||||||||||||    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||| |  | || |||| | |||||||||||||||  ||   |    
T  19885 cat-gagcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatctcttaaacatcat-aatc-attatctcttat-ttatccaataatttggaggttcaac 19980  T
Q  222 atcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 270  Q
    |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  19981 atcatcttgatcatcttataccgactcatgcagcttgattaaataacaa 20029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 116 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 14916 - 14692
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaat-cgacaacctattatata-atccaataattt 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||  ||||| | ||||| || | ||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  14916 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttatattcaacaacctcttaaatatatccaataattt 14819  T
Q  214 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataat 312  Q
    ||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||| | |||| || ||||| ||| ||||    
T  14818 ggaacatcatcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaactaacaaacagcaacataggcagta-agaaaatcatcatgatatagtaat 14723  T
Q  313 atcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 343  Q
    ||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  14722 atcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 14692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 33 - 275
Target Start/End: Original strand, 23658 - 23897
Alignment:
Q  33 tcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagc 132  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  |||    
T  23658 tcgctatttgagtattaatatacctccagggcat-aagcccccatcactatt-gagctaaagctctatcgtgttgagtacaaagctccatggcat-gagc 23754  T
Q  133 ccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt---catcatctt 229  Q
    |||||||||    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||   |||| |  | || |||| | |||||||||||||||  ||   |||||||||    
T  23755 ccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatctcttaaacatc-acaatc-atcatctcttat-ttatccaataatttggaggttcaacatcatctt 23851  T
Q  230 catcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 275  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  23852 gatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagca 23897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 116 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 3022 - 2801
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |  | |||||| || |||||| | ||| | | ||||| | |||||||||||||    
T  3022 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacatcatcttaa-caacttaaaacaacatcatcttata-agtccaataatttgg 2926  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 314  Q
    ||| |||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||    
T  2925 aacatcatcatcatcatc---ttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagctacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatat 2830  T
Q  315 caaatgcaagacaacaacatctcaaatat 343  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  2829 caaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 2801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 3324 - 3283
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatg 158  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3324 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatg 3283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 116 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 1256 - 1102
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatata-atccaataattt 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||  ||||| | ||||| || | ||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  1256 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataaacaacaacctcttaaatatatccaataattt 1159  T
Q  214 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 270  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1158 ggaacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 1102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 116 - 270
Target Start/End: Original strand, 6510 - 6664
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatata-atccaataattt 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||  ||||| | ||||| || | ||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  6510 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataagcaacaacctcttaaatatatccaataattt 6607  T
Q  214 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 270  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6608 ggaacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 6664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 116 - 270
Target Start/End: Original strand, 13890 - 14044
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatata-atccaataattt 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||  ||||| | ||||| || | ||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  13890 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataagcaacaacctcttaaatatatccaataattt 13987  T
Q  214 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 270  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13988 ggaacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 14044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 43 - 139
Target Start/End: Original strand, 7386 - 7482
Alignment:
Q  43 agtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaac 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7386 agtattaatttacttccagggcatcaagcccccatcgctaattgagctaaagctccaacgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaac 7482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 116 - 343
Target Start/End: Original strand, 5547 - 5769
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataatccaataatttg 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || | ||  ||||| | || || || | ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5547 gctccagggcatcaagcccccaacaatgga-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcatataaacaacaacctcttata-aatccaataatttg 5643  T
Q  215 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataata 313  Q
    |||| | || |||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||  |||| || ||||| |||| ||||    
T  5644 gaacatgattatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagtaaaataacaaacagcaacataggcagtat-gaaaatcatcatgatataacaata 5739  T
Q  314 tcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 343  Q
    || |||||||  ||||||||||||||||||    
T  5740 tcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 5769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 40 - 140
Target Start/End: Original strand, 7486 - 7585
Alignment:
Q  40 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaac 139  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| || |||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7486 ttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccc-atcgataattgagctaaaactccaacgtgttgagtacaaagctccagggcatcaagcccccaac 7584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 116 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 46010 - 45791
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttg 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | || |||||| || |||| | | ||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  46010 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacatcttaa-caacttagaacaacaacctcttaaataagtccaataatttg 45913  T
Q  215 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataata 313  Q
    |||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||||    
T  45912 gaacatcatcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagaaaaataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaata 45817  T
Q  314 tcaaatgcaagacaacaacatctcaa 339  Q
    || |||| ||| || |||||||||||    
T  45816 tcgaatgtaagtcatcaacatctcaa 45791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 116 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 24101 - 23898
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttg 214  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || | || |||||| || |||| | | ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  24101 gctccagggcatcaatcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacatcttaa-caacttagaacaacaacctcttatataagtccaataatttg 24004  T
Q  215 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataata 313  Q
    |||| ||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||||    
T  24003 gaacatcatcatcttca---acttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaata 23908  T
Q  314 tcaaatgcaa 323  Q
    || |||||||    
T  23907 tcgaatgcaa 23898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 116 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 2861 - 2640
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||  ||||| | ||||||| | ||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  2861 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttaaaacaacaacctcttata-agtccaataatttgg 2765  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 314  Q
    ||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||   ||| || ||||  |||| |||||    
T  2764 aacatcatcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacatcaacataggcagtat-gtaaatcatcatgttataacaatat 2669  T
Q  315 caaatgcaagacaacaacatctcaaatat 343  Q
      |||||||  ||||||||||||||||||    
T  2668 tgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 2640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 116 - 343
Target Start/End: Original strand, 31 - 255
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatata-atccaataattt 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||  ||||| | ||||| |||| ||||||| |||  || ||||||||||||    
T  31 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaacttaa-cttcttataatcaacaacctcttaagtatatccaataattt 128  T
Q  214 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataat 312  Q
    ||||| ||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||    
T  129 ggaacatcatcatc---atcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaat 224  T
Q  313 atcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 343  Q
    ||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  225 atcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 8129 - 7880
Alignment:
Q  25 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| || |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  8129 agcccccatcgctatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcactaatttgagctaatgctccatcgtgttgagtacaaagctccagg 8031  T
Q  124 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt--- 220  Q
    ||||  ||||||||||||    ||| ||||||||| |||||| |||||||||||| | |||| |  | || |||| | |||||||||||||||| ||       
T  8030 gcat-gagcccccaacaaatgtatgttaatgcatggactcgatctcttaaacatcat-aatc-atcatctcttat-ttatccaataatttggaagttcaa 7935  T
Q  221 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 275  Q
    ||||||||| |||| || | | ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  7934 catcatcttgatcatctcatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagca 7880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 116 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 15999 - 15845
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatata-atccaataattt 213  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||  || | ||  ||||| | ||||| || | ||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  15999 gctccagggcatcaaacccccaacaatgaa-tgctaatgcatagacacaacaacttaa-cttcttataagcaacaacctcttaaatatatccaataattt 15902  T
Q  214 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 270  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15901 ggaacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 15845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 275
Target Start/End: Original strand, 178705 - 178952
Alignment:
Q  25 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaagg 124  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||||| |||  ||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||    
T  178705 agcccccatcgctaattgagtgttaatataccgccagggcat-aagcccccatcgctatt-gagctaaagctccatcatgttaagtacaaagctccaggg 178802  T
Q  125 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt---c 221  Q
     || | |||||||||||    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||   |||| |  | || |||| | |||||||||||||||  ||   |    
T  178803 tatga-gcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatctcttaaacatc-acaatc-atcatctcttat-ttatccaataatttggaggttcaac 178898  T
Q  222 atcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 275  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  178899 atcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagca 178952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 202 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 6259 - 6137
Alignment:
Q  202 atccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaaca 300  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||| | ||| || ||    
T  6259 atccaataatttggaacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagtaacataggcagtatgc-aaatcatca 6161  T
Q  301 tgacataataatatcaaatgcaag 324  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||    
T  6160 tgatataacaatatcgaatgcaag 6137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 113 - 340
Target Start/End: Original strand, 10426 - 10650
Alignment:
Q  113 aaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatata-atccaataa 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || | ||  ||||| | ||||| || | ||||||| ||||||| |||||||||    
T  10426 aaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatccatggacacaacaacttaacc-tcttataaacaacaacctcttatatatatccaataa 10523  T
Q  211 tttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataat 309  Q
    |||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| ||||     
T  10524 tttggaacat-atcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttttttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataac 10619  T
Q  310 aatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaa 340  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  10620 aatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaa 10650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 116 - 343
Target Start/End: Original strand, 129808 - 130031
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttg 214  Q
    |||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||| || | || |||||| || |||  | | ||||||| ||| |||| |||| |||||||    
T  129808 gctccagggcatcaagcctgcaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacatcttaa-caacttggaacaacaacctcttaaataagtccattaatttg 129905  T
Q  215 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataata 313  Q
    |||| || |||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||||    
T  129906 gaacatcttcatc---atcaacttagaccgactcatgcatcttagttaaataacacacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaata 130001  T
Q  314 tcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 343  Q
    || |||||||| || |||||||||||||||    
T  130002 tcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 130031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 201 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 60848 - 60620
Alignment:
Q  201 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaa-acaa 298  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| | ||||||||||||| |       
T  60848 aatccaataatttggaac---atcatctt--tcatcttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatacaaaacagct 60754  T
Q  299 catgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtata-aaat-tatcacatcataatcaacatca 396  Q
    ||||| |||  |||||||| |||||  ||||||||||||||| || |||  |||| ||||||||||| |||| |||| |||||||| || | ||||||||    
T  60753 catgatataccaatatcaa-tgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacataattaacaacatca 60655  T
Q  397 aaacatctta-aacagcttcacagattataattaa 430  Q
    || ||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  60654 aatcattttataacagcttcacagattatcattaa 60620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 37 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 193277 - 192997
Alignment:
Q  37 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccc 135  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||| || ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  193277 tatttgagtattaatatacttccagggcatgag-cccccatcgttaatttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccc 193180  T
Q  136 caaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa-catcttaaatcgacaacctattata-taatccaataatttggaacttcatcatcttca- 231  Q
    ||||| |||  ||||||||||||| |||| | || ||||| |||||| |||| |  | || ||||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |     
T  193179 caacatatg-tatgctaatgcatggactctaactgttaaagcatctt-aatc-atcatctcttatattagtccaataatttggaacatcaacatcttaat 193083  T
Q  232 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtat-acaaaaacaacatgacataataatatca 316  Q
    ||||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| || | |||| || |||| |||| |||||||||| |||||||    
T  193082 tcaacatggactgactcatgcaacttagttaattaacaacagcagcataggcagaatcacaacaacatcatgacataacaatatca 192997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 124 - 343
Target Start/End: Original strand, 945 - 1158
Alignment:
Q  124 gcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttca 222  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||  || || || | || ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||   |    
T  945 gcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaactcaa-caacatagatcaacaacctcttatataagtccaataatttggaac---a 1039  T
Q  223 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgc 321  Q
    || ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | |||||| ||||| |||| |||||||||| |    
T  1040 tcttctt--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaacagcatgatataacaatatcaaatac 1136  T
Q  322 aagacaacaacatctcaaatat 343  Q
     |  || |||||||||||||||    
T  1137 gaatcatcaacatctcaaatat 1158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 201 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 53681 - 53487
Alignment:
Q  201 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaac 299  Q
    ||||||||||||||||||   ||| ||||  ||| ||||||| || |||||||||||||||||  ||||| |||||||| | ||||||| ||||| ||||    
T  53681 aatccaataatttggaac---atcttctt--tcatcttagactgattcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caac 53588  T
Q  300 atgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaa 397  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||  |||| |||  |||||||| |||| |||||||||    
T  53587 atgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 53488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 116 - 320
Target Start/End: Original strand, 32003 - 32202
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |  | |||||| || |||||| | ||| | | ||||| | |||||||||||||    
T  32003 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacatcatcttaa-caacttaaaacaacatcatcttata-agtccaataatttgg 32099  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 314  Q
    ||| |||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||| ||||| ||||| || ||||| |||| |||||    
T  32100 aacatcatcatcatcatc---ttagaccgactcatgcagcttagataaataacaaacaacaacataagtagtatgcaaaatcatcatgatataacaatat 32196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 116 - 335
Target Start/End: Original strand, 12665 - 12884
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaa-atcgacaacctattatataa-tccaataattt 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || | ||  ||||| | |||||  | | ||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  12665 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgataatgcatggacacaacaacttaa-cttcttattaacaacaacctcttatataagtccaatcattt 12762  T
Q  214 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataat 312  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| | ||| ||| | ||| || ||||| |||| |||    
T  12763 ggaacatcatcataatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagctaaataacaaacaacaacataggcaatatgc-aaatcatcatgatataacaat 12861  T
Q  313 atcaaatgcaagacaacaacatc 335  Q
    ||| |||||||| || |||||||    
T  12862 atcgaatgcaagtcatcaacatc 12884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0671 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0671
Description:

Target: scaffold0671; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 182
Target Start/End: Original strand, 5898 - 6056
Alignment:
Q  24 aagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaa 122  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||     
T  5898 aagcccccaacgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagctcccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtgttgagtactaagctccag 5996  T
Q  123 ggcatcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 182  Q
    |||||  ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  5997 ggcat-gagcccccaacatatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatcttaa 6056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 116 - 342
Target Start/End: Original strand, 12472 - 12693
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatataa-tccaataattt 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||| ||  ||||| ||||||| ||   || |||| |||||||| |||||||||||    
T  12472 gctccagggcatcaagcccccaacgat-aaatgcgaatgcatggactcaacaacttaa-catcttagaaaaaacgacctcttatataaatccaataattt 12569  T
Q  214 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataat 312  Q
    |||||   ||| ||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||    
T  12570 ggaac---atcttctt--tcatcttagaccgactcatgtagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaat 12663  T
Q  313 atcaaatgcaagacaacaacatctcaaata 342  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  12664 atcaaatgcaagtcatcaacatctcaaata 12693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 90 - 166
Target Start/End: Original strand, 20881 - 20957
Alignment:
Q  90 taaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgac 166  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20881 taaagctccaacgtgttgagtacaaagctccagggcatcaaggccccaacaatgaaatgctaatgcatggactcgac 20957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 16661 - 16513
Alignment:
Q  25 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 123  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| || ||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  16661 agcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgttattttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctccagg 16563  T
Q  124 gcatcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaa 174  Q
    ||||  | ||||||||| |||  ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  16562 gcat-gatcccccaacatatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaa 16513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 116 - 293
Target Start/End: Original strand, 6721 - 6889
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttg 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||| |||| |||| | | ||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  6721 gctccatggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatggacacaacctctt-aacaacttagaacaacaacctcttaaataagtccaataatttg 6818  T
Q  215 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaa 293  Q
    |||| |||||||         ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||    
T  6819 gaacatcatcat---------cttagaccgactcatgcagctcagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 6889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 292 - 340
Target Start/End: Original strand, 8090 - 8138
Alignment:
Q  292 aaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaa 340  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8090 aaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaa 8138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 116 - 335
Target Start/End: Original strand, 12842 - 13057
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttg 214  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |  | ||  ||||| || |||| | | ||||||| |||||||| |||||||||||     
T  12842 gctccagggcatgaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggaaacaacaacttaa-caacttagaacaacaacctcttatataagtccaataatttt 12939  T
Q  215 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataata 313  Q
    |||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||||    
T  12940 gaacatcatcatcttca---acttagaccgactcatgctgctcagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcagcatgatataacaata 13035  T
Q  314 tcaaatgcaagacaacaacatc 335  Q
    || |||||||| || |||||||    
T  13036 tcgaatgcaagtcatcaacatc 13057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 40 - 178
Target Start/End: Original strand, 18056 - 18193
Alignment:
Q  40 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaa 138  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || | ||||||||    
T  18056 ttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtgttcagtactaagctccagggtatga-gcccccaa 18153  T
Q  139 caatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatc 178  Q
    |||    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  18154 caaatgtatgctaatgcatggactcgacttcttaaacatc 18193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 116 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 28986 - 28813
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttgg 215  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | || |||||| || |||| | | ||| | | || || | |||||||||||||    
T  28986 gctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacatcttaa-caacttagaacaacatcatctttta-agtccaataatttgg 28890  T
Q  216 aacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca--acagcaacacaagcagtatacaaa 293  Q
    ||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| | ||||||| ||||    
T  28889 aacatcatcatc---atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacattacagcaacataggcagtatgcaaa 28813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 54; Significance: 7e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 201 - 299
Target Start/End: Original strand, 11952 - 12044
Alignment:
Q  201 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaac 299  Q
    |||||||||| ||||||| |||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  11952 aatccaataaattggaacatcatc--cttcatc---ttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtataccaaaacaac 12044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 54; Significance: 7e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 40 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 15976 - 15742
Alignment:
Q  40 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaa 138  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| |||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||| |||    
T  15976 ttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaatttgagttaatgctccatcgtgttgagtacaaagctccagggcat-gagcccgcaa 15879  T
Q  139 caatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt---catcatcttcatcaa 235  Q
    |||    ||||||||||||| ||| || |||||||||||| | |||| |  | || |||| | |||||||||||||||  ||   ||||||||| ||||     
T  15878 caaatgtatgctaatgcatggacttgatctcttaaacatcat-aatc-atcatctcttat-ttatccaataatttggaggttcaacatcatcttgatcat 15782  T
Q  236 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 275  Q
    |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  15781 cttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagca 15742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 10830 - 10681
Alignment:
Q  25 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaagg 124  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||    |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||    
T  10830 agcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatta--atttgagctaatgctccatcgtgttgagtacaaagctctaggg 10734  T
Q  125 catcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatc 178  Q
    |||  ||||||||||||    || |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  10733 cat-gagcccccaacaaatgtatcctaatgcatggactcgatctcttaaacatc 10681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 18767 - 18610
Alignment:
Q  25 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 123  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||| | |    
T  18767 agcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgttaatttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctctagg 18669  T
Q  124 gcatcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 182  Q
    ||||  ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  18668 gcat-gagcccccaacatatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatcttaa 18610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 112 - 270
Target Start/End: Original strand, 984 - 1135
Alignment:
Q  112 caaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataa 210  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || | ||  || || | ||||| |   |||| || |||||||| ||||||||    
T  984 caaagctccagggcatcaagcccccaacaatgaa-tgctaattcatggacacaacaactcaacc-tcttaga---acaatctcttatataaatccaataa 1078  T
Q  211 tttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 270  Q
    ||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1079 tttggaac---atcttcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 1135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 282 - 431
Target Start/End: Original strand, 6675 - 6826
Alignment:
Q  282 gcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatca 379  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||  ||||||||||| |||||| ||  ||| | ||||||||||| || ||  |  |||||    
T  6675 gcagtatacaaaatcaacatgacataatgatatcaatagcaattcaacaacatcttaaatattcaaacattattcaagtaatgcataaaacgttatatca 6774  T
Q  380 catcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaac 431  Q
    |||||||||||||| ||| | ||| || ||||||| ||||||||||| ||||    
T  6775 catcataatcaacaacaacatatcatatacagctttacagattataaataac 6826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 182
Target Start/End: Original strand, 10299 - 10456
Alignment:
Q  25 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaag 123  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||| | |    
T  10299 agcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgttaatttgagctaatgctccatcgtgttgagtactaagctcaagg 10397  T
Q  124 gcatcaagcccccaaca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 182  Q
    ||||  ||| ||||||| |||  ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  10398 gcat-gagcacccaacatatg-tatgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatcttaa 10456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 116 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 8277 - 7997
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttg 214  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || | ||   | || || |||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  8277 gctccagggcatcaatcccccaacaatgaa-tgctaatgcatggacacaacaagtcaa-caacttagatcaacaacctcttatataaatccaataatttg 8180  T
Q  215 gaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaac-agcaacacaagcagtatacaaaa-acaacatgacataataat 312  Q
    |||| || || |  ||||||   ||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||| || | ||||||| ||||  |   ||||| ||||||||    
T  8179 gaacatcttctt--tcatca---tagaccgacgcatgcagcttaattaaataacaaatagcagcataggcagtatgcaaatcagctcatgatataataat 8085  T
Q  313 atcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatcaacatcaaa 398  Q
    |||||||| ||  ||||||||||| ||| || |||  |||| ||||||||||  ||||||||  |||||||| |||| ||||||||||    
T  8084 atcaaatgaaattcaacaacatcttaaacattcatatataattcaagtaatgtatataaaattatatcacattataaacaacatcaaa 7997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 175 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 8233 - 8118
Alignment:
Q  175 catcttaaatcgacaacctattatataa-tccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aaca 272  Q
    |||||||||||  |||||| ||| |||| ||||||||||||||||   ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  8233 catcttaaatcatcaacctcttaaataaatccaataatttggaac---atcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaacaaacaaaca 8139  T
Q  273 gcaacacaagcagtatacaaa 293  Q
    |||||| | ||||||||||||    
T  8138 gcaacataggcagtatacaaa 8118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 116 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 103848 - 103632
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaa-atcgacaacctattatataa-tccaataattt 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||   ||||||| |||| ||  ||||| |||||||  | | || |||| |||||||| |||||||||||    
T  103848 gctccatggcatcaagcccccaacaatgaa-tgagtatgcatggactcaacaacttaa-catcttagcaacaacgacctcttatataaatccaataattt 103751  T
Q  214 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaa-ataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaa--catgacataata 310  Q
    |||||   ||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |  |||||||||| | | |||||| ||||||||  ||||| |||| |    
T  103750 ggaac---atcctctt--tcaacttagaccgactaatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggtagtata-aaaaacaattcatgatataaca 103657  T
Q  311 atatcaaatgcaagacaacaacatc 335  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  103656 atatcaaatgcaaaacaacaacatc 103632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 40 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 5104 - 4875
Alignment:
Q  40 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaa 138  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||| |||||||| | |||||||| |||||  | ||||| ||||||||||    
T  5104 ttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgctaatttgagctaatgctccatcatgttgagtactaagctttagggcat-aagcccccaa 5007  T
Q  139 caatgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaaatcgacaacctattatata-atccaataatttggaactt---catcatcttcatc 233  Q
    ||     |||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| |  | || ||||||| |||||||||||||||  ||   ||||||||| |||    
T  5006 catatctatgctattgcatggactcgatctcttaaaacatctt-aatc-atcatctcttatatatatccaataatttggaggttcaacatcatcttaatc 4909  T
Q  234 aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa 267  Q
    | |||| |  |||||||||| |||||||||||||    
T  4908 atcttatattgactcatgcaacttagttaaataa 4875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0634 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0634
Description:

Target: scaffold0634; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 4952 - 4894
Alignment:
Q  43 agtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctatttgacctaaagctccatc 101  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4952 agtattaatatacttccaggccatcaagcccccatcgctatttgagctaaagctccatc 4894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 121
Target Start/End: Original strand, 466 - 547
Alignment:
Q  40 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctcca 121  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  466 ttgagtattaatatacttccagggcat-aagcctccatcgctaatttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctcca 547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 375 - 429
Target Start/End: Original strand, 1074 - 1128
Alignment:
Q  375 tatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaacagcttcacagattataatta 429  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1074 tatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacatcttcacagattataatta 1128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 242
Target Start/End: Original strand, 539 - 688
Alignment:
Q  91 aaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatcttaaatcgacaa 190  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||| ||| | | |||||||||||    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||| |  |    
T  539 aaagctccattgtggtgagtacaaagctccagggcctga-gcccccaacaaatgtatgctaatgcatggactcgatctcttaaacatcat-aatc-atca 635  T
Q  191 cctattata-taatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagac 242  Q
     || ||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||    
T  636 tctcttatattagtccaataatttggaacatcattatcttcaacaactaagac 688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 78
Target Start/End: Original strand, 20471 - 20529
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatc 78  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  20471 catcaagcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcatcaagcccccatc 20529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 182
Target Start/End: Original strand, 14482 - 14624
Alignment:
Q  40 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaa 138  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||| ||||| |||| ||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||    
T  14482 ttgagtattaatatacttccagggaat-aagcccccttcgctaatttgagctaatgctacatcgtgttgagtactaagctccagggcatga-gcccccaa 14579  T
Q  139 ca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 182  Q
    || ||| | |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  14580 catatgta-tgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatcttaa 14624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 182
Target Start/End: Original strand, 38922 - 39064
Alignment:
Q  40 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaa 138  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||| ||||| |||| ||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||    
T  38922 ttgagtattaatatacttccagggtat-aagcccccttcgctaatttgagctaatgctgcatcgtgttgagtactaagctccagggcatga-gcccccaa 39019  T
Q  139 ca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 182  Q
    || ||| | |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  39020 catatgta-tgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatcttaa 39064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 182
Target Start/End: Original strand, 23498 - 23640
Alignment:
Q  40 ttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta-tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaa 138  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||| || |||||   |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||    
T  23498 ttgagtattaatatacttccagggaat-aagcccccatcgataatttgagaaaaagctacatcgtgttgagtactaagctccagggcatga-gcccccaa 23595  T
Q  139 ca-atgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 182  Q
    || ||| | |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  23596 catatgta-tgctaatgcatggactcgatctcttaaaacatcttaa 23640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 278
Target Start/End: Original strand, 30235 - 30392
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatat-aatccaataattt 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||  ||| |||| || |  | |||| |||||| |||||||||||||    
T  30235 gctccagggcatcaagcccccaacaatgtaatgctaatgcatggacttgacgtctt--acaacttagaaacatcgacctcttatataaatccaataattt 30332  T
Q  214 ggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 278  Q
    ||||   || ||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||   ||||||||||||    
T  30333 ggaa---caacatctt--tcatcttagaccgactcatgcagtttaattaatatacaacagcaaca 30392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 419
Target Start/End: Original strand, 225482 - 225611
Alignment:
Q  292 aaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaat--tatcacatcataatc 389  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||  |||| ||||||||||| |||| |||  |||||||| |||| |    
T  225482 aaaacagcgtgatataataatatcaaatgcaat-caacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaac 225580  T
Q  390 aacatcaaaacatctta-aacagcttcacag 419  Q
    ||||||||| |||| || | |||||||||||    
T  225581 aacatcaaatcatcatatatcagcttcacag 225611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 218
Target Start/End: Original strand, 225353 - 225455
Alignment:
Q  116 gctccaaggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctcttaaacatctta-aatcgacaacctattatat-aatccaataattt 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||  | | ||| ||||| || | ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  225353 gctccagggcatcaagcccccaacaatg-aatgctaatgcatggactcaacaac-tcaacctcttagaaacaacaacctcttatataaatccaataattt 225450  T
Q  214 ggaac 218  Q
    |||||    
T  225451 ggaac 225455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0423 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0423
Description:

Target: scaffold0423; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 28 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 72 - 18
Alignment:
Q  28 ccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgcta 82  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  72 ccccatcgctatttgagttttaatatacttccagggcatcaagcccccatcgcta 18  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 37 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 22105 - 21866
Alignment:
Q  37 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccc 135  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  22105 tattttagtattaatatactttcagggcatgag-cccccatcgttattttgagttaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccc 22008  T
Q  136 caac-aatgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt---catcatcttc 230  Q
    |||| |||| ||||||||||||||  ||| | ||||| ||||||||| |||| |  | ||  ||||| |||||||||||||||  ||   |||||||||     
T  22007 caacaaatgtaatgctaatgcatgggctcaatctcttaaaacatctt-aatc-atcatctcatatat-atccaataatttggaggttcaacatcatctta 21911  T
Q  231 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 275  Q
    |||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  21910 atcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagca 21866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 37 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 29997 - 29758
Alignment:
Q  37 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccc 135  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  29997 tattttagtattaatatactttcagggcatgag-cccccatcgttattttgagttaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccc 29900  T
Q  136 caac-aatgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaaatcgacaacctattatataatccaataatttggaactt---catcatcttc 230  Q
    |||| |||| ||||||||||||||  ||| | ||||| ||||||||| |||| |  | ||  ||||| |||||||||||||||  ||   |||||||||     
T  29899 caacaaatgtaatgctaatgcatgggctcaatctcttaaaacatctt-aatc-atcatctcatatat-atccaataatttggaggttcaacatcatctta 29803  T
Q  231 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 275  Q
    |||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  29802 atcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagca 29758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 182
Target Start/End: Original strand, 1696 - 1842
Alignment:
Q  37 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt--gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagccc 134  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |  | ||||||| |||||  || |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||  |||||    
T  1696 tattttagtattaatatactttcagggcatgag-ctcccatcgttatttttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagccc 1793  T
Q  135 ccaacaatgaaatgctaatgcatgaactcgacctctt-aaacatcttaa 182  Q
    |||||||    ||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||    
T  1794 ccaacaaatgtatgctaatgcatggactcaatctcttaaaacatcttaa 1842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0697 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0697
Description:

Target: scaffold0697; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 163
Target Start/End: Original strand, 6506 - 6546
Alignment:
Q  123 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatgaactc 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6506 ggcatcaagcccccaacaatgaaatgctaatgcatggactc 6546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 108
Target Start/End: Original strand, 32251 - 32334
Alignment:
Q  25 agcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgct-atttgacctaaagctccatcgtattga 108  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||| |||| |||||||||| ||||    
T  32251 agcccccatcgttatttgagtattaatatacttccagggcat-aagcccccatcgttaatttgagctaatgctccatcgtgttga 32334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 294
Target Start/End: Original strand, 25121 - 25184
Alignment:
Q  232 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaa 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | |||||||| ||||    
T  25121 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaa 25184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 281196 - 281071
Alignment:
Q  37 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccc 135  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||| ||||| || |||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  281196 tattttagtattaatatactttcagggcatgag-cccccatcgttattttgagctaatgctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccc 281099  T
Q  136 caacaatgaaatgctaatgcatgaactc 163  Q
    ||||||    ||||||||||||| ||||    
T  281098 caacaaatgtatgctaatgcatggactc 281071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 339
Target Start/End: Original strand, 267649 - 267784
Alignment:
Q  201 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaa-acaa 298  Q
    |||| |||||||||||||   ||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||| ||||| | |||||||| |||| |       
T  267649 aatcaaataatttggaac---atcatctt--tcatcttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacatcaacatatgcagtatataaaacagtt 267743  T
Q  299 catgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaa 339  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  267744 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaatatctcaa 267784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 323
Target Start/End: Original strand, 29558 - 29660
Alignment:
Q  221 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatg 320  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||| || | || | | ||  ||||| || | ||||||||||||||||||| ||    
T  29558 catcatcttaatcaacttagactgactcatgtgacttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaataatagcatgacataataatatcaattg 29657  T
Q  321 caa 323  Q
    |||    
T  29658 caa 29660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1655 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1655
Description:

Target: scaffold1655; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 69
Target Start/End: Original strand, 1193 - 1242
Alignment:
Q  20 catcaagcccccgtcgctatttgagtattaatttacttccagggcatcaa 69  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  1193 catcaaacccccatcgctatttgagtattaatatacttccaaggcatcaa 1242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 394 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 17929 - 17892
Alignment:
Q  394 tcaaaacatcttaaacagcttcacagattataattaac 431  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17929 tcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaac 17892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 201 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 1930 - 1874
Alignment:
Q  201 aatccaataatttggaacttcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagtta 262  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  1930 aatccaataatttggaacatcatc--cttcatc---ttagaccgactcatgcagcttagtta 1874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 141
Target Start/End: Original strand, 6361 - 6418
Alignment:
Q  83 tttgacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccccaacaa 141  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  6361 tttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctccagggcat-gagcccccaacaa 6418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 141
Target Start/End: Original strand, 2649 - 2752
Alignment:
Q  37 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaacccccatcgctattt-gacctaaagctccatcgtattgagtacaaagctccaaggcatcaagcccc 135  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||  ||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||  ||||||    
T  2649 tattttagtattaatatactttcagggcatgag-cccccatcattattttgagctaaagctccatcgtggtgagtacaaagctcaagggcat-gagcccc 2746  T
Q  136 caacaa 141  Q
    ||||||    
T  2747 caacaa 2752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 206624 - 206575
Alignment:
Q  238 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagta 287  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||    
T  206624 tagatcgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacataggcagta 206575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 299 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 2257 - 2213
Alignment:
Q  299 catgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatat 343  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  2257 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 2213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0780 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0780
Description:

Target: scaffold0780; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 4906 - 4870
Alignment:
Q  37 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaaaccc 73  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  4906 tatttgagcattaatatacttccagggcatcaaaccc 4870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 69
Target Start/End: Original strand, 14401 - 14433
Alignment:
Q  37 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaa 69  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14401 tatttgagtattaatatacttccagggcatcaa 14433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 69
Target Start/End: Original strand, 12396 - 12428
Alignment:
Q  37 tatttgagtattaatttacttccagggcatcaa 69  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12396 tatttgagtattaatatacttccagggcatcaa 12428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 305 - 377
Target Start/End: Original strand, 13092 - 13164
Alignment:
Q  305 ataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataactcaagtaatgcgtataaaattat 377  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||| | ||||||||| |||| ||||||    
T  13092 ataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattgaagtaatgcatatataattat 13164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University