View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8810A_low_341 (Length: 230)

Name: NF8810A_low_341
Description: NF8810A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8810A_low_341
NF8810A_low_341
[»] chr3 (174 HSPs)
chr3 (1-230)||(6490750-6490979)
chr3 (1-230)||(6501404-6501633)
chr3 (1-230)||(9994294-9994523)
chr3 (1-230)||(9982286-9982515)
chr3 (1-230)||(12238014-12238243)
chr3 (1-230)||(12249840-12250069)
chr3 (1-230)||(39673284-39673513)
chr3 (1-230)||(13557179-13557408)
chr3 (1-230)||(19777990-19778219)
chr3 (1-230)||(19788627-19788856)
chr3 (1-230)||(23756903-23757132)
chr3 (1-230)||(23767499-23767728)
chr3 (1-230)||(6180929-6181158)
chr3 (1-230)||(6221103-6221332)
chr3 (1-230)||(13121267-13121496)
chr3 (1-230)||(13131509-13131738)
chr3 (1-230)||(14475826-14476055)
chr3 (1-230)||(24383920-24384151)
chr3 (1-230)||(4175158-4175387)
chr3 (1-230)||(5537422-5537651)
chr3 (1-230)||(5548006-5548235)
chr3 (1-230)||(37866050-37866279)
chr3 (1-230)||(37885183-37885412)
chr3 (1-230)||(5866097-5866328)
chr3 (1-230)||(5876696-5876927)
chr3 (1-230)||(20720716-20720947)
chr3 (1-230)||(23647353-23647583)
chr3 (1-230)||(20684180-20684408)
chr3 (1-230)||(23635314-23635543)
chr3 (1-230)||(504569-504799)
chr3 (1-230)||(526935-527165)
chr3 (1-230)||(4743342-4743572)
chr3 (1-230)||(4753929-4754159)
chr3 (1-230)||(5580035-5580266)
chr3 (1-230)||(18483648-18483878)
chr3 (1-230)||(35186981-35187211)
chr3 (1-230)||(41683282-41683512)
chr3 (1-230)||(41693851-41694081)
chr3 (1-230)||(37759274-37759503)
chr3 (1-230)||(8774261-8774491)
chr3 (1-230)||(10098672-10098902)
chr3 (1-230)||(16385679-16385909)
chr3 (1-230)||(24659504-24659734)
chr3 (1-230)||(24670084-24670314)
chr3 (1-230)||(38194328-38194558)
chr3 (1-230)||(39382294-39382524)
chr3 (1-230)||(12297202-12297434)
chr3 (1-230)||(38204863-38205094)
chr3 (1-230)||(5510300-5510530)
chr3 (1-230)||(5520478-5520708)
chr3 (1-230)||(5628419-5628649)
chr3 (1-230)||(11272785-11273016)
chr3 (1-230)||(13373067-13373298)
chr3 (1-230)||(13394255-13394486)
chr3 (1-230)||(39371657-39371887)
chr3 (1-230)||(10627342-10627572)
chr3 (1-230)||(10655664-10655894)
chr3 (1-230)||(24706956-24707186)
chr3 (1-230)||(12287380-12287612)
chr3 (1-230)||(28314633-28314864)
chr3 (1-230)||(20673595-20673824)
chr3 (1-230)||(1794885-1795114)
chr3 (1-230)||(29461614-29461843)
chr3 (1-230)||(29472466-29472695)
chr3 (1-230)||(48336846-48337075)
chr3 (1-230)||(13383661-13383892)
chr3 (1-230)||(9391605-9391834)
chr3 (1-230)||(11163435-11163663)
chr3 (1-230)||(11217126-11217355)
chr3 (1-230)||(19887755-19887984)
chr3 (1-230)||(933231-933461)
chr3 (1-230)||(28325249-28325478)
chr3 (1-230)||(1784472-1784701)
chr3 (1-230)||(9381059-9381288)
chr3 (1-230)||(11206475-11206704)
chr3 (1-230)||(7795008-7795238)
chr3 (1-230)||(7804919-7805149)
chr3 (1-228)||(4403878-4404104)
chr3 (1-228)||(4433365-4433591)
chr3 (1-207)||(13262097-13262303)
chr3 (1-195)||(17910441-17910636)
chr3 (1-230)||(9535213-9535443)
chr3 (1-230)||(38314299-38314527)
chr3 (2-230)||(8740527-8740755)
chr3 (1-196)||(14258501-14258695)
chr3 (1-207)||(14322116-14322321)
chr3 (1-207)||(8996381-8996588)
chr3 (1-207)||(16076531-16076739)
chr3 (1-207)||(9006933-9007140)
chr3 (1-207)||(27882986-27883193)
chr3 (1-193)||(1053311-1053505)
chr3 (1-136)||(13601838-13601973)
chr3 (1-196)||(29933996-29934192)
chr3 (1-196)||(29983150-29983346)
chr3 (1-154)||(15194516-15194670)
chr3 (1-155)||(28168715-28168870)
chr3 (1-207)||(17281859-17282066)
chr3 (1-158)||(8784875-8785034)
chr3 (1-193)||(1063740-1063934)
chr3 (1-140)||(18857426-18857564)
chr3 (1-196)||(29906617-29906813)
chr3 (1-196)||(29947782-29947978)
chr3 (1-196)||(29996936-29997132)
chr3 (28-207)||(16671586-16671766)
chr3 (1-194)||(2245965-2246162)
chr3 (1-196)||(13199682-13199880)
chr3 (137-230)||(14465332-14465425)
chr3 (1-102)||(19121370-19121471)
chr3 (1-97)||(33650805-33650901)
chr3 (1-194)||(51989587-51989784)
chr3 (2-188)||(15663180-15663370)
chr3 (1-194)||(31114428-31114625)
chr3 (1-194)||(17006590-17006788)
chr3 (1-194)||(22150642-22150840)
chr3 (1-97)||(24393356-24393452)
chr3 (143-230)||(8784989-8785076)
chr3 (1-73)||(11530402-11530474)
chr3 (99-230)||(15663108-15663240)
chr3 (1-188)||(15651545-15651736)
chr3 (1-194)||(41045138-41045337)
chr3 (1-194)||(13953659-13953857)
chr3 (1-156)||(17017426-17017586)
chr3 (1-153)||(27172465-27172622)
chr3 (101-230)||(15651473-15651603)
chr3 (1-194)||(15832804-15833002)
chr3 (1-194)||(49989657-49989855)
chr3 (1-156)||(10528770-10528931)
chr3 (16-194)||(14580752-14580937)
chr3 (127-230)||(17961073-17961179)
chr3 (1-52)||(35579002-35579053)
chr3 (1-51)||(13076497-13076547)
chr3 (14-157)||(37412045-37412193)
chr3 (1-125)||(21735769-21735896)
chr3 (14-156)||(45862162-45862309)
chr3 (14-194)||(12753187-12753372)
chr3 (127-207)||(28168811-28168892)
chr3 (1-184)||(15848538-15848726)
chr3 (99-194)||(51340509-51340605)
chr3 (1-48)||(27849621-27849668)
chr3 (99-156)||(18006023-18006081)
chr3 (1-156)||(13147689-13147851)
chr3 (99-194)||(15848700-15848796)
chr3 (16-194)||(11909606-11909789)
chr3 (156-194)||(21735868-21735906)
chr3 (1-42)||(7608861-7608902)
chr3 (103-187)||(12756018-12756103)
chr3 (1-49)||(13410752-13410800)
chr3 (99-157)||(4243694-4243753)
chr3 (14-49)||(6252831-6252866)
chr3 (144-183)||(11074019-11074058)
chr3 (1-48)||(13931392-13931439)
chr3 (143-230)||(18006038-18006124)
chr3 (99-184)||(15848670-15848756)
chr3 (19-69)||(17769645-17769698)
chr3 (19-69)||(19070946-19070999)
chr3 (15-69)||(20736609-20736662)
chr3 (144-194)||(52919976-52920026)
chr3 (17-69)||(4768229-4768281)
chr3 (99-136)||(8710418-8710455)
chr3 (99-136)||(9062305-9062342)
chr3 (99-155)||(13410623-13410680)
chr3 (1-38)||(17961006-17961043)
chr3 (127-184)||(18005989-18006049)
chr3 (104-196)||(27849689-27849782)
chr3 (1-49)||(6174732-6174780)
chr3 (144-184)||(8710404-8710444)
chr3 (144-188)||(8874693-8874737)
chr3 (144-184)||(9062291-9062331)
chr3 (1-49)||(11078152-11078200)
chr3 (1-48)||(12410413-12410461)
chr3 (1-49)||(14078029-14078077)
chr3 (95-194)||(16879508-16879608)
chr3 (99-158)||(22770433-22770493)
chr3 (14-46)||(50299645-50299677)
[»] chr6 (115 HSPs)
chr6 (1-230)||(26043767-26043996)
chr6 (1-230)||(9123544-9123773)
chr6 (1-230)||(9112907-9113136)
chr6 (1-230)||(32962346-32962575)
chr6 (1-230)||(32972965-32973195)
chr6 (1-230)||(12854576-12854805)
chr6 (1-230)||(12865102-12865331)
chr6 (1-230)||(12717248-12717479)
chr6 (1-230)||(12727897-12728128)
chr6 (1-230)||(3671602-3671831)
chr6 (1-230)||(27372387-27372616)
chr6 (1-230)||(27462737-27462966)
chr6 (1-230)||(27505497-27505726)
chr6 (2-230)||(3660939-3661167)
chr6 (1-230)||(4630425-4630655)
chr6 (1-230)||(16930005-16930235)
chr6 (1-230)||(17982913-17983144)
chr6 (1-230)||(17985122-17985353)
chr6 (1-230)||(25985635-25985866)
chr6 (1-230)||(26025013-26025243)
chr6 (1-230)||(26035587-26035817)
chr6 (1-230)||(27341248-27341478)
chr6 (1-230)||(27401988-27402218)
chr6 (1-230)||(27412647-27412877)
chr6 (1-230)||(31983038-31983268)
chr6 (1-230)||(32301455-32301685)
chr6 (1-230)||(32312144-32312374)
chr6 (1-230)||(34818204-34818435)
chr6 (1-230)||(34807572-34807804)
chr6 (1-230)||(16959176-16959406)
chr6 (1-230)||(26864340-26864570)
chr6 (1-230)||(26874964-26875194)
chr6 (1-230)||(29384306-29384536)
chr6 (1-230)||(33198882-33199112)
chr6 (1-230)||(20030316-20030545)
chr6 (1-230)||(20063067-20063296)
chr6 (1-230)||(25787257-25787485)
chr6 (1-230)||(28251975-28252203)
chr6 (1-230)||(28357122-28357350)
chr6 (1-207)||(16123971-16124177)
chr6 (1-230)||(12827247-12827476)
chr6 (1-230)||(18926176-18926404)
chr6 (1-230)||(7376170-7376400)
chr6 (1-230)||(27383988-27384217)
chr6 (1-230)||(7751647-7751878)
chr6 (1-207)||(32756955-32757159)
chr6 (1-230)||(31571969-31572198)
chr6 (1-207)||(17746219-17746426)
chr6 (1-207)||(27166877-27167084)
chr6 (1-207)||(5844640-5844847)
chr6 (1-188)||(27474372-27474559)
chr6 (1-188)||(27503870-27504057)
chr6 (1-207)||(29765090-29765297)
chr6 (1-138)||(10404043-10404180)
chr6 (1-207)||(18826673-18826880)
chr6 (1-207)||(18835068-18835275)
chr6 (1-139)||(12353138-12353277)
chr6 (1-134)||(25583467-25583600)
chr6 (1-125)||(11147708-11147832)
chr6 (2-207)||(22308342-22308549)
chr6 (1-196)||(25687196-25687395)
chr6 (114-230)||(27504013-27504129)
chr6 (1-194)||(25518238-25518434)
chr6 (1-194)||(11235047-11235244)
chr6 (1-194)||(21127628-21127825)
chr6 (1-194)||(7586711-7586908)
chr6 (1-98)||(12416901-12416997)
chr6 (1-158)||(31931002-31931163)
chr6 (114-230)||(27474515-27474630)
chr6 (1-156)||(17047138-17047297)
chr6 (1-194)||(17742152-17742347)
chr6 (1-158)||(18554849-18555010)
chr6 (1-158)||(12953586-12953747)
chr6 (1-156)||(11205524-11205683)
chr6 (1-194)||(20635118-20635316)
chr6 (1-125)||(9934131-9934255)
chr6 (143-230)||(12353252-12353339)
chr6 (141-230)||(4292420-4292509)
chr6 (1-194)||(17608861-17609058)
chr6 (1-69)||(14757777-14757848)
chr6 (1-91)||(22292446-22292538)
chr6 (1-52)||(1902289-1902340)
chr6 (1-52)||(27819055-27819106)
chr6 (1-52)||(30120483-30120534)
chr6 (1-194)||(19453076-19453275)
chr6 (1-194)||(22386201-22386399)
chr6 (14-194)||(14070627-14070811)
chr6 (16-153)||(17063793-17063935)
chr6 (156-230)||(11147662-11147736)
chr6 (43-158)||(19289837-19289950)
chr6 (1-49)||(15551423-15551471)
chr6 (99-230)||(18027239-18027370)
chr6 (127-230)||(31931101-31931205)
chr6 (1-48)||(18027387-18027434)
chr6 (99-157)||(24719301-24719360)
chr6 (99-157)||(24729086-24729145)
chr6 (101-194)||(14051946-14052039)
chr6 (99-156)||(14051954-14052012)
chr6 (1-39)||(25678963-25679001)
chr6 (1-49)||(17927189-17927237)
chr6 (146-230)||(18554968-18555052)
chr6 (1-49)||(21034428-21034476)
chr6 (95-194)||(23006561-23006661)
chr6 (95-194)||(23781705-23781805)
chr6 (1-49)||(24719437-24719485)
chr6 (1-49)||(25929875-25929923)
chr6 (1-43)||(3680510-3680552)
chr6 (1-43)||(19625207-19625249)
chr6 (1-43)||(20113347-20113389)
chr6 (1-43)||(24116224-24116266)
chr6 (144-176)||(10820696-10820728)
chr6 (1-49)||(14883651-14883699)
chr6 (1-48)||(15478450-15478497)
chr6 (95-194)||(17446210-17446310)
chr6 (99-158)||(32335364-32335424)
[»] chr5 (135 HSPs)
chr5 (1-230)||(10755013-10755242)
chr5 (1-230)||(40390878-40391107)
chr5 (1-230)||(40401540-40401769)
chr5 (1-230)||(15992839-15993068)
chr5 (1-230)||(16003401-16003630)
chr5 (1-230)||(27602928-27603157)
chr5 (1-230)||(39353009-39353238)
chr5 (1-230)||(39365002-39365231)
chr5 (1-230)||(5290085-5290315)
chr5 (1-230)||(5300656-5300886)
chr5 (1-230)||(6131312-6131541)
chr5 (1-230)||(9347063-9347292)
chr5 (1-230)||(23362632-23362861)
chr5 (1-230)||(34772431-34772660)
chr5 (1-230)||(34783376-34783605)
chr5 (1-230)||(14557525-14557756)
chr5 (1-230)||(14568162-14568393)
chr5 (1-228)||(27622277-27622504)
chr5 (1-230)||(30069413-30069643)
chr5 (1-230)||(36582067-36582297)
chr5 (1-230)||(36592622-36592852)
chr5 (1-230)||(9336476-9336705)
chr5 (1-230)||(22147044-22147272)
chr5 (1-230)||(22157627-22157855)
chr5 (1-230)||(9376971-9377201)
chr5 (1-230)||(14041118-14041348)
chr5 (1-230)||(15693541-15693771)
chr5 (1-230)||(15740489-15740719)
chr5 (1-230)||(15769649-15769879)
chr5 (1-230)||(17607580-17607810)
chr5 (1-230)||(17618195-17618425)
chr5 (1-230)||(17719438-17719668)
chr5 (1-230)||(17730090-17730320)
chr5 (1-230)||(23296798-23297029)
chr5 (1-230)||(23307366-23307597)
chr5 (1-230)||(23707963-23708194)
chr5 (1-230)||(24567610-24567840)
chr5 (1-230)||(24816395-24816625)
chr5 (1-230)||(24826983-24827213)
chr5 (1-230)||(27041721-27041951)
chr5 (1-230)||(27052345-27052575)
chr5 (1-230)||(27460682-27460912)
chr5 (1-230)||(27471081-27471311)
chr5 (1-230)||(30227004-30227235)
chr5 (1-230)||(30237531-30237762)
chr5 (1-230)||(31349054-31349284)
chr5 (1-230)||(31359668-31359898)
chr5 (1-230)||(35216027-35216257)
chr5 (1-230)||(35226611-35226841)
chr5 (1-230)||(39490458-39490689)
chr5 (1-230)||(39501648-39501879)
chr5 (1-230)||(40513497-40513728)
chr5 (1-230)||(22559958-22560187)
chr5 (1-230)||(27204313-27204542)
chr5 (1-230)||(14030565-14030795)
chr5 (1-230)||(14446510-14446740)
chr5 (1-230)||(14457122-14457352)
chr5 (1-230)||(23697305-23697536)
chr5 (1-230)||(24808433-24808663)
chr5 (1-230)||(31834004-31834237)
chr5 (1-230)||(31844482-31844715)
chr5 (1-230)||(33951308-33951539)
chr5 (1-230)||(36688215-36688445)
chr5 (1-230)||(36698781-36699011)
chr5 (1-230)||(37728761-37728991)
chr5 (1-230)||(37740077-37740307)
chr5 (1-230)||(42043305-42043536)
chr5 (1-230)||(42053880-42054111)
chr5 (1-230)||(6976329-6976561)
chr5 (1-230)||(6986819-6987051)
chr5 (1-230)||(22676637-22676869)
chr5 (1-230)||(22686528-22686760)
chr5 (1-230)||(43043181-43043410)
chr5 (1-230)||(20798217-20798446)
chr5 (1-230)||(31419184-31419413)
chr5 (1-230)||(1121412-1121641)
chr5 (1-230)||(1108654-1108883)
chr5 (1-230)||(23406967-23407196)
chr5 (1-230)||(31449075-31449304)
chr5 (1-230)||(36084982-36085211)
chr5 (1-230)||(36229260-36229489)
chr5 (1-230)||(42395505-42395734)
chr5 (1-230)||(8522362-8522592)
chr5 (1-230)||(43621403-43621633)
chr5 (1-230)||(20552336-20552566)
chr5 (1-230)||(21702634-21702863)
chr5 (1-230)||(23392922-23393151)
chr5 (1-230)||(19464492-19464722)
chr5 (1-230)||(20562846-20563076)
chr5 (1-230)||(34052481-34052710)
chr5 (1-230)||(34063142-34063371)
chr5 (1-227)||(17446206-17446432)
chr5 (1-230)||(19478522-19478752)
chr5 (1-230)||(24925647-24925878)
chr5 (1-230)||(24982928-24983159)
chr5 (1-207)||(37407192-37407397)
chr5 (1-230)||(17456822-17457051)
chr5 (1-158)||(7031666-7031823)
chr5 (1-230)||(21705474-21705710)
chr5 (1-207)||(20625310-20625518)
chr5 (1-196)||(20417459-20417654)
chr5 (1-207)||(106664-106871)
chr5 (1-196)||(32753455-32753650)
chr5 (1-194)||(20215662-20215860)
chr5 (1-160)||(21420271-21420431)
chr5 (1-158)||(13522618-13522779)
chr5 (1-194)||(40228051-40228250)
chr5 (1-156)||(40033321-40033482)
chr5 (1-155)||(35543694-35543852)
chr5 (1-194)||(23477769-23477966)
chr5 (1-158)||(36096215-36096376)
chr5 (1-158)||(36097672-36097833)
chr5 (1-158)||(20168630-20168791)
chr5 (127-230)||(7031762-7031865)
chr5 (1-156)||(23487945-23488104)
chr5 (1-156)||(1914839-1915000)
chr5 (43-158)||(13403702-13403817)
chr5 (12-192)||(11208557-11208741)
chr5 (1-76)||(13533375-13533456)
chr5 (14-194)||(25112423-25112608)
chr5 (14-194)||(25171514-25171699)
chr5 (15-194)||(32160156-32160340)
chr5 (99-196)||(12078357-12078456)
chr5 (127-194)||(13403755-13403823)
chr5 (144-196)||(20550432-20550484)
chr5 (95-194)||(20567296-20567396)
chr5 (99-158)||(23589238-23589298)
chr5 (17-69)||(26013259-26013310)
chr5 (1-49)||(31589637-31589685)
chr5 (1-48)||(26056184-26056231)
chr5 (156-194)||(13533474-13533512)
chr5 (14-47)||(6513128-6513161)
chr5 (99-187)||(26013304-26013393)
chr5 (146-194)||(13522737-13522785)
chr5 (146-230)||(35543649-35543733)
[»] chr4 (105 HSPs)
chr4 (1-230)||(5022360-5022589)
chr4 (1-230)||(18752896-18753125)
chr4 (1-230)||(18763506-18763735)
chr4 (1-230)||(48370755-48370984)
chr4 (1-230)||(450200-450429)
chr4 (1-230)||(15561486-15561715)
chr4 (1-230)||(19955369-19955598)
chr4 (1-230)||(21996037-21996266)
chr4 (1-230)||(22006635-22006864)
chr4 (1-230)||(27815352-27815581)
chr4 (1-230)||(30926901-30927130)
chr4 (1-230)||(17917675-17917905)
chr4 (1-230)||(4947961-4948190)
chr4 (1-230)||(14844060-14844289)
chr4 (1-230)||(19944734-19944963)
chr4 (1-230)||(40470994-40471223)
chr4 (1-230)||(460781-461010)
chr4 (1-230)||(30937479-30937708)
chr4 (1-230)||(40454756-40454985)
chr4 (1-230)||(36017959-36018189)
chr4 (1-230)||(36028512-36028742)
chr4 (1-230)||(49517758-49517988)
chr4 (1-230)||(17928323-17928553)
chr4 (1-230)||(24028492-24028724)
chr4 (1-230)||(25656759-25656988)
chr4 (1-230)||(27656222-27656453)
chr4 (1-230)||(27666795-27667026)
chr4 (1-230)||(29042063-29042293)
chr4 (1-230)||(16255490-16255719)
chr4 (1-230)||(16266083-16266312)
chr4 (1-230)||(18130646-18130878)
chr4 (1-230)||(52703412-52703641)
chr4 (1-230)||(10741001-10741231)
chr4 (1-230)||(10954770-10955000)
chr4 (1-230)||(24639871-24640101)
chr4 (1-230)||(55745659-55745889)
chr4 (1-230)||(10909031-10909260)
chr4 (1-230)||(10751575-10751805)
chr4 (1-230)||(10965344-10965574)
chr4 (1-230)||(18078313-18078544)
chr4 (1-230)||(55756270-55756500)
chr4 (1-230)||(10695265-10695493)
chr4 (1-230)||(16316954-16317183)
chr4 (1-230)||(16304730-16304959)
chr4 (1-207)||(3370337-3370544)
chr4 (1-207)||(3390077-3390284)
chr4 (1-230)||(5872995-5873223)
chr4 (1-230)||(14836509-14836738)
chr4 (2-230)||(4986817-4987045)
chr4 (1-230)||(15207794-15208023)
chr4 (1-230)||(10300157-10300387)
chr4 (1-230)||(19580864-19581093)
chr4 (1-171)||(25008519-25008689)
chr4 (1-207)||(11535467-11535674)
chr4 (1-158)||(47152528-47152684)
chr4 (1-137)||(19143504-19143640)
chr4 (1-207)||(11514657-11514864)
chr4 (1-185)||(24713050-24713234)
chr4 (1-207)||(31267222-31267429)
chr4 (1-196)||(49002422-49002617)
chr4 (1-196)||(55650946-55651141)
chr4 (1-91)||(8183486-8183576)
chr4 (1-194)||(19241641-19241838)
chr4 (1-97)||(10290248-10290345)
chr4 (1-72)||(19570640-19570711)
chr4 (1-158)||(16819825-16819986)
chr4 (1-158)||(23508765-23508926)
chr4 (1-158)||(14711253-14711416)
chr4 (1-158)||(14778917-14779080)
chr4 (1-194)||(18775123-18775320)
chr4 (1-156)||(36210587-36210747)
chr4 (1-194)||(18007529-18007726)
chr4 (1-53)||(9920958-9921010)
chr4 (1-52)||(28050187-28050238)
chr4 (1-52)||(49509601-49509652)
chr4 (1-192)||(33377801-33377997)
chr4 (1-52)||(17199074-17199125)
chr4 (2-48)||(17527016-17527063)
chr4 (81-158)||(17994267-17994343)
chr4 (1-69)||(39532269-39532339)
chr4 (42-136)||(8997740-8997831)
chr4 (99-158)||(18773578-18773637)
chr4 (15-69)||(19052749-19052803)
chr4 (156-230)||(4987052-4987126)
chr4 (1-73)||(18775559-18775637)
chr4 (1-69)||(7221937-7222007)
chr4 (95-194)||(19889508-19889608)
chr4 (1-49)||(19889651-19889699)
chr4 (146-230)||(23508884-23508968)
chr4 (15-69)||(13977914-13977968)
chr4 (156-207)||(39532226-39532277)
chr4 (129-194)||(1671908-1671974)
chr4 (99-156)||(1671908-1671966)
chr4 (1-43)||(8686121-8686163)
chr4 (1-39)||(18775930-18775968)
chr4 (99-196)||(32491346-32491444)
chr4 (1-69)||(32491438-32491508)
chr4 (99-183)||(9266769-9266854)
chr4 (115-187)||(14154528-14154601)
chr4 (99-230)||(7222001-7222132)
chr4 (95-194)||(16325024-16325124)
chr4 (1-49)||(16325167-16325215)
chr4 (146-194)||(16819819-16819867)
chr4 (1-69)||(24619110-24619181)
chr4 (99-154)||(24619175-24619231)
[»] chr1 (110 HSPs)
chr1 (1-230)||(51629632-51629863)
chr1 (1-230)||(51656893-51657124)
chr1 (1-230)||(4177448-4177677)
chr1 (1-230)||(35012461-35012690)
chr1 (1-230)||(5640155-5640384)
chr1 (1-230)||(12898426-12898655)
chr1 (1-230)||(21863194-21863423)
chr1 (1-230)||(33084094-33084324)
chr1 (1-230)||(5650712-5650941)
chr1 (1-230)||(10998229-10998458)
chr1 (1-230)||(12730080-12730309)
chr1 (1-230)||(12740673-12740902)
chr1 (1-230)||(19178492-19178721)
chr1 (1-230)||(19187371-19187600)
chr1 (1-230)||(35404837-35405068)
chr1 (1-230)||(35649136-35649367)
chr1 (1-230)||(38094607-38094838)
chr1 (1-230)||(38105232-38105463)
chr1 (1-230)||(7689904-7690136)
chr1 (1-230)||(12614761-12614990)
chr1 (1-230)||(12624226-12624455)
chr1 (1-230)||(5832750-5832980)
chr1 (1-230)||(5843352-5843582)
chr1 (1-230)||(7506833-7507064)
chr1 (1-230)||(7517430-7517661)
chr1 (1-230)||(36236874-36237105)
chr1 (1-230)||(36247421-36247652)
chr1 (1-230)||(21877299-21877529)
chr1 (1-230)||(3171154-3171384)
chr1 (1-230)||(3181756-3181986)
chr1 (1-230)||(47608376-47608606)
chr1 (1-230)||(47618984-47619214)
chr1 (1-230)||(35638484-35638712)
chr1 (1-230)||(2538068-2538298)
chr1 (1-230)||(5973291-5973520)
chr1 (1-230)||(154733-154963)
chr1 (1-230)||(20441761-20441990)
chr1 (1-230)||(4251009-4251242)
chr1 (17-230)||(148658-148872)
chr1 (1-230)||(7677377-7677606)
chr1 (1-207)||(17956771-17956978)
chr1 (1-230)||(18382348-18382577)
chr1 (1-230)||(39586504-39586732)
chr1 (81-230)||(4166872-4167021)
chr1 (1-230)||(39194538-39194769)
chr1 (1-230)||(12944741-12944971)
chr1 (1-155)||(23580816-23580970)
chr1 (1-196)||(20196171-20196367)
chr1 (1-207)||(11195536-11195744)
chr1 (1-139)||(9050994-9051132)
chr1 (1-184)||(47194736-47194919)
chr1 (1-194)||(14388608-14388804)
chr1 (1-194)||(18311454-18311649)
chr1 (1-230)||(22610420-22610653)
chr1 (1-196)||(674978-675173)
chr1 (1-194)||(41133100-41133293)
chr1 (102-230)||(47194896-47195024)
chr1 (1-92)||(16710366-16710457)
chr1 (1-158)||(46181367-46181529)
chr1 (1-194)||(5929106-5929302)
chr1 (1-73)||(4717664-4717736)
chr1 (1-194)||(28379389-28379588)
chr1 (4-158)||(28473660-28473818)
chr1 (1-194)||(22018727-22018925)
chr1 (1-194)||(23926458-23926657)
chr1 (1-158)||(45071117-45071278)
chr1 (1-184)||(22642259-22642448)
chr1 (127-230)||(9050932-9051036)
chr1 (1-156)||(20251200-20251361)
chr1 (1-194)||(26548744-26548942)
chr1 (1-194)||(19170813-19171011)
chr1 (143-230)||(23580771-23580857)
chr1 (99-161)||(19965763-19965825)
chr1 (43-158)||(20884370-20884483)
chr1 (1-192)||(17370437-17370633)
chr1 (1-53)||(25218042-25218094)
chr1 (14-194)||(34256004-34256188)
chr1 (1-53)||(36551159-36551211)
chr1 (1-52)||(13223586-13223637)
chr1 (1-52)||(24049120-24049171)
chr1 (1-52)||(36100073-36100124)
chr1 (1-50)||(9749843-9749892)
chr1 (94-194)||(19037499-19037600)
chr1 (99-194)||(22642392-22642488)
chr1 (5-158)||(44200443-44200604)
chr1 (81-158)||(52351174-52351250)
chr1 (127-230)||(46181325-46181429)
chr1 (99-157)||(9346299-9346358)
chr1 (99-157)||(16233624-16233683)
chr1 (1-48)||(23975486-23975533)
chr1 (99-156)||(21543566-21543624)
chr1 (1-43)||(22202376-22202418)
chr1 (14-139)||(7745595-7745721)
chr1 (95-194)||(17025451-17025551)
chr1 (146-230)||(20867299-20867383)
chr1 (1-43)||(21541200-21541243)
chr1 (1-39)||(19037403-19037441)
chr1 (117-158)||(20867341-20867383)
chr1 (1-39)||(23058990-23059028)
chr1 (99-156)||(26280547-26280605)
chr1 (99-187)||(7309312-7309401)
chr1 (101-153)||(22639779-22639832)
chr1 (114-194)||(22654989-22655070)
chr1 (95-158)||(18130506-18130570)
chr1 (1-49)||(18614313-18614361)
chr1 (146-230)||(20884328-20884412)
chr1 (1-49)||(22601219-22601267)
chr1 (101-196)||(26280537-26280633)
chr1 (127-194)||(28473756-28473824)
chr1 (1-48)||(31358761-31358809)
[»] chr8 (100 HSPs)
chr8 (1-230)||(6318951-6319180)
chr8 (1-230)||(26110847-26111076)
chr8 (1-230)||(9856912-9857141)
chr8 (1-230)||(43247941-43248170)
chr8 (1-230)||(3220248-3220477)
chr8 (1-230)||(18448986-18449215)
chr8 (1-230)||(19128364-19128593)
chr8 (1-230)||(32078131-32078360)
chr8 (1-230)||(32088704-32088933)
chr8 (1-230)||(36292535-36292766)
chr8 (1-230)||(36303138-36303369)
chr8 (1-230)||(6150685-6150913)
chr8 (1-230)||(6160640-6160868)
chr8 (1-230)||(241438-241669)
chr8 (1-230)||(252023-252254)
chr8 (1-230)||(794793-795024)
chr8 (1-230)||(849402-849633)
chr8 (1-230)||(3349062-3349292)
chr8 (1-230)||(3359659-3359889)
chr8 (1-230)||(9340759-9340989)
chr8 (1-230)||(9367903-9368133)
chr8 (1-230)||(44480706-44480936)
chr8 (1-230)||(44491322-44491552)
chr8 (1-230)||(26120522-26120754)
chr8 (1-230)||(31214628-31214857)
chr8 (1-230)||(210588-210819)
chr8 (1-230)||(724211-724442)
chr8 (1-230)||(29076346-29076576)
chr8 (1-230)||(29086597-29086827)
chr8 (1-230)||(36077552-36077782)
chr8 (1-230)||(36088138-36088368)
chr8 (1-230)||(15791734-15791964)
chr8 (1-230)||(19138896-19139125)
chr8 (1-230)||(20161666-20161895)
chr8 (1-230)||(13689003-13689234)
chr8 (1-230)||(23469896-23470125)
chr8 (1-230)||(15781145-15781375)
chr8 (1-230)||(19224550-19224779)
chr8 (1-230)||(19417967-19418197)
chr8 (1-230)||(19428542-19428772)
chr8 (1-230)||(16746616-16746845)
chr8 (1-230)||(30315131-30315365)
chr8 (1-230)||(18153353-18153582)
chr8 (1-230)||(40213603-40213833)
chr8 (1-230)||(18157872-18158101)
chr8 (1-230)||(18769572-18769802)
chr8 (1-159)||(13697185-13697345)
chr8 (1-139)||(20195601-20195739)
chr8 (1-230)||(22167459-22167692)
chr8 (1-230)||(22136294-22136527)
chr8 (1-196)||(3843137-3843332)
chr8 (1-196)||(20260088-20260283)
chr8 (1-196)||(21046718-21046913)
chr8 (1-174)||(23363743-23363920)
chr8 (1-188)||(7018894-7019085)
chr8 (1-73)||(15998808-15998880)
chr8 (1-73)||(23270531-23270603)
chr8 (1-70)||(26735573-26735642)
chr8 (1-156)||(19460608-19460767)
chr8 (1-156)||(19558286-19558445)
chr8 (1-156)||(23271689-23271848)
chr8 (127-230)||(20195697-20195801)
chr8 (1-79)||(23290516-23290593)
chr8 (1-156)||(29378996-29379157)
chr8 (1-158)||(22211869-22212030)
chr8 (1-194)||(17519623-17519820)
chr8 (1-194)||(40002615-40002814)
chr8 (99-194)||(7018854-7018954)
chr8 (1-158)||(8031444-8031608)
chr8 (1-194)||(28902857-28903054)
chr8 (14-196)||(45568479-45568666)
chr8 (14-194)||(21287805-21287990)
chr8 (1-48)||(12541071-12541118)
chr8 (99-194)||(21298504-21298600)
chr8 (1-69)||(24498761-24498832)
chr8 (99-156)||(21540474-21540532)
chr8 (104-157)||(24678970-24679024)
chr8 (1-49)||(16376048-16376096)
chr8 (95-194)||(18557517-18557617)
chr8 (1-69)||(24634774-24634847)
chr8 (1-69)||(1210399-1210469)
chr8 (115-196)||(15934195-15934277)
chr8 (1-43)||(15934381-15934423)
chr8 (1-39)||(15969520-15969558)
chr8 (3-69)||(17687410-17687479)
chr8 (99-148)||(17879155-17879205)
chr8 (1-43)||(19153422-19153464)
chr8 (16-69)||(23433607-23433660)
chr8 (1-43)||(43644286-43644328)
chr8 (2-43)||(19706906-19706947)
chr8 (2-43)||(19942626-19942667)
chr8 (14-70)||(29772215-29772272)
chr8 (99-196)||(1210305-1210405)
chr8 (1-49)||(17928477-17928525)
chr8 (1-49)||(18557440-18557487)
chr8 (99-194)||(21540444-21540540)
chr8 (146-194)||(22211863-22211911)
chr8 (1-49)||(24679101-24679149)
chr8 (101-157)||(27739408-27739464)
chr8 (15-43)||(45539155-45539183)
[»] chr2 (90 HSPs)
chr2 (1-230)||(9763188-9763417)
chr2 (1-230)||(16768522-16768751)
chr2 (1-230)||(30489244-30489473)
chr2 (1-230)||(43082233-43082462)
chr2 (1-230)||(1099615-1099844)
chr2 (1-230)||(4099393-4099622)
chr2 (1-230)||(4209468-4209697)
chr2 (1-230)||(7006227-7006456)
chr2 (1-230)||(9773724-9773953)
chr2 (1-230)||(11389229-11389458)
chr2 (1-230)||(22915284-22915513)
chr2 (1-230)||(22960752-22960981)
chr2 (1-230)||(24328154-24328383)
chr2 (1-230)||(24338824-24339053)
chr2 (1-230)||(43092842-43093071)
chr2 (1-230)||(4220060-4220289)
chr2 (1-230)||(17857857-17858086)
chr2 (1-230)||(40250772-40251001)
chr2 (1-230)||(11395592-11395823)
chr2 (1-230)||(11405908-11406139)
chr2 (1-230)||(18393057-18393288)
chr2 (1-230)||(29243801-29244030)
chr2 (1-230)||(29254380-29254609)
chr2 (1-230)||(34790637-34790866)
chr2 (1-230)||(34804780-34805009)
chr2 (1-230)||(40221911-40222140)
chr2 (1-230)||(10266572-10266802)
chr2 (1-230)||(10277149-10277379)
chr2 (1-230)||(32217451-32217682)
chr2 (1-230)||(34477507-34477737)
chr2 (1-230)||(36252264-36252493)
chr2 (1-230)||(35263169-35263399)
chr2 (1-230)||(35273794-35274024)
chr2 (1-230)||(39170515-39170745)
chr2 (1-230)||(27220959-27221189)
chr2 (1-228)||(9897996-9898226)
chr2 (1-228)||(9908584-9908814)
chr2 (1-230)||(35252560-35252790)
chr2 (1-230)||(43344986-43345216)
chr2 (1-230)||(43354601-43354831)
chr2 (1-230)||(28732322-28732551)
chr2 (1-230)||(2561067-2561296)
chr2 (1-230)||(24428006-24428235)
chr2 (1-230)||(18769325-18769553)
chr2 (1-230)||(24415441-24415670)
chr2 (1-230)||(28721736-28721965)
chr2 (1-230)||(21172886-21173117)
chr2 (1-230)||(26866651-26866880)
chr2 (1-230)||(26879240-26879469)
chr2 (1-180)||(21650975-21651155)
chr2 (1-207)||(38586530-38586738)
chr2 (1-207)||(27978825-27979031)
chr2 (1-207)||(28065354-28065560)
chr2 (1-207)||(36785242-36785450)
chr2 (1-196)||(967958-968154)
chr2 (1-196)||(22763229-22763428)
chr2 (1-196)||(22773933-22774132)
chr2 (1-196)||(17970724-17970919)
chr2 (1-196)||(24274604-24274799)
chr2 (1-195)||(1041727-1041922)
chr2 (1-230)||(19355894-19356127)
chr2 (1-109)||(30794388-30794497)
chr2 (1-156)||(19302918-19303077)
chr2 (1-156)||(19498457-19498616)
chr2 (1-158)||(19313482-19313643)
chr2 (1-194)||(23393179-23393376)
chr2 (1-158)||(38033296-38033458)
chr2 (1-194)||(20647068-20647265)
chr2 (1-194)||(24802059-24802257)
chr2 (1-158)||(22754891-22755054)
chr2 (1-194)||(24815026-24815224)
chr2 (14-194)||(1083418-1083603)
chr2 (102-187)||(16587510-16587596)
chr2 (81-156)||(19300477-19300551)
chr2 (1-48)||(22682823-22682871)
chr2 (1-48)||(14794452-14794498)
chr2 (1-48)||(19321021-19321068)
chr2 (99-157)||(21845679-21845738)
chr2 (99-196)||(21911374-21911473)
chr2 (1-74)||(38040538-38040617)
chr2 (1-39)||(22615277-22615315)
chr2 (1-49)||(21845554-21845602)
chr2 (95-194)||(22382968-22383068)
chr2 (144-183)||(21548821-21548860)
chr2 (1-43)||(24851329-24851371)
chr2 (1-69)||(27766146-27766213)
chr2 (15-51)||(8685027-8685062)
chr2 (1-49)||(24843597-24843645)
chr2 (1-49)||(25918172-25918220)
chr2 (12-44)||(40331191-40331223)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (1-230)||(2276-2505)
[»] scaffold0386 (1 HSPs)
scaffold0386 (1-230)||(11943-12172)
[»] chr7 (112 HSPs)
chr7 (1-230)||(166484-166713)
chr7 (1-230)||(177076-177305)
chr7 (1-230)||(9084873-9085102)
chr7 (1-230)||(9094587-9094816)
chr7 (1-230)||(21003490-21003719)
chr7 (1-230)||(48710973-48711202)
chr7 (1-230)||(6867707-6867936)
chr7 (1-230)||(6878339-6878568)
chr7 (1-230)||(9432853-9433082)
chr7 (1-230)||(20989242-20989471)
chr7 (1-230)||(26653807-26654036)
chr7 (1-230)||(26700136-26700365)
chr7 (1-230)||(37343789-37344018)
chr7 (1-230)||(2706094-2706325)
chr7 (1-230)||(26390578-26390809)
chr7 (1-230)||(26401220-26401451)
chr7 (1-230)||(26294511-26294741)
chr7 (1-230)||(468063-468292)
chr7 (1-230)||(5685108-5685337)
chr7 (1-230)||(22099327-22099556)
chr7 (1-230)||(17961206-17961437)
chr7 (1-230)||(24734340-24734571)
chr7 (1-230)||(24744287-24744518)
chr7 (1-230)||(40042590-40042821)
chr7 (1-230)||(40053139-40053370)
chr7 (1-230)||(8627536-8627767)
chr7 (1-230)||(14746151-14746381)
chr7 (1-230)||(24931085-24931315)
chr7 (1-230)||(9443449-9443678)
chr7 (1-230)||(22088712-22088941)
chr7 (1-230)||(1987128-1987358)
chr7 (1-230)||(1997749-1997979)
chr7 (1-230)||(2716698-2716929)
chr7 (1-230)||(11004773-11005003)
chr7 (1-230)||(17950600-17950831)
chr7 (1-230)||(42865415-42865645)
chr7 (1-230)||(42876041-42876271)
chr7 (1-230)||(8616974-8617204)
chr7 (1-230)||(588802-589031)
chr7 (1-230)||(4222196-4222426)
chr7 (1-230)||(1367219-1367448)
chr7 (1-230)||(3165324-3165553)
chr7 (1-230)||(8002547-8002777)
chr7 (1-230)||(8013192-8013422)
chr7 (1-230)||(15888810-15889039)
chr7 (1-230)||(20490596-20490825)
chr7 (1-230)||(21770424-21770653)
chr7 (1-230)||(31116992-31117221)
chr7 (2-230)||(30049110-30049338)
chr7 (1-230)||(9159320-9159549)
chr7 (1-230)||(9169775-9170004)
chr7 (1-207)||(40055258-40055464)
chr7 (82-230)||(455281-455429)
chr7 (1-207)||(17064034-17064241)
chr7 (1-158)||(4211627-4211785)
chr7 (1-204)||(38403719-38403924)
chr7 (1-155)||(540702-540857)
chr7 (1-194)||(48381774-48381969)
chr7 (1-139)||(44280113-44280251)
chr7 (102-230)||(11095744-11095872)
chr7 (1-207)||(18418702-18418909)
chr7 (1-207)||(18440783-18440990)
chr7 (1-230)||(3476823-3477052)
chr7 (1-196)||(8933152-8933347)
chr7 (1-139)||(38594256-38594393)
chr7 (1-194)||(29589576-29589773)
chr7 (1-196)||(12734681-12734876)
chr7 (1-196)||(15215904-15216100)
chr7 (1-196)||(13681909-13682103)
chr7 (1-196)||(26210065-26210260)
chr7 (1-194)||(8999458-8999657)
chr7 (1-158)||(24882945-24883106)
chr7 (1-91)||(25212471-25212561)
chr7 (1-73)||(19986159-19986231)
chr7 (1-71)||(20967258-20967328)
chr7 (1-86)||(457618-457703)
chr7 (127-230)||(540798-540903)
chr7 (1-194)||(11087568-11087766)
chr7 (127-230)||(44280209-44280313)
chr7 (127-230)||(4211724-4211827)
chr7 (14-194)||(4412532-4412717)
chr7 (1-194)||(13175129-13175327)
chr7 (1-61)||(1878923-1878985)
chr7 (14-194)||(4433105-4433290)
chr7 (1-69)||(11015393-11015463)
chr7 (127-207)||(38594217-38594298)
chr7 (99-196)||(23125439-23125537)
chr7 (1-48)||(11572876-11572924)
chr7 (1-69)||(12223090-12223161)
chr7 (99-158)||(16308289-16308349)
chr7 (127-230)||(24882903-24883007)
chr7 (1-44)||(19711733-19711776)
chr7 (1-38)||(6044957-6044994)
chr7 (99-183)||(9802671-9802756)
chr7 (1-48)||(2501662-2501710)
chr7 (1-49)||(7488620-7488668)
chr7 (1-61)||(10257765-10257828)
chr7 (14-188)||(602171-602348)
chr7 (1-69)||(16105624-16105694)
chr7 (1-43)||(4820879-4820921)
chr7 (99-196)||(11572762-11572860)
chr7 (1-43)||(13259125-13259167)
chr7 (1-43)||(13261338-13261380)
chr7 (1-43)||(13266465-13266507)
chr7 (6-44)||(15087949-15087987)
chr7 (94-194)||(13172922-13173023)
chr7 (129-184)||(9802671-9802727)
chr7 (12-44)||(12175059-12175091)
chr7 (1-49)||(16308426-16308474)
chr7 (1-49)||(16411401-16411449)
chr7 (1-48)||(16464416-16464461)
chr7 (99-158)||(20094640-20094700)
[»] scaffold0133 (2 HSPs)
scaffold0133 (1-230)||(30716-30947)
scaffold0133 (1-230)||(42961-43195)
[»] scaffold0047 (2 HSPs)
scaffold0047 (1-230)||(40894-41123)
scaffold0047 (1-230)||(33343-33572)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (1-230)||(7325-7554)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (1-230)||(7283-7512)
[»] scaffold0105 (2 HSPs)
scaffold0105 (1-230)||(7545-7776)
scaffold0105 (1-230)||(37399-37630)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (1-230)||(37175-37404)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (1-230)||(14169-14398)
scaffold0028 (1-230)||(54564-54793)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (1-230)||(11047-11276)
scaffold0068 (1-230)||(8200-8436)
[»] scaffold0391 (1 HSPs)
scaffold0391 (1-230)||(2659-2889)
[»] scaffold0407 (1 HSPs)
scaffold0407 (1-207)||(12581-12789)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (1-207)||(40086-40293)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (1-230)||(1579-1808)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (1-230)||(35120-35352)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (1-207)||(4881-5087)
[»] scaffold0084 (2 HSPs)
scaffold0084 (1-207)||(57247-57455)
scaffold0084 (99-142)||(927-970)
[»] scaffold0497 (1 HSPs)
scaffold0497 (1-207)||(10752-10959)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (1-196)||(15312-15508)
[»] scaffold0163 (1 HSPs)
scaffold0163 (1-230)||(29055-29287)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (1-196)||(127227-127427)
scaffold0012 (5-194)||(16190-16384)
[»] scaffold0570 (2 HSPs)
scaffold0570 (1-161)||(1-162)
scaffold0570 (1-192)||(2192-2387)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (1-99)||(23357-23455)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (1-119)||(1-118)
[»] scaffold0627 (1 HSPs)
scaffold0627 (1-90)||(8650-8739)
[»] scaffold0017 (4 HSPs)
scaffold0017 (1-194)||(59374-59571)
scaffold0017 (1-194)||(40828-41027)
scaffold0017 (1-109)||(174965-175074)
scaffold0017 (156-230)||(175062-175136)
[»] scaffold0099 (2 HSPs)
scaffold0099 (13-230)||(18807-19038)
scaffold0099 (1-230)||(17397-17644)
[»] scaffold1200 (1 HSPs)
scaffold1200 (1-87)||(1-87)
[»] scaffold2071 (2 HSPs)
scaffold2071 (1-158)||(955-1116)
scaffold2071 (146-230)||(913-997)
[»] scaffold0544 (2 HSPs)
scaffold0544 (1-158)||(10275-10436)
scaffold0544 (146-230)||(10233-10317)
[»] scaffold0443 (2 HSPs)
scaffold0443 (1-158)||(1525-1686)
scaffold0443 (127-194)||(1519-1587)
[»] scaffold0002 (3 HSPs)
scaffold0002 (1-69)||(100204-100272)
scaffold0002 (1-192)||(475770-475966)
scaffold0002 (1-192)||(482290-482486)
[»] scaffold0185 (1 HSPs)
scaffold0185 (1-194)||(32387-32586)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (1-158)||(328-489)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (1-68)||(155682-155749)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (1-158)||(60650-60813)
[»] scaffold0073 (2 HSPs)
scaffold0073 (1-158)||(57946-58107)
scaffold0073 (146-230)||(58065-58149)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (1-158)||(29282-29443)
scaffold0001 (146-230)||(29240-29324)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (1-194)||(61127-61327)
[»] scaffold1409 (1 HSPs)
scaffold1409 (1-60)||(1797-1856)
[»] scaffold0655 (1 HSPs)
scaffold0655 (1-194)||(4513-4712)
[»] scaffold0738 (1 HSPs)
scaffold0738 (1-142)||(5331-5475)
[»] scaffold0194 (1 HSPs)
scaffold0194 (5-61)||(4437-4493)
[»] scaffold1263 (1 HSPs)
scaffold1263 (1-194)||(1645-1843)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (1-194)||(20890-21088)
[»] scaffold0289 (1 HSPs)
scaffold0289 (1-52)||(4313-4364)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (2-153)||(38487-38641)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (1-156)||(256-415)
scaffold0090 (1-156)||(4636-4795)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (1-52)||(61136-61187)
[»] scaffold1321 (1 HSPs)
scaffold1321 (1-194)||(1452-1650)
[»] scaffold0414 (1 HSPs)
scaffold0414 (1-51)||(1474-1524)
[»] scaffold0752 (1 HSPs)
scaffold0752 (1-158)||(815-976)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (16-196)||(165146-165331)
scaffold0011 (102-194)||(59060-59153)
[»] scaffold0349 (2 HSPs)
scaffold0349 (14-139)||(13938-14068)
scaffold0349 (127-184)||(14026-14084)
[»] scaffold0207 (5 HSPs)
scaffold0207 (1-184)||(19959-20147)
scaffold0207 (101-193)||(20123-20216)
scaffold0207 (129-194)||(10250-10316)
scaffold0207 (99-156)||(10250-10308)
scaffold0207 (99-156)||(20151-20209)
[»] scaffold0050 (2 HSPs)
scaffold0050 (2-184)||(35015-35201)
scaffold0050 (99-194)||(35145-35241)
[»] scaffold0422 (2 HSPs)
scaffold0422 (1-184)||(11128-11315)
scaffold0422 (99-194)||(11259-11355)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (99-194)||(6970-7066)
scaffold0018 (1-184)||(7010-7198)
[»] scaffold0382 (1 HSPs)
scaffold0382 (1-74)||(1882-1961)
[»] scaffold0211 (2 HSPs)
scaffold0211 (99-156)||(1-59)
scaffold0211 (14-186)||(1-178)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (16-156)||(2338-2483)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (99-194)||(4415-4511)
[»] scaffold0771 (1 HSPs)
scaffold0771 (1-125)||(5799-5927)
[»] scaffold0311 (1 HSPs)
scaffold0311 (1-49)||(19475-19523)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (99-156)||(38609-38667)
scaffold0132 (101-194)||(38601-38695)
[»] scaffold0878 (1 HSPs)
scaffold0878 (134-171)||(4829-4866)
[»] scaffold0622 (2 HSPs)
scaffold0622 (99-194)||(3914-4011)
scaffold0622 (1-49)||(4027-4075)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (99-194)||(4528-4625)
scaffold0040 (99-138)||(8279-8318)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (80-158)||(59775-59852)
[»] scaffold1507 (1 HSPs)
scaffold1507 (1-43)||(20-63)
[»] scaffold1281 (1 HSPs)
scaffold1281 (1-43)||(2056-2098)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (2-69)||(9630-9699)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (99-156)||(9497-9557)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (1-74)||(16363-16442)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (1-43)||(378218-378260)
scaffold0004 (1-49)||(87807-87855)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (1-34)||(52370-52403)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (105-156)||(22546-22598)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (101-196)||(13542-13638)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (1-49)||(76643-76691)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (1-49)||(113-161)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 174)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 6490979 - 6490750
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
6490979 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactg 6490880  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
6490879 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 6490780  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
6490779 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 6490750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 6501633 - 6501404
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
6501633 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactg 6501534  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
6501533 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 6501434  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
6501433 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 6501404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 9994523 - 9994294
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
9994523 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactg 9994424  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
9994423 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 9994324  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
9994323 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 9994294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 9982515 - 9982286
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
9982515 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcataaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactg 9982416  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
9982415 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 9982316  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
9982315 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 9982286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 12238243 - 12238014
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
12238243 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactg 12238144  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
12238143 ctcaagaacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 12238044  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
12238043 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 12238014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 12250069 - 12249840
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
12250069 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactg 12249970  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
12249969 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttataatcaaacaaaaata 12249870  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
12249869 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 12249840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 39673513 - 39673284
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
39673513 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttcacaaaaatg 39673414  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
39673413 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaata 39673314  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
39673313 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 39673284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 13557179 - 13557408
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
13557179 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 13557278  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
13557279 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 13557378  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
13557379 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 13557408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 19777990 - 19778219
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
19777990 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 19778089  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
19778090 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 19778189  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
19778190 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 19778219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 19788627 - 19788856
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
19788627 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 19788726  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
19788727 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 19788826  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
19788827 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 19788856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 23756903 - 23757132
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
23756903 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 23757002  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
23757003 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 23757102  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
23757103 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 23757132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 23767499 - 23767728
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
23767499 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 23767598  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
23767599 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 23767698  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
23767699 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 23767728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 6181158 - 6180929
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
6181158 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 6181059  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
6181058 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 6180959  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
6180958 cagagaattgagtttgagttgaacacttga 6180929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 6221332 - 6221103
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
6221332 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 6221233  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
6221232 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 6221133  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
6221132 cagagaattgagtttgagttgaacacttga 6221103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 13121267 - 13121496
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
13121267 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 13121366  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
13121367 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 13121466  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
13121467 cagagaattgagtttgaattgaacacttga 13121496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 13131509 - 13131738
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
13131509 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 13131608  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
13131609 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 13131708  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
13131709 cagagaattgagtttgaattgaacacttga 13131738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 14475826 - 14476055
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
14475826 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 14475925  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
14475926 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 14476025  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
14476026 cagagaattgagtttgaattgaacacttga 14476055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 24384151 - 24383920
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
24384151 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 24384052  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
24384051 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 24383952  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
24383951 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 24383920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 4175387 - 4175158
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
4175387 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 4175288  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
4175287 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaata 4175188  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
4175187 cagagaattgagtttgagttgaacacttga 4175158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 5537651 - 5537422
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
5537651 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 5537552  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
5537551 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaacaata 5537452  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
5537451 cagagaattgagtttgaattgaacacttga 5537422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 5548235 - 5548006
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
5548235 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 5548136  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
5548135 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaacaata 5548036  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
5548035 cagagaattgagtttgaattgaacacttga 5548006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 37866050 - 37866279
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
37866050 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 37866149  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
37866150 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaata 37866249  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
37866250 cagagaattgagtttgagttgaacacttga 37866279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 37885183 - 37885412
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
37885183 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 37885282  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
37885283 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaata 37885382  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
37885383 cagagaattgagtttgagttgaacacttga 37885412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 5866328 - 5866097
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
5866328 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 5866229  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
5866228 tgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 5866129  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
5866128 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 5866097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 5876927 - 5876696
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
5876927 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 5876828  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
5876827 tgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 5876728  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
5876727 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 5876696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 20720716 - 20720947
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
20720716 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 20720815  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
20720816 tgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 20720915  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
20720916 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 20720947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 23647353 - 23647583
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-t 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||  |    
23647353 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaat 23647452  T
100 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
23647453 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaat 23647552  T
200 acagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
23647553 acagagaattgagtttgaattgaacacttga 23647583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 20684408 - 20684180
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
20684408 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 20684310  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
20684309 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 20684210  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
20684209 cagagaattgagtttgaattgaacacttga 20684180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 23635314 - 23635543
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
23635314 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaatg 23635413  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
23635414 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaata 23635513  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||    
23635514 caaagaattaagtttgacttgaacacttga 23635543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 504799 - 504569
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
504799 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 504701  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
504700 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 504601  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
504600 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 504569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 527165 - 526935
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
527165 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 527067  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
527066 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 526967  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
526966 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 526935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 4743342 - 4743572
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
4743342 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 4743440  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
4743441 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 4743540  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
4743541 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 4743572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 4753929 - 4754159
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
4753929 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 4754027  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
4754028 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 4754127  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
4754128 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 4754159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 5580266 - 5580035
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
5580266 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 5580167  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
5580166 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaa 5580067  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
5580066 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 5580035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 18483648 - 18483878
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||     
18483648 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacta 18483746  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
18483747 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 18483846  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
18483847 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 18483878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 35186981 - 35187211
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
35186981 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 35187079  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
35187080 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 35187179  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
35187180 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 35187211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 41683282 - 41683512
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
41683282 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 41683380  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
41683381 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 41683480  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
41683481 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 41683512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 41693851 - 41694081
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
41693851 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 41693949  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
41693950 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 41694049  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
41694050 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 41694081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 37759274 - 37759503
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || || | ||||||||||||||| ||    
37759274 gaagtagttcagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactcctcaatactttctaagtgtgagacttcacaaaaatg 37759373  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
37759374 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 37759473  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
37759474 cagagaattgagtttgaattgaacacttga 37759503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 8774261 - 8774491
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
8774261 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 8774359  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
8774360 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 8774459  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
8774460 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 8774491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 10098672 - 10098902
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
10098672 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 10098770  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
10098771 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 10098870  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
10098871 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 10098902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 16385679 - 16385909
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||     
16385679 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacta 16385777  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
16385778 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 16385877  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
16385878 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 16385909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 24659504 - 24659734
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
24659504 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 24659602  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
24659603 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacagaaa 24659702  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
24659703 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 24659734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 24670084 - 24670314
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
24670084 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 24670182  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
24670183 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacagaaa 24670282  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
24670283 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 24670314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 38194328 - 38194558
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
38194328 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 38194426  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
38194427 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 38194526  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
38194527 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 38194558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 39382294 - 39382524
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
39382294 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 39382392  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
39382393 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 39382492  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
39382493 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 39382524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 12297434 - 12297202
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
12297434 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 12297335  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
12297334 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaa 12297235  T
199 tacagagaattgagtttg-acttgaacacttga 230  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
12297234 tacagagaattgagtttgaaattgaacacttga 12297202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 38204863 - 38205094
Alignment:
1 gaagtagtccag-ccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
38204863 gaagtagtccagtccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaact 38204961  T
100 --gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaac 197  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
38204962 atgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 38205061  T
198 atacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
38205062 atacagagaattgagtttgaattgaacacttga 38205094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 5510300 - 5510530
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
5510300 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 5510398  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
5510399 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaa 5510498  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
5510499 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 5510530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 5520478 - 5520708
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
5520478 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 5520576  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
5520577 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaa 5520676  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
5520677 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 5520708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 5628649 - 5628419
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
5628649 gaagtagtccagtcccc-ttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 5628551  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
5628550 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaa 5628451  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
5628450 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 5628419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 11273016 - 11272785
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
11273016 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 11272917  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |    
11272916 tgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcactcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaa 11272817  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
11272816 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 11272785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 13373298 - 13373067
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || || |||||||||||||||||       
13373298 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcagtactttctaagtatgagacttcacaaaaaaa 13373199  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
13373198 tgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 13373099  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
13373098 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 13373067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 13394486 - 13394255
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || || |||||||||||||||||       
13394486 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcagtactttctaagtatgagacttcacaaaaaaa 13394387  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
13394386 tgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 13394287  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
13394286 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 13394255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 39371657 - 39371887
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
39371657 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 39371755  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
39371756 tgctcaagcatacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 39371855  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
39371856 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 39371887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 10627572 - 10627342
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||  ||    
10627572 gaagtagtacagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaacgattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaagatg 10627473  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac-aaacat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
10627472 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaaat 10627373  T
200 acagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
10627372 acagagaattgagtttgacttgaacacttga 10627342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 10655894 - 10655664
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||  ||    
10655894 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaacgattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaagatg 10655795  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac-aaacat 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
10655794 ctcaaacacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaaat 10655695  T
200 acagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
10655694 acagagaattgagtttgacttgaacacttga 10655664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 24707186 - 24706956
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-t 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||  |    
24707186 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttctcaaaaaat 24707087  T
100 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||    
24707086 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagatttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaat 24706987  T
200 acagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||    
24706986 acagtgaattaagtttgacttgaacacttga 24706956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 12287612 - 12287380
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
12287612 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 12287513  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
12287512 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaaccaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaa 12287413  T
199 tacagagaattgagtttg-acttgaacacttga 230  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
12287412 tacagagaattgagtttgaaattgaacacttga 12287380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 28314864 - 28314633
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
28314864 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 28314766  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac-aaac 197  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
28314765 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 28314666  T
198 atacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
28314665 atacagagaattgagtttgaattgaacacttga 28314633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 20673824 - 20673595
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-t 99  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||  |    
20673824 gaagtagtccaatcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaat 20673726  T
100 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
20673725 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagtaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaat 20673626  T
200 acagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
20673625 acagagaattgagtttgaattgaacacttga 20673595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 1795114 - 1794885
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
1795114 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatg 1795015  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
1795014 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaata 1794915  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    || |||| | |||||||||| |||||||||    
1794914 caaagaaataagtttgacttaaacacttga 1794885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 29461843 - 29461614
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
29461843 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataataacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatg 29461744  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
29461743 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaata 29461644  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||||||||    
29461643 caatgaattaagtttgacttgaacacttga 29461614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 29472695 - 29472466
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
29472695 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatg 29472596  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
29472595 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaata 29472496  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||||||||    
29472495 caatgaattaagtttgacttgaacacttga 29472466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 48336846 - 48337075
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
48336846 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatg 48336945  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
48336946 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaata 48337045  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||  ||| | ||||||||||||||||||||    
48337046 caatgaaattagtttgacttgaacacttga 48337075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 13383892 - 13383661
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || || |||||||||||||||||       
13383892 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcagtactttctaagtatgagacttcacaaaaaaa 13383793  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
13383792 tgctcaagcacacaagtaagagtcttccaatgctcaagaactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 13383693  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
13383692 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 13383661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 9391834 - 9391605
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||    
9391834 gaagaagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttctcaaaaatg 9391735  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
9391734 ctcaagcacacacgcaagagtcttcccatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaata 9391635  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||  ||| | ||||||||||||||||||||    
9391634 caatgaaataagtttgacttgaacacttga 9391605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 11163435 - 11163663
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
11163435 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tg 11163533  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
11163534 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaata 11163633  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||| ||| |  |||||||||||||||||||    
11163634 cagggaaatatgtttgacttgaacacttga 11163663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 11217355 - 11217126
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
11217355 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatg 11217256  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
11217255 ctcaagcactcacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaata 11217156  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||  ||| | ||||||||||||||||||||    
11217155 caatgaaataagtttgacttgaacacttga 11217126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19887984 - 19887755
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
19887984 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatg 19887885  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
19887884 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagaatcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaata 19887785  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||  ||| | ||||||||||||||||||||    
19887784 caatgaaataagtttgacttgaacacttga 19887755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 933231 - 933461
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |    
933231 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat 933330  T
100 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||    
933331 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaat 933430  T
200 acagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||  ||| |  |||||||||||||||||||    
933431 acaatgaaataggtttgacttgaacacttga 933461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 28325478 - 28325249
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
28325478 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 28325380  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac-aaac 197  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||     
28325379 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagca--caggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 28325282  T
198 atacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
28325281 atacagagaattgagtttgaattgaacacttga 28325249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 1784701 - 1784472
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
1784701 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcgatactctctaagtatgagacttctcaaaaatg 1784602  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||    
1784601 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgattaaacaaaaata 1784502  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    || |||| | |||||||||| |||||||||    
1784501 caaagaaataagtttgacttaaacacttga 1784472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 9381288 - 9381059
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||  |||| ||    
9381288 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcagtactatctaagtatgagacttcttaaaagtg 9381189  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
9381188 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaata 9381089  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||  ||| | ||||||||||||||||||||    
9381088 caatgaaataagtttgacttgaacacttga 9381059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 11206704 - 11206475
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
11206704 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatg 11206605  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
11206604 ctcaagcacatacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatactcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaata 11206505  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||  ||| | ||||||||||||||||||||    
11206504 caatgaaataagtttgacttgaacacttga 11206475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 7795238 - 7795008
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |    
7795238 gaagtagtccagtcccccttgcacttcgaaggagatttcactataatcacaaagattacacagtgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaat 7795139  T
100 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||    
7795138 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaat 7795039  T
200 acagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||  ||| | ||||||||||||||||||||    
7795038 acaatgaaataagtttgacttgaacacttga 7795008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 7805149 - 7804919
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |    
7805149 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacacagtgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaat 7805050  T
100 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||    
7805049 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaat 7804950  T
200 acagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    | |  ||| | ||||||||||||||||||||    
7804949 ataatgaaataagtttgacttgaacacttga 7804919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 4403878 - 4404104
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
4403878 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tg 4403976  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
4403977 ctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttccaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaata 4404076  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacactt 228  Q
    ||| ||| |  |||||||||||||||||    
4404077 cagggaaatatgtttgacttgaacactt 4404104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 4433365 - 4433591
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
4433365 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tg 4433463  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
4433464 ctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttccaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaata 4433563  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacactt 228  Q
    ||| ||| |  |||||||||||||||||    
4433564 cagggaaatatgtttgacttgaacactt 4433591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 13262303 - 13262097
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
13262303 gaagtagtccagtccccgttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatg 13262204  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||    
13262203 ctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgttcaaacaaaaata 13262104  T
201 cagagaa 207  Q
    |||||||    
13262103 cagagaa 13262097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 17910636 - 17910441
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |    
17910636 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaactgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaat 17910537  T
100 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaa 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
17910536 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaa 17910441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 9535213 - 9535443
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact 99  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||  |||| |    
9535213 gaagtagtccagtcccccttgtacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctaaaaaat 9535312  T
100 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||    
9535313 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcgctaagcaagagtcttctaatgctcaagcatgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaat 9535412  T
200 acagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||  ||| | ||||||||||||||||||||    
9535413 acaatgaaataagtttgacttgaacacttga 9535443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 38314299 - 38314527
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
38314299 gaagtagtccagtcccccttgcagttccaaggagatttcactataaccacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tg 38314397  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
38314398 ctcaagcacacagacaagagtctaccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaata 38314497  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||| ||| |  |||||||||||||||||||    
38314498 cagggaaatatgtttgacttgaacacttga 38314527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 8740755 - 8740527
Alignment:
2 aagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
8740755 aagtagtccagtctcccttgctcttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tg 8740657  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||    
8740656 ctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaaata 8740557  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||||||    |||||||||||||||||||    
8740556 cagagaaaaatgtttgacttgaacacttga 8740527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 14258695 - 14258501
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
14258695 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctgaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tg 14258597  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 196  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
14258596 ctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaggagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaa 14258501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 14322321 - 14322116
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
14322321 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaagagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaactatgagacttctcaaaa-tg 14322223  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||  ||||||||| |||    
14322222 ctcaaccacacaggcaagagtcttctaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgtaggctagaggcttctgttcaaacaaaaata 14322123  T
201 cagagaa 207  Q
    |||||||    
14322122 cagagaa 14322116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 8996588 - 8996381
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |    
8996588 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-t 8996490  T
100 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |    
8996489 gctcaagcacgcaggcaagagttttccaatgctcaagcactaaagcaagagtctactaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaa 8996390  T
199 tacagagaa 207  Q
    |||||||||    
8996389 tacagagaa 8996381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 16076531 - 16076739
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||     
16076531 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa- 16076629  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaac 197  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||     
16076630 tgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaa 16076729  T
198 atacagagaa 207  Q
    ||||||||||    
16076730 atacagagaa 16076739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 9007140 - 9006933
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||| |    
9007140 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctgagtatgagacttctcaaaa-t 9007042  T
100 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |    
9007041 gctcaagcatgcaggcaagagtcttccaatgctcaagctctaaagcaagagtctactaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaa 9006942  T
199 tacagagaa 207  Q
    |||||||||    
9006941 tacagagaa 9006933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 27882986 - 27883193
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |    
27882986 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-t 27883084  T
100 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||  ||||||||| |    
27883085 gctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtctactaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctgttcaaacaaaaa 27883184  T
199 tacagagaa 207  Q
    |||||||||    
27883185 tacagagaa 27883193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 1053311 - 1053505
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagattt-cacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||     
1053311 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa- 1053409  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 193  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
1053410 tgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctaatcaaac 1053505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 13601838 - 13601973
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
13601838 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatg 13601937  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaag 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13601938 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaag 13601973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 29934192 - 29933996
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||      
29934192 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaataatctcacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaa-- 29934095  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 196  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
29934094 tgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgtaggcaagagacttccaatcaaacaaa 29933996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 29983346 - 29983150
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||      
29983346 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaataatctcacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaa-- 29983249  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 196  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
29983248 tgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgtaggcaagagacttccaatcaaacaaa 29983150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 15194670 - 15194516
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |    
15194670 gaagtagtccagtcccccttgcacttcctaggagatttcactataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat 15194571  T
100 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttc 154  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
15194570 gctcaagcacacacacaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttc 15194516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 28168715 - 28168870
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
28168715 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatg 28168814  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttct 155  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||    
28168815 ctcaagcacgcacgcaagagtcttctaatgctcaagcacacaggcaagagacttct 28168870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 17282066 - 17281859
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagattt-cacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||      
17282066 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttctcaaa-- 17281969  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaac 197  Q
    ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||     
17281968 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaa 17281869  T
198 atacagagaa 207  Q
    ||||| ||||    
17281868 atacacagaa 17281859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 8784875 - 8785034
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||      
8784875 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 8784973  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaat 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
8784974 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaat 8785034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 1063740 - 1063934
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagattt-cacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 98  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||     
1063740 gaagttgtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa- 1063838  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 193  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||    
1063839 tgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgtaggcgagaggcttctaatcaaac 1063934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 18857564 - 18857426
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
18857564 gaagtagtccagtcccccttgcacttctaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tg 18857466  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact 140  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
18857465 ctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcact 18857426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 29906813 - 29906617
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||      
29906813 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaataatctcacagattacaaatgttcaatactctctaagtatgagacttcacaaa-- 29906716  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 196  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
29906715 tgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagccctaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagcgacttccaatcaaacaaa 29906617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 29947978 - 29947782
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||      
29947978 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaataatctcacagattacaaatgttcaatactctctaagtatgagacttcacaaa-- 29947881  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 196  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
29947880 tgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagccctaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagcgacttccaatcaaacaaa 29947782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 29997132 - 29996936
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||      
29997132 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaataatctcacagattacaaatgttcaatactctctaagtatgagacttcacaaa-- 29997035  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 196  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
29997034 tgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagccctaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagcgacttccaatcaaacaaa 29996936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 16671766 - 16671586
Alignment:
28 caaggagatttcacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 126  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| | ||| |||||||||||||| || |||| |||||    
16671766 caaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctctaaa-tgctcaagcacacaggcgagagacttcc 16671668  T
127 aatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacatacagagaa 207  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| || || |||| |||||  ||||||||| ||||||||||    
16671667 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacacatgcgagaggcttcttttcaaacaaaaatacagagaa 16671586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 2245965 - 2246162
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||    
2245965 gaagtagtccagtcccccttgtatttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactctcaag-tatgagacttctca 2246063  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 193  Q
    ||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
2246064 aa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaac 2246161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 13199880 - 13199682
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaa 95  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||| |||||||||||||| |||||| || |  ||||||||||| |||    
13199880 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaaaaataatcacacagattacaaatgcttaatactctctag-tatgagacttctcaa 13199782  T
96 aactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 194  Q
    |  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||    
13199781 a--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatcgtcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaaca 13199684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 137 - 230
Target Start/End: Original strand, 14465332 - 14465425
Alignment:
137 cactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacatacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
14465332 cactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttga 14465425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 19121471 - 19121370
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
19121471 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatg 19121372  T
101 ct 102  Q
    ||    
19121371 ct 19121370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 33650805 - 33650901
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 97  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||    
33650805 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaa 33650901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 51989784 - 51989587
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||| | ||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||||||    
51989784 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcatacagattacaactgctcaatactacctag-tatgagacttcaca 51989686  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 193  Q
    ||  |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||   |||| ||||||  |  ||||||||||||||||||||    
51989685 aa--tgctcaagcacacaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctttgctcaagcactaaaacaagagacttctaatcaaac 51989588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 15663370 - 15663180
Alignment:
2 aagtagtccagccccccttgcacttccaaggagattt-cacta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaa 95  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||     |||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| |||    
15663370 aagtagaccagtcccccttgcactttcaaggagattttcactaagagataatcacaaagattacaaatgctcaatactctc-tagtatgagacttctcaa 15663272  T
96 aactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaat 188  Q
    |  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||  | ||||||| ||||||||    
15663271 a--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaat 15663180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 31114625 - 31114428
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||||      
31114625 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacctag-tatgagacttcaat 31114527  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 193  Q
    ||  ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||    
31114526 aa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaac 31114429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 17006590 - 17006788
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcaca 94  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||||    
17006590 gaagtagtctagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaca 17006689  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 193  Q
    ||  ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  | ||||||||||| || ||||||    
17006690 aa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcttatgctcaagcactaaagcaagagacttatattcaaac 17006787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 22150642 - 22150840
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||||    
22150642 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaca 22150741  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 193  Q
    ||  ||||||||||| || | ||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||    
22150742 aa--tgctcaagcacgcaggaaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaac 22150839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 24393452 - 24393356
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 97  Q
    |||||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
24393452 gaagtagtccagtcccccttgcaatacaaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaa 24393356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 143 - 230
Target Start/End: Original strand, 8784989 - 8785076
Alignment:
143 gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacatacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
8784989 gcaagagtcttccaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttga 8785076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Original strand, 11530402 - 11530474
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatact 73  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
11530402 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatact 11530474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 99 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15663240 - 15663108
Alignment:
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaac 197  Q
    |||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |     
15663240 tgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacagaa 15663141  T
198 atacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
     |||| ||||    |||||||||||||||||||    
15663140 ttacacagaaaaatgtttgacttgaacacttga 15663108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 15651736 - 15651545
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagattt-cacta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 94  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||     |||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||    
15651736 gaagtagtctagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaagagataatcacaaagattacaaatgctcaatactctc-tagtatgagacttctca 15651638  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaat 188  Q
    ||  |||||||||||  | || |||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||  | ||||||| ||||||||    
15651637 aa--tgctcaagcacgtaggcgagagacttccaatactcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaaggactaaagcaagagtcttctaat 15651545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 41045138 - 41045337
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcac 93  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | |||||||||||||    
41045138 gaagtagtccaatcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcac 41045237  T
94 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaa 192  Q
    |||  || |||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||   | ||||||||||||||||||||    
41045238 aaa--tgttcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcattaaagcaagagacttctaatcaaa 41045335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 13953659 - 13953857
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcac 93  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||     
13953659 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca- 13953757  T
94 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaa 192  Q
      || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||    
13953758 --aattgctcaagcacacaagcaagagacttcctttgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 13953855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 17017426 - 17017586
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    |||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||||    
17017426 gaagtagtccagtcccccttgtacttccaaggagatttccactaagtttaatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaca 17017525  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 156  Q
    ||  ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
17017526 aa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcta 17017586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 27172465 - 27172622
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta------taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcac 93  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||      |||||||| ||||||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| |    
27172465 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaaatcaataatcacacagattacaactgctcaatactctctag-tatgagacttctc 27172563  T
94 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagactt 153  Q
    |||  ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
27172564 aaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagactt 27172622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 101 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15651603 - 15651473
Alignment:
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacat 199  Q
    |||||||||  | |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |  |    
15651603 ctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaaggactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgtaggcgagagacttctaatcaaacagaatt 15651504  T
200 acagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||| ||||    |||||||||||||||||||    
15651503 acacagaaaaatgtttgacttgaacacttga 15651473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 15832804 - 15833002
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcac 93  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||     
15832804 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca- 15832902  T
94 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaa 192  Q
      || ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |||||    
15832903 --aattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagaactaaagcaagagacttctattcaaa 15833000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 49989657 - 49989855
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcac 93  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| |||||||||||   |  | ||||||||||||     
49989657 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaattgctcaatactgcacctagtatgagacttca- 49989755  T
94 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaa 192  Q
      || ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||    
49989756 --aattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 49989853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 10528770 - 10528931
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcac 93  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||     
10528770 gaagtagtccagtcccccttgaacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcat 10528869  T
94 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 156  Q
    |||  ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
10528870 aaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcta 10528931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 194
Target Start/End: Original strand, 14580752 - 14580937
Alignment:
16 cccttgcacttccaaggagattt-cacta------taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagca 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||      ||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||  ||||||||||    
14580752 cccttgcacttccaaggagattttcactaaatcaataatctcacagattacaactgctcaatactttcaag-tatgagacttctcaaa--tgctcaagca 14580848  T
109 cacacgcaagagtcttcc--aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 194  Q
    | || ||||||| ||||   |||||||||||||  || ||||||||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||||    
14580849 cgcaggcaagagacttctcaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 14580937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 127 - 230
Target Start/End: Original strand, 17961073 - 17961179
Alignment:
127 aatgctcaagcactaa-gcaagagacttct--aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacatacagagaattgagtttgacttgaa 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||| |  ||| ||||||||    
17961073 aatgctcaagcactaaagcaagagacttctcaaatgctcaagcacacaggcaagagacttctattcaaacaaaaatataaagaaattggttggacttgaa 17961172  T
224 cacttga 230  Q
    |||||||    
17961173 cacttga 17961179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 35579053 - 35579002
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 52  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35579053 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 35579002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 13076497 - 13076547
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaca 51  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13076497 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaca 13076547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Original strand, 37412045 - 37412193
Alignment:
14 cccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaag 106  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||   || ||||||||    
37412045 cccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaag 37412141  T
107 cacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaa 157  Q
    |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
37412142 cacacaagcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctaa 37412193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 21735769 - 21735896
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||| ||    
21735769 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacaaattacaactgctcaatactatc-tagtatgagacttccca 21735867  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttc 125  Q
    ||  ||||||||||| || ||||||| ||||    
21735868 aa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttc 21735896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 45862309 - 45862162
Alignment:
14 cccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaag 106  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| |||||||||||   |  | ||||||||||||   || ||||||||    
45862309 cccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactgcacctagtatgagacttca---aattgctcaag 45862213  T
107 cacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 156  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
45862212 cacacaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 45862162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 12753372 - 12753187
Alignment:
14 cccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaag 106  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||   || ||||||||    
12753372 cccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaag 12753276  T
107 cacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 194  Q
    |||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | | ||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||||    
12753275 cacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacacaggaaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 12753187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 207
Target Start/End: Original strand, 28168811 - 28168892
Alignment:
127 aatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacatacagagaa 207  Q
    |||||||||||||  | ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
28168811 aatgctcaagcacgcacgcaagagtcttctaatgctcaagcacacaggcaagagacttctgttcaaacaaaaatacagagaa 28168892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 15848538 - 15848726
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agattacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcac 93  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||||  |  | |||||||||||      
15848538 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaagagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttc-- 15848635  T
94 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttc 184  Q
     ||| ||||||||||| || ||||||| ||||   |||||||||||| |||||||||||||   ||||| ||||||  | ||||||||||||    
15848636 -aaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcttttgctcaagcactaaagcaagagactttctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 15848726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 194
Target Start/End: Original strand, 51340509 - 51340605
Alignment:
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 194  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||  ||||| |||||   | |||||||||||||| |||||||    
51340509 tgctcaagcacacaggcaagagacttcctatgctcaagcattaaagcaagagacttcctatgctcaagcattaaagcaagagacttctattcaaaca 51340605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 27849621 - 27849668
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 48  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27849621 gaagtagtacagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 27849668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 156
Target Start/End: Original strand, 18006023 - 18006081
Alignment:
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 156  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
18006023 tgctcaagcacacaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 18006081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 13147689 - 13147851
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agattacaa-atgctcaatacta-tcaaaatatgagacttca 92  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||||||  ||||||||||||  |  | ||||||||||      
13147689 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaacttgctcaatactacacctagtatgagactt-- 13147786  T
93 caaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 156  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||| ||| |  || ||||||||| ||||||||||||||||    
13147787 caaaattgctcaagcacgcaggcaagagacttactttgatcaagcactaaagcaagagacttcta 13147851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 194
Target Start/End: Original strand, 15848700 - 15848796
Alignment:
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 194  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||  |  ||||||||||||| |||||||    
15848700 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaaacaagagacttctattcaaaca 15848796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 11909789 - 11909606
Alignment:
16 cccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagca 108  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||   || ||||||||||    
11909789 cccttgcacttccaatgagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaagca 11909693  T
109 cacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 194  Q
    |||| ||||||  |||||  ||||||||| |  ||||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||||    
11909692 cacaggcaagaaacttcctttgctcaagcccacaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 11909606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 156 - 194
Target Start/End: Original strand, 21735868 - 21735906
Alignment:
156 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 194  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
21735868 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 21735906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 7608902 - 7608861
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcact 42  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
7608902 gaagtactccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 7608861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 12756103 - 12756018
Alignment:
103 caagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaa 187  Q
    |||||||||| |||||||  || |||||||||| ||| |  | |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||    
12756103 caagcacacaagcaagagattttcaatgctcaatcacaattgaaagagacttccaatgcttaagcacacaagcaagagacttctaa 12756018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 13410800 - 13410752
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 49  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
13410800 gaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 13410752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 4243753 - 4243694
Alignment:
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaa 157  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||  |||||||||||||||||    
4243753 tgcttaagcacacacgcaagagtcttcctatgttcaaccacaaaagcaagagacttctaa 4243694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 49
Target Start/End: Original strand, 6252831 - 6252866
Alignment:
14 cccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 49  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
6252831 cccccttgcacttccaaggagatttcactaaaatca 6252866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 183
Target Start/End: Original strand, 11074019 - 11074058
Alignment:
144 caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagactt 183  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
11074019 caagagacttctattgctcaagcacgcaggcaagagactt 11074058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 13931392 - 13931439
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 48  Q
    |||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||    
13931392 gaagtagtccagtcccctttgcacatctaaggagatttcactataatc 13931439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 143 - 230
Target Start/End: Original strand, 18006038 - 18006124
Alignment:
143 gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacatacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||| | ||||| |||| |  |||||||||||||||||||    
18006038 gcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacacaaataca-agaaattggtttgacttgaacacttga 18006124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 184
Target Start/End: Original strand, 15848670 - 15848756
Alignment:
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttc 184  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||  | ||||||||||||    
15848670 tgctcaagcactaaagcaagagactttctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 15848756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 17769698 - 17769645
Alignment:
19 ttgcacttccaaggaga--tttcactataatcaca-aagattacaaatgctcaa 69  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
17769698 ttgcacttccaaggagatttttcactataatcacacaagattacaattgctcaa 17769645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 19070999 - 19070946
Alignment:
19 ttgcacttccaaggaga--tttcactataatcaca-aagattacaaatgctcaa 69  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
19070999 ttgcacttccaaggagatttttcactataatcacacaagattacaattgctcaa 19070946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 20736662 - 20736609
Alignment:
15 ccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaa 69  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||    
20736662 ccccttgcactttcaagg-gatttcactataacctcaaacattacaaatgctcaa 20736609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 194
Target Start/End: Original strand, 52919976 - 52920026
Alignment:
144 caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 194  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||||    
52919976 caagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttctaatcaaaca 52920026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 4768281 - 4768229
Alignment:
17 ccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-agattacaaatgctcaa 69  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
4768281 ccttgcacttccaag-agatttcactataatctcactagattacaaatgctcaa 4768229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 136
Target Start/End: Original strand, 8710418 - 8710455
Alignment:
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaag 136  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
8710418 tgctcaagcacacaggcaagagacttccaatgctcaag 8710455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 136
Target Start/End: Original strand, 9062305 - 9062342
Alignment:
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaag 136  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
9062305 tgctcaagcacacaggcaagagacttccaatgctcaag 9062342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 13410680 - 13410623
Alignment:
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta-agcaagagacttct 155  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||| ||||||    
13410680 tgctcaagcacaaacgcaagagttttcctatgctcaagcacaagagcaagaaacttct 13410623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 17961006 - 17961043
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagattt 38  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
17961006 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaagaagattt 17961043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 127 - 184
Target Start/End: Original strand, 18005989 - 18006049
Alignment:
127 aatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaa--tgcttaagcacgcaggcaagagacttc 184  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||| |||||| |||||||||||||||    
18005989 aatgctcaagcactaaagcaagagacttctcagatgctcaagcacacaggcaagagacttc 18006049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 104 - 196
Target Start/End: Original strand, 27849689 - 27849782
Alignment:
104 aagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 196  Q
    ||||||| | ||||||| |||| ||| |||||||||  |||||||||| |||  ||||||||||||  |  |||||||||||||| ||||||||    
27849689 aagcacaaaagcaagagacttcaaatactcaagcacacaagcaagagatttcctatgcttaagcacaaaaacaagagacttctaaacaaacaaa 27849782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 6174732 - 6174780
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 49  Q
    |||||||| | | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
6174732 gaagtagttctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 6174780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 184
Target Start/End: Original strand, 8710404 - 8710444
Alignment:
144 caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttc 184  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
8710404 caagagacttctattgctcaagcacacaggcaagagacttc 8710444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 8874737 - 8874693
Alignment:
144 caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaat 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||    
8874737 caagagacttctaatgcttaagcacaactgcaagagacttctaat 8874693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 184
Target Start/End: Original strand, 9062291 - 9062331
Alignment:
144 caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttc 184  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
9062291 caagagacttctattgctcaagcacacaggcaagagacttc 9062331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 11078152 - 11078200
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 49  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
11078152 gaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 11078200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 12410461 - 12410413
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatc 48  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
12410461 gaagtagtccagcttcccttacacttccaaggagattttcactataatc 12410413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 14078077 - 14078029
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 49  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||    
14078077 gaagtagtccactcccccttgcacttcaaaggagagttcactaaaatca 14078029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 194
Target Start/End: Original strand, 16879508 - 16879608
Alignment:
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 193  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||  |||| || ||||||||| ||  ||||||| |||  ||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||    
16879508 aaactactcaagcacaaaagcaagaggtttcctatactcaagcacaaacacaagagagttcctatgcttaagcacaaaagcaagagacttctaaacaaac 16879607  T
194 a 194  Q
    |    
16879608 a 16879608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 22770493 - 22770433
Alignment:
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaat 158  Q
    ||||||||||||   ||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
22770493 tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttctaat 22770433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 46
Target Start/End: Original strand, 50299645 - 50299677
Alignment:
14 cccccttgcacttccaaggagatttcactataa 46  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
50299645 cccccttgcacttccaaggagagttcactataa 50299677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 115)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 26043767 - 26043996
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
26043767 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaagctg 26043866  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
26043867 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 26043966  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
26043967 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 26043996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 9123773 - 9123544
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
9123773 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 9123674  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
9123673 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaata 9123574  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
9123573 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 9123544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 9113136 - 9112907
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
9113136 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaagagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 9113037  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
9113036 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaata 9112937  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
9112936 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 9112907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 32962575 - 32962346
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
32962575 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 32962476  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
32962475 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 32962376  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
32962375 cagagaattgagtttgaattgaacacttga 32962346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 32973195 - 32972965
Alignment:
1 gaagtagtccag-ccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |    
32973195 gaagtagtccagtccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaat 32973096  T
100 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
32973095 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaat 32972996  T
200 acagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
32972995 acagagaattgagtttgaattgaacacttga 32972965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 12854576 - 12854805
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| |||| ||    
12854576 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcagaaaaatg 12854675  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
12854676 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 12854775  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
12854776 cagagaattgagtttgaattgaacacttga 12854805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 12865102 - 12865331
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| |||| ||    
12865102 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcagaaaaatg 12865201  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
12865202 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 12865301  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
12865302 cagagaattgagtttgaattgaacacttga 12865331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 12717479 - 12717248
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
12717479 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 12717380  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
12717379 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 12717280  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
12717279 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 12717248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 12728128 - 12727897
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
12728128 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 12728029  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
12728028 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 12727929  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
12727928 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 12727897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 3671602 - 3671831
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||    
3671602 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatacttcctaagtatgagacttcacaaaaatg 3671701  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
3671702 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacaaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 3671801  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
3671802 cagagaattgagtttgaattgaacacttga 3671831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 27372387 - 27372616
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||  ||    
27372387 gaagtagtccagtcccccttgtacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatctaagtgtgagacttcacaaagatg 27372486  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
27372487 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaata 27372586  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
27372587 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 27372616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 27462737 - 27462966
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||  ||    
27462737 gaagtagtccagtcccccttgtacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatctaagtgtgagacttcacaaagatg 27462836  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
27462837 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaata 27462936  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
27462937 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 27462966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 27505497 - 27505726
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||  ||    
27505497 gaagtagtccagtcccccttgtacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatctaagtgtgagacttcacaaagatg 27505596  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
27505597 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaata 27505696  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
27505697 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 27505726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 2 - 230
Target Start/End: Original strand, 3660939 - 3661167
Alignment:
2 aagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgc 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | || ||||||||||||||||| |||    
3660939 aagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatacttcctaagtatgagacttcacaaaaatgc 3661038  T
102 tcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacatac 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
3661039 tcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacaaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatac 3661138  T
202 agagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
3661139 agagaattgagtttgaattgaacacttga 3661167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 4630425 - 4630655
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
4630425 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 4630523  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
4630524 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 4630623  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
4630624 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 4630655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 16930005 - 16930235
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||     
16930005 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacta 16930103  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
16930104 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 16930203  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
16930204 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 16930235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 17983144 - 17982913
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
17983144 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 17983045  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
17983044 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaa 17982945  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
17982944 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 17982913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 17985353 - 17985122
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
17985353 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 17985254  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
17985253 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaa 17985154  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
17985153 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 17985122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 25985635 - 25985866
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||       
25985635 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaa 25985734  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
25985735 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 25985834  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
25985835 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 25985866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 26025013 - 26025243
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
26025013 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 26025111  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
26025112 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 26025211  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
26025212 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 26025243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 26035587 - 26035817
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
26035587 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 26035685  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
26035686 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 26035785  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
26035786 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 26035817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 27341248 - 27341478
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
27341248 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 27341346  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
27341347 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 27341446  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
27341447 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 27341478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 27401988 - 27402218
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
27401988 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 27402086  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
27402087 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 27402186  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
27402187 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 27402218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 27412647 - 27412877
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
27412647 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 27412745  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
27412746 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 27412845  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
27412846 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 27412877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 31983268 - 31983038
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
31983268 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 31983170  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
31983169 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 31983070  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
31983069 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 31983038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 32301685 - 32301455
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
32301685 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 32301587  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
32301586 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 32301487  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
32301486 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 32301455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 32312374 - 32312144
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
32312374 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 32312276  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
32312275 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 32312176  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
32312175 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 32312144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 34818435 - 34818204
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||       
34818435 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaa 34818336  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
34818335 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 34818236  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
34818235 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 34818204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 34807804 - 34807572
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||       
34807804 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaa 34807705  T
99 -tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaac 197  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
34807704 atgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 34807605  T
198 atacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
34807604 atacagagaattgagtttgaattgaacacttga 34807572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 16959176 - 16959406
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||     
16959176 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaagagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacta 16959274  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
16959275 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 16959374  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
16959375 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 16959406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 26864340 - 26864570
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||||||||     
26864340 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtaagagacttcacaaaacta 26864438  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
26864439 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 26864538  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
26864539 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 26864570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 26874964 - 26875194
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||||||||     
26874964 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtaagagacttcacaaaacta 26875062  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
26875063 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 26875162  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
26875163 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 26875194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 29384306 - 29384536
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
29384306 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 29384404  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
29384405 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaa 29384504  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
29384505 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 29384536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 33198882 - 33199112
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-t 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||  |    
33198882 gaagtagtccagtcccccttgcacttctaaggagatttgactataatcaccaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaat 33198981  T
100 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
33198982 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcatgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaat 33199081  T
200 acagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
33199082 acagagaattgagtttgagttgaacacttga 33199112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 20030545 - 20030316
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
20030545 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatg 20030446  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
20030445 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaata 20030346  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |   ||| | ||||||||||||||||||||    
20030345 ctatgaaataagtttgacttgaacacttga 20030316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 20063296 - 20063067
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
20063296 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatg 20063197  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
20063196 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagtactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctaatcaaacaaaaata 20063097  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |   ||| | ||||||||||||||||||||    
20063096 ctatgaaataagtttgacttgaacacttga 20063067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 25787257 - 25787485
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||    
25787257 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgacacttctcaaaa-tg 25787355  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
25787356 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaata 25787455  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||  ||| | ||||||||||||||||||||    
25787456 caatgaaataagtttgacttgaacacttga 25787485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 28252203 - 28251975
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||    
28252203 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaacaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaagatg 28252104  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||    
28252103 ctcaagcacacacgcaagagacttccactgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatcaaacaaaaata 28252005  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||    
28252004 cagacaattgagtttgacttgaacacttga 28251975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 28357350 - 28357122
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||    
28357350 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaacaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaagatg 28357251  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||    
28357250 ctcaagcacacacgcaagagacttccactgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatcaaacaaaaata 28357152  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||    
28357151 cagacaattgagtttgacttgaacacttga 28357122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 16124177 - 16123971
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
16124177 gaagtagtcaagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatg 16124078  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
16124077 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctaaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctattcaaacaaaaata 16123978  T
201 cagagaa 207  Q
    |||||||    
16123977 cagagaa 16123971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 12827247 - 12827476
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
12827247 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttaactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatg 12827346  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||    
12827347 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaatagtcttctaatgctcaagcacacaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaata 12827446  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||  ||| | ||||||||||||||||||||    
12827447 caatgaaataagtttgacttgaacacttga 12827476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 18926404 - 18926176
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |     
18926404 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaatt- 18926306  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
18926305 ctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaata 18926206  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||  ||| | ||||||||||||||||||||    
18926205 caatgaaataagtttgacttgaacacttga 18926176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 7376400 - 7376170
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |    
7376400 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacgaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat 7376301  T
100 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacat 199  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||    
7376300 gcttaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaat 7376201  T
200 acagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||  ||| | ||||||||||||||||||||    
7376200 acaatgaaataagtttgacttgaacacttga 7376170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 27383988 - 27384217
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagattt-cactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||  |    
27383988 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactataatcaacaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaagat 27384087  T
100 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacat 199  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||  |    
27384088 gctcaagcacacacgcaagagacttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatcaaacaaaagt 27384186  T
200 acagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
27384187 acagacaattgagtttgatttgaacacttga 27384217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 7751878 - 7751647
Alignment:
1 gaagtagtccag-ccccccttgcacttccaaggagattt-cactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||      
7751878 gaagtagtccagtccccccttgcacttccaaagagattttcactataatcaacaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaga 7751779  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||      
7751778 tgctcaagcacacacgcaagagacttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacaaaagcaagagacttctaatcaaacaaaag 7751679  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||    
7751678 tacagacaattgagtttgaattgaacacttga 7751647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 32756955 - 32757159
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| ||||| ||    
32756955 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactct--aagtatgagacttctcaaaaatg 32757052  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||  ||||||||| |||    
32757053 ctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagtacgcagacaagagacttctgttcaaacaaaaata 32757152  T
201 cagagaa 207  Q
    |||||||    
32757153 cagagaa 32757159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 31571969 - 31572198
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact 99  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |    
31571969 gaagtagttcagtcccccttgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttctcaaaa-t 31572067  T
100 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |    
31572068 gctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaaa 31572167  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||||||||    |||||||||||||||||||    
31572168 tacagagaa-aatgtttgacttgaacacttga 31572198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 17746426 - 17746219
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |    
17746426 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-t 17746328  T
100 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |    
17746327 gctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaaa 17746228  T
199 tacagagaa 207  Q
    |||||||||    
17746227 tacagagaa 17746219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 27167084 - 27166877
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |    
27167084 gaagtagtccagtcccccttgcactttcaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-t 27166986  T
100 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |    
27166985 gctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaaa 27166886  T
199 tacagagaa 207  Q
    |||||||||    
27166885 tacagagaa 27166877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 5844640 - 5844847
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |    
5844640 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa-t 5844738  T
100 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||| |||||||||||| |||| |||||  ||||||||| |    
5844739 gctcaagcacgcaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagactctactaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctgttcaaacaaaaa 5844838  T
199 tacagagaa 207  Q
    |||||||||    
5844839 tacagagaa 5844847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 27474372 - 27474559
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagattt-cactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||  |    
27474372 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactataatcaacaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaagat 27474471  T
100 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaat 188  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||    
27474472 gctcaagcacacacgcaagagacttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaat 27474559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 27503870 - 27504057
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagattt-cactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||  |    
27503870 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactataatcaacaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaagat 27503969  T
100 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaat 188  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||    
27503970 gctcaagcacacacgcaagagacttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaat 27504057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 29765090 - 29765297
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact 99  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |    
29765090 gaagtagtccagtcctccttgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-t 29765188  T
100 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |    
29765189 gctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaaa 29765288  T
199 tacagagaa 207  Q
    |||| ||||    
29765289 tacaaagaa 29765297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 10404180 - 10404043
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
10404180 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatg 10404081  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagca 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10404080 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagca 10404043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 18826880 - 18826673
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||| |    
18826880 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagatttctcaaaa-t 18826782  T
100 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||| ||||| | ||||||||  ||||||||| |    
18826781 gctcaagcacacaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatactcaagcacacaggcgacagacttcttttcaaacaaaaa 18826682  T
199 tacagagaa 207  Q
    |||||||||    
18826681 tacagagaa 18826673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 18835275 - 18835068
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |    
18835275 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-t 18835177  T
100 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||  | || |||| |||||  ||||||||| |    
18835176 gctcaagcacacaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacagaagcgagaggcttcttttcaaacaaaaa 18835077  T
199 tacagagaa 207  Q
    |||||||||    
18835076 tacagagaa 18835068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 12353138 - 12353277
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcac-aaaact 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| | |||| |    
12353138 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatt 12353237  T
100 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12353238 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 12353277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 25583467 - 25583600
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
25583467 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 25583566  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctca 134  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
25583567 ctcaagcacacacgcatgagtcttccaatgctca 25583600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 11147832 - 11147708
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||| ||    
11147832 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgcttaatactctctaagtatgagacttcacaaaaatg 11147733  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttc 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
11147732 ctcaagcacacacgcaagagtcttc 11147708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 22308342 - 22308549
Alignment:
2 aagtagtccagccccccttgcacttccaaggagattt-cacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||| |    
22308342 aagtagtccagtcccccttgcacttcgaaggagattttcaataataatctcaaagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttctcaaaa-t 22308440  T
100 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    |||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |    
22308441 gctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcaagcaggcaagaggcttctaatcaaacagaaa 22308540  T
199 tacagagaa 207  Q
    |||| ||||    
22308541 tacacagaa 22308549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 25687395 - 25687196
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||| || ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
25687395 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatc-cacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcaca 25687297  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 193  Q
    ||  ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||  | ||||||| |||||||||||||    
25687296 aa--tgctcaagcactcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatcaaac 25687199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 114 - 230
Target Start/End: Original strand, 27504013 - 27504129
Alignment:
114 gcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacatacagagaattgagt 213  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
27504013 gcaagagacttctaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagacaattgagt 27504112  T
214 ttgacttgaacacttga 230  Q
    |||| ||||||||||||    
27504113 ttgatttgaacacttga 27504129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 25518238 - 25518434
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaa 95  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    |||||||| ||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||| |||    
25518238 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaagagatttccactaaaaataatcacacagattacaactgctcaatactacctag-tatgagacttctcaa 25518336  T
96 aactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta-agcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 194  Q
    |  |||||||| || || |||| || ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
25518337 a--tgctcaagtacgcaggcaaaagactttcaatgctcaagcactacagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaaca 25518434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 11235047 - 11235244
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| | ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||    
11235047 gaagtagtccattcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacaaattacaactgctcaatactatctag-tatgagacttcaca 11235145  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 193  Q
    ||  ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||    
11235146 aa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaac 11235243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 21127628 - 21127825
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||||||    
21127628 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacctag-tatgagacttcaca 21127726  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 193  Q
    ||  ||||||||||| || ||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||    
21127727 aa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctacgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaac 21127824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 7586908 - 7586711
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||  |||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||||||    
7586908 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacactgattacaactgctcaatactacctag-tatgagacttcaca 7586810  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 193  Q
    ||  ||||||||||| || ||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||    
7586809 aa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctacgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaac 7586712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 12416997 - 12416901
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
12416997 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaac 12416901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 31931002 - 31931163
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||    
31931002 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatctag-tatgagacttccca 31931100  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 158  Q
    ||  ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
31931101 aa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 31931163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 114 - 230
Target Start/End: Original strand, 27474515 - 27474630
Alignment:
114 gcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacatacagagaattgagt 213  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
27474515 gcaagagacttctaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatcaaacaaaagtacagacaattgagt 27474613  T
214 ttgacttgaacacttga 230  Q
    |||| ||||||||||||    
27474614 ttgatttgaacacttga 27474630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 17047138 - 17047297
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagattt-cacta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||    
17047138 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaaaaaataatcacacagattacaactgctcaatactatc-aagtatgagacttctca 17047236  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 156  Q
    ||  ||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
17047237 aa--tgctcaagcatgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 17047297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 17742347 - 17742152
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttcc-aaggagatttc-acta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 97  Q
    |||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| ||||     
17742347 gaagtagtccagtcccccttgcactttttaaggagatttccactaataatcgcacagattacaaatgctcaatactctctag-tatgagacttctcaaa- 17742250  T
98 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttc-taatcaaaca 194  Q
     ||||||||||| || ||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
17742249 -tgctcaagcacgcaggcgggagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttcttaatcaaaca 17742152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 18554849 - 18555010
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||    
18554849 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatctag-tatgagacttccca 18554947  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 158  Q
    ||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
18554948 aa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 18555010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 12953747 - 12953586
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||    
12953747 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaattgctcaatactatctag-tatgagacttctca 12953649  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 158  Q
    ||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
12953648 aa--tgctcaagcacgcaggctagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagaggcttctaat 12953586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 11205524 - 11205683
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| | ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||    
11205524 gaagtagtccattcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacatattacaactgctcaatactatctag-tatgagacttcaca 11205622  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 156  Q
    ||  ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
11205623 aa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 11205683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 20635118 - 20635316
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcac 93  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||     
20635118 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca- 20635216  T
94 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaa 192  Q
      |||||||||||||| || ||||||| ||||   |||||||| ||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||    
20635217 --aactgctcaagcacgcaggcaagagacttcatttgctcaagtactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 20635314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 9934255 - 9934131
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 98  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  | || |||||||| ||||      
9934255 gaagtagtccagtccccctcgcacttccaaggagatttccactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctcttagtacgagacttctcaaa-- 9934158  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 125  Q
    ||||||||||| || || |||||||||    
9934157 tgctcaagcacgcaggcgagagtcttc 9934131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 143 - 230
Target Start/End: Original strand, 12353252 - 12353339
Alignment:
143 gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacatacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
12353252 gcaagagtcttccaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaaagaattaagtttgaattgaacacttga 12353339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 141 - 230
Target Start/End: Original strand, 4292420 - 4292509
Alignment:
141 aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacatacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| |   ||||||||||||||||||    
4292420 aagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacagcgaaatttttttgacttgaacacttga 4292509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 17609058 - 17608861
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagattt-cacta----taatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||    |||||||| ||||||||| | |||||||| |  |  | ||| ||||||||      
17609058 gaagtagtccagtctcccttgcacttccaaggagattttcactaagtttaatcacacagattacaactactcaataccacacctagtataagacttca-- 17608961  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 193  Q
     || ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||    
17608960 -aattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaac 17608862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Original strand, 14757777 - 14757848
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggaga--tttcactataatcaca-aagattacaaatgctcaa 69  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
14757777 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttttcactataatcacacaagattacaaatgctcaa 14757848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 22292446 - 22292538
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggaga-tttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttc 91  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||    
22292446 gaagtagtccagtcccccttgcatttccaaggagattttcactaataatctcaaagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttc 22292538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Original strand, 1902289 - 1902340
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 52  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1902289 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 1902340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 27819106 - 27819055
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 52  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27819106 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 27819055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 30120534 - 30120483
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 52  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
30120534 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 30120483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 19453275 - 19453076
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-actat-----aatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcac 93  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||      ||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | |||||||||||||    
19453275 gaagtagtccagtcccccttgtatttccaaggagatttccactaagaaaaaatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcac 19453176  T
94 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaa 192  Q
    |||  ||||||||||| || ||||||  ||||   |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  |  ||||||||||||| |||||    
19453175 aaa--tgctcaagcacgcaggcaagatacttcttttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaatcaagagacttctattcaaa 19453078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 22386201 - 22386399
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcac 93  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||| ||  |  | ||||||||||||     
22386201 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatattacacctagtatgagacttca- 22386299  T
94 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaa 192  Q
      || |||||||| || || ||| ||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||    
22386300 --aattgctcaagtacgcaggcatgagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 22386397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 14070811 - 14070627
Alignment:
14 cccccttgcacttccaaggagatttc-----actataatcacaaa-gattacaaatgctcaatactatcaaaa--tatgagacttcacaaaactgctcaa 105  Q
    |||||||||||||||||||||| |||     | |||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| |  || ||||||||| ||   |||||||    
14070811 cccccttgcacttccaaggagagttccactaagtataatcacaactgattacaactgctcaatact-tcaacaagtacgagacttcaaaa---tgctcaa 14070716  T
106 gcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 194  Q
    |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||||    
14070715 gcacacaa-caagagacttcctatgctcaagcacacaagcaagagacttcttatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 14070627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 153
Target Start/End: Original strand, 17063793 - 17063935
Alignment:
16 cccttgcacttccaaggagattt-cacta------taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagca 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||      ||||| || ||||||||| || ||||||||||||   ||||||||||| ||||  ||||||| ||    
17063793 cccttgcacttccaaggagattttcactaaatcaataatctcacagattacaattgttcaatactatcatg-tatgagacttctcaaa--tgctcaaaca 17063889  T
109 cacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagactt 153  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
17063890 cgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagactt 17063935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 11147736 - 11147662
Alignment:
156 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacatacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||||| |||||| || ||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
11147736 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttcttatcaaacaaaaatacaaagaattaagtttgacttgaacacttga 11147662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 43 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 19289950 - 19289837
Alignment:
43 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 141  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||| ||||||||||||| |    
19289950 ataatcacacatattacaactgctcaatactatctag-tatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttcctatgctcaagcactaa 19289854  T
142 agcaagagacttctaat 158  Q
    || ||||||||||||||    
19289853 aggaagagacttctaat 19289837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 15551423 - 15551471
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 49  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
15551423 gaagtagtccagtcccccttgcactttcaaggagatttcactaaaatca 15551471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 18027370 - 18027239
Alignment:
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaac 197  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||| ||| |||||||||  |||||||||| |||  ||||| ||||||  | ||||||||||||||| ||||||||     
18027370 tgctcaagcacacaagcaagggacttcaaatactcaagcacacaagcaagagatttcatatgctcaagcacaaaagcaagagacttctaaacaaacaaa- 18027272  T
198 atacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
     |||| |||| | ||||||  ||||||||||||    
18027271 ttacacagaaataagtttggtttgaacacttga 18027239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 230
Target Start/End: Original strand, 31931101 - 31931205
Alignment:
127 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacatacagagaattgagtttgacttgaaca 225  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| |  |||| ||||    ||||||||||||||    
31931101 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaaca 31931200  T
226 cttga 230  Q
    |||||    
31931201 cttga 31931205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 18027434 - 18027387
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 48  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
18027434 gaagtagtccagtctcccttgcacttctaaggagatttcactataatc 18027387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 24719360 - 24719301
Alignment:
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaa 157  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
24719360 tgctcaagcccacacacaagagtcttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttctaa 24719301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 24729145 - 24729086
Alignment:
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaa 157  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||    
24729145 tgctcaagcccacacgcaagagtcttcgtatgctcaagcacaaaagcaagagacttctaa 24729086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 101 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 14052039 - 14051946
Alignment:
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 194  Q
    ||||||||||||  |||||| | ||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||||    
14052039 ctcaagcacacaa-caagagacatcctatgctcaagcacacaagcaagagacttcttatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 14051946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 14052012 - 14051954
Alignment:
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 156  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
14052012 tgctcaagcacacaagcaagagacttcttatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 14051954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 25678963 - 25679001
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc 39  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
25678963 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc 25679001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 17927189 - 17927237
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 49  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
17927189 gaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 17927237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 230
Target Start/End: Original strand, 18554968 - 18555052
Alignment:
146 agagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacatacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| |  |||| ||||    |||||||||||||||||||    
18554968 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttga 18555052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 21034428 - 21034476
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 49  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
21034428 gaagtagtccactcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 21034476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 23006661 - 23006561
Alignment:
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 193  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||  |||| |||||||||||| ||| | |||||||||  ||||| ||||||  |  ||||||||||||||||||||    
23006661 aaactactcaagcacaaaagcaagaggtttcctatgctcaagcacaaaggcgagagacttcctatgctcaagcactaaaacaagagacttctaatcaaac 23006562  T
194 a 194  Q
    |    
23006561 a 23006561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 194
Target Start/End: Original strand, 23781705 - 23781805
Alignment:
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 193  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||  |||| |||||||||||| || || |||||||||  ||||| ||||||  |  ||||||||||||||||||||    
23781705 aaactactcaagcacaaaagcaagaggtttcctatgctcaagcacaaaggcgagagacttcctatgctcaagcactaaaacaagagacttctaatcaaac 23781804  T
194 a 194  Q
    |    
23781805 a 23781805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 24719485 - 24719437
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 49  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
24719485 gaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 24719437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 25929875 - 25929923
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 49  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
25929875 gaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 25929923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 3680510 - 3680552
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcacta 43  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||    
3680510 gaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 3680552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 19625207 - 19625249
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcacta 43  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||    
19625207 gaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 19625249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 20113389 - 20113347
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcacta 43  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||    
20113389 gaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 20113347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 24116224 - 24116266
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcacta 43  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||    
24116224 gaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 24116266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 176
Target Start/End: Original strand, 10820696 - 10820728
Alignment:
144 caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaa 176  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
10820696 caagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaa 10820728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 14883699 - 14883651
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 49  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
14883699 gaagtagtctggtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 14883651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 15478497 - 15478450
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatc 48  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
15478497 gaagtagtccagtcccc-ttgcacttccaaggagattttcactataatc 15478450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 17446310 - 17446210
Alignment:
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 193  Q
    ||||| ||||||||||   |||||||  |||| |||||||||||| || ||||||||||||  ||||| ||||||  | ||||||||||| || ||||||    
17446310 aaactactcaagcacaacagcaagaggtttcctatgctcaagcacaaatgcaagagacttcatatgctcaagcacaaaagcaagagacttatattcaaac 17446211  T
194 a 194  Q
    |    
17446210 a 17446210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 158
Target Start/End: Original strand, 32335364 - 32335424
Alignment:
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaat 158  Q
    |||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
32335364 tgctcaagcacaaacgcaatagacttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttataat 32335424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 206; Significance: 1e-113; HSPs: 135)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 10755242 - 10755013
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
10755242 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactg 10755143  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
10755142 ctcacgcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagaactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 10755043  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
10755042 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 10755013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 40391107 - 40390878
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
40391107 gaagtagtccagtcccccttacacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttcacaaaaatg 40391008  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
40391007 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 40390908  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
40390907 cagagaattgagtttgagttgaacacttga 40390878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 40401769 - 40401540
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
40401769 gaagtagtccagtcccccttgcactttcaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttcacaaaaatg 40401670  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
40401669 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 40401570  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
40401569 cagagaattgagtttgagttgaacacttga 40401540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 15992839 - 15993068
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
15992839 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 15992938  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
15992939 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 15993038  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
15993039 cagagaattgagtttgaattgaacacttga 15993068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 16003401 - 16003630
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
16003401 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 16003500  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
16003501 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 16003600  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
16003601 cagagaattgagtttgaattgaacacttga 16003630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 27602928 - 27603157
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
27602928 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 27603027  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
27603028 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaata 27603127  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
27603128 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 27603157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 39353238 - 39353009
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
39353238 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 39353139  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
39353138 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 39353039  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
39353038 cagagaattgagtttgagttgaacacttga 39353009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 39365231 - 39365002
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
39365231 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 39365132  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
39365131 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 39365032  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
39365031 cagagaattgagtttgagttgaacacttga 39365002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 5290085 - 5290315
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-t 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |    
5290085 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaat 5290184  T
100 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
5290185 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaat 5290284  T
200 acagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
5290285 acagagaattgagtttgacttgaacacttga 5290315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 5300656 - 5300886
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-t 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |    
5300656 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaat 5300755  T
100 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
5300756 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaat 5300855  T
200 acagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
5300856 acagagaattgagtttgacttgaacacttga 5300886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 6131541 - 6131312
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || || |||||||||||||| ||    
6131541 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtaagagacttcacaaaaatg 6131442  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
6131441 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 6131342  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
6131341 cagagaattgagtttgaattgaacacttga 6131312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 9347292 - 9347063
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
9347292 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 9347193  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
9347192 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaacaata 9347093  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
9347092 cagagaattgagtttgaattgaacacttga 9347063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 23362861 - 23362632
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
23362861 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 23362762  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
23362761 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 23362662  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||    
23362661 tagagaattgagtttgaattgaacacttga 23362632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 34772660 - 34772431
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
34772660 gaagtagtccagtcccccttgcactaccaaggagatttcactataatcacaaaaattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 34772561  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
34772560 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaata 34772461  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
34772460 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 34772431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 34783605 - 34783376
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
34783605 gaagtagtccagtcccccttgcactaccaaggagatttcactataatcacaaaaattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 34783506  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
34783505 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaata 34783406  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
34783405 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 34783376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 14557525 - 14557756
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
14557525 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactttaatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 14557624  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
14557625 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 14557724  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
14557725 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 14557756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 14568162 - 14568393
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
14568162 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactttaatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 14568261  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
14568262 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 14568361  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
14568362 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 14568393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 27622277 - 27622504
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| |||| ||    
27622277 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcataaaaatg 27622376  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
27622377 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaata 27622476  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacactt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
27622477 cagagaattgagtttgacttgaacactt 27622504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 30069413 - 30069643
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-t 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |    
30069413 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaat 30069512  T
100 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacat 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
30069513 gctcacgcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaat 30069612  T
200 acagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
30069613 acagagaattgagtttgacttgaacacttga 30069643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 36582067 - 36582297
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
36582067 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 36582166  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac-aaacat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
36582167 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaaat 36582266  T
200 acagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
36582267 acagagaattgagtttgaattgaacacttga 36582297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 36592622 - 36592852
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
36592622 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 36592721  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac-aaacat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
36592722 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaaat 36592821  T
200 acagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
36592822 acagagaattgagtttgaattgaacacttga 36592852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 9336705 - 9336476
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
9336705 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 9336606  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||    
9336605 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagatacttctaatcaaacaacaata 9336506  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
9336505 cagagaattgagtttgaattgaacacttga 9336476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22147272 - 22147044
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
22147272 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 22147174  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
22147173 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 22147074  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
22147073 cagagaattgagtttgaattgaacacttga 22147044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22157855 - 22157627
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
22157855 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 22157757  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
22157756 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 22157657  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
22157656 cagagaattgagtttgaattgaacacttga 22157627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 9376971 - 9377201
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
9376971 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 9377069  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
9377070 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 9377169  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
9377170 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 9377201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 14041348 - 14041118
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
14041348 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 14041250  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
14041249 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 14041150  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
14041149 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 14041118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 15693541 - 15693771
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
15693541 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 15693639  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
15693640 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 15693739  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
15693740 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 15693771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15740719 - 15740489
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
15740719 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 15740621  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
15740620 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 15740521  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
15740520 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 15740489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15769879 - 15769649
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
15769879 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 15769781  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
15769780 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 15769681  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
15769680 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 15769649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 17607810 - 17607580
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
17607810 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 17607712  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
17607711 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 17607612  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
17607611 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 17607580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 17618425 - 17618195
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
17618425 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 17618327  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
17618326 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 17618227  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
17618226 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 17618195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 17719668 - 17719438
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
17719668 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 17719570  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
17719569 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 17719470  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
17719469 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 17719438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 17730320 - 17730090
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
17730320 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 17730222  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
17730221 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 17730122  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
17730121 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 17730090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 23297029 - 23296798
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
23297029 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 23296930  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
23296929 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaa 23296830  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
23296829 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 23296798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 23307597 - 23307366
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
23307597 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 23307498  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
23307497 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaa 23307398  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
23307397 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 23307366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 23708194 - 23707963
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
23708194 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 23708095  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
23708094 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaa 23707995  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
23707994 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 23707963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 24567840 - 24567610
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
24567840 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 24567742  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
24567741 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 24567642  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
24567641 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 24567610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 24816395 - 24816625
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
24816395 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 24816493  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
24816494 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 24816593  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
24816594 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 24816625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 24826983 - 24827213
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
24826983 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 24827081  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
24827082 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 24827181  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
24827182 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 24827213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 27041721 - 27041951
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
27041721 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 27041819  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
27041820 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 27041919  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
27041920 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 27041951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 27052345 - 27052575
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
27052345 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 27052443  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
27052444 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 27052543  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
27052544 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 27052575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 27460912 - 27460682
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
27460912 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 27460814  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
27460813 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 27460714  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
27460713 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 27460682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 27471311 - 27471081
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
27471311 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 27471213  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
27471212 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 27471113  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
27471112 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 27471081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 30227004 - 30227235
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
30227004 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 30227103  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
30227104 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaa 30227203  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
30227204 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 30227235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 30237531 - 30237762
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
30237531 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 30237630  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
30237631 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaa 30237730  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
30237731 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 30237762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 31349284 - 31349054
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
31349284 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 31349186  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
31349185 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 31349086  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
31349085 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 31349054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 31359898 - 31359668
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
31359898 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 31359800  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
31359799 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 31359700  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
31359699 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 31359668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 35216257 - 35216027
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
35216257 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 35216159  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
35216158 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 35216059  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
35216058 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 35216027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 35226841 - 35226611
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
35226841 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 35226743  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
35226742 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 35226643  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
35226642 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 35226611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 39490458 - 39490689
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
39490458 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 39490557  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
39490558 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaa 39490657  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
39490658 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 39490689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 39501648 - 39501879
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
39501648 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 39501747  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
39501748 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaa 39501847  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
39501848 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 39501879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 40513497 - 40513728
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
40513497 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 40513596  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
40513597 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaa 40513696  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
40513697 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 40513728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22560187 - 22559958
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
22560187 gaagtagttcagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcataaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 22560088  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||    
22560087 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacacaggcaagagacttctgatcaaacaaaaata 22559988  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||    
22559987 caaagaattgagtttgacttgaacacttga 22559958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 27204542 - 27204313
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
27204542 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 27204443  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
27204442 ctcaaacacacacgcaagagtcttccaatgctcaaacactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcatgcaagagacttctaatcaaacaaaaata 27204343  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
27204342 cagagaattgagtttgaattgaacacttga 27204313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 14030795 - 14030565
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
14030795 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 14030697  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
14030696 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttttaatcaaacaaaaa 14030597  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
14030596 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 14030565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 14446510 - 14446740
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
14446510 gaagtagtccagtcccccttgcactttcaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 14446608  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
14446609 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 14446708  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
14446709 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 14446740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 14457122 - 14457352
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
14457122 gaagtagtccagtcccccttgcactttcaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 14457220  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
14457221 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 14457320  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
14457321 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 14457352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 23697536 - 23697305
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
23697536 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 23697437  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
23697436 tgctcacgcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggctagagacttctaatcaaacaaaaa 23697337  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
23697336 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 23697305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 24808663 - 24808433
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||     
24808663 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatacttttaaagtatgagacttcacaaaacta 24808565  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
24808564 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 24808465  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
24808464 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 24808433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 31834237 - 31834004
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||       
31834237 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaa 31834138  T
99 --tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 196  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31834137 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 31834038  T
197 catacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
31834037 aatacagagaattgagtttgaattgaacacttga 31834004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 31844715 - 31844482
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||       
31844715 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaa 31844616  T
99 --tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 196  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31844615 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 31844516  T
197 catacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
31844515 aatacagagaattgagtttgaattgaacacttga 31844482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 33951308 - 33951539
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
33951308 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 33951407  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
33951408 tgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaa 33951507  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
33951508 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 33951539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 36688445 - 36688215
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
36688445 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 36688347  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
36688346 tgctcaagcacactcgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 36688247  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
36688246 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 36688215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 36699011 - 36698781
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
36699011 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 36698913  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
36698912 tgctcaagcacactcgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 36698813  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
36698812 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 36698781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 37728761 - 37728991
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
37728761 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 37728859  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
37728860 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 37728959  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
37728960 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 37728991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 37740077 - 37740307
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
37740077 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 37740175  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
37740176 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 37740275  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
37740276 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 37740307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 42043536 - 42043305
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
42043536 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 42043437  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
42043436 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaa 42043337  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
42043336 tacagagaattgagtttgaatcgaacacttga 42043305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 42054111 - 42053880
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
42054111 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 42054012  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
42054011 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaa 42053912  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
42053911 tacagagaattgagtttgaatcgaacacttga 42053880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 6976561 - 6976329
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
6976561 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 6976462  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
6976461 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaga 6976362  T
199 tacagagaattgagtttg-acttgaacacttga 230  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
6976361 tacagagaattgagtttgaaattgaacacttga 6976329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 6987051 - 6986819
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
6987051 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 6986952  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
6986951 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaga 6986852  T
199 tacagagaattgagtttg-acttgaacacttga 230  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
6986851 tacagagaattgagtttgaaattgaacacttga 6986819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22676869 - 22676637
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
22676869 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 22676770  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
22676769 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaa 22676670  T
199 tacagagaattgagtttg-acttgaacacttga 230  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
22676669 tacagagaattgagtttgaaattgaacacttga 22676637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22686760 - 22686528
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
22686760 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 22686661  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
22686660 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaa 22686561  T
199 tacagagaattgagtttg-acttgaacacttga 230  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
22686560 tacagagaattgagtttgaaattgaacacttga 22686528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 43043181 - 43043410
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
43043181 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaatg 43043280  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
43043281 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcaataagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaata 43043380  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||||||||    
43043381 caaggaattaagtttgacttgaacacttga 43043410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 20798446 - 20798217
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
20798446 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggatatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaatg 20798347  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||    
20798346 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctactgctcaagcacacaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaata 20798247  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||    
20798246 caaagaattaagtttgacttgaacacttga 20798217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 31419413 - 31419184
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||  ||    
31419413 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaggattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaagatg 31419314  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
31419313 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaagcaagagacttctgatcaaacaaaaata 31419214  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||    
31419213 caaagaattaagtttgacttgaacacttga 31419184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 1121412 - 1121641
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
1121412 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatactcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatg 1121511  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
1121512 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaata 1121611  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||||||||    
1121612 caatgaattaagtttgacttgaacacttga 1121641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 1108654 - 1108883
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
1108654 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatactcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatg 1108753  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
1108754 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaaaagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaata 1108853  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||||||||    
1108854 caatgaattaagtttgacttgaacacttga 1108883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 23407196 - 23406967
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
23407196 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatg 23407097  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||    
23407096 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttttgatcaaacaaaaata 23406997  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||  ||| | ||||||||||||||||||||    
23406996 caatgaaataagtttgacttgaacacttga 23406967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 31449304 - 31449075
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||  ||    
31449304 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaggattacaactgatcaatactttctaagtatgagacttcacaaagatg 31449205  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
31449204 ctcaaccacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagaacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaata 31449105  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||    
31449104 caaagaattaagtttgacttgaacacttga 31449075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 36085211 - 36084982
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||    
36085211 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcgcaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgaaacttctcaaaaatg 36085112  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
36085111 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaata 36085012  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||  ||| | ||||||||||||||||||||    
36085011 caatgaaataagtttgacttgaacacttga 36084982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 36229489 - 36229260
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
36229489 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatg 36229390  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
36229389 ctcaagcacacatgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaata 36229290  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||  ||| | ||||||||||||||||||||    
36229289 caatgaaataagtttgacttgaacacttga 36229260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 42395734 - 42395505
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||  ||    
42395734 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaagaagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaagatg 42395635  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
42395634 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaata 42395535  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||||||||    
42395534 caatgaattaagtttgacttgaacacttga 42395505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 8522592 - 8522362
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-t 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||  |    
8522592 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaaat 8522493  T
100 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||    
8522492 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcattaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaat 8522393  T
200 acagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||  ||||| ||||||||||||||||||||    
8522392 acaatgaattaagtttgacttgaacacttga 8522362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 43621403 - 43621633
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |    
43621403 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat 43621502  T
100 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||    
43621503 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaat 43621602  T
200 acagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||  ||| | ||||||||||||||||||||    
43621603 acaatgaaataagtttgacttgaacacttga 43621633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 20552566 - 20552336
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |    
20552566 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat 20552467  T
100 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||    
20552466 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagtactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaat 20552367  T
200 acagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||  ||| | ||||||||||||||||||||    
20552366 acaatgaaataagtttgacttgaacacttga 20552336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 21702634 - 21702863
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| ||||| ||    
21702634 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctttaagtatgagacttctcaaaaatg 21702733  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
21702734 ctcatgcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaata 21702833  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||  ||| |  |||||||||||||||||||    
21702834 caatgaaatatgtttgacttgaacacttga 21702863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 23393151 - 23392922
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||| ||||| ||    
23393151 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtttgagacttctcaaaaatg 23393052  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
23393051 ctcaagcacacacgcaaaagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaata 23392952  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||  ||| | |||||||||||||| |||||    
23392951 caatgaaataagtttgacttgaacgcttga 23392922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19464722 - 19464492
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||| | ||||| |    
19464722 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacgaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagactactcaaaaat 19464623  T
100 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||    
19464622 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaat 19464523  T
200 acagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||  ||| | ||||||||||||||||||||    
19464522 acaatgaaataagtttgacttgaacacttga 19464492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 20563076 - 20562846
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |    
20563076 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat 20562977  T
100 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacat 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||    
20562976 gctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagtactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaat 20562877  T
200 acagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||  ||| | ||||||||||||||||||||    
20562876 acaatgaaataagtttgacttgaacacttga 20562846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 34052710 - 34052481
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
34052710 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tg 34052612  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac-aaacat 199  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||    
34052611 ctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaaat 34052512  T
200 acagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||  ||| | ||||||||||||||||||||    
34052511 acaatgaaataagtttgacttgaacacttga 34052481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 34063371 - 34063142
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
34063371 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tg 34063273  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac-aaacat 199  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||    
34063272 ctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaaat 34063173  T
200 acagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||  ||| | ||||||||||||||||||||    
34063172 acaatgaaataagtttgacttgaacacttga 34063142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 17446206 - 17446432
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
17446206 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tg 17446304  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac-aaacat 199  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||    
17446305 ctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaaat 17446404  T
200 acagagaattgagtttgacttgaacact 227  Q
    |||| ||| |  ||||||||||||||||    
17446405 acagggaaatatgtttgacttgaacact 17446432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19478752 - 19478522
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || || ||||||||| | ||||| |    
19478752 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacgaagattacaaaatgttcaatactctctaagtatgagactactcaaaaat 19478653  T
100 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||    
19478652 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaat 19478553  T
200 acagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||  ||| | ||||||||||||||||||||    
19478552 acaatgaaataagtttgacttgaacacttga 19478522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 24925647 - 24925878
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||| ||| |||||      
24925647 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagatttctcaaaata 24925746  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |    
24925747 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacacaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaa 24925846  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||  ||| | ||||||||||||||||||||    
24925847 tacaatgaaataagtttgacttgaacacttga 24925878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 24982928 - 24983159
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||  |||||||||| |||||      
24982928 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagcatgagacttctcaaaata 24983027  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |    
24983028 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacacaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaa 24983127  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||  ||| | ||||||||||||||||||||    
24983128 tacaatgaaataagtttgacttgaacacttga 24983159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 37407397 - 37407192
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
37407397 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgttcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tg 37407299  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    
37407298 ctcaagcacgcaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaata 37407199  T
201 cagagaa 207  Q
    |||||||    
37407198 cagagaa 37407192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 17456822 - 17457051
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
17456822 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacgataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tg 17456920  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca-t 199  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |    
17456921 ctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagtaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaaat 17457020  T
200 acagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||| | | |  |||||||||||||||||||    
17457021 acaggggaatatgtttgacttgaacacttga 17457051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 7031666 - 7031823
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
7031666 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttcacaaaaatg 7031765  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7031766 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 7031823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 21705474 - 21705710
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatg-------ctcaatactatcaaaatatgagacttcac 93  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||| |  || ||||||||||| |    
21705474 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatgctcaatactctttaagtatgagacttctc 21705573  T
94 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 193  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
21705574 aaaaatgctcatgcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaac 21705673  T
194 aaacatacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||| |||||  ||| |  |||||||||||||||||||    
21705674 aaaaatacaatgaaatatgtttgacttgaacacttga 21705710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 20625518 - 20625310
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagattt-cacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 98  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||     
20625518 gaagtagtctagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaataatctcaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa- 20625420  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaac 197  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||| || |||| |||||| |||||||||     
20625419 tgctcaagcacgcaggcaagaggcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcatgcatgcgagaggcttctattcaaacaaaa 20625320  T
198 atacagagaa 207  Q
    ||||| ||||    
20625319 atacacagaa 20625310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 20417654 - 20417459
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| ||||      
20417654 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctag-tatgagacttctcaaa-- 20417558  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 196  Q
    ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
20417557 tgctcaagcacgcatgcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctattcaaacaaa 20417459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 106871 - 106664
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagattt-cacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||      
106871 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaataatctcaaagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttctcaaa-- 106774  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaac 197  Q
    | ||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| |     
106773 ttctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctaatcaaacagaa 106674  T
198 atacagagaa 207  Q
    ||||| ||||    
106673 atacacagaa 106664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 32753455 - 32753650
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-actataa-tcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||| |||||||||||| || |  ||||||||||| ||||      
32753455 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaaaaatcacacagattacagatgctcaatactctctag-tatgagacttctcaaa-- 32753551  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 196  Q
    ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
32753552 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgtaggcaagagacttctattcaaacaaa 32753650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 20215860 - 20215662
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||||    
20215860 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaca 20215761  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 193  Q
    ||  |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||  | ||||||||||| || ||||||    
20215760 aa--tgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttttattcaaac 20215663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 21420271 - 21420431
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggaga-tttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||  | ||||||||||| ||||      
21420271 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaataatctcaaagattacaaatgctcaattctctcttagtatgagacttctcaaa-- 21420368  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgc 160  Q
    || |||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
21420369 tggtcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgc 21420431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 13522618 - 13522779
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||    
13522618 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatctag-tatgagacttccca 13522716  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 158  Q
    ||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
13522717 aa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 13522779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 40228051 - 40228250
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcac 93  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | |||||||||||||    
40228051 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcac 40228150  T
94 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaa 192  Q
    |||  ||||||||||| || ||||||| || ||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||    
40228151 aaa--tgctcaagcacgcaggcaagagactccctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 40228248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 40033482 - 40033321
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcac 93  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | |||||||||||||    
40033482 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcac 40033383  T
94 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 156  Q
    |||  ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
40033382 aaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 40033321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 35543852 - 35543694
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||| ||    
35543852 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatc-tagtatgagacttccca 35543754  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttct 155  Q
    ||  ||||||||||  || || |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
35543753 aa--tgctcaagcatgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct 35543694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 23477769 - 23477966
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||    |||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||      
23477769 gaagtagtccagtccctcttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca-- 23477866  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 193  Q
     || ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||    
23477867 -aattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaac 23477965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 36096376 - 36096215
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||| ||    
36096376 gaagtagttcagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacctag-tatgagacttccca 36096278  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 158  Q
    ||  ||||||||||| || || |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
36096277 aa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 36096215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 36097833 - 36097672
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||| ||    
36097833 gaagtagttcagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacctag-tatgagacttccca 36097735  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 158  Q
    ||  ||||||||||| || || |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
36097734 aa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 36097672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 20168791 - 20168630
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 94  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||| |  | ||||||||||| ||    
20168791 gaagtagtctagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatacta-cctagtatgagacttccca 20168693  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 158  Q
    ||  ||||||||||| || || |||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
20168692 aa--tgctcaagcacgcaggcgagagactttctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 20168630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 127 - 230
Target Start/End: Original strand, 7031762 - 7031865
Alignment:
127 aatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacatacagagaattgagtttgacttgaaca 225  Q
    |||||||||||||  | ||||||| |||| |||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
7031762 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaaca 7031860  T
226 cttga 230  Q
    |||||    
7031861 cttga 7031865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 23487945 - 23488104
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||  ||||||||| ||||||||||||  |  | |||||||||||       
23487945 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacgcagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttc--- 23488041  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 156  Q
    ||| ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
23488042 aaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcta 23488104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 1914839 - 1915000
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcac 93  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | |||||||||||||    
1914839 gaagtagtccagtcccccttgcactttcaaggagatttccactaagtaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcac 1914938  T
94 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 156  Q
    |||  ||||| |||||  | ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
1914939 aaa--tgctcgagcactaaagcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcta 1915000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 43 - 158
Target Start/End: Original strand, 13403702 - 13403817
Alignment:
43 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-t 140  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||      
13403702 ataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcacga 13403799  T
141 aagcaagagacttctaat 158  Q
    ||||||||||||||||||    
13403800 aagcaagagacttctaat 13403817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 11208741 - 11208557
Alignment:
12 gccccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactatcaa--aatatgagacttcacaaaactgctc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| |||||||||||| |||  | |||||||||||| ||   |||||    
11208741 gccccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtataatcacaactgattacaactgctcaatacta-caactagtatgagacttcaaaa---tgctc 11208646  T
104 aagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaa 192  Q
    ||||||||| ||||||  |||||  | |||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||    
11208645 aagcacaca-gcaagatacttcctttactcaagcacacaagcaagagacttcttatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 11208557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 76
Target Start/End: Original strand, 13533375 - 13533456
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatc 76  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
13533375 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatc 13533456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 25112608 - 25112423
Alignment:
14 cccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaag 106  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||   || ||||||||    
25112608 cccccttgtacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaag 25112512  T
107 cacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 194  Q
    ||| || ||||||  |||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||||    
25112511 cacgcaggcaagatacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 25112423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 25171699 - 25171514
Alignment:
14 cccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaag 106  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||   || ||||||||    
25171699 cccccttgtacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaag 25171603  T
107 cacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 194  Q
    ||| || ||||||  |||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||||    
25171602 cacgcaggcaagatacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 25171514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 194
Target Start/End: Original strand, 32160156 - 32160340
Alignment:
15 ccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagc 107  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||   || | |||||||    
32160156 ccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattactcaagc 32160252  T
108 acacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 194  Q
    ||||| |||||||  ||||  |||||||||||  ||||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||||    
32160253 acacaggcaagagatttcctttgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 32160340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 196
Target Start/End: Original strand, 12078357 - 12078456
Alignment:
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgctt--aagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaa 195  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||  ||||||  | ||||||||||| ||| |||||||    
12078357 tgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgcttgcaagcacaaaagcaagagacttttaa-caaacaa 12078455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 194
Target Start/End: Original strand, 13403755 - 13403823
Alignment:
127 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 194  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||  ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
13403755 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcacgaaagcaagagacttctaatcaaaca 13403823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 196
Target Start/End: Original strand, 20550432 - 20550484
Alignment:
144 caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 196  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||    
20550432 caagagacttctaatgctcaagcacaactgcaagagacttctaatcaaacaaa 20550484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 194
Target Start/End: Original strand, 20567296 - 20567396
Alignment:
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 193  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||  ||||  ||||||||||| || ||||||||||||  ||||| ||||||  |  ||||||||||||||||||||    
20567296 aaactactcaagcacaaaagcaagaggtttcctttgctcaagcacaaacgcaagagacttcatatgctcaagcacaaaaccaagagacttctaatcaaac 20567395  T
194 a 194  Q
    |    
20567396 a 20567396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 158
Target Start/End: Original strand, 23589238 - 23589298
Alignment:
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaat 158  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||    
23589238 tgctcaagcacaaacgcaaaagtcttcctaagctcaagcacaaaagcaagagacttctaat 23589298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 69
Target Start/End: Original strand, 26013259 - 26013310
Alignment:
17 ccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaa 69  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
26013259 ccttgcactttcaagg-gatttcactataatctcatagattacaaatgctcaa 26013310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 31589685 - 31589637
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 49  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
31589685 gaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 31589637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 26056231 - 26056184
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 48  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
26056231 gaagtagtccagtcccccttgaacttccaatgatatttcactataatc 26056184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 194
Target Start/End: Original strand, 13533474 - 13533512
Alignment:
156 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 194  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
13533474 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaaca 13533512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 6513161 - 6513128
Alignment:
14 cccccttgcacttccaaggagatttcactataat 47  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
6513161 cccccttgcacttccaaggagagttcactataat 6513128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Original strand, 26013304 - 26013393
Alignment:
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaa 187  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||  |||||||| ||| |  | |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
26013304 tgctcaagcacacaaacaagagacttcagatgctcaatcacaactgaaagagacttccaatgcttaagcatgcaagcaagacacttctaa 26013393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 146 - 194
Target Start/End: Original strand, 13522737 - 13522785
Alignment:
146 agagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 194  Q
    ||||||||| |||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||    
13522737 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaaca 13522785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 146 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 35543733 - 35543649
Alignment:
146 agagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacatacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||| |||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||||| |  |||| ||||    |||||||||||||||||||    
35543733 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctgatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttga 35543649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 206; Significance: 1e-113; HSPs: 105)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 5022360 - 5022589
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
5022360 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataattacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactg 5022459  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
5022460 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttttaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 5022559  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
5022560 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 5022589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 18753125 - 18752896
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
18753125 gaagtagtccagtcccccttgctcttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactg 18753026  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
18753025 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 18752926  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
18752925 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 18752896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 18763735 - 18763506
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
18763735 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactg 18763636  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
18763635 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcatgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 18763536  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
18763535 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 18763506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 48370755 - 48370984
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
48370755 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 48370854  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
48370855 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaata 48370954  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
48370955 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 48370984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 450200 - 450429
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
450200 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 450299  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
450300 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 450399  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
450400 cagagaattgagtttgaattgaacacttga 450429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15561715 - 15561486
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
15561715 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 15561616  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
15561615 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 15561516  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
15561515 cagagaattgagtttgaattgaacacttga 15561486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19955598 - 19955369
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
19955598 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 19955499  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
19955498 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 19955399  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
19955398 cagagaattgagtttgagttgaacacttga 19955369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 21996037 - 21996266
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
21996037 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 21996136  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
21996137 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 21996236  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
21996237 cagagaattgagtttgaattgaacacttga 21996266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 22006635 - 22006864
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
22006635 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 22006734  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
22006735 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 22006834  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
22006835 cagagaattgagtttgaattgaacacttga 22006864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 27815581 - 27815352
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
27815581 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 27815482  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
27815481 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgttcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaata 27815382  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
27815381 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 27815352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 30927130 - 30926901
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
30927130 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 30927031  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
30927030 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 30926931  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
30926930 cagagaattgagtttgaattgaacacttga 30926901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 17917675 - 17917905
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |     
17917675 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatt 17917774  T
100 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
17917775 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaat 17917874  T
200 acagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
17917875 acagagaattgagtttgagttgaacacttga 17917905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 4947961 - 4948190
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
4947961 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 4948060  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
4948061 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacacaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 4948160  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
4948161 cagagaattgagtttgagttgaacacttga 4948190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 14844289 - 14844060
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||||||||||||||| ||    
14844289 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgcttaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 14844190  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
14844189 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 14844090  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
14844089 cagagaattgagtttgaattgaacacttga 14844060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19944963 - 19944734
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
19944963 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 19944864  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
19944863 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgttcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 19944764  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
19944763 cagagaattgagtttgagttgaacacttga 19944734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 40471223 - 40470994
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
40471223 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatg 40471124  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
40471123 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaata 40471024  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||    
40471023 cagagaattaagtttgacttgaacacttga 40470994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 460781 - 461010
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
460781 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattactactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 460880  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
460881 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagaattctaatcaaacaaaaata 460980  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
460981 cagagaattgagtttgaattgaacacttga 461010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 30937708 - 30937479
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
30937708 gaagtagtccagttccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 30937609  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
30937608 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 30937509  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||    
30937508 cggagaattgagtttgaattgaacacttga 30937479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 40454985 - 40454756
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
40454985 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatg 40454886  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
40454885 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcatgcaagagacttctgatcaaacaaaaata 40454786  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||    
40454785 cagagaattaagtttgacttgaacacttga 40454756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 36017959 - 36018189
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
36017959 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 36018057  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
36018058 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 36018157  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
36018158 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 36018189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 36028512 - 36028742
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
36028512 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 36028610  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
36028611 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 36028710  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
36028711 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 36028742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 49517758 - 49517988
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
49517758 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 49517856  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
49517857 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 49517956  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
49517957 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 49517988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 17928323 - 17928553
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |     
17928323 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatt 17928422  T
100 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
17928423 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatcaaacaaaaat 17928522  T
200 acagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
17928523 acagagaattgagtttgagttgaacacttga 17928553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 24028724 - 24028492
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||       
24028724 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaa 24028625  T
99 -tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaac 197  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
24028624 atgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 24028525  T
198 atacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
24028524 atacagagaattgagtttgagttgaacacttga 24028492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 25656759 - 25656988
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||    
25656759 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgaaacttctcaaaaatg 25656858  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||    
25656859 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacacaggcaagagacttctgatcaaacaaaaata 25656958  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||    
25656959 cagagaattaagtttgacttgaacacttga 25656988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 27656222 - 27656453
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
27656222 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 27656321  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
27656322 tgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaa 27656421  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
27656422 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 27656453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 27666795 - 27667026
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
27666795 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 27666894  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
27666895 tgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaa 27666994  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
27666995 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 27667026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 29042293 - 29042063
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
29042293 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 29042195  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
29042194 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 29042095  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
29042094 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 29042063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 16255490 - 16255719
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
16255490 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 16255588  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca-t 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
16255589 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatt 16255688  T
200 acagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
16255689 acagagaattgagtttgaattgaacacttga 16255719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 16266083 - 16266312
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
16266083 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 16266181  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca-t 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
16266182 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatt 16266281  T
200 acagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
16266282 acagagaattgagtttgaattgaacacttga 16266312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 18130878 - 18130646
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
18130878 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 18130779  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatc-aaacaaac 197  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||     
18130778 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaaacaaaa 18130679  T
198 atacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
18130678 atacagagaattgagtttgaattgaacacttga 18130646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 52703412 - 52703641
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
52703412 gaagtagtccagtcccccttgtacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 52703511  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||    
52703512 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatgaaacaaaaata 52703611  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||    
52703612 cagagaattgagtttgagttaaacacttga 52703641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 10741231 - 10741001
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
10741231 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 10741133  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |    
10741132 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaattaaacagaaa 10741033  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
10741032 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 10741001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 10955000 - 10954770
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
10955000 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 10954902  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |    
10954901 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaattaaacagaaa 10954802  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
10954801 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 10954770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 24639871 - 24640101
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
24639871 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 24639969  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
24639970 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaa 24640069  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
24640070 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 24640101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 55745889 - 55745659
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||      
55745889 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacaa 55745791  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
55745790 tgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 55745691  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
55745690 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 55745659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 10909031 - 10909260
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
10909031 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatg 10909130  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
10909131 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaata 10909230  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||||||||    
10909231 caatgaattaagtttgacttgaacacttga 10909260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 10751805 - 10751575
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
10751805 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 10751707  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |    
10751706 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttttaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaattaaacagaaa 10751607  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
10751606 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 10751575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 10965574 - 10965344
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
10965574 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 10965476  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |    
10965475 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttttaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaattaaacagaaa 10965376  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
10965375 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 10965344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 18078544 - 18078313
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||     
18078544 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttcacaaaacta 18078445  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |    
18078444 tgctcaagcacacacgcaagaggcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaagcaagaggcttctgatcaaacaaaaa 18078345  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| |||||    
18078344 tacaaagaattaagtttgacttgaacgcttga 18078313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 55756500 - 55756270
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||      
55756500 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacaa 55756402  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
55756401 tgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 55756302  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
55756301 tacaaagaattgagtttgaattgaacacttga 55756270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 10695265 - 10695493
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
10695265 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tg 10695363  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
10695364 ctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaata 10695463  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||| ||| |  |||||||||||||||||||    
10695464 cagggaaatatgtttgacttgaacacttga 10695493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 16316954 - 16317183
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
16316954 gaagtagtccagtcccccttgtacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatg 16317053  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
16317054 ctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaata 16317153  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||  ||| | ||||||||||||||||||||    
16317154 caatgaaataagtttgacttgaacacttga 16317183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 16304730 - 16304959
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
16304730 gaagtagtccagtcccccttgtacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatg 16304829  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||    
16304830 ctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaataaaaata 16304929  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||  ||| | ||||||||||||||||||||    
16304930 caatgaaataagtttgacttgaacacttga 16304959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 3370337 - 3370544
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-t 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||  |    
3370337 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttctcaaaaaat 3370436  T
100 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||    
3370437 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacttagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgttcaaacaaaaat 3370536  T
200 acagagaa 207  Q
    ||||||||    
3370537 acagagaa 3370544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 3390077 - 3390284
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-t 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||  |    
3390077 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttctcaaaaaat 3390176  T
100 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||    
3390177 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacttagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgttcaaacaaaaat 3390276  T
200 acagagaa 207  Q
    ||||||||    
3390277 acagagaa 3390284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 5872995 - 5873223
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |     
5872995 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-ta 5873093  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    
5873094 ctcaagcacgcaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaata 5873193  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    || |||| |  |||||||||||||||||||    
5873194 caaagaaatatgtttgacttgaacacttga 5873223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 14836738 - 14836509
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |     
14836738 gaagtagtccagtccctcttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaata 14836639  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||| |||||||||| |||    
14836638 cttaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacacaggctagagtcttctgatcaaacaaaaata 14836539  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    || |||| | ||||||||||||||||||||    
14836538 caaagaaataagtttgacttgaacacttga 14836509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 4987045 - 4986817
Alignment:
2 aagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgc 101  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||    
4987045 aagtagtccagtcccccttacacttccaagcagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgc 4986946  T
102 tcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacatac 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
4986945 tcaaacacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatac 4986846  T
202 agagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |  ||| |  |||||| ||||||||||||    
4986845 aatgaaatatgtttgagttgaacacttga 4986817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15208023 - 15207794
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
15208023 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcaccataatcactaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tg 15207925  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac-aaacat 199  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||    
15207924 ctcaagcatgcaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaaat 15207825  T
200 acagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||| ||| |  |||||||||||||||||||    
15207824 acagggaaatatgtttgacttgaacacttga 15207794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 10300157 - 10300387
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |    
10300157 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-t 10300255  T
100 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |    
10300256 gctcaagcacgcaggctagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaaa 10300355  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||||||||    |||||||||||||||||||    
10300356 tacagagaaaaatgtttgacttgaacacttga 10300387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 19580864 - 19581093
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
19580864 gaagtagtctagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tg 19580962  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaa-acat 199  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||| | |||||| || | ||    
19580963 ctcaagcacacaggaaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcgggcaagagtcttttgatcaaaaaagaaat 19581062  T
200 acagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||| ||| |  |||||||||||||||||||    
19581063 acagggaaatatgtttgacttgaacacttga 19581093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 25008519 - 25008689
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
25008519 gaagtagtccagtcccccttgcatttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatg 25008618  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgca 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
25008619 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgca 25008689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 11535467 - 11535674
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |    
11535467 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-t 11535565  T
100 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |    
11535566 gctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaaa 11535665  T
199 tacagagaa 207  Q
    |||||||||    
11535666 tacagagaa 11535674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 47152684 - 47152528
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
47152684 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tg 47152586  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 158  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
47152585 ctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaat 47152528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 19143640 - 19143504
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
19143640 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatg 19143541  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagc 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
19143540 ctcaaacacacacgcaagagtcttccaatgctcaagc 19143504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 11514657 - 11514864
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagattt-cacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||      
11514657 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaa-- 11514754  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaac 197  Q
    ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||     
11514755 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaa 11514854  T
198 atacagagaa 207  Q
    ||||| ||||    
11514855 atacatagaa 11514864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 24713050 - 24713234
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact 99  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||  ||||| |    
24713050 gaagtagtccagtccccattgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttttcaaaa-t 24713148  T
100 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttct 185  Q
    |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| | |||| |||||    
24713149 gctcaagcacgcaggaaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtctactaatgctcaagcacgcagacgagaggcttct 24713234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 31267429 - 31267222
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 98  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||| |||||     
31267429 gaagtagtccagtcccc-ttgcacttccaaggagatttccactaataatctcaaagattacaaatgctcaatattctctaagtatgagacttctcaaaa- 31267332  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaac 197  Q
    ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||     
31267331 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaa 31267232  T
198 atacagagaa 207  Q
    ||||||||||    
31267231 atacagagaa 31267222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 49002617 - 49002422
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||||| || |  ||||||||||| ||||      
49002617 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaataatcacacagattacagatgctcaatactctctag-tatgagacttctcaaa-- 49002521  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 196  Q
    ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
49002520 tgctcaagcacgcatgcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctattcaaacaaa 49002422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 55650946 - 55651141
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-actataa-tcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||| |||||||||||| || |  ||||||||||| ||||      
55650946 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaaaaatcacacagattacagatgctcaatactctctag-tatgagacttctcaaa-- 55651042  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 196  Q
    ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
55651043 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgaaggcaagagacttctattcaaacaaa 55651141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 8183576 - 8183486
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttc 91  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
8183576 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttc 8183486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 19241641 - 19241838
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||||||    
19241641 gaagtagtccagtcctccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacctag-tatgagacttcaca 19241739  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 193  Q
    ||  ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||    
19241740 aa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaac 19241837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 10290248 - 10290345
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 97  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
10290248 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa 10290345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 19570640 - 19570711
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatac 72  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19570640 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatac 19570711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 16819986 - 16819825
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||| ||    
16819986 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactaactag-tatgagacttccca 16819888  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 158  Q
    ||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
16819887 aa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 16819825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 23508765 - 23508926
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 94  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||    
23508765 gaagtagtcaagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatctag-tatgagacttctca 23508863  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 158  Q
    ||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
23508864 aa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 23508926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 14711416 - 14711253
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcac 93  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | |||||||||||||    
14711416 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcac 14711317  T
94 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 158  Q
    |||  ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
14711316 aaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 14711253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 14779080 - 14778917
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcac 93  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | |||||||||||||    
14779080 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcac 14778981  T
94 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 158  Q
    |||  ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
14778980 aaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 14778917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 18775320 - 18775123
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-actat-----aatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||     ||||||| ||||||||| |||||||||||  | |  |  |||||||| ||    
18775320 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactatgaaataatcacacagattacaactgctcaatactgcctag-tgggagacttctca 18775222  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 193  Q
    ||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||    
18775221 aa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaac 18775124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 36210747 - 36210587
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagattt-cacta----taatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    |||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |  | ||||||| ||||||    
36210747 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacacagattacaactgctcaagactacacctagtatgagaattcaca 36210648  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 156  Q
    ||  ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
36210647 aa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcta 36210587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 18007726 - 18007529
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||| ||||||| | |  |||||||||||       
18007726 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgcttaatactacctag-tatgagacttcc-- 18007630  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 193  Q
    ||| ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| || |||||||||||  ||||| ||||||  | | |||||||||||| ||||||    
18007629 aaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaatcaagagacttcctatgctcaagcactaaagtaagagacttctattcaaac 18007530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 9921010 - 9920958
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 53  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9921010 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 9920958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Original strand, 28050187 - 28050238
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 52  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
28050187 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 28050238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Original strand, 49509601 - 49509652
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 52  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
49509601 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 49509652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 33377801 - 33377997
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcac 93  Q
    |||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| | ||||||||||  |  | ||||||||||||     
33377801 gaagtagtccagtccccattacacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaacttctcaatactacacctagtatgagacttca- 33377899  T
94 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaa 192  Q
      || ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||    
33377900 --aattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 33377997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 17199125 - 17199074
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 52  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17199125 gaagtagtccaatcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 17199074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 17527063 - 17527016
Alignment:
2 aagtagtccagccccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatc 48  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
17527063 aagtagtccagccccccttgcacttccaaggagattttcactataatc 17527016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 17994343 - 17994267
Alignment:
81 tatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 158  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| || | ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
17994343 tatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggtaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 17994267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 39532339 - 39532269
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggaga-tttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaa 69  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||    
39532339 gaagtagtccagtcccccttgcacttacaaggagattttcactaaaaatcacacagattacaaatgctcaa 39532269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 8997831 - 8997740
Alignment:
42 tataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaag 136  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  | || |||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| |||||||||||||||    
8997831 tataatcacacagattacaattgctcaatactatc-tagtacgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaag 8997740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 158
Target Start/End: Original strand, 18773578 - 18773637
Alignment:
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 158  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||    
18773578 tgctcaagcacacacacaagagacttcctatgctcaagcacaaatcaatagacttctaat 18773637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 69
Target Start/End: Original strand, 19052749 - 19052803
Alignment:
15 ccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaca-aagattacaaatgctcaa 69  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
19052749 ccccttgcacttccaagg-gatttcactataatcacacaagattacaattgctcaa 19052803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 156 - 230
Target Start/End: Original strand, 4987052 - 4987126
Alignment:
156 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacatacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  ||| |  |||||| ||||||||||||    
4987052 aatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaatatgtttgagttgaacacttga 4987126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 18775637 - 18775559
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatact 73  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
18775637 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaacgagatttccactatgaaataatcacacagattacaactgctcaatact 18775559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Original strand, 7221937 - 7222007
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa---gattacaaatgctcaa 69  Q
    |||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||    
7221937 gaagtagtccagtccgccttgcactttcaatgagatttcactataatc-caaatttgattacaaatgctcaa 7222007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 19889608 - 19889508
Alignment:
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 193  Q
    ||||| |||||||||| |  ||||||  |||| |||||||||||| ||| |||||| ||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||    
19889608 aaactactcaagcacaaaatcaagaggtttcctatgctcaagcacaaagacaagagtcttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttctaatcaaac 19889509  T
194 a 194  Q
    |    
19889508 a 19889508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 19889699 - 19889651
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 49  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
19889699 gaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 19889651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 230
Target Start/End: Original strand, 23508884 - 23508968
Alignment:
146 agagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacatacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| |  |||| ||||    |||||||||||||||||||    
23508884 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttga 23508968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 13977968 - 13977914
Alignment:
15 ccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac-aaagattacaaatgctcaa 69  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
13977968 ccccttgcacttc-aaggaattttcactataatcactaaagattacaaatgctcaa 13977914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 39532277 - 39532226
Alignment:
156 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacatacagagaa 207  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
39532277 aatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaagatacagagaa 39532226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 194
Target Start/End: Original strand, 1671908 - 1671974
Alignment:
129 tgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 194  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||||    
1671908 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 1671974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 156
Target Start/End: Original strand, 1671908 - 1671966
Alignment:
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 156  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
1671908 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 1671966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 8686163 - 8686121
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcacta 43  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
8686163 gaagtagtcctgccccccttgcactttcaaggagagttcacta 8686121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 18775968 - 18775930
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc 39  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
18775968 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaacgagatttc 18775930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 32491444 - 32491346
Alignment:
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 196  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||| | ||||||||||| |||  ||||| || |||  |  |||||||||||||| ||||||||    
32491444 tgctcaagcacacaagcaagagacttcaaatactcaagctcataagcaagagatttcctatgctcaaacacaaaaacaagagacttctaaacaaacaaa 32491346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 32491508 - 32491438
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatc-acaaagattacaaatgctcaa 69  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
32491508 gaagtagttcagtccctcttgcactttcaaggagattttcactataatctacactgattacaaatgctcaa 32491438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 183
Target Start/End: Original strand, 9266769 - 9266854
Alignment:
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagactt 183  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||| |||| |||||||||  ||||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||    
9266769 tgctcaagcacacatacaagagactttcaatactcaagcacacaagcaagagacttcatatgctcaagcacaaaagcaagagactt 9266854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 14154601 - 14154528
Alignment:
115 caagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaa 187  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||  || |||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||    
14154601 caagagacttcctatgctcaagaacacaatcaagagacttctaatgctcaagcacaaatgcaagagacttctaa 14154528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 230
Target Start/End: Original strand, 7222001 - 7222132
Alignment:
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaac 197  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||| ||  |||||||||  |||||||||| |||  ||||| ||||||  | |||||||| |||||| ||||||||     
7222001 tgctcaagcacataagcaagagacttcaaacactcaagcacacaagcaagagatttcctatgctcaagcacaaaagcaagagatttctaaacaaacaaa- 7222099  T
198 atacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
     |||| |||| | ||||| | ||||||||||||    
7222100 ttacacagaaataagttttatttgaacacttga 7222132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 16325124 - 16325024
Alignment:
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 193  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||  |||| |||||||||||| ||  |||||  ||||| ||||| ||||||  | |||| ||||||||||||||||    
16325124 aaactactcaagcacaaaagcaagaggtttcctatgctcaagcacaaacacaagattcttcttatgctcaagcacaaaagcaatagacttctaatcaaac 16325025  T
194 a 194  Q
    |    
16325024 a 16325024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 16325215 - 16325167
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 49  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
16325215 gaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 16325167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 146 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 16819867 - 16819819
Alignment:
146 agagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 194  Q
    ||||||||| |||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||    
16819867 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaaca 16819819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Original strand, 24619110 - 24619181
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggaga--tttcactataatcaca-aagattacaaatgctcaa 69  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||  ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||    
24619110 gaagtagtctagtcccccatgcacttccaatgagatttttcactttaatcacacaagattacaattgctcaa 24619181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 154
Target Start/End: Original strand, 24619175 - 24619231
Alignment:
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttc 154  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||  ||||||||||||||    
24619175 tgctcaagcacacaagcaagagactttaaatgctcaagcacaaaagcaagagacttc 24619231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 110)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 51629863 - 51629632
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||      
51629863 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacaa 51629764  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
51629763 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 51629664  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
51629663 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 51629632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 51657124 - 51656893
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||      
51657124 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacaa 51657025  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
51657024 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 51656925  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
51656924 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 51656893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 4177448 - 4177677
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
4177448 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 4177547  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
4177548 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 4177647  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
4177648 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 4177677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 35012461 - 35012690
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
35012461 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 35012560  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
35012561 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaata 35012660  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
35012661 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 35012690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 5640384 - 5640155
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
5640384 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 5640285  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
5640284 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 5640185  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
5640184 cagagaattgagtttgaattgaacacttga 5640155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 12898655 - 12898426
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
12898655 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 12898556  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
12898555 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 12898456  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
12898455 cagagaattgagtttgaattgaacacttga 12898426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 21863194 - 21863423
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
21863194 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 21863293  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
21863294 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 21863393  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
21863394 cagagaattgagtttgaattgaacacttga 21863423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 33084094 - 33084324
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-t 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||  |    
33084094 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaat 33084193  T
100 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
33084194 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaat 33084293  T
200 acagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
33084294 acagagaattgagtttgacttgaacacttga 33084324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 5650941 - 5650712
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||    
5650941 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaacaatg 5650842  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
5650841 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 5650742  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
5650741 cagagaattgagtttgagttgaacacttga 5650712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 10998458 - 10998229
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
10998458 gaagtagtccggtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 10998359  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
10998358 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 10998259  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
10998258 cagagaattgagtttgaattgaacacttga 10998229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 12730080 - 12730309
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
12730080 gaagtagttcagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaatg 12730179  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
12730180 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 12730279  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
12730280 cagagaattgagtttgaattgaacacttga 12730309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 12740673 - 12740902
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
12740673 gaagtagttcagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaatg 12740772  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
12740773 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 12740872  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
12740873 cagagaattgagtttgaattgaacacttga 12740902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 19178492 - 19178721
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
19178492 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 19178591  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
19178592 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaata 19178691  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
19178692 cagagaattgagtttgagttgaacacttga 19178721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 19187371 - 19187600
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
19187371 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 19187470  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
19187471 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaata 19187570  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
19187571 cagagaattgagtttgagttgaacacttga 19187600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 35405068 - 35404837
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
35405068 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 35404969  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
35404968 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 35404869  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
35404868 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 35404837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 35649367 - 35649136
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
35649367 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 35649268  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
35649267 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 35649168  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
35649167 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 35649136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 38094607 - 38094838
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
38094607 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 38094706  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
38094707 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 38094806  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
38094807 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 38094838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 38105232 - 38105463
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
38105232 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 38105331  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
38105332 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 38105431  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
38105432 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 38105463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 7690136 - 7689904
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
7690136 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 7690037  T
100 --gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaac 197  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
7690036 atgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 7689937  T
198 atacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
7689936 atacagagaattgagtttgaattgaacacttga 7689904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 12614990 - 12614761
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
12614990 gaagtagtccagtcccccttccacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 12614891  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
12614890 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctactgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 12614791  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
12614790 cagagaattgagtttgaattgaacacttga 12614761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 12624455 - 12624226
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
12624455 gaagtagtccagtcccccttccacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 12624356  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
12624355 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctactgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 12624256  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
12624255 cagagaattgagtttgaattgaacacttga 12624226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 5832750 - 5832980
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
5832750 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 5832848  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
5832849 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 5832948  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
5832949 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 5832980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 5843352 - 5843582
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
5843352 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 5843450  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
5843451 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 5843550  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
5843551 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 5843582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 7506833 - 7507064
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
7506833 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 7506932  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
7506933 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaa 7507032  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
7507033 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 7507064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 7517430 - 7517661
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
7517430 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 7517529  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
7517530 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaa 7517629  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
7517630 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 7517661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 36237105 - 36236874
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
36237105 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 36237006  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
36237005 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaa 36236906  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
36236905 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 36236874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 36247652 - 36247421
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
36247652 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 36247553  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
36247552 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaa 36247453  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
36247452 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 36247421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 21877299 - 21877529
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
21877299 gaagtagtccaatcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 21877398  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatc-aaacaaacat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
21877399 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaacaaaaat 21877498  T
200 acagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
21877499 acagagaattgagtttgaattgaacacttga 21877529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 3171154 - 3171384
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
3171154 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 3171252  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
3171253 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 3171352  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
3171353 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 3171384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 3181756 - 3181986
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
3181756 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 3181854  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
3181855 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 3181954  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
3181955 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 3181986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 47608606 - 47608376
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
47608606 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 47608508  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
47608507 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcaataagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 47608408  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
47608407 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 47608376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 47619214 - 47618984
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
47619214 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 47619116  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
47619115 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcaataagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 47619016  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
47619015 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 47618984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 35638712 - 35638484
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
35638712 gaagtagtccagtcccccttccacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 35638613  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
35638612 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctactgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaat- 35638514  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
35638513 cagagaattgagtttgaattgaacacttga 35638484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 2538068 - 2538298
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
2538068 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 2538166  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
2538167 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaa 2538266  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
2538267 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 2538298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 5973291 - 5973520
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
5973291 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatg 5973390  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||     
5973391 ctcaagcacacacgcaagagtcttctaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatg 5973490  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||||||||    
5973491 caatgaattaagtttgacttgaacacttga 5973520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 154963 - 154733
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-t 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||  |    
154963 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaaat 154864  T
100 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacat 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||    
154863 gctcaaacacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaat 154764  T
200 acagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||  ||||| ||||||||||||||||||||    
154763 acaatgaattaagtttgacttgaacacttga 154733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 20441990 - 20441761
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
20441990 gaagtagtccactcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatg 20441891  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
20441890 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttataatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaata 20441791  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||  ||| | ||||||||||||||||||||    
20441790 caatgaaataagtttgacttgaacacttga 20441761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 4251242 - 4251009
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttc----acaaa 96  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    | |||    
4251242 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctaaaaaaaa 4251143  T
97 actgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 196  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
4251142 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaa 4251043  T
197 catacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
     |||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
4251042 aatacaatgaattaagtttgacttgaacacttga 4251009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 148872 - 148658
Alignment:
17 ccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-tgctcaagcacacacgc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
148872 ccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaaatgctcaagcacacacgc 148773  T
116 aagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacatacagagaattgagttt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  ||||| |||||    
148772 aagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagttt 148673  T
216 gacttgaacacttga 230  Q
    |||||||||||||||    
148672 gacttgaacacttga 148658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 7677377 - 7677606
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
7677377 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacgaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatg 7677476  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||    
7677477 ctcaaacacacacgcaagagttttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttccaatgctcaagcacacaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaata 7677576  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    || |||| | ||||||||||||||||||||    
7677577 caaagaaataagtttgacttgaacacttga 7677606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 17956771 - 17956978
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
17956771 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatg 17956870  T
101 ctc-aagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacat 199  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||    
17956871 ctcaaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaaacactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgtaggcaagagacttctgttcaaacaaaaat 17956970  T
200 acagagaa 207  Q
    ||||||||    
17956971 acagagaa 17956978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 18382577 - 18382348
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
18382577 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaagagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tg 18382479  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca-t 199  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |    
18382478 ctcaagcacacatgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaaat 18382379  T
200 acagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||| |||    |||||||||||||||||||    
18382378 acagggaaacatgtttgacttgaacacttga 18382348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 39586504 - 39586732
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
39586504 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tg 39586602  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||    
39586603 ctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttttaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttatgatcaaacaaaaata 39586702  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |   ||| | ||||||| ||||||||||||    
39586703 ccatgaaataagtttgatttgaacacttga 39586732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 81 - 230
Target Start/End: Original strand, 4166872 - 4167021
Alignment:
81 tatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagaga 180  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
4166872 tatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagaga 4166971  T
181 cttctaatcaaacaaacatacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
4166972 cttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttga 4167021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 39194769 - 39194538
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| |||||      
39194769 gaagtagtccagtcccccttgcacttccagctagatttcactacaatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaaa 39194670  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |    
39194669 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacacaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaa 39194570  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||  ||| | ||||||||||||||||||||    
39194569 tacaatgaaataagtttgacttgaacacttga 39194538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 12944741 - 12944971
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |    
12944741 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-t 12944839  T
100 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     ||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |    
12944840 actcaagcacgcaggcaagagacttacaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaa 12944939  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||||||||    |||||||||||||||||||    
12944940 tacagagaaaaatgtttgacttgaacacttga 12944971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 23580970 - 23580816
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
23580970 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 23580871  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 155  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23580870 cttaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttct 23580816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 20196367 - 20196171
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |    
20196367 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-t 20196269  T
100 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 196  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
20196268 gctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaa 20196171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 11195744 - 11195536
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagattt-cactataa-tcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||     
11195744 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcattaaaaatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa- 11195646  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaac 197  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||     
11195645 tgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgatcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcaagcaggcaagaggcttctattcaaacaaaa 11195546  T
198 atacagagaa 207  Q
    ||||||||||    
11195545 atacagagaa 11195536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 9051132 - 9050994
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
9051132 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatg 9051033  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 139  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
9051032 ctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcac 9050994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 47194736 - 47194919
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
47194736 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tg 47194834  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttc 184  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||| | ||||||  ||||||||| ||||    
47194835 ctcaagcacataggcaagagtcttccaatgctcaagcacataggcaagagtcttccaatgatcaagcacataggcaagagtcttc 47194919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 14388804 - 14388608
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagattt-cacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||     
14388804 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa- 14388706  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttc-taatcaaaca 194  Q
    ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||    
14388705 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttcttaatcaaaca 14388608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 18311649 - 18311454
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagattt-cacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||     
18311649 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaataatcacacatattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa- 18311551  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 194  Q
    ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||    
18311550 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaaca 18311454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22610653 - 22610420
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||    
22610653 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactttctag-tatgagacttctca 22610555  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 193  Q
    ||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
22610554 aa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaggagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaac 22610457  T
194 aaacatacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    | |  |||| ||||    |||||||||||||||||||    
22610456 agaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttga 22610420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 674978 - 675173
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| ||||      
674978 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccacaaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctag-tatgagacttctcaaa-- 675074  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 196  Q
    ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
675075 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaacgctcaagcacgcaggcgagaggcttctaatcaaacaaa 675173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 41133293 - 41133100
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 98  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| ||||      
41133293 gaagtagtccagtcccccttgtacttccaaggagatttccactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctag-tatgagacttctcaaa-- 41133197  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 194  Q
    ||||||||||| || || || | |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
41133196 tgctcaagcacgcaggcgagggacttccaatgctcaagcactaaaacaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaaca 41133100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 230
Target Start/End: Original strand, 47194896 - 47195024
Alignment:
102 tcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacatac 201  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
47194896 tcaagcacataggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatac 47194995  T
202 agagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |  ||| | ||||||||||||||||||||    
47194996 aatgaaataagtttgacttgaacacttga 47195024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 16710366 - 16710457
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttca 92  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||    
16710366 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttca 16710457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 46181529 - 46181367
Alignment:
1 gaagtagtccag-ccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcac 93  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| |    
46181529 gaagtagtccagtccccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatctag-tatgagacttccc 46181431  T
94 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 158  Q
    |||  ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
46181430 aaa--tgctcaagcacgcatgcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 46181367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 5929106 - 5929302
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagattt-cacta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 94  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||     |||||||| |||||| || |||||||||||| | |  ||||||||||| ||    
5929106 gaagtagtctagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaagaaataatcacacagatta-aactgctcaatactacctag-tatgagacttccca 5929203  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 193  Q
    ||  ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||    
5929204 aa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaac 5929301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Original strand, 4717664 - 4717736
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatact 73  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
4717664 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatact 4717736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 28379389 - 28379588
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagattt-cacta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcac 93  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||     |||||||| ||||||||| || |||||||||  |  | |||||||||||||    
28379389 gaagtagtccattcccccttgcacttccaaggagattttcactaagtaataatcacacagattacaactgttcaatactacacctagtatgagacttcac 28379488  T
94 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaa 192  Q
    |||  ||||||||||||||  |||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||    
28379489 aaa--tgctcaagcacacaaacaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 28379586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 158
Target Start/End: Original strand, 28473660 - 28473818
Alignment:
4 gtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 97  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| | |||||||||| | |  ||||||||||||||||     
28473660 gtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactactcaatactacctag-tatgagacttcacaaa- 28473757  T
98 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 158  Q
     ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
28473758 -tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 28473818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 22018727 - 22018925
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagattt-cacta----taatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||    |||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||||    
22018727 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggatattttcactaagtttaatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaca 22018826  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 193  Q
    ||  ||||||||||| || ||||||  |||||  |||||||||||||| | ||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||    
22018827 aa--tgctcaagcacgcaggcaagacacttcctttgctcaagcactaaagaaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaac 22018924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 23926458 - 23926657
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcac 93  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||| |    
23926458 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttctc 23926557  T
94 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaa 192  Q
    ||   |||||||| || || ||||||| |||||  |||||||||||  || ||||||||||| |||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||    
23926558 aat--tgctcaaggacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaa 23926655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 45071278 - 45071117
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| | ||||||| |||||||||||| |  | ||||||||||| ||    
45071278 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacaaattacaactgctcaatacta-cgtagtatgagacttccca 45071180  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 158  Q
    ||  ||||||||||| || || |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
45071179 aa--tgctcaagcacgcaggctagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 45071117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 22642259 - 22642448
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcac 93  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||||  |  | |||||||||||||    
22642259 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaagaagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcac 22642358  T
94 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttc 184  Q
    |||  ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||  | ||||||||||||    
22642359 aaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactcaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 22642448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 127 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 9051036 - 9050932
Alignment:
127 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacatacagagaattgagtttgacttgaaca 225  Q
    |||||||||||||  || |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |   |||||||||||||    
9051036 aatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctaatcaaacaaaaatacagagaaatatttttgacttgaaca 9050937  T
226 cttga 230  Q
    |||||    
9050936 cttga 9050932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 20251200 - 20251361
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcac 93  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||     
20251200 gaagtagtccattcccccttgcacttccaaggagatttccactaacaaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaa 20251299  T
94 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 156  Q
    |||  ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
20251300 aaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcta 20251361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 26548942 - 26548744
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||    ||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||||    
26548942 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcactcttattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaca 26548843  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 193  Q
    ||  ||||||||||| ||  |||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  |  ||||||||||||| ||||||    
26548842 aa--tgctcaagcacgcagtcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaaccaagagacttctattcaaac 26548745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 19171011 - 19170813
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcac 93  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | |||||||||||      
19171011 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttc-- 19170914  T
94 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaa 192  Q
     ||| ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||   |||| ||||||  | |||||||||||||| |||||    
19170913 -aaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 19170815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 143 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 23580857 - 23580771
Alignment:
143 gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacatacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||  || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
23580857 gcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttga 23580771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 99 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 19965825 - 19965763
Alignment:
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgct 161  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
19965825 tgctcaagcacgcaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaggagacttctaatgct 19965763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 43 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 20884483 - 20884370
Alignment:
43 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-a 141  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||| ||||  ||||||||||| || || ||||  |||||||||||||||||| |    
20884483 ataatcacacagattacaactgctcaatactatc-tagtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagaattccaatgctcaagcactaa 20884387  T
142 agcaagagacttctaat 158  Q
    |||||||||||||||||    
20884386 agcaagagacttctaat 20884370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 17370437 - 17370633
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcac 93  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||     
17370437 gaagtagtcgagtccccattgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca- 17370535  T
94 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaa 192  Q
      || ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||    
17370536 --aattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 17370633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 25218094 - 25218042
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 53  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25218094 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 25218042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 34256188 - 34256004
Alignment:
14 cccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaag 106  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||   || ||||||||    
34256188 cccccttgcacttccaagtagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaag 34256092  T
107 cacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 194  Q
    ||| || ||||||| |||||  |||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||  | ||||||||||||| ||||||||    
34256091 cacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcacacagcaagagacttcttatgctcaagcactaaagcaagagacttcttatcaaaca 34256004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 36551211 - 36551159
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 53  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36551211 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 36551159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Original strand, 13223586 - 13223637
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 52  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13223586 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 13223637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 24049171 - 24049120
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 52  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24049171 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 24049120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Original strand, 36100073 - 36100124
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 52  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36100073 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 36100124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 9749892 - 9749843
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac 50  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9749892 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac 9749843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 94 - 194
Target Start/End: Original strand, 19037499 - 19037600
Alignment:
94 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaa 192  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||   |||| ||||||  | ||||||||||||||||||||    
19037499 aaaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaa 19037598  T
193 ca 194  Q
    ||    
19037599 ca 19037600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 99 - 194
Target Start/End: Original strand, 22642392 - 22642488
Alignment:
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 194  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||||    
22642392 tgctcaagcactcaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 22642488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 158
Target Start/End: Original strand, 44200443 - 44200604
Alignment:
5 tagtccagccccccttgcacttccaaggagattt-cacta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 98  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||| |  | ||||||||||||||||      
44200443 tagttcagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatacta-cctagtatgagacttcacaaa-- 44200539  T
99 tgctcaagca----cacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 158  Q
    ||||||||||    | |||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
44200540 tgctcaagcatgcgcgcacgcaagagacttcatatgctcaagcactaaagcaagagatttctaat 44200604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 52351250 - 52351174
Alignment:
81 tatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 158  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| || | ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
52351250 tatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggtaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 52351174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 46181429 - 46181325
Alignment:
127 aatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacatacagagaattgagtttgacttgaaca 225  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| |  |||| ||||    ||||||||||||||    
46181429 aatgctcaagcacgcatgcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaaca 46181330  T
226 cttga 230  Q
    |||||    
46181329 cttga 46181325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 157
Target Start/End: Original strand, 9346299 - 9346358
Alignment:
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaa 157  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||    
9346299 tgctcaagcatacacgcaagagtcttcctatgctcaagcacaaaaacaagagacttctaa 9346358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 16233683 - 16233624
Alignment:
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaa 157  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||    
16233683 tgctcaagcacaaacgcaagagtcttcctatgctcaagcacaaaagcaagaaacttctaa 16233624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 23975533 - 23975486
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 48  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
23975533 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaagaagatttaactataatc 23975486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 156
Target Start/End: Original strand, 21543566 - 21543624
Alignment:
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 156  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
21543566 tgctcaagcacacaagcaagagactttctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 21543624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 22202418 - 22202376
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcacta 43  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
22202418 gaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 22202376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 7745721 - 7745595
Alignment:
14 cccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatca-aaatatgagacttcacaaaactgctcaagc 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||| ||||||||| ||||||||||||  | || |||||||||||       |||||||||    
7745721 cccccttgcacttccaaggagagtttcactaaaaataatcacacagattacaattgctcaatactacaacaagtatgagacttc----ctttgctcaagc 7745626  T
108 acacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 139  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
7745625 acaca-gcaagagacttcctatgctcaagcac 7745595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 17025551 - 17025451
Alignment:
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 193  Q
    ||||| ||||||||||   |||||||  |||| ||||||||| |||||  |||||||||||  ||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||    
17025551 aaactactcaagcacaactgcaagagatttcctatgctcaagaactaaatcaagagacttcctatgctcaagcacacaagcaagagacttctattcaaac 17025452  T
194 a 194  Q
    |    
17025451 a 17025451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 20867383 - 20867299
Alignment:
146 agagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacatacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| |  |||| ||||    |||||||||||||||||||    
20867383 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttga 20867299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 21541200 - 21541243
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggaga-tttcacta 43  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
21541200 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcacta 21541243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 19037403 - 19037441
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc 39  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
19037403 gaagtagtccagtccaccttgcacttccaaggagatttc 19037441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 20867383 - 20867341
Alignment:
117 agagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 158  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
20867383 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 20867341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 23058990 - 23059028
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc 39  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
23058990 gaagtagttcagtcccccttgcacttccaaggagatttc 23059028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 26280605 - 26280547
Alignment:
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttcta 156  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||    
26280605 tgctcaagcacaaacgcaagagacttcatatgctcaagcacaaaagcaagagacttcta 26280547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Original strand, 7309312 - 7309401
Alignment:
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaa 187  Q
    ||||||||||||   ||||||| ||||| ||||||||| ||  || |||||||||||||||| | ||||||  | |||||||||||||||    
7309312 tgctcaagcacaactgcaagagacttcctatgctcaagaacacaatcaagagacttctaatgttcaagcacaaatgcaagagacttctaa 7309401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 101 - 153
Target Start/End: Original strand, 22639779 - 22639832
Alignment:
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagactt 153  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||    
22639779 ctcaagcacacaagcaagagacttcaaatgctcaagcacaaaagcaagagactt 22639832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 114 - 194
Target Start/End: Original strand, 22654989 - 22655070
Alignment:
114 gcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 194  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  |  ||||||||||||| |||||||    
22654989 gcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaaccaagagacttctattcaaaca 22655070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 18130570 - 18130506
Alignment:
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaat 158  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||  |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
18130570 aaactactcaagcacaaaagcaagaggtttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttctaat 18130506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 18614313 - 18614361
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 49  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
18614313 gaagtagtccactcccccttgaacttccaaggagaattcactaaaatca 18614361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 146 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 20884412 - 20884328
Alignment:
146 agagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacatacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||| ||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| |  |||| ||||    |||||||||||||||||||    
20884412 agagaattccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaaatgtttgacttgaacacttga 20884328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 22601267 - 22601219
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 49  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
22601267 gaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 22601219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 26280633 - 26280537
Alignment:
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 196  Q
    |||||||||| | |||||||  |||  |||||||||||| || ||||||||||||  ||||| ||||||  | ||||||||||||||  ||||||||    
26280633 ctcaagcacaaaagcaagagatttcttatgctcaagcacaaacgcaagagacttcatatgctcaagcacaaaagcaagagacttctagacaaacaaa 26280537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 127 - 194
Target Start/End: Original strand, 28473756 - 28473824
Alignment:
127 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 194  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||  ||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||    
28473756 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaaca 28473824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 31358761 - 31358809
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatc 48  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
31358761 gaagtagtccaatcccccctgcacttccaaggagattttcactataatc 31358809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 100)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 6319180 - 6318951
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
6319180 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 6319081  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
6319080 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaata 6318981  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
6318980 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 6318951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 26110847 - 26111076
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
26110847 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 26110946  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
26110947 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 26111046  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
26111047 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 26111076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 9857141 - 9856912
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
9857141 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 9857042  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
9857041 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 9856942  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
9856941 cagagaattgagtttgaattgaacacttga 9856912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 43247941 - 43248170
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
43247941 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 43248040  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
43248041 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttttaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 43248140  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
43248141 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 43248170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 3220248 - 3220477
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
3220248 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 3220347  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
3220348 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaaacacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaata 3220447  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
3220448 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 3220477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 18448986 - 18449215
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
18448986 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgcgcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 18449085  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
18449086 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 18449185  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
18449186 cagagaattgagtttgagttgaacacttga 18449215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 19128364 - 19128593
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
19128364 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 19128463  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
19128464 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaata 19128563  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
19128564 cagagaattgagtttgagttgaacacttga 19128593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 32078360 - 32078131
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
32078360 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 32078261  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
32078260 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaacaata 32078161  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
32078160 cagagaattgagtttgaattgaacacttga 32078131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 32088933 - 32088704
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
32088933 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 32088834  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
32088833 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaacaata 32088734  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
32088733 cagagaattgagtttgaattgaacacttga 32088704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 36292535 - 36292766
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
36292535 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 36292634  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
36292635 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 36292734  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
36292735 tacagagagttgagtttgaattgaacacttga 36292766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 36303138 - 36303369
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
36303138 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 36303237  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
36303238 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 36303337  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
36303338 tacagagagttgagtttgaattgaacacttga 36303369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 6150685 - 6150913
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
6150685 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 6150783  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
6150784 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 6150883  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
6150884 cagagaattgagtttgaattgaacacttga 6150913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 6160640 - 6160868
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
6160640 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 6160738  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
6160739 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 6160838  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
6160839 cagagaattgagtttgaattgaacacttga 6160868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 241438 - 241669
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
241438 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 241537  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
241538 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 241637  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||    
241638 tacagagaattgagtttgaattaaacacttga 241669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 252023 - 252254
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
252023 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 252122  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
252123 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 252222  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||    
252223 tacagagaattgagtttgaattaaacacttga 252254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 794793 - 795024
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
794793 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 794892  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
794893 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 794992  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||    
794993 tacagagaattgagtttgaattaaacacttga 795024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 849633 - 849402
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
849633 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 849534  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
849533 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 849434  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||    
849433 tacagagaattgagtttgaattaaacacttga 849402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 3349292 - 3349062
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
3349292 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 3349194  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
3349193 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 3349094  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
3349093 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 3349062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 3359889 - 3359659
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
3359889 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 3359791  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
3359790 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 3359691  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
3359690 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 3359659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 9340759 - 9340989
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
9340759 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 9340857  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
9340858 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 9340957  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
9340958 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 9340989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 9367903 - 9368133
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
9367903 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 9368001  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
9368002 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 9368101  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
9368102 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 9368133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 44480706 - 44480936
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
44480706 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 44480804  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
44480805 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 44480904  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
44480905 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 44480936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 44491322 - 44491552
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
44491322 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 44491420  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
44491421 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 44491520  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
44491521 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 44491552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 26120522 - 26120754
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||       
26120522 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaa 26120621  T
99 -tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaac 197  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
26120622 ttgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 26120721  T
198 atacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
26120722 atacagagaattgagtttgaattgaacacttga 26120754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 31214628 - 31214857
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
31214628 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaatg 31214727  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
31214728 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaata 31214827  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    || |||||| |||||||||| |||||||||    
31214828 caaagaattaagtttgacttaaacacttga 31214857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 210819 - 210588
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
210819 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 210720  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
210719 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 210620  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||||    
210619 tacagagaattgagattgaattaaacacttga 210588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 724442 - 724211
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
724442 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 724343  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
724342 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 724243  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||||    
724242 tacagagaattgagattgaattaaacacttga 724211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 29076346 - 29076576
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
29076346 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 29076444  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
29076445 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaa 29076544  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
29076545 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 29076576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 29086597 - 29086827
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
29086597 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 29086695  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
29086696 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaa 29086795  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
29086796 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 29086827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 36077552 - 36077782
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
36077552 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 36077650  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
36077651 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 36077750  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
36077751 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 36077782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 36088138 - 36088368
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
36088138 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 36088236  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
36088237 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 36088336  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
36088337 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 36088368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15791964 - 15791734
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-t 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || || |||||||||||||||||  |    
15791964 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcagtactttctaagtatgagacttcacaaaaaat 15791865  T
100 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacat 199  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
15791864 gctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaat 15791765  T
200 acagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
15791764 acagagaattgagtttgaattgaacacttga 15791734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 19138896 - 19139125
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |     
19138896 gaagtagtccaatcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatt 19138995  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
19138996 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcgctaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaata 19139095  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
19139096 cagagaattgagtttgagttgaacacttga 19139125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 20161895 - 20161666
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
20161895 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatg 20161796  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
20161795 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctaatcaaacaaaaata 20161696  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||||||||    
20161695 caatgaattaagtttgacttgaacacttga 20161666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 13689234 - 13689003
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
13689234 gaagtagtccagtcccccttgcactttcaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 13689135  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
13689134 tgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaa 13689035  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
13689034 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 13689003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 23470125 - 23469896
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
23470125 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatg 23470026  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
23470025 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaata 23469926  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||||||||    
23469925 caatgaattaagtttgacttgaacacttga 23469896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15781375 - 15781145
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-t 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| || || |||||||||||||||||  |    
15781375 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttcactataatcacaaagattgcaactgctcagtactttctaagtatgagacttcacaaaaaat 15781276  T
100 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacat 199  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
15781275 gctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaat 15781176  T
200 acagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
15781175 acagagaattgagtttgaattgaacacttga 15781145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 19224550 - 19224779
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| ||||| ||    
19224550 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctttaagtatgagacttctcaaaaatg 19224649  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
19224650 cttaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaata 19224749  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||||||||    
19224750 caatgaattaagtttgacttgaacacttga 19224779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 19417967 - 19418197
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact 99  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |    
19417967 gaagtagtccagtcccctttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat 19418066  T
100 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||    
19418067 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaat 19418166  T
200 acagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||  ||| | ||||||||||||||||||||    
19418167 acaatgaaataagtttgacttgaacacttga 19418197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 19428542 - 19428772
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact 99  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |    
19428542 gaagtagtccagtcccctttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat 19428641  T
100 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||    
19428642 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaat 19428741  T
200 acagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||  ||| | ||||||||||||||||||||    
19428742 acaatgaaataagtttgacttgaacacttga 19428772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 16746616 - 16746845
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
16746616 gaagtagttcagtcccccttgcacttccaaggagattttactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatg 16746715  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||| |||||||||| |||    
16746716 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcatgcaagactcttctgatcaaacaaaaata 16746815  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    || |||| | ||||||||||||||||||||    
16746816 caaagaaataagtttgacttgaacacttga 16746845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 30315365 - 30315131
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||  ||    
30315365 gaagtactccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaagatg 30315266  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggc-----aagagacttctaatcaaacaa 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     ||||||||||| |||||||||    
30315265 ctcaagcacacacgcaagagtcttccgatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagataagagacttctgatcaaacaa 30315166  T
196 acatacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    | |||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
30315165 aaatacaatgaattaagtttgacttgaacacttga 30315131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 18153353 - 18153582
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
18153353 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tg 18153451  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca-t 199  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |    
18153452 ctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatactcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatt 18153551  T
200 acagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||  || |  |||||||||||||||||||    
18153552 acaggaaaatatgtttgacttgaacacttga 18153582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 40213833 - 40213603
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
40213833 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcagaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatg 40213734  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||    
40213733 ctcaagcacgcaggcaaaagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttatattcaaacaaaaata 40213634  T
201 cagag-aattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||| || |  |||||||||||||||||||    
40213633 cagagaaaatatgtttgacttgaacacttga 40213603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 18157872 - 18158101
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
18157872 gaagtagtccagtcccccttccacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tg 18157970  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca-t 199  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |    
18157971 ctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatactcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatt 18158070  T
200 acagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||  || |  |||||||||||||||||||    
18158071 acaggaaaatatgtttgacttgaacacttga 18158101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 18769802 - 18769572
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
18769802 gaagtagtccagtcccccttgcaatttcaaggagatttcaccataatcacaaagattaaaaatgttcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatg 18769703  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca-t 199  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
18769702 ctcaagcacagacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaaat 18769603  T
200 acagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||  ||| |  |||||||||||||||||||    
18769602 acaatgaaatatgtttgacttgaacacttga 18769572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 13697345 - 13697185
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||      
13697345 gaagtagtccagtcccccttgcactttcaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 13697246  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatg 159  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13697245 tgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatg 13697185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 20195601 - 20195739
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
20195601 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttaactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatg 20195700  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
20195701 ctcaagcacacacgcaagagtcttctaatgctcaagcac 20195739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22167692 - 22167459
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||    
22167692 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatctag-tatgagacttctca 22167594  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 193  Q
    ||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
22167593 aa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaac 22167496  T
194 aaacatacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    | |  |||| ||||    |||||||||||||||||||    
22167495 agaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttga 22167459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22136527 - 22136294
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||    
22136527 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatctag-tatgagacttctca 22136429  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 193  Q
    ||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||    
22136428 aa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatgctcaagcaggcaggcgagagacttctaatcaaac 22136331  T
194 aaacatacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    | |  |||| ||||    |||||||||||||||||||    
22136330 agaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttga 22136294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 3843137 - 3843332
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcacta--taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |  |||||||| ||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| ||||      
3843137 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccagaaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctag-tatgagacttctcaaa-- 3843233  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 196  Q
    ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
3843234 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaa 3843332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 20260283 - 20260088
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||  | |  ||||||||||| ||||      
20260283 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaataatcacacagattacaaatgctcagtactcactag-tatgagacttctcaaa-- 20260187  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 196  Q
    ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
20260186 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttttaatgctcaagcatgcaggcgagaggcttctaatcaaacaaa 20260088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 21046913 - 21046718
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||  | |  ||||||||||| ||||      
21046913 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaataatcacacagattacaaatgctcagtactcactag-tatgagacttctcaaa-- 21046817  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 196  Q
    ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
21046816 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttttaatgctcaagcatgcaggcgagaggcttctaatcaaacaaa 21046718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 23363743 - 23363920
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaa 95  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||| |||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||| |||    
23363743 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaaaaataatcacacagattacaaatgttcaatactctcttagtatgagacttctcaa 23363842  T
96 aactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggc 174  Q
    |  ||||||||| | || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
23363843 a--tgctcaagcgcgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggc 23363920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 7019085 - 7018894
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| ||    
7019085 gaagtagtccaatcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctag-tatgagacttctca 7018987  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaat 188  Q
    ||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||  | ||||||| ||||||||    
7018986 aa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaat 7018894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 15998880 - 15998808
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatact 73  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15998880 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatact 15998808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 23270603 - 23270531
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatact 73  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23270603 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatact 23270531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 26735642 - 26735573
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaat 70  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26735642 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaat 26735573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 19460608 - 19460767
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||||||    
19460608 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacctag-tatgagacttcaca 19460706  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 156  Q
    ||  ||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
19460707 aa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactcgagcaagagacttcta 19460767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 19558286 - 19558445
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||||||    
19558286 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacctag-tatgagacttcaca 19558384  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 156  Q
    ||  ||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
19558385 aa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactcgagcaagagacttcta 19558445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 23271848 - 23271689
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| | |||||||||| | |  ||||||||||||||    
23271848 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactactcaatactacctag-tatgagacttcaca 23271750  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 156  Q
    ||  ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
23271749 aa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 23271689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 127 - 230
Target Start/End: Original strand, 20195697 - 20195801
Alignment:
127 aatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacatacagagaattgagtttgacttgaaca 225  Q
    |||||||||||||  | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||    
20195697 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctaatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttgaaca 20195796  T
226 cttga 230  Q
    |||||    
20195797 cttga 20195801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Original strand, 23290516 - 23290593
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaa 79  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||    
23290516 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaa 23290593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 29378996 - 29379157
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaa-agattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcac 93  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    ||||||||  ||||||||| ||||||||||||  |  | |||||||||||||    
29378996 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacaccagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcac 29379095  T
94 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 156  Q
    |||  ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
29379096 aaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcta 29379157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 22212030 - 22211869
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||    
22212030 gaagtagtccagtcccctttgcactttcaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactctctag-tatgagacttccca 22211932  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 158  Q
    ||  |||||| |||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
22211931 aa--tgctcaggcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 22211869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 17519820 - 17519623
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||| ||||||||| || |||||||||  |  | ||||||||||||||    
17519820 gaagtagttcagttccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacacagattacaactgatcaatactacacctagtatgagacttcaca 17519721  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 193  Q
    ||  ||||||||||| || ||||||| |||||  |||| ||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||    
17519720 aa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctaaagcactaaagcaaaagacttct-atgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaac 17519624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 40002615 - 40002814
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-----actataatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcac 93  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||     | | |||||||||  |||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||     
40002615 gaagtagtccagtcccccttgcacttctaaggagagttccattaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca- 40002713  T
94 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaa 192  Q
     ||| ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||    
40002714 -aaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 40002812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 7018954 - 7018854
Alignment:
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcagg----caagagacttctaatcaaac 193  Q
    |||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||    | ||||||||||||||||||    
7018954 tgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgatcgagagacttctaatcaaac 7018855  T
194 a 194  Q
    |    
7018854 a 7018854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 8031444 - 8031608
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcac 93  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | |||||||||||||    
8031444 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcac 8031543  T
94 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagca-ct-aagcaagagacttctaat 158  Q
    |||  ||||||||||| ||   ||||| |||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||    
8031544 aaa--tgctcaagcacgcagaaaagagacttcctttgctcaagcagctaaagcaagagacttctaat 8031608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 28902857 - 28903054
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||    |||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  |  ||||||||| |      
28902857 gaagtagttcagtcccccttgcacttccaaggagagttccactaagtttaatcacacagattacaactgctcaatactacacctagcatgagacttta-- 28902954  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 193  Q
     || ||||||||||| || ||||||| |||||  | |||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||    
28902955 -aattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttactcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaac 28903053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 45568666 - 45568479
Alignment:
14 cccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaag 106  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||   || ||||||||    
45568666 cccccttacacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaag 45568570  T
107 cacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 196  Q
    |||||| |||| || |||||  |||||||||||  ||||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||||||    
45568569 cacacaggcaaaagacttcctttgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacaaa 45568479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 194
Target Start/End: Original strand, 21287805 - 21287990
Alignment:
14 cccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaag 106  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||   || ||||||||    
21287805 cccccttgcacttccaacgagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaag 21287901  T
107 cacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 194  Q
     ||||| ||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||||    
21287902 tacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 21287990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 12541071 - 12541118
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 48  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12541071 gaagtagtccaatcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 12541118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 194
Target Start/End: Original strand, 21298504 - 21298600
Alignment:
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 194  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||||  |||||  |||||  | |||||||||||||| |||||||    
21298504 tgctcaagcacacaagcaagagacttcctttgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcgagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 21298600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 24498832 - 24498761
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagattt--cactataatcaca-aagattacaaatgctcaa 69  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
24498832 gaagtagtccagtcccccttgcatttcgaaggagattttccactataatcacacaagattacaattgctcaa 24498761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 156
Target Start/End: Original strand, 21540474 - 21540532
Alignment:
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 156  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
21540474 tgctcaagcacacatgcaagagacttcctatgctcaagcactaaagaaagagacttcta 21540532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 104 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 24679024 - 24678970
Alignment:
104 aagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagc-actaagcaagagacttctaa 157  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||    
24679024 aagcacacacgcaagagtcttcctatgctcaagcaaaaaagcaagagacttctaa 24678970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 16376096 - 16376048
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 49  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
16376096 gaagtagtcatgacccccttgcacttccaaggagatttcactaaaatca 16376048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 194
Target Start/End: Original strand, 18557517 - 18557617
Alignment:
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 193  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||  |||| ||| |||||||| || ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||    
18557517 aaactactcaagcacaaaagcaagaggtttcctatgttcaagcacaaacgcaagagacttcatatgctcaagcacaaaagcaagagacttctattcaaac 18557616  T
194 a 194  Q
    |    
18557617 a 18557617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Original strand, 24634774 - 24634847
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggaga--tttcactataatcaca---aagattacaaatgctcaa 69  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||||||||| |||||    
24634774 gaagtagtccagtctcccttgcccttccaaggagatttttcactataatcacacacaagattacaaattctcaa 24634847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 1210469 - 1210399
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa--agattacaaatgctcaa 69  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
1210469 gaagtagtcctgtccctcttgcacttccaaggagagttcactaaaatcagaatctgattacaaatgctcaa 1210399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 15934277 - 15934195
Alignment:
115 caagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 196  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| ||||||    |||||||||||||| |||||||||    
15934277 caagagacttcctatgctcaagcacaactgcaagagacttcttatgctcaagcacaactgcaagagacttctattcaaacaaa 15934195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 15934423 - 15934381
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcacta 43  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||    
15934423 gaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 15934381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 15969558 - 15969520
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc 39  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
15969558 gaagtagtccggtcccccttgcacttccaaggagatttc 15969520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 69
Target Start/End: Original strand, 17687410 - 17687479
Alignment:
3 agtagtccagccccccttgcacttccaaggaga--tttcactataatcaca-aagattacaaatgctcaa 69  Q
    ||||||| || | ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
17687410 agtagtcaagtctcccttgcacttccaaagagatttttcactataatcacataagattacaattgctcaa 17687479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 148
Target Start/End: Original strand, 17879155 - 17879205
Alignment:
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaaga 148  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
17879155 tgctcaagcacacaagcaagagactttcaatgctcaagcacataagcaaga 17879205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 19153422 - 19153464
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcacta 43  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||    
19153422 gaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 19153464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 23433660 - 23433607
Alignment:
16 cccttgcacttccaaggagatttcactataatcaca-aagattacaaatgctcaa 69  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
23433660 cccttgcacttccaagg-gatttcactataataacacatgattacaaatgctcaa 23433607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 43644286 - 43644328
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcacta 43  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||    
43644286 gaagtagtcctgccccccttgcaattccaaggagagttcacta 43644328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 43
Target Start/End: Original strand, 19706906 - 19706947
Alignment:
2 aagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcacta 43  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||    
19706906 aagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 19706947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 43
Target Start/End: Original strand, 19942626 - 19942667
Alignment:
2 aagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcacta 43  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||    
19942626 aagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 19942667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 29772272 - 29772215
Alignment:
14 cccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac-aaagattacaaatgctcaat 70  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||    
29772272 cccccttgcattttcaaggagttttcattataatcactaaagattacaaatgttcaat 29772215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 1210405 - 1210305
Alignment:
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagactt-cta-atgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaa 195  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||  |||||||||| || ||| ||||| ||||||  | |||| |||||||||| |||||||    
1210405 tgctcaagcacacaagcaagagacttcaaatactcaagcacacaagcaagagatttcctatatgctcaagcacagaagcaaaagacttctaaacaaacaa 1210306  T
196 a 196  Q
    |    
1210305 a 1210305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 17928477 - 17928525
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 49  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
17928477 gaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 17928525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 18557440 - 18557487
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 49  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
18557440 gaagtagtcca-ctccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 18557487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 194
Target Start/End: Original strand, 21540444 - 21540540
Alignment:
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 194  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||| ||||||  | | |||||||||||| |||||||    
21540444 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcacacatgcaagagacttcctatgctcaagcactaaagaaagagacttctattcaaaca 21540540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 146 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 22211911 - 22211863
Alignment:
146 agagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 194  Q
    ||||||||| |||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||    
22211911 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaaca 22211863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 24679149 - 24679101
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 49  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
24679149 gaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 24679101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 157
Target Start/End: Original strand, 27739408 - 27739464
Alignment:
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaa 157  Q
    |||||||||||| | |||||  |||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
27739408 ctcaagcacacaagtaagagatttcctatgctcaagcagaaagcaagagacttctaa 27739464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 45539183 - 45539155
Alignment:
15 ccccttgcacttccaaggagatttcacta 43  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
45539183 ccccttgcacttccaaggagatttcacta 45539155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 90)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 9763417 - 9763188
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||    
9763417 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaaatatgagacttcacaaaaatg 9763318  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
9763317 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 9763218  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
9763217 cagagaattgagtttgaattgaacacttga 9763188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 16768522 - 16768751
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
16768522 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 16768621  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
16768622 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaata 16768721  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
16768722 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 16768751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 30489473 - 30489244
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||    
30489473 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcaaaagactg 30489374  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
30489373 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 30489274  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||    
30489273 ctgagaattgagtttgaattgaacacttga 30489244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 43082233 - 43082462
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
43082233 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 43082332  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
43082333 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaata 43082432  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
43082433 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 43082462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 1099844 - 1099615
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
1099844 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 1099745  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
1099744 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 1099645  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
1099644 cagagaattgagtttgaattgaacacttga 1099615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 4099393 - 4099622
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
4099393 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 4099492  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
4099493 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 4099592  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
4099593 cagagaattgagtttgaattgaacacttga 4099622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 4209468 - 4209697
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
4209468 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 4209567  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
4209568 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 4209667  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
4209668 cagagaattgagtttgaattgaacacttga 4209697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 7006456 - 7006227
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
7006456 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 7006357  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
7006356 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 7006257  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
7006256 cagagaattgagtttgagttgaacacttga 7006227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 9773953 - 9773724
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
9773953 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 9773854  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
9773853 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 9773754  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
9773753 cagagaattgagtttgaattgaacacttga 9773724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 11389458 - 11389229
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
11389458 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 11389359  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
11389358 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 11389259  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
11389258 cagagaattgagtttgaattgaacacttga 11389229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22915513 - 22915284
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
22915513 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 22915414  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
22915413 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 22915314  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
22915313 cagagaattgagtttgaattgaacacttga 22915284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22960981 - 22960752
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
22960981 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 22960882  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
22960881 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 22960782  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
22960781 cagagaattgagtttgaattgaacacttga 22960752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 24328383 - 24328154
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
24328383 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 24328284  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
24328283 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 24328184  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
24328183 cagagaattgagtttgagttgaacacttga 24328154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 24339053 - 24338824
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
24339053 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaattg 24338954  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
24338953 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 24338854  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
24338853 cagagaattgagtttgagttgaacacttga 24338824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 43092842 - 43093071
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
43092842 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 43092941  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
43092942 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagtaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaata 43093041  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
43093042 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 43093071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 4220060 - 4220289
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
4220060 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactactcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 4220159  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
4220160 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 4220259  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
4220260 cagagaattgagtttgaattgaacacttga 4220289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 17858086 - 17857857
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || || ||||||||||||||||| ||    
17858086 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatattttctaagtatgagacttcacaaaaatg 17857987  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
17857986 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 17857887  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
17857886 cagagaattgagtttgagttgaacacttga 17857857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 40250772 - 40251001
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
40250772 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 40250871  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
40250872 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagcgacttctaatcaaacaaaaata 40250971  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
40250972 cagagaattgagtttgaattgaacacttga 40251001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 11395823 - 11395592
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
11395823 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 11395724  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
11395723 tgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 11395624  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
11395623 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 11395592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 11406139 - 11405908
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
11406139 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 11406040  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
11406039 tgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 11405940  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
11405939 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 11405908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 18393288 - 18393057
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
18393288 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 18393189  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
18393188 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 18393089  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
18393088 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 18393057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 29243801 - 29244030
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
29243801 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 29243900  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
29243901 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagaaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaata 29244000  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
29244001 cagagaattgagtttgagttgaacacttga 29244030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 29254380 - 29254609
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
29254380 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataataacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 29254479  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
29254480 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaata 29254579  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
29254580 cagagaattgagtttgagttgaacacttga 29254609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 34790866 - 34790637
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || || ||||||||||||||||| ||    
34790866 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcagtactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 34790767  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
34790766 ctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 34790667  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
34790666 cagagaattgagtttgaattgaacacttga 34790637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 34805009 - 34804780
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || || ||||||||||||||||| ||    
34805009 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcagtactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 34804910  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
34804909 ctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 34804810  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
34804809 cagagaattgagtttgaattgaacacttga 34804780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 40221911 - 40222140
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| ||||||||||||| ||    
40221911 gaagtagttcagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtataagacttcacaaaaatg 40222010  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
40222011 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 40222110  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
40222111 cagagaattgagtttgaattgaacacttga 40222140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 10266572 - 10266802
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
10266572 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 10266670  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
10266671 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 10266770  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
10266771 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 10266802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 10277149 - 10277379
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
10277149 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 10277247  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
10277248 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 10277347  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
10277348 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 10277379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 32217451 - 32217682
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||       
32217451 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaa 32217550  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
32217551 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 32217650  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
32217651 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 32217682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 34477507 - 34477737
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-t 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||  |    
34477507 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaat 34477606  T
100 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
34477607 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaacaat 34477706  T
200 acagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
34477707 acagagaattgagtttgaattgaacacttga 34477737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 36252493 - 36252264
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
36252493 gaagtaatccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 36252394  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
36252393 ctcaagcacacacgtaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctaatcaaacaaaaata 36252294  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
36252293 cagagaattgagtttgaattgaacacttga 36252264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 35263169 - 35263399
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
35263169 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 35263267  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
35263268 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 35263367  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
35263368 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 35263399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 35273794 - 35274024
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
35273794 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 35273892  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
35273893 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 35273992  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
35273993 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 35274024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 39170745 - 39170515
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
39170745 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 39170647  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
39170646 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacagaaa 39170547  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
39170546 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 39170515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 27220959 - 27221189
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
27220959 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 27221057  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
27221058 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 27221157  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||    
27221158 tatagagaattgagtttgaattgaacacttga 27221189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9898226 - 9897996
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||       
9898226 gaagtagttcagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaa 9898127  T
99 -tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaac 197  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
9898126 atgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 9898027  T
198 atacagagaattgagtttgacttgaacactt 228  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||    
9898026 atacagagaattgagtttaagttgaacactt 9897996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9908814 - 9908584
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||       
9908814 gaagtagtccagtcccccttacacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaa 9908715  T
99 -tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaac 197  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||     
9908714 atgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcagacaagagacttctaatcaaacaaaa 9908615  T
198 atacagagaattgagtttgacttgaacactt 228  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
9908614 atacagagaattgagtttgagttgaacactt 9908584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 35252560 - 35252790
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
35252560 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 35252658  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
35252659 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 35252758  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||||||    
35252759 tacagagaattgagttgaatttgaacacttga 35252790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 43344986 - 43345216
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||| |||||||||     
43344986 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagactacacaaaacta 43345084  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
43345085 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggctagagacttctaatcaaacaaaaa 43345184  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
43345185 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 43345216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 43354601 - 43354831
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||| |||||||||     
43354601 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagactacacaaaacta 43354699  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
43354700 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggctagagacttctaatcaaacaaaaa 43354799  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
43354800 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 43354831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 28732551 - 28732322
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
28732551 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatg 28732452  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
28732451 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaata 28732352  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||  ||| | ||||||||||||||||||||    
28732351 caatgaaataagtttgacttgaacacttga 28732322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 2561067 - 2561296
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
2561067 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttaactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatg 2561166  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
2561167 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaata 2561266  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||  ||||| | ||||||||||||||||||    
2561267 caatgaattaaatttgacttgaacacttga 2561296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 24428235 - 24428006
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
24428235 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatg 24428136  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||    
24428135 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacacaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaata 24428036  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    || |||  | ||||||||||||||||||||    
24428035 caaagagataagtttgacttgaacacttga 24428006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 18769553 - 18769325
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| ||||| ||    
18769553 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatgctctctaagtatgagacttctcaaaa-tg 18769455  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
18769454 ctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaata 18769355  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||  ||| | ||||||||||||||||||||    
18769354 caatgaaataagtttgacttgaacacttga 18769325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 24415670 - 24415441
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
24415670 gaagttgtccagtcacccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatg 24415571  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||    
24415570 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacacaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaata 24415471  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    || |||  | ||||||||||||||||||||    
24415470 caaagagataagtttgacttgaacacttga 24415441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 28721965 - 28721736
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
28721965 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattgcaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatg 28721866  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||    
28721865 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaaaaggcttctgatcaaacaaaaata 28721766  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||  ||  | ||||||||||||||||||||    
28721765 caatgatataagtttgacttgaacacttga 28721736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21173117 - 21172886
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| |||||      
21173117 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaaa 21173018  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||| |    
21173017 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttatgatcaaacaaaaa 21172918  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||  ||| | ||||||||||||||||||||    
21172917 tacaatgaaataagtttgacttgaacacttga 21172886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 26866651 - 26866880
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
26866651 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tg 26866749  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac-aaacat 199  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||    
26866750 ctcaagcacacaggcaagagtcttccaatcctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaaat 26866849  T
200 acagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||| ||| |  |||||||||||||||||||    
26866850 acagggaaatatgtttgacttgaacacttga 26866880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 26879240 - 26879469
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
26879240 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tg 26879338  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca-t 199  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| | |    
26879339 ctcaagcacataggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagttttctaatgctcaagcacgtaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaaat 26879438  T
200 acagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    | || ||| |  |||||||||||||||||||    
26879439 atagggaaatatgtttgacttgaacacttga 26879469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 21651155 - 21650975
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
21651155 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 21651057  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagaga 180  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
21651056 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagaga 21650975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 38586738 - 38586530
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| |||||       
38586738 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaagtgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaaaa 38586639  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |  ||||||||| |    
38586638 tgctcaagcacgcaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaagcaagagacttatgttcaaacaaaaa 38586539  T
199 tacagagaa 207  Q
    |||||||||    
38586538 tacagagaa 38586530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 27979031 - 27978825
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |    
27979031 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-t 27978933  T
100 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacat 199  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||  ||||||||| ||    
27978932 gctcaagcacgcaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtctactaatgctcaagcacgcaggcgagagtcttctgttcaaacaaaaat 27978833  T
200 acagagaa 207  Q
    ||||||||    
27978832 acagagaa 27978825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 28065560 - 28065354
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |    
28065560 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-t 28065462  T
100 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacat 199  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||  ||||||||| ||    
28065461 gctcaagcacgcaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtctactaatgctcaagcacgcaggcgagagtcttctgttcaaacaaaaat 28065362  T
200 acagagaa 207  Q
    ||||||||    
28065361 acagagaa 28065354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 36785450 - 36785242
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagattt-cactat-aatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||     
36785450 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaagaatcacaaaaattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa- 36785352  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaac 197  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||     
36785351 tgctcaagcacgcaggcaagagtcttccaatggtcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaa 36785252  T
198 atacagagaa 207  Q
    ||||||||||    
36785251 atacagagaa 36785242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 968154 - 967958
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagattt-cacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||      
968154 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttgctctaataatcacacagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttctcaaa-- 968057  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 196  Q
    ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
968056 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctaatcaaacaaa 967958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 22763229 - 22763428
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagattt-cacta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||     ||||| || | ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
22763229 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttacactaagaaataatc-cacatattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcaca 22763327  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 193  Q
    ||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||    
22763328 aa--tgctcaagcacacaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaagcaagagacttccaatcaaac 22763425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 22773933 - 22774132
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||     ||||| || ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
22773933 gaagtagtccagtcccctttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatc-cacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcaca 22774031  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 193  Q
    ||  |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||    
22774032 aa--tgctcaagcacacaggaaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttccaattaaac 22774129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 17970919 - 17970724
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 98  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | |  ||||| ||||| ||||      
17970919 gaagtagtctagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaataatcacacagattacaaatgctcaatactaactag-tatgaaacttctcaaa-- 17970823  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 196  Q
    ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
17970822 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctaatcaaacaaa 17970724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 24274604 - 24274799
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 98  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||  | |  ||||||||||| ||||      
24274604 gaagtagtccagtccccctcgcacttccaaggagatttccactaataatcacacagattacaaatgctcaatactcactag-tatgagacttctcaaa-- 24274700  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 196  Q
    ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
24274701 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctattcaaacaaa 24274799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 1041727 - 1041922
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggaga-tttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||      
1041727 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaataatcttatagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttctcaaa-- 1041824  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaa 195  Q
    ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
1041825 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttataatgctcaagcacacaggcgagaggcttctaatcaaacaa 1041922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 19355894 - 19356127
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||  |    
19355894 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaacaaataatcacacagattacaactgctcaatactatctag-tatgagacttccta 19355992  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 193  Q
    ||  ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||    
19355993 aa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaggcactaaagcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaac 19356090  T
194 aaacatacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    | |  |||| ||||    |||||||||||||||||||    
19356091 agaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttga 19356127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 30794388 - 30794497
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattac-aaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |    
30794388 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat 30794487  T
100 gctcaagcac 109  Q
    ||||||||||    
30794488 gctcaagcac 30794497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 19303077 - 19302918
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagattt-cacta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||||||    
19303077 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacctag-tatgagacttcaca 19302979  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 156  Q
    ||  ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
19302978 aa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 19302918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 19498616 - 19498457
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||    
19498616 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatctag-tatgagacttccca 19498518  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 156  Q
    ||  ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
19498517 aa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 19498457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 19313643 - 19313482
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagattt-cacta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||     |||||||| |||||| || |||||||||||| | |  ||||||||||| ||    
19313643 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaagaaataatcacacagattataactgctcaatactaccgag-tatgagacttccca 19313545  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 158  Q
    ||  ||||||||||| || |||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
19313544 aa--tgctcaagcacgcaggcaagagatttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 19313482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 23393376 - 23393179
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggaga-tttcacta---taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||  |||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||      
23393376 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca-- 23393279  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 193  Q
     || ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||  | | |||||||||||| ||||||    
23393278 -aattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagtaagagacttctattcaaac 23393180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 38033458 - 38033296
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||| |  | |||||||||||| |    
38033458 gaagtagtccagtctcccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatacta-cctagtatgagacttca-a 38033361  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 158  Q
    ||| ||||||||||| || |||| || |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
38033360 aaaatgctcaagcacgcaggcaaaagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 38033296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 20647265 - 20647068
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||| ||||||| | |  |||||||||||       
20647265 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgcttaatactacctag-tatgagacttcc-- 20647169  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 193  Q
    ||| ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| || |||||||||||  ||||| ||||||  | | |||||||||||| ||||||    
20647168 aaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaatcaagagacttcctatgctcaagcactaaagtaagagacttctattcaaac 20647069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 24802257 - 24802059
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcac 93  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |    |||||||||  |||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||     
24802257 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcacaaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaa 24802158  T
94 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaa 192  Q
    ||   |||||| |||| || ||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||    
24802157 aa---tgctcatgcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 24802061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 22754891 - 22755054
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcac 93  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| | ||||| ||||  |  | |||||||||||||    
22754891 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaacttctcaacactacacctagtatgagacttcac 22754990  T
94 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 158  Q
    | |  |||| |||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
22754991 aga--tgcttaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 22755054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 24815224 - 24815026
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcac 93  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||     
24815224 gaagtagtccagtcccccttacactttcaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca- 24815126  T
94 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaa 192  Q
      || ||||||||||| || ||||| | |||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||    
24815125 --aattgctcaagcacgcaggcaagtgacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 24815028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 194
Target Start/End: Original strand, 1083418 - 1083603
Alignment:
14 cccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaag-attacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaag 106  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||   ||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||   || ||||||||    
1083418 cccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaacttattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaag 1083514  T
107 cacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 194  Q
    |||||| ||||||| |||||  |||||||||||  | ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||||    
1083515 cacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 1083603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 16587596 - 16587510
Alignment:
102 tcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaa 187  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||| || | || ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
16587596 tcaagcacacaaacaagagacttccaatgctcaatcacaaatgaaacagacttccaatgctcaagcacgcatgcaagagacttctaa 16587510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 19300551 - 19300477
Alignment:
81 tatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 156  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
19300551 tatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 19300477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 22682823 - 22682871
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatc 48  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
22682823 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactataatc 22682871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 14794498 - 14794452
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 48  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
14794498 gaagtagtccagtcccc-ttgcacttccaaggagatttcactataatc 14794452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 19321068 - 19321021
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 48  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
19321068 gaagtagtacagtcccccttgcacttccaaggagatttcactaaaatc 19321021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 157
Target Start/End: Original strand, 21845679 - 21845738
Alignment:
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaa 157  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||    
21845679 tgctcaagcacaaacgcaagagtcttcctatgctcaagcacaaaagcaaaagacttctaa 21845738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 21911473 - 21911374
Alignment:
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa-tgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 196  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||| | |||||||||  |||||||||| |||  ||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||    
21911473 tgctcaagcacactagcaagagacttccaaatactcaagcacacaagcaagagatttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttctaatcaaacaaa 21911374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 38040617 - 38040538
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatacta 74  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
38040617 gaagtagtccagtctcccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatacta 38040538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 22615277 - 22615315
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc 39  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
22615277 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc 22615315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 21845554 - 21845602
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 49  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
21845554 gaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 21845602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 194
Target Start/End: Original strand, 22382968 - 22383068
Alignment:
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 193  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||   |||| |||||||||||| ||  |||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||    
22382968 aaactactcaagcacaaaagcaagacgtttcctatgctcaagcacaaacacaagagacttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttctaatcaaac 22383067  T
194 a 194  Q
    |    
22383068 a 22383068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 21548860 - 21548821
Alignment:
144 caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagactt 183  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
21548860 caagagacttctaatgctcaagcacgcaagcaagagactt 21548821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 24851371 - 24851329
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcacta 43  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||    
24851371 gaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 24851329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 27766213 - 27766146
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaca-aagattacaaatgctcaa 69  Q
    |||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
27766213 gaagtagtccagtcccc-ttacacttccaagga-atttcactataatcacactagattacaattgctcaa 27766146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 51
Target Start/End: Original strand, 8685027 - 8685062
Alignment:
15 ccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaca 51  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
8685027 ccccttgcacttccaagg-gatttcactataatcaca 8685062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 24843597 - 24843645
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 49  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
24843597 gaagtagtccactccaccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 24843645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 25918172 - 25918220
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 49  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||    
25918172 gaagtagtcctgcctcccttacacttccaaggagagttcactaaaatca 25918220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 44
Target Start/End: Original strand, 40331191 - 40331223
Alignment:
12 gccccccttgcacttccaaggagatttcactat 44  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
40331191 gccccccttgcacttccaaggagagttcactat 40331223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 2276 - 2505
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
2276 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaccaagattacaaatgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaaatg 2375  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
2376 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactatgcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaata 2475  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
2476 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 2505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0386 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0386
Description:

Target: scaffold0386; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 11943 - 12172
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
11943 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 12042  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
12043 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 12142  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
12143 cagagaattgagtttgaattgaacacttga 12172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 112)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 166484 - 166713
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
166484 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 166583  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
166584 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 166683  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
166684 cagagaattgagtttgaattgaacacttga 166713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 177076 - 177305
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
177076 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 177175  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
177176 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 177275  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
177276 cagagaattgagtttgaattgaacacttga 177305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 9084873 - 9085102
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
9084873 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 9084972  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
9084973 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 9085072  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
9085073 cagagaattgagtttgaattgaacacttga 9085102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 9094587 - 9094816
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
9094587 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 9094686  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
9094687 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 9094786  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
9094787 cagagaattgagtttgaattgaacacttga 9094816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21003719 - 21003490
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
21003719 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataataacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 21003620  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
21003619 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaata 21003520  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
21003519 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 21003490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 48711202 - 48710973
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
48711202 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 48711103  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
48711102 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 48711003  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
48711002 cagagaattgagtttgaattgaacacttga 48710973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 6867936 - 6867707
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
6867936 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaggattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 6867837  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
6867836 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 6867737  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
6867736 cagagaattgagtttgagttgaacacttga 6867707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 6878568 - 6878339
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
6878568 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaggattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 6878469  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
6878468 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 6878369  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
6878368 cagagaattgagtttgagttgaacacttga 6878339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 9432853 - 9433082
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||    
9432853 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacacaaatg 9432952  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
9432953 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaata 9433052  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
9433053 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 9433082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 20989242 - 20989471
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
20989242 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacagatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 20989341  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||    
20989342 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcagacaagagacttctgatcaaacaaaaata 20989441  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
20989442 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 20989471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 26654036 - 26653807
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
26654036 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 26653937  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
26653936 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaata 26653837  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
26653836 cagagaattgagtttgaattgaacacttga 26653807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 26700365 - 26700136
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
26700365 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 26700266  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
26700265 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaata 26700166  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
26700165 cagagaattgagtttgaattgaacacttga 26700136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 37343789 - 37344018
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
37343789 gaagtagtccagtcccccttgcatttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 37343888  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
37343889 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 37343988  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
37343989 cagagaattgagtttgagttgaacacttga 37344018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 2706325 - 2706094
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
2706325 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 2706226  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
2706225 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 2706126  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
2706125 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 2706094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 26390809 - 26390578
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
26390809 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 26390710  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
26390709 tgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 26390610  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
26390609 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 26390578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 26401451 - 26401220
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
26401451 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 26401352  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
26401351 tgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 26401252  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
26401251 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 26401220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 26294741 - 26294511
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-t 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||  |    
26294741 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaat 26294642  T
100 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
26294641 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaat 26294542  T
200 acagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
26294541 acagagaattgagtttgaattgaacacttga 26294511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 468292 - 468063
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||    
468292 gaagtaatccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatacttcctaagtatgagacttcacaaaaatg 468193  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
468192 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 468093  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
468092 cagagaattgagtttgaattgaacacttga 468063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 5685108 - 5685337
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||| ||||||||| ||    
5685108 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagatttcacaaaaatg 5685207  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
5685208 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcacaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaata 5685307  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
5685308 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 5685337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 22099327 - 22099556
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
22099327 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 22099426  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
22099427 ctcaagcacgcatgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 22099526  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
22099527 cagagaattgagtttgaattgaacacttga 22099556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 17961437 - 17961206
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||       
17961437 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaa 17961338  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
17961337 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 17961238  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
17961237 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 17961206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 24734340 - 24734571
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||      
24734340 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacaa 24734439  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
24734440 tgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 24734539  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
24734540 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 24734571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 24744287 - 24744518
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||      
24744287 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacaa 24744386  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
24744387 tgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 24744486  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
24744487 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 24744518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 40042821 - 40042590
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
40042821 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 40042722  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
40042721 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaa 40042622  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
40042621 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 40042590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 40053370 - 40053139
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
40053370 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 40053271  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
40053270 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaa 40053171  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
40053170 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 40053139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 8627536 - 8627767
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||      
8627536 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacatactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaaaa 8627635  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
8627636 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 8627735  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
8627736 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 8627767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 14746381 - 14746151
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
14746381 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 14746282  T
101 ctcaa-gcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacat 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
14746281 ctcaaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaaacactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaat 14746182  T
200 acagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
14746181 acagagaattgagttttacttgaacacttga 14746151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 24931315 - 24931085
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| |     
24931315 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatt 24931216  T
100 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacat 199  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
24931215 gctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaat 24931116  T
200 acagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
24931115 acagagaattgagtttgagttgaacacttga 24931085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 9443449 - 9443678
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||    
9443449 gaagtagtacagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacacaaatg 9443548  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||    
9443549 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggaaagagacttctgatcaaacaaaaata 9443648  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
9443649 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 9443678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 22088712 - 22088941
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
22088712 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 22088811  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
22088812 ctcaagcatgcatgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 22088911  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
22088912 cagagaattgagtttgaattgaacacttga 22088941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 1987128 - 1987358
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
1987128 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 1987226  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
1987227 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 1987326  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
1987327 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 1987358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 1997749 - 1997979
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
1997749 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 1997847  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
1997848 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 1997947  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
1997948 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 1997979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 2716929 - 2716698
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
2716929 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 2716830  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
2716829 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatggtcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcatgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 2716730  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
2716729 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 2716698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 11004773 - 11005003
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
11004773 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 11004871  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
11004872 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 11004971  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
11004972 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 11005003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 17950831 - 17950600
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||       
17950831 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaa 17950732  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
17950731 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcatgcaagagacttctaatcaaacaaaaa 17950632  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
17950631 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 17950600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 42865415 - 42865645
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
42865415 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 42865513  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
42865514 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 42865613  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
42865614 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 42865645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 42876041 - 42876271
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
42876041 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 42876139  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
42876140 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 42876239  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
42876240 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 42876271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 8616974 - 8617204
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-t 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||  |    
8616974 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaat 8617073  T
100 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacat 199  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
8617074 tctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaatcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaat 8617173  T
200 acagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
8617174 acagagaattgagtttgaattgaacacttga 8617204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 588802 - 589031
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||    
588802 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttctcaaaaatg 588901  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
588902 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgttcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaata 589001  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||  |||||  |||||||||||||||||||    
589002 caatgaattatgtttgacttgaacacttga 589031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 4222196 - 4222426
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||       
4222196 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaa 4222294  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
4222295 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 4222394  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
4222395 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 4222426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 1367219 - 1367448
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
1367219 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatg 1367318  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
1367319 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaata 1367418  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||||||||    
1367419 caatgaattaagtttgacttgaacacttga 1367448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 3165324 - 3165553
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
3165324 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatg 3165423  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
3165424 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaata 3165523  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||||||||    
3165524 caatgaattaagtttgacttgaacacttga 3165553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 8002777 - 8002547
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||| |||     
8002777 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaacacta 8002679  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
8002678 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaa 8002579  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
8002578 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 8002547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 8013422 - 8013192
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||| |||     
8013422 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaacacta 8013324  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
8013323 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaa 8013224  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
8013223 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 8013192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15889039 - 15888810
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
15889039 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatg 15888940  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
15888939 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaata 15888840  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||  ||| | ||||||||||||||||||||    
15888839 caatgaaattagtttgacttgaacacttga 15888810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 20490596 - 20490825
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
20490596 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatg 20490695  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
20490696 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaata 20490795  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||  ||||| ||||||||| ||||||||||    
20490796 caatgaattaagtttgactcgaacacttga 20490825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21770653 - 21770424
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
21770653 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatg 21770554  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
21770553 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaata 21770454  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||  ||| | ||||||||||||||||||||    
21770453 caatgaaataagtttgacttgaacacttga 21770424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 31117221 - 31116992
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
31117221 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaatg 31117122  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
31117121 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcaataagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaata 31117022  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||  ||| | ||||||||||||||||||||    
31117021 caatgaaataagtttgacttgaacacttga 31116992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 230
Target Start/End: Original strand, 30049110 - 30049338
Alignment:
2 aagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgc 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||    
30049110 aagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgc 30049209  T
102 tcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacatac 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||    
30049210 tcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcatgcaagagtcttctgatcaaacaaaaatac 30049309  T
202 agagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    | |||| | ||||||||||||||||||||    
30049310 aaagaaataagtttgacttgaacacttga 30049338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 9159320 - 9159549
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
9159320 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgatcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatg 9159419  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||    
9159420 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagaggcttctaatgctcaagcacgcaagcaagaggcttctgatcaaacaaaaata 9159519  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||  ||| | ||||||||||||||||||||    
9159520 caatgaaataagtttgacttgaacacttga 9159549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 9169775 - 9170004
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
9169775 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgatcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatg 9169874  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||    
9169875 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagaggcttctaatgctcaagcacgcaagcaagaggcttctgatcaaacaaaaata 9169974  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||  ||| | ||||||||||||||||||||    
9169975 caatgaaataagtttgacttgaacacttga 9170004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 40055464 - 40055258
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
40055464 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatg 40055365  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||    
40055364 ctcaagcacgcaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaatagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgttcaaacaaaaata 40055265  T
201 cagagaa 207  Q
    || ||||    
40055264 cacagaa 40055258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 82 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 455429 - 455281
Alignment:
82 atgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagac 181  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
455429 atgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaaaagac 455330  T
182 ttctaatcaaacaaacatacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
455329 ttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttga 455281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 17064241 - 17064034
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact 99  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |    
17064241 gaagtagtccattcccccttgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-t 17064143  T
100 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |    
17064142 gctcaagcacgcaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaaa 17064043  T
199 tacagagaa 207  Q
    |||||||||    
17064042 tacagagaa 17064034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 4211627 - 4211785
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||       
4211627 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaa 4211725  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4211726 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 4211785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 38403924 - 38403719
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagattt-cacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||     
38403924 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa- 38403826  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaac 197  Q
    | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||     
38403825 tactcaagcacgcaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaag 38403726  T
198 atacaga 204  Q
    |||||||    
38403725 atacaga 38403719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 540702 - 540857
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
540702 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcgctataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 540801  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttct 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
540802 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacgcaggcaagagacttct 540857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 48381774 - 48381969
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagattt-cacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||     
48381774 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa- 48381872  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 194  Q
    ||||||||||| || || || | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
48381873 tgctcaagcacgcaggcgagggacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctaatcaaaca 48381969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 44280113 - 44280251
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
44280113 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttaactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatg 44280212  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
44280213 ctcaagcacacacgcaagagtcttctaatgctcaagcac 44280251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 102 - 230
Target Start/End: Original strand, 11095744 - 11095872
Alignment:
102 tcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacatac 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
11095744 tcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttataatgctcaagcacgcaggcgagagacttgtaatcaaacaaaaatac 11095843  T
202 agagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
11095844 agagaattgagtttgaattgaacacttga 11095872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 18418702 - 18418909
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagattt-cacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||      
18418702 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaataatctcaaagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttctcaaa-- 18418799  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaac 197  Q
    ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| |     
18418800 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctaatcaaacagaa 18418899  T
198 atacagagaa 207  Q
    ||||| ||||    
18418900 atacacagaa 18418909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 18440783 - 18440990
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagattt-cacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||      
18440783 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaataatctcaaagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttctcaaa-- 18440880  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaac 197  Q
    ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| |     
18440881 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctaatcaaacagaa 18440980  T
198 atacagagaa 207  Q
    ||||| ||||    
18440981 atacacagaa 18440990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 3477052 - 3476823
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagattt-cacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| ||||      
3477052 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctag-tatgagacttctcaaa-- 3476956  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaac 197  Q
    ||||||||||| || || |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |     
3476955 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgcttaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacagaa 3476856  T
198 atacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
     |||| ||||    |||||||||||||||||||    
3476855 ttacacagaaaattgtttgacttgaacacttga 3476823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 8933152 - 8933347
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| ||||      
8933152 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctag-tatgagacttctcaaa-- 8933248  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 196  Q
    ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
8933249 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctattcaaacaaa 8933347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 38594393 - 38594256
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
38594393 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tg 38594295  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 139  Q
    ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||    
38594294 ctcaagcacgcaggcaagagtcttctaatgctcaagcac 38594256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 29589576 - 29589773
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||    
29589576 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagatcacaaatgctcaatactatctag-tatgagacttctca 29589674  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 193  Q
    ||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
29589675 aa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaac 29589772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 12734876 - 12734681
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||      
12734876 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctc-tagtatgagacttctcaaa-- 12734780  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 196  Q
    ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
12734779 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagattcttctaaggctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaa 12734681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 15215904 - 15216100
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttca-cta--taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaa 97  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||| ||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| ||||     
15215904 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttaactaaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctag-tatgagacttctcaaa- 15216001  T
98 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 196  Q
     ||||||||||| || || |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
15216002 -tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctaaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggctagagacttctattcaaacaaa 15216100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 13681909 - 13682103
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 98  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| ||||      
13681909 gaagtagtccagacccc-ttgcacttcgaaggagatttccactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctag-tatgagacttctcaaa-- 13682004  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 196  Q
    ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
13682005 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctaatcaaacaaa 13682103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 26210260 - 26210065
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatt-tcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||      
26210260 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattcccactaataatcacacagattacagatgctcaatactctc-tagtatgagacttctcaaa-- 26210164  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 196  Q
    ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||| |||||||||    
26210163 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggggagagactactattcaaacaaa 26210065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 8999657 - 8999458
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcac 93  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | |||||||||||||    
8999657 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcac 8999558  T
94 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaa 192  Q
    |||  ||||||||||| || ||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||    
8999557 aaa--tgctcaagcacgcaggcaagaaacttcaaatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaa 8999460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 24883106 - 24882945
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||    
24883106 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatctag-tatgagacttccca 24883008  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 158  Q
    ||  ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
24883007 aa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 24882945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 25212561 - 25212471
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttc 91  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    
25212561 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactctctaagtatgagacttc 25212471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 19986231 - 19986159
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatact 73  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19986231 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatact 19986159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Original strand, 20967258 - 20967328
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaata 71  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20967258 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaata 20967328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 457703 - 457618
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgag 86  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||    
457703 gaagtaatccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgag 457618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 127 - 230
Target Start/End: Original strand, 540798 - 540903
Alignment:
127 aatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac-aaacatacagagaattgagtttgacttgaac 224  Q
    |||||||||||||  | ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
540798 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaaatacagagaattgagtttgacttgaac 540897  T
225 acttga 230  Q
    ||||||    
540898 acttga 540903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 11087766 - 11087568
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-----actataatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||     | | |||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||||    
11087766 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggcgatttccgctaagtttaatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaca 11087667  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 193  Q
    ||  ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||   |||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||    
11087666 aa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaac 11087569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 127 - 230
Target Start/End: Original strand, 44280209 - 44280313
Alignment:
127 aatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacatacagagaattgagtttgacttgaaca 225  Q
    |||||||||||||  | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||    
44280209 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctaatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttgaaca 44280308  T
226 cttga 230  Q
    |||||    
44280309 cttga 44280313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 127 - 230
Target Start/End: Original strand, 4211724 - 4211827
Alignment:
127 aatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacatacagagaattgagtttgacttgaaca 225  Q
    |||||||||||||  | ||||||| |||| |||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
4211724 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 4211822  T
226 cttga 230  Q
    |||||    
4211823 cttga 4211827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 4412717 - 4412532
Alignment:
14 cccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaag 106  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||   || ||||||||    
4412717 cccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaag 4412621  T
107 cacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 194  Q
    |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||   ||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||||    
4412620 cacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagactttctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 4412532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 13175327 - 13175129
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagattt-cacta----taatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    |||||||| ||||||||| |||||| |||||  |  | | ||||||||||||    
13175327 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacacagattacaactgctcagtactacacctagtctgagacttcaca 13175228  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 193  Q
    ||  ||||||||||| || || | || |||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||  |   |||||||||||| ||||||    
13175227 aa--tgctcaagcacgcaggctatagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaattaagagacttctattcaaac 13175130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 1878985 - 1878923
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatcaca-aagattacaa 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
1878985 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagattttcactataatcacataagattacaa 1878923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 4433290 - 4433105
Alignment:
14 cccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaag 106  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||    |||||||||  |||||||||||||||||||||  |  | ||||||||||||   || ||||||||    
4433290 cccccttgcacttccaaggaaagtttcactaagtttaatcacaactgattacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaag 4433194  T
107 cacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 194  Q
    |||||| ||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||| ||   ||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||||    
4433193 cacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagaatttctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 4433105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Original strand, 11015393 - 11015463
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatcacaaa-gattacaaatgctcaa 69  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
11015393 gaagtagttcagttccccttgcacttccaaggagattttcactataatcacaaatgattacaaatgctcaa 11015463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 38594298 - 38594217
Alignment:
127 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacatacagagaa 207  Q
    |||||||||||||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||    
38594298 aatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacaaagaa 38594217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 196
Target Start/End: Original strand, 23125439 - 23125537
Alignment:
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 196  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||  |||||||||| |||||||||| |||| |  | | ||||||||||||| ||||||||    
23125439 tgctcaagcacacaagcaagagacttcaaatactcaagcacacaagcaagagatttctaatgctcaagcccaaaagtaagagacttctaaacaaacaaa 23125537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 11572924 - 11572876
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatc 48  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
11572924 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactataatc 11572876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 12223161 - 12223090
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggaga--tttcactataatcaca-aagattacaaatgctcaa 69  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
12223161 gaagtggtccagtcccccttgcacttctaaggagatttttcactataatcacacaagattacaattgctcaa 12223090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 16308349 - 16308289
Alignment:
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaat 158  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
16308349 tgctcaagcacacacgtaagagtcttcctatgctcaagcacaaaagtaagagacttctaat 16308289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 24883007 - 24882903
Alignment:
127 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacatacagagaattgagtttgacttgaaca 225  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| |  |||| ||||    ||||||||||||||    
24883007 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaaca 24882908  T
226 cttga 230  Q
    |||||    
24882907 cttga 24882903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 19711776 - 19711733
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactat 44  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
19711776 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 19711733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 6044994 - 6044957
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagattt 38  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
6044994 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 6044957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 183
Target Start/End: Original strand, 9802671 - 9802756
Alignment:
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagactt 183  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||  ||||| |||||| || |||||| ||||    
9802671 tgctcaagcacataagcaagagacttcctatgctcaagcacacaagcaagagacttcacatgctcaagcacacaagcaagacactt 9802756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 2501710 - 2501662
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatc 48  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
2501710 gaagtagtcaagtcccccttgcacttccaaggagattttcactataatc 2501662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 7488668 - 7488620
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 49  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||    
7488668 gaagtagtccagtcccccttacacttccaaggagagttcactaaaatca 7488620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 10257828 - 10257765
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggaga--tttcactataatcac-aaagattacaa 61  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||    
10257828 gaagtagtccaaacccccttgcacttccaaggacatttttcactataatcacaaaagattacaa 10257765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 188
Target Start/End: Original strand, 602171 - 602348
Alignment:
14 cccccttgcacttccaaggaga-tttcac----tataatcaca-aagattacaaatgctcaatac-tatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaag 106  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||   || |||||||||||   | | ||||||||    
602171 cccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtataatcacacaagattacaactgctcaatacttaaacaagtatgagacttc---agattgctcaag 602267  T
107 cacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaat 188  Q
    |||||| ||||||| ||| | |||||||| |||  ||| ||||||||||  ||||| ||||||  | ||||||||||||||||    
602268 cacaca-gcaagagactt-ctatgctcaaacacacaagtaagagacttcagatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 602348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 16105694 - 16105624
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa--agattacaaatgctcaa 69  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||  |  |||||||||||||||||    
16105694 gaagtagtcctgccctccttgcacttctaaggagagttcactaaaatcaatatcagattacaaatgctcaa 16105624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 4820879 - 4820921
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcacta 43  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||    
4820879 gaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 4820921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 11572860 - 11572762
Alignment:
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 196  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||  |||||||||| |||  ||||| || |||  | |||||| |||||||| ||||||||    
11572860 tgctcaagcacacaagcaagagacttcaaatactcaagcacacaagcaagagatttcatatgctcaatcacaaaagcaagacacttctaaacaaacaaa 11572762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 13259167 - 13259125
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcacta 43  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||    
13259167 gaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 13259125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 13261380 - 13261338
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcacta 43  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||    
13261380 gaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 13261338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 13266507 - 13266465
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcacta 43  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||    
13266507 gaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 13266465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 44
Target Start/End: Original strand, 15087949 - 15087987
Alignment:
6 agtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactat 44  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
15087949 agtcctgccccccttgcacttccaaggagagttcactat 15087987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 94 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 13173023 - 13172922
Alignment:
94 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacta-agcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaa 192  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||  |||| |||||||||||| |  ||||||||||||  || || ||||||  | |||||||||||||| |||||    
13173023 aaaactactcaagcacaaaagcaagaggtttccgatgctcaagcacaactgcaagagacttcctatactcaagcacaaaagcaagagacttctattcaaa 13172924  T
193 ca 194  Q
    ||    
13172923 ca 13172922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 184
Target Start/End: Original strand, 9802671 - 9802727
Alignment:
129 tgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttc 184  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||| || ||||||||||||    
9802671 tgctcaagcacataagcaagagacttcctatgctcaagcacacaagcaagagacttc 9802727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 12175091 - 12175059
Alignment:
12 gccccccttgcacttccaaggagatttcactat 44  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
12175091 gccccccttgcacttccaaggagagttcactat 12175059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 16308474 - 16308426
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 49  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
16308474 gaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaagagagttcactaaaatca 16308426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 16411401 - 16411449
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 49  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
16411401 gaagtagtcctgtcccacttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 16411449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 16464416 - 16464461
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 48  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||||    
16464416 gaagtagtccagtcccccttgcaattccaaggaga--tcactataatc 16464461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 158
Target Start/End: Original strand, 20094640 - 20094700
Alignment:
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaat 158  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||  |||||| |||||||||||    
20094640 tgctcaagcacacaaacaagagtctttcaatgctcgagcacacaagcaatagacttctaat 20094700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 30716 - 30947
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac-- 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
30716 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaa 30815  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
30816 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaa 30915  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
30916 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 30947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 43195 - 42961
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaat-gctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac- 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| || || |||||||||||| ||||      
43195 gaagtagtccagtcccccttgcactttcaaggagatttcactataatcacaaagattacaaaacgcttaatactctctaagtatgagacttcaaaaaaaa 43096  T
99 ---tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaa 195  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||    
43095 aaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggccagaggcttctgatcaaacaa 42996  T
196 acatacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    | ||||  |||| | ||||||||||||||||||||    
42995 aaataccaagaaataagtttgacttgaacacttga 42961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 41123 - 40894
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||||||||||||||| ||    
41123 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgcttaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatg 41024  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
41023 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 40924  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
40923 cagagaattgagtttgaattgaacacttga 40894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 33572 - 33343
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |     
33572 gaagtagtccagtccctcttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaata 33473  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||| |||||||||| |||    
33472 cttaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacacaggctagagtcttctgatcaaacaaaaata 33373  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    || |||| | ||||||||||||||||||||    
33372 caaagaaataagtttgacttgaacacttga 33343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 7554 - 7325
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||    
7554 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttgactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtaagagacttcacaaaaatg 7455  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
7454 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaata 7355  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||    
7354 cagagaattaagtttgacttgaacacttga 7325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 7512 - 7283
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
7512 gaagtagtccagtcccccttgcactttcaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactgtctaagtatgagacttcacaaaaatg 7413  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
7412 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgatcaagcacgcaggcaagaaacttctaatcaaacaaaaata 7313  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
7312 cagagaattgagtttgagttgaacacttga 7283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105 (Bit Score: 181; Significance: 6e-98; HSPs: 2)
Name: scaffold0105
Description:

Target: scaffold0105; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 7545 - 7776
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
7545 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 7644  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
7645 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctattgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaa 7744  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
7745 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 7776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 37630 - 37399
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact- 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||     
37630 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacta 37531  T
100 -gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaca 198  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
37530 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctattgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaa 37431  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
37430 tacagagaattgagtttgaattgaacacttga 37399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 174; Significance: 9e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 37404 - 37175
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
37404 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatg 37305  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
37304 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaata 37205  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    || |||| | ||||||||||||||||||||    
37204 caaagaaataagtttgacttgaacacttga 37175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 174; Significance: 9e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 14169 - 14398
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
14169 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatg 14268  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
14269 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaata 14368  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||||||||    
14369 caatgaattaagtttgacttgaacacttga 14398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 54793 - 54564
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
54793 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatg 54694  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
54693 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaata 54594  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||  ||||| | ||||||||||||||||||    
54593 caatgaattaactttgacttgaacacttga 54564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 11276 - 11047
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| ||||| ||    
11276 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctttaagtatgagacttctcaaaaatg 11177  T
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacata 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
11176 ctcatgcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaata 11077  T
201 cagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||  ||| |  |||||||||||||||||||    
11076 caatgaaatatgtttgacttgaacacttga 11047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 8436 - 8200
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaat-------actatcaaaatatgagacttcac 93  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||| |  || ||||||||||| |    
8436 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatgctcaatactctttaagtatgagacttctc 8337  T
94 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 193  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
8336 aaaaatgctcatgcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaac 8237  T
194 aaacatacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||| |||||  ||| |  |||||||||||||||||||    
8236 aaaaatacaatgaaatatgtttgacttgaacacttga 8200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 2889 - 2659
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa-tgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |    
2889 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaat 2790  T
100 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||    
2789 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaagcaagaggcttctgatcaaacaaaaat 2690  T
200 acagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||  ||| |  |||||||||||||||||||    
2689 acaatgaaatatgtttgacttgaacacttga 2659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 12789 - 12581
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagattt-cactat-aatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||     
12789 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaagaatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa- 12691  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaac 197  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||     
12690 tgctcaagcacgcaggcaagagtcttccaatgctcaaggactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaa 12591  T
198 atacagagaa 207  Q
    ||||||||||    
12590 atacagagaa 12581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 107; Significance: 9e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 40086 - 40293
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagattt-cacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||      
40086 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaa-- 40183  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaac 197  Q
    ||||||||||| || || |||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||     
40184 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatactcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacacaggcaagaggcttctattcaaacaaaa 40283  T
198 atacagagaa 207  Q
    ||||||||||    
40284 atacagagaa 40293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 106; Significance: 3e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 1579 - 1808
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||  | |  ||||||||||| ||||      
1579 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaataatcacacagattacaaatgctcaatactcactag-tatgagacttctcaaa-- 1675  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaac 197  Q
    ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |     
1676 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacagaa 1775  T
198 atacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
     |||| ||||    |||||||||||||||||||    
1776 ttacacagaaaattgtttgacttgaacacttga 1808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 35120 - 35352
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaa 95  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||| |||||||||||| |||||||| || |  ||||||||||| |||    
35120 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttctactaaaaataatcacacagattacaaatgttcaatactctctag-tatgagacttctcaa 35218  T
96 aactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 194  Q
    |  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
35219 a--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaaca 35316  T
195 aacatacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
     |  |||| ||||   |||| |||||||||||||||    
35317 gaattacacagaaaatagttagacttgaacacttga 35352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 4881 - 5087
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| ||||      
4881 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccacaaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctag-tatgagacttctcaaa-- 4977  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaac 197  Q
    ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||     
4978 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaa 5077  T
198 atacagagaa 207  Q
    ||||| ||||    
5078 atacacagaa 5087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 57455 - 57247
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagattt-cacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 98  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||     
57455 gaagtagtctagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgatacttctcaaaa- 57357  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaac 197  Q
    ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||| |||||| | |||||||     
57356 tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaatgcaagagtcttctaatgcacaagcacgcaggcgagaggcttctattaaaacaaaa 57257  T
198 atacagagaa 207  Q
    ||||| ||||    
57256 atacacagaa 57247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 970 - 927
Alignment:
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 142  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
970 tgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcactaa 927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0497 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0497
Description:

Target: scaffold0497; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 10959 - 10752
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagattt-cacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| || |      
10959 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaataatctcaaagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttctcaga-- 10862  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaac 197  Q
    ||||||||||| || |  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||| |||     
10861 tgctcaagcacgcaggtgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaataaaa 10762  T
198 atacagagaa 207  Q
    ||||| ||||    
10761 atacacagaa 10752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 15312 - 15508
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||      
15312 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaataatcacacagattacagatgctcaatactctcttagtatgagacttctcaaa-- 15409  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 196  Q
    |||| |||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||    
15410 tgctgaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatggtcaagcacgcaggcgagaggcttctgatcaaacaaa 15508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 29055 - 29287
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |  ||||||||||| ||    
29055 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatac-atctag-tatgagacttccca 29152  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 193  Q
    ||  ||||||||||| || |  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
29153 aa--tgctcaagcacgcaggagagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgcttaggcacgcaggcgagagacttctaatcaaac 29250  T
194 aaacatacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    | |  |||| ||||    |||||||||||||||||||    
29251 agaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttga 29287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 127227 - 127427
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcac 93  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||| || ||||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||| |    
127227 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatc-cacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttctc 127325  T
94 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaa 192  Q
    |||  |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
127326 aaa--tgctcaagcacacaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatcaaa 127423  T
193 caaa 196  Q
    ||||    
127424 caaa 127427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 194
Target Start/End: Original strand, 16190 - 16384
Alignment:
5 tagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact 99  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||  |    
16190 tagtctagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaaagataatcacacagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttctcaaa--t 16287  T
100 gctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttc-taatcaaaca 194  Q
    |||||||| | || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
16288 gctcaagcgcgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttcttaatcaaaca 16384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0570
Description:

Target: scaffold0570; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 162 - 1
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||      
162 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaataatctcacagattacaaatgttcaatactctctaagtatgagacttcacaaa-- 65  T
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgct 161  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||    
64 tgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaaacaagagtcttctaatgct 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 2387 - 2192
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||    ||||||||  |||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||||    
2387 gaagtagtccagtctcccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaca 2288  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaa 192  Q
    ||  ||||||||||  || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||    
2287 aa--tgctcaagcatgcatgcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagaggcttct-atgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 2192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 79; Significance: 4e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 23357 - 23455
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaact 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
23357 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaact 23455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 79; Significance: 4e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 118 - 1
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactg 100  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
118 gaagtagtccagtcccccttgcaattccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tg 20  T
101 ctcaagcacacacgcaaga 119  Q
    |||||||||| | ||||||    
19 ctcaagcacataggcaaga 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0627
Description:

Target: scaffold0627; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 8739 - 8650
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagactt 90  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
8739 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagactt 8650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 4)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 59571 - 59374
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| |||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||    
59571 gaagtagtccagtctcccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaaatgctcaatacta-cctagtatgagacttcaca 59473  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 193  Q
    ||  ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||    
59472 aa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaac 59375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 41027 - 40828
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcac 93  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| ||||||||| ||  |  | |||||||||||||    
41027 gaagtagtctagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatattacacctagtatgagacttcac 40928  T
94 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaa 192  Q
    |||  |||||||||||  | ||||||| |||||  |||||||||| ||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||    
40927 aaa--tgctcaagcacgtaggcaagagacttcctttgctcaagcaataaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaa 40830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 174965 - 175074
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggaga-tttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaac 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||     
174965 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaaaaatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa- 175063  T
99 tgctcaagcac 109  Q
    |||||||||||    
175064 tgctcaagcac 175074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 230
Target Start/End: Original strand, 175062 - 175136
Alignment:
156 aatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacatacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    |||||||||||||||||||    
175062 aatgctcaagcacgtaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacagagaaaaatgtttgacttgaacacttga 175136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Original strand, 18807 - 19038
Alignment:
13 ccccccttgcacttccaaggagatttcactataatc-acaaagatta--caaatgctc-aatactatcaaaatatgagacttcacaaaa---ctgctcaa 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||| |||||| || || ||||||| ||| |||||    |||||||    
18807 ccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaacaaagattaacaaaatgctctaatactctctaagtatgagatttctcaaaaattatgctcaa 18906  T
106 gcacacacgcaagagtcttcc--aatgctcaagc-actaag-caagagacttctaat-gcttaagcacgcaggc-aagagacttctaatcaaac-aaaca 198  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| ||| |    
18907 gcacacacgcaagagtcttcccaaatgctcaagcaactaagacaagagtcttctaatagctcaagcacacaggcaaagaggcttctgatcaaacaaaaaa 19006  T
199 tacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||  ||| | ||||||||||||||||||||    
19007 tacaatgaaataagtttgacttgaacacttga 19038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 17644 - 17397
Alignment:
1 gaagtagtccag-ccccccttgcactt-ccaaggag-atttcactat--aatcacaaa-gattac--aaatgct-caatactatcaaaatatgagacttc 91  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||   ||||||| ||||||| || ||  ||||||||||    
17644 gaagtagtccagtccccccttgcactttccaaggagtatttcactattaaatcacaaaagattaacaaaatgctacaatactctctaagcatgagacttc 17545  T
92 ---acaaaactgctcaag-cacacacgcaa-gagtcttccaatgct-caagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttct 185  Q
       | ||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
17544 tacaaaaaatagctcaagtcacacacgcaaagagtcttccaatgctacaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacacaggcaagaggcttct 17445  T
186 aat--caaacaaacatacagagaattgag-tttgacttgaacacttga 230  Q
     ||   ||||||| |||||  ||| | || ||||||||||||||||||    
17444 gatacaaaacaaaaatacaatgaaataagttttgacttgaacacttga 17397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1200 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold1200
Description:

Target: scaffold1200; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 87 - 1
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgaga 87  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||    
87 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgaga 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2071 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold2071
Description:

Target: scaffold2071; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 1116 - 955
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||    
1116 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatctag-tatgagacttccca 1018  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 158  Q
    ||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
1017 aa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2071; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 997 - 913
Alignment:
146 agagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacatacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| |  |||| ||||    |||||||||||||||||||    
997 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttga 913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 10436 - 10275
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-actat-----aatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||     ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||    
10436 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactatgaaataatcacacagattacaactgctcaatactatctag-tatgagacttccca 10338  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 158  Q
    ||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
10337 aa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 10275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 10317 - 10233
Alignment:
146 agagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacatacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| |  |||| ||||    |||||||||||||||||||    
10317 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttga 10233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 1686 - 1525
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||||||    
1686 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacctag-tatgagacttcaca 1588  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 158  Q
    ||  ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
1587 aa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 1525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 127 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 1587 - 1519
Alignment:
127 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 194  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||  ||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||    
1587 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaaca 1519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 3)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Original strand, 100204 - 100272
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaa 69  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
100204 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaa 100272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 475966 - 475770
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||| | ||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||||    
475966 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacacatattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaca 475867  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaa 192  Q
    ||  ||||||||||| ||  |||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||    
475866 aa--tgctcaagcacgcagacaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 475770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 482486 - 482290
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||| | ||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||||    
482486 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacacatattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcaca 482387  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaa 192  Q
    ||  ||||||||||| ||  |||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||    
482386 aa--tgctcaagcacgcagacaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 482290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 32387 - 32586
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcac 93  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||     |||||||| |  |||||| ||||||||||||  |  | |||||||||||||    
32387 gaagtagttcagtccccctggcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacaatttacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcac 32486  T
94 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaa 192  Q
    |||  ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||    
32487 aaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaa 32584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 328 - 489
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||| |  | ||||||||||| ||    
328 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatacta-cctagtatgagacttccca 426  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 158  Q
    ||  ||||||||||| || || |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
427 aa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 155749 - 155682
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctca 68  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
155749 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctca 155682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 60650 - 60813
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcac 93  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | |||||||||||||    
60650 gaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcac 60749  T
94 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 158  Q
    |||  ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
60750 aaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 60813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 57946 - 58107
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| |||||| || ||||||||||||||  | ||||||||||| ||    
57946 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattataactgctcaatactatc-tagtatgagacttccca 58044  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 158  Q
    ||  ||||||||||   | || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
58045 aa--tgctcaagcatgtaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 58107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 230
Target Start/End: Original strand, 58065 - 58149
Alignment:
146 agagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacatacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| |  |||| ||||    |||||||||||||||||||    
58065 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttga 58149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 29443 - 29282
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-actat-----aatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 94  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||     ||||||| ||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||| ||    
29443 gaagtagtctagtcccccttgcacttccaatgagatttccactatgaaataatcacacagattacaactgctcaatactatc-tagtatgagacttccca 29345  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 158  Q
    ||  ||||||||||  || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
29344 aa--tgctcaagcatgcatgctagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 29282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 29324 - 29240
Alignment:
146 agagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaacatacagagaattgagtttgacttgaacacttga 230  Q
    ||||||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| |  |||| ||||    |||||||||||||||||||    
29324 agagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttga 29240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 61127 - 61327
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcac 93  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| |||||| || ||||||||||||  |  | ||||||||||| |    
61127 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtaataatcacacagattataactgctcaatactacacctagtatgagacttcgc 61226  T
94 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa--gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaa 191  Q
    |||  ||||||||||| || ||||||| |||||  ||||||||||| ||  ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||    
61227 aaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcacaaaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaa 61324  T
192 aca 194  Q
    |||    
61325 aca 61327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1409 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1409
Description:

Target: scaffold1409; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 1797 - 1856
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 60  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1797 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 1856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0655 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0655
Description:

Target: scaffold0655; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 4513 - 4712
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcac 93  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||     
4513 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagttccactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca- 4611  T
94 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaa 192  Q
     ||| ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||| ||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||    
4612 -aaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcattaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 4710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0738 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0738
Description:

Target: scaffold0738; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 5475 - 5331
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||    
5475 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactctctag-tatgagacttccca 5377  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa 142  Q
    ||  | ||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||||    
5376 aa--ttctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 5331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0194 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0194
Description:

Target: scaffold0194; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 4493 - 4437
Alignment:
5 tagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaa 61  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4493 tagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaa 4437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1263 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1263
Description:

Target: scaffold1263; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 1843 - 1645
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcac 93  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||||  |  | || |||||||||     
1843 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtacgagacttca- 1745  T
94 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaa 192  Q
      || ||||||||||| || ||||||| ||| |  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||    
1744 --aattgctcaagcacgcaggcaagagactttctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 1647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 21088 - 20890
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcac 93  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    |||||||||  |||||||| | ||||||||||  |  | ||||||||||||     
21088 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagtgtttcactaagtttaatcacaactgattacaactactcaatactacacctagtatgagacttca- 20990  T
94 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaa 192  Q
      || ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||    
20989 --aattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaa 20892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0289 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0289
Description:

Target: scaffold0289; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Original strand, 4313 - 4364
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 52  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4313 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 4364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 38641 - 38487
Alignment:
2 aagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaa 95  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| ||||||||||||||  | ||| ||||||| |||    
38641 aagtagtccagttccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatc-tagtataagacttcccaa 38543  T
96 aactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagactt 153  Q
    |  ||||||||||| || || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
38542 a--tgctcaagcacgcaggcgagagactt-caatgctcaagcactaaagcaagagactt 38487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 256 - 415
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||  ||||     |||||||| | ||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||| ||    
256 gaagtagttcagtaccccttgcacttccaaggagattttgactaagaaataatcacacatattacaactgctcaatactacctag-tatgagacttccca 354  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 156  Q
    ||  |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
355 aa--tgctcaagcacacaggcaagagacttcctatgctcaagaactaaagcaagagacttcta 415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 4636 - 4795
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||  ||||     |||||||| | ||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||| ||    
4636 gaagtagttcagtaccccttgcacttccaaggagattttgactaagaaataatcacacatattacaactgctcaatactacctag-tatgagacttccca 4734  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 156  Q
    ||  |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
4735 aa--tgctcaagcacacaggcaagagacttcctatgctcaagaactaaagcaagagacttcta 4795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 61187 - 61136
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 52  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
61187 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 61136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1321 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1321
Description:

Target: scaffold1321; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 1650 - 1452
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agattacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcac 93  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||||  |  | || ||||||||      
1650 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtacgagacttc-- 1553  T
94 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaa 192  Q
     ||| ||||||||||| || ||||||| ||| |  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||  | | |||||||||||| |||||    
1552 -aaattgctcaagcacgcaggcaagagactttctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagtaagagacttctattcaaa 1454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0414
Description:

Target: scaffold0414; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 1474 - 1524
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaca 51  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1474 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaca 1524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0752
Description:

Target: scaffold0752; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 815 - 976
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |  | ||||||| | | ||    
815 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatacta-cctagtatgagaatgccca 913  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 158  Q
    ||  ||||||||||| || || |||| ||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||    
914 aa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttcctatgttcaaggactaaagcaagagacttctaat 976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 165331 - 165146
Alignment:
16 cccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagca 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||| |||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||   || ||||||||||    
165331 cccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaaatgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaagca 165235  T
109 cacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 196  Q
    |||| ||||||| |||||  |||||||||||  | | ||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||||||    
165234 cacaggcaagagacttcctttgctcaagcacacaggaaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaacaaa 165146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 102 - 194
Target Start/End: Original strand, 59060 - 59153
Alignment:
102 tcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 194  Q
    ||||||||| | |||||||  |||| |||||||||||| || |||||| |||||  ||||| || |||  | ||||||||||||||||||||||    
59060 tcaagcacaaaagcaagaggtttcctatgctcaagcacaaatgcaagatacttcctatgctcaaccacaaaagcaagagacttctaatcaaaca 59153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 139
Target Start/End: Original strand, 13938 - 14068
Alignment:
14 cccccttgcacttccaaggagatttc-acta-------taatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaaatatgagacttcacaaaactgctcaa 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||| |||||||| |||||||||||| || |  ||||||||||  ||||  |||||||    
13938 cccccttgcacttccaaggagatttccactaaaatcaataatcacacagattacagatgctcaatactctctag-tatgagacttatcaaa--tgctcaa 14034  T
106 gcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac 139  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
14035 gcacacaggcaagagacttccaatgctcaagcac 14068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 127 - 184
Target Start/End: Original strand, 14026 - 14084
Alignment:
127 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttc 184  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
14026 aatgctcaagcacacaggcaagagacttccaatgctcaagcacgcaggcaagagacttc 14084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 5)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 19959 - 20147
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agattacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcac 93  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||||  |  | |||||||||||      
19959 gaagtagtccagttccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttc-- 20056  T
94 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttc 184  Q
     ||| ||||||||||| || ||||||| |||||  | |||||||||| |||||||||||| |   | || ||||||||||||||||||||||    
20057 -aaattgctcaagcacgcaagcaagagacttccttttctcaagcactaaagcaagagactcccttttctcaagcacgcaggcaagagacttc 20147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 193
Target Start/End: Original strand, 20123 - 20216
Alignment:
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 193  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||| | ||||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||    
20123 ctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcaatcaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaac 20216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 194
Target Start/End: Original strand, 10250 - 10316
Alignment:
129 tgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 194  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||||    
10250 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 10316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 156
Target Start/End: Original strand, 10250 - 10308
Alignment:
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 156  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
10250 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 10308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 156
Target Start/End: Original strand, 20151 - 20209
Alignment:
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 156  Q
    ||||||||||  || ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
20151 tgctcaagcaatcaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 20209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 184
Target Start/End: Original strand, 35015 - 35201
Alignment:
2 aagtagtccagccccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcacaa 95  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||| ||||||||| ||||||||||||  |  | |||||||||||   |    
35015 aagtagtccagtttcccttgcacttccaaggagattttcactaagtttaatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttc---a 35111  T
96 aactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttc 184  Q
    || ||||||||||| || ||||||| ||||   |||||||||||| |||||||||||||   ||||| ||||||  | ||||||||||||    
35112 aattgctcaagcacgcaggcaagagacttcttttgctcaagcactaaagcaagagactttctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 35201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 194
Target Start/End: Original strand, 35145 - 35241
Alignment:
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 194  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||||    
35145 tgctcaagcactaaagcaagagactttctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 35241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 11128 - 11315
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatt-----tcactataatcacaaagattacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcaca 94  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||     ||| | |||||||| ||||||||| |||||||||| |  |  | |||||||||||       
11128 gaagtagtccagtcccctttgcacttccaaggagattttcactcagtttaatcacacagattacaactgctcaataccacacctagtatgagacttc--- 11224  T
95 aaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttc 184  Q
    ||| ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||| |||||| |||||||   |||| ||||||  | ||||||||||||    
11225 aaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaatagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 11315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 194
Target Start/End: Original strand, 11259 - 11355
Alignment:
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 194  Q
    |||||||||||  | |||| || |||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||| ||||||||| |||||||    
11259 tgctcaagcactaaagcaatagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaatagacttctattcaaaca 11355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 7066 - 6970
Alignment:
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 194  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||||    
7066 tgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 6970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 7198 - 7010
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcac 93  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||     
7198 gaagtagtccagtcccccttacactttcaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca- 7100  T
94 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttc 184  Q
      || ||||||||||| || ||||| | |||||  |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||  | ||||||||||||    
7099 --aattgctcaagcacgcaggcaagtgacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 7010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0382 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0382
Description:

Target: scaffold0382; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 1961 - 1882
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatacta 74  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
1961 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtaataatcacacagattacaactgctcaatacta 1882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 59 - 1
Alignment:
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 156  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
59 tgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 178 - 1
Alignment:
14 cccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaag 106  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||||  |  | | ||| ||||||   || ||||||||    
178 cccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtttgacacttca---aattgctcaag 82  T
107 cacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttcta 186  Q
    ||||||  |||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||||  ||||| ||||||  | ||||||||||||||    
81 cacacagacaagagacttcctttgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 2483 - 2338
Alignment:
16 cccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gattacaaatgctcaatactat-caaaatatgagacttcacaaaactgctcaagca 108  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||||  |  | ||||||||||||   || ||||||||||    
2483 cccttgcacttccaatgagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttca---aattgctcaagca 2387  T
109 cacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttcta 156  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
2386 cacaggcaagagacttcctatgctcaagcacacaagcaagagacttcta 2338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 4511 - 4415
Alignment:
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 194  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  |||||||||| |||  ||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||||    
4511 tgctcaagcacacaagcaagagacttcctttgctcaagcacacaagcaagagatttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 4415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0771 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0771
Description:

Target: scaffold0771; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 5799 - 5927
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agattacaaatgctcaatacta-tcaaaatatgagacttcac 93  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||||  |  | |||||||||||      
5799 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttc-- 5896  T
94 aaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttc 125  Q
     ||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
5897 -aaattgctcaagcacacaagcaagagacttc 5927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 19475 - 19523
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 49  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
19475 gaagtagtcctgccccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 19523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 38667 - 38609
Alignment:
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttcta 156  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
38667 tgctcaagcacacaagcaagagactttctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 38609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 38695 - 38601
Alignment:
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 194  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  |||||||||||||   ||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||||    
38695 ctcaggcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcacacaagcaagagactttctatgctcaagcactaaagcaagagacttctattcaaaca 38601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0878 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0878
Description:

Target: scaffold0878; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 4866 - 4829
Alignment:
134 aagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgca 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
4866 aagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgca 4829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 4011 - 3914
Alignment:
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttcc-aatgctcaagcac-taagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 194  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||  ||||| ||||||  | ||||||||||| ||| ||||||    
4011 tgctcaagcacacaagcaagagacttccaaatactcaagcacataagcaagagatttcatatgctcaagcacaaaagcaagagacttataaacaaaca 3914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 4075 - 4027
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 49  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
4075 gaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 4027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 4625 - 4528
Alignment:
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa-tgctcaagcact-aagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 194  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||  |||||||||| |||  ||||| ||||||  | ||||||||||||||| ||||||    
4625 tgctcaagcacacaagcaagagacttccaaatactcaagcacacaagcaagagatttcctatgctcaagcaccaaagcaagagacttctaaacaaaca 4528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 8318 - 8279
Alignment:
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagca 138  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
8318 tgctcaagcacacaagcaagaggcttccaatgctcaagca 8279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 59852 - 59775
Alignment:
80 atatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagacttctaat 158  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
59852 atatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaaaaaagagacttctaat 59775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1507 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1507
Description:

Target: scaffold1507; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 63 - 20
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggaga-tttcacta 43  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
63 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcacta 20  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1281 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1281
Description:

Target: scaffold1281; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 2098 - 2056
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcacta 43  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||    
2098 gaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 2056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 9699 - 9630
Alignment:
2 aagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa--agattacaaatgctcaa 69  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
9699 aagtagtcctgtcccccttgtacttccaaggagagttcactaaaatcagaatctgattacaaatgctcaa 9630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 156
Target Start/End: Original strand, 9497 - 9557
Alignment:
99 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcact---aagcaagagacttcta 156  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||    
9497 tgctcaagcacacagacaagagacttcctatgctcaagcactaaaaagcaagagacttcta 9557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Original strand, 16363 - 16442
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agattacaaatgctcaatacta 74  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| ||||||||||||    
16363 gaagtagtccaatcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatacta 16442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 378260 - 378218
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcacta 43  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
378260 gaagtagtcatgccccccttgcacttccaaggagagttcacta 378218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 87807 - 87855
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 49  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
87807 gaagtagttcactcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 87855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 34
Target Start/End: Complemental strand, 52403 - 52370
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggag 34  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
52403 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggag 52370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 156
Target Start/End: Original strand, 22546 - 22598
Alignment:
105 agcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagacttcta 156  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
22546 agcacaaacgcaagagacttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttcta 22598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 196
Target Start/End: Original strand, 13542 - 13638
Alignment:
101 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 196  Q
    ||||||||||   |||||||  |||| ||||||||| |||||  |||||||||||| ||||| ||| || || |||||||||||||| | |||||||    
13542 ctcaagcacaactgcaagagatttcctatgctcaagaactaaatcaagagacttcttatgctcaagtacacaagcaagagacttctattaaaacaaa 13638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 76643 - 76691
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 49  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
76643 gaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaagagagttcactaaaatca 76691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 113 - 161
Alignment:
1 gaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 49  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
113 gaagtagtcctgtcccacttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University