View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8810A_low_402 (Length: 209)

Name: NF8810A_low_402
Description: NF8810A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8810A_low_402
NF8810A_low_402
[»] chr3 (58 HSPs)
chr3 (1-209)||(16626470-16626678)
chr3 (1-207)||(18530474-18530680)
chr3 (1-205)||(5652473-5652677)
chr3 (1-204)||(4626030-4626233)
chr3 (1-204)||(17993753-17993956)
chr3 (7-209)||(31034081-31034283)
chr3 (7-209)||(32292844-32293046)
chr3 (7-204)||(5713319-5713516)
chr3 (7-204)||(5724229-5724426)
chr3 (7-204)||(5757051-5757248)
chr3 (7-204)||(5767942-5768139)
chr3 (13-209)||(8296070-8296266)
chr3 (13-209)||(15741058-15741254)
chr3 (13-209)||(18051360-18051556)
chr3 (13-209)||(18330767-18330963)
chr3 (7-209)||(22387542-22387744)
chr3 (13-209)||(4796617-4796813)
chr3 (13-209)||(15892670-15892866)
chr3 (10-209)||(6192411-6192610)
chr3 (7-209)||(7073304-7073506)
chr3 (7-209)||(29148719-29148921)
chr3 (13-209)||(8301231-8301427)
chr3 (10-206)||(4721726-4721922)
chr3 (13-209)||(35880864-35881060)
chr3 (7-209)||(4417011-4417213)
chr3 (7-209)||(10396225-10396427)
chr3 (7-209)||(28115918-28116120)
chr3 (7-209)||(11110313-11110515)
chr3 (19-209)||(29664934-29665124)
chr3 (7-209)||(5467077-5467279)
chr3 (7-209)||(8211830-8212032)
chr3 (7-209)||(28021367-28021569)
chr3 (7-209)||(48466019-48466221)
chr3 (7-209)||(4346651-4346853)
chr3 (7-209)||(18277016-18277218)
chr3 (7-209)||(18292317-18292519)
chr3 (7-209)||(18307618-18307820)
chr3 (19-209)||(20576811-20577001)
chr3 (7-183)||(20066135-20066311)
chr3 (7-183)||(32439246-32439422)
chr3 (7-209)||(21674785-21674987)
chr3 (7-209)||(22870820-22871022)
chr3 (7-209)||(22885879-22886081)
chr3 (7-209)||(36997041-36997243)
chr3 (7-209)||(51782115-51782317)
chr3 (7-209)||(51797205-51797407)
chr3 (7-209)||(31964437-31964639)
chr3 (7-209)||(50134035-50134237)
chr3 (7-209)||(5596321-5596523)
chr3 (7-209)||(5609286-5609488)
chr3 (7-209)||(6542426-6542628)
chr3 (19-209)||(17984920-17985110)
chr3 (7-209)||(28339394-28339596)
chr3 (7-209)||(5013804-5014006)
chr3 (7-209)||(18242831-18243033)
chr3 (7-209)||(47023545-47023747)
chr3 (7-209)||(18225283-18225485)
chr3 (7-209)||(24328251-24328453)
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (7-209)||(15284851-15285053)
chr4 (1-209)||(15228010-15228218)
chr4 (1-204)||(24460533-24460736)
chr4 (6-206)||(1900402-1900602)
chr4 (1-209)||(14235448-14235656)
chr4 (1-179)||(15391291-15391469)
chr4 (10-209)||(17014149-17014348)
chr4 (13-209)||(24592237-24592433)
chr4 (13-209)||(14665170-14665366)
chr4 (7-209)||(5006019-5006221)
chr4 (7-209)||(36344438-36344640)
chr4 (7-209)||(6569999-6570201)
chr4 (7-183)||(34188909-34189085)
chr4 (7-209)||(14763227-14763429)
chr4 (7-209)||(18800536-18800738)
chr4 (7-209)||(31126441-31126643)
chr4 (7-209)||(40105561-40105763)
chr4 (7-183)||(24112808-24112984)
chr4 (7-209)||(33673721-33673923)
chr4 (8-209)||(14098688-14098889)
chr4 (19-209)||(21969859-21970049)
chr4 (7-209)||(54833533-54833735)
chr4 (7-209)||(27163240-27163442)
chr4 (7-209)||(30753900-30754102)
chr4 (19-209)||(39850796-39850986)
[»] chr2 (41 HSPs)
chr2 (1-209)||(19456333-19456541)
chr2 (1-205)||(27118809-27119013)
chr2 (1-204)||(3784775-3784978)
chr2 (1-206)||(21703079-21703284)
chr2 (1-204)||(16163720-16163923)
chr2 (1-204)||(34157132-34157334)
chr2 (1-209)||(34303215-34303423)
chr2 (1-209)||(27393090-27393298)
chr2 (13-204)||(31891245-31891436)
chr2 (19-201)||(9349902-9350084)
chr2 (7-209)||(40233638-40233840)
chr2 (10-209)||(27434356-27434555)
chr2 (13-209)||(23128478-23128674)
chr2 (7-209)||(22925940-22926142)
chr2 (13-209)||(12655675-12655871)
chr2 (13-209)||(28882347-28882543)
chr2 (10-209)||(20838048-20838247)
chr2 (19-209)||(12586949-12587139)
chr2 (19-209)||(13936456-13936646)
chr2 (19-209)||(27777361-27777551)
chr2 (19-209)||(27817119-27817309)
chr2 (7-209)||(37375288-37375490)
chr2 (7-209)||(260665-260867)
chr2 (19-209)||(12716514-12716704)
chr2 (19-209)||(16829250-16829440)
chr2 (19-209)||(16892041-16892231)
chr2 (19-209)||(27803846-27804036)
chr2 (7-209)||(32049925-32050127)
chr2 (7-209)||(37925620-37925822)
chr2 (19-209)||(39051734-39051924)
chr2 (7-179)||(34286481-34286653)
chr2 (7-179)||(34291541-34291713)
chr2 (7-206)||(34861807-34862006)
chr2 (7-209)||(11635098-11635300)
chr2 (7-209)||(11641287-11641489)
chr2 (7-209)||(21677094-21677296)
chr2 (7-209)||(31876408-31876610)
chr2 (7-209)||(37685821-37686023)
chr2 (7-209)||(37701086-37701288)
chr2 (8-209)||(39890202-39890403)
chr2 (7-95)||(34279576-34279664)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (1-209)||(2581-2789)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (1-209)||(20340258-20340466)
chr1 (1-209)||(16207954-16208162)
chr1 (1-209)||(20461205-20461413)
chr1 (7-209)||(28151992-28152194)
chr1 (7-209)||(51638348-51638550)
chr1 (7-209)||(10962800-10963002)
chr1 (7-209)||(28585111-28585313)
chr1 (7-209)||(41793231-41793433)
[»] chr6 (47 HSPs)
chr6 (1-209)||(22456800-22457008)
chr6 (1-204)||(28162779-28162982)
chr6 (1-204)||(33374127-33374330)
chr6 (7-209)||(14143151-14143353)
chr6 (7-209)||(26788072-26788274)
chr6 (7-209)||(27196445-27196647)
chr6 (7-209)||(27252593-27252795)
chr6 (1-209)||(13521939-13522147)
chr6 (1-204)||(8892182-8892384)
chr6 (1-204)||(8903417-8903619)
chr6 (1-209)||(27290236-27290444)
chr6 (13-209)||(20160835-20161031)
chr6 (13-209)||(22171800-22171996)
chr6 (10-209)||(22934746-22934945)
chr6 (10-209)||(23857191-23857390)
chr6 (10-209)||(27272446-27272645)
chr6 (1-107)||(22477241-22477347)
chr6 (7-209)||(16749982-16750184)
chr6 (7-209)||(26918508-26918710)
chr6 (13-209)||(26989135-26989331)
chr6 (13-209)||(13298817-13299013)
chr6 (13-209)||(24304484-24304680)
chr6 (13-209)||(24863851-24864047)
chr6 (13-200)||(27000207-27000394)
chr6 (7-209)||(29549603-29549805)
chr6 (13-209)||(15424183-15424379)
chr6 (7-209)||(4757892-4758094)
chr6 (7-209)||(4773134-4773336)
chr6 (7-209)||(16674267-16674469)
chr6 (7-209)||(27007855-27008057)
chr6 (7-209)||(27359858-27360060)
chr6 (7-209)||(27450201-27450403)
chr6 (7-209)||(29573141-29573343)
chr6 (88-209)||(17092306-17092427)
chr6 (7-209)||(4545641-4545843)
chr6 (19-209)||(30557882-30558072)
chr6 (7-209)||(34463212-34463414)
chr6 (7-209)||(3696209-3696411)
chr6 (19-209)||(4525426-4525616)
chr6 (7-209)||(4724000-4724202)
chr6 (19-209)||(17025417-17025607)
chr6 (7-209)||(28207582-28207784)
chr6 (7-209)||(16943893-16944095)
chr6 (7-209)||(26116276-26116478)
chr6 (7-209)||(29501543-29501745)
chr6 (7-209)||(27044515-27044718)
chr6 (7-209)||(26777481-26777683)
[»] chr7 (36 HSPs)
chr7 (6-206)||(16449810-16450010)
chr7 (1-206)||(16041449-16041654)
chr7 (1-204)||(31088278-31088481)
chr7 (1-204)||(45733586-45733789)
chr7 (7-209)||(26484826-26485028)
chr7 (7-206)||(2108817-2109016)
chr7 (7-209)||(2775491-2775693)
chr7 (7-209)||(39210832-39211034)
chr7 (10-209)||(26682809-26683008)
chr7 (10-209)||(4200682-4200881)
chr7 (7-209)||(5128124-5128326)
chr7 (13-209)||(2154711-2154907)
chr7 (13-209)||(16518225-16518421)
chr7 (13-209)||(10916677-10916873)
chr7 (13-209)||(11424585-11424781)
chr7 (13-209)||(16503189-16503385)
chr7 (7-209)||(26274903-26275105)
chr7 (7-209)||(3445438-3445640)
chr7 (7-209)||(26435389-26435591)
chr7 (7-209)||(4144932-4145134)
chr7 (7-209)||(5147149-5147351)
chr7 (7-209)||(11441704-11441906)
chr7 (7-209)||(24592350-24592552)
chr7 (7-209)||(31564199-31564401)
chr7 (7-183)||(18540931-18541107)
chr7 (7-209)||(26319678-26319880)
chr7 (7-209)||(26537679-26537881)
chr7 (7-209)||(26669723-26669925)
chr7 (7-209)||(9618783-9618985)
chr7 (7-209)||(45387475-45387677)
chr7 (7-209)||(16736269-16736471)
chr7 (7-209)||(16751323-16751525)
chr7 (7-209)||(17523664-17523866)
chr7 (7-209)||(17529349-17529551)
chr7 (7-183)||(5159651-5159827)
chr7 (7-209)||(31125052-31125254)
[»] chr5 (50 HSPs)
chr5 (1-206)||(22888604-22888809)
chr5 (1-204)||(13184473-13184676)
chr5 (1-204)||(13440319-13440522)
chr5 (1-209)||(25199163-25199371)
chr5 (1-209)||(33877381-33877589)
chr5 (1-204)||(11325928-11326131)
chr5 (7-209)||(29888902-29889104)
chr5 (10-209)||(23892349-23892548)
chr5 (13-209)||(24687977-24688173)
chr5 (10-209)||(33777630-33777829)
chr5 (7-209)||(9548363-9548565)
chr5 (10-209)||(23752270-23752469)
chr5 (13-209)||(22998934-22999130)
chr5 (13-209)||(11549500-11549696)
chr5 (13-209)||(23717808-23718004)
chr5 (13-209)||(24970164-24970360)
chr5 (13-209)||(30934779-30934975)
chr5 (7-209)||(15658580-15658782)
chr5 (7-209)||(28649375-28649577)
chr5 (7-209)||(37671303-37671505)
chr5 (7-206)||(18500553-18500752)
chr5 (7-209)||(9317591-9317793)
chr5 (7-209)||(12132295-12132497)
chr5 (7-209)||(13324649-13324851)
chr5 (7-209)||(30152158-30152360)
chr5 (7-209)||(31431580-31431782)
chr5 (7-209)||(31826227-31826429)
chr5 (7-209)||(18375232-18375434)
chr5 (19-209)||(24681592-24681782)
chr5 (19-209)||(24724119-24724309)
chr5 (7-209)||(32599292-32599494)
chr5 (19-209)||(33516508-33516698)
chr5 (7-209)||(37358463-37358665)
chr5 (19-209)||(40473369-40473559)
chr5 (7-209)||(43078392-43078594)
chr5 (7-183)||(33292665-33292841)
chr5 (7-209)||(8665295-8665497)
chr5 (7-209)||(15758677-15758879)
chr5 (7-209)||(26480532-26480734)
chr5 (7-209)||(29966886-29967088)
chr5 (7-209)||(30029555-30029757)
chr5 (7-183)||(41674849-41675025)
chr5 (7-209)||(2511191-2511393)
chr5 (7-209)||(3789681-3789883)
chr5 (7-209)||(6874445-6874647)
chr5 (7-209)||(30168609-30168811)
chr5 (7-209)||(37755120-37755322)
chr5 (7-209)||(37770807-37771009)
chr5 (7-209)||(5638050-5638252)
chr5 (7-209)||(34616658-34616860)
[»] scaffold0415 (2 HSPs)
scaffold0415 (1-206)||(1844-2048)
scaffold0415 (7-206)||(6143-6344)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (1-206)||(20513-20717)
scaffold0124 (19-209)||(30595-30785)
[»] chr8 (23 HSPs)
chr8 (1-205)||(19658926-19659129)
chr8 (1-205)||(33244790-33244994)
chr8 (1-204)||(44563226-44563427)
chr8 (1-179)||(22080790-22080968)
chr8 (1-209)||(9354747-9354956)
chr8 (7-209)||(18710717-18710919)
chr8 (10-208)||(16283583-16283781)
chr8 (13-209)||(19688235-19688431)
chr8 (13-209)||(27608787-27608983)
chr8 (13-209)||(16277691-16277887)
chr8 (13-209)||(14557761-14557957)
chr8 (38-209)||(189256-189427)
chr8 (13-209)||(2137141-2137337)
chr8 (7-209)||(12092606-12092808)
chr8 (7-209)||(3329389-3329591)
chr8 (7-209)||(19674572-19674774)
chr8 (19-209)||(29829465-29829655)
chr8 (7-209)||(31354655-31354857)
chr8 (7-209)||(31489632-31489834)
chr8 (7-209)||(19208242-19208444)
chr8 (7-209)||(19286593-19286795)
chr8 (7-209)||(28361837-28362039)
chr8 (7-209)||(33258854-33259056)
[»] scaffold0558 (1 HSPs)
scaffold0558 (1-159)||(1-159)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (1-179)||(21686-21864)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (22-209)||(541-728)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (13-209)||(46908-47104)
scaffold0089 (13-209)||(39992-40188)
scaffold0089 (13-209)||(29900-30096)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (13-209)||(52-248)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (13-209)||(27429-27625)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (7-209)||(9697-9899)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (7-209)||(7162-7364)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (7-209)||(26124-26326)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (7-209)||(14853-15055)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (7-209)||(8989-9191)
scaffold0159 (7-209)||(20146-20348)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (7-209)||(8080-8282)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (115-170)||(46764-46819)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 181; Significance: 5e-98; HSPs: 58)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16626678 - 16626470
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaacc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16626678 ttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagacc 16626579  T
Q  101 aaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16626578 aaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtccttgacaatcctcttccgaatcacactgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 16626479  T
Q  201 cagacttga 209  Q
    |||||||||    
T  16626478 cagacttga 16626470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 18530474 - 18530680
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaacc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18530474 ttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagacc 18530573  T
Q  101 aaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18530574 aaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcgtgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgagggagctcc 18530673  T
Q  201 cagactt 207  Q
    |||||||    
T  18530674 cagactt 18530680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 5652473 - 5652677
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaacc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||    
T  5652473 ttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagacc 5652572  T
Q  101 aaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5652573 aaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcatgctgctgtgaacatgattgaggtatgtgaggaagctcc 5652672  T
Q  201 cagac 205  Q
    |||||    
T  5652673 cagac 5652677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 4626030 - 4626233
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaacc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||    
T  4626030 ttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagacc 4626129  T
Q  101 aaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4626130 aaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgagaaagctcc 4626229  T
Q  201 caga 204  Q
    ||||    
T  4626230 caga 4626233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 17993956 - 17993753
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaacc 100  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||    
T  17993956 ttccgttcggacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagacc 17993857  T
Q  101 aaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17993856 aaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 17993757  T
Q  201 caga 204  Q
    ||||    
T  17993756 caga 17993753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 31034283 - 31034081
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  31034283 tctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaa 31034184  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    | || || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31034183 agttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggact 31034084  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  31034083 tga 31034081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 32292844 - 32293046
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  32292844 tctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaa 32292943  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    | || || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32292944 agttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggact 32293043  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  32293044 tga 32293046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 204
Target Start/End: Original strand, 5713319 - 5713516
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  5713319 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 5713418  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 204  Q
    |  | || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5713419 agctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 5713516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 204
Target Start/End: Original strand, 5724229 - 5724426
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  5724229 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 5724328  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 204  Q
    |  | || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5724329 agctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 5724426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 5757248 - 5757051
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  5757248 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 5757149  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 204  Q
    |  | || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5757148 agctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 5757051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 5768139 - 5767942
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  5768139 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 5768040  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 204  Q
    |  | || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5768039 agctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 5767942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 8296070 - 8296266
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaa 112  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | |||||||| || |    
T  8296070 ctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttga 8296169  T
Q  113 cctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    | |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  8296170 cttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 8296266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15741254 - 15741058
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaa 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | |    
T  15741254 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgctctgggtcatgatgtcgagggatgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 15741155  T
Q  113 cctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    | |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  15741154 cttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 15741058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 18051360 - 18051556
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaa 112  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | |    
T  18051360 ctcaaatgtgatttctatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 18051459  T
Q  113 cctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    | |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||    
T  18051460 cttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgattgaagtatgtgagaaagctcctagacttga 18051556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 18330767 - 18330963
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaa 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | |    
T  18330767 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 18330866  T
Q  113 cctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    | |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  18330867 cttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 18330963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22387744 - 22387542
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | |||||||    
T  22387744 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaa 22387645  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||    
T  22387644 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagact 22387545  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  22387544 tga 22387542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 4796813 - 4796617
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaa 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || || |||||||||||  | ||||||||  | |    
T  4796813 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctga 4796714  T
Q  113 cctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    | |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  4796713 cttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 4796617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15892866 - 15892670
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaa 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | |    
T  15892866 ctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 15892767  T
Q  113 cctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    | |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  15892766 cttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 15892670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 209
Target Start/End: Original strand, 6192411 - 6192610
Alignment:
Q  10 gacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaat 109  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||      
T  6192411 gacctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagc 6192510  T
Q  110 taacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  6192511 tgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 6192610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 7073304 - 7073506
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | |||||||    
T  7073304 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaa 7073403  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  |||| |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  7073404 agctaacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 7073503  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  7073504 tga 7073506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 29148921 - 29148719
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | |||||||    
T  29148921 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaa 29148822  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||||    
T  29148821 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagact 29148722  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  29148721 tga 29148719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 8301427 - 8301231
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaa 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | |    
T  8301427 ctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtagaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 8301328  T
Q  113 cctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    | |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  8301327 cttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 8301231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 206
Target Start/End: Original strand, 4721726 - 4721922
Alignment:
Q  10 gacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaat 109  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || |||||| |||||||||| || || ||||| |||||  | ||||||||      
T  4721726 gacctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacactttgaagtatatcgtgaaaaatctcattgatcaaggaaagc 4721825  T
Q  110 taacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    | || ||| |||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||    
T  4721826 tgactttttagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgttgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagact 4721922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 35880864 - 35881060
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaa 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || || |||||||||||  | ||||||||  | |    
T  35880864 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctga 35880963  T
Q  113 cctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    | |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| ||||||| |||| ||||||||    
T  35880964 cttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttga 35881060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 4417011 - 4417213
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||||| || ||||||||  | |||||||    
T  4417011 tctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaaggaa 4417110  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  4417111 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 4417210  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  4417211 tga 4417213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 10396225 - 10396427
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  10396225 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 10396324  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | ||||||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  10396325 agctgacctttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 10396424  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  10396425 tga 10396427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 28116120 - 28115918
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | |||||||    
T  28116120 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaa 28116021  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || |  ||||||||||| |||||    
T  28116020 agctgacatttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgcgaggaagctcctagact 28115921  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  28115920 tga 28115918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11110515 - 11110313
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || ||||    
T  11110515 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 11110416  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||| || | |||||||||||| |||||    
T  11110415 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgattgaagtgtgtgaggaagctccaagact 11110316  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  11110315 tga 11110313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 29665124 - 29664934
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttg 118  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || ||||    
T  29665124 tgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 29665025  T
Q  119 agaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    |||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  29665024 agaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcacgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 29664934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 5467077 - 5467279
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  5467077 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 5467176  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    || | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  5467177 aactgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 5467276  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  5467277 tga 5467279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 8211830 - 8212032
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  8211830 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 8211929  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  8211930 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 8212029  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  8212030 tga 8212032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 28021367 - 28021569
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||| ||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  28021367 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggttatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 28021466  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||    
T  28021467 agctgacttttgagaataatgtcccccacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagact 28021566  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  28021567 tga 28021569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 48466019 - 48466221
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | |||||||    
T  48466019 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaa 48466118  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  48466119 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 48466218  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  48466219 tga 48466221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 4346853 - 4346651
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || ||||    
T  4346853 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 4346754  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  4346753 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgataatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 4346654  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  4346653 tga 4346651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18277218 - 18277016
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || ||||    
T  18277218 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 18277119  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  18277118 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 18277019  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  18277018 tga 18277016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18292519 - 18292317
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || ||||    
T  18292519 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 18292420  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  18292419 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 18292320  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  18292319 tga 18292317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18307820 - 18307618
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || ||||    
T  18307820 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 18307721  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  18307720 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 18307621  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  18307620 tga 18307618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20577001 - 20576811
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttg 118  Q
    |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || ||||    
T  20577001 tgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 20576902  T
Q  119 agaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    |||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  20576901 agaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 20576811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Original strand, 20066135 - 20066311
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| ||| | || ||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| || || ||||| ||| | ||||| |    
T  20066135 tctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaaggga 20066234  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 183  Q
    | ||||| |||||||||||  | || ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  20066235 agttaacttttgagaacaatatgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgattgag 20066311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Original strand, 32439246 - 32439422
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| ||| | || ||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| || || ||||| ||| | ||||| |    
T  32439246 tctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaaggga 32439345  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 183  Q
    | ||||| |||||||||||  | || ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  32439346 agttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgattgag 32439422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 21674785 - 21674987
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  21674785 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 21674884  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||    || |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  21674885 agctgacttttgagaataatgctccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 21674984  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  21674985 tga 21674987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22871022 - 22870820
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || ||||    
T  22871022 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 22870923  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||| ||| |||||    
T  22870922 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagact 22870823  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  22870822 tga 22870820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22886081 - 22885879
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || ||||    
T  22886081 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 22885982  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||| ||| |||||    
T  22885981 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagact 22885882  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  22885881 tga 22885879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 36997243 - 36997041
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||||| || ||||||||  | ||||| |    
T  36997243 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaaggga 36997144  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  ||||  |||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || |||| ||||||| |||| |||||    
T  36997143 agctgacttttgagaataatgtcccatatgtcctcgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagact 36997044  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  36997043 tga 36997041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 51782115 - 51782317
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || ||||    
T  51782115 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcagggaa 51782214  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  51782215 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 51782314  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  51782315 tga 51782317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 51797205 - 51797407
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || ||||    
T  51797205 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcagggaa 51797304  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  51797305 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 51797404  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  51797405 tga 51797407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 31964639 - 31964437
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||| || || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  31964639 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 31964540  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  31964539 agctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 31964440  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  31964439 tga 31964437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 50134237 - 50134035
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||| || || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  50134237 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 50134138  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  50134137 agctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 50134038  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  50134037 tga 50134035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 5596523 - 5596321
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || || |||||  | ||||| |    
T  5596523 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaaggga 5596424  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  5596423 agctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 5596324  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  5596323 tga 5596321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 5609488 - 5609286
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||| || ||||| || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  5609488 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaagggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 5609389  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| || ||    
T  5609388 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggct 5609289  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  5609288 tga 5609286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 6542628 - 6542426
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || ||||    
T  6542628 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 6542529  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||||||  | || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | | |||||||||| |||||    
T  6542528 agctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtaaggaagctcctagact 6542429  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  6542428 tga 6542426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 17985110 - 17984920
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttg 118  Q
    ||||| || |||||||||||  | |||||||| || || ||||| || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || ||||    
T  17985110 tgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttg 17985011  T
Q  119 agaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    |||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||||    
T  17985010 agaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctcctagacttga 17984920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 28339394 - 28339596
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||| || || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  28339394 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 28339493  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||    
T  28339494 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagact 28339593  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  28339594 tga 28339596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 5013804 - 5014006
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  5013804 tctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 5013903  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||    
T  5013904 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagact 5014003  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  5014004 tga 5014006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 18242831 - 18243033
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | || |||||||| || || || || ||||||||||| || || || || |||||  | ||||| |    
T  18242831 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaaggga 18242930  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  18242931 agctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 18243030  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  18243031 tga 18243033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 47023545 - 47023747
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  47023545 tctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 47023644  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || ||||| ||  ||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||    
T  47023645 agctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagact 47023744  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  47023745 tga 47023747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 18225283 - 18225485
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||| || || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  18225283 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 18225382  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||  ||||||| ||||| || || | ||| |||||||| || ||    
T  18225383 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctcctaggct 18225482  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  18225483 tga 18225485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 24328251 - 24328453
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || |||||||| || || || || ||||||||  | ||||| |    
T  24328251 tctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 24328350  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||    
T  24328351 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagact 24328450  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  24328451 tga 24328453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 179; Significance: 9e-97; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15285053 - 15284851
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15285053 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagaccaaggaa 15284954  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15284953 aattgacctttgagaataacgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgttgctgtgaacatgattgaggtatgtgaggaagctcccagact 15284854  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  15284853 tga 15284851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 15228010 - 15228218
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaacc 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  | |    
T  15228010 ttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcacgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatc 15228109  T
Q  101 aaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||    
T  15228110 agggaaagttaacctttgagaataacgtccgtcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattggggtatatgagatagctcc 15228209  T
Q  201 cagacttga 209  Q
    |||||||||    
T  15228210 cagacttga 15228218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 24460736 - 24460533
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaacc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||    
T  24460736 ttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagacc 24460637  T
Q  101 aaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24460636 aaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaagtatatgaggaagctcc 24460537  T
Q  201 caga 204  Q
    ||||    
T  24460536 caga 24460533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 6 - 206
Target Start/End: Original strand, 1900402 - 1900602
Alignment:
Q  6 ttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaagga 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||  | ||||||    
T  1900402 ttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacactttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaagga 1900501  T
Q  106 aaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagac 205  Q
    || ||||| |||||||| ||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1900502 aagttaacttttgagaataatgtcccttatgtccttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagac 1900601  T
Q  206 t 206  Q
    |    
T  1900602 t 1900602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14235656 - 14235448
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaacc 100  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  14235656 ttccatttcgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggccatgatgttgagggatgttacgctttgaagttcattgtaaagaagctcatagacc 14235557  T
Q  101 aaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    | ||||| ||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||    
T  14235556 agggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcacgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgagacctatgaagaagctcc 14235457  T
Q  201 cagacttga 209  Q
    ||| |||||    
T  14235456 cagtcttga 14235448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 15391469 - 15391291
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaacc 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||     
T  15391469 ttccgttctgacctcaagtgcgatttccatcaaggtgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgact 15391370  T
Q  101 aaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgat 179  Q
    | ||||| ||||| |||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15391369 agggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgttcttgacaatcctcttctgaatcacgctgctgtgaacatgat 15391291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 209
Target Start/End: Original strand, 17014149 - 17014348
Alignment:
Q  10 gacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaat 109  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||      
T  17014149 gacctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagc 17014248  T
Q  110 taacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  17014249 tgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 17014348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24592433 - 24592237
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaa 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | |    
T  24592433 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 24592334  T
Q  113 cctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    | |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  24592333 cttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttcccaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 24592237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 14665170 - 14665366
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaa 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | |    
T  14665170 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 14665269  T
Q  113 cctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    | |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  14665270 cttttgagaataatatcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 14665366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 5006019 - 5006221
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  5006019 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 5006118  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    | || || |||||||| ||  |||| || ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  5006119 agttgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttctgaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 5006218  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  5006219 tga 5006221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 36344640 - 36344438
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || |||||| |  | || ||||    
T  36344640 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcagggaa 36344541  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  36344540 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 36344441  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  36344440 tga 36344438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 6569999 - 6570201
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  6569999 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 6570098  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  6570099 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 6570198  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  6570199 tga 6570201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 34189085 - 34188909
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| || || ||||| ||| | ||||| |    
T  34189085 tctgatcttaagtgtgacttccatcaaggtgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaaggga 34188986  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 183  Q
    | ||||| |||||||||||  | || ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  34188985 agttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgattgag 34188909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14763429 - 14763227
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || ||||    
T  14763429 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 14763330  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  14763329 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 14763230  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  14763229 tga 14763227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18800738 - 18800536
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| || ||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  18800738 tctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 18800639  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  18800638 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 18800539  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  18800538 tga 18800536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 31126643 - 31126441
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || ||||    
T  31126643 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 31126544  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| | ||| |||||||| |||||    
T  31126543 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagact 31126444  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  31126443 tga 31126441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 40105763 - 40105561
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  40105763 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 40105664  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||    
T  40105663 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagact 40105564  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  40105563 tga 40105561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Original strand, 24112808 - 24112984
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| ||| | || ||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| || || ||||| ||| | ||||| |    
T  24112808 tctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaaggga 24112907  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 183  Q
    | ||||| |||||||||||  | || ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  24112908 agttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgattgag 24112984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 33673923 - 33673721
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || ||||    
T  33673923 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 33673824  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||| ||| |||||    
T  33673823 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagact 33673724  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  33673723 tga 33673721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Original strand, 14098688 - 14098889
Alignment:
Q  8 ctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaa 107  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||    
T  14098688 ctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaa 14098787  T
Q  108 attaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagactt 207  Q
      | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||    
T  14098788 gctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagactt 14098887  T
Q  208 ga 209  Q
    ||    
T  14098888 ga 14098889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 21969859 - 21970049
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttg 118  Q
    |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || ||||    
T  21969859 tgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 21969958  T
Q  119 agaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    |||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||  | | |||||||| ||| ||||||||    
T  21969959 agaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgattgaaatgtgtgaggaagttcctagacttga 21970049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 54833533 - 54833735
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || || |||||  | ||||| |    
T  54833533 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaaggga 54833632  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  54833633 agctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 54833732  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  54833733 tga 54833735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 27163442 - 27163240
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || |||||||| || || || || || |||||  | ||||| |    
T  27163442 tctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaaactcattgatcaaggga 27163343  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  27163342 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 27163243  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  27163242 tga 27163240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 30753900 - 30754102
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || || |||||  | ||||| |    
T  30753900 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaaggga 30753999  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  30754000 agctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 30754099  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  30754100 tga 30754102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 39850796 - 39850986
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttg 118  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || |||||| |  | || |||||  | || ||||    
T  39850796 tgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttg 39850895  T
Q  119 agaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    |||| ||  | || |||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  39850896 agaataatgttccacatgtccttgacaacccccttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 39850986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 177; Significance: 1e-95; HSPs: 41)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19456541 - 19456333
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaacc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19456541 ttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagaatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagacc 19456442  T
Q  101 aaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19456441 aaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgttgtgaacatgattgaggtatgtgaggaagctcc 19456342  T
Q  201 cagacttga 209  Q
    |||||||||    
T  19456341 cagacttga 19456333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 27118809 - 27119013
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaacc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||    
T  27118809 ttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagacc 27118908  T
Q  101 aaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27118909 aaggaaaattgacctttgagaataacgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgttgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 27119008  T
Q  201 cagac 205  Q
    |||||    
T  27119009 cagac 27119013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 3784775 - 3784978
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaacc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||    
T  3784775 ttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagacc 3784874  T
Q  101 aaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3784875 aaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 3784974  T
Q  201 caga 204  Q
    ||||    
T  3784975 caga 3784978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 21703284 - 21703079
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaacc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  | |    
T  21703284 ttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcaaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatc 21703185  T
Q  101 aaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    | ||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21703184 agggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 21703085  T
Q  201 cagact 206  Q
    ||||||    
T  21703084 cagact 21703079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 16163720 - 16163923
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaacc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||    
T  16163720 ttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatggcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagacc 16163819  T
Q  101 aaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16163820 aaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 16163919  T
Q  201 caga 204  Q
    ||||    
T  16163920 caga 16163923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 34157132 - 34157334
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaacc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||    
T  34157132 ttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaa-ctcatagacc 34157230  T
Q  101 aaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34157231 aaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 34157330  T
Q  201 caga 204  Q
    ||||    
T  34157331 caga 34157334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 34303423 - 34303215
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaacc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||    
T  34303423 ttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagacc 34303324  T
Q  101 aaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34303323 aaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaaacatgctgctataaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 34303224  T
Q  201 cagacttga 209  Q
    |||||||||    
T  34303223 cagacttga 34303215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 27393090 - 27393298
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaacc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |    
T  27393090 ttccattctgacctcaagtgcgatttccatcaaggtgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgatc 27393189  T
Q  101 aaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    | ||||| ||||| |||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||   ||||| |||| |||    
T  27393190 agggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgctgttgtgaacatgatcgagacttatgaagaagttcc 27393289  T
Q  201 cagacttga 209  Q
    ||| |||||    
T  27393290 cagtcttga 27393298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 31891436 - 31891245
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaa 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |    
T  31891436 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattga 31891337  T
Q  113 cctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 204  Q
    ||||| |||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31891336 cctttaagaataacgtccctcacgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 31891245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 9350084 - 9349902
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttg 118  Q
    |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || ||||    
T  9350084 tgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttg 9349985  T
Q  119 agaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctccc 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9349984 agaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctccc 9349902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 40233638 - 40233840
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  40233638 tctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 40233737  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  | || |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  40233738 agctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaaaatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 40233837  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  40233838 tga 40233840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 27434555 - 27434356
Alignment:
Q  10 gacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaat 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||      
T  27434555 gacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagc 27434456  T
Q  110 taacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  27434455 tgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 27434356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23128674 - 23128478
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaa 112  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | |    
T  23128674 ctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 23128575  T
Q  113 cctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    | |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  23128574 cttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 23128478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22926142 - 22925940
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||| || || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  22926142 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 22926043  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22926042 agctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggact 22925943  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  22925942 tga 22925940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 12655675 - 12655871
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaa 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | |    
T  12655675 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 12655774  T
Q  113 cctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    | |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || || || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  12655775 cttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgccgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 12655871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 28882347 - 28882543
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaa 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | |    
T  28882347 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 28882446  T
Q  113 cctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    | |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  28882447 cttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 28882543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 209
Target Start/End: Original strand, 20838048 - 20838247
Alignment:
Q  10 gacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaat 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||      
T  20838048 gaccttaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagc 20838147  T
Q  110 taacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||  |||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  20838148 tgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatttgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 20838247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 12586949 - 12587139
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttg 118  Q
    |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || ||||    
T  12586949 tgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaaggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttg 12587048  T
Q  119 agaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    |||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  12587049 agaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 12587139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 13936646 - 13936456
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttg 118  Q
    |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || |||||||||||||| || || ||||||||  | ||||| ||  | || ||||    
T  13936646 tgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtacatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttg 13936547  T
Q  119 agaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    |||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  13936546 agaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 13936456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 27777361 - 27777551
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttg 118  Q
    |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || ||||    
T  27777361 tgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 27777460  T
Q  119 agaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    |||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  27777461 agaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 27777551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 27817119 - 27817309
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttg 118  Q
    |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || ||||    
T  27817119 tgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 27817218  T
Q  119 agaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    |||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  27817219 agaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 27817309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 37375288 - 37375490
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || |||||| |  | || ||||    
T  37375288 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcagggaa 37375387  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || | || ||||||||| |||||    
T  37375388 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtggggaagctcctagact 37375487  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  37375488 tga 37375490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 260867 - 260665
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || ||||    
T  260867 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 260768  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || |  ||||||| ||| |||||    
T  260767 agctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcaacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgcgaggaagttcctagact 260668  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  260667 tga 260665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12716704 - 12716514
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttg 118  Q
    |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || ||||    
T  12716704 tgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 12716605  T
Q  119 agaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    |||| ||  | || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  12716604 agaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 12716514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16829440 - 16829250
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttg 118  Q
    ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || ||||    
T  16829440 tgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 16829341  T
Q  119 agaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    |||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| | ||| |||||||| ||||||||    
T  16829340 agaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttga 16829250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 16892041 - 16892231
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttg 118  Q
    ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || ||||    
T  16892041 tgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 16892140  T
Q  119 agaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    |||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| | ||| |||||||| ||||||||    
T  16892141 agaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttga 16892231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 27803846 - 27804036
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttg 118  Q
    |||||||| |||||||||||  | || |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || ||||    
T  27803846 tgtgattttcatcaaggtgccttaggccatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 27803945  T
Q  119 agaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    |||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  27803946 agaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 27804036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 32049925 - 32050127
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || ||||    
T  32049925 tctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 32050024  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || | |||||||| ||| |||||    
T  32050025 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgattgaagtgtgtgaggaagttcctagact 32050124  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  32050125 tga 32050127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 37925620 - 37925822
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  37925620 tctgatctcaaatgcgacttccatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 37925719  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||    
T  37925720 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagact 37925819  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  37925820 tga 37925822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 39051924 - 39051734
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttg 118  Q
    |||||||| |||||||||||  | || |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || ||||    
T  39051924 tgtgattttcatcaaggtgccttaggccatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 39051825  T
Q  119 agaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    |||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  39051824 agaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 39051734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 179
Target Start/End: Original strand, 34286481 - 34286653
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | |||||||    
T  34286481 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcacgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaa 34286580  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgat 179  Q
    |  | || || ||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  34286581 agctgactttcgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgctgccgtgaatatgat 34286653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 179
Target Start/End: Original strand, 34291541 - 34291713
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | |||||||    
T  34291541 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcacgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaa 34291640  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgat 179  Q
    |  | || || ||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  34291641 agctgactttcgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgctgccgtgaatatgat 34291713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 206
Target Start/End: Original strand, 34861807 - 34862006
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  34861807 tctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 34861906  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||    
T  34861907 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagact 34862006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11635300 - 11635098
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  | |||||||||||||| || || || |||||||||||||| || || |||||  |  | ||||| |    
T  11635300 tctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgttgaggggtgttatgctttgaagtacatcgtgaagaagcttgttgatcaaggga 11635201  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  | || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || |  ||||||||||| |||||    
T  11635200 agctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgataatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgcgaggaagctcctagact 11635101  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  11635100 tga 11635098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11641489 - 11641287
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  | |||||||||||||| || || || |||||||||||||| || || |||||  |  | ||||| |    
T  11641489 tctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgttgaggggtgttatgctttgaagtacatcgtgaagaagcttgttgatcaaggga 11641390  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  | || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || |  ||||||||||| |||||    
T  11641389 agctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgataatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgcgaggaagctcctagact 11641290  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  11641289 tga 11641287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21677296 - 21677094
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  21677296 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 21677197  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||| ||| |||||    
T  21677196 agctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagact 21677097  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  21677096 tga 21677094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 31876408 - 31876610
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||| || || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  31876408 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 31876507  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||    
T  31876508 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagact 31876607  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  31876608 tga 31876610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 37686023 - 37685821
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  37686023 tctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 37685924  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||    
T  37685923 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatccttttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagact 37685824  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  37685823 tga 37685821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 37701288 - 37701086
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  37701288 tctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 37701189  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||    
T  37701188 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatccttttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagact 37701089  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  37701088 tga 37701086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Original strand, 39890202 - 39890403
Alignment:
Q  8 ctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaa 107  Q
    |||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||| ||||||| || || || || |||||  | ||||| ||    
T  39890202 ctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctctgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaa 39890301  T
Q  108 attaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagactt 207  Q
      | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||    
T  39890302 gctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagactt 39890401  T
Q  208 ga 209  Q
    ||    
T  39890402 ga 39890403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 95
Target Start/End: Original strand, 34279576 - 34279664
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcat 95  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||    
T  34279576 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcat 34279664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 173; Significance: 3e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 2789 - 2581
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaacc 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  2789 ttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattaacc 2690  T
Q  101 aaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2689 aaggaaagttaacttttgagaacaatatccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 2590  T
Q  201 cagacttga 209  Q
    |||||||||    
T  2589 cagacttga 2581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 173; Significance: 3e-93; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20340466 - 20340258
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaacc 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  20340466 ttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattaacc 20340367  T
Q  101 aaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20340366 aaggaaagttaacttttgagaacaatatccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 20340267  T
Q  201 cagacttga 209  Q
    |||||||||    
T  20340266 cagacttga 20340258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16208162 - 16207954
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaacc 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  | |    
T  16208162 ttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatc 16208063  T
Q  101 aaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16208062 aaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgagaaagctcc 16207963  T
Q  201 cagacttga 209  Q
    |||||||||    
T  16207962 cagacttga 16207954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 20461205 - 20461413
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaacc 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20461205 ttccgttctgacctcaagtgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagacc 20461304  T
Q  101 aaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    |||||||||| |||||||| || | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  20461305 aaggaaaattgacctttgaaaatatcgtccctcatgtcctcgataatcctcttccgaatcacgctgttgtgaacatgattgaggtatatgagcaagctcg 20461404  T
Q  201 cagacttga 209  Q
    |||||||||    
T  20461405 cagacttga 20461413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 28151992 - 28152194
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  28151992 tctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaa 28152091  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    | || || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  28152092 agttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgagatatatgaggaagctcccggact 28152191  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  28152192 tga 28152194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 51638348 - 51638550
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||||| || ||||||||  | ||||| |    
T  51638348 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaaggga 51638447  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  51638448 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 51638547  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  51638548 tga 51638550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 10962800 - 10963002
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  10962800 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 10962899  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||  | | ||| |||||||| |||||    
T  10962900 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaaatgtgtgaagaagctccgagact 10962999  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  10963000 tga 10963002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 28585111 - 28585313
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| || || || |||||||||||  |||||||||| || || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  28585111 tctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 28585210  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||    
T  28585211 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagact 28585310  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  28585311 tga 28585313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 41793433 - 41793231
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||| || || || || || ||||||||||| || || || |||||| |  | ||||| |    
T  41793433 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgtcgatcaaggga 41793334  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  41793333 agctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 41793234  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  41793233 tga 41793231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 47)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22457008 - 22456800
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaacc 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||    
T  22457008 ttccgttcttacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttaaagtacattgtgaagaagctcatagacc 22456909  T
Q  101 aaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22456908 aaggaaagttaacttttgagaataatttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacgtgattgaggtatatgaggaagctcc 22456809  T
Q  201 cagacttga 209  Q
    |||||||||    
T  22456808 cagacttga 22456800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 28162779 - 28162982
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaacc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||    
T  28162779 ttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcggaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagacc 28162878  T
Q  101 aaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28162879 aaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 28162978  T
Q  201 caga 204  Q
    ||||    
T  28162979 caga 28162982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 33374330 - 33374127
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaacc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||    
T  33374330 ttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagacc 33374231  T
Q  101 aaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    |||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33374230 aaggaaaattgacttttgagaataacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 33374131  T
Q  201 caga 204  Q
    ||||    
T  33374130 caga 33374127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14143353 - 14143151
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  14143353 tctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaa 14143254  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    | || || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14143253 agttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggact 14143154  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  14143153 tga 14143151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 26788072 - 26788274
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  26788072 tctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaa 26788171  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    | || || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26788172 agttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggact 26788271  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  26788272 tga 26788274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 27196445 - 27196647
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  27196445 tctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaa 27196544  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    | || || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27196545 agttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggact 27196644  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  27196645 tga 27196647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 27252795 - 27252593
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  27252795 tctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaa 27252696  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    | || || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27252695 agttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggact 27252596  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  27252595 tga 27252593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 13522147 - 13521939
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaacc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| || |||||||| ||||    
T  13522147 ttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattgtgaagaagctcattaacc 13522048  T
Q  101 aaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    ||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13522047 aaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 13521948  T
Q  201 cagacttga 209  Q
    | |||||||    
T  13521947 cggacttga 13521939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 8892384 - 8892182
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaacc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||    
T  8892384 ttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaa-ctcatagacc 8892286  T
Q  101 aaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8892285 aaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaagtatatgaggaagctcc 8892186  T
Q  201 caga 204  Q
    ||||    
T  8892185 caga 8892182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 8903619 - 8903417
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaacc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||    
T  8903619 ttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaa-ctcatagacc 8903521  T
Q  101 aaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8903520 aaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaagtatatgaggaagctcc 8903421  T
Q  201 caga 204  Q
    ||||    
T  8903420 caga 8903417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 27290444 - 27290236
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaacc 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||  | |    
T  27290444 ttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaagtacattgtgaagaagctcattgatc 27290345  T
Q  101 aaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  27290344 aaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcaacaatcttcttccgaatcatgctactgtaaatatgattgaggtatatgaggaagctcc 27290245  T
Q  201 cagacttga 209  Q
     ||||||||    
T  27290244 tagacttga 27290236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 20160835 - 20161031
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaa 112  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| | ||  | |    
T  20160835 ctcaagtgtgatttccaccaaggtgccttaggtcatgatgtggaagggtgctatgctttgaagtatattgtgaaaaagctcatagaccaatggaagctga 20160934  T
Q  113 cctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    | || ||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  20160935 ctttcgagaataacgtccctcatgttcttgacaatcctcttctgaatcatgctgttgtgaacatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 20161031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22171996 - 22171800
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaa 112  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| | ||  | |    
T  22171996 ctcaagtgtgatttccaccaaggtgccttaggtcatgatgtggaagggtgctatgctttgaagtatattgtgaaaaagctcatagaccaatggaagctga 22171897  T
Q  113 cctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    | || ||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  22171896 ctttcgagaataacgtccctcatgttcttgacaatcctcttctgaatcatgctgttgtgaacatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 22171800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22934945 - 22934746
Alignment:
Q  10 gacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaat 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||      
T  22934945 gacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagc 22934846  T
Q  110 taacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    |||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  22934845 taacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 22934746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23857390 - 23857191
Alignment:
Q  10 gacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaat 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||      
T  23857390 gacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagc 23857291  T
Q  110 taacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    |||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  23857290 taacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 23857191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 27272645 - 27272446
Alignment:
Q  10 gacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaat 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || || |||||||||||  | ||||| ||      
T  27272645 gacctcaaatgtgatttccatcaaggcgctctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcatcgatcaagggaagc 27272546  T
Q  110 taacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    | ||||||||||| ||  | || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||| |||||| ||||||||    
T  27272545 tgacctttgagaataatgttccgcatgtcctcgataatcctcttccaaatcatgctgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggtagctcctagacttga 27272446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 22477347 - 22477241
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaacc 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||    
T  22477347 ttccgttctaacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttaaagtacattgtgaagaagctcatagacc 22477248  T
Q  101 aaggaaa 107  Q
    |||||||    
T  22477247 aaggaaa 22477241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 16749982 - 16750184
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | |||||||    
T  16749982 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaa 16750081  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||    
T  16750082 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagact 16750181  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  16750182 tga 16750184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 26918508 - 26918710
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || || |||||||| ||  | |||||||    
T  26918508 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaaaaagcttattgatcaaggaa 26918607  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||    
T  26918608 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagact 26918707  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  26918708 tga 26918710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 26989135 - 26989331
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaa 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||  | ||||||||  | |    
T  26989135 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtaaagaagctcattgatcaaggaaagctga 26989234  T
Q  113 cctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    | |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  26989235 cttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 26989331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 13299013 - 13298817
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaa 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| || || ||||||||| |||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | |    
T  13299013 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgacgtcgagggatgctacactttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 13298914  T
Q  113 cctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    | |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  13298913 cttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 13298817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24304680 - 24304484
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaa 112  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| | ||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | |    
T  24304680 ctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgatttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 24304581  T
Q  113 cctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    | |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  24304580 cttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 24304484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 24863851 - 24864047
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaa 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | |    
T  24863851 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 24863950  T
Q  113 cctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    | |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  24863951 cttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 24864047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 200
Target Start/End: Original strand, 27000207 - 27000394
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaa 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || || |||||||||||  | ||||||||  | |    
T  27000207 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctga 27000306  T
Q  113 cctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    | |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  27000307 cttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcc 27000394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 29549603 - 29549805
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | |||||||    
T  29549603 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaa 29549702  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || || | ||||||||||||  ||||    
T  29549703 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctggact 29549802  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  29549803 tga 29549805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15424379 - 15424183
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaa 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || || |||||||||||  | ||||||||  | |    
T  15424379 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccttgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctga 15424280  T
Q  113 cctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    | |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||  | |||| |||||||||||| ||||||||    
T  15424279 cttttgagaataatgtcccgcacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcaaagtatgtgaggaagctcctagacttga 15424183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 4757892 - 4758094
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || || || ||||||||  | || ||||    
T  4757892 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 4757991  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  4757992 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 4758091  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  4758092 tga 4758094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 4773134 - 4773336
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || ||||    
T  4773134 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 4773233  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  4773234 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 4773333  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  4773334 tga 4773336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 16674267 - 16674469
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  16674267 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 16674366  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  16674367 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 16674466  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  16674467 tga 16674469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 27007855 - 27008057
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  |||| ||||    
T  27007855 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgaccagggaa 27007954  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | | |||||||||| |||||    
T  27007955 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtaaggaagctcctagact 27008054  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  27008055 tga 27008057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 27360060 - 27359858
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || || || ||||||||  | || ||||    
T  27360060 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 27359961  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  27359960 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 27359861  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  27359860 tga 27359858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 27450403 - 27450201
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || || || ||||||||  | || ||||    
T  27450403 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 27450304  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  27450303 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 27450204  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  27450203 tga 27450201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 29573141 - 29573343
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  29573141 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 29573240  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||    
T  29573241 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagact 29573340  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  29573341 tga 29573343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 88 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 17092427 - 17092306
Alignment:
Q  88 aagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtat 187  Q
    ||||||||  |||| ||||| || || |||||||| ||   ||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17092427 aagctcattgaccagggaaagttgacttttgagaataatacccctcatgtcctcgataatccccttccaaaccacgctgctgtgaacatgactgaggtat 17092328  T
Q  188 atgaggaagctcccagacttga 209  Q
     |||||||||| ||| ||||||    
T  17092327 gtgaggaagctaccaaacttga 17092306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 4545843 - 4545641
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || ||||    
T  4545843 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 4545744  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||||||  | || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  4545743 agctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 4545644  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  4545643 tga 4545641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 30558072 - 30557882
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttg 118  Q
    ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || ||||    
T  30558072 tgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 30557973  T
Q  119 agaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    |||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| | ||| |||||||| ||||||||    
T  30557972 agaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttga 30557882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 34463414 - 34463212
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || ||||    
T  34463414 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 34463315  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  34463314 agctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 34463215  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  34463214 tga 34463212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 3696209 - 3696411
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| || ||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  3696209 tctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 3696308  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||  | | ||| |||||||| |||||    
T  3696309 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaaatgtgtgatgaagctcctagact 3696408  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  3696409 tga 3696411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 4525426 - 4525616
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttg 118  Q
    ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||||| || ||||||||  | || |||||  | || ||||    
T  4525426 tgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 4525525  T
Q  119 agaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    |||||||  | || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  4525526 agaacaatgttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 4525616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 4724202 - 4724000
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || || |||||  | || ||||    
T  4724202 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcagggaa 4724103  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||||||  | || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  4724102 agctgacttttgagaacaatgttccacatgtcctcgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 4724003  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  4724002 tga 4724000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 17025417 - 17025607
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttg 118  Q
    |||||||| |||||||||||  | || |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || ||||    
T  17025417 tgtgattttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 17025516  T
Q  119 agaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    |||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  17025517 agaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 17025607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 28207582 - 28207784
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | || |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||| |    
T  28207582 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaaactcattgatcaaggga 28207681  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  28207682 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 28207781  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  28207782 tga 28207784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16944095 - 16943893
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||| || || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  16944095 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 16943996  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||  ||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||    
T  16943995 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagact 16943896  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  16943895 tga 16943893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 26116478 - 26116276
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || ||||    
T  26116478 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 26116379  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  26116378 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 26116279  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  26116278 tga 26116276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 29501543 - 29501745
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || || |||||  | ||||| |    
T  29501543 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaaggga 29501642  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  29501643 agctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 29501742  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  29501743 tga 29501745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 27044515 - 27044718
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgct-acgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaagga 105  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || | | ||||||||||| || || || || |||||  | |||||     
T  27044515 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtggttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaaggg 27044614  T
Q  106 aaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagac 205  Q
    ||  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||    
T  27044615 aagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagac 27044714  T
Q  206 ttga 209  Q
    ||||    
T  27044715 ttga 27044718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 26777683 - 26777481
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || || |||||  | ||||| |    
T  26777683 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaaggga 26777584  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||  ||| |||||    
T  26777583 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaaaatcctagact 26777484  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  26777483 tga 26777481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 36)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 6 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 16450010 - 16449810
Alignment:
Q  6 ttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaagga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  | || |||    
T  16450010 ttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaggga 16449911  T
Q  106 aaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagac 205  Q
    || ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16449910 aagttaacttttgagaataacgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagac 16449811  T
Q  206 t 206  Q
    |    
T  16449810 t 16449810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 16041449 - 16041654
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaacc 100  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |    
T  16041449 ttccgttctgacctaaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtagaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaaaaagctcattgatc 16041548  T
Q  101 aaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    | ||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16041549 agggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatacgaggaagctcc 16041648  T
Q  201 cagact 206  Q
    ||||||    
T  16041649 cagact 16041654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 31088481 - 31088278
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaacc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||    
T  31088481 ttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagacc 31088382  T
Q  101 aaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31088381 aaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 31088282  T
Q  201 caga 204  Q
    ||||    
T  31088281 caga 31088278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 45733586 - 45733789
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaacc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||    
T  45733586 ttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagacc 45733685  T
Q  101 aaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45733686 aaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 45733785  T
Q  201 caga 204  Q
    ||||    
T  45733786 caga 45733789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 26484826 - 26485028
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  26484826 tctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaa 26484925  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    | || || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26484926 agttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggact 26485025  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  26485026 tga 26485028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 7 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 2109016 - 2108817
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  2109016 tctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaa 2108917  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    | || || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2108916 agttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggact 2108817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 2775491 - 2775693
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  2775491 tctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattgtgaagaagctcattaaccaaggaa 2775590  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    | || || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2775591 agttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggact 2775690  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  2775691 tga 2775693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 39211034 - 39210832
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  39211034 tctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctttgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaa 39210935  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    | || || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39210934 agttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggact 39210835  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  39210834 tga 39210832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 26683008 - 26682809
Alignment:
Q  10 gacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaat 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  26683008 gacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattttaaaaaaactcatagaccaaggaaaat 26682909  T
Q  110 taacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    | ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26682908 tgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttga 26682809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 209
Target Start/End: Original strand, 4200682 - 4200881
Alignment:
Q  10 gacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaat 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| || |||||||| ||||||||||| |    
T  4200682 gacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagt 4200781  T
Q  110 taacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    | || |||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4200782 tgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgataaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttga 4200881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 5128124 - 5128326
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || || || ||||||||  | |||||||    
T  5128124 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgagggatgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaa 5128223  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||    
T  5128224 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagact 5128323  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  5128324 tga 5128326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 2154711 - 2154907
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaa 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | |    
T  2154711 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctaggtcatgatgtcgagggatgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 2154810  T
Q  113 cctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    | |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  2154811 cttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 2154907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16518421 - 16518225
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaa 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| | ||||||||| || || || ||||||||  | |||||||| || |    
T  16518421 ctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgttttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttga 16518322  T
Q  113 cctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    | |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  16518321 cttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 16518225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 10916873 - 10916677
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaa 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | |    
T  10916873 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 10916774  T
Q  113 cctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    | |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  10916773 cttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 10916677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11424781 - 11424585
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaa 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | |    
T  11424781 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 11424682  T
Q  113 cctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    | |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| ||||||| |||| ||||||||    
T  11424681 cttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttga 11424585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16503385 - 16503189
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaa 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| | ||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | |    
T  16503385 ctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgttttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 16503286  T
Q  113 cctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    | |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  16503285 cttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 16503189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 26275105 - 26274903
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  26275105 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 26275006  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| | ||| |||||||| |||||    
T  26275005 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagact 26274906  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  26274905 tga 26274903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 3445438 - 3445640
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||||| || ||||||||  | ||||| |    
T  3445438 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaaggga 3445537  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||||| |||| |||||    
T  3445538 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgctgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagact 3445637  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  3445638 tga 3445640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 26435389 - 26435591
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || ||||    
T  26435389 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 26435488  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  26435489 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 26435588  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  26435589 tga 26435591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 4145134 - 4144932
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  4145134 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 4145035  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||    
T  4145034 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagact 4144935  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  4144934 tga 4144932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 5147351 - 5147149
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || ||||    
T  5147351 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 5147252  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || |  ||||||||||| |||||    
T  5147251 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgcgaggaagctcctagact 5147152  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  5147151 tga 5147149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 11441704 - 11441906
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  11441704 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 11441803  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||    
T  11441804 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagact 11441903  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  11441904 tga 11441906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24592552 - 24592350
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||| || || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  24592552 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 24592453  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  24592452 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcacgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 24592353  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  24592352 tga 24592350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 31564401 - 31564199
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || ||||    
T  31564401 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 31564302  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  31564301 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 31564202  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  31564201 tga 31564199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Original strand, 18540931 - 18541107
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| ||| | || ||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| || || ||||| ||| | ||||| |    
T  18540931 tctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaaggga 18541030  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 183  Q
    | ||||| |||||||||||  | || ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  18541031 agttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgattgag 18541107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 26319880 - 26319678
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  26319880 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 26319781  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||    
T  26319780 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagact 26319681  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  26319680 tga 26319678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 26537881 - 26537679
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| || ||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  26537881 tctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 26537782  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  26537781 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 26537682  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  26537681 tga 26537679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 26669925 - 26669723
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  26669925 tctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 26669826  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||    
T  26669825 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagact 26669726  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  26669725 tga 26669723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 9618783 - 9618985
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||| || || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  9618783 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 9618882  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||    
T  9618883 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagact 9618982  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  9618983 tga 9618985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 45387475 - 45387677
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  45387475 tctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 45387574  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| || ||    
T  45387575 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgaggct 45387674  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  45387675 tga 45387677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16736471 - 16736269
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  16736471 tctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 16736372  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || || | |||||||||||| || ||    
T  16736371 agctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccgaatcatgccgccgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggct 16736272  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  16736271 tga 16736269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16751525 - 16751323
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  16751525 tctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 16751426  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || || | |||||||||||| || ||    
T  16751425 agctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccgaatcatgccgccgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggct 16751326  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  16751325 tga 16751323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 17523664 - 17523866
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  17523664 tctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 17523763  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || || | |||||||||||| || ||    
T  17523764 agctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccgaatcatgccgccgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggct 17523863  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  17523864 tga 17523866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 17529551 - 17529349
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  17529551 tctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 17529452  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || || | |||||||||||| || ||    
T  17529451 agctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccgaatcatgccgccgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggct 17529352  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  17529351 tga 17529349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Original strand, 5159651 - 5159827
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| ||| | || ||||||||| | || ||||| ||| | |||||||| || || ||||| ||| | ||||| |    
T  5159651 tctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttaaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaaggga 5159750  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 183  Q
    | ||||| |||||||||||  | || ||||||||||| ||||| || || ||| | ||||| ||||| || ||||||    
T  5159751 agttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatgatgctgccgtgaatataattgag 5159827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 31125052 - 31125254
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | || |||||||| || || || || ||||||||||| || || || || |||||  | ||||| |    
T  31125052 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcatcgatcaaggga 31125151  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  31125152 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 31125251  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  31125252 tga 31125254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 154; Significance: 7e-82; HSPs: 50)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 22888604 - 22888809
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaacc 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  | |    
T  22888604 ttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatc 22888703  T
Q  101 aaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22888704 aaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 22888803  T
Q  201 cagact 206  Q
     |||||    
T  22888804 tagact 22888809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 13184676 - 13184473
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaacc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||    
T  13184676 ttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagacc 13184577  T
Q  101 aaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13184576 aaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 13184477  T
Q  201 caga 204  Q
    ||||    
T  13184476 caga 13184473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 13440522 - 13440319
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaacc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||    
T  13440522 ttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagacc 13440423  T
Q  101 aaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13440422 aaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttctgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 13440323  T
Q  201 caga 204  Q
    ||||    
T  13440322 caga 13440319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 25199163 - 25199371
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaacc 100  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||  | |    
T  25199163 ttccgttctgatctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttaaagtacattgtgaagaagctcattgatc 25199262  T
Q  101 aaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  25199263 aaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgagaaagcccc 25199362  T
Q  201 cagacttga 209  Q
    |||||||||    
T  25199363 cagacttga 25199371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 33877381 - 33877589
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaacc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| || |||||||| ||||    
T  33877381 ttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattgtgaagaagctcattaacc 33877480  T
Q  101 aaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    ||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33877481 aaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 33877580  T
Q  201 cagacttga 209  Q
    | |||||||    
T  33877581 cggacttga 33877589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 11325928 - 11326131
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaacc 100  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||    
T  11325928 ttccgttcggacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaacc 11326027  T
Q  101 aaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    ||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11326028 aaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgttgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 11326127  T
Q  201 caga 204  Q
    ||||    
T  11326128 caga 11326131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 29889104 - 29888902
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||  | |||||||    
T  29889104 tctgacctcatatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaagtacatcgtgaagaagctcattgatcaaggaa 29889005  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    | || || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29889004 agttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtgtatgaggaagctcccagact 29888905  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  29888904 tga 29888902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 209
Target Start/End: Original strand, 23892349 - 23892548
Alignment:
Q  10 gacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaat 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||| || || ||||||||  | |||||||| |    
T  23892349 gacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaagatgctatgctctgaagtacatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagt 23892448  T
Q  110 taacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23892449 taacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcatgctgctgtgaacgtgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 23892548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24688173 - 24687977
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaa 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || || |||||||||||  | ||||||||  | |    
T  24688173 ctcaaatgtgatttccatcaaggcgctctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctga 24688074  T
Q  113 cctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    | |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  24688073 cttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 24687977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 209
Target Start/End: Original strand, 33777630 - 33777829
Alignment:
Q  10 gacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaat 109  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || || |||||||||||  | ||||||||      
T  33777630 gacctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagc 33777729  T
Q  110 taacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  33777730 tgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 33777829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 9548565 - 9548363
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | |||||||    
T  9548565 tctgatctcaagtgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaa 9548466  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  9548465 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 9548366  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  9548365 tga 9548363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23752469 - 23752270
Alignment:
Q  10 gacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaat 109  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||      
T  23752469 gacctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagc 23752370  T
Q  110 taacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  23752369 tgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 23752270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22999130 - 22998934
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaa 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | |    
T  22999130 ctcaagtgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 22999031  T
Q  113 cctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    | |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  22999030 cttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaaccatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 22998934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 11549500 - 11549696
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaa 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | |    
T  11549500 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 11549599  T
Q  113 cctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    | |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||  ||||||||||| ||||||||    
T  11549600 cttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgcgaggaagctcctagacttga 11549696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23718004 - 23717808
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaa 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | |    
T  23718004 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 23717905  T
Q  113 cctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    | |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  23717904 cttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 23717808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 24970164 - 24970360
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaa 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||    |    
T  24970164 ctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagcgga 24970263  T
Q  113 cctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    | |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||  | |||  |||||||||||| ||||||||    
T  24970264 cttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgctgctgtaaatatgatcaaagtacgtgaggaagctcctagacttga 24970360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 30934779 - 30934975
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaa 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | |    
T  30934779 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 30934878  T
Q  113 cctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    | |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||  | ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  30934879 cttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtatatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 30934975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15658782 - 15658580
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | |||||||    
T  15658782 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaa 15658683  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||  | | |||||||||||| |||||    
T  15658682 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaaatgtgtgaggaagctcctagact 15658583  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  15658582 tga 15658580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 28649375 - 28649577
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  28649375 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 28649474  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  28649475 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 28649574  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  28649575 tga 28649577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 37671505 - 37671303
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || ||||    
T  37671505 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 37671406  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  37671405 agctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 37671306  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  37671305 tga 37671303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 18500752 - 18500553
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || ||||    
T  18500752 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 18500653  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  18500652 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 18500553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 9317591 - 9317793
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  9317591 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 9317690  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||    
T  9317691 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagact 9317790  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  9317791 tga 9317793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 12132295 - 12132497
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  12132295 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 12132394  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||    
T  12132395 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagact 12132494  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  12132495 tga 12132497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 13324851 - 13324649
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || ||||    
T  13324851 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 13324752  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  13324751 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 13324652  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  13324651 tga 13324649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 30152158 - 30152360
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  30152158 tctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 30152257  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  30152258 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 30152357  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  30152358 tga 30152360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 31431580 - 31431782
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || || || ||||||||  | || ||||    
T  31431580 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 31431679  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  31431680 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 31431779  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  31431780 tga 31431782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 31826429 - 31826227
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||||| || ||||||||  | ||||| |    
T  31826429 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaaggga 31826330  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || |||| ||||||| |||| |||||    
T  31826329 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagact 31826230  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  31826229 tga 31826227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18375434 - 18375232
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||| || || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  18375434 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 18375335  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| |||||||| || | |||||||||||| |||||    
T  18375334 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgattgaagtgtgtgaggaagctcctagact 18375235  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  18375234 tga 18375232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 24681592 - 24681782
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttg 118  Q
    |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || ||||    
T  24681592 tgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 24681691  T
Q  119 agaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    |||| ||  | || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  24681692 agaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 24681782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 24724119 - 24724309
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttg 118  Q
    |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || ||||    
T  24724119 tgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 24724218  T
Q  119 agaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    |||| ||  | || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  24724219 agaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 24724309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 32599494 - 32599292
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||| || || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || ||||    
T  32599494 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgcattaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 32599395  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| || || | ||||||||| || |||||    
T  32599394 agctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatccgctaccgaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagcccctagact 32599295  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  32599294 tga 32599292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 33516508 - 33516698
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttg 118  Q
    ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || ||||    
T  33516508 tgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 33516607  T
Q  119 agaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    |||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| | ||| |||||||| ||||||||    
T  33516608 agaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttga 33516698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 37358665 - 37358463
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | || |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||| |    
T  37358665 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaaactcattgatcaaggga 37358566  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  37358565 agctgacttttgagaataatattccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 37358466  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  37358465 tga 37358463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 40473559 - 40473369
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttg 118  Q
    |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || ||||    
T  40473559 tgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 40473460  T
Q  119 agaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    |||| ||  | || |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  40473459 agaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 40473369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 43078392 - 43078594
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || |||||| |  | || ||||    
T  43078392 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcagggaa 43078491  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  43078492 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 43078591  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  43078592 tga 43078594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Original strand, 33292665 - 33292841
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| ||| | || ||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| || || ||||| ||| | ||||| |    
T  33292665 tctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaaggga 33292764  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 183  Q
    | ||||| |||||||||||  | || ||||||||||| ||||| || || ||||| | ||| ||||| |||||||||    
T  33292765 agttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgatgccgtgaatatgattgag 33292841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 8665497 - 8665295
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  8665497 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 8665398  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||| ||| |||||    
T  8665397 agctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagact 8665298  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  8665297 tga 8665295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15758879 - 15758677
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  15758879 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 15758780  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  15758779 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 15758680  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  15758679 tga 15758677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 26480532 - 26480734
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||| || || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  26480532 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 26480631  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||    
T  26480632 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagact 26480731  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  26480732 tga 26480734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 29967088 - 29966886
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||| || || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  29967088 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 29966989  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||    
T  29966988 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagact 29966889  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  29966888 tga 29966886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 30029555 - 30029757
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||| || || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  30029555 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 30029654  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||    
T  30029655 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagact 30029754  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  30029755 tga 30029757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Original strand, 41674849 - 41675025
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| || || ||||| ||| | ||||| |    
T  41674849 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggccatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaaggga 41674948  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 183  Q
    |  | || |||||||| ||  | || ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  41674949 agctgacttttgagaataatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgattgag 41675025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 2511191 - 2511393
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  2511191 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 2511290  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| || ||    
T  2511291 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggct 2511390  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  2511391 tga 2511393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 3789681 - 3789883
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || || |||||  | ||||| |    
T  3789681 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaaggga 3789780  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  3789781 agctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 3789880  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  3789881 tga 3789883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 6874445 - 6874647
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||| || || || || || ||||||||||| || || || ||||| ||  | ||||| |    
T  6874445 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagcttatcgatcaaggga 6874544  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  6874545 agctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 6874644  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  6874645 tga 6874647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 30168609 - 30168811
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| || ||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  30168609 tctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 30168708  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || |||| ||| ||| |||| |||||    
T  30168709 agctcacttttgagaataatgtcccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaagaaactcctagact 30168808  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  30168809 tga 30168811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 37755120 - 37755322
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || ||||    
T  37755120 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 37755219  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  37755220 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 37755319  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  37755320 tga 37755322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 37771009 - 37770807
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||  | || ||||||||  | || ||||    
T  37771009 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcatgaagaagctcattgatcagggaa 37770910  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||||||  | || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||| | |||||    
T  37770909 agctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagcttctagact 37770810  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  37770809 tga 37770807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 5638050 - 5638252
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||| || || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  5638050 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 5638149  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || ||||| || ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||    
T  5638150 agctgacttttgaaaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgttgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagact 5638249  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  5638250 tga 5638252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 34616658 - 34616860
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || || |||||  | ||||| |    
T  34616658 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaaggga 34616757  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||| ||| |||||    
T  34616758 agctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagact 34616857  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  34616858 tga 34616860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 2048 - 1844
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaacc 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  | |    
T  2048 ttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatc 1949  T
Q  101 aaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1948 aaggaaa-ttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaagaagctcc 1850  T
Q  201 cagact 206  Q
    ||||||    
T  1849 cagact 1844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 206
Target Start/End: Original strand, 6143 - 6344
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttc-catcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgcttt-gaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaagg 104  Q
    ||||| ||||| ||||||||  |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||| |||||| || || || ||||||||  | || ||    
T  6143 tctgatctcaaatgtgatttttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaggg 6242  T
Q  105 aaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 204  Q
    |||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||    
T  6243 aaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaga 6342  T
Q  205 ct 206  Q
    ||    
T  6343 ct 6344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 20513 - 20717
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaacc 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  | |    
T  20513 ttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatc 20612  T
Q  101 aaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20613 aaggaaa-ttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaagaagctcc 20711  T
Q  201 cagact 206  Q
    ||||||    
T  20712 cagact 20717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 30595 - 30785
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttg 118  Q
    ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || ||||    
T  30595 tgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 30694  T
Q  119 agaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    |||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  30695 agaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 30785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 149; Significance: 7e-79; HSPs: 23)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 19659129 - 19658926
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaacc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||    
T  19659129 ttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaa-ctcatagacc 19659031  T
Q  101 aaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19659030 aaggaaaattgacctttgagaataacgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 19658931  T
Q  201 cagac 205  Q
    |||||    
T  19658930 cagac 19658926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 33244790 - 33244994
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaacc 100  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||    
T  33244790 ttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgcgctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagacc 33244889  T
Q  101 aaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  33244890 aaggaaaattgacctttgagaataacgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccgaaccacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctct 33244989  T
Q  201 cagac 205  Q
    |||||    
T  33244990 cagac 33244994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 44563226 - 44563427
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaacc 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||    
T  44563226 ttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaa-ctcatagacc 44563324  T
Q  101 aaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 200  Q
    ||||||| || || |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44563325 aaggaaagttgacttttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgt-aacatgattgaggtatatgaggaagctcc 44563423  T
Q  201 caga 204  Q
    ||||    
T  44563424 caga 44563427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 22080968 - 22080790
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaacc 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||    
T  22080968 ttccgttctgacctcaagtgcgatttccatcaaggtgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgacc 22080869  T
Q  101 aaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgat 179  Q
    | ||||| ||||| |||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22080868 agggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgat 22080790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 9354747 - 9354956
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt-aaaaaagctcataaac 99  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||| ||    
T  9354747 ttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgacgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaaactcatagac 9354846  T
Q  100 caaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctc 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||| ||    
T  9354847 caaggaaaattgacctttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttc 9354946  T
Q  200 ccagacttga 209  Q
    | ||||||||    
T  9354947 ctagacttga 9354956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 18710717 - 18710919
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || || || ||||||||  | |||||||    
T  18710717 tctgatctcaagtgtgattttcatcagggtgccctaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaa 18710816  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18710817 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggact 18710916  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  18710917 tga 18710919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 208
Target Start/End: Original strand, 16283583 - 16283781
Alignment:
Q  10 gacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaat 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||      
T  16283583 gacctcaaatgtgatttccatcaaggcaccctgggtcatgatgtcgaagggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagc 16283682  T
Q  110 taacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttg 208  Q
    | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||    
T  16283683 tgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgattgaagtatgtgaggaagctcctagacttg 16283781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 19688235 - 19688431
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaa 112  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || || |||||||||||  | |||||||| || |    
T  19688235 ctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagttga 19688334  T
Q  113 cctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    | |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||  ||||||||||| ||||||||    
T  19688335 cttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgcgaggaagctcctagacttga 19688431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 27608983 - 27608787
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaa 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | |    
T  27608983 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgagggatgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 27608884  T
Q  113 cctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    | |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  27608883 cttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 27608787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 16277691 - 16277887
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaa 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | |    
T  16277691 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 16277790  T
Q  113 cctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    | |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || || || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  16277791 cttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgccgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 16277887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 14557761 - 14557957
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaa 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | |    
T  14557761 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 14557860  T
Q  113 cctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    | |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||  |||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  14557861 cttttgagaataatgtcccgcacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatgtgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 14557957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 38 - 209
Target Start/End: Original strand, 189256 - 189427
Alignment:
Q  38 ctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgt 137  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || || |||||||| ||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| |||||    
T  189256 ctctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaaaaagcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgt 189355  T
Q  138 cctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||  |||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  189356 cctcgacaatcctcttccaaatcatgcctctgttaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 189427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 2137337 - 2137141
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaa 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || || |||||||||||  | ||||||||  | |    
T  2137337 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccttgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctga 2137238  T
Q  113 cctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    | |||||||| ||  || | ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || | || |||| ||||||| ||||||||    
T  2137237 cttttgagaataatgtctcgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagcatgtgagaaagctcctagacttga 2137141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12092808 - 12092606
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || ||||    
T  12092808 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 12092709  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  12092708 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 12092609  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  12092608 tga 12092606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 3329591 - 3329389
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || |||||| |  | ||||| |    
T  3329591 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcaaggga 3329492  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||  ||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  3329491 agctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 3329392  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  3329391 tga 3329389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 19674572 - 19674774
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  | ||||||||||| ||  | || || ||||||||||| ||||| || ||||||||  | ||||| |    
T  19674572 tctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgagaggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaaggga 19674671  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  19674672 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 19674771  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  19674772 tga 19674774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 29829465 - 29829655
Alignment:
Q  19 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttg 118  Q
    |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || ||||    
T  29829465 tgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 29829564  T
Q  119 agaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    |||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  29829565 agaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttga 29829655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 31354655 - 31354857
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||| || || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  31354655 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 31354754  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||||||||    
T  31354755 agctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcccagact 31354854  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  31354855 tga 31354857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 31489834 - 31489632
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| || ||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  31489834 tctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 31489735  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||    
T  31489734 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagact 31489635  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  31489634 tga 31489632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19208444 - 19208242
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||| || || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  19208444 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 19208345  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||    
T  19208344 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagact 19208245  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  19208244 tga 19208242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 19286593 - 19286795
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || || |||||  | ||||| |    
T  19286593 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaaggga 19286692  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  19286693 agctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 19286792  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  19286793 tga 19286795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 28362039 - 28361837
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||| || || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  28362039 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 28361940  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||    
T  28361939 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagact 28361840  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  28361839 tga 28361837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 33258854 - 33259056
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||| || || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  33258854 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 33258953  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || || ||||| || | |||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||    
T  33258954 agctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgttgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagact 33259053  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  33259054 tga 33259056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0558 (Bit Score: 119; Significance: 5e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0558
Description:

Target: scaffold0558; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 159 - 1
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaacc 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  | |    
T  159 ttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatc 60  T
Q  101 aaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaat 159  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  59 agggaaagttaaccttcgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaat 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 107; Significance: 8e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 21686 - 21864
Alignment:
Q  1 ttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaacc 100  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||    
T  21686 ttccgttctgacctcaagtgcgatttccatcaaggggctctgggccaagatgttgaaggatgttacgctttgaagtagattgtaaagaagctcattgacc 21785  T
Q  101 aaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgat 179  Q
    | ||||| ||||| ||| |||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21786 agggaaagttaacttttaagaacaatgtccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgat 21864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 728 - 541
Alignment:
Q  22 gatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgaga 121  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  | || ||||| ||||| |||||||    
T  728 gatttccatcaagatgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgaga 629  T
Q  122 acaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    | ||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||| |||| |||||| |||||    
T  628 ataatgtccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatcgagacttatgaagaagttcccagtcttga 541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 47104 - 46908
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaa 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | |    
T  47104 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 47005  T
Q  113 cctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    | |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  47004 cttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 46908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 40188 - 39992
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaa 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || || ||  |||||||  | ||||||||  | |    
T  40188 ctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaggagctcattgatcaaggaaagctga 40089  T
Q  113 cctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    | |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  40088 cttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 39992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 29900 - 30096
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaa 112  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | |    
T  29900 ctcaaatgtgatttccaccaaggcgccctgggtcacgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 29999  T
Q  113 cctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    | |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||| || ||||| || |||| |||||||||||  ||||||||    
T  30000 cttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcttagacttga 30096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 248 - 52
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaa 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | |    
T  248 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgcgttgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctga 149  T
Q  113 cctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    | |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  148 cttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 52  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 65; Significance: 9e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 27429 - 27625
Alignment:
Q  13 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaa 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||| ||  | ||||||||  | |    
T  27429 ctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagcttattgatcaaggaaagctga 27528  T
Q  113 cctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 209  Q
    | |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  27529 cttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 27625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 59; Significance: 3e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 9697 - 9899
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||||| || ||||||||  | ||||| |    
T  9697 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaaggga 9796  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  9797 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 9896  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  9897 tga 9899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 47; Significance: 5e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 7364 - 7162
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  7364 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 7265  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| ||||| || || | ||| |||||||| |||||    
T  7264 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagact 7165  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  7164 tga 7162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 47; Significance: 5e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 26326 - 26124
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  26326 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 26227  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||  | | ||| |||||||| |||||    
T  26226 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaaatgtgtgaagaagctccgagact 26127  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  26126 tga 26124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15055 - 14853
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||| || || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  15055 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 14956  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  |||| || || | |||||||||||| |||||    
T  14955 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatgtgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 14856  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  14855 tga 14853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 9191 - 8989
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  9191 tctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 9092  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| || ||    
T  9091 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggct 8992  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  8991 tga 8989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 20146 - 20348
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  20146 tctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 20245  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| || ||    
T  20246 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggct 20345  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  20346 tga 20348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Original strand, 8080 - 8282
Alignment:
Q  7 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 106  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | || |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| || || |||||  | ||||| |    
T  8080 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaaactcattgatcaaggga 8179  T
Q  107 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 206  Q
    |  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  8180 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 8279  T
Q  207 tga 209  Q
    |||    
T  8280 tga 8282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 46819 - 46764
Alignment:
Q  115 tttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgt 170  Q
    |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  46819 tttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgctgctgt 46764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University