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 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8833_high_1 (Length: 445)

Name: NF8833_high_1
Description: NF8833
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8833_high_1
NF8833_high_1
[»] chr6 (16 HSPs)
chr6 (8-428)||(13185435-13185861)
chr6 (142-418)||(32183771-32184048)
chr6 (133-418)||(521159-521446)
chr6 (142-390)||(15134860-15135114)
chr6 (142-322)||(22747049-22747229)
chr6 (142-390)||(15489400-15489645)
chr6 (140-327)||(1040378-1040565)
chr6 (198-379)||(15611515-15611695)
chr6 (133-418)||(20969578-20969865)
chr6 (143-374)||(21208192-21208421)
chr6 (199-390)||(2912704-2912897)
chr6 (149-304)||(6837791-6837946)
chr6 (155-359)||(3611036-3611234)
chr6 (142-245)||(5188237-5188340)
chr6 (154-312)||(13756422-13756582)
chr6 (8-36)||(13164399-13164427)
[»] chr7 (21 HSPs)
chr7 (133-384)||(965262-965517)
chr7 (149-384)||(34519278-34519514)
chr7 (142-381)||(1706386-1706626)
chr7 (142-418)||(12287076-12287351)
chr7 (133-305)||(1778741-1778912)
chr7 (136-385)||(41966084-41966332)
chr7 (148-420)||(1910959-1911230)
chr7 (142-384)||(35015715-35015958)
chr7 (156-358)||(33037272-33037476)
chr7 (133-253)||(27164294-27164414)
chr7 (142-276)||(6182608-6182742)
chr7 (133-277)||(4905068-4905211)
chr7 (168-323)||(29235519-29235676)
chr7 (243-330)||(47066021-47066108)
chr7 (133-392)||(22527991-22528256)
chr7 (167-316)||(26575994-26576143)
chr7 (147-268)||(2485126-2485247)
chr7 (237-411)||(16706587-16706763)
chr7 (237-411)||(17680823-17680999)
chr7 (149-223)||(4163278-4163352)
chr7 (249-323)||(41853294-41853368)
[»] chr4 (28 HSPs)
chr4 (132-392)||(36284489-36284752)
chr4 (136-414)||(46433039-46433316)
chr4 (142-418)||(16529826-16530102)
chr4 (133-420)||(36755106-36755393)
chr4 (142-420)||(56192208-56192487)
chr4 (142-420)||(3533860-3534139)
chr4 (142-413)||(55692904-55693180)
chr4 (133-279)||(13205506-13205652)
chr4 (133-323)||(44515894-44516084)
chr4 (166-392)||(3232628-3232843)
chr4 (133-419)||(37996900-37997183)
chr4 (142-299)||(45549010-45549167)
chr4 (142-304)||(43334640-43334803)
chr4 (133-416)||(38476087-38476364)
chr4 (152-358)||(25197263-25197475)
chr4 (155-416)||(15024521-15024784)
chr4 (185-307)||(17999015-17999137)
chr4 (142-268)||(29844955-29845081)
chr4 (149-304)||(37182449-37182604)
chr4 (149-390)||(44707555-44707795)
chr4 (143-250)||(12832314-12832421)
chr4 (190-276)||(54183974-54184060)
chr4 (149-276)||(28992494-28992621)
chr4 (335-416)||(13205690-13205772)
chr4 (287-418)||(29845083-29845214)
chr4 (335-416)||(12832441-12832523)
chr4 (338-390)||(19477655-19477708)
chr4 (227-288)||(20491225-20491286)
[»] chr3 (23 HSPs)
chr3 (155-413)||(19332037-19332296)
chr3 (136-416)||(29078722-29079005)
chr3 (148-414)||(20935989-20936254)
chr3 (148-390)||(11137624-11137868)
chr3 (142-418)||(19554752-19555026)
chr3 (142-304)||(47864857-47865021)
chr3 (166-411)||(26952389-26952634)
chr3 (142-299)||(48962306-48962463)
chr3 (187-412)||(26919232-26919451)
chr3 (129-279)||(47495535-47495684)
chr3 (142-323)||(18090440-18090626)
chr3 (142-276)||(20826320-20826455)
chr3 (142-275)||(10046338-10046469)
chr3 (133-299)||(46909774-46909940)
chr3 (147-416)||(37333172-37333441)
chr3 (152-276)||(47342455-47342579)
chr3 (142-276)||(38521861-38521994)
chr3 (251-316)||(44542943-44543008)
chr3 (363-418)||(18090360-18090415)
chr3 (190-276)||(42470985-42471071)
chr3 (168-225)||(44543202-44543259)
chr3 (227-328)||(51370392-51370492)
chr3 (167-220)||(16882993-16883046)
[»] chr8 (21 HSPs)
chr8 (142-420)||(6148256-6148535)
chr8 (133-381)||(43429346-43429601)
chr8 (142-420)||(7186180-7186459)
chr8 (149-412)||(40216356-40216619)
chr8 (167-420)||(37127512-37127766)
chr8 (144-419)||(8845552-8845835)
chr8 (133-327)||(1597948-1598143)
chr8 (142-323)||(20765693-20765872)
chr8 (142-420)||(41407190-41407469)
chr8 (142-299)||(43417724-43417880)
chr8 (142-276)||(3692008-3692142)
chr8 (144-250)||(3346667-3346773)
chr8 (136-247)||(42845328-42845439)
chr8 (215-299)||(39949657-39949742)
chr8 (184-284)||(23629563-23629664)
chr8 (184-304)||(40978781-40978894)
chr8 (287-384)||(42845233-42845330)
chr8 (231-271)||(40215799-40215839)
chr8 (166-275)||(34474276-34474387)
chr8 (133-192)||(39949739-39949798)
chr8 (338-390)||(34474445-34474497)
[»] chr5 (10 HSPs)
chr5 (73-418)||(16561739-16562084)
chr5 (73-358)||(10667242-10667526)
chr5 (142-416)||(23418859-23419126)
chr5 (142-316)||(35377772-35377946)
chr5 (166-390)||(27903575-27903798)
chr5 (215-421)||(19279422-19279629)
chr5 (146-418)||(43100767-43101042)
chr5 (148-416)||(9622195-9622477)
chr5 (142-324)||(5422976-5423158)
chr5 (195-275)||(7211373-7211453)
[»] chr1 (33 HSPs)
chr1 (142-390)||(16255290-16255538)
chr1 (133-415)||(33016375-33016654)
chr1 (133-416)||(29700950-29701232)
chr1 (144-346)||(50378137-50378339)
chr1 (142-323)||(20381065-20381244)
chr1 (142-418)||(8259294-8259571)
chr1 (142-380)||(32714105-32714338)
chr1 (142-358)||(50377760-50377975)
chr1 (148-316)||(25388920-25389087)
chr1 (142-323)||(48379549-48379730)
chr1 (133-384)||(24120174-24120426)
chr1 (133-416)||(51776543-51776826)
chr1 (142-307)||(5959201-5959365)
chr1 (142-304)||(15342701-15342863)
chr1 (166-411)||(12140751-12140995)
chr1 (147-304)||(9693875-9694032)
chr1 (133-276)||(39923382-39923518)
chr1 (149-276)||(14625092-14625218)
chr1 (142-276)||(42693318-42693453)
chr1 (142-250)||(4085664-4085772)
chr1 (214-299)||(18236431-18236515)
chr1 (263-384)||(33737241-33737362)
chr1 (218-316)||(26451808-26451906)
chr1 (287-411)||(47024310-47024435)
chr1 (335-416)||(14624967-14625049)
chr1 (343-414)||(48379474-48379545)
chr1 (149-299)||(48941393-48941544)
chr1 (295-412)||(9694053-9694171)
chr1 (149-223)||(26450883-26450956)
chr1 (343-419)||(15342884-15342960)
chr1 (164-235)||(43728469-43728539)
chr1 (343-416)||(20381248-20381322)
chr1 (366-420)||(25389763-25389817)
[»] chr2 (17 HSPs)
chr2 (152-384)||(7315193-7315427)
chr2 (142-422)||(9032519-9032809)
chr2 (155-421)||(25322802-25323068)
chr2 (166-276)||(38935231-38935341)
chr2 (132-253)||(5732721-5732842)
chr2 (287-419)||(9548459-9548591)
chr2 (169-323)||(840154-840308)
chr2 (185-307)||(20638542-20638664)
chr2 (187-297)||(15463999-15464109)
chr2 (257-416)||(19494730-19494890)
chr2 (149-223)||(14169951-14170025)
chr2 (149-234)||(19494892-19494977)
chr2 (202-285)||(33047845-33047928)
chr2 (152-250)||(43652645-43652743)
chr2 (354-419)||(840322-840387)
chr2 (148-220)||(9548602-9548673)
chr2 (185-276)||(22705649-22705740)
[»] scaffold0069 (2 HSPs)
scaffold0069 (142-323)||(60854-61033)
scaffold0069 (343-416)||(61037-61111)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (227-416)||(428283-428476)
[»] scaffold1940 (1 HSPs)
scaffold1940 (133-416)||(547-816)
[»] scaffold0355 (1 HSPs)
scaffold0355 (142-323)||(2603-2781)
[»] scaffold0039 (2 HSPs)
scaffold0039 (142-304)||(94158-94319)
scaffold0039 (295-351)||(101624-101680)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (142-276)||(178204-178338)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (142-276)||(201-335)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (142-276)||(22848-22983)
[»] scaffold0332 (1 HSPs)
scaffold0332 (142-304)||(4395-4558)
[»] scaffold0281 (1 HSPs)
scaffold0281 (350-416)||(22270-22336)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 351; Significance: 0; HSPs: 16)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 13185861 - 13185435
Alignment:
Q  8 tgagatggacatccaattttaagcaaaaccttatatatatat--tgatcatctcactatatgttctttaagaccatcca----aaacagagaacctcaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||| ||||||||||||    
T  13185861 tgagatggacatccaattttaagcaaaaccttatatatatatattgatcatctcactatatattctttaagaccatccatccaaaactgagaacctcaaa 13185762  T
Q  102 ttaggtgctcaaatgtttcatatgggcccctatcattaactttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattat 201  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  13185761 ttaggtgctcaaatgtttcatatgagtccctatcattaactttacggtaatacttaataagcaccaattttctccaacccagcagctcaaaagaaattat 13185662  T
Q  202 taaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttcaacaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagata 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13185661 taaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttcaacaaaatttatataatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagata 13185562  T
Q  302 gagggttcttccatagtcacccttctccaatggcacccatatattttactccacaataggatgcctatttaatgtggtgctaagtaggttacgcttccac 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  13185561 gagggttcttccatagtcacccttctccaatggcacccatatattttactccacaataggatgcctatttaatgcggtgctaagtaggttatgcttccac 13185462  T
Q  402 cattgtggatggtctaagtgtgacttc 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  13185461 cattgtggatggtctaagtgtgacttc 13185435  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 142 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 32184048 - 32183771
Alignment:
Q  142 tttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttca 241  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||    
T  32184048 tttacggtaatacttaataaacaccaattttctccaacccaacacctcaaaagaaattattaaataagtcctacaaataattttatatcattacatttca 32183949  T
Q  242 acaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcacccttctccaatggcacccat 341  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||| |||||||  | |||||||    
T  32183948 acaaaaattatttattttattaagatttattaaatgtgacccatgaaaaatgaagaaagagagggtgcttccatagccaccgttctccatagccacccat 32183849  T
Q  342 atattttactccacaat-aggatgcctatttaatgtggtgctaagtaggttacgcttccaccattgtggatggtctaa 418  Q
    ||||| |||||||||||  || |||||||||||| || |||||| ||| | | ||  |||||||||||||||||||||    
T  32183848 atattatactccacaatgggggtgcctatttaatatgatgctaaatagatgaagcacccaccattgtggatggtctaa 32183771  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 133 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 521446 - 521159
Alignment:
Q  133 atcattaactttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcat 232  Q
    ||||||||  |||| |||| ||| | ||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||    
T  521446 atcattaatattactgtaacactcagtaaacatcaattttctctaatccagcacctcaaaagaaattattaaatagatcccacaaataattatatatcat 521347  T
Q  233 tacgtttcaacaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtccca-cgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcacccttctccaa 331  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |   |||||| |||||| ||||| | |||||| || ||||||||| ||     
T  521346 tacatttcaacaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggaccaagaaaaaaataaagagagagaggatgcttccaaagccacccttcttcat 521247  T
Q  332 tggcacccatatattttactccacaatag-gatgcctatttaatgtggtgctaagtaggttacgcttccaccattgtggatggtctaa 418  Q
     | ||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  521246 agacactcatatattttactccacaatggagatgcttatttaatgtggtgctaaataggttaagcatgcaccattgtggatggtctaa 521159  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 142 - 390
Target Start/End: Original strand, 15134860 - 15135114
Alignment:
Q  142 tttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttca 241  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |  |||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  15134860 tttactgtaatacttaataaacaccaattttctccaacctagtaccttaaaagaaattattaaatagattccacaaataattttatatcattacatttca 15134959  T
Q  242 acaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaag----agatagagggttcttccatagtcacccttctccaatggcac 337  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||    ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||  | |||    
T  15134960 acaaaatttatttattttattaagatttattaaatgagacccatgaaaaatgaagagaaagagagagggtgcttccatagccacccttctccatagccac 15135059  T
Q  338 ccatatattttactccacaat--aggatgcctatttaatgtggtgctaagtaggt 390  Q
    |||| |||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  15135060 ccatgtattatactccacaatggagggtgcctatttaatgtggtgctaaataggt 15135114  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 142 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 22747229 - 22747049
Alignment:
Q  142 tttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttca 241  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| | ||||||||| |||||    
T  22747229 tttacggtaatacttaataagcgtcaattttctccaacccagtacctcaaaagaaattattaaataggtcttacaaataattttatatcattacatttca 22747130  T
Q  242 acaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcacc 322  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||  | |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  22747129 acaaattttatttattttattaatatttattaaatgtgacccatgaaaaatgaagagagagagggtgcttccatagccacc 22747049  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 142 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 15489645 - 15489400
Alignment:
Q  142 tttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttca 241  Q
    |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | | ||||| |||||    
T  15489645 tttacgataatacttaataagcaccaattttctccaacccaacacatcaaaagaaattattaaataggtcccacaaataattatatgtaattacatttca 15489546  T
Q  242 acaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcacccttctccaatggcacccat 341  Q
    || |||||| |||| | ||||||||||||||||||  | ||| | |||||||    || ||||||| ||||||||| |||  |||||||  | ||||||     
T  15489545 acgaaatttctttattatattaagatttattaaatgagacccgcaaaaaatg----gagagagggtgcttccatagccacttttctccatagacacccaa 15489450  T
Q  342 atattttactccacaat-aggatgcctatttaatgtggtgctaagtaggt 390  Q
    ||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  15489449 atattatactccacaatgggggtgcctatttaatgtggtgctaaataggt 15489400  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 140 - 327
Target Start/End: Original strand, 1040378 - 1040565
Alignment:
Q  140 actttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgttt 239  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| || |||    
T  1040378 actttacggtaatacttaataatcatccattttctccaactcaacacctcaaaataaattattaaatatgtcccataaataattctatatcatcacattt 1040477  T
Q  240 c-aacaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcacccttct 327  Q
    | || |||| ||||||| |||||||| |||||||||  | | ||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||    
T  1040478 caaaaaaaaattatttattttattaatatttattaacga-gacctgcgaaaaatgaagagagagagggtgcttccatagcgacccttct 1040565  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 198 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 15611695 - 15611515
Alignment:
Q  198 ttattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttcaacaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaaga 297  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |  |||||| ||||    
T  15611695 ttattaaataggtcccataaataattttatatcattacatttcaacaaaatttatttaatttattaagatttattatataggaccaataaaaaataaaga 15611596  T
Q  298 gatagagggttcttccatagtcacccttctccaatggcacccatatattttactccacaat-aggatgcctatttaatgtggt 379  Q
    |  |||| || |||||||||||||| |||||||  | || |||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  15611595 g--agagtgtgcttccatagtcacctttctccacagacaaccatgtattttactccacaataaggatgtttatttaatgtggt 15611515  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 133 - 418
Target Start/End: Original strand, 20969578 - 20969865
Alignment:
Q  133 atcattaactttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcat 232  Q
    ||||| || ||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||    
T  20969578 atcatcaattttacggtactacttcataagcaccaattttctccaacctagcacctgaaaagaaattattaaataggtcccaccaataattttatatcat 20969677  T
Q  233 tac-gtttcaacaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcacccttctccaa 331  Q
    |||  ||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||  ||| ||||| | |||||| ||| | |  || ||||| |||||| |||||     
T  20969678 tacatttttaacaaaatttattcattttactaagatttattaaatgggatccatgaaaattaaagagagagatgatgttttcatagccaccctcctccat 20969777  T
Q  332 tggcacccatatattttactccacaat-aggatgcctatttaatgtggtgctaagtaggttacgcttccaccattgtggatggtctaa 418  Q
       ||||||||| || |||| ||||||  || |||||| ||||||||||||||| ||||| | |   |||||||||||||||||||||    
T  20969778 aaacacccatatgttatacttcacaatgggggtgcctacttaatgtggtgctaaataggtgaagtacccaccattgtggatggtctaa 20969865  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 143 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 21208421 - 21208192
Alignment:
Q  143 ttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttcaa 242  Q
    ||||||||||| ||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||  |||  |||||||||| | ||||||||  ||| |     
T  21208421 ttacggtaataattaataagcaccacttttctccaacccaacaccttaaaataaattactaaattggtcatacaaataattttatatcattatattttat 21208322  T
Q  243 caaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcacccttctccaatggcacccata 342  Q
    ||   |||||||| |||||||||||||||| |||  | |||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||| ||| ||||||||  | ||||||||    
T  21208321 ca---tttatttattttattaagatttatttaatgagacccatgaaaaatgaagaaagagagggtgcttccatagccactcttctccatagccacccata 21208225  T
Q  343 tattttactccacaat-aggatgcctatttaat 374  Q
    |||| | ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  21208224 tattattctccacaataagggtgcctatttaat 21208192  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 199 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 2912897 - 2912704
Alignment:
Q  199 tattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttc-aacaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaaga 297  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||  |||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  2912897 tattaaataagccctacaaataactctatatcattatatttctaacaaaatttattcattttactaagatttattaaatgagacccattaaaaatgaaga 2912798  T
Q  298 gatagagggttcttccatagtcacccttctccaatggcacccatatattttactccacaatag-gatgcctatttaatgtggtgctaagtaggt 390  Q
    || ||||| | ||||||||| |||||| ||||| | |||| ||||| ||  |||||||||| | | ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  2912797 gagagaggttgcttccatagccaccctcctccattagcactcatatgttacactccacaatggaggtgcctatttaatgtggttctaaataggt 2912704  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 149 - 304
Target Start/End: Original strand, 6837791 - 6837946
Alignment:
Q  149 taatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttc-aacaaaa 247  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||  | ||||||||||||| |||||||  | | ||||| ||||| ||| ||||||||| |||  |||||||    
T  6837791 taatacttaataagcatcaattttcaccaacctagcacctcaaaagaa-ttattaaccaggccccaccaataactctatatcattacatttttaacaaaa 6837889  T
Q  248 tttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagag 304  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||||  | |||| |||||||||||||| ||||    
T  6837890 tttattcattttactaagatttattaaatgagacccatgaaaaatgaagagagagag 6837946  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 155 - 359
Target Start/End: Original strand, 3611036 - 3611234
Alignment:
Q  155 ttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttcaacaaaatttattt 254  Q
    ||||||| | |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |  |||||||  ||| ||||      ||||    
T  3611036 ttaataagcgtcaattttttccaacccaacacttcaaaagaaattattaaataagtcttacaaataattttacatcattatatttgaaca------attt 3611129  T
Q  255 aatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcacccttctccaatggcacccatatattttactcca 354  Q
      ||||||||||||||||||||  | ||   |||||||||||||| |||||||  || ||||  ||| ||||| ||  ||||| |||||||| ||||||     
T  3611130 tttttattaagatttattaaatgagaccagtgaaaaatgaagagagagagggtgttttcataaccactcttcttcataggcacacatatattatactcct 3611229  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 5188340 - 5188237
Alignment:
Q  142 tttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttca 241  Q
    |||| ||||||| ||||||| || ||||||||| |||  || ||| ||||||||||||||||||||  | ||||||  |||| | ||||||||| |||||    
T  5188340 tttatggtaatatttaataagcaccaattttcttcaatccagcacttcaaaagaaattattaaatagtttccacaataaattttatatcattacatttca 5188241  T
Q  242 acaa 245  Q
    ||||    
T  5188240 acaa 5188237  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 312
Target Start/End: Original strand, 13756422 - 13756582
Alignment:
Q  154 cttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcatta-cgtttcaacaaaatttat 252  Q
    |||||||||||  |||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||   |  | |||||| | | ||| ||||   ||| ||||| ||||||    
T  13756422 cttaataaacacaaattttcttcaatctaacacctcaaaagaaattattaaatataccttataaataactttatatgattatatttttaacaagatttat 13756521  T
Q  253 ttaatttattaagatttattaaat-aggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttc 312  Q
    | | |||| ||||||||||||||| ||   ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  13756522 tcattttactaagatttattaaatgagactccatgaaaaatgaagagatagagggtgcttc 13756582  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 8 - 36
Target Start/End: Complemental strand, 13164427 - 13164399
Alignment:
Q  8 tgagatggacatccaattttaagcaaaac 36  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13164427 tgagatggacatccaattttaagcaaaac 13164399  T

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Target: chr7 (Bit Score: 146; Significance: 9e-77; HSPs: 21)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 133 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 965517 - 965262
Alignment:
Q  133 atcattaactttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaat---tattaaataagtcccacaaataattctctat 229  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| || |||||||||||| | |||    
T  965517 atcattaattttacgctaatacttaataaacacccattttctccaacccaacacctcaaaagaaataattattaaataggttccacaaataattttatat 965418  T
Q  230 cattacgtttcaacaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcacccttctcc 329  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || |||| |||||||||||||  ||||||    
T  965417 cattacatttcaacaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggacccacgaaaaatgaagacagagggggtgcttccatagtcactattctcc 965318  T
Q  330 aatggcacccatatattttactccacaat-aggatgcctatttaatgtggtgctaa 384  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  965317 atagacacccatatattttactccacaatgggggtgcctatttaatgtggtgctaa 965262  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 149 - 384
Target Start/End: Original strand, 34519278 - 34519514
Alignment:
Q  149 taatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttcaacaaaat 248  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  34519278 taatagttaataagcaccaattttctccagtccagcacctcaaaagaaattattaaataggtcccacaaataattctatatcattacattttaacaaaat 34519377  T
Q  249 ttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcacccttctccaatggcacccatatatttt 348  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||  |||||||| |||||||    
T  34519378 ttatatagtttattaagatttattaaataggacttgtgaaaaatgaagagagagagggtgcttccatagccaccattctccataggcacccaaatatttt 34519477  T
Q  349 actccacaatagga-tgcctatttaatgtggtgctaa 384  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  34519478 actccataatgggagtgcctatttaatgtggtgctaa 34519514  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 142 - 381
Target Start/End: Original strand, 1706386 - 1706626
Alignment:
Q  142 tttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttca 241  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  1706386 tttaccgtcatacttaataagcatcaattttctccaatccagcaccttaaaagaaattattaaataggtcccacaaataattttatatcattacatttca 1706485  T
Q  242 acaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcacccttctccaatggcacccat 341  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||  |||| ||||||   | |||||||    
T  1706486 acaaaatttatttattttattaatatttattaaataggacccatggaaaatgaagagagagagggtgcttccataaccaccattctccgtagccacccat 1706585  T
Q  342 atattttactccacaat-aggatgcctatttaatgtggtgc 381  Q
     |||| ||||||| |||  || |||||||||||||||||||    
T  1706586 gtattatactccataatgggggtgcctatttaatgtggtgc 1706626  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 142 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 12287351 - 12287076
Alignment:
Q  142 tttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttca 241  Q
    ||||| |||||||||||| | || |||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||    
T  12287351 tttaccgtaatacttaatgagcaccaattttctccaatccagcaccttaaaagaaattattaaataagtccaacaaataattttatatcattacatttca 12287252  T
Q  242 acaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcacccttctccaatggcacccat 341  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |  ||| |||||||||||||  ||||||| ||| ||||| |||||||||  |  | ||| |||    
T  12287251 acaaaatttattcattttattaagatttattaaatgagatccatgaaaaatgaagag--agagggtgctttcatagccacccttcttgatagacactcat 12287154  T
Q  342 atattttactccacaatag-gatgcctatttaatgtggtgctaagtaggttacgcttccaccattgtggatggtctaa 418  Q
     | || ||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||| ||||| | ||  ||||||||| |||||||||||    
T  12287153 gtcttatactccacaatggaggtgcctatttaatgtggtgttaaataggtaaagcacccaccattgaggatggtctaa 12287076  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 133 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 1778912 - 1778741
Alignment:
Q  133 atcattaactttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcat 232  Q
    |||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||| | ||||||    
T  1778912 atcattcattttacggtaatatttaataaacaccaattttctccaatccaacacctcaaaagaaattattaaattgatcctacaaataattttatatcat 1778813  T
Q  233 tacgtttcaacaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagg 305  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||    
T  1778812 tacatttcaacaaaatttattt-atttattaagatttattaaatatgacccatgaaaaatgaagagaaagagg 1778741  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 136 - 385
Target Start/End: Original strand, 41966084 - 41966332
Alignment:
Q  136 attaactttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattac 235  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||| | |||||||||    
T  41966084 attaattttacagtaatacttaataagcatcaattttctccaacccaacacctcaaaagaaattattaaataggactcataaataattttatatcattac 41966183  T
Q  236 gtttcaacaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcacccttctccaatggc 335  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||  |||||  ||| | | ||||| ||||||||| || |||||||||  |||    
T  41966184 atttcaacaaaa-ttatttaatttattaagatttataaaatagaaccaacataaaat--agacacatagggtgcttccatagccatccttctccataggc 41966280  T
Q  336 acccatatattttactccacaat-aggatgcctattt-aatgtggtgctaag 385  Q
    |||| | ||||||||| ||||||  || ||||||||| ||||||||||||||    
T  41966281 acccgtttattttacttcacaatgtgggtgcctatttaaatgtggtgctaag 41966332  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 148 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 1911230 - 1910959
Alignment:
Q  148 gtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttcaacaaaa 247  Q
    |||||| |||||||  || |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||| ||||  |||||||||||    
T  1911230 gtaatatttaataagtattaattttctccaacttaacaccttaaaagaaattattaaatagatcccacaaataattttatattattatatttcaacaaaa 1911131  T
Q  248 tttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcacccttctccaatggcacccatatattt 347  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | || |||| ||||||| |||||| |||||||  ||| |||| |||  ||||||   | ||||||| ||||     
T  1911130 tttatttattttattaagatttattaactgggacccatgaaaaat-aagagagagagggtgattctatagccactattctccgtagccacccatgtatta 1911032  T
Q  348 tactccacaataggatgcctatttaatgtggtgctaagtaggttacgcttccaccattgtggatggtctaagt 420  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||| | ||||||| ||||| | ||  |||||||| ||||||||||||||    
T  1911031 tacttcacaatagggtgtctatttaatatagtgctaaataggtgaagcacccaccattatggatggtctaagt 1910959  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 142 - 384
Target Start/End: Original strand, 35015715 - 35015958
Alignment:
Q  142 tttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttca 241  Q
    |||| ||||||||||||||||||   |||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||| |||| |  ||| ||| | ||| ||||| |||||    
T  35015715 tttatggtaatacttaataaacactcattttctccaacccatcaccttaaaagaaattactaaataggtcctatgaattattttatataattacatttca 35015814  T
Q  242 acaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcacccttctccaatggcacccat 341  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||| |  | || ||||    
T  35015815 acaaaatttatttattttattaagatttattaaaagagacccataaaaaatgaagagagagagggtgcttccatagccaccattctctatagccatccat 35015914  T
Q  342 atattttactccacaat-aggatgcctatttaatgtggtgctaa 384  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  35015915 atattatactccacaatgagggtgcctatttaatatggtgctaa 35015958  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 156 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 33037476 - 33037272
Alignment:
Q  156 taataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttcaacaaaatttattta 255  Q
    |||||| || || ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||| ||| |||||  ||||||||    
T  33037476 taataagcaccacttttctccaacccagcacctcaaaataaattattaaataggttccacaaataattttatatcattacattttaacaacgtttattta 33037377  T
Q  256 atttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagag--ggttcttccatagtcacccttctccaatggcacccatatattttactcc 353  Q
     ||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||| ||||  ||| ||||||||   |||||||||||  | |||| ||||||| | ||||    
T  33037376 ttttattaagatttattaaatacgatccatgaaaaatgaagagagagagatggtgcttccatatctacccttctccatagccacctatatattattctcc 33037277  T
Q  354 acaat 358  Q
    |||||    
T  33037276 acaat 33037272  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 133 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 27164414 - 27164294
Alignment:
Q  133 atcattaactttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcat 232  Q
    |||||||| ||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||| ||||||    
T  27164414 atcattaattttatagtaatatttaataaacaccaattttctccaacccaacacctcaaaagaaattactaaataggtcttacaaataattctatatcat 27164315  T
Q  233 tacgtttcaacaaaatttatt 253  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  27164314 tacatttcaacaaaatttatt 27164294  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 142 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 6182742 - 6182608
Alignment:
Q  142 tttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttca 241  Q
    |||||||||||||||||||| || || |||||| |||| || |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||| ||| |    
T  6182742 tttacggtaatacttaataagcaccacttttcttcaacccagcacctcaaaataaattattaaataggtctcacaaataattttatatcattacatttta 6182643  T
Q  242 acaaaatttatttaatttattaagatttattaaat 276  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  6182642 acaacatttatttattttattaagagttattaaat 6182608  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 133 - 277
Target Start/End: Original strand, 4905068 - 4905211
Alignment:
Q  133 atcattaactttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcat 232  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||  || || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||| ||    
T  4905068 atcattaattttacg-taatatttaataagcattaattttctccaatccagcatctcaagagaaattattaaataggtcccacaaataaatttatattat 4905166  T
Q  233 tacgtttcaacaaaatttatttaatttattaagatttattaaata 277  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  4905167 tacatttcaacaaaatttatttaatttatcaagattcattaaata 4905211  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 168 - 323
Target Start/End: Original strand, 29235519 - 29235676
Alignment:
Q  168 attttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttcaacaaaatttatttaatttattaagat 267  Q
    |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||  ||| | |||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  29235519 attttctccaacccagcacttcaaaagaaattattaaatagatcctataaataattttatatcattacatttcaataaaatttatttattttattaagat 29235618  T
Q  268 ttattaaataggtcccacgaaaaatga--agagatagagggttcttccatagtcaccc 323  Q
    ||||||||| ||  ||| |||| ||||  ||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  29235619 ttattaaatgggatccatgaaatatgaagagagagagagggtgcttccatagccaccc 29235676  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 243 - 330
Target Start/End: Original strand, 47066021 - 47066108
Alignment:
Q  243 caaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcacccttctcca 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  47066021 caaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagatagagatggtgcttccatagacactcttctcca 47066108  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 133 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 22528256 - 22527991
Alignment:
Q  133 atcattaactttacggtaatacttaataaacatcaatttt---ctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctat 229  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||||| ||  ||||||   ||||||| || ||||| ||| |||||||||||| | |||||  ||| |||| | |||    
T  22528256 atcattattttttcggtaatacttaataagcactaatttttatctccaacacagcaccttaaacgaaattattaaacaggtccct-aaagaattatatat 22528158  T
Q  230 cattacgtttcaacaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaa---tgaagagatagagggttcttccatagtcacccttc 326  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||  ||||||    ||||||| ||||||| ||||||||  ||||| ||    
T  22528157 catttcatttcaacaaaatttatttaatttattaagatttattcaatcggatccgtgaaaaaattagaagagagagagggtgcttccatatccacccctc 22528058  T
Q  327 tccaatggcacccatatattttactccacaatagga-tgcctatttaatgtggtgctaagtaggtta 392  Q
    ||||  ||||||| |||||| |||| |||||| ||| || |||||||||||||| || | |||||||    
T  22528057 tccataggcacccgtatattatacttcacaattggagtgtctatttaatgtggttctgaataggtta 22527991  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 167 - 316
Target Start/End: Original strand, 26575994 - 26576143
Alignment:
Q  167 aattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttcaacaaaatttatttaatttattaaga 266  Q
    ||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||  || || |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26575994 aattttcaccaatccaacaccttaaaagaaattattaaatagatctcataaataattttatatcattacatttcaacaaaatttatttattttattaaga 26576093  T
Q  267 tttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccata 316  Q
     |||||||||  |  ||| |||||||||||| | || |||| ||||||||    
T  26576094 attattaaatgagatccatgaaaaatgaagaaagagtgggtgcttccata 26576143  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 268
Target Start/End: Original strand, 2485126 - 2485247
Alignment:
Q  147 ggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttcaacaaa 246  Q
    ||||||||||||||  ||   |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||    
T  2485126 ggtaatacttaatatgcacagattttctccaactcaacacctcaaaaaaaattattaaatatgtctcacaaataattttatatcattaaatttcaataaa 2485225  T
Q  247 atttatttaatttattaagatt 268  Q
    ||||||||| || |||| ||||    
T  2485226 atttatttatttcattatgatt 2485247  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 237 - 411
Target Start/End: Original strand, 16706587 - 16706763
Alignment:
Q  237 tttcaacaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaa--tgaagagatagagggttcttccatagtcacccttctccaatgg 334  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||  | || || |||||  |||||||| ||||||| |||   ||| || ||| |||||   |    
T  16706587 tttcaacaaaatttattcattttactaagatttattaaatgagaccaacaaaaaaaatgaagagagagagggtgcttttgtagccatcctcctccataag 16706686  T
Q  335 cacccatatattttactccacaataggatgcctatttaatgtggtgctaagtaggttacgcttccaccattgtggat 411  Q
    ||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| | ||  ||||||||||||||    
T  16706687 cacccatatgttatactccacaatggggtgcctatttaatgtggtgctaaataggtgaagcacccaccattgtggat 16706763  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 237 - 411
Target Start/End: Original strand, 17680823 - 17680999
Alignment:
Q  237 tttcaacaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaa--tgaagagatagagggttcttccatagtcacccttctccaatgg 334  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||  | || || |||||  |||||||| ||||||| |||   ||| || ||| |||||   |    
T  17680823 tttcaacaaaatttattcattttactaagatttattaaatgagaccaacaaaaaaaatgaagagagagagggtgcttttgtagccatcctcctccataag 17680922  T
Q  335 cacccatatattttactccacaataggatgcctatttaatgtggtgctaagtaggttacgcttccaccattgtggat 411  Q
    ||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| | ||  ||||||||||||||    
T  17680923 cacccatatgttatactccacaatggggtgcctatttaatgtggtgctaaataggtgaagcacccaccattgtggat 17680999  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 149 - 223
Target Start/End: Original strand, 4163278 - 4163352
Alignment:
Q  149 taatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataatt 223  Q
    ||||||||| ||| || |||||||||| ||| || ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4163278 taatacttactaagcaccaattttctctaacccagcaccataaaagaaattattaaataggtcccacaaataatt 4163352  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 323
Target Start/End: Original strand, 41853294 - 41853368
Alignment:
Q  249 ttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcaccc 323  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |  |||| ||||||| |||||| |||| || ||||||||| |||||    
T  41853294 ttatttattttattaagatttattaaatggaacccatgaaaaataaagagagagagtgtacttccatagccaccc 41853368  T

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Target: chr4 (Bit Score: 141; Significance: 9e-74; HSPs: 28)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 132 - 392
Target Start/End: Original strand, 36284489 - 36284752
Alignment:
Q  132 tatcattaactttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatca 231  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||||  | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  36284489 tatcattaattttactgtaacacttaataagaaccaattttctccaacacaacacttcaaaagaaattattaaataggtcccacaaataattctatatca 36284588  T
Q  232 ttacgtttcaacaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcacccttctccaa 331  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||     
T  36284589 ttacatttcaacaaaatttatttaatttattaagatttattaaatatgaccaacaaaaaatgaagagagagagggtgcttccataggcacccttctccat 36284688  T
Q  332 tggcacccatatattttactccacaatag-gatgcctatttaa--tgtggtgctaagtaggtta 392  Q
     |  |||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  36284689 agatacccatatgttttactccacaatggaggtgcctatttaatgtgtggtgctaaataggtta 36284752  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 136 - 414
Target Start/End: Original strand, 46433039 - 46433316
Alignment:
Q  136 attaactttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattac 235  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  46433039 attaaatttacagtaatacttaataagtatcaattttctccaatccaacacctcaaaataaattattaaataggtcccacaaataattctatatcattac 46433138  T
Q  236 gtttcaacaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcacccttctccaatggc 335  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  | | || ||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||  |||    
T  46433139 atttcaacaaaatttatttaattcattaagatttattaattaaat-caacaaaaaatgaagagagagagggtgcttccatagctacccttctccataggc 46433237  T
Q  336 acccatatattttactccacaataggatgcctatttaatgtggtgctaagtaggttacgcttccaccattgtggatggt 414  Q
    |||||||||| || ||||||||| || | ||||||||| |||||||||| ||||||| ||  ||| |||||||||||||    
T  46433238 acccatatatattgctccacaatggggtacctatttaaagtggtgctaaataggttaagcacccatcattgtggatggt 46433316  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 142 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 16530102 - 16529826
Alignment:
Q  142 tttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttca 241  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  16530102 tttaccgtaatacttaataagcaccaattttctccaac-cagctccttaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattttatatcattacatttca 16530004  T
Q  242 acaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcacccttctccaatggcacccat 341  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||| |||||||  | |||||||    
T  16530003 acaaaatttatttattttattaagatttattaaaagggacccatgaaaaatgaagagagagatggtgcttccatagccaccattctccatagccacccat 16529904  T
Q  342 atattttactccacaat-aggatgcctatttaatgtggtgctaagtaggttacgcttccaccattgtggatggtctaa 418  Q
     |||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||| | ||  |||||||||||||||||||||    
T  16529903 gtattatactccacaatgggggtgcctatttaatgtggtgctaaataggtgaagcacccaccattgtggatggtctaa 16529826  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 133 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 36755393 - 36755106
Alignment:
Q  133 atcattaactttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcat 232  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  36755393 atcactaattttacggtaatatttaataagcaccaattttctctaacccaacacctcaata-aaattattaaataagtcctacaaataattttatatcat 36755295  T
Q  233 tacgtttcaacaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcacccttctccaat 332  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||      
T  36755294 tacatttcaacaaaatttatttattttattaagatttattaaatgtgacccgtgaaaaatgaagagagagagggtgcttccatagccacccttctccata 36755195  T
Q  333 ggcacccatatattttactccacaatag-gatgcctatttaatgtggtgctaagtaggttacgcttccaccattgtggatggtctaagt 420  Q
    | |||||||||||| ||||||||||| | | || ||||||||| ||||||||| ||| | | ||  |||||||||||||||||| ||||    
T  36755194 gccacccatatattatactccacaatggaggtgtctatttaatatggtgctaaatagatgaagcacccaccattgtggatggtccaagt 36755106  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 142 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 56192487 - 56192208
Alignment:
Q  142 tttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttca 241  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||| ||  ||||    
T  56192487 tttatggtaatacttaataagcaccaattttctccaacccaacacctcaaaagaaattattaaataggttccacatataattctatatcatcacaattca 56192388  T
Q  242 acaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcacccttctccaatggcacccat 341  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    | ||| ||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||| |  | |||||||    
T  56192387 acaaaatttctttattttattaagatttattaaatgaaactcacaaaaaatggagagagagagggtgctttcatagccacccttctctatagacacccat 56192288  T
Q  342 atattttactccacaa-taggatgcctatttaatgtggtgctaagtaggttacgcttccaccattgtggatggtctaagt 420  Q
    ||||||||||||||||   || |||||||||||||||||| ||| ||||| | ||  ||||||||||||||| |||||||    
T  56192287 atattttactccacaacgggggtgcctatttaatgtggtgttaaataggtaaagcacccaccattgtggatgatctaagt 56192208  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 142 - 420
Target Start/End: Original strand, 3533860 - 3534139
Alignment:
Q  142 tttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattac-gtttc 240  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||  |||     
T  3533860 tttacggtaatacttaataagcaccatttttctccaacccaacacctcaaaataaattattaaataggtcccacaaataattttatatcattacattttt 3533959  T
Q  241 aacaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcacccttctccaatggcaccca 340  Q
     |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||  |||| || ||| ||||| ||||| ||||||  | ||||||    
T  3533960 tacaatatttatttattttattaagatttattaaatgagacccatgaaaaatgaagag--agagagtgctttcatagccacccatctccatagccaccca 3534057  T
Q  341 tatattttactccacaat-aggatgcctatttaatgtggtgctaagtaggttacgc-ttccaccattgtggatggtctaagt 420  Q
    |||||| | |||||||||  || ||||||||||||||| |||||| ||||| | ||   ||||| |||||||||||||||||    
T  3534058 tatattattctccacaatgggggtgcctatttaatgtgatgctaaataggtgaagcaccccaccgttgtggatggtctaagt 3534139  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 142 - 413
Target Start/End: Original strand, 55692904 - 55693180
Alignment:
Q  142 tttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataa-ttctctatcattacgtttc 240  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| || || || |||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||| ||||    
T  55692904 tttactgtaatacttgataaacaccaattttctccaacccagcatcttaaaagaaattattaaataggtcccacaaataatttttatatcattacatttc 55693003  T
Q  241 aacaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatga----agagatagagggttcttccatagtcacccttctccaatggca 336  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||  ||  ||| |||||||||    ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |  | ||    
T  55693004 aacaaaatttatttatgttattaagatttattcaa-cgggaccatgaaaaatgaagagagagagagagggtgcttccatagccacccttctctatagtca 55693102  T
Q  337 cccatatattttactccacaat-aggatgcctatttaatgtggtgctaagtaggttacgcttccaccattgtggatgg 413  Q
    || ||  ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| | | || |||| ||||||||||||    
T  55693103 ccaatgcattatactccacaatgaagatgcctatttaatgtggtgctaaatagatgaagcatccatcattgtggatgg 55693180  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 133 - 279
Target Start/End: Original strand, 13205506 - 13205652
Alignment:
Q  133 atcattaactttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcat 232  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||    
T  13205506 atcattaattttacggtaatccttactaagcattaattttctccaacccaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataatttgatattat 13205605  T
Q  233 tacgtttcaacaaaatttatttaatttattaagatttattaaatagg 279  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  13205606 tacatttcaacaaaatttatttaatttattaaaatttaattaatagg 13205652  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 133 - 323
Target Start/End: Original strand, 44515894 - 44516084
Alignment:
Q  133 atcattaactttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcat 232  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| ||   |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||| | ||||||    
T  44515894 atcattcattttacggtaatacttaataatcactgattttctccaacccagcaccttaaaagaaattattaaatagatcccactaataattttatatcat 44515993  T
Q  233 tacgtttcaacaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcaccc 323  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||| | ||||| ||| ||||| |||||    
T  44515994 tacatttcaacaaaatttatttattttattaatatttattaaatgggacccatgaaaaatgaagagagaaagggtgctttcatagccaccc 44516084  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 166 - 392
Target Start/End: Original strand, 3232628 - 3232843
Alignment:
Q  166 caattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttcaacaaaatttatttaatttattaag 265  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||              
T  3232628 caattttctccaatccaacacttcaaaagaaattattaaataggtcccacaaataattctatatcattatatttcaacaaaatttattta---------- 3232717  T
Q  266 atttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcacccttctccaatggcacccatatattttactccacaa-taggatg 364  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||  |||||||  |||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||  ||| ||    
T  3232718 atttattaaataggaccaacaaaaaatgaagag--agagggtgattccataaccacccttctccataggcacccatatattttacttcacaacgagggtg 3232815  T
Q  365 cctatttaatgtggtgctaagtaggtta 392  Q
    |  ||||||||||||||||| |||||||    
T  3232816 ctaatttaatgtggtgctaaataggtta 3232843  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 133 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 37997183 - 37996900
Alignment:
Q  133 atcattaactttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcat 232  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||| |||| || || ||||||||||||||| ||||| |||||||||| || | | ||||||    
T  37997183 atcattaattttacgataatacttaataagcaccaattttcttcaacccagcatctcaaaagaaattataaaatatgtcccacaaa-aactttgtatcat 37997085  T
Q  233 tacgtttcaacaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcacccttctccaat 332  Q
    | | ||||||||||||||||| | ||||  || | |||||||||  | ||||  ||||||||||||  |||| || ||||| ||| |||||| ||| | |    
T  37997084 ttcatttcaacaaaatttattcattttacaaaaacttattaaatgagaccca-aaaaaatgaagag--agagagtgcttccgtagccaccctcctcgatt 37996988  T
Q  333 ggcacccatatattttactccacaat-aggatgcctatttaatgtggtgctaagtaggttacgcttccaccattgtggatggtctaag 419  Q
     ||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||   | || |||||||||||||||||||||||    
T  37996987 agcaaccatatattatactccacaatgaggatgtctatttaatgtggtgctaaatagaagaagcatccaccattgtggatggtctaag 37996900  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 142 - 299
Target Start/End: Original strand, 45549010 - 45549167
Alignment:
Q  142 tttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttca 241  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||  | |||||| | ||||||||| ||| |    
T  45549010 tttacggtaatacttaataagcaccacttttctccaacccagcaccttaaaataaattattaaataagtccccaagataattttatatcattacatttta 45549109  T
Q  242 acaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagaga 299  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  45549110 acaacatttatttattttattaagatttattaattgggacccatgaaaaatgaagaga 45549167  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 142 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 43334803 - 43334640
Alignment:
Q  142 tttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattac-gtttc 240  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||| || ||| || |||||| ||| |||||||||  |||     
T  43334803 tttactgtaatacttaataagcatcaattttcttaaacccaacatctcaaaagaaattattaattaggtctcataaataactctatatcattacattttt 43334704  T
Q  241 aacaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagag 304  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  43334703 aacaaaatttattcattttactaagatttattaaataggacccatgaaaaatgaagagagagag 43334640  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 133 - 416
Target Start/End: Original strand, 38476087 - 38476364
Alignment:
Q  133 atcattaactttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcat 232  Q
    |||||| | ||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||       | | |||||||||||||||| |||||| ||||  || | ||||||    
T  38476087 atcattcattttactgtaatatttaataagcaccaattttctccaacg-------ttagaagaaattattaaataggtcccataaatttttttatatcat 38476179  T
Q  233 tacgtttcaacaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcacccttctccaat 332  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||| |||  || ||||||||  |||| |||||||      
T  38476180 tacatttcaacaaaatttatttattttattaagatttattaaatgtggcccatgaaaaatgaagagagagaacgtgcttccataaccacctttctccata 38476279  T
Q  333 ggcacccatatattttactccacaat-aggatgcctatttaatgtggtgctaagtaggttacgcttccaccattgtggatggtct 416  Q
      |||||||||||| |||| || |||  || || ||||||||||||||||||| ||||| | ||  |||||||| | ||||||||    
T  38476280 accacccatatattatacttcataatgggggtgtctatttaatgtggtgctaaataggtgaagcacccaccattatagatggtct 38476364  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 152 - 358
Target Start/End: Original strand, 25197263 - 25197475
Alignment:
Q  152 tacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttcaac-aaaattt 250  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||    
T  25197263 tacttaataggcatcaattttctccaacccaacaccacaaaagaaattactaaataggtcccacaaataattccatatcattacatttcaactaaaattt 25197362  T
Q  251 atttaatttattaagatttattaaatag-gt----cccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcacccttctccaatggcacccatatat 345  Q
    ||||| || |||| |||||||||||| | ||     |||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||| |   ||||| | ||||    
T  25197363 atttatttcattatgatttattaaatggtgtggtgtccacaaaaagtgaagagagagagggtccttccatagccaccattctctataagcacctaaatat 25197462  T
Q  346 tttactccacaat 358  Q
    | |||||||||||    
T  25197463 tatactccacaat 25197475  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 155 - 416
Target Start/End: Original strand, 15024521 - 15024784
Alignment:
Q  155 ttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttcaac-aaaatttatt 253  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  ||||||| ||||| ||||    
T  15024521 ttaataaacatcaattttctctaacccagtaccacaaaataaattattaaataggtcccacaaataattcaatatcattatatttcaacaaaaatatatt 15024620  T
Q  254 taatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcacccttctccaatggcacccatatattttactcc 353  Q
    || || |||| |||||||||||| ||   ||| |||| || ||||| ||||| | ||||||||| |||||||||| |  | || | | ||||| ||||||    
T  15024621 tatttcattatgatttattaaatggggttcacaaaaagtgtagagagagaggatgcttccatagccacccttctctagagacatcaaaatattatactcc 15024720  T
Q  354 acaatag-gatgcctatttaatgtggtgctaagtaggttacgcttccaccattgtggatggtct 416  Q
    | ||| | | |||||||||||| || |||||| ||||| | || ||||| ||| ||||||||||    
T  15024721 ataatggaggtgcctatttaatatgatgctaaataggtgaagcatccactattatggatggtct 15024784  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 185 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 17999137 - 17999015
Alignment:
Q  185 acctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttcaacaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtccca 284  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||| ||||||||| |||  |||||||||||||| |||| || |||||||||||| || ||||    
T  17999137 acctcaaaagaaattattaaataggtcttacaaataactctatatcattacatttttacaaaatttatttattttaatacgatttattaaatgggaccca 17999038  T
Q  285 cgaaaaatgaagagatagagggt 307  Q
     |||||||||||||| |||||||    
T  17999037 tgaaaaatgaagagaaagagggt 17999015  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 142 - 268
Target Start/End: Original strand, 29844955 - 29845081
Alignment:
Q  142 tttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttca 241  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||   ||||||||| |||      
T  29844955 tttacgataatacttaataaacatcacttttctccaacccagcatctcaaaataaattattaaataggtctcacaaataatttgatatcattacattttg 29845054  T
Q  242 acaaaatttatttaatttattaagatt 268  Q
     ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  29845055 ccaacatttatttattttattaagatt 29845081  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 149 - 304
Target Start/End: Original strand, 37182449 - 37182604
Alignment:
Q  149 taatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttcaac-aaaa 247  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||   |  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||| ||||| |||| || ||||    
T  37182449 taatacttaataagcatcaattttttccaatcgagtacctcaaaagaaattattaaa-aggtcccacaaataactctatattattacatttctaccaaaa 37182547  T
Q  248 tttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagag 304  Q
    |||||| | |||| |||||||||||| || || |||| |||||||||||||| ||||    
T  37182548 tttattcattttactaagatttattagatgggacccatgaaaaatgaagagagagag 37182604  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 149 - 390
Target Start/End: Original strand, 44707555 - 44707795
Alignment:
Q  149 taatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttcaac-aaaa 247  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||  |||||  |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||    
T  44707555 taatatttactaagcatcaattttctccaac-cagcacgacaaaagaaattacaaaatagatcccacaaataattatatatcattacatttcaacaaaaa 44707653  T
Q  248 tttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcacccttctccaatggcacccatatattt 347  Q
    |||||||| || |||| |||||||||||| ||  | || |||| ||  |||| | |||||  ||| |||||||||||||| |   |||| ||| |||||     
T  44707654 tttatttatttcattatgatttattaaatggggtctacaaaaagtg--gagagaaagggtgtttctatagtcacccttcttcttaggcatccaaatatta 44707751  T
Q  348 tactccacaat-aggatgcctatttaatgtggtgctaagtaggt 390  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||| | ||||||| |||||    
T  44707752 tactccacaatgatgatgtctatttaatatagtgctaaataggt 44707795  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 143 - 250
Target Start/End: Original strand, 12832314 - 12832421
Alignment:
Q  143 ttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttcaa 242  Q
    |||| |||||||||| ||| || |||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||    
T  12832314 ttaccgtaatacttagtaagcaccaattttctccggcccaacacctaaaaagaaattattaaataggtccgacaaataattttatattattacatttcaa 12832413  T
Q  243 caaaattt 250  Q
    ||||||||    
T  12832414 caaaattt 12832421  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 190 - 276
Target Start/End: Original strand, 54183974 - 54184060
Alignment:
Q  190 aaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttcaacaaaatttatttaatttattaagatttattaaat 276  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  54183974 aaaaaaaattattaaataggtcccataaataattatatatcattacatttcaacaaattttatttatattattaagatttattaaat 54184060  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 149 - 276
Target Start/End: Original strand, 28992494 - 28992621
Alignment:
Q  149 taatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttcaacaaaat 248  Q
    |||||| |||||||||  | ||||||||||| || |||| |||| ||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||  ||  | |||| |    
T  28992494 taatacctaataaacactatttttctccaacccagcaccgcaaaggaaattactaaataggttccacaaataattctatatcattatattcaaccaaatt 28992593  T
Q  249 ttatttaatttattaagatttattaaat 276  Q
    ||||||| || |||| ||||||||||||    
T  28992594 ttatttatttcattatgatttattaaat 28992621  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 335 - 416
Target Start/End: Original strand, 13205690 - 13205772
Alignment:
Q  335 cacccatatattttactccacaatag-gatgcctatttaatgtggtgctaagtaggttacgcttccaccattgtggatggtct 416  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  13205690 cacccatatattttacttcacaatggagatgtctatttaatgtggtactaaataggttaagcacccaccattgtggatggtct 13205772  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 418
Target Start/End: Original strand, 29845083 - 29845214
Alignment:
Q  287 aaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcacccttctccaatggcacccatatattttactccacaa-taggatgcctatttaatgtggtgctaag 385  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||| | ||||||||   || | |||||||||||||||| |||     
T  29845083 aaaaatgaagacagagagggtgcttccatagccacccttct-caatgtcacgcatatattattctccacaacgggggtacctatttaatgtggtgttaaa 29845181  T
Q  386 taggttacgcttccaccattgtggatggtctaa 418  Q
    |||||   |   |||||||||||||||||||||    
T  29845182 taggtggaggacccaccattgtggatggtctaa 29845214  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 335 - 416
Target Start/End: Original strand, 12832441 - 12832523
Alignment:
Q  335 cacccatatattttactccacaatagga-tgcctatttaatgtggtgctaagtaggttacgcttccaccattgtggatggtct 416  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||| | ||  |||||||||| ||||||||    
T  12832441 cacccatgtattatactccacaataggggtgccgatttaatgtggtgctaaataggtgaagcacccaccattgtagatggtct 12832523  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 338 - 390
Target Start/End: Original strand, 19477655 - 19477708
Alignment:
Q  338 ccatatattttactccacaatag-gatgcctatttaatgtggtgctaagtaggt 390  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  19477655 ccatatattatactccacaatagagatacctatttaatgtggtgataaataggt 19477708  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 288
Target Start/End: Original strand, 20491225 - 20491286
Alignment:
Q  227 tatcattacgtttcaacaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaa 288  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||||| || |||||    
T  20491225 tatcattaaatttcaataaaatttatttattttagtatgatttattaaatagggcctacgaa 20491286  T

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Target: chr3 (Bit Score: 140; Significance: 4e-73; HSPs: 23)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 155 - 413
Target Start/End: Original strand, 19332037 - 19332296
Alignment:
Q  155 ttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttcaacaaaatttattt 254  Q
    ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||   |||||||||||||||||    
T  19332037 ttaataagcaccaattttctccaacccaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattttatatcattataattcaacaaaatttattt 19332136  T
Q  255 aatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcacccttctccaatggcacccatatattttactcca 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||  |  | ||||||| |||||||||    
T  19332137 aatttattaagatttattaaataggaccaacaaaaaatgaagagagaaagggttcttccatagctacccttctccatagatatccatatactttactcca 19332236  T
Q  355 caatag-gatgcctatttaatgtggtgctaagtaggttacgcttccaccattgtggatgg 413  Q
    |||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||| || ||| |||||||||||||    
T  19332237 caatagaggtgtctatttaacgtggtgctaaataggttaagcatccgccattgtggatgg 19332296  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 136 - 416
Target Start/End: Original strand, 29078722 - 29079005
Alignment:
Q  136 attaactttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattac 235  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  29078722 attaaatttacgataatacttaataagcatcaattttctccaatccaacacttcaaaataaattattaaataggtcccataaataattctatatcattac 29078821  T
Q  236 gtttcaacaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatga----agagatagagggttcttccatagtcacccttctccaa 331  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  | | || ||||||||    ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||     
T  29078822 atttcaacaaaatttacttaatttattaagatttattaattaaat-caacaaaaaatgaagagagagagagagggtgcttccatagccacccttctccat 29078920  T
Q  332 tggcacccatatattttactccacaataggatgcctatttaatgtggtgctaagtaggttacgcttccaccattgtggatggtct 416  Q
     | ||||||| ||| |||||||||||| || | |||||||||||||||| ||| ||||||| ||   || |||||||||||||||    
T  29078921 agacacccatgtatattactccacaatggggtacctatttaatgtggtgttaaataggttaagcactcatcattgtggatggtct 29079005  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 148 - 414
Target Start/End: Original strand, 20935989 - 20936254
Alignment:
Q  148 gtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttcaacaaaa 247  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  20935989 gtaatacttaataagtaccaattttcttcaatccaacacctcaaaataaattattaaataggccccacaaataattctatatcattacatttcaacaaaa 20936088  T
Q  248 tttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcacccttctccaatggcacccatatattt 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  | | |  ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||| |    
T  20936089 tttatttaatttattaagatttattaattaaat-caataaaaaatgaagagagagagggtgcttccatagccacccttctccataggcacctatatatat 20936187  T
Q  348 tactccacaataggatgcctatttaatgtggtgctaagtaggttacgcttccaccattgtggatggt 414  Q
    ||||||||||| || | ||||||||| |||||  ||| ||| ||| || |||| |||||||||||||    
T  20936188 tactccacaatggggtacctatttaaagtggtattaaatagattaagcatccatcattgtggatggt 20936254  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 148 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 11137868 - 11137624
Alignment:
Q  148 gtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttcaacaaaa 247  Q
    ||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||| | ||||||| | |||||||||||    
T  11137868 gtaatacttaataagtactaattttctccaacccaacacctcaaaagaagttattaaatagatcctacaaataattttatatcattgcatttcaacaaaa 11137769  T
Q  248 tttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcacccttctccaatggcaccc--atatat 345  Q
    ||||||||  |||| |||| |||||||||  | ||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||| |  |||||||   |||||    
T  11137768 tttatttatcttatgaagaattattaaatgagacccgcaaaaaatgaagagagagagggtgcttccatagtcatcattctctataggcacccctgtatat 11137669  T
Q  346 tttactccacaataggatgcctatttaatgtggtgctaagtaggt 390  Q
    | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  11137668 tatactccacaatatgatgcttatttaatgtggtgttaaataggt 11137624  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 142 - 418
Target Start/End: Original strand, 19554752 - 19555026
Alignment:
Q  142 tttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgt-ttc 240  Q
    ||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||| ||||||||| | ||     
T  19554752 tttacagtaatactgaataagaatcaattttctccaacccagcacctcaaaagaaattattaaat-agccccataaataactctatatcattacatattt 19554850  T
Q  241 aacaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcacccttctccaatggcaccca 340  Q
    |||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||  |||| || |||||||||||||||| || | ||  || |||    
T  19554851 aacaaattttttttattttactaagatttattaaatggaacccatgaaaaatgaagag--agagagtgcttccatagtcaccctcct-ctataacatcca 19554947  T
Q  341 tatattttactccacaatagg-atgcctatttaatgtggtgctaagtaggttacgcttccaccattgtggatggtctaa 418  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||| ||||  | || ||||||||||||||||||||||    
T  19554948 tatattatactccacaataggaatgcctatttaatatagtggtaaataggagaagcatccaccattgtggatggtctaa 19555026  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 142 - 304
Target Start/End: Original strand, 47864857 - 47865021
Alignment:
Q  142 tttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaat--tattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgttt 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || |  |||||||||||| | |||||||||| | ||||||||| |||    
T  47864857 tttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacccagcacctcaaaaaaattactattaaataagttctacaaataattttttatcattacattt 47864956  T
Q  240 caacaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagag 304  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  | |||| |||||||||||||| ||||    
T  47864957 caacaaaatttatttattttattaaaatttattaaatgtgacccatgaaaaatgaagagagagag 47865021  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 166 - 411
Target Start/End: Original strand, 26952389 - 26952634
Alignment:
Q  166 caattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttcaacaaaatttatttaatttattaag 265  Q
    ||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||| |    
T  26952389 caattgtctccaacccagcaccacaaaagaaattattaaataggtctaacaaataattttatatcattacatttcaacaaaaattatttatttcattatg 26952488  T
Q  266 atttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcacccttctccaatggcacccatatattttactccacaatag-gatg 364  Q
    ||||||||||||||  ||   ||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||  |||||||| ||||| ||||||||||| | | ||    
T  26952489 atttattaaatagggtcc-gtaaaagcgaagagagagagggtgcttccatagtcactcttgtccataggcacccaaatattatactccacaatggaggtg 26952587  T
Q  365 cctatttaatgtggtgctaagtaggttacgcttccaccattgtggat 411  Q
     ||||||||| ||||||||| ||||| | ||  ||||||||||||||    
T  26952588 tctatttaatatggtgctaaataggtgaagcacccaccattgtggat 26952634  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 142 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 48962463 - 48962306
Alignment:
Q  142 tttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttca 241  Q
    |||||||||||||||||||| ||   |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| | |||||||||  ||||    
T  48962463 tttacggtaatacttaataagcactcattttctccaactcagcacctcaaaagaaattattaaataggtcatacaaataattttatatcattacaattca 48962364  T
Q  242 acaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagaga 299  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||||||||||    
T  48962363 acaaaaattatttattttattaaaatttattaaatggaacccatgaaaaatgaagaga 48962306  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 187 - 412
Target Start/End: Original strand, 26919232 - 26919451
Alignment:
Q  187 ctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttcaacaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacg 286  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||| || ||| |     
T  26919232 ctcaaaagaaattattaaataggtcccataaataattttatatcattacatttcaacaaaatttatttattgaattaaaatttattaaatgggacccgca 26919331  T
Q  287 aaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcacccttctccaatggcacccatatattttactccacaat-aggatgcctatttaatgtggtgctaag 385  Q
    ||||||||||||  ||| ||| ||||||||| |||| |||||||     ||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||| |||||||||     
T  26919332 aaaaatgaagag--agaaggtgcttccatagccaccattctcca-----acccatatattatactctacaatgggggtgcttatttaatatggtgctaaa 26919424  T
Q  386 taggttacgcttccaccattgtggatg 412  Q
    || || | || ||||||||||||||||    
T  26919425 tatgtgaagcatccaccattgtggatg 26919451  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 129 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 47495684 - 47495535
Alignment:
Q  129 ccctatcattaactttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctcta 228  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||  ||  | |||||||| | ||    
T  47495684 ccctatgattaattttatggtaatact-aataagcatcaattttctctaactcagtacctaaaaagaaattattaaatagctcatataaataattttata 47495586  T
Q  229 tcattacgtttcaacaaaatttatttaatttattaagatttattaaatagg 279  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47495585 tcattacatttcaacaaaatttatttaatttattaagatttattaaatagg 47495535  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 142 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 18090626 - 18090440
Alignment:
Q  142 tttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaaga-----aattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacg 236  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| || |||||||||| |     ||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||| |     
T  18090626 tttacggtaatacttaataagtatcacttttctccaacccagcacctcaaaataaatataattattaactaggtcccacaaataattttatatcattcca 18090527  T
Q  237 tttcaacaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcaccc 323  Q
    ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||  |||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  18090526 ttttaacaacatttatttattttattaagatttattaaatgagacccataaaaaatgatgagagagagggtgcttccataggcaccc 18090440  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 142 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 20826455 - 20826320
Alignment:
Q  142 tttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattac-gtttc 240  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||| |||  ||||||||  |||     
T  20826455 tttacggtaatacttaataagcatcaattttctccaacccaacacctcaaaataaattattgaataggtcccaccaataactctagatcattacattttt 20826356  T
Q  241 aacaaaatttatttaatttattaagatttattaaat 276  Q
    ||||||||||||| | | || |||||||||||||||    
T  20826355 aacaaaatttattcattatactaagatttattaaat 20826320  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 142 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 10046469 - 10046338
Alignment:
Q  142 tttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttca 241  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||| |  ||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||  ||| |    
T  10046469 tttacggtaatacttaataagcaccacttttctccaacccagcacctcaata--aattattcaataggtcccacaaataattttatatcattaaatttta 10046372  T
Q  242 acaaaatttatttaatttattaagatttattaaa 275  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10046371 acaacatttatttattttattaagatttattaaa 10046338  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 133 - 299
Target Start/End: Original strand, 46909774 - 46909940
Alignment:
Q  133 atcattaactttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcat 232  Q
    ||||| || |||||||||||||| || ||  | |||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||| | | ||||||    
T  46909774 atcatcaattttacggtaatactgaagaagaaccaattttctccagcctaacacttcaaaagaaattattaaatagctcc-acaaataactttatatcat 46909872  T
Q  233 tacgtttc-aacaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagaga 299  Q
    ||| |||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||    
T  46909873 tacatttttaacaaaaattatttattttattaagatttattaaatgggacccatgaaatatgaagaga 46909940  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 147 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 37333441 - 37333172
Alignment:
Q  147 ggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaatt-attaaataagtccc-acaaataattctctatcattacgtttc-aac 243  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||  |||||| || ||||| ||||| | || ||| |||||||| ||| || | |||| |||  |||    
T  37333441 ggtaatacttaatcagcaccaattttctccaactcataacctcataaaaaatttattaacttaggccccacaaataactctataccgttacatttttaac 37333342  T
Q  244 aaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcacccttctccaatggcacccatat 343  Q
    | |||||||| | |||| |||| ||||||||||  | |||| ||||| ||||||||    |||| ||||||||| |||||||||||    ||||| ||||    
T  37333341 ataatttattcattttactaaggtttattaaatgtgacccatgaaaattgaagaga----gggtgcttccatagccacccttctccgtaagcaccgatat 37333246  T
Q  344 attttactccacaat-aggatgcctatttaatgtggtgctaagtaggttacgcttccaccattgtggatggtct 416  Q
     || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||  |||||||||||||| ||||    
T  37333245 gttatactccacaatgaggatgtctatttaatgtggtgctaaataggtgaagcacccaccattgtggatagtct 37333172  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 152 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 47342579 - 47342455
Alignment:
Q  152 tacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttcaac-aaaattt 250  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||| || ||||||||| ||||||| |||||| |||||| || ||||| | ||||||||| ||||||| |||||||    
T  47342579 tacttaataagcatca-ttttcttcaacccatcacctcaaatgaaattactaaataggtcccagaagtaattatatatcattacatttcaaccaaaattt 47342481  T
Q  251 atttaatttattaagatttattaaat 276  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||    
T  47342480 atttatttcattatgatttattaaat 47342455  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 276
Target Start/End: Original strand, 38521861 - 38521994
Alignment:
Q  142 tttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttca 241  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||  | ||||| |||| | || |||||||| ||  || |||||||||  ||| ||||| |||||    
T  38521861 tttatggtaatacttaataagcatcgattttctccaacctagcacctaaaaaaatat-attaaataggtttcataaataattcaatataattacatttca 38521959  T
Q  242 acaaaatttatttaatttattaagatttattaaat 276  Q
    ||||||| | |||  ||||||||||||||||||||    
T  38521960 acaaaatgtctttgttttattaagatttattaaat 38521994  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 251 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 44543008 - 44542943
Alignment:
Q  251 atttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccata 316  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  44543008 atttattttattaagatttattaaataggacccacaaaaaatgaagagagagagggtgtttccata 44542943  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 363 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 18090415 - 18090360
Alignment:
Q  363 tgcctatttaatgtggtgctaagtaggttacgcttccaccattgtggatggtctaa 418  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | | || ||||||||||||||||||||||    
T  18090415 tgcctatttaatgtggtgctaaatagatgaagcatccaccattgtggatggtctaa 18090360  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 42471071 - 42470985
Alignment:
Q  190 aaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttcaacaaaatttatttaatttattaagatttattaaat 276  Q
    ||||||||||||||||||  |  || | |||||| | ||||||||| |||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||    
T  42471071 aaaagaaattattaaatagttttcatatataattatatatcattacatttcaacaaaaaatgtttattttattaagatttattaaat 42470985  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 168 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 44543259 - 44543202
Alignment:
Q  168 attttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattct 225  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  44543259 attttctccaacccaacatcttaaaagaaattattaaataggttccactaataattct 44543202  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 51370492 - 51370392
Alignment:
Q  227 tatcattacgtttcaacaaaa-tttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcaccctt 325  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||  |||| |||| |||||||| |||| ||  |||||||| ||| |||    
T  51370492 tatcattatatttcaacaaaaatttatttatttcattatgatttattaaataggatccacaaaaagtgaagagagagagtgt--ttccatagccactctt 51370395  T
Q  326 ctc 328  Q
    |||    
T  51370394 ctc 51370392  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16883046 - 16882993
Alignment:
Q  167 aattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaata 220  Q
    |||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  16883046 aattttcttcaactcagtacctcaaaagaaattattaagtaagtcccataaata 16882993  T

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Target: chr8 (Bit Score: 123; Significance: 5e-63; HSPs: 21)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 142 - 420
Target Start/End: Original strand, 6148256 - 6148535
Alignment:
Q  142 tttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttca 241  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  6148256 tttacggtaatatttaataagcatcaattttctacaacccagcaccttaaaagaaattattaaataggtcccacaaataattctatatcattaaatttca 6148355  T
Q  242 acaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaag--agatagagggttcttccatagtcacccttctccaatggcaccc 339  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||| ||||||| |||||| || || |||||||||  | |||||    
T  6148356 acaaaatttatttattttattaagatttattaaataggacccgcgaaaaatgaagaaagagagagggtgcttcca-agccatccttctccatagacaccc 6148454  T
Q  340 atatattttactccacaatag-gatgcctatttaatgtggtgctaagtaggttacgcttccaccattgtggatggtctaagt 420  Q
    ||||||| |||| |||||| | ||||| || ||||| ||||| ||| ||||| | ||  |||||||||||||||||||||||    
T  6148455 atatattatacttcacaatggagatgctta-ttaatatggtgttaaataggtgaagcacccaccattgtggatggtctaagt 6148535  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 133 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 43429601 - 43429346
Alignment:
Q  133 atcattaactttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcat 232  Q
    |||||||| ||||||||| ||| |||||   | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  43429601 atcattaattttacggtagtacataataggtaccaattttctccaacccaacacctcaaaagaaattattaaataagttccacaaataattctatatcat 43429502  T
Q  233 tacgtttcaacaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaa------gagatagagggttcttccatagtcacccttc 326  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || || |||||||||      |||| |||| || |||| |||| ||||||||    
T  43429501 tacatttcaacaaaatttatttaattttttaggatttattaaataggaccaacaaaaaatgaagagagagagagagagagtgcttctatagccacccttc 43429402  T
Q  327 tccaatggcacccatatattttactccacaat-aggatgcctatttaatgtggtgc 381  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||    
T  43429401 tccataggcacccatatattttactccaaaatgggggtgcctatttaatgtggtgc 43429346  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 142 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 7186459 - 7186180
Alignment:
Q  142 tttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttca 241  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||| |||||| | ||||||||  ||| |    
T  7186459 tttacggtaatacttaataagcaccacttttctccaacccaacacctcaaaataaattattaaattggtctcacagataattttatatcattatatttta 7186360  T
Q  242 acaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcacccttctccaatggcacccat 341  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||  | |||||||    
T  7186359 acaacatttatttattttattaagatttattaaatgggacccatgaaaaatgaagatagagagggtgcttccatagccacccttctccatagccacccat 7186260  T
Q  342 atattttactccacaat-aggatgcctatttaatgtggtgctaagtaggttacgcttccaccattgtggatggtctaagt 420  Q
    ||||| | ||||||||| ||  ||||||||||||  |||||||| || || | ||  ||||||||||| |||||||||||    
T  7186259 atattattctccacaatgagagtgcctatttaatacggtgctaaatatgtgaagcacccaccattgtgtatggtctaagt 7186180  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 149 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 40216619 - 40216356
Alignment:
Q  149 taatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttcaacaaaat 248  Q
    |||||||||||||||| ||| ||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  40216619 taatacttaataaacaccaaattcttccaacccaacaccttaaaagaaattattaaataggccccaccaataattttatatcattacatttcaacaaaat 40216520  T
Q  249 ttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcacccttctccaatggcacccatatatttt 348  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    ||||  |||||| |    
T  40216519 ttatttattttattaagatttattaaacgtgacccatgaaaaatgaagagatagagggtgcttccataaccacccttctccataaccaccattatattat 40216420  T
Q  349 actccacaataggatgcctatttaatgtggtgctaagtaggttacgcttccaccattgtggatg 412  Q
    |||||||||| | |||  |||||||||||||||||| ||||| | || |||||||| |||||||    
T  40216419 actccacaatggaatgggtatttaatgtggtgctaaataggtgaagcatccaccatcgtggatg 40216356  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 167 - 420
Target Start/End: Original strand, 37127512 - 37127766
Alignment:
Q  167 aattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttcaacaaaatttatttaatttattaaga 266  Q
    |||||||||||||  | ||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37127512 aattttctccaaccgagcaccttaaaataaattattaaatagatcccacaaataattttatatcattacatttcaacaaaatttatttattttattaaga 37127611  T
Q  267 tttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcacccttctccaatggcacccatatattttactccacaat-aggatgc 365  Q
    | ||||||||  | |||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||  | |||| || |||| ||||||||| | |||||||    
T  37127612 tctattaaatgagacccatgaaaaatgaagagaaagaggttgcttccatagccactcttctccatagccacctatttattatactccacagtgaggatgc 37127711  T
Q  366 ctatttaatgtggtgctaagtaggttacgcttccaccattgtggatggtctaagt 420  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| | ||  ||||||||||| || ||||||||    
T  37127712 ctatttaatgtggtgataaataggtaaagcacccaccattgtgaatagtctaagt 37127766  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 144 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 8845835 - 8845552
Alignment:
Q  144 tacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttca-- 241  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||| ||| |||||||||||||        
T  8845835 tacggtaatacttaataaacaccgattttctccaacctagcacctcaaaa-aaattattaaataggccccaccaataactctatatcattacgttttttt 8845737  T
Q  242 acaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatga------agagatagagggttcttccatagtcacccttctccaatggc 335  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||      ||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||   ||    
T  8845736 acaaaatttattcattttactaagatttattaaatgggacccatgaaaaatgaatagagagagagagagggtgcttccatagccaccctcctccataagc 8845637  T
Q  336 acccatatattttactccacaatagga-tgcctatttaatgtggtgctaagtaggttacgcttccaccattgtggatggtctaag 419  Q
    |||||||| || ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| ||||| | ||  ||||||||||||||||||||||    
T  8845636 acccatatgttatactccacaatggaagtgcctatttaatgtggtgctaaataggtaaagcacccaccattgtggatggtctaag 8845552  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 133 - 327
Target Start/End: Original strand, 1597948 - 1598143
Alignment:
Q  133 atcattaactttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcat 232  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||||| || |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  1597948 atcactaattttacggtaatatttaataagcaccaatattctccaaccgaacacctcaaaagaaattattaaataggtcccacaaataattttatatcat 1598047  T
Q  233 tacgtttcaacaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccac-gaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcacccttct 327  Q
    ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |  | ||  ||||||||||||| |||| || ||||||||| |||| ||||    
T  1598048 tacatttcaacaaaatatatataatttattaagatttattaaatatgatcaacaaaaaaatgaagagagagagcgtgcttccatagccaccattct 1598143  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 142 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 20765872 - 20765693
Alignment:
Q  142 tttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttca 241  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||   ||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  20765872 tttaccgtaatacttaataagcatcaattttctccaacccagcaccttaaaagaaaatattaaatagtgcccacaaataattttatatcattacatttca 20765773  T
Q  242 acaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcaccc 323  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||  ||| ||| ||||||||| |||||    
T  20765772 acaaaatttatttattttattaagatttattaaattggacccataaaaaatgaagag--agaaggtgcttccatagccaccc 20765693  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 142 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 41407469 - 41407190
Alignment:
Q  142 tttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttca 241  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||| | |||| || || |||||||||||||||||||||  ||| |||||||| | | |||||||||  ||||    
T  41407469 tttacggtaatacttaataaacactcattttatgcaactcagcatctcaaaagaaattattaaatagatcctacaaataactttatatcattacacttca 41407370  T
Q  242 acaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcacccttctccaatggcacccat 341  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |  |||| ||||||| |  ||| ||||||| ||||||||| |||| ||||| |  | |||||||    
T  41407369 acaaaatttatttattctattaaaatttattaaatggaacccatgaaaaataagaagagagagggtgcttccatagccaccattctctatagccacccat 41407270  T
Q  342 atattttactccacaat-aggatgcctatttaatgtggtgctaagtaggttacgcttccaccattgtggatggtctaagt 420  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||| ||| ||| | | ||  ||| ||||||||||||| |||||    
T  41407269 atattttactccacaatgatggtgcctatttaatatggtgttaaatagatgaagcacccatcattgtggatggtttaagt 41407190  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 142 - 299
Target Start/End: Original strand, 43417724 - 43417880
Alignment:
Q  142 tttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttca 241  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||| |||||    
T  43417724 tttacggtaattcttaataaacaccgatttttttcaacccaacacctcaac-gaaattattaaataggtcccacaaataattatgtatgattacatttca 43417822  T
Q  242 acaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagaga 299  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  || ||||||||| |||||    
T  43417823 acaaaatttctttattttattaagatttattaaatgggatccgcgaaaaatgtagaga 43417880  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 142 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 3692142 - 3692008
Alignment:
Q  142 tttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttca 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||||||| |  | | | |||||||||| ||||||||  |||||    
T  3692142 tttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaatctagaacctcaaaagaaattattaaacagtttcaataaataattctatatcattagatttca 3692043  T
Q  242 acaaaatttatttaatttattaagatttattaaat 276  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  3692042 acaaaatttatttatcttattaatatttattaaat 3692008  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 144 - 250
Target Start/End: Original strand, 3346667 - 3346773
Alignment:
Q  144 tacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttcaac 243  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  3346667 tacggtactacttaataaacaccagttttcttcaacccaacacctcaaaagaaattattaaataggttcgacaaataattctaaatcattacatttcaac 3346766  T
Q  244 aaaattt 250  Q
    |||||||    
T  3346767 aaaattt 3346773  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 136 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 42845439 - 42845328
Alignment:
Q  136 attaactttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattac 235  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||  |  || || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  42845439 attaaatttacggtaatatttaataagtatcaattttctcacatccagcatctcaaaataaattattaaataggtcccacaaataattctatatcattac 42845340  T
Q  236 gtttcaacaaaa 247  Q
     |||||||||||    
T  42845339 atttcaacaaaa 42845328  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 215 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 39949742 - 39949657
Alignment:
Q  215 caaataattctctatcattacgtttcaacaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccac-gaaaaatgaagaga 299  Q
    ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||    
T  39949742 caaataattctatatcgttacatttcaacaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggaccaacaaaaaaatgaagaga 39949657  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 184 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 23629664 - 23629563
Alignment:
Q  184 cacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattac-gtttcaacaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcc 282  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||  ||| || |||||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||    
T  23629664 cacctcaaaagaaattattaattagatcccacaaataattctataacattacatttttaataaaatttattcattttactaagatttattaaataggacc 23629565  T
Q  283 ca 284  Q
    ||    
T  23629564 ca 23629563  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 184 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 40978894 - 40978781
Alignment:
Q  184 cacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttcaacaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtccc 283  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||| |||||||||      |||| ||||||||||||||||||||  | |||    
T  40978894 cacctcaaaagaaattattaaataggttccacaaataattttatatcattacatttcaacaa-----ttttattttattaagatttattaaatgagaccc 40978800  T
Q  284 acgaaaaatgaagagatagag 304  Q
    |  ||||||||||||| ||||    
T  40978799 a--aaaaatgaagagagagag 40978781  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 287 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 42845330 - 42845233
Alignment:
Q  287 aaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcacccttctccaatggcacccatatattttactccacaataggatgcctatttaatgtggtgctaa 384  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||| |||||||| ||| |  | ||||||||||||||||||||    
T  42845330 aaaaatgaagagagggagggtgcttccatagccaccattctccataggcacccatatatattactccataatggagtacctatttaatgtggtgctaa 42845233  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 40215839 - 40215799
Alignment:
Q  231 attacgtttcaacaaaatttatttaatttattaagatttat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40215839 attacgtttcaacaaaatttatttattttattaagatttat 40215799  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 275
Target Start/End: Original strand, 34474276 - 34474387
Alignment:
Q  166 caattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatc--attacgtttcaacaaaatttatttaatttatta 263  Q
    |||||||||||||| ||  |  |||||||||||||||||||| ||| || |||   |||| |||   ||||| |||||||||||  |||||| |||||||    
T  34474276 caattttctccaacccattatatcaaaagaaattattaaataggtctcataaaattttctatatactattacatttcaacaaaaaatatttattttatta 34474375  T
Q  264 agatttattaaa 275  Q
    ||||||||||||    
T  34474376 agatttattaaa 34474387  T

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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 39949798 - 39949739
Alignment:
Q  133 atcattaactttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaa 192  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  39949798 atcattaattttatagtaatacttaataagcacaaattttctccaactcaacacctcaaa 39949739  T

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Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 338 - 390
Target Start/End: Original strand, 34474445 - 34474497
Alignment:
Q  338 ccatatattttactccacaataggatgcctatttaatgtggtgctaagtaggt 390  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| |||||    
T  34474445 ccatatattatactccacaatgggatgcatatttaacgtggtgttaaataggt 34474497  T

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Target: chr5 (Bit Score: 121; Significance: 8e-62; HSPs: 10)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 73 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 16562084 - 16561739
Alignment:
Q  73 taagaccatccaaaacagagaacctcaaattaggtgctcaaatgtttcatatgggcccctatcattaactttacggtaatacttaataaacatcaatttt 172  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||  | ||||| |    
T  16562084 taagaccatccacaacagagcacctaaaattgggtgcttaaatgggtcatatgggtccctatcattaattttacaataatacttaataagtaccaattat 16561985  T
Q  173 ctccaacgcaacacctcaaaagaaa-ttattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttcaacaaaatttatttaatttattaagatttat 271  Q
    ||||||| || | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16561984 ctccaacccagcccctcaaaaaaaaattattaaataagtcccacaaataattatatatcattatatttcaacaaaatttatttaatttattaagatttat 16561885  T
Q  272 taaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcacccttctccaatggcacccatatattttactccacaa-taggatgcctatt 370  Q
    |||||     ||  |||||||||||||  |||| || ||||||||| |||  |||||||  | |||| |||| |||||||||||||  |||   ||||||    
T  16561884 taaatgaaatccgtgaaaaatgaagag--agagagtgcttccatagccacatttctccatagacacctatattttttactccacaacgagggctcctatt 16561787  T
Q  371 taatgtggtgctaagtaggttacgcttccaccattgtggatggtctaa 418  Q
    |||||| ||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  16561786 taatgtagtgctaaatagattaagctcccaccattgtggatcgtctaa 16561739  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 73 - 358
Target Start/End: Original strand, 10667242 - 10667526
Alignment:
Q  73 taagaccatccaaaacagagaacctcaaattaggtgctcaaatgtttcatatgggcccctatcattaactttacggtaatacttaataaacatcaatttt 172  Q
    |||||| ||||  ||||||| | || ||||| |||||| ||| |  |||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10667242 taagactatccgcaacagagcatctaaaattgggtgcttaaaggggtcatttgggtccctatgattaattttacggtaatacttaataagcatcaatttt 10667341  T
Q  173 ctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttcaacaaaatttatttaatttattaagatttatt 272  Q
    ||||||| |   |  |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10667342 ctccaaccctgaatttcaaaa-aaattattaaataggtctcacaaataattctatatcattacattttaacaaaatttatttaatttgttaagatttatt 10667440  T
Q  273 aaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcacccttctccaatggcacccatatattttactccacaat 358  Q
    ||||||| | |  |||||||||||||| ||||||| ||||||||  | |||||||| |  | |||||||||||||||||| |||||    
T  10667441 aaataggactcgggaaaaatgaagagagagagggtgcttccataacctcccttctctatagacacccatatattttactctacaat 10667526  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 142 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 23419126 - 23418859
Alignment:
Q  142 tttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttca 241  Q
    ||||| |||||||||||||| ||   |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| | ||||||||| |||||    
T  23419126 tttacagtaatacttaataagcactgattttctccaacccagcacctcaaaagaaattattaaataggccctacaaataattttatatcattacatttca 23419027  T
Q  242 acaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcacccttctccaatggcacccat 341  Q
    |||||||||        |||||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||  | |||||||    
T  23419026 acaaaattt--------tattaagatttattaaatgggacccaagaaaaatgaatagagagagggtgcttccatagccaccattctccatagccacccat 23418935  T
Q  342 atattttactccacaat-aggatgcctatttaatgtggtgctaagtaggttacgcttccaccattgtggatggtct 416  Q
    ||||| |||||||||||  || ||||||||||||  |||| ||| ||| | | ||  ||| |||||||||||||||    
T  23418934 atattatactccacaatgggggtgcctatttaatacggtgttaaatagatgaagcacccatcattgtggatggtct 23418859  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 142 - 316
Target Start/End: Original strand, 35377772 - 35377946
Alignment:
Q  142 tttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttca 241  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||| | ||||||||| |||||    
T  35377772 tttatggtaatacttagtaagcactaattttctccaacccagcacctcaaaagaaattattaaatagggcatacaaataattttatatcattacatttca 35377871  T
Q  242 acaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccata 316  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |  ||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  35377872 acaaaatttatttattttattaagatttattaaatgtgagccatgaaaaatgatgagagagagggtgcttccata 35377946  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 166 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 27903798 - 27903575
Alignment:
Q  166 caattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttcaacaaaatttatttaatttattaag 265  Q
    |||||||||| ||| ||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||| ||||     
T  27903798 caattttctcaaacccaacatctaaaaagaagttattaaataggtcccacaaataattttatatcattacattttaacaaaatttaattatttttttaat 27903699  T
Q  266 atttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcacccttctccaatggcacccatatattttactccacaataggatgc 365  Q
    |||||||||||  | |||| |||||||||||||| ||| | | ||||||||  |||| || ||||  | ||||||| |||| ||||||||||| || |||    
T  27903698 atttattaaatgtgacccatgaaaaatgaagagagagatgatgcttccatatccaccatt-tccatagtcacccatgtattatactccacaatggggtgc 27903600  T
Q  366 ctatttaatgtggtgctaagtaggt 390  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||    
T  27903599 ctatttaatgtagtgctaaataggt 27903575  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 215 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 19279629 - 19279422
Alignment:
Q  215 caaataattctctatcattacgtttcaacaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttcca 314  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |  ||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  19279629 caaataattttatatcattacatttcaacaaaatttatttattttattaatatttattaaatgtgatccatgaaaaaggaagagagagagggtgcttcca 19279530  T
Q  315 tagtcacccttctccaatggcacccatatattttactccacaatagg-atgcctatttaatgtggtgctaagtaggttacgcttccaccattgtggatgg 413  Q
    ||| || |||||||||  | ||||||| |||| ||||||| ||  ||  || |||||||||||| |||||| ||||| | ||  ||||||||||||||||    
T  19279529 tagccatccttctccatagccacccatgtattatactccataaagggtgtgtctatttaatgtgatgctaaataggtgaagcacccaccattgtggatgg 19279430  T
Q  414 tctaagtg 421  Q
    ||| ||||    
T  19279429 tcttagtg 19279422  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 146 - 418
Target Start/End: Original strand, 43100767 - 43101042
Alignment:
Q  146 cggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattac-gtttcaaca 244  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||| | || |||||||||||  || || ||||||  ||| ||||    
T  43100767 cggtaatacttgataaacaccaattttctccaactc-attcctcaaaagaaattattaact-aggcccacaaataaccctataccattacatttttaaca 43100864  T
Q  245 aaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaaga----gatagagggttcttccatagtcacccttctccaatggcaccca 340  Q
    ||||||||| | ||||  |||||||||||||| || |||| ||||| ||||||    ||  |||||| ||||||||| || ||| |||||   |||||||    
T  43100865 aaatttattcattttacaaagatttattaaatgggacccatgaaaattgaagagtgggagggagggtgcttccatagccaacctactccataagcaccca 43100964  T
Q  341 tatattttactccacaat-aggatgcctatttaatgtggtgctaagtaggttacgcttccaccattgtggatggtctaa 418  Q
    ||| || ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||    
T  43100965 tatgttatactccacaatgagggtgcttatttaatgtggtgctaaataggttaagcacccaccatt-tggatggtctaa 43101042  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 148 - 416
Target Start/End: Original strand, 9622195 - 9622477
Alignment:
Q  148 gtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattatta---aataagtcccacaaataattctctatcattacgt--ttcaa 242  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||  | || ||||||||| |||||||   | || | ||||||||||| ||| ||||||||| |  || ||    
T  9622195 gtaatacttaataagcatcaattttctccaacctagcatctcaaaagagattattattaactaggccccacaaataactctatatcattacatattttaa 9622294  T
Q  243 caaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatga--------agagatagagggttcttccatagtcacccttctccaatgg 334  Q
    |||| |||||| | |||| |||||||||||||||||| | || ||||| |||        ||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||   |    
T  9622295 caaagtttattcattttactaagatttattaaataggactcatgaaaattgaagagagagagagagagagggtgcttccatagtcaccctcttccataag 9622394  T
Q  335 cacccatatattttactccacaat-aggatgcctatttaatgtggtgctaagtaggttacgcttccaccattgtggatggtct 416  Q
    ||| ||||| || |||||||||||  || || ||||||||||||||||||| ||||| | ||  |||||||||||||||||||    
T  9622395 cactcatatgttatactccacaatgggggtgtctatttaatgtggtgctaaataggtgaagcacccaccattgtggatggtct 9622477  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 142 - 324
Target Start/End: Original strand, 5422976 - 5423158
Alignment:
Q  142 tttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttc- 240  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||   ||||||||||||||| | |||||||| | ||||| ||||| ||| |||| |||| |||      
T  5422976 tttacagtaatacttaataagcaccaattttctccaatctaacacctcaaaagaattaattaaatagg-cccaccaataactctatatctttacattttt 5423074  T
Q  241 aacaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcaccct 324  Q
    ||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||   |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  5423075 aacgaaatttattcattttactaagatttattaaataggacccatataaaatgaagagagagagggtgcttccatagccaccct 5423158  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 7211453 - 7211373
Alignment:
Q  195 aaattattaaataagtcccacaaataattctctatc-attacgtttcaacaaaatttatttaatttattaagatttattaaa 275  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| || || ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  7211453 aaattattaaataggtcccacaaataattttatatcaatgacatttcaacaaaattta-ttattttattaaaatttattaaa 7211373  T

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Target: chr1 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 33)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 142 - 390
Target Start/End: Original strand, 16255290 - 16255538
Alignment:
Q  142 tttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttca 241  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||    
T  16255290 tttacggtaatacttaataagcatcaattttctccaacccagcacctcaaaagaaattattaaatttgtctcacaaataattctatatcattccatttca 16255389  T
Q  242 acaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcacccttctccaatggcacccat 341  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |    ||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||| ||  |||||||||    
T  16255390 acaaaatttatttattttattaagatttattaaatgggacttgtgaaaattgaagagaaagagggtgcttccatagccactcttctacataggcacccat 16255489  T
Q  342 atattttactccacaat-aggatgcctatttaatgtggtgctaagtaggt 390  Q
    ||||| |||| || ||| ||| ||  |||||||||||||||||| |||||    
T  16255490 atattatacttcataatgagggtg-ttatttaatgtggtgctaaataggt 16255538  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 133 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 33016654 - 33016375
Alignment:
Q  133 atcattaactttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcat 232  Q
    |||||||| |||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||    
T  33016654 atcattaattttatgataatatttgataaatatcaattttctccaacccaacacctcaaaagaaattattaaataggttccacaaataattttatatcat 33016555  T
Q  233 tacgtttcaacaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacga-aaaatgaagagatagagggttcttccatagtcacccttctccaa 331  Q
    |   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || | |||||||||||| ||||||| |||||||     || |||||||     
T  33016554 tgaatttcaacaaaatttatttaatttactaagatttattaaataggaccaacaacaaaatgaagagagagagggtgcttccat-----cctttctccat 33016460  T
Q  332 tggcacccatatattttactccacaatag-gatgcctatttaatgtggtgctaagtaggttacgcttccaccattgtggatggtc 415  Q
      ||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||| || |||| ||  | |||||||| |||||||    
T  33016459 aagcacccatatattttactccaaaatggaggtgcctatttaatgtggtgctaaataagttaagcacctaccattgtagatggtc 33016375  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 133 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 29701232 - 29700950
Alignment:
Q  133 atcattaactttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcat 232  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||||||| || |||||| |||||| | | |||||     
T  29701232 atcattaatttttcggtaatacttaataaacaccaattttctccaacccagcatcttaaaagaaattattaactaggtcccagaaataaatatatatcac 29701133  T
Q  233 tacgtttcaacaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcacccttctccaat 332  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| | || || ||||||||||||  ||||||| ||| ||||| ||||||||||||      
T  29701132 tacatttcaacaaaatttatttaaattattaagactcattaaatatgaccaacaaaaaatgaagag--agagggtactttcatagccacccttctccata 29701035  T
Q  333 ggcacccatatattttactccacaat-aggatgcctatttaatgtggtgctaagtaggttacgcttccaccattgtggatggtct 416  Q
      |||||||||||||| ||||||| |  || |||||||||||| | ||||||| ||||||| ||  |||||||| ||||||||||    
T  29701034 tacacccatatattttgctccacagtgggggtgcctatttaatattgtgctaaataggttaagcacccaccattctggatggtct 29700950  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 144 - 346
Target Start/End: Original strand, 50378137 - 50378339
Alignment:
Q  144 tacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttcaac 243  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| | ||||||||| |||||||    
T  50378137 tacggtaacacttaataagcaccaattttctccaatccagcacctcaaaagaaattattaaataggtcctataaataattttatatcattacatttcaac 50378236  T
Q  244 aaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcacccttctccaatggcacccatat 343  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||  |  ||||||||    
T  50378237 aaaatttatttattttattaatatttattaaatatgacccatgaaaaatgaagagagtgagggtgcttccatagccacccttctccatagctacccatat 50378336  T
Q  344 att 346  Q
    |||    
T  50378337 att 50378339  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 142 - 323
Target Start/End: Original strand, 20381065 - 20381244
Alignment:
Q  142 tttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttca 241  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  20381065 tttaccgtaatacttaataagcatcaattttctccaacccagcaccttaaaaggaattattaaatagggcccacaaataattttatatcattacatttca 20381164  T
Q  242 acaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcaccc 323  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |  |||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||    
T  20381165 acaaaatttatttattttattaagattttttaaatggaacccatgaaaaatgaagag--agagggtgcttccatagccaccc 20381244  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 142 - 418
Target Start/End: Original strand, 8259294 - 8259571
Alignment:
Q  142 tttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttca 241  Q
    ||||| |||||||||||| || || |||||||| |||  || |||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||| || | ||||||||| |||||    
T  8259294 tttacagtaatacttaatcaaaattaattttctacaatccagcacctcaaaagaaattatcaaataggttttacaaatatttttatatcattacatttca 8259393  T
Q  242 acaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcacccttctccaatggcacccat 341  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||  | |||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||  | |||||||    
T  8259394 acaaaatttatttattttattaaaatttattaaatgtgacccatgaaaaatgaagagggagagggtgcttccataaccacccttctccatagccacccat 8259493  T
Q  342 atattttactccacaat-aggatgcctatttaatgtggtgctaagtaggttacgcttccaccattgtggatggtctaa 418  Q
    ||||| ||| |||||||  || |||||||||||| || |||||| ||| | | ||  |||||||||| ||||||||||    
T  8259494 atattataccccacaatgggggtgcctatttaatatgatgctaaatagatgaagcacccaccattgtagatggtctaa 8259571  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 142 - 380
Target Start/End: Original strand, 32714105 - 32714338
Alignment:
Q  142 tttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttca 241  Q
    ||||||||||||||  |||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||    
T  32714105 tttacggtaatact--ataagcaccaattttctccaacccatcacctcaaaagaaattattaaataagtcctacaaataattttatatcattacatttca 32714202  T
Q  242 acaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcacccttctccaatggcacccat 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||| | |||||||||||  ||||||| | ||||||  |||||| || ||  | |||||||    
T  32714203 acaaaatttatttaatttattaagattcattaaatgtgacccatggaaaatgaagag--agagggtgc-tccata-acaccctccttcatagccacccat 32714298  T
Q  342 atattttactccacaata-ggatgcctatttaatgtggtg 380  Q
    ||||| ||||| |||| | ||||||||||||||| |||||    
T  32714299 atattatactctacaacagggatgcctatttaatatggtg 32714338  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 142 - 358
Target Start/End: Original strand, 50377760 - 50377975
Alignment:
Q  142 tttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatca-ttacgtttc 240  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||| ||||    
T  50377760 tttacggtaatacttaataagtaccaattttctccaacccagcacctcaaaagaaattattaaataggtcccacaaatagttctatatcatttacctttc 50377859  T
Q  241 aacaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcacccttctccaatggcaccca 340  Q
    || ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |  ||| | |||||| |||||  |||| || ||||||||  |||||| |||||  ||||||||    
T  50377860 aataaaatttctttactttattaagatttattaaatggaacccgcaaaaaataaagag--agagagtgcttccataaccaccctcctccataggcaccca 50377957  T
Q  341 tatattttactccacaat 358  Q
    |||||| ||||| |||||    
T  50377958 tatattatactctacaat 50377975  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 148 - 316
Target Start/End: Original strand, 25388920 - 25389087
Alignment:
Q  148 gtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttcaacaaaa 247  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||| | |||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  25388920 gtaatacttaataagcatcaattttttccaacccaacaccttaaaagaaattactaaataggtcctataaataattttatatcattacatttcaacaaaa 25389019  T
Q  248 tttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccata 316  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||| ||| ||||||||    
T  25389020 tttatttattttattaaaatttattaaataggacccatgaaaaatgaa-agagagaaggtgcttccata 25389087  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 142 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 48379730 - 48379549
Alignment:
Q  142 tttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttca 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||| |||||    
T  48379730 tttaccgtaatacttaataaacattaattttctccaaccaaacaccttaaaagaaattattaaataggtcccacaaatatttttgtatcattacatttca 48379631  T
Q  242 acaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcaccc 323  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||| |||||| |  |||| |||||||||| ||  |||| || ||||||||| |||||    
T  48379630 acaaaatttatttattttattaaatttttttaaatggaacccatgaaaaatgaaaagtgagagtgtgcttccatagccaccc 48379549  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 133 - 384
Target Start/End: Original strand, 24120174 - 24120426
Alignment:
Q  133 atcattaactttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcat 232  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||  ||| ||| |||||| | ||||||    
T  24120174 atcattcattttacggtaatacttaataagtatcacttttctccaactcaacatctcaaaataaatttttaaatagatcctacagataattttatatcat 24120273  T
Q  233 tacgtttcaacaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcacccttctccaat 332  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | || |||| |||||||||||||| ||| ||| ||| ||||| || | |||||||      
T  24120274 tacattttaacaacatttatttattttattaagatttattaactgggacccaagaaaaatgaagagagagatggtgctttcatagccatctttctccata 24120373  T
Q  333 ggcacccatatattttactccacaat-aggatgcctatttaatgtggtgctaa 384  Q
    | | |||||| ||| | |||||||||  || | ||||||||||||||||||||    
T  24120374 gccgcccatacattattctccacaatgggggttcctatttaatgtggtgctaa 24120426  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 133 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 51776826 - 51776543
Alignment:
Q  133 atcattaactttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcat 232  Q
    ||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | | || |||||| ||| || |||    
T  51776826 atcatcaattttacggtaatacttgataagcatcaattttctccaacccaacacctcaaaagaaattattaactaggccgcataaataactctataccat 51776727  T
Q  233 tac-gtttcaacaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcacccttctccaa 331  Q
    |||  ||| ||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||  | |||| ||||| |||||||  |||||||  |||||||| |||| | |||||     
T  51776726 tacatttttaacgaaatttattcattttactaagatttattaaatgtgacccatgaaaattgaagag--agagggtgtttccatagccaccatcctccat 51776629  T
Q  332 tggcacccatatattttactccacaata-ggatgcctatttaatgtggtgctaagtaggttacgcttccaccattgtggatggtct 416  Q
      ||| |||||| || |||| || |||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |  |  |||||||| ||||||||||    
T  51776628 aagcatccatatgttatacttcataatagggttgcctatttaatgtggtgctaaataggtgaaacacccaccattatggatggtct 51776543  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 142 - 307
Target Start/End: Original strand, 5959201 - 5959365
Alignment:
Q  142 tttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttca 241  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||  ||||  ||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||| | |||  |||| |||||    
T  5959201 tttacggtaatactta-taagcatcgattttctccaatccaacgtctcaaagtaaattattaaataggtcctacaaataattttatattgttacatttca 5959299  T
Q  242 acaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggt 307  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||    
T  5959300 acaaaatttatttattttattaagatttattaaataggacccgcaaaaaatgaagagaaagagggt 5959365  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 142 - 304
Target Start/End: Original strand, 15342701 - 15342863
Alignment:
Q  142 tttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttca 241  Q
    ||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||| || ||| | |||| ||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||  |||||    
T  15342701 tttactgtaatatttaataaacaccaattttcttcaacccagcactttaaaataaattattaaataggtcctacaaataattttatatcattatatttca 15342800  T
Q  242 acaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagag 304  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||  | |||| |||||||||||||| ||||    
T  15342801 acaaaatttatttattttattaaaatttattaaatgtggcccatgaaaaatgaagagagagag 15342863  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 166 - 411
Target Start/End: Original strand, 12140751 - 12140995
Alignment:
Q  166 caattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttcaaca-aaatttatttaatttattaa 264  Q
    ||||||||||||||  |  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||     
T  12140751 caattttctccaacctagtaccacaaaagaaattactaaataagtcccacaaataatt-tatatcattacatttcaatataaatttatttaattcattat 12140849  T
Q  265 gatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcacccttctccaatggcacccatatattttactccacaat-aggat 363  Q
    |||||||||||||||  |||| |||  |||||||  |||||||  |||||||| |||||||||| |  ||||| || ||||| ||||||||||| |||||    
T  12140850 gatttattaaatagggtccacaaaaggtgaagag--agagggtggttccatagccacccttctcgacaggcacacaaatattatactccacaataaggat 12140947  T
Q  364 gcctatttaatgtggtgctaagtaggttacgcttccaccattgtggat 411  Q
    ||||||| ||| | ||| ||| ||||| |  |  ||||||||||||||    
T  12140948 gcctattaaatatagtgttaaataggtgaaacacccaccattgtggat 12140995  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 147 - 304
Target Start/End: Original strand, 9693875 - 9694032
Alignment:
Q  147 ggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttcaacaaa 246  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| | |||| |||||||||| |||||||||  ||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  9693875 ggtaatacttaataagcaccaattttattcaacacaacacctcacaagaaattacaaaataggttccacaaataattctatatcattacatttcaacaaa 9693974  T
Q  247 atttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagag 304  Q
    ||||||||| || |||| ||||||| |||| ||  || |||||| |||||||| ||||    
T  9693975 atttatttatttcattatgatttatgaaatgggagccgcgaaaagtgaagagagagag 9694032  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 133 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 39923518 - 39923382
Alignment:
Q  133 atcattaactttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcat 232  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||     | |||||||||   |   ||    
T  39923518 atcattaattttacggtaatacttaataaataccaattttctcaaacccaacacctcaaaagaaattattaaata----gctcaaataattacat---at 39923426  T
Q  233 tacgtttcaacaaaatttatttaatttattaagatttattaaat 276  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39923425 tacatttcaacaaaatttatttaatttattaagatttattaaat 39923382  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 149 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 14625218 - 14625092
Alignment:
Q  149 taatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttcaacaaaat 248  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||  || ||||| ||    
T  14625218 taatacttaataaacaccatttttctccaatccagcacctcaaaataaattattaaataggtcccacaaataattttatatcattacactttaacaacat 14625119  T
Q  249 ttatttaatttattaagatttattaaat 276  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  14625118 ttatttattttatt-agatttattaaat 14625092  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 142 - 276
Target Start/End: Original strand, 42693318 - 42693453
Alignment:
Q  142 tttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattac-gtttc 240  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||| ||| |||||||||  |||     
T  42693318 tttacggtaatacttaataagcaccaattttctccaacctagcacctcaaaagaaattatttaataagctccaccaataactctatatcattacattttt 42693417  T
Q  241 aacaaaatttatttaatttattaagatttattaaat 276  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  42693418 aacaaaatttattcattttactaagatttattaaat 42693453  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 142 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 4085772 - 4085664
Alignment:
Q  142 tttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttca 241  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||| |||||    
T  4085772 tttacgataatacttaatgaacatcaattttcttcaactcaacatctcaaaggaaattattgaataagttccgcaaataattttatatcattacatttca 4085673  T
Q  242 acaaaattt 250  Q
    |||||||||    
T  4085672 acaaaattt 4085664  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 214 - 299
Target Start/End: Original strand, 18236431 - 18236515
Alignment:
Q  214 acaaataattctctatcattacgtttcaacaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagaga 299  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||    
T  18236431 acaaataattctatatcattacttttcaacaaa-tttatttaatttattaagatttattaaatatgaccgacaaaaaatgaagaga 18236515  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 263 - 384
Target Start/End: Original strand, 33737241 - 33737362
Alignment:
Q  263 aagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcacccttctccaatggcacccatatattttactccacaatagga 362  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| | ||||||   | ||| ||| |||| ||||||||||| |      
T  33737241 aagatttattaaataggacccatgaaaaatgaagagagagagggtgctttcatagtcatctttctccgtagccactcatgtattatactccacaatggag 33737340  T
Q  363 tgcctatttaatgtggtgctaa 384  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  33737341 tgcctatctaatgtggtgctaa 33737362  T

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Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 218 - 316
Target Start/End: Original strand, 26451808 - 26451906
Alignment:
Q  218 ataattctctatcattacgtttcaacaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccata 316  Q
    |||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||    |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  26451808 ataattttatatcattacatttcatcaaaatttattaattttattaagatttattaaatgaagcccatgaaaaatgaagagagagagggtgcttccata 26451906  T

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Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 47024435 - 47024310
Alignment:
Q  287 aaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcacccttctccaatggcacccatatattttactccacaatag-gatgcctatttaatgtggtgctaag 385  Q
    ||||||||| ||| |||||||  ||| |||| |||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||  ||     
T  47024435 aaaaatgaacagagagagggtgtttctatagccacctttctctataggcatccatatattttactccacaatggaggtgcctatttaatgtggtgtgaaa 47024336  T
Q  386 taggttacgcttccaccattgtggat 411  Q
    ||| ||||||  ||||||||||||||    
T  47024335 tagattacgcacccaccattgtggat 47024310  T

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Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 335 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 14625049 - 14624967
Alignment:
Q  335 cacccatatattttactccacaatagga-tgcctatttaatgtggtgctaagtaggttacgcttccaccattgtggatggtct 416  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| | ||  |||||||||| ||||||||    
T  14625049 cacccatatattattctccacaataggagtgcctctttaatgtggtgctaaataggtgaagcacccaccattgtagatggtct 14624967  T

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Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 343 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 48379545 - 48379474
Alignment:
Q  343 tattttactccacaataggatgcctatttaatgtggtgctaagtaggttacgcttccaccattgtggatggt 414  Q
    |||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| | ||  |||||||||||||||||    
T  48379545 tattatactctacaatggggtgcctatttaatgtggtgctaaataggtgaagcacccaccattgtggatggt 48379474  T

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Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 149 - 299
Target Start/End: Original strand, 48941393 - 48941544
Alignment:
Q  149 taatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttcaa-caaaa 247  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||  | | | ||||||||   ||||||||| ||||||  ||||    
T  48941393 taatatttaataagcaccaattttctccaacccagcaccacaaaagaaattacgaaatagattctataaataatttcatatcattacatttcaataaaaa 48941492  T
Q  248 tttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagaga 299  Q
    |||||||| || |||| ||||| |||||| ||  |||| |||| ||||||||    
T  48941493 tttatttatttcattatgattttttaaatggggtccacaaaaagtgaagaga 48941544  T

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Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 412
Target Start/End: Original strand, 9694053 - 9694171
Alignment:
Q  295 agagatagagggttcttccatagtcacccttctccaatggca-cccatatattttactccacaataggatgcctatttaatgtggtgctaagtaggttac 393  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||  |||| |||| || || ||||||||||| || |||||||||| | ||||||||| ||||| |     
T  9694053 agagagagagggtgcttccttagccacccttctccataggcaacccaaatgttatactccacaatggggtgcctatttagtatggtgctaaataggtgaa 9694152  T
Q  394 gcttccaccattgtggatg 412  Q
    ||  |||||||| ||||||    
T  9694153 gcacccaccattttggatg 9694171  T

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Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 223
Target Start/End: Original strand, 26450883 - 26450956
Alignment:
Q  149 taatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataatt 223  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  26450883 taatacttaataagcacccattttctccaacccagcacctcaaaa-aaattattgaataggtcctacaaataatt 26450956  T

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Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 419
Target Start/End: Original strand, 15342884 - 15342960
Alignment:
Q  343 tattttactccacaataggatgcctatttaatgtggtgctaagtaggttacgcttccaccattgtggatggtctaag 419  Q
    |||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| ||||| | ||  |||||||||| |||| ||||||    
T  15342884 tattatactccacaatggggtgcttatttaatgtggtgctaaataggtgaagcacccaccattgtagatgatctaag 15342960  T

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Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 235
Target Start/End: Original strand, 43728469 - 43728539
Alignment:
Q  164 atcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattac 235  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||| || |||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  43728469 atcaattttctccaacctaacacctaaaaa-aatttataaaataagccccacaaataactctatatcattac 43728539  T

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Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 343 - 416
Target Start/End: Original strand, 20381248 - 20381322
Alignment:
Q  343 tattttactccacaatagga-tgcctatttaatgtggtgctaagtaggttacgcttccaccattgtggatggtct 416  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |  | ||||||||||||| ||||||    
T  20381248 tattatactccacaatgggagtgcctatttaatatggtgctaaataggtgaaacatccaccattgtggttggtct 20381322  T

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Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 366 - 420
Target Start/End: Original strand, 25389763 - 25389817
Alignment:
Q  366 ctatttaatgtggtgctaagtaggttacgcttccaccattgtggatggtctaagt 420  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||| |||| |||||||    
T  25389763 ctatttaatgtggtgctaaataggttaagcacccaccattgttgatgatctaagt 25389817  T

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Target: chr2 (Bit Score: 111; Significance: 7e-56; HSPs: 17)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 152 - 384
Target Start/End: Original strand, 7315193 - 7315427
Alignment:
Q  152 tacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcc-cacaaataattctctatcattacgtttcaacaaaattt 250  Q
    |||||||||| || |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||    
T  7315193 tacttaataagcaccaattttctccaatccaacaccttaaaagaaattattaaataggtccacacaaataattttacatcattacatttcaacaaaattt 7315292  T
Q  251 atttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcacccttctccaatggcacccatatattttac 350  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || |||| | ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||| |||    
T  7315293 atttattttattaagatttattaaatgggacccatggaaaattaagagagagagggtgcttccatagtcacccttctccatagccacccatgtattatac 7315392  T
Q  351 tccacaat-aggatgcctatttaatgtggtgctaa 384  Q
    |||||||| ||| || ||||||||  |||||||||    
T  7315393 tccacaatgagggtgtctatttaacatggtgctaa 7315427  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 142 - 422
Target Start/End: Original strand, 9032519 - 9032809
Alignment:
Q  142 tttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttca 241  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  9032519 tttaccgtaatacttaataagcactaattttctccaacccaacaccttaaaagagattattaaataggtcccacaaataattttatatcattacgtttca 9032618  T
Q  242 acaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatga----------agagatagagggttcttccatagtcacccttctccaa 331  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||          ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||     
T  9032619 acaaaatttatttattttattaagatttatt-aatgggacccatgaaaaatgaagagagagagagagagagaggatgcttccatagccacccttctccat 9032717  T
Q  332 tggcacccatatattttactccacaatag-gatgcctatttaatgtggtgctaagtaggttacgcttccaccattgtggatggtctaagtgt 422  Q
     | ||||||| |||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||| | ||  |||||||| |||||||||| |||||    
T  9032718 agccacccatgtattatactccataatagaggtgcctatttaatgtggtgttaaataggtgaagcacccaccattttggatggtcttagtgt 9032809  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 155 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 25323068 - 25322802
Alignment:
Q  155 ttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttcaacaaaatttattt 254  Q
    ||||||| ||| | |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25323068 ttaataagcattagttttcttcaactcaacaccttaaaagaaattattaaatatgtcccacaaataattttatatcattacatttcaacaaaatttattt 25322969  T
Q  255 aatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtc-acccttctccaatggcacccatatattttactcc 353  Q
    | |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||| ||| ||||  ||| | |||||||||||  | || | || |||| |||||     
T  25322968 attttattaagatttattaaatgggacccatgaaaaatgaagagagagaaggtgcttc--tagccaacccttctccatagccatcgatgtattatactct 25322871  T
Q  354 acaat-aggatgcctatttaatgtggtgctaagtaggttacgcttccaccattgtggatggtctaagtg 421  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||  | |||| |||| |||||||||| ||||    
T  25322870 acaatgagggtgcctatttaatgtggtgttaaataggttaaacatccatcattatggatggtcttagtg 25322802  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 166 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 38935341 - 38935231
Alignment:
Q  166 caattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttcaacaaaatttatttaatttattaag 265  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38935341 caattttctccaacccagcacctcaaacgaaattattaaataggtctcacaaataattctatatctttacatttcaacaaaatttatttattttattaag 38935242  T
Q  266 atttattaaat 276  Q
    |||||||||||    
T  38935241 atttattaaat 38935231  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 132 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 5732842 - 5732721
Alignment:
Q  132 tatcattaactttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatca 231  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||  || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5732842 tatcattaattttacagtaatacttaattaacactaattttctccaatccagcaccttaaaaaaaattattaaataagtcccacaaataattctatatca 5732743  T
Q  232 ttacgtttcaacaaaatttatt 253  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  5732742 ttacatttcaacaaaatttatt 5732721  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 287 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 9548591 - 9548459
Alignment:
Q  287 aaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcacccttctccaatggcacccatatattttactccacaataggatgcctatttaatgtggtgctaagt 386  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |    
T  9548591 aaaaatgaagagatagaggttgcttccatagccacccttcttcataggcactcatatagtttactccacaatggggtgtctatttaatgtggtgctaaat 9548492  T
Q  387 aggttacgcttccaccattgtggatggtctaag 419  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  9548491 aggttaagcatccaccattgtagatggtctaag 9548459  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 169 - 323
Target Start/End: Original strand, 840154 - 840308
Alignment:
Q  169 ttttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttcaacaaaatttatttaatttattaagatt 268  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||| ||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  840154 ttttcttcaacccaacacctcaaaataaattattaaataagtctcacaaataattttatattattacattttaacaacatttacttattttattaagatt 840253  T
Q  269 tattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcaccc 323  Q
    ||||| || || |||| ||||| |||||||  ||||||| ||||||||| |||||    
T  840254 tattacatgggacccatgaaaactgaagagtgagagggtgcttccatagccaccc 840308  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 185 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 20638664 - 20638542
Alignment:
Q  185 acctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttcaacaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtccca 284  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||| ||||||||| |||  |||||||||||||| |||| || |||||||||||| || ||||    
T  20638664 acctcaaaagaaattattaaataggtcttacaaataactctatatcattacatttttacaaaatttatttattttaatacgatttattaaatgggaccca 20638565  T
Q  285 cgaaaaatgaagagatagagggt 307  Q
     |||||||||||||| |||||||    
T  20638564 tgaaaaatgaagagaaagagggt 20638542  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 187 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 15464109 - 15463999
Alignment:
Q  187 ctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttcaacaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacg 286  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  | || |||    
T  15464109 ctcaaaagaaattattaaataggtcctacaaataattttaaatcactacatttcaacaaaatttatttattttattaaaatttattaaatgagacctacg 15464010  T
Q  287 aaaaatgaaga 297  Q
    |||||||||||    
T  15464009 aaaaatgaaga 15463999  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 257 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 19494890 - 19494730
Alignment:
Q  257 tttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcacccttctccaatggcacccatatattttactccaca 356  Q
    |||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||  ||| || ||||||||| |||| |||||||  | |||||||||||| |||||||||    
T  19494890 tttattaagatttattaaatgggactcatgaaaaatgaagagagggagagtgcttccatagccaccattctccatagtcacccatatattatactccaca 19494791  T
Q  357 at-aggatgcctatttaatgtggtgctaagtaggttacgcttccaccattgtggatggtct 416  Q
    ||  || |||||||||||| |||| |||| ||| | | || |||| |||||||||||||||    
T  19494790 atgggggtgcctatttaatatggtactaaatagatgaagcatccatcattgtggatggtct 19494730  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 149 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14170025 - 14169951
Alignment:
Q  149 taatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataatt 223  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  14170025 taatatttgataaacataaattttctccaacccaacaccttaaaagaaattattaaataggttcgacaaataatt 14169951  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19494977 - 19494892
Alignment:
Q  149 taatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcatta 234  Q
    ||||| ||||||| || | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||| | ||||||||    
T  19494977 taatatttaataagcaccgattttctccaacccaacatctcaaaagaaattattaaataagttatacaaataattttatatcatta 19494892  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 33047928 - 33047845
Alignment:
Q  202 taaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttcaacaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccac 285  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||  |||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  33047928 taaataaatcccacaaataattctatatcattatattgaaacacaatttatttattttattatgattttttaaataggacccac 33047845  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 152 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 43652743 - 43652645
Alignment:
Q  152 tacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttcaacaaaattt 250  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||| |||||||| ||||||  |  || |||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||    
T  43652743 tacttaataaacaccaattttctccaacccagcaccgcaacagaaattactaaatagatatcataaataattttatatcattacatttcaacaacattt 43652645  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 354 - 419
Target Start/End: Original strand, 840322 - 840387
Alignment:
Q  354 acaataggatgcctatttaatgtggtgctaagtaggttacgcttccaccattgtggatggtctaag 419  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||| ||||||||||    
T  840322 acaatggggtgcctatttaatgtggtgctaagtaggtgaagcacccaccattgtgaatggtctaag 840387  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 9548673 - 9548602
Alignment:
Q  148 gtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaata 220  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  9548673 gtaatactcaataaacactaattttctccaacccaaca-ctcaaaaaaaattattaaataggtcccataaata 9548602  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 185 - 276
Target Start/End: Original strand, 22705649 - 22705740
Alignment:
Q  185 acctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttcaacaaaatttatttaatttattaagatttattaaat 276  Q
    |||||| |||||||||  ||||| || |||||||||||| | | ||| ||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||    
T  22705649 acctcataagaaattacaaaataggttccacaaataattttatgtcaatacatttcaacaaaatttatttatttcattatgatttatgaaat 22705740  T

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Target: scaffold0069 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 142 - 323
Target Start/End: Original strand, 60854 - 61033
Alignment:
Q  142 tttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttca 241  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  60854 tttaccgtaatacttaataagcatcaattttctccaacccagcaccttaaaaggaattattaaatagggcccacaaataattttatatcattacatttca 60953  T
Q  242 acaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcaccc 323  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |  |||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||    
T  60954 acaaaatttatttattttattaagattttttaaatggaacccatgaaaaatgaagag--agagggtgcttccatagccaccc 61033  T

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Target: scaffold0069; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 343 - 416
Target Start/End: Original strand, 61037 - 61111
Alignment:
Q  343 tattttactccacaatagga-tgcctatttaatgtggtgctaagtaggttacgcttccaccattgtggatggtct 416  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |  | ||||||||||||| ||||||    
T  61037 tattatactccacaatgggagtgcctatttaatatggtgctaaataggtgaaacatccaccattgtggttggtct 61111  T

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Target: scaffold0001 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 227 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 428476 - 428283
Alignment:
Q  227 tatcattacgtttcaacaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagata----gagggttcttccatagtcacc 322  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    |||| |||||||||||||| |    |||||| ||||||||| ||||    
T  428476 tatcattacatttcaacaaaatttatttattttattaagatttattaaatcaaacccatgaaaaatgaagagagatagagagggtgcttccatagccacc 428377  T
Q  323 cttctccaatggcacccatatattttactccacaataggatgcctatttaatgtggtgctaagtaggttacgcttccaccattgtggatggtct 416  Q
    ||||||||  | ||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||| | ||  |||||||||||||||||||    
T  428376 cttctccatagccacccatgtattatactccacaatggggtgcctatttaatctggtgctaaataggtgaagcacccaccattgtggatggtct 428283  T

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Target: scaffold1940 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold1940
Description:

Target: scaffold1940; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 133 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 816 - 547
Alignment:
Q  133 atcattaactttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcat 232  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||||| || || |||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  816 atcattcattttatggtaatacttaataagcaccatttttctccaacctagcacctcaaaataaattattaaataggtcccacaaataattttatatcat 717  T
Q  233 tacgtttcaacaaaatt-tatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcacccttctccaa 331  Q
    ||| ||| ||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||          |||||||||||    ||||||| ||||||||| ||||||||||||     
T  716 tacattttaacaacattatattt--tttattaagatttattaaa----------gaaaaatgaag----agagggtgcttccatagccacccttctccat 633  T
Q  332 tggcacccatatattttactccacaat-aggatgcctatttaatgtggtgctaagtaggttacgcttccaccattgtggatggtct 416  Q
     | |||||||||||| | |||||||||  || |||||||||||||||||| ||| ||||| | || | ||||||||||||||||||    
T  632 agccacccatatattattctccacaatgggggtgcctatttaatgtggtgttaaataggtgaagcattcaccattgtggatggtct 547  T

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Target: scaffold0355 (Bit Score: 79; Significance: 9e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 142 - 323
Target Start/End: Original strand, 2603 - 2781
Alignment:
Q  142 tttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttca 241  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||| |  ||| || ||||| | ||||||||| |||||    
T  2603 tttaccgtaatacttaataagcatcaattttctccaatccagcaccttaaaagaaattattaaatagggtccataactaattttatatcattacatttca 2702  T
Q  242 acaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagagggttcttccatagtcaccc 323  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||  ||||||| |||||| || |||||    
T  2703 acaaaatttatttattttattaagatttattaaat-gggaccatgaaaaatgaagag--agagggtgcttccagagccaccc 2781  T

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Target: scaffold0039 (Bit Score: 79; Significance: 9e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 142 - 304
Target Start/End: Original strand, 94158 - 94319
Alignment:
Q  142 tttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttca 241  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||| |||||||| ||||||||||  ||  |||||||||| | ||||||||| |||||    
T  94158 tttacggtaatacttaatagacatcaattttctacaatccaacaccacaaaagaa-ttattaaatatatcatacaaataattttatatcattacatttca 94256  T
Q  242 acaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagag 304  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  | |||||||||||||| ||||    
T  94257 acaaaatttatttattttattaagatttattaaataagacttatgaaaaatgaagagagagag 94319  T

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Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 295 - 351
Target Start/End: Original strand, 101624 - 101680
Alignment:
Q  295 agagatagagggttcttccatagtcacccttctccaatggcacccatatattttact 351  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||| ||||    
T  101624 agagagagagggtgcttccatagccacccttctccatagccacccatatattatact 101680  T

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Target: scaffold0006 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 142 - 276
Target Start/End: Original strand, 178204 - 178338
Alignment:
Q  142 tttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttca 241  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||  |||| |||||||||||||||||| | | ||||| ||||| | ||||||||| |||||    
T  178204 tttaccgtaatacttaataagcatcaattttctccaatccagtaccttaaaagaaattattaaatagggcacacaactaattttgtatcattacatttca 178303  T
Q  242 acaaaatttatttaatttattaagatttattaaat 276  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  178304 ataaaatttatttattttattaagatttattaaat 178338  T

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Target: scaffold0466 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 142 - 276
Target Start/End: Original strand, 201 - 335
Alignment:
Q  142 tttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacgtttca 241  Q
    |||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||  || | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| || || |||||    
T  201 tttacggtaatacttaataagcaccgattttctccaacacagtactttaaaagaaattattaaatatgtcctacaaataattctatataataacatttca 300  T
Q  242 acaaaatttatttaatttattaagatttattaaat 276  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  301 acaaaatttctttattttattaagatttataaaat 335  T

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Target: scaffold0127 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 142 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 22983 - 22848
Alignment:
Q  142 tttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattac-gtttc 240  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||  |||     
T  22983 tttacggtactacttaataagcaccaattttctccaacatagcacctgaaaagaaattattaaataggtcccaccaataattttatatcattacattttt 22884  T
Q  241 aacaaaatttatttaatttattaagatttattaaat 276  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  22883 aacaaaatttattcattttactaagatttattaaat 22848  T

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Target: scaffold0332 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0332
Description:

Target: scaffold0332; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 304
Target Start/End: Original strand, 4395 - 4558
Alignment:
Q  142 tttacggtaatacttaataaacatcaattttctccaacgcaacacctcaaaagaaattattaaataagtcccacaaataattctctatcattacg-tttc 240  Q
    ||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| || |   ||||||||| | | || ||| ||| |||     
T  4395 tttacagtaatatttaataagcaccaattttctccaacccaacacttcaaaagaatttattaactaggcttcacaaataactatataccatcacgttttt 4494  T
Q  241 aacaaaatttatttaatttattaagatttattaaataggtcccacgaaaaatgaagagatagag 304  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||  ||| ||||| |||||||| ||||    
T  4495 aacaaaatttattcattttattaagttttattaaatgggatccatgaaaattgaagagagagag 4558  T

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Target: scaffold0281 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0281
Description:

Target: scaffold0281; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 350 - 416
Target Start/End: Original strand, 22270 - 22336
Alignment:
Q  350 ctccacaataggatgcctatttaatgtggtgctaagtaggttacgcttccaccattgtggatggtct 416  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||||| ||| ||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  22270 ctccacaatggggtgtctatttaatgtggtgttaaataggtgaagcatccaccattgtggatggtct 22336  T

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