View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8843_high_7 (Length: 215)

Name: NF8843_high_7
Description: NF8843
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8843_high_7
NF8843_high_7
[»] chr6 (9 HSPs)
chr6 (13-200)||(17958599-17958786)
chr6 (13-198)||(634317-634502)
chr6 (13-198)||(6377731-6377916)
chr6 (26-200)||(34841056-34841230)
chr6 (26-200)||(8221751-8221925)
chr6 (26-200)||(24916931-24917105)
chr6 (26-200)||(18641834-18642008)
chr6 (13-174)||(29952327-29952489)
chr6 (26-188)||(24114707-24114869)
[»] chr4 (14 HSPs)
chr4 (13-200)||(2212584-2212771)
chr4 (13-200)||(46914778-46914965)
chr4 (13-200)||(53181732-53181919)
chr4 (26-200)||(3530577-3530751)
chr4 (26-200)||(3615566-3615740)
chr4 (26-200)||(8994333-8994507)
chr4 (26-200)||(13113111-13113285)
chr4 (13-182)||(36658099-36658268)
chr4 (26-200)||(16172169-16172343)
chr4 (27-200)||(33606632-33606805)
chr4 (13-200)||(34434838-34435025)
chr4 (26-200)||(28900568-28900742)
chr4 (26-200)||(28446824-28446998)
chr4 (26-200)||(36564743-36564916)
[»] chr3 (21 HSPs)
chr3 (13-200)||(17469061-17469248)
chr3 (13-200)||(25788009-25788196)
chr3 (13-198)||(25829966-25830151)
chr3 (13-200)||(42598664-42598851)
chr3 (13-200)||(47146918-47147105)
chr3 (13-200)||(33935822-33936009)
chr3 (26-200)||(6045650-6045824)
chr3 (26-200)||(30415778-30415952)
chr3 (26-200)||(42563557-42563731)
chr3 (26-200)||(10424974-10425148)
chr3 (13-200)||(51429519-51429694)
chr3 (26-200)||(26157417-26157591)
chr3 (26-200)||(43475038-43475212)
chr3 (27-200)||(33188387-33188560)
chr3 (13-200)||(50019643-50019818)
chr3 (6-198)||(30689122-30689315)
chr3 (26-200)||(4874420-4874594)
chr3 (67-200)||(4852727-4852860)
chr3 (13-191)||(21227770-21227948)
chr3 (150-200)||(33751209-33751259)
chr3 (90-191)||(21229898-21229999)
[»] chr2 (10 HSPs)
chr2 (13-200)||(9073221-9073408)
chr2 (13-200)||(30819918-30820105)
chr2 (13-198)||(12857526-12857711)
chr2 (13-200)||(8854644-8854831)
chr2 (22-200)||(5145682-5145860)
chr2 (26-200)||(7585851-7586025)
chr2 (13-198)||(31185544-31185729)
chr2 (22-200)||(31205267-31205446)
chr2 (13-200)||(4278714-4278901)
chr2 (57-139)||(2779425-2779507)
[»] chr1 (15 HSPs)
chr1 (13-200)||(31470833-31471020)
chr1 (13-200)||(45241685-45241872)
chr1 (13-200)||(17785890-17786077)
chr1 (26-200)||(2475441-2475615)
chr1 (26-200)||(48385497-48385671)
chr1 (26-200)||(47297866-47298040)
chr1 (26-200)||(17676628-17676802)
chr1 (26-200)||(33166834-33167008)
chr1 (26-200)||(38837005-38837179)
chr1 (13-200)||(51522887-51523074)
chr1 (26-179)||(8470899-8471051)
chr1 (34-187)||(18318078-18318231)
chr1 (26-200)||(48406975-48407137)
chr1 (128-200)||(10265804-10265876)
chr1 (118-174)||(45978665-45978721)
[»] chr8 (14 HSPs)
chr8 (14-200)||(35101042-35101228)
chr8 (13-200)||(13816684-13816871)
chr8 (13-200)||(5213430-5213617)
chr8 (14-181)||(26749200-26749367)
chr8 (26-200)||(1955601-1955775)
chr8 (26-200)||(15056194-15056368)
chr8 (26-200)||(38205538-38205712)
chr8 (26-200)||(30529944-30530118)
chr8 (22-200)||(17744217-17744395)
chr8 (13-95)||(5735767-5735849)
chr8 (129-200)||(1633962-1634033)
chr8 (136-190)||(27359720-27359774)
chr8 (136-190)||(27369077-27369131)
chr8 (17-55)||(27392271-27392309)
[»] chr7 (7 HSPs)
chr7 (13-198)||(22193863-22194048)
chr7 (26-200)||(36521076-36521250)
chr7 (28-200)||(22659494-22659666)
chr7 (26-200)||(32127561-32127735)
chr7 (26-200)||(26814712-26814886)
chr7 (26-119)||(40301220-40301313)
chr7 (22-129)||(1940162-1940268)
[»] scaffold1240 (1 HSPs)
scaffold1240 (13-200)||(17-204)
[»] chr5 (9 HSPs)
chr5 (13-174)||(31012330-31012491)
chr5 (13-200)||(4579654-4579829)
chr5 (26-200)||(32973672-32973846)
chr5 (26-200)||(27945201-27945375)
chr5 (26-200)||(40891371-40891545)
chr5 (26-200)||(30646179-30646353)
chr5 (26-200)||(29616839-29617013)
chr5 (128-200)||(34710648-34710720)
chr5 (13-60)||(21365263-21365310)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (26-200)||(105423-105597)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (26-186)||(110521-110681)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (57-191)||(166670-166804)
[»] scaffold0658 (1 HSPs)
scaffold0658 (136-192)||(6549-6605)
[»] scaffold1454 (1 HSPs)
scaffold1454 (26-57)||(1-32)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 9)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 200
Target Start/End: Original strand, 17958599 - 17958786
Alignment:
Q  13 cagagaggagaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgtttta 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17958599 cagagaggagaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgtttta 17958698  T
Q  113 attatatgagcaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17958699 attatatgagcaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 17958786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 13 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 634502 - 634317
Alignment:
Q  13 cagagaggagaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgtttta 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  634502 cagagaggagaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgtttta 634403  T
Q  113 attatatgagcaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgat 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  634402 attatatgagcaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgat 634317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 13 - 198
Target Start/End: Original strand, 6377731 - 6377916
Alignment:
Q  13 cagagaggagaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgtttta 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6377731 cagagaggagaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgtttta 6377830  T
Q  113 attatatgagcaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgat 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6377831 attatatgagcaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgat 6377916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 26 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 34841230 - 34841056
Alignment:
Q  26 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34841230 catattggggtaaaattgctgagtattgtaacgagcattgctcattcgattctccgcgcgatgtagttgcatgccgaaaccgttttaattatatgaacaa 34841131  T
Q  126 aataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34841130 attaataaataaatgggttggtgcttatgatagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 34841056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 26 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 8221925 - 8221751
Alignment:
Q  26 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8221925 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagaattgctcattcgattctccgcgcgatgtagttgcatgccgcaaccgttttaattatatgagcaa 8221826  T
Q  126 aataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8221825 attaataaataaatgggttggtgcttatgatggcgctaagcattttcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 8221751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 26 - 200
Target Start/End: Original strand, 24916931 - 24917105
Alignment:
Q  26 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| || ||| || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24916931 catattggggtaaaattgctgagtattgcaatgagcattgctcattcgatcctccgcgtgatataattgcttgccgaaaccattttaattatatgagcaa 24917030  T
Q  126 aataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24917031 agtaataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaaacgtttgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 24917105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 26 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 18642008 - 18641834
Alignment:
Q  26 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||| || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18642008 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagcattgctcattcgatcctccgcgtgatgtaattgcttgccgaaaccattttaattatatgagcaa 18641909  T
Q  126 aataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  18641908 agtaataaataaatggattggtgcttatgaaatcgctaagcgtttgcaaagaagcggttggttggaagatgatgt 18641834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 174
Target Start/End: Original strand, 29952327 - 29952489
Alignment:
Q  13 cagagaggagaaacatatt-ggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgtttt 111  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  29952327 cagagaggagaaacatattaggggtaaatttgctgagtattgtaatgaatattgctcatttaattatccccgcgatctagttgtatgccgaaaccgtttt 29952426  T
Q  112 aattatatgagcaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaa 174  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||    
T  29952427 aattatatgagcaaagtaataaataaatggattggtgcttatgaaaacattaagcgtttgcaa 29952489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 26 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 24114869 - 24114707
Alignment:
Q  26 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | | |||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24114869 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagcattactcattcgattctgcgctcgatgtaattgcatgccaaaaccgttttaattatatgagcaa 24114770  T
Q  126 aataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtc 188  Q
    ||||   |||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||| |||||||||| | ||||||    
T  24114769 aataccgaataaatggattggcgcttatgaaggtgctaaacgtttgcaaggaagtgcttggtc 24114707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 14)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 200
Target Start/End: Original strand, 2212584 - 2212771
Alignment:
Q  13 cagagaggagaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgtttta 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2212584 cagagaggagaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgtttta 2212683  T
Q  113 attatatgagcaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2212684 attatatgagcaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 2212771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 200
Target Start/End: Original strand, 46914778 - 46914965
Alignment:
Q  13 cagagaggagaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgtttta 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46914778 cagagaggagaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaactgtttta 46914877  T
Q  113 attatatgagcaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46914878 attatatgagcaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 46914965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 200
Target Start/End: Original strand, 53181732 - 53181919
Alignment:
Q  13 cagagaggagaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgtttta 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53181732 cagagaggagaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgtttta 53181831  T
Q  113 attatatgagcaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53181832 attatatgagcaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagtgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 53181919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 26 - 200
Target Start/End: Original strand, 3530577 - 3530751
Alignment:
Q  26 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3530577 catattggggtaaaattgctgagtattgtaacgagcattgctcattcgattctccgcgcgatgtagttgcatgccgaaaccgttttaattatatgaacaa 3530676  T
Q  126 aataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3530677 attaataaataaatgggttggtgcttatgatagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 3530751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 26 - 200
Target Start/End: Original strand, 3615566 - 3615740
Alignment:
Q  26 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3615566 catattggggtaaaattgctgagtattgtaacgagcattgctcattcgattctccgcgcgatgtagttgcatgccgaaaccgttttaattatatgaacaa 3615665  T
Q  126 aataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3615666 attaataaataaatgggttggtgcttatgatagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 3615740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 26 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 8994507 - 8994333
Alignment:
Q  26 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8994507 catattggggtaaaattgctgagtattgtaacgagcattgctcattcgattctccgcgcgatgtagttgcatgccgaaaccgttttaattatatgaacaa 8994408  T
Q  126 aataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8994407 attaataaataaatgggttggtgcttatgatagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 8994333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 26 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 13113285 - 13113111
Alignment:
Q  26 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13113285 catattggggtaaaattgctgagtattgtaacgagcattgctcattcgattctccgcgcgatgtagttgcatgccgaaaccgttttaattatatgaacaa 13113186  T
Q  126 aataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13113185 attaataaataaatgggttggtgcttatgatagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 13113111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 36658268 - 36658099
Alignment:
Q  13 cagagaggagaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgtttta 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  36658268 cagagaggaaaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtgttgctcatttgattctccccgggatctagttgcatgcagaaaccgtttta 36658169  T
Q  113 attatatgagcaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcgg 182  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  36658168 attatatgagcaaagtaataaataaatggattggtgcttatgaaagcgttaagcgtttgcaaggaagcgg 36658099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 200
Target Start/End: Original strand, 16172169 - 16172343
Alignment:
Q  26 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  16172169 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagcattgctcattcgattctccgcgcgatgtagttgcatgccgaaaccggtataataatatgagcaa 16172268  T
Q  126 aataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16172269 attaataaataaatgggttggtgcttatgatggcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 16172343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 27 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 33606805 - 33606632
Alignment:
Q  27 atattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaaa 126  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||| |||| || ||| || |||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  33606805 atattggggtaaaattgttgagtattgtaatgaacattactcattcgatcctccgcgtgatgtaattgcttgccgaaatcattttaattatatgagcaaa 33606706  T
Q  127 ataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33606705 gtaataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtttgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 33606632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 200
Target Start/End: Original strand, 34434838 - 34435025
Alignment:
Q  13 cagagaggagaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgtttta 112  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| || ||| || |||| ||||||||||||||||    
T  34434838 cagacaggtgaagcatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagcattgcaaattcgatcctccgcgtgatgtaattgcatgccgaaaccgtttta 34434937  T
Q  113 attatatgagcaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34434938 attatatgagcaaagtaataaataaatggattgatgtttatgaaagcgctaagcatttgcaaggaagcggttggttggaagatgatgt 34435025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 26 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 28900742 - 28900568
Alignment:
Q  26 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 125  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28900742 catattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagcattgctcattcgattctccgtgtgatgtagttgcatgccgaaaccattttaattatatgagcaa 28900643  T
Q  126 aataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    | ||||||||||||   |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28900642 attaataaataaatttgttggtgcttatgatggcgctaagcgtttgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 28900568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 26 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 28446998 - 28446824
Alignment:
Q  26 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 125  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || | | || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28446998 catattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagcattgctcattcgatcctccacgtggtgtaattgcatgcagaaaccgttttaattatatgagcaa 28446899  T
Q  126 aataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    |||| |  ||||||||||||  ||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  28446898 aatactgtataaatggattgacgcttatgaaggcgctaagagtttgcaaggaagtggttggtcggaggctgatgt 28446824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 200
Target Start/End: Original strand, 36564743 - 36564916
Alignment:
Q  26 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 125  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||| |||||| ||| ||||||| |||  |  ||| |||  ||| | ||  || || |||| |||    
T  36564743 catattggggtaaaattgttgattattgtaatgatcatt-ctcatttgatcctccccgtgatgcatctgcgtgcaaaaatcattacaactacatgaacaa 36564841  T
Q  126 aataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    |||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||  |||||| ||||||||  |||||||    
T  36564842 aatacttaataaatggattggcgcttatgatagcgctaaacgtatgcaacaaagcgggtggtcggagaatgatgt 36564916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 21)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 17469248 - 17469061
Alignment:
Q  13 cagagaggagaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgtttta 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17469248 cagagaggagaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgtttta 17469149  T
Q  113 attatatgagcaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17469148 attatatgagcaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 17469061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 200
Target Start/End: Original strand, 25788009 - 25788196
Alignment:
Q  13 cagagaggagaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgtttta 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25788009 cagagaggagaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgtttta 25788108  T
Q  113 attatatgagcaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25788109 attatatgagcaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 25788196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 13 - 198
Target Start/End: Original strand, 25829966 - 25830151
Alignment:
Q  13 cagagaggagaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgtttta 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25829966 cagagaggagaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgtttta 25830065  T
Q  113 attatatgagcaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgat 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25830066 attatatgagcaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgat 25830151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 200
Target Start/End: Original strand, 42598664 - 42598851
Alignment:
Q  13 cagagaggagaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgtttta 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42598664 cagagaggagaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgctgaaaccgtttta 42598763  T
Q  113 attatatgagcaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42598764 attatatgagcaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 42598851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 47147105 - 47146918
Alignment:
Q  13 cagagaggagaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgtttta 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47147105 cagagaggagaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtatagctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgtttta 47147006  T
Q  113 attatatgagcaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47147005 attatatgagcaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 47146918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 33936009 - 33935822
Alignment:
Q  13 cagagaggagaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgtttta 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33936009 cagagaggagaaacatattagggtaaaattgttgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcatgccgaaaccgtttta 33935910  T
Q  113 attatatgagcaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33935909 attatatgagcaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtttgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 33935822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 26 - 200
Target Start/End: Original strand, 6045650 - 6045824
Alignment:
Q  26 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6045650 catattggggtaaaattgctgagtattgtaacgagcattgctcattcgattctccgcgcgatgtagttgcatgccgaaaccgttttaattatatgaacaa 6045749  T
Q  126 aataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6045750 attaataaataaatgggttggtgcttatgatagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 6045824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 26 - 200
Target Start/End: Original strand, 30415778 - 30415952
Alignment:
Q  26 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30415778 catattggggtaaaattgctgagtattgtaacgagcattgctcattcgattctccgcgcgatgtagttgcatgccgaaaccgttttaattatatgaacaa 30415877  T
Q  126 aataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30415878 attaataaataaatgggttggtgcttatgatagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 30415952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 26 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 42563731 - 42563557
Alignment:
Q  26 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42563731 catattggggtaaaattgctgagtattgtaacgagcattgctcattcgattctccgcgcgatgtagttgcatgccgaaaccgttttaattatatgaacaa 42563632  T
Q  126 aataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42563631 attaataaataaatgggttggtgcttatgatagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 42563557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 26 - 200
Target Start/End: Original strand, 10424974 - 10425148
Alignment:
Q  26 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10424974 catattggggtaaaattgctgagtattgtaacgagcattgctcattcgattctccgcgcgatgtagttgcatgccgaaaccgttttaattatatgaacaa 10425073  T
Q  126 aataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10425074 attaataaataaatgggttggtgcttatgatagcgctaagcatatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 10425148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 51429694 - 51429519
Alignment:
Q  13 cagagaggagaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgtttta 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51429694 cagagaggagaaacatattggggtaaaattgctgagtattg------------ctcattcgattctccacgcgatctagttgcctgccgaaaccgtttta 51429607  T
Q  113 attatatgagcaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51429606 attatatgaacaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaaaatgatgt 51429519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 200
Target Start/End: Original strand, 26157417 - 26157591
Alignment:
Q  26 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| || ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26157417 catattggggtaaaattgctgagtattgcaatgagcattgctcattcgatcctccgcgtgatataattgcttgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 26157516  T
Q  126 aataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26157517 agtaataaataaatggattggtgcttatgaaagtgctaagcgtctgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 26157591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 43475212 - 43475038
Alignment:
Q  26 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43475212 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagcattgctcattcgattctccgcgcgatgtagttgcatgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 43475113  T
Q  126 aataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43475112 attaataaataaatgggttggtgcttatgatggcactaagcgtttgcaaggaagcggttggtcggaaaatgatgt 43475038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 27 - 200
Target Start/End: Original strand, 33188387 - 33188560
Alignment:
Q  27 atattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaaa 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33188387 atattggggtaaaattgctgagtattgtaatgaacattgctaattcgattctccgcgcgatgcagttgcatgccgaaaccgttttaattatatgagcaaa 33188486  T
Q  127 ataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33188487 ttaataaataaatgggttggtgcttatgatggcgctaagcgtttgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 33188560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 50019818 - 50019643
Alignment:
Q  13 cagagaggagaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgtttta 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||            |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50019818 cagagaggagaaacatattggggtaaaattgctaagtattg------------ctcattcgattctccccgcgatctagttgcatgccgaaaccgtttta 50019731  T
Q  113 attatatgagcaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50019730 attatatgaacaaagtaataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtttgcaaggaagcggttggtctgaagatgatgt 50019643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 198
Target Start/End: Original strand, 30689122 - 30689315
Alignment:
Q  6 ggagaagc-agagaggagaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaa 104  Q
    |||||||| |||| || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  30689122 ggagaagctagaggggtgaaatatattggggtgaaattgctgagtattgtaatgagtatggctcatttgattctccgcgggatctagttgcatgccgaaa 30689221  T
Q  105 ccgttttaattatatgagcaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgat 198  Q
     | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30689222 tcattttaattatataagcaaagtaataaataaatggattggtgcttatgatgccgctaagcgtttgcaaggaagtggttggtcggaagatgat 30689315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 26 - 200
Target Start/End: Original strand, 4874420 - 4874594
Alignment:
Q  26 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 125  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4874420 catattgggttaaaattgttgagtattgtaatgagcatcgctcattcgattctccgcgcgactcagttgcatgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 4874519  T
Q  126 aataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4874520 attaataaataaatgggttggtgcttatgatggtgctaagcgtttgcaaggaagcggttggtcgaaagatgatgt 4874594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 67 - 200
Target Start/End: Original strand, 4852727 - 4852860
Alignment:
Q  67 tcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagc 166  Q
    |||||||||||||| |||||   || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||    
T  4852727 tcattcgattctccgcgcgactcaggtgcatgccgaaaccgttttaattatatgagcaaattaataaataaatgggttggtgcttatgatggtgctaagc 4852826  T
Q  167 gtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4852827 gtttgcaaggaagcggttggtcgaaagatgatgt 4852860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 21227948 - 21227770
Alignment:
Q  13 cagagaggagaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgtttta 112  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||| | ||||  |||||| || |||||||||| ||    
T  21227948 cagaaaggtgaaacatattggggtagaattgttgattattgtaatgagaattgctcatttgatcctccgcacgatggagttgcatgtcgaaaccgttata 21227849  T
Q  113 attatatgagcaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcgga 191  Q
    ||||||||| ||||||| ||  |||||||||||| |||||||| |||  ||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  21227848 attatatgaacaaaatactaggtaaatggattggcgcttatgatagcattaatcgttttcaaggaagcggttggtcgga 21227770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 33751259 - 33751209
Alignment:
Q  150 ttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33751259 ttatgaaagcgctaagcgtttgcaaggaagcggttggtcagaagatgatgt 33751209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 191
Target Start/End: Original strand, 21229898 - 21229999
Alignment:
Q  90 agttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcg 189  Q
    |||||| || |||||| ||| ||||||||||| ||||||| |   |||||||||||| |||||||| || |||| || | |||||| |||| ||||||||    
T  21229898 agttgcatgtcgaaactgttataattatatgaacaaaatactgggtaaatggattggcgcttatgatagtgctatgcatttgcaagcaagcagttggtcg 21229997  T
Q  190 ga 191  Q
    ||    
T  21229998 ga 21229999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 10)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 200
Target Start/End: Original strand, 9073221 - 9073408
Alignment:
Q  13 cagagaggagaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgtttta 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9073221 cagagaggagaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgtttta 9073320  T
Q  113 attatatgagcaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9073321 attatatgagcaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 9073408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 200
Target Start/End: Original strand, 30819918 - 30820105
Alignment:
Q  13 cagagaggagaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgtttta 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30819918 cagagaggagaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgtttta 30820017  T
Q  113 attatatgagcaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30820018 attatatgagcaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 30820105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 13 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 12857711 - 12857526
Alignment:
Q  13 cagagaggagaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgtttta 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12857711 cagagaggagaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgtttta 12857612  T
Q  113 attatatgagcaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgat 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12857611 attatatgagcaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgat 12857526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 8854831 - 8854644
Alignment:
Q  13 cagagaggagaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgtttta 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8854831 cagagaggagaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgtttta 8854732  T
Q  113 attatatgagcaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8854731 attatatgagtaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 8854644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 22 - 200
Target Start/End: Original strand, 5145682 - 5145860
Alignment:
Q  22 gaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatga 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| || ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5145682 gaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagcattgctcatttgatcctccgcgtgatgtaattgcttgccgaaaccgttttaattatatga 5145781  T
Q  122 gcaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5145782 gcaaagtaataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtttgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 5145860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 26 - 200
Target Start/End: Original strand, 7585851 - 7586025
Alignment:
Q  26 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7585851 catattggggtaaaattgctgagtattgtaacgagcattgctcattcgattctccgcgcgatgtagttgcatgccgaaaccgttttaattatatgaacaa 7585950  T
Q  126 aataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7585951 attaataaataaatgggttggtgcttatgatagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 7586025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 198
Target Start/End: Original strand, 31185544 - 31185729
Alignment:
Q  13 cagagaggagaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgtttta 112  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  31185544 cagaggggtgaaacatattggggtaaaattgatgagtattgtattgagtatggctcatttgattctccgcgggatctagttgcatgccaaaaccgtttta 31185643  T
Q  113 attatatgagcaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgat 198  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31185644 attatatgagcaaagtaataaataaatggattagtgcttatgatgccgctaagcgtttgcaaggaagcggttggtcggaagatgat 31185729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 200
Target Start/End: Original strand, 31205267 - 31205446
Alignment:
Q  22 gaaacatattggggtaaaattgctgagtattg-taatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatg 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  31205267 gaaacatattggggtaaaattgatgagtattggtaatgagtacggctcatttgattctccgcgggatctagttgcatgccgaaactgttttaattatatg 31205366  T
Q  121 agcaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31205367 agcaaagtaataaataaatggattagtgcttatgatgccgctaagcgtttgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 31205446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 4278901 - 4278714
Alignment:
Q  13 cagagaggagaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgtttta 112  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || | || ||| || |||| ||||||||||||||||    
T  4278901 cagacaggtgaagcatattggggtaaaattgttgagtattgtaatgagcattgctcattcgatccttcgcgtgatgtaattgcatgccgaaaccgtttta 4278802  T
Q  113 attatatgagcaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||  ||| ||||||||||| | ||||||    
T  4278801 attatatgagcaaagtactaaataaatggattggcgcttatgatggcgctaagcgtttgcaaataagtggttggtcggaggctgatgt 4278714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 57 - 139
Target Start/End: Original strand, 2779425 - 2779507
Alignment:
Q  57 tgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaaaataataaataaat 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2779425 tgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcatgccgaaaccgttttaattatatgagcaaagtaataaataaat 2779507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 15)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 31471020 - 31470833
Alignment:
Q  13 cagagaggagaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgtttta 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31471020 cagagaggagaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgtttta 31470921  T
Q  113 attatatgagcaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31470920 attatatgagcaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 31470833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 45241872 - 45241685
Alignment:
Q  13 cagagaggagaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgtttta 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45241872 cagagaggagaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgtttta 45241773  T
Q  113 attatatgagcaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45241772 attatatgagcaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 45241685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 17786077 - 17785890
Alignment:
Q  13 cagagaggagaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgtttta 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  17786077 cagagaggagaaacaaattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattatccccgcgatctagttgcatgccgaaatcgtttta 17785978  T
Q  113 attatatgagcaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17785977 attatatgagcaaagtaataaataaatggattggtgcttatgaaagcactaagcgtttgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 17785890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 26 - 200
Target Start/End: Original strand, 2475441 - 2475615
Alignment:
Q  26 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2475441 catattggggtaaaattgctgagtattgtaacgagcattgctcattcgattctccgcgcgatgtagttgcatgccgaaaccgttttaattatatgaacaa 2475540  T
Q  126 aataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2475541 attaataaataaatgggttggtgcttatgatagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 2475615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 26 - 200
Target Start/End: Original strand, 48385497 - 48385671
Alignment:
Q  26 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  48385497 catattggggtaaaattgctgagtattgtaacgagcattgctcattcgattctccgcgcgatgtagttgcatgccgaaaccgttttaattatatgaacaa 48385596  T
Q  126 aataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48385597 attaataaataaatgggttggtgcttatgatagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 48385671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 26 - 200
Target Start/End: Original strand, 47297866 - 47298040
Alignment:
Q  26 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 125  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47297866 catattggggtaaagttgctgagtattgtaatgagcattgctcattcgattctccacgcgatgtagttgcatgccgaaactgttttaattatatgagcaa 47297965  T
Q  126 aataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47297966 attaataaataaatggattggtgcttatgatggcgctaagcgtttgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 47298040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 26 - 200
Target Start/End: Original strand, 17676628 - 17676802
Alignment:
Q  26 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17676628 catattggggtaaaattgctgagtattataatgagcattgctcattcgattctccgcgcgatgcagttgcatgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 17676727  T
Q  126 aataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17676728 attaataaataaatgggttggtgcttatgatggcactaagcgtttgcaaggaagcagttggtcggaagatgatgt 17676802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 26 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 33167008 - 33166834
Alignment:
Q  26 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||| || |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  33167008 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgatcctctgcgtgatgtaattgcttgccgaaaccgttttagttatatgtgcaa 33166909  T
Q  126 aataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    | |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33166908 agtaataaataattggattgatgcttatgaaatcgctaagcgtttgcaaggaagcggttggtaggaagatgatgt 33166834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 26 - 200
Target Start/End: Original strand, 38837005 - 38837179
Alignment:
Q  26 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 125  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38837005 catattggtgtaaaattgctgagtattgtaatgagcattgctcattcaattctccgcgcgatgcagctgcatgccaaaaccgttttaattatatgagcaa 38837104  T
Q  126 aataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  38837105 attaataaataaatgggttggtgcttatgatggcgctaagcgtttgcaaggaagcggttcgtcagaagatgatgt 38837179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 51523074 - 51522887
Alignment:
Q  13 cagagaggagaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgtttta 112  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||| |||| || ||| || |||| ||||||||||||||||    
T  51523074 cagacaggtgaagcatattggggtaaaattgatgagtattgtaatgatcattgcttattcgatcctccgcgtgatgtaattgcatgccgaaaccgtttta 51522975  T
Q  113 attatatgagcaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  51522974 tttatatgagcaaaatactaaataaatggattggcgtttatgaaggcgctaagcgtttgcaaggaagtggttggtcggaggctgatgt 51522887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 26 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 8471051 - 8470899
Alignment:
Q  26 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 125  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8471051 catatttgggtataattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccgcgcgaagtagttgcatgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 8470952  T
Q  126 aataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaag 179  Q
    | |||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||    
T  8470951 attaataaataaatgggtt-gtgcttaagatggcgctaagcgtttgcaaggaag 8470899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 34 - 187
Target Start/End: Original strand, 18318078 - 18318231
Alignment:
Q  34 ggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaaaataataa 133  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  18318078 ggtaaaattgttaagtattgtaatgagcattgctcattcgattctccgcgcgatgtaattgcatgccgaaactgttttaattatatgagcaaaatactaa 18318177  T
Q  134 ataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggt 187  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  18318178 ataaatggattgacgcttatgaaggcgctaagcgtttgcaaggaagtggttggt 18318231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 26 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 48407137 - 48406975
Alignment:
Q  26 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 125  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  48407137 catattggggtaaaattgttgagtattgtaacgagcattgctcattcgattctccgcgcaatgtagttgcatgccgaaaccgttttaattatatgaacaa 48407038  T
Q  126 aataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    | |||||||||||||| |||||            ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48407037 attaataaataaatgggttggt------------gctaagcgtatgcaaagaagcggttggtcggaagatgatgt 48406975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 200
Target Start/End: Original strand, 10265804 - 10265876
Alignment:
Q  128 taataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10265804 taataaataaatgggttggtgcttatgatggcgctaagcgtttgcaaggaagcggttggtcagaagatgatgt 10265876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 45978721 - 45978665
Alignment:
Q  118 atgagcaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaa 174  Q
    |||| ||||||| | |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||    
T  45978721 atgaacaaaatacttaataaatggattgacgcttatgacggcgctaagcgtatgcaa 45978665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 14)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 35101228 - 35101042
Alignment:
Q  14 agagaggagaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35101228 agagaggagaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaa 35101129  T
Q  114 ttatatgagcaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35101128 ttatatgagcaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 35101042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 13816871 - 13816684
Alignment:
Q  13 cagagaggagaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgtttta 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13816871 cagagaggagaaacatatttgggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcatgccgaaaccgtttta 13816772  T
Q  113 attatatgagcaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13816771 attatatgagcaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgaatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 13816684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 5213617 - 5213430
Alignment:
Q  13 cagagaggagaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgtttta 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5213617 cagagaggagaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgtttta 5213518  T
Q  113 attatatgagcaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  5213517 attatacgagcaaaataataaataaatggattggggcttatgaaagcgctaagcgtatgcaagtaagcggttggtcggaaaatgatgt 5213430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 181
Target Start/End: Original strand, 26749200 - 26749367
Alignment:
Q  14 agagaggagaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaa 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26749200 agagaggagaaacatattggtgtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcatgccgaaaccgttttaa 26749299  T
Q  114 ttatatgagcaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcg 181  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  26749300 ttatatgagcaaagtaataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaaacgtttgcaaggaagcg 26749367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 26 - 200
Target Start/End: Original strand, 1955601 - 1955775
Alignment:
Q  26 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1955601 catattggggtaaaattgctgagtattgtaacgagcattgctcattcgattctccgcgcgatgtagttgcatgccgaaaccgttttaattatatgaacaa 1955700  T
Q  126 aataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1955701 attaataaataaatgggttggtgcttatgatagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 1955775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 26 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 15056368 - 15056194
Alignment:
Q  26 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 125  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15056368 catattggggtaaaattgttgagtattgtaacgagcattgctcattcgattctccgcgcgatgtagttgcatgccgaaaccgttttaattatatgaacaa 15056269  T
Q  126 aataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15056268 attaataaataaatgggttggtgcttatgatagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 15056194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 26 - 200
Target Start/End: Original strand, 38205538 - 38205712
Alignment:
Q  26 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38205538 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagcattgctcattcgatcctccgcgtgatgtaattgcttgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 38205637  T
Q  126 aataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38205638 agtaataaataaatggattggtgcttatgaaaaagctaagcgtttgcaaggaagcggttgatcggaagatgatgt 38205712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 26 - 200
Target Start/End: Original strand, 30529944 - 30530118
Alignment:
Q  26 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30529944 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagcattgctcattcgatcctccgcgtgatgtaattgcttgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 30530043  T
Q  126 aataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  30530044 agtaataaatgaatggattggtgcttatgaaaacgccaagcgtttgcaaggaaacggtaagtcggaagatgatgt 30530118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 17744395 - 17744217
Alignment:
Q  22 gaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatga 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |  ||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||    
T  17744395 gaaacatattagggtaaaattgctgagtattgtaatgagtatggctcatttgattctccactggatctagttgcatgccagaactgttttaattatatga 17744296  T
Q  122 gcaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  17744295 gcaaagtaataaataaatgggttggtgcttatgatgtcgctaagcgtttgcaagaaagtggttggtcggaagatgatgt 17744217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 5735849 - 5735767
Alignment:
Q  13 cagagaggagaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgc 95  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  5735849 cagaggggagaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcatttgattctccccgcgatcaagttgc 5735767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 129 - 200
Target Start/End: Original strand, 1633962 - 1634033
Alignment:
Q  129 aataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1633962 aataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagtgtttgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 1634033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 136 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 27359774 - 27359720
Alignment:
Q  136 aaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcgg 190  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  27359774 aaatggattggtgcttataaaggcgctaagcgtttacaaggaagcgattggtcgg 27359720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 136 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 27369131 - 27369077
Alignment:
Q  136 aaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcgg 190  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  27369131 aaatggattggtgcttataaaggcgctaagcgtttacaaggaagcgattggtcgg 27369077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 27392309 - 27392271
Alignment:
Q  17 gaggagaaacatattggggtaaaattgctgagtattgta 55  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27392309 gaggtgaaacatattggggtaaaattgctgagtattgta 27392271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 7)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 13 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 22194048 - 22193863
Alignment:
Q  13 cagagaggagaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgtttta 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22194048 cagagaggagaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgtttta 22193949  T
Q  113 attatatgagcaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgat 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22193948 attatatgagcaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgat 22193863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 26 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 36521250 - 36521076
Alignment:
Q  26 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36521250 catattggggtaaaattgctgagtattgtaacgagcattgctcattcgattctccgcgcgatgtagttgcatgccgaaaccgttttaattatatgaacaa 36521151  T
Q  126 aataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36521150 attaataaataaatgggttggtgcttatgatagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 36521076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 28 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 22659666 - 22659494
Alignment:
Q  28 tattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaaaa 127  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22659666 tattggggtaaaattgttgagtattttaatgagcattgctcattcgattctccgcgcgatgtagttgcatgccgaaaccgttttaattatatgagcaaat 22659567  T
Q  128 taataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22659566 taataaataaatgggttggtgcttatgatggcgttaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 22659494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 26 - 200
Target Start/End: Original strand, 32127561 - 32127735
Alignment:
Q  26 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| || ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32127561 catattggggtaaaattgctgagtattgcaatgagcattgctcattcgatcctccgcgtgatataattgcttgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 32127660  T
Q  126 aataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32127661 agtaataaataaatggattggtgcttatgaaagtgttaagcgtttgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 32127735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 26 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 26814886 - 26814712
Alignment:
Q  26 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 125  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||  |||| || ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26814886 catattggggtaaaattgctaagtattgcaatgagcattgctcattcgaccctccgcgtgatataattgcttgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 26814787  T
Q  126 aataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26814786 agtaataaataaatggattgatgcttatgaaagtgctaagcgtttgcaaggaaacggttggtcggaagatgatgt 26814712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 119
Target Start/End: Original strand, 40301220 - 40301313
Alignment:
Q  26 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  40301220 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagcattgctcattcgattctccgtgcgatgtagttgcatgccgaaaccattttaattatat 40301313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 129
Target Start/End: Original strand, 1940162 - 1940268
Alignment:
Q  22 gaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatga 121  Q
    ||||||||||| |||| ||||| ||||| | |||||||| |||  ||||||||| |||| ||||||  |||||  || |||||||||||||||||||||     
T  1940162 gaaacatattgaggtagaattgttgagtgt-gtaatgagcatttatcattcgatcctccgcgcgatgaagttgaatgtcgaaaccgttttaattatatgt 1940260  T
Q  122 gcaaaata 129  Q
     |||||||    
T  1940261 acaaaata 1940268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1240 (Bit Score: 168; Significance: 3e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold1240
Description:

Target: scaffold1240; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 200
Target Start/End: Original strand, 17 - 204
Alignment:
Q  13 cagagaggagaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgtttta 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17 cagagaggagaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctctccgcgatctagttgcatgccgaaaccgtttta 116  T
Q  113 attatatgagcaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  117 attatatgagcaaagtaataaataaatggattggtgcttatgaaagcactaagcgtttgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 9)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 174
Target Start/End: Original strand, 31012330 - 31012491
Alignment:
Q  13 cagagaggagaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgtttta 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31012330 cagagaggagaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgtttta 31012429  T
Q  113 attatatgagcaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaa 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31012430 attatatgagcaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaa 31012491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 4579829 - 4579654
Alignment:
Q  13 cagagaggagaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgtttta 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4579829 cagagaggagaaacatattggggtaaaattgctgagtattgt------------tcattcgattctccccgcgatctagttgtctgccgaaaccgtttta 4579742  T
Q  113 attatatgagcaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4579741 attatatgagcaaaataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 4579654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 26 - 200
Target Start/End: Original strand, 32973672 - 32973846
Alignment:
Q  26 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32973672 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagcattgctcattcgattctccgcgcgatatagttgcatgccgaaaccgttttaattatatgaacaa 32973771  T
Q  126 aataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32973772 attaataaataaatgggttggtgcttatgatagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 32973846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 26 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 27945375 - 27945201
Alignment:
Q  26 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27945375 catattggggtaaaattgctgagtattgtaacgagcattgctcattcgattctccgcgcgatgtagttgcatgccgaaaccgttttaattatatgaacaa 27945276  T
Q  126 aataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27945275 attaataaataaatgggttggtgcttatgatagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 27945201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 26 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 40891545 - 40891371
Alignment:
Q  26 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40891545 catattggggtaaaattgctgagtattgtaacgagcattgctcattcgattctccgcgcgatgtagttgcatgccgaaaccgttttaattatatgaacaa 40891446  T
Q  126 aataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40891445 attaataaataaatgggttggtgcttatgatagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 40891371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 26 - 200
Target Start/End: Original strand, 30646179 - 30646353
Alignment:
Q  26 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30646179 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagcattgctcattcgattctccgctcgatgtagttgcatgccgaaactgttttaattatatgagcaa 30646278  T
Q  126 aataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    |  ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30646279 atgaataaataaatgggttggtgcttatgatggcgctaagcgtttgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 30646353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 26 - 200
Target Start/End: Original strand, 29616839 - 29617013
Alignment:
Q  26 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 125  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29616839 catatttgggtaaaattcctgagtattgtaacgagcattgatcattcgattctccgtgcgatgtagttgcatgccgaaaccgttttaattatatgaacaa 29616938  T
Q  126 aataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29616939 attaataaataaatgggttggtgcttatgatagcgctaagcgtatgcaaggaagcggtttgtcggaagatgatgt 29617013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 128 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 34710720 - 34710648
Alignment:
Q  128 taataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34710720 taataaataaatggattggtgcttatgaaagtgctaagcgtttgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 34710648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 21365310 - 21365263
Alignment:
Q  13 cagagaggagaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgag 60  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21365310 cagataggtgaaacatattggggtaaaattgctgagtattgtaatgag 21365263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 105597 - 105423
Alignment:
Q  26 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| || ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  105597 catattggggtaaaattgctgagtattgcaatgagcattgctcattcgatcctccgcgtgatataattgcttgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 105498  T
Q  126 aataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  105497 agtaataaataaatggattggtgcttatgaaagtgctaagcgtttgcaaggaagcggttggtcggaagatgatgt 105423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 26 - 186
Target Start/End: Original strand, 110521 - 110681
Alignment:
Q  26 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  110521 catattggggtaaaattgctgagtattgtaatgagcattgctcattcgatcctccgcgtgatgtaattgcttgccgaaaccgttttaattatatgagcaa 110620  T
Q  126 aataataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttgg 186  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  110621 agtaataaataaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcttttgcaaggaagcggttgg 110681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 67; Significance: 6e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 57 - 191
Target Start/End: Original strand, 166670 - 166804
Alignment:
Q  57 tgagtattgctcattcgattctccccgcgatctagttgcctgccgaaaccgttttaattatatgagcaaaataataaataaatggattggtgcttatgaa 156  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||| ||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||   |||||||||||| ||||||||     
T  166670 tgagtattgttcatttgatcctccgcgcgatggagttgcatgccgaaaccgttataattatatgaactgaataatgggtaaatggattggcgcttatgat 166769  T
Q  157 agcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcgga 191  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  166770 agcgctaagcgtttgcaaggaagcggttggtcgga 166804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0658 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0658
Description:

Target: scaffold0658; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 192
Target Start/End: Original strand, 6549 - 6605
Alignment:
Q  136 aaatggattggtgcttatgaaagcgctaagcgtatgcaaggaagcggttggtcggaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||| |||||| ||||||    
T  6549 aaatggattggtgcttatgaaggcgctaagcttttgcaatgaaacggttgatcggaa 6605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1454 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1454
Description:

Target: scaffold1454; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 32 - 1
Alignment:
Q  26 catattggggtaaaattgctgagtattgtaat 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32 catattggggtaaaattgctgagtattgtaat 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University