View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8846_low_2 (Length: 514)

Name: NF8846_low_2
Description: NF8846
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8846_low_2
NF8846_low_2
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (6-496)||(111553-112044)
[»] chr4 (12 HSPs)
chr4 (6-496)||(16629325-16629816)
chr4 (35-496)||(17828312-17828763)
chr4 (35-496)||(17837703-17838154)
chr4 (6-496)||(7846527-7847020)
chr4 (6-496)||(16210947-16211437)
chr4 (6-473)||(44888572-44889023)
chr4 (35-473)||(53946092-53946528)
chr4 (12-454)||(16396756-16397199)
chr4 (46-454)||(2829395-2829790)
chr4 (380-455)||(1293213-1293288)
chr4 (381-454)||(9836197-9836269)
chr4 (410-455)||(14600870-14600914)
[»] chr2 (17 HSPs)
chr2 (6-496)||(45190629-45191120)
chr2 (11-456)||(37862800-37863245)
chr2 (6-496)||(574052-574548)
chr2 (6-496)||(12570378-12570868)
chr2 (5-496)||(22687448-22687935)
chr2 (6-473)||(3605701-3606161)
chr2 (252-496)||(16934310-16934554)
chr2 (252-496)||(17004970-17005214)
chr2 (101-256)||(16902674-16902829)
chr2 (101-256)||(16996065-16996220)
chr2 (421-496)||(24942719-24942794)
chr2 (12-80)||(69861-69928)
chr2 (380-455)||(24239168-24239243)
chr2 (35-68)||(16902641-16902674)
chr2 (35-68)||(16996032-16996065)
chr2 (28-117)||(21109457-21109545)
chr2 (229-272)||(70068-70109)
[»] chr7 (11 HSPs)
chr7 (35-496)||(27988307-27988769)
chr7 (6-496)||(24540599-24541090)
chr7 (11-496)||(19585568-19586053)
chr7 (6-496)||(45552989-45553485)
chr7 (6-454)||(10415538-10415983)
chr7 (6-216)||(12491404-12491613)
chr7 (28-272)||(12515153-12515399)
chr7 (6-117)||(9007108-9007218)
chr7 (351-455)||(12769954-12770058)
chr7 (229-286)||(12770143-12770200)
chr7 (229-272)||(9006955-9006996)
[»] chr3 (10 HSPs)
chr3 (6-496)||(20744843-20745333)
chr3 (35-496)||(2489368-2489829)
chr3 (35-496)||(13119767-13120228)
chr3 (6-496)||(19828012-19828501)
chr3 (35-496)||(4782770-4783238)
chr3 (6-393)||(20292931-20293316)
chr3 (11-473)||(51978540-51979000)
chr3 (6-496)||(12376344-12376834)
chr3 (247-473)||(13112867-13113093)
chr3 (349-473)||(18560802-18560926)
[»] chr6 (16 HSPs)
chr6 (6-496)||(24505178-24505668)
chr6 (35-496)||(26020910-26021372)
chr6 (34-496)||(1596248-1596710)
chr6 (6-496)||(16321102-16321591)
chr6 (6-496)||(16333250-16333739)
chr6 (6-496)||(18712051-18712540)
chr6 (12-473)||(26168184-26168656)
chr6 (6-496)||(790997-791488)
chr6 (21-473)||(17823929-17824366)
chr6 (318-496)||(26161699-26161877)
chr6 (6-185)||(18706116-18706295)
chr6 (83-473)||(30657981-30658377)
chr6 (246-454)||(16923424-16923634)
chr6 (381-454)||(27787698-27787770)
chr6 (6-60)||(30657931-30657984)
chr6 (35-90)||(18201430-18201486)
[»] chr5 (26 HSPs)
chr5 (6-496)||(27274154-27274644)
chr5 (6-496)||(31916604-31917095)
chr5 (6-496)||(37298787-37299278)
chr5 (6-470)||(34130462-34130927)
chr5 (35-496)||(37548609-37549068)
chr5 (6-473)||(4037952-4038420)
chr5 (34-496)||(18209806-18210275)
chr5 (34-496)||(18219144-18219613)
chr5 (34-496)||(21681435-21681902)
chr5 (6-496)||(22173225-22173713)
chr5 (34-496)||(19888353-19888817)
chr5 (6-496)||(13571653-13572143)
chr5 (35-496)||(30943798-30944249)
chr5 (6-496)||(37817392-37817881)
chr5 (35-496)||(30953220-30953671)
chr5 (13-496)||(20764151-20764630)
chr5 (13-496)||(42090498-42090980)
chr5 (35-272)||(37648003-37648239)
chr5 (5-454)||(205451-205898)
chr5 (269-496)||(37651640-37651866)
chr5 (18-473)||(20896769-20897220)
chr5 (6-456)||(20904508-20904955)
chr5 (6-92)||(19780782-19780867)
chr5 (6-117)||(21483780-21483890)
chr5 (381-454)||(31105271-31105343)
chr5 (381-455)||(21484164-21484238)
[»] scaffold0553 (1 HSPs)
scaffold0553 (6-496)||(628-1119)
[»] chr8 (13 HSPs)
chr8 (35-496)||(13674046-13674508)
chr8 (6-494)||(33773907-33774396)
chr8 (6-496)||(14881464-14881954)
chr8 (6-496)||(14893814-14894304)
chr8 (6-496)||(20531098-20531586)
chr8 (6-496)||(31999019-31999507)
chr8 (6-297)||(31991429-31991721)
chr8 (11-496)||(5759198-5759677)
chr8 (11-473)||(23014788-23015245)
chr8 (6-473)||(11430446-11430900)
chr8 (12-117)||(31224485-31224589)
chr8 (11-122)||(2690042-2690152)
chr8 (381-454)||(7757622-7757694)
[»] scaffold0433 (1 HSPs)
scaffold0433 (35-496)||(13240-13703)
[»] chr1 (21 HSPs)
chr1 (5-485)||(20317819-20318300)
chr1 (6-496)||(27065881-27066372)
chr1 (6-473)||(20308685-20309152)
chr1 (56-496)||(26193266-26193707)
chr1 (6-473)||(22960708-22961172)
chr1 (6-473)||(49333163-49333628)
chr1 (30-473)||(25823254-25823693)
chr1 (6-473)||(37011820-37012274)
chr1 (18-238)||(20314482-20314702)
chr1 (6-481)||(18096712-18097184)
chr1 (6-431)||(25039191-25039617)
chr1 (289-485)||(20328428-20328624)
chr1 (52-454)||(41543915-41544312)
chr1 (6-321)||(4950499-4950808)
chr1 (12-486)||(21821220-21821690)
chr1 (6-134)||(20328302-20328430)
chr1 (370-485)||(20314357-20314472)
chr1 (52-183)||(19748364-19748495)
chr1 (6-102)||(25044403-25044499)
chr1 (6-108)||(21792925-21793026)
chr1 (237-473)||(21782530-21782768)
[»] scaffold0014 (4 HSPs)
scaffold0014 (5-495)||(146486-146975)
scaffold0014 (93-496)||(153389-153778)
scaffold0014 (233-496)||(114513-114776)
scaffold0014 (13-177)||(114326-114489)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (11-473)||(18576-19037)
[»] scaffold0706 (3 HSPs)
scaffold0706 (6-425)||(1745-2165)
scaffold0706 (421-496)||(4104-4179)
scaffold0706 (421-496)||(4317-4392)
[»] scaffold0058 (4 HSPs)
scaffold0058 (6-327)||(29070-29392)
scaffold0058 (337-473)||(23923-24059)
scaffold0058 (368-426)||(41273-41331)
scaffold0058 (172-205)||(55415-55448)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (6-240)||(23211-23445)
scaffold0122 (450-496)||(23167-23213)
[»] scaffold1468 (1 HSPs)
scaffold1468 (6-473)||(1144-1609)
[»] scaffold1705 (2 HSPs)
scaffold1705 (6-243)||(949-1186)
scaffold1705 (235-473)||(688-927)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (11-265)||(7452-7705)
[»] scaffold0265 (1 HSPs)
scaffold0265 (12-486)||(11119-11589)
[»] scaffold0018 (6 HSPs)
scaffold0018 (349-496)||(59825-59973)
scaffold0018 (6-104)||(54825-54922)
scaffold0018 (6-104)||(58777-58874)
scaffold0018 (6-104)||(60205-60302)
scaffold0018 (349-486)||(54456-54593)
scaffold0018 (349-486)||(58408-58545)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (19-133)||(4511-4624)
[»] scaffold0406 (2 HSPs)
scaffold0406 (351-455)||(15238-15342)
scaffold0406 (6-108)||(15601-15702)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (35-122)||(28545-28631)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (59-108)||(6783-6832)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (410-455)||(216464-216508)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (35-90)||(92647-92703)


Alignment Details
Target: scaffold0031 (Bit Score: 400; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 496
Target Start/End: Original strand, 111553 - 112044
Alignment:
Q  6 gatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctg 105  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  111553 gatgaacatcagaatgttgctgtgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctg 111652  T
Q  106 ggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt 205  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  111653 ggtccattccatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt 111752  T
Q  206 gattcaaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgc-atcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagag 304  Q
    || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  111753 gaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagagaggatagtggatctgcaatcttcaggcccatgcttcaaggagatttgcttgattcatctcagag 111852  T
Q  305 tacacgttatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacatta 404  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  111853 tacacgttatctctgatgcaagatctccttttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagaagtgaacattc 111952  T
Q  405 tgatctcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactctaatattaaaacacaactga 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| | ||||||||    
T  111953 tgatctcagaatgttccatttgttcttactttaggttgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaaacctaatagtaagatacaactga 112044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 400; Significance: 0; HSPs: 12)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 16629816 - 16629325
Alignment:
Q  6 gatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctg 105  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16629816 gatgaacatcagaatgttgctgtgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctg 16629717  T
Q  106 ggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt 205  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16629716 ggtccattccatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt 16629617  T
Q  206 gattcaaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgc-atcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagag 304  Q
    || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16629616 gaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagagaggatagtggatctgcaatcttcaggcccatgcttcaaggagatttgcttgattcatctcagag 16629517  T
Q  305 tacacgttatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacatta 404  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  16629516 tacacgttatctctgatgcaagatctccttttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagaagtgaacattc 16629417  T
Q  405 tgatctcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactctaatattaaaacacaactga 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| | ||||||||    
T  16629416 tgatctcagaatgttccatttgttcttactttaggttgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaaacctaatagtaagatacaactga 16629325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 496
Target Start/End: Original strand, 17828312 - 17828763
Alignment:
Q  35 catcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggtccatccaatacgtgacatgagatttg 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17828312 catcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgggtttctgggtccatccaatacgtgacatgagatttg 17828411  T
Q  135 ttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgattcaaatctatcttggaattggtgcag 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  17828412 ttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcag 17828511  T
Q  235 gagagagaggatagtggatctgc-atcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagagtacacgttatctctgatgcaagagctcat 333  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  17828512 gaaagagaggatagtggatctgcaatcttcaggcccatgcttcaaggagatttgct-----------agagtacacgttatctctgatgcaagatctcct 17828600  T
Q  334 tttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacattatgatctcagaatgttccatttgttcttac 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17828601 tttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagaagtgaacattctgatctcagaatgtttcatttgttcttac 17828700  T
Q  434 tttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactctaatattaaaacacaactga 496  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| | ||||||||    
T  17828701 tttaggttgatttataagacttaacttttaatgtaatcaaacctaatagtaagatacaactga 17828763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 496
Target Start/End: Original strand, 17837703 - 17838154
Alignment:
Q  35 catcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggtccatccaatacgtgacatgagatttg 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17837703 catcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgggtttctgggtccatccaatacgtgacatgagatttg 17837802  T
Q  135 ttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgattcaaatctatcttggaattggtgcag 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  17837803 ttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcag 17837902  T
Q  235 gagagagaggatagtggatctgc-atcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagagtacacgttatctctgatgcaagagctcat 333  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  17837903 gaaagagaggatagtggatctgcaatcttcaggcccatgcttcaaggagatttgct-----------agagtacacgttatctctgatgcaagatctcct 17837991  T
Q  334 tttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacattatgatctcagaatgttccatttgttcttac 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17837992 tttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagaagtgaacattctgatctcagaatgtttcatttgttcttac 17838091  T
Q  434 tttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactctaatattaaaacacaactga 496  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| | ||||||||    
T  17838092 tttaggttgatttataagacttaacttttaatgtaatcaaacctaatagtaagatacaactga 17838154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 6 - 496
Target Start/End: Original strand, 7846527 - 7847020
Alignment:
Q  6 gatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctg 105  Q
    |||| ||||||  |||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  7846527 gatgaacatcagcatgttgttgtgttcttcatcagaatgtta-atattcatgatgttcttcatctgggttcttcaatgatgaatgtcagatgagtttctg 7846625  T
Q  106 ggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagtt-acttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagt 204  Q
    ||    | ||| |||||||||||||||||||   | |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7846626 ggctagttcaagacgtgacatgagatttgttgg-gctttatcctccaaaaggtgacttctccatatgcagcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagt 7846724  T
Q  205 tgattcaaatctatcttggaatt-ggtgcaggagagagaggatagtggatctgca-tcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcag 302  Q
    |||||||||| | || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7846725 tgattcaaatatgtcctggattttggtgcaggagagagaggatagtggatctgtaatcttcaggcccatgcttcaaggagatatgcttgattcatatcag 7846824  T
Q  303 agtacacgttatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacat 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7846825 agtacacgttatctctgatgcaagatctccttttgctagcttttccaactttccaccaactatactgttcatggctggaagcatgtgcagaagtgaacat 7846924  T
Q  403 tatgatc-tcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagactt-aacttttaatgtaatcaactctaatattaaaacacaactga 496  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||    
T  7846925 tctgatcttcagaatgttccatttgttcttactttaggttgatttgtaagacttaaatttttaatgtaatcaaacctaatagtaagacacaactga 7847020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 6 - 496
Target Start/End: Original strand, 16210947 - 16211437
Alignment:
Q  6 gatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctg 105  Q
    |||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16210947 gatgaacatcagaatgttgatgtgttcttcatcagaatgtt-gatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaatgatgaatgtctgatgagtttctg 16211045  T
Q  106 ggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttc-aaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagt 204  Q
    |||   | |||  |||||||||||||||||| | | |||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  16211046 ggtttgttcaaggcgtgacatgagatttgtt-aggctttatccagcaaaaagtaacttctccatatgcatcaaaaattgctggataaagtaggataaagt 16211144  T
Q  205 tgattcaaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgcatcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagag 304  Q
    ||||||||||||  ||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    ||||||    
T  16211145 tgattcaaatcttccttggatattgtgcaggagagagaggatagtgggtctgcaacttcaggcccatgcttctaggagatttgcttgattttgttcagag 16211244  T
Q  305 tacacgttatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacatta 404  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||     
T  16211245 tacaagttatctctgatgcaagatctccttttgctacctttttcatctttccaccaactacactgttcatagctggaagcatgtgcaggagtgaacattc 16211344  T
Q  405 tgatc-tcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactctaatattaaaacacaactga 496  Q
    ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16211345 tgaccatcagaatgttctatttgttcttactttaggttgatttgtaagacttaacttttgatgtaatcaactctaatagtaaaacacaactga 16211437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 6 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 44889023 - 44888572
Alignment:
Q  6 gatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctg 105  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44889023 gatgaacatcagaatgttgctgtgttcttcatcagaatgtt-gatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaatgatgaatgtctgatgagtttctg 44888925  T
Q  106 ggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaa-gttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagt 204  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |          |||||||||    
T  44888924 ggtttatccaatacgtgacatgagatttgttggacttt-atccatcaaaaagtaacttctccatatgcatcaaaagttgat----------ggataaagt 44888836  T
Q  205 tgattcaaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgca-tcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcaga 303  Q
    |    ||||| | ||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    ||| |    
T  44888835 tac--caaatttgtcttggacttggtgcaggagagaga---tagtggatctgcaatcttcaggctcatgcttctaggagatttgcttgattttgttcaaa 44888741  T
Q  304 gtacacgttatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacatt 403  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  44888740 gtacacgttatctctgatgcaagatctccttttgctacctttttcttctttctaccaactacactgttcatagctggaagcatgtgcagaagtgaacatt 44888641  T
Q  404 atgatc-tcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaa 473  Q
     ||| | |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||   |||||| ||||||||||    
T  44888640 ctgaccatcagaatgtttcatttgctcttactttatgatgatttgtaagac--gacttttgatgtaatcaa 44888572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 35 - 473
Target Start/End: Original strand, 53946092 - 53946528
Alignment:
Q  35 catcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggtccatccaatacgtgacatgagatttg 134  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||  |||| |||||||||||    
T  53946092 catcagaatgttc-atattcatgacgttcttcatatgggttcatcaatgatgaatgtctgatgagtttctgggtttgttcaaggcgtggcatgagatttg 53946190  T
Q  135 ttcaagttttatccttcaaaa-gttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgattcaaatctatcttggaattggtgca 233  Q
    ||   | |||||||  ||||| || |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||  || |||||    
T  53946191 ttgg-gctttatccaccaaaaagtaacttttccatatgcatcaaaagttgctggataaagtaggataaagttgattcaaatatgtcttggtctttgtgca 53946289  T
Q  234 ggagagagaggatagtggatctgcatcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagagtacacgttatctctgatgcaagagctcat 333  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||    |||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |    
T  53946290 ggagagagaggatagtgggtctgcaacttcaggttcatgcttctaggagatttgctagattttgttcagagtacaagttatatctgatgcaagatctcct 53946389  T
Q  334 tttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacattatgatc-tcagaatgttccatttgttctta 432  Q
    ||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  53946390 tttgctaactttttcttctttctaccaactacactgttcatagttagaagcatgtgcaggagtgaacattctgatcatcagaatgtttcatttgatctta 53946489  T
Q  433 ctttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaa 473  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||    
T  53946490 ctttaggatgatttgtaggact--acttttgatgtaatcaa 53946528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 16397199 - 16396756
Alignment:
Q  12 catcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggtcca 111  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||       
T  16397199 catcagaatgttgttgtgttcttcatcagaatgtt-gatatctatgatgttcttcatctgggttcatcaatgatgaaagtctgatgagtttctgggtttt 16397101  T
Q  112 tccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttc-aaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgattc 210  Q
      ||| |||||||||||||||||||  || |||||||  | |||||| |||||| ||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||  |    
T  16397100 ctcaagacgtgacatgagatttgtt-gagctttatccaccaaaaagtaacttcttcatatgcattaaaagttgctggataaagtaagataaagttgaacc 16397002  T
Q  211 aaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgc-atcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagagtacac 309  Q
    |||||| ||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||| |||| |||||||    ||||||||||     
T  16397001 aaatctgtcttggtcattgtgcaggagagagaggatagtggatctgcaatcttcaggcccatgcttctaggaaattttcttgattttgttcagagtacaa 16396902  T
Q  310 gttatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacattatgatc 409  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||    || | | |||| ||||||||||||| ||||| | | |||||||||| |||  |||||||| ||| |    
T  16396901 gttatctctgatgcaagatctccttttgctttgcttgctaacttttcaccaactacactattcatagttagaagcatgtgtagagatgaacattctgacc 16396802  T
Q  410 -tcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagact 454  Q
     |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16396801 atcagaatgtttcatttgctcttactttaggatgatttgtaagact 16396756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 46 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 2829790 - 2829395
Alignment:
Q  46 ttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagtttta 145  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||   | ||||    
T  2829790 ttgatgttcatgatgttcttcatctaggttcatcaatgatgaatgtttgatgagtttatcggtttatccaatacgtgacatgagatttgttgg-gcttta 2829692  T
Q  146 tccttcaaaa-gttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgattcaaatctatcttggaattggtgcaggagagagagg 244  Q
    |||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |          ||||||||||   |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||      
T  2829691 tccaccaaaaagtaacttctccatatgcatcaaaagttgat----------ggataaagtta--tcaaatctgtcttggacttgatgcaggagagaga-- 2829606  T
Q  245 atagtggatctgca-tcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagagtacacgttatctctgatgcaagagctcattttgctagct 343  Q
     ||||||||||||| ||||||||| |||| ||| | |||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||   |    
T  2829605 -tagtggatctgcaatcttcaggcccatgcttctatgagatttgcttggttttgttcagagtacacgttatctctgatgcaagatctccttttgctttgt 2829507  T
Q  344 tttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacattatgatc-tcagaatgttccatttgttcttactttaggatg 442  Q
    || | | |||| ||||||||||| ||||||| | |  ||||||||||| |  |||| ||| ||| | ||| |||||| |||||| | |||||||| ||||    
T  2829506 ttgctaacttttcaccaactacattgttcatagttaaaagcatgtgcaaagatgaaaattctgaccatcaaaatgtttcatttgcttttactttaagatg 2829407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 380 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 1293288 - 1293213
Alignment:
Q  380 gaagcatgtgcagacgtgaacattatgatc-tcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagactt 455  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | || |||| || |||||||||||||    
T  1293288 gaagcatgtgcagagctgaacattttgatcatcagaatgttccatttgttttcac-ttagtattatttgtaagactt 1293213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 381 - 454
Target Start/End: Original strand, 9836197 - 9836269
Alignment:
Q  381 aagcatgtgcagacgtgaacattatgatc-tcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagact 454  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  9836197 aagcatgtgcagagctgaacattctgatcgtcagaatgttccttttgtt-tcactt-aggatgatttgtaagact 9836269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 410 - 455
Target Start/End: Original strand, 14600870 - 14600914
Alignment:
Q  410 tcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagactt 455  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  14600870 tcagaatgttccatttgtttttac-ataggatgatttgtaagactt 14600914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 400; Significance: 0; HSPs: 17)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 45191120 - 45190629
Alignment:
Q  6 gatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctg 105  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45191120 gatgaacatcagaatgttgctgtgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctg 45191021  T
Q  106 ggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt 205  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45191020 ggtccattccatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt 45190921  T
Q  206 gattcaaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgc-atcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagag 304  Q
    || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45190920 gaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagagaggatagtggatctgcaatcttcaggcccatgcttcaaggagatttgcttgattcatctcagag 45190821  T
Q  305 tacacgttatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacatta 404  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  45190820 tacacgttatctctgatgcaagatctccttttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagaagtgaacattc 45190721  T
Q  405 tgatctcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactctaatattaaaacacaactga 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| | ||||||||    
T  45190720 tgatctcagaatgttccatttgttcttactttaggttgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaaacctaatagtaagatacaactga 45190629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 456
Target Start/End: Original strand, 37862800 - 37863245
Alignment:
Q  11 acatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggtcc 110  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37862800 acatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatattcctgatgttcttcatctaggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggtcc 37862899  T
Q  111 atccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgattc 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37862900 atccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaaataggataaagttgattc 37862999  T
Q  211 aaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgcatcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagagtacacg 310  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37863000 aaatctgtcttggatttggtgcaggagagagaggatagtggatctgcatcttcaggctcatgcttcaaggagatttgcttgattcatatcagagtacacg 37863099  T
Q  311 ttatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacattatgatct 410  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  37863100 ttatctcttatgcaagatttcattttgctagctttttcatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagaagtgaacattctgatct 37863199  T
Q  411 cagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagactta 456  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37863200 cagaatgttccatttgttcttactttaggttgatttgtaagactta 37863245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 574548 - 574052
Alignment:
Q  6 gatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctg 105  Q
    |||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  574548 gatgaacatcagaatgttgatgtgttcttcatcagaatgtttgatattcgtgatgttcttcatctaggttcatccaggatgaatgtctgatgagttcctg 574449  T
Q  106 ggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt 205  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  574448 ggttcatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccctcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt 574349  T
Q  206 gattcaaatctatcttggaattggtgcaggagagagag------gatagtggatctgcatcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatat 299  Q
    ||  ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    |    
T  574348 gaaacaaatttgtcttggatttggtgcaggagagagagagagaggatagtggatctgcatcttcaggcccatgcttcaaggagatttgcttgattttgtt 574249  T
Q  300 cagagtacacgttatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaa 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  574248 cagagtacacgttatctctgatgcaagatctccttttgctaacttttccatctttccaccaaccacactgttcatggctggaagcatgtgcagaagtgaa 574149  T
Q  400 cattatgatctcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactctaatattaaaacacaactga 496  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| | ||||||||    
T  574148 cattctgatctcagaatgttccatttgttcttactttaggttgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaaacctaatagtaagatacaactga 574052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 6 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 12570868 - 12570378
Alignment:
Q  6 gatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctg 105  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  12570868 gatgaacatcagaatgttgctgtgttcttcatcagaatgtttggtattcatgatgttcttcatctgggttcatcaatgatgaatgtctgatgagtttcta 12570769  T
Q  106 ggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt 205  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12570768 ggtctatccaatacatgacatgagatttgttcaggttttatccttaaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt 12570669  T
Q  206 gattcaaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgcatcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagagt 305  Q
        ||||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12570668 --accaaatctgtcttagaatttgtgcaggagagagtggatagtggatctgcatcttcaggaccatgcttcaaggagatttgcttgattcaaatcagagt 12570571  T
Q  306 acacgttatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttc--atggctggaagcatgtgcagacgtgaacatt 403  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  12570570 acacgttatctctgatgcaagatcttcttttgctagctttttcatctttccaccaactacactgttcatatagctggaagcatgtgcagaaatgaacatt 12570471  T
Q  404 atgatc-tcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactctaatattaaaacacaactga 496  Q
     ||| | |||||||||| || || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12570470 ctgaccttcagaatgtttca-ttcttcttactttaagttgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactctaatagtaaaacacaactga 12570378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 5 - 496
Target Start/End: Original strand, 22687448 - 22687935
Alignment:
Q  5 agatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttct 104  Q
    ||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  22687448 agatgaacatcagaatgttg-tgtgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcattgatgaatgtttgatgagtttct 22687546  T
Q  105 gggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagt 204  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22687547 gggttcatccaatacgtgacatgagatttcttcaggttttatccttaaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttg-aaaagtaggataaagt 22687645  T
Q  205 tgattcaaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgcatcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagag 304  Q
    |    ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||||    
T  22687646 t--accaaatctgtcttggacttcgtgcaggagagagaggatagtggatttgcatattcaggcccatgctt-aaggagattttcttgattcatatcagag 22687742  T
Q  305 tacacgttatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacatta 404  Q
     |||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||     
T  22687743 gacacgttacctcttatgcaagatctccttttgctagctttttcatctttccaccaactacactgttcattgctggaagcatgtgcagaagtgaacattc 22687842  T
Q  405 tgatc-tcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactctaatattaaaacacaactga 496  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||| ||||||||||    
T  22687843 tgatcttcaaaatgttccatttgttcttactttaggtttatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaaacctaacagtaagacacaactga 22687935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 6 - 473
Target Start/End: Original strand, 3605701 - 3606161
Alignment:
Q  6 gatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctg 105  Q
    |||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  3605701 gatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcatcagaatgtt-gatattcatgatgttcttcatctaggttcatcaatgatgaatgtctgatgagtttcta 3605799  T
Q  106 ggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaa-gttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagt 204  Q
    |||  ||||||||||||| ||||||||||||   | |||||||  ||||| || |||||||||||| |||||||||||| | || |||||| ||||||||    
T  3605800 ggtttatccaatacgtgatatgagatttgttgg-gctttatccaccaaaaagtaacttctccatatccatcaaaagttgatggataaagtatgataaagt 3605898  T
Q  205 tgattcaaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgca-tcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcaga 303  Q
    |   |||||||| ||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||| |||| ||  || ||||||||||||||    |||||    
T  3605899 ta--tcaaatctgtcttggacttggtgcaggagagaga---tagtggatctgcaatcttcaggcccatgcttttagaagatttgcttgattttgttcaga 3605993  T
Q  304 gtacacgttatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacatt 403  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||   |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  3605994 gtacatgttatctctgatgcaagttctccttttgctacctttttt-tctttctaccaactacactgttcatagctggaagcatgtgcagaagagaacatt 3606092  T
Q  404 atgatc-tcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaa 473  Q
     ||| | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  3606093 ctgaccatcagaatgtttcatttgctcttactttaggatgatttgtaagact--acttttgatgtaatcaa 3606161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 252 - 496
Target Start/End: Original strand, 16934310 - 16934554
Alignment:
Q  252 atctgcatcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagagtacacgttatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatc 351  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    |||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  16934310 atctgcatcttcaggcccatgcttcaaggagatttgcttgattttgttcagagtaaatgttatctctgatgcaagatctccttttgctagcttttccatc 16934409  T
Q  352 tttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacattatgatctcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaag 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  16934410 tttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtacagaagtgaacattctgatctcagaatgttcaatttgttcttactttaggttgatctgtaag 16934509  T
Q  452 acttaacttttaatgtaatcaactctaatattaaaacacaactga 496  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||    
T  16934510 acttaacttttaatgtaatcaaacctaatagtaagacacaactga 16934554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 252 - 496
Target Start/End: Original strand, 17004970 - 17005214
Alignment:
Q  252 atctgcatcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagagtacacgttatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatc 351  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    |||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  17004970 atctgcatcttcaggcccatgcttcaaggagatttgcttgattttgttcagagtaaatgttatctctgatgcaagatctccttttgctagcttttccatc 17005069  T
Q  352 tttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacattatgatctcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaag 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  17005070 tttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtacagaagtgaacattctgatctcagaatgttcaatttgttcttactttaggttgatctgtaag 17005169  T
Q  452 acttaacttttaatgtaatcaactctaatattaaaacacaactga 496  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||    
T  17005170 acttaacttttaatgtaatcaaacctaatagtaagacacaactga 17005214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 101 - 256
Target Start/End: Original strand, 16902674 - 16902829
Alignment:
Q  101 ttctgggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16902674 ttctgggtccatccaatacgtgacataagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggata 16902773  T
Q  201 aagttgattcaaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctg 256  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16902774 aagttgattcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagagaggatagtggatctg 16902829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 101 - 256
Target Start/End: Original strand, 16996065 - 16996220
Alignment:
Q  101 ttctgggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16996065 ttctgggtccatccaatacgtgacataagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggata 16996164  T
Q  201 aagttgattcaaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctg 256  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16996165 aagttgattcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagagaggatagtggatctg 16996220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 421 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 24942794 - 24942719
Alignment:
Q  421 catttgttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactctaatattaaaacacaactga 496  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| | ||||||||    
T  24942794 catttgttcttactttaggttgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaaacctaatagtaagatacaactga 24942719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 80
Target Start/End: Original strand, 69861 - 69928
Alignment:
Q  12 catcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatca 80  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  69861 catcagaatgttgttatgttcttcatcagaatg-ttgatgttcatcatggtcttcatttgggttcatca 69928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 380 - 455
Target Start/End: Original strand, 24239168 - 24239243
Alignment:
Q  380 gaagcatgtgcagacgtgaacattatgatc-tcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagactt 455  Q
    |||||||||||| |  |||||||| ||||| | ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  24239168 gaagcatgtgcaaagctgaacattctgatcattagaatgttccatttgttttcactt-aggatgatttgtaagactt 24239243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 68
Target Start/End: Original strand, 16902641 - 16902674
Alignment:
Q  35 catcagaatgtttgatattcatgatgttcttcat 68  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16902641 catcagaatgtttaatattcatgatgttcttcat 16902674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 68
Target Start/End: Original strand, 16996032 - 16996065
Alignment:
Q  35 catcagaatgtttgatattcatgatgttcttcat 68  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16996032 catcagaatgtttaatattcatgatgttcttcat 16996065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 21109545 - 21109457
Alignment:
Q  28 tgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggtccatccaat 117  Q
    |||||||  |||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||  ||||| ||| ||||||||||| ||||  |||||||    
T  21109545 tgttctttgtcagaatgtt-gatgttcatcatgatcttcatctgggtttatcattgatgagtgtatgatgagtttcagggtttatccaat 21109457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 229 - 272
Target Start/End: Original strand, 70068 - 70109
Alignment:
Q  229 gtgcaggagagagaggatagtggatctgcatcttcaggctcatg 272  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  70068 gtgcaggagagaga--atagtggatctgcatcttcaggcccatg 70109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 391; Significance: 0; HSPs: 11)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 27988769 - 27988307
Alignment:
Q  35 catcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggtccatccaatacgtgacatgagatttg 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27988769 catcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctggatccatccaatacgtgacatgagatttg 27988670  T
Q  135 ttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgattcaaatctatcttggaattggtgcag 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  27988669 ttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgattcaaatctgtcttggatttggtgcag 27988570  T
Q  235 gagagagaggatagtggatctgc-atcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagagtacacgttatctctgatgcaagagctcat 333  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  27988569 gagtgagaggatagtggatctgcaatcttcaggcccatgcttcaaggagatttgcttgattcatatcagagtacacgttatctctgatgcaagatctcct 27988470  T
Q  334 tttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacattatgatctcagaatgttccatttgttcttac 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27988469 tttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagaagtgaacattctgatcttagaatgttccatttgttcttac 27988370  T
Q  434 tttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactctaatattaaaacacaactga 496  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||    
T  27988369 tttaggttgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaaacctaatagtaagacacaactga 27988307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 496
Target Start/End: Original strand, 24540599 - 24541090
Alignment:
Q  6 gatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctg 105  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24540599 gatgaacatcagaatgttgctgtgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtcagatgagtttctg 24540698  T
Q  106 ggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt 205  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24540699 ggtccattccatacgtgacatgagatatgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt 24540798  T
Q  206 gattcaaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgc-atcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagag 304  Q
    ||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||    ||||||    
T  24540799 gaaacaaatctgtcttggatttggtgcaggagagagaggatagtggatctgcaatcttcaggcccatgcttcaaagagatttgcttgattttgttcagag 24540898  T
Q  305 tacacgttatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacatta 404  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  24540899 tacacgttatctctgatgcaagatctccttttgctaacttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagaagtgaacattc 24540998  T
Q  405 tgatctcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactctaatattaaaacacaactga 496  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| | ||||||||    
T  24540999 tgatctcataatgttccatttgttcttactttaggttgatttataagacttaacttttaatgtaatcaaacctaatagtaagatacaactga 24541090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 19586053 - 19585568
Alignment:
Q  11 acatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggtcc 110  Q
    |||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19586053 acatcagaatgttgttgtgttcttcatcagaatgattgatattcatgatgttcttcatttgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggacc 19585954  T
Q  111 atccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgattc 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19585953 atccaatacttgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccttatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatc 19585854  T
Q  211 aaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgc-atcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagagtacac 309  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19585853 aaatctgtcttggatttggtgcaggagagagaggatagtggatctgcaatcttcatgctcatgcttcaaggagatttgcttgattcacatcagagtacac 19585754  T
Q  310 gttatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacattatgatc 409  Q
     ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||    
T  19585753 attatctctgatgcaagatctccttttgctagcttttccatctttccaccaactacact-atcatggctggaagcatgtgcagaagtgaacattctaatc 19585655  T
Q  410 tcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactctaatattaaaacacaactga 496  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||| ||| | ||||||||    
T  19585654 tcagaatgttccatttgttcttactttaggttgatttttatgacttaacttttaatgtaatcaaacctaatagtaagatacaactga 19585568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 45553485 - 45552989
Alignment:
Q  6 gatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctg 105  Q
    |||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45553485 gatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcatcagaatgtttgatattcacgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtcagatgagtttctg 45553386  T
Q  106 ggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt 205  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45553385 ggtccattccatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaagataaagtt 45553286  T
Q  206 gattcaaatctatcttggaattggtgcaggagagagag------gatagtggatctgca-tcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcata 298  Q
    || |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||      ||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45553285 gaatcaaatctgtcttggatttggtgcaagagagagagagagaggatagtggatctgtaatcttcaggcccatgcttcaaggagatttgcttgattcata 45553186  T
Q  299 tcagagtacacgttatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtga 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45553185 tcagagtacacgttatctctgatgcaagatctccttt-gctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagaagtga 45553087  T
Q  399 acattatgatctcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactctaatattaaaacacaactga 496  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| | ||||||||    
T  45553086 acattctgatctcagaatgttccatttgttcttactttaggttgatttataagacttaacttttaatgtaatcaaacctaatagtaagatacaactga 45552989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 6 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 10415983 - 10415538
Alignment:
Q  6 gatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctg 105  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10415983 gatgaacatcagaatgttgctatgttcttcatcagaatgtttggtattcatgatgttcttcatctaggttcatcaatgatgaatgtctgatgagtttctg 10415884  T
Q  106 ggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaa-gttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagt 204  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  10415883 ggtttatccaatacgtgacatgagatttgttgg-gctttatccaccaaaaagtaacttctccatatgcatcaaaagttgatggataaagtaggataaagt 10415785  T
Q  205 tgattcaaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgca-tcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcaga 303  Q
    |    ||||||  ||||||| || ||||||||||||||   || |||||||||| ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||    |||||    
T  10415784 tac--caaatcagtcttggacttagtgcaggagagaga---taatggatctgcaatcttcgggcccatgcttctaggagatttgcttgattttattcaga 10415690  T
Q  304 gtacacgttatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacatt 403  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| | |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  10415689 gtacatgttatctctgatgcaagatctccttttgctacctttttcttctttctacctactacactgttcatagctggaagcatgtgcagaagtgaacatt 10415590  T
Q  404 atgatc-tcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagact 454  Q
     ||| | |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  10415589 ctgaccatcagaatgtttcatttgctcttcctttaggatgatttgtaagact 10415538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 12491613 - 12491404
Alignment:
Q  6 gatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctg 105  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||     
T  12491613 gatgaacatcagaatgttgctgtgttcttcatcagaatgtt-gatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaatgatgaatgtatgatgagtttcta 12491515  T
Q  106 ggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttc-aaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagt 204  Q
    |||   || ||  |||||||||||||||||| | | |||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||    
T  12491514 ggtttgtctaaggcgtgacatgagatttgtt-aggctttatccaccaaaaagtaacttctccatatgcatcaaaaattgttggataaagtaggataaagt 12491416  T
Q  205 tgattcaaatct 216  Q
    ||| ||||||||    
T  12491415 tgaatcaaatct 12491404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 12515399 - 12515153
Alignment:
Q  28 tgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggtccatccaatacgtgacatg 127  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||   || ||  |||||||||    
T  12515399 tgttcttcatcagaatgtt-gatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaatgatgaatgtatgatgagtttctaggtttgtctaaggcgtgacatg 12515301  T
Q  128 agatttgttcaagttttatccttc-aaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgattcaaatctatcttggaat 226  Q
    ||||||||| | | |||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||  |||||       
T  12515300 agatttgtt-aggctttatccaccaaaaagtaacttctccatatgtatcaaaagttgttggataaagtaggataaagttgaatcaaatctgccttggtca 12515202  T
Q  227 tggtgcag--gagagagaggatagtggatctgc-atcttcaggctcatg 272  Q
    | ||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  12515201 ttgtgcaggagagagagaggatagtggatatgcaatcttcaggcccatg 12515153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 9007218 - 9007108
Alignment:
Q  6 gatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctg 105  Q
    |||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||| | | ||||||| |||||||||||   |||||||| |||||||||||||    
T  9007218 gatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcatcagaatgtt-gatgttcatcaagatcttcatttgggttcatcatatatgaatgtatgatgagtttctg 9007120  T
Q  106 ggtccatccaat 117  Q
    |||  |||||||    
T  9007119 ggtttatccaat 9007108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 351 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 12770058 - 12769954
Alignment:
Q  351 ctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacattatgatc-tcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgta 449  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| |   ||||||||||||||  |||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  12770058 ctttcctccaactacattgttcatagtatgaagcatgtgcagagatgaacattctgaccattagaatgttccatttgttcttac-ttaagatgatttgta 12769960  T
Q  450 agactt 455  Q
    ||||||    
T  12769959 agactt 12769954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 12770200 - 12770143
Alignment:
Q  229 gtgcaggagagagaggatagtggatctgcatcttcaggctcatggttcaaggagattt 286  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||| ||| |||||||||    
T  12770200 gtgcaggagagagagagtagtggatctgcagcttcaggtccatgcttctaggagattt 12770143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 229 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 9006996 - 9006955
Alignment:
Q  229 gtgcaggagagagaggatagtggatctgcatcttcaggctcatg 272  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  9006996 gtgcaggagagagag--tagtggatctgcatcttcaggttcatg 9006955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 384; Significance: 0; HSPs: 10)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 496
Target Start/End: Original strand, 20744843 - 20745333
Alignment:
Q  6 gatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctg 105  Q
    |||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20744843 gatgaacatcagaattttgctgtgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctg 20744942  T
Q  106 ggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt 205  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20744943 ggaccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaactaggataaagtt 20745042  T
Q  206 gattcaaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgc-atcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagag 304  Q
    || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20745043 gaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagagaggatagtggatctgcaatcttcaggcccatgcttcaaggagatttgcttgattcatctcagag 20745142  T
Q  305 tacacgttatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacatta 404  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  20745143 tacacgttatctctgatgcaagatctc-ctttgctagcttttccatctttccaccaactatactgttcatggctggaagcatgtgcagaagtgaacattc 20745241  T
Q  405 tgatctcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactctaatattaaaacacaactga 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| | ||||||||    
T  20745242 tgatctcagaatgttccatttgttcttactttaggttgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaaacctaatagtaagatacaactga 20745333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 496
Target Start/End: Original strand, 2489368 - 2489829
Alignment:
Q  35 catcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggtccatccaatacgtgacatgagatttg 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2489368 catcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttcttggtccatccaatacgtgacatgagatttg 2489467  T
Q  135 ttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgattcaaatctatcttggaattggtgcag 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  2489468 ttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgattcaaatctgtcttggatttggtgcag 2489567  T
Q  235 gagagagaggatagtggatctgcatcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagagtacacgttatctctgatgcaagagctcatt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||    
T  2489568 gagagagaggatagtggatctgcatcttcaggcccatgcttcaaggagatttgcttgattttgttcagagtacatgttatctctgatgcaagatctcctt 2489667  T
Q  335 ttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacattatgatctcagaatgttccatttgttcttact 434  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2489668 ttgctagtttttccatctttccaccaactacactgttcatggctagaagcatgtgcagaagtgaacattctgatctcagaatgttccatttgttcttact 2489767  T
Q  435 ttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactctaatattaaaacacaactga 496  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| | ||||||||    
T  2489768 ttaggttgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaaacctaatagtaagatacaactga 2489829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 496
Target Start/End: Original strand, 13119767 - 13120228
Alignment:
Q  35 catcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggtccatccaatacgtgacatgagatttg 134  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13119767 catcagaatgtttaatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggtccatccaatacgtgacatgagatttg 13119866  T
Q  135 ttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgattcaaatctatcttggaattggtgcag 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  13119867 ttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgattcaaatctgtcttggatttggtgtag 13119966  T
Q  235 gagagagaggatagtggatctgcatcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagagtacacgttatctctgatgcaagagctcatt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||    
T  13119967 gagagagaggatagtggatctgcatcttcaggcccatgcttcaaggagatttgcttgattttgttcagagtacatgttatctctgatgcaagatctcctt 13120066  T
Q  335 ttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacattatgatctcagaatgttccatttgttcttact 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13120067 ttgctagcttttccatctttccaccaactacaccgttcatggctggaagcatgtgcagaagtgaacattctgatctcagaatgttccatttgttcttact 13120166  T
Q  435 ttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactctaatattaaaacacaactga 496  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||    
T  13120167 ttaggttgatctgtaagacttaacttttaatgtaatcaaacctaatagtaagacacaactga 13120228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 496
Target Start/End: Original strand, 19828012 - 19828501
Alignment:
Q  6 gatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctg 105  Q
    |||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  19828012 gatgaacatcagaatgttgatgtgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtcagatgggtttctg 19828111  T
Q  106 ggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt 205  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19828112 ggtccattccatacgtgacatgagatatgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt 19828211  T
Q  206 gattcaaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgc-atcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagag 304  Q
    ||  ||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19828212 gaaacaaatctgtcttggatttggtgcag--gagagaggatagtggatctgcaatcttcaggcccatgcttcaaggagatttgcttgattcatctcagag 19828309  T
Q  305 tacacgttatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacatta 404  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  19828310 tacacgttatctctgatgcaagatctccttttgctagctttttgatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagaagtgaacattc 19828409  T
Q  405 tgatctcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactctaatattaaaacacaactga 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| | ||||||||    
T  19828410 tgatctcagaatgttccatttgttcttactttaggttgatttgaaagacttaacttttaatgtaatcaaacctaatagtaagatacaactga 19828501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 496
Target Start/End: Original strand, 4782770 - 4783238
Alignment:
Q  35 catcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggtccatccaatacgtgacatgagatttg 134  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4782770 catcagaatgtttaatattcatgattttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggtccatccaatacgtgacatgagatttg 4782869  T
Q  135 ttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgattcaaatctatcttggaattggtgcag 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||    
T  4782870 ttcaagttttatccttcaaaagttacttcaccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgattcaaatctgtcttggatttggttcag 4782969  T
Q  235 ------gagagagaggatagtggatctgc-atcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagagtacacgttatctctgatgcaaga 327  Q
          ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4782970 gagagagagagagaggatagtggatctgcaatcttcaggcccatgcttcaaggagatttgcttgattcatctcagagtacaggttatctctgatgcaaga 4783069  T
Q  328 gctcattttgctagc-ttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacattatgatctcagaatgttccatttg 426  Q
     |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  4783070 tctc-ctttgctagctttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagaagtgaacattctgatctcataatgttccatttg 4783168  T
Q  427 ttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactctaatattaaaacacaactga 496  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| | ||||||||    
T  4783169 ttcttactttaggttgatttataagacttaacttttaatgtaatcaaacctaatagtaagatacaactga 4783238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 6 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 20293316 - 20292931
Alignment:
Q  6 gatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctg 105  Q
    |||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20293316 gatgaacatcagaatgttgatgtgttcttcatcagaatgtttggtattcatgaagttcttcatctaggttcatcaatgatgaatgtctgatgagtttctg 20293217  T
Q  106 ggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt 205  Q
    |||   ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  20293216 ggtttgtccaatacgtgacttgagatttgttcaggttttatccttaaaaatttacttctccatatgcatcaaaagttgctgaaaaaagtaggataaagtt 20293117  T
Q  206 gattcaaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgcatcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagagt 305  Q
        ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||     
T  20293116 ac--caaatctgtcttggactttgtgcaggagagagaggatagtggatctgcatcttcaggcccatgcttcaaggagatttgcttgattcaaattagagg 20293019  T
Q  306 acacgttatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcaga 393  Q
    |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20293018 acacgttatctctgatgcaagatccccttttgctagctttttcatctttccaccaactacattgttcatggctggaagcatgtgcaga 20292931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Original strand, 51978540 - 51979000
Alignment:
Q  11 acatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggtcc 110  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||      
T  51978540 acatcagaatgttgttgtgttcttcatcaaaatgtt-gatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaatgatgaatgtctgataagtttctgggttt 51978638  T
Q  111 atccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaa-gttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgatt 209  Q
     | |||   |||||||||||||||||   | |||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||    
T  51978639 gttcaaggagtgacatgagatttgttgg-gctttatccacaaaaaagtaacttctccatatgcatcaaaagtcgctggataaagtaggataaaattgatt 51978737  T
Q  210 caaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgcatcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagagtacac 309  Q
    |||||||  |||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| || | || ||| |||||||||||| ||||    ||||||||||     
T  51978738 caaatctgccttggtctttgtgcaggagagagaggatagtgggtctgcaac-tcatgcccgtgcttctaggagatttgctagattttgttcagagtacaa 51978836  T
Q  310 gttatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctgg-aagcatgtgcagacgtgaacattatgat 408  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||   ||||| ||| |||     
T  51978837 gttatctctgatgcaagatctccttttgctacatttttcttctttctaccaactacactgttcatagctggaaaacatgtgcatgagtgaatattctgac 51978936  T
Q  409 c-tcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaa 473  Q
    | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||    
T  51978937 catcagaatgtttcatttgctcttactttaggatgatttgcaagact--acttttgatgtaatcaa 51979000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 6 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 12376834 - 12376344
Alignment:
Q  6 gatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctg 105  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12376834 gatgaacatcagaatgttgctgtgttcttcatcagaatgct-gatattcatgatgttcttcatttgggttaatcaatgatgaatgtctgatgagtttctg 12376736  T
Q  106 ggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatc-aaaagttgcttgaaaaagtaggataaagt 204  Q
    |||   | |||| |||||||| ||||||||| | | |||||||   |||||| ||||| ||||||||| | |||| ||||| || |||||||||||||||    
T  12376735 ggtttgttcaatgcgtgacataagatttgtt-aggctttatccacaaaaagtaacttcaccatatgcagccaaaatttgctggataaagtaggataaagt 12376637  T
Q  205 tgattcaaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgcatcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagag 304  Q
    |||  |||||||  ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| | |||||||  |||||||  |||||||    
T  12376636 tgaaccaaatctgacttggacattgtgcaggagagagaggatagtggatctgcagcttcaggcccatgcttctaagagattttattgattctgatcagag 12376537  T
Q  305 tacacg-ttatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacatt 403  Q
      || | |||||||||| |||||| ||| |||||||    || | | |||| || |||||||||||||||| | |  ||||||||||| |  ||||||||    
T  12376536 ggcaagtttatctctga-gcaagatctccttttgctttgcttgctaacttttcaacaactacactgttcatagttaaaagcatgtgcaaagatgaacatt 12376438  T
Q  404 atgatc-tcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactctaatattaaa-acacaactga 496  Q
     ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||| |||| ||||||||||    
T  12376437 ctgaccttcagaatgttccttttgttcttactttaggatgatttgtaagactt-acttttgatgtaatcaatcctaatagtaaagacacaactga 12376344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 247 - 473
Target Start/End: Original strand, 13112867 - 13113093
Alignment:
Q  247 agtggatctgcatcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagagtacacgttatctctgatgcaagagctcattttgctagctttt 346  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  13112867 agtggatctgcatcttcaggcccatgcttcaagaagatttgcttgattttgttcagagtacatgttatctctgatgcaagatctccttttgctagctttt 13112966  T
Q  347 ccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacattatgatctcagaatgttccatttgttcttactttaggatgattt 446  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  13112967 ccatcttcccaccaactacattgttcatggctggaagcatgtgcagaagtgaacattctgatctcagaatgttccatttgttcttactttaggttgatct 13113066  T
Q  447 gtaagacttaacttttaatgtaatcaa 473  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||    
T  13113067 ataagacttaacttctaatgtaatcaa 13113093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 349 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 18560926 - 18560802
Alignment:
Q  349 atctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacattatgatctcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgt 448  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  18560926 atctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagaagtgaacattctgatctcagaatgttccatttgttcttactttaggttgatttga 18560827  T
Q  449 aagacttaacttttaatgtaatcaa 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  18560826 aagacttaacttttaatgtaatcaa 18560802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 383; Significance: 0; HSPs: 16)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 496
Target Start/End: Original strand, 24505178 - 24505668
Alignment:
Q  6 gatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctg 105  Q
    |||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  24505178 gatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggataaatgtctaatgagtttctg 24505277  T
Q  106 ggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  24505278 ggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagtttcttgaaaaagtaggataaattt 24505377  T
Q  206 gattcaaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgcatcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagagt 305  Q
    || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24505378 gaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagagaggatagtggatctgcatcttcaggctcatgcttcaaggagatttgcttgattcatatcagagt 24505477  T
Q  306 acacgttatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacattat 405  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||||| |    
T  24505478 acacgttatctctgatgcaagatatccttttgctagcttttccatctttctaccaactacactgttcatggatggaaacatgtgcagaagtaaacattct 24505577  T
Q  406 gatctcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactctaatattaaaacacaactga 496  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| | ||||||||    
T  24505578 gatctcagaatgttccatttgttcttactttaggttgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaaacctaatagtaagatacaactga 24505668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 496
Target Start/End: Original strand, 26020910 - 26021372
Alignment:
Q  35 catcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggtccatccaatacgtgacatgagatttg 134  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26020910 catcagaatgtttaatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggtccatccaatacgtgacatgagatttg 26021009  T
Q  135 ttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgattcaaatctatcttggaattggtgcag 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  26021010 ttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgattcaaatctgtcttggatttggtgcag 26021109  T
Q  235 gagagagaggatagtggatctgc-atcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagagtacacgttatctctgatgcaagagctcat 333  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||     
T  26021110 gagagagaggatagtggatctgcaatcttcaggcccatgcttcaaggagatttgcttgattcatctcagagtacacattatctctgatgcaagatctca- 26021208  T
Q  334 tttgctagc-ttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacattatgatctcagaatgttccatttgttctta 432  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26021209 tttgctagctttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagaagtgaacattctgatctcagaatgttccatttgttctta 26021308  T
Q  433 ctttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactctaatattaaaacacaactga 496  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| | ||||||||    
T  26021309 ctttaggttgattgataagacttaacttttaatgtaatcaaacctaatagtaagatacaactga 26021372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 34 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 1596710 - 1596248
Alignment:
Q  34 tcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggtccatccaatacgtgacatgagattt 133  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1596710 tcatcagaatgtttaatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttcttggtccatccaatacgtgacatgagattt 1596611  T
Q  134 gttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgattcaaatctatcttggaattggtgca 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  1596610 gttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttaattcaaatctgtcttggatttggtgca 1596511  T
Q  234 ggagagagaggatagtggatctgcatcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagagtacacgttatctctgatgcaagagctcat 333  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    |||||||||| ||||||||  |||||||| ||| |    
T  1596510 ggagagagaggataatggatctgcatcttcaggcccatgcttcaaggagatttgcttgattttgttcagagtacatgttatctccaatgcaagatctcct 1596411  T
Q  334 tttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacattatgatctcagaatgttccatttgttcttac 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1596410 tttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagaagtgaacattctgatctcagaatgttccatttgttcttac 1596311  T
Q  434 tttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactctaatattaaaacacaactga 496  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||    
T  1596310 tttaggttgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaaacctaatagtaagacacaactga 1596248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 16321591 - 16321102
Alignment:
Q  6 gatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctg 105  Q
    |||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16321591 gatgaacatcagaatgtagctgtgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatttgggttcatcaatgatgaatgtctgatgagtttctg 16321492  T
Q  106 ggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt 205  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16321491 ggttcattcaatacgtgacatgagatttgttcatgttttatccttaaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt 16321392  T
Q  206 gattcaaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgcatcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagagt 305  Q
        ||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||     
T  16321391 --accaaatctgtcttggattttctgcaggagagagaggatagtggatctgcatcttcaggcccatgcttcaaggagatttgcttgattcaaatcaaagg 16321294  T
Q  306 acacgttatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacattat 405  Q
    | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  16321293 atacgttatctctgatgcaagatctccttttgctagcttttccatctttccaccaactgtactgttcatggctggaagcatgtgcagaagtgaacattct 16321194  T
Q  406 gatc-tcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactctaatattaaaacacaactga 496  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  16321193 gatcttcagaatgttcaatttgttcttactttaggttgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaacactgatagtaaaacacaactga 16321102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 16333739 - 16333250
Alignment:
Q  6 gatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctg 105  Q
    |||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16333739 gatgaacatcagaatgtagctgtgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatttgggttcatcaatgatgaatgtctgatgagtttctg 16333640  T
Q  106 ggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt 205  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16333639 ggttcattcaatacgtgacatgagatttgttcatgttttatccttaaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt 16333540  T
Q  206 gattcaaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgcatcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagagt 305  Q
        ||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||     
T  16333539 --accaaatctgtcttggattttctgcaggagagagaggatagtggatctgcatcttcaggcccatgcttcaaggagatttgcttgattcaaatcaaagg 16333442  T
Q  306 acacgttatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacattat 405  Q
    | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  16333441 atacgttatctctgatgcaagatctccttttgctagcttttccatctttccaccaactgtactgttcatggctggaagcatgtgcagaagtgaacattct 16333342  T
Q  406 gatc-tcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactctaatattaaaacacaactga 496  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  16333341 gatcttcagaatgttcaatttgttcttactttaggttgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaacactgatagtaaaacacaactga 16333250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 496
Target Start/End: Original strand, 18712051 - 18712540
Alignment:
Q  6 gatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctg 105  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18712051 gatgaacatcagaatgttgctgtgttcttcatcaaaatgtttggtattcatgatgttcttcatctgggttcatcaatgatgaatgtctgatgagtttctg 18712150  T
Q  106 ggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt 205  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18712151 ggtttatccaatacgtgacatgagatttgttcaggttttatccttaaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgctggaaaaagtaggataaagtt 18712250  T
Q  206 gattcaaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgcatcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagagt 305  Q
        ||||| | ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||     
T  18712251 --accaaatatgtcttggactttgtgcaggagagataggatagtggatctacatcttcaggcccatgcttcaaggagatttgcttgattcaaataagagg 18712348  T
Q  306 acacgttatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacattat 405  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||| |    
T  18712349 acacgttatctctgatgcaagatctccttttgctagcttttacatctttccaccaactacactgttcatggttgaaagcatgtgcagaaatgaacattct 18712448  T
Q  406 gatc-tcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactctaatattaaaacacaactga 496  Q
    || | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18712449 gaccttcagaatgtttcatttgttcttactttaggttgatttgtaagacttgacttttaatgtaatcaactttaatagtaaaacacaactga 18712540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 12 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 26168656 - 26168184
Alignment:
Q  12 catcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggt--- 108  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       
T  26168656 catcagaatgttgctgtgttcttcatcagaatgtt-gatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctggcttta 26168558  T
Q  109 -cca----------tccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtagg 197  Q
     |||          ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||    
T  26168557 tccaattggctttatccaatacgtgacatgagatttgttcaggttttatccttaaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgctggaaaagttagg 26168458  T
Q  198 ataaagttgattcaaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgcatcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcat 297  Q
    ||||||||    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||     
T  26168457 ataaagttac--caaatctgtcttggatttggtgcaggagagagaggatagtggatctgcaccttcaggcccatgcttcaaggagatttgcttgattcaa 26168360  T
Q  298 atcagagtacacgttatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtg 397  Q
    |||| || | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26168359 atcataggatacgttatctctgatgcaagatctccttttgctagctttttcatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagaagtg 26168260  T
Q  398 aacattatgatctcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaa 473  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26168259 aacattctgatctcagaatgttccatttgttcttactttaggttgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaa 26168184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 6 - 496
Target Start/End: Original strand, 790997 - 791488
Alignment:
Q  6 gatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctg 105  Q
    |||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  790997 gatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcatcagaatgtt-gatattcatgatgttcttcatctgagttcatcaatgatgaatgtctgatgagtttctg 791095  T
Q  106 ggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaa-gttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagt 204  Q
    |||     |||  |||||||||||||||||| | |||||||||  ||||| || |||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||||    
T  791096 ggttttctcaaggcgtgacatgagatttgtt-aggttttatccaccaaaaagtaacttctccatatgcataaaaagctgctggataaagtaggataaagt 791194  T
Q  205 tgattcaaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgca-tcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcaga 303  Q
    |||  |||||||  ||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    | |||    
T  791195 tgaaccaaatctgccttggatattgtgcagga-agagaggatagtggatctgcaatcttcaggcccatgcttccaggagatttgcttgattttgttaaga 791293  T
Q  304 gtacacgttatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacatt 403  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  791294 gtacaagttatctctgatgcaagatctccttttgctagctttttcttctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcaggagtgaacatt 791393  T
Q  404 atgatc-tcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactctaatattaa-aacacaactga 496  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  791394 ctgatcttcagaatgttccatttgttcttactttaggttgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaaacctaatagtaacaacacaactga 791488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 17824366 - 17823929
Alignment:
Q  21 gttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggtccatccaatacg 120  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||     
T  17824366 gttgctgtgttcttcatcagaatgtttggtattcatgatgttcttcatctgggttcatcaatgatgaatgtctgatgagtttctggatttatctaataca 17824267  T
Q  121 tgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaa-gttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgattcaaatctatc 219  Q
    ||||||||||||||||   | ||||| |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |          ||||||||||    ||||||| ||    
T  17824266 tgacatgagatttgttgg-gctttattcaccaaaaagtaacttctccatatgcatcaaaagttgat----------ggataaagttac--caaatctgtc 17824180  T
Q  220 ttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgca-tcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagagtacacgttatctct 318  Q
    ||| | |||||||||||||||||    |||| ||||||| | ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    || |||||||||||||||||    
T  17824179 ttgaatttggtgcaggagagagac---agtgtatctgcaattttcaggcacatgcttcaaggggatttgcttgattttgttcggagtacacgttatctct 17824083  T
Q  319 gatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacattatgatc-tcagaatg 417  Q
    ||||||||| |||  ||||||| ||||| | |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||| | ||||||||    
T  17824082 gatgcaagatctccctttgctatctttttcttctttctaccaactacactattcatagctggaagcatgtgcaaaagtgaacattctgaccatcagaatg 17823983  T
Q  418 ttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaa 473  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||    
T  17823982 tttcatttgctcttactttaggatgatatgtaagact--acttttgatgtaatcaa 17823929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 318 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 26161877 - 26161699
Alignment:
Q  318 tgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacattatgatctcagaatg 417  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  26161877 tgatgcaagatctccttttgctagctttttcatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagaagtgaacattctgatctcagaatg 26161778  T
Q  418 ttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactctaatattaaaacacaactga 496  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26161777 ttccatttgttcttactttaggttgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactctaatagtaaaacacaactga 26161699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 6 - 185
Target Start/End: Original strand, 18706116 - 18706295
Alignment:
Q  6 gatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctg 105  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18706116 gatgaacatcagaatgttgctgtgttcttcatcaaaatgtttggtattcatgatgttcttcatctgggttcatcaatgatgaatgtctgatgagtttctg 18706215  T
Q  106 ggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgct 185  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18706216 ggtttatccaatacgtgacatgagatttgttcaggttttatccttaaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgct 18706295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 83 - 473
Target Start/End: Original strand, 30657981 - 30658377
Alignment:
Q  83 gatgaatgtctgatgagtttctgggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaa-gttacttctccatatgcatcaaaagt 181  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  30657981 gatgaatgtttgatgagtttctgagtttatccaatacgtgacatgagatttgttgg-gctttatccaccaaaaagtaacttctccatatgcatcaaaagt 30658079  T
Q  182 tgcttgaaaaagtaggataaagttgattcaaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgc-atcttcaggctcatggttcaagg 280  Q
    || | || ||||||||||||||||    ||||||| ||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||  |||| ||| |||    
T  30658080 tgatggataaagtaggataaagtt--accaaatctgtcttggacttggtgcaggagaga---gatagtggatctgcaatcttcaggtccatgcttctagg 30658174  T
Q  281 agatttgcttgattcatatcagagtacacgttatctctgatgcaagagctcattttgctagctttt--------cc---atctttccaccaactacactg 369  Q
    ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  |   ||||        ||    |||||| |||||||||||||    
T  30658175 agatttgcttgattttgttcagagtacacgttatctctgatgcaagatctcctttttttttttttttttttttacctttttctttctaccaactacactg 30658274  T
Q  370 ttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacattatgatc-tcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgta 468  Q
    ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  30658275 ttcgtagctggaagcatgtgcagaagtgaacattctgaccatcagaatgtttcatttgctcttactttaggatgatttgtaagact--acttttgatgta 30658372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 246 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 16923634 - 16923424
Alignment:
Q  246 tagtggatctgcatcttc-aggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagagtacacgttatctctgatgcaagagctcattttgctagctt 344  Q
    |||||||||||||| ||  |||| |||| ||| |||||||||| ||||||    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    |    
T  16923634 tagtggatctgcattttttaggcccatgcttctaggagatttgtttgattttgttcagtgtacacgttatctctgatgcaagatctccttttgctttgct 16923535  T
Q  345 ttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacattatgatc-tcagaatgttccatttgttcttactttaggatga 443  Q
    | | |  ||| || |||||||||||||| | | |  |||||||||||||  |||||||| ||| | | |||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  16923534 tgctaaattttcatcaactacactgttcgtagttaaaagcatgtgcagagatgaacattctgaccataagaatgtttcatttgctcttactttaagatga 16923435  T
Q  444 tttgtaagact 454  Q
    |||||||||||    
T  16923434 tttgtaagact 16923424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 381 - 454
Target Start/End: Original strand, 27787698 - 27787770
Alignment:
Q  381 aagcatgtgcagacgtgaacattatgatc-tcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagact 454  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  27787698 aagcatgtgcagagctgaacattctgatcatcagaatgttccttttgtt-tcactt-aggatgatttgtaagact 27787770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 60
Target Start/End: Original strand, 30657931 - 30657984
Alignment:
Q  6 gatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatg 60  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  30657931 gatgaacatcagaatgttgctgtgttcttcatcagaatg-ttgatgttcatgatg 30657984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 18201486 - 18201430
Alignment:
Q  35 catcagaatgtt-tgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatg 90  Q
    |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  18201486 catcagaatgttgttatgttcatgatgatcttcatctgggttcatcatgtatgaatg 18201430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 380; Significance: 0; HSPs: 26)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 496
Target Start/End: Original strand, 27274154 - 27274644
Alignment:
Q  6 gatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctg 105  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27274154 gatgaacatcagaatgttgctgtgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagttcctg 27274253  T
Q  106 ggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt 205  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27274254 ggtccatccaatacatgacaggggatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt 27274353  T
Q  206 gattcaaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgc-atcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagag 304  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27274354 gattcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagagaggatagtggatctgcaatcttcaggcccatgctttaaggagatttgcttgattcatctcagag 27274453  T
Q  305 tacacgttatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacatta 404  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  27274454 tacacgttatctctgatgcaagatctc-ctttgctagcttttccatctttccaccaactacattgttcatggctggaagcatgtgcagaagtgaacattc 27274552  T
Q  405 tgatctcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactctaatattaaaacacaactga 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| | ||||||||    
T  27274553 tgatctcagaatgttccatttgttcttactttaggttgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaaacctaatagtaagatacaactga 27274644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 31917095 - 31916604
Alignment:
Q  6 gatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctg 105  Q
    |||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31917095 gatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttctttatcggggttcatcaaggatgaatgtctgatgagttcctg 31916996  T
Q  106 ggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31916995 ggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccctcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagtttcttgaaaaagtaggataaagtt 31916896  T
Q  206 gattcaaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgc-atcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagag 304  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31916895 gattcaaatctgtcttggatttggtgcaggagaaagaggatagtggatctgcaatcttcaggcccatgcttcaaggagatttgcttgattcatatcaaag 31916796  T
Q  305 tacacgttatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacatta 404  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||     
T  31916795 tacacgttatctctgatgcaagatctccttttgctagcgtttccatctttccactaactacactgttcatggctggaagcatgtgcataagtgaacattc 31916696  T
Q  405 tgatctcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactctaatattaaaacacaactga 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||    
T  31916695 tgatctcagaatgttccatttgttcttactttaggttgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaaacctaatagtaagacacaactga 31916604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 496
Target Start/End: Original strand, 37298787 - 37299278
Alignment:
Q  6 gatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctg 105  Q
    |||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  37298787 gatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtcagatgagtgtctg 37298886  T
Q  106 ggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt 205  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37298887 ggtccattccatacgtgacatgagatttgttcaagttatatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaagataaagtt 37298986  T
Q  206 gattcaaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgc-atcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagag 304  Q
    || |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37298987 gaatcaaatctgtcttggatttggtgcaagagagagaggatagtggatctgcaatcttcaggcccatgcttcaaggagatttgcttgattcatctcagag 37299086  T
Q  305 tacacgttatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacatta 404  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  37299087 tacacgttatctctgatgcaagatctccttttgctagtttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagaagtgaacattc 37299186  T
Q  405 tgatctcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactctaatattaaaacacaactga 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||    
T  37299187 tgatctcagaatgttccatttgttcttactttaggttgatttataagacttaacttttaatgtaatcaaacctaatattaagatacaactga 37299278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 470
Target Start/End: Original strand, 34130462 - 34130927
Alignment:
Q  6 gatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctg 105  Q
    |||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34130462 gatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctg 34130561  T
Q  106 ggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt 205  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  34130562 ggaccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaatgttacttctccaaatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtagaaaaaagtt 34130661  T
Q  206 gattcaaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgc-atcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagag 304  Q
    || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34130662 gaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagagaggatagtggatctgcaatcttcaggcccatgcttcaaggagatttgcttgattcatatcagag 34130761  T
Q  305 tacacgttatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacatta 404  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  34130762 tacacgttatctctgatgcaatatctccttttgctagctttttcatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagaagtgaacattc 34130861  T
Q  405 tgatctcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaat 470  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34130862 tgatctcagaatgttccatttcttcttactttaggttgatttgtaagacttaacttttaatgtaat 34130927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 496
Target Start/End: Original strand, 37548609 - 37549068
Alignment:
Q  35 catcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggtccatccaatacgtgacatgagatttg 134  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37548609 catcagaatgtttaatattcataatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggtccatccaatacgtgacatgagatttg 37548708  T
Q  135 ttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgattcaaatctatcttggaattggtgcag 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  37548709 ttcaagttttatccttcaaaagttacttctccat-tgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgatt-aaatctgtcttggatttggtgcag 37548806  T
Q  235 gagagagaggatagtggatctgca-tcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagagtacacgttatctctgatgcaagagctcat 333  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| |    
T  37548807 gaaagagaggatagtggatctgcaatcttcaggcccatgcttcaaggagatttgcttgattcatctcagagtacacgttatctttgatgcaagatctc-t 37548905  T
Q  334 tttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacattatgatctcagaatgttccatttgttcttac 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37548906 tttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagaagtgaacattctgatctcagaatgttccatttgttcttac 37549005  T
Q  434 tttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactctaatattaaaacacaactga 496  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| | ||||||||    
T  37549006 tttaggttgatttataagacttaacttttaatgtaatcaaacctaatagtaagatacaactga 37549068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 473
Target Start/End: Original strand, 4037952 - 4038420
Alignment:
Q  6 gatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctg 105  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  4037952 gatgaacatcagaatgttgctgtgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatccaggatgaatgtctgatgagttcctg 4038051  T
Q  106 ggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt 205  Q
     || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4038052 agttcatccaatacgtgacctgagatttgttcaagttttatccctcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt 4038151  T
Q  206 gattcaaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgc-atcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagag 304  Q
    ||  ||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    ||||||    
T  4038152 gaaacaaatatgtcttggatttggtgaaggagagagaggatagtggatctgcaatcttcaggcccatgcttcaaggagatttgcttgattttgttcagag 4038251  T
Q  305 tacacgttatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacatta 404  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  4038252 tacacgttatctctgatgcaagatctccttttgctaacttttccatctttccaccaactacactgttcatggctgaaagcatgtgcagacgtgaacattc 4038351  T
Q  405 tgatctcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaa 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4038352 tgatctcagaatgttccatttgttcttactttaggttgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaa 4038420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 34 - 496
Target Start/End: Original strand, 18209806 - 18210275
Alignment:
Q  34 tcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggtccatccaatacgtgacatgagattt 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  18209806 tcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtcagatgagtttctggatccattccatacgtgacatgagattt 18209905  T
Q  134 gttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgattcaaatctatcttggaattggtgca 233  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  18209906 gttcaagtgttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgca 18210005  T
Q  234 g------gagagagaggatagtggatctgca-tcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagagtacacgttatctctgatgcaag 326  Q
           |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18210006 aaagagagagagagaggatagtggatctgcaatcttcaggcccatgcttcaaggagatttgcttgattcatctcagagtacacgttatctctgatgcaag 18210105  T
Q  327 agctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacattatgatctcagaatgttccatttg 426  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18210106 atctccttttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagaagtgaacattctgatctcagaatgttccatttg 18210205  T
Q  427 ttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactctaatattaaaacacaactga 496  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| | ||||||||    
T  18210206 ttcttactttaggttgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaaacctaatagtaagatacaactga 18210275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 34 - 496
Target Start/End: Original strand, 18219144 - 18219613
Alignment:
Q  34 tcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggtccatccaatacgtgacatgagattt 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  18219144 tcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtcagatgagtttctggatccattccatacgtgacatgagattt 18219243  T
Q  134 gttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgattcaaatctatcttggaattggtgca 233  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  18219244 gttcaagtgttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgca 18219343  T
Q  234 g------gagagagaggatagtggatctgca-tcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagagtacacgttatctctgatgcaag 326  Q
           |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18219344 aaagagagagagagaggatagtggatctgcaatcttcaggcccatgcttcaaggagatttgcttgattcatctcagagtacacgttatctctgatgcaag 18219443  T
Q  327 agctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacattatgatctcagaatgttccatttg 426  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18219444 atctccttttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagaagtgaacattctgatctcagaatgttccatttg 18219543  T
Q  427 ttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactctaatattaaaacacaactga 496  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| | ||||||||    
T  18219544 ttcttactttaggttgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaaacctaatagtaagatacaactga 18219613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 34 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 21681902 - 21681435
Alignment:
Q  34 tcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggtccatccaatacgtgacatgagattt 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  21681902 tcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtcagatgagtttctggatccattccatacgtgacatgagattt 21681803  T
Q  134 gttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgattcaaatctatcttggaattggtgca 233  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  21681802 gttcaagtgttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgca 21681703  T
Q  234 ----ggagagagaggatagtggatctgc-atcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagagtacacgttatctctgatgcaagag 328  Q
         ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  21681702 aaagagagagagaggatagtggatctgcaatcttcaggcccatgcttcaaggagatttgcttgattcatctcagagtacacgttatctctgatgcaagat 21681603  T
Q  329 ctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacattatgatctcagaatgttccatttgtt 428  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21681602 ctccttttgctagcttttccatctttccaccaactacattgttcatggctggaagcatgtgcagaagtgaacattctgatctcagaatgttccatttgtt 21681503  T
Q  429 cttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactctaatattaaaacacaactga 496  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| | ||||||||    
T  21681502 cttactttaggttgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaaacctaatagtaagatacaactga 21681435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 496
Target Start/End: Original strand, 22173225 - 22173713
Alignment:
Q  6 gatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctg 105  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  22173225 gatgaacatcagaatgttgctgtgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtcagatgggtttctg 22173324  T
Q  106 ggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt 205  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22173325 ggtccattccatacgtgacatgagatatgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt 22173424  T
Q  206 gattcaaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgc-atcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagag 304  Q
    ||  ||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  22173425 gaaccaaatctgtcttggatttggtgcag--gagagaggatagtggatctgcaatcttcaggcccatgcttcaaggagatttgttggattcatctcagag 22173522  T
Q  305 tacacgttatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacatta 404  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  22173523 tacacgttatctctgatgcaagatctc-ctttgctagcttttccacctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagaagtgaacattc 22173621  T
Q  405 tgatctcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactctaatattaaaacacaactga 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| | ||||||||    
T  22173622 tgatctcagaatgttccatttgttcttactttaggttgatttataagacttaacttttaatgtaatcaaacctaatagtaagatacaactga 22173713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 34 - 496
Target Start/End: Original strand, 19888353 - 19888817
Alignment:
Q  34 tcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggtccatccaatacgtgacatgagattt 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  19888353 tcatcagaatgtttgatattcatgatgctcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtcagatgagtttctggatccattccatacgtgacatgagattt 19888452  T
Q  134 gttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgattcaaatctatcttggaattggtgca 233  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  19888453 gttcaagtgttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgca 19888552  T
Q  234 --ggagagagaggatagtggatctgc-atcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagagtacacgttatctctgatgcaagagct 330  Q
       ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19888553 agagagagagaggatagtggatctgcaatcttcaggcccatgcttcaaggagatttgcttgattcatatcagagtacacgttatctctgatgcaagatct 19888652  T
Q  331 cattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacattatgatctcagaatgttccatttgttct 430  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19888653 c-ctttgctagcttttccatctttccaccaactacactgtttatggctggaagcatgtgcagaagtgaacattctgatctcagaatgttccatttgttct 19888751  T
Q  431 tactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactctaatattaaaacacaactga 496  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||    
T  19888752 tactttaggttgatctgtaagacttaacttttaatgtaatcaaacctaatagtaagacacaactga 19888817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 496
Target Start/End: Original strand, 13571653 - 13572143
Alignment:
Q  6 gatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctg 105  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  13571653 gatgaacatcagaatgttgctgtgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtcagatgggtttctg 13571752  T
Q  106 ggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt 205  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13571753 ggtccattccatacgtgacatgagatatgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt 13571852  T
Q  206 gattcaaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgc-atcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagag 304  Q
    ||  ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || | ||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  13571853 gaaccaaatctgtcttggatttggtgcaagagagagaggatagtggatctgcaatcttcaggcccatgctttacggagagttgctggattcatctcagag 13571952  T
Q  305 tacacgttatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacatta 404  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||     
T  13571953 tacacgttatctctgatgcaagatttc-ctttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagaaatgaacattc 13572051  T
Q  405 tgatctcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactctaatattaaaacacaactga 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| | ||||||||    
T  13572052 tgatctcagaatgttccatttgttcttactttaggttgatttgaaagacttaacttttaatgtaatcaaacctaatagtaagatacaactga 13572143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 496
Target Start/End: Original strand, 30943798 - 30944249
Alignment:
Q  35 catcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggtccatccaatacgtgacatgagatttg 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30943798 catcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgggtttctgggtccatccaatacgtgacatgagatttg 30943897  T
Q  135 ttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgattcaaatctatcttggaattggtgcag 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  30943898 ttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcag 30943997  T
Q  235 gagagagaggatagtggatctgc-atcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagagtacacgttatctctgatgcaagagctcat 333  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  30943998 gaaagagaggatagtggatctgcaatcttcaggcccatgcttcaaggagatttgct-----------agagtacacgttatctctgatgcaagatctcct 30944086  T
Q  334 tttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacattatgatctcagaatgttccatttgttcttac 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30944087 tttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagaagtgaacattctgatctcagaatgtttcatttgttcttac 30944186  T
Q  434 tttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactctaatattaaaacacaactga 496  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| | ||||||||    
T  30944187 tttaggttgatttataagacttaacttttaatgtaatcaaacctaatagtaagatacaactga 30944249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 37817881 - 37817392
Alignment:
Q  6 gatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctg 105  Q
    |||| |||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  37817881 gatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcattagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtcagatgggtttctg 37817782  T
Q  106 ggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt 205  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37817781 ggtccattccatacgtgacatgagatatgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt 37817682  T
Q  206 gattcaaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgc-atcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagag 304  Q
    ||  ||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37817681 gaaccaaatctgtcttggatttggtgcaggag--agaggatcgtggatctgcaatcttcaggcccatgcttcaaggagatttgcttgattcatctcagag 37817584  T
Q  305 tacacgttatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacatta 404  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  37817583 tacacgttatctctgatgcaagatctccttttgctagctttttgatcttttcaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagaagtgaacattc 37817484  T
Q  405 tgatctcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactctaatattaaaacacaactga 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| | ||||||||    
T  37817483 tgatctcagaatgttccatttgttctttctttaggttgatttgaaagacttaacttttaatgtaatcaaacctaatagtaagatacaactga 37817392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 496
Target Start/End: Original strand, 30953220 - 30953671
Alignment:
Q  35 catcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggtccatccaatacgtgacatgagatttg 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30953220 catcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctggattcatcaaggatgaatgtctgatgggtttctgggtccatccaatacgtgacatgagatttg 30953319  T
Q  135 ttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgattcaaatctatcttggaattggtgcag 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  30953320 ttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcag 30953419  T
Q  235 gagagagaggatagtggatctgc-atcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagagtacacgttatctctgatgcaagagctcat 333  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  30953420 gaaagagaggatagtggatctgcaatcttcaggcccatgcttcaaggagatttgct-----------agagtacacgttatctctgatgcaagatctcct 30953508  T
Q  334 tttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacattatgatctcagaatgttccatttgttcttac 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30953509 tttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagaagtgaacattctgatctcagaatgtttcatttgttcttac 30953608  T
Q  434 tttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactctaatattaaaacacaactga 496  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| | ||||||||    
T  30953609 tttaggttgatttataagacttaacttttaatgtaatcaaacctaatagtaagatacaactga 30953671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 13 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 20764630 - 20764151
Alignment:
Q  13 atcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggtccat 112  Q
    |||| ||||||||| |||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  20764630 atcagaatgttgctgtgttctgcattggaatgtttggtattcatgatgttcttcatctgggttcatcaatgatgaatgtctgatgagtttctaggtttat 20764531  T
Q  113 ccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgattcaa 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||    
T  20764530 ccaatacgtgacatgagatttgttcaggttttatccttaaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt--accaa 20764433  T
Q  213 atctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgcatcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagagtacacgtt 312  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| | || || |||||||    
T  20764432 atctgtcttggactttgtgcaggagagagaggatagtggatctgcatcttcaggcccatgcttcaagtagatttgcttgattcaaaccaaaggacacgtt 20764333  T
Q  313 atctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacattatgatc-tc 411  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||| | ||    
T  20764332 atctctgatgcaagatttcattttgctagctttttcatctttccaccaactac---gttcatggctggaagcatatgcagaaatgaacattttgaccttc 20764236  T
Q  412 agaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactctaatattaaaacacaactga 496  Q
    | |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  20764235 aaaatgtttcttttgttcttactttaggttgatttgtaagacttaacttttaatgtaattaactctaatagtaaaacacaactga 20764151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 13 - 496
Target Start/End: Original strand, 42090498 - 42090980
Alignment:
Q  13 atcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggtccat 112  Q
    |||| ||||||| | |||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||  ||    
T  42090498 atcagaatgttgatgtgttgttcaccagaacgtttggtattcatgatgttcttcatctaggttcatcaacgatgaatgtctgatgagtttatgagtttat 42090597  T
Q  113 ccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgattcaa 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||    |||    
T  42090598 ccaatacgtgacatgagatttgttcaggttttacccttaaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgctggataaagtaggataaaattac--caa 42090695  T
Q  213 atctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgcatcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagagtacacgtt 312  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  42090696 atctgtcttggacttggtgcatgagagagaggatagtggatctgcatcttcagtcccatgcttcaatgagatttgcttgattcaaatcagaggacacgtt 42090795  T
Q  313 atctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacattatgatc-tc 411  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||  |||||||| ||| | ||    
T  42090796 atctctgatgcaagatctccttttgctagctttttcatctttccaccaactacattgttcatggttagaagcatgtgcagaaatgaacattctgaccttc 42090895  T
Q  412 agaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactctaatattaaaacacaactga 496  Q
     ||||||| | ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42090896 ggaatgtttcttttgttcttactttagtttgatttttaagacttaacttttaatgtaatcaactctaatagtaaaacacaactga 42090980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 35 - 272
Target Start/End: Original strand, 37648003 - 37648239
Alignment:
Q  35 catcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggtccatccaatacgtgacatgagatttg 134  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37648003 catcagaatgtttaatattcataatgttcttcgtctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggtccatccaatacgtgacatgagatttg 37648102  T
Q  135 ttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgattcaaatctatcttggaattggtgcag 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  37648103 ttcaagttttatccttcaaaagttacttctccat-tgcatcaaaagttgcttgaaaaaataggataaagttgatt-aaatctgtcttggatttggtgcag 37648200  T
Q  235 gagagagaggatagtggatctgc-atcttcaggctcatg 272  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  37648201 gaaagagaggatagtggatctgcaatcttcaggcccatg 37648239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 5 - 454
Target Start/End: Original strand, 205451 - 205898
Alignment:
Q  5 agatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttct 104  Q
    ||||| ||| || ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  205451 agatgaacaccagaatgttgttgtgttcttcatcagaatgtt-gatattcatgatgttcttcatttgggttcatcaatgatgaatgtcttatgagtttct 205549  T
Q  105 gggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttc-aaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaag 203  Q
     |||   | ||||  ||||||||| |||||||   |||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  205550 aggtttgttcaatttgtgacatgatatttgtt-gggttttatccaccaaaaagtaacttctccatatgcatcaaaagttgttggataaagtaggataaag 205648  T
Q  204 ttgattcaaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgc-atcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcag 302  Q
    ||   |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    ||||    
T  205649 tt--atcaaatctgtcttggacttggtgcaggagagaga-gatagtggatctgcaatcttcaggcccatgcttctaggagatttgcttgattttgttcag 205745  T
Q  303 agtacacgttatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacat 402  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||    || | | |||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||  |||||||    
T  205746 agtacacgttatctctaatggaagatctccttttgctttgcttgctaacttttcaccaactacactgttcatagttagaagcatgtgcagagatgaacat 205845  T
Q  403 tatgatc-tcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagact 454  Q
    | ||| | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  205846 tctgaccatcagaatgtttcatttgctcttactttaggatgatttgtaagact 205898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 269 - 496
Target Start/End: Original strand, 37651640 - 37651866
Alignment:
Q  269 catggttcaaggagatttgcttgattcatatcagagtacacgttatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacact 368  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37651640 catgcttcaaggagatttgcttgattcatctcagagtacacgttatctttgatgcaagatctc-ttttgctagcttttccatctttccaccaactacact 37651738  T
Q  369 gttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacattatgatctcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgta 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  37651739 gttcatggctggaagcatgtgcagaagtgaacattctgatctcagaatgttccatttgttcttactttaggttgatttataagacttaacttttaatgta 37651838  T
Q  469 atcaactctaatattaaaacacaactga 496  Q
    |||||  |||||| ||| | ||||||||    
T  37651839 atcaaacctaatagtaagatacaactga 37651866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 20897220 - 20896769
Alignment:
Q  18 aatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggtccatccaat 117  Q
    ||||||| | |||||||||| |||||| | ||| || |||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||| |   | ||||    
T  20897220 aatgttgttgtgttcttcataagaatgat-gatgtttatgatgttattcatctgggttcatctttgatgaatgtatgatgagtttctggatttgttcaat 20897122  T
Q  118 acgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaa-gttgcttgaaaaagtaggataaagttgattcaaatct 216  Q
     |||| |||  |||||  | | | ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| |  |||||||    
T  20897121 gcgtgccatatgattttct-aggctttatccataaaaagttacttctctatatgcatcaaaaagttgctggataaagtaggataaagttaac-caaatct 20897024  T
Q  217 atcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgcatcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagagtacacgt-tatc 315  Q
       ||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||  | |||| ||  | |||||||| |||||||  |||| || ||| || ||||    
T  20897023 gcattgaacttggtgcaggagagaga--atagtggatctgcagtttcatacccatgcttataagagatttggttgattctgatcaaaggacatgtctatc 20896926  T
Q  316 tctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacattatgatct-caga 414  Q
    ||||| |||||||||| |||||||    || | | |||| |||||||||||||| |||| | | ||||| ||||||||  |||||||| ||| || ||||    
T  20896925 tctga-gcaagagctccttttgctttacttgctaacttttcaccaactacactgctcatagttagaagcttgtgcagagatgaacattctgaccttcaga 20896827  T
Q  415 atgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaa 473  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  20896826 atgttcctttttttcttactttagaatgatttgtaagactt-acttttgatgtaatcaa 20896769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 6 - 456
Target Start/End: Original strand, 20904508 - 20904955
Alignment:
Q  6 gatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctg 105  Q
    |||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||  || ||  ||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| |||||| ||||||    
T  20904508 gatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcatcagaacgtta-atttttttgatgtttttcatctaggttcatcattgatgaatgtatgatgaatttctg 20904606  T
Q  106 ggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaa-gttgcttgaaaaagtaggataaagt 204  Q
    |||   | ||||  ||| |||  ||||| | | || ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  20904607 ggtttgttcaatgtgtgccatatgattt-tccgagctttatccataaaaagttacttctccatttgcatcaaaaagttgctggataaagtaggataaagt 20904705  T
Q  205 tgattcaaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgcatcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagag 304  Q
    | |  |||||||   ||| |  ||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||| || |||| ||  ||||||||| |||||||   |||| ||    
T  20904706 taac-caaatctgcattgaacatggtgcatgagagaga--atagtggacctgcatcttcaagcccatgcttataggagattttcttgattatgatcaaag 20904802  T
Q  305 tacacgt-tatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacatt 403  Q
     ||| || ||||||||| ||||||| || |||||||    || | | |||| |||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||  | | ||||    
T  20904803 gacatgtctatctctga-gcaagagttccttttgctttgcttgctaacttttcaccaactacactgctcatagttagaagcatgtgcagagataaccatt 20904901  T
Q  404 atgatct-cagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagactta 456  Q
     ||| || || |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20904902 ctgaccttcataatgttcctttttttcttactttagaatgatttgtaagactta 20904955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 19780867 - 19780782
Alignment:
Q  6 gatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtc 92  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  19780867 gatgaacatcagaatgttgctgtgttcttcatcagaatgtt-gatattcatgatgttcttcatctaggttcatcaatgatgaatgtc 19780782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 117
Target Start/End: Original strand, 21483780 - 21483890
Alignment:
Q  6 gatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctg 105  Q
    |||| |||||| ||||||| | |||||||||||| |||||| ||| ||||| ||| ||||||||| ||||||| |   |||||||| |||||||||||||    
T  21483780 gatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcatcaaaatgtt-gatgttcattatgatcttcatctaggttcattatttatgaatgtatgatgagtttctg 21483878  T
Q  106 ggtccatccaat 117  Q
    |||  |||||||    
T  21483879 ggtttatccaat 21483890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 381 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 31105343 - 31105271
Alignment:
Q  381 aagcatgtgcagacgtgaacattatgatc-tcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagact 454  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  31105343 aagcatgtgcagagctgaacattatgatcatcagaatgttccttttgtt-tcac-ttaggatgatttgtaagact 31105271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 381 - 455
Target Start/End: Original strand, 21484164 - 21484238
Alignment:
Q  381 aagcatgtgcagacgtgaacattatgatc-tcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagactt 455  Q
    ||||||||||| |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | || | |||||||||||||||||||    
T  21484164 aagcatgtgcatagctgaacattgtgatcatcagaatgttccatttgttttcacct-aggatgatttgtaagactt 21484238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0553 (Bit Score: 376; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0553
Description:

Target: scaffold0553; HSP #1
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 496
Target Start/End: Original strand, 628 - 1119
Alignment:
Q  6 gatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctg 105  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  628 gatgaacatcagaatgttgctctgttcttcataagaatgtttgattttcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctt 727  T
Q  106 ggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt 205  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  728 ggaccatccattacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt 827  T
Q  206 gattcaaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgc-atcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagag 304  Q
    || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  828 gaatcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagagaggatagtggatctgcaatcttcaggcccatgcttcatggagatttgcttgattcatatcagag 927  T
Q  305 tacacgttatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacatta 404  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  928 tacactttatctctgatgcaagatctccttttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagaagtgaacattc 1027  T
Q  405 tgatctcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactctaatattaaaacacaactga 496  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| | ||||||||    
T  1028 tgatcttagaatattccatttgttcttactttaggttgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaaacctaatagtaagatacaactga 1119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 375; Significance: 0; HSPs: 13)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 13674508 - 13674046
Alignment:
Q  35 catcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggtccatccaatacgtgacatgagatttg 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13674508 catcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgggtttctgggtccatccaatacgtgacatgagatttg 13674409  T
Q  135 ttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgattcaaatctatcttggaattggtgcag 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  13674408 ttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaatcaaatctgtcttggatttggtgcag 13674309  T
Q  235 gagagagaggatagtggatctgc-atcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagagtacacgttatctctgatgcaagagctcat 333  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  13674308 gaaagagaggatagtggatctgcaatcttcaggcccatgcttcaaggagatttgcttgattcatctcagagtacacgttatctctgatgcaagatctcct 13674209  T
Q  334 tttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacattatgatctcagaatgttccatttgttcttac 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13674208 tttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagaagtgaacattctgatctcagaatgtttcatttgttcttac 13674109  T
Q  434 tttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactctaatattaaaacacaactga 496  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| | ||||||||    
T  13674108 tttaggttgatttataagacttaacttttaatgtaatcaaacctaatagtaagatacaactga 13674046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 494
Target Start/End: Original strand, 33773907 - 33774396
Alignment:
Q  6 gatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctg 105  Q
    |||| |||||| ||||||| | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33773907 gatgaacatcagaatgttgttgtgatattcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggatcatcaaggatgaaagtctgatgagtttctg 33774006  T
Q  106 ggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt 205  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33774007 ggtcaatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccctcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt 33774106  T
Q  206 gattcaaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgc-atcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagag 304  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33774107 gattcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagagaggatagtggatctgcaatcttcaggcccatgcttcaaggagatttgcttgattcatataagag 33774206  T
Q  305 tacacgttatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacatta 404  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  33774207 tacacgttatctctgatgcaagatctccttctgctagcttttccatctttccactaattacactgttcatggctggaagcatgtgcagaagtgaacattc 33774306  T
Q  405 tgatctcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactctaatattaaaacacaact 494  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| | ||||||    
T  33774307 tgatctcagaatgttccatttgttcttactttaggttgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaaacctaatagtaagatacaact 33774396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 496
Target Start/End: Original strand, 14881464 - 14881954
Alignment:
Q  6 gatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctg 105  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14881464 gatgaacatcagaatgttgctgtgttctttattagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggtttatcaaggatgaatgtcagatgagtttctg 14881563  T
Q  106 ggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt 205  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14881564 ggtccattccatacgtgacatgagatatgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt 14881663  T
Q  206 gattcaaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgc-atcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagag 304  Q
    ||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  14881664 gaaacaaatctgtcttggatttggtgcaggagagagaggatagtggatctgcaatcttcaggcccatgcttcaaggagatttgctggattcatctcagag 14881763  T
Q  305 tacacgttatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacatta 404  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  14881764 tacacgttatctctgatgcaagatctc-ctttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagaagtgaacattc 14881862  T
Q  405 tgatctcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactctaatattaaaacacaactga 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| | ||||||||    
T  14881863 tgatctcagaatgttccatttgttcttactttaggttgatttataagacttaacttttaatgtaatcaaacctaatagtaagatacaactga 14881954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 496
Target Start/End: Original strand, 14893814 - 14894304
Alignment:
Q  6 gatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctg 105  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14893814 gatgaacatcagaatgttgctgtgttctttattagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggtttatcaaggatgaatgtcagatgagtttctg 14893913  T
Q  106 ggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt 205  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14893914 ggtccattccatacgtgacatgagatatgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt 14894013  T
Q  206 gattcaaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgc-atcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagag 304  Q
    ||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  14894014 gaaacaaatctgtcttggatttggtgcaggagagagaggatagtggatctgcaatcttcaggcccatgcttcaaggagatttgctggattcatctcagag 14894113  T
Q  305 tacacgttatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacatta 404  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  14894114 tacacgttatctctgatgcaagatctc-ctttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagaagtgaacattc 14894212  T
Q  405 tgatctcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactctaatattaaaacacaactga 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| | ||||||||    
T  14894213 tgatctcagaatgttccatttgttcttactttaggttgatttataagacttaacttttaatgtaatcaaacctaatagtaagatacaactga 14894304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 496
Target Start/End: Original strand, 20531098 - 20531586
Alignment:
Q  6 gatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctg 105  Q
    |||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20531098 gatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaatgatgaatgtctgatgagtttctg 20531197  T
Q  106 ggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt 205  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20531198 agttcatccaatacgtgacatgagatttgttcatgttttatccttaaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt 20531297  T
Q  206 gattcaaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgcatcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagagt 305  Q
        ||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||     
T  20531298 ac--caaatttgtcttggattttgtgcaggagagagaggatagtggatctgcatcttcaggcccatgcttcaaggagatttgctttattcaaattagagg 20531395  T
Q  306 acacgttatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacattat 405  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  20531396 acacgttatctctgatgcaagatctccttttgctagctttttcatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagaagtgaacattct 20531495  T
Q  406 gatctcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactctaatattaaaacacaactga 496  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  20531496 gatctcagaatgttccatttgttcgtactttaggttgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaaacctaatagtaaaacacaactga 20531586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 496
Target Start/End: Original strand, 31999019 - 31999507
Alignment:
Q  6 gatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctg 105  Q
    |||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31999019 gatgaacatcagaattttgctgtgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatggatgtctgatgagtttctg 31999118  T
Q  106 ggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt 205  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  31999119 ggtccattccatacgtgacatgagattttttcaagttttatccttcgaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgctcgaaaaagtaagataaagtt 31999218  T
Q  206 gattcaaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgc-atcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagag 304  Q
    || |||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31999219 gaatcaaatctgtcttggatttggtgcag--gagagaggatagtggatctgcaatcttcaggcccatgcttcaaggagatttgcttgattcatctcagag 31999316  T
Q  305 tacacgttatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacatta 404  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  31999317 tacacgttatctctgatgcaagatctc-ctttgctagcttttcgatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagaagtgaacattc 31999415  T
Q  405 tgatctcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactctaatattaaaacacaactga 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| | ||||||||    
T  31999416 tgatctcagaatgttccatttgttcttactttaggttgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaaacctaatagtaagatacaactga 31999507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 6 - 297
Target Start/End: Original strand, 31991429 - 31991721
Alignment:
Q  6 gatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctg 105  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31991429 gatgaacatcagaatgttgctgtgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttcta 31991528  T
Q  106 ggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt 205  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31991529 ggtccattccatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaagataaagtt 31991628  T
Q  206 gattcaaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgc-atcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcat 297  Q
    || |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31991629 gaatcaaatatgtcttggatttggtgcaggagagagaggatagtggatctgcaatcttcaggcccatgcttcaaggagatttgcttgattcat 31991721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 11 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 5759677 - 5759198
Alignment:
Q  11 acatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggtcc 110  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      
T  5759677 acatcagaatgttgttgtgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaatgatgaatgtctgatgagtttctgggttt 5759578  T
Q  111 atccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgattc 210  Q
     |||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    |    
T  5759577 gtccaatgcgtgacataagatttgttcaaattctatccttaataagttacttctccatatgcatcaaaagttgctggataaagtaggataaagtt--acc 5759480  T
Q  211 aaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgc-atcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagagtacac 309  Q
    |||||| |||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||| || ||||||||||||| |  ||||| | | |     
T  5759479 aaatctgtcttggacattgtgcaggagagagaggataatggatctgcaatcttcaggcccatgcttctagaagatttgcttgatactgatcaggggataa 5759380  T
Q  310 gt-tatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacattatgat 408  Q
    ||  |||||||  |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||  |||||||| |||     
T  5759379 gtcaatctctg-cgcaagatctccttttgctagctttttcatctttccaccaactacactgt-------tggaagcatgtgcagaaatgaacattctgac 5759288  T
Q  409 c-tcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgt-aatcaactctaatattaaaacacaactga 496  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5759287 cttcagaatgttccatttgttcttactttaggttaatttgcaagacttaacttttgatgtaaatcaactctaatagtaaaacacaactga 5759198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Original strand, 23014788 - 23015245
Alignment:
Q  11 acatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggtcc 110  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |      
T  23014788 acatcataatgttgttgtgttcttcatcagaatgtttggtattcatgatgttcttcatctgggttcatcaatgatgaatatctgatgagtttctggattt 23014887  T
Q  111 atccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaa-gttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgatt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||        
T  23014888 atccaatacgtgacatgagatttgttga-gctttattcaccaaaaagtaacttctccatatgcatcaaaagttgatggataaagtaggataaagttac-- 23014984  T
Q  210 caaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgca-tcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagagtaca 308  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||   ||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    ||||||||||    
T  23014985 caaatctgtcttggatttggtgtaggagagaga---tagtggatctgcaatcttcaggccaatgcttcaaggagatttgcttgattttattcagagtaca 23015081  T
Q  309 cgttatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacattatgat 408  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||| | |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||     
T  23015082 cgttatctctgatgcaagatctccctttgctatctttttcttctttctaccaactacactattcatagctggaagcatgtgcaaaagtgaacattctgac 23015181  T
Q  409 c-tcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaa 473  Q
    | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  23015182 catcagaatgtttcatttgctcttactttaggatgatttgtaagact--acttttgatgtaatcaa 23015245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 6 - 473
Target Start/End: Original strand, 11430446 - 11430900
Alignment:
Q  6 gatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctg 105  Q
    |||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11430446 gatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcatcagaatgtt-gatatccatgatgttcttcatctgggttcatcaatgatgaatgtctgatgagtttctg 11430544  T
Q  106 ggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaa-gttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagt 204  Q
    |||   | |||  ||||||||||||||||||   | |||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |          |||||||||    
T  11430545 ggtttgttcaaggcgtgacatgagatttgttgg-gctttatccaccaaaaagtaacttctccatatgcatcaaaagttgtt----------ggataaagt 11430633  T
Q  205 tgattcaaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgcatcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagag 304  Q
    |||||||||| |  |||||  || ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||| ||| ||||||||| || ||||    ||||||    
T  11430634 tgattcaaatttgccttggtctttgtgcaggagagagaggatagtgagtctgcaacttcaggcccatgcttctaggagattttctagattttgttcagag 11430733  T
Q  305 tacacgttatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacatta 404  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||     
T  11430734 tacaagttatctcttatgcaagatctccttttgctacctttttcttctttctaccaactacactgttcatagctggaagcatgtgcaggagtgaacattc 11430833  T
Q  405 tgatc-tcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaa 473  Q
    ||| | |||| || || |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  11430834 tgaccatcag-atttttcatttgatcttactttaggatgatttgtaagact--acttttgatgtaatcaa 11430900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 117
Target Start/End: Original strand, 31224485 - 31224589
Alignment:
Q  12 catcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggtcca 111  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||   ||||| |||||||||||   |||||||  ||||||||||||||||  |    
T  31224485 catcagaatgttgttgtgttcttcatcagaatg-ttgatgttcatcatgacattcatatgggttcatcatttatgaatgaatgatgagtttctgggttta 31224583  T
Q  112 tccaat 117  Q
    ||||||    
T  31224584 tccaat 31224589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 122
Target Start/End: Original strand, 2690042 - 2690152
Alignment:
Q  11 acatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggtcc 110  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||    |||  |||||||||||   |||| ||| ||||||||||||||||      
T  2690042 acatcagaatgttgttatgttcttcatcagaatgtt-gatgttcatcatgacaatcagttgggttcatcatttatgagtgtatgatgagtttctgggttt 2690140  T
Q  111 atccaatacgtg 122  Q
    ||||||| ||||    
T  2690141 atccaatgcgtg 2690152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 381 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 7757694 - 7757622
Alignment:
Q  381 aagcatgtgcagacgtgaacattatgatc-tcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagact 454  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  7757694 aagcatgtgcagagctgaacattttgaccatcagaatgttccatctgtt-ttactt-aggatgatttgtaagact 7757622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433 (Bit Score: 372; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0433
Description:

Target: scaffold0433; HSP #1
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 496
Target Start/End: Original strand, 13240 - 13703
Alignment:
Q  35 catcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggtccatccaatacgtgacatgagatttg 134  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13240 catcagaatgttgaatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggtccatccaatacgtgacatgagatttg 13339  T
Q  135 ttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgattcaaatctatcttggaattggtg-ca 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  13340 ttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgattcaaatctgtcttggatttggtgtca 13439  T
Q  234 ggagagagaggatagtggatctgca-tcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagagtacacgttatctctgatgcaagagctca 332  Q
    ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  13440 ggaaagagaggataatggatctgcaatcttcaggcccatgcttcaaggagatttgcttgattcatctcagagtacacgttatctctgatgcaagatctcc 13539  T
Q  333 ttttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacattatgatctcagaatgttccatttgttctta 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13540 ttttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagaagtgaacattctgatctcagaatgttccatttgttctta 13639  T
Q  433 ctttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactctaatattaaaacacaactga 496  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| | ||||||||    
T  13640 ctttaggttgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaaacctaatagtaagatacaactga 13703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 370; Significance: 0; HSPs: 21)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 485
Target Start/End: Original strand, 20317819 - 20318300
Alignment:
Q  5 agatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttct 104  Q
    ||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20317819 agatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttattcatctaggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttct 20317918  T
Q  105 gggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagt 204  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20317919 gggaccatccaatacgtgacaaaagatttgttcaagttttatccctcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagt 20318018  T
Q  205 tgattcaaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgc-atcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcaga 303  Q
    |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20318019 tgaaacaaatctatcttggatttggtgcaggagagagaggatagtggatctgcaatcttcaagcccatgcttcaaggagatttgcttgattcatctcaga 20318118  T
Q  304 gtacacgttatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacatt 403  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20318119 gtacacgttatctctgatgcaagatctccttttgctagcttttccatttttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagaagtgaacatt 20318218  T
Q  404 atgatctcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactctaatattaa 485  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20318219 ctgatcttagaatgttccatttgttcttactttaggttgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaaacctaatattaa 20318300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 27066372 - 27065881
Alignment:
Q  6 gatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctg 105  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  27066372 gatgaacatcagaatgttgctgtgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgagtgtcagatgagtttctg 27066273  T
Q  106 ggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt 205  Q
    ||||||| | |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27066272 ggtccattccatacgtgacatgaggtatgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt 27066173  T
Q  206 gattcaaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgc-atcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagag 304  Q
    ||  ||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27066172 gaaacaaatatgtcttggatttggtgcaagagagagaggatagtggatctgcaatcttcaggcccatgcttaaaggagatttgcttgattcatctcagag 27066073  T
Q  305 tacacgttatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacatta 404  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  27066072 tacacgttatctctgacgcaagatctccttttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagaagtgaacattc 27065973  T
Q  405 tgatctcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactctaatattaaaacacaactga 496  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| | ||||||||    
T  27065972 tgatatcagaatgttccatttgttcttactttaggttgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaaacctaatagtaagatacaactga 27065881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 20309152 - 20308685
Alignment:
Q  6 gatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctg 105  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||     
T  20309152 gatgaacatcagaatgttgctgtgttcttcatcagaatctttgatattcattatgttcttcatctgggttcatccaggatgaatgtctgatgagttccta 20309053  T
Q  106 ggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt 205  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20309052 ggttcatccaatacgtgacatgagatttgttcatgttttatccctcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt 20308953  T
Q  206 gattcaaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgc-atcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagag 304  Q
    ||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20308952 gaaacaaatctgtcttggatttggtgcaggagagagaggatagtggatctgcaatcttcaggcccatgcttcaaagagatttgcttgattcatatcagag 20308853  T
Q  305 tacacgttatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacatta 404  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  20308852 tacacgttatctctgatgcaagatctc-ctttgctagcttttccatcttttcaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagaagtgaacattc 20308754  T
Q  405 tgatctcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaa 473  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20308753 tgatttcagaatgttccatttgttcttactttaggttgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaa 20308685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 496
Target Start/End: Original strand, 26193266 - 26193707
Alignment:
Q  56 tgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaa 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26193266 tgatgttcttcatctgggttcatcaatgatgaatgtatgatgagtttctgggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaga 26193365  T
Q  156 gttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgattcaaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatct 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26193366 gttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgattcaaatctgtcttggatttggtgtaggagagagaggatagtggatct 26193465  T
Q  256 gc-atcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagagtacacgttatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatcttt 354  Q
    || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  26193466 gcaatcttcaggcccatgcttcaaggagatttgcttgattttgttcagagtacacgttatctctgatgcaagatctccttttgctagcttttccatcttt 26193565  T
Q  355 ccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacattatgatctcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagact 454  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26193566 ccaccaactacactgttcatggctggaaacatgtgcagaagtgaacattctgatttcagaatgttccatttgttcttactttaggttgatttgtaagact 26193665  T
Q  455 taacttttaatgtaatcaactctaatattaaaacacaactga 496  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||| ||| ||||||    
T  26193666 taacttttaatgtaatcaaacctaatagtaagacataactga 26193707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 6 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 22961172 - 22960708
Alignment:
Q  6 gatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctg 105  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||     
T  22961172 gatgaacatcataatgttgttgtgttcttcatcagaatgtt-gatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaatgatgaatgtctgatgattttcta 22961074  T
Q  106 ggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt 205  Q
    | |   ||||||  ||||||| |||||| || | ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  22961073 gatttgtccaatgtgtgacataagatttatttaggttttatccttaaaaagttacttcttcataagcatcaaaagttgctggataaagtgggataaagtt 22960974  T
Q  206 gattcaaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgcatcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagagt 305  Q
    |   ||||| | ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||| |    ||||||     
T  22960973 gc--caaatttgtcttggactttgtgcaagagagagaggatagtggatctgcatcttcagacccatccttctaggagatttgcttgaatttgttcagagg 22960876  T
Q  306 acacgttatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacattat 405  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  | |||||| |    
T  22960875 acaagttatctctgatgcaagatctcctttttctacctttttcatctttccaccaactacattgttcatagctggaagcatgtgcagagattaacattct 22960776  T
Q  406 gatc-tcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaa 473  Q
    || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22960775 gaccatcagaatgttccttttgttcttactttaggatgatttgtaagactt-acttttaatgtaatcaa 22960708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 6 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 49333628 - 49333163
Alignment:
Q  6 gatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctg 105  Q
    |||| |||||| ||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49333628 gatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcatcaaaatgtt-gatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaatgatgaatgtctgatgagtttctg 49333530  T
Q  106 ggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttc-aaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagt 204  Q
    |||   | |||  ||||||||||||||||||  || |||||||  | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  49333529 ggtttgttcaaggcgtgacatgagatttgtt-gagctttatccaccaaaaagtaacttatccatatgcatcaaaagttgctgaataaagtaggataaagt 49333431  T
Q  205 tgattcaaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgcatcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagag 304  Q
    |||| |||||||  |||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||| ||| |||||||||||| ||||    ||||||    
T  49333430 tgatccaaatctgccttggtctttgtgcaggagagagaggatagtgggtctgcaacttcagacccatgcttctaggagatttgctagattttgttcagag 49333331  T
Q  305 tacacgttatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacatta 404  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| | |||||| | |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||     
T  49333330 tacaagttatctctgatgtaagatctccttttgctacctttttcttctttctatcaactacattgttcatagctggaaggatgtgcaggagtgaacattc 49333231  T
Q  405 tgatc-tcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaa 473  Q
    ||| | |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  49333230 tgaccatcagaatgtttcatttgatcttactttagaatgatttgtaagact--acttttgatgtaatcaa 49333163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 30 - 473
Target Start/End: Original strand, 25823254 - 25823693
Alignment:
Q  30 ttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggtccatccaatacgtgacatgag 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||   | ||| |||||||||||     
T  25823254 ttcttcatcagaatgtt-gatattcatgatgttcttcatatgggttcatcaatgatgaatgtctgatgagtttctaggtttgttcaagacgtgacatgat 25823352  T
Q  130 atttgttcaagttttatccttc-aaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgattcaaatctatcttggaattg 228  Q
    |||||||   |||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||  ||||| | ||||||   |     
T  25823353 atttgtt-gggttttatccaccaaaaagtaacttctccatatgcatcaaaagttgttggataaagtaggataaagttgaaccaaatatgtcttggttatt 25823451  T
Q  229 gtgcaggagagagaggatagtggatctgc-atcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagagtacacgttatctctgatgcaaga 327  Q
    ||||||||||||   |||||||||| ||| |||||||||| ||||  || | |||||||||||||||    |||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  25823452 gtgcaggagaga---gatagtggatatgcaatcttcaggcccatgcatctaagagatttgcttgattttgttcagagtacaagttatctctgatgcatga 25823548  T
Q  328 gctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacattatgatc-tcagaatgttccatttg 426  Q
     ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |  |||||||| ||| | |||||||||| ||||||    
T  25823549 tctccttttgctacctttttcatctttccaccaactacactgttcatagctggaagcatgcgcatagatgaacattctgaccatcagaatgtttcatttg 25823648  T
Q  427 ttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaa 473  Q
     |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  25823649 ctcttactttaggatgatttgtaagact--acttttgatgtaatcaa 25823693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 6 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 37012274 - 37011820
Alignment:
Q  6 gatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctg 105  Q
    |||| |||||| ||||||||  |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  37012274 gatgaacatcagaatgttgccgtgttcttcatcagattgtt-gatgttcatgatgttcttcatctgggttcatcaatgatgaatgtttgatgagtttctg 37012176  T
Q  106 ggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaa-gttacttctccatatgcatca---aaagttgcttgaaaaagtaggataa 201  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||  ||||| || ||||||||||||||||||   ||||||| |          ||||||    
T  37012175 ggtttatccaatacgtgacatgagatttgttgg-gctttatccaccaaaaagtaacttctccatatgcatcatcaaaagttgat----------ggataa 37012087  T
Q  202 agttgattcaaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgca-tcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatc 300  Q
     |||    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||    ||    
T  37012086 cgttac--caaatctgtcttggacttggtgcaggagagaga---tagtggatctgcaatcttcaggcctatgcttctaggagatttgcttgattttgttc 37011992  T
Q  301 agagtacacgttatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaac 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  37011991 agagtacacgttatctctgatgcaatatctccttttgctacctttttcttctttctaccaactacactgttcatagctggaagcatgtgcagaagtgaac 37011892  T
Q  401 attatgatc-tcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaa 473  Q
    ||| ||| | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  37011891 attctgaccatcagaatgtttcatttgctcttactttaggatgatttgtaagact--acttttgatgtaatcaa 37011820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 18 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 20314702 - 20314482
Alignment:
Q  18 aatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggtccatccaat 117  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  20314702 aatgttgttgtgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctaggttcatccaggatgaatgtctgatgagttcctgggttcatccaat 20314603  T
Q  118 acgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgattcaaatcta 217  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |     
T  20314602 acgtaacatgagatttgttcaagttttatccctcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgaaacaaatttg 20314503  T
Q  218 tcttggaattggtgcaggaga 238  Q
    ||||||| |||||||| ||||    
T  20314502 tcttggatttggtgcatgaga 20314482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 6 - 481
Target Start/End: Original strand, 18096712 - 18097184
Alignment:
Q  6 gatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctg 105  Q
    |||| |||||| ||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||     
T  18096712 gatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcatcaaaatgtt-gatattcatgatgttcttcatttgagttcatcaatgatgaatgtatgatgagtttctc 18096810  T
Q  106 ggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatc-aaaagttgcttgaaaaagtaggataaagt 204  Q
    |||   | ||||  ||||||| |||||||||  || |||||||||  || |||| || |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  18096811 ggtttgttcaatgtgtgacataagatttgtt-taggtttatccttataatgttatttttccatatgcatcaaaaagttgctggataaagtaggataaagt 18096909  T
Q  205 tgattcaaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgcatcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagag 304  Q
    |   |||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||| ||| || ||||||||||||| |  |||||||    
T  18096910 t--atcaaatctgtcttggacattgtgcaggagagagaggatagtgaatctgcaacttcaagcccatgcttctagaagatttgcttgatactgatcagag 18097007  T
Q  305 tacacgt-tatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacatt 403  Q
     | |  | ||||||| | |||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |  ||||||||    
T  18097008 gataattatatctct-aagcaagatctcttttttctagctttttcatctttccaccaactacactattcatagctggaagcatgtgcaaagatgaacatt 18097106  T
Q  404 atgatc-tcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactctaata 481  Q
     ||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||    
T  18097107 ctgaccattagaatgttccttttgttcttactttaggatgatttgtaagactt-acttttgatgtagtcaattctaata 18097184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 431
Target Start/End: Original strand, 25039191 - 25039617
Alignment:
Q  6 gatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctg 105  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  25039191 gatgaacatcagaatgttgctgtgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaatgatgaatgtctgatgagtttttg 25039290  T
Q  106 ggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttc-aaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagt 204  Q
    |||     |||  |||||| ||||||||||| | | ||||| |  | |||||| | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  25039291 ggtttgctcaaggcgtgacctgagatttgtt-aggctttattcaccaaaaagtaaattctccatatgcatcaaaagttgctggataaagtaggataaagt 25039389  T
Q  205 tgattcaaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgcatcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagag 304  Q
    | |  |||||||  ||| ||  | |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    ||||||    
T  25039390 taaaccaaatctgcctttgatattgtgcaggagagagatgatagtgaatctgcagcttcaggcccatgcttctaggagatttgcttgattttgttcagag 25039489  T
Q  305 tacacgttatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacatta 404  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |    || | | |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||   |||||||||     
T  25039490 tacaagttatctctgatgcaagatctccttttgttttgcttgctaacttttcaccaactacactgttcgtagctggaagcatgtgcaagagtgaacattc 25039589  T
Q  405 tga-tctcagaatgttccatttgttctt 431  Q
    |||   ||||||||||||||||||||||    
T  25039590 tgacattcagaatgttccatttgttctt 25039617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 289 - 485
Target Start/End: Original strand, 20328428 - 20328624
Alignment:
Q  289 ttgattcatatcagagtacacgttatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgt 388  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20328428 ttgattcatctcagagtacacgttatctctgatgcatgatctccttttgctagcttttccatttttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgt 20328527  T
Q  389 gcagacgtgaacattatgatctcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactctaatattaa 485  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20328528 gcagaagtgaacattctgatctcagaatgttccatttgttcttactttaggttgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaaacctaatattaa 20328624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 52 - 454
Target Start/End: Original strand, 41543915 - 41544312
Alignment:
Q  52 ttcatgatgttcttcatctgggttcatcaag-gatgaatgtctgatgagtttctgggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatcctt 150  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||   |||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  41543915 ttcatgatgatcttcatctgggttcatcaaatgatgaatgtctgatgagttgttgggttg-tccagtgcgtgacataagatttgttcaggttttatcctt 41544013  T
Q  151 caaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgattcaaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtg 250  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||    ||||||| ||||||| |||||||||||||||   |||| ||    
T  41544014 aaaaagttacttctccatatgtatcaaaagttgctggataaagtgggataaagtt--accaaatctgtcttggacttggtgcaggagaga---gatattg 41544108  T
Q  251 gatctgc-atcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagagtacacgttatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttcca 349  Q
    ||||||| ||||||| |  |||| ||| ||| |||||||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||    || | |    
T  41544109 gatctgcaatcttcaagtccatgcttctaggcgatttgcttgattttgttcagagtacaagttatctctgatgcaagatctccttttgctttgcttgcta 41544208  T
Q  350 tctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacattatgatc-tcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgt 448  Q
      ||| ||||||||| | ||||||| | | ||||||||||||||  |||||||| ||| | |||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||    
T  41544209 aattttcaccaactatattgttcatagttagaagcatgtgcagagctgaacattctgaccatcagaatgttccatctgtt-tcac-ttaggatgatttgt 41544306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 6 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 4950808 - 4950499
Alignment:
Q  6 gatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctg 105  Q
    |||| |||||| ||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  4950808 gatgaacatcagaatgttgatgtgttcttcatcaaaatgtt-gatattcatgatattcttcatctgagttcatcaatgatgaatgtatgatgagtttctg 4950710  T
Q  106 ggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttc-aaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagt 204  Q
    |||   |||||| ||||||||||||||||||  |  |||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |    
T  4950709 ggtttgtccaatgcgtgacatgagatttgttgga-ctttatccaccaaaaagtaacttctccatatgcatcaaaagttgatagataaagtaggataaaat 4950611  T
Q  205 tgattcaaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgc-atcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcaga 303  Q
       | ||||||| ||||||| |||||||| ||||||   ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    |||||    
T  4950610 ---tacaaatctgtcttggacttggtgcaagagaga---gatagtgaatctgcaatcttcaggctcatgtttctaggagatttgcttggttttgttcaga 4950517  T
Q  304 gtacacgttatctctgat 321  Q
    ||||| ||||||| ||||    
T  4950516 gtacaagttatctatgat 4950499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 486
Target Start/End: Original strand, 21821220 - 21821690
Alignment:
Q  12 catcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggtcca 111  Q
    ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | | ||||||||||||||       
T  21821220 catcagaatgttgttgtgttcttcatcagaatgtta-atgtttatgatgttcttcatctgggttcatcattgatgaatttattatgagtttctgggtttg 21821318  T
Q  112 tccaatacgtgacatgagatttgttcaagt-tttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaa-gttgcttgaaaaagtaggataaagttgatt 209  Q
    | ||||  ||| |||  |||||  ||  || ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||| |      
T  21821319 ttcaatgtgtgccatatgattt--tcctgtctttatccataaaaagttacttctccatatgcataaaaaagttgctggataaagtaggataaagttaac- 21821415  T
Q  210 caaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgcatcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagagtacac 309  Q
    ||||| |   ||| | |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||| ||  ||||||||| ||||||||  |||| || |||     
T  21821416 caaatttgcattgaacttggtgcaggagagaga--atagtggacctgcatcttcaggcccatgcttataggagattttcttgattctgatcaaaggacat 21821513  T
Q  310 gt-tatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacattatgat 408  Q
    || ||||||||| |||||||||| |||||||    || | | |||| ||||||||||| || |||| | | ||||||||||||||  |||||||| | |     
T  21821514 gtatatctctga-gcaagagctccttttgctttgcttgctaacttttcaccaactacagtgctcatagttagaagcatgtgcagagatgaacattctaac 21821612  T
Q  409 ct-cagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactctaatattaaa 486  Q
    || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||  |||||| ||||    
T  21821613 cttcagaatgttcctttttttcttactttaggatgatttgtaagactt-acttttgttgtaatcaatcctaatagtaaa 21821690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 6 - 134
Target Start/End: Original strand, 20328302 - 20328430
Alignment:
Q  6 gatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctg 105  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  20328302 gatgaacatcagaatgttgctgtgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttattcatctgggttcatcaaggatgaatctctgatgagtttcta 20328401  T
Q  106 ggtccatccaatacgtgacatgagatttg 134  Q
    || |||||||||||||||||  |||||||    
T  20328402 ggaccatccaatacgtgacaaaagatttg 20328430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 370 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 20314472 - 20314357
Alignment:
Q  370 ttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacattatgatctcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaa 469  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20314472 ttcatggctggaagcatgtgcagaagtgaacattctgatctcagaatgttccatttgttcttacgttaggttgatttgtaagacttaacttttaatgtaa 20314373  T
Q  470 tcaactctaatattaa 485  Q
    ||||  ||||||||||    
T  20314372 tcaaacctaatattaa 20314357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 52 - 183
Target Start/End: Original strand, 19748364 - 19748495
Alignment:
Q  52 ttcatgatgttcttcatctgggttcatcaag-gatgaatgtctgatgagtttctgggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatcctt 150  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||   |||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  19748364 ttcatgatgatcttcatctgggttcatcaaatgatgaatgtctgatgagtttctgggttg-tccagtgcgtgacataagatttgttcaggttttatcctt 19748462  T
Q  151 caaaagttacttctccatatgcatcaaaagttg 183  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19748463 aaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttg 19748495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 6 - 102
Target Start/End: Original strand, 25044403 - 25044499
Alignment:
Q  6 gatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagttt 102  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25044403 gatgaacatcagaatgttgctgtgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaatgatgaatgtctgatgagttt 25044499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 21793026 - 21792925
Alignment:
Q  6 gatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctg 105  Q
    |||| |||||| ||||||| | |||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  21793026 gatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcataagaatgtt-gatgtttatgatgttcttcatctgggttcatcattgatgaatgtatgatgagtttctg 21792928  T
Q  106 ggt 108  Q
    |||    
T  21792927 ggt 21792925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 21782768 - 21782530
Alignment:
Q  237 gagagaggatagtggatctgcatcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagagtacacgt-tatctctgatgcaagagctcattt 335  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| || |||| ||  | |||||||| |||||||  |||| || ||| || ||||||||| |||||||||| |||    
T  21782768 gagagagaatagtggatctgcagcttcatgcccatgcttataagagatttggttgattctgatcaaaggacatgtctatctctga-gcaagagctccttt 21782670  T
Q  336 tgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacattatgatct-cagaatgttccatttgtt--ctta 432  Q
    ||||    || | | |||| ||||||||||| || |||| | | ||||| | ||||||  |||||||| ||| || ||||||||||| ||| ||  ||||    
T  21782669 tgctttgcttgctaacttttcaccaactacattgctcatagttagaagcttatgcagagatgaacattctgaccttcagaatgttcctttttttttctta 21782570  T
Q  433 ctttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaa 473  Q
    |||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  21782569 ctttagaatgatttgtgagactt-acttttgatgtaatcaa 21782530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 337; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 146975 - 146486
Alignment:
Q  5 agatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttct 104  Q
    ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  146975 agatgaacatcagaatgttgctgtgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatattcttcatctgggttcatcaatgatgaatgtctgatgagtttct 146876  T
Q  105 gggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagt 204  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  146875 gggttcatccaatacgtgacatgagatttgttcatgttttatccataaaaagttacttcttcatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagt 146776  T
Q  205 tgattcaaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgcatcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagag 304  Q
    |    ||||||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| | || ||||    
T  146775 t--accaaatctgtctttgactttgtgcaggagagagaggatagtggatctgcatcttcaggcccatgcttcaaggagatttgcttaattaaaataagag 146678  T
Q  305 tacacgttatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacatta 404  Q
     ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  146677 aacaagttatctctgatgcaagatctccttttgctagctttttcatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagaagtgaacattc 146578  T
Q  405 tgatc-tcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactctaatattaaaacacaactg 495  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  146577 tgatcttcagaatgttccacttgttcttactttaggttgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaaacctaatagtaaaacacaactg 146486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 93 - 496
Target Start/End: Original strand, 153389 - 153778
Alignment:
Q  93 tgatgagtttctgggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaa 192  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  153389 tgatgagtttctgggttcatccaatacgtgacataagatttgttcatgttttatccttaaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaa 153488  T
Q  193 gtaggataaagttgattcaaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgcatcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttga 292  Q
    |||||||||||||    ||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || || ||||||| |||||    
T  153489 gtaggataaagtt--accaaatctgtcttgggttttgtgcaggagagagaggatagtggatttgcatcttcaggcccatgctttaacgagatttccttga 153586  T
Q  293 ttcatatcagagtacacgttatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcag 392  Q
    |||| || |||| ||| |||||||||||||||| | ||| |||            ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  153587 ttcaaattagaggacatgttatctctgatgcaatatctccttt------------catctttccaccaactacactattcatcgctggaagcatgtgcag 153674  T
Q  393 acgtgaacattatgatctcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactctaatattaaaacacaa 492  Q
    | ||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  153675 aagtgaacattctaacctcagaatgttccatttgttattactttaggttcatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaaacctaatagtaaaacacaa 153774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 233 - 496
Target Start/End: Original strand, 114513 - 114776
Alignment:
Q  233 aggagagagaggatagtggatctgcatcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagagtacacgttatctctgatgcaagagctca 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| | |||     
T  114513 aggagagagaggatagtggatctgcatcttcaggcccatgcttcaaggagatttgtttgattcaaatcagaggacacgttatctctaatgcaatatctcc 114612  T
Q  333 ttttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacattatgatctcagaatgttccatttgttctta 432  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  114613 ttttgctagctttttcatctttccaccaactacactgttcatgactggaagcatgtgcagaagtgaacattctgatcttagaatgttccatttgttctta 114712  T
Q  433 ctttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactctaatattaaaacacaactga 496  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  114713 ctttaggttgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactctaataataaaacacaactga 114776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Original strand, 114326 - 114489
Alignment:
Q  13 atcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggtccat 112  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  114326 atcagaatgttgttgtgttcttcatcagaatgtt-gatattcatgatgttcttcatctgggtttatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggtttat 114424  T
Q  113 ccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaa 177  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  114425 cacatacgtgacatgagatttgttcaggttttatccttaaaaagttacttctccatatgcatcaa 114489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 329; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 19037 - 18576
Alignment:
Q  11 acatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggtcc 110  Q
    |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  19037 acatcagaatgttgttgtgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctaggttcatcaatgatgaatgtctgatgagtttctgggttc 18938  T
Q  111 atccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgattc 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |    
T  18937 atccaatacgtgacatgagatttgttcaggttatatccttgaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt--acc 18840  T
Q  211 aaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgcatcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagagtacacg 310  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||     
T  18839 aaatctgtcttggattttgtgcaggagagagaggatagtgaatctgcatcttcaggcccatgcttcaaggagatttgcttgatttaaatcagaggacaca 18740  T
Q  311 ttatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacattatgatc- 409  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||     
T  18739 ttatctctgatgcaagatctccttttgctagctttttcatctttccaccaactacactgttcatggctagaagcatgtgcagaagtgaacattctgatct 18640  T
Q  410 tcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaa 473  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18639 tcagaatgttccatctgttcttactttaggttgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaa 18576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 325; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 425
Target Start/End: Original strand, 1745 - 2165
Alignment:
Q  6 gatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctg 105  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1745 gatgaacatcagaatgttgctgtgttctttatcagaatgtttgatatttatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctg 1844  T
Q  106 ggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1845 ggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaggttttatccttcaaaggttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggatatagtt 1944  T
Q  206 gattcaaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgc-atcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagag 304  Q
    ||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1945 gattcaaatctgtcttggatttcatgcaggagagagaggatagtggatctgcaatcttcaggcccatgcttcaaggagatttgctagattcatatcagag 2044  T
Q  305 tacacgttatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacatta 404  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  2045 tacacgttatctctgatgcaagatctccttttgctagattttaaatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagaagtgaacattc 2144  T
Q  405 tgatctcagaatgttccattt 425  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  2145 tgatctcagaatgttccattt 2165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 421 - 496
Target Start/End: Original strand, 4104 - 4179
Alignment:
Q  421 catttgttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactctaatattaaaacacaactga 496  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| | ||||||||    
T  4104 catttgttcttactttaggttgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaaacctaatagtaagatacaactga 4179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 421 - 496
Target Start/End: Original strand, 4317 - 4392
Alignment:
Q  421 catttgttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactctaatattaaaacacaactga 496  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| | ||||||||    
T  4317 catttgttcttactttaggttgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaaacctaatagtaagatacaactga 4392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 4)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 6 - 327
Target Start/End: Original strand, 29070 - 29392
Alignment:
Q  6 gatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctg 105  Q
    |||| |||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||    
T  29070 gatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcatcaaaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatccaggatgaatttctgatgattatctg 29169  T
Q  106 ggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt 205  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29170 ggtccatccaacacgtgacatgagattttttcaggttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt 29269  T
Q  206 gattcaaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgc-atcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagag 304  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29270 gattcaaatctgtcttggatttggtgcaggagagagaggatagtggatctgcaatcttcaggcccatgcttcaaggagattttcttgattcatatcagag 29369  T
Q  305 tacacgttatctctgatgcaaga 327  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  29370 tacacgttatctctgatgcaaga 29392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 337 - 473
Target Start/End: Original strand, 23923 - 24059
Alignment:
Q  337 gctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacattatgatctcagaatgttccatttgttcttacttt 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23923 gctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagaagtgaacattctgatctcagaatgttccatttgttcttacttt 24022  T
Q  437 aggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaa 473  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24023 aggttgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaa 24059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 368 - 426
Target Start/End: Original strand, 41273 - 41331
Alignment:
Q  368 tgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacattatgatctcagaatgttccatttg 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41273 tgttcatggctggaagcatgtgcagaagtgaacattctgatctcagaatgttccatttg 41331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 205
Target Start/End: Original strand, 55415 - 55448
Alignment:
Q  172 catcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt 205  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  55415 catcaaaagttggttgaaaaagtaggataaagtt 55448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 6 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 23445 - 23211
Alignment:
Q  6 gatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctg 105  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23445 gatgaacatcagaatgttgctgtgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctg 23346  T
Q  106 ggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt 205  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  23345 ggaccattcaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaattatgataaagtt 23246  T
Q  206 gattcaaatctatcttggaattggtgcaggagaga 240  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  23245 gattcaaatctgtcttggatttggtgcaggagaga 23211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 450 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 23213 - 23167
Alignment:
Q  450 agacttaacttttaatgtaatcaactctaatattaaaacacaactga 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||    
T  23213 agacttaacttttaatgtaatcaaacctaatagtaagacacaactga 23167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1468 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold1468
Description:

Target: scaffold1468; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 6 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 1609 - 1144
Alignment:
Q  6 gatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctg 105  Q
    |||| |||||| ||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1609 gatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcatcaaaatgtt-gatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaatgatgaatgtctgatgagtttctg 1511  T
Q  106 ggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttc-aaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagt 204  Q
    |||   | |||  ||||||||||||||||||  || |||||||  | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  1510 ggtttgttcaaggcgtgacatgagatttgtt-gagctttatccaccaaaaagtaacttatccatatgcatcaaaagttgctgaataaagtaggataaagt 1412  T
Q  205 tgattcaaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgcatcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagag 304  Q
    |||| |||||||  |||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||| ||| |||||||||||| ||||    ||||||    
T  1411 tgatccaaatctgccttggtctttgtgcaggagagagaggatagtgggtctgcaacttcagacccatgcttctaggagatttgctagattttgttcagag 1312  T
Q  305 tacacgttatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacatta 404  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| | |||||| | |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||     
T  1311 tacaagttatctctgatgtaagatctccttttgctacctttttcttctttctatcaactacattgttcatagctggaaggatgtgcaggagtgaacattc 1212  T
Q  405 tgatc-tcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaa 473  Q
    ||| | |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  1211 tgaccatcagaatgtttcatttgatcttactttagaatgatttgtaagact--acttttgatgtaatcaa 1144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1705 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold1705
Description:

Target: scaffold1705; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 6 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 1186 - 949
Alignment:
Q  6 gatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctg 105  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  1186 gatgaacatcagaatgttgctgtgttcttcatcagaatgtttgatattcttgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctggtgagttcctg 1087  T
Q  106 ggtccatccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt 205  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1086 ggtccattccatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaagttgcttgaaaaagtaggataaagtt 987  T
Q  206 gattcaaatctatcttggaattggtgcaggagagagag 243  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  986 gattcaaatatgtcttggatttggtgcaggagagagag 949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1705; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 235 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 927 - 688
Alignment:
Q  235 gagagagaggatagtggatctgca-tcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagagtacacgttatctctgatgcaagagctcat 333  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| || |||| |||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  927 gagagagaggatagtggatctgtaatcttcaagcccatgcttcaaggagatttgcttgattttgttcagagtacacgttatctctgatgcaagatctcct 828  T
Q  334 tttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacattatgatctcagaatgttccatttgttcttac 433  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  827 tttgctatcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgtagaagtgaacattctgatctcagaatgttccatttgttcctac 728  T
Q  434 tttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaa 473  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  727 tttaggttgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaa 688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 108; Significance: 5e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 7705 - 7452
Alignment:
Q  11 acatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggtcc 110  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||      
T  7705 acatcagaatgttgttgtgttcttcatcaaaatgtt-gatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaagatgaatgtatgatgagtttctgggttt 7607  T
Q  111 atccaatacgtgacatgagatttgttcaagttttatccttcaaaagttacttctccatatgcat-caaaagttgcttgaaaaagtaggataaagttgatt 209  Q
     | ||||  ||||||| |||||||||   | |||||||   |||||| ||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||      
T  7606 gttcaatgtgtgacataagatttgtt-gggctttatccacaaaaagtaacttctccatatgaatccaaaagttgctggataaagtaggataaagttgaac 7508  T
Q  210 caaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgcatcttcag 265  Q
    ||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  7507 caaatctgtcttggacattgtgcaggagagagaggataatggatctgcagcttcag 7452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0265 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0265
Description:

Target: scaffold0265; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 11589 - 11119
Alignment:
Q  12 catcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggtcca 111  Q
    ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | | ||||||||||||||       
T  11589 catcagaatgttgttgtgttcttcatcagaatgtta-atgtttatgatgttcttcatctgggttcatcattgatgaatttattatgagtttctgggtttg 11491  T
Q  112 tccaatacgtgacatgagatttgttcaagt-tttatccttcaaaagttacttctccatatgcatcaaaa-gttgcttgaaaaagtaggataaagttgatt 209  Q
    | ||||  ||| |||  |||||  ||  || ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||| |      
T  11490 ttcaatgtgtgccatatgattt--tcctgtctttatccataaaaagttacttctccatatgcataaaaaagttgctggataaagtaggataaagttaac- 11394  T
Q  210 caaatctatcttggaattggtgcaggagagagaggatagtggatctgcatcttcaggctcatggttcaaggagatttgcttgattcatatcagagtacac 309  Q
    ||||| |   ||| | |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||| ||  ||||||||| ||||||||  |||| || |||     
T  11393 caaatttgcattgaacttggtgcaggagagaga--atagtggacctgcatcttcaggcccatgcttataggagattttcttgattctgatcaaaggacat 11296  T
Q  310 gt-tatctctgatgcaagagctcattttgctagcttttccatctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacattatgat 408  Q
    || ||||||||| |||||||||| |||||||    || | | |||| ||||||||||| || |||| | | ||||||||||||||  |||||||| | |     
T  11295 gtatatctctga-gcaagagctccttttgctttgcttgctaacttttcaccaactacagtgctcatagttagaagcatgtgcagagatgaacattctaac 11197  T
Q  409 ct-cagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagacttaacttttaatgtaatcaactctaatattaaa 486  Q
    || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||  |||||| ||||    
T  11196 cttcagaatgttcctttttttcttactttaggatgatttgtaagactt-acttttgttgtaatcaatcctaatagtaaa 11119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 6)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 349 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 59973 - 59825
Alignment:
Q  349 atctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacattatgatct-cagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttg 447  Q
    |||||||||||||||||| |||| || | | ||||||||||| ||  | |||||| ||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  59973 atctttccaccaactacattgttgatagttagaagcatgtgcggagatcaacattctgaccttcagaatgttcattttgttcttactttaggatgatttg 59874  T
Q  448 taagacttaacttttaatgtaatcaactctaatattaaa-acacaactga 496  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||  |||||| |||| ||||||||||    
T  59873 taagactt-acttttgatgtaatcaatcctaatagtaaagacacaactga 59825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 54922 - 54825
Alignment:
Q  6 gatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttct 104  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||  ||||||||||||    
T  54922 gatgaacatcagaatgttgctatgttcttcatcaaaatgtt-gatgttcatgatgttcttcatctaggttcatcattgatgaatgaatgatgagtttct 54825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 58874 - 58777
Alignment:
Q  6 gatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttct 104  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||  ||||||||||||    
T  58874 gatgaacatcagaatgttgctatgttcttcatcaaaatgtt-gatgttcatgatgttcttcatctaggttcatcattgatgaatgaatgatgagtttct 58777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 60302 - 60205
Alignment:
Q  6 gatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttct 104  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||  ||||||||||||    
T  60302 gatgaacatcagaatgttgctatgttcttcatcaaaatgtt-gatgttcatgatgttcttcatctaggttcatcattgatgaatgaatgatgagtttct 60205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #5
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 349 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 54593 - 54456
Alignment:
Q  349 atctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacattatgatctc-agaatgttccatttgttcttactttaggatgatttg 447  Q
    |||||||||||||||||| |||| || | | ||||||||||| ||  | |||||| ||| ||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  54593 atctttccaccaactacattgttgatagttagaagcatgtgcggagatcaacattctgacctttagaatgttcattttgttcttactttaggatgatttg 54494  T
Q  448 taagacttaacttttaatgtaatcaactctaatattaaa 486  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||  |||||| ||||    
T  54493 taagactt-acttttgatgtaatcaatcctaatagtaaa 54456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #6
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 349 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 58545 - 58408
Alignment:
Q  349 atctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacattatgatctc-agaatgttccatttgttcttactttaggatgatttg 447  Q
    |||||||||||||||||| |||| || | | ||||||||||| ||  | |||||| ||| ||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  58545 atctttccaccaactacattgttgatagttagaagcatgtgcggagatcaacattctgacctttagaatgttcattttgttcttactttaggatgatttg 58446  T
Q  448 taagacttaacttttaatgtaatcaactctaatattaaa 486  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||  |||||| ||||    
T  58445 taagactt-acttttgatgtaatcaatcctaatagtaaa 58408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 4624 - 4511
Alignment:
Q  19 atgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggtccatccaata 118  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||   ||||||     
T  4624 atgttgttgtgttcttcatcagaatgtc-gatattcaagatgttcttcatttggattcatcaatgatgaatgtctgatgagtttttgggtttgtccaatg 4526  T
Q  119 cgtgacatgagattt 133  Q
    |||||||| ||||||    
T  4525 cgtgacataagattt 4511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0406 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0406
Description:

Target: scaffold0406; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 351 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 15342 - 15238
Alignment:
Q  351 ctttccaccaactacactgttcatggctggaagcatgtgcagacgtgaacattatgatc-tcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgta 449  Q
    ||||||||||||||||||||| || |   |||||||||||| |  |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  15342 ctttccaccaactacactgtttatagtatgaagcatgtgcaaagatgaacattctgaccatcagaatgttccatttgttcttac-ttagaatgatttgta 15244  T
Q  450 agactt 455  Q
    ||||||    
T  15243 agactt 15238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0406; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 15702 - 15601
Alignment:
Q  6 gatggacatcataatgttgctatgttcttcatcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctg 105  Q
    |||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||   |||| ||| |||||| ||||||    
T  15702 gatgaacatcagaatgttgttgtgttcttcatcagaatgttc-attttcatcatgttcttcatctgggttcatcatttatgagtgtatgatgaatttctg 15604  T
Q  106 ggt 108  Q
    |||    
T  15603 ggt 15601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 122
Target Start/End: Original strand, 28545 - 28631
Alignment:
Q  35 catcagaatgtttgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggtccatccaatacgtg 122  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||||  |||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  28545 catcagaatgtt-gatgttcattatgatcttcatctgggttcatcatttatgaatgtaagatgagtttctgggtttatccaatgcgtg 28631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 108
Target Start/End: Original strand, 6783 - 6832
Alignment:
Q  59 tgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatgtctgatgagtttctgggt 108  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||    
T  6783 tgttcttcatttgggttcatcattgatgaatgtgtgatgagtttatgggt 6832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 410 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 216508 - 216464
Alignment:
Q  410 tcagaatgttccatttgttcttactttaggatgatttgtaagactt 455  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  216508 tcagaatgttccatttgtttttacat-aggatgatttgtaagactt 216464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 90
Target Start/End: Original strand, 92647 - 92703
Alignment:
Q  35 catcagaatgtt-tgatattcatgatgttcttcatctgggttcatcaaggatgaatg 90  Q
    |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  92647 catcagaatgttgttatgttcatgatgatcttcatctgggttcatcatgtatgaatg 92703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University