View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF8861_low_19 (Length: 250)

Name: NF8861_low_19
Description: NF8861
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF8861_low_19
NF8861_low_19
[»] chr4 (33 HSPs)
chr4 (1-242)||(819745-819986)
chr4 (1-242)||(20813361-20813602)
chr4 (1-242)||(34395449-34395690)
chr4 (5-242)||(21959278-21959515)
chr4 (1-242)||(45458670-45458910)
chr4 (9-242)||(44056114-44056347)
chr4 (1-242)||(12837016-12837255)
chr4 (1-233)||(23269758-23269989)
chr4 (2-242)||(30458096-30458335)
chr4 (9-242)||(8872288-8872519)
chr4 (9-242)||(30232310-30232544)
chr4 (1-242)||(44347018-44347255)
chr4 (1-208)||(16732361-16732567)
chr4 (9-242)||(53704550-53704781)
chr4 (1-233)||(52265332-52265563)
chr4 (9-162)||(55376493-55376645)
chr4 (9-234)||(53907533-53907747)
chr4 (9-233)||(18494153-18494375)
chr4 (12-233)||(13809335-13809554)
chr4 (1-233)||(27961163-27961394)
chr4 (1-233)||(15045020-15045251)
chr4 (1-166)||(7185734-7185899)
chr4 (26-166)||(7964601-7964742)
chr4 (15-166)||(14901437-14901589)
chr4 (27-165)||(41256259-41256399)
chr4 (26-79)||(47535042-47535095)
chr4 (1-233)||(15109173-15109404)
chr4 (26-166)||(18276651-18276792)
chr4 (27-166)||(15013172-15013312)
chr4 (87-166)||(34177538-34177617)
chr4 (65-166)||(19821665-19821768)
chr4 (130-166)||(37956913-37956949)
chr4 (130-162)||(40885458-40885490)
[»] chr6 (26 HSPs)
chr6 (1-242)||(32898982-32899223)
chr6 (1-242)||(16086209-16086450)
chr6 (1-234)||(16106708-16106941)
chr6 (9-242)||(18432843-18433075)
chr6 (1-242)||(18777338-18777562)
chr6 (9-242)||(13014524-13014757)
chr6 (1-233)||(18570471-18570700)
chr6 (1-242)||(22441126-22441363)
chr6 (126-242)||(25640376-25640491)
chr6 (1-208)||(18399130-18399337)
chr6 (1-93)||(31628460-31628552)
chr6 (27-233)||(15079535-15079739)
chr6 (26-233)||(35135836-35136043)
chr6 (26-166)||(18629497-18629638)
chr6 (26-166)||(17083088-17083228)
chr6 (12-162)||(25367129-25367280)
chr6 (168-242)||(31628549-31628622)
chr6 (1-233)||(33324884-33325116)
chr6 (37-164)||(33538261-33538389)
chr6 (1-161)||(21623360-21623522)
chr6 (1-172)||(21410933-21411105)
chr6 (1-161)||(22361660-22361820)
chr6 (26-166)||(17556908-17557048)
chr6 (26-166)||(16887680-16887822)
chr6 (130-232)||(25919936-25920036)
chr6 (26-79)||(29605666-29605719)
[»] chr3 (58 HSPs)
chr3 (1-242)||(17100845-17101085)
chr3 (1-242)||(17101530-17101770)
chr3 (1-242)||(54424204-54424445)
chr3 (9-234)||(317333-317556)
chr3 (9-242)||(6154145-6154378)
chr3 (1-242)||(38527920-38528159)
chr3 (1-233)||(22144096-22144327)
chr3 (1-242)||(14304240-14304479)
chr3 (1-233)||(50111876-50112106)
chr3 (4-242)||(34439157-34439395)
chr3 (1-208)||(14298613-14298820)
chr3 (1-207)||(12349388-12349594)
chr3 (9-242)||(16995876-16996107)
chr3 (56-242)||(6146583-6146769)
chr3 (1-242)||(35123887-35124127)
chr3 (1-242)||(16181764-16182001)
chr3 (1-233)||(8631982-8632211)
chr3 (1-242)||(13817703-13817941)
chr3 (26-233)||(14527904-14528110)
chr3 (1-233)||(14295631-14295861)
chr3 (1-233)||(14301258-14301488)
chr3 (1-233)||(55440682-55440903)
chr3 (1-233)||(17522714-17522944)
chr3 (1-242)||(19570507-19570744)
chr3 (1-233)||(3578281-3578511)
chr3 (18-238)||(17938782-17938999)
chr3 (1-242)||(30207408-30207651)
chr3 (1-233)||(11060831-11061060)
chr3 (34-233)||(12560060-12560258)
chr3 (115-233)||(40939432-40939549)
chr3 (161-234)||(13835973-13836046)
chr3 (12-233)||(17139711-17139931)
chr3 (1-71)||(53898440-53898510)
chr3 (27-166)||(11328854-11328995)
chr3 (1-204)||(14059067-14059268)
chr3 (1-92)||(11196283-11196374)
chr3 (34-166)||(39656751-39656883)
chr3 (1-56)||(19260839-19260894)
chr3 (26-161)||(17191758-17191895)
chr3 (34-166)||(11882108-11882240)
chr3 (1-166)||(16880315-16880482)
chr3 (16-82)||(15876275-15876341)
chr3 (26-161)||(17204898-17205035)
chr3 (26-99)||(15517848-15517920)
chr3 (26-166)||(9590643-9590784)
chr3 (131-233)||(12487601-12487701)
chr3 (1-168)||(47784648-47784821)
chr3 (34-166)||(13301359-13301491)
chr3 (34-166)||(13312015-13312147)
chr3 (87-166)||(48421855-48421935)
chr3 (1-161)||(3576331-3576493)
chr3 (26-166)||(14814653-14814795)
chr3 (1-38)||(6146764-6146801)
chr3 (130-166)||(17960201-17960237)
chr3 (130-165)||(14080832-14080867)
chr3 (130-165)||(38810905-38810940)
chr3 (1-108)||(12488674-12488781)
chr3 (87-162)||(51961030-51961106)
[»] chr5 (33 HSPs)
chr5 (1-241)||(21397284-21397524)
chr5 (4-242)||(20712271-20712509)
chr5 (1-242)||(24182947-24183187)
chr5 (1-242)||(21646556-21646795)
chr5 (3-242)||(1168020-1168257)
chr5 (1-242)||(21906891-21907131)
chr5 (9-242)||(4865462-4865692)
chr5 (9-242)||(28261716-28261945)
chr5 (1-233)||(19405730-19405962)
chr5 (1-231)||(11337012-11337241)
chr5 (1-161)||(11584246-11584405)
chr5 (9-231)||(23466636-23466856)
chr5 (26-139)||(23981433-23981546)
chr5 (1-93)||(24475769-24475861)
chr5 (130-229)||(22662510-22662608)
chr5 (26-213)||(3674079-3674266)
chr5 (1-166)||(432655-432820)
chr5 (1-161)||(19862401-19862563)
chr5 (26-164)||(21310600-21310739)
chr5 (1-172)||(16595699-16595871)
chr5 (26-166)||(21297064-21297205)
chr5 (1-166)||(28902383-28902550)
chr5 (1-166)||(28938778-28938945)
chr5 (36-166)||(7728647-7728779)
chr5 (1-172)||(23494111-23494283)
chr5 (43-166)||(37983598-37983722)
chr5 (26-166)||(21617233-21617375)
chr5 (34-166)||(32966037-32966171)
chr5 (26-161)||(21222503-21222638)
chr5 (36-166)||(6456848-6456980)
chr5 (1-161)||(5450736-5450898)
chr5 (26-166)||(24225235-24225376)
chr5 (26-166)||(24084294-24084437)
[»] scaffold0021 (5 HSPs)
scaffold0021 (1-242)||(132063-132305)
scaffold0021 (2-234)||(88468-88700)
scaffold0021 (1-233)||(16091-16324)
scaffold0021 (1-233)||(25622-25855)
scaffold0021 (1-233)||(11880-12112)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (1-242)||(38490-38731)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (1-242)||(40851-41091)
scaffold0034 (1-242)||(46358-46598)
[»] chr7 (30 HSPs)
chr7 (1-242)||(143831-144071)
chr7 (1-242)||(15822247-15822486)
chr7 (1-234)||(45451992-45452223)
chr7 (1-242)||(47289973-47290215)
chr7 (1-242)||(12369654-12369895)
chr7 (1-242)||(12759179-12759419)
chr7 (1-242)||(13862747-13862984)
chr7 (1-242)||(26070080-26070319)
chr7 (1-242)||(26093867-26094106)
chr7 (1-242)||(44865423-44865660)
chr7 (1-242)||(3895217-3895455)
chr7 (1-233)||(11287609-11287838)
chr7 (1-233)||(12247944-12248175)
chr7 (9-242)||(39046444-39046675)
chr7 (9-242)||(35095015-35095245)
chr7 (1-233)||(16569830-16570060)
chr7 (1-233)||(16595602-16595832)
chr7 (1-161)||(7283956-7284115)
chr7 (138-242)||(26069422-26069525)
chr7 (1-233)||(49047499-49047729)
chr7 (26-233)||(13274994-13275199)
chr7 (26-167)||(16914816-16914958)
chr7 (34-166)||(34241096-34241229)
chr7 (26-166)||(48356861-48357002)
chr7 (26-166)||(9611525-9611666)
chr7 (26-166)||(9839096-9839237)
chr7 (1-161)||(13377721-13377883)
chr7 (1-161)||(17223830-17223993)
chr7 (26-108)||(14271848-14271929)
chr7 (87-162)||(25124407-25124483)
[»] chr1 (25 HSPs)
chr1 (2-242)||(22402924-22403164)
chr1 (1-242)||(35054948-35055189)
chr1 (1-242)||(49967842-49968082)
chr1 (1-233)||(9783890-9784119)
chr1 (1-233)||(35522177-35522407)
chr1 (1-233)||(21718420-21718649)
chr1 (1-154)||(41212263-41212415)
chr1 (9-242)||(27329580-27329803)
chr1 (127-242)||(20346342-20346456)
chr1 (15-166)||(19603303-19603454)
chr1 (15-166)||(22829315-22829466)
chr1 (2-166)||(16646105-16646271)
chr1 (15-166)||(20955329-20955480)
chr1 (2-161)||(13376752-13376913)
chr1 (1-166)||(16656830-16656997)
chr1 (33-207)||(51627513-51627687)
chr1 (33-166)||(22143251-22143384)
chr1 (33-166)||(17609152-17609286)
chr1 (26-166)||(21195231-21195373)
chr1 (1-99)||(20177367-20177464)
chr1 (34-166)||(36356181-36356315)
chr1 (1-166)||(8537798-8537965)
chr1 (1-166)||(8603037-8603204)
chr1 (26-166)||(49997169-49997311)
chr1 (26-166)||(52400848-52400990)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (1-242)||(22883-23124)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (2-242)||(24542-24782)
[»] chr8 (30 HSPs)
chr8 (1-242)||(37611860-37612100)
chr8 (1-242)||(20561446-20561686)
chr8 (2-242)||(22234620-22234858)
chr8 (1-234)||(25122634-25122864)
chr8 (2-242)||(41246850-41247088)
chr8 (1-234)||(20573016-20573247)
chr8 (66-242)||(20529667-20529843)
chr8 (1-242)||(20481797-20482035)
chr8 (1-234)||(19992882-19993110)
chr8 (1-232)||(21681195-21681426)
chr8 (1-172)||(22981465-22981633)
chr8 (143-242)||(20653848-20653946)
chr8 (1-233)||(39446590-39446821)
chr8 (1-161)||(21198046-21198207)
chr8 (34-165)||(15970046-15970177)
chr8 (126-233)||(21259321-21259426)
chr8 (56-162)||(7000519-7000624)
chr8 (1-108)||(23837390-23837497)
chr8 (26-166)||(5854831-5854972)
chr8 (1-166)||(33528617-33528783)
chr8 (34-203)||(31194176-31194346)
chr8 (26-166)||(15933515-15933656)
chr8 (26-166)||(23149996-23150135)
chr8 (1-99)||(17285396-17285493)
chr8 (26-161)||(23225973-23226106)
chr8 (26-79)||(26011711-26011764)
chr8 (1-163)||(38533841-38534005)
chr8 (26-108)||(23158378-23158460)
chr8 (26-166)||(27232979-27233120)
chr8 (68-166)||(22735736-22735836)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (1-242)||(60998-61240)
scaffold0001 (21-242)||(79704-79925)
scaffold0001 (11-245)||(70436-70666)
[»] scaffold0673 (2 HSPs)
scaffold0673 (1-242)||(637-877)
scaffold0673 (9-233)||(6671-6892)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (1-242)||(15065-15304)
[»] scaffold0359 (2 HSPs)
scaffold0359 (1-242)||(1509-1748)
scaffold0359 (1-242)||(11469-11708)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (1-242)||(11384-11623)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (9-242)||(48346-48576)
scaffold0068 (9-242)||(61794-62024)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (1-242)||(4756-4993)
scaffold0447 (1-242)||(9370-9607)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (1-242)||(7365-7602)
[»] chr2 (28 HSPs)
chr2 (1-242)||(36890500-36890740)
chr2 (3-233)||(28974243-28974471)
chr2 (1-242)||(4447949-4448188)
chr2 (1-233)||(25602216-25602449)
chr2 (1-242)||(271362-271600)
chr2 (1-242)||(25875738-25875975)
chr2 (9-235)||(23836530-23836752)
chr2 (1-233)||(27261995-27262227)
chr2 (9-233)||(22579688-22579909)
chr2 (5-233)||(24571117-24571343)
chr2 (9-162)||(32466057-32466208)
chr2 (123-242)||(17367131-17367251)
chr2 (35-166)||(722617-722747)
chr2 (1-165)||(68184-68350)
chr2 (126-233)||(7321837-7321942)
chr2 (1-166)||(23821529-23821694)
chr2 (1-166)||(23830608-23830773)
chr2 (26-166)||(19666745-19666885)
chr2 (26-233)||(19668933-19669139)
chr2 (1-166)||(31146068-31146236)
chr2 (34-204)||(24294374-24294545)
chr2 (26-99)||(24087345-24087417)
chr2 (12-108)||(25305634-25305730)
chr2 (130-166)||(3135-3171)
chr2 (68-166)||(22775103-22775203)
chr2 (68-166)||(22780481-22780581)
chr2 (116-157)||(17366959-17367000)
chr2 (1-108)||(43646085-43646192)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (1-242)||(7761-8002)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (1-242)||(254630-254869)
scaffold0011 (1-242)||(261236-261475)
[»] scaffold1867 (1 HSPs)
scaffold1867 (1-208)||(336-542)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (1-233)||(70805-71035)
scaffold0031 (1-233)||(31235-31468)
scaffold0031 (26-160)||(97093-97228)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (1-233)||(9179-9410)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (1-233)||(11532-11763)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (1-242)||(10129-10367)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (3-233)||(159494-159722)
scaffold0014 (1-233)||(85524-85753)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (9-233)||(112371-112592)
scaffold0022 (1-166)||(102810-102977)
scaffold0022 (130-203)||(109905-109977)
[»] scaffold0816 (1 HSPs)
scaffold0816 (9-242)||(2882-3112)
[»] scaffold0480 (2 HSPs)
scaffold0480 (1-242)||(5065-5302)
scaffold0480 (1-233)||(8706-8937)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (9-233)||(31410-31632)
scaffold0120 (9-233)||(21711-21933)
scaffold0120 (51-233)||(47374-47554)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (1-242)||(109277-109517)
scaffold0035 (1-242)||(117778-118018)
[»] scaffold0740 (1 HSPs)
scaffold0740 (1-242)||(4476-4713)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (1-233)||(2108-2338)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (1-206)||(164406-164609)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (3-233)||(400-629)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (1-233)||(33854-34085)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (1-162)||(25403-25564)
scaffold0158 (1-61)||(25150-25210)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (1-161)||(15367-15526)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (1-162)||(213-371)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (1-161)||(1573-1732)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (1-161)||(19850-20009)
scaffold0122 (1-161)||(24154-24313)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (1-161)||(20365-20524)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (1-143)||(252902-253044)
[»] scaffold0310 (2 HSPs)
scaffold0310 (1-161)||(10-169)
scaffold0310 (1-161)||(6304-6463)
[»] scaffold0342 (2 HSPs)
scaffold0342 (1-128)||(6134-6261)
scaffold0342 (130-233)||(12590-12692)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (1-245)||(3511-3755)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (1-103)||(5133-5235)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (127-242)||(8665-8779)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (1-245)||(7997-8241)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (36-161)||(1-125)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (26-233)||(89689-89894)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (64-233)||(5500-5670)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (1-233)||(33552-33783)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (64-233)||(70130-70298)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (1-233)||(2141-2371)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (26-232)||(1173-1378)
scaffold0409 (26-232)||(9428-9633)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (26-233)||(10879-11084)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (1-166)||(197142-197308)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (1-232)||(1371-1601)
scaffold0456 (1-232)||(8516-8746)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (26-162)||(8227-8364)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (15-166)||(69663-69815)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (42-232)||(22254-22443)
[»] scaffold0032 (3 HSPs)
scaffold0032 (26-166)||(104513-104653)
scaffold0032 (1-99)||(93730-93828)
scaffold0032 (187-233)||(93675-93720)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (1-161)||(76740-76902)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (33-166)||(31244-31378)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (1-56)||(146793-146848)
scaffold0025 (26-161)||(53563-53699)
scaffold0025 (25-79)||(85748-85802)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (15-166)||(2731-2883)
[»] scaffold0521 (1 HSPs)
scaffold0521 (26-242)||(11311-11526)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (1-161)||(6918-7080)
[»] scaffold0634 (1 HSPs)
scaffold0634 (26-166)||(5629-5770)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (34-166)||(43687-43820)
scaffold0080 (26-166)||(23561-23702)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (26-166)||(26879-27020)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (26-162)||(79756-79892)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (130-166)||(28859-28895)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 33)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 819986 - 819745
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  819986 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcaccataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcatttt 819887  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  819886 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctc 819787  T
Q  201 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  819786 atagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctc 819745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 20813602 - 20813361
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20813602 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcatttt 20813503  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctc 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  20813502 tcatacaaataatttaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttaggcttcaatttcgctc 20813403  T
Q  201 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20813402 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctc 20813361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 34395449 - 34395690
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34395449 caattattcattacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagtacgaatttcatcatttatgaacaattaatcagttcacccaattaagcacttt 34395548  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctc 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  34395549 tcatacaaataattgaaaattgcaataagtgataatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttaggcttcaatttttctc 34395648  T
Q  201 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34395649 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctc 34395690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 5 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 21959515 - 21959278
Alignment:
Q  5 tatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcat 104  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  21959515 tatccataacttcatacatttaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcatttatgaacaatcaattaattcacccaaataagcacttttcat 21959416  T
Q  105 acaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctag 204  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21959415 acaaataattgaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctag 21959316  T
Q  205 ctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  21959315 ctcttctcccaactcttgattcttcaagtcatcttctc 21959278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 45458910 - 45458670
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45458910 caattatctatcacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 45458811  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctc 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45458810 tcatacaaataattgaaaattgcaataaatgattatgatgaattataa-ccccttaccttagttaggttaatctctttagcttagacttcaattttgctc 45458712  T
Q  201 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45458711 ctagcttttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctc 45458670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Original strand, 44056114 - 44056347
Alignment:
Q  9 cataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44056114 cataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaa 44056213  T
Q  109 ataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctct 208  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  44056214 ataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttaggtttcaattttgctcctagctct 44056313  T
Q  209 tctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    ||| | ||||||||||||||||| || |||||||    
T  44056314 tctactaacccttgattcttcaaatcctcttctc 44056347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 12837255 - 12837016
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12837255 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatatcatcatttatggacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 12837156  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctc 200  Q
    |||| |||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  12837155 tcattcaaa-aattgaaaatagcaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttag-taggttaatctccctagcttaggcttcaattttgctc 12837058  T
Q  201 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12837057 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctc 12837016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23269989 - 23269758
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  23269989 caattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaaacacttt 23269890  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctc 200  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23269889 tcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctc 23269790  T
Q  201 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagt 233  Q
    |||||||  || |||| ||||||||||||||||    
T  23269789 ctagctcaact-ccaatccttgattcttcaagt 23269758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 30458096 - 30458335
Alignment:
Q  2 aattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactttt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30458096 aattatccataacttcatacatctaaacatgacatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactttt 30458195  T
Q  102 catacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcc 201  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30458196 catacaaataattcaaaattacaataagtaattatgatgaattctaacccccttaccttag-taggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctcc 30458294  T
Q  202 tagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    ||| | ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  30458295 tagattttctctcaaccctcgattcttcaagtcctcttctc 30458335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 8872519 - 8872288
Alignment:
Q  9 cataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaa 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  8872519 catagcttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcaccacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaa 8872420  T
Q  109 ataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctct 208  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8872419 ataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaacccccttactttag-taggttaatctccctagcttaggcttcaattttgctcctagctct 8872322  T
Q  209 tctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  8872321 tctcctaacccttgattcttcaagtcctcttctc 8872288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 30232544 - 30232310
Alignment:
Q  9 cataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcataca 107  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||  | || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||     
T  30232544 cataacttcatatatacaaacatgtcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-acacaattaagcacttattcatacc 30232446  T
Q  108 aataatt--aaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagc 205  Q
    | |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30232445 a-taattgaaaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccctcttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagc 30232347  T
Q  206 tcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  30232346 tcttctcccaatccttgattcttcaagtcctcttctc 30232310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 44347018 - 44347255
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  44347018 caattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta 44347117  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctc 200  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  44347118 tcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaactcccttaccttag-tagattaatctccttagcttaggcttcaattttgctc 44347215  T
Q  201 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    ||| ||| |||  | |||||||||||||||| || |||||||    
T  44347216 ctaactc-tctatc-acccttgattcttcaattcctcttctc 44347255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 16732361 - 16732567
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16732361 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 16732460  T
Q  101 tcatacaaataatt-aaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgct 199  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||| |    
T  16732461 tcatac-actaattaaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaacctctttaccttagttagattaatctccctagtttaggcttcaattttggt 16732558  T
Q  200 cctagctct 208  Q
    |||||||||    
T  16732559 cctagctct 16732567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 53704781 - 53704550
Alignment:
Q  9 cataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  53704781 cataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaa 53704682  T
Q  109 ataatt-aaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctc 207  Q
    |||||| ||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |   ||||||  |||||||||| |||||||||     
T  53704681 ataattgaaaaataacaa-aagtgattatgatgaattctaacccccttaccttag-taggttactcccctaagcttaagcttcaattttactcctagct- 53704585  T
Q  208 ttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    |   ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  53704584 taaccccaatccttgattcttcaagtcctcttctc 53704550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 52265563 - 52265332
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- 99  Q
    |||||||| | |||||||| |||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||     
T  52265563 caattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattagagcacgaatttcatcatctatgaacaattaatcaatt-acccaattaaacactta 52265465  T
Q  100 ttcatacaaataatt-aaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgc 198  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  52265464 ttcatacaa-taattgaaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtcagattaatctccctagcttaggcttcaatttagc 52265366  T
Q  199 tcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagt 233  Q
    ||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||    
T  52265365 tcctagctc-tcttccaatctttgattcttcaagt 52265332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 55376645 - 55376493
Alignment:
Q  9 cataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  55376645 cataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaa 55376546  T
Q  109 ataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttag 162  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  55376545 ataattgaaaatttcaa-aagtgattatgatgaagactaacccccttaccttag 55376493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 53907747 - 53907533
Alignment:
Q  9 cataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||        ||||||||||||| ||||||||    
T  53907747 cataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatc--------caattaagcacttatcatacaa 53907656  T
Q  109 ataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctct 208  Q
    |||||| |||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||  |||||||||||||| ||||| |    
T  53907655 ataattgaaaactacaa-aagtgattatgatgaattctaacccccttaccttag-taggttaatctcctaagcttaagcttcaattttgctcatagct-t 53907559  T
Q  209 tctcccaacccttgattcttcaagtc 234  Q
       ||||| |||||||||||||||||    
T  53907558 aaccccaatccttgattcttcaagtc 53907533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18494375 - 18494153
Alignment:
Q  9 cataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcataca 107  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||  | || |||||||||||| ||||||| || ||||||||||| | |||||||     
T  18494375 cataacttcatacatacgaacatgtcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattgatcaatt-acacaattaagcacctattcatacc 18494277  T
Q  108 aataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctc 207  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  | ||||||| |||||||| |     
T  18494276 a-taattgaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagcttaagcctcaatttagctcctagat- 18494179  T
Q  208 ttctcccaacccttgattcttcaagt 233  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||    
T  18494178 ttcttccaatccttgattcttcaagt 18494153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13809554 - 13809335
Alignment:
Q  12 aacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaat 110  Q
    |||||||| |||  |||||| ||||||||||| |||||||||||  | || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |    
T  13809554 aacttcatgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacttattcatacaa-t 13809457  T
Q  111 aatt-aaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctctt 209  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |  ||||||||| || |||||||| |    
T  13809456 aattgaaaaatggcaataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaat-tccctagctcaagcttcaatttagcccctagctc-t 13809359  T
Q  210 ctcccaacccttgattcttcaagt 233  Q
    ||||||| |||||| |||||||||    
T  13809358 ctcccaatccttgaatcttcaagt 13809335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 27961163 - 27961394
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- 99  Q
    ||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||| |||  | || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||     
T  27961163 caattattcataacttcatgcattcaaacatgtcatcataattggagcacggattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcactta 27961261  T
Q  100 ttcatacaaataattaaaaattgcaata--agtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttg 197  Q
    ||||||| || |||| ||| || || ||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |  ||||| |||||    
T  27961262 ttcatac-aacaattgaaatttacactaacaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaat-tccctagctcaagcttcacttttg 27961359  T
Q  198 ctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagt 233  Q
    |||||||||| |||  ||| |||||| |||||||||    
T  27961360 ctcctagctc-tctttcaatccttgaatcttcaagt 27961394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 15045020 - 15045251
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- 99  Q
    |||||||| | |||||||| |||  ||||||  |||||||||| |||||||||||  | || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||     
T  15045020 caattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcactta 15045118  T
Q  100 ttcatacaaataattaaaaattgcaa--taagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttg 197  Q
    ||||||| || |||| | ||||  ||   || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |  |||||  || |    
T  15045119 ttcatac-aacaattgagaatttaaactaaaatgattatgatgaaatctaacccccttaccttagttagattaat-tccctagctcaagcttcaccttag 15045216  T
Q  198 ctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagt 233  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||    
T  15045217 ctcctagctc-tcttccaatccttgaatcttcaagt 15045251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 7185899 - 7185734
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- 99  Q
    ||||||||  ||| ||||| |||  |||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||  |||||||||||||||| || |  |||||||||||||     
T  7185899 caattatcactaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacaaattttaacaactatgaacaattaatcactt-attcaattaagcactta 7185801  T
Q  100 ttcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
     ||||||||  ||| ||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  7185800 atcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgatgaattctaacctccttaccttaattag 7185734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 26 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 7964742 - 7964601
Alignment:
Q  26 aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt-tcatacaaataattaaaaattgca 124  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||  |||||||||||| ||| || || |||||||||||||  ||||||||  ||| ||||||| ||    
T  7964742 aaacatatcatcataattagagcacggattttaacaactatgaacaattactcactt-actcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattaca 7964644  T
Q  125 ataagtgattgtgat-gaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
     ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7964643 ctaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttagttag 7964601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 15 - 166
Target Start/End: Original strand, 14901437 - 14901589
Alignment:
Q  15 ttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataat 113  Q
    |||||||||  |||||| |  ||||||||||||||||||||  | ||  |||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  14901437 ttcatacattcaaacatattgtcataattagagcacgaattataacaaatatgaacaattaatcattt-actcaattaagcacttattcatacaa-taat 14901534  T
Q  114 t-aaaaattgcaataag-tgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
    | ||||||||||||||  ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  14901535 tgaaaaattgcaataaaatgattatgatgaaatttaacccccttaccttagttag 14901589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 41256399 - 41256259
Alignment:
Q  27 aacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataattaaaaattgcaa 125  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || |  |||||||||||||   |||||||  ||| ||||||| |||    
T  41256399 aacatttcatcataattagagcacgaatttcaacaactatgaacaattaatcactt-attcaattaagcacttaaacatacaacaaatgaaaaattacaa 41256301  T
Q  126 -taagtgattgtga-tgaattctaacccccttaccttagtta 165  Q
     ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41256300 ctaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttagtta 41256259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 26 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 47535095 - 47535042
Alignment:
Q  26 aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatca 79  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  47535095 aaacatatcatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatca 47535042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15109404 - 15109173
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- 99  Q
    |||||||| | |||||||| |||  ||||||  |||||||||| ||||| |||||  | |  ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||     
T  15109404 caattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcatgaattctaactattatgaataattaatcaatt-actcaattaagcactta 15109306  T
Q  100 ttcatacaaataattaaaaattgcaat--aagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttg 197  Q
    |||||||||  |||| | ||||  ||   || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |  |||||  || |    
T  15109305 ttcatacaac-aattgagaatttaaactaaaatgattatgatgaaatctaacccccttaccttagttagattaat-tccctagctcaagcttcaccttag 15109208  T
Q  198 ctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagt 233  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||    
T  15109207 ctcctagctc-tcttccaatccttgaatcttcaagt 15109173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 26 - 166
Target Start/End: Original strand, 18276651 - 18276792
Alignment:
Q  26 aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataatt-aaaaattgc 123  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||  | || |||||||||||||  |||||| ||||||| |||||| ||    
T  18276651 aaacatatcatcatatttagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatcacat-actcaattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaatcgc 18276748  T
Q  124 aataagtgattgtga-tgaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
    | ||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  18276749 actaaatgattatgattgaattctaaccccgttaccttaattag 18276792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 15013312 - 15013172
Alignment:
Q  27 aacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataattaaaaattgcaa 125  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||| || |  |||||||||||||   ||||| || || | |||||| |||    
T  15013312 aacatatcatcataattagagcacgaatttaaacaactatgaacaattaatcactt-attcaattaagcacttaaacatac-aacaaatgaaaattacaa 15013215  T
Q  126 -taagtgattgtga-tgaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
     ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15013214 ctaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttagttag 15013172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 87 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 34177617 - 34177538
Alignment:
Q  87 caattaagcactt-ttcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34177617 caattaagcacttattcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgatgaattctaa-ccccttaccttagttag 34177538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 19821768 - 19821665
Alignment:
Q  65 atgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataattaaaaattg---caataagtgattgtgatgaattctaacccccttacctt 160  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||   | | || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19821768 atgatcaattaatcaatt-actcaattaagcacttattcata-aaacaattgaaaattgacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctt 19821671  T
Q  161 agttag 166  Q
    ||||||    
T  19821670 agttag 19821665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 37956949 - 37956913
Alignment:
Q  130 tgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37956949 tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag 37956913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 130 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 40885490 - 40885458
Alignment:
Q  130 tgattgtgatgaattctaacccccttaccttag 162  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40885490 tgattatgatgaattctaacccccttaccttag 40885458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 206; Significance: 1e-113; HSPs: 26)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 32898982 - 32899223
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32898982 caattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcaccaaattaagcacttt 32899081  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctc 200  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32899082 tcataccaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctatctagcttagacttcaattttgctc 32899181  T
Q  201 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32899182 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctc 32899223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 16086209 - 16086450
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16086209 caattatccataacttcatacatctaaacatatcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaattaattcacccaattaagcacttt 16086308  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctc 200  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16086309 tcatacaattaattgaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctc 16086408  T
Q  201 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  16086409 ctatttcttctcccaacccttgattcttcaagttctcttctc 16086450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 16106708 - 16106941
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  16106708 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttacgaacaattaattaattcactcaattaagcacttt 16106807  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctc 200  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  16106808 tcatacaattaattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttaggcttcaattttactc 16106907  T
Q  201 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16106908 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtc 16106941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Original strand, 18432843 - 18433075
Alignment:
Q  9 cataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18432843 cataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcatcatttatgaacaaataatcaattcacccaattaagctcttttcatacaa 18432942  T
Q  109 ataattaaaaatt-gcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctc 207  Q
     ||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  18432943 -taattgaaaatttgcaataa-tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttaggcttcaatttttctcctagctc 18433040  T
Q  208 ttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18433041 ttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctc 18433075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 18777338 - 18777562
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||                 ||||||||||    
T  18777338 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagaacacgaatttcatcttttatgaacaat-----------------taagcacttt 18777420  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctc 200  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18777421 tcatacaaataattgaaaattccaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctc 18777520  T
Q  201 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18777521 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctc 18777562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 13014757 - 13014524
Alignment:
Q  9 cataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13014757 cataacttcatacatctaaacatgtcatcataattaaagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaatttagcacttttcatacaa 13014658  T
Q  109 --ataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagct 206  Q
      |||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  13014657 acataattgaaaattacaataagtgattatgataaattctaacccccttaccttag-taggttaatctccctagcttaggcttaaattttgctcctagct 13014559  T
Q  207 cttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    | || || |  ||||||||||||||||| |||||||    
T  13014558 c-tccccaagtccttgattcttcaagtcctcttctc 13014524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 18570471 - 18570700
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  18570471 caattatccataacatcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta 18570570  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctc 200  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  18570571 tcatacaaataattgaaaattacaa-aattgattatgatgaattctaacccccttaccttag-tatgttaatctccttagcttaggcttcaattttgctc 18570668  T
Q  201 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagt 233  Q
    |||||||  | ||||| ||||||||||||||||    
T  18570669 ctagctcaac-cccaatccttgattcttcaagt 18570700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 22441126 - 22441363
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  22441126 caattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagtacgaatttcatcatatatgaacaattaatcaattcactcaattaagcactta 22441225  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctc 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  22441226 tcatacaaataattgaaaattgcaa-aagtgattatgatgaattctaacccccttaccttag-taggttaatctccatagcttagacttcaatttttctc 22441323  T
Q  201 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    ||||||||  |    ||||||||||||||||||| |||||||    
T  22441324 ctagctctctt--ttacccttgattcttcaagtcctcttctc 22441363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 126 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 25640491 - 25640376
Alignment:
Q  126 taagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgatt 225  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25640491 taagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagtt-ggttaatctctctagattaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgatt 25640393  T
Q  226 cttcaagtcttcttctc 242  Q
    |||||||||||||||||    
T  25640392 cttcaagtcttcttctc 25640376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 18399130 - 18399337
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- 99  Q
    |||||||| | |||||||| |||  ||||||  |||||||||| |||||||||||  | || ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||     
T  18399130 caattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattagtcaatt-actcaattaagcactta 18399228  T
Q  100 ttcatacaaataattaaaaattgcaataag-tgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgc 198  Q
    ||||||||| ||||| ||| || || |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18399229 ttcatacaa-taattgaaatttacactaaaatgattatgaagaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagcttagacttcaattttgc 18399327  T
Q  199 tcctagctct 208  Q
    ||||||||||    
T  18399328 tcctagctct 18399337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 31628460 - 31628552
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaa 93  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31628460 caattatcaataacttcatacatctaaacatgtaatcataattcgaatacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaa 31628552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 27 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15079739 - 15079535
Alignment:
Q  27 aacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataatt-aaaaattgca 124  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||  |||||| |||||||||||| | |||||||| | ||| |||||| |||||||| ||||||| ||    
T  15079739 aacatatcatcctagttagagcacgaatttaa-catctatgaataattaatcaatt-atccaattaatcccttattcata-aaataattgaaaaattaca 15079643  T
Q  125 ataag-tgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttga 223  Q
     |||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  15079642 ctaaaatgattatgatgaattctaacccc-ttaccttagttagattaatccctctagcttaagcttcacttttgctcctagctc-tcttccaatccttga 15079545  T
Q  224 ttcttcaagt 233  Q
    ||||||||||    
T  15079544 ttcttcaagt 15079535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 35136043 - 35135836
Alignment:
Q  26 aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataatt--aaaaattg 122  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||| | | |||||| ||||| ||||||||| |||||  |||||||     
T  35136043 aaacatatcatcctagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcaatt-atctaattaatcacttattcatacaa-taattgaaaaaatta 35135946  T
Q  123 caataag-tgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctcttctcccaaccctt 221  Q
    || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |  ||||| ||| ||||||||||| ||| |||| ||||    
T  35135945 cactaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaat-tccctagctcaagcttcactttagctcctagctc-tcttccaatcctt 35135848  T
Q  222 gattcttcaagt 233  Q
    || |||||||||    
T  35135847 gaatcttcaagt 35135836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 26 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 18629638 - 18629497
Alignment:
Q  26 aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataattaaaaattgca 124  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||| || |  ||||||| |||||  ||||||||  ||| ||||||| ||    
T  18629638 aaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatcactt-attcaattaaacacttaatcatacaacaaataaaaaattaca 18629540  T
Q  125 ataagtgattgtga-tgaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
     ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18629539 ctaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttagttag 18629497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 17083228 - 17083088
Alignment:
Q  26 aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt-tcatacaaataattaaaaattgca 124  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | | ||  |||||||||||||||| || |  |||||||||||||  ||||||||  ||| ||||||| ||    
T  17083228 aaacatatcatcataattagagcacgaatattaacaactatgaacaattaatcactt-attcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattaca 17083130  T
Q  125 ataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
     ||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17083129 ctaaatgattaaaatgaattctaacccccttaccttagttag 17083088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 25367280 - 25367129
Alignment:
Q  12 aacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaat 110  Q
    ||||||||||||  ||||||  |||||||||| |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||| |    
T  25367280 aacttcatacattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattg-ctcaattaagcacttattcatacaa-t 25367183  T
Q  111 aattaaaaattg-caataag-tgattgtgatgaattctaacccccttaccttag 162  Q
    |||| ||||||  || |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25367182 aattgaaaatttacactaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag 25367129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 168 - 242
Target Start/End: Original strand, 31628549 - 31628622
Alignment:
Q  168 ttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||| |||||||    
T  31628549 ttaatctctctagcttaggcttcaattttgctcctagctc-tctctccatccttgattcttcaagtcctcttctc 31628622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 33324884 - 33325116
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- 99  Q
    |||||||| | || ||||| |||  |||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||     
T  33324884 caattatcaacaatttcatgcatacaaacatatcatcctagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcaatt-atccaattaatcactta 33324982  T
Q  100 ttcatacaaataattaaaa--attgcaataag-tgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaatttt 196  Q
    ||||||||  ||||| |||  ||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||| |  ||||| |||     
T  33324983 ttcatacat-taattgaaataattacactaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatgaat-tccctagctcaagcttcacttta 33325080  T
Q  197 gctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagt 233  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||| |||| ||||    
T  33325081 gctcctagctc-tcttccaatccttgaatctttaagt 33325116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 37 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 33538389 - 33538261
Alignment:
Q  37 cataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt-tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattg 135  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||| || || |||||||||||||  ||||||||  ||| ||||||| || ||| |||||     
T  33538389 catagttagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatcactt-actcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgatta 33538291  T
Q  136 tgat-gaattctaacccccttaccttagtt 164  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33538290 tgattgaattctaacccccttaccttagtt 33538261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 21623360 - 21623522
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- 99  Q
    |||||||| | |||||||| |||  ||||||  |||||||||| |||||||||||  | || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||     
T  21623360 caattatcaacaacttcatgcattcaaacataccatcataattggagcacgaattctaacatttatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcactta 21623458  T
Q  100 ttcatacaaataattaaaaattgcaat-aagtgattgtga-tgaattctaacccccttacctta 161  Q
    |||||||||  | | | ||||| || | || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  21623459 ttcatacaacaattgagaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacccccttacctta 21623522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 21411105 - 21410933
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- 99  Q
    |||||||| | |||||||| |||  | ||||  |||||||||| |||||| ||||  | |  ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||     
T  21411105 caattatcaacaacttcatgcattcatacataacatcataattggagcacaaattctaacgattatgaacaattagtcaattc-ctcaattaagcactta 21411007  T
Q  100 ttcatacaaataattaaaaattg-caataag-tgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaat 172  Q
    ||||||||| ||||| ||||||  || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21411006 ttcatacaa-taattgaaaatttacactaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaat 21410933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 22361820 - 22361660
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- 99  Q
    |||||||| | || ||||| |||  |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||| |||  | |||||||||||||     
T  22361820 caattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacaaattttatcatctatgaacaattaatc-atttgctcaattaagcactta 22361722  T
Q  100 ttcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtga-tgaattctaacccccttacctta 161  Q
    |||||||||  | | ||||||| | | || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  22361721 ttcatacaacaattgaaaaattacta-aaatgattatgattgaattctaacccccttacctta 22361660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 17557048 - 17556908
Alignment:
Q  26 aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataattaaaaattgca 124  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||  | || ||| |||| ||||||| ||    
T  17557048 aaacatatcatcataattagagcacgaattt-aacaactatgaacaaataatcaatt-attcaattaagcacttaataatgcaattaatgaaaaattaca 17556951  T
Q  125 ataagtgattgtga-tgaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
     ||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17556950 ctagatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattag 17556908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 16887822 - 16887680
Alignment:
Q  26 aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataatt-aaaaattgc 123  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||| || |  ||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||      
T  16887822 aaacatattatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcattt-attcaattaatcacttattcatacaa-taattgaaaaattat 16887725  T
Q  124 aataag--tgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
    | |||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16887724 actaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag 16887680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 232
Target Start/End: Original strand, 25919936 - 25920036
Alignment:
Q  130 tgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttc 229  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||| |   |||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||| |||||    
T  25919936 tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaat-tccctagttctaacttcactttagctcctagctc-tcccccaatccttgaatcttc 25920033  T
Q  230 aag 232  Q
    |||    
T  25920034 aag 25920036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 79
Target Start/End: Original strand, 29605666 - 29605719
Alignment:
Q  26 aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatca 79  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||    
T  29605666 aaacatatcaccataattagagcacgaatttcaacaactatgaacaaataatca 29605719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 206; Significance: 1e-113; HSPs: 58)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 17100845 - 17101085
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17100845 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatggacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 17100944  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctc 200  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17100945 tcatacaaa-aattgaaaatagcaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatttctctagcttagacttcaattttgctc 17101043  T
Q  201 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17101044 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctc 17101085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 17101530 - 17101770
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17101530 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatggacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 17101629  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctc 200  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17101630 tcatacaaa-aattgaaaatagcaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatttctctagcttagacttcaattttgctc 17101728  T
Q  201 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17101729 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctc 17101770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 54424204 - 54424445
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54424204 caattatccataacttcatacatctaaacatggcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 54424303  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctc 200  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  54424304 tcatacaaataattgaaaattgaaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgcgc 54424403  T
Q  201 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  54424404 ctagctcttctcccaatccttgattctttaagtcctcttctc 54424445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 317556 - 317333
Alignment:
Q  9 cataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  317556 cataacttcatacatctaaacatgtcatcatacttagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaa 317457  T
Q  109 ataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctct 208  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  317456 ataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaacccccttaccttag-taggttaatctccctagcttaggcttcaattttgctcctagctct 317359  T
Q  209 tctcccaacccttgattcttcaagtc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  317358 tctcccaacccttgattcttcaagtc 317333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 6154378 - 6154145
Alignment:
Q  9 cataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaa 108  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  6154378 cataatttcatacatctaaacatgtcattataattagaggacgaatttcatgacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatagaa 6154279  T
Q  109 ataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctct 208  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  6154278 ataattgaaaattataataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatatctctagcttaggcttcaattttgctcctagatct 6154179  T
Q  209 tctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6154178 tctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctc 6154145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 38527920 - 38528159
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38527920 caattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttt 38528019  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctc 200  Q
    ||||||||||| || |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  38528020 tcatacaaatagttgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaacccccttaccttag-taggttaatctccctagcttaagcttcaattttgctc 38528117  T
Q  201 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38528118 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctc 38528159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22144327 - 22144096
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22144327 caattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcagttatgaacagttaatcaattcacccaattaagcacttt 22144228  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctc 200  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||     
T  22144227 tcatacaaataattgaaaattacaaaaagtgattatgatgaattctaacccccttaccttag-taggttaatctctctagcttaggcttcaatttttctt 22144129  T
Q  201 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagt 233  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22144128 ctatctcttctcccaacccttgattcttcaagt 22144096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 14304240 - 14304479
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14304240 caattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 14304339  T
Q  101 tcatacaaataatt-aaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgct 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  14304340 tcatacaaataattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttaggcttcaatttttct 14304438  T
Q  200 cctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    |||||||||  |  || |||||||||||||||||| |||||||    
T  14304439 cctagctctctt--caccccttgattcttcaagtcctcttctc 14304479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 50112106 - 50111876
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  50112106 caattattcataacttcatacatctaaacatggcatcataattagagcatgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttt 50112007  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctc 200  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50112006 tcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctc 50111907  T
Q  201 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagt 233  Q
    ||||||||  || ||  ||||||||||||||||    
T  50111906 ctagctctcttcaca--ccttgattcttcaagt 50111876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 34439395 - 34439157
Alignment:
Q  4 ttatccataacttcatacatc-taaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttc 102  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  34439395 ttatccataacttcatacctcataaacatgacatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaaacacttttc 34439296  T
Q  103 atacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcct 202  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  34439295 atacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaatctccttaccttag-taggttaatctctctagcataggcttcaattttgctcct 34439197  T
Q  203 agctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  34439196 agctcttctcccaacccttgattcttcaagttctcttctc 34439157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 14298613 - 14298820
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14298613 caattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 14298712  T
Q  101 tcatacaaataatt-aaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgct 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  14298713 tcatacaaataattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttaggcttcaatttttct 14298811  T
Q  200 cctagctct 208  Q
    |||||||||    
T  14298812 cctagctct 14298820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 12349594 - 12349388
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12349594 caattatccataaatttatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatggacaattaattaattcacccaattaagcacttt 12349495  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctc 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  12349494 tcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttaagcttcaatattgctc 12349395  T
Q  201 ctagctc 207  Q
    |||||||    
T  12349394 ctagctc 12349388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 16996107 - 16995876
Alignment:
Q  9 cataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  16996107 cataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcaccacttatgaataattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaa 16996008  T
Q  109 ataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctct 208  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16996007 ataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaacccccttaccttag-tagcttaatctacctagcttaggcttcaattttgctcctagctct 16995910  T
Q  209 tctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16995909 tctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctc 16995876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 56 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 6146769 - 6146583
Alignment:
Q  56 tcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaaccccctt 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6146769 tcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaaccccctt 6146670  T
Q  156 accttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6146669 accttagttaggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctc 6146583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 35123887 - 35124127
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35123887 caattatccataatttcatacatccaaacacgtcatcataattaaagtacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 35123986  T
Q  101 tcatacaaataatt-aaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgct 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  35123987 tcatacaaataattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaacccctttaccttagttagattaatctccctagcttaggcttcaattttgct 35124085  T
Q  200 cctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  35124086 cctagctc-tctctcaatccttgattcttcaagtcctcttctc 35124127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 16182001 - 16181764
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  16182001 caattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta 16181902  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctc 200  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  16181901 tcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaacccccttaccttag-tagattaatctccctagcttaggcttcaattttgctc 16181804  T
Q  201 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    ||||||| |||  | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  16181803 ctagctc-tctatc-acccttgattcttcaagtcctcttctc 16181764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 8631982 - 8632211
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  8631982 caattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcacttaagaacaattaattaattcatccaattaagcacttt 8632081  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctc 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||  |||  || ||||||||| ||||||||||||||    
T  8632082 tcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaatcctaacccccttaccttagatagagtaa--tccctagcttaggcttcaattttgctc 8632179  T
Q  201 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagt 233  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  8632180 ctagctc-tcacccaatccttgattcttcaagt 8632211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 13817703 - 13817941
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  13817703 caattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgtacaattaatcaattcatccaattaagcactta 13817802  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctc 200  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13817803 tcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaacccccttaccttag-taggttaatctccctagcttagacttcaattttgctc 13817900  T
Q  201 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
     ||||| |   ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  13817901 atagct-taaccccaatccttgattcttcaagtcctcttctc 13817941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 26 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14528110 - 14527904
Alignment:
Q  26 aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataatt-aaaaattgca 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  14528110 aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacctaattaagcacttttcatacaa-taattgaaaaattgca 14528012  T
Q  125 ataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgat 224  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  14528011 ataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagcttaggcttcaattttgctcctagctc-tcccccaatccttgat 14527913  T
Q  225 tcttcaagt 233  Q
    |||||||||    
T  14527912 tcttcaagt 14527904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 14295631 - 14295861
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  14295631 caattatccataacttcatacattcaaacatgacatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccattttagcacttt 14295730  T
Q  101 tcatacaaataatt-aaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgct 199  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||  |||||||| |||    
T  14295731 tcatac-aataattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagattagggttcaatttagct 14295828  T
Q  200 cctagctcttctcccaacccttgattcttcaagt 233  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  14295829 cctagctc-tcccccaatccttgattcttcaagt 14295861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 14301258 - 14301488
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  14301258 caattatccataacttcatacattcaaacatgacatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccattttagcacttt 14301357  T
Q  101 tcatacaaataatt-aaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgct 199  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||  |||||||| |||    
T  14301358 tcatac-aataattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagattagggttcaatttagct 14301455  T
Q  200 cctagctcttctcccaacccttgattcttcaagt 233  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  14301456 cctagctc-tcccccaatccttgattcttcaagt 14301488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 55440903 - 55440682
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- 99  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  55440903 caattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactta 55440804  T
Q  100 ttcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgct 199  Q
    |||||||           ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  55440803 ttcatac-----------aattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagcctaggcttcaattttgct 55440715  T
Q  200 cctagctcttctcccaacccttgattcttcaagt 233  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  55440714 cctagctc-tcttccaatccttgattcttcaagt 55440682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17522944 - 17522714
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    |||||||||| | ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||     
T  17522944 caattatccacatcttcatacatccaaaactgtcatcataattagagcacgaagttcatcatttatgaacaaataatcaattcacccaaataagcacttc 17522845  T
Q  101 tcatacaaataatt-aaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgct 199  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  17522844 tcatacaa-taattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttatattaatctccctagcttaggcttcaattttgct 17522747  T
Q  200 cctagctcttctcccaacccttgattcttcaagt 233  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  17522746 cctagctc-tcccccaatccttgattcttcaagt 17522714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 19570744 - 19570507
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||     
T  19570744 caattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcaaaattagagcacaaatttcatcacatatgaaaaattaatcaattcatccaattaagcactta 19570645  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctc 200  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||    
T  19570644 tcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaa-ccccttaccttag-taggttaatctccctagctaaggcttgaattttgctc 19570548  T
Q  201 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    |||||| |   ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  19570547 ctagct-taaccccaatccttgattcttcaagtcctcttctc 19570507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 3578281 - 3578511
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  3578281 caattatccataacttcatacat-tcaacatgtcatcataattagagaatgaatatcatcatttatgaacaattaatcaatttacccaattaagcactta 3578379  T
Q  100 ttcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgct 199  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||    
T  3578380 ttcctacaa-taattgaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccgcttaccttagttagattaatctccctagcttaggcttcaatttttct 3578478  T
Q  200 cctagctcttctcccaacccttgattcttcaagt 233  Q
    | |||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  3578479 catagctc-tcttccaatccttgattcttcaagt 3578511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 238
Target Start/End: Original strand, 17938782 - 17938999
Alignment:
Q  18 atacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattaaa 117  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17938782 atacatccaaacatgtcaccataattagagcacgaatttcatcactcaagaacaattaattaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaa 17938881  T
Q  118 aattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctcttctcccaac 217  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||| | |  |||  || ||||||||  |||||||||||||||||||||  | | ||||    
T  17938882 aattgcaataagtgattatgatgaaccctaacccccttatcttagatggagtaa--tccctagcttaagcttcaattttgctcctagctcaac-cacaac 17938978  T
Q  218 ccttgattcttcaagtcttct 238  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  17938979 ccttgattcttcaagtcttct 17938999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 30207408 - 30207651
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- 99  Q
    |||||||| | |||||||| |||  ||||||  |||||||||| |||||||||||  | |   |||||| |||||||||||| || |||||||||||||     
T  30207408 caattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaaccagtatgaataattaatcaatt-actcaattaagcactta 30207506  T
Q  100 ttcatacaaataattaaaaattgcaataag--tgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttg 197  Q
    |||||||||  | | |||| || || |||   ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  30207507 ttcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattataacccccttaccttagttagattaatctccctagcttaggcttcaattttg 30207606  T
Q  198 ctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30207607 ctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctc 30207651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 11061060 - 11060831
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||||   || ||||| |||| |||| | ||||||||||||||     
T  11061060 caattattcataacttcatacatttaaaaat-tgatcataattagagcacgaatttcatcatccattaacaaataattaatt-atccaattaagcactta 11060963  T
Q  100 ttcatacaaataatt-aaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgc 198  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||| ||||||    
T  11060962 ttcatacaa-taattgaaaaattgcaatta-tgattatgatgaattccaacccccttaccttagttagattaatctccctagcttaagcttcagttttgc 11060865  T
Q  199 tcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagt 233  Q
    ||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||    
T  11060864 tcctagctc-tcttccactccttgattcttcaagt 11060831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 34 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12560258 - 12560060
Alignment:
Q  34 catcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataatt-aaaaattgcaataagtg 131  Q
    |||||||||| |||||||||||  | || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  12560258 catcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacttattcatacaa-taattgaaaaattgcaataaatg 12560161  T
Q  132 attgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaa 231  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  ||||||||| |||| ||| || ||| |||| ||||||||||||||    
T  12560160 attatgatgaattttaacccccttaccttagttagattaatctccctaacttaagcttcaatttagctcatagttc-tcttccaatccttgattcttcaa 12560062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 115 - 233
Target Start/End: Original strand, 40939432 - 40939549
Alignment:
Q  115 aaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctcttctccc 214  Q
    |||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40939432 aaaatttgcaatgaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttatattaatctccctagcttaggcttcaattttgctcctagctc-tctccc 40939530  T
Q  215 aacccttgattcttcaagt 233  Q
    || ||||||||||||||||    
T  40939531 aatccttgattcttcaagt 40939549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 161 - 234
Target Start/End: Original strand, 13835973 - 13836046
Alignment:
Q  161 agttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13835973 agttaggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtc 13836046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 233
Target Start/End: Original strand, 17139711 - 17139931
Alignment:
Q  12 aacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaat 110  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||  | || ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||      
T  17139711 aacttcatgcattcaaacatgtcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacacttaatcaatt-actcaattaagcacttattcatacaac- 17139808  T
Q  111 aattaaaaattgcaataag--tgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctct 208  Q
    |||| ||| || || ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||  |  |||||||||  ||||||||||     
T  17139809 aattgaaatttacactaagaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaat-tccctagcccaagcttcaatttacctcctagctc- 17139906  T
Q  209 tctcccaacccttgattcttcaagt 233  Q
    ||| |||| |||||| |||||||||    
T  17139907 tcttccaatccttgaatcttcaagt 17139931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 53898510 - 53898440
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaaca 71  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53898510 caattattcataacttcatagatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaaca 53898440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 11328995 - 11328854
Alignment:
Q  27 aacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataattaaaaatt---g 122  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  | || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||        
T  11328995 aacatgtcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aataattgaaaatttaca 11328898  T
Q  123 caataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
    | | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11328897 ctaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag 11328854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 14059268 - 14059067
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- 99  Q
    |||||||| | |||||||| |||  ||||||  |||||||||| |||||||||||  | || | ||||||||||| |||||| |  |||||||||||||     
T  14059268 caattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaatcatgaacaattagtcaatt-agtcaattaagcactta 14059170  T
Q  100 ttcatacaaataattaaaaattgcaat-aagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgc 198  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| | || ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||| ||    
T  14059169 ttcatac-aataattgaaaattgcactaaaatgattatgatgaattataaccccctta-cttagttagattaat-tccctagcttagacttcactttagc 14059073  T
Q  199 tcctag 204  Q
    ||||||    
T  14059072 tcctag 14059067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 11196374 - 11196283
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaatta 92  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||    
T  11196374 caattatccataacttcatacattcaaacatatcatcattattagagcacaaatttcatcatccatgaacaattaatcaattcacctaatta 11196283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 34 - 166
Target Start/End: Original strand, 39656751 - 39656883
Alignment:
Q  34 catcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataattaaaaattgcaataagtga 132  Q
    |||||||||| ||||||| |||| | || ||||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||  | | |||||||||| ||| |||    
T  39656751 catcataattggagcacggattttaacaattatgaacaattaatcattt-actcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaaattgcactaaatga 39656849  T
Q  133 ttgtgatgaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
    || |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  39656850 ttatgatcaattctaactcccttaccttagttag 39656883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 19260894 - 19260839
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaattt 56  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19260894 caattatccataacttcatacatctaaacatatcatcataattagagcacgaattt 19260839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 26 - 161
Target Start/End: Original strand, 17191758 - 17191895
Alignment:
Q  26 aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataattaaaaattgca 124  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||| || |||||||||| || |||||||||  | | ||||||| ||    
T  17191758 aaacatatcatcataattagagcacgaattttatcatctatgaacaattaatc-atttactcaattaagcaattgttcatacaacaattgaaaaattaca 17191856  T
Q  125 at-aagtgattgtga-tgaattctaacccccttacctta 161  Q
     | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17191857 ctaaaatgattgtgattgaattctaacccccttacctta 17191895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 11882240 - 11882108
Alignment:
Q  34 catcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt-tcatacaaataattaaaaattgcaataagtga 132  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||  || |||||| |||||| || |  |||||||||||||  ||||||||  |||||||| || || ||| |||    
T  11882240 catcataattagagcatgaaattcaacatctaagaacaaataatcactt-attcaattaagcacttaatcatacaacaaattaaaagttacactaaatga 11882142  T
Q  133 ttgtgatgaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11882141 ttatgatgaattctaacccccttaccttagttag 11882108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 16880315 - 16880482
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- 99  Q
    |||||||| | |||||| | |||  |||||| ||||| ||||| |||||||||||  | || |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||     
T  16880315 caattatcaacaacttcttgcattcaaacatatcatcgtaattggagcacgaattcaaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaaacacttg 16880413  T
Q  100 ttcatacaaataattaaaaattgca--ataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
    |||||||||  | | |||| || ||  | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16880414 ttcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag 16880482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 82
Target Start/End: Original strand, 15876275 - 15876341
Alignment:
Q  16 tcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaatt 82  Q
    |||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  15876275 tcatgcatttaaacatattatcataattagagcacgaatttcatcatctatgaacaattaatcaatt 15876341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 161
Target Start/End: Original strand, 17204898 - 17205035
Alignment:
Q  26 aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataattaaaaattgca 124  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||| ||| |  | | ||||||| ||    
T  17204898 aaacatatcatcataattagagcacgaattttatcatctatgaacaattaatc-atttactcaattaagcacttgttcgtaccacaattgaaaaattaca 17204996  T
Q  125 at-aagtgattgtgat-gaattctaacccccttacctta 161  Q
     | || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  17204997 ctaaaatgattatgatggaattctaacccccttacctta 17205035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 26 - 99
Target Start/End: Original strand, 15517848 - 15517920
Alignment:
Q  26 aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt 99  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  15517848 aaacatatcatcataattagagcacgaattttaacatttatgaacaattaatcactt-actcaattaagcactt 15517920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 9590784 - 9590643
Alignment:
Q  26 aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt-tcatacaaataatt-aaaaattgc 123  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| |||| | ||  ||||||||||||| || || |  |||||||||||||  ||||||||  | || ||||||| |    
T  9590784 aaacatatcatcatagttagagcacggattttaacaactatgaacaattaaccactt-attcaattaagcacttaatcatacaacaatttgaaaaattac 9590686  T
Q  124 aataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9590685 actaaatgattatgatgaattctaatccccttaccttagttag 9590643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12487701 - 12487601
Alignment:
Q  131 gattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttca 230  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |  ||||| ||| |||| |||||| ||| |||| |||||| ||||||    
T  12487701 gattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaat-tccctagctcaagcttcattttagctcttagctc-tcttccaatccttgaatcttca 12487604  T
Q  231 agt 233  Q
    |||    
T  12487603 agt 12487601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 47784821 - 47784648
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatca----cttatgaacaattaatcaattcacccaattaagca 96  Q
    |||||||| | |||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||||||  | ||    | | |||||||| ||||| || || ||||||||||    
T  47784821 caattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattataacaacttcctttgaacaataaatcattt-actcaattaagca 47784723  T
Q  97 ctt-ttcatacaaataattaaaaattgcaataag--tgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggt 168  Q
    ||| |||||||||  | | |||| || || |||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47784722 cttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggt 47784648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 13301491 - 13301359
Alignment:
Q  34 catcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt-tcatacaaataattaaaaattgcaataagtga 132  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||  || |||| | |||||| || |  |||||||||||||  ||||||||  ||| ||||||  || ||| |||    
T  13301491 catcataattagagcacgaaattcaacatctaagaaccaataatcactt-attcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaatcacactaaatga 13301393  T
Q  133 ttgtgatgaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13301392 ttatgatgaattctaacccccttaccttaattag 13301359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 13312147 - 13312015
Alignment:
Q  34 catcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt-tcatacaaataattaaaaattgcaataagtga 132  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||  || |||| | |||||| || |  |||||||||||||  ||||||||  ||| ||||||  || ||| |||    
T  13312147 catcataattagagcacgaaattcaacatctaagaaccaataatcactt-attcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaatcacactaaatga 13312049  T
Q  133 ttgtgatgaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13312048 ttatgatgaattctaacccccttaccttaattag 13312015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 87 - 166
Target Start/End: Original strand, 48421855 - 48421935
Alignment:
Q  87 caattaagcactt-ttcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||| || ||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  48421855 caattaagcacttattcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgatgaattctaactctcttaccttagttag 48421935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 3576493 - 3576331
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- 99  Q
    |||||||| | |||||||| |||  |||||| ||||||||||||||| |||||||  | ||  | ||||||||||||| ||| || |||||||||||||     
T  3576493 caattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagtacgaattataacaactttgaacaattaatc-atttactcaattaagcactta 3576395  T
Q  100 ttcatacaaataattaaaaattgcaat-aagtgattgtga-tgaattctaacccccttacctta 161  Q
    ||| |||||  | | ||||||| || | || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  3576394 ttcgtacaacaattgaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacccccttacctta 3576331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 14814795 - 14814653
Alignment:
Q  26 aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt-tcatacaaataattaaaaattgca 124  Q
    |||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||  ||||| ||| |||||| || |  |||||||||||||  |||| ||| |||| ||||||| ||    
T  14814795 aaacatatcaccataattaaagcacgaatttcaacaactatgagcaaataatcactt-attcaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattaca 14814697  T
Q  125 a-taagtgattgtgat-gaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
    | ||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  14814696 actaattgattatggttgaattctaacccccttaccttagttag 14814653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 6146801 - 6146764
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatca 38  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6146801 caattattcataacttcatacatctaaacatgtcatca 6146764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 17960237 - 17960201
Alignment:
Q  130 tgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17960237 tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag 17960201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 130 - 165
Target Start/End: Original strand, 14080832 - 14080867
Alignment:
Q  130 tgattgtgatgaattctaacccccttaccttagtta 165  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14080832 tgattatgatgaattctaacccccttaccttagtta 14080867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 130 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 38810940 - 38810905
Alignment:
Q  130 tgattgtgatgaattctaacccccttaccttagtta 165  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38810940 tgattatgatgaattctaacccccttaccttagtta 38810905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 12488781 - 12488674
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- 99  Q
    |||||||| | |||||||| |||| |||||    ||||||||||||||| |||||  | || ||||||||||||||| || | || |||||||||||||     
T  12488781 caattatcaacaacttcatgcatccaaacacaatatcataattagagcatgaattctaacaattatgaacaattaattaa-tgactcaattaagcactta 12488683  T
Q  100 ttcatacaa 108  Q
    |||||||||    
T  12488682 ttcatacaa 12488674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 51961106 - 51961030
Alignment:
Q  87 caattaagcacttt-tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttag 162  Q
    |||||||||||||  ||||||||  ||| ||||||| || ||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  51961106 caattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 51961030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 33)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 21397284 - 21397524
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21397284 caattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttt 21397383  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctc 200  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
T  21397384 tcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctatcttaggcttcaatttttctc 21397483  T
Q  201 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttct 241  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21397484 ctagatcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttct 21397524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 4 - 242
Target Start/End: Original strand, 20712271 - 20712509
Alignment:
Q  4 ttatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttca 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20712271 ttatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatca-ttatgaacaattaatcaattcactcaattaagcacttttca 20712369  T
Q  104 tacaaataattaaaaattgcaa-taagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcct 202  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20712370 tacaagtaattgaaaattgcaaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatttctctagcttaggcttcaattttgctcct 20712469  T
Q  203 agctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  20712470 agctcttctcccaacccttgattcttcaagttctcttctc 20712509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 24183187 - 24182947
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24183187 caattatccatgacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 24183088  T
Q  101 tcatacaaataatt-aaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgct 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  24183087 tcatacaaataattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagcttaggcttcaattttgct 24182989  T
Q  200 cctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  24182988 cctagctc-tctcccaatccttgattcttcaagtcctcttctc 24182947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 21646795 - 21646556
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21646795 caattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagtacgaatttcatcacatatgaacatttaatcaattcacccaaataagcacttt 21646696  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctc 200  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  21646695 tcatacaaataatt-gaaattgcaataagtgattatgatgaattttaacccccttaccttag-taggttaatctctctagtttaggcttcaattttgctc 21646598  T
Q  201 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21646597 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctc 21646556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 3 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 1168257 - 1168020
Alignment:
Q  3 attatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttc 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  1168257 attatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcaccaaaataagcatttttc 1168158  T
Q  103 atacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcct 202  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  1168157 atacaaataattgaaaattgcaataagtga-tatgatgaattctaacccccttaccttag-tagattaatctccctagcttaggcttcaattttgctcct 1168060  T
Q  203 agctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1168059 agctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctc 1168020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 21906891 - 21907131
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21906891 caattatccataacttcatatgtctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaattaattcacccaattaagcacttt 21906990  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctc 200  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21906991 tcatacaaataattgaaaattgtgataaatgattatgataaattct-acccccttaccttagttatattactctctctagcttaggcttcaattttgctc 21907089  T
Q  201 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  21907090 ctagctcttctccaaacccttgattcttcaagtcctcttctc 21907131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Original strand, 4865462 - 4865692
Alignment:
Q  9 cataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  4865462 cataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcaccatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaa 4865561  T
Q  109 ataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctct 208  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  4865562 ataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaacccccttaccttag-taggttaatctccctagcttaggcttcaattttgctcctagctca 4865659  T
Q  209 tctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
     | || || ||||||||||||||||| |||||||    
T  4865660 ac-ccaaatccttgattcttcaagtcctcttctc 4865692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Original strand, 28261716 - 28261945
Alignment:
Q  9 cataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  28261716 cataacttcatacatctaaacatgtcatcataactagagcacgaatttcaccacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaa 28261815  T
Q  109 ataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctct 208  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||     
T  28261816 ataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaacccccttaccttag-taggttaatctccttagcttaggcttcaattttgctcctagctc- 28261912  T
Q  209 tctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    |||  | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  28261913 tctatc-acccttgattcttcaagtcctcttctc 28261945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 19405730 - 19405962
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- 99  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19405730 caattatccataacttcatacattcaaatatgtcatcataattagagcataaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactta 19405829  T
Q  100 ttcatacaaataatt-aaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgc 198  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  19405830 ttcatac-aataattgaaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagcttaggcttcaatttagc 19405928  T
Q  199 tcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagt 233  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  19405929 tcctagctc-tcccccaatccttgattcttcaagt 19405962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 11337241 - 11337012
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- 99  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||     
T  11337241 caattattcataacttcatacatccaaacatatcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaaccaattcatccaattaagcactta 11337142  T
Q  100 ttcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgct 199  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |  |||||||||||||    
T  11337141 ttcatac-aataattgaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagctcaagcttcaattttgct 11337043  T
Q  200 cctagctcttctcccaacccttgattcttcaa 231  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  11337042 cctagctc-tcccccaatccttgattcttcaa 11337012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 11584246 - 11584405
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||     
T  11584246 caattattcataacttcatacatccaaatatgtcatcataaatagagcacgaatttcaccactcatgaacaattaattaattcatccaattaagcactta 11584345  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttacctta 161  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11584346 tcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaacccccttacctta 11584405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Original strand, 23466636 - 23466856
Alignment:
Q  9 cataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcataca 107  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||   ||||||| |||||||||||  |  | |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||    
T  23466636 cataacttcttacatacaaacatgttgccataattggagcacgaattctaataattatgaacaattaatcaatt-acacaattaatcacttattcataca 23466734  T
Q  108 aataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctc 207  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23466735 a-taattgaaaattgcaataattgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagcttaggcttcaattttgctcctagctc 23466833  T
Q  208 ttctcccaacccttgattcttcaa 231  Q
     ||| |||  ||||||||||||||    
T  23466834 -tcttccactccttgattcttcaa 23466856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 26 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 23981546 - 23981433
Alignment:
Q  26 aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattaaaaattgcaa 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  23981546 aaacatatcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaatgcactaaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattgcaa 23981447  T
Q  126 taagtgattgtgat 139  Q
    ||||||||| ||||    
T  23981446 taagtgattatgat 23981433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 24475769 - 24475861
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaa 93  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24475769 caattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagaacacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaa 24475861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 130 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22662608 - 22662510
Alignment:
Q  130 tgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttc 229  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  22662608 tgattatgatgaattctatcccccttaccttagttagattaatctccctagcttagacttcaatttttctcctagctc-tctcccaatccttgattcttc 22662510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 213
Target Start/End: Original strand, 3674079 - 3674266
Alignment:
Q  26 aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataattaaaaattgca 124  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||  | || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||  |||| |||||| ||    
T  3674079 aaacatatcatcataatttgagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacttattcatacaac-aattgaaaattaca 3674176  T
Q  125 ataag--tgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctcttctcc 213  Q
     |||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |  ||||| ||| |||||||| || |||||    
T  3674177 ctaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaat-tccctagctcaagcttcactttagctcctagatcctctcc 3674266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 432655 - 432820
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- 99  Q
    |||||||| | |||| ||| |||  |||||| ||||||||||| |||| ||||||| | || |||||| |||||||||| || || |||||||||||||     
T  432655 caattatcaacaactacatgcattcaaacatatcatcataattggagcgcgaattttaacaattatgatcaattaatcattt-actcaattaagcactta 432753  T
Q  100 ttcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
    ||||| |||  | | |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  432754 ttcatgcaacaattgaaaaattgcagtaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag 432820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 19862401 - 19862563
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- 99  Q
    |||||||| | |||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||| || || |||||||||||||     
T  19862401 caattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcactt-actcaattaagcactta 19862499  T
Q  100 ttcatacaaataattaaaaattgcaat-aagtgattgtga-tgaattctaacccccttacctta 161  Q
    |||||||||  ||| ||||||| || | || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  19862500 ttcatacaacaaatgaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacccccttacctta 19862563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 21310739 - 21310600
Alignment:
Q  26 aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataattaaaaattgca 124  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||  ||||||||  ||| ||||||| ||    
T  21310739 aaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatttatgaacaattaatcactt-actcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattaca 21310641  T
Q  125 at-aagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagtt 164  Q
     | || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21310640 ctaaaatgattatgatgaattttaacccccttaccttagtt 21310600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 16595699 - 16595871
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- 99  Q
    |||||||| | |||||||| |||  ||||||  |||||||||| |||||||||||  | || ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||     
T  16595699 caattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattagtcaatt-actcaattaagcactta 16595797  T
Q  100 ttcatacaaataattaaaaattg-caataag-tgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaat 172  Q
    ||||||||| ||||| ||||||  || |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  16595798 ttcatacaa-taattgaaaatttacactaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtaagattaat 16595871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 26 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 21297205 - 21297064
Alignment:
Q  26 aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt-tcatacaaataattaaaaattgca 124  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||| | || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||  ||||||||  ||| ||||||| ||    
T  21297205 aaacatatcatcatagttagaggacgaattttaacatttatgaacaattaatcactt-actcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattaca 21297107  T
Q  125 ataag-tgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
     |||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21297106 ctaaaataattatgatgaattctaacccccttaccttagttag 21297064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 28902383 - 28902550
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- 99  Q
    |||||||| | ||||| || |||  ||||||  |||||||||| |||||||||||  | || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||     
T  28902383 caattatcaacaactttatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcactta 28902481  T
Q  100 ttcatacaaataattaaaaatt---gcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
    ||||||| || |||| ||||||    | | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28902482 ttcatac-aacaattgaaaattaacactacaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag 28902550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 28938778 - 28938945
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- 99  Q
    |||||||| | ||||| || |||  ||||||  |||||||||| |||||||||||  | || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||     
T  28938778 caattatcaacaactttatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcactta 28938876  T
Q  100 ttcatacaaataattaaaaatt---gcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
    ||||||| || |||| ||||||    | | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28938877 ttcatac-aacaattgaaaattaacactacaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag 28938945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 36 - 166
Target Start/End: Original strand, 7728647 - 7728779
Alignment:
Q  36 tcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataattaaaaattgca--ataagtga 132  Q
    |||||||| ||| |||||||  | || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||  ||| |||| || ||  | || |||    
T  7728647 tcataattggagtacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacttattcatacaacaaatgaaaatttacaccaaaaatga 7728745  T
Q  133 ttgtgatgaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7728746 ttatgatgaattctaacccccttaccttagttag 7728779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 23494111 - 23494283
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- 99  Q
    ||||| |||| |||||||| |||   |||||||||||||| || |||||||||||  | || |||||||||||||||  ||| || |||||||||||||     
T  23494111 caattttccacaacttcatgcattcgaacatgtcatcatagttggagcacgaattctaacaattatgaacaattaattgatt-actcaattaagcactta 23494209  T
Q  100 ttcatacaaataattaaaaattgca--ataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaat 172  Q
    ||||||| || |||| ||| || ||  | || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23494210 ttcatac-aacaattgaaatttacactaaaaatgattatgatgatttctaacccccttaccttagttagattaat 23494283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 43 - 166
Target Start/End: Original strand, 37983598 - 37983722
Alignment:
Q  43 tagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt-tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgat-g 140  Q
    |||||||| ||||| | ||  |||||||||||||||| || || |||||||||||||  ||||||||  ||| ||||||| || ||| ||||| |||| |    
T  37983598 tagagcacaaattttaacaactatgaacaattaatcactt-actcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgattg 37983696  T
Q  141 aattctaacccccttaccttagttag 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  37983697 aattctaacccccttaccttagttag 37983722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 166
Target Start/End: Original strand, 21617233 - 21617375
Alignment:
Q  26 aaacatgtcatcataattagagcacgaatt-tcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataatt-aaaaattg 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| | |  ||| ||||||||||||||  || || |||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||     
T  21617233 aaacatatcatcataattagagcacgaattctaacaactaatgaacaattaatccctt-actcaattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaatta 21617330  T
Q  123 caataagtgattgtga-tgaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
    || ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21617331 cactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattag 21617375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 32966171 - 32966037
Alignment:
Q  34 catcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataattaaaaatt---gcaataag 129  Q
    |||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| || |||| || |||| ||||||    | | ||     
T  32966171 catcataattggagcacgaattttaacaattatgaacaattaatc-atttactcaattaagcacttatttatac-aacaattgaaaattcacactaaaaa 32966074  T
Q  130 tgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32966073 tgattatgatgaattctaaccctcttaccttagttag 32966037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 21222638 - 21222503
Alignment:
Q  26 aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataatt-aaaaattgc 123  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  | ||  ||||||||||||||||||  || |||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||| |    
T  21222638 aaacatatcatcataattagagcacgaattctaacaactatgaacaattaatcaat--actcaattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattac 21222542  T
Q  124 aataagtgattgtga-tgaattctaacccccttacctta 161  Q
    | ||| | ||| ||| |||| |||||||||| |||||||    
T  21222541 actaaataattatgattgaactctaacccccatacctta 21222503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 166
Target Start/End: Original strand, 6456848 - 6456980
Alignment:
Q  36 tcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataattaaaaattgcaa-taagtgat 133  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||| || |  |||||||||||||  |||| ||| |||| ||||||| ||| ||| ||||    
T  6456848 tcataattagagcacgaatttcaacaactatgaacaaataatcactt-attcaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgat 6456946  T
Q  134 tgt-gatgaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
    | | | |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  6456947 tatggttgaaatctaacccccttatcttagttag 6456980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 5450898 - 5450736
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- 99  Q
    |||||||| | |||||||| |||  ||||||  |||||||||| ||||| |||||  | || |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||     
T  5450898 caattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcatgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcattta 5450800  T
Q  100 ttcatacaaataattaaaaattgca--ataagtgattgtgatgaattctaacccccttacctta 161  Q
    || || |||  | | |||| || ||  | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5450799 tttatgcaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta 5450736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 24225376 - 24225235
Alignment:
Q  26 aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttc-atacaaataattaaaaattgca 124  Q
    |||||| ||| ||||||||  ||||||| |||| ||  || ||||||||||||| || | | ||||||||||||  | |||||| || | ||||||| ||    
T  24225376 aaacatatcaccataattaaggcacgaaattcaacatctaagaacaattaatcacttaatc-aattaagcacttaaccatacaactagtgaaaaattaca 24225278  T
Q  125 ataagtgattgtgat-gaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
     ||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  24225277 ctaaatgattatgattgaattctaactcccttaccttagttag 24225235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 166
Target Start/End: Original strand, 24084294 - 24084437
Alignment:
Q  26 aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcactta-tgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt-tcatacaaataattaaaaattgc 123  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||||||| ||| || ||| ||||||| |||||| || |  |||||||||||||  |||| ||| |||| ||||||| |    
T  24084294 aaacatatcaccataattagggcacgaatgtcaccaattaatgaacaaataatcactt-attcaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattac 24084392  T
Q  124 aa-taagtgattgtgat-gaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
    || ||| ||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  24084393 aactaattgattatggttgaattctaatccccttaccttagttag 24084437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 132305 - 132063
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  132305 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 132206  T
Q  101 tcatacaaataatt-aaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgct 199  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  132205 tcatagaaataattgaaaaattgcaataagtgattatgatgaattccaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaatttttct 132106  T
Q  200 cctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  132105 catagctcttctcccaacccttaattcttcaagtcctcttctc 132063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 234
Target Start/End: Original strand, 88468 - 88700
Alignment:
Q  2 aattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactttt 101  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  88468 aattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacgaatttcatcatttatggacaattaatcaattcacccaattaaacactttt 88567  T
Q  102 catacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcc 201  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  88568 catacaaataattgaaaatagcaataagtgattatgatgaattctaacccccttacctttattagattaatctctctagcttaggcttcaatttttctcc 88667  T
Q  202 tagctcttctcccaacccttgattcttcaagtc 234  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  88668 tagctcttctccgaacccttgattcttcaagtc 88700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 16091 - 16324
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaa-ttaatcaattcacccaattaagcactt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16091 caattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacggatttcatcatttatgaacaaattaatcaattcacccaattaagcactt 16190  T
Q  100 -ttcatacaaataattaaaaattgca--ataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaatttt 196  Q
     ||||||||| ||||| ||| |||||  | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||     
T  16191 gttcatacaa-taattgaaa-ttgcaccaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagcttaggcttcaattta 16288  T
Q  197 gctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagt 233  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  16289 gctcctagctc-tcccccaatccttgattcttcaagt 16324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 25622 - 25855
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaa-ttaatcaattcacccaattaagcactt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25622 caattatccataacttcatacattaaaacatgtcatcataattagagcacggatttcatcatttatgaacaaattaatcaattcacccaattaagcactt 25721  T
Q  100 -ttcatacaaataattaaaaattgca--ataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaatttt 196  Q
     ||||||||| ||||| ||| |||||  | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||     
T  25722 gttcatacaa-taattgaaa-ttgcaccaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagcttaggcttcaattta 25819  T
Q  197 gctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagt 233  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  25820 gctcctagctc-tcccccaatccttgattcttcaagt 25855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 11880 - 12112
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- 99  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  11880 caattatccataacttcatacattgaaacatgtcatcataattagagcacgaaattcatcatttatgaacaattaatcaattgacccaattaagcactta 11979  T
Q  100 ttcatacaaataattaaaaattgca--ataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttg 197  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||  | || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||      
T  11980 ttcatacaa-taattgaaa-ttgcaccaaaaatgattatgatgaattctaaccaccttaccttagttagattaatctccctagcttaggcttcaatttaa 12077  T
Q  198 ctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagt 233  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  12078 ctcctagctcttct-ccaatccttgattcttcaagt 12112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 38490 - 38731
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38490 caattattcataaattcataaatctaaacatgtcatcataattagagcgcgtatttcatcatttatgaacaattaattaattcacccaattaagcacttt 38589  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctc 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38590 tcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctc 38689  T
Q  201 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38690 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctc 38731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 40851 - 41091
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40851 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagtacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactat 40950  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctc 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  40951 tcatacaa-taattaaaaattgcaataaatgattatgatgaattataacccccttaccttagttaggttaatctctttagcttaggcttcaattttgctc 41049  T
Q  201 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41050 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctc 41091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 46358 - 46598
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46358 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcaaaattagagtacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 46457  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctc 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  46458 tcatacaa-taattaaaaattgcaataaatgattatgatgaattataaccctcttaccttaattaggttaatctctttagcttaggcttcaattttgctc 46556  T
Q  201 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  46557 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaaatcctcttctc 46598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 30)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 143831 - 144071
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  143831 caattatttataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttt 143930  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctc 200  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  143931 ttatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttag-taggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctc 144029  T
Q  201 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  144030 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctc 144071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 15822486 - 15822247
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15822486 caattatccataacttcatacatccaa-catgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 15822388  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctc 200  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15822387 tcatacaaataactgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttag-taggttaatctctctagcttagactttaattttgctc 15822289  T
Q  201 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15822288 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctc 15822247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 45452223 - 45451992
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45452223 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 45452124  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctc 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  45452123 tcatacaaataattgaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctatagcttaggcttcaattttgctc 45452024  T
Q  201 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtc 234  Q
    ||||||||  |  || ||||||||||||||||||    
T  45452023 ctagctctctt--catcccttgattcttcaagtc 45451992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 47289973 - 47290215
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  47289973 caattattcataacttcatatatctaaacatggcatcataattagagctcgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcatttt 47290072  T
Q  101 tcatacaaataatt-aaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgct 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47290073 tcatacaaataattgaaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttaattaggttaatctctctagtttagacttcaattttgct 47290172  T
Q  200 cctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47290173 ccaagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctc 47290215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 12369895 - 12369654
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12369895 caattatccgtaacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttaatcatttatgaacaattaattaattcacccaattaagcacttt 12369796  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctc 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  12369795 tcatacaaataattgaaaattgcaataaatgataatgatgaaatctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttaggcttcaatttcgctc 12369696  T
Q  201 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12369695 ctaaatcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctc 12369654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 12759179 - 12759419
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12759179 caattatccataacttcatacatctaaacatatcatcataattggagcacaaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaaacacttt 12759278  T
Q  101 tcatacaaataatt-aaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgct 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12759279 tcatacaaataattgaaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctccctagcttagacttcaattttgct 12759378  T
Q  200 cctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    |||||||||  |  || |||||||||||||||||| |||||||    
T  12759379 cctagctctctt--caccccttgattcttcaagtcctcttctc 12759419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 13862984 - 13862747
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    |    
T  13862984 caattattcataacttcatacatctaaacatttcatcataattagagcacgaatttcatcatttatggacaattaatctattcacccaattaagc----t 13862889  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctc 200  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13862888 tcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctaacttaggcttcaattttgctc 13862789  T
Q  201 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  13862788 ctagctcttctcccaaccattgattcttcaagtcctcttctc 13862747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 26070319 - 26070080
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||     
T  26070319 caattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaatt-acacaattaagcactta 26070221  T
Q  100 ttcatacaaataatt-aaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgc 198  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26070220 ttcatacca-taattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaacccc-ttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgc 26070124  T
Q  199 tcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26070123 tcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctc 26070080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 26094106 - 26093867
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||     
T  26094106 caattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaatt-acacaattaagcactta 26094008  T
Q  100 ttcatacaaataatt-aaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgc 198  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26094007 ttcatacca-taattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaacccc-ttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgc 26093911  T
Q  199 tcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26093910 tcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctc 26093867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 44865423 - 44865660
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44865423 caattattcataacttcatacatctaaacatggcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttt 44865522  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctc 200  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44865523 tcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaa-tctaacccccttaccttag-taggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctc 44865620  T
Q  201 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    ||||||||  | |  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  44865621 ctagctctctttc--acccttgattcttcaagtcatcttctc 44865660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 3895217 - 3895455
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  3895217 caattatccataacttcatacatctaaacatttcatcagaattagagcatgaatttcatcaattatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta 3895316  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctc 200  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  3895317 tcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaacccccttaccttag-taggttaatctccctagcttaggcttcaattttgctc 3895414  T
Q  201 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    |||||||  | ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  3895415 ctagctcaac-cccaatccttgattcttcaagtcctcttctc 3895455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 11287609 - 11287838
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11287609 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcaacataatcagagcactaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaaacacttt 11287708  T
Q  101 tcatacaaataatt-aaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgct 199  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11287709 tcatac-aataattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagcttagacttcaattttgct 11287806  T
Q  200 cctagctcttctcccaacccttgattcttcaagt 233  Q
    |||||||| ||| |||  ||||||||||||||||    
T  11287807 cctagctc-tct-ccactccttgattcttcaagt 11287838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12248175 - 12247944
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||     
T  12248175 caattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaagtaatcaatt-atccaattaagcactta 12248077  T
Q  100 ttcatacaaataatt-aaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgc 198  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  12248076 ttcatac-aataattgaaaaattgcaatatatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagcttaggcttcaattttgc 12247978  T
Q  199 tcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagt 233  Q
    ||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  12247977 tcctacctc-tcttccaatccttgattcttcaagt 12247944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 39046675 - 39046444
Alignment:
Q  9 cataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  39046675 cataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaa 39046576  T
Q  109 ataatt-aaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctc 207  Q
    |||||| ||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||  ||||||||||||||||||||     
T  39046575 ataattgaaaaataacaa-aagtgattatgatgaattctaacccccttaccttag-taggttaatctcctaagcttaagcttcaattttgctcctagct- 39046479  T
Q  208 ttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    |   ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  39046478 taaccccaatccttgattcttcaagtcctcttctc 39046444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Original strand, 35095015 - 35095245
Alignment:
Q  9 cataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  35095015 cataacttcatacatctaaacatgttatcacaattagagcatgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaa 35095114  T
Q  109 ataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctct 208  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||  |||||||||||||||||||| |    
T  35095115 ataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaacccccttaccttag-taggttaatctcctaagcttaagcttcaattttgctcctagct-t 35095211  T
Q  209 tctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
       |||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  35095212 aaccccaatacttgattcttcaagtcctcttctc 35095245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16570060 - 16569830
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||     
T  16570060 caattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataatgagagcacgaatttcatcatttatgagcaaataatcaatt-atccaattaagcactta 16569962  T
Q  100 ttcatacaaataatt-aaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgc 198  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  ||||||||| ||    
T  16569961 ttcatac-aataattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattttaacccccttacctttgttagattaatctccctagcttatgcttcaatttagc 16569864  T
Q  199 tcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagt 233  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  16569863 tcctagctc-tcccccaatccttgattcttcaagt 16569830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 16595602 - 16595832
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||     
T  16595602 caattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataatgagagcacgaatttcatcatttatgagcaaataatcaatt-atccaattaagcactta 16595700  T
Q  100 ttcatacaaataatt-aaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgc 198  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  ||||||||| ||    
T  16595701 ttcatac-aataattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattttaacccccttacctttgttagattaatctccctagcttatgcttcaatttagc 16595798  T
Q  199 tcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagt 233  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  16595799 tcctagctc-tcccccaatccttgattcttcaagt 16595832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 7284115 - 7283956
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  7284115 caatcatccataacttcacacatctaaacatgtcatcataattagagtacgaatttcaccacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta 7284016  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttacctta 161  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  7284015 tcatataaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaaaactaacccccttacctta 7283956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 138 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 26069525 - 26069422
Alignment:
Q  138 atgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttc 237  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26069525 atgaattctaacccc-ttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctc 26069427  T
Q  238 ttctc 242  Q
    |||||    
T  26069426 ttctc 26069422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 49047729 - 49047499
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- 99  Q
    |||||||| | |||||||| |||  ||||||||||| |||||| |||||| ||||  | || || ||||||||||||||||| || |||||||||||||     
T  49047729 caattatcaacaacttcatgcattcaaacatgtcattataattggagcacaaattctaacaattctgaacaattaatcaatt-actcaattaagcactta 49047631  T
Q  100 ttcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgct 199  Q
    |||||| ||  | | |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| | |  ||||||||| |||    
T  49047630 ttcatataacaattgaaaaatggcaataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaat-tccctagttcaagcttcaatttagct 49047532  T
Q  200 cctagctcttctcccaacccttgattcttcaagt 233  Q
    |||||||| ||| |||| |||||| |||||||||    
T  49047531 cctagctc-tcttccaatccttgaatcttcaagt 49047499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 26 - 233
Target Start/End: Original strand, 13274994 - 13275199
Alignment:
Q  26 aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataattaaaaattgca 124  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||  | || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||  | | |||||| |||    
T  13274994 aaacatatcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaaatggca 13275092  T
Q  125 ataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgat 224  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| || |   |||| ||| ||||||||||| ||| |||| ||||||     
T  13275093 ataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaat-tccctaactcaagattcactttagctcctagctc-tcttccaatccttgaa 13275190  T
Q  225 tcttcaagt 233  Q
    |||||||||    
T  13275191 tcttcaagt 13275199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 16914958 - 16914816
Alignment:
Q  26 aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataatt-aaaaattgc 123  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||| || || |||||||||||||  |||||| ||||||| |||| || |    
T  16914958 aaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatcactt-actcaattaagcacttaatcatac-aataattgaaaagttac 16914861  T
Q  124 aataagtgattgtga-tgaattctaacccccttaccttagttagg 167  Q
    | ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  16914860 actaaatgattgtgattgaattctaacccctttaccttaattagg 16914816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 34 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 34241229 - 34241096
Alignment:
Q  34 catcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt-tcatacaaataattaaaaattgcaataagtga 132  Q
    ||||||||||| | ||||||||| ||||  |||||||||||||||| || || ||||||| |||||  ||||||||  ||| ||||||| || ||| |||    
T  34241229 catcataattataacacgaattttatcaactatgaacaattaatcactt-actcaattaatcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatga 34241131  T
Q  133 ttgtgat-gaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34241130 ttatgattgaattctaacccccttaccttagttag 34241096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 166
Target Start/End: Original strand, 48356861 - 48357002
Alignment:
Q  26 aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataattaaaaattgca 124  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||  |||||||||||||||| || || |||||||||| ||  ||||||||  ||| ||||||| ||    
T  48356861 aaacatatcatcataattagagcacaaattttaacaactatgaacaattaatcactt-actcaattaagcatttaatcatacaacgaatgaaaaattaca 48356959  T
Q  125 ataagtgattgtga-tgaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
     ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48356960 ctaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattag 48357002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 26 - 166
Target Start/End: Original strand, 9611525 - 9611666
Alignment:
Q  26 aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataatt-aaaaattgc 123  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||  | || |||||||||||||  | |||| ||||||| ||||||| |    
T  9611525 aaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatcacgt-actcaattaagcacttaatgatac-aataattgaaaaattac 9611622  T
Q  124 aataagtgattgtga-tgaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
    | ||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  9611623 actaaatgattatgattgaattctaaccctcttaccttaattag 9611666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 26 - 166
Target Start/End: Original strand, 9839096 - 9839237
Alignment:
Q  26 aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataatt-aaaaattgc 123  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||  | || |||||||||||||  | |||| ||||||| ||||||| |    
T  9839096 aaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatcacgt-actcaattaagcacttaatgatac-aataattgaaaaattac 9839193  T
Q  124 aataagtgattgtga-tgaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
    | ||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  9839194 actaaatgattatgattgaattctaaccctcttaccttaattag 9839237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 13377721 - 13377883
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- 99  Q
    |||||||| | |||||||| |||  ||||||  |||||||||| |||||||||||  | || |||||||||||||||| ||| || |||| || |||||     
T  13377721 caattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcgatt-actcaatgaatcactta 13377819  T
Q  100 ttcatacaaataattaaaaattgca--ataagtgattgtgatgaattctaacccccttacctta 161  Q
    |||||||||  | | |||| || ||  | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13377820 ttcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta 13377883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 17223993 - 17223830
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- 99  Q
    |||||||||| |||||| | |||  |||||| |||||||||||||||||||||||  | ||  | ||||||||||||  ||| || |||||||||||||     
T  17223993 caattatccacaacttcgtgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattataacaactttgaacaattaat-tatttactcaattaagcactta 17223895  T
Q  100 ttcatacaaataatt-aaaaattgca--ataagtgattgtga-tgaattctaacccccttacctta 161  Q
     ||||| |||||||| ||||||| ||  | || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  17223894 atcata-aaataattgaaaaattacactaaaaatgattatgattgaattctaacccccttacctta 17223830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 14271929 - 14271848
Alignment:
Q  26 aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaa 108  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  14271929 aaacatatcaccataattagagcacgaatttga-caactatgaacaattaatc-atttactcaattaagcacttattcatacaa 14271848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 162
Target Start/End: Original strand, 25124407 - 25124483
Alignment:
Q  87 caattaagcacttt-tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttag 162  Q
    |||||||||||||  ||||||||  ||| ||||||| || ||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  25124407 caattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 25124483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 25)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 22403164 - 22402924
Alignment:
Q  2 aattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactttt 101  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22403164 aattattcataacttcatacatctagacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactttt 22403065  T
Q  102 catacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcc 201  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  22403064 catacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctaccttaggctttaattttgctcc 22402965  T
Q  202 tagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22402964 taactcttcttccaacccttgattcttcaagtcctcttctc 22402924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 35054948 - 35055189
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35054948 caattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaattaaatcatttatgaacaattaaccaattcacccaattaagcacttt 35055047  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctc 200  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35055048 tcatacaaataattgaaaatagaaataagtgattatgatgaattttaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctc 35055147  T
Q  201 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  35055148 ctagatcttctcccaacccttgattcttcatgtcctcttctc 35055189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 49967842 - 49968082
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  49967842 caattattcataacttcatacatctaaacatggcatcataattagagcacgaatttcatgatttttgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttt 49967941  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctc 200  Q
    |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  49967942 tcatgcaaataattgaaaattacaataagtgattacgatgaattctaacccccttaccttag-taggttaatctctctaccttagacttcaattttgctt 49968040  T
Q  201 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  49968041 ctagctcttctcccaactcttgattcttcaagtcatcttctc 49968082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 9784119 - 9783890
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9784119 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcatcacttatgaacaatttatcaattcacccaattaagcacttt 9784020  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctc 200  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||  || ||||||||| ||||||||||||||    
T  9784019 tcataccaataattgaaaattgcagtaagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagatagagtaa--tccctagcttaggcttcaattttgctc 9783922  T
Q  201 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagt 233  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  9783921 ctagctc-tcacccaatccttgattcttcaagt 9783890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 35522407 - 35522177
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35522407 caattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcccttt 35522308  T
Q  101 tcatacaaataatt-aaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgct 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  35522307 tcatacaaataattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaactcccttaccttagttagattaatctccttagcttaggcttcaattttgct 35522209  T
Q  200 cctagctcttctcccaacccttgattcttcaagt 233  Q
    |||||||||  |  || |||||||||||||||||    
T  35522208 cctagctctctt--caccccttgattcttcaagt 35522177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 21718420 - 21718649
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21718420 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatccatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 21718519  T
Q  101 tcatacaaataatt-aaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgct 199  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||| ||||||||  ||||||||| |||    
T  21718520 tcatac-aataattgaaaaattgcaataa-tgattatattgaattctaa-tcccttaccttagttagattagtctccctagcttatgcttcaatttagct 21718616  T
Q  200 cctagctcttctcccaacccttgattcttcaagt 233  Q
    | ||||| ||| ||||| | ||||||||||||||    
T  21718617 catagct-ttcccccaatcattgattcttcaagt 21718649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 41212263 - 41212415
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  41212263 caattattcataacttcatacctctaaacaggtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaaacactta 41212362  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaaccccct 154  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  41212363 tcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaaccccct 41212415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 27329803 - 27329580
Alignment:
Q  9 cataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcataca 107  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||      ||    ||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||     
T  27329803 cataacttcatatatacaaacatgtcatcataattggagcacgaatt------ct----aacaattaatcaatt-acacaattaaacacttattcatacc 27329715  T
Q  108 aataatt-aaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagct 206  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||    
T  27329714 a-taattgaaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagattgggcttcaattttactcctagct 27329616  T
Q  207 cttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  27329615 cttctctcaatcattgattcttcaagtcctcttctc 27329580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 127 - 242
Target Start/End: Original strand, 20346342 - 20346456
Alignment:
Q  127 aagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattc 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20346342 aagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagt-aggttaatctccctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcctaacccttgattc 20346440  T
Q  227 ttcaagtcttcttctc 242  Q
    |||||||| |||||||    
T  20346441 ttcaagtcctcttctc 20346456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 166
Target Start/End: Original strand, 19603303 - 19603454
Alignment:
Q  15 ttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataat 113  Q
    |||||||||  ||||||  |||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  19603303 ttcatacattcaaacataacatcataattggagcacgaattttaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacttattcatac-aataat 19603400  T
Q  114 t-aaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
    | |||| ||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19603401 tgaaaatttgcactaaatgattatgatgaattctagcccccttaccttagttag 19603454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 22829466 - 22829315
Alignment:
Q  15 ttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataat 113  Q
    |||||||||  ||||||  |||||||||| |||||||||||  | || ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||  | |    
T  22829466 ttcatacattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaataattaatcaatt-actcaattaagcacttattcatacaacaatt 22829368  T
Q  114 taaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
     |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22829367 gaaaaattgcactaaatgattatgatgaattctaacccccttactttagttag 22829315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 166
Target Start/End: Original strand, 16646105 - 16646271
Alignment:
Q  2 aattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-t 100  Q
    ||||||| | |||||||| |||  ||||||  |||||||||| |||||||||||  | || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |    
T  16646105 aattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacttat 16646203  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgca--ataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
    ||||||||  | | |||| || ||  | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16646204 tcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag 16646271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 20955480 - 20955329
Alignment:
Q  15 ttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataat 113  Q
    |||||||||  ||||||  |||||||||| |||||| ||||  | || ||||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||  | |    
T  20955480 ttcatacattcaaacataacatcataattggagcacaaattctaacaattatgaacaattaatcattt-actcaattaagcacttattcatacaacaatt 20955382  T
Q  114 taaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
     |||| ||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20955381 gaaaatttgcactaaatgattatgatgaattataacccccttaccttagttag 20955329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 13376913 - 13376752
Alignment:
Q  2 aattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-t 100  Q
    ||||||| | |||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||      
T  13376913 aattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgattctcatcatctatgaacaattaatcaatt-actaaattaagcacttaa 13376815  T
Q  101 tcatacaaataatt-aaaaattgcaat-aagtgattgtga-tgaattctaacccccttacctta 161  Q
    |||||| ||||||| ||||||| || | || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  13376814 tcatac-aataattgaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacccccttacctta 13376752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 16656830 - 16656997
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- 99  Q
    |||||||| | ||||| || |||  ||||||  |||||||||| |||||||||||  | || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||     
T  16656830 caattatcaacaactttatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcactta 16656928  T
Q  100 ttcatacaaataattaaaaatt---gcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
    ||||||| || |||| ||||||    | | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16656929 ttcatac-aacaattgaaaattaacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag 16656997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 33 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 51627687 - 51627513
Alignment:
Q  33 tcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataattaaaaattgcaataag-- 129  Q
    ||||||||||| |||||| ||||  | |  |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||  |||| ||| || || |||       
T  51627687 tcatcataattggagcacaaattctaacgattatgaacaaataatcaatt-actcaattaagcacttattcatgcaac-aattgaaatttacactaaaaa 51627590  T
Q  130 tgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctc 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  51627589 tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaa-ctccctagcttaagcttcaatttagctcctagctc 51627513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 33 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 22143384 - 22143251
Alignment:
Q  33 tcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataatt-aaaaattgcaat-aag 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| || | ||     
T  22143384 tcatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatc-atttatccaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaattacactaaaa 22143287  T
Q  130 tgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22143286 tgattatgatgaattctaa-ccccttaccttagttag 22143251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 166
Target Start/End: Original strand, 17609152 - 17609286
Alignment:
Q  33 tcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt-tcatacaaataatt-aaaaattgcaataagt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||  ||||| ||| |||||| || || |||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||| || ||| |    
T  17609152 tcatcataattagagcacgaattctaacaactatgatcaactaatcactt-actcaattaagcacttaatcatacaa-taattgaaaaattacactaaat 17609249  T
Q  131 gattgtgat-gaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17609250 gattatgattgaattctaacccccttaccttagttag 17609286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 26 - 166
Target Start/End: Original strand, 21195231 - 21195373
Alignment:
Q  26 aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataattaaaaattgca 124  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||| || |  |||||||||||||   |||||||  ||| ||||||| ||    
T  21195231 aaacatatcaccataattagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatcactt-attcaattaagcacttaaacatacaacaaatgaaaaattaca 21195329  T
Q  125 a-taagtgattgtga-tgaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
    | ||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  21195330 actaaatgattatgattgaattctaaaccccttaccttagttag 21195373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 20177367 - 20177464
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt 99  Q
    |||||||| | |||||| | |||  |||||| ||||||||||| |||||||||||  | || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  20177367 caattatcaacaacttcgtgcattaaaacatatcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcactt 20177464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 34 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 36356315 - 36356181
Alignment:
Q  34 catcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataattaaaaattgcaataag--t 130  Q
    |||||||||  |||||||||||  | || | |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||  | | |||| || || |||   |    
T  36356315 catcataataggagcacgaattctaacaatcatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaat 36356217  T
Q  131 gattgtgatgaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36356216 gattatgatgaattctaacccccttactttagttag 36356181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 8537965 - 8537798
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||||  ||| ||||| |||  |||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||   |||||| | ||||||||| |  ||| |||||||||     
T  8537965 caattatcactaatttcatgcattcaaacatatcatcataatcaaagcacgaatttcaacaaccatgaacgaataatcaatt-attcaactaagcactta 8537867  T
Q  101 -tcatacaaataattaaaaattgcaa-taagtgattgtgat-gaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
     |||| ||| |||| ||||||| ||| ||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  8537866 atcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatgattgaattctaactcccttaccttagttag 8537798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 8603204 - 8603037
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||||  ||| ||||| |||  |||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||   |||||| | ||||||||| |  ||| |||||||||     
T  8603204 caattatcactaatttcatgcattcaaacatatcatcataatcaaagcacgaatttcaacaaccatgaacgaataatcaatt-attcaactaagcactta 8603106  T
Q  101 -tcatacaaataattaaaaattgcaa-taagtgattgtgat-gaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
     |||| ||| |||| ||||||| ||| ||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  8603105 atcatgcaattaatgaaaaattacaactaattgattatgattgaattctaactcccttaccttagttag 8603037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 49997311 - 49997169
Alignment:
Q  26 aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt-tcatacaaataattaaaaattgca 124  Q
    |||||| ||| ||||| ||| |||| ||||||| || | |||||||| |||||| || |  |||||||||||||  |||| ||| |||| ||||||| ||    
T  49997311 aaacatatcaccataactagggcacaaatttcaacaatcatgaacaaataatcactt-attcaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattaca 49997213  T
Q  125 a-taagtgattgtgat-gaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
    | ||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  49997212 actaattgattatgtttgaattctaacccccttaccttagttag 49997169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 166
Target Start/End: Original strand, 52400848 - 52400990
Alignment:
Q  26 aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt-tcatacaaataattaaaaattgca 124  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||| |||||| || |  |||||||||||||  |||| ||| |||| ||||||| ||    
T  52400848 aaacatatcaccataattagagcacgaaagtcaacaactatgaacaaataatcactt-attcaattaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattaca 52400946  T
Q  125 a-taagtgattgtgat-gaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
    | ||| ||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  52400947 actaattgattatggttgaattctaaccctcttaccttagttag 52400990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 22883 - 23124
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22883 caattattcaaaacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttt 22982  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctc 200  Q
    | |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  22983 tgatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctttagcttaggcttcaattttgctc 23082  T
Q  201 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  23083 ctagctcttctcccaatccttgattcttcaagtcctcttctc 23124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 24782 - 24542
Alignment:
Q  2 aattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactttt 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24782 aattatcaataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatggacaattaatcaattcacctaattaagcactttt 24683  T
Q  102 catacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcc 201  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  24682 catacaaataattgaaaatttcaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttatgcttcaattttgctcc 24583  T
Q  202 tagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24582 tagctcttctcccaacccttgattctgcaagtcctcttctc 24542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 30)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 37611860 - 37612100
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  37611860 caattatttataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatctaattaagcacttt 37611959  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctc 200  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  37611960 tcatacaaataattgaaaattataataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttag-taggttaatctctctatcttaggcttcaattttgctc 37612058  T
Q  201 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37612059 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcatcttctc 37612100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 20561686 - 20561446
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20561686 caattatctataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 20561587  T
Q  101 tcatacaaataatt-aaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgct 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  20561586 tcatacaaataattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagcttaggcttcaattttgct 20561488  T
Q  200 cctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  20561487 cctagctc-tctcccaatccttgattcttcaagtcctcttctc 20561446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 22234858 - 22234620
Alignment:
Q  2 aattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactttt 101  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  22234858 aattattcataacttcatacatctaaacacgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcattcaattaagcacttat 22234759  T
Q  102 catacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcc 201  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | | ||||| |||||||||||||||    
T  22234758 catacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaacccccttaccttag-tagattaatctcccaaacttagtcttcaattttgctcc 22234661  T
Q  202 tagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22234660 tagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctc 22234620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 25122634 - 25122864
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25122634 caattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattggagcacgaatttgatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttt 25122733  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctc 200  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25122734 tcatacaaataattgaaaattataataa-tgattatgatgaattctaacccccttaccttag-taggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctc 25122831  T
Q  201 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtc 234  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25122832 ctagctcttctcccaacccttg-ttcttcaagtc 25122864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 41246850 - 41247088
Alignment:
Q  2 aattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactttt 101  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41246850 aattattcataacttcatacatctaaacatgacatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaaaaattaatcaattcatccaattaagcactttt 41246949  T
Q  102 catacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcc 201  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41246950 catacaactaattgaaaattacaataagtgattatgatgaactctaacccccttaccttag-taggtcaatctctctagcttaggcttcaattttgctcc 41247048  T
Q  202 tagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    || ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  41247049 tacctcttctccgaaccctt-attcttcaagtcctcttctc 41247088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20573247 - 20573016
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20573247 caattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactta 20573148  T
Q  101 tcatacaaataatt-aaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgct 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  20573147 tcatacaaataattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagcttaggcttcaattttgct 20573049  T
Q  200 cctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtc 234  Q
    |||||||||  |  || ||||||||||||||||||    
T  20573048 cctagctctctt--caccccttgattcttcaagtc 20573016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 66 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 20529843 - 20529667
Alignment:
Q  66 tgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagtta 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20529843 tgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattataacccccttaccttagtta 20529744  T
Q  166 ggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20529743 ggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctcctagatcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctc 20529667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 20481797 - 20482035
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- 99  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||     
T  20481797 caattattcataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatccatgaacaaataatcaatt-atccaattaagcactta 20481895  T
Q  100 ttcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgct 199  Q
    ||||||||  ||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  20481896 ttcatacat-taattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattttaacccccttaccttagt-aggttaatctccctagcttaggcttcaattttgct 20481992  T
Q  200 cctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20481993 cctacctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctc 20482035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19993110 - 19992882
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19993110 caattattcataacttcgtacatctaaacatgtcatcataattagagtacggatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttt 19993011  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctc 200  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  19993010 tcatacaaataatt-gaaattacaa-aagtgattatgatgaattataacccccttaccttag-tagattaatctccctagcttaggcttcaatttttctc 19992914  T
Q  201 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtc 234  Q
    ||||||| |||  | |||||||||||||||||||    
T  19992913 ctagctc-tctatc-acccttgattcttcaagtc 19992882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 21681195 - 21681426
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- 99  Q
    |||||||||||||  | ||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||     
T  21681195 caattatccataaacttatacattcaaatatgtcatcataattagatcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattcaacaaattaagcactta 21681294  T
Q  100 ttcatacaaataatt-aaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgc 198  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  21681295 ttcatacaa-taattgaaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttatttagattaatctccctagcttaggcttcaatttttc 21681393  T
Q  199 tcctagctcttctcccaacccttgattcttcaag 232  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  21681394 tcctagctc-tctcccaatccttgattcttcaag 21681426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 22981465 - 22981633
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- 99  Q
    |||||||| | |||||||| |||  ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  22981465 caattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattagagcacaaatttcatca--tctgaacaattaatcaatt-acccaattaagcactta 22981561  T
Q  100 ttcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaat 172  Q
    |||||||||| | | |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22981562 ttcatacaaa-attgaaaaattgcaatatatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaat 22981633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 143 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 20653946 - 20653848
Alignment:
Q  143 ttctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  20653946 ttctaacccccttaccttagttagattaatctccctagcttaggcttcaattttgctcctagctc-tctcctaatccttgattcttcaagtcctcttctc 20653848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 39446821 - 39446590
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- 99  Q
    |||||||||| |||||||  |||  |||||||||||||||||| ||||| |||||  | || |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||     
T  39446821 caattatccacaacttcaagcattcaaacatgtcatcataattggagcatgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcattta 39446723  T
Q  100 ttcatacaaataattaaaaattgcaataag--tgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttg 197  Q
    |||||||||  |||| ||| || || |||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |  ||||||||| |    
T  39446722 ttcatacaac-aattgaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaat-tccctagctcaagcttcaatttag 39446625  T
Q  198 ctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagt 233  Q
    ||| |||||| ||| |||| |||||| |||||||||    
T  39446624 ctcatagctc-tcttccaatccttgaatcttcaagt 39446590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 21198207 - 21198046
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- 99  Q
    |||||||| | |||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||     
T  21198207 caattatctacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaatttcatcatctatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcactta 21198109  T
Q  100 ttcatacaaataatt-aaaaattgcaat-aagtgattgtgatgaattctaacccccttacctta 161  Q
     |||||| ||||||| ||||||| || | || ||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  21198108 atcatac-aataattgaaaaattacactaaaatgattataatgaattctaacccccttatctta 21198046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 34 - 165
Target Start/End: Original strand, 15970046 - 15970177
Alignment:
Q  34 catcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataatt-aaaaattgcaataagtg 131  Q
    |||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||| || || |||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||    
T  15970046 catcataattggagcacgaattttaacaattatgaacaattaatcattt-actcaattaagcatttattcatacaa-taattgaaaaattgcactaaatg 15970143  T
Q  132 attgtgatgaattctaacccccttaccttagtta 165  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15970144 attatgatgaattccaacccccttaccttagtta 15970177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 126 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21259426 - 21259321
Alignment:
Q  126 taagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgatt 225  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||| |    
T  21259426 taagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaat-tccctagcttaagcttcaatttagctcctagctc-tcttccaatccttgaat 21259329  T
Q  226 cttcaagt 233  Q
    ||||||||    
T  21259328 cttcaagt 21259321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 56 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 7000624 - 7000519
Alignment:
Q  56 tcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaaccccctt 155  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||  || |||||||| |||||||  |||||||||||    
T  7000624 tcatcacatatgaacaattaatcaattcatcctattaagcacttatcatacaaataattgaaaatt-aaaaaagtgattatgatgaaaactaaccccctt 7000526  T
Q  156 accttag 162  Q
    || ||||    
T  7000525 actttag 7000519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 23837390 - 23837497
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- 99  Q
    |||||||| | |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||     
T  23837390 caattatcaacaacttcatgcatttaaacatatcatcataattagagcacgaattttatcatctatgaacaattaatc-atttactcaattaagcactta 23837488  T
Q  100 ttcatacaa 108  Q
    |||||||||    
T  23837489 ttcatacaa 23837497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 166
Target Start/End: Original strand, 5854831 - 5854972
Alignment:
Q  26 aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataatt-aaaaattgc 123  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||| || || |||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||| |    
T  5854831 aaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatcactt-actcaattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattac 5854928  T
Q  124 aataagtgattgtga-tgaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
    | ||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  5854929 actaaatgattatgattgaattctaacctccttaccttaattag 5854972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 33528617 - 33528783
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    |||||||| | || ||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||  || ||||||||||||| || |  |||||||||||||     
T  33528617 caattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacggaattcaacatctaagaacaattaatcactt-attcaattaagcactta 33528715  T
Q  101 -tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgat-gaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
     ||||||||  ||| ||||||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33528716 atcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttagttag 33528783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 31194346 - 31194176
Alignment:
Q  34 catcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataattaaaaattgcaataag--t 130  Q
    |||| |||||||||||||||||  | || | |||||||||||||||||| || |||||||||| || |||||||||  | | |||| ||||| |||   |    
T  31194346 catcgtaattagagcacgaattctaacaatcatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaatttgcactaaaaat 31194248  T
Q  131 gattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctccta 203  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  31194247 gattatgatgaaaactaacccccttaccttagttagattaat-tcactagcttaagcttcacttttgctccta 31194176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 26 - 166
Target Start/End: Original strand, 15933515 - 15933656
Alignment:
Q  26 aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataatt-aaaaattgc 123  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||  |||||||||||||||| || || |||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||| |    
T  15933515 aaacatatcatcataattagagcacaaattttaacaactatgaacaattaatcactt-actcaattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattac 15933612  T
Q  124 aataagtgattgtga-tgaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
    | ||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  15933613 actaaatgattatgatttaattctaacccccttaccttaattag 15933656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 26 - 166
Target Start/End: Original strand, 23149996 - 23150135
Alignment:
Q  26 aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataattaaaaattgca 124  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||  ||||||||   | | ||||||  |    
T  23149996 aaacatatcatcataattggagcacgaattttaacaattatgaacaattaatc-atttactcaattaagcacttactcatacaa--caatgaaaattaaa 23150092  T
Q  125 ataagtgattgtgatgaattctaa-cccccttaccttagttag 166  Q
     ||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  23150093 ctaaatgattatgatgaattataaccccccttaccttagttag 23150135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 17285396 - 17285493
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt 99  Q
    |||||||| | |||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||  | || ||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||    
T  17285396 caattatcaacaacttcatgcatttaaacatatcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattattcaatt-attcaattaagcactt 17285493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 23226106 - 23225973
Alignment:
Q  26 aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcac-ttttcatacaaataatt-aaaaattgc 123  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||||| | ||  |||||||||||||||| |    |||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  23226106 aaacatatcatcatagttagagcacaaattttaacatctatgaacaattaatcatt----ccaattaaacactttttcatac-aataattgaaaaattgc 23226012  T
Q  124 aat-aagtgattgtgatgaattctaacccccttacctta 161  Q
    | | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  23226011 actaaaatgattatgatgaattctaacccctttacctta 23225973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 79
Target Start/End: Original strand, 26011711 - 26011764
Alignment:
Q  26 aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatca 79  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||    
T  26011711 aaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatca 26011764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 38533841 - 38534005
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- 99  Q
    |||||||| | |||||||| |||  ||||||  |||||||||| ||| |||||||  | || ||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||     
T  38533841 caattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagtacgaattctaacaattatgaacaattagtcaatt-acttaattaagcactta 38533939  T
Q  100 ttcatacaaataatt-----aaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagt 163  Q
    ||||||||| |||||     || ||||   |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38533940 ttcatacaa-taattcatacaacaattc--ataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagt 38534005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 108
Target Start/End: Original strand, 23158378 - 23158460
Alignment:
Q  26 aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaa 108  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||| | || |||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| |||||||||    
T  23158378 aaacatatcatcataattggagcatgaattttaacaattatgaacaattaatc-atttactcaaataagcacttattcatacaa 23158460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 27233120 - 27232979
Alignment:
Q  26 aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataattaaaaattgca 124  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| | |||||| || |  |||||||||||||   ||| ||| |||| ||||||| ||    
T  27233120 aaacatatcatcataattagagcacgaatttcaacaactatgaactaataatcactt-attcaattaagcacttaaccatgcaattaatgaaaaattaca 27233022  T
Q  125 a-taagtgattgt-gatgaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
    | ||| ||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  27233021 actaattgattatggttgaattctaa-ccccttaccttagttag 27232979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 22735836 - 22735736
Alignment:
Q  68 aacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataattaaaaattgcaataag--tgattgtgatgaattctaacccccttaccttagtt 164  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||  | | |||| || || |||   ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22735836 aacaattaatcaatt-actcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacattaaaaatgattatgatgaattttaacccccttaccttagtt 22735738  T
Q  165 ag 166  Q
    ||    
T  22735737 ag 22735736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 60998 - 61240
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  60998 caattattcataacatcatacatctaaacatgttatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 61097  T
Q  101 tcatacaaataatt-aaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgct 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  61098 tcatacaaataattgaaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaagttaatttctctagcttaagcttcaattttgct 61197  T
Q  200 cctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  61198 cctatctcttctcccaactcttgattcttcaagtcctcttctc 61240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 21 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 79925 - 79704
Alignment:
Q  21 catctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattaaaaat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  79925 catctaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaat 79826  T
Q  121 tgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctcttctcccaaccct 220  Q
    | |||| ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  79825 tacaatgagtgattatgatcaattctaacccccttagcttagttaggttaatctctctagcttatgcttcaattttactcctagctcttctctcaaccct 79726  T
Q  221 tgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    |||||| ||||||| |||||||    
T  79725 tgattcctcaagtcctcttctc 79704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 70666 - 70436
Alignment:
Q  11 taacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||    
T  70666 taacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaactcatccaaataagcacttttcttacaaat 70567  T
Q  111 aattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctcttc 210  Q
    |||| |||||| |||| ||| ||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  70566 aattgaaaattacaatgagttattatg----attctaacccccttaccttagttaggttaatctctctaggttaggcttcaattttgatcctagctcttc 70471  T
Q  211 tcccaacccttgattcttcaagtcttcttctcact 245  Q
    ||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  70470 tctgaacccttgattcctcaagtcctcttctcact 70436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 2)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 877 - 637
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||     
T  877 caattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacatatgaacaatcaatcaattcactcaattaagcactta 778  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctc 200  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  777 tcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttag-taggttactctctctagcttaggcttcaattttgctc 679  T
Q  201 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  678 ctagctcttctcccaacccttgattcttgaagtcctcttctc 637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 6892 - 6671
Alignment:
Q  9 cataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  6892 cataacttcatacatctaaacatgtcctcgtaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactgatcatacaa 6793  T
Q  109 ataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctct 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  6792 ataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccc---accttagttaggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctcctagatct 6696  T
Q  209 tctcccaacccttgattcttcaagt 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  6695 tctcccaacccttgattcttcaagt 6671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 15065 - 15304
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  15065 caattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta 15164  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctc 200  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15165 tcatacatataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaacccccttaccttag-taggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctc 15262  T
Q  201 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15263 ctagctcttcccccaacccttgattcttcaagtcctcttctc 15304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 183; Significance: 4e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 1509 - 1748
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  1509 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcatgattagagcacgaatttcatcatttatacacaattaatcaattcattcaattaaccacttt 1608  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctc 200  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1609 tcatacaaataattgaa--ttgcaataagtgattatgatgaattctaacccccttgccttagttaggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctc 1706  T
Q  201 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1707 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctc 1748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 11708 - 11469
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11708 caattattcataacttcatacatctaaacatggcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttt 11609  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctc 200  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11608 tcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttag-taggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctc 11510  T
Q  201 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    |||||| |   ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  11509 ctagct-taaccccaatccttgattcttcaagtcctcttctc 11469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 11623 - 11384
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  11623 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcaac-aattaaacacttt 11525  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11524 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccccataccttagttaggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctc 11425  T
Q  201 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    ||||||| || | | ||||||||||||||||||  |||||||    
T  11424 ctagctc-tccctccacccttgattcttcaagtactcttctc 11384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Original strand, 48346 - 48576
Alignment:
Q  9 cataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  48346 cataacttcatacatctaaacatttcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaa 48445  T
Q  109 ataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctct 208  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48446 ataattgaaaattacaa-aagtgattatgataaattctaa-ccccttaccttag-taggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctct 48542  T
Q  209 tctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48543 tctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 48576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Original strand, 61794 - 62024
Alignment:
Q  9 cataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  61794 cataacttcatacatctaaacatttcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaa 61893  T
Q  109 ataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctct 208  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  61894 ataattgaaaattacaa-aagtgattatgataaattctaa-ccccttaccttag-taggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctct 61990  T
Q  209 tctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  61991 tctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 62024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 4756 - 4993
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  4756 caattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta 4855  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctc 200  Q
    |||||||||||||| ||||||   | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4856 tcatacaaataattgaaaatt---acaagtgattatgatgaattctaacccccttaccttag-taggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctc 4951  T
Q  201 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4952 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctc 4993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 9370 - 9607
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  9370 caattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta 9469  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctc 200  Q
    |||||||||||||| ||||||   | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9470 tcatacaaataattgaaaatt---acaagtgattatgatgaattctaacccccttaccttag-taggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctc 9565  T
Q  201 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9566 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctc 9607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 7365 - 7602
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  7365 caattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta 7464  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctc 200  Q
    |||||||||||||| ||||||   | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7465 tcatacaaataattgaaaatt---acaagtgattatgatgaattctaacccccttaccttag-taggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctc 7560  T
Q  201 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7561 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctc 7602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 28)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 36890740 - 36890500
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36890740 caattatccataacttcatacatctaaacatgccatcacaattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaaataagcacttt 36890641  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctc 200  Q
    |||||| | ||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||     
T  36890640 tcatacca-taattgaaaataacaataagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctatagcttaggcttcaattttgctg 36890542  T
Q  201 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  36890541 ctagctcttctcccaacctttgattcttcaagtcctcttctc 36890500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 3 - 233
Target Start/End: Original strand, 28974243 - 28974471
Alignment:
Q  3 attatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttc 102  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28974243 attatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcaccaaattaagcacttttc 28974342  T
Q  103 atacaaataatt-aaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcc 201  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28974343 atac-aataattgaaaaattgaaataa-tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagcttagacttcaattttgctcc 28974440  T
Q  202 tagctcttctcccaacccttgattcttcaagt 233  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  28974441 tagctc-tctcccaatccttgattcttcaagt 28974471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 4448188 - 4447949
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4448188 caattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcactcaattaagcacttt 4448089  T
Q  101 tcatacaaataatt-aaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgct 199  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  4448088 tcatataaataattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagtttaggcttcaattttgct 4447990  T
Q  200 cctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
     ||||||||  |  || |||||||||||||||||| |||||||    
T  4447989 tctagctctctt--caccccttgattcttcaagtcctcttctc 4447949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 25602216 - 25602449
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25602216 caattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagtacgaatttcatcatccatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactta 25602315  T
Q  100 ttcatacaaataatt-aaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgc 198  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  25602316 ttcatacaa-taattgaaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagcttaggcttcaattttgc 25602414  T
Q  199 tcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagt 233  Q
    || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  25602415 tcatagctcttcccccaatccttgattcttcaagt 25602449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 271362 - 271600
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  271362 caattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcttcatttatgaataattaatcaattcacccaattaagcacttt 271461  T
Q  101 tcatacaaataatt-aaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgct 199  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  271462 tcatac-aataattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctccttagcttaggcttcaattttgct 271559  T
Q  200 cctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    |||||||||  |  || || ||||||||||||||| |||||||    
T  271560 cctagctctctt--caccctttgattcttcaagtcctcttctc 271600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 25875975 - 25875738
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  25875975 caattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaaacactta 25875876  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctc 200  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  25875875 tcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaacccccttaccttag-taggttaatctccctagcttaggcttcaattttgctc 25875778  T
Q  201 ctagctct-tctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
     ||||||| | ||   || |||||||||||||||| |||||||    
T  25875777 gtagctctatatc---actcttgattcttcaagtcctcttctc 25875738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23836752 - 23836530
Alignment:
Q  9 cataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||    
T  23836752 cataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatctaattaagcacttatcattcaa 23836653  T
Q  109 ataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctct 208  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||     
T  23836652 ataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaacccccttaccttag-tatgttaatctcctaagcttaggcttcaattttgctcctagctc- 23836556  T
Q  209 tctcccaacccttgattcttcaagtct 235  Q
    |||  | ||||||||||||||||||||    
T  23836555 tctatc-acccttgattcttcaagtct 23836530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 27261995 - 27262227
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  27261995 caattatccataactttatacatccaaacatgtcatcataattagggcacaaatttcatcatccatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta 27262094  T
Q  100 ttcatacaaataatt-aaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgc 198  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  27262095 ttcatac-aataattgaaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaactcccttaccttagttagattaatctccctagcttaggcttcaatttagc 27262193  T
Q  199 tcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagt 233  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  27262194 tcctagct-ttcccccaatccttgattcttcaagt 27262227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22579909 - 22579688
Alignment:
Q  9 cataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcataca 107  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||  | || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  22579909 cataacttcatacatacaaacatgtcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-acacaattaagcacttattcataca 22579811  T
Q  108 aataatt-aaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagct 206  Q
    | ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  22579810 a-taattgaaaaattgcaata-gtgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaaattaatctccctagcttaggcttcaatttagctcctagct 22579713  T
Q  207 cttctcccaacccttgattcttcaagt 233  Q
    | ||| ||||  |||||||||||||||    
T  22579712 c-tcttccaa-tcttgattcttcaagt 22579688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24571343 - 24571117
Alignment:
Q  5 tatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttca 103  Q
    |||||| |||||||| |||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||    
T  24571343 tatccacaacttcatgcattcaaacgtgtcatcaaaattagagcacgaatttcatcatctatgaacaattaatcaatt-acccaattaagcatttattca 24571245  T
Q  104 tacaaataattaaaa-attgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcct 202  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||    
T  24571244 tacaa-taattgaaacattgcaataa-tgattatgatgaattctaaccccctaaccttagttagattaatctccctatcttaaacttcaatttagctcct 24571147  T
Q  203 agctcttctcccaacccttgattcttcaagt 233  Q
    ||||| ||| ||||   ||||||||||||||    
T  24571146 agctc-tcttccaatttttgattcttcaagt 24571117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 162
Target Start/End: Original strand, 32466057 - 32466208
Alignment:
Q  9 cataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| || |||||    
T  32466057 cataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcattcaaataagcacttatcgtacaa 32466156  T
Q  109 ataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttag 162  Q
    |||||||||| || ||| |||||||| |||||||  |||| |||||||||||||    
T  32466157 ataattaaaattttcaa-aagtgattatgatgaagactaa-ccccttaccttag 32466208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 123 - 242
Target Start/End: Original strand, 17367131 - 17367251
Alignment:
Q  123 caataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagt--taggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctcttctcccaaccct 220  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17367131 caataagtgattatgatgaattctaaccctcttacctaattagtaggttaat-tctctagcttaggcttcaattttgctcgtagctcttctcccaaccct 17367229  T
Q  221 tgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  17367230 tgattcttcaagtcctcttctc 17367251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 35 - 166
Target Start/End: Original strand, 722617 - 722747
Alignment:
Q  35 atcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataattaaaaattgcaataagtgat 133  Q
    ||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||  ||||  |||||||| ||| ||||    
T  722617 atcataattggagcacgaattttaacaattatgaacaattaatcattt-actcaattaagcacttattcatacaac-aattgcaaattgcactaaatgat 722714  T
Q  134 tgtgatgaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  722715 tatgatgaattctaacccctttaccttagttag 722747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 68184 - 68350
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- 99  Q
    |||||||| | |||||||| |||  ||||||  |||||||||| |||||||||||  | || |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||     
T  68184 caattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatctatt-actcaattaagcactta 68282  T
Q  100 ttcatacaaataattaaaaat---tgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagtta 165  Q
    ||||||| || |||| |||||   | | | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  68283 ttcatac-aacaattgaaaatttatactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagtta 68350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 126 - 233
Target Start/End: Original strand, 7321837 - 7321942
Alignment:
Q  126 taagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgatt 225  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||| | |||||||||| |||||||| || ||| |||| |||||| |    
T  7321837 taagtgattataatgaattctaacccccttaccttagttagattaat-tcccaagctcaaacttcaatttagctcctagatc-tcttccaatccttgaat 7321934  T
Q  226 cttcaagt 233  Q
    ||||||||    
T  7321935 cttcaagt 7321942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 23821694 - 23821529
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- 99  Q
    |||||||| | |||||| | |||  ||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||| || || |||||||||||||     
T  23821694 caattatcaacaacttcctgcattcaaacataacatcataattagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatcactt-actcaattaagcactta 23821596  T
Q  100 ttcatacaaataatt-aaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
      ||| | ||||||| ||||||| || ||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23821595 agcatgc-aataattgaaaaattacactaaatgattataatgaaatctaacccccttaccttagttag 23821529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 23830773 - 23830608
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- 99  Q
    |||||||| | |||||| | |||  ||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||| || || |||||||||||||     
T  23830773 caattatcaacaacttcctgcattcaaacataacatcataattagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatcactt-actcaattaagcactta 23830675  T
Q  100 ttcatacaaataatt-aaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
      ||| | ||||||| ||||||| || ||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23830674 agcatgc-aataattgaaaaattacactaaatgattataatgaaatctaacccccttaccttagttag 23830608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 166
Target Start/End: Original strand, 19666745 - 19666885
Alignment:
Q  26 aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataatt-aaaaattgc 123  Q
    |||||| |||| ||| |||||||| |||||| | ||  |||||||||||||||| || |  |||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||| |    
T  19666745 aaacatatcattatagttagagcatgaattttaacaactatgaacaattaatcactt-attcaattaagcatttattcatacaa-taattgaaaaattac 19666842  T
Q  124 aataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
    | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19666843 actaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttaattag 19666885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19669139 - 19668933
Alignment:
Q  26 aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataatt-aaaaattgc 123  Q
    |||||| ||| |||| |||||||| | |||| | ||  |||||||||||||||| || | |||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||| |    
T  19669139 aaacatatcaccatagttagagcatggattttaacatctatgaacaattaatcattt-atccaattaatcacttattcatacaa-taattgaaaaattac 19669042  T
Q  124 aataag-tgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttg 222  Q
    | |||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||| |  ||||| ||| ||||||||||| |||  ||| |||||    
T  19669041 actaaaatgattatgatgaattctaaccccgttaccttagttagattaat-tccctagctcaagcttcactttagctcctagctc-tctttcaatccttg 19668944  T
Q  223 attcttcaagt 233  Q
    | |||||||||    
T  19668943 aatcttcaagt 19668933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 31146236 - 31146068
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- 99  Q
    |||||||| | |||||||| |||  ||||||  |||||||||| || ||||||||  | || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||     
T  31146236 caattatcaacaacttcatgcattcaaacataccatcataattggaacacgaattctaacaattatggacaattaatcaatt-actcagttaagcactta 31146138  T
Q  100 ttcatacaaataattaaaaattg---caataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
    |||||||||  | || ||||||    ||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31146137 ttcatacaacaatttgaaaatttacacaaaagatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag 31146068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 34 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 24294545 - 24294374
Alignment:
Q  34 catcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataattaaaaattgcaataag--t 130  Q
    |||||||||| |||||||||||  | || | |||||||||||||||||| || |||||||| | || |||||||||  | | |||| || || |||   |    
T  24294545 catcataattggagcacgaattctaacaatcatgaacaattaatcaatt-actcaattaagaatttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaat 24294447  T
Q  131 gattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctag 204  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||| || |||||| | |||||||||| ||||||||    
T  24294446 gattatgatgaactttaacccccttaccttagttagatcaat-tccctagctcaaacttcaatttagctcctag 24294374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 24087417 - 24087345
Alignment:
Q  26 aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt 99  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| | || ||||||| ||||||||| || || |||||||||||||    
T  24087417 aaacatatcatcataattagagcccgaattttaacatttatgaataattaatcactt-actcaattaagcactt 24087345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 108
Target Start/End: Original strand, 25305634 - 25305730
Alignment:
Q  12 aacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaa 108  Q
    |||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||||||  | ||  | ||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  25305634 aacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattataacaactttgaacaattaatc-atttactcaattaagcacttattcatacaa 25305730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 3171 - 3135
Alignment:
Q  130 tgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3171 tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttag 3135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 22775203 - 22775103
Alignment:
Q  68 aacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataattaaaaattgcaataag--tgattgtgatgaattctaacccccttaccttagtt 164  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||  | | |||| || || |||   ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22775203 aacaattaatcaatt-actcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattcttacccccttaccttagtt 22775105  T
Q  165 ag 166  Q
    ||    
T  22775104 ag 22775103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 22780581 - 22780481
Alignment:
Q  68 aacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataattaaaaattgcaataag--tgattgtgatgaattctaacccccttaccttagtt 164  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||  | | |||| || || |||   ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22780581 aacaattaatcaatt-actcaattaagcacttattcatacaacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattcttacccccttaccttagtt 22780483  T
Q  165 ag 166  Q
    ||    
T  22780482 ag 22780481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 116 - 157
Target Start/End: Original strand, 17366959 - 17367000
Alignment:
Q  116 aaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttac 157  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  17366959 aaaattacaataagtgattatgattaattctaacccccttac 17367000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 43646085 - 43646192
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- 99  Q
    |||||||| | |||||||| |||  |||||| ||| |||||||||||||||||||  | ||  | ||||||||||||| ||| || ||||||| |||||     
T  43646085 caattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcaacataattagagcacgaattataacaactttgaacaattaatc-atttactcaattaaacactta 43646183  T
Q  100 ttcatacaa 108  Q
    |||||||||    
T  43646184 ttcatacaa 43646192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 7761 - 8002
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacat-gtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt 99  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7761 caattatttataacttcatacatctaaacataggcatcataattagatcatgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactt 7860  T
Q  100 ttcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgct 199  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7861 ttcatacaaataattgaaaattacaataagtaattatgatgaattctaacccccttaccttag-taggttaatctctctagcttaggcttcaattttgct 7959  T
Q  200 cctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7960 cctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctc 8002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 254869 - 254630
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  254869 caattattcataacttcatacatctaagcatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcatatatgaacaattaatcaattcatccaattaaacactta 254770  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctc 200  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254769 tcatacaaataatt-gaaattacaataagtgattatgatgaattatatcccccttaccttag-taggttaatctctctagcttagacttcaattttgctc 254672  T
Q  201 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  254671 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctc 254630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 261475 - 261236
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  261475 caattattcataacttcatacatctaagcatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcatatatgaacaattaatcaattcatccaattaaacactta 261376  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctc 200  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  261375 tcatacaaataatt-gaaattacaataagtgattatgatgaattatatcccccttaccttag-taggttaatctctctagcttagtcttcaattttgctc 261278  T
Q  201 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  261277 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcctcttctc 261236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1867 (Bit Score: 164; Significance: 9e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold1867
Description:

Target: scaffold1867; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 336 - 542
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  336 caattattcataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 435  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctc 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  436 tcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgattaattctaacccccttaccttag-taggttaatctccctagcttaggcttcaatttttctc 534  T
Q  201 ctagctct 208  Q
    ||||||||    
T  535 ctagctct 542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 70805 - 71035
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  70805 caattatccataacttcatacatccaaacatgacatcataattagagcacgaatttcatcatttataaactattaattaattcacccaattaagcacttt 70904  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctc 200  Q
    |||||| ||||| | |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  70905 tcatac-aataactgaaaattacaataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagcttaggcttcaattttgctc 71003  T
Q  201 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagt 233  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  71004 ctagctc-tctcccaatccttgattcttcaagt 71035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 31235 - 31468
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31235 caattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaaataatcaattcacccaattaagcacttt 31334  T
Q  101 tcatacaaataatt-aaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaa--cccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttg 197  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  31335 tcatac-aataattgaaaaattgcaatgaatgattatgatgaattctaacccccccttaccttagttagattaatctccctagcttaggcttcaattttg 31433  T
Q  198 ctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagt 233  Q
     ||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||    
T  31434 atcctagctc-tcttccaatccttgattcatcaagt 31468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 97228 - 97093
Alignment:
Q  26 aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcact-tttcatacaaataatt-aaaaattgc 123  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | | ||  ||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||   |||||| ||||||| ||||||| |    
T  97228 aaacatatcatcataattagagcacgaatcttaacaactatgaacaattaatc-actcactcaattaaacactaaatcatac-aataattgaaaaattac 97131  T
Q  124 aataagtgattgtga-tgaattctaacccccttacctt 160  Q
    | ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  97130 actaaatgattatgattgaattctaacccccttacctt 97093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 9179 - 9410
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9179 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaaaaattaatcaattcactcaattaagcacttt 9278  T
Q  101 tcatacaaataatt--aaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgc 198  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9279 tcatac-aataattgaaaaaattgcaataa-tgattatgataaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagcttagacttcaattttgc 9376  T
Q  199 tcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagt 233  Q
    |||||||||  | |||||  |||||||||||||||    
T  9377 tcctagctcaac-cccaattcttgattcttcaagt 9410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 11763 - 11532
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  11763 caattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagtacaaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta 11664  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctc 200  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||    
T  11663 tcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaacccccttagcttagttagattaatctccctagcttaggcttcaattttgttc 11564  T
Q  201 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagt 233  Q
    |||||||  | ||||| ||||||||||||||||    
T  11563 ctagctcaac-cccaatccttgattcttcaagt 11532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 10129 - 10367
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10129 caattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 10228  T
Q  101 tcatacaaataatt-aaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgct 199  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||  ||    
T  10229 tcatacaaagaattgaaaatttgcaataa-tgattattatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccttagcttaggcttcaattt--ct 10325  T
Q  200 cctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  10326 cctagctc-tctcccattccttgattcttcaagtcctcttctc 10367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 233
Target Start/End: Original strand, 159494 - 159722
Alignment:
Q  3 attatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttc 102  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  159494 attatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttc 159593  T
Q  103 atacaaataatt-aaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcc 201  Q
     ||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  159594 gtac-aataattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagcttaggcttcaattttgctcc 159691  T
Q  202 tagctcttctcccaacccttgattcttcaagt 233  Q
     ||||| ||| |||  ||||||||||||||||    
T  159692 aagctc-tcttccactccttgattcttcaagt 159722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 85524 - 85753
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  85524 caattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcatttataaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 85623  T
Q  101 tcatacaaataatt-aaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgct 199  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  85624 tcatac-aataattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaacccccttaccttagtaagattaatctccctagcttagacttcaattttgct 85721  T
Q  200 cctagctcttctcccaacccttgattcttcaagt 233  Q
    ||| ||| |||| |||  ||||||||||||||||    
T  85722 ccttgct-ttct-ccactccttgattcttcaagt 85753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 112592 - 112371
Alignment:
Q  9 cataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  112592 cataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaaataagtacttttcatacaa 112493  T
Q  109 ataatt-aaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctc 207  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  112492 -taattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagcttaggcttcaattttgctcctagctc 112395  T
Q  208 ttctcccaacccttgattcttcaagt 233  Q
    |  |  || |||||||||||||||||    
T  112394 tctt--caccccttgattcttcaagt 112371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 102977 - 102810
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- 99  Q
    |||||||| | |||||||| |||  |||||| ||||||||||| |||||||||||  | || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||     
T  102977 caattatcaaaaacttcatgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcactta 102879  T
Q  100 ttcatacaaataattaaaaatt---gcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
    ||||||| || |||| ||||||    ||| || ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  102878 ttcatac-aacaattgaaaatttacacaaaaaatgattatgatgaattataaaccccttaccttagttag 102810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 203
Target Start/End: Original strand, 109905 - 109977
Alignment:
Q  130 tgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctccta 203  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  109905 tgattatgatgaattctaaccaccttaccttagttagattaat-tccctagcttaggcttcactttagctccta 109977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0816 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0816
Description:

Target: scaffold0816; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 3112 - 2882
Alignment:
Q  9 cataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  3112 cataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcatttatcatacaa 3013  T
Q  109 ataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctct 208  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  3012 ataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaacccccttaccttag-taggttagtctccctagcttaggcttcaattttgctcctagct-t 2916  T
Q  209 tctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
       ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  2915 aaccccaatccttgattcttcaagtcatcttctc 2882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 5302 - 5065
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  5302 caattattcataacttcatacatctaaacatctcatcataataagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta 5203  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctc 200  Q
    |||||||||||||| ||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  5202 tcatacaaataattgaaaattagaa-aagtgattatgatgaattctaacccccttaccttag-tagattaatctccctagcttaggcttcaattttgctc 5105  T
Q  201 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    ||||||| |||  | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  5104 ctagctc-tctatc-acccttgattcttcaagtcctcttctc 5065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 8937 - 8706
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- 99  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  8937 caattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattttcccaattaagcactta 8838  T
Q  100 ttcatacaaataattaaaaattgca--ataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttg 197  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||  | || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||     
T  8837 ttcatacaa-taattgaaa-ttgcaccaaaaatgattatgatgaactctaacccccttaccttagttagattaatctccctagcttaggcttcatttttt 8740  T
Q  198 ctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagt 233  Q
    |||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||    
T  8739 ctcctagctc-tcttccaa-tcttgattcttcaagt 8706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Original strand, 31410 - 31632
Alignment:
Q  9 cataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaa 108  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  31410 cataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagatcatgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcgcccaattaagcacttttcatac-a 31508  T
Q  109 ataatt-aaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctc 207  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |     
T  31509 ataattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctcctagat- 31606  T
Q  208 ttctcccaacccttgattcttcaagt 233  Q
    ||| ||||| |||||| |||||||||    
T  31607 ttcccccaatccttgactcttcaagt 31632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Original strand, 21711 - 21933
Alignment:
Q  9 cataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaa 108  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |    
T  21711 cataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcgcccaattaagcctttttcatac-a 21809  T
Q  109 ataatt-aaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctc 207  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |     
T  21810 ataattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattataacccccttaccttagttaggttaatctctctaccttaggcttcaattttgctcctagat- 21907  T
Q  208 ttctcccaacccttgattcttcaagt 233  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  21908 ttcccccaatccttgattcttcaagt 21933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 51 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 47554 - 47374
Alignment:
Q  51 gaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataatt-aaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaac 149  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  47554 gaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcgcccaattaagcacttttcatacaa-taattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaac 47457  T
Q  150 ccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagt 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||| |||||||||    
T  47456 ccccttaccttagttaggttaatctctctagcttaggcttcaattttgctcctagat-ttcccccaatccttgactcttcaagt 47374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 109517 - 109277
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  109517 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcagccaattaagcacttt 109418  T
Q  101 tcatacaaataatt---aaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttg 197  Q
    |||||| |||||||   |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| | ||||||||     
T  109417 tcatac-aataattgaaaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctaccttaggcatcaattttt 109320  T
Q  198 ctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    |||||||||||  |  || |||||||||||||||||| |||||||    
T  109319 ctcctagctctctt--caccccttgattcttcaagtcctcttctc 109277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 118018 - 117778
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  118018 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcagccaattaagcacttt 117919  T
Q  101 tcatacaaataatt---aaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttg 197  Q
    |||||| |||||||   |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| | ||||||||     
T  117918 tcatac-aataattgaaaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctaccttaggcatcaattttt 117821  T
Q  198 ctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    |||||||||||  |  || |||||||||||||||||| |||||||    
T  117820 ctcctagctctctt--caccccttgattcttcaagtcctcttctc 117778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0740 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0740
Description:

Target: scaffold0740; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 4476 - 4713
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  4476 caattattcataatttgatacatctaaacatgtcattataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta 4575  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctc 200  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  4576 tcatacaaataattgaaaattacaa-acgtgattatgatgaattctaacccccttaccttag-tagattaatctccctagcttaggcttcaattttgctc 4673  T
Q  201 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagtcttcttctc 242  Q
    ||||||| |||  | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  4674 ctagctc-tctatc-acccttgattcttcaagtcctcttctc 4713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 2108 - 2338
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2108 caattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgagcaattaatcaattcacccaattaagcacttt 2207  T
Q  101 tcatacaaataatt-aaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgct 199  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  2208 tcatac-aataattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaacccccttactttagttagattaatctccctagcttaggcttcaatttagct 2305  T
Q  200 cctagctcttctcccaacccttgattcttcaagt 233  Q
    ||||| || || ||||| ||||||||||||||||    
T  2306 cctagttc-tcccccaatccttgattcttcaagt 2338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 164406 - 164609
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||     
T  164406 caattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcatcacttatgaaaaattaatcaattcatccaattaagcactta 164505  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctc 200  Q
     ||||||| ||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  164506 ccatacaattaattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaacccccttaccttag-taggttaatctccctagcttaggcttcaattttgctc 164603  T
Q  201 ctagct 206  Q
    ||||||    
T  164604 ctagct 164609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 629 - 400
Alignment:
Q  3 attatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-tt 101  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  629 attatccataatttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttatt 530  T
Q  102 catacaaataatt-aaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctc 200  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||| ||    
T  529 catac-aataattgaaaaatagcaataaatga-tatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagattaggcttcaattttgatc 432  T
Q  201 ctagctcttctcccaacccttgattcttcaagt 233  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  431 ctagctc-tctcccaatccttgattcttcaagt 400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 33854 - 34085
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  33854 caattatctataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttacgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta 33953  T
Q  100 ttcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgct 199  Q
     |||||| | ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  33954 atcatac-agtaattgaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaatccccttaccttagttagattaatctccctagcttaggcttcaatttagct 34052  T
Q  200 cctagctcttctcccaacccttgattcttcaagt 233  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  34053 cctagct-ttcccccaatccttgattcttcaagt 34085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 25403 - 25564
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25403 caattattcataacttcatacatccaaacatgtcatcataaatagagcacaaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttt 25502  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttag 162  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  25503 tcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaagactaacccccttaccttag 25564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Original strand, 25150 - 25210
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatca 61  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  25150 caattattcataacttcatacatccaaacatgtcatcataaatagagcacaaatttcatca 25210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 15526 - 15367
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  15526 caattgtccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcaccacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta 15427  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttacctta 161  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  15426 tcatacaaataatttaaaattacaa-aagtgattatgatgaatgctaacccccttacctta 15367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 213 - 371
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  213 caattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcat---tagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaattaattcacccaattaagcacttt 309  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttag 162  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  310 tcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaagactaacccccttaccttag 371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 1573 - 1732
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1573 caattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacataggaacaattaatcaattcacccaattaagcactta 1672  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttacctta 161  Q
    |||| ||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  1673 tcatccaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 1732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 20009 - 19850
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  20009 caattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta 19910  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttacctta 161  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  19909 tcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 19850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 24313 - 24154
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  24313 caattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta 24214  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttacctta 161  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  24213 tcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 24154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 20365 - 20524
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  20365 caattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactta 20464  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttacctta 161  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  20465 tcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 20524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 253044 - 252902
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  253044 caattatccctaacttcatacatccaaacatgtcatcataatcaaagcacgaattttatcatttatgcacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 252945  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaat 143  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  252944 tcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaat 252902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 169 - 10
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||     
T  169 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataaatatagcacgaatttcatcatttattaacatttaatcaattcatccaattaagcactta 70  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttacctta 161  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  69 tcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 10  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 6463 - 6304
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||     
T  6463 caattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataaatatagcacgaatttcatcatttatgaacagttaatcaattcatccaattaagcactta 6364  T
Q  101 tcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttacctta 161  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  6363 tcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaacccccttacctta 6304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 6134 - 6261
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6134 caattatccataacttcatacattcaaacatgtcgtcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcaccaaattaagcacttt 6233  T
Q  101 tcatacaaataatt-aaaaattgcaataa 128  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  6234 tcatac-aataattgaaaaattgcaataa 6261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 130 - 233
Target Start/End: Original strand, 12590 - 12692
Alignment:
Q  130 tgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttc 229  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| || ||| |||  ||||||||||||    
T  12590 tgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagcttaggcttcaatttttctcctaggtc-tcttccactccttgattcttc 12688  T
Q  230 aagt 233  Q
    ||||    
T  12689 aagt 12692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 3511 - 3755
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- 99  Q
    |||||||  |||||||||| |||  ||||||  |||||||||| |||||||||||  | || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||     
T  3511 caattataaataacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcactta 3609  T
Q  100 ttcatacaaataatta-aaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgc 198  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||  ||||||||| ||    
T  3610 ttcatacaa-taattgtaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatccccctatcttaagcttcaatttagc 3708  T
Q  199 tcctagctcttctcccaacccttgattcttcaag-tcttcttctcact 245  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||| |||||||| || ||||||||||    
T  3709 tcctagctc-tcttccaatccttgaatcttcaagttcctcttctcact 3755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Original strand, 5133 - 5235
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5133 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgaacaattaattaattcacccaattaagcacttt 5232  T
Q  101 tca 103  Q
    |||    
T  5233 tca 5235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 127 - 242
Target Start/End: Original strand, 8665 - 8779
Alignment:
Q  127 aagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattc 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8665 aagtgattatgatgaattctaacccccttaccttagt-aggttaatctccctagcttaggcttcaattttgctcctagctcttctcctaacccttgattc 8763  T
Q  227 ttcaagtcttcttctc 242  Q
    |||||||| |||||||    
T  8764 ttcaagtcctcttctc 8779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 7997 - 8241
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- 99  Q
    |||||||  |||||||||| |||  ||||||  |||||||||| |||||||||||  | ||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||     
T  7997 caattataaataacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaaatatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcactta 8095  T
Q  100 ttcatacaaataatta-aaaattgcaataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgc 198  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||  ||||||||| ||    
T  8096 ttcatacaa-taattgtaaaattgcaataaatgattacgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatccccctagcttaagcttcaatttagc 8194  T
Q  199 tcctagctcttctcccaacccttgattcttcaag-tcttcttctcact 245  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||| || ||||| || ||||||||||    
T  8195 tcctagctc-tcttccaatccttgaatcgtcaagttcctcttctcact 8241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 36 - 161
Target Start/End: Original strand, 1 - 125
Alignment:
Q  36 tcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattg 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||     
T  1 tcataaatagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgatta 99  T
Q  136 tgatgaattctaacccccttacctta 161  Q
    |||||||  |||||||||||||||||    
T  100 tgatgaacactaacccccttacctta 125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 26 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 89894 - 89689
Alignment:
Q  26 aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataattaaaaattgca 124  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||| ||    
T  89894 aaacatatcatcatagttggagcacgaatttaa-catctatgaacaattaatcaatt-atccaattaatcacttattcatacaa-taattgaaaattaca 89798  T
Q  125 ataagt-gattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttga 223  Q
     |||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||  ||| ||||||    
T  89797 ctaaaaagattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatctccctagcttaggcttcaatttagctcctagctc-tctttcaatccttga 89699  T
Q  224 ttcttcaagt 233  Q
    ||||||||||    
T  89698 ttcttcaagt 89689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 5670 - 5500
Alignment:
Q  64 tatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataatt-aaaaattgcaataag-tgattgtgatgaattctaacccccttacctt 160  Q
    |||||||||||||||| || |  ||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||| || |||  ||||| | ||||||| ||||||||||| |||    
T  5670 tatgaacaattaatcactt-attcaattaagcacttattcatataa-taattgaaaaattacactaaaatgattatcatgaattataacccccttatctt 5573  T
Q  161 agttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagt 233  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5572 agttaggttactccctctagcttaggcttcaattttgctcctaactcttctcccaacccttgattcttcaagt 5500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 33783 - 33552
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- 99  Q
    |||||||||| |||||||  |||  |||||||||||||||||| ||||| |||||  | || |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||     
T  33783 caattatccacaacttcaagcattcaaacatgtcatcataattggagcatgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-actcaattaagcattta 33685  T
Q  100 ttcatacaaataattaaaaattgcaataag--tgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttg 197  Q
    |||||||||  |||| ||| || || |||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |  ||||||||| |    
T  33684 ttcatacaac-aattgaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaat-tccctagctcaagcttcaatttag 33587  T
Q  198 ctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagt 233  Q
    ||| |||||| ||| |||| |||||| |||||||||    
T  33586 ctcatagctc-tcttccaatccttgaatcttcaagt 33552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 70298 - 70130
Alignment:
Q  64 tatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataattaaaaattgca-ataagtgattgtgatgaattctaacccccttacctta 161  Q
    ||||||||||||||||||| |  || |||| ||||| ||||||||| ||||| |||||| || | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  70298 tatgaacaattaatcaatt-atacatttaatcacttattcatacaa-taattgaaaatttcacaaaaatgattatgatgaattctaacccccttacctta 70201  T
Q  162 gttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagt 233  Q
    ||||| |||||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  70200 gttagattaatccccctagcttaagcttcatttttgctcctagctc-tcttccaatccttgattcttcaagt 70130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 2371 - 2141
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- 99  Q
    |||||||| | |||||||| |||  ||||||  |||||||||| |||||||||||  |  | ||||||  |||||||||||| || |||||||||||||     
T  2371 caattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaataattatgattaattaatcaatt-actcaattaagcactta 2273  T
Q  100 ttcatacaaataattaaaaattgcaataag-tgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgc 198  Q
    |||||||||  |||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||| |  ||||| ||| ||    
T  2272 ttcatacaac-aattaaaaattgcactaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagatcaat-tctcttgctcaagcttcactttagc 2175  T
Q  199 tcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagt 233  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||    
T  2174 tcctagctc-tcttccaatccttgaatcttcaagt 2141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1378 - 1173
Alignment:
Q  26 aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataatt-aaaaattgc 123  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |    
T  1378 aaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcattt-atccaattaagcacttattcatacaa-taattgaaaaattac 1281  T
Q  124 aataag-tgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttg 222  Q
    | |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||| | |  ||||| ||| ||||||||||| ||| |||| |||||    
T  1280 actaatatgattatgatgaattctaacccccttaccttagatagattaat-tccctagatcaagcttcactttagctcctagctc-tcttccaatccttg 1183  T
Q  223 attcttcaag 232  Q
    | ||||||||    
T  1182 aatcttcaag 1173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 9633 - 9428
Alignment:
Q  26 aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataatt-aaaaattgc 123  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |    
T  9633 aaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcattt-atccaattaagcacttattcatacaa-taattgaaaaattac 9536  T
Q  124 aataag-tgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttg 222  Q
    | |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||| | |  ||||| ||| ||||||||||| ||| |||| |||||    
T  9535 actaatatgattatgatgaattctaacccccttaccttagatagattaat-tccctagatcaagcttcactttagctcctagctc-tcttccaatccttg 9438  T
Q  223 attcttcaag 232  Q
    | ||||||||    
T  9437 aatcttcaag 9428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 233
Target Start/End: Original strand, 10879 - 11084
Alignment:
Q  26 aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataattaaaaattgca 124  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||  | ||  |||||||||||||| | || | |||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||  |    
T  10879 aaacatatcatcatagatagagcacgaattataacatctatgaacaattaattattt-atccaattaatcacttattcatacaa-taattgaaaattata 10976  T
Q  125 ataag-tgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagct-tagacttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttg 222  Q
     |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||    
T  10977 ctaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttagttagattaatc-ctctagctctag-cttcacttttgctcctagctc-tctcccaatctttg 11073  T
Q  223 attcttcaagt 233  Q
    || ||||||||    
T  11074 atccttcaagt 11084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 197308 - 197142
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- 99  Q
    |||||||| | || |||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||  || ||||||||||||| || | ||||||||||||||     
T  197308 caattatcaacaatttcatacattcaaacatatcatcataattagagcccgaaattcaacatctaagaacaattaatcactt-atccaattaagcactta 197210  T
Q  100 ttcatacaaataattaaaaattgcaataagtgattgtga-tgaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
     ||||||||  ||| ||||||| || ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  197209 atcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttaccttaattag 197142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1601 - 1371
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- 99  Q
    ||||||||  ||| ||||| |||  |||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||     
T  1601 caattatcactaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatc-atttatccaattaagcactta 1503  T
Q  100 ttcatacaaataatt-aaaaattgcaat-aagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttg 197  Q
    ||||||| ||||||| |||| || || | || | ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| || |||||| |  ||||| ||| |    
T  1502 ttcatac-aataattgaaaatttacactaaaataattatgatgaattctaaaccccttaccttagatagattaat-tccctagctcaagcttcactttag 1405  T
Q  198 ctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaag 232  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||    
T  1404 ctcctagctc-tcttccaatccttgaatcttcaag 1371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8746 - 8516
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- 99  Q
    ||||||||  ||| ||||| |||  |||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||     
T  8746 caattatcactaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatc-atttatccaattaagcactta 8648  T
Q  100 ttcatacaaataatt-aaaaattgcaat-aagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttg 197  Q
    ||||||| ||||||| |||| || || | || | ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| || |||||| |  ||||| ||| |    
T  8647 ttcatac-aataattgaaaatttacactaaaataattatgatgaattctaaaccccttaccttagatagattaat-tccctagctcaagcttcactttag 8550  T
Q  198 ctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaag 232  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||    
T  8549 ctcctagctc-tcttccaatccttgaatcttcaag 8516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 162
Target Start/End: Original strand, 8227 - 8364
Alignment:
Q  26 aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataatt-aaaaattgc 123  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||| |    
T  8227 aaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatc-atttatccaattaatcacttattcatac-aataattgaaaaattac 8324  T
Q  124 aat-aagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttag 162  Q
    | | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8325 attaaaatgattatgatgaattctaacccccttaccttag 8364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 166
Target Start/End: Original strand, 69663 - 69815
Alignment:
Q  15 ttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataat 113  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||| ||  | |||||||||||||  |||||| ||||||    
T  69663 ttcatgcatttaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatcactt-tctcaattaagcacttaatcatac-aataat 69760  T
Q  114 t-aaaaattgcaataagtgattgtga-tgaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
    | ||||||| || ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  69761 tgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccccttatcttaattag 69815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22443 - 22254
Alignment:
Q  42 ttagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataattaaaaattg-caataag-tgattgtga 138  Q
    ||||||||||||||| | ||  |||||||||| ||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |  || |||  ||||| |||    
T  22443 ttagagcacgaattttaacatctatgaacaatcaatcaat-catccaattaatcacttattcatacaa-taattaaaaaataacactaaaatgattatga 22346  T
Q  139 tgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagcttagacttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaag 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| || |  ||||| ||| ||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||    
T  22345 tgaattctaacccccttaccttagttagattaat-tccctacctcaagcttcactttagctcctagctc-tcttccaatccttgaatcttcaag 22254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 104653 - 104513
Alignment:
Q  26 aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataattaaaaattgca 124  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||| | ||  |||||||||||||||| || || |||||||||| || |||||||||  | | ||||||| ||    
T  104653 aaacatatcatcatagttagagcatgaattttaacatctatgaacaattaatcactt-actcaattaagcaattattcatacaacaattgaaaaattaca 104555  T
Q  125 ataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
     ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  104554 ctaaatgattatgatgaattctaacccacttaccttaattag 104513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 93828 - 93730
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttc-atcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt 99  Q
    |||||||| | |||||||| |||  | |||| ||||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  93828 caattatcaaaaacttcatgcatacatacatatcatcataattggagcacgaatttctaacagttatgaacaattaat-aatttacccaattaagcactt 93730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 93720 - 93675
Alignment:
Q  187 cttcaattttgctcctagctcttctcccaacccttgattcttcaagt 233  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  93720 cttcacttttgctcctagctct-ctcccaatccttgattcttcaagt 93675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 76902 - 76740
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- 99  Q
    |||||||| | || ||||| |||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||| || |||||||| ||||     
T  76902 caattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcatgaatttcatcatctatgaacaattactcaatt-actcaattaagtactta 76804  T
Q  100 ttcatacaaataatt-aaaaattgcaat-aagtgattgtga-tgaattctaacccccttacctta 161  Q
     |||||| ||||||| ||||||| || | || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  76803 atcatac-aataattgaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaacccccttacctta 76740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 33 - 166
Target Start/End: Original strand, 31244 - 31378
Alignment:
Q  33 tcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt-tcatacaaataatt-aaaaattgcaataagt 130  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||  |||||||||||||||| || || |||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||| || ||| |    
T  31244 tcatcataattagagcacgaattctaacaactatgaacaattaatcactt-actcaattaagcacttaatcatacaa-taattgaaaaattacactaaat 31341  T
Q  131 gattgtgat-gaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  31342 gattatgattgaattctaacccccttaccttaattag 31378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 56
Target Start/End: Original strand, 146793 - 146848
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaattt 56  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  146793 caattatacataacttcatacatctaaacatgtcatcataattaaagcatgaattt 146848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 161
Target Start/End: Original strand, 53563 - 53699
Alignment:
Q  26 aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt-tcatacaaataatt-aaaaattgc 123  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| |||||  | ||  |||||||||||||||| || || |||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||| |    
T  53563 aaacatatcatcattattagagcatgaattctaacaactatgaacaattaatcactt-actcaattaagcacttaatcatacaa-taattgaaaaattac 53660  T
Q  124 aataagtgattgtgat-gaattctaacccccttacctta 161  Q
    | ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  53661 actaaatgattatgattgaattctaacccccttacctta 53699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 79
Target Start/End: Original strand, 85748 - 85802
Alignment:
Q  25 taaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatca 79  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  85748 taaacatatcatcataattagagcacgaatttcaacaactatgaacaattaatca 85802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 15 - 166
Target Start/End: Original strand, 2731 - 2883
Alignment:
Q  15 ttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagca-cttttcatacaaataat 113  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||| || ||  |||||| || ||  || |||||  |||    
T  2731 ttcatgcatccaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatcactt-actgaattaatcatctaatcttacaacaaat 2829  T
Q  114 taaaaattgcaataagtgattgtga-tgaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
     ||||||| || ||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2830 gaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaacccgcttaccttagttag 2883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 26 - 242
Target Start/End: Original strand, 11311 - 11526
Alignment:
Q  26 aaacatgtcatcataattagagcacgaatttc-atcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataatt-aaaaattg 122  Q
    |||||| ||||||||||| || || ||||||  | || |||||||||||||||||  | || ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||     
T  11311 aaacatatcatcataattggaacatgaatttttaacaattatgaacaattaatcatct-actcaattaagcacttattcatacaa-taattgaaaaatta 11408  T
Q  123 caataagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttaggttaatctctctagct-tagacttcaattttgctcctagctcttctcccaaccctt 221  Q
    || ||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||| ||| ||||| |||  |||||||||| ||| |||| ||||    
T  11409 cactaaatgattatgatgaattataacccc-ttaccttagttagattaat-tccctagctctag-cttcactttacctcctagctc-tcttccaatcctt 11504  T
Q  222 gattcttcaag-tcttcttctc 242  Q
    || |||||||| ||||||||||    
T  11505 gaatcttcaagctcttcttctc 11526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 7080 - 6918
Alignment:
Q  1 caattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt- 99  Q
    |||||||| | |||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||  |||| ||| || |||||||||||||     
T  7080 caattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttgacaattatgaacaacaaatc-atttactcaattaagcactta 6982  T
Q  100 ttcatacaaataattaaaaattgcaat-aagtgattgtga-tgaattctaacccccttacctta 161  Q
    |||||||||  | | ||||||| || | || ||||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  6981 ttcatacaacgattgaaaaattacattaaaatgattataattgaattctaacccccttacctta 6918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0634 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0634
Description:

Target: scaffold0634; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 166
Target Start/End: Original strand, 5629 - 5770
Alignment:
Q  26 aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattaaaaattgcaa 125  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  | | |||||||| |||||| || |  |||||||||||||  |||  || |||| ||||||| |||    
T  5629 aaacatatcaccataattagagcacgaatttcaaaaatgatgaacaaataatcactt-attcaattaagcacttaacatggaattaataaaaaattacaa 5727  T
Q  126 -taagtgattgtgat-gaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
     ||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  5728 ctaattgattatggttgaattctaacccccttaccttagttag 5770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 43820 - 43687
Alignment:
Q  34 catcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttt-tcatacaaataattaaaaattgcaataagtga 132  Q
    ||||||||||||||||  ||||| | ||  |||||||||||||||| || || |||||||||||||  ||||||||  | | ||||||| || ||| |||    
T  43820 catcataattagagcattaattttaacaactatgaacaattaatcactt-actcaattaagcacttaatcatacaacaattgaaaaattacactaaatga 43722  T
Q  133 ttgtgat-gaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  43721 ttatgattgaattctaacccccttaccttaattag 43687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 23702 - 23561
Alignment:
Q  26 aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataattaaaaattgca 124  Q
    |||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||| |  ||| |||||||||  |||| ||| |||| ||||||| ||    
T  23702 aaacatatcaccataattaaagcacgaatttcaacaactatgaacaaataatcaatt-attcaactaagcacttaatcatgcaattaatgaaaaattaca 23604  T
Q  125 ataagtgattgtga-tgaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
    |  | | ||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  23603 actaatcattatgattgaattctaacccccttatcttaattag 23561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 26 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 27020 - 26879
Alignment:
Q  26 aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattaaaaattgcaa 125  Q
    |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||| || | |||||||| |||||| || |  |||||||||||||  |||  || |||| ||||||| |||    
T  27020 aaacatatcaccataattatagcacgattttcaacaatgatgaacaaataatcactt-attcaattaagcacttaacatggaattaatgaaaaattacaa 26922  T
Q  126 -taagtgattgtgat-gaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
     ||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  26921 ctaattgattatggttgaattctaacccccttaccttagttag 26879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 162
Target Start/End: Original strand, 79756 - 79892
Alignment:
Q  26 aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactt-ttcatacaaataatt-aaaaattgc 123  Q
    |||||| |||||||| |||| |||||||||| | ||  ||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||| |    
T  79756 aaacatatcatcatagttagtgcacgaattttagcatctatgaacaattaatc-atttatccaattaatcacttattcatac-aataattgaaaaattac 79853  T
Q  124 aat-aagtgattgtgatgaattctaacccccttaccttag 162  Q
    | | || | ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  79854 actaaaataattatgatgaattctaa-ccccttaccttag 79892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 130 - 166
Target Start/End: Original strand, 28859 - 28895
Alignment:
Q  130 tgattgtgatgaattctaacccccttaccttagttag 166  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28859 tgattatgatgaattctaaccccgttaccttagttag 28895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University